View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF1715-Insertion-7 (Length: 852)
Name: NF1715-Insertion-7
Description: NF1715
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF1715-Insertion-7 |
 |  |
|
| [»] scaffold0888 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0022 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1424 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0262 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0025 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0134 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0073 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0499 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1370 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0532 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0017 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0107 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0003 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0550 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0090 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0029 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0002 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0472 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0196 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0118 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0636 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0582 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 165; Significance: 8e-88; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Original strand, 618494 - 618744
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
618494 |
attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa |
618593 |
T |
 |
| Q |
555 |
ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaa |
653 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
618594 |
ttagtataagtataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttccatatcaaa |
618693 |
T |
 |
| Q |
654 |
tttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
618694 |
tt------taaattataaccacacttataactttaagataacacaatataaaatcta |
618744 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Original strand, 37532586 - 37532761
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37532586 |
attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa |
37532685 |
T |
 |
| Q |
555 |
-ttagttaagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa |
629 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37532686 |
tttagttaagtataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa |
37532761 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 250 - 427
Target Start/End: Original strand, 47759418 - 47759588
Alignment:
| Q |
250 |
aaaaaatgaagaaactgaacctgcttcttctgacgagcaaggttccaaattctccaa-acatgttttccaatctagtgttcctctcttggggacttctcg |
348 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
47759418 |
aaaaaatgaagaaactgaacctgcttcttctgacgagcaaggttccaaattctccaacacatgttttccaatctagtgttcctctcttgaggacttctcg |
47759517 |
T |
 |
| Q |
349 |
atgaagaagcctagtaacaacaaatcaaattcaacaaattatttgaattgatgaaaataagttgaattaaaagaaagag |
427 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
47759518 |
atgaagaagcctagtaacaacaaatcaaat--------tgagttaaattgatgaaaataagttgaattgaaagaaagag |
47759588 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 459 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 786952 - 786710
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
786952 |
tgtcaacaaatattattatacagtacgtcagcgtatttttgcaaaaatattacgtatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag |
786853 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt |
655 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
786852 |
tacaagtataataatccaaatacttttatcgtta--tgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaagttaagatgatattttttt-catatcgaatt |
786756 |
T |
 |
| Q |
656 |
tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaat |
707 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
786755 |
------taaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaat |
786710 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 31920506 - 31920258
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31920506 |
tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag |
31920407 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt |
655 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
31920406 |
tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttt-catatcgaatt |
31920308 |
T |
 |
| Q |
656 |
tactaataaattataaccacatttataac-tttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
31920307 |
------taaattataaccacaattataacttttaagataaaataatataaaatcta |
31920258 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 49709213 - 49708966
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49709213 |
tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag |
49709114 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt |
655 |
Q |
| |
|
| | ||||| |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
49709113 |
tacaggtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattaaaattatattttttt-catatcaaatt |
49709015 |
T |
 |
| Q |
656 |
tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
49709014 |
------taaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatcta |
49708966 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 35854943 - 35854764
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35854943 |
tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaaaattacatatgctaagtttaacaatgaatgcatcttatactacaaataattag |
35854844 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
35854843 |
tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatata-aaaattaagatgata |
35854764 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 55560151 - 55560331
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55560151 |
tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagtaaattacatatgctaagtttaacaatgaatgcatcttatactacaaataattag |
55560250 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55560251 |
tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
55560331 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 49788012 - 49788193
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || ||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
49788012 |
tgtcaacaaatattattacacagtatgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatgctacaaataattag |
49788111 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaata-ctttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
49788112 |
tacaagtataataatccaaatattttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaatgaagatgata |
49788193 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 459 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 1859713 - 1859613
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1859713 |
tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag |
1859614 |
T |
 |
| Q |
559 |
t |
559 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
1859613 |
t |
1859613 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 455 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 9281925 - 9281828
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaata |
553 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9281925 |
attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcagtgtatttttactaaaatatta-ttatattaaatttaataatgagtacatcttatactacaaata |
9281828 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 509 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 38517541 - 38517436
Alignment:
| Q |
509 |
tacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagat |
605 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| ||| |||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
38517541 |
tacatatgctaagtttaacaatgagtgaatcttatactacaaataattagtacaagtataataatccagatatttttatcgttatatgcaatgtttagat |
38517442 |
T |
 |
| Q |
606 |
atttca |
611 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
38517441 |
atttca |
38517436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 568 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 6244846 - 6244782
Alignment:
| Q |
568 |
aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat |
632 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6244846 |
aatccaaatatttttatcgttgtatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat |
6244782 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Original strand, 37532796 - 37532844
Alignment:
| Q |
662 |
taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37532796 |
taaattataaccatacttataactttaagataacataatataaaatcta |
37532844 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 165; Significance: 8e-88; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Original strand, 37802934 - 37803184
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37802934 |
attatgtcaacaaataataatatacagtatgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacattttatactacaaataa |
37803033 |
T |
 |
| Q |
555 |
ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaa |
653 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37803034 |
ttagtataagtataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatctcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttccatatcaaa |
37803133 |
T |
 |
| Q |
654 |
tttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
37803134 |
tt------taaattataaccacacttataactttaagataacacaatataaaatcta |
37803184 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 9999460 - 9999207
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
9999460 |
attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacgatgagtacatcttatactacaaataa |
9999361 |
T |
 |
| Q |
555 |
ttagt-taagt---ataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatc |
650 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9999360 |
ttagtataaatataataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttccatatc |
9999261 |
T |
 |
| Q |
651 |
aaatttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9999260 |
aaat------gtaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatcta |
9999207 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 10234472 - 10234218
Alignment:
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455 |
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554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10234472 |
attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa |
10234373 |
T |
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| Q |
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649 |
Q |
| |
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|
|
| T |
10234372 |
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10234273 |
T |
 |
| Q |
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710 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10234272 |
caaat------gtaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatcta |
10234218 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 455 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 47692075 - 47691893
Alignment:
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554 |
Q |
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|
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47691976 |
T |
 |
| Q |
555 |
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636 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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ttaatataagtataaattcaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaattatatacaaaattaagatgata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 10109650 - 10109472
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
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| T |
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attatgtcaacaaataataatatacagtacatcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa |
10109551 |
T |
 |
| Q |
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629 |
Q |
| |
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| T |
10109550 |
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10109472 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 41221244 - 41221070
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41221244 |
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T |
 |
| Q |
555 |
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629 |
Q |
| |
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|
| T |
41221144 |
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41221070 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 455 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 50409208 - 50408952
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
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|
|
| T |
50409208 |
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50409109 |
T |
 |
| Q |
555 |
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644 |
