View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1726-Insertion-3 (Length: 942)

Name: NF1726-Insertion-3
Description: NF1726
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1726-Insertion-3
NF1726-Insertion-3
[»] chr1 (208 HSPs)
chr1 (7-543)||(37585004-37585535)
chr1 (735-942)||(37584626-37584833)
chr1 (298-543)||(6089786-6090032)
chr1 (298-553)||(31238761-31239017)
chr1 (298-543)||(34931130-34931376)
chr1 (300-543)||(9413067-9413311)
chr1 (299-553)||(27530343-27530597)
chr1 (299-553)||(229147-229403)
chr1 (292-553)||(2489134-2489395)
chr1 (332-553)||(41855248-41855468)
chr1 (299-543)||(48853869-48854114)
chr1 (332-553)||(36694896-36695118)
chr1 (332-553)||(36710997-36711219)
chr1 (296-543)||(40614643-40614891)
chr1 (299-553)||(52602033-52602287)
chr1 (299-553)||(45285551-45285805)
chr1 (343-543)||(50246714-50246916)
chr1 (293-554)||(51422159-51422424)
chr1 (299-553)||(28052231-28052487)
chr1 (299-543)||(41317645-41317890)
chr1 (343-553)||(45794386-45794597)
chr1 (343-553)||(52430958-52431169)
chr1 (297-553)||(15892301-15892559)
chr1 (297-528)||(26549857-26550088)
chr1 (359-544)||(39324575-39324762)
chr1 (332-553)||(42275933-42276155)
chr1 (299-540)||(5765730-5765973)
chr1 (334-546)||(8104065-8104278)
chr1 (344-528)||(36674083-36674269)
chr1 (299-553)||(38530891-38531145)
chr1 (343-546)||(943421-943626)
chr1 (334-553)||(11741439-11741659)
chr1 (299-553)||(38261382-38261638)
chr1 (297-546)||(23530593-23530845)
chr1 (332-553)||(25509250-25509470)
chr1 (343-553)||(30290307-30290518)
chr1 (298-546)||(28888161-28888412)
chr1 (299-515)||(896792-897010)
chr1 (299-553)||(4102455-4102709)
chr1 (299-543)||(9378841-9379089)
chr1 (332-528)||(14090025-14090223)
chr1 (314-543)||(19792618-19792848)
chr1 (299-543)||(21630845-21631093)
chr1 (332-553)||(8923443-8923663)
chr1 (314-543)||(13343824-13344056)
chr1 (343-553)||(49907063-49907274)
chr1 (299-523)||(9715431-9715658)
chr1 (344-553)||(11907013-11907223)
chr1 (299-553)||(12814526-12814782)
chr1 (345-542)||(14347174-14347373)
chr1 (299-543)||(15763366-15763613)
chr1 (343-552)||(42872118-42872328)
chr1 (299-513)||(14171612-14171827)
chr1 (302-553)||(24855323-24855576)
chr1 (299-553)||(8472091-8472344)
chr1 (343-553)||(16575876-16576087)
chr1 (332-553)||(15100398-15100626)
chr1 (345-529)||(43395459-43395643)
chr1 (343-528)||(47300677-47300864)
chr1 (332-543)||(1767637-1767848)
chr1 (299-553)||(7763491-7763744)
chr1 (359-543)||(15289985-15290171)
chr1 (343-543)||(50008267-50008469)
chr1 (299-513)||(27037350-27037567)
chr1 (343-529)||(2280018-2280206)
chr1 (343-543)||(9202290-9202491)
chr1 (299-480)||(25283920-25284104)
chr1 (343-553)||(46075652-46075862)
chr1 (299-523)||(28885842-28886069)
chr1 (304-528)||(31086667-31086894)
chr1 (343-543)||(16456687-16456889)
chr1 (332-552)||(48067668-48067889)
chr1 (344-553)||(32169740-32169949)
chr1 (299-543)||(3549083-3549327)
chr1 (314-523)||(27575391-27575603)
chr1 (332-553)||(15111623-15111849)
chr1 (345-553)||(43668188-43668399)
chr1 (359-553)||(1039182-1039376)
chr1 (359-553)||(1046088-1046282)
chr1 (345-543)||(10383828-10384029)
chr1 (298-505)||(25228285-25228495)
chr1 (332-543)||(26544555-26544766)
chr1 (299-477)||(44529414-44529593)
chr1 (299-553)||(38613517-38613773)
chr1 (359-543)||(39750182-39750367)
chr1 (359-553)||(15811033-15811227)
chr1 (359-553)||(23542021-23542215)
chr1 (316-523)||(37589012-37589221)
chr1 (359-553)||(44646313-44646507)
chr1 (343-529)||(31465730-31465918)
chr1 (332-510)||(45038136-45038315)
chr1 (359-543)||(47068839-47069024)
chr1 (332-544)||(25271241-25271452)
chr1 (345-513)||(36880409-36880576)
chr1 (593-701)||(37584862-37584970)
chr1 (362-543)||(39873488-39873671)
chr1 (359-553)||(30289663-30289857)
chr1 (359-529)||(35984463-35984634)
chr1 (343-553)||(37951734-37951944)
chr1 (359-553)||(45039454-45039648)
chr1 (343-546)||(45335933-45336138)
chr1 (359-546)||(50937826-50938015)
chr1 (334-513)||(51810957-51811138)
chr1 (344-546)||(34503284-34503488)
chr1 (332-543)||(38174927-38175136)
chr1 (359-553)||(39362995-39363189)
chr1 (343-553)||(39497475-39497685)
chr1 (359-553)||(44649671-44649865)
chr1 (359-543)||(50008025-50008210)
chr1 (332-543)||(3934656-3934869)
chr1 (342-543)||(9700534-9700736)
chr1 (342-543)||(27974939-27975142)
chr1 (342-543)||(32149094-32149297)
chr1 (343-553)||(18237134-18237344)
chr1 (359-543)||(1048053-1048238)
chr1 (344-543)||(47296352-47296553)
chr1 (345-529)||(7212345-7212531)
chr1 (343-543)||(31635915-31636116)
chr1 (360-543)||(32153595-32153780)
chr1 (359-552)||(47429188-47429381)
chr1 (343-553)||(7784033-7784246)
chr1 (299-449)||(51561070-51561220)
chr1 (385-543)||(41619995-41620152)
chr1 (314-466)||(44454580-44454736)
chr1 (359-543)||(10433371-10433558)
chr1 (359-542)||(46506214-46506398)
chr1 (381-543)||(2637009-2637172)
chr1 (333-480)||(1837347-1837502)
chr1 (443-553)||(39867542-39867651)
chr1 (299-421)||(32906705-32906829)
chr1 (345-528)||(48022972-48023156)
chr1 (375-543)||(4592629-4592799)
chr1 (381-543)||(39425653-39425816)
chr1 (344-546)||(47263503-47263709)
chr1 (403-553)||(11352908-11353059)
chr1 (350-486)||(18172424-18172561)
chr1 (381-544)||(4371589-4371751)
chr1 (381-543)||(4389660-4389823)
chr1 (299-435)||(26547662-26547802)
chr1 (381-543)||(27479649-27479812)
chr1 (386-542)||(43456449-43456606)
chr1 (345-543)||(22567120-22567319)
chr1 (381-523)||(23893520-23893663)
chr1 (375-543)||(26768436-26768605)
chr1 (382-552)||(29437678-29437848)
chr1 (381-542)||(27669894-27670055)
chr1 (345-502)||(31154351-31154509)
chr1 (343-486)||(47754433-47754578)
chr1 (343-513)||(15616214-15616388)
chr1 (365-528)||(35945274-35945438)
chr1 (381-552)||(49549044-49549215)
chr1 (381-552)||(52428931-52429101)
chr1 (381-543)||(17483784-17483946)
chr1 (375-543)||(50074461-50074631)
chr1 (381-528)||(30996810-30996958)
chr1 (299-540)||(1427253-1427497)
chr1 (358-480)||(31338945-31339071)
chr1 (299-540)||(33336855-33337097)
chr1 (381-552)||(39627059-39627230)
chr1 (362-546)||(1197970-1198157)
chr1 (375-543)||(9424818-9424988)
chr1 (381-543)||(21290172-21290335)
chr1 (381-543)||(48363837-48364000)
chr1 (457-543)||(32908286-32908372)
chr1 (385-552)||(1867282-1867451)
chr1 (343-432)||(26544377-26544466)
chr1 (311-480)||(30761011-30761183)
chr1 (381-552)||(15302567-15302738)
chr1 (299-543)||(35693113-35693362)
chr1 (443-543)||(51561764-51561864)
chr1 (447-553)||(27530801-27530905)
chr1 (381-546)||(37850260-37850426)
chr1 (344-436)||(13698769-13698862)
chr1 (381-516)||(38920314-38920448)
chr1 (381-467)||(45810116-45810204)
chr1 (345-510)||(33163183-33163352)
chr1 (381-528)||(51467296-51467443)
chr1 (463-546)||(44455529-44455612)
chr1 (381-521)||(4279951-4280090)
chr1 (454-543)||(3262968-3263057)
chr1 (388-553)||(5854423-5854587)
chr1 (472-553)||(5858297-5858377)
chr1 (369-470)||(18114282-18114385)
chr1 (375-470)||(22940637-22940733)
chr1 (381-528)||(46271175-46271321)
chr1 (444-543)||(19349258-19349357)
chr1 (444-543)||(38505850-38505948)
chr1 (414-544)||(8905462-8905591)
chr1 (416-480)||(13054802-13054866)
chr1 (375-530)||(15624709-15624869)
chr1 (385-543)||(43789705-43789869)
chr1 (366-480)||(2606722-2606841)
chr1 (388-543)||(9411210-9411366)
chr1 (359-414)||(8946443-8946498)
chr1 (380-475)||(25968416-25968512)
chr1 (416-516)||(37000730-37000831)
chr1 (359-451)||(9413517-9413609)
chr1 (381-439)||(38509067-38509126)
chr1 (500-543)||(45809870-45809913)
chr1 (299-420)||(5966749-5966869)
chr1 (377-415)||(10332366-10332404)
chr1 (332-397)||(11351475-11351541)
chr1 (429-523)||(39647664-39647758)
chr1 (494-543)||(18114595-18114644)
chr1 (366-415)||(23932941-23932990)
chr1 (455-544)||(43589318-43589406)
chr1 (494-543)||(47754069-47754118)
chr1 (463-543)||(52001328-52001409)
[»] chr7 (174 HSPs)
chr7 (299-551)||(12930363-12930616)
chr7 (299-543)||(27529279-27529524)
chr7 (299-546)||(35569393-35569641)
chr7 (299-543)||(7607373-7607620)
chr7 (299-552)||(3024627-3024878)
chr7 (299-543)||(1574770-1575015)
chr7 (299-553)||(4856848-4857107)
chr7 (299-553)||(11647575-11647829)
chr7 (302-553)||(30895602-30895855)
chr7 (298-543)||(23919783-23920029)
chr7 (299-553)||(47323268-47323524)
chr7 (297-553)||(6799283-6799539)
chr7 (299-543)||(32759609-32759854)
chr7 (299-553)||(43279747-43280000)
chr7 (343-553)||(8612359-8612570)
chr7 (343-553)||(25247475-25247686)
chr7 (343-553)||(29064241-29064452)
chr7 (343-553)||(31200148-31200359)
chr7 (343-553)||(39197760-39197971)
chr7 (343-553)||(39871397-39871608)
chr7 (299-539)||(21870075-21870318)
chr7 (332-543)||(19920614-19920824)
chr7 (343-543)||(36697915-36698117)
chr7 (299-543)||(41803209-41803458)
chr7 (343-553)||(1275517-1275728)
chr7 (343-553)||(29285821-29286032)
chr7 (343-553)||(32872159-32872370)
chr7 (343-553)||(34978861-34979072)
chr7 (343-553)||(40300272-40300483)
chr7 (299-553)||(43081294-43081549)
chr7 (343-553)||(44547468-44547679)
chr7 (299-553)||(2289755-2290011)
chr7 (304-553)||(42298172-42298421)
chr7 (343-553)||(8290945-8291156)
chr7 (299-544)||(21119608-21119856)
chr7 (299-508)||(24299943-24300155)
chr7 (343-553)||(31458039-31458250)
chr7 (343-553)||(33858651-33858861)
chr7 (343-553)||(36646421-36646632)
chr7 (343-553)||(41025880-41026091)
chr7 (332-546)||(48008982-48009200)
chr7 (343-543)||(2006526-2006728)
chr7 (343-543)||(48521077-48521279)
chr7 (299-553)||(9140272-9140528)
chr7 (332-543)||(10475752-10475965)
chr7 (314-543)||(45907296-45907526)
chr7 (343-553)||(6387367-6387578)
chr7 (343-553)||(17491557-17491768)
chr7 (343-553)||(17561446-17561657)
chr7 (296-553)||(26736522-26736787)
chr7 (343-553)||(32814475-32814686)
chr7 (332-553)||(38361193-38361412)
chr7 (299-543)||(28016285-28016532)
chr7 (343-553)||(7449311-7449521)
chr7 (343-543)||(7703605-7703806)
chr7 (299-522)||(19619105-19619331)
chr7 (343-553)||(41252146-41252356)
chr7 (343-553)||(26255137-26255348)
chr7 (299-539)||(44780132-44780373)
chr7 (314-543)||(38736503-38736733)
chr7 (332-528)||(9998353-9998551)
chr7 (299-498)||(20950779-20950978)
chr7 (343-529)||(38428212-38428399)
chr7 (343-553)||(38858340-38858550)
chr7 (332-543)||(787984-788197)
chr7 (343-553)||(47657450-47657659)
chr7 (343-543)||(7400179-7400384)
chr7 (343-553)||(29642928-29643138)
chr7 (345-543)||(36711085-36711284)
chr7 (344-511)||(12130131-12130298)
chr7 (343-553)||(21295193-21295403)
chr7 (359-553)||(29177053-29177247)
chr7 (311-553)||(37913117-37913361)
chr7 (343-513)||(17326952-17327124)
chr7 (299-528)||(23364080-23364312)
chr7 (299-544)||(27881827-27882075)
chr7 (299-523)||(30737751-30737979)
chr7 (361-546)||(7400523-7400710)
chr7 (347-528)||(18112955-18113138)
chr7 (343-543)||(44719178-44719375)
chr7 (359-553)||(43440910-43441105)
chr7 (314-478)||(21870846-21871013)
chr7 (332-553)||(43093181-43093403)
chr7 (299-480)||(16957749-16957932)
chr7 (299-513)||(26842845-26843069)
chr7 (359-553)||(34012319-34012513)
chr7 (349-544)||(41787301-41787495)
chr7 (299-513)||(23109148-23109365)
chr7 (343-543)||(23320702-23320908)
chr7 (334-543)||(28060769-28060978)
chr7 (332-461)||(32117998-32118127)
chr7 (342-553)||(41002938-41003149)
chr7 (343-553)||(9036714-9036924)
chr7 (298-543)||(41444253-41444501)
chr7 (345-553)||(25950872-25951083)
chr7 (365-542)||(31802929-31803105)
chr7 (426-553)||(17317483-17317609)
chr7 (334-541)||(46266151-46266358)
chr7 (343-546)||(31581726-31581931)
chr7 (361-543)||(45778021-45778208)
chr7 (343-553)||(9303688-9303902)
chr7 (298-465)||(27325907-27326076)
chr7 (381-552)||(30534748-30534917)
chr7 (381-546)||(19845490-19845658)
chr7 (415-553)||(26299357-26299494)
chr7 (334-553)||(9299139-9299362)
chr7 (314-537)||(17878131-17878346)
chr7 (343-553)||(34895899-34896110)
chr7 (381-543)||(42887903-42888066)
chr7 (359-538)||(10538931-10539116)
chr7 (386-528)||(3796058-3796202)
chr7 (381-553)||(32964218-32964390)
chr7 (382-552)||(49044944-49045114)
chr7 (382-552)||(32699530-32699698)
chr7 (344-510)||(47534689-47534853)
chr7 (299-432)||(33381358-33381494)
chr7 (417-553)||(9233436-9233571)
chr7 (334-467)||(21587534-21587669)
chr7 (387-543)||(24210979-24211134)
chr7 (390-546)||(46414835-46414994)
chr7 (381-543)||(24504735-24504898)
chr7 (359-543)||(18751788-18751970)
chr7 (388-543)||(19292889-19293045)
chr7 (299-543)||(40120994-40121244)
chr7 (381-543)||(2345366-2345529)
chr7 (359-535)||(2470876-2471054)
chr7 (381-543)||(27813551-27813714)
chr7 (382-552)||(44510168-44510337)
chr7 (343-543)||(29629768-29629967)
chr7 (365-553)||(22991552-22991739)
chr7 (381-552)||(9682645-9682815)
chr7 (343-553)||(5524782-5524993)
chr7 (381-528)||(35888378-35888524)
chr7 (381-543)||(45722058-45722221)
chr7 (388-543)||(3881371-3881527)
chr7 (445-543)||(31769220-31769318)
chr7 (375-543)||(33342189-33342356)
chr7 (381-543)||(43934642-43934803)
chr7 (365-471)||(21135371-21135478)
chr7 (381-543)||(3775874-3776043)
chr7 (381-542)||(37915195-37915356)
chr7 (311-411)||(12616162-12616263)
chr7 (377-524)||(20182099-20182245)
chr7 (381-521)||(23802006-23802146)
chr7 (381-513)||(33683007-33683140)
chr7 (381-552)||(33682757-33682925)
chr7 (345-513)||(49110813-49110983)
chr7 (425-543)||(10071242-10071360)
chr7 (343-436)||(20075005-20075099)
chr7 (419-504)||(32811293-32811378)
chr7 (365-543)||(12631620-12631803)
chr7 (375-543)||(28016994-28017164)
chr7 (420-513)||(3478814-3478907)
chr7 (381-529)||(46415118-46415266)
chr7 (381-552)||(8782033-8782207)
chr7 (299-540)||(46148485-46148728)
chr7 (334-544)||(19497291-19497506)
chr7 (460-543)||(32643658-32643741)
chr7 (454-543)||(12616280-12616369)
chr7 (382-529)||(34693465-34693614)
chr7 (359-451)||(43008254-43008345)
chr7 (359-422)||(34900780-34900842)
chr7 (426-529)||(40299186-40299288)
chr7 (381-467)||(47649001-47649088)
chr7 (343-409)||(10071851-10071917)
chr7 (377-479)||(25530689-25530793)
chr7 (375-441)||(31137220-31137288)
chr7 (492-553)||(33381509-33381569)
chr7 (385-480)||(18312303-18312396)
chr7 (496-543)||(20074940-20074987)
chr7 (381-411)||(6910638-6910668)
chr7 (381-411)||(32643627-32643657)
chr7 (362-404)||(34037502-34037544)
chr7 (444-513)||(4700530-4700599)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (299-543)||(164265-164510)
[»] chr5 (167 HSPs)
chr5 (299-543)||(7940503-7940748)
chr5 (302-553)||(32964174-32964425)
chr5 (299-553)||(13759188-13759442)
chr5 (299-553)||(10511211-10511466)
chr5 (299-543)||(12743875-12744122)
chr5 (332-553)||(43060184-43060406)
chr5 (297-543)||(20141998-20142245)
chr5 (299-543)||(9020746-9020991)
chr5 (314-553)||(27873099-27873340)
chr5 (299-553)||(34332259-34332516)
chr5 (299-543)||(20987954-20988199)
chr5 (343-553)||(22527734-22527945)
chr5 (332-553)||(23285077-23285301)
chr5 (299-553)||(14913691-14913945)
chr5 (332-543)||(14649236-14649449)
chr5 (343-553)||(1265991-1266202)
chr5 (343-553)||(10734305-10734516)
chr5 (299-552)||(20186544-20186799)
chr5 (299-553)||(4194724-4194976)
chr5 (299-543)||(34889017-34889264)
chr5 (299-542)||(4976028-4976275)
chr5 (299-543)||(21239150-21239396)
chr5 (314-541)||(31507375-31507605)
chr5 (343-543)||(31888944-31889146)
chr5 (299-546)||(40643142-40643392)
chr5 (299-541)||(23285815-23286060)
chr5 (343-553)||(17674442-17674653)
chr5 (343-553)||(28041135-28041346)
chr5 (332-543)||(28140693-28140906)
chr5 (343-553)||(32478180-32478391)
chr5 (296-543)||(9064958-9065208)
chr5 (296-543)||(9268029-9268279)
chr5 (299-541)||(16440984-16441227)
chr5 (345-553)||(42561135-42561344)
chr5 (299-552)||(3028056-3028313)
chr5 (343-553)||(4984900-4985111)
chr5 (343-553)||(6673012-6673223)
chr5 (343-553)||(15190599-15190810)
chr5 (343-553)||(34662246-34662457)
chr5 (332-528)||(13703583-13703778)
chr5 (332-553)||(22657810-22658032)
chr5 (296-553)||(7734876-7735136)
chr5 (299-542)||(9264025-9264271)
chr5 (299-546)||(40951782-40952032)
chr5 (343-553)||(13862779-13862990)
chr5 (314-543)||(14619300-14619532)
chr5 (343-553)||(16153039-16153250)
chr5 (296-553)||(35547303-35547562)
chr5 (301-513)||(21750011-21750226)
chr5 (332-528)||(38371747-38371943)
chr5 (343-553)||(41641137-41641352)
chr5 (343-543)||(3686538-3686740)
chr5 (345-553)||(4753004-4753213)
chr5 (349-553)||(8283898-8284103)
chr5 (334-546)||(15521717-15521931)
chr5 (299-513)||(20517925-20518139)
chr5 (345-553)||(23092426-23092635)
chr5 (299-513)||(14435883-14436100)
chr5 (299-553)||(39121429-39121685)
chr5 (343-553)||(24307925-24308136)
chr5 (343-553)||(24365187-24365398)
chr5 (299-524)||(39758957-39759185)
chr5 (343-543)||(25600844-25601046)
chr5 (297-553)||(35039039-35039296)
chr5 (343-546)||(5528022-5528227)
chr5 (356-553)||(14571329-14571524)
chr5 (332-553)||(18615835-18616061)
chr5 (343-553)||(7951603-7951813)
chr5 (299-509)||(8144459-8144672)
chr5 (359-553)||(13660903-13661095)
chr5 (347-553)||(19571726-19571933)
chr5 (344-543)||(39984820-39985023)
chr5 (343-542)||(41383957-41384157)
chr5 (359-553)||(16127301-16127495)
chr5 (344-552)||(32617561-32617770)
chr5 (299-553)||(41418352-41418606)
chr5 (332-545)||(15774836-15775051)
chr5 (359-553)||(3497601-3497795)
chr5 (359-553)||(9828435-9828629)
chr5 (359-553)||(40004210-40004404)
chr5 (359-545)||(40738459-40738646)
chr5 (332-486)||(11780862-11781018)
chr5 (359-544)||(186148-186334)
chr5 (388-543)||(12806697-12806854)
chr5 (296-513)||(17714645-17714869)
chr5 (344-553)||(3160312-3160522)
chr5 (359-546)||(38161581-38161769)
chr5 (343-527)||(17592586-17592771)
chr5 (359-553)||(32147335-32147529)
chr5 (381-543)||(41686938-41687099)
chr5 (388-553)||(20987789-20987955)
chr5 (375-553)||(22581552-22581730)
chr5 (359-553)||(31158227-31158419)
chr5 (359-543)||(14570691-14570874)
chr5 (381-543)||(25837059-25837222)
chr5 (297-503)||(37034238-37034445)
chr5 (365-513)||(3628983-3629132)
chr5 (332-477)||(30182958-30183104)
chr5 (366-545)||(14789602-14789782)
chr5 (298-451)||(42030338-42030493)
chr5 (343-553)||(26605400-26605618)
chr5 (381-543)||(1303400-1303561)
chr5 (359-553)||(23286282-23286469)
chr5 (381-553)||(24170175-24170348)
chr5 (365-543)||(5283099-5283277)
chr5 (381-543)||(6328626-6328789)
chr5 (381-543)||(28414507-28414670)
chr5 (381-541)||(16926506-16926666)
chr5 (299-426)||(26889593-26889721)
chr5 (381-552)||(31657727-31657898)
chr5 (359-542)||(33639343-33639527)
chr5 (416-552)||(39180504-39180639)
chr5 (381-543)||(8949866-8950029)
chr5 (344-451)||(15674920-15675027)
chr5 (381-546)||(15559581-15559751)
chr5 (381-552)||(16285013-16285184)
chr5 (384-552)||(11432353-11432527)
chr5 (381-553)||(35784743-35784912)
chr5 (345-513)||(12098642-12098811)
chr5 (381-552)||(13235985-13236153)
chr5 (381-543)||(31642238-31642401)
chr5 (382-552)||(39971057-39971227)
chr5 (381-546)||(23259961-23260127)
chr5 (377-543)||(37206170-37206338)
chr5 (381-552)||(24857599-24857769)
chr5 (433-553)||(26674480-26674599)
chr5 (433-553)||(26946086-26946205)
chr5 (375-543)||(37700144-37700314)
chr5 (381-552)||(21069680-21069851)
chr5 (381-543)||(39692477-39692638)
chr5 (345-490)||(26076175-26076320)
chr5 (422-543)||(26894739-26894859)
chr5 (449-544)||(13735700-13735794)
chr5 (426-516)||(20187158-20187248)
chr5 (334-513)||(9438866-9439049)
chr5 (359-512)||(8100194-8100348)
chr5 (377-543)||(30117164-30117333)
chr5 (299-389)||(12807129-12807220)
chr5 (381-543)||(18251067-18251234)
chr5 (344-471)||(2328408-2328528)
chr5 (356-436)||(13958649-13958730)
chr5 (389-528)||(27834010-27834150)
chr5 (377-543)||(16099279-16099448)
chr5 (332-470)||(35495044-35495182)
chr5 (381-467)||(9727498-9727584)
chr5 (381-467)||(8356362-8356449)
chr5 (375-543)||(26699368-26699537)
chr5 (375-543)||(26969101-26969270)
chr5 (442-553)||(4902849-4902951)
chr5 (385-523)||(16636825-16636967)
chr5 (332-388)||(20988250-20988306)
chr5 (375-543)||(13335339-13335508)
chr5 (345-419)||(10561242-10561316)
chr5 (375-452)||(24875950-24876028)
chr5 (432-490)||(35998613-35998671)
chr5 (359-413)||(39181902-39181956)
chr5 (375-543)||(10116631-10116803)
chr5 (359-411)||(4902966-4903018)
chr5 (366-414)||(7408878-7408926)
chr5 (454-530)||(7956578-7956654)
chr5 (382-438)||(9264756-9264811)
chr5 (473-553)||(30182125-30182204)
chr5 (381-451)||(7001445-7001516)
chr5 (299-414)||(7956415-7956530)
chr5 (444-510)||(21591812-21591878)
chr5 (444-510)||(21595929-21595995)
chr5 (345-407)||(37330994-37331056)
[»] chr3 (219 HSPs)
chr3 (299-543)||(20621425-20621670)
chr3 (299-543)||(45513376-45513621)
chr3 (299-543)||(10015530-10015775)
chr3 (299-543)||(19897577-19897822)
chr3 (332-553)||(53361628-53361850)
chr3 (299-553)||(8321967-8322221)
chr3 (332-553)||(48909914-48910134)
chr3 (299-553)||(17753274-17753530)
