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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17178_low_5 (Length: 420)

Name: NF17178_low_5
Description: NF17178
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17178_low_5
NF17178_low_5
[»] chr5 (9 HSPs)
chr5 (13-138)||(33336300-33336425)
chr5 (13-138)||(37827275-37827400)
chr5 (13-138)||(43489461-43489586)
chr5 (13-138)||(37037477-37037602)
chr5 (13-138)||(2027837-2027962)
chr5 (13-138)||(3616677-3616802)
chr5 (207-349)||(33336494-33336631)
chr5 (13-111)||(23417053-23417151)
chr5 (13-104)||(18003407-18003498)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (13-138)||(4122296-4122421)
chr7 (13-138)||(11806347-11806472)
chr7 (13-138)||(25519847-25519972)
chr7 (13-138)||(10267910-10268035)
chr7 (13-138)||(336917-337042)
chr7 (13-138)||(10902386-10902511)
chr7 (13-138)||(43311114-43311239)
chr7 (13-138)||(3524060-3524185)
chr7 (13-138)||(32592482-32592607)
[»] chr3 (9 HSPs)
chr3 (13-138)||(27644241-27644366)
chr3 (13-138)||(3863804-3863929)
chr3 (13-138)||(49529853-49529977)
chr3 (13-138)||(38516864-38516990)
chr3 (13-138)||(20395080-20395205)
chr3 (13-138)||(28392588-28392713)
chr3 (13-138)||(34946916-34947041)
chr3 (13-94)||(44552047-44552128)
chr3 (100-138)||(44552020-44552058)
[»] chr2 (8 HSPs)
chr2 (13-138)||(30111892-30112017)
chr2 (13-138)||(30123179-30123304)
chr2 (13-138)||(7355216-7355341)
chr2 (13-138)||(3536288-3536413)
chr2 (13-138)||(30877230-30877355)
chr2 (13-136)||(43379871-43379994)
chr2 (13-138)||(12534349-12534474)
chr2 (13-138)||(2273973-2274098)
[»] chr8 (9 HSPs)
chr8 (13-138)||(9312264-9312389)
chr8 (13-138)||(35217804-35217929)
chr8 (13-138)||(16726895-16727020)
chr8 (13-138)||(23715941-23716066)
chr8 (13-138)||(32740920-32741045)
chr8 (13-138)||(42990343-42990468)
chr8 (13-136)||(44501196-44501319)
chr8 (13-138)||(38224552-38224677)
chr8 (13-138)||(12773573-12773698)
[»] chr6 (4 HSPs)
chr6 (13-138)||(30702808-30702933)
chr6 (13-137)||(14220361-14220485)
chr6 (13-138)||(5309044-5309169)
chr6 (39-138)||(21351079-21351178)
[»] chr4 (12 HSPs)
chr4 (13-138)||(15056336-15056461)
chr4 (13-138)||(21398627-21398752)
chr4 (13-138)||(45117997-45118122)
chr4 (13-138)||(1084295-1084420)
chr4 (13-138)||(5927236-5927361)
chr4 (13-138)||(10489755-10489880)
chr4 (13-138)||(14678468-14678593)
chr4 (19-135)||(17194641-17194757)
chr4 (13-136)||(54072629-54072750)
chr4 (13-138)||(49545374-49545499)
chr4 (13-111)||(45108290-45108388)
chr4 (13-111)||(27181784-27181882)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (13-138)||(7391206-7391331)
chr1 (13-138)||(41775301-41775426)
chr1 (13-138)||(16640527-16640652)
chr1 (13-138)||(22146417-22146542)
chr1 (13-138)||(29650928-29651053)
chr1 (13-111)||(8363804-8363902)
[»] scaffold0129 (1 HSPs)
scaffold0129 (13-138)||(37772-37897)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 9)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 33336300 - 33336425
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  33336300 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagaatttattaatttat 33336399  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33336400 cgagtattaatttaaagagtttctac 33336425  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 37827400 - 37827275
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37827400 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 37827301  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  37827300 cgagtattaatttaaagagtttctac 37827275  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 43489461 - 43489586
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43489461 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 43489560  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  43489561 cgagtattaatttaaagagtttctac 43489586  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 37037602 - 37037477
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37037602 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcgggatcgaacaaatttattattttagagagtttattaatttac 37037503  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  37037502 cgagtattaatttaaagagtttctac 37037477  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 2027837 - 2027962
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  2027837 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggctcaagtcgggaccggacaaatttattattttagagaatttattaatttat 2027936  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  2027937 cgagtattaatttaaagagtttctac 2027962  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 3616677 - 3616802
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3616677 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactgacccaagtcggaaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 3616776  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3616777 cgagtattaattttaagagtttctac 3616802  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 207 - 349
Target Start/End: Original strand, 33336494 - 33336631
Alignment:
Q  207 acgaaattaagcatttgttaaataactggaatatactactacatataatattaaaatgtgcacaacgtattnnnnnnnnnngagtgaggatatatatatt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||    
T  33336494 acgaaattaagcatttgttaaataacggga-----ctactacatataatattaaaatgtgcacaacgtattaaaaaaaaaagagtgaggatatatatatt 33336588  T
Q  307 tagtttttggaaaaactttgaaacttaatttagagtgtgtata 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33336589 tagtttttggaaaaactttgaaacttaatttagtgtgtgtata 33336631  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 23417053 - 23417151
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaattta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23417053 aaaattattatcttattattttatcaaattattcaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaattta 23417151  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 18003498 - 18003407
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18003498 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggctcaaatcggaaccggacaaatttattattttagagagtttat 18003407  T