Q |
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||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
50409108 |
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50409009 |
T |
 |
| Q |
645 |
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707 |
Q |
| |
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| T |
50409008 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 455 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 10230879 - 10230695
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10230879 |
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10230780 |
T |
 |
| Q |
555 |
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636 |
Q |
| |
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|
| T |
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ttagtataaatataataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaa-gtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 455 - 632
Target Start/End: Original strand, 15329746 - 15329926
Alignment:
| Q |
455 |
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554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
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15329845 |
T |
 |
| Q |
555 |
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632 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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15329926 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Original strand, 10970080 - 10970338
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10970080 |
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10970179 |
T |
 |
| Q |
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644 |
Q |
| |
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||||| ||| ||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |
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|
| T |
10970180 |
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10970278 |
T |
 |
| Q |
645 |
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710 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10970279 |
catatcaaattta------aattataaccatacttataactttaagataacataatataaaatcta |
10970338 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2622506 - 2622265
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9 |
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106 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
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2622407 |
T |
 |
| Q |
107 |
gtgacatatcataataatattaacatcaaaataaaagtcagacaaagtaa--aaagtgcaactatatatgtgattaatgaaaaaataaagtgttagaat- |
203 |
Q |
| |
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| T |
2622406 |
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2622307 |
T |
 |
| Q |
204 |
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243 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2622306 |
caacaagatacataccggtagccaaatgcaggaaatcgctac |
2622265 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 10037679 - 10037432
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
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10037580 |
T |
 |
| Q |
559 |
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655 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
10037579 |
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10037481 |
T |
 |
| Q |
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710 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10037480 |
------taaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatcta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 11361293 - 11361046
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| Q |
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tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11361293 |
tgtcaacaaatattattatacagtacgtcgacgtatttttgcaaaaatattacgtatgttaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag |
11361194 |
T |
 |
| Q |
559 |
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655 |
Q |
| |
|
| || |||| |||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11361193 |
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11361095 |
T |
 |
| Q |
656 |
tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11361094 |
------taaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatcta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 11367682 - 11367435
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tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11367682 |
tgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcatatttttgcaaaaatattacatatgctaagtataacaatgagtgcatcttatactacaaataattag |
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T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt |
655 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
11367582 |
tacaagtataataatccaaataatttaatcgatatatgcaaagtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttt-catatcgaatt |
11367484 |
T |
 |
| Q |
656 |
tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11367483 |
------taaattataacgacaattataactttaagataacataatataaaatcta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 10109015 - 10108835
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459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tgtcaacaaatattattacacagtacgtcgacgtatttttgcaataaaattacatatgctaagtttaaaaatgagtgcatcttatactacaaataattag |
10108916 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10108915 |
tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 491 - 636
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491 |
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Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
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tgtggaatgtttag--atatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
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Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10040978 |
tgtgcaatgtttagacatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 494 - 710
Target Start/End: Original strand, 41764585 - 41764798
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
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tttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatacaacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttat |
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T |
 |
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gtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatttactaataaattataaccacatttataac-tttaa |
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Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
41764685 |
atacaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttt-catatcgaatt------taaattataaccacaattataacttttaa |
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T |
 |
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gataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41764778 |
gataacataatataaaatcta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 10230256 - 10230074
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| |
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tgtcaacaaatattattacacagtacgtcgacgtatttttgcaagaaaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataatt |
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557 |
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636 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10230156 |
agtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
10230074 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 455 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 52917794 - 52917633
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
52917794 |
attatgtcaacaagtaataata-acagtacgtaaacgtttttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaagaatgactaaatcttatactacaaataa |
52917696 |
T |
 |
| Q |
555 |
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616 |
Q |
| |
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||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
52917695 |
ttagtataagtataactccaaatactttaatcgttatgtccaatgtttagatattttaaaata |
52917633 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 459 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 31847 - 31675
Alignment:
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459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31847 |
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31748 |
T |
 |
| Q |
559 |
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628 |
Q |
| |
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| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31747 |
tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaatta |
31675 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 459 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 23092579 - 23092403
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23092579 |
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23092480 |
T |
 |
| Q |
559 |
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632 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23092479 |
tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcagtgtttagatatttcaaaatatatacaaaaataagat |
23092403 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 27273441 - 27273261
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
27273441 |
tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatactaagtttaacaatgaatgtatcttatactacaaataattag |
27273342 |
T |
 |
| Q |
559 |
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636 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
27273341 |
tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatataaaattaagatgata |
27273261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 459 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 10233849 - 10233673
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || || ||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10233849 |
tgtcaacaaatattattacacagtccgtcgacgtatttttgcaagaaaattgcatatgctaagtttaacaatgattgcatcttatactacaaataattat |
10233750 |
T |
 |
| Q |
559 |
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632 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10233749 |
tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat |
10233673 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 662 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 46912196 - 46912151
Alignment:
| Q |
662 |
taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaat |
707 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
46912196 |
taaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaat |
46912151 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 52916802 - 52916754
Alignment:
| Q |
662 |
taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
52916802 |
taaattataaccacacttataaatttaagataacataatataaaatcta |
52916754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 10040909 - 10040861
Alignment:
| Q |
662 |
taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10040909 |
taaattataaccacacttataattgtaagataacataatataaaatcta |
10040861 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 10109435 - 10109387
Alignment:
| Q |
662 |
taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
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|
| T |
10109435 |
taaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatcta |
10109387 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0888 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:
Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Original strand, 905 - 1154
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
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| T |
905 |
attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaatgtattacatatgctaagtttcacaatgagtacatcttatactacaaataa |
1004 |
T |
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| Q |
555 |
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653 |
Q |
| |
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| T |
1005 |
ttagtataagtataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata-ttttttccatatcaaa |
1103 |
T |
 |
| Q |
654 |
tttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
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| T |
1104 |
tt------taaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatcta |
1154 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Original strand, 48239969 - 48240219
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
48239969 |
attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa |
48240068 |
T |
 |
| Q |
555 |
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653 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |
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| T |
48240069 |
ttaatataagtataaatccaaatagtttaatcgttatgtgcaatgtttatatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttttccatataaaa |
48240168 |
T |
 |
