View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1717R-Insertion-11 (Length: 955)

Name: NF1717R-Insertion-11
Description: NF1717R
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1717R-Insertion-11
NF1717R-Insertion-11
[»] chr8 (61 HSPs)
chr8 (500-682)||(12670247-12670429)
chr8 (498-682)||(30454094-30454278)
chr8 (495-680)||(36720745-36720932)
chr8 (499-679)||(2626472-2626657)
chr8 (497-681)||(28817624-28817810)
chr8 (500-683)||(35261633-35261818)
chr8 (499-679)||(13160655-13160836)
chr8 (497-679)||(17823527-17823711)
chr8 (499-680)||(39460993-39461178)
chr8 (500-679)||(29521685-29521866)
chr8 (500-682)||(7136524-7136710)
chr8 (500-656)||(20869523-20869677)
chr8 (500-680)||(44530103-44530285)
chr8 (500-678)||(45071219-45071398)
chr8 (499-682)||(6760776-6760962)
chr8 (500-680)||(26954086-26954271)
chr8 (498-681)||(18164758-18164942)
chr8 (512-682)||(8897761-8897933)
chr8 (515-680)||(12625858-12626026)
chr8 (504-673)||(20284075-20284250)
chr8 (504-673)||(21070703-21070879)
chr8 (499-681)||(25250475-25250661)
chr8 (528-680)||(31457155-31457308)
chr8 (511-666)||(44781517-44781675)
chr8 (511-679)||(28407381-28407538)
chr8 (500-657)||(24245405-24245562)
chr8 (523-657)||(24365081-24365218)
chr8 (501-611)||(11748254-11748366)
chr8 (567-680)||(19729363-19729476)
chr8 (563-677)||(29877111-29877227)
chr8 (554-681)||(5135288-5135416)
chr8 (564-682)||(20869941-20870063)
chr8 (499-680)||(40604905-40605087)
chr8 (555-667)||(8483950-8484064)
chr8 (511-665)||(42083712-42083868)
chr8 (545-667)||(389642-389768)
chr8 (572-679)||(16225045-16225156)
chr8 (605-682)||(26102578-26102655)
chr8 (522-670)||(22598133-22598282)
chr8 (511-657)||(14017990-14018138)
chr8 (532-635)||(23000263-23000365)
chr8 (525-626)||(35105902-35106006)
chr8 (522-657)||(11000971-11001109)
chr8 (555-667)||(5689640-5689754)
chr8 (563-681)||(10857845-10857966)
chr8 (511-589)||(30962865-30962942)
chr8 (572-626)||(23286378-23286432)
chr8 (557-666)||(17250888-17251001)
chr8 (602-681)||(16013512-16013593)
chr8 (696-780)||(20241863-20241947)
chr8 (696-780)||(20251120-20251204)
chr8 (499-543)||(23286431-23286475)
chr8 (616-680)||(35107310-35107374)
chr8 (524-681)||(36918102-36918261)
chr8 (501-633)||(44742564-44742698)
chr8 (570-639)||(43942348-43942421)
chr8 (630-682)||(27468089-27468141)
chr8 (637-679)||(23286337-23286379)
chr8 (835-902)||(20242063-20242132)
chr8 (835-902)||(20250935-20251004)
chr8 (500-537)||(42840863-42840900)
[»] chr6 (50 HSPs)
chr6 (500-682)||(1346918-1347100)
chr6 (500-680)||(1354756-1354936)
chr6 (499-681)||(29355853-29356040)
chr6 (511-680)||(12221913-12222087)
chr6 (499-682)||(9161076-9161262)
chr6 (514-683)||(2166406-2166579)
chr6 (514-683)||(2178039-2178212)
chr6 (564-681)||(26097178-26097295)
chr6 (502-672)||(3815084-3815256)
chr6 (564-681)||(25557743-25557860)
chr6 (500-682)||(1941809-1941993)
chr6 (499-612)||(8409196-8409311)
chr6 (524-680)||(28007604-28007761)
chr6 (500-666)||(15866052-15866218)
chr6 (500-617)||(6024187-6024306)
chr6 (499-589)||(14975172-14975262)
chr6 (556-672)||(32579436-32579553)
chr6 (511-657)||(14553477-14553626)
chr6 (501-624)||(13905034-13905158)
chr6 (532-666)||(23240837-23240971)
chr6 (511-683)||(24097546-24097716)
chr6 (523-680)||(32728156-32728314)
chr6 (554-667)||(33138841-33138956)
chr6 (531-682)||(18277190-18277343)
chr6 (504-619)||(20400625-20400742)
chr6 (683-780)||(21861937-21862034)
chr6 (511-679)||(7947371-7947541)
chr6 (504-589)||(24734591-24734676)
chr6 (503-589)||(12063424-12063510)
chr6 (522-678)||(2755422-2755583)
chr6 (522-679)||(12889402-12889562)
chr6 (504-680)||(23930126-23930303)
chr6 (617-681)||(6808468-6808532)
chr6 (602-682)||(12892065-12892147)
chr6 (607-681)||(13267788-13267862)
chr6 (500-582)||(33922927-33923009)
chr6 (602-679)||(383760-383837)
chr6 (602-680)||(12885969-12886049)
chr6 (497-589)||(22967122-22967214)
chr6 (497-589)||(23821179-23821271)
chr6 (516-575)||(8417442-8417501)
chr6 (518-589)||(27855530-27855601)
chr6 (511-549)||(19649299-19649337)
chr6 (691-727)||(13167330-13167366)
chr6 (645-681)||(25997750-25997786)
chr6 (538-589)||(17432332-17432383)
chr6 (555-643)||(15865893-15865982)
chr6 (628-682)||(20906783-20906837)
chr6 (499-552)||(1916190-1916243)
chr6 (680-721)||(28063812-28063853)
[»] chr7 (85 HSPs)
chr7 (497-682)||(32758212-32758397)
chr7 (500-680)||(21172008-21172188)
chr7 (499-679)||(48735122-48735303)
chr7 (511-679)||(10693073-10693241)
chr7 (528-682)||(42391097-42391251)
chr7 (499-678)||(42476826-42477005)
chr7 (520-675)||(33871914-33872070)
chr7 (500-682)||(47077852-47078034)
chr7 (498-679)||(2541019-2541203)
chr7 (500-681)||(42798623-42798806)
chr7 (499-681)||(42805477-42805663)
chr7 (511-682)||(19426887-19427059)
chr7 (513-678)||(11617589-11617756)
chr7 (499-682)||(34626205-34626389)
chr7 (500-679)||(22698967-22699151)
chr7 (511-681)||(27629599-27629771)
chr7 (500-679)||(47716413-47716596)
chr7 (499-677)||(35334818-35334996)
chr7 (525-678)||(11741774-11741927)
chr7 (500-682)||(43557426-43557613)
chr7 (500-667)||(2662948-2663112)
chr7 (500-650)||(46354148-46354302)
chr7 (506-680)||(40463837-40464012)
chr7 (543-680)||(31591108-31591245)
chr7 (511-682)||(19265781-19265951)
chr7 (511-657)||(13805068-13805214)
chr7 (511-679)||(23419674-23419843)
chr7 (522-657)||(19266426-19266563)
chr7 (529-682)||(32233132-32233286)
chr7 (511-657)||(28362167-28362314)
chr7 (499-598)||(42495917-42496017)
chr7 (554-682)||(7879646-7879776)
chr7 (511-655)||(48123508-48123653)
chr7 (501-618)||(5180218-5180337)
chr7 (522-635)||(14099050-14099165)
chr7 (522-635)||(14409067-14409182)
chr7 (522-678)||(29907393-29907552)
chr7 (501-598)||(18326989-18327087)
chr7 (504-667)||(14732833-14732999)
chr7 (501-639)||(8148985-8149126)
chr7 (521-634)||(7644931-7645047)
chr7 (545-677)||(18512455-18512588)
chr7 (503-682)||(25198679-25198864)
chr7 (500-588)||(7193039-7193127)
chr7 (532-678)||(18747472-18747621)
chr7 (499-657)||(28078154-28078313)
chr7 (499-618)||(12473257-12473378)
chr7 (511-678)||(3469176-3469348)
chr7 (505-589)||(7794598-7794682)
chr7 (512-680)||(39123857-39124031)
chr7 (523-624)||(6736867-6736969)
chr7 (565-657)||(38604546-38604639)
chr7 (537-682)||(38262193-38262340)
chr7 (506-589)||(1424002-1424085)
chr7 (556-667)||(21566445-21566559)
chr7 (522-589)||(44123713-44123780)
chr7 (680-811)||(11828629-11828756)
chr7 (602-683)||(27889312-27889393)
chr7 (522-678)||(16341254-16341413)
chr7 (571-680)||(35787268-35787378)
chr7 (688-809)||(6530526-6530647)
chr7 (557-649)||(15108427-15108520)
chr7 (500-589)||(21447544-21447633)
chr7 (558-643)||(1408469-1408556)
chr7 (544-634)||(35203437-35203531)
chr7 (689-811)||(21813745-21813867)
chr7 (522-664)||(42101899-42102044)
chr7 (562-667)||(23231573-23231680)
chr7 (511-551)||(29140490-29140530)
chr7 (696-780)||(44338186-44338270)
chr7 (619-679)||(45018923-45018983)
chr7 (587-681)||(39093437-39093532)
chr7 (616-683)||(45811919-45811985)
chr7 (567-681)||(23618975-23619088)
chr7 (632-682)||(36602535-36602585)
chr7 (812-864)||(11828641-11828693)
chr7 (505-549)||(28685266-28685310)
chr7 (820-902)||(46963811-46963895)
chr7 (709-768)||(46963921-46963980)
chr7 (602-680)||(23065924-23066002)
chr7 (587-654)||(33500556-33500625)
chr7 (602-667)||(36267829-36267895)
chr7 (501-555)||(45019002-45019056)
chr7 (605-666)||(21139761-21139822)
chr7 (835-902)||(44338386-44338455)
[»] chr1 (94 HSPs)
chr1 (499-680)||(34725097-34725278)
chr1 (500-682)||(47214488-47214670)
chr1 (500-683)||(38478278-38478461)
chr1 (500-680)||(32632556-32632737)
chr1 (500-682)||(45812534-45812716)
chr1 (500-683)||(46247949-46248134)
chr1 (499-680)||(14617014-14617197)
chr1 (504-680)||(19414420-19414596)
chr1 (500-680)||(20004089-20004273)
chr1 (500-682)||(18944620-18944807)
chr1 (500-683)||(46991781-46991966)
chr1 (506-680)||(30395725-30395903)
chr1 (537-681)||(35253185-35253329)
chr1 (506-680)||(12126836-12127010)
chr1 (505-682)||(45402077-45402257)
chr1 (515-665)||(23768334-23768486)
chr1 (499-685)||(27201623-27201813)
chr1 (500-680)||(10668197-10668386)
chr1 (499-680)||(27474257-27474439)
chr1 (498-680)||(41319805-41319989)
chr1 (511-682)||(18724543-18724714)
chr1 (519-682)||(6925096-6925261)
chr1 (500-643)||(22930105-22930248)
chr1 (499-682)||(8197019-8197204)
chr1 (505-681)||(18741955-18742137)
chr1 (523-658)||(25468284-25468421)
chr1 (511-680)||(6983810-6983978)
chr1 (511-657)||(11596502-11596648)
chr1 (499-677)||(19932755-19932934)
chr1 (511-643)||(20036209-20036343)
chr1 (511-667)||(2435798-2435956)
chr1 (564-682)||(31382211-31382330)
chr1 (539-680)||(35005139-35005284)
chr1 (511-625)||(4430080-4430196)
chr1 (522-676)||(10378738-10378884)
chr1 (522-667)||(35117777-35117927)
chr1 (506-680)||(9939443-9939623)
chr1 (586-679)||(4349703-4349796)
chr1 (511-626)||(33222972-33223089)
chr1 (565-682)||(23796507-23796626)
chr1 (523-682)||(19701570-19701732)
chr1 (511-589)||(22327088-22327165)
chr1 (498-575)||(34714598-34714675)
chr1 (523-657)||(44485131-44485267)
chr1 (522-618)||(17470407-17470505)
chr1 (511-682)||(35019219-35019390)
chr1 (503-589)||(25290143-25290231)
chr1 (501-622)||(24564322-24564445)
chr1 (511-681)||(50811928-50812100)
chr1 (555-677)||(22324925-22325049)
chr1 (557-667)||(45264411-45264524)
chr1 (522-617)||(50760288-50760385)
chr1 (522-667)||(27136663-27136811)
chr1 (502-567)||(40424721-40424786)
chr1 (602-682)||(1517308-1517388)
chr1 (522-589)||(2435985-2436052)
chr1 (587-682)||(43768205-43768300)
chr1 (501-587)||(21723642-21723727)
chr1 (616-682)||(50606498-50606564)
chr1 (511-677)||(15511150-15511320)
chr1 (504-662)||(18335305-18335465)
chr1 (556-665)||(43207528-43207640)
chr1 (522-622)||(52910216-52910319)
chr1 (589-657)||(15505632-15505700)
chr1 (602-669)||(4249453-4249520)
chr1 (602-669)||(4249777-4249844)
chr1 (602-669)||(4250101-4250168)
chr1 (509-624)||(34679274-34679390)
chr1 (498-587)||(22151479-22151568)
chr1 (523-667)||(23371124-23371268)
chr1 (533-625)||(31272429-31272522)
chr1 (523-676)||(39214961-39215117)
chr1 (534-680)||(19974073-19974221)
chr1 (565-665)||(34148974-34149076)
chr1 (586-681)||(42304205-42304302)
chr1 (500-589)||(10163736-10163825)
chr1 (832-902)||(15630035-15630108)
chr1 (553-657)||(30682844-30682948)
chr1 (557-672)||(31442396-31442515)
chr1 (629-680)||(19386575-19386626)
chr1 (511-586)||(25554817-25554891)
chr1 (612-674)||(4587568-4587630)
chr1 (602-676)||(28894561-28894635)
chr1 (563-657)||(20169111-20169207)
chr1 (704-776)||(2072458-2072530)
chr1 (602-670)||(4430008-4430076)
chr1 (614-666)||(33594144-33594196)
chr1 (509-564)||(49546024-49546078)
chr1 (602-680)||(20999849-20999927)
chr1 (564-610)||(44745854-44745900)
chr1 (821-899)||(2072363-2072444)
chr1 (628-681)||(16120823-16120876)
chr1 (602-635)||(21910693-21910726)
chr1 (586-626)||(46859131-46859172)
[»] chr4 (98 HSPs)
chr4 (500-682)||(11054145-11054327)
chr4 (497-679)||(20224935-20225117)
chr4 (499-681)||(48598823-48599005)
chr4 (500-682)||(47528527-47528709)
chr4 (499-681)||(5648212-5648395)
chr4 (498-678)||(6430627-6430808)
chr4 (499-682)||(30639333-30639517)
chr4 (511-682)||(16408598-16408773)
chr4 (499-682)||(5306657-5306845)
chr4 (511-678)||(8473621-8473790)
chr4 (524-681)||(9832311-9832468)
chr4 (538-677)||(29207900-29208039)
chr4 (500-676)||(21646918-21647098)
chr4 (500-682)||(23501747-23501927)
chr4 (89-376)||(24224891-24225186)
chr4 (519-678)||(40915802-40915962)
chr4 (503-680)||(16911519-16911700)
chr4 (526-682)||(17043392-17043549)
chr4 (527-682)||(39077793-39077948)
chr4 (521-682)||(47443928-47444095)
chr4 (526-681)||(54175043-54175202)
chr4 (519-679)||(44363130-44363294)
chr4 (522-683)||(35567146-35567309)
chr4 (500-681)||(13256397-13256578)
chr4 (521-667)||(19027823-19027971)
chr4 (499-626)||(14590790-14590920)
chr4 (503-680)||(14983791-14983970)
chr4 (532-681)||(25463108-25463258)
chr4 (524-679)||(30690176-30690340)
chr4 (500-665)||(37494805-37494972)
chr4 (563-682)||(20639655-20639777)
chr4 (496-667)||(54730199-54730375)
chr4 (500-682)||(10660358-10660544)
chr4 (500-682)||(10874503-10874689)
chr4 (512-657)||(49938615-49938759)
chr4 (505-682)||(30352577-30352767)
chr4 (554-681)||(10277755-10277882)
chr4 (500-679)||(20405047-20405224)
chr4 (511-667)||(30496334-30496490)
chr4 (529-640)||(41018833-41018945)
chr4 (529-656)||(7385499-7385628)
chr4 (566-681)||(25629069-25629186)
chr4 (509-643)||(47441566-47441701)
chr4 (500-679)||(55766466-55766647)
chr4 (500-679)||(55830721-55830902)
chr4 (501-657)||(54966977-54967133)
chr4 (503-589)||(17315390-17315476)
chr4 (608-682)||(38786673-38786747)
chr4 (522-682)||(20908633-20908797)
chr4 (558-682)||(9987831-9987957)
chr4 (522-627)||(487186-487294)
chr4 (564-678)||(7909281-7909397)
chr4 (524-679)||(32478792-32478942)
chr4 (522-682)||(39029059-39029220)
chr4 (511-598)||(42164230-42164317)
chr4 (566-657)||(49796818-49796910)
chr4 (511-618)||(25343153-25343261)
chr4 (589-679)||(20225119-20225211)
chr4 (570-680)||(51865037-51865149)
chr4 (558-666)||(21489099-21489210)
chr4 (524-682)||(23580205-23580365)
chr4 (511-663)||(30581481-30581636)
chr4 (511-589)||(54640431-54640508)
chr4 (503-576)||(5313099-5313172)
chr4 (522-587)||(43035224-43035289)
chr4 (618-682)||(32484307-32484371)
chr4 (523-657)||(3580862-3580994)
chr4 (615-682)||(28494222-28494289)
chr4 (531-640)||(32629308-32629418)
chr4 (534-680)||(7038041-7038188)
chr4 (605-682)||(33836484-33836563)
chr4 (511-589)||(36589710-36589786)
chr4 (617-679)||(38755908-38755970)
chr4 (602-682)||(36816381-36816462)
chr4 (521-642)||(44357195-44357319)
chr4 (511-616)||(51420539-51420646)
chr4 (718-791)||(54147571-54147644)
chr4 (615-679)||(11394923-11394987)
chr4 (615-679)||(11404650-11404714)
chr4 (522-586)||(12257688-12257752)
chr4 (586-678)||(12711450-12711542)
chr4 (503-543)||(18969698-18969738)
chr4 (501-577)||(20373898-20373974)
chr4 (522-592)||(41549358-41549428)
chr4 (585-663)||(16494258-16494338)
chr4 (499-544)||(29879634-29879679)
chr4 (629-682)||(35532077-35532130)
chr4 (618-679)||(40553937-40553998)
chr4 (618-679)||(44718641-44718702)
chr4 (511-626)||(49938491-49938608)
chr4 (628-681)||(56322984-56323037)
chr4 (820-902)||(16870646-16870730)
chr4 (573-676)||(12047721-12047823)
chr4 (709-768)||(16870561-16870620)
chr4 (617-679)||(25388249-25388311)
chr4 (511-573)||(50856344-50856405)
chr4 (617-682)||(8820581-8820646)
chr4 (537-625)||(10379997-10380086)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (500-681)||(30533-30714)
[»] chr3 (82 HSPs)
chr3 (499-681)||(1217065-1217247)
chr3 (504-678)||(22122918-22123092)
chr3 (499-683)||(40272808-40272994)
chr3 (499-679)||(39203491-39203671)
chr3 (500-682)||(13730599-13730785)
chr3 (499-680)||(13628789-13628975)
chr3 (500-680)||(12914034-12914216)
chr3 (498-678)||(22609741-22609921)
chr3 (500-682)||(46421031-46421218)
chr3 (498-678)||(7696893-7697068)
chr3 (513-682)||(26869696-26869866)
chr3 (500-682)||(52926216-52926391)
chr3 (498-680)||(16735415-16735598)
chr3 (499-682)||(8247683-8247871)
chr3 (501-680)||(29366719-29366902)
chr3 (554-679)||(31592879-31593004)
chr3 (500-667)||(6411834-6412002)
chr3 (511-682)||(26573115-26573287)
chr3 (499-662)||(9607178-9607345)
chr3 (527-682)||(7942993-7943150)
chr3 (573-683)||(15797271-15797381)
chr3 (497-681)||(5173717-5173905)
chr3 (500-598)||(10870033-10870132)
chr3 (523-681)||(34420641-34420802)
chr3 (532-681)||(516417-516571)
chr3 (500-626)||(4495717-4495845)
chr3 (574-681)||(26292382-26292489)
chr3 (554-679)||(10795423-10795552)
chr3 (582-681)||(34771362-34771461)
chr3 (564-681)||(54484730-54484850)
chr3 (511-626)||(45620881-45620998)
chr3 (523-682)||(25944468-25944630)
chr3 (522-681)||(53996563-53996725)
chr3 (556-679)||(14986989-14987116)
chr3 (499-682)||(12525385-12525567)
chr3 (539-683)||(54374341-54374488)
chr3 (526-657)||(30928169-30928302)
chr3 (535-663)||(33926094-33926224)
chr3 (567-683)||(49013469-49013589)
chr3 (496-680)||(25517169-25517358)
chr3 (511-667)||(45948850-45949010)
chr3 (522-667)||(19731000-19731147)
chr3 (520-678)||(33235526-33235687)
chr3 (604-683)||(24577917-24577996)
chr3 (570-684)||(45786209-45786327)
chr3 (535-640)||(45139515-45139624)
chr3 (570-644)||(47624088-47624163)
chr3 (586-677)||(353351-353444)
chr3 (535-626)||(54032612-54032705)
chr3 (522-596)||(53062036-53062112)
chr3 (530-657)||(8410889-8411016)
chr3 (604-683)||(24578007-24578086)
chr3 (563-678)||(31904857-31904975)
chr3 (511-589)||(35417904-35417981)
chr3 (526-633)||(39211992-39212101)
chr3 (613-682)||(24851298-24851367)
chr3 (619-680)||(30452892-30452953)
chr3 (522-667)||(19751576-19751723)
chr3 (503-619)||(21874999-21875111)
chr3 (566-679)||(31831241-31831343)
chr3 (556-633)||(55401208-55401288)
chr3 (557-665)||(43114882-43114994)
chr3 (503-589)||(26782345-26782431)
chr3 (555-654)||(9276289-9276395)
chr3 (543-624)||(52428532-52428616)
chr3 (562-683)||(50624949-50625072)
chr3 (499-589)||(11461733-11461826)
chr3 (522-681)||(44403553-44403715)
chr3 (680-803)||(50295443-50295566)
chr3 (510-667)||(829454-829612)
chr3 (637-682)||(6242282-6242327)
chr3 (500-589)||(43956552-43956640)
chr3 (499-539)||(9276249-9276289)
chr3 (521-589)||(9627712-9627780)
chr3 (500-544)||(39430465-39430509)
chr3 (524-643)||(1121260-1121382)
chr3 (563-670)||(31672732-31672842)
chr3 (833-902)||(42530741-42530812)
chr3 (631-682)||(47624208-47624259)
chr3 (522-619)||(28904941-28905041)
chr3 (646-683)||(4495672-4495709)
chr3 (503-540)||(23871418-23871455)
[»] chr2 (76 HSPs)
chr2 (499-680)||(21779260-21779441)
chr2 (499-679)||(23397719-23397899)
chr2 (500-680)||(8455315-8455497)
chr2 (500-680)||(9671134-9671315)
chr2 (496-679)||(14530268-14530455)
chr2 (501-679)||(10543653-10543835)
chr2 (503-682)||(25249735-25249915)
chr2 (502-680)||(11514392-11514571)
chr2 (500-643)||(12023955-12024099)
chr2 (501-680)||(24200622-24200805)
chr2 (502-683)||(19977710-19977893)
chr2 (537-682)||(14444720-14444866)
chr2 (498-679)||(25079717-25079901)
chr2 (499-644)||(22371010-22371154)
chr2 (500-682)||(7214488-7214674)
chr2 (506-681)||(27573581-27573757)
chr2 (537-682)||(10546153-10546301)
chr2 (517-684)||(17667973-17668142)
chr2 (501-679)||(14544018-14544201)
chr2 (523-663)||(99281-99421)
chr2 (502-681)||(17896215-17896397)
chr2 (501-670)||(32781298-32781467)
chr2 (500-680)||(5840982-5841166)
chr2 (517-684)||(17623535-17623704)
chr2 (562-682)||(36871509-36871629)
chr2 (512-680)||(39914305-39914475)
chr2 (511-682)||(24859985-24860156)
chr2 (522-657)||(21377095-21377232)
chr2 (524-634)||(5450263-5450376)
chr2 (500-616)||(17705449-17705567)
chr2 (500-681)||(26684618-26684803)
chr2 (522-657)||(33795261-33795398)
chr2 (561-682)||(30826052-30826173)
chr2 (511-680)||(44643488-44643659)
chr2 (521-679)||(40416871-40417031)
chr2 (531-682)||(25641487-25641639)
chr2 (524-681)||(31158437-31158598)
chr2 (511-676)||(4516354-4516520)
chr2 (684-780)||(1173669-1173765)
chr2 (526-657)||(17380259-17380391)
chr2 (566-679)||(40762234-40762349)
chr2 (522-641)||(23145736-23145857)
chr2 (522-641)||(23557526-23557647)
chr2 (518-599)||(44604826-44604908)
chr2 (523-683)||(45235813-45235976)
chr2 (555-682)||(15296403-15296533)
chr2 (535-668)||(19614981-19615117)
chr2 (522-657)||(44521395-44521532)
chr2 (586-679)||(25632551-25632644)
chr2 (498-546)||(39189556-39189604)
chr2 (522-589)||(29419981-29420048)
chr2 (500-549)||(27466262-27466311)
chr2 (557-678)||(13245096-13245210)
chr2 (556-667)||(17471558-17471673)
chr2 (561-657)||(30864439-30864536)
chr2 (619-680)||(34080176-34080237)
chr2 (540-623)||(2003592-2003678)
chr2 (586-666)||(24890453-24890533)
chr2 (531-667)||(31821355-31821491)
chr2 (618-678)||(40579750-40579810)
chr2 (618-682)||(41409936-41410000)
chr2 (613-687)||(4794871-4794945)
chr2 (511-577)||(35017783-35017849)
chr2 (628-682)||(39189501-39189555)
chr2 (609-666)||(31523296-31523353)
chr2 (501-589)||(17472926-17473014)
chr2 (616-680)||(23488555-23488619)
chr2 (619-683)||(34766330-34766394)
chr2 (693-780)||(38584256-38584344)
chr2 (628-679)||(8575979-8576030)
chr2 (709-768)||(8986123-8986182)
chr2 (609-676)||(31525771-31525838)
chr2 (602-669)||(39499240-39499307)
chr2 (820-896)||(8986208-8986286)
chr2 (631-680)||(22371199-22371248)
chr2 (523-584)||(34752759-34752820)
[»] chr5 (63 HSPs)
chr5 (500-682)||(35710267-35710449)
chr5 (499-680)||(41014272-41014454)
chr5 (500-681)||(8169982-8170163)
chr5 (533-680)||(32703411-32703558)
chr5 (499-680)||(38879534-38879719)
chr5 (500-682)||(24448844-24449028)
chr5 (503-680)||(4619103-4619284)
chr5 (503-681)||(43334159-43334341)
chr5 (500-679)||(1565385-1565566)
chr5 (497-609)||(37024626-37024738)
chr5 (561-676)||(7368413-7368528)
chr5 (498-679)||(22187237-22187422)
chr5 (498-657)||(22600406-22600567)
chr5 (503-680)||(22861668-22861844)
chr5 (503-657)||(27328709-27328867)
chr5 (501-656)||(2838733-2838890)
chr5 (680-864)||(11335394-11335572)
chr5 (503-678)||(12006329-12006508)
chr5 (555-679)||(13801767-13801895)
chr5 (522-680)||(28516432-28516593)
chr5 (511-682)||(19142940-19143111)
chr5 (497-589)||(23974732-23974823)
chr5 (585-679)||(34154814-34154908)
chr5 (529-683)||(1405170-1405326)
chr5 (557-667)||(43574617-43574729)
chr5 (524-657)||(24323727-24323862)
chr5 (524-657)||(24360351-24360486)
chr5 (506-675)||(30006285-30006456)
chr5 (522-667)||(208939-209086)
chr5 (570-679)||(7097760-7097870)
chr5 (604-680)||(16957374-16957450)
chr5 (571-679)||(16880647-16880757)
chr5 (565-678)||(20135623-20135740)
chr5 (511-642)||(39301089-39301222)
chr5 (530-667)||(1850624-1850762)
chr5 (505-618)||(31299591-31299705)
chr5 (503-576)||(17419871-17419944)
chr5 (620-682)||(16028621-16028683)
chr5 (531-639)||(22907904-22908014)
chr5 (586-667)||(9794390-9794471)
chr5 (586-680)||(3771381-3771475)
chr5 (566-680)||(29334415-29334532)
chr5 (538-667)||(42924842-42924977)
chr5 (554-639)||(41425956-41426043)
chr5 (620-679)||(30877564-30877623)
chr5 (689-811)||(9511703-9511825)
chr5 (526-657)||(34074584-34074717)
chr5 (500-549)||(19438703-19438752)
chr5 (637-678)||(19438759-19438800)
chr5 (511-572)||(39079875-39079935)
chr5 (541-589)||(22025538-22025586)
chr5 (628-680)||(32354211-32354263)
chr5 (561-679)||(5873322-5873441)
chr5 (709-780)||(24136719-24136790)
chr5 (499-538)||(41956885-41956924)
chr5 (511-589)||(10634238-10634315)
chr5 (617-679)||(25622533-25622595)
chr5 (564-679)||(12575660-12575779)
chr5 (606-667)||(13774927-13774988)
chr5 (619-680)||(39801591-39801652)
chr5 (616-668)||(4654426-4654478)
chr5 (798-893)||(9511742-9511845)
chr5 (609-682)||(10943842-10943914)
[»] scaffold0187 (4 HSPs)
scaffold0187 (503-677)||(10052-10226)
scaffold0187 (503-677)||(20380-20554)
scaffold0187 (497-565)||(8896-8964)
scaffold0187 (497-565)||(19224-19292)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (511-679)||(11097-11264)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (502-681)||(13022-13202)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (505-679)||(58936-59114)
[»] scaffold0057 (5 HSPs)
scaffold0057 (499-682)||(24769-24949)
scaffold0057 (511-682)||(46796-46969)
scaffold0057 (559-680)||(43672-43794)
scaffold0057 (616-684)||(46702-46770)
scaffold0057 (523-569)||(46995-47041)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (555-680)||(48633-48758)
[»] scaffold1176 (1 HSPs)
scaffold1176 (515-675)||(1591-1751)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (511-680)||(10775-10946)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (499-626)||(226458-226588)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (500-626)||(35070-35200)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (514-648)||(4125-4264)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (592-682)||(24130-24220)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (511-679)||(72867-73031)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (499-574)||(83828-83903)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (514-626)||(43097-43209)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (511-657)||(23569-23712)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (501-682)||(24619-24786)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (520-589)||(8865-8934)
[»] scaffold0954 (1 HSPs)
scaffold0954 (562-667)||(3560-3667)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (609-679)||(58630-58699)
[»] scaffold0867 (1 HSPs)
scaffold0867 (602-663)||(3685-3746)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 143; Significance: 1e-74; HSPs: 61)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 500 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 12670429 - 12670247
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 599  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12670429 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 12670330  T
Q  600 ccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  12670329 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttaccctttttt 12670247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 498 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 30454278 - 30454094
Alignment:
Q  498 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30454278 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacaaggtaa 30454179  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30454178 ggctgcgtacgatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttttt 30454094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 495 - 680
Target Start/End: Original strand, 36720745 - 36720932
Alignment:
Q  495 agtttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacag 592  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36720745 agtttgaggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacag 36720844  T
Q  593 ggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  36720845 ggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcacccggttgccctttt 36720932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 499 - 679
Target Start/End: Original strand, 2626472 - 2626657
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-----aaaacagg 593  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  2626472 tgaggggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaacagg 2626571  T
Q  594 gtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  2626572 gtaagactgcgtacaatacaccaaatgatgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagcttcagtgcaccagattgcccttt 2626657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 497 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 28817810 - 28817624
Alignment:
Q  497 tttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacaggg 594  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  28817810 tttgaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaggg 28817711  T
Q  595 taagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  28817710 taaggctgcgtacaatacacccaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcccttttt 28817624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 500 - 683
Target Start/End: Original strand, 35261633 - 35261818
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  35261633 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagccctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 35261732  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 683  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  35261733 ggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttta 35261818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 499 - 679
Target Start/End: Original strand, 13160655 - 13160836
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 597  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13160655 tgaggggtaacctcggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaa 13160754  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||| || |||||||||||    
T  13160755 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcgccgggttgcccttt 13160836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 497 - 679
Target Start/End: Original strand, 17823527 - 17823711
Alignment:
Q  497 tttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--caggg 594  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  17823527 tttgaggggtaatcttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaccagga 17823626  T
Q  595 taagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  17823627 taagactgcgtaaaatacaccaaatggtggaaccccttcccgaaccctgcatatgcaggagctttagtgcaccgggttgcccttt 17823711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 499 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 39461178 - 39460993
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 596  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  39461178 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgagactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagta 39461079  T
Q  597 agaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    || | |||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  39461078 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgagaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 39460993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 500 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 29521866 - 29521685
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  29521866 gaggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcgtgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtttaaaaaacagggtaa 29521767  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  29521766 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaacccatcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgctcttt 29521685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 500 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 7136710 - 7136524
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaa 597  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  7136710 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaccagggtaa 7136611  T
Q  598 gaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  7136610 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttaccctttttt 7136524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 500 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 20869677 - 20869523
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 599  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20869677 gagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 20869578  T
Q  600 ccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagc 656  Q
    | | ||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  20869577 ctgtgtacaatacaccaa--ggtgagaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc 20869523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 500 - 680
Target Start/End: Original strand, 44530103 - 44530285
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  44530103 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgctgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 44530202  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  44530203 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgacctttt 44530285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 500 - 678
Target Start/End: Original strand, 45071219 - 45071398
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 598  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45071219 gaggggtaaccttggcgatactggtaaagttgttgtcatgtgattgtaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 45071318  T
Q  599 accgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 678  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  45071319 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccctt 45071398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 499 - 682
Target Start/End: Original strand, 6760776 - 6760962
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 596  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6760776 tgaggggtaactt-ggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 6760874  T
Q  597 agaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    || |  ||||||||||||||  |||||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6760875 aggcttcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttctcggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 6760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 500 - 680
Target Start/End: Original strand, 26954086 - 26954271
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggta 596  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  26954086 gaggggtaactttggcgtaattggtaaagttgttgtcatgtgattagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggta 26954185  T
Q  597 agaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    || | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  26954186 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacctcgcatatgcgggagctttagtgcactgggttgccctttt 26954271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 498 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 18164942 - 18164758
Alignment:
Q  498 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggta 596  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18164942 ttgaggggtaatcttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggta 18164843  T
Q  597 agaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    ||   ||||||||||||||||| | || || |  ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  18164842 aggttgcgtacaatacaccaaaggatgtgaccatttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccattttt 18164758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 512 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 8897933 - 8897761
Alignment:
Q  512 tggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaagaccgcgtacaa 609  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||| |  |||||||    
T  8897933 tggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgacagcaaggtcacgggttgaagtcctggaaacaaccgcttgtgtaaaaaatagggtaaggctacgtacaa 8897834  T
Q  610 tacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  8897833 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttactgcacccggttgccctttttt 8897761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 515 - 680
Target Start/End: Original strand, 12625858 - 12626026
Alignment:
Q  515 cgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaagaccgcgtacaata 611  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||    
T  12625858 cgcaactggtaaagttgttgtcgtgtgacttgtaggtcacgggctcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactgcatacaata 12625957  T
Q  612 caccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12625958 caccaaatggtgggaccccctcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 12626026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 504 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 20284250 - 20284075
Alignment:
Q  504 ggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt----aaaacagggtaaga 599  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||||||||     
T  20284250 ggtaaccttgacgcaacgggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaagggtaagg 20284151  T
Q  600 ccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttg 673  Q
    | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  20284150 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccgggttg 20284075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 504 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 21070879 - 21070703
Alignment:
Q  504 ggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-----aaaacagggtaag 598  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |     |||| ||||||||    
T  21070879 ggtaaccttgacgcaacgggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaaagggtaag 21070780  T
Q  599 accgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttg 673  Q
     | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  21070779 gctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccgggttg 21070703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 499 - 681
Target Start/End: Original strand, 25250475 - 25250661
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 596  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||    
T  25250475 tgagaggtaaccttggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacatgttcaagtcctggaaacagcctattgtgtaaaaaatagggta 25250574  T
Q  597 agaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
     | | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  25250575 tggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccccgcatatgcgggagatttagtgcaccgggttgcccttttt 25250661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 528 - 680
Target Start/End: Original strand, 31457155 - 31457308
Alignment:
Q  528 gttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtggga 626  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||  ||| | |||||||||||| |||||||| |||    
T  31457155 gttgttgtcatgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctgtaaacaacctcttgtgtaaaaataggaaaaggctgcgtacaatacatcaaatggtagga 31457254  T
Q  627 tcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
     ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31457255 ccccttcccaaaccctgcgtatgcgggagctctagtgcaccggattgccctttt 31457308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 511 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 44781675 - 44781517
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| | | |||||    
T  44781675 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaagttcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgtgtaca 44781577  T
Q  609 atacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcac 666  Q
    |||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  44781576 atacaccaaaaatgttgggaccccgtcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 44781517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 511 - 679
Target Start/End: Original strand, 28407381 - 28407538
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaa 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||               
T  28407381 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag----------- 28407469  T
Q  610 tacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
      ||||||||||||||| |||||||| ||||||   |||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  28407470 -gcaccaaatggtgggaccccttcccggaccctacgtatgcgggagctttactgcaccgggttgcccttt 28407538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 500 - 657
Target Start/End: Original strand, 24245405 - 24245562
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 599  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||| |||  ||||||||||||    
T  24245405 gaggggtaaccttggggcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaac-gtctcttatgt--aacagggtaaga 24245501  T
Q  600 ccgcgtacaatacacc---aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    |  |||||||| ||||   |||| |||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||    
T  24245502 ctacgtacaatgcaccaaaaaattgtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagct 24245562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 523 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 24365218 - 24365081
Alignment:
Q  523 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaat 619  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  24365218 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaatgtcacgggttcaagccctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatcagggtaaggctgcgaacaatacaccaaat 24365119  T
Q  620 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    ||||||| |||||||| |||||||  |||| |||||||    
T  24365118 ggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagct 24365081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 501 - 611
Target Start/End: Original strand, 11748254 - 11748366
Alignment:
Q  501 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaag 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  11748254 aggggtaactttggtgcaactggtgaaattgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttttgtaaaaagcagggtaag 11748353  T
Q  599 accgcgtacaata 611  Q
    || ||||||||||    
T  11748354 acagcgtacaata 11748366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 567 - 680
Target Start/End: Original strand, 19729363 - 19729476
Alignment:
Q  567 tggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcac 666  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19729363 tggaaacagtctcttatgtaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatacgggagctctagtgcac 19729462  T
Q  667 caggttgccctttt 680  Q
      | ||||||||||    
T  19729463 tggattgccctttt 19729476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 563 - 677
Target Start/End: Original strand, 29877111 - 29877227
Alignment:
Q  563 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctcta 660  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||  ||    
T  29877111 gtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcgtta 29877210  T
Q  661 gtgcaccaggttgccct 677  Q
    |||||||||| ||||||    
T  29877211 gtgcaccaggctgccct 29877227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 554 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 5135416 - 5135288
Alignment:
Q  554 cgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcg 651  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||     
T  5135416 cgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaagagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgca 5135317  T
Q  652 ggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    |||||| | ||||||| || ||||||||||    
T  5135316 ggagct-ttgtgcaccgggctgcccttttt 5135288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 564 - 682
Target Start/End: Original strand, 20869941 - 20870063
Alignment:
Q  564 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct 659  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||| | ||||||||||||| |    
T  20869941 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttccaggaccccgcatatgcgggagcttt 20870040  T
Q  660 agtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  20870041 agtgcaccgggttgccctttttt 20870063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 499 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 40605087 - 40604905
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggta 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||  ||||||||||| ||||||||  || |||||||||| |  || ||    
T  40605087 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggatgattatgggttcaagtcatggaaacaatcttttgtgtaaaaaattggata 40604988  T
Q  597 agaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||   ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | |||||   |||||||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  40604987 aggttgcgtacaatacactaaatgat-ggatcccttccgaaaccctacgtatgcgggagctttagtgcaccgaattgccctttt 40604905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 555 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 8484064 - 8483950
Alignment:
Q  555 gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgg 652  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||||||    
