View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17256_low_15 (Length: 264)

Name: NF17256_low_15
Description: NF17256
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17256_low_15
NF17256_low_15
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (3-252)||(27450638-27450886)
chr7 (11-252)||(47521927-47522168)
chr7 (3-252)||(5538501-5538750)
chr7 (3-252)||(34741586-34741828)
chr7 (3-249)||(16680317-16680563)
chr7 (3-249)||(17654553-17654799)
chr7 (3-252)||(10521688-10521937)
chr7 (11-252)||(37343116-37343357)
chr7 (16-236)||(13322905-13323125)
chr7 (3-240)||(15071245-15071482)
chr7 (3-252)||(42504884-42505133)
chr7 (3-252)||(41883398-41883647)
chr7 (3-252)||(48406216-48406465)
chr7 (3-249)||(17837818-17838057)
chr7 (3-252)||(17460212-17460461)
chr7 (3-252)||(17592753-17593002)
chr7 (3-252)||(35607341-35607590)
chr7 (11-252)||(9368352-9368593)
chr7 (53-252)||(16488280-16488480)
chr7 (81-240)||(11630243-11630402)
chr7 (1-251)||(47670154-47670404)
chr7 (1-238)||(36980416-36980651)
chr7 (130-252)||(41734713-41734835)
chr7 (74-248)||(17747638-17747813)
chr7 (112-235)||(22726680-22726803)
chr7 (11-73)||(41734638-41734700)
chr7 (1-73)||(9491989-9492061)
chr7 (11-45)||(11630418-11630452)
chr7 (120-205)||(9491891-9491976)
chr7 (213-252)||(19801568-19801607)
[»] chr3 (31 HSPs)
chr3 (3-250)||(20353399-20353646)
chr3 (1-252)||(17562289-17562540)
chr3 (3-257)||(2271997-2272251)
chr3 (3-252)||(44232576-44232818)
chr3 (3-240)||(41615127-41615356)
chr3 (3-252)||(49266315-49266564)
chr3 (3-238)||(9473137-9473372)
chr3 (3-238)||(36130343-36130578)
chr3 (3-252)||(42901106-42901355)
chr3 (11-257)||(54388991-54389237)
chr3 (3-252)||(599725-599974)
chr3 (15-252)||(34048295-34048532)
chr3 (3-240)||(46698273-46698510)
chr3 (11-252)||(50477723-50477964)
chr3 (3-238)||(52388558-52388793)
chr3 (3-252)||(46401563-46401812)
chr3 (12-240)||(49141476-49141704)
chr3 (3-252)||(4005357-4005605)
chr3 (3-252)||(6927989-6928232)
chr3 (3-252)||(50214113-50214355)
chr3 (3-224)||(48565734-48565948)
chr3 (54-252)||(2648522-2648720)
chr3 (3-240)||(42759520-42759750)
chr3 (3-233)||(47071152-47071375)
chr3 (1-252)||(48891373-48891624)
chr3 (3-236)||(16646365-16646586)
chr3 (1-237)||(42804922-42805158)
chr3 (2-251)||(30253041-30253290)
chr3 (1-120)||(50758955-50759074)
chr3 (197-252)||(11380982-11381037)
chr3 (68-184)||(12672370-12672486)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (3-240)||(50278012-50278249)
chr4 (3-257)||(8110009-8110263)
chr4 (3-252)||(21018542-21018791)
chr4 (1-252)||(10729944-10730195)
chr4 (1-252)||(10943713-10943964)
chr4 (3-236)||(44676950-44677183)
chr4 (3-252)||(6178754-6179003)
chr4 (3-252)||(40355367-40355616)
chr4 (3-252)||(49168369-49168618)
chr4 (39-252)||(50196220-50196437)
chr4 (3-252)||(31424598-31424847)
chr4 (3-252)||(41795989-41796238)
chr4 (1-257)||(71793-72049)
chr4 (11-252)||(49093287-49093529)
chr4 (60-252)||(50020648-50020840)
chr4 (3-252)||(1306084-1306335)
chr4 (1-250)||(13624485-13624734)
chr4 (11-252)||(51686001-51686221)
chr4 (81-252)||(46438956-46439127)
chr4 (11-236)||(37016563-37016776)
chr4 (11-238)||(14317475-14317702)
chr4 (94-252)||(30723691-30723849)
chr4 (11-211)||(30706770-30706970)
chr4 (3-228)||(50904221-50904437)
chr4 (28-257)||(55278729-55278958)
chr4 (68-252)||(21535188-21535362)
chr4 (12-257)||(40886573-40886820)
chr4 (1-235)||(12891768-12891999)
chr4 (157-252)||(11081589-11081684)
chr4 (3-88)||(30723877-30723962)
chr4 (1-110)||(41931068-41931177)
chr4 (188-250)||(41931008-41931070)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (3-240)||(5301269-5301506)
chr8 (3-252)||(34819560-34819809)
chr8 (3-252)||(15033715-15033964)
chr8 (3-236)||(34367576-34367809)
chr8 (11-252)||(20858879-20859120)
chr8 (3-252)||(35554453-35554695)
chr8 (3-236)||(39604145-39604378)
chr8 (3-257)||(39831696-39831942)
chr8 (3-252)||(1055384-1055633)
chr8 (3-252)||(23019237-23019486)
chr8 (3-252)||(26662305-26662554)
chr8 (1-257)||(45132595-45132851)
chr8 (3-240)||(40075662-40075892)
chr8 (11-252)||(486683-486924)
chr8 (11-235)||(5679727-5679951)
chr8 (3-252)||(22446-22695)
chr8 (3-252)||(30761222-30761485)
chr8 (3-252)||(42482456-42482705)
chr8 (11-212)||(21176303-21176504)
chr8 (79-252)||(43214318-43214491)
chr8 (81-252)||(41243034-41243205)
chr8 (2-252)||(51939-52189)
chr8 (72-245)||(22500772-22500945)
chr8 (3-52)||(43214261-43214310)
chr8 (3-52)||(41243215-41243264)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (3-252)||(36653446-36653695)
chr2 (3-252)||(39950352-39950595)
chr2 (3-236)||(29398571-29398804)
chr2 (3-252)||(15834114-15834363)
chr2 (3-252)||(28471386-28471635)
chr2 (3-252)||(30493911-30494160)
chr2 (11-252)||(5354837-5355078)
chr2 (3-252)||(43536654-43536903)
chr2 (11-252)||(43981387-43981628)
chr2 (11-240)||(45431371-45431600)
chr2 (3-240)||(17423324-17423561)
chr2 (3-236)||(10825884-10826110)
chr2 (3-150)||(7189671-7189818)
chr2 (1-251)||(7416638-7416888)
chr2 (11-235)||(20067426-20067647)
chr2 (1-251)||(40538395-40538631)
chr2 (108-143)||(22529914-22529949)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (3-252)||(47505198-47505447)
chr1 (3-257)||(47660730-47660984)
chr1 (3-252)||(45828433-45828682)
chr1 (3-252)||(52804725-52804974)
chr1 (11-257)||(19522223-19522462)
chr1 (3-252)||(13636950-13637199)
chr1 (3-240)||(19158878-19159115)
chr1 (3-252)||(21143794-21144036)
chr1 (3-236)||(31780627-31780853)
chr1 (11-252)||(3729293-3729534)
chr1 (39-252)||(50617843-50618056)
chr1 (11-235)||(16269758-16269982)
chr1 (3-240)||(95058-95288)
chr1 (3-252)||(22526860-22527101)
chr1 (3-252)||(11196720-11196969)
chr1 (3-252)||(38120109-38120358)
chr1 (3-252)||(26878574-26878816)
chr1 (1-251)||(49854968-49855218)
chr1 (111-252)||(51336870-51337011)
chr1 (68-147)||(23273427-23273506)
chr1 (174-252)||(23273351-23273429)
chr1 (124-238)||(35256370-35256484)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (3-252)||(8577489-8577738)
chr5 (3-252)||(38407801-38408043)
chr5 (3-240)||(5199625-5199855)
chr5 (3-252)||(38970899-38971148)
chr5 (11-257)||(30707913-30708159)
chr5 (3-252)||(19038113-19038362)
chr5 (3-252)||(28238683-28238932)
chr5 (6-252)||(42538654-42538900)
chr5 (3-248)||(28879456-28879701)
chr5 (1-251)||(8699377-8699627)
chr5 (79-252)||(42937606-42937780)
chr5 (3-204)||(7760195-7760389)
chr5 (1-252)||(15939501-15939751)
chr5 (11-207)||(511605-511794)
chr5 (3-252)||(8613-8852)
chr5 (68-238)||(40622969-40623139)
chr5 (3-52)||(42937788-42937837)
chr5 (199-236)||(7761597-7761634)
chr5 (11-51)||(40623144-40623184)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (3-252)||(26172776-26173024)
chr6 (3-252)||(22304088-22304337)
chr6 (3-252)||(31770932-31771174)
chr6 (3-252)||(6204007-6204256)
chr6 (3-252)||(11690974-11691223)
chr6 (3-252)||(30826568-30826817)
chr6 (3-202)||(2406023-2406222)
chr6 (3-246)||(2407101-2407337)
chr6 (3-252)||(27638606-27638855)
chr6 (20-252)||(3384304-3384535)
chr6 (1-251)||(32642748-32642997)
chr6 (55-251)||(32641812-32642008)
chr6 (2-251)||(24085775-24086014)
chr6 (1-166)||(18005475-18005640)
chr6 (3-88)||(26440299-26440384)
chr6 (37-229)||(21603276-21603468)
chr6 (186-237)||(18001770-18001821)
chr6 (209-252)||(3502038-3502081)
chr6 (218-252)||(24885583-24885617)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (1-237)||(12206-12442)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (11-235)||(22256-22481)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (39-146)||(56472-56579)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 27450886 - 27450638
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  27450886 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctgtgtgttatggtaca 27450787  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27450786 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaatgaagagtagatcattgcacaacagtgggagcggtatga 27450687  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27450686 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg-cgttgttgcct 27450638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 47522168 - 47521927
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47522168 cttccgcacttacacgtttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggaaagcagacatggcggatggcggatgactatgtgttatggtacactagggtg 47522069  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47522068 tctcaccctcagattttgccacctattccaggagatcttccgaggccagcaaatgaagagcagatcattgcacagcagtgggagcggtatgaggcgagaa 47521969  T
Q  211 gctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  47521968 gctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 47521927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 5538750 - 5538501
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5538750 ttcgtcgacttccgcactcacacacttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtgctatggtaca 5538651  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  5538650 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatctttcgaggccagcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtgggagcggtatga 5538551  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  5538550 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggtttgtggtgttgttgcct 5538501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 34741586 - 34741828
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  34741586 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcagccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcgga-------tggctatgtgttatggtaca 34741678  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  34741679 ctaggctgtctcaacctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgagaccagcaaatgaagagcatatcgttgcacaacagtgggagtggtatga 34741778  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34741779 ggcgagaagctcgtctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 34741828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 16680317 - 16680563
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16680317 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattagggtgagcaggcaggagagcagacttggcggatggcggatggctatgtgttatggtaca 16680416  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16680417 ctagggtgtgtcaccctcagattttgccacctgttccatgagatcttccgaggccagcaaatgaagagaagatcattgcacaacagtggaagcggtatga 16680516  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttg 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16680517 ggcgagaagctcgtctgacacctatgacatggttagtgccgctgttg 16680563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 17654553 - 17654799
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17654553 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattagggtgagcaggcaggagagcagacttggcggatggcggatggctatgtgttatggtaca 17654652  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17654653 ctagggtgtgtcaccctcagattttgccacctgttccatgagatcttccgaggccagcaaatgaagagaagatcattgcacaacagtggaagcggtatga 17654752  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttg 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17654753 ggcgagaagctcgtctgacacctatgacatggttagtgccgctgttg 17654799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 10521688 - 10521937
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  10521688 ttcgtcgactttcgcactcacacgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtcatatggtaca 10521787  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10521788 ctagggtgtctcaccctcatatcttgccacctcttccaggagatcttccgagacctgcaaatgaagagcatatcattgcagagcagtgggagcggtatga 10521887  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10521888 ggtgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtagcgttgttgcct 10521937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 37343116 - 37343357
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37343116 cttccgcactcacacgcttaaggaggccgattggggtgagcaggcagcagagcagacatggcatatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtg 37343215  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaa 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||    
T  37343216 tctcaccctcagatttttccacctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtgagagcggtacaaggcgagaa 37343315  T
Q  211 gctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37343316 gctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 37343357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 236
Target Start/End: Original strand, 13322905 - 13323125
Alignment:
Q  16 gcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctca 115  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  13322905 gcactcacacgcttaagggggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggcgatgttctatggtacactatggtgtctca 13323004  T
Q  116 ccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcg 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  13323005 ccctcagatattgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatgaagagcagatcattgcacaacagtgggagcggtatgaggcgagaagctca 13323104  T
Q  216 cctgacacctatgacatggtt 236  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  13323105 cttgacacctatgacatggtt 13323125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15071482 - 15071245
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  |||||||||    
T  15071482 ttcgtcgacttccgcactcacatgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtaca 15071383  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15071382 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtgggagcggtatga 15071283  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15071282 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg 15071245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 42505133 - 42504884
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  |||||||||    
T  42505133 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtaca 42505034  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  42505033 ctagggtgtctcaccctcatatcttgctgcctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagaccagtgggagcggtatga 42504934  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42504933 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgttgttgcct 42504884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 41883398 - 41883647
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||    
T  41883398 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtaca 41883497  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  41883498 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 41883597  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41883598 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 41883647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 48406216 - 48406465
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||    
T  48406216 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtaca 48406315  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  48406316 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 48406415  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  48406416 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 48406465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 17837818 - 17838057
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||  |||||||||    
T  17837818 ttcgtcgacttccgcacttacacgcttaaggcagacgattggggtgagcaagcaggagagcagacatggcgga-------tggctatgtcctatggtaca 17837910  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  || ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17837911 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagaacagatcattgcagagcagtgggagcggtatga 17838010  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17838011 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttg 17838057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 17460461 - 17460212
