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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1715-Insertion-7 (Length: 852)

Name: NF1715-Insertion-7
Description: NF1715
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1715-Insertion-7
NF1715-Insertion-7
[»] chr4 (14 HSPs)
chr4 (455-710)||(618494-618744)
chr4 (455-629)||(37532586-37532761)
chr4 (250-427)||(47759418-47759588)
chr4 (459-707)||(786710-786952)
chr4 (459-710)||(31920258-31920506)
chr4 (459-710)||(49708966-49709213)
chr4 (459-636)||(35854764-35854943)
chr4 (459-636)||(55560151-55560331)
chr4 (459-636)||(49788012-49788193)
chr4 (459-559)||(1859613-1859713)
chr4 (455-553)||(9281828-9281925)
chr4 (509-611)||(38517436-38517541)
chr4 (568-632)||(6244782-6244846)
chr4 (662-710)||(37532796-37532844)
[»] chr3 (27 HSPs)
chr3 (455-710)||(37802934-37803184)
chr3 (455-710)||(9999207-9999460)
chr3 (455-710)||(10234218-10234472)
chr3 (455-636)||(47691893-47692075)
chr3 (455-629)||(10109472-10109650)
chr3 (455-629)||(41221070-41221244)
chr3 (455-707)||(50408952-50409208)
chr3 (455-636)||(10230695-10230879)
chr3 (455-632)||(15329746-15329926)
chr3 (455-710)||(10970080-10970338)
chr3 (9-243)||(2622265-2622506)
chr3 (459-710)||(10037432-10037679)
chr3 (459-710)||(11361046-11361293)
chr3 (459-710)||(11367435-11367682)
chr3 (459-636)||(10108835-10109015)
chr3 (491-636)||(10040930-10041078)
chr3 (494-710)||(41764585-41764798)
chr3 (459-636)||(10230074-10230256)
chr3 (455-616)||(52917633-52917794)
chr3 (459-628)||(31675-31847)
chr3 (459-632)||(23092403-23092579)
chr3 (459-636)||(27273261-27273441)
chr3 (459-632)||(10233673-10233849)
chr3 (662-707)||(46912151-46912196)
chr3 (662-710)||(52916754-52916802)
chr3 (662-710)||(10040861-10040909)
chr3 (662-710)||(10109387-10109435)
[»] scaffold0888 (1 HSPs)
scaffold0888 (455-710)||(905-1154)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (455-710)||(48239969-48240219)
chr1 (455-710)||(28960863-28961111)
chr1 (455-636)||(7101827-7102009)
chr1 (455-635)||(2453932-2454113)
chr1 (455-710)||(36206008-36206257)
chr1 (456-710)||(16043153-16043402)
chr1 (459-710)||(25075039-25075285)
chr1 (459-710)||(48776510-48776757)
chr1 (459-710)||(16040815-16041061)
chr1 (459-710)||(16748848-16749095)
chr1 (459-636)||(18147545-18147725)
chr1 (459-636)||(37391328-37391507)
chr1 (459-636)||(52499588-52499768)
chr1 (459-636)||(36518795-36518975)
chr1 (459-635)||(6312175-6312354)
chr1 (501-629)||(12450841-12450961)
chr1 (193-245)||(9325336-9325388)
chr1 (662-710)||(12450757-12450805)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (455-710)||(98000-98257)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (455-710)||(4221186-4221445)
chr6 (455-707)||(10186342-10186593)
chr6 (456-710)||(12518404-12518653)
chr6 (459-710)||(15330329-15330575)
chr6 (455-629)||(30880927-30881102)
chr6 (459-710)||(12516176-12516424)
chr6 (465-636)||(14906355-14906527)
chr6 (459-636)||(31512675-31512855)
chr6 (459-632)||(29642537-29642713)
chr6 (459-710)||(24195691-24195938)
chr6 (662-707)||(14906291-14906336)
[»] chr7 (11 HSPs)
chr7 (455-710)||(21071232-21071486)
chr7 (455-629)||(22843403-22843578)
chr7 (459-710)||(45122536-45122782)
chr7 (456-629)||(5829713-5829890)
chr7 (724-833)||(531518-531627)
chr7 (459-636)||(42231011-42231191)
chr7 (462-636)||(7035561-7035738)
chr7 (459-636)||(9002305-9002485)
chr7 (724-825)||(632759-632860)
chr7 (459-636)||(12787166-12787346)
chr7 (662-710)||(5829927-5829975)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (455-710)||(125007-125265)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (456-710)||(15033760-15034009)
chr5 (455-710)||(6088007-6088256)
chr5 (455-629)||(14194052-14194227)
chr5 (455-629)||(26831498-26831676)
chr5 (455-710)||(18115597-18115846)
chr5 (455-710)||(2262168-2262429)
chr5 (455-629)||(17872080-17872255)
chr5 (455-710)||(43525060-43525309)
chr5 (455-710)||(25543920-25544174)
chr5 (459-710)||(4050596-4050842)
chr5 (459-635)||(30313240-30313419)
chr5 (459-710)||(43448270-43448517)
chr5 (459-636)||(10023988-10024168)
chr5 (459-624)||(37260185-37260354)
chr5 (459-636)||(8429759-8429939)
chr5 (459-636)||(24630984-24631164)
chr5 (459-636)||(30347664-30347844)
chr5 (461-636)||(27879942-27880121)
chr5 (459-618)||(3688820-3688982)
chr5 (459-618)||(3877803-3877965)
chr5 (459-636)||(26792667-26792847)
chr5 (481-636)||(37371770-37371941)
chr5 (459-604)||(39882072-39882220)
chr5 (662-710)||(14194265-14194313)
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (455-710)||(14713061-14713320)
chr8 (455-629)||(13424496-13424671)
chr8 (455-632)||(14764490-14764667)
chr8 (459-710)||(31979707-31979954)
chr8 (481-636)||(25219774-25219932)
chr8 (459-636)||(7780601-7780781)
chr8 (459-636)||(7820691-7820871)
chr8 (459-710)||(21114858-21115106)
chr8 (514-710)||(37915275-37915468)
chr8 (494-612)||(33862603-33862724)
chr8 (459-559)||(30306106-30306206)
chr8 (567-636)||(30306000-30306069)
chr8 (662-710)||(13424412-13424460)
chr8 (662-710)||(33863123-33863172)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (455-709)||(2881653-2881911)
chr2 (455-629)||(24244735-24244910)
chr2 (455-707)||(17687530-17687779)
chr2 (455-629)||(3641932-3642107)
chr2 (455-629)||(27508245-27508420)
chr2 (455-629)||(40488869-40489047)
chr2 (459-636)||(39441854-39442033)
chr2 (455-570)||(2868545-2868661)
chr2 (454-636)||(36047873-36048058)
chr2 (459-636)||(28667360-28667541)
chr2 (459-636)||(37826194-37826375)
chr2 (509-710)||(24270184-24270381)
chr2 (461-636)||(41921359-41921538)
chr2 (560-707)||(35608690-35608831)
chr2 (459-632)||(21394225-21394401)
chr2 (517-636)||(26955164-26955286)
chr2 (662-710)||(3641849-3641897)
chr2 (455-506)||(35608837-35608888)
chr2 (662-710)||(24244656-24244703)
[»] scaffold1424 (1 HSPs)
scaffold1424 (455-710)||(461-729)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (455-710)||(17800-18052)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (455-636)||(13351-13532)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (455-629)||(6410-6588)
scaffold0134 (662-710)||(6623-6671)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (459-710)||(23383-23630)
scaffold0073 (459-710)||(18248-18495)
[»] scaffold0499 (1 HSPs)
scaffold0499 (459-636)||(10002-10182)
[»] scaffold1370 (1 HSPs)
scaffold1370 (482-710)||(1375-1598)
[»] scaffold0532 (2 HSPs)
scaffold0532 (481-629)||(3522-3671)
scaffold0532 (662-711)||(3706-3755)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (455-629)||(185432-185613)
scaffold0017 (662-710)||(185349-185397)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (482-636)||(44863-45020)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (459-710)||(164316-164564)
scaffold0003 (459-710)||(172431-172679)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (459-636)||(4712-4892)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (459-636)||(50123-50303)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (459-632)||(133050-133226)
scaffold0029 (662-710)||(133249-133297)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (461-632)||(310880-311054)
scaffold0002 (662-710)||(331454-331502)
scaffold0002 (662-710)||(311077-311125)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (482-636)||(13320-13477)
[»] scaffold0196 (2 HSPs)
scaffold0196 (455-557)||(23283-23385)
