View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17126_high_2 (Length: 404)

Name: NF17126_high_2
Description: NF17126
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17126_high_2
NF17126_high_2
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (20-382)||(4139046-4139410)
chr7 (20-382)||(24586336-24586698)
chr7 (20-382)||(16745321-16745684)
chr7 (28-382)||(4205363-4205717)
chr7 (28-382)||(31084431-31084786)
chr7 (20-359)||(26509496-26509837)
chr7 (20-382)||(5141135-5141498)
chr7 (28-382)||(26313658-26314011)
chr7 (20-374)||(26441235-26441590)
chr7 (20-359)||(26663713-26664053)
chr7 (20-359)||(26678905-26679245)
chr7 (20-353)||(5164387-5164720)
chr7 (20-359)||(31558195-31558534)
chr7 (20-359)||(26518790-26519127)
chr7 (17-370)||(45393205-45393558)
chr7 (28-359)||(39206948-39207279)
chr7 (20-359)||(5154081-5154419)
chr7 (20-370)||(26268886-26269240)
chr7 (28-370)||(11446874-11447216)
chr7 (23-359)||(45737298-45737636)
chr7 (20-353)||(11418580-11418913)
chr7 (28-377)||(3451297-3451647)
chr7 (20-359)||(2160567-2160908)
chr7 (28-382)||(16047289-16047640)
chr7 (20-374)||(16443804-16444159)
chr7 (20-359)||(2779249-2779582)
chr7 (20-359)||(31129902-31130235)
chr7 (20-274)||(26595750-26596006)
chr7 (28-382)||(10847557-10847915)
chr7 (34-359)||(16512255-16512574)
chr7 (28-359)||(10910735-10911060)
chr7 (275-359)||(26531926-26532010)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (20-382)||(28355827-28356192)
chr8 (28-382)||(29835300-29835653)
chr8 (20-382)||(31483747-31484111)
chr8 (20-382)||(19680425-19680786)
chr8 (34-359)||(33248366-33248690)
chr8 (20-359)||(9360622-9360960)
chr8 (20-359)||(31360528-31360867)
chr8 (20-359)||(18796706-18797046)
chr8 (20-338)||(44567002-44567322)
chr8 (28-382)||(19202260-19202603)
chr8 (22-359)||(18715480-18715819)
chr8 (28-370)||(12086608-12086951)
chr8 (20-359)||(15773574-15773913)
chr8 (20-353)||(21342047-21342381)
chr8 (28-359)||(33264731-33265061)
chr8 (20-353)||(19911039-19911374)
chr8 (101-370)||(16260212-16260480)
chr8 (28-377)||(22074814-22075164)
chr8 (28-359)||(19655232-19655560)
chr8 (34-382)||(27602805-27603146)
chr8 (28-359)||(22138906-22139231)
chr8 (34-359)||(2131159-2131478)
chr8 (34-359)||(19694095-19694416)
chr8 (34-354)||(14569162-14569479)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (20-382)||(31958413-31958777)
chr3 (20-382)||(5603271-5603635)
chr3 (20-382)||(24334113-24334477)
chr3 (28-382)||(28109917-28110276)
chr3 (20-359)||(5717031-5717371)
chr3 (20-359)||(5764087-5764427)
chr3 (20-359)||(5727941-5728281)
chr3 (20-359)||(47029416-47029756)
chr3 (20-370)||(4340634-4340984)
chr3 (20-377)||(32296574-32296932)
chr3 (20-359)||(10649034-10649373)
chr3 (34-382)||(29142726-29143077)
chr3 (28-382)||(28345111-28345464)
chr3 (20-359)||(4790591-4790931)
chr3 (20-359)||(4422881-4423220)
chr3 (20-370)||(29658926-29659276)
chr3 (20-377)||(5590319-5590676)
chr3 (34-382)||(4629725-4630072)
chr3 (20-359)||(10402112-10402450)
chr3 (34-377)||(21680646-21680988)
chr3 (20-359)||(17970824-17971161)
chr3 (20-359)||(5472951-5473289)
chr3 (28-359)||(51787985-51788316)
chr3 (20-359)||(8217595-8217936)
chr3 (20-370)||(18248690-18249040)
chr3 (34-359)||(22381553-22381877)
chr3 (28-359)||(22864814-22865143)
chr3 (28-359)||(22879873-22880202)
chr3 (20-370)||(17978908-17979259)
chr3 (20-370)||(28027243-28027591)
chr3 (28-359)||(18231156-18231487)
chr3 (20-359)||(48471890-48472233)
chr3 (20-382)||(16422123-16422485)
chr3 (34-353)||(18286327-18286645)
chr3 (34-353)||(18301628-18301946)
chr3 (20-359)||(20071996-20072337)
chr3 (20-351)||(11104319-11104651)
chr3 (20-359)||(6536701-6537040)
chr3 (20-359)||(5019676-5020014)
chr3 (28-370)||(20570812-20571154)
chr3 (20-359)||(7079185-7079529)
chr3 (34-359)||(31030217-31030535)
chr3 (28-382)||(16618455-16618813)
chr3 (20-359)||(18057223-18057565)
chr3 (34-370)||(18336580-18336910)
chr3 (34-353)||(6207869-6208184)
chr3 (34-354)||(32445122-32445433)
chr3 (28-354)||(19700454-19700792)
chr3 (34-353)||(4727602-4727915)
chr3 (34-359)||(15735072-15735392)
chr3 (28-359)||(5658097-5658425)
chr3 (28-359)||(4689614-4689939)
chr3 (34-359)||(8283430-8283766)
chr3 (34-353)||(35886733-35887048)
chr3 (251-359)||(15886894-15887004)
chr3 (275-359)||(8002523-8002607)
chr3 (28-222)||(15886707-15886895)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (20-382)||(22922048-22922412)
chr2 (20-382)||(39896043-39896405)
chr2 (20-382)||(19410389-19410753)
chr2 (20-353)||(12661543-12661875)
chr2 (20-359)||(254557-254896)
chr2 (20-359)||(37945770-37946110)
chr2 (20-359)||(27809699-27810040)
chr2 (20-359)||(37383675-37384014)
chr2 (20-382)||(37679796-37680160)
chr2 (20-382)||(37695061-37695425)
chr2 (28-359)||(13930457-13930790)
chr2 (20-359)||(16167476-16167815)
chr2 (20-382)||(21671075-21671440)
chr2 (34-382)||(11629104-11629451)
chr2 (20-359)||(12592808-12593151)
chr2 (20-359)||(3788492-3788830)
chr2 (20-359)||(27122523-27122860)
chr2 (28-359)||(37931370-37931708)
chr2 (20-359)||(9343892-9344231)
chr2 (28-377)||(12710514-12710863)
chr2 (34-377)||(40239489-40239831)
chr2 (20-360)||(34867680-34868019)
chr2 (20-359)||(34160842-34161183)
chr2 (28-370)||(16823250-16823592)
chr2 (28-370)||(16897888-16898230)
chr2 (20-359)||(39045727-39046066)
chr2 (28-370)||(27782219-27782561)
chr2 (28-359)||(32055800-32056130)
chr2 (28-359)||(31882285-31882615)
chr2 (20-309)||(31868691-31868979)
chr2 (20-377)||(21697078-21697438)
chr2 (20-359)||(34297154-34297486)
chr2 (28-382)||(27396298-27396662)
chr2 (28-359)||(34268839-34269165)
chr2 (34-359)||(28888277-28888597)
chr2 (34-359)||(23122497-23122817)
chr2 (28-359)||(27428366-27428690)
chr2 (28-382)||(19450331-19450694)
chr2 (34-359)||(20843910-20844235)
chr2 (20-160)||(23116993-23117133)
chr2 (304-359)||(31887682-31887737)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (20-359)||(3647148-3647487)
chr1 (20-359)||(10968667-10969007)
chr1 (28-370)||(51644211-51644555)
chr1 (28-352)||(10951100-10951425)
chr1 (28-360)||(28591084-28591415)
chr1 (20-359)||(41787224-41787565)
chr1 (20-359)||(28155728-28156069)
chr1 (20-382)||(20334330-20334694)
chr1 (20-382)||(16201942-16202312)
chr1 (20-382)||(20466756-20467126)
chr1 (34-382)||(21891691-21892025)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (20-360)||(18369347-18369687)
chr5 (20-359)||(30174472-30174812)
chr5 (20-360)||(33881132-33881472)
chr5 (34-382)||(6880287-6880636)
chr5 (20-353)||(11555367-11555699)
chr5 (20-377)||(3795527-3795885)
chr5 (28-382)||(9323461-9323814)
chr5 (28-359)||(37746151-37746482)
chr5 (28-382)||(12138160-12138513)
chr5 (28-370)||(37352467-37352809)
chr5 (28-363)||(8659295-8659629)
chr5 (20-354)||(43084270-43084604)
chr5 (20-338)||(18494583-18494900)
chr5 (34-382)||(33298517-33298869)
chr5 (20-359)||(40467368-40467707)
chr5 (28-359)||(13318651-13318981)
chr5 (20-359)||(28655249-28655589)
chr5 (20-359)||(37760989-37761329)
chr5 (20-360)||(11329643-11329985)
chr5 (20-359)||(13436489-13436834)
chr5 (34-377)||(28953609-28953952)
chr5 (20-359)||(13180608-13180943)
chr5 (28-360)||(24729976-24730308)
chr5 (28-370)||(30158030-30158372)
chr5 (34-359)||(41680711-41681037)
chr5 (20-359)||(9544522-9544862)
chr5 (20-353)||(23631982-23632317)
chr5 (28-382)||(26486380-26486723)
chr5 (28-370)||(33522378-33522721)
chr5 (34-359)||(37665315-37665640)
chr5 (28-370)||(31820233-31820573)
chr5 (28-359)||(30035433-30035763)
chr5 (20-370)||(2517061-2517412)
chr5 (20-382)||(22894400-22894761)
chr5 (20-370)||(32590091-32590440)
chr5 (28-359)||(15752681-15753006)
chr5 (20-359)||(34622525-34622865)
chr5 (28-359)||(5643807-5644136)
chr5 (34-359)||(18122245-18122570)
chr5 (20-359)||(31437471-31437803)
chr5 (34-359)||(15652589-15652912)
chr5 (20-354)||(25206289-25206630)
chr5 (20-354)||(25270445-25270786)
chr5 (34-359)||(22992953-22993270)
chr5 (28-354)||(23897886-23898206)
chr5 (34-359)||(33783494-33783814)
chr5 (34-354)||(24975861-24976175)
chr5 (37-359)||(24608252-24608570)
chr5 (28-359)||(30940643-30940968)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (20-382)||(27284224-27284586)
chr6 (20-360)||(13518056-13518396)
chr6 (20-382)||(8899561-8899923)
chr6 (20-376)||(27623569-27623927)
chr6 (20-359)||(16755817-16756157)
chr6 (20-359)||(4763760-4764099)
chr6 (20-359)||(27063479-27063817)
chr6 (20-370)||(27355973-27356323)
chr6 (20-359)||(28166491-28166831)
chr6 (28-370)||(26110281-26110622)
chr6 (20-370)||(34458370-34458718)
chr6 (20-370)||(27491119-27491469)
chr6 (28-376)||(16937895-16938243)
chr6 (28-370)||(30551870-30552212)
chr6 (20-370)||(33370293-33370643)
chr6 (20-360)||(16680135-16680476)
chr6 (34-370)||(4531274-4531609)
chr6 (21-370)||(27200172-27200522)
chr6 (21-370)||(27248711-27249061)
chr6 (28-370)||(26772499-26772840)
chr6 (28-353)||(29579018-29579342)
chr6 (28-370)||(4539628-4539971)
chr6 (34-359)||(4778877-4779203)
chr6 (28-359)||(26791813-26792144)
chr6 (20-382)||(29555532-29555894)
chr6 (20-359)||(29507413-29507754)
chr6 (28-370)||(28213440-28213783)
chr6 (20-382)||(22928743-22929107)
chr6 (38-353)||(13292831-13293140)
chr6 (50-359)||(26926765-26927073)
chr6 (20-359)||(27013730-27014062)
chr6 (20-359)||(14139262-14139595)
chr6 (34-359)||(27031020-27031342)
chr6 (28-275)||(26666528-26666774)
chr6 (20-359)||(27208901-27209236)
chr6 (20-359)||(27239992-27240327)
chr6 (34-359)||(24869707-24870026)
chr6 (37-359)||(27025142-27025460)
chr6 (34-359)||(24299636-24299956)
chr6 (28-359)||(15406403-15406730)
chr6 (28-359)||(15418190-15418517)
chr6 (34-316)||(20174589-20174881)
chr6 (34-316)||(22161110-22161402)
chr6 (280-382)||(23851450-23851552)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (20-377)||(39856630-39856985)
chr4 (20-359)||(20332337-20332677)
chr4 (20-359)||(40099551-40099891)
chr4 (20-359)||(27157227-27157568)
chr4 (20-359)||(24586276-24586616)
chr4 (28-377)||(5011870-5012220)
chr4 (20-360)||(14104553-14104892)
chr4 (20-360)||(30759774-30760112)
chr4 (20-360)||(33667718-33668056)
chr4 (20-359)||(54839402-54839740)
chr4 (20-359)||(5700551-5700890)
chr4 (28-370)||(18794540-18794882)
chr4 (34-359)||(34182893-34183216)
chr4 (34-359)||(14753423-14753747)
chr4 (28-370)||(21975704-21976046)
chr4 (28-370)||(31120433-31120776)
chr4 (34-359)||(24118674-24118998)
chr4 (34-359)||(36338455-36338772)
chr4 (34-353)||(6575879-6576190)
chr4 (20-382)||(1906240-1906607)
chr4 (20-370)||(15233816-15234170)
chr4 (28-382)||(15276552-15276909)
chr4 (28-382)||(15380161-15380515)
chr4 (20-353)||(1673877-1674213)
chr4 (34-280)||(36324246-36324484)
chr4 (34-359)||(14671027-14671349)
chr4 (34-359)||(17019063-17019384)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (20-359)||(9557-9895)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (20-382)||(3094-3458)
scaffold0159 (20-216)||(17949-18147)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (20-359)||(12036-12374)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (20-359)||(8844-9182)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (20-359)||(18585-18926)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (20-359)||(4518-4860)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (20-359)||(9914-10252)
scaffold0143 (34-359)||(33297-33619)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (28-382)||(1634-1988)
scaffold0322 (20-382)||(12023-12396)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (28-370)||(13938-14281)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (20-370)||(15558-15915)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (28-382)||(25092-25454)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (34-359)||(6066-6388)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (34-353)||(24835-25150)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (199-370)||(366-537)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (215-382)||(26243-26410)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (20-145)||(1-126)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (221-353)||(40759-40898)
scaffold0099 (34-80)||(40559-40606)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Original strand, 4139046 - 4139410
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139046 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 4139145  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaa--aaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4139146 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 4139245  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4139246 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 4139345  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||    
T  4139346 cacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttcagatgaagatg 4139410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Original strand, 24586336 - 24586698
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586336 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 24586435  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||    
T  24586436 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtctt-aaacgaaagcacaggct 24586534  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24586535 caatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 24586634  T
Q  320 cagcaatcattacatttccc-aaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24586635 cagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagattcagatgaagatg 24586698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Original strand, 16745321 - 16745684
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 117  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16745321 gacatcaacatactctcattcatgcatgtttcgtttgaatataccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 16745420  T
Q  118 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16745421 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaagg 16745519  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16745520 ctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 16745619  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16745620 cacagtaatcattacatttcccaaaaactttgaattcgcaagcacagaagcttcagatgaagatg 16745684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 28 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 4205717 - 4205363
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4205717 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaatttttcaaaatgtttgttt 4205618  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  4205617 caagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttg 4205520  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4205519 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 4205420  T
Q  327 cattacatttccca-aaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4205419 cattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatg 4205363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 28 - 382
Target Start/End: Original strand, 31084431 - 31084786
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  31084431 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaatgtttgttt 31084530  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  31084531 caagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattg 31084629  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatctt-attggttggtggtacattgaacacagcaa 325  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31084630 atgtataagagtggtggtcaaccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaa 31084729  T
Q  326 tcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31084730 tcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatg 31084786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 26509496 - 26509837
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaag-ttttcaattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26509496 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaggttttcaattttcaaaat 26509595  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26509596 gtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcacaggc 26509695  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  26509696 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaa 26509795  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  26509796 cacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 26509837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Original strand, 5141135 - 5141498
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttta-aaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141135 gacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat 5141234  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5141235 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaagg 5141333  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5141334 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 5141433  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||||| || || |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5141434 cacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatg 5141498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 28 - 382
Target Start/End: Original strand, 26313658 - 26314011
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26313658 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 26313757  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  26313758 aagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttga 26313855  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26313856 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 26313955  T
Q  328 attacatttccc-aaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  26313956 attacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaacttcagatgaagatg 26314011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26441590 - 26441235
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441590 gacatcaacacactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 26441491  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26441490 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaagaaaaaatggagtttttaaacaaaagcaaaggc 26441391  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26441390 tcaaattgatgtataagagtggcggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 26441291  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcaga 374  Q
    |||| || || |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441290 acagtaaccactacagttcatagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcaga 26441235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 26663713 - 26664053
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663713 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 26663812  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26663813 tttgtttcgagcattgtcgttatcaaaatataaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggc 26663912  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26663913 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 26664012  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  26664013 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 26664053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 26678905 - 26679245
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26678905 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 26679004  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26679005 tttgtttcgagcattgtcgttatcaaaatataaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggc 26679104  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26679105 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 26679204  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  26679205 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 26679245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 5164720 - 5164387
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5164720 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 5164621  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtattta-gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  5164620 tttgtttcaagcattgttattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatataggctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagc 5164522  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5164521 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 5164422  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaatt 353  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  5164421 acagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 5164387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 31558195 - 31558534
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31558195 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 31558294  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31558295 gtttgtttcaagtattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 31558393  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31558394 tcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 31558493  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||  ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  31558494 acagtgatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 31558534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26519127 - 26518790
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26519127 gacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 26519028  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26519027 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggct 26518930  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26518929 caatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 26518830  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  26518829 cagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 26518790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 45393558 - 45393205
Alignment:
Q  17 atggacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaa 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393558 atggacatcaccatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaa 45393459  T
Q  117 a-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 215  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  45393458 aatgtttgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtgtatagctttgaaagtagaagaaaagtagagtttt-aaacaaaagcaca 45393360  T
Q  216 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattg 315  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45393359 agctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 45393260  T
Q  316 aacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    ||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  45393259 aacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacataagctt 45393205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Original strand, 39206948 - 39207279
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39206948 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 39207047  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39207048 caagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatattttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttg 39207146  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39207147 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtggtacattgaacacagcaat 39207246  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||| ||||   ||||||||||||| ||||    
T  39207247 cattacacttcctggaaactttgaattcgcaag 39207279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5154419 - 5154081
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5154419 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 5154320  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | |||    
T  5154319 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagct 5154221  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5154220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 5154121  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  5154120 cagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 5154081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 370
Target Start/End: Original strand, 26268886 - 26269240
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  26268886 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 26268985  T
Q  118 --tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaa 214  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||     
T  26268986 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcac 26269084  T
Q  215 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacatt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26269085 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 26269184  T
Q  315 gaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    |||||||| |||||| ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269185 gaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 26269240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11447216 - 11446874
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtt 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  11447216 cataccctcgctcatgcatgtttcacttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaaatgtttgtt 11447117  T
Q  126 tcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  11447116 tcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaatt 11447019  T
Q  226 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11447018 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 11446919  T
Q  326 tcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11446918 tcactacatttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 11446874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 23 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 45737636 - 45737298
Alignment:
Q  23 atcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa----t 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  45737636 atcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaat 45737537  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  45737536 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggc 45737439  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45737438 tcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 45737339  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||  ||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  45737338 acagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 45737298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Original strand, 11418580 - 11418913
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  11418580 gacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacagaaagttttcaattttcaaaaat 11418679  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  11418680 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggc 11418778  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11418779 tcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 11418878  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaatt 353  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11418879 acagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 11418913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 3451647 - 3451297
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa---tgtttgt 124  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  3451647 cataccctcgctcatgcatgttccatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgt 3451548  T
Q  125 ttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||||||    
T  3451547 ttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcaccagctcaaat 3451450  T
Q  225 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  3451449 tgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtg 3451350  T
Q  325 atcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 377  Q
    |||| |||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451349 atcactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 3451297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 2160908 - 2160567
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  2160908 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagatttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 2160809  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  2160808 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtaaaaaggaaatagagtttt-aaacaaaagcacag 2160710  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattga 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2160709 gctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattga 2160610  T
Q  317 acacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  2160609 acacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 2160567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 28 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 16047640 - 16047289
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  16047640 catacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtatcctgttgctcaggcttgctttcaaaa-tagacaaaaacttttcaattttcaggatgtttgtttc 16047542  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16047541 aagcattgtcattatcaagatagaaagaaaat-ttttgtacatagctttgacagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattga 16047444  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16047443 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatc 16047344  T
Q  328 attacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    | |||||||||   ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  16047343 actacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatgaagatg 16047289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 20 - 374
Target Start/End: Original strand, 16443804 - 16444159
