View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17241_high_26 (Length: 339)

Name: NF17241_high_26
Description: NF17241
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17241_high_26
NF17241_high_26
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (82-335)||(23153972-23154224)
chr3 (85-335)||(44252674-44252925)
chr3 (85-335)||(39655183-39655434)
chr3 (81-335)||(44953341-44953596)
chr3 (85-334)||(48390727-48390977)
chr3 (88-339)||(34025877-34026129)
chr3 (85-335)||(44639201-44639452)
chr3 (85-335)||(49579991-49580242)
chr3 (85-335)||(7469688-7469939)
chr3 (85-335)||(29284263-29284514)
chr3 (85-335)||(39728598-39728849)
chr3 (88-335)||(22535754-22536002)
chr3 (85-335)||(52572536-52572787)
chr3 (85-335)||(43582505-43582755)
chr3 (89-335)||(23580755-23581001)
chr3 (85-335)||(6738315-6738555)
chr3 (85-320)||(4557215-4557451)
chr3 (156-335)||(44172553-44172733)
chr3 (156-335)||(44179253-44179433)
chr3 (86-320)||(54317086-54317321)
chr3 (84-320)||(4015953-4016190)
chr3 (85-335)||(29842235-29842485)
chr3 (114-335)||(52198081-52198304)
chr3 (79-297)||(48305545-48305763)
chr3 (84-328)||(42758308-42758553)
chr3 (135-335)||(34154345-34154542)
chr3 (84-335)||(44106703-44106953)
chr3 (77-335)||(20086936-20087183)
chr3 (90-335)||(49025608-49025841)
chr3 (85-288)||(23546858-23547055)
chr3 (85-335)||(10823612-10823854)
chr3 (85-335)||(17146064-17146311)
chr3 (85-320)||(53631846-53632082)
chr3 (94-320)||(830951-831171)
chr3 (106-286)||(10043213-10043393)
chr3 (85-232)||(42243418-42243565)
chr3 (85-328)||(19111669-19111912)
chr3 (123-328)||(34119592-34119796)
chr3 (138-282)||(30616244-30616388)
chr3 (85-219)||(10371183-10371323)
chr3 (94-257)||(30904737-30904897)
chr3 (123-280)||(3385804-3385961)
chr3 (85-174)||(29858485-29858574)
chr3 (8-80)||(3176197-3176269)
chr3 (273-335)||(23547070-23547133)
chr3 (136-328)||(30682755-30682947)
chr3 (206-322)||(31126826-31126943)
chr3 (84-169)||(31271208-31271293)
chr3 (90-178)||(31126746-31126834)
chr3 (289-335)||(48306650-48306697)
chr3 (94-212)||(23910171-23910289)
chr3 (123-224)||(3414485-3414586)
chr3 (85-154)||(12369103-12369172)
chr3 (144-280)||(4553173-4553309)
chr3 (122-179)||(34593222-34593280)
chr3 (178-232)||(41937016-41937070)
chr3 (263-315)||(23910332-23910385)
chr3 (211-288)||(25302430-25302506)
chr3 (175-223)||(1337080-1337128)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (85-335)||(2367253-2367504)
chr6 (89-335)||(32853771-32854018)
chr6 (85-335)||(27534611-27534862)
chr6 (90-335)||(5863298-5863544)
chr6 (85-335)||(3483833-3484084)
chr6 (85-335)||(27738699-27738950)
chr6 (86-335)||(10187991-10188234)
chr6 (85-335)||(10142428-10142679)
chr6 (84-335)||(12141312-12141564)
chr6 (85-335)||(24225625-24225882)
chr6 (89-335)||(32053015-32053255)
chr6 (85-324)||(12309510-12309756)
chr6 (85-294)||(32532509-32532718)
chr6 (85-233)||(30986283-30986431)
chr6 (123-252)||(9442441-9442569)
chr6 (85-278)||(15498309-15498502)
chr6 (85-338)||(12678004-12678257)
chr6 (85-232)||(31496465-31496612)
chr6 (85-232)||(31501851-31501998)
chr6 (113-328)||(11762379-11762595)
chr6 (85-257)||(28079606-28079778)
chr6 (85-328)||(14506020-14506252)
chr6 (85-320)||(24602778-24603002)
chr6 (122-320)||(30816199-30816399)
chr6 (85-314)||(14254906-14255135)
chr6 (126-266)||(13769069-13769209)
chr6 (89-266)||(14410782-14410946)
chr6 (137-257)||(20610944-20611064)
chr6 (85-241)||(34178245-34178395)
chr6 (85-280)||(29341239-29341434)
chr6 (186-288)||(20349039-20349141)
chr6 (243-321)||(14032497-14032576)
chr6 (84-169)||(14034584-14034669)
chr6 (116-257)||(18908899-18909040)
chr6 (123-257)||(256440-256574)
chr6 (151-257)||(9458864-9458970)
chr6 (175-255)||(32959868-32959948)
chr6 (186-257)||(29199896-29199967)
chr6 (186-254)||(7393898-7393966)
chr6 (116-163)||(9402676-9402723)
chr6 (173-223)||(19367049-19367099)
chr6 (113-161)||(7393837-7393885)
chr6 (181-265)||(9402587-9402670)
chr6 (85-161)||(29199807-29199883)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (85-335)||(4583046-4583297)
chr5 (83-335)||(4920753-4921006)
chr5 (82-335)||(17853201-17853453)
chr5 (85-335)||(5908599-5908850)
chr5 (85-335)||(13401915-13402164)
chr5 (91-335)||(12866468-12866714)
chr5 (85-335)||(15890134-15890384)
chr5 (113-335)||(12834513-12834737)
chr5 (89-333)||(29245866-29246111)
chr5 (80-335)||(40517733-40517989)
chr5 (89-335)||(22694817-22695063)
chr5 (85-335)||(30996523-30996773)
chr5 (83-335)||(35311750-35311993)
chr5 (85-335)||(42987391-42987641)
chr5 (88-335)||(20973410-20973647)
chr5 (85-282)||(10127062-10127252)
chr5 (83-335)||(3564649-3564889)
chr5 (206-334)||(1218684-1218812)
chr5 (134-329)||(28045589-28045784)
chr5 (85-241)||(33727912-33728068)
chr5 (113-335)||(6092468-6092680)
chr5 (85-335)||(6155831-6156080)
chr5 (85-319)||(18206961-18207196)
chr5 (113-335)||(6369623-6369845)
chr5 (83-328)||(12447315-12447548)
chr5 (186-328)||(27302747-27302890)
chr5 (126-254)||(38972931-38973059)
chr5 (85-257)||(28568932-28569104)
chr5 (199-320)||(35194014-35194136)
chr5 (85-328)||(27088284-27088506)
chr5 (116-257)||(2681222-2681363)
chr5 (88-257)||(6810164-6810321)
chr5 (175-318)||(38006470-38006614)
chr5 (116-255)||(23044933-23045072)
chr5 (113-184)||(42717569-42717640)
chr5 (85-321)||(2412637-2412874)
chr5 (89-185)||(1218803-1218899)
chr5 (186-321)||(2985088-2985224)
chr5 (89-224)||(40187572-40187707)
chr5 (84-253)||(16311203-16311372)
chr5 (190-339)||(8453389-8453537)
chr5 (181-256)||(10822533-10822608)
chr5 (8-66)||(20963815-20963873)
chr5 (89-211)||(24207736-24207857)
chr5 (85-161)||(18451834-18451910)
chr5 (123-215)||(39422394-39422486)
chr5 (83-257)||(12915479-12915652)
chr5 (117-210)||(43523801-43523894)
chr5 (190-257)||(27900417-27900484)
chr5 (124-257)||(32574887-32575021)
chr5 (244-328)||(3573158-3573243)
chr5 (175-280)||(12457500-12457605)
chr5 (191-280)||(29664954-29665043)
chr5 (181-257)||(12712564-12712640)
chr5 (221-320)||(30115425-30115525)
chr5 (151-257)||(12250976-12251082)
chr5 (128-210)||(18116471-18116553)
chr5 (181-254)||(12773828-12773901)
chr5 (181-325)||(15564573-15564718)
chr5 (111-155)||(27302709-27302754)
chr5 (187-224)||(30116819-30116856)
chr5 (299-327)||(33862310-33862338)
[»] chr7 (77 HSPs)
chr7 (85-335)||(16866101-16866352)
chr7 (78-335)||(30650563-30650821)
chr7 (85-335)||(21702591-21702842)
chr7 (79-335)||(17885397-17885654)
chr7 (84-335)||(35074401-35074654)
chr7 (86-294)||(10072440-10072648)
chr7 (85-335)||(37182207-37182457)
chr7 (85-335)||(45885675-45885926)
chr7 (86-335)||(7779940-7780190)
chr7 (85-335)||(38139702-38139954)
chr7 (85-335)||(3226856-3227107)
chr7 (88-335)||(18125141-18125389)
chr7 (85-339)||(39455932-39456178)
chr7 (82-335)||(44734266-44734518)
chr7 (85-335)||(39316927-39317178)
chr7 (84-335)||(25905560-25905812)
chr7 (112-335)||(45380038-45380262)
chr7 (85-335)||(17851786-17852035)
chr7 (84-335)||(41741359-41741610)
chr7 (85-335)||(43507365-43507628)
chr7 (81-328)||(27850238-27850480)
chr7 (79-319)||(38152835-38153075)
chr7 (84-328)||(18825775-18826026)
chr7 (85-335)||(24753107-24753346)
chr7 (89-328)||(12980315-12980556)
chr7 (90-339)||(41103584-41103828)
chr7 (113-338)||(37579192-37579416)
chr7 (87-335)||(37195921-37196159)
chr7 (198-335)||(44794051-44794188)
chr7 (85-335)||(44985828-44986059)
chr7 (85-339)||(45708781-45709027)
chr7 (88-328)||(5377024-5377265)
chr7 (93-335)||(44658385-44658610)
chr7 (85-328)||(3920477-3920706)
chr7 (126-320)||(2630525-2630720)
chr7 (83-280)||(3157071-3157267)
chr7 (90-328)||(16078952-16079191)
chr7 (186-335)||(16811662-16811811)
chr7 (179-335)||(25979921-25980078)
chr7 (175-321)||(26622897-26623044)
chr7 (85-322)||(26004396-26004620)
chr7 (127-282)||(27896427-27896582)
chr7 (83-202)||(44785166-44785285)
chr7 (84-328)||(24425319-24425552)
chr7 (137-282)||(8906551-8906696)
chr7 (85-279)||(23533526-23533707)
chr7 (85-256)||(37218016-37218188)
chr7 (137-271)||(33841075-33841208)
chr7 (137-286)||(5565269-5565418)
chr7 (85-279)||(19439932-19440114)
chr7 (85-256)||(4101554-4101725)
chr7 (95-279)||(23475195-23475367)
chr7 (85-256)||(27063346-27063517)
chr7 (157-271)||(10995817-10995930)
chr7 (151-257)||(18683985-18684091)
chr7 (151-257)||(22973399-22973505)
chr7 (117-320)||(25782856-25783053)
chr7 (153-254)||(44845113-44845214)
chr7 (157-257)||(31426019-31426119)
chr7 (126-257)||(27063149-27063280)
chr7 (126-262)||(30839084-30839221)
chr7 (172-257)||(32546203-32546288)
chr7 (85-169)||(23457158-23457242)
chr7 (85-161)||(43550339-43550415)
chr7 (171-328)||(46127180-46127334)
chr7 (137-240)||(42908003-42908106)
chr7 (190-278)||(29855468-29855556)
chr7 (88-169)||(31000074-31000155)
chr7 (84-212)||(5022652-5022779)
chr7 (116-241)||(29157376-29157503)
chr7 (132-222)||(10990818-10990908)
chr7 (85-163)||(16811822-16811899)
chr7 (85-143)||(29292804-29292862)
chr7 (151-257)||(43218294-43218400)
chr7 (188-257)||(28309503-28309572)
chr7 (181-282)||(42005891-42005991)
chr7 (175-223)||(29292749-29292797)
[»] chr8 (53 HSPs)
chr8 (84-335)||(29108731-29108983)
chr8 (85-335)||(27932340-27932592)
chr8 (85-335)||(24927876-24928127)
chr8 (85-335)||(32302987-32303239)
chr8 (85-335)||(45235992-45236243)
chr8 (88-335)||(39445489-39445729)
chr8 (85-339)||(1063430-1063691)
chr8 (83-335)||(11254923-11255168)
chr8 (83-294)||(40248279-40248490)
chr8 (85-334)||(24869934-24870184)
chr8 (93-335)||(4230648-4230880)
chr8 (85-294)||(20399561-20399770)
chr8 (83-335)||(17220644-17220894)
chr8 (85-335)||(34776993-34777238)
chr8 (82-320)||(17469197-17469424)
chr8 (85-320)||(1012559-1012796)
chr8 (85-335)||(2075744-2075995)
chr8 (85-241)||(35215558-35215713)
chr8 (85-328)||(43113536-43113780)
chr8 (122-320)||(24568881-24569078)
chr8 (83-229)||(5858560-5858706)
chr8 (85-271)||(37960872-37961058)
chr8 (85-232)||(14155563-14155710)
chr8 (129-328)||(34139381-34139580)
chr8 (83-266)||(28345488-28345673)
chr8 (82-257)||(27777105-27777280)
chr8 (85-256)||(15068498-15068668)
chr8 (137-286)||(27056517-27056666)
chr8 (90-280)||(8545265-8545454)
chr8 (246-335)||(28977185-28977275)
chr8 (175-282)||(9642351-9642458)
chr8 (126-257)||(14687405-14687536)
chr8 (85-252)||(29416097-29416263)
chr8 (123-287)||(30481369-30481533)
chr8 (192-317)||(14186265-14186391)
chr8 (88-222)||(15173793-15173927)
chr8 (129-240)||(6388470-6388581)
chr8 (82-241)||(32392293-32392452)
chr8 (206-258)||(2075863-2075915)
chr8 (84-339)||(36131838-36132080)
chr8 (197-261)||(33631921-33631985)
chr8 (284-324)||(34021416-34021456)
chr8 (123-253)||(17084061-17084185)
chr8 (175-254)||(39379581-39379658)
chr8 (90-257)||(5700362-5700517)
chr8 (123-280)||(29918590-29918747)
chr8 (116-255)||(10297466-10297605)
chr8 (186-257)||(30904052-30904123)
chr8 (84-150)||(29089888-29089954)
chr8 (189-282)||(9476027-9476120)
chr8 (125-210)||(12468171-12468254)
chr8 (83-131)||(11880725-11880773)
chr8 (83-131)||(11898141-11898189)
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (85-335)||(37106627-37106871)
chr2 (85-335)||(30846873-30847125)
chr2 (85-335)||(13830664-13830914)
chr2 (89-335)||(24414046-24414293)
chr2 (85-335)||(36128016-36128268)
chr2 (85-335)||(9632314-9632565)
chr2 (85-335)||(37999411-37999656)
chr2 (85-335)||(13705265-13705522)
chr2 (110-335)||(7314583-7314809)
chr2 (84-335)||(12193735-12193988)
chr2 (85-335)||(10208341-10208591)
chr2 (85-335)||(10920573-10920817)
chr2 (98-335)||(45115486-45115726)
chr2 (88-339)||(45256747-45256999)
chr2 (85-335)||(8915848-8916098)
chr2 (89-256)||(37472673-37472840)
chr2 (84-335)||(42797910-42798150)
chr2 (89-335)||(44746023-44746270)
chr2 (82-328)||(31942092-31942340)
chr2 (85-216)||(12341648-12341779)
chr2 (85-328)||(6027811-6028043)
chr2 (116-282)||(22900776-22900942)
chr2 (186-328)||(14540716-14540859)
chr2 (85-320)||(19104747-19104987)
chr2 (8-85)||(41525312-41525390)
chr2 (137-282)||(15546726-15546871)
chr2 (86-211)||(18106029-18106155)
chr2 (137-257)||(14331534-14331648)
chr2 (126-266)||(35248336-35248476)
chr2 (85-256)||(24051534-24051705)
chr2 (247-335)||(18106162-18106251)
chr2 (85-160)||(25213945-25214020)
chr2 (137-278)||(10212393-10212533)
chr2 (190-255)||(25210386-25210451)
chr2 (173-257)||(38342517-38342601)
chr2 (296-335)||(37472851-37472890)
chr2 (186-280)||(35965319-35965412)
chr2 (157-257)||(43371560-43371660)
chr2 (124-223)||(40734533-40734632)
chr2 (191-253)||(3547177-3547239)
chr2 (126-240)||(26755764-26755878)
chr2 (126-257)||(44057889-44058021)
chr2 (174-255)||(6164472-6164553)
chr2 (89-241)||(13954769-13954920)
chr2 (89-241)||(14095976-14096127)
chr2 (197-237)||(16226759-16226799)
chr2 (281-328)||(16226833-16226881)
chr2 (175-271)||(18485641-18485737)
chr2 (186-242)||(33175251-33175307)
[»] chr4 (80 HSPs)
chr4 (84-335)||(39046886-39047137)
chr4 (85-335)||(31752389-31752640)
chr4 (83-335)||(48459414-48459667)
chr4 (85-335)||(11028005-11028257)
chr4 (85-335)||(43893161-43893411)
chr4 (84-335)||(44317467-44317720)
chr4 (85-335)||(6382183-6382435)
chr4 (84-335)||(7608903-7609155)
chr4 (85-335)||(31918469-31918721)
chr4 (85-335)||(5902531-5902776)
chr4 (85-335)||(55826534-55826786)
chr4 (85-335)||(47550264-47550515)
chr4 (80-335)||(11122775-11123031)
chr4 (85-335)||(21423794-21424045)
chr4 (85-335)||(42299724-42299972)
chr4 (88-335)||(32585422-32585664)
chr4 (85-282)||(15987173-15987370)
chr4 (85-317)||(26564782-26565015)
chr4 (173-335)||(47239384-47239547)
chr4 (89-328)||(6481950-6482191)
chr4 (85-319)||(37349072-37349296)
chr4 (171-320)||(1724307-1724457)
chr4 (84-328)||(19534395-19534634)
chr4 (137-286)||(10302067-10302216)
chr4 (136-328)||(37107351-37107543)
chr4 (181-328)||(12825468-12825616)
chr4 (85-254)||(19882967-19883136)
chr4 (138-282)||(43309472-43309614)
chr4 (125-328)||(7985076-7985276)
chr4 (113-320)||(39375227-39375434)
chr4 (137-256)||(3737789-3737908)
chr4 (186-328)||(32596196-32596339)
chr4 (82-169)||(53906246-53906333)
chr4 (83-257)||(25941150-25941324)
chr4 (84-213)||(1724180-1724308)
chr4 (256-335)||(42774694-42774774)
chr4 (126-257)||(1866501-1866632)
chr4 (123-222)||(19548887-19548985)
chr4 (85-207)||(7334108-7334230)
chr4 (82-251)||(31415839-31416008)
chr4 (82-257)||(45065261-45065436)
chr4 (151-257)||(47103750-47103856)
chr4 (86-240)||(33615241-33615395)
chr4 (176-257)||(29527824-29527905)
chr4 (157-257)||(14605908-14606008)
chr4 (81-257)||(36919135-36919311)
chr4 (119-254)||(4741162-4741296)
chr4 (85-240)||(41914907-41915062)
chr4 (109-210)||(12505475-12505577)
chr4 (187-288)||(16575093-16575194)
chr4 (88-257)||(21956728-21956897)
chr4 (85-218)||(30673012-30673145)
chr4 (247-335)||(4766389-4766474)
chr4 (116-248)||(15733468-15733600)
chr4 (276-328)||(425763-425816)
chr4 (124-257)||(9929118-9929250)
chr4 (246-324)||(13015323-13015402)
chr4 (190-257)||(21544591-21544658)
chr4 (226-328)||(28695194-28695297)
chr4 (175-262)||(31782620-31782707)
chr4 (215-294)||(53906346-53906425)
chr4 (199-280)||(33516097-33516178)
chr4 (82-179)||(50375829-50375925)
chr4 (126-238)||(39086188-39086300)
chr4 (133-216)||(4737861-4737944)
chr4 (186-257)||(10574431-10574502)
chr4 (133-212)||(11696875-11696954)
chr4 (83-142)||(47239313-47239372)
chr4 (305-335)||(15987372-15987402)
chr4 (191-257)||(30266347-30266413)
chr4 (191-257)||(30285775-30285841)
chr4 (87-152)||(13768365-13768430)
chr4 (137-238)||(29035495-29035596)
chr4 (137-238)||(29047628-29047729)
chr4 (85-161)||(3909013-3909089)
chr4 (116-152)||(9280842-9280878)
chr4 (136-224)||(25265127-25265214)
chr4 (175-271)||(25298834-25298930)
chr4 (186-238)||(36306816-36306868)
chr4 (88-144)||(44887669-44887725)
[»] chr1 (61 HSPs)
chr1 (81-335)||(17134875-17135130)
chr1 (85-335)||(51421786-51422037)
chr1 (85-335)||(36187130-36187381)
chr1 (84-335)||(24236670-24236922)
chr1 (88-335)||(19572425-19572673)
chr1 (81-335)||(29936344-29936605)
chr1 (84-335)||(5180973-5181219)
chr1 (85-335)||(18353990-18354241)
chr1 (84-335)||(45866095-45866346)
chr1 (85-335)||(49250683-49250934)
chr1 (86-335)||(34611001-34611251)
chr1 (82-335)||(40087371-40087624)
chr1 (85-329)||(23490681-23490926)
chr1 (85-335)||(16408874-16409120)
chr1 (85-335)||(50426565-50426816)
chr1 (86-335)||(42439581-42439831)
chr1 (85-335)||(28297861-28298125)
chr1 (85-339)||(39616227-39616472)
chr1 (85-335)||(42707747-42707991)
chr1 (83-335)||(3627905-3628148)
chr1 (86-323)||(13390353-13390574)
chr1 (85-335)||(24710786-24711026)
chr1 (89-328)||(44615389-44615630)
chr1 (89-328)||(44792939-44793180)
chr1 (85-328)||(9982800-9983044)
chr1 (85-222)||(23968621-23968758)
chr1 (84-320)||(34673191-34673428)
chr1 (155-335)||(17091939-17092120)
chr1 (127-328)||(29871237-29871439)
chr1 (85-320)||(12494953-12495189)
chr1 (175-335)||(34060025-34060180)
chr1 (85-321)||(16433089-16433311)
chr1 (85-232)||(13798270-13798417)
chr1 (218-335)||(23966800-23966919)
chr1 (95-250)||(35936749-35936904)
chr1 (85-211)||(13020646-13020772)
chr1 (78-179)||(20774651-20774752)
chr1 (85-320)||(49740936-49741153)
chr1 (138-282)||(34085217-34085361)
chr1 (85-250)||(19003576-19003741)
chr1 (85-222)||(33293441-33293578)
chr1 (135-279)||(10778527-10778671)
chr1 (248-335)||(20774560-20774649)
chr1 (86-182)||(34059059-34059155)
chr1 (116-210)||(2514811-2514906)
chr1 (116-257)||(16237245-16237386)
chr1 (123-251)||(48576060-48576194)
chr1 (193-257)||(48125701-48125765)
chr1 (84-254)||(35069799-35069968)
chr1 (84-165)||(38106304-38106385)
chr1 (111-251)||(5293342-5293481)
chr1 (157-257)||(23058473-23058573)
chr1 (111-267)||(41476888-41477044)
chr1 (8-78)||(24541395-24541466)
chr1 (176-257)||(39219265-39219346)
chr1 (89-210)||(42728861-42728979)
chr1 (186-223)||(44632152-44632189)
chr1 (303-335)||(13020616-13020648)
chr1 (190-266)||(25154842-25154918)
chr1 (276-319)||(35936918-35936962)
chr1 (186-262)||(12718783-12718859)
[»] scaffold0519 (1 HSPs)
scaffold0519 (83-335)||(10225-10470)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (85-321)||(33334-33577)
[»] scaffold0189 (1 HSPs)
scaffold0189 (192-335)||(4184-4329)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (85-320)||(90539-90770)
[»] scaffold0795 (1 HSPs)
scaffold0795 (85-220)||(267-401)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (82-222)||(14091-14230)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (85-319)||(14718-14953)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (83-257)||(67755-67929)
scaffold0008 (83-257)||(75598-75772)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (85-222)||(7738-7874)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (84-253)||(107301-107469)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (157-257)||(211370-211470)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (109-210)||(14900-15002)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (157-254)||(2978-3075)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (194-319)||(197346-197472)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (193-257)||(70101-70165)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (190-253)||(16977-17040)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (194-257)||(128140-128203)
scaffold0013 (191-257)||(105485-105551)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (186-255)||(4592-4661)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Original strand, 23153972 - 23154224
Alignment:
Q  82 aactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtat 181  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||| |||||||||||    
T  23153972 aactaagcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgccggaaccaaccccaatttgacgggtttttcccgttttaactgagtttgggtatgggtat 23154071  T
Q  182 gggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatt 281  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  23154072 gggttttccccgatttcaaa-cacgggtatggaacgggtaacgagtatataggtacccactccgaacccatactcatacctatcccaaatgtaaaaaatt 23154170  T
Q  282 actttatgttgatttgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23154171 actttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 23154224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 44252925 - 44252674
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44252925 taggcatggcaacaaaatccatacccgtggttacccgtccgaatcaaaccaaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 44252826  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  44252825 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgtgtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatataaaaaactact 44252726  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44252725 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 44252674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 39655183 - 39655434
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  39655183 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtatggg 39655282  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||    
T  39655283 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacccgtctcaaatgtaaaaaactact 39655382  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39655383 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 39655434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 81 - 335
Target Start/End: Original strand, 44953341 - 44953596
Alignment:
Q  81 caactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggta 180  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  44953341 caactaggcatggcaacaaaattcatacccgtggttacccgctcgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtttgggta 44953440  T
Q  181 tgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaat 280  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| ||||| || ||| ||||||||| |||||||     
T  44953441 tgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtactcaccccgaactcatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaac 44953540  T
Q  281 tactttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44953541 tactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 44953596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 334
Target Start/End: Original strand, 48390727 - 48390977
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  48390727 taggcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgttcgaaccaaatccaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 48390826  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  48390827 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggaatataggtacccatcctgaacccatacccatacccgtcccgaacgtaaaaaattact 48390926  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaa 334  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48390927 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaaaaaaa 48390977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 88 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 34026129 - 34025877
Alignment:
Q  88 gcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatt 187  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||    
T  34026129 gcatggcaacaaaacccatacccgcggttaccctcccgaaccaaaaccaatttgacggttttttcccgttttgactgggtttggatatgggtatgggttt 34026030  T
Q  188 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattacttta 287  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  34026029 tccccgatttcaaaacacaggtatgggacgggtaacgagtatataggtttccaccccgaactcatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattatttta 34025930  T
Q  288 tgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaattac 339  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34025929 tgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaattac 34025877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 44639452 - 44639201
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44639452 taggcatggcaacaaaactcatatccgtggttacccgtccgaacgaaacccaatttgactggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatggg 44639353  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||| |    
T  44639352 ttttcccatatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgttccaaatgtaaaaaattatt 44639253  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44639252 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 44639201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 49580242 - 49579991
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  49580242 taggcatgacaacaaaacccatacccgtggttatccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 49580143  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  49580142 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataggtacccacctcgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 49580043  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49580042 ttatattgatatgttatgttattttgtttgatgattgtcatgttaataaaaa 49579991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 7469688 - 7469939
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7469688 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 7469787  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| | ||||    
T  7469788 ttttccctgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacacaaacccgtcccaaatgtaaaacactact 7469887  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7469888 ttatgtggatatgttatgttattttgtttgataattgtcatcttaataaaaa 7469939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 29284514 - 29284263
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29284514 taggcatggcaacaaaactcatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 29284415  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||||    
T  29284414 tttttcccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccagcccgaacccatacccaaacccgtcccagatgtaaaaaactact 29284315  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29284314 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 29284263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 39728849 - 39728598
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  39728849 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgtccgaaccaaatccaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgagtatagg 39728750  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  39728749 ttttcctcgatctcaaaatacgggtatgggatgggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 39728650  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39728649 ttatgttgatatgtaatgttattttgtttgataattgttctgttaataaaaa 39728598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 88 - 335
Target Start/End: Original strand, 22535754 - 22536002
Alignment:
Q  88 gcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatt 187  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||    
T  22535754 gcatggcaacaaaacccatacccgcggttatccgcccgaaccaaactcaatttgatgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgagttt 22535853  T
Q  188 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattacttta 287  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | | |||||| |||||||||||| |||||  |||| |||| |||||||||| ||||    
T  22535854 tccccaatttcaaaacacggatatgggacgggtaacgggtatacaggcacccaccccgaacccatacacatactcgtcctaaatgtaaaaaattatttta 22535953  T
Q  288 tgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22535954 tgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 22536002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 52572787 - 52572536
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  52572787 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttatccgcccgaaccaaactcaatttgacaggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgag 52572688  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||| |||||| ||  || ||||||||| ||||||||||||    
T  52572687 ttttcctcgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagggacccaccccgaatccatactcaagcccgtcccaaatgtaaaaaattact 52572588  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52572587 ttatgttaatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 52572536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 43582755 - 43582505
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||  ||||| ||||| |    
T  43582755 taggcattgcaacaaaacccatatccgcggttacccgcccgaaccaaatccaatttgatgggttttctccgtttttactgggtttgagtatgtgtatgag 43582656  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  43582655 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacgggtaacgtgtatgtaggtacccac-ccgaacccatattcatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 43582557  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  43582556 ttatattgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgtaaataaaaa 43582505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 89 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23581001 - 23580755
Alignment:
Q  89 catggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggattt 188  Q
    |||| ||||||||  |||| | ||||||||| | |||||  |||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||    
T  23581001 catgacaacaaaacacatacctgcggttacctgcccgaattaaattcaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtatgagtttt 23580902  T
Q  189 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttat 288  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||| |||||    
T  23580901 ccccaatttcaaaacacgagtatgaaacgggtaacgggtatataggtacccactccgaacccatacccacacttatcccaaatgtaaaaaattattttat 23580802  T
Q  289 gttgatttgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23580801 gttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 23580755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 6738315 - 6738555
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6738315 taggcatggcaataaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacaggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 6738414  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||||||||||||||||           |||||||||| ||||||| |||||||| || || |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6738415 ttttccccgatttcaaaac-----------acgggtaacgggtatataggtacccaccccaaatccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 6738503  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6738504 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaa 6738555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 85 - 320
Target Start/End: Original strand, 4557215 - 4557451
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  4557215 taggcatgacaacaaaactcatacccgtggttacccacccgaacaaaacccaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtttggg 4557314  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | || |||| |||  | |||||||||    
T  4557315 ttttccccgttttcaaaacatgggtatgggacgggtaacgagtatataggtacccaccccgaacccatacccaaatctatcccgaatgcagaaaattact 4557414  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattg 320  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4557415 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattg 4557451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 44172733 - 44172553
Alignment:
Q  156 ttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacc 255  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44172733 ttttgactgggtttgagtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatacc 44172634  T
Q  256 catacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44172633 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 44172553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 44179433 - 44179253
Alignment:
Q  156 ttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacc 255  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44179433 ttttgactgggtttgagtatgggtatgggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatacc 44179334  T
Q  256 catacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44179333 caaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 44179253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 86 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 54317321 - 54317086
Alignment:
Q  86 aggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggga 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| || || |     
T  54317321 aggcatggcaacaaaatccatatccgtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgagtatgtgtttgagt 54317222  T
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactt 285  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||   | ||||||||||    
T  54317221 tttccccgatttcaaaacacaagtataggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccattcccaaacccgtcccaaacgaagaaaattactt 54317122  T
Q  286 tatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattg 320  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  54317121 tatgttgatatgccatgttattttgtttgataattg 54317086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 84 - 320
Target Start/End: Original strand, 4015953 - 4016190
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  4015953 ctaggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccacccgaacgaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgactaggtttgggtatgggtttgg 4016052  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattac 283  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||  | |||| |||    
T  4016053 gttttccccgatttcaaaacatgggtatgggacggataacgggtatataggtacccactccgaacccatacccaaactcgtcccgaatgcagaaaactac 4016152  T
Q  284 tttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattg 320  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4016153 cttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattg 4016190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 29842485 - 29842235
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||| |  |||  || | ||||| ||||| ||||||||    
T  29842485 taggcatgacaacaaaatccatactcgcagttatccgtctgaaccaaatctaatttgacgggtttttcatgttcggattgggtttgggtataggtatggg 29842386  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  29842385 ttttccc-gattttaaaacacgggtatgggactggtaacgggaatataggtacccaccccgaacccatactcatacccgtctcaaatgtaaaaaattact 29842287  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29842286 ttatgttgatttgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 29842235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 114 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 52198304 - 52198081
Alignment:
Q  114 gttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgg 213  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  52198304 gttacccgcccaaaccaaacctaatttgacgggttttttctgttttgactgggtttgggtatgggtatgggtttttcccgatctcaaaacacaggtatgg 52198205  T
Q  214 gacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttg-tatg-ttattttgtt 311  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  52198204 gacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgttccaaatgtaaaaaattactttacgttgatatgctatgtttattttgtt 52198105  T
Q  312 tgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  52198104 tgataattgtcatgttaataaaaa 52198081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 79 - 297
Target Start/End: Original strand, 48305545 - 48305763
Alignment:
Q  79 tgcaactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatggg 178  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  48305545 tgcaattagacatgacaacaaaatccatacccgcggttacccacccgaaccaaacccaatctgacgggttttccccattttgactgggtttggttatggg 48305644  T
Q  179 tatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaa 278  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| || |||||| ||||||    
T  48305645 tatgagttttccccaatttcaaaacacgggtatggaacgagtatcgggtatataggtacccaccccgaacctatacccaaacccgttccaaatgtaaaaa 48305744  T
Q  279 attactttatgttgatttg 297  Q
    |||||||||||||||||||    
T  48305745 attactttatgttgatttg 48305763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 84 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 42758553 - 42758308
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||    
T  42758553 ctaggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgatccaaacccaatttgacggattttccccgttttaactgggtttgggtatgagtttgg 42758454  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattac 283  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||   | ||||||||    
T  42758453 gtttcccccgatttcaaaacacaggtatgggacgggtaacaggtatataggtatgcaccccgaacccatacccaaacccgtcccgaacgaagaaaattac 42758354  T
Q  284 tttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42758353 tttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgccatgtta 42758308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 135 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34154542 - 34154345
Alignment:
Q  135 caatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataag 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||| |    
T  34154542 caatttgacggattttccccgttttgactgggtttggatatgggtatgtgttttccccgatttcaaaacatgggtatgaaacgggtaacaagaatatagg 34154443  T
Q  235 tacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatat-aaaaaattactttatgttgatttgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaa 333  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34154442 tacccaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaaattactttatgttga----tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaa 34154347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 84 - 335
Target Start/End: Original strand, 44106703 - 44106953
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||| | ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  44106703 ctaggcatggcaacaaaacacatacccgtgattacccgcccgaacaaaactcaatttgacgg-ttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtatgg 44106801  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattac 283  Q
      ||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| | || |||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||    
T  44106802 t-tttccccaatcttaaaacacgggtatgggacgcgtaacggatatataggtatctaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattac 44106900  T
Q  284 tttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44106901 tttatgttaatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 44106953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 77 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20087183 - 20086936
Alignment:
Q  77 aatgcaactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatg 176  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |   |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||    
T  20087183 aatgcatctaggcatggcaacaaaatccataccagcggttacctgctggaaccaaatccaatttgacggattttctccgttttgactgggtttggatatg 20087084  T
Q  177 ggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaa 276  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||           ||||| | ||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  20087083 ggtatgggttttccccgatttcaaaacacg-----------ggtaatgggtatataggtacccaccccgaaccc-tactcatacccgtcccaaatgtaaa 20086996  T
Q  277 aaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20086995 aaattattttatgttgatatgtcatgttattttgcttgataattgtcatgttaataaaaa 20086936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 90 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 49025841 - 49025608
Alignment:
Q  90 atggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttc 189  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||| |||            ||||    
T  49025841 atggcaacaaaatccatacccgtggttacccgcctgaaccaaacccaatttgatgggtttttcctgttttgactgggtttgggt------------tttc 49025754  T
Q  190 cccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatg 289  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  49025753 cccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacaca-tccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttgtg 49025655  T
Q  290 ttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49025654 ttgatatgttatgttattttgtttgataattgttatgttaataaaaa 49025608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 288
Target Start/End: Original strand, 23546858 - 23547055
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||         
