View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1724-Insertion-2 (Length: 957)

Name: NF1724-Insertion-2
Description: NF1724
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1724-Insertion-2
NF1724-Insertion-2
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (8-957)||(37703507-37704459)
chr5 (95-957)||(37712463-37713328)
chr5 (95-957)||(37533939-37534804)
chr5 (95-909)||(37640762-37641585)
chr5 (88-957)||(37697626-37698504)
chr5 (269-957)||(37399451-37400133)
chr5 (88-909)||(37436597-37437412)
chr5 (269-957)||(37824734-37825425)
chr5 (118-924)||(37380802-37381621)
chr5 (268-909)||(37391584-37392228)
chr5 (95-612)||(37595517-37596037)
chr5 (88-923)||(37429616-37430468)
chr5 (647-957)||(37595163-37595476)
chr5 (88-829)||(37411755-37412504)
chr5 (88-252)||(37391390-37391554)
chr5 (93-254)||(37441491-37441650)
chr5 (130-252)||(37825460-37825582)
chr5 (8-86)||(37437447-37437525)
chr5 (8-78)||(37698571-37698641)
chr5 (125-252)||(37399289-37399416)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (88-909)||(16841328-16842146)
chr4 (95-605)||(24216193-24216703)
chr4 (644-931)||(24216751-24217033)
chr4 (22-86)||(16841203-16841270)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (275-909)||(14553928-14554556)
chr3 (95-252)||(14554606-14554760)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 824; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 824; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 957
Target Start/End: Complemental strand, 37704459 - 37703507
Alignment:
Q  8 tttggtccttgccccttagtttcaggttatgtttcctatataaatagaggctaatcaattggtatatcctaaatcatcagaatgcggtccttttttattc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37704459 tttggtccttgccccttagtttcaggttatgtttcctatataaatagaggctaatcaattggtatatcctaaatcatcaaaatgcggtccttttttattc 37704360  T
Q  108 tattgccttattttacttttcacttgttcttgttattgctgcttactcattttacttcctacactttctcattgtgcagccaacatgatagctccgcctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37704359 tattgccttattttacttttcacttgttcttgttattgctgcttactcattttacttcctacactttctcattgtgcagccaacatgatagctccgcctt 37704260  T
Q  208 gttacaattcaaacactcattttctgtcaacacttcatctaaacccggttttctgtctatgtgttcgtctttttcttttaagacagaatcttggaaaacc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37704259 gttacaattcaaacactcattttctgtcaacacttcatctaaacccggttttctgtctatgtgtttgtctttttcttttaagacagaatcttggaaaacc 37704160  T
Q  308 ggcacagattgttgcgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccgtgtctgatcacgtgattggtttggatctcagttgcaacaatctgaaaggtgaattac 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37704159 ggcacagattgttgcgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccgtgtctgatcacgtgattggtttggatctcagttgcaacaatctgaaaggtgaattac 37704060  T
Q  408 aacctaatagcacaatctacragcttagacaccttcaacaactcaacttggcttttaatcatttttctggatcttcaatgcctattggtattggcgattt 507  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37704059 aacctaatagcacaatctacaagcttagacaccttcaacaactcaacttggcttttaatcatttttctggatcttcaatgcctattggtattggcgattt 37703960  T
Q  508 agtgaatctcacacatctaaatttatcattttgtcacctcaagagtaatactccctccacaatctctcatttgtcaaaattaatatcacttgatcttagc 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37703959 agtgaatctcacacatctaaatttatcattttgtcacctcaagggtaatactccctccacaatctctcatttgtcaaaattaatatcacttgatcttagc 37703860  T
Q  608 agttatagttactcgaacatggaaattaatccgttgacatggaagaaactcattcgtaatgctactaatttaagggagcttcatttggatagagtgaata 707  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  37703859 agttatagttactcgaacatggaaattaatccgttgacatggaagaaactcattcataatgctactaatttaagggagcttcatttgaatagtgtggata 37703760  T
Q  708 tgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttctcttagtctaccaaaaactgagttgcaaggaaatttgtc 807  Q
    ||||||| || |  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37703759 tgtcttccattacggagagctcattgtcaatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttctcttagtctatcagaaactgagttgcaaggaaatttgtc 37703660  T
Q  808 aagtggcatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatctaattataaccttcgtggtcaacttccaaagtccaactggagcactcctcta 907  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  37703659 aagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcattcaattataaccttagtggtcaacttccaaaatccaactggagctctcctcta 37703560  T
Q  908 ag-tacttggtcctctctttctctgctttt--aagtgaaattccgtattccat 957  Q
    || ||||||  |||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||    
T  37703559 agatacttgaacctctcttcctctgctttttcaggtgaaattccttattccat 37703507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 957
Target Start/End: Complemental strand, 37713328 - 37712463
Alignment:
Q  95 tccttttttattctattgccttattttacttttcacttgttcttgttattgctgcttactcattttacttcctacactttctcattgtgcagccaacatg 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||    
T  37713328 tccttttttattccattgccttattttacctttcacttcttctcgttgttgttgcttactcattttacttcccacactttctcactgtgcaacaaacatg 37713229  T
Q  195 atagctccgccttgttacaattcaaacactcattttctgtcaacacttcatctaaacccggttttctgt-ctatg--tgttcgtctttttcttttaagac 291  Q
    | | ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  |   | || || ||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  37713228 acaactctgccttgttacaattcaaaaactctttttctgtcaacacttcatctcaacccaat---ccgtactttggttgttcctctttttctttcaagac 37713132  T
Q  292 agaatcttggaaaaccggcacagattgttgcgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccgtgtctgatcacgtgattggtttggatctcagttgcaacaat 391  Q
    |||||||||| ||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  37713131 agaatcttggcaaaacagtacagattgttgtgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgtcagatcacgtgattggtctggacctcagttgcaacaat 37713032  T
Q  392 ctgaaaggtgaattacaacctaatagcacaatctacragcttagacaccttcaacaactcaacttggcttttaatcatttttctggatcttcaatgccta 491  Q
    || |||||||||||||| || |||||||| ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  37713031 ctaaaaggtgaattacatcccaatagcaccatctttcagcttaaacaccttcaacaactcaacttggcttttaatcatttttcttggtcttcaatgccta 37712932  T
Q  492 ttggtattggcgatttagtgaatctcacacatctaaatttatcattttgtcacctcaagagtaatactccctccacaatctctcatttgtcaaaattaat 591  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37712931 ttggtgttggagatttagtgaaactcacacatctaaatctatcaaattgttacctcaatggtaatattccttccacaatctctcatttgtcaaaattagt 37712832  T
Q  592 atcacttgatcttagcagttatagttactcgaacatggaaattaatccgttgacatggaagaaactcattcgtaatgctactaatttaagggagcttcat 691  Q