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  16443804 gacatcaacatatgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttcaaaa-tagacaaaaactttttcaattttcaagat 16443902  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16443903 gtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttt-aaacaaaagcaaag 16444001  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16444002 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcaggcgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 16444101  T
Q  317 acacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcaga 374  Q
    |||||| ||  | ||||||||  | ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  16444102 acacagtaacgactacatttcttagaaactttgaattcgcaagcacataagcttcaga 16444159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 2779582 - 2779249
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||  ||||||||||||||||||    
T  2779582 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatg 2779488  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||    
T  2779487 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagct 2779389  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2779388 caaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 2779289  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  2779288 cagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 2779249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31130235 - 31129902
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||  ||||||||||||||||||    
T  31130235 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatg 31130141  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||    
T  31130140 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagct 31130042  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31130041 caaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 31129942  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  31129941 cagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 31129902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26596006 - 26595750
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26596006 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 26595907  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595906 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataaaaagaaaatgtgttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 26595807  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcaca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26595806 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcaca 26595750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 10847915 - 10847557
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaag---ttttcaattttcaaaatgtttgt 124  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||||||||    |||||||||||||| ||||||||    
T  10847915 catacgctcactcatgcacgtttcgtttgaacgtaccttgttgctcaggtttactttcaaaac-agacaaaaaacttttttcaattttcaagatgtttgt 10847817  T
Q  125 ttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctca 221  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||| ||||||     
T  10847816 ttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttgtacatagctttgaaagtagagagaaaatagagttt-cagacaaaagcacaggctcg 10847718  T
Q  222 aattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacaca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10847717 aattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacaca 10847618  T
Q  322 gcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    | || || ||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  10847617 gtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatgaagatg 10847557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Original strand, 16512255 - 16512574
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttc-aattttcaaaatgtttgtttcaagca 132  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||    
T  16512255 ctcgctcatgcatatttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttt---------caaaaacttttccaattatcaagatgtttgtttcgagca 16512345  T
Q  133 tt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 229  Q
    || |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16512346 tttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggcttaaattgatg 16512444  T
Q  230 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16512445 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcat 16512544  T
Q  330 tacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  16512545 tacatttcctagaaactttgaattcgcaag 16512574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Original strand, 10910735 - 10911060
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||       ||  |||||||||||||| ||| |||||||    
T  10910735 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccatgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttc 10910826  T
Q  128 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
     |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10910827 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaat 10910925  T
Q  225 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  10910926 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttagtgatacattgaacacagca 10911025  T
Q  325 atcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||    
T  10911026 atcattacatttcctagaaactttgtattcgcaag 10911060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 275 - 359
Target Start/End: Original strand, 26531926 - 26532010
Alignment:
Q  275 aagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  26531926 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 26532010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Original strand, 28355827 - 28356192
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355827 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 28355926  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaag--aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28355927 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 28356026  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28356027 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 28356126  T
Q  318 cacagcaatcattacatttccc-aaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28356127 cacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagattcagatgaagatg 28356192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 28 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 29835653 - 29835300
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29835653 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 29835554  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29835553 aagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tggagttttcaaacaaaagcacaggctcaatttga 29835455  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835454 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 29835355  T
Q  328 attacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29835354 attacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaggcttcagatgaagatg 29835300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Original strand, 31483747 - 31484111
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31483747 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccttgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 31483846  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaa--aaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31483847 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 31483946  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31483947 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 31484046  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| ||||    
T  31484047 cacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgtggaagcttcagatgaagatg 31484111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 19680786 - 19680425
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19680786 gacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 19680687  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19680686 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggct 19680589  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19680588 caatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 19680489  T
Q  320 cagcaatcattacatttccc-aaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19680488 cagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatg 19680425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33248690 - 33248366
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248690 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 33248591  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtata 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  33248590 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtata 33248492  T
Q  234 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattaca 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248491 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattaca 33248392  T
Q  334 tttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||    
T  33248391 tttcctagaaactttgaattcgcaag 33248366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9360960 - 9360622
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360960 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 9360861  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360860 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 9360762  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  9360761 caacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattggaca 9360662  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  9360661 cagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 9360622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31360867 - 31360528
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360867 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 31360768  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31360767 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 31360669  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31360668 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 31360569  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||    
T  31360568 acagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaag 31360528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18797046 - 18796706
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797046 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 18796947  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  18796946 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagc 18796848  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18796847 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttataaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaa 18796748  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  18796747 cacggtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 18796706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 20 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 44567322 - 44567002
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  44567322 gacatcaacatactctcgcttatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 44567223  T
Q  118 --tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 215  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  44567222 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcaca 44567125  T
Q  216 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattg 315  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44567124 ggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 44567025  T
Q  316 aacacagcaatcattacatttcc 338  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  44567024 aacacagcaatcattacatttcc 44567002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 382
Target Start/End: Original strand, 19202260 - 19202603
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19202260 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 19202359  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||           |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  19202360 aagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaa-----------atagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttga 19202447  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19202448 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 19202547  T
Q  328 attacatttcccaaaa-actttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19202548 attacatttcccaaaagactttgaattcacaagtacagaaacttcagatgaagatg 19202603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18715819 - 18715480
Alignment:
Q  22 catcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     ||||    
T  18715819 catcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaaaaa 18715720  T
Q  118 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  18715719 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacagg 18715622  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18715621 ctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 18715522  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||  ||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  18715521 cacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 18715480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Original strand, 12086608 - 12086951
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12086608 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgctcaggcttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 12086707  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||    
T  12086708 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttg 12086806  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagcaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  12086807 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaa 12086906  T
Q  326 tcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
     || |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12086907 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 12086951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15773913 - 15773574
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15773913 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 15773814  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||    
T  15773813 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgttttgtatatagctctgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagc 15773715  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15773714 tcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 15773615  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  15773614 acagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 15773574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Original strand, 21342047 - 21342381
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21342047 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 21342146  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  21342147 gcttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacagaagcacaggc 21342245  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21342246 tcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaa 21342345  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaatt 353  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21342346 cacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 21342381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33265061 - 33264731
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  33265061 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgttcgttt 33264962  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  33264961 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattg 33264864  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33264863 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 33264764  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||  ||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  33264763 catggcatttcctaggaactttgaattcgcaag 33264731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Original strand, 19911039 - 19911374
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  19911039 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 19911138  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19911139 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtaaaaaggaaatagagtttt-aaacaaaagcacag 19911237  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattga 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19911238 gctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaaaggtaattttattggttggtggtacattga 19911337  T
Q  317 acacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaatt 353  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  19911338 acacagtaatcattacatctcctagaaactttgaatt 19911374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 101 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16260480 - 16260212
Alignment:
Q  101 gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16260480 gttttcgattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttt 16260382  T
Q  201 tcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16260381 tcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattg 16260282  T
Q  301 gttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16260281 gttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagctt 16260212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 22074814 - 22075164
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||    
T  22074814 catacgctcgctcatgcacgtttcgtttgaatgtaccttgttgctcatgcttgctttcaaaac-agacaaaaacttttttattttcaagaagtttgtttc 22074912  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||    
T  22074913 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcctaggctcgaat 22075011  T
Q  225 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22075012 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggca 22075111  T
Q  325 atcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 377  Q
    | || ||||||||| | ||||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||    
T  22075112 accactacatttcctagaaactttgaattcgcaaacacaaaagcttctgatga 22075164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Original strand, 19655232 - 19655560
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19655232 catacactcgctcatgcacgttttgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttcaaaaa-------aaacttttcaattttcaagatgtttgtttc 19655324  T
Q  128 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19655325 aagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaat 19655423  T
Q  225 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa--tcttattggttggtggtacattgaacacag 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19655424 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgagactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttttattggttggtggtacattgaacacag 19655523  T
Q  323 caatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  19655524 caatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 19655560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 34 - 382
Target Start/End: Original strand, 27602805 - 27603146
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||        || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27602805 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgcacaggtttgcttttcaaaa--------aacttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 27602895  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27602896 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 27602994  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatt 330  Q
     |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  27602995 ctaagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccact 27603094  T
Q  331 acatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27603095 acagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatg 27603146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22139231 - 22138906
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||           |||||||||||||| | |||||||||    
T  22139231 catacactcgctcatgcacgtttcatttcaatgtaccctgttgctcaagtttgctttcaaaaact---------ttttcaattttcaagacgtttgtttc 22139141  T
Q  128 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  22139140 aagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaat 22139042  T
Q  225 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22139041 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacaac 22138942  T
Q  324 aatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  22138941 aatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 22138906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Original strand, 2131159 - 2131478
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2131159 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaag-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 2131250  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2131251 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 2131349  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2131350 ataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacatcaatcatt 2131449  T
Q  331 acatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  2131450 acatttcctagaaactttgaattcgcaag 2131478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19694416 - 19694095
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  19694416 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcat 19694324  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||  |||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19694323 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcggagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 19694225  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19694224 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcat 19694125  T
Q  330 tacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  19694124 tacatttcctagaaactttgaattcgcaag 19694095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 14569479 - 14569162
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||       ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  14569479 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgtctttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcat 14569388  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatt-----tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | ||     || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14569387 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttttttgaacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattg 14569289  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14569288 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaat 14569189  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattc 354  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14569188 cattaca-ttcccaaaaactttgaattc 14569162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Original strand, 31958413 - 31958777
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31958413 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 31958512  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaa--aaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31958513 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 31958612  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31958613 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 31958712  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||    
T  31958713 cacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttcagatgaagatg 31958777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Original strand, 5603271 - 5603635
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5603271 gacatcaacatactctcgctcatgcatgttttatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 5603370  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaa--aaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5603371 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 5603470  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5603471 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 5603570  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||    
T  5603571 cacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttcagatgaagatg 5603635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 24334477 - 24334113
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24334477 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 24334378  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaa--aaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24334377 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtgtatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 24334278  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24334277 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 24334178  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||    
T  24334177 cacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttcagatgaagatg 24334113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 28 - 382
Target Start/End: Original strand, 28109917 - 28110276
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat----gtttg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||    
T  28109917 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaacgtttg 28110016  T
Q  124 tttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110017 tttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaa 28110116  T
Q  224 ttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  28110117 ttgatgtataagagtggtggtcagcccaaggcatgactccacggattcataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagt 28110216  T
Q  324 aatcattacatttccc-aaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28110217 aatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatg 28110276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5717371 - 5717031
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717371 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 5717272  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717271 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 5717172  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5717171 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 5717072  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  5717071 acagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 5717031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 5764087 - 5764427
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764087 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 5764186  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764187 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 5764286  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5764287 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 5764386  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  5764387 acagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 5764427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5728281 - 5727941
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728281 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 5728182  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728181 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 5728082  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5728081 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 5727982  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  5727981 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 5727941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 47029756 - 47029416
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029756 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 47029657  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029656 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 47029557  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47029556 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 47029457  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  47029456 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 47029416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 370
Target Start/End: Original strand, 4340634 - 4340984
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  4340634 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaat 4340733  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4340734 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 4340832  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4340833 tcaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 4340932  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    |||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4340933 acagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagctt 4340984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 32296932 - 32296574
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296932 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 32296833  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32296832 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggc 32296733  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32296732 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 32296633  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 377  Q
    |||| ||||| |||||||||   ||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||||    
T  32296632 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcgcagaaacttctgatga 32296574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10649373 - 10649034
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649373 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 10649274  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10649273 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 10649175  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10649174 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 10649075  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||    