T  23546858 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcatgaaccaaacccaatttaacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggt----- 23546952  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||||    
T  23546953 -tttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaactact 23547051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 10823612 - 10823854
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||  |||||||| || |||||||  |||||||||| |||||  || |||||||| ||||| |||||||||         
T  10823612 taggcatggcaacaaaactcatacccgtcgttacccgcccaaaccaaattcaatttgacgagttttttccattttgactaggtttgggtatgggt----- 10823706  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  10823707 -tttctccgatctcaaaacacgggtatgagattgataacgggtatataagtaccc---ccgaacccatacccaaacctctcccaaatgtaaaaaattact 10823802  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10823803 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 10823854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 17146064 - 17146311
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||  | ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |   || ||||||||||||||    
T  17146064 taggcatgacaataaaacccatatatgtggtcacccgtccaaaccaaatccaatttgacgggttt-ccccgttttgacat---ttgggtatgggtatggg 17146159  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||  || || |||||||| |||||||| |||||||||   |||||| ||| |||| |||||||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||    
T  17146160 ttttttccaatctcaaaacatgggtatggaacgggtaacagttatataggtatccaccccgaacccatacacaaacccttcccaaatgtaaaaaattact 17146259  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17146260 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 17146311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 53632082 - 53631846
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||| ||||  |||| ||| |||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| || |    
T  53632082 taggcatggcaataaaactcatacccgtggttactcgttcgaaccaaacttaatttgacgggttttcctcgttttgaatgggtataggtatgggtttgag 53631983  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| || ||  ||||| ||| || |||||||||    
T  53631982 ttttcccaaattttaaaacacgtgtatgagacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcaaactcgtcccgaatctagaaaattact 53631883  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattg 320  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  53631882 ttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattg 53631846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 831171 - 830951
Alignment:
Q  94 caacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccg 193  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||      || ||||    
T  831171 caacaaaactcatatccgtggttacccgcccaaaccaaaccaaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggta------tttcccg 831078  T
Q  194 atttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttga 293  Q
     |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||| |   ||||| |||  | |||||||||||||||| |    
T  831077 ttttcaaaacacgggtatgagacggataacgagtatat-ggtacccaccctgaacccatacccaaattcgtcccgaatgcagaaaattactttatgttaa 830979  T
Q  294 tttg-tatgttattttgtttgataattg 320  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  830978 tatgctatgttattttgtttgataattg 830951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 286
Target Start/End: Original strand, 10043213 - 10043393
Alignment:
Q  106 tatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacac 205  Q
    |||||| || |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||| | ||||||||||     
T  10043213 tatccgtgggtacccgaccataccaaccccaatttgacgggttttctccactttgactgggtttgggtatgggtttgggttttccctggtttcaaaacat 10043312  T
Q  206 gggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattacttt 286  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| | |||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  10043313 gggtatgggacgggtaacggggttatatgcacccaccccgaacccatacccatacccatcccgaatataaaaaattacttt 10043393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42243565 - 42243418
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| || ||||    
T  42243565 taggcgtggcaacaaaatccatatctgcgggcatccgtctgaaccaaacccaatttgacgggttttccccggtttgactgggtttgggtatgagtttggg 42243466  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatata 232  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  42243465 tttttcccgatttcaatacacgggtatgagatgggtaacgaggatata 42243418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19111912 - 19111669
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |  |  ||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||| |||||| || || |    
T  19111912 taggcatgacaacaaaactcatatccgtggttactcacctaaaccaaatccaatttgacggatttttccctttttgattgggtttgggtatgagtttgag 19111813  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |||| ||| || | |||| || |||||||||    
T  19111812 tttttcccgatttcaaaacacgggtacgggatggataacgggtatataagtacccaccctaaacccatgcccaaacccgtacaaaatgtagaaaattact 19111713  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  19111712 ttatgtt-atatgtcatgttattttgtttgataattttcgtgtta 19111669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 34119796 - 34119592
Alignment:
Q  123 ccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 222  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||| || || | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||    
T  34119796 ccgaaccaaatctaatttgacgggttttccccattttgattgggtttgggtatgagtttgagtttttcccgattttaaaacacgggtatgagacggataa 34119697  T
Q  223 cgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttgtatgttattttgtttgataattgtc 322  Q
    |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||  | |||| |||||| ||||||| ||    |||||||||||||||||||||    
T  34119696 caggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaatccgtcccaaatgcagaaaactactttgtgttgatatg-ccattattttgtttgataattgtc 34119598  T
Q  323 atgtta 328  Q
     |||||    
T  34119597 gtgtta 34119592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 138 - 282
Target Start/End: Original strand, 30616244 - 30616388
Alignment:
Q  138 tttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtac 237  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||   |||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||     
T  30616244 tttgaggggtttttcccgttttgactgaatttgagtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacggatatgggacgggtaacgaggttatatataa 30616343  T
Q  238 ccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatta 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  30616344 ccaccccgaacccatacccatacccgtcccaaacgtaaaaaatta 30616388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 219
Target Start/End: Original strand, 10371183 - 10371323
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatg-- 182  Q
    |||||||| |||||||| ||| | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||      
T  10371183 taggcatgacaacaaaacccagacccgtggttacccgctcgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtttgggtatgag 10371282  T
Q  183 ---gga-tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacggg 219  Q
       ||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  10371283 tatggattttccccaatctcaaaacacgggtatggggcggg 10371323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Original strand, 30904737 - 30904897
Alignment:
Q  94 caacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccg 193  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| |||||| || |||  |||  | |    
T  30904737 caacaaaatccatacccgcgggtatccgtccgaactaaatccaatttgacggg-tttccccgcttttac-tggtttgggtatgagtttggcttttttctg 30904834  T
Q  194 atttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  30904835 atttcaaaacacgggtacgggacgggt-acggggatataggtacccaccccgaacccataccca 30904897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 3385804 - 3385961
Alignment:
Q  123 ccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||   |||  || ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3385804 ccgaaccaaacccaattcgacgggttttccccgctttgactgggtttaggtatggatttgaatttttacccatttcaaaacacgggtacgggacaggtaa 3385903  T
Q  223 cgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaat 280  Q
    |||| ||||| ||| ||||  |||| ||||||| | ||| || || ||| ||||||||    
T  3385904 cgaggatataggtagccaccacgaatccataccaaaacccgtacctaatgtaaaaaat 3385961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 174
Target Start/End: Original strand, 29858485 - 29858574
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggta 174  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29858485 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttaacggattttccccgttttgactgggtttgggta 29858574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 3176197 - 3176269
Alignment:
Q  8 tatgaaggaggttatttggagtaaaagaaaaaacaatactagagttttggccattttttgttttaagagaatg 80  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3176197 tatgaaagaggttatttggagaaagagaaaaaccaatactaaagttttggccattttttggtttaagagaatg 3176269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 273 - 335
Target Start/End: Original strand, 23547070 - 23547133
Alignment:
Q  273 taaaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23547070 taaaaaactactttatgttaatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 23547133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 30682947 - 30682755
Alignment:
Q  136 aatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagt 235  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||||||| || |||| |||| |||| ||   ||||| |||||   | |    
T  30682947 aatttgacaggttttctctgttttgactgggtttgggaatggatatgagttttccccgacttaaaaatacggatatgagatatgtaacaagtatcaga-t 30682849  T
Q  236 acccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    | ||||  |||||| |||| || ||| ||||  ||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30682848 atccacctcgaacctatactcaaacccgtcctgaatgtagaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataatggtcatgtta 30682755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 322
Target Start/End: Original strand, 31126826 - 31126943
Alignment:
Q  206 gggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttg-tatgtta 304  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||| |||||||| ||  |||||||||  | |||| ||| || ||||||| ||  ||||||    
T  31126826 gggtatgggacgggtaacatgtatataggtatccaccccgaactcatacccaaactcgtcccaaatgcagaaaactacattgtgttgatatgccatgtta 31126925  T
Q  305 ttttgtttgataattgtc 322  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31126926 ttttgtttgataattgtc 31126943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 169
Target Start/End: Original strand, 31271208 - 31271293
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggttt 169  Q
    |||||||||||||| ||| || || |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||    
T  31271208 ctaggcatggcaaccaaacccgtacccgcgggtacccgtccgaatcaaactcaatttgacggatttttcccgctttgactgggttt 31271293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 178
Target Start/End: Original strand, 31126746 - 31126834
Alignment:
Q  90 atggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatggg 178  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||| ||  |||||||||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31126746 atggcaacaaaacccatacacgtggttaaccacccgaaccaaacttaaattgatgggttttccccgttttgatttggtttgggtatggg 31126834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 335
Target Start/End: Original strand, 48306650 - 48306697
Alignment:
Q  289 gttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48306650 gttgatttgtcatgttaatttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 48306697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 212
Target Start/End: Original strand, 23910171 - 23910289
Alignment:
Q  94 caacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccg 193  Q
    |||||||| |||||  || ||||||| ||||||| | ||  ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||  ||||| || || | ||||| ||    
T  23910171 caacaaaacccatactcgtggttacctgtccgaatcgaattcaatttgacggattttttccgttttgactgggtttgtgtatgagtttgagttttcctcg 23910270  T
Q  194 atttcaaaacacgggtatg 212  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  23910271 atttcaaaacacggatatg 23910289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 224
Target Start/End: Original strand, 3414485 - 3414586
Alignment:
Q  123 ccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 222  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||| | ||||| | ||||||| || | ||| ||||||||  ||||||| ||| ||||| |||||    
T  3414485 ccgaaccaaacccaattcgataggttttccccgctttgattgggtttggttatgggtttgagtttttcccgattttcaaacacgagtacgggacaggtaa 3414584  T
Q  223 cg 224  Q
    ||    
T  3414585 cg 3414586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12369172 - 12369103
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttcccc 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12369172 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttattcacccgaaccaaactcaatttgacggattttcccc 12369103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 4553309 - 4553173
Alignment:
Q  144 gggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactc 243  Q
    |||||||| ||| ||||||| || ||||||||| || || | ||| ||||||||||||||| ||||  || ||||||||   | |||||| ||| ||| |    
T  4553309 gggttttctccgctttgactgggcttaggtatgcgtttgagtttttcccgatttcaaaacatgggtgcggaacgggtaatagggatataaatacacaccc 4553210  T
Q  244 cgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaat 280  Q
    ||||||||||| || ||| ||| | ||| ||||||||    
T  4553209 cgaacccatactcaaacccgtctcgaatgtaaaaaat 4553173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 34593280 - 34593222
Alignment:
Q  122 tccgaaccaaacccaatttgacgg-gttttccccgttttgacttggtttaggtatgggt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| | |||||||||||||    
T  34593280 tccgaaccaaacccaatttgacggatttttttccgttttgactggatttaggtatgggt 34593222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 232
Target Start/End: Original strand, 41937016 - 41937070
Alignment:
Q  178 gtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatata 232  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  41937016 gtatgggttttccccgattttaaaacacgagtatgagacggataacgggtatata 41937070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 315
Target Start/End: Original strand, 23910332 - 23910385
Alignment:
Q  263 gtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgat 315  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23910332 gtcccgaatgtagaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgat 23910385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25302506 - 25302430
Alignment:
Q  211 tgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttat 288  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||| |||  || |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25302506 tgggacgagtaacggggatatatgtatccatcccaaacccataccca-acatgtcccaaatatagaaaattactttat 25302430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1337128 - 1337080
Alignment:
Q  175 tgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 223  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1337128 tgggtttgggttttcaccgatttcaaaacaagtgtatgggacgggtaac 1337080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2367504 - 2367253
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2367504 taggcatggcaacaaaacccatatccgtggttacccgtccgaaccaaacccaatttgatgggtttttcccgttttgactaggtttgggtatgggtatggg 2367405  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||    
T  2367404 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatggaaaaaattact 2367305  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2367304 ttatgtggatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 2367253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 89 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32854018 - 32853771
Alignment:
Q  89 catggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggattt 188  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||    
T  32854018 catggcaacaaaacccatacccgtggttatccgaccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttggttatgggtatgggtttt 32853919  T
Q  189 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttat 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32853918 ccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttat 32853819  T
Q  289 gttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32853818 gttgatatgttatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaa 32853771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27534862 - 27534611
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |    
T  27534862 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttaaccgtccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtatgag 27534763  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  27534762 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaatccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 27534663  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27534662 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 27534611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 90 - 335
Target Start/End: Original strand, 5863298 - 5863544
Alignment:
Q  90 atggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttc 189  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  5863298 atggcaacaaaacccatacccgtggttacctgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggttttc 5863397  T
Q  190 cccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| || ||||||    
T  5863398 cccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagatacccacctcgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaatattttatg 5863497  T
Q  290 ttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5863498 ttgatatgttatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaa 5863544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 3483833 - 3484084
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  3483833 taggcatggcaacaaaacccatactcatggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgtgtatggg 3483932  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  3483933 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggatgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 3484032  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3484033 ttatgtggatatgttatgttattttgtttcataattgtcatcttaataaaaa 3484084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27738950 - 27738699
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||| ||| |||||||  |||||  |||||||||| | ||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27738950 tagggatgtcaacaaaccccatactcgcggttacctgcccgaaccaaattcaatttgatgggtttttcccgttttgactgggtttaggtatgggtatggg 27738851  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27738850 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacagatatatatgtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 27738751  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27738750 ttatgttgatatgttatgttattttgtatgataattgtcatgttaataaaaa 27738699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 10187991 - 10188234
Alignment:
Q  86 aggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggga 185  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  10187991 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 10188090  T
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactt 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||| ||    
T  10188091 tttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgg-------gtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccatcccaaatgtaaaaaattattt 10188183  T
Q  286 tatgttgat-ttgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10188184 tatgttgatatattatgttattttgttcgataattgtcatgttaataaaaa 10188234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 10142428 - 10142679
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||   | ||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10142428 taggcatggcaacaaaacccatacttgtggttatccgctcgaaccaaactcaatttggcgggttttcctcgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 10142527  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  10142528 ttttccccgatctcaaaaaacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacccaaacctgtcccaaatgtaaaaaattatt 10142627  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10142628 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 10142679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 84 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12141564 - 12141312
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |   ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12141564 ctaggcatggcaacaaaacccatacctatggttacccgcccgaaccaaattcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtacgggtatgg 12141465  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattac 283  Q
    | ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||     
T  12141464 gttttccccaatctcaaaacacggatatgggacgggtgacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattat 12141365  T
Q  284 tttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12141364 tttatgttgatacgttatgttattttgtttgataattgtcatcttaataaaaa 12141312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24225882 - 24225625
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  24225882 taggcatgacaacaaaactcatacccatggttacccgtccgaaccaaattcaatttgacaggttttccccgttttgattgggtttgggtttgggtatggg 24225783  T
Q  185 a------tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaa 278  Q
           |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||    
T  24225782 tatggattttccccgatctcaaaacacggatatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatgcccaaacccgtcccaaatgtaaaaa 24225683  T
Q  279 attactttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24225682 attattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 24225625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 89 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32053255 - 32053015
Alignment:
Q  89 catggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggattt 188  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||      |||    
T  32053255 catggcaacaaaacccatacccacgtttatccg-ccggaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggt------ttt 32053163  T
Q  189 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttat 288  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  32053162 ccccgatttcaaaacatggatatgggacgggtaacgggtatatatgtacccaccccaaacccatacccaaacccgtccaaaatgtaaaaaaatactttat 32053063  T
Q  289 gttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32053062 gttgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaa 32053015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 85 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12309756 - 12309510
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggt------atggg 178  Q
    |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||      |||||    
T  12309756 taggcatgacaacaaaccccatacccgcggttacccgcccgaaccagacccaatttgacgagttttccccattttgactgggtttgggtttgggtatggg 12309657  T
Q  179 tatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaa 278  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  12309656 tatgggtattccctgatttcaaaacacgggtatggaacgggtaacaggtatatatgtacccaccccgaaccgatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaa 12309557  T
Q  279 attactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcat 324  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12309556 attactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcat 12309510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 32532718 - 32532509
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||||  ||||||| | | |||||  ||||| |||||||    
T  32532718 taggcatgacaacaaaatccatatctgcggttatccgcccaaatcaaatccaatttgacgggttttttccgttttcattgggtttgagtatgagtatggg 32532619  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  32532618 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaatgggtatataggtacccaccccgaacccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 32532519  T
Q  285 ttatgttgat 294  Q
    ||||||||||    
T  32532518 ttatgttgat 32532509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30986431 - 30986283
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  30986431 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgagtttgggtatgggtatggg 30986332  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataa 233  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30986331 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataa 30986283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 123 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 9442569 - 9442441
Alignment:
Q  123 ccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9442569 ccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgact-ggtttgggtatgggtatgggattttcccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 9442471  T
Q  223 cgagtatataagtacccactccgaacccat 252  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  9442470 cgggtatagaggtacccactccgaacccat 9442441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15498502 - 15498309
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  15498502 taggcattgcaacaaaatccatactcacggttatccgcccgaatcaaacccaatttaacgggttttctccgttttgaatgggtttgggtatggatatggg 15498403  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaa 278  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| |||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  15498402 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacaggtaatgggtatataggtacccatcccgaacccacacccaaacccgtcccaaatgtaaaaa 15498309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 338
Target Start/End: Original strand, 12678004 - 12678257
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||  | |||||||||| |  | ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || || |    
T  12678004 taggcatggcagcaaatcccataaccgtggttacccacctgaaccaaacctatctcgacaggttttcgccgttttgactgggtttgggtatgagtttgcg 12678103  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||  | ||||||| |    
T  12678104 ttttccccgatttcaagacacaggtatgggacgggtaaagggtatataggtacccaccctgaacccatacccaaacccgtcccgaattgagaaaattatt 12678203  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaatta 338  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12678204 ttatattgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcgtgtt-ataaaaatta 12678257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31496612 - 31496465
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  31496612 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgtccaaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgag 31496513  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatata 232  Q
     |||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  31496512 ttttccccgatctcgaaacatgggtatgggacgggggacgggtatata 31496465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31501998 - 31501851
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  31501998 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgtccaaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgag 31501899  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatata 232  Q
     |||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  31501898 ttttccccgatctcgaaacatgggtatgggacgggggacgggtatata 31501851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 113 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11762595 - 11762379
Alignment:
Q  113 ggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatg 212  Q
    |||||| || ||||||  || ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | ||||| | | || ||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  11762595 ggttactcgcccgaacacaatccaatttgacgggttttccccatttttactgggtttggatatggatttaggtttttcccgatttctaaacaagggtatg 11762496  T
Q  213 ggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttg-tatgttattttgtt 311  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||| |||||||| |||  |||||||| || ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  11762495 ggacgggtaacgggtatataggtgtccaccccgaactcatacccaaacccatcccaaatgtagaaaattactttatgttgatatgccatgttattttgtt 11762396  T
Q  312 tgataattgtcatgtta 328  Q
      ||||||||| |||||    
T  11762395 atataattgtcgtgtta 11762379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 257
Target Start/End: Original strand, 28079606 - 28079778
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||  ||  |||||||||| |||||||||| || |||| |||| ||  |||| ||||||||| ||||    
T  28079606 taggcatgacaacaaaacccatacccgcgggtacccacccataccaaacccattttgacgggtatttcccgctttggctgagtttgggtatgggtttggg 28079705  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28079706 ttttccccgatttcaaaacatgggtacgggacgggtaacggggatataggtacccaccccgaacccataccca 28079778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14506252 - 14506020
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| ||| ||||  |||| ||| ||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||               
T  14506252 taggcatgacaataaaactcatacccgtggttaaccatccgaacgaaactcaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggt----------- 14506164  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||  | |||| ||||    
T  14506163 -tttccccgatttcaaaacacaggtatgggacgggtaacaagtatttaggtacccaccccgaacccatacttaaacccgtcccaaatgcagaaaactact 14506065  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    || ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14506064 ttgtgttgatatgtcacgttattttgtttgataattgtcgtgtta 14506020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 320
Target Start/End: Original strand, 24602778 - 24603002
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||               
T  24602778 taggcatgacaacaaaatccatacacgtggttacccacccgaacgaaactcaatttgacggtttttccctgttttgactgggtttgggt----------- 24602866  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||  || | ||| || |||||||||    
T  24602867 -tttcccagatttcaaaacatgggtatgtgacgggtaacaggtatatagatacccaccccgaacccatacccaaacccatcacgaatgtagaaaattact 24602965  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattg 320  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  24602966 ttatgttgatgtgccatgttattttgtttgataattg 24603002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 30816399 - 30816199
Alignment:
Q  122 tccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggta 221  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||| | ||||||| || | |||||||  |||  |||||||||||||||| |||||    
T  30816399 tccgaaccaaacccaatttgatggattttccccgttttgattgggtttggatatgggtttgagttttccccatttt--aaacacgggtatgggatgggta 30816302  T
Q  222 acgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaat---ataaaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataa 317  Q
    | | ||||||| | |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| |||   | |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  30816301 atgggtatataggaacccaccccgaacccatatccaaacccgtcccgaatgcaaaaaaaaactactttatgttgatatgtgatgttattttgttggataa 30816202  T
Q  318 ttg 320  Q
    |||    
T  30816201 ttg 30816199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14255135 - 14254906
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||  |||||||||||||  || ||||||||   |||| |||||||| |||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || |    
T  14255135 taggcatgctaacaaaatccatactcgtggttacccactcgaatcaaacccattttgacagattttcctcgttttgactgggtttgggtatgggtttgag 14255036  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||   ||||||||||||| |   |||||||||  ||| ||| |||    
T  14255035 ttttctctgatttc-aaacacgggtatgggacgtgtaacggaaatataggtacccaccatgaacccatacccaaattcgtcccaaatgcaaataataact 14254937  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttga 314  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14254936 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttga 14254906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13769209 - 13769069
Alignment:
Q  126 aaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacga 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  13769209 aaccaaacccaatttcacgggttttactcgctttgactgggtttaggtatgggtttcggttttccccgacttcaaaacatgggtatgggacgggtaacgg 13769110  T
Q  226 gtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcc 266  Q
      ||||| |||||||| | ||||||||| ||| ||| ||||    
T  13769109 acatataggtacccacccagaacccatatccaaacccgtcc 13769069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 89 - 266
Target Start/End: Original strand, 14410782 - 14410946
Alignment:
Q  89 catggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggattt 188  Q
    |||| |||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||            |||    
T  14410782 catgacaacaaaacccatgtccgtggttacccgtccaaaccaaatctaatttgacggattttccc-gttttgactaggtttgagt------------ttt 14410868  T
Q  189 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcc 266  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  14410869 cccagatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcc 14410946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 137 - 257
Target Start/End: Original strand, 20610944 - 20611064
Alignment:
Q  137 atttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagta 236  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |||    
T  20610944 atttgacgggtttttcccgatttaactgggtttaggtatgggtttggggtttccccgatttcaaaatacgggtaggggacgggtaacgggaatatatgta 20611043  T
Q  237 cccactccgaacccataccca 257  Q
     |||| ||||| | |||||||    
T  20611044 tccaccccgaaactataccca 20611064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 241
Target Start/End: Original strand, 34178245 - 34178395
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||| ||||  |||| |||||| |||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||      ||||||||||    
T  34178245 taggcatggcaataaaactcatacccgcgggtacccgcctgaaccatacccaatttgatgggtgttccccgttttgacagggtt------tgggtatggg 34178338  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccac 241  Q
     || ||| |||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  34178339 tttcccctgatttcaaaacacgggtacgagacgggtaacaaggatataggtacccac 34178395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29341434 - 29341239
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||| ||||| |||||||| | |||||| ||||||||| | ||||| | |||| || ||||    
T  29341434 taggcatggcaacaaaacccatatccgcgggtactcgctcgaatcaaactcaatttgatgagttttctccgttttgattgggtttggatatgagtttggg 29341335  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaat 280  Q
     ||| ||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||||   ||||| |||||||  || ||| |||||||| ||| ||||| ||| || |||||    
T  29341334 tttttcccgattttcaaacatgggcatgagacgggtaacggagatataggtacccatcccaaactcatacccaaacccgtcccgaatgtagaaaat 29341239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 186 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20349141 - 20349039
Alignment:
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| |||||| |||||||| | | ||  ||||| |||||||||| ||    
T  20349141 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgagtaacggggatataggtacccaccccgaactcatacccaaatccgttgcaaatgtaaaaaattaatt 20349042  T
Q  286 tat 288  Q
    |||    
T  20349041 tat 20349039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 243 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14032576 - 14032497
Alignment:
Q  243 ccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgt 321  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14032576 ccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgcataaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgt 14032497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14034669 - 14034584
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggttt 169  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  14034669 ctaggcatggcaacaaaacccataaccgtggttacccacccgaactaaacccattttgatgggttttacccgttttgactgggttt 14034584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18909040 - 18908899
Alignment:
Q  116 tacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatggga 215  Q
    |||||| || |||||| | | ||||||||| |||| |||| | |||||  ||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18909040 tacccgcccaaaccaacctcgatttgacggatttttcccgatgtgactgagtttgagtatgagtttgggttttccccgatttcaaaatacggatatggga 18908941  T
Q  216 cgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||||||    
T  18908940 cgggtaacaaggatatatgtacccaccccaaactcataccca 18908899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 257
Target Start/End: Original strand, 256440 - 256574
Alignment:
Q  123 ccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 222  Q
    ||||||||||| |||||| | || ||||||||| ||||  |  |||| |||||| || || | ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  256440 ccgaaccaaactcaatttaatggattttccccgctttggttgtgtttgggtatgagtttgagttttccccgatttcaaaacatgggtacgagacgggtaa 256539  T
Q  223 cgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
     | | ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  256540 tgggcatataggtacccaccccaaacccataccca 256574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 9458970 - 9458864
Alignment:
Q  151 ccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaaccc 250  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| | || ||||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||| ||||||      
T  9458970 ccccgatttgactgggtttgggtatgggtctgggttttccccgatttaataatacgggtacgggatgggtaacgggaatatatgtacccaccccgaactt 9458871  T
Q  251 ataccca 257  Q
    |||||||    
T  9458870 ataccca 9458864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 32959948 - 32959868
Alignment:
Q  175 tgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacc 255  Q
    ||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  32959948 tgggtttgggttttccctaatttcaaaacacgggtacggaacgggtaacggggatataggtatccaccccgaacccatacc 32959868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 257
Target Start/End: Original strand, 29199896 - 29199967
Alignment:
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  29199896 tttccccgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaacagggatatatgtatctaccccgaacccataccca 29199967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 254
Target Start/End: Original strand, 7393898 - 7393966
Alignment:
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatac 254  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| | ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  7393898 tttccccgatttcaaaacacgagtaagagacggataatgggtatataggtatccaccccgaacccatac 7393966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 9402723 - 9402676
Alignment:
Q  116 tacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgact 163  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  9402723 tacccgcccgaaccaaacccaatttgatggattttccccgctttgact 9402676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19367099 - 19367049
Alignment:
Q  173 tatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 223  Q
    |||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19367099 tatgggtatggattttccccaattttaaaacacgggtatgagacgggtaac 19367049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 161
Target Start/End: Original strand, 7393837 - 7393885
Alignment:
Q  113 ggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttga 161  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7393837 ggttacacgtccgaatcaaatccaatttgacggattttccccattttga 7393885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9402670 - 9402587
Alignment:
Q  181 tgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtc 265  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  | ||||| ||  |||| |||||||||||| || |||||||    
