View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17151_low_1 (Length: 675)

Name: NF17151_low_1
Description: NF17151
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17151_low_1
NF17151_low_1
[»] chr2 (91 HSPs)
chr2 (347-657)||(2808717-2809028)
chr2 (13-311)||(2808383-2808681)
chr2 (13-308)||(32913115-32913410)
chr2 (13-311)||(6173502-6173802)
chr2 (13-305)||(45128080-45128374)
chr2 (12-311)||(3270139-3270439)
chr2 (13-311)||(7015622-7015921)
chr2 (13-311)||(9986253-9986558)
chr2 (13-311)||(36233875-36234178)
chr2 (25-311)||(30420547-30420836)
chr2 (13-308)||(4192712-4193007)
chr2 (13-311)||(27249062-27249362)
chr2 (13-311)||(21570319-21570619)
chr2 (13-311)||(3725051-3725350)
chr2 (13-267)||(8805781-8806036)
chr2 (24-305)||(40659854-40660134)
chr2 (13-311)||(20046993-20047292)
chr2 (13-311)||(8971539-8971839)
chr2 (62-310)||(34598858-34599108)
chr2 (13-277)||(41430932-41431198)
chr2 (13-307)||(25086908-25087207)
chr2 (23-277)||(26025331-26025587)
chr2 (13-311)||(27477025-27477318)
chr2 (13-306)||(27949299-27949596)
chr2 (13-311)||(459186-459485)
chr2 (12-239)||(3269021-3269251)
chr2 (12-239)||(3269580-3269810)
chr2 (13-257)||(22421660-22421898)
chr2 (13-302)||(4228011-4228293)
chr2 (13-298)||(17319208-17319490)
chr2 (140-311)||(40626066-40626238)
chr2 (161-306)||(32680640-32680788)
chr2 (13-310)||(39641770-39642069)
chr2 (76-199)||(31580563-31580686)
chr2 (13-309)||(37614037-37614334)
chr2 (158-311)||(41712821-41712976)
chr2 (21-290)||(32197715-32197984)
chr2 (13-253)||(8308103-8308339)
chr2 (76-311)||(9374530-9374760)
chr2 (13-165)||(32679021-32679173)
chr2 (13-149)||(84092-84227)
chr2 (21-115)||(40625976-40626070)
chr2 (190-269)||(31581808-31581888)
chr2 (13-92)||(33229051-33229130)
chr2 (53-278)||(38293449-38293679)
chr2 (206-310)||(42949585-42949691)
chr2 (13-98)||(38575396-38575481)
chr2 (13-99)||(41712700-41712785)
chr2 (16-173)||(44881657-44881813)
chr2 (139-201)||(12647990-12648052)
chr2 (16-162)||(18113890-18114035)
chr2 (139-304)||(10237290-10237457)
chr2 (118-252)||(10248077-10248211)
chr2 (226-311)||(24587583-24587669)
chr2 (241-311)||(33229129-33229199)
chr2 (148-209)||(18763431-18763492)
chr2 (574-638)||(2814047-2814111)
chr2 (13-65)||(34600332-34600384)
chr2 (148-204)||(39310928-39310984)
chr2 (57-250)||(36323790-36323981)
chr2 (95-204)||(4904171-4904277)
chr2 (16-211)||(13141457-13141651)
chr2 (148-211)||(36943197-36943260)
chr2 (151-308)||(37876685-37876846)
chr2 (139-306)||(30923510-30923678)
chr2 (97-308)||(35220179-35220397)
chr2 (226-308)||(3308790-3308874)
chr2 (16-306)||(18694922-18695220)
chr2 (148-204)||(1421644-1421700)
chr2 (148-204)||(7677949-7678005)
chr2 (97-173)||(32448647-32448722)
chr2 (86-221)||(11189620-11189755)
chr2 (17-92)||(19028849-19028923)
chr2 (98-173)||(29574657-29574732)
chr2 (226-308)||(32448786-32448869)
chr2 (139-173)||(6358943-6358977)
chr2 (97-201)||(6436579-6436679)
chr2 (148-202)||(7646443-7646497)
chr2 (225-308)||(14955374-14955459)
chr2 (83-113)||(17261606-17261636)
chr2 (140-198)||(34128755-34128813)
chr2 (139-173)||(37416706-37416740)
chr2 (148-307)||(43397195-43397366)
chr2 (97-172)||(4264472-4264544)
chr2 (225-308)||(12648087-12648172)
chr2 (148-204)||(5427944-5428000)
chr2 (148-204)||(7448215-7448271)
chr2 (139-171)||(14416169-14416201)
chr2 (225-308)||(24461290-24461373)
chr2 (101-173)||(37994275-37994347)
chr2 (148-204)||(38445134-38445190)
[»] chr4 (94 HSPs)
chr4 (13-311)||(10389665-10389964)
chr4 (13-311)||(34024349-34024647)
chr4 (13-311)||(25273753-25274061)
chr4 (13-311)||(4643734-4644036)
chr4 (13-311)||(43153925-43154231)
chr4 (13-309)||(9528788-9529087)
chr4 (13-311)||(38706621-38706921)
chr4 (13-311)||(51317863-51318163)
chr4 (13-310)||(31381583-31381881)
chr4 (13-310)||(53616561-53616861)
chr4 (13-311)||(868035-868340)
chr4 (15-308)||(37188508-37188800)
chr4 (13-311)||(50766423-50766720)
chr4 (13-306)||(6972692-6972988)
chr4 (14-311)||(20569130-20569432)
chr4 (13-311)||(43444271-43444570)
chr4 (13-311)||(9283789-9284089)
chr4 (13-311)||(1531784-1532086)
chr4 (13-306)||(10359459-10359752)
chr4 (32-311)||(9645479-9645760)
chr4 (16-267)||(8009275-8009526)
chr4 (13-311)||(35964887-35965186)
chr4 (77-304)||(56194484-56194715)
chr4 (13-311)||(44947281-44947590)
chr4 (13-257)||(29965566-29965813)
chr4 (19-263)||(14183729-14183974)
chr4 (13-311)||(2115499-2115799)
chr4 (13-311)||(18138825-18139124)
chr4 (13-311)||(49126038-49126337)
chr4 (13-306)||(12265338-12265640)
chr4 (18-306)||(21090036-21090315)
chr4 (13-267)||(32952662-32952913)
chr4 (13-196)||(47417657-47417840)
chr4 (13-182)||(49410232-49410401)
chr4 (83-305)||(35261071-35261299)
chr4 (57-311)||(2624375-2624631)
chr4 (13-270)||(49680456-49680715)
chr4 (13-259)||(46991042-46991289)
chr4 (13-187)||(45227952-45228126)
chr4 (14-257)||(52097828-52098076)
chr4 (14-248)||(3336076-3336304)
chr4 (13-311)||(27593740-27594048)
chr4 (194-311)||(47416762-47416881)
chr4 (109-241)||(1931723-1931856)
chr4 (16-125)||(23100745-23100853)
chr4 (226-306)||(5333657-5333736)
chr4 (77-306)||(41255355-41255585)
chr4 (226-299)||(5333585-5333658)
chr4 (97-204)||(28857377-28857484)
chr4 (191-277)||(35351250-35351337)
chr4 (101-239)||(36204415-36204558)
chr4 (97-173)||(52944317-52944393)
chr4 (13-69)||(56199218-56199274)
chr4 (98-173)||(18048889-18048964)
chr4 (16-91)||(28834164-28834238)
chr4 (196-277)||(1008207-1008289)
chr4 (100-173)||(43853448-43853521)
chr4 (148-204)||(32766492-32766548)
chr4 (17-125)||(36184599-36184706)
chr4 (139-290)||(36194592-36194745)
chr4 (139-308)||(4142821-4143002)
chr4 (77-282)||(21554783-21554990)
chr4 (139-247)||(27651872-27651980)
chr4 (139-173)||(22300855-22300889)
chr4 (148-210)||(35348279-35348341)
chr4 (139-173)||(47320460-47320494)
chr4 (15-48)||(9645437-9645470)
chr4 (61-173)||(43353512-43353629)
chr4 (148-209)||(56156717-56156778)
chr4 (148-204)||(22611161-22611217)
chr4 (77-172)||(52204340-52204433)
chr4 (148-204)||(53811006-53811062)
chr4 (148-204)||(56040721-56040777)
chr4 (148-204)||(2520755-2520813)
chr4 (98-173)||(21405532-21405607)
chr4 (151-198)||(29961002-29961049)
chr4 (253-311)||(3338816-3338874)
chr4 (139-173)||(9145955-9145989)
chr4 (154-204)||(11300072-11300122)
chr4 (199-298)||(36184335-36184437)
chr4 (16-69)||(19853445-19853497)
chr4 (16-89)||(21662541-21662613)
chr4 (16-89)||(21671305-21671377)
chr4 (151-204)||(26633749-26633802)
chr4 (98-171)||(36161719-36161792)
chr4 (262-311)||(50179649-50179698)
chr4 (77-121)||(1008319-1008363)
chr4 (101-209)||(2069611-2069718)
chr4 (148-204)||(21686317-21686372)
chr4 (16-92)||(33921155-33921230)
chr4 (148-204)||(44596642-44596698)
chr4 (164-204)||(47158205-47158245)
chr4 (202-257)||(49072858-49072914)
chr4 (97-173)||(51888238-51888314)
[»] chr7 (82 HSPs)
chr7 (13-311)||(35667143-35667442)
chr7 (13-306)||(22927781-22928076)
chr7 (13-309)||(42311148-42311446)
chr7 (13-311)||(35496086-35496386)
chr7 (13-311)||(26492231-26492531)
chr7 (13-311)||(42066973-42067271)
chr7 (13-305)||(48207775-48208066)
chr7 (13-310)||(1448741-1449039)
chr7 (13-311)||(46821880-46822181)
chr7 (23-311)||(1485178-1485467)
chr7 (13-308)||(23425284-23425579)
chr7 (14-311)||(42408228-42408527)
chr7 (13-307)||(45198944-45199238)
chr7 (13-311)||(46338919-46339220)
chr7 (13-309)||(20116451-20116748)
chr7 (13-306)||(23085391-23085687)
chr7 (13-311)||(26583580-26583875)
chr7 (13-306)||(433602-433898)
chr7 (13-311)||(21266258-21266556)
chr7 (13-311)||(14627790-14628091)
chr7 (13-311)||(2843152-2843438)
chr7 (13-246)||(23786508-23786741)
chr7 (13-311)||(31235695-31236004)
chr7 (13-236)||(6558817-6559043)
chr7 (13-307)||(6001891-6002195)
chr7 (13-238)||(17222911-17223136)
chr7 (13-311)||(32684551-32684834)
chr7 (13-211)||(34773679-34773877)
chr7 (13-300)||(35261174-35261463)
chr7 (13-285)||(32521840-32522116)
chr7 (71-310)||(17610998-17611233)
chr7 (13-170)||(19560007-19560164)
chr7 (13-306)||(20083203-20083504)
chr7 (13-211)||(7640686-7640881)
chr7 (13-245)||(46818330-46818561)
chr7 (109-241)||(17499666-17499799)
chr7 (109-241)||(17553415-17553548)
chr7 (13-109)||(13592420-13592515)
chr7 (169-267)||(36143776-36143875)
chr7 (139-308)||(35132794-35132965)
chr7 (139-308)||(1749220-1749389)
chr7 (138-277)||(3860852-3860991)
chr7 (101-201)||(24069425-24069525)
chr7 (101-211)||(969478-969588)
chr7 (148-204)||(37837533-37837589)
chr7 (139-304)||(1100804-1100969)
chr7 (139-209)||(3394426-3394496)
chr7 (148-247)||(24770161-24770262)
chr7 (16-125)||(46244185-46244292)
chr7 (139-277)||(1575113-1575253)
chr7 (148-204)||(8001621-8001677)
chr7 (148-204)||(9450212-9450268)
chr7 (183-249)||(7740568-7740635)
chr7 (101-257)||(5546279-5546437)
chr7 (139-173)||(22742928-22742962)
chr7 (139-308)||(24350910-24351091)
chr7 (139-173)||(28476211-28476245)
chr7 (16-121)||(43369687-43369791)
chr7 (148-204)||(19296830-19296886)
chr7 (148-204)||(30756894-30756950)
chr7 (148-204)||(34899682-34899738)
chr7 (148-204)||(39171665-39171721)
chr7 (97-173)||(41553461-41553537)
chr7 (97-173)||(41553806-41553882)
chr7 (148-204)||(42978570-42978626)
chr7 (95-188)||(3267237-3267327)
chr7 (226-308)||(30756982-30757067)
chr7 (139-247)||(48930686-48930791)
chr7 (194-243)||(43369858-43369908)
chr7 (206-246)||(7640887-7640928)
chr7 (151-204)||(12141386-12141439)
chr7 (270-311)||(12539125-12539166)
chr7 (206-257)||(286682-286734)
chr7 (251-311)||(17499797-17499857)
chr7 (230-307)||(19404922-19405001)
chr7 (148-204)||(26623865-26623921)
chr7 (148-204)||(39328865-39328921)
chr7 (101-173)||(41554155-41554227)
chr7 (139-211)||(44311860-44311932)
chr7 (148-212)||(45349874-45349938)
chr7 (16-92)||(46700118-46700193)
chr7 (148-204)||(47590271-47590327)
[»] chr1 (76 HSPs)
chr1 (13-306)||(51871739-51872033)
chr1 (17-311)||(28035009-28035305)
chr1 (13-311)||(51868556-51868856)
chr1 (13-311)||(9172358-9172660)
chr1 (13-311)||(9180340-9180642)
chr1 (13-311)||(40880924-40881224)
chr1 (13-311)||(25406195-25406495)
chr1 (13-311)||(5324469-5324768)
chr1 (13-311)||(33291329-33291630)
chr1 (13-311)||(5701127-5701429)
chr1 (13-311)||(7342592-7342892)
chr1 (13-304)||(14545397-14545687)
chr1 (13-311)||(50272051-50272351)
chr1 (13-311)||(35584529-35584832)
chr1 (13-309)||(7997659-7997959)
chr1 (13-306)||(45425977-45426268)
chr1 (13-311)||(30818262-30818556)
chr1 (13-257)||(34519057-34519298)
chr1 (13-306)||(50166010-50166305)
chr1 (13-311)||(11453805-11454105)
chr1 (13-311)||(30878945-30879245)
chr1 (13-306)||(38520446-38520739)
chr1 (13-275)||(9919295-9919559)
chr1 (13-304)||(3871285-3871578)
chr1 (15-306)||(20266177-20266470)
chr1 (13-311)||(19715806-19716107)
chr1 (13-305)||(27872615-27872907)
chr1 (13-277)||(39987294-39987558)
chr1 (13-311)||(50148242-50148540)
chr1 (15-311)||(18569224-18569521)
chr1 (14-242)||(31836745-31836975)
chr1 (13-268)||(9687116-9687384)
chr1 (13-311)||(7312017-7312309)
chr1 (77-306)||(44637297-44637527)
chr1 (134-305)||(19723209-19723382)
chr1 (13-306)||(45805739-45806015)
chr1 (13-311)||(40646558-40646844)
chr1 (13-305)||(48365677-48365956)
chr1 (13-306)||(41081615-41081911)
chr1 (13-251)||(39927466-39927705)
chr1 (206-305)||(25728064-25728164)
chr1 (13-193)||(33817079-33817271)
chr1 (13-192)||(33876549-33876740)
chr1 (182-278)||(30558736-30558832)
chr1 (13-92)||(32677041-32677120)
chr1 (13-92)||(19723404-19723483)
chr1 (97-173)||(12635159-12635235)
chr1 (64-173)||(16801310-16801419)
chr1 (148-204)||(5983797-5983853)
chr1 (148-228)||(7836871-7836951)
chr1 (97-173)||(47132892-47132968)
chr1 (97-173)||(49626903-49626978)
chr1 (151-308)||(51916739-51916900)
chr1 (139-173)||(16161823-16161857)
chr1 (138-304)||(19052368-19052536)
chr1 (139-173)||(34413163-34413197)
chr1 (148-204)||(11462523-11462579)
chr1 (139-211)||(19060861-19060933)
chr1 (225-285)||(34528586-34528646)
chr1 (13-44)||(11709618-11709649)
chr1 (148-211)||(21686827-21686890)
chr1 (139-210)||(32679164-32679235)
chr1 (139-247)||(48750096-48750204)
chr1 (154-204)||(7337744-7337794)
chr1 (98-172)||(31692495-31692568)
chr1 (154-204)||(45415519-45415569)
chr1 (96-173)||(799812-799889)
chr1 (140-173)||(9341716-9341749)
chr1 (225-308)||(16161676-16161761)
chr1 (139-212)||(41994377-41994450)
chr1 (226-308)||(49626754-49626838)
chr1 (148-204)||(1742242-1742298)
chr1 (97-173)||(24582940-24583015)
chr1 (13-45)||(27915015-27915047)
chr1 (35-115)||(31317797-31317876)
chr1 (97-173)||(44543262-44543337)
[»] chr3 (81 HSPs)
chr3 (13-306)||(29503331-29503624)
chr3 (13-311)||(25631437-25631738)
chr3 (13-309)||(25162302-25162599)
chr3 (13-311)||(46934506-46934805)
chr3 (13-311)||(49552135-49552434)
chr3 (13-311)||(4178428-4178728)
chr3 (13-309)||(39917309-39917605)
chr3 (13-306)||(32607337-32607632)
chr3 (16-311)||(50611332-50611628)
chr3 (13-310)||(44907310-44907609)
chr3 (13-311)||(38854947-38855247)
chr3 (13-311)||(14464371-14464673)
chr3 (13-311)||(36905985-36906285)
chr3 (13-311)||(12115957-12116261)
chr3 (13-306)||(17237671-17237968)
chr3 (13-311)||(35499109-35499413)
chr3 (13-311)||(51202165-51202460)
chr3 (17-304)||(38440496-38440781)
chr3 (13-289)||(42719406-42719680)
chr3 (13-306)||(22802890-22803193)
chr3 (13-241)||(30648630-30648860)
chr3 (14-202)||(3848831-3849019)
chr3 (139-311)||(4172430-4172604)
chr3 (13-304)||(46178447-46178731)
chr3 (13-211)||(36734604-36734801)
chr3 (53-311)||(37169094-37169353)
chr3 (21-311)||(25849684-25849964)
chr3 (15-253)||(31794001-31794231)
chr3 (140-310)||(2342357-2342528)
chr3 (13-189)||(21488078-21488256)
chr3 (206-306)||(3850560-3850661)
chr3 (13-201)||(6910623-6910802)
chr3 (13-115)||(2342524-2342626)
chr3 (13-95)||(21916555-21916636)
chr3 (147-248)||(47980708-47980811)
chr3 (147-248)||(47989995-47990098)
chr3 (147-248)||(47999282-47999385)
chr3 (147-248)||(48008569-48008672)
chr3 (93-204)||(20464993-20465101)
chr3 (214-290)||(21487996-21488073)
chr3 (155-258)||(30829891-30829995)
chr3 (98-173)||(4396362-4396437)
chr3 (58-175)||(20911614-20911731)
chr3 (226-311)||(36735278-36735363)
chr3 (204-275)||(6913249-6913321)
chr3 (148-204)||(43488665-43488721)
chr3 (138-247)||(51923634-51923743)
chr3 (97-200)||(4821766-4821868)
chr3 (101-172)||(46322356-46322427)
chr3 (153-257)||(54378818-54378923)
chr3 (139-173)||(7546595-7546629)
chr3 (139-173)||(12947343-12947377)
chr3 (139-201)||(29239300-29239362)
chr3 (139-173)||(51487091-51487125)
chr3 (148-204)||(9998424-9998480)
chr3 (148-204)||(10108193-10108249)
chr3 (148-204)||(10233027-10233083)
chr3 (148-204)||(12050723-12050779)
chr3 (84-173)||(24396492-24396585)
chr3 (148-204)||(36461506-36461562)
chr3 (148-204)||(40487282-40487338)
chr3 (259-302)||(6823556-6823599)
chr3 (138-173)||(8914693-8914728)
chr3 (139-173)||(16235407-16235441)
chr3 (139-173)||(27706299-27706333)
chr3 (150-204)||(38860197-38860251)
chr3 (148-202)||(40556671-40556725)
chr3 (139-173)||(42460731-42460765)
chr3 (226-259)||(6902831-6902864)
chr3 (16-173)||(30293419-30293575)
chr3 (151-204)||(31271885-31271938)
chr3 (148-189)||(36910716-36910757)
chr3 (148-189)||(52923192-52923233)
chr3 (148-204)||(6954771-6954827)
chr3 (148-204)||(10229433-10229489)
chr3 (138-170)||(21289886-21289918)
chr3 (52-92)||(26716075-26716115)
chr3 (97-173)||(35175389-35175465)
chr3 (148-204)||(44960027-44960083)
chr3 (148-204)||(45568520-45568576)
chr3 (148-204)||(47896109-47896165)
[»] chr5 (73 HSPs)
chr5 (13-305)||(27266770-27267065)
chr5 (13-289)||(2057749-2058027)
chr5 (14-311)||(16981159-16981457)
chr5 (13-311)||(18677376-18677677)
chr5 (13-305)||(781264-781556)
chr5 (13-311)||(19280856-19281155)
chr5 (13-311)||(7246827-7247127)
chr5 (13-304)||(21060194-21060485)
chr5 (13-311)||(34881579-34881885)
chr5 (16-308)||(7886852-7887145)
chr5 (13-302)||(7150246-7150537)
chr5 (13-311)||(35475249-35475547)
chr5 (13-311)||(7241651-7241952)
chr5 (13-310)||(19259723-19260020)
chr5 (13-311)||(43261730-43262028)
chr5 (13-257)||(30298131-30298375)
chr5 (13-311)||(28235454-28235753)
chr5 (13-311)||(41184351-41184655)
chr5 (47-311)||(36344436-36344700)
chr5 (13-311)||(26578118-26578420)
chr5 (13-311)||(42579746-42580056)
chr5 (13-305)||(3271313-3271612)
chr5 (77-311)||(30371593-30371830)
chr5 (13-311)||(27751783-27752093)
chr5 (13-303)||(43148607-43148895)
chr5 (13-267)||(42886392-42886646)
chr5 (13-308)||(20257607-20257902)
chr5 (16-209)||(10649619-10649809)
chr5 (13-277)||(15570812-15571075)
chr5 (77-267)||(27576325-27576516)
chr5 (13-168)||(4954005-4954160)
chr5 (86-257)||(7613042-7613213)
chr5 (206-311)||(10649322-10649428)
chr5 (131-304)||(11767683-11767859)
chr5 (21-278)||(42432802-42433058)
chr5 (194-311)||(6445805-6445923)
chr5 (139-305)||(14211076-14211242)
chr5 (38-277)||(42432019-42432254)
chr5 (13-113)||(11768070-11768167)
chr5 (83-257)||(19983336-19983514)
chr5 (17-103)||(6445951-6446036)
chr5 (53-306)||(28097027-28097278)
chr5 (138-267)||(1582159-1582288)
chr5 (138-267)||(1602527-1602656)
chr5 (21-143)||(22978843-22978964)
chr5 (156-307)||(11192240-11192392)
chr5 (13-74)||(30298951-30299012)
chr5 (148-204)||(6012213-6012269)
chr5 (159-255)||(1696923-1697021)
chr5 (226-308)||(2979476-2979560)
chr5 (148-249)||(14082448-14082556)
chr5 (16-173)||(19100552-19100708)
chr5 (139-173)||(28540979-28541013)
chr5 (155-204)||(24229866-24229915)
chr5 (148-204)||(9113800-9113856)
chr5 (148-204)||(13007186-13007242)
chr5 (148-204)||(38597754-38597810)
chr5 (13-49)||(41418633-41418669)
chr5 (98-173)||(10332576-10332651)
chr5 (153-204)||(14726541-14726592)
chr5 (139-173)||(19103540-19103574)
chr5 (139-173)||(19349682-19349716)
chr5 (139-173)||(39567283-39567317)
chr5 (144-173)||(2979384-2979413)
chr5 (213-277)||(10148701-10148766)
chr5 (226-308)||(39567136-39567220)
chr5 (16-92)||(6216978-6217053)
chr5 (152-204)||(13421890-13421942)
chr5 (148-204)||(25980115-25980171)
chr5 (148-204)||(26825387-26825443)
chr5 (252-308)||(31391949-31392005)
chr5 (203-277)||(35631792-35631868)
chr5 (16-92)||(35920929-35921004)
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (13-311)||(17237197-17237495)
chr6 (13-311)||(33740489-33740789)
chr6 (13-311)||(12652806-12653110)
chr6 (13-311)||(23947228-23947528)
chr6 (13-311)||(25064101-25064402)
chr6 (13-306)||(16419029-16419324)
chr6 (13-311)||(4088325-4088626)
chr6 (13-311)||(8028029-8028329)
chr6 (13-299)||(4468437-4468724)
chr6 (20-305)||(8196325-8196612)
chr6 (13-311)||(7875955-7876256)
chr6 (13-311)||(7881013-7881314)
chr6 (13-311)||(8496831-8497133)
chr6 (13-306)||(10228550-10228845)
chr6 (13-299)||(12165719-12166005)
chr6 (13-311)||(4984478-4984788)
chr6 (13-257)||(35001510-35001756)
chr6 (13-305)||(28635024-28635327)
chr6 (13-182)||(33110608-33110777)
chr6 (102-309)||(34489116-34489327)
chr6 (13-310)||(33543535-33543830)
chr6 (109-305)||(17334647-17334848)
chr6 (13-248)||(25337499-25337731)
chr6 (186-311)||(33109700-33109826)
chr6 (77-282)||(4351971-4352183)
chr6 (136-214)||(7027799-7027877)
chr6 (13-95)||(7027947-7028029)
chr6 (13-102)||(16892727-16892816)
chr6 (16-229)||(1704065-1704277)
chr6 (97-243)||(26588499-26588648)
chr6 (13-86)||(17334846-17334919)
chr6 (13-61)||(20619585-20619633)
chr6 (101-173)||(22571461-22571533)
chr6 (16-61)||(12059687-12059732)
chr6 (101-173)||(31296807-31296879)
chr6 (93-201)||(31575530-31575638)
chr6 (139-201)||(30493491-30493553)
chr6 (226-267)||(8266545-8266586)
chr6 (139-308)||(1523250-1523425)
chr6 (206-277)||(5582757-5582829)
chr6 (148-204)||(23128577-23128633)
chr6 (148-204)||(32059868-32059924)
chr6 (148-204)||(32327292-32327348)
chr6 (148-204)||(33053243-33053299)
chr6 (195-257)||(13436707-13436770)
chr6 (138-173)||(14801810-14801845)
chr6 (138-173)||(30776655-30776690)
chr6 (139-173)||(8102709-8102743)
chr6 (139-172)||(546014-546047)
chr6 (138-211)||(28981126-28981199)
chr6 (155-204)||(34018519-34018568)
chr6 (148-204)||(68076-68132)
chr6 (148-204)||(606163-606219)
chr6 (148-204)||(7515277-7515333)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (13-311)||(42447938-42448239)
chr8 (13-311)||(44099847-44100143)
chr8 (13-311)||(11725555-11725853)
chr8 (13-311)||(4808837-4809137)
chr8 (13-305)||(35580337-35580629)
chr8 (13-310)||(11196766-11197056)
chr8 (13-311)||(19876085-19876383)
chr8 (20-306)||(33895959-33896248)
chr8 (13-311)||(9619268-9619569)
chr8 (13-308)||(34611680-34611977)
chr8 (13-311)||(2655742-2656043)
chr8 (13-311)||(43890035-43890336)
chr8 (13-311)||(9072590-9072891)
chr8 (13-306)||(32724392-32724695)
chr8 (13-307)||(11464049-11464344)
chr8 (13-311)||(14906834-14907135)
chr8 (13-257)||(43192258-43192502)
chr8 (13-311)||(44577909-44578203)
chr8 (13-311)||(9498510-9498812)
chr8 (13-306)||(28239711-28240014)
chr8 (13-303)||(29777110-29777392)
chr8 (13-299)||(37565790-37566079)
chr8 (13-311)||(17949120-17949408)
chr8 (14-311)||(33342310-33342606)
chr8 (15-311)||(15597081-15597378)
chr8 (13-290)||(16794187-16794464)
chr8 (13-307)||(27747026-27747319)
chr8 (13-259)||(33298781-33299027)
chr8 (13-248)||(39153054-39153293)
chr8 (13-165)||(23851405-23851557)
chr8 (13-311)||(15046765-15047065)
chr8 (13-124)||(43135490-43135600)
chr8 (139-278)||(36532804-36532944)
chr8 (97-199)||(5333391-5333493)
chr8 (140-211)||(8443579-8443650)
chr8 (145-267)||(18733938-18734061)
chr8 (98-168)||(15889574-15889644)
chr8 (97-277)||(17427211-17427395)
chr8 (148-308)||(37971135-37971299)
chr8 (148-204)||(7883314-7883370)
chr8 (190-305)||(12173381-12173495)
chr8 (190-305)||(12417809-12417923)
chr8 (148-204)||(23230603-23230659)
chr8 (182-308)||(31013688-31013817)
chr8 (16-160)||(35812688-35812830)
chr8 (203-277)||(17430970-17431045)
chr8 (148-211)||(20553314-20553377)
chr8 (97-211)||(1236722-1236835)
chr8 (97-211)||(1239422-1239535)
chr8 (99-173)||(29617301-29617375)
chr8 (97-173)||(15344297-15344372)
chr8 (97-173)||(15433362-15433437)
chr8 (97-173)||(15524666-15524741)
chr8 (139-171)||(39657440-39657472)
chr8 (139-173)||(18890770-18890804)
chr8 (139-173)||(41896501-41896535)
chr8 (205-265)||(25241706-25241767)
chr8 (152-204)||(3673401-3673453)
chr8 (226-285)||(14585565-14585627)
chr8 (145-173)||(14585690-14585718)
chr8 (139-211)||(20227347-20227419)
chr8 (101-173)||(24099284-24099356)
chr8 (217-311)||(24853554-24853650)
[»] scaffold0495 (1 HSPs)
scaffold0495 (13-306)||(5269-5564)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (13-306)||(16231-16528)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (13-263)||(201284-201534)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (13-311)||(361710-362005)
[»] scaffold0311 (2 HSPs)
scaffold0311 (167-311)||(8586-8731)
scaffold0311 (13-125)||(8745-8857)
[»] scaffold0426 (2 HSPs)
scaffold0426 (13-191)||(6293-6471)
scaffold0426 (226-305)||(6210-6289)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (17-211)||(83353-83544)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (108-308)||(20402-20600)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (81-257)||(453853-454030)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (101-173)||(6016-6088)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (16-165)||(34695-34843)
[»] scaffold0888 (1 HSPs)
scaffold0888 (139-308)||(1751-1922)
[»] scaffold0127 (2 HSPs)
scaffold0127 (148-204)||(15449-15505)
scaffold0127 (230-308)||(15333-15413)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (148-204)||(32822-32878)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (54-173)||(36639-36758)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (225-308)||(58242-58327)
[»] scaffold0608 (1 HSPs)
scaffold0608 (262-311)||(108-157)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (16-69)||(50880-50932)
[»] scaffold0884 (1 HSPs)
scaffold0884 (148-204)||(2048-2104)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (148-204)||(1302-1358)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (16-92)||(31207-31282)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 91)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 347 - 657
Target Start/End: Original strand, 2808717 - 2809028
Alignment:
Q  347 ttagggccggcttattggagagggagaaaacacatatgtaataaacatactattgagtcgcgaaaaaggtcac-acaatacgagttaccgaaataaatgt 445  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  2808717 ttagggccgacttgatggagagggagaaaacacatatgtaataaacatactattaagtcgcgaaaaaggtcaccacaataggagttaccgaaagaaatgt 2808816  T
Q  446 aattggatccatcaatattaattttgaaataacttaggaggtttccacttgatgagaatttcaatttgagtgtcactcaagtaagcaggagggcactgca 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2808817 aattggatccatcaatattaattttgaaataacttaggaggtttccacttgatgagaatttcaatttgagtgtcactcaagtaagcaggagggcactgca 2808916  T
Q  546 aagttgagtatgaataacatccacttaattacctaaactaatcatgaattactcagggtaatatgaaatttttgagaaaattatcttatttttgtcaaac 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2808917 aagttgagtatgaataacatccacttaattacctaaactaatcatgaattactcggggtaatatgaaatttttgagaaaattatcttatttttgtcaaac 2809016  T
Q  646 caaagcatacaa 657  Q
    ||||||||||||    
T  2809017 caaagcatacaa 2809028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 2808383 - 2808681
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2808383 aatatatgataaaattaaagtgatcggaatatccatggcttccggatctgcaacgttgacgccaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 2808482  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2808483 tcagatgaacatcgcaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaac 2808581  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2808582 ctagatctatgtgaaaatcacttatttagactgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctcaat 2808681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32913410 - 32913115
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32913410 aatatatgataaaattaaagtgaccgtaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctt-caatatgaa 32913312  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32913311 tcagatgaacaccgtaagaagacggaaaatcaaacagcgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 32913212  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  32913211 ctagatctatgtgaaaatcacttatttaaattgaaatatagagaaaaggatcaagaggggtgatttcaggtcaagaattgatccaaaaccacccctc 32913115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6173802 - 6173502
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6173802 aatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaatgatcgatctttcaatatgaa 6173703  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaa 211  Q
    ||| |||||||||| |  || | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6173702 tcaaatgaacaccgcacaaagatggaaaatcaaacaacgccacacaagacaacgaacaacaaaccaccacacttcgatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 6173603  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  6173602 cctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaagaatagaccgaaaaccacccctcaa 6173503  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  6173502 t 6173502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 45128374 - 45128080
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||    
T  45128374 aatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgtccaaatctttgattgaataattgatatttcaataggaa 45128275  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaa 211  Q
    | | |||||||||| ||||| | |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45128274 taaaatgaacaccgcaagaagatgagaaagcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 45128175  T
Q  212 cctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccaccc 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  45128174 cctagatctatgtgaaagtcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccaccc 45128080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 3270139 - 3270439
Alignment:
Q  12 gaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatga 111  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3270139 gaatatatagtaaaattaaagtgaccggaatatccatgacctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatga 3270238  T
Q  112 atcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 211  Q
    |||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3270239 atcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccccacaaaacgacgaacaacaagccaccacacttagatgatgaaatcacaaaaaaaaaa 3270338  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3270339 cctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaaaagaaaaagatgaaaatgagtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctcaa 3270438  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  3270439 t 3270439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 7015622 - 7015921
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7015622 aatatatgataaaattaaagcgacgggaatatccatggcattcggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatatttcaatatgaa 7015721  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7015722 tcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaggaaaaaac 7015821  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  7015822 ctaaatctatgtgaaaatcaattatttagattgaaataaagagaaaaagattaggaggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccaacccccaat 7015921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 9986253 - 9986558
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9986253 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatggcctccgaatctgcaacgttgacgcccaaatctttaattgaataatcgatctttcaatatgaa 9986352  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaa---- 208  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  9986353 tcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaat 9986452  T
Q  209 aaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaataga--tgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccaccc 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |  ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9986453 aaacctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaattagagataaaaaaaattgaagagggatgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccaccc 9986552  T
Q  306 ctcaat 311  Q
    ||||||    
T  9986553 ctcaat 9986558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36234178 - 36233875
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36234178 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaa 36234079  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  36234078 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaaaaatcaccacacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaa 36233979  T
Q  213 ----ctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccct 307  Q
        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36233978 aaatctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcatgaattgacccaaaaccacccct 36233879  T
Q  308 caat 311  Q
    ||||    
T  36233878 caat 36233875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 25 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30420836 - 30420547
Alignment:
Q  25 aattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacac 124  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30420836 aattaaagtgactggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatctatctttcaatatgaatcaaatgaacac 30420737  T
Q  125 cgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa--aaaacctagatctat 222  Q
    || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  30420736 cgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaaacctagatctat 30420637  T
Q  223 gtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  30420636 gtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaaaaattgatccaaaaccacccctcaat 30420547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4193007 - 4192712
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  4193007 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatctatggcctccggatctgcaacgttgacgctcaaatctttgacggaataatcgatctt-caaaatgaa 4192909  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    |||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4192908 tcagatgaacactgcaagaagacgggaaatcaaacaacaccacacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 4192809  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||| | |||||||||| ||||    
T  4192808 ctaaatatatgtgaaaatcacttatttagattgaaatatagagaaaaagatgaagaggggtgatctcaggtcaaaaattgatccaaaaccacacctc 4192712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 27249062 - 27249362
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27249062 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctcaggatctgcaacgctgacgcccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaa 27249161  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||    
T  27249162 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatcttgaaattacaaagaaaaaaa 27249261  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  27249262 cctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaagtattgacccaaaaccacccttcaa 27249361  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  27249362 t 27249362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 21570319 - 21570619
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21570319 aatatatgataaaattaaagtgaacggaatattcatggcctccggatctgcaacattgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctt-caatatgaa 21570417  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcac--aaagaaaaa 210  Q
    ||| ||||||||||  |||| |||| |||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  21570418 tcaaatgaacaccgcgagaagacgggaaactaaacaacgtcacacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaaaaaaaaaa 21570517  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  21570518 atctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatatagagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccaccactca 21570617  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  21570618 at 21570619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3725350 - 3725051
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3725350 aatatatgaaaaaattaaagtgatcggaatatctatggcctctggatctacaacgttgacgctcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 3725251  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| | |||||||  |  || |||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  3725250 tcaaacgaacaccacacaaagacgagaaatcaaacaacgccgtacaagacaacgaacaacaaaccaccacacttagacgatgaaatcacaaagaaaaaat 3725151  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3725150 caagatctatgtgaaaatcacttatttatattgaaatagagagaaaaagatgaagaggaatgattttaggtcaaaaattgacccaaaaccacccctcaat 3725051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8806036 - 8805781
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8806036 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgacctccgaatctgcaacgttgacgccaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 8805937  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||  | ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8805936 tcaaatgaacaccacacgaagacgggaaatcaaacaacgtcgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacactcagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 8805837  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaaga 267  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||    
T  8805836 ctagatccatgtgaaaatcacttatttaaattgaaataaagagaaaaatatgaaga 8805781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 305
Target Start/End: Original strand, 40659854 - 40660134
Alignment:
Q  24 aaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaaca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||    
T  40659854 aaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctccaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcagtaagaatcaaatgagca 40659953  T
Q  124 ccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatg 223  Q
     || | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40659954 tcggacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaagcaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaatctagatctatg 40660053  T
Q  224 tg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccaccc 305  Q
    || |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  40660054 tgaaaatcacttatttagattgaaat--agagaaaaagatgaagatgtgtgatttcaggtcaagaattgactcaaaaccaccc 40660134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 20046993 - 20047292
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20046993 aatatatgataaaattaaagtcaccggaatattcatggcctccggatctgcaacgttgatgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaa 20047092  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    | | |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20047093 taaaatgaacaccgtaagaagacatgaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaatgaaaaaaa 20047192  T
Q  212 cctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||| |||    
T  20047193 cctaaatctatgtaaaagtcacttatttagattgaaaaagagagaaaaagatgaata-gggtgatttcaggtcaagaattgatccaaaactaccccccaa 20047291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 8971539 - 8971839
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||    |||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  8971539 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatcaatgacatctggatctgcaacgttgacatccaaatctttaattga-taattgatctttcattatgaa 8971637  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| ||||||| || | ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8971638 tcaaatgaacatcgcacgaagatgggaaatcaaacaacgctgcacaagacgacgaacaacaaaccaccatacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 8971737  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaat--agagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8971738 ctagatctatgtgaaaatcacttatttagattaaaataaagagagaaaaagatgaagagggatgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctca 8971837  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  8971838 at 8971839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 62 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34599108 - 34598858
Alignment:
Q  62 gcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaaga 161  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  34599108 gcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcacgaagatggaaaatcaaacaacgccgcacaaga 34599009  T
Q  162 cgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatag 260  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34599008 cgatgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaaaaaaaaaactagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaag 34598909  T
Q  261 atgaaga-ggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    ||||||| | | |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  34598908 atgaagatgagttgatttgaggtcaagaattgatccaaaaccacccctcaa 34598858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41431198 - 41430932
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  || |||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  41431198 aatatatgataaaattaaagtcatcggaatatccatggtctctggatctgcaacgttgacatccaaatctttgattgaataatcgatctttcaattggaa 41431099  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaa-a 211  Q
    | | |||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41431098 taaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaca 41430999  T
Q  212 cctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattt 277  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  41430998 cctagatctatgtaaaagtgacttatttagattgaaatatagagaaaaagatgaagaggggtgattt 41430932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25087207 - 25086908
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25087207 aatatatgataagattaaagtgactggaatatccatggcttctgaatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaataatcgatcttttaatatgaa 25087108  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    | |  ||||||| | ||||| | || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  25087107 taaattgaacactgcaagaagaagggaaagcaaacaacgtcgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcaaaaataaaaaac 25087008  T
Q  213 ctagatctatgtgaaa-----tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccct 307  Q
    ||||||||||||||||     |||||||| |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25087007 ctagatctatgtgaaaatcactcacttatatagattcaaatagatggaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaataattgacccaaaaccacccct 25086908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 277
Target Start/End: Original strand, 26025331 - 26025587
Alignment:
Q  23 aaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaac 122  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||| || || |  |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26025331 aaaattaaagtgactggaatattcatcgcctccggatctgcaacattgacacccaaatttttgattgaataaccgatctttcaagatgaatcaaatgaac 26025430  T
Q  123 accgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctat 222  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26025431 accgcaagaagacgaaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaccaacaaactaccacacttacatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctat 26025530  T
Q  223 gtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaaga-ggggtgattt 277  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26025531 gtgaaaaccacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagatggggtgattt 26025587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27477318 - 27477025
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgg-cttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27477318 aatatatgataaaattaaagtgaccgaaatatctatggtcttccg-atctgcaacgttgatgcccaaatctttgattgaataatcgatc-ttcaatatga 27477221  T
Q  112 atcagatgaacaccg-taagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaa 210  Q
    |||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||    
T  27477220 atcaaatgaacaccgcaaagaagacggaaaatcaaacagcgccgcacaagactacaaacaacaaaccacc------agatgatgaaatcacaaagaaaaa 27477127  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  27477126 atctagatctatgtgaaaattacttatttagattgaaatatagagaaaaagatgaagaggggtgatttcatgtcaataattgacccaaaaccatccctca 27477027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27949596 - 27949299
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27949596 aatatatgataaaattaaagtgactggaatatccatggcctttggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataattgatctttcgatatgaa 27949497  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcaca----aagaaa 208  Q
    ||| ||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    || |||    
T  27949496 tcaaatgaacatcgcaagaagacgggaaatcaaacaacgccgtacaagacgacgaacaataaaccaccacacttagatgatgaaatcgcaatagaaaaaa 27949397  T
Q  209 aaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| | | ||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  27949396 aaacctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaacagagcgaaaaggatgaata-gtgtgatttcaggtcaagaattgtcccaaaatcacccc 27949299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 459186 - 459485
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  459186 aatatatgataaaattaaaatgactgaaatacctatg-catccggatctgcaacgttgacgcctaaatctttgattaaataatcgatctttcaatatgaa 459284  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||| ||| ||||||    
T  459285 tcaaatgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgtcgtacaagacgacgaacagcacaccacgacactcagatgacgaaatcacgaagaaaaaaa 459384  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  459385 cctatatctatgtgaaaatcgcttatttaaaatgaaatagagagaaaaggatgaagaggggtgatttcaggtcaaaaattgacccaaaaccacccctcaa 459484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 239
Target Start/End: Original strand, 3269021 - 3269251
Alignment:
Q  12 gaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatga 111  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3269021 gaatatatagtaaaattaaagtgaccggaatatccatgacctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatga 3269120  T
Q  112 atcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcac--aaagaaaa 209  Q
    |||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  3269121 atcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccccacaaaacgacgaacaacaagccaccacacttagatgatgaaatcacaaaaaaaaaa 3269220  T
Q  210 aacctagatctatgtg-aaatcacttattta 239  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3269221 aacctagatctatgtgaaaatcacttattta 3269251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 239
Target Start/End: Original strand, 3269580 - 3269810
Alignment:
Q  12 gaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatga 111  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3269580 gaatatatagtaaaattaaagtgaccggaatatccatgacctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatga 3269679  T
Q  112 atcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcac--aaagaaaa 209  Q
    |||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  3269680 atcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccccacaaaacgacgaacaacaagccaccacacttagatgatgaaatcacaaaaaaaaaa 3269779  T
Q  210 aacctagatctatgtg-aaatcacttattta 239  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3269780 aacctagatctatgtgaaaatcacttattta 3269810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22421898 - 22421660
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||||| |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22421898 aatatatgataaaactaaagtgaccggaatatc-------tccggatctgtaacgttgacgcccaaatcattgattgaataatcgatctttcaatacgaa 22421806  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| ||||| | || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22421805 tcaaatgaacaccgcaagaagatgggaaatcaaacaacaccgcgcaagatgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 22421706  T
Q  213 ctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaa 257  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22421705 ctagatctatgtgaaagtcacttatttagattgaaatagagagaaa 22421660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 4228293 - 4228011
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaa-ttaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatga 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||||        ||    
T  4228293 aatatatgataaaaattaaagtgatcggaatatccatgacctccggatctgcaacgtt---gcctaaatctttgattgaataatcgatct--------ga 4228205  T
Q  112 atcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa--aa 209  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  4228204 atcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccatcacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 4228105  T
Q  210 aacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaacca 302  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4228104 aacatagatctatgtgtaaatcacttatttatattgaaataaagataaaaatatgaagatgtgtgatttcaggtcaagaattgacccaaaacca 4228011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 17319490 - 17319208
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatcttt-gattgaataatcgatctttcaatatga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17319490 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatg-ctttcggatctgcaacgttgacgctcaaatcttttgattgaataatcgatctt-caatatga 17319393  T
Q  112 atcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 211  Q
     ||| |||||||||| || || |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||    
T  17319392 gtcaaatgaacaccgcaacaagacggaaaatcaa-caacgctgcacaagacgaagaacaacacaccaccacactcagatgacgaaatcatgaagaaaaaa 17319294  T
Q  212 cctagatctatgtgaaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaa 298  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||    
T  17319293 cctagatctatgtgaaaatagttatttagattgaaatagatagaaa-aaatgaggagggatgatttcaggtcaaaaattgacccaaa 17319208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 140 - 311
Target Start/End: Original strand, 40626066 - 40626238
Alignment:
Q  140 aatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttattt 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  40626066 aatcaaacaacaccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacgtagatctatgtgaaaatcccttattt 40626165  T