T  10649074 acagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaag 10649034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 34 - 382
Target Start/End: Original strand, 29142726 - 29143077
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttt--aaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142726 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccatgttgctcaggtttgttttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagc 29142825  T
Q  132 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142826 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaaaaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 29142925  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatt 330  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  29142926 ataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccact 29143025  T
Q  331 acatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29143026 acagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatg 29143077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 28 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28345464 - 28345111
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28345464 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaatttttcaaaatgtttgttt 28345365  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  28345364 caagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcataggctcaatttg 28345267  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28345266 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 28345167  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||    
T  28345166 cattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttcagatgaagatg 28345111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 4790591 - 4790931
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790591 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 4790690  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  4790691 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagc 4790789  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  4790790 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgaatccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaa 4790889  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  4790890 cacggtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 4790931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4423220 - 4422881
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4423220 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 4423121  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4423120 gtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 4423022  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4423021 tcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 4422922  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||| |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  4422921 acagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 4422881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 20 - 370
Target Start/End: Original strand, 29658926 - 29659276
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  29658926 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaat 29659025  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29659026 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatataactttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcaaaggc 29659124  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29659125 tcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 29659224  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    || | || || |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659225 acggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 29659276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Original strand, 5590319 - 5590676
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590319 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 5590418  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  5590419 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacaggc 5590517  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5590518 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 5590617  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 377  Q
    |||| |||||| |||  ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5590618 acagtaatcatgacagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctttagatga 5590676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 34 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 4630072 - 4629725
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4630072 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 4629974  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629973 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 4629875  T
Q  233 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattac 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  4629874 aagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattaacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactac 4629775  T
Q  333 atttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    | |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4629774 agttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatg 4629725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10402450 - 10402112
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10402450 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 10402351  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  10402350 gtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaa-aaaaatagaatttt-aatcaaaagcacaggc 10402253  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10402252 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 10402153  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  10402152 acagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 10402112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 34 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21680988 - 21680646
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680988 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 21680890  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680889 tgtcattatcaaaatggaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 21680791  T
Q  233 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattac 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  21680790 aagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactac 21680691  T
Q  333 atttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 377  Q
    | |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680690 agttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 21680646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 17970824 - 17971161
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970824 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 17970923  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17970924 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatagctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggct 17971021  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  17971022 caatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacgttgaaca 17971121  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  17971122 cagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 17971161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5473289 - 5472951
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  5473289 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaaat 5473191  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5473190 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 5473092  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5473091 tcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 5472992  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  5472991 acagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 5472951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 51788316 - 51787985
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51788316 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 51788217  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51788216 caagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatattttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttg 51788118  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51788117 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtggtacattgaacacagcaat 51788018  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||| ||||   ||||||||||||| ||||    
T  51788017 cattacacttcctggaaactttgaattcgcaag 51787985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8217936 - 8217595
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  8217936 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 8217837  T
Q  118 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8217836 tgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaag 8217738  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8217737 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatccacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 8217638  T
Q  317 acacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  8217637 acacagtaatcactacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 8217595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18249040 - 18248690
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  18249040 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaat 18248941  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18248940 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatgtagctttgaaagtagaagaaaaatagagttc-caaacaaaagcaaaggc 18248842  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18248841 tcaacttgatgtataagagtgatggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 18248742  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    || | || || |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248741 acggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 18248690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Original strand, 22381553 - 22381877
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22381553 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtacactgtcgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 22381651  T
Q  133 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22381652 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtat 22381750  T
Q  233 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattac 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22381751 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgac 22381850  T
Q  333 atttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  22381851 atttcctagaaactttgaattcgcaag 22381877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Original strand, 22864814 - 22865143
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22864814 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 22864913  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaa-aatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22864914 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaagcatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattg 22865010  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22865011 atgtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 22865110  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22865111 catgacatttcccagaaactttgaattcgcaag 22865143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Original strand, 22879873 - 22880202
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22879873 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 22879972  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaa-aatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22879973 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaagcatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattg 22880069  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22880070 atgtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 22880169  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22880170 catgacatttcccagaaactttgaattcgcaag 22880202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 370
Target Start/End: Original strand, 17978908 - 17979259
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttta-aaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17978908 gacatcaacataccctcgctcatgcatatttcctttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat 17979007  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| ||     
T  17979008 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagt 17979106  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17979107 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 17979206  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17979207 cacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctt 17979259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28027591 - 28027243
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027591 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 28027492  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | |||    
T  28027491 tttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagaatttt-aaacaaaagcacaagct 28027394  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28027393 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcctgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 28027294  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    ||| ||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28027293 cagtaatcactacagttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagctt 28027243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18231487 - 18231156
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18231487 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgactgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgttt 18231388  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18231387 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaagaaaacagagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattg 18231289  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231288 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcgcaaatcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 18231189  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  18231188 cattacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 18231156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 48472233 - 48471890
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaatttt-----ca 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||      |    
T  48472233 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacagaaagttttcaatttttaaaaaa 48472134  T
Q  115 aaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  48472133 aaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcac 48472035  T
Q  215 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacatt 314  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48472034 aagctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgagggcgtgactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 48471935  T
Q  315 gaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  48471934 gaacacatcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 48471890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 16422485 - 16422123
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||| ||    
T  16422485 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttcaaaa-tacacaaaaactttttcaattttcaagat 16422387  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16422386 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaag 16422288  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16422287 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 16422188  T
Q  317 acacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16422187 acacagtaatcattacattt-ccggaaactttgaattcgcaagcacagaagcttcagatgaagatg 16422123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 34 - 353
Target Start/End: Original strand, 18286327 - 18286645
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagc 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18286327 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagc 18286425  T
Q  132 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  18286426 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgta 18286523  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  18286524 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatga 18286623  T
Q  332 catttcccaaaaactttgaatt 353  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  18286624 catttcccagaaactttgaatt 18286645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 34 - 353
Target Start/End: Original strand, 18301628 - 18301946
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagc 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18301628 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagc 18301726  T
Q  132 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  18301727 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgta 18301824  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  18301825 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatga 18301924  T
Q  332 catttcccaaaaactttgaatt 353  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  18301925 catttcccagaaactttgaatt 18301946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20072337 - 20071996
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20072337 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 20072238  T
Q  118 --tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 215  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  20072237 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcaca 20072140  T
Q  216 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattg 315  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20072139 ggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 20072040  T
Q  316 aacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||  ||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  20072039 aacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 20071996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 351
Target Start/End: Original strand, 11104319 - 11104651
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104319 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 11104418  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat--gttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  11104419 tttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatttagctttgaaagtaaaaagaaaatagag-tttcaaacaaaagcacagg 11104517  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11104518 ctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtggctccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 11104617  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaa 351  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||||||||||    
T  11104618 cacagcaatcattacacttcctggaaactttgaa 11104651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 6536701 - 6537040
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6536701 gacatcaacatactctcgctcatgcatgcttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagtttttaattttcaaaaat 6536800  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||    
T  6536801 gtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagc 6536899  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6536900 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 6536999  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6537000 acagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaag 6537040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5020014 - 5019676
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5020014 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 5019915  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||    
T  5019914 gttcgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaag-tagagtttt-aaacaaaagcacaagc 5019817  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5019816 tcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 5019717  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||| |||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  5019716 acagtaatcatgacatttcctggaaactttgaattcgcaag 5019676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Original strand, 20570812 - 20571154
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  20570812 catacacttgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttattt 20570911  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  20570912 caagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaacggctcaacttg 20571010  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  20571011 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaac 20571110  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    || |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20571111 cactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 20571154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7079529 - 7079185
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttc-aattttcaaaat 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7079529 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttttaattttcaaaat 7079430  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaa-aatagaaagaaaatgttttgtattta----gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||| ||  |||| ||||||| || |||||||||    
T  7079429 gtttgtttcaagcattgtcattatcaagaatagaaagaaaatgttttgtatatatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-cagacaaaagca 7079331  T
Q  214 aaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacat 313  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7079330 caagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacat 7079231  T
Q  314 tgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  7079230 tgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 7079185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Original strand, 31030217 - 31030535
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31030217 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcat 31030310  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtata 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31030311 tatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgacgtata 31030409  T
Q  234 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattaca 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31030410 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgaca 31030509  T
Q  334 tttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    | ||| | ||||||||||||| ||||    
T  31030510 tctcctagaaactttgaattcgcaag 31030535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 28 - 382
Target Start/End: Original strand, 16618455 - 16618813
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagtttt---caattttcaaaatgtttgt 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||   |||||||||| ||||||||    
T  16618455 catacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttcaaaa-tggacaaaaactttttttcaattttcaagatgtttgt 16618553  T
Q  125 ttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctca 221  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16618554 ttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctca 16618652  T
Q  222 aattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacaca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16618653 aattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacaca 16618752  T
Q  322 gcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    | || || ||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  16618753 gtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatgaagatg 16618813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18057565 - 18057223
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  18057565 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 18057466  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||  |||  ||||||| ||||||||||||  |    
T  18057465 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacgg 18057367  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18057366 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 18057267  T
Q  316 aacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  18057266 aacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 18057223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 34 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18336910 - 18336580
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18336910 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 18336817  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtata 233  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  18336816 tatcattatcataatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaatcgatgtata 18336718  T
Q  234 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattac 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18336717 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattac 18336618  T
Q  333 atttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||| || |||||    
T  18336617 atttcctagaaactttgaattcgcaagtataggagctt 18336580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 34 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6208184 - 6207869
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  6208184 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcct 6208092  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6208091 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgacgta 6207992  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6207991 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatt 6207892  T
Q  331 acatttcccaaaaactttgaatt 353  Q
    |||||||| | ||||||||||||    
T  6207891 acatttcctagaaactttgaatt 6207869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 32445433 - 32445122
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32445433 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcat 32445342  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtata 233  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  32445341 tatcattatcaaaacagaaagaaaatgttttgtatataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtata 32445243  T
Q  234 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattaca 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  32445242 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgaca 32445143  T
Q  334 tttcccaaaaactttgaattc 354  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  32445142 tttcccagaaactttgaattc 32445122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 19700792 - 19700454
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtt 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||| |||||||||    
T  19700792 catacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttcaaaa-tagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtt 19700694  T
Q  126 tcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtattt-----------agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagca 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||           ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  19700693 tcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttttttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagca 19700595  T
Q  214 aaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacat 313  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19700594 caggcttaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacat 19700495  T
Q  314 tgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattc 354  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  19700494 tgaacacagtaatcactacatttcctagaaactttgaattc 19700454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 34 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4727915 - 4727602
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4727915 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 4727823  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4727822 ttgtcattattaaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgta 4727724  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  4727723 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatca 4727624  T
Q  332 catttcccaaaaactttgaatt 353  Q
    ||||||| | ||||||||||||    
T  4727623 catttcctagaaactttgaatt 4727602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Original strand, 15735072 - 15735392
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  15735072 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcat 15735165  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| |||| ||||| | ||||||||| |||  || ||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15735166 ttgtcattattaaaaatagaagggaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaagaaagc-agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 15735263  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735264 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatt 15735363  T
Q  331 acatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  15735364 acatttcctagaaactttgaattcgcaag 15735392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5658425 - 5658097
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||      |||  ||||||||||| || |||||||||||    
T  5658425 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgcttaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaatttttaagatgtttgtttc 5658333  T
