View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17141_high_12 (Length: 223)

Name: NF17141_high_12
Description: NF17141
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17141_high_12
NF17141_high_12
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (2-214)||(11357-11569)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (2-214)||(19204752-19204964)
chr8 (2-214)||(15771188-15771400)
chr8 (5-214)||(18794321-18794530)
chr8 (2-214)||(19657731-19657943)
chr8 (2-214)||(28358342-28358554)
chr8 (2-214)||(31358142-31358354)
chr8 (5-214)||(14561241-14561450)
chr8 (5-214)||(19691715-19691924)
chr8 (5-213)||(19678064-19678272)
chr8 (2-214)||(44564598-44564810)
chr8 (5-214)||(2133650-2133859)
chr8 (5-214)||(18713101-18713310)
chr8 (5-214)||(27605295-27605504)
chr8 (17-213)||(22077316-22077512)
chr8 (5-210)||(31486265-31486470)
chr8 (2-214)||(9358239-9358451)
chr8 (5-214)||(33245986-33246195)
chr8 (2-214)||(12089113-12089325)
chr8 (2-214)||(29832940-29833152)
chr8 (5-214)||(21344561-21344770)
chr8 (2-214)||(33262348-33262560)
chr8 (2-177)||(19844781-19844956)
chr8 (14-177)||(22412564-22412727)
chr8 (14-141)||(14212665-14212792)
chr8 (14-84)||(16768949-16769019)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (2-214)||(26316162-26316374)
chr7 (2-214)||(16747831-16748043)
chr7 (2-214)||(31127519-31127731)
chr7 (5-214)||(2158189-2158398)
chr7 (2-214)||(26271400-26271612)
chr7 (5-214)||(2106477-2106686)
chr7 (5-214)||(10913183-10913392)
chr7 (2-214)||(2776866-2777078)
chr7 (2-214)||(26681420-26681632)
chr7 (2-214)||(45390832-45391044)
chr7 (5-214)||(16514744-16514953)
chr7 (2-214)||(4203001-4203213)
chr7 (5-213)||(24588849-24589057)
chr7 (2-214)||(26666228-26666440)
chr7 (5-214)||(3448921-3449130)
chr7 (5-214)||(11421093-11421302)
chr7 (5-214)||(22145810-22146019)
chr7 (5-214)||(26534187-26534396)
chr7 (5-214)||(31086936-31087145)
chr7 (5-213)||(11444502-11444710)
chr7 (2-214)||(26512010-26512222)
chr7 (2-214)||(39209453-39209665)
chr7 (5-214)||(4141560-4141769)
chr7 (5-214)||(5131611-5131820)
chr7 (2-207)||(16044927-16045132)
chr7 (2-214)||(5143654-5143866)
chr7 (5-214)||(5161998-5162207)
chr7 (5-214)||(26516407-26516616)
chr7 (2-214)||(10842308-10842520)
chr7 (2-214)||(10845232-10845444)
chr7 (5-214)||(45734928-45735131)
chr7 (5-210)||(26438872-26439077)
chr7 (2-214)||(31560704-31560916)
chr7 (5-214)||(16446320-16446529)
chr7 (2-143)||(797908-798049)
chr7 (14-177)||(29090140-29090303)
chr7 (14-141)||(2557159-2557286)
chr7 (14-141)||(15193707-15193834)
chr7 (2-141)||(16392821-16392960)
chr7 (2-141)||(30369333-30369472)
chr7 (14-117)||(16127229-16127332)
chr7 (37-177)||(16238112-16238252)
chr7 (2-141)||(9469932-9470071)
chr7 (14-84)||(1893019-1893089)
chr7 (5-143)||(16286764-16286902)
chr7 (29-146)||(25727135-25727252)
[»] chr6 (53 HSPs)
chr6 (2-214)||(27626083-27626295)
chr6 (2-214)||(29576626-29576838)
chr6 (2-214)||(27197797-27198009)
chr6 (2-214)||(27251226-27251438)
chr6 (2-214)||(28164103-28164315)
chr6 (2-214)||(33372803-33373015)
chr6 (5-214)||(13295323-13295532)
chr6 (5-214)||(27061121-27061330)
chr6 (5-214)||(29553172-29553381)
chr6 (2-214)||(13520564-13520776)
chr6 (2-214)||(26789428-26789640)
chr6 (2-214)||(27286736-27286948)
chr6 (2-214)||(29505028-29505240)
chr6 (2-213)||(30554389-30554600)
chr6 (5-214)||(3699698-3699907)
chr6 (5-214)||(27022751-27022960)
chr6 (2-214)||(14141766-14141978)
chr6 (2-214)||(24302129-24302341)
chr6 (5-214)||(8902075-8902284)
chr6 (5-214)||(16753436-16753645)
chr6 (5-214)||(24867331-24867540)
chr6 (2-214)||(34460878-34461090)
chr6 (8-214)||(22931256-22931462)
chr6 (8-214)||(23853701-23853907)
chr6 (5-214)||(16677755-16677964)
chr6 (5-214)||(26921992-26922201)
chr6 (2-214)||(27011343-27011555)
chr6 (5-203)||(27180071-27180269)
chr6 (5-203)||(27268970-27269168)
chr6 (5-214)||(26774999-26775208)
chr6 (5-213)||(16940400-16940608)
chr6 (2-214)||(27358482-27358694)
chr6 (2-214)||(27448825-27449037)
chr6 (5-214)||(15420692-15420901)
chr6 (5-214)||(27488748-27488957)
chr6 (2-214)||(4776492-4776704)
chr6 (2-214)||(4528897-4529109)
chr6 (2-214)||(4720507-4720719)
chr6 (2-214)||(26112784-26112996)
chr6 (2-214)||(28211066-28211278)
chr6 (2-214)||(4542146-4542358)
chr6 (2-214)||(4761375-4761587)
chr6 (5-214)||(20172162-20172371)
chr6 (5-214)||(22163620-22163829)
chr6 (2-214)||(17088815-17089027)
chr6 (68-214)||(15408905-15409051)
chr6 (2-90)||(22455610-22455698)
chr6 (14-177)||(23971179-23971342)
chr6 (29-144)||(25707650-25707765)
chr6 (14-141)||(18120093-18120220)
chr6 (14-141)||(18212114-18212241)
chr6 (2-141)||(9135798-9135937)
chr6 (14-144)||(27545526-27545656)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (2-214)||(9321098-9321310)
chr5 (2-214)||(26484016-26484228)
chr5 (2-214)||(12135797-12136009)
chr5 (5-214)||(30172094-30172303)
chr5 (2-214)||(3793163-3793375)
chr5 (2-214)||(24586996-24587208)
chr5 (5-214)||(11552980-11553189)
chr5 (5-214)||(18124742-18124951)
chr5 (5-214)||(23629595-23629804)
chr5 (5-214)||(24973531-24973740)
chr5 (5-214)||(28956111-28956320)
chr5 (5-210)||(37758608-37758813)
chr5 (5-213)||(5641413-5641621)
chr5 (2-214)||(8661801-8662013)
chr5 (2-214)||(18497051-18497263)
chr5 (2-214)||(30155653-30155865)
chr5 (2-214)||(33878752-33878964)
chr5 (2-214)||(40469876-40470088)
chr5 (2-213)||(33520002-33520213)
chr5 (5-214)||(9547035-9547244)
chr5 (5-214)||(22995443-22995652)
chr5 (5-214)||(25203903-25204112)
chr5 (5-214)||(25268058-25268267)
chr5 (5-214)||(33296153-33296362)
chr5 (5-210)||(41678330-41678535)
chr5 (5-214)||(6877930-6878139)
chr5 (5-214)||(13183119-13183328)
chr5 (5-214)||(13439009-13439218)
chr5 (5-214)||(30938260-30938469)
chr5 (2-214)||(11327259-11327471)
chr5 (2-210)||(18371864-18372072)
chr5 (2-210)||(24727591-24727799)
chr5 (5-214)||(2514687-2514896)
chr5 (2-214)||(28652864-28653076)
chr5 (2-214)||(31435086-31435298)
chr5 (2-214)||(37767317-37767529)
chr5 (2-214)||(43081877-43082089)
chr5 (2-214)||(29887523-29887735)
chr5 (2-214)||(34620140-34620352)
chr5 (2-213)||(22892085-22892296)
chr5 (3-210)||(30033051-30033258)
chr5 (2-214)||(32592600-32592812)
chr5 (5-214)||(33781114-33781319)
chr5 (5-207)||(15655091-15655293)
chr5 (5-214)||(37667812-37668021)
chr5 (2-214)||(13321156-13321368)
chr5 (2-214)||(37354969-37355181)
chr5 (2-214)||(31822733-31822945)
chr5 (2-210)||(15755182-15755390)
chr5 (14-141)||(3483602-3483729)
chr5 (2-141)||(11943821-11943960)
chr5 (2-91)||(34469244-34469333)
chr5 (2-141)||(5439624-5439763)
chr5 (2-141)||(15784124-15784263)
chr5 (2-141)||(17957719-17957858)
chr5 (2-141)||(36375361-36375500)
chr5 (2-141)||(37000015-37000154)
chr5 (2-141)||(31520929-31521068)
chr5 (14-84)||(20388445-20388515)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (2-214)||(5009503-5009715)
chr4 (2-214)||(40102066-40102278)
chr4 (2-214)||(6573486-6573698)
chr4 (2-214)||(54837019-54837231)
chr4 (3-214)||(15231501-15231712)
chr4 (5-214)||(24116293-24116502)
chr4 (5-214)||(34185389-34185598)
chr4 (2-214)||(1903882-1904094)
chr4 (2-210)||(14102171-14102379)
chr4 (2-214)||(18797043-18797255)
chr4 (2-213)||(21973329-21973540)
chr4 (2-213)||(31122942-31123153)
chr4 (5-214)||(17016677-17016886)
chr4 (2-214)||(27159746-27159958)
chr4 (3-214)||(20334850-20335061)
chr4 (5-214)||(24588790-24588999)
chr4 (5-214)||(33670229-33670438)
chr4 (2-213)||(30757388-30757599)
chr4 (5-214)||(18313607-18313816)
chr4 (2-210)||(36340950-36341158)
chr4 (2-214)||(39854265-39854477)
chr4 (5-187)||(14759762-14759944)
chr4 (5-214)||(14668647-14668856)
chr4 (59-214)||(5698220-5698375)
chr4 (2-214)||(15281366-15281578)
chr4 (68-213)||(15384778-15384923)
chr4 (14-177)||(14725265-14725428)
chr4 (2-72)||(15387949-15388019)
chr4 (14-141)||(19767979-19768106)
chr4 (2-143)||(55784760-55784901)
chr4 (14-144)||(18044699-18044829)
chr4 (29-144)||(1881598-1881713)
chr4 (14-84)||(12515872-12515942)
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (2-214)||(28112426-28112638)
chr3 (5-214)||(11106831-11107040)
chr3 (5-214)||(17981421-17981630)
chr3 (5-214)||(22384050-22384259)
chr3 (5-214)||(6205482-6205691)
chr3 (5-214)||(15737566-15737775)
chr3 (2-214)||(21678279-21678491)
chr3 (2-213)||(18228772-18228983)
chr3 (5-214)||(4627364-4627573)
chr3 (5-214)||(4725210-4725419)
chr3 (5-214)||(4793107-4793316)
chr3 (5-214)||(8299550-8299759)
chr3 (5-214)||(18304126-18304335)
chr3 (5-214)||(18334209-18334418)
chr3 (5-214)||(31032708-31032917)
chr3 (2-214)||(5605786-5605998)
chr3 (2-214)||(5714649-5714861)
chr3 (2-214)||(5725559-5725771)
chr3 (2-214)||(5766597-5766809)
chr3 (2-210)||(8215311-8215519)
chr3 (2-214)||(32294204-32294416)
chr3 (3-214)||(5017291-5017502)
chr3 (5-214)||(4687234-4687443)
chr3 (5-214)||(7076785-7076994)
chr3 (5-214)||(8285942-8286151)
chr3 (5-214)||(18054841-18055050)
chr3 (5-214)||(18273524-18273733)
chr3 (5-214)||(18288825-18289034)
chr3 (5-214)||(19698069-19698278)
chr3 (5-214)||(20069619-20069828)
chr3 (5-210)||(32442730-32442935)
chr3 (5-214)||(35884345-35884554)
chr3 (2-213)||(51785599-51785810)
chr3 (8-214)||(15889177-15889383)
chr3 (5-214)||(29145228-29145437)
chr3 (2-214)||(47027029-47027241)
chr3 (5-214)||(10399723-10399932)
chr3 (5-214)||(24331742-24331951)
chr3 (2-214)||(5592829-5593041)
chr3 (2-214)||(28024858-28025070)
chr3 (2-214)||(29661442-29661654)
chr3 (5-214)||(5653664-5653873)
chr3 (5-214)||(20573315-20573524)
chr3 (5-214)||(48469506-48469715)
chr3 (5-214)||(4343148-4343357)
chr3 (5-214)||(4420494-4420703)
chr3 (2-214)||(5470564-5470776)
chr3 (5-214)||(28342756-28342965)
chr3 (2-214)||(18246317-18246529)
chr3 (2-214)||(22867320-22867532)
chr3 (2-214)||(22882379-22882591)
chr3 (5-214)||(8000139-8000348)
chr3 (5-214)||(10646652-10646861)
chr3 (5-214)||(31960927-31961136)
chr3 (5-214)||(6539214-6539423)
chr3 (2-210)||(16620966-16621174)
chr3 (87-214)||(17973333-17973460)
chr3 (2-91)||(17992526-17992615)
chr3 (14-177)||(11924867-11925030)
chr3 (14-141)||(6571942-6572069)
chr3 (2-84)||(15919093-15919175)
chr3 (2-141)||(5950347-5950486)
chr3 (14-177)||(7088536-7088699)
chr3 (14-141)||(16431993-16432120)
chr3 (14-141)||(22960041-22960168)
chr3 (5-143)||(20443696-20443834)
chr3 (14-177)||(15705061-15705224)
chr3 (2-141)||(37260254-37260393)
chr3 (14-144)||(4450363-4450493)
chr3 (2-141)||(46380910-46381049)
chr3 (2-84)||(15592513-15592595)
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (2-214)||(11631602-11631814)
chr2 (2-214)||(40237122-40237334)
chr2 (2-213)||(3786107-3786318)
chr2 (2-210)||(21673597-21673805)
chr2 (2-214)||(34294768-34294980)
chr2 (5-214)||(27430859-27431068)
chr2 (2-214)||(21699589-21699801)
chr2 (2-214)||(22924566-22924778)
chr2 (2-214)||(31879900-31880112)
chr2 (2-214)||(37682313-37682525)
chr2 (2-214)||(37697578-37697790)
chr2 (2-213)||(16825757-16825968)
chr2 (2-213)||(16895512-16895723)
chr2 (5-214)||(20841530-20841739)
chr2 (2-214)||(257071-257283)
chr2 (2-214)||(13932965-13933177)
chr2 (2-214)||(19412919-19413131)
chr2 (2-214)||(27120138-27120350)
chr2 (2-214)||(27779848-27780060)
chr2 (2-214)||(27819605-27819817)
chr2 (2-214)||(32053417-32053629)
chr2 (2-214)||(34158458-34158670)
chr2 (2-214)||(37928983-37929195)
chr2 (2-214)||(39048237-39048449)
chr2 (2-213)||(27395176-27395387)
chr2 (5-214)||(12659153-12659362)
chr2 (5-214)||(27807320-27807529)
chr2 (5-214)||(34271338-34271547)
chr2 (2-214)||(9346404-9346616)
chr2 (2-214)||(31889909-31890121)
chr2 (5-214)||(12590425-12590634)
chr2 (5-214)||(28885896-28886105)
chr2 (5-214)||(16165097-16165306)
chr2 (5-214)||(23124987-23125195)
chr2 (5-210)||(37381294-37381499)
chr2 (2-214)||(12713019-12713231)
chr2 (2-214)||(34865298-34865510)
chr2 (5-214)||(37948280-37948489)
chr2 (2-210)||(39893683-39893891)
chr2 (2-214)||(19452841-19453053)
chr2 (14-177)||(34701702-34701865)
chr2 (2-143)||(21760104-21760245)
chr2 (2-141)||(22950007-22950146)
chr2 (14-141)||(42394161-42394288)
chr2 (2-141)||(12384274-12384413)
chr2 (29-144)||(34533931-34534046)
chr2 (14-84)||(26723824-26723894)
chr2 (5-57)||(27828077-27828129)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (2-214)||(10966282-10966494)
chr1 (2-213)||(10948694-10948905)
chr1 (2-214)||(16204463-16204675)
chr1 (2-214)||(28588602-28588814)
chr1 (2-214)||(20336845-20337057)
chr1 (2-210)||(51641835-51642043)
chr1 (2-214)||(28153353-28153565)
chr1 (8-214)||(21894177-21894383)
chr1 (2-214)||(3644753-3644965)
chr1 (8-214)||(41789739-41789945)
chr1 (9-214)||(20464600-20464805)
chr1 (14-146)||(22489650-22489782)
chr1 (2-141)||(5628500-5628639)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (2-214)||(7575-7787)
scaffold0143 (5-214)||(30911-31120)
scaffold0143 (2-214)||(19685-19897)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (2-214)||(9637-9849)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (8-214)||(16202-16408)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (5-214)||(3685-3894)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (2-213)||(22621-22832)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (5-214)||(9654-9863)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (5-214)||(5608-5817)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (2-214)||(9660-9872)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (29-213)||(22758-22942)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (5-214)||(13189-13398)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (2-214)||(11564-11776)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (2-189)||(5125-5312)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (30-214)||(118762-118946)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (29-208)||(43145-43333)
[»] scaffold0196 (1 HSPs)
scaffold0196 (87-214)||(1979-2109)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (14-141)||(10845-10972)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (2-141)||(29785-29924)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (2-84)||(34799-34881)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (14-84)||(4969-5039)


Alignment Details
Target: scaffold0237 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11569 - 11357
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11569 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 11470  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11469 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 11370  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  11369 acctcttgatgat 11357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19204964 - 19204752
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19204964 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 19204865  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19204864 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 19204765  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  19204764 acctcttgatgat 19204752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 15771188 - 15771400
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15771188 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 15771287  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15771288 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 15771387  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  15771388 acctcttgatgat 15771400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 18794321 - 18794530
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18794321 aaacgcctgcgtcattatttgatgagtcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 18794420  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18794421 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 18794520  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  18794521 tcttgatgat 18794530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19657943 - 19657731
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    |||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19657943 gccaaacgcctgcgccattatttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagttgctgttactggga 19657844  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19657843 agattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 19657744  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  19657743 acctcttgatgat 19657731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28358554 - 28358342
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  28358554 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgttgttactggga 28358455  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28358454 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagtattcttgccgatcatcttgcttacca 28358355  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  28358354 acctcttgatgat 28358342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 31358142 - 31358354
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31358142 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 31358241  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31358242 agattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 31358341  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  31358342 acctcttgatgat 31358354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 14561241 - 14561450
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14561241 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 14561340  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14561341 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 14561440  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  14561441 tcttgatgat 14561450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 19691715 - 19691924
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||| ||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19691715 aaacgcctacgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 19691814  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19691815 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 19691914  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  19691915 tcttgatgat 19691924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Original strand, 19678064 - 19678272
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19678064 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaaga 19678163  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19678164 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 19678263  T
Q  205 tcttgatga 213  Q
    |||||||||    
T  19678264 tcttgatga 19678272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 44564598 - 44564810
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  44564598 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactggga 44564697  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  44564698 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatctggcttacca 44564797  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  44564798 acctcttgatgat 44564810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2133859 - 2133650
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  2133859 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaaa 2133760  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2133759 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 2133660  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  2133659 tcttgatgat 2133650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 18713101 - 18713310
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    ||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18713101 aaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 18713200  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18713201 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 18713300  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  18713301 tcttgatgat 18713310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27605504 - 27605295
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27605504 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaaga 27605405  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  27605404 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgtcgatcaccttgcttaccaacc 27605305  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  27605304 tcttgatgat 27605295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22077512 - 22077316
Alignment:
Q  17 cactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgttggc 116  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  22077512 cactatttgatgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccaatcaagtatatctttgagaaagctgatgttactggaaaaattgcgcgttggc 22077413  T
Q  117 aaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatga 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22077412 aaatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 22077316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31486470 - 31486265
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  31486470 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttaccgggaaga 31486371  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31486370 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatggtattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 31486271  T
Q  205 tcttga 210  Q
    ||||||    
T  31486270 tcttga 31486265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 9358239 - 9358451
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  9358239 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaa 9358338  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9358339 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaagactcaaaaggcaatcaagggtagcattcttgcagatcatcttgcttacca 9358438  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  9358439 acctcttgatgat 9358451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 33245986 - 33246195
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33245986 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaaga 33246085  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33246086 ttgcacgctgacagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaagcttaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 33246185  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  33246186 tcttgatgat 33246195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12089325 - 12089113
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    |||||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  12089325 gccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 12089226  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  12089225 agatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatca 12089126  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  12089125 acctcttgatgat 12089113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 29832940 - 29833152
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  29832940 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 29833039  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||    