T  8484064 gggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggcaaggctgcgtacaatacaccaattggtgggaccccatcccagaccctgcgtatgcgg 8483965  T
Q  653 gagctctagtgcacc 667  Q
    ||||| ||| |||||    
T  8483964 gagctttagggcacc 8483950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 511 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 42083868 - 42083712
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaagaccgcgtaca 608  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| ||| | |||||||    
T  42083868 ttggcgcaac-ggtaaaattgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatggggcaaggctgcgtaca 42083770  T
Q  609 atacacc-aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgca 665  Q
     || ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || | ||||||| |||||||    
T  42083769 gtataccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgtgtacgtgggagctttagtgca 42083712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 545 - 667
Target Start/End: Original strand, 389642 - 389768
Alignment:
Q  545 gaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt----aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagacc 640  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  389642 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaccctcttgtgtcaaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatgatgggatccctttcctgacc 389741  T
Q  641 ctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
    |||  |||||| ||||| |||||||||    
T  389742 ctgcgtatgcgagagctttagtgcacc 389768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 572 - 679
Target Start/End: Original strand, 16225045 - 16225156
Alignment:
Q  572 acagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  16225045 acagcctcttatgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaataatggtgggatcccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 16225144  T
Q  668 aggttgcccttt 679  Q
     ||||| |||||    
T  16225145 gggttgtccttt 16225156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 605 - 682
Target Start/End: Original strand, 26102578 - 26102655
Alignment:
Q  605 tacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26102578 tacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcttatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttttt 26102655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 522 - 670
Target Start/End: Original strand, 22598133 - 22598282
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaat 619  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |   |||||||||||||| |    
T  22598133 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgggttcaaatcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctatgtacaatacaccaatt 22598232  T
Q  620 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccagg 670  Q
    |||| || || ||||| |||| ||  ||||||||| || ||||||||||||    
T  22598233 ggtgagaccctttcccggaccttgcgtatgcggga-ctttagtgcaccagg 22598282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 511 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 14018138 - 14017990
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  14018138 ttggcgcaac-ggtaatgttgttgtcacgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtgagactgcgtaca 14018040  T
Q  609 atacaccaaa-tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    |||||| ||| |||||||| | |||||  ||||||| | |||||| ||||    
T  14018039 atacactaaattggtgggaccacttcctggaccctgcagatgcggtagct 14017990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 532 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 23000365 - 23000263
Alignment:
Q  532 ttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatccc 630  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    | |||||||||||||||||||||| |||    
T  23000365 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggt--aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacacggtaaggttccatacaatacaccaaatggtgggacccc 23000268  T
Q  631 ttccc 635  Q
    |||||    
T  23000267 ttccc 23000263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 525 - 626
Target Start/End: Original strand, 35105902 - 35106006
Alignment:
Q  525 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagaccgcgtacaatacacca-aatgg 621  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | || ||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  35105902 aaagttgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagagagtgtaaggctgcgtacaatacaccagaatgg 35106001  T
Q  622 tggga 626  Q
    |||||    
T  35106002 tggga 35106006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 522 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 11001109 - 11000971
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa 618  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||| ||||| |||  |||||||||   || | |||| | | |||||||||||||||    
T  11001109 ggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcgcgggttcaaattctgaaaacaacctactgtgtaaaaaaacaagataaggctgtgtacaatacaccaaa 11001010  T
Q  619 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    |||||||| |||| |||  ||||||| ||||| ||||||    
T  11001009 tggtgggacccctacccgaaccctgtttatgcaggagct 11000971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 555 - 667
Target Start/End: Original strand, 5689640 - 5689754
Alignment:
Q  555 gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgg 652  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||  |||| ||    
T  5689640 gggttcaagtcttgtaaatagcctcttgtgtaaaaagcagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggaaccccttcccgaaccatgcgtatgtgg 5689739  T
Q  653 gagctctagtgcacc 667  Q
    ||||| |||||||||    
T  5689740 gagctttagtgcacc 5689754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 563 - 681
Target Start/End: Original strand, 10857845 - 10857966
Alignment:
Q  563 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct 659  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| | |||||  |||| ||  |||||||||||| |    
T  10857845 gtccaggaaaccgcctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgcacaatacaccaattggtgggaccacttcctggaccttgcgtatgcgggagcttt 10857944  T
Q  660 agtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  10857945 agtgcaccgggttgcccttttt 10857966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 511 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 30962942 - 30962865
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30962942 ttggcgcaac-ggaaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgacttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 30962865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 572 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 23286432 - 23286378
Alignment:
Q  572 acagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtggga 626  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  23286432 acagcctcttgtgtaaaacagggtaaagctgcgtacaatacaccaaatggtggga 23286378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 557 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 17251001 - 17250888
Alignment:
Q  557 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgg 652  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||||||||||  |||||||||| || |||||  ||||||  ||||  |    
T  17251001 gttcaagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacaggttaaggcagcgtacaatacaccaataatggtgggaccctttcccgaaccctgcgtatgaag 17250902  T
Q  653 gagctctagtgcac 666  Q
    ||||| ||||||||    
T  17250901 gagctttagtgcac 17250888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 602 - 681
Target Start/End: Original strand, 16013512 - 16013593
Alignment:
Q  602 gcgtacaatacaccaaa--tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    ||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  16013512 gcgtacaatacactaaaaatggtgcgaccccttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccgggttgtccttttt 16013593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 696 - 780
Target Start/End: Original strand, 20241863 - 20241947
Alignment:
Q  696 ttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaattggtttgtttgtttggttggt 780  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  20241863 ttgatttagttttgtttggttcaatttgtttggttgttgggtgagtcaaaatagtgctcacaattagtttgttcgtttgtttggt 20241947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 696 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 20251204 - 20251120
Alignment:
Q  696 ttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaattggtttgtttgtttggttggt 780  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  20251204 ttgatttagttttgtttggttcaatttgtttggttgttgggtgagtcaaaatagtgctcacaattagtttgttcgtttgtttggt 20251120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 499 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 23286475 - 23286431
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 543  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23286475 tgaggggtaaccttgtcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 23286431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 35107374 - 35107310
Alignment:
Q  616 aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  35107374 aaatggtgggaccccttcccggacgctgtgtatgcggaagctttagtgcaccgggttgccctttt 35107310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 524 - 681
Target Start/End: Original strand, 36918102 - 36918261
Alignment:
Q  524 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatgg 621  Q
    |||| ||||||| |||  ||||||||||  |  |||||||| |||||||||   |||| |||||||  ||||||||| | | |||||||||||||||| |    
T  36918102 taaaattgttgttatggaactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaacaatttcttatgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatag 36918201  T
Q  622 tgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    | |||| |||||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||  |||||| |||||||    
T  36918202 taggattccttcccaaaccctatgtatgcgagagctttaatgcaaaaggttgtccttttt 36918261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 44742698 - 44742564
Alignment:
Q  501 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaag 598  Q
    ||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||  |||| || |||||   | |||||||| |||||||||  ||| |||||||||  |||||||||    
T  44742698 agggggaaccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcgcgtgattgtaaggtcatgagttcaagttctggaaacaatctcctgtgtaaaaaacagggtaag 44742600  T
Q  599 accgcgtacaatacacc-aaatggtgggatcccttc 633  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  44742599 gctgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttc 44742564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 570 - 639
Target Start/End: Original strand, 43942348 - 43942421
Alignment:
Q  570 aaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagac 639  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  43942348 aaacagcctcttatgtcaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagac 43942421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 630 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 27468141 - 27468089
Alignment:
Q  630 cttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  27468141 cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 27468089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 637 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 23286379 - 23286337
Alignment:
Q  637 gaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23286379 gaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgcccttt 23286337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 835 - 902
Target Start/End: Original strand, 20242063 - 20242132
Alignment:
Q  835 gtttggtgggtcgagtgctcacactttgg-tgttt-gtgagtaagtgctcacaatttggtttctcctccc 902  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  20242063 gtttggtgagtcgagttctcacactttggttgtttggtgagcgtgtgctcacaatttggtttcttctccc 20242132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 835 - 902
Target Start/End: Complemental strand, 20251004 - 20250935
Alignment:
Q  835 gtttggtgggtcgagtgctcacactttggt-gtttg-tgagtaagtgctcacaatttggtttctcctccc 902  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  20251004 gtttggtgagtcgagttctcacactttggttgtttggtgagcgtgtgctcacaatttggtttcttctccc 20250935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 500 - 537
Target Start/End: Original strand, 42840863 - 42840900
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtca 537  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42840863 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtca 42840900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 143; Significance: 1e-74; HSPs: 50)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 500 - 682
Target Start/End: Original strand, 1346918 - 1347100
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 599  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  1346918 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccacttgtgtaaaacagggtaagg 1347017  T
Q  600 ccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1347018 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttttt 1347100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 500 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 1354936 - 1354756
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 599  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1354936 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 1354837  T
Q  600 ccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1354836 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 1354756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 499 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 29356040 - 29355853
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaag-ttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta--aaacagggt 595  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29356040 tgaggggtaaccttggcacaactggtaaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagggt 29355941  T
Q  596 aagaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    ||| | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  29355940 aaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 29355853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 511 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 12222087 - 12221913
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  12222087 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtaca 12221988  T
Q  609 atacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagc-tctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  12221987 atacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgccctttt 12221913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 499 - 682
Target Start/End: Original strand, 9161076 - 9161262
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 597  Q
    ||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9161076 tgaggggtaaccttgacgcaatcggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagagtaa 9161175  T
Q  598 gaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | | |||||||||||| ||  |||||||||| |||||| | |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9161176 ggctgcgtacaatacatcaataatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcaccaggttgccctttttt 9161262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 514 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 2166579 - 2166406
Alignment:
Q  514 gcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagaccgcgtacaata 611  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||    
T  2166579 gcgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttgcgtacaata 2166480  T
Q  612 cacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 683  Q
    |||||  |||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2166479 caccaataatggtgggaccccttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttta 2166406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 514 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 2178212 - 2178039
Alignment:
Q  514 gcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagaccgcgtacaata 611  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||    
T  2178212 gcgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttgcgtacaata 2178113  T
Q  612 cacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 683  Q
    |||||  |||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2178112 caccaataatggtgggaccccttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttta 2178039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 564 - 681
Target Start/End: Original strand, 26097178 - 26097295
Alignment:
Q  564 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtg 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26097178 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgaagggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 26097277  T
Q  664 caccaggttgcccttttt 681  Q
    |||| |||||||||||||    
T  26097278 caccgggttgcccttttt 26097295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 502 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 3815256 - 3815084
Alignment:
Q  502 ggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaga 599  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| | |||| ||    
T  3815256 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaacagactattgtgtaaaaaatatggtacga 3815157  T
Q  600 ccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggtt 672  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||   ||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  3815156 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccctttcccgaaccctacgtatgcggaagctttagtgcaccgggtt 3815084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 564 - 681
Target Start/End: Original strand, 25557743 - 25557860
Alignment:
Q  564 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtg 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  || | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  25557743 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgaaggaaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 25557842  T
Q  664 caccaggttgcccttttt 681  Q
    |||| |||||||||||||    
T  25557843 caccgggttgcccttttt 25557860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 500 - 682
Target Start/End: Original strand, 1941809 - 1941993
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| || ||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  1941809 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatctgactggaaggtcgcggattgaagtcatgtaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 1941908  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | | |||||||||||||| |||||||||| ||| |||  || | ||| |||||||||| | | |||||||  |||||||||||||    
T  1941909 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccatcctggatcttgtgtatgcgggagtttttgtgcaccgtgttgccctttttt 1941993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 612
Target Start/End: Original strand, 8409196 - 8409311
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 596  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  8409196 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctggaaactgcctcttgtgtaaaaaacagggta 8409295  T
Q  597 agaccgcgtacaatac 612  Q
    || | |||||||||||    
T  8409296 aggctgcgtacaatac 8409311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 524 - 680
Target Start/End: Original strand, 28007604 - 28007761
Alignment:
Q  524 taaagttgttgtcatgtgac-tgaaa-ggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatgg 621  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||     
T  28007604 taaagttgttgtcatgtgacatgaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaagagcctcttgtgtaaaacagggtcaggctgcgtacaatacaccaaatgc 28007703  T
Q  622 tgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||||| ||||||||  | |||  |||||||| |||||||||||||| | || |||||||    
T  28007704 tgggaccccttccc-taacctccatatgcggaagctctagtgcaccggattaccctttt 28007761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 500 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 15866218 - 15866052
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctctt--gtgtaaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||    
T  15866218 gaggggtaaccttggcccaactggtaaagttgttggcatgtgattgaaaggtcatgggttcaattcctggaaacagcctcttaagtaaaaaacagggtaa 15866119  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcac 666  Q
      | ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||||| || ||||||||    
T  15866118 agctgcgt--aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtttgcgggatctatagtgcac 15866052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 500 - 617
Target Start/End: Original strand, 6024187 - 6024306
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  6024187 gaggggtaattttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacggtttcaaatcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaa 6024286  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaa 617  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  6024287 gactgcgtacaatacaccaa 6024306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 499 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 14975262 - 14975172
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14975262 tgagggataaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 14975172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 556 - 672
Target Start/End: Original strand, 32579436 - 32579553
Alignment:
Q  556 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcggga 654  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||  | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32579436 ggttcaagtcctggaaacagcctctggtataaaaatacggtaagcctgcgtacaataccccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcatatgcggga 32579535  T
Q  655 gctctagtgcaccaggtt 672  Q
    ||| |||| | |||||||    
T  32579536 gctttagtactccaggtt 32579553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 511 - 657
Target Start/End: Original strand, 14553477 - 14553626
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||||||| | | ||| |    
T  14553477 ttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgact-aaaggtcacaggttcaagtcctggaaatagcttcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtata 14553575  T
Q  609 atacaccaaa--tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  14553576 atacaccaaaactggtgggaccccttcgtagaccctgtgtatgcgggagct 14553626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 501 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 13905158 - 13905034
Alignment:
Q  501 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaag 598  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||||||||    
T  13905158 agggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggctcaagtcctgaaaacgacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 13905060  T
Q  599 accgcgtacaatacaccaaatggtgg 624  Q
     | || |||||| |||||||||||||    
T  13905059 gctgcatacaattcaccaaatggtgg 13905034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 532 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 23240971 - 23240837
Alignment:
Q  532 ttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatccct 631  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  23240971 ttgtcacgtgactgaaaggtcacaggtgcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagtttgcgtacaatataccaattggtgggacccct 23240872  T
Q  632 tcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcac 666  Q
    ||   |||  ||  |||||||||||| ||||||||    
T  23240871 tctaggacaatgcgtatgcgggagctttagtgcac 23240837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 511 - 683
Target Start/End: Original strand, 24097546 - 24097716
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||  || ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||  ||||||||| | || ||||    
T  24097546 ttggcacaactggtaaaattgatgtcatgttactgaaaggtcacgagtttaagtcctcgaaccagcctcttgtataaaaaacagggtaaggctgcttaca 24097645  T
Q  609 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 683  Q
    |    ||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  24097646 a----ccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtgtcccaggttgccctttttta 24097716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 523 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 32728314 - 32728156
Alignment:
Q  523 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatg 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||  |||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||     
T  32728314 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagattcaagttttggaaacaacctcttatgtaaaaaacagggtaagactgtgtacaatataccaaata 32728215  T
Q  621 gtgggatccc-ttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||||  |||| ||||||||||||   ||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  32728214 gtgg--tccctttcccagaccctacgtatgcgggaactttagtgcaccatgttgccctttt 32728156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 554 - 667
Target Start/End: Original strand, 33138841 - 33138956
Alignment:
Q  554 cgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcg 651  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||     
T  33138841 cgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtataaaaaacagagtaaggccgcgtacaatacaccaaatggtgggacccttttccggaccctgtgtatgca 33138940  T
Q  652 ggagctctagtgcacc 667  Q
    | |||| |||||||||    
T  33138941 gtagctttagtgcacc 33138956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 531 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 18277343 - 18277190
Alignment:
Q  531 gttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatc 628  Q
    |||||| ||||||| ||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||   | |||||  |||||||||||||||| |    
T  18277343 gttgtcctgtgactaaaaggtcacgggttcaaatcttggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgagtacagaacaccaaatggtgggacc 18277244  T
Q  629 ccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||| |||| ||   |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  18277243 ccttcctagactctacgtatgcgggagctttactgcaccgggttgtcctttttt 18277190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 504 - 619
Target Start/End: Original strand, 20400625 - 20400742
Alignment:
Q  504 ggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagacc 601  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||     
T  20400625 ggtaaccttggcgcaattggtatagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagttatggaaacaatctcttgtgtaaaaaacagggtaagact 20400724  T
Q  602 gcgtacaatacaccaaat 619  Q
    ||||||| ||||| ||||    
T  20400725 gcgtacagtacactaaat 20400742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 683 - 780
Target Start/End: Original strand, 21861937 - 21862034
Alignment:
Q  683 agtttcgttcagtttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaattggtttgtttgtttggttggt 780  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||   |||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21861937 agtttagttcagtttgatttggtttcgtttggttcaatttatttggtttttgagtgagtcaaaatagttctcacaattggtttgtttgtttgtttggt 21862034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 511 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 7947541 - 7947371
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    |||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||||    
T  7947541 ttggcgcaac-ggtaaagttggtgttgcgtgactgaaaggtcaccggttcaactcctggaaacaacctcctgtgtaaaaaccagggtaaggctgcgtaca 7947443  T
Q  609 atacacc-aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||  |||| ||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  7947442 atacaccaaaatggtgggcccccttcccggaccttgcgtatgtgggagctttagtgcacttggctgcccttt 7947371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 504 - 589
Target Start/End: Original strand, 24734591 - 24734676
Alignment:
Q  504 ggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  24734591 ggtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaaaagttcaaatccttgaaacaacctcttgtgtaaaa 24734676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 503 - 589
Target Start/End: Original strand, 12063424 - 12063510
Alignment:
Q  503 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  12063424 gggtaaccttggtgcaactgataaagttgttatcatgagactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaatagcctcttgtataaaa 12063510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 522 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 2755583 - 2755422
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt--gtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc--aa 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| || ||||| |||||| |    |||| ||| |||| | ||||||||||||||  ||    
T  2755583 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtaggttcaagtcttgcaaacatcctcttataccaaaaataggctaaggctgcgtacaatacaccaaaa 2755484  T
Q  618 atggtgggatcccttcccagaccctgtatat--gcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 678  Q
    |||||||||  |||||||| | |||| ||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2755483 atggtgggagtccttcccaaatcctgcatatgcgcgggagctttagtgcacc-ggttgccctt 2755422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 522 - 679
Target Start/End: Original strand, 12889402 - 12889562
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc-aaa 618  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||  | |||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||| ||| | || ||||||||||| |||    
T  12889402 ggtaaagttgttgtcacgtgagtgaaaggtcacaggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgttaaaaacagggcaaggctgcatacaatacacctaaa 12889501  T
Q  619 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
     | ||||| ||||| || |||||| | | || ||||||| ||||||| | || ||||||||    
T  12889502 cgatgggacccctttccggaccctctgtgtgtgggagctttagtgcatcgggctgcccttt 12889562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 504 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 23930303 - 23930126
Alignment:
Q  504 ggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttc-aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccg 602  Q
    |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| || ||||||  || |||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| |    |     |    
T  23930303 ggtaaccttggcgcaactcataaagatgttgtcatgtgtctcaaaggtcacgagttccaagtcatggaaacagtctcatgtgtaaaaaacaagatagttg 23930204  T
Q  603 cgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  23930203 cgtacaatacaccagatggtgggaccccttcacggaccctgcttatgcgggagctttagtgcaccgagttgccctttt 23930126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 617 - 681
Target Start/End: Original strand, 6808468 - 6808532
Alignment:
Q  617 aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6808468 aatggtgggaccccttcccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 6808532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 682
Target Start/End: Original strand, 12892065 - 12892147
Alignment:
Q  602 gcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12892065 gcgtataatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 12892147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 607 - 681
Target Start/End: Original strand, 13267788 - 13267862
Alignment:
Q  607 caatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  13267788 caatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgcccttttt 13267862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 500 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 33923009 - 33922927
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttg 582  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||||||| |||||  |||||||    
T  33923009 gaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatttgactgaaaagtcacaggttcaagtcctagaaacgtcctcttg 33922927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 383837 - 383760
Alignment:
Q  602 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||    
T  383837 gcgtacaatacaccaaattgtgggaccccttctcagaccctgcgtatgcgggagcttcagtccaccgggttgcccttt 383760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 680
Target Start/End: Original strand, 12885969 - 12886049
Alignment:
Q  602 gcgtacaatacaccaaa--tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12885969 gcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 12886049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 497 - 589
Target Start/End: Original strand, 22967122 - 22967214
Alignment:
Q  497 tttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  22967122 tttgaggggtaaccttcgcgcatctgataaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgtaaaa 22967214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 497 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 23821271 - 23821179
Alignment:
Q  497 tttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  23821271 tttgaggggtaaccttcgcgcatctgataaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgtaaaa 23821179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 516 - 575
Target Start/End: Original strand, 8417442 - 8417501
Alignment:
Q  516 gcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacag 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| ||| |||||||||    
T  8417442 gcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgagttcaggtcatggaaacag 8417501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 518 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 27855601 - 27855530
Alignment:
Q  518 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||| |||||| | ||||||| || |||||||||    
T  27855601 aactggtaaagtttttgtcatgtgactgaaatgtcgcgagtttaagtcccgaaaacagcttcctgtgtaaaa 27855530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 511 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 19649337 - 19649299
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaag 549  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19649337 ttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaag 19649299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 691 - 727
Target Start/End: Original strand, 13167330 - 13167366
Alignment:
Q  691 tcagtttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttg 727  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13167330 tcagtttgatttggtttcgtttggttcaatttgtttg 13167366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 645 - 681
Target Start/End: Original strand, 25997750 - 25997786
Alignment:
Q  645 atatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25997750 atatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 25997786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 538 - 589
Target Start/End: Original strand, 17432332 - 17432383
Alignment:
Q  538 tgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17432332 tgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaa 17432383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 555 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 15865982 - 15865893
Alignment:
Q  555 gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctg 643  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||  | ||||  ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  15865982 gggttcaattcctggaaacagcctcttacgtaaaaaaacagggtaaagctgcgt--aatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctg 15865893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 628 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 20906837 - 20906783
Alignment:
Q  628 cccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||    
T  20906837 cccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgaaccaagttgctctttttt 20906783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 499 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 1916243 - 1916190
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtt 552  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  1916243 tgaggggtaactgtgacgcaactgataaagatgttgtcatataactgaaaggtt 1916190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 680 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 28063853 - 28063812
Alignment:
Q  680 tttagtttcgttcagtttgatttggtttcgtttgattcaatt 721  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28063853 tttaatttggttcagtttgatttggtttcgtttggttcaatt 28063812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 142; Significance: 5e-74; HSPs: 85)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 497 - 682
Target Start/End: Original strand, 32758212 - 32758397
Alignment:
Q  497 tttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggta 596  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32758212 tttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggta 32758311  T
Q  597 agaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32758312 aggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttttt 32758397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 500 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 21172188 - 21172008
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 599  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21172188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 21172089  T
Q  600 ccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21172088 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 21172008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 499 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 48735303 - 48735122
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcct-ggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaa 597  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  48735303 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttggaaacaacctcttgtgtaaaacacggtaa 48735204  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48735203 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 48735122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 511 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 10693241 - 10693073
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaat 610  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  10693241 ttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaagagggtaaggctgcgtacaat 10693142  T
Q  611 acaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10693141 acaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcactgggttgcccttt 10693073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 528 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 42391251 - 42391097
Alignment:
Q  528 gttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggat 627  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  42391251 gttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcttcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggac 42391152  T
Q  628 cccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42391151 cccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttttt 42391097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 499 - 678
Target Start/End: Original strand, 42476826 - 42477005
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 598  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  42476826 tgaggggtaacattggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacggattcaagttctggaaacagtctcttgtgtaaaacaaggtaag 42476925  T
Q  599 accgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 678  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42476926 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctaggctctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 42477005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 520 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 33872070 - 33871914
Alignment:
Q  520 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||    
T  33872070 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaa 33871971  T
Q  619 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcc 675  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33871970 tggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgagagctttagtgcaccaggttgcc 33871914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 500 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 47078034 - 47077852
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 599  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||      
T  47078034 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaatagagtaaag 47077935  T
Q  600 ccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
      ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  47077934 ttgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccaaaccctacatatgcgggagctctagtgcaccggattgccttttttt 47077852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 498 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 2541203 - 2541019
Alignment:
Q  498 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg-aaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--caggg 594  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  2541203 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaggg 2541104  T
Q  595 taagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  2541103 taaggctgcgtactatacaccaaatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtttcccttt 2541019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 500 - 681
Target Start/End: Original strand, 42798623 - 42798806
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |||||    
T  42798623 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaa 42798722  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  42798723 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccctttcccggaccctgcatatgcgggagctatagtgcatcgggttgcccttttt 42798806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 499 - 681
Target Start/End: Original strand, 42805477 - 42805663
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 596  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42805477 tgaggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 42805576  T
Q  597 agaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    || | | |||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42805577 aggctgtgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 42805663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 511 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 19427059 - 19426887
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||    
T  19427059 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaagactgcgtaca 19426960  T
Q  609 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  19426959 atacaccaaatggtggga-cccttctcggaccctgcatatgcgagagcttcagtgcaccgggttgccctttttt 19426887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 513 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 11617756 - 11617589
Alignment:
Q  513 ggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaat 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  11617756 ggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaat 11617657  T