Q  128 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||  || | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||     
T  5658332 aagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataacgttgaaagtaaaaggaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaaa 5658234  T
Q  225 tgat--gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacag 322  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5658233 tgatatgtataagagtggtggtcagccgaaggcctgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacgttgaacacag 5658134  T
Q  323 caatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  5658133 caatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 5658097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4689939 - 4689614
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  4689939 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttc 4689848  T
Q  128 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
     |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||  || ||| ||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4689847 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataacttagaaagtaaaagaaagc-agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaat 4689750  T
Q  225 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4689749 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacgcagc 4689650  T
Q  324 aatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  4689649 aatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 4689614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Original strand, 8283430 - 8283766
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaag---------ttttcaattttcaaaatgtttgt 124  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | |||||          |||||||||||||| ||| ||||    
T  8283430 ctcgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgcttgt 8283529  T
Q  125 ttcaagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctca 221  Q
    ||| |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||||| ||  |||   ||| |||||||||||| || | |||||    
T  8283530 ttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcggag-tttcaaacaaaaacacatgctca 8283628  T
Q  222 aattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8283629 aattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacaca 8283728  T
Q  322 gcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  8283729 tcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 8283766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 35887048 - 35886733
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  35887048 ctcgctcatgtatgtt-cgtttgaatgtaccctgttacacaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 35886956  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35886955 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 35886857  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35886856 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagtaatcat 35886757  T
Q  330 tacatttcccaaaaactttgaatt 353  Q
    ||||||||| | ||||||||||||    
T  35886756 tacatttcctagaaactttgaatt 35886733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 251 - 359
Target Start/End: Original strand, 15886894 - 15887004
Alignment:
Q  251 aaggcgtgactccacggattc-acaaagcttggaaaatggtaatctt-attggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaacttt 348  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15886894 aaggcgtgactccacggattttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaacttt 15886993  T
Q  349 gaattcacaag 359  Q
    |||||| ||||    
T  15886994 gaattcgcaag 15887004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8002607 - 8002523
Alignment:
Q  275 aagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||    
T  8002607 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaag 8002523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 222
Target Start/End: Original strand, 15886707 - 15886895
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       ||||  |||||||||||||| ||||||| |||    
T  15886707 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaa-------aaaactttttcaattttcaagatgtttgcttc 15886798  T
Q  128 aagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaa 222  Q
     |||| ||||||||| | ||||||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||| || ||||||||    
T  15886799 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaagtatttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaaacacaggctcaa 15886895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Original strand, 22922048 - 22922412
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22922048 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 22922147  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaa--aaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22922148 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 22922247  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22922248 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 22922347  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||    
T  22922348 cacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttcagatgaagatg 22922412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 39896405 - 39896043
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39896405 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 39896306  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  39896305 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagct 39896207  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39896206 caaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattcacaaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 39896107  T
Q  320 cagcaatcattacattt-cccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  39896106 cagtaatcattacatttccccaaaaactttgaattctcaagtacagaagcttcagatgacgatg 39896043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Original strand, 19410389 - 19410753
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19410389 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtatcctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 19410488  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaa--aaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19410489 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtgtatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 19410588  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19410589 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 19410688  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||    
T  19410689 cacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttcagatgaagatg 19410753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12661875 - 12661543
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661875 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 12661776  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  12661775 tttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagct 12661677  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12661676 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 12661577  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaatt 353  Q
    ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12661576 cagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 12661543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 254557 - 254896
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  254557 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaatg 254655  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaa-atagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  254656 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 254755  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  254756 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 254855  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  254856 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 254896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 37945770 - 37946110
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945770 gacatcaacatactcttactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 37945869  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945870 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 37945969  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  37945970 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtatattgaac 37946069  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  37946070 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 37946110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27810040 - 27809699
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27810040 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaacctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 27809941  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809940 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 27809841  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27809840 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 27809741  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  27809740 cacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 27809699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 37384014 - 37383675
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37384014 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 37383915  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  37383914 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagct 37383816  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37383815 caaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaac 37383716  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  37383715 acagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 37383675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Original strand, 37679796 - 37680160
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaa 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||    
T  37679796 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaaa 37679895  T
Q  118 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  37679896 tgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacag 37679993  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattg 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  37679994 gctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 37680093  T
Q  316 aacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37680094 aacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatg 37680160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Original strand, 37695061 - 37695425
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaa 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||    
T  37695061 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaaa 37695160  T
Q  118 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  37695161 tgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacag 37695258  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattg 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  37695259 gctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 37695358  T
Q  316 aacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37695359 aacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatg 37695425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Original strand, 13930457 - 13930790
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13930457 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 13930556  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930557 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 13930656  T
Q  226 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930657 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaa 13930756  T
Q  326 tcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  13930757 tcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 13930790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16167815 - 16167476
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167815 gacatcaacataccctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 16167716  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16167715 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 16167617  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16167616 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 16167517  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  16167516 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 16167476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Original strand, 21671075 - 21671440
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagt-tttcaattttcaaaa- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||     
T  21671075 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaaatttcaattttcaaaaa 21671174  T
Q  118 -tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 215  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  21671175 atgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcaca 21671272  T
Q  216 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatctt-attggttggtggtacatt 314  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21671273 ggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacatt 21671372  T
Q  315 gaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21671373 gaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatg 21671440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 34 - 382
Target Start/End: Original strand, 11629104 - 11629451
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11629104 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgtttttcaaaatagacaaagagttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagca 11629202  T
Q  133 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11629203 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaaataaaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 11629300  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11629301 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatta 11629400  T
Q  332 catttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11629401 catttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatg 11629451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12593151 - 12592808
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 117  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  12593151 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttccaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 12593052  T
Q  118 --tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 215  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12593051 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaa 12592952  T
Q  216 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12592951 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 12592852  T
Q  316 aacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  12592851 aacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 12592808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3788830 - 3788492
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788830 gacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 3788731  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788730 tttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 3788632  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3788631 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 3788532  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  3788531 cagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 3788492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27122860 - 27122523
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122860 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 27122761  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27122760 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcaaaggct 27122663  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27122662 caatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 27122563  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  27122562 cagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 27122523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 37931708 - 37931370
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37931708 catactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 37931609  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaa------tagagttttcaaacaaaagcaaaggctc 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931608 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctc 37931509  T
Q  221 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacac 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37931508 aaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 37931409  T
Q  321 agcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  37931408 agcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 37931370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 9343892 - 9344231
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  9343892 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatggacaaaaagttttcaattttcaaaaat 9343991  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  9343992 gtttgtttcaagcattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagc 9344090  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9344091 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 9344190  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  9344191 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 9344231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 12710514 - 12710863
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtt 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12710514 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtt 12710613  T
Q  126 tcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  12710614 tcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaatt 12710711  T
Q  226 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12710712 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 12710811  T
Q  326 tcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 377  Q
    ||| |||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710812 tcactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 12710863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 34 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40239831 - 40239489
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239831 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 40239733  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239732 tgtcattatcaaaatggaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 40239634  T
Q  233 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattac 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  40239633 aagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactac 40239534  T
Q  333 atttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 377  Q
    | |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239533 agttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 40239489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 34868019 - 34867680
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34868019 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 34867920  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34867919 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggc 34867822  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34867821 tcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactctacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 34867722  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagt 360  Q
    |||| ||||||| |||||||   ||||||||||||| |||||    
T  34867721 acagtaatcatttcatttcctggaaactttgaattcgcaagt 34867680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34161183 - 34160842
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  34161183 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 34161084  T
Q  118 -tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| |     
T  34161083 atgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaa 34160985  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34160984 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 34160885  T
Q  317 acacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  34160884 acacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaag 34160842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Original strand, 16823250 - 16823592
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16823250 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 16823349  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  16823350 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattg 16823448  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823449 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 16823548  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    ||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16823549 cattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctt 16823592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16898230 - 16897888
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16898230 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 16898131  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  16898130 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattg 16898032  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16898031 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 16897932  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    ||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16897931 cattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctt 16897888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 39045727 - 39046066
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39045727 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 39045826  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  39045827 gtttgtttcaagtattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagc 39045925  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  39045926 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttagtggtacattgaac 39046025  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||| ||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||    
T  39046026 acagtaatcattacattttctggaaactttgaattcgcaag 39046066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27782561 - 27782219
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27782561 catacactcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 27782462  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  27782461 caagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaacggctcaacttg 27782363  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  27782362 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaac 27782263  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    || |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782262 cactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 27782219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32056130 - 32055800
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  32056130 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgttt 32056031  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  32056030 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaatttt-aaacaaaagcacaggctcaatttg 32055933  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  32055932 atgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaat 32055833  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| ||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  32055832 catgacatttcctggaaactttgaattcgcaag 32055800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31882615 - 31882285
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31882615 catattctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgctcaagtttgcttttcaaaatagaaaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgttt 31882516  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  31882515 caagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattg 31882418  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31882417 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagcaat 31882318  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  31882317 cattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 31882285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 20 - 309
Target Start/End: Original strand, 31868691 - 31868979
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 118  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31868691 gacatcaacacactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 31868790  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31868791 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggc 31868888  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggt 309  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31868889 tcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaatgcttgaaaaatggtaattttattggttggtggt 31868979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Original strand, 21697078 - 21697438
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaa 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||| |    
T  21697078 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgctcaggtttgctttcaaaa-tagacaaaaaactttttcaattttcaaga 21697176  T
Q  118 tgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaa 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| |  | | |||||||| ||||||||||||     
T  21697177 tgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtaggaagatagtagagttt-caaacaaaagcac 21697275  T
Q  215 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacatt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21697276 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 21697375  T
Q  315 gaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 377  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  21697376 gaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagctttagatga 21697438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34297486 - 34297154
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||  |||||||||||| |||||    
T  34297486 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcgaaatg 34297393  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||    
T  34297392 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagct 34297294  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34297293 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 34297194  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  34297193 cagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 34297154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27396662 - 27396298
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaag----------ttttcaattttcaaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||           |||||||||||||| |    
T  27396662 catacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgcttaggtttgctttcaaaaag-gacaaaaaactttttttttttttcaattttcaaga 27396564  T
Q  118 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |    
T  27396563 tgtttgtttcaagcattgtcattataaagatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaca 27396465  T
Q  216 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27396464 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattg 27396365  T
Q  316 aacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||||| | || || ||||||||| | ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  27396364 aacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacaaaagcttctgatgaagatg 27396298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Original strand, 34268839 - 34269165
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||  ||||||||||| || |||||||||||    
T  34268839 catacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaatttttaagatgtttgtttc 34268931  T
Q  128 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |    
T  34268932 aagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacatgctcaatt 34269030  T
Q  225 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagca 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34269031 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggagaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaaca 34269130  T
Q  325 atcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34269131 atcatgacatttcctagaaactttgaattcacaag 34269165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28888597 - 28888277
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28888597 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 28888505  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28888504 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 28888406  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28888405 ataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatg 28888306  T
Q  331 acatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  28888305 acatttcctagaaactttgaattcgcaag 28888277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Original strand, 23122497 - 23122817
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23122497 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 23122589  T
Q  134 t-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23122590 ttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 23122688  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23122689 taagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttgcaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagcaatcatt 23122788  T