T  29833040 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatcctcgccgatcaccttgcttatca 29833139  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  29833140 acctcttgatgat 29833152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21344770 - 21344561
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||  |  |   ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21344770 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaaccgcccagctcaagtatatctctgagaaagctgttgttactgggaaga 21344671  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21344670 ttgcacgctgacagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 21344571  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  21344570 tcttgatgat 21344561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 33262348 - 33262560
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  33262348 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 33262447  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||    
T  33262448 agatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatcctcgccgatcaccttgcttatca 33262547  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  33262548 acctcttgatgat 33262560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 19844781 - 19844956
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    |||||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | ||| |||    
T  19844781 gccaaacgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatccaatcaagtacatatttgagaagccagctttaactagaa 19844880  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcat 177  Q
     |||||| || ||||| ||| | ||||| || |||||||| |||  |   ||||| || |||||||||||||||||    
T  19844881 ggattgctcgctggcagatgttattgtccgagtatgatatcgtgcatcgcactcagaaagcaatcaaaggtagcat 19844956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 22412564 - 22412727
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| || |    
T  22412564 cgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgct 22412663  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcat 177  Q
    |||| ||| | ||||| || |||||||| | || |   ||||| || |||||||||||||||||    
T  22412664 ggcagatgttattgtccgagtatgatatcgagtatcgcactcagaaagcaatcaaaggtagcat 22412727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 141
Target Start/End: Original strand, 14212665 - 14212792
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| || |    
T  14212665 cgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgct 14212764  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
    |||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  14212765 ggcagatgttattgtccgagtatgatat 14212792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Original strand, 16768949 - 16769019
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaa 84  Q
    ||||||||| || | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16768949 cgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 16769019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26316374 - 26316162
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26316374 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 26316275  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26316274 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 26316175  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  26316174 acctcttgatgat 26316162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16748043 - 16747831
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16748043 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 16747944  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16747943 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 16747844  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  16747843 acctcttgatgat 16747831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 31127519 - 31127731
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  31127519 gccaaacgcctgcgtcattatttgatgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactggga 31127618  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31127619 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 31127718  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  31127719 acctcttgatgat 31127731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 2158189 - 2158398
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2158189 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 2158288  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2158289 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 2158388  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  2158389 tcttgatgat 2158398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26271612 - 26271400
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26271612 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgttgttacgggaa 26271513  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26271512 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 26271413  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  26271412 acctcttgatgat 26271400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2106686 - 2106477
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2106686 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaaga 2106587  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2106586 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 2106487  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  2106486 tcttgatgat 2106477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10913392 - 10913183
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10913392 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 10913293  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10913292 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 10913193  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  10913192 tcttgatgat 10913183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 2776866 - 2777078
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2776866 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactggga 2776965  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776966 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 2777065  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  2777066 acctcttgatgat 2777078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26681632 - 26681420
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  26681632 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactggga 26681533  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26681532 agattgcacgcgggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 26681433  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  26681432 acctcttgatgat 26681420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 45390832 - 45391044
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45390832 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 45390931  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  45390932 agattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 45391031  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  45391032 acctcttgatgat 45391044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16514953 - 16514744
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16514953 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaatagatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 16514854  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16514853 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 16514754  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  16514753 tcttgatgat 16514744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 4203001 - 4203213
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4203001 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaaatatatctttgagaaagctgctgttactggga 4203100  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4203101 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggccatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 4203200  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  4203201 acctcttgatgat 4203213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24589057 - 24588849
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589057 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 24588958  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  24588957 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacc 24588858  T
Q  205 tcttgatga 213  Q
    |||||||||    
T  24588857 tcttgatga 24588849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26666440 - 26666228
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26666440 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtcactggaa 26666341  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  26666340 agattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 26666241  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  26666240 acctcttgatgat 26666228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 3448921 - 3449130
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  3448921 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgccgtcactggaaaga 3449020  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3449021 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 3449120  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  3449121 tcttgatgat 3449130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11421302 - 11421093
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11421302 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 11421203  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11421202 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 11421103  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  11421102 tcttgatgat 11421093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 22145810 - 22146019
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22145810 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccataatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 22145909  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22145910 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcgaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 22146009  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  22146010 tcttgatgat 22146019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26534396 - 26534187
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26534396 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 26534297  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26534296 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacc 26534197  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||| ||||||    
T  26534196 tctcgatgat 26534187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31087145 - 31086936
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31087145 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 31087046  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31087045 ttgcacgctggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 31086946  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||| ||||||    
T  31086945 tctcgatgat 31086936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Original strand, 11444502 - 11444710
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11444502 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaaga 11444601  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11444602 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 11444701  T
Q  205 tcttgatga 213  Q
    |||||||||    
T  11444702 tcttgatga 11444710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26512222 - 26512010
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  26512222 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttgattgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactggga 26512123  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  26512122 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 26512023  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  26512022 acctcttgatgat 26512010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39209665 - 39209453
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  39209665 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttgattgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactggga 39209566  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  39209565 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 39209466  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  39209465 acctcttgatgat 39209453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4141769 - 4141560
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4141769 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactggaaaga 4141670  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4141669 ttgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 4141570  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  4141569 tcttgatgat 4141560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 5131611 - 5131820
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    ||||||||| |||| ||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  5131611 aaacgcctgtgtcattatttggtgaatcatacaacttggttaatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactaggaaga 5131710  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5131711 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 5131810  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  5131811 tcttgatgat 5131820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Original strand, 16044927 - 16045132
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16044927 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggattcgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 16045026  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16045027 agattgcacgctggtagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 16045126  T
Q  202 acctct 207  Q
    ||||||    
T  16045127 acctct 16045132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5143866 - 5143654
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  5143866 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcagccgttactggga 5143767  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5143766 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcctacca 5143667  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||| ||||||    
T  5143666 acctctcgatgat 5143654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 5161998 - 5162207
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5161998 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaaga 5162097  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5162098 ttgcacgctggcaggtgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 5162197  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  5162198 tcttgatgat 5162207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 26516407 - 26516616
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26516407 aaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaaga 26516506  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26516507 ttgcacgatggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 26516606  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  26516607 tcttgatgat 26516616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10842520 - 10842308
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  10842520 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgctgttactggga 10842421  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10842420 agattgcacgctggcaaatgctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 10842321  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  10842320 acctcttgatgat 10842308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 10845232 - 10845444
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  10845232 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgctgttactggga 10845331  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10845332 agattgcacgctggcaaatgctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 10845431  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  10845432 acctcttgatgat 10845444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 45734928 - 45735131
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |      ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45734928 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatta------tctttgagaaagctgctgttactgggaaga 45735021  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  45735022 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 45735121  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  45735122 tcttgatgat 45735131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 210
Target Start/End: Original strand, 26438872 - 26439077
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  26438872 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaaga 26438971  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26438972 tcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 26439071  T
Q  205 tcttga 210  Q
    ||||||    
T  26439072 tcttga 26439077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31560916 - 31560704
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  31560916 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 31560817  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  31560816 agatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatca 31560717  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  31560716 acctcttgatgat 31560704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16446529 - 16446320
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16446529 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaaga 16446430  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  16446429 ttgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatggtattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgctgatcaccttgcttatcaacc 16446330  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||| ||||||    
T  16446329 tctcgatgat 16446320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 798049 - 797908
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | || ||||    
T  798049 gccaaacgcctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaggatggatccgatcaagtacatctttgagaaacccgctttgacaggaa 797950  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattg 143  Q
      ||||| || ||||| ||| | || || |||||||||||||    
T  797949 gaattgcccggtggcagatgttattatccgaatatgatattg 797908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 29090140 - 29090303
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| || |    
T  29090140 cgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgct 29090239  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcat 177  Q
    |||| ||| | ||||| || |||||||| | || |   ||||| || |||||||||||||||||    
T  29090240 ggcagatgttattgtccgagtatgatatcgagtatcgcactcagaaagcaatcaaaggtagcat 29090303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 141
Target Start/End: Original strand, 2557159 - 2557286
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| || |    
T  2557159 cgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgct 2557258  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
    |||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  2557259 ggcagatgttattgtccgagtatgatat 2557286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 141
Target Start/End: Original strand, 15193707 - 15193834
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| || |    
T  15193707 cgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgct 15193806  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
    |||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  15193807 ggcagatgttattgtccgagtatgatat 15193834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16392960 - 16392821
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || |||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | || ||||    
T  16392960 gccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaa 16392861  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
     ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  16392860 ggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 16392821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 30369472 - 30369333
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || |||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | || ||||    
T  30369472 gccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaa 30369373  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
     ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  30369372 ggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 30369333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16127332 - 16127229
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| || |    
T  16127332 cgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgct 16127233  T
Q  114 ggca 117  Q
    ||||    
T  16127232 ggca 16127229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 16238112 - 16238252
Alignment:
Q  37 aacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatat 136  Q
    |||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||  |  || | ||||||| |||||| || ||||| ||| | ||||| || |||    
T  16238112 aacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccaactttaactggaaggattgctcgatggcagatgttattgtccgagtat 16238211  T
Q  137 gatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcat 177  Q
    |||||||||| |   || || || |||||||||||||||||    
T  16238212 gatattgtgtatcgcacccagaaagcaatcaaaggtagcat 16238252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 9469932 - 9470071
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    |||| |||||| ||||| ||| |||| ||||| || || ||| || |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | || ||||    
T  9469932 gccagacgcctccgtcattatatgattaatcacactacgtggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaa 9470031  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
     ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  9470032 ggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 9470071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 1893089 - 1893019
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaa 84  Q
    ||||||||| || | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1893089 cgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 1893019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16286902 - 16286764
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||| || |||||| |||| | |||||| || ||||||||||| |  || ||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| | || ||||  |    
T  16286902 aaacgcctccgccactatatgattagtcatactacatggttgatatctaagatggatccgatcaagtacgtctttgagaaacccgctttgacaggaagaa 16286803  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattg 143  Q
    |||| || ||||| ||| | || || |||||||||||||    