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||    
T  17460461 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtaca 17460362  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  17460361 ctagggtgtttcaccctcatatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 17460262  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17460261 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 17460212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 17592753 - 17593002
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||    
T  17592753 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtaca 17592852  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  17592853 ctagggtgtttcaccctcatatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 17592952  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17592953 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 17593002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 35607590 - 35607341
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||| | || |||||||||||||  | |||||||    
T  35607590 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcaggtggcggatggctatgtcctgtggtaca 35607491  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||  ||||||||||    
T  35607490 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtgacagcggtatga 35607391  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  35607390 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 35607341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 9368593 - 9368352
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||| ||||||||| | | | ||||| || |||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  9368593 cttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgtgcaggcaggagaggatacacggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtg 9368494  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  9368493 tctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatgaggcgagaa 9368394  T
Q  211 gctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9368393 gctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 9368352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 53 - 252
Target Start/End: Original strand, 16488280 - 16488480
Alignment:
Q  53 agcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccc-tcagattttgccacctcttccaggagatcttct 151  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  16488280 agcaggagagcagacatggcggataagggatggatatgtgttatggtacactaaggtgtttcacccctcagattgtgccacctcttccaggagatcttcc 16488379  T
Q  152 gaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcc 251  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16488380 gaggccagcaaatgaagagtagatcattgcacagcagtgggagcggtacgatgcgagaagctcgcctgatagctatgacatggttagtgtcgttgttgcc 16488479  T
Q  252 t 252  Q
    |    
T  16488480 t 16488480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 81 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11630402 - 11630243
Alignment:
Q  81 gatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattg 180  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||    
T  11630402 gatggttatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatgaagatcagatcattg 11630303  T
Q  181 cacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg 240  Q
    ||||   ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11630302 cacaatggtgagagcggtatgaggcgaaaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg 11630243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 47670404 - 47670154
Alignment:
Q  1 ctttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggta 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||  |  |||||||||| | ||||||    
T  47670404 ctttcgtcaacttccgcactcacgcgcttaagtcggccgattggggtgagcatccaggagaggagacatggcgtatagcatatggctatgtatgatggta 47670305  T
Q  101 cactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtat 200  Q
    | | |  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||  ||||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||||||     
T  47670304 cgccattgtgtctcaccctcagaatttgccacttcttccaggagatatttcgaggcctccaaatgaggagcagatcattgcagagcagtgggagcggtac 47670205  T
Q  201 gaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcc 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||    
T  47670204 gaggcgagaagctcgcctgatacctatgacatggttagcggcgatgttgcc 47670154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 36980416 - 36980651
Alignment:
Q  1 ctttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggta 100  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||| |||||| |||||  |||  |||||   ||||||    
T  36980416 ctttcgtcgactttcacactcacacacttaaggcggccgatttgggtgtgcatacaggagagcagacatggcgtatgac--atgattatgtacgatggta 36980513  T
Q  101 cactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtat 200  Q
    |||    ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||||||     
T  36980514 caccgttgtgcctcaccctcagatttagccacttcttccaggagatattctgaggcctccaaatgaggagcagatcattgcagagcagtgggagcggtac 36980613  T
Q  201 gaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttag 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36980614 gaggcgagaagctcgcctgatacctatgacatggttag 36980651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 252
Target Start/End: Original strand, 41734713 - 41734835
Alignment:
Q  130 cacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatga 229  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  41734713 cacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtgggagcggtacgaggtgagaagctcgtctgacacctatga 41734812  T
Q  230 catggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  41734813 catggttagtgtcgttgttgcct 41734835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17747813 - 17747638
Alignment:
Q  74 gatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgagg-ccagcaaatgaagtgca 172  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||   ||| ||| |||||||  ||||    
T  17747813 gatgaaggatggctatatgatatggtacactacagtgtctcaccctctgattttgccacttcttctaggagatctttcaaggcccatcaaatgagttgca 17747714  T
Q  173 tatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgtt 248  Q
     |||||||||||||| || |||  ||| ||||||||| |||||||||   | ||||| ||| |||||| |||||||    
T  17747713 aatcattgcacatcattgagagaagtacgaggcgagaggctcgcctgcttcttatgagatgtttagtggcgttgtt 17747638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22726803 - 22726680
Alignment:
Q  112 ctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaag 211  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||| |||||||||| ||||| | ||  ||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  22726803 ctcaccctctgattttgccacttatttaaggagatcttatgaggccagctaatgaggagccgatcattgcacaacagtggaagcagtacgaggcgagagg 22726704  T
Q  212 ctcgcctgacacctatgacatggt 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  22726703 ctcgcctgatacctatgacatggt 22726680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 41734638 - 41734700
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcg 73  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  41734638 cttccgcactcacacgcttaaggaggccgattggggtgagcaggcagcagagcagacatggcg 41734700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 9492061 - 9491989
Alignment:
Q  1 ctttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcg 73  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||    
T  9492061 ctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcgaccaattggggtgagcatgtaggagaggagacatggcg 9491989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 11630452 - 11630418
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggg 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11630452 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggg 11630418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9491976 - 9491891
Alignment:
Q  120 cagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggc 205  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||  |||||  ||||||| | ||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  9491976 cagattttgccacttcttctaggagatattccaaggcctccaaatgaggagcagatcattgcagagcagtgggagcggtacgaggc 9491891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 252
Target Start/End: Original strand, 19801568 - 19801607
Alignment:
Q  213 tcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19801568 tcgcctgacacctatgacatggttagtgtcactgttgcct 19801607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 31)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 250
Target Start/End: Original strand, 20353399 - 20353646
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20353399 ttcgtcgacttccacactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggctgatggcggatggctatgtgttatggtaca 20353498  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20353499 ctagggtgtctcaccctcagatttttccacctctttcacgagatcttctgaggccaacaaatgaagagcagatcattgcacagcagtgggagcggtatga 20353598  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgc 250  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20353599 gacgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgc 20353646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 17562540 - 17562289
Alignment:
Q  1 ctttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| |||||||    
T  17562540 ctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtgctatggta 17562441  T
Q  101 cactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  17562440 cactagggtgtctcaccctcagatctcgccatctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatgaaaagcagatcattgcaaagcagtgggagcggtat 17562341  T
Q  201 gaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17562340 gaggcgagaagctcgcttgacacctatgacatggttagtggcgttgttgcct 17562289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2272251 - 2271997
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  2272251 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtcctatggtaca 2272152  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2272151 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatcttttgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagaccagtgggagcggtatga 2272052  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcctttgct 257  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||    
T  2272051 ggcgagaagctcgcctaacacctatgacatgattagtggcgctgttgcctatgct 2271997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 44232576 - 44232818
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||        |||||||||||||||    
T  44232576 ttcgtcggcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaagagagcatacatggctgatgaca-------atgtgttatggtaca 44232668  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44232669 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatgaaaagcagatcattgcacatcagtgggagcggtatga 44232768  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44232769 ggtgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgccgttgttgcct 44232818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Original strand, 41615127 - 41615356
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  41615127 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttagggcggccgat-ggggtgagcaggcaggagagcagacatggcgga-------tggctatgtgttatggtaca 41615218  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41615219 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttacaggagatcttccgaggccagcaaatgaagagcagatcattgcacaacagtggaagcggtatga 41615318  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41615319 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg 41615356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 49266564 - 49266315
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||| | |||| || ||||||||||||||    
T  49266564 ttcgtcgactttcgcactcacacgcttaaggtggccgattagggtgagcaggcaggaaagcagacatggcggatggcagatgactgtgtgttatggtaca 49266465  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  49266464 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggtcagcaaatgaagagcaaatcattgcatagcagtgggagcggtatta 49266365  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  49266364 ggcgagaagctcgtctgacacttatgacatggttagtggcgatgttgcct 49266315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 238
Target Start/End: Original strand, 9473137 - 9473372
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  9473137 ttcgtcgacttccgcactcagacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagaggagacatgacggatggcggatggctatgtcctatggtaca 9473236  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  9473237 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtgagagcggtatga 9473336  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9473337 ggcgagaagctcgcctgacacctacgatatggttag 9473372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 238
Target Start/End: Original strand, 36130343 - 36130578
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | ||||||||| || |||||||||    
T  36130343 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcaggagagcatacatggcggatggctgatggctatatgctatggtaca 36130442  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||    
T  36130443 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctctccctggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcatatcattgcagaccagttggagcggtaaga 36130542  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttag 238  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  36130543 ggcgagaagctcgtctgacacctacgacatggttag 36130578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 42901355 - 42901106
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||    
T  42901355 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtaca 42901256  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  42901255 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 42901156  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  42901155 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 42901106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 257
Target Start/End: Original strand, 54388991 - 54389237
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  54388991 cttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtg 54389090  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  54389091 tctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatgaggcgagaa 54389190  T
Q  211 gctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcctttgct 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  54389191 gctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcctatgct 54389237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 599725 - 599974
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||||||  | |||||||||    
T  599725 ttcgtcgacttctgcactcacacgcttaaggtggacgattggggtgagcaggcaggagagcagtcatggcggatggctgatggctattagctatggtaca 599824  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  599825 ctaggatgtctcaccctcagatttcgccacctcttcctggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtgggagcggtacga 599924  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  599925 ggcgagaagctcgcctgacacctacgacatggttagtgccgctgttgcct 599974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 252
Target Start/End: Original strand, 34048295 - 34048532
Alignment:
Q  15 cgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  34048295 cgcactcacacgcttaaggcggtagcttggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctc 34048394  T
Q  115 accctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctc 214  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34048395 accctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatgaggcgagaagctc 34048494  T
Q  215 gcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  34048495 gcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 34048532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 46698510 - 46698273
