View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17118_low_3 (Length: 206)

Name: NF17118_low_3
Description: NF17118
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17118_low_3
NF17118_low_3
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (1-206)||(30676556-30676761)
chr6 (1-206)||(34963484-34963689)
chr6 (1-206)||(12742428-12742633)
chr6 (1-206)||(24422658-24422862)
chr6 (1-206)||(33861905-33862109)
chr6 (1-206)||(33864389-33864593)
chr6 (1-206)||(1540758-1540962)
chr6 (1-198)||(8055140-8055337)
chr6 (1-206)||(18334439-18334643)
chr6 (1-206)||(2291027-2291231)
chr6 (1-206)||(22782338-22782542)
chr6 (1-206)||(19858766-19858970)
chr6 (1-206)||(25688613-25688818)
chr6 (1-206)||(26924487-26924691)
chr6 (1-175)||(19005157-19005330)
chr6 (52-206)||(12942363-12942517)
chr6 (12-206)||(19847814-19847989)
chr6 (1-158)||(25656740-25656897)
chr6 (86-206)||(17377694-17377814)
chr6 (74-206)||(23992604-23992738)
chr6 (53-206)||(28289183-28289334)
chr6 (100-206)||(18914142-18914248)
chr6 (73-175)||(31630524-31630626)
chr6 (99-206)||(1598266-1598372)
chr6 (57-175)||(18913994-18914111)
chr6 (100-203)||(31630390-31630493)
chr6 (1-104)||(1595660-1595763)
chr6 (53-175)||(15875469-15875590)
chr6 (100-206)||(19005361-19005467)
chr6 (124-206)||(25535641-25535723)
chr6 (100-206)||(15875621-15875717)
chr6 (1-68)||(18456830-18456897)
chr6 (1-82)||(25754920-25755001)
chr6 (1-69)||(3852000-3852068)
chr6 (1-64)||(16448514-16448577)
chr6 (12-82)||(20556864-20556934)
chr6 (57-122)||(18937252-18937317)
chr6 (3-68)||(8227449-8227515)
chr6 (100-174)||(35056707-35056781)
chr6 (1-42)||(18461990-18462031)
chr6 (116-174)||(32259078-32259136)
chr6 (97-174)||(15875565-15875642)
chr6 (108-138)||(17883303-17883333)
chr6 (97-174)||(18914086-18914163)
chr6 (11-52)||(25644446-25644487)
chr6 (3-67)||(20109255-20109322)
chr6 (17-68)||(23076862-23076914)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (1-206)||(16413162-16413367)
chr8 (3-206)||(24485890-24486093)
chr8 (1-206)||(1484513-1484717)
chr8 (1-206)||(5853139-5853343)
chr8 (1-206)||(14409291-14409495)
chr8 (1-206)||(4483391-4483596)
chr8 (1-206)||(22001864-22002068)
chr8 (1-206)||(4542220-4542424)
chr8 (1-206)||(20046042-20046246)
chr8 (1-206)||(14823884-14824090)
chr8 (1-175)||(20403338-20403511)
chr8 (1-175)||(15203109-15203282)
chr8 (1-206)||(15070670-15070876)
chr8 (1-175)||(19896379-19896553)
chr8 (13-175)||(32810054-32810215)
chr8 (1-175)||(45290572-45290745)
chr8 (73-206)||(27472263-27472395)
chr8 (74-206)||(32121912-32122044)
chr8 (74-206)||(18677911-18678043)
chr8 (1-174)||(19936882-19937056)
chr8 (100-206)||(1326778-1326884)
chr8 (100-206)||(38549851-38549957)
chr8 (73-175)||(38549988-38550090)
chr8 (111-206)||(16198115-16198210)
chr8 (102-198)||(16401779-16401875)
chr8 (111-206)||(25657999-25658094)
chr8 (73-175)||(20982604-20982710)
chr8 (100-175)||(13425336-13425411)
chr8 (100-175)||(20982498-20982573)
chr8 (120-198)||(24048841-24048919)
chr8 (53-175)||(1326915-1327042)
chr8 (86-175)||(16401908-16401996)
chr8 (93-206)||(19896524-19896637)
chr8 (97-206)||(15203025-15203134)
chr8 (97-206)||(20403486-20403595)
chr8 (100-164)||(13425241-13425305)
chr8 (1-68)||(41598299-41598366)
chr8 (1-82)||(25484245-25484326)
chr8 (1-67)||(19801367-19801433)
chr8 (100-206)||(19936754-19936850)
chr8 (3-68)||(26224032-26224097)
chr8 (97-206)||(45290488-45290597)
chr8 (3-68)||(13508023-13508089)
chr8 (10-68)||(13597555-13597614)
chr8 (100-171)||(21513636-21513707)
chr8 (100-174)||(18815609-18815683)
chr8 (3-58)||(17612059-17612114)
chr8 (100-174)||(36733302-36733376)
chr8 (100-174)||(38988730-38988804)
chr8 (100-174)||(39019827-39019901)
chr8 (100-167)||(5083001-5083068)
chr8 (11-68)||(20498687-20498745)
chr8 (53-99)||(35026849-35026895)
chr8 (97-174)||(19936829-19936906)
chr8 (110-174)||(38549936-38550000)
chr8 (97-175)||(1326862-1326940)
chr8 (53-99)||(2418860-2418906)
chr8 (97-174)||(13425284-13425361)
chr8 (97-174)||(20982552-20982629)
chr8 (97-162)||(32810190-32810255)
chr8 (17-68)||(5083092-5083144)
chr8 (110-174)||(13425390-13425454)
chr8 (17-68)||(37116479-37116531)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (1-206)||(3515118-3515323)
chr4 (1-206)||(14970553-14970758)
chr4 (1-206)||(44615399-44615604)
chr4 (1-206)||(15118199-15118403)
chr4 (1-206)||(50222186-50222390)
chr4 (1-206)||(19242810-19243016)
chr4 (1-206)||(18239266-18239470)
chr4 (1-175)||(18215152-18215325)
chr4 (1-206)||(44772930-44773138)
chr4 (1-175)||(12185-12358)
chr4 (1-175)||(52312621-52312794)
chr4 (1-175)||(15355202-15355375)
chr4 (1-175)||(19618050-19618223)
chr4 (1-198)||(7641041-7641243)
chr4 (1-206)||(1837366-1837560)
chr4 (52-206)||(15534343-15534497)
chr4 (53-206)||(36038033-36038186)
chr4 (53-206)||(14048740-14048893)
chr4 (100-206)||(362390-362496)
chr4 (53-206)||(49547620-49547773)
chr4 (100-206)||(19617913-19618019)
chr4 (100-206)||(52872919-52873025)
chr4 (100-206)||(18215015-18215121)
chr4 (100-203)||(15355068-15355171)
chr4 (100-206)||(15496020-15496126)
chr4 (53-175)||(15496949-15497070)
chr4 (54-175)||(52873056-52873176)
chr4 (107-206)||(29267570-29267669)
chr4 (100-206)||(14746358-14746464)
chr4 (53-175)||(14746495-14746618)
chr4 (100-206)||(19857798-19857894)
chr4 (97-206)||(52312769-52312878)
chr4 (93-175)||(19857685-19857767)
chr4 (97-206)||(12101-12210)
chr4 (1-82)||(12611054-12611135)
chr4 (73-141)||(362268-362336)
chr4 (1-68)||(21815569-21815636)
chr4 (1-68)||(44102325-44102392)
chr4 (1-63)||(22353948-22354010)
chr4 (1-82)||(51463838-51463919)
chr4 (1-68)||(15367805-15367872)
chr4 (1-68)||(15402818-15402885)
chr4 (1-64)||(20149941-20150004)
chr4 (2-68)||(15371318-15371384)
chr4 (2-68)||(15373599-15373665)
chr4 (1-82)||(23803235-23803316)
chr4 (3-58)||(44928873-44928928)
chr4 (1-66)||(16223647-16223712)
chr4 (1-68)||(15370133-15370199)
chr4 (3-68)||(13789-13855)
chr4 (3-67)||(43198492-43198557)
chr4 (53-105)||(19857607-19857659)
chr4 (164-206)||(30147189-30147231)
chr4 (11-68)||(52243132-52243190)
chr4 (97-174)||(19617998-19618075)
chr4 (110-175)||(14629428-14629493)
chr4 (97-174)||(14746443-14746520)
chr4 (97-174)||(15355150-15355227)
chr4 (97-174)||(19857742-19857819)
chr4 (95-152)||(26922388-26922445)
chr4 (110-174)||(362347-362411)
chr4 (100-152)||(26922437-26922489)
chr4 (17-68)||(53082090-53082142)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-206)||(11399-11605)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (1-202)||(4805-5006)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (1-206)||(14058-14263)
scaffold0230 (99-206)||(23377-23484)
[»] chr2 (63 HSPs)
chr2 (1-206)||(39682424-39682629)
chr2 (1-206)||(18809054-18809258)
chr2 (1-206)||(23711860-23712064)
chr2 (1-206)||(571508-571713)
chr2 (1-206)||(28577210-28577414)
chr2 (1-206)||(23130973-23131178)
chr2 (1-206)||(23133440-23133645)
chr2 (1-206)||(23709379-23709583)
chr2 (1-206)||(26505490-26505694)
chr2 (1-206)||(26507968-26508172)
chr2 (1-206)||(34402368-34402573)
chr2 (1-206)||(24898042-24898246)
chr2 (1-206)||(24905479-24905683)
chr2 (1-206)||(24907954-24908158)
chr2 (1-206)||(24900525-24900729)
chr2 (1-206)||(24903002-24903206)
chr2 (1-206)||(32039345-32039549)
chr2 (1-206)||(32214777-32214972)
chr2 (1-175)||(6726106-6726279)
chr2 (1-171)||(21154942-21155111)
chr2 (3-175)||(22105526-22105697)
chr2 (1-206)||(23135701-23135895)
chr2 (1-175)||(24367885-24368058)
chr2 (1-175)||(24642732-24642907)
chr2 (3-175)||(38967488-38967658)
chr2 (52-206)||(20261381-20261535)
chr2 (74-206)||(25616365-25616497)
chr2 (1-200)||(24529399-24529580)
chr2 (100-206)||(23707063-23707169)
chr2 (100-206)||(24918350-24918456)
chr2 (53-206)||(10684609-10684764)
chr2 (100-206)||(24642595-24642701)
chr2 (100-206)||(24671235-24671341)
chr2 (100-206)||(24681654-24681760)
chr2 (1-122)||(45029784-45029905)
chr2 (100-206)||(38967689-38967795)
chr2 (53-175)||(23707200-23707323)
chr2 (53-175)||(24918196-24918319)
chr2 (53-172)||(24671081-24671201)
chr2 (116-206)||(45027751-45027840)
chr2 (97-206)||(22105672-22105781)
chr2 (97-206)||(24368033-24368142)
chr2 (53-175)||(24681500-24681623)
chr2 (97-206)||(6726254-6726363)
chr2 (97-206)||(21154854-21154963)
chr2 (97-206)||(41523919-41524028)
chr2 (1-69)||(43137410-43137478)
chr2 (13-82)||(22173799-22173868)
chr2 (10-67)||(19671953-19672010)
chr2 (100-174)||(21368365-21368439)
chr2 (100-174)||(23799457-23799531)
chr2 (11-67)||(23708558-23708615)
chr2 (93-169)||(22686145-22686221)
chr2 (3-58)||(22459511-22459566)
chr2 (29-68)||(29601478-29601517)
chr2 (132-175)||(41524003-41524045)
chr2 (11-52)||(7688-7729)
chr2 (97-174)||(23707148-23707225)
chr2 (97-174)||(24642680-24642757)
chr2 (97-174)||(24918294-24918371)
chr2 (17-68)||(20520131-20520183)
chr2 (126-174)||(22686062-22686110)
chr2 (17-68)||(23791405-23791457)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-206)||(20858-21063)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-206)||(37932-38137)
[»] chr7 (70 HSPs)
chr7 (1-206)||(456432-456637)
chr7 (1-206)||(16232631-16232836)
chr7 (1-206)||(27216971-27217176)
chr7 (1-206)||(41523028-41523233)
chr7 (1-206)||(41525490-41525695)
chr7 (1-206)||(11393133-11393338)
chr7 (1-206)||(15376560-15376764)
chr7 (1-206)||(20384970-20385174)
chr7 (1-206)||(21189442-21189646)
chr7 (1-206)||(32125602-32125806)
chr7 (1-205)||(16213795-16213999)
chr7 (1-206)||(14948969-14949173)
chr7 (1-206)||(18640383-18640587)
chr7 (1-206)||(16410170-16410374)
chr7 (3-206)||(18430825-18431027)
chr7 (1-206)||(24702349-24702544)
chr7 (1-206)||(24704796-24704991)
chr7 (1-206)||(26355828-26356034)
chr7 (1-206)||(26358280-26358486)
chr7 (1-206)||(13869458-13869664)
chr7 (1-175)||(11972607-11972780)
chr7 (52-206)||(11303409-11303563)
chr7 (41-206)||(18627717-18627881)
chr7 (2-175)||(15081825-15081999)
chr7 (53-206)||(16108535-16108688)
chr7 (100-203)||(14269806-14269909)
chr7 (100-206)||(8940489-8940595)
chr7 (53-206)||(29796771-29796926)
chr7 (53-206)||(29800590-29800745)
chr7 (53-203)||(23664802-23664952)
chr7 (53-175)||(14269940-14270061)
chr7 (100-206)||(15081688-15081794)
chr7 (102-203)||(45847504-45847605)
chr7 (100-206)||(8468945-8469051)
chr7 (35-149)||(13841157-13841270)
chr7 (73-175)||(45847638-45847739)
chr7 (53-175)||(38898106-38898229)
chr7 (53-175)||(8940335-8940458)
chr7 (100-180)||(38897995-38898075)
chr7 (110-206)||(13841274-13841370)
chr7 (53-141)||(8468803-8468891)
chr7 (97-206)||(11972755-11972864)
chr7 (1-82)||(13647440-13647521)
chr7 (1-67)||(20110657-20110723)
chr7 (1-68)||(12756655-12756722)
chr7 (1-68)||(17061899-17061966)
chr7 (1-68)||(44116620-44116687)
chr7 (1-69)||(3386444-3386512)
chr7 (3-68)||(38898360-38898425)
chr7 (95-174)||(13745569-13745648)
chr7 (100-175)||(15119918-15119993)
chr7 (3-68)||(19486682-19486748)
chr7 (110-174)||(38294567-38294631)
chr7 (1-39)||(24275282-24275320)
chr7 (11-67)||(12255730-12255787)
chr7 (17-68)||(15008437-15008489)
chr7 (17-68)||(20220128-20220180)
chr7 (3-68)||(2280057-2280123)
chr7 (124-174)||(9743795-9743845)
chr7 (97-174)||(14269888-14269965)
chr7 (97-174)||(15081773-15081850)
chr7 (97-174)||(38898054-38898131)
chr7 (17-68)||(1867933-1867985)
chr7 (110-174)||(8468902-8468966)
chr7 (110-174)||(8940446-8940510)
chr7 (10-58)||(15113066-15113114)
chr7 (10-58)||(15116603-15116651)
chr7 (28-68)||(16495540-16495580)
chr7 (126-174)||(25941523-25941571)
chr7 (110-174)||(43747672-43747736)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (1-200)||(21474939-21475138)
chr1 (1-206)||(13988977-13989181)
chr1 (1-206)||(21923138-21923342)
chr1 (1-206)||(23593580-23593786)
chr1 (1-206)||(16362028-16362234)
chr1 (1-198)||(21840878-21841074)
chr1 (1-175)||(29776799-29776972)
chr1 (1-205)||(15859856-15860059)
chr1 (1-175)||(29298247-29298420)
chr1 (1-175)||(16275240-16275414)
chr1 (2-175)||(22122945-22123117)
chr1 (3-175)||(31612426-31612597)
chr1 (100-206)||(16275103-16275209)
chr1 (75-175)||(22050767-22050866)
chr1 (97-206)||(22122861-22122970)
chr1 (110-206)||(27161433-27161529)
chr1 (97-206)||(22050683-22050792)
chr1 (97-206)||(29776947-29777056)
chr1 (97-206)||(31612572-31612681)
chr1 (86-174)||(27161518-27161605)
chr1 (110-206)||(29298461-29298557)
chr1 (1-82)||(45574812-45574893)
chr1 (1-68)||(13212845-13212912)
chr1 (1-68)||(21347073-21347140)
chr1 (1-64)||(40389266-40389329)
chr1 (3-68)||(433123-433189)
chr1 (1-68)||(21342208-21342275)
chr1 (1-68)||(21707278-21707345)
chr1 (1-68)||(21711820-21711887)
chr1 (156-206)||(13227129-13227179)
chr1 (156-206)||(29535317-29535367)
chr1 (110-175)||(29298408-29298473)
chr1 (53-106)||(43543214-43543267)
chr1 (11-58)||(16758775-16758822)
chr1 (93-174)||(12710130-12710211)
chr1 (11-66)||(21861510-21861566)
chr1 (22-68)||(35261019-35261066)
chr1 (23-68)||(21477653-21477699)
chr1 (11-68)||(21896194-21896252)
chr1 (97-174)||(16275188-16275265)
chr1 (28-68)||(14295494-14295534)
chr1 (126-174)||(22824136-22824184)
chr1 (17-68)||(41049974-41050026)
chr1 (28-68)||(51130702-51130742)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (1-206)||(17286-17491)
scaffold0023 (1-206)||(94522-94726)
scaffold0023 (3-49)||(44568-44614)
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (1-206)||(13544136-13544340)
chr3 (1-206)||(17463289-17463493)
chr3 (1-198)||(45606761-45606958)
chr3 (1-206)||(7781193-7781398)
chr3 (1-206)||(16454128-16454332)
chr3 (1-206)||(34159437-34159641)
chr3 (1-206)||(55476602-55476806)
chr3 (1-206)||(6468981-6469185)
chr3 (1-198)||(12567671-12567867)
chr3 (1-206)||(13154102-13154306)
chr3 (1-206)||(10247570-10247774)
chr3 (3-206)||(27165364-27165568)
chr3 (3-206)||(53301350-53301554)
chr3 (1-175)||(9707484-9707658)
chr3 (1-175)||(8899205-8899378)
chr3 (1-175)||(16282689-16282862)
chr3 (1-206)||(13151637-13151841)
chr3 (2-197)||(8499631-8499827)
chr3 (1-175)||(41123998-41124171)
chr3 (1-175)||(38961769-38961942)
chr3 (1-206)||(28848468-28848662)
chr3 (1-206)||(15412541-15412747)
chr3 (74-206)||(46822445-46822577)
chr3 (53-206)||(54520985-54521138)
chr3 (53-206)||(15977696-15977848)
chr3 (60-206)||(12305315-12305461)
chr3 (73-206)||(10557091-10557224)
chr3 (100-206)||(12119500-12119606)
chr3 (55-206)||(29544688-29544839)
chr3 (111-206)||(13436520-13436615)
chr3 (53-175)||(11913928-11914051)
chr3 (1-93)||(17446614-17446706)
chr3 (124-206)||(24513910-24513992)
chr3 (97-206)||(38961685-38961794)
chr3 (110-206)||(25237063-25237159)
chr3 (95-175)||(17444694-17444773)
chr3 (97-203)||(17444613-17444719)
chr3 (97-203)||(41124146-41124252)
chr3 (97-206)||(16282604-16282714)
chr3 (1-82)||(43550448-43550529)
chr3 (1-82)||(50242933-50243014)
chr3 (110-194)||(25229476-25229560)
chr3 (1-68)||(53070637-53070704)
chr3 (6-68)||(17248225-17248287)
chr3 (1-68)||(29172566-29172634)
chr3 (1-68)||(17672737-17672804)
chr3 (108-175)||(25237009-25237075)
chr3 (1-68)||(12119708-12119775)
chr3 (3-68)||(24340661-24340727)
chr3 (110-206)||(20630038-20630138)
chr3 (3-68)||(37642203-37642269)
chr3 (3-58)||(22147474-22147529)
chr3 (100-174)||(25201323-25201397)
chr3 (11-67)||(2051138-2051195)
chr3 (11-67)||(52523666-52523723)
chr3 (116-174)||(15025934-15025992)
chr3 (3-68)||(23274804-23274870)
chr3 (110-175)||(17044330-17044395)
chr3 (176-206)||(10379613-10379643)
chr3 (100-130)||(11913867-11913897)
chr3 (97-174)||(11913876-11913953)
chr3 (129-174)||(18700200-18700245)
chr3 (120-173)||(50351664-50351717)
chr3 (110-174)||(12119585-12119649)
chr3 (29-68)||(15207079-15207119)
chr3 (29-68)||(15246161-15246201)
chr3 (29-68)||(15265282-15265322)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (1-206)||(134322-134526)
scaffold0028 (1-206)||(136791-136995)
scaffold0028 (1-206)||(139260-139464)
scaffold0028 (1-206)||(141729-141933)
scaffold0028 (1-206)||(144198-144402)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (1-206)||(264615-264819)
chr5 (1-206)||(42245212-42245416)
chr5 (1-206)||(20909123-20909327)
chr5 (1-206)||(39245247-39245451)
chr5 (1-206)||(39363495-39363700)
chr5 (1-206)||(10732787-10732991)
chr5 (1-206)||(29346091-29346295)
chr5 (1-206)||(29348564-29348768)
chr5 (1-206)||(29351037-29351241)
chr5 (1-175)||(32027504-32027677)
chr5 (1-206)||(38619546-38619752)
chr5 (1-206)||(23064623-23064829)
chr5 (1-175)||(29330045-29330215)
chr5 (1-175)||(20917830-20918003)
chr5 (74-206)||(17517010-17517142)
chr5 (1-206)||(2154478-2154665)
chr5 (53-206)||(9776521-9776674)
chr5 (100-206)||(20901767-20901873)
chr5 (53-203)||(37804752-37804902)
chr5 (1-175)||(20901904-20902060)
chr5 (97-206)||(32027652-32027761)
chr5 (110-206)||(20917693-20917789)
chr5 (1-68)||(36154767-36154834)
chr5 (97-206)||(29330190-29330298)
chr5 (1-64)||(18319021-18319084)
chr5 (1-64)||(24067219-24067282)
chr5 (1-67)||(11581184-11581250)
chr5 (1-68)||(10775660-10775726)
chr5 (100-171)||(18743965-18744036)
chr5 (5-68)||(31061184-31061247)
chr5 (3-68)||(40725970-40726036)
chr5 (100-174)||(1628169-1628243)
chr5 (97-175)||(20917777-20917855)
chr5 (100-172)||(21399896-21399968)
chr5 (11-52)||(22144174-22144215)
chr5 (97-174)||(20901852-20901929)
chr5 (133-174)||(24067282-24067323)
chr5 (100-174)||(18743852-18743923)
chr5 (110-174)||(20198507-20198571)
chr5 (28-68)||(36314689-36314729)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (1-206)||(13503-13708)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-206)||(9353-9557)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-198)||(10884-11080)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (1-206)||(40511-40715)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (13-206)||(6070-6262)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (3-187)||(38521-38706)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-157)||(501195-501351)
scaffold0001 (1-68)||(85563-85630)
scaffold0001 (172-206)||(501347-501381)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (53-206)||(3186-3339)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (53-206)||(53718-53873)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (53-206)||(1591-1744)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (53-206)||(4149-4304)
[»] scaffold0306 (2 HSPs)
scaffold0306 (53-206)||(15083-15238)
scaffold0306 (141-206)||(11186-11251)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (86-206)||(6782-6902)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (100-206)||(30229-30335)
scaffold0149 (1-173)||(30043-30196)
[»] scaffold0494 (3 HSPs)
scaffold0494 (100-206)||(370-476)
scaffold0494 (1-107)||(12194-12300)
scaffold0494 (100-175)||(507-582)
[»] scaffold1792 (1 HSPs)
scaffold1792 (99-206)||(416-523)
[»] scaffold0043 (3 HSPs)
scaffold0043 (100-198)||(10001-10099)
scaffold0043 (141-175)||(9936-9970)
scaffold0043 (97-174)||(9945-10022)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (59-175)||(27958-28073)
scaffold0114 (97-206)||(28048-28157)
[»] scaffold0747 (2 HSPs)
scaffold0747 (100-206)||(799-905)
scaffold0747 (53-175)||(645-768)
[»] scaffold0513 (3 HSPs)
scaffold0513 (100-187)||(10647-10734)
scaffold0513 (53-175)||(10765-10886)
scaffold0513 (97-174)||(10713-10790)
[»] scaffold0145 (2 HSPs)
scaffold0145 (1-175)||(9860-10016)
scaffold0145 (111-173)||(10005-10067)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (53-175)||(15150-15273)
scaffold0106 (100-199)||(15030-15119)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (117-206)||(57708-57797)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (53-163)||(35955-36065)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (108-206)||(13473-13571)
scaffold0040 (153-203)||(43002-43052)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (1-82)||(12169-12250)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-68)||(158434-158501)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (1-82)||(217-298)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (1-82)||(1250-1331)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (1-82)||(82183-82264)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (1-68)||(79268-79335)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (53-175)||(1204-1327)
scaffold0599 (100-130)||(1143-1173)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (111-206)||(6682-6767)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (1-68)||(2112-2179)
scaffold0247 (3-68)||(17965-18031)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (1-68)||(16895-16962)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-68)||(20364-20430)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (3-68)||(164574-164639)
scaffold0007 (3-68)||(161073-161138)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (1-68)||(4326-4392)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (1-68)||(4408-4475)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (147-206)||(7996-8055)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (4-60)||(12047-12103)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (156-206)||(68227-68277)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (3-68)||(11581-11647)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (3-68)||(38194-38260)
[»] scaffold0174 (2 HSPs)
scaffold0174 (95-174)||(15282-15361)
scaffold0174 (110-168)||(15350-15408)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (110-173)||(16263-16326)
scaffold0123 (17-68)||(667-719)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (11-68)||(13254-13312)
scaffold0357 (17-68)||(16038-16090)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (11-68)||(27687-27745)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (3-68)||(53487-53553)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (11-68)||(225531-225589)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (1-47)||(13119-13165)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (11-68)||(7997-8055)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (11-68)||(60653-60711)
[»] scaffold1186 (1 HSPs)
scaffold1186 (110-175)||(313-378)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (17-69)||(18175-18228)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (110-175)||(187890-187955)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (29-68)||(165-205)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (3-67)||(8583-8650)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (17-68)||(6221-6273)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (28-68)||(1012-1052)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (17-68)||(97137-97189)
scaffold0006 (17-68)||(106415-106467)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (118-174)||(66762-66818)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 30676761 - 30676556
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676761 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 30676662  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676661 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 30676562  T
Q  201 gcagta 206  Q
    | ||||    
T  30676561 gaagta 30676556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 34963484 - 34963689
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963484 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 34963583  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  34963584 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgatctatgt 34963683  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  34963684 gcagta 34963689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 12742428 - 12742633
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742428 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 12742527  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12742528 atataacacttcatcaatcatggacaaggtcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctactt 12742627  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  12742628 gcagta 12742633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 24422658 - 24422862
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422658 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 24422757  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422758 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 24422856  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  24422857 gcagta 24422862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 33861905 - 33862109
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861905 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 33862004  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33862005 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 33862103  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  33862104 gcagta 33862109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 33864389 - 33864593
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864389 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 33864488  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864489 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 33864587  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  33864588 gcagta 33864593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1540962 - 1540758
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540962 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 1540863  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540862 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 1540764  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  1540763 gcagta 1540758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 8055140 - 8055337
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055140 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 8055239  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8055240 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcattgtgacctac 8055337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18334643 - 18334439
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334643 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 18334544  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334543 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 18334445  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  18334444 gcagta 18334439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2291231 - 2291027
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291231 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 2291132  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291131 atataacacttcatcagtcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 2291033  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  2291032 gcagta 2291027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 22782338 - 22782542
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782338 cgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcttaaaacatcatatatac 22782437  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22782438 atataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctatgt 22782536  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  22782537 gcagta 22782542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19858970 - 19858766