T  16286802 ttgcccggtggcagatgttattatccgaatatgatattg 16286764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Original strand, 25727135 - 25727252
Alignment:
Q  29 aatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgttggcaaatgcttttgt 128  Q
    ||||| || ||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||| ||||||||  | ||| | || ||||  ||||| || ||||| ||| | ||||    
T  25727135 aatcacactacttggttgatgtccaaaatggacccgatcaagtacatttttgagaagccggctttaacaggaagaattgctcgctggcagatgttattgt 25727234  T
Q  129 ctgaatatgatattgtgt 146  Q
    |||| |||||||||||||    
T  25727235 ctgagtatgatattgtgt 25727252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 53)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27626295 - 27626083
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27626295 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatctagaatggatccaatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 27626196  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27626195 agattgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 27626096  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  27626095 acctcttgatgat 27626083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 29576626 - 29576838
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29576626 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccaatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 29576725  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29576726 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 29576825  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  29576826 acctcttgatgat 29576838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 27197797 - 27198009
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  27197797 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactggga 27197896  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27197897 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 27197996  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  27197997 acctcttgatgat 27198009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27251438 - 27251226
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  27251438 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactggga 27251339  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27251338 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 27251239  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  27251238 acctcttgatgat 27251226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 28164103 - 28164315
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28164103 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 28164202  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28164203 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcatcttgcttacca 28164302  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  28164303 acctcttgatgat 28164315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33373015 - 33372803
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33373015 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacatctttgagaaagctgctgttactggga 33372916  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33372915 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttacca 33372816  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  33372815 acctcttgatgat 33372803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13295532 - 13295323
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13295532 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 13295433  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13295432 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 13295333  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  13295332 tcttgatgat 13295323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 27061121 - 27061330
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27061121 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 27061220  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27061221 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatattatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 27061320  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  27061321 tcttgatgat 27061330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 29553172 - 29553381
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29553172 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 29553271  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29553272 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 29553371  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  29553372 tcttgatgat 29553381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13520776 - 13520564
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13520776 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 13520677  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13520676 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 13520577  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  13520576 acctcttgatgat 13520564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 26789428 - 26789640
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    |||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  26789428 gccaaaagcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactggga 26789527  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789528 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 26789627  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  26789628 acctcttgatgat 26789640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27286948 - 27286736
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27286948 gccaaacgcctgcgccactatttgatgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctattactggga 27286849  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  27286848 agattgcacgttggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcctatca 27286749  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  27286748 acctcttgatgat 27286736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 29505028 - 29505240
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  29505028 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 29505127  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29505128 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttacca 29505227  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  29505228 acctcttgatgat 29505240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30554600 - 30554389
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30554600 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 30554501  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  30554500 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatca 30554401  T
Q  202 acctcttgatga 213  Q
    ||||||||||||    
T  30554400 acctcttgatga 30554389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 3699698 - 3699907
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3699698 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttaatatccagaatggatccaataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 3699797  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3699798 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 3699897  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  3699898 tcttgatgat 3699907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 27022751 - 27022960
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27022751 aaacgcctgcgtcattatttggtgagtcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 27022850  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27022851 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 27022950  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  27022951 tcttgatgat 27022960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 14141978 - 14141766
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  14141978 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactggga 14141879  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14141878 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 14141779  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  14141778 acctcttgatgat 14141766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24302341 - 24302129
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  24302341 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 24302242  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24302241 agattgcacgctgacagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 24302142  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  24302141 acctcttgatgat 24302129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8902284 - 8902075
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  8902284 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaata 8902185  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8902184 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 8902085  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  8902084 tcttgatgat 8902075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 16753436 - 16753645
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16753436 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactgggaaga 16753535  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16753536 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 16753635  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  16753636 tcttgatgat 16753645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 24867331 - 24867540
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  24867331 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttaccgggaaga 24867430  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24867431 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 24867530  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  24867531 tcttgatgat 24867540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34461090 - 34460878
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  34461090 gccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 34460991  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  34460990 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 34460891  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  34460890 acctcttgatgat 34460878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22931462 - 22931256
Alignment:
Q  8 cgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattg 107  Q
    ||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22931462 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaagattg 22931363  T
Q  108 cacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctct 207  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22931362 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 22931263  T
Q  208 tgatgat 214  Q
    |||||||    
T  22931262 tgatgat 22931256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23853907 - 23853701
Alignment:
Q  8 cgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattg 107  Q
    ||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23853907 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaagattg 23853808  T
Q  108 cacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctct 207  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23853807 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 23853708  T
Q  208 tgatgat 214  Q
    |||||||    
T  23853707 tgatgat 23853701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 16677755 - 16677964
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    ||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16677755 aaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatgtctttgagaaagctgctgttactggaaaga 16677854  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16677855 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaagggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaacc 16677954  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  16677955 tcttgatgat 16677964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 26921992 - 26922201
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26921992 aaacgcctgcgtcattatttggtgagtcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactgggaaga 26922091  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26922092 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 26922191  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  26922192 tcttgatgat 26922201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 27011343 - 27011555
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27011343 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 27011442  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  27011443 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatca 27011542  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  27011543 acctcttgatgat 27011555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Original strand, 27180071 - 27180269
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27180071 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcataccacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 27180170  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaac 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27180171 ttgcacgctggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaac 27180269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 27269168 - 27268970
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27269168 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcataccacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 27269069  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaac 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27269068 ttgcacgctggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaac 27268970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26775208 - 26774999
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26775208 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaaaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaaga 26775109  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26775108 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatatcgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 26775009  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  26775008 tcttgatgat 26774999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16940608 - 16940400
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16940608 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaaga 16940509  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  16940508 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacc 16940409  T
Q  205 tcttgatga 213  Q
    |||||||||    
T  16940408 tcttgatga 16940400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27358694 - 27358482
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  27358694 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 27358595  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  27358594 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatca 27358495  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  27358494 acctcttgatgat 27358482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27449037 - 27448825
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  27449037 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 27448938  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  27448937 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatca 27448838  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  27448837 acctcttgatgat 27448825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15420901 - 15420692
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  15420901 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactaggaaga 15420802  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15420801 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatgttgtgttcaaaactcaaaagggaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 15420702  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  15420701 tcttgatgat 15420692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 27488748 - 27488957
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27488748 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacctggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaaga 27488847  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  27488848 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacc 27488947  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  27488948 tcttgatgat 27488957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 4776492 - 4776704
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  4776492 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 4776591  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  4776592 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatca 4776691  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  4776692 acctcttgatgat 4776704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 4528897 - 4529109
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    |||||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  4528897 gccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 4528996  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  4528997 agatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatca 4529096  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  4529097 acctcttgatgat 4529109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4720719 - 4720507
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    |||||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  4720719 gccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 4720620  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  4720619 agatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatca 4720520  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  4720519 acctcttgatgat 4720507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26112996 - 26112784
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    |||||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  26112996 gccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 26112897  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  26112896 agatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatca 26112797  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  26112796 acctcttgatgat 26112784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 28211066 - 28211278
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    |||||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  28211066 gccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 28211165  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  28211166 agatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatca 28211265  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  28211266 acctcttgatgat 28211278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4542358 - 4542146
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    |||||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  4542358 gccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 4542259  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| || ||    
T  4542258 agatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccaatcaccttgcttatca 4542159  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  4542158 acctcttgatgat 4542146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 4761375 - 4761587
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  4761375 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatatagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 4761474  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  4761475 agatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatca 4761574  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  4761575 acctcttgatgat 4761587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 20172162 - 20172371
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||    
T  20172162 aaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccaaaatggatccgataaagtacatcttcgagaaacctgctgttaccgggaaga 20172261  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20172262 ttgcacgttggcagatgcttttatctgaatatgacattgtgttcaaggttcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 20172361  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
     || ||||||    
T  20172362 cctggatgat 20172371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22163829 - 22163620
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||    
T  22163829 aaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccaaaatggatccgataaagtacatcttcgagaaacctgctgttaccgggaaga 22163730  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22163729 ttgcacgttggcagatgcttttatctgaatatgacattgtgttcaaggttcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 22163630  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
     || ||||||    
T  22163629 cctggatgat 22163620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17089027 - 17088815
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||| || |    
T  17089027 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcgactgttacaggga 17088928  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||    
T  17088927 agattgcacgatggcagatgctcttgtccgaatatgatattgtgttcaaaactcaaatggcaatcaaaggtagcatccttgctgatcaccttgcttatca 17088828  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  17088827 acctcttgatgat 17088815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 68 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15409051 - 15408905
Alignment:
Q  68 aagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatca 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15409051 aagtatatctttgagaaagctgctgttactaggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatgttgtgttcaaaactcaaaagggaatca 15408952  T
Q  168 aaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15408951 aaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 15408905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 22455698 - 22455610
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgc 90  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  22455698 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 22455610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23971342 - 23971179
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||| ||||||  | |    
T  23971342 cgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatccaatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgcttgat 23971243  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcat 177  Q
    |||| ||| | ||||| || ||||||||||||| |   || || || |||||||||||||||||    
T  23971242 ggcagatgttattgtccgagtatgatattgtgtatcgcacccagaaagcaatcaaaggtagcat 23971179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 144