T  9402670 tgggttttccccgatttcaaaacatgggtacaggacgggtaacatggatataggtgtccac-ccgaacccatactcaaacctgtc 9402587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 161
Target Start/End: Original strand, 29199807 - 29199883
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttga 161  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||   | |||||| || |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  29199807 taggcatggcaacaaaatccatgcccataggtacccgcccaaaccaaccccgatttgacggattttccccgatttga 29199883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4583297 - 4583046
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  4583297 taggcatggcaacaaaactcatatccacggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttggatatgggtatggg 4583198  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4583197 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggttcccaccccaaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 4583098  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4583097 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 4583046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4921006 - 4920753
Alignment:
Q  83 actaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatg 182  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  4921006 actaggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttggttatgggtatg 4920907  T
Q  183 ggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatta 282  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  4920906 ggttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtatccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaatta 4920807  T
Q  283 ctttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4920806 ctttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 4920753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Original strand, 17853201 - 17853453
Alignment:
Q  82 aactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtat 181  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||    
T  17853201 aactaggcatggcaacaaaacgcatacccgcggttacccacctgaaccaaacctaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatggatat 17853300  T
Q  182 gggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatt 281  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  17853301 gggttttccccgatttcaaa-cacgggtatgggacgggtaacggatatatagatacccactccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaatt 17853399  T
Q  282 actttatgttgatttgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17853400 actttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 17853453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 5908599 - 5908850
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||| |    
T  5908599 taggcatggcaacaaaatccatacccgtggttatccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccattttgattgggtttgggtatgggtatgag 5908698  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  5908699 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatatgtacacaccccaaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 5908798  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5908799 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 5908850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 13401915 - 13402164
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  13401915 taggcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttttccgttttgactaggtttgggtatgggtatgag 13402014  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13402015 tttttcccgattttcaaacacgggtatggaacgggtaacgggtatttaggtacccactccgaaccca-accgatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 13402113  T
Q  285 ttatgttgatttgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13402114 ttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 13402164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 335
Target Start/End: Original strand, 12866468 - 12866714
Alignment:
Q  91 tggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttcc 190  Q
    ||||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | ||||     
T  12866468 tggcaacaaaacccatacatgtggttacccgtccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgagttttct 12866567  T
Q  191 ccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgt 290  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12866568 ccgatttcaaaacatgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccgcgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgt 12866667  T
Q  291 tgatttg--tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12866668 tgatatgtctatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 12866714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15890384 - 15890134
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||| |||||||    
T  15890384 taggcatgacaacaaaacccatactcgcggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggtttttcccgttttgactaggtttggctatgtgtatggg 15890285  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15890284 ttttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccac-ccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 15890186  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15890185 ttatgttgatatgtcatgttattttatttgataattgtcatattaatgaaaa 15890134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 113 - 335
Target Start/End: Original strand, 12834513 - 12834737
Alignment:
Q  113 ggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||    
T  12834513 ggttacccgtccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgggttttctccaatttcaaaacatggatatg 12834612  T
Q  213 ggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttg--tatgttattttgt 310  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  12834613 ggacgggtaacaggtatataggtacctaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattaatttatgttgatatgtctatgttattttgt 12834712  T
Q  311 ttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12834713 ttgataattgtcatgttaataaaaa 12834737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 89 - 333
Target Start/End: Original strand, 29245866 - 29246111
Alignment:
Q  89 catggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggattt 188  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||    
T  29245866 catgacaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactaggtttgggtatgggtatgagtttt 29245965  T
Q  189 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttat 288  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    
T  29245966 ctccgatttcaaaacacgggtatgggacgaataacatgtatataggtacccaccccaaacccatacccatacccatcccaaatgtaaaaaattattttat 29246065  T
Q  289 gttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaa 333  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29246066 gttggtatgtcatgttattttgtttgataattgttatgttaataaa 29246111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 80 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 40517989 - 40517733
Alignment:
Q  80 gcaactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggt 179  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  40517989 gcaattaggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcctgaaccaaattcaatttgacggatttttcccgttttgactgggtttgggtatgggt 40517890  T
Q  180 atgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaa 279  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||  |||||||    
T  40517889 atgggttttccccgatcccaaaacacgggtatgggatgggtaacgggtatatagttacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaaggtaaaaaa 40517790  T
Q  280 ttactttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40517789 ttattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 40517733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 89 - 335
Target Start/End: Original strand, 22694817 - 22695063
Alignment:
Q  89 catggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggattt 188  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  22694817 catggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggaattttcccgttttaactgggtttgggtatgggtatggg-ttt 22694915  T
Q  189 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttat 288  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  22694916 ccccgatctcaaaatacgggtatgggacgactaacgggtatagaggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattattttat 22695015  T
Q  289 gttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22695016 gttgatatgtaatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 22695063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30996773 - 30996523
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  30996773 taggcatggcaacaaaacccatatctacggttatccgtccgaaccaaacccaatttgacggattttccc-gttttgactgggtttgggtatgagtatggg 30996675  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  30996674 ttttctccgattttaaaacacgagtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaacacacacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 30996575  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30996574 ttaagttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 30996523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 35311993 - 35311750
Alignment:
Q  83 actaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatg 182  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||| |||     
T  35311993 actaggcatgacaataaaactcatatccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttttccgttttgactgagtttgggtatggatat- 35311895  T
Q  183 ggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatta 282  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  35311894 --------ccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacagatatataggtacccactccgaacccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaatta 35311803  T
Q  283 ctttatgttgatttgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35311802 ttttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 35311750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 42987391 - 42987641
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||||     
T  42987391 taggcatggcaacaaaacccatattcgtggt-atccgtccgaaccaaattcaatttggcgggtttttcccgttttgactgagtttgggtacgggtatgga 42987489  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |    
T  42987490 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgtgtaacggatatataggtacccatcccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattatt 42987589  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42987590 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 42987641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 88 - 335
Target Start/End: Original strand, 20973410 - 20973647
Alignment:
Q  88 gcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatt 187  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||    
T  20973410 gcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccattctgacgggttttccccgttttgactgggtttggttatgggtatgggttt 20973509  T
Q  188 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattacttta 287  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||           ||||||| |||||||||||||||    
T  20973510 tccccgattttcaaacacgggtatgggatgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccata-----------cccaaatgtaaaaaattacttta 20973598  T
Q  288 tgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20973599 tgttgatatgtcatggtattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 20973647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10127252 - 10127062
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10127252 taggcatgacaacaaaatccatacccgtggttatccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 10127153  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatta 282  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  10127152 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgg-------gtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaatta 10127062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Original strand, 3564649 - 3564889
Alignment:
Q  83 actaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatg 182  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3564649 actagacatgacaacaaaatccatactcgcggtt-cccgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccc-gttttgactgggtttgggtatgggtatg 3564746  T
Q  183 ggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtaccc-actccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatt 281  Q
    |  |||| ||||||||||||||||  ||           ||  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||    
T  3564747 gattttctccgatttcaaaacacgaata-----------acaggtatataggtaccctactccgaacccatatccatacccgttccaaatgtaaaaaatt 3564835  T
Q  282 actttatgttgatttgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564836 actttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 3564889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 206 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1218812 - 1218684
Alignment:
Q  206 gggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttgtatgttat 305  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1218812 gggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccactccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatttgtatgttat 1218713  T
Q  306 tttgtttgataattgtcatgttaataaaa 334  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1218712 tttgtttgataattgtcatgttaaaaaaa 1218684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 134 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28045784 - 28045589
Alignment:
Q  134 ccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataa 233  Q
    |||||||||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||     
T  28045784 ccaatttgacgtatttttcccattttgactgtgtttaggtatgggtatgggtttttccctaattcaaaacacgaatatgggacgggtaacgggtatatag 28045685  T
Q  234 gtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaa 329  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28045684 gtacccac-ccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgttttataattgttatgttaa 28045589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 85 - 241
Target Start/End: Original strand, 33727912 - 33728068
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||     
T  33727912 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttccccgttttgattgggtttggatatgggtatgga 33728011  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccac 241  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33728012 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccac 33728068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 113 - 335
Target Start/End: Original strand, 6092468 - 6092680
Alignment:
Q  113 ggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatg 212  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||      
T  6092468 ggttacccgcccgaaccaaattcaatttaacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtatgggtttttcccgatctcaaaacacgggta-- 6092565  T
Q  213 ggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttg-tatgttattttgtt 311  Q
             ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  6092566 ---------acgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaatccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtt 6092656  T
Q  312 tgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
T  6092657 tgataattgcaatgttaataaaaa 6092680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 6155831 - 6156080
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||||||| ||  ||| |||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| || ||||    
T  6155831 taggcatggcaacaaaactcatacctgcggttatccacccgtaccaaatcaaatttaacgggttttcttcgttttgactgggtttgggtatgtgtttggg 6155930  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | | ||| ||||| |  |||||||||    
T  6155931 ttttccccgatttcaaaacacgggtataggacaggtaa--ggtatatatgtacccaccccgaacccatacccaaaaccgtcacaaatgttgaaaattact 6156028  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6156029 ttatgtttatatgacatgttattttgtttgataattgtcatggtaataaaaa 6156080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18207196 - 18206961
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || ||| || ||||    
T  18207196 taggcatggcaacaaaactcatacccgtggttacccacccaaaccaaacccaatttgacgtgtttttcccgttttgactgggtttgggcatgagtttggg 18207097  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||| || |||||||||    
T  18207096 ttttcctcgatttcaaaactcgtgtatgggacaggtaacaggtatataggtacccac-ccgaacccatattcaaacccgtcccgaatgtagaaaattact 18206998  T
Q  285 t-tatgttgatttg-tatgttattttgtttgataatt 319  Q
    | ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  18206997 tctatgttgatatgccatgttattttgtttaataatt 18206961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 113 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6369845 - 6369623
Alignment:
Q  113 ggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatg 212  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| |  |||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| ||| |||||    
T  6369845 ggttacccgctcgaaccaaacctaatttgacggttttttctcgttttgattgagtttgggcatgggtatgagttttccctgatttcaaaatacgagtatg 6369746  T
Q  213 ggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtt 311  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||    
T  6369745 gga-gggtaacgtgtatatatgtacccaccccgaacccatactttaacccgtccaaaatgtaaaaaattactttatgttgatgcgtcgtgttattttgtt 6369647  T
Q  312 tgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||| |||||||||| ||||    
T  6369646 tgataattatcatgttaatgaaaa 6369623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 12447548 - 12447315
Alignment:
Q  83 actaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatg 182  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||             
T  12447548 actaggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccacccgaaccaaacccaatttgacggattt-ccccattttgactgggtttgggt--------- 12447459  T
Q  183 ggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatta 282  Q
       |||||  ||||  ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| ||    
T  12447458 ---tttccttgattgtaaaacacaggtatgggacaggtaatgggtatataggtacccaccccgaacctatacccaaacccgtcccaaatatagaaaacta 12447362  T
Q  283 ctttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12447361 ctttatgttaatatgtcatgttattttgtttgataattgtcgtgtta 12447315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 186 - 328
Target Start/End: Original strand, 27302747 - 27302890
Alignment:
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactt 285  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| | |||||| |||||||| ||||| |||||  |||||  ||||||||  |||||||||||||    
T  27302747 tttccccgatttcaaaacacggatatgagacggataacaaatatataggtacccaccccgaatccatagtcatacacgtcccaaacgtaaaaaattactt 27302846  T
Q  286 tatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27302847 tatgttaatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgtta 27302890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 38973059 - 38972931
Alignment:
Q  126 aaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacga 225  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||     
T  38973059 aaccaaactcattttgacaggttttccccgttttgactgggtttaggtatgagtttgggtttttcccgatttcaaaacatgggtatgggataggtaacgg 38972960  T
Q  226 gtatataagtacccactccgaacccatac 254  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  38972959 gaatataggtacccaccccgaacccatac 38972931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 257
Target Start/End: Original strand, 28568932 - 28569104
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| |||| | || || || ||| || |||||  | | ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| || |||     
T  28568932 taggcatggcaacaaaacccatgttcgtgggtagccgcccaaaccatcctcgatttgacgggttttccctgatttgactgggtttgggtatgagtttgga 28569031  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
     |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28569032 ttttccccgatttcaaaatgcgggtacgggacgggtaacggggatataggtacccaccccgaacccataccca 28569104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 199 - 320
Target Start/End: Original strand, 35194014 - 35194136
Alignment:
Q  199 aaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttg- 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||||| || ||| ||||| ||| || |||||||||||||||| || ||     
T  35194014 aaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaactcatactcaaacccgtcccgaatgtagaaaattactttatgttaatatgc 35194113  T
Q  298 tatgttattttgtttgataattg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  35194114 tatgttattttgtttgataattg 35194136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 328
Target Start/End: Original strand, 27088284 - 27088506
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||| || | ||    
T  27088284 taggcatggcaacaaaatccatacccgtgattatccacccgaaccaaactcattttgacgg--tttccccgttttaactaggtttgggtatgtgtttagg 27088381  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||| |||||| || |||||||||||||||                   |||||| ||||||||||||||| ||| ||| | ||| || ||||||| |    
T  27088382 ttttcctcgattttaagacacgggtatgggac-------------------acccaccccgaacccatacccaaacccgtctcgaatgtagaaaattatt 27088462  T
Q  285 ttatgttgatttgtatgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27088463 ttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgttatgtta 27088506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2681363 - 2681222
Alignment:
Q  116 tacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatggga 215  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| || ||| || |||| ||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  2681363 tacccgtccaaaccaacctcaatttgacgggttttccccgatttgactgagtttgggcatgagtttgggttttccccgatttcaaaatacaggtacggga 2681264  T
Q  216 cgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
     |||||| | | |||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  2681263 tgggtaatggggatatgagtatccaccccgaacccataccca 2681222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6810321 - 6810164
Alignment:
Q  88 gcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatt 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||||            ||| || |||| ||    
T  6810321 gcatggcaacaaaacccatatccgtggatacccgtccgaaccaaactcaatttgacggattttttccgctttga------------atgagtttgggttt 6810234  T
Q  188 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    |||||||||| | |||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6810233 tccccgattttagaacacgggtacggaacgggtaacgaggatataagtactcaccccgaacccataccca 6810164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 318
Target Start/End: Original strand, 38006470 - 38006614
Alignment:
Q  175 tgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatata 274  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||| | | ||||| ||| |     
T  38006470 tgggtttgggttttccccaatttcaaaatacgggtatgggacgcgtaacagatatataggtacccaccccgaacccatacccaaatccgtcccgaatgtt 38006569  T
Q  275 aaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataat 318  Q
     ||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  38006570 gaaaattaatttatgttaatatgtcatgttattttgtttgataat 38006614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 255
Target Start/End: Original strand, 23044933 - 23045072
Alignment:
Q  116 tacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatggga 215  Q
    |||||| || |||||| ||| |||||||||||||| |||  |||||||  |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23044933 tacccgcccaaaccaaccccgatttgacgggtttttcccaatttgactgagtttgggtatgggtttaggttttccccgatttcaaaatacgggtacggga 23045032  T
Q  216 cgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacc 255  Q
     ||||||||   ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23045033 tgggtaacggagatatatgtacccaccccgaacccatacc 23045072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 184
Target Start/End: Original strand, 42717569 - 42717640
Alignment:
Q  113 ggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  42717569 ggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgttttgactggatttgggtatgggtatggg 42717640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Original strand, 2412637 - 2412874
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||  |||| || || ||  ||||  ||||||||||| |||||||| |||||| |  |||| ||||||||| ||      
T  2412637 taggcatggcaaaaaaattcataaccgttgttatccatctgagtcaaattcaatttgacggattttccccattttgattgagtttgggtatgggtttgaa 2412736  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||| ||| ||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| |||||||  | ||||| ||||||| ||  |||||  ||  | |||||||||    
T  2412737 tttttcccaatttcaaaacacgggtatgggataaataacgggtatatatgtacccatcctgaaccaatacccaaactcgtcccgtatgcagaaaattact 2412836  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgt 321  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2412837 ttatattgatatgtcatgttattttgtttgataattgt 2412874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1218899 - 1218803
Alignment:
Q  89 catggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggga 185  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1218899 catggcaacaaaacccatacccgcggttacccgctcgaaccaaatccaatttgacgagttttttccattttgactgggtttgggtatgggtatggga 1218803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 186 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 2985224 - 2985088
Alignment:
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactt 285  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||  ||||| ||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| ||    
T  2985224 tttctccgatttcaagacatgggtttgggacgggtaacgggtatataggtactcatcccgaaaccatacccaaatctgtctcgaatatagaaaattattt 2985125  T
Q  286 tatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgt 321  Q
    ||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2985124 tatattgatatgtcatgttattttatttgataattgt 2985088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 224
Target Start/End: Original strand, 40187572 - 40187707
Alignment:
Q  89 catggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggattt 188  Q
    ||||||| |||||  |||| | |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||| ||||| |  ||| || |||| |||    
T  40187572 catggcagcaaaactcatacctgcgggtacccgtccgaaccaaactcattttgacgggttttcctcgctttgactgggtttggaaatgagtttgggtttt 40187671  T
Q  189 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 224  Q
    |||| ||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  40187672 ccccaatttcaaaacacgggtgcgagacgggtaacg 40187707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 253
Target Start/End: Original strand, 16311203 - 16311372
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    ||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||| | ||||| | |||| || ||     
T  16311203 ctaggcataacaacaaaactcatatccgcgggtacccgcctgaaccaaacctaatttgacggttttttcccgctttgattgggtttggatatgagtttga 16311302  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccata 253  Q
    | |||  |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||  | ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16311303 gttttttccgatttcaaaacacgagtacgagacggataacagggatataggtacccaccccgaacccata 16311372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 190 - 339
Target Start/End: Original strand, 8453389 - 8453537
Alignment:
Q  190 cccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacct-gtcccaaatataaaaaattactttat 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||| ||| || ||  ||||| || | || ||||||||| || ||||||| |||||    
T  8453389 cccgatttcaaaacacgggtatgggatgggtaacagatatataggtacacaccccaaagtcatactcaaaactcgtcccaaatgtagaaaattagtttat 8453488  T
Q  289 gttgatttgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaattac 339  Q
    ||| || |||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  8453489 gttaatatgtc-gttattttgtttaataattgtcatgtt-ataaaaattac 8453537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 256
Target Start/End: Original strand, 10822533 - 10822608
Alignment:
Q  181 tgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccc 256  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10822533 tgggttttctccgatttcaaaacacgggtataggacgggtaacggggttatatgtacccaccccgaacccataccc 10822608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 20963873 - 20963815
Alignment:
Q  8 tatgaaggaggttatttggagtaaaagaaaaaacaatactagagttttggccatttttt 66  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20963873 tatgaaagaggttatttggagaaagagaaaaaacaataccagagttttggccatttttt 20963815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24207857 - 24207736
Alignment:
Q  89 catggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggattt 188  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||  | |||||| | |||| |||| ||||| |  |||| ||||||||| || | |||    
T  24207857 catggcaacaaaatccatacccgcgggtacccacccgaaccaaactaagtttgac-gatttttcccgctttgattgagtttgggtatgggtttgagtttt 24207759  T
Q  189 ccccgatttcaaaacacgggtat 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  24207758 ccccgatttcaaaacacaggtat 24207736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 161
Target Start/End: Original strand, 18451834 - 18451910
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttga 161  Q
    |||||||| |||||||| |||||  || || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18451834 taggcatgacaacaaaacccatacacgtgggttcccgtccgaaccaaacccagtttgacgggttttccccgatttga 18451910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39422486 - 39422394
Alignment:
Q  123 ccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatggga 215  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||| | |||| || |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39422486 ccgaaccacacccaaattgacaggttttccccgctttgattgggtttggatatgagtttgggtttttctcgatttcaaaacacgggtatggga 39422394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12915652 - 12915479
Alignment:
Q  83 actaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatg 182  Q
    |||||||||| |||||||||||||      || |||||| || ||||||  || ||||||||| ||| ||||| ||||||| || || ||||||||| ||    
T  12915652 actaggcatgacaacaaaatccatgcttatgggtacccgcccaaaccaacaccgatttgacggattt-ccccgatttgactggggttgggtatgggtttg 12915554  T
Q  183 ggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    || ||| |||||||||| || || || ||||||| ||||| | | ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  12915553 ggtttttcccgatttcataatacaggcatgggacaggtaatggggatacatgtacccactccgaagccataccca 12915479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 43523894 - 43523801
Alignment:
Q  117 acccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggta 210  Q
    |||| ||| |||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||||  |||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  43523894 acccatccaaaccaatcccgatttgacggatttttcccgatttgactgagtttgggtatgagtttgggttttccccgatttcaaaatacgggta 43523801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 257
Target Start/End: Original strand, 27900417 - 27900484
Alignment:
Q  190 cccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  27900417 cccgatttcaaaacatgggtatgggacgggtaatgtggatataggtacccatctcgaacccataccca 27900484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 257
Target Start/End: Original strand, 32574887 - 32575021
Alignment:
Q  124 cgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttgg-tttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 222  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| |||| |||||| ||| ||| || |  ||| |||| |||||||||||||||||||| | || |||| ||||||    
T  32574887 cgaaccaaatccattttgacaggtttttcccgctttgacctgggtttggggacaggtttgggttttccccgatttcaaaacacagatacgggatgggtaa 32574986  T
Q  223 cgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    |  | ||||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  32574987 catggatatatgtacccatcccgaacccaaaccca 32575021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3573243 - 3573158
Alignment:
Q  244 cgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    ||||||||||| || |||  |||| ||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3573243 cgaacccatactcaaacccctcccgaatgtagaaaattattttatgttgatatgtcatgttattctgtttgataattgtcgtgtta 3573158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12457605 - 12457500
Alignment:
Q  175 tgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatata 274  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    ||||||  || |||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||    
T  12457605 tgggtttggggtttcctcgatttcaaaatacgggtatgggacaggtaacatagatataaacactcactccgaactcatacccaaacccgtcccgaatgta 12457506  T
Q  275 aaaaat 280  Q
     |||||    
T  12457505 gaaaat 12457500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29665043 - 29664954
Alignment:
Q  191 ccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaat 280  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||| || |||||    
T  29665043 ccgatttcaaaacacgggtacatgatgggtaacggggatataggtacccacttcgaactcatacccaaacccgtcccgaatgtacaaaat 29664954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Original strand, 12712564 - 12712640
Alignment:
Q  181 tgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||   ||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  12712564 tgggttttctccgatttcaaaatacgggtacgggacggataacggagatatatgtacccacctcgaacccataccca 12712640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 30115525 - 30115425
Alignment:
Q  221 aacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataatt 319  Q
    |||| ||||||  |||||||  |||||||||||  || ||| ||||| |||  | ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30115525 aacgggtatattggtacccatcccgaacccatattcaaacccgtcccgaatgcataaaattattttatgttgatatgctatgttattttgtttgataatt 30115426  T
Q  320 g 320  Q
    |    
T  30115425 g 30115425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12251082 - 12250976
Alignment:
Q  151 ccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac-gagtatataagtacccactccgaacc 249  Q
    ||||| ||||||| ||||  ||||||||  |||  ||| | ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||    
T  12251082 ccccgatttgactaggttcgggtatgggcttggatttttcacgatttcaaaatacgggtaccggacgggtaacagag-atatatgtacccactctgaacc 12250984  T
Q  250 cataccca 257  Q
    ||||||||    
T  12250983 cataccca 12250976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 210
Target Start/End: Original strand, 18116471 - 18116553
Alignment:
Q  128 ccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggta 210  Q
    |||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||||  |||| |||||| || |||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  18116471 ccaaccccgatttgacggatttttcccgatttgactgagtttgggtatgagtttgggttttctccgatttcaaaatacgggta 18116553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 254
Target Start/End: Original strand, 12773828 - 12773901
Alignment:
Q  181 tgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatac 254  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||   ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  12773828 tgggttttctccgatttcaaaatacgggtacgggacggataacggagatatatgtacccacctcgaacccatac 12773901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15564718 - 15564573
Alignment:
Q  181 tgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaat 280  Q
    |||| ||| ||||||||||| | | | |||||||| |||||||| ||||||  |||  ||  |||||| ||||| || ||  ||||| ||| || |||||    
T  15564718 tgggtttttcccgatttcaagaaatgcgtatgggatgggtaacgggtatatctgtattcatcccgaactcatactcaaactcgtcccgaatgtagaaaat 15564619  T
Q  281 tactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatg 325  Q
    |||||||  ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15564618 tactttacattgatatgtcatgttattttttttgaaaattgtcatg 15564573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 155
Target Start/End: Original strand, 27302709 - 27302754
Alignment:
Q  111 gcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacggg-ttttccccg 155  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  27302709 gcggttacccgtccaaaccaatcccaatttgacgggattttccccg 27302754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30116856 - 30116819
Alignment:
Q  187 ttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30116856 ttccccgatttcaaaacacgagtatgggacggttaacg 30116819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 327
Target Start/End: Original strand, 33862310 - 33862338
Alignment:
Q  299 atgttattttgtttgataattgtcatgtt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33862310 atgttattttgtttgataattgtcatgtt 33862338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 77)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16866352 - 16866101
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  16866352 taggcatggcaacaaaactcatatccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttggttatgggtatggg 16866253  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16866252 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgagtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 16866153  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16866152 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaa 16866101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30650821 - 30650563
Alignment:
Q  78 atgcaactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgg 177  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30650821 atgcaagtaggcatgtcaacaaaactcatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttaggtatgg 30650722  T
Q  178 gtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaa 277  Q
    ||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||    
T  30650721 gtatgagttttccccaatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaatccgtcccaaatgtaaaa 30650622  T
Q  278 aattactttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30650621 aattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaa 30650563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21702842 - 21702591
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  21702842 taggcatggcaacaaaacccatatccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggatttttcccgttttgactgggtttgggtatgagtatggg 21702743  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  21702742 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccataccccaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 21702643  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21702642 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 21702591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 79 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17885654 - 17885397
Alignment:
Q  79 tgcaactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatggg 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||    
T  17885654 tgcaagtaggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacctgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgaatatggg 17885555  T
Q  179 tatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaa 278  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || || || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  17885554 tatgggttttccccgattttaaaacatgggtatgggacgggtaacgggtatataggttccaaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaa 17885455  T
Q  279 attactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17885454 attactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgtcaataaaaa 17885397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 84 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 35074654 - 35074401
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35074654 ctaggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaattagacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgg 35074555  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatat-aaaaaatta 282  Q
    | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||    
T  35074554 gttttccccgatcttaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaacccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaacta 35074455  T