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858970 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataacaatcaacatcttaaaacatcatatatac 19858871  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19858870 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-agcatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctatgt 19858772  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  19858771 gcagta 19858766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 25688613 - 25688818
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25688613 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataatcatatcacaatataacaacaccaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatttatac 25688712  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25688713 atataacacttcctcaatcatggacaatatcgtattcacaaaaatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtcacctacgt 25688812  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  25688813 gcagta 25688818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26924691 - 26924487
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26924691 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatgtac 26924592  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  26924591 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacgtacgt 26924493  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  26924492 gcagta 26924487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 19005157 - 19005330
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005157 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 19005256  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005257 atataacatttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 19005330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 206
Target Start/End: Original strand, 12942363 - 12942517
Alignment:
Q  52 aatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12942363 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacat 12942462  T
Q  152 acatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12942463 acatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagta 12942517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19847989 - 19847814
Alignment:
Q  12 ttcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacactt 111  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    |||||||||||||||||||||||    
T  19847989 ttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat-------------------catcatatatacatataacactt 19847909  T
Q  112 catcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847908 catcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 19847814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 25656740 - 25656897
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25656740 cgtctcaattattcacatataattcaactaatacatatataattatatcacaatataaaaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcttatatac 25656839  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatata 158  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25656840 atataacacttcatcaatcttggacaatatcgtagtcacaaatatatacatacatata 25656897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 86 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17377814 - 17377694
Alignment:
Q  86 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattatt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17377814 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactatttcatcaatcatattcaattatt 17377715  T
Q  186 cactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17377714 cactgtgacctacgtgcagta 17377694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Original strand, 23992604 - 23992738
Alignment:
Q  74 atcaacatcttaaaacatcat---atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23992604 atcaacatcttaaaacatcatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaa 23992702  T
Q  171 tcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23992703 tcatattcaattattcattgtgacctacgtgcagta 23992738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 53 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28289334 - 28289183
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 152  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||    
T  28289334 atataacgacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcg--ctcacaaatatatacata 28289237  T
Q  153 catatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28289236 catatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagta 28289183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Original strand, 18914142 - 18914248
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18914142 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtatttacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacg 18914241  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  18914242 tgcagta 18914248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 73 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 31630626 - 31630524
Alignment:
Q  73 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630626 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 31630527  T
Q  173 ata 175  Q
    |||    
T  31630526 ata 31630524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 206
Target Start/End: Original strand, 1598266 - 1598372
Alignment:
Q  99 acatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598266 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 1598364  T
Q  199 gtgcagta 206  Q
    ||||||||    
T  1598365 gtgcagta 1598372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 175
Target Start/End: Original strand, 18913994 - 18914111
Alignment:
Q  57 aacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacata 156  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18913994 aacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattca-taacatatacatacata 18914092  T
Q  157 tactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18914093 tactaattcatcaatcata 18914111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 31630493 - 31630390
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  31630493 catataacactttatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatatttaattattcattgtgacatacg 31630394  T
Q  200 tgca 203  Q
    ||||    
T  31630393 tgca 31630390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 1595660 - 1595763
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595660 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatggatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 1595759  T
Q  101 atat 104  Q
    ||||    
T  1595760 atat 1595763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 53 - 175
Target Start/End: Original strand, 15875469 - 15875590
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 152  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15875469 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacatttcattaatcatttacaatatcgtattcac-aacatatacata 15875567  T
Q  153 catatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  15875568 catataataattcatcaatcata 15875590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Original strand, 19005361 - 19005467
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  19005361 catataacatttcatcaattatgaacaatatcgcattcacaaacatatacatacctatagtaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctaca 19005460  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  19005461 tgcagta 19005467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 206
Target Start/End: Original strand, 25535641 - 25535723
Alignment:
Q  124 acaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25535641 acaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacatgcagta 25535723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Original strand, 15875621 - 15875717
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15875621 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacat----------atactaattcatcaatcatattcaattatttactgtgacctacg 15875710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 18456830 - 18456897
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456830 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 18456897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 25754920 - 25755001
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatc 82  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  25754920 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 25755001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 3852068 - 3852000
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaa 69  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3852068 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaaa 3852000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 16448577 - 16448514
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 64  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448577 cgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 16448514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 20556934 - 20556864
Alignment:
Q  12 ttcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatc 82  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  20556934 ttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 20556864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 122
Target Start/End: Original strand, 18937252 - 18937317
Alignment:
Q  57 aacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 122  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18937252 aacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 18937317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 8227515 - 8227449
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaa 68  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8227515 tctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 8227449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 35056707 - 35056781
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35056707 catataataattcatcaatcatgaacaacatcataatcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 35056781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 18461990 - 18462031
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaa 42  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18461990 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaa 18462031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 174
Target Start/End: Original strand, 32259078 - 32259136
Alignment:
Q  116 aatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  32259078 aatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 32259136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Original strand, 15875565 - 15875642
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  15875565 atacatataataattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 15875642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 17883333 - 17883303
Alignment:
Q  108 acttcatcaatcatgaacaatatcgtattca 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17883333 acttcatcaatcatgaacaatatcgtattca 17883303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Original strand, 18914086 - 18914163
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  18914086 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 18914163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Original strand, 25644446 - 25644487
Alignment:
Q  11 attcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 52  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25644446 attcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcaca 25644487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 67
Target Start/End: Original strand, 20109255 - 20109322
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatataca--attatatcacaatat-aacaacatcaa 67  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20109255 tctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 20109322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Original strand, 23076862 - 23076914
Alignment:
Q  17 atatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaata-taacaacatcaaa 68  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  23076862 atataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaa 23076914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16413367 - 16413162
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413367 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 16413268  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16413267 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgatctacgt 16413168  T
Q  201 gcagta 206  Q
    | ||||    
T  16413167 gaagta 16413162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24486093 - 24485890
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacat 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24486093 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttagaacatcatatatacat 24485994  T
Q  103 ataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24485993 ataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgc 24485894  T
Q  203 agta 206  Q
    ||||    
T  24485893 agta 24485890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 1484513 - 1484717
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484513 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 1484612  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484613 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 1484711  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  1484712 gcagta 1484717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5853343 - 5853139
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853343 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 5853244  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853243 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 5853145  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  5853144 gcagta 5853139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14409495 - 14409291
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409495 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 14409396  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409395 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 14409297  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  14409296 gcagta 14409291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 4483391 - 4483596
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483391 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 4483490  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4483491 atataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcagtgtgacctacgt 4483590  T
Q  201 gcagta 206  Q
     |||||    
T  4483591 tcagta 4483596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 22001864 - 22002068
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001864 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 22001963  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22001964 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcaatgttacctacgt 22002062  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  22002063 gcagta 22002068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4542424 - 4542220
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542424 cgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 4542325  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4542324 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgcgacctacgt 4542226  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  4542225 gcagta 4542220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20046246 - 20046042
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046246 cgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 20046147  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  20046146 atataacacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactcattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacat 20046048  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  20046047 gcagta 20046042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 14823884 - 14824090
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatc--atatat 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  14823884 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacattaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatat 14823983  T
Q  99 acatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823984 acatataacacttcatcaatcatggataatatcgtatttac-aacatatacattcatatactaattaatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 14824082  T
Q  199 gtgcagta 206  Q
    ||||||||    
T  14824083 gtgcagta 14824090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 20403338 - 20403511
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403338 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 20403437  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403438 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 20403511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15203282 - 15203109
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203282 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 15203183  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203182 atataacacttcatcaatcatggataatatcttattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 15203109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 15070670 - 15070876
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatata 99  Q
    ||||||||||||||||| || ||  || | |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  15070670 cgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatatctgaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatcataaata 15070769  T
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15070770 catataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactatgacctacg 15070869  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    | |||||    
T  15070870 ttcagta 15070876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 19896379 - 19896553
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatctt-aaaacatcatatata 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19896379 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaaatatcatatata 19896478  T
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19896479 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatatatacatatactaattcatcaatcata 19896553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Original strand, 32810054 - 32810215
Alignment:
Q  13 tcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttc 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32810054 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatgtaacacttc 32810153  T
Q  113 atcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32810154 atcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 32810215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 45290745 - 45290572
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290745 cgtctcaattattcacatataattcaattaatgcagatacaattatatcacagtataacaacgtcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 45290646  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290645 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 45290572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 73 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27472395 - 27472263
Alignment:
Q  73 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 172  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472395 aatcaacatcttaaa-catcatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 27472297  T
Q  173 atattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472296 atattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 27472263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Original strand, 32121912 - 32122044
Alignment:
Q  74 atcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatca 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32121912 atcaacatcttaaaacatcatacatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatgcatacatatactaattcatcaatca 32122011  T
Q  174 tattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32122012 tattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 32122044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18678043 - 18677911
Alignment:
Q  74 atcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatca 173  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18678043 atcaacatcttaaaacatcatacataaatataacacttcatcaatcatggataatatcgtattcacaaacatatacatatacatactaattcatcaatca 18677944  T
Q  174 tattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18677943 tattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 18677911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19937056 - 19936882
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatct--taaaacatcatatat 98  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||   | |||||||||||||    
T  19937056 cgtctcaattactcacaaataattcaatcaatgcacatacagttatatcacaatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatat 19936957  T
Q  99 acatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936956 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 19936882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1326884 - 1326778
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1326884 catataacacttcatcaatcataaacaatatcgtatttacaaacatgtacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 1326785  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  1326784 tgcagta 1326778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 38549957 - 38549851
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38549957 catataaaaattcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacatacg 38549858  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  38549857 tgcagta 38549851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 73 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 38550090 - 38549988
Alignment:
Q  73 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38550090 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacgtatactaattcatcaatc 38549991  T
Q  173 ata 175  Q
    |||    
T  38549990 ata 38549988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 111 - 206
Target Start/End: Original strand, 16198115 - 16198210
Alignment:
Q  111 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16198115 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctacgtgcagta 16198210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16401875 - 16401779
Alignment:
Q  102 tataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401875 tataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 16401779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 111 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25658094 - 25657999
Alignment:
Q  111 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25658094 tcatcaatcatgaacaatatcaaattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 25657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20982710 - 20982604
Alignment:
Q  73 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatata----acacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatc 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20982710 aatcaacatcttaaaacatcatatatatatatatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatc 20982611  T
Q  169 aatcata 175  Q
    |||||||    
T  20982610 aatcata 20982604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 13425411 - 13425336
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13425411 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 13425336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20982573 - 20982498
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20982573 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 20982498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Original strand, 24048841 - 24048919
Alignment:
Q  120 atgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 198  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048841 atgnacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 24048919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 53 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 1327042 - 1326915
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatata------acacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacata 146  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1327042 atataacaacatcaaataataatcaacatctcaaaacatcgtatatacatatatatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacata 1326944  T
Q  147 tacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1326943 tacatacatataccaattcatcaatcata 1326915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16401996 - 16401908
Alignment:
Q  86 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401996 aaacatcatatatacatataacatttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 16401908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 206
Target Start/End: Original strand, 19896524 - 19896637
Alignment:
Q  93 atatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtg 192  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19896524 atatatacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatcctaattcatcaatcacattcaattattcactgtg 19896623  T
Q  193 acctacgtgcagta 206  Q
    ||||||||||||||    
T  19896624 acctacgtgcagta 19896637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15203134 - 15203025
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 196  Q
    |||||||||  | |||||||||||| || || ||| || ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203134 atacatatactaattcatcaatcataaataacatcatactcataaacatatacattcatatattaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 15203035  T
Q  197 acgtgcagta 206  Q
    ||||||||||    
T  15203034 acgtgcagta 15203025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 20403486 - 20403595
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 196  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20403486 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatatttaattattcactgtgacct 20403585  T
Q  197 acgtgcagta 206  Q
    ||| ||||||    
T  20403586 acgcgcagta 20403595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13425305 - 13425241
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatt 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13425305 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatt 13425241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 41598299 - 41598366
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598299 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 41598366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 25484326 - 25484245