Target Start/End: Original strand, 25707650 - 25707765
Alignment:
Q  29 aatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgttggcaaatgcttttgt 128  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | || ||||  ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  25707650 aatcacactacttggttgatatccaaaatggatccaatcaagtacatttttgagaagcctgctttaacaggaagaattgctcgttggcagatgctattgt 25707749  T
Q  129 ctgaatatgatattgt 144  Q
    | || |||||||||||    
T  25707750 ccgagtatgatattgt 25707765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 141
Target Start/End: Original strand, 18120093 - 18120220
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| || |    
T  18120093 cgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgct 18120192  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
    |||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  18120193 ggcagatgttattgtccgagtatgatat 18120220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18212241 - 18212114
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| || |    
T  18212241 cgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgct 18212142  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
    |||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  18212141 ggcagatgttattgtccgagtatgatat 18212114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 9135937 - 9135798
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || |||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | || ||||    
T  9135937 gccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaa 9135838  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
     ||||||||| ||||| |||||  | ||||| ||||||||    
T  9135837 ggattgcacggtggcagatgctactatctgagtatgatat 9135798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 144
Target Start/End: Original strand, 27545526 - 27545656
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||||||| || | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | || ||||  ||||| ||||    
T  27545526 cgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaagccggctttaacaggaagaattgctcgtt 27545625  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgt 144  Q
    |||| ||| | ||||| || |||||||||||    
T  27545626 ggcagatgttattgtccgagtatgatattgt 27545656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 9321098 - 9321310
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9321098 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 9321197  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9321198 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 9321297  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  9321298 acctcttgatgat 9321310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 26484016 - 26484228
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484016 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 26484115  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26484116 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 26484215  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  26484216 acctcttgatgat 26484228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 12135797 - 12136009
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12135797 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 12135896  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12135897 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattatgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 12135996  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  12135997 acctcttgatgat 12136009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 30172094 - 30172303
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30172094 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttgattgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgccgttactggaaaga 30172193  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30172194 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 30172293  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  30172294 tcttgatgat 30172303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 3793163 - 3793375
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3793163 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggacccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 3793262  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3793263 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 3793362  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  3793363 acctcttgatgat 3793375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 24586996 - 24587208
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  24586996 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 24587095  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24587096 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 24587195  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  24587196 acctcttgatgat 24587208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 11552980 - 11553189
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11552980 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 11553079  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11553080 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 11553179  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  11553180 tcttgatgat 11553189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18124951 - 18124742
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18124951 aaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 18124852  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18124851 ttgcacgctggcagatgctgttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 18124752  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  18124751 tcttgatgat 18124742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 23629595 - 23629804
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23629595 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 23629694  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23629695 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 23629794  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  23629795 tcttgatgat 23629804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 24973531 - 24973740
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24973531 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 24973630  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24973631 ttgcacgttggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 24973730  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  24973731 tcttgatgat 24973740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28956320 - 28956111
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28956320 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacatctttgagaaagctgccgttactggaaaga 28956221  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28956220 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 28956121  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  28956120 tcttgatgat 28956111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 210
Target Start/End: Original strand, 37758608 - 37758813
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37758608 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgccgttactggaaaga 37758707  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37758708 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 37758807  T
Q  205 tcttga 210  Q
    ||||||    
T  37758808 tcttga 37758813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Original strand, 5641413 - 5641621
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5641413 aaacgcctgcgtcattatctggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 5641512  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  5641513 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatcaacc 5641612  T
Q  205 tcttgatga 213  Q
    |||||||||    
T  5641613 tcttgatga 5641621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8662013 - 8661801
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8662013 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 8661914  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8661913 agattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 8661814  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  8661813 acctcttgatgat 8661801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18497263 - 18497051
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18497263 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 18497164  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18497163 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttacca 18497064  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  18497063 acctcttgatgat 18497051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 30155653 - 30155865
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30155653 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 30155752  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  30155753 agattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 30155852  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  30155853 acctcttgatgat 30155865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 33878752 - 33878964
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  33878752 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 33878851  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33878852 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 33878951  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  33878952 acctcttgatgat 33878964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40470088 - 40469876
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  40470088 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 40469989  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40469988 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 40469889  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  40469888 acctcttgatgat 40469876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 33520002 - 33520213
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33520002 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 33520101  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  33520102 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatca 33520201  T
Q  202 acctcttgatga 213  Q
    ||||||||||||    
T  33520202 acctcttgatga 33520213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9547244 - 9547035
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9547244 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 9547145  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9547144 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 9547045  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  9547044 tcttgatgat 9547035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22995652 - 22995443
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22995652 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 22995553  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22995552 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 22995453  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  22995452 tcttgatgat 22995443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 25203903 - 25204112
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| | | || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25203903 aaacgcctgcgtcattttttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 25204002  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25204003 ttgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 25204102  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  25204103 tcttgatgat 25204112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 25268058 - 25268267
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| | | || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25268058 aaacgcctgcgtcattttttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 25268157  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25268158 ttgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 25268257  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  25268258 tcttgatgat 25268267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 33296153 - 33296362
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33296153 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 33296252  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33296253 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 33296352  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  33296353 tcttgatgat 33296362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 210
Target Start/End: Original strand, 41678330 - 41678535
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41678330 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 41678429  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41678430 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 41678529  T
Q  205 tcttga 210  Q
    ||||||    
T  41678530 tcttga 41678535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 6877930 - 6878139
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  6877930 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgccgtcactggaaaga 6878029  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6878030 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 6878129  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  6878130 tcttgatgat 6878139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13183328 - 13183119
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13183328 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 13183229  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13183228 ttgcacgctggcagatgcttttgtcttaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 13183129  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  13183128 tcttgatgat 13183119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13439218 - 13439009
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13439218 aaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtcactgggaaga 13439119  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13439118 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatatcgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 13439019  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  13439018 tcttgatgat 13439009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 30938260 - 30938469
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30938260 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 30938359  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30938360 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 30938459  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  30938460 tcttgatgat 30938469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 11327259 - 11327471
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  11327259 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 11327358  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11327359 agatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 11327458  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  11327459 acctcttgatgat 11327471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18372072 - 18371864
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18372072 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatcagatcaagtatatctttgagaaagctgccgttactggaa 18371973  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18371972 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 18371873  T
Q  202 acctcttga 210  Q
    |||||||||    
T  18371872 acctcttga 18371864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 24727591 - 24727799
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  24727591 gccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgtcactggga 24727690  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24727691 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 24727790  T
Q  202 acctcttga 210  Q
    |||||||||    
T  24727791 acctcttga 24727799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 2514687 - 2514896
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  2514687 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgccgtcactggaaaga 2514786  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2514787 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 2514886  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  2514887 tcttgatgat 2514896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 28652864 - 28653076
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  28652864 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaa 28652963  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28652964 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaagggtagcattcttgcagatcatcttgcttacca 28653063  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  28653064 acctcttgatgat 28653076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 31435086 - 31435298
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435086 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 31435185  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  31435186 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatca 31435285  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  31435286 acctcttgatgat 31435298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37767529 - 37767317
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  37767529 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactggga 37767430  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  37767429 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatca 37767330  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  37767329 acctcttgatgat 37767317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 43081877 - 43082089
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  43081877 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggattcgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaa 43081976  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43081977 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaagggtagcattcttgcagatcatcttgcttacca 43082076  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  43082077 acctcttgatgat 43082089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29887735 - 29887523
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  29887735 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatcctatcaagtatatctttgagaaagctgttgttactggga 29887636  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  29887635 agattgcactctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgataatctcgcctacca 29887536  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||| ||||||    
T  29887535 acctctcgatgat 29887523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 34620140 - 34620352
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  34620140 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 34620239  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  34620240 agattgcacgctggcagatgttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttacca 34620339  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  34620340 acctcttgatgat 34620352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 22892085 - 22892296
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22892085 gccaaacgcctgcgtcactatttggtgaatcataaaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 22892184  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||    
T  22892185 agattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgttgatcaccttgcctatca 22892284  T
Q  202 acctcttgatga 213  Q
    ||| || |||||    
T  22892285 accgctcgatga 22892296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 210
Target Start/End: Original strand, 30033051 - 30033258
Alignment:
Q  3 ccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaa 102  Q
    |||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30033051 ccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaggctgctgttactggaaa 30033150  T
Q  103 gattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaa 202  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  30033151 gattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaa 30033250  T
Q  203 cctcttga 210  Q
    ||||||||    
T  30033251 cctcttga 30033258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 32592812 - 32592600
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  32592812 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaa 32592713  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32592712 agattgcacgctggcagatgttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttacca 32592613  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  32592612 acctcttgatgat 32592600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 33781114 - 33781319
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33781114 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 33781213  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33781214 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaa----caaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 33781309  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  33781310 tcttgatgat 33781319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15655293 - 15655091
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||| ||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15655293 aaacgcctacgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactgggaaga 15655194  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15655193 ttgcgcgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 15655094  T
Q  205 tct 207  Q
    |||    
T  15655093 tct 15655091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37668021 - 37667812
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  37668021 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactgggaaga 37667922  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  37667921 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacc 37667822  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    |||| |||||    
T  37667821 tcttaatgat 37667812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13321368 - 13321156
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  13321368 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 13321269  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||    
T  13321268 agattgcacgttggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcgatcaaaggtagcatcctcgccgatcaccttgcttatca 13321169  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  13321168 acctcttgatgat 13321156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37355181 - 37354969