Q  239 agattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  40626166 agattgaaatagagagaaaaagacgaagaggggtgatttcaggtcaagaatagacccaaaatcacccctcaat 40626238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 161 - 306
Target Start/End: Original strand, 32680640 - 32680788
Alignment:
Q  161 acgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag--aaaaaacctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaa 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32680640 acgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaaacctagatctatgtgaaagtcacttatttagattgaaatagagagaaa 32680739  T
Q  258 tagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
     ||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  32680740 aagatgaagatgagtgatttcaggtcaagaatcgaccgaaaaccacccc 32680788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 310
Target Start/End: Original strand, 39641770 - 39642069
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||  | | || ||||||||||||||||| | ||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39641770 aatatatgataaaataaaagtgactgaaatactcgt-gcctccggatctgcaacgttgatgcccaaattttggattgaataattgatctttcaatatgaa 39641868  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag--aaaaa 210  Q
    | | ||||| |||| || || |||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||   ||||| ||| | ||||||||||||||| |||  |||||    
T  39641869 ttaaatgaataccgcaacaagacgggaaatcaaacaatgacgcacaagatgacgaacaaactaccacaacattcagatgatgaaatcacgaagaaaaaaa 39641968  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||| |||| | ||||| |||| |||||    
T  39641969 acctagatctatgtgaaaatcatttatttaaattgaaatagagagaaaaagatgaagataagtgatttcaggtcaaaaattgatccaaagccactcctca 39642068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 76 - 199
Target Start/End: Original strand, 31580563 - 31580686
Alignment:
Q  76 aaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaa 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31580563 aaaatctttgatttaataatcgatctttcaatataaatcaaatgaacaccgcacgaatacgggaaataaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaa 31580662  T
Q  176 ccaccacacttagatgatgaaatc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  31580663 ccaccacacttagatgatgaaatc 31580686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 309
Target Start/End: Original strand, 37614037 - 37614334
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| || ||| |||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37614037 aatatatgataaaattaaagtgattggaatactcatgtctcccg-atctgcaacgttgacacaaaaatatttgattgaataatcaatctttcaatatgaa 37614135  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacact-tagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 211  Q
    ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||  |||| | |||| ||| ||| | |||    
T  37614136 tcaaatgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaacgacgcacaagacgaagaacaacacatcaccacactcaagattacgaaaccacgaag-acaaa 37614234  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagag--aaatagatgaagag-gggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccct 307  Q
      ||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||| | | ||||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  37614235 tttagatctatatgaaaatcacttatttag--tgaaatagagagaaaaaaagatgaagcgagagtgatttcaggtcaaaaattaatccaaaactacccct 37614332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 311
Target Start/End: Original strand, 41712821 - 41712976
Alignment:
Q  158 aagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa-cctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagaga 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  41712821 aagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgaggaaatcacagagaaaaaaacctaaatctatgtgaaaatcacttatttagattaaaatagagaga 41712920  T
Q  256 aatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||  |||||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41712921 aaatgatgaaaatgggtgatttcacgtcaagaattaacccaaaaccacccctcaat 41712976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 290
Target Start/End: Original strand, 32197715 - 32197984
Alignment:
Q  21 ataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatga 120  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||| || ||||  |||| ||||||| |||| || || ||| ||||||||||| ||||    
T  32197715 ataaaattagagtgaccagaataaccatg-catccggatctgcaacattgacgcccaaatatttgattaaatagtcaatattttaatatgaatcaaatga 32197813  T
Q  121 acaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatct 220  Q
    |||||| || || || | ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  32197814 acaccgcaacaagacaggaaatcaaacaatgccgcgcaagacgatgggcaacacactaccacacttagatgacgaaatcacaaagaaaaaacctaaattt 32197913  T
Q  221 atg-tgaaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatt 290  Q
    |||   |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  32197914 atgcaaaaatcatttatttatattgaaataaagagaaaaagatgaagatgagtgatttttggtcaaaaatt 32197984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8308339 - 8308103
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||   ||| | ||||||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8308339 aatatatgataaagttaaagtgattggaatagttatg-catccggatctgcaacgttgacgtccaattctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 8308241  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| ||||| || | || ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | ||||| | |||||| |||||||| ||||||||||    
T  8308240 tcaaatgaaaactgcaacaatacag-aaatcaaacaacgctgcacaagacgacgaacaac-acgcgccacagtcagatgacgaaatcacgaagaaaaaac 8308143  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagaga 253  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  8308142 ctagatctatgtgaaaatcac--atttagattgaattagaga 8308103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 311
Target Start/End: Original strand, 9374530 - 9374760
Alignment:
Q  76 aaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaa 175  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||  || || |||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||| |    
T  9374530 aaaatctttgattgaataatcgttctttcaaaatgaatcaaatgaacaccacaacaagacggaaaaacaaacaatgacgcacaagatgacgaacaacaca 9374629  T
Q  176 ccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtga 274  Q
    |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||      ||||||| ||||| |||||||||  | |||    
T  9374630 ccaccacaataagatgacgaaatcacgaagaaaaatcttagatttatgtgaaaatcccttattt------aaatagaaagaaaaagatgaagaatgttga 9374723  T
Q  275 ttttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||| | ||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  9374724 tttcatgtcaaaaattgacccaaaaccatccctcaat 9374760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 165
Target Start/End: Original strand, 32679021 - 32679173
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32679021 aatatatgataaaattaaagtcaccggaatatctatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataagaa 32679120  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 165  Q
    | | ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  32679121 taaaatgaacatcgcaagaagacaggaaagcaaacaacgccacacaagacgac 32679173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 149
Target Start/End: Original strand, 84092 - 84227
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  84092 aatatatgataaaattaaagtggccggaatatccatgacatccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgat-tttcaatatgaa 84190  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaa 149  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| |||||||||||    
T  84191 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaa 84227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 115
Target Start/End: Original strand, 40625976 - 40626070
Alignment:
Q  21 ataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatca 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40625976 ataaaattaaagtgaccggaatatccatggccgccggatctgcaacgttgacgatcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatca 40626070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 190 - 269
Target Start/End: Original strand, 31581808 - 31581888
Alignment:
Q  190 tgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagagg 269  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31581808 tgatgaaatcaaaaagaaaaaaactagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagagg 31581888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Original strand, 33229051 - 33229130
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaat 92  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  33229051 aatatatgataaaattaaagtgactggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 33229130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 38293679 - 38293449
Alignment:
Q  53 tccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgc 152  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||||| |||| |||||| ||||| || || |||||||  | || || |||| | |||||||||||     
T  38293679 tccggatctacaacgttgacgctcgaatcattgattgaacaatcaatcttttaatataaaccaaatgaacattgcaataagacgggatatcaaacaacgt 38293580  T
Q  153 cgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaa-----acctagatctatgtgaaatcacttatttagattgaaa 247  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||  ||||   | || |||||||| ||||||||     | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38293579 cacacaagacgacgaacaacataacactgcactcgtacgaagaaatcacgaagaaaaaaaaagaactagatctatgtgaaatcacttattttgattgaaa 38293480  T
Q  248 tagagagaaatagatgaagaggggtgatttt 278  Q
    || | |||||  |||||||| | ||||||||    
T  38293479 tacatagaaaatgatgaagatgagtgatttt 38293449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 206 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 42949691 - 42949585
Alignment:
Q  206 aaaaaacctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaata-gatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccac 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||| ||  |||| |||    
T  42949691 aaaaaacctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaaagatgaagaggggtgatttcaagtcaagaattaacataaaatcac 42949592  T
Q  304 ccctcaa 310  Q
    |||||||    
T  42949591 ccctcaa 42949585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 38575396 - 38575481
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcga 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  38575396 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatcga 38575481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 99
Target Start/End: Original strand, 41712700 - 41712785
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgat 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41712700 aatatatgataaaattaaaatgaccggaatattcatggcctccgtatctgcaacgttgacgctcaaatctttga-tgaataatcgat 41712785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 173
Target Start/End: Original strand, 44881657 - 44881813
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| || |||||||||||| ||||| |   ||||  ||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  44881657 atatgataaaattaaagtgaccgaaatactcatgtct-ccggatctgcaatgttaatgtgcaaattattgattgaataactaatcttttaatatgaatca 44881755  T
Q  116 gatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
     |||||||  ||||||| ||  ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  44881756 aatgaacattgtaagaagacaaaaaataaaataatgccgcacaagatgacgaacaaca 44881813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 201
Target Start/End: Original strand, 12647990 - 12648052
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||    
T  12647990 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacaccgcacttagacgatgaaatcac 12648052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18114035 - 18113890
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatca 115  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||| ||  |||  |||||||||||||| ||    ||||| || |||||||||  ||| |||||||||||| ||    
T  18114035 atatgataaaattaaattgatcgaaatatcgatatcttt-ggatctgcaacgttgacatccaaatcatttattgaataactgatatttcaatatgaacca 18113937  T
Q  116 gatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagac 162  Q
     || ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18113936 tattaacaccgcaataagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagac 18113890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 304
Target Start/End: Original strand, 10237290 - 10237457
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcac-aaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttat 236  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |  | |||| ||| || |||||||| |||||||||  || ||| |||||| |||||||||||    
T  10237290 aaatcaaagaacgctgcacaagacgacgaacaacacaacgtcgcactaagacgacgaaatcacgaaagaaaaa--cttgatgtatgtgaaaatcacttat 10237387  T
Q  237 ttagattgaaatagagag--aaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacc 304  Q
    ||||||||||| | || |  ||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||| ||||    
T  10237388 ttagattgaaagaaaggggaaaaaagatgtagaggggtgattctaggtcaaaaattgacctaaaatcacc 10237457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10248211 - 10248077
Alignment:
Q  118 tgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctaga 217  Q
    ||||||||| || || |||| |||| ||| ||||||  | |||||| | ||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||| |||||||| ||||||    
T  10248211 tgaacaccgcaataaaacgggaaataaaaaaacgccatataagacggcaaacaacacaccgccacactcagatgacgaagtcacgaagaaaaa-cctaga 10248113  T
Q  218 tctatgt-gaaatcacttatttagattgaaatagag 252  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10248112 tctatatagaaatcacttaattagattgaaatagag 10248077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24587669 - 24587583
Alignment:
Q  226 aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaacca-cccctcaat 311  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  24587669 aaatcatttatttaaattgaaatatagataaaaagatgaagagaggtgattttgggtcaaaaattgacccaaaaccatcccctcaat 24587583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 311
Target Start/End: Original strand, 33229129 - 33229199
Alignment:
Q  241 attgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  33229129 attgaaatagagaaaaaaagatgaagagaggtgattttagctcaataattgacccaaaaccacccttcaat 33229199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18763492 - 18763431
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18763492 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacaccgcacttagacgatgaaatcacaaaaaaaa 18763431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 574 - 638
Target Start/End: Original strand, 2814047 - 2814111
Alignment:
Q  574 ttacctaaactaatcatgaattactcagggtaatatgaaatttttgagaaaattatcttattttt 638  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || | ||||| |||||||||||    
T  2814047 ttacctaaactaatcatgaattgctcagggtaatatgagattcttaataaaatgatcttattttt 2814111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 34600384 - 34600332
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaa 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  34600384 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggcctccgaatctgcaa 34600332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 39310928 - 39310984
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39310928 aacgctgcacaagacgaagaacaacacaacaccacacttagatgatgaaatcacaaa 39310984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36323981 - 36323790
Alignment:
Q  57 gatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgca 156  Q
    ||||||||||||| |||   ||| | ||||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||    || || |||  |||||||||   ||||||    
T  36323981 gatctgcaacgttgacgtccaaaccattgattgaataacagatctttcaataggaaccaaatgaacatttcaacaagacgagaaatcaaac---gccgca 36323885  T
Q  157 caagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatag 250  Q
    |||||| || ||||||| |   || |||| | | || ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  36323884 caagacaacaaacaacacaaagccgcactcaaacgacgaaatcacagagaaaaaacctaaatctatgtgaaaatcacttatttagaatgtaatag 36323790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 204
Target Start/End: Original strand, 4904171 - 4904277
Alignment:
Q  95 tcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatg 194  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||| || || ||  ||||||||||   | ||||||||||||||||||||| | | |||||||| || || |    
T  4904171 tcgatctttcaatatgaaccaaacgaacaccgcaacaagacacaaaatcaaac---gtcgcacaagacgacgaacaacacaacgccacactttgacgacg 4904267  T
Q  195 aaatcacaaa 204  Q
    ||||||||||    
T  4904268 aaatcacaaa 4904277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13141651 - 13141457
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatca 115  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||||| |||| |||| | |||| ||||||| |||   ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||| ||    
T  13141651 atatgataaactaaaagtggctggaatattcatg-cttcagaatctacaacgttgacgtccaaatcattgatcgaatagtcgatctttaaataggaacca 13141553  T
Q  116 gatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 211  Q
     ||||| |||  || || ||  |||||||||||||   |||||| ||||||||||||| |    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13141552 aatgaataccaaaacaagacataaaatcaaacaacaatgcacaaaacgacgaacaacacaaagtcacatttagacgatgaaatcacgaagaaaaaa 13141457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 211
Target Start/End: Original strand, 36943197 - 36943260
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  36943197 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaaaaaaaaa 36943260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 37876685 - 37876846
Alignment:
Q  151 gccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaata 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||  ||||||||||  |||||  | |||  ||||| ||| |||||||||||||| ||| |    
T  37876685 gccgcacaagacgacgaacaacaaaacgccgcacttagacgaccaaatcacaaaagaaaaaatttgatagatgtgaaaaccacttatttagattaaaaga 37876784  T
Q  250 ga---gagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
     |   | |||| ||||| | | |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  37876785 aaaaggggaaaaagatgtacaagggtgattctaggtcaaaaattgacctaaaaccacccctc 37876846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 306
Target Start/End: Original strand, 30923510 - 30923678
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac---ctagatctatgtgaaa-tcactt 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| | | ||||||  ||| || |||||||||||| | |||    || ||||||||| ||| ||| ||    
T  30923510 aaatcaaa-aacgccgcacaagacgacatacaacacagcgccacacccagacgacgaaatcacaaaggagaaattatcttgatctatgtaaaaatcattt 30923608  T
Q  235 atttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    ||||||||||||||  |||| || ||||||||| |||||||||  |||||| |||| ||| ||||| |||||    
T  30923609 atttagattgaaat--agagtaaaagatgaagatgggtgatttcgggtcaaaaattgacctaaaacgacccc 30923678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35220397 - 35220179
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaa 196  Q
    |||||||||||| |||  | ||||||||||| | || ||| ||||||||||   |||||||||||||| |||||||| |   || |||||||| || |||    
T  35220397 gatctttcaataggaactaaatgaacaccgtgacaaaacgcaaaatcaaac---gccgcacaagacgatgaacaacataatgccgcacttagacgacgaa 35220301  T
Q  197 atcaca--------aagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttaga-ttgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaag 286  Q
    ||||||        ||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||  | | | || ||||| |||||||||||| ||||||||     
T  35220300 atcacaaaaaacacaagaaaaaaacttgatttatgtgaaaaccacttatttagatttgaaaagggggggaaaagatggagaggggtgattctaggtcaaa 35220201  T
Q  287 aatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    || | ||| |||||||||||||    
T  35220200 aaataacctaaaaccacccctc 35220179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3308874 - 3308790
Alignment:
Q  226 aaatcacttatttagattgaaatagagag--aaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |  ||| ||||| | |||||||||| |||||||| |||| ||| |||| ||||||||    
T  3308874 aaatcacttatttagattgaaataaaggggaaaaaagatgcaaaggggtgattctaggtcaaaaattgacctaaaatcacccctc 3308790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18695220 - 18694922
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatca 115  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||| |  ||||||||||||| |||   ||||| |||||||| ||    |||||||||||  ||| |    
T  18695220 atatgataaaattaaagtggtcgaaatattcatggct-ctagatctgcaacgttgacgaccaaatcattgattgagtacctaatctttcaatagaaatta 18695122  T
Q  116 gatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatc-------acaaagaaa 208  Q
     |||||||||  |  || || |||||||||| || | ||||||||||||||||||| | ||  || |||| |  ||| ||||||       | ||| |||    
T  18695121 aatgaacaccacatcaaaactgaaaatcaaataatgtcgcacaagacgacgaacaaaacactgccgcactcaattgacgaaatcataaaaaaaaaaaaaa 18695022  T
Q  209 aaacctagatctatgt-gaaatcacttatttagattgaaatagagag-aaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    ||| |  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||| ||| || | || |||||| ||||||||    
T  18695021 aaatcgtgatctatgtaaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaaagatgaagatgaatgattttgggtaaaaagttgacccaataccacccc 18694922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1421700 - 1421644
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| || |||||||||||    
T  1421700 aacgctgcacaagacgacgaacaacataacaccgcacttagacgacgaaatcacaaa 1421644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 7677949 - 7678005
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  7677949 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 7678005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Original strand, 32448647 - 32448722
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| || || | |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32448647 gatctttcaatatgaacca-acgaacaccgcaacaagatgccaaatcaaacaacggcgcacaagacgacgaacaaca 32448722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 221
Target Start/End: Original strand, 11189620 - 11189755
Alignment:
Q  86 attgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacact 185  Q
    |||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||  || || |||  |||||||||||  | ||||||||||||| | ||||   |  ||| |     
T  11189620 attgaatagttgatctttcaataacaatcagatgaacaccacaacaagacgagaaatcaaacaatactgcacaagacgacgtataacattgcgtcactca 11189719  T
Q  186 tagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatcta 221  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  11189720 tagacaatgaaatcacgaagaaaaaacctaaatcta 11189755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 92
Target Start/End: Original strand, 19028849 - 19028923
Alignment:
Q  17 tatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaat 92  Q
    |||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  19028849 tatgataaaatctaagttaccgaaatatccat-gcttctggatttgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaat 19028923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 173
Target Start/End: Original strand, 29574657 - 29574732
Alignment:
Q  98 atctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| | || || | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29574657 atctttcaatatgaatcaaacaaacactgcaacaaaatgtgaaatcaaacaatgccgcacaagacgacgaacaaca 29574732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 32448786 - 32448869
Alignment:
Q  226 aaatcacttatttagattgaaatagagag-aaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    ||||||||||||||||| |||| | || | ||| ||||| |||||||||||||||||||||  | | ||| |||||||||||||    
T  32448786 aaatcacttatttagatcgaaagaaaggggaaaaagatgcagaggggtgattttaggtcaaataatgacctaaaaccacccctc 32448869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Original strand, 6358943 - 6358977
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6358943 aaatcaaacaacgctgcacaagacgacgaacaaca 6358977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6436679 - 6436579
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaa 196  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || | | |||||||   |||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||  |||||    
T  6436679 gatctttcattatgaaccagacgaacaccgtaacaagatgcaaaatca---aacgtcgcacaagacgacgaac-acacaacaccacactcagaccatgaa 6436584  T
Q  197 atcac 201  Q
    |||||    
T  6436583 atcac 6436579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7646497 - 7646443
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcaca 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||    
T  7646497 aacgccgcacaagacgacgaacaacataacgccgcacttagacgacgaaatcaca 7646443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 14955459 - 14955374
Alignment:
Q  225 gaaatcacttatttagattgaaatagagag--aaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| ||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||  |||| ||||||||    
T  14955459 gaaatcacttatttagattgaaagaaagaggaaaaaagatgcagagggatgattctaggtcaaaaattgacttaaaatcacccctc 14955374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 17261636 - 17261606
Alignment:
Q  83 ttgattgaataatcgatctttcaatatgaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17261636 ttgattgaataatcgatctttcaatatgaat 17261606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 198
Target Start/End: Original strand, 34128755 - 34128813
Alignment:
Q  140 aatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaat 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||| || |||||    
T  34128755 aatcaaacaacgtcgcacaagacgacgaacaacataacaccgcactcagacgacgaaat 34128813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 37416740 - 37416706
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37416740 aaatcaaacaacgtcgcacaagacgacgaacaaca 37416706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 307
Target Start/End: Original strand, 43397195 - 43397366
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcac-----------aaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcactta 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||| || ||||||||           |||||||||| || ||| |||||| ||| ||||||    
T  43397195 aacgccacacaagacgacgaacaacacaacgccacacttagacgacgaaatcacgaaaaaacacaaaagaaaaaa-cttgatatatgtgaaaaccactta 43397293  T
Q  236 tttagattgaaa-tagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccct 307  Q
    ||||||||||||  | || |||| ||||| |||| ||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  43397294 tttagattgaaagaaaagggaaaaagatgtagagaggtgattctaggtcaaaaaatgacctaaaaccacccct 43397366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 4264544 - 4264472
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaac 172  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||| || || |||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  4264544 gatctttcaataagaaccaaatgaacaccgcaataagacgcgaaatcaaaca---ccgcacaagacgacgaacaac 4264472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Original strand, 12648087 - 12648172
Alignment:
Q  225 gaaatcacttatttagattgaaataga-gagaaata-gatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||| | ||||  ||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  12648087 gaaatcacttatttagattgaaagaaaagagaaaaaagatgtggaggggtgattctaggtcaaaaaatgacctaaaaccacccctc 12648172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 5427944 - 5428000
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| || || |||||||||||    
T  5427944 aacgccacacaagacgacgaacaacaaaacgccgcacttggacgacgaaatcacaaa 5428000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7448271 - 7448215
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||  | |||||||||||    
T  7448271 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacaacgaaatcacaaa 7448215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 14416201 - 14416169
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaa 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14416201 aaatcaaacaacgccacacaagacgacgaacaa 14416169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24461373 - 24461290
Alignment:
Q  225 gaaatcacttatttagattg-aaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||  |||| ||||| |||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  24461373 gaaatcacttatttagattgaaaaaagaga-aaacggatgcagaggagtgattctaggtcaaaaaatgacctaaaaccacccctc 24461290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 37994347 - 37994275
Alignment:
Q  101 tttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | || || | | |||||||||||| |||| ||| || |||||||||||    
T  37994347 tttcaatatgaatcaaatgaacactgcaacaagatgcaaaatcaaacaatgccgtacaggaagacgaacaaca 37994275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 38445190 - 38445134
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |  |||||||| || |||||||||||    
T  38445190 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgctgcacttagacgacgaaatcacaaa 38445134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 94)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 10389665 - 10389964
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10389665 aatatatgataaaattaaagtgatcggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgctcaaatcgttgattgaataatcgatatttcaatatgaa 10389764  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10389765 tcaaatgaacaccgcaagaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcaaaaggaaaaaac 10389864  T
Q  213 ctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10389865 ctagatctatgtgaaagtcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagatgagtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctcaat 10389964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 34024349 - 34024647
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34024349 aatatatgataaaattaaaatgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgctcaaatcgttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 34024448  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| | |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34024449 tca-aagaacaccgcaagaagatggaaaatcaaacaacgtcatacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcaaaaagaaaaaac 34024547  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34024548 ctagatctatgtgaaaataacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgatccaaaaccacccctcaat 34024647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25274061 - 25273753
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25274061 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatttttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 25273962  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa----a 208  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  25273961 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 25273862  T
Q  209 aaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaa-----tagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaacca 302  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  25273861 aaacctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaagatgaagatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgatccaaaacca 25273762  T
Q  303 cccctcaat 311  Q
    |||||||||    
T  25273761 cccctcaat 25273753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4644036 - 4643734
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4644036 aatatatgataaaattaaattgaccggaatattcatgacctccggatctgcaactttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 4643937  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa--aaa 210  Q
    ||| |||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  4643936 tcaaatgaacaccgcacaaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 4643837  T
Q  211 acctagatctatgtgaaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaaga--ggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  4643836 atctagatctatgtgaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagaggggggtgatttcaggtcaaaaattcacctaaaaccacccctc 4643737  T
Q  309 aat 311  Q
    |||    
T  4643736 aat 4643734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 43153925 - 43154231
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43153925 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgtaacgttgacgctcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 43154024  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag------- 205  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||           
T  43154025 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccacacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttaaatgataaaatcacaaagaaaaaac 43154124  T
Q  206 -aaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccac 303  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  43154125 aaaaaaacctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaa-agatgaagaggggtgatttcaagtcaagaattgacccaaaaccac 43154223  T
Q  304 ccctcaat 311  Q
    | ||||||    
T  43154224 ctctcaat 43154231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 309
Target Start/End: Original strand, 9528788 - 9529087
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9528788 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgacctccagatctgcaacgttgacggccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 9528887  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag--aaaaa 210  Q
    ||| ||||||| || | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  9528888 tcaaatgaacatcgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccatcacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 9528987  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9528988 acataaatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagataaagaggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctca 9529087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 38706621 - 38706921
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38706621 aatatatgataaaattaaagtgaccgaaatatccatggcctccggatttgcaacgttgatgcccaaatcttcgattgaataatcgatctttcaatataaa 38706720  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    ||| || ||||||| | ||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38706721 tcaaattaacaccgcacgaagacgggaaatgaaacaacgctgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 38706820  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38706821 cctaaatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagaagggtgattttagatcaagaattgacccaaaaccacccctcaa 38706920  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  38706921 t 38706921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 51318163 - 51317863
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  51318163 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgacctccggatctgcaacgttgacgcccaaattgttgattgaacaatcaatctttcaatatgaa 51318064  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| || ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51318063 tcaaattaacaccgcaagaagacgggaaatcaaacaatgccgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaatcaaaaagaaaaaac 51317964  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtc-aagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  51317963 ctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagatgagtgatttcaggtcaaagaattgacccaaaatcacccctcaa 51317864  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  51317863 t 51317863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 310
Target Start/End: Original strand, 31381583 - 31381881
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||| || ||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31381583 aatatatgataaaattaaagtgaccggagtattcatgacctccgaatttgcaatgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatcttttaatatgaa 31381682  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| || ||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31381683 tcaaattaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgctgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 31381782  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31381783 ttagatctatgtgaaaatcacttatttaaattgaaaaagagagaaaaagatgagaaggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccatcaa 31381881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 310
Target Start/End: Original strand, 53616561 - 53616861
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  53616561 aatatataatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaattgatctttcaatatgaa 53616660  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag--aaaaa 210  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  53616661 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaa 53616760  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  53616761 acctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaacgatgaagagtggtgatttcaggtcaagaattgacccaaagtcacccctca 53616860  T
Q  310 a 310  Q
    |    
T  53616861 a 53616861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 868340 - 868035
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  868340 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctacaacgttcacatccaaatctttgattgaataattgatctttcaatatgaa 868241  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  868240 tcaaatgaacaccgcaagaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaaga-aaaat 868142  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttaga-------ttgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacc 304  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||| |||||||||    
T  868141 ctagatctatgtgaaaataacttatttagattgaaatttgaaatagagagaaaaagatgaagaggggtgatttcatgtcaagaatcgacctaaaaccacc 868042  T
Q  305 cctcaat 311  Q
    |||||||    
T  868041 cctcaat 868035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Original strand, 37188508 - 37188800
Alignment:
Q  15 tatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatc 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  37188508 tatatgataaaattaaagtgacaggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctt-caaaatgaatc 37188606  T
Q  115 agatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacct 214  Q
    |||||||||||| || ||  ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  37188607 agatgaacaccgcaaaaaggcgggaaatcaaacagcgccgcacaaaacgacgaacaacaaaccaccacacttaaatgatgaaatcacaaagaaaaaa-ct 37188705  T
Q  215 agatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  37188706 agatatatgtgaaaatcacttatttagattgaaatatagagaaaaagatgaagatgagtgatttcaggtcaataattgacccaaaaccactcctc 37188800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 50766423 - 50766720
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  50766423 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaacaatagatctttcaatatgaa 50766522  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  50766523 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaa---gacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaa 50766619  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  50766620 cttagatctatgtgaaaatcatttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagagggatgatttcagatcaagaattgacccaaaaccacctctcaa 50766719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6972988 - 6972692
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6972988 aatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaacctttgattgaataatcgatctttcaataggaa 6972889  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa--aaa 210  Q
    | | |||||||| | ||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  6972888 taaaatgaacactgcaagaagacaggaaagcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 6972789  T
Q  211 acctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    || | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  6972788 acatggatctatgtaaaagtcacttatttagattgaaatacagataaaaagatgaagagaggtgatttcagatcaagaattgacccaaaaccacccc 6972692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20569432 - 20569130
Alignment:
Q  14 atatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaat 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |  |||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20569432 atatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctttggatttgcaacgttgacaccaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaat 20569333  T
Q  114 cagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag----aaaa 209  Q
    || |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||    ||||    
T  20569332 caaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaaccccgcagaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattataaagaaaaaaaa 20569233  T
Q  210 aacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  20569232 aacctagatctatgtgaaaatcatttatttagattgaaataaagagaaaaaaatgaagaggggtgatttcaggttaagaattgacccaaaaccacccatc 20569133  T
Q  309 aat 311  Q
    |||    
T  20569132 aat 20569130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43444570 - 43444271
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |  || |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43444570 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatattcattgtctc-ggatctgcaacgttgacgcccatatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaa 43444472  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaa 211  Q
    ||| |||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  43444471 tcaaatgaacaccgcacgtagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaa 43444372  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| || |||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  43444371 cctagatatatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagatgggtgatttcagatcaaaaattgacccaaaactacccctcaa 43444272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9284089 - 9283789
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| || ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9284089 aatatatgatgaaattaaagtgactgaaatattcattgcctccagatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaa 9283990  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa-gaaaaaa 211  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  9283989 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccacacaagacgacaaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattacaaataaaaaaa 9283890  T
Q  212 cctagatctatgt-gaaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9283889 cctagatctatgtaaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaacgatgaagaggggtgatttcaggttaagtattgacccaaaaccacccctcaa 9283790  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  9283789 t 9283789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1532086 - 1531784
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1532086 aatatatgataaaattaaagtgtccagaatatccatgacctccggttctgcaacgttgacgcccaaatttttgattgaataattgatctttcaacatgaa 1531987  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa--aaa 210  Q
    ||| || ||||||| | ||| || | ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  1531986 tcaaataaacaccgcacgaagacaggaaatcaaacaacgccacacaagacgacagacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 1531887  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagaga-aatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1531886 atctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagagaaaagataaagaggggtgatttcaggtcaagaattgacccaataccacccctc 1531787  T
Q  309 aat 311  Q
    |||    
T  1531786 aat 1531784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 10359459 - 10359752
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10359459 aatatatgataaaaataaagtgactggaatatccatgcct-caagatctgcaacgttgatgcccaaatcttttattgaataatcgatctttcaatatgaa 10359557  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10359558 tcaaatgaacaccacaagaagacgggaaatcaaacaacaccgcaaaagacggcgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacgaagaaaaaac 10359657  T
Q  213 ctagatctatg-tgaaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10359658 ctagatatatgttaaaatcacttatttagatcgaaatagagagaaaaagatgaagttgggtgatttcaggtcaaaaattgacccaaaaccacccc 10359752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 311
Target Start/End: Original strand, 9645479 - 9645760
Alignment:
Q  32 gtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaaga 131  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||  |||||||| ||||||| |   |||| ||||||||||||| ||||||| || | ||    
T  9645479 gtgaccggaatatccatcgcctccggatctgcaatgttgacgcccaaatcttttattgaattacttatctctcaatatgaatcaaatgaacagcgcacga 9645578  T
Q  132 atacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaacctagatctatgtgaaa-t 229  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  9645579 cgacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaccaccacacttagatgatgaaatcgcaaagaaaaaaacctagatctatgtgaaagt 9645678  T
Q  230 cacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  9645679 cacttatttagattgaaatagagacaaaaagatgaagaggggtgatatcaggtcaagaattgacccaaaacgacccctcaat 9645760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 267
Target Start/End: Original strand, 8009275 - 8009526
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatca 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| | ||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||  || ||||||    
T  8009275 atatgataaaattaaagtgatcggaatatccatggtcttcggatatacaacgttgacgcccaaatttttgattgaataatcaatctttctgtaagaatca 8009374  T
Q  116 gatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaccta 215  Q
     |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8009375 aatgaacaccgtatgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa-cta 8009473  T
Q  216 gatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaaga 267  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8009474 gatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaaga 8009526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 35964887 - 35965186
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| || |||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35964887 aatatatgataaaattaaagtgactgaaatactcatgcct-ccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatcttttaatatgaa 35964985  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||  || || |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||    
T  35964986 tcaaatgaacaccacaataagacgggaaatcaaacaacgccacacaggacgacgaacaacacaccaccacactcggatgacgaaatcacgaaaaaaaaac 35965085  T
Q  213 ctagatctatgtg--aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  35965086 ctagatctatgtgaaaaatcacttattcagattgaaatagagagaaaaagatgaagagaggtgatttcaggtaaaaaattgacccaaaaccacccctcaa 35965185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 77 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 56194715 - 56194484
Alignment:
Q  77 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaac 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56194715 aaatctttgattaaataatcgatctttcaataggaataaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaac 56194616  T
Q  177 caccacacttagatgatgaaatcacaaagaa---aaaacctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  56194615 caccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaaaacctagatctatgtgaaagtcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagaggttt 56194516  T
Q  273 gattttaggtcaagaatttacccaaaaccacc 304  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  56194515 gatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacc 56194484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 44947590 - 44947281
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44947590 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggccttcggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatattaa 44947491  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa----a 208  Q
    ||| |||||||||  | ||| |||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |    