chr3 (299-553)||(19054594-19054850)
chr3 (332-543)||(49383394-49383607)
chr3 (299-543)||(31186809-31187054)
chr3 (299-543)||(43158477-43158722)
chr3 (299-552)||(15996514-15996767)
chr3 (332-553)||(21459024-21459246)
chr3 (299-543)||(43686552-43686799)
chr3 (297-553)||(50433126-50433384)
chr3 (346-553)||(10220974-10221180)
chr3 (296-553)||(28673032-28673289)
chr3 (299-553)||(47066976-47067232)
chr3 (303-544)||(52044539-52044781)
chr3 (343-553)||(9499281-9499492)
chr3 (343-553)||(43868145-43868356)
chr3 (299-543)||(43978211-43978456)
chr3 (332-543)||(50726559-50726770)
chr3 (332-543)||(50786078-50786289)
chr3 (334-553)||(7251057-7251277)
chr3 (299-553)||(10656733-10656989)
chr3 (332-546)||(46049761-46049975)
chr3 (299-553)||(53164205-53164461)
chr3 (343-553)||(32467467-32467678)
chr3 (343-553)||(49126982-49127193)
chr3 (299-543)||(52291168-52291413)
chr3 (299-546)||(17698773-17699021)
chr3 (314-553)||(27688028-27688266)
chr3 (332-553)||(48887719-48887941)
chr3 (343-543)||(31531195-31531397)
chr3 (302-553)||(33212438-33212691)
chr3 (298-553)||(46845230-46845487)
chr3 (345-543)||(12050181-12050379)
chr3 (342-553)||(32962888-32963099)
chr3 (297-546)||(48213800-48214050)
chr3 (343-553)||(7181392-7181603)
chr3 (299-528)||(13809548-13809780)
chr3 (343-553)||(22103713-22103924)
chr3 (343-553)||(23700569-23700780)
chr3 (343-553)||(23719024-23719235)
chr3 (343-553)||(23737480-23737691)
chr3 (343-553)||(26221330-26221541)
chr3 (343-553)||(45252815-45253026)
chr3 (343-553)||(46703069-46703280)
chr3 (343-553)||(52673229-52673440)
chr3 (343-553)||(54782701-54782912)
chr3 (314-553)||(2993301-2993540)
chr3 (299-546)||(32978530-32978777)
chr3 (359-543)||(45323889-45324073)
chr3 (343-553)||(1641884-1642094)
chr3 (343-553)||(7051504-7051715)
chr3 (343-553)||(21756528-21756739)
chr3 (343-553)||(35165747-35165957)
chr3 (332-553)||(35711317-35711537)
chr3 (299-546)||(38071243-38071494)
chr3 (343-553)||(43701220-43701431)
chr3 (343-553)||(45048806-45049017)
chr3 (343-553)||(46878223-46878434)
chr3 (304-553)||(50517266-50517517)
chr3 (314-552)||(51489410-51489649)
chr3 (332-553)||(1450284-1450506)
chr3 (343-553)||(25148501-25148708)
chr3 (299-522)||(12906151-12906377)
chr3 (299-553)||(23776236-23776490)
chr3 (343-543)||(45745829-45746031)
chr3 (343-542)||(54604372-54604573)
chr3 (343-553)||(25148906-25149117)
chr3 (343-553)||(30040801-30041012)
chr3 (343-553)||(54107395-54107606)
chr3 (332-513)||(6784543-6784726)
chr3 (343-543)||(20656094-20656296)
chr3 (349-553)||(46861662-46861867)
chr3 (343-553)||(26593549-26593760)
chr3 (332-553)||(8546946-8547168)
chr3 (299-553)||(14758880-14759132)
chr3 (343-554)||(44543823-44544034)
chr3 (344-553)||(53686782-53686992)
chr3 (343-543)||(36005554-36005756)
chr3 (343-552)||(9780024-9780233)
chr3 (346-553)||(32569039-32569247)
chr3 (299-553)||(42390643-42390899)
chr3 (299-553)||(42801521-42801777)
chr3 (343-553)||(35867867-35868078)
chr3 (299-523)||(40919025-40919252)
chr3 (332-513)||(43557226-43557409)
chr3 (359-553)||(4024094-4024288)
chr3 (359-553)||(16435038-16435232)
chr3 (302-553)||(35572200-35572450)
chr3 (299-541)||(41992279-41992509)
chr3 (299-513)||(1084693-1084910)
chr3 (297-523)||(4759086-4759317)
chr3 (386-543)||(12683009-12683168)
chr3 (359-553)||(33361501-33361688)
chr3 (343-553)||(17591330-17591540)
chr3 (343-553)||(50647729-50647939)
chr3 (343-553)||(52059030-52059240)
chr3 (343-543)||(37728764-37728965)
chr3 (296-553)||(46862102-46862361)
chr3 (302-553)||(50730367-50730621)
chr3 (302-553)||(50782233-50782487)
chr3 (359-553)||(33868490-33868684)
chr3 (343-553)||(36099007-36099216)
chr3 (366-543)||(49383640-49383819)
chr3 (343-553)||(20862238-20862449)
chr3 (359-553)||(36317456-36317650)
chr3 (299-467)||(41750927-41751097)
chr3 (299-479)||(54866388-54866570)
chr3 (298-477)||(25879256-25879437)
chr3 (344-553)||(26058588-26058790)
chr3 (343-543)||(10044892-10045092)
chr3 (332-528)||(33976549-33976743)
chr3 (360-543)||(22832411-22832595)
chr3 (359-546)||(26306408-26306596)
chr3 (359-553)||(14428652-14428845)
chr3 (344-480)||(19350162-19350300)
chr3 (332-510)||(24087111-24087288)
chr3 (334-543)||(53271643-53271852)
chr3 (312-473)||(23308059-23308223)
chr3 (381-544)||(28810944-28811108)
chr3 (345-543)||(41824159-41824358)
chr3 (359-544)||(26806181-26806367)
chr3 (381-553)||(38340992-38341162)
chr3 (334-528)||(51283838-51284034)
chr3 (343-553)||(39952313-39952523)
chr3 (381-543)||(44561519-44561682)
chr3 (345-543)||(20877684-20877881)
chr3 (374-553)||(43408543-43408724)
chr3 (386-545)||(44542301-44542462)
chr3 (343-480)||(37144271-37144411)
chr3 (381-553)||(47008325-47008497)
chr3 (345-546)||(1572379-1572580)
chr3 (417-543)||(49543728-49543854)
chr3 (334-528)||(54849429-54849625)
chr3 (346-513)||(52177880-52178050)
chr3 (299-543)||(29383065-29383312)
chr3 (343-543)||(25916451-25916655)
chr3 (379-543)||(1111469-1111634)
chr3 (343-542)||(25130702-25130898)
chr3 (379-543)||(27646127-27646292)
chr3 (299-414)||(18658168-18658284)
chr3 (381-552)||(48904086-48904257)
chr3 (381-543)||(34021818-34021981)
chr3 (365-528)||(41392686-41392851)
chr3 (393-513)||(55287342-55287460)
chr3 (381-552)||(17589699-17589870)
chr3 (381-528)||(29719534-29719682)
chr3 (365-513)||(33290427-33290574)
chr3 (299-451)||(39625197-39625352)
chr3 (359-543)||(46879069-46879255)
chr3 (365-523)||(54927897-54928057)
chr3 (418-529)||(18658320-18658432)
chr3 (394-543)||(30819929-30820079)
chr3 (381-543)||(42755392-42755555)
chr3 (381-546)||(8379725-8379891)
chr3 (381-552)||(42526448-42526619)
chr3 (421-523)||(46557747-46557849)
chr3 (381-530)||(24813650-24813798)
chr3 (333-543)||(16776660-16776873)
chr3 (381-515)||(4836516-4836649)
chr3 (344-543)||(22527408-22527607)
chr3 (381-552)||(36584753-36584919)
chr3 (354-546)||(36600191-36600384)
chr3 (390-542)||(48655072-48655225)
chr3 (384-543)||(15095249-15095409)
chr3 (443-543)||(20848612-20848712)
chr3 (381-543)||(45404426-45404588)
chr3 (386-523)||(31533438-31533576)
chr3 (383-543)||(4564285-4564449)
chr3 (386-546)||(7886890-7887051)
chr3 (343-441)||(20848985-20849085)
chr3 (381-516)||(12918661-12918797)
chr3 (381-543)||(42044077-42044238)
chr3 (343-414)||(12675207-12675278)
chr3 (381-528)||(28875075-28875222)
chr3 (375-487)||(35938468-35938582)
chr3 (385-543)||(48902536-48902694)
chr3 (381-542)||(40215052-40215214)
chr3 (444-553)||(9582285-9582393)
chr3 (381-552)||(32969049-32969219)
chr3 (366-486)||(23650639-23650761)
chr3 (381-552)||(31541070-31541236)
chr3 (374-511)||(2764219-2764356)
chr3 (381-544)||(34265547-34265717)
chr3 (377-467)||(38364295-38364387)
chr3 (375-539)||(49543996-49544161)
chr3 (381-528)||(34811380-34811527)
chr3 (416-552)||(52693547-52693682)
chr3 (482-553)||(7462922-7462992)
chr3 (375-540)||(8503318-8503488)
chr3 (381-441)||(31397930-31397990)
chr3 (456-543)||(39625693-39625780)
chr3 (375-437)||(40048120-40048183)
chr3 (411-473)||(54690375-54690435)
chr3 (343-409)||(9582396-9582462)
chr3 (375-470)||(13702672-13702769)
chr3 (472-546)||(54690581-54690655)
chr3 (381-461)||(21497634-21497715)
chr3 (381-441)||(22494483-22494544)
chr3 (416-481)||(27067500-27067565)
chr3 (314-426)||(49791408-49791521)
chr3 (420-460)||(4073365-4073405)
chr3 (471-543)||(7886460-7886532)
chr3 (426-480)||(51486230-51486284)
chr3 (471-543)||(41751383-41751455)
chr3 (333-389)||(46557689-46557745)
chr3 (432-480)||(48136964-48137012)
chr3 (375-414)||(20084703-20084742)
chr3 (444-543)||(40047982-40048081)
chr3 (333-419)||(16776521-16776607)
chr3 (299-372)||(43408192-43408266)
chr3 (498-543)||(29454725-29454770)
chr3 (377-480)||(36824537-36824636)
chr3 (432-545)||(52661651-52661763)
[»] chr8 (174 HSPs)
chr8 (296-543)||(32522581-32522829)
chr8 (298-543)||(23687904-23688150)
chr8 (299-543)||(18111716-18111961)
chr8 (299-543)||(23487115-23487360)
chr8 (314-546)||(25058090-25058323)
chr8 (298-544)||(9035279-9035526)
chr8 (299-553)||(33865283-33865536)
chr8 (299-553)||(33980506-33980759)
chr8 (296-553)||(40784932-40785191)
chr8 (299-553)||(5783886-5784143)
chr8 (299-542)||(8566255-8566498)
chr8 (299-552)||(26016612-26016865)
chr8 (299-553)||(7683303-7683558)
chr8 (299-553)||(2944013-2944267)
chr8 (299-553)||(5162346-5162602)
chr8 (343-553)||(50879-51090)
chr8 (343-553)||(4076214-4076425)
chr8 (299-542)||(7682777-7683022)
chr8 (299-552)||(8072868-8073123)
chr8 (332-553)||(35143295-35143515)
chr8 (343-553)||(38878763-38878974)
chr8 (298-543)||(44747099-44747346)
chr8 (299-546)||(39029226-39029473)
chr8 (343-543)||(41014555-41014757)
chr8 (332-543)||(257311-257524)
chr8 (332-543)||(658396-658609)
chr8 (332-543)||(844132-844345)
chr8 (299-528)||(31886737-31886967)
chr8 (296-543)||(45283528-45283776)
chr8 (343-553)||(8948135-8948346)
chr8 (343-553)||(14699494-14699705)
chr8 (343-553)||(18455762-18455973)
chr8 (343-553)||(28191959-28192170)
chr8 (343-553)||(34490559-34490770)
chr8 (299-552)||(39406602-39406857)
chr8 (344-553)||(8951213-8951423)
chr8 (332-553)||(32475006-32475222)
chr8 (343-544)||(35504364-35504567)
chr8 (343-546)||(1774390-1774595)
chr8 (332-543)||(18641150-18641363)
chr8 (343-553)||(18754186-18754398)
chr8 (343-553)||(8251717-8251928)
chr8 (343-553)||(29598266-29598477)
chr8 (343-552)||(32675541-32675751)
chr8 (345-553)||(34568532-34568741)
chr8 (343-543)||(36661710-36661912)
chr8 (299-543)||(41615957-41616208)
chr8 (374-553)||(29806038-29806218)
chr8 (343-546)||(38183350-38183555)
chr8 (299-552)||(16448492-16448747)
chr8 (343-553)||(26980761-26980971)
chr8 (343-529)||(42598500-42598688)
chr8 (299-553)||(5774090-5774347)
chr8 (343-553)||(12255137-12255347)
chr8 (343-553)||(12260680-12260890)
chr8 (299-513)||(12825028-12825244)
chr8 (299-553)||(38967185-38967441)
chr8 (343-529)||(16117235-16117423)
chr8 (343-529)||(16125494-16125682)
chr8 (302-543)||(24992566-24992810)
chr8 (342-553)||(28864291-28864502)
chr8 (343-553)||(13153970-13154180)
chr8 (343-553)||(33745681-33745891)
chr8 (299-541)||(38780881-38781125)
chr8 (332-543)||(42985289-42985501)
chr8 (343-553)||(28579681-28579891)
chr8 (343-553)||(36176887-36177098)
chr8 (332-553)||(11482893-11483115)
chr8 (334-553)||(11798647-11798866)
chr8 (299-543)||(44888731-44888978)
chr8 (292-539)||(4778646-4778894)
chr8 (359-553)||(40741307-40741501)
chr8 (296-465)||(30140211-30140383)
chr8 (299-553)||(44580616-44580874)
chr8 (343-552)||(16999039-16999250)
chr8 (343-553)||(43653988-43654198)
chr8 (343-552)||(4631338-4631547)
chr8 (359-553)||(29279238-29279432)
chr8 (343-546)||(42218131-42218333)
chr8 (332-523)||(44021077-44021270)
chr8 (359-543)||(17856578-17856763)
chr8 (343-480)||(35202952-35203088)
chr8 (332-553)||(8797062-8797292)
chr8 (359-553)||(29321095-29321289)
chr8 (360-543)||(5593470-5593654)
chr8 (343-553)||(44502661-44502875)
chr8 (359-523)||(44748263-44748429)
chr8 (344-553)||(2152026-2152235)
chr8 (299-513)||(45260304-45260520)
chr8 (365-544)||(39463035-39463215)
chr8 (332-480)||(110184-110336)
chr8 (394-553)||(5951160-5951318)
chr8 (343-512)||(21652266-21652441)
chr8 (334-553)||(21136896-21137117)
chr8 (359-543)||(45425086-45425269)
chr8 (359-553)||(44250920-44251116)
chr8 (343-513)||(5268050-5268221)
chr8 (311-480)||(35203116-35203278)
chr8 (345-543)||(40855846-40856047)
chr8 (381-552)||(11293696-11293867)
chr8 (343-513)||(36245697-36245869)
chr8 (343-543)||(26990612-26990814)
chr8 (359-552)||(13568710-13568898)
chr8 (345-553)||(14583919-14584126)
chr8 (344-480)||(44056855-44056990)
chr8 (387-529)||(31089750-31089893)
chr8 (381-546)||(35179648-35179814)
chr8 (381-543)||(43292821-43292982)
chr8 (381-552)||(36786511-36786681)
chr8 (365-543)||(17336469-17336647)
chr8 (381-543)||(12802661-12802822)
chr8 (365-526)||(25056707-25056868)
chr8 (426-543)||(44580922-44581039)
chr8 (381-543)||(44165292-44165455)
chr8 (382-543)||(5244451-5244613)
chr8 (381-523)||(23894731-23894872)
chr8 (375-543)||(30512818-30512985)
chr8 (456-553)||(7758808-7758904)
chr8 (332-441)||(14625680-14625791)
chr8 (334-543)||(24260729-24260940)
chr8 (381-552)||(26625836-26626007)
chr8 (332-419)||(28965643-28965730)
chr8 (381-543)||(36941320-36941482)
chr8 (359-541)||(11113829-11114018)
chr8 (365-543)||(23497779-23497960)
chr8 (382-543)||(13141511-13141670)
chr8 (359-467)||(2767759-2767867)
chr8 (343-546)||(14548473-14548677)
chr8 (381-552)||(23995620-23995790)
chr8 (403-546)||(40529354-40529497)
chr8 (381-552)||(5109924-5110095)
chr8 (462-552)||(28965547-28965636)
chr8 (345-441)||(42747361-42747459)
chr8 (342-476)||(29738143-29738276)
chr8 (299-543)||(31618992-31619234)
chr8 (381-546)||(41898317-41898485)
chr8 (299-392)||(17851249-17851343)
chr8 (388-513)||(39970555-39970683)
chr8 (457-543)||(42885105-42885191)
chr8 (444-553)||(19176178-19176286)
chr8 (381-543)||(26502530-26502694)
chr8 (375-541)||(39970021-39970189)
chr8 (343-448)||(42885315-42885423)
chr8 (363-490)||(23424913-23425041)
chr8 (429-523)||(9615956-9616050)
chr8 (293-397)||(5952482-5952587)
chr8 (454-546)||(17851345-17851437)
chr8 (401-478)||(28929339-28929418)
chr8 (344-420)||(44580539-44580615)
chr8 (444-542)||(42220510-42220606)
chr8 (343-437)||(7758713-7758808)
chr8 (302-414)||(16894062-16894175)
chr8 (297-385)||(34070969-34071058)
chr8 (359-451)||(39112562-39112655)
chr8 (393-540)||(45145297-45145446)
chr8 (334-476)||(28740973-28741116)
chr8 (382-480)||(36409710-36409809)
chr8 (299-466)||(19700749-19700918)
chr8 (453-543)||(37023179-37023269)
chr8 (425-546)||(13401789-13401909)
chr8 (411-480)||(29073738-29073807)
chr8 (428-543)||(4348382-4348497)
chr8 (359-414)||(41388546-41388601)
chr8 (375-412)||(42486245-42486282)
chr8 (381-441)||(5449587-5449646)
chr8 (428-528)||(25635979-25636079)
chr8 (375-467)||(15021174-15021268)
chr8 (395-467)||(16893811-16893885)
chr8 (343-405)||(40530336-40530398)
chr8 (444-513)||(5449231-5449300)
chr8 (365-441)||(19176844-19176920)
chr8 (425-513)||(19260972-19261061)
chr8 (375-408)||(19715659-19715692)
chr8 (416-449)||(34071077-34071110)
[»] chr2 (172 HSPs)
chr2 (298-552)||(12889948-12890202)
chr2 (299-543)||(40788829-40789074)
chr2 (299-553)||(22182664-22182918)
chr2 (299-553)||(41003985-41004239)
chr2 (299-553)||(31751111-31751370)
chr2 (299-543)||(13336496-13336741)
chr2 (299-543)||(23465186-23465431)
chr2 (328-553)||(6007614-6007840)
chr2 (298-553)||(11851926-11852181)
chr2 (297-553)||(19318792-19319050)
chr2 (332-553)||(40607744-40607966)
chr2 (299-553)||(8912615-8912869)
chr2 (299-553)||(1748381-1748637)
chr2 (343-546)||(13197429-13197634)
chr2 (299-543)||(40680404-40680648)
chr2 (299-553)||(15227890-15228144)
chr2 (314-543)||(20643533-20643763)
chr2 (343-553)||(25624774-25624982)
chr2 (299-552)||(2060360-2060614)
chr2 (343-553)||(34883632-34883843)
chr2 (332-543)||(17665575-17665786)
chr2 (302-553)||(26322035-26322288)
chr2 (299-553)||(1142997-1143253)
chr2 (299-543)||(38214531-38214776)
chr2 (332-543)||(7531654-7531865)
chr2 (323-543)||(7666329-7666551)
chr2 (299-553)||(11385909-11386163)
chr2 (343-543)||(20252261-20252463)
chr2 (298-543)||(41834457-41834706)
chr2 (344-543)||(1943625-1943826)
chr2 (333-523)||(25523572-25523762)
chr2 (359-553)||(34113573-34113766)
chr2 (343-554)||(37229481-37229693)
chr2 (343-546)||(41967988-41968192)
chr2 (343-553)||(8990246-8990457)
chr2 (343-553)||(20727642-20727853)
chr2 (343-553)||(36130812-36131023)
chr2 (343-552)||(32120987-32121197)
chr2 (344-528)||(45474381-45474567)
chr2 (342-553)||(41450558-41450770)
chr2 (343-553)||(5664680-5664891)
chr2 (343-553)||(8716676-8716887)
chr2 (299-543)||(11865026-11865274)
chr2 (343-553)||(15404492-15404702)
chr2 (299-542)||(19034465-19034708)
chr2 (359-553)||(28840680-28840875)
chr2 (343-553)||(34062449-34062660)
chr2 (332-553)||(7418535-7418758)
chr2 (342-553)||(7491886-7492097)
chr2 (299-542)||(10399201-10399447)
chr2 (332-543)||(32712559-32712770)
chr2 (343-553)||(42629414-42629617)
chr2 (299-553)||(18375234-18375490)
chr2 (299-553)||(24345459-24345715)
chr2 (343-553)||(16669668-16669879)
chr2 (343-553)||(40680769-40680980)
chr2 (299-543)||(2200030-2200277)
chr2 (334-553)||(4711769-4711988)
chr2 (332-553)||(24973842-24974064)
chr2 (298-513)||(34944157-34944368)
chr2 (332-553)||(44573662-44573878)
chr2 (332-543)||(5255585-5255797)
chr2 (299-553)||(38121250-38121506)
chr2 (299-513)||(45628620-45628837)
chr2 (299-511)||(30779740-30779955)
chr2 (334-543)||(36021025-36021235)
chr2 (299-510)||(7933504-7933718)
chr2 (349-553)||(15435667-15435871)
chr2 (343-553)||(22897433-22897643)
chr2 (343-553)||(23789011-23789221)
chr2 (299-513)||(19353272-19353489)
chr2 (332-553)||(1859590-1859811)
chr2 (362-543)||(8782517-8782700)
chr2 (359-553)||(1359833-1360027)
chr2 (359-553)||(8841458-8841652)
chr2 (359-553)||(16805592-16805786)
chr2 (359-553)||(16844874-16845068)
chr2 (361-553)||(18374505-18374697)
chr2 (299-540)||(40173142-40173380)
chr2 (299-553)||(15917820-15918074)
chr2 (299-544)||(8030758-8030993)
chr2 (359-553)||(2438267-2438461)
chr2 (343-553)||(16108260-16108470)
chr2 (359-553)||(16456673-16456867)
chr2 (359-553)||(39833800-39833994)
chr2 (378-513)||(3670309-3670446)
chr2 (359-543)||(11201734-11201919)
chr2 (299-472)||(30466247-30466423)
chr2 (345-513)||(5070389-5070557)
chr2 (334-553)||(27560248-27560467)
chr2 (359-553)||(9697942-9698136)
chr2 (332-543)||(12619858-12620073)
chr2 (343-513)||(3060405-3060577)
chr2 (381-543)||(43701021-43701185)
chr2 (344-527)||(19630976-19631160)
chr2 (344-527)||(19827877-19828061)
chr2 (359-553)||(17408095-17408289)
chr2 (344-528)||(15353249-15353430)
chr2 (375-553)||(29239410-29239588)
chr2 (359-514)||(1422224-1422379)
chr2 (359-528)||(7116100-7116270)
chr2 (416-546)||(12873037-12873167)
chr2 (348-543)||(29830545-29830742)
chr2 (343-553)||(12360498-12360707)
chr2 (345-528)||(18223686-18223872)
chr2 (299-541)||(8295374-8295606)
chr2 (343-543)||(23083544-23083750)
chr2 (345-553)||(15571228-15571436)
chr2 (388-543)||(13215649-13215805)
chr2 (343-480)||(44436269-44436408)
chr2 (382-552)||(3095342-3095512)
chr2 (381-543)||(31633670-31633833)
chr2 (381-552)||(40544367-40544540)
chr2 (359-553)||(45151790-45151987)
chr2 (343-510)||(16809001-16809168)
chr2 (343-510)||(16848282-16848449)
chr2 (381-552)||(30857981-30858152)
chr2 (382-552)||(36750708-36750878)
chr2 (299-513)||(14493555-14493769)
chr2 (299-432)||(16636362-16636496)
chr2 (378-546)||(9040926-9041095)
chr2 (305-542)||(11083431-11083671)
chr2 (381-552)||(2788161-2788331)
chr2 (359-527)||(29830835-29831002)
chr2 (381-552)||(30830166-30830336)
chr2 (375-543)||(12296244-12296415)
chr2 (360-513)||(7461290-7461442)
chr2 (416-553)||(10757837-10757973)
chr2 (381-529)||(18970552-18970701)
chr2 (381-543)||(12873560-12873719)
chr2 (381-552)||(41494445-41494616)
chr2 (385-543)||(6028393-6028552)
chr2 (382-552)||(41422555-41422725)
chr2 (423-513)||(7446946-7447036)
chr2 (378-480)||(40348225-40348326)
chr2 (359-467)||(8867712-8867818)
chr2 (378-543)||(6650975-6651142)
chr2 (381-552)||(9701113-9701284)
chr2 (430-553)||(26334717-26334840)
chr2 (381-543)||(28566202-28566365)
chr2 (383-543)||(43700668-43700833)
chr2 (375-513)||(11121065-11121205)
chr2 (381-542)||(11944461-11944623)
chr2 (381-552)||(34432024-34432194)
chr2 (444-543)||(4897630-4897729)
chr2 (444-543)||(4945024-4945123)
chr2 (365-507)||(22302593-22302738)
chr2 (427-553)||(32511061-32511186)
chr2 (381-552)||(18294036-18294205)
chr2 (430-543)||(44017791-44017904)
chr2 (299-529)||(13598582-13598814)
chr2 (381-516)||(21838695-21838830)
chr2 (375-541)||(26273372-26273540)
chr2 (381-543)||(27725513-27725679)
chr2 (381-543)||(4408600-4408764)
chr2 (377-529)||(25888342-25888497)
chr2 (379-543)||(12969562-12969728)
chr2 (332-396)||(26334658-26334722)
chr2 (365-513)||(3904527-3904677)
chr2 (332-435)||(4897427-4897530)
chr2 (332-435)||(4944821-4944924)
chr2 (375-421)||(16807078-16807124)
chr2 (375-421)||(16846359-16846405)
chr2 (487-553)||(24300281-24300346)
chr2 (345-411)||(32511185-32511251)
chr2 (366-546)||(36556204-36556389)
chr2 (366-543)||(44417450-44417631)
chr2 (377-480)||(8056071-8056175)
chr2 (443-543)||(15079299-15079398)
chr2 (492-553)||(44436756-44436816)
chr2 (388-480)||(40544653-40544746)
chr2 (473-543)||(30466155-30466225)
[»] chr6 (109 HSPs)
chr6 (299-552)||(31149987-31150240)
chr6 (299-543)||(13866646-13866891)
chr6 (298-546)||(31487109-31487360)
chr6 (299-553)||(20449920-20450176)
chr6 (332-553)||(13647902-13648124)
chr6 (332-553)||(34915316-34915538)
chr6 (299-553)||(402362-402616)
chr6 (299-553)||(8670177-8670431)
chr6 (299-546)||(9341886-9342136)