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Target: chr7 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 4122296 - 4122421
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4122296 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaatttcttacattggcccaagtcgggaccggataaatttattattttaaagagtttattaatttac 4122395  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  4122396 cgagtattaatttaaagagtttctac 4122421  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 11806347 - 11806472
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11806347 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaatttcttacattggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 11806446  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  11806447 cgagtattaatttaaagagtttctac 11806472  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 25519847 - 25519972
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25519847 aaaattattatcttattattttatcaaattattcaattttttacactggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 25519946  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25519947 cgagtattaatttaaagagtttctac 25519972  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 10268035 - 10267910
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  10268035 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttat 10267936  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10267935 cgagtattaatttaaagagtttctac 10267910  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 336917 - 337042
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  336917 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactagcccaagtcgggatcggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 337016  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  337017 cgagtattaatttaaagagtttctac 337042  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 10902386 - 10902511
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10902386 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactgacccaagtcggaaccggacaaatttattattttatagagtttattaatttac 10902485  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  10902486 cgagtattaatttaaagagtttctac 10902511  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 43311239 - 43311114
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  43311239 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttat 43311140  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  43311139 cgaatattaatttaaagagtttctac 43311114  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 3524060 - 3524185
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3524060 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcggtatcttacaaatttattattttagagagtttattaatttac 3524159  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3524160 cgagtattaatttaaagagtttctac 3524185  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 32592482 - 32592607
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| | | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32592482 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaatttgtgatcgtacaaatttattattttagagagtttattaatttac 32592581  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  32592582 cgagtattaatttaaagagtttctac 32592607  T