Q  611 acaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 678  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| ||| || ||||||||| ||||||||||    
T  11617656 acaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcaggacctttagtgcaccgggttgccctt 11617589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 499 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 34626389 - 34626205
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaa 597  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   | | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34626389 tgaggggtaaccttagcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggccacagattcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaacagggtaa 34626290  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||    
T  34626289 ggctgcgttcaatacaccaaatggtgggatcccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagttcatcgggttgccctttttt 34626205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 500 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 22699151 - 22698967
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  22699151 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttatgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 22699052  T
Q  598 gaccgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcc-cttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  22699051 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccggaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 22698967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 511 - 681
Target Start/End: Original strand, 27629599 - 27629771
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   ||||| |    
T  27629599 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatttgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtaaa 27629698  T
Q  609 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  27629699 atacaccaaatggtgggaccccttcccgggccctgcatatgcggtagcttcagtgcaccgggttgcccttttt 27629771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 500 - 679
Target Start/End: Original strand, 47716413 - 47716596
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  47716413 gaggggtaaccttggcacaactggaaaagttgttgccatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 47716512  T
Q  598 gaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    | | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  47716513 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttggtgcaccgggttgcccttt 47716596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 499 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 35334996 - 35334818
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 598  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  35334996 tgagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagtctcgtgtaaaaaacagggtaag 35334897  T
Q  599 accgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccct 677  Q
    || | |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||    
T  35334896 actgtgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggtttccct 35334818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 525 - 678
Target Start/End: Original strand, 11741774 - 11741927
Alignment:
Q  525 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgg 624  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11741774 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacagcttctagtgtaaaatagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgg 11741873  T
Q  625 gatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 678  Q
    ||||||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11741874 gatcccttcccggattctgcacatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 11741927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 500 - 682
Target Start/End: Original strand, 43557426 - 43557613
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  43557426 gaggggtaaccttgccgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagtaa 43557525  T
Q  598 gaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagc-tctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | | |||||||||||||||  |||||||||| ||| |||| ||| |||  ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  43557526 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccctcccggactctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgccctttttt 43557613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 500 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 2663112 - 2662948
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 599  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  2663112 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgga--gtcataggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatagggtaagg 2663015  T
Q  600 ccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2663014 ctgcgtacaatacaccaaatggtggga-cccttttcagaccctgcatatgcgggagctctagcgcacc 2662948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 500 - 650
Target Start/End: Original strand, 46354148 - 46354302
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  46354148 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46354247  T
Q  598 gaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgc 650  Q
    | | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  46354248 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgc 46354302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 506 - 680
Target Start/End: Original strand, 40463837 - 40464012
Alignment:
Q  506 taactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcg 604  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | |||    
T  40463837 taaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatagaaacagtctcttgtgtaaaaactgggtaaggctgcg 40463936  T
Q  605 tacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||  ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||    
T  40463937 tataatacaccaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgagttgccctttt 40464012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 543 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 31591245 - 31591108
Alignment:
Q  543 ctgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccct 642  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||| |    
T  31591245 ctgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaacagagtaaggctgcgtacaatacaataaatggtgggaccccttcccggacctt 31591146  T
Q  643 gtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31591145 gcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 31591108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 511 - 682
Target Start/End: Original strand, 19265781 - 19265951
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaa 609  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||||    
T  19265781 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggatacagccgcttgtgtaaaaagagggtaaggctgcgtacaa 19265879  T
Q  610 tacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  19265880 tacaccaaatggtgggaccccttcccgga-cctacatatgtgggagctttagtgcaccgggctgccctttttt 19265951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 511 - 657
Target Start/End: Original strand, 13805068 - 13805214
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca-gggtaagaccgcgtacaa 609  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| | | ||||||    
T  13805068 ttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtaacgggttcaagtcctggaaatagcctctggtgtaaaacaggggtaaggctgtgtacaa 13805166  T
Q  610 tacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  |||||||  ||||||||||||    
T  13805167 tacaccaaatggtgggaccacttcctggaccctgcgtatgcgggagct 13805214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 511 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 23419843 - 23419674
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  23419843 ttggcgcaac-ggtaaagttgctgtcatgtgactaaaaggtcacaggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtaca 23419745  T
Q  609 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | |||||| ||| ||||||| | || ||||||||    
T  23419744 atacaccaaatggtgggaccccttcctagaccttgcgtgtgcgggggctttagtgcatcgggctgcccttt 23419674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 522 - 657
Target Start/End: Original strand, 19266426 - 19266563
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaat 619  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19266426 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtgggttcaagtcctgaaaatagccacttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 19266525  T
Q  620 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
     ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  19266526 tgtgggatcccttcccggaccctgcgtatgcgggagct 19266563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 529 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 32233286 - 32233132
Alignment:
Q  529 ttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggat 627  Q
    |||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  32233286 ttgttgtcacctgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggcagcgtatattacaccaaatggtgggat 32233187  T
Q  628 cccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
     |||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||| || |||||||||||    
T  32233186 tccttcccaaaccctgcatatgagggagcttcagtgcaccgggctgccctttttt 32233132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 511 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 28362314 - 28362167
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||  |||||| | |||||||    
T  28362314 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtggctgaaaggtcacaggttcaagtcctagaaactgcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggctgcgtaca 28362216  T
Q  609 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  28362215 atacaccaaatggtgggaccccttcccagaccttgcatatgtgggagct 28362167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 42496017 - 42495917
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 597  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  42496017 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaacagggtaa 42495918  T
Q  598 g 598  Q
    |    
T  42495917 g 42495917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 554 - 682
Target Start/End: Original strand, 7879646 - 7879776
Alignment:
Q  554 cgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcg 651  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||    
T  7879646 cgggttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcg 7879745  T
Q  652 ggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  7879746 ggagcttcagtgcaccgggttgccctttttt 7879776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 511 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 48123653 - 48123508
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa--aacagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || || ||||    
T  48123653 ttggcgcaac-ggtaaagttgttatcatgtgtctgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacagggtaaaactgcataca 48123555  T
Q  609 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggag 655  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  |||| || |||||||||||    
T  48123554 atacaccaaatggtgggacccctttctggaccatgcatatgcgggag 48123508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 501 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 5180337 - 5180218
Alignment:
Q  501 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaag 598  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  5180337 aggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaacttctggaaacagcctcttgtgtcaaaaacagggtaag 5180238  T
Q  599 accgcgtacaatacaccaaa 618  Q
    || | |||||| ||||||||    
T  5180237 actgtgtacaacacaccaaa 5180218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 522 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 14099165 - 14099050
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaat 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14099165 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacaccaaat 14099066  T
Q  620 ggtgggatcccttccc 635  Q
    ||||||| ||||||||    
T  14099065 ggtgggaccccttccc 14099050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 522 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 14409182 - 14409067
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaat 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14409182 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacaccaaat 14409083  T
Q  620 ggtgggatcccttccc 635  Q
    ||||||| ||||||||    
T  14409082 ggtgggaccccttccc 14409067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 522 - 678
Target Start/End: Original strand, 29907393 - 29907552
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgt--catgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc-a 616  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| || ||||| | |||| ||||||||| |    
T  29907393 ggtaaagttgttgtatcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatagtgtaaggctgcgttcaatacaccaa 29907492  T
Q  617 aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 678  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  29907493 aatggtgggaccccatcccggaccctg--tatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 29907552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 501 - 598
Target Start/End: Original strand, 18326989 - 18327087
Alignment:
Q  501 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 598  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18326989 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttgaaggtcacgggttcaagtcccggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 18327087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 504 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 14732999 - 14732833
Alignment:
Q  504 ggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcct--cttgtgtaaaacagggtaagacc 601  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||  | |||  ||||||||||||| |     
T  14732999 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcccatgtaaaaaacagggtaaggct 14732900  T
Q  602 gcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
    |||| |||||||||  ||||||||  |  |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14732899 gcgt-caatacaccaaaaatggtgaaactccttcccgaaccctgtttatgcgggagctttagtgcacc 14732833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 501 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 8149126 - 8148985
Alignment:
Q  501 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaa 597  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||  || |||||||||||| ||||  ||||||||||   |||| |||||||    
T  8149126 aggggtaaccttggcacaactggtaatgttgttgtcatgtgactgcaaagtcacgagttcaagtcctgaaaactacctcttgtgttaaaaaatagggtaa 8149027  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagac 639  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8149026 ggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccagac 8148985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 521 - 634
Target Start/End: Original strand, 7644931 - 7645047
Alignment:
Q  521 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc-aa 617  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  7644931 tggtaaatttgttgtaacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagatagcgtacaatacaccaaa 7645030  T
Q  618 atggtgggatcccttcc 634  Q
    || |||||| |||||||    
T  7645031 attgtgggaccccttcc 7645047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 545 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 18512588 - 18512455
Alignment:
Q  545 gaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctg 643  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  18512588 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaatagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctg 18512489  T
Q  644 tatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccct 677  Q
      |||||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  18512488 cgtatgcgggagctttggtgcactgggttgccct 18512455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 503 - 682
Target Start/End: Original strand, 25198679 - 25198864
Alignment:
Q  503 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaa---gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggta 596  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||| ||||   ||| ||||||||| || ||||||||||   || ||||    
T  25198679 gggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaagatcatgggatcaaaaagtcttggaaacagtcttttgtgtaaaaaaacaaggta 25198778  T
Q  597 agaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||| | ||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  25198779 agaccgcgtataatgcactaaatggtaggatcccttcccagacccttcgtatgtgagagctttagtgcaccgggttgcactttttt 25198864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 500 - 588
Target Start/End: Original strand, 7193039 - 7193127
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa 588  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7193039 gaggggtaaccttggcgtaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaa 7193127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 532 - 678
Target Start/End: Original strand, 18747472 - 18747621
Alignment:
Q  532 ttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatc 628  Q
    |||||| |||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||| |    
T  18747472 ttgtcacgtgactgaaaggtcacgggatcaagtcttggaaacagccttttgtgtaaaaaagcagggtaaggctgcgtataatacaccaattggtgggacc 18747571  T
Q  629 ccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 678  Q
    ||||||   ||||||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  18747572 ccttcctgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggctgccctt 18747621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 499 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 28078313 - 28078154
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||| |||   ||||||||||||    
T  28078313 tgaggggtaaccctggcgcaactcgtgaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagtctcgtgtaaaaaaacagggtaa 28078214  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    |   || | |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||||| |||||    
T  28078213 ggttgcatgcaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaatcctgcatatgcgagagct 28078154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 499 - 618
Target Start/End: Original strand, 12473257 - 12473378
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 596  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  12473257 tgaggggtagccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtatctgaaaggtcatgggttcaagtcctgcaaacaacctcttgtgtcaaaaacagggta 12473356  T
Q  597 agaccgcgtacaatacaccaaa 618  Q
    ||   |||||||||||||||||    
T  12473357 aggatgcgtacaatacaccaaa 12473378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 511 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 3469348 - 3469176
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa----cagggtaagaccgcgta 606  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||||| ||||||  |||||||||||||    ||||||| |   |||||    
T  3469348 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagactcaagtcctagaaacattctcttgtgtaaaaaaaacagggtacggttgcgta 3469250  T
Q  607 caatacaccaaa--tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 678  Q
    ||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  3469249 caatacaccaaaaatggcgggaccccttcctagaccctgtgtatgcgggagctttagtgcgctgggttgccctt 3469176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 505 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 7794682 - 7794598
Alignment:
Q  505 gtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7794682 gtaaccttagcgcaactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttatgtaaaa 7794598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 512 - 680
Target Start/End: Original strand, 39123857 - 39124031
Alignment:
Q  512 tggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggta----agaccgcgta 606  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||    || | |||||    
T  39123857 tggcgcaa-tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaacgacacgggttcaagtcctagaaacggtctcttgtgtaaaaacagggtagggaaggctgcgta 39123955  T
Q  607 caatacaccaaa--tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
     |||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||  |||| ||||||| | |||||||| | |||||||||    
T  39123956 aaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgagggagctttggtgcaccaagctgccctttt 39124031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 523 - 624
Target Start/End: Original strand, 6736867 - 6736969
Alignment:
Q  523 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatgg 621  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  6736867 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcaaaacaacctcttgtataaaaacaaggtaagactgcatacaatacaccaaatgg 6736966  T
Q  622 tgg 624  Q
    |||    
T  6736967 tgg 6736969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 565 - 657
Target Start/End: Original strand, 38604546 - 38604639
Alignment:
Q  565 cctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  ||||||||||||    
T  38604546 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgagacccctttccggaccctgcgtatgcgggagct 38604639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 537 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 38262340 - 38262193
Alignment:
Q  537 atgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcc 634  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |   |||||    || |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38262340 atgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaatatggtaatgttgcatacaatacaccaaatgatgggaccccttcc 38262241  T
Q  635 cagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |  || |||  |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  38262240 cgaacactgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgccctttttt 38262193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 506 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 1424085 - 1424002
Alignment:
Q  506 taactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  1424085 taactttggcgcaactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacggattcaaatcctggaaacagtctgttgtgtaaaa 1424002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 556 - 667
Target Start/End: Original strand, 21566445 - 21566559
Alignment:
Q  556 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa-tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgg 652  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||    
T  21566445 ggttcaagtcttggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagaggaagactgcgtacaatacaccaaaatggtaggaccccttcccgaaccctgcatatgcgg 21566544  T
Q  653 gagctctagtgcacc 667  Q
    ||||| |||||||||    
T  21566545 gagctttagtgcacc 21566559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 522 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 44123780 - 44123713
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44123780 ggtaaagttggtgtcatgtgactgaaagattacgggttcaagtactggaaacagcctcttgtgtaaaa 44123713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 680 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 11828756 - 11828629
Alignment:
Q  680 tttagtttcgttcagtttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaattggtttgtttgtttggttgg 779  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||| || | ||| ||||||||    |||||| ||||||| ||    
T  11828756 tttagtttggttcagtttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttgattgtaggatgagacaagatagtgctcacaa----tttgttagtttggtggg 11828661  T
Q  780 tctagtgctcacaatttagttgttgggtgagt 811  Q
    || |||||||||||||| |||||  |||||||    
T  11828660 tcaagtgctcacaatttggttgtctggtgagt 11828629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 602 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 27889393 - 27889312
Alignment:
Q  602 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| | || |||| |||||||||||||||    
T  27889393 gcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttggtacaccgggttgccctttttta 27889312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 522 - 678
Target Start/End: Original strand, 16341254 - 16341413
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc-aaa 618  Q
    |||||||||||| ||||||   ||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||    
T  16341254 ggtaaagttgttatcatgtatttgaaaggtcacgggttcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctacgtacaatacaccaaaa 16341353  T
Q  619 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 678  Q
    |||||||  | |||||| ||||    ||||||||||||| | ||||||| || |||||||    
T  16341354 tggtgggccctcttcccggacctatcatatgcgggagctttggtgcaccgggctgccctt 16341413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 571 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 35787378 - 35787268
Alignment:
Q  571 aacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccag 669  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||  | |||||| |    
T  35787378 aacagcctcttgtgtaaaaacatggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggcgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcaatgcaccgg 35787279  T
Q  670 gttgccctttt 680  Q
    |||||||||||    
T  35787278 gttgccctttt 35787268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 688 - 809
Target Start/End: Original strand, 6530526 - 6530647
Alignment:
Q  688 cgttcagtttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaattggtttgtttgtttggttggtctagtgc 787  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  ||||| |||||||| | |||   ||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||     
T  6530526 cgttcagtttgatttggattcgttttgttcaatttgtttgattgttgggtgagtcaagatagtattcacaattggtttgtctgtttggtgagtcaaatgt 6530625  T
Q  788 tcacaatttagttgttgggtga 809  Q
    ||||||||| |||||| |||||    
T  6530626 tcacaatttggttgtttggtga 6530647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 557 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 15108520 - 15108427
Alignment:
Q  557 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatg 649  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||| | | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15108520 gttcaagtcctggaaacagtttcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgtgtacaatacatcaaatagtgggatcccttcccaaaccctgtgtatg 15108427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 500 - 589
Target Start/End: Original strand, 21447544 - 21447633
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||  ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21447544 gaggggtaaccttggcgcaactgataaatttgttgtcatgtaattggaaggtcacggattcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaa 21447633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 558 - 643
Target Start/End: Original strand, 1408469 - 1408556
Alignment:
Q  558 ttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctg 643  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||| | | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  1408469 ttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgtgtacaatacagcaaatggtgggaccccttcccggaccctg 1408556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 544 - 634
Target Start/End: Original strand, 35203437 - 35203531
Alignment:
Q  544 tgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcc 634  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  35203437 tgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacattctcttgtgtaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaaaaatggtgggatcccttcc 35203531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 689 - 811
Target Start/End: Original strand, 21813745 - 21813867
Alignment:
Q  689 gttcagtttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaattggtttgtttgtttggttggtctagtgct 788  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||  | |||||| | ||   |||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||    
T  21813745 gttcggtttgatttggattcggttggttcaatttgtttggttgttaggcgagtcaagatattcctcacaattggtttatttgtttggtgagtcaagtgct 21813844  T
Q  789 cacaatttagttgttgggtgagt 811  Q
    |||| ||| |||||| |||||||    
T  21813845 cacactttggttgtttggtgagt 21813867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 522 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 42102044 - 42101899
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctctt--gtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa- 618  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||| || ||||||| ||| | |||     
T  42102044 ggtaaagttgttgtcacgtgactggaaggtcaaaagttcaagtcctggaaacagcctcttccgtaaaaaacagggtaacactgcgtacagtactctaaag 42101945  T
Q  619 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgc 664  Q
    |||||||| || ||||| |||||||  ||| ||| |||| ||||||    
T  42101944 tggtgggaccctttcccggaccctgcgtatccggcagctttagtgc 42101899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 667
Target Start/End: Original strand, 23231573 - 23231680
Alignment:
Q  562 agtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct 659  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | | |||||| | ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||  ||||||  ||||||| |||| |    
T  23231573 agtcctggaaagagcctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccgaatgatgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggcagcttt 23231672  T
Q  660 agtgcacc 667  Q
    ||||||||    
T  23231673 agtgcacc 23231680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 29140530 - 29140490
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggt 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29140530 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggt 29140490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 696 - 780
Target Start/End: Original strand, 44338186 - 44338270
Alignment:
Q  696 ttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaattggtttgtttgtttggttggt 780  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  44338186 ttgatttagttttgtttggttcaatttgtttggttgttgggtgagtcaaaatagtgctcacaattagtttgttcgtttgtttggt 44338270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 619 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 45018983 - 45018923
Alignment:
Q  619 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    |||||| | |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45018983 tggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 45018923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 587 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 39093532 - 39093437
Alignment:
Q  587 aaacagggtaagaccgcgtacaatacacca-aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| || | || |||||| | |||| ||||||||| || ||||||||||    
T  39093532 aaacagggtaagactgtgtacaatacaccataatagtgggaacccttcccggaacttgcatatgcagaagctttagtgcaccgggctgcccttttt 39093437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 616 - 683
Target Start/End: Original strand, 45811919 - 45811985
Alignment:
Q  616 aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 683  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  45811919 aaatggtgggatccctttccagaccctgcttatgcaggagctttagtgca-cgggttgccctttttta 45811985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 567 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 23619088 - 23618975
Alignment:
Q  567 tggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcac 666  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| |||||   | |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||  | ||| |||||| |||||||     
T  23619088 tggaaacaacctct-gtataaaacagagtaagcttgtgtacaatacatcaaatggtgggaccccttcgcagaccttgcgtttgcaggagctttagtgcag 23618990  T
Q  667 caggttgcccttttt 681  Q
    | |||||||||||||    
T  23618989 cgggttgcccttttt 23618975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 632 - 682
Target Start/End: Original strand, 36602535 - 36602585
Alignment:
Q  632 tcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  36602535 tcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 36602585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 812 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 11828693 - 11828641
Alignment:
Q  812 aagatagtactcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggt 864  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11828693 aagatagtgctcacaatttgttagtttggtgggtcaagtgctcacaatttggt 11828641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 505 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 28685310 - 28685266
Alignment:
Q  505 gtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaag 549  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28685310 gtaactttagtgcaactgttaaagttgttgtcatgtgactgaaag 28685266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 820 - 902
Target Start/End: Complemental strand, 46963895 - 46963811
Alignment:
Q  820 actcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggt-gtttg-tgagtaagtgctcacaatttggtttctcctccc 902  Q
    ||||| |||| | |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  46963895 actcataatttgcttgtttggtgagtcgatttctcacactttggttgtttggtgagcatgtgctcacaatttggtttcttctccc 46963811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 46963980 - 46963921
Alignment:
Q  709 gtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaattggtttgtt 768  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  46963980 gtttggttcaatttgtttggttgttgggtgagtcaaaatagtgctcacaattggtttgtt 46963921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 602 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 23066002 - 23065924
Alignment:
Q  602 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||  | |||| ||||| ||||||| | ||||||| | ||||||||||    
T  23066002 gcgtacaatacaccatatgatgggatccctttccgaatcctgcatatgtgggagctttggtgcaccggattgccctttt 23065924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 587 - 654
Target Start/End: Original strand, 33500556 - 33500625
Alignment:
Q  587 aaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa--tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcggga 654  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||  |||||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  33500556 aaacagggtaagactgcgtactatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggga 33500625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 602 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 36267895 - 36267829
Alignment:
Q  602 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccaga-ccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || || || || |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36267895 gcgtacaatacaccaaatggttggacccatttcccgaaccctgtgtatgcgggagctttagtgcacc 36267829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 45019056 - 45019002
Alignment:
Q  501 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcg 555  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||||    
T  45019056 aggggtaaccttggcgcaactggtaaaggtcctgtcatgtgactggaaggctgcg 45019002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 605 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 21139822 - 21139761
Alignment:
Q  605 tacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcac 666  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||  || |||| ||||||| |||| ||||||||    
T  21139822 tacagtacaccaaatggtgggaccccttcccgaactctgtgtatgcggaagctttagtgcac 21139761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 835 - 902
Target Start/End: Original strand, 44338386 - 44338455
Alignment:
Q  835 gtttggtgggtcgagtgctcacactttgg-tgttt-gtgagtaagtgctcacaatttggtttctcctccc 902  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  44338386 gtttggtgagtcgagttctcacactttggttgtttggtgagcgtgtgctcacaatttggtttcttctccc 44338455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 142; Significance: 5e-74; HSPs: 94)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 499 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 34725278 - 34725097
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 598  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34725278 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 34725179  T
Q  599 accgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34725178 gctgcgtacaatacactaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 34725097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 500 - 682
Target Start/End: Original strand, 47214488 - 47214670
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  47214488 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtttaaaacagggtaagg 47214587  T
Q  600 ccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  47214588 ttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccagattaccctttttt 47214670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 500 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 38478461 - 38478278
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 599  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38478461 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaacttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 38478362  T
Q  600 ccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 683  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38478361 ctgcgtacaatacaccaaatggtggaaccccttctcggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttttta 38478278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 500 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 32632737 - 32632556
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 598  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32632737 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 32632638  T
Q  599 accgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  32632637 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccaaaccctgcatatgcgggagcttgagtgcaccaggtttccctttt 32632556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 500 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 45812716 - 45812534
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 599  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  45812716 gaggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtaaaagagggtaagg 45812617  T
Q  600 ccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  45812616 ctgcatacaatacaccaaatggtgggaccccttcccaaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccttttttt 45812534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 500 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 46248134 - 46247949
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaa 597  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  46248134 gaggggtaaccttggctcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46248035  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 683  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  46248034 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgtaccgggttgccctttttta 46247949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 499 - 680
Target Start/End: Original strand, 14617014 - 14617197
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa--aacagggta 596  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  14617014 tgaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacaaggta 14617113  T
Q  597 agaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  14617114 aggttgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttaccctttt 14617197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 504 - 680
Target Start/End: Original strand, 19414420 - 19414596
Alignment:
Q  504 ggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgc 603  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||| | ||    
T  19414420 ggtaaccttggcgtaattggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaagagcctcttatgtaaaacaggttaaggctgc 19414519  T
Q  604 gtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19414520 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 19414596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 500 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 20004273 - 20004089
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||    
T  20004273 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctctcgtgtaaaaaacaaggtaa 20004174  T
Q  598 gaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    | | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20004173 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 20004089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 500 - 682
Target Start/End: Original strand, 18944620 - 18944807
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18944620 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaaggcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 18944719  T
Q  598 gaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagc-tctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  18944720 ggctgcgtacaatacaccaacaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgccctttttt 18944807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 500 - 683
Target Start/End: Original strand, 46991781 - 46991966
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  46991781 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46991880  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 683  Q
    | | | |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  46991881 ggctgtgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggttgcccattttta 46991966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 506 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 30395903 - 30395725
Alignment:
Q  506 taactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgc 603  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||    
T  30395903 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactttaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 30395804  T
Q  604 gtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  30395803 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgccctttt 30395725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 537 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 35253329 - 35253185
Alignment:
Q  537 atgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttccca 636  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  35253329 atgtgactgaaagatcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccg 35253230  T
Q  637 gaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35253229 gaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggattgcccttttt 35253185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 506 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 12127010 - 12126836
Alignment:
Q  506 taactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgt 605  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  12127010 taaccttggcgcaactcgtaaagttgttgtcatgtaattgaaaggtcacgggtttaagttctggaaacagcttcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgt 12126911  T
