View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17187_high_3 (Length: 429)

Name: NF17187_high_3
Description: NF17187
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17187_high_3
NF17187_high_3
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (4-409)||(14025342-14025747)
chr6 (4-416)||(13911877-13912289)
chr6 (4-409)||(13892603-13893008)
chr6 (56-409)||(14015211-14015564)
chr6 (4-403)||(14110543-14110942)
chr6 (4-409)||(13932409-13932814)
chr6 (1-409)||(13874896-13875304)
chr6 (4-409)||(13862429-13862834)
chr6 (3-409)||(14084728-14085134)
chr6 (4-416)||(14047404-14047796)
chr6 (6-409)||(13472598-13473001)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 4 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 14025747 - 14025342
Alignment:
Q  4 acaacaatctcaaaggatcaatccctaattttcaagtaataaatcgttgttcttttttatctctttcatcaaatgaatttgaagggcccattccatcatt 103  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || ||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14025747 acaataatctcaaaggattaattccaaatcttcaagtcaaaaatcgttgttctgttttatctctttcatcaaatgaatttgaagggcctattccaccatt 14025648  T
Q  104 tctacaaggttccatggttattgatttgtccaaaaacaaattctctgattctcttccattcttatgtgaaaatggtatagatgcaatgttaggccagtta 203  Q
    |||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  14025647 tctaaaaggttctacagttactgatttgtccaaaaacaaattctctgattctcttccattcctatgtaaaaatggtatagatgcagtgttaggccagttt 14025548  T
Q  204 gatctttcaaataatcaattatctggacaaattccagactgttggagcaatttcaaatcattagcttatcttgatttgagccacaacaatttttcaggga 303  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||||    
T  14025547 gacctttcgaataatcaattatctggacgaattccaaactgttggagcaatttcaagtcattagtttatgtagatttgagcagcaacaatttttcaggga 14025448  T
Q  304 agattcccacttcaatgggatcagttgtagaactgcaagcattactattaaggaacaacaacttaacagaggagatccctttctccttaatgaattgcac 403  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14025447 agattcctacttcaatgggatcacttgtagaactgcaagcattcctattgaggaacaacaacttgacaggggagatccctttctccttaatgaactgcac 14025348  T
Q  404 aaagtt 409  Q
    ||||||    
T  14025347 aaagtt 14025342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 4 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 13912289 - 13911877
Alignment:
Q  4 acaacaatctcaaaggatcaatccctaattttcaagtaataaatcgttgttcttttttatctctttcatcaaatgaatttgaagggcccattccatcatt 103  Q
    |||| ||||||||||| | ||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13912289 acaataatctcaaaggcttaattccaaatcttcaagtaaaaaatctttgttctgttttatcactttcatcaaatgaatttgaagggcccattccaccatt 13912190  T
Q  104 tctacaaggttccatggttattgatttgtccaaaaacaaattctctgattctcttccattcttatgtgaaaatggtatagatgcaatgttaggccagtta 203  Q
    |||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  13912189 tctcaaaggttctacagttattgatttgtccaaaaacaagttctctgattctcttccattcctctgtgcaaatggtatagatgcagtgttaggccagttt 13912090  T
Q  204 gatctttcaaataatcaattatctggacaaattccagactgttggagcaatttcaaatcattagcttatcttgatttgagccacaacaatttttcaggga 303  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13912089 gaccttccgaataatcaattatctggacaaattccagattgctggagcaatttcaagtcattagcttatctagatttgagccagaacaatttttcaggga 13911990  T
Q  304 agattcccacttcaatgggatcagttgtagaactgcaagcattactattaaggaacaacaacttaacagaggagatccctttctccttaatgaattgcac 403  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13911989 agattccaacttcaatgggatcacttgtagaactgcaagcattactattgaggaacaatagcttaacaggggagatccctttctccttaatgaactgcac 13911890  T
Q  404 aaagttgttaatg 416  Q
    ||||||| |||||    
T  13911889 aaagttgataatg 13911877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 4 - 409
Target Start/End: Original strand, 13892603 - 13893008
Alignment:
Q  4 acaacaatctcaaaggatcaatccctaattttcaagtaataaatcgttgttcttttttatctctttcatcaaatgaatttgaagggcccattccatcatt 103  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || ||| ||||||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13892603 acaataatctcaaaggattaattccaaatcttcaagtcaaaaattattgttctattttatctctttcatcaaatgaatttgaagggcctattccaccatt 13892702  T
Q  104 tctacaaggttccatggttattgatttgtccaaaaacaaattctctgattctcttccattcttatgtgaaaatggtatagatgcaatgttaggccagtta 203  Q
