View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17134_low_43 (Length: 407)

Name: NF17134_low_43
Description: NF17134
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17134_low_43
NF17134_low_43
[»] chr5 (67 HSPs)
chr5 (47-407)||(39572819-39573179)
chr5 (47-407)||(19119859-19120227)
chr5 (47-407)||(7693230-7693589)
chr5 (47-407)||(38528044-38528411)
chr5 (48-407)||(32563150-32563508)
chr5 (49-407)||(5837557-5837923)
chr5 (47-407)||(8741692-8742062)
chr5 (47-407)||(12910350-12910723)
chr5 (47-401)||(9200233-9200586)
chr5 (47-407)||(31786453-31786821)
chr5 (47-407)||(36866762-36867130)
chr5 (47-407)||(40133385-40133753)
chr5 (47-407)||(30969131-30969499)
chr5 (49-401)||(25500739-25501099)
chr5 (47-407)||(22019632-22019991)
chr5 (48-407)||(22980794-22981161)
chr5 (48-407)||(31705419-31705785)
chr5 (47-407)||(27330306-27330672)
chr5 (47-407)||(36860423-36860792)
chr5 (47-407)||(35511289-35511652)
chr5 (47-407)||(23116037-23116397)
chr5 (49-407)||(699152-699518)
chr5 (47-407)||(35826293-35826658)
chr5 (47-407)||(15724490-15724856)
chr5 (47-407)||(35933902-35934264)
chr5 (47-407)||(22973889-22974257)
chr5 (60-407)||(33908246-33908600)
chr5 (47-407)||(22255181-22255550)
chr5 (49-407)||(7208671-7209037)
chr5 (89-407)||(42342775-42343089)
chr5 (48-407)||(28416358-28416696)
chr5 (126-407)||(15992347-15992636)
chr5 (47-407)||(17157838-17158208)
chr5 (60-407)||(27318295-27318649)
chr5 (47-407)||(5829897-5830261)
chr5 (47-407)||(24886102-24886455)
chr5 (118-407)||(35504436-35504733)
chr5 (51-407)||(8436970-8437333)
chr5 (47-407)||(21088576-21088941)
chr5 (49-280)||(26268076-26268307)
chr5 (47-390)||(1428983-1429320)
chr5 (47-407)||(8466745-8467094)
chr5 (104-366)||(6824329-6824599)
chr5 (47-289)||(5112247-5112488)
chr5 (60-401)||(43308473-43308814)
chr5 (47-389)||(13956187-13956520)
chr5 (194-407)||(25669733-25669944)
chr5 (198-407)||(2888252-2888469)
chr5 (117-407)||(23954609-23954895)
chr5 (47-407)||(14919346-14919704)
chr5 (47-239)||(14409310-14409501)
chr5 (288-407)||(14409148-14409267)
chr5 (84-202)||(25668687-25668804)
chr5 (288-407)||(25889619-25889738)
chr5 (338-407)||(43254154-43254223)
chr5 (304-407)||(26269074-26269177)
chr5 (60-184)||(11898015-11898139)
chr5 (47-132)||(26317774-26317859)
chr5 (47-124)||(16004474-16004552)
chr5 (47-95)||(22616494-22616542)
chr5 (47-92)||(26411293-26411338)
chr5 (48-95)||(10237415-10237462)
chr5 (48-95)||(21320752-21320799)
chr5 (80-131)||(22255608-22255659)
chr5 (61-95)||(5748442-5748476)
chr5 (48-94)||(35504168-35504214)
chr5 (47-92)||(25513771-25513816)
[»] chr7 (66 HSPs)
chr7 (61-407)||(22687228-22687574)
chr7 (47-407)||(37109847-37110217)
chr7 (47-407)||(5657299-5657667)
chr7 (47-403)||(8861260-8861624)
chr7 (47-407)||(21991611-21991970)
chr7 (47-407)||(18797304-18797670)
chr7 (47-407)||(4582894-4583262)
chr7 (47-407)||(6546494-6546862)
chr7 (47-407)||(15612577-15612944)
chr7 (47-400)||(30055501-30055863)
chr7 (47-395)||(12165727-12166074)
chr7 (47-407)||(17842402-17842772)
chr7 (47-407)||(27283719-27284088)
chr7 (47-407)||(32820871-32821239)
chr7 (47-407)||(9355644-9356012)
chr7 (47-407)||(32432432-32432795)
chr7 (49-407)||(11071182-11071546)
chr7 (49-407)||(25691362-25691729)
chr7 (47-403)||(31578886-31579255)
chr7 (48-407)||(24211717-24212085)
chr7 (47-407)||(41764896-41765264)
chr7 (47-407)||(37346997-37347364)
chr7 (49-407)||(23111167-23111535)
chr7 (191-407)||(26587910-26588126)
chr7 (47-406)||(10359033-10359400)
chr7 (47-407)||(7334769-7335136)
chr7 (48-370)||(33688117-33688446)
chr7 (47-354)||(43686016-43686330)
chr7 (63-405)||(48928117-48928466)
chr7 (47-407)||(31520559-31520909)
chr7 (74-407)||(26980325-26980649)
chr7 (73-407)||(29173541-29173865)
chr7 (47-407)||(10481578-10481948)
chr7 (48-335)||(38258521-38258816)
chr7 (167-407)||(15672577-15672828)
chr7 (49-291)||(27421322-27421563)
chr7 (141-400)||(44598735-44599002)
chr7 (133-407)||(37703316-37703590)
chr7 (84-407)||(35353120-35353451)
chr7 (79-407)||(43925113-43925438)
chr7 (47-241)||(12390622-12390816)
chr7 (180-407)||(46480947-46481182)
chr7 (49-259)||(44413353-44413564)
chr7 (48-280)||(48928517-48928748)
chr7 (156-291)||(37704241-37704376)
chr7 (288-407)||(37704406-37704525)
chr7 (288-407)||(44411358-44411477)
chr7 (288-407)||(12390467-12390586)
chr7 (288-407)||(34361996-34362115)
chr7 (47-196)||(26524364-26524513)
chr7 (97-391)||(32593040-32593324)
chr7 (79-241)||(38053493-38053647)
chr7 (47-177)||(34362205-34362334)
chr7 (352-407)||(38258867-38258922)
chr7 (307-371)||(27421219-27421283)
chr7 (86-145)||(44598378-44598437)
chr7 (288-354)||(38053685-38053751)
chr7 (47-92)||(241024-241069)
chr7 (49-111)||(8299192-8299254)
chr7 (50-94)||(34095888-34095932)
chr7 (47-143)||(37704143-37704239)
chr7 (60-93)||(46481217-46481250)
chr7 (49-101)||(3953733-3953785)
chr7 (50-94)||(6444198-6444242)
chr7 (47-95)||(8133561-8133609)
chr7 (47-95)||(23402371-23402419)
[»] chr8 (61 HSPs)
chr8 (47-407)||(38643977-38644345)
chr8 (47-407)||(6098336-6098709)
chr8 (47-407)||(5299769-5300137)
chr8 (47-407)||(36694789-36695157)
chr8 (49-407)||(465843-466199)
chr8 (47-407)||(16446698-16447066)
chr8 (73-400)||(11727049-11727384)
chr8 (47-401)||(9864147-9864509)
chr8 (47-407)||(27082661-27083029)
chr8 (53-407)||(37970342-37970704)
chr8 (47-407)||(34894966-34895329)
chr8 (47-407)||(12876108-12876477)
chr8 (47-403)||(1204926-1205290)
chr8 (47-407)||(43643418-43643786)
chr8 (47-354)||(13307622-13307936)
chr8 (47-407)||(40862418-40862787)
chr8 (47-407)||(16222862-16223230)
chr8 (47-407)||(23854254-23854622)
chr8 (118-407)||(1149455-1149752)
chr8 (47-407)||(8803639-8803997)
chr8 (47-407)||(44869495-44869864)
chr8 (49-407)||(7890780-7891137)
chr8 (47-407)||(39098942-39099300)
chr8 (47-407)||(10555028-10555393)
chr8 (47-407)||(30654406-30654774)
chr8 (48-407)||(31933709-31934076)
chr8 (47-241)||(34952028-34952222)
chr8 (47-398)||(33906223-33906568)
chr8 (124-407)||(1953811-1954104)
chr8 (229-407)||(24823217-24823395)
chr8 (48-407)||(35459534-35459888)
chr8 (173-407)||(4132509-4132750)
chr8 (74-291)||(41910935-41911153)
chr8 (47-253)||(1150090-1150296)
chr8 (47-240)||(41362517-41362707)
chr8 (288-407)||(12587830-12587949)
chr8 (194-407)||(18259229-18259446)
chr8 (288-407)||(34951880-34951999)
chr8 (288-407)||(35859182-35859301)
chr8 (79-289)||(43025733-43025943)
chr8 (288-394)||(1149756-1149862)
chr8 (295-407)||(33198057-33198169)
chr8 (155-241)||(7998401-7998488)
chr8 (341-407)||(41362723-41362789)
chr8 (340-407)||(43025974-43026041)
chr8 (47-111)||(15009241-15009305)
chr8 (147-236)||(33197948-33198029)
chr8 (288-361)||(34463722-34463792)
chr8 (47-163)||(4133085-4133199)
chr8 (47-132)||(24823378-24823463)
chr8 (49-96)||(35735983-35736030)
chr8 (53-95)||(23176763-23176805)
chr8 (47-95)||(4108912-4108960)
chr8 (47-113)||(33197891-33197957)
chr8 (47-92)||(1835392-1835437)
chr8 (47-92)||(1879233-1879278)
chr8 (50-95)||(5018013-5018058)
chr8 (54-95)||(8151412-8151453)
chr8 (229-273)||(12585297-12585341)
chr8 (47-95)||(28220955-28221003)
chr8 (47-95)||(41191019-41191066)
[»] chr1 (67 HSPs)
chr1 (47-407)||(1547283-1547635)
chr1 (73-407)||(27532794-27533134)
chr1 (47-407)||(2959744-2960112)
chr1 (47-407)||(38823210-38823578)
chr1 (60-407)||(47279198-47279553)
chr1 (47-407)||(10181819-10182188)
chr1 (47-407)||(16415641-16416010)
chr1 (49-407)||(238325-238690)
chr1 (47-407)||(7078875-7079254)
chr1 (47-407)||(15382929-15383298)
chr1 (47-407)||(3534928-3535287)
chr1 (47-407)||(34012194-34012557)
chr1 (66-407)||(9902866-9903215)
chr1 (47-407)||(32267030-32267398)
chr1 (76-400)||(51128884-51129216)
chr1 (49-407)||(15752027-15752393)
chr1 (47-407)||(27227297-27227657)
chr1 (47-407)||(19899580-19899949)
chr1 (47-396)||(30326775-30327132)
chr1 (47-407)||(8222127-8222492)
chr1 (60-407)||(37451295-37451649)
chr1 (47-407)||(42721035-42721400)
chr1 (47-405)||(3309144-3309515)
chr1 (47-407)||(11742180-11742530)
chr1 (47-405)||(18422647-18423006)
chr1 (84-407)||(32216088-32216419)
chr1 (60-407)||(4330288-4330645)
chr1 (60-407)||(28564595-28564948)
chr1 (47-407)||(15168085-15168460)
chr1 (47-407)||(23999343-23999712)
chr1 (47-407)||(27267012-27267376)
chr1 (47-407)||(39393379-39393748)
chr1 (47-407)||(30254420-30254787)
chr1 (48-407)||(10922724-10923091)
chr1 (47-407)||(47682306-47682673)
chr1 (60-407)||(14758050-14758396)
chr1 (49-407)||(27563717-27564084)
chr1 (49-407)||(28769651-28770017)
chr1 (49-407)||(41926161-41926520)
chr1 (47-261)||(48620633-48620847)
chr1 (129-407)||(25160710-25160997)
chr1 (79-407)||(46931439-46931774)
chr1 (79-407)||(40884841-40885177)
chr1 (47-407)||(31621360-31621733)
chr1 (79-407)||(27763122-27763458)
chr1 (47-391)||(37618729-37619076)
chr1 (146-407)||(22170806-22171075)
chr1 (49-347)||(33725472-33725778)
chr1 (243-407)||(48353735-48353906)
chr1 (288-407)||(1359747-1359866)
chr1 (290-407)||(21289847-21289964)
chr1 (132-356)||(38759610-38759846)
chr1 (47-195)||(21289661-21289816)
chr1 (288-407)||(31962861-31962981)
chr1 (47-142)||(30254854-30254948)
chr1 (47-113)||(22170750-22170816)
chr1 (353-407)||(33725423-33725478)
chr1 (47-95)||(13876919-13876967)
chr1 (47-95)||(16132475-16132523)
chr1 (50-94)||(45319610-45319654)
chr1 (87-177)||(1359933-1360022)
chr1 (47-92)||(4150490-4150535)
chr1 (50-95)||(42663785-42663830)
chr1 (47-92)||(47279159-47279204)
chr1 (370-407)||(48620916-48620953)
chr1 (47-95)||(26970261-26970309)
chr1 (47-95)||(43579242-43579290)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (47-407)||(4318638-4319007)
chr6 (47-407)||(3879755-3880123)
chr6 (47-407)||(33892828-33893186)
chr6 (49-407)||(29182165-29182529)
chr6 (47-407)||(1945833-1946203)
chr6 (47-407)||(8513233-8513589)
chr6 (50-407)||(6090998-6091363)
chr6 (47-407)||(5627391-5627760)
chr6 (47-407)||(7234848-7235218)
chr6 (48-407)||(20768087-20768450)
chr6 (60-407)||(21016934-21017283)
chr6 (49-407)||(6088910-6089264)
chr6 (49-325)||(30353256-30353540)
chr6 (73-291)||(15491641-15491859)
chr6 (47-407)||(33618834-33619201)
chr6 (47-280)||(7055166-7055399)
chr6 (300-407)||(7054588-7054696)
chr6 (47-178)||(18498433-18498565)
chr6 (365-407)||(33724075-33724117)
chr6 (47-95)||(19631749-19631797)
chr6 (50-92)||(4488589-4488631)
chr6 (50-92)||(25440961-25441003)
chr6 (48-96)||(3005392-3005440)
chr6 (47-95)||(11084152-11084200)
[»] chr3 (74 HSPs)
chr3 (47-407)||(4015451-4015818)
chr3 (47-400)||(7327306-7327668)
chr3 (47-401)||(34132926-34133288)
chr3 (49-407)||(46297579-46297945)
chr3 (47-407)||(52040739-52041108)
chr3 (47-407)||(37203058-37203427)
chr3 (47-407)||(37157699-37158067)
chr3 (47-400)||(26941084-26941445)
chr3 (47-407)||(39282644-39283011)
chr3 (47-407)||(44891498-44891856)
chr3 (60-407)||(29099359-29099705)
chr3 (97-400)||(42505899-42506210)
chr3 (47-407)||(2007925-2008298)
chr3 (47-407)||(3655016-3655387)
chr3 (47-407)||(40552076-40552444)
chr3 (47-407)||(44186334-44186686)
chr3 (47-407)||(21193597-21193966)
chr3 (47-407)||(22450959-22451327)
chr3 (50-391)||(32373466-32373813)
chr3 (47-407)||(11466815-11467169)
chr3 (60-407)||(53228969-53229325)
chr3 (47-407)||(48354932-48355300)
chr3 (49-407)||(24707932-24708295)
chr3 (47-407)||(33378602-33378967)
chr3 (48-407)||(25579731-25580098)
chr3 (47-407)||(47481513-47481882)
chr3 (79-407)||(3362276-3362614)
chr3 (106-407)||(14586497-14586796)
chr3 (60-407)||(24488779-24489134)
chr3 (170-407)||(22622535-22622780)
chr3 (47-407)||(4761465-4761836)
chr3 (47-363)||(45174494-45174821)
chr3 (62-407)||(11357198-11357535)
chr3 (168-399)||(33698265-33698504)
chr3 (50-407)||(22445882-22446247)
chr3 (79-407)||(21009618-21009955)
chr3 (47-280)||(35844317-35844550)
chr3 (47-395)||(46994490-46994835)
chr3 (60-407)||(40935995-40936332)
chr3 (49-407)||(43975709-43976068)
chr3 (49-379)||(54828546-54828883)
chr3 (73-407)||(54505825-54506167)
chr3 (117-354)||(43348319-43348563)
chr3 (170-407)||(36012251-36012498)
chr3 (150-407)||(29163912-29164161)
chr3 (174-407)||(1089811-1090052)
chr3 (47-258)||(51212955-51213166)
chr3 (89-401)||(38591727-38592051)
chr3 (48-363)||(11835494-11835790)
chr3 (47-228)||(20373300-20373481)
chr3 (47-243)||(27480368-27480564)
chr3 (75-280)||(53176074-53176278)
chr3 (290-407)||(50475053-50475177)
chr3 (288-396)||(51212599-51212707)
chr3 (288-407)||(27480175-27480298)
chr3 (242-407)||(11356975-11357140)
chr3 (213-407)||(20373080-20373263)
chr3 (61-133)||(2613895-2613967)
chr3 (288-361)||(53811597-53811670)
chr3 (133-196)||(53811698-53811767)
chr3 (86-131)||(33698218-33698263)
chr3 (48-104)||(29163839-29163895)
chr3 (47-95)||(49359628-49359676)
chr3 (47-111)||(55343405-55343469)
chr3 (50-92)||(5124671-5124713)
chr3 (47-95)||(40640634-40640682)
chr3 (47-95)||(47930666-47930714)
chr3 (48-95)||(19606914-19606961)
chr3 (47-97)||(42665539-42665589)
chr3 (50-92)||(48155220-48155262)
chr3 (50-95)||(38392628-38392673)
chr3 (50-94)||(4556543-4556587)
chr3 (50-94)||(13006902-13006946)
chr3 (50-94)||(20108102-20108146)
[»] chr4 (72 HSPs)
chr4 (49-407)||(33341397-33341766)
chr4 (49-407)||(34947938-34948306)
chr4 (47-407)||(55240948-55241315)
chr4 (48-407)||(37775670-37776026)
chr4 (47-407)||(7703517-7703877)
chr4 (47-400)||(37663591-37663950)
chr4 (49-407)||(47253751-47254108)
chr4 (47-400)||(19089303-19089664)
chr4 (47-407)||(28002829-28003197)
chr4 (49-407)||(17167715-17168081)
chr4 (47-407)||(55477734-55478106)
chr4 (49-407)||(17173292-17173658)
chr4 (47-407)||(30002484-30002835)
chr4 (49-407)||(36493532-36493897)
chr4 (48-407)||(4597994-4598350)
chr4 (64-407)||(23761089-23761439)
chr4 (47-407)||(29584043-29584409)
chr4 (61-407)||(50764746-50765088)
chr4 (50-407)||(32592096-32592452)
chr4 (47-407)||(25184113-25184481)
chr4 (47-407)||(35020874-35021246)
chr4 (47-407)||(32912422-32912791)
chr4 (49-407)||(27396618-27396982)
chr4 (47-407)||(25700899-25701268)
chr4 (47-407)||(34361334-34361702)
chr4 (61-407)||(46888001-46888354)
chr4 (47-407)||(49375966-49376335)
chr4 (47-407)||(19440491-19440860)
chr4 (47-407)||(50697242-50697610)
chr4 (47-407)||(37287733-37288096)
chr4 (47-407)||(879391-879759)
chr4 (47-407)||(9139247-9139595)
chr4 (47-407)||(3042611-3042987)
chr4 (50-407)||(6864038-6864403)
chr4 (47-404)||(42199729-42200096)
chr4 (49-407)||(5047809-5048174)
chr4 (155-407)||(1815409-1815669)
chr4 (47-407)||(32579444-32579814)
chr4 (63-407)||(33816359-33816728)
chr4 (146-407)||(17272067-17272332)
chr4 (47-354)||(38011854-38012169)
chr4 (47-253)||(39397918-39398115)
chr4 (73-278)||(54499217-54499424)
chr4 (108-407)||(4934055-4934353)
chr4 (301-407)||(35025409-35025515)
chr4 (47-280)||(35025574-35025799)
chr4 (288-407)||(7152047-7152166)
chr4 (288-407)||(4205233-4205352)
chr4 (288-407)||(39400257-39400376)
chr4 (189-407)||(46883957-46884177)
chr4 (310-407)||(23431826-23431923)
chr4 (299-407)||(26896346-26896456)
chr4 (47-152)||(4205116-4205221)
chr4 (47-139)||(4396326-4396418)
chr4 (345-407)||(38012568-38012630)
chr4 (47-132)||(53124287-53124372)
chr4 (288-343)||(56050179-56050234)
chr4 (47-129)||(7152235-7152317)
chr4 (47-95)||(46884197-46884245)
chr4 (47-113)||(17272011-17272077)
chr4 (88-161)||(23518400-23518473)
chr4 (48-95)||(51204580-51204627)
chr4 (47-101)||(38812254-38812308)
chr4 (47-95)||(2704512-2704560)
chr4 (50-94)||(42063006-42063050)
chr4 (50-94)||(47028103-47028147)
chr4 (47-95)||(47073657-47073705)
chr4 (49-105)||(52516599-52516655)
chr4 (47-102)||(38811813-38811868)
chr4 (49-95)||(20097491-20097537)
chr4 (47-95)||(49878636-49878683)
chr4 (47-95)||(54995799-54995847)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (49-400)||(7889-8248)
[»] chr2 (58 HSPs)
chr2 (49-407)||(33660212-33660569)
chr2 (47-407)||(4166922-4167290)
chr2 (47-407)||(5881534-5881897)
chr2 (79-407)||(33709067-33709403)
chr2 (47-401)||(27349789-27350142)
chr2 (47-392)||(4263926-4264280)
chr2 (47-407)||(4763628-4763999)
chr2 (47-407)||(31570569-31570937)
chr2 (49-407)||(3176941-3177307)
chr2 (49-407)||(43770683-43771039)
chr2 (47-407)||(19424477-19424831)
chr2 (47-407)||(26357577-26357945)
chr2 (47-391)||(4478368-4478717)
chr2 (47-407)||(18494116-18494471)
chr2 (47-407)||(29241980-29242341)
chr2 (80-407)||(43648080-43648415)
chr2 (47-407)||(37905709-37906079)
chr2 (47-407)||(33550818-33551189)
chr2 (47-407)||(11366215-11366584)
chr2 (48-405)||(13711465-13711825)
chr2 (47-407)||(44913662-44914035)
chr2 (47-378)||(19313852-19314186)
chr2 (47-407)||(39167204-39167566)
chr2 (146-407)||(41960939-41961208)
chr2 (49-344)||(36641988-36642293)
chr2 (47-407)||(2325213-2325573)
chr2 (47-407)||(19289158-19289521)
chr2 (47-407)||(35958909-35959260)
chr2 (47-407)||(41465509-41465869)
chr2 (60-375)||(44285962-44286285)
chr2 (49-313)||(41463779-41464051)
chr2 (117-406)||(7006774-7007054)
chr2 (47-333)||(17071646-17071940)
chr2 (47-280)||(17054066-17054299)
chr2 (167-407)||(31861972-31862220)
chr2 (128-344)||(45327801-45328025)
chr2 (47-280)||(33902068-33902299)
chr2 (288-407)||(19500750-19500869)
chr2 (304-407)||(41051135-41051238)
chr2 (188-280)||(18258257-18258349)
chr2 (74-192)||(41051263-41051382)
chr2 (327-397)||(18257383-18257453)
chr2 (320-407)||(41463425-41463512)
chr2 (342-407)||(33902317-33902382)
chr2 (47-113)||(41960883-41960949)
chr2 (150-230)||(19501760-19501839)
chr2 (47-111)||(31861895-31861959)
chr2 (47-95)||(34441921-34441969)
chr2 (368-407)||(17053966-17054005)
chr2 (368-407)||(17071607-17071646)
chr2 (48-95)||(42005390-42005437)
chr2 (49-95)||(41643874-41643920)
chr2 (47-95)||(18514771-18514819)
chr2 (47-94)||(43446463-43446510)
chr2 (377-407)||(45328028-45328058)
chr2 (47-83)||(17692662-17692698)
chr2 (51-95)||(18947598-18947642)
chr2 (47-95)||(41713164-41713212)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (49-407)||(11908-12276)
[»] scaffold0002 (5 HSPs)
scaffold0002 (47-407)||(134-496)
scaffold0002 (101-407)||(408246-408559)
scaffold0002 (71-285)||(94330-94544)
scaffold0002 (288-407)||(93918-94036)
scaffold0002 (47-95)||(408706-408754)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (49-407)||(43959-44324)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (49-407)||(154463-154828)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (49-407)||(145832-146199)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (47-407)||(267282-267644)
[»] scaffold0009 (4 HSPs)
scaffold0009 (47-138)||(42348-42439)
scaffold0009 (317-384)||(100993-101058)
scaffold0009 (47-111)||(100821-100885)
scaffold0009 (191-232)||(100894-100935)
[»] scaffold0662 (1 HSPs)
scaffold0662 (50-94)||(6982-7026)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 67)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 39572819 - 39573179
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| | || ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39572819 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagttaagttaatactataatataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagtga 39572918  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39572919 catcaaaagttcagttctcatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccac 39573018  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattact 346  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39573019 aaagtgtaacactcgagactatcacatgatatcaacaactctgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattact 39573118  T
Q  347 agatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39573119 agatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 39573179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 19119859 - 19120227
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19119859 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttgtggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgctagtaacaccccactgtttgtacagtga 19119958  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19119959 catcaaaagttcagtccccatagtgtcatcaattcatcagattaacaagaataaacttactctaattttatcctaccttgttttaagtataacaccccac 19120058  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||    
T  19120059 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactccgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctcaaagtctaagatgttgcaa 19120158  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19120159 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtgatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaa 19120227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 7693230 - 7693589
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  7693230 ggaaaattctatggtgaagtcattaaaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgtttgtacagtgg 7693329  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7693330 catcaaaagttcaatcctcttagtatcatcaattcattagattaacatgaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccac 7693429  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||         ||||||||||| | ||| ||        ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  7693430 aaagtgtaacac---------tcacatgatattagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttgcaa 7693520  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7693521 gcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 7693589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 38528411 - 38528044
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38528411 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatggtttttctgatgaagttaacactataacatcaaaattgtaatgagtaacaccccattgtttatacagtga 38528312  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38528311 catcaaaagttcagtctcat-agtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcttaccttgtttcaagtgtaacaccccac 38528213  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38528212 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctatttacatgttaaagatatcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaa 38528113  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38528112 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 38528044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 48 - 407
Target Start/End: Original strand, 32563150 - 32563508
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgac 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32563150 gaaaattctatggtgaagtcattaaaatgatttttctgatgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtctgtacagtgac 32563249  T
Q  148 atcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32563250 atcaaaagttcagtccccttaatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacagcccaca 32563349  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    |||||||||||         ||||||||||||| ||| ||        ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32563350 aagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttatagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaag 32563440  T
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32563441 aattactagataaattattattgatcattaatcagcaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 32563508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Original strand, 5837557 - 5837923
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||  ||||| |||| | |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5837557 aaaattctacggtgaattcatgagaatgacttttctggtgaaggtaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 5837656  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5837657 tcaaaatttcagtctccatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaatttaatcctacattgttttaagtgtaataccccacaa 5837756  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||        ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5837757 agtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagatgacaacgacaaaatagtacctgcaagtccaagatgttgcaagc 5837856  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5837857 attactagatgaattactgttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaa 5837923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 8742062 - 8741692
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacagtg 145  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||    
T  8742062 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccccattgtttgtacaatg 8741963  T
Q  146 acatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |    
T  8741962 gcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacaattaatctaattttgtcataccttgttttaagtgtaacacccta 8741863  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatga-tatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 336  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||| | ||| ||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8741862 caaagtgtaacacttaagactatcacatgattatgagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaaatgttgc 8741763  T
Q  337 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8741762 aagcatcactagatgaaatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 8741692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 12910350 - 12910723
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtac----- 141  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||         
T  12910350 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaaaactataacatcaaaaatatagtgcgtaacaccccactgtttgtacagtac 12910449  T
Q  142 agtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 241  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12910450 agtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacatgactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 12910549  T
Q  242 cccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 333  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12910550 cccacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgccaacaatacaataatacatgtaagtccaagatgt 12910649  T
Q  334 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12910650 tgcaagcattactagatgaattactattgaacattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 12910723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 401
Target Start/End: Original strand, 9200233 - 9200586
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9200233 ggaaaattttatggtgaagtcattaaaataacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacagtttgtacagtga 9200332  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  9200333 catcaaaagtttagtcctcttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacattccac 9200432  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||         ||||||||||||| ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  9200433 aaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctataagtctaagatgttgcaa 9200523  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9200524 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 9200586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 31786821 - 31786453
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||| |   |||||||||||||||||||     
T  31786821 ggaaaattctatagtgaagtagtgagaatgacttttttggtgaagttaacactatagcatgaaaaatgtagtgagcactgccccactgtttgtacagtgg 31786722  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  31786721 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccctac 31786622  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31786621 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgattgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaa 31786522  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31786521 gcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 31786453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 36866762 - 36867130
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  36866762 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgatttttctggtgaagttaacactataatatcaaaaatattgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgg 36866861  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36866862 catcaaaagttcagtcccgatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 36866961  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa--------ttctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||         | ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  36866962 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaa 36867061  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
     ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36867062 acattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaa 36867130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 40133385 - 40133753
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  40133385 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttgtggtgaagttaacattatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatgg 40133484  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40133485 catcaaaagttcagtccccataatatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 40133584  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa--------ttctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||         | ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  40133585 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaa 40133684  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40133685 gcattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaa 40133753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 30969499 - 30969131
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    ||||||||||| | ||||||||| | ||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  30969499 ggaaaattctacaatgaagtcatgagaatgatttatctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttatacaatga 30969400  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  30969399 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacacctcac 30969300  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |         |||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||||| |||||    
T  30969299 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctataagttcaagatgctgcaa 30969200  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30969199 gtattactagatgagttactattaatcattaatcagtaatccacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 30969131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 49 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 25501099 - 25500739
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||    
T  25501099 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgaataacacctcactgtttgtacactgcca 25501000  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25500999 tcaaaagttaagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaagaataaacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 25500900  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa--ttc------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    ||||||||||| || |  |||||||||||||| |||  |||      ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25500899 agtgtaacacttaagatcatcacatgatatcagcaactttctttagatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagc 25500800  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 401  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25500799 attactagatgaaatactgttgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaa 25500739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 22019632 - 22019991
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22019632 ggaaatttctatggtgaagttattagaatgacttttctggtgaagttaaaactatagaatcaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttgtatagtga 22019731  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22019732 catcaaaagttaagtccccttagtatcatcacttcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccac 22019831  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||| ||||||         ||||||||||||| ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||    
T  22019832 aaagtataacac---------tcacatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttgtaa 22019922  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22019923 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaa 22019991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 48 - 407
Target Start/End: Original strand, 22980794 - 22981161
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgac 147  Q
    ||||||| |||  |||||| || | |||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| |   |||||||| |||||||||||||  || ||||    
T  22980794 gaaaattttatgatgaagttatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagtatcaaaaatacagtgagtaataccccactgtttgagcaatgac 22980893  T
Q  148 atcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22980894 atcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcaca 22980993  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    || ||||||||| || |||||||||| ||||||  || ||        ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  22980994 aaatgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttgcaat 22981093  T
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22981094 cattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 22981161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 48 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 31705785 - 31705419
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgac 147  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  31705785 gaaaattctatggtgaagtcataaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacaccctaccgtttgtacaatgac 31705686  T
Q  148 atcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| | ||||    
T  31705685 atcaaaagtccagtcctct-agtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcgtaacatctcaca 31705587  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    || ||||||||| || || ||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31705586 aaatgtaacacttaagaccatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaaagataaaatagtacatataagtccaagatgttgcaag 31705487  T
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31705486 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 31705419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 27330306 - 27330672
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||| |   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||     
T  27330306 ggaaaattctatggtgaagtcgtgggaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttg--agtaacaccttactgtttgtacaatgg 27330403  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  27330404 catcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccat 27330503  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
     |||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||| ||        |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27330504 gaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatgttgcaa 27330603  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27330604 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaa 27330672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 36860423 - 36860792
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||| ||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36860423 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgatttttctggtgaagttaacactatagtataaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatga 36860522  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctacc-ttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36860523 catcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcatactaacaagagtacatttaatctaattttatcctaccttttttttaagtgtaacacccca 36860622  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa--------ttctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||         | ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  36860623 caaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgca 36860722  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36860723 agcattactaaatgaattactattaatcatgaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagcattaa 36860792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 35511652 - 35511289
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| || ||||||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35511652 ggaaaatcctatggtgaagtcatgaaaatgacgtttctgatgaagttaacattataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaagtga 35511553  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  35511552 catcaaaagttcagtcatcatactatcaccaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccac 35511453  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||| ||||||||     |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35511452 aaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaa 35511358  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35511357 gcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 35511289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 23116397 - 23116037
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  23116397 ggaaaattctatggtgacgtcatgaaaatgactttttttatgaagttaacattataacatcaaaactgtagtgagtagcaccccactgtttgtacagtgg 23116298  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
     ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23116297 aatcaaaagttcagtttacatagtatcatcaattcatcagattaacaatattacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccac 23116198  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23116197 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 23116098  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23116097 gcattac--------tgactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 23116037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Original strand, 699152 - 699518
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||| ||| ||||||| || | |||||||||| || ||||||||| |||||| ||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  699152 aaaattttatggtgaagttatgagaatgacttttctgatgaagttaacactatagcataaaaaatctagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 699251  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  699252 tcaaaagttcagtcatcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttattttaagtgtaacactccacaa 699351  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    ||||||| ||| || |||||||||| |||||| ||| |         ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  699352 agtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagc 699451  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  699452 attactagatgaattactattgattattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 699518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 35826658 - 35826293
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  35826658 ggaaaattctatggtgaagtcatgataatgactttttttgtgaagttaatactataacatcaaaaatgtactgagtaacacttcattgtttgtacagtga 35826559  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  35826558 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat-agattaacaataccacatttaatctaattttattctacattgttttaagcgtaacactccac 35826460  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    |||||||||| || || | |||  ||| |||||| ||| ||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35826459 aaagtgtaacccttaagattat--cataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 35826362  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35826361 gcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 35826293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 15724490 - 15724856
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  15724490 ggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagttttgtgagtaacaccccactgtttatacaatga 15724589  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| || |    
T  15724590 catc-aaagttcagt-cccataatatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttattttaagtataacacgcccc 15724687  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    |||||||| || | || ||||||| ||||||||||||| |         |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||    
T  15724688 aaagtgtatcaattaagactatcatatgatatcaacaactttgtttacatgttaaagatgtcaactataaaatagtacttgtaagtccaaaatattgtaa 15724787  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15724788 gcattactagatgaattactattaatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 15724856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 35933902 - 35934264
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||        ||||     
T  35933902 ggaaaattgtatggtgaagtcatgagaatgatttttttgatgaagttaacactatagaatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactt-------agtgg 35933994  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35933995 catcaaaagtccagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctagtttttatcctaccttgttttaagtgtaacacccta 35934094  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa------ttc--tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||      |||  |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35934095 caaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacaataaaatagtaccggtaagtccaagatgttgca 35934194  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35934195 agcattactagttgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgattcaaacattaa 35934264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 22974257 - 22973889
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| ||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  22974257 ggaaaattctatggtgaagttatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaaagtaatgagtaacatcccactgtttgtacaataa 22974158  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||| | | | || ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||    
T  22974157 catcaaaagttcaattctcatattatcatcaactcatcagaataacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgttataagcgtaacacctcac 22974058  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||| ||||||||| || ||||| |||| |||| | ||| ||        |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22974057 aaaatgtaacacttaagactattacataatattatcaactctgtttgcatgttaaagatttcgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 22973958  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22973957 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 22973889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 60 - 407
Target Start/End: Original strand, 33908246 - 33908600
Alignment:
Q  60 gtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttca 159  Q
    |||||||||| | |||||  ||| ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  33908246 gtgaagtcatgagaatgaactttctggtgaagtcaacactatatcatcaaaagtgtagtgagtagcactccactgtttgtacggtggcatcaaaagttca 33908345  T
Q  160 gtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 259  Q
    |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  33908346 gtcctcatagtatcatcaattattcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccagaaagtgtaacact 33908445  T
Q  260 caaaactatcacatgata---tcaacaat-----tctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 351  Q
     || |||||| ||| |||   ||||| ||     | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33908446 taagactatcgcataatatcgtcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat- 33908544  T
Q  352 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33908545 aattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 33908600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 22255181 - 22255550
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaag-tgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 145  Q
    |||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  22255181 ggaaaactctacggtgaagtcataaaaataacttttttggtgaagttaacattataacatcaaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatg 22255280  T
Q  146 acatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
     ||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||| ||    
T  22255281 gcatcaaaagttcagttctcatattatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttagcctattttgttataagcgtaacaccaca 22255380  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| |         ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22255381 caaagtgtaacacttaaaactattacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaatattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 22255480  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22255481 agccttactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 22255550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 7209037 - 7208671
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgactttttt-ggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgac 147  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| |||| ||    ||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  7209037 aaaattctacggtgaagtcataaaaatgactttttttggtgaagttaacattgtaacataaaaaatgcaacgagtaacaccctaccgtttgtacattgac 7208938  T
Q  148 atcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||    
T  7208937 atcaaaagttcagtcctct-agtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataaacgtaacacctcaca 7208839  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||||   ||| ||        ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7208838 aagtgtaacacttaagactatcacataatattttcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaag 7208739  T
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7208738 tattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 7208671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 89 - 407
Target Start/End: Original strand, 42342775 - 42343089
Alignment:
Q  89 aagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagat 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342775 aagttaatactataacatcaaaaatgttgtgagtaataccccactgtttatacagtgacatcaaaaaatt--tccccttagtatcatcaattcatcagat 42342872  T
Q  189 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc- 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||         ||||||||||||| ||| ||     
T  42342873 taacaagaatacacttaatctaattttatctta-cttgttttaagtgtaatacaccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcatcaactct 42342962  T
Q  288 -------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 380  Q
           |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42342963 gtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataggacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaatcagtaatca 42343062  T
Q  381 acaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  42343063 acaatttaaaaatgaatcaaacattaa 42343089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 48 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28416696 - 28416358
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgac 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||     || |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  28416696 gaaaattctatggtgaagtcattagaatga-----ttagtgaagttaacactataatatcaaaagtattgtgagtaacatcccactgtttgtacagtgga 28416602  T
Q  148 atcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  28416601 atcaaaagttcaatctccttaatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctgccttattttaagtgtaacaccccaca 28416502  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattacta 347  Q
    |||||||||||         ||||||||||||| ||| ||       |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  28416501 aagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactc-------gatgccaacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattactt 28416418  T
Q  348 gatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28416417 gatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaaagaatcaaacattaa 28416358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 126 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15992636 - 15992347
Alignment:
Q  126 accccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctacctt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15992636 accccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttgatctaattttattctacctt 15992537  T
Q  226 gttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtaca 317  Q
    | ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||  || ||        ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  15992536 gatttgagtgcaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcaggaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacc 15992437  T
Q  318 tgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15992436 ggtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 15992347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 17158208 - 17157838
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttg---gtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacag 143  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    |||||||||| |||||||||| |||| |||  |||||||||| |||| |||||||||     
T  17158208 ggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgatttttttttttgtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaa 17158109  T
Q  144 tgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 243  Q
    ||||||||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |||||| || ||||||||||||||    
T  17158108 tgacatcaaaagttc-gtcattatagtatcattaattcatcagattaacaagactacacttagtataattgtatcttaccttattataagtgtaacaccc 17158010  T