Q  283 ctttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35074454 ctttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 35074401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 86 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10072648 - 10072440
Alignment:
Q  86 aggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggga 185  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  10072648 aggcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 10072549  T
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactt 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  10072548 tttccccgatttcaaaacacgggtatggaacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccataaccgtcccaaatgtaaaaaattactt 10072449  T
Q  286 tatgttgat 294  Q
    |||||||||    
T  10072448 tatgttgat 10072440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 37182457 - 37182207
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  37182457 taggcgtggcaacaaaacccatatccgcggttacccgcccgaatcaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtatggg 37182358  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||      
T  37182357 ttttctccgaattcaaaacacgggtatgggacgggtagcgggtatataggtactca-tccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattatc 37182259  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37182258 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 37182207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 45885675 - 45885926
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  45885675 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgctcgaaccaaacccaatttaacgggttttctccgttttgactgggtttgggtatgggtatgag 45885774  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| | | | ||||||||| ||||||||||||    
T  45885775 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacaagtatataggtacccaccccgaacccataccaaaatccgtcccaaatgtaaaaaattact 45885874  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45885875 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaa 45885926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7780190 - 7779940
Alignment:
Q  86 aggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggga 185  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  7780190 aggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccatccgaaccaaactcaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgggt 7780091  T
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||    
T  7780090 tttccccgatctcaaaacacgggtatgggacggataatgggtatataggtacccaccccgaacctatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaatttattt 7779991  T
Q  286 tatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7779990 tatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 7779940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 38139702 - 38139954
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  38139702 taggcatggcaagaaaacccatatccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgatggattttccccgttttgactgggtttggatatgggtatggg 38139801  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatat-aaaaaattac 283  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||| ||||| | |||||||||     
T  38139802 ttttccccaatttcaaaacacgagtatgggacgggtaatgagtatataagtacccaccccgaacccataaccaaacccgtctcaaatgtaaaaaaattat 38139901  T
Q  284 tttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38139902 tttatattgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 38139954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 3226856 - 3227107
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||  ||||  |||||||||||||    
T  3226856 taggcatggcaacaaaatccatacatgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacggattttcctcgttttaactgagtttgagtatgggtatggg 3226955  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||   |||||||| |||||||||| |    
T  3226956 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggaatataggtacccaccccgaacccatactcatacacatcccaaatgtaaaaaattatt 3227055  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3227056 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 3227107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 88 - 335
Target Start/End: Original strand, 18125141 - 18125389
Alignment:
Q  88 gcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatt 187  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| ||    
T  18125141 gcatgacaacaaaattcatatccgtggttactcgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgtgtatgagtatgggttt 18125240  T
Q  188 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattacttta 287  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  18125241 ttcccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacgcatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactacttta 18125340  T
Q  288 tgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18125341 tgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 18125389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 339
Target Start/End: Original strand, 39455932 - 39456178
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  39455932 taggcatggcaacaaaatcca-------ggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgagttttccccgttttgactgggtttgggtatggatatggg 39456024  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  39456025 ttttccccgatttcaaaacatgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaa-ccatactcatacccgtcccaaatgt-aaaaattact 39456122  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaattac 339  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  39456123 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgccatggtaataaaaattac 39456178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Original strand, 44734266 - 44734518
Alignment:
Q  82 aactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtat 181  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| || ||| ||||    
T  44734266 aactaggcatggcaacaaaactcatactcgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccc--ttttgactgggtttgggaatgtgtat 44734363  T
Q  182 gggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatt 281  Q
    | | ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||    
T  44734364 gtgtttttctcgatttcaaaacacgggtatgggaccggtaatgggtatataggtacccaccccgaacccatacacatatccgtcccaaatgtaaaaaatt 44734463  T
Q  282 actttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44734464 actttatgttgatatgtcatgttattttatttgataattgtcatgttaataaaaa 44734518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 39317178 - 39316927
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| |    
T  39317178 taggcatggcaacaaaattcatactcgcggttatccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttggatatgagtatgag 39317079  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||  | |||| |||||||||| | ||| ||||| |||||||||| |    
T  39317078 ttttcctcgatttcaaaacacgggtatgggacgggtagcgggtatatatgtatccatcctgaactcatacccatatccgtctcaaatgtaaaaaattatt 39316979  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39316978 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 39316927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 84 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25905812 - 25905560
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25905812 ctaggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgctcgaactaaacccaatttgacaggttttcccctttttgactgggtttgggtatgggtatgg 25905713  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacct-gtcccaaatataaaaaatta 282  Q
    | ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||| |||||| |||||||| || | ||||||||| ||||||||||    
T  25905712 gttttccccaatctcaaaacacaggtatgggacgggtaacgggtacataggta-ccaccccgaactcatacccaaacatcgtcccaaatgtaaaaaatta 25905614  T
Q  283 ctttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25905613 ttttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 25905560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 112 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 45380262 - 45380038
Alignment:
Q  112 cggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  45380262 cggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgg-ttttccctgttttgactgggtttggatatgggtatgggtttttcccgatttcaaaatacgggtat 45380164  T
Q  212 gggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatat-aaaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttg 309  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  45380163 gggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacctaaactcgtcccaaatgtaaaaaaattactttatgttgacatgtcatgttattttg 45380064  T
Q  310 tttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  45380063 tttgataattgtcatgttaataaaaa 45380038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17852035 - 17851786
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17852035 taggcatggcaacaaaacccatacttgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgatggattttctccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 17851936  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||| ||||    
T  17851935 ttttccccga--tcttaacacgggtatgggacgggtaacggatatataggtacccatcccgaacccatacccaaacccatcccaaatgtaaaaaactact 17851838  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17851837 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 17851786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 84 - 335
Target Start/End: Original strand, 41741359 - 41741610
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| | ||| |||||| ||||||    
T  41741359 ctaggcatggcaacaaaacccatatttgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgatgagttttccccatttttactggatttgggtatgagtatgg 41741458  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattac 283  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| || |||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  41741459 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacggataacgggtatgtaggtacccac-ccgaacccatattcatacccgtcccaaatgtaaaaaattac 41741557  T
Q  284 tttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41741558 tttatactgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaa 41741610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 43507628 - 43507365
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  43507628 taggcatggcaataaaattcatatccgcggttacccgtctgaaccaaacccaatttgatgggttttccccgttttgactgggtttgggtataagtatggg 43507529  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| |    
T  43507528 ttttccccgatttcaaaacatgggtatgagacgggtaacgggtatataggcacccaccctgaacccatacctatactcgtcccaaatgtaaaaaattatt 43507429  T
Q  285 ttatgttga-------------tttgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43507428 ttatgttgatatgtcatgttattttgtatgttattttgtttgataattgtcatattaataaaaa 43507365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 81 - 328
Target Start/End: Original strand, 27850238 - 27850480
Alignment:
Q  81 caactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggta 180  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||     
T  27850238 caactaggcatggcaacaaaactcatatccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggtttttccccgttttgattgggtttgggtatgggt- 27850336  T
Q  181 tgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaat 280  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||| ||| ||||| ||| || |||||    
T  27850337 -----tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtgtataggtacccatcccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgtagaaaat 27850431  T
Q  281 tactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    ||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27850432 tactttacgatgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcgtgtta 27850480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 79 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 38153075 - 38152835
Alignment:
Q  79 tgcaactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatggg 178  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  38153075 tgcagctaggcatggcaacaaaaactatacccacggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacggattttccc-gttttgactgggtttgggtatggg 38152977  T
Q  179 tatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaa 278  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||    
T  38152976 tatgggttttccccgatttcaaaacatgggtatggaacggataacggctatataggtacccaccccgaacccatacctaaacccgtcccaaatgtaaaaa 38152877  T
Q  279 attactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataatt 319  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  38152876 attattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataatt 38152835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 84 - 328
Target Start/End: Original strand, 18825775 - 18826026
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggta------tgg 177  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||       |||    
T  18825775 ctaggcatggcaacaaaacccatacccatggttaaccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtgagggtgtgg 18825874  T
Q  178 gtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaa 277  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||  ||||||||| | ||    
T  18825875 gtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccgtacccaaacccatcccaaatacagaa 18825974  T
Q  278 aattactttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    ||||| |||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18825975 aattattttacgttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgtta 18826026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24753346 - 24753107
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  24753346 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgtccgaaccaaattcaatttgacggattttctccgttttgactgggtttggatatgggtatggg 24753247  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||           ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |    
T  24753246 -ttttcccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggt-----------acccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattatt 24753159  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24753158 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 24753107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 12980556 - 12980315
Alignment:
Q  89 catggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggattt 188  Q
    |||||||||||||  |||| ||| |||||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || |||    
T  12980556 catggcaacaaaactcatacccgtggttacccgctagaaccaaactcaatttaacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggttttggtttt 12980457  T
Q  189 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaat-ataaaaaattacttta 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||| || ||||    
T  12980456 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaatgggtatataagtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgcaaaaaaaatatttta 12980357  T
Q  288 tgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12980356 tgttgatatgccatgttattttgtttgataattttcgtgtta 12980315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 90 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 41103828 - 41103584
Alignment:
Q  90 atggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttc 189  Q
    ||||||||||||  |||| | | |||||||||  ||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | |||||||||      ||||    
T  41103828 atggcaacaaaactcatacctgtggttacccgcgcgaaccaaatccgatttgacggatttttcccgttttgactgggtgtgggtatgggt------tttc 41103735  T
Q  190 cccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  41103734 cccgatttcaaaacacgggtatgggacggttaacgggtatataagtacccaccccgaacccatacataaacccgtcctaaatgtaaaaaattattttatg 41103635  T
Q  290 ttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaattac 339  Q
    ||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41103634 ttgatatctcttgttattttgtttgataattgtcatgttaatacaaattac 41103584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 113 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 37579416 - 37579192
Alignment:
Q  113 ggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatg 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||  |||    
T  37579416 ggttacccgcccgaaccaaacccaattagacgggttttccccgttttgactaggtttgggtatgggtttggatttttcccgatttcgaaacacgg--atg 37579319  T
Q  213 gg-acgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttg-tatgttattttgt 310  Q
    || | |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||  | ||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||    
T  37579318 ggtaagggtaacgggtatataggtacccaccccgaacctatacccaaagctgtctcaaatgcagaaaattactttatgttgctatgccatgttattttgt 37579219  T
Q  311 ttgataattgtcatgttaataaaaatta 338  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37579218 ttgataattgtcatgtt-ataaaaatta 37579192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 37195921 - 37196159
Alignment:
Q  87 ggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggat 186  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||  |    
T  37195921 ggcatgacaacaaaatccatacccgtggttatccgcccaaaccaaactcaatttgacggattttccctgttttgattaggtttgggtatgggtatggatt 37196020  T
Q  187 ttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattacttt 286  Q
    |||||||||||||||||           || ||||| | |||||||  ||||||| ||||| ||||||||| ||| |||  |||| ||||||||||||||    
T  37196021 ttccccgatttcaaaac-----------acaggtaatgggtatatagctacccaccccgaatccatacccaaacccgtcataaatgtaaaaaattacttt 37196109  T
Q  287 atgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37196110 atgttgatatgttatgttattttgtttgataactgtcatgttaataaaaa 37196159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 198 - 335
Target Start/End: Original strand, 44794051 - 44794188
Alignment:
Q  198 caaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttg 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  44794051 caaaacacgggtatgagacgggtaacgagtata-aggtacccaccccgaacccatacccaaacctgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatg 44794149  T
Q  298 -tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44794150 ttatgttattttgtttgataattgtcatgttactaaaaa 44794188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 44985828 - 44986059
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  44985828 taggcattgcaacaaaactcatactcgcggttacccatccgaaccaaatctaatttgacggattttctccgttttgattgggtttgggtatggatatggg 44985927  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||| |||||||||||             |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||      ||||||||| |||||||||| |    
T  44985928 ttttctccgatttcaaac------------acgggtaacgggtatataaatacccactccgaactcataccc------gtcccaaatgtaaaaaatta-t 44986008  T
Q  285 ttatgttgatttgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44986009 ttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 44986059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 339
Target Start/End: Original strand, 45708781 - 45709027
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || | ||| ||| ||||| |||| |||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| |||||||||         
T  45708781 taggcatggcaacaaaactcatatacgtgattatccgcccgaatcaaatccaatttgatagattttcctcgttttgactgggttttggtatgggt----- 45708875  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| | ||| |||| |||| |||||   ||||    
T  45708876 -tttctccgatctcaaaacacgggtattggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacctaaacccgtccaaaatgtaaaa---tact 45708971  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaattac 339  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45708972 ttatgttgatatgttatattattttgtttgataattgtcatattaataaaaattac 45709027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 88 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5377265 - 5377024
Alignment:
Q  88 gcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatt 187  Q
    ||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||  || |||||||| | ||||| |||| |||| |||||||||| | || ||  ||||| || |||| ||    
T  5377265 gcatgacaataaaattcatacccgtggttacctatctgaaccaaatctaatttaacggatttttcccgttttgattggggttgagtatgagtttgggttt 5377166  T
Q  188 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattacttta 287  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||  | ||||||||||||    
T  5377165 tccccgatttcaaaacacaggtatgggacgggtaaagggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaatctgtcccgaatgcagaaaattacttta 5377066  T
Q  288 tgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  5377065 tgttgatatatcatgtaattttgtttgataattgtcgtgtta 5377024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 335
Target Start/End: Original strand, 44658385 - 44658610
Alignment:
Q  93 gcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttcccc 192  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  44658385 gcaacaaaacccatacccgcggttacctgcccgaaccaaatccaatttgacgggttttcctcgttttgactgggtttgggtatgggtatgagtttttccc 44658484  T
Q  193 gatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttg 292  Q
    |||||||||||||||                  ||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||| || |||||||||    
T  44658485 gatttcaaaacacgg------------------gtatataggtacctatcccgaacccatacccaaacccgtaccaaatgtaaaaaaatattttatgttg 44658566  T
Q  293 atttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44658567 atatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 44658610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3920706 - 3920477
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||   ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||               
T  3920706 taggcatgacaacaaaactcatatccg---ttacccacccgaaccaaacccaatttgatgggtttttcccgttttgactgggtttgggt----------- 3920621  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||| || ||||||| |    
T  3920620 -tttccccgatttcaaaacactggtatgggacggataacaggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaaactgtcccgaatgtagaaaattatt 3920522  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3920521 ttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgccatgtta 3920477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 126 - 320
Target Start/End: Original strand, 2630525 - 2630720
Alignment:
Q  126 aaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacga 225  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||     
T  2630525 aaccaaacccaatttgacgtgttttacccatttttactgggtttgggtatgggtttgggttttccccgattt-aaaacatgggtatgggacgggtgacgg 2630623  T
Q  226 gtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaat-ataaaaaattactttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattg 320  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||   |||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  2630624 gtatatagatacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgcaaaaaaactactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattg 2630720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3157267 - 3157071
Alignment:
Q  83 actaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatg 182  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||   |||| |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |     
T  3157267 actaggcatggcaccaaaaatcatacatgcgggtacccgcccgaaccaaacctaatttgtcgg-ttttccccgctttgacttggtttgggtatgggttta 3157169  T
Q  183 ggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaat 280  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||||    
T  3157168 ggttttccccgatttcaaaatatgggtatgggacggataacggggatataggtacccacaccgaacctatacccaaacccgtcccaaacatagaaaat 3157071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 90 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16079191 - 16078952
Alignment:
Q  90 atggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttc 189  Q
    |||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||  | |||||||||  |||| |||||  || |||| ||||    
T  16079191 atggcaacaaaacccatactcgtggttacccgcccgaagcaaacctaatttgacgagttttttcggttttgactgagtttgggtataagtttgggttttc 16079092  T
Q  190 cccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatg 289  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || |||| ||||||| ||  |||   |||| | |||||||||||| |    
T  16079091 tccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtgcccaccccaaacctatacccaaactcgtcatgaatacagaaaattactttacg 16078992  T
Q  290 ttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16078991 ttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgtta 16078952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 186 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16811811 - 16811662
Alignment:
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactt 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||    
T  16811811 tttccccgatctcaaaacacgggtatgagacggataatgggtatatagatacccac-ccgaacccatacccaaagccgtcccaaatgtaaaaaattactt 16811713  T
Q  286 tatgttgat-ttgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16811712 tatgttgatatattatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaa 16811662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 179 - 335
Target Start/End: Original strand, 25979921 - 25980078
Alignment:
Q  179 tatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaa 278  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||||||| || ||| |||||||| | |  | |||||| ||||||    
T  25979921 tatgggttttccccgatttcaaaacacaggtatgagacgggtaacggatatatatgtacccaccccaaactcatacccaaatcctttccaaatgtaaaaa 25980020  T
Q  279 attactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25980021 attattttatgttgaaatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaa 25980078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 175 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 26623044 - 26622897
Alignment:
Q  175 tgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatata 274  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||  | |||  |    
T  26623044 tgggtttgggttttccctgatttcaaaacacgggtatgggatgggtaatgggtatataagtacccaccccgaacccatacccaaactcgtttcgaatgca 26622945  T
Q  275 aaaaattactttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgt 321  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  26622944 aaaaattattttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgt 26622897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 322
Target Start/End: Original strand, 26004396 - 26004620
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||            ||||| ||||    
T  26004396 taggcatggcaacaaaactcatacccgtggttacccgcccgaaccaaacacaatttgatgggtttttcccgttttgac------------tgggtttggg 26004483  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| |||||||||||||   ||  | ||| |||  | |||||||||    
T  26004484 ttttcctcgatttcaaaacttgggtatgggacgggtaacaggtatatagatacccaccccgaacccatacc--aactcgccccgaatgcagaaaattact 26004581  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtc 322  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26004582 ttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgtc 26004620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Original strand, 27896427 - 27896582
Alignment:
Q  127 accaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgag 226  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | || ||||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27896427 accaaccccaatttgatgggtttttctcgctttgattgggtttgggtatgggtttgggttttcccttatttcaaaacatgggtatgggacgggtaacggg 27896526  T
Q  227 tatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatta 282  Q
      |||| | ||| || |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27896527 gttatatgcaccaaccccgaactcatacccatacccgtcccgaatataaaaaatta 27896582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 202
Target Start/End: Original strand, 44785166 - 44785285
Alignment:
Q  83 actaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatg 182  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  44785166 actaggcatggcaacaaaattcatacatgtggttacccgcccgaatcaaacccaatttgacgagttttccccgttttgactaagtttgggtatgggtatg 44785265  T
Q  183 ggatttccccgatttcaaaa 202  Q
    || |||| ||||| ||||||    
T  44785266 ggttttctccgatctcaaaa 44785285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24425552 - 24425319
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  || ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||        | ||      
T  24425552 ctaggcatggcaacaaaactcatacacgtggttaccagcccgaaccaaacccaatttgacggattttctccgttttgattgggttt--------gaat-- 24425463  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattac 283  Q
      |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||  ||| ||| || ||||||  | ||||||||    
T  24425462 --tttctctgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccctgaccccatttccaaacccgttccaaatgcataaaattac 24425365  T
Q  284 tttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    | ||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| || |||||    
T  24425364 tatatgttgatatgccatgttattctgtttgataattatcgtgtta 24425319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 137 - 282
Target Start/End: Original strand, 8906551 - 8906696
Alignment:
Q  137 atttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagta 236  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| | | ||| ||||||||| || | |||| |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |  |||| |||    
T  8906551 atttgacgggttttctccgctttgattggatttgggtatgggtttgagttttctccgatttcaaaacacgagtatgagacgaataacggggttatatgta 8906650  T
Q  237 cccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatta 282  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  8906651 cccaccccgaacccatatccatacctgttccaaatgtaaaaaatta 8906696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 279
Target Start/End: Original strand, 23533526 - 23533707
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||            ||||| ||||    
T  23533526 taggcatgacaacaaaatccatacccgcgggtaccctcccgaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgatttgac------------tgggtttggg 23533613  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaa 279  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||| || |||||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||||    
T  23533614 ttttccccgatttgaaaatacgggtatgcgatgggtaatg-ggatatatgtacccacttcgaacccatacccaaactcgtcccgaatgtaaaaaa 23533707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 37218188 - 37218016
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| ||||||||  |||| | |||| |||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| || || |    
T  37218188 taggcatgacaacaaaactcataccagcggatacccacccgaaccaaactcaatttgatgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtttgag 37218089  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac-gagtatataagtacccactccgaacccataccc 256  Q
     |||  || |||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  37218088 ttttatcctatttcaaaacacaggtacgggacgggtaacgggggatataagtaccaagcccgaactcataccc 37218016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 137 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33841208 - 33841075
Alignment:
Q  137 atttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagta 236  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||  |||||  | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| |||    
T  33841208 atttgacgggtttttcccgctttgact-ggtttgagtatgaatttgagttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacatggttatatgta 33841110  T
Q  237 cccactccgaacccatacccatacctgtcccaaat 271  Q
    | ||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33841109 ctcaccccgaacccatactcatacccgtcccaaat 33841075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 137 - 286
Target Start/End: Original strand, 5565269 - 5565418
Alignment:
Q  137 atttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagta 236  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| | ||| ||| |||| |||||| |||||||||  |||| ||||||| |||||||| |  |||| |||    
T  5565269 atttgacggattttccccgctttgactggatttggttataggtttgggttttccctgatttcaaagtacggatatgggatgggtaacggggttatatgta 5565368  T
Q  237 cccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattacttt 286  Q
    ||||| || |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||    
T  5565369 cccacccctaacccatacccatacacatcccaaatgtaaaaaattacttt 5565418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 279
Target Start/End: Original strand, 19439932 - 19440114
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||            ||||| || |    
T  19439932 taggcatgtaaacaaaaaccatacccgcgggtaccctctcgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgctttgac------------tgggtttgag 19440019  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaa 279  Q
     |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||    
T  19440020 ttttccctgatttgaaaacacgggtttgggatgggtaatggggatatatgtacccacttcgaacccatacccaaacccgtcccgaatgtaaaaaa 19440114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4101725 - 4101554
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | | ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| | || |||| ||||    
T  4101725 taggcatggcaacaaaatccatacccacagatacccgttcgtaccaaactcaatttgatgggtttttcccgctttgactaggtttggataagggtttggg 4101626  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccc 256  Q
     |||||  ||||||||||||| ||||  ||| |||| ||  | ||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  4101625 ttttccatgatttcaaaacacaggtacaggatgggttacagggatatatgtacccatcctgaacccataccc 4101554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 279
Target Start/End: Original strand, 23475195 - 23475367
Alignment:
Q  95 aacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccga 194  Q
    ||||||| ||||| ||| || |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||            ||| |||||    
T  23475195 aacaaaacccatacccgtggataccctctcgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgctttgactgggtttgggt------------ttttcccga 23475282  T
Q  195 tttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaa 279  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||    
T  23475283 tttcaaaacacgggtttgggatgggtaatggggatatatgtacccacttcgaacccatacccaaacccgtcccgaatgtaaaaaa 23475367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27063517 - 27063346
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||  || || ||| || |||||| ||| ||||||||| |||| |||  ||||||| ||||| ||||||||| | ||    
T  27063517 taggcatggcaacaaaacccgtgcccatggataaccgcccaaaccaaccccgatttgacggatttttcccaatttgactgggtttgggtatgggtctcgg 27063418  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccc 256  Q
     |||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  27063417 ttttccccgatttaataatacgggtacgggacgggtaacgggaatatatgtacccaccccgaactcataccc 27063346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 271
Target Start/End: Original strand, 10995817 - 10995930
Alignment:
Q  157 tttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccc 256  Q
    ||||||||||| | |||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  10995817 tttgacttggtct-ggtatgagtttgggttttccccgatttcaagacacgggtatgggacgggtaacagggttatatatacccaccccgaacccataccc 10995915  T
Q  257 atacctgtcccaaat 271  Q
    ||||| || ||||||    
T  10995916 atacccgttccaaat 10995930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18684091 - 18683985
Alignment:
Q  151 ccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaaccc 250  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||| ||| ||||  |||||||    
T  18684091 ccccgatttgactaggtttgggtatgggttcgggttttccccgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaacagggatatatgtatccacctcgaaccc 18683992  T
Q  251 ataccca 257  Q
    |||||||    
T  18683991 ataccca 18683985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22973505 - 22973399
Alignment:
Q  151 ccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaaccc 250  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||  ||||||||  |||||||    
T  22973505 ccccgatttgactgggtttgggtatgggtttgggttttccacgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaatggggatatctgtacccacctcgaaccc 22973406  T
Q  251 ataccca 257  Q
    |||||||    
T  22973405 ataccca 22973399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 320
Target Start/End: Original strand, 25782856 - 25783053
Alignment:
Q  117 acccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggac 216  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||| |       |||| |||| ||||||  |||||||||||||| |||    
T  25782856 acccgtgcgaaccaaacccgatttgtcggattttctccgttttgattgggtttagtt-------tgggttttctccgattataaaacacgggtatgagac 25782948  T
Q  217 gggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgat 315  Q
    || ||| | ||||||| |||||||| |||||| |||||| | | | ||||| |||  | |||||||||||||||| || | | || ||||||||||||||    
T  25782949 ggataatgggtatataggtacccaccccgaactcataccaaaatccgtcccgaatgcagaaaattactttatgttaatatctcatattattttgtttgat 25783048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 254
Target Start/End: Original strand, 44845113 - 44845214
Alignment:
Q  153 ccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccat 252  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  44845113 ccgttttgactgagttttggtatgggtttgggttttccccgatttcataatacgggtacgggacggttaatgaggatatatttacccaccccgaacccat 44845212  T
Q  253 ac 254  Q
    ||    
T  44845213 ac 44845214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31426119 - 31426019
Alignment:
Q  157 tttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccc 256  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||| |||||||    
T  31426119 tttgactgggttttggtattggtttgggttttccccgatttaaaaatacgggtatgagacgggtaacggggatatatgtatccaccccgaacgcataccc 31426020  T
Q  257 a 257  Q
    |    
T  31426019 a 31426019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27063280 - 27063149
Alignment:
Q  126 aaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacga 225  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||| || || | ||||| ||||||||||| |||||||  |||||| |||||     
T  27063280 aaccaaccccgatttgacggattttccctgatttgactgggtttgggtatgagtttgagttttcctcgatttcaaaatacgggtacaggacggataacgg 27063181  T
Q  226 gtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    | ||||| |||| ||| |||||| ||||||||    
T  27063180 ggatatatgtactcaccccgaactcataccca 27063149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 262
Target Start/End: Original strand, 30839084 - 30839221
Alignment:
Q  126 aaccaaacccaatttgacgggttttcc-ccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 224  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||| || || | |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30839084 aaccaaccccgatttgacgggttttcttccgatttgactgggtttgggtatgagtttgagttttccctgatttcaaaatacgggtatgggacgagtaacg 30839183  T
Q  225 agtatataagtacccactccgaacccatacccatacct 262  Q
     | ||||| ||| | || |||||| ||| |||| ||||    
T  30839184 tggatatatgtatctaccccgaactcatgcccaaacct 30839221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 32546288 - 32546203
Alignment:
Q  172 gtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    |||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32546288 gtatgggtttggatttttcccgatttcaaaatacgggtacggaacgggtaacggggatatatgtacccaccccgaacccataccca 32546203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23457242 - 23457158
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggttt 169  Q
    ||||||||  |||||||  |||| |||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23457242 taggcatgtaaacaaaactcatacccgcgggtaccctctcgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgctttgactgggttt 23457158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 161
Target Start/End: Original strand, 43550339 - 43550415
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttga 161  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||| || |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  43550339 taggcatgacaacaaaactcatatccgtggatacccgtctgaatcaaacctaatttgacgggttttccccattttga 43550415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 328