Q  606 acaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||    
T  12126910 acaatacaccaaattgtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctgtagtgcactgcgttgccctttt 12126836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 505 - 682
Target Start/End: Original strand, 45402077 - 45402257
Alignment:
Q  505 gtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggt--aag-ac 600  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  |    
T  45402077 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtga-tggaaggtaacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggttcaagttc 45402175  T
Q  601 cgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  45402176 tgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccgttttt 45402257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 515 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 23768486 - 23768334
Alignment:
Q  515 cgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatac 612  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  23768486 cgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatac 23768387  T
Q  613 accaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgca 665  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  23768386 accaaatggtgggacaccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 23768334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 499 - 685
Target Start/End: Original strand, 27201623 - 27201813
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 596  Q
    ||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  27201623 tgaggggtaaccttagcgtaaatggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtcagaaacagggta 27201722  T
Q  597 agaccgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttttagt 685  Q
    || | ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  27201723 aggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcattgggttgcccttttttagt 27201813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 500 - 680
Target Start/End: Original strand, 10668197 - 10668386
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgt-----gactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacag 592  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  10668197 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaa 10668296  T
Q  593 ggtaagaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||||||   |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10668297 ggtaaggttgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 10668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 499 - 680
Target Start/End: Original strand, 27474257 - 27474439
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 597  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  27474257 tgaggggtaaccttagctcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaacagggcaa 27474356  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
      | |||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  27474357 agctgcgtacaatacactgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgccctttt 27474439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 498 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 41319989 - 41319805
Alignment:
Q  498 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggt 595  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  41319989 ttgaggggtaaccttgacacaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggt 41319890  T
Q  596 aagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||  ||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||    
T  41319889 aaggctgcgtacaatacaccaaatgatgggaccccttcccgaacccttcatatgcgggagtttcagtgcactgggttgccctttt 41319805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 511 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 18724714 - 18724543
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | |||||    
T  18724714 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtaca 18724616  T
Q  609 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||    
T  18724615 atacaccaaatcttgggaccccttcccggaccctacatatgcgggagct-ttgtgcaccaagctgccccttttt 18724543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 519 - 682
Target Start/End: Original strand, 6925096 - 6925261
Alignment:
Q  519 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacca 616  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||| | ||| ||||||||||     
T  6925096 actggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcggacaatacaccg 6925195  T
Q  617 aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||    
T  6925196 aatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgagttgccttttttt 6925261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 500 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 22930248 - 22930105
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 598  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22930248 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaacagggtaag 22930149  T
Q  599 accgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctg 643  Q
       | | ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  22930148 gttgtg-acaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctg 22930105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 499 - 682
Target Start/End: Original strand, 8197019 - 8197204
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 596  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||| ||||    
T  8197019 tgaggggtaaccttggtgcaactggtcaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggtaattgcctcttgtgtaaaaaacatggta 8197118  T
Q  597 agaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    || |  |||||| ||||||||||||| ||| |||||| | |||||||  ||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  8197119 aggctacgtacagtacaccaaatggtaggaccccttctcggaccctgcgtatgttggagctttagtgtaccgggttgccctttttt 8197204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 505 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 18742137 - 18741955
Alignment:
Q  505 gtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcct-ggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagac 600  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || | |||||||| || |||| |   ||||||||||||| |    
T  18742137 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaaatcttgggaaacagtcttttgtataaaaaaacagggtaaggc 18742038  T
Q  601 cgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  18742037 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggtttcccttttt 18741955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 523 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 25468421 - 25468284
Alignment:
Q  523 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatg 620  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||    
T  25468421 gtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatg 25468322  T
Q  621 gtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctc 658  Q
    || ||| | ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25468321 gttggacctcttcccagaccctgcgtatgcgggagctc 25468284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 511 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 6983978 - 6983810
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaat 610  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||   |||||||||    
T  6983978 ttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcgtataaaaaacagggtaagtatgcgtacaat 6983880  T
Q  611 acaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||  || || |||||| | ||||||| || |||||||||    
T  6983879 acaccaaatggtgggacccctttccggaccctgcgtaggcaggagctttggtgcaccgggctgccctttt 6983810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 511 - 657
Target Start/End: Original strand, 11596502 - 11596648
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaa 609  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||    
T  11596502 ttggcgcaac-ggtaaagtggctgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtataa 11596600  T
Q  610 tacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||    
T  11596601 tacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagct 11596648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 499 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 19932934 - 19932755
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 596  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  |||| ||| ||| ||||||  |||||||||||    
T  19932934 tgaggggttaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagt--tggatacaacct-ttgtgtaaaaaacagggta 19932838  T
Q  597 agaccgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccct 677  Q
    || | ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||  |||||  || |  |||||||||||||||||||    
T  19932837 aggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaagatcattagtgcaccaggttgccct 19932755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 511 - 643
Target Start/End: Original strand, 20036209 - 20036343
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa---acagggtaagaccgcgtac 607  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||   | |||||||||  |||| |    
T  20036209 ttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaaactcttgtgtaaagagaaagggtaagattgcgttc 20036307  T
Q  608 aatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctg 643  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  20036308 aatacaccaaatggtggaaccccttcccggaccctg 20036343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 511 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 2435956 - 2435798
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| | |||||||    
T  2435956 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtgaaaaatagggtaagcctgcgtaca 2435858  T
Q  609 atacacc-aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||    ||||||||||| |||||||||    
T  2435857 atacaccaaaatggtgggacccctttccgtaccctccgcatgcgggagctttagtgcacc 2435798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 564 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 31382330 - 31382211
Alignment:
Q  564 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| || |    
T  31382330 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcatatgcgggagctttact 31382231  T
Q  663 gcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | ||| ||||||||||||||    
T  31382230 gtaccgggttgccctttttt 31382211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 539 - 680
Target Start/End: Original strand, 35005139 - 35005284
Alignment:
Q  539 gtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa--tggtgggatcccttcc 634  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  35005139 gtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcc 35005238  T
Q  635 cagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    | |||||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  35005239 cggaccctgcgtatgcgggcgctttagtgcaccgggttgccctttt 35005284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 511 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 4430196 - 4430080
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| || ||||||  ||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  4430196 ttggcgcagctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggtttaagtcttgaaaacagtatcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtaca 4430097  T
Q  609 atacaccaaatggtggg 625  Q
    |||||||||||||||||    
T  4430096 atacaccaaatggtggg 4430080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 522 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 10378884 - 10378738
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatgg 621  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||        || | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10378884 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggttacgggttcaagtcctggaaag-------tgag-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgg 10378793  T
Q  622 tgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccc 676  Q
    ||||| ||||||   ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  10378792 tgggaccccttcttggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggctgccc 10378738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 522 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 35117927 - 35117777
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagaccgcgtacaatacacc--aa 617  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||||||  ||    
T  35117927 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaaa 35117828  T
Q  618 atggtgggatcccttcccagaccctgtat-atgcgggagctctagtgcacc 667  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||  | |||| |||||| |||||||||    
T  35117827 atgatgggaccccttcccggaccctgcgtaatgcaggagctttagtgcacc 35117777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 506 - 680
Target Start/End: Original strand, 9939443 - 9939623
Alignment:
Q  506 taactttggcgcaactggtaaa-gttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaagaccg 602  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||||   |    
T  9939443 taaccttggcgcaaccggtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtttaagaaacatggtaaggttg 9939542  T
Q  603 cgtacaatacacc--aaatggtggga-tcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||  |||||| | |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  9939543 cgtgcaatacaccaaaaatggtgggacccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttaccctttt 9939623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 586 - 679
Target Start/End: Original strand, 4349703 - 4349796
Alignment:
Q  586 aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4349703 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 4349796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 511 - 626
Target Start/End: Original strand, 33222972 - 33223089
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaa 609  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||    
T  33222972 ttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggatttaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggaaaggttgcgtacaa 33223071  T
Q  610 tacacc-aaatggtggga 626  Q
    |||||| |||||||||||    
T  33223072 tacaccaaaatggtggga 33223089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 565 - 682
Target Start/End: Original strand, 23796507 - 23796626
Alignment:
Q  565 cctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||  |||||   |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  23796507 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaatcaatgtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccagaccctgcatatgctggagctttagt 23796606  T
Q  663 gcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  23796607 gcaccgggctgccctttttt 23796626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 523 - 682
Target Start/End: Original strand, 19701570 - 19701732
Alignment:
Q  523 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaagaccgcgtacaatacaccaaa-t 619  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |   ||||||   | ||||||||||||||| |    
T  19701570 gtaaagttgttgtcgtgtgactgaaatgtcacgggtttaagtcatgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggatgggtacaatacaccaaaat 19701669  T
Q  620 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  19701670 ggtggggccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggctaccctttttt 19701732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 511 - 589
Target Start/End: Original strand, 22327088 - 22327165
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22327088 ttggcgcaac-ggcaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaa 22327165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 34714598 - 34714675
Alignment:
Q  498 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacag 575  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  34714598 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaacag 34714675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 523 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 44485267 - 44485131
Alignment:
Q  523 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatg 620  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  44485267 gtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttatagtcctggaaacaaccacttgtgtaaaagacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 44485168  T
Q  621 gtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    || ||| |||||||| || |||   ||||||||||||    
T  44485167 gttggaccccttcccggatcctacgtatgcgggagct 44485131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 522 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 17470505 - 17470407
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa 618  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17470505 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaatggtcatgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 17470407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 511 - 682
Target Start/End: Original strand, 35019219 - 35019390
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||  |||| | || ||||    
T  35019219 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacagattcaagtcctgtaaacaacctcttgtataaaaatcagtataaggctgcataca 35019317  T
Q  609 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||    
T  35019318 atacaccaattggtggga-cccctcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggctgccatttttt 35019390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 503 - 589
Target Start/End: Original strand, 25290143 - 25290231
Alignment:
Q  503 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaa--acagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  25290143 gggtaaccttggcgcaacaggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcttggaaacacagcctcttgtgtaaaa 25290231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 501 - 622
Target Start/End: Original strand, 24564322 - 24564445
Alignment:
Q  501 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaag 598  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  24564322 aggggtaaccttggcgcaaccagtaaagttgatgtcttgtgattgaaaggtcgcagattcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 24564421  T
Q  599 accgcgtacaatacaccaaatggt 622  Q
       ||||||||| |||||||||||    
T  24564422 ggtgcgtacaattcaccaaatggt 24564445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 511 - 681
Target Start/End: Original strand, 50811928 - 50812100
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagaccgcgtac 607  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||   ||||||    
T  50811928 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacggaatcatgtcctggaaacagcttcttgtgtaaaaaaacagggtaaggttgcgtac 50812026  T
Q  608 aatacacc-aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||   |||||  |||||||||||| || |||||  || ||||||||||    
T  50812027 aatacaccaaaatggt-ggaccccttcccgcgccctgcgtatgcgggagctttaatgcactgggctgcccttttt 50812100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 555 - 677
Target Start/End: Original strand, 22324925 - 22325049
Alignment:
Q  555 gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcg 651  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||  |||||||||   ||| |||| |||||||  ||||||    
T  22324925 gggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtggagccccgtccc-gaccctgcgtatgcg 22325023  T
Q  652 ggagctctagtgcaccaggttgccct 677  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||    
T  22325024 ggagctttagtgcaccaggctgccct 22325049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 557 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 45264524 - 45264411
Alignment:
Q  557 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa-tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcggg 653  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||| | | || |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  45264524 gttcaagtcctggaaacaacctcttgtgcaaaaaacagagtaaggctgtgtgcaatacaccaaaatggtgggaccccttctcagaccctgcatatgcggg 45264425  T
Q  654 agctctagtgcacc 667  Q
    |||| |||||||||    
T  45264424 agctttagtgcacc 45264411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 522 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 50760385 - 50760288
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtg--taaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaa 617  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||| | ||||| ||||||||||    
T  50760385 ggtaaagtagttgtcatgtgactgagaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtataaaactgggtaaggctgcgtataatacaccaa 50760288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 522 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 27136811 - 27136663
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa- 618  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||   || |||||||| |||| |||| ||||||||||||||  || ||||||   |||||||||||||||||     
T  27136811 ggtaaagttgttgtcacgtgattggaaggacacgagttcaagttctgggaacaacctcttgtgtaaaaaacatggtaaggttgcgtacaatacaccaaaa 27136712  T
Q  619 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
    |||||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27136711 tggtgggaccccttcctagatcatgtgtatgcgggagctccagtgcacc 27136663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 502 - 567
Target Start/End: Original strand, 40424721 - 40424786
Alignment:
Q  502 ggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcct 567  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  40424721 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggccacgggttcaagtcct 40424786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 602 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 1517388 - 1517308
Alignment:
Q  602 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1517388 gcgtacaatacaccaattggtgggaccccttctcagaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 1517308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 522 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 2436052 - 2435985
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2436052 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcctgtgtaaaa 2435985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 587 - 682
Target Start/End: Original strand, 43768205 - 43768300
Alignment:
Q  587 aaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| || |||||| || |||||||||||    
T  43768205 aaacagggtaaggctgcctacaatacaccaattggtgggaccccttcccagaccctgcgtatacgggagctttaatgcaccgggctgccctttttt 43768300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 501 - 587
Target Start/End: Original strand, 21723642 - 21723727
Alignment:
Q  501 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa 587  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21723642 aggggtaaccttcgcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactggatggttacaagttc-agtcctggaaacagcctcttgtgtaa 21723727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 616 - 682
Target Start/End: Original strand, 50606498 - 50606564
Alignment:
Q  616 aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  50606498 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 50606564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 511 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 15511320 - 15511150
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcg--ta 606  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||  |   || ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| | |||  ||    
T  15511320 ttggcgcaa-tggtaaagttgttgtaatgtggctgaaaggtcacatattgaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcggata 15511222  T
Q  607 caatacacc-aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccct 677  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||  |||| | ||||| ||||||||| || ||||||    
T  15511221 caatacaccaaaatggtggtaccccttcctggaccctgcgtatgtgtgagctttagtgcaccgggctgccct 15511150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 504 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 18335465 - 18335305
Alignment:
Q  504 ggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagacc 601  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||  |  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||        
T  18335465 ggtaaccttggcgcaagtgataaagtttttgtcatgtgtctgaaaggtcacaagttaaagtcctggaaacagtctcttgtttaaaaattagggtaaagtt 18335366  T
Q  602 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagt 662  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || |||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  18335365 gcgtacaatacatcaaatgatgggaccctttcctagaccatgtgtatacgggagctttagt 18335305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 556 - 665
Target Start/End: Original strand, 43207528 - 43207640
Alignment:
Q  556 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa-tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgg 652  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | ||||||     
T  43207528 ggtttaagtcttggaaacaacctcttatgtgaaaaacagggtaagacggcatacaatacaccaaattggtgggacctcttcccagaccctatgtatgcga 43207627  T
Q  653 gagctctagtgca 665  Q
    ||||| |||||||    
T  43207628 gagctttagtgca 43207640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 522 - 622
Target Start/End: Original strand, 52910216 - 52910319
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| || |||||||||||||||  ||   ||||||||||| ||| | |||||||||||| ||    
T  52910216 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaactcttggaaacagcctcttaggtaaaaaaacagggtaggactgtgtacaatacacctaa 52910315  T
Q  619 tggt 622  Q
    ||||    
T  52910316 tggt 52910319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 589 - 657
Target Start/End: Original strand, 15505632 - 15505700
Alignment:
Q  589 acagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  15505632 acagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 15505700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 4249520 - 4249453
Alignment:
Q  602 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccag 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| || ||||||||    
T  4249520 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgcaccag 4249453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 4249844 - 4249777
Alignment:
Q  602 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccag 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| || ||||||||    
T  4249844 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgcaccag 4249777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 4250168 - 4250101
Alignment:
Q  602 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccag 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| || ||||||||    
T  4250168 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgcaccag 4250101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 509 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 34679390 - 34679274
Alignment:
Q  509 ctttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgta 606  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |  |  |||| | |||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  34679390 ctttggcgcaac-ggtaaagttattgtcatgtgactgaaatatcacatgttccattcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 34679292  T
Q  607 caatacaccaaatggtgg 624  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  34679291 ctatacatcaaatggtgg 34679274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 587
Target Start/End: Original strand, 22151479 - 22151568
Alignment:
Q  498 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa 587  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22151479 ttgagggataattttagcgcaactgataaagttgttgtcatctgactgtaaggtcataggttcaagttctggaaacagcctcttatgtaa 22151568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 667
Target Start/End: Original strand, 23371124 - 23371268
Alignment:
Q  523 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca-gggtaagaccgcgtacaatacaccaaatgg 621  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| | ||| |||   | |||||||||||||||||     
T  23371124 gtaaagttgttttcgcatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccacttgggtaaaaaacgggcaaggttgtgtacaatacaccaaatgc 23371223  T
Q  622 tgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  |||| || |||| |||||||||    
T  23371224 tgggacccctt-ccagaccctgcgtatgtggtagctttagtgcacc 23371268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 533 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 31272522 - 31272429
Alignment:
Q  533 tgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtggg 625  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | |||||||  ||| |||||||||||    
T  31272522 tgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacatggtaaggctgcgtacagcacatcaaatggtggg 31272429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 39215117 - 39214961
Alignment:
Q  523 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc-aaat 619  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||  |  |||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||  || ||||    
T  39215117 gtaaagttattgtcacgtgactaaaaggtcccaagttcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctgcgtacaatattccaaaat 39215018  T
Q  620 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccc 676  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||  |||| || |||| ||||||||| || |||||    
T  39215017 ggtgggtccccttcccaaaccctgcgtatgtggaagctttagtgcaccgggctgccc 39214961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 534 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 19974221 - 19974073
Alignment:
Q  534 gtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc-aaatggtgggatccct 631  Q
    |||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||| |||   |||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  19974221 gtcacgtgactgaaagatcacgggttcaagtcttggaaacagcctcaagtgtaaaaatagggcaaggttgcgtacaatacaccaaaatgatgggacccat 19974122  T
Q  632 tcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    |||| ||| || | |||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  19974121 tcccggactctatgtatgcgggagctttagtgcacggggctgccctttt 19974073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 565 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 34149076 - 34148974
Alignment:
Q  565 cctggaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagt 662  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||   |||||||| | ||||||||||| || |||||||  ||||||| |||||| ||||| |||||    
T  34149076 cctggaaacagcctcttgtgtagaaaatagggtaaggttgcgtacaaaagaccaaatggtgagaccccttcctggaccctgcatatgcaggagcgctagt 34148977  T
Q  663 gca 665  Q
    |||    
T  34148976 gca 34148974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 42304302 - 42304205
Alignment:
Q  586 aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa--tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| |||  |||||||| |||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  42304302 aaaacagggtaaggttgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccggattgcccttttt 42304205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 500 - 589
Target Start/End: Original strand, 10163736 - 10163825
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||| |  ||| |||| ||| ||||| |||||| |||||||    
T  10163736 gaggggtaacattggcgcaactgataaagttgttgtcatgtggctaaaatgttacaagtttaagttctgaaaacaacctcttatgtaaaa 10163825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 832 - 902
Target Start/End: Complemental strand, 15630108 - 15630035
Alignment:
Q  832 tttgtttggtgggtcgagtgctcacactttgg-tgttt-gtgagt-aagtgctcacaatttggtttctcctccc 902  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15630108 tttgtttggtgagtcgagtgctcacactttggttgtttggtgagtcgagtgctcacaatttggtttcttctccc 15630035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 553 - 657
Target Start/End: Original strand, 30682844 - 30682948
Alignment:
Q  553 gcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcg 651  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||  | |||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||    
T  30682844 gcgggttcaaatcctgaaaatagcctcttgtgtaaaaacaaggtaagattgtgtac-atacaacaaatggtgggaccccttcccggaccgtgcgtatgcg 30682942  T
Q  652 ggagct 657  Q
    ||||||    
T  30682943 ggagct 30682948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 557 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 31442515 - 31442396
Alignment:
Q  557 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa-tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgg 652  Q
    ||||||||| | |||||||||| || |||||||   |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||| |||| ||    
T  31442515 gttcaagtcttagaaacagccttttatgtaaaaaaacagggtaaggatgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggacactgtgtatgtgg 31442416  T
Q  653 gagctctagtgcaccaggtt 672  Q
    ||||| | ||||||| ||||    
T  31442415 gagctttggtgcaccgggtt 31442396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 629 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 19386626 - 19386575
Alignment:
Q  629 ccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19386626 ccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgaaccaggttgctctttt 19386575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 511 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 25554891 - 25554817
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta 586  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||   || ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25554891 ttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcacgtgactaaaaggccacgtgtttaagtcctggaaacaacctcttgtgta 25554817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 612 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 4587630 - 4587568
Alignment:
Q  612 caccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgc 674  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  4587630 caccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcctatgcgggagcttcagtgcaccgggttgc 4587568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 602 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 28894635 - 28894561
Alignment:
Q  602 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccc 676  Q
    |||||||||||| ||||||||   | ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  28894635 gcgtacaatacatcaaatggtaaaaccccttcctagaccctgcatatgcgagagctttagtgcaccaggctgccc 28894561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 563 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 20169207 - 20169111
Alignment:
Q  563 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |   |||||||| | ||||||||| ||||  |||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  20169207 gtcctgaaaacaccctcttgtgtaaaaaaaaaggtaagactgtgtacaataccccaatcggtgggactccttcccggaccctgcatatgcgggagct 20169111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 704 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 2072530 - 2072458
Alignment:
Q  704 gtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaattggtttgtttgtttggt 776  Q
    |||||||||  |||||||||||| | ||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  2072530 gtttcgtttagttcaatttgtttagttgttgggtgagtcaagatagggctcaccattggtttgattgtttggt 2072458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 602 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 4430076 - 4430008
Alignment:
Q  602 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccagg 670  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| |  || ||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  4430076 gcgtacaatacaccaaatggtggaacccctttctggatcctgtgtatgcgggagctttagtgctccagg 4430008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 614 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 33594196 - 33594144
Alignment:
Q  614 ccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcac 666  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  33594196 ccaattggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 33594144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 509 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 49546078 - 49546024
Alignment:
Q  509 ctttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagt 564  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||    
T  49546078 ctttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtggctgaaaggttacaggttcaagt 49546024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 602 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 20999927 - 20999849
Alignment:
Q  602 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||   ||||||  || ||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  20999927 gcgtacaatacaccaaatgatggggccccttccggcaccctgcgtacgcgggagctttagtgcaccgggctgccctttt 20999849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 564 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 44745900 - 44745854
Alignment:
Q  564 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaat 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||    
T  44745900 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaacaaggtaaagctgcgtacaat 44745854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 821 - 899
Target Start/End: Complemental strand, 2072444 - 2072363
Alignment:
Q  821 ctcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttgg-tgttt-gtgag-taagtgctcacaatttggtttctcct 899  Q
    ||||||||| | ||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  2072444 ctcacaatttgattgtttgatgagtcgagtgctcatactttggttgtttggtgagttatgtactcacaatttggtttctcct 2072363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 628 - 681
Target Start/End: Original strand, 16120823 - 16120876
Alignment:
Q  628 cccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  16120823 cccttcccggcccctgcatatgcgggagctttaatgcaccaggctgcccttttt 16120876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 21910726 - 21910693
Alignment:
Q  602 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttccc 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21910726 gcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttccc 21910693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 586 - 626
Target Start/End: Original strand, 46859131 - 46859172
Alignment:
Q  586 aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc-aaatggtggga 626  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  46859131 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaatggtggga 46859172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 139; Significance: 3e-72; HSPs: 98)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 500 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 11054327 - 11054145
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11054327 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtaaaacagggtaaga 11054228  T
Q  600 ccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | |||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11054227 ctgcgtacaatacaccaaatggcggaaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttttt 11054145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 497 - 679
Target Start/End: Original strand, 20224935 - 20225117
Alignment:
Q  497 tttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggta 596  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20224935 tttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaacagggta 20225034  T
Q  597 agaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20225035 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 20225117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 499 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 48599005 - 48598823
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 598  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48599005 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 48598906  T
Q  599 accgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48598905 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccatgcatatgccggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 48598823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 500 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 47528709 - 47528527
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 599  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47528709 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 47528610  T
Q  600 ccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47528609 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgaatatgtgggagctctagtgcaccgggttgccctttttt 47528527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 499 - 681
Target Start/End: Original strand, 5648212 - 5648395
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 597  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5648212 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaa 5648311  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  5648312 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcactgggttgcccttttt 5648395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 498 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 6430808 - 6430627
Alignment:
Q  498 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggta 596  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6430808 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggta 6430709  T
Q  597 agaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 678  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  6430708 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccacttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccgggttgccctt 6430627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 499 - 682
Target Start/End: Original strand, 30639333 - 30639517
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 597  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  30639333 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcttgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagactcttgtgtaaaaacagggtaa 30639432  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | | |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  30639433 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcactgggttgccctttttt 30639517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 511 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 16408773 - 16408598
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  16408773 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtaca 16408674  T
Q  609 atacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||||  |||||||| | |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16408673 atacaccaataatggtggaaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 16408598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 499 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 5306845 - 5306657