scaffold0196 (662-710)||(23182-23230)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (459-632)||(29749-29928)
[»] scaffold0636 (1 HSPs)
scaffold0636 (515-636)||(1-125)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (540-636)||(10276-10375)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 165; Significance: 8e-88; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Original strand, 618494 - 618744
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
618494 attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa 618593  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaa 653  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||    
618594 ttagtataagtataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttccatatcaaa 618693  T
654 tttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
618694 tt------taaattataaccacacttataactttaagataacacaatataaaatcta 618744  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Original strand, 37532586 - 37532761
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
37532586 attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa 37532685  T
555 -ttagttaagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 629  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37532686 tttagttaagtataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 37532761  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 250 - 427
Target Start/End: Original strand, 47759418 - 47759588
Alignment:
250 aaaaaatgaagaaactgaacctgcttcttctgacgagcaaggttccaaattctccaa-acatgttttccaatctagtgttcctctcttggggacttctcg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
47759418 aaaaaatgaagaaactgaacctgcttcttctgacgagcaaggttccaaattctccaacacatgttttccaatctagtgttcctctcttgaggacttctcg 47759517  T
349 atgaagaagcctagtaacaacaaatcaaattcaacaaattatttgaattgatgaaaataagttgaattaaaagaaagag 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        | | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
47759518 atgaagaagcctagtaacaacaaatcaaat--------tgagttaaattgatgaaaataagttgaattgaaagaaagag 47759588  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 459 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 786952 - 786710
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
786952 tgtcaacaaatattattatacagtacgtcagcgtatttttgcaaaaatattacgtatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 786853  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt 655  Q
    |  |||||||  |||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||        |||||| ||||    
786852 tacaagtataataatccaaatacttttatcgtta--tgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaagttaagatgatattttttt-catatcgaatt 786756  T
656 tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaat 707  Q
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
786755 ------taaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaat 786710  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 31920506 - 31920258
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
31920506 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 31920407  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt 655  Q
    |  |||||||  |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||    
31920406 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttt-catatcgaatt 31920308  T
656 tactaataaattataaccacatttataac-tttaagataatataatataaaatcta 710  Q
          ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
31920307 ------taaattataaccacaattataacttttaagataaaataatataaaatcta 31920258  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 49709213 - 49708966
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
49709213 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 49709114  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt 655  Q
    |  | |||||  |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||        |||||||||||    
49709113 tacaggtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattaaaattatattttttt-catatcaaatt 49709015  T
656 tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
49709014 ------taaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatcta 49708966  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 35854943 - 35854764
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
35854943 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaaaattacatatgctaagtttaacaatgaatgcatcttatactacaaataattag 35854844  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
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35854843 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatata-aaaattaagatgata 35854764  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 55560151 - 55560331
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
55560151 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagtaaattacatatgctaagtttaacaatgaatgcatcttatactacaaataattag 55560250  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |  |||||||  |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
55560251 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 55560331  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 49788012 - 49788193
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
49788012 tgtcaacaaatattattacacagtatgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatgctacaaataattag 49788111  T
559 t-taagtata--aatccaaata-ctttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |  |||||||  ||||||||||  ||| ||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
49788112 tacaagtataataatccaaatattttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaatgaagatgata 49788193  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 459 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 1859713 - 1859613
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
1859713 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 1859614  T
559 t 559  Q
    |    
1859613 t 1859613  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 455 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 9281925 - 9281828
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaata 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
9281925 attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcagtgtatttttactaaaatatta-ttatattaaatttaataatgagtacatcttatactacaaata 9281828  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 509 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 38517541 - 38517436
Alignment:
509 tacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagat 605  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||| ||| ||| |||| || |||||||||||    
38517541 tacatatgctaagtttaacaatgagtgaatcttatactacaaataattagtacaagtataataatccagatatttttatcgttatatgcaatgtttagat 38517442  T
606 atttca 611  Q
    ||||||    
38517441 atttca 38517436  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 568 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 6244846 - 6244782
Alignment:
568 aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat 632  Q
    |||||||||| ||| ||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6244846 aatccaaatatttttatcgttgtatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat 6244782  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Original strand, 37532796 - 37532844
Alignment:
662 taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
37532796 taaattataaccatacttataactttaagataacataatataaaatcta 37532844  T