T  44947490 tcaaatgaacaccacacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacaacaaccaacaaaccaccacacttagataatgaaatcacaaagaaaaaaa 44947391  T
Q  209 aaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaataga-tga-----agaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaacc 301  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||| | |||  ||     |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44947390 aaacctagatctatgcgaaaatcacttatttagattgagagagagagagagagagagagagagagagaggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaacc 44947291  T
Q  302 acccctcaat 311  Q
    ||||||||||    
T  44947290 acccctcaat 44947281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29965813 - 29965566
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  29965813 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattacctccggatctgcaacgttgatgcccaaatctttgattgaacaatcaatctttcaatatgaa 29965714  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa--aaa 210  Q
    ||| |||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  29965713 tcaaatgaacaccgcacaaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaa 29965614  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaa 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29965613 acctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaa 29965566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14183974 - 14183729
Alignment:
Q  19 tgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  14183974 tgataaaattaaagtgaccggaatatccatggtctccggttctgcaacgttgacgccaaaatctttgattgaatagtcgatctttcaatatgaatcaaat 14183875  T
Q  119 gaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaacctaga 217  Q
    |||||||| | ||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14183874 gaacaccgcatgaagacagaaaatcaaacaac-acgcacaagactacgaacaacaaaccaccacacttagatggtgaaatcacaaagaaaaaaacttaga 14183776  T
Q  218 tctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatg 263  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14183775 tccttgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatg 14183729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 2115499 - 2115799
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2115499 aatatatgatgaaattaaagtgactggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatttttgattgaacaatcgatctttcaatatgaa 2115598  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag--aaaaa 210  Q
    | | ||||| | || | ||| | |  ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  2115599 ttaaatgaatatcgcacgaagatgagaaatcaaacaac-acgcacaagacgacaaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaa 2115697  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2115698 acctaaatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagaaaagtgatttcaggtcaataattgacccaaaaccacccctca 2115797  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  2115798 at 2115799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 18138825 - 18139124
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||| |  || ||||||||||||| ||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18138825 aatatatgataaaatttaagtgatcggaataccaatgccc-ccagatctgcaacgttgacgcccaaatatgtgattgaataatcgatctttcaatagaaa 18138923  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||| | || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||||    
T  18138924 tcaaatgaacactgcaacaagatggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaccaccacactcaggtgacgaaatcattaagaaaaaac 18139023  T
Q  213 ctagatctatgtg--aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  18139024 ctagatgtatgtgaaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaatgatgaagaggtgtgattccaggtcaaaaatttacctaaaatcacccctcaa 18139123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 49126038 - 49126337
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||| |  || ||||||||||||| ||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  49126038 aatatatgataaaatttaagtgatcggaataccaatgccc-ccagatctgcaacgttgacgcccaaatatgtgattgaataatcgatctttcaatagaaa 49126136  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||| | || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||||    
T  49126137 tcaaatgaacactgcaacaagatggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaccaccacactcaggtgacgaaatcattaagaaaaaac 49126236  T
Q  213 ctagatctatgtg--aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  49126237 ctagatgtatgtgaaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaatgatgaagaggtgtgattccaggtcaaaaatttacctaaaatcacccctcaa 49126336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12265640 - 12265338
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttcc--------ggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||        |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12265640 aatatatgataaaattaaagtgattggaatacccatgtcttccatgcctccggatctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaataattgatctttc 12265541  T
Q  105 aatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||  ||||||||  ||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||  |    
T  12265540 aatatgaatcaagtgaacaccacaacgatacgagaaatcaaacaacgccgcac-agacgacgaacaacaaaccgccacactcagatgacaaaatcacgta 12265442  T
Q  205 gaaaaaacctagatctatgtg--aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaacca 302  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| ||    
T  12265441 gagaaaacctagatctatgtgaaaaatcacttatttagattgaaatagggataaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaaaaattgaccaaaaatca 12265342  T
Q  303 cccc 306  Q
    ||||    
T  12265341 cccc 12265338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21090315 - 21090036
Alignment:
Q  18 atgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaata--atcgatctttcaatatgaatca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||             |||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||    
T  21090315 atgataaaattaaagtgaccggaatattcatg-cttccggatctgccc-----------aaatctttgattgaatataatttatccttcaatatgaatca 21090228  T
Q  116 gatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaccta 215  Q
     |||||||||| || || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21090227 aatgaacaccgcaaaaaaacgaaaaatcaaacaacgtcgtacaagacgacgaacaacaaaccaccatatttagatgatgaaatcacgaagaaaaaaccta 21090128  T
Q  216 gatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||    
T  21090127 aatctatgtgaaaatcacttatttatattgaaatagagagaaaaagatgaagatgagtgatttcagatcaaagattgacccaaaaccacccc 21090036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Original strand, 32952662 - 32952913
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  32952662 aatataagataaaattaaattgaccggaatatccatgact-ccggacctgcaacattgacgctcaaatctttgattgaataatcgtattttcaatatgaa 32952760  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    | | ||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  32952761 ttaaatgaacaccgtaacaaga-tgaaaatcaaacaac-ccgcataagacgacaaacaacacaccaacacacttagatgacgaaatcacaaagaaaaaa- 32952857  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaaga 267  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  32952858 ctagatctatgtgaaaaacacttatttaatttgaaatagagagaaaaagatgaaga 32952913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 47417840 - 47417657
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47417840 aatatatgatgaaattaaagtgaatggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaa 47417741  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaa 196  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  47417740 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacatttagatgatgaa 47417657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 49410401 - 49410232
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49410401 aatatatgataaaattaaagtgacaggaatattcacggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 49410302  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccac 182  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49410301 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgctgcacaagacgacgaacaacaaaccaccac 49410232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 83 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 35261299 - 35261071
Alignment:
Q  83 ttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccac 182  Q
    |||| |||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  35261299 ttgaatgaatagttgatcttttaatatgaatcaaatgaacaccgcaagaagacggaaaatcaaacaacgccgcagaagacgacaaacaacacaccaccac 35261200  T
Q  183 acttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagaga-gaaatagatgaagagggg----tgatt 276  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||    | |||    
T  35261199 acttagatgatcaaatcacgaagaaaaaacctaaatctatgtgaaaatcacttatttagattgcaataaagaggaaaaagatgaagaggggatgattatt 35261100  T
Q  277 ttaggtcaagaatttacccaaaaccaccc 305  Q
    | ||||||| |||| |||||||| |||||    
T  35261099 tcaggtcaaaaattgacccaaaatcaccc 35261071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 57 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2624631 - 2624375
Alignment:
Q  57 gatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcga-tctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgc 155  Q
    ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || || |||| ||||||||| |||||||    
T  2624631 gatctgcaacgttgacgcccaattctttgattgaataatcgaatctttcaatatgaatcaaataaacaccgcaacaagacgggaaatcaaactacgccgc 2624532  T
Q  156 acaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaataga-g 252  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  2624531 acaagacgacgaacaacacaccaccacact--catgacgaaatcacgaagaaaaaaacctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagact 2624434  T
Q  253 agaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    | ||| |||||| || | || |||| ||||||| |||  |||||||| |||||||||||    
T  2624433 ataaaaagatgatgatgagttatttcaggtcaaaaatcaacccaaaatcacccctcaat 2624375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 49680715 - 49680456
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  49680715 aatatatgatgaaattaaagtgaccgaaatatc-attgcatccggatctgcaacgttgacgcccaaatatttgattgaacaatctatctttcaatatgaa 49680617  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa----- 207  Q
    ||| |||    ||| | ||| |||  |||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||         
T  49680616 tcaaatgt---ccgcacgaagacgtgaaatcaaacaacacaacacaagacgacgaataacaaatcaccacacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaa 49680520  T
Q  208 aaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggg 270  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  49680519 aaaacctagatccatgtgaaaatcacttatttggattgaaataaagagaaaaagatgaagaggg 49680456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Original strand, 46991042 - 46991289
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||   ||| || |  ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46991042 aatatatgataaaattaaagtgatcgggatacatatgtct-ctagatctgcaacgttgacacccaaatctttgattgaataatcgatatttcaatatgaa 46991140  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    ||| |||||||||| || || | || ||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||  ||| ||||||    
T  46991141 tcaaatgaacaccgcaacaagatgggaaatcaaacaacgccacagaagacgacaaacaacacaccaccacactcagatgacaaaatcatgaagaaaaaaa 46991240  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaata 259  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46991241 tctagatctatgtgaaaatcactcatttagattgaaatagagagaaata 46991289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 45227952 - 45228126
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  45227952 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggtctccgaatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatgtaaa 45228051  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacactta 187  Q
    ||| ||||| | |||| ||| |||| |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45228052 tcaaatgaatatcgtacgaagacgggaaattaaacaataccgcacaagacggcgaacaacaaaccaccacactta 45228126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 257
Target Start/End: Original strand, 52097828 - 52098076
Alignment:
Q  14 atatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacg-ctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52097828 atatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatg-catccagatctgcaacgttgacggcccaaatctttgattgaataattgatctttcaatatgaa 52097926  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca---aaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaa 209  Q
    ||| ||||||||   ||||||| || |||||||||||| | ||||||||| || |||||||    |||||||||||  |||||  ||||||| |||| ||    
T  52097927 tcaaatgaacactacaagaataggggaaatcaaacaactctgcacaagacaacaaacaacacaccaccaccacactcggatgacaaaatcacgaagagaa 52098026  T
Q  210 aacctagatctatgtg--aaatcacttatttagattgaaatagagagaaa 257  Q
    ||  ||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52098027 aatttagttctatgcgaaaaatcacttatttagattgaaatagggagaaa 52098076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 248
Target Start/End: Original strand, 3336076 - 3336304
Alignment:
Q  14 atatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaat 113  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||       ||||||||||||| | | |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3336076 atatatgataaaattaaaatgatcggaatgtc-------tccggatctgcaatgctgacgccaaa-tctttgattgaataatcaatctttcaatatgaat 3336167  T
Q  114 cagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacg-ccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    || |||||||||| || || | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  3336168 caaatgaacaccgcaacaagatggaaaatcaaacaacgtccgcacaggacgacgaacaacacaccaccacactcagatgacaaaatcacgaagaaaaaac 3336267  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaat 248  Q
    ||||||  ||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  3336268 ctagatagatgtgaaaataacttgtttagattgaaat 3336304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 27593740 - 27594048
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| || ||||||||| ||| || | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27593740 aatatatgataaaattaaagtgacaggaatactcatggct-ccagatctgcaatgttgactccaaa-tcttttattgaataatcgatctttcaatatgaa 27593837  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    | | || |||| || || || |||| |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||     
T  27593838 ttaaataaacatcgcaaaaagacgggaaatcaaaaaaagtcgcacaagatgacgaacaacacaccaccacactcagataacgaaatcacgaagaaaaaat 27593937  T
Q  213 ctagatctatgtg-------------aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaa 299  Q
     ||||||||||||             || || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||| ||| ||||    
T  27593938 atagatctatgtgaagatctatgtgaaactcgcttatttagattgaaatatagagaaaaagatgaaga-gggtgatttcatgtcaaaaattgacctaaaa 27594036  T
Q  300 ccacccctcaat 311  Q
     ||||| |||||    
T  27594037 tcacccatcaat 27594048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 194 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 47416881 - 47416762
Alignment:
Q  194 gaaatcacaaagaaaaaacct-agatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaattt 291  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||     
T  47416881 gaaattacaaagaaaaaaacttagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagaggggtgatttcaagtcaataattg 47416782  T
Q  292 acccaaaaccacccctcaat 311  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  47416781 acccaaaatcacccctcaat 47416762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 241
Target Start/End: Original strand, 1931723 - 1931856
Alignment:
Q  109 tgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaa 208  Q
    ||||||| |||||||||| || || |||| |||| |||||| | || ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1931723 tgaatcaaatgaacaccgcaacaagacgggaaatgaaacaatgtcggacaagacggtgaacaacacaccactacacttagatgatgaaatcacaatgaaa 1931822  T
Q  209 aaacctagatctatgtg-aaatcacttatttaga 241  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  1931823 aaacctagatctttgtgaaaataacttatttaga 1931856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23100853 - 23100745
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatca 115  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| | || ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23100853 atatgatacaattaaattgaccgaaatacccatgacatc-ggatctgcaactttgacactcaaatcattgattgaataattgatctttcaatatgaatca 23100755  T
Q  116 gatgaacacc 125  Q
     |||||||||    
T  23100754 aatgaacacc 23100745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 226 - 306
Target Start/End: Original strand, 5333657 - 5333736
Alignment:
Q  226 aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||    
T  5333657 aaatcacttatttatattgaaatagagagaaaaagatgaaga-gggtgatttcatgtcaaaaattgacccaaaaccacccc 5333736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 306
Target Start/End: Original strand, 41255355 - 41255585
Alignment:
Q  77 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaac 176  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||||  || ||||| |||| |||| ||| |||| |||||||||| || ||||||| |     
T  41255355 aaatcattgattgaatatctgatctttcagtatgaatcaaatgaacgtcgcaagaagacgggaaattaaataacgtcgcacaagacaacaaacaacataa 41255454  T
Q  177 caccacacttagatgatgaaatcac-aaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtga 274  Q
    ||| | ||||||  || |||||||| ||  |||||||||| || |||||| ||||||| | || ||| | ||||||  ||||| |||||||||  | |||    
T  41255455 cactatacttagtcgacgaaatcacgaataaaaaaacctaaatttatgtgaaaatcacgtgttaagagt-aaataggtagaaaaagatgaagattgatga 41255553  T
Q  275 ttttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  41255554 ttttaggtcaaaaattgacccaaaacaacccc 41255585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 299
Target Start/End: Original strand, 5333585 - 5333658
Alignment:
Q  226 aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaa 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  5333585 aaatcacttatttatattgaaatagagagaaaaagatgaagatgtgtgatttcaggtcaaaaattgacccaaaa 5333658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28857484 - 28857377
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaa 196  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| ||  | |||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | || |||||||| ||||||    
T  28857484 gatctttcaatatgaaacaaacgaacaccgcaactagacgcggaatcaaacaacgccgcacaagacaacgaacaacacaacgccgcacttagacgatgaa 28857385  T
Q  197 atcacaaa 204  Q
    ||||||||    
T  28857384 atcacaaa 28857377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 277
Target Start/End: Original strand, 35351250 - 35351337
Alignment:
Q  191 gatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtgaa-atcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattt 277  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||| | |||||||    
T  35351250 gatgaaatcacgtagaaaaaacctagatctatgtgaatatcacttatttaaattgaaataaagcgaaaaggatgaagatgtgtgattt 35351337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 239
Target Start/End: Original strand, 36204415 - 36204558
Alignment:
Q  101 tttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacg-ccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatc 199  Q
    |||||||||||| || |||||||||| || |||| |  ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | | || |||||||| || ||||||    
T  36204415 tttcaatatgaaccaaatgaacaccgcaacaatatgcgaaatcaaacaacgcccgtacaggacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatc 36204514  T
Q  200 acaaagaaaaaa---cctagatctatgt-gaaatcacttattta 239  Q
    || |||||||||    || ||||||||| |||||||||||||||    
T  36204515 acgaagaaaaaaaacacttgatctatgtggaaatcacttattta 36204558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 52944393 - 52944317
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52944393 gatctttcaatatgaaacaaacgaacaccgcaacaagacgcaaaattaaacaacgccgcacaaaacgacgaacaaca 52944317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 56199274 - 56199218
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgtt 69  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  56199274 aatatatgataaaattaaagtcatcggaatattcatggctttcggatctgcaacgtt 56199218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18048964 - 18048889
Alignment:
Q  98 atctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || ||  || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18048964 atctttcaatatgaatcaaacgaacaccgcaacaaggcgcaaaatcaaacaacgccacacaagacgacaaacaaca 18048889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 91
Target Start/End: Original strand, 28834164 - 28834238
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaa 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  28834164 atatgataaaattaaagtgaccggaatagtcatgtc-tccggatctacaacgttgacactaaaatcgttgattgaa 28834238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1008289 - 1008207
Alignment:
Q  196 aatcacaaagaaaaaacctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattt 277  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| | |||||||    
T  1008289 aatcacgaagaaaaaaactaaatttatgtgaaaatcacttatttagattaaaatagagagaaaaagatgcagatgagtgattt 1008207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 43853521 - 43853448
Alignment:
Q  100 ctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  43853521 ctttcaatatgaaccaaatgagcaccgcaacaatacgcgaaatcaaacaacgccgcacaagatgatgaacaaca 43853448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32766548 - 32766492
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| || |||||||||||    
T  32766548 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacaccgcacttagacgacgaaatcacaaa 32766492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 36184706 - 36184599
Alignment:
Q  17 tatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcag 116  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||  ||| || || ||||| ||||||| || | |||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||     
T  36184706 tatgataaaatcaaagtgaccataatatttatgcct-cctgatctacaacgttgacaccaaaatcattgattgaataaccgatctttcaatagaaatcaa 36184608  T
Q  117 atgaacacc 125  Q
    |||||||||    
T  36184607 atgaacacc 36184599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 36194745 - 36194592
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcac-aaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttat 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||| |||  | |||||||| |||||||||  || ||| |||||| |||||||||||    
T  36194745 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgtcgcactaagacaacgaaatcacgaaagaaaaa--cttgatgtatgtgaaaatcacttat 36194648  T
Q  237 ttagattgaaataga-gag-aaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatt 290  Q
    ||| ||||||| | | ||| ||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||    
T  36194647 ttaaattgaaagaaaggagaaaaaagatgcagagggatgtttttaggtcaaaaatt 36194592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 308
Target Start/End: Original strand, 4142821 - 4143002
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa---------aaaacctagatctatgtgaaat 229  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || ||||||||||| ||         |||| || |||  ||||||||     
T  4142821 aaatcaaacgccgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaaaaacacaaaaggaaaaacttgatagatgtgaaaa 4142920  T
Q  230 cacttatttagattga---aatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    ||||||||||||||||   || || |  ||| ||||| |||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  4142921 cacttatttagattgaaagaaaaggggaaaaaagatgtagaggggtgattctaggtcaaaaaatgacctaaaaccacccctc 4143002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 282
Target Start/End: Original strand, 21554783 - 21554990
Alignment:
Q  77 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcac-aagacgacgaacaacaaa 175  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||| | |||  ||||| ||||||| |  || || |||  ||||||||||| || |||| |||| |||||||||||      
T  21554783 aaatcattgattgaatagttgatcttccgatagaaatcaaatgaacatcacaacaagacgagaaatcaaacaatgcggcactaagatgacgaacaacacg 21554882  T
Q  176 ccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtga 274  Q
     |||| |||| |||  | |||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||| | | ||| |||| |||| | ||||    
T  21554883 tcacctcactcagacaacgaaatcacaaagaaaatatctagatttatgtgaaaatcacttatttcgaatgaaataaatataaaaagattaagatgcgtga 21554982  T
Q  275 ttttaggt 282  Q
    ||| ||||    
T  21554983 tttcaggt 21554990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27651980 - 27651872
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcac-aaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttat 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |    |||| ||| || |||||||| |||||||||  || ||| |||||| |||||||||||    
T  27651980 aaatcaaacaacaccgcacaagacgacgaacaacacaacgttgcactaagacgacgaaatcacgaaagaaaaa--cttgatgtatgtgaaaatcacttat 27651883  T
Q  237 ttagattgaaa 247  Q
    |||||||||||    
T  27651882 ttagattgaaa 27651872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22300889 - 22300855
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22300889 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 22300855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35348341 - 35348279
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  35348341 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaaaaaaaa 35348279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Original strand, 47320460 - 47320494
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47320460 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 47320494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 48
Target Start/End: Original strand, 9645437 - 9645470
Alignment:
Q  15 tatatgataaaattaaagtgaccggaatatccat 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9645437 tatatgataaaattaaagtgaccggaatatccat 9645470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 173
Target Start/End: Original strand, 43353512 - 43353629
Alignment:
Q  61 tgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatcttt-----caatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgc 155  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||     ||||| |||||| ||||||  ||||| || |   |||||||||||||| | |    
T  43353512 tgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaataaccgatattttatttcaataggaatcaaatgaacgacgtaacaagataaaaaatcaaacaacgacac 43353611  T
Q  156 acaagacgacgaacaaca 173  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43353612 acaagacgacgaacaaca 43353629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 209
Target Start/End: Original strand, 56156717 - 56156778
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaa 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  56156717 aacgccacacaagacgacgaacaacacaacgccacacttagacgacgaaatcacaaaaaaaa 56156778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22611217 - 22611161
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  22611217 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 22611161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 172
Target Start/End: Original strand, 52204340 - 52204433
Alignment:
Q  77 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaac 172  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||| |||   ||||| | ||||||||||| || ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  52204340 aaatcattgattgaa--atcgatcttttaatggtaatcaaacgaacaccgtaacaagacgcaaaatcaaacaatgtcacacaagacgacgaacaac 52204433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 53811062 - 53811006
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||| ||||| |||||    
T  53811062 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacgccgcatttagatgacgaaatgacaaa 53811006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 56040721 - 56040777
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | || |||||||||||    
T  56040721 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacgccgcacttaaacgacgaaatcacaaa 56040777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2520813 - 2520755
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaac--caccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| || |||||||||||    
T  2520813 aacgccgcacaagacgacgaacaacacacaacaccgcacttagacgacgaaatcacaaa 2520755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 21405607 - 21405532
Alignment:
Q  98 atctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |  || ||| |||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||    
T  21405607 atcttttaatatgaatcaaatgaacaccgcatcaagacgaaaaatcaaacaatgtcgcccaagacgacaaacaaca 21405532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 198
Target Start/End: Original strand, 29961002 - 29961049
Alignment:
Q  151 gccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||    
T  29961002 gccgcacaagacgacgaacaacacaaccccacacttagacgatgaaat 29961049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 311
Target Start/End: Original strand, 3338816 - 3338874
Alignment:
Q  253 agaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||||| |||||||||  | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  3338816 agaaaaagatgaagattgatgattttaggtcaaaaattgacccaaaaccacctctcaat 3338874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Original strand, 9145955 - 9145989
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9145955 aaatcaaacaatgccgcacaagacgacgaacaaca 9145989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 204
Target Start/End: Original strand, 11300072 - 11300122
Alignment:
Q  154 gcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| || |||||||||||    
T  11300072 gcacaagacgacgaacaacacaacaccgcacttagacgacgaaatcacaaa 11300122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 36184437 - 36184335
Alignment:
Q  199 cacaaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaat-agaga-gaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttaccc 295  Q
    |||||||||||||| ||||| | | || |||||||||||||| |||||||| |||||  ||| |||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||    
T  36184437 cacaaagaaaaaacatagatatgtatggaaatcacttatttaaattgaaatgagagataaaaaagatgaagagagatgattttagatcaataattgaccc 36184338  T
Q  296 aaa 298  Q
    |||    
T  36184337 aaa 36184335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Original strand, 19853445 - 19853497
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgtt 69  Q
    ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19853445 atatgataaaacttaagtcaccgaaatatccatg-cttccggatctgcaacgtt 19853497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21662613 - 21662541
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattg 89  Q
    |||||||||||   |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  21662613 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatg-cttccggatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattg 21662541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21671377 - 21671305
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattg 89  Q
    |||||||||||   |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  21671377 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatg-cttccggatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattg 21671305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 204
Target Start/End: Original strand, 26633749 - 26633802
Alignment:
Q  151 gccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  26633749 gccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 26633802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 36161792 - 36161719
Alignment:
Q  98 atctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaa 171  Q
    ||||||| |||||||  | | |||||||| || || ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  36161792 atctttcgatatgaacaaaacgaacaccgcaacaaaacgtaaaatcaaacaacgacgcacaagacaacgaacaa 36161719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 50179698 - 50179649
Alignment:
Q  262 tgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50179698 tgaagatgagtgatttcaggttaagaattgacccaaaaccacccctcaat 50179649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 77 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 1008363 - 1008319
Alignment:
Q  77 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  1008363 aaatcattgattgaataatcgatattttaatatgaatcaaatgaa 1008319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 209
Target Start/End: Original strand, 2069611 - 2069718
Alignment:
Q  101 tttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatca 200  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| || || | |  ||||||||||||| |||||| || ||||||| ||| | | |||||||||||| | |||||||    
T  2069611 tttcaatatgaaccaaatgaataccgcaacaagatgcgaaatcaaacaacgtcgcacaggatgacgaac-acataacgccacacttagataaagaaatca 2069709  T
Q  201 caaagaaaa 209  Q
    |||| ||||    
T  2069710 caaaaaaaa 2069718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 21686317 - 21686372
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  21686317 aacgccgcacaagacgacgaacaacaca-cgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 21686372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 33921230 - 33921155
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaat 92  Q
    ||||||||||||  |||| || | |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  33921230 atatgataaaatctaagtcactgaaatacccatg-cttccggatctgcaacgttgacgctcaaattattgattgaat 33921155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44596698 - 44596642
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |  |||||||||| || |||||||||||    
T  44596698 aacgccgcacaagacgacgaacaatacaacgtcacacttagacgaggaaatcacaaa 44596642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 47158245 - 47158205
Alignment:
Q  164 acgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  47158245 acgaacaacaaaacacctcacttagatgacgaaatcacaaa 47158205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 257
Target Start/End: Original strand, 49072858 - 49072914
Alignment:
Q  202 aaagaaaaaacctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaa 257  Q
    ||||||||||  || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  49072858 aaagaaaaaatataaatctatgtgaaaatcacttatatagattgaaataaagagaaa 49072914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Original strand, 51888238 - 51888314
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| || || | |  ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  51888238 gatctttcaatatgaaccaaacgaacaccgcaacaagatgcgaaatcaaacaacgtcgcataagacgatgaacaaca 51888314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 82)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 35667143 - 35667442
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35667143 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccgaatctgcaacattgacgctcaaatcgttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 35667242  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35667243 tcaaatgaacaccgcaagaagacggaaaatcaaaaaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcaaaaagaaaaaac 35667342  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  35667343 ctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaatatgaagaagggtgattttaagtcaagaattgatccaaaaccacccctcaat 35667442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 22927781 - 22928076
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22927781 aatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaa 22927880  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    | | |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22927881 taaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 22927980  T
Q  212 cctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22927981 actagatctgtgtgaaagtcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaaaaggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccc 22928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 42311446 - 42311148
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42311446 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgacctccggatctgcaacgttgacggccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 42311347  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaa 211  Q
    ||| ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  42311346 tcaaatgaacatcgcacgaagacggaaaatcaaacaacgctgcataagacgacgaacaacaaaccgccacacttaaatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 42311247  T
Q  212 cctagatctatgtgaa-atcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42311246 cctagatctatgtgaatatcacttatttagattgaaatagagagaaaatgatgaagagggatgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctca 42311148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 35496086 - 35496386
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35496086 aatatatgatgaaattaaagtgaccgaaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatcttcgattgaataatcgatctttcaatataaa 35496185  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    ||| |||||||||| | ||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35496186 tcaaatgaacaccgcacgaggacgggaaatgaaacaacgccgcacaagacgatgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 35496285  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35496286 cctagatctatgtgaaaatcacttaattagattgaaatagagagaaaaagatgaagattggtgattttaggtcaagaattgacccaaaaccacccctcaa 35496385  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  35496386 t 35496386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26492531 - 26492231
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26492531 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccaaggcatccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgacctttcaatatgaa 26492432  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaa 211  Q
    ||| ||||||| ||   ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26492431 tcaaatgaacatcgcgcgaagacgggaaatcaaacaacgcagcacaagacggcggacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 26492332  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26492331 actagatctatgtgaaaatcacttatttaaattgaaatagagagaaaaagatgaagaggggttatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctcaa 26492232  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  26492231 t 26492231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 42066973 - 42067271
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42066973 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggcttccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctt-caatatgaa 42067071  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  42067072 tcaaatgaacaccgcaagaagacgagaaatcaaacagcgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaacacacttagatgatgaaatcagaaagaaaaaat 42067171  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  42067172 ctatatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatatagataacaagatgaagagaggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaatcacccttcaat 42067271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 48208066 - 48207775
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||    
T  48208066 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgtataatggatctt-caaaatgaa 48207968  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48207967 tcaaatgaacaccgcaagaagacgggaaatcaaacagcgcagcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 48207868  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccaccc 305  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  48207867 atagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatattgagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaagaa-tgacccaaaaccaccc 48207775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 310
Target Start/End: Original strand, 1448741 - 1449039
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1448741 aatatatgataaaattaaagtgatcggaatatccatagggtccggatctgcaacgttgacatccaaatctttgattgaataatggatctttcaatatgaa 1448840  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  1448841 tcaaatgaacaccgcaagaagacgagaaatcaaacaacgccgcacaatacgacgaacaacaaacaaccacacttagatgatgaaatcacaaataaaaaat 1448940  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1448941 ctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaagagatgaagtttggttatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctcaa 1449039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 46822181 - 46821880
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  46822181 aatatatgatgaaattaaagtgatcggaatattcattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatcgatcttttaatatgaa 46822082  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa--aaa 210  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  46822081 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagaagacgaacaacaaatcaccatacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaa 46821982  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46821981 atctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctca 46821882  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  46821881 at 46821880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 311
Target Start/End: Original strand, 1485178 - 1485467
Alignment:
Q  23 aaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaac 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| | |||||     
T  1485178 aaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaatgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatttttcaattggaataaaatgaat 1485277  T
Q  123 accgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctat 222  Q
    |||| ||||| | || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1485278 accgcaagaagatgggaaaacaaacaacgctgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaatctagatctat 1485377  T
Q  223 gtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1485378 gtgaaagtcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagacgggtgattttaggtcaagaattaacccaaaaccaccccccaat 1485467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 308
Target Start/End: Original strand, 23425284 - 23425579
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| || | ||  ||||||||| || ||||||||||||| ||| || ||    
T  23425284 aatatatgataaaagtaaagtgactagaatatccatggcctccggatctgcaacattgatgcccaaatctttgttttaataatcgatctt-caaaataaa 23425382  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23425383 tcagatgaacaccgcaagaagacgggaaatcaaacagcaccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttaaatgatgaaatcacaaagaaaaaac 23425482  T
Q  213 ctagatctatgt-gaaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23425483 ctagatctatgtaaaaatcacttatttagattgaaatatagagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctc 23425579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42408527 - 42408228
Alignment:
Q  14 atatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42408527 atatatgataaaattaaagtgatcggaatatccatggcattcggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaat 42408428  T
Q  114 cagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaac 212  Q
    || ||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  42408427 caaatgaataccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgctgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttaaatgatgaaatcacaaagaaaaaaac 42408328  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||    
T  42408327 ctagatccatgtgaaaaacaattatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagatggatgatttcaggtcaagaactgaccaaaaaccatccctcaat 42408228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 307
Target Start/End: Original strand, 45198944 - 45199238
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  45198944 aatatatgataaaatcaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataaccgatctt-caaaatgaa 45199042  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45199043 tcagatgaacaccgcaagaagacgggaaatcaaacagcgccgcacaaaacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 45199142  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccct 307  Q
     ||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| | || | ||||||||||||||    
T  45199143 ttagatctatatgaaaatcacttatttaaattaaaatatagagaaaaagatgaagatgggtgatttcaggtcaatagttgatccaaaaccacccct 45199238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 46339220 - 46338919
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  46339220 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgccttcgaatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatagatctttcaatatgaa 46339121  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa--aaa 210  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||    
T  46339120 tcaaatgaacaccgtacgaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttaaatgatgaaattacaaagaaaaaaa 46339021  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  46339020 agctagatctatgtgaaaatcacttatttacattgaaataaagagaaaaagatgaagagggataatttcaggtcaagaattgacccaaaactacccctca 46338921  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  46338920 at 46338919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 20116748 - 20116451
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | || || ||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20116748 aatatttgataaaattaaagtgaccggaatatctatgacctctgggtctgcaacgttgacgcccaaagttttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 20116649  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  20116648 tcaaatgaacaccgcaagaagacggtaaatcaaacaacgacgcacaagacgacgaacaacaaacaaccacatgtatatgatgaaatcacaaagaaaaaac 20116549  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  20116548 ctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagatagaaaaagatgaagaagggtgatttcaggtcaaaaattgacccaaaactacccctca 20116451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23085687 - 23085391
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23085687 aatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggtctccagatctgcaacgttgacgttcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 23085588  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaa 211  Q
    | | |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23085587 taaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaatgccgcacatgacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgataaaatcacaaagaaaaaaa 23085488  T
Q  212 cctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaaga-ggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||    
T  23085487 cctagatctatgtgaaagtcaattatttagattgaaatagaaagaaaaagatgaagagggggtgatttcaagtcaataattgacccaaaaccacccc 23085391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26583875 - 26583580
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26583875 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatgacctccgaatctgcaacgttgacgct-----ctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 26583781  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaa 211  Q
    ||| |||||||  | | ||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26583780 tcaaatgaacattgcacgaagactggaaatcaaacaacgccgcacaagacgatgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 26583681  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26583680 cctagatatatatgaaaatcacttatttagattgaaatagagataaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgaccaaaaaccacccctcaa 26583581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 433602 - 433898
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  433602 aatatatgataaaattaaagtcaccggaatattcatggcctccggatctgcaacgttaacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaa 433701  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaacca-ccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaa 210  Q
    | | |||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  433702 taaaatgaacactgtaagaagacgagaaagcaaacaacgctgcacaagacaacgaacaacaaaccacccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 433801  T