| Q |
654 |
tttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
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|
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| T |
48240169 |
tt------taaattataatcacacttataactttaagataacacaatataaaatcta |
48240219 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 28961111 - 28960863
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
28961111 |
attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcagcgtatttttgcaaaaatattacatatattaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa |
28961012 |
T |
 |
| Q |
555 |
ttagttaagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaat |
654 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
28961011 |
ttagttaagtataaatccaaatactttaatcgttatttgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata-ttttttccatatcaaat |
28960913 |
T |
 |
| Q |
655 |
ttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
| | |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
28960912 |
t------tcaattataagtacacttataactttaagataacataatataaaatcta |
28960863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 455 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 7102009 - 7101827
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
7102009 |
attatgtcaacaaataataatatacaatacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacgtcttatactacaaataa |
7101910 |
T |
 |
| Q |
555 |
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636 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7101909 |
ttagtataagtataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaattatatacaaaattaagatgata |
7101827 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 455 - 635
Target Start/End: Original strand, 2453932 - 2454113
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
2453932 |
attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttatcaatgagtgcatcttatactacaaataa |
2454031 |
T |
 |
| Q |
555 |
ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat |
635 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2454032 |
ttagtataagtataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttaaatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat |
2454113 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 36206257 - 36206008
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
36206257 |
attatgttaacaaataataatatacaatacgtcagagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaataggtacatcatatatgacaaataa |
36206158 |
T |
 |
| Q |
555 |
ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaa |
653 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
36206157 |
ttagtataagtataaatctaaatactttaatcattatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaaaatgatattttttt-catatcaaa |
36206059 |
T |
 |
| Q |
654 |
tttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
36206058 |
tt------taaattatagctacatttataactttaagataatacaatataaaatcta |
36206008 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 456 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 16043402 - 16043153
Alignment:
| Q |
456 |
ttatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataat |
555 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16043402 |
ttatgtcaacaaataataatatacaatacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgttaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataat |
16043303 |
T |
 |
| Q |
556 |
tagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaat |
654 |
Q |
| |
|
|| | ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |
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|
| T |
16043302 |
taatataagtttaaatccaaatactttgatcgttatgtgcaatggttacatatttcaaaatatagacaaaattaagatgatatttttttctatatcaaat |
16043203 |
T |
 |
| Q |
655 |
ttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16043202 |
t------gaaattataatcacacttttaactttaaaataacataatataaaatcta |
16043153 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Original strand, 25075039 - 25075285
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25075039 |
tgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactac-aataattag |
25075137 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt |
655 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |
|
|
| T |
25075138 |
tacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttt-cttatcgaatt |
25075236 |
T |
 |
| Q |
656 |
tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
25075237 |
------taaattataatcacaattataactttaagataacataatataaaatcta |
25075285 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Original strand, 48776510 - 48776757
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
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Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
48776510 |
tgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttataatacaaataattaa |
48776609 |
T |
 |
| Q |
559 |
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655 |
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T |
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Q |
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| T |
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48776757 |
T |
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Target: chr1; HSP #9
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Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 16041061 - 16040815
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558 |
Q |
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T |
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655 |
Q |
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16040864 |
T |
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Q |
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| T |
16040863 |
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16040815 |
T |
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Target: chr1; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Original strand, 16748848 - 16749095
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558 |
Q |
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| T |
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16748947 |
T |
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559 |
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655 |
Q |
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| T |
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16749046 |
T |
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| Q |
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710 |
Q |
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| T |
16749047 |
------taaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatcta |
16749095 |
T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 18147725 - 18147545
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558 |
Q |
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T |
 |
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559 |
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636 |
Q |
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| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
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Target Start/End: Original strand, 37391328 - 37391507
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558 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
559 |
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Q |
| |
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| T |
37391428 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 52499768 - 52499588
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558 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 36518975 - 36518795
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| Q |
459 |
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558 |
Q |
| |
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36518876 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
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| T |
36518875 |
tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaaaatgata |
36518795 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 459 - 635
Target Start/End: Original strand, 6312175 - 6312354
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| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
559 |
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635 |
Q |
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| T |
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tacaaatataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattatgatgat |
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T |
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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 501 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 12450961 - 12450841
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599 |
Q |
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12450871 |
T |
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Q |
| |
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12450870 |
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T |
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Target: chr1; HSP #17
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 12450805 - 12450757
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taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
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12450805 |
taaattatagccacacttataactttaagataacataatataaaatcta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 148; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Original strand, 98000 - 98257
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Q |
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98000 |
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T |
 |
| Q |
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645 |
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710 |
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| T |
98199 |
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98257 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 146; Significance: 2e-76; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Original strand, 4221186 - 4221445
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attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
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Q |
| |
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| T |
4221186 |
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4221285 |
T |
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Q |
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| T |
4221286 |
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4221385 |
T |
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645 |
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710 |
Q |
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| T |
4221386 |
catatcaaatt------taaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatcta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 455 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 10186593 - 10186342
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| |
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T |
 |
| Q |
554 |
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649 |
Q |
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| T |
10186493 |
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10186394 |
T |
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707 |
Q |
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| T |
10186393 |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 456 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 12518653 - 12518404
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Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
556 |
tagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaat |
654 |
Q |
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| T |
12518553 |
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12518454 |
T |
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| Q |
655 |
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710 |
Q |
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| T |
12518453 |
t------taaattataatcacacttttaactttaagataacataatataaaatcta |
12518404 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 15330575 - 15330329
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459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
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|
| T |
15330575 |
tgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatactaagtttaacaatgagtgcattttatactacaaataattag |
15330476 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt |
655 |
Q |
| |
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| T |
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tacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttaaatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttt--catatccaatt |