    |||||||||||||||||||| | |  |   | |  || || | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  37712831 atcacttgatcttagcagttttggggatgtggaattgaaactaaatccattgacatggaagaaactcattcataatgctactaatttaagggaactttat 37712732  T
Q  692 ttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttctcttagtctaccaaaaactgagt 791  Q
    |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||    
T  37712731 ttggataatgtgaacatgtcttccatcagagagagctctttgtcaatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttctcttagtctacgagacactgtgt 37712632  T
Q  792 tgcaaggaaatttgtcaagtggcatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatctaattataaccttcgtggtcaacttccaaagtccaa 891  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37712631 tgcaaggaaatatatcaagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatttaatcaaaaccttagtggtcaacttccaaagtccaa 37712532  T
Q  892 ctggagcactcctctaa-gtacttggtcctctctttctctgctttt--aagtgaaattccgtattccat 957  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||    
T  37712531 ctggagcactcctctaaggtacttggtcctctcttcctctgctttttcaggtgaaattccttattccat 37712463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 957
Target Start/End: Complemental strand, 37534804 - 37533939
Alignment:
Q  95 tccttttttattctattgccttattttacttttcacttgttcttgttattgctgcttactcattttacttcctacactttctcattgtgcagccaacatg 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  37534804 tccttttttattccattgccttattttacctttcactttttcttgttgttgttgattactcattttacttcctacactttctcactgtgcaacaaacatg 37534705  T
Q  195 atagctccgccttgttacaattcaaacactcattttctgtcaacacttcatctaaacccggttttctgtctatgtgttcgtctttttcttttaagacaga 294  Q
    | | ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||| |  ||||  |       |||| ||||||||||| ||||||||    
T  37534704 acaactctgccttgttacaattcaaaaactctttttctgtcagcacttcatctcaactctattttgcgc------gttcttctttttctttcaagacaga 37534611  T
Q  295 atcttggaaaaccggcacagattgttgcgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccgtgtctgatcacgtgattggtttggatctcagttgcaacaatctg 394  Q
    ||||||| ||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  37534610 atcttgggaaaacagtacagattgttgtgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgtcagatcacgtgattggtctggacctcagttgcaacaatcta 37534511  T
Q  395 aaaggtgaattacaacctaatagcacaatctacragcttagacaccttcaacaactcaacttggcttttaatcatttttctggatcttcaatgcctattg 494  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  37534510 aaaggtgaattacatcccaatagcaccatctttcagcttaaacaccttcaacaactcaacttggcttttaatcatttttcttggtcttcaatacctattg 37534411  T
Q  495 gtattggcgatttagtgaatctcacacatctaaatttatcattttgtcacctcaagagtaatactccctccacaatctctcatttgtcaaaattaatatc 594  Q
    || |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | | ||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37534410 gtgttggagatttagtgaaactcacacatctaaatctatcatactctgacctcagtggtaatattccttccacaatctctcatttgtcaaaattagtatc 37534311  T
Q  595 acttgatcttagcagttatagttactc-gaac----atggaaatt-aatccgttgacatggaagaaactcattcgtaatgctactaatttaagggagctt 688  Q
    ||||||||||||||||||  | | | | |||     || |||| | ||| |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  37534310 acttgatcttagcagttactggtccgcagaagtgggattgaaactcaattcgttcatttggaagaaactcattcataatgctactaatttaagggaactt 37534211  T
Q  689 catttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttctcttagtctaccaaaaactg 788  Q
     |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  37534210 tatttggataatgtgaacatgtcttccatcagagagagctctttgtcaatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttctcttagtctatcagaaactg 37534111  T
Q  789 agttgcaaggaaatttgtcaagtggcatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatctaattataaccttcgtggtcaacttccaaagtc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  37534110 agttgcaaggaaatttgtcaagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatctaatgataaccttagtggtcaacttccaaagtc 37534011  T
Q  889 caactggagcactcctctaa-gtacttggtcctctctttctctgctttt--aagtgaaattccgtattccat 957  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||    
T  37534010 caactggagcactcctctaaggtacttggtcctctctttctctgctttttcaggtgaaattccttattccat 37533939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 909
Target Start/End: Complemental strand, 37641585 - 37640762
Alignment:
Q  95 tccttttttattctattgccttattttacttttcacttgttcttgttattgctgcttactcattttacttcctacactttctcattgtgcagccaacatg 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  37641585 tccttttttattccattgccttattttacctttcacttcttgttgttgttgttgattactcattttacttcctacactttctcactgtgcaaccaacatg 37641486  T
Q  195 atagctccgccttgttacaattcaaacactcattttctgtcaacacttcatctaaacc---cggttttctgtctatgtgttcgtctttttcttttaagac 291  Q
    | | ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   || | || ||||||  ||| | ||||||||||| |||||    
T  37641485 acacctctgccttgttacaattcaaaaactctttttctgtcaacacttcatctaaaccggacgatattttgtctagttgtccctctttttctttcaagac 37641386  T
Q  292 agaatcttggaaaaccggcacagattgttgcgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccgtgtctgatcacgtgattggtttggatctcagttgcaacaat 391  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  37641385 agaatcttggaaaaacaatacagattgttgtgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgtcagatcacgtgattggtctggacctcagttgcaacaat 37641286  T
Q  392 ctgaaaggtgaattacaacctaatagcacaatctacragcttagacaccttcaacaactcaacttggcttttaatcatttttctggatcttcaatgccta 491  Q
    || |||||||||||||| || |||||||| ||||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  37641285 ctaaaaggtgaattacatcccaatagcaccatctttcagcttaaacaccttcaccaactcaacttggcttttaataatttttctttgtcttcaatgccta 37641186  T
Q  492 ttggtattggcgatttagtgaatctcacacatctaaatttatcattttgtcacctcaagagtaatactccctccacaatctctcatttgtcaaaattaat 591  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||   ||| |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37641185 ttggtgttggagatttagtgaaactcacacatctaaatctatcaaaatgttacctcaatggtaatattccttccacaatctctcatttgtcaaaattagt 37641086  T
Q  592 atcacttgatcttagcagttatagttactcgaaca--------tggaaattaatccgttgacatggaagaaactcattcgtaatgctactaatttaaggg 683  Q
    |||||||||||||||||||||  | | |  |||||        || || | ||| | || |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37641085 atcacttgatcttagcagttactggtcc--gaacaagtgggattgaaactcaattcattcatttggaagaaactcattcataatgctactaatttaaggg 37640988  T
Q  684 agcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttctcttagtctaccaaa 783  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||| || |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37640987 agcttcatttgaatagtgtggatatgtcttccattacggagagctctttgtcaatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttctcttagtctacgaaa 37640888  T