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||    
T  46698510 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaagacggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtaca 46698411  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  46698410 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 46698311  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46698310 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg 46698273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 50477964 - 50477723
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  50477964 cttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtg 50477865  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  50477864 tctcaccctcagatcttgccacctattccagtagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatgaggcgagaa 50477765  T
Q  211 gctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  50477764 gctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 50477723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 52388793 - 52388558
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||| || ||||||| |    
T  52388793 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcaggagagtagacatggcggatggctgatggctatatgctatggtaga 52388694  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||| ||    
T  52388693 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctctcaatggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagacaagtgggagcggtacga 52388594  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52388593 ggcgagaagctcgcctgacacctacgacatggttag 52388558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 46401563 - 46401812
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  | ||||||     
T  46401563 ttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgtccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacg 46401662  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  46401663 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 46401762  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  46401763 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 46401812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 49141704 - 49141476
Alignment:
Q  12 ttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtgt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  49141704 ttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgt 49141605  T
Q  112 ctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaag 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||    
T  49141604 ctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatgaggcgggaag 49141505  T
Q  212 ctcgcctgacacctatgacatggttagtg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49141504 ctcgcctgacacctatgacatggttagtg 49141476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 4005605 - 4005357
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| || |||||||||    
T  4005605 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaagcggc-gattggggtgagtaggcaggagagcagacatggcggatggctgatggctatatgctatggtaca 4005507  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| | | | |||||||||||| ||    
T  4005506 ctagggtgtctcaccctcatactttgccacctctccctagagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgtagaccggtgggagcggtacga 4005407  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  4005406 ggcgagaagctcgcctgacgcctacgacatggttagcggcgttgttgcct 4005357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 6927989 - 6928232
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgtt-atggtac 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||       |||||||||| |||||||    
T  6927989 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcgcaagagcagacatggcggatg-------gctatgtgtttatggtac 6928081  T
Q  102 actagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatg 201  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||| |    
T  6928082 actaaggtgtgtcaccctcaaattttgccacctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatgaagagcagatcattgcagagcggtgggagcggtacg 6928181  T
Q  202 aggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6928182 aggtgagaagttcgcctgacacctatggcatggttagtgtcgtagttgcct 6928232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 50214355 - 50214113
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||       |||||||| |||||||||    
T  50214355 ttcgtcgacttcctcactcacacgcttaagacgaccgattggggtgagcagctaagagagcagacatggcggatg-------gctatgtgctatggtaca 50214263  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50214262 ctagggtgtctcaccctcaaatcttgccacctcttccaggagatattccgaggccagcaaatgaaaagcagatcattgcacagcagtgggagcggtatga 50214163  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  50214162 ggcgagaagcccgcctaacacctatgacatggattgtggcgttgttgcct 50214113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Original strand, 48565734 - 48565948
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  48565734 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggtcgaatggggtgagcaggcacaagagcagacatggcgga-------tggctatgtgttatggtaca 48565826  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||| ||| ||    
T  48565827 ctgaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccagaagatcttccgaggccagcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtgggagcagtacga 48565926  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  48565927 ggcgagaagctcgcctgacacc 48565948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 54 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 2648720 - 2648522
Alignment:
Q  54 gcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctga 153  Q
    ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  2648720 gcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccga 2648621  T
Q  154 ggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2648620 ggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagaccaatgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 2648522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Original strand, 42759520 - 42759750
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||       ||||||||| ||||||||||    
T  42759520 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggtggtcgattggggtgagcagacacaagagcagacatggcgga-------tggctatgttttatggtaca 42759612  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  42759613 ctaaggtgtctcaccctcaaattttgccacctcttctaagagatcttccgaggccagcaaatgaagaacagatcattgcacagtagtgggagcggcatga 42759712  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg 240  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  42759713 ggcgagaagctcgtctgacacccatgacatggttagtg 42759750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 47071375 - 47071152
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||       |||||||| |||||||||    
T  47071375 ttcgtcgacttccgcactcacatgcttaaggcggctgattgaggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatg-------gctatgtgctatggtaca 47071283  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||| ||  ||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  47071282 ctagggtgtctcactcttggatcttgccacctttaccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtgggagcggtatga 47071183  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatg 233  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47071182 ggcgagaaactcgcctgacatctatgacatg 47071152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 48891373 - 48891624
Alignment:
Q  1 ctttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  |||||| ||| | |||||||||||   ||||||    
T  48891373 ctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggagtgagcatgcatgagagcaggcatggcgtatggcagatggctatgtacgatggta 48891472  T
Q  101 cactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtat 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||  ||||||| | | | ||||||||  | ||||||||||||||     
T  48891473 caccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttcttccaggagatattacgaggcctccaaatgaggagaagatcattgctgagcagtgggagcggtac 48891572  T
Q  201 gaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  48891573 gaggcgagaagctcgcctgatacctatgacatggttagcggcgttgttgcct 48891624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 236
Target Start/End: Original strand, 16646365 - 16646586
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||            ||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |    
T  16646365 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcagacgattggggtgagcacaca------------tggcggatggcggatgactatgtgctatggtaaa 16646452  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16646453 ctagggtgtctcaccctttgattttgccacctcttccaggagatcttccgagacttgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtgggagcggtatga 16646552  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggtt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16646553 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggtt 16646586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 42805158 - 42804922
Alignment:
Q  1 ctttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| | ||| | |||||||||||   ||||||    
T  42805158 ctttcgtcgacttccgcactcgtacgcttaaggcgggcgattggggtgagcatgcatgagaggagacatggtgtatggcagatggctatgtacgatggta 42805059  T
Q  101 cactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtat 200  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||| ||||||| | | ||||||||||||||     
T  42805058 caccattgtgtctcaccctcagattttgccacttcttccaggagatattctgaggcctccaaatgaggagcagatcattgtagagcagtgggagcggtac 42804959  T
Q  201 gaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggtta 237  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  42804958 gaggcaagaagctcgcatgatacctatgatatggtta 42804922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30253290 - 30253041
Alignment:
Q  2 tttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtac 101  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| || | |||||| ||| | |||||||||||   |||||||    
T  30253290 tttcatcgacttccgcactcacacgcttaaggcggctgactggggtgagcatgcaagagaacaaacatggcgtatggcagatggctatgtacgatggtac 30253191  T
Q  102 actagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatg 201  Q
    |     ||||||||  ||||||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||| |    
T  30253190 atcgttgtgtctcatgctcagattttgccacttcttctgggagatattccgaggcctccaaatgaagagcatatcattgtagagcagtgggagcggtacg 30253091  T
Q  202 aggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcc 251  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||    
T  30253090 aggctagaagctcgcctgatacctatgacatggttagcggcgctgttgcc 30253041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 50758955 - 50759074
Alignment:
Q  1 ctttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||   |||||||||||   ||||||    
T  50758955 ctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcatgcaggagagcagacatggcgtatggtagatggctatgtacgatggta 50759054  T
Q  101 cactagggtgtctcaccctc 120  Q
    |||    |||||||||||||    
T  50759055 caccgttgtgtctcaccctc 50759074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11381037 - 11380982
Alignment:
Q  197 gtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11381037 gtatgaggcgtgaagctcgcctaacacctatgacatggttagtgccgttgttgcct 11380982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 184
Target Start/End: Original strand, 12672370 - 12672486
Alignment:
Q  68 atggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaa 167  Q
    ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||  ||| |||| ||||||||| | |||||||||| |||   ||  || || |||||||||||||||     
T  12672370 atggcagatgaaggatggctatatgctatggtaccttagagtgtttcaccctcaaagtttgccacctattctgagatctcctccgaggccagcaaatgag 12672469  T
Q  168 gtgcatatcattgcaca 184  Q
    | ||| |||||||||||    
T  12672470 gagcagatcattgcaca 12672486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Original strand, 50278012 - 50278249
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  50278012 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcagccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtgttatggcaca 50278111  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50278112 ctagggtgtctcaccctcatattttgtcacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatgaagagcagatcattgcacagcagtgggagcggtatga 50278211  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50278212 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg 50278249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Original strand, 8110009 - 8110263
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8110009 ttcgtcgactttcgcactcatacgcttaaggcagccgattggggtgagcaggcaagagagcagacatggttgatggcggatggctatgtgttatggtaca 8110108  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8110109 ctagggtgtctcaccctcagatttttccacatcttccaggagatcttccgaggccagcaaatgaagagcagatcattgcacagcagtgggagcggtatga 8110208  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcctttgct 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| || |||||||| ||||    
T  8110209 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatatttcgtgccgctgttgcctatgct 8110263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21018791 - 21018542
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  21018791 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggagacatggcggatggcggatggctatgtcctatggtaca 21018692  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  21018691 ctagggtgtctcaccctaagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagtagtgggagcggtatga 21018592  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  21018591 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttaatggcgctgttgcct 21018542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10730195 - 10729944
Alignment:
Q  1 ctttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| || |||| ||| |||||||||||||||||    
T  10730195 ctttcgtcgacttccgcactcacacgctgaaggaggccgattggggtgagcaggcacgagagcagacatgacgtatgagggagggctatgtgttatggta 10730096  T
Q  101 cactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtat 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||||||     
T  10730095 cactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatgaggagcagatcattgcagagcagtgggagcggtac 10729996  T
Q  201 gaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10729995 aaggcgagaagctcgcctgatacctatgacatggttagcggcgttgttgcct 10729944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10943964 - 10943713
Alignment:
Q  1 ctttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| || |||| ||| |||||||||||||||||    
T  10943964 ctttcgtcgacttccgcactcacacgctgaaggaggccgattggggtgagcaggcacgagagcagacatgacgtatgagggagggctatgtgttatggta 10943865  T
Q  101 cactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtat 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||||||     
T  10943864 cactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatgaggagcagatcattgcagagcagtgggagcggtac 10943765  T
Q  201 gaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10943764 aaggcgagaagctcgcctgatacctatgacatggttagcggcgttgttgcct 10943713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44677183 - 44676950
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  44677183 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagaacagacatggcacatggcggatggctgtgtgctatggtaca 44677084  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||| | |||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  44677083 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatttttcgaggcctgtaaatgaagagcagatcattgcagagcagtgggagcggtatga 44676984  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggtt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44676983 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggtt 44676950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 6179003 - 6178754