Target Start/End: Original strand, 46127180 - 46127334
Alignment:
Q  171 ggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaa 270  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||  || |||| |||||||| |||| | ||||| || ||| ||||||||    
T  46127180 ggtatgggtttggggtttccc-gatttaaaatcacgggtatgggacggataacaggtgtataggtacccacaccgatctcatactcaaacccgtcccaaa 46127278  T
Q  271 tataaaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    |  | ||||||| ||||||   || ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  46127279 tgcagaaaattattttatg---atatgtcatgttattttgtttgatcattgtcgtgtta 46127334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 42908003 - 42908106
Alignment:
Q  137 atttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagta 236  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||| | ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||| |||    
T  42908003 atttgacggttttttcccaatttgattgggtttgggtatgagtttgggttttccccgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaatggggatatatgta 42908102  T
Q  237 ccca 240  Q
    ||||    
T  42908103 ccca 42908106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 278
Target Start/End: Original strand, 29855468 - 29855556
Alignment:
Q  190 cccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaa 278  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||| || |||  ||| ||| ||||||||| ||| ||||||    
T  29855468 cccgatttcaaagcacgagtatgggacgggtaatgggcatataagtacccacaccaaactgataaccaaacctgtcccgaatgtaaaaa 29855556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 31000155 - 31000074
Alignment:
Q  88 gcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggttt 169  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||  ||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  31000155 gcatggcaacaaaacccatacccacggacacccgcccaaactaaacccaatttaacgggttttacccgctttgactaggttt 31000074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 5022779 - 5022652
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    ||||||| || |||||||| |||| |||  | |||| || |||||||| ||| ||||||||||||||| | | ||||||| |||| | ||||| || ||     
T  5022779 ctaggcaggggaacaaaattcatacccgtaggtacctgttcgaaccaaccccgatttgacgggttttctctgatttgactaggttca-gtatgagtttga 5022681  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatg 212  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5022680 gttttccccaatttcaaaatacgggtatg 5022652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29157503 - 29157376
Alignment:
Q  116 tacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttc--aaaacacgggtatgg 213  Q
    ||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||  ||||||  ||||| ||||||| | |||  |||||||||||||  || | |||||||||     
T  29157503 tacccgtccaaaccaactccgatttgacgggttttcaccaatttgacagggtttgggtatggttttggattttccccgatttcataatatacgggtatga 29157404  T
Q  214 gacgggtaacgagtatataagtacccac 241  Q
    ||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  29157403 gacgggtaacggggatatatgtatccac 29157376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 222
Target Start/End: Original strand, 10990818 - 10990908
Alignment:
Q  132 acccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 222  Q
    |||||||| ||| |||||||||||  |||| |  ||||  ||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10990818 acccaattagacaggttttccccgccttgaatgagtttgagtatgggttgggtttttccccgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaa 10990908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16811899 - 16811822
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgact 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||  || |||||| || ||||||| ||| ||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  16811899 taggcatggcaacaaaa-ccatactcgtggttactcgcccgaacctaactcaatttgacaggttttctccattttgact 16811822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 29292862 - 29292804
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgac 143  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| | |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  29292862 taggtatggcaacaaaatccatacccgcaggtacccacccgaaccaaacctaatttgac 29292804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 43218400 - 43218294
Alignment:
Q  151 ccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaaccc 250  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| || |  |||  |||||||||||||   ||||| |||| ||| |||||| |    
T  43218400 ccccgatttgactgggtttgggtatgggtttgggttttccccaatttcataatataggtgcgggacgggtaacggcgatatatgtactcaccccgaactc 43218301  T
Q  251 ataccca 257  Q
    |||||||    
T  43218300 ataccca 43218294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28309572 - 28309503
Alignment:
Q  188 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| | || |||||| ||||||||    
T  28309572 tccctgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaacgggaatatatgtatctaccccgaactcataccca 28309503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 42005991 - 42005891
Alignment:
Q  181 tgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaat 280  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||| |||| ||| || || ||||| |||| || ||||||||| ||||||||    
T  42005991 tgggttttcctcaatttcaaaacacgtgtatgggacgggttacggggttatatgtactcac-cccaaaccataaccattcccgtcccaaatgtaaaaaat 42005893  T
Q  281 ta 282  Q
    ||    
T  42005892 ta 42005891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29292797 - 29292749
Alignment:
Q  175 tgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  29292797 tgggtatggattttccccgatttcaaaacacgggtacgagatgggtaac 29292749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 53)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 84 - 335
Target Start/End: Original strand, 29108731 - 29108983
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  29108731 ctagacatggcagcaaaacccataactgcggttactcgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgg 29108830  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattac 283  Q
    | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  29108831 gtttttcccgattttaaaacatgggtatgggacgggtaacgggtatatatgtacccaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattac 29108930  T
Q  284 tttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29108931 tttatgttgatatgtcatattattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 29108983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27932592 - 27932340
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcgg-ttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    |||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27932592 taggcatgacaacaaaactcatacccgcgggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgg 27932493  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattac 283  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||     
T  27932492 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgagtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcatatccgtcccaaatgtaaaaaattat 27932393  T
Q  284 tttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27932392 tttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 27932340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24928127 - 24927876
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24928127 taggcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 24928028  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  24928027 ttttccctgatctcgaaacacgggtatgagacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 24927928  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24927927 ttatgtggatatgttatgttattttgtttgataattgtcatcttaataaaaa 24927876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32303239 - 32302987
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32303239 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaacaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 32303140  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatat-aaaaaattac 283  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||     
T  32303139 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactat 32303040  T
Q  284 tttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32303039 tttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 32302987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 45236243 - 45235992
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |    
T  45236243 taggcatggcaacaaaacccaaacccgcagttacctgtctgagccaaaaccaatttgacgggttttccccgttttgactgagtttgagtatgggtatgag 45236144  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  45236143 ttttccctgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaatgggtatataggtacccaccccgaacccatatccatacccgtcccaaatgtaaaaaattaat 45236044  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45236043 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaa 45235992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 88 - 335
Target Start/End: Original strand, 39445489 - 39445729
Alignment:
Q  88 gcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatt 187  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  39445489 gcatggcaataaaatcaatatccgcggttactcgtccgaaccaaactcaatttgacggattttccccgttttgactaggtttgggtatgggtatgggttt 39445588  T
Q  188 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattacttta 287  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||        |    
T  39445589 ttcccgatttcaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtttataggtacccaccccgaactcatacccatacccgtcccaaatgtaaaaa--------a 39445680  T
Q  288 tgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445681 tgtagatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 39445729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 85 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 1063691 - 1063430
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggt------atggg 178  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||      |||||    
T  1063691 taggcatggcaacaaaactcatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccgatttgacgggttttccccgttttgactgggtgtgggtgtgggtatggg 1063592  T
Q  179 tatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaa 278  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | |  |||||| | ||||||    
T  1063591 tatgggtttttcccgatttcaaaacacgggtatgggacggttaacgggtatataagtacccaccccgaactcatacccaaatccatcccaagtgtaaaaa 1063492  T
Q  279 attactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaattac 339  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1063491 attactttatgttgatatgtcttgttattttgtttgataattgtcatgttgataaaaattac 1063430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Original strand, 11254923 - 11255168
Alignment:
Q  83 actaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatg 182  Q
    |||||||||| |||||||| |||||   ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||       
T  11254923 actaggcatgacaacaaaacccatacatgcggttacctgtccgaaccaaatccaatttgacgggttttttccgttttgactaggtttgggtatgggt--- 11255019  T
Q  183 ggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatta 282  Q
        || |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11255020 ----tttcccgctttccaaacacgggtatgggacggataacaggtatataggtacccactacgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaatta 11255115  T
Q  283 ctttatgttgatttgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11255116 ctttgtgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatattaataaaaa 11255168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 83 - 294
Target Start/End: Original strand, 40248279 - 40248490
Alignment:
Q  83 actaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatg 182  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  40248279 actaggtatgacaacaaaacccatacccgcggttactcgcctgaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtata 40248378  T
Q  183 ggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatta 282  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  40248379 tgttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacggataacgggtatataggtacccatcccgaacccatacccatatccgtcccaaatgtaaaaaatta 40248478  T
Q  283 ctttatgttgat 294  Q
    ||||||||||||    
T  40248479 ctttatgttgat 40248490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 334
Target Start/End: Original strand, 24869934 - 24870184
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| |||||||| ||| | || |||||| |||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||| |||| |    
T  24869934 taggcatgacaacaaaacccacacccacggttatccgctcgaatcaaatccaatttgacgggtttttcccgttttgactgaatttgggtatggctatgag 24870033  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24870034 ttttccccgattttaaaacacgggtatgtgacgggtaacgggtatataggtacccaccccgagcccatacctaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 24870133  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaa 334  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24870134 ttatgttgatatgtcatgttaatttgtttgataattgtcatgttaataaaa 24870184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 93 - 335
Target Start/End: Original strand, 4230648 - 4230880
Alignment:
Q  93 gcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttcccc 192  Q
    |||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4230648 gcaacaaaatccatacatgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgggttttcccc 4230747  T
Q  193 gatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttg 292  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||           ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4230748 gatctcaaaacacaggtatgggacgagtaacgggtatataggt-----------acccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttg 4230836  T
Q  293 at-ttgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4230837 atacattatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 4230880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20399770 - 20399561
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  20399770 taggcatggcaacaaaaccaatacccgtggttacccgctcgaaccaaacccaatttgacgagttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtttggg 20399671  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||  ||||||||| |    
T  20399670 ttttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatagatacccaccccgaacccattcccaaacccgtcccgaatgcaaaaaattatt 20399571  T
Q  285 ttatgttgat 294  Q
    ||||||||||    
T  20399570 ttatgttgat 20399561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17220894 - 17220644
Alignment:
Q  83 actaggcatggcaacaaaatccatatccgcg--gttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggta 180  Q
    |||||||||| |||||||| | ||| |||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||    
T  17220894 actaggcatgacaacaaaacctatacccgcgcggttacccgcacgaaccaaatccaatttgacgggttttccccattttgactgagtttgggtatgggta 17220795  T
Q  181 tgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaat 280  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| || | | |  |||||| |||||||| ||||||     |||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  17220794 tggattttccccgatttcaaaacacgggtatgggatggatgatggttatataggtacccaccccgaac-----cccatacccgtcccaaatgtaaaagat 17220700  T
Q  281 tactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17220699 tactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 17220644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34777238 - 34776993
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||         
T  34777238 taggcatggcaacaaaactcatacccgtgattacccgtccgaaccaaacccaatttaacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgggt----- 34777144  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||  |||| || |||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||| |||||||||| |    
T  34777143 -ttttcccgatctcaaaacacgggtatggaacgagtaacaggtatttaggtacccaccccgaacccatacccaaatccatcccaaatgtaaaaaattatt 34777045  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  34777044 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgcaatgttaataaaaa 34776993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17469424 - 17469197
Alignment:
Q  82 aactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtat 181  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||            
T  17469424 aactaggcatggcaacaaaacccatacccgtagttacccacccgaaccaaacccaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggt-------- 17469333  T
Q  182 gggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatt 281  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| ||| ||||||| |  | |||| |    
T  17469332 ----tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacccaaacccgtcccaactgcagaaaact 17469237  T
Q  282 actttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattg 320  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  17469236 actttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattg 17469197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1012796 - 1012559
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||| |||||| || ||||    
T  1012796 taggcatggcaataaaatccatacccgtggttacccacccgaatcaaacccaatttgacgggttttcctcgttttgattgagtttgggtatgagtttggg 1012697  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaat--ataaaaaatta 282  Q
     |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| |||  | |||||| ||    
T  1012696 ttttccccgattt-aaaacatgagtatgggacgggtaatgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaactcgtcccgaatgcaaaaaaaacta 1012598  T
Q  283 ctttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattg 320  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  1012597 ctttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattg 1012559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 2075744 - 2075995
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2075744 taggcatggcaacaaaactcatatccgtggttacccgcctgaaccaaacccaatttgacggattttctccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 2075843  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatggg-acgggtaacgagtatataagtacccact-ccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatta 282  Q
     ||| |||||| |||||||| |||||||||  ||||    | |||  ||  |||||  | ||   |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  2075844 tttttcccgatctcaaaacatgggtatgggttcggg--gtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaatta 2075941  T
Q  283 ctttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2075942 ctttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 2075995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35215713 - 35215558
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| ||||||  | ||||    
T  35215713 taggcatagcaacaaaacccatatccgtggttacccgtccgacccaaacccaatttgaccggtttttcccgttttgaccgggtttgggtatgattttggg 35215614  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccac 241  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35215613 -ttttcccgatttcaaaacacgggtatgagacgggtaacgagtatataggtacccac 35215558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 328
Target Start/End: Original strand, 43113536 - 43113780
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||  ||||| |  ||||    
T  43113536 taggcatggcaataaaactcatacccgtggttacccacccgaaccaaacccaatttaacgggttttccctgctttgactgggtttgcgtatgagattggg 43113635  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||| | | ||| | |||  | |||| ||||    
T  43113636 tttttcccgatttcaaaacacgggcatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaactcatacccaaatccgtctcgaatgcagaaaactact 43113735  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    | |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  43113736 tcatgttgatatgttatgttattttgttagataattgtcgtgtta 43113780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 122 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 24569078 - 24568881
Alignment:
Q  122 tccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggta 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  24569078 tccgaaccaaacctaatttgacgggttttccccgttt-gattgggtttaggtatgggtatggatttttcccgatttcacaacatgggtatgggacaggta 24568980  T
Q  222 acgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttgtatgttattttgtttgataattg 320  Q
     || ||||||| ||| |||| |||||||||||| || | | ||||| |||  | |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  24568979 gcgggtatataggtatccaccccgaacccatactcaaatccgtcccgaatggagaaaactactttatgttgatatgtcagttattttgtttgataattg 24568881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 229
Target Start/End: Original strand, 5858560 - 5858706
Alignment:
Q  83 actaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatg 182  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||    
T  5858560 actagacatggcaacaaaatccatacctgtggttacctacccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttg 5858659  T
Q  183 ggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtat 229  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5858660 ggtttttcccgatttaaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtat 5858706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 271
Target Start/End: Original strand, 37960872 - 37961058
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| || |||||  ||||||||  |||||||  ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| || ||||    
T  37960872 taggcatgacatcaaaactcatatccgtagttacccacccgaaccgaacctaatttgatgggtttttcccgttttgactaggtttgggtatgagtttggg 37960971  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaat 271  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  37960972 ttttccccgatttaaaaacacgggtatgggacaggtaacaggtatataggtacacaccccgaactcatacccaaacccgtcccaaat 37961058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14155710 - 14155563
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||| || ||||    
T  14155710 taggcgtggcaacaaaatccatatctgcgggcatccgtctgaaccaaacccaatttgacgggttttccccggtatgactgggtttgggtatgagtttggg 14155611  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatata 232  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  14155610 tttttcccgatttcaaaacacgggtataagatgggtaacgaggatata 14155563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 34139580 - 34139381
Alignment:
Q  129 caaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagta 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| || | || |||||||||||| ||||||||| ||| ||||  |||||  |||    
T  34139580 caaacccaatttgacgggttttcctcgttttgactgggtttgggtatgtgt-ttggttttccccgatttaaaaacacggatataggacatgtaacaggta 34139482  T
Q  229 tataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaat-ataaaaaattactttatgttgat-ttgtatgttattttgtttgataattgtcatgt 326  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| |||   |||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||| |||    
T  34139481 tataggtacccaccccgaa-ccatacccaaacccgtcccgaatgcaaaaaaattactttatgttgatagaccatgttattttgtttgataattgtcgtgt 34139383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28345673 - 28345488
Alignment:
Q  83 actaggcatggcaacaaaatccatat--ccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggta 180  Q
    |||||||||||||||||||  |||||  |||||  |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||     
T  28345673 actaggcatggcaacaaaactcatatacccgcgactacccgcccgaaccaaatcctttttgacgggtttttcccgctttgactgggtttcggtataggtt 28345574  T
Q  181 tgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcc 266  Q
    |||  ||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  28345573 tggattttacccgattccaaaacacgggtacaggatgggtaacgaggatataggcacccaccccgaacccatacccaaacttgtcc 28345488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 257
Target Start/End: Original strand, 27777105 - 27777280
Alignment:
Q  82 aactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtat 181  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| |||| | ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || |    
T  27777105 aactaggcatgacaacaaaactcatacccgcaggtacctatccgaaccaaacttaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttgggtatgtgttt 27777204  T
Q  182 gggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac-gagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    | | ||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  27777205 gagtttttcccgatttcaaaacacaggtacgggacaggtaacagag-atacaggtacccaccccgaacccataccca 27777280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 256
Target Start/End: Original strand, 15068498 - 15068668
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||  || |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||  |||    
T  15068498 taggcatggcaacaaaacccgtgcccatgggtacccgcccaaaccaaccccgatttgacgggttttccccgatttgactgggtctgggtatgggttcggg 15068597  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccc 256  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  15068598 ttttccccgatttcaaaatacgggtacgggacaggtaacg-ggatatatgtatccaccccgaacccataccc 15068668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 286
Target Start/End: Original strand, 27056517 - 27056666
Alignment:
Q  137 atttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagta 236  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||||| | ||||||| |||| ||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |  ||||  ||    
T  27056517 atttgacgggttttcctcgctttggctgggtttggttatgggtttgggtttttcccgatttcaaagtacaggtatgggacgggtaacggggttatatcta 27056616  T
Q  237 cccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattacttt 286  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  27056617 cccaccccgaacccatacacatactcgtcccaaatgtaaaaaattacttt 27056666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 280
Target Start/End: Original strand, 8545265 - 8545454
Alignment:
Q  90 atggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttc 189  Q
    |||| |||||||| |||| |||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||| |||||| || |||||  || |||| ||||    
T  8545265 atggtaacaaaatgcatacccgcgggtacctgtccaaaccaaactcaaattgacgg-ttttctccgctttaacttggattgggtataagtttgggttttc 8545363  T
Q  190 cccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaat 280  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||  ||||||| |||||||||||| || ||  ||||||||| || |||||    
T  8545364 tccgatttcaaaacacgggtatggaacgagtaacggggatatagatacccaccccgaacccatactcaaactcgtcccaaatgtagaaaat 8545454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 246 - 335
Target Start/End: Original strand, 28977185 - 28977275
Alignment:
Q  246 aacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28977185 aacccacacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 28977275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 175 - 282
Target Start/End: Original strand, 9642351 - 9642458
Alignment:
Q  175 tgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatata 274  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||  || |||  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  9642351 tgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggggttatatatatccatcccgaacccatactcatacccgtcccaaatgta 9642450  T
Q  275 aaaaatta 282  Q
    ||||||||    
T  9642451 aaaaatta 9642458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14687536 - 14687405
Alignment:
Q  126 aaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacga 225  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| | ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||      
T  14687536 aacctaacccaatttggcgggttttccccactttgattgggtttgggtatggatttgggttttccccgatttcaaaacacaggtatgggacgagaaacag 14687437  T
Q  226 gtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    | ||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  14687436 ggatatatgtatccaccccgaacccataccca 14687405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 252
Target Start/End: Original strand, 29416097 - 29416263
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||  | ||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || ||      
T  29416097 taggcatggcaacaaaattcatactcccgggtacccacccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgagtttgggtatgagtttgac 29416196  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccat 252  Q
     ||| | | |||| |||||||| |||  ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  29416197 tttttctctattt-aaaacacgagtaaaggatgggtaacgaggatatatgtacccaccccgaacccat 29416263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 287
Target Start/End: Original strand, 30481369 - 30481533
Alignment:
Q  123 ccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 222  Q
    |||||||||||| || |||| || ||||||| ||||||| | |||||  ||||| || |||| ||| || |||||||||| ||| ||||| |||| ||||    
T  30481369 ccgaaccaaacctaaattgatggattttccctgttttgattgggtttgagtatgagtttgggtttttcctgatttcaaaatacgagtatgagacgagtaa 30481468  T
Q  223 cgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattacttta 287  Q
     ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||||||| ||||    
T  30481469 tgaggatataggtacccaccccgaacccatacccaaactcgtcccgaatgtaaaaaattaattta 30481533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14186391 - 14186265
Alignment:
Q  192 cgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgtt 291  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||| ||||  ||| || ||||||| ||||||||    
T  14186391 cgatttcaaaacacgggtatgggatgggtaacggatatataggtactcaccctgaacccatacccaaacccgtcctgaatgtagaaaattaatttatgtt 14186292  T
Q  292 gatttg-tatgttattttgtttgataa 317  Q
     || ||  |||||||||||||||||||    
T  14186291 aatatgccatgttattttgtttgataa 14186265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 222
Target Start/End: Original strand, 15173793 - 15173927
Alignment:
Q  88 gcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatt 187  Q
    ||||||||||||||||| |||||  || |||||| || |||||| | | ||||||||||||||| | | ||||||| ||||| |||||| || || | ||    
T  15173793 gcatggcaacaaaatccttatccatgggtacccgcccaaaccaacctcgatttgacgggttttctctgatttgactgggtttgggtatgtgtttgagttt 15173892  T
Q  188 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 222  Q
    | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15173893 ttcccgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaa 15173927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 240
Target Start/End: Original strand, 6388470 - 6388581
Alignment:
Q  129 caaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagta 228  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||  |||| ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| | |    
T  6388470 caaactcaatttgacgggctttctccgttttgactgagtttgggtatgggtttgggtcttccccgattttaaaacacgggtacaagacgggtaacgggga 6388569  T
Q  229 tataagtaccca 240  Q
    |||| |||||||    
T  6388570 tataggtaccca 6388581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 241
Target Start/End: Original strand, 32392293 - 32392452
Alignment:
Q  82 aactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtat 181  Q
    |||||||||||||| |||||   |||   ||||| ||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||| | | ||||| ||||||| | |    
T  32392293 aactaggcatggcagcaaaacttatacatgcggtaacccacccgaaccaaccccaatttgatgggtttttcccgctttaaatgggttttggtatggattt 32392392  T
Q  182 gggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccac 241  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||    
T  32392393 gggtttttctcgatttcaaaacacgagtatgggacagataatgagaatatatgtacccac 32392452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2075915 - 2075863
Alignment:
Q  206 gggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccat 258  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2075915 gggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccat 2075863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 339
Target Start/End: Original strand, 36131838 - 36132080
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||| || ||||  |||||||||             ||||| ||     
T  36131838 ctaggcatgacaacaaaattcatatccgtggttacccacccgaaccaaacctaatttgatggattttttccgttttga------------ttgggtttga 36131925  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattac 283  Q
    | ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| | | ||| | ||| |||| |||||| ||||| || | | ||||| |||  | ||| |||     
T  36131926 gttttcccctatttcaaaacacgagtatgggatgggtaaagggcatacaggtatccaccccgaactcatacacaaatccgtcccgaatgcagaaagttat 36132025  T
Q  284 tttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaattac 339  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  36132026 tttatgtt-atatgtcatgttattttgtttgataattgccgtgtt-ataaaaattac 36132080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 261
Target Start/End: Original strand, 33631921 - 33631985
Alignment:
Q  197 tcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacc 261  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| | | |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33631921 tcaaaacatgggtatgggacgagtaatggggatataagtacccaccccaaacccatacccatacc 33631985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 284 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34021456 - 34021416
Alignment:
Q  284 tttatgttgatttgtatgttattttgtttgataattgtcat 324  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34021456 tttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcat 34021416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 253
Target Start/End: Original strand, 17084061 - 17084185
Alignment:
Q  123 ccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 222  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| | | |||||      |||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  17084061 ccgaaccaaattcaagttgacgggttttccccgctttgactgggttttgatttgggt------tttctccgattttaaaacacgggtacgagacgggtaa 17084154  T
Q  223 cgagtatataagtacccactccgaacccata 253  Q
    || | |||||  ||||||| |||||| ||||    
T  17084155 cggggatatagatacccaccccgaactcata 17084185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 254
Target Start/End: Original strand, 39379581 - 39379658
Alignment:
Q  175 tgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatac 254  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  39379581 tgggtatgggttttccc-gatctcaaaacacgggtacgggacgggtaatgaggataaaagtacccac-ccgaactcatac 39379658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 5700517 - 5700362
Alignment:
Q  90 atggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttc 189  Q
    ||||||||||||||| |  | |||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||            |||     
T  5700517 atggcaacaaaatccttgacagcgggtactcatccgaaccaaacctattttgacgggttttttccgttttgactgggtttaagt------------tttt 5700430  T
Q  190 cccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| | |||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  5700429 cccgatttcaaaacacaggtatgagactggtaacggggatatagatacccacctcgaacccataccca 5700362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29918747 - 29918590
Alignment:
Q  123 ccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 222  Q
    ||||||||||  |||  ||||| ||||| || | ||||||| | ||| |||||| || || | ||| ||||||||||||||||  |||  | ||||||||    
T  29918747 ccgaaccaaattcaaactgacgagtttttcctgctttgactggttttgggtatgagtttgagtttttcccgatttcaaaacacatgtacagaacgggtaa 29918648  T
Q  223 cgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaat 280  Q
    | |  ||||| |||||||| ||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||||||    
T  29918647 caaagatatatgtacccaccccgaaaccatacacaaacccgtcccaaatgtaaaaaat 29918590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10297605 - 10297466
Alignment:
Q  116 tacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatggga 215  Q
    |||||| || |||||| ||  ||||||||||||||||| | ||| | | ||||| | | ||  | |||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  10297605 tacccgcccaaaccaatcctgatttgacgggttttccctgattttattgggtttggatgtgaatttgggttttccccgatttcaaaatacggggacggga 10297506  T
Q  216 cgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacc 255  Q
    | ||||||| | ||||| ||||| || | |||||||||||    
T  10297505 caggtaacggggatatatgtacctaccctgaacccatacc 10297466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 30904123 - 30904052
Alignment:
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |   |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  30904123 tttcctcgatttcaaaacacgggtacgagacgggtaatggagatataagtacccaccccatacccataccca 30904052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 29089954 - 29089888
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggtttt 150  Q
    |||||||||||||||||  ||||||    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29089954 ctaggcatggcaacaaagcccatatttatggttacccacccgaatcaaacccaatttgacgggtttt 29089888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 282
Target Start/End: Original strand, 9476027 - 9476120
Alignment:
Q  189 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatta 282  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||  |||||| | |||||| |||||||  |||||||||||||| |||  |||| ||| || |||||||    
T  9476027 ccccgatttcaaaaaacggatacgggacaagtaacggggatataaatacccacctcgaacccatacccaaacccatcccgaatgtagaaaatta 9476120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 210
Target Start/End: Original strand, 12468171 - 12468254
Alignment:
Q  125 gaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggta 210  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||  |||||  | |||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  12468171 gaaccaaacccaatttgatggg-tttctccgttttgac-tggtttgagtatgaatttgggttttcctcgatttcgaaacacgggta 12468254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 131
Target Start/End: Original strand, 11880725 - 11880773
Alignment:
Q  83 actaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||    
T  11880725 actaggcatggcaacaaaatccatgtccacggatacccgcccaaaccaa 11880773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 131
Target Start/End: Original strand, 11898141 - 11898189
Alignment:
Q  83 actaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| || ||||||    
T  11898141 actaggcatggcaacaaaatccatgtccacggatacccgcccaaaccaa 11898189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 37106871 - 37106627
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  37106871 taggcatgacaacaaaactcatactcgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgagtttgggtatgggtatggg 37106772  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||      ||||||||| ||||||||||||    
T  37106771 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccactccgaacccataccc------gtcccaaatgtaaaaaattact 37106678  T
Q  285 ttatgttgatttgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106677 ttatgttgatatatatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 37106627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30847125 - 30846873
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30847125 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 30847026  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatat-aaaaaattac 283  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| | | |||||| |||    
T  30847025 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaattgtaaaaaaactac 30846926  T
Q  284 tttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30846925 tttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 30846873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13830914 - 13830664
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||| ||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13830914 taggtatgacaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatggg 13830815  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  13830814 ttttcctcgatctcaaaacacgggtatgggac-ggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatactcaaacctgtcccaaatgtaaaaaattact 13830716  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13830715 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgtaaataaaaa 13830664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 89 - 335