Q  331 acatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  23122789 acatttcctagaaactttgaattcgcaag 23122817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Original strand, 27428366 - 27428690
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaatgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  27428366 catacactcgctcatgcacgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttt---------caaaaacttttgcaattttcaagatgtttgttt 27428455  T
Q  127 caagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaa 223  Q
    | | |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |  || ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27428456 cgaacatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgcacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaa 27428554  T
Q  224 ttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagc 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27428555 ttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagc 27428654  T
Q  324 aatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  27428655 aatcattacatttcctagaaactttgaactcacaag 27428690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 382
Target Start/End: Original strand, 19450331 - 19450694
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagtttt------caattttcaaaatgtt 121  Q
    ||||| ||| ||||||||  |||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||      |||||||||| |||||    
T  19450331 catacgctcactcatgcacatttcgtttgaacgtaccttgttgctcaggtttactttcaaaac-agacaaaaacttttttttttcaattttcaagatgtt 19450429  T
Q  122 tgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatt-----tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||     || |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| |     
T  19450430 tgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttttgtacatacctttgaaagtagagagaaaatagagttt-caaacaaaagcacat 19450528  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattga 316  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19450529 gctcgaattgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgattccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattga 19450628  T
Q  317 acacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    |||| | || || ||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  19450629 acacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatgaagatg 19450694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20844235 - 20843910
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  20844235 ctcgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcat 20844141  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgt--atttagcttt-gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 228  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |  |  || |||| ||| ||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20844140 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgaacataacttttgaaggtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgat 20844042  T
Q  229 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 327  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20844041 gtataagagtggtgtccagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 20843942  T
Q  328 attacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  20843941 attacatttcctaggaactttgaattcgcaag 20843910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23117133 - 23116993
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||      
T  23117133 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgcccaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatggtcaaaaac 23117034  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg 160  Q
     ||  ||||||||||||||| || || |||| | |||||||    
T  23117033 gttagttcaagcattgtcatgatgaagataggaggaaaatg 23116993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 359
Target Start/End: Original strand, 31887682 - 31887737
Alignment:
Q  304 ggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  31887682 ggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 31887737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3647487 - 3647148
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647487 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 3647388  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3647387 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggct 3647288  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3647287 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 3647188  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| || |||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  3647187 cagtaaccattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 3647148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10969007 - 10968667
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10969007 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 10968908  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968907 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 10968808  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10968807 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 10968708  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  10968707 acagtaatcaggacatctcctagaaactttgaattcgcaag 10968667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 51644555 - 51644211
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgttt 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51644555 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgttt 51644456  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644455 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 51644356  T
Q  226 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaa 325  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51644355 gatgtgtaagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 51644256  T
Q  326 tcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    |||| ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644255 tcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 51644211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 28 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 10951425 - 10951100
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951425 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttacttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 10951326  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951325 aagcattgtcattatcaaaataaaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 10951226  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951225 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 10951126  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaat 352  Q
    ||||||||||||   |||||||||||    
T  10951125 cattacatttcctggaaactttgaat 10951100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 28 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28591415 - 28591084
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591415 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 28591316  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28591315 aagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattga 28591217  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591216 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 28591117  T
Q  328 attacatttcccaaaaactttgaattcacaagt 360  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  28591116 attacatttcctggaaactttgaattcgcaagt 28591084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 41787224 - 41787565
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttc---aaa 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  41787224 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 41787323  T
Q  117 atgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  41787324 atgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaa 41787421  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  41787422 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 41787521  T
Q  316 aacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  41787522 aacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 41787565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28156069 - 28155728
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  28156069 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 28155970  T
Q  118 --tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 215  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  28155969 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcaca 28155872  T
Q  216 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattg 315  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28155871 ggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 28155772  T
Q  316 aacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||  ||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  28155771 aacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 28155728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Original strand, 20334330 - 20334694
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  20334330 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttcaaaa-tagacaaaaactttttcaattttcaagat 20334428  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |    
T  20334429 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaca 20334527  T
Q  216 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattg 315  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20334528 atttcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatttacaaggcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 20334627  T
Q  316 aacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20334628 aacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagcttcagatgaagatg 20334694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Original strand, 16201942 - 16202312
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaag---ttttcaattttcaaa 116  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    ||||||||||||||     
T  16201942 gacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttcaaaa-tagacgaaaaaactttttcaattttcaag 16202040  T
Q  117 atgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatt-----tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaa 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||     | |||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||    
T  16202041 atgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaaatagaaagaaaatgtttttttttgtacatggctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaa 16202139  T
Q  210 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16202140 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 16202239  T
Q  310 acattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||| |||   ||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||    
T  16202240 acattgaacacagtaattactacatgtcctggaaactttgaattcgcaagcacaggagcttctgatgaagatg 16202312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 20467126 - 20466756
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttc--------aattt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||         |||||    
T  20467126 gacatcaacatacactcgctcacgcatgtttcgtttgaatgtaccttgctgctcaggtttgctttcaaaa-tagacaggaactttttttttttctaattt 20467028  T
Q  112 tcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--ttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaa 209  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  20467027 tgaagatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatggtttttgtacatagctttgaaagtggaaagaaagtagagttt-caaacaaa 20466929  T
Q  210 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20466928 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 20466829  T
Q  310 acattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||||||||||||| ||  | ||||||||| | ||||||||||||  |||| | ||||||||| ||||| ||||    
T  20466828 acattgaacacagtaacgactacatttcctagaaactttgaatttgcaagcatagaagcttctgatgaagatg 20466756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 34 - 382
Target Start/End: Original strand, 21891691 - 21892025
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||      |||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  21891691 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaaaaaactt----ttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcat 21891785  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| |||| ||||| |||||||||||           ||||  || || | ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21891786 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttt-----------tgaacataaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 21891873  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  21891874 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatcact 21891973  T
Q  331 acatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  21891974 acatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaagcttctgatgaagatg 21892025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 18369347 - 18369687
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369347 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 18369446  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  18369447 tttgtttcaagcattgtcattaccaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcgaaggtt 18369546  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18369547 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 18369646  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagt 360  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  18369647 cagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagt 18369687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30174812 - 30174472
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174812 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 30174713  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174712 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 30174613  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30174612 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 30174513  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  30174512 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 30174472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 33881472 - 33881132
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881472 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 33881373  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881372 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtggaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 33881273  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33881272 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 33881173  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagt 360  Q
    ||| |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  33881172 cagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagt 33881132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 34 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 6880636 - 6880287
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6880636 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 6880537  T
Q  133 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6880536 ttgtcattatcaaaataggaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtctt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtat 6880438  T
Q  233 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattac 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6880437 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattac 6880338  T
Q  333 atttccca-aaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  6880337 atttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagattcagatgaagatg 6880287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 11555699 - 11555367
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11555699 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaagaagttttcaattttcaaaatg 11555600  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  11555599 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagct 11555501  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11555500 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 11555401  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaatt 353  Q
    ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11555400 cagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 11555367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 3795885 - 3795527
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3795885 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 3795786  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3795785 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggc 3795686  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3795685 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 3795586  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 377  Q
    |||| ||||| |||||||||   ||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  3795585 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaggctttagatga 3795527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 28 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 9323814 - 9323461
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9323814 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 9323715  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  9323714 aagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttga 9323617  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9323616 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 9323517  T
Q  328 attacatttccc-aaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9323516 attacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaacttcagatgaagatg 9323461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Original strand, 37746151 - 37746482
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746151 catactctcgctcatgcatgcttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 37746250  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746251 gagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 37746350  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37746351 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 37746450  T
Q  328 attacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  37746451 atgacatttcccagaaactttgaattcgcaag 37746482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 28 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 12138513 - 12138160
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12138513 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 12138414  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  12138413 aagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttga 12138316  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12138315 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 12138216  T
Q  328 attacatttccc-aaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  12138215 attacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaacttcagatgaagatg 12138160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Original strand, 37352467 - 37352809
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352467 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 37352566  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37352567 aagcattgtcattatcaaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttg 37352665  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37352666 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 37352765  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37352766 catgacatttcccagaaactttgaatccacaagtgcagaagctt 37352809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 28 - 363
Target Start/End: Original strand, 8659295 - 8659629
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8659295 catactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 8659394  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  8659395 caagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaaacaaaggctcaacttg 8659493  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659494 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggcgaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 8659593  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtaca 363  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8659594 cattacatttccc-gaaactttgaattcacaagtaca 8659629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 20 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 43084604 - 43084270
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43084604 gacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaactttcaaaatg 43084505  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43084504 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 43084406  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43084405 tcaaattgatgcataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 43084306  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattc 354  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43084305 acagtaatcattacatttcccgaaaactttgaattc 43084270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 20 - 338
Target Start/End: Original strand, 18494583 - 18494900
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494583 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 18494682  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18494683 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaagtaaattgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggct 18494781  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18494782 caaattgatgtatgagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 18494881  T
Q  320 cagcaatcattacatttcc 338  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18494882 cagcaatcattacatttcc 18494900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 34 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 33298869 - 33298517
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttt--aaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298869 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccatgttgctcaggtttgttttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagc 33298770  T
Q  132 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298769 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaaaaaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 33298670  T
Q  230 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcat 329  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  33298669 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccac 33298570  T
Q  330 tacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33298569 tacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatg 33298517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 40467368 - 40467707
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40467368 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 40467467  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  40467468 gtttgtttcaagcattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagc 40467566  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40467567 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 40467666  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  40467667 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 40467707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Original strand, 13318651 - 13318981
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318651 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 13318750  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  13318751 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattga 13318849  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13318850 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 13318949  T
Q  328 attacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13318950 ataacatttcccagaaactttgaattcgcaag 13318981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28655589 - 28655249
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaa- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  28655589 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaaa 28655490  T
Q  118 -tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  28655489 atgtttgtttcgagcattgtcattattaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacag 28655392  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28655391 gctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 28655292  T
Q  317 acacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  28655291 acacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 28655249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 37761329 - 37760989
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttt-aaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37761329 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtgccctgttgctcaggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaa 37761230  T
Q  118 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37761229 tgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaagg 37761131  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37761130 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 37761031  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  37761030 cacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 37760989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 11329985 - 11329643
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  11329985 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttaaaaat 11329886  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat--ttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  11329885 gtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatttagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaaaacaaaagcaaag 11329787  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattga 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11329786 gctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 11329687  T
Q  317 acacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  11329686 acacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagt 11329643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 13436489 - 13436834
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aa 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  13436489 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 13436588  T
Q  116 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaag-aaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagca 213  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13436589 aatgtttgtttcaagcgttgccattatcaaaatagaaagaaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagag-tttcaaacaaaagca 13436687  T
Q  214 aaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtaca 312  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  13436688 caagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtaca 13436787  T
Q  313 ttgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  13436788 ttgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 13436834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 34 - 377
Target Start/End: Original strand, 28953609 - 28953952
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttt-aaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagc 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  28953609 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattcccaaaaatgtttgtttcaagc 28953707  T
Q  132 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953708 attgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 28953806  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatta 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28953807 taagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacta 28953906  T
Q  332 catttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 377  Q
    ||  ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953907 cagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 28953952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 13180608 - 13180943
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||  |||||||||||||| |||    
T  13180608 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatg 13180702  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13180703 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggct 13180802  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  13180803 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaac 13180902  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  13180903 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 13180943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24730308 - 24729976
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtt 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24730308 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtt 24730209  T
Q  126 tcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  24730208 tcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaggctcaattt 24730111  T
Q  226 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24730110 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 24730011  T
Q  326 tcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagt 360  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  24730010 tcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagt 24729976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 30158372 - 30158030
