View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17202_high_5 (Length: 613)

Name: NF17202_high_5
Description: NF17202
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17202_high_5
NF17202_high_5
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (18-575)||(54395894-54396451)
chr4 (48-571)||(23596755-23597278)
chr4 (42-571)||(23587897-23588426)
chr4 (343-400)||(9336356-9336413)
chr4 (253-373)||(35132129-35132249)
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (51-571)||(8017586-8018106)
chr7 (39-575)||(8102138-8102674)
chr7 (54-433)||(39985259-39985638)
chr7 (206-385)||(17259902-17260081)
chr7 (206-385)||(17267600-17267779)
chr7 (253-385)||(7878108-7878240)
chr7 (253-385)||(8581361-8581493)
chr7 (348-382)||(8537700-8537734)
chr7 (336-382)||(8545297-8545343)
chr7 (253-388)||(8575984-8576119)
chr7 (253-388)||(8590296-8590431)
chr7 (338-388)||(8659021-8659071)
chr7 (343-400)||(10494839-10494896)
chr7 (343-400)||(13333833-13333890)
chr7 (253-382)||(27831250-27831379)
chr7 (285-382)||(29582248-29582345)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (259-388)||(12245787-12245916)
chr2 (253-388)||(11999066-11999200)
chr2 (253-385)||(12234351-12234482)
chr2 (253-400)||(16657892-16658039)
chr2 (315-388)||(16662429-16662502)
chr2 (327-391)||(5446218-5446282)
chr2 (279-379)||(17648442-17648542)
chr2 (252-376)||(17717061-17717185)
chr2 (17-84)||(12258720-12258787)
chr2 (285-400)||(43625058-43625173)
chr2 (177-379)||(17666982-17667184)
chr2 (285-379)||(17718358-17718452)
chr2 (336-385)||(7541887-7541936)
chr2 (336-385)||(14703069-14703118)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (225-385)||(12528165-12528325)
chr8 (259-387)||(42273062-42273190)
chr8 (252-313)||(43744549-43744610)
[»] chr1 (2 HSPs)
chr1 (336-402)||(4679015-4679081)
chr1 (265-382)||(15594698-15594815)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (339-382)||(28219582-28219625)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 550; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 54396451 - 54395894
Alignment:
Q  18 agtggtaatgcaagagctttgaggagattaagaacagcttgtgagagagctaagagaacactttcttcaactgctcagacaacaatagaaattgattctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54396451 agtggtaatgcaagagctttgaggagattaagaacagcttgtgagagagctaagagaacactttcttcaactgctcagacaacaatagaaattgattctt 54396352  T
Q  118 tgtttgaaggaattgatttctatgcaactattacaagggcgagatttgaagaattgaatatggatttgtttaggaaatgtatggaacctgttgagaagtg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54396351 tgtttgaaggaattgatttctatgcaactattacaagggcgagatttgaagaattgaatatggatttgtttaggaaatgtatggaacctgttgagaagtg 54396252  T
Q  218 tctaagggatgctaagattgataagagtcatgttcatgaagttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctcttgcaggatttc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54396251 tctaagggatgctaagattgataagagtcatgttcatgaagttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagcttttgcaggatttc 54396152  T
Q  318 ttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttcaagcagcgattttgagcggtgaaggtgatgaaa 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54396151 ttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttcaagcagcgattttgagcggtgaaggtgatgaaa 54396052  T
Q  418 aggttcaagatcttctgttgcttgatgttactcctcttagtttggggttggaaactgctggtggtgttatgacgactttgattccaaggaacacgacgat 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54396051 aggttcaagatcttctgttgcttgatgttactcctcttagtttggggttggaaactgctggtggtgttatgacgactttgattccaaggaacacgacgat 54395952  T
Q  518 tcctactaagaaggagcagattttctcaacttactcagataaccaacctggtgttttg 575  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54395951 tcctacgaagaaggagcagattttctcaacttactcagataaccaacctggtgttttg 54395894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 48 - 571
Target Start/End: Original strand, 23596755 - 23597278
Alignment:
Q  48 agaacagcttgtgagagagctaagagaacactttcttcaactgctcagacaacaatagaaattgattctttgtttgaaggaattgatttctatgcaacta 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||  | || |    
T  23596755 agaactgcttgtgagagagctaagaggactctttcctctactgctcaaaccaccattgaaattgattctttgtttgagggtattgacttttacactacca 23596854  T
Q  148 ttacaagggcgagatttgaagaattgaatatggatttgtttaggaaatgtatggaacctgttgagaagtgtctaagggatgctaagattgataagagtca 247  Q
    ||||  | ||  | ||||||||  | || |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||        