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Target: chr3 (Bit Score: 165; Significance: 8e-88; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Original strand, 37802934 - 37803184
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
37802934 attatgtcaacaaataataatatacagtatgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacattttatactacaaataa 37803033  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaa 653  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||    
37803034 ttagtataagtataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatctcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttccatatcaaa 37803133  T
654 tttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
37803134 tt------taaattataaccacacttataactttaagataacacaatataaaatcta 37803184  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 9999460 - 9999207
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
9999460 attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacgatgagtacatcttatactacaaataa 9999361  T
555 ttagt-taagt---ataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatc 650  Q
    ||||| ||| |   |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
9999360 ttagtataaatataataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttccatatc 9999261  T
651 aaatttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||||       ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
9999260 aaat------gtaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatcta 9999207  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 10234472 - 10234218
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
10234472 attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa 10234373  T
555 ttagt-taagt---ataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata-nnnnnnnccatat 649  Q
    ||||| ||| |   |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
10234372 ttagtataaatataataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttttccatat 10234273  T
650 caaatttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    |||||       ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
10234272 caaat------gtaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatcta 10234218  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 455 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 47692075 - 47691893
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
47692075 attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacgtcttatactacaaataa 47691976  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
47691975 ttaatataagtataaattcaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaattatatacaaaattaagatgata 47691893  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 10109650 - 10109472
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
10109650 attatgtcaacaaataataatatacagtacatcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa 10109551  T
555 ttagt-taagt---ataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 629  Q
    ||||| ||| |   |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10109550 ttagtataaatataataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 10109472  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 41221244 - 41221070
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
41221244 attatgtcaaaaaataataatatatagtacgttcgcgtatttttgcaaaaatattacatatgttaaatttaacaatgagtacatcttatactacaaataa 41221145  T
555 ttagttaagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
41221144 ttagttaagtataaatccaaatactttaatatttatgtgcaatgtttaggtatttcaaaatatatacaaaattaa 41221070  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 455 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 50409208 - 50408952
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
50409208 attatgtcaactaataataatatatagtacgttggcgtattttttcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa 50409109  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatat---------acaaaattaagatgatannnnnnnc 644  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||            
50409108 ttagtataagtataaattcaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttatatatttcaaaatatatacaatattaacaaaattaagatgatatttttttt 50409009  T
645 catatcaaatttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaat 707  Q
    |||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
50409008 catatcaaatt------taaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaat 50408952  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 455 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 10230879 - 10230695
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
10230879 attatgtcaacaaattataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctatgtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa 10230780  T
555 ttagt-taagt---ataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    ||||| ||| |   |||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10230779 ttagtataaatataataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaa-gtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 10230695  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 455 - 632
Target Start/End: Original strand, 15329746 - 15329926
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||    
15329746 attatgtcaacaaataataatatacagtacctcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttgacaaggagtacatcttatactacaaataa 15329845  T
555 ttagt-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat 632  Q
    |||||  |||||||  |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15329846 ttagtacaagtataacaatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat 15329926  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Original strand, 10970080 - 10970338
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
10970080 attatgtcaacaagtaataatatacagtatgtcgacgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaagaatgactacatcttatactacaaataa 10970179  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaat---------taagatgatannnnnnnc 644  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||       |    
10970180 ttagtataactataactccaaatactttaatcgttgtgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaataaacaaaattaagatgatatttttt-c 10970278  T
645 catatcaaatttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    |||||||||||||      ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
10970279 catatcaaattta------aattataaccatacttataactttaagataacataatataaaatcta 10970338  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2622506 - 2622265
Alignment:
9 ttgtggttatgaagtttctcctacattgatgcagatgttttagatcattagtattgataggagaaaaccgaaaaccac--aaaaaggatactgaaatatg 106  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
2622506 ttgtgattatgaagtgtctcctacattgacgcagatgttttagatcattagtactcataggagaaaaccgaaaaccacataaaaaggatacggaaatatg 2622407  T
107 gtgacatatcataataatattaacatcaaaataaaagtcagacaaagtaa--aaagtgcaactatatatgtgattaatgaaaaaataaagtgttagaat- 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||| ||||  |||  | || |||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||     
2622406 gtgacatatcatcataatattaaggtcagaatagaagtcacacaacataaagatagggcaactatatatgtgattaatgaacagatacaatgttagaatt 2622307  T
204 --ctaagatacatactggtagccaaatgcaggaaattgctac 243  Q
        ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
2622306 caacaagatacataccggtagccaaatgcaggaaatcgctac 2622265  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 10037679 - 10037432
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
10037679 tgtcaacaaatattattatacagtacgtcagcatatttttgcaaaaatattacatatgctatgtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 10037580  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt 655  Q
    |  |||||||  |||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| ||||    
10037579 tacaagtatagtaatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttggatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttt-aatatcgaatt 10037481  T
656 tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
10037480 ------taaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatcta 10037432  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 11361293 - 11361046
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
11361293 tgtcaacaaatattattatacagtacgtcgacgtatttttgcaaaaatattacgtatgttaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 11361194  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt 655  Q
    |  || ||||  |||||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||||||    
11361193 tacaaatataataatccaaatacttttatggttatatgcaatgtttagatatttcaaattatatacaaaattaagatgatattttttt-catatcaaatt 11361095  T
656 tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
11361094 ------taaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatcta 11361046  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 11367682 - 11367435
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
11367682 tgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcatatttttgcaaaaatattacatatgctaagtataacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 11367583  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt 655  Q
    |  |||||||  |||||||||| |||||||  ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||    
11367582 tacaagtataataatccaaataatttaatcgatatatgcaaagtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttt-catatcgaatt 11367484  T
656 tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
          ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
11367483 ------taaattataacgacaattataactttaagataacataatataaaatcta 11367435  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 10109015 - 10108835
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
10109015 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcgacgtatttttgcaataaaattacatatgctaagtttaaaaatgagtgcatcttatactacaaataattag 10108916  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |  |||||||  |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10108915 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 10108835  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 491 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 10041078 - 10040930
Alignment:
491 gtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaata-attagttaagtataaatccaaatactttaatcatta 589  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||||||| |||    
10041078 gtatttttgccaaaatattacatatgctaagtttaacaataagtacatcttatactacagatatattttataagtataaatccaaatactttaatcctta 10040979  T
590 tgtggaatgtttag--atatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
10040978 tgtgcaatgtttagacatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 10040930  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 494 - 710
Target Start/End: Original strand, 41764585 - 41764798
Alignment:
494 tttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt-taagtata--aatccaaatactttaatcattat 590  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||| ||||    
41764585 tttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatacaacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttat 41764684  T
591 gtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatttactaataaattataaccacatttataac-tttaa 689  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||      ||||||||||||||| ||||||| |||||    
41764685 atacaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttt-catatcgaatt------taaattataaccacaattataacttttaa 41764777  T
690 gataatataatataaaatcta 710  Q
    ||||| |||||||||||||||    
41764778 gataacataatataaaatcta 41764798  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 10230256 - 10230074
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaa--aaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataatt 556  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
10230256 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcgacgtatttttgcaagaaaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataatt 10230157  T
557 agtt-aagtataa--atccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |||  ||||||||  ||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10230156 agtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 10230074  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 455 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 52917794 - 52917633
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||    
52917794 attatgtcaacaagtaataata-acagtacgtaaacgtttttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaagaatgactaaatcttatactacaaataa 52917696  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaata 616  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||    
52917695 ttagtataagtataactccaaatactttaatcgttatgtccaatgtttagatattttaaaata 52917633  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 459 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 31847 - 31675
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
31847 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgaaagaaaattacatatgctaagtttaacaataagtgcatcttatactacaaataattag 31748  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaatta 628  Q
    |  |||||||  |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31747 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaatta 31675  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 459 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 23092579 - 23092403
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
23092579 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagattaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 23092480  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat 632  Q
    |  |||||||  |||||||||| ||| ||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
23092479 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcagtgtttagatatttcaaaatatatacaaaaataagat 23092403  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 27273441 - 27273261
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||    
27273441 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatactaagtttaacaatgaatgtatcttatactacaaataattag 27273342  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |  |||||||  |||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
27273341 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatataaaattaagatgata 27273261  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 459 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 10233849 - 10233673
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || || |||||  |||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||     
10233849 tgtcaacaaatattattacacagtccgtcgacgtatttttgcaagaaaattgcatatgctaagtttaacaatgattgcatcttatactacaaataattat 10233750  T
559 tt-aagtataa--atccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat 632  Q
    |  ||||||||  ||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10233749 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat 10233673  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 662 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 46912196 - 46912151
Alignment:
662 taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaat 707  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
46912196 taaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaat 46912151  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 52916802 - 52916754
Alignment:
662 taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
52916802 taaattataaccacacttataaatttaagataacataatataaaatcta 52916754  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 10040909 - 10040861
Alignment:
662 taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||    
10040909 taaattataaccacacttataattgtaagataacataatataaaatcta 10040861  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 10109435 - 10109387
Alignment:
662 taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
10109435 taaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatcta 10109387  T