15330378 |
T |
 |
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710 |
Q |
| |
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| T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
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Query Start/End: Original strand, 455 - 629
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ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa |
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| T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
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Target Start/End: Complemental strand, 12516424 - 12516176
Alignment:
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459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12516424 |
tgtcaacaaatattattttacagtacgtcggcgtatttctgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag |
12516325 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt |
655 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
12516324 |
tacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttttcatatcgaatt |
12516225 |
T |
 |
| Q |
656 |
tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
12516224 |
------taaattataaacacaattataactttaagatatcataatataaaatcta |
12516176 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 465 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 14906527 - 14906355
Alignment:
| Q |
465 |
caaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaata---attagtta |
561 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||| |||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
14906527 |
caaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatactgagttgaacaatgagtacattacatactacaaatatacatta--ta |
14906430 |
T |
 |
| Q |
562 |
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636 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
14906429 |
agtatagatccaaatactttaatcattatgtgcaatatttagatatttcaaaatatttacagaattaagaagata |
14906355 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 31512675 - 31512855
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31512675 |
tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag |
31512774 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31512775 |
tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaacgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
31512855 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 459 - 632
Target Start/End: Original strand, 29642537 - 29642713
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29642537 |
tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag |
29642636 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat |
632 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| ||| ||| || | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29642637 |
tacaagtataataatccaaatatttttatcgttgtatgcaacgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat |
29642713 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 24195938 - 24195691
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24195938 |
tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagttttacaatgagtgcatcttatactacaaaaaattaa |
24195839 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt |
655 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||| ||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |
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|
| T |
24195838 |
tacaagtataataatcaaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagattatattgtttt-catatcgaatt |
24195740 |
T |
 |
| Q |
656 |
tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
24195739 |
------taaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatcta |
24195691 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 662 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 14906336 - 14906291
Alignment:
| Q |
662 |
taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaat |
707 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14906336 |
taaattacaatcacatttataactttaagataacataatataaaat |
14906291 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 143; Significance: 1e-74; HSPs: 11)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Original strand, 21071232 - 21071486
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| Q |
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attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21071232 |
attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatattatactacaaataa |
21071331 |
T |
 |
| Q |
555 |
ttagt-taagt---ataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata-nnnnnnnccatat |
649 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21071332 |
ttagtataagtataataaatccaaatactttaatcgttgtgtacaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttttccatat |
21071431 |
T |
 |
| Q |
650 |
caaatttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
21071432 |
caaatt------taaattataacaacacttataactttaagataacataatataaaatcta |
21071486 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 22843578 - 22843403
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22843578 |
attatgtcaacaaataataatatacagtacgtccgcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgattacatcttatactacaaataa |
22843479 |
T |
 |
| Q |
555 |
ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa |
629 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22843478 |
ttagtataaatataaatccaaatactttagtcgttatgtgcaatgtttagatatttttaaatatatacaaaattaa |
22843403 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Original strand, 45122536 - 45122782
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
45122536 |
tgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatattacaaataattag |
45122635 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt |
655 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||| |||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
45122636 |
tacaagtataataattcaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttt--catatcgaatt |
45122733 |
T |
 |
| Q |
656 |
tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45122734 |
------taaattataaccacaattataactttaagataatataatataaaatcta |
45122782 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 456 - 629
Target Start/End: Original strand, 5829713 - 5829890
Alignment:
| Q |
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ttatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataat |
555 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5829713 |
ttatgtcaacaaataataatatacagtacgttggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacgtcttatacgacaaataat |
5829812 |
T |
 |
| Q |
556 |
tagt-taagta---taaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa |
629 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5829813 |
tagtataagtatagtaaatcaaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatttacaaaattaa |
5829890 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
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Target Start/End: Original strand, 531518 - 531627
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| Q |
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tcattctggtcaacctgtcatgcctgggttttcttcatctactggccattctatgcagccacctttttcttctcaaggtggtcaatctactgcacaaaca |
823 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
531518 |
tcattctggtcaacctgtcatgcctgggttttcgtcatctactggccattctatgcagccacctttttcttctcaaggtggtcaatctactgcacaaaca |
531617 |
T |
 |
| Q |
824 |
agtgatcata |
833 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
531618 |
agtgatcata |
531627 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 42231191 - 42231011
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| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
42231191 |
tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgaatgcatcttatactaaaaataattag |
42231092 |
T |
 |
| Q |
559 |
tt-aagtataa--atccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42231091 |
tacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
42231011 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 462 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 7035738 - 7035561
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| Q |
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caacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt-t |
560 |
Q |
| |
|
||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7035738 |
caacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaattttaacaatgaatgcatcttatactacaaataattagtac |
7035639 |
T |
 |
| Q |
561 |
aagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7035638 |
aagtataataatccaaatatttttatcgttatatgaaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
7035561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 9002305 - 9002485
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9002305 |
tgtcaacaaatattattacacagtacgtcgtcttatttttgcaataatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaaaaattag |
9002404 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||| |||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9002405 |
tacaagtataataattcaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
9002485 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 724 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 632860 - 632759
Alignment:
| Q |
724 |
tcattctggtcaacctgtcatgcctgggttttcttcatctactggccattctatgcagccacctttttcttctcaaggtggtcaatctactgcacaaaca |
823 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
632860 |
tcattctggtcaacctggcatgcctgggttttcgtcatctactggacattctatgcagccaccttttgcttctcaaggcggtcaatctactgcacaaaca |
632761 |
T |
 |
| Q |
824 |
ag |
825 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
632760 |
ag |
632759 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 12787166 - 12787346
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| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || ||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| | |
|
|
| T |
12787166 |
tgtcaacaaatattattacacagtaagtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgaatcttatactacaaataataaa |
12787265 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12787266 |
tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
12787346 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Original strand, 5829927 - 5829975
Alignment:
| Q |
662 |
taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5829927 |
taaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatcta |
5829975 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 141; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 125265 - 125007
Alignment:
| Q |
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attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
125265 |
attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgttaagcttaacaatgagtacatcttatactacaaataa |
125166 |
T |
 |
| Q |
555 |
ttagttaagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaa---------ttaagatgatannnnnnncc |
645 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
125165 |
ttagttaagtataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaatgtttagatattgcaaaatatatacaaaattaacaagattaagatgatatttttttcc |
125066 |
T |
 |
| Q |
646 |
atatcaaatttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
125065 |
atatcaaatt------taaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatcta |
125007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 140; Significance: 7e-73; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 456 - 710
Target Start/End: Original strand, 15033760 - 15034009
Alignment:
| Q |
456 |
ttatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataat |
555 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
15033760 |
ttatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttataatacaaataat |
15033859 |
T |
 |
| Q |
556 |
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654 |
Q |
| |
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| T |
15033860 |
taatataagtataaatccaaatactttgatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatattcaaaattaagatgaaatttttttcaatatcaaat |
15033959 |
T |
 |
| Q |
655 |
ttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
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| T |
15033960 |
t------taaattataatcacacttttaactttaagataacataatataaaatcta |
15034009 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 6088256 - 6088007
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
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| T |
6088256 |
attatgtcaacaaataataatatacaatacgtcggcgtatttttgtaaaa-tattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa |
6088158 |
T |
 |
| Q |
555 |
ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata-nnnnnnnccatatcaa |
652 |
Q |
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||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |
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| T |