T  23596855 ttactcgcgctcgttttgaagagctcaacatggatctatttaggaagtgtatggagcctgttgagaagtgtttgagggatgctaagatggataagaacag 23596954  T
Q  248 tgttcatgaagttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtatt 347  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||     
T  23596955 tgttgatgatgttgttcttgttggcggatcgactaggattcccaaggttcaacaacttttgcaagatttcttcaatgggaaggaactttgtaagagcatc 23597054  T
Q  348 aaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttcaagcagcgattttgagcggtgaaggtgatgaaaaggttcaagatcttctgttgcttgatgtta 447  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||  |||| || || || |||||| ||||||| |||||||    
T  23597055 aaccctgatgaggctgttgcttatggcgctgcagtccaagctgctattttgagcggcgaaggcaatgagaaagtacaggatcttttgttgctggatgtta 23597154  T
Q  448 ctcctcttagtttggggttggaaactgctggtggtgttatgacgactttgattccaaggaacacgacgattcctactaagaaggagcagattttctcaac 547  Q
    ||||||||    | || ||||| ||||| || || || |||||    || ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||| | || || ||    
T  23597155 ctcctctttcccttggtttggagactgcaggaggagtcatgactgtgttaattccgagaaacacaacaattcctaccaagaaggagcaggtgttttcgac 23597254  T
Q  548 ttactcagataaccaacctggtgt 571  Q
     || || |||||||||||||||||    
T  23597255 ctattctgataaccaacctggtgt 23597278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 42 - 571
Target Start/End: Original strand, 23587897 - 23588426
Alignment:
Q  42 agattaagaacagcttgtgagagagctaagagaacactttcttcaactgctcagacaacaatagaaattgattctttgtttgaaggaattgatttctatg 141  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||      
T  23587897 agattgagaactgcttgcgagagagctaagaggaccctttcctctactgctcaaaccaccattgaaattgattcattgtttgagggtattgacttttaca 23587996  T
Q  142 caactattacaagggcgagatttgaagaattgaatatggatttgtttaggaaatgtatggaacctgttgagaagtgtctaagggatgctaagattgataa 241  Q
    | || || ||  ||||  | ||||||||  | || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  23587997 ctaccatcactcgggctcgttttgaagagctcaacatggatctgtttaggaagtgtatggagcctgttgagaagtgtttgagggatgctaagatggataa 23588096  T
Q  242 gagtcatgttcatgaagttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaag 341  Q
    ||    ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||    
T  23588097 gaacagtgtccatgatgttgttcttgttggtggatccactaggattcccaaggttcaacaacttttgcaagatttcttcaatggaaaggagctttgtaag 23588196  T
Q  342 agtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttcaagcagcgattttgagcggtgaaggtgatgaaaaggttcaagatcttctgttgcttg 441  Q
    || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| ||  |||| || || || |||||  ||||||| |    
T  23588197 agcatcaaccccgatgaagctgttgcatatggggcagccgtccaagctgctattttgagtggtgagggcaatgagaaagtgcaggatctgttgttgctgg 23588296  T
Q  442 atgttactcctcttagtttggggttggaaactgctggtggtgttatgacgactttgattccaaggaacacgacgattcctactaagaaggagcagatttt 541  Q
    |||||||||||||     | || ||||| || || || ||||| |||||    |||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||  | ||    
T  23588297 atgttactcctctctcccttggtttggagaccgcaggaggtgtcatgactgtattgattcctagaaacacaaccattcctaccaagaaggagcaagtgtt 23588396  T
Q  542 ctcaacttactcagataaccaacctggtgt 571  Q
     ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  23588397 ttcaacctactctgataatcaacctggtgt 23588426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 400
Target Start/End: Original strand, 9336356 - 9336413
Alignment:
Q  343 gtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttcaagcagcgattttgag 400  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  9336356 gtatcaacccagatgaggctgttgcttatggtgcagctgttcaagctgctattttgag 9336413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35132249 - 35132129
Alignment:
Q  253 atgaagttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccc 352  Q
    |||| |||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||  | || ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  35132249 atgatgttgttcttgttggagggtcttctaggattcccaaagtgcagcagctattgcaaaactttttcaaagggaaggagttgtgcaagagcattaaccc 35132150  T
Q  353 tgatgaagctgttgcttatgg 373  Q
     ||||| ||||| ||||||||    
T  35132149 cgatgaggctgtagcttatgg 35132129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 157; Significance: 4e-83; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 51 - 571
Target Start/End: Original strand, 8017586 - 8018106
Alignment:
Q  51 acagcttgtgagagagctaagagaacactttcttcaactgctcagacaacaatagaaattgattctttgtttgaaggaattgatttctatgcaactatta 150  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || || || || || ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||  | || || |    
T  8017586 acagcttgtgagagagcgaagagaactctctcttctactgcacaaactaccattgagattgattctttgtttgagggtgttgatttttacaccacaatca 8017685  T
Q  151 caagggcgagatttgaagaattgaatatggatttgtttaggaaatgtatggaacctgttgagaagtgtctaagggatgctaagattgataagagtcatgt 250  Q
    |  | || |||||||| ||| | || |||||| |||| || || |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| || ||||    |||    
T  8017686 cccgtgcaagatttgaggaacttaacatggatctgttcagaaagtgtatggagcctgttgagaagtgtttgagagatgctaagatggacaagaactctgt 8017785  T
Q  251 tcatgaagttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaac 350  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8017786 tcatgatgttgttcttgttggcggttcaactagaattcccaaagttcagcaactgttgcaagatttcttcaatggtaaagagctttgcaagagtatcaac 8017885  T
Q  351 cctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttcaagcagcgattttgagcggtgaaggtgatgaaaaggttcaagatcttctgttgcttgatgttactc 450  Q
    || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | ||| |  | ||||| ||||    
T  8017886 ccagacgaggctgttgcttatggtgccgctgtacaagcagcaattttgagtggtgaaggcaatgaaaaggttcaagatttgctgcttttggatgtcactc 8017985  T
Q  451 ctcttagtttggggttggaaactgctggtggtgttatgacgactttgattccaaggaacacgacgattcctactaagaaggagcagattttctcaactta 550  Q
    |  |   | ||||  | ||||||||||||||||| |||||    || |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||  ||||||| |||||    
T  8017986 cattgtctctgggtctagaaactgctggtggtgtcatgactgtattaattccaaggaacaccacaattccaaccaagaaggagcaagttttctctactta 8018085  T
Q  551 ctcagataaccaacctggtgt 571  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8018086 ctcagataaccaacctggtgt 8018106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 39 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 8102674 - 8102138
Alignment:
Q  39 aggagattaagaacagcttgtgagagagctaagagaacactttcttcaactgctcagacaacaatagaaattgattctttgtttgaaggaattgatttct 138  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| || || || || || || ||||||||||||||||| ||  ||||||| |    
T  8102674 aggagattgagaaccgcatgtgagagagcgaagagaactctctcatcaaccgcacaaactaccattgagattgattctttgtttgagggtgttgattttt 8102575  T
Q  139 atgcaactattacaagggcgagatttgaagaattgaatatggatttgtttaggaaatgtatggaacctgttgagaagtgtctaagggatgctaagattga 238  Q
    |  | || || ||  | || |||||||| ||| | || |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| ||    
T  8102574 acaccacaatcacccgtgccagatttgaggaacttaacatggatctgttcaggaagtgtatggagcctgttgagaagtgtttgagagatgctaagatgga 8102475  T
Q  239 taagagtcatgttcatgaagttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgc 338  Q
     |||||    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||    
T  8102474 caagagcacagttcatgatgttgttcttgttggtggttcaactaggattcccaaagttcagcaactgttgcaagacttcttcaatggtaaggagctatgc 8102375  T
Q  339 aagagtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttcaagcagcgattttgagcggtgaaggtgatgaaaaggttcaagatcttctgttgc 438  Q
    || || || ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||  |||| |||||||||||| |  || |      
T  8102374 aaaagcatcaaccccgacgaggctgttgcttatggtgccgctgttcaagctgctatcttgagtggtgaaggaaatgagaaggttcaagatttgttgcttt 8102275  T
Q  439 ttgatgttactcctcttagtttggggttggaaactgctggtggtgttatgacgactttgattccaaggaacacgacgattcctactaagaaggagcagat 538  Q
    | ||||| || ||  |   |   || ||||| ||||| || ||||| |||||    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||  |    
T  8102274 tggatgtcaccccattgtctcaaggtttggagactgcaggaggtgtcatgactgtattgattccaaggaacactaccattccaaccaagaaggagcaagt 8102175  T
Q  539 tttctcaacttactcagataaccaacctggtgttttg 575  Q
    |||||| || || ||||| ||||||||||||||||||    
T  8102174 tttctctacgtattcagacaaccaacctggtgttttg 8102138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 39985638 - 39985259
Alignment:
Q  54 gcttgtgagagagctaagagaacactttcttcaactgctcagacaacaatagaaattgattctttgtttgaaggaattgatttctatgcaactattacaa 153  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |  | |||||      
T  39985638 gcttgtgaaagagcgaagagaactctctcttctactgcccagaccaccattgaaattgattctctttttgaaggaattgatttctactcccccattactc 39985539  T
Q  154 gggcgagatttgaagaattgaatatggatttgtttaggaaatgtatggaacctgttgagaagtgtctaagggatgctaagattgataagagtcatgttca 253  Q