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||    
T  6179003 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtaca 6178904  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  6178903 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 6178804  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6178803 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 6178754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 40355616 - 40355367
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || || ||||| ||||  |||||||||    
T  40355616 ttcgtcgacttccgcactcacacgattaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcgaatggcaatgtcatatggtaca 40355517  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  40355516 ctagggtgtctaaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgagacctgcaaatgaagagcagatcattgcagaccagtgggagcggtatga 40355417  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40355416 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgttgttgcct 40355367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 49168369 - 49168618
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||    
T  49168369 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtaca 49168468  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  49168469 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 49168568  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  49168569 ggcgagaagctcgcctgacacctatggcatggttagtggcgctgttgcct 49168618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 39 - 252
Target Start/End: Original strand, 50196220 - 50196437
Alignment:
Q  39 gattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacact----agggtgtctcaccctcagattttgccacct 134  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50196220 gattggggtgtgcaggtaggagagcagacatggctgatggtggatggctatgtgttatggtacactcactagggtgtctcaccctcagattttgccacct 50196319  T
Q  135 cttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatgg 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50196320 cttccaggagatcttccgaggccagcaaatgaagagcagatcattgcacagcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatgg 50196419  T
Q  235 ttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||| || ||||||||    
T  50196420 ttagtgccgctgttgcct 50196437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 31424598 - 31424847
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | ||| |||    
T  31424598 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggcaca 31424697  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  31424698 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 31424797  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  31424798 ggcgagaagctcgtctgacacctgtgacatggttagtggcgctgttgcct 31424847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 41796238 - 41795989
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||||| ||| |||||||  |  |||||||||||| || ||||||     
T  41796238 ttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcctggggtgagcaggtaggagaggagacatggcgggcgggggatggctatgtcttgtggtacg 41796139  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  41796138 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 41796039  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41796038 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 41795989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 71793 - 72049
Alignment:
Q  1 ctttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||   ||||||    
T  71793 ctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcatgcaggagagcagacatggcgtatggcggatggctatgtacgatggta 71892  T
Q  101 cactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtat 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||| |  |||||||||||||     
T  71893 caccgttgtgtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagatattctgaggcctccaaatgaggagcagatcattgcagagtagtgggagcggtac 71992  T
Q  201 gaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcctttgct 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  71993 gaggcgagaagctcgcctgatacctatgacatggttagcggcgttgttgcctatgct 72049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 49093287 - 49093529
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatgg-cggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggt 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | |||| ||| || |||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  49093287 cttccgcactcacatgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatgggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggt 49093386  T
Q  110 gtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgaga 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  49093387 gtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatgaggcgaga 49093486  T
Q  210 agctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  49093487 agctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 49093529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 60 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 50020840 - 50020648
Alignment:
Q  60 gagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccag 159  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  50020840 gagcagacatggctgatggcggatggctatatgttatggtacactagggtgtctcaccctcaaattttgccacctcttccaagagatcttccgaggccag 50020741  T
Q  160 caaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  50020740 caaatgaagagcagatcattgcataacagtgggagcggtatgaggcgagaagcttgcctgacacctatgacatggttagtgccgctgttgcct 50020648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1306335 - 1306084
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcg--gatgacggatggctatgtgttatggta 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| | ||||||| | | ||||||  | || |||||||||||||  | |||||    
T  1306335 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggtaggagaggatacatggcgcgggtggcggatggctatgtcctgtggta 1306236  T
Q  101 cactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||||||| | |||||| |||||||     
T  1306235 cactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagaagatcattgcagagcagtggcagcggtaa 1306136  T
Q  201 gaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1306135 gaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 1306084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13624734 - 13624485
Alignment:
Q  1 ctttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | ||||||    
T  13624734 ctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcatgcaagagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtatgatggta 13624635  T
Q  101 cactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtat 200  Q
    ||     |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||  ||||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||||||     
T  13624634 catcgttgtgtctcaccctcagatttttccacatcttccaggagatattctgatgcctccaaatgaggagcagatcattgcagagcagtgggagcggtac 13624535  T
Q  201 gaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgc 250  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13624534 gaggcgagaagctcgcatgatacctatgatatggttagtggcgttgttgc 13624485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 51686001 - 51686221
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51686001 cttctgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagaacagacatggcggatgacagatggctatgtgttatggtacactagggtg 51686100  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaa 210  Q
    ||||                     ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51686101 tctc---------------------ttctaggagatcttccgaggccaacaaatgaagagcagatcattgcacaacagtgggagcggtatgaggcgagaa 51686179  T
Q  211 gctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  51686180 gctcgcctgacacctatgacatggttagtgccgctgttgcct 51686221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 81 - 252
Target Start/End: Original strand, 46438956 - 46439127
Alignment:
Q  81 gatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattg 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  46438956 gatggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcaaattttgccacctcttccatgagatcttccgaggccagcaaacgaatagcagatcattg 46439055  T
Q  181 cacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
     | | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46439056 tagagcagtggaagcggtacgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 46439127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37016776 - 37016563
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||            |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37016776 cttccgcactcacacacttaaggcggacgattggggtg------------agcagacatggcggatggcggatggctatgtgctatggtacactagggtg 37016689  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaa 210  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||    
T  37016688 tctcaccctaagatcttgccacctctttcagtagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtgaaagcggtatgaggcgagaa 37016589  T
Q  211 gctcgcctgacacctatgacatggtt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  37016588 gctcgcctgacacctatgacatggtt 37016563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 14317475 - 14317702
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||  || |||||||| | |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14317475 cttccgcactcacacgcttaaggagcctgaatggggtgagccggcgggagagcaaacatggcgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtg 14317574  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaa 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| | ||| || |||||| | ||||| |||||||| ||||||||||    
T  14317575 tctcaccctcatattttgccacctcttccaggagatcttccgagaccatcaaatgaggagcagattattgcagagcagtgtgagcggtacgaggcgagaa 14317674  T
Q  211 gctcgcctgacacctatgacatggttag 238  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  14317675 gctcgcgtgatacctatgacattgttag 14317702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 30723849 - 30723691
Alignment:
Q  94 tatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtggga 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| ||||||||| | ||||||||    
T  30723849 tatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgtaaatgaagagcagatcattgcagaccagtggga 30723750  T
Q  194 gcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30723749 gcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 30723691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 211
Target Start/End: Original strand, 30706770 - 30706970
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| |||| |||  | | ||||||||| ||||||| ||||    
T  30706770 cttctgcactcacacgtttaaggaggccgattggggtgagctggcagcagagcagacatggcgtatgagggaatgttgtgtgttatgatacactaaggtg 30706869  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  |||| |||||||| ||||||||||    
T  30706870 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttcggaggccaacaaatgaagagcatatcattgcagagtagtgtgagcggtacgaggcgagaa 30706969  T
Q  211 g 211  Q
    |    
T  30706970 g 30706970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 50904221 - 50904437
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||| |       |||||||| |||||||||    
T  50904221 ttcgtcgatttccgcactcacacgcttaaggtggccgattgaggtgagcaggtaggagagcagacatggcggacg-------gctatgtgctatggtaca 50904313  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||| | ||  ||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  50904314 ctagggtatctcaccctcagattttgtcacctctttcagaagatcttcccaggccagcaaatgaggagc--atcattgcagagcagtgggagcggtacga 50904411  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatg 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  50904412 ggcgagaagctcgcctgatacctatg 50904437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 55278958 - 55278729
Alignment:
Q  28 ttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagatttt 127  Q
    |||||| | ||||||| ||||||| | ||  |||| ||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  55278958 ttaaggagcccgattgaggtgagccaacaaaagaggagacatggcggatggaggatggctatgtactatggtacactagggtgactcaccctctgatttt 55278859  T
Q  128 gccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctat 227  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |||||||||| || |||    
T  55278858 gccacttcttccaggatatcttccgaggccagctaatgaggagcaaatcattgcacaacagtgggagtagtacgaggcgagaggctcgcctgatacttat 55278759  T
Q  228 gacatggttagtgtcgttgttgcctttgct 257  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  55278758 gacatggttagtggtgttgttgcctatgct 55278729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21535362 - 21535188
Alignment:
Q  68 atggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaa 167  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||          |||    
T  21535362 atggtggatgagggatgactatgtgttatggtacactacgatgtctcaccttcagatttttccacctcttccaggagatcttctgag----------gaa 21535273  T
Q  168 gtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    | | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21535272 gagtagatcattgcacaacagtgagagcggtatgaggcgagaagctcgcctgatacctatgacatggttagtgccgctgttgcct 21535188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 40886820 - 40886573
Alignment:
Q  12 ttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtgt 111  Q
    ||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||  ||| |||||  || ||||| ||||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  40886820 ttccgtactcacacgattaaggagcccgattggggtgagccggcatgagaggtgacatggcagatggatgatggttatatgttatggtacactagggtgt 40886721  T
Q  112 ctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtggga--gcggtatgaggcgaga 209  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| | |   | |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||    
T  40886720 ctcaccctcagattttgccacttattccggtatcacctctgaggccagcaaatgaggagcagatcattgcacaccagtgggagcgcggtacgaggcgaga 40886621  T
Q  210 agctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcctttgct 257  Q
     |||| | ||| || ||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  40886620 ggctctcttgatacttatgagatgattaatggcgttgttgcctatgct 40886573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 12891768 - 12891999
Alignment:
Q  1 ctttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggta 100  Q
    ||||||| | || |||||||||||   |||||| | ||||||||||| ||| |||||||   || | ||||||||||  |||||||||| |    |||||    
T  12891768 ctttcgttgactaccgcactcacaaaattaaggagcccgattggggtcagccagcaggaccacatacatggcggatggaggatggctatatacggtggta 12891867  T
Q  101 cactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtat 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||  ||||||| | ||||| | | | ||| ||||||||||||||||||  ||     
T  12891868 cactagggtgtatcaccctcagattttgccacttctttcgggagatctttcgaggccaactaatgatgagaagatcgttgcacatcagtgggagcaatac 12891967  T
Q  201 gaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggt 235  Q
    ||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  12891968 gaggcgagaagctcgc---atacctatgacatggt 12891999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11081684 - 11081589
Alignment:
Q  157 cagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  11081684 cagcaaatgaagggcagatcattgcagagcagtgggggcggtacgaggcgagaagctcgcctgatacctgtgacatggttagtggcgatgttgcct 11081589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 30723962 - 30723877
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggcta 88  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || ||||||||||    
T  30723962 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggcta 30723877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 41931177 - 41931068
Alignment:
Q  1 ctttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |  |||| ||| || | |||| |||||||    
T  41931177 ctttcgtcgacttccgcactcacatgattaaggaggccgattggggtgagcaggcagcagagcagacatgacttatgagggagggttgtgtgctatggta 41931078  T
Q  101 cactagggtg 110  Q
    ||||| ||||    
T  41931077 cactaaggtg 41931068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41931070 - 41931008
Alignment:
Q  188 gtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgc 250  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | |||||||||    
T  41931070 gtgggagcggtacgaggcgagaagctcgcctgatacttgtgacatggttagcggcgttgttgc 41931008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5301506 - 5301269
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5301506 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattgaggcgagcaggcaggagagcagacatgatggatggcggatgactatgtgttatggtaca 5301407  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5301406 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccaaggccagcaaatgaagagcatatcattgcacagcagtgggagcggtatga 5301307  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5301306 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg 5301269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 34819809 - 34819560
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34819809 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcagccgattggggtgagcaggcacaggagcagacatggcggatggcggatggctatgtgttatggtaca 34819710  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  34819709 ctaaggtgtttcaccctcagatttttccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtgggagcggtacga 34819610  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34819609 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgccgttgttgcct 34819560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15033964 - 15033715
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||  | |||||||    
T  15033964 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcggatggcggatggctatgtcctgtggtaca 15033865  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15033864 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagatcagtgggagcagtatga 15033765  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15033764 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 15033715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34367809 - 34367576
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34367809 ttcgtcgactttcgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtgctatggtaca 34367710  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  34367709 ctagggtatctcaccctcagatcttgccacctctttcaggagatcttctgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtgagagcggtatga 34367610  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggtt 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34367609 ggcgagaagctcgcctgaaacctatgacatggtt 34367576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 20858879 - 20859120
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20858879 cttccacactcacacccttaaggcggcctattggagtgagcaggcaggagagcatacatggatgatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtg 20858978  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaa 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20858979 tctcaccctcagatttttccacctcttccaggagatctttcgaggcaagcaaatgaagagtagatcattgcacagcagtgggagcggtatgaggcgagaa 20859078  T
Q  211 gctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20859079 gctcgactgacacctatgacatggttagtgccgttgttgcct 20859120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 35554453 - 35554695
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  35554453 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcacaaaagcagacatggcgga-------tggctatgtgttatggtaca 35554545  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||    
T  35554546 ctaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtgagagcggtacga 35554645  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35554646 ggcaagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgccgttgttgcct 35554695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 236
Target Start/End: Original strand, 39604145 - 39604378
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||| |||||| ||||||  |||||||||    
T  39604145 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggtggccgattggggtgagcatgcaggagagtagacatgacggatggcggatgactatgtcctatggtaca 39604244  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  39604245 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggaaatcttctgaggcctgcaaatgaagagtagatcattgcagagcagtgtgagcggtatga 39604344  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggtt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39604345 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggtt 39604378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 39831942 - 39831696
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||        ||||||||||||||||    
T  39831942 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggtcgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatgat-------tatgtgttatggtaca 39831850  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39831849 ctagg-tgtctcaccctcagattttgccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaatgaagagcagatcattgcacaggagtgggagcggtatga 39831751  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcctttgct 257  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  39831750 ggcgagaagctcgctggactcctatgacatggttagtggcgttgttgcctatgct 39831696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 1055384 - 1055633
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||    
T  1055384 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtaca 1055483  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  1055484 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 1055583  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1055584 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 1055633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23019486 - 23019237
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||    
T  23019486 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtaca 23019387  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  23019386 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 23019287  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23019286 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 23019237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 26662305 - 26662554
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||    
T  26662305 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtaca 26662404  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  26662405 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 26662504  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26662505 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 26662554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 45132595 - 45132851
Alignment:
Q  1 ctttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || ||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  45132595 ctttcgtcgacttccgcactcacatgcttaaggaggccgattggggtgagcaggtagcagatcagacatggcgtatgagggagggctatgtgttatggta 45132694  T
Q  101 cactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtat 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | | ||||||||| | |||||| |||||||     
T  45132695 cactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatgaggagtagatcattgcagagcagtggaagcggtac 45132794  T
Q  201 gaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcctttgct 257  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||| |||||| ||||    
T  45132795 gaggcgagaagctcgcctgatgcctatgacatggttagcggcgttattgcctatgct 45132851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40075892 - 40075662
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||    
T  40075892 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcaaccgattggggtgagcaggcacaagagcagacatggcggatg-------gctatgtgttatggtaca 40075800  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||    
T  40075799 ctaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatgaagggcagatcattgcagagcagtgagagcggtacga 40075700  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40075699 ggcgagaagctcgcctaacacctatgacatggttagtg 40075662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 486924 - 486683
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  486924 cttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtg 486825  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  486824 tctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatctttcgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatgaggcgagaa 486725  T
Q  211 gctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  486724 gctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 486683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 5679727 - 5679951
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  5679727 cttccgcactcacacgcttaaggagcccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcgtatgagggatggctatgtgctatggtatactacggtg 5679826  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaa 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  5679827 tctcaccctcggattttgccacctcttccagtagatcttccgaggctagcaaatgaagaggagatcattgcacagcattgggagcggtacgaggcgagaa 5679926  T
Q  211 gctcgcctgacacctatgacatggt 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  5679927 gctcgcctgatacctatgacatggt 5679951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22695 - 22446
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || | |||| ||||||  | |||||||    
T  22695 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcagatgactatgtcctgtggtaca 22596  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  22595 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatattccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 22496  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22495 ggcgagaggctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 22446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 30761485 - 30761222
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatgg--------------cggatgacggatggcta 88  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||              |||||| |||||| |||    
T  30761485 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggtggccgattggggtgagcatgcaggagagcagacatggtggatggcagatggcggatggcggatgacta 30761386  T
Q  89 tgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcag 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  ||| |||||| |||| |||    
T  30761385 tgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcaaatttttccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaataaaaagcagatcattacacagcag 30761286  T
Q  189 tgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30761285 tggaagcggtatgaggtgagaagctcgcctgatacctatgacatggttagtgccgctgttgcct 30761222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 42482705 - 42482456
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||| |||||| || | | |||| || || ||||||||||| |  | |||||||    
T  42482705 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttgaggcggacgctcggggtgagcaggcaggaaaggatacatggtgggtggcggatggctatatcctgtggtaca 42482606  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  42482605 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagtagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 42482506  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  42482505 ggcgataagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 42482456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21176504 - 21176303
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||  ||||    
T  21176504 cttccgcactcacacgcttaaggagcacgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcgtatgagggatgactatgtgctatggtacactgcggtg 21176405  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaa 210  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21176404 tcacaccctcagattttgacacctcttccagaagatcttctgaggccagcaaatgaagagccgatcattgcacatcagtgagagcggtacgaggcgagaa 21176305  T
Q  211 gc 212  Q
    ||    
T  21176304 gc 21176303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 79 - 252
Target Start/End: Original strand, 43214318 - 43214491
Alignment:
Q  79 cggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcat 178  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  43214318 cggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatattatgaggcctgcaaatgaagagcagatcat 43214417  T
Q  179 tgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  43214418 tgcagaccagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgatacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 43214491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 81 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 41243205 - 41243034
Alignment:
Q  81 gatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattg 180  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| |||| ||    
T  41243205 gatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgtcacctcttccaggagatcttccaaggcctgcaaatgaagagcaaatcactg 41243106  T
Q  181 cacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41243105 cagagcagtgggagcggtacgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgccgctgttgcct 41243034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 252
Target Start/End: Original strand, 51939 - 52189
Alignment:
Q  2 tttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtac 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||| |||||||||||   |||||||    
T  51939 tttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggtcgattggggtgagcatgcatgagagcagacatggcatatgacagatggctatgtacgatggtac 52038  T
Q  102 actagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatg 201  Q
    ||    |||||||||||||| ||||| |||| |||| || ||||| ||| ||||||  |||||||   ||| ||||||||| | |||||||||||||| |    
T  52039 accgttgtgtctcaccctcacatttttccacttctttcatgagatattccgaggcctccaaatgagaagcagatcattgcagagcagtgggagcggtacg 52138  T
Q  202 aggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  52139 aggcgagaagctcacctgatatctatgacatggttagcggcgttgttgcct 52189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 245
Target Start/End: Original strand, 22500772 - 22500945
Alignment:
Q  72 cggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgc 171  Q
    ||||||| ||| | |||| || |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| | |||  |||  || ||||| |||| ||||||| | ||    
T  22500772 cggatgaaggacgtctatatgctatggtacactagggtttctcatcctcatattttgccacatattctgggatctcctctgaagccaacaaatgatgagc 22500871  T
Q  172 atatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgtt 245  Q
    | ||||||||||| ||||||||||   |  | |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  22500872 agatcattgcacaccagtgggagcaacaccaagcgagaggctcgcctgatacctatgatatggttagtggcgtt 22500945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 52
Target Start/End: Original strand, 43214261 - 43214310
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagca 52  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43214261 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcgaacgattggggtgagca 43214310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 41243264 - 41243215
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagca 52  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  41243264 ttcgtcgacttccgcactgacacgcttaaggcagacgattggggtgagca 41243215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 36653695 - 36653446