Q  784 aactgagttgcaaggaaatttgtcaagtggcatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatctaattataaccttcgtggtcaacttcca 883  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||    
T  37640887 aactgagttgcaaggaaatttgtcaagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatttaatcaaaaccttagtggtcaacttcca 37640788  T
Q  884 aagtccaactggagcactcctctaag 909  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  37640787 aagtccaactggagcactcctctaag 37640762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 88 - 957
Target Start/End: Complemental strand, 37698504 - 37697626
Alignment:
Q  88 aatgcggtccttttttattctattgccttattttacttttcacttgttcttgttattgctgcttactcattttacttcctacactttctcattgtgcagc 187  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |    
T  37698504 aatggggtccttttttattctattgccttattttgcctttcactttttcttgttgttgttgcttactcattttacttcctacacactctcattatgcaac 37698405  T
Q  188 caacatgatagctccgccttgttacaattcaaacactcattttctgtcaacacttcatctaaacccggttttctgtctatgtgttcgtctttttctttta 287  Q
    || ||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||| |||| | | ||  |||||  ||||| ||||||||||  |    
T  37698404 catcatgacagttctgccttgttacaattcaaaaactcattttcagttaacacttcgtctcaacctgatatttggtctagatgttcctctttttcttcca 37698305  T
Q  288 agacagaatcttggaaaaccggcacagattgttgcgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccgtgtctgatcacgtgattggtttggatctcagttgcaa 387  Q
     ||||||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  37698304 ggacagaatcttggaaaaacaatacagattgttgcaagtgggatggtgtcacgtgtgacactgagtcggattacgtgattggtttggacctcagttgcaa 37698205  T
Q  388 caatctgaaaggtgaattacaacctaatagcacaatctacragcttagacaccttcaacaactcaacttggcttttaatcatttttctggatcttcaatg 487  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||| | ||||||||     
T  37698204 caatttgaaaggtgaattacatcccaatagcactatcttccagcttagacgccttcaacaacttaatttggcttttaataatttttcttggtcttcaata 37698105  T
Q  488 cctattggtattggcgatttagtgaatctcacacatctaaatttatcattttgtcacctcaagagtaatactccctccacaatctctcatttgtcaaaat 587  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37698104 cctattggtgtcggagatttagtgaaactcacacatctaaatctatcaaattgttacctcaatggtaatattccttccacaatctctcatttgtcaaaat 37698005  T
Q  588 taatatcacttgatcttagcagttatagttactcgaaca--------tggaaattaatccgttgacatggaagaaactcattcgtaatgctactaattta 679  Q
    || ||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||        || || | ||| | || |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37698004 tagtatcacttgatcttagcagttactggta--cgaacaagtgggattgaaactcaattcattcatttggaagaaactcattcataatgctactaattta 37697907  T
Q  680 agggagcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttctcttagtctac 779  Q
    ||||| |||||| |  || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37697906 agggatcttcatcttaatggagtgaacatgtcttcaatcggagagagctcattgtcaatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttctcttagtctac 37697807  T
Q  780 caaaaactgagttgcaaggaaatttgtcaagtggcatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatctaattataaccttcgtggtcaact 879  Q
     ||| |||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||    
T  37697806 gaaacactgtgttgcaaggaaatatatcaagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatttaatcaaaaccttagtggtcaact 37697707  T
Q  880 tccaaagtccaactggagcactcctctaa-gtacttggtcctctctttctctgctt--ttaagtgaaattccgtattccat 957  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| | ||||||  | | |||||||||| ||||||||    
T  37697706 tccaaagtccaactggagcactcctctaaggtacttagacctctcttacactgctttctcaggtgaaattccttattccat 37697626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 269 - 957
Target Start/End: Original strand, 37399451 - 37400133
Alignment:
Q  269 tgttcgtctttttcttttaagacagaatcttggaaaaccggcacagattgttgcgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccgtgtctgatcacgtgattg 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37399451 tgttcctctttttctttcaagacagaatcttgggaaaacagtacagattgttgtgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgtcagatcacgtgattg 37399550  T
Q  369 gtttggatctcagttgcaacaatctgaaaggtgaattacaacctaatagcacaatctacragcttagacaccttcaacaactcaacttggcttttaatca 468  Q
    || |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||   |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  37399551 gtctggacctcagttgcaacaaactaaaaggtgaattacatcccaatagcatcatctttcagcttagacaccttcaacaacttaatttggcttttaataa 37399650  T
Q  469 tttttctggatcttcaatgcctattggtattggcgatttagtgaatctcacacatctaaatttatcattttgtcacctcaagagtaatactccctccaca 568  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  |||||| ||| ||||||    
T  37399651 tttttctgggtcttcaatgcctattggtgttggagatttagtgaaactcacacatctaaatacatcatattgtaacctcaatggtaatattccttccaca 37399750  T
Q  569 atctctcatttgtcaaaattaatatcacttgatcttagcagttatagttactcgaacatggaaattaatccgttgacatggaagaaactcattcgtaatg 668  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||  | ||  |||||| ||       || | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  37399751 atctctcatttgtcaaaattagtatcacttgatcttagc--tttaactttgtcgaacttg-------attcattgacatggaagaaactcattcataatg 37399841  T
Q  669 ctactaatttaagggagcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttc 768  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37399842 ctactaatttaagggagcttcatttgaatattgtgaacatgtcttccctcagagagagctctttgtcaatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttc 37399941  T
Q  769 tcttagtctaccaaaaactgagttgcaaggaaatttgtcaagtggcatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatctaattataacctt 868  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  37399942 tcttagtctatcagaaactgagttgcaaggaaatttgtcaagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatttaatcaaaacctt 37400041  T
Q  869 cgtggtcaacttccaaagtccaactggagcactcctctaa-gtacttggtcctctctttctctgctttt--aagtgaaattccgtattccat 957  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||    
T  37400042 agtggtcaacttccaaagtccaactggagcactcctctaaggtacttggtcctctcttcctctgctttttcaggtgaaattccctattccat 37400133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 88 - 909
Target Start/End: Complemental strand, 37437412 - 37436597
Alignment:
Q  88 aatgcggtccttttttattctattgccttattttacttttcacttgttcttgttattgctgcttactcattttacttcctacactttctcattgtgcagc 187  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |  |||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||| |    