Q  211 acctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  433802 atctagatctatgtgaaagtcatttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaaaagggatgatttcaggtcaaaaattgacccaaaaccacccc 433898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21266556 - 21266258
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21266556 aatatatgataaaactaaagtcaccgaaatattcatggcctccggatctgcaacgttgatgctcaaatctttgattgaataatcgatctt-caatatgaa 21266458  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaac-gccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 211  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  21266457 tcagatgaacaccgcaagaagacggaaaattaaaaaaatgtcgcacaagacgacgaataacaaaccaccacacttagatgatgaaatcaaaaagaaaac- 21266359  T
Q  212 cctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21266358 cctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagagaggtgatttcatgtcaataattgacccaaaaccacccctcaa 21266259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 14627790 - 14628091
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14627790 aatatatgataaaattaaagtgactggaatattcatggcctccgaatctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 14627889  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    ||| || |||||||||  || |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14627890 tcaaataaacaccgtactaagacgagaaatcaaacaacgccgcacaatacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaggaaaaaaa 14627989  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagagg-ggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| ||||  ||| || | || |||||||||||||| |||    
T  14627990 cctatatttatgtgaaaatcacttatttagattgaattagagaaaaaaagatgaagaggaggtaatttccggtaaaaatttgacccaaaaccacccttca 14628089  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  14628090 at 14628091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 2843152 - 2843438
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2843152 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacattgacgctcaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaa 2843251  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| |||||||||||||            |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2843252 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacg------------acgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattacaaa-aaaaaac 2843338  T
Q  213 ctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  2843339 ctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagaggggtgttttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccttcaat 2843438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23786741 - 23786508
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23786741 aatatatgataaaattaaagtgacaggaatatccatgacctcgggatctggaacgttgacgtttaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 23786642  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  23786641 tcaaatgaacaccgcaagaagacgagaaatcaaacaacgccgcagaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatg-aatcacaaagaaaaaat 23786543  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaa 246  Q
     ||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  23786542 ttagatatgtgtgaaaatcacttatttagattgaa 23786508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 31235695 - 31236004
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttcc--------ggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttc 104  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||        |||| ||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| ||||||||    
T  31235695 aatacatgataaaattaaagtgatcggaatacccatgtcttccatgcctccggatttgcaacgttgacgctcaaagatttgattgaataattgatctttc 31235794  T
Q  105 aatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||  |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |    
T  31235795 aatatgaatcaaatgaacaccgcaacgatacgagaaatcaaacaacgctgcacaagacgacgaacaacaaaccgccacacttagatgacgaaatcacgta 31235894  T
Q  205 gaaaaaacctagatctatgtg--aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaacca 302  Q
    || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||| |||| |||||||| ||    
T  31235895 gagaaaacctagatctatgtgaaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagaggggagatttcatgtcaaaaattgacccaaaatca 31235994  T
Q  303 c-ccctcaat 311  Q
    | ||||||||    
T  31235995 ctccctcaat 31236004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6559043 - 6558817
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6559043 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatttttcaaaatgaa 6558944  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaaga--aaaa 210  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  6558943 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcgaacaacgtcgtacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaagaaaa 6558844  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttat 236  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6558843 acctaaatctatgtgaaaatcacttat 6558817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6002195 - 6001891
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttcc--------ggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttc 104  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||        |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6002195 aatacatgataaaattaaggtgaccggaatactcatgtcttccataccttcggatctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaataattgatctttc 6002096  T
Q  105 aatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |    
T  6002095 aatatgaatcaaatgaacaccgcgacgatacgagaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccgccacactcagatgacgaaatcacgta 6001996  T
Q  205 gaaaaaacctagatctatgtg--aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaacca 302  Q
    || |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||||| ||    
T  6001995 gagaaaacctaaatctatgtgaaaaatcacttatttagattaaaatagggagaaaaagatgaagatgggtgatttcaggtcaaaaattgatccaaaatca 6001896  T
Q  303 cccct 307  Q
    |||||    
T  6001895 cccct 6001891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 238
Target Start/End: Original strand, 17222911 - 17223136
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17222911 aatatatgataaaattaaagtgaccagaatatccatggccttcaaatctgcaacgttgacatccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 17223010  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||| | | ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17223011 tcaaatgaacac-gcatgaagaaggaaaatcaaaccacgccgcacaagacgatgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 17223109  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttattt 238  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17223110 ctagatctatgtgaaaatcacttattt 17223136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 32684834 - 32684551
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32684834 aatatatgataaaactaaagtgaccggaatatccatggcctccagatctgtaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatatttcaatatgaa 32684735  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaaga---aaa 209  Q
    ||| |||||||||| |  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||   |||    
T  32684734 tcaaatgaacaccgcacaaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaa-------------------aaatcacaaagaaagaaa 32684654  T
Q  210 aacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32684653 aacctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaacgatgaagacatgtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctc 32684554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 34773877 - 34773679
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  34773877 aatatatgatgaaattaaagtgactggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacgatcgatctttcaatatgaa 34773778  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 211  Q
    ||| |||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  34773777 tcaaatgaacaccgcaagaagacaggaaatcaaacaacgccgcataagacgacgaataacaaatcaccacacttagatgatcaaattacaaagaaaaaa 34773679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35261463 - 35261174
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35261463 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatacacatgcct-ccggatctgcaacattgacgtctaaatctttgattgaataatcgatcttttaatatgaa 35261365  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag--aaaaa 210  Q
    ||| ||||||| || |  || ||||||||||||| || || |||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||  |||||    
T  35261364 tcaaatgaaca-cgcacaaagacggaaaatcaaataatgctgcaggagacgacgaacaacacacaaccacacttggatgacgaaatcacgaagaaaaaaa 35261266  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaataga-gagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaac 300  Q
    | ||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  35261265 atctaaatttatgtgaaaatcacttatttggattgaaatggactagaaaaagatgaagatgggtgattttaggtcaaaaattggcccaaaac 35261174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 285
Target Start/End: Original strand, 32521840 - 32522116
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||  |||| |  ||||| | ||||| || | ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32521840 aatatatgataaaataaaagtgtctggaatactcatgcc--ccggaacagcaacattgatgcctaaatctttgattgaataattgatctttcaatatgaa 32521937  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||  ||||| || ||||||||||    
T  32521938 tcaaatgaacaccacaacaaaacggaaaatcaaacaacgccgcacaagatgacgaacaacacacaaccacactcagatggcgaaataacgaagaaaaaac 32522037  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagag-----aaatagatgaagaggggtgattttaggtcaa 285  Q
     || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||     ||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  32522038 ataaatctatgtgaaaatcacttatttaaattgaaatagagagagaaaaaaaagatgaagatgggtgatttcaggtcaa 32522116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 71 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17611233 - 17610998
Alignment:
Q  71 acgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaaca 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  17611233 acgctcaaatctttgattgaataatcaatctttcaatatgaatcaaatgaacactgcaacaagacagaaaatcaaacaactccgcacaagacgacgaata 17611134  T
Q  171 acaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtgaaatcacttatttagattgaaataga-gagaaatagatgaagagg 269  Q
    ||| |||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||       |||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  17611133 acacaccaccacactcggatgacgaaatcacgaagaaaaaatctagttttatgtgaaa-----attttaaattgaaatggactagaaaaagatgaagagg 17611039  T
Q  270 ggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    |||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  17611038 ggtgatttcaggtcataaattgacctaaaaccacccctcaa 17610998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19560164 - 19560007
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19560164 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggtctccggatctgcaaggttgacgtccaaatctttgattgaataatcaatctttcaatatgaa 19560065  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaaca 170  Q
    ||| ||||||||   ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19560064 tcaaatgaacacatcaagaaaatgagaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaaca 19560007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20083504 - 20083203
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaata-tc-catggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatg 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| || |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  20083504 aatatatgataaaactaaagtgaccggaatactcacatgtct-ccggatatgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa-aatcgatctttcaaaata 20083407  T
Q  111 aatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaa-----caacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag 205  Q
    || ||  ||||||||| || || |||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||     ||||| |||| ||||||||||||  |||||||  |||    
T  20083406 aaacaactgaacaccgcaacaagacgggaaatcaaacaacgtctcacaagacgacaaattaaccaacacaccatcacacttagatgtcgaaatcatgaag 20083307  T
Q  206 aaaaaa-cctagatctatgtg---aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaacc 301  Q
    |||||| ||||||| ||| ||   ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  20083306 aaaaaaacctagatatatatgtgaaaattgcttatttagattgaaatagaaagaaaaagatgaagagtggt-attttaggtcaaaaattaacctaaaacc 20083208  T
Q  302 acccc 306  Q
    |||||    
T  20083207 acccc 20083203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 7640686 - 7640881
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaa-tatga 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  7640686 aatatatgatgaaattaaagtgaccagaatatccatgacatccagatttgcaatgttgacgcccaaatatttgattgaataatcgatctttcaaatgtga 7640785  T
Q  112 atcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 211  Q
    || | ||||    || ||||| | || ||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7640786 ataaaatga----cgcaagaagatgggaaagcaaacaacgcctcacaaggcgacgagcaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaaaaaaaaa 7640881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Original strand, 46818330 - 46818561
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| || | ||||||||||||||  ||| ||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  46818330 aatatatgataaaattaaagtgaacggaatacacatgact-ctggatctgcaacgttg-cgccaat-tctttgactgaacaatcgatcttttaatatgaa 46818426  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    | | |||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||||||  ||| |||||||  ||||| |||||||  ||||||||||    
T  46818427 ttaaatgaacaccgcaacaatacgagaaatcaaacaacgccgcacaagatttcgaacaacgcaccgccacactcggatgacgaaatcatgaagaaaaaac 46818526  T
Q  213 ctagatctatgtg--aaatcacttatttagattga 245  Q
    | | || ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  46818527 caaaatttatgtgaaaaatcacttatttagattga 46818561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 241
Target Start/End: Original strand, 17499666 - 17499799
Alignment:
Q  109 tgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaa 208  Q
    ||||||| ||||| |||| || || |||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17499666 tgaatcaaatgaataccgcaacaagacggaaaatcaaacaatgtcgcacaagacggtgaacaatacaccactacacttagatgatgaaatcacaatgaaa 17499765  T
Q  209 aaacctagatctatgtg-aaatcacttatttaga 241  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  17499766 aaacctagatctttgtgaaaataacttatttaga 17499799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 109 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17553548 - 17553415
Alignment:
Q  109 tgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaa 208  Q
    ||||||| ||||| |||| || || |||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17553548 tgaatcaaatgaataccgcaacaagacggaaaatcaaacaatgtcgcacaagacggtgaacaatacaccactacacttagatgatgaaatcacaatgaaa 17553449  T
Q  209 aaacctagatctatgtg-aaatcacttatttaga 241  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  17553448 aaacctagatctttgtgaaaataacttatttaga 17553415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 109
Target Start/End: Original strand, 13592420 - 13592515
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13592420 aatatatgataaaattaaagtgaccagaatacccatg-catccggatctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaataatcgatcttccaatat 13592515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 36143875 - 36143776
Alignment:
Q  169 caacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaaga 267  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36143875 caacacaccaccacactcagacgacgaaatcacgaagaaaaaacctagatctacgtgaaaaacacttatttagattgaattagagagaaaaagatgaaga 36143776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35132965 - 35132794
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcac-aaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttat 236  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |  | |||| ||| || |||||||| |||||||||  || ||| |||||| |||||||||||    
T  35132965 aaatcaaacaacgccgaacaagacgacgaacaacacaacgtcgcactaagacgacgaaatcacgaaagaaaaa--cttgatgtatgtgaaaatcacttat 35132868  T
Q  237 ttagattgaaatagagag--aaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    ||||||| ||| | || |  ||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||| ||||||||    
T  35132867 ttagattaaaagaaaggggaaaaaagatgtagaggggtgattctaggtcaaaaattgacctaaaatcacccctc 35132794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 308
Target Start/End: Original strand, 1749220 - 1749389
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcac-aaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttat 236  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  | |||| ||| || |||||||| |||||||||  || ||| |||||| |||||||||||    
T  1749220 aaatcaaacaatgccgcacaagacgacgaacaacacaacgtcgcactaagacgacgaaatcacgaaagaaaaa--cttgatgtatgtgaaaatcacttat 1749317  T
Q  237 ttagattgaaatagagag-aaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    ||||||||||| | || | ||| ||||||||  |||||||| |||||||| |||| ||| |||| ||||||||    
T  1749318 ttagattgaaagaaagggaaaaaagatgaag-cgggtgattctaggtcaaaaattgacctaaaatcacccctc 1749389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3860991 - 3860852
Alignment:
Q  138 aaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtgaaa-tcacttat 236  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || || |||| | |  | |||||| | ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  3860991 aaaatcaatcaacgccgcacaagacaacaaataacacagcgtcgcacttaaacgatgaaatcacgaagaaaaa-ccaagatctatgtgaaaatcacttat 3860893  T
Q  237 ttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattt 277  Q
    ||| ||||||| | ||||||| |||| |||||  |||||||    
T  3860892 ttatattgaaacaaagagaaaaagataaagagatgtgattt 3860852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 201
Target Start/End: Original strand, 24069425 - 24069525
Alignment:
Q  101 tttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatca 200  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | || |||| ||| ||||||||||    
T  24069425 tttcaatatgaatcaaacgaacaccgcaacaatacgccaaatcaaaaaacgccgcacaagacaacgaacaacacaacgccgcactcagacgatgaaatca 24069524  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  24069525 c 24069525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 211
Target Start/End: Original strand, 969478 - 969588
Alignment:
Q  101 tttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatca 200  Q
    |||||||||||| || |  ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| | | | ||||||||||    
T  969478 tttcaatatgaaccaaacaaacaccgcaataagacgcaaaatcaaacaacgccgcaaaagacgacgaacaacacaacgccacattcaaacgatgaaatca 969577  T
Q  201 caaagaaaaaa 211  Q
    | |||||||||    
T  969578 cgaagaaaaaa 969588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 37837533 - 37837589
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||    
T  37837533 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagatgatgaaatcacaaa 37837589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 304
Target Start/End: Original strand, 1100804 - 1100969
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtgaaa-tcacttatt 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | | ||  | | | | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||  ||| |||||| ||    
T  1100804 aaatcaaacaacaccgcacaagacgatgaacaacatatcgccggattcatacgatgaaatcacgaagaaaaaac-tagatatatgcaaaaatcacttgtt 1100902  T
Q  238 tagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacc 304  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||  |||||| | || ||||||| |||||    
T  1100903 aaaattgaaatagagagaaaaagatgaagatgagtggtttcgggtcaaaatttgacccaaagccacc 1100969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3394496 - 3394426
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaa 209  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  3394496 aaatcaaacaacaccacacaagacgacgaacaacacaacaccgcactcagacgatgaaatcacgaagaaaa 3394426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24770262 - 24770161
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcac-aaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattga 245  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| | |||| |||||||| || |||||||| ||||||||||  | ||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24770262 aacgtcgcataagacgacgaacaacacaacaccgcacttagacgacgaaatcacaaaagaaaaaaatttgatatatgtgaaaaccacttatttagattga 24770163  T
Q  246 aa 247  Q
    ||    
T  24770162 aa 24770161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 46244185 - 46244292
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatca 115  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||| || | |||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| |||| |||||||| ||| ||    
T  46244185 atatgataaaattaaagtgaccaaaatatcaatgtctt-cgaacctgcaacgttgacgctcaaatcattga-tgaataaccgatttttcaataggaacca 46244282  T
Q  116 gatgaacacc 125  Q
     |||||||||    
T  46244283 aatgaacacc 46244292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 277
Target Start/End: Original strand, 1575113 - 1575253
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaa-acctagatctatgtga-aatcacttat 236  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  | |||||| | | | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||| || ||| ||||||    
T  1575113 aaatcaaacaacgtcgcacaaaataatgaacaatatatcgccacatttagacgatgaaatcacaaagaaaaataattagatctatgcgacaataacttat 1575212  T
Q  237 ttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattt 277  Q
     || |||||||||  |||||| ||||||||| | |||||||    
T  1575213 gtaaattgaaataaggagaaaaagatgaagatgagtgattt 1575253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 8001621 - 8001677
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||||    
T  8001621 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 8001677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 9450212 - 9450268
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| || |||||||||||    
T  9450212 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccacacttagacgacgaaatcacaaa 9450268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7740635 - 7740568
Alignment:
Q  183 acttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaata 249  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  7740635 acttagattatgaaatcacaaagaaaaaatctaaatctatgtgaaaataatttatttaaattgaaata 7740568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 5546437 - 5546279
Alignment:
Q  101 tttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatca 200  Q
    |||||||| ||| || || ||||||| || |||| |||||||||||| |  | ||||||||||| ||| |||| |   | ||| | ||| || ||||| |    
T  5546437 tttcaataagaaccaaattaacaccgcaacaatatggaaaatcaaacgatactgcacaagacgatgaataacacaatgcaacattgagacgacgaaatga 5546338  T
Q  201 caaagaaaaaacct-agatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaa 257  Q
    | ||||||||| || | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5546337 cgaagaaaaaaacttaaatttatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaa 5546279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22742962 - 22742928
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22742962 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 22742928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 308
Target Start/End: Original strand, 24350910 - 24351091
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaa---------aaacctagatctatgtgaaa- 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||| ||| || |||||||| || |||         ||| || ||| |||||||||     
T  24350910 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgtcgcactaagacgacgaaatcactaaaaaacacgaaagaaaaacttgatgtatgtgaaaa 24351009  T
Q  229 tcacttatttagattgaaatagagagaaata--gatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||| |  |||| | |||||||||| |||||||| |||| ||| |||| ||||||||    
T  24351010 tcacttatttagattgaaagaaagggaaaaaaggatgcacaggggtgattctaggtcaaaaattgacctaaaatcacccctc 24351091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 28476245 - 28476211
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28476245 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 28476211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 121
Target Start/End: Original strand, 43369687 - 43369791
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatca 115  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||  |||| | ||||||||||||||||| | |  |||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||| ||    
T  43369687 atatgataaaattaaagtgactagaatactcatg-catccggatctgcaacgttgatgacaaaaccattgattgaatagccgatctttcaataggaacca 43369785  T
Q  116 gatgaa 121  Q
     |||||    
T  43369786 aatgaa 43369791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19296886 - 19296830
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  19296886 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 19296830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 30756894 - 30756950
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  30756894 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 30756950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 34899682 - 34899738
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  34899682 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 34899738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 39171665 - 39171721
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||    
T  39171665 aacgctgcacaagacgacgaacaacaaaacgcagcacttagatgacgaaatcacaaa 39171721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Original strand, 41553461 - 41553537
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||| ||| || |||  |||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  41553461 gatctttcaatatgaaccaaacgaacaccataacaagacgcgaaatcaaataacgtcacacaagacgacgaacaaca 41553537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Original strand, 41553806 - 41553882
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||| ||| || |||  |||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  41553806 gatctttcaatatgaaccaaacgaacaccataacaagacgcgaaatcaaataacgtcacacaagacgacgaacaaca 41553882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42978626 - 42978570
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  42978626 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 42978570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Original strand, 3267237 - 3267327
Alignment:
Q  95 tcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttag 188  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||| | || |||  |||||||||   | ||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  3267237 tcgatctttcaatatgaattaaacgaacaccgtgataagacgcgaaatcaaac---gtcgcacaagacgacgaacaacaaaacgccgcacttag 3267327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 30756982 - 30757067
Alignment:
Q  226 aaatcacttatttagattgaaatagagag---aaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||| | |  |   ||| ||||| |||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  30756982 aaatcacttatttagattgaaagaaaaggggaaaaaagatgtagaggggtgattctaggtcaaaaaattacctaaaaccacccctc 30757067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 48930791 - 48930686
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  | |||| ||| || ||||||   | ||||||| || ||| |||||| ||||||||||||    
T  48930791 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaataacacaacgtcgcactaagacgacgaaatc---atgaaaaaa-cttgatgtatgtgaaaatcacttatt 48930696  T
Q  238 tagattgaaa 247  Q
    ||||||||||    
T  48930695 tagattgaaa 48930686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 194 - 243
Target Start/End: Original strand, 43369858 - 43369908
Alignment:
Q  194 gaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagatt 243  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43369858 gaaatcacgaagaaaaaacttatatctatgtgaaaatcacttatttagatt 43369908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Original strand, 7640887 - 7640928
Alignment:
Q  206 aaaaaacctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaa 246  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7640887 aaaaaacctatatctatgtgaaaatcacttatttagattgaa 7640928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 204
Target Start/End: Original strand, 12141386 - 12141439
Alignment:
Q  151 gccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||| || |||||||||||    
T  12141386 gccgcacaagacgacaaacaacaaaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 12141439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 311
Target Start/End: Original strand, 12539125 - 12539166
Alignment:
Q  270 ggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12539125 ggtgatttcaggtcaagaattgaccaaaaaccacccctcaat 12539166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 257
Target Start/End: Original strand, 286682 - 286734
Alignment:
Q  206 aaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaa 257  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  286682 aaaaaacctagatatatgtggaaatcacttatttagattaaattagatagaaa 286734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 251 - 311
Target Start/End: Original strand, 17499797 - 17499857
Alignment:
Q  251 agagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||    
T  17499797 agagaaaaagatgaagatgagtgattttaggttaaatattgacccaaaactacccctcaat 17499857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 230 - 307
Target Start/End: Original strand, 19404922 - 19405001
Alignment:
Q  230 cacttatttagattgaaataga--gagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccct 307  Q
    |||||||||||||||||| | |  || ||| ||||| |||||||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||    
T  19404922 cacttatttagattgaaagaaaaggaaaaaaagatgtagaggggtgattctaggtcaaaaaatgacctaaaaccacccct 19405001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 26623865 - 26623921
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | || |||| ||| ||||||||||||||    
T  26623865 aacgccgtacaagacgacgaacaacacaacgccgcactcagacgatgaaatcacaaa 26623921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 39328865 - 39328921
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||  ||||||| || |||||||||||    
T  39328865 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgtacttagacgacgaaatcacaaa 39328921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 173
Target Start/End: Original strand, 41554155 - 41554227
Alignment:
Q  101 tttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||| || | ||||||| ||| || |||  |||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  41554155 tttcaatatgaaccaaacgaacaccataacaagacgcgaaatcaaataacgtcacacaagacgacgaacaaca 41554227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 211
Target Start/End: Original strand, 44311860 - 44311932
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 211  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | | |  | |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  44311860 aaatcaaacaacgtcgcagaagacgacgaacaatacaacgacgcactcagacgatgaaatcacgaagaaaaaa 44311932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 212
Target Start/End: Original strand, 45349874 - 45349938
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||||||||| || ||||||||| | |||||||    
T  45349874 aacgccacacaaaacgacgaacaacacaacgccacacttagacgacgaaatcacagaaaaaaaac 45349938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 46700193 - 46700118
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaat 92  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| | | ||  ||||| ||||||||||    
T  46700193 atatgataaaatctaagtcaccgaaatatccatg-cttccggatctgcaacgctgatgcccaaatcattgattgaat 46700118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 47590327 - 47590271
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||  | |||||||||||    
T  47590327 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacaacgaaatcacaaa 47590271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 76)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 51872033 - 51871739
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51872033 aatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgttcaaatatttgattgaataatcgatctttcaataagaa 51871934  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    | | |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51871933 taaaatgaacaccgcaagaagacggaaaagcaaacaacgtcgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaag 51871834  T
Q  213 ctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51871833 ctagatctatgtgaaagtcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagaggggtgattttaggtcaagaattgacccaaaaccacccc 51871739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28035305 - 28035009
Alignment:
Q  17 tatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcag 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28035305 tatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggcctccggatctgcaatgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaa 28035206  T
Q  117 atgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaaccta 215  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28035205 atgaacaccgtacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaaccta 28035106  T
Q  216 gatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  28035105 gatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagatgagtgatttcaggtcaataattgacccaaaaccacctctcaat 28035009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 51868556 - 51868856
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||  ||| ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51868556 aatatatgataaaattaaagtcatcggaatattcatggtctccagatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataagaa 51868655  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    | | |||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51868656 taaaatgaacaccgcaagaagacgagaaagcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 51868755  T
Q  212 cctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  51868756 cctagatctatgtgaaagtcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattaacccaaaaccaccccccaa 51868855  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  51868856 t 51868856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9172660 - 9172358
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9172660 aatatatgataaaattaaagtcaccggaatatctatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaa 9172561  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaat--cacaaag-aaaa 209  Q
    | | |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  9172560 taaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgataaaatcacacaaagaaaaa 9172461  T
Q  210 aacctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  9172460 aacctagatctatgtgaaagtcacttatttagattgaaatagagaaaaaaatatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccccc 9172361  T
Q  309 aat 311  Q
    |||    
T  9172360 aat 9172358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9180642 - 9180340
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9180642 aatatatgataaaattaaagtcaccggaatatctatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaa 9180543  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaat--cacaaag-aaaa 209  Q
    | | |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  9180542 taaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgataaaatcacacaaagaaaaa 9180443  T
Q  210 aacctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  9180442 aacctagatctatgtgaaagtcacttatttagattgaaatagagaaaaaaatatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccccc 9180343  T
Q  309 aat 311  Q
    |||    
T  9180342 aat 9180340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 40880924 - 40881224
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  40880924 aatatatgataaaattaaagtgaccagaatatccatggccttcggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgattttt-aatatgaa 40881022  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaa--tcacaaagaaaaa 210  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||    
T  40881023 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatctcaaaaaaaaaaa 40881122  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  40881123 acctagatctaagtgaaaatcactcatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagatgagtgattttaggtcaagaattgacccaaaaccatccctca 40881222  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  40881223 at 40881224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 25406195 - 25406495
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25406195 aatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatgacctctggatctgcaacgttgacgtcgaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaa 25406294  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    | | |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  25406295 taaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacgccacacaagacgacgaacaataaaccaccacacttagatgacgaaatcacaaagaaaaaaa 25406394  T
Q  212 cctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  25406395 cctagatctatgtgaaagtcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagaggtgtgatttcaggtcaagaattgacccaaaatcaccccccaa 25406494  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  25406495 t 25406495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 5324469 - 5324768
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5324469 aatatatgataaaattaaagtgaccgaaatatccatggcccccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatttttcaatatgaa 5324568  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| || || |||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5324569 tcaaatgaacaccgcaaaaagacgggaaatcaaacaataccgcacaagacggcgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaaggaaaaac 5324668  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
     || || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  5324669 ttaaatttacgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagagaggtgattccaggtcaagaattgacccaaaatcatccctcaat 5324768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 33291329 - 33291630
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  33291329 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatcgcctccgaatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaattacttatctttcaatatgaa 33291428  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    ||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33291429 tcaaatgaacaccgcacgacgacggaaaatcaaacaacaccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 33291528  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagag-aaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33291529 catagatttatgtgaaaatcacttatttatattgaaatagaaagaaaaaaaatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctca 33291628  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  33291629 at 33291630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5701429 - 5701127
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5701429 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgtctccggatctgcaacgttgatgcccaaatctttgattgaacaatcgatatttcaatatgaa 5701330  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa---aa 209  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||    
T  5701329 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaa 5701230  T
Q  210 aacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||    
T  5701229 aacctagatctatgtgaaaatcacttatttaaattgaaataaagagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaagtattgacccaaagtcacccctc 5701130  T
Q  309 aat 311  Q
    |||    
T  5701129 aat 5701127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7342892 - 7342592
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7342892 aatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggtctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaa 7342793  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaa 211  Q
    | | ||||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7342792 taaaatgaacaacgcaagaagacgggaaaacaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 7342693  T
Q  212 cctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    | |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  7342692 catagatctacgtaaaagtcacttatttagattgaaatagataaaaaaatatgaagaggggtgatttcaggtcaaaaattgacccaaaaccaccccccaa 7342593  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  7342592 t 7342592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 14545687 - 14545397
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  14545687 aatatatgataaaattaaaatgatcggaatactcatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctt-caaaataaa 14545589  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14545588 tcagatgaacaccgcaagaagacgggaa-tcaaacagcgtcgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 14545490  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacc 304  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  14545489 ctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatatagagaaaaagatgaagatgagtgatttcaggtcaagaattgacacaaaaccacc 14545397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 50272051 - 50272351
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50272051 aatatatgacaaaattaaagtgactggaatattcattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatttttcaatatgaa 50272150  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  50272151 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaaaacgacgaacaacaaatcaccaaacttagaagatgaaatcacaaagaaaaaaa 50272250  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  50272251 cttagatctatgtgaaaattacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaataggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccttcaa 50272350  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  50272351 t 50272351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 35584529 - 35584832
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35584529 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattggctccggatctgcaacgttgacgcccaaatatttgattgaacaatcgatctttcaatatgaa 35584628  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag----aaa 208  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||    |||    
T  35584629 tcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagattataaaattacaaagaaaaaaa 35584728  T
Q  209 aaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccct 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  35584729 aaacctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagatgagtgatttcaggttaagaattgacccaaaatcacccct 35584828  T
Q  308 caat 311  Q
    ||||    
T  35584829 caat 35584832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 7997959 - 7997659
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7997959 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatattcattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttggttgaacaatcgatatttcaatatgaa 7997860  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa---aa 209  Q
    ||| |||||||| | | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||    
T  7997859 tcaaatgaacactgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaa 7997760  T
Q  210 aacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||    
T  7997759 aacctagatctatgtgaaaatcacttatttatattgaaataaagagaaaaagatgaagaagggtgatttcagatcaaaaattaacccaaaaccacccctc 7997660  T
Q  309 a 309  Q
    |    
T  7997659 a 7997659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 45425977 - 45426268
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45425977 aatatatgataaaattaaagtgaccgaaatattcatggccttcggatctgcaacgttgacgctcaaatttttgattgaataatcgatctttcgatatgaa 45426076  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| | ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  45426077 tcaaatgaacaccgcacgatgatgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcaca---aaaaaac 45426173  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  |||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||    
T  45426174 ttagatctatgtgaaaatcacttatttagatttaaatagagagaaaaagatgaaaataggtgatttcaaatcaagaattgacccaaaaccacccc 45426268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 30818262 - 30818556
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  30818262 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggccaccggatctacaacgttaacgcctaaatctttgattgaataatcgatctttcgataagaa 30818361  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| |  |  |||| | ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  30818362 tcaaatgaacaccgcacaatgacgggagatcaaacaac-----acaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaaaaaaaaaa 30818456  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  30818457 ctagatttatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagatgggtgatttcaggtcaataattgacccaaaactacccctcaat 30818556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34519298 - 34519057
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34519298 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgtgtcc----aaatcgttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 34519203  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34519202 tcaaatgaacaccacaagaagacgagaaatcaaacaacgccgcacaaaacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcaaaaagaaaaaac 34519103  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaa 257  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34519102 ctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaa 34519057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 50166010 - 50166305
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50166010 aatatatgataaaattaaagtcaccagaatacccatggcctccggatctacaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaa 50166109  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    | | |||||||||| ||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  50166110 taaaatgaacaccgcaagaagacgagaaagcaaataacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacatagaaaaaaa 50166209  T
Q  212 cctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||  |||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  50166210 cctaaatctatgtgaaattcacttatttagattgaaatagatagaaaaagataaagaggggcaatttcaggtcaataattgacccaaaaccacccc 50166305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11454105 - 11453805
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11454105 aatatatgataaaattaaagtgaccagaatatctatgacctccggatctgcaatgttgacgctcaaatctttgattgaataatcgctctttcaagatgaa 11454006  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| ||||| |||| || || |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11454005 tcaaatgaataccgcaaaaagacgggaaatcaaacagcgctgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 11453906  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaat--agagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||||| |||| |||  |||||| ||||||    
T  11453905 ctagatctatgtgaaaaccacttatttagattgaaatagagagagaaaaagatgaaga-gagtgatttcaagtcaaaaattgaccagaaaccatccctca 11453807  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  11453806 at 11453805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30879245 - 30878945
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30879245 aatatatgatgaaattaaagtgatcggaatatccattgcctccgaatctgcaacgttgacgcccaaatatttgattgaacaatcgatctttcaatatgaa 30879146  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag--aaaaa 210  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||    