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Target: chr3 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 9)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27644366 - 27644241
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27644366 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 27644267  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27644266 cgagtattaatttaaagagtttctac 27644241  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 3863804 - 3863929
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3863804 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 3863903  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3863904 cgagtattaatttaaagagtttctac 3863929  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 49529853 - 49529977
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49529853 aaaattattatcttattattttatcgagtttt-caattttttacattggcccaagtcgggacctgacaaatttattattttagagagtttattaatttac 49529951  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  49529952 cgagtattaatttaaagagtttctac 49529977  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 38516990 - 38516864
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38516990 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 38516891  T
Q  113 c-gagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  38516890 ctgagtattaatttaaagagtttctac 38516864  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 20395080 - 20395205
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20395080 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaattcattattttagagagtttattaatttac 20395179  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  20395180 cgaggattaatttaaagagtttctac 20395205  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28392713 - 28392588
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28392713 aaaattattatcttattatttcattgaatttttcaattttttacattggcttaagtcgggaccggataaatttattattttagagagtttattaatttac 28392614  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28392613 cgagtattaatttaaagagtttctac 28392588  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 34946916 - 34947041
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34946916 aaaattattatcttattattttatcgaattatccaattttttacactggcccaagttgggatcggataaatttattattttagagagtttattaatttac 34947015  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  34947016 cgagtattaatttaaagaatttctac 34947041  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 44552128 - 44552047
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattatttta 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44552128 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattaattta 44552047  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 44552058 - 44552020
Alignment:
Q  100 tttattaatttaccgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44552058 tttattaatttaccgagtattaatttaaagagtttctac 44552020  T

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Target: chr2 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 8)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 30112017 - 30111892
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30112017 aaaattattatcttattattttatcgagttattcaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 30111918  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  30111917 cgagtattaatttaaagagtttctac 30111892  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 30123304 - 30123179
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30123304 aaaattattatcttattattttatcgagttattcaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 30123205  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  30123204 cgagtattaatttaaagagtttctac 30123179  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 7355341 - 7355216
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7355341 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 7355242  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  7355241 cgagtattaatttaaagagtttctac 7355216  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 3536288 - 3536413
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3536288 aaaattattatcttattattttatcgaattatttaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 3536387  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3536388 cgagtattaatttaaagagtttctac 3536413  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 30877355 - 30877230
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30877355 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagttgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 30877256  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  30877255 cgagtattaatttaaagagtttctac 30877230  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 43379994 - 43379871
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43379994 aaaattattatcttattattttatcaagtttttcaatttcttaaattggcccaagtcgggatcggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 43379895  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  43379894 cgagtattaatttaaagagtttct 43379871  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 12534349 - 12534474
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12534349 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagttgagaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 12534448  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  12534449 cgagtattaatttaaagagtttctac 12534474  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 2273973 - 2274098
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2273973 aaaattattatcttattattttatcgaattactcaattttttacactgactcaagtcggaaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 2274072  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  2274073 cgagtattaatttaaagaatttctac 2274098  T

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Target: chr8 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 9312389 - 9312264
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9312389 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 9312290  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9312289 cgagtattaatttaaagagtttctac 9312264  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 35217804 - 35217929
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35217804 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 35217903  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  35217904 cgagtattaatttaaagagtttctac 35217929  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16727020 - 16726895
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16727020 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagaaagtttattaatttac 16726921  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16726920 cgagtattaatttaaagagtttctac 16726895  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 23716066 - 23715941
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23716066 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggctcaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 23715967  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23715966 cgagtattaatttaaagagtttctac 23715941  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 32741045 - 32740920
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32741045 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggctcaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttat 32740946  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  32740945 cgagtattaatttaaagagtttctac 32740920  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 42990343 - 42990468
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42990343 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactagcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 42990442  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  42990443 cgagtattaatttaaagagtttctac 42990468  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 44501319 - 44501196
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44501319 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaaatcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 44501220  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  44501219 cgagtattaatttaaagagtttct 44501196  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 38224552 - 38224677
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38224552 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcctaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 38224651  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  38224652 cgagtattaatttaaagattttctac 38224677  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 12773573 - 12773698
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  12773573 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaaatcggaaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttat 12773672  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  12773673 cgagtattaatttaaagagtttctac 12773698  T