chr6 (299-553)||(34126183-34126437)
chr6 (299-553)||(1729842-1730097)
chr6 (343-553)||(34301616-34301827)
chr6 (332-553)||(11847613-11847835)
chr6 (299-553)||(15498671-15498925)
chr6 (332-553)||(925708-925928)
chr6 (299-523)||(2090730-2090957)
chr6 (299-543)||(23604513-23604760)
chr6 (311-553)||(1147020-1147262)
chr6 (304-546)||(19097547-19097790)
chr6 (299-553)||(25045382-25045638)
chr6 (299-543)||(31091496-31091741)
chr6 (298-553)||(390365-390618)
chr6 (343-543)||(25197203-25197405)
chr6 (296-553)||(16272704-16272961)
chr6 (299-553)||(17227267-17227523)
chr6 (299-552)||(13690471-13690726)
chr6 (299-543)||(7772227-7772474)
chr6 (299-506)||(20373123-20373331)
chr6 (343-543)||(6147434-6147636)
chr6 (332-553)||(12143821-12144041)
chr6 (343-543)||(23397924-23398125)
chr6 (343-528)||(25024290-25024477)
chr6 (299-543)||(15355295-15355540)
chr6 (332-543)||(31711623-31711834)
chr6 (343-543)||(33487882-33488084)
chr6 (343-553)||(287198-287409)
chr6 (343-553)||(30248689-30248900)
chr6 (347-544)||(15966950-15967149)
chr6 (343-528)||(17175249-17175436)
chr6 (299-543)||(23578166-23578412)
chr6 (299-543)||(16122305-16122551)
chr6 (343-553)||(12105848-12106059)
chr6 (343-553)||(1779829-1780039)
chr6 (344-543)||(5457463-5457664)
chr6 (388-546)||(9660506-9660666)
chr6 (332-553)||(19418897-19419119)
chr6 (359-553)||(8743229-8743423)
chr6 (332-523)||(13010893-13011086)
chr6 (344-541)||(10195779-10195978)
chr6 (332-545)||(33773626-33773843)
chr6 (343-553)||(9388574-9388786)
chr6 (357-513)||(5576178-5576334)
chr6 (343-553)||(34741508-34741718)
chr6 (343-553)||(230891-231101)
chr6 (359-553)||(15126506-15126700)
chr6 (343-543)||(18105956-18106157)
chr6 (375-528)||(9299246-9299400)
chr6 (359-540)||(345547-345729)
chr6 (343-553)||(3177222-3177431)
chr6 (388-543)||(344915-345071)
chr6 (343-543)||(6417926-6418123)
chr6 (359-528)||(235825-235993)
chr6 (366-528)||(32615054-32615216)
chr6 (300-446)||(11104699-11104850)
chr6 (343-528)||(15287205-15287390)
chr6 (382-552)||(6418476-6418646)
chr6 (367-513)||(17952167-17952315)
chr6 (381-545)||(27581435-27581600)
chr6 (381-552)||(22998868-22999039)
chr6 (381-552)||(23789365-23789536)
chr6 (381-543)||(8217544-8217705)
chr6 (388-553)||(11656174-11656341)
chr6 (366-523)||(4823043-4823198)
chr6 (359-544)||(8175711-8175892)
chr6 (379-546)||(11161899-11162069)
chr6 (382-552)||(4175285-4175455)
chr6 (381-552)||(22710309-22710478)
chr6 (375-542)||(8646021-8646190)
chr6 (385-543)||(13901690-13901850)
chr6 (381-552)||(28236026-28236195)
chr6 (461-553)||(29036167-29036258)
chr6 (381-543)||(14629954-14630115)
chr6 (381-552)||(9038685-9038854)
chr6 (420-513)||(11840451-11840544)
chr6 (346-553)||(22852119-22852326)
chr6 (381-546)||(27310482-27310646)
chr6 (381-516)||(11200672-11200808)
chr6 (416-543)||(29293658-29293785)
chr6 (388-553)||(23923534-23923698)
chr6 (417-543)||(13446006-13446131)
chr6 (381-552)||(28980678-28980850)
chr6 (375-470)||(6840088-6840183)
chr6 (299-540)||(23282543-23282789)
chr6 (366-546)||(33012473-33012654)
chr6 (343-411)||(29036259-29036327)
chr6 (360-459)||(26211032-26211135)
chr6 (332-461)||(2746317-2746448)
chr6 (381-552)||(13321151-13321320)
chr6 (388-538)||(493510-493661)
chr6 (430-544)||(8637148-8637262)
chr6 (468-553)||(11104614-11104698)
chr6 (377-510)||(32982442-32982575)
chr6 (413-463)||(17545389-17545439)
chr6 (419-480)||(8595646-8595707)
chr6 (332-386)||(9660167-9660221)
chr6 (395-490)||(7847150-7847246)
chr6 (493-543)||(5575426-5575476)
chr6 (343-389)||(11655853-11655899)
chr6 (494-543)||(2365030-2365079)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (299-543)||(6351-6596)
[»] chr4 (218 HSPs)
chr4 (299-543)||(625708-625953)
chr4 (299-543)||(13620595-13620840)
chr4 (302-546)||(13389654-13389898)
chr4 (332-553)||(20788973-20789195)
chr4 (332-553)||(37173875-37174097)
chr4 (299-543)||(14793764-14794009)
chr4 (343-553)||(52978024-52978235)
chr4 (297-553)||(36129828-36130085)
chr4 (297-543)||(37776473-37776720)
chr4 (299-553)||(17339120-17339376)
chr4 (300-553)||(36900852-36901104)
chr4 (343-546)||(44294837-44295042)
chr4 (343-553)||(10588116-10588327)
chr4 (305-553)||(48030355-48030603)
chr4 (311-540)||(52850205-52850437)
chr4 (311-543)||(55876431-55876664)
chr4 (314-553)||(20454938-20455177)
chr4 (298-553)||(26625742-26625997)
chr4 (343-552)||(35675704-35675914)
chr4 (299-543)||(47683140-47683386)
chr4 (299-553)||(37842217-37842471)
chr4 (299-546)||(40809604-40809854)
chr4 (332-543)||(30049857-30050070)
chr4 (299-553)||(36990956-36991212)
chr4 (314-543)||(41620565-41620795)
chr4 (299-540)||(6462430-6462673)
chr4 (343-553)||(6753567-6753778)
chr4 (343-553)||(20285805-20286016)
chr4 (299-543)||(46950043-46950288)
chr4 (299-543)||(56432569-56432817)
chr4 (333-553)||(45096941-45097160)
chr4 (345-553)||(15241521-15241730)
chr4 (343-554)||(43387777-43387989)
chr4 (334-553)||(50424629-50424849)
chr4 (332-543)||(50602871-50603083)
chr4 (343-553)||(54676589-54676801)
chr4 (332-553)||(18706417-18706637)
chr4 (343-553)||(24754120-24754331)
chr4 (343-541)||(30771575-30771775)
chr4 (296-553)||(31937118-31937377)
chr4 (343-553)||(32032775-32032986)
chr4 (343-553)||(37352585-37352796)
chr4 (333-543)||(38027183-38027395)
chr4 (343-553)||(45742590-45742801)
chr4 (345-543)||(47228514-47228714)
chr4 (343-553)||(53276970-53277181)
chr4 (343-544)||(29427539-29427742)
chr4 (344-553)||(37357484-37357694)
chr4 (299-543)||(50450964-50451211)
chr4 (343-553)||(17609806-17610016)
chr4 (334-546)||(33413566-33413780)
chr4 (299-553)||(33988536-33988787)
chr4 (299-543)||(25123983-25124231)
chr4 (342-553)||(51536209-51536421)
chr4 (299-553)||(55562865-55563121)
chr4 (343-553)||(9328024-9328235)
chr4 (343-553)||(36391896-36392107)
chr4 (343-553)||(47299022-47299233)
chr4 (298-553)||(54623843-54624099)
chr4 (343-552)||(20391222-20391432)
chr4 (299-553)||(20767955-20768211)
chr4 (332-543)||(37518056-37518267)
chr4 (332-543)||(37522272-37522483)
chr4 (299-486)||(54535921-54536111)
chr4 (311-553)||(48241401-48241645)
chr4 (314-553)||(51717853-51718093)
chr4 (314-528)||(55014721-55014937)
chr4 (299-543)||(23777543-23777787)
chr4 (343-553)||(34273003-34273214)
chr4 (343-553)||(47806902-47807113)
chr4 (332-546)||(18882399-18882617)
chr4 (299-513)||(20761564-20761781)
chr4 (343-528)||(37364583-37364770)
chr4 (314-553)||(38899799-38900038)
chr4 (332-553)||(47311332-47311553)
chr4 (343-552)||(49228502-49228712)
chr4 (360-553)||(50352106-50352300)
chr4 (343-553)||(4035867-4036077)
chr4 (345-553)||(5375344-5375552)
chr4 (311-546)||(16545735-16545972)
chr4 (314-528)||(18004009-18004224)
chr4 (299-553)||(375466-375722)
chr4 (302-528)||(34963450-34963678)
chr4 (342-553)||(51335835-51336047)
chr4 (299-543)||(54877755-54877998)
chr4 (301-553)||(28298111-28298366)
chr4 (343-553)||(30745584-30745794)
chr4 (345-553)||(4455102-4455313)
chr4 (345-553)||(8343949-8344156)
chr4 (343-543)||(25474867-25475067)
chr4 (343-543)||(1028569-1028771)
chr4 (302-553)||(39114631-39114884)
chr4 (343-543)||(50533934-50534136)
chr4 (343-543)||(422713-422914)
chr4 (299-503)||(30523764-30523969)
chr4 (344-553)||(49793133-49793341)
chr4 (343-543)||(53629843-53630044)
chr4 (357-553)||(9808396-9808593)
chr4 (343-553)||(29014109-29014319)
chr4 (332-480)||(46480793-46480943)
chr4 (359-553)||(55632060-55632254)
chr4 (299-513)||(29460444-29460661)
chr4 (298-543)||(49373433-49373679)
chr4 (332-552)||(29519938-29520158)
chr4 (359-552)||(5743460-5743653)
chr4 (301-543)||(15500353-15500598)
chr4 (377-543)||(38405643-38405805)
chr4 (359-543)||(39144455-39144640)
chr4 (299-543)||(39670775-39671023)
chr4 (342-553)||(1859186-1859396)
chr4 (359-553)||(2615744-2615940)
chr4 (334-543)||(20747221-20747431)
chr4 (343-513)||(34948437-34948607)
chr4 (343-513)||(1173642-1173814)
chr4 (332-502)||(45850497-45850669)
chr4 (380-552)||(41191449-41191622)
chr4 (344-543)||(37639673-37639873)
chr4 (332-553)||(45921473-45921692)
chr4 (345-543)||(4094759-4094958)
chr4 (343-553)||(4416007-4416217)
chr4 (359-553)||(52870686-52870880)
chr4 (334-553)||(19281866-19282076)
chr4 (343-513)||(18018739-18018911)
chr4 (299-468)||(41191275-41191447)
chr4 (359-553)||(25708480-25708674)
chr4 (299-470)||(32898978-32899152)
chr4 (359-543)||(4549690-4549875)
chr4 (343-543)||(6083335-6083536)
chr4 (336-544)||(49329540-49329750)
chr4 (343-553)||(39184315-39184523)
chr4 (381-552)||(13498309-13498480)
chr4 (342-470)||(33501712-33501842)
chr4 (299-477)||(23623753-23623933)
chr4 (356-523)||(39184048-39184217)
chr4 (343-543)||(26866646-26866849)
chr4 (365-523)||(28495455-28495615)
chr4 (311-434)||(4143549-4143673)
chr4 (379-542)||(26889722-26889884)
chr4 (381-552)||(52181009-52181178)
chr4 (384-552)||(29508848-29509016)
chr4 (299-414)||(5734387-5734503)
chr4 (382-552)||(23390172-23390342)
chr4 (299-437)||(49489880-49490019)
chr4 (401-552)||(49490011-49490161)
chr4 (416-546)||(20286098-20286228)
chr4 (359-513)||(31071779-31071932)
chr4 (359-529)||(52966160-52966331)
chr4 (390-543)||(48149017-48149172)
chr4 (381-552)||(6629299-6629467)
chr4 (379-553)||(28501208-28501381)
chr4 (381-543)||(30868621-30868786)
chr4 (314-433)||(55777056-55777175)
chr4 (345-553)||(17678305-17678514)
chr4 (297-414)||(39879919-39880037)
chr4 (359-480)||(3168236-3168356)
chr4 (334-448)||(6807492-6807608)
chr4 (365-547)||(13138773-13138956)
chr4 (356-528)||(20180715-20180888)
chr4 (381-529)||(47109643-47109792)
chr4 (418-529)||(5734539-5734651)
chr4 (381-552)||(13549023-13549193)
chr4 (314-433)||(55841236-55841355)
chr4 (381-543)||(17467942-17468102)
chr4 (359-553)||(36211300-36211494)
chr4 (381-513)||(48801442-48801575)
chr4 (381-549)||(6656568-6656736)
chr4 (375-516)||(8418162-8418305)
chr4 (382-552)||(18872760-18872930)
chr4 (381-543)||(30010675-30010836)
chr4 (381-551)||(41333873-41334044)
chr4 (381-543)||(32684648-32684809)
chr4 (365-467)||(42598519-42598621)
chr4 (311-420)||(27009592-27009704)
chr4 (381-528)||(53564179-53564327)
chr4 (420-512)||(53906099-53906191)
chr4 (381-516)||(20783266-20783400)
chr4 (381-543)||(37780038-37780199)
chr4 (385-516)||(49613987-49614118)
chr4 (334-468)||(51329557-51329692)
chr4 (381-543)||(3085497-3085656)
chr4 (381-552)||(21265263-21265433)
chr4 (375-481)||(706658-706766)
chr4 (375-481)||(729851-729959)
chr4 (381-552)||(35909684-35909856)
chr4 (311-543)||(10497417-10497651)
chr4 (435-543)||(42528469-42528577)
chr4 (299-398)||(48148663-48148763)
chr4 (420-510)||(18879581-18879671)
chr4 (375-510)||(26169770-26169906)
chr4 (463-553)||(36040868-36040957)
chr4 (474-546)||(23621506-23621578)
chr4 (444-552)||(39797477-39797584)
chr4 (366-451)||(5840103-5840187)
chr4 (381-529)||(6595556-6595705)
chr4 (381-543)||(50648972-50649140)
chr4 (465-553)||(468413-468500)
chr4 (385-480)||(19596268-19596364)
chr4 (444-543)||(24073013-24073112)
chr4 (444-539)||(50622480-50622575)
chr4 (463-553)||(11469142-11469231)
chr4 (463-553)||(11522230-11522319)
chr4 (425-523)||(51787603-51787701)
chr4 (454-543)||(38613458-38613547)
chr4 (365-467)||(55968949-55969053)
chr4 (429-522)||(7326036-7326133)
chr4 (375-480)||(26186516-26186623)
chr4 (365-421)||(54158710-54158766)
chr4 (375-543)||(22130324-22130497)
chr4 (381-438)||(9030093-9030150)
chr4 (375-464)||(22294307-22294399)
chr4 (381-441)||(50621563-50621624)
chr4 (381-512)||(7776767-7776902)
chr4 (472-528)||(46481303-46481359)
chr4 (366-441)||(38615984-38616058)
chr4 (470-544)||(38319655-38319729)
chr4 (488-546)||(51329697-51329755)
chr4 (366-467)||(20128631-20128732)
chr4 (495-544)||(30191766-30191815)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (298-553)||(3479-3736)
[»] scaffold0907 (1 HSPs)
scaffold0907 (299-543)||(4316-4561)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (299-543)||(4404-4649)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (299-543)||(45722-45967)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (345-553)||(258908-259117)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (295-553)||(18538-18797)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (299-543)||(48706-48951)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (295-553)||(5192-5450)
[»] scaffold0549 (1 HSPs)
scaffold0549 (295-553)||(9920-10178)
[»] scaffold0649 (1 HSPs)
scaffold0649 (343-553)||(4082-4293)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (345-543)||(6926-7126)
[»] scaffold0883 (1 HSPs)
scaffold0883 (332-552)||(1763-1984)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (332-552)||(45556-45777)
[»] scaffold0308 (2 HSPs)
scaffold0308 (343-553)||(5070-5281)
scaffold0308 (343-543)||(14133-14334)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (343-553)||(31471-31682)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (343-553)||(51466-51677)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (314-553)||(355057-355296)
scaffold0002 (359-465)||(92307-92415)
[»] scaffold0604 (1 HSPs)
scaffold0604 (299-553)||(3525-3778)
[»] scaffold0576 (1 HSPs)
scaffold0576 (299-543)||(285-530)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (343-553)||(47682-47892)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (343-543)||(24416-24616)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (343-552)||(61637-61847)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (328-523)||(9195-9392)
[»] scaffold0039 (3 HSPs)
scaffold0039 (299-553)||(93827-94083)
scaffold0039 (365-543)||(103870-104048)
scaffold0039 (391-528)||(92510-92647)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (343-513)||(9538-9710)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (332-523)||(19732-19925)
[»] scaffold0368 (1 HSPs)
scaffold0368 (343-552)||(8261-8470)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (303-506)||(24303-24501)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (343-553)||(12106-12316)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (343-553)||(117888-118098)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (299-479)||(40606-40789)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (296-553)||(4804-5059)
scaffold0443 (482-553)||(4722-4792)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (359-553)||(65439-65633)
[»] scaffold0280 (3 HSPs)
scaffold0280 (388-522)||(8410-8545)
scaffold0280 (299-443)||(13303-13450)
scaffold0280 (332-388)||(8080-8136)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (416-553)||(1306-1442)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (332-467)||(18481-18618)
[»] scaffold0086 (2 HSPs)
scaffold0086 (360-542)||(32965-33148)
scaffold0086 (366-456)||(22031-22119)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (381-552)||(17507-17678)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (381-552)||(246499-246669)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (343-544)||(34155-34355)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (381-552)||(36188-36357)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (381-543)||(11485-11645)
[»] scaffold0311 (2 HSPs)
scaffold0311 (425-543)||(9534-9652)
scaffold0311 (334-411)||(9059-9136)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (359-543)||(156202-156389)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (366-480)||(619-733)
scaffold0407 (366-480)||(7083-7197)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (377-470)||(1953-2050)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (377-543)||(5494-5661)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (345-421)||(13112-13187)
[»] scaffold2116 (1 HSPs)
scaffold2116 (497-553)||(1-56)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (375-543)||(47206-47376)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (341-395)||(17500-17554)
[»] scaffold0263 (1 HSPs)
scaffold0263 (359-465)||(13679-13787)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 208)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 37585535 - 37585004
Alignment:
Q  7 aacatcagctcaaataatacttgcaacatgattttctatgtacgcaagaattatatttcgaacttcgaacttatggtcacttttttaaaggtataaatct 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37585535 aacatcaactcaaataatacttgcaacatgattttctatgtacgcaagaattatatttcgaactt-------atggtcacttttttaaaggtataaatct 37585443  T
Q  107 cttaccacttaaatgattgatagaagaaaaatatgaatgnnnnnnn-agttaaaagttgaaatatcacaatcgcgttttgcaaaagtccttcttttagtt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37585442 cttaccacttaaatgattgatagaagaaaaatatgaatgttttttttagttaaaagttgaaatatcacaatcgcgttttgcaaaagtccttctttcagtt 37585343  T
Q  206 caaaaaatggtgtttaccgcctatatggaagtagaccccactccatttccttttacttactaggcatcacatgccaatgccaacacaatctagtactacc 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   || |||||||    
T  37585342 caaaaaatggtgtttaccgcctatatggaagtagaccccactccatttccttttccttactaggcatcacatgccaatgccaactcagcatactactacc 37585243  T
Q  306 tccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattt 404  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37585242 tccgttcttaattatagggtccttttgaaaaaataacaggaattaagataatagatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattt 37585143  T
Q  405 tatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaata 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  37585142 tatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 37585043  T
Q  505 attaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||| || ||| | ||||||  ||||||||||||    
T  37585042 attaatgtatttggaatttacaaaggggtcttataaaaa 37585004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 735 - 942
Target Start/End: Complemental strand, 37584833 - 37584626
Alignment:
Q  735 ggcgttttgatttgaaacagtgtgttcaccaatggcatcagtattccgtagggtaatgttgaaattatcagcaacgcggtggtcggagctcataaacatc 834  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37584833 ggcgttttgatttgaaacagtgtgttcgccaatggcatcagtattccgtagggtaatgttgaaattatcagcaacgcggtggtcggagctcataaacatc 37584734  T
Q  835 tccattgtggatgaatttgtgtggggaatcgttacggctttcgagtcagtcgctcttgtctctatgctctgcttcttcttcctgtcctatggctgcacca 934  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37584733 tccattgtggatgaatttgtgtggggaatcgttacggctttcgagtcagtcgctcttgtctctatgctctgcttcttcttcctgtcctatggctgcacca 37584634  T
Q  935 tctgatcc 942  Q
    ||||||||    
T  37584633 tctgatcc 37584626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 298 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 6090032 - 6089786
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6090032 gtactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 6089933  T
Q  397 tacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  6089932 tacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 6089833  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  6089832 aagaaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaa 6089786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 298 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 31239017 - 31238761
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcatttt--aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttt 395  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |  |||  ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31239017 gtactacctccgtccctaattatagggcccctttgaaaaaaatagcgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 31238918  T
Q  396 ttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31238917 ttacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattactgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggcatgtatgt 31238818  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  31238817 aaagaaataattaaagtagttggaaatagcaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 31238761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 298 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 34931376 - 34931130
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    |||||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34931376 gtactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 34931277  T
Q  397 tacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  34931276 tacaattttatcctttaagagagagttggttcatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 34931177  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  34931176 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 34931130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 300 - 543
Target Start/End: Original strand, 9413067 - 9413311
Alignment:
Q  300 actacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||| || || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9413067 actaccttcgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 9413166  T