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    |||||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  37355181 gccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 37355082  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  37355081 agatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatca 37354982  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  37354981 acctcttgatgat 37354969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31822945 - 31822733
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |    
T  31822945 gccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagcggccgttactggga 31822846  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  31822845 agatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatca 31822746  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  31822745 acctcttgatgat 31822733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15755390 - 15755182
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  15755390 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggacccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 15755291  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  15755290 agatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatca 15755191  T
Q  202 acctcttga 210  Q
    |||||||||    
T  15755190 acctcttga 15755182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 3483729 - 3483602
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| || |    
T  3483729 cgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgct 3483630  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
    |||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  3483629 ggcagatgttattgtccgagtatgatat 3483602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 11943960 - 11943821
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || |||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | || ||||    
T  11943960 gccaaacgcctccgtcattatatgatcaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaa 11943861  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
     ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  11943860 ggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 11943821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 91
Target Start/End: Original strand, 34469244 - 34469333
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgct 91  Q
    |||||||| || ||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  34469244 gccaaacgtctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaagatggatccgatcaagtacatctttgagaaacctgct 34469333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 5439763 - 5439624
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| || |||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | || ||||    
T  5439763 gccaagcgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaa 5439664  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
     ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  5439663 ggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 5439624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 15784263 - 15784124
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || || ||| || |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | || ||||    
T  15784263 gccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacgtggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaa 15784164  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
     ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  15784163 ggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 15784124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 17957719 - 17957858
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| || |||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | |  ||||    
T  17957719 gccaagcgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctgatatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagcccgctttgataggaa 17957818  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
     ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  17957819 ggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 17957858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 36375500 - 36375361
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || |||||| || |||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||  | ||| | || ||||    
T  36375500 gccaaacgcctccgtcattatatgatcaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaaatacatatttgagaagcccgctttgacaggaa 36375401  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
     ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  36375400 ggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 36375361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 37000154 - 37000015
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || |||||| || |||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||  | ||| | || ||||    
T  37000154 gccaaacgcctccgtcattatatgatcaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaaatacatatttgagaagcccgctttgacaggaa 37000055  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
     ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  37000054 ggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 37000015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 31520929 - 31521068
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| || |||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | || ||||    
T  31520929 gccaagcgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaa 31521028  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
     ||||||||| ||||| |||||  | || |||||||||||    
T  31521029 ggattgcacggtggcagatgctactatcggaatatgatat 31521068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 20388515 - 20388445
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaa 84  Q
    ||||||||| || | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20388515 cgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 20388445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 5009503 - 5009715
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5009503 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 5009602  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5009603 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 5009702  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  5009703 acctcttgatgat 5009715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 40102278 - 40102066
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40102278 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 40102179  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40102178 agattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 40102079  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  40102078 acctcttgatgat 40102066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 6573486 - 6573698
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6573486 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 6573585  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6573586 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 6573685  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  6573686 acctcttgatgat 6573698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 54837019 - 54837231
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  54837019 gccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 54837118  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54837119 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 54837218  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  54837219 acctcttgatgat 54837231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 15231501 - 15231712
Alignment:
Q  3 ccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaa 102  Q
    |||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15231501 ccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaa 15231600  T
Q  103 gattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaa 202  Q
    | ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15231601 ggttgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaa 15231700  T
Q  203 cctcttgatgat 214  Q
    ||||||||||||    
T  15231701 cctcttgatgat 15231712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 24116293 - 24116502
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24116293 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaaga 24116392  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24116393 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 24116492  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  24116493 tcttgatgat 24116502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34185598 - 34185389
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34185598 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 34185499  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34185498 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 34185399  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  34185398 tcttgatgat 34185389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 1903882 - 1904094
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  1903882 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 1903981  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1903982 agattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 1904081  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    ||||||| |||||    
T  1904082 acctcttaatgat 1904094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 14102171 - 14102379
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14102171 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgccgttactggaa 14102270  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14102271 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 14102370  T
Q  202 acctcttga 210  Q
    |||||||||    
T  14102371 acctcttga 14102379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18797255 - 18797043
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797255 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 18797156  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18797155 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttacca 18797056  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  18797055 acctcttgatgat 18797043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 21973329 - 21973540
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21973329 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 21973428  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  21973429 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatca 21973528  T
Q  202 acctcttgatga 213  Q
    ||||||||||||    
T  21973529 acctcttgatga 21973540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31123153 - 31122942
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31123153 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 31123054  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  31123053 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatca 31122954  T
Q  202 acctcttgatga 213  Q
    ||||||||||||    
T  31122953 acctcttgatga 31122942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 17016677 - 17016886
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17016677 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 17016776  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17016777 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 17016876  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  17016877 tcttgatgat 17016886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27159958 - 27159746
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27159958 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 27159859  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  27159858 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttatca 27159759  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  27159758 acctcttgatgat 27159746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20335061 - 20334850
Alignment:
Q  3 ccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaa 102  Q
    |||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20335061 ccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaa 20334962  T
Q  103 gattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaa 202  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  20334961 gattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccctgcttaccaa 20334862  T
Q  203 cctcttgatgat 214  Q
    ||||||||||||    
T  20334861 cctcttgatgat 20334850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24588999 - 24588790
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24588999 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 24588900  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  24588899 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcttaccaacc 24588800  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  24588799 tcttgatgat 24588790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33670438 - 33670229
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  33670438 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaaga 33670339  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  33670338 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacc 33670239  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  33670238 tcttgatgat 33670229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 30757388 - 30757599
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  30757388 gccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgtcactggga 30757487  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30757488 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 30757587  T
Q  202 acctcttgatga 213  Q
    ||||||||||||    
T  30757588 acctcttgatga 30757599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18313816 - 18313607
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18313816 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaaga 18313717  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  18313716 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacc 18313617  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  18313616 tcttgatgat 18313607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 36341158 - 36340950
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  36341158 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 36341059  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  36341058 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 36340959  T
Q  202 acctcttga 210  Q
    |||||||||    
T  36340958 acctcttga 36340950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 39854265 - 39854477
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  39854265 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagcggccgttactggaa 39854364  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  39854365 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaagggtagcattcttgcagatcatcttgcttacca 39854464  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  39854465 acctcttgatgat 39854477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 14759944 - 14759762
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14759944 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 14759845  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgat 187  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14759844 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgat 14759762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 14668647 - 14668856
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    ||||| |||||||| ||| || | |||||||| ||||||||||||||||  || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  14668647 aaacgtctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccaagatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttaccgggaaga 14668746  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14668747 ttgcacgctggcagatgcttttgtctaaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 14668846  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  14668847 tcttgatgat 14668856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 59 - 214
Target Start/End: Original strand, 5698220 - 5698375
Alignment:
Q  59 gatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaa 158  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5698220 gatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaa 5698319  T
Q  159 aggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5698320 aggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 5698375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15281578 - 15281366
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    |||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  15281578 gccaaaagcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgctgttactggga 15281479  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15281478 agattgcacgctggcaaatgctcttgtccaaatatgacattatgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 15281379  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    ||| |||||||||    
T  15281378 accgcttgatgat 15281366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 68 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15384923 - 15384778
Alignment:
Q  68 aagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatca 167  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15384923 aagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaaattgcgcgttggcaaatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaagtcaatca 15384824  T
Q  168 aaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatga 213  Q
    ||||||||||||||||  ||||  ||||||| || |||||||||||    
T  15384823 aaggtagcattcttgcatatcacgttgcctatcagcctcttgatga 15384778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14725428 - 14725265
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| || |    
T  14725428 cgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgct 14725329  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcat 177  Q
    |||| ||| | ||||| ||||||||||| | || |   ||||| || |||||||||||||||||    
T  14725328 ggcagatgttattgtccgaatatgatatcgagtatcgcactcagaaagcaatcaaaggtagcat 14725265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15388019 - 15387949
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagta 72  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15388019 gccaaacgcctgcgccactatttgatgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccaatcaagta 15387949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 141
Target Start/End: Original strand, 19767979 - 19768106
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| || |    
T  19767979 cgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgct 19768078  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
    |||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  19768079 ggcagatgttattgtccgagtatgatat 19768106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 55784760 - 55784901
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||| |  || || || ||||||||||||||||||||| | ||| | || ||||    
T  55784760 gccaaacgcctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaagatggacccgatcaagtacatctttgagaaacccgctttgacaggaa 55784859  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattg 143  Q
      ||||| || ||||| ||| | || || |||||||||||||    
T  55784860 gaattgcccggtggcagatgttattatccgaatatgatattg 55784901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 144
Target Start/End: Original strand, 18044699 - 18044829
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||||||| || | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | || ||||  ||||| ||||    
T  18044699 cgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaagccggctttaacaggaagaattgctcgtt 18044798  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgt 144  Q
    |||||||| | ||||  || |||||||||||    
T  18044799 ggcaaatgttattgttcgagtatgatattgt 18044829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 1881713 - 1881598
Alignment:
Q  29 aatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgttggcaaatgcttttgt 128  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | || ||||  ||||| |||||||| ||| | ||||    
T  1881713 aatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaagccggctttaacaggaagaattgctcgttggcagatgttattgt 1881614  T
Q  129 ctgaatatgatattgt 144  Q
    | || |||||||||||    
T  1881613 ccgagtatgatattgt 1881598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Original strand, 12515872 - 12515942
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaa 84  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  12515872 cgtcattatatgattaatcacactacttggttgatatctaaaatggatccaatcaagtatgtctttgagaa 12515942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28112638 - 28112426
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28112638 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 28112539  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28112538 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 28112439  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  28112438 acctcttgatgat 28112426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11107040 - 11106831
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11107040 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 11106941  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11106940 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 11106841  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  11106840 tcttgatgat 11106831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17981630 - 17981421
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17981630 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 17981531  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17981530 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 17981431  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  17981430 tcttgatgat 17981421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22384259 - 22384050
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384259 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 22384160  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22384159 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 22384060  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  22384059 tcttgatgat 22384050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 6205482 - 6205691
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6205482 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 6205581  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6205582 ttgcacgttggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcatcttgcttaccaacc 6205681  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  6205682 tcttgatgat 6205691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15737775 - 15737566