T  37437412 aatggggtccttttttattcttttgccttgttttgcccttcacttgttctcgttgttgttgcttactcactttactacccacactttctcattatgcaac 37437313  T
Q  188 caacatgatagctccgccttgttacaattcaaacactcattttctgtcaacacttcatctaaacccggttttctgt-ctatg--tgttcgtctttttctt 284  Q
    || ||||| | ||| ||||| |||||||||||| |||| |||  | |||||||||||||| |||||  |   | || || ||  ||||  ||||||||||    
T  37437312 catcatgacacctctgccttattacaattcaaaaactcttttcttctcaacacttcatctcaacccaat---ccgtactttggttgtttctctttttctt 37437216  T
Q  285 ttaagacagaatcttggaaaaccggcacagattgttgcgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccgtgtctgatcacgtgattggtttggatctcagttg 384  Q
    | ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  37437215 tcaagacagaatcttgggaaaacagtacagattgttgtgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgtcagatcacgtgattggtctggacctcagttg 37437116  T
Q  385 caacaatctgaaaggtgaattacaacctaatagcacaatctacragcttagacaccttcaacaactcaacttggcttttaatcatttttctggatcttca 484  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  37437115 caacaatctgaaaggtgaattacatcccaatagcaccatctttcagcttaaacaccttcaacaactcaacttggcttttaatcatttttctgagtcttca 37437016  T
Q  485 atgcctattggtattggcgatttagtgaatctcacacatctaaatttatcattttgtcacctcaagagtaatactccctccacaatctctcatttgtcaa 584  Q
    || |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||   |||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  37437015 atacctattggtattagtgatttagtgaaactcacacatctaaacctatcatactgtgacctcagtggtaatattccttccaaaatctctcatttgtcaa 37436916  T
Q  585 aattaatatcacttgatcttagcagttatagttactcgaacatggaaattaatccgttgacatggaagaaactcattcgtaatgctactaatttaaggga 684  Q
    ||||| |||| |||||||||| || ||||  ||  |      ||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37436915 aattagtatcccttgatcttaacaattatgattctt------tggaactcaatccattcgcatggaagaaactcattcataatgctactaatttaaggga 37436822  T
Q  685 gcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttctcttagtctaccaaaa 784  Q
    ||||||| || || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| | || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||       
T  37436821 gcttcatctgaatggagtgaaaatgtcttcaattggagagagctctttgtcgttgttaacgaatttgtcatcttctttggtttctcttagtctagcatcc 37436722  T
Q  785 actgagttgcaaggaaatttgtcaagtggcatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatctaattataaccttcgtggtcaacttccaa 884  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||    
T  37436721 actcagttgcaaggaaatttgtcaagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatttaatcaaaaccttagtggtcaacttccaa 37436622  T
Q  885 agtccaactggagcactcctctaag 909  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  37436621 agtccaactggagcactcctctaag 37436597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 269 - 957
Target Start/End: Complemental strand, 37825425 - 37824734
Alignment:
Q  269 tgttcgtctttttcttttaagacagaatcttggaaaaccggcacagattgttgcgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccgtgtctgatcacgtgattg 368  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37825425 tgttcctctttttctttcaagacagaatcttgggaaaacagtacagattgttgtgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgtcagatcacgtgattg 37825326  T
Q  369 gtttggatctcagttgcaacaatctgaaaggtgaattacaacctaatagcacaatctacragcttagacaccttcaacaactcaacttggcttttaatca 468  Q
    || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37825325 gtctggacctcagttgcaacaatctaaaaggtgaattacatcccaatagcaccatctttcagcttaaacaccttcaacaactcaacttggcttttaatga 37825226  T
Q  469 tttttctggatcttcaatgcctattggtattggcgatttagtgaatctcacacatctaaatttatcattttgtcacctcaagagtaatactccctccaca 568  Q
    |||||||   |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||   ||| |||||||  |||||| ||| ||||||    
T  37825225 tttttctttgtcttcaatgcctattggtgttggagatttagtgaaactcacacatctaaatctatcaaaatgttacctcaatggtaatattccttccaca 37825126  T
Q  569 atctctcatttgtcaaaattaatatcacttgatcttagcagttatagttactcgaacatggaaattaatccgttgacatggaagaaactcattcgtaatg 668  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |  |  ||  |    || || | ||| | || |  |||||||||||||||| |||||    
T  37825125 atctctcatttgtcaaaattagtatcacttgatctcagcagaaactggcacgtgggattgaaactcaattcattcatttggaagaaactcattcataatg 37825026  T
Q  669 ctactaatttaagggagcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttc 768  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37825025 ctactaatttaagggatcttcatcttaatggagtgaacatgtcttcaatcggagagagctcattgtcaatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttc 37824926  T
Q  769 tcttagtctaccaaaaactgagttgcaaggaaatttgtcaagtggcatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatctaattataacctt 868  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  37824925 tcttagtctacgaaacactgtgttgcaaggaaatatatcaagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatttaatcataacctt 37824826  T
Q  869 cgtggtcaacttccaaagtccaactggagcactcctctaa-gtacttggtcctctctttctctgctttt--aagtgaaattccgtattccat 957  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  | |||||||||| ||||||||    
T  37824825 agtggtcaacttccaaagtccaactggagcactcctctaaggtacttggacctctcttcctctgctttttcaggtgaaattccttattccat 37824734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 118 - 924
Target Start/End: Original strand, 37380802 - 37381621
Alignment:
Q  118 ttttacttttcacttgttcttgttattgctgcttactcattttacttcctacactttctcattgtgcagccaacatgatagctccgccttgttacaattc 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| |||    
T  37380802 ttttacctttcacttgttcttgttgttgttgcttactcattttacttcccacactttctcattgtgcaaccaacatgatacatctgccttgttacatttc 37380901  T
Q  218 aaacactcattttctgtcaacacttcatctaaacccggt------tttctgtctatgtgttcgtctttttcttttaagacagaatcttggaaaaccggca 311  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |      |||  | |||  |||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||     |    
T  37380902 aaaaactcattttctttcaacacttcatcgaaatccgatatacatttttggcctagatgttccactttttctttcaagatagaatcttggaaaaataata 37381001  T
Q  312 cagattgttgcgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccgtgtctgatcacgtgattggtttggatctcagttgcaacaatctgaaaggtgaattacaacc 411  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  37381002 cagattgttgtgggtgggatggtgtcacgtgcgactccatgtcagatcatgtgattggtctggacctcagttgcagcaatctgaatggtgaattacatcc 37381101  T
Q  412 taatagcacaatctacragcttagacaccttcaacaactcaacttggcttttaatcatttttctggatcttcaatgcctattggtattggcgatttagtg 511  Q
     ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||| | || ||||||  |||||||||    