Q  399 caattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaa 498  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  9413167 caattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaa 9413266  T
Q  499 gaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  9413267 gaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 9413311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 27530343 - 27530597
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  27530343 tactacctccgtccctaattatagggccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgctttta 27530442  T
Q  399 caattttatcctttaaaag--agagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  27530443 caattttatcctttaagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 27530541  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  27530542 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttat-aaaaagggacaaaa 27530597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 229147 - 229403
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  229147 tactacctctgtccttaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgttttt 229246  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  229247 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 229346  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttata-aaaaagggacaaaa 553  Q
    | |||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  229347 aaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttatataaaaagggacaaaa 229403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 292 - 553
Target Start/End: Original strand, 2489134 - 2489395
Alignment:
Q  292 aatctagtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactat 390  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  2489134 aatcaagtactacctccgtccctaattatagagccattttgaaaaaataacgggaattaagataatgaacatttgtattaaatatatttgtaattactat 2489233  T
Q  391 tgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatg 490  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||| | | | |||    
T  2489234 tgtttttacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgtaaaaaaagatgtataataaatatgagcatg 2489333  T
Q  491 catgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
     |||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |  |||||| ||||||||||||||    
T  2489334 tatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataccaaaaagttcttat-aaaaagggacaaaa 2489395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Original strand, 41855248 - 41855468
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41855248 aaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaattggtttatg 41855347  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||      
T  41855348 ttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggg 41855447  T
Q  532 gtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  41855448 gtcttat-aaaaagggacaaaa 41855468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 48854114 - 48853869
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  48854114 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacaggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgttttt 48854015  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  48854014 acaattttatcctttaagagagaaatggtttacgttttcaacatattatttattattgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 48853915  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||||    
T  48853914 agaaagaattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaa 48853869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 36695118 - 36694896
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagt--tggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||    
T  36695118 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaggtggttta 36695019  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  36695018 tgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaataacaaag 36694919  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
      |||||||| |||||||||||||    
T  36694918 gggtcttata-aaaagggacaaaa 36694896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 36711219 - 36710997
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagt--tggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||    
T  36711219 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaggtggttta 36711120  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  36711119 tgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaataacaaag 36711020  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
      |||||||| |||||||||||||    
T  36711019 gggtcttata-aaaagggacaaaa 36710997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 296 - 543
Target Start/End: Original strand, 40614643 - 40614891
Alignment:
Q  296 tagtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtt 394  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  40614643 tagtactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 40614742  T
Q  395 tttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| | ||| |||    
T  40614743 tttacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggagcatgtatg 40614842  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||  ||||||||||||    
T  40614843 taaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaa 40614891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 52602287 - 52602033
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||| |||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  52602287 tactccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 52602188  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  52602187 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 52602088  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  52602087 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 52602033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 45285551 - 45285805
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||| |||  |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45285551 tactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaa-taacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 45285649  T
Q  399 caattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||    
T  45285650 caattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgta 45285749  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  45285750 aagaaataattaatgtagttggaaataggaaataagttttat-aaaaagggacaaaa 45285805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 50246714 - 50246916
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  50246714 ggaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 50246813  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  50246814 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataa 50246913  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  50246914 aaa 50246916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 293 - 554
Target Start/End: Original strand, 51422159 - 51422424
Alignment:
Q  293 atctagtactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa--taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactat 390  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||  |||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  51422159 atctaatactacctccgtccctaattataaggtccttttaaaaaaaataacgcgaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattat 51422258  T
Q  391 tgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagggg-- 486  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||      
T  51422259 tgtttttacaattttatgctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgccgattgaaggaaaagatgtataataaataggggca 51422358  T
Q  487 tatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaag 554  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  51422359 tatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat--aaaagggacaaaag 51422424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 28052487 - 28052231
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||| |||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28052487 tactacctccgtccctaattacaggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 28052388  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    | ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||    
T  28052387 ataattttatcctttaagagagatggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattggagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 28052288  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28052287 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagaggtcttata-aaaagggacaaaa 28052231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 41317890 - 41317645
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  41317890 tactacctccgtctctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 41317791  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | || ||||| ||| ||||||    
T  41317790 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgtaa 41317691  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  41317690 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 41317645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 45794597 - 45794386
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||    
T  45794597 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaaca 45794498  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||     
T  45794497 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtgtgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata- 45794399  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  45794398 aaaagggacaaaa 45794386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 52430958 - 52431169
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  52430958 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 52431057  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  52431058 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 52431156  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  52431157 aaaagggacaaaa 52431169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 553
Target Start/End: Original strand, 15892301 - 15892559
Alignment:
Q  297 agtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttt 395  Q
    ||||||| ||| | || |||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15892301 agtactatctctgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 15892400  T
Q  396 ttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcat 493  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||  ||    
T  15892401 ttacaattttatcctttaagaaagagtgttggtttatgttttcaacattctatttattactgattgaaaaaaaagatgtataataaataggagcatatat 15892500  T
Q  494 gtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15892501 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttat-aaaaagggacaaaa 15892559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 297 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 26550088 - 26549857
Alignment:
Q  297 agtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttt 395  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  26550088 agtactacatccgtccttaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgta-ttagtattgttt 26549990  T
Q  396 ttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||    
T  26549989 ttacaattttatcctttaagagagaaattgtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgt 26549890  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| ||||    
T  26549889 aaagaaataattaatatagttggaaatagcaaa 26549857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 359 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 39324762 - 39324575
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattga 456  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39324762 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttga 39324663  T
Q  457 ttgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaa 544  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||    
T  39324662 ttgaagaaaaagatgaataatagataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaaa 39324575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Original strand, 42275933 - 42276155
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggttta 429  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| |||    
T  42275933 aaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaatagggttggctta 42276032  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||    
T  42276033 tgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaag 42276132  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
      ||||||| ||||||||||||||    
T  42276133 gggtcttat-aaaaagggacaaaa 42276155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 299 - 540
Target Start/End: Original strand, 5765730 - 5765973
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  | |||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5765730 tactacctccgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 5765829  T
Q  398 acaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||| ||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  5765830 acaattttctccttaagagagagtgttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 5765929  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||    
T  5765930 aagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataa 5765973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 334 - 546
Target Start/End: Original strand, 8104065 - 8104278
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatg 431  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||    
T  8104065 aaaattatgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 8104164  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||       
T  8104165 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa-cg 8104263  T
Q  532 gtcttataaaaaagg 546  Q
    |||||||||||||||    
T  8104264 gtcttataaaaaagg 8104278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 344 - 528
Target Start/End: Original strand, 36674083 - 36674269
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacat 441  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  36674083 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacat 36674182  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  36674183 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgcatgtaaaaaaataattaatgtagttaaaaatagcaaa 36674269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 38530891 - 38531145
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38530891 tactacctccgtccctaattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattaatattgttttt 38530990  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    | ||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38530991 ataattttatcctttaagagggagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggtatgcatgtaa 38531090  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||||   |||||| ||||||||||||||    
T  38531091 agaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagcgatcttat-aaaaagggacaaaa 38531145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 343 - 546
Target Start/End: Original strand, 943421 - 943626
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  943421 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 943520  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||    
T  943521 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatgacaaaggagtcttataa 943620  T
Q  541 aaaagg 546  Q
    ||||||    
T  943621 aaaagg 943626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 334 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 11741659 - 11741439
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatg 431  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||    
T  11741659 aaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 11741560  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||      
T  11741559 ttttcaacatcttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 11741460  T
Q  532 gtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  11741459 gtcttata-aaaagggacaaaa 11741439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 38261638 - 38261382
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||  |||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38261638 tactacctccgtccctaattataaggttcttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttctattaaatatgtttgtaattactattgttttt 38261539  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  38261538 acaattttatcctttaagaaagagtgttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 38261439  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||  |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38261438 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaggagtcttata-aaaagggacaaaa 38261382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 297 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 23530845 - 23530593
Alignment:
Q  297 agtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttt 395  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23530845 agtactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 23530746  T
Q  396 ttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcat 493  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  23530745 ttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatcttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 23530646  T
Q  494 gtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  23530645 gtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaagg 23530593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 25509470 - 25509250
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  25509470 aaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagttttatcctttaagagagagatgttttatg 25509371  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||      
T  25509370 ttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaaggg 25509271  T
Q  532 gtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  25509270 gtcttata-aaaagggacaaaa 25509250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 30290518 - 30290307
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||  ||| |||||| |||||||||    
T  30290518 ggaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttttagaaagaatgttagtttatattttcaaca 30290419  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||     
T  30290418 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttata- 30290320  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  30290319 aaaagggacaaaa 30290307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 298 - 546
Target Start/End: Original strand, 28888161 - 28888412
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    |||||||||||| || |||||||| || | |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28888161 gtactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 28888260  T
Q  397 tacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||    
T  28888261 tacaattttttcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatg 28888360  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  |||||| ||||||||    
T  28888361 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttacaaaaaagg 28888412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 299 - 515
Target Start/End: Original strand, 896792 - 897010
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||||||| |  |||||||| |||| |||| ||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  896792 tactacctccgtctctaattataaggtccttttgaaaaataaggaaaattaagataattgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 896891  T
Q  399 caattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||    
T  896892 caattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagaggcatgcatgta 896991  T
Q  497 aagaaataattaatgtact 515  Q
    || ||||||||||||||||    
T  896992 aacaaataattaatgtact 897010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 4102455 - 4102709
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||| |||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4102455 tactccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 4102554  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| ||||||    
T  4102555 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaagatgtataattaataagggcatgtatgtaa 4102654  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  4102655 agaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 4102709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 9378841 - 9379089