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Target: scaffold0888 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Original strand, 905 - 1154
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
905 attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaatgtattacatatgctaagtttcacaatgagtacatcttatactacaaataa 1004  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaa 653  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||    
1005 ttagtataagtataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata-ttttttccatatcaaa 1103  T
654 tttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
1104 tt------taaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatcta 1154  T

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Target: chr1 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Original strand, 48239969 - 48240219
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
48239969 attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa 48240068  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaa 653  Q
    ||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| |||    
48240069 ttaatataagtataaatccaaatagtttaatcgttatgtgcaatgtttatatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttccatataaaa 48240168  T
654 tttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||      |||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
48240169 tt------taaattataatcacacttataactttaagataacacaatataaaatcta 48240219  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 28961111 - 28960863
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
28961111 attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcagcgtatttttgcaaaaatattacatatattaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa 28961012  T
555 ttagttaagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaat 654  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||    
28961011 ttagttaagtataaatccaaatactttaatcgttatttgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata-ttttttccatatcaaat 28960913  T
655 ttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    |      | ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
28960912 t------tcaattataagtacacttataactttaagataacataatataaaatcta 28960863  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 455 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 7102009 - 7101827
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
7102009 attatgtcaacaaataataatatacaatacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacgtcttatactacaaataa 7101910  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
7101909 ttagtataagtataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaattatatacaaaattaagatgata 7101827  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 455 - 635
Target Start/End: Original strand, 2453932 - 2454113
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||    
2453932 attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttatcaatgagtgcatcttatactacaaataa 2454031  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat 635  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
2454032 ttagtataagtataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttaaatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat 2454113  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 36206257 - 36206008
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||  ||||||||    
36206257 attatgttaacaaataataatatacaatacgtcagagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaataggtacatcatatatgacaaataa 36206158  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaa 653  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||||    
36206157 ttagtataagtataaatctaaatactttaatcattatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaaaatgatattttttt-catatcaaa 36206059  T
654 tttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||      ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
36206058 tt------taaattatagctacatttataactttaagataatacaatataaaatcta 36206008  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 456 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 16043402 - 16043153
Alignment:
456 ttatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataat 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
16043402 ttatgtcaacaaataataatatacaatacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgttaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataat 16043303  T
556 tagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaat 654  Q
    || | ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||       | |||||||||    
16043302 taatataagtttaaatccaaatactttgatcgttatgtgcaatggttacatatttcaaaatatagacaaaattaagatgatatttttttctatatcaaat 16043203  T
655 ttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    |       ||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||    
16043202 t------gaaattataatcacacttttaactttaaaataacataatataaaatcta 16043153  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Original strand, 25075039 - 25075285
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
25075039 tgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactac-aataattag 25075137  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt 655  Q
    |  |||||||  |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||| ||||    
25075138 tacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttt-cttatcgaatt 25075236  T
656 tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
          |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
25075237 ------taaattataatcacaattataactttaagataacataatataaaatcta 25075285  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Original strand, 48776510 - 48776757
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||     
48776510 tgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttataatacaaataattaa 48776609  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt 655  Q
    |  |||||||  ||  ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||| ||||    
48776610 tacaagtataataaaacaaatactttaatcgatatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaaaatgatattttttt-catatcgaatt 48776708  T
656 tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
          ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
48776709 ------taaattataaccacaattataactttaagataatataatataaaatcta 48776757  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 16041061 - 16040815
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
16041061 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtaattttgcaaaaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 16040962  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt 655  Q
    |  |||||||  |||||| ||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||| | |     
16040961 tacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatataaaattaagatgatattttttt-catatcgatt- 16040864  T
656 tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
16040863 ------taaattataaccacagttataactttaagataacataatataaaatcta 16040815  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Original strand, 16748848 - 16749095
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || ||  | ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
16748848 tgtcaacaaatattattacgcagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaataatgagtgcatcttatactacaaataattag 16748947  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt 655  Q
    |  |||||||  |||||||||| ||| ||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||        |||||| ||||    
16748948 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatattcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaaaattatattttttt-catatcgaatt 16749046  T
656 tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
16749047 ------taaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatcta 16749095  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 18147725 - 18147545
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || |||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
18147725 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcatatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 18147626  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |  |||||||  |||||||||| ||| |||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18147625 tacaagtataataatccaaatatttttatcgctatgtgcaatgcttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 18147545  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 37391328 - 37391507
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
37391328 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaaaattacatatgctaagtttaacaatgaatgcatcttatactacaaataattag 37391427  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |  |||||||  |||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
37391428 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatata-aaaattaagatgata 37391507  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 52499768 - 52499588
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||||    
52499768 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgaatgcatcttatactataaataattag 52499669  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |  |||||||  |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
52499668 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 52499588  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 36518975 - 36518795
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||    
36518975 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaaccatgaatgcatcttatactacaaataattag 36518876  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |  |||||||  |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
36518875 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaaaatgata 36518795  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 459 - 635
Target Start/End: Original strand, 6312175 - 6312354
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
6312175 tgtcaacaaatattattacacggtacgtcggcatatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgcgtgcatcttatactacaaataattag 6312274  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat 635  Q
    |  || ||||  |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
6312275 tacaaatataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattatgatgat 6312354  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 501 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 12450961 - 12450841
Alignment:
501 aaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgt 599  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||         |||| ||| |||||||||    
12450961 aaaagtattacatatgctaagtttaaaaatgaatacatcttatactacaaataattagtataagtataaatcc---------aatcgttacgtggaatgt 12450871  T
600 ttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
12450870 ttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 12450841  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9325388 - 9325336
Alignment:
193 agtgttagaatctaagatacatactggtagccaaatgcaggaaattgctacta 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
9325388 agtgttagaatctaagaaacataatggtagccaaatgcagaaaattactacta 9325336  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 12450805 - 12450757
Alignment:
662 taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
12450805 taaattatagccacacttataactttaagataacataatataaaatcta 12450757  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 148; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Original strand, 98000 - 98257
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
98000 attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacgtcttatactacaaataa 98099  T
555 ttagttaagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatat---------acaaaattaagatgatannnnnnncc 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||       ||    
98100 ttagttaagtataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaattaagatgata-ttttttcc 98198  T
646 atatcaaatttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
98199 atatcaaatt------taaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatcta 98257  T

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Target: chr6 (Bit Score: 146; Significance: 2e-76; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Original strand, 4221186 - 4221445
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
4221186 attatgtcaacaaataataatatacagtatgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacattttatactacaaataa 4221285  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaat---------taagatgatannnnnnnc 644  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||       |    
4221286 ttagtataagtataaatacaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaactaagatgatatttttttc 4221385  T
645 catatcaaatttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    |||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
4221386 catatcaaatt------taaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatcta 4221445  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 455 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 10186593 - 10186342
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtattttt-gcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaata 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
10186593 attatgtcaacaaataataatatacagtacttcggcgtattttttgcaaaaatattacatatgttaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaata 10186494  T
554 attagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaatt---aagatgatannnnnnnccatat 649  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||       ||||||    
10186493 attagtataagtataaatccaaatattttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaagatgatatttttttccatat 10186394  T
650 caaatttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaat 707  Q
    ||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
10186393 caaatt------taaattataaccacagttataactttaagataacataatataaaat 10186342  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 456 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 12518653 - 12518404
Alignment:
456 ttatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataat 555  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
12518653 ttatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataat 12518554  T
556 tagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaat 654  Q
    || | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||       | |||| ||||    
12518553 taatataagtataaatccaaatactttgatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatttatacaaaattaggatgatatttttttctatattaaat 12518454  T
655 ttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    |      |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
12518453 t------taaattataatcacacttttaactttaagataacataatataaaatcta 12518404  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 15330575 - 15330329
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
15330575 tgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatactaagtttaacaatgagtgcattttatactacaaataattag 15330476  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt 655  Q
    |  |||||||  |||||||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||    
15330475 tacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttaaatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttt--catatccaatt 15330378  T
656 tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
15330377 ------taaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatcta 15330329  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 30881102 - 30880927
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||    
30881102 attatgtcaacaaataataatatacagtacgtccgcgtatttttgcaaaaatattgcatatgctaagtttaacaataattacatcttatactacaaataa 30881003  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 629  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
30881002 ttagtataagtataaatccaaatactttaatcgttatatgcaatgtttagatatttttaaatatatacaaaattaa 30880927  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 12516424 - 12516176
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
12516424 tgtcaacaaatattattttacagtacgtcggcgtatttctgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 12516325  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt 655  Q
    |  |||||||  |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||    
12516324 tacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttttcatatcgaatt 12516225  T
656 tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
          |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
12516224 ------taaattataaacacaattataactttaagatatcataatataaaatcta 12516176  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 465 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 14906527 - 14906355
Alignment:
465 caaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaata---attagtta 561  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||  ||||||||||||   ||||  ||    
14906527 caaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatactgagttgaacaatgagtacattacatactacaaatatacatta--ta 14906430  T
562 agtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
14906429 agtatagatccaaatactttaatcattatgtgcaatatttagatatttcaaaatatttacagaattaagaagata 14906355  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 31512675 - 31512855
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
31512675 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 31512774  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |  |||||||  |||||||||| ||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31512775 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaacgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 31512855  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 459 - 632
Target Start/End: Original strand, 29642537 - 29642713
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
29642537 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 29642636  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat 632  Q
    |  |||||||  |||||||||| ||| ||| || | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29642637 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttgtatgcaacgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat 29642713  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 24195938 - 24195691
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||| |||||     
24195938 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagttttacaatgagtgcatcttatactacaaaaaattaa 24195839  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt 655  Q
    |  |||||||  |||| ||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        |||||| ||||    
24195838 tacaagtataataatcaaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagattatattgtttt-catatcgaatt 24195740  T
656 tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
24195739 ------taaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatcta 24195691  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 662 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 14906336 - 14906291
Alignment:
662 taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaat 707  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
14906336 taaattacaatcacatttataactttaagataacataatataaaat 14906291  T