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaa 597  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5306845 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgatgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatcagggtaa 5306746  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatg----cgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||    |||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  5306745 ggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtggacgggagctttaatgcaccgggttgccctttttt 5306657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 511 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 8473790 - 8473621
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaat 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || ||||||    
T  8473790 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgaccggaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtttaacagggtaaggctgcatacaat 8473691  T
Q  611 acaccaaatggtgggatcccttcccag--accctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 678  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |   ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8473690 acaccaaatggtgggaccccttccccggacccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 8473621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 524 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 9832468 - 9832311
Alignment:
Q  524 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtg 623  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9832468 taaaattgttgtgatctgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 9832369  T
Q  624 ggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  9832368 ggaccccttcccggaccctgcatatgcaggaactctagtgcaccgggttgcccttttt 9832311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 538 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 29208039 - 29207900
Alignment:
Q  538 tgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccag 637  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  29208039 tgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaattgcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgg 29207940  T
Q  638 accctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccct 677  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29207939 accctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 29207900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 500 - 676
Target Start/End: Original strand, 21646918 - 21647098
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  21646918 gagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaa 21647017  T
Q  598 gaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccc 676  Q
    | | |||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21647018 ggctgcgtacaatataccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 21647098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 500 - 682
Target Start/End: Original strand, 23501747 - 23501927
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaa 597  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||      ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23501747 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtc------acagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 23501840  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |   ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  23501841 ggttgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 23501927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 89 - 376
Target Start/End: Original strand, 24224891 - 24225186
Alignment:
Q  89 attgcttggaagaaacaaaagattagagaaattggtaacatgatgtttactttgatatggtaacttgcaccgttccactgactagaattatttctttgga 188  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||| ||||| | ||||||| | | | ||||||||||||||    
T  24224891 attgcttggtagaaacaaa---ttagagaaattgggaacatgatgtttgcttcgaaatggtaatttgcaacattccactaattggtattatttctttgga 24224987  T
Q  189 ttttgggagattcacggt-----------ttggatggttttgagcatgcttttgaaattaattgcatcactcatcaataatttggattttagagacatag 277  Q
    ||||   |||||||||||           ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  24224988 ttttt--agattcacggtgtgcatattgtttggatggttttgagcacg-ttttgaaattaattgcatcaatcatcaatattttggattttagagacgtag 24225084  T
Q  278 aagttattcttttaccatggtatttccttg-----tttctttgatatacttgtcgtcactggttaatgattgttcggtttgctctgattgttggtcgata 372  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||     ||||||||  || |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| ||||    
T  24225085 aagttattctttcaccatggtatttacttgtttaatttctttg--atgcttgtcgtcattggttaatgtttgttcggtctgctccggttgttggttgata 24225182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 519 - 678
Target Start/End: Original strand, 40915802 - 40915962
Alignment:
Q  519 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaa 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  40915802 actggtaaagttgttgtcatgtgactataaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaa 40915901  T
Q  618 atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 678  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||  |||||||| | ||||||||    
T  40915902 atggtgggagcccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccggattgccctt 40915962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 503 - 680
Target Start/End: Original strand, 16911519 - 16911700
Alignment:
Q  503 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagac 600  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||| |    
T  16911519 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtacaaatcagggtaaggc 16911618  T
Q  601 cgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
     |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  || ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||    
T  16911619 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtacgcgggagctttagtttaccgggttgccctttt 16911700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 526 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 17043549 - 17043392
Alignment:
Q  526 aagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtg 623  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17043549 aagttgttgtcaagtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 17043450  T
Q  624 ggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||| ||||| |||||    
T  17043449 ggaccccttcccagaccctgcatatgctggagcttta-tgcaccaggctgccccttttt 17043392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 527 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 39077948 - 39077793
Alignment:
Q  527 agttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtggga 626  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||    
T  39077948 agttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggttgcgtacaatataccaaatggtgaga 39077849  T
Q  627 tcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
       ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39077848 catctttccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccttttttt 39077793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 521 - 682
Target Start/End: Original strand, 47443928 - 47444095
Alignment:
Q  521 tggtaaagttgttgtcatgtgactga----aaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacac 614  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| | |||||||||||||    
T  47443928 tggtaaagttgttctcatgtgaccgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacac 47444027  T
Q  615 caaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  47444028 caaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagcttcagtgcactgggttgccctttttt 47444095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 526 - 681
Target Start/End: Original strand, 54175043 - 54175202
Alignment:
Q  526 aagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctgg-aaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc-aaatggt 622  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  54175043 aagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacggattcaagtcctggaaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaatggt 54175142  T
Q  623 gggatccctt-cccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  54175143 gggaccccttccccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttttt 54175202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 519 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 44363294 - 44363130
Alignment:
Q  519 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc- 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||| | | ||||||||  ||||     
T  44363294 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacagcctcgtgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtacaacgcacca 44363195  T
Q  616 -aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  44363194 aaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 44363130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 522 - 683
Target Start/End: Original strand, 35567146 - 35567309
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaat 619  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| | | |||||| |||||||||    
T  35567146 ggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagccacttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaacacaccaaat 35567245  T
Q  620 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 683  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||  | |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  35567246 ggtgggaccccttcccgaaccctgcgtctgcgggagctttagtgcaccgggctgccctttttta 35567309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 500 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 13256578 - 13256397
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||    
T  13256578 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcataggttcaagtcctgg----agcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 13256483  T
Q  598 gaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    | | |||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||  |||| | || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13256482 ggctgcgtacaatacaccaataatagtgggaccccttcccgaaccccgcatctgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 13256397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 521 - 667
Target Start/End: Original strand, 19027823 - 19027971
Alignment:
Q  521 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa 618  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||     
T  19027823 tggtagagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaat 19027922  T
Q  619 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||  |||| ||||||| |||||||||    
T  19027923 tggtgggacccctttccagactctgcgtatgtgggagctttagtgcacc 19027971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 626
Target Start/End: Original strand, 14590790 - 14590920
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggt 595  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||    
T  14590790 tgagtggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggt 14590889  T
Q  596 aagaccgcgtacaatacaccaaatggtggga 626  Q
    ||| | || ||||||||| ||||||||||||    
T  14590890 aaggctgcatacaatacatcaaatggtggga 14590920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 503 - 680
Target Start/End: Original strand, 14983791 - 14983970
Alignment:
Q  503 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaagac 600  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| || |||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |  |||||||      
T  14983791 gggtaaccttggcagaactggtaaagttgttgtcatatgattggaaggtcacggattcaagtctttgaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggt 14983890  T
Q  601 cgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
     || |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  14983891 tgcctacaatacactaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgtaccatgttgccctttt 14983970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 532 - 681
Target Start/End: Original strand, 25463108 - 25463258
Alignment:
Q  532 ttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcc 629  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| |||   |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  25463108 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggaaaggttgcgtacaacacaccaaatggtgggaccc 25463207  T
Q  630 cttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  25463208 cttcccggaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccaggctacccttttt 25463258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 524 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 30690340 - 30690176
Alignment:
Q  524 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---------cagggtaagaccgcgtacaatacac 614  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         ||||||||| | || ||||||||||    
T  30690340 taaagtggttgtcaagtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaaaagcctcttgtgtaaaaaataaaaaacagggtaaggctgcatacaatacac 30690241  T
Q  615 caaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  30690240 caattggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggctgcccttt 30690176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 500 - 665
Target Start/End: Original strand, 37494805 - 37494972
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  37494805 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgccatgcgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 37494904  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgca 665  Q
    |   || ||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||  ||||| |||||| |||||||    
T  37494905 ggttgcatacaatataccaaatggtgggacccctttcgggaccctgcgtatgcaggagctttagtgca 37494972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 563 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 20639777 - 20639655
Alignment:
Q  563 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa-tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct 659  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| |    
T  20639777 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 20639678  T
Q  660 agtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  20639677 agtgcaccgggttgccctttttt 20639655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 496 - 667
Target Start/End: Original strand, 54730199 - 54730375
Alignment:
Q  496 gtttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacag 592  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||    
T  54730199 gtttgatgggtaactttggcgcaatcggtaaagttgttgtcatgtgaccaaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaaatag 54730298  T
Q  593 ggtaagaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
    | |||| | ||||| |||||||||  |||| ||| | |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  54730299 gataaggctgcgtataatacaccaataatgatggaaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 54730375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 500 - 682
Target Start/End: Original strand, 10660358 - 10660544
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| |||  |||| ||||||     
T  10660358 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtat 10660457  T
Q  598 gaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct-agtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | | || ||||||||||||  ||||||| || ||||||| ||| ||||  |||||||||||| | |||||| | |||||||| |||||    
T  10660458 ggctgcatacaatacaccaataatggtgagaccccttccaaga-cctgcgtatgcgggagctttaagtgcatcgggttgccccttttt 10660544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 500 - 682
Target Start/End: Original strand, 10874503 - 10874689
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| |||  |||| ||||||     
T  10874503 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtat 10874602  T
Q  598 gaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct-agtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | | || ||||||||||||  ||||||| || ||||||| ||| ||||  |||||||||||| | |||||| | |||||||| |||||    
T  10874603 ggctgcatacaatacaccaataatggtgagaccccttccaaga-cctgcgtatgcgggagctttaagtgcatcgggttgccccttttt 10874689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 512 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 49938759 - 49938615
Alignment:
Q  512 tggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaat 610  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   | |||||||    
T  49938759 tggcgcaacggtaaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacggggtaag---gtgtacaat 49938663  T
Q  611 acacc-aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  49938662 acaccaaaatggtgggaccccttcccataccctgcatatgcgggagct 49938615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 505 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 30352767 - 30352577
Alignment:
Q  505 gtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-------aaaacagggtaa 597  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||    
T  30352767 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcaagtgaccgaaaggtcacgggttagagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaaaacagggtaa 30352668  T
Q  598 g----accgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |     | ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  30352667 gtaaagctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgtgttgccctttttt 30352577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 554 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 10277882 - 10277755
Alignment:
Q  554 cgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcggg 653  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||    
T  10277882 cgggttcaaatccttgaaacagcctcttgtataaaataggataaggctgcgtacaatacaccaaatggtgaaaccccttcccagaccctgcatatgcggg 10277783  T
Q  654 agctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    || ||||||| ||| | |||||||||||    
T  10277782 agttctagtgaaccggattgcccttttt 10277755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 500 - 679
Target Start/End: Original strand, 20405047 - 20405224
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggta 596  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||       ||| |||||||||||||||||||||   |||||||    
T  20405047 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacggg-------cctagaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggta 20405139  T
Q  597 agaccgcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    |||  ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||   |||||||||||    
T  20405140 agattgcgtacaatacactaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcattgggttgcccttt 20405224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 511 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 30496490 - 30496334
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaat 610  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||| | || ||||||    
T  30496490 ttggcgcaactgtaaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaacacgggtaaggctgcatacaat 30496391  T
Q  611 acaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||  ||||  |||||| |||||||||    
T  30496390 acaccaaatggggggactccttcccggaccgtgcttatgatggagctttagtgcacc 30496334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 529 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 41018945 - 41018833
Alignment:
Q  529 ttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggat 627  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||     
T  41018945 ttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaattagggtaaggctacgtacaatacaccaaatagtgggac 41018846  T
Q  628 cccttcccagacc 640  Q
    |||||||||||||    
T  41018845 cccttcccagacc 41018833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 529 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 7385628 - 7385499
Alignment:
Q  529 ttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtggga 626  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||   | || ||||||||||||||||||||    
T  7385628 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagccctggaaacagcctcatgtgtaaaaaatagggtaaggttgtgtgcaatacaccaaatggtggga 7385529  T
Q  627 tcccttcccagaccctgtatatgcgggagc 656  Q
     || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  7385528 ccctttcccggaccctgtgtatgcgggagc 7385499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 566 - 681
Target Start/End: Original strand, 25629069 - 25629186
Alignment:
Q  566 ctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtg 663  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  25629069 ctggaaacagtctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctacatatgcgggagctttagtg 25629168  T
Q  664 caccaggttgcccttttt 681  Q
    |||| |||||||||||||    
T  25629169 caccgggttgcccttttt 25629186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 509 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 47441701 - 47441566
Alignment:
Q  509 ctttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgta 606  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||  ||||||||| | | |||    
T  47441701 ctttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccaagaaacagtctcttttgtaaaaatcagggtaaggctgtgta 47441603  T
Q  607 caatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctg 643  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  47441602 caatacaccaaatggttggaccccttcccggaccctg 47441566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 500 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 55766647 - 55766466
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgc-gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  | ||||||||||  |||||||||  ||||||||  |||||||||||    
T  55766647 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccggaaggtcacggggttcaagttttggaaacagtttcttgtgtgtaaacagggtaa 55766548  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    | | |||||||||||||  |||||||| | ||| |||| |||| ||  |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||    
T  55766547 ggctgcgtacaatacactgaatggtggaaccccatcccggaccttgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggatgcccttt 55766466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 500 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 55830902 - 55830721
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgg-gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  ||| ||||||||  ||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  55830902 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatcggaaggtcacggagttcaagttttggaaacagtctcttgtgtgtaaacagggtaa 55830803  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
      | |||||||||||||  |||||||| | ||| |||| |||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  55830802 tgctgcgtacaatacactgaatggtggaaccccatcccggaccttgcgtatgcgagagctttagtgcaccaggatgcccttt 55830721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 501 - 657
Target Start/End: Original strand, 54966977 - 54967133
Alignment:
Q  501 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaag 598  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||||||||    
T  54966977 agggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 54967075  T
Q  599 accgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
       || ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||  |||||||||||||    
T  54967076 gttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctacatatgcgggagct 54967133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 503 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 17315476 - 17315390
Alignment:
Q  503 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  17315476 gggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctcgaaacaacctcttgtgtaaaa 17315390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 608 - 682
Target Start/End: Original strand, 38786673 - 38786747
Alignment:
Q  608 aatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38786673 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttttt 38786747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 522 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 20908797 - 20908633
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaag-gttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaagaccgcgtacaatacaccaaa 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||| |||||||| | |||| | ||||| ||  |||||| | |||||||||||||||||    
T  20908797 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaatgttacatgttcaagtcatggaaacatcgtcttttctaaaaaagaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 20908698  T
Q  619 -tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
     |||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  20908697 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacaaggctgccctttttt 20908633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 558 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 9987957 - 9987831
Alignment:
Q  558 ttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggag 655  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| || |||||||||||    
T  9987957 ttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaacaatagggtaaggctgcatacaatacaccaaatggtgggaccccttccttgaccttgcatatgcgggag 9987858  T
Q  656 ctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    || || |||||| || |||| ||||||    
T  9987857 ctttaatgcaccgggctgccttttttt 9987831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 522 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 487294 - 487186
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtg--taaaacagggtaagaccgcgtacaatacac-caaa 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||||  | |||||||||||||  |||    
T  487294 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtataaaacaaggtaaagctgcgtacaatacactaaaa 487195  T
Q  619 tggtgggat 627  Q
    |||||||||    
T  487194 tggtgggat 487186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 564 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 7909397 - 7909281
Alignment:
Q  564 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgc-gggagctctag 661  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||| ||||||| |||    
T  7909397 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggggagctttag 7909298  T
Q  662 tgcaccaggttgccctt 678  Q
    |||| | ||||||||||    
T  7909297 tgcatcgggttgccctt 7909281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 524 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 32478942 - 32478792
Alignment:
Q  524 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggt 622  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||  | ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| | |     |||||||||||||||    
T  32478942 taaagttgttgtcatgtgaccgagaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctctagtgtaaaaacagggtaaggctg-----aatacaccaaatggt 32478848  T
Q  623 gggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    |||| |||||||| ||||| |  |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||    
T  32478847 gggaccccttcccggacccagcgtatgcgggagct-ttgtgcaccgggtggcccttt 32478792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 522 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 39029220 - 39029059
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacac-caaa 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||    |||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | |||||||||||  |||    
T  39029220 ggtaaagttgttgtcgtgtgactaaaaggtcataggttcaagccttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacacgaaaa 39029121  T
Q  619 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||    
T  39029120 tggtgggaccactttccggaccctgcatatgcgggagctttag-gca-caggatgccctttttt 39029059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 511 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 42164317 - 42164230
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 598  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  42164317 ttggcgcaac-ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaag 42164230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 566 - 657
Target Start/End: Original strand, 49796818 - 49796910
Alignment:
Q  566 ctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  49796818 ctggaaacagcctcttgtgttaaaacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 49796910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 511 - 618
Target Start/End: Original strand, 25343153 - 25343261
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||||||| ||||||| || |||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  25343153 ttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcacgtgactgataggtcacaggttcaagttctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtaca 25343251  T
Q  609 atacaccaaa 618  Q
    ||||||||||    
T  25343252 atacaccaaa 25343261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 589 - 679
Target Start/End: Original strand, 20225119 - 20225211
Alignment:
Q  589 acagggtaagaccgcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20225119 acagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 20225211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 570 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 51865149 - 51865037
Alignment:
Q  570 aaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||    
T  51865149 aaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggggccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttattgcacc 51865050  T
Q  668 aggttgccctttt 680  Q
     |  |||||||||    
T  51865049 ggactgccctttt 51865037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 558 - 666
Target Start/End: Original strand, 21489099 - 21489210
Alignment:
Q  558 ttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc-aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcggga 654  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||    
T  21489099 ttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagagtaagactgcgtacaatgcaccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggga 21489198  T
Q  655 gctctagtgcac 666  Q
    ||| | ||||||    
T  21489199 gctttcgtgcac 21489210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 524 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 23580365 - 23580205
Alignment:
Q  524 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa-tg 620  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||| ||    
T  23580365 taaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctagaaagagcctcttgtgtaaaaaacaggggaagactgcgtaggatacaccaaaatg 23580266  T
Q  621 gtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | | || ||||||   |||| ||| |||| ||||||| |||||||||  | |||||||||||    
T  23580265 gcgagaccccttcttggacc-tgtgtatgtgggagctttagtgcaccgagctgccctttttt 23580205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 511 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 30581636 - 30581481
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagaccgcgtac 607  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||  | ||| ||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||||||   |||||||||||||   | ||||    
T  30581636 ttggcgcaac-gctaaagttgttgtcacatcactaaaaggtcaagggttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggtgtgtac 30581538  T
Q  608 aatacacc-aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtg 663  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||    
T  30581537 aatacaccaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtaggagctttagtg 30581481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 511 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 54640508 - 54640431
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54640508 ttggcgcaac-ggtaaaattgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaa 54640431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 503 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 5313172 - 5313099
Alignment:
Q  503 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagc 576  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||| |||||||    
T  5313172 gggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaattcctgaaaacagc 5313099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 522 - 587
Target Start/End: Original strand, 43035224 - 43035289
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa 587  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  43035224 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccaggaaacaacctcttgtgtaa 43035289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 618 - 682
Target Start/End: Original strand, 32484307 - 32484371
Alignment:
Q  618 atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  32484307 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 32484371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 3580994 - 3580862
Alignment:
Q  523 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatg 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||| |||||||   |||||||||||||  || |||||| | | || ||||||||||||||    
T  3580994 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgagttcaagtc-tggaaac---ctcttgtgtaaaaaccatggtaaggctgtgtgcaatacaccaaatg 3580899  T
Q  621 gtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
     | ||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  3580898 ctaggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagct 3580862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 615 - 682
Target Start/End: Original strand, 28494222 - 28494289
Alignment:
Q  615 caaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  28494222 caaatggtgggaccccttcccagatcctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgccttttttt 28494289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 32629418 - 32629308
Alignment:
Q  531 gttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa-tggtgggatc 628  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||| |||| |    
T  32629418 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaaatcctcgaaacagcctcttgtaaaaaaacagggtaaggccgcctac-atacaccaaattggcgggacc 32629320  T
Q  629 ccttcccagacc 640  Q
    ||||||| ||||    
T  32629319 ccttcccggacc 32629308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 534 - 680
Target Start/End: Original strand, 7038041 - 7038188
Alignment:
Q  534 gtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc-aaatggtgggatccc 630  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   ||    
T  7038041 gtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcct-gaaacagcttcttgtgtaaaaaatagggtaagacttcgtacaatacaccaaaatggtggggcacc 7038139  T
Q  631 ttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    | ||| |||||||  ||| | |||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  7038140 tacccggaccctgcgtatac-ggagctttagtgcactgggttgccctttt 7038188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 605 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 33836563 - 33836484
Alignment:
Q  605 tacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  33836563 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacgggttgccctttttt 33836484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 589
Target Start/End: Original strand, 36589710 - 36589786
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36589710 ttggcgcaac-ggtaaagttgatgtcacatgactgaaacgtc-caggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 36589786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 617 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 38755970 - 38755908
Alignment:
Q  617 aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  38755970 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 38755908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 602 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 36816462 - 36816381
Alignment:
Q  602 gcgtacaatacaccaaat-ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||||||||||||  |||||||  ||||||  |||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  36816462 gcgtacaatacaccaaaaaggtgggactccttcctggaccctgtgtatgcgggagctttagtgtaccgggttgccctttttt 36816381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 521 - 642
Target Start/End: Original strand, 44357195 - 44357319
Alignment:
Q  521 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaagaccgcgtacaatacacc-aa 617  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||   | ||||||||||| |||||| ||| |||||||  ||| || |||||||  ||||||||||||| ||    
T  44357195 tggtaaagttattgttatgtaactgaaaggtcatgagttcaagtcctagaaacaaccttttgtgtaataaatagagtaagacgacgtacaatacaccaaa 44357294  T
Q  618 atggtgggatcccttcccagaccct 642  Q
    |||| |||| | |||||||||||||    
T  44357295 atggcgggacctcttcccagaccct 44357319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 511 - 616
Target Start/End: Original strand, 51420539 - 51420646
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtt-gcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtac 607  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||  |  | |||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | | ||||    
T  51420539 ttggcgcaac-ggtgaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcagttgattcaagtcatggaaacaacctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgggtac 51420637  T
Q  608 aatacacca 616  Q
    |||||||||    
T  51420638 aatacacca 51420646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 718 - 791
Target Start/End: Original strand, 54147571 - 54147644
Alignment:
Q  718 aatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaattggtttgtttgtttggttggtctagtgctcac 791  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  54147571 aatttgtttggttgttaggtgagtcaagatagtcctcacaattggtttgtttgtttggtaggtcaagtgctcac 54147644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 615 - 679
Target Start/End: Original strand, 11394923 - 11394987
Alignment:
Q  615 caaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11394923 caaatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 11394987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 615 - 679
Target Start/End: Original strand, 11404650 - 11404714
Alignment:
Q  615 caaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11404650 caaatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 11404714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 522 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 12257752 - 12257688
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta 586  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  12257752 ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaaatcctagaaacagcgtcttgtgta 12257688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 12711542 - 12711450
Alignment:
Q  586 aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 678  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  |  ||||||| | || |||||||||  |||||||||    
T  12711542 aaaatagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggcgggaccccttctcagacctagcgtatgcggaaactttagtgcacccagttgccctt 12711450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 503 - 543
Target Start/End: Original strand, 18969698 - 18969738
Alignment:
Q  503 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 543  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18969698 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 18969738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 20373974 - 20373898
Alignment:
Q  501 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcc 577  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||  |  |||||| |||| |||||||||    
T  20373974 aggggtaactttggcgcaactggtcaagttgttctcatatgactgaaatgtcacatgttcaattccttgaaacagcc 20373898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 522 - 592
Target Start/End: Original strand, 41549358 - 41549428
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacag 592  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  41549358 ggtaaagttgttgacacatgattgaaatgtcacgggttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaacag 41549428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 585 - 663
Target Start/End: Original strand, 16494258 - 16494338
Alignment:
Q  585 taaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa--tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtg 663  Q
    |||||||||||||  | || ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  16494258 taaaacagggtaaagctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccctttcccagaccctgtgtatgcggaagctttagtg 16494338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 499 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 29879679 - 29879634
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgact 544  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29879679 tgaggggtaacattggtgcaactgataaagttgttgtcatgtgact 29879634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 629 - 682
Target Start/End: Original strand, 35532077 - 35532130
Alignment:
Q  629 ccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  35532077 ccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 35532130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 40553998 - 40553937
Alignment:
Q  618 atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    |||||| || |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  40553998 atggtgtgaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 40553937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 618 - 679
Target Start/End: Original strand, 44718641 - 44718702
Alignment:
Q  618 atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |||| |||||||||||    
T  44718641 atggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagcacaccgggttgcccttt 44718702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 49938608 - 49938491
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaa 609  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||  | | |||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||||| | |||| |||    
T  49938608 ttggcgcaacggtaaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacagattcaagtcttggaagcagcgtattgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtccaa 49938509  T
Q  610 taca-ccaaatggtggga 626  Q
    | || | |||||||||||    
T  49938508 ttcatcaaaatggtggga 49938491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 628 - 681
Target Start/End: Original strand, 56322984 - 56323037
Alignment:
Q  628 cccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  56322984 cccttcccggaccccggatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 56323037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 820 - 902
Target Start/End: Original strand, 16870646 - 16870730
Alignment:
Q  820 actcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggt-gtttg-tgagtaagtgctcacaatttggtttctcctccc 902  Q
    ||||| |||| | |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  16870646 actcataatttgcttgtttggtgagtcgatttctcacactttggttgtttggtgagcatgtgctcacaatttggtttcttctccc 16870730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 12047823 - 12047721
Alignment:
Q  573 cagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggtt 672  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||  || | ||| || |||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||| |    
T  12047823 cagcctattgttaaaaacagggtaagactgcatacaatacaccagttgat-ggacccattcccataccctatgtatgcgggacctatagtgcaccaggct 12047725  T
Q  673 gccc 676  Q
    ||||    
T  12047724 gccc 12047721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 768
Target Start/End: Original strand, 16870561 - 16870620
Alignment:
Q  709 gtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaattggtttgtt 768  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  16870561 gtttggttcaatttgtttggttgttgggtgagtcaaaatagtgctcacaattggtttgtt 16870620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 617 - 679
Target Start/End: Original strand, 25388249 - 25388311
Alignment:
Q  617 aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||  |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25388249 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcatgagctttagtgcaccgggttgcccttt 25388311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 511 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 50856405 - 50856344
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaac 573  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  50856405 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacatgattgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaac 50856344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 682
Target Start/End: Original strand, 8820581 - 8820646
Alignment:
Q  617 aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  8820581 aatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgagagttttagtgcatcagattgtcctttttt 8820646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 537 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 10380086 - 10379997
Alignment:
Q  537 atgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtggg 625  Q
    |||||||||||||||  |  |||||||||||  ||||| |||||||||| |||| ||| ||| |  |||||||||||||||||| |||||    
T  10380086 atgtgactgaaaggtcacttgttcaagtcctacaaacaacctcttgtgtaaaaataggataaaattgcgtacaatacaccaaatagtggg 10379997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 500 - 681
Target Start/End: Original strand, 30533 - 30714
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 599  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  30533 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaggg 30632  T
Q  600 ccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30633 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 30714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 135; Significance: 8e-70; HSPs: 82)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 499 - 681
Target Start/End: Original strand, 1217065 - 1217247
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 598  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1217065 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgtagtcatgtcactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 1217164  T
Q  599 accgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
     | |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1217165 gctgcgtacaatacaccaaatggcgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttt 1217247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 504 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 22123092 - 22122918
Alignment:
Q  504 ggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgc 603  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  22123092 ggtaaccttggcgccactggtaaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaacagggtaaggctgc 22122993  T
Q  604 gtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 678  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22122992 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgagagctctagtgcaccgggttgccctt 22122918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 499 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 40272994 - 40272808
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 596  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  40272994 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 40272895  T
Q  597 agaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 683  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  40272894 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttta 40272808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 499 - 679
Target Start/End: Original strand, 39203491 - 39203671
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 598  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39203491 tgaggggtaaccttggcacaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccttgaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 39203590  T
Q  599 accgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  39203591 gttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccttgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 39203671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 500 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 13730785 - 13730599
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13730785 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 13730686  T
Q  598 gaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | | | |||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13730685 ggctgtgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 13730599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 499 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 13628975 - 13628789
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaa-gttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta--aaacagggt 595  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13628975 tgaggggtaaccttggcacaactggtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagggt 13628876  T
Q  596 aagaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||| | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13628875 aaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 13628789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 500 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 12914216 - 12914034
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12914216 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgaccgaaaggtcacaagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 12914117  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    | | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  12914116 ggcggcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccagaccctgcatatgcgggagcttcaatgcaccgggttgccctttt 12914034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 498 - 678
Target Start/End: Original strand, 22609741 - 22609921
Alignment:
Q  498 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggta 596  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22609741 ttgaggggtaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtaacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggta 22609839  T
Q  597 agaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 678  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  22609840 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccctt 22609921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 500 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 46421218 - 46421031
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  46421218 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46421119  T
Q  598 gaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct-agtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||    
T  46421118 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttaagtgcaccggtttgccctttttt 46421031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 498 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 7697068 - 7696893
Alignment:
Q  498 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7697068 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaacagggtaa 7696969  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 678  Q
    | | ||||||||||||||||||||      |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  7696968 ggctgcgtacaatacaccaaatgg-----ccccttcccggacactgcatatgtgggagctctagtgcaccgggtttccctt 7696893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 513 - 682
Target Start/End: Original strand, 26869696 - 26869866
Alignment:
Q  513 ggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaata 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  26869696 ggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctctggtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaata 26869795  T
Q  612 caccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||| ||  |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  26869796 caccaaatggtgggaccccttgccggaccatgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccctttttt 26869866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 500 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 52926391 - 52926216
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 599  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||     
T  52926391 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-------gtaagg 52926299  T
Q  600 ccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  52926298 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggacaccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccgggttgccctttttt 52926216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 498 - 680
Target Start/End: Original strand, 16735415 - 16735598
Alignment:
Q  498 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggta 596  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16735415 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggta 16735514  T
Q  597 agaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  ||||||| ||||  |||||||  ||||||||||||    
T  16735515 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggacactgcgtatgcggtagcttcagtgcactgggttgccctttt 16735598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 499 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 8247871 - 8247683
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 596  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8247871 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 8247772  T
Q  597 agaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct-agtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||   |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||||  ||||||||| ||||    
T  8247771 aggttgcgtacaatacaccaataatggtgggactccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttaagtgcactgggttgccctatttt 8247683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 501 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 29366902 - 29366719
Alignment:
Q  501 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaag 598  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  29366902 aggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaag 29366803  T
Q  599 accgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
     | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  29366802 gctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcactgggttgccctttt 29366719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 554 - 679
Target Start/End: Original strand, 31592879 - 31593004
Alignment:
Q  554 cgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcggg 653  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  31592879 cgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggactccttcccggaccctgcatatgcggg 31592978  T
Q  654 agctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  31592979 agctctagtgcaccgggttgcccttt 31593004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 500 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 6412002 - 6411834
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 598  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6412002 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgataggtcatgggttcaagtcttgtaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 6411903  T
Q  599 accgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||    
T  6411902 gctgcgtacaatacaccaaatgatgggaccccttcccagaccttgcgtatgcgggagctttagtgcacc 6411834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 511 - 682
Target Start/End: Original strand, 26573115 - 26573287
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  26573115 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtaca 26573213  T
Q  609 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  26573214 atacaccaattggtgggaccccatcccggaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcaccaggctgccctctttt 26573287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 499 - 662
Target Start/End: Original strand, 9607178 - 9607345
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 596  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  9607178 tgaggggtaaccttggcgcaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatcggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggta 9607277  T
Q  597 agaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagt 662  Q
    || | ||||| |||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  9607278 aggctgcgtagaatacaccaataatgttgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 9607345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 527 - 682
Target Start/End: Original strand, 7942993 - 7943150
Alignment:
Q  527 agttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgg 624  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7942993 agttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcatcttgtctaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacatcaaatggtgg 7943092  T
Q  625 gatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||    
T  7943093 gatccctttccagaccatgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgccttttttt 7943150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 573 - 683
Target Start/End: Original strand, 15797271 - 15797381
Alignment:
Q  573 cagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggtt 672  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15797271 cagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccgggtt 15797370  T
Q  673 gccctttttta 683  Q
    |||||||||||    
T  15797371 gccctttttta 15797381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 497 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 5173905 - 5173717
Alignment:
Q  497 tttgaggggtaactttggcgcaactggtaaa-gttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-caggg 594  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |    
T  5173905 tttgaggggtaaccttggcgcaactcgtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacaaag 5173806  T
Q  595 taagaccgcgtacaatacaccaaa--tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    ||||   || | ||||||||||||  |||||||  |||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5173805 taaggttgcatgcaatacaccaaaaatggtggggccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 5173717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 500 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 10870132 - 10870033
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 598  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10870132 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 10870033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 523 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 34420802 - 34420641
Alignment:
Q  523 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc-aaat 619  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||    
T  34420802 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtaccatacaccaaaat 34420703  T
Q  620 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||  |||| ||||||| ||||||||  || ||||||||||    
T  34420702 ggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgtgggagctttagtgcacatggctgcccttttt 34420641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 532 - 681
Target Start/End: Original strand, 516417 - 516571
Alignment:
Q  532 ttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc---aaatggtggga 626  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||||| |||   |||||| ||||    
T  516417 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgcacaataaaccaaaaaatggcggga 516516  T
Q  627 tcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
     |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  516517 ccccttccccgaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 516571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 500 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 4495845 - 4495717
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||||||    
T  4495845 gaggggtaaccttcgcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctgaaaatagcctattgtgtaaaaaacagggtaa 4495746  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtggga 626  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||    
T  4495745 ggctgcgtacaatacaccaaatggtggga 4495717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 574 - 681
Target Start/End: Original strand, 26292382 - 26292489
Alignment:
Q  574 agcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttg 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26292382 agcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacgatacaccaaatgatgggatcccttcccgaaccctgcatatgcgggaactctagtgcaccgggttg 26292481  T
Q  674 cccttttt 681  Q
     |||||||    
T  26292482 tccttttt 26292489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 554 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 10795552 - 10795423
Alignment:
Q  554 cgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa--tggtgggatcccttcccagaccctgtatatg 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||  ||||    
T  10795552 cgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatg 10795453  T
Q  650 cgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10795452 cgggagcttcagtgcaccaggttgcccttt 10795423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 582 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 34771461 - 34771362
Alignment:
Q  582 gtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  34771461 gtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgcccttttt 34771362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 564 - 681
Target Start/End: Original strand, 54484730 - 54484850
Alignment:
Q  564 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctcta 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   || |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||    
T  54484730 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttta 54484829  T
Q  661 gtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  54484830 gtgcaccgggttgcccttttt 54484850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 511 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 45620998 - 45620881
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagaccgcgtac 607  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||    
T  45620998 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgtac 45620900  T
Q  608 aatacaccaaatggtggga 626  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  45620899 aatacaccaattggtggga 45620881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 523 - 682
Target Start/End: Original strand, 25944468 - 25944630
Alignment:
Q  523 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc-aaat 619  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  25944468 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaaccgcctctcgtgtaaaaaactgggcaaggctgagtacaatacaccaaaat 25944567  T
Q  620 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||| |||||||| |||||||  |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  25944568 ggtgggaccccttccctgaccctgcgtatgtgggagctttagcgcaccaggctgccctttttt 25944630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 522 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 53996725 - 53996563
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc-aaa 618  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | || ||||||||||| |||    
T  53996725 ggtaaatttgttgtcatttgactgaaaggtcacgtgttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcttacaatacaccaaaa 53996626  T
Q  619 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||  |||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  53996625 tggtgggaccccttccctgacactgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgcccttttt 53996563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 556 - 679
Target Start/End: Original strand, 14986989 - 14987116
Alignment:
Q  556 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcg 651  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| || ||||| |||| || |||||||    
T  14986989 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggacccattcccggaccttgcatatgcg 14987088  T
Q  652 ggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  14987089 ggagctttagtgcaccgggtttcccttt 14987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 499 - 682
Target Start/End: Original strand, 12525385 - 12525567
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggta 596  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12525385 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgt---catatgactgaaaggtcacaggttcgagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggta 12525481  T
Q  597 agaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    || | ||| |  | ||   |||||||||||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  12525482 aggctgcgaagtacaccaaaaatggtgggacaccttcctagaccctgtgtatacgggagcttcactgcaccaggttgctctttttt 12525567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 539 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 54374488 - 54374341
Alignment:
Q  539 gtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaagaccgcgtacaatacaccaaa-tggtgggatcccttccc 635  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  54374488 gtgactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcgtacaatccaccaaaatggtgggaccccttccc 54374389  T
Q  636 agaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 683  Q
     ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||    
T  54374388 ggaccctgcatatgcgggagctttagttcaccaggctgccatttttta 54374341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 526 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 30928302 - 30928169
Alignment:
Q  526 aagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtg 623  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||   | ||| |||||||||| ||| |    
T  30928302 aagttcttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgtgtaaaatacaccaattggcg 30928203  T
Q  624 ggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  30928202 ggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagct 30928169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 535 - 663
Target Start/End: Original strand, 33926094 - 33926224
Alignment:
Q  535 tcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacca-aatggtgggatccctt 632  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  33926094 tcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccataatggtgggacccctt 33926193  T
Q  633 cccagaccctgtatatgcgggagctctagtg 663  Q
    ||  ||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  33926194 cctggaccctgcatatgcgagagctttagtg 33926224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 567 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 49013589 - 49013469
Alignment:
Q  567 tggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagt 662  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||    
T  49013589 tggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatacgcgggagctttagt 49013490  T
Q  663 gcaccaggttgccctttttta 683  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  49013489 gcaccgggttgccctttttta 49013469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 496 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 25517358 - 25517169
Alignment:
Q  496 gtttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagt--cctggaaacagcctcttgtgtaaaa---c 590  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || | | |   |||||||||| ||||||||||||||   |    
T  25517358 gttttagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggatgatgggacctggaaacatcctcttgtgtaaaaaaac 25517259  T
Q  591 agggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    | | || | | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25517258 aagatatggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgctggagctttagtgcaccgggttgccctttt 25517169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 511 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 45949010 - 45948850
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaa---aggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaagaccgcgt 605  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||   ||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| | || |    
T  45949010 ttggcgcaac-ggtgaagttgttttcatgtgactgaaggaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcat 45948912  T
Q  606 acaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  45948911 acaatacaccaattggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 45948850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 522 - 667
Target Start/End: Original strand, 19731000 - 19731147
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaat 619  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||   |||||||||||||| | |    
T  19731000 ggtaaatttgttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgcgtacaatacacctatt 19731099  T
Q  620 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||    
T  19731100 ggtgggaccctttcccagactctgtgtatgcaggagctttagtgcacc 19731147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 520 - 678
Target Start/End: Original strand, 33235526 - 33235687
Alignment:
Q  520 ctggtaaagttgttgtcatgtgac-tgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaagaccgcgtacaatacacc 615  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||||| || || ||| ||||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||||||     
T  33235526 ctggtaaagttgttgtcatgtgacatgaaaggtcacaagttcaaatcgtgtaaagagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactgtgtacaatacact 33235625  T
Q  616 aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 678  Q
    ||||||||||| ||| || |||||| |   ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  33235626 aaatggtggga-cccctcgcagaccttacgtatgcggaagctttagtgcaccaggttgccctt 33235687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 604 - 683
Target Start/End: Original strand, 24577917 - 24577996
Alignment:
Q  604 gtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 683  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24577917 gtacaatacactaaatggtgggatcctttcccagaccctgcatatacgggagctctagtgcaccggattgccctttttta 24577996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 570 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 45786327 - 45786209
Alignment:
Q  570 aaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa--tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgca 665  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||| |||||| |||||||    
T  45786327 aaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgaatgctggagctttagtgca 45786228  T
Q  666 ccaggttgcccttttttag 684  Q
    || ||||||||||| ||||    
T  45786227 ccgggttgccctttattag 45786209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 535 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 45139624 - 45139515
Alignment:
Q  535 tcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagaccgcgtacaatacacc--aaatggtgggatccc 630  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  45139624 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagttttggaaacaacctcttgtgtaaaacacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggacccc 45139525  T
Q  631 ttcccagacc 640  Q
    ||||||||||    
T  45139524 ttcccagacc 45139515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 570 - 644
Target Start/End: Original strand, 47624088 - 47624163
Alignment:
Q  570 aaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgt 644  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  47624088 aaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgt 47624163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 586 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 353444 - 353351
Alignment:
Q  586 aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccct 677  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  353444 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 353351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 535 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 54032705 - 54032612
Alignment:
Q  535 tcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtggga 626  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||    
T  54032705 tcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccgaatggtggga 54032612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 522 - 596
Target Start/End: Original strand, 53062036 - 53062112
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  53062036 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtcaaaaacagggta 53062112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 530 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 8411016 - 8410889
Alignment:
Q  530 tgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcc 629  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| | ||  |||||||||||| |||||||| |     
T  8411016 tgttgtcatgggactgaaaggtcaccggttcaggtcctggaaactgcctcgtgtaaaaaacagggtaaggctgctcacaatacaccaactggtgggacct 8410917  T
Q  630 cttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    |||| ||||||||| ||| |||| ||||    
T  8410916 cttctcagaccctgcataggcggaagct 8410889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 604 - 683
Target Start/End: Original strand, 24578007 - 24578086
Alignment:
Q  604 gtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 683  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24578007 gtacaatacactaaatggtgggactctttcccagaccctacatatgcgggaactctagtgcaccgggttgccctttttta 24578086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 563 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 31904975 - 31904857
Alignment:
Q  563 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtggga-tcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct 659  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |   | |||||||||| |    
T  31904975 gtcctggaaacagcctattatgtaaaaaacagggtatgactgcgtacaatacaccaaatggtgggacccccttcccagatcttacgtgtgcgggagcttt 31904876  T
Q  660 agtgcaccaggttgccctt 678  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  31904875 agtgcaccaggctgccctt 31904857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 511 - 589
Target Start/End: Original strand, 35417904 - 35417981
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35417904 ttggcgcaac-ggtaaagttgttatcatgtgactgagaggtcacgagttcaaatcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 35417981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 526 - 633
Target Start/End: Original strand, 39211992 - 39212101
Alignment:
Q  526 aagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa--aacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtg 623  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||| || |||  |    
T  39211992 aagttgtcgttatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaataacctcttgtgtaaataacaaggtaagactgcgtacaatacatcagatgacg 39212091  T
Q  624 ggatcccttc 633  Q
    ||||||||||    
T  39212092 ggatcccttc 39212101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 613 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 24851367 - 24851298
Alignment:
Q  613 accaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24851367 accaaatggtgggaccccttcccggatcctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 24851298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 619 - 680
Target Start/End: Original strand, 30452892 - 30452953
Alignment:
Q  619 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30452892 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 30452953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 522 - 667
Target Start/End: Original strand, 19751576 - 19751723
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaat 619  Q
    |||||| || |||||| |||| ||||||||  ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||   |||||||||||||| | |    
T  19751576 ggtaaattttttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaatcaaggtaaggttgcgtacaatacacctatt 19751675  T
Q  620 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
    ||||||| || |||||||||  ||| |||||  ||||| |||||||||    
T  19751676 ggtgggaccctttcccagactttgtgtatgcatgagctttagtgcacc 19751723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 503 - 619
Target Start/End: Original strand, 21874999 - 21875111
Alignment:
Q  503 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaga 599  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| | ||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||     
T  21874999 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactga-------cgggttcaaattctggaaacaacctcttgtgttaaaaaagagggtaagg 21875091  T
Q  600 ccgcgtacaatacaccaaat 619  Q
    | ||||||||||||| ||||    
T  21875092 ctgcgtacaatacactaaat 21875111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 679
Target Start/End: Original strand, 31831241 - 31831343
Alignment:
Q  566 ctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgca 665  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||           || ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  31831241 ctggaaacagcctcttgtgtaaaatagggtaaggctgcatacaatacaccaaatggt-----------ccggaccctgcatatgcgggtgctctagtgca 31831329  T
Q  666 ccaggttgcccttt 679  Q
    || |||||||||||    
T  31831330 ccgggttgcccttt 31831343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 556 - 633
Target Start/End: Original strand, 55401208 - 55401288
Alignment:
Q  556 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc-aaatggtgggatcccttc 633  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  55401208 ggttcaagtcctgtaaacagcctcttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtataatacaccaaaatggtgggaccccttc 55401288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 557 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 43114994 - 43114882
Alignment:
Q  557 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaa-gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccaga-ccctgtatatgcg 651  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |  | |||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||  ||||||    
T  43114994 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggctacctacaatacaccaaatggtggga-cccttcctggacccctgcgtatgcg 43114896  T
Q  652 ggagctctagtgca 665  Q
    |||||| |||||||    
T  43114895 ggagctttagtgca 43114882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 503 - 589
Target Start/End: Original strand, 26782345 - 26782431
Alignment:
Q  503 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||  ||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  26782345 gggtaaccttgacgcaattggtaaagttattgtcatgcgattgaaaggtcacggattcaagtccttgaaacaatctcttgtgtaaaa 26782431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 555 - 654
Target Start/End: Original strand, 9276289 - 9276395
Alignment:
Q  555 gggttcaagtcctggaaaca------gcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtat 646  Q
    ||||||||||||||||||||      |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||  |    
T  9276289 gggttcaagtcctggaaacaacctcagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggt-ggaccctttcccggaccctgcgt 9276387  T
Q  647 atgcggga 654  Q
    ||||||||    
T  9276388 atgcggga 9276395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 543 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 52428616 - 52428532
Alignment:
Q  543 ctgaaaggttgcgggttcaagtc-ctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgg 624  Q
    |||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  52428616 ctgaaaggtcacgggtttaagtctctggaagcagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatagtgg 52428532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 50625072 - 50624949
Alignment:
Q  562 agtcctggaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct 659  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||   |||||||||||||||  ||||||||  ||||||  | |||||  || | ||||||| |    
T  50625072 agtcctagaaacagcctcttgtgtataaaaaagggtaaggtagcgtacaatacaccatttggtgggacgccttcctgggccctgcgtaagtgggagcttt 50624973  T
Q  660 agtgcaccaggttgccctttttta 683  Q
    |||||||| || ||||||||||||    
T  50624972 agtgcaccgggctgccctttttta 50624949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 11461826 - 11461733
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcg---caactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| | |||| |||| ||||||| || || ||||||||||    
T  11461826 tgaggggtaactttgacgacgcaactggtaaagttgttgtcatatgacaggaaggttacaggtttaagttctggaaatagtcttttgtgtaaaa 11461733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 522 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 44403715 - 44403553
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagaccgcgtacaata-caccaaa 618  Q
    ||||||||| |||||| ||| || ||||||  | |||| ||||||||| || |||||||||||||||  ||| |||||| | ||| | |||| ||| |||    
T  44403715 ggtaaagttattgtcacgtggctaaaaggtcacaggttaaagtcctgggaatagcctcttgtgtaaaagacaaggtaaggctgcggagaataccacaaaa 44403616  T
Q  619 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    |||||||| |||||||| ||||||   ||||| | |||| ||||||||| || |||| |||||    
T  44403615 tggtgggaccccttcccggaccctacgtatgctgaagctttagtgcaccgggctgcctttttt 44403553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 680 - 803
Target Start/End: Original strand, 50295443 - 50295566
Alignment:
Q  680 tttagtttcgttcagtttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaattggtttgtttgtttggttgg 779  Q
    |||||||  ||||||||| |||| |||  ||||| |||||||||||||| |||||  |||||   | ||| || ||||||| | |||||||||| || ||    
T  50295443 tttagttcggttcagtttaatttcgttctgtttggttcaatttgtttggttgttggatgagttgagatagtgcacacaatttgattgtttgtttagtggg 50295542  T
Q  780 tctagtgctcacaatttagttgtt 803  Q
    || |||||||||||||| ||||||    
T  50295543 tcaagtgctcacaatttggttgtt 50295566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 510 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 829612 - 829454
Alignment:
Q  510 tttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagaccgcgtac 607  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    || |||||||| || |||||| |||||||| ||||  |||  ||||    ||||||    
T  829612 tttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaagacc-cgagttcaagttctagaaacaacctcttgtctaaagaacatagtaaagttgcgtac 829515  T
Q  608 aatacaccaaa-tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||  ||||| |||||| |||||||||    
T  829514 aatacaccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgcacc 829454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 637 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 6242327 - 6242282
Alignment:
Q  637 gaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6242327 gaccctgcatatgcaggagctctagtgcaccgggttgccctttttt 6242282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 500 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 43956640 - 43956552
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| ||   ||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  43956640 gagggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgttacttgactgaaaagtccggggttcatgttctggaaacagcctcatgtgtaaaa 43956552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 499 - 539
Target Start/End: Original strand, 9276249 - 9276289
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatg 539  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9276249 tgaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatg 9276289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 521 - 589
Target Start/End: Original strand, 9627712 - 9627780
Alignment:
Q  521 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9627712 tggtaacgttggtgtcacgtgactgaaagggtatgggtttaagtcctagaaacagactcttgtgtaaaa 9627780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 500 - 544
Target Start/End: Original strand, 39430465 - 39430509
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgact 544  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  39430465 gaggggtaactttgacgcaactggtaaagttgctgtcatctgact 39430509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 524 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 1121382 - 1121260
Alignment:
Q  524 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaagaccgcgtacaatacacc-aaatg 620  Q
    |||| ||||||||  ||| |||||||||  || ||| |||||||||||||| | |||||||||  ||| | ||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  1121382 taaatttgttgtccggtggctgaaaggtcacgtgtttaagtcctggaaacaacttcttgtgtaagaaataaggtgagactgcgtacaatacaccaaaatg 1121283  T
Q  621 gtgggatcccttcccagaccctg 643  Q
    | |||| || ||| |||||||||    
T  1121282 gcgggagcctttctcagaccctg 1121260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 563 - 670
Target Start/End: Original strand, 31672732 - 31672842
Alignment:
Q  563 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtggga-tcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct 659  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  || || ||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | | |   | |||||||||| |    
T  31672732 gtcctggaaacagcctattatgtaaaaaacaaggcaagagtgcgtacaatacaccaaatggtgggactctcttcccatatcttacgtgtgcgggagcttt 31672831  T
Q  660 agtgcaccagg 670  Q
    |||||||||||    
T  31672832 agtgcaccagg 31672842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 833 - 902
Target Start/End: Original strand, 42530741 - 42530812
Alignment:
Q  833 ttgtttggtgggtcgagtgctcacactttgg-tgttt-gtgagtaagtgctcacaatttggtttctcctccc 902  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  42530741 ttgtttggtgagtcgagttctcacactttggttgtttggtgagcgtgtgctcacaatttggtttcttctccc 42530812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 631 - 682
Target Start/End: Original strand, 47624208 - 47624259
Alignment:
Q  631 ttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  47624208 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 47624259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 522 - 619
Target Start/End: Original strand, 28904941 - 28905041