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36653695 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcagacaggagagcagacatggtggatgacggatggctatgtgttatggtata 36653596  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  36653595 ctcgggtgtctcgccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaattgaagagcagatcattgcacaacagtgggagcggtagga 36653496  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36653495 gacgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 36653446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 39950352 - 39950595
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  39950352 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtcctatggtaca 39950451  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||      ||||    
T  39950452 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggg------atga 39950545  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39950546 ggcgagaagctcgtctgacacctatgacatggttagtggcgttgttgcct 39950595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29398804 - 29398571
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  29398804 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatgactatgtgctatggtaca 29398705  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||||||    
T  29398704 ctagggtgtctcaccctcagattttgtcatctcttccaggaaatcttcctaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcggtgggagcggtatga 29398605  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggtt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29398604 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggtt 29398571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 15834114 - 15834363
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||    
T  15834114 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtaca 15834213  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  15834214 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 15834313  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15834314 ggcgagaaactcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 15834363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 28471386 - 28471635
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| | ||||||| | | |||||||  | |||||||||||||  |||||||||    
T  28471386 ttcgtcgacttccgcactcacacgattaaggcggacgatcggggtgagcaggtaggagaggatacatggcgggcggcggatggctatgtcatatggtaca 28471485  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  28471486 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgagacctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtgggagcggtatga 28471585  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28471586 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 28471635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 30494160 - 30493911
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||    
T  30494160 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtaca 30494061  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  30494060 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 30493961  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30493960 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 30493911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 5354837 - 5355078
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  5354837 cttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtg 5354936  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  5354937 tctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatgaggcgagaa 5355036  T
Q  211 gctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5355037 gctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 5355078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 43536903 - 43536654
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || | |||||||||||  | |||||||    
T  43536903 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcagatggctatgtcctgtggtaca 43536804  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  43536803 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagtagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 43536704  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43536703 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgttgttgcct 43536654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Original strand, 43981387 - 43981628
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | |||||||  | |||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  43981387 cttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtg 43981486  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  || ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  43981487 tctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagaacagatcattgcagagcagtggcagcggtatgaggcgagaa 43981586  T
Q  211 gctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  43981587 gctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 43981628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 45431371 - 45431600
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| || | | ||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45431371 cttccgcactcacacgattaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggaaaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtg 45431470  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45431471 tctcaccctcagatcttgccaccttttctaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagatcattggtagcggtatgaggcgagaa 45431570  T
Q  211 gctcgcctgacacctatgacatggttagtg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45431571 gctcgcctgacacctatgacatggttagtg 45431600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Original strand, 17423324 - 17423561
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  | ||||||     
T  17423324 ttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacg 17423423  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  17423424 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 17423523  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423524 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg 17423561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10826110 - 10825884
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||       |||||||  |||||||||    
T  10826110 ttcgtcgacttccgcactcacatgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcagaatagcagacatggcggatg-------gctatgtcctatggtaca 10826018  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  10826017 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatattccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggaagcggtatga 10825918  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggtt 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10825917 ggcgagaagctcacctgacacctatgacatggtt 10825884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 150
Target Start/End: Original strand, 7189671 - 7189818
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  7189671 ttcgtcgacttccgtactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggctgatgacggatggctatatgctatggtaca 7189770  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttc 150  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  7189771 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctctttcaggagatcttc 7189818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 7416638 - 7416888
Alignment:
Q  1 ctttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggta 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||  ||| | |||||||||||   ||||||    
T  7416638 ctttcttcgacttccgcactcacacgcttaaggcagccgattgcggtgagcatgcaggagaggagacatggcatatggcagatggctatgtacgatggta 7416737  T
Q  101 cactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtat 200  Q
    | | |  | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| | ||| ||||||||| |  |||||||||||||     
T  7416738 cgccattgcgtctcactctcagattttgccacttcttccaggagatattccgaggcctccaaatgaggagcaaatcattgcagagtagtgggagcggtac 7416837  T
Q  201 gaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcc 251  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||| || || |||||||    
T  7416838 gaggcgagaagctcgcctgatacctatgatatagttactggcgatgttgcc 7416888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20067647 - 20067426
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    |||||| ||| ||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  20067647 cttccgtactgacacgattaaggagctcgattggggtgagccagcaggatag-agaaatggcggatggaggatggctatgtaatatggtacattagggtg 20067549  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaa 210  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | | | ||||||||||| ||||||||||  |  |||| |||      
T  20067548 tctcaccctctgattttgccacttcttctaggagatcttccgaggccagctaatgaggagaagatcattgcacagcagtgggagcaatgcgaggtgag-- 20067451  T
Q  211 gctcgcctgacacctatgacatggt 235  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||    
T  20067450 gctcgcctgatacctatgacgtggt 20067426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 40538395 - 40538631
Alignment:
Q  1 ctttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggta 100  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||           ||   |||||   ||||||    
T  40538395 cttttgtcgacttccacactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcatgcaggagaggagacatg-----------at---tatgtacgatggta 40538480  T
Q  101 cactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtat 200  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| | ||| |||| |||| | ||||||||||| ||     
T  40538481 cgccattgtgtctcaccctcagattttgccacttcttccaagagatattctgaggcctccaaatgaggagcagatcaatgcagagcagtgggagcgatac 40538580  T
Q  201 gaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcc 251  Q
    |||||||||| ||||| | | || |||||||  ||||| | ||||||||||    
T  40538581 gaggcgagaaactcgctttatacttatgacaatgttagcggcgttgttgcc 40538631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22529949 - 22529914
Alignment:
Q  108 gtgtctcaccctcagattttgccacctcttccagga 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22529949 gtgtctcaccctcagattttgccacctattccagga 22529914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 47505198 - 47505447
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  47505198 ttcgtcgacttccgcgctcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcagatggctatgtgctatggtaca 47505297  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47505298 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatctttcgaggacagtaaatgaagagcagatcattgcacaacagtgggagcggtatga 47505397  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  47505398 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 47505447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Original strand, 47660730 - 47660984
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  47660730 ttcgtcgacttctgcactcacacgcttaaggtggccgattggggtgagccgacacgagagcagacatggcggatggcggatgactatgtgttatggtaca 47660829  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| | || ||||||||||| ||    
T  47660830 ctaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagagaagatcattgcagagcaatgggagcggtacga 47660929  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcctttgct 257  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47660930 ggcaagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcctatgct 47660984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 45828433 - 45828682
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  45828433 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcacaagagcagacatggcgaatggaggatggctatgtgttatggtaca 45828532  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  45828533 ctaaggtgtttcaccctcagattttgccacctctttcatgagatcttatgaggccagcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtgggagcggtacga 45828632  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  45828633 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgccgatgttgcct 45828682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 52804725 - 52804974
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52804725 ttcgtcgacttccacactcacacacttaaggcggctgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggaggatgacggatggctatgtgctatggtaca 52804824  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  52804825 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccagctcttccagtagatattccgaggccagcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtgggagcggtatga 52804924  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  52804925 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggtttgtggcgctgttgcct 52804974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19522462 - 19522223
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  19522462 cttccgccctcacacgcttaaggcagccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatg-------gctatgtgttatggtacactagggtg 19522370  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19522369 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatctttcgaggccagcaaataaagagcagatcattgcacagcagtgagagcggtatgaggcgagaa 19522270  T
Q  211 gctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcctttgct 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19522269 gctcgcctgacacctatgacatggttagtgccgttgttgcctatgct 19522223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13637199 - 13636950
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  |||||||||    
T  13637199 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtaca 13637100  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13637099 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagaccagtgggagcggtatga 13637000  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13636999 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 13636950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Original strand, 19158878 - 19159115
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||  |||||||||    
T  19158878 ttcgtcgacttccgcactcacacgattaaggcggacgatcggggtcagcaggcaggagaggagacatggcggacggcggatggctatgtcatatggtaca 19158977  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19158978 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtgggagcggtatga 19159077  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19159078 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg 19159115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 21143794 - 21144036
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||       |||||||||| |||||||||    
T  21143794 ttcgtcgacttccgcactcacacacttaaggtggccgattggggtgagcaagcagaagagcagacaaggcgga-------tggctatgtgctatggtaca 21143886  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21143887 cttgggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagttcttccgaggccagcaaatgaagagcagatcattgcacagcagtgggagcggtatga 21143986  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21143987 ggcgagaagcttgcctgacacctatgacatggtttgtggcgttgttgcct 21144036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31780853 - 31780627
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||       |||||||| |||||||||    
T  31780853 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagtaggcaggagagcagacatggcggatg-------gctatgtgctatggtaca 31780761  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| | | |||||||||||||||||    
T  31780760 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccagcagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgtagagcagtgggagcggtatga 31780661  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggtt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31780660 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggtt 31780627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 3729534 - 3729293
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| | ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  3729534 cttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagtaggcaggagaggatacatggcgggtgacggatggctatgtcctgtggtacactagggtg 3729435  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  3729434 tctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatgaggcgagaa 3729335  T