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Target: chr7 (Bit Score: 143; Significance: 1e-74; HSPs: 11)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Original strand, 21071232 - 21071486
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
21071232 attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatattatactacaaataa 21071331  T
555 ttagt-taagt---ataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata-nnnnnnnccatat 649  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
21071332 ttagtataagtataataaatccaaatactttaatcgttgtgtacaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttttccatat 21071431  T
650 caaatttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||||||      ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
21071432 caaatt------taaattataacaacacttataactttaagataacataatataaaatcta 21071486  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 22843578 - 22843403
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
22843578 attatgtcaacaaataataatatacagtacgtccgcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgattacatcttatactacaaataa 22843479  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 629  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
22843478 ttagtataaatataaatccaaatactttagtcgttatgtgcaatgtttagatatttttaaatatatacaaaattaa 22843403  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Original strand, 45122536 - 45122782
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
45122536 tgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatattacaaataattag 45122635  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt 655  Q
    |  |||||||  ||| |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||    
45122636 tacaagtataataattcaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttt--catatcgaatt 45122733  T
656 tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
          ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
45122734 ------taaattataaccacaattataactttaagataatataatataaaatcta 45122782  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 456 - 629
Target Start/End: Original strand, 5829713 - 5829890
Alignment:
456 ttatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataat 555  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
5829713 ttatgtcaacaaataataatatacagtacgttggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacgtcttatacgacaaataat 5829812  T
556 tagt-taagta---taaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 629  Q
    |||| ||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
5829813 tagtataagtatagtaaatcaaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatttacaaaattaa 5829890  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 724 - 833
Target Start/End: Original strand, 531518 - 531627
Alignment:
724 tcattctggtcaacctgtcatgcctgggttttcttcatctactggccattctatgcagccacctttttcttctcaaggtggtcaatctactgcacaaaca 823  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
531518 tcattctggtcaacctgtcatgcctgggttttcgtcatctactggccattctatgcagccacctttttcttctcaaggtggtcaatctactgcacaaaca 531617  T
824 agtgatcata 833  Q
    ||||||||||    
531618 agtgatcata 531627  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 42231191 - 42231011
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||||    
42231191 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgaatgcatcttatactaaaaataattag 42231092  T
559 tt-aagtataa--atccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |  ||||||||  ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
42231091 tacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 42231011  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 462 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 7035738 - 7035561
Alignment:
462 caacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt-t 560  Q
    ||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||      
7035738 caacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaattttaacaatgaatgcatcttatactacaaataattagtac 7035639  T
561 aagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |||||||  |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7035638 aagtataataatccaaatatttttatcgttatatgaaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 7035561  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 9002305 - 9002485
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
9002305 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcgtcttatttttgcaataatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaaaaattag 9002404  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |  |||||||  ||| |||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9002405 tacaagtataataattcaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 9002485  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 724 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 632860 - 632759
Alignment:
724 tcattctggtcaacctgtcatgcctgggttttcttcatctactggccattctatgcagccacctttttcttctcaaggtggtcaatctactgcacaaaca 823  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
632860 tcattctggtcaacctggcatgcctgggttttcgtcatctactggacattctatgcagccaccttttgcttctcaaggcggtcaatctactgcacaaaca 632761  T
824 ag 825  Q
    ||    
632760 ag 632759  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 12787166 - 12787346
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||| |     
12787166 tgtcaacaaatattattacacagtaagtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgaatcttatactacaaataataaa 12787265  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |  |||||||  |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12787266 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 12787346  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Original strand, 5829927 - 5829975
Alignment:
662 taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
5829927 taaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatcta 5829975  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 141; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 125265 - 125007
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
125265 attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgttaagcttaacaatgagtacatcttatactacaaataa 125166  T
555 ttagttaagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaa---------ttaagatgatannnnnnncc 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||       ||    
125165 ttagttaagtataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaatgtttagatattgcaaaatatatacaaaattaacaagattaagatgatatttttttcc 125066  T
646 atatcaaatttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
125065 atatcaaatt------taaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatcta 125007  T