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15737775 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 15737676  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15737675 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaatgtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 15737576  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  15737575 tcttgatgat 15737566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 21678279 - 21678491
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  21678279 gccaaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacaacttggatgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactggga 21678378  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21678379 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctgcca 21678478  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  21678479 acctcttgatgat 21678491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 18228772 - 18228983
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18228772 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 18228871  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  18228872 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatca 18228971  T
Q  202 acctcttgatga 213  Q
    ||||||||||||    
T  18228972 acctcttgatga 18228983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 4627364 - 4627573
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4627364 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccaataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 4627463  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4627464 ttgcacgctggcagatgctgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 4627563  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  4627564 tcttgatgat 4627573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 4725210 - 4725419
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4725210 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 4725309  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4725310 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggaaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 4725409  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  4725410 tcttgatgat 4725419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4793316 - 4793107
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4793316 aaacgcctgcgtcattatttggtgagtcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 4793217  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4793216 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 4793117  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  4793116 tcttgatgat 4793107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 8299550 - 8299759
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8299550 aaacgcctgcgtcattatttgatgaatcatacaacttggttgatatccataatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 8299649  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8299650 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagaattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 8299749  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  8299750 tcttgatgat 8299759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18304335 - 18304126
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18304335 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 18304236  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18304235 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 18304136  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  18304135 tcttgatgat 18304126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 18334209 - 18334418
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18334209 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 18334308  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18334309 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcatcttgcttaccaacc 18334408  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  18334409 tcttgatgat 18334418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31032917 - 31032708
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31032917 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 31032818  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31032817 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 31032718  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||| ||||||    
T  31032717 tctagatgat 31032708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5605998 - 5605786
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5605998 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 5605899  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5605898 agatcgcacgctggcagatgcttttgtccgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttacca 5605799  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  5605798 acctcttgatgat 5605786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 5714649 - 5714861
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714649 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 5714748  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  5714749 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgagtatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttatca 5714848  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  5714849 acctcttgatgat 5714861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 5725559 - 5725771
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5725559 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 5725658  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  5725659 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgagtatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttatca 5725758  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  5725759 acctcttgatgat 5725771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5766809 - 5766597
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5766809 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 5766710  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  5766709 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgagtatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttatca 5766610  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  5766609 acctcttgatgat 5766597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 8215311 - 8215519
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8215311 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 8215410  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8215411 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 8215510  T
Q  202 acctcttga 210  Q
    |||||||||    
T  8215511 acctcttga 8215519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 32294204 - 32294416
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  32294204 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 32294303  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  32294304 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 32294403  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  32294404 acctcttgatgat 32294416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 5017291 - 5017502
Alignment:
Q  3 ccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaa 102  Q
    |||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5017291 ccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaa 5017390  T
Q  103 gattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaa 202  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5017391 gattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttaccaa 5017490  T
Q  203 cctcttgatgat 214  Q
    ||||||||||||    
T  5017491 cctcttgatgat 5017502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 4687234 - 4687443
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4687234 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 4687333  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4687334 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaagacagtcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 4687433  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  4687434 tcttgatgat 4687443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 7076785 - 7076994
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7076785 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgacatccagaatggatccgataaaatatatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 7076884  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7076885 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagtattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 7076984  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  7076985 tcttgatgat 7076994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8286151 - 8285942
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  8286151 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttaccgggaaga 8286052  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8286051 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 8285952  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  8285951 tcttgatgat 8285942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 18054841 - 18055050
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18054841 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 18054940  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18054941 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 18055040  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  18055041 tcttgatgat 18055050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18273733 - 18273524
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18273733 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 18273634  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  18273633 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaatc 18273534  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  18273533 tcttgatgat 18273524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18289034 - 18288825
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18289034 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 18288935  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  18288934 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaatc 18288835  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  18288834 tcttgatgat 18288825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 19698069 - 19698278
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19698069 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 19698168  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    |||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19698169 ttgcccgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 19698268  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  19698269 tcttgatgat 19698278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 20069619 - 20069828
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20069619 aaacgcctgcgtcattatctggtgaatcatacaacttggttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 20069718  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20069719 ttgcacgctagcagatgctgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 20069818  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  20069819 tcttgatgat 20069828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 210
Target Start/End: Original strand, 32442730 - 32442935
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32442730 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 32442829  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  32442830 ttgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 32442929  T
Q  205 tcttga 210  Q
    ||||||    
T  32442930 tcttga 32442935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 35884345 - 35884554
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35884345 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 35884444  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35884445 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaattaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 35884544  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  35884545 tcttgatgat 35884554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 51785599 - 51785810
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  51785599 gccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgtcactggga 51785698  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51785699 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 51785798  T
Q  202 acctcttgatga 213  Q
    ||||||||||||    
T  51785799 acctcttgatga 51785810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15889383 - 15889177
Alignment:
Q  8 cgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattg 107  Q
    ||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15889383 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccggtaaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaagattg 15889284  T
Q  108 cacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctct 207  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15889283 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 15889184  T
Q  208 tgatgat 214  Q
    |||||||    
T  15889183 tgatgat 15889177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29145437 - 29145228
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  29145437 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttaccgggaaga 29145338  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29145337 ttgcacgctggcagatgcttttatctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 29145238  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  29145237 tcttgatgat 29145228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 47027029 - 47027241
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  47027029 gccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtcactggaa 47027128  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  47027129 agattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 47027228  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  47027229 acctcttgatgat 47027241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 10399723 - 10399932
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10399723 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactgggaaga 10399822  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  10399823 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgtcgatcaccttgcttaccaacc 10399922  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    |||| |||||    
T  10399923 tcttaatgat 10399932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 24331742 - 24331951
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    ||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  24331742 aaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaaga 24331841  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24331842 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 24331941  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  24331942 tcttgatgat 24331951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5593041 - 5592829
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  5593041 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttaatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 5592942  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5592941 agattgcacactggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaacgcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 5592842  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  5592841 acctcttgatgat 5592829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 28024858 - 28025070
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  28024858 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaa 28024957  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28024958 agattgcacgctggcagatgttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttacca 28025057  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  28025058 acctcttgatgat 28025070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29661654 - 29661442
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  29661654 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaa 29661555  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29661554 agattgcacgatggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttacca 29661455  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||| ||||||    
T  29661454 acctctcgatgat 29661442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 5653664 - 5653873
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||| ||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5653664 aaacgcttgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaaga 5653763  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5653764 ttgcacgctgacaggtgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcctgcctaccaacc 5653863  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  5653864 tcttgatgat 5653873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20573524 - 20573315
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20573524 aaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaaga 20573425  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  20573424 ttgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttatcaacc 20573325  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  20573324 tcttgatgat 20573315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 48469506 - 48469715
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  48469506 aaacgcctgcgtcattatttggtgaaccatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaaga 48469605  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  48469606 ttgcgcgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccaatcatcttgcttaccaacc 48469705  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  48469706 tcttgatgat 48469715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4343357 - 4343148
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4343357 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaaga 4343258  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  4343257 ttgcacgctggcagatgttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacc 4343158  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  4343157 tcttgatgat 4343148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 4420494 - 4420703
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    ||||||||||| || ||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  4420494 aaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaaga 4420593  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4420594 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 4420693  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  4420694 tcttgatgat 4420703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 5470564 - 5470776
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  5470564 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 5470663  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  5470664 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatca 5470763  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  5470764 acctcttgatgat 5470776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 28342756 - 28342965
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    ||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  28342756 aaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaaga 28342855  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  28342856 tcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacc 28342955  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  28342956 tcttgatgat 28342965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 18246317 - 18246529
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  18246317 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 18246416  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  18246417 agatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatca 18246516  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  18246517 acctcttgatgat 18246529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22867532 - 22867320
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  22867532 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 22867433  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  22867432 agatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatca 22867333  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  22867332 acctcttgatgat 22867320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22882591 - 22882379
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  22882591 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 22882492  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  22882491 agatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatca 22882392  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  22882391 acctcttgatgat 22882379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 8000139 - 8000348
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    ||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  8000139 aaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccaataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaaga 8000238  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||    
T  8000239 tcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcacctggcttaccagcc 8000338  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||| ||||||    
T  8000339 tctcgatgat 8000348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 10646652 - 10646861
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    ||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  10646652 aaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccaataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaaga 10646751  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||    
T  10646752 tcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcacctggcttaccagcc 10646851  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||| ||||||    
T  10646852 tctcgatgat 10646861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31961136 - 31960927
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    ||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  31961136 aaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaaga 31961037  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  31961036 tcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaagacagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacc 31960937  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  31960936 tcttgatgat 31960927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6539423 - 6539214