Q  244 cacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 335  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||| |||| | ||| ||||||        |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17158009 cacaaagtgtaacacttaagaccatcacataatattatcaactctgtttgcatgataaagatttcaacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttg 17157910  T
Q  336 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17157909 caagcattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 17157838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 60 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27318649 - 27318295
Alignment:
Q  60 gtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttca 159  Q
    |||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  27318649 gtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactaaaacataaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaatgacatcaaaagttta 27318550  T
Q  160 gtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 259  Q
    || | |  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27318549 gttctcacagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacact 27318450  T
Q  260 caaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 351  Q
     || |||||||||| |||||| ||| ||        |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||| |||||||| |||    
T  27318449 taagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtaca--taagtttaagatgttgcaaacattactatatg 27318352  T
Q  352 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaa-tttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27318351 aattactattgatcattaatcaaaaatcaacaattttaaaaatgaatcaaacattaa 27318295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 5829897 - 5830261
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataa----catcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtaca 142  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| | |||||    ||| |||| |||  |||||||||||| || |||||||||    
T  5829897 ggaaaattctagggtgaagtcgtaaaaatgatttttttggtgaagttaacattataattaacataaaaaatgtaatgagtaacaccctaccgtttgtaca 5829996  T
Q  143 gtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacc 242  Q
     |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||         ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  5829997 atgacatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaatt---------aacaagactacacttaatctcattttatcttaccttgttataagcgtaacacc 5830087  T
Q  243 ccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtt 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||        ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5830088 ccacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtt 5830187  T
Q  335 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5830188 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaa 5830261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 24886102 - 24886455
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgactttt--ttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagt 144  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  24886102 ggaaaattttatggtgaaatcatgagaatgacttttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaat 24886201  T
Q  145 gacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc 244  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |                  
T  24886202 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattat-------------- 24886287  T
Q  245 acaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 336  Q
       |||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |||        |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24886288 ---aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 24886384  T
Q  337 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24886385 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 24886455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 118 - 407
Target Start/End: Original strand, 35504436 - 35504733
Alignment:
Q  118 tgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttat 217  Q
    ||||||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  35504436 tgagtaacacctcaccgtttgtatgatgacatcaaaagttcaatcattatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatataattttat 35504535  T
Q  218 cctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaa 309  Q
    |||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| | ||| ||||||        |||||| |||||||||||    
T  35504536 cctaccatattataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaaatctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaa 35504635  T
Q  310 atagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35504636 atagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 35504733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 51 - 407
Target Start/End: Original strand, 8436970 - 8437333
Alignment:
Q  51 aattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatc 150  Q
    |||||||  |||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||| | || ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8436970 aattctaatgtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaaattaacactatagcttccaaagtgtagtgagtaacatcccattgtttgtacagtgacatc 8437069  T
Q  151 aaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaag 250  Q
    ||||||||||||| | |  |||||||||  ||||||||| |||| | ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| |    
T  8437070 aaaagttcagtcctcattatatcatcaac-catcagatttacaaaactatgcttaatctaattttatcctgccttgttttaagttatacaccccacaatg 8437168  T
Q  251 tgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcat 342  Q
    ||||||||| || | |||||||| |||| | ||| ||||||        ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  8437169 tgtaacacttaagattatcacataatatgatcaactctgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgaaaacat 8437268  T
Q  343 tactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8437269 tactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaatattaa 8437333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 21088941 - 21088576
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgactttttt-ggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 145  Q
    |||||||||||   ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||  || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  21088941 ggaaaattctacgatgaagtcacgaaaatgactttttttggtgaagttaa-actgtagtataaaaaatgttgtgagtgacaccccactgtttgtacaatg 21088843  T
Q  146 acatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21088842 acatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcatactaacaagaatacatttaatctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacatccca 21088743  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa--------ttctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    |||||||||||||| || | |||||||| |||||| |||         | ||||||||||| |||||||||||||  |  ||||| |||||||||||| |    
T  21088742 caaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataacatctgtaaatccaagatgttgta 21088643  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  21088642 agcattactagatgaattactattaatcatgaataaataat---caatttaaaaatgaatcaaacattaa 21088576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 49 - 280
Target Start/End: Original strand, 26268076 - 26268307
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26268076 aaaattctacagtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttttgagtaacaccccactgtttgtacggtgaca 26268175  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26268176 tcaaaagtttagtccacatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacaattaatcaaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccgcacaa 26268275  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 280  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26268276 agtgtaacacttaagactatcacatgatatca 26268307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 47 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 1429320 - 1428983
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  1429320 ggaaaaatctatggtgaagtcatgaaaatgactcttttggtgaagttaacactatagcatcaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacactgg 1429221  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  1429220 catcaaaaattcagtctccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttgttttaa-------------- 1429135  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
       |||||||||| || |||||||||| ||||||  || | |        |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1429134 ---gtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactttatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 1429038  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaa---tcaacaatttaaa 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  1429037 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatattcaacaatttaaa 1428983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 8466745 - 8467094
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||     
T  8466745 ggaaaattctatgatgaggtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactgtaacatcaaaagtgttgtgaataacacccc-ctctttgtacagtgg 8466843  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||                    
T  8466844 tatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgtttt---------------- 8466927  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctg--------ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
     || ||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||||        |||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||    
T  8466928 -aaatgtaacacttaagactatcatatgatatcaccaactctgtttacatattaaaggtgt-aacgataaaatattatttgtaagtccaaaatgttgcaa 8467025  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8467026 gcattactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacagtttaaaaatgaatcaaacattaa 8467094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 104 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6824599 - 6824329
Alignment:
Q  104 catcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagt--tcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaataca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6824599 catcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacagtgacatcaaaagtgttcagtcttcatagtatcatcaatttatcagattaacaagaataca 6824500  T
Q  202 cttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaa 293  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| | ||| ||        ||||||    
T  6824499 cttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacaagatat-agcaactctgtttgcatgttaa 6824401  T
Q  294 agatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatca 366  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  6824400 agatgtcaa-gataaaacaatacatgtaagtctaagatgttgcaagcatcactagatgagatactattgatca 6824329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 47 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5112488 - 5112247
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5112488 ggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacataaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 5112389  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  5112388 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcattaaattaacaagactatacttaatctaattttatcataccatgttttaagtgtaa-accccac 5112290  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctg 289  Q
    |||||  |||||| || ||| |||||| |||||| ||| ||||    
T  5112289 aaagtacaacacttaagactttcacataatatcatcaactctg 5112247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 60 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 43308814 - 43308473
Alignment:
Q  60 gtgaagtcattaaaatgacttttttg-gtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttc 158  Q
    |||||||||| | ||||||||||||  || ||||||| | ||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||    
T  43308814 gtgaagtcatgagaatgactttttttagtaaagttaacattataacatcaaaaatgtaatgaataacaccc-actgttcgtacaatggcatcaaaagttc 43308716  T
Q  159 agtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac 258  Q
    ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  43308715 agtcctcatagtatcatcaactcatcagcttaacaaaactatacttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccctgaaaagtgtaacac 43308616  T
Q  259 tcaaaactatcacatgatatcaacaattctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 358  Q
    | || |||||  ||| |  ||  |     ||||||||||  | || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43308615 ttaagactatatcatcaactcttcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaagcattactagatgaattact 43308516  T
Q  359 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 401  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  43308515 attgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaacgaatcaaa 43308473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 47 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 13956520 - 13956187
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |      
T  13956520 ggaaaattctacggtgaagtcatgaaaatgacttttctcatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacacctcactgtttgtacacttg 13956421  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||                   |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||| ||    
T  13956420 catat-----------------gtatcatcaattcatcagattaacaaaacttcacttaatctaattttattttatcttgtttcaagtgtaacaccctac 13956338  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    |||| |||||||| || ||||||| || |||||| ||| | ||||        ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13956337 aaagcgtaacacttaagactatcatataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgttagtccaagatgttgcaa 13956238  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaa 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13956237 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaa 13956187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 194 - 407
Target Start/End: Original strand, 25669733 - 25669944
Alignment:
Q  194 agaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt-- 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||         |||||||||| ||| ||||||      
T  25669733 agaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaa-gtgtaacactca---------catgatatcatcaactctgtttg 25669822  T
Q  292 ------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaat 385  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25669823 catgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaat 25669922  T
Q  386 ttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25669923 ttaaaaatgaatcaaacattaa 25669944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 198 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2888469 - 2888252
Alignment:
Q  198 tacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt------ 291  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||  ||| ||||||||||||| || ||||||| || |||||| ||| | ||||          
T  2888469 tacacttaatctaattttattttaccttgtttcaagtttaacattccataaagtgtaacacttaagactatcagataatatcatcaaatatgtttgcatg 2888370  T
Q  292 --aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaa 389  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2888369 ttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttacaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaa 2888270  T
Q  390 aaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2888269 aaatgaatcaaacattaa 2888252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 117 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 23954895 - 23954609
Alignment:
Q  117 gtgagtaacaccccactgtttgtac-agtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23954895 gtgagtaacaccccactgtttttactagtggcatcaaaagttcagtttccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaatttt 23954796  T
Q  216 atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgt-------taaagatgtcaacgataa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |||||       | || ||| |||||||||    
T  23954795 atcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaaatgccaacgataa 23954696  T
Q  309 aatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||| ||  ||||||| |||||||     | ||||||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23954695 aataatatttgtaagtgcaagatg-----aacattacttgatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaa 23954609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 14919704 - 14919346
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttgg-tgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 145  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | ||| | |||||| | ||||||||| | ||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||| || | ||    
T  14919704 ggaaaattatatggtgaagtcatgagaattattttttttgatgaagttaacattataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcactgtttatataatg 14919605  T
Q  146 acatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  14919604 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcatattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacacctca 14919505  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    |||| ||||| ||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||  |||| ||||||| |||    |||||||||||| |||||    
T  14919504 caaattgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacaataaaattgta----taagtccaagatattgca 14919409  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    | |      ||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  14919408 atc------agatgaattac-attgatcattaatcagaaatctaaaatttaaaaatgaatcaaacattaa 14919346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 14409501 - 14409310
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||  ||| |||     
T  14409501 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaaatgtagtgagtagcaccccactcttaatacggtgg 14409402  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaac 239  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14409401 catcaaaagttcagtctcat-agtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaac 14409310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 288 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 14409267 - 14409148
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14409267 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaattactattgatcattattcagcaatcaacaattt 14409168  T
Q  388 aaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  14409167 aaaaatgaatcgaacattaa 14409148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 84 - 202
Target Start/End: Original strand, 25668687 - 25668804
Alignment:
Q  84 tggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcat 183  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25668687 tggtgaagttaacact-taacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgaacagtggcatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcat 25668785  T
Q  184 cagattaacaagaatacac 202  Q
     ||||||||||||||||||    
T  25668786 tagattaacaagaatacac 25668804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 288 - 407
Target Start/End: Original strand, 25889619 - 25889738
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 387  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25889619 tgttaaagataccaacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgaaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 25889718  T
Q  388 aaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  25889719 aaaaatgaattaaacattaa 25889738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 338 - 407
Target Start/End: Original strand, 43254154 - 43254223
Alignment:
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254154 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 43254223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 304 - 407
Target Start/End: Original strand, 26269074 - 26269177
Alignment:
Q  304 gataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaca 403  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  26269074 gataaaatagtacctgtaagtttaagatgttgtaagcaatactagataaattactactgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaccaatca 26269173  T
Q  404 ttaa 407  Q
    ||||    
T  26269174 ttaa 26269177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 184
Target Start/End: Original strand, 11898015 - 11898139
Alignment:
Q  60 gtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttca 159  Q
    |||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||   |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |    
T  11898015 gtgaagtcatgataataacttttctggtaaagttaatattatagcatcaaaagtgcactgagtaacaccctactagttgtacagtgacatcaaaagttta 11898114  T
Q  160 gtccccttagtatcatcaattcatc 184  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  11898115 gtcctcatagtatcatcaattcatc 11898139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26317859 - 26317774
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccac 132  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   ||||||||||||||    
T  26317859 ggaaaattctatgatgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatataacgagtaacaccccac 26317774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 16004552 - 16004474
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaat-gacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaa 124  Q
    |||||||||||| || ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16004552 ggaaaattctatggtaaagtcatgagaattgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagtaa 16004474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Original strand, 22616494 - 22616542
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22616494 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaa 22616542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 92
Target Start/End: Original strand, 26411293 - 26411338
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagt 92  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26411293 ggaaaattctatggtgaagtcattagaatgatttttttggtgaagt 26411338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 95
Target Start/End: Original strand, 10237415 - 10237462
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  10237415 gaaaattctattgtgaagtcatgaaaatgacttttctagtgaagttaa 10237462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 95
Target Start/End: Original strand, 21320752 - 21320799
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  21320752 gaaaattctatggtgaagtaataaaaatgacttttttgatgaagttaa 21320799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 131
Target Start/End: Original strand, 22255608 - 22255659
Alignment:
Q  80 tttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccca 131  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  22255608 tttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacccca 22255659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 95
Target Start/End: Original strand, 5748442 - 5748476
Alignment:
Q  61 tgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5748442 tgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaa 5748476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 94
Target Start/End: Original strand, 35504168 - 35504214
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagtta 94  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35504168 gaaaattctatgttgaagtcataaaaatgatttttttggtgaagtta 35504214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 92
Target Start/End: Original strand, 25513771 - 25513816
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagt 92  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  25513771 ggaaaattctatggtgaagtcgttaaaatgatttttctggtgaagt 25513816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 66)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 61 - 407
Target Start/End: Original strand, 22687228 - 22687574
Alignment:
Q  61 tgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcag 160  Q
    ||||||||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  22687228 tgaagtcatgagaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagtggtatcaaaagttcag 22687327  T
Q  161 tccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactc 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22687328 tccccatagtatcatcaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactc 22687427  T
Q  261 aaaactatcacatgatatcaacaattctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactat 360  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22687428 aagactatctcatgatatcaacaactctgttaaggatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattaatagatgaattactat 22687527  T
Q  361 tgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22687528 tgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcatacattaa 22687574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 37109847 - 37110217
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  37109847 ggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatga 37109946  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcc--taccttgttttaagtgtaacacccc 244  Q
    ||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||    
T  37109947 catcaaaagttcagtcattataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacacccc 37110046  T
Q  245 acaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 336  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||| |||||| ||| ||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37110047 acaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 37110146  T
Q  337 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37110147 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 37110217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 5657667 - 5657299
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5657667 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 5657568  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5657567 catcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcatattaacaaaaatacacttaatttaattttatcctactttgttttaagtgtaacagcccac 5657468  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||| ||| || |||||| |||||||||| ||| |         ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5657467 aaagtgtaatacttaagactatcgcatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaa 5657368  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  5657367 gcattactagatgaattactattgatcattaatgagtaatcaaaaatttaaaaatgaataaatcattaa 5657299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 47 - 403
Target Start/End: Original strand, 8861260 - 8861624
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| | | |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  8861260 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctcgcgaagttaacactatagcatcaaaagtgttatgaataacaccccactgtttgtacagtgg 8861359  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  8861360 catcaaaagttaagtccccatagtatcatcaattaatcagattaacaacaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccgc 8861459  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||        ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  8861460 aaagtgtaacactcaagaccatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcat 8861559  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaca 403  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8861560 gcattactagatgaaatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaca 8861624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 21991611 - 21991970
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||  |||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  21991611 ggaaaattctagggtgaagtcatgagaatgatttttatggtgaagttaacactatagcatcaaaattgttgcgagtaacaccccactgtttgtacagtgt 21991710  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21991711 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 21991810  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |         ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21991811 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 21991910  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||     |||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21991911 gca-----agatgaattactattgatc----atcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 21991970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 18797304 - 18797670
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18797304 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacacta--acataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatga 18797401  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  18797402 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacacctcac 18797501  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18797502 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 18797601  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797602 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 18797670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 4582894 - 4583262
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  4582894 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaatactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatga 4582993  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4582994 catcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccac 4583093  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa--------ttctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||         | ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  4583094 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgatcaaataatatttgtaagttcaagatgttgcaa 4583193  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4583194 gcattactggatgaattactattaatcatgaatcagtcatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaa 4583262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 6546494 - 6546862
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  6546494 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgatttttctagtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacaccccactatttgtacagtaa 6546593  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||| | |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6546594 catcaaaagtttactatccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 6546693  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||| ||||||| || | ||||||||||||||| ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||    
T  6546694 aaagtataacacttaatattatcacatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgaggcaa 6546793  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6546794 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaa 6546862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15612944 - 15612577
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||| || ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||     
T  15612944 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaataacgtttcttgtgaagttaacactataacatcaaa-gtgttatgagtaacaccccagtgtttgtagagtgg 15612846  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15612845 catcaaaagttcagtccctataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 15612746  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||        ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15612745 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaa 15612646  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15612645 gcattactagatgaattattgttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaa 15612577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 400
Target Start/End: Original strand, 30055501 - 30055863
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttgg-tgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 145  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30055501 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgactttttttgatgaagttaacactataatatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatg 30055600  T
Q  146 acatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |    
T  30055601 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcattaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacacccta 30055700  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa-----ttc---tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     |||   ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30055701 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 30055800  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30055801 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 30055863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 395
Target Start/End: Original strand, 12165727 - 12166074
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12165727 ggaaaattctacggtgaagtcgttaaaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatccaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 12165826  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12165827 catcaaaagttaagtcccttaagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccac 12165926  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||         |||||| |||||| ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  12165927 aaagtgtaacac---------tcacataatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaa 12166017  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatga 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12166018 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatga 12166074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 17842772 - 17842402
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  17842772 ggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatga 17842673  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcc--taccttgttttaagtgtaacacccc 244  Q
    ||||||||| ||||||    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||| |||||| |||    
T  17842672 catcaaaagctcagtcattataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacatccc 17842573  T
Q  245 acaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 336  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||| |||||| ||| ||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17842572 acaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 17842473  T
Q  337 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17842472 aagcattattagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 17842402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 27283719 - 27284088
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  27283719 ggaaaattctatggtgaagttataaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatga 27283818  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
     |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27283819 aatcaaaagttcagtcctcatagtattatcaatttatcagattaacaagactatacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccac 27283918  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |         ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27283919 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatattatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 27284018  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaat-gaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  27284019 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaataaaatcaaacattaa 27284088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 32821239 - 32820871
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  32821239 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttttggtgaagttaacaatataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaatgg 32821140  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  32821139 catcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaagactacagttaatttagttttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccat 32821040  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||| |||||| ||| ||        ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32821039 aaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaa 32820940  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32820939 gcattactagatgaattactattaatcattcatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 32820871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 9356012 - 9355644
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | ||||||  |||||||||| |||| |||||| ||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9356012 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaatgaccattttggtgaatttaacactatagcataaaaaatgtagtgagcaataccccactgtttgtacagtga 9355913  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||| ||| | | || |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9355912 catcaaaagtttagttctcatattatcgttaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttcatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 9355813  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |         ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9355812 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaa 9355713  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9355712 gcattactagatgaattgctattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 9355644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 32432432 - 32432795
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||| |||||     ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  32432432 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgatttttctggtgaagttaacactat-----caaaaatgttgtgagtaacaccccattgtttgtacaatga 32432526  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32432527 catcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacagttaatataattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccac 32432626  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctg--------ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||  |||        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32432627 aaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacactgtttgcatattaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtgttgcaa 32432726  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32432727 gcattactagatgaattattattaatcatgaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 32432795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Original strand, 11071182 - 11071546
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatg-acttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgac 147  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | | | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11071182 aaaattctatggtgaagtcatgaaaatgtatttttttggtaaagttagtactatatcatcaaaaatatagcgagtaacactccactgtttgtacagtgac 11071281  T
Q  148 atcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11071282 atcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcagattaacaacactacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccaca 11071381  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa-----ttc---tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    |||||||||||| || | |||||||| |||||| |||     |||   |||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  11071382 aagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactttgttcgcatgttaaaga---caacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttgcaaa 11071478  T
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11071479 cattactagatgaattactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 11071546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25691729 - 25691362
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaac-accccactgtttgtacagtgac 147  Q
    |||||| ||| |||||||||| | |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| |    
T  25691729 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttctcgtgaagttaacactataacatcaaaagtattgtgagtaattacctcactgtttgtacagtggc 25691630  T
Q  148 atcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    ||||| |||||||| |   |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25691629 atcaacagttcagttcttatagtattatcaattcatcatattaacaaaaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccaca 25691530  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| |||        ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||     
T  25691529 aagtgtcacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagatgttaacgataaaataacacatgtaagttcaaaatgttgcaaa 25691430  T
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25691429 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 25691362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 31579255 - 31578886
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttg-----tac 141  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||      |||    
T  31579255 ggaaaattctatggtgaagtcataagaataatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttaatttatac 31579156  T
Q  142 agtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 241  Q
    | |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31579155 aatgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacac 31579056  T
Q  242 cccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 333  Q
    || | ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |         ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31579055 cctataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgt 31578956  T
Q  334 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaca 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31578955 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaataatttaaaaatgaatcaaaca 31578886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 48 - 407
Target Start/End: Original strand, 24211717 - 24212085
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgac 147  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| || | || |    
T  24211717 gaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccctactgtttatagaatggc 24211816  T
Q  148 atcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||    
T  24211817 atcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacatcctaca 24211916  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    |||||||||||  || |||||||||| |||||| ||| |         ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24211917 aagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatgttgcaag 24212016  T
Q  340 cattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24212017 cattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 24212085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 41765264 - 41764896
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    ||||||||| || |||||||||| | |||||||||| || | |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  41765264 ggaaaattccatggtgaagtcatgagaatgacttttctgataaagtcaatactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggtgg 41765165  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  41765164 catcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttactctaccttgttttaagtgtaacaccccag 41765065  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |         ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41765064 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagattttgcaa 41764965  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41764964 gcattactggatgaattattattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaa 41764896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 37346997 - 37347364
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37346997 ggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgatttttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatataatgagtaacaccccattgtttgtacagtga 37347096  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || | ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||    
T  37347097 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaatttattaaattaacaggactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaa-actccac 37347195  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||| |||||| ||| ||        ||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  37347196 aaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaa 37347295  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37347296 gcattactcgatgaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 37347364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Original strand, 23111167 - 23111535
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||    
T  23111167 aaaattctgtggtgaagtcatgaaaatgatttttctggtgaagttaacactataacatcaaaaatattgtgagtaacacaccactatttgtacaatggca 23111266  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattt--tatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||||||  |  | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23111267 tcaaaagttcaaccatcgtagtatcatcaattcattagattaacaagactacacttaatctaattttatatcatactttgttttaagcgtaacaccccac 23111366  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  23111367 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaaatcaaagatgttgaaa 23111466  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23111467 gcattactagaagaattactattgatcataaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 23111535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 191 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 26588126 - 26587910
Alignment:
Q  191 acaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26588126 acaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaagactatcacatgatatcaacaactctgt 26588027  T
Q  291 taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaa 390  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26588026 taaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaggcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaa 26587927  T
Q  391 aatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||| |||||||||||||    
T  26587926 aataaatcaaacattaa 26587910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 47 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 10359400 - 10359033
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| || |||||  |||| |||||||||||| |||||||||| || ||| ||| ||||||||    
T  10359400 ggaaaattctatggtgaagtcatgataatgacttttctggtaaaattaatcttatagcatcaaaagtgtagtgagtaacatcctactatttatacagtga 10359301  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacactt-aatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10359300 catcaaaagttcagt-ctgatagtatcatcaattcatcagatcaacaagactacacttaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacacccca 10359202  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | | || ||| ||        |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  10359201 caaagtgtaacacttaagactatcacataacaacatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaattagtacttgtaagtccaagattttgca 10359102  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatta 406  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10359101 agcattactaaatgatttactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatta 10359033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 7334769 - 7335136
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||  |||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7334769 ggaaaattctacggtgaagtcgtgagaatgacttttttgatgaagttaacactataacataaaatatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatga 7334868  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7334869 catcaaaagttcagttctcatagtatcatcaactcatcagcttaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccac 7334968  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt-------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    | ||||||||||| || | ||||| || |||||| ||| |        ||||||||||  | || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7334969 agagtgtaacacttaagattatcagataatatcatcaactagtttgaatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaag 7335068  T
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7335069 cattactagatgaattactattaatcattaatcagaaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaa 7335136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 48 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33688446 - 33688117
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgac 147  Q
    ||||||| ||| ||||||| || | |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |    
T  33688446 gaaaattatatggtgaagttatgagaatgacttttctggt-aagttaacactataacatcaaaagtgttatgagtaacatcctactgtttgtccagtggc 33688348  T
Q  148 atcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  33688347 atcaaaagttcagtctctatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcatactttgttttaagtgtaacactccata 33688248  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||| |||        |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33688247 aagtgtaacattcaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 33688148  T
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaa 370  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33688147 cattactagatgaattgctattgatcattaa 33688117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 47 - 354
Target Start/End: Original strand, 43686016 - 43686330