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa---aacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa 618  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||| |||||| || ||||| |||||||||||   |||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  28904941 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaagtcacatgtttaagtccagggaacagtctcttgtgtaaaataacaaggtaagactgtgtacattacaccaaa 28905040  T
Q  619 t 619  Q
    |    
T  28905041 t 28905041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 646 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 4495709 - 4495672
Alignment:
Q  646 tatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 683  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  4495709 tatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttta 4495672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 503 - 540
Target Start/End: Original strand, 23871418 - 23871455
Alignment:
Q  503 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgt 540  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23871418 gggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgt 23871455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 134; Significance: 3e-69; HSPs: 76)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 499 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 21779441 - 21779260
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 598  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21779441 tgaggggtaaccttggcgcaactggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggagacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 21779342  T
Q  599 accgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21779341 gttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 21779260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 499 - 679
Target Start/End: Original strand, 23397719 - 23397899
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 598  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23397719 tgaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatagggtaag 23397818  T
Q  599 accgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
     |  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23397819 gctacgtacaatacaccaaatggtgggaccccttctcggaccctacatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 23397899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 500 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 8455497 - 8455315
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaa 597  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8455497 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacacagggtaa 8455398  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8455397 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgccggagctttagtgcaccgggttgccctttt 8455315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 500 - 680
Target Start/End: Original strand, 9671134 - 9671315
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg-aaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 598  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9671134 gaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaatgtcacgggttcaaatcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 9671233  T
Q  599 accgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9671234 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 9671315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 496 - 679
Target Start/End: Original strand, 14530268 - 14530455
Alignment:
Q  496 gtttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagg 593  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  14530268 gtttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagg 14530367  T
Q  594 gtaagaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    ||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14530368 gtaaggctacgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 14530455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 501 - 679
Target Start/End: Original strand, 10543653 - 10543835
Alignment:
Q  501 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaag 598  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  10543653 aggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacggcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 10543752  T
Q  599 accgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
     | ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10543753 gctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 10543835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 503 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 25249915 - 25249735
Alignment:
Q  503 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaacagggtaagacc 601  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |     
T  25249915 gggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagtctcttgtgtacaaacagggtaaggct 25249816  T
Q  602 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  25249815 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcaccgggttgccctttttt 25249735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 502 - 680
Target Start/End: Original strand, 11514392 - 11514571
Alignment:
Q  502 ggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaga 599  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||     
T  11514392 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaactcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaagtaagg 11514491  T
Q  600 ccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  11514492 ctgcgtacaatacaccaaatggtggga-cccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgccctttt 11514571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 500 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 12024099 - 12023955
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 598  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12024099 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 12024000  T
Q  599 accgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctg 643  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  12023999 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccctcccggaccctg 12023955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 501 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 24200805 - 24200622
Alignment:
Q  501 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaag 598  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24200805 aggggtaaccttgatgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 24200706  T
Q  599 accgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
     | ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||  |||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24200705 gctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaacccttcccggaccctgagtatgtgagagctttagtgcaccgggttgccctttt 24200622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 502 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 19977893 - 19977710
Alignment:
Q  502 ggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaga 599  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  || ||||     
T  19977893 ggggtaaccttggcggaactggtgaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttttgtaaaaaataggataagg 19977794  T
Q  600 ccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 683  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  19977793 ttgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttagtgcaccagattaccctttttta 19977710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 537 - 682
Target Start/End: Original strand, 14444720 - 14444866
Alignment:
Q  537 atgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttccc 635  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14444720 atgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgtgtacgatacaccaaatggtgggaccccttccc 14444819  T
Q  636 agaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
     |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14444820 ggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgccctttttt 14444866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 498 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 25079901 - 25079717
Alignment:
Q  498 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacaggg 594  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | |||||| ||||||||||   |||||| ||    
T  25079901 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttagaaacaacctcttgtgtaaaaaaacaagg 25079802  T
Q  595 taagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    ||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25079801 taaggatgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaagagctttagtgcaccgggttgcccttt 25079717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 499 - 644
Target Start/End: Original strand, 22371010 - 22371154
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 598  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  22371010 tgaggggtaaccttggcccaactggtaaagttgttgtcatgtgactgggaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcgtgt-aaaaacagggtaag 22371108  T
Q  599 accgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgt 644  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22371109 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgt 22371154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 500 - 682
Target Start/End: Original strand, 7214488 - 7214674
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaa 597  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  7214488 gaggggtaactttggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaatacagggtaa 7214587  T
Q  598 gaccgcgtacaatacac--caaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | | |||||||||||||   |||||||| ||||||||| | ||| |||  |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  7214588 ggctgcgtacaatacacaaaaaatggtgagatcccttctcggacactgcgtatgcgagagttttagtgcaccaggttgccttttttt 7214674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 506 - 681
Target Start/End: Original strand, 27573581 - 27573757
Alignment:
Q  506 taactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaacagggtaagaccgcg 604  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||| | |||    
T  27573581 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcattggttcaagtccgggcaacagcctcttgtgtataaacatggtaaggctgcg 27573680  T
Q  605 tacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    |||||||||||||||||||| | |  |||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  27573681 tacaatacaccaaatggtggaaccatttcccaaaccctgtgtatgtgggagctttagtgcatcgggttgcccttttt 27573757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 537 - 682
Target Start/End: Original strand, 10546153 - 10546301
Alignment:
Q  537 atgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttc 633  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10546153 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacatcctcttgtataaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttc 10546252  T
Q  634 ccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    || |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  10546253 ccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 10546301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 517 - 684
Target Start/End: Original strand, 17667973 - 17668142
Alignment:
Q  517 caactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacac 614  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||    
T  17667973 caactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacac 17668072  T
Q  615 caaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttttag 684  Q
    |||||||||| | |||||| |  ||||||  |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17668073 caaatggtggaaccccttctcgaaccctgcgtatatgggagctttagtgcaccgggttgcccttttttag 17668142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 501 - 679
Target Start/End: Original strand, 14544018 - 14544201
Alignment:
Q  501 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaa 597  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  14544018 aggggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacaggtccaggtactggaaacagcctcttgtgtagaaaaacagggtaa 14544117  T
Q  598 gaccgcgtacaata--caccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    ||| |||| |||||  ||  ||||||| ||| |||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14544118 gactgcgtgcaataaccaaaaaatggtcggaccccttccgggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaagttgcccttt 14544201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 523 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 99421 - 99281
Alignment:
Q  523 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggt 622  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  99421 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtaaaaaacatggcaaggctgcgtacaatacaccaaatggt 99322  T
Q  623 gggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtg 663  Q
    || | |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  99321 ggaaccccttctcagaccctgtgtatgcgggagctttagtg 99281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 502 - 681
Target Start/End: Original strand, 17896215 - 17896397
Alignment:
Q  502 ggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaag 598  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||||||||   |||| ||||||||    
T  17896215 ggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaaatagggtaag 17896314  T
Q  599 accgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
     | |||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||  |||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  17896315 gctgcgtacaatataccaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcatcgagttgcccttttt 17896397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 501 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 32781467 - 32781298
Alignment:
Q  501 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaag 598  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||  || |||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  32781467 agggggaaccttggcgcaa-tggtaaagttgttgcaatgttgctgaaaggtcacgagttcaagtctcggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 32781369  T
Q  599 accgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccagg 670  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  32781368 actgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgggagct-ttgtgcaccagg 32781298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 500 - 680
Target Start/End: Original strand, 5840982 - 5841166
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||    
T  5840982 gaggggtaaccttggtgcaaatgataaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaa 5841081  T
Q  598 gaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    |   |||||||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  5841082 ggatgcgtacaatacatcaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgccctttt 5841166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 517 - 684
Target Start/End: Original strand, 17623535 - 17623704
Alignment:
Q  517 caactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacac 614  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||    
T  17623535 caactggtaaagttgttgtcatgcgactggaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacac 17623634  T
Q  615 caaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttttag 684  Q
    |||||||||| | ||||||||  | ||||  |||| || |||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  17623635 caaatggtggaaccccttcccgaatcctgcgtatgtggaagctttagtgcactgggttgcccttttttag 17623704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 562 - 682
Target Start/End: Original strand, 36871509 - 36871629
Alignment:
Q  562 agtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctcta 660  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||||||| ||    
T  36871509 agtcctggaaacagcctcttgtgtgaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgga-cctgcgtatgcgggagcttta 36871607  T
Q  661 gtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  36871608 gtgcaccgggttgccctttttt 36871629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 512 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 39914475 - 39914305
Alignment:
Q  512 tggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||| ||||||||||   |||||||||||||   | |||||    
T  39914475 tggcgcatctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggatcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggatgtgtaca 39914376  T
Q  609 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || |||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  39914375 atacaccgaatggtgggacccctt-cctgaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccctttt 39914305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 511 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 24860156 - 24859985
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaa 609  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| |||| |||||| ||| || | ||||||||    
T  24860156 ttggcgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactggaaggttacgggtttaagccctggaaacaacctctggtgtaaaaacatggt-aggctgcgtacaa 24860058  T
Q  610 tacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||||||||| | | |||||| | |||||||  |||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||    
T  24860057 tacaccaaatggtagaaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgccttttttt 24859985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 522 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 21377232 - 21377095
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaat 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | | ||||||| ||||||||    
T  21377232 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacgagttcaagtcatagaaacatcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgggtacaatgcaccaaat 21377133  T
Q  620 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||  |||| |||||||    
T  21377132 ggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgtgggagct 21377095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 524 - 634
Target Start/End: Original strand, 5450263 - 5450376
Alignment:
Q  524 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatg 620  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||   |||||| |||||| | ||||||||||||||||| |    
T  5450263 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaagg 5450362  T
Q  621 gtgggatcccttcc 634  Q
    |||||| |||||||    
T  5450363 gtgggaccccttcc 5450376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 500 - 616
Target Start/End: Original strand, 17705449 - 17705567
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaa--aacagggtaa 597  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||    
T  17705449 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaacaacagagtaa 17705548  T
Q  598 gaccgcgtacaatacacca 616  Q
    | | | |||||||||||||    
T  17705549 ggctgtgtacaatacacca 17705567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 500 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 26684803 - 26684618
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacag-cctcttgtgtaaaacag---ggt 595  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |    |||    
T  26684803 gaggggtaactttagcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcaaaggtttaagtcctgaaaacagacctcttgtgtaaaaaaatatggt 26684704  T
Q  596 aagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    ||| | |||||||||| || ||||||||||| | ||||||  ||||||  |||||||||||| || |||||| | ||| |||||||    
T  26684703 aaggctgcgtacaatatactaaatggtgggacctcttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttaatgcaccggattgtccttttt 26684618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 522 - 657
Target Start/End: Original strand, 33795261 - 33795398
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtac-aatacaccaaa 618  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| | |||||| ||||||||  |    
T  33795261 ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaacaacctcttgggtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaaatacacc-ta 33795359  T
Q  619 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33795360 tggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgggagct 33795398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 561 - 682
Target Start/End: Original strand, 30826052 - 30826173
Alignment:
Q  561 aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct 659  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  30826052 aagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaatagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtggaa-cccttcccagaccctacatatgcgggagcttt 30826150  T
Q  660 agtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||||| ||| ||||||||    
T  30826151 agtgcaccagattgtcctttttt 30826173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 511 - 680
Target Start/End: Original strand, 44643488 - 44643659
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaagaccgcgtac 607  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  || |||||||| || |||| ||||||||  ||||||   ||| ||||| | ||||||    
T  44643488 ttggcgcaa-tggtaaagttgtcatcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagttctagaaagagcctcttccgtaaaaaaacagagtaaggctgcgtac 44643586  T
Q  608 aatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  44643587 aatgtaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagccttagtgcaccgggctgccctttt 44643659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 521 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 40417031 - 40416871
Alignment:
Q  521 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| ||| | | ||||||||||||||     
T  40417031 tggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaaaacagggaaaggctgtgtacaatacaccaat 40416932  T
Q  619 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    || ||||| || ||    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  40416931 tgatgggacccttttttggaccctgcatatgcgagagctttagtgcaccgggttgcccttt 40416871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 531 - 682
Target Start/End: Original strand, 25641487 - 25641639
Alignment:
Q  531 gttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcc 629  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25641487 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcattttgtgtgaaaacagggtaaagttgcgtacaatacaccaaattgtgggaccc 25641586  T
Q  630 cttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||  | ||||  |||||| ||||| ||||| ||| | ||| ||||||||    
T  25641587 cttcccgaatcctgcgtatgcgagagctttagtgaaccggattgtcctttttt 25641639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 524 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 31158598 - 31158437
Alignment:
Q  524 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa--t 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||  ||||||||||  || ||||||| ||||||  |    
T  31158598 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttaaagtcttcaaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaagattgcatacaataaaccaaaaat 31158499  T
Q  620 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | ||| |||||||    
T  31158498 ggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtacacctgattgtccttttt 31158437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 511 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 4516520 - 4516354
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |   ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||    
T  4516520 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacatattcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggcaacgctgcgtaca 4516422  T
Q  609 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccc 676  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||  |||| || |||| ||||| ||| || |||||    
T  4516421 atacaccaattggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtggaagctttagtgtaccgggctgccc 4516354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 684 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 1173765 - 1173669
Alignment:
Q  684 gtttcgttcagtttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaattggtttgtttgtttggttggt 780  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||  |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1173765 gtttggttcagtttgatttggtttcgtttgattaaatttgtttggttgttaggtgagtcaagatagttctcaaaattggtttgtttgtttgtttggt 1173669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 526 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 17380391 - 17380259
Alignment:
Q  526 aagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgg 624  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||   | || |||||||||||||| |||    
T  17380391 aagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtataaacagggtaaggttgtgtgcaatacaccaaatgatgg 17380292  T
Q  625 gatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
     | |||||||  |||||||   |||||||||||    
T  17380291 aaccccttcctggaccctgcggatgcgggagct 17380259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 566 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 40762349 - 40762234
Alignment:
Q  566 ctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtg 663  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||  |||| ||||||| |||||    
T  40762349 ctggaaacagcctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctacgtacaatacaccaaatggtgggaccctttcctggaccctgcgtatgtgggagctttagtg 40762250  T
Q  664 caccaggttgcccttt 679  Q
    |||| |||||||||||    
T  40762249 caccgggttgcccttt 40762234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 522 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 23145857 - 23145736
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaat 619  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |    
T  23145857 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacaccaatt 23145758  T
Q  620 ggtgggatcccttcccagaccc 641  Q
    ||||||| || ||||| |||||    
T  23145757 ggtgggaccctttcccggaccc 23145736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 522 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 23557647 - 23557526
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaat 619  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |    
T  23557647 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacaccaatt 23557548  T
Q  620 ggtgggatcccttcccagaccc 641  Q
    ||||||| || ||||| |||||    
T  23557547 ggtgggaccctttcccggaccc 23557526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 518 - 599
Target Start/End: Original strand, 44604826 - 44604908
Alignment:
Q  518 aactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaga 599  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  44604826 aactgctaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaga 44604908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 523 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 45235976 - 45235813
Alignment:
Q  523 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca---gggtaagaccgcgtacaatacaccaaat 619  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |   ||||||| |  |||  ||||||| ||||    
T  45235976 gtaaagttgttctcatgtgactgaaagatcacgagttcaagtcctagaaacagtctcttctgtaaaataatagggtaaggctacgtgtaatacacaaaat 45235877  T
Q  620 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 683  Q
    ||||||| ||||| |||||||||   ||||| |||||| ||||| |||| ||||||| ||||||    
T  45235876 ggtgggaccccttaccagaccctacgtatgcaggagctttagtgtaccaagttgccccttttta 45235813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 555 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 15296533 - 15296403
Alignment:
Q  555 gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagaccgcgtacaatacacc-aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcg 651  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||||||||| | |||||||  |||| |    
T  15296533 gggttcaagtcccggaaacagcctgttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatataccaaaatagtgggatcccttctcggaccctgcgtatgtg 15296434  T
Q  652 ggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | |||| | |||| ||||| |||||||||||    
T  15296433 gaagctttggtgcgccaggctgccctttttt 15296403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 535 - 668
Target Start/End: Original strand, 19614981 - 19615117
Alignment:
Q  535 tcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatccc 630  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| || ||| |||    
T  19614981 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttgaaacatcctcttgtataaaaaacagggtaagactgcgtacaatataccaataatagt-ggacccc 19615079  T
Q  631 ttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacca 668  Q
    |||||  ||||||  ||||| |||||| ||||||||||    
T  19615080 ttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgcacca 19615117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 522 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 44521532 - 44521395
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaat 619  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  || |||||| || ||||||||  |||||||||  |||||| |||||| | || || ||||||||||||    
T  44521532 ggtaaagttgttatcacgtgactgaaaggtcacgcgttcaaatcttggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcatataatacaccaaat 44521433  T
Q  620 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    || |||| ||||||||||||  || |||| ||||||||    
T  44521432 ggcgggagcccttcccagacattgcatatacgggagct 44521395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 586 - 679
Target Start/End: Original strand, 25632551 - 25632644
Alignment:
Q  586 aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |   |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25632551 aaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggattccttcccgaaccttacgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 25632644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 498 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 39189604 - 39189556
Alignment:
Q  498 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactga 546  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39189604 ttgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactga 39189556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 522 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 29420048 - 29419981
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29420048 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaa 29419981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 27466311 - 27466262
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaag 549  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27466311 gaggcgtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaag 27466262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 557 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 13245210 - 13245096
Alignment:
Q  557 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagc 656  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||       |||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| || |||| |||||||    
T  13245210 gttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt-------ggtaaggctgcgtacattacactaaatggtgggaccccttcccggaccatgcatatacgggagc 13245118  T
Q  657 tctagtgcaccaggttgccctt 678  Q
    | ||||| | | ||||||||||    
T  13245117 tttagtgtatcgggttgccctt 13245096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 556 - 667
Target Start/End: Original strand, 17471558 - 17471673
Alignment:
Q  556 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc-aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcg 651  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||| || || |||||||| |||||||  ||||||    
T  17471558 ggttcaagtctcagaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaaaatgatgagaccccttccctgaccctgcctatgcg 17471657  T
Q  652 ggagctctagtgcacc 667  Q
    |||| | |||||||||    
T  17471658 ggagttttagtgcacc 17471673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 561 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 30864536 - 30864439
Alignment:
Q  561 aagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  30864536 aagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaatagggtaagggtgcgtacaatataccaaatggtaagatcctttcccaaaccctgcgtatgcggaagct 30864439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 619 - 680
Target Start/End: Original strand, 34080176 - 34080237
Alignment:
Q  619 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  34080176 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagttttagtgcaccgggttgccctttt 34080237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 540 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 2003678 - 2003592
Alignment:
Q  540 tgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtg 623  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||    
T  2003678 tgactgaaaggtcacgggtacaagtcctggaaacagccccttgcgtaaaaaaacagggtaaggatgcgtacaatacaacaaatggtg 2003592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 666
Target Start/End: Original strand, 24890453 - 24890533
Alignment:
Q  586 aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcac 666  Q
    |||||| |||||| | || ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  24890453 aaaacaaggtaaggctgcatacaatacaccaattggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcac 24890533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 531 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 31821491 - 31821355
Alignment:
Q  531 gttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatccc 630  Q
    ||||| |||||||||||||||  || ||||||||| | |||||||||   |||  |||| ||||||||   | ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  31821491 gttgttatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcgtagaaacagccgtgtgtaaaaaatagggtaaggttgtgtacaatacaccaaatgatgggacccc 31821392  T
Q  631 ttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
    || ||  | ||||| |||||||||||| || ||||||    
T  31821391 tttccgaaacctgtgtatgcgggagctttaatgcacc 31821355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 618 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 40579810 - 40579750
Alignment:
Q  618 atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 678  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  40579810 atggtgggaccccttcccggaccctgagtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 40579750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 618 - 682
Target Start/End: Original strand, 41409936 - 41410000
Alignment:
Q  618 atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||    
T  41409936 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccctctttt 41410000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 613 - 687
Target Start/End: Original strand, 4794871 - 4794945
Alignment:
Q  613 accaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttg-cccttttttagttt 687  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  4794871 accaaatgatgggaccccttcccggatcctgcatatgcgggagctctagtgca-caggttgtcccttttatagttt 4794945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 511 - 577
Target Start/End: Original strand, 35017783 - 35017849
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac-tgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcc 577  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||    
T  35017783 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgacttgaaaggtcacgggtttaagtcctgaaaacagcc 35017849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 628 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 39189555 - 39189501
Alignment:
Q  628 cccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39189555 cccttcccggaccccgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccttttttt 39189501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 666
Target Start/End: Original strand, 31523296 - 31523353
Alignment:
Q  609 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcac 666  Q
    |||||||||||||||| | || |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31523296 atacaccaaatggtggaaccctttcccaaaccctgcatatgcgggagctttagtgcac 31523353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 501 - 589
Target Start/End: Original strand, 17472926 - 17473014
Alignment:
Q  501 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||| ||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  17472926 aggggtaaccttgacgcaactaataaagttgttgtcaaatgattgaaaggtcacgggttcaggtcttagaaatagcctattgtgtaaaa 17473014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 616 - 680
Target Start/End: Original strand, 23488555 - 23488619
Alignment:
Q  616 aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  23488555 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggttgctctttt 23488619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 619 - 683
Target Start/End: Original strand, 34766330 - 34766394
Alignment:
Q  619 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 683  Q
    |||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||    
T  34766330 tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacgggtttccctttttta 34766394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 693 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 38584344 - 38584256
Alignment:
Q  693 agtttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaa-ttggtttgtttgtttggttggt 780  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||   ||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  38584344 agttttattcggtttagtttggttcaatttgtttggttgttgggtgagtcaaaatagtgctcacaatttggtttgttcgtttgtttggt 38584256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 628 - 679
Target Start/End: Original strand, 8575979 - 8576030
Alignment:
Q  628 cccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8575979 cccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 8576030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 709 - 768
Target Start/End: Original strand, 8986123 - 8986182
Alignment:
Q  709 gtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaattggtttgtt 768  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  8986123 gtttggttcaatttgtttggttgttgggtgagtcaaaatagtgctcacaattggtttgtt 8986182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 609 - 676
Target Start/End: Original strand, 31525771 - 31525838
Alignment:
Q  609 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccc 676  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  31525771 atacaccaaatgatgggaccctttgccagaccctgcatatgcgggagctttagtgtaccggattgccc 31525838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 602 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 39499307 - 39499240
Alignment:
Q  602 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccag 669  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  |  | ||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  39499307 gcgtacaatacatcaaatggtgggatcccttttcgaatcctgcgtatgcgggagctttagtgcaccag 39499240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 820 - 896
Target Start/End: Original strand, 8986208 - 8986286
Alignment:
Q  820 actcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttgg-tgttt-gtgagtaagtgctcacaatttggtttct 896  Q
    ||||| |||| | |||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8986208 actcataatttgcttgtttggtgagtcgatttctcacactttggttgtttggtgagcatgtgctcacaatttggtttct 8986286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 631 - 680
Target Start/End: Original strand, 22371199 - 22371248
Alignment:
Q  631 ttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22371199 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 22371248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 523 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 34752820 - 34752759
Alignment:
Q  523 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtg 584  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  34752820 gtaaacttgttatcatgtgactgaaaggtcacgaattcaagttctggaaacaacctcttgtg 34752759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 63)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 500 - 682
Target Start/End: Original strand, 35710267 - 35710449
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 599  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  35710267 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatagggtaagg 35710366  T
Q  600 ccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35710367 ctgcgttcaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaacatgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttttt 35710449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 499 - 680
Target Start/End: Original strand, 41014272 - 41014454
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 597  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41014272 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaa 41014371  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  41014372 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 41014454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 500 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 8170163 - 8169982
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaga 599  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  8170163 gagggctaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaacagggtaagg 8170064  T
Q  600 ccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||    
T  8170063 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagtttcagtgcaccgggttgcccttttt 8169982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 533 - 680
Target Start/End: Original strand, 32703411 - 32703558
Alignment:
Q  533 tgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatccctt 632  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32703411 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccctt 32703510  T
Q  633 cccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32703511 cccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 32703558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 499 - 680
Target Start/End: Original strand, 38879534 - 38879719
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 596  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  38879534 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggta 38879633  T
Q  597 agaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    || | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38879634 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 38879719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 500 - 682
Target Start/End: Original strand, 24448844 - 24449028
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 597  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||    
T  24448844 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaa 24448943  T
Q  598 gaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24448944 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 24449028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 503 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 4619284 - 4619103