Q  211 gctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3729334 gctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 3729293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 39 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 50618056 - 50617843
Alignment:
Q  39 gattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttc 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  50618056 gattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcagatgactatgtgctatggtacaccagggtgtctcaccctcagatcttgcaacctcttc 50617957  T
Q  139 caggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttag 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50617956 caggagatcttccgaggccagcaaatgaagagcagatcattgcacaacagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggtttg 50617857  T
Q  239 tgtcgttgttgcct 252  Q
    || || ||||||||    
T  50617856 tggcgctgttgcct 50617843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16269982 - 16269758
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  16269982 cttccgcactcacacgcttaaggagcccaattggggtgagccggcaggagagcagacatggcggatgagggatcgctatgtgttatggtacactacgatg 16269883  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaa 210  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  16269882 tctcacccttagattgtgccacctcttccaggagatcttgtgaggccagcaaatgaagagcagatcattgcacagtagtgggagcggtaagaggcgagaa 16269783  T
Q  211 gctcgcctgacacctatgacatggt 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  16269782 gctcgcctgatacctatgacatggt 16269758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 95288 - 95058
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||       |||||||  ||| |||||    
T  95288 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggatgattggggtgagcagacaggagagtagacatggcggatg-------gctatgtcctatagtaca 95196  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  95195 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatcttctgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagtagtgggagcggtatga 95096  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  95095 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg 95058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 22526860 - 22527101
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||       |||||||||  |||||||||    
T  22526860 ttcgtcgacttccgccctcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcaaacatggcgga-------tggctatgtcctatggtaca 22526952  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| ||||| | |||||||| ||||||||    
T  22526953 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatc-ttgcagagcagtgggaacggtatga 22527051  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22527052 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 22527101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 11196720 - 11196969
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| || |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11196720 ttcgtcgatttccgcactcacatgcttaaggcggccgattagggtgagcaggcagcagagcagacatgtcgtatgagggagggctatgtgttatggtaca 11196819  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||| | | ||||||||||||  |    
T  11196820 ctaaggtgtctcaccctcgtattttgccacctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatgaagatcagatcattgcagagccgtgggagcggtacaa 11196919  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  11196920 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatagttagtgccgctgttgcct 11196969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 38120358 - 38120109
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38120358 ttcgtcgacttccacactcacacgcttcaggccgccgattggggtgagcaggtagcagagcagacatggcgtatgagggagggctatgtgttatggtaca 38120259  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||| |||  | || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||| | | ||||||||| |||| ||    
T  38120258 ctaaggtaacccatcctcagatttttccacctcttctaggagatcttccgatgccagcaaatgaagagcagatcattgtagagcagtgggagtggtacga 38120159  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38120158 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 38120109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 26878574 - 26878816
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||| | | |||||| |||       |||||||  | |||||||    
T  26878574 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggaagctcggggtgagcaagcaggagaggatacatggcgaatg-------gctatgtcctgtggtaca 26878666  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  26878667 ctggggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagtagatcttctgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 26878766  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26878767 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 26878816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 49855218 - 49854968
Alignment:
Q  1 ctttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggta 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||   ||||||    
T  49855218 ctttcgtcgacttgcgcactcacacacttaaggcggccgattggggtgagcatgcaggagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtacgatggta 49855119  T
Q  101 cactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtat 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||  |||||  ||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  49855118 caccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttctttcgggagatattccaaggcctccaaatgaggagcatatcattgcagagcagtgggagcggtac 49855019  T
Q  201 gaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcc 251  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  49855018 gaggcgagaagctcccctgatacctatgacatggttagtggcgatgttgcc 49854968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 111 - 252
Target Start/End: Original strand, 51336870 - 51337011
Alignment:
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaa 210  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  51336870 tctcacccttagattttgccacttcttccaggagatattctgaggcctccaaatgaggagcagatcattgcagagcagtgggagcggtacgaggcgagaa 51336969  T
Q  211 gctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  51336970 gctcgcatgatacctatgacatggttagcggcgctgttgcct 51337011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23273506 - 23273427
Alignment:
Q  68 atggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatc 147  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23273506 atggcggatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccatctcttctaggagatc 23273427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 174 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23273429 - 23273351
Alignment:
Q  174 atcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23273429 atcattgcacagcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgccagacacctatgacatggttagtgccgttgtagcct 23273351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35256484 - 35256370
Alignment:
Q  124 ttttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacac 223  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||  ||||||| | ||||||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| ||    
T  35256484 ttttgccacttattccaggagatattccgaggcctccaaatgaggagcatatcattgcagagcagtgggagtggtacaaggcgagaagctcgcatgatac 35256385  T
Q  224 ctatgacatggttag 238  Q
    |||||||||||||||    
T  35256384 ctatgacatggttag 35256370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8577738 - 8577489
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| | | |||||||||||  |||||||||    
T  8577738 ttcgtcgacttccgcactcacacgattaaggcggacgatcggggtcagcaggcaggagaggagacatggcggacggcagatggctatgtcatatggtaca 8577639  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8577638 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatcttctgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcacagcagtgggagcggtatga 8577539  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8577538 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgttgttgcct 8577489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 38408043 - 38407801
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||       |||||||| |||||||||    
T  38408043 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatg-------gctatgtgctatggtaca 38407951  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  38407950 ctagggtgtctcacccttagatcttgccacctcttccaggagatcttcctaggccagcaaatgaagagcaggtcattgcacagcagtgggagcggtatga 38407851  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  38407850 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggtttgtggcgttgttgcct 38407801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 240
Target Start/End: Original strand, 5199625 - 5199855
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  5199625 ttcgtcgacttccgcactcacacgtttaaggcggccgattgaggtgagcaggcaggagagcagacatggcgga-------tggctatgtgttatggtaca 5199717  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  5199718 ctagggtgtctcaccctcagattttgccatctcttctaggagatcttccgaggccagcaaatgaagagcagatcattgcatagcagtgggagcggtatga 5199817  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5199818 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtg 5199855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 38970899 - 38971148
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  38970899 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcgaccgattggggtgagcagacagcagagcagacatggcgtatgagggagggctatgtgttgtggtaca 38970998  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  38970999 ctaaggtgtctcaccctcagatttttccacctcttccaggagatcttcctaggccagcaaatgaagagcaaatcattgcagagcagtgggagcgatatga 38971098  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38971099 agcgagaagctcgtctgacacctatgacatggttagtgccgttgttgcct 38971148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 257
Target Start/End: Original strand, 30707913 - 30708159
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30707913 cttccgcactcacacgattaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtg 30708012  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  30708013 tctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaataaagagcagatcattgcagaccagtgggagcggtatgaggcgagaa 30708112  T
Q  211 gctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcctttgct 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  30708113 gctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcctatgct 30708159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19038362 - 19038113
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||| ||| |||||||  | |||||||||||||  | ||||||     
T  19038362 ttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtgagcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacg 19038263  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  19038262 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 19038163  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19038162 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 19038113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 28238932 - 28238683
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  |  ||||||    
T  28238932 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcgaggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctggggtaca 28238833  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| || | |||||| ||||||||||    
T  28238832 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattacagagcagtggcagcggtatga 28238733  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28238732 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 28238683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 252
Target Start/End: Original strand, 42538654 - 42538900
Alignment:
Q  6 gtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacacta 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  42538654 gtcgacttccgcactcacacgcttacagcgaccgattggggtgagcaggcacaagagcagatatgatagatggtggatggctatgtgttatggtacacta 42538753  T
Q  106 gggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggc 205  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| | | |||||| ||||||| |||||    
T  42538754 aagtgtttcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccgagaccagcaaatgaagagcagatcattgtagagcagtggaagcggtacgaggc 42538853  T
Q  206 gagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  42538854 gagaagctctcctgacacaaatgacatggttagtgtcgctgttgcct 42538900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 248
Target Start/End: Original strand, 28879456 - 28879701
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||    
T  28879456 ttcgtcgacttccgcactcacacgattaaggcggacgatcgggatgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtaca 28879555  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  28879556 ctagggtgtctcaccctcagatctttccacctctttcaggagatcttccgaggcctgcaaatgaatagcagatcattgcagaccagtgggagcggtatga 28879655  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgtt 248  Q
    || ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28879656 ggtgagaaactcgtctgacacctacgacatggttagtggcgttgtt 28879701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8699627 - 8699377
Alignment:
Q  1 ctttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||   ||||||    
T  8699627 ctttcgtcgacttccgcactcacacgcttgaggaggccgattggggtgagcatgcaggagagcagacatggcgtttgacagatgcctatgtacgatggta 8699528  T
Q  101 cactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtat 200  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  | ||||| ||||| |||| |||| | ||||||||||||||     
T  8699527 caccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttcttccaggagatattccgaggcctcctaatgaggtgcagatcactgcatagcagtgggagcggtac 8699428  T
Q  201 gaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcc 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||    
T  8699427 gaggcgagaagctcgcctgatacctatgacatggttagcggcgctgttgcc 8699377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 79 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 42937780 - 42937606
Alignment:
Q  79 cggatggctatgtgttatgg-tacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatca 177  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| | ||||||||    
T  42937780 cggatggctatgtgctatgggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttcccaggctagcaaatgaggagcatatca 42937681  T
Q  178 ttgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  42937680 ttgcagagcagtgggagcggtacgaggcgagaagctcgcctgatacctatgacatggttagtgccgctgttgcct 42937606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Original strand, 7760195 - 7760389
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||       |||||||||| |||||||||    
T  7760195 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcgga-------tggctatgtgctatggtaca 7760287  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | || |||||| | ||||| |||||||||||    
T  7760288 ctagggtgtctcaccctcaaatcttgtcacctcttccaggagatcttctgaggcctgcaaatgaagagaagataattgcagagcagtgagagcggtatga 7760387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 15939501 - 15939751
Alignment:
Q  1 ctttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggta 100  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||| |||||||| | |||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  15939501 cttttgtcgacttccgcactcacacgcttaaggagaccgattgggatgagcaggcagtagagcagacaaggcgtatgagggagggctatgtgttatggta 15939600  T
Q  101 cactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtat 200  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||  | | || | | |||||||     
T  15939601 cactaagttgtctcacccttagattttgccacctcttccaggatatctttcgaggccagcaaatgaggagcagatcattaaagagcaat-gaagcggtac 15939699  T