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  43686016 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgactttttgggtgaagttaacactataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccc-actgtttgtacaatgg 43686114  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43686115 catcaaaagttcagtccctatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 43686214  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa--------ttctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||         | ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  43686215 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaa 43686314  T
Q  339 gcattactagatgaat 354  Q
    |||||||| |||||||    
T  43686315 gcattactggatgaat 43686330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 63 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 48928466 - 48928117
Alignment:
Q  63 aagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtc 162  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  48928466 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactatttgtacggtgccatcaaaagttcagtc 48928367  T
Q  163 cccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaa 262  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||  || ||    
T  48928366 ccat-agtattatcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaatgcttaa 48928268  T
Q  263 aactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 354  Q
     |||||| ||| |||||| ||| |         ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48928267 gactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaat 48928168  T
Q  355 tactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt 405  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  48928167 tactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaataaatcgaacatt 48928117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 31520909 - 31520559
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  31520909 ggaaaattttatgatgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatatagtgagtaacactccattgtttgtacagtga 31520810  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||                    
T  31520809 catcaaaagttcagt-cccatagtatcatcaattcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgtttt---------------- 31520727  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
     |||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |||        |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31520726 -aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaa 31520628  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31520627 gcattactcgatgaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 31520559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 74 - 407
Target Start/End: Original strand, 26980325 - 26980649
Alignment:
Q  74 atgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatc 173  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  26980325 atgacttttatggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacggtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccccataatatc 26980424  T
Q  174 atcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacat 273  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||                 |||||||||||| || ||||||||||    
T  26980425 atcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgtttt-----------------aagtgtaacacttaagactatcacat 26980507  T
Q  274 gatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatc 365  Q
    ||||||| ||| ||        ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  26980508 gatatcagcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagtattactagatgaattattgttgatc 26980607  T
Q  366 attaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26980608 attaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaa 26980649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 73 - 407
Target Start/End: Original strand, 29173541 - 29173865
Alignment:
Q  73 aatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtat 172  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29173541 aatgacttttctggtgaagttaacactgtagtatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtat 29173640  T
Q  173 catcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcaca 272  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 |||||| ||||| || |||||||||    
T  29173641 catcaattcatcaaactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgtttt-----------------aagtgttacacttaagactatcaca 29173723  T
Q  273 tgatatcaacaattctgt-------taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatc 365  Q
    | |||||| ||| |||||       | || ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29173724 taatatcatcaactctgtttgcatgttaaaatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatc 29173823  T
Q  366 attaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29173824 atgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 29173865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 10481578 - 10481948
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttgg-tgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacagt 144  Q
    |||||||||||| || |||| |  | ||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||| | |  ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  10481578 ggaaaattctatggtaaagttaggagaatgactttttttaatgaagttaacactataacataaaaaatataatgagtaacacccccactgtttgtacaat 10481677  T
Q  145 gacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc 244  Q
    |||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  10481678 gacatcaaaaattcagtctttatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacgcttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacacccc 10481777  T
Q  245 acaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 336  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||| ||||||  |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  10481778 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctctttgcatgtcaaagattccaacaataaaatagtatccgtaagtccaagatgttgc 10481877  T
Q  337 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  10481878 aagtattactagatgaattactattgatcgttaatcagtaattaacaatttaaaaataaattaaatattaa 10481948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 48 - 335
Target Start/End: Original strand, 38258521 - 38258816
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgac 147  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||  ||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  38258521 gaaaattctacggtgaagtcataaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccacaccgtttgtacaatgac 38258620  T
Q  148 atcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  38258621 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccaca 38258720  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 335  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |         ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38258721 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 38258816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 167 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15672828 - 15672577
Alignment:
Q  167 tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaact 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  15672828 tagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaagact 15672729  T
Q  267 atcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataa---aatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 355  Q
    ||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15672728 atcacataatatcatcaactctatttgaatgttaaagatgccaacgataaaataatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaatt 15672629  T
Q  356 actattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15672628 actattgatcatgcatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaa 15672577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 49 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 27421563 - 27421322
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27421563 aaaattctatggtgaagtcgtgataatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatgaca 27421464  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    ||||||||||||| ||  || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27421463 tcaaaagttcagt-cctataatatcataaatttatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacatcccacaa 27421365  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt 291  Q
    ||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||| ||||||    
T  27421364 agtgtaacacttaagactatcgtatgatatcagcaactctgtt 27421322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 141 - 400
Target Start/End: Original strand, 44598735 - 44599002
Alignment:
Q  141 cagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca 240  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44598735 cagtggcatcaaaaattcaatccccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaaca 44598834  T
Q  241 ccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 332  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||        ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  44598835 ccccacaaagtgtaacacctaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaataatacatgtaagtctaagatg 44598934  T
Q  333 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatc---agtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 400  Q
    || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  44598935 ttacaagcattactagatgaa--actattgatcattaatcaataataatcaacaattt-aaaatgaatcaa 44599002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 133 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 37703590 - 37703316
Alignment:
Q  133 tgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaa 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||        |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  37703590 tgtttgtatagtgacatcaaaagttcagtctccatagtatcatca--------gattaataagactacacttaatctaattttatcatatcttattttaa 37703499  T
Q  233 gtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagt 324  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||| ||| | ||||        ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  37703498 gtgtaacatcccacaaagtgtaccacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagt 37703399  T
Q  325 ccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37703398 ccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaa 37703316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 84 - 407
Target Start/End: Original strand, 35353120 - 35353451
Alignment:
Q  84 tggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagtt-cagtccccttagtatcatcaattca 182  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||  |||||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  35353120 tggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccattgtttgtacgatggaatcaaaagtttctgtccccatagtatcaccaattca 35353219  T
Q  183 tcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaac 282  Q
    |||||||||||||| | || ||| |  |  |    | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| ||| |||||| |    
T  35353220 tcagattaacaagactgca-ttactagatgtaacacttaccttgttttaagtgtaacaccccagaaaatgtaacacttaagactatctcataatatcatc 35353318  T
Q  283 aattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcag 374  Q
    || | |        |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35353319 aactatatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatcactattgatcattaatcag 35353418  T
Q  375 taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35353419 caatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaa 35353451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 79 - 407
Target Start/End: Original strand, 43925113 - 43925438
Alignment:
Q  79 ttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaa 178  Q
    |||||| |||||||||| | | ||  || |||| |||||||||||||||| ||||||    ||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  43925113 ttttttagtgaagttaacattgtagtataaaaaatgttgtgagtaacacctcactgt----acaatgacatcaaaagttcagtctacatagtatcatcaa 43925208  T
Q  179 ttcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 278  Q
     | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||| || || ||||||| ||||    
T  43925209 ct-atcagactaacaataatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgcaacacctcacaacgtttaatacttaatacaatcacataatat 43925307  T
Q  279 caacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 370  Q
    || ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||| |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  43925308 catcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatac------gtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcatgaa 43925401  T
Q  371 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43925402 tcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 43925438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12390816 - 12390622
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12390816 ggaaaattctatggtgaagtcatcagatcgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgtaatgagtaacatcccactgtttgtgcagtga 12390717  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 241  Q
    |||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12390716 catcaaaagttatgtccccatagtattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttcttttaagtgtaacac 12390622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 180 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 46481182 - 46480947
Alignment:
Q  180 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 279  Q
    ||||||||||||||||| || |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  46481182 tcatcagattaacaagactatacttgatgtaattttattctacattgttttaagtgtaacatctcataaagtgtaacacttaagactatcacataatatc 46481083  T
Q  280 aacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 371  Q
    |  || | ||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46481082 attaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaat 46480983  T
Q  372 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  46480982 cagtaatcaacaatttaaaaataaataaaacattaa 46480947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 44413564 - 44413353
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttgg-tgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgac 147  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  44413564 aaaattctatggtaaagtcatgaaaatgactttttttaatgaagttaacactataacatcaaaaatatagtgagtaacaccccaatgtttgtacactgaa 44413465  T
Q  148 atcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44413464 atcaaaagttcggtctccatagtatcttcaattcatcaaattaacaaggctacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccccaca 44413365  T
Q  248 aagtgtaacact 259  Q
    ||||||||||||    
T  44413364 aagtgtaacact 44413353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 48928748 - 48928517
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgac 147  Q
    ||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |    
T  48928748 gaaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactatttgtacggtgcc 48928649  T
Q  148 atcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |    
T  48928648 atcaaaagttcagt-cccatagtattatcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattattttaagtgtaacacctcaga 48928550  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 280  Q
    ||||||||  || || |||||| ||| ||||||    
T  48928549 aagtgtaatgcttaagactatcgcataatatca 48928517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 291
Target Start/End: Original strand, 37704241 - 37704376
Alignment:
Q  156 ttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37704241 ttcagtccccatagtatcatcaatttatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 37704340  T
Q  256 cactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt 291  Q
    |||| || ||||||| || |||||| ||| ||||||    
T  37704341 cacttaagactatcatataatatcatcaactctgtt 37704376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 288 - 407
Target Start/End: Original strand, 37704406 - 37704525
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37704406 tgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattaccagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaattt 37704505  T
Q  388 aaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  37704506 acaaatgaatcaaacattaa 37704525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 288 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 44411477 - 44411358
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44411477 tgttaaagatgccaacgataaaatattatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattaatattgaccattaatcagtaatcaacaattt 44411378  T
Q  388 aaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  44411377 aaaaatgaatgaaacattaa 44411358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 288 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 12390586 - 12390467
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 387  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  12390586 tgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaccattactagatgaattactatttatcattaatcagtaattgacaattt 12390487  T
Q  388 aaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||  |||||||||    
T  12390486 aaaaatgaaataaacattaa 12390467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 288 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 34362115 - 34361996
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 387  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  34362115 tgttaaaaatatcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaaacattactagatgaattacttttgatcattaatcagtcattaacaattt 34362016  T
Q  388 aaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34362015 aaaaatgaatcaaacattaa 34361996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 26524513 - 26524364
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||     
T  26524513 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgatgttaacactataacatcaaaaatgttgtgactaacactccattgtttgtgcagtgg 26524414  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaaga 196  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26524413 catcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaatttatcatattaacaaga 26524364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 32593324 - 32593040
Alignment:
Q  97 actataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaaga 196  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  32593324 actatagcattaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttatatggtggtatcaaaagttcagtctcac-agtatcatcaattcatcagattatcaaaa 32593226  T
Q  197 atacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt----- 291  Q
     | || |||||||||||||||| |||||||||||||                 |||||||||| || |||||| ||| |||||| ||| | ||||         
T  32593225 ctgcatttaatctaattttatcataccttgttttaa-----------------gtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcat 32593143  T
Q  292 ---aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattta 388  Q
       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  32593142 gttaaagatgtcaacgttaaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaaatattactagataaattactatggatcattaatcagcaatcaacaattta 32593043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 241
Target Start/End: Original strand, 38053493 - 38053647
Alignment:
Q  79 ttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaa 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||| |||||||    
T  38053493 ttttttggtgaagttaatactataacataaaaaatgtaatgagtaaaaccctactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagttctcatagtgtcatcaa 38053592  T
Q  179 ttcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 241  Q
            |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  38053593 --------attaacaagactacacttaatctaattttatcatactttgttataagtgtaacac 38053647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 34362334 - 34362205
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| ||||| | || | |||||||||| | |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34362334 ggaaaattctatggtgaaattatgagaatgacttttctaggaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 34362235  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatca 177  Q
    |||| |||||||||| | | |||||||||||    
T  34362234 catc-aaagttcagttctcatagtatcatca 34362205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 352 - 407
Target Start/End: Original strand, 38258867 - 38258922
Alignment:
Q  352 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38258867 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 38258922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27421283 - 27421219
Alignment:
Q  307 aaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  27421283 aaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaatgttacaagatgaaataatattgatcattaat 27421219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 44598378 - 44598437
Alignment:
Q  86 gtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  44598378 gtgaagttaatactataatatcaaaaatgttgtgagtaacactctactgtttggacagtg 44598437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 354
Target Start/End: Original strand, 38053685 - 38053751
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 354  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  38053685 tgttaaagattccaacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaaacattatttgatgaat 38053751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 241069 - 241024
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagt 92  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  241069 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagt 241024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 111
Target Start/End: Original strand, 8299192 - 8299254
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||    
T  8299192 aaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaacactatagtatcaaaa 8299254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 34095932 - 34095888
Alignment:
Q  50 aaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagtta 94  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  34095932 aaattctatggtgaagtcattcaattgacttttttggtgaagtta 34095888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 143
Target Start/End: Original strand, 37704143 - 37704239
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaag-tgttgtgagtaacaccccactgtttgtacag 143  Q
    ||||||||||||  |||| | || ||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  37704143 ggaaaattctatgatgaaattataaaaatgattttttta-tgaagttaacactatagcataaaaaaatgtagtgagtaacaccccattgtttgtacag 37704239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 46481250 - 46481217
Alignment:
Q  60 gtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagtt 93  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46481250 gtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagtt 46481217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 101
Target Start/End: Original strand, 3953733 - 3953785
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactat 101  Q
    ||||||||||  ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3953733 aaaattctatgatgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaatcctat 3953785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 6444242 - 6444198
Alignment:
Q  50 aaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagtta 94  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  6444242 aaattctatggtgaagtcattcaattgactttttcggtgaagtta 6444198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 8133609 - 8133561
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  8133609 ggaaaattctactgtgaagtcataagaataacttttttggtgaagttaa 8133561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 23402419 - 23402371
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||||||| | |||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  23402419 ggaaaattctatggcgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaa 23402371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 61)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 38643977 - 38644345
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  38643977 ggaaaattctatggtgaaatcatgagaatgacttttttggtcaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtctagtgg 38644076  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  38644077 catcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccat 38644176  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38644177 aaagtgtaacactcaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 38644276  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  38644277 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaaaaatttaaaaataaatcaaacattaa 38644345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 6098709 - 6098336
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6098709 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaataacttttttggtgaagttaatactatagcatcaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 6098610  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6098609 catcaaaagttcagtccccatagtatcgtcaattcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccccac 6098510  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacg-----ataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 333  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||| |||||     ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6098509 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgatacaatacaatagtacttgtaagtccaagatgt 6098410  T
Q  334 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6098409 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 6098336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 5300137 - 5299769
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||     
T  5300137 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttaatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtaagtagcactctactgtttgtacagtgg 5300038  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5300037 catcaaaagttcagtccttatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacaccccac 5299938  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || | ||||| ||||||||| |||||         ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5299937 aaagtgtaacacttaagattatcaaatgatatcagcaattttgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 5299838  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5299837 gcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaa 5299769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 36695157 - 36694789
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36695157 ggaaaattctatggtgaagtcaggaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatga 36695058  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36695057 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccac 36694958  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36694957 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaaatccaagatgttgcaa 36694858  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  36694857 gcatcactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaataatttaaaaataaatcaaacattaa 36694789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Original strand, 465843 - 466199
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  465843 aaaattttatggtgaagtcattaaaatgacttttgtggtgaagttaacacgataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggca 465942  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  465943 tcaaaaattcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccccacaa 466042  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    ||||||||||         |||||| |||||| ||| ||        ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  466043 agtgtaacac---------tcacat-atatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaataatacctgtaagtctaagatgttgcaagc 466132  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  466133 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 466199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16447066 - 16446698
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||     
T  16447066 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgataaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtataatgg 16446967  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16446966 catcaaaagtttagtccccatactatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccac 16446867  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    |||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16446866 aaagcgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 16446767  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16446766 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatctaacattaa 16446698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 73 - 400
Target Start/End: Original strand, 11727049 - 11727384
Alignment:
Q  73 aatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtat 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | || |||    
T  11727049 aatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtaagtaacaccccactatttgtatagtggcatcaaaagttcagtcctcataatat 11727148  T
Q  173 catcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcaca 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  11727149 catcaattcatcaaattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcaca 11727248  T
Q  273 tgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 364  Q
    |||||||||||| |         ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11727249 tgatatcaacaactttgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 11727348  T
Q  365 cattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11727349 cattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 11727384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 401
Target Start/End: Original strand, 9864147 - 9864509
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9864147 ggaaaattctataatgaagtcacgaaaatgacttttttggtgaaattaacactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatga 9864246  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864247 catcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 9864346  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||         ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9864347 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgcaa 9864446  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 401  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864447 gcattactagatgaataactagtaatcatgaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 9864509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27083029 - 27082661
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  27083029 ggaaaattctatggtgaagtcatcagactgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacaccccactgtttgtgcagtgg 27082930  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |    
T  27082929 cattaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccatgttttaagtctaacaccccgc 27082830  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||  || |         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27082829 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 27082730  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27082729 gcattactagatgaattactacttatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaa 27082661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 53 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 37970704 - 37970342
Alignment:
Q  53 ttctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaa 152  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  37970704 ttctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgccatcaa 37970605  T
Q  153 aagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtg 252  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37970604 aagttcagccctcatagtatcatcaattcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtg 37970505  T
Q  253 taacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatta 344  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37970504 taacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatccttacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatta 37970405  T
Q  345 ctagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37970404 ctagatgaattactgttgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 37970342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 34894966 - 34895329
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  34894966 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaagtgg 34895065  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  34895066 catcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccac 34895165  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||| ||||||||     |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34895166 aaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgaaaaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaa 34895260  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34895261 gcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 34895329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 12876108 - 12876477
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| || ||||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  12876108 ggaaaattctatggttaagtcacgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatataaaaaatgttgtgagtaacacccaactgtttgtacaatga 12876207  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12876208 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaagaaggatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccac 12876307  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaa-actatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12876308 aaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttaca 12876407  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  12876408 ggcattactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaacagtttgaaaataaatcaaacattaa 12876477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 403
Target Start/End: Original strand, 1204926 - 1205290
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| ||  |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  1204926 ggaaaattttacggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataacataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 1205025  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1205026 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatcatattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagcgtaacaccccac 1205125  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||| |||||| ||| ||        |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1205126 aaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 1205225  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaca 403  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1205226 gtattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcagcaatttaaaaatgaatcaaaca 1205290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 43643786 - 43643418
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| | |||||||||||| |||    
T  43643786 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgactattttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactctactgtttgtacaatga 43643687  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||| |||||||| ||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  43643686 catccaaagttcaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcac 43643587  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||| | ||| ||        ||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43643586 aaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 43643487  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43643486 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcgacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 43643418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 47 - 354
Target Start/End: Original strand, 13307622 - 13307936
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13307622 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactatttgtacagtga 13307721  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  13307722 catcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcatcagattagcaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaaatgtaacaccccac 13307821  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgt-------taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||       | || |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  13307822 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaaatgtcaacgataaaatagtacccgtaagttcaagatgttgcaag 13307921  T
Q  340 cattactagatgaat 354  Q
    |||||| ||||||||    
T  13307922 cattacaagatgaat 13307936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 40862418 - 40862787
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaag-tgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 145  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40862418 ggaaaattctatagtgaagtcacgaaaataacttttctggtgaagttaacactataatatcaaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatg 40862517  T
Q  146 acatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
     |||||||||||||||| | |  ||||||||||||  ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  40862518 gcatcaaaagttcagtctcatg-gtatcatcaatttttcatactaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttctaagtgtaacactcca 40862616  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatga---tatcaacaat-----tctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |   ||||||| ||     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40862617 caaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 40862716  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt-aaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40862717 agcattactagatgaattactatttgtcataaatcagtaatcgacaatttaaaaaatgaatcaaacattaa 40862787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 16222862 - 16223230
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||| | | |||||||   |||||| ||||||||| |||    
T  16222862 ggaaaattctacggtgaaatcatgagaatgacttttctggtgaatttaacactataacataaaaaatatagtgagtagttccccacagtttgtacaatga 16222961  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||     
T  16222962 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatccttccttgttttaaacgtaacaccccaa 16223061  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctg--------ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || | |||||||| |||||| ||| | ||        ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16223062 aaagtgtaacacttaagagtatcacataatatcatcaactttgtttgcattttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaa 16223161  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16223162 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 16223230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 23854622 - 23854254
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||| ||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||  |||||||||||| ||||||||| || |||    
T  23854622 ggaaaagtctacggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacacccaactgtttgtgcaatga 23854523  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||     
T  23854522 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcattagattaacaatactacaattaatctaattttatcttacctagttataagtgtaacaccgcat 23854423  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23854422 aaagtgtaacacttaagacaatcacataatatcatcaactctgcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 23854323  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854322 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 23854254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 118 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1149752 - 1149455
Alignment:
Q  118 tgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttat 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1149752 tgagtaacaacccactgtttgtacaatgacatcaaaagttctgtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttat 1149653  T
Q  218 cctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaa 309  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| | ||| |         ||||||||||  ||||||||||    
T  1149652 cttaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaa 1149553  T
Q  310 atagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1149552 atagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 1149455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 8803997 - 8803639
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| |||||| | |||    
T  8803997 ggaaaattctatggtgaagtcat----atgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactccactatttgtagaatga 8803902  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||||||||| |       ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |     
T  8803901 catcaaaagttcagcc-------tatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctaa 8803809  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |||        |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8803808 aaagtgtaacacttaatactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 8803709  T
Q  339 gcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8803708 gcattaccagatgaatatactattgatcattaatcagtaatgaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 8803639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 44869495 - 44869864
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgtt--gtgagtaacaccccactgtttgtacagt 144  Q
    |||||||||||  ||||| | || | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |  |||||||||||| ||| |    
T  44869495 ggaaaattctacggtgaaattataagaataacttttttggtgaagttaacactataacattaaaagtattttgtgagtgat-ccccactgtttgcacaat 44869593  T
Q  145 gacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccc 243  Q
    ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||    
T  44869594 gacatcaaaagttcaatcgtcatagtatcatcaatttatcagattaacaataatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgttgt-ccc 44869692  T
Q  244 cacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa------ttc--tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 335  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||      |||  |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||    
T  44869693 cacaaagtgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacgataaaatagtaccgataagtccaagatattg 44869792  T
Q  336 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44869793 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaaccaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 44869864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 7891137 - 7890780
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |         ||||| |||| ||||||||| || ||    
T  7891137 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgactttttttgtgaagttaacactataacatcaaaaat---------aacactccaccgtttgtacaatggca 7891047  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    |||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  7891046 tcaaaagttcggtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacactcaatctagttttatcttactttgttataagcgtaacaccccacaa 7890947  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctg--------ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
     |||||||||| || | |||||||| |||||| ||| ||||        ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7890946 cgtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactctggttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagc 7890847  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7890846 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaa 7890780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 39099300 - 39098942
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| || |||        ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||| |      
T  39099300 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctgatga--------ctataacatcaaaagt--tgcaagtaacaccccactctttgtacactag 39099211  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  39099210 catcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcttaccctgttttaagtgtaacatcccac 39099111  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||| | ||||| || |||||| |||||||||| ||| ||        ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  39099110 aaagtatcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtatatgtaagtccaaaatgttgcaa 39099011  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  39099010 gcattactagatgaattactattgatcattaattaataatcaataatttaaaaatgcatcaaacattaa 39098942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10555393 - 10555028
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||  |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  10555393 ggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccactgtttgtacaatga 10555294  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||    
T  10555293 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgcaacacctcac 10555194  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    |||  ||||||||    |||||||||| |||||| ||| |         ||||||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10555193 aaaacgtaacact--tgactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaa 10555096  T
Q  339 gcattactagatgaatt--actattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10555095 gcattactagatgaattacactattgatcatta---agtaataaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 10555028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 30654774 - 30654406
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||  | |||    
T  30654774 ggaaaattttatggtgaagtcataagagtgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgttgaatga 30654675  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||||||||| |  | ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  30654674 catcaaaagttcagccttcatagtatcatcacttcatcaggttaacaagactacacttaatttaattttaccatacattgttttaagcgtaacaccctac 30654575  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||  || ||        ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30654574 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgttaaaaatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 30654475  T
Q  339 gcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  30654474 gcattactaaatgaatatattattgatcattaatcagtaattaacaattt-aaaatgaatcaaatattaa 30654406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 48 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 31934076 - 31933709
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgac 147  Q
    ||||||||||  ||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| | |  |||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  31934076 gaaaattctaacgtgaagttatgagaatgatttttttggtgaagttaacactatgatatcaaaaatataatgagtaacaccccactctttatacaatgac 31933977  T
Q  148 atcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||| ||||    
T  31933976 atcaaaagttcagtcattatagtatcatcaattcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcataataccgcaca 31933877  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| ||        |||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||      
T  31933876 aagtgtaacacttaaaattatcacataatatcatcaagtctgtttgcatgttaaggattccaacaataaaatagtacttgtaagtctaagatattgcaga 31933777  T
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  31933776 cattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaaatattaa 31933709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 47 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34952222 - 34952028
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34952222 ggaaaattctatagtaaagtcattaaaatgacttttctggtcaagttaacactatatcatcaaaagtgttgtgagtaacagcccactgtttgtacagtga 34952123  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34952122 catcaaaagttcagtccctttagtatcatcaattcatcaaattaataagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacac 34952028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 47 - 398
Target Start/End: Original strand, 33906223 - 33906568
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| ||||| | || | |||||||||| ||||||||| || ||||||  || |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||          
T  33906223 ggaaaattctatggtgaaattatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactatagtattaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttata------ 33906316  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
          ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||     
T  33906317 ------aagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaagggtaacattccaa 33906410  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||| |||||| ||| | ||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906411 aaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 33906510  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  33906511 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatca--aatttaaaaatgaatc 33906568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 124 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1954104 - 1953811