T  30879145 tcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacg-cgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttaaatgatgaaattacaaagaaaaaaa 30879047  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| | |||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30879046 acatagatctatgtgaaaatcacttatttagattaaaataaagagaaaaagatgaagagagatgatctcaggtcaaaaattgacccaaaaccacccctca 30878947  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  30878946 at 30878945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 38520446 - 38520739
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||  ||   ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38520446 aatatacgataaaattaaagtgactggaatatccatgcct-ccgaatctgcaacgttgacgcacaa---tttgatttaataatcgatctttcaatatgaa 38520541  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaa---gacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  38520542 tcagatgaacaccgtaagaatacgggaaatcaaacaacgccacacaagacgacgacgaacaacaaaccaccactcttagatgatgaaatcacgaagaaaa 38520641  T
Q  210 aacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| || |||| | |||||||||||||    
T  38520642 aacatagatctatgtgaaaatcacttatttagatcgaaatagagagaaaaagatgaagatgagtgatttcaggtaaaaaattgatccaaaaccacccc 38520739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9919559 - 9919295
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9919559 aatatatgatcaaattaaagtcaccggaatattcatggcctccggatttgcaacattgacgttcaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaa 9919460  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaa 211  Q
    | | |||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9919459 taaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacgccgtacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatggtgaaatcacaaagaaaaaaa 9919360  T
Q  212 cctagatctatgt-gaaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgat 275  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9919359 catagatctatgtaaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagaggggtgat 9919295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3871578 - 3871285
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaa-tatga 111  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | || |||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  3871578 aatatatgttaaaattatagtgaccgaaatatacatgacctctggatctgcaacgttgacacccaaatctttgattgaataatcgatctttcaaatataa 3871479  T
Q  112 atcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 211  Q
    |||| | |||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3871478 atcaaa-gaacaccgcaagaagacgggaaatcaaacaacgctgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 3871380  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaaga-ggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacc 304  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| | |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  3871379 cttagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaattgagagagaaagatgaaaagggggtgatttcagatcaagaattaacccaaaaccacc 3871285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20266470 - 20266177
Alignment:
Q  15 tatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatc 114  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| |||||| || |||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20266470 tatatgatgaaattaaagtgactggaacatccattgcctccgaatctgcaacgttgatgcccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaatc 20266371  T
Q  115 agatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaacc 213  Q
    | |||  ||||| | ||| |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  20266370 aaatgtccaccgcacgaagacgggaaatcaaacaattccacacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaagc 20266271  T
Q  214 tagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20266270 tagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagatgggtgattttagatcaagaattgacccaaaaccacccc 20266177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 19715806 - 19716107
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  19715806 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctctagatctgcaacgttgacgcccaaatctttgatttaacaatcgatctttcaatatgaa 19715905  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcac----aaagaaa 208  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    ||| |||    
T  19715906 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgctgcacaagacgacgaacaac-aatcaccacacttagatgatgaaattacaatgaaaaaaa 19716004  T
Q  209 aaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccct 307  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  19716005 aaacctaaatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaaga-gggtgatttcagatcaagaattgacccaaaaccacctct 19716103  T
Q  308 caat 311  Q
    ||||    
T  19716104 caat 19716107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27872907 - 27872615
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||| || | |||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27872907 aatatatgataaaattaaaatgattggaatattcacgccttccg-atctacaacgttgacgctcaaatctttaattgaataatcgatccttcaatttgaa 27872809  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    | | |||||||||| ||||| ||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27872808 ttaaatgaacaccgcaagaagacaaaaaatcaaacaacgtcgaacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgcaatcacgaagaaaaaac 27872709  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccaccc 305  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||    
T  27872708 ttagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagcgaaaaagatgaagatgggtgatttcatgtcaaaaattgacccaaaaccaccc 27872615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39987558 - 39987294
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39987558 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcct-ccggatctgcaacgttgacgcccaattctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 39987460  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||     
T  39987459 tcaaatgaacaccgcagcaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaatacaccaccacactcggatggtgaaatcacgaagaaaaaa- 39987361  T
Q  213 ctagatctatgtg--aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattt 277  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  39987360 ctagatctatatgaaaaatcacttatttagattgaatcagagagaaaaagatgaagagaggtgattt 39987294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 50148540 - 50148242
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50148540 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcttccggatctgcaacgttgacgcccacatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaa 50148441  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag---aaaa 209  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||| | |||||||||||    |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||    
T  50148440 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaatgtcgcacaagacg----acaacaaatcaccacacttagaagatgaaattacaaagaaaaaaa 50148345  T
Q  210 aacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| || |||||| || || |||||| |||||||||||||||||    
T  50148344 aacctagatctatgtgaaaatcacttatttagattaaaataaagagaaaaggatgaagatggatgatttcagatctagaattgacccaaaaccacccctc 50148245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Original strand, 18569224 - 18569521
Alignment:
Q  15 tatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| || |  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  18569224 tatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcct-ctggatctgcaacgttgacacccaaatcttcaattgaataatcgatctttcaatatgaatt 18569322  T
Q  115 agatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaacc 213  Q
    | |||||||||| || || |||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||| ||||| ||||||    
T  18569323 aaatgaacaccgcaacaagacgggaaatctaacaacaccggacaagatgacgaacaacacaccaccacactcaaatgacgaaatcacgaagaagaaaacc 18569422  T
Q  214 tagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18569423 tagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagacaggtgatttcttgtcaaaaattgacccaaaaccacccctcaat 18569521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31836975 - 31836745
Alignment:
Q  14 atatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaat 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31836975 atatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgct-ccggttctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaacaatcgatttttcaatatgaat 31836877  T
Q  114 cagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa--aaaa 211  Q
    || |||||||||| | ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  31836876 caaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacaccgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaaa 31836777  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagat 242  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31836776 cctagatctatgtgaaaatcacttatttagat 31836745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 268
Target Start/End: Original strand, 9687116 - 9687384
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9687116 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggcctctggatctgcaac-ttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 9687214  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag------- 205  Q
    ||| |||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  9687215 tcaaatgaacaccgcaagaagatgggaaatcaaacaacgccgcacaagatgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaataaaa 9687314  T
Q  206 ---aaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttag----attgaaatagagagaaatagatgaagag 268  Q
       |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9687315 acaaaaaaacctatatctatgtgaaaatcacttatttagattaattgaaatagagagaaa-agatgaagag 9687384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 7312017 - 7312309
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| |  |||||||||||| ||| |||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  7312017 aatatatgataaaactaaagtgaccgaaatactcatg-caaccggatctgcaatgttgacgtccaaatctttgtttgaattatcgatctttcaatatgaa 7312115  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| || || ||||||||||||||||     |||||||| | |||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  7312116 tcaaatgaacaccgcaacaagacggaaaatcaaacaa-----cacaagacaatgaacaacacaccaccacacttagat-acgaaatcacgaagaaaaaac 7312209  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  7312210 ctagatctacgtgaaaatcatttatttaatttgaaatagagagaaaaagatgaagagaagtaattttaggtcaaaaattgacccaaaactacccctcaat 7312309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 77 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 44637527 - 44637297
Alignment:
Q  77 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaac 176  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |     
T  44637527 aaatctttgatgtaatatttgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgtaacaagacgggaaaccaaacaacgtcgcacaagactacgaacaacacat 44637428  T
Q  177 caccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagaga-gaaatagatgaagaggggtga 274  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| |||||    
T  44637427 caccacatttagatgacgaaatcacaaagaagaaacttagatctacgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagataaaaaagatgaagagaggtga 44637328  T
Q  275 ttttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  44637327 ttttatgtcaa-aattgacccaaaaccacccc 44637297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 134 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19723382 - 19723209
Alignment:
Q  134 acggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaacctagatctatgtg-aaatca 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  19723382 acggaaaatcaaacaacgccgcagaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaacctagatctatgtgaaaatca 19723283  T
Q  232 cttatttagattgaaatagagag-aaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccaccc 305  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| |||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||    
T  19723282 cttatttagattg-aatagagagaaaaaatatgaagagaggtgatttcaagtcaataattgacccaaaaccaccc 19723209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 45805739 - 45806015
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  45805739 aatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgttcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatcggaa 45805838  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaa-tcacaaagaaaaaa 211  Q
    | | |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |    
T  45805839 tgaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaaca------------acgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaagtcac-------tta 45805919  T
Q  212 cctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
      ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||| || |||| |||| |||||||||||||||    
T  45805920 tttagatttatgtgaaagtcacttatttagattgaaatagagagaaaaagaggaagaaaggtgatttcagatcaaaaattgacccaaaaccacccc 45806015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40646844 - 40646558
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatc----tttcaata 108  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||    ||||||||    
T  40646844 aatatatgatgaaattatagtgaccagaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatcgatcgatctttcaata 40646745  T
Q  109 tgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaa 208  Q
    ||||||| || ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| | |                   || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40646744 tgaatcaaataaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgcccccc-------------------caacacacttagatgatgaaattacaaagaaa 40646664  T
Q  209 aaa--cctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccaccc 305  Q
    |||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40646663 aaaaacctagatctacgtgaaaatcacttatttagattgaaataaatagaaaaagatgaagatgagtgattttaggtcaagaattgacccaaaaccaccc 40646564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
Target Start/End: Original strand, 48365677 - 48365956
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||   ||| || |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48365677 aatatatgataaaattaaagtaatcggaatacttatg-ctcccggatctgcaacgttgacgttcaaatctttgattgaataatcgatccttcaatatgaa 48365775  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| ||||||||||  | || ||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  48365776 tcaaatgaacaccgctacaagacaaaaaatcaaacaacgttgcacaagatgacgaacaacacaccaccacactcagatgacgaaatcacgaagaaaaaac 48365875  T
Q  213 ctagatctatgtgaaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccaccc 305  Q
    |||||||| |||            |||| |||||| ||||||||| |||||||||  |||||||| |  |||| |||| ||||||||||||||    
T  48365876 ctagatctctgt------------ttagtttgaaacagagagaaaaagatgaagataggtgatttcatttcaaaaattgacccaaaaccaccc 48365956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 41081615 - 41081911
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatcttt-caatatga 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| || ||||||||||||| || | ||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41081615 aatatatgataaaattaaaatgaccagaatacacatgcct-ccggatctgcaacattgatgctcagatttttgattgaataatcgatcttttcaatatga 41081713  T
Q  112 atcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 211  Q
    |||| |||||||| | || ||  |   |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||||| ||| |||| | |||||||    
T  41081714 atcatatgaacactgcaacaaggcatgaaattaaacaacgccgcacaagccgatgaacaacacaccaccacactcggatgacgaagtcacgatgaaaaaa 41081813  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaataga-gagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaattta-cccaaaaccacccc 306  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  41081814 cctagatctatgcgcaaatcacttatatagattgaaatggactagaaaaagatgaagatgagtgatttcaggtcaaaaattgaccccaaaaccacccc 41081911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 251
Target Start/End: Original strand, 39927466 - 39927705
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||| |||||||||||||| ||    |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  39927466 aatatatgataaaattaaagtgattggaatactcatgtcttc-ggatctgcaacgttgacatccaaattttttattggataaccgatctttcaatatgaa 39927564  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
     || |||||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||||    
T  39927565 acaaatgaacaccgcaacaagacgggaaatcaaacaacgccacacaagacgacgaacaacacaccaccacactcggatgacgaaatcacgaagaaaaaaa 39927664  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaataga 251  Q
     |||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||    
T  39927665 tctagatctatctgaaaattatttatttagattgaaataga 39927705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 206 - 305
Target Start/End: Original strand, 25728064 - 25728164
Alignment:
Q  206 aaaaaacctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25728064 aaaaaacctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagaggagtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacc 25728163  T
Q  305 c 305  Q
    |    
T  25728164 c 25728164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Original strand, 33817079 - 33817271
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttg-------------attgaataatcgat 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |     |||||||||             ||||||||||||||    
T  33817079 aatatatgagaaaattaaagtgaccggaatattcatggcctccggatctgcaacgttgatatccaaatctttgattgaataatttgattgaataatcgat 33817178  T
Q  100 ctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgat 193  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || || |||  |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33817179 ctttcaatatgaatcaaatgaacaccg-aaaaagacgagaaatcaaacaacgcagcataagacgacaaacaataaaccaccacacttaaatgat 33817271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 33876549 - 33876740
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttg-------------attgaataatcgat 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |     |||||||||             ||||||||||||||    
T  33876549 aatatatgagaaaattaaagtgaccggaatattcatggcctccggatctgcaacgttgatatccaaatctttgattgaataatttgattgaataatcgat 33876648  T
Q  100 ctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatga 192  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || || |||  |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  33876649 ctttcaatatgaatcaaatgaacaccg-aaaaagacgagaaatcaaacaacgcagcataagacgacaaacaataaaccaccacacttaaatga 33876740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 182 - 278
Target Start/End: Original strand, 30558736 - 30558832
Alignment:
Q  182 cacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtgaaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgatttt 278  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||    
T  30558736 cactcagatgatgaaatcataaagaaaaaacctagatctgtgtgaaatcacttttttagattgaaatagaaagaaaaatatgaagaggagttatttt 30558832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Original strand, 32677041 - 32677120
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaat 92  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  32677041 aatatatgataaaattaaagtgactggaatatccatcgcctccgaatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 32677120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 19723483 - 19723404
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaat 92  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  19723483 aatatatgataaaattaaagtaaccgaaatatccatcgcctccggatctgctacgttgacgcccaaatctttgattgaat 19723404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 12635235 - 12635159
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||   | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12635235 gatctttcaatatgaaccaaatgaacaccactacaaaacgtaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 12635159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16801419 - 16801310
Alignment:
Q  64 aacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacg 163  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||  | ||||||| |  ||  |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16801419 aacgttgacgttaaaatcattgattgaataactgatctttcaatacgaacaaaatgaacaactcaaatatacagaaaattaaataacgccgcacaagacg 16801320  T
Q  164 acgaacaaca 173  Q
    ||||||||||    
T  16801319 acgaacaaca 16801310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5983853 - 5983797
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||||    
T  5983853 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 5983797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 228
Target Start/End: Original strand, 7836871 - 7836951
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtgaaa 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | | || |||||||| ||||||||||||||  ||||| || ||| |||||||||    
T  7836871 aacgtcgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgatgaaatcacaaaagaaaaaacttgatatatgtgaaa 7836951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 47132968 - 47132892
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| || || |||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47132968 gatctttcaatatgaagcaaacgaacaccgcaacaagacgcgaaattaaacaacgccgcacaaaacgacgaacaaca 47132892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 49626978 - 49626903
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| || || | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49626978 gatctttcaatatgaacca-acgaacaccgcaacaagatgtcaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 49626903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 51916739 - 51916900
Alignment:
Q  151 gccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattga---a 246  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||  | ||||| ||||||||||||||   |||| || ||| ||| || ||| ||||||||||||||||   |    
T  51916739 gccgcacaagacgactaacaacataacaccgtaattagacgatgaaatcacaaaaggaaaaacttgatttatttgaaaaccacttatttagattgaaaga 51916838  T
Q  247 atagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    | ||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||| || |  || |||||||||||||    
T  51916839 aaagagaaaaaaagatgtagatgagtgattttaggtcaaaaaatagcctaaaaccacccctc 51916900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16161857 - 16161823
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16161857 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 16161823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 304
Target Start/End: Original strand, 19052368 - 19052536
Alignment:
Q  138 aaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccacca--cacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtgaa-atcactt 234  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||| | | | |||  ||||  || || ||||||||| ||||||||| ||||||| | | || |||||||    
T  19052368 aaaatcaaacaacgatgctcaagacgacgaacaatatagcgccagacactcggacgacgaaatcacacagaaaaaac-tagatctttttaaatatcactt 19052466  T
Q  235 atttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacc 304  Q
    ||||||| ||||| |||||  || | |||||||  | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  19052467 atttagactgaaagagagaacaaaatatgaagattgatgatttcgggtcaaaaatttacccaaaaccacc 19052536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Original strand, 34413163 - 34413197
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34413163 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 34413197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 11462523 - 11462579
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||| |||||||||||    
T  11462523 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaatgccggacttagatgacgaaatcacaaa 11462579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19060933 - 19060861
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    | |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  19060933 aaatcaaacaacgccacacaagacgacgaacaacacaaggtcgcacttagacgacgaaatcacaaaaaaaaaa 19060861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 34528646 - 34528586
Alignment:
Q  225 gaaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaa 285  Q
    |||||||||||||||||| |||| | || |||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  34528646 gaaatcacttatttagatcgaaagaaagggaaaaagatgcagaggggtgattctaggtcaa 34528586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 44
Target Start/End: Original strand, 11709618 - 11709649
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatat 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11709618 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatat 11709649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21686890 - 21686827
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||  ||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  21686890 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgtacttagacgacgaaatcacaaaaaaaaaa 21686827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 210
Target Start/End: Original strand, 32679164 - 32679235
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaa 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  32679164 aaatcaaactacgccgcacaagatgacgaacaacacaacgccgcactcagacgatgaaatcacgaaaaaaaa 32679235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 48750204 - 48750096
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcac-aaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttat 236  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  | |||| |||    |||||||| |||||||||  || ||| |||||| |||||||||||    
T  48750204 aaatcaaacaacgtcgcacaagacgacgaacaacacaacgtcgcactaagacagcgaaatcacgaaagaaaaa--cttgatgtatgtgaaaatcacttat 48750107  T
Q  237 ttagattgaaa 247  Q
    |||||||||||    
T  48750106 ttagattgaaa 48750096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 204
Target Start/End: Original strand, 7337744 - 7337794
Alignment:
Q  154 gcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||| | | || |||||||| ||||||||||||||    
T  7337744 gcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgatgaaatcacaaa 7337794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 172
Target Start/End: Original strand, 31692495 - 31692568
Alignment:
Q  98 atctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaac 172  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||| || || | | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31692495 atctttcaatatgaacca-acgaacaccgcaacaagaagcaaaatcaaacaacaccgcacaagacgacaaacaac 31692568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 45415569 - 45415519
Alignment:
Q  154 gcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||||    
T  45415569 gcacaagacgacgaacaacaaaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 45415519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 173
Target Start/End: Original strand, 799812 - 799889
Alignment:
Q  96 cgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| || || ||  ||| ||||||||| | |||||||| ||| |||||||    
T  799812 cgatctttcaatatgaaccaaatgaacaccgcaataagacaaaaattcaaacaacactgcacaagatgacaaacaaca 799889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9341749 - 9341716
Alignment:
Q  140 aatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9341749 aatcaaacaacgctgcacaagacgacgaacaaca 9341716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16161761 - 16161676
Alignment:
Q  225 gaaatcacttatttagattgaaataga-gag-aaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||  |||||||    
T  16161761 gaaatcacttatttagattgaaataaaggagaaaaaatatgaagagaggtgattctaggtcaaaaattgacctaaaattacccctc 16161676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41994450 - 41994377
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | || || | ||| | |||||||||||| |||||||    
T  41994450 aaatcaaacaacgctgcacaagacgatgaacaacacaacgccgcattcagacgttgaaatcacaaaaaaaaaac 41994377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 49626838 - 49626754
Alignment:
Q  226 aaatcacttatttagattgaaatagagag--aaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    ||||||||||||||||| |||| | || |  ||| ||||| |||||||||||||||||||||  | | ||| |||||||||||||    
T  49626838 aaatcacttatttagatagaaagaaaggggaaaaaagatgcagaggggtgattttaggtcaaagaatgacctaaaaccacccctc 49626754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1742298 - 1742242
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  1742298 aacgtcgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 1742242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 24583015 - 24582940
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| || || | |  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24583015 gatctttcaatatgaacca-acgaacaccgcaacaagatgccaaatcaaacaacgccgcacaaggcgatgaacaaca 24582940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 45
Target Start/End: Original strand, 27915015 - 27915047
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatc 45  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27915015 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatc 27915047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 31317876 - 31317797
Alignment:
Q  35 accggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatca 115  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||  ||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||||||    
T  31317876 accgaaatatccatg-cttccgggtctgtaacgttgacgcccaaatcattgattgaaaagttgatctttcaataggaatca 31317797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 44543337 - 44543262
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| || || | |  |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  44543337 gatctttcaatatgaacca-acgaacaccgcaataagatgccaaatcaaacaacgccgcataatacgacgaacaaca 44543262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 215; Significance: 1e-117; HSPs: 81)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29503624 - 29503331
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  29503624 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctt-caaaatgaa 29503526  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29503525 tcagatgaacaccgcaagaagacggaaaatcaaacagcgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 29503426  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29503425 ctagatctatgtgaaaatcaattatttagattgaaatatagagaaaaatatgaagatgggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaatcacccc 29503331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 25631437 - 25631738
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25631437 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcatccggatctacaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatataaa 25631536  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag--aaaaa 210  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  25631537 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatgaaacaacgccgcacaagacggagaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 25631636  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  25631637 acctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatggagagggatgattttaggtcaaaaattgacccaaaaccacccctca 25631736  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  25631737 at 25631738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 25162599 - 25162302
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25162599 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccattacctccggatctgcaacgttgacggtcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 25162500  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaa 211  Q
     || |||||||||| | ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25162499 acaaatgaacaccgcacgaagatgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaactaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 25162400  T
Q  212 cctagatctatgtgaaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||||| || |||||||||||||||    
T  25162399 cctagatctatgtgaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagatgggtgatttcaaatcaagaattgacacaaaaccacccctca 25162302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 46934805 - 46934506
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46934805 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgaactccggatctgcaatgttgacgcccaaatcgttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 46934706  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  46934705 tcaaatgaacaccgcaagaagacgggaaatcaaacaacaccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcaacaagaaaaaac 46934606  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  46934605 ctggatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagagaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaaaaattgaccaaaaaccacccctcaat 46934506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 49552135 - 49552434
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49552135 aatatatgataaaactaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgatgctcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatgtgaa 49552234  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    | | |||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49552235 taaaatgaacaccgcaagaaaacgagaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacatttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 49552334  T
Q  213 ctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  49552335 ctagattaatgtgaaattcacttatttagattgaaatagagaaaaaatgatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccatcaat 49552434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4178728 - 4178428
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  4178728 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaatgttgacgcccaaatctttgtttgaataatggatctttcaatataaa 4178629  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaa 211  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4178628 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatgaaacaacgccgcacaagacgatgaaaaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 4178529  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
     |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4178528 gctagatttatctgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagatgggtgattttaggtcaagaattgacccaaaaccacccctcaa 4178429  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  4178428 t 4178428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 309
Target Start/End: Original strand, 39917309 - 39917605
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39917309 aatatatgataaaattaaagtgactggaatatccatgacctccggatctgcaacgttgacggtcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 39917408  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| | ||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39917409 tcaaatgaacaccgcacgaagac-gaaaatcaaacaacgtcgtacaagacaacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaggaaaaaac 39917507  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  39917508 ctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaattagagagaaaaatatgaagatggatgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccactcctca 39917605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32607632 - 32607337
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  32607632 aatatatgatgaaattaaagtgatcggaatattcattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatcaatctttcaatatgaa 32607533  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa--aaa 210  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  32607532 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccacacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaa 32607433  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  32607432 acctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaatgatgaagaggggt-atttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccc 32607337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 50611332 - 50611628
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatca 115  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50611332 atatgataaaatttaagtgacccgaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatcttcgattgaataatcgatctttcaatataaatca 50611431  T
Q  116 gatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaacct 214  Q
     |||||||||| | ||  ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50611432 aatgaacaccgcacgaggacggaaaatgaaac-acgccgcataagacgacgaacaataaaccatcacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaacct 50611530  T
Q  215 agatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||    
T  50611531 agatctatatgaaaatcacttatttagattgaaatatagagaaaaagatgaagaggggtgattttaggtcaataattgacccaaaaccatctctcaat 50611628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 310
Target Start/End: Original strand, 44907310 - 44907609
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44907310 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatattcgttgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatatttgattgaacaatcgatctttcaatatgaa 44907409  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag--aaaaa 210  Q
    | | |||||||||| | ||| |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  44907410 ttaaatgaacaccgcacgaagataggaaatcaaacaacg-cgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaa 44907508  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44907509 acctagatctatgtgaaaatcacttgtttagattgaaataaagagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctca 44907608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 38854947 - 38855247
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38854947 aatatatgataaaattaaagtgcccggaatatcaatggcctccggatttgcaacgttgacgcccaaatattcgattgaataatcgatctttcaatataaa 38855046  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag--aaaaa 210  Q
    ||| |||||||||| | ||  |||| | || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  38855047 tcaaatgaacaccgcacgaggacgggagatgaaacaacgccacacaagacaacgaacaacaaaccatcacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 38855146  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38855147 atctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgatatagagagaaaaagatgaagaggggtgattttcggtcaagaa-tgacccaaaaccacccctca 38855245  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  38855246 at 38855247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14464673 - 14464371
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14464673 aatatatgacaaaattaaagtgactggaacatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 14464574  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa---aa 209  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| |||| |||||||||||||| | |||| |||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||    
T  14464573 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaattaaacaacgccgcacgaaacgatgaatgacaaatcaccacacttagaagatgaaatcacaaagaaaaaaa 14464474  T
Q  210 aacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  14464473 aacttagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaataggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccttc 14464374  T
Q  309 aat 311  Q
    |||    
T  14464373 aat 14464371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36906285 - 36905985
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36906285 aatatatgatgaaattaaagtgactggaatatctattgcctccggaactgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaattgatctttcaatatgaa 36906186  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaa 211  Q
    ||| ||||||||   | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  36906185 tcaaatgaacactacacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaa 36906086  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  36906085 cctaaatctatgtgaaaatcacttatttatattgaaataaagagaaaaagatgaagaagggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccatccatcaa 36905986  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  36905985 t 36905985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12116261 - 12115957
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12116261 aatatatgatgaaattaaagtgactagaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaa 12116162  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaac-aaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag----aa 207  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    ||    
T  12116161 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacaacgaacaacaaaatcaccacacttagataatgaaattacaaagaaaaaa 12116062  T
Q  208 aaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| | |||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  12116061 aaaacctagatctttgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagaggaaaagatgaagagagatgatttcaggtcaagaattgactcaaaaccacccc 12115962  T
Q  307 tcaat 311  Q
    |||||    
T  12115961 tcaat 12115957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17237968 - 17237671
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17237968 aatatataataaaattaaagtgaccggaatatccatagcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatattttaatatgaa 17237869  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa---aa 209  Q
    ||| || |||||||   ||| ||   | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  17237868 tcaaatcaacaccgcgcgaaaacaagatatcaaacaacgccgcacaagacgacaaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 17237769  T
Q  210 aacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  17237768 aacctaaatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaacagatgaagatgaatgattttaggtcaagaattgacctagaaccacccc 17237671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 35499109 - 35499413
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35499109 aatatatgatgaaattaaagtgatcggaatatccattgtctccggatttgcaatgttaacgcccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaa 35499208  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag----aaa 208  Q
    ||| |||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    |||    
T  35499209 tcaaatgaacaccgcacaaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagataatgaaattacaaagaaaaaaa 35499308  T
Q  209 aaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaaga-ggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||    
T  35499309 aaacctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagagggggtgatttcaggtaaaaaattgaccaaaaaccacccc 35499408  T
Q  307 tcaat 311  Q
    |||||    
T  35499409 tcaat 35499413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 51202165 - 51202460
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  51202165 aatatatgataaaattaaagtgaccgggatattcatcgcctccggatttgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaattactgatctttcaatatgaa 51202264  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag---aaaa 209  Q
    ||| |||||||||| | ||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  51202265 tcaaatgaacaccgcacgacgatgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacaaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 51202364  T
Q  210 aacctagatctatgtgaaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  51202365 aacctagatctatgtgaaa------atttagattgaaatagagagaaaaatatgaagatgggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaatcacccctca 51202458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 304
Target Start/End: Original strand, 38440496 - 38440781
Alignment:
Q  17 tatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcag 116  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38440496 tatgacaaaattaaagtgatcggaatattcatggcctccagatctgcaatgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaa 38440595  T
Q  117 atgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctag 216  Q
    |||||||  | | ||| ||| ||||||||||   |||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  38440596 atgaacattgcacgaagacgaaaaatcaaac---gccatataagacgacgaacaacaaaccaccacactttgatcatgaaatcaaaaagaaaaaacctag 38440692  T
Q  217 atctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacc 304  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  38440693 atctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagataaagaggagtgatttcaggtcaagaattgactcaaaaccacc 38440781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 42719680 - 42719406
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||| |||||||||||| ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42719680 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcacgacctccgaatctgcaacgttgacctccgaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 42719581  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||    
T  42719580 tcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaactcaca---taaaaac 42719484  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaat 289  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  42719483 ctagatctacatgaaaatcacttatttaaattgaaatagagagaaaaatacgaagatgagtgatttcaggtcaagaat 42719406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22803193 - 22802890
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttcc--------ggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttc 104  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||        |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22803193 aatacatgataaaattaaagtgatcggaatacccatgtcttccatgcctccggatctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaataattgatctttc 22803094  T
Q  105 aatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||| |||| |    
T  22803093 aatatgaatcaaatgaacaccgcaacgatacgagaaatcaaacaacgccgcataagacgacgaacaacaaaccgccacactcaaatgacgaaagcacata 22802994  T
Q  205 gaaaaaacctagatctatgtg--aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaacca 302  Q
    || |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| |||| |||||||| ||    
T  22802993 gagaaaacctagatctacgtgaaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagaggagtgatttcatgtcaaaaattgacccaaaatca 22802894  T
Q  303 cccc 306  Q
    ||||    
T  22802893 cccc 22802890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Original strand, 30648630 - 30648860
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||  |||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30648630 aatatatgataaaattaaagttaccgaaatattcatggccgccggatttgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 30648729  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    | | |||||||||| ||||| | || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30648730 taaaatgaacaccgcaagaagatgggaaagcaaacaacaccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 30648829  T
Q  212 cctagatctatgtgaaa-tcacttatttaga 241  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30648830 actagatctatgtgaaagtcacttatttaga 30648860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 202
Target Start/End: Original strand, 3848831 - 3849019
Alignment:
Q  14 atatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaat 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3848831 atatatgataaaattaaagtcaccggaatatctatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaat 3848930  T
Q  114 cagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcaca 202  Q
     | |||||||||| ||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3848931 aaaatgaacaccgcaagaagatgggaaagcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttacatgatgaaatcaca 3849019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 139 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4172604 - 4172430
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa-cctagatctatgtgaaa-tcacttat 236  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4172604 aaatgaaacaacaccgcacaagacgacgaaaaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaacctagatctatgtgaaaatcacttat 4172505  T
Q  237 ttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4172504 ttagattgaaatagagagaaaaagatgaagatggatgattttatgttaagaattgacccaaaaccacccctcaat 4172430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 46178731 - 46178447