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    ||||||||||| || ||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||    
T  6539423 aaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttacggggaaga 6539324  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  6539323 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatcaacc 6539224  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  6539223 tcttgatgat 6539214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16621174 - 16620966
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| |||||| ||||||||||| | |    
T  16621174 gccaaacgcttgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcagataaagtatatcttcgagaaacctgctgttactagga 16621075  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621074 agattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 16620975  T
Q  202 acctcttga 210  Q
    |||||||||    
T  16620974 acctcttga 16620966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17973460 - 17973333
Alignment:
Q  87 ctgctgttactggaaagattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17973460 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 17973361  T
Q  187 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17973360 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 17973333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 17992615 - 17992526
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgct 91  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  17992615 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgct 17992526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11925030 - 11924867
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| || |    
T  11925030 cgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaggatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgct 11924931  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcat 177  Q
    |||| ||| | ||||| || |||||||| | || |   ||||| || |||||||||||||||||    
T  11924930 ggcagatgttattgtccgagtatgatatcgagtatcgcactcagaaagcaatcaaaggtagcat 11924867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 141
Target Start/End: Original strand, 6571942 - 6572069
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||| ||| || || |    
T  6571942 cgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatccaatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggatcgctcgct 6572041  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
    |||||||| | ||||| || ||||||||    
T  6572042 ggcaaatgttattgtccgagtatgatat 6572069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 84
Target Start/End: Original strand, 15919093 - 15919175
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaa 84  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| | |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15919093 gccaaacgcctccgtcattatatgattagtcatactacttggttgatatccaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaa 15919175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 5950486 - 5950347
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || |||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | || ||||    
T  5950486 gccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaa 5950387  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
     ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  5950386 ggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 5950347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7088699 - 7088536
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| || |    
T  7088699 cgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgct 7088600  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcat 177  Q
    |||| ||| | ||||  || |||||||| | || |   ||||| || |||||||||||||||||    
T  7088599 ggcagatgttattgttcgagtatgatatcgagtatcgtactcagaaagcaatcaaaggtagcat 7088536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 141
Target Start/End: Original strand, 16431993 - 16432120
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| || |    
T  16431993 cgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgct 16432092  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
    |||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  16432093 ggcagatgttattgtccgagtatgatat 16432120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 141
Target Start/End: Original strand, 22960041 - 22960168
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| || |    
T  22960041 cgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgct 22960140  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
    |||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  22960141 ggcagatgttattgtccgagtatgatat 22960168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 143
Target Start/End: Original strand, 20443696 - 20443834
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    ||||| || ||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||  |    
T  20443696 aaacgtctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaagatggatccgatcaagtacatctttgagaaacctgctttgacaggaagaa 20443795  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattg 143  Q
    |||| || ||||| ||| | || || |||||||||||||    
T  20443796 ttgcccggtggcagatgttattatccgaatatgatattg 20443834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 15705061 - 15705224
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||  | ||| | || |||| |||||| || |    
T  15705061 cgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggacccaatcaagtacatatttgagaagccagctttaaccggaaggattgctcgct 15705160  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcat 177  Q
    |||| ||| | || || || |||||||| |||| |   || || || |||||||||||||||||    
T  15705161 ggcagatgttattatccgagtatgatatcgtgtatcgcacccagaaagcaatcaaaggtagcat 15705224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 37260393 - 37260254
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | || |||||  | |||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | || ||||    
T  37260393 gccaaacgcctccgtcattatataattaatcacgctacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaa 37260294  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
     ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  37260293 ggattgcacggtggcaaatgctactatctgaatatgatat 37260254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 144
Target Start/End: Original strand, 4450363 - 4450493
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||||||| || | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | || ||||  ||||| ||||    
T  4450363 cgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaagccggctttaacaggaagaattgctcgtt 4450462  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgt 144  Q
    |||||||| | ||||  || |||||||||||    
T  4450463 ggcaaatgttattgttcgagtatgatattgt 4450493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 46380910 - 46381049
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||| || || || |||||| || |||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| | || ||||    
T  46380910 gccaagcgcctccgtcattatatgattaaccacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaaatacatatttgagaaacccgctttgacaggaa 46381009  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
     ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  46381010 ggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 46381049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 15592595 - 15592513
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaa 84  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| | |||||| |||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15592595 gccaaacgcctccgtcattatatgattagtcatactacttggctgatatctaaaatggatccgatcaagtacatatttgagaa 15592513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11631814 - 11631602
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11631814 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 11631715  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11631714 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 11631615  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  11631614 acctcttgatgat 11631602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 40237122 - 40237334
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  40237122 gccaaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactggga 40237221  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40237222 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 40237321  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  40237322 acctcttgatgat 40237334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 3786107 - 3786318
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  3786107 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 3786206  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3786207 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 3786306  T
Q  202 acctcttgatga 213  Q
    ||||||||||||    
T  3786307 acctcttgatga 3786318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21673805 - 21673597
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673805 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccaataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 21673706  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21673705 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcatcttgcttacca 21673606  T
Q  202 acctcttga 210  Q
    |||||||||    
T  21673605 acctcttga 21673597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 34294768 - 34294980
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  34294768 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 34294867  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34294868 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 34294967  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  34294968 acctcttgatgat 34294980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27431068 - 27430859
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27431068 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 27430969  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27430968 ttgcacgttggcagatgcttttgtcggaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 27430869  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  27430868 tcttgatgat 27430859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21699801 - 21699589
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  21699801 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 21699702  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21699701 agattgcatgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 21699602  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  21699601 acctcttgatgat 21699589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22924778 - 22924566
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  22924778 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactggga 22924679  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22924678 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 22924579  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  22924578 acctcttgatgat 22924566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 31879900 - 31880112
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31879900 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 31879999  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31880000 agattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttacca 31880099  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  31880100 acctcttgatgat 31880112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37682525 - 37682313
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682525 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 37682426  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37682425 agattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 37682326  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  37682325 acctcttgatgat 37682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37697790 - 37697578
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37697790 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 37697691  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37697690 agattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 37697591  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  37697590 acctcttgatgat 37697578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16825968 - 16825757
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825968 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 16825869  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  16825868 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatca 16825769  T
Q  202 acctcttgatga 213  Q
    ||||||||||||    
T  16825768 acctcttgatga 16825757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 16895512 - 16895723
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16895512 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 16895611  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  16895612 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatca 16895711  T
Q  202 acctcttgatga 213  Q
    ||||||||||||    
T  16895712 acctcttgatga 16895723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 20841530 - 20841739
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20841530 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 20841629  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20841630 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 20841729  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  20841730 tcttgatgat 20841739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 257283 - 257071
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  257283 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaa 257184  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257183 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 257084  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  257083 acctcttgatgat 257071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13933177 - 13932965
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    |||||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13933177 gccaaacgcctgcggcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 13933078  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13933077 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 13932978  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  13932977 acctcttgatgat 13932965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19413131 - 19412919
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19413131 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgccgttactggaa 19413032  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19413031 agatcgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 19412932  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  19412931 acctcttgatgat 19412919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 27120138 - 27120350
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    |||||||||||| |||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27120138 gccaaacgcctgtgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 27120237  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27120238 agattgcgcgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 27120337  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  27120338 acctcttgatgat 27120350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 27779848 - 27780060
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  27779848 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactggga 27779947  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27779948 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 27780047  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  27780048 acctcttgatgat 27780060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 27819605 - 27819817
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  27819605 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactggga 27819704  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27819705 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 27819804  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  27819805 acctcttgatgat 27819817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 32053417 - 32053629
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32053417 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgattaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 32053516  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  32053517 agatcgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcagaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttatca 32053616  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  32053617 acctcttgatgat 32053629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 34158458 - 34158670
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  34158458 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactggga 34158557  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  34158558 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcatcttgcttacca 34158657  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  34158658 acctcttgatgat 34158670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 37928983 - 37929195
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  37928983 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtcactggaa 37929082  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37929083 agattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 37929182  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  37929183 acctcttgatgat 37929195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39048449 - 39048237
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  39048449 gccaaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtcactggga 39048350  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  39048349 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcaccttgcttacca 39048250  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  39048249 acctcttgatgat 39048237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 27395176 - 27395387
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27395176 gccaaacgcctgcgccactatttgatgaatcatacaacttgggtgatatccaggatggatccaatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 27395275  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  27395276 aaattgcgcgttggcaaatgctcttgtctgaatatgatattttgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcctatca 27395375  T
Q  202 acctcttgatga 213  Q
    ||||||||||||    
T  27395376 acctcttgatga 27395387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 12659153 - 12659362
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12659153 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 12659252  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12659253 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 12659352  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  12659353 tcttgatgat 12659362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 27807320 - 27807529
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27807320 aaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaaga 27807419  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27807420 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 27807519  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  27807520 tcttgatgat 27807529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 34271547 - 34271338
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34271547 aaacgcctgcgtcattatttggtgaaccatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 34271448  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34271447 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 34271348  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  34271347 tcttgatgat 34271338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9346616 - 9346404
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  9346616 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaa 9346517  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9346516 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttacca 9346417  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  9346416 acctcttgatgat 9346404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31890121 - 31889909
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31890121 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactggga 31890022  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31890021 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 31889922  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  31889921 acctcttgatgat 31889909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 12590425 - 12590634
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  12590425 aaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaaga 12590524  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12590525 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 12590624  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  12590625 tcttgatgat 12590634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 28885896 - 28886105
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  28885896 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatatagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaaa 28885995  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28885996 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcgtaccaacc 28886095  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  28886096 tcttgatgat 28886105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 16165097 - 16165306
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16165097 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatctagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaaaga 16165196  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16165197 ttgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcaccttgcttaccaacc 16165296  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  16165297 tcttgatgat 16165306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23125195 - 23124987
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23125195 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 23125096  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23125095 ttgcacgctggcagatgcttttatctgaatacgatattgtg-ttcaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcgtaccaacc 23124997  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  23124996 tcttgatgat 23124987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 210
Target Start/End: Original strand, 37381294 - 37381499