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||||||  || |||||||| | || ||| |||||||||  | |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9378841 tactacctccatccctaattataagatcttttgaaaaaataacggaaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 9378940  T
Q  399 caattttatcctttaaaagagag----ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    |||||||||||||||| ||||||    | |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||    
T  9378941 caattttatcctttaagagagagagagtcggtttatgtttttaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataagtagggacatgtatg 9379040  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  9379041 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaa 9379089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 332 - 528
Target Start/End: Original strand, 14090025 - 14090223
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttgg--ttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |   ||||    
T  14090025 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaggtaattta 14090124  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14090125 tgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 14090223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 314 - 543
Target Start/End: Original strand, 19792618 - 19792848
Alignment:
Q  314 taattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 412  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||   ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19792618 taattatagggcccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 19792717  T
Q  413 aaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgt 512  Q
    || | | || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |    
T  19792718 aagataaagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatat 19792817  T
Q  513 acttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | ||  |||||  |||| |||||||||||||    
T  19792818 agttgaaaatagaaaaggagtcttataaaaa 19792848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 21630845 - 21631093
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | | |||| |||||||||  |||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21630845 tactacctccgtccctaattatatagcctttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 21630944  T
Q  398 acaattttatcctttaaa---agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    |||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  21630945 acaaatttatccttttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 21631044  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    || |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  21631045 tagagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 21631093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Original strand, 8923443 - 8923663
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  8923443 aaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagttttatcctttaagagagagatgttttatg 8923542  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||      
T  8923543 ttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggg 8923642  T
Q  532 gtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  8923643 atcttat-aaaaagggacaaaa 8923663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 314 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 13344056 - 13343824
Alignment:
Q  314 taattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 412  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13344056 taattataaggttattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 13343957  T
Q  413 aa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaat 510  Q
    ||  ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  13343956 aagaaagagtgttggcttatgttttcaacattctatttattgctgatagaagaaaaagatgtacaataaataggggcatgtacgtaaagaaataattaat 13343857  T
Q  511 gtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  13343856 gtagttagaaatagaaaataagtcttataaaaa 13343824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 49907274 - 49907063
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||  ||| |||||| |||||||||    
T  49907274 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttaacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttattttttcaaca 49907175  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||     
T  49907174 tgatatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata- 49907076  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  49907075 aaaagggacaaaa 49907063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 299 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 9715658 - 9715431
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| || | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9715658 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 9715559  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  9715558 acaattttatcctttaagaaagagggttgccttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaattggggcatgcatgt 9715459  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||    
T  9715458 aaagaaataattaatgtagttggaaata 9715431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 344 - 553
Target Start/End: Original strand, 11907013 - 11907223
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacat 441  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||||||    
T  11907013 gaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 11907112  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||| ||    
T  11907113 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttat-aa 11907211  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  11907212 aaagggacaaaa 11907223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 12814526 - 12814782
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa--taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | ||||||||||  |||  |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12814526 tactacctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaaataacgggaattaagatactggatattagtattaaatatgtttgcaattactattgtttt 12814625  T
Q  397 tacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||    
T  12814626 tacaattttatcctttaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttactgttgattgaagaaaaagatgtataat-aataggggcatgtatg 12814724  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  12814725 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagtgtcttat-aaaaagggacaaaa 12814782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 345 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 14347373 - 14347174
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||    
T  14347373 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagagggagggttggtttatgttttcaacatg 14347274  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||| || ||||||||    
T  14347273 ttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagaggttttataaaa 14347174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 15763613 - 15763366
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15763613 tactacctccgtccataattatagggttcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 15763514  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    | || |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| | | | ||| ||||    
T  15763513 aaaaatttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattactgactgaagaaaaaaatgtataataaatatgagcatgtatgt 15763414  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||||    
T  15763413 aaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttataaaaa 15763366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 343 - 552
Target Start/End: Original strand, 42872118 - 42872328
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||| |    
T  42872118 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaata 42872217  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  ||||||| |    
T  42872218 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaatggggtcttat-a 42872316  T
Q  541 aaaagggacaaa 552  Q
    ||||||||||||    
T  42872317 aaaagggacaaa 42872328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 299 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 14171827 - 14171612
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||| |||||| || ||||||||||  | |||| ||||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14171827 tactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgttttt 14171728  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  14171727 acaattttatcctttaaaagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaa 14171628  T
Q  498 agaaataattaatgta 513  Q
    | ||||||||||||||    
T  14171627 aaaaataattaatgta 14171612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 302 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 24855576 - 24855323
Alignment:
Q  302 tacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttaca 400  Q
    |||||||| || |||||||| || |||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24855576 tacctccgtccctaattataaggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 24855477  T
Q  401 attttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaa 498  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||    
T  24855476 attttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaatattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaa 24855377  T
Q  499 gaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  24855376 gaaataattaatgtagttgaaaatagaaaatgagtcttat-aaaaagggacaaaa 24855323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 8472344 - 8472091
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattataggg-tcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||  | |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  8472344 tactacctccgtccctaattatagggctcttttaaaaaaataacggaaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 8472245  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaag-aaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||| | || ||||| ||| |||||    
T  8472244 acaattttatccttt--aagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaaatgtatagttaataggggcatgtatgta 8472147  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  8472146 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 8472091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 16575876 - 16576087
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  16575876 ggaattaagatagtggatatttgtattcaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 16575975  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  16575976 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataactaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 16576074  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  16576075 aaaagggacaaaa 16576087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 15100626 - 15100398
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--------tt 423  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||        ||    
T  15100626 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagagagagagagagagtt 15100527  T
Q  424 ggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  15100526 ggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattattgtagtttgaaata 15100427  T
Q  524 acaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
     |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  15100426 gcaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 15100398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 345 - 529
Target Start/End: Original strand, 43395459 - 43395643
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgtt 444  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  43395459 aattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgtt 43395558  T
Q  445 atttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  43395559 atttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaag 43395643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 528
Target Start/End: Original strand, 47300677 - 47300864
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  47300677 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 47300776  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  47300777 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaa 47300864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Original strand, 1767637 - 1767848
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||    
T  1767637 aaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgcattatatatgtttgtaattagcattgtttttacaattttatcatttaagagagaaatggtttatg 1767736  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||      
T  1767737 ttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggg 1767836  T
Q  532 gtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||    
T  1767837 gtcttataaaaa 1767848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 7763491 - 7763744
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  | |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  7763491 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 7763590  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| ||||||    
T  7763591 acagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttaattgaagaaaaagat-tataattaataggggcatgtatgtaa 7763689  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||   |||||| ||||||||||||||    
T  7763690 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttat-aaaaagggacaaaa 7763744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 359 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 15290171 - 15289985
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattga 456  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  15290171 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatattatcctttaagagagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattgctga 15290072  T
Q  457 ttgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||  |||||||||||||    
T  15290071 ttgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaa 15289985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 50008267 - 50008469
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  50008267 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttgcaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 50008366  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||    
T  50008367 tgttaattattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataa 50008466  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  50008467 aaa 50008469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 299 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 27037567 - 27037350
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27037567 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaataactattgttttt 27037468  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  27037467 acaattttatcctttaagaaagagagctggcttatgctttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 27037368  T
Q  496 aaagaaataattaatgta 513  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27037367 aaagaaataattaatgta 27037350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 343 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 2280206 - 2280018
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  2280206 ggaattaagatagtggatatttctattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 2280107  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2280106 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaag 2280018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 9202290 - 9202491
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||    
T  9202290 ggaattaagaaagtgtatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagaggtggtttatgttttcaacat 9202389  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  9202390 gttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 9202489  T
Q  542 aa 543  Q
    ||    
T  9202490 aa 9202491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 299 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 25284104 - 25283920
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25284104 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttataattactattgttttt 25284005  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25284004 acaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaa 25283920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 46075652 - 46075862
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  46075652 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 46075751  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||| |    
T  46075752 tgttatttattgttgatt-aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgcaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttat-a 46075849  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  46075850 aaaagggacaaaa 46075862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 299 - 523
Target Start/End: Original strand, 28885842 - 28886069
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  | |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28885842 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 28885941  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||| ||||    
T  28885942 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtttcataaataggggcatgtatgt 28886041  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  28886042 aaataaataattaatgtagttggaaata 28886069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 304 - 528
Target Start/End: Original strand, 31086667 - 31086894
Alignment:
Q  304 cctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaat 402  Q
    |||||| |||||||||||  ||| |||| |||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31086667 cctccgtccttaattataaagtccttttgaaaaaataatgggagttaagatagtggatatttgtattaaatgtgtttgtaattactattgtttttacaat 31086766  T
Q  403 tttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaaga 500  Q
    |||||||||||| |||||   ||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  31086767 tttatcctttaagagagatgattgatttatgtttttaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaagaggggcatatatgtaaaga 31086866  T
Q  501 aataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||    
T  31086867 aataattaatgtagttggaaatagcaaa 31086894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 16456889 - 16456687
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  16456889 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 16456790  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    || ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||    
T  16456789 tgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggagcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataa 16456690  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  16456689 aaa 16456687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 332 - 552
Target Start/End: Original strand, 48067668 - 48067889
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||    
T  48067668 aaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagaaagagggttggctta 48067767  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||  ||||    
T  48067768 tgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatttagttggaaatagaaaag 48067867  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
      ||||||| |||||||||||||    
T  48067868 gggtcttat-aaaaagggacaaa 48067889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 344 - 553
Target Start/End: Original strand, 32169740 - 32169949
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga-gttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | |  ||||| |||||||||||    
T  32169740 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttattctttaagaaagaaggttatttatattttcaacatg 32169839  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| |||    
T  32169840 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttat-aaa 32169938  T
Q  543 aagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||    
T  32169939 aagggacaaaa 32169949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 3549327 - 3549083