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  46178731 aatatatgataaaataaaagtgaccggaatacccatgcct-ccggatctgcaacgttgacgcccaattctttgattgaataatcaatatttcaatatgaa 46178633  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||| | || |||||        ||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||  || || |||||||| ||||||||||    
T  46178632 tcaaatgaacactgcaacaatac--------aaacaacactgcacaagatgacgaacaatacaccaccacactcggaagacgaaatcacgaagaaaaaac 46178541  T
Q  213 ctagatctatgtgaaat--cacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacc 304  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||||||    
T  46178540 ctagatctatgtgaaaaagcacttatttagattgaattagagagaaaaagatgaagagggatgatttcaggtcataaattgacccaaaaccacc 46178447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 36734604 - 36734801
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| || || ||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36734604 aatatatgataaaattaaagtaaccgaaatactcatgcct-ccagatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattcaataatcgatctttcattatgaa 36734702  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 211  Q
    ||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||    
T  36734703 tcaaatgaacaccgcaataagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaccatcacatttggatgacgaaatcacgaagaaaaaa 36734801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 53 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37169353 - 37169094
Alignment:
Q  53 tccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgc 152  Q
    ||||||||||||||||| |||   || ||||| |||||||||| |||||| | |||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  37169353 tccggatctgcaacgttgacgtctaattctttaattgaataattgatctt-cgatatgaatcaaatgagcaccgcaacaatacggaaaatcaaacaacgc 37169255  T
Q  153 cgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg--aaatcacttatttagattgaaatag 250  Q
     ||||||||||||| |||||| |||| ||||||  | ||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||    
T  37169254 tgcacaagacgacggacaacagaccatcacactcgggtgacgaaatcaagaagaaaaaatctagatctatgtgaaaaatcacttatttatattgaattag 37169155  T
Q  251 agagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||| |||| || |||| | |||||| |||||||||||    
T  37169154 agagaaaaaggtgaagagaggtgatttcaggtaaaaaattgatccaaaatcacccctcaat 37169094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25849964 - 25849684
Alignment:
Q  21 ataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatga 120  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25849964 ataaagttaaagtgactggaatattcatgtct-ccggatctgcaacgttgacgctaaaatctttaattgaataatcgatttttcaatatgaatcaaatga 25849866  T
Q  121 acaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatct 220  Q
    |||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||    |||||| |||||||||||      | ||||| |  |||||||||  |||||||    
T  25849865 acaccgcaagaagacgggaaataaaacaacgctgcacaagacg----acaacacaccaccacact------acgaaattatgaagaaaaaatttagatct 25849776  T
Q  221 atgtgaa-atcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||| | ||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  25849775 atgtgaacatcacttatctgaattgaaatagaaagaaaaagacgaataagggtgatttcaagtcaaaaattgactcaaaaccacccctcaat 25849684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31794231 - 31794001
Alignment:
Q  15 tatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatc 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31794231 tatatgataaaattaaactgaccggaatactcatgcct-ccgaatctgcaacgttgatgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatc 31794133  T
Q  115 agatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacct 214  Q
    | |||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||| | ||            
T  31794132 aaatgaacaccgcaacaagatagaaaatcaaacaacgccgcacaaaacgacgaacaacacaccactacactcagatgacaaaatcacgagga-------- 31794041  T
Q  215 agatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagaga 253  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31794040 agatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagaga 31794001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 140 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2342528 - 2342357
Alignment:
Q  140 aatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaacctagatctatgtg-aaatcacttatt 237  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  2342528 aatcaaacaacgccgcactagacaacgaataacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaatatagatatatgtgaaaatcacttatt 2342429  T
Q  238 tagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  2342428 tagattgaaatagagagaaaaagatgaagagggttga-ttcaggtttagaattgacccaaaaccacccctcaa 2342357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21488256 - 21488078
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggct--tccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||   |||| ||  ||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21488256 aatatatgataaaattaaagtgactagaatgctcatgcctcctccagatctacaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatttttcaatatg 21488157  T
Q  111 aatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttaga 189  Q
    ||||| || ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21488156 aatcaaataaacaccgcaagaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacaaacaacataccaccacacttaga 21488078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 206 - 306
Target Start/End: Original strand, 3850560 - 3850661
Alignment:
Q  206 aaaaaacctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  3850560 aaaaaacctagatctatgtgaaagtcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgatccaaaaccacc 3850659  T
Q  305 cc 306  Q
    ||    
T  3850660 cc 3850661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Original strand, 6910623 - 6910802
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| || ||  |||| |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6910623 aatatatgataaaattaaattgactggaata--catgtct-ccatatctacaacattgacgctcaaatctatgattgaataatcgatctttcaatatgaa 6910719  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcac 201  Q
    ||| ||||||||      |  |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6910720 tcaaatgaacac------ataacggaaaatcaaacaacatcgcacaaaacgacgaataatataccaccacacttagatgatgaaatcac 6910802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 2342626 - 2342524
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2342626 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatatcctccgaatttgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatatttcaatatgaa 2342527  T
Q  113 tca 115  Q
    |||    
T  2342526 tca 2342524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 21916636 - 21916555
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataat 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21916636 aatatatgataaaattaaagtgaccgaaatatccatggtttccggatctgcaacgttgacgctcaaat-tttgattgaataat 21916555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 248
Target Start/End: Original strand, 47980708 - 47980811
Alignment:
Q  147 caacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg--aaatcacttatttagattg 244  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |   |||| |||||||| || |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  47980708 caacgccgcataagacgatgaacaacaaaccaccacaatcgaatgacgaaatcacgaataaaagacctagatttatgtgaaaaatcacttatttagattg 47980807  T
Q  245 aaat 248  Q
    ||||    
T  47980808 aaat 47980811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 248
Target Start/End: Original strand, 47989995 - 47990098
Alignment:
Q  147 caacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg--aaatcacttatttagattg 244  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |   |||| |||||||| || |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  47989995 caacgccgcataagacgatgaacaacaaaccaccacaatcgaatgacgaaatcacgaataaaagacctagatttatgtgaaaaatcacttatttagattg 47990094  T
Q  245 aaat 248  Q
    ||||    
T  47990095 aaat 47990098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 248
Target Start/End: Original strand, 47999282 - 47999385
Alignment:
Q  147 caacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg--aaatcacttatttagattg 244  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |   |||| |||||||| || |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  47999282 caacgccgcataagacgatgaacaacaaaccaccacaatcgaatgacgaaatcacgaataaaagacctagatttatgtgaaaaatcacttatttagattg 47999381  T
Q  245 aaat 248  Q
    ||||    
T  47999382 aaat 47999385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 248
Target Start/End: Original strand, 48008569 - 48008672
Alignment:
Q  147 caacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg--aaatcacttatttagattg 244  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |   |||| |||||||| || |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  48008569 caacgccgcataagacgatgaacaacaaaccaccacaatcgaatgacgaaatcacgaataaaagacctagatttatgtgaaaaatcacttatttagattg 48008668  T
Q  245 aaat 248  Q
    ||||    
T  48008669 aaat 48008672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 204
Target Start/End: Original strand, 20464993 - 20465101
Alignment:
Q  93 aatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatga 192  Q
    |||||||||||||||| || | | ||||||||||  | || ||| ||||||||||   |||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||    
T  20464993 aatcgatctttcaataggatttaaatgaacaccgcgacaagacgcaaaatcaaac---gccgtacaagacgacgaacaacacaacacctcacttagacga 20465089  T
Q  193 tgaaatcacaaa 204  Q
    ||||||||||||    
T  20465090 tgaaatcacaaa 20465101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21488073 - 21487996
Alignment:
Q  214 tagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatt 290  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  21488073 tagatctacgtgaaagtcacttatttagattgaaatggagagaaaaagatgaagattggtgatttcaggtcaaaaatt 21487996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 30829995 - 30829891
Alignment:
Q  155 cacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgt-gaaatcacttatttagattgaaatagaga 253  Q
    ||||| ||||| ||||||| | |  |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||  ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  30829995 cacaaaacgacaaacaacacaacgtcacactcagatgatgaaatcacgatgaaacaacctagatctatgtcaaaatccctcatttggattgaaatagaga 30829896  T
Q  254 gaaat 258  Q
    |||||    
T  30829895 gaaat 30829891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 173
Target Start/End: Original strand, 4396362 - 4396437
Alignment:
Q  98 atctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || ||  || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4396362 atctttcaatatgaatcaaacgaacaccgcaacaaggcgcaaaatcaaacaacgccacacaagacgacaaacaaca 4396437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 175
Target Start/End: Original strand, 20911614 - 20911731
Alignment:
Q  58 atctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcac 157  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||| | ||  | |||| || || | ||||||||||||||||    ||    
T  20911614 atctgcaacgttaacaccaaaatcattgatagaatagtcaatctttcagtatgaattaaatacaaaccgcaacaacatggaaaatcaaacaacgatatac 20911713  T
Q  158 aagacgacgaacaacaaa 175  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20911714 aagacgacgaacaacaaa 20911731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 311
Target Start/End: Original strand, 36735278 - 36735363
Alignment:
Q  226 aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| | | |||||||||| |||||| |||| || |||| ||| ||||||||| ||||||    
T  36735278 aaatcacttatttaaattgaaatatagagagaaaaatgaagagggatgatttcaggtaaaaaattgaccaaaaaccacctctcaat 36735363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 275
Target Start/End: Original strand, 6913249 - 6913321
Alignment:
Q  204 agaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgat 275  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  6913249 agaaaaaacctcgatctatgtgaaaatcacctatctagattgaaacatagagaaagagatgaaaaggggtgat 6913321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 43488665 - 43488721
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| || |||||||||||    
T  43488665 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccacacttagacgacgaaatcacaaa 43488721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 51923743 - 51923634
Alignment:
Q  138 aaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcac-aaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcactta 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |  |||||| ||| || |||||||| |||||||||  || |||  ||||| ||||||||||    
T  51923743 aaaatcaaataacgccgcacaagatgacgaacaacacaacgtcacactaagacgacgaaatcacgaaagaaaaa--cttgatgcatgtgaaaatcactta 51923646  T
Q  236 tttagattgaaa 247  Q
    ||||||||||||    
T  51923645 tttagattgaaa 51923634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4821868 - 4821766
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaa 196  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| || || ||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||||    
T  4821868 gatctttcaatatgaaccaaacgaacaccgcaacaagacgcaaaatcaaacaatgtca-acaagacgacgaacaatacaacaccgcacttagacgatgaa 4821770  T
Q  197 atca 200  Q
    ||||    
T  4821769 atca 4821766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 172
Target Start/End: Original strand, 46322356 - 46322427
Alignment:
Q  101 tttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaac 172  Q
    |||||||||||| || |||||||||| || || |||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  46322356 tttcaatatgaaccaaatgaacaccgcaacaagacggaaaaacaaacaacaccgtacaaaacgacgaacaac 46322427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 54378923 - 54378818
Alignment:
Q  153 cgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtgaaa--tcacttatttagattgaaatag 250  Q
    ||||||||||||||||  ||| | ||||||||| || |||  ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| |    
T  54378923 cgcacaagacgacgaaatacacatcaccacactcaggtgacaaaatcacgaagaaaaaat-tagatctacgtgaaaaatcactcatttagattgaaatgg 54378825  T
Q  251 agagaaa 257  Q
    |||||||    
T  54378824 agagaaa 54378818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 7546629 - 7546595
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7546629 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 7546595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Original strand, 12947343 - 12947377
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12947343 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 12947377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29239362 - 29239300
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcac 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | || |||| ||| |||||||||||    
T  29239362 aaatcaaacagcgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcactcagacgatgaaatcac 29239300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 51487125 - 51487091
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51487125 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 51487091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9998480 - 9998424
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  9998480 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 9998424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10108249 - 10108193
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  10108249 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 10108193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10233083 - 10233027
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  10233083 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 10233027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 12050723 - 12050779
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||| || |||||||||||    
T  12050723 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacgccgcgcttagacgacgaaatcacaaa 12050779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 173
Target Start/End: Original strand, 24396492 - 24396585
Alignment:
Q  84 tgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacgg----aaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    ||||||||||  | |||||| |||| |||||| |||||||||| || || ||||    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24396492 tgattgaatagacaatcttttaataagaatcaaatgaacaccgcaacaagacggacggaaaatcaaacaacgtcgcacaagacgacaaacaaca 24396585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 36461506 - 36461562
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  36461506 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 36461562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40487338 - 40487282
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  40487338 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 40487282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 302
Target Start/End: Original strand, 6823556 - 6823599
Alignment:
Q  259 agatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaacca 302  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  6823556 agatgaagaggggtgatttcagatcaagaattgacccaaaacca 6823599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8914728 - 8914693
Alignment:
Q  138 aaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8914728 aaaatcaaacagcgccgcacaagacgacgaacaaca 8914693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16235441 - 16235407
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16235441 aaatcaaacaacgccgcacaagacggcgaacaaca 16235407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Original strand, 27706299 - 27706333
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27706299 aaattaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 27706333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 204
Target Start/End: Original strand, 38860197 - 38860251
Alignment:
Q  150 cgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||| || |||||||||||    
T  38860197 cgccgcacaagacgacgaacaacaaaacgtcgcacttagacgacgaaatcacaaa 38860251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 40556725 - 40556671
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcaca 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||    
T  40556725 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatcaca 40556671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 42460765 - 42460731
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42460765 aaatcaaacaacgccgcacaagacgatgaacaaca 42460731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6902864 - 6902831
Alignment:
Q  226 aaatcacttatttagattgaaatagagagaaata 259  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6902864 aaatcactcatttagattgaaatagagagaaata 6902831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 173
Target Start/End: Original strand, 30293419 - 30293575
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatca 115  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||  |||| | |||| || |||||| || || || ||||| ||||||||||| |   ||||||| || ||||||    
T  30293419 atatgataaagttaatgtgaccgaaatactcatg-catccgaatttgcaacattgactctcaaatcattgattgaatagtttgtctttcagtaggaatca 30293517  T
Q  116 gatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
     ||||| ||   || || | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  30293518 aatgaatactacaacaagatggaaaatcaaacaacatcgcgcaagacgacgaacaaca 30293575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 204
Target Start/End: Original strand, 31271885 - 31271938
Alignment:
Q  151 gccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| || |||||||||||    
T  31271885 gccgcacaagacgacgaacaacacaaaaccgcacttagacgaagaaatcacaaa 31271938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 36910716 - 36910757
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttaga 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  36910716 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacgccgcacttaga 36910757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Original strand, 52923192 - 52923233
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttaga 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  52923192 aacgccgcacaagacgacgaacaacacagcgccacacttaga 52923233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 6954771 - 6954827
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | || |||||||| || |||||||||||    
T  6954771 aacgccgcacaagacgacgaacaatacaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 6954827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10229489 - 10229433
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  10229489 aacgccgcacaagatgacgaacaacacaacgccgcacttagaagacgaaatcacaaa 10229433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 170
Target Start/End: Original strand, 21289886 - 21289918
Alignment:
Q  138 aaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaaca 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21289886 aaaatcaaacaacgccgcacaagacaacgaaca 21289918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 92
Target Start/End: Original strand, 26716075 - 26716115
Alignment:
Q  52 ttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaat 92  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  26716075 ttccggatctgcaacgttgacgccaaaatcattgattgaat 26716115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 35175465 - 35175389
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    ||||||||||||| || || | |||||||| || || ||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  35175465 gatctttcaatataaaccaaacgaacaccgcaacaagacatgaaatcaaacaacgctgcacaagacgatgaacaaca 35175389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 44960027 - 44960083
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||| || | | |||| |||||||| || |||||||||||    
T  44960027 aacgccgcacaagacgacgaataatacaacaccgcacttagacgacgaaatcacaaa 44960083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 45568520 - 45568576
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  45568520 aacgccacacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 45568576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 47896165 - 47896109
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||| || || |||||||||||    
T  47896165 aacgccgcacaagacaacgaacaacacaacgccacactttgacgacgaaatcacaaa 47896109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 73)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
Target Start/End: Original strand, 27266770 - 27267065
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27266770 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgacctccggatctgcaacgttgacggtcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 27266869  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag--aaaaa 210  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  27266870 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacagtgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 27266969  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccaccc 305  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27266970 acctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaatatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccaccc 27267065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 289
Target Start/End: Original strand, 2057749 - 2058027
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2057749 aatatatgataaaattatagtgaccggaatatccatggcatctggatctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 2057848  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2057849 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcgcaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcataaagaaaaaaa 2057948  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaat 289  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2057949 cctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagaggggtgattttaggtcaagaat 2058027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16981457 - 16981159
Alignment:
Q  14 atatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaat 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16981457 atatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatgacctccggatctgcaacgatgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaat 16981358  T
Q  114 cagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacc 213  Q
    || | |||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16981357 caaaggaacaccgcaagaagacggaaaattaaacaatgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccgcacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacc 16981258  T
Q  214 tagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  16981257 tagatatatgtgtaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaatatgaagaggagtgatttcaggtcaagaattgatccaataccacccctcaat 16981159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 18677376 - 18677677
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18677376 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggtctccggatctgcaatgttgacgccaaattatttgattaaataatcgatctttcaatatgaa 18677475  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag--aaaaa 210  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  18677476 tcaaatgaacaccgtacgaagacggaaaatcaaacaacgtcccacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 18677575  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  18677576 acctagatctatgtgaaaatcacttatttagattaaaatagagagaaaaagatgaagagggatgatttcagatcaataattgacccaaaaccacccctca 18677675  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  18677676 at 18677677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 781556 - 781264
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  781556 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttgacgctcaaatttttgattgaataattgatctt-caaaatgaa 781458  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  781457 tcagatgaacaccgcaagaagacgggaaatcaaacagtgccgcacatgacgacgaacaacaaaccaccatacttagatgatgaaatcacaaagaaaaacc 781358  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccaccc 305  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  781357 ctagatctatctgaaaatcacttatttagattgaaatatagagaaaaagatgaagatgggtgatttcaggtcaagaattgaaccaaaaccaccc 781264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 19280856 - 19281155
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19280856 aatatatgataatattaaagtcaccggaatatccatagcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaa 19280955  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    | | |||||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19280956 taaaatgaacactgcaagaagatggaaaagcaaacaacgctgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 19281055  T
Q  213 ctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19281056 ctagatatgtgtgaaagtcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagatgggtgatttccggtcaaaaatttacccaaaaccaccccccaat 19281155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7247127 - 7246827
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  7247127 aatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgttcaaatctttgattgtataatcgatctatcaataggaa 7247028  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaa 211  Q
    | | |||||||||| ||||| || | |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7247027 taaaatgaacaccgcaagaagacaggaaaaaaaataacgccgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 7246928  T
Q  212 cctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  7246927 cctagatctatgtgaaagtcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagaggggtggtttcaggttaagaattgacccaaaaccaccccccaa 7246828  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  7246827 t 7246827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 304
Target Start/End: Original strand, 21060194 - 21060485
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21060194 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctt-caaaatgaa 21060292  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    | |||||||||| | ||||| |||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21060293 ttagatgaacactgcaagaagacgggaaatcaaaaagtgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgacatcacgaagaaaaaac 21060392  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacc 304  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  21060393 ctacatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatatagagaaaaagatgaagagtggtgatttcagatcaagaattgacccaaaaccacc 21060485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34881885 - 34881579
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34881885 aatatatgatataattaaagtgac-ggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataattgatctttcaatatgaa 34881787  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa----- 207  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  34881786 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 34881687  T
Q  208 ----aaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaacca 302  Q
        |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  34881686 agaaaaaaactagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaa-agatgaagagaggtgatttcaggtcaagaattgacccagaacca 34881588  T
Q  303 cccctcaat 311  Q
    |||||||||    
T  34881587 cccctcaat 34881579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 7886852 - 7887145
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatca 115  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7886852 atatgataaaactatagtgaccggaatatccatgacctccggatctgcaacgttaatgccaaaatctttgattgaataatcgatcttttaatatgaatca 7886951  T
Q  116 gatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaccta 215  Q
    ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  7886952 gacaaacaccgcaagaagacggaaaatcaaacaatgttgtacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcaaaaagaaaaaacata 7887051  T
Q  216 gatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7887052 gatttatgtgaaaatcacttatttagattaaaatagagaggaaaagacgaagagggatgatttcaggtcaagaatggacccaaaaccacccctc 7887145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 302
Target Start/End: Original strand, 7150246 - 7150537
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  7150246 aatatatgataaaattaaagtcaccgaaatatccatggtctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataattgatctttcaatgggaa 7150345  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    | | |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7150346 taaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaagcacaaagaaaaaaa 7150445  T
Q  212 cctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaacca 302  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||    
T  7150446 cttagatctatgtgaaagtcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaaaaattaatccaaaacca 7150537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 35475249 - 35475547
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35475249 aatatatgataaaattaaagtgactggaatatccatggcttctgaatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatcttt-aatatgaa 35475347  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||  |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  35475348 tcaaatgaacaccgcaagaagacgagaaatcaaacagcgccgcataaaacgacgaacaacaaaccaccacacgtaaatgatgaaatcacaaagaaaaaat 35475447  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  35475448 ctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatatagataacaagatgaagagaggtgatttcagatcaagaattaacccaaaatcacccctcaat 35475547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7241952 - 7241651
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtga-ccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatga 111  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  7241952 aatatatgataaaattaaagtcaaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgttcaaatctttgattgtataatcgatctatcaatagga 7241853  T
Q  112 atcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaa 210  Q
    || | |||||||||| ||||| || | |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  7241852 ataaaatgaacaccgcaagaagacaggaaagaaaataacgccgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacaattagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 7241753  T
Q  211 acctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  7241752 acctagatctatgtgaaagtcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagaggggtggtttcaggttaagaattgacccaaaaccacccccca 7241653  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  7241652 at 7241651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 310
Target Start/End: Original strand, 19259723 - 19260020
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19259723 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctttggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 19259822  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag--aaaaa 210  Q
    ||| || ||||||| | ||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  19259823 tcaaataaacaccgcacgaagacgg-gaatcaaacaacaccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacagagaaaaaaa 19259921  T
Q  211 acctagatctatgtg--aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19259922 acttagatctatgtgaaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaa---aagaattggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctc 19260018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 43261730 - 43262028
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43261730 aatatatgataacattaaagtgaccggaatatccatgaccttcggatctgcaactttgactcccaaatctttgattgaataatcgatttttcaatatgaa 43261829  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  43261830 tcaaataaacaccgcaagaagacggaaaatcaaacaacaccgcataagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgataaaatcacaaag-gaaaac 43261928  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  43261929 ctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagataaaaagatgaagatgggtgatttcaggttaagaattgactcaaaatcacctctcaat 43262028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 30298375 - 30298131
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30298375 aatatatgataaaattaaagtggccggaatatccatggcctccagatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcaatctt-caatatgaa 30298277  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30298276 tcaaataaacaccgcaagaagacggaaaatcaaacagcgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcataaagaaaaaac 30298177  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaa 257  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30298176 ctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatatagagaaa 30298131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28235753 - 28235454
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||| || | || ||||   |||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  28235753 aatatatgataaaattaaagtgatcgaaatatccatggcctccagatctacatctttgacgcctgaatctttgattgaatacttgatctttcaataagaa 28235654  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    | | |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28235653 taaaatgaacaccgcaagaagatggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacagacaacaaaccatcacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaat 28235554  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  28235553 ctagatctatgtgaaaatcacttatttagatcgaaatagaaagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaatgattgacccaaaaccacccctcaat 28235454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 41184351 - 41184655
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41184351 aatatatgataaaattaaagtgactggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 41184450  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag------- 205  Q
    ||| | |||||||  | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  41184451 tcaaacgaacaccacacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 41184550  T
Q  206 ---aaaaaacctagatctatgtgaaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaacca 302  Q
       ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| | ||||| |||| |||||||| ||    
T  41184551 aaaaaaaaacctagatctatgtgaa---aattatttagattgaaatagagagaaa-agatgaagaatggtgatttcatgtcaaaaattgacccaaaatca 41184646  T
Q  303 cccctcaat 311  Q
     ||||||||    
T  41184647 tccctcaat 41184655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 47 - 311
Target Start/End: Original strand, 36344436 - 36344700
Alignment:
Q  47 atggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaa 146  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||  || |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  36344436 atggcctccggatctgcaatgttcacgcccaactctttgattgaaaaattaatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaaaaaaacggaaaatcaaa 36344535  T
Q  147 caacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattga 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  36344536 caacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgat-aaatcacaaagaaaaaacttagatccatgtgaaaataacttatttagattga 36344634  T
Q  246 aatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  36344635 aatatagagaaaaagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatcgactcaaaaccacccctcaat 36344700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26578420 - 26578118
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26578420 aatatatgatgaaattaaagtgaccgaaatattcattgcttccggatctgcaacattgacgcccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaa 26578321  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa---aa 209  Q
    ||| |||||||| | | ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||   ||    
T  26578320 tcaaatgaacactgcacgaagacgggaaatcaaacaacgtcgcacaagacgacgaacaacaaatcactacatttagatgatgaaattacaaagaaaaaaa 26578221  T
Q  210 aacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| || ||    
T  26578220 aacctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagatgagtgatttcaggtcaagaattgaccaaaaaccatccatc 26578121  T
Q  309 aat 311  Q
    |||    
T  26578120 aat 26578118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42580056 - 42579746
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42580056 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttaaatatgaa 42579957  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaa---- 208  Q
    | | |||||||| | | ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  42579956 taaaatgaacactgcacgaagacagaaaatcaaacaacgtcgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 42579857  T
Q  209 ----aaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagag---aaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaac 300  Q
        ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   ||| | ||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||    
T  42579856 aaaaaaacctaaatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagaaagaaaaaaaaaatgaaaaggggtgatttcatgtcaataattgacccaaaac 42579757  T
Q  301 cacccctcaat 311  Q
    |||||||||||    
T  42579756 cacccctcaat 42579746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
Target Start/End: Original strand, 3271313 - 3271612
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||   |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3271313 aatatatgataaaattaaagtgatcggaatatccatggtctcctgatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattaaataatggatctttcaatatgaa 3271412  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3271413 tcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgctgcacaagacgacgaataacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 3271512  T
Q  213 -------ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacc 304  Q
            |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||| ||||    
T  3271513 aaaaaaattagacctatgtgaaaatcacttatttagattgaaacagagagaaa-agatgaagaggagtgatttcatgtcaagaattgacctaaaatcacc 3271611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 77 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30371830 - 30371593
Alignment:
Q  77 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaac 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  30371830 aaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaattaaatgaacaccgcacgaagatgggaaatcaaacaacgccgcacaagatgacgaacaacaaat 30371731  T
Q  177 caccacacttagatgatgaaatcacaaagaa--aaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtg 273  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30371730 caccacacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaaacctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagaggggtg 30371631  T
Q  274 attttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    |||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  30371630 atttcaggtcaaatattgacccaaaaccacccctcaat 30371593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27752093 - 27751783
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |  | ||||||||| |||||||| || || |||||||||    
T  27752093 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatctatggcctccagatctgcaacgttgacacccatatctttgatcgaataatcaatatt-caatatgaa 27751995  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||| |||||||| | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27751994 tcaaatgaacaccgcaagaagacgggaaatcaaatagcgccccaaaaggcgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 27751895  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagag-----------agaaatagatgaagagg-ggtgattttaggtcaagaatttacccaaaa 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||           | ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27751894 ctagatctatgtgaaaatcacttatttatattgaaatatagaaagaaagaaaaaaaaaagatgaagaggaggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaa 27751795  T
Q  300 ccacccctcaat 311  Q
    ||||||||||||    
T  27751794 ccacccctcaat 27751783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 43148895 - 43148607
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |   ||||||||||    |||||||||||||||||| |||    
T  43148895 aatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccagatctgcaacgttgaggtccaaatctttga----ataatcgatctttcaataggaa 43148800  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaa 211  Q
    | | ||||||| || ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43148799 taaaatgaacaacgcaagaagacgggaaagcaaacaacaccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 43148700  T
Q  212 cctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccac 303  Q
     ||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | |  | |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  43148699 tctaaatatatgtgaaagtcacttatttagatcgaaatagagagaaaaggatgaaaatgaataattttaagtcaagaattgacccaaaaccac 43148607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 42886646 - 42886392
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttc--cggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatg 110  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42886646 aatatattataaaattaaattgaccggaata-ccatgccgtcttcggatctgcaacgttgacg-tcaaatctttgattgaataatcgatcttttaatatg 42886549  T
Q  111 aatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaa 210  Q
    ||||| |||||||| | || ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  42886548 aatcaaatgaacactgcaacaaggcgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaccaccacactcagatgatgaaatcacgaag-aaaa 42886450  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaaga 267  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  42886449 acctaaatctatgtgaaaagcacttattttgattgaaatagagagaaaaggatgaaga 42886392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 308
Target Start/End: Original strand, 20257607 - 20257902
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20257607 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccacgt-ttccggatctacaacgttgacgcgcaaatctttgattgaataatcgatacttcaatatgaa 20257705  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    ||| |||||||||| || || |||||||||| || || | |||||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||   |||| |  ||| ||||||    
T  20257706 tcaaatgaacaccgcaacaagacggaaaatc-aataatgtcgcacaagacgacgaacaacacgctgccacactcagatggcaaaataatgaagaaaaaaa 20257804  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| || |||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||    
T  20257805 cctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagaagtagatggatgatttcaggtcaaaaattgaccaaaaactacccctc 20257902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10649809 - 10649619
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatca 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||  || ||||  || ||||||    
T  10649809 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatatttgattgaataataaatttttctgtaagaatca 10649710  T
Q  116 gatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaa 209  Q
     |||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649709 aatgaacaccgcacgaagacggtaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaa---ccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaa 10649619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15571075 - 15570812
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || |||||| |||||||||||||   || | |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15571075 aatatatgataaaattaaagtgactggaatacacatgact-ccggatgtgcaacgttaacgtccaattatttgattgaataatagatctt-caatatgaa 15570978  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||  || |||| || || ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  15570977 tcaaatgaacaccacaacaatatgggaa-tcaaacaacaccgcataagacgacgaacaacacaccaccacactcgggtgacgaaatcacaaagaaaaaac 15570879  T
Q  213 ctagatctatgtg--aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattt 277  Q
    ||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15570878 ctacatctatgtgaaaaatcaaatatttagattgaattatagagaaaaagatgaagagggatgattt 15570812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 77 - 267
Target Start/End: Original strand, 27576325 - 27576516
Alignment:
Q  77 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaac 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| || || |||| ||||||||||||| ||||||||  || |||||||| ||    
T  27576325 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatataaaataaatgaacaccgcaacaagacgggaaatcaaacaacgtcgcacaagtagaagaacaacatac 27576424  T
Q  177 caccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtgaa-atcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaaga 267  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  27576425 caccacactcatatgacgaaatcacaaagaaaaaatctagatctatgtgaatatcacttatttacattgaaatagagagaaaaggatgaaga 27576516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4954160 - 4954005
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4954160 aatatatgataaaattaaagtcaccggaatattcatggcctccgaatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaa 4954061  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaa 168  Q
    | | |||||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4954060 taaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagaaaacaacgccgcacaagacgacgaa 4954005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 257
Target Start/End: Original strand, 7613042 - 7613213
Alignment:
Q  86 attgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacact 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7613042 attgaataatcgatctttcaatatgaatcaaatgaacaccgcaacaagacgagaaatcaaacaacattgcacaagacgacgaacaacacaccaccacact 7613141  T
Q  186 tagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaa 257  Q
     ||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  7613142 cagatgacaaaatcatgaag-aaaaacctagatctatatgaaaaacacttatttagattgaaacagagagaaa 7613213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 206 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10649428 - 10649322
Alignment:
Q  206 aaaaaacctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  10649428 aaaaaacctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaatcacc 10649329  T