T  37381102 caatagcacaatcttccagcttagacaccttcaacaactcaacttggcttttaataatttttctgggtctttattgcatgttagtattgatgatttagtg 37381201  T
Q  512 aatctcacacatctaaatttatcattttgtcacctcaagagtaatactccctccacaatctctcatttgtcaaaattaatatcacttgatcttagcagtt 611  Q
    |||||||||||||||||| |||||   |||  ||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  37381202 aatctcacacatctaaatctatcacactgttccctcggtggtaatattccctccacaatctctcatttgtcaaaattagtatcacttgatctcagcagtt 37381301  T
Q  612 atagttactcgaacatgg------aaattaatccgttgacatggaagaaactcattcgtaatgctactaatttaagggagcttcatttggatagagtgaa 705  Q
    ||  | | | | | ||||      || | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | | | |||||    
T  37381302 attatgattggcatatgggattgaaactcaatccattgacatggaagaaactcattcataatgctactaatttaagggagctttctttaggttgtgtgaa 37381401  T
Q  706 tatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttctcttagtctaccaaaaactgagttgcaaggaaatttg 805  Q
     ||||| || || |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  37381402 catgtcctctattagagcgagctctttatctatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttctcttggtctaggagaaactgggttgcaaggaaatttg 37381501  T
Q  806 tcaagtggcatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatctaattataaccttcgtggtcaacttccaaagtccaactggagcactcctc 905  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||| |  | ||  |  |||||||||| || ||||||||||||||||||     
T  37381502 tcaagtgacatcctctctttacctaatctccaaacactagatttatcatctaataaatatctgagcagtcaacttccgaaatccaactggagcactcctt 37381601  T
Q  906 t-aagtacttggtcctctct 924  Q
    | | |||||||| |||||||    
T  37381602 tgaggtacttggacctctct 37381621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 268 - 909
Target Start/End: Original strand, 37391584 - 37392228
Alignment:
Q  268 gtgttcgtctttttcttttaagacagaatcttggaaaaccggcacagattgttgcgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccgtgtctgatcacgtgatt 367  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37391584 gtgttcctctttttctttcaagacagaatcttggaaaaacagtacaaattgttgcaagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgtcagatcacgtgatt 37391683  T
Q  368 ggtttggatctcagttgcaacaatctgaaaggtgaattacaacctaatagcacaatctacragcttagacaccttcaacaactcaacttggcttttaatc 467  Q
    |   | || ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  37391684 gaactagacctcagttgcaacaatttgaatggtgatttacatcccaatagcactatctttcagcttagacaccttcaacaactcaacttgtctttaaatt 37391783  T
Q  468 atttttctggatcttcaatgcctattggtattggcgatttagtgaatctcacacatctaaatttatcattttgtcacctcaagagtaatactccctccac 567  Q
     ||||| ||| |||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||| ||||||   |||||| |||||||||    
T  37391784 ttttttttgggtcttcattgcatgttggtattggtgatttagtgaatctcacatatctaaatctatcaaattgttacctcagtggtaatattccctccac 37391883  T
Q  568 aatctctcatttgtcaaaattaatatcacttgatcttagcagttatagttac-tcgaaca-----tggaaattaatccgttgacatggaagaaactcatt 661  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |  || | |||||     |  || || || | |||||||||||||||||||||    
T  37391884 aatctctcatttgtcaaaattagtatcacttgatcttagcaattaccggcacttggaacaacaactcaaacttgatacattgacatggaagaaactcatt 37391983  T
Q  662 cgtaatgctactaatttaagggagcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatttgtcatcctctt 761  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  37391984 cataatgctactaatttaagggagcttcatttgaatagagtggatatgtattccattagagagagctctttgtctatgctaaagaatgtgtcatcctctt 37392083  T
Q  762 tggtttctcttagtctaccaaaaactgagttgcaaggaaatttgtcaagtggcatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatctaatta 861  Q
    ||||||||||||| |||  | ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||   ||| |    
T  37392084 tggtttctcttaggctaggagaaattgggttgcaaggaaatttgtcaagtgccatcctctctttacctaatcttcaaagactagatttgtca---aataa 37392180  T
Q  862 taaccttcgtggtcaacttccaaagtccaactggagcactcctctaag 909  Q
    | | ||| | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  37392181 tgaacttagcggtaaacttccaaaatcaaactggagcactcctctaag 37392228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 95 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 37596037 - 37595517
Alignment:
Q  95 tccttttttattctattgccttattttacttttcacttgttcttgttattg---ctgcttactcattttacttcctacactttctcattgtgcagccaac 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  37596037 tccttttttattccattgccttattttacctttcactttttcttgttgttgttgctgcttactcattttacttcctacactttctcattgtgcaacaaac 37595938  T
Q  192 atgatagctccgccttgttacaattcaaacactcattttctgtcaacacttcatctaaacccggttttctgt-ctatg--tgttcgtctttttcttttaa 288  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  |   | || || ||  ||||| ||||||||||| ||    
T  37595937 atgacaactctgccttgttacaattcaaaaactctttttctgtcaacacttcatctcaacccaat---ccgtactttggttgttcctctttttctttcaa 37595841  T
Q  289 gacagaatcttggaaaaccggcacagattgttgcgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccgtgtctgatcacgtgattggtttggatctcagttgcaac 388  Q
    ||||||||||||| ||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37595840 gacagaatcttgggaaaacagtacagattgttgtgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatgtcagatcacgtgattggtctggacctcagttgcaac 37595741  T
Q  389 aatctgaaaggtgaattacaacctaatagcacaatctacragcttagacaccttcaacaactcaacttggcttttaatcatttttctggatcttcaatgc 488  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  37595740 aatcttaaaggtgaattacatcccaatagcaccatctttcagcttaaacaccttcaacaactcaacttggcttttaataatttttctgagtcttcaatgc 37595641  T
Q  489 ctattggtattggcgatttagtgaatctcacacatctaaatttatcattttgtcacctcaagagtaatactccctccacaatctctcatttgtcaaaatt 588  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37595640 ctattggtgttggagatttagtgaaactcacacatctaaatctatcatattgttacctcagtggtaatattccttccacaatctctcatttgtcaaaatt 37595541  T
Q  589 aatatcacttgatcttagcagtta 612  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  37595540 agtatcacttgatcttagcagtta 37595517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 88 - 923
Target Start/End: Complemental strand, 37430468 - 37429616
Alignment:
Q  88 aatgcggtccttttttattctattgccttattttacttttcacttgttcttgttattgctgcttactcattttacttcctacactttctcattgtgcagc 187  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| |||||| || | |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||| || || ||| ||||||      
T  37430468 aatggggtccttttgttttctatttccttatcttgcctttcacttgttcttgttgatgctgctaactctttttacttcctatacattttcaatgtgcaag 37430369  T
Q  188 caacatgatagctccgccttgttacaattcaaacactcattttctgtcaacacttcatctaaacccggttttctgtctatgtgttcgtctttttctttta 287  Q