Target Start/End: Original strand, 24414046 - 24414293
Alignment:
Q  89 catggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggattt 188  Q
    ||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||    
T  24414046 catggcaacaaaacccatacctgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtatcggtttt 24414145  T
Q  189 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttat 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24414146 ccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactactttat 24414245  T
Q  289 gttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24414246 gttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 24414293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 36128016 - 36128268
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  36128016 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttactcgtccgaaccaaacctaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgtg 36128115  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatat-aaaaaattac 283  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||    
T  36128116 gtttccccgatctcgaaacacgggtatgggatgggtaacgggtatataggtactcaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactac 36128215  T
Q  284 tttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36128216 tttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 36128268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9632565 - 9632314
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||  |||||||||||||    
T  9632565 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgaatgggtttgagtatgggtatggg 9632466  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  9632465 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaatgggtatataggtatccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 9632366  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9632365 ttatgttgatatgttatgttatttttttttataattgtcatgttaataaaaa 9632314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 37999656 - 37999411
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||| |||      |||||||||||    
T  37999656 taggcatggcaacaaaacccatatccgtggttagtcgcccgaaccaaattcaatttgacgggtttcccccattttgactgggt------atgggtatggg 37999563  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  37999562 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgagacgggtaacgggtatataagtacccaccccgaactcatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 37999463  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37999462 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 37999411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 13705265 - 13705522
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggta------tggg 178  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||      ||||    
T  13705265 taggcatggcaacaaaactcatacccatggttacccgtccgaaccatacccaatttgacgggttttccccgttttgacagggtttgggtatgggtatggg 13705364  T
Q  179 tatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaa 278  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| | ||||    
T  13705365 tatgagttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacctaaacccgtcccaaatgtgaaaa 13705464  T
Q  279 attactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13705465 attactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 13705522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 110 - 335
Target Start/End: Original strand, 7314583 - 7314809
Alignment:
Q  110 cgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggt 209  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||    
T  7314583 cgcggttaaccgcccgaaccaaactcaatttgacggattttccccgttttgactgggtttggatatgggtatgggttttccccgattttaaaatacgagt 7314682  T
Q  210 atgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttgt-atgttatttt 308  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7314683 atgggacgggtaacgggtatataggttcccaccccgaacccatacccacacccgtcccaaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttatttt 7314782  T
Q  309 gtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    
T  7314783 gtttgataaatatcatgttaataaaaa 7314809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 84 - 335
Target Start/End: Original strand, 12193735 - 12193988
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcg-gttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatg 182  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||| |||||    
T  12193735 ctaggcatggcaacaaaaaccatacccgcgcgttacccacccgagccaaacccaatttgacgggtttttccgattttgactgggtttgggtatgagtatg 12193834  T
Q  183 ggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatta 282  Q
     | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||  |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12193835 tgtttttcccgatttcagaacacgggtatgggacgggtaatgggtatatagatacccacctcgaatccatatccatacccgtcccaaatgtaaaaaatta 12193934  T
Q  283 ctttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12193935 ctttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaa 12193988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 10208341 - 10208591
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| | ||| ||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10208341 taggcatggcaacaaaactcatacccgtgattatccgcccgaaccaaagttaatttgacgg-ttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 10208439  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| || |||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10208440 ttttccccaatcttaaaacacgggtatgggacgggtaatggatatataggtacctaccccgaacccatactcaaaccagtcccaaatgtaaaaaattact 10208539  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10208540 ttatgttaatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 10208591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10920817 - 10920573
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  10920817 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgataggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgga 10920718  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||  ||||| |||||||||| |||||||||||        |||||| ||| |||| ||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||    
T  10920717 ttttttccgatctcaaaacacgagtatgggacgg-------atatataggtatccaccccgaacccatacccaaatccgtcccaaatgtaaaaaattact 10920625  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10920624 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 10920573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 98 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 45115726 - 45115486
Alignment:
Q  98 aaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatggg--tatgggatttccccgat 195  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| | ||||| ||||    
T  45115726 aaaacccatacccgcggttacttgtccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatatgagttttcctcgat 45115627  T
Q  196 ttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatt 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||   | |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  45115626 ttcaaaacacgggtatgagacgggtaacaggtatataggtacccatcccgaacccatagttaaacccatcccaaatgtaaaaaattacattatgttgata 45115527  T
Q  296 tgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45115526 tgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 45115486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 88 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 45256999 - 45256747
Alignment:
Q  88 gcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatt 187  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||  |||| |||||||| |  |||| | || |||| |||||||||||| ||| | | |||| ||||| | ||    
T  45256999 gcatgacaacaaaatccatatctgtggttagtcgtctgaaccaaatcagatttaatggatttttcccgttttgactgggtgtggatatgagtatgagttt 45256900  T
Q  188 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattacttta 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  45256899 tccccgatttcaaaacacgggtatgagacggttaatgggtatataagtacccaccccgaacccatacctaaacccgtcccaaatgtaaaaaattacttta 45256800  T
Q  288 tgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaattac 339  Q
    | ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45256799 ttttgatatgtcttgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaattac 45256747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 8915848 - 8916098
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||| |||||||||||| ||||| | | ||||| ||| || || ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| | ||||||||||||    
T  8915848 taggtatggcaacaaaacccatacctgtggttatccgcccaaatcaaattcaatttgacggatttttcccgttttgactgagtttggatatgggtatggg 8915947  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| |    
T  8915948 ttttctc-gatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattatt 8916046  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8916047 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 8916098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 89 - 256
Target Start/End: Original strand, 37472673 - 37472840
Alignment:
Q  89 catggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggattt 188  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  |||    
T  37472673 catggtaacaaaacccatacccgcagttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtatggatttt 37472772  T
Q  189 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  37472773 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatttaggtacccacttcgaacccataccc 37472840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 84 - 335
Target Start/End: Original strand, 42797910 - 42798150
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||  |||||| |        
T  42797910 ctaggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaatctaatttgacgggtttttct-gttttgactgggtttgagtatggat---- 42798004  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatat-aaaaaatta 282  Q
      |||||||      |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||    
T  42798005 --tttcccc------aaaacacgggtatgagacgggtaacgggtatataagtacccaccccgaacccatacacaaacctgtcccaaatgtaaaaaaatta 42798096  T
Q  283 ctttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42798097 ctttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 42798150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 335
Target Start/End: Original strand, 44746023 - 44746270
Alignment:
Q  89 catggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggattt 188  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| | |||| |||    
T  44746023 catggcaacaaaactcatatccacggttacccacccgtaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgattgagtttgggtatggatttgggtttt 44746122  T
Q  189 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttat 288  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||| ||||||||| | ||| ||||| || ||| ||||||||| || ||||| |||||||    
T  44746123 ccccgatttcaaaacacgaatatgggacgggtaatgggtatatatgtacccacttcaaactcatactcaaacccgtcccaaatgtagaaaatcactttat 44746222  T
Q  289 gttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
     ||||| ||  |||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||    
T  44746223 cttgatatgccatgttattttatttgatcattgtaatggttataaaaa 44746270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 328
Target Start/End: Original strand, 31942092 - 31942340
Alignment:
Q  82 aactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtat 181  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| | ||||||| |    
T  31942092 aactaggtatgacaacaaaacccatacccgtggttacccgcccaaaccaaactcaatttgatgggtttttcccgctttgactgggtttggatatgggttt 31942191  T
Q  182 gggatttccccgatttc-aaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaat 280  Q
    ||| | ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| |||||  | ||||     
T  31942192 gggttatcctcgatttcaaaaacacgggtatgagacgggtaacaggtatataagtacccaccccaaacccataaccaaacctgtcacaaatgcagaaaac 31942291  T
Q  281 tactttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31942292 tactttatgctgatatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgtta 31942340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12341779 - 12341648
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  12341779 taggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgagtttgggtatgggtatggg 12341680  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggac 216  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12341679 ttttccccgatttcaaaacacaggtatgggac 12341648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 328
Target Start/End: Original strand, 6027811 - 6028043
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| |||||||| |||||  || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||               
T  6027811 taggcatgacaacaaaacccatactcgtggttatccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgattgggtttgggt----------- 6027899  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||  | |||| || |    
T  6027900 -tttccccgattttaaaacatgggtatgagacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatactcatacccgtcctgaatgcagaaaagtatt 6027998  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    ||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6027999 ttatgttgataagccatgttattttgtttgataattgtcgtgtta 6028043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22900942 - 22900776
Alignment:
Q  116 tacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatggga 215  Q
    |||||| || |||| | ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22900942 tacccgccctaacccatcccgatttgacgggttttcctcactttgacttggtctgggtatgggtttgggtttttcccgatttcaaaacacgggtatggga 22900843  T
Q  216 cgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatta 282  Q
    || |||||| |  ||||  ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  22900842 cgagtaacggggttatatatacccaccccgaactcatacccatacccgtcccaaacgtaaaaaatta 22900776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 186 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14540859 - 14540716
Alignment:
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||| || | | ||||| ||  || ||||||||||    
T  14540859 tttccccgatttcaaaacacgggtatgagacaggtaacgggtatataggcacccactcggaatccatactcaaatccgtcccgaacgtagaaaattactt 14540760  T
Q  286 tatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14540759 tatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcgtgtta 14540716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 320
Target Start/End: Original strand, 19104747 - 19104987
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| | |||   | |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||| |||||| || ||||    
T  19104747 taggcatggcaacaaaacctatacatgtggttaccaatccgaatcaaacccaatttgatgggttttttccgttttgattgggtttgggtatgagtttggg 19104846  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgg----gtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaat 280  Q
     ||||||||||||| ||||||||    |||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||  |||| |||||| || ||| ||||| |||  | |||||    
T  19104847 ttttccccgatttccaaacacgggcctgtatgggatgtgtaacgggtatataggtatccacctcgaatccatactcaaacccgtcccgaatgcagaaaat 19104946  T
Q  281 tactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattg 320  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||    
T  19104947 tactttatgttgacgtgtcatgttattttgtttaataattg 19104987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 85
Target Start/End: Original strand, 41525312 - 41525390
Alignment:
Q  8 tatgaaggaggttatttggagtaaaagaaaa-aacaatactagagttttggccattttttgttttaagagaatgcaact 85  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525312 tatgaaggaggttatttggagtaagagaaaaaaacaatactagagttttggccattttttgttttaagagaatgcaact 41525390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 137 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15546871 - 15546726
Alignment:
Q  137 atttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagta 236  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| | | | || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||  ||    
T  15546871 atttgacgagttttccccgctttgactggatctgggcatgggtttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacatggttatatata 15546772  T
Q  237 cccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatta 282  Q
    ||||| | |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  15546771 cccaccctgaacccatacccatacccttcccaaatgtaaaaaatta 15546726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 211
Target Start/End: Original strand, 18106029 - 18106155
Alignment:
Q  86 aggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaattt-gacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||| ||||||||  |||||  | ||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  18106029 aggcatgacaacaaaactcatatatgtggttacccgcccgaatcaaactcaattttgacggattttccccgttttgactgggtttggatatgggtatggg 18106128  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtat 211  Q
     |||||||||| |||||||||||||||    
T  18106129 ttttccccgatctcaaaacacgggtat 18106155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 137 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14331648 - 14331534
Alignment:
Q  137 atttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagta 236  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||      ||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  14331648 atttgacgggttttccccggtttgactaggtttgggtatgggt------tttcccctatttaaaaatacaggtatgggacgggtaacggggatatatgta 14331555  T
Q  237 cccactccgaacccataccca 257  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  14331554 cccactccgaacccataccca 14331534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 35248336 - 35248476
Alignment:
Q  126 aaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacga 225  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |  ||||| |  |||| |||| |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |     
T  35248336 aaccaaacccattttgatgggttttcctcactttgattgagtttgggtacgggtttgggttttccacgattacaaaacacgggtatgggacgggtaaagg 35248435  T
Q  226 gtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcc 266  Q
    | ||| | |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  35248436 ggataaaggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcc 35248476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 256
Target Start/End: Original strand, 24051534 - 24051705
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  || |||| | || || |||  || |||||| || ||||| ||| ||| | | ||||| ||||||||| ||||    
T  24051534 taggcatggcaacaaaatccatgtccatgggtacctgcccaaatcaactccgatttgatggattttctccgatttaattgggtttgggtatgggtttggg 24051633  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccc 256  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  | ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  24051634 atttctccgattttaaaatacgagtatgggacgggtaacagggatatatgtacctaccccgaacccataccc 24051705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 247 - 335
Target Start/End: Original strand, 18106162 - 18106251
Alignment:
Q  247 acccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgat-ttgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106162 acccatacccgaacctgttccaaatgtaaaaaattattttatgttgatacattatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 18106251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25214020 - 25213945
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttg 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25214020 taggcatggcaacaaaacccatatccacgggtacccacccgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgctttg 25213945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10212533 - 10212393
Alignment:
Q  137 atttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagta 236  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| |  |||  ||     
T  10212533 atttgacgagtttttcctgttttgactgggttttggtatgagtttgggttttccccgatttccaaacacggttacgggacaggtaacggggttatgtgtg 10212434  T
Q  237 cccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaa 278  Q
     |||| || ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  10212433 accac-cccaacccatacccttacccgtcccgaatataaaaa 10212393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25210451 - 25210386
Alignment:
Q  190 cccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacc 255  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  25210451 cccgactttaaaacacgggtatgggacgggtaacgaggatatatgtacccaccccaaacccatacc 25210386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 257
Target Start/End: Original strand, 38342517 - 38342601
Alignment:
Q  173 tatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    ||||||| || | |||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  38342517 tatgggtttgagttttccccgattttaaaatacggatacgggacgggtaacggggatatatgtacccaccccgaacccataccca 38342601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 335
Target Start/End: Original strand, 37472851 - 37472890
Alignment:
Q  296 tgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37472851 tgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 37472890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 35965412 - 35965319
Alignment:
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaat 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | |||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| || |||||    
T  35965412 tttccccgatttcaaaacacgggtatgg-atgtgtaatggggatacatgtacccactccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgtagaaaat 35965319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 43371660 - 43371560
Alignment:
Q  157 tttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccc 256  Q
    |||||||  |||| ||||| ||| || | |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  43371660 tttgactgagtttgggtattggtttgagttttccccgattttaaaatacgggtacgggacgggtaacggggatatatgtacccaccccaaactcataccc 43371561  T
Q  257 a 257  Q
    |    
T  43371560 a 43371560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 223
Target Start/End: Original strand, 40734533 - 40734632
Alignment:
Q  124 cgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||||  | |||| ||||  ||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  40734533 cgaaccaaattcaatttgacgggttttatccgctttgatttggtttgggtatgaatttgggttttcagcgattttcaaacacgggtatgagacgggtaac 40734632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3547239 - 3547177
Alignment:
Q  191 ccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccata 253  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||| |||||||| |||||||||||    
T  3547239 ccgatttcaaaatacgggtacgggacgggtaacggagatatatgtacccaccccgaacccata 3547177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26755878 - 26755764
Alignment:
Q  126 aaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacga 225  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||| || |||| ||||  |||||| |||| | |||||| |||||  |||||     
T  26755878 aaccaaccccgatttgacgggtttttcccgatttgactgggtttgggtatgagtttgggttttcttcgattttaaaatatgggtatcggacgattaacgg 26755779  T
Q  226 gtatataagtaccca 240  Q
    | ||||| |||||||    
T  26755778 ggatatatgtaccca 26755764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44058021 - 44057889
Alignment:
Q  126 aaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacga 225  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||  ||  ||||||| ||||| |||| | || |||  |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||| |     
T  44058021 aaccaaccccgatttgacgagttttttccaatttgactgggtttgggtacgagtttggattttccctgatttcaaaataccggtacgggacgggtaatgg 44057922  T
Q  226 gtatataagtaccca-ctccgaacccataccca 257  Q
    | ||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  44057921 ggatatatgtacccacccccgaacccataccca 44057889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 255
Target Start/End: Original strand, 6164472 - 6164553
Alignment:
Q  174 atgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacc 255  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||   ||||| |||||||||||||   ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  6164472 atgggtttgggttttccccaatttcaaaatttgggtacgggacgggtaacggtgatatatgtacccaccccgaactcatacc 6164553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13954920 - 13954769
Alignment:
Q  89 catggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggattt 188  Q
    |||||||||||||   ||| |||||  ||||||  | |||||||| ||| ||||| |||||||  || ||||||| ||||| |||||| || ||   |||    
T  13954920 catggcaacaaaactaatacccgcgaatacccgctctaaccaaacgcaaattgacaggttttctacgctttgactgggtttgggtatgtgtttgaatttt 13954821  T
Q  189 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccac 241  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| || |||| ||| |||||    
T  13954820 ccccgattttaaaacac-ggtacgggacaggtaacaaggatattagtgcccac 13954769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14096127 - 14095976
Alignment:
Q  89 catggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggattt 188  Q
    |||||||||||||   ||| |||||  ||||||  | |||||||| ||| ||||| |||||||  || ||||||| ||||| |||||| || ||   |||    
T  14096127 catggcaacaaaactaatacccgcgaatacccgctctaaccaaacgcaaattgacaggttttctacgctttgactgggtttgggtatgtgtttgaatttt 14096028  T
Q  189 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccac 241  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| || |||| ||| |||||    
T  14096027 ccccgattttaaaacac-ggtacgggacaggtaacaaggatattagtgcccac 14095976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 237
Target Start/End: Original strand, 16226759 - 16226799
Alignment:
Q  197 tcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtac 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16226759 tcaaaacaagggtatgggacgggtaacgggtatataggtac 16226799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 328
Target Start/End: Original strand, 16226833 - 16226881
Alignment:
Q  281 tactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16226833 tacttcatgttgatttgtcatgttattttatttgataattgtcgtgtta 16226881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18485737 - 18485641
Alignment:
Q  175 tgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaat 271  Q
    ||||| |||| | ||| |||||| |||| |||||||  | |||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||  |||||||    
T  18485737 tgggtttgggttatcctcgattttaaaatacgggtacagtacgggtaacggggatatatgtacccaccctgaacccatacccaaaccttacccaaat 18485641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33175307 - 33175251
Alignment:
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccact 242  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||||| |||||||||    
T  33175307 tttctccgattttaaaacacgggtacgggtcgggtagcgtgtatataggtacccact 33175251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 80)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 84 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 39047137 - 39046886
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||  ||||||||||||    
T  39047137 ctaggcatggcaacaaaacctatatccacggttacccgtccgaatcaaacccaatttgatgggttttctccgttttgactgaatttgagtatgggtatgg 39047038  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattac 283  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  39047037 gttttccccaatttccaaacacgggtatgggacatgtaacgggtatataggtacccactccaaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattac 39046938  T
Q  284 tttatgttgatttgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39046937 tttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 39046886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31752640 - 31752389
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  31752640 taggcatgacaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaatcaaatccaatttgacgggtttttaccgttttgattgggtttggatatgggtatggg 31752541  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31752540 ttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacgagtaacgagtatataggttcccaccccgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattact 31752441  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31752440 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 31752389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 48459667 - 48459414
Alignment:
Q  83 actaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatg 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| | | |||  |||||| ||||    
T  48459667 actaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaatcaaaccaaatttgatgggtttttcccattttgattggatttgagtatggatatg 48459568  T
Q  183 ggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatta 282  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  48459567 ggttttccccgatttcaaaacatgggtatggaacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatacccatacccatcccaaatgtaaaaaatta 48459468  T
Q  283 ctttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48459467 ctttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 48459414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11028257 - 11028005
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  11028257 taggcatggcaacaaaacccatacacgtggttacccacccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccgttttgactggatttgggtatgggtatggg 11028158  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatat-aaaaaattac 283  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  11028157 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaactcatacccaaacctgtcccaaatgtaaaaaaattac 11028058  T
Q  284 tttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11028057 tttatattgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 11028005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 43893411 - 43893161
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43893411 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgagccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 43893312  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  43893311 -tttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtatccaccccgaattcatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 43893213  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43893212 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 43893161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 84 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 44317720 - 44317467
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44317720 ctaggcaaggcaacaaaacccatacccgtggttactcgcccgaatcaaacccaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgg 44317621  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatat-aaaaaatta 282  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||    
T  44317620 gttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaacta 44317521  T
Q  283 ctttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44317520 ctttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 44317467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 6382183 - 6382435
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6382183 taggcatggcaataaaacccatacccgtggttacccgcccgaatcaaacccaatttgacgggttttccccgctttgactgggtttgggtatgggtatggg 6382282  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatat-aaaaaattac 283  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||     
T  6382283 ttttctccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactat 6382382  T
Q  284 tttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6382383 tttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 6382435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 84 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7609155 - 7608903
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  7609155 ctagacatggcaacaaaacccatactcgtggttacccacccgaactaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactggatttgggtatgggtatgg 7609056  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattac 283  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||    
T  7609055 gttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactac 7608956  T
Q  284 tttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7608955 tctatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 7608903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 31918469 - 31918721
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  31918469 taggcatggcaacaaaacccatatccgtggttacctgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtatggg 31918568  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatat-aaaaaattac 283  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||    
T  31918569 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgagtaatgggtatatagttacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactac 31918668  T
Q  284 tttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31918669 tttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 31918721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 5902531 - 5902776
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||         
T  5902531 taggcatggcaacaaaacctatacccgtggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggt----- 5902625  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  5902626 -tttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 5902724  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5902725 ttatgttgatatgttatcttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 5902776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 55826534 - 55826786
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||| |||||||    
T  55826534 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgtccgaaccaaatccaatttgacggattttccctgttttgactgggtttggatatgagtatggg 55826633  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatat-aaaaaattac 283  Q
     |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| | |||||| |||    
T  55826634 ttttccccgatctcgaaacacaggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatatccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactac 55826733  T
Q  284 tttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55826734 tttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcacgttaataaaaa 55826786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 47550264 - 47550515
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||| ||||||| |||||   | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  47550264 taggcatggaaacaaaacccatacatgtggttacccgcccgaaccaaactcaatttggcggattttccccattttgactgggtttgggtataggtatgag 47550363  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |    
T  47550364 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattatt 47550463  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47550464 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 47550515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 80 - 335
Target Start/End: Original strand, 11122775 - 11123031
Alignment:
Q  80 gcaactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggt 179  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
T  11122775 gcaattaggcatggcaacaaaactcatacccgtggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacggattttttccgttttgactgagtttgggtatgggt 11122874  T
Q  180 atgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaa 279  Q
    ||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||    
T  11122875 atgggttttctccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaa 11122974  T
Q  280 ttactttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
     |||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11122975 ctactttatgttgatatgttttgttattttgttttataattgtcatgttaataaaaa 11123031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21424045 - 21423794
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21424045 taggcatggcaataaaactcatacccgtggttacccgcccgaaccaaatccaatttgacggatttttcccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 21423946  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||| || ||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  21423945 ttttccccaatctcgaaacacgggtatgagacgggtaacgggtatataggtacccaccccaaacccatacacaaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 21423846  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21423845 ttatgttgatatgttatattattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 21423794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 42299972 - 42299724
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||     
T  42299972 taggcatgacaacaaaattcatatatgcggttacccatccgaaccaaactcaatttgacgggttttttccggtttgactgagtttaggtatgggtatgga 42299873  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||| || ||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  42299872 ttttccccgatttcaaaacac-ggtat-ggacgggtaacgggtatataggtacccaccctgaacccatactcaaacacgtcccaaatat-aaaaagtact 42299776  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42299775 ttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcttgttaataaaaa 42299724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 88 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32585664 - 32585422
Alignment:
Q  88 gcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatt 187  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |      ||    
T  32585664 gcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccgcccaaaccaaacccaatttgaccggttttcccctttttgactgggtttgggtatgaat------tt 32585571  T
Q  188 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattacttta 287  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  32585570 tctccgatttcaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccctgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaacttacttta 32585471  T
Q  288 tgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32585470 tgtttatatgtcttgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 32585422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 282
Target Start/End: Original strand, 15987173 - 15987370
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||||||||| |    
T  15987173 taggcatggcaacaaaacccacattcgcggttacccacccgaaccaaacccaatttgacgggttttctccattttgattgggtttgggtatgggtatgag 15987272  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatta 282  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15987273 ttttcccagattttaaaacacgggtatgggatgggtaacgggtatatagatacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatataaaaaatta 15987370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 85 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26565015 - 26564782
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||| || || |    
T  26565015 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccacccgaaccaaatccaatttgacggattttcttcgttttgactgggtttgggtatgagtttgag 26564916  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||  | |||| ||||    
T  26564915 ctttccccgatttcaaaacgcgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaaaccatacccaaacccgtcccaaatgcagaaaactact 26564816  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataa 317  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  26564815 ttatgttgatatgtcatgttagtttgtttgataa 26564782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 173 - 335
Target Start/End: Original strand, 47239384 - 47239547
Alignment:
Q  173 tatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaata 272  Q
    |||||||||||  |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  47239384 tatgggtatggattttttccgattttaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggttcccaccctgaacccatacccatacctgtcccaaatg 47239483  T
Q  273 taaaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47239484 taaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 47239547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 89 - 328
Target Start/End: Original strand, 6481950 - 6482191
Alignment:
Q  89 catggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggattt 188  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||| | ||||| ||||||||| |||| |||    