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatc 82  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  25484326 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataataacatcaaatcataatcaacatc 25484245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 19801433 - 19801367
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaa 67  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19801433 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattataacacaatataacaacatcaa 19801367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19936850 - 19936754
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||          ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19936850 catataacacttcatcaatcatgaacaatataatattcacaaacatatac----------taattcatcaatcataaacaattattcactgtgacctacg 19936761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Original strand, 26224032 - 26224097
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224032 tctcaattattcacatataatttaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 26224097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 45290597 - 45290488
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 196  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  45290597 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcatattcaattattcactatgatct 45290498  T
Q  197 acgtgcagta 206  Q
    ||||||||||    
T  45290497 acgtgcagta 45290488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 13508089 - 13508023
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaa 68  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13508089 tctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 13508023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 13597614 - 13597555
Alignment:
Q  10 tattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaa 68  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13597614 tattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 13597555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 171
Target Start/End: Original strand, 21513636 - 21513707
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21513636 catataatacttcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaat 21513707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18815683 - 18815609
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  18815683 catataatacttcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcacataataattcatcaatcat 18815609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 17612114 - 17612059
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 58  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17612114 tctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 17612059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36733376 - 36733302
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  36733376 catataatacttcatcaatcatgaaaaacatcatattcatcaacatatacattcatataataaatcatcaatcat 36733302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 38988730 - 38988804
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  38988730 catataataattcatcaatcatgaacatcatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 38988804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 39019827 - 39019901
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39019827 catataataattcatcaatcatgaacatcatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 39019901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5083068 - 5083001
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcat 167  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5083068 catataataattcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcat 5083001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 68
Target Start/End: Original strand, 20498687 - 20498745
Alignment:
Q  11 attcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaa 68  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20498687 attcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 20498745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 53 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 35026895 - 35026849
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatata 99  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35026895 atataacaatatcaaacgataatcaacatcttaaaacatcatatata 35026849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19936906 - 19936829
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  19936906 atacatatactaattcatcaatcatgaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 19936829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 38550000 - 38549936
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  38550000 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataaaaattcatcaatcat 38549936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 1326940 - 1326862
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||| | | || ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||    
T  1326940 atacatataccaattcatcaatcataaacaaaagcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcata 1326862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 2418906 - 2418860
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatata 99  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2418906 atataacaatatcaaacgataatcaacatcttgaaacatcatatata 2418860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13425361 - 13425284
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  13425361 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 13425284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20982629 - 20982552
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  20982629 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 20982552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 162
Target Start/End: Original strand, 32810190 - 32810255
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaa 162  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  32810190 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaa 32810255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 5083144 - 5083092
Alignment:
Q  17 atatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaata-taacaacatcaaa 68  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  5083144 atatgattcacataatgcatatacaaatatatcacattactaacaacatcaaa 5083092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13425454 - 13425390
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  13425454 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 13425390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Original strand, 37116479 - 37116531
Alignment:
Q  17 atatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaata-taacaacatcaaa 68  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  37116479 atataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaa 37116531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 3515118 - 3515323
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515118 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 3515217  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515218 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaaaatatacatacatataataattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 3515317  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  3515318 gcagta 3515323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14970758 - 14970553
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970758 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 14970659  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14970658 atataacacttcatcaattatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatattaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctatgt 14970559  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  14970558 gcagta 14970553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 44615399 - 44615604
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615399 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 44615498  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615499 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 44615598  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  44615599 gcagta 44615604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15118403 - 15118199
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118403 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 15118304  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118303 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 15118205  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  15118204 gcagta 15118199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 50222390 - 50222186
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222390 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaatatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 50222291  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222290 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 50222192  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  50222191 gcagta 50222186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 19242810 - 19243016
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatata 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242810 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaactccaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatata 19242909  T
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19242910 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactatgacctacg 19243009  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    | |||||    
T  19243010 ttcagta 19243016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18239470 - 18239266
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239470 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 18239371  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18239370 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactcattcatcaatcatattcaaaaattcactgtgacctacgt 18239272  T
Q  201 gcagta 206  Q
    | ||||    
T  18239271 gaagta 18239266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18215325 - 18215152
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215325 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcttaaaacatcatatatac 18215226  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215225 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 18215152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 44773138 - 44772930
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatc----atat 96  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||    ||||    
T  44773138 cgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaatatcatatatat 44773039  T
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44773038 atacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcgtatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacct 44772940  T
Q  197 acgtgcagta 206  Q
    ||||||||||    
T  44772939 acgtgcagta 44772930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 12358 - 12185
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12358 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatccaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 12259  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12258 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 12185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 52312621 - 52312794
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312621 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 52312720  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312721 atataacacttcattaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 52312794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15355375 - 15355202
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355375 cgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 15355276  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355275 atataacatttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 15355202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19618223 - 19618050
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618223 cgtctcaattattcacctataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 19618124  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19618123 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacatacatataccaattcatcaatcata 19618050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7641243 - 7641041
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  7641243 cgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaatatcatatatat 7641144  T
Q  101 atata------acacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgac 194  Q
    |||||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641143 atatatatataacacttcatcaatcatgaaaaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactcattcatcaatcatattcaattattcactgtgac 7641045  T
Q  195 ctac 198  Q
    ||||    
T  7641044 ctac 7641041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1837560 - 1837366
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837560 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatatcacattataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 1837461  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1837460 atataaaacttcatcaatcatggacaatatcgttttcaca-----------acatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacgt 1837372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 206
Target Start/End: Original strand, 15534343 - 15534497
Alignment:
Q  52 aatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15534343 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacat 15534442  T
Q  152 acatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15534443 acatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagta 15534497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 53 - 206
Target Start/End: Original strand, 36038033 - 36038186
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36038033 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacata 36038132  T
Q  153 catatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36038133 catatcttaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagta 36038186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 53 - 206
Target Start/End: Original strand, 14048740 - 14048893
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 152  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14048740 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacctcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaacatatacata 14048839  T
Q  153 catatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14048840 catatattaatttatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgtagta 14048893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Original strand, 362390 - 362496
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362390 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 362489  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  362490 tgcagta 362496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 53 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 49547773 - 49547620
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 152  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49547773 atataacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatcatagatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacata 49547674  T
Q  153 catatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  49547673 catatattaattcatcaatcataaataattcttcactatgacctacgtgcagta 49547620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19618019 - 19617913
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618019 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 19617920  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  19617919 tgcagta 19617913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 52873025 - 52872919
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873025 catataacacatcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 52872926  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  52872925 tgcagta 52872919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18215121 - 18215015
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215121 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattaataaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 18215022  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  18215021 tgcagta 18215015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15355171 - 15355068
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15355171 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatatatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacg 15355072  T
Q  200 tgca 203  Q
    ||||    
T  15355071 tgca 15355068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15496126 - 15496020
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15496126 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcagaaacatatacatacatatattaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacttacg 15496027  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  15496026 tgcagta 15496020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 53 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15497070 - 15496949
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 152  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15497070 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcac-aacatatacata 15496972  T
Q  153 catatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  15496971 catatattaattcatcaatcata 15496949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 52873176 - 52873056
Alignment:
Q  54 tataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatac 153  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52873176 tataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatac 52873078  T
Q  154 atatactaattcatcaatcata 175  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  52873077 gtatattaattcatcaatcata 52873056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 206
Target Start/End: Original strand, 29267570 - 29267669
Alignment:
Q  107 cacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29267570 cacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgcaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgttcagta 29267669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14746464 - 14746358
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14746464 catataacacttcatcaatcatgaacataatagtattcacaaacatatacatatatatactaattcatcaatcatatttaattattcactgtgacctacg 14746365  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  14746364 tgcagta 14746358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14746618 - 14746495
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||    
T  14746618 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcgc-aacatataca 14746520  T
Q  151 tacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14746519 tacatatactaattcatcaatcata 14746495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Original strand, 19857798 - 19857894
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857798 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacat----------atactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 19857887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 52312769 - 52312878
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 196  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312769 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 52312868  T
Q  197 acgtgcagta 206  Q
     |||||||||    
T  52312869 gcgtgcagta 52312878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 175
Target Start/End: Original strand, 19857685 - 19857767
Alignment:
Q  93 atatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857685 atatatatataaaatacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 19857767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12210 - 12101
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 196  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||  ||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12210 atacatatactaattcatcaatcataaacaacataatacacataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 12111  T
Q  197 acgtgcagta 206  Q
    ||||||||||    
T  12110 acgtgcagta 12101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 12611054 - 12611135
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatc 82  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  12611054 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 12611135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 141
Target Start/End: Original strand, 362268 - 362336
Alignment:
Q  73 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaa 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  362268 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatattgtattcacaa 362336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 21815636 - 21815569
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21815636 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcataatataacaacatcaaa 21815569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 44102325 - 44102392
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44102325 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaa 44102392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 22353948 - 22354010
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaaca 63  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22353948 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaaca 22354010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 51463919 - 51463838
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatc 82  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  51463919 cgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 51463838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 15367805 - 15367872
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367805 cgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 15367872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 15402818 - 15402885
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402818 cgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 15402885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 20149941 - 20150004
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 64  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20149941 cgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 20150004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 68
Target Start/End: Original strand, 15371318 - 15371384
Alignment:
Q  2 gtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15371318 gtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 15371384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 68
Target Start/End: Original strand, 15373599 - 15373665
Alignment:
Q  2 gtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15373599 gtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 15373665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 23803316 - 23803235
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatc 82  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||    
T  23803316 cgtctaaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacataaaatcataatcaacatc 23803235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 44928928 - 44928873
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 58  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928928 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 44928873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 16223647 - 16223712
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatca 66  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16223647 cgtctcaattattcacatataattcaactaacccatatacaattatatcacaatataacaacatca 16223712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 15370133 - 15370199
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370133 cgtctcaattattcacatataattcaactac-gcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 15370199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 13855 - 13789
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaa 68  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13855 tctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 13789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 43198557 - 43198492
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 67  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  43198557 tctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 43198492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 105
Target Start/End: Original strand, 19857607 - 19857659
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatata 105  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19857607 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatatatata 19857659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Original strand, 30147189 - 30147231
Alignment:
Q  164 tcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30147189 tcatcaatcatattcaattattcactgtgacctatgtgtagta 30147231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 52243190 - 52243132
Alignment:
Q  11 attcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaa 68  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  52243190 attcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 52243132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19618075 - 19617998
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  19618075 atacatataccaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 19617998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 175
Target Start/End: Original strand, 14629428 - 14629493
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    ||||||||| |||||| | ||| ||||||  ||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  14629428 ttcatcaataatgaacgacatcatattcattaacatatacattcatataatacttcatcaatcata 14629493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14746520 - 14746443
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  14746520 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 14746443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15355227 - 15355150
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  15355227 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 15355150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Original strand, 19857742 - 19857819
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  19857742 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 19857819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 26922445 - 26922388