Alignment:
Q  124 acaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatc-atcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctac 222  Q
    |||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| |||    
T  1954104 acaccctactatttggacagtggcatcaaaagttcagccctcatagtatctatcaattcatcagattaatatgactacactaaatctaattttatcatac 1954005  T
Q  223 cttgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatag 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||| ||| ||||||        |||| |||||||||||||||||    
T  1954004 cttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaagttgtcaacgataaaatag 1953905  T
Q  314 tacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1953904 tacctgtaaatccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaattttaaaatgaatcaaacattaa 1953811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 229 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 24823395 - 24823217
Alignment:
Q  229 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24823395 ttaagtgtaacaccccacaaagtataatactcaagattatcacatgatatcaacaactctgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaa 24823296  T
Q  329 gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24823295 gatgttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaa 24823217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 35459888 - 35459534
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgac 147  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| | ||             ||||| ||||||| ||||    
T  35459888 gaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttcgtaaagttaatactataatataaaaaatctt-------------cactgattgtacaatgac 35459802  T
Q  148 atcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    || ||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  35459801 attaaaagttcagtcctcataatatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctactttgttataaatgtaacatcccaca 35459702  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
     | | ||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||        |||||| || || |||||||||||  ||||||||||| |||||||||     
T  35459701 gattataacacttaagactattacataatatcatcaattctgtttgtatgttaaagatttcgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttgcaaa 35459602  T
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35459601 cattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 35459534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 173 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4132750 - 4132509
Alignment:
Q  173 catcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcaca 272  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  4132750 catcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttt-aagtgtaacaccccacaaagtgtaacacataagactatcaca 4132652  T
Q  273 tgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 364  Q
    | |||||| ||| | ||||        ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4132651 taatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 4132552  T
Q  365 cattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4132551 cattaatttgtaatcaacaatttaaaaatgaattacacattaa 4132509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 74 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41911153 - 41910935
Alignment:
Q  74 atgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtat 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||   |||||  |||||||| |||||||  | ||||||    
T  41911153 atgatttttttggtgaagttaatactatatcatcaaaagtgtcgtgagtaacacccccactattataacagtagcatcaaaaattcagtcaacatagtat 41911054  T
Q  173 catcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcaca 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41911053 catcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaatactatcaca 41910954  T
Q  273 tgatatcaacaattctgtt 291  Q
    |||||||| ||| ||||||    
T  41910953 tgatatcaccaactctgtt 41910935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 47 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1150296 - 1150090
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  1150296 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacgctataacatcaaaaatgtaatgagtaacatcccactgtttgtacaacga 1150197  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1150196 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccac 1150097  T
Q  247 aaagtgt 253  Q
    |||||||    
T  1150096 aaagtgt 1150090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 240
Target Start/End: Original strand, 41362517 - 41362707
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  41362517 ggaaaattctatggtgaagttatgaaaatgacttttttggtgaagttaacactag--cataaaaa-tgtagtgagtaacaccccactatttgtatagtga 41362613  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca 240  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41362614 catcaaaagttcagacctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactaaacttgatataattttatcataccttgttttaagtgtaaca 41362707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 288 - 407
Target Start/End: Original strand, 12587830 - 12587949
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12587830 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaattaacaattt 12587929  T
Q  388 aaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12587930 aaaaatgaatcaaacattaa 12587949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 194 - 407
Target Start/End: Original strand, 18259229 - 18259446
Alignment:
Q  194 agaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc------ 287  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||     ||||| ||||||| |||||           
T  18259229 agaatacatttaatttaattttatcataccttattttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacctaag----tcacaagatatcagcaatttaatttg 18259324  T
Q  288 --tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaat 385  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||    
T  18259325 catgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattattgttgatcagtaatgagtaatcaacaat 18259424  T
Q  386 ttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  18259425 ttaaaaatgaatcaatcattaa 18259446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 288 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 34951999 - 34951880
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34951999 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagtcttactacatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 34951900  T
Q  388 aaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34951899 aaaaatgaatcaaacattaa 34951880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 288 - 407
Target Start/End: Original strand, 35859182 - 35859301
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35859182 tgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagttcgagatgttgcaagcattactagatgaattaatattgatcattaatcagtaatcaacaattt 35859281  T
Q  388 aaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  35859282 aaaaatgaatcaaacattaa 35859301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 79 - 289
Target Start/End: Original strand, 43025733 - 43025943
Alignment:
Q  79 ttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaa 178  Q
    |||| ||||||||||||   ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||  || ||||||||||| |   || |||||||||    
T  43025733 ttttatggtgaagttaacgatatagtatcaaaagtgttgtgattaataccccactctttgtacaatggtattaaaagttcagttcatataatatcatcaa 43025832  T
Q  179 ttcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 278  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43025833 ttcatcagactaagaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaactgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaactatcacataatat 43025932  T
Q  279 caacaattctg 289  Q
    || ||| ||||    
T  43025933 catcaactctg 43025943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 288 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1149862 - 1149756
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 387  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1149862 tgttaaagattccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 1149763  T
Q  388 aaaaatg 394  Q
    |||||||    
T  1149762 aaaaatg 1149756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 295 - 407
Target Start/End: Original strand, 33198057 - 33198169
Alignment:
Q  295 gatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg 394  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33198057 gatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcatcactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatg 33198156  T
Q  395 aatcaaacattaa 407  Q
    |||||| ||||||    
T  33198157 aatcaatcattaa 33198169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 155 - 241
Target Start/End: Original strand, 7998401 - 7998488
Alignment:
Q  155 gttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaa-ttttatcctaccttgttttaagtgtaacac 241  Q
    |||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7998401 gttcggtccccataatatcatcaatacatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacac 7998488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 341 - 407
Target Start/End: Original strand, 41362723 - 41362789
Alignment:
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41362723 attactagatgaattactattgatcattaaccagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaa 41362789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 340 - 407
Target Start/End: Original strand, 43025974 - 43026041
Alignment:
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43025974 cattattagataaattactattgatcatgaatcagtgatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 43026041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 111
Target Start/End: Original strand, 15009241 - 15009305
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaa 111  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15009241 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaa 15009305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 236
Target Start/End: Original strand, 33197948 - 33198029
Alignment:
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgt 236  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  33197948 catcaaaagttcagtctccataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacac--------attttatcctaccttgttttaagtgt 33198029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 361
Target Start/End: Original strand, 34463722 - 34463792
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34463722 tgttaaagatgtcaacgataaaataatacctataagtcc---atgttgcaagcattactaaatgaattactatt 34463792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4133199 - 4133085
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| ||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||   ||| ||||   | |||||||| |||  |||||||||||||||     
T  4133199 ggaaaattttatggtcaagtcatcagaatgacttttttggtgaagttaacactag--cataaaaaagatagtgagtaatacctgactgtttgtacagtgg 4133102  T
Q  147 catcaaaagttcagtcc 163  Q
    |||||||||||||||||    
T  4133101 catcaaaagttcagtcc 4133085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24823463 - 24823378
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccac 132  Q
    ||||||| |||| || |||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||    
T  24823463 ggaaaatactatggtaaagttatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataatatcaaaagtgttaagtgtaacaccccac 24823378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 35736030 - 35735983
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaat 96  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35736030 aaaattctatggtgaagtcattagaatgacttttttggtgaagttaat 35735983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 23176805 - 23176763
Alignment:
Q  53 ttctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23176805 ttctatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaa 23176763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 4108960 - 4108912
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4108960 ggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtaaagttaa 4108912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Original strand, 33197891 - 33197957
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagt 113  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||| | |||| || | |||||||||||||| ||||||||||    
T  33197891 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaataatttttctgattaagttaatactatagcatcaaaagt 33197957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 1835437 - 1835392
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagt 92  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  1835437 ggaaaattctatggtgaagttgttagaatgacttttttggtgaagt 1835392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 1879278 - 1879233
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagt 92  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  1879278 ggaaaattctatggtgaagttgttagaatgacttttttggtgaagt 1879233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 95
Target Start/End: Original strand, 5018013 - 5018058
Alignment:
Q  50 aaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  5018013 aaattctatggtgaagtcatgataatgacttttttagtgaagttaa 5018058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 8151453 - 8151412
Alignment:
Q  54 tctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8151453 tctatggtgcagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaa 8151412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 273
Target Start/End: Original strand, 12585297 - 12585341
Alignment:
Q  229 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacat 273  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||    
T  12585297 ttaagtgtaacaccccacaaaatctaacacttaatactatcacat 12585341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 28221003 - 28220955
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    ||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  28221003 ggaaaattctatgataaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaa 28220955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 41191066 - 41191019
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  41191066 ggaaaatt-tatggtgaagttatgaaaatgacttttttggtgaagttaa 41191019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 67)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 1547283 - 1547635
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  1547283 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataacataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagtgg 1547382  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1547383 catcaaaagttcagttctcatagtatcat--------cagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccac 1547474  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattact 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1547475 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaactctgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattact 1547574  T
Q  347 agatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1547575 agatgaattaccattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 1547635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 73 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27533134 - 27532794
Alignment:
Q  73 aatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtat 172  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27533134 aatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtattgtgggtaacaacccactctttgtacagtggcatcaaaagttcaatccccatagtat 27533035  T
Q  173 catcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcaca 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27533034 catcaattcatcagattaacaagaatacacttaatc-aattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacactcaagactatcaca 27532936  T
Q  273 tgatatcaacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 364  Q
    |||||||| |||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27532935 tgatatcagcaattctgtttgcaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 27532836  T
Q  365 cattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27532835 cattaatcagtaatcaacaa-ttaaaaatgaatcaaacattaa 27532794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 2959744 - 2960112
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2959744 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtaagtaacatcccactgtttgtacagtga 2959843  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2959844 catcaaaagttcagtcctcatagtgtcatcaattcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatcccac 2959943  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |         ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2959944 aaattgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaa 2960043  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2960044 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 2960112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 38823210 - 38823578
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  38823210 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggttaagttaacactatagcatcaaaattgttgcgagtaacaccccactatttgtacagtgt 38823309  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  38823310 catcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaagtgtaacacccaac 38823409  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||        ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||    
T  38823410 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttagagatgccaacgataaaataatacctgtaagtctaaaatgttgcaa 38823509  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  38823510 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaacaaatattaa 38823578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 60 - 407
Target Start/End: Original strand, 47279198 - 47279553
Alignment:
Q  60 gtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttca 159  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  47279198 gtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacattatactatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcgaaagttca 47279297  T
Q  160 gtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 259  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  47279298 gtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaattgtaacatcccataaagtgtaacact 47279397  T
Q  260 caaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 351  Q
     || ||||||||||||||||||||| |         ||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  47279398 taagactatcacatgatatcaacaactatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattattagatg 47279497  T
Q  352 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47279498 aattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 47279553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 10182188 - 10181819
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| | | ||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  10182188 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaaaactgtaacataaaaaatatagtgcgtaacacgccactgtttgtacagtgg 10182089  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10182088 catcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 10181989  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagta-catgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||| |||| ||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  10181988 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgacaacaatacaatagtaccttgtaagtccaaaatgttgca 10181889  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10181888 agcattactagatgaattactattgaacattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 10181819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 16415641 - 16416010
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccac-tgtttgtacagtg 145  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  16415641 ggaaaattctaaggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacaccctaaatgtttgtacagtg 16415740  T
Q  146 acatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
     |||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16415741 gcatcaaaagttcagccatcatagtatcatcaattcattagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaatacccca 16415840  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    || | ||||| ||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16415841 catattgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 16415940  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16415941 agcattattagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 16416010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 238690 - 238325
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || |||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  238690 aaaattctatagtgaagtcacgaaaataacttttttggtgaagttaacactatagtattaaaaatgttgtgagtaacatcc-actgtttgtacaatgaca 238592  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  238591 tcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattaatcagactaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 238492  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa--------ttctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||| |||         | ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  238491 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataatatctgtaagtccaagatgttgcaagc 238392  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  238391 attactagatgaattactattaatcatgaatcagtaatccacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 238325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 7079254 - 7078875
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccact-----------gt 135  Q
    |||||||| ||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           ||    
T  7079254 ggaaaattttatggtaaagtcatgataatgacttttttggtgaagttaacactataatatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactaacacctcactgt 7079155  T
Q  136 ttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtg 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079154 ttgtacaatgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtg 7079055  T
Q  236 taacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtcca 327  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||        ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  7079054 taacaccccacaaagtataagacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtcta 7078955  T
Q  328 agatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7078954 agatattgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaa 7078875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 15382929 - 15383298
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||| ||     
T  15382929 ggaaaattctatggtgaagttataaaaatgacttttttggtgaaattaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacatcccaccgtttgtacaatgt 15383028  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15383029 catcaaaagttcagtcatcgtagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccac 15383128  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |         ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15383129 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtatgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaa 15383228  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15383229 gcattactagatgaattactattgattattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaa 15383298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 3534928 - 3535287
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||| | |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  3534928 ggaaaattctattatgaagtcattagaattaattttctagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccttactgtttgtgcagtga 3535027  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3535028 catcaaaagttcagtccccttaatattatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctgccttgttttaagtgtaacaccccac 3535127  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||         | ||||||||||| ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3535128 aaagtgtaacac---------ttacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttgcaa 3535218  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3535219 gcattactagatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 3535287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 34012557 - 34012194
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  34012557 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacgtttatgatgaagttaacactataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaagtgg 34012458  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  34012457 catcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccac 34012358  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||| ||||||||     |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  34012357 aaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagttcaagatgttgcaa 34012263  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34012262 gcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 34012194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 66 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 9903215 - 9902866
Alignment:
Q  66 tcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcccc 165  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9903215 tcatgaaaatgacttttttgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacaccccgctgtttgtacagtgacatcaaaagttcaatccac 9903116  T
Q  166 ttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaac 265  Q
     || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  9903115 atactatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttacattgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagac 9903016  T
Q  266 tatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac 357  Q
    |||||||| |||||| ||| |         ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9903015 tatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtaccagtaagtccaagatgctgcaagcactactagatgaattac 9902916  T
Q  358 tattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9902915 tattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaa 9902866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 32267030 - 32267398
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32267030 ggaaaattttatggtgaagtcataagaatgactttttttgtgaagttaacaatataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatga 32267129  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||| ||| | || |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  32267130 catcaaaagttcactcctcatattatcatcaacccatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacactccac 32267229  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |         ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  32267230 aaagtgtaacactcaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaatattccaactataaaatagtacctgtaggtccaagatgttgcaa 32267329  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32267330 gcattactagatgaattactattgaacattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 32267398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 76 - 400
Target Start/End: Original strand, 51128884 - 51129216
Alignment:
Q  76 gacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcat 175  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||    
T  51128884 gacttttttagtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcattatagtatcat 51128983  T
Q  176 caattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatga 275  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  51128984 caattcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacaattaaaactatcacataa 51129083  T
Q  276 tatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcat 367  Q
    ||||| ||| ||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51129084 tatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcat 51129183  T
Q  368 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51129184 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 51129216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Original strand, 15752027 - 15752393
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  15752027 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatatagtgagtaacacctcactgtttgtacaatggca 15752126  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15752127 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccataa 15752226  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    ||||||||||| || | |||||||| ||||||  || ||        ||||||| ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||      
T  15752227 agtgtaacacttaagagtatcacataatatcattaactctgtttgcatgttaaaaattccaacgacaaaataatacatgtaagtccaagaagttgcaatt 15752326  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15752327 tttactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaa 15752393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27227657 - 27227297
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||   ||| |||| |||  |      |||| ||||||||||||||||     
T  27227657 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactag--cataaaaaatgtact------cacctcactgtttgtacagtgg 27227566  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27227565 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 27227466  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| |         ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27227465 aaagtgcaacacttaagactatcacatgatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaa 27227366  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27227365 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaaccatttaaaaatgaattaaacattaa 27227297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 19899949 - 19899580
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||| | ||     
T  19899949 ggaaaattctatggtgaagtcataataatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacacctcactgtttgtagaatgg 19899850  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| ||    
T  19899849 catcaaaagttcaaccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcatacattgttctaagcgtaacaccctac 19899750  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19899749 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcaccaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 19899650  T
Q  339 gcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19899649 gcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 19899580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 47 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 30327132 - 30326775
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |||| || ||||||||| |      
T  30327132 ggaaaattctatagtgaagtcataaaaatgactttttttgtgaatttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaatacccaaccgtttgtacaatag 30327033  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  30327032 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccac 30326933  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |         ||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30326932 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatttaagtccaagatgttgcaa 30326833  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaa 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30326832 gcattactagatgaattactattgatcatcaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaa 30326775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 8222127 - 8222492
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||   ||| ||     
T  8222127 ggaaaattctacggtgaagtcataaaaatgacctttttagtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccacaccgtt---acaatgg 8222223  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8222224 catcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccac 8222323  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8222324 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 8222423  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8222424 gcattactagatgaatta-tattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaa 8222492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 60 - 407
Target Start/End: Original strand, 37451295 - 37451649
Alignment:
Q  60 gtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttca 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||  | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  37451295 gtgaagtcataaaaatgacttttttggtaaagttaacactataacatcaaaaatgtaataagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagttca 37451394  T
Q  160 gtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 259  Q
    |||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  37451395 gtcctct-agtatcatcaatttatcatattaacaagactacacttaatctaattttatctgaccttgttataagtgtaacacctcaaaaagtgtaacact 37451493  T
Q  260 caaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 351  Q
     || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37451494 taagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatg 37451593  T
Q  352 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37451594 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 37451649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 42721035 - 42721400
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42721035 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttttggtgaagttagccctatatcataaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagtaa 42721134  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42721135 catcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccac 42721234  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||| ||||||| || | |||||| | |||||| ||| |         |||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42721235 aaagtataacacttaagattatcacgtaatatcatcaactttgtttgcatgttaaaga---caacgataaaatattacatgtaagtccaagatgttgcaa 42721331  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42721332 ttattactagattaattactattgatcattaatgagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaa 42721400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 405
Target Start/End: Original strand, 3309144 - 3309515
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  3309144 ggaaaattctatggtaaagtcatgagaatgacttttctggtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccc-actgtttgtacagtgg 3309242  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaa-ttttatcctaccttgttttaagtgtaacacc--- 242  Q
     |||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||       
T  3309243 tatcaaaagttcaatcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaaatgtaacacctca 3309342  T
Q  243 --ccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 332  Q
       ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||| ||        ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  3309343 ctacactaagtgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacccgtaagtccaagata 3309442  T
Q  333 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3309443 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt 3309515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11742530 - 11742180
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| ||| ||||||| || | |||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11742530 ggaaaattttatcgtgaagttatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatattatcaaaagtgttgtaagtaacaccccactgtttgtacagtga 11742431  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||                    
T  11742430 catcaaaagttcagt-cccataatatcatcaattcatcggattaacaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgtttt---------------- 11742348  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
     |||||||||| | || ||||||||||||||||| ||| ||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11742347 -aagtgtaacaattaagactatcacatgatatcagcaactctctttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 11742249  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11742248 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 11742180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 405
Target Start/End: Original strand, 18422647 - 18423006
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |   |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  18422647 ggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatataacgagtaacaccccaccgtttgtacaatga 18422746  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  18422747 catcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttatatgcgtaacaccccac 18422846  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||  ||        ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18422847 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcacctccgtttgcatgttaaagattccaacgataaaaaagcacatgtaagtccaagatgttgcaa 18422946  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt 405  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18422947 gcattgctagatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt 18423006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 84 - 407
Target Start/End: Original strand, 32216088 - 32216419
Alignment:
Q  84 tggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcat 183  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  32216088 tggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaatggcgtcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcat 32216187  T
Q  184 cagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaaca 283  Q
     |||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  |    
T  32216188 tagattaacaaaactaaacttaatcaaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataa 32216287  T
Q  284 attc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagt 375  Q
    | ||        ||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32216288 actctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcagt 32216387  T
Q  376 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32216388 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 32216419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 60 - 407
Target Start/End: Original strand, 4330288 - 4330645
Alignment:
Q  60 gtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaat-actataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacagtgacatcaaaagtt 157  Q
    ||||||| || | |||||||||| || ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||    
T  4330288 gtgaagttatgagaatgacttttctgatgaagataaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacacccccaatgtttgtacagtgggatcaaaagtt 4330387  T
Q  158 cagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaaca 257  Q
    |||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4330388 cagtcatcatagtatcatcaatttatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaaatgtaaca 4330487  T
Q  258 ctcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactaga 349  Q
    || || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4330488 cttaagactatcacataatatcatcaactctttttgcatgttaaagatgtcaaagataaaatagtacttgtaagtccaatatgttgcaagcattactaga 4330587  T
Q  350 tgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4330588 tgaattacaattgatcattaatcagtaatcaacaatataaaaatgaatcaaacattaa 4330645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 60 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28564948 - 28564595
Alignment:
Q  60 gtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttca 159  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28564948 gtgaagttatgaaaatgatttttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccttactgtttgtacaatgacatcaaaagttca 28564849  T
Q  160 gtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 259  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||    
T  28564848 gtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcatgccttgttataagcataacaccccgtaaagtgtaacact 28564749  T
Q  260 caaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 351  Q
       ||||||||||| |||||| ||| ||        |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28564748 --taactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatg 28564651  T
Q  352 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28564650 aattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 28564595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 15168085 - 15168460
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtaca---- 142  Q
    |||||||||||| ||||||| || | ||||  |||| ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||         
T  15168085 ggaaaattctatcgtgaagtgatgagaatgctttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacgttgt 15168184  T
Q  143 ---gtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaac 239  Q
       ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15168185 acggtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcagttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaac 15168284  T
Q  240 accccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagat 331  Q
    ||| || ||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||| ||| | ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15168285 acctcagaaagtgtaacacttaaggctatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtacaagat 15168384  T
Q  332 gttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15168385 gttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaa 15168460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 23999343 - 23999712
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||| | |   ||||||||||||||| |||||| | |||    
T  23999343 ggaaaattttatggtgaagtcataagaatgatttttttggtgaagttaacactacaacataaaaaatataacgagtaacaccccactatttgtagaatga 23999442  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  23999443 catcaaaagttcagccctcatagtattatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctac 23999542  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23999543 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 23999642  T
Q  339 gcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23999643 gcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 23999712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27267376 - 27267012
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||   ||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  27267376 ggaaaattatat-gtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactag--cataaaaaatgtagtgagtgacaccccactgtttgtacagtgg 27267280  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27267279 cattaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttaat-ctaccttgttttgagtgtaacaccccac 27267181  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    |||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  27267180 aaagtgcaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaa 27267081  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  27267080 gcattactagatgaattactattgataattaatcaataatcaataatttaaaaatgaattaaacattaa 27267012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 39393379 - 39393748
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||  ||||||| || | |||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||     
T  39393379 ggaaaattctacggtgaagttatgagaatgacttttctaatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaatacttcattgtttgtacagtgg 39393478  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaa-ttttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  39393479 catcaaaagtttaatccccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacacttcatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacatccta 39393578  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||| | ||| ||        ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  39393579 caaagtgtaacacttaagactatcatatgatattagcaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaaatccaagatgttgca 39393678  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39393679 aacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaa 39393748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 30254420 - 30254787
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||  ||||||| || | |||||||||||| |||    
T  30254420 ggaaaattctatggtgaagttataagaatgacttttttgttgaagttaacaatataacatcaaaaatgtaatgagtaatacac-actgtttgtacaatga 30254518  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |     
T  30254519 catcaaaagttcagtcctcaaagtatcatcaattcatcagattaacaagactagacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataacaccctat 30254618  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||| ||| || ||| ||        ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30254619 aaagtgtaacacttaagactgtcacataataacatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaa 30254718  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30254719 gcattactagatgaattactattgattattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 30254787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 48 - 407
Target Start/End: Original strand, 10922724 - 10923091
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgac 147  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10922724 gaaaattttatggtgaaatcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaagaccccactgtttgtacaatgac 10922823  T
Q  148 atcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  10922824 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatcttattttatcataccttgttataagggtaacacctcaca 10922923  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    |||||||||||| || ||| |||||| |||||| ||| ||        ||||||||||    || |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  10922924 aagtgtaacacttaagactgtcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttgcaag 10923023  T
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10923024 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 10923091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 47682673 - 47682306
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacac-cccactgtttgtacagtg 145  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||   ||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  47682673 ggaaaattttatggtgaagtcatgagagtgacttttttggtgaagttaacactag--cataaaaaatgttgtgagtaacactcccactgcttgtacagtg 47682576  T
Q  146 acatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
      |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||    
T  47682575 gtatcaaaagttcattcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacatttaaactaattttattctgccttgttttaagtgtaacacctca 47682476  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    |||||||||||||| || ||||||| || |||||| ||| |         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  47682475 caaagtgtaacacttaagactatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgca 47682376  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  47682375 agcattactaaatgaattactattgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaaagaattaaacattaa 47682306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 60 - 407
Target Start/End: Original strand, 14758050 - 14758396
Alignment:
Q  60 gtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttca 159  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  14758050 gtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcacacaactgtttgtacggtggcatcaaaagttca 14758149  T
Q  160 gtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 259  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||         |    
T  14758150 gtccccatagtttcatcaattcattagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaa---------t 14758240  T
Q  260 caaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 351  Q
     || |||||| ||| |||||| ||| |         ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14758241 taagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 14758340  T
Q  352 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14758341 aattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaa 14758396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27564084 - 27563717
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttg-gtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgac 147  Q
    |||||||||  ||||||| || ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| | |||| | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27564084 aaaattctacggtgaagttatgaaaatgattttttttagtgaagttaacactataactttaaaaatatagtgagtaacactccactgtttgtatagtgac 27563985  T
Q  148 atcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27563984 atcaaaagttcagttccgataatattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtataataccccaca 27563885  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    ||| | |||||| || ||||||| || || ||| ||| ||        |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27563884 aagaggaacacttaagactatcatataatttcatcaactctgtttgcatgttaaagatgcaaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttgcaag 27563785  T