Alignment:
Q  503 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagac 600  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  4619284 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 4619185  T
Q  601 cgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
     |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4619184 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgagagctttagtgcaccgggttgccctttt 4619103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 503 - 681
Target Start/End: Original strand, 43334159 - 43334341
Alignment:
Q  503 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaga 599  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||     
T  43334159 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaaacagggtaagg 43334258  T
Q  600 ccgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  43334259 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctg-cgatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttt 43334341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 500 - 679
Target Start/End: Original strand, 1565385 - 1565566
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggta 596  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||   ||    
T  1565385 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgagtaaaaaaacatatta 1565484  T
Q  597 agaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    || | ||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1565485 aggctgcgtacaatgcaccaaatggcgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagct-tagtgcaccgggttgcccttt 1565566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 497 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 37024738 - 37024626
Alignment:
Q  497 tttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggta 596  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37024738 tttgaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggta 37024639  T
Q  597 agaccgcgtacaa 609  Q
    || | ||||||||    
T  37024638 aggctgcgtacaa 37024626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 561 - 676
Target Start/End: Original strand, 7368413 - 7368528
Alignment:
Q  561 aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctcta 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  7368413 aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaattggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctcta 7368512  T
Q  661 gtgcaccaggttgccc 676  Q
    ||||||| ||||||||    
T  7368513 gtgcaccgggttgccc 7368528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 498 - 679
Target Start/End: Original strand, 22187237 - 22187422
Alignment:
Q  498 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggt 595  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| | |    
T  22187237 ttgaggggtaactttggcgcaactagtaaagttgttgtcatttgactgaaaggtcaccggtttaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatgat 22187336  T
Q  596 aagaccgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||   || || ||||||||| |||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22187337 aagactgcgtacaatacaccaaaaacaatgagaccccttcccaaaccctacatatgcaggagctttagtgcatcaggttgcccttt 22187422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 498 - 657
Target Start/End: Original strand, 22600406 - 22600567
Alignment:
Q  498 ttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggt 595  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||   | |||||||||  |||||||    
T  22600406 ttgaggggtaaccttgacgtaactggtaaagttgttatcatgtgactggaaggttacgggttcaagtcctggaaacaatattttgtgtaaaacacagggt 22600505  T
Q  596 aagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  22600506 aaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccggatcctgcgtatgcgggagct 22600567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 503 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 22861844 - 22861668
Alignment:
Q  503 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccg 602  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||  ||||||| |    
T  22861844 gggtaaccttggcacaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaagcagtctcttgtgtaaaaca-agtaagactg 22861746  T
Q  603 cgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    |  |||||||| |||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  22861745 ctcacaatacatcaaatggtgggaccccttctcgaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgaattgccctttt 22861668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 503 - 657
Target Start/End: Original strand, 27328709 - 27328867
Alignment:
Q  503 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagac 600  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |    
T  27328709 gggtaaccttgacgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 27328808  T
Q  601 cgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
     |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  27328809 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 27328867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 501 - 656
Target Start/End: Original strand, 2838733 - 2838890
Alignment:
Q  501 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg-aaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaag 598  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||   |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  2838733 aggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaaggtcacgaggtcaagtctcagaaacagcatcttgtgtaaaaacagggtaag 2838832  T
Q  599 accgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagc 656  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||    
T  2838833 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttctcggaccctgcgtatgcgggagc 2838890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 680 - 864
Target Start/End: Complemental strand, 11335572 - 11335394
Alignment:
Q  680 tttagtttcgttcagtttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaattggtttgtttgtttggttgg 779  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  11335572 tttagtttcattcagtttgatttgatttcgtttggttcaatttgtttggttgttg-gtgagtcaagatagtgctcacaattggtttgtttgtttggcggg 11335474  T
Q  780 tctagtgctcacaatttagttgttgggtgagtaagatagtactcacaattggtttgtttggtgggtcgagtgctcacactttggt 864  Q
    || ||||||||||||||  ||||| ||||     |  |||||||||| || | |||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  11335473 tcaagtgctcacaatttgtttgtttggtg-----ggaagtactcacactttggttgtttggtgagtcgaatgctcacaatttggt 11335394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 503 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 12006508 - 12006329
Alignment:
Q  503 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcggg-ttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaga 599  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |  |||||||     
T  12006508 gggtagctttggcgcaactgctcaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggggttcaagtc-tggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtaagg 12006410  T
Q  600 ccgcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 678  Q
    |  | |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  12006409 ctccatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccgtgttgccctt 12006329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 555 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 13801895 - 13801767
Alignment:
Q  555 gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccagaccctgtatatgc 650  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  13801895 gggttcaagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgc 13801796  T
Q  651 gggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13801795 gagagctttagtgcaccgggttgcccttt 13801767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 522 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 28516593 - 28516432
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaataca-ccaaa 618  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| || | | |||||||||||| | |||    
T  28516593 ggtaaagttgttgtcaggtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacatcctcttgtgtaaaaaacaggctagggctgcgtacaatacatcaaaa 28516494  T
Q  619 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    |||||||| || |||||||||||||   |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28516493 tggtgggacccattcccagaccctgcgcatgcaggagctttagtggaccaggttgccctttt 28516432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 511 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 19143111 - 19142940
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagaccgcgtacaa 609  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| |   | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  19143111 ttggcgcaa-tggtaaaattgttgtcacgtgactaaaatgccacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacag 19143013  T
Q  610 tacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||| | ||||||||  |  |||||||||||    
T  19143012 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccatgcgtatgcgggagatttagtgcactggcctgccctttttt 19142940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 497 - 589
Target Start/End: Original strand, 23974732 - 23974823
Alignment:
Q  497 tttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23974732 tttgaggggtaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaa 23974823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 585 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 34154908 - 34154814
Alignment:
Q  585 taaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  34154908 taaatcagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggtagctctagtgcaccgggttgcccttt 34154814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 529 - 683
Target Start/End: Original strand, 1405170 - 1405326
Alignment:
Q  529 ttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtggga 626  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |  | |||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  1405170 ttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttatataaaaaatagagtaagtttgcgtacaatacaccaaatggtggga 1405269  T
Q  627 tcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttta 683  Q
     || ||||   |||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  1405270 ccctttcctgaaccctgcatatgcgggagctctagtacaccggattgccctttttta 1405326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 557 - 667
Target Start/End: Original strand, 43574617 - 43574729
Alignment:
Q  557 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcggga 654  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  43574617 gttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgcgtacaatataccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggga 43574716  T
Q  655 gctctagtgcacc 667  Q
    ||| ||| |||||    
T  43574717 gctttagagcacc 43574729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 524 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 24323862 - 24323727
Alignment:
Q  524 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatgg 621  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||   ||||| ||||| |||||| |    
T  24323862 taaagttgttatcgtgtgactgaaatgtcaaatgttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactccaaatag 24323763  T
Q  622 tgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24323762 tgggaccccttcccagaccctgtatatgcgggagct 24323727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 524 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 24360486 - 24360351
Alignment:
Q  524 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatgg 621  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||     |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||   ||||| ||||| |||||| |    
T  24360486 taaagttgttatcgtgtgactgaaatgtcaaatgttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactccaaatag 24360387  T
Q  622 tgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24360386 tgggaccccttcccagaccctgtatatgcgggagct 24360351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 506 - 675
Target Start/End: Original strand, 30006285 - 30006456
Alignment:
Q  506 taactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagaccgc 603  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    | ||||||||| | ||||| |||||| | ||||  |||||||||| | |     
T  30006285 taacattggcgcaactgataaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcatagattcaagtccggaaaacaacctcttatataaacaacagggtaaggctgt 30006384  T
Q  604 gtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcc 675  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |  ||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  30006385 gtacattacactaaatggtgggaccccttcccggggcctatgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 30006456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 522 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 209086 - 208939
Alignment:
Q  522 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc-aaat 619  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | || | ||||||||| ||||    
T  209086 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacaagttcaagtcctggcaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcattcaatacaccaaaat 208987  T
Q  620 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
    ||||||| |||||||  |||||||  |||||  ||||| |||||||||    
T  208986 ggtgggaccccttcctggaccctgggtatgcaagagctttagtgcacc 208939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 570 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 7097870 - 7097760
Alignment:
Q  570 aaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacca 668  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  7097870 aaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacca 7097771  T
Q  669 ggttgcccttt 679  Q
     | ||||||||    
T  7097770 tgctgcccttt 7097760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 604 - 680
Target Start/End: Original strand, 16957374 - 16957450
Alignment:
Q  604 gtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16957374 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 16957450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 571 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 16880757 - 16880647
Alignment:
Q  571 aacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacca 668  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| || | |||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||||     
T  16880757 aacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgtgaccacttcccggaccatgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 16880658  T
Q  669 ggttgcccttt 679  Q
    |||| ||||||    
T  16880657 ggtttcccttt 16880647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 565 - 678
Target Start/End: Original strand, 20135623 - 20135740
Alignment:
Q  565 cctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctcta 660  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||| | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| | |||||| ||||||  |    
T  20135623 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcaggagcttca 20135722  T
Q  661 gtgcaccaggttgccctt 678  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  20135723 gtgcaccgggttgccctt 20135740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 511 - 642
Target Start/End: Original strand, 39301089 - 39301222
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtg--taaaacagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||||   ||||| |    
T  39301089 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgttactgaaaggtcacgggttcaagtcttgggaacaacctcttgtgtataaaacagggtaaggatgcgtata 39301187  T
Q  609 atacacc-aaatggtgggatcccttcccagaccct 642  Q
    || |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  39301188 atgcaccaaaaaggtgggaccccttcccggaccct 39301222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 530 - 667
Target Start/End: Original strand, 1850624 - 1850762
Alignment:
Q  530 tgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatc 628  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||  ||||   |||||||||||| |||||||||||| |    
T  1850624 tgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaataacctcttgtgtaaaaacagaataagggtgcgtacaatacatcaaatggtgggacc 1850723  T
Q  629 ccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
     |||||  |||||||   |||||| |||| |||||||||    
T  1850724 acttcctggaccctgcggatgcggaagctttagtgcacc 1850762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 505 - 618
Target Start/End: Original strand, 31299591 - 31299705
Alignment:
Q  505 gtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaagaccgc 603  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||| || ||    
T  31299591 gtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttacaggtcactagttcaagtcctagaaacagcctcttgtattaaaacagtgtaaaactgc 31299690  T
Q  604 gtacaatacaccaaa 618  Q
    |||||||||| ||||    
T  31299691 gtacaatacatcaaa 31299705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 503 - 576
Target Start/End: Original strand, 17419871 - 17419944
Alignment:
Q  503 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagc 576  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17419871 gggtaattttggcgtaactggtaaaattgttgtaatgtgactgaaaggttacgagttcaagtcctggaaacagc 17419944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 620 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 16028683 - 16028621
Alignment:
Q  620 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16028683 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttttt 16028621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 531 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 22908014 - 22907904
Alignment:
Q  531 gttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcc 629  Q
    ||||| |||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||| ||    
T  22908014 gttgttatgtgactgaaaggtcaagggttcaagtccaagaaacagcctcttgtgtaaaaacagagtaaggttgcatacaatacaccaaatggtgggaccc 22907915  T
Q  630 ct-tcccagac 639  Q
    || ||||||||    
T  22907914 ctctcccagac 22907904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 586 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 9794471 - 9794390
Alignment:
Q  586 aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||| | |||| |||||||||    
T  9794471 aaaacagggtaagactgcatacaatacaccaaatagtgggatcccttcacagacccagcatatgcagaagctttagtgcacc 9794390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 680
Target Start/End: Original strand, 3771381 - 3771475
Alignment:
Q  586 aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||||||||||||| | | | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||| |||| ||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  3771381 aaaacagggtaaggctgtgaacaatacaccaattggtgggaccccttcccggactctgtgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgccctttt 3771475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 566 - 680
Target Start/End: Original strand, 29334415 - 29334532
Alignment:
Q  566 ctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacca-aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagt 662  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||  |||| |||| || || |    
T  29334415 ctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccagaatggtgggacccattcccggaccctgcgtatgtgggatctttaat 29334514  T
Q  663 gcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||||| || |||||||||    
T  29334515 gcaccgggctgccctttt 29334532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 538 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 42924977 - 42924842
Alignment:
Q  538 tgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttc 633  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||    
T  42924977 tgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaaaatgatggaatcccttc 42924878  T
Q  634 ccag--accctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
    ||||  ||||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  42924877 ccagacaccctgcgtatgcggaagctttagtgcacc 42924842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 554 - 639
Target Start/End: Original strand, 41425956 - 41426043
Alignment:
Q  554 cgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagac 639  Q
    ||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||  ||||||||| | || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  41425956 cgggttcaagttctggaaacaacttattgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaattggtgggaccccttcccagac 41426043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 620 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 30877623 - 30877564
Alignment:
Q  620 ggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30877623 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 30877564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 689 - 811
Target Start/End: Original strand, 9511703 - 9511825
Alignment:
Q  689 gttcagtttgatttggtttcgtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaattggtttgtttgtttggttggtctagtgct 788  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||  |||||| | | |||  ||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||    
T  9511703 gttcggtttgatttggattcgcttggttgaatttgtttggttgttaggtgagttaagatagtcctcacaattcgtttgtttgtttggtgagtcgagtgct 9511802  T
Q  789 cacaatttagttgttgggtgagt 811  Q
    |||| ||  |||||| |||||||    
T  9511803 cacacttcggttgtttggtgagt 9511825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 526 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 34074717 - 34074584
Alignment:
Q  526 aagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtg 623  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||  |||||   |||| |||||||||||||||      
T  34074717 aagttgttgtcacatgactgaaaggtcacaagttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacacagtaaggttgcgttcaatacaccaaatggca 34074618  T
Q  624 ggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    ||  ||||||||| ||||||  |||| |||||||    
T  34074617 gggccccttcccaaaccctgcgtatgggggagct 34074584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 500 - 549
Target Start/End: Original strand, 19438703 - 19438752
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaag 549  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19438703 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactaaaag 19438752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 637 - 678
Target Start/End: Original strand, 19438759 - 19438800
Alignment:
Q  637 gaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 678  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19438759 gaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 19438800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 511 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 39079935 - 39079875
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaa 572  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  39079935 ttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgacagaaaggtcacgggttcaagtcttggaaa 39079875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 589
Target Start/End: Original strand, 22025538 - 22025586
Alignment:
Q  541 gactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22025538 gactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 22025586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 628 - 680
Target Start/End: Original strand, 32354211 - 32354263
Alignment:
Q  628 cccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  32354211 cccttcccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 32354263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 561 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 5873441 - 5873322
Alignment:
Q  561 aagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct 659  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |   ||||| |||||||| ||||||||  ||| ||| ||| |||  |||||||||||| |    
T  5873441 aagtcgtggaaacagcctcttgtgtaaaaatagggtaaggctaagtacactacaccaattggtgggactcctccccggacactgcgtatgcgggagcttt 5873342  T
Q  660 agtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    |||||| | || ||||||||    
T  5873341 agtgcatcgggatgcccttt 5873322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 709 - 780
Target Start/End: Original strand, 24136719 - 24136790
Alignment:
Q  709 gtttgattcaatttgtttggctgttgagtgagtcatggtagagctcacaattggtttgtttgtttggttggt 780  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24136719 gtttggttcaatttgtttggttgttgggtgagtcaaaatagtgctcacaattggtttgttcgtttgtttggt 24136790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 538
Target Start/End: Original strand, 41956885 - 41956924
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcat 538  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41956885 tgaggggtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcat 41956924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 511 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 10634315 - 10634238
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||    
T  10634315 ttggcgcaac-ggtgaagttgttgtcaagtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctagaaacaacctcgtgtgcaaaa 10634238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 617 - 679
Target Start/End: Original strand, 25622533 - 25622595
Alignment:
Q  617 aatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  25622533 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 25622595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 564 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 12575779 - 12575660
Alignment:
Q  564 tcctggaaacagcctcttgtgtaaa---acagggtaagaccgcgtacaatacaccaaa-tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct 659  Q
    ||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||  ||||| |||||| |    
T  12575779 tcctggaaacagcctcttgcgtaaataaacaggctaaagttgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcaggagcttt 12575680  T
Q  660 agtgcaccaggttgcccttt 679  Q
     ||||||| || ||||||||    
T  12575679 ggtgcaccgggctgcccttt 12575660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 606 - 667
Target Start/End: Original strand, 13774927 - 13774988
Alignment:
Q  606 acaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacc 667  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  13774927 acaatacaccaaatggcaggatccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 13774988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 680
Target Start/End: Original strand, 39801591 - 39801652
Alignment:
Q  619 tggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  39801591 tggtgggaccccttcccagaccctacgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccatttt 39801652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 616 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 4654478 - 4654426
Alignment:
Q  616 aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcacca 668  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4654478 aaatggtgggatcccttctcgaaccctgcatatgcgggagctttagtgcacca 4654426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 798 - 893
Target Start/End: Original strand, 9511742 - 9511845
Alignment:
Q  798 gttgttgggtgagt-aagatagtactcacaattggttt----gtttggtgggtcgagtgctcacactttgg-tgttt-gtgagt-aagtgctcacaattt 889  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  9511742 gttgttaggtgagttaagatagtcctcacaattcgtttgtttgtttggtgagtcgagtgctcacacttcggttgtttggtgagtcgagtgctcacaattt 9511841  T
Q  890 ggtt 893  Q
    ||||    
T  9511842 ggtt 9511845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 609 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 10943914 - 10943842
Alignment:
Q  609 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||||||   |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  10943914 atacaccaaataacgggaccccttcccggaccctgca-atgcgggagctttagtgcaccgggctgccctttttt 10943842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 123; Significance: 1e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 503 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 10226 - 10052
Alignment:
Q  503 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccg 602  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  10226 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagagtaagactg 10127  T
Q  603 cgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccct 677  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  10126 cgtacaatacaccaaatagtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccgggttgccct 10052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 503 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 20554 - 20380
Alignment:
Q  503 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccg 602  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  20554 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagagtaagactg 20455  T
Q  603 cgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccct 677  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  20454 cgtacaatacaccaaatagtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccgggttgccct 20380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 497 - 565
Target Start/End: Original strand, 8896 - 8964
Alignment:
Q  497 tttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtc 565  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  8896 tttgaggggtaaccttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagtc 8964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 497 - 565
Target Start/End: Original strand, 19224 - 19292
Alignment:
Q  497 tttgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtc 565  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  19224 tttgaggggtaaccttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagtc 19292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 113; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 511 - 679
Target Start/End: Original strand, 11097 - 11264
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaat 610  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || ||||||    
T  11097 ttggcgcaactggtaaagttgttct-atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacaaagtaaggctgcttacaat 11195  T
Q  611 acaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11196 acaccaaatggtgggacaccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 11264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 502 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 13202 - 13022
Alignment:
Q  502 ggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagac 600  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |    
T  13202 ggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaacaaggtaaggc 13103  T
Q  601 cgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttt 681  Q
     |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13102 tgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggggctttagtgcaccgggttgcccttttt 13022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 97; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 505 - 679
Target Start/End: Original strand, 58936 - 59114
Alignment:
Q  505 gtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccg 602  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |    
T  58936 gtaaccttggagcaactggtaaacttattgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaagactg 59035  T
Q  603 cgtacaatacacc--aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  59036 cgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagactctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcccttt 59114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 95; Significance: 6e-46; HSPs: 5)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 499 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 24949 - 24769
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggta 596  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||     |||||||||||||||||||  |||||||    
T  24949 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtc-----aacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 24855  T
Q  597 agaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  24854 aggctgcgtacaacacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcagccggttgccctttttt 24769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 511 - 682
Target Start/End: Original strand, 46796 - 46969
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaagaccgcgtaca 608  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |||||||   |||||||    
T  46796 ttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtgctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggttgcgtaca 46895  T
Q  609 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  46896 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttttt 46969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 559 - 680
Target Start/End: Original strand, 43672 - 43794
Alignment:
Q  559 tcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatccc-ttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  43672 tcaagttctggaaacagcgtcttgtgtaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccctttctcggaccctgcatatgcgggagct 43771  T
Q  658 ctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    |||||||||   |||||||||||    
T  43772 ctagtgcactgagttgccctttt 43794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 616 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 46770 - 46702
Alignment:
Q  616 aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttttttag 684  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || |||| |||| ||||| |||||||    
T  46770 aaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttaatgcatcaggctgcccatttttag 46702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 523 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 47041 - 46995
Alignment:
Q  523 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctgg 569  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||    
T  47041 gtaaagttgttgtcaggtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgg 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 555 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 48758 - 48633
Alignment:
Q  555 gggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcggga 654  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  48758 gggttcaagtggtggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggga 48659  T
Q  655 gctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  48658 gctctagtgcaccgggttgccctttt 48633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1176 (Bit Score: 93; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1176
Description:

Target: scaffold1176; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 515 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 1751 - 1591
Alignment:
Q  515 cgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacaatacac 614  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||    
T  1751 cgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacaacctcttgtgtaaaacaggataaggctgcatacaatacac 1652  T
Q  615 caaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcc 675  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1651 caaatgatgggaccccttcccggacccggcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcc 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 511 - 680
Target Start/End: Original strand, 10775 - 10946
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| | | |||| ||    
T  10775 ttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaaggtctgaaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtcca 10874  T
Q  609 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttt 680  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||  |||||| |||||    
T  10875 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgctctttt 10946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 73; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 499 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 226588 - 226458
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggt 595  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||    
T  226588 tgagtggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggt 226489  T
Q  596 aagaccgcgtacaatacaccaaatggtggga 626  Q
    ||| | || ||||||||| ||||||||||||    
T  226488 aaggctgcatacaatacatcaaatggtggga 226458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 500 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 35200 - 35070
Alignment:
Q  500 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttg-ttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt---aaaacagggt 595  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||    
T  35200 gagggataactttggtgcaactggtaaagtttattgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtgtgaaaacagggt 35101  T
Q  596 aagaccgcgtacaatacaccaaatggtggga 626  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  35100 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtggga 35070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 63; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 514 - 648
Target Start/End: Original strand, 4125 - 4264
Alignment:
Q  514 gcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagaccgcgtacaata 611  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||    
T  4125 gcgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttgcgtacaata 4224  T
Q  612 cacc---aaatggtgggatcccttcccagaccctgtatat 648  Q
    ||||   || |||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  4225 caccaataattggtgggaccccttcccggaccctatatat 4264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 63; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 592 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 24220 - 24130
Alignment:
Q  592 gggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24220 gggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggattgccctttttt 24130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 59; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 511 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 73031 - 72867
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaaca-gcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtac 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |       |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||  || |||||| | || |||    
T  73031 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgtgtca-------cgggttcaagtcctagaaacaagtctcttgtgtaaaaaacacggtaaggctgcctac 72939  T
Q  608 aatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  72938 aatacaccaaatggtagtaccccttcccggaacctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 72867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 56; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 499 - 574
Target Start/End: Original strand, 83828 - 83903
Alignment:
Q  499 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaaca 574  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  83828 tgaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaaca 83903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 50; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 514 - 626
Target Start/End: Original strand, 43097 - 43209
Alignment:
Q  514 gcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaagaccgcgtacaatac 612  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    ||||||||    
T  43097 gcgcaactggtaaagttattgtcatgtgattgaaaggtcacgagttcaggtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaacagagtaagacatt-tacaatac 43195  T
Q  613 accaaatggtggga 626  Q
    | ||||||||||||    
T  43196 atcaaatggtggga 43209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 49; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 511 - 657
Target Start/End: Original strand, 23569 - 23712
Alignment:
Q  511 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagaccgcgtaca 608  Q
    |||||||||| |||||||||||    |||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||| || | |||||||    
T  23569 ttggcgcaac-ggtaaagttgt----atgtgactgaaagggtacgggttcaagtcttgcaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtgaggctgcgtaca 23663  T
Q  609 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagct 657  Q
    ||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| |||||||    
T  23664 atgtagcaaatggtgggaccccttcccagaccttgagtatgtgggagct 23712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 501 - 682
Target Start/End: Original strand, 24619 - 24786
Alignment:
Q  501 aggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagac 600  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||              |||||||||    
T  24619 aggggtaaccttggcacaattgataaagttgttgtcaagtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcc--------------gggtaagac 24704  T
Q  601 cgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctttttt 682  Q
     ||||| |||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||  ||| ||||||||  |||||||| | ||||||||||||    
T  24705 tgcgtataatacaccaaatagtggaccccctttccagaccctgcgtatacgggagcttcagtgcacctgattgccctttttt 24786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 589
Target Start/End: Original strand, 8865 - 8934
Alignment:
Q  520 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  8865 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaattcctggaaacaacttcttgtgtaaaa 8934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0954 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0954
Description:

Target: scaffold0954; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 667
Target Start/End: Original strand, 3560 - 3667
Alignment:
Q  562 agtcctggaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaagaccgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctct 659  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | | |||||| | ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||  ||||||  ||||||| |||| |    
T  3560 agtcctggaaagagcctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccgaatgatgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggcagcttt 3659  T
Q  660 agtgcacc 667  Q
    ||||||||    
T  3660 agtgcacc 3667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 609 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 58699 - 58630
Alignment:
Q  609 atacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttt 679  Q
    ||||||| ||||||| || |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  58699 atacaccgaatggtgagaccccttctcggaccctgtgtatgcgggagctct-gtgcaccaggctgcccttt 58630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0867 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0867
Description:

Target: scaffold0867; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 3746 - 3685
Alignment:
Q  602 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccagaccctgtatatgcgggagctctagtg 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |  || | |||||||||||||||| |||||    
T  3746 gcgtacaatacaccaaatggtgggacccttttctcgatcttgtatatgcgggagctttagtg 3685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University