    | || |||||||| ||  | || |||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||| ||| | || ||||| ||||| || ||||    ||| ||    
T  39985538 gtgcaagatttgaggagctcaacatggatctctttagaaaatgtatggagccagttgagaaatgtttgagagatgccaagatggacaagaaaagtgtcca 39985439  T
Q  254 tgaagttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccct 353  Q
     || ||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| || || |||    
T  39985438 cgatgttgtccttgtaggaggttctaccagaattccaaaggttcaacaacttttgcaagatttctttaacggaaaggagctatgcaagagcataaatcct 39985339  T
Q  354 gatgaagctgttgcttatggtgctgctgttcaagcagcgattttgagcggtgaaggtgatgaaaaggttcaagatcttct 433  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||| ||  |||| |||||||| ||||||||    
T  39985338 gatgaggctgttgcatatggtgctgctgttcaggctgctatcttgagtggtgagggcaatgagaaggttcaggatcttct 39985259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 206 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 17260081 - 17259902
Alignment:
Q  206 tgttgagaagtgtctaagggatgctaagattgataagagtcatgttcatgaagttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctc 305  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||     || |||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||| || || ||     
T  17260081 tgttgagaagtgtcttagtgatggtaagattgacaagagcagaattgatgatgttgtccttgttggtggatcttctaggattccgaaagtgcagcaacta 17259982  T
Q  306 ttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttca 385  Q
    ||||||||||||||||| || || ||  | |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17259981 ttgcaggatttcttcaagggtaaggaattatgcaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtgctgctgttca 17259902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 206 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 17267779 - 17267600
Alignment:
Q  206 tgttgagaagtgtctaagggatgctaagattgataagagtcatgttcatgaagttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctc 305  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    ||| |||| ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || || ||     
T  17267779 tgttgagaagtgtcttagtgatgctaagattgacaagagcagagttgatgatgttgtccttgttggtgggtcttctaggattccgaaagtgcagcaacta 17267680  T
Q  306 ttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttca 385  Q
    |||||| | |||||||| ||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17267679 ttgcagaacttcttcaaggggaaggaattatgcaaaagtatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtgctgctgttca 17267600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 385
Target Start/End: Original strand, 7878108 - 7878240
Alignment:
Q  253 atgaagttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccc 352  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||  ||||| || ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||  || || |||||    
T  7878108 atgatgttgtacttgttggtggatcatctaggattctcaaagtgcagcagctattgcaggacttttttaaggggaaggatatttgcagtagcatcaaccc 7878207  T
Q  353 tgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttca 385  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7878208 ggatgaagctgttgcttatggtgcagctgttca 7878240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 8581493 - 8581361
Alignment:
Q  253 atgaagttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccc 352  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| |||||   |||||| || ||||| || ||| | ||||| ||  | |||||||| || |||||    
T  8581493 atgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggagtttttccaggggaaggaattatgcaagagcatcaaccc 8581394  T
Q  353 tgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttca 385  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8581393 tgatgaggctgttgcttatggtgctgctattca 8581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 8537734 - 8537700
Alignment:
Q  348 aaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgt 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8537734 aaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgt 8537700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 8545343 - 8545297
Alignment:
Q  336 tgcaagagtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgt 382  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8545343 tgcaagagcattaaccctgatgaggctgttgcttatggtgcagctgt 8545297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 8576119 - 8575984