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| |  ||||||||| ||| |||  |||||||||  |||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  3549327 tactacctccgtctctaattatagagtcctttcgaaaaaataacgggaattaagatagtgtatatttatattaaatatgtttgtaattagtatt-ttttt 3549229  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| || |||    
T  3549228 acaattttatcctttaagagataaatgatttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatataa 3549129  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  3549128 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaa 3549083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 314 - 523
Target Start/End: Original strand, 27575391 - 27575603
Alignment:
Q  314 taattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 412  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27575391 taattataaggtctttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtctgaaattactattgtttttacaattttatccttt 27575490  T
Q  413 aa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaat 510  Q
    ||  ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27575491 aagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 27575590  T
Q  511 gtacttagaaata 523  Q
    ||| || ||||||    
T  27575591 gtagttggaaata 27575603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 15111849 - 15111623
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag------ttgg 425  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||      ||||    
T  15111849 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattaattttacaattttatcctttaagagagagatagagttgg 15111750  T
Q  426 tttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataac 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||| ||||||||||||||||| |||| || |||||| |    
T  15111749 tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatatggacatgtatgtaaagaaataattattgtagtttgaaatagc 15111650  T
Q  526 aaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  15111649 aaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 15111623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 345 - 553
Target Start/End: Original strand, 43668188 - 43668399
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |   ||| |||||||||||||||||    
T  43668188 aattaagatagtggatatttgtattaaatttgtttgtaattactattgtttttataattttatcctttaagagaaaagattgatttatgttttcaacatg 43668287  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttata-aa 541  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| ||    
T  43668288 ttatttattgctgattgatgaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattgaaaatagcaaagaagtcttatataa 43668387  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||| ||||    
T  43668388 aaagggaaaaaa 43668399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 1039182 - 1039376
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||    
T  1039182 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattactgat 1039281  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  1039282 tgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 1039376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 1046088 - 1046282
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||    
T  1046088 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattactgat 1046187  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  1046188 tgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 1046282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 345 - 543
Target Start/End: Original strand, 10383828 - 10384029
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa---agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||| | || |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |   |||||||| |||||||||||| | ||    
T  10383828 aattaagaaagtggatatttatattaaatttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatat 10383927  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  10383928 gttatttattactaattgaagaaaaagatatataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaa 10384027  T
Q  542 aa 543  Q
    ||    
T  10384028 aa 10384029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 298 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 25228495 - 25228285
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaa-ataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    |||||||||||| ||||||||| | || |||||| |||| ||||  | |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25228495 gtactacctccgtccttaattaaaaggccattttgaaaatataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 25228396  T
Q  397 tacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  25228395 tacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 25228296  T
Q  495 taaagaaataa 505  Q
    |||||||||||    
T  25228295 taaagaaataa 25228285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 26544766 - 26544555
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    ||||||||| | ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||  || ||||||    
T  26544766 aaaaaataacaagaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttatgagagaaatgatttatg 26544667  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  |||||     
T  26544666 ttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataatttataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtaattgaaaatagaaaagag 26544567  T
Q  532 gtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||    
T  26544566 gtcttataaaaa 26544555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 299 - 477
Target Start/End: Original strand, 44529414 - 44529593
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  44529414 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 44529513  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataat 477  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  44529514 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaaaaaaaagatgtataat 44529593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 38613773 - 38613517
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  | |||| |||||||||  |||| ||| ||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  38613773 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaactaaaatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattattttt 38613674  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  38613673 acaattttatcctttaagaaagagggctggcttatgttttcaacattctatttattgatgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 38613574  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  38613573 aaagaaataattaatgtagttagaaatataaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 38613517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 359 - 543
Target Start/End: Original strand, 39750182 - 39750367
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | |||||| |||||  ||||    
T  39750182 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgat 39750281  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||    
T  39750282 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 39750367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 15811033 - 15811227
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  15811033 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 15811132  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  15811133 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 15811227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 23542215 - 23542021
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||| ||||| | ||| || |||||  ||||    
T  23542215 atatttgtattaaatttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatattttccatatgctacttattgctgat 23542116  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  23542115 tgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 23542021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 316 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 37589221 - 37589012
Alignment:
Q  316 attatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta- 413  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  37589221 attataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaattttatcttttaa 37589122  T
Q  414 -aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgt 512  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  37589121 gaaagagggttggtttatgttttcaacattccatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata-gggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 37589023  T
Q  513 acttagaaata 523  Q
    | || ||||||    
T  37589022 agttggaaata 37589012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 44646507 - 44646313
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  44646507 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 44646408  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  44646407 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 44646313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 343 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 31465918 - 31465730
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  31465918 ggaattaagaaagtgaatatttgcattaaacttatttgttatcactaatgtttttacaattttatcctttaagagagatagttagtttatgttttcaaca 31465819  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31465818 tgttatttattgctaattaaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaaggaatagttaatgtacttggaaataacaaag 31465730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 332 - 510
Target Start/End: Original strand, 45038136 - 45038315
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| | |    
T  45038136 aaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcatttaagaaagagagttggctaa 45038235  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaat 510  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  45038236 tgttttcaacattctatttattgctgattgaa-aaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 45038315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 359 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 47069024 - 47068839
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||| | ||| || |||||  ||||    
T  47069024 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatccttaaaagagagagttagtttatattttccatatgctacttattgctgat 47068925  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47068924 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgcagttagaaataacaaagaggtcttataaaaa 47068839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 332 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 25271452 - 25271241
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||   |||||||    
T  25271452 aaaaaataacgggaattaaaatagtgaatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaattttat--tttaagagagaggaatggttta 25271355  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||    
T  25271354 tgttatcaacatgtta-ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaacaattaatgtagttggaaatagcaaag 25271256  T
Q  530 aagtcttataaaaaa 544  Q
    |  ||||| ||||||    
T  25271255 agatcttaaaaaaaa 25271241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 345 - 513
Target Start/End: Original strand, 36880409 - 36880576
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgtt 444  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  36880409 aattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtatttacaattttatcctttaagaaat-gttagtttatgttttcaacatgtt 36880507  T
Q  445 atttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  36880508 atttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgta 36880576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 593 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 37584970 - 37584862
Alignment:
Q  593 tagggacgtaagcagtaataatttaaccatttacaaccattattacggtggtgattaaaatcttcaaataaatacccgaatctctcatccctattattat 692  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37584970 tagggacgtaagtattaataatttaaccatttacaaccattattacggtggtgattaaaatcttcaaataaatacccgaatctctcatccctattattat 37584871  T
Q  693 tttgcacac 701  Q
    |||||||||    
T  37584870 tttgcacac 37584862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 362 - 543
Target Start/End: Original strand, 39873488 - 39873671
Alignment:
Q  362 tttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattg 459  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||    
T  39873488 tttgtattaaatatgtatgtaattattattgtttttccaattttatcctttaagagagagggttggtttatgtttttaacatattatttattgctgattg 39873587  T
Q  460 aagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || || |||||| |||| | ||||||||||||    
T  39873588 aagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatatgtcttataaaaa 39873671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 30289663 - 30289857
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  30289663 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 30289762  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  30289763 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 30289857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 359 - 529
Target Start/End: Original strand, 35984463 - 35984634
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || ||||| |||||    
T  35984463 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgat 35984562  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35984563 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttaaaaataacaaag 35984634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 37951734 - 37951944
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||    
T  37951734 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaatattatccttaagaaagagagttagtttatgttttccatat 37951833  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||| ||    
T  37951834 gctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttat-aa 37951932  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  37951933 aaagggacaaaa 37951944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 45039648 - 45039454
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  45039648 atattagtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 45039549  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  45039548 tgaagaaaaagatgtataataaataagggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 45039454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 343 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 45336138 - 45335933
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||    
T  45336138 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttcttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatattttcaaca 45336039  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||  |  | ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||    
T  45336038 tgttatttattgttaattgaaaaaaaaaatgtataataaatggaagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtaggaaataacaaaggggtcttataa 45335939  T
Q  541 aaaagg 546  Q
    ||||||    
T  45335938 aaaagg 45335933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 359 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 50938015 - 50937826
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattga 456  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||  |||    
T  50938015 atatttgtattaaatatctttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattcaatttattgctga 50937916  T
Q  457 ttgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||   |||||||||||||||    
T  50937915 ttgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaaagg 50937826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 334 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 51811138 - 51810957
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagt--tggtttatg 431  Q
    |||||||  |||||||||||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||    
T  51811138 aaaataacgggaattaagatggtggatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaggaatgatttatg 51811039  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  51811038 ttttcaacatgttattgattgctgattgaagaaaaagatgtatagtaaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgta 51810957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 344 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 34503488 - 34503284
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacat 441  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34503488 gaattaagatggtgaatatttgtattaaatatatttgtaattactattgcttttataattttatcttttaagagagagggttggtttatgttttcaacat 34503389  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||  | |||||||||    
T  34503388 gttatttattgctgattgaaaaaaaaaatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgcagttgaaaatagcaaatgaatcttataaa 34503289  T
Q  542 aaagg 546  Q
    |||||    
T  34503288 aaagg 34503284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 38175136 - 38174927
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaa-gataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttat 430  Q
    |||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||    
T  38175136 aaaaaataatggaaattaaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattgttattgtttttacaattttattctttga--gagtgttggtttat 38175039  T
Q  431 gttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaaga 530  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| | |||  || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||      
T  38175038 gttttcaacatgttatttattgttgattgaatgaaaagatgtataataaataagggcgtgtatgtaaa-aaataattaatgtagttaaaaatagcaaaat 38174940  T
Q  531 agtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||    
T  38174939 agtcttataaaaa 38174927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 39362995 - 39363189
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||  | |||||| |||||  ||||    
T  39362995 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgtttttcatatgttacttattgctgat 39363094  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||    
T  39363095 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttat-aaaaagggacaaaa 39363189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 39497685 - 39497475
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||||| | ||    
T  39497685 ggaattaagaaagcgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagatagttagtttatgttttccatat 39497586  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |    
T  39497585 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata-a 39497487  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  39497486 aaagggacaaaa 39497475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 44649865 - 44649671
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  44649865 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 44649766  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||    
T  44649765 tgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttata-aaaagggacaaaa 44649671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 359 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 50008210 - 50008025
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattga 456  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| | | |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50008210 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttcataattttatcatttaagaaaaaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttga 50008111  T
Q  457 ttgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||    
T  50008110 ttgaagaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 50008025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 3934869 - 3934656
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||| |||    
T  3934869 aaaaaataacgggaattaagatagtgagtatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagatggttggctta 3934770  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||   ||| || |||| |||||||||||||| ||  |||||  |||     
T  3934769 tgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggaacatgtatctaaacaaataattaatgtagttgaaaatagaaaat 3934670  T
Q  530 aagtcttataaaaa 543  Q
     |||||||||||||    
T  3934669 gagtcttataaaaa 3934656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 342 - 543
Target Start/End: Original strand, 9700534 - 9700736
Alignment:
Q  342 aggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||  | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  9700534 aggaattaagaaagtgagtatttgtattaaagttatttgtaatcactattgattttacaattttatcctttagaaagagagatagtttatattttcaaca 9700633  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||||| || || |||||||||| || |||||||||    
T  9700634 tgctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatatatgtaaagaaataattaatttaattggaaataacaaggaggtcttataa 9700733  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  9700734 aaa 9700736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 342 - 543