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Target: chr5 (Bit Score: 140; Significance: 7e-73; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 456 - 710
Target Start/End: Original strand, 15033760 - 15034009
Alignment:
456 ttatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataat 555  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
15033760 ttatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttataatacaaataat 15033859  T
556 tagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaat 654  Q
    || | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |       | |||||||||    
15033860 taatataagtataaatccaaatactttgatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatattcaaaattaagatgaaatttttttcaatatcaaat 15033959  T
655 ttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    |      |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
15033960 t------taaattataatcacacttttaactttaagataacataatataaaatcta 15034009  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 6088256 - 6088007
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
6088256 attatgtcaacaaataataatatacaatacgtcggcgtatttttgtaaaa-tattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa 6088158  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata-nnnnnnnccatatcaa 652  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||| ||    
6088157 ttagtataagtataaattcaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaactatatacaaaattaagatgatattttttttccatattaa 6088058  T
653 atttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    |||      |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
6088057 att------taaattataaccacatttataactttaa-ataacataatataaaatcta 6088007  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Original strand, 14194052 - 14194227
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
14194052 attatttcaacaaataatgatatacagtacgtcggcgtatttttacaaaaatattacatatgctaagtttatcaatgggtacatcttatactacaaataa 14194151  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 629  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
14194152 ttagtataagtataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 14194227  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 26831676 - 26831498
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
26831676 attatgtcaacaaattataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa 26831577  T
555 ttagt-taagt---ataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 629  Q
    ||||| ||| |   |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26831576 ttagtataaatataataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 26831498  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 18115846 - 18115597
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaata- 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    ||||||||||||||     
18115846 attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcatatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagcaaccgttatactacaaatat 18115747  T
554 attagttaagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaa 653  Q
    |||   | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||    
18115746 attttatgattataaatccaaatactttaatcattaagtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata-ttttttccatgtcaaa 18115648  T
654 tttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||      ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
18115647 tt------taaattaaaaccacacttataactttaagataacataatataaaatcta 18115597  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Original strand, 2262168 - 2262429
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacg---tcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaa 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
2262168 attatgtcaacaaataataatatacagtacgacgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgttaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaa 2262267  T
552 taa-ttagttaagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatat---------acaaaattaagatgatannnnn 641  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||         
2262268 taatttagttaagtataaattcaaatactttaatcgttatctgcaatgtttagatatttcaaaatatatataaaattaacaaaattaagatgata-tttt 2262366  T
642 nnccatatcaaatttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
      ||||||||||||      ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
2262367 ttccatatcaaatt------taaattataaccatacttataactttaagataacataatataaaatcta 2262429  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Original strand, 17872080 - 17872255
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||    
17872080 attatgtcaacaaataataatatacagtacgtccgcgtatttttgcaaaaatattgcatatgctaagtttaacaataattacatcttatactacaaataa 17872179  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 629  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
17872180 ttagtataagtataaatccaaatactttaatcgttatatgcaatgtttagatatttttaaatatatacaaaattaa 17872255  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Original strand, 43525060 - 43525309
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaata- 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  | ||||||||||||||     
43525060 attatgtcaacaaataataatatagagtacgtcgacacatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagcaactgttatactacaaatat 43525159  T
554 attagttaagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaa 653  Q
    |||   | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||  ||||    
43525160 attttatgattataaatccaaatactttaatcattatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata-ttttttccatgacaaa 43525258  T
654 tttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||      ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
43525259 tt------taaattaaaaccacacttataactttaagataacataatataaaatcta 43525309  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Original strand, 25543920 - 25544174
Alignment:
455 attatgtcaacaaata---ataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaa 551  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
25543920 attatgtcaacaaataataataatatacagtacatcggcttatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaa 25544019  T
552 taattagt-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccata 648  Q
    ||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||    
25544020 taattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcgatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttt-cata 25544118  T
649 tcaaatttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
     | ||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
25544119 acgaatt------taaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatcta 25544174  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 4050842 - 4050596
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
4050842 tgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactac-aataattag 4050744  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt 655  Q
    |  |||||||  |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||| ||||    
4050743 tacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttt-cttatcgaatt 4050645  T
656 tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
          |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
4050644 ------taaattataaacacaattataactttaagataacataatataaaatcta 4050596  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 459 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 30313419 - 30313240
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| | ||||||||||||    
30313419 tgtcaacaaatattattatacagtacatcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatgcgacaaataattag 30313320  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat 635  Q
    |  |||||||  |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30313319 tacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat 30313240  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 43448517 - 43448270
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
43448517 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggtgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 43448418  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt 655  Q
    |  |||||||  |||||||||| ||| ||| |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||        |||||| ||||    
43448417 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttaaatttttcaaaatatatacaaaattaagattatattgtttt-catatcgaatt 43448319  T
656 tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
43448318 ------taaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatcta 43448270  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 10024168 - 10023988
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||    
10024168 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgaatgcatcttatactacaaataattag 10024069  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |  |||||||  |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10024068 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 10023988  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 37260354 - 37260185
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
37260354 tgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcatatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 37260255  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatat-ttcaaaatatatacaaa 624  Q
    |  |||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||    
37260254 tacaagtataataatccaaatacttttatcattatatgcaatgtttagatatatacaaaatatatacaaa 37260185  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 8429759 - 8429939
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
8429759 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcgacgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcattttatgctacaaataattag 8429858  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |  |||||||  |||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
8429859 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaatgaagatgata 8429939  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 24630984 - 24631164
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||||    
24630984 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgaatgcatcttatactataaataattag 24631083  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |  |||||||  |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24631084 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 24631164  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 30347664 - 30347844
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| | ||  |||||||| ||||||||||    
30347664 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgcgaagtttaacaatgaatgcaccttatactataaataattag 30347763  T
559 tt-aagtataa--atccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |  ||||||||  ||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30347764 tacaagtataataatccaaatatttttatcattatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 30347844  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 461 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 27880121 - 27879942
Alignment:
461 tcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt- 559  Q
    |||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||     
27880121 tcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaagttacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattagta 27880022  T
560 taagtata--aatcc-aaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
     |||||||  ||||| ||||| ||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27880021 caagtataataatccaaaatatttttatcgttatatggaatttttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 27879942  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 459 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 3688982 - 3688820
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
3688982 tgtcaacaaatattattatacagtacgtcgacgtatttttgcaaaaatattacgtatgttaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataattag 3688883  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatata 618  Q
    |  |||||||  |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||    
3688882 tacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaattata 3688820  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 459 - 618
Target Start/End: Original strand, 3877803 - 3877965
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
3877803 tgtcaacaaatattattatacagtacgtcgacgtatttttgcaaaaatattacgtatgttaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataattag 3877902  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatata 618  Q
    |  |||||||  |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||    
3877903 tacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaattata 3877965  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 26792847 - 26792667
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||  ||||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
26792847 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcgacgtatttttaaaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatacaacaaataattag 26792748  T
559 tt-aagtataa--atccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |  ||||||||  ||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26792747 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 26792667  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 481 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 37371941 - 37371770
Alignment:
481 gtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt-taagtata--aatccaaa-- 575  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||      
37371941 gtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattagtacaagtataataatccaaata 37371842  T
576 --tacttta---------atcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
      || ||||         |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
37371841 attagtttaacattgcatatcattatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 37371770  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 459 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 39882220 - 39882072
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
39882220 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcgacgtatttttgcaaaaaaattacatatgctaattttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 39882121  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttaga 604  Q
    |  |||||||  |||||| ||| ||| ||| |||| || ||||||||||    
39882120 tacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttaga 39882072  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Original strand, 14194265 - 14194313
Alignment:
662 taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
14194265 taaattataactacacttataactttaagataacataatataaaatcta 14194313  T

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Target: chr8 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 14713320 - 14713061
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
14713320 attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaataagtacatcttatactacaaataa 14713221  T
555 -ttagttaagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatat---------acaaaattaagatgatannnnnnnc 644  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||       |    
14713220 tttagttaaatataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaattaagatgatatttttttc 14713121  T
645 catatcaaatttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    |||||||||||      ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
14713120 catatcaaatt------taaattataaccatacttataactttaagataacataatataaaatcta 14713061  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 13424671 - 13424496
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||    
13424671 attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttatcaatgagttcatcttatactacaaataa 13424572  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 629  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13424571 ttagtataagtataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 13424496  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 455 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 14764667 - 14764490
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
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14764667 attatgtcaacaaataataatatacagtacctcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttgacaaggagtacatcttatactacaaataa 14764568  T
555 ttagttaagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat 632  Q
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14764567 tta--caagtataacaatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat 14764490  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Original strand, 31979707 - 31979954
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
31979707 tgtcaacaaatattattatacagtaagtcggcgtatttttgcaaaaatataacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 31979806  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt 655  Q
    |  |||||||  |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||        ||| |||||||    
31979807 tacaagtataataatccaaatactttgatcgttatatgcaatgtttagctattttgaaatatatacaaaattaagattatattttttt-catttcaaatt 31979905  T
656 tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
31979906 ------taaattataaccacaattataactttaagataacataatatataatcta 31979954  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 481 - 636
Target Start/End: Original strand, 25219774 - 25219932
Alignment:
481 gtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt-taagtata--aatccaaata 577  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
25219774 gtacgtcggcgtatttttgcaaaaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgaatcttatactacaaataattagtacaagtataataatccaaata 25219873  T
578 ctttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
     ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
25219874 tttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 25219932  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 7780781 - 7780601
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||| ||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
7780781 tgtcaataaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatactaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 7780682  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |  |||||||  |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7780681 taaaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 7780601  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 7820871 - 7820691
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||| ||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
7820871 tgtcaataaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatactaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 7820772  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
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7820771 taaaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 7820691  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Original strand, 21114858 - 21115106
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || ||  |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
21114858 tgtcaacaaatattattacacaatacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 21114957  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatac-aaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaat 654  Q
    | || |||||  |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||        |||||| |||    
21114958 tataggtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaaattaagattatatattttt-catatcgaat 21115056  T
655 ttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    |      ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
21115057 t------taaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatcta 21115106  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 514 - 710
Target Start/End: Original strand, 37915275 - 37915468
Alignment:
514 atgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagtt-aagtataa--atccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttc 610  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||| |||| |  ||||||||||||||||    
37915275 atgctaagtttaacaatgagtgcatcttatacaacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatacaatgtttagatatttc 37915374  T
611 aaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatttactaataaattataaccacatttataac-tttaagataatataatataaaatct 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||      ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
37915375 aaaatatatacaaaattaagatgatattttttt-catatcgaatt------taaattataaccacaattataacttttaagataacataatataaaatct 37915467  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 494 - 612
Target Start/End: Original strand, 33862603 - 33862724
Alignment:
494 tttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt-taagtata--aatccaaatactttaatcattat 590  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||| ||||    
33862603 tttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatacaacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttat 33862702  T
591 gtggaatgtttagatatttcaa 612  Q
     |  ||||||||||||||||||    
33862703 atacaatgtttagatatttcaa 33862724  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 459 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 30306206 - 30306106
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
30306206 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcagcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 30306107  T
559 t 559  Q
    |    
30306106 t 30306106  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 567 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 30306069 - 30306000
Alignment:
567 aaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30306069 aaatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 30306000  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 13424460 - 13424412
Alignment:
662 taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
13424460 taaattataaccacacttttaactttaagataacataatataaaatcta 13424412  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Original strand, 33863123 - 33863172
Alignment:
662 taaattataaccacatttataac-tttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
33863123 taaattataaccacaattataacttttaagataacataatataaaatcta 33863172  T