Alignment:
Q  253 atgaagttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccc 352  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| |||||   |||||| || |||||  | ||||| ||||| ||  | || ||||| || |||||    
T  8576119 atgatgttgtccttgttggtggttcttctaggattcctaaagtgagacagctattacaggaggttttcaaggggaaggaattatgtaagagcatcaaccc 8576020  T
Q  353 tgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttcaagc 388  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8576019 tgatgaggctgttgcttatggtgctgttgtccaagc 8575984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 8590431 - 8590296
Alignment:
Q  253 atgaagttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccc 352  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| ||||| || || || |  ||||| || |||| ||| || || || ||    
T  8590431 atgatgttgtacttgttggtggttcttctaggattcccaaagtgcagcagctattgcaagacttttttatggggaaggatctttacaatagcatcaatcc 8590332  T
Q  353 tgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttcaagc 388  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8590331 agatgaggctgttgcttatggtgcagctgttcaagc 8590296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 8659071 - 8659021
Alignment:
Q  338 caagagtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttcaagc 388  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  8659071 caagagtatcaacccagatgaggctgttgcttatggtgcagctcttcaagc 8659021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 400
Target Start/End: Original strand, 10494839 - 10494896
Alignment:
Q  343 gtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttcaagcagcgattttgag 400  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  10494839 gtatcaacccagatgaggctgttgcttatggtgcagctgttcaggctgctattttgag 10494896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 400
Target Start/End: Original strand, 13333833 - 13333890
Alignment:
Q  343 gtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttcaagcagcgattttgag 400  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  13333833 gtatcaacccagatgaggctgttgcttatggtgcagctgttcaggctgctattttgag 13333890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 382
Target Start/End: Original strand, 27831250 - 27831379
Alignment:
Q  253 atgaagttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccc 352  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||| ||||| || ||||| |||  ||| || ||||| || || ||  | |||||||| || || ||    
T  27831250 atgatgttgtccttgttggtggctcttcaaggattcccaaagtgcagcagctattggcggactttttcaagggaaaggatttgtgcaagagcatcaatcc 27831349  T
Q  353 tgatgaagctgttgcttatggtgctgctgt 382  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  27831350 tgatgaggctgttgcttttggtgcagctgt 27831379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 382
Target Start/End: Original strand, 29582248 - 29582345
Alignment:
Q  285 attccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgt 382  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||  | |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  29582248 attcccaaagtgcatcagctattgcaagaatttttcaaggggaaggatttgtgcatgagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtgcagctgt 29582345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 388
Target Start/End: Original strand, 12245787 - 12245916
Alignment:
Q  259 ttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccctgatga 358  Q
    |||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||  | |||||||| ||||||||||| ||    
T  12245787 ttgtacttgttggtggatcttctaggattcccaaagtccaacagctattacaggactttttcaacgggaaggaattgtgcaagagcattaaccctgacga 12245886  T
Q  359 agctgttgcttatggtgctgctgttcaagc 388  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||    
T  12245887 ggctgttgcttatggggcagctgttcaagc 12245916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 11999200 - 11999066
Alignment:
Q  253 atgaagttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccc 352  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| || |||||||| || || || || ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  11999200 atgatgttgtacttgttggtggatcttctaggatcccaaa-gtccaacagctattacatgactttttcaacgggaaggagttgtgcaagagcattaaccc 11999102  T
Q  353 tgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttcaagc 388  Q
    |||||| ||||| |||||||| || |||||||||||    