    || ||||| || || |||||||||||||||||  | ||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||  ||||   ||||| ||||||||||| |    
T  37430368 catcatgacagttctgccttgttacaattcaagaattcattttttatcaacacttcatctcaacctggtttttggtctcactgttcctctttttctttca 37430269  T
Q  288 agacagaatcttggaaaaccggcacagattgttgcgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccgtgtctgatcacgtgattggtttggatctcagttgcaa 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| | ||||||||| |||| || ||||||||    
T  37430268 agacagaatcttggaaaaccggcacagattgctgcgagtgggatggtgtcacgtgcgacatcatgtacgattatgtgattggtctggaccttagttgcaa 37430169  T
Q  388 caatctgaaaggtgaattacaacctaatagcacaatctacragcttagacaccttcaacaactcaacttggcttttaatcatttttctggatcttcaatg 487  Q
    ||||||||| |||||||||    | |||||||| ||||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||  ||    
T  37430168 caatctgaacggtgaattagcggccaatagcaccatctttcaacttaaacaccttcaacaactcaacttggcttttaatgattttttcgggtcttcggtg 37430069  T
Q  488 cctattggtattggcgatttagtgaatctcacacatctaaatttatcattttgtcacctcaagagtaatactccctccacaatctctcatttgtcaaaat 587  Q
    | |  ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||        | | |   |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37430068 catgctggtattggtgatctagtgaagctcacacatctaaatctatcaaacaccggcattagtggtaatatttcctccacaatctctcatttgtcaaaat 37429969  T
Q  588 taatatcacttgatcttagcagttatagttactcgaacatg------------gaaattaatccgttgacatggaagaaactcattcgtaatgctactaa 675  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||            ||| ||  |||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37429968 tagtatcacttgatcttagcagttatagttactggaacatggaacagaaactcgaacttggtccactcacatggaagaaactcattcttaatgctactaa 37429869  T
Q  676 tttaagggagcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttctcttagt 775  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||| |||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||| |||||| || |||||||||||  |||||  |    
T  37429868 tttaagggagcttcatttgaatactgtggatatatctttaatcagagagagatctttgtcgctgctaaggaatttatcgtcctctttggtcgctcttgat 37429769  T
Q  776 ctaccaaaaactgagttgcaaggaaatttgtca----agtggcatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatctaattataaccttcgt 871  Q
    ||| |||  ||||  ||||||| ||||||  ||    |||| ||||||||||||||| |||||||||  | | |||||||| | |||| |  ||||| ||    
T  37429768 ctatcaatcactggcttgcaagaaaattttccaagctagtgacatcctctctttaccaaatcttcaagaactagatttgtcttttaatgaggaccttagt 37429669  T
Q  872 ggtcaacttccaaagtccaactggagcactcctctaa-gtacttggtcctctc 923  Q
    ||  ||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  37429668 gggaaacttccactgtccaactggagcactcccctaaggtacttggacctctc 37429616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 647 - 957
Target Start/End: Complemental strand, 37595476 - 37595163
Alignment:
Q  647 tggaagaaactcattcgtaatgctactaatttaagggagcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaaga 746  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| || |  |||||||||||||  ||||||||||    
T  37595476 tggaagaaactcattcataatgctactaatttaagggagcttcatttgaatagtgtggatatgtcttccattacggagagctctttgtccatgctaaaga 37595377  T
Q  747 atttgtcatcctctttggtttctcttagtctaccaaaaactgagttgcaaggaaatttgtcaagtggcatcctctctttacctaatcttcaaagattgga 846  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37595376 atttttcatcctctttggtttctcttcttctacgaaacactgggttgcaaggaaatttgtcaagtgacatcctctctttacctaatcttcaaagattgga 37595277  T
Q  847 tttgtcatctaattataaccttcgtggtcaacttccaaagtccaactggagcactcctctaa-gtacttggtcctctctttctctgctttt--aagtgaa 943  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||  ||| |||||||||  | |||||    
T  37595276 tttgtcatttaatgataaccttagtggtcaacttccaaagtccaacttgagcactcctctaaggtacttgaacctccgtttatctgctttttcaggtgaa 37595177  T
Q  944 attccgtattccat 957  Q
    ||||| ||||||||    
T  37595176 attccttattccat 37595163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 88 - 829
Target Start/End: Original strand, 37411755 - 37412504
Alignment:
Q  88 aatgcggtccttttttattctattgccttattttacttttcacttgttcttgttattgctgcttactcattttacttcctacactttctcattgtgcagc 187  Q
    |||| |||||| |||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  37411755 aatggggtcctgttttgttctattgtcctattttacctttcacttgttcttgttgctgctgtttactcattttacttcctacaccttctcattatgcaac 37411854  T
Q  188 caacatgatagctccgccttgttacaattcaaacactcattttctgtcaa---cacttcatctaaacccggttttctgtctatgtgttcgtctttttctt 284  Q
     | ||||| ||||  |||||||||||||||||  ||| | ||  ||||||   || ||||||| | |  | | ||  | |||  ||||| ||||||||||    
T  37411855 tatcatgacagctttgccttgttacaattcaagaacttacttcttgtcaatggcatttcatctcagcatgatatttggcctagttgttcctctttttctt 37411954  T
Q  285 ttaagacagaatcttggaaaaccggcacagattgttgcgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccgtgtctgatcacgtgattggtttggatctcagttg 384  Q
    | || ||||| ||||||||||     |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  37411955 tgaaaacagattcttggaaaaataatacagattgttgcgagtggtatggtgtcatgtgcgacaccgttttggatcatgtgattggtttggaccttaggtg 37412054  T
Q  385 caacaatctgaaaggtgaattacaacctaatagcacaatctacragcttagacaccttcaacaactcaacttggcttttaatcatttttctggatcttca 484  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| |||| | | |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   | |||||     
T  37412055 caacaatcttaaaggtgaattacatctcaatagcactatcttcaaacttaaacaccttcaacgactcaac-tggcttttaatgattttttcaggtcttcg 37412153  T
Q  485 atgcctattggtattggcgatttagtgaatctcacacatctaaatttatcattttgtcacctcaagagtaatactccctccacaatctctcatttgtcaa 584  Q
     ||| |  || |||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||     |    |||   |||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  37412154 gtgcatgatgatattagtgatttggtgaatctcacacatcttaatttatcaaacactggaatcatttgtaatattccttccacaatctctcacttgtcaa 37412253  T
Q  585 aattaatatcacttgatcttagcagttatagttac-tcgaaca-----tggaaattaatccgttgacatggaagaaactcattcgtaatgctactaattt 678  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  | ||| | || ||     |  || || |||| || ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||    
T  37412254 aattagtatcacttgatcttagcagtaactgatacatggatcaaaaactcaaacttgatcccttcacatggaaggaactcattcataatgttacaaattt 37412353  T
Q  679 aagggagcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttctcttagtcta 778  Q
    ||| ||||||||| || |||| ||  |||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37412354 aagcgagcttcatctgaatagtgttgatatgtcttccatcagagagaattctttgtcgctgctaaagaatttgtcatcctctctggtctctcttagtcta 37412453  T