Alignment:
Q  95 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 152  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||    
T  26922445 atatacatataataattcatcagtcatgaacaacatcatattcatcaacatatacata 26922388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Original strand, 362347 - 362411
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  362347 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 362411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 26922489 - 26922437
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 152  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||    
T  26922489 catataataattcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacata 26922437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 53082142 - 53082090
Alignment:
Q  17 atatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaata-taacaacatcaaa 68  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  53082142 atataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaa 53082090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 183; Significance: 3e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 11399 - 11605
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatca-tatata 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11399 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaaaatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaatatata 11498  T
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11499 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattaactgtgacctacg 11598  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  11599 tgcagta 11605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 182; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 4805 - 5006
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4805 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacaacatatatac 4904  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4905 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacgt 5004  T
Q  201 gc 202  Q
    ||    
T  5005 gc 5006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 182; Significance: 1e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 14058 - 14263
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14058 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 14157  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14158 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 14257  T
Q  201 gcagta 206  Q
     |||||    
T  14258 tcagta 14263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23484 - 23377
Alignment:
Q  99 acatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23484 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctac 23385  T
Q  199 gtgcagta 206  Q
    ||||||||    
T  23384 gtgcagta 23377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 182; Significance: 1e-98; HSPs: 63)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 39682424 - 39682629
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682424 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 39682523  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682524 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 39682623  T
Q  201 gcagta 206  Q
     |||||    
T  39682624 tcagta 39682629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 18809054 - 18809258
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809054 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 18809153  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809154 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 18809252  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  18809253 gcagta 18809258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23712064 - 23711860
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712064 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 23711965  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711964 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 23711866  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  23711865 gcagta 23711860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 571508 - 571713
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  571508 cgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 571607  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  571608 atataacacttcattaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacgt 571707  T
Q  201 gcagta 206  Q
     |||||    
T  571708 tcagta 571713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 28577210 - 28577414
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577210 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 28577309  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577310 atataacacttcatcaatcatggacaatattgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 28577408  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  28577409 gcagta 28577414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 23130973 - 23131178
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130973 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 23131072  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23131073 atataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacgt 23131172  T
Q  201 gcagta 206  Q
     |||||    
T  23131173 tcagta 23131178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 23133440 - 23133645
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133440 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 23133539  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23133540 atataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacgt 23133639  T
Q  201 gcagta 206  Q
     |||||    
T  23133640 tcagta 23133645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23709583 - 23709379
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709583 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 23709484  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23709483 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattcttcattgtgacctacgt 23709385  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  23709384 gcagta 23709379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 26505490 - 26505694
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505490 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 26505589  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505590 atataacacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 26505688  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  26505689 gcagta 26505694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 26507968 - 26508172
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507968 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 26508067  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508068 atataacacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 26508166  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  26508167 gcagta 26508172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 34402573 - 34402368
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402573 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 34402474  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34402473 atataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacgt 34402374  T
Q  201 gcagta 206  Q
     |||||    
T  34402373 tcagta 34402368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24898246 - 24898042
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898246 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 24898147  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24898146 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgttacctacgt 24898048  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  24898047 gcagta 24898042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24905683 - 24905479
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905683 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 24905584  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24905583 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgttacctacgt 24905485  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  24905484 gcagta 24905479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24908158 - 24907954
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908158 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 24908059  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24908058 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgttacctacgt 24907960  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  24907959 gcagta 24907954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24900729 - 24900525
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900729 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 24900630  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24900629 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatataaattcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgttacctacgt 24900531  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  24900530 gcagta 24900525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24903206 - 24903002
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903206 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 24903107  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24903106 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatataaattcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgttacctacgt 24903008  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  24903007 gcagta 24903002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 32039549 - 32039345
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039549 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcttaaaacatcatatatac 32039450  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32039449 atataacacttcatcgatcatggacaatatcagattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacgt 32039351  T
Q  201 gcagta 206  Q
     |||||    
T  32039350 tcagta 32039345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 32214972 - 32214777
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214972 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 32214873  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214872 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtatacacaaacat----------atactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 32214783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 6726106 - 6726279
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726106 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 6726205  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726206 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 6726279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 21155111 - 21154942
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155111 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 21155012  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 171  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155011 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaat 21154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 22105526 - 22105697
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacat 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105526 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaattataatcaacatcttaaaacatcatatatacat 22105625  T
Q  103 ataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105626 ataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatttacatacatatactaattcatcaatcata 22105697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 23135701 - 23135895
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23135701 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaacatcaaatgataatcagcatcttaaaacatcatatatac 23135800  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135801 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcaca-----------acatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 23135889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 24367885 - 24368058
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24367885 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataaccaacatcttaaaacatcatatatac 24367984  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367985 atataatacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 24368058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 24642907 - 24642732
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatc--ttaaaacatcatatat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||   | |||||||||||||    
T  24642907 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcaacttaaacatcatatat 24642808  T
Q  99 acatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642807 acatataacacttcatcaatcatgtacaatatcgtattcgc-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 24642732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 38967488 - 38967658
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacat 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38967488 tctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatata-caacatcaaataataatcaacatcttaagacatcatatatacat 38967586  T
Q  103 ataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38967587 ataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcata 38967658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 206
Target Start/End: Original strand, 20261381 - 20261535
Alignment:
Q  52 aatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20261381 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacat 20261480  T
Q  152 acatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20261481 acatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagta 20261535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Original strand, 25616365 - 25616497
Alignment:
Q  74 atcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatca 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25616365 atcaacatcttaaaacatcatacatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatca 25616464  T
Q  174 tattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  25616465 tattcaattattcattgtgacctacgtgaagta 25616497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24529580 - 24529399
Alignment:
Q  1 cgtctcaattatt-cacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatata 99  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    ||||||||| |    
T  24529580 cgtctcaattatttcatatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat-------------------catcatataca 24529500  T
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529499 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 24529400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23707169 - 23707063
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707169 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 23707070  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  23707069 tgcagta 23707063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Original strand, 24918350 - 24918456
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918350 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 24918449  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  24918450 tgcagta 24918456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 53 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10684764 - 10684609
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatata--catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 150  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10684764 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatatacatataacccttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatataca 10684665  T
Q  151 tacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10684664 tacatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgatctacgtgcagta 10684609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24642701 - 24642595
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24642701 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctaca 24642602  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  24642601 tgcagta 24642595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Original strand, 24671235 - 24671341
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24671235 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctacg 24671334  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  24671335 tgcagta 24671341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Original strand, 24681654 - 24681760
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24681654 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctacg 24681753  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  24681754 tgcagta 24681760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 45029905 - 45029784
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45029905 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacatttatatcacaatataacaacatgaaataataatcatcatcttaaaacatcatatatac 45029806  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  45029805 atataacacttcatcaatcatg 45029784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Original strand, 38967689 - 38967795
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  38967689 catataacacttcaacaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgagctgcg 38967788  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  38967789 tgcagta 38967795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 53 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 23707323 - 23707200
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  23707323 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatataca 23707225  T
Q  151 tacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23707224 tacatatactaattcatcaatcata 23707200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 175
Target Start/End: Original strand, 24918196 - 24918319
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||    
T  24918196 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatgca 24918294  T
Q  151 tacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24918295 tacatatactaattcatcaatcata 24918319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 53 - 172
Target Start/End: Original strand, 24671081 - 24671201
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 150  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  24671081 atataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataatacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatataca 24671179  T
Q  151 tacatatactaattcatcaatc 172  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24671180 tacatatactaattcatcaatc 24671201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 45027840 - 45027751
Alignment:
Q  116 aatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45027840 aatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacgtgcagta 45027751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 22105672 - 22105781
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 196  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105672 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 22105771  T
Q  197 acgtgcagta 206  Q
    |||| |||||    
T  22105772 acgttcagta 22105781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 24368033 - 24368142
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 196  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368033 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatgatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 24368132  T
Q  197 acgtgcagta 206  Q
    ||||||||||    
T  24368133 acgtgcagta 24368142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 53 - 175
Target Start/End: Original strand, 24681500 - 24681623
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 150  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||   | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  24681500 atataacaacatcaaatgatgatcaacatcaacttaaacatcatatatacatctaatacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatataca 24681598  T
Q  151 tacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24681599 tacatatactaattcatcaatcata 24681623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 6726254 - 6726363
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 196  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726254 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatgctaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 6726353  T
Q  197 acgtgcagta 206  Q
    | ||||||||    
T  6726354 atgtgcagta 6726363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21154963 - 21154854
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 196  Q
    |||||||||  | ||||||||| || ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154963 atacatatactaattcatcaattataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 21154864  T
Q  197 acgtgcagta 206  Q
    | ||||||||    
T  21154863 atgtgcagta 21154854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 41524028 - 41523919
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 196  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41524028 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcgtatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacct 41523929  T
Q  197 acgtgcagta 206  Q
    ||||||||||    
T  41523928 acgtgcagta 41523919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 43137410 - 43137478
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaa 69  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43137410 cgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaaa 43137478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 22173868 - 22173799
Alignment:
Q  13 tcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatc 82  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  22173868 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 22173799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Original strand, 19671953 - 19672010
Alignment:
Q  10 tattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaa 67  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19671953 tattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataacaacatcaa 19672010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 21368365 - 21368439
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21368365 catataataattcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 21368439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 23799457 - 23799531
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23799457 catataataattcatcaatcatgaataacatcatattcaacaacatatacattcatataataattcatcaatcat 23799531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 23708615 - 23708558
Alignment:
Q  11 attcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 67  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23708615 attcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 23708558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 169
Target Start/End: Original strand, 22686145 - 22686221
Alignment:
Q  93 atatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatca 169  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22686145 atatattcatataataattcatcaatcatgaaaaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatca 22686221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22459566 - 22459511
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 58  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22459566 tctcaaatattcacatataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataa 22459511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 68
Target Start/End: Original strand, 29601478 - 29601517
Alignment:
Q  29 taatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29601478 taatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaa 29601517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 41524045 - 41524003
Alignment:
Q  132 gtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41524045 gtattcacaa-catatacatacatatactaattcatcaatcata 41524003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 7729 - 7688
Alignment:
Q  11 attcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 52  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7729 attcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcaca 7688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23707225 - 23707148
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  23707225 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 23707148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24642757 - 24642680
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  24642757 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 24642680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Original strand, 24918294 - 24918371
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  24918294 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 24918371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 20520183 - 20520131
Alignment:
Q  17 atatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaata-taacaacatcaaa 68  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||    
T  20520183 atataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatcaaa 20520131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 174
Target Start/End: Original strand, 22686062 - 22686110
Alignment:
Q  126 aatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22686062 aatatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 22686110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Original strand, 23791405 - 23791457
Alignment:
Q  17 atatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaata-taacaacatcaaa 68  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  23791405 atataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaa 23791457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 178; Significance: 3e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 20858 - 21063
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20858 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 20957  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20958 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacgt 21057  T
Q  201 gcagta 206  Q
     |||||    
T  21058 tcagta 21063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 178; Significance: 3e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 37932 - 38137
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37932 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 38031  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38032 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacgt 38131  T