T  11999101 tgatgaggctgtagcttatggggcagctgttcaagc 11999066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 253 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 12234482 - 12234351
Alignment:
Q  253 atgaagttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccc 352  Q
    |||||||||| ||| |||| || ||  | |||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12234482 atgaagttgtccttattggcgggtcctctaggattcccaaagtgcagcaactattgcaggattttttcaaggggaaggagctgtgcaagagtattaaccc 12234383  T
Q  353 tgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttca 385  Q
    ||| || || ||||||||||  || ||||||||    
T  12234382 tga-gaggcggttgcttatgaggcagctgttca 12234351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 400
Target Start/End: Original strand, 16657892 - 16658039
Alignment:
Q  253 atgaagttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccc 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||| | |||||||| ||||| ||  | || ||||| || || ||||| || || ||  | ||||| ||||| |||||    
T  16657892 atgacgttgttcttgtgggtggctcatctaggattcccaaagtgcaggatctattgcaagactttttcaagggcaaggatttatgcaaaagtatcaaccc 16657991  T
Q  353 tgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttcaagcagcgattttgag 400  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  16657992 ggatgaagctgttgcttacggtgcagctgttcaagctgctattttgag 16658039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 388
Target Start/End: Original strand, 16662429 - 16662502
Alignment:
Q  315 ttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttcaagc 388  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  16662429 ttcttcaatgggaaggagttgtgcaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggggcagctgtgcaagc 16662502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 391
Target Start/End: Original strand, 5446218 - 5446282
Alignment:
Q  327 aaagagctttgcaagagtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttcaagcagc 391  Q
    ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  5446218 aaagagccttgcaaaagcattaatcctgatgaagctgtggcttatggcgccgctgttcaagcagc 5446282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 379
Target Start/End: Original strand, 17648442 - 17648542
Alignment:
Q  279 acaaggattccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctg 378  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  17648442 acaagaattccaaaggttcaacaactattgcaggatttctttgacggaaaggagctatgcaatagcattaatcccgatgaggctgttgcatatggtgctg 17648541  T
Q  379 c 379  Q
    |    
T  17648542 c 17648542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 376
Target Start/End: Original strand, 17717061 - 17717185
Alignment:
Q  252 catgaagttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaacc 351  Q
    ||||| ||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||  | || ||||| |||||||| ||||| |    
T  17717061 catgatgttgtccttgtaggaggttctaccagaattccaaaggttcaacaactattgcaggatttctttaacagaaaggagctatgcaagagcattaatc 17717160  T
Q  352 ctgatgaagctgttgcttatggtgc 376  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||    
T  17717161 ccgatgaggctgttgcatatggtgc 17717185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 84
Target Start/End: Original strand, 12258720 - 12258787
Alignment:
Q  17 aagtggtaatgcaagagctttgaggagattaagaacagcttgtgagagagctaagagaacactttctt 84  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  12258720 aagtggaaatccaagagctttgaggagattgaaaacagcttgtgagagtgcaaaaagatcactttctt 12258787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 43625173 - 43625058
Alignment:
Q  285 attccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttc 384  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    ||| | || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  43625173 attccaaaagtaaaacagctgttgcaggagtttttcaaggggaaggaatcatgcgaaagcataaaccctgatgaggctgttgcttatggtgcagctgtcc 43625074  T
Q  385 aagcagcgattttgag 400  Q
    | || || ||||||||    
T  43625073 aggctgctattttgag 43625058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 379
Target Start/End: Original strand, 17666982 - 17667184
Alignment:
Q  177 atggatttgtttaggaaatgtatggaacctgttgagaagtgtctaagggatgctaagattgataagagtcatgttcatgaagttgttcttgttggtggat 276  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |  |||||||| ||| | ||  |||||||||| || || ||   ||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  17666982 atggatctctttaggaaatgtatggagcaagttgagaaatgtttgagaaatgctaagatggacaaaagaagtgtccatgatgttgtccttgtaggaggtt 17667081  T