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27563784 tattactagatgaattaatattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaaagaatcaaacattaa 27563717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Original strand, 28769651 - 28770017
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||||||||| || ||||||||| || ||    
T  28769651 aaaattctatggtgaagtcataaaaataactttttttgtgaagttaacactatgacatcaaaaatgtaatgagtaacaccc-accgtttgtacaatggca 28769749  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccaca 247  Q
    ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||| |||||||    
T  28769750 tcaaaggttcggtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataaacgtaacacccccaca 28769849  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    ||||||||| || || |||||||||| |||||| ||  ||        |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  28769850 aagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatcacctctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaaa 28769949  T
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28769950 cattgctagatgaattactattgatcattaattaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 28770017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Original strand, 41926161 - 41926520
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  41926161 aaaattctatggtgaagttatgaaaatgatttttttgatgaagttaatactataacatcaaaaatatagtgagtaatatcccactgtttgtacagtggca 41926260  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  41926261 tcacaagttcagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaa 41926360  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    |||||||||||      ||| | || |||||| ||| ||        ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  41926361 agtgtaacact------tattaaataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacttgtaagtccaagatatt-caagc 41926453  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  41926454 attactagatgaattactattgatcattaattaataatcaatgatttaaaattgaatcaaacattaa 41926520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 47 - 261
Target Start/End: Original strand, 48620633 - 48620847
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48620633 ggaaaattctatgttgaagttattaaaatgacttttcttgtgaagttaacaatataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 48620732  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48620733 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccac 48620832  T
Q  247 aaagtgtaacactca 261  Q
    |||||||||||||||    
T  48620833 aaagtgtaacactca 48620847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 129 - 407
Target Start/End: Original strand, 25160710 - 25160997
Alignment:
Q  129 ccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgtt 228  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25160710 ccaccgtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagattaataagactacacttaatctcattttatcctaccttgtt 25160809  T
Q  229 ttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgt 320  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||        ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25160810 ataagtgtaacaccccacaaagtataacacttaaaactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgt 25160909  T
Q  321 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25160910 aagtccaagatgttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaa 25160997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 79 - 407
Target Start/End: Original strand, 46931439 - 46931774
Alignment:
Q  79 ttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaa 178  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| |  | |||||||| ||||| || | || |||||||||    
T  46931439 tttttttgtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaataccccactgtttgtagaacggcatcaaaaattcagccctcataatatcatcaa 46931538  T
Q  179 ttcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 278  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||   || ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  46931539 ttcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttc--agcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatat 46931636  T
Q  279 caacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcatta 369  Q
    || ||| |||        ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  46931637 catcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatattattgatcatta 46931736  T
Q  370 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46931737 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 46931774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 79 - 407
Target Start/End: Original strand, 40884841 - 40885177
Alignment:
Q  79 ttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaa 178  Q
    |||| ||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  40884841 ttttctggtgaagtcaacaccataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtccctatagtatcttcaa 40884940  T
Q  179 ttcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 278  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| || |||||| ||| ||||    
T  40884941 ttcatcagattaacaagattgcacttaatctagttttatcctatcttgttttaagtgtaacattccgaaaagtgtaacacttaagactatcgcataatat 40885040  T
Q  279 caacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 370  Q
    || ||| |         ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40885041 catcaactatgtttgcatgttaaagatgccgatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaa 40885140  T
Q  371 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    | || |||||| |||| ||||||||||| || |||||    
T  40885141 ttagcaatcaataattcaaaaatgaatcgaatattaa 40885177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 31621733 - 31621360
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||| |||||| || ||||||| |||     
T  31621733 ggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagtcaacactataacatcaaaggtgtattgagtagcaccccgctatttgtacggtgg 31621634  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||     
T  31621633 catcaaaaattcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgcaatacccca- 31621535  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa-------------ttctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 333  Q
     |||||| ||||| || |||||| ||| ||||||||||             ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31621534 gaagtgtgacacttaagactatcgcataatatcaacaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaatatgt 31621435  T
Q  334 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt-aaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31621434 tgcaagcattagtagatgaactactattgatcattaatcatcaatcaacaatttaaaaaatgaatcgaacattaa 31621360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 79 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27763458 - 27763122
Alignment:
Q  79 ttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaa 178  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||| ||| || | ||||||||||||    
T  27763458 tttttttgtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccc-atagtttgtagaatgacatcaaaagtccagccctcatagtatcatcaa 27763360  T
Q  179 ttcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 278  Q
    || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| ||||    
T  27763359 tttatcaggttaacaagactacacttaatctaattttatcatacctagttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaatacttaagactatcacataatat 27763260  T
Q  279 caacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcatta 369  Q
     | ||| ||        ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27763259 aatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagttcaagatgttgcaagcattactagataaatatactattgatcatta 27763160  T
Q  370 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27763159 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 27763122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 47 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 37619076 - 37618729
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaa--caccccactgtttgtacagt 144  Q
    |||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||  |||||||||||||||| | |    
T  37619076 ggaaaattctatggtgaagttataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatttaatgagtaaaacaccccactgtttgtaaaat 37618977  T
Q  145 gacatcaaaagttcagtccccttagtat--catcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacc 242  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |    
T  37618976 gacatcaaaagttcagttctcatagtatatcatcaattcatcagattaacaatactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataacatc 37618877  T
Q  243 ccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtt 334  Q
    ||| ||||||||||||         ||| || |||||| ||| ||        ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37618876 ccataaagtgtaacac---------tcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgtt 37618786  T
Q  335 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaa 391  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  37618785 gcaagcattactagatgaattagtattgaccattaatcaataatcaacaatttaaaa 37618729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 407
Target Start/End: Original strand, 22170806 - 22171075
Alignment:
Q  146 acatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
    |||||||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22170806 acatcaaaagttcagtctacataatatcatcaattcattagattaataacactacacttaatctaatttcatcctaccttgtttcaaatgtaacacccca 22170905  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||||||        ||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  22170906 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataattcttgtaagtctaagatgttgca 22171005  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22171006 aacattattagataaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaa 22171075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33725778 - 33725472
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| || ||||||  | |||||||||| | ||||||| ||  ||||| ||||||||||||  |||||| || |||||| ||| |   ||| ||    
T  33725778 aaaattctatggtaaagtcaagagaatgacttttctagtgaagtcaacgctatatcatcaaaagtgtattgagtagcagcccactatttctttggtggca 33725679  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33725678 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccagaa 33725579  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    ||||||||| | || |||||| ||| |||||| ||| |         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  33725578 agtgtaacatttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagaccaaaatgttgcaaac 33725479  T
Q  341 attacta 347  Q
    |||||||    
T  33725478 attacta 33725472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 243 - 407
Target Start/End: Original strand, 48353735 - 48353906
Alignment:
Q  243 ccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtt 334  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||        ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  48353735 ccacaaagtgtaacact-aagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatatt 48353833  T
Q  335 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48353834 gcaagcattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 48353906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 288 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1359866 - 1359747
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 387  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1359866 tgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagttcaaaatgttgcaagcattactggatgaattactatcgatcattaatcagtaatcaacaattt 1359767  T
Q  388 aaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1359766 aaaaatgaatcaaacattaa 1359747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 290 - 407
Target Start/End: Original strand, 21289847 - 21289964
Alignment:
Q  290 ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaa 389  Q
    ||||||||| |||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21289847 ttaaagatgccaacgataaaataacacttataagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaa 21289946  T
Q  390 aaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21289947 aaatgaatcaaacattaa 21289964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 132 - 356
Target Start/End: Original strand, 38759610 - 38759846
Alignment:
Q  132 ctgtttgtacagtgacatcaaaagttcag----tccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    ||  | || |||||||||||||||| ||||| || | |||| ||||| |||||||||| || ||| |    
T  38759610 ctgtttgtacagtgacatcaaaagttcagccagtcttcgtaatatcatcaattcatcatattaataaaactacatttaatttaattttatcatatcttat 38759709  T
Q  228 tttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| || |||||| ||| |         |||||||| ||||||| |||||||| || |||    
T  38759710 tttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttgagactatcagataatatcaccaactatgtttgcatgttaaaggtgtcaactataaaataatatatg 38759809  T
Q  320 taagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatta 356  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38759810 taactccaagatgttgcaagcattactagattaatta 38759846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 195
Target Start/End: Original strand, 21289661 - 21289816
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaa-------aagtgttgtgagtaacaccccactgtttgt 139  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||       || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21289661 ggaaaaatctattgtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatatcataaataataaaaaatgtagtgagtaacaccccactgtttgt 21289760  T
Q  140 acagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaag 195  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21289761 acagtggcatcaaaagttcagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaag 21289816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 288 - 407
Target Start/End: Original strand, 31962861 - 31962981
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaa-tt 386  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  31962861 tgttaaagaaatcaacgataaaataatatatgtaagtttaagatgttgcaagcattattagatgaactactattgatcattaatcggtaatcaacaattt 31962960  T
Q  387 taaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  31962961 taaaaataaatcaaacattaa 31962981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 30254854 - 30254948
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtaca 142  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  ||  ||||| |||||||||||||||    
T  30254854 ggaaaattctatggtgaagtcataataatgacttttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatggataaca-cccactgtttgtaca 30254948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Original strand, 22170750 - 22170816
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagt 113  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22170750 ggaaaattctatggtgaaatcatgaaaatgacttttctaatgaagttaacactataacatcaaaagt 22170816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 353 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 33725478 - 33725423
Alignment:
Q  353 attactattgatcattaatcagtaatcaacaatt-taaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  33725478 attactattgatcattaatcagcaatcaacaattaaaaaaatgaatcgaacattaa 33725423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 13876967 - 13876919
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  13876967 ggaaaattctatggtgaagttatgaaaatgacttttatggtgaagttaa 13876919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Original strand, 16132475 - 16132523
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  16132475 ggaaaattctatggtgaagtcaatagattgacttttttggtgaagttaa 16132523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 94
Target Start/End: Original strand, 45319610 - 45319654
Alignment:
Q  50 aaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagtta 94  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  45319610 aaattctatggtgaagtcattcaattgacttttttggtgaagtta 45319654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1360022 - 1359933
Alignment:
Q  87 tgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatca 177  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | | |||| ||| |   || |||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1360022 tgaagttaatactataacattaaaaatatagtga-taatatttcagtgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatca 1359933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 4150535 - 4150490
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagt 92  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  4150535 ggaaaattctatggtgaagtcatgataatgacttttctggtgaagt 4150490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 42663830 - 42663785
Alignment:
Q  50 aaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  42663830 aaattctatggtgaagtcatgataatgacttttttagtgaagttaa 42663785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 92
Target Start/End: Original strand, 47279159 - 47279204
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagt 92  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47279159 ggaaaaatctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagt 47279204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 407
Target Start/End: Original strand, 48620916 - 48620953
Alignment:
Q  370 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48620916 atcattaatcaacaattttaaaatgaatcaaacattaa 48620953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Original strand, 26970261 - 26970309
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||| ||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  26970261 ggaaaattttatggtaaagtcatgataatgacttttttggtgaagttaa 26970309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Original strand, 43579242 - 43579290
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| | ||||||||||    
T  43579242 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagttaa 43579290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4319007 - 4318638
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4319007 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttatgagtaacaccccactgtttgtacagtga 4318908  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaa-ttttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4318907 catcaaaagttcaacccccatagtatcatcaattcattagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacacccta 4318808  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||        ||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||    
T  4318807 taaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgttttcatgttaaagatgtcaacgatgaaatagtacgggaaagtccaagatgttgca 4318708  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4318707 agcattactagatgaattactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaa 4318638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3880123 - 3879755
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  3880123 ggaaaattctatggtgaagtcacgagaatgacttttctggtgaagttaacattatagtatcaaaagtgttgtgagtaacaccctactgtttgtacaatga 3880024  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3880023 catcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatatacttattctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacaccccac 3879924  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3879923 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaa 3879824  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3879823 gcattactagatgaattactattgatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 3879755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 33893186 - 33892828
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  33893186 ggaaaattctatggtaaagtcattagaataatttttttagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatga 33893087  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
     || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  33893086 tattaaaagttcagtccc-ttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttatgtataacaccccac 33892988  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||         ||||||||||||| ||| ||        ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33892987 aaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactcagtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 33892897  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33892896 acattactaaatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 33892828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Original strand, 29182165 - 29182529
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||| ||| |||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29182165 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgattttattgatgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttatacagtgtca 29182264  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccaca 247  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |    
T  29182265 tcaaaagttcagtctccatattatcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccatattttaagtgtaacacccccata 29182364  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||        |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29182365 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctatttgcaggttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaag 29182464  T
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
     |||||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29182465 tattactagatgaattac---tgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaa 29182529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 1945833 - 1946203
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgactttt-ttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 145  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  1945833 ggaaaattctacggtgaagtcataagaatgactttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtagaatg 1945932  T
Q  146 acatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |    
T  1945933 acatcaaaagttcagccctcatagtatcatgaattcatcaagttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacacccta 1946032  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1946033 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttaca 1946132  T
Q  338 agcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1946133 agcattattagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 1946203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 8513233 - 8513589
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8513233 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataatatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 8513332  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaa-ttttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||      |||||||| |    
T  8513333 catcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttgatctaatttttatcctaccttgttt------taacacccta 8513426  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||        ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| || |||||    
T  8513427 caaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaagtccaaaatcttgca 8513526  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8513527 agcattactagatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 8513589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 50 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 6091363 - 6090998
Alignment:
Q  50 aaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacat 149  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| | | |||||| |||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||| || |||    
T  6091363 aaattctattgtgaagtcatgaaaataatttttttggtaaagttaaca-tgtaacataaaaaatgtagtgagtaacacaccattgtttgtacaatgccat 6091265  T
Q  150 caaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaa 249  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6091264 caaaagttcagtactcgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagcgtaacacccaacaaa 6091165  T
Q  250 gtgtaacactcaaa-actatcacatgatatcaacaattctg--------ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||||        ||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6091164 gtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatattaaagattcaaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 6091065  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6091064 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 6090998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 5627391 - 5627760
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |  |||||||||||||||| |||||| | |||    
T  5627391 ggaaaattctaaggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatataatgagtaacaccccactatttgtagaatga 5627490  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  5627491 catcaaaagttcagccctcatagtattatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctac 5627590  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||| |||||| ||| ||        |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5627591 aaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 5627690  T
Q  339 gcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5627691 gcattactaggtgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaa 5627760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 7235218 - 7234848
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| ||||||| || | ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  7235218 ggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttccggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggtgc 7235119  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7235118 catcaaaagttcagtctcat-agtattatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccag 7235020  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    |||||||||| || || |||||| ||| |||||| ||| |         ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7235019 aaagtgtaacgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 7234920  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaat---cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7234919 acattactagatgaattactattgatcattaatcaacaacaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaa 7234848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 48 - 407
Target Start/End: Original strand, 20768087 - 20768450
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgac 147  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||| || || | |||||||  |||| |    
T  20768087 gaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcatcc-attgtttgtt-agtggc 20768184  T
Q  148 atcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  20768185 atcaaaagttcagtcctcatagtatcattaattcatcagattaacaagattac--ttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacatcccata 20768282  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    |||||||||||| || |  ||| ||| |||||| ||||| ||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20768283 aagtgtaacacttaagatcatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtgttgcaag 20768382  T
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20768383 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattgaacattaa 20768450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 60 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 21017283 - 21016934
Alignment:
Q  60 gtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttca 159  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | | ||  || |||| ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||    
T  21017283 gtgaagtcacgaaaatgacttttttggtgaagttaacattgtagtataaaaaatgttgtgagtaacaccccattatttgtacaatggcatcaaaagttca 21017184  T
Q  160 gtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 259  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21017183 gtccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaataaacttaatctaattttatcctacgttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 21017084  T
Q  260 caaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 351  Q
     || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||| |||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21017083 taagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtac------gtctaagatgttgcaagcattactagatg 21016990  T
Q  352 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21016989 aattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttataaatgaatcaaatattaa 21016934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Original strand, 6088910 - 6089264
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  6088910 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactatagtatcaaaagtgttgtgagtaacgccccactgtttgtaaagtggca 6089009  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaa-ttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||      |||||| | |||    
T  6089010 tcaaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatatccttgatctaatttttatcctaccttgttt------taacactctaca 6089103  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    | || ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||        ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  6089104 aggtataacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccagtaagtccaaaatgttgcaag 6089203  T
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6089204 cattactatatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 6089264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 49 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 30353540 - 30353256
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| ||    
T  30353540 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacattataacatcaaaagtgttgcgagtaatatctcactgtttgtacagtggca 30353441  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    || | ||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  30353440 tcgatagttcagtctccatagtatcatcaattcatcatataaacaagaatacacttaatctaattttatcatgccttgttttaagtgtaacatcccacaa 30353341  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtc 325  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30353340 agtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtc 30353256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 73 - 291
Target Start/End: Original strand, 15491641 - 15491859
Alignment:
Q  73 aatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtat 172  Q
    |||||||||| | |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||    
T  15491641 aatgacttttctcgtgaagttaacattgtaacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttgtacagtggcatcaaaagttcagccctcatagtat 15491740  T
Q  173 catcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcaca 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  15491741 catcaattcatcagattaacaagaatgcacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaaatatcaca 15491840  T
Q  273 tgatatcaacaattctgtt 291  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  15491841 tgatatcagcaattctgtt 15491859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 33618834 - 33619201
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||  ||||||||||   ||  |||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||| || |||| | ||||||| |||     
T  33618834 ggaaaattctacggtgaagtcatgggaaatacttttctggtgaagtcaacactatcgcatcaaaagtgtagtgagtagcaacccattatttgtacggtgg 33618933  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| |     
T  33618934 catcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacc--------agtgtaacaccctag 33619025  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt-------------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 333  Q
    || |||| ||||| || | |||| ||| |||||| ||| | ||||             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33619026 aa-gtgtgacacttaagagtatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaatatgt 33619124  T
Q  334 tgcaagcattactagatgaattactattgatcatta---atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33619125 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatgatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaa 33619201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7055399 - 7055166
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |  | ||||||||| |||| |||||| | |||    
T  7055399 ggaaaattttatggtgaagtcataagaatgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatataattagtaacacctcactatttgtagaatga 7055300  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||    
T  7055299 catcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacacgctac 7055200  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 280  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7055199 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatca 7055166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 300 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 7054696 - 7054588
Alignment:
Q  300 caacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatc 398  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7054696 caacgataaaatagtaactgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaatatactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaagatgaatc 7054597  T
Q  399 aaacattaa 407  Q
    |||||||||    
T  7054596 aaacattaa 7054588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 178
Target Start/End: Original strand, 18498433 - 18498565
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaaca-ccccactgtttgtacagtg 145  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  18498433 ggaaaaatctatagtgaagtcatgagaatgactttcctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgtagtgagcaacacccccacagtttgtacagtg 18498532  T
Q  146 acatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaa 178  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18498533 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 18498565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 33724117 - 33724075
Alignment:
Q  365 cattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33724117 cattaatcattaagcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 33724075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Original strand, 19631749 - 19631797
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  19631749 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttctggtgaagttaa 19631797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 4488631 - 4488589
Alignment:
Q  50 aaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagt 92  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4488631 aaattctacggtgaagtcgttaaaatgacttttttggtgaagt 4488589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 92
Target Start/End: Original strand, 25440961 - 25441003
Alignment:
Q  50 aaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagt 92  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25440961 aaattctatggtgaagtcgttaaaatgacttttctggtgaagt 25441003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 3005440 - 3005392
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaat 96  Q
    |||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  3005440 gaaaattctatgttgaagtcatgagaatgacttttttgatgaagttaat 3005392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 11084200 - 11084152
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||    
T  11084200 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaataacttttctggtaaagttaa 11084152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 74)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 4015451 - 4015818
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  4015451 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctgatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccaactgtttgtagagtga 4015550  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4015551 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatataattagtctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccac 4015650  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt-------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    ||||||| ||||| || |||||| |||  ||||||||| |        ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4015651 aaagtgtcacacttaagactatcgcattgtatcaacaacttgtttgcatgttaaagatgccaacggtaaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 4015750  T
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4015751 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 4015818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 47 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7327668 - 7327306
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaat-actataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 145  Q
    |||||||||||| ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  7327668 ggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttttagtgaagttaaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccattatttgtacagtg 7327569  T
Q  146 acatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  7327568 acatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcggattaacaagaatacacttaatttatttttatcctaccttctttctagtgtaacacccca 7327469  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||        ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  7327468 caaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgca 7327369  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7327368 agcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 7327306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 47 - 401
Target Start/End: Original strand, 34132926 - 34133288
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34132926 ggaaaattctataatgaagtcacgaaaatgacttttttggtgaaattaacactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatga 34133025  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34133026 catcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 34133125  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||         ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34133126 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 34133225  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 401  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34133226 gcattactagatgaattactagtaatcatgaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 34133288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 46297945 - 46297579
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||| || |     
T  46297945 aaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaaatatagtgagtaacacaccactgtttgtacaatggcg 46297846  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46297845 tcaaaagttcagtccccgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatcaaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 46297746  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  46297745 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaagc 46297646  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46297645 attactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 46297579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 52041108 - 52040739
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccac-tgtttgtacagtg 145  Q
    ||||||||||   |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| ||||    
T  52041108 ggaaaattctgaggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaatactataacatcaaaagtgtagtgagtaactccccaaatgtttgtatagtg 52041009  T
Q  146 acatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52041008 gcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaatacccca 52040909  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    || ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52040908 catagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 52040809  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52040808 aacattactagatgaatgattattgatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 52040739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 37203058 - 37203427
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  37203058 ggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgatttttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 37203157  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  37203158 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttttagtgtatcaccccac 37203257  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa---------ttctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||          | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || | |||    
T  37203258 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacctgtaagtccaatatatcgca 37203357  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37203358 agcattactagatgaattaccattgatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 37203427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 37157699 - 37158067
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  37157699 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatggcttttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtt-gtacagtgg 37157797  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  37157798 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaatttataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttcaagtgtaacaccccac 37157897  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa---------ttctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||          | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  37157898 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaatatgtcgca 37157997  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37157998 agcattactagatgaattaccattgatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 37158067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 26941445 - 26941084
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26941445 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgatttttttggtgaagttaacactataaaatcaaaattataatgagtaacaccccactgtttgtataatga 26941346  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||     
T  26941345 catcaaaagttcagtcctcatggtatcattaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaatacctcat 26941246  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| ||        ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26941245 aaagtgtaacacttaaaactatcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 26941146  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26941145 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 26941084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 39282644 - 39283011
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || | || |||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||     
T  39282644 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttctgataaaattaacactataacatcaaaactgt-gtgagtaataccccactgtttatacagtgg 39282742  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||| | | || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39282743 catcaaaagttcagttctcatattatcatccattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccac 39282842  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |        ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||    
T  39282843 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatatgtttgcctgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctgtaaatccaaaatgttgcaa 39282942  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39282943 gcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 39283011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 44891498 - 44891856
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         |     
T  44891498 ggaaaattatacggtgaagtcatgaaaatgacttttt-ggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgt---------gg 44891587  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44891588 catcaaaagtttagtccacatagtatcatcaattaatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccac 44891687  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||        ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||    
T  44891688 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctacaagtctaagatgttgcaa 44891787  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44891788 gcattactagatgaattactgttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaa 44891856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 60 - 407
Target Start/End: Original strand, 29099359 - 29099705
Alignment:
Q  60 gtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttca 159  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29099359 gtgaagtcattagaatgacttttctggtgaagttaacactataacataaaaaatgtcgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatctaaagttca 29099458  T
Q  160 gtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||          
T  29099459 gtccccttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcgtgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgt------ 29099552  T
Q  260 caaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 351  Q
       |||| ||||||||||||| ||| ||        |||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29099553 ---aactttcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 29099649  T
Q  352 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29099650 aattaccattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 29099705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 97 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 42506210 - 42505899
Alignment:
Q  97 actataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaaga 196  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42506210 actataacatcaaaattgtaatgagtaataccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaaga 42506111  T
Q  197 atacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa-----ttc---t 288  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     |||   |    
T  42506110 ctacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcat 42506011  T
Q  289 gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattta 388  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42506010 gttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattta 42505911  T
Q  389 aaaatgaatcaa 400  Q
    ||||||||||||    
T  42505910 aaaatgaatcaa 42505899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 2007925 - 2008298
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| ||||||||| | |  ||||||| ||||||  ||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2007925 ggaaaattatatagtgaactaaagaaaatgatttttttt-tgaagttaacactatagcgttaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 2008023  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  2008024 catcaaaagttcaatccccatagcatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatctaattttatcctacctcgttttaagtgt-acactccac 2008122  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2008123 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaa 2008222  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcag-------taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2008223 gcattactagatgaaataatattgatcattaatcagtaatcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 2008298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3655387 - 3655016
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  3655387 ggaaaattttatggtgaagtcataaaaatgacttttttgataaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatga 3655288  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||    
T  3655287 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttagaagcgtaacacaccac 3655188  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||        ||||||||||  || ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  3655187 aaaatgtaacacttaaaactatcacatgatatcatcagctctgtttgcatgttaaagattccatcgataaaataacacatataagtccaagatgttgcaa 3655088  T
Q  339 gcattactag--atgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaat-gaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3655087 gcattactagatatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaaatcaaacattaa 3655016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 40552444 - 40552076
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  40552444 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggagaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatga 40552345  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || |||||| |||| |||||| |||||    
T  40552344 catcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaacactacacttaatttaattttatcttagcttgttataagcgtaacatcccac 40552245  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    || |||||||||| |  | | |||||| |||||| ||| ||        ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40552244 aacgtgtaacacttaggattgtcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccatgatgttgcaa 40552145  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40552144 gcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 40552076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 44186686 - 44186334