Q  201 gcagta 206  Q
     |||||    
T  38132 tcagta 38137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 178; Significance: 3e-96; HSPs: 70)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 456432 - 456637
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  456432 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 456531  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  456532 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacgt 456631  T
Q  201 gcagta 206  Q
     |||||    
T  456632 tcagta 456637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 16232631 - 16232836
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232631 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 16232730  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16232731 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacgt 16232830  T
Q  201 gcagta 206  Q
     |||||    
T  16232831 tcagta 16232836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 27216971 - 27217176
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27216971 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 27217070  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27217071 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacgt 27217170  T
Q  201 gcagta 206  Q
     |||||    
T  27217171 tcagta 27217176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 41523028 - 41523233
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523028 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 41523127  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41523128 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacgt 41523227  T
Q  201 gcagta 206  Q
     |||||    
T  41523228 tcagta 41523233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 41525490 - 41525695
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525490 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 41525589  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41525590 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacgt 41525689  T
Q  201 gcagta 206  Q
     |||||    
T  41525690 tcagta 41525695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11393338 - 11393133
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393338 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 11393239  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11393238 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactatgacctacgt 11393139  T
Q  201 gcagta 206  Q
     |||||    
T  11393138 tcagta 11393133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15376764 - 15376560
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376764 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 15376665  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376664 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 15376566  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  15376565 gcagta 15376560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20385174 - 20384970
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385174 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 20385075  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385074 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 20384976  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  20384975 gcagta 20384970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21189646 - 21189442
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189646 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 21189547  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189546 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaac-tatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 21189448  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  21189447 gcagta 21189442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 32125602 - 32125806
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125602 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 32125701  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125702 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 32125800  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  32125801 gcagta 32125806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 16213795 - 16213999
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16213795 cgtcttaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaacataacaacatcaaatggtaatcaacatatgaaaacatcatatatac 16213894  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16213895 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcttattcaattattcactgtgacctacgt 16213994  T
Q  201 gcagt 205  Q
    |||||    
T  16213995 gcagt 16213999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14949173 - 14948969
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949173 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 14949074  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949073 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 14948975  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  14948974 gcagta 14948969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 18640383 - 18640587
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640383 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacataaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 18640482  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640483 atataacacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcac-aacatatacattcatatagtaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 18640581  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  18640582 gcagta 18640587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 16410170 - 16410374
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410170 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatcatagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 16410269  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410270 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattgatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 16410368  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  16410369 gcagta 16410374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Original strand, 18430825 - 18431027
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacat 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430825 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacat 18430924  T
Q  103 ataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgc 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  18430925 ataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcagattcaattattcactatgttctacgtgc 18431023  T
Q  203 agta 206  Q
    ||||    
T  18431024 agta 18431027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 24702349 - 24702544
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702349 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 24702448  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702449 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaa----------acatatactaattcatgaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 24702538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 24704796 - 24704991
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704796 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 24704895  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704896 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaa----------acatatactaattcatgaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 24704985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26356034 - 26355828
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcata--tat 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  26356034 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacattaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatat 26355935  T
Q  99 acatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355934 acatataacacttcatcaattatggacaatatcgtatttac-aacatatacattcatatactaattaatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 26355836  T
Q  199 gtgcagta 206  Q
    ||| ||||    
T  26355835 gtgtagta 26355828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26358486 - 26358280
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcata--tat 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  26358486 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacattaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatat 26358387  T
Q  99 acatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26358386 acatataacacttcatcaattatggacaatatcgtatttac-aacatatacattcatatactaattaatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 26358288  T
Q  199 gtgcagta 206  Q
    ||| ||||    
T  26358287 gtgtagta 26358280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 13869458 - 13869664
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatata 99  Q
    ||||||||||||||| | || ||  || | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869458 cgtctcaattattcaaagataatctaattgatgcatatacaattatatcccaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatcatatata 13869557  T
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13869558 catataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacg 13869657  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    | |||||    
T  13869658 ttcagta 13869664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 11972607 - 11972780
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11972607 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaatatcttaaaacatcatatatac 11972706  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972707 atgtaacacttcatcaatcatgggcaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 11972780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 206
Target Start/End: Original strand, 11303409 - 11303563
Alignment:
Q  52 aatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11303409 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacat 11303508  T
Q  152 acatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11303509 acatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagta 11303563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 206
Target Start/End: Original strand, 18627717 - 18627881
Alignment:
Q  41 aattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcaca 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||     
T  18627717 aattatatcacaatataacaagatcaaatactaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcacggaaaatatcgtattcac- 18627815  T
Q  141 aacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18627816 aacatatacattcatataataattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 18627881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15081999 - 15081825
Alignment:
Q  2 gtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatc--ttaaaacatcatatata 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||   | ||||||||||||||    
T  15081999 gtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcaacttaaacatcatatata 15081900  T
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081899 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 15081825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 53 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16108688 - 16108535
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16108688 atataacaacatcaaacggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatattgtattcacaaatatatacata 16108589  T
Q  153 catatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  16108588 catatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacgtacgtgtagta 16108535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14269909 - 14269806
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269909 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 14269810  T
Q  200 tgca 203  Q
    ||||    
T  14269809 tgca 14269806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Original strand, 8940489 - 8940595
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940489 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 8940588  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  8940589 tgcagta 8940595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 53 - 206
Target Start/End: Original strand, 29796771 - 29796926
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatat--atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 150  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  29796771 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatatacatataacccttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatataca 29796870  T
Q  151 tacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  29796871 tacatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgatctacgtgcagta 29796926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 53 - 206
Target Start/End: Original strand, 29800590 - 29800745
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatat--atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 150  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  29800590 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatatacatataacccttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatataca 29800689  T
Q  151 tacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  29800690 tacatatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgatctacgtgcagta 29800745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23664952 - 23664802
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 152  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23664952 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatacatataacctttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacata 23664853  T
Q  153 catatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgca 203  Q
    |||||| |||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23664852 catatattaattcatcaatcatcaacaattcttcactgtgacctacatgca 23664802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 53 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14270061 - 14269940
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 152  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14270061 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacata 14269963  T
Q  153 catatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  14269962 catatattaattcatcaatcata 14269940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15081794 - 15081688
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15081794 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcacttagacctacg 15081695  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  15081694 tgcagta 15081688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 45847605 - 45847504
Alignment:
Q  102 tataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45847605 tataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacagacatatacatacatataccaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtg 45847506  T
Q  202 ca 203  Q
    ||    
T  45847505 ca 45847504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Original strand, 8468945 - 8469051
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  8468945 catataacatttcatcaatcatgaacaatatcgtattcaaaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctaca 8469044  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  8469045 tgcagta 8469051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 149
Target Start/End: Original strand, 13841157 - 13841270
Alignment:
Q  35 atatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgta 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13841157 atatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgta 13841256  T
Q  135 ttcacaaacatatac 149  Q
    |||| ||||||||||    
T  13841257 ttca-aaacatatac 13841270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 45847739 - 45847638
Alignment:
Q  73 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 172  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45847739 aatcaacatcttaaa-catcatatatacatataaaacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatattaattcatcaatc 45847641  T
Q  173 ata 175  Q
    |||    
T  45847640 ata 45847638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 53 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 38898229 - 38898106
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  38898229 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatataca 38898131  T
Q  151 tacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  38898130 tacatatactaattcatcaatcata 38898106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 175
Target Start/End: Original strand, 8940335 - 8940458
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  8940335 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatataca 8940433  T
Q  151 tacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  8940434 taaatatactaattcatcaatcata 8940458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 38898075 - 38897995
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaa 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38898075 catataacacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaa 38897995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 206
Target Start/End: Original strand, 13841274 - 13841370
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13841274 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 13841370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 141
Target Start/End: Original strand, 8468803 - 8468891
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaa 141  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8468803 atataacaacatcaaataataatcaacatcataaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa 8468891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 11972755 - 11972864
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 196  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972755 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatgcattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 11972854  T
Q  197 acgtgcagta 206  Q
    |||| |||||    
T  11972855 acgtacagta 11972864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 13647440 - 13647521
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatc 82  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  13647440 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 13647521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 20110657 - 20110723
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaa 67  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110657 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaa 20110723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 12756722 - 12756655
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12756722 cgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 12756655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 17061966 - 17061899
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17061966 cgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 17061899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 44116620 - 44116687
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116620 cgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 44116687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 3386444 - 3386512
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaa 69  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3386444 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatcacaatataacatcatcaaaa 3386512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 38898425 - 38898360
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  38898425 tctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacagtataacaacgtcaaa 38898360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13745648 - 13745569
Alignment:
Q  95 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||| ||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13745648 atattcatataataattcattaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 13745569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15119993 - 15119918
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  15119993 catataataattcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcataaatcata 15119918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 19486748 - 19486682
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaa 68  Q
    |||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19486748 tctcaaataatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 19486682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Original strand, 38294567 - 38294631
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  38294567 ttcatcaatcatgaacaacatcatattcgccaacatatacattcatagaataattcatcaatcat 38294631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 24275282 - 24275320
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatata 39  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24275282 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 24275320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 12255787 - 12255730
Alignment:
Q  11 attcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 67  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12255787 attcatatataattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 12255730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 15008489 - 15008437
Alignment:
Q  17 atatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaata-taacaacatcaaa 68  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  15008489 atataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaa 15008437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 20220180 - 20220128
Alignment:
Q  17 atatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaata-taacaacatcaaa 68  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20220180 atataattcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaa 20220128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 2280123 - 2280057
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaa 68  Q
    |||||| |||||| |||| |||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2280123 tctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaa 2280057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9743845 - 9743795
Alignment:
Q  124 acaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  9743845 acaatatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 9743795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14269965 - 14269888
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  14269965 atacatatattaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 14269888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15081850 - 15081773
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  15081850 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 15081773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 38898131 - 38898054
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  38898131 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 38898054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 1867985 - 1867933
Alignment:
Q  17 atatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaata-taacaacatcaaa 68  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  1867985 atataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaa 1867933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Original strand, 8468902 - 8468966
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  8468902 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacatttcatcaatcat 8468966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Original strand, 8940446 - 8940510
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  8940446 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 8940510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 58
Target Start/End: Original strand, 15113066 - 15113114
Alignment:
Q  10 tattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 58  Q
    ||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  15113066 tattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataa 15113114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 58
Target Start/End: Original strand, 15116603 - 15116651
Alignment:
Q  10 tattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 58  Q
    ||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  15116603 tattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataa 15116651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 68
Target Start/End: Original strand, 16495540 - 16495580
Alignment:
Q  28 gtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16495540 gtaatgtatatacaattatataacattataacaacatcaaa 16495580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 174
Target Start/End: Original strand, 25941523 - 25941571
Alignment:
Q  126 aatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  25941523 aatatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 25941571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Original strand, 43747672 - 43747736
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  43747672 ttcatcaattatgaacaacatcatattcatcaacatatactttcatataatacttcatcaatcat 43747736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 176; Significance: 5e-95; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21475138 - 21474939
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475138 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 21475039  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21475038 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacgt 21474939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 13988977 - 13989181
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988977 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 13989076  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989077 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 13989175  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  13989176 gcagta 13989181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21923342 - 21923138
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923342 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 21923243  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923242 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 21923144  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  21923143 gcagta 21923138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23593786 - 23593580
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatata 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593786 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatata 23593687  T