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  37381294 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaaga 37381393  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37381394 ttgcacggtggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 37381493  T
Q  205 tcttga 210  Q
    ||||||    
T  37381494 tcttga 37381499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12713231 - 12713019
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  12713231 gccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagcggccgttactggaa 12713132  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12713131 agattgcacgatggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 12713032  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  12713031 acctcttgatgat 12713019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 34865298 - 34865510
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  34865298 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 34865397  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  34865398 agatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttatca 34865497  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  34865498 acctcttgatgat 34865510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37948489 - 37948280
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  37948489 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaaga 37948390  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||    
T  37948389 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttgtcaacc 37948290  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  37948289 tcttgatgat 37948280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 39893683 - 39893891
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  39893683 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggacccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 39893782  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39893783 agatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggccatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 39893882  T
Q  202 acctcttga 210  Q
    |||||||||    
T  39893883 acctcttga 39893891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19453053 - 19452841
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  19453053 gccaaacgcctacgtcattatttggtgaatcatataacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgctgttactggga 19452954  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19452953 agattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagctatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 19452854  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  19452853 acctcttgatgat 19452841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 34701702 - 34701865
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| || |    
T  34701702 cgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgct 34701801  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcat 177  Q
    |||| ||| | ||||| || |||||||| | || |   ||||| || |||||||||||||||||    
T  34701802 ggcagatgttattgtccgagtatgatatcgagtatcgcactcagaaagcaatcaaaggtagcat 34701865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 21760245 - 21760104
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | || ||||    
T  21760245 gccaaacgcctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaagatggatccgatcaagtacatctttgagaaacccgctttgacaggaa 21760146  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattg 143  Q
      ||||| || ||||| ||| | || || |||||||||||||    
T  21760145 gaattgcccggtggcagatgttattatccgaatatgatattg 21760104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 22950007 - 22950146
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || |||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | || ||||    
T  22950007 gccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaa 22950106  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
     ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  22950107 ggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 22950146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 141
Target Start/End: Original strand, 42394161 - 42394288
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| || |    
T  42394161 cgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgct 42394260  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
    |||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  42394261 ggcagatgttattgtccgagtatgatat 42394288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 12384274 - 12384413
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || || ||| || |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | || ||||    
T  12384274 gccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacgtggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagcccgctttgacaggaa 12384373  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
     ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  12384374 ggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 12384413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 34534046 - 34533931
Alignment:
Q  29 aatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgttggcaaatgcttttgt 128  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | || ||||  ||||| |||||||| ||| | ||||    
T  34534046 aatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaagccggctttaacaggaagaattgctcgttggcagatgttattgt 34533947  T
Q  129 ctgaatatgatattgt 144  Q
    | || |||||||||||    
T  34533946 ccgagtatgatattgt 34533931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 26723894 - 26723824
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaa 84  Q
    ||||||||| || | ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26723894 cgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 26723824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 27828077 - 27828129
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaat 57  Q
    ||||||||||| || ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27828077 aaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaat 27828129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 10966282 - 10966494
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10966282 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 10966381  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10966382 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 10966481  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  10966482 acctcttgatgat 10966494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Original strand, 10948694 - 10948905
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10948694 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 10948793  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  10948794 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttatca 10948893  T
Q  202 acctcttgatga 213  Q
    ||||||||||||    
T  10948894 acctcttgatga 10948905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16204675 - 16204463
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16204675 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 16204576  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    ||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16204575 agattgcccgctggaagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 16204476  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  16204475 acctcttgatgat 16204463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 28588602 - 28588814
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  28588602 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaa 28588701  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28588702 agattgcacgctggcagatgcttttatctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 28588801  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  28588802 acctcttgatgat 28588814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20337057 - 20336845
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20337057 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 20336958  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20336957 agattgcacgctggcagatgctcttatctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 20336858  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    ||| |||||||||    
T  20336857 accccttgatgat 20336845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Original strand, 51641835 - 51642043
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||  || | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51641835 gccaaacgcctgcgtcattacttggtgaaccatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 51641934  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51641935 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatactgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 51642034  T
Q  202 acctcttga 210  Q
    |||||||||    
T  51642035 acctcttga 51642043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 28153353 - 28153565
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  28153353 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactggga 28153452  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28153453 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttacca 28153552  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  28153553 acctcttgatgat 28153565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 8 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21894383 - 21894177
Alignment:
Q  8 cgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattg 107  Q
    ||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  21894383 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgttactgggaaggttg 21894284  T
Q  108 cacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctct 207  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21894283 cacgctggcagatgctattgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcatcttgcctaccaacctct 21894184  T
Q  208 tgatgat 214  Q
    |||||||    
T  21894183 tgatgat 21894177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 3644753 - 3644965
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  3644753 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggaa 3644852  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  3644853 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgcttatca 3644952  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  3644953 acctcttgatgat 3644965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41789945 - 41789739
Alignment:
Q  8 cgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattg 107  Q
    |||||||| || ||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  41789945 cgcctgcgccattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactgggaagattg 41789846  T
Q  108 cacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctct 207  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  41789845 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacctct 41789746  T
Q  208 tgatgat 214  Q
    |||||||    
T  41789745 tgatgat 41789739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 214
Target Start/End: Original strand, 20464600 - 20464805
Alignment:
Q  9 gcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgc 108  Q
    |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20464600 gcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgctgttactgggaagattgc 20464699  T
Q  109 acgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctctt 208  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20464700 acgctggcagatgctcttgtctgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccaatcatcttgcctgccaacctctt 20464799  T
Q  209 gatgat 214  Q
    ||||||    
T  20464800 gatgat 20464805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Original strand, 22489650 - 22489782
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| || |    
T  22489650 cgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatccaatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgat 22489749  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgt 146  Q
    |||| ||| | ||||| || |||||||| ||||    
T  22489750 ggcagatgttattgtccgagtatgatatcgtgt 22489782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 5628639 - 5628500
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||| || || || |||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | || ||||    
T  5628639 gccaagcgcctccgtcattatatgattaaccacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaaacccgctttgacaggaa 5628540  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
     ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  5628539 ggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 5628500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 7575 - 7787
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7575 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 7674  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7675 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 7774  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  7775 acctcttgatgat 7787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 30911 - 31120
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30911 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaacctgctgttactgggaaga 31010  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31011 ttgcacgctggcagatgctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 31110  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  31111 tcttgatgat 31120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 19685 - 19897
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  19685 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgctgttactggga 19784  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19785 agattgcacgctggcaaatgctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 19884  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  19885 acctcttgatgat 19897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 9637 - 9849
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9637 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggga 9736  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9737 agattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttacca 9836  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  9837 acctcttgatgat 9849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 214
Target Start/End: Original strand, 16202 - 16408
Alignment:
Q  8 cgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattg 107  Q
    ||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16202 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaagattg 16301  T
Q  108 cacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctct 207  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16302 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 16401  T
Q  208 tgatgat 214  Q
    |||||||    
T  16402 tgatgat 16408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 3685 - 3894
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3685 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggattcgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 3784  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3785 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 3884  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  3885 tcttgatgat 3894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22832 - 22621
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22832 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 22733  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  22732 agattgcacgctggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgcttatca 22633  T
Q  202 acctcttgatga 213  Q
    ||||||||||||    
T  22632 acctcttgatga 22621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 9654 - 9863
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    ||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9654 aaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 9753  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9754 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 9853  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  9854 tcttgatgat 9863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5817 - 5608
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  5817 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgccgtcactggaaaga 5718  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 5618  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  5617 tcttgatgat 5608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 9660 - 9872
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9660 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaaatatatctttgagaaagctgctgttactggga 9759  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9760 agattgcaagctggcagatgctcttgtctgaatatgatgttgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 9859  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||| ||||||||    
T  9860 accttttgatgat 9872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 213
Target Start/End: Original strand, 22758 - 22942
Alignment:
Q  29 aatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgttggcaaatgcttttgt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  22758 aatcatacaacttggttgatatccaggatggatccaatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaaattgcgcgttggcaaatgctcttgt 22857  T
Q  129 ctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatga 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22858 ctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 22942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 13189 - 13398
Alignment:
Q  5 aaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 104  Q
    |||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  13189 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaggcggccgttactgggaaga 13288  T
Q  105 ttgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 204  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13289 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 13388  T
Q  205 tcttgatgat 214  Q
    ||||||||||    
T  13389 tcttgatgat 13398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 214
Target Start/End: Original strand, 11564 - 11776
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    |||||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  11564 gccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgttactggga 11663  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 201  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  11664 agatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgcttatca 11763  T
Q  202 acctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||    
T  11764 acctcttgatgat 11776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5312 - 5125
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |    
T  5312 gccaaacgccttcgtcattacctggtaaatcatactacttggttgatatccaggatggatccaatcaagtatatcttcgagaagcctgctgttactggga 5213  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatca 189  Q
    |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5212 agattgcacactggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatca 5125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 118946 - 118762
Alignment:
Q  30 atcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgttggcaaatgcttttgtc 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  118946 atcatacaacttgggtgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtc 118847  T
Q  130 tgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 214  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  118846 tgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagctatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 118762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 43333 - 43145
Alignment:
Q  29 aatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtac-atctttgag-aaagctgctgttactggaaagattgcacgttggcaaatgc-ttt 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  43333 aatcatacaacgtggttgatatccagaatggatccgataaagtaatatctttgagtaaagctgctgttactgggaagattgcacgttggcagatgctttt 43234  T
Q  126 tgtctgaatat-gatattgtgtt-taaaactc-aaaaggcaatcaaaggtagc--attcttgccgatca-tcttgcctaccaacctctt 208  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  43233 tgtctgaatatagatattgtgttcaaaaactcaaaaaggcaatcaaaggtagctatttcttgccgatcattcttgcttaccaacctctt 43145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0196 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0196
Description:

Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 214
Target Start/End: Original strand, 1979 - 2109
Alignment:
Q  87 ctgctgttactggaaagattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgtttaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc---attcttgc 183  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  1979 ctgctgttactaggaagattggacgctggcagatgctcttgtctgaatatggcattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattattcttgc 2078  T
Q  184 cgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2079 cgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 2109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 141
Target Start/End: Original strand, 10845 - 10972
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgtt 113  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| | ||||||| |||||| || |    
T  10845 cgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagctttaactggaaggattgctcgct 10944  T
Q  114 ggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
    |||| ||| | ||||| || ||||||||    
T  10945 ggcagatgttattgtccgagtatgatat 10972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 29785 - 29924
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaaagctgctgttactggaa 101  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| || |||||| || |||| | ||| |||||||||| |||||| ||||||||  | ||| | || ||||    
T  29785 gccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaggtacatatttgagaagcccgctttgacaggaa 29884  T
Q  102 agattgcacgttggcaaatgcttttgtctgaatatgatat 141  Q
     ||||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  29885 ggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 29924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 34881 - 34799
Alignment:
Q  2 gccaaacgcctgcgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaa 84  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| | |||||| |||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34881 gccaaacgcctccgtcattatatgattagtcatactacttggctgatatctaaaatggatccgatcaagtacatatttgagaa 34799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 5039 - 4969
Alignment:
Q  14 cgtcactatctgataaatcatacaacttggttgatatccagaattgatccaatcaagtacatctttgagaa 84  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  5039 cgtcattatatgattaatcacactacttggttgatatctaaaatggatccaatcaagtatgtctttgagaa 4969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University