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    ||||||||||||  |||||||   | ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  44186686 ggaaaattctatgatgaagtcgagagaatgatttttttggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccgctgtttatacagtga 44186587  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44186586 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcaaattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacaccccac 44186487  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
                    |||||||||||||||||||||| ||        ||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  44186486 ----------------aactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctctaagtctaagatgttgcaa 44186403  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44186402 gcattactagataaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 44186334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 21193597 - 21193966
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21193597 ggaaaattctatggtaaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactgttgaatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtagagtga 21193696  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21193697 catcaaaagttcagtccccatggtatcattaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccat 21193796  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaa-actatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    ||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| ||        ||||||||||    ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||    
T  21193797 aaaggataacacttaaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagattctcacgataaaatagtagccgtaagttcaagatgttgca 21193896  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21193897 accattactaaatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 21193966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 22450959 - 22451327
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||  |||     
T  22450959 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcacctcactgtttgtatggtgg 22451058  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||     
T  22451059 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccttaccttgttttaagtgtaacaccccag 22451158  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
     |||||||||| | || ||||||  || |||||| ||| |         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22451159 taagtgtaacatttaacactatcgtataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 22451258  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22451259 gcattactagatgaattattattgatcattaatcagcaatcaaaaatttaaaaatgaatcgaacattaa 22451327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 50 - 391
Target Start/End: Original strand, 32373466 - 32373813
Alignment:
Q  50 aaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacat 149  Q
    |||||||||  ||||||||| | ||||||||||    | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||    
T  32373466 aaattctatgatgaagtcatgagaatgacttttccaataaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaactcc--actgtttgtacagtggcat 32373563  T
Q  150 caaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaa 249  Q
    |||||||||   |||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32373564 caaaagttccaccccaatggtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaa 32373663  T
Q  250 gtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctg--------ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagca 341  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32373664 gtgtgacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatattaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaagca 32373763  T
Q  342 ttactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaa 391  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32373764 ttactagatgaatttctattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaa 32373813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 11466815 - 11467169
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11466815 ggaaaattctatggtgaagtcttgagaatgacttttctgatgaagttaagactataacatcgcaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 11466914  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11466915 catcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccac 11467014  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||        |||| |||||  |||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  11467015 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgtttaagataccaacgacaaaatagtacctgcaagtctaagatgttgcaa 11467114  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
           ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11467115 -------tagatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaa 11467169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 60 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 53229325 - 53228969
Alignment:
Q  60 gtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccc-cactgtttgtacagtgacatcaaaagttc 158  Q
    |||||||||| ||||| | |||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||    
T  53229325 gtgaagtcatgaaaattatttttctggtgaaattaacactatagcatcaaaagtgtagtgagcaacaccctcaatgtttgtacagttgcatcaaaagttc 53229226  T
Q  159 agtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac 258  Q
    ||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53229225 agtcatcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacagttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaactccccacaaagtgtaacac 53229126  T
Q  259 tcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 350  Q
    | || ||||||||||  ||||| ||| |         ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53229125 ttaagactatcacatagtatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagttcaagatgttgcaagcattactagat 53229026  T
Q  351 gaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53229025 gaattagtattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 53228969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 48354932 - 48355300
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| || |||| |||  |||||||||||||| |||||||||| ||     
T  48354932 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttatggtgaagttaacactataatattaaaaatgtaatgagtaacaccccattgtttgtacaatgg 48355031  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||    
T  48355032 catcaaaagttcagttctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttagtctaattttatcctaccttgttataaatgtaacataccac 48355131  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||  | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48355132 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaa 48355231  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48355232 gtattactagatgaattattattgatcattaatcagtaagcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 48355300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 24708295 - 24707932
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||  ||| ||||| ||  ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  24708295 aaaattttatggtgaagttatcaaaatgactttttt--tgatgttaacacg-taacatcaaaactgcagtgagtaacacctcactgt--gtacagtgaca 24708201  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacactta--atctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24708200 tcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttttgatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccac 24708101  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| |         ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24708100 aaagtgtaacacttaaaacaatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagaagttgcaa 24708001  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24708000 gcattattagataaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 24707932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 33378967 - 33378602
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |  |||| || | ||||||||||   ||||||| || ||||||  ||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||| ||||    
T  33378967 ggaaaattctatggcaaagttatgagaatgactttt---gtgaagtcaacactatagtatcaaaagtgtagtgagtagtaccccaatatttgtacggtga 33378871  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33378870 catcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaa 33378771  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
     |||||||| ||| || |||||| ||| || ||| ||| |         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33378770 gaagtgtaatacttaagactatcgcataatctcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaa 33378671  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33378670 acattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacgatttaaaaatgaatcaaacattaa 33378602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 48 - 407
Target Start/End: Original strand, 25579731 - 25580098
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgac 147  Q
    ||||||| ||| || |||| || | ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||| ||| |||||||||    
T  25579731 gaaaattttatggttaagttatgagaatgatttttctggtgaagttaatactatagcatcaaaagtgttgtgaataacattctactatttatacagtgac 25579830  T
Q  148 atcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25579831 atcaaaagttcagtccccatattatcatcagtttattagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgtttttagtgtaacaccccaca 25579930  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||        ||||||||||| |||||||||||  |||| | ||| || ||||| |||||||    
T  25579931 aagtgtaacacttaagactattacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaactgtacctataaatctaagatattgcaag 25580030  T
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25580031 cattactagatgaattactattgatcattaatccgcaatcaacaatttaaaaatgaaccaatcattaa 25580098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 47481513 - 47481882
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| ||| ||||||||||   |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  47481513 ggaaaattttatggtgaagtcataggaatgatgtttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtagaatga 47481612  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| || ||||  |||||||| ||    
T  47481613 catcaaaagtttagccctcatagtatcatcaattcatcatgttaacaagactacacttaatataattttattataccttattctaagcataacaccctac 47481712  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||  || ||        | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  47481713 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatattaaagatttcaacgataaaatagtacttgtaagttcaagatgttgcaa 47481812  T
Q  339 gcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47481813 gcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 47481882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 79 - 407
Target Start/End: Original strand, 3362276 - 3362614
Alignment:
Q  79 ttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaa 178  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| || | | |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | | ||||||||||    
T  3362276 ttttttggtgaagttaacactatagcatcagaaatatagtgagtaacatcccactatttgtacagtggcatcaaaagttcactcctcatggtatcatcaa 3362375  T
Q  179 ttcatcagattaacaagaatacac--ttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgat 276  Q
    |||||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |     
T  3362376 ttcatcatgttaacaagactacactattaatctaattttatcctaccttattttaagtgaaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataac 3362475  T
Q  277 atcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 368  Q
    |||| ||| ||        |||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3362476 atcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaattgtacttagaagtccaatatgttgcaagcattactggatgaattactattgatcatt 3362575  T
Q  369 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3362576 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 3362614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 106 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 14586796 - 14586497
Alignment:
Q  106 tcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacactta 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14586796 tcaaaagtgttgtgagtaacacctcactatttatacagtgatatcaaaagttttgtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacactta 14586697  T
Q  206 atctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagat 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||  ||||||||||||| |         ||||||||||    
T  14586696 atctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacac---------tcgtatgatatcaacaactatgtttgcatgttaaagat 14586606  T
Q  298 gtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaat 397  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14586605 gccaacgataaaatagtac-ggtaagtccaagatgttgcaagcattactagataaattactactgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaat 14586507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 60 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 24489134 - 24488779
Alignment:
Q  60 gtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttca 159  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24489134 gtgaagtcacgaaaatgattttttttgtgaagttaagactatagtattaaaaatgttgtgagtaacattccactgtttgcacaatgacatcaaaagttca 24489035  T
Q  160 gtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 259  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24489034 gtccccatattatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacacctcacaaggtgtaacact 24488935  T
Q  260 caaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 351  Q
     || |||||||||  |||||| ||| ||        ||||||||||| |||| ||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24488934 taagactatcacacaatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtgtcagtaagttcaagatgttgcaagcattactagatg 24488835  T
Q  352 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
     ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24488834 cattactattaatcatgaatcaataatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaa 24488779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 170 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 22622780 - 22622535
Alignment:
Q  170 tatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatc 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  22622780 tatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagactatc 22622681  T
Q  270 acatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 361  Q
    |||| |||||| ||| ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22622680 acataatatcatcaaatctgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 22622581  T
Q  362 gatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22622580 gatcattaatcagtaatcaactatttaaaaatgaatcaaacattaa 22622535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4761836 - 4761465
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgactttttt--ggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagt 144  Q
    |||||||||||| ||||| |||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  4761836 ggaaaattctatggtgaattcatgagattgacttttttttggtgaagttaatactataatatcaaaaatgtaatgagtaacacttcactgtttgtacaat 4761737  T
Q  145 gacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccc 243  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  4761736 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatctgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacacccc 4761637  T
Q  244 cacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 335  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||| |||||| ||| |         ||||||||||  | || |||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  4761636 cacaaagtataacacttaagactatcacataatatcatcaactatatttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctataagtccaaaatgttg 4761537  T
Q  336 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4761536 caaacattaccagatgaattactattaatcattaatcagaaatcaacaatttgaaaatgaatcaaacattaa 4761465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 47 - 363
Target Start/End: Original strand, 45174494 - 45174821
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtg--agtaacaccccactgtttgtacagt 144  Q
    |||||||| ||| |||||||  | | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  45174494 ggaaaattttatggtgaagttgtgagaataacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgtgagtaacacttcactgtttgtacagt 45174593  T
Q  145 gacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaa-ttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 243  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45174594 agcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacactc 45174693  T
Q  244 cacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 335  Q
     ||||||||||||||| || ||||| | ||||||||| ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  45174694 tacaaagtgtaacacttaagactataatatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaacggtaagtccaagatgttg 45174793  T
Q  336 caagcattactagatgaattactattga 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45174794 caagcattactagatgaattactattga 45174821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 62 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11357535 - 11357198
Alignment:
Q  62 gaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacagtgacatcaaaagttcag 160  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11357535 gaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtatagtgagtaacacccccactgtttgtacagttgcatcaaaagttcag 11357436  T
Q  161 tccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactc 260  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||                 |||||     
T  11357435 tcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgta-----------------acactt 11357353  T
Q  261 aaaactatcacatgatatcaacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 352  Q
    || |||||||||| |||||| ||| |||        |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357352 aagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 11357253  T
Q  353 attactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357252 attactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 11357198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 168 - 399
Target Start/End: Original strand, 33698265 - 33698504
Alignment:
Q  168 agtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaacta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  33698265 agtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 33698364  T
Q  268 tcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattacta 359  Q
    || |||||||||  ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  33698365 tcgcatgatatcggcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatattgcaagcattactagatgaattaata 33698464  T
Q  360 ttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698465 ttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatca 33698504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 50 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 22446247 - 22445882
Alignment:
Q  50 aaattctatagtgaagtcattaaaatgactttttt-ggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22446247 aaattctacggtgaagtcatgaaaatgactttttttggtgaagttaacattatatcatcaaaaatatagtgagtaacaccccact-tttgtacagtggca 22446149  T
Q  149 tcaaaagttcagtccc-cttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  22446148 tcaaaagttcaaaccctcatagtatcatcaattcatcatataaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaaca-ctcaca 22446050  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa----ttctg----ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    | || |||||||||| ||||||| || |||||| |||    || ||    ||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  22446049 atgtataacactcaagactatcatataatatcatcaactatttttgcatattaaagataccaacgataaaatagtacctttaagtccaaaatgttgcaag 22445950  T
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22445949 tattactggatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaatatgaatcaaacattaa 22445882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 79 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 21009955 - 21009618
Alignment:
Q  79 ttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaa 178  Q
    |||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || | || |||||||||    
T  21009955 tttttttgtgaatttgacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactatttgtagaatgacatcaaaagttcagccctcatattatcatcaa 21009856  T
Q  179 ttcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 278  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  21009855 ttcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataacttgttctaagcataacactctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatat 21009756  T
Q  279 caacaa-------ttc-tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcatta 369  Q
    || |||       | | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21009755 catcaacaatatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaatatactattgatcatta 21009656  T
Q  370 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21009655 atcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 21009618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 47 - 280
Target Start/End: Original strand, 35844317 - 35844550
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35844317 ggaaaattctatggtgaagtcatgataatgacttttctggtgaagttaacactataacaacaaaaatgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagtga 35844416  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaa-ttttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  35844417 catcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctacctagttttaagtgtaacacccta 35844516  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 280  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  35844517 caaagtgtaacacttaaga-tatcacatgatatca 35844550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 47 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 46994835 - 46994490
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||  |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||           |||| |||    
T  46994835 ggaaaattctacggtgaagtcgtaagaatgatttttttggtgaagttaatactataacatcaaaa-tgtaatgagtaacaca----------tacaatga 46994747  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  46994746 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacgccccac 46994647  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgt--------taaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||        |||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46994646 aaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattatgtttgcatgctaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaa 46994547  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatga 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46994546 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatga 46994490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 60 - 407
Target Start/End: Original strand, 40935995 - 40936332
Alignment:
Q  60 gtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttca 159  Q
    |||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40935995 gtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacacctcattgtttatacagtgacatcaaaagttca 40936094  T
Q  160 gtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 259  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||                  ||||||||||||    
T  40936095 gtcctcatagtatcatctattcatcagattaacaagaatacacttaatataattttatccaacttttttt------------------aagtgtaacact 40936176  T
Q  260 caaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 351  Q
     || ||||||||||||||| | ||| ||        ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  40936177 taagactatcacatgatattagcaactccgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaagcattactagata 40936276  T
Q  352 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  40936277 aattactattgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaataaatcaatcattaa 40936332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 43976068 - 43975709
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||   |||| || |||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||  |||||    
T  43976068 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttttg---aagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcactccactatttgtacgatgaca 43975972  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    ||||||||| | ||| | || ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  43975971 tcaaaagtttaatcctcataatatcatcaattcatcagattaacaaaattgcacttaatctaattttatcttatcttgttttaagtgtaacaccccagaa 43975872  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt-----------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    ||||||||       |||||| ||| |||||| ||| |            ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  43975871 agtgtaac-------actatcgcataatatcatcaactatgttgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagattttgca 43975779  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43975778 agcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaa 43975709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 49 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 54828883 - 54828546
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||  |||  ||||    
T  54828883 aaaattttatggtgaagtcataaaaataatttttttggtaaagttaacactataacataaaaa-tgtaatgagtaacaccccaccgtttaaacaacgaca 54828785  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    |||||| |||| ||  | ||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  54828784 tcaaaaattcattcttcatagcatcatcaattcatcatatgaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacatcccacaa 54828685  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa--------ttctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||| |||         | ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54828684 agtgtaacacttaaaactatcaaataatatcatcaactatgtttgtatgttaaaaattccaactataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 54828585  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatc 379  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54828584 attactagataaattactattgatcattaatcagtaatc 54828546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 73 - 407
Target Start/End: Original strand, 54505825 - 54506167
Alignment:
Q  73 aatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtat 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| | ||| || | ||||||||||| ||||| || | ||||||    
T  54505825 aatgacttttttgttgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccattatttatagaatgacatcaaaaattcag-cctcatagtat 54505923  T
Q  173 catcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcaca 272  Q
    ||| ||| |||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||| || |||||||||    
T  54505924 cataaatacatcgggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacactctacaaagtgtaacacttaagactatcaca 54506023  T
Q  273 tgatatcaacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattga 363  Q
    | |||||| | | | |        |||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54506024 taatatcatctactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttataagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaatatactattga 54506123  T
Q  364 tcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54506124 tcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 54506167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 117 - 354
Target Start/End: Original strand, 43348319 - 43348563
Alignment:
Q  117 gtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttta 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43348319 gtgagcaacaccccactgtttgtttagtggcatcaaaagttcagtctt-ttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttta 43348417  T
Q  217 tcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataa 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||||||||    
T  43348418 tcctaccttgttttaagtgtaacatcccataaagtgtgacacttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataa 43348517  T
Q  309 aatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 354  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43348518 aatagtacttgtaagtttaagatgttgcaagcattactaaatgaat 43348563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 170 - 407
Target Start/End: Original strand, 36012251 - 36012498
Alignment:
Q  170 tatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactat 268  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||    
T  36012251 tatcatcaattcatcagatgaacaagaatacacctaatctaatttttatcctaccttgttttcagtgtaacatcccacaaaatgtaacacttaagactat 36012350  T
Q  269 cacatgatatcaacaattct---------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattacta 359  Q
    || ||||||||| ||| |||         |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36012351 caaatgatatcagcaactcttgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccgataagtccaaaatgctgcaagcattactagatgaattacta 36012450  T
Q  360 ttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36012451 ttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaa 36012498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 150 - 407
Target Start/End: Original strand, 29163912 - 29164161
Alignment:
Q  150 caaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaa 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29163912 caaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaa 29164011  T
Q  250 gtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagca 341  Q
    |||||||||         ||||||||||||| ||| ||        |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  29164012 gtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttacaagca 29164102  T
Q  342 ttactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29164103 ttactagatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaa 29164161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 174 - 407
Target Start/End: Original strand, 1089811 - 1090052
Alignment:
Q  174 atcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccccacaaagtgtaacactcaaaactatcaca 272  Q
    ||||||| ||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1089811 atcaatttatcagatcaacaggactacattaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 1089910  T
Q  273 tgatatcaacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 364  Q
    | | |||||||| |||        |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1089911 taacatcaacaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacat-taaatccaagattttgcaagcattactagatgaattactattgat 1090009  T
Q  365 cattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1090010 cattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 1090052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 47 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 51213166 - 51212955
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||  |||| |||||||||||||||||||| ||     
T  51213166 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactgtaacataaaaaatgtaatgagcaacaccccactgtttgtacaatgg 51213067  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51213066 catcaaaagttgagtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccac 51212967  T
Q  247 aaagtgtaacac 258  Q
    ||||||||||||    
T  51212966 aaagtgtaacac 51212955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 89 - 401
Target Start/End: Original strand, 38591727 - 38592051
Alignment:
Q  89 aagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgt----ttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatc 184  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | | | |||||||| | || |||    ||||||| || ||||||||||| ||||| | || ||| ||||| |||||    
T  38591727 aagttaacactataacatcaaaattatagggagtaacatctcattgtattgttgtacaatggcatcaaaagttaagtccacatattattatcaactcatc 38591826  T
Q  185 agattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa 284  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||| || |||||||||| |||||| |||    
T  38591827 agattaacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgtttcaagtgtaataccccacaaaacgtgacacttaagactatcacataatatcatcaa 38591926  T
Q  285 ttctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagta 376  Q
     ||| ||        ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||    
T  38591927 atctatttgcatgtcaaagatgacaacgataaaaaagtatttgtaaatccaagatgttgcaagcattattaaacaaattactattgatcattaatcagta 38592026  T
Q  377 atcaacaatttaaaaatgaatcaaa 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  38592027 atcaacaatttaaaaatgaatcaaa 38592051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 48 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 11835790 - 11835494
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgac 147  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       
T  11835790 gaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactat-----caaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagt--- 11835699  T
Q  148 atcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaat-tttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
                  |||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  11835698 --------------ccccatagtatcatcaatttatcatattaacaaaaatacacttaatctaatatttatcctaccttgttttaagtgtaacaacctac 11835613  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtta--aagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatta 344  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||| ||| ||   | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11835612 aaagtgtaacaattaagactatcacatgatatcatcaactctatttgcatgatgttaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaaacatta 11835513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20373481 - 20373300
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| |||    
T  20373481 ggaaaattttatagtgaagtcataagaatgatttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaacgagtaacaccccactgtttgtacaatga 20373382  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgtt 228  Q
    ||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20373381 catcaaaagttcagttctcatggtatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtt 20373300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27480564 - 27480368
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | |||||  |||||||| |||| || ||||||||||||||||| |  |||||| || || | ||||||||| ||||    
T  27480564 ggaaaattctatgatgaagtcatgagaatgatatttttggtaaagtcaacactataacatcaaaagtataatgagtagcatccaattgtttgtacggtga 27480465  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27480464 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccc 27480368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 75 - 280
Target Start/End: Original strand, 53176074 - 53176278
Alignment:
Q  75 tgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatca 174  Q
    |||||||| || ||||||||| |  |||||||||||| |||||| |||||    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  53176074 tgacttttctgatgaagttaacatcataacatcaaaaatgttgtaagtaa-tgtccactgtttgtacaataacatcaaaagttcagtcctcatagtatca 53176172  T
Q  175 tcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatg 274  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||| | |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  53176173 tcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaacctcattttaaatataacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatg 53176272  T
Q  275 atatca 280  Q
    ||||||    
T  53176273 atatca 53176278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 290 - 407
Target Start/End: Original strand, 50475053 - 50475177
Alignment:
Q  290 ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattg-------atcattaatcagtaatcaac 382  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||||||||||||||||||     
T  50475053 ttaaagatgtcaaggataaaataatacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattagtattgatcattaatcattaatcagtaatcaat 50475152  T
Q  383 aatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  50475153 aatttaaaaatgaatcaaacattaa 50475177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 288 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 51212707 - 51212599
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 387  Q
    ||||||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  51212707 tgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaattaaaaatcaacaattt 51212608  T
Q  388 aaaaatgaa 396  Q
    |||||||||    
T  51212607 aaaaatgaa 51212599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 288 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27480298 - 27480175
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg----caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaaca 383  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  27480298 tgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaaatgttaattacaaacattactagatgaattactattgattattaatcagcgatcaaca 27480199  T
Q  384 atttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  27480198 atttaaaaatgaatcgaacattaa 27480175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11357140 - 11356975
Alignment:
Q  242 cccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctg--------ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||||        ||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11357140 cccacaaagtgtaacactcaagactatcatataatatcatcaactctggttgtatgttaaatatgccaatgataaaatagtatttgtaagtccaagatgt 11357041  T
Q  334 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||        ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11357040 tgcaagcatta--------attactattcatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatccaacattaa 11356975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 213 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 20373263 - 20373080
Alignment:
Q  213 tttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacg 304  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||        ||||||  |||||    
T  20373263 tttatcctaccttgttataagcgtaatatcccataaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacg 20373164  T
Q  305 ataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacat 404  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20373163 ataaaatagtacatataagtccaagatg-------------------aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacat 20373083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 133
Target Start/End: Original strand, 2613895 - 2613967
Alignment:
Q  61 tgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccact 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  2613895 tgaagtcattaaaatgacttttttgttgaagttaacactataacaccaaaagtgttgtgagtaacaccacact 2613967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 288 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 53811670 - 53811597
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 361  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  53811670 tgttaaagataccaacgataaaataatactcgtaagtccaagatgttgcaggcattcctagatgaattactatt 53811597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 53811767 - 53811698
Alignment:
Q  133 tgtttgtacagtgacatcaaaagttcagt------ccccttagtatcatcaattcatcagattaacaaga 196  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53811767 tgtttgtacagtggcatcaaaagttcagtatataaccccatagtatcatcaattcatcagattaacaaga 53811698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 131
Target Start/End: Original strand, 33698218 - 33698263
Alignment:
Q  86 gtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccca 131  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33698218 gtgaagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagtaacacccca 33698263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 104
Target Start/End: Original strand, 29163839 - 29163895
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataac 104  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  29163839 gaaaattttatggtgaagtcattaaaatgatttttctggtgaagttaacactataac 29163895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 49359676 - 49359628
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  49359676 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgactttttttgtgaagttaa 49359628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 55343469 - 55343405
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaa 111  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||    
T  55343469 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatatcaaaa 55343405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 92
Target Start/End: Original strand, 5124671 - 5124713
Alignment:
Q  50 aaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagt 92  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5124671 aaattctatggtgaaatcattaaaatgacttttttggtgaagt 5124713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 40640682 - 40640634
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  40640682 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaa 40640634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 47930714 - 47930666
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  47930714 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttctggtgaagttaa 47930666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 19606961 - 19606914
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  19606961 gaaaattctatggtgaagttataaaaatgacttttctggtgaagttaa 19606914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 42665589 - 42665539
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaata 97  Q
    |||||||||||| ||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||    
T  42665589 ggaaaattctatggtgaagttatgataatgatttttttggtgaagttaata 42665539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 48155262 - 48155220
Alignment:
Q  50 aaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagt 92  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48155262 aaattctacggtgaagtcgttaaaatgacttttttggtgaagt 48155220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 38392673 - 38392628
Alignment:
Q  50 aaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    ||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  38392673 aaattatatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaa 38392628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 94
Target Start/End: Original strand, 4556543 - 4556587
Alignment:
Q  50 aaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagtta 94  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  4556543 aaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctcgtgaagtta 4556587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 94
Target Start/End: Original strand, 13006902 - 13006946
Alignment:
Q  50 aaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagtta 94  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13006902 aaattatatggtgaagtcgttaaaatgacttttttagtgaagtta 13006946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 20108146 - 20108102
Alignment:
Q  50 aaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagtta 94  Q
    ||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  20108146 aaattctatggtgaagttattcaattgacttttttggtgaagtta 20108102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 72)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Original strand, 33341397 - 33341766
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtg----ttgtgagtaacaccccactgtttgtacagt 144  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||||| ||    ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  33341397 aaaattctatagtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaaattaacactatatcatcaaaattgattgttgcgaggaacaccccactgtttgtacagt 33341496  T
Q  145 gacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc 244  Q
    | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33341497 ggcatcaaaagttcagtcccat-agtatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctc 33341595  T
Q  245 acaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 336  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33341596 acaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgt 33341695  T
Q  337 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33341696 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 33341766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 34948306 - 34947938
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  34948306 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttctggcgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtaaagtggca 34948207  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34948206 tcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgtttaaagtgcaacaccccacaa 34948107  T
Q  249 agtgtaac--actcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||        ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34948106 agtgtaacgtacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaa 34948007  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34948006 gcattactagatgaaatactattgatcgttaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 34947938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 55241315 - 55240948
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  55241315 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagttaatactatattatcaaaattgttgcgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 55241216  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  55241215 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaatttatcaga-taagaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacacctcac 55241117  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||| ||        ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55241116 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatgtcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 55241017  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
     ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55241016 acattactagataaattactattaatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 55240948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 48 - 407
Target Start/End: Original strand, 37775670 - 37776026
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgac 147  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37775670 gaaaattctacggtgaagtcattaaaatgatttttttggtgaagttagcactataatattaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggc 37775769  T
Q  148 atcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37775770 atcaaaagttcc--ccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 37775867  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    |||||||||||         ||||||||||||| ||| |         ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37775868 aagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaag 37775958  T
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37775959 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 37776026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 7703517 - 7703877
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    ||||||||||||  | ||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  7703517 ggaaaattctatgttaaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtcagtaacaccccactgtttgtacggtga 7703616  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7703617 catcaaaagttcagtccccatagtatcatca--------gattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacactccac 7703708  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||        ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7703709 aaagtgtcacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaa 7703808  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7703809 gcattactagatgaattactatttatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 7703877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 37663950 - 37663591
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37663950 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttgatgaagttaacacta--acattaaaactgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatga 37663853  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  37663852 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccac 37663753  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa-----ttc---tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     |||   ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37663752 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 37663653  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37663652 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 37663591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Original strand, 47253751 - 47254108