    |||| ||||||| |   ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  13892703 tctaaaaggttctacacttattgacttgtccaaaaacaaattctccgattctcttccattcctatgtacaaatggtatagattcaatgttaggccagttt 13892802  T
Q  204 gatctttcaaataatcaattatctggacaaattccagactgttggagcaatttcaaatcattagcttatcttgatttgagccacaacaatttttcaggga 303  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13892803 gacctttcaaataatcaattatctggacgagttccagactgttggaacaatttcaaggcattagtttatctcgatttgagccacaacaattttttaggga 13892902  T
Q  304 agattcccacttcaatgggatcagttgtagaactgcaagcattactattaaggaacaacaacttaacagaggagatccctttctccttaatgaattgcac 403  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  13892903 agattcctacttcaatgggatcacttgtagaactgcaagcattactattgaggaacaacagcttaacagaggagatccctttctccttaatgaactgcag 13893002  T
Q  404 aaagtt 409  Q
    ||||||    
T  13893003 aaagtt 13893008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 56 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 14015564 - 14015211
Alignment:
Q  56 ttttttatctctttcatcaaatgaatttgaagggcccattccatcatttctacaaggttccatggttattgatttgtccaaaaacaaattctctgattct 155  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14015564 ttttatatctctttcatcaaatgaatttgaagggcctattccagcatttctacaaggttctgaacttattgatttgtccaaaaacaaattctctgattct 14015465  T
Q  156 cttccattcttatgtgaaaatggtatagatgcaatgttaggccagttagatctttcaaataatcaattatctggacaaattccagactgttggagcaatt 255  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14015464 cgtccattcctatgtgcaaatggtatagatgcaatgttaggccaggttgacctttcaaataatcaattatctggacaaattccaaactgttggagcaatt 14015365  T
Q  256 tcaaatcattagcttatcttgatttgagccacaacaatttttcagggaagattcccacttcaatgggatcagttgtagaactgcaagcattactattaag 355  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |     
T  14015364 tcaagtcattagcttatgttgatttgagtcacaacaatttttcagggaagattcctacttcaatgggatcacttgtaaaactgcaagcattactattgac 14015265  T
Q  356 gaacaacaacttaacagaggagatccctttctccttaatgaattgcacaaagtt 409  Q
    |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14015264 gaacaatagcttaataggggagatccctttctccttaatgaactgcacaaagtt 14015211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 4 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14110942 - 14110543
Alignment:
Q  4 acaacaatctcaaaggatcaatccctaattttcaagtaataaatcgttgttcttttttatctctttcatcaaatgaatttgaagggcccattccatcatt 103  Q
    |||| ||||||||||||  ||| || ||| ||||||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14110942 acaataatctcaaaggaataattccaaatcttcaagtaaaaaattattgctctagtttatctctttcattaaatgaatttgaagggcccattccaccatt 14110843  T
Q  104 tctacaaggttccatggttattgatttgtccaaaaacaaattctctgattctcttccattcttatgtgaaaatggtatagatgcaatgttaggccagtta 203  Q
    |||||||||||||   ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  14110842 tctacaaggttcccatgttattgacctgtccaaaaacaagttctctgattcttttccattcttatgtgcaaatggtatagatgtaatgttaggccaattt 14110743  T
Q  204 gatctttcaaataatcaattatctggacaaattccagactgttggagcaatttcaaatcattagcttatcttgatttgagccacaacaatttttcaggga 303  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14110742 gacctttcaaataatcaattatctggaagaattccagactgttggagcaatttcaagtcattggtttatgttgatttgagccacaacaatttttcaggga 14110643  T
Q  304 agattcccacttcaatgggatcagttgtagaactgcaagcattactattaaggaacaacaacttaacagaggagatccctttctccttaatgaattgcac 403  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14110642 agattccttcttcaatgggatcacttgttaatctgcaagcattactattgaggaacaatagcttaacagaggagatccctttctccttaatgaactgcac 14110543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 13932814 - 13932409
Alignment:
Q  4 acaacaatctcaaaggatcaatccctaattttcaagtaataaatcgttgttcttttttatctctttcatcaaatgaatttgaagggcccattccatcatt 103  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||| | |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13932814 acaataatctcaaaggttcaattccaaatcttcaagtcaaaaatcactgttctcttttatctctttcatcaaatgaatttgaagggcctattccagcatt 13932715  T
Q  104 tctacaaggttccatggttattgatttgtccaaaaacaaattctctgattctcttccattcttatgtgaaaatggtatagatgcaatgttaggccagtta 203  Q
    | ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| | |||| |||||||||| ||| ||| ||||  |||||     
T  13932714 tttacaaggttctgcacttattgatttgtccaaaaacaaattttcagattctcgcccattcctttgtgcaaatggtataaatgaaatcttagctcagttt 13932615  T
Q  204 gatctttcaaataatcaattatctggacaaattccagactgttggagcaatttcaaatcattagcttatcttgatttgagccacaacaatttttcaggga 303  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13932614 gatgtttcaaataatcaattatctggacgaattccagactgttggagcaatttcaagtcattagtttatgtagatttgagccacaacaatttttcaggga 13932515  T
Q  304 agattcccacttcaatgggatcagttgtagaactgcaagcattactattaaggaacaacaacttaacagaggagatccctttctccttaatgaattgcac 403  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13932514 agattccaacttcaatgggatcacttgtaatactgcgagcattactattgaggaacaacaacttgacaggggagatccctttctccttaatgaactgcac 13932415  T
Q  404 aaagtt 409  Q
    | ||||    
T  13932414 acagtt 13932409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 409
Target Start/End: Original strand, 13874896 - 13875304
Alignment:
Q  1 catacaacaatctcaaaggatcaatccctaattttcaagtaataaatcgttgttcttttttatctctttcatcaaatgaatttgaagggcccattccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |    
T  13874896 catacaacaatctcaaaggattaattccgaatcttcatgtaaaaaatcattgttcttttttatctcttgcatcaaatcaatttgaaggctccattccacc 13874995  T
Q  101 atttctacaaggttccatggttattgatttgtccaaaaacaaattctctgattctcttccattcttatgtgaaaatggtatagatgcaatgttaggccag 200  Q
    ||||||   ||||||  |   |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  13874996 atttctcagaggttctgtatctattgatttgtccaaaaacaaattctctaactctattcaatttttatgtgaaaatggtatagatgaagcgttaggccag 13875095  T
Q  201 ttagatctttcaaataatcaattatctggacaaattccagactgttggagcaatttcaaatcattagcttatcttgatttgagccacaacaatttttcag 300  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13875096 tttgacctttcaaataatcaattatctggaagaattccagattgttggagaaatttcaaatcattagcttatgtagatttgagccacaacaatttttcag 13875195  T
Q  301 ggaagattcccacttcaatgggatcagttgtagaactgcaagcattactattaaggaacaacaacttaacagaggagatccctttctccttaatgaattg 400  Q
    |||| |||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | || ||||||||||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  13875196 ggaaaattccttcttcaatgggatcactcgtagaactgcaagcattaatgttgaggaacaacagtttaatggaggatatccctttctccttaatgaactg 13875295  T
Q  401 cacaaagtt 409  Q
    |||||||||    
T  13875296 cacaaagtt 13875304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 409
Target Start/End: Original strand, 13862429 - 13862834
Alignment:
Q  4 acaacaatctcaaaggatcaatccctaattttcaagtaataaatcgttgttcttttttatctctttcatcaaatgaatttgaagggcccattccatcatt 103  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |||||  |||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13862429 acaataatcttaaaggatcaattccaaatttaaaagtaaaaaatcactgttctcttttatctctttcatcaaatgattttgaagggcccattccaccatt 13862528  T
Q  104 tctacaaggttccatggttattgatttgtccaaaaacaaattctctgattctcttccattcttatgtgaaaatggtatagatgcaatgttaggccagtta 203  Q
    ||||| ||||||     |||||||| | || ||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||     
T  13862529 tctacgaggttctggacttattgatctatcgaaaaataaattctcagattctcgttcattcctatgtgcaaatgttatagatgaaatgttagctcagttt 13862628  T
Q  204 gatctttcaaataatcaattatctggacaaattccagactgttggagcaatttcaaatcattagcttatcttgatttgagccacaacaatttttcaggga 303  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  13862629 gatgtttcaaataatcaattatctggacgaattccagactgttggagcaatttcaagtcattagtttatgtagatttgagtcacaacaatttttcaggga 13862728  T
Q  304 agattcccacttcaatgggatcagttgtagaactgcaagcattactattaaggaacaacaacttaacagaggagatccctttctccttaatgaattgcac 403  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13862729 tgattccaacttcaatgggatcacttgtaaaactgcgagcattactattgaggaacaatagcttaacagagcagatcccttcctccttaatgaactgcac 13862828  T
Q  404 aaagtt 409  Q
    ||||||    
T  13862829 aaagtt 13862834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 14085134 - 14084728
Alignment:
Q  3 tacaacaatctcaaaggatcaatccctaattttcaagtaataaatcgttgttcttttttatctctttcatcaaatgaatttgaagggcccattccatcat 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||  ||| ||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  14085134 tacaacaatttcaaaggatcaattccgaatctccacataagaaattattgttcttttttatttctgtcatcaaatgaatttgaaggtcccattccaccat 14085035  T