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Target: chr2 (Bit Score: 137; Significance: 4e-71; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 455 - 709
Target Start/End: Original strand, 2881653 - 2881911
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
2881653 attatgtcaacaaataataatatacagtatgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacattttatactacaaataa 2881752  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatat---------acaaaattaagatgatannnnnnnc 644  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||       |    
2881753 ttagtataagtataaattcaaatactttaattgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaattaagatgatatttttttc 2881852  T
645 catatcaaatttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatct 709  Q
    |||||||||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
2881853 catatcaaatt------taaattataaccacacttataactttaagataacacaatataaaatct 2881911  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 24244910 - 24244735
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
24244910 attatgtcaacaaataataatacacagtacctcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatattttatactacaaataa 24244811  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 629  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24244810 ttagtataagtataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 24244735  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 455 - 707
Target Start/End: Original strand, 17687530 - 17687779
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
17687530 attatatcaacaaataataatatacagtacttcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgttaagtttaacaatgagtacatcttatagtacaaataa 17687629  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaatt---aagatgatannnnnnnccatatc 650  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||       |||||||    
17687630 ttagtataagtataaatcc-aatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaagatgatatttttttccatatc 17687728  T
651 aaatttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaat 707  Q
    |||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
17687729 aaatt------taaattataaccacagttataactttaagataacataatataaaat 17687779  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 3642107 - 3641932
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
3642107 attatgttaacaaataataatatacagtacgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa 3642008  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 629  Q
    ||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
3642007 ttaatataagaataaatctaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttggatatttcaaaatatatacaaaattaa 3641932  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 27508420 - 27508245
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
27508420 attatgtcaacaaataataatatacaatacgtcggcatatttttgcaaaaatattacatatgttaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa 27508321  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 629  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
27508320 ttagtataagtataaattcaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattaa 27508245  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Original strand, 40488869 - 40489047
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
40488869 attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgttaagtttaacaatgagtatatcttatactacaaataa 40488968  T
555 ttagt-taagt---ataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 629  Q
    ||||| |||||   ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
40488969 ttagtataagtataataaatctaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttaaaaatatatacaaaattaa 40489047  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 39441854 - 39442033
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
39441854 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaa-attacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacatataattag 39441952  T
559 tt-aagtataa--atccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
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39441953 tacaagtataatgatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 39442033  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 455 - 570
Target Start/End: Original strand, 2868545 - 2868661
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
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2868545 attatgtcaacaaataataatatacagtatgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacattttatactacaaataa 2868644  T
555 ttagt-taagtataaat 570  Q
    ||||| |||||||||||    
2868645 ttagtataagtataaat 2868661  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 454 - 636
Target Start/End: Original strand, 36047873 - 36048058
Alignment:
454 tattatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaata 553  Q
    |||| |||||||||||| || || || |||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||    
36047873 tattttgtcaacaaatattattacacagtacgttggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgactcttatactacaaata 36047972  T
554 attagt-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    ||||||  |||||||  |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
36047973 attagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 36048058  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 28667360 - 28667541
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||    
28667360 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatgctacaaataatcag 28667459  T
559 t-taagtata--aatccaaata-ctttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |  |||||||  ||||||||||  ||| ||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
28667460 tacaagtataataatccaaatattttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaatgaagatgata 28667541  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 37826194 - 37826375
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||    
37826194 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatgctacaaataatcag 37826293  T
559 t-taagtata--aatccaaata-ctttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |  |||||||  ||||||||||  ||| ||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
37826294 tacaagtataataatccaaatattttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaatgaagatgata 37826375  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 509 - 710
Target Start/End: Original strand, 24270184 - 24270381
Alignment:
509 tacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagat 605  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||    
24270184 tacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattagtacaggtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagat 24270283  T
606 atttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaa 705  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||        |||||| ||||      ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
24270284 atttcaaaatatatacaaaattaagattatatattttt-catatcgaatt------taaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaa 24270376  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 461 - 636
Target Start/End: Original strand, 41921359 - 41921538
Alignment:
461 tcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt- 559  Q
    |||||||||| || || || ||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||     
41921359 tcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttacaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatgctacaaataattagta 41921458  T
560 taagtata--aatccaaata-ctttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
     |||||||  ||||||||||  ||| ||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
41921459 caagtataataatccaaatattttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaatgaagatgata 41921538  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 560 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 35608831 - 35608690
Alignment:
560 taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatttact 659  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| |||||        
35608831 taagtataaatccagatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatcttttttttcatatgaaatt---- 35608736  T
660 aataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaat 707  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
35608735 --taaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaat 35608690  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 459 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 21394401 - 21394225
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
21394401 tgtcaacaaatattattacacagtacatcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagattaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 21394302  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat 632  Q
    |  |||||||  |||| ||||| ||| ||| |||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
21394301 tacaagtataataatctaaatatttttatcgttatatgcagtgtttagatattttaaaatatatacaaaaataagat 21394225  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 517 - 636
Target Start/End: Original strand, 26955164 - 26955286
Alignment:
517 ctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagtt-aagtataa--atccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaa 613  Q
    |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||    
26955164 ctaagtttaacaatgaatgcatcttatactacaaataattagtacaagtataataatctaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaa 26955263  T
614 atatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |||||||||||||||||||||||    
26955264 atatatacaaaattaagatgata 26955286  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 3641897 - 3641849
Alignment:
662 taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
3641897 taaattataaccacacttataactttaagataacacaatataaaatcta 3641849  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 455 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 35608888 - 35608837
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaat 506  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
35608888 attatttcaacaaataatgatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaat 35608837  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 24244703 - 24244656
Alignment:
662 taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
24244703 taaattataaccacacttataa-tttaagataacataatataaaatcta 24244656  T

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Target: scaffold1424 (Bit Score: 130; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 729 - 461
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
729 attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatactacaaataa 630  T
555 ttagt-taagt---ataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatat---------acaaaattaagatgatannnnn 641  Q
    ||||| |||||   |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||         
629 ttagtataagtataataaattcaaatacttcaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaacaaaattaagatgatatgttt 530  T
642 nnccatatcaaatttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
      ||||||||||||||    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
529 ttccatatcaaatttaaatttaaattataacaacacttataactttaagataacataatataaaatcta 461  T

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Target: scaffold0262 (Bit Score: 130; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 18052 - 17800
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
18052 attatgtcaataaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgaatacatcttatactacaaataa 17953  T
555 ttagt-taagt---ataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatc 650  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
17952 ttagtataagtataataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttaaatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttt-catatc 17854  T
651 aaatttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    |||||       |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
17853 aaatt------aaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatcta 17800  T

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Target: scaffold0025 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 455 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 13532 - 13351
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
13532 attatgttaacaaataataatatacagtacgtcggcttatttttgcaaaaatattac-tatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa 13434  T
555 ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13433 ttagtataagtataaatccaaatattttaatcgttacgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 13351  T