Target Start/End: Original strand, 27974939 - 27975142
Alignment:
Q  342 aggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaac 439  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  |   ||||||||||||||    
T  27974939 aggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttattttttaagagagagagtatatttatgttttcaac 27975038  T
Q  440 atgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttata 539  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| | | | ||| ||||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||  ||| |||||    
T  27975039 atgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatatgtgcatgtatgtaaataaataattaatgcagttgaaaataacaaaagagttttata 27975138  T
Q  540 aaaa 543  Q
    ||||    
T  27975139 aaaa 27975142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 342 - 543
Target Start/End: Original strand, 32149094 - 32149297
Alignment:
Q  342 aggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaa--gagagttggtttatgttttcaac 439  Q
    ||||||||||| | |  ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| |||    
T  32149094 aggaattaagaaagtagatattttcattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaaaatagagagttagtttatgttttgaac 32149193  T
Q  440 atgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttata 539  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||| || || ||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  32149194 atgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtgaaataaatagaggcatgtatgtaaataaataataaatgtgcttagaaataacaaaagggtcttata 32149293  T
Q  540 aaaa 543  Q
    ||||    
T  32149294 aaaa 32149297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 18237344 - 18237134
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||| ||||| | ||    
T  18237344 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattctatccttaagagagagagttagtttatattttccatat 18237245  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |    
T  18237244 gctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaagcatgtatgtaaagaaataagtaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttata-a 18237146  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  18237145 aaagggacaaaa 18237134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 359 - 543
Target Start/End: Original strand, 1048053 - 1048238
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||  | ||| || |||||  ||||    
T  1048053 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgat 1048152  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||    
T  1048153 tgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttttaaaaa 1048238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 344 - 543
Target Start/End: Original strand, 47296352 - 47296553
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgt 443  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||     
T  47296352 gaattaagataatcgatattggtattaaagatgtttgtaatcactattgttttcacaattttgtcctttaga-gagaggtagtttatgttttcaacatga 47296450  T
Q  444 tatttattattgatt---gaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    |||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||  || |||||    
T  47296451 tatttattgttgattattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaacaaataattaatgtagttggaaatagcaaagatatcctataa 47296550  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  47296551 aaa 47296553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 345 - 529
Target Start/End: Original strand, 7212345 - 7212531
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  7212345 aattaatatagtgaatatttgtataaaagttgtttgtaatcattattgtttttataattttatcctttatgaaagatggttagtttatgttttcaacatg 7212444  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
     |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  7212445 atatttattgttcattcaagaaaaatatgtataataaataaaggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaag 7212531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 31635915 - 31636116
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttc--aaca 440  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||   | |    
T  31635915 ggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttttacaattttatcc-ttaaaagagagttaatttatgttttccatata 31636013  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    || |||||||   | |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||| ||||  ||||||||||    
T  31636014 tgctatttatggctaattgaagaaaaagatgtagaataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataa 31636113  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  31636114 aaa 31636116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 360 - 543
Target Start/End: Original strand, 32153595 - 32153780
Alignment:
Q  360 tatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaa--gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  32153595 tatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagatggagagttagtttatgttttgaacatgttatttattgttgat 32153694  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||  ||||  |||||| | ||||||| ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  32153695 tgaagaaaataatgtgaaataaataagggtatgtatgtaaataaataataaatctatttagaaataacaaaagggtcttataaaaa 32153780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 359 - 552
Target Start/End: Original strand, 47429188 - 47429381
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    |||||| |||||||  |||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| || |||| || ||||||||| |||||    
T  47429188 atatttatattaaagttgtttgtagtcactattatttttacaattttattctttagagagagagttagtttatattctcaatatattatttattgttgat 47429287  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | |||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  47429288 taaagaaaaagatgtataataaatggggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagagatcttat-aaaaagggacaaa 47429381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 7784246 - 7784033
Alignment:
Q  343 ggaattaagataa-tgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa---agagagttggtttatgttttcaa 438  Q
    |||||||||| || || |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |   |||||||| |||||| ||||| |    
T  7784246 ggaattaagaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttagtttatattttcca 7784147  T
Q  439 catgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttat 538  Q
     ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   |||||||    
T  7784146 tatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttat 7784047  T
Q  539 aaaaaagggacaaaa 553  Q
     || |||||||||||    
T  7784046 -aataagggacaaaa 7784033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 299 - 449
Target Start/End: Original strand, 51561070 - 51561220
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  51561070 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 51561169  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttattta 449  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  51561170 acaattttatcctttaagagaaagatggtttatgtttt-aacatattattta 51561220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 385 - 543
Target Start/End: Original strand, 41619995 - 41620152
Alignment:
Q  385 tactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagg 484  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||| | |||||| | |    
T  41619995 tactattgtttttacaattttatc-tttaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaagaaaaagatgcaaaataaataag 41620093  T
Q  485 ggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  41620094 ggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttagaaataccaaataaatcttataaaaa 41620152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 314 - 466
Target Start/End: Original strand, 44454580 - 44454736
Alignment:
Q  314 taattatagggtcatttt--aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 411  Q
    |||||||||| || ||||  |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44454580 taattataggatccttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgattttacaattttatcctt 44454679  T
Q  412 taaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaa 466  Q
    ||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  44454680 taagagagatggatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgatagaagaaaa 44454736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 359 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 10433558 - 10433371
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa---agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattg 455  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| | |   ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  10433558 atatttgtattaaatttgtttctaatcactattgtttttacaattttattcttaagagagagagaattagtatatattttcaacatgttatttattgctg 10433459  T
Q  456 attgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||| ||||||| || | |||||||||  |||||||||||||    
T  10433458 attgaataaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataaataatgtagttggcaataacaaatgagtcttataaaaa 10433371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 359 - 542
Target Start/End: Original strand, 46506214 - 46506398
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| | ||| | ||||||  | ||    
T  46506214 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatccttaagaaagagagttgatttatgttttccatatgatgtttattgctcat 46506313  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||  ||||| ||||   |||||||||||    
T  46506314 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaagtaattaatatagttgaaaatagcaaaagggtcttataaaa 46506398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 2637009 - 2637172
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  2637009 taattactattgtttttataattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataa 2637108  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | ||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  2637109 ataagggtacgttggtaaagaaataattaatgtacttagaaataccaaaggggtcttataaaaa 2637172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 333 - 480
Target Start/End: Original strand, 1837347 - 1837502
Alignment:
Q  333 aaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--------aaagagagttg 424  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |        | ||||||||     
T  1837347 aaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtcttaaatatgtttgtaattactattgcttttacaatattatccttcaagagagagagagagagttt 1837446  T
Q  425 gtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1837447 gtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaa 1837502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 443 - 553
Target Start/End: Original strand, 39867542 - 39867651
Alignment:
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||    
T  39867542 ttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttat-aaa 39867640  T
Q  543 aagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||    
T  39867641 aagggacaaaa 39867651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 299 - 421
Target Start/End: Original strand, 32906705 - 32906829
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt--aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32906705 tactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatttgtttgtaattactattgtttt 32906804  T
Q  397 tacaattttatcctttaaaagagag 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32906805 tacaattttatcctttaaaagagag 32906829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 345 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 48023156 - 48022972
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgt 443  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||  | ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||| ||||| |||||||||||| | |||     
T  48023156 aattaagaaaatgaatatttacattaaagttatttgtaattacaattgtttttataattttattcttaagaaagtgagttagtttatgttttccatatgc 48023057  T
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || ||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  48023056 tatttattgttgatttaagaaaaatatatataataaataggggcatgtatgcaaagaaataattaatgtagttggaaataccaaa 48022972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 375 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 4592799 - 4592629
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaga--gagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  4592799 tgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctataagagatagagttagtttatgttttcaacatattatttattgctagttgaagaaaaagatgt 4592700  T
Q  473 ataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||| | ||  ||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||    
T  4592699 ataataaatatggacatgtatgtaaagtaatagttaatgtacttgaaaatatcaaaggtgtcttataaaaa 4592629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 39425653 - 39425816
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||    
T  39425653 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaatgatgcaaaataa 39425752  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | |||||||   |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||  ||||||||||||    
T  39425753 ataagggtatgttggtaatgaaataatttatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaa 39425816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 344 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 47263709 - 47263503
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||||  | |||    
T  47263709 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagattgagagttagtttatgtttttcatatg 47263610  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaag----atgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttat 538  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||    |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||  | ||||||    
T  47263609 tta-ttattgctgattgaagaaaaagatgtatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgaatcttat 47263511  T
Q  539 aaaaaagg 546  Q
    ||||||||    
T  47263510 aaaaaagg 47263503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 403 - 553
Target Start/End: Original strand, 11352908 - 11353059
Alignment:
Q  403 tttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaaga 500  Q
    |||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||      
T  11352908 tttatcctttaagagagggagttagtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgtaaaat 11353007  T
Q  501 aataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  11353008 aataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 11353059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 350 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 18172561 - 18172424
Alignment:
Q  350 agataatgaatatttgtattaaac-atgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttattt 448  Q
    ||||| || |||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   | || |||||||||| ||||||||||||    
T  18172561 agatagtggatatttatattaaattatgtttgtaattactgttgtttttacaattttatcctttaagagttggatgatttatgtttttaacatgttattt 18172462  T
Q  449 attattgattgaagaaaaagatgtataataaacagggg 486  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18172461 atagttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggg 18172424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 544
Target Start/End: Original strand, 4371589 - 4371751
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||| | ||||||    
T  4371589 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatattttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaa 4371687  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaa 544  Q
     | || || |   ||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4371688 taaggataggttggtaaataaataattaatgtacttgaaaatatcaaagaagtcttataaaaaa 4371751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 4389823 - 4389660
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||| | |||||    
T  4389823 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataa 4389724  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | | ||| |   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||    
T  4389723 ataagagtaggttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaagagatcttataaaaa 4389660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 299 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 26547802 - 26547662
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||  | |||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26547802 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaataacggaaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 26547703  T
Q  399 caattttatccttt----aaaagagagttggtttatgtttt 435  Q
    |||||||||| |||    || ||||||||||||||||||||    
T  26547702 caattttatcatttaagaaagagagagttggtttatgtttt 26547662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 27479812 - 27479649
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataata 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||  ||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||    
T  27479812 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagggaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaata 27479714  T
Q  479 aacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    || | |||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||||    
T  27479713 aataagggtatgttagtaaaaaaataattaatgtacttggaaataccaaagggatcttataaaaa 27479649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 386 - 542
Target Start/End: Original strand, 43456449 - 43456606
Alignment:
Q  386 actattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagg 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | |||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43456449 actattgtttttacaattttatccttaagaaagagagttagtttatgttttccatatgcaattttttgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagg 43456548  T
Q  485 ggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    || | | ||||||| |||||| ||||||| || |||||| ||||  | ||||||||||    
T  43456549 ggcaggtatgtaaataaataactaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttataaaa 43456606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 345 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 22567319 - 22567120
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgt 443  Q
    |||||||| | || ||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  || | | ||||||||  ||||||||||| | |||     
T  22567319 aattaagaaagtggatatttgtattatttttgtttgtaatcactattgtttttacaattttattattaagagagagagttaatttatgttttccatatgc 22567220  T
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||| |||||| |||||||||||| || || |||||| ||||  |||||| ||||||    
T  22567219 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtattataaatatggacatgtatgtaaggaaataattaatatagttggaaatagcaaaagagtcttgtaaaaa 22567120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 381 - 523
Target Start/End: Original strand, 23893520 - 23893663
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  23893520 taattaccattgtttttacaattttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataa 23893619  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
    | | |||||||   |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23893620 ataagggtatgttagtaaagaaataattaatgcacttggaaata 23893663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 375 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 26768605 - 26768436
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| || ||||||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||| |    
T  26768605 tgtttgtaattgttattgtttttacaattttaacctttaagagagaaagttagtgtatgttt-caacatagtatttaatgttgattgaagaaaaagatat 26768507  T
Q  473 ataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | |||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||    
T  26768506 aaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttagaaatacaaaagggatcttataaaaa 26768436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 382 - 552
Target Start/End: Original strand, 29437678 - 29437848
Alignment:
Q  382 aattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||| || ||  |||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||    
T  29437678 aattactattgtttttacaattttatccttaatagagagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgaatgaagaaaaaaatgcaaaataaa 29437777  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