Q  779 ccaaaaactgagttgcaaggaaatttgtcaagtggcatcctctctttacct 829  Q
       || |||   ||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||||    
T  37412454 gggaacactagtttgcaaggaaatttagcaagtgacattccctctttacct 37412504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 88 - 252
Target Start/End: Original strand, 37391390 - 37391554
Alignment:
Q  88 aatgcggtccttttttattctattgccttattttacttttcacttgttcttgttattgctgcttactcattttacttcctacactttctcattgtgcagc 187  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  37391390 aatggggtccttgtttattttattgccttattttacctttcacttgttcatgttgttgttgcttactcattttacttcctatactctctcattgtgcaac 37391489  T
Q  188 caacatgatagctccgccttgttacaattcaaacactcattttctgtcaacacttcatctaaacc 252  Q
    |  ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  37391490 cttcatgatagctctgccttgctacaattcaaaaactcattttttgtcaacacttcatcaaaacc 37391554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 93 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37441650 - 37441491
Alignment:
Q  93 ggtccttttttattctattgccttattttacttttcacttgttcttgttattgctgcttactcattttacttcctacactttctcattgtgcagccaaca 192  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | ||||    
T  37441650 ggtccttttttattttattgccttattttacctttcacatgttcttcttgttgctgcttactcattttacttcctatactttctcactgtgaaacaaaca 37441551  T
Q  193 tgatagctccgccttgttacaattcaaacactcattttctgtcaacacttcatctaaacccg 254  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||| |||||||    
T  37441550 tgacacctctgccttgttacaattcaaaaactc--tttcagtcaacacttcatcgaaacccg 37441491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 37825582 - 37825460
Alignment:
Q  130 cttgttcttgttattgctgcttactcattttacttcctacactttctcattgtgcagccaacatgatagctccgccttgttacaattcaaacactcattt 229  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  37825582 cttgttcttgttgttgttgattactcattttacttcctacactttctcactgtgcaacaaacatgacaactctgccttgttacaattcaaaaactctttt 37825483  T
Q  230 tctgtcaacacttcatctaaacc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  37825482 tctgtcaacacttcatctaaacc 37825460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 37437525 - 37437447
Alignment:
Q  8 tttggtccttgccccttagtttcaggttatgtttcctatataaatagaggctaatcaattggtatatcctaaatcatca 86  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37437525 tttggtccttgccccttagtttcaagttatgtttcctatataaatagaggctaatcatttggtatatcctaaatcatca 37437447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 37698641 - 37698571
Alignment:
Q  8 tttggtccttgccccttagtttcaggttatgtttcctatataaatagaggctaatcaattggtatatccta 78  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698641 tttggtcctttccccgtagtttcaggttatgtttcctatataaatagaggctaatcaattggtatatccta 37698571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 252
Target Start/End: Original strand, 37399289 - 37399416
Alignment:
Q  125 tttcacttgttcttgttattgctgcttactcattttacttcctacactttctcattgtgcagccaacatgatagctccgccttgttacaattcaaacact 224  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||| | ||| |||||||||||||||||| | |    
T  37399289 tttcacttgttcttgttgttgttgattactcattttacttcatacactttctcactatgcaaccatcatgacacctctgccttgttacaattcaaaaatt 37399388  T
Q  225 cattttctgtcaacacttcatctaaacc 252  Q
    |||||| |||  |||||||||| |||||    
T  37399389 cattttttgttgacacttcatcaaaacc 37399416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 297; Significance: 1e-166; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 88 - 909
Target Start/End: Original strand, 16841328 - 16842146
Alignment:
Q  88 aatgcggtccttttttattctattgccttattttacttttcacttgttcttgttattgctgcttactcattttacttcctacactttctcattgtgcagc 187  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||| |||| |  |||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| |    
T  16841328 aatggggtccttttttattgttttgccttgttttgcccttcacttgttctttgtgctgctgcttactcactttacttcacacactttgtcattctgcaac 16841427  T
Q  188 caacatgatagctccgccttgttacaattcaaacactcattttctgtcaacacttcatctaaacccggttttctgtctatgtgttcgtctttttctttta 287  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  | | ||         ||||| |||  |||||| |    
T  16841428 caacatgacagctctgctttgttacatttcaaaaactcattttctgtcaacacttcatctcaacttgatatt---------tgttcctctacttctttca 16841518  T
Q  288 agacagaatcttggaaaaccggcacagattgttgcgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccgtgtctgatcacgtgattggtttggatctcagttgcaa 387  Q
    ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |  || ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16841519 agacaaaatcttggaaaaacggtacggattgttgcaagtgggatggtgtcacgtgtgacactgaatcagattacgtggttggtttggacctcagttgcaa 16841618  T
Q  388 caatctgaaaggtgaattacaacctaatagcacaatctacragcttagacaccttcaacaactcaacttggcttttaatcatttttctggatcttcaatg 487  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||| |||  | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16841619 caatttgaaaggtgaattacatcccaatagcactatcctccagttaagacaccttcaacaactcaacttggcttttaataatttttctgggtcttcaatg 16841718  T
Q  488 cctattggtattggcgatttagtgaatctcacacatctaaatttatcattttgtcacctcaagagtaatactccctccacaatctctcatttgtcaaaat 587  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||  || | | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16841719 cctattggtattagcgatttagtgaatatcacacatctaaatctatcatactgtgacctcaatggtgacattcactccacaatctctcatttgtcaaaat 16841818  T
Q  588 taatatcacttgatcttagcagttatagttactcgaacatgg------aaattaatccgttgacatggaagaaactcattcgtaatgctactaatttaag 681  Q
    || |||| |||||||||||| ||||    |||   ||  |||      || | ||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16841819 tagtatctcttgatcttagcggttactcgtacgaaaaagtgggattgaaactcaattcgttcacttggaagaaactcattcataatgctactaaattaag 16841918  T
Q  682 ggagcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttctcttagtctacca 781  Q
    ||| ||| || |  || ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  16841919 ggatctttatctaaatggagtgaacatgtcttcaattggagagagctctttgtcaatgctaaacaatttgtcatcctctttggtttctcttcatctagca 16842018  T
Q  782 aaaactgagttgcaaggaaatttgtcaagtggcatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatctaattataaccttcgtggtcaacttc 881  Q
    || ||||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  | |||||||||||| | |||||||||  |||| |  ||||| ||||||||||||    
T  16842019 aacactggtttgcaaggaaatttgttaagtgacatactctctttgtcaaatcttcaaagactagatttgtcacataatcaagaccttagtggtcaacttc 16842118  T
Q  882 caaagtccaactggagcactcctctaag 909  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16842119 caaaatccaactggagcactcctctaag 16842146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 95 - 605