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23593686 catataacacttcattaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacg 23593587  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    | |||||    
T  23593586 ttcagta 23593580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 16362028 - 16362234
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatata 99  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362028 cgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatata 16362127  T
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16362128 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattaacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataataaattattcactgtgacctacg 16362227  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    | |||||    
T  16362228 ttcagta 16362234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 21840878 - 21841074
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840878 cgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 21840977  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21840978 atataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgttacctac 21841074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 29776799 - 29776972
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776799 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 29776898  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776899 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 29776972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15860059 - 15859856
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15860059 cgtcttaattactcacaaataattcaatcaatgcacatacaattatatcacaatataacaacatcagatggtaatcaacatcttaagacatcatatatac 15859960  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15859959 atataacacttcatcaaccatggacaatatcgtattcgc-aagatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 15859861  T
Q  201 gcagt 205  Q
    |||||    
T  15859860 gcagt 15859856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 29298247 - 29298420
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298247 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataataacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 29298346  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29298347 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatatatatactaattcatcaatcata 29298420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16275414 - 16275240
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16275414 cgtctcaattattcacataaaattcaattaatgcatataccattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaatatcttgaaacatcatatatac 16275315  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275314 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgcaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 16275240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22123117 - 22122945
Alignment:
Q  2 gtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatataca 101  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22123117 gtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaatatcttaaaacatcatatataca 22123018  T
Q  102 tataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22123017 tataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacataaacatacatataccaattcatcaatcata 22122945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 31612426 - 31612597
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacat 102  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31612426 tctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaatatcttaaaacatcatatatacat 31612525  T
Q  103 ataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612526 ataatacttcatcaatcatggacaatattgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 31612597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16275209 - 16275103
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16275209 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgaattcacaaacatatacatacatatattaattcatcaatcgtattcaattattcactgtgacctacg 16275110  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  16275109 tgcagta 16275103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22050866 - 22050767
Alignment:
Q  75 tcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050866 tcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcat 22050768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22122970 - 22122861
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 196  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22122970 atacatataccaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 22122871  T
Q  197 acgtgcagta 206  Q
    ||||||||||    
T  22122870 acgtgcagta 22122861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 110 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27161529 - 27161433
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27161529 ttcatcaatcattaacaatattttattcataaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctacgtgcagta 27161433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22050792 - 22050683
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 196  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050792 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 22050693  T
Q  197 acgtgcagta 206  Q
    ||||||||||    
T  22050692 acgtgcagta 22050683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 29776947 - 29777056
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 196  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776947 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 29777046  T
Q  197 acgtgcagta 206  Q
    ||||||||||    
T  29777047 acgtgcagta 29777056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 31612572 - 31612681
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 196  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||||||| || | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31612572 atacatatactaattcatcaatcataaacaatatcatactgataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactttgacct 31612671  T
Q  197 acgtgcagta 206  Q
    ||||||||||    
T  31612672 acgtgcagta 31612681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27161605 - 27161518
Alignment:
Q  86 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27161605 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatatacatatatatactaattcatcaatcat 27161518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 206
Target Start/End: Original strand, 29298461 - 29298557
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29298461 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacttatgtgcagta 29298557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 45574893 - 45574812
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatc 82  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||    
T  45574893 cgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataagaacatcaaatcataatcaacatc 45574812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 13212912 - 13212845
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212912 cgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 13212845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 21347073 - 21347140
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347073 cgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 21347140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 40389266 - 40389329
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 64  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40389266 cgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 40389329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Original strand, 433123 - 433189
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  433123 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaa 433189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 21342208 - 21342275
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21342208 cgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattacatcacaatataacaacatcaaa 21342275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 21707278 - 21707345
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21707278 cgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcacaatataacatcatcaaa 21707345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 21711820 - 21711887
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21711820 cgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcacaatataacatcatcaaa 21711887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 206
Target Start/End: Original strand, 13227129 - 13227179
Alignment:
Q  156 atactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13227129 atactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgtagta 13227179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 206
Target Start/End: Original strand, 29535317 - 29535367
Alignment:
Q  156 atactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29535317 atactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgtagta 29535367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 175
Target Start/End: Original strand, 29298408 - 29298473
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29298408 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcata 29298473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 106
Target Start/End: Original strand, 43543214 - 43543267
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataa 106  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43543214 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataa 43543267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 16758775 - 16758822
Alignment:
Q  11 attcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 58  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16758775 attcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 16758822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 174
Target Start/End: Original strand, 12710130 - 12710211
Alignment:
Q  93 atatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||| ||||||| | | || ||||| ||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  12710130 atatattcatataataatccagcaatcgtgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 12710211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 21861566 - 21861510
Alignment:
Q  11 attcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatca 66  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21861566 attcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatca 21861510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 35261066 - 35261019
Alignment:
Q  22 attcaagtaatgcatatacaattatatcacaata-taacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  35261066 attcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaa 35261019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 68
Target Start/End: Original strand, 21477653 - 21477699
Alignment:
Q  23 ttcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21477653 ttcaagtaatgcgtatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 21477699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 21896252 - 21896194
Alignment:
Q  11 attcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaa 68  Q
    ||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21896252 attcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 21896194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16275265 - 16275188
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  16275265 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 16275188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 14295534 - 14295494
Alignment:
Q  28 gtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14295534 gtaatgtatatacaattatataacattataacaacatcaaa 14295494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22824184 - 22824136
Alignment:
Q  126 aatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22824184 aatatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 22824136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 41050026 - 41049974
Alignment:
Q  17 atatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaata-taacaacatcaaa 68  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||    
T  41050026 atataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaaa 41049974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 68
Target Start/End: Original strand, 51130702 - 51130742
Alignment:
Q  28 gtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  51130702 gtaatgtatatacaattatataacattataacaacatcaaa 51130742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 174; Significance: 8e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17491 - 17286
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17491 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacagtataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 17392  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17391 atatgacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaagcatatacatacatatactaattcatcgatcatattcaactattcactgtgacctacgt 17292  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  17291 gcagta 17286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 94522 - 94726
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  94522 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 94621  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94622 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 94720  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  94721 gcagta 94726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 49
Target Start/End: Original strand, 44568 - 44614
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatc 49  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  44568 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatagaattatatc 44614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 174; Significance: 8e-94; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 13544136 - 13544340
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544136 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatcatatatac 13544235  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13544236 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgttacctacgt 13544334  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  13544335 gcagta 13544340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 17463289 - 17463493
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463289 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 17463388  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463389 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 17463487  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  17463488 gcagta 17463493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 45606958 - 45606761
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606958 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 45606859  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45606858 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctac 45606761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7781398 - 7781193
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781398 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 7781299  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  7781298 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcgatcataatcaattattcactgtgacctatgt 7781199  T
Q  201 gcagta 206  Q
     |||||    
T  7781198 tcagta 7781193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16454332 - 16454128
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454332 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 16454233  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454232 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 16454134  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  16454133 gcagta 16454128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 34159437 - 34159641
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159437 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 34159536  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159537 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 34159635  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  34159636 gcagta 34159641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 55476602 - 55476806
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476602 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 55476701  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476702 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 55476800  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  55476801 gcagta 55476806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6469185 - 6468981
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469185 cgtctcaattagtcacatataattgaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 6469086  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469085 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 6468987  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  6468986 gcagta 6468981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 12567671 - 12567867
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567671 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatcatatatac 12567770  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12567771 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgttacctac 12567867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13154306 - 13154102
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154306 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 13154207  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13154206 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgttacctacgt 13154108  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  13154107 gcagta 13154102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10247774 - 10247570
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247774 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 10247675  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10247674 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactagttgatccatcatattcaattattcactctgacctacgt 10247576  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  10247575 gcagta 10247570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Original strand, 27165364 - 27165568
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatataca 101  Q
    |||||| |||||| |||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165364 tctcaaatattcatatataatttaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatataca 27165463  T
Q  102 tataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtg 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  27165464 tataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacgtt 27165563  T
Q  202 cagta 206  Q
    |||||    
T  27165564 cagta 27165568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 53301554 - 53301350
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatataca 101  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301554 tctcaaatattcatatataattcaagtattacgtatacaattatatcacaatataaacaacataaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatataca 53301455  T
Q  102 tataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtg 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  53301454 tataacacttcatcaatcatgtacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacgtt 53301355  T
Q  202 cagta 206  Q
    |||||    
T  53301354 cagta 53301350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9707658 - 9707484
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707658 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 9707559  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707558 atataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 9707484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 8899205 - 8899378
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899205 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcttaaaacatcatatatac 8899304  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899305 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 8899378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16282862 - 16282689
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282862 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 16282763  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282762 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 16282689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13151841 - 13151637
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151841 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 13151742  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13151741 atatcacacttcatcaggcatggacaatatcgtattcac-aacatataccttcatatactaattcatcaatcatatacaattattcactgttacctacgt 13151643  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  13151642 gcagta 13151637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 197
Target Start/End: Original strand, 8499631 - 8499827
Alignment:
Q  2 gtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||| || ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499631 gtctcaattattcacagataatctaattaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatcatatatac 8499730  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgaccta 197  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8499731 atataaaacttcattaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgaccta 8499827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 41123998 - 41124171
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123998 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 41124097  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124098 atataacacttcaccaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 41124171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 38961942 - 38961769
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38961942 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataaccaacatcttaaaacatcatatatac 38961843  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961842 atataatacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 38961769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28848662 - 28848468
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848662 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 28848563  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848562 atataacacttcatcaatcatggaaaatatcgtattcaca-----------acatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 28848474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 15412541 - 15412747
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatata 99  Q
    ||||||||||||||||| || ||  || | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15412541 cgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatatcccaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacttcatatata 15412640  T
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15412641 catataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcgatcataatcaattatacactgtgacctacg 15412740  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    | |||||    
T  15412741 ttcagta 15412747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Original strand, 46822445 - 46822577
Alignment:
Q  74 atcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatca 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822445 atcaacatcttaaaacatcatacatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatca 46822544  T
Q  174 tattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822545 tattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 46822577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 53 - 206
Target Start/End: Original strand, 54520985 - 54521138
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54520985 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacata 54521084  T
Q  153 catatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54521085 catatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagta 54521138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 53 - 206
Target Start/End: Original strand, 15977696 - 15977848
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 152  Q
    ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  15977696 atataacaacatcaaataataaccaacatcttaaaacatcatatatacatataacactttatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatt 15977794  T
Q  153 catatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977795 catatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 15977848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 60 - 206
Target Start/End: Original strand, 12305315 - 12305461
Alignment:
Q  60 aacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatac 159  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  12305315 aacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacatacatatat 12305414  T
Q  160 taattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12305415 taattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagta 12305461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 206
Target Start/End: Original strand, 10557091 - 10557224
Alignment:
Q  73 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10557091 aatcaacatctcaaaacatcatatatacatataaaacttcatcaatcatggacaatatcgaattcacaaacatatacatacatatattaattcatcaatc 10557190  T
Q  173 atattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10557191 atattcaattattcacagtgacctatgtgcagta 10557224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12119606 - 12119500
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119606 catataatacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 12119507  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  12119506 tgcagta 12119500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 29544839 - 29544688
Alignment:
Q  55 ataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacataca 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||| ||||| |||||    
T  29544839 ataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcattttaacaaatatatagataca 29544740  T
Q  155 tatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  29544739 tatattaattcatcaatcataaacaattcttcattgtgacctacgtgcagta 29544688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 111 - 206
Target Start/End: Original strand, 13436520 - 13436615
Alignment:
Q  111 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436520 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatatatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 13436615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11914051 - 11913928
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||    