6088157 |
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6088058 |
T |
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| Q |
653 |
atttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
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| T |
6088057 |
att------taaattataaccacatttataactttaa-ataacataatataaaatcta |
6088007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Original strand, 14194052 - 14194227
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |
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| T |
14194052 |
attatttcaacaaataatgatatacagtacgtcggcgtatttttacaaaaatattacatatgctaagtttatcaatgggtacatcttatactacaaataa |
14194151 |
T |
 |
| Q |
555 |
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629 |
Q |
| |
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| T |
14194152 |
ttagtataagtataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa |
14194227 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 26831676 - 26831498
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
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||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
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| T |
26831676 |
attatgtcaacaaattataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa |
26831577 |
T |
 |
| Q |
555 |
ttagt-taagt---ataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa |
629 |
Q |
| |
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||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
26831576 |
ttagtataaatataataaatccaaatactttaatcgctatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa |
26831498 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 18115846 - 18115597
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaata- |
553 |
Q |
| |
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|
| T |
18115846 |
attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcatatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagcaaccgttatactacaaatat |
18115747 |
T |
 |
| Q |
554 |
attagttaagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaa |
653 |
Q |
| |
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||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |
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| T |
18115746 |
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18115648 |
T |
 |
| Q |
654 |
tttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
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| T |
18115647 |
tt------taaattaaaaccacacttataactttaagataacataatataaaatcta |
18115597 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Original strand, 2262168 - 2262429
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacg---tcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaa |
551 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
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| T |
2262168 |
attatgtcaacaaataataatatacagtacgacgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgttaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaa |
2262267 |
T |
 |
| Q |
552 |
taa-ttagttaagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatat---------acaaaattaagatgatannnnn |
641 |
Q |
| |
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|
| T |
2262268 |
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2262366 |
T |
 |
| Q |
642 |
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710 |
Q |
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| T |
2262367 |
ttccatatcaaatt------taaattataaccatacttataactttaagataacataatataaaatcta |
2262429 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Original strand, 17872080 - 17872255
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
17872080 |
attatgtcaacaaataataatatacagtacgtccgcgtatttttgcaaaaatattgcatatgctaagtttaacaataattacatcttatactacaaataa |
17872179 |
T |
 |
| Q |
555 |
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629 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17872180 |
ttagtataagtataaatccaaatactttaatcgttatatgcaatgtttagatatttttaaatatatacaaaattaa |
17872255 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Original strand, 43525060 - 43525309
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaata- |
553 |
Q |
| |
|
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|
| T |
43525060 |
attatgtcaacaaataataatatagagtacgtcgacacatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagcaactgttatactacaaatat |
43525159 |
T |
 |
| Q |
554 |
attagttaagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaa |
653 |
Q |
| |
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||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |
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|
| T |
43525160 |
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43525258 |
T |
 |
| Q |
654 |
tttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43525259 |
tt------taaattaaaaccacacttataactttaagataacataatataaaatcta |
43525309 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Original strand, 25543920 - 25544174
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaata---ataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaa |
551 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25543920 |
attatgtcaacaaataataataatatacagtacatcggcttatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaa |
25544019 |
T |
 |
| Q |
552 |
taattagt-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccata |
648 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25544020 |
taattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcgatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttt-cata |
25544118 |
T |
 |
| Q |
649 |
tcaaatttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
25544119 |
acgaatt------taaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatcta |
25544174 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 4050842 - 4050596
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4050842 |
tgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactac-aataattag |
4050744 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt |
655 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |
|
|
| T |
4050743 |
tacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttt-cttatcgaatt |
4050645 |
T |
 |
| Q |
656 |
tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4050644 |
------taaattataaacacaattataactttaagataacataatataaaatcta |
4050596 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 459 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 30313419 - 30313240
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||||| |
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|
| T |
30313419 |
tgtcaacaaatattattatacagtacatcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatgcgacaaataattag |
30313320 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat |
635 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30313319 |
tacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgat |
30313240 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 43448517 - 43448270
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43448517 |
tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggtgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag |
43448418 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt |
655 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |
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|
| T |
43448417 |
tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttaaatttttcaaaatatatacaaaattaagattatattgtttt-catatcgaatt |
43448319 |
T |
 |
| Q |
656 |
tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
43448318 |
------taaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatcta |
43448270 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 10024168 - 10023988
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
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Q |
| |
|
|||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 37260354 - 37260185
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558 |
Q |
| |
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| T |
37260354 |
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37260255 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatat-ttcaaaatatatacaaa |
624 |
Q |
| |
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| ||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||| |
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| T |
37260254 |
tacaagtataataatccaaatacttttatcattatatgcaatgtttagatatatacaaaatatatacaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 8429759 - 8429939
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459 |
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| |
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| T |
8429759 |
tgtcaacaaatattattacacagtacgtcgacgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcattttatgctacaaataattag |
8429858 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8429859 |
tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaatgaagatgata |
8429939 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 24630984 - 24631164
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tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
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| |
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|||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||| |
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|
| T |
24630984 |
tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgaatgcatcttatactataaataattag |
24631083 |
T |
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636 |
Q |
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24631084 |
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24631164 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 30347664 - 30347844
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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30347763 |
T |
 |
| Q |
559 |
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636 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
30347764 |
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30347844 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 461 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 27880121 - 27879942
Alignment:
| Q |
461 |
tcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt- |
559 |
Q |
| |
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| T |
27880121 |
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27880022 |
T |
 |
| Q |
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636 |
Q |
| |
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|
|
| T |
27880021 |
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27879942 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 459 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 3688982 - 3688820
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
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| T |
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3688883 |
T |
 |
| Q |
559 |
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618 |
Q |
| |
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| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
3688882 |
tacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaattata |
3688820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 459 - 618
Target Start/End: Original strand, 3877803 - 3877965
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
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|||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3877803 |
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3877902 |
T |
 |
| Q |
559 |
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618 |
Q |
| |
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| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
3877903 |
tacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaattata |
3877965 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 26792847 - 26792667
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| |
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|
| T |
26792847 |
tgtcaacaaatattattacacagtacgtcgacgtatttttaaaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatacaacaaataattag |
26792748 |
T |
 |
| Q |
559 |
tt-aagtataa--atccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26792747 |
tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
26792667 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 481 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 37371941 - 37371770
Alignment:
| Q |
481 |
gtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt-taagtata--aatccaaa-- |
575 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |
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| T |
37371941 |
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37371842 |