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Target: chr6 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 30702933 - 30702808
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30702933 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttat 30702834  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  30702833 cgagtattaatttaaagagtttctac 30702808  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 137
Target Start/End: Original strand, 14220361 - 14220485
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14220361 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagacgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 14220460  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttcta 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14220461 cgagtattaatttaaagagtttcta 14220485  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 5309169 - 5309044
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5309169 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaatttcttacattggcctaaatcggaaccggacaaatttattattttagagaatttattaatttac 5309070  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5309069 cgagtattaatttaaagagtttctac 5309044  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 21351178 - 21351079
Alignment:
Q  39 agtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttaccgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21351178 agtttttcaattttttacattggcccaagtcgggatcagacaaatttattattttagagagtttattaatttaccgagtattaaattaaagagtttctac 21351079  T

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Target: chr4 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 12)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 15056336 - 15056461
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15056336 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 15056435  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15056436 cgagtattaatttaaagagtttctac 15056461  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 21398627 - 21398752
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21398627 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 21398726  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21398727 cgagtattaatttaaagagtttctac 21398752  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 45117997 - 45118122
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45117997 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcctaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 45118096  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  45118097 cgagtattaatttaaagagtttctac 45118122  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 1084420 - 1084295
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1084420 aaaattattatcttactattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcggaaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 1084321  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  1084320 cgagtattaatttaaagagtttctac 1084295  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 5927236 - 5927361
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5927236 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcgggatcgaacaaatttattattttagagagtttattaatttac 5927335  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5927336 cgagtattaatttaaagagtttctac 5927361  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 10489755 - 10489880
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10489755 aaaattattatcttattattttatcgaattatttaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 10489854  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  10489855 caagtattaatttaaagagtttctac 10489880  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 14678468 - 14678593
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14678468 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcgggagcgaacaaatttattattttagagagtttattaatttac 14678567  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  14678568 cgagtattaatttaaagagtttctac 14678593  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17194757 - 17194641
Alignment:
Q  19 attatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttaccgagta 118  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17194757 attatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttaccgagta 17194658  T
Q  119 ttaatttaaagagtttc 135  Q
    |||||||||||||||||    
T  17194657 ttaatttaaagagtttc 17194641  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Original strand, 54072629 - 54072750
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54072629 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggcctaagtcggaaccgaacaaatttattatttt--agagtttattaatttac 54072726  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttct 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  54072727 cgagtattaatttaaagagtttct 54072750  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 49545499 - 49545374
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49545499 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactgacccaaatcaggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 49545400  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  49545399 cgagtattaatttaaagagtttctac 49545374  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 45108290 - 45108388
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaattta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45108290 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaattta 45108388  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 27181882 - 27181784
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaattta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27181882 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggctcaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaattta 27181784  T

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Target: chr1 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 7391206 - 7391331
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7391206 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 7391305  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  7391306 cgagtattaatttaaagagtttctac 7391331  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 41775301 - 41775426
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41775301 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactagcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 41775400  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  41775401 cgagtattaatttaaagagtttctac 41775426  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16640652 - 16640527
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16640652 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcccaagtcgggaccagacaaatttattattttagagagtttattaatttac 16640553  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  16640552 tgagtattaatttaaagagtttctac 16640527  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22146542 - 22146417
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |     
T  22146542 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggcctaagtcggaaccggacaaatttattattttagagagtttattaattcat 22146443  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  22146442 cgagtattaatttaaagagtttctac 22146417  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 29650928 - 29651053
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | | | ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29650928 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactagccaaagtcgggaacgaacaaatttattattttagagagtttattaatttac 29651027  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  29651028 cgagtattaatttaaaaagtttctac 29651053  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 8363804 - 8363902
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaattta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8363804 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaattttttacactggctcaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaattta 8363902  T

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Target: scaffold0129 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0129
Description:

Target: scaffold0129; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 37897 - 37772
Alignment:
Q  13 aaaattattatcttattattttatcgagtttttcaattttttacattggtccaagtcgggaccggacaaatttattattttaaagagtttattaatttac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37897 aaaattattatcttattattttatcgaattattcaactttttacactggcccaagtcgggaccggacaaatttattattttagagagtttattaatttac 37798  T
Q  113 cgagtattaatttaaagagtttctac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  37797 cgagtattaatttaaagagtttctac 37772  T

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