T  6481950 catggcaacaaaacctatacccgtggttatccacccgaatcaaactcaatttgacggattttctctgttttgattgggtttgggtatgggtttgggtttt 6482049  T
Q  189 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaat-ataaaaaattacttta 287  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||| || ||||    
T  6482050 ccccaatttaaaaacacgggtatgggacgagtaaagggtatatatgtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgcaaaaaaactaattta 6482149  T
Q  288 tgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6482150 tattgatatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgtta 6482191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 37349296 - 37349072
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || || |    
T  37349296 taggcatggcaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacaggttttccccgttttgactgggtttgggtatgagtttgag 37349197  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||||||||||||||           ||||| | ||||||| ||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||  | ||||||| |    
T  37349196 ttttccccgatttcaaaacacg-----------ggtaatgggtatataggtatccaccctgaacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaattatt 37349108  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataatt 319  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  37349107 ttatgttgatatgccatgttattttgtttgataatt 37349072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 171 - 320
Target Start/End: Original strand, 1724307 - 1724457
Alignment:
Q  171 ggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaa 270  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  1724307 ggtatgggtttgggttttccccgatttcaaaacatgggtatgggacgggtaacggttatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccgaa 1724406  T
Q  271 tataaaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattg 320  Q
    |  | |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1724407 tgcagaaaactactttatgttgatatgtcatgttattttgttagataattg 1724457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 84 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19534634 - 19534395
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||| |||||| ||        
T  19534634 ctaggcatggcaaaaaaaccaatatccgtgattacctgtccaaaccaaatccaatttgacgggttttctccgttttcattgggtttgggtatgagt---- 19534539  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattac 283  Q
      |||| ||||||| ||||   ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||| |||||||| ||| ||| | ||| || |||||||     
T  19534538 --tttctccgattttaaaatctgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccacctcgaactcatacccaaacccgtcacgaatgtagaaaattat 19534441  T
Q  284 tttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19534440 tttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcgtgtta 19534395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 137 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10302216 - 10302067
Alignment:
Q  137 atttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagta 236  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |  |||| |||    
T  10302216 atttgatgggttttccccgttttgattgggtttgggtatgggtttaggttttccccgatttcaaagtacgggtatgagacgggtaacggggttatatgta 10302117  T
Q  237 cccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattacttt 286  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  10302116 cccaccccgaacccatacccatatccgtcccaaatgtaaaaaattacttt 10302067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37107543 - 37107351
Alignment:
Q  136 aatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagt 235  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||  ||||| || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  37107543 aatttgacgggtttttcccattttgactgggtttgtgtatgagtttgggttttccca-atttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggt 37107445  T
Q  236 acccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    |||||| |||||   ||||| | |  | |||| |||  | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37107444 acccaccccgaatttataccaaaatatatcccgaatgcagaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgccatgtta 37107351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 181 - 328
Target Start/End: Original strand, 12825468 - 12825616
Alignment:
Q  181 tgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaat 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| | |  | |||||    
T  12825468 tgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggatatatacgtacccaccctgaacctatacccaaacctgtcccgagtgcagaaaat 12825567  T
Q  281 tactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12825568 tactttatgttgatatatcatgttattttgtttgataattatcgtgtta 12825616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 254
Target Start/End: Original strand, 19882967 - 19883136
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||  ||||| || ||||    
T  19882967 taggcatggcaacaaaacccatactcgcgaatacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgctttgattgggtttgagtatgagtttggg 19883066  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatac 254  Q
     |||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||| | ||||| ||| |||| ||||||| ||||    
T  19883067 ttttccccgattttaaaacacggatacgggaagggtaacggggatataggtatccaccccgaaccgatac 19883136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 138 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43309614 - 43309472
Alignment:
Q  138 tttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtac 237  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||  ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| || |    
T  43309614 tttgacgggttttctccgctttgactgggtttgagtatgagtttgggtttttcccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggggttatatgtgc 43309515  T
Q  238 ccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatta 282  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43309514 ccact--gaacccatacccatacctgtctcaaatgtaaaaaatta 43309472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 125 - 328
Target Start/End: Original strand, 7985076 - 7985276
Alignment:
Q  125 gaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||  || |||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  7985076 gaaccaaacccaatttgacgggttttcctggttttgattgggtttgggtataagtttggattttctccgatttcaaaacatgggtatgggacggataac- 7985174  T
Q  225 agtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtca 323  Q
       || || |||| ||  ||||||||||||||| ||| ||||| |||  | |||| || |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||     
T  7985175 ---atgtatgtactcatcccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaagtattttatgttgataagtcatgttattttgtttgataattgtcg 7985271  T
Q  324 tgtta 328  Q
    |||||    
T  7985272 tgtta 7985276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 39375434 - 39375227
Alignment:
Q  113 ggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatg 212  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||  |||| | |||| || |||  ||||||||||||||||| ||||||||     
T  39375434 ggttacccgcccgaaccaaattcaatttgacgggtttttcctattttgactgagtttggatatgagtttggcttttccccgatttcaaaatacgggtata 39375335  T
Q  213 ggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaat-ataaaaaattactttatgttgatttgtatgttattttgtt 311  Q
    |||||||||||| |||||||  || |||| || | | ||||| || ||| ||||||| |   |||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||    
T  39375334 ggacgggtaacgggtatatagatatccaccccaatcacatactcaaacccgtcccaattgcaaaaaaattactttacgttgatgt-catgttattttgtt 39375236  T
Q  312 tgataattg 320  Q
    |||||||||    
T  39375235 tgataattg 39375227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3737908 - 3737789
Alignment:
Q  137 atttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagta 236  Q
    ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| |||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||    
T  3737908 atttgacggattttttccgctttgacttggtttaggtgtgggttagggtttttcccaatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgaggttatatgta 3737809  T
Q  237 cccactccgaacccataccc 256  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  3737808 cccatcccgaacccataccc 3737789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 186 - 328
Target Start/End: Original strand, 32596196 - 32596339
Alignment:
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  | ||| |||||||| || |||| | ||| || ||||||| ||    
T  32596196 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtccccacctcaaactcatacccaaacttgtctcgaatgtagaaaattattt 32596295  T
Q  286 tatgttgat-ttgtatgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    ||||||||| |   |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  32596296 tatgttgatataccatgtcatttggtttgataattgtcatgtta 32596339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 169
Target Start/End: Original strand, 53906246 - 53906333
Alignment:
Q  82 aactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggttt 169  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  53906246 aactaggcatggcaacaaaacccatacccacggttatccgcccgaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgttttgactgggttt 53906333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25941324 - 25941150
Alignment:
Q  83 actaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatg 182  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| || |   ||||| || |||| |||| |||||| | |||||||||||  ||||| ||||||| || ||| || ||    
T  25941324 actagacatggcaataaaatccatacccacaagtacccatctgaactaaactcaatttaatgggttttccccactttgatttggtttgggcatgtgtttg 25941225  T
Q  183 ggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25941224 ggtttttcccgatttcaaaacacgggtacgggacaggtaacgggaagataggtacccaccccgaacccataccca 25941150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 213
Target Start/End: Original strand, 1724180 - 1724308
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    |||||||||| |||||||  |||| ||| | ||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  1724180 ctaggcatggtaacaaaactcatacccgtgtttacccacccgaaccaaactcaatttgacgtgttttccccg-tttgactgggtttgggtatgggtttgg 1724278  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgg 213  Q
    | ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  1724279 gtttttcccgatttcaaaacatgggtatgg 1724308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 42774774 - 42774694
Alignment:
Q  256 catacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42774774 catacccgtccaaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 42774694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 126 - 257
Target Start/End: Original strand, 1866501 - 1866632
Alignment:
Q  126 aaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacga 225  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |     
T  1866501 aaccaaccccgatttgacggattttccccgatttgactaggtctgggtatgagtatgggtttttcccgatttcaaaatacgggtacgagacgggtaatgc 1866600  T
Q  226 gtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    | ||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  1866601 ggatatatgtatccaccccgaacccataccca 1866632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 123 - 222
Target Start/End: Original strand, 19548887 - 19548985
Alignment:
Q  123 ccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19548887 ccgaaccaaacccaatttgacgg-ttttcccctctttgactgggtttgggtatggataagggttttccccgatttcaaaacacaggtacgggacgggtaa 19548985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 207
Target Start/End: Original strand, 7334108 - 7334230
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||   |||| || ||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| | |||     
T  7334108 taggcatggcaacaaaacccatacttgcgggtatccgcctgaaccaaacctaatttgacgggtttttcccgctttgactgggtttgggtatggatttgga 7334207  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgg 207  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  7334208 ttttccccgatttcaaaacacgg 7334230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 31415839 - 31416008
Alignment:
Q  82 aactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtat 181  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||  || |||||| || || ||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  || |    
T  31415839 aactaggcatggcaacgaaacccatgtccatgggtacccgcccaaatcaaccccgatttaacgggttttccccgatttgactgggtttaggtataagttt 31415938  T
Q  182 gggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaaccca 251  Q
    ||  |||| |||||||||||| ||||||| |||| || ||||  | ||||| |||||||| |||||||||    
T  31415939 ggattttctccgatttcaaaatacgggtacgggatggataacagggatatatgtacccaccccgaaccca 31416008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 45065436 - 45065261
Alignment:
Q  82 aactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtat 181  Q
    |||||||||||||||||||| || |  ||  || |||||| || |||||| ||| |||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||| |    
T  45065436 aactaggcatggcaacaaaacccgtgcccatgggtacccgcccaaaccaaccccgatttgacgagttttccccaatttgactgggtttgggtataggttt 45065337  T
Q  182 gggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||  | ||||| |||||||  |||||| ||||||||    
T  45065336 aggttttcctcgatttcaaaatacgggtacgggacgagtaacagggatatatgtacccatcccgaacgcataccca 45065261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 47103856 - 47103750
Alignment:
Q  151 ccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaaccc 250  Q
    ||||| ||||||| |||||  |||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||    
T  47103856 ccccgatttgactgggtttttgtatgggtttgggttttccccaatttcaaaatacgggtacggggcgggtaacgcggatatatgtacccaccccgaaccc 47103757  T
Q  251 ataccca 257  Q
    |||||||    
T  47103756 ataccca 47103750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 240
Target Start/End: Original strand, 33615241 - 33615395
Alignment:
Q  86 aggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggga 185  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| || | || || | ||||| ||||||||| |  |     
T  33615241 aggcatgacaactaaacccatatccgcgggtacccatccgaaccaaacccgatttgacagattttacctgcttagattgggtttgggtatgggtttaagt 33615340  T
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtaccca 240  Q
    ||||| |||||| | || || |||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  33615341 tttcctcgatttaataaaacaggtatgggacgggtaacggggatataggtaccca 33615395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29527905 - 29527824
Alignment:
Q  176 gggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29527905 gggtttgggttttccccgatttcaaaatacgggtacgtgacgggtaacggggatatatgtacccaccccgaacccataccca 29527824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 257
Target Start/End: Original strand, 14605908 - 14606008
Alignment:
Q  157 tttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccc 256  Q
    |||||||  |||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14605908 tttgactgagtttgggtatgggtttgggttttctccgatttcaaaatacgggtacgagacgggtaacagggatatatgtacccaccccgaacccataccc 14606007  T
Q  257 a 257  Q
    |    
T  14606008 a 14606008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 36919311 - 36919135
Alignment:
Q  81 caactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggta 180  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||  ||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| | || ||| ||| ||||| |||||| ||     
T  36919311 caactaggcatgacaacaaaactcatactcgcgggtacgcatccgaaccaaactcaatttgacgggtttttctcgctttaactgggtttgggtatgagtt 36919212  T
Q  181 tgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    || | ||||||||| || |||||| | |||| ||||| |||||| | ||||| ||| |||  |  ||||||||||||    
T  36919211 tgagttttccccgactttaaaacatgtgtataggacgagtaacgtggatataggtatccatccttaacccataccca 36919135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 254
Target Start/End: Original strand, 4741162 - 4741296
Alignment:
Q  119 ccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgg 218  Q
    |||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||| ||||  |||| | |||| || || | ||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  4741162 ccgtccgaaccaaacataaattgacaagttttccccgttt-gactgagtttggatatgagtttgagttttcctcgattttaaaacatgggtatgggacgg 4741260  T
Q  219 gtaacgagtatataagtacccactccgaacccatac 254  Q
     ||||  | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4741261 ataacagggatataagtacccaccccgaacccatac 4741296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 240
Target Start/End: Original strand, 41914907 - 41915062
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| |||||||| ||||  ||  || || ||| || |||||| ||| |||||| || ||||||||| ||||||| ||||  |||||| || ||||    
T  41914907 taggcatgacaacaaaacccatgcccatgggtaaccgcccaaaccaaccccgatttgatggattttccccgatttgactgggttcgggtatgagtttggg 41915006  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtaccca 240  Q
     ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  41915007 ttttccccgatttcaaaatatgggtacgggaagggtaacggggatatatgtaccca 41915062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 210
Target Start/End: Original strand, 12505475 - 12505577
Alignment:
Q  109 ccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttagg-tatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgg 207  Q
    ||||||||||||  ||||||||||   || ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12505475 ccgcggttaccctcccgaaccaaatttaaattgacgggttttctccgctttgattgggtttagggtatgagtttgggttttccccgatttcaaaacacgg 12505574  T
Q  208 gta 210  Q
    |||    
T  12505575 gta 12505577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 16575194 - 16575093
Alignment:
Q  187 ttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattacttt 286  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||  |||| |||||||||| |||    
T  16575194 ttcctcgattttaaaacgcgggtacgggatggataacgaggatataagtacccactccgaacctatacccaaactcgtcttaaatgtaaaaaattaattt 16575095  T
Q  287 at 288  Q
    ||    
T  16575094 at 16575093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 257
Target Start/End: Original strand, 21956728 - 21956897
Alignment:
Q  88 gcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatt 187  Q
    ||||| |||||||| ||||| |  ||| |||||| |||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||| | | | ||| |||||| || |||| ||    
T  21956728 gcatgacaacaaaacccataccaacgggtacccgcccgaaccaaatcaaatttgacaggtttttcccattttaattggatttgggtatgagtttgggttt 21956827  T
Q  188 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    |  ||||||| |||||||||||| || | | |||||| | ||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  21956828 tttccgattttaaaacacgggtacggaatgagtaacggggatataggtgcccaccccgaacccataccca 21956897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30673145 - 30673012
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||  || || |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||| |||||| || |||     
T  30673145 taggcatgacaacaaaacccatgtccatgggtatccgtccaaaccaaccacaatttgacgggttttccctgatttgattgggtttgggtatgagtttgga 30673046  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgg 218  Q
     |||| ||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  30673045 ttttctccgattttaaaatacgggtacgggacgg 30673012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 335
Target Start/End: Original strand, 4766389 - 4766474
Alignment:
Q  247 acccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||| || |||||| ||||||||| ||||    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4766389 acccaaactcatacccgtcccaaatgtaaa----tactttatgttgatatgttatgttattttatttgataattgtcatgttaataaaaa 4766474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 248
Target Start/End: Original strand, 15733468 - 15733600
Alignment:
Q  116 tacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatggga 215  Q
    |||||| || |||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||| | | ||||| ||||||| |||| | ||||| ||||||||||| ||||||| | ||    
T  15733468 tacccgcccaaaccaaccccgatttgataggttttccccgattttattaggtttgggtatggatatgagttttcctcgatttcaaaatacgggtacgaga 15733567  T
Q  216 cgggtaacgagtatataagtacccactccgaac 248  Q
    |||||||||   ||||| |||||||| ||||||    
T  15733568 cgggtaacggagatatatgtacccaccccgaac 15733600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 425816 - 425763
Alignment:
Q  276 aaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  425816 aaaattactttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcatgtta 425763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 257
Target Start/End: Original strand, 9929118 - 9929250
Alignment:
Q  124 cgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 223  Q
    ||||||||| ||| |||||| || ||||||| ||| |||| | ||| |||||||||||| | ||| || |||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  9929118 cgaaccaaatccattttgactggatttcccccttt-gactagatttgggtatgggtatgagtttttcctgatttcaaaatacgggtatagtacgggtaac 9929216  T
Q  224 gagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
      | ||||| |||||||| |||||| | ||||||    
T  9929217 atggatataggtacccaccccgaactcttaccca 9929250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 324
Target Start/End: Original strand, 13015323 - 13015402
Alignment:
Q  246 aacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcat 324  Q
    ||||||||| || ||| ||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13015323 aacccatactcaaacccgtctcgaatgtaaaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattttcat 13015402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21544658 - 21544591
Alignment:
Q  190 cccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | | ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21544658 cccgatttcaaaatacgggtacgggacaggtaatggggatatatgtacccaccccgaacccataccca 21544591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 328
Target Start/End: Original strand, 28695194 - 28695297
Alignment:
Q  226 gtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcat 324  Q
    ||||||| |||| ||| |||||| |||||||| ||  ||| ||||||||  ||||| |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||     
T  28695194 gtatataggtactcaccccgaactcatacccaaactcgtctcaaatataggaaattgctttatgttgatatgcaatgttattttatttgataattgtcac 28695293  T
Q  325 gtta 328  Q
    ||||    
T  28695294 gtta 28695297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 31782707 - 31782620
Alignment:
Q  175 tgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacct 262  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||| | ||||| |||||||| || ||| |||||||| ||||    
T  31782707 tgggtttgggttttccccgatttcaaaatacgggtacggtacaggtaacggggatatatgtacccaccccaaactcatacccaaacct 31782620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 294
Target Start/End: Original strand, 53906346 - 53906425
Alignment:
Q  215 acgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgat 294  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| | | ||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  53906346 acgggtaacaggtatataggtacccaccccgaacccatatctaaactcgtcccaaatgtaaaaaattacttcatgttgat 53906425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 280
Target Start/End: Original strand, 33516097 - 33516178
Alignment:
Q  199 aaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaat 280  Q
    |||||||||||| | || |||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||| ||||||||    
T  33516097 aaaacacgggtacgagatgggtaacagggatataagtacccaccccgaacctatacccaaacccgtctcaaatgtaaaaaat 33516178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 179
Target Start/End: Original strand, 50375829 - 50375925
Alignment:
Q  82 aactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggt 179  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| || ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||| | ||||| || ||||||    
T  50375829 aactaggcatgacaacaaaa-ccataaccgcgggtaaccgcccgaaccaaactcaattcgacggatttttcccgctttgattgggtttgggcatgggt 50375925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39086300 - 39086188
Alignment:
Q  126 aaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacga 225  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| | |||| || || | |||| ||||||||| |||| ||||  || ||||||||||     
T  39086300 aaccaaactcaatttgacggattttctccgttttgattgggtttggatatgagtttgagttttctccgatttcacaacatgggtgcggtacgggtaacgg 39086201  T
Q  226 gtatataagtacc 238  Q
    | ||||| |||||    
T  39086200 ggatataggtacc 39086188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 216
Target Start/End: Original strand, 4737861 - 4737944
Alignment:
Q  133 cccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggac 216  Q
    ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||   |||| || |||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  4737861 cccaattcgatgggttttcccccctttgacttggtttgaatatgagtttgggttttcctcgattttaaaacatgggtatgggac 4737944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 257
Target Start/End: Original strand, 10574431 - 10574502
Alignment:
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    |||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| | ||||| |||||| | |||||| ||||||||    
T  10574431 tttccccgatttcataatacaggtacgggacgggtaacggggatatatgtacccgccccgaactcataccca 10574502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11696954 - 11696875
Alignment:
Q  133 cccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatg 212  Q
    ||||||||||  |||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| | || |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11696954 cccaatttgataggttttcttcgtgttgactgggtttgggtatgggtttaggttttctccgatttcaaaacaccggtatg 11696875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 142
Target Start/End: Original strand, 47239313 - 47239372
Alignment:
Q  83 actaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttga 142  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  47239313 actaggcatggcaacaaaactcatactcgcggttatccgtccaaaccaaactcaatttga 47239372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 335
Target Start/End: Original strand, 15987372 - 15987402
Alignment:
Q  305 ttttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15987372 ttttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 15987402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 257
Target Start/End: Original strand, 30266347 - 30266413
Alignment:
Q  191 ccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    ||||||||| || |||||||  |||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  30266347 ccgatttcataatacgggtacaggacgggtaacggggatatatgtatccaccccgaacccataccca 30266413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 30285841 - 30285775
Alignment:
Q  191 ccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    ||||||||| || |||||||  |||||||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  30285841 ccgatttcataatacgggtacaggacgggtaacggggatatatgtatccaccccgaacccataccca 30285775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 152
Target Start/End: Original strand, 13768365 - 13768430
Alignment:
Q  87 ggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttcc 152  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13768365 ggcatggcaacaaaaccgatacccatggttacccacccgaatcaaactcaatttgacgggttttcc 13768430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 238
Target Start/End: Original strand, 29035495 - 29035596
Alignment:
Q  137 atttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagta 236  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||  ||||  |||||||| |||| ||||| | |||| ||||||| |||| ||||||| ||| ||  |||||||||    
T  29035495 atttgatgggtatttcccgttttgactgtgtttcagtatgggtttgggctttcctcaattttaaaacaccggtacgggacggataatgaagatataagta 29035594  T
Q  237 cc 238  Q
    ||    
T  29035595 cc 29035596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 238
Target Start/End: Original strand, 29047628 - 29047729
Alignment:
Q  137 atttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagta 236  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||  ||||  |||||||| |||| ||||| | |||| ||||||| |||| ||||||| ||| ||  |||||||||    
T  29047628 atttgatgggtatttcccgttttgactgtgtttcagtatgggtttgggctttcctcaattttaaaacaccggtacgggacggataatgaagatataagta 29047727  T
Q  237 cc 238  Q
    ||    
T  29047728 cc 29047729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 161
Target Start/End: Original strand, 3909013 - 3909089
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttga 161  Q
    |||||||||||||||||  |||| || |||||||| | ||||||| | ||| |||||| || |||||||| ||||||    
T  3909013 taggcatggcaacaaaactcatacccacggttacctgcccgaacccaccccgatttgatggattttccccattttga 3909089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 152
Target Start/End: Original strand, 9280842 - 9280878
Alignment:
Q  116 tacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttcc 152  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9280842 tacctgtccgaaccaaacccaatttgatgggttttcc 9280878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 224
Target Start/End: Original strand, 25265127 - 25265214
Alignment:
Q  136 aatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacg 224  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||  |||| ||||||| | |||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||    
T  25265127 aatttgacgggttttttccgctttgactgcgtttgggtatggct-tgggttttccccgattttaaaacatgggtacgggataggtaacg 25265214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 271
Target Start/End: Original strand, 25298834 - 25298930
Alignment:
Q  175 tgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaat 271  Q
    ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| |||| |||||| | | |||||  |  |||| ||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  25298834 tgggtttgggtttttccggatttcaaaacacgggtacgggatgggtaatggggatatagctgtccaccccgaacccatacccaaacccgtaccaaat 25298930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 36306868 - 36306816
Alignment:
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacc 238  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| |||||    
T  36306868 tttctccgatttcaaaacacgggtatgagacggttaacggggatataggtacc 36306816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 44887725 - 44887669
Alignment:
Q  88 gcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacg 144  Q
    ||||| ||||||||  |||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  44887725 gcatgacaacaaaactcatacccacggttatccgcccgaaccaaacccaatttgacg 44887669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 61)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 81 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17135130 - 17134875
Alignment:
Q  81 caactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggta 180  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  17135130 caactaggcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttctctgttttgactgggtttgggtgtgggta 17135031  T
Q  181 tgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaat 280  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||    
T  17135030 tgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacgggtaacgggtatataggtaccatccccgaacccatacccatactcgtcccatatgtaaaaaat 17134931  T
Q  281 tactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17134930 tactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 17134875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 51422037 - 51421786
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51422037 taggcatggcaataaaatccatatccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgatgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatggg 51421938  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  51421937 tttttcccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacatgtatatatgtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 51421838  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
     ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51421837 ctatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaa 51421786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 36187130 - 36187381
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36187130 taggcatggcaacaaaacccatacccgtcgttacccgcccgaaccaaactcaatttggcgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 36187229  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| |    
T  36187230 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccctgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaagttatt 36187329  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36187330 ttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 36187381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 84 - 335
Target Start/End: Original strand, 24236670 - 24236922
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24236670 ctaggcatggcaacaaaactcatacccatggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttaggtatgggtatgg 24236769  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattac 283  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||     
T  24236770 gttttccccgatctcaaaacacgggtatggaacggggaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattat 24236869  T
Q  284 tttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24236870 tttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 24236922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 88 - 335
Target Start/End: Original strand, 19572425 - 19572673
Alignment:
Q  88 gcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatt 187  Q
    |||||||||||||| |||||   | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  19572425 gcatggcaacaaaacccatacttgtggttacccgcccgaaccaaacctaatttgacgggttttccccattttgactgggtttgggtatgggtatgggttt 19572524  T
Q  188 tccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattacttta 287  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  19572525 ttcccgatttcaaaacacgggtatgggacaggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaattatttta 19572624  T
Q  288 tgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19572625 tgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgccatgttaataaaaa 19572673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 81 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 29936605 - 29936344
Alignment:
Q  81 caactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatg---- 176  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||        
T  29936605 caactaggcatgacaacaaaacccatacccgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactaagtttgggtatgagta 29936506  T
Q  177 --ggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatata 274  Q
      |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  29936505 tgggtatgggttttccccgatctcaaaatacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgta 29936406  T
Q  275 aaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  29936405 aaaaattactttatgttgatatgtaatgttatttttttttataattgtcatgttaataaaaa 29936344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 84 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5181219 - 5180973
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  5181219 ctaggcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaattcaatttgacgggttttccccattttgactgggtttaggtatgggtatgg 5181120  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattac 283  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||||||||||      || |||||| ||||||||||     
T  5181119 gttttccccgatttcaaaatacgggtatgggacgggtaacgggtatataggcacccaccccaaacccataccc------gttccaaatgtaaaaaattat 5181026  T
Q  284 tttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5181025 tttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 5180973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 18353990 - 18354241
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | |||   ||||||||||||    
T  18353990 taggcatggcaacaaaacccgtacccgcgattacccgcccgaaccaaattcaatttgacgggtttttcccgttttgactggatttgaatatgggtatggg 18354089  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| |    
T  18354090 ttttccccgatttcaaaacatgggtatgggacgggtaacgggtatataagttcccaccccgaaccgatacccatactcgtcccaaatgtaaaaaattatt 18354189  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18354190 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 18354241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 84 - 335
Target Start/End: Original strand, 45866095 - 45866346
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45866095 ctaggcatggcaacaaaacccatactcgcggttacccgcccgagccaaacctaaattgacgggttttctcc-ttttgactaggtttgggtatgggtatgg 45866193  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattac 283  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  45866194 gttttccccgatttcaaaacacgggtatgagacaggtaatgagtatataggtacccaccccaaactcatacccatacccatcccaaatgtaaaaaattac 45866293  T
Q  284 tttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45866294 tttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaa 45866346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 49250683 - 49250934
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  49250683 taggcatgacaacaaaattcatacccgtggttatccgcccgaaccaaattcaatttgacgggttttctccgttttgactgggtttgggtatgggtatgag 49250782  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  49250783 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaatgggtatataggtatccacctcgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaactact 49250882  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49250883 ttatgttgatatgttatgctattttgtttgataattgtcatgttgataaaaa 49250934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34611251 - 34611001
Alignment:
Q  86 aggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggga 185  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||     
T  34611251 aggcatgacaacaaaatccatacccgtggttacccgcctgaaccaaatccaatttgacgggttttccccgttttgattgaatttgggtatgggtatgggt 34611152  T
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactt 285  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||    
T  34611151 ttttcccgatctcaaaacacgggtatgggacatgtaacgtgtatataggtactcaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaatactactt 34611052  T
Q  286 tatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34611051 tatgttgatatgttatattattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 34611001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Original strand, 40087371 - 40087624
Alignment:
Q  82 aactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtat 181  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  40087371 aactaggcatggcaacaaaactcatacccgcggttatccgtctgaaccaaattcaatttgacggattttccccgttttgactgagtttgggtatgggtat 40087470  T
Q  182 gggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatt 281  Q
    | | ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||| | ||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  40087471 gagttttccccga-ttcaaaacacaggtatgggatgagtaacgggaatataggtacccaccccgaactcatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaatt 40087569  T
Q  282 actttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40087570 actttatgttgatatatcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 40087624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 85 - 329
Target Start/End: Original strand, 23490681 - 23490926
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |   |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23490681 taggcatggcaacaaaacccatactcatagttacccgcccgaaccaaatccaatttgacgggtttttcctgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 23490780  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| || |    
T  23490781 ttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccataccaaaacccgtcccaaatgtaaaaaactaat 23490880  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaa 329  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23490881 ttatgtggatatgttatgttattttgtttgataattgtcatcttaa 23490926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16409120 - 16408874