T |
 |
| Q |
576 |
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636 |
Q |
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| T |
37371841 |
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37371770 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 459 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 39882220 - 39882072
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39882220 |
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39882121 |
T |
 |
| Q |
559 |
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604 |
Q |
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| T |
39882120 |
tacaagtataataatccatatatttttatcgttatatgcaatgtttaga |
39882072 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Original strand, 14194265 - 14194313
Alignment:
| Q |
662 |
taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14194265 |
taaattataactacacttataactttaagataacataatataaaatcta |
14194313 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 14713320 - 14713061
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
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|
|
| T |
14713320 |
attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaataagtacatcttatactacaaataa |
14713221 |
T |
 |
| Q |
555 |
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644 |
Q |
| |
|
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|
| T |
14713220 |
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14713121 |
T |
 |
| Q |
645 |
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710 |
Q |
| |
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|
| T |
14713120 |
catatcaaatt------taaattataaccatacttataactttaagataacataatataaaatcta |
14713061 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 13424671 - 13424496
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13424671 |
attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttatcaatgagttcatcttatactacaaataa |
13424572 |
T |
 |
| Q |
555 |
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629 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
13424571 |
ttagtataagtataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa |
13424496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 455 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 14764667 - 14764490
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14764667 |
attatgtcaacaaataataatatacagtacctcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttgacaaggagtacatcttatactacaaataa |
14764568 |
T |
 |
| Q |
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632 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14764567 |
tta--caagtataacaatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat |
14764490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Original strand, 31979707 - 31979954
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31979707 |
tgtcaacaaatattattatacagtaagtcggcgtatttttgcaaaaatataacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag |
31979806 |
T |
 |
| Q |
559 |
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655 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |
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|
| T |
31979807 |
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31979905 |
T |
 |
| Q |
656 |
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710 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
31979906 |
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31979954 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 481 - 636
Target Start/End: Original strand, 25219774 - 25219932
Alignment:
| Q |
481 |
gtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt-taagtata--aatccaaata |
577 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25219774 |
gtacgtcggcgtatttttgcaaaaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgaatcttatactacaaataattagtacaagtataataatccaaata |
25219873 |
T |
 |
| Q |
578 |
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636 |
Q |
| |
|
||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25219874 |
tttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
25219932 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 7780781 - 7780601
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7780781 |
tgtcaataaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatactaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag |
7780682 |
T |
 |
| Q |
559 |
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636 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7780681 |
taaaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
7780601 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 7820871 - 7820691
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
7820871 |
tgtcaataaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatactaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag |
7820772 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7820771 |
taaaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
7820691 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Original strand, 21114858 - 21115106
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21114858 |
tgtcaacaaatattattacacaatacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag |
21114957 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatac-aaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaat |
654 |
Q |
| |
|
| || ||||| |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| |
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|
| T |
21114958 |
tataggtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaaattaagattatatattttt-catatcgaat |
21115056 |
T |
 |
| Q |
655 |
ttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
21115057 |
t------taaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaaatcta |
21115106 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 514 - 710
Target Start/End: Original strand, 37915275 - 37915468
Alignment:
| Q |
514 |
atgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagtt-aagtataa--atccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttc |
610 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37915275 |
atgctaagtttaacaatgagtgcatcttatacaacaaataattagtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatacaatgtttagatatttc |
37915374 |
T |
 |
| Q |
611 |
aaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatttactaataaattataaccacatttataac-tttaagataatataatataaaatct |
709 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37915375 |
aaaatatatacaaaattaagatgatattttttt-catatcgaatt------taaattataaccacaattataacttttaagataacataatataaaatct |
37915467 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 494 - 612
Target Start/End: Original strand, 33862603 - 33862724
Alignment:
| Q |
494 |
tttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt-taagtata--aatccaaatactttaatcattat |
590 |
Q |
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| T |
33862603 |
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33862702 |
T |
 |
| Q |
591 |
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612 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33862703 |
atacaatgtttagatatttcaa |
33862724 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 459 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 30306206 - 30306106
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || ||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30306206 |
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30306107 |
T |
 |
| Q |
559 |
t |
559 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
30306106 |
t |
30306106 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 567 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 30306069 - 30306000
Alignment:
| Q |
567 |
aaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30306069 |
aaatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
30306000 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 13424460 - 13424412
Alignment:
| Q |
662 |
taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13424460 |
taaattataaccacacttttaactttaagataacataatataaaatcta |
13424412 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Original strand, 33863123 - 33863172
Alignment:
| Q |
662 |
taaattataaccacatttataac-tttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
33863123 |
taaattataaccacaattataacttttaagataacataatataaaatcta |
33863172 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 137; Significance: 4e-71; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 455 - 709
Target Start/End: Original strand, 2881653 - 2881911
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2881653 |
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2881752 |
T |
 |
| Q |
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644 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2881753 |
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2881852 |
T |
 |
| Q |
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709 |
Q |
| |
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||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |
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|
| T |
2881853 |
catatcaaatt------taaattataaccacacttataactttaagataacacaatataaaatct |
2881911 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 24244910 - 24244735
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24244910 |
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24244811 |
T |
 |
| Q |
555 |
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629 |
Q |
| |
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| T |
24244810 |
ttagtataagtataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa |
24244735 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 455 - 707
Target Start/End: Original strand, 17687530 - 17687779
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |
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| T |
17687530 |
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17687629 |
T |
 |
| Q |
555 |
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650 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
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| T |
17687630 |
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17687728 |
T |
 |
| Q |
651 |
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707 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
17687729 |
aaatt------taaattataaccacagttataactttaagataacataatataaaat |
17687779 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 3642107 - 3641932
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
3642107 |
attatgttaacaaataataatatacagtacgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa |
3642008 |
T |
 |
| Q |
555 |
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629 |
Q |
| |
|
||| | |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3642007 |
ttaatataagaataaatctaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttggatatttcaaaatatatacaaaattaa |
3641932 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 27508420 - 27508245
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
27508420 |
attatgtcaacaaataataatatacaatacgtcggcatatttttgcaaaaatattacatatgttaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa |
27508321 |
T |
 |
| Q |
555 |
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629 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27508320 |
ttagtataagtataaattcaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattaa |
27508245 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Original strand, 40488869 - 40489047
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
40488869 |
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40488968 |
T |
 |
| Q |
555 |
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629 |
Q |
| |
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||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
40488969 |
ttagtataagtataataaatctaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttaaaaatatatacaaaattaa |
40489047 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 39441854 - 39442033
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
39441854 |
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39441952 |
T |
 |
| Q |
559 |
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636 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39441953 |
tacaagtataatgatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
39442033 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 455 - 570
Target Start/End: Original strand, 2868545 - 2868661
Alignment:
| Q |
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attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2868545 |
attatgtcaacaaataataatatacagtatgtcggagtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacattttatactacaaataa |
2868644 |
T |
 |
| Q |
555 |
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570 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