Q  277 caacaaggattccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgc 376  Q
    | || || |||||||| ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||  | || |||||||  ||||||||    
T  17667082 ctaccagaattccaaaggttcaacaattattgcaggatttctttaacggaaaggagctatgcaatagcattaatcccaacgaggctgttgtgtatggtgc 17667181  T
Q  377 tgc 379  Q
    |||    
T  17667182 tgc 17667184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 379
Target Start/End: Original strand, 17718358 - 17718452
Alignment:
Q  285 attccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgc 379  Q
    |||||||| |||||||| || | ||||||| |||| || || || || || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17718358 attccaaaggttcaacaactatggcaggatgtctttaacggaaaggatctatgcaagagcattaatcccgatgaggctgttgcatatggtgctgc 17718452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 7541936 - 7541887
Alignment:
Q  336 tgcaagagtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttca 385  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  7541936 tgcaagagcattaatcctgatgaggctgttgcttatggggcagctgttca 7541887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 14703118 - 14703069
Alignment:
Q  336 tgcaagagtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttca 385  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  14703118 tgcaacagcattaaccctgatgaagctgtagcttatggggcagctgttca 14703069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 12528325 - 12528165
Alignment:
Q  225 gatgctaagattgataagagtcatgttcatgaagttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatg 324  Q
    ||||||||||| || ||||||  |||  ||||  |||| ||||||||||| ||  | |||||||| |||||  | ||||| |||||||| || ||||| |    
T  12528325 gatgctaagatggacaagagtagtgtagatgatattgtacttgttggtggctcgtctaggattcccaaagtgaagcagctattgcaggagtttttcaagg 12528226  T
Q  325 ggaaagagctttgcaagagtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttca 385  Q
    | || ||| | | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12528225 gcaaggagttatacaagagcatcaaccctgatgaggctgttgcttatggtgccgctgttca 12528165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 387
Target Start/End: Original strand, 42273062 - 42273190
Alignment:
Q  259 ttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccctgatga 358  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||| |||  |||| || ||||    |||| |  | |||||||||||    
T  42273062 ttgttcttgttggtggaagcacaaggattccaaaggtacaacaactcttgaaggattactttgatggaaaggagccaaacaagggcgtcaaccctgatga 42273161  T
Q  359 agctgttgcttatggtgctgctgttcaag 387  Q
    ||| ||||| | |||||||||||| ||||    
T  42273162 agcagttgcctttggtgctgctgtgcaag 42273190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43744610 - 43744549
Alignment:
Q  252 catgaagttgttcttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctcttgcagga 313  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  43744610 catgatgttgttcttgttggtggctcctctaggattccaaaagtacaacaactattgcagga 43744549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 402
Target Start/End: Original strand, 4679015 - 4679081
Alignment:
Q  336 tgcaagagtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgttcaagcagcgattttgagcg 402  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||    
T  4679015 tgcaagagtatcaacccagatgaggctgttgcttatggtgcagctatccaagctgctattttgagcg 4679081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15594815 - 15594698
Alignment:
Q  265 ttgttggtggatcaacaaggattccaaaagttcaacagctcttgcaggatttcttcaatgggaaagagctttgcaagagtattaaccctgatgaagctgt 364  Q
    |||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||| ||| | || || ||  | |||| ||| || ||||||||||| |||||    
T  15594815 ttgttggtgggtcttctaggattcccaaagtgcaacaactattgaaggattttttcgagggaaaggaattgtgcatgagcatcaaccctgatgaggctgt 15594716  T
Q  365 tgcttatggtgctgctgt 382  Q
    |||||||||||| |||||    
T  15594715 tgcttatggtgcagctgt 15594698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28219625 - 28219582
Alignment:
Q  339 aagagtattaaccctgatgaagctgttgcttatggtgctgctgt 382  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28219625 aagagcattaaccctgatgaggctgttgcttatggtgcagctgt 28219582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University