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| |||||||| |||||  | ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16409120 taggcatgacaacaaaacccatacacacggttacccctc-gaatcaaacccaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatggg 16409022  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||| | | ||| |  |||||| ||||||||||||    
T  16409021 ttttccccaatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtaccgaccccgaacccatagctaaacccgctccaaatgtaaaaaattact 16408922  T
Q  285 ttatgttgatttgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||  || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408921 ttatgt--atgt-catgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 16408874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 50426565 - 50426816
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggt----- 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||         
T  50426565 taggcatggcaacaaaatccatacccgcggttaccggctcgaaccaaacccaatttaacaggttttctccgttttgactgggtttgggtttgggtttggg 50426664  T
Q  180 -atgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaa 278  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||      ||||||||| ||||||    
T  50426665 tatgggctttccctgatttcaaaacacgggtatgagacggataacgggtatataggtacccaccccgaacccataccc------gtcccaaatgtaaaaa 50426758  T
Q  279 attactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50426759 tttactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 50426816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Original strand, 42439581 - 42439831
Alignment:
Q  86 aggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggga 185  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| |||||||||   ||||  || ||||||||  |||| ||||||||||||       
T  42439581 aggcatggcaacaaaatccatattcgtggttatccgcccgaaccaaactcaatttgacaaattttttccattttgactgagtttgggtatgggtatgaat 42439680  T
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactt 285  Q
    |||  ||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||   |||||||| |||||||||||||    
T  42439681 tttttccgatctcaaaacatgggtatgggacgagtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatatccaaactcatcccaaatgtaaaaaattactt 42439780  T
Q  286 tatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42439781 tatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 42439831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28298125 - 28297861
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  28298125 taggcatgtcaacaaaactcatatccgtggttacccacccgaaccaaatccaatttgacgggttttccctgttttgattggatttgggtatgggtatggg 28298026  T
Q  185 a------------tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaata 272  Q
                 |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||     
T  28298025 tatgggtatgagttttccccgatctcgaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccaaatg 28297926  T
Q  273 t-aaaaaattactttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    | |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28297925 taaaaaaactattttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 28297861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 39616472 - 39616227
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatcc-gcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||    
T  39616472 taggcatgacaacaaaactcataccccgcggttacccgcccgaaccaaactcaatttgacgagttttccccgttttgactgagtttgggtatgagtatgg 39616373  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattac 283  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||            | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  39616372 gttttcccctatttcaaaacacgggtataggacgggtaacaagtatata-----------ggcacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattat 39616284  T
Q  284 tttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaattac 339  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  39616283 tttatgttgatatgtcatgttattttgtttgctaattatcatgttaataaaaattac 39616227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 42707747 - 42707991
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||| |||||||||||| |||||  || ||||| |||||| ||| |||   |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |    
T  42707747 taggtatggcaacaaaacccataatcgtggttatccgtccaaactaaatttaatttgacggatttttcccattttgactgggtttgggtatgagtatgag 42707846  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||      ||||||||| |||||||||| |    
T  42707847 ttttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggaatataagtactcac-ccgaacccataccc------gtcccaaatgtaaaaaattatt 42707939  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42707940 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 42707991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Original strand, 3627905 - 3628148
Alignment:
Q  83 actaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatg 182  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||||             
T  3627905 actaggcatgacaacaaaactcatacacgcggttacccgcccgaaccaaactcaatttgatgagtttttcccgttttgactgggtataggt--------- 3627995  T
Q  183 ggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaa--tataaaaaat 280  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||  || |||||||    
T  3627996 ---tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatgtaggtacccaccccgaacccatactcattccagtcccaaatgtaaaaaaaat 3628092  T
Q  281 tactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3628093 tactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattatcatgttaataaaaa 3628148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13390574 - 13390353
Alignment:
Q  86 aggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggga 185  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||       
T  13390574 aggcatggcaacaaaacccatacccacggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggg-tttccccgttttgactgggtttgggtatgggtatgaat 13390476  T
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactt 285  Q
    ||||||||||||||||||||                ||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13390475 tttccccgatttcaaaacac----------------acgggtatataggtacccaccccgaactcatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactt 13390392  T
Q  286 tatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtca 323  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13390391 tatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtca 13390353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24711026 - 24710786
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| |||||||| ||| | ||| | ||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||    
T  24711026 taggcatgacaacaaaacccacacccgtgattatccacccgaaccaaattcaatttgacgggttttccccgttttgactgggtttggatatgagtatggg 24710927  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||           |||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24710926 ttttccccgatctcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatataggt-----------acccatactcaaacccgtcccaaatgtaaaaaattact 24710838  T
Q  285 ttatgttgat-ttgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24710837 ttatgttgatacattatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 24710786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 328
Target Start/End: Original strand, 44615389 - 44615630
Alignment:
Q  89 catggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggattt 188  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||    
T  44615389 catggcaacaaaacccatacccgtggttacccacccagaccaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgagtttgggtttt 44615488  T
Q  189 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaat-ataaaaaattacttta 287  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||   |||||| |||||||    
T  44615489 ccctgatttaaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccaaactcatacccaaacccgtcccaaatccaaaaaaactacttta 44615588  T
Q  288 tgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44615589 tcttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgtta 44615630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 89 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 44793180 - 44792939
Alignment:
Q  89 catggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggattt 188  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||    
T  44793180 catggcaacaaaacccatacccgtggttacccacccagaccaaactcaatttgacgggtttttcccgttttgactgggtttgggtatgagtttgggtttt 44793081  T
Q  189 ccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaat-ataaaaaattacttta 287  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||   |||||| |||||||    
T  44793080 ccctgatttaaaaacacgggtatgggacgggtaacaggtatataggtacccaccccaaactcatacccaaacccgtcccaaatccaaaaaaactacttta 44792981  T
Q  288 tgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44792980 tcttgatatgccatgttattttgtttgataattgtcgtgtta 44792939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 85 - 328
Target Start/End: Original strand, 9982800 - 9983044
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| |||||| |  |||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||      
T  9982800 taggcatggcaacaaaactcatacccgtggttactctcccgaaccaaatccaatttgatggattttctccgttttgactgggtttgggtatgagtttgaa 9982899  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  |||| |||  | |||||||||    
T  9982900 ttttccccaatttcaaaacacgggaatgggatgggtaacgagtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccatcccgaatgcagaaaattact 9982999  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgtta 328  Q
    ||||||| || | | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9983000 ttatgttaatatatcatgttattttgtttgataattctcatgtta 9983044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 85 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23968758 - 23968621
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  23968758 taggcatggcaacaaaacccatacccgcggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttccccattttgattgggtttgggtatgggtatggg 23968659  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 222  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23968658 ttttccccggtttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 23968621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 320
Target Start/End: Original strand, 34673191 - 34673428
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| | | | ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||    
T  34673191 ctaggcatgacaacaaaactcataccagtgattacccgcccgaaccaaacccaatttaacggattttccccattttaactgggtttgggtatgggtttgg 34673290  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattac 283  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||   | |||| |||    
T  34673291 gtttttcccaatttcaaaacacgggtatgagactggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacctgttccgaacgaagaaaactac 34673390  T
Q  284 tttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattg 320  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  34673391 tttatgttgatatgccatgttattttgtttgataattg 34673428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 155 - 335
Target Start/End: Original strand, 17091939 - 17092120
Alignment:
Q  155 gttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatac 254  Q
    |||||||||  |||| | |||| ||||| | |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | || ||| |||||||||| |    
T  17091939 gttttgactgagtttggatatgagtatgagttttccccgattttataacacaggtatgggacgcgtaacgggtatataggcactcaccccgaacccatgc 17092038  T
Q  255 ccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092039 ccatacccgtcccaaatgtaaaaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 17092120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 127 - 328
Target Start/End: Original strand, 29871237 - 29871439
Alignment:
Q  127 accaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgag 226  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||| || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |    
T  29871237 accaaactcaatttgacgggttttcctcgttttgactaagtttgggtatgagtttgggttttctccgatttcaaaacatgggtatgggacaggtaactgg 29871336  T
Q  227 tatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatg 325  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||||| ||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  29871337 tatataggtacccaccctgaactcatacccaaacccgtcccgaatgtagaaaattattttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattcccatg 29871436  T
Q  326 tta 328  Q
    |||    
T  29871437 tta 29871439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12495189 - 12494953
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| ||||||||| ||||   | ||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | ||    
T  12495189 taggcatgacaacaaaattcatacatgtggttacccacctgaaccaaatccaatttgacggattttccccactttgactgggtttcggtatgggttttgg 12495090  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||| || |||| ||||    
T  12495089 tttttcccgatttcaaaacacggatatgggacgtgtaacgggtatataggtacccacctcgaacccatacccaaacccgtcccaaatgtagaaaactact 12494990  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattg 320  Q
     ||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||    
T  12494989 atatgttgacatgacatgttattttgttttataattg 12494953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 175 - 335
Target Start/End: Original strand, 34060025 - 34060180
Alignment:
Q  175 tgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatata 274  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||      ||||||| | ||    
T  34060025 tgggtatgagttttcctcgatttcaaaacacgggtatgagacggataacaggtatataggtacccactccgaacccataccc------gtcccaattgta 34060118  T
Q  275 aaa-aattactttatgttgatttgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34060119 aaaaaattactttatgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 34060180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Original strand, 16433089 - 16433311
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||  ||               
T  16433089 taggcatggcaataaaacctatatccgtggttacccatccgaaccaaactcaatttgacggattttccccattttgattgggtttgagt----------- 16433177  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||   ||||||||||||||| |||   |||||||  | |||||||||    
T  16433178 -tttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggatatataggtaccc---ccgaacccatacccaaacccaccccaaatgcagaaaattact 16433273  T
Q  285 ttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgt 321  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16433274 ttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataattgt 16433311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13798417 - 13798270
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||  | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||| |||||| || ||||    
T  13798417 taggcgtggcaacaaaatccatatatgcgggcatccgtctgaaccaaacccaatttaacgggttttccccggtatgactgggtttgggtatgagtttggg 13798318  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatata 232  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  13798317 tttttcccgatttcaaaacacgggtatgagatgggtaacgaggatata 13798270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 218 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23966919 - 23966800
Alignment:
Q  218 ggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatat-aaaaaattactttatgttgatttg-tatgttattttgtttgat 315  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23966919 ggtaacgggtatataggtacccaccccgaacccatactcatacccgtcccaaatgtaaaaaaattactttatgttgatatgttatgttattttgtttgat 23966820  T
Q  316 aattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  23966819 aattgtcatgtttataaaaa 23966800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 95 - 250
Target Start/End: Original strand, 35936749 - 35936904
Alignment:
Q  95 aacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccga 194  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||    
T  35936749 aacaaaatccatacccgtagttacctgtccgaaccaaattcaatctgacgggtttttctcattttgacttggtttgggtatgagtttgggttttccccga 35936848  T
Q  195 tttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaaccc 250  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| || |||||    
T  35936849 tttcaaatcacgagtatgggacggataacgggtatataggtacccaccccaaaccc 35936904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13020772 - 13020646
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||    
T  13020772 taggcatgacaacaaaacctatatctgcggttacctgtccgaaccaaactcaatctgacgggttttctccgtcttgactgggtttggttatgggtatggg 13020673  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtat 211  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13020672 ttttccccgatttcaaaacacgagtat 13020646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20774752 - 20774651
Alignment:
Q  78 atgcaactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgg 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20774752 atgccactaggcatggcaacaaaacccatactcgtggttacccgcccgaaccaaacccaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgg 20774653  T
Q  178 gt 179  Q
    ||    
T  20774652 gt 20774651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 320
Target Start/End: Original strand, 49740936 - 49741153
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||               
T  49740936 taggcatggcaacaaaatccatacccgtggttatccacttgaaccaaactcaatttgacggattttcccctttttgactgggtttaggt----------- 49741024  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     ||||||| ||||||||||| || ||||||||||       ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||  | |||| ||||    
T  49741025 -tttccccaatttcaaaacatggatatgggacgg-------gtatataggtacccaccccgaacccatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaactact 49741116  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattg 320  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  49741117 ttatgttaatatgttatgttattttgtttgataattg 49741153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 138 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 34085361 - 34085217
Alignment:
Q  138 tttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtac 237  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||  | |||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||| ||||    
T  34085361 tttgacgggttttctccgctttgactgggttaggatatgagtttgggtttttcccgatttcaaaacacgagtatgggatgggtaacggggttatatgtac 34085262  T
Q  238 ccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatta 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  34085261 ccaccccgaacccatacccatactcgtcctaaatgtaaaaaatta 34085217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 250
Target Start/End: Original strand, 19003576 - 19003741
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||  || |||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||  |||    
T  19003576 taggcatggcaacaaaacccgtgcccatgggtacccgcccaaagcaaccccgatttgacgggttttccccgatttgactaggtttgggtatgggttcggg 19003675  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaaccc 250  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||| || |||||    
T  19003676 ttttccccgattacaaaatacgggtatgggacggataacggggatatatgtatccaccccaaaccc 19003741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 222
Target Start/End: Original strand, 33293441 - 33293578
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| || ||||| | ||||| ||| ||| |||||||  ||||  ||||||||| | ||||| |||||| || ||||    
T  33293441 taggcatagcaacaaaatccgtatccgtgggtacccattcgaactaaatccattttgacgaattttttccgttttgattgggtttgggtatgagtttggg 33293540  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 222  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33293541 tttttcccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 33293578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 279
Target Start/End: Original strand, 10778527 - 10778671
Alignment:
Q  135 caatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataag 234  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||| || |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||      
T  10778527 caatttgacgggttttttccgctttgactgggtttgggtatgagtttaagtttttcccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacggggttataga 10778626  T
Q  235 tacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaa 279  Q
    || |||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||    
T  10778627 tatccaccccgaacccatactcatacccgtctcaaatgtaaaaaa 10778671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20774649 - 20774560
Alignment:
Q  248 cccatacccatacctgtcccaaatataaaaaat-tactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20774649 cccatacccaaacccgtcccaaatgtaaaaaaactactttatgttgatatgttatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 20774560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 182
Target Start/End: Original strand, 34059059 - 34059155
Alignment:
Q  86 aggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatg 182  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  34059059 aggcatggcaacaaaacccatacccacggttatccgtccgaaccaaattcaatttgacgggttattcccgttttgactagatttgggtatgggtatg 34059155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2514906 - 2514811
Alignment:
Q  116 tacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggttt-aggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggta 210  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  2514906 tacccgtccaaaccaaacccaacttgatgggttttccccgttttgattgggtttggggtatgagtttgggttttccccaatttcaaaacacgggta 2514811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 257
Target Start/End: Original strand, 16237245 - 16237386
Alignment:
Q  116 tacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatggga 215  Q
    ||||||||| |||||| ||  |||||| ||| |||| ||  |||||||  |||| | ||||  | |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16237245 tacccgtccaaaccaaccctgatttgatgggctttctccaatttgactgagtttggatatgaatttgggttttccccgatttcaaaatacgggtaaggga 16237344  T
Q  216 cgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  16237345 cgggtaacgaggatatatgtactaaccccgaacccataccca 16237386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 48576060 - 48576194
Alignment:
Q  123 ccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg------gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggac 216  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||      | ||||||| || ||||||||| |||||| |||    
T  48576060 ccgaaccaaatccaaattgatgggttttccccattttgactaggtttgggtatgggtatgggttagagttttccccaatctcaaaacacaggtatgagac 48576159  T
Q  217 gggtaacgagtatataagtacccactccgaaccca 251  Q
    |||||| | | ||| |||| ||||||| |||||||    
T  48576160 gggtaatggggataaaagtgcccactctgaaccca 48576194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 48125701 - 48125765
Alignment:
Q  193 gatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  48125701 gattttaaaacacgggtacgggacgggtaacgaggatataggtatccaccccgaacccataccca 48125765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 254
Target Start/End: Original strand, 35069799 - 35069968
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||  || |||| | || |||||| ||| |||||||||  |||| ||  ||||||| | ||| |||||| || ||     
T  35069799 ctaggcatggtaacaaaatccatgtccatggatacc-gcccaaaccaaccccgatttgacggagtttctccaatttgactggatttgggtatgagtttga 35069897  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatac 254  Q
    | |||||||||||||| || |||||||   ||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  35069898 gttttccccgatttcataatacgggtacaagacgggtaacagggatatatgtacccaccccgaacccatac 35069968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 38106385 - 38106304
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttg 165  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  |  |||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  38106385 ctaggcatggcaacaaaactcatactcatggttacccatccgaaccaaacacaatttgatggattttccccattttgacttg 38106304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 251
Target Start/End: Original strand, 5293342 - 5293481
Alignment:
Q  111 gcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggta 210  Q
    |||| |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||  ||||  ||||| || |||| |||| |||||||||||| || ||||    
T  5293342 gcggatacccgcctgaactaaacccaatttaacgggttttctccgctttgactgtgtttgagtatgagtttggg-tttctccgatttcaaaatactggta 5293440  T
Q  211 tgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaaccca 251  Q
      |||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  5293441 caggacggataacagggatatatgtacccactccaaaccca 5293481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23058573 - 23058473
Alignment:
Q  157 tttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccc 256  Q
    ||||||| |||||  |||||||| || | |||| ||||||||||||  || ||| | ||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23058573 tttgactgggtttgagtatgggtttgagttttctccgatttcaaaatgcgagtacgagacgggtaacggggatataggtacccaccccgaacccataccc 23058474  T
Q  257 a 257  Q
    |    
T  23058473 a 23058473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 267
Target Start/End: Original strand, 41476888 - 41477044
Alignment:
Q  111 gcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggta 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||  ||||   |||| || |||| |||   |||||  |||| ||| |||    
T  41476888 gcggatacccgtccgaaccaaacctattttgatgggtttttcccgctttgactgagtttgaatatgagtttgggtttttttcgattggaaaatacgagta 41476987  T
Q  211 tgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtccc 267  Q
     ||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  41476988 cgggacggataacgtggatatatgtacccaccccgaatccatacccaaacccgtccc 41477044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 78
Target Start/End: Original strand, 24541395 - 24541466
Alignment:
Q  8 tatgaaggaggttatttggagtaaaagaaaaaacaatactagagttttggcca-ttttttgttttaagagaa 78  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  24541395 tatgaaagaggttatttggagaaagagaaaaaacaataagagagttttcgccatttttttgtgttaagagaa 24541466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 39219346 - 39219265
Alignment:
Q  176 gggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||| || ||  |||||| | ||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  39219346 gggtttgggttttccccgattttaaaacacgggtacggaacaagtaacggggatacatgtacccaccccgaacccataccca 39219265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 210
Target Start/End: Original strand, 42728861 - 42728979
Alignment:
Q  89 catggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgggattt 188  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||  || ||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||| ||||||| | ||||||| |  | |||    
T  42728861 catggcaacaaaatccata-ccacgggtatacgcccgaaccaaacacaatttgacgggttat-cccgctttgatttggtttggatatgggt-ttcgtttt 42728957  T
Q  189 ccccgatttcaaaacacgggta 210  Q
     ||||||||||||||| |||||    
T  42728958 tcccgatttcaaaacatgggta 42728979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 223
Target Start/End: Original strand, 44632152 - 44632189
Alignment:
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44632152 tttctccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaac 44632189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13020648 - 13020616
Alignment:
Q  303 tattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13020648 tattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 13020616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 266
Target Start/End: Original strand, 25154842 - 25154918
Alignment:
Q  190 cccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcc 266  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| | | ||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||    
T  25154842 cccgatttcaaaacacgagtacgggacgagtaatggggatataagtacccacttcgaactcatgcccaaacccgtcc 25154918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 319
Target Start/End: Original strand, 35936918 - 35936962
Alignment:
Q  276 aaaattactttatgttgatttgt-atgttattttgtttgataatt 319  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  35936918 aaaattactttatgttgatatgtcatgttattttgtttgataatt 35936962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 262
Target Start/End: Original strand, 12718783 - 12718859
Alignment:
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacct 262  Q
    |||||||||||||| || ||| ||| | |||||||||||   ||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  12718783 tttccccgatttcataatacgtgtacgagacgggtaacggaaatatatgtacccaccctgaacccatacccaaacct 12718859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0519 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0519
Description:

Target: scaffold0519; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10470 - 10225
Alignment:
Q  83 actaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatg 182  Q
    |||||||||| |||||||| |||||   ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||       
T  10470 actaggcatgacaacaaaacccatacatgcggttacctgtccgaaccaaatccaatttgacgggttttttccgttttgactaggtttgggtatgggt--- 10374  T
Q  183 ggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaatta 282  Q
        || |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10373 ----tttcccgctttccaaacacgggtatgggacggataacaggtatataggtacccactacgaacccatacccatacccgtcccaaatgtaaaaaatta 10278  T
Q  283 ctttatgttgatttgtatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10277 ctttgtgttgatatgtatgttattttgtttgataattgtcatattaataaaaa 10225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 33577 - 33334
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgac------ttggtttaggtatggg 178  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  | |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||       | ||||| ||||||||    
T  33577 taggcatggcaacaaaacctatatccgtggttacccacctgaactaaactcaatttgacgggttttacccgttttgatcgggtttgggtttgggtatggg 33478  T
Q  179 tatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaa 278  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| |||  | |||    
T  33477 tttgggttttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgggtatatatgtacccaccccgaacccatacccaaactcgtcccgaatgcagaaa 33378  T
Q  279 attactttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattgt 321  Q
    | |||||||||||||  ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  33377 actactttatgttgacatgccatgttattttgtttggtaattgt 33334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0189 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4329 - 4184
Alignment:
Q  192 cgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatat-aaaaaattactttatgt 290  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||| ||  ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  4329 cgatttcaaaacacgggtatgagactggtaacgagtatatttgtacccacttcaaacccatacccaaactcgtcccaaatgtaaaaaaaatactttatgt 4230  T
Q  291 tgatttgt-atgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 335  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4229 tgatatgtcatgttattttgtttgataattgtcatgttaataaaaa 4184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 90770 - 90539
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatc-catatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    |||||||||||| |||| | |||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||        
T  90770 taggcatggcaaaaaaaactcatacccgtggttacccgcccgaactaaactcaatttgacggattttccccgttttgactgggtttgggtatgggt---- 90675  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattac 283  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||| | |||||||||||| || |   ||||  |||  | |||||||     
T  90674 --tttccccgatttcaaaacacgggtatgagacggttaacgggtatattggtaccctccccgaacccatacacaaattcgtcctgaatgcagaaaattat 90577  T
Q  284 tttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataattg 320  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||    
T  90576 tttatgttgatatgccatgttattttgtttaataattg 90539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0795 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0795
Description:

Target: scaffold0795; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 401 - 267
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||  |    
T  401 taggcatgacaacaaaacccatatccgtgattacccgccagaaccaaactcaatt-gacgggttttctccgttttgactgagtttgggtatgggtatcag 303  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggt 220  Q
     ||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  302 ttttcctcaatctcaaaacacgggtatgggacgggt 267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 222
Target Start/End: Original strand, 14091 - 14230
Alignment:
Q  82 aactaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtat 181  Q
    |||||| |||| ||||||||  ||||  || ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||| || |    
T  14091 aactagacatgacaacaaaactcatactcgtggttacccacccaaaccaaacccaatttgacgggtttttcccgttttgtttgggtttgggtatgagttt 14190  T
Q  182 gggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 222  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  14191 gagttttccccgattt-aaaacacgggtatggaacgggtaa 14230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 14953 - 14718
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||||||||||| | |||||  | | ||||| | || |||||||   ||||||||||| |||  | ||||| ||| | ||| |||||| || ||||    
T  14953 taggcatggcaacaaatttcatataagtgtttacctgcccaaaccaaatttaatttgacggggtttttcagttttcactggatttgggtatgagtttggg 14854  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattact 284  Q
     |||| |||||||||||||||  | ||||||||| ||| | ||||||| ||||||||   |||| |||||||| ||  ||||||||| || ||||||| |    
T  14853 ttttctccgatttcaaaacacatgcatgggacggataatgggtatataggtacccaccttgaacacatacccaaactcgtcccaaatgtagaaaattatt 14754  T
Q  285 ttatgttgatttg-tatgttattttgtttgataatt 319  Q
    | |||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  14753 taatgttgatatgatatattattttgtttgataatt 14718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 67929 - 67755
Alignment:
Q  83 actaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatg 182  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||  |  |||||| || |||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||    
T  67929 actaggcatggcaacaaaacccgtgcccatgagtacccgcccaaaccaaccccgatttgacaggttttccccgatttgactgggtttgagtatgggtttg 67830  T
Q  183 ggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    |  |||||||||||| |||| |||| || ||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||| || |||||||    
T  67829 gattttccccgattttaaaatacggatacgggacggataacggggatatatgtacccaccccgagcctataccca 67755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 75772 - 75598
Alignment:
Q  83 actaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatg 182  Q
    ||||||||||||||||||| || |  ||  |  |||||| || |||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||    
T  75772 actaggcatggcaacaaaacccgtgcccatgagtacccgcccaaaccaaccccgatttgacaggttttccccgatttgactgggtttgagtatgggtttg 75673  T
Q  183 ggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    |  |||||||||||| |||| |||| || ||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||| || |||||||    
T  75672 gattttccccgattttaaaatacggatacgggacggataacggggatatatgtacccaccccgagcctataccca 75598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7874 - 7738
Alignment:
Q  85 taggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatggg 184  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||  |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||| || | |     
T  7874 taggcatgccaacaaaatccatacccgtggttacccacccgaactaaatttaatttgacgggttttccccgttttgattgagtttgggtatgtgt-taga 7776  T
Q  185 atttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaa 222  Q
     |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7775 ttttctccaatttcaaaacacgggtatgagacgggtaa 7738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 253
Target Start/End: Original strand, 107301 - 107469
Alignment:
Q  84 ctaggcatggcaacaaaatccatatccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttaggtatgggtatgg 183  Q
    ||||||||| |||||||| |   |||| |||||| || ||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||| ||     
T  107301 ctaggcatgacaacaaaacctgcatccacggttatccatccgacccaaccccgatttgacgg-ttttccccactttgattgggtttaggtataggtttga 107399  T
Q  184 gatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccata 253  Q
    | ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |    |||||||||||||| |||||| ||||    
T  107400 gtttttctcgatttcaaaacacaggtatgggacgggtagcatagatataagtacccaccccgaactcata 107469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 157 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 211470 - 211370
Alignment:
Q  157 tttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccc 256  Q
    |||||||  |||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  211470 tttgactgagtttgggtatgggtttgggttttctccgatttcaaaatacgggtacgagacgggtaacagggatatatgtacccaccccgaacccataccc 211371  T
Q  257 a 257  Q
    |    
T  211370 a 211370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15002 - 14900
Alignment:
Q  109 ccgcggttacccgtccgaaccaaacccaatttgacgggttttccccgttttgacttggtttagg-tatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgg 207  Q
    ||||||||||||  ||||||||||   || ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15002 ccgcggttaccctcccgaaccaaatttaaattgacgggttttctccgctttgattgggtttagggtatgagtttgggttttccccgatttcaaaacacgg 14903  T
Q  208 gta 210  Q
    |||    
T  14902 gta 14900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3075 - 2978
Alignment:
Q  157 tttgacttggtttaggtatgggtatgggatttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatac 254  Q
    ||||||| ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3075 tttgactgggtttgggtatgagtttgggttttccccgatttcaaaatacgggtacaggacggataactgggatatatgtacccaccccgaacccatac 2978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 319
Target Start/End: Original strand, 197346 - 197472
Alignment:
Q  194 atttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacccatacctgtcccaaatataaaaaattactttatgttga 293  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||  | ||||| |||||||  ||||| | ||||||| ||| ||||| |||  | ||||||||||||||||||    
T  197346 atttcaaaacacggatatgagacaagtaacaggcatataggtacccaaaccgaatctatacccaaacccgtcccgaatgcagaaaattactttatgttga 197445  T
Q  294 tttg-tatgttattttgtttgataatt 319  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||    
T  197446 tatgccatgttattttgtttgataatt 197472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 70165 - 70101
Alignment:
Q  193 gatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  70165 gatttcataatacgggtacgggacgggtaacgaggatatatgtacccaccccaaacccataccca 70101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17040 - 16977
Alignment:
Q  190 cccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccata 253  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |||||| ||||    
T  17040 cccgatttcaaaatacgtgtatgggacgggtgacggggatatatgtacccaccccgaactcata 16977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 257
Target Start/End: Original strand, 128140 - 128203
Alignment:
Q  194 atttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||| | | ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  128140 atttcataatacgggtacgggacgggtaatggggatatatgtacccaccccgaacccataccca 128203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 257
Target Start/End: Original strand, 105485 - 105551
Alignment:
Q  191 ccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccataccca 257  Q
    ||||||||  || ||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  105485 ccgatttcttaatacgggtacgggacgggtaacagggatatatgtacccaccccgaacccataccca 105551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 255
Target Start/End: Original strand, 4592 - 4661
Alignment:
Q  186 tttccccgatttcaaaacacgggtatgggacgggtaacgagtatataagtacccactccgaacccatacc 255  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||  | |||||  |||||||  ||||||||||||    
T  4592 tttccccaatttcaaaatacgggtatgggacaggtaacagggatatagctacccaccacgaacccatacc 4661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University