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30158372 catattctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 30158273  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  30158272 caagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaggtagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattg 30158174  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158173 atgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 30158074  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    || ||||||||  | ||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  30158073 cactacatttcttagaaactttgaatccacgagtacataagctt 30158030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41681037 - 41680711
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttt-aaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41681037 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 41680939  T
Q  133 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680938 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 41680839  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatta 331  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  41680838 taagagtggtggtcagccaagggcacgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccatta 41680739  T
Q  332 catttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  41680738 catttcctagaaactttgaattcgcaag 41680711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 9544522 - 9544862
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  9544522 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttacttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 9544621  T
Q  118 --tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 215  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  9544622 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcaca 9544719  T
Q  216 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattg 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9544720 ggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 9544819  T
Q  316 aacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  9544820 aacacagtaatcattacattt-cctgaaactttgaattcgcaag 9544862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23632317 - 23631982
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttt-aaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaa 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  23632317 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttttcaaaaatagacaaaaagctttttcaattttcaag 23632218  T
Q  117 atgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |     
T  23632217 atgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaa 23632119  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattga 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23632118 gctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacgaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 23632019  T
Q  317 acacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaatt 353  Q
    |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  23632018 acacggtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 23631982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 26486723 - 26486380
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26486723 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 26486624  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||           |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  26486623 aagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaa-----------atagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttga 26486536  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26486535 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 26486436  T
Q  328 attacatttccca-aaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  26486435 attacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaacttcagatgaagatg 26486380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33522721 - 33522378
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33522721 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 33522622  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || | |||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  33522621 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaatt 33522523  T
Q  226 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522522 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaa 33522423  T
Q  326 tcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    |||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  33522422 tcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctt 33522378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Original strand, 37665315 - 37665640
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttt-aaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagc 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37665315 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttttaaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagc 37665413  T
Q  132 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  37665414 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgta 37665512  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  37665513 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatga 37665612  T
Q  332 catttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  37665613 catttcccagaaattttgaattcgcaag 37665640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Original strand, 31820233 - 31820573
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31820233 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccttgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 31820332  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  31820333 aagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttga 31820430  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  31820431 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaacc 31820530  T
Q  328 attacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    | |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820531 actacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 31820573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30035763 - 30035433
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  30035763 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgttt 30035664  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  30035663 caagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaatttt-aaacaaaagcacaggctcaatttg 30035566  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  30035565 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaat 30035466  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  30035465 catgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 30035433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 20 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2517412 - 2517061
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 117  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  2517412 gacatcaacatactctcattcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 2517313  T
Q  118 -tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| |     
T  2517312 atgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaatct-caaacaaaagcacaa 2517215  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2517214 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgagggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 2517115  T
Q  317 acacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    |||||| |||||| ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517114 acacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 2517061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 22894761 - 22894400
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaag-ttttcaattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  22894761 gacatcaacatacactcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttcaaaa-tagacaaaaaccttttcaattttcaagat 22894663  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22894662 gtttgtttcaagcatggtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggc 22894564  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22894563 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 22894464  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    |||| || || ||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  22894463 acagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatgaagatg 22894400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 370
Target Start/End: Original strand, 32590091 - 32590440
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32590091 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 32590190  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32590191 gttcgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaag-tagagtttt-aaacaaaagcacaggc 32590288  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32590289 tcaatttgatgtataagagtggtagtcggccaaaggcatgaccccacgaattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 32590388  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    |||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32590389 acagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagctt 32590440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Original strand, 15752681 - 15753006
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15752681 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 15752780  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    ||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  15752781 aagtattgtcattatcaa----gaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattga 15752874  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15752875 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatc 15752974  T
Q  328 attacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    || |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  15752975 atgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 15753006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34622865 - 34622525
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  34622865 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagtttttaattttcaaaaat 34622766  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | ||    
T  34622765 gtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagc 34622667  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  34622666 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattcacaaaacttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaa 34622567  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  34622566 cacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 34622525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5644136 - 5643807
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5644136 catactctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcgattttcaaaaatgtttgttt 5644038  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  5644037 caggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaagaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattg 5643940  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5643939 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgat 5643840  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| |||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  5643839 catgacatttcctaggaactttgaattcgcaag 5643807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Original strand, 18122245 - 18122570
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18122245 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttctcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 18122343  T
Q  133 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18122344 ttgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatagctttgaaagtagaaaaaaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgta 18122442  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  18122443 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatga 18122542  T
Q  332 catttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  18122543 catctcctagaaactttgaattcgcaag 18122570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31437803 - 31437471
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||  ||||||||||||||||||    
T  31437803 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatg 31437710  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||    
T  31437709 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagct 31437611  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31437610 caaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 31437511  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  31437510 cagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 31437471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Original strand, 15652589 - 15652912
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | | ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15652589 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttttttaaaaaaaaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcat 15652687  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtata 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15652688 tatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtata 15652786  T
Q  234 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattaca 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15652787 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggtacattgaacacagcaatcatgaca 15652886  T
Q  334 tttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||    
T  15652887 tttcctagaaactttgaattcgcaag 15652912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 25206630 - 25206289
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaag-----ttttcaattttca 114  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||      |||||||||||||    
T  25206630 gacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgttcaggtttgctttcaaaa-tagacaaaaaaaaactttttcaattttca 25206532  T
Q  115 aaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaag 211  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||    
T  25206531 agatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaag 25206433  T
Q  212 caaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggta 310  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25206432 cacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggta 25206333  T
Q  311 cattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattc 354  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||    
T  25206332 cattgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaattc 25206289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 25270786 - 25270445
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaag-----ttttcaattttca 114  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||      |||||||||||||    
T  25270786 gacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgttcaggtttgctttcaaaa-tagacaaaaaaaaactttttcaattttca 25270688  T
Q  115 aaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaag 211  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||    
T  25270687 agatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaag 25270589  T
Q  212 caaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggta 310  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25270588 cacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggta 25270489  T
Q  311 cattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattc 354  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||    
T  25270488 cattgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaattc 25270445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Original strand, 22992953 - 22993270
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22992953 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgcttgtttcgagcat 22993045  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtata 233  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22993046 catcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtata 22993144  T
Q  234 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattaca 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  22993145 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcgataca 22993244  T
Q  334 tttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||  |||||||||||||| ||||    
T  22993245 tttcctgaaaactttgaattcgcaag 22993270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 23898206 - 23897886
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |          |||||||||||||| |||||||||||    
T  23898206 catacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttcaaaact----------ttttcaattttcaagatgtttgtttc 23898117  T
Q  128 aagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt----gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaa 222  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    |||  |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  23898116 aagcatttgtcattattaaaatagaaagaaaatgttttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaa 23898018  T
Q  223 attgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacag 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23898017 attgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgaatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacag 23897918  T
Q  323 caatcattacatttcccaaaaactttgaattc 354  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23897917 caatcattacatttcctagaaactttgaattc 23897886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33783814 - 33783494
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33783814 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctccggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 33783723  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa--tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 229  Q
    | |||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33783722 ttgtcattattaaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatg 33783624  T
Q  230 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33783623 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcat 33783524  T
Q  330 tacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  33783523 tacatttcctagaaactttgaattcgcaag 33783494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 34 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 24976175 - 24975861
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttc-aattttcaaaatgtttgtttcaagca 132  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24976175 ctcgctcatgcatatttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttt---------caaaaacttttccaattttcaagatgtttgtttcgagca 24976085  T
Q  133 tt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 229  Q
    || |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  24976084 tttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatg 24975986  T
Q  230 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24975985 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaatcat 24975886  T
Q  330 tacatttcccaaaaactttgaattc 354  Q
    ||||||||| | |||||||||||||    
T  24975885 tacatttcctagaaactttgaattc 24975861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 37 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24608570 - 24608252
Alignment:
Q  37 gctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttg 135  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  24608570 gctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttg 24608478  T
Q  136 tcatta-tcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtata 233  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||||| ||  |||   ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24608477 tcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcggag-tttcaaacaaaagcacatgctcaaattgatgtata 24608379  T
Q  234 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattac 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24608378 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattac 24608279  T
Q  333 atttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  24608278 atttcctagaaactttgaattcgcaag 24608252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30940968 - 30940643
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  30940968 catacactcgctcatgcatgtt-cttttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa--------actttttcaattttcaagatgtttgtttc 30940878  T
Q  128 aagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
     |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||||| ||  |||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30940877 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcaga-atttcaaacaaaagcacaggctcaaat 30940779  T
Q  225 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagc 323  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30940778 agatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagc 30940679  T
Q  324 aatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  30940678 aatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 30940643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Original strand, 27284224 - 27284586
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284224 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 27284323  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  27284324 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagc 27284422  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27284423 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 27284522  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    |||| ||||| |||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  27284523 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaagcttcagatgaagatg 27284586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 13518056 - 13518396
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518056 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 13518155  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtggaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 13518255  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13518256 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 13518355  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagt 360  Q
    ||| |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  13518356 cagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagt 13518396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Original strand, 8899561 - 8899923
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899561 gacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 8899660  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8899661 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 8899759  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8899760 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 8899859  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    |||| || || |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8899860 acagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatg 8899923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 376
Target Start/End: Original strand, 27623569 - 27623927
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27623569 gacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttaaaatg 27623668  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaa-tgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaa-atagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27623669 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 27623768  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27623769 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 27623868  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatg 376  Q
    ||||| || || |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27623869 cacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttctgatg 27623927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16756157 - 16755817
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat- 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16756157 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattgtcaaaata 16756058  T
Q  119 -gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  16756057 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaag 16755959  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16755958 ctcaaattgatgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 16755859  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  16755858 cacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 16755817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4764099 - 4763760
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4764099 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 4764000  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4763999 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 4763901  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4763900 tcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 4763801  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  4763800 acagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 4763760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27063817 - 27063479
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27063817 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 27063718  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27063717 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggc 27063620  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27063619 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggtacattgaac 27063520  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27063519 acagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcacaag 27063479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 370
Target Start/End: Original strand, 27355973 - 27356323
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  27355973 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaat 27356072  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27356073 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcaaaggc 27356171  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27356172 tcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 27356271  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    || | || || |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356272 acggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 27356323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28166831 - 28166491
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  28166831 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 28166732  T
Q  118 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28166731 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcaaagg 28166633  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28166632 ctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 28166533  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||    
T  28166532 cacagcaatcattacatttcctggaaactttggattcgcaag 28166491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Original strand, 26110281 - 26110622
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110281 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 26110380  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26110381 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattga 26110479  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26110480 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 26110579  T
Q  328 attacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    | ||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26110580 actacatttcttagaaactttgaatccacaagtgcagaagctt 26110622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 20 - 370
Target Start/End: Original strand, 34458370 - 34458718
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34458370 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaatg 34458468  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34458469 tttgtttcaaccattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagcttagaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggct 34458567  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34458568 caacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 34458667  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    | | || || |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458668 cggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 34458718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27491469 - 27491119
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  27491469 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaat 27491370  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  27491369 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagc 27491271  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27491270 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 27491171  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    || | || || |||| |||  | |||||||||||||||||||| || |||||    
T  27491170 acggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtataggagctt 27491119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 28 - 376
Target Start/End: Original strand, 16937895 - 16938243
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  16937895 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgttt 16937994  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  16937995 caagcattgccattatcaaaatagaaggaaaataatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttg 16938092  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16938093 atgtataagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 16938192  T
Q  327 cattacatttccc-aaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatg 376  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16938193 cattacatttcccaaaaaactttgaattcgcaagtacaaaagcttcagatg 16938243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Original strand, 30551870 - 30552212