Target Start/End: Original strand, 24216193 - 24216703
Alignment:
Q  95 tccttttttattctattgccttattttacttttcacttgttcttgttattgctgcttactcattttacttcctacactttctcattgtgcagccaacatg 194  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  24216193 tccttttttattctaatgcctcatttgacctttcacttgttcatgttgttgttgcttactcattttacttcttacacttactcattctgcaaccatcatg 24216292  T
Q  195 atagctccgccttgttacaattcaaacactcattttctgtcaacacttcatctaaacccggttttctgtctatgtgttcgtctttttcttttaagacaga 294  Q
    | || || || ||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||||||  |||||| ||| | ||| ||    
T  24216293 acagttctgcattgttacaattcaagaactcatttgttgtcaacacttcatctgaacccgatatttggtctatgtgttccactttttatttcaggacgga 24216392  T
Q  295 atcttggaaaaccggcacagattgttgcgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccgtgtctgatcacgtgattggtttggatctcagttgcaacaatctg 394  Q
    ||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||   |||  || ||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  24216393 atcctggaaaaatggtgcagattgttgcgagtgggatggggtcatgtgtgacactaggtcaaattacgtgattggtctggaccttagttgcaacaatctg 24216492  T
Q  395 aaaggtgaattacaacctaatagcacaatctacragcttagacaccttcaacaactcaacttggcttttaatcatttttctggatcttcaatgcctattg 494  Q
    |||||||| ||||| || ||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||| | |||    
T  24216493 aaaggtgagttacatccaaattgcactatcttcaagcttagacaccttcaacaactcaacttggcctttaataatttttcttggtcttcaatgcatgttg 24216592  T
Q  495 gtattggcgatttagtgaatctcacacatctaaatttatcattttgtcacctcaagagtaatactccctccacaatctctcatttgtcaaaattaatatc 594  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||| |||| |   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || | ||    
T  24216593 ggattggtgatctagtgaatctcacatatctaaatttatcaagctgttaccttactggtaatattccctccacaatctctcagttgtcaaaactagtgtc 24216692  T
Q  595 acttgatctta 605  Q
    |||||||||||    
T  24216693 acttgatctta 24216703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 644 - 931
Target Start/End: Original strand, 24216751 - 24217033
Alignment:
Q  644 acatggaagaaactcattcgtaatgctactaatttaagggagcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaa 743  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  || || ||||| | || ||||||||||||||||||||||||      ||||    
T  24216751 acatggaagaaactcattcataatgctactaatttaagggagctttacctgaatggagtggacatatcttcaatcagagagagctctttg------ctaa 24216844  T
Q  744 agaatttgtcatcctctttggtttctcttagtctaccaaaaactgagttgcaaggaaatttgtcaagtggcatcctctctttacctaatcttcaaagatt 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  24216845 agaatttgtcatcctctttggtttctcttagtctagcatccactggattgcaaggaaatatgtcaagtgacatcctctctttaccaaatcttcaaaaact 24216944  T
Q  844 ggatttgtcatctaattataaccttcgtggtcaacttccaaagtccaactggagcactcctctaa-gtacttggtcctctctttctctg 931  Q
     ||||||||||| ||| |  ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24216945 agatttgtcatcgaatcaagaccttcgtggtaaatttccaacgtccaactggagcactcccctaaggtacttggacctctctttctctg 24217033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 86
Target Start/End: Original strand, 16841203 - 16841270
Alignment:
Q  22 cttagtttcaggttatgtttcctatataaata---gaggctaatcaattggtatatcctaaatcatca 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16841203 cttagtttcaggttatgtttcctatataaatagaggaggctaatcagttggtatatcgtaaatcatca 16841270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 275 - 909
Target Start/End: Complemental strand, 14554556 - 14553928
Alignment:
Q  275 tctttttcttttaagacagaatcttggaaaaccggcacagattgttgcgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccgtgtctgatcacgtgattggtttgg 374  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||   | |    
T  14554556 tctttttctttcaagacagaatcttggaaaaagagtacagattgttgcgagtgggatggtgtcacgtgcgacaccatatcaggtcacgtgattgaactag 14554457  T
Q  375 atctcagttgcaacaatctgaaaggtgaattacaacctaatagcacaatctacragcttagacaccttcaacaactcaacttggcttttaatcatttttc 474  Q
    | || |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||     
T  14554456 accttagttgcaacaatttgaatggtgaattacatcctaatagcactatcttccagcttagacaccttcaacaactcaacctagcttttaatgatatttt 14554357  T
Q  475 tggatcttcaatgcctattggtattggcgatttagtgaatctcacacatctaaatttatcattttgtcacctcaagagtaatactccctccacaatctct 574  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||   |||| |||| |   |||||| ||| ||||||||||||    
T  14554356 tgggtcttcaatgcctcttggtattggcgatttagtgaaactcatgcatctaaatatatccaattgttaccttagtggtaatattccttccacaatctct 14554257  T
Q  575 catttgtcaaaattaatatcacttgatcttagcagttatagttactcgaacatggaaattaatccgttgacatggaagaaactcattcgtaatgctacta 674  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     ||| |  | ||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14554256 catttgtcaaaattagtatcacttgatcttagca-tta-----actggttcttggaaattaatccatttacatggaataaactcattcataatgctacta 14554163  T
Q  675 atttaagggagcttcatttggatagagtgaatatgtcttcaatcagagagagctctttgttgatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttctcttag 774  Q
    |||||||||| ||| || || || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14554162 atttaagggatctttatctgaatggagtgaacatgtcttccatcagagagagctctttgtcaatgctaaagaatttgtcatcctctttggtttctcttag 14554063  T
Q  775 tctaccaaaaactgagttgcaaggaaatttgtcaagtggcatcctctctttacctaatcttcaaagattggatttgtcatctaattataaccttcgtggt 874  Q
    |||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||| | | ||||||  |  |||| ||   ||| |||||    
T  14554062 tctagcaaacaccgggttgcaaggaaatttgtcaagtgacatactctctttgccaaatcttcaaaaactagatttggtaggtaatgatggtcttagtggt 14553963  T
Q  875 caacttccaaagtccaactggagcactcctctaag 909  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14553962 caacttccaaaatccaactggagtactcctctaag 14553928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 95 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14554760 - 14554606
Alignment:
Q  95 tccttttttattctattgccttattttacttttcacttgttcttgttattgctgcttactcattttacttcctacactttctcattgtgcagccaacatg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14554760 tccttttttattctattgccttattttacctttcactttttctt---attgttgcttactcattttacttcctatactttctcattgtgcaaccaacatg 14554664  T
Q  195 atagctccgccttgttacaattcaaacactcattttctgtcaacacttcatctaaacc 252  Q
    | | ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  14554663 acacctctgccttgttacaattcaaaaactctttttctgtcaacacttcttcgaaacc 14554606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University