T  11914051 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatgtaca 11913953  T
Q  151 tacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11913952 tacatatactaattcatcaatcata 11913928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 17446706 - 17446614
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatca 93  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  17446706 cgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 17446614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 206
Target Start/End: Original strand, 24513910 - 24513992
Alignment:
Q  124 acaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24513910 acaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgatctacgtgcagta 24513992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 38961794 - 38961685
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 196  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961794 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 38961695  T
Q  197 acgtgcagta 206  Q
    ||||||||||    
T  38961694 acgtgcagta 38961685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 206
Target Start/End: Original strand, 25237063 - 25237159
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25237063 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 25237159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 95 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 17444773 - 17444694
Alignment:
Q  95 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444773 atatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 17444694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17444719 - 17444613
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 196  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17444719 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacct 17444620  T
Q  197 acgtgca 203  Q
    |||||||    
T  17444619 acgtgca 17444613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 203
Target Start/End: Original strand, 41124146 - 41124252
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 196  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124146 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactagttcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 41124245  T
Q  197 acgtgca 203  Q
    |||||||    
T  41124246 acgtgca 41124252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16282714 - 16282604
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaa-caatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacc 195  Q
    |||||||||  | |||||||||||| || ||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16282714 atacatatactaattcatcaatcataaaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacc 16282615  T
Q  196 tacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||    
T  16282614 tacgtgcagta 16282604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 43550529 - 43550448
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatc 82  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  43550529 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 43550448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 50242933 - 50243014
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatc 82  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  50242933 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 50243014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 194
Target Start/End: Original strand, 25229476 - 25229560
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgac 194  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25229476 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgac 25229560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 53070704 - 53070637
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53070704 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatctaacaacatcaaa 53070637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 17248287 - 17248225
Alignment:
Q  6 caattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17248287 caattattcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 17248225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 29172634 - 29172566
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaata-taacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  29172634 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatactatcaacatcaaa 29172566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 17672737 - 17672804
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17672737 cgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcacaatataacatcatcaaa 17672804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 175
Target Start/End: Original strand, 25237009 - 25237075
Alignment:
Q  108 acttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25237009 acttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaa-catatacattcatatactaattcatcaatcata 25237075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 12119775 - 12119708
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    ||||||||||||||||| || ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119775 cgtctcaattattcacagataatctaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 12119708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 24340727 - 24340661
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaa 68  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24340727 tctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 24340661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20630138 - 20630038
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatca----atcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagt 205  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| || |||  | |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630138 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcagataacacttcatcaatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagt 20630039  T
Q  206 a 206  Q
    |    
T  20630038 a 20630038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 37642269 - 37642203
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaa 68  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37642269 tctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 37642203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22147529 - 22147474
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 58  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22147529 tctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 22147474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 25201323 - 25201397
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  25201323 catataataattcattaatcatgaacaatatcatattcatcaatatatacattcatataataattcatcaatcat 25201397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 2051195 - 2051138
Alignment:
Q  11 attcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 67  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  2051195 attcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 2051138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 52523723 - 52523666
Alignment:
Q  11 attcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaa 67  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  52523723 attcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 52523666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15025992 - 15025934
Alignment:
Q  116 aatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||  | ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15025992 aatcatgaacaatatcatattcatcatcatatacattcatataataattcatcaatcat 15025934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Original strand, 23274804 - 23274870
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaa 68  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  23274804 tctcaaatattcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataaacaacatcaaa 23274870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 175
Target Start/End: Original strand, 17044330 - 17044395
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||   || |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17044330 ttcatcaatcatgaacaacatcatattcgtcaatatatacattcatataataattcatcaatcata 17044395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 206
Target Start/End: Original strand, 10379613 - 10379643
Alignment:
Q  176 ttcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10379613 ttcaattattcactgtgacctacgtgcagta 10379643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 11913897 - 11913867
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11913897 catataacacttcatcaatcatgaacaatat 11913867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11913953 - 11913876
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  11913953 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 11913876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18700245 - 18700200
Alignment:
Q  129 atcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18700245 atcgtattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatcat 18700200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 50351717 - 50351664
Alignment:
Q  120 atgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatca 173  Q
    |||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  50351717 atgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatca 50351664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12119649 - 12119585
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| ||| |||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  12119649 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaatatatacattcatataatacttcatcaatcat 12119585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 68
Target Start/End: Original strand, 15207079 - 15207119
Alignment:
Q  29 taatgcatatacaattatatcacaat-ataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15207079 taatgcatatacaattatatcacattaataacaacatcaaa 15207119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 68
Target Start/End: Original strand, 15246161 - 15246201
Alignment:
Q  29 taatgcatatacaattatatcacaat-ataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15246161 taatgcatatacaattatatcacattaataacaacatcaaa 15246201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 68
Target Start/End: Original strand, 15265282 - 15265322
Alignment:
Q  29 taatgcatatacaattatatcacaat-ataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15265282 taatgcatatacaattatatcacattaataacaacatcaaa 15265322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 134322 - 134526
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  134322 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 134421  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134422 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 134520  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  134521 gcagta 134526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 136791 - 136995
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  136791 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 136890  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136891 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 136989  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  136990 gcagta 136995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 139260 - 139464
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  139260 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 139359  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139360 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 139458  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  139459 gcagta 139464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 141729 - 141933
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  141729 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 141828  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141829 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 141927  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  141928 gcagta 141933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 144198 - 144402
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  144198 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 144297  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144298 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 144396  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  144397 gcagta 144402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 264819 - 264615
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  264819 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 264720  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  264719 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatatttaattattcactgtgacctacgt 264621  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  264620 gcagta 264615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 42245416 - 42245212
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245416 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 42245317  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245316 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 42245218  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  42245217 gcagta 42245212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 20909123 - 20909327
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909123 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 20909222  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20909223 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactctgacctacgt 20909321  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  20909322 gcagta 20909327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 39245247 - 39245451
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245247 cgtcccaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 39245346  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245347 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 39245445  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  39245446 gcagta 39245451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 39363495 - 39363700
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363495 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 39363594  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  39363595 atataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcagtgtgacctacgt 39363694  T
Q  201 gcagta 206  Q
     |||||    
T  39363695 tcagta 39363700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10732991 - 10732787
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732991 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaccgtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 10732892  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10732891 atataacacttcatcaatcatggacaaaatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgatctacgt 10732793  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  10732792 gcagta 10732787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 29346091 - 29346295
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346091 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 29346190  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29346191 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactagttgatccatcatattcaattattcactctgacctacgt 29346289  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  29346290 gcagta 29346295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 29348564 - 29348768
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348564 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 29348663  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29348664 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactagttgatccatcatattcaattattcactctgacctacgt 29348762  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  29348763 gcagta 29348768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 29351037 - 29351241
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351037 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 29351136  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29351137 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactagttgatccatcatattcaattattcactctgacctacgt 29351235  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  29351236 gcagta 29351241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 32027504 - 32027677
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027504 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 32027603  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027604 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 32027677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 38619546 - 38619752
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatata 99  Q
    ||||||||||||||||| || ||  || | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619546 cgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatattccaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatcatatata 38619645  T
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38619646 catataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacg 38619745  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    | |||||    
T  38619746 ttcagta 38619752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 23064623 - 23064829
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatata 99  Q
    ||||||||||||||||| || ||  || | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23064623 cgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatatcccaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacataatatata 23064722  T
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  23064723 catataaaacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataataaattattcactgtgacctacg 23064822  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    | |||||    
T  23064823 ttcagta 23064829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 29330045 - 29330215
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  29330045 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa---taataatcatcttaaaacatcatatatac 29330141  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330142 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 29330215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20918003 - 20917830
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918003 cgtctcaattattcacatctaattcaagtaaagcatatataattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 20917904  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917903 atataacacttcatcaatcatggacaagatcgtattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 20917830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 74 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17517142 - 17517010
Alignment:
Q  74 atcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatca 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17517142 atcaacatcttaaaacatcatacatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatca 17517043  T
Q  174 tattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17517042 tattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 17517010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2154665 - 2154478
Alignment:
Q  1 cgtctcaattatt-cacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatata 99  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    |||||||||||    
T  2154665 cgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat-------------------catcatatata 2154585  T
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154584 catataacacttcatcaatcatggacagtatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 2154485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 53 - 206
Target Start/End: Original strand, 9776521 - 9776674
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 152  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9776521 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatacatataacccttcaccaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacata 9776620  T
Q  153 catatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9776621 catatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagta 9776674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20901873 - 20901767
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20901873 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcacagtgacctacg 20901774  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  20901773 tgcagta 20901767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 37804902 - 37804752
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 152  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37804902 atataacaacatcaaattctaattaacatcttaaaacatcatatatacatataacgcttcattaatcattgacaatatcgtattcacaaatatatacata 37804803  T
Q  153 catatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgca 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37804802 catatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgca 37804752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20902060 - 20901904
Alignment:
Q  1 cgtctcaattatt-cacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatata 99  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    |||||||||||    
T  20902060 cgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat-------------------catcatatata 20901980  T
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901979 catataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 20901904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 32027652 - 32027761
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 196  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32027652 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcacagtgacct 32027751  T
Q  197 acgtgcagta 206  Q
    ||||||||||    
T  32027752 acgtgcagta 32027761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20917789 - 20917693
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20917789 ttcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcaccgtgacttacgtgcagta 20917693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 36154834 - 36154767
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36154834 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaa 36154767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 29330190 - 29330298
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 196  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29330190 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcgtaaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaatt-ttcactgttacct 29330288  T
Q  197 acgtgcagta 206  Q
    ||||||||||    
T  29330289 acgtgcagta 29330298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 18319084 - 18319021
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 64  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319084 cgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 18319021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 24067219 - 24067282
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 64  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24067219 cgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 24067282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 11581250 - 11581184
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaa 67  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581250 cgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatataacaacatcaa 11581184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 10775726 - 10775660
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10775726 cgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-acaacatcaaa 10775660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 171
Target Start/End: Original strand, 18743965 - 18744036
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaat 171  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18743965 catataatacttcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaat 18744036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Original strand, 31061184 - 31061247
Alignment:
Q  5 tcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061184 tcaattattcacaaataatttaattaatgcatataaaattatatcacaatataacaacatcaaa 31061247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Original strand, 40725970 - 40726036
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaa 68  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40725970 tctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 40726036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1628243 - 1628169
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  1628243 catataatacttcatcaatcattaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataatagttcatcaatcat 1628169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 20917855 - 20917777
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||  || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20917855 atacatatactaattcatcaatcataaacaacataatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcata 20917777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21399968 - 21399896
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatc 172  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21399968 catataataattcatcaaccatgaacaacatcatattcattaacatatacattcatataataattcatcaatc 21399896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Original strand, 22144174 - 22144215
Alignment:
Q  11 attcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 52  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144174 attcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22144215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20901929 - 20901852
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  20901929 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 20901852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 174
Target Start/End: Original strand, 24067282 - 24067323
Alignment:
Q  133 tattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24067282 tattcataaacatatacattcatataataattcatcaatcat 24067323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 18743852 - 18743923
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||   || ||||||  ||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  18743852 catataataattcatcaatcatgaaca---tcatattcattaacatatacattcatataatacttcatcaatcat 18743923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20198571 - 20198507
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  20198571 ttcatcaattatgaacaacatcatattcattaacatataccttcatataatacttcatcaatcat 20198507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 68
Target Start/End: Original strand, 36314689 - 36314729
Alignment:
Q  28 gtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36314689 gtaatgtatatacaattatataacattataacaacatcaaa 36314729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 13503 - 13708
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13503 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatac 13602  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13603 atgtaacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcactgtgacctacgt 13702  T
Q  201 gcagta 206  Q
     |||||    
T  13703 tcagta 13708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 9353 - 9557
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9353 cgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcaaatatac 9452  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9453 atataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgttacctacgt 9551  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  9552 gcagta 9557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 10884 - 11080
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10884 cgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 10983  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10984 atataacacttcatcaatcatggacaatatcatattcac-aacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgttacctac 11080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 40511 - 40715
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40511 cgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacttcatatatac 40610  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40611 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactctgacctacgt 40709  T
Q  201 gcagta 206  Q
    ||||||    
T  40710 gcagta 40715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 154; Significance: 7e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Original strand, 6070 - 6262
Alignment:
Q  13 tcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttc 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6070 tcacatataattcaagtaatgcatatgcaattaaatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttc 6169  T
Q  113 atcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6170 atcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 6262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 38706 - 38521
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatataca 101  Q
    |||||| |||| | |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38706 tctcaaatatttatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatataca 38607  T
Q  102 tataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38606 tataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattca 38521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 133; Significance: 2e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 501195 - 501351
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  501195 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatagtaatcaacatcttaaaacattatatatac 501294  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatat 157  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501295 atataacacatcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatat 501351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 85630 - 85563
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85630 cgtctgaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 85563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 206
Target Start/End: Original strand, 501347 - 501381
Alignment:
Q  172 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501347 catattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 501381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 122; Significance: 9e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 53 - 206
Target Start/End: Original strand, 3186 - 3339
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3186 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatctacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaacatatacata 3285  T
Q  153 catatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3286 catatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagta 3339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 117; Significance: 8e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 53 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 53873 - 53718
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 150  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  53873 atataacaacatcaaatgataatcaacatctacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatataatattcacaaacatataca 53774  T
Q  151 tacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53773 tacatatactaatttatcaatcatattcaattattcattgtgacctacgtgcagta 53718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 114; Significance: 5e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 53 - 206
Target Start/End: Original strand, 1591 - 1744
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  1591 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatataacacttcatcaatcattgacaatatcgtattcacaaatatataaata 1690  T
Q  153 catatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1691 catatattaattcatcaatcataaacaattcttcactgtgacctacgtgcagta 1744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 53 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4304 - 4149
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  4304 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatataatattcacaaacatataca 4205  T
Q  151 tacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4204 tacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacccacgtgcagta 4149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 53 - 206
Target Start/End: Original strand, 15083 - 15238
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  15083 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatagtattcacaaacatataaa 15182  T
Q  151 tacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15183 tacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacgtgcagta 15238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 141 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11251 - 11186
Alignment:
Q  141 aacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11251 aacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgtagta 11186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 86 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6902 - 6782
Alignment:
Q  86 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattatt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6902 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatagtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattatt 6803  T
Q  186 cactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  6802 cactgtgacctacgtgtagta 6782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Original strand, 30229 - 30335
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30229 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 30328  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  30329 tgcagta 30335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 30043 - 30196
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||                    ||||||||||||    
T  30043 cgtctcaattattcacatataattcaaataattcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat-------------------catcatatatac 30123  T
Q  101 atataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatca 173  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30124 atataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaagcatatacatacatatactaattcatcaatca 30196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 476 - 370
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  476 catataacactttatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatgttcaattattcactgtgacctacg 377  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  376 tgcagta 370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 12300 - 12194
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12300 cgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatac 12201  T
Q  101 atataac 107  Q
    |||||||    
T  12200 atataac 12194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 582 - 507
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  582 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 206
Target Start/End: Original strand, 416 - 523
Alignment:
Q  99 acatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  416 acatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcacaaacatatacttacatatactaattcatcaatcatattcaattattcattgtgacctac 515  T
Q  199 gtgcagta 206  Q
    ||||||||    
T  516 gtgcagta 523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 198
Target Start/End: Original strand, 10001 - 10099
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10001 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacacacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctac 10099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 141 - 175
Target Start/End: Original strand, 9936 - 9970
Alignment:
Q  141 aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9936 aacatatacatacatatactaattcatcaatcata 9970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Original strand, 9945 - 10022
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  9945 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 10022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 59 - 175
Target Start/End: Original strand, 27958 - 28073
Alignment:
Q  59 caacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatata 158  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27958 caacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcac-aacatatacatacatata 28056  T
Q  159 ctaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||    
T  28057 ctaattcatcaatcata 28073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Original strand, 28048 - 28157
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 196  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28048 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacct 28147  T
Q  197 acgtgcagta 206  Q
    ||||| ||||    
T  28148 acgtgaagta 28157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 206
Target Start/End: Original strand, 799 - 905
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  799 catataaaacttcatcaatcatgaacaatatagtattcacaaacatatacatacatatacaaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacg 898  T
Q  200 tgcagta 206  Q
    |||||||    
T  899 tgcagta 905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 175
Target Start/End: Original strand, 645 - 768
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  645 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcgtattcgc-aacatataca 743  T
Q  151 tacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  744 tacatatactaattaatcaatcata 768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10734 - 10647
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattca 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10734 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattca 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 53 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 10886 - 10765
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacata 152  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10886 atataacaacatcaaataatactcaacattttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaattatggacagtatcgtattcac-aacatatacata 10788  T
Q  153 catatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10787 catatactaattcatcaatcata 10765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10790 - 10713
Alignment:
Q  97 atacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  10790 atacatatactaattcatcaatcataaacaacatcatactcataaacatatacattcatataacacttcatcaatcat 10713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 9860 - 10016
Alignment:
Q  1 cgtctcaattatt-cacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatata 99  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||                   ||||||||    
T  9860 cgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcgt-------------------catatata 9940  T
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9941 catataacacttcatcaatcatgtacaatatcgtattcacaaacttatacatacatatactaactcatcaatcata 10016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 173
Target Start/End: Original strand, 10005 - 10067
Alignment:
Q  111 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatca 173  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10005 tcatcaatcataaacaacatcgtactcataaacatatacattcatatactaattcatcaatca 10067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 53 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15273 - 15150
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||    
T  15273 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatattgtattcgc-aacatataca 15175  T
Q  151 tacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15174 tacatatactaattcatcaatcata 15150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15119 - 15030
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacg 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||          |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15119 catataacacttcatcaattatgaacaatatagtattcacaaacat----------atactaattcattaatcatattcaattattcactatgacctacg 15030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 117 - 206
Target Start/End: Original strand, 57708 - 57797
Alignment:
Q  117 atcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  57708 atcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaatttatcactcatattcaagtattcactgtgacctacgtgcagta 57797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 76; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 53 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 36065 - 35955
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacac-ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacat 151  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36065 atataagaacatcaaaaaataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacactttcatcaatcatggacaatatcatattcac-aacatatacat 35967  T
Q  152 acatatactaat 163  Q
    ||||||||||||    
T  35966 acatatactaat 35955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13571 - 13473
Alignment:
Q  108 acttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13571 acttcatcaatcatggacaatatcatattcacaaacatacacatacatatactaattcatcaatcataatcaattattcattgtgacctacgttcagta 13473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 203
Target Start/End: Original strand, 43002 - 43052
Alignment:
Q  153 catatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgca 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43002 catatactaattcatcaatcatattcagttattcactgtgacctacgtgca 43052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 12169 - 12250
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatc 82  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  12169 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 12250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 158501 - 158434
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158501 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 158434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 217 - 298
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatc 82  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  217 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 1331 - 1250
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatc 82  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  1331 cgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 1250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 82183 - 82264
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaaaggtaatcaacatc 82  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  82183 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatc 82264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 79335 - 79268
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  79335 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaagtatatcacaatataacaacatcaaa 79268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 1327 - 1204
Alignment:
Q  53 atataacaacatcaaaaggtaatcaacatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatataca 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||| || |    
T  1327 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatggacaatatcttattctc-aacatttata 1229  T
Q  151 tacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    | |||||||||||| || |||||||    
T  1228 ttcatatactaatttattaatcata 1204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1173 - 1143
Alignment:
Q  100 catataacacttcatcaatcatgaacaatat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1173 catataacacttcatcaatcatgaacaatat 1143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 57; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 206
Target Start/End: Original strand, 6682 - 6767
Alignment:
Q  111 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6682 tcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacat----------atactaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacgtgcagta 6767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 2179 - 2112
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2179 cgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 2112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 18031 - 17965
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaa 68  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18031 tctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 17965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 16895 - 16962
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16895 cgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaa 16962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 20430 - 20364
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20430 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-aacatcaaa 20364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 164639 - 164574
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164639 tctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 164574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 161138 - 161073
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  161138 tctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaatatcaaa 161073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 4326 - 4392
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4326 cgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-acaacatcaaa 4392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 4408 - 4475
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  4408 cgtctcaattaatcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacatcatcaaa 4475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 206
Target Start/End: Original strand, 7996 - 8055
Alignment:
Q  147 tacatacatatactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7996 tacatacatatattaattcatcaatcatattcaattattcactatgacctacgtgcagta 8055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 60
Target Start/End: Original strand, 12047 - 12103
Alignment:
Q  4 ctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaca 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12047 ctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcacaatataaca 12103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 206
Target Start/End: Original strand, 68227 - 68277
Alignment:
Q  156 atactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgcagta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  68227 atactaattcatcaatcatattcaattattcactgtgacctacgtgtagta 68277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Original strand, 11581 - 11647
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaa 68  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11581 tctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 11647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 38260 - 38194
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaa 68  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  38260 tctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 38194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 174
Target Start/End: Original strand, 15282 - 15361
Alignment:
Q  95 atatacatataacacttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  15282 atattcatataataattcatcaatcatgaacaatatcatattcatcgacatatacattcaaataataattcatcaatcat 15361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 168
Target Start/End: Original strand, 15350 - 15408
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatc 168  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15350 ttcatcaatcatgaataacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatc 15408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 173
Target Start/End: Original strand, 16263 - 16326
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatca 173  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16263 ttcatcaatcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcaatca 16326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Original strand, 667 - 719
Alignment:
Q  17 atatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaata-taacaacatcaaa 68  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  667 atataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaa 719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 68
Target Start/End: Original strand, 13254 - 13312
Alignment:
Q  11 attcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaa 68  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13254 attcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaa 13312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 16090 - 16038
Alignment:
Q  17 atatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaa 68  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16090 atataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaa 16038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 27745 - 27687
Alignment:
Q  11 attcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaa 68  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27745 attcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaa 27687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 53553 - 53487
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaa 68  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  53553 tctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 53487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 68
Target Start/End: Original strand, 225531 - 225589
Alignment:
Q  11 attcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaa 68  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  225531 attcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaa 225589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 13119 - 13165
Alignment:
Q  1 cgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatacaattata 47  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  13119 cgtctcaattattcacatataattgaagtaatgcatatataattata 13165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 8055 - 7997
Alignment:
Q  11 attcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatat-aacaacatcaaa 68  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8055 attcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaa 7997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 60711 - 60653
Alignment:
Q  11 attcacatatgattcaagtaatgcatatacaattatatcaca-atataacaacatcaaa 68  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||    
T  60711 attcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaacaacatcaaa 60653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 175
Target Start/End: Original strand, 313 - 378
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    ||||||||| |||||| | ||| ||||||  ||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  313 ttcatcaataatgaacgacatcatattcattaacatatacattcatataatacttcatcaatcata 378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 18228 - 18175
Alignment:
Q  17 atatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaat-ataacaacatcaaaa 69  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  18228 atataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaaa 18175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 187955 - 187890
Alignment:
Q  110 ttcatcaatcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcata 175  Q
    ||||||||| |||||| | ||| ||||||  ||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  187955 ttcatcaataatgaacgacatcatattcattaacatatacattcatataatacttcatcaatcata 187890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 68
Target Start/End: Original strand, 165 - 205
Alignment:
Q  29 taatgcatatacaattatatcacaata-taacaacatcaaa 68  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  165 taatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaa 205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 67
Target Start/End: Original strand, 8583 - 8650
Alignment:
Q  3 tctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatataca--attatatcacaatat-aacaacatcaa 67  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8583 tctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 6273 - 6221
Alignment:
Q  17 atatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaat-ataacaacatcaaa 68  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  6273 atataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaa 6221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 1052 - 1012
Alignment:
Q  28 gtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaa 68  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1052 gtaatgtatatacaattatataacattataacaacatcaaa 1012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Original strand, 97137 - 97189
Alignment:
Q  17 atatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaata-taacaacatcaaa 68  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  97137 atataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaa 97189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Original strand, 106415 - 106467
Alignment:
Q  17 atatgattcaagtaatgcatatacaattatatcacaata-taacaacatcaaa 68  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  106415 atataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaa 106467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 66818 - 66762
Alignment:
Q  118 tcatgaacaatatcgtattcacaaacatatacatacatatactaattcatcaatcat 174  Q
    |||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  66818 tcatgaacaacatcatattcatcaacatatacattcatataataattcatcattcat 66762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University