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Target: scaffold0134 (Bit Score: 125; Significance: 6e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Original strand, 6410 - 6588
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
6410 attatgtcaacaaataataatatacagtacatcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa 6509  T
555 ttagt-taagt---ataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 629  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
6510 ttagtataagtataataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatataaaattaa 6588  T

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Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Original strand, 6623 - 6671
Alignment:
662 taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
6623 taaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatcta 6671  T

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Target: scaffold0073 (Bit Score: 112; Significance: 4e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 23630 - 23383
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
23630 tgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatattacaaataattag 23531  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt 655  Q
    |  |||||||  |||||||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| | ||    
23530 tacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttatatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttt-catatcgagtt 23432  T
656 tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
23431 ------taaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatcta 23383  T

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Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 18495 - 18248
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
18495 tgtcaacaaatattattatacagtaagtcggcgtatttttgcaaaaatataacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 18396  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt 655  Q
    |  |||||||  |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||        ||| |||||||    
18395 tacaagtataataatccaaatactttgatcgttatatgcaatgtttagctattttgaaatatatacaaaattaagattatattttttt-catttcaaatt 18297  T
656 tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
18296 ------taaattataaccacaattataactttaagataacataatatataatcta 18248  T

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Target: scaffold0499 (Bit Score: 110; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 10182 - 10002
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
10182 tgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtataacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 10083  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |  |||||||  |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10082 tacaagtataataatccaaatactttcatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 10002  T

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Target: scaffold1370 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1370
Description:

Target: scaffold1370; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 482 - 710
Target Start/End: Original strand, 1375 - 1598
Alignment:
482 tacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaata-attagttaagtataaatccaaatactt 580  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||    
1375 tacgtcggcgtatttttgccaaaatattacatatgctaagtttaacaataagtacatcttatactacaaatatattttataagtataaatccaaatactt 1474  T
581 taatcattatgtggaatgtttag--atatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatttactaataaattataaccacatt 678  Q
    ||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| |||||||      ||||||||||||||| |    
1475 taatctttatgtgcaatgtttagatatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttt--catgtcaaatt------taaattataaccacact 1566  T
679 tataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    
1567 tataactttaagataacataatataaaatcta 1598  T

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Target: scaffold0532 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0532
Description:

Target: scaffold0532; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 481 - 629
Target Start/End: Original strand, 3522 - 3671
Alignment:
481 gtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt-taagtataaatccaaatact 579  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
3522 gtacgtcgccgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgaatacatcttatactacaaataattattataagtataaatccaaagact 3621  T
580 ttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 629  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
3622 ttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 3671  T

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Target: scaffold0532; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 662 - 711
Target Start/End: Original strand, 3706 - 3755
Alignment:
662 taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatctac 711  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
3706 taaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctac 3755  T

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Target: scaffold0017 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 185613 - 185432
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataata---tacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaa 551  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
185613 attatgtcaacaaataataataatatacagtacgtcggcttatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgaatacatcttatactacaaa 185514  T
552 taattagt-taagt---ataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa 629  Q
    |||||||| |||||   |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
185513 taattagtataagtataataaatacaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattaa 185432  T

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Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 185397 - 185349
Alignment:
662 taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
185397 taaattataacaacacttataattttaagataacataatataaaatcta 185349  T

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Target: scaffold0107 (Bit Score: 103; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 482 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 45020 - 44863
Alignment:
482 tacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaata-attagttaagtataaatccaaatactt 580  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||    
45020 tacgtcggtgtatttttgccaaaatattacatatgctaagtttaacaataagtacatcttatactacaaatatattttataagtataaatccaaatactt 44921  T
581 taatcattatgtggaatgtttag--atatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    ||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
44920 taatctttatgtgcaatgtttagatatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 44863  T

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Target: scaffold0003 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 164564 - 164316
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaa-tattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataatta 557  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
164564 tgtcaacaaatattattatacagtacgtcgacgtatttttgcaaaaaatattacgtatgttaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataatta 164465  T
558 gtt-aagtataa--atccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaat 654  Q
    ||  ||||||||  ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
164464 gtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaattatatacaaaattaagatgatattttttt-catatcaaat 164366  T
655 ttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
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164365 t------taaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatcta 164316  T

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Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 172679 - 172431
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaa-tattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataatta 557  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
172679 tgtcaacaaatattattatacagtacgtcgacgtatttttgcaaaaaatattacgtatgttaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataatta 172580  T
558 gtt-aagtataa--atccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaat 654  Q
    ||  ||||||||  ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||||    
172579 gtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaattatatacaaaattaagatgatattttttt-catatcaaat 172481  T
655 ttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
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172480 t------taaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatcta 172431  T

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Target: scaffold0550 (Bit Score: 90; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 4712 - 4892
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || |  ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
4712 tgtcaacaaatattattacatagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 4811  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
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4812 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgttttgatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 4892  T

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Target: scaffold0090 (Bit Score: 90; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 50123 - 50303
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || ||  | ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
50123 tgtcaacaaatattattacgcagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 50222  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
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50223 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaataaagatgata 50303  T

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Target: scaffold0029 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 459 - 632
Target Start/End: Original strand, 133050 - 133226
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
133050 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaacttacgtatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag 133149  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat 632  Q
    |  |||||||  |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
133150 tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat 133226  T

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Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Original strand, 133249 - 133297
Alignment:
662 taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||    
133249 taaattataaccacaattataaatttaagataacaaaatataaaatcta 133297  T

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Target: scaffold0002 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 461 - 632
Target Start/End: Original strand, 310880 - 311054
Alignment:
461 tcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt- 559  Q
    |||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||     
310880 tcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaacttacgtatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattagta 310979  T
560 taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat 632  Q
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310980 catgtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat 311054  T

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Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Original strand, 331454 - 331502
Alignment:
662 taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
331454 taaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatcta 331502  T

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Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Original strand, 311077 - 311125
Alignment:
662 taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||    
311077 taaattataaccacaattataaatttaagataacaaaatataaaatcta 311125  T

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Target: scaffold0472 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 482 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 13477 - 13320
Alignment:
482 tacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt-taagtata--aatccaaatac 578  Q
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13477 tacgtcgacgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattagtacaagtataataatttaaatat 13378  T
579 tttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13377 ttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 13320  T

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Target: scaffold0196 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0196
Description:

Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 455 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 23385 - 23283
Alignment:
455 attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa 554  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
23385 attatgtcagcaaataataatatacagtacgtcgccttatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa 23286  T
555 tta 557  Q
    |||    
23285 tta 23283  T

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Target: scaffold0196; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 23230 - 23182
Alignment:
662 taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta 710  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
23230 taaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatcta 23182  T

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Target: scaffold0118 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 459 - 632
Target Start/End: Original strand, 29749 - 29928
Alignment:
459 tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag 558  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||    
29749 tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatacaaagtttaacaatgaatgaatcttatactacaaataattag 29848  T
559 t-taagtata--aatccaaatactttaatc---attatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat 632  Q
    |  |||||||  |||||||||| ||| |||   ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29849 tacaagtataataatccaaatatttttatcattattatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat 29928  T

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Target: scaffold0636 (Bit Score: 66; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0636
Description:

Target: scaffold0636; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 515 - 636
Target Start/End: Original strand, 1 - 125
Alignment:
515 tgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagtt-aagtataa--atccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttca 611  Q
    |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||    
1 tgctaagtttaacaatgaatgcatcttatactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttca 100  T
612 aaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
101 aaatatatacaaaattaagatgata 125  T

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Target: scaffold0582 (Bit Score: 53; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 540 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 10375 - 10276
Alignment:
540 ttatactacaaataattagtt-aagtataa--atccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 636  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||| ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
10375 ttatactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaacgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata 10276  T

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