Q  103 ttctacaaggttccatggttattgatttgtccaaaaacaaattctctgattctcttccattcttatgtgaaaatggtatagatgcaatgttaggccagtt 202  Q
    ||||   |||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||  |||| ||| |     
T  14085034 ttcttagaggttccataaatattgatctgtccaaaaataaattcaatgattctgttccattcatatgtgcaaatggtatagatgtaactttagcccattc 14084935  T
Q  203 agatctttcaaataatcaattatctggacaaattccagactgttggagcaatttcaaatcattagcttatcttgatttgagccacaacaatttttcaggg 302  Q
     || |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |      
T  14084934 tgacctttcaaacaatcaattatctagacgaattccagactgttggagcaatttcaaggcattagcttatgtagatttgagccacaacaatttctcggca 14084835  T
Q  303 aagattcccacttcaatgggatcagttgtagaactgcaagcattactattaaggaacaacaacttaacagaggagatccctttctccttaatgaattgca 402  Q
    |||||||| | |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14084834 aagattcctatttcattgggatcacttgtagaacttcaagcattactgttaaggaacaacagcttaacagaggagatccctttctccttaatgaactgca 14084735  T
Q  403 caaagtt 409  Q
    |||||||    
T  14084734 caaagtt 14084728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 14047796 - 14047404
Alignment:
Q  4 acaacaatctcaaaggatcaatccctaattttcaagtaataaatcgttgttcttttttatctctttcatcaaatgaatttgaagggcccattccatcatt 103  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || ||| ||||||  | || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||    
T  14047796 acaataatctcaaaggattaattccaaatcttcaagccaaaagtcaatgttcttttttatctctttcatcaaatgaatttgaagggtccactccaccttt 14047697  T
Q  104 tctacaaggttccatggttattgatttgtccaaaaacaaattctctgattctcttccattcttatgtgaaaatggtatagatgcaatgttaggccagtta 203  Q
    ||||| ||||||     | |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  14047696 tctactaggttctggattaattgatctttccaaaaataaattctccgattctcttccattcttatgtgaaagtggtatagatgcaatattaggccagtt- 14047598  T
Q  204 gatctttcaaataatcaattatctggacaaattccagactgttggagcaatttcaaatcattagcttatcttgatttgagccacaacaatttttcaggga 303  Q
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14047597 -------------------tatctggacaaattccagactgttggagcaatttcaaggcattagcttatctagatttgagccacaacaatttttctggga 14047517  T
Q  304 agattcccacttcaatgggatcagttgtagaactgcaagcattactattaaggaacaacaacttaacagaggagatccctttctccttaatgaattgcac 403  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  14047516 agattcctacttcaatgggatcacttgtagaactgcgagcattaatattgaggaacaatagcttaacaggggagatcccttcctccttaatgaactgcac 14047417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 409
Target Start/End: Original strand, 13472598 - 13473001
Alignment:
Q  6 aacaatctcaaaggatcaatccctaattttcaagtaataaatcgttgttcttttttatctctttcatcaaatgaatttgaagggcccattccatcatttc 105  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13472598 aacaatctcaaaggattaattccaaatcttcaagtaaaaaatcattgttcttttttatatctttcatcaaatgaatttgaagggtccattccaccatttc 13472697  T
Q  106 tacaaggttccatggttattgatttgtccaaaaacaaattctctgattctcttccattcttatgtgaaaatggtatagatgcaatgttaggccagttaga 205  Q
    ||  ||||||     |||||||| |||||||||| || |||||||||||||  || ||| |||||| ||| |||| ||||  ||||||| | ||  | ||    
T  13472698 taagaggttcttcatttattgatctgtccaaaaataagttctctgattctcgccctttcctatgtgcaaacggtagagatataatgttacgtcaacttga 13472797  T
Q  206 tctttcaaataatcaattatctggacaaattccagactgttggagcaatttcaaatcattagcttatcttgatttgagccacaacaatttttcagggaag 305  Q
     ||||| |||||| |||| || |||  ||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  13472798 cctttcgaataataaattttcgggaggaattccaaattgttggagcaacttcaagtcattagtttatgtagatttgagtcacaacaatttttcctggaag 13472897  T
Q  306 attcccacttcaatgggatcagttgtagaactgcaagcattactattaaggaacaacaacttaacagaggagatccctttctccttaatgaattgcacaa 405  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||    
T  13472898 attcctacttcaatgggatctcttgtagaacttcaagcattaatattgaggaaaaacatcttaacagaggaaatccctgtctccttaatgaactgtacaa 13472997  T
Q  406 agtt 409  Q
    ||||    
T  13472998 agtt 13473001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University