Q  201 gaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15939700 gaggcgagaagctcgcatgatacctatgacatggttagaggcgttgttgcct 15939751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 511794 - 511605
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | | ||||| ||||       ||||||||||||||||||||| ||||    
T  511794 cttccgcactcacacgtttaaggcggccgattggggtgagcaggcacaagagaatacatggcagatg-------gctatgtgttatggtacactaaggtg 511702  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcga 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||||| | | |||||||||||| |||||||    
T  511701 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatgaatcgtagatcattgcagagcggtgggagcggtacgaggcga 511605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8852 - 8613
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  8852 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcagacgatcggggtgagcaggcaggagaggagacatgacggatgacggatgactatgtcctatggtaca 8753  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||||||||||      || || | |  |    |||||| ||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||  | | |||||||||||||||||    
T  8752 ctagggtgtctcac------atcttccgaggt----caggaggtcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattcaatagcagtgggagcggtatga 8663  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  8662 ggcgagaagctcgcctgacacctgtgacatggttagtggcgctgttgcct 8613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 68 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40623139 - 40622969
Alignment:
Q  68 atggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaa 167  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  40623139 atggcgtatgaaggagggctatgtgttatggtacactaaggtgcctcatcctcagattttgccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaatgag 40623040  T
Q  168 gtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttag 238  Q
    |  |||||||||| | | ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  40623039 gaacatatcattgaagagcagtgagagcggtacgaggcgagaagctcgcttgatacatatgacatggttag 40622969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 42937837 - 42937788
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagca 52  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42937837 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcgaccgattggggtgagca 42937788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 236
Target Start/End: Original strand, 7761597 - 7761634
Alignment:
Q  199 atgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggtt 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7761597 atgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggtt 7761634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 40623184 - 40623144
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagc 51  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  40623184 cttccgcactcacacgcttaaggagcctgattggggtgagc 40623144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 26172776 - 26173024
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26172776 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattgggataagcaggcaggagagcagacattgcggatggcggatgtctatgtgttatggtaca 26172875  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26172876 ctagggtgtctcacc-tcaaattttgccacctcttcgaggagatcttccgacgccagcaaataaagagcagatcattgcacagcagtgggagcggtatga 26172974  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26172975 ggcgagaagctcacctgacacctatgacatggttagtgccgttgttgcct 26173024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 22304088 - 22304337
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||    
T  22304088 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtaca 22304187  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22304188 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagaccagtgggagcggtatga 22304287  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22304288 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 22304337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 31770932 - 31771174
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||       |||||||||| |||||||||    
T  31770932 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcgga-------tggctatgtgctatggtaca 31771024  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  31771025 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatgaagagcagatcattgcacagcagtgggagcagtatga 31771124  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31771125 ggtgagaaactcgcttgacacctatgacatggtttgtggcgttgttgcct 31771174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 6204007 - 6204256
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||    
T  6204007 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtaca 6204106  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  6204107 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 6204206  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6204207 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 6204256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 11690974 - 11691223
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||    
T  11690974 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtaca 11691073  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  11691074 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 11691173  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11691174 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 11691223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 30826817 - 30826568
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | |||||||    
T  30826817 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtaca 30826718  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  30826717 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 30826618  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30826617 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 30826568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 2406222 - 2406023
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2406222 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatgacggacgacggatggctatgtgttatggtaca 2406123  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2406122 caagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaatgaagagcagatcagtgcacataagtgggagcggtatga 2406023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 246
Target Start/End: Original strand, 2407101 - 2407337
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| ||||| ||||       ||||||||||||||||||    
T  2407101 ttcgtcgacttccgcacttacacgcttaaggcggccgatcgaggtgaacaggcaggagagcagaaatggcagatg-------gctatgtgttatggtaca 2407193  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2407194 ctagggtgtctcaccctcggattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatgaagagcagatcattgcacagcagtgggagcggtatga 2407293  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttg 246  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||    
T  2407294 agcgagaagctcgccgcacacctatgacatggttaatgccgttg 2407337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 27638606 - 27638855
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtaca 102  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| | | ||||||| || |||||||||||||  | ||||||     
T  27638606 ttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacg 27638705  T
Q  103 ctagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  27638706 ctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaagagatcttccgaggcctgcaaatgaagagcagatcattgcagagcagtggcagcggtatga 27638805  T
Q  203 ggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27638806 ggcgagaagttcgcctgacacctatgacatggtcagtggcgttgttgcct 27638855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 252
Target Start/End: Original strand, 3384304 - 3384535
Alignment:
Q  20 tcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccct 119  Q
    |||||||||||||| | |||||||  ||||||| |||| |||||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  3384304 tcacacgcttaaggagaccgattgaagtgagcaggcagcagagcagacatggcatatgagggagggctatgtgttatgatacactaagatgtctcaccct 3384403  T
Q  120 cagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctg 219  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || |  |||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  3384404 cagattttgccatctcttccag-agatcttccgaggccagcaaatgaagagcaaatcatttcagagtagtgggagcgatacgaggcgagaagctggcctg 3384502  T
Q  220 acacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3384503 acacctatgacatggttagtgttgttgttgcct 3384535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 32642748 - 32642997
Alignment:
Q  1 ctttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggta 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||| |||||| ||||| |||||||||||   ||||||    
T  32642748 ctttcgtcgacttccgtactcacacgcttaaggcggctgattggg-tgagcatgtaggagggtagacatggcgtatgacagatggctatgtacgatggta 32642846  T
Q  101 cactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtat 200  Q
    |||    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||||||     
T  32642847 caccgttgtgtctcaccctcaaattttgccacttcttccaggagatattccgaggcctccaaatgaggagcagatcattgcagagcagtgggagcggtac 32642946  T
Q  201 gaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcc 251  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32642947 gaggcgagaagctcccctgatacctatgacatggttagtggcgttgttgcc 32642997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32642008 - 32641812
Alignment:
Q  55 caggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgag 154  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||   |||||||||    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| |||    
T  32642008 caggagagcagacatggcgtatgacagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcaaattttgtcacttcttccaggagatattccgag 32641909  T
Q  155 gccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcc 251  Q
    |||  ||||||| | ||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  32641908 gcctccaaatgaggagcggatcattgcagagcagtgggagcggtacgaggcgagaagctcgcctgatacctatgacatggttagcggcgttgttgcc 32641812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24086014 - 24085775
Alignment:
Q  2 tttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtac 101  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||   |||||||    
T  24086014 tttcgtcgacttccgcactcacacacttaaggcggccgattggggtgagcatgcaggagagcaggcatggcgtatggcagatggctatgtacgatggtac 24085915  T
Q  102 actagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatg 201  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||||  ||||||| | ||||          | ||||||||||||||      
T  24085914 accgttgtgtctcaccctcagattttgccacttcttgtaggagatattcggaggcctccaaatgaggagcat----------agcagtgggagcggtaca 24085825  T
Q  202 aggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcc 251  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| || |||| |||||    
T  24085824 aggcgagaagcttgcctgatacctatgatatggttactggcgttattgcc 24085775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18005640 - 18005475
Alignment:
Q  1 ctttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggta 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | |||| | ||| | |||||||||||   | ||||    
T  18005640 ctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcatgcagcagaggaaacatggtgtatggcagatggctatgtacgaaggta 18005541  T
Q  101 cactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatga 166  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||    
T  18005540 caccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttcttccaggagattttccgaggcctccaaatga 18005475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 88
Target Start/End: Original strand, 26440299 - 26440384
Alignment:
Q  3 ttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggcta 88  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26440299 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcgactgattggggtgagccggcaggagagcagacatggcggatggcggatggcta 26440384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 229
Target Start/End: Original strand, 21603276 - 21603468
Alignment:
Q  37 ccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctct 136  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||  ||||   ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  21603276 ccgattggggtgagccagcaggagaggcgacatggaagatggatgatggctatatactatggtacactacggtgtctcaccctcagatttttccacctat 21603375  T
Q  137 tccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatga 229  Q
    ||| |||  || ||   ||| ||||||||| | ||| ||||||| |||||||||  ||| ||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  21603376 tccgggatctcctccatggctagcaaatgaggagcaaatcattgtacatcagtgaaagcagtacgaggcgagaggctcgcttgatacctatga 21603468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18001821 - 18001770
Alignment:
Q  186 cagtgggagcggtatgaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggtta 237  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18001821 cagtgggagcggtacaaggcgagaagctcgcttgatacctatgacatggtta 18001770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 252
Target Start/End: Original strand, 3502038 - 3502081
Alignment:
Q  209 aagctcgcctgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3502038 aagctcgcctgccacctatgacatggttagtggcgctgttgcct 3502081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24885617 - 24885583
Alignment:
Q  218 tgacacctatgacatggttagtgtcgttgttgcct 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24885617 tgacacctatgacatggttagtgtcgctgttgcct 24885583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 12206 - 12442
Alignment:
Q  1 ctttcgtcgtcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggta 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||   ||||||    
T  12206 ctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggaggtcgattggggtgagcatgcaggagagcagacatggcgtatggcggatggctatgtaggatggta 12305  T
Q  101 cactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtat 200  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||||||     
T  12306 caccattgtgtctcaccctcagattttgccacttcttccaggaaatattccgaggccaccaaatgaggagcagatcattgcagagcagtgggagcggtac 12405  T
Q  201 gaggcgagaagctcgcctgacacctatgacatggtta 237  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  12406 gaggtgagaagctggcctgatacctatgacagggtta 12442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22481 - 22256
Alignment:
Q  11 cttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtg 110  Q
    |||||| ||||||||| |||||| | ||||||  ||| |||  || |||||| ||| ||| | ||||   ||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  22481 cttccgtactcacacgattaaggagtccgattacggtcagccggctggagaggagacatgacagatggatgatggctatatactatggtacactagggtg 22382  T
Q  111 tctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatctt-ctgaggccagcaaatgaagtgcatatcattgcacatcagtgggagcggtatgaggcgaga 209  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||    
T  22381 tctcaacctctgattttgccacttcttctaggagatctttctgaggctagcaaatgaggagcatatcattgcacagcagtgggagcactacgaggcgaga 22282  T
Q  210 agctcgcctgacacctatgacatggt 235  Q
      ||||||||| ||||||||||||||    
T  22281 gactcgcctgatacctatgacatggt 22256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 146
Target Start/End: Original strand, 56472 - 56579
Alignment:
Q  39 gattggggtgagcaagcaggagagcagatatggcggatgacggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttc 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  56472 gattggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcagatgactatgtgctatggtacaccagggtgtctcaccctcagatcttgcaacctcttc 56571  T
Q  139 caggagat 146  Q
    ||||||||    
T  56572 caggagat 56579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University