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  47253751 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactatatcatcaaaagtgttgtgagtaacaccc-attgtttatacagtgaca 47253849  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||        |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47253850 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatca--------gattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 47253941  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||        ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  47253942 agtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaagc 47254041  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47254042 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaa 47254108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 47 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 19089664 - 19089303
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  19089664 ggaaaattctatggtgaagtcataagaataacttttttgatgaagttaacactataatatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtataatga 19089565  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||| ||    
T  19089564 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctatatgcgtaacaccctac 19089465  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa-----ttc---tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     |||   |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19089464 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 19089365  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089364 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 19089303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28003197 - 28002829
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||| || ||||  || ||||||||||||||||||    
T  28003197 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtcagtagtactccactgtttgtacagtga 28003098  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28003097 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcggattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccag 28002998  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28002997 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcta 28002898  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28002897 acattactagatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaa 28002829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Original strand, 17167715 - 17168081
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17167715 aaaattctatggtgaagttacgaaaatgacttttctgatgaagttaacattataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgaca 17167814  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17167815 tcaaaagttcattctccatagtatcattaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaa 17167914  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17167915 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagc 17168014  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17168015 atcactagatgaattactatttatcattaattagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaa 17168081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 55478106 - 55477734
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgt----aca 142  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||    |||    
T  55478106 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacactccactgtttgtttgtaca 55478007  T
Q  143 gtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacc 242  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  55478006 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgttataagtgtaacacc 55477907  T
Q  243 ccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtt 334  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55477906 ccacaacgtgtaacactgaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatttaagtccaagatgtt 55477807  T
Q  335 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55477806 gcaagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 55477734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Original strand, 17173292 - 17173658
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17173292 aaaattctatggtgaagttacgaaaatgacttttctgatgaagttaacattataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgaca 17173391  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17173392 tcaaaagttcaatctccatagtatcattaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaa 17173491  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17173492 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagc 17173591  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17173592 atcactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaa 17173658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 30002835 - 30002484
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30002835 ggaaaactctatggtgaagtcattaaaatgatttttctggtgaagttaacactgtagcatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagtga 30002736  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30002735 catcaaaagttcagtcttcttagtatcatca--------gattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccac 30002644  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    |||||||||||||||         |||||||||| ||| ||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30002643 aaagtgtaacactca---------catgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatttaagtctaagatgttgcaa 30002553  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30002552 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaataaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 30002484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 36493897 - 36493532
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36493897 aaaattctatggtgaagtcatgaaaataacttttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatatagtgagtaacaccccattgtttgtacagtgaca 36493798  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  36493797 tcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaa-actccacaa 36493699  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    ||||||||||| || |||| ||||| |||||| ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  36493698 agtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatattgcaagc 36493599  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36493598 attactcgatgaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 36493532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 48 - 407
Target Start/End: Original strand, 4597994 - 4598350
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgac 147  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4597994 gaaaattttatggtgaagtcattagaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaa-gtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggc 4598092  T
Q  148 atcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4598093 atcaaaagttcagtccccttagactcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcct-gcttgttttaagtgtaacaccccaca 4598191  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    |||||||||||         ||||||||||||| ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4598192 aagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgttttcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatttaaatccaagatgttgcaag 4598282  T
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598283 cattattagattaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 4598350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 64 - 407
Target Start/End: Original strand, 23761089 - 23761439
Alignment:
Q  64 agtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcc 163  Q
    |||||| | ||||||| || | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23761089 agtcatgagaatgactattcttgtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagtcc 23761188  T
Q  164 ccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaa 263  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||     
T  23761189 ccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttat-ctaccttgttttaagtgtaacacctcataaagtgtcacatttaag 23761287  T
Q  264 actatcacatgatatcaacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 355  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||        |||||||||  |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23761288 actatcgcatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagataccaacgataaaattgtacctataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 23761387  T
Q  356 actattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23761388 attattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaa 23761439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 29584409 - 29584043
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||| |   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||     
T  29584409 ggaaaattctatggtgaagtcgtgggaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttg--agtaacacctcactgtttgtacaatgg 29584312  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||     
T  29584311 catcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgttacaccccat 29584212  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
     |||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||| ||        |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29584211 gaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatgttgcaa 29584112  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29584111 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaa 29584043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 61 - 407
Target Start/End: Original strand, 50764746 - 50765088
Alignment:
Q  61 tgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcag 160  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  50764746 tgaagtcatgagaataacttttttgatgaagttaacacta--acatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacggtgacatcaaaagttcaa 50764843  T
Q  161 tccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactc 260  Q
    ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||| |||||||    
T  50764844 tcctcatagtatcatcaattcattagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctac----------gtgtaacaccccacaaagtgaaacactc 50764933  T
Q  261 aaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 352  Q
    || | ||||||||||||||| ||| | ||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50764934 aatattatcacatgatatcagcaactatgtttgcaagttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatga 50765033  T
Q  353 attactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50765034 attactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 50765088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 50 - 407
Target Start/End: Original strand, 32592096 - 32592452
Alignment:
Q  50 aaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacat 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  32592096 aaattttattgtgaagtcattataatgacttttttgatgaagttaacactacagtatcaaaagtgttgagagtaacactccactgtttgtatagtgacat 32592195  T
Q  150 caaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaa 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32592196 caaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaa 32592295  T
Q  250 gtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagca 341  Q
    |||||||||         ||| ||||| ||| ||| |         ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  32592296 gtgtaacac---------tcatatgatttcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtctacgataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgaaagca 32592386  T
Q  342 ttactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32592387 ttactaaatgaattactattgatcgttaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 32592452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 25184113 - 25184481
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| | |||||||||||| |||    
T  25184113 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgactattttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactctactgtttgtacaatga 25184212  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||| |||||||| ||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  25184213 catccaaagttcaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcac 25184312  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||| | ||| ||        ||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25184313 aaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 25184412  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25184413 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcgacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 25184481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 35021246 - 35020874
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  35021246 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaacattataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacattgg 35021147  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    | |||||||||  |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35021146 cgtcaaaagtttcgtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccac 35021047  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  35021046 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaa 35020947  T
Q  339 gcattactagatgaattac----tattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
     ||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35020946 acattactagatgaattactatatattgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 35020874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 32912791 - 32912422
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| | | |||||| | |||    
T  32912791 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccctagtatttgtagaatga 32912692  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
     |||||||||||||  | | || ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  32912691 tatcaaaagttcagcactcataatatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctac 32912592  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32912591 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgtatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 32912492  T
Q  339 gcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32912491 gcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 32912422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Original strand, 27396618 - 27396982
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27396618 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacattatagcattaaaagtgttatgagtaacaccctactgtttgtacaatgaca 27396717  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    |||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  27396718 tcaaaagtttcgtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaagtgtaacatcccataa 27396817  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    ||||| ||||| || || ||| |||||||||| |||  |        |||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||| |||||||||||    
T  27396818 agtgtcacacttaagaccatcgcatgatatcagcaacgctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaagtggtacctataagtccaaaatgttgcaagc 27396917  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27396918 attactagatgaattactattgatcattaat--gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 27396982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25701268 - 25700899
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25701268 ggaaaattttatggtgaagtcatgataatgacttttttggtaaagttaacattataacatcaaaagtgtagtgagtaacaccctactgtttgtacagtga 25701169  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-cccca 245  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25701168 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaggactacactaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccca 25701069  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    |||||||||||||| || | |||||||| | |||| ||| |         ||||||||| ||||||||||||||||||   |||| || ||||| |||||    
T  25701068 caaagtgtaacacttaagattatcacataacatcatcaactttgtttgcatgttaaagaagtcaacgataaaatagtatccgtaaatctaagattttgca 25700969  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  25700968 agcattgttagatgaattactattgatcattaatcaataatgtacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 25700899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 34361702 - 34361334
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  34361702 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtagaatga 34361603  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||| |||||||||| || | || ||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  34361602 cattaaaagttcag-cctcataatatcatcaattcatccggttaacaaaattacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccctac 34361504  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  34361503 aaagtgtaacacttaaagctatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatgttgcaa 34361404  T
Q  339 gcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34361403 gcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 34361334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 61 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 46888354 - 46888001
Alignment:
Q  61 tgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcag 160  Q
    ||||||||  ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  46888354 tgaagtcaagaaaataacttttctgatgaagttaatactataacatcaaaattgtagtgagtaataccccactatttgtacagcggcatcaaaagttcag 46888255  T
Q  161 tccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactc 260  Q
    ||||| || |||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||     
T  46888254 tccccatactatcgttaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaacgtaacact- 46888156  T
Q  261 aaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 352  Q
     | |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46888155 tagactatcacataatatcatcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttacaagcattactagatga 46888056  T
Q  353 attactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46888055 attactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaa 46888001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 49375966 - 49376335
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttt-tggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 145  Q
    |||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49375966 ggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgactttttctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgtcgtgagtaacaccccactgcttgtacagtg 49376065  T
Q  146 acatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||||   ||||||||    
T  49376066 gcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacgcttgatctaattttattctgccttgatttaagttatacacccca 49376165  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    ||| |||||||||| || | |||||||| |||||| ||| |         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  49376166 caatgtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactttgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagaagttgaa 49376265  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  49376266 agcattactaaatgaattactattgatcattaatcagtaatcaagaatttaaaaatgaattaaacattaa 49376335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 19440860 - 19440491
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaa-gtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 145  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||| |||| ||||||||| ||    
T  19440860 ggaaaattctatggtgaaagtcatgagaatgacttttttggtgatgttaacactataacatcaaaaatgtaatgattaacactccaccgtttgtacaatg 19440761  T
Q  146 acatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
     ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||    
T  19440760 gcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcttagcttgttataagcgtaacacccca 19440661  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    ||| ||||||| || ||   ||| |||| |||||| ||| ||        ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19440660 caacgtgtaacccttaagtttataacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 19440561  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19440560 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaattaatcaaacattaa 19440491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 50697242 - 50697610
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| || |||||||||| |||| | |   ||||||||||| || ||||||||| |||    
T  50697242 ggaaaattctacggtgaagtcataaaaatgatttttttagtgaagtaaacactataacataaaaaatataacgagtaacaccctaccgtttgtacaatga 50697341  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  50697342 catcaaaagttcaattctct-agtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagcgtaacaccacac 50697440  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc---------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    |||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||| ||         ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  50697441 aaagtgcaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcaatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaattccaagatgttgta 50697540  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50697541 agcattactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 50697610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 37287733 - 37288096
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgactttttt-ggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 145  Q
    |||||||||||| ||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37287733 ggaaaattctatggtgaagtaatgagaatgactttttttggtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 37287832  T
Q  146 acatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttt-atcctaccttgttttaagtgtaacacccc 244  Q
     ||||||||||||| ||| | || |||||| |        |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  37287833 gcatcaaaagttcaatcctcataatatcataa--------gattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaagtgtaacgcccc 37287924  T
Q  245 -acaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtta--------aagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 335  Q
     ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| ||| | ||||         |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37287925 cacaaaatgtaacacttaagactagcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttgaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 37288024  T
Q  336 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37288025 caagcattattagatgaattactattgagcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaa 37288096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 879759 - 879391
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| ||  |||||||||| | ||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||  ||||||||||| || |||||||||| |||    
T  879759 ggaaaattttaaggtgaagtcatgagaataatttttttggtgaagtaaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcattgtttgtacaatga 879660  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||| | ||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  879659 catcaaaagtttaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacataatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcac 879560  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||| |         ||||||||||    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  879559 aaagtgtaacatttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 879460  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  879459 gcattactagatgaattattattgatcattaataagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 879391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 9139247 - 9139595
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||   |||| ||| |||| |   |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9139247 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaattgacttttttggtgaagttaacgttatagcataaaaaata--gtgagtaacaccccaccgtttgtacagtga 9139344  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  9139345 cataaaaagttcaatccccatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaactgtaacaccctac 9139444  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattact 346  Q
    ||||||||||||| || |  | | | || |  ||       ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9139445 aaagtgtaacacttaagataaactc-tgtttgca-------tgttaaagatgccaacgataacgtagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattact 9139536  T
Q  347 agatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  9139537 agacgaattactattgatcattaatcaataatc--taatttaaaaatgaatcaaacattaa 9139595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 3042611 - 3042987
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||  ||||||| ||||||| |||| |||| |||    
T  3042611 ggaaaattctatggtgaaatcataaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacatacaaaatgtaatgagtaataccccaccgtttatacaatga 3042710  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttag----------tatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgt 236  Q
    |||||||| |||||||   ||||          |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||    
T  3042711 catcaaaaattcagtca--ttagagtatcaatgtatcatcaattcatcatattaacaagattacacttaatataattttatcataccttattataagcgt 3042808  T
Q  237 aacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaa 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| | ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3042809 aacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcttgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaa 3042908  T
Q  329 gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3042909 catgttgcaagcattactagatgaattagtattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 3042987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 50 - 407
Target Start/End: Original strand, 6864038 - 6864403
Alignment:
Q  50 aaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacat 149  Q
    ||||| ||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |  ||| ||||| || ||| |||||||| |  |||    
T  6864038 aaattgtatggtgatgtcatgagaatgacttttttggtgaagttatcactataacatcaaaaatttaatgaataacatccaactttttgtacaatagcat 6864137  T
Q  150 caaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaa 249  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6864138 caaaagtccagtcctcatagtatcatcaatttatcagattaacaagactacatttaatttaattttatcataccttgttataagcgtaacaccccacaaa 6864237  T
Q  250 gtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagca 341  Q
    |||||| ||| || |||||||||| |||||| ||| |         ||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  6864238 gtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaataatatttgtaagttcaagatgttgcaagca 6864337  T
Q  342 ttactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6864338 ttactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 6864403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 47 - 404
Target Start/End: Original strand, 42199729 - 42200096
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| | |||||| | |||    
T  42199729 ggaaaaatctatggtgaaatcataagaatgatttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaatgagtaataccccattatttgtagaatga 42199828  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  42199829 cataaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctac 42199928  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagta-catgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||  || ||        ||||||||||  ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  42199929 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaataataccttgtaagtccaagatgttgca 42200028  T
Q  338 agcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacat 404  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  42200029 agcattactagatgaatatactactgttcattaatcagtaatcaataatttaaaaattaatcaaacat 42200096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 5048174 - 5047809
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    ||||||||||| |||||| || | ||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||  ||| |    
T  5048174 aaaattctataatgaagttatgagaatgatttttctggtgaagtcaactctataacatcaaaagtgtagtgagtaggaccacactgtttgtacgatgata 5048075  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  5048074 tcaaaagttcagttcccatagtatcatcaattcatgagattaacaagactgcatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaata-cccgcaa 5047976  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||||||  || |         ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5047975 aatgtaacacttaagactatcacatgatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagt 5047876  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5047875 tttactagataaattattattgatcagtaatcaacaataaacaatttaaaaatgaatcgaacattaa 5047809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 155 - 407
Target Start/End: Original strand, 1815409 - 1815669
Alignment:
Q  155 gttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgta 254  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1815409 gttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacatttactctaattttatcctaccttgttttaagggtaacaccccacaaagtgta 1815508  T
Q  255 acactcaaaactatcacatgatatcaacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattact 346  Q
    ||||| || |||||||||| |||||| ||| |||        |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1815509 acacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaaacattact 1815608  T
Q  347 agatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1815609 agatgaattacaattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 1815669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 32579444 - 32579814
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgt---acag 143  Q
    |||||||| ||| |||||||  | | |||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||   || |    
T  32579444 ggaaaattttatggtgaagttctgagaatgacttttctggtgaagtcaacattataacatcaaaagtgcagtgagtagcaccccagtgtttgttgtacgg 32579543  T
Q  144 tgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 243  Q
    || ||||||||||| |||| | | ||||| |||| ||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  32579544 tgccatcaaaagtttagtctcat-agtattatcagttcatcagattaacatgactgtacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaagacct 32579642  T
Q  244 cacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 335  Q
    || |||||||||| || || ||||||  || |||||| ||| | ||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32579643 cagaaagtgtaactcttaagactatcttataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 32579742  T
Q  336 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32579743 caaacattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaa 32579814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 63 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 33816728 - 33816359
Alignment:
Q  63 aagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtc 162  Q
    ||||||| | ||||| |||| ||||||||| || | | || |||||||||||| ||||||| |||| |||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  33816728 aagtcatgagaatgatttttctggtgaagtcaacattgtagcatcaaaagtgtagtgagtagcacctcactatttatacggtggcatcaaaagttcagtc 33816629  T
Q  163 cccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac-----------------ccca 245  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||    
T  33816628 tccatagtatcatcaatttatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaaagtgtaatacccca 33816529  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctg--------ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| |||||| ||| | ||        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33816528 caaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagttcatgtaagtccaagatgttgca 33816429  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33816428 aacattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaa 33816359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 407
Target Start/End: Original strand, 17272067 - 17272332
Alignment:
Q  146 acatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17272067 acatcaaaagttcagtc----tagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacccca 17272162  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
      |||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||| ||| ||        |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17272163 tgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatattaaagatttcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 17272262  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17272263 agcattactagatgaattactattgatcattaatcggtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaa 17272332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 47 - 354
Target Start/End: Original strand, 38011854 - 38012169
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||     
T  38011854 ggaaaattctatggtgaaatcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgaatagcaccccactgtttgtacggtgc 38011953  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||     
T  38011954 catcaaaagttcagtccccataatattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatttaattttattataccttgttttaagtgtaacatcccag 38012053  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    |||||||||| || || |||||||||| |||||| ||| | |        |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38012054 aaagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcacgttaaaaatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 38012153  T
Q  339 gcattactagatgaat 354  Q
      ||||||||||||||    
T  38012154 atattactagatgaat 38012169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 253
Target Start/End: Original strand, 39397918 - 39398115
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39397918 ggaaaattctatggtgaagtcattagaatgacttttatggtgaagttaacactataacattaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttgtacagtga 39398017  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39398018 catcaaaagttcagtcttctcagtatcatca---------attaacaagaatacacttaatctaattttatcctgccttattttaagtgtaacaccccac 39398108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 73 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 54499424 - 54499217
Alignment:
Q  73 aatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtac-agtgacatcaaaagttcagtccccttagta 171  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |  |||||    
T  54499424 aatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccaccgtttgtactaatgacatcaaaagttcagtctctatagta 54499325  T
Q  172 tcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaa-ttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatca 270  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | || |||||||    
T  54499324 tcatcaattcatcatattaacaagaatatacttaatctaatttttatcataccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacttttaagactatca 54499225  T
Q  271 catgatat 278  Q
    ||||||||    
T  54499224 catgatat 54499217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 108 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4934353 - 4934055
Alignment:
Q  108 aaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaa 206  Q
    |||| ||| |||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4934353 aaaaatgtagtgagtaacacccccattgtttgtacactggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcatttcatcagattaacaagactacacttaa 4934254  T
Q  207 tctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatg 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || ||||||| || |||||| ||| |         |||||||||||    
T  4934253 tctaattttattctaccttgttttaagtccaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatg 4934154  T
Q  299 tcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaa-tttaaaaatgaat 397  Q
     ||||||||||||||||| |           |||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  4934153 acaacgataaaatagtacct-----------atgttgcacgcattaatagatgaatttctattaatcattaatcagtaatcaaaaattttaaaaataaat 4934065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 301 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 35025515 - 35025409
Alignment:
Q  301 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35025515 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 35025416  T
Q  401 acattaa 407  Q
    |||||||    
T  35025415 acattaa 35025409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 35025799 - 35025574
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |||    
T  35025799 ggaaaattctatgctgaagtcatgaaaatgatttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttatacgttga 35025700  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||        ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  35025699 catcaaaagttcagtcctcgtagtatc--------atcagattaacaagactgcatttaatataattttatcctatcttgttttaagtgtcacaccccag 35025608  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 280  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||| ||||||    
T  35025607 aaagtgtaacacttaagactatcgcataatatca 35025574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 288 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 7152166 - 7152047
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 387  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7152166 tgttaaatatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagattttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaattt 7152067  T
Q  388 aaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7152066 aaaaatgaatcaaacattaa 7152047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 288 - 407
Target Start/End: Original strand, 4205233 - 4205352
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  4205233 tgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatcactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaataattt 4205332  T
Q  388 aaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4205333 aaaaatgaatcaaacattaa 4205352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 288 - 407
Target Start/End: Original strand, 39400257 - 39400376
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 387  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39400257 tgttaaagatgccaacgataaaatggtacctttaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatgactattgatcattaatcagcaatcaacaattt 39400356  T
Q  388 aaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39400357 aaaaatgaatcaaacattaa 39400376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 189 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 46884177 - 46883957
Alignment:
Q  189 taacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct 288  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||| |    
T  46884177 taacgagactacacttaatctaattttatcatatcttgttataagc-taacatctcacaaaatgtaacacttaaa-ctatcacataatatcataaatttt 46884080  T
Q  289 gtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 380  Q
    |||        ||| ||  ||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46884079 gtttgcatgttaaaaattccaaagataaaatagta--tgtaagtcc--gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 46883984  T
Q  381 acaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  46883983 acaatttaaaaataaatcaaacattaa 46883957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 310 - 407
Target Start/End: Original strand, 23431826 - 23431923
Alignment:
Q  310 atagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23431826 atagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattagtagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgcatcaaacattaa 23431923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 299 - 407
Target Start/End: Original strand, 26896346 - 26896456
Alignment:
Q  299 tcaacgataaaatagtacatgtaagtcc-aagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaa 396  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26896346 tcaacgataaaatagtacttgtaagtccgaaaatgttgcaaacattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaa 26896445  T
Q  397 tcaaacattaa 407  Q
    || ||||||||    
T  26896446 tcgaacattaa 26896456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 4205116 - 4205221
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  4205116 ggaaaattctatggtgaagtcaggaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatatcaaaaatgttctgaataacaccccactgtttgtacaatga 4205215  T
Q  147 catcaa 152  Q
    ||||||    
T  4205216 catcaa 4205221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 139
Target Start/End: Original strand, 4396326 - 4396418
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| ||||||    
T  4396326 ggaaaattctatagtgaagtcataaaaatgacttttttagtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgt 4396418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 38012568 - 38012630
Alignment:
Q  345 ctagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  38012568 ctagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaa 38012630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Original strand, 53124287 - 53124372
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccac 132  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||    
T  53124287 ggaaaattatatgatgaagtcattaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatataatgagtaacaccccac 53124372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 343
Target Start/End: Original strand, 56050179 - 56050234
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatt 343  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  56050179 tgttaaagacttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 56050234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 7152317 - 7152235
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccc 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  7152317 ggaaaattctatggtgaagtcatgctaatgacttttctggtaaagttaacattataacatcaaaagtatagtgagtaacaccc 7152235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 46884245 - 46884197
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  46884245 ggaaaattctatagtgaagtcataaaaatgacttttttggcgaagttaa 46884197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Original strand, 17272011 - 17272077
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagt 113  Q
    |||||||||||| |||||||| |   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17272011 ggaaaattctatggtgaagtcgtgggaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagt 17272077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23518473 - 23518400
Alignment:
Q  88 gaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagt 161  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  23518473 gaagttaacactataacattaaaactgtagtgactaacaccccactgttaatacagtggcatcaaaaattcagt 23518400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 95
Target Start/End: Original strand, 51204580 - 51204627
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  51204580 gaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttctggtgaagttaa 51204627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 38812308 - 38812254
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactat 101  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  38812308 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaatcctat 38812254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Original strand, 2704512 - 2704560
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  2704512 ggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaa 2704560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 94
Target Start/End: Original strand, 42063006 - 42063050
Alignment:
Q  50 aaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagtta 94  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  42063006 aaattctatggtgaagtcattcaattgacttttttggtgaagtta 42063050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 94
Target Start/End: Original strand, 47028103 - 47028147
Alignment:
Q  50 aaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagtta 94  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  47028103 aaattctatggtgaagtcattcaattgacttttttggtgaagtta 47028147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 47073705 - 47073657
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  47073705 ggaaaattctatggtaaagtcatgataatgacttttttggtgaagttaa 47073657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 105
Target Start/End: Original strand, 52516599 - 52516655
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataaca 105  Q
    |||||| ||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  52516599 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttatggtgaagttaacactataaca 52516655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 102
Target Start/End: Original strand, 38811813 - 38811868
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactata 102  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  38811813 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaatcctata 38811868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 20097537 - 20097491
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  20097537 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaa 20097491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Original strand, 49878636 - 49878683
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  49878636 ggaaaattctatggtgaagt-atgataatgacttttttggtgaagttaa 49878683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 54995847 - 54995799
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  54995847 ggaaaattctacgatgaagtcatgataatgacttttttggtgaagttaa 54995799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 49 - 400
Target Start/End: Original strand, 7889 - 8248
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| ||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7889 aaaattctatggtgaagttataagaatgacttttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgaca 7988  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||    
T  7989 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgctataagcgtaacaccccacaa 8088  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa-----ttc---tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||| |||     |||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8089 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 8188  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8189 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 8248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 58)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 33660569 - 33660212
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33660569 aaaattctatggtgaagtcattaaaatgacttttctagttaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccaactgtttgtacagtggca 33660470  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33660469 tcaaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcattagattaacaggaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 33660370  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    ||||||||||          |||||||||||| ||| |         ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||    
T  33660369 agtgtaacac---------ccacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctgagatgttgcaagc 33660279  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33660278 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 33660212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 4166922 - 4167290
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  4166922 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaacattatagtatcaaaaatattgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgg 4167021  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4167022 catcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 4167121  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaa--------ttctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||         | ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  4167122 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaa 4167221  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4167222 gcattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaa 4167290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 5881534 - 5881897
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaa-----agtgttgtgagtaacaccccactgtttgtac 141  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5881534 ggaaaattttattgtgaagtcattaaaatgacttttctggtgaagttgatattataacatcaaaacaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtac 5881633  T
Q  142 agtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacac 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  5881634 agtgacatcaaaagttgagtccccttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaatctaa-tttatcataccttgttttaagtgtaatac 5881732  T
Q  242 cccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 333  Q
    | |||||||||||||||         |||||||||||||||||||         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5881733 ctcacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcaacaattttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtctaagatgt 5881823  T
Q  334 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5881824 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattattcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 5881897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 79 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 33709403 - 33709067
Alignment:
Q  79 ttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaa 178  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33709403 ttttatggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgcgagtaacactccactgttagtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaa 33709304  T
Q  179 ttcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatat 278  Q
     |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||| ||||||||    
T  33709303 atattcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatat 33709204  T
Q  279 caacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 370  Q
    || ||| ||        ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33709203 cagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacttgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 33709104  T
Q  371 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33709103 tcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 33709067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 47 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 27350142 - 27349789
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgac-ttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 145  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27350142 ggaaaattttatggtgaagtcattaaaataatattttttggtgaagttaacactatagcatcaaaaatgttgtgagtaacaccacactgtttgtacagtg 27350043  T
Q  146 acatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27350042 acatcaaaagttcagtccc-ttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacacccca 27349944  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattct--------gttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    |||||||||||||         |||||||||||||  || |||        |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  27349943 caaagtgtaacac---------tcacatgatatcaggaactctgtttgcaagttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgca 27349853  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27349852 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 27349789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 47 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4264280 - 4263926
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4264280 ggaaaattctatggtgaagtcatcataatgacttttctggtaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgtttgtacagtga 4264181  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4264180 catcaaaagttcagtctccatagtattatcaattcatcatattaagaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtttaacaccccac 4264081  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatc-acatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||| ||        ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4264080 aaagtgtaacacttaagactatcaacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatataagttcaagatgttgca 4263981  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaa 392  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4263980 agcattactagatgaaataatattgatcattgatcagtaatcaacaatttaaaaa 4263926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 4763628 - 4763999
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaata---ctataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacag 143  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |   ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4763628 ggaaaattctatgatgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacaacactatatcaacaaaactgtagtgagtaacaccccactgtttgtacag 4763727  T
Q  144 tgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccc 243  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  4763728 tgacatcaaaagttcagttcccatagtataatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttattctaccttgtttcaagtgtagcaccc 4763827  T
Q  244 cacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 335  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||        |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  4763828 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattctttttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatattg 4763927  T
Q  336 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4763928 caagcattactagttgaattactattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaa 4763999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 31570937 - 31570569
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| ||||||| || | ||| |||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||    
T  31570937 ggaaaattctatggtgaagttatgagaataacttttctggtgaaattaacactataacattaaaagtgttgtaagtaacaccccactatttttatagtga 31570838  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31570837 catcaaaagttcagtccacatagtatcatgaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccccac 31570738  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||        ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  31570737 aaaatgtaacacttaagactgtcacatgatatcaacaactctgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtttaagatgttgcaa 31570638  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  31570637 gcattgctagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaaatatttaaaaatgaatcaatcattaa 31570569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Original strand, 3176941 - 3177307
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  3176941 aaaattctatggtgaagttacgaaaatgacttttctgatgaagttaatactataatatcaaaaatgttttgagtaacacgcaactgtttgtacaatgaca 3177040  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3177041 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 3177140  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |         |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  3177141 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaactataaaatagtacatgtaagtccaagatattacaagc 3177240  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3177241 attactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaacaatttgaaaataaatcaaacattaa 3177307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 43771039 - 43770683
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  43771039 aaaattctatggtgaagtcattagaatga-ttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttatacagtggca 43770941  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  43770940 tcaaaagttcagtccccttaatatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatttaattttatcctgccttgttttaagtgtaacacctcacaa 43770841  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    ||||||||||         ||||||||||||| ||| ||        ||||||||||| |||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  43770840 agtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctttaagttcaagatgttgcaagc 43770750  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43770749 attactagatgaatttctattgatcattaattagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 43770683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 19424831 - 19424477
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||     
T  19424831 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaatggcttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttatatagtgg 19424732  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19424731 catcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccac 19424632  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattact 346  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||| ||||||    |||| |     || ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19424631 aaagtgtaacatttaagactatcacatgatatcagcaactctgtt-tgcatgtta-----aagatagtacctgcaagtctaagatgttgcaagcattact 19424538  T
Q  347 agatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19424537 agatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaa 19424477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 26357577 - 26357945
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26357577 ggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacatcccactgtttgtacagtga 26357676  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||| |   |||  | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  26357677 catcaaaagttcagttcttatagagttatcaattcatcatattaacaagatcacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatcccac 26357776  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| | ||||        ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  26357777 aaattgtaacacttaaaactatcacataatattatcaaatgtgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatttttaagtccaagatgttgcaa 26357876  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26357877 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 26357945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 47 - 391
Target Start/End: Original strand, 4478368 - 4478717
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcatt-aaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 145  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4478368 ggaaaattctatagtgaagtcatagaaaatgatatttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccattgtttgtacagtg 4478467  T
Q  146 acatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaa-ttttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc 244  Q
     ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     |    
T  4478468 gcatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaa-----c 4478562  T
Q  245 acaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 336  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| ||        ||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  4478563 acaaagtgtaacacttaagtctatcacatgatatcaccaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtatcggtaagtccaagatgttgc 4478662  T
Q  337 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaa 391  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4478663 aagcattactagatgaattgctattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaa 4478717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 18494471 - 18494116
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||            ||    
T  18494471 ggaaaattctgtggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccac------------ga 18494384  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  18494383 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattcactagaatacacttgatctaattttatcctaccttgtattaagtgtaa-acctcac 18494285  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    |||| || ||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18494284 aaagagtcacacttaagactatcacatgatatcaacgactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgtaa 18494185  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494184 gcattactagatgaattgctattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 18494116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 29242341 - 29241980
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  29242341 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatggtttttttggtgaagttaaaactataacataaaaaatatagtgcgtaacaccccactgtttgtacagtgg 29242242  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
     |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29242241 tatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 29242142  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||  || |||||||||| |||||| ||| ||        |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||           
T  29242141 aaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgtcaacgatacaatagtacctgtaagtccaagat------- 29242049  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29242048 gaattactagatgaattactattgaacattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 29241980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 80 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 43648415 - 43648080
Alignment:
Q  80 tttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaat 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||  | ||||||||||||     
T  43648415 tttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcactgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaac 43648316  T
Q  180 tcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatc 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||| |||||    
T  43648315 tcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagtgtaacaccacacaaagtataacacttaagactatcacataatatc 43648216  T
Q  280 aacaa------ttc--tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 371  Q
    | |||      |||  |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43648215 atcaactttgtttccatgttaaagatttcaacgataaaatagcacttgtaagtccaagatgtcgcaaacattactagatgaattactattgatcattaat 43648116  T
Q  372 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43648115 cagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 43648080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 37905709 - 37906079
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||   |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  37905709 ggaaaattctatggtgaagttataaaaatga-ttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaacgagtaacaccccaccgtttgtacaatga 37905807  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca--cccc 244  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||    
T  37905808 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacccccc 37905907  T
Q  245 acaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 336  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  || ||        ||||||||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37905908 acaaagtgtaacacttaaaactatcgcataatatcattaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaataacacatgtaagtccaagatgttgc 37906007  T
Q  337 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacattaa 407  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37906008 aagaattactggatgaattactattgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaa 37906079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 33551189 - 33550818
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33551189 ggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgacttttttagtgaagttaacactataacatcaaaaatgtagtgagtaacaccccactgtttgtacaatga 33551090  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  33551089 catcaaaagttcggtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctacgttgttttaagcgtaacaccccac 33550990  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||| |  || |||||| ||| |         |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  33550989 aaagtgtaacacttaagacta-cgtataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacttgaaagtccaatatgttgcaa 33550891  T
Q  339 gcattactagatgaattactattga----tcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33550890 gcattactagatgaataactattgattatttattaaccagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 33550818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 11366584 - 11366215
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  ||||||||| | |||| |||||| | |||    
T  11366584 ggaaaattctatggtgaaatcataagaatgacttttttggtgaaattaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacatctcactatttgtataatga 11366485  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||| || |||||| |||   |||||||| ||    
T  11366484 catcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacatttaatataattttatcatatcttgttctaaacataacaccctac 11366385  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11366384 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 11366285  T
Q  339 gcattactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11366284 gcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 11366215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 48 - 405
Target Start/End: Original strand, 13711465 - 13711825
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgac 147  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13711465 gaaaattctatggtgaagtcatcagaatgacttttctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacagtttgtacagtgac 13711564  T
Q  148 atcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 247  Q
    |||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     | ||||||||||||||||||||| |    
T  13711565 atcaaaagtttagtccacatggtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttat-----catgttttaagtgtaacaccccata 13711659  T
Q  248 aagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 339  Q
    |||| ||| | | || ||||| ||||||||||| ||| ||        ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  13711660 aagtataatagttaagactatgacatgatatcagcaactctgtatgcatgttaaagatgccagcgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaaa 13711759  T
Q  340 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt 405  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13711760 caatactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaatcatt 13711825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 44913662 - 44914035
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccact-gtttgtacagtg 145  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || ||||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||    
T  44913662 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttatg-tgaagttaacactgtagtatcaaaaatgttgtgagtaacacctcacttgtttgtaaaatg 44913760  T
Q  146 acatcaaaagttcagtcccct-tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca-ccc 243  Q
    |||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  44913761 acataaaaagttcaatcccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaacacccc 44913860  T
Q  244 cacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 335  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44913861 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 44913960  T
Q  336 caagcattactag---atgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||| |||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44913961 caagcattattagaaaatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 44914035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 47 - 378
Target Start/End: Original strand, 19313852 - 19314186
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  19313852 ggaaaattctatggtgaagtcattagaatgacttttctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccttactatttatacagtga 19313951  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19313952 catcaaaagttcagtcctat-agtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatcgaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccac 19314050  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatg---taagtccaagatgttg 335  Q
    ||||||||||       ||||||||||||||||| ||| |         |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||    
T  19314051 aaagtgtaac-------actatcacatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatgtcagcgataaaatagtacatgttataagtctaagatgttg 19314143  T
Q  336 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19314144 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 19314186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 39167566 - 39167204
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||| ||| |||||||||  | ||||| ||||||| ||||||||| |  |||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  39167566 ggaaaattttatggtgaagtcacgagaatgatttttttgatgaagttaacagaatagtatcaaaagtattgtgagtaacacctcactgtttgtacaatga 39167467  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  39167466 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagagtaacaagaatacacttattctaattttattataccttgttttaagtgtaacatcccac 39167367  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||      ||||||||||| |||||| ||| ||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  39167366 aaagtgtaac------aactatcacataatatcatcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaattgttgcta 39167273  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39167272 gcattactagatgaattactattaattatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaa 39167204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 146 - 407
Target Start/End: Original strand, 41960939 - 41961208
Alignment:
Q  146 acatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41960939 acatcaaaagttcagtccacatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacacccca 41961038  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    |||||||||||||| || | |||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  41961039 caaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttgca 41961138  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41961139 agcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 41961208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 49 - 344
Target Start/End: Original strand, 36641988 - 36642293
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36641988 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaaattaatactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacacctcactgtttgtacagtgaca 36642087  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaa--ttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36642088 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctac 36642187  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| ||        ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  36642188 aaagtgtaacacttaagactatcacatgataccagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccggtaagttcaagatgttgcaa 36642287  T
Q  339 gcatta 344  Q
    ||||||    
T  36642288 gcatta 36642293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2325573 - 2325213
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| ||||||| ||   |||||||||| | |||||||||| | |||||||||| || |||  |||||||||||||| |||||||||| ||     
T  2325573 ggaaaattctatggtgaagttatgtgaatgacttttctcgtgaagttaacaatataacatcataaatgtattgagtaacaccccattgtttgtacactgg 2325474  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2325473 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa--------attaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccac 2325382  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| | ||||        ||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  2325381 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaa 2325282  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2325281 gcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaa 2325213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 19289521 - 19289158
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||     |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19289521 ggaaaattctatggtgaagtca-----atgacttttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatataatgagtaacaccccattgtttgtacaatga 19289427  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||| ||| | |  ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  19289426 catcaaaagttaagttctcacagtatcatcaactcatcagattaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttataaatgtaacatcccac 19289327  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||  | || |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  19289326 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtgtgcatgttaaagattccgacaataaaataatacctgtaagtccaagatattgcaa 19289227  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19289226 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaattaacaatttaaaaatgaattaaacattaa 19289158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 35958909 - 35959260
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||| |||  |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  35958909 ggaaaattctatgatgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttgccactataacataaaaaatgtaatgagcaacaccccactgtttgtacaatga 35959008  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||| ||||||||||            ||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  35959009 cattaaaagttcag------------catcaattcatcatattaacaagactgcacttaatataattt-atcctaccttgttataagcgtaacaccccac 35959095  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||| | || |||||||||| |||||| ||| | ||||        |||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  35959096 aaagtgtaacagttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgt----ccaagatgttgcaa 35959191  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35959192 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 35959260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 41465509 - 41465869
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |  | | |||          
T  41465509 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaggtgtagtgagtagcaccctaacgctggta------ 41465602  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
      ||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  41465603 --tcaaaagttcagtccctataatatcatcaattcattagattcacaagactgaacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacctcag 41465700  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||| |||||| ||||| ||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41465701 aaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 41465800  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  41465801 acattactatatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaattgaatcgaacattaa 41465869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 60 - 375
Target Start/End: Original strand, 44285962 - 44286285
Alignment:
Q  60 gtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttca 159  Q
    ||||||||||   ||||| |||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || | | ||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  44285962 gtgaagtcatgcgaatgatttttctgatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagcaatatctcactgtttgtatagtggcatcaaaagttta 44286061  T
Q  160 gtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 259  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44286062 gtccacatagtatcataaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 44286161  T
Q  260 caaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 351  Q
     || ||||||||||||||||||||| |         ||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  44286162 taagactatcacatgatatcaacaactttgtttgcatgttaaatatgctaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagcattgttagatg 44286261  T
Q  352 aattactattgatcattaatcagt 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  44286262 aattactattgatcattaatcagt 44286285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 49 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41464051 - 41463779
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| |||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  41464051 aaaattctatggtgaagtcgtgagaatgacatttttggtgaagttaatactataaaatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagtggca 41463952  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  41463951 tcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacttttaatataattttatcatactttgttttaattgtaacacctcacaa 41463852  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatag 313  Q
    | ||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  41463851 aatgtaacatttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatag 41463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 117 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 7007054 - 7006774
Alignment:
Q  117 gtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttta 216  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7007054 gtgagtaacatcccactgtttgtacagtagcatcaaaagtttagttcccatagtatcatcaatttataagattaacaagaatacacttaatctaatttta 7006955  T
Q  217 tcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------aaagatgtcaacgataa 308  Q
    || |||||||||||||||||||||                 || || | ||||||||||||||| ||| ||||||        ||||||| |||||||||    
T  7006954 tcataccttgttttaagtgtaaca-----------------cttaagaatatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataa 7006872  T
Q  309 aatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatta 406  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7006871 aatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatttctattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatta 7006774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 17071940 - 17071646
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || ||||||| | || | |||||||| |||    
T  17071940 ggaaaattctatggtgaagtcatgcgaatgacttttttggtgaagttaacactataacaacaaaaatgtagtaagtaacatctcattatttgtacaatga 17071841  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17071840 catcaaaagttcggtattcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccac 17071741  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 333  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| |         ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17071740 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgt 17071646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 47 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17054299 - 17054066
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| | || |||||||||| |||    
T  17054299 ggaaaattctatggtgaagtcatgcgaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtagtaagtaacatctcattgtttgtacaatga 17054200  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    |||||||||| | ||   | || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17054199 catcaaaagtncggtattcataatatcatcaattcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccac 17054100  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 280  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  17054099 aaagtgtaacacttaanactatcacataatatca 17054066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 167 - 407
Target Start/End: Original strand, 31861972 - 31862220
Alignment:
Q  167 tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaact 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  31861972 tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttaacatacattgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaatt 31862071  T
Q  267 atcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattact 358  Q
    ||||||| |||||| ||| ||        |||||| |||  | || |||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||    
T  31862072 atcacataatatcatcaagtctgtttgcatgttaaggattccgacaataaaatagtacttgtaagtccaagatattgtagacattactagatgaattact 31862171  T
Q  359 attgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  31862172 attgatcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaaatattaa 31862220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 128 - 344
Target Start/End: Original strand, 45327801 - 45328025
Alignment:
Q  128 cccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgt 227  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45327801 cccattgtttatacggtgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgt 45327900  T
Q  228 tttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatg 319  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||  || |||||| ||| ||||||  || |         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45327901 tttaagtgtaacacctcagaaagtgtaacacataagactatcgcataatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatg 45328000  T
Q  320 taagtccaagatgttgcaagcatta 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  45328001 taagtccaagatgttgcaagcatta 45328025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 47 - 280
Target Start/End: Original strand, 33902068 - 33902299
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||  |||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  33902068 ggaaaattctatgatgaagtcgttagaatgacttttctggtgaagttaacacta--acataaaaaatgtagtgagtaataccccactgtttgtaaaatga 33902165  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  33902166 catcaaaagttcagtcctcaaagtatcatcagttcatcagattaacaagactatatttaatcgaattttatcctaccttgttttaagggtagcaccccac 33902265  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 280  Q
    ||||||||||||| || | |||||||| ||||||    
T  33902266 aaagtgtaacacttaatagtatcacataatatca 33902299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 288 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 19500869 - 19500750
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 387  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500869 tgttaaagatgttaacgataaaatagtacatgtaatttcaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 19500770  T
Q  388 aaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  19500769 aaaaatgaatcaaatattaa 19500750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 304 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 41051238 - 41051135
Alignment:
Q  304 gataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaca 403  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41051238 gataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgtaagcattgctagatgaattgttattgatcattaatcaataatcaacaattcaaaaatgaatcaaaca 41051139  T
Q  404 ttaa 407  Q
    ||||    
T  41051138 ttaa 41051135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 188 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18258349 - 18258257
Alignment:
Q  188 ttaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatca 280  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18258349 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctacatttttttaagtgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatca 18258257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 41051382 - 41051263
Alignment:
Q  74 atgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtac-agtgacatcaaaagttcagtccccttagtat 172  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  41051382 atgacttttctgatgaagctaatactatagcatcaaaagtgttgtgtataacacttcactatttgtaccagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtat 41051283  T
Q  173 catcaattcatcagattaac 192  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41051282 catcaattcatcagattaac 41051263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 327 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 18257453 - 18257383
Alignment:
Q  327 aagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaat 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18257453 aagatgttgcaagcattactagatgaattattatttatcattaatcagtaatcgacaattttaaaatgaat 18257383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 320 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 41463512 - 41463425
Alignment:
Q  320 taagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||    
T  41463512 taagtctaagatgttgtaaacattaatagataaattactattgatcattaatcaataattaataatttaaaaatgaatcaatcattaa 41463425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 407
Target Start/End: Original strand, 33902317 - 33902382
Alignment:
Q  342 ttactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33902317 ttactagatgaattattattgattattaatctgtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaa 33902382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Original strand, 41960883 - 41960949
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagt 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  41960883 ggaaaattctatggtgaagtcatagaaatgacttttttgatgaagttaacactataacatcaaaagt 41960949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19501839 - 19501760
Alignment:
Q  150 caaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgtttt 230  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19501839 caaaagttcagtctctatagtatcatcaattcatcagattaacaa-actacatttaatctaattttattctactttgtttt 19501760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 111
Target Start/End: Original strand, 31861895 - 31861959
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaa 111  Q
    |||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  31861895 ggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttttggtgaagttaatattatgatatcaaaa 31861959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 34441969 - 34441921
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  34441969 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtaaagttaa 34441921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 368 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 17054005 - 17053966
Alignment:
Q  368 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17054005 taatcagtaatcaacaatgtaaaaatgaatcaaacattaa 17053966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 368 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 17071646 - 17071607
Alignment:
Q  368 taatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17071646 taatcagtaatcaacaatgtaaaaatgaatcaaacattaa 17071607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 95
Target Start/End: Original strand, 42005390 - 42005437
Alignment:
Q  48 gaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  42005390 gaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttttggtgaagttaa 42005437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 95
Target Start/End: Original strand, 41643874 - 41643920
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  41643874 aaaattctatggtgaagtcatgataatgacttttttggtgaagttaa 41643920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 18514819 - 18514771
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  18514819 ggaaaattttatagtgaagtcatgagaatgacttttttgatgaagttaa 18514771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 43446510 - 43446463
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagtta 94  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  43446510 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgactttttcggtgaagtta 43446463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 407
Target Start/End: Original strand, 45328028 - 45328058
Alignment:
Q  377 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45328028 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 45328058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 17692698 - 17692662
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttt 83  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17692698 ggaaaattctatggtgaagtcattaaattgacttttt 17692662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 18947642 - 18947598
Alignment:
Q  51 aattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  18947642 aattctatggtgaagtcatgaaaataacttttctggtgaagttaa 18947598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Original strand, 41713164 - 41713212
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||| ||||    
T  41713164 ggaaaattctatagtgaaatcatgaaaatgatttttctggtgaaattaa 41713212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Original strand, 11908 - 12276
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcatta-aaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccc-actgtttgta-cagtg 145  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  11908 aaaattctatggtgaagtcatgagaaatgacttttctggtgaaattaacaccataacattaaaagtgttgtgagtaacacccccattgtttgtatcagtg 12007  T
Q  146 acatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 245  Q
      |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12008 gtatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacacccca 12107  T
Q  246 caaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 337  Q
    |||||||| ||||| || |||||| |||||||||| ||| ||        ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12108 caaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgca 12207  T
Q  338 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12208 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaat-aatcaaacattaa 12276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 5)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 134 - 496
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 146  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  134 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaacactgtagtataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatgg 233  T
Q  147 catcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 246  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  234 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctatcttattttaagtgtaacaccccat 333  T
Q  247 aaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 338  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||| |||||||||||||||||      ||||||||||||||||    
T  334 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac------gtccaagatgttgcaa 427  T
Q  339 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  428 gcattactagatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 101 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 408559 - 408246
Alignment:
Q  101 taacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatac 200  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||  || ||||||| | ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  408559 taacatcaaaaatgtaatgagtaacaccttaccgtttgtaaaatgaaatcaaaagttcagtcctct-agtatcatcaattcatcagattaacaagactac 408461  T
Q  201 acttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattctgtt--------a 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||  |||||| ||| ||||||        |    
T  408460 acttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtggaacacttaagactatcacacaatatcatcaactctgtttgcatgtta 408361  T
Q  293 aagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaa 392  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  408360 aagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaa 408261  T
Q  393 tgaatcaaacattaa 407  Q
    |||||||||||||||    
T  408260 tgaatcaaacattaa 408246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 71 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 94544 - 94330
Alignment:
Q  71 aaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtccccttagt 170  Q
    |||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| || |    
T  94544 aaaatgacttttctgatgaagttaacattataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagtttggtccccatact 94445  T
Q  171 atcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaaaactatca 270  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  94444 atcatcaattcatgagattaacaagactacacttaatttaattttattctagcttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatta 94345  T
Q  271 catgatatcaacaat 285  Q
    ||| |||||| ||||    
T  94344 cataatatcatcaat 94330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 288 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 94036 - 93918
Alignment:
Q  288 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  94036 tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcattaatcactaatcaacaattt 93937  T
Q  388 aaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
     |||||||||||||||||||    
T  93936 -aaaatgaatcaaacattaa 93918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 408754 - 408706
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaa 95  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  408754 ggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgatttttttggtgaagttaa 408706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Original strand, 43959 - 44324
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| |||||||| | | || ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||| || ||    
T  43959 aaaattctatggtgaagtcgtaagaaagacttttttggtgaagttaacgctataatatcaaaaatgtaatgagtaacaccccgttgtttgtacaatggca 44058  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||||    
T  44059 taaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccccacaa 44158  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    |||||||||||  || ||||||||| |||||| ||| |         |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44159 agtgtaacact-taagctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttgttgcaagc 44257  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44258 attactgaatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaa 44324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 154828 - 154463
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||| |||||||| | | || ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||  |||||||||||||  |||||||||| || ||    
T  154828 aaaattctatggtgaagtcgtaagaaagacttttttggtgaagttaacgctataatatcaaaaatgtaatgagtaacaccccgttgtttgtacaatggca 154729  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||||    
T  154728 taaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccccacaa 154629  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    |||||||||||  || ||||||||| |||||| ||| |         |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  154628 agtgtaacact-taagctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttgttgcaagc 154530  T
Q  341 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  154529 attactgaatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaa 154463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 49 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 146199 - 145832
Alignment:
Q  49 aaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 148  Q
    |||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||  |||||||||||||| | |||||| | |||||    
T  146199 aaaattctacggtgaagtcataagaatgatttttttggttaagttaacattataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccattatttgtagaatgaca 146100  T
Q  149 tcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 248  Q
    |||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||    
T  146099 tcaaaagttcagccttcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaa 146000  T
Q  249 agtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaattc--------tgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 340  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||        ||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  145999 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtgtctgtaagtccaagatgttgcaagc 145900  T
Q  341 attactagatgaat-tactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  145899 attactaaatgaatatacaattgatcattaatcagtaataaaaaatttaaaaatgaattaaacattaa 145832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 267282 - 267644
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgactttttt-ggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgttt-gtacagt 144  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||| |  || | |||||| |||||||| | | |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  267282 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaattattttttttggtaatatttacactatagcatcaaaaatatagtgagtaacatccaactgttttgtacagt 267381  T
Q  145 gacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc 244  Q
    | |||||||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  267382 gtcatcaaaagttcagtctctataatatcatcaattcattagattagcaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacatccc 267481  T
Q  245 acaaagtgtaacactcaaa-actatcacatgatatcaacaatt--------ctgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 335  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| |         ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  267482 acaaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgctg 267581  T
Q  336 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaa 407  Q
    |||| ||||||||||||||||         |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  267582 caagaattactagatgaatta---------accaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaa 267644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 138
Target Start/End: Original strand, 42348 - 42439
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttg 138  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42348 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaataatttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttg 42439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 317 - 384
Target Start/End: Original strand, 100993 - 101058
Alignment:
Q  317 atgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaa 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  100993 atgtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgcattacta--gatcattaatcagtaatcaacaa 101058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 111
Target Start/End: Original strand, 100821 - 100885
Alignment:
Q  47 ggaaaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaa 111  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  100821 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacgctataacatcaaaa 100885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 232
Target Start/End: Original strand, 100894 - 100935
Alignment:
Q  191 acaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaa 232  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  100894 acaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaa 100935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0662 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0662
Description:

Target: scaffold0662; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 94
Target Start/End: Original strand, 6982 - 7026
Alignment:
Q  50 aaattctatagtgaagtcattaaaatgacttttttggtgaagtta 94  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6982 aaattctatggtgaagtcattcaattgacttttttggtgaagtta 7026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University