2868645 |
ttagtataagtataaat |
2868661 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 454 - 636
Target Start/End: Original strand, 36047873 - 36048058
Alignment:
| Q |
454 |
tattatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaata |
553 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| || || || |||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
36047873 |
tattttgtcaacaaatattattacacagtacgttggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgactcttatactacaaata |
36047972 |
T |
 |
| Q |
554 |
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636 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36047973 |
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36048058 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 28667360 - 28667541
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
28667360 |
tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatgctacaaataatcag |
28667459 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaata-ctttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28667460 |
tacaagtataataatccaaatattttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaatgaagatgata |
28667541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 37826194 - 37826375
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
37826194 |
tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatgctacaaataatcag |
37826293 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaata-ctttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37826294 |
tacaagtataataatccaaatattttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaatgaagatgata |
37826375 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 509 - 710
Target Start/End: Original strand, 24270184 - 24270381
Alignment:
| Q |
509 |
tacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagat |
605 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
24270184 |
tacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattagtacaggtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagat |
24270283 |
T |
 |
| Q |
606 |
atttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaa |
705 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
24270284 |
atttcaaaatatatacaaaattaagattatatattttt-catatcgaatt------taaattataaccacaattataactttaagataacaaaatataaa |
24270376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 461 - 636
Target Start/End: Original strand, 41921359 - 41921538
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461 |
tcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt- |
559 |
Q |
| |
|
|||||||||| || || || ||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41921359 |
tcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttacaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatgctacaaataattagta |
41921458 |
T |
 |
| Q |
560 |
taagtata--aatccaaata-ctttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
41921459 |
caagtataataatccaaatattttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaatgaagatgata |
41921538 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 560 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 35608831 - 35608690
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| Q |
560 |
taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatttact |
659 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
35608831 |
taagtataaatccagatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatcttttttttcatatgaaatt---- |
35608736 |
T |
 |
| Q |
660 |
aataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaat |
707 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35608735 |
--taaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaat |
35608690 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 459 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 21394401 - 21394225
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
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|||||||||||| || || || |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21394401 |
tgtcaacaaatattattacacagtacatcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagattaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag |
21394302 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat |
632 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||| ||||| ||| ||| |||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21394301 |
tacaagtataataatctaaatatttttatcgttatatgcagtgtttagatattttaaaatatatacaaaaataagat |
21394225 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 517 - 636
Target Start/End: Original strand, 26955164 - 26955286
Alignment:
| Q |
517 |
ctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagtt-aagtataa--atccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaa |
613 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26955164 |
ctaagtttaacaatgaatgcatcttatactacaaataattagtacaagtataataatctaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaa |
26955263 |
T |
 |
| Q |
614 |
atatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26955264 |
atatatacaaaattaagatgata |
26955286 |
T |
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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
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| Q |
662 |
taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
3641897 |
taaattataaccacacttataactttaagataacacaatataaaatcta |
3641849 |
T |
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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 455 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 35608888 - 35608837
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaat |
506 |
Q |
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|
||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
35608888 |
attatttcaacaaataatgatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaat |
35608837 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 24244703 - 24244656
Alignment:
| Q |
662 |
taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24244703 |
taaattataaccacacttataa-tttaagataacataatataaaatcta |
24244656 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1424 (Bit Score: 130; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:
Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 729 - 461
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attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
729 |
attatgtcaacaaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtatatcttatactacaaataa |
630 |
T |
 |
| Q |
555 |
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641 |
Q |
| |
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||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
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| T |
629 |
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530 |
T |
 |
| Q |
642 |
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710 |
Q |
| |
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|||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
529 |
ttccatatcaaatttaaatttaaattataacaacacttataactttaagataacataatataaaatcta |
461 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0262 (Bit Score: 130; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:
Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 455 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 18052 - 17800
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attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18052 |
attatgtcaataaataataatatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgaatacatcttatactacaaataa |
17953 |
T |
 |
| Q |
555 |
ttagt-taagt---ataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatc |
650 |
Q |
| |
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||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17952 |
ttagtataagtataataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttaaatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttt-catatc |
17854 |
T |
 |
| Q |
651 |
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710 |
Q |
| |
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||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17853 |
aaatt------aaaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatcta |
17800 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 455 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 13532 - 13351
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| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13532 |
attatgttaacaaataataatatacagtacgtcggcttatttttgcaaaaatattac-tatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa |
13434 |
T |
 |
| Q |
555 |
ttagt-taagtataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13433 |
ttagtataagtataaatccaaatattttaatcgttacgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
13351 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0134 (Bit Score: 125; Significance: 6e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:
Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Original strand, 6410 - 6588
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| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
6410 |
attatgtcaacaaataataatatacagtacatcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa |
6509 |
T |
 |
| Q |
555 |
ttagt-taagt---ataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa |
629 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6510 |
ttagtataagtataataaatccaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatataaaattaa |
6588 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Original strand, 6623 - 6671
Alignment:
| Q |
662 |
taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6623 |
taaattataacaacacttataactttaagataacatagtataaaatcta |
6671 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0073 (Bit Score: 112; Significance: 4e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:
Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 23630 - 23383
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| Q |
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tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23630 |
tgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatattacaaataattag |
23531 |
T |
 |
| Q |
559 |
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655 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |
|
|
| T |
23530 |
tacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttatatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatattttttt-catatcgagtt |
23432 |
T |
 |
| Q |
656 |
tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
23431 |
------taaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatcta |
23383 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 18495 - 18248
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18495 |
tgtcaacaaatattattatacagtaagtcggcgtatttttgcaaaaatataacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag |
18396 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaatt |
655 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
18395 |
tacaagtataataatccaaatactttgatcgttatatgcaatgtttagctattttgaaatatatacaaaattaagattatattttttt-catttcaaatt |
18297 |
T |
 |
| Q |
656 |
tactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
18296 |
------taaattataaccacaattataactttaagataacataatatataatcta |
18248 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0499 (Bit Score: 110; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:
Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 10182 - 10002
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| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10182 |
tgtcaacaaatattattatacagtacgtcggcgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtataacaatgagtgcatcttatactacaaataattag |
10083 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10082 |
tacaagtataataatccaaatactttcatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
10002 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1370 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1370
Description:
Target: scaffold1370; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 482 - 710
Target Start/End: Original strand, 1375 - 1598
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tacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaata-attagttaagtataaatccaaatactt |
580 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1375 |
tacgtcggcgtatttttgccaaaatattacatatgctaagtttaacaataagtacatcttatactacaaatatattttataagtataaatccaaatactt |
1474 |
T |
 |
| Q |
581 |
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678 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
1475 |
taatctttatgtgcaatgtttagatatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatatttttt--catgtcaaatt------taaattataaccacact |
1566 |
T |
 |
| Q |
679 |
tataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1567 |
tataactttaagataacataatataaaatcta |