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30551870 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 30551969  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  30551970 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattg 30552068  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552069 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 30552168  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    ||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  30552169 cattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctt 30552212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 370
Target Start/End: Original strand, 33370293 - 33370643
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  33370293 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggttcgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaat 33370392  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33370393 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgctttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 33370491  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33370492 tcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 33370591  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    || | || || |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370592 acggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 33370643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16680476 - 16680135
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680476 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgtcgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 16680377  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatttagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  16680376 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaag 16680278  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16680277 ctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgacggcgtgactccacggattttcaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 16680178  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagt 360  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  16680177 cacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagt 16680135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 34 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 4531609 - 4531274
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4531609 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 4531511  T
Q  133 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 232  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4531510 ttgtcattatcaaaatggaaagagaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtat 4531412  T
Q  233 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattac 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  4531411 aagagtggtgatcagccgaaggcacgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgac 4531312  T
Q  333 atttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4531311 atttcccagaaacttcgaattcacaagtacagaagctt 4531274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27200522 - 27200172
Alignment:
Q  21 acatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-aatg 119  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27200522 acatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaagaatg 27200423  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | ||    
T  27200422 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aatcaaaagcacaagc 27200325  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27200324 tcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaa 27200225  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27200224 cacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagctt 27200172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 21 - 370
Target Start/End: Original strand, 27248711 - 27249061
Alignment:
Q  21 acatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-aatg 119  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27248711 acatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaagaatg 27248810  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | ||    
T  27248811 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aatcaaaagcacaagc 27248908  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27248909 tcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaa 27249008  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27249009 cacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagctt 27249061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Original strand, 26772499 - 26772840
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26772499 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgtttttcaaaatagacaaaaagttttcaatcttcaaaaatgtttgttt 26772598  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  26772599 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattg 26772696  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26772697 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 26772796  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    || ||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26772797 cactacatttcttagaaactttgaatccacaagtgcagaagctt 26772840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 29579342 - 29579018
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29579342 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaatgtttgttt 29579243  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  29579242 caagcattgtcattatcaagatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattg 29579145  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579144 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 29579045  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaatt 353  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||    
T  29579044 cattacatttcctggaaactttgaatt 29579018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Original strand, 4539628 - 4539971
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539628 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 4539727  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagt-agaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||    
T  4539728 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttg 4539826  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagcaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  4539827 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaa 4539926  T
Q  326 tcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
     || |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539927 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 4539971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4779203 - 4778877
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4779203 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 4779105  T
Q  133 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagcttt-gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4779104 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcgtatacagcttttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgta 4779006  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatt 330  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4779005 taagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatt 4778906  T
Q  331 acatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  4778905 acatttcctgaaaactttgaattcgcaag 4778877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26792144 - 26791813
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26792144 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 26792045  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26792044 caagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcacaagctcaaattg 26791946  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26791945 acgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgattccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 26791846  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  26791845 catgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 26791813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 29555894 - 29555532
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  29555894 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgttcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagcttttaattttctaaaat 29555795  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||| || ||||||||| | ||    
T  29555794 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-cagacaaaagcacaagc 29555696  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29555695 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 29555596  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    |||| ||||| |||||||||   ||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||    
T  29555595 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagatg 29555532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 29507754 - 29507413
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29507754 gacatcaacatactctcgctcatgcatgttccatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 29507655  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||  |||| ||||||||||||||| |     
T  29507654 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaa 29507556  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29507555 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 29507456  T
Q  317 acacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  29507455 acacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 29507413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28213783 - 28213440
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28213783 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgctcaggcttgcttttcaaaacacacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 28213684  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||    
T  28213683 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttg 28213585  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagcaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  28213584 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaa 28213485  T
Q  326 tcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
     || |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28213484 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 28213440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Original strand, 22928743 - 22929107
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  22928743 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctattgctcaggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 22928842  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  22928843 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcatag 22928941  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattga 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22928942 gctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 22929041  T
Q  317 acacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    |||||| ||||| |||||||||   ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22929042 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaagcttcagatgaagatg 22929107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 38 - 353
Target Start/End: Original strand, 13292831 - 13293140
Alignment:
Q  38 ctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtc 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  13292831 ctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatc 13292925  T
Q  138 attatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13292926 attatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagag 13293024  T
Q  238 tggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttc 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13293025 tggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttc 13293124  T
Q  338 ccaaaaactttgaatt 353  Q
    | | ||||||||||||    
T  13293125 ctagaaactttgaatt 13293140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 50 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26927073 - 26926765
Alignment:
Q  50 tcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26927073 tcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaat 26926974  T
Q  149 agaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagc 248  Q
    |||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26926973 agaaggaaaataaattgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagc 26926876  T
Q  249 cgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaacttt 348  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||    
T  26926875 cgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaacttt 26926776  T
Q  349 gaattcacaag 359  Q
    |||||| ||||    
T  26926775 gaattcgcaag 26926765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27014062 - 27013730
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||  ||||||||||||||||||    
T  27014062 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatg 27013969  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||    
T  27013968 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagct 27013870  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27013869 caaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 27013770  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  27013769 cagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 27013730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 14139262 - 14139595
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     ||||  ||||||||||||||||||    
T  14139262 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccatgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatg 14139356  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||    
T  14139357 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagct 14139455  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14139456 caaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 14139555  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  14139556 cagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaag 14139595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27031342 - 27031020
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27031342 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaaaa----aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 27031248  T
Q  134 t-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||||||  |||  || ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27031247 ttgtcattattaaaatagaaggaaaatgttttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 27031149  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27031148 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaatacagcaatcatt 27031049  T
Q  331 acatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27031048 acatttcctagaaactttgaattcacaag 27031020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 26666528 - 26666774
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26666528 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgtttttcaaaatagacaaaaagttttcaatcttcaaaaatgtttgttt 26666627  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26666628 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattg 26666725  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaa 275  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26666726 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaa 26666774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27209236 - 27208901
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||       ||  |||||||||||||| |||    
T  27209236 gacatcaacatactctcgctcatgcacgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatg 27209145  T
Q  120 tttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa---tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaa 214  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||     
T  27209144 tttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcac 27209046  T
Q  215 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacatt 314  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27209045 acgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacatt 27208946  T
Q  315 gaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  27208945 gaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 27208901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 27239992 - 27240327
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||       ||  |||||||||||||| |||    
T  27239992 gacatcaacatactctcgctcatgcacgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatg 27240083  T
Q  120 tttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa---tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaa 214  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||     
T  27240084 tttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcac 27240182  T
Q  215 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacatt 314  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27240183 acgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacatt 27240282  T
Q  315 gaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  27240283 gaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 27240327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24870026 - 24869707
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24870026 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 24869935  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24869934 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 24869836  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24869835 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatg 24869736  T
Q  331 acatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  24869735 acatttcctagaaactttgaattcgcaag 24869707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27025460 - 27025142
Alignment:
Q  37 gctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-g 135  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |    
T  27025460 gctcatgcatgtctcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttg 27025368  T
Q  136 tcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt--gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 232  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||  || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27025367 tcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtat 27025269  T
Q  233 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattac 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27025268 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattac 27025169  T
Q  333 atttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||| | | ||||||||||| ||||    
T  27025168 atttcctagagactttgaattcgcaag 27025142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Original strand, 24299636 - 24299956
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca- 132  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||| | ||||     
T  24299636 ctcgcttatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttactcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgttccgagcat 24299729  T
Q  133 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    |||||||||| |||| |||| | ||| | |||||||  || |||||| |||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24299730 ttgtcattattaaaaaagaagggaaacgtttttgtacataactttgagagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 24299828  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24299829 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtgatacattgaacacaacaatcatta 24299928  T
Q  332 catttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  24299929 catttcctagaaactttgaattcgcaag 24299956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Original strand, 15406403 - 15406730
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||   ||| |||||||| | |||||||||||    
T  15406403 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aactttttccaattttccagatgtttgtttc 15406495  T
Q  128 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
     |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15406496 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacatatctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaat 15406594  T
Q  225 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15406595 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagc 15406694  T
Q  324 aatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||| |||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  15406695 aatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaag 15406730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Original strand, 15418190 - 15418517
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||   ||| |||||||| | |||||||||||    
T  15418190 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aactttttccaattttccagatgtttgtttc 15418282  T
Q  128 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
     |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15418283 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacatatctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaat 15418381  T
Q  225 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15418382 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagc 15418481  T
Q  324 aatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||| |||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  15418482 aatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaag 15418517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 34 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20174881 - 20174589
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagaca-aaaagttttcaat------tttcaaaatgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| || |  ||      ||| | |||||||||||    
T  20174881 ctcgctcatgcatgtttcacttgaaagtaccttgttgctaaggtttgcttttcaaaatagacagaaaacttcttgatatttttttttagaatgtttgttt 20174782  T
Q  127 -caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagta--gaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaa 222  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| |||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  20174781 tcaagcattgtcatcatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacataactttggaagtaaagagaaaaaatagagttt-caaacaaaagcacagactcaa 20174683  T
Q  223 attgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20174682 attgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 20174589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 34 - 316
Target Start/End: Original strand, 22161110 - 22161402
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagaca-aaaagttttcaat------tttcaaaatgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| || |  ||      ||| | |||||||||||    
T  22161110 ctcgctcatgcatgtttcacttgaaagtaccttgttgctaaggtttgcttttcaaaatagacagaaaacttcttgatatttttttttagaatgtttgttt 22161209  T
Q  127 -caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagta--gaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaa 222  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| |||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  22161210 tcaagcattgtcatcatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacataactttggaagtaaagagaaaaaatagagttt-caaacaaaagcacagactcaa 22161308  T
Q  223 attgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22161309 attgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 22161402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 280 - 382
Target Start/End: Original strand, 23851450 - 23851552
Alignment:
Q  280 tggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatg 379  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||   ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  23851450 tggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaagcttcagatgaag 23851549  T
Q  380 atg 382  Q
    |||    
T  23851550 atg 23851552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 39856985 - 39856630
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856985 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 39856886  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  39856885 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-agagtttt-aaacaaaagcaaaggct 39856788  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39856787 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 39856688  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 377  Q
    ||| || || |||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856687 cagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 39856630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 20332337 - 20332677
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332337 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 20332436  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332437 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 20332536  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20332537 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 20332636  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  20332637 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 20332677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 40099551 - 40099891
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099551 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 40099650  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40099651 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggc 40099750  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40099751 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 40099850  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  40099851 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 40099891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 27157227 - 27157568
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157227 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 27157326  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaa-atagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27157327 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 27157426  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27157427 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 27157526  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  27157527 cacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 27157568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 24586276 - 24586616
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586276 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctattgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 24586375  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24586376 tttgtttcgagcattgtccttatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggct 24586475  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  24586476 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaac 24586575  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  24586576 acatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 24586616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5012220 - 5011870
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5012220 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtgccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgttt 5012121  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  5012120 caagcattgccattatccaagtagaaagaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaagtagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttg 5012022  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatctt-attggttggtggtacattgaacacagcaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5012021 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaa 5011922  T
Q  326 tcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5011921 tcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 5011870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14104892 - 14104553
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104892 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 14104793  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| | |||    
T  14104792 tttgtttcaagcattgtcattaccaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaagaaaacagagtttt-aaacaaaagcacaagct 14104694  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14104693 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 14104594  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagt 360  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  14104593 cagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagt 14104553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 30760112 - 30759774
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30760112 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaagtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 30760013  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30760012 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggct 30759915  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30759914 caatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 30759815  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagt 360  Q
    ||| |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  30759814 cagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagt 30759774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 33667718 - 33668056