Q  305 cctcaat 311  Q
    |||||||    
T  10649328 cctcaat 10649322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 131 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11767859 - 11767683
Alignment:
Q  131 aatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacc-tagatctatgtgaaa- 228  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||| | || ||||| ||||||     
T  11767859 aatacggaaaatcaaacaacttcgtacaagacgacgaacaacacaccaccacactcagatggcgacatcacgaagaaaaaaacatatatctacgtgaaaa 11767760  T
Q  229 -tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacc 304  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  11767759 atcacttatttagattgaaatatagagaaaaagatgaagacagatgattttaggtcaaaaattgacctaaaaccacc 11767683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 42433058 - 42432802
Alignment:
Q  21 ataaaattaaag-tgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatg 119  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |   ||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||    
T  42433058 ataaaattaaagatgaccgaaatattcatggcttc-ggatctgcaacgttgacgttcggatcattgattgaataattgatctt-caataagaatcaaatg 42432961  T
Q  120 aacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatc 219  Q
    || || | || || |||||| ||||||||||| || ||| | |  ||||||| | | |||| |||| |||  | |||||||||||||||||||||| |||    
T  42432960 aatacaggaacaagacggaatatcaaacaacgacgtacagg-caccgaacaatacatcaccgcactcagacaaagaaatcacaaagaaaaaacctaaatc 42432862  T
Q  220 tatgtgaaat-cacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgatttt 278  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||    
T  42432861 tatatgaaattcacttttttagattgaaatagagagaaaaatataaagagaggtgatttt 42432802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 194 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6445923 - 6445805
Alignment:
Q  194 gaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaattta 292  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | |||||||||||  |||||||| ||||||||||| || || |||| |    
T  6445923 gaaatcacgaagaaaaaacctagatctatgtaaaaatcacttatttaaattaagatagagagaaaacgatgaagatgggtgattttaagttaaaaattga 6445824  T
Q  293 cccaaaaccacccctcaat 311  Q
    | |||||||||||||||||    
T  6445823 ctcaaaaccacccctcaat 6445805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14211242 - 14211076
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtgaaa-tcacttatt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    | |||| ||| || |||||||| ||  |||||| | ||| ||||||||| |||||||||    
T  14211242 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaatgtcgcactaagacgacgaaatcacgaaataaaaactt-gatgtatgtgaaaatcacttatt 14211144  T
Q  238 tagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccaccc 305  Q
    |||||||||| | || |||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||    
T  14211143 tagattgaaagaaagggaaaaagatgcagaggggtgattctaggtcaaaaattgacctaaaatcaccc 14211076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 277
Target Start/End: Original strand, 42432019 - 42432254
Alignment:
Q  38 ggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacgg 137  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | ||| |||||| ||||||  |||||| | || |||||| ||||||||   || || | ||    
T  42432019 ggaatattcatggct-ccggatctgcaacgttgacgtttagatcattgattaaataattaatcttt-agtaggaatcaaatgaacacatgaacaagatgg 42432116  T
Q  138 aaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtgaaatcacttatt 237  Q
    || ||||||||||| || ||||| |  ||||||| | | |||| |||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  42432117 aatatcaaacaacgacgtacaag-caccgaacaatacagcaccgcactcaaacgatgaaattacaaagaaaaaacctagatctatat-aaatcacttttt 42432214  T
Q  238 tagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattt 277  Q
    |  ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  42432215 ttaattgaaaaagagagaaaaatatgaagagaggtgattt 42432254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 11768167 - 11768070
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||| || || ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11768167 aatatatgataaaattaaagtgaccataata--catgcct-ccagatttgcaacattgacgctcaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 11768071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 257
Target Start/End: Original strand, 19983336 - 19983514
Alignment:
Q  83 ttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccac 182  Q
    |||||||||||| | ||||  ||| ||||| || |||||||||  || || ||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||    
T  19983336 ttgattgaataaccaatctcccaacatgaagcaaatgaacaccacaacaagacgaaaaaactaacaacgccgcacaaggcgacgaacaacacagcgccac 19983435  T
Q  183 acttagatgatgaaatcacaaagaaa--aaacctagatctatgt-gaaatcacttatttaga-ttgaaatagagagaaa 257  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||  || |||| ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  19983436 actcatatgacgaaatcacaaagaaaataaccctaaatctatgtcaaaatcacgtatttagatttgaaatagaaagaaa 19983514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 6446036 - 6445951
Alignment:
Q  17 tatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatcttt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  6446036 tatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgtctt-cgaaactgcaacgttgacgtctaaacctttgattgaataatcgatcttt 6445951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28097278 - 28097027
Alignment:
Q  53 tccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgc 152  Q
    ||||||||||| | ||| ||| | ||||| |||||||||    |||||||||||  |||| || ||||||||| || ||| |||  |||||||||||| |    
T  28097278 tccggatctgctatgttgacgttcaaatcattgattgaac---cgatctttcaacgtgaaccaaatgaacaccataggaagacgagaaatcaaacaacac 28097182  T
Q  153 cgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaa-aacctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatag 250  Q
    ||||||| ||||| | ||||| | ||  | ||| | |  | |||||||  ||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  28097181 cgcacaaaacgacaaccaacacaacattatactcatacaacgaaatcatgaagaaaataacctaaatttatgtgaaaatcacttatttatattgaaattg 28097082  T
Q  251 agagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    || |||| ||||||||| |||||| || ||||||| |||| || ||||||||||||    
T  28097081 agcgaaa-agatgaagatgggtgaattcaggtcaaaaattgacacaaaaccacccc 28097027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 267
Target Start/End: Original strand, 1582159 - 1582288
Alignment:
Q  138 aaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |  | |||| | | |||||||||||  || ||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  1582159 aaaatcaaacaacgccgcacaagacgacaaacgacacaacgtcgcactcatacgatgaaatcacgtag-aaaaagctagatctacgtgaaaatcacttat 1582257  T
Q  237 ttagattgaaatagagagaaatagatgaaga 267  Q
    ||||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  1582258 ttagattaaaatggagagaaaaatatgaaga 1582288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1602656 - 1602527
Alignment:
Q  138 aaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |  | |||| | | |||||||||||  || ||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  1602656 aaaatcaaacaacgccgcacaagacgacaaacgacacaacgtcgcactcatacgatgaaatcacgtag-aaaaagctagatctacgtgaaaatcacttat 1602558  T
Q  237 ttagattgaaatagagagaaatagatgaaga 267  Q
    ||||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  1602557 ttagattaaaatggagagaaaaatatgaaga 1602527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 143
Target Start/End: Original strand, 22978843 - 22978964
Alignment:
Q  21 ataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatga 120  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||| || | | |||||||| ||| ||||  |||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  22978843 ataaaatgaaagtgaccgaaatacccatgcct-cagaatctgcaatgttgacgcccaaatctttgatttaataatttttctttcaatatgaatcaaatga 22978941  T
Q  121 acaccgtaagaatacggaaaatc 143  Q
    |||||| || || ||||||||||    
T  22978942 acaccgcaacaaaacggaaaatc 22978964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11192392 - 11192240
Alignment:
Q  156 acaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaacctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagaga 253  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||| | | || ||| |||| ||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  11192392 acaagacgacaaacaacacaacaccacactcaaacgacgaactcacgaaggaaaaaacttagatctgcgtgaaaatcacttatttag-ttgatatagaga 11192294  T
Q  254 gaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccct 307  Q
     ||| |||| || |  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11192293 caaaaagattaatataggtgatttcaggtcaaaaattgacccaaaaccacccct 11192240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 30299012 - 30298951
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgc 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||    
T  30299012 aatatatgataaaattaaagtgaccagaatatccatggcatccagatctgcaatgttgacgc 30298951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 6012213 - 6012269
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6012213 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacaccgcacttagacgatgaaatcacaaa 6012269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 255
Target Start/End: Original strand, 1696923 - 1697021
Alignment:
Q  159 agacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaacctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagaga 255  Q
    |||| ||||||||||   || |||||||||| || || ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1696923 agacaacgaacaacatgacatcacacttagacgaagagatcacaaagaataaaatatagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagtgaga 1697021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 2979476 - 2979560
Alignment:
Q  226 aaatcacttatttagattgaaatagagag--aaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||  ||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||| ||||||||    
T  2979476 aaatcacttatttagattgaaagaaagaggaaaaaagatgcagaggggtgattataggtcaaaaattgacctaaaatcacccctc 2979560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 249
Target Start/End: Original strand, 14082448 - 14082556
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa------aaaacctagatctatgtgaaa-tcacttatttag 240  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||| ||      |||| || ||| |||||||||  |||||||||||    
T  14082448 aacgccgtacaagacgacgaacaacacaacgccacacttagacgatgaaatcacaaaaaatataagaaaaacttgatatatgtgaaagccacttatttag 14082547  T
Q  241 attgaaata 249  Q
    |||||||||    
T  14082548 attgaaata 14082556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 173
Target Start/End: Original strand, 19100552 - 19100708
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatca 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||  | ||||| |||||| | | | ||||| |||||||||||| |  |||||||||| ||||||    
T  19100552 atatgataaaattaaagtgactggaatactcatgtcttaag-atctggaacgttgatgttcaaatcattgattgaataaccactctttcaataggaatca 19100650  T
Q  116 gatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
     ||||||||||||  || ||   ||| | ||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  19100651 aatgaacaccgtaccaagacaagaaaccgaacaacgtcgcacaagacaacgaataaca 19100708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Original strand, 28540979 - 28541013
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28540979 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 28541013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 204
Target Start/End: Original strand, 24229866 - 24229915
Alignment:
Q  155 cacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||    
T  24229866 cacaagacgacgaacaacaaaacgccgcacttagatgacgaaatcacaaa 24229915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 9113800 - 9113856
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  9113800 aacgccgcacaagacgacgaacaacagaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 9113856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13007242 - 13007186
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  13007242 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 13007186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 38597810 - 38597754
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  38597810 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 38597754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 49
Target Start/End: Original strand, 41418633 - 41418669
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatg 49  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41418633 aatatatgataaaattaaagtgagcggaatatccatg 41418669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 173
Target Start/End: Original strand, 10332576 - 10332651
Alignment:
Q  98 atctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| | || || |||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10332576 atctttcaatatgaatcaaacaaacactgcaacaagacgcgaaatcaaacaatgccgcacaagacgacaaacaaca 10332651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 204
Target Start/End: Original strand, 14726541 - 14726592
Alignment:
Q  153 cgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| || |||||||||||    
T  14726541 cgcacaagacgacgaacaacacaacaccgcacttagacgacgaaatcacaaa 14726592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Original strand, 19103540 - 19103574
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19103540 aaatcaaacaacgccgcacaagacgactaacaaca 19103574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19349716 - 19349682
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19349716 aaatcaaataacgccgcacaagacgacgaacaaca 19349682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 39567317 - 39567283
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39567317 aaatcaaacaacgccgcacaagacaacgaacaaca 39567283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 173
Target Start/End: Original strand, 2979384 - 2979413
Alignment:
Q  144 aaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2979384 aaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 2979413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10148766 - 10148701
Alignment:
Q  213 ctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattt 277  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |  ||||| | |||||||||| ||||||    
T  10148766 ctagatctatgtgaaaatcacttatttagattaaaatgggaagaaaaatatgaagagggttgattt 10148701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 39567220 - 39567136
Alignment:
Q  226 aaatcacttatttagattgaa--atagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||  | || | |||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||| ||||||||    
T  39567220 aaatcacttatttagattgaaagaaagggggaaaaagatgcagaggcgtgattctaggtcaaaaattgacctaaaatcacccctc 39567136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 6217053 - 6216978
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaat 92  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||    
T  6217053 atatgataaaatttaagtcaccgaaatacacatg-cttccgaatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaat 6216978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13421942 - 13421890
Alignment:
Q  152 ccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||  ||||||||||    
T  13421942 ccgcacaagacgacgaacaacacaacatcacacttagacgaaaaaatcacaaa 13421890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25980171 - 25980115
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| || |||| ||||||    
T  25980171 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaataccgcacttagacgacgaaaccacaaa 25980115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26825443 - 26825387
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  26825443 aacgccgcacaagaagacgaacaacacaacgccgcacttagaagacgaaatcacaaa 26825387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 252 - 308
Target Start/End: Original strand, 31391949 - 31392005
Alignment:
Q  252 gagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  31391949 gagaaaaagatgtagaggggtgattctaggtcaaaaaatgacctaaaaccacccctc 31392005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 277
Target Start/End: Original strand, 35631792 - 35631868
Alignment:
Q  203 aagaaaaaacctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaataga-gagaaatagatgaagaggggtgattt 277  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | || ||| || |||||| |||||||||    
T  35631792 aagaaaaaacttagatatatgtaaaaatcacttatttagattgaaatataggaaaaagagttgaagatgggtgattt 35631868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 92
Target Start/End: Original strand, 35920929 - 35921004
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaat 92  Q
    |||||||||||| ||| | ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||    
T  35920929 atatgataaaatcaaaatcactagaatatcgatg-cttccggatctgcaacgttgacgttcaaatcattgattgaat 35921004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 17237197 - 17237495
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17237197 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacacccaaatctttgattgaataatcgatctt-caaaatgaa 17237295  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17237296 tcagatgaacaccgcaagaagacgggaaatccaacagcgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgctgaaatcacaaagaaaaaac 17237395  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17237396 ctagatctatgtgaaaataacttatttagattgaaatatagagaaaaagatgaagaggggtgatttcatgtcaagaattgacccaaaaccacccctcaat 17237495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 33740489 - 33740789
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33740489 aatatatgataaaattaaagtgaccgaaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgctcaaatcttcgattgaataatcgatctttcaatataaa 33740588  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    ||| |||||||||| | ||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33740589 tcaaatgaacaccgcacgaggacggtaaatgaaacaacgccgcacaaaacgacgaacaacaaaccgccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 33740688  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  33740689 cctaaatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagaggggtgattttaggtcaagaattgaccaaaaaccacccctcaa 33740788  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  33740789 t 33740789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12653110 - 12652806
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12653110 aatatatgataaaattaaagcgaccggaatatccatgacctccagatctgcaacgttgacggccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 12653011  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-----aa 207  Q
    ||| |||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||    
T  12653010 tcaaatgaacaccgcacgaagatggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgatgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaaggaaaaaa 12652911  T
Q  208 aaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12652910 aaaatctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccc 12652811  T
Q  307 tcaat 311  Q
    |||||    
T  12652810 tcaat 12652806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 23947228 - 23947528
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaatt-aaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatga 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23947228 aatatatgataaaatttaaagtgaccagaatatccatggcctccggatctgcaacattgacgcccaaatcgttgattggattatcgatctttcaatatga 23947327  T
Q  112 atcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 211  Q
    |||| |||||||||| || || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23947328 atcaaatgaacaccgcaaaaagatgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcaaaaagaaaaaa 23947427  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23947428 cctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaacgatgaagatgggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctcaa 23947527  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  23947528 t 23947528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25064402 - 25064101
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||| | || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25064402 aatatatgatgaaattaaagtgccgggcatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaa 25064303  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa--aaa 210  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  25064302 tcaaatgaacaccgcacgaaaacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaa 25064203  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25064202 acctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagagaggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctca 25064103  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  25064102 at 25064101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16419324 - 16419029
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16419324 aatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatttttcaatatgaa 16419225  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaa 211  Q
    | | |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16419224 taaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 16419125  T
Q  212 cctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  16419124 caaagatctatgtgaaagtcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagatgggtgattttaggttaagaattgactcaaaaccacccc 16419029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4088626 - 4088325
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||  || |||    
T  4088626 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatcgatctttctgtaagaa 4088527  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    ||| ||||||| || | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4088526 tcaaatgaacatcgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgatgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcaaaaagaaaaaaa 4088427  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagaga-gaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4088426 actagatctatgtgaaaatcacttatttagattgtaatagagataaaaaaaatgaagatgggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctca 4088327  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  4088326 at 4088325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 8028029 - 8028329
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8028029 aatatatgataaaattaaagtgactggaatatccatgaccttcggatctgcaatgttaacgcccaaatctttgattgaataaccgatcttttaatatgaa 8028128  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    ||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8028129 tcaaatgaacaccgtacgatgacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcataaagaaaaaaa 8028228  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||  || |||| |||| |||||||| |||| |||||    
T  8028229 cttagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaacagagagaaaaagatgaagtggggtgattccagatcaataattgacccaaaatcacctctcaa 8028328  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  8028329 t 8028329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4468724 - 4468437
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  4468724 aatatatgataaaattaaagtggccggaatatccatgacctctggatctgcaacgttgacggccaaatctttgattgaataatcgatccttcaatataaa 4468625  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4468624 tcaaatgaacactgcatgaagacggaaaatcaaacaacgctgcacaagacgacgaataacaaaccaccacacttatatgatgaaatcacaaagaaaaaac 4468525  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaa 299  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||    
T  4468524 ctagatctatatgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaacaagatgaagaggggtgacttcatgtcaagaattgacccaaaa 4468437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 305
Target Start/End: Original strand, 8196325 - 8196612
Alignment:
Q  20 gataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatg 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||| |||    
T  8196325 gataaaattaaagtgaccggaatatacatggcctccggatctacaacgttgacgcccaaatcgttgattgaataatcgatctttctgtaagaatcaaatg 8196424  T
Q  120 aacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaacctagat 218  Q
    ||||||| |  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8196425 aacaccgcacaaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttatatgatgaaatcacaaagaaaaaaacctagat 8196524  T
Q  219 ctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccaccc 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  8196525 ctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaatacgggtgattttaggtcaagaactgatccaaaaccaccc 8196612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 7875955 - 7876256
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7875955 aatatatgatgaaattaaagtgatcggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatcgatcttttaatatgaa 7876054  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag--aaaaa 210  Q
    |||  ||||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||  |||||    
T  7876055 tcaattgaacaccgcacgaagatggaaaatcaaacaacgtcgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattgcaaagaaaaaaa 7876154  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  7876155 atctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagatgggtgattttaggtcaataattgatccaaaaccacccctca 7876254  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  7876255 at 7876256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 7881013 - 7881314
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7881013 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaa 7881112  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag--aaaaa 210  Q
    |||  ||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||  |||||    
T  7881113 tcaattgaacaccgcatgaagatggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattgcaaagaaaaaaa 7881212  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||| | ||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  7881213 atctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagaaaggtgatttcaagtcaataattgatccaaaaccacccctca 7881312  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  7881313 at 7881314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8497133 - 8496831
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8497133 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcatcaggatctgcaacgttgccgcccaaatctttgattgaagaatcgatctttcaatatgaa 8497034  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa---aa 209  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||  ||||||||   ||    
T  8497033 tcaaatgaacaccgcacgaagacgagaaatcaaacaacgccgcacaagatgacgaacaacaaatcaccgcacttaaatgatgaaactacaaagaaaaaaa 8496934  T
Q  210 aacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8496933 aacctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgactcaaaaccacccctc 8496834  T
Q  309 aat 311  Q
    |||    
T  8496833 aat 8496831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10228845 - 10228550
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  10228845 aatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcaatctttcaatagaaa 10228746  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaa 211  Q
    | | |||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  10228745 taaaatgaacaccacaagaagacgggaaagcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccatcacacttaaatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 10228646  T
Q  212 cctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    | ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10228645 catagatatatgtaaaagtcacttatttagattgaagtagagagagaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccc 10228550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12166005 - 12165719
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12166005 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatagcatccggatctgcaacgttgacgcccaaatcttcgattgaataatcaatctttcaatatgaa 12165906  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    | | |||||||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12165905 ttaaatgaacaccgcaagaa-acgtgaaatcgaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgataaaaccacaaagaaaaaac 12165807  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaa 299  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  12165806 ctaaatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataggcataaaaagatgaagaggagtgatttcaggtcaataattgacccaaaa 12165719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 4984478 - 4984788
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4984478 aatatatgataaaattaaagtgatcggaatatccatgacctccgaatctgcaacgttgatgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 4984577  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag------- 205  Q
    ||| |||||||||  | ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  4984578 tcaaatgaacacctcacgaagacgggaaatcaaacaacaccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaaggaaaaac 4984677  T
Q  206 -aaaaaacctagatc----tatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaa 299  Q
     ||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  4984678 aaaaaaacctagatctatatatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaa-agatgaagatgagtgatttcaggtcaagaattgacccaaaa 4984776  T
Q  300 ccacccctcaat 311  Q
    ||||||||||||    
T  4984777 ccacccctcaat 4984788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 35001756 - 35001510
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  35001756 aatatatgataaaattaaagtcaccggaatattcatgaccttcggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataattgatctttcaataggaa 35001657  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaa 211  Q
    | | |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35001656 taaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 35001557  T
Q  212 cctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaa 257  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35001556 catagatctatgtaaaagtcacttatttagattaaaatagagagaaa 35001510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
Target Start/End: Original strand, 28635024 - 28635327
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttcc--------ggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttc 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||        ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  28635024 aatacatgataaaattaaagtgaccggagtatccatgtcttccatgcctccggatctgcaacattgacgctcaaatctttgattgaataattaatctttc 28635123  T
Q  105 aatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||  |||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||  |    
T  28635124 aatatgaatcaaatgaacaccgcaacgatacgagaaatcaaacaacaccgtacaagacgacgaacaacaaaccgccacactcaaatgacgaaatcacgta 28635223  T
Q  205 gaaaaaacctagatctatgtga---aatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaacc 301  Q
    |||||||| ||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||| | ||||| | |||||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||||| |    
T  28635224 gaaaaaacttagatctatgtaaaagaatcacttatttaaattgaaataaaaagaaaaatatgaagagggatgatttgaggtcaaaaattgtcccaaaatc 28635323  T
Q  302 accc 305  Q
    ||||    
T  28635324 accc 28635327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33110777 - 33110608
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33110777 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgacctccggatctgcaacgttgacgccaaaatctttgattgaataatcgatcttttaatatgaa 33110678  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccac 182  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33110677 tcaaatgaacaccgcacgaagacgagaaatcaaacaacaccgcacaagacgatgaacaacaaaccaccac 33110608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 34489327 - 34489116
Alignment:
Q  102 ttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcac 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  34489327 ttcaatatgaatcaaatgaacaccacaacaatatgggaaatcaaacaacgtcgcacaagacgacgaacaacacaccaccacactcggatgatgaaatcac 34489228  T
Q  202 aaagaaaaaacctagatctatgtg--aaatcacttatt--tagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaa 297  Q
     |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| | | ||    
T  34489227 gaagaaaaaacctagatctatgtgaaaaatcacttatttatatattgaattagagagaaaaagatgaagaggggtgattttaagtcaaaaattgatcaaa 34489128  T
Q  298 aaccacccctca 309  Q
    ||||||||||||    
T  34489127 aaccacccctca 34489116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 310
Target Start/End: Original strand, 33543535 - 33543830
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| || || |  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33543535 aatatataataaaattaaa-tggtcggaatacccatg-cttccggatctgcaacattgacacccaaatttttgattgaatagtcgatctttcaatatgaa 33543632  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    | |  ||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||| |||||||| ||| ||||||    
T  33543633 taa--tgaacaccgcaacaagacagaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaccaccataatcagatgacgaaatcacgaag-aaaaac 33543729  T
Q  213 ctagatctatgtg--aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatg-aagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
     || |||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| | ||||||| ||||||| || | || |||||||||||||||    
T  33543730 ttaaatctatgtgaaaaattacttatttagattgaaatatagagaaaaagatgaaagatgagtgatttcaggtcaaaaactgactcaaaaccacccctca 33543829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 109 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 17334848 - 17334647
Alignment:
Q  109 tgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa- 207  Q
    ||||||| |||| || || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  17334848 tgaatcaaatgatcatcgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgtacaacaaatcaccacacttagattatgaaattacaaagaaa 17334749  T
Q  208 ---aaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccac 303  Q
       ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||| || ||||||||  | ||||||||||    
T  17334748 aaaaaaacttagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaacagaaaaagatgaagattggtgatttcagatcaagaatcgatccaaaaccac 17334649  T
Q  304 cc 305  Q
    ||    
T  17334648 cc 17334647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25337731 - 25337499
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||| || | |||| |||||| || | ||| |||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  25337731 aatatatgataaaattaaggtgactggaataccaatgcct-ctggatttgcaaccttgatgctcaaatctttca----ataatcgatctttcaatatgaa 25337637  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    ||| |||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||||    
T  25337636 tcaaatgaacaccgcaacaagacgaaaaatcaaacaacaccgcgcaagacgacgaacaacacaccaccacactcggatgacgaaatcacgaagaaaaaaa 25337537  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaat 248  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25337536 cctagatttatgtgaaaatcatttatttagattgaaat 25337499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 33109826 - 33109700
Alignment:
Q  186 tagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtca 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||    
T  33109826 tagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagatggacgattttaggtca 33109727  T
Q  285 agaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||    
T  33109726 aaaattgacccaaaaccacccgtcaat 33109700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 282
Target Start/End: Original strand, 4351971 - 4352183
Alignment:
Q  77 aaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaac 176  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |  |  |||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||| |     
T  4351971 aaatctttgattaaataatcgatctttcaatatgaattaaatgaataccgcaccatgacgggaaatcaaataacgccacataagacgacgaacaacacat 4352070  T
Q  177 caccacacttagatgatgaaatcacaaag-----aaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaataga-gagaaatagatgaagagg 269  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| |||     |||||| ||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| | ||||||| |    
T  4352071 caccacactcggatgacgaaatcacgaagaagacaaaaaaactaaatctatatgaaaatcacttatttggattgaaattgactagaaaaatatgaagatg 4352170  T
Q  270 ggtgattttaggt 282  Q
    |||||||| ||||    
T  4352171 ggtgatttcaggt 4352183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 7027877 - 7027799
Alignment:
Q  136 ggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacct 214  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  7027877 ggaaaatcaaacaactccgtacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttaaatgatgaaatcacagggaaaaaacct 7027799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 7028029 - 7027947
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataat 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7028029 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatctatggcctccggatctacaaggttgacgctcaaatctttgattgaataat 7027947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 102
Target Start/End: Original strand, 16892727 - 16892816
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctt 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  16892727 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcctaaatctttaattgaacaattgatctt 16892816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Original strand, 1704065 - 1704277
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatca 115  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||||| | | | ||||| || |||||||||||||| |||| ||  ||| ||    
T  1704065 atatgatacaattaaagtgactggaatattcatg-catccggatctacaacgttgatgttcaaatcatttattgaataatcgatatttcgattagaacca 1704163  T
Q  116 gatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaccta 215  Q
     |||||||||| || || |||  |||| ||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||||| ||| ||  |||| || |||||||||| |     
T  1704164 aatgaacaccgcaacaagacgagaaattaaataatgttgcacaagatcacgaacaacacaacaccacactcagacgacaaaattactaagaaaaaacatg 1704263  T
Q  216 gatctatgtgaaat 229  Q
    ||||||||||||||    
T  1704264 gatctatgtgaaat 1704277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 243
Target Start/End: Original strand, 26588499 - 26588648
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaa 196  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | | || |||| | | ||||||    
T  26588499 gatctttcaatatgaaccaaacgaacaccgcaacaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacaatcaacacaactccgcactcaaacgatgaa 26588598  T
Q  197 at--cacaaagaaaaaacctagatctatgt-gaaatcacttatttagatt 243  Q
     |  |||||| |||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  26588599 ttcacacaaaaaaaaaaacttgatatatgtggaaaccacttatttagatt 26588648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17334919 - 17334846
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttga 86  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |  ||||||||||    
T  17334919 aatatatgatgaaattaaagtgactggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacacccaaatctttga 17334846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 20619633 - 20619585
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatct 61  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20619633 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggtctccggatct 20619585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 101 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22571533 - 22571461
Alignment:
Q  101 tttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    ||||||||| || || | ||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22571533 tttcaatattaaccaaacgaacaccataacaaaacgcaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 22571461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 61
Target Start/End: Original strand, 12059687 - 12059732
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatct 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12059687 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggtctccggatct 12059732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31296879 - 31296807
Alignment:
Q  101 tttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | || || | | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31296879 tttcaatatgaatcaaatgaacactgcaacaagatgcaaaatcaaacaacgccgcacaagatgatgaacaaca 31296807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 201
Target Start/End: Original strand, 31575530 - 31575638
Alignment:
Q  93 aatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatga 192  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | |||| || | ||||||    
T  31575530 aatcgatttttcaataggaatcagacgaacatcgcaacaagacgagaaatcaaacaacgtcgcacatgacgatgaacaacataacaccgcattcagatga 31575629  T
Q  193 tgaaatcac 201  Q
     ||||||||    
T  31575630 cgaaatcac 31575638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30493553 - 30493491
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcac 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||| || ||||||||    
T  30493553 aaatcaaacaacgctgcacaagacgacgaacaacacaacaccgcactcagacgaggaaatcac 30493491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8266586 - 8266545
Alignment:
Q  226 aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaaga 267  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8266586 aaatcacttatttagattgaagtagagagaaaaagatgaaga 8266545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1523425 - 1523250
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaa-----aaacctagatctatgtg-aaatcac 232  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |  | |||| ||| || |||||||| || |||     ||| || ||| |||||| |||||||    
T  1523425 aaatcaaacaatgtcgcacaagacgacgaacaacacaacgtcgcactaagacgacgaaatcacgaaaaaacaagaaaaacttgatgtatgtggaaatcac 1523326  T
Q  233 ttatttagattgaaa-tagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| | ||| ||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||| ||||||||    
T  1523325 ttatttagattgaaagaaaagagaaaaaaatgcaga-gggtgattctaggtcaaaaattgacctaaaatcacccctc 1523250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 277
Target Start/End: Original strand, 5582757 - 5582829
Alignment:
Q  206 aaaaaacctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattt 277  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||||||    
T  5582757 aaaaaacttagatctatttgaaaatcatttatttagattaaaatataaagaaaaagatgaagagtggtgattt 5582829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23128633 - 23128577
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | | || |||||||| ||||||||||||||    
T  23128633 aacgccacacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgatgaaatcacaaa 23128577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32059924 - 32059868
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||| || |||||||||||    
T  32059924 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgtcacacttagacgaagaaatcacaaa 32059868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 32327292 - 32327348
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||  |||||||||||||    
T  32327292 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagactatgaaatcacaaa 32327348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 33053243 - 33053299
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  33053243 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 33053299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13436770 - 13436707
Alignment:
Q  195 aaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaa 257  Q
    ||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13436770 aaatcacgaataaaaaatatagatttatgtgaaaatcacttatttaaattgaaatagagagaaa 13436707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14801845 - 14801810
Alignment:
Q  138 aaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14801845 aaaatcaaacagcgccgcacaagacgacgaacaaca 14801810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 30776690 - 30776655
Alignment:
Q  138 aaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30776690 aaaatcaaacaacgccgcacaagatgacgaacaaca 30776655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 8102743 - 8102709
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8102743 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaaaaaca 8102709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 546047 - 546014
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaac 172  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  546047 aaatcaaacaacgtcgcacaagacgacgaacaac 546014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28981199 - 28981126
Alignment:
Q  138 aaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 211  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | | ||  ||| ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  28981199 aaaatcaaacaacaccgcagaagacgacgaacaacacaacgccgtactcagacgataaaatcacaaaaaaaaaa 28981126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34018568 - 34018519
Alignment:
Q  155 cacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||| || |||||||||||    
T  34018568 cacaagacgacgaacaacacaacgccacacttagacgacgaaatcacaaa 34018519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 68076 - 68132
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| | ||||||||||||| || |||||||||||    
T  68076 aacgccgcacaagacggtgaataacacaacaccacacttagacgacgaaatcacaaa 68132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 606219 - 606163
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  606219 aacgccgcacaagatgacgaacaacacaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 606163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 7515277 - 7515333
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||||    
T  7515277 aacgtcgcccaagacgacgaacaacaaaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 7515333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 42447938 - 42448239
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42447938 aatatatgataaaattaaagtgtctggaatattcatggccttcggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatatttcaatatgaa 42448037  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa--aaa 210  Q
    ||| |||||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  42448038 tcaaatgaacaccgcacgaagacgaaaaatcaaacaatgccgcacaagacgacgaacaacaaacctccacacttagatgatgaaatcacaaagaaacaaa 42448137  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42448138 acctagatctatatgtaaatcacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattaacccaaaaccacccctca 42448237  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  42448238 at 42448239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 44099847 - 44100143
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44099847 aatatatgataaaattaaagtg--cggaatattcatggcctccggatctgcaacgttcacgcccaactctttgattgaataattgatctttcaatatgaa 44099944  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44099945 tcaaatgaacaccgcaaaaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgat-aaatcacaaagaaaaaac 44100043  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44100044 ttagatctatgtgaaaataacttatttagattgaaatatagagaaaaagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatcgacccaaaaccacccctcaat 44100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11725853 - 11725555
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11725853 aatatatgataaaactaaagtgaccggagtatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttaattgaataatcgatctt-caatatgaa 11725755  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11725754 tcagatgaacaccgcaagaaaatgggaaatcaaacaatgtcgcacaagacgatgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcaaaaagaaaaaac 11725655  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11725654 ctagatctatgtgaaaaacacttatttagattgaaataaagagaaaaagacgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctcaat 11725555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4809137 - 4808837