1598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0532 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0532
Description:
Target: scaffold0532; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 481 - 629
Target Start/End: Original strand, 3522 - 3671
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481 |
gtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt-taagtataaatccaaatact |
579 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
3522 |
gtacgtcgccgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgaatacatcttatactacaaataattattataagtataaatccaaagact |
3621 |
T |
 |
| Q |
580 |
ttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa |
629 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3622 |
ttaatcgttatgtgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa |
3671 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0532; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 3706 - 3755
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| Q |
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taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatctac |
711 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
3706 |
taaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatctac |
3755 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0017 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:
Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 455 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 185613 - 185432
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attatgtcaacaaataataata---tacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaa |
551 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
185613 |
attatgtcaacaaataataataatatacagtacgtcggcttatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgaatacatcttatactacaaa |
185514 |
T |
 |
| Q |
552 |
taattagt-taagt---ataaatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaa |
629 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
185513 |
taattagtataagtataataaatacaaatactttaatcgttatgtgcaatgtttagatattttaaaatatatacaaaattaa |
185432 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0017; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 185397 - 185349
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taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
185397 |
taaattataacaacacttataattttaagataacataatataaaatcta |
185349 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0107 (Bit Score: 103; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:
Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 482 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 45020 - 44863
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tacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaata-attagttaagtataaatccaaatactt |
580 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45020 |
tacgtcggtgtatttttgccaaaatattacatatgctaagtttaacaataagtacatcttatactacaaatatattttataagtataaatccaaatactt |
44921 |
T |
 |
| Q |
581 |
taatcattatgtggaatgtttag--atatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44920 |
taatctttatgtgcaatgtttagatatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
44863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:
Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 164564 - 164316
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tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaa-tattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataatta |
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Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
164564 |
tgtcaacaaatattattatacagtacgtcgacgtatttttgcaaaaaatattacgtatgttaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataatta |
164465 |
T |
 |
| Q |
558 |
gtt-aagtataa--atccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaat |
654 |
Q |
| |
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|| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |
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| T |
164464 |
gtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaattatatacaaaattaagatgatattttttt-catatcaaat |
164366 |
T |
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| Q |
655 |
ttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
164365 |
t------taaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatcta |
164316 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 459 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 172679 - 172431
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaa-tattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataatta |
557 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
172679 |
tgtcaacaaatattattatacagtacgtcgacgtatttttgcaaaaaatattacgtatgttaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataatta |
172580 |
T |
 |
| Q |
558 |
gtt-aagtataa--atccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgatannnnnnnccatatcaaat |
654 |
Q |
| |
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|| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
172579 |
gtacaagtataataatccaaatacttttatcgttatatgcaatgtttagatattttaaattatatacaaaattaagatgatattttttt-catatcaaat |
172481 |
T |
 |
| Q |
655 |
ttactaataaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
172480 |
t------taaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatcta |
172431 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0550 (Bit Score: 90; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:
Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 4712 - 4892
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
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|
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| T |
4712 |
tgtcaacaaatattattacatagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag |
4811 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
4812 |
tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgttttgatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
4892 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0090 (Bit Score: 90; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:
Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 459 - 636
Target Start/End: Original strand, 50123 - 50303
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || | ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
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| T |
50123 |
tgtcaacaaatattattacgcagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag |
50222 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
50223 |
tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaataaagatgata |
50303 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0029 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:
Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 459 - 632
Target Start/End: Original strand, 133050 - 133226
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
133050 |
tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaacttacgtatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattag |
133149 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat |
632 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
133150 |
tacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat |
133226 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Original strand, 133249 - 133297
Alignment:
| Q |
662 |
taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
133249 |
taaattataaccacaattataaatttaagataacaaaatataaaatcta |
133297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0002 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:
Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 461 - 632
Target Start/End: Original strand, 310880 - 311054
Alignment:
| Q |
461 |
tcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt- |
559 |
Q |
| |
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| T |
310880 |
tcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaacttacgtatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattagta |
310979 |
T |
 |
| Q |
560 |
taagtata--aatccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat |
632 |
Q |
| |
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| ||||| |||||||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
310980 |
catgtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat |
311054 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Original strand, 331454 - 331502
Alignment:
| Q |
662 |
taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
331454 |
taaattataaccacaattataactttaagataacataatataaaatcta |
331502 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Original strand, 311077 - 311125
Alignment:
| Q |
662 |
taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
311077 |
taaattataaccacaattataaatttaagataacaaaatataaaatcta |
311125 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0472 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:
Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 482 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 13477 - 13320
Alignment:
| Q |
482 |
tacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagt-taagtata--aatccaaatac |
578 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |
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|
| T |
13477 |
tacgtcgacgtatttttgcaagaaaattacatatgctaagtttaacaatgagtgcatcttatactacaaataattagtacaagtataataatttaaatat |
13378 |
T |
 |
| Q |
579 |
tttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
|
||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13377 |
ttttatcgttatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
13320 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0196 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0196
Description:
Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 455 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 23385 - 23283
Alignment:
| Q |
455 |
attatgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataa |
554 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
23385 |
attatgtcagcaaataataatatacagtacgtcgccttatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaacaatgagtacatcttatactacaaataa |
23286 |
T |
 |
| Q |
555 |
tta |
557 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
23285 |
tta |
23283 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0196; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 662 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 23230 - 23182
Alignment:
| Q |
662 |
taaattataaccacatttataactttaagataatataatataaaatcta |
710 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
23230 |
taaattataaccacacttataactttaagataacataatataaaatcta |
23182 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0118 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:
Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 459 - 632
Target Start/End: Original strand, 29749 - 29928
Alignment:
| Q |
459 |
tgtcaacaaataataatatacggtacgtcggtgtatttttgcaaaaatattacatatgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattag |
558 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29749 |
tgtcaacaaatattattacacagtacgtcggcgtatttttgcaagaaaattacatatacaaagtttaacaatgaatgaatcttatactacaaataattag |
29848 |
T |
 |
| Q |
559 |
t-taagtata--aatccaaatactttaatc---attatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat |
632 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29849 |
tacaagtataataatccaaatatttttatcattattatatgcaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagat |
29928 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0636 (Bit Score: 66; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0636
Description:
Target: scaffold0636; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 515 - 636
Target Start/End: Original strand, 1 - 125
Alignment:
| Q |
515 |
tgctaagtttaataatgagtacattttatactacaaataattagtt-aagtataa--atccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttca |
611 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1 |
tgctaagtttaacaatgaatgcatcttatactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaatgtttagatatttca |
100 |
T |
 |
| Q |
612 |
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636 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
101 |
aaatatatacaaaattaagatgata |
125 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0582 (Bit Score: 53; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:
Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 540 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 10375 - 10276
Alignment:
| Q |
540 |
ttatactacaaataattagtt-aagtataa--atccaaatactttaatcattatgtggaatgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
636 |
Q |
| |
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|
| T |
10375 |
ttatactacaaataattagtacaagtataataatccaaatatttttatcgttatatgcaacgtttagatatttcaaaatatatacaaaattaagatgata |
10276 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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