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33667718 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaagtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 33667817  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33667818 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggct 33667915  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33667916 caatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 33668015  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagt 360  Q
    ||| |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  33668016 cagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagt 33668056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 54839740 - 54839402
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54839740 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 54839641  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||    
T  54839640 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttt-caagcaaaagcacaggc 54839543  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54839542 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 54839443  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||| |||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  54839442 acagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag 54839402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5700890 - 5700551
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5700890 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaat 5700791  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||    
T  5700790 gttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagc 5700693  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5700692 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaa 5700593  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5700592 cacagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaattcgcaag 5700551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Original strand, 18794540 - 18794882
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18794540 catactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaagaatgtttgttt 18794639  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18794640 caagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaatttg 18794738  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||     
T  18794739 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaac 18794838  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    || |||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794839 cactacagtttttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 18794882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Original strand, 34182893 - 34183216
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34182893 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 34182990  T
Q  133 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34182991 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtat 34183089  T
Q  233 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattac 332  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  34183090 aagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgac 34183189  T
Q  333 atttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  34183190 atttcccagaaactttgaattcgcaag 34183216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Original strand, 14753423 - 14753747
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagc 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14753423 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagc 14753521  T
Q  132 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  14753522 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgta 14753619  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  14753620 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatga 14753719  T
Q  332 catttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14753720 catttcccagaaactttgaattcgcaag 14753747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21976046 - 21975704
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21976046 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 21975947  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||  || |||||||||    
T  21975946 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcgcagtctcaaattg 21975848  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975847 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 21975748  T
Q  327 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    ||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  21975747 cattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctt 21975704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Original strand, 31120433 - 31120776
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttt-aaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31120433 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgttt 31120532  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  31120533 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaatt 31120631  T
Q  226 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31120632 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaa 31120731  T
Q  326 tcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    |||||||||||||    ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31120732 tcattacatttcctgggaacttcgaatccacaagtacagaagctt 31120776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24118998 - 24118674
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24118998 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctccggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 24118900  T
Q  133 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24118899 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-cagacaaaagcacaagctcaaattgatgtat 24118801  T
Q  233 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattac 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24118800 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgac 24118701  T
Q  333 atttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24118700 atttcccagaaactttgaattcgcaag 24118674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Original strand, 36338455 - 36338772
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36338455 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcat 36338547  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtata 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  36338548 tatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtata 36338646  T
Q  234 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattaca 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  36338647 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggcggtacattgaacacagtaatcatgaca 36338746  T
Q  334 tttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    | ||| | ||||||||||||| ||||    
T  36338747 tctcctagaaactttgaattcgcaag 36338772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 34 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6576190 - 6575879
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576190 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaag------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 6576098  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtata 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  6576097 tatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtata 6575999  T
Q  234 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattaca 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  6575998 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatcaca 6575899  T
Q  334 tttcccaaaaactttgaatt 353  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  6575898 tttcctagaaactttgaatt 6575879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 1906607 - 1906240
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaa 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||| |    
T  1906607 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttcaaaa-tagacaaaaaactttttcaattttcaaga 1906509  T
Q  118 tgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgttt----tgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagc 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||  | |||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||    
T  1906508 tgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcttttgtacatggctttgaaagtagaaagatagtagagttt-caaacaaaagc 1906410  T
Q  213 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtaca 312  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1906409 acagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagatatacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 1906310  T
Q  313 ttgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||| |||| |||  |||||| ||||| ||||    
T  1906309 ttgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacatgagcttctgatgaagatg 1906240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15234170 - 15233816
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaag------ttttcaattttc 113  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||       ||||||| ||||    
T  15234170 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgcccaggtttgctttcaaaa-tagacaaaaaaaaaactttttcaagtttc 15234072  T
Q  114 aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagca 213  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||    
T  15234071 aagatgtttgcttcaagcattgtcattatcaagataaaaagaaatttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagca 15233973  T
Q  214 aaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15233972 aaggctcaaattgatgtataagagtggtggttagccgaaggcgtgactctacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacat 15233873  T
Q  314 tgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    || ||| || || || ||||||||| | ||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  15233872 tggacatagtaaccactacatttcctataaactttgaattcgcaagcacaaaagctt 15233816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 28 - 382
Target Start/End: Original strand, 15276552 - 15276909
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagtttt---caattttcaaaatgtttgt 124  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||    
T  15276552 catacgctcactcatgcacgtttcgtttgaacgtaccttgttgctcaagtttactttcaaaac-agacaaaaactttttttcaattttcaagatgtttgt 15276650  T
Q  125 ttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  15276651 ttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtagagagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcga 15276749  T
Q  223 attgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacag 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15276750 attgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacgg 15276849  T
Q  323 caatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
     || || ||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  15276850 taaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatgaagatg 15276909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 382
Target Start/End: Original strand, 15380161 - 15380515
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||| ||||  | |||||| |||||||||||    
T  15380161 catacgctcgctcatgcacgtttcgtttgaatgtaccttgttgctcaggcttgctttcaaaac-agacaaaaacttttttaatttcaagatgtttgtttc 15380259  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  15380260 aagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcgaatt 15380358  T
Q  226 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaacacagcaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  15380359 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacgataa 15380458  T
Q  326 tcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
     || |||||||||   ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  15380459 ccactacatttccttgaaactttgaattcgcaagcacaaaagcttcggatgaagatg 15380515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1674213 - 1673877
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaa 117  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||| |    
T  1674213 gacatcaacacacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaagtttgctttcaaaa-tagacaaaaaactttttcaattttcaaga 1674115  T
Q  118 tgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaa 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||  | |||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||||     
T  1674114 tgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttttgtacatggctttgaaagtagaaagatagtagagttt-caaacaaaagcac 1674016  T
Q  215 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacatt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  1674015 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggagtgacaccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtatatt 1673916  T
Q  315 gaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaatt 353  Q
    |||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||    
T  1673915 gaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaatt 1673877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 34 - 280
Target Start/End: Original strand, 36324246 - 36324484
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36324246 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcat 36324338  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtata 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  36324339 tatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtata 36324437  T
Q  234 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagctt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36324438 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagctt 36324484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14671349 - 14671027
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14671349 ctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 14671256  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtt-ttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||  || ||||||||||| ||  |||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14671255 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttcttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacgggctcaaattgatgt 14671157  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14671156 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcat 14671057  T
Q  330 tacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  14671056 tacatttcctagaaactttgaattcacaag 14671027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17019384 - 17019063
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||  ||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  17019384 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattctcaagatgtttgtttcgagcat 17019292  T
Q  134 t-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagcttt-gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||| ||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17019291 ttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtacatagcttttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcataggctcaaattgatgt 17019193  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17019192 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagtaatcat 17019093  T
Q  330 tacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  17019092 tacatttcctagaaactttgaattcgcaag 17019063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 9557 - 9895
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9557 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 9656  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  9657 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagct 9755  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  9756 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaaca 9855  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  9856 cagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 9895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Original strand, 3094 - 3458
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3094 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 3193  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3194 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 3293  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3294 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 3393  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||||| ||||| |||||||||   ||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||    
T  3394 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagatg 3458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18147 - 17949
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18147 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 18048  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18047 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaag 17949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12374 - 12036
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12374 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 12275  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12274 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttatatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 12176  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12175 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 12076  T
Q  320 cagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||| ||||| |||||||||   ||| ||||||||| ||||    
T  12075 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaag 12036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 8844 - 9182
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8844 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaat 8943  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||    
T  8944 gttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagc 9041  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9042 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 9141  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9142 acagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaattcgcaag 9182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18926 - 18585
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttc---aaa 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  18926 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 18827  T
Q  117 atgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  18826 atgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaa 18729  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18728 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 18629  T
Q  316 aacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  18628 aacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 18585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 4518 - 4860
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  4518 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 4617  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  4618 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaag 4716  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattgg-ttggtggtacattg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  4717 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggtttggtggtacattg 4816  T
Q  316 aacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  4817 aacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaag 4860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10252 - 9914
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10252 gacatcaacatactctcgcttatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 10153  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10152 gtttgtttcaaacattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggc 10055  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10054 tcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcatggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaac 9955  T
Q  319 acagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  9954 acagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaag 9914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33619 - 33297
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33619 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttacaaaaa----aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 33525  T
Q  134 t-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33524 ttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 33426  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  33425 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacaacaatcatt 33326  T
Q  331 acatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  33325 acatttcctagaaactttgaattcgcaag 33297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 1988 - 1634
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1988 catactctcgctcatgcatgtttcatttgatcgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaagtaaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 1889  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1888 caagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattg 1791  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagcaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1790 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaa 1691  T
Q  326 tcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||| |||||||||   ||| |||||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||    
T  1690 tcactacatttcctggaaattttgaattcataagcacagaaacttctgatgaagatg 1634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 12396 - 12023
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  12396 gacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttcaaaa-tagacaaaaactttttcaattttcaagat 12298  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtattt-----------agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaaca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||           ||||||||||||||||  | | |||||||| ||||||    
T  12297 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagcaaatgtttttttttttttttttacatagctttgaaagtagaaagatagtagagttt-caaaca 12199  T
Q  208 aaagcaaaggctcaaa-ttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggt 306  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12198 aaagcacaggctcaaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggt 12099  T
Q  307 ggtacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||   ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12098 ggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgagttcgcaagtacagaagcttctgatgaagatg 12023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14281 - 13938
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14281 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgctcaggcttgcttttcaaaacacacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 14182  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||    
T  14181 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttg 14083  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagcaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  14082 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaa 13983  T
Q  326 tcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
     || |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13982 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 13938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15915 - 15558
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttta-aaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa- 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15915 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaa 15816  T
Q  118 -----tgtttgtttcaagcattgtcattatc-aaaatagaaagaaaatgttttgtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaag 211  Q
         |||||||||| |||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15815 aaaaatgtttgtttcgagcattgtcatcgtttaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaag 15717  T
Q  212 caaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtac 311  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15716 caaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtac 15617  T
Q  312 attgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    ||||||||| | || || |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15616 attgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 15558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 25454 - 25092
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaag-------ttttcaattttcaaaatgt 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||        |||||||||||||| ||||    
T  25454 catacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgctcaggtttgctttcaaaac-agacaaaaaacttttttttttcaattttcaagatgt 25356  T
Q  121 ttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   |||  |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||  |||    
T  25355 ttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagataatgttttttcgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcgcagg 25257  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25256 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaa 25157  T
Q  318 cacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    ||| | || || ||||||||| | ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  25156 cacggtaaccactacatttcctagaaactttgaatttgcaagcacagaagcttctgatgaagatg 25092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6388 - 6066
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6388 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcat 6296  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgt--atttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 229  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |  |  || ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||    
T  6295 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgaacataactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaatatgatg 6197  T
Q  230 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagcaatca 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6196 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttactggttggtggtacattgaacacagcaatca 6097  T
Q  329 ttacatttcccaaaaactttgaattcacaag 359  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  6096 ttacatttcctagaaactttgaattcgcaag 6066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 34 - 353
Target Start/End: Original strand, 24835 - 25150
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||      |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24835 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggttttcttttcaaaa------aaaaattttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 24927  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatttagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24928 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 25026  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-tcttattggttggtggtacattgaacacagcaatcat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25027 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacccagcaatcat 25126  T
Q  330 tacatttcccaaaaactttgaatt 353  Q
    ||||||||| | ||||||||||||    
T  25127 tacatttcctagaaactttgaatt 25150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 199 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 537 - 366
Alignment:
Q  199 tttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttat 298  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  537 tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttat 438  T
Q  299 tggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagctt 370  Q
    |||||||||||||||||||||| | || || |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  437 tggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctt 366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 215 - 382
Target Start/End: Original strand, 26243 - 26410
Alignment:
Q  215 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatcttattggttggtggtacatt 314  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  26243 aggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcacagatttacaaagcttgaaaaatggaaattttatttgttggtggtacatt 26342  T
Q  315 gaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgatgatg 382  Q
    || ||| | || || ||||||||| | ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  26343 gagcacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattagcaagcacagaagcttctgatgaagatg 26410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 126 - 1
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttaaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  126 gacatcaacatacacttgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgc-tttcaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 28  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaa 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27 gtttgtttcaagcattgtcattatcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 353
Target Start/End: Original strand, 40759 - 40898
Alignment:
Q  221 aaattgatgtataagagtggtggtc-agccgaaggcgtgactcc-acggattcac-aaagcttgg-aaaatggtaa-tcttattggttggtggtac-att 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  40759 aaattgatgtataagagtggtggtcaagccgaaggcgtgactccaacggatttacaaaagcttggaaaaatggtaatttttattggttggtggtacaatt 40858  T
Q  315 g-aacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaatt 353  Q
    | |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  40859 gaaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaatt 40898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 80
Target Start/End: Original strand, 40559 - 40606
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatg-tttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttg 80  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40559 ctcgctcatgcattatttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttg 40606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University