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4809137 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatccttgattgaacaatcgatctttcaatatgaa 4809038  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaa 211  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4809037 tcaaatgaacaccgcacgaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaa 4808938  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4808937 gctagatctatgtgaaaatcacttatttacattgaaataaagaaaaaaagatgaagaggggtaatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctcaa 4808838  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  4808837 t 4808837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 35580629 - 35580337
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  35580629 aatatatgataaaactaaagtgaccggaatatccatg-catccggatctgcaacgttcatgcctaaatctttgagtgaataatcgatcattcaatatgaa 35580531  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35580530 tcaaacgaacaccgcaagaagacggaaaatcaaacaacgtcgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacgaagaaaaaac 35580431  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccaccc 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  35580430 ctagatctatgtgaaaatcacttatttaaattgaaatagagagaaaaagatgaagatgagtgattttatgtcaaaaattgacccaaaaccaccc 35580337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11197056 - 11196766
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||     |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11197056 aatatataataaaattaaagtgatcggaatatccat-----ccggatctgcaacgttgacgcccaaatcgttgattgaataatcgatctt-caatatgaa 11196963  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11196962 tcaaatgaacaccgcaagaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcaaaaagaaaaaac 11196863  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11196862 ctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaat--agagaaaaagatgaagatggatgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctcaa 11196766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19876383 - 19876085
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19876383 aatatatgatcaaattaaagtgaccggaatatccatggtctccggatctgcaacgttcaggcccaaatctttgattgaataatcgatctt-caatatgaa 19876285  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19876284 tcaaatgaacaccacaagaagacggggaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccactacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 19876185  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19876184 cttgatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatattgagaaaaagatgaagatgagtaatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctcaat 19876085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 33896248 - 33895959
Alignment:
Q  20 gataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatg 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||    
T  33896248 gataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaattggaataaaatg 33896149  T
Q  120 aacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa--aaaacctaga 217  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33896148 aacaccgcaagaagacgggaaaacaaacaacgccgcacaagaagacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaaacctaga 33896049  T
Q  218 tctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  33896048 tctatgtgaaagtcacttatttagatttaaatagagagaaaaagatgaagaggggtgactttagatcaagaattgacccaaaaccacccc 33895959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 9619268 - 9619569
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  9619268 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaaagttgacgcccaaatctttgatttaacaatcgatctttcaatatgaa 9619367  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaa--agaaaaa 210  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  | |||||    
T  9619368 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacgtagatgatgaaattacaatgaaaaaaa 9619467  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9619468 atctaaatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctca 9619567  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  9619568 at 9619569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34611977 - 34611680
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  34611977 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatcgcctccgaatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaattacttatctttcaatatgaa 34611878  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaa 211  Q
    ||| |||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34611877 tcaaatgaacaccgcacgacgacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 34611778  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34611777 cctagatttatgtgaaaatcacttatttagactgaaatagaaagaaaaatatgaagatgagtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccctc 34611680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2656043 - 2655742
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2656043 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcgacgttgacacccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaa 2655944  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa--aaa 210  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  2655943 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgctgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaa 2655844  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  2655843 atctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagatgggtgattgcaggtcaagaattgacccaaaaccaccgctca 2655744  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  2655743 at 2655742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 43890035 - 43890336
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  43890035 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaaaatgaa 43890134  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag--aaaaa 210  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  43890135 tcaaatgaacaccgtacgaagacgggaaatcaaataacgtcgcacaagacgacgaacaacaaatcaccatacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaa 43890234  T
Q  211 acctagatctatgt-gaaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || | | ||||||||||||||||    
T  43890235 atctagatctatgtcaaaatcacttatttagattgaattaaagagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaaaaaatgatccaaaaccacccctca 43890334  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  43890335 at 43890336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9072891 - 9072590
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9072891 aatatatgataaaattaaagtcatcggaatatccatggcctccgaatctgcaacgttgacatccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaa 9072792  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa--aaa 210  Q
    | | |||||||||| ||||| | || ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  9072791 taaaatgaacaccgcaagaagatgggaaagcaaacaacgccgcacaagatgaagaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 9072692  T
Q  211 acctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    | |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  9072691 atctagatttatgtgaaagtcacttatttaaattgaaatagagagaaaaagatgaagaggggtgatttcaagtcaaaaattgacccaaaaccacccccca 9072592  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  9072591 at 9072590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 32724392 - 32724695
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32724392 aatataagataagattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatatttcaatatgaa 32724491  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||| | | ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32724492 tcaaatgaacactgcacgaagactggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacagttagatgatgaaatcataaagaaaaaac 32724591  T
Q  213 ---------ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaattt-acccaaaacc 301  Q
             ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  32724592 aaaaaaaatctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaa-agatgaagagaagtgatttcaggtcaataatttgacccaaaacc 32724690  T
Q  302 acccc 306  Q
    |||||    
T  32724691 acccc 32724695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11464344 - 11464049
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11464344 aatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaa 11464245  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa--aaa 210  Q
    ||| |||||||||| |  || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  11464244 tcaaatgaacaccgcacaaagactagaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaa 11464145  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccct 307  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11464144 atctagatctatgtgaaaatcacttattcaaattgaaataaagagaa--gaatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgacctaaaaccacccct 11464049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 14906834 - 14907135
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  14906834 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccaaatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaacaatcgatcttttaatacgaa 14906933  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaa--a 210  Q
    ||| ||||||| || | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||  |    
T  14906934 tcaaatgaacatcgcacgaagacgggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacaaacaacaaatcaccacattttgatgatgaaattacaaagaaaaaga 14907033  T
Q  211 acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctca 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||| || ||||||    
T  14907034 acctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagagaaaaagatgaagatgggtgatttcaggtcaagaattgatccaaaatcatccctca 14907133  T
Q  310 at 311  Q
    ||    
T  14907134 at 14907135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 257
Target Start/End: Original strand, 43192258 - 43192502
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||| || |  |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  43192258 aatatatgataaaattaaagtgatcggaatattcatgtct-ccggatctgcaacgttgacacccaaatatttgatcgaataatcgatctttcaaaatgaa 43192356  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43192357 tcaaatgaacaccacaagaagacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacgaagaaaaaac 43192456  T
Q  213 ctagatctatgt-gaaatcacttatttagattgaaatagagagaaa 257  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43192457 ctagatctatgtaaaaaccacttatttagattgaaatagagagaaa 43192502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 44578203 - 44577909
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||  |||||        |||||||||||||||||||| ||    
T  44578203 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgtcattcggatctgcaacgttgacgcccaaatcaa------aataatcgatctttcaatataaa 44578110  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa- 211  Q
    ||| || || |||| | ||| | || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  44578109 tcaaataaataccgcatgaagatgggagatgaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaa 44578010  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  44578009 cctagatctatgtgtaaatcacttagttagattgaaatagagagaaaaagatgaagaggagtgattttaggtcaaaaattgacccaaaaccacccctcaa 44577910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 9498510 - 9498812
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||| |||||||  ||   ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9498510 aatatatgatgaaattaaagtgacaggaatatccattgccttcggatctacaacgttgtcgtccaaatctttgattgaacaatcgatcttttaatatgaa 9498609  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag----aaa 208  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    |||    
T  9498610 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaaagccgcacaagacaacgaacaacaaatcaccacacttagatgatgaaattacaaagaaaaaaa 9498709  T
Q  209 aaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccct 307  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  9498710 aaacctaaatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaataaagataaaaagatgaagaggggtgatttcaggt-aagaattgacccaaaaccacccct 9498808  T
Q  308 caat 311  Q
    ||||    
T  9498809 caat 9498812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28240014 - 28239711
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttcc--------ggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttc 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||        |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28240014 aataaatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgtcttccatgcctccggatctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaataattgatctttc 28239915  T
Q  105 aatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    ||||| ||||| |||||||||| || ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| |  |    
T  28239914 aatattaatcaaatgaacaccgcaacaatacgaggaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccgccacactcaaatgacgaaatcgcgta 28239815  T
Q  205 gaaaaaacctagatctatgtg--aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaacca 302  Q
    || ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||| ||    
T  28239814 gagaaaacctagatctatgtgaaaaaacacttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagagaggtgatttcaggtcaaaaattgacccaaaatca 28239715  T
Q  303 cccc 306  Q
    ||||    
T  28239714 cccc 28239711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 29777392 - 29777110
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29777392 aatatatgataatattaaagtcaccggaatatccatggtctccggatctgcaatgttgacgtccaaatctttgattgaataatcgatctttcaataggaa 29777293  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaa 211  Q
    | | |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29777292 taaaatgaacaccgcaagaagacgggaaagcaaacaatgtcgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 29777193  T
Q  212 cctagatctatgtgaaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccac 303  Q
    ||||||||         || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||    
T  29777192 cctagatc---------tcgcttatttagattgaaatagagagaaaaagatgaagaggagtgatttcatgtcaataattgacccaaaaccac 29777110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 299
Target Start/End: Original strand, 37565790 - 37566079
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |   |||||||||||||||    
T  37565790 aatatatgataaaatcaaagtgaccggaatatccatcgcattcggatctgcaacgttaacgcccaaatctttaattgaattacttatctttcaatatgaa 37565889  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    ||| |||||| ||| | ||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  37565890 tcaaatgaacgccgcacgacgaaggaaaatcaaacaatgccgcacaagacgacgaataacaaaccaccacacttagatgatgaaatctcaaagaaaaaaa 37565989  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagaga-gaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaa 299  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||| || |||| |||| ||||||||    
T  37565990 cctaaatctatgtgaaaatcaattatttagattgaaatagagataaaaaaaatgaagaagggtgatttcagatcaataattgacccaaaa 37566079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17949408 - 17949120
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17949408 aatatatgataaaattaaagtgaccgtaatatccatggcctccggatctggaacgttgacgcccaaatctctgattgaataatcgatctttcaatatgaa 17949309  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa-gaaaaaa 211  Q
    | | |||||||||  | ||| |||| |||||||||||||||||            ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  17949308 taaaatgaacaccacacgaagacggcaaatcaaacaacgccgc------------acaacaaaccatcacacttagatgatgaaatcacaaataaaaaaa 17949221  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaa 310  Q
     | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||    
T  17949220 tcaagatctatgtgaaaatcgcttatttagattgaaatagagagaaaaaggtgaagaggggtgatttcaggtcaataattgacccaaaatcacccatcaa 17949121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 33342606 - 33342310
Alignment:
Q  14 atatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| || || |||||||||||| | ||   || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  33342606 atatatgataaaattaaagtgacctgaatactcatgcct-ccagatctgcaacgtga-cgtccaattctttgattgaataattgatctt-caatatgaat 33342510  T
Q  114 cagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacc 213  Q
    || || ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  33342509 caaataaacaccgcaacaatacgggaaatcaaaaaacgccgcataagacgaagaacaacacaccaccacacttgggtgacgaaatcacgaagaaaaaacc 33342410  T
Q  214 tagatctatgtg--aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  33342409 tagatctatgtgaaaaatcacttatttagattgaattagagaaaaaaggatgaagaggggtgatttcaggttaaaaattgacccaaaaccacccctcaat 33342310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 311
Target Start/End: Original strand, 15597081 - 15597378
Alignment:
Q  15 tatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatc 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  15597081 tatatgagaaaattaaagtgaccgaaatatctatgactat-ggatctacaacgttgacgctcaaatcttcgattgaataaccgatcgtttaatatgaatc 15597179  T
Q  115 agatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacct 214  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||  ||||||||||||    
T  15597180 aaatgaacaccgtaacaaaacggaaaatcaaccaaggcctcacaagacgacaaacaacacaccactacactcggatgacgaaatcatgaagaaaaaacct 15597279  T
Q  215 agatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaataga-gagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  15597280 agatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatggactagaaaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaaaaattgactgaaaaccacccctcaat 15597378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16794464 - 16794187
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||| |||| |  ||||||||||| | | | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16794464 aatatatgataaaattatatagaccagaatacccatgccttc-gattctgcaacgttgatgttcaattctttgattgaataattgatctttcaatatgaa 16794366  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  16794365 tcaaatgaacaccgtaacaatacgggaaatcaaacgacgttgcacaagacgacgaacaacataacaccactctcggatgatgaaatcacgaag-aaaaac 16794267  T
Q  213 ctagatctatgtg--aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatt 290  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| ||||    
T  16794266 ctagatttatgtgaaaaatcacttatttagattgaattagagagaaaaagatgaagatgggtgatttcaagtcaaaaatt 16794187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 307
Target Start/End: Original strand, 27747026 - 27747319
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| | ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27747026 aatatatgataaa-taaaagtgaccggaatacccatg-catccggatctacaacgttgatgcccaaatctttgattgaataattgatctttcaatatgaa 27747123  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| || || || | ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27747124 tcaaatgaacaccgcaacaaaacaggaaatcaaacactgtcgcacaagatgacgaacaacacaccaccacacccagatggtgaaatcacgaagaaaaaac 27747223  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccct 307  Q
     || || |||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||| | ||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  27747224 ttatatttatgtgaaaattacttatttaaattgaaatggagataaaaagatgaagaatggtgatttcaagtcaaaaattgacccaaaactacccct 27747319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33299027 - 33298781
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| | |||| |||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||    
T  33299027 aatatatgataaaattaaagtgactagaatactcatg-catccgtatctgcaacgttgacgaccaaatctttaattgaataatcactctttcgatatgaa 33298929  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||| |  || |||  |||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| | |||| ||||| ||||||||||||  |||||    
T  33298928 tcaaatgaacaccgcagcaagacgagaaatcaaacaacaccacacaagacgatgaacaacacaccactagacttggatgacgaaatcacaaaggtaaaac 33298829  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaata 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33298828 ctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaattagagaaaaata 33298781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 248
Target Start/End: Original strand, 39153054 - 39153293
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||| | || |  |||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  39153054 aatatatgataaaattaaagtgatcggaatacccatgcct-ccggatctgcaacgctgacacccaaatttttaattgaataatcaatctttcaatgtgaa 39153152  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaa-- 210  Q
    ||| ||||| | ||||| || |||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||      
T  39153153 tcaaatgaaaatcgtaacaagacgcgaaatcgaacaacgcgacacaagacgacgaacaacacaccaccacactcggatgacgaaatcacgaagaaaaaaa 39153252  T
Q  211 --acctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaat 248  Q
      ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  39153253 atacctaaatctatgtgaaaatcacttatttaaattgaaat 39153293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 165
Target Start/End: Original strand, 23851405 - 23851557
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23851405 aatatatgatgaaattaaagttaccgaaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaacaatcgatctttcaatatgaa 23851504  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 165  Q
    ||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23851505 tcaaatgaacaccgcacgaagacgggaaatcaaacaacgtcgcacaagacgac 23851557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15047065 - 15046765
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||  |||| || | |||||||||||||| |||   ||| |||| |||| | ||||||| ||||||||| ||    
T  15047065 aatatatgataaaattaaagtaatcggaatacacatgcct-ctggatctgcaacgttgacgtccaaaacttttattgga-aatcgatttttcaatatcaa 15046968  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag-aaaaaa 211  Q
    ||| || |||| || |  || || | |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||||||    
T  15046967 tcaaataaacatcgcaccaagacaggaaatcaaacagcaccgcacaagacgacgaacaacacaccaccacactcggatgacgaaatcacgaagaaaaaaa 15046868  T
Q  212 cctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaataga-gagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaattta-cccaaaaccacccctc 308  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| |  |||| |||| | ||||||| ||||||||    
T  15046867 cctagatctatgtgaaaatcacttacttgaattgaaatggactagaaaaagatgaagagaggtgatttcatatcaaaaattgaccccaaaatcacccctc 15046768  T
Q  309 aat 311  Q
    |||    
T  15046767 aat 15046765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 43135490 - 43135600
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  43135490 aatatatgataaaattaaagtgaccagaatatacatggcttccggatctgaaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatc-ttcactatgaa 43135588  T
Q  113 tcagatgaacac 124  Q
    ||||||||||||    
T  43135589 tcagatgaacac 43135600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 139 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36532944 - 36532804
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtgaaatc-acttatt 237  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||| | | ||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||    
T  36532944 aaatcaaacaacaccgcacaagacgacgaacaacacaacaccacacctagacgataaaacctcgaagaaaaaacctaaatatatgtgaaaactccttatt 36532845  T
Q  238 tagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgatttt 278  Q
    || ||||||||||||| ||| | || |||| || |||||||    
T  36532844 taaattgaaatagagataaaaaaattaagatggatgatttt 36532804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5333493 - 5333391
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaa 196  Q
    |||||||||||| ||| || | |||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||| |||    
T  5333493 gatctttcaataggaaccaaacgaacaccggaacaagacgcaaaatcaaacaacaccgcacaagacgacgaacaacacaacaccgcactcagatgacgaa 5333394  T
Q  197 atc 199  Q
    |||    
T  5333393 atc 5333391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 211
Target Start/End: Original strand, 8443579 - 8443650
Alignment:
Q  140 aatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  8443579 aatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacacaacaccgcacttagacgacgaaatcataaaaaaaaaa 8443650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18734061 - 18733938
Alignment:
Q  145 aacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac-ctagatctatgtgaaatcacttatttagatt 243  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| | |  |||| | ||| ||||| ||||| |||||||||  | |||||||| | |||||| ||||||| |||    
T  18734061 aacatcgccgcacaagacggcgaacaacacatcgtcacattgagacgatgatatcacgaagaaaaaaaaccagatctatttaaaatcaattatttaaatt 18733962  T
Q  244 gaaatagagagaaatagatgaaga 267  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  18733961 gaaatagagagaaaaagatgaaga 18733938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15889644 - 15889574
Alignment:
Q  98 atctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaa 168  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15889644 atctttcaatatgaatcaaatgaacatcgcaaccagaaggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaa 15889574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Original strand, 17427211 - 17427395
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaa 196  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||| ||||  || ||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| |    |||||| | |||| |||    
T  17427211 gatctttcaataagaagcaaatgaacatcgtagcaagacaaaaaattaaacaacggcgcacaagacgaagaataacacaatgtcacactcatatgacgaa 17427310  T
Q  197 atcacaaagaa---aaaacctagatctatgtgaaat-cacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattt 277  Q
    || || |||||   ||||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| || ||| |||||    
T  17427311 ataacgaagaagaaaaaacctagatctatttgaaaagcacttatttacactgaaatagagagaaaaagatgatgatgggggattt 17427395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 37971299 - 37971135
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattga- 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||||   || | || | |  ||||| ||||||||||||||||||||     
T  37971299 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaaaggaacaacttggtagatgtgaaaatcacttatttagattgaa 37971200  T
Q  246 --aatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
      || || |  ||| ||||| |||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||| ||||    
T  37971199 agaaaaggggaaaaaagatgtagaggggtgattctaggtcaaaaaatgacctaaaaccactcctc 37971135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 7883314 - 7883370
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||    
T  7883314 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagatgacgaaatcacaaa 7883370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12173495 - 12173381
Alignment:
Q  190 tgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtga-aatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaa 288  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| | |||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||| |     
T  12173495 tgatgaaatcatgaagaaaaaac-tagaaccatgtaagaaacacttattttgattgaaatagagaaaaa-agataaagatgggtgatttcaggtcaaaag 12173398  T
Q  289 tttacccaaaaccaccc 305  Q
    || ||||||||||||||    
T  12173397 ttgacccaaaaccaccc 12173381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12417923 - 12417809
Alignment:
Q  190 tgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtga-aatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaa 288  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| | |||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||||| |     
T  12417923 tgatgaaatcatgaagaaaaaac-tagaaccatgtaagaaacacttattttgattgaaatagagaaaaa-agataaagatgggtgatttcaggtcaaaag 12417826  T
Q  289 tttacccaaaaccaccc 305  Q
    || ||||||||||||||    
T  12417825 ttgacccaaaaccaccc 12417809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23230659 - 23230603
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||||    
T  23230659 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaatcgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 23230603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 308
Target Start/End: Original strand, 31013688 - 31013817
Alignment:
Q  182 cacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtgaaatc-acttatttagattgaaataga---gagaaatagatgaagaggggtgattt 277  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||||||| | |   | |||| ||||| ||||||||||||     
T  31013688 cacttagacgacgaaatcacaaaaaaaaaac-tagatagatgtgaaaaccacttatttagattgaaagaaaagggggaaaaagatgtagaggggtgattc 31013786  T
Q  278 taggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    |||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  31013787 taggtcaaaaaatgacctaaaaccacccctc 31013817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 35812830 - 35812688
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatca 115  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||  |||| |||  | |||| |||||||||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35812830 atatgataaaattaaagtcactgaaatactcatgtcttt-gtatcttcaacgttaacgtccaaatcattaattgaataaccgatctttcaatatgaatca 35812732  T
Q  116 gatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaag 160  Q
     || |||| ||||| || ||  | ||||||||||| |||||||||    
T  35812731 aataaaca-cgtaacaagacaaacaatcaaacaacaccgcacaag 35812688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 277
Target Start/End: Original strand, 17430970 - 17431045
Alignment:
Q  203 aagaaaaaacctagatctatgtgaaat-cacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattt 277  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || ||| |||||    
T  17430970 aagaaaaaacctagatctatctgaaaagcacttatttagattgacatagagagagaaagatgatgatgggggattt 17431045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 211
Target Start/End: Original strand, 20553314 - 20553377
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  20553314 aacgccgcataagacgacgaacaacaaaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaaaaaaaaa 20553377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 211
Target Start/End: Original strand, 1236722 - 1236835
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaa 196  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| || || | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    | |||||||| || |||    
T  1236722 gatctttcaatatgaacca-acgaacaccgcaacaagatgccaaatcaaacaacgccgcacaagacaacgaacaacacaaggtcgcacttagacgacgaa 1236820  T
Q  197 atcacaaagaaaaaa 211  Q
    |||||||| ||||||    
T  1236821 atcacaaaaaaaaaa 1236835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 211
Target Start/End: Original strand, 1239422 - 1239535
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaa 196  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| || || | |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    | |||||||| || |||    
T  1239422 gatctttcaatatgaacca-acgaacaccgcaacaagatgccaaatcaaacaacgccgcacaagacgatgaacaacacaaggtcgcacttagacgacgaa 1239520  T
Q  197 atcacaaagaaaaaa 211  Q
    |||||||| ||||||    
T  1239521 atcacaaaaaaaaaa 1239535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 173
Target Start/End: Original strand, 29617301 - 29617375
Alignment:
Q  99 tctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||| ||| || | |||||||| || || |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29617301 tctttcaataagaaccaaacgaacaccgcaacaagacgcgaaatcaaacagcgccgcacaagacgacgaacaaca 29617375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15344372 - 15344297
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| || || | |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15344372 gatctttcaatatgaacca-acgaacaccgcaacaagatgtcaaatcaaactacgccgcacaagacgacgaacaaca 15344297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15433437 - 15433362
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| || || | |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15433437 gatctttcaatatgaacca-acgaacaccgcaacaagatgtcaaatcaaactacgccgcacaagacgacgaacaaca 15433362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15524741 - 15524666
Alignment:
Q  97 gatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||| || || | |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15524741 gatctttcaatatgaacca-acgaacaccgcaacaagatgtcaaatcaaactacgccgcacaagacgacgaacaaca 15524666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 39657472 - 39657440
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaa 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39657472 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaa 39657440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Original strand, 18890770 - 18890804
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18890770 aaatcaaacaacgtcgcacaagacgacgaacaaca 18890804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 41896535 - 41896501
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41896535 aaatcaaacaacgccgcacaagacgaccaacaaca 41896501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 265
Target Start/End: Original strand, 25241706 - 25241767
Alignment:
Q  205 gaaaaaacctagatctatgtga-aatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaa 265  Q
    ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25241706 gaaaaaatctaaatttatgtgacaatcacttattgagattgaaatagaaagaaaaagatgaa 25241767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3673453 - 3673401
Alignment:
Q  152 ccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||| || |||||||||||    
T  3673453 ccgcataagacgacgaacaacacaacaccgcacttagacgacgaaatcacaaa 3673401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14585627 - 14585565
Alignment:
Q  226 aaatcacttatttagattga---aatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaa 285  Q
    ||||||||||||||||||||   || ||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  14585627 aaatcacttatttagattgaaagaaaagagaaaaaaagatgcagaggggtgattctaggtcaa 14585565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 145 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14585718 - 14585690
Alignment:
Q  145 aacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14585718 aacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 14585690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 211
Target Start/End: Original strand, 20227347 - 20227419
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 211  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | | |  | |||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  20227347 aaatcaaacaacgtcgcagaagacgacgaacaatacaacgacgcactcagacgatgaaatcacgaagaaaaaa 20227419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 173
Target Start/End: Original strand, 24099284 - 24099356
Alignment:
Q  101 tttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||| || |||||||||| || || | |  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  24099284 tttcaatatgaaccaaatgaacaccgcaacaagatgcgaaatcaaacaacgcggtacaggacgacgaacaaca 24099356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 217 - 311
Target Start/End: Original strand, 24853554 - 24853650
Alignment:
Q  217 atctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatt-tacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||||| | |||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||    
T  24853554 atctatgtgcaaatcacttatttacattaaaatagaaagaaaaagacgaagatgagtgatttcgggtcaataattgaacctaaaaccacctctcaat 24853650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0495 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0495
Description:

Target: scaffold0495; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5564 - 5269
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  5564 aatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaataatcaatctttcaatagaaa 5465  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa-aaaa 211  Q
    | | |||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5464 taaaatgaacaccacaagaagacgggaaagcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccatcacacttaaatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 5365  T
Q  212 cctagatctatgtgaaa-tcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    | ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5364 catagatatatgtaaaagtcacttatttagattgaagtagagagagaaagatgaagaggggtgatttcaggtcaagaattgacccaaaaccacccc 5269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 16231 - 16528
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16231 aatatataataaaattaaagtgaccggaatatccatagcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatattttaatatgaa 16330  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaag---aaaa 209  Q
    ||| || |||||||   ||| ||   | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  16331 tcaaatcaacaccgcgcgaaaacaagatatcaaacaacgccgcacaagacgacaaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaaa 16430  T
Q  210 aacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  16431 aacctaaatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagagaaacagatgaagatgaatgattttaggtcaagaattgacctagaaccacccc 16528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 164; Significance: 3e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 263
Target Start/End: Original strand, 201284 - 201534
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  201284 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctacggatctacaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctt-caatatgaa 201382  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||||  ||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  201383 tcaaatgaacaccacaagaagacgtgaaatcaaacagcgccgcacaagactacgaacaacaaaccatcacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaat 201482  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatg 263  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  201483 ctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatatagagaaaaagatg 201534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 142; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 361710 - 362005
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||  |||||||  || |||    
T  361710 aatatatgagaaaattaaagtgactggagtatccatggcctccggatctacaacgttgacgtccaaatctttgattgaataattaatctttctgtaagaa 361809  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaac 212  Q
    ||| |||||||| | |  || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  361810 tcaaatgaacactgcaccaagacaggaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccatacttaaatgatgaaatcacaa--aaaaaac 361907  T
Q  213 ctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    |||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  361908 ctaactctatgtgaaaattacttatttagattgaaat--agagaaaaagatggagaggggtgatttcaggtcaagaattgactcaaaaccacccctcaat 362005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8731 - 8586
Alignment:
Q  167 aacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8731 aacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtgaaaatcacttatttagattgaaatagagataaaaagatgaa 8632  T
Q  266 gaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
     ||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8631 aaggggtgatttcaagttaagaattaacccaaaaccacccctcaat 8586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 8857 - 8745
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8857 aatatatgataaaattaaagtgaccagaatatccatggtctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 8758  T
Q  113 tcagatgaacacc 125  Q
    ||| |||||||||    
T  8757 tcaaatgaacacc 8745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6471 - 6293
Alignment:
Q  13 aatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6471 aatatatgataaaactaaagtgaccggattattcatggcctttggatctgcaacgttgatgcccaaatatttgattgaataatcgatctttcaatatgaa 6372  T
Q  113 tcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatg 191  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6371 tcaaatgaacaccgcaagaagacgggaaatcaaacaatgccgtacaagacgacgaacaacaaaccaccacactaagatg 6293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 6289 - 6210
Alignment:
Q  226 aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccaccc 305  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  6289 aaatcacttatttagattggaatagagaaaaaaagatgaagaggggtgattttaggtcaagaattgacctgaaaccaccc 6210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Original strand, 83353 - 83544
Alignment:
Q  17 tatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcag 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | || | |||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  83353 tatggtaaaattaaagtgaccggaaaatccatgacctctgaatctgcaacgttgacggccaaatcttcgattgaataatcgatctttcaatatgaatcaa 83452  T
Q  117 atgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 211  Q
    ||||| |||| | ||| |||  |||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  83453 atgaataccgcacgaagacgagaaatcaaacaacgccgcacaa---gacaaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaa 83544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 308
Target Start/End: Original strand, 20402 - 20600
Alignment:
Q  108 atgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaagaa 207  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  20402 atgaatcaaatgaacaccgcaagaaaacggaaaatcaaacaacgtcgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatc-taaaaaa 20500  T
Q  208 aaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccc 306  Q
    |||| | | |||||| || ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||  | ||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||    
T  20501 aaaagccaaatctatatgaaaatcacttatttagatt-taatagagtgaaaaagatgacaatgggtgatttcaggtcaaaaattga-ccaaaaccacccc 20598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 86; Significance: 9e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 81 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 454030 - 453853
Alignment:
Q  81 ctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccacc 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  454030 ctttgattgaataatcgatctttcaatatgagtcaaatgaacaccgcaacaagactgaaaatcaaacaacgccgcccaagacgacgaacaacacaccatc 453931  T
Q  181 acacttagatgatgaaatcacaaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttatttagattgaaatagagagaaa 257  Q
    ||| | | || | |||||||| |||||||||| || || |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  453930 acaatcaaataacgaaatcacgaagaaaaaacgtaaatatatgtgaaaatcacttatttaaattaaaataaagagaaa 453853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 6088 - 6016
Alignment:
Q  101 tttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    |||||||||||| || |||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6088 tttcaatatgaaccaaatgaacaccgcaacaatacgcgaaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaaca 6016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 165
Target Start/End: Original strand, 34695 - 34843
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatca 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |  |||| || |||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  34695 atatgataaaattaaagtgactggaaaactcatgtct-ccggatttgcaacgttgacgcataaatcattgattgcatagtagatctttcaatatgaatca 34793  T
Q  116 gatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgccgcacaagacgac 165  Q
     |||||| | | || || |||  ||||||||||| | |||| ||||||||    
T  34794 aatgaaccctgcaacaaaacgagaaatcaaacaatgtcgcagaagacgac 34843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0888 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 308
Target Start/End: Original strand, 1751 - 1922
Alignment:
Q  139 aaatcaaacaacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcac-aaagaaaaaacctagatctatgtg-aaatcacttat 236  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |  | |||| ||| || |||||||| |||||||||  || ||| |||||| |||||||||||    
T  1751 aaatcaaacaacgccggacaagacgacgaacaacagaacgtcgcactaagacgacgaaatcacgaaagaaaaa--cttgatgtatgtgaaaatcacttat 1848  T
Q  237 ttagattgaaatagagag--aaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    ||||||||||| | || |  ||| ||||| |||| ||||||| |||||||| |||| ||| || | ||||||||    
T  1849 ttagattgaaagaaaggggaaaaaagatgcagagaggtgattctaggtcaaaaattgacctaatatcacccctc 1922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15505 - 15449
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15505 aacgccgcacaagacgacgaacaacacaacaccgcacttagatgacgaaatcacaaa 15449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15413 - 15333
Alignment:
Q  230 cacttatttagattgaaataga--gagaaatagatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    |||||||||||||||||| | |  | |||| ||||| |||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  15413 cacttatttagattgaaagaaaaggggaaaaagatgtagaggggtgattctaggtcaaaaaatgacctaaaaccacccctc 15333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 32822 - 32878
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||||    
T  32822 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaacgccgcacttagacgacgaaatcacaaa 32878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 173
Target Start/End: Original strand, 36639 - 36758
Alignment:
Q  54 ccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaataatcgatctttcaatatgaatcagatgaacaccgtaagaatacggaaaatcaaacaacgcc 153  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||  ||||||||||  || ||||||||||||||| || || | ||||  || || |    |||||||||||| ||    
T  36639 ccggatctgcaatgttgacgctcaaattattgattgaattgtcaatctttcaatatgaaccaaataatcaccacaacaagaaaagaaatcaaacaactcc 36738  T
Q  154 gcacaagacgacgaacaaca 173  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36739 gcacaagacgacgaacaaca 36758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Original strand, 58242 - 58327
Alignment:
Q  225 gaaatcacttatttagattgaaatagagagaaata--gatgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  |||| |  |||| ||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||    
T  58242 gaaatcacttatttagattgaaagaaaaggaaaaaaggatgcagaggggtgattttaggtcaaaaaatgacctaaaaccacccctc 58327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0608 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0608
Description:

Target: scaffold0608; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 157 - 108
Alignment:
Q  262 tgaagaggggtgattttaggtcaagaatttacccaaaaccacccctcaat 311  Q
    |||||| | ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  157 tgaagatgagtgatttcaggttaagaattgacccaaaaccacccctcaat 108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 50932 - 50880
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgtt 69  Q
    ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50932 atatgataaaacttaagtcaccgaaatatccatg-cttccggatctgcaacgtt 50880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0884 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0884
Description:

Target: scaffold0884; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 2048 - 2104
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||    
T  2048 aacgccacataagacgacgaacaacaaaatgccgcacttagacgatgaaatcacaaa 2104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1358 - 1302
Alignment:
Q  148 aacgccgcacaagacgacgaacaacaaaccaccacacttagatgatgaaatcacaaa 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | | || |||||||| || |||||||||||    
T  1358 aacgccacacaagacgacgaacaacacaacgccgcacttagacgaagaaatcacaaa 1302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 92
Target Start/End: Original strand, 31207 - 31282
Alignment:
Q  16 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcttccggatctgcaacgttaacgctaaaatctttgattgaat 92  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||||||||    
T  31207 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatg-cttccggatctgcaacattgatgctcaaatcgttgattgaat 31282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University