     | |||||||   |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  29437778 taagggtatgttggtaaagaaataattgatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaa 29437848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 381 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 27670055 - 27669894
Alignment:
Q  381 taattactattgttttt-acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| | | |||    
T  27670055 taattactattgttttttacaattttatcctt-aaaagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaagtaa 27669957  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    | |  ||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||   ||||||||||    
T  27669956 ataaaggtatgttggtaaagaaataattaatatacttggaaatatcaaagggatcttataaaa 27669894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 345 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 31154509 - 31154351
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgt 443  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||  | |||     
T  31154509 aattaagaaaatggatatttatattaaagttgtttttaatcactattgtttttacaattttatccttaaaagagataattggtttatgtttttcatatgc 31154410  T
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaa 502  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| || || ||| ||| |||||||    
T  31154409 tatttattgttgattgaaggaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgcaaagaaa 31154351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 343 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 47754578 - 47754433
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaa--gagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    ||||||||  || ||||||||| |||||||  ||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  47754578 ggaattaatttagtgaatatttatattaaagttgtttgtaaataccgtcgtttttacaaatttatcctttaagatagagagtttgtttatgttttcaaca 47754479  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagggg 486  Q
    |  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47754478 tactatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggg 47754433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 343 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 15616388 - 15616214
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta---aaagagagttggtttatgttttcaac 439  Q
    |||||||||| | || ||| || |||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||| || |   | |||||||| |||||||||||| |     
T  15616388 ggaattaagaaagtggataattatattaaagttgtttgtaatcatcattgtttttacaattttatctttaagagagagagagttagtttatgttttccat 15616289  T
Q  440 atgttatttattattgattgaa-gaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    ||| |||||||| |||||| || |||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15616288 atgctatttattgttgattaaaggaaaaatatgtataaaaaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgta 15616214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 365 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 35945438 - 35945274
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaaga 463  Q
    ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||| | ||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  35945438 gtattaaatttgtatgtaattattattgtttttataattttatccttaagaaagaaaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 35945339  T
Q  464 aaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    |||||||| | |||||| |  | ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  35945338 aaaagatgcaaaataaataaagatatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaa 35945274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 49549215 - 49549044
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||||    
T  49549215 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaaaaaaaaatgcaaaataa 49549116  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||||||    
T  49549115 ataagggtgtgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttata-aaaagggacaaa 49549044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 52429101 - 52428931
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  52429101 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataa 52429003  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  || ||||| |||||||||||||    
T  52429002 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagagccttat-aaaaagggacaaa 52428931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 17483946 - 17483784
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||   ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  17483946 taattactattgattttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataa 17483848  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||  ||||||||||||    
T  17483847 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaa 17483784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 375 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 50074631 - 50074461
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagt--tggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||  |  ||||| ||||||| ||  |||||| | ||||| ||||||||  ||||    
T  50074631 tgtttgtagttgctattgtttttataattttatcctttgagagagagtgttattttatattttcaatatagtatttaatgttgatcgaagaaaacaatgt 50074532  T
Q  473 ataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | |||||| ||| |||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  50074531 aaaataaataggagtatgttggtaaagaattaattaatgtacttggaaataccaaagaagtcttataaaaa 50074461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 381 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 30996958 - 30996810
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataata 478  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||  ||  |||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||    
T  30996958 taattactattgtttttataattttatcctt-aagagagaggattaatttacgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaata 30996860  T
Q  479 aacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    || | || ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30996859 aataaggatatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaa 30996810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 299 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 1427497 - 1427253
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa--taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||  |||  | |||||||| |||  ||| |  || ||||  |||| ||||||||||||| |||    
T  1427497 tactacctccgtccctaattataggatcatttaaaaaaaaataacggaaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttggtaattactattggttt 1427398  T
Q  397 tacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||   ||    
T  1427397 tacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatatagtatttaatgttgattgaagaaaaatatacaaaataaataggggtatgatggt 1427298  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
     || || ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  1427297 gaaaaattaattaatgcacttggaaataacaaaggggtcttataa 1427253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 358 - 480
Target Start/End: Original strand, 31338945 - 31339071
Alignment:
Q  358 aatatttgtattaaacatgtttgtaatt--actattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattat 453  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||| ||||| || |    
T  31338945 aatatttgtattaaatttgtttgtaattgtattattgtttttacaatttcatcctttaaaagagagagtttgtttctgttttcaacatgctatttcttgt 31339044  T
Q  454 tgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||    
T  31339045 tgattaaagaaaaaaatttataataaa 31339071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 299 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 33337097 - 33336855
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa--taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||  |||   ||||||||| |||  ||| |  || ||||  |||| ||||||||||||| |||    
T  33337097 tactacctccgtccttaattataggatcctttaaaaaaaaataacgagaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttggtaattactattggttt 33336998  T
Q  397 tacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| ||  |||||  | ||||||||| ||||| ||  | |||||| |||||||||   ||     
T  33336997 tacaattttatcc-ttaagagagagttaatttatgttttcaatataatatttgatgttgattgaaaaaaaatatacaaaataaataggggtatgatggtg 33336899  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    || || ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33336898 aaaaattaattaatgcacttggaaataacaaagaggtcttataa 33336855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Original strand, 39627059 - 39627230
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | ||||  ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||| | |||||    
T  39627059 taattactattgtttttacaattttatccttaagagaaatagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataa 39627158  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||||    ||||||||||||||||  ||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  39627159 ataagggtagatttgtaaagaaataattagcgtacttgaaaatatcaaagaggtcttat-aaaaagggacaaa 39627230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 362 - 546
Target Start/End: Original strand, 1197970 - 1198157
Alignment:
Q  362 tttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa----aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||     ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  1197970 tttgtattaaagctgtttataattgctattgtttttaaaattttatcttttaagagggagagagttaatttatgtttttaacatgctatttattgttgat 1198069  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| |   ||| | | |||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | ||||||| |||||||    
T  1198070 tgaaaaaaaaaatgtatattaaataatagtacgtaggtaaagaaataattaatgtagttag-aatagcaaacatgtcttattaaaaagg 1198157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 375 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 9424988 - 9424818
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||  ||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||| |    
T  9424988 tgtttataattaatattgtttttacaattttatcttttaagagagagaattattttatgttttcaacataatatttaatgttgattgaagaaaaagatat 9424889  T
Q  473 ataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | |||||| || ||||||   ||||| ||| |||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||| ||||    
T  9424888 aaaataaatagaggtatgttggtaaaaaaagaattaatgtatttgaaaataccaaagagatcttatgaaaa 9424818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 21290335 - 21290172
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||| ||  ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||| | |||||    
T  21290335 taattactattgtttttataattttatccttaagacaaagaattaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataa 21290236  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | ||||| |   ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||    
T  21290235 ataagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaa 21290172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 48363837 - 48364000
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |   ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  48363837 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataa 48363936  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | |||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||  ||||| ||||||    
T  48363937 ataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttaaaaacaccaaaggggtcttttaaaaa 48364000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 457 - 543
Target Start/End: Original strand, 32908286 - 32908372
Alignment:
Q  457 ttgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||    
T  32908286 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaggaataattaatgtagttggaaatagcaaataagtcttataaaaa 32908372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 385 - 552
Target Start/End: Original strand, 1867282 - 1867451
Alignment:
Q  385 tactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacag 483  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||| |     
T  1867282 tactattggttttacaattttatccttaagaaatagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgatcgaagaaaaaaatgtaaaataaataa 1867381  T
Q  484 gggtatgcatgt-aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    || ||||    | ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||   || ||||||||||||||||||    
T  1867382 ggatatgttgataaaaaaaataattaatgtactcagaaatatcaaaagggtgttataaaaaagggacaaa 1867451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 343 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26544466 - 26544377
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgt 432  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  26544466 ggaattaagatagtagatatttgtattaaatatatttgtaattattattgtttttacaattttattctttaagagagagatggtttatgt 26544377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 311 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 30761183 - 30761011
Alignment:
Q  311 ccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcc 409  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||| |||  | | | ||| |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  30761183 ccttaattatagggtccttttaaaaaaataacgggagttaagaaaattgaaagtggtaataagtttgtttgtaattgctattgtttttacaattttattc 30761084  T
Q  410 tttaaaag--agagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||| ||  |||||| || ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || || ||||||    
T  30761083 tttaagagaaagagttagtgtatgttttcaacatggtatttaatactgattgaagaaaaaaatataaaataaa 30761011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Original strand, 15302567 - 15302738
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||    
T  15302567 taattactattatttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatacaaaataa 15302666  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | || ||||   |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||   ||||||| |||||||||||||    
T  15302667 ataaggatatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaatggtcttat-aaaaagggacaaa 15302738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 35693362 - 35693113
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||| | |  ||| | ||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  35693362 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagaaatttgataatggtaataaatttgtttgtaaatactattgttttt 35693263  T
Q  398 acaattttatccttta----aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcat 493  Q
    |||||||||||||| |    | ||||||||  ||||||||||||| ||  |||||| | ||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||       
T  35693262 acaattttatccttgaagagagagagagttattttatgttttcaatatagtatttaatgttgattgaaaaaaaagatgttgaataactaggggtatgttg 35693163  T
Q  494 gtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||| || |||||||||| |||  ||||| |||||   |||||||||||    
T  35693162 gtaaaaaattaattaatgtgcttgaaaatatcaaagggatcttataaaaa 35693113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 443 - 543
Target Start/End: Original strand, 51561764 - 51561864
Alignment:
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||   |||||||||||    
T  51561764 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttgaaaataacaaatgtgtcttataaaa 51561863  T
Q  543 a 543  Q
    |    
T  51561864 a 51561864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 447 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 27530905 - 27530801
Alignment:
Q  447 ttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||| |||||||    
T  27530905 ttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaatg-agtcttat-aaaaagg 27530808  T
Q  547 gacaaaa 553  Q
    |||||||    
T  27530807 gacaaaa 27530801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 381 - 546
Target Start/End: Original strand, 37850260 - 37850426
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| ||  ||||||||||||| ||  |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||    
T  37850260 taattactattgtttttgcaattttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaagaaaaagatataaaataa 37850359  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    | | |||||||   ||||| ||||||||||| || || |||||| ||||   ||||||| |||||||    
T  37850360 ataagggtatgttggtaaaaaaataattaatctatttggaaataccaaaagggtcttatgaaaaagg 37850426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 13698862 - 13698769
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttc 436  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||    
T  13698862 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttattcttaagagagagagttggtttatgttttc 13698769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 381 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 38920448 - 38920314
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||   ||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||    
T  38920448 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaagaaaa--atgcaaaataa 38920351  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtactt 516  Q
    | | |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  38920350 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtactt 38920314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 381 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 45810204 - 45810116
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa--agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaa 467  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    
T  45810204 taattactattatttttacaattttatcctttaaaggagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaaaaaaa 45810116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 345 - 510
Target Start/End: Original strand, 33163183 - 33163352
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgtt 444  Q
    |||| ||| ||| |||| ||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    |||||||| |||||||||||||||||  |    
T  33163183 aatttagaaaattaatacttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttatacaattttatcttt---gagagagttagtttatgttttcaacataat 33163279  T
Q  445 atttattat-------tgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaat 510  Q
    ||||| |||       ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||    
T  33163280 atttaatatatattgctgattcaagaaaaaaatgtataataaataagggtatgtaggtaaagaaataattaat 33163352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 381 - 528
Target Start/End: Original strand, 51467296 - 51467443
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  51467296 taattactattgtttttataattttatccttaagagagagggttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataa 51467394  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  51467395 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatatacttggaaataccaaa 51467443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 463 - 546
Target Start/End: Original strand, 44455529 - 44455612
Alignment:
Q  463 aaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44455529 aaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaataacaaagagatcttataaaaaagg 44455612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 381 - 521
Target Start/End: Original strand, 4279951 - 4280090
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||   ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  4279951 taattactattgtttttacaattttatccttaagcgagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaa--atgtaaaataa 4280048  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaa 521  Q
    | | || || |   ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4280049 ataaggttaagttggtaaagaaataattaatgtacttggaaa 4280090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 454 - 543
Target Start/End: Original strand, 3262968 - 3263057
Alignment:
Q  454 tgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| | || ||||   |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3262968 tgattgaagaaaaagatataaaataaagaaggatatgttggtaaagaattaattaatgtatttagaaataccaaagaagtcttataaaaa 3263057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 388 - 553
Target Start/End: Original strand, 5854423 - 5854587
Alignment:
Q  388 tattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggt 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||  | | | |||| |||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||    
T  5854423 tattgtttttgcaattttatccttagagataaagttagtttatgttttcaacataatatttatggttgattgaagaaaaatatgcaaaataaataggggt 5854522  T
Q  488 atgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||   |||| |||||||| ||| || || |||||| ||||   ||||||| | ||||||||||||    
T  5854523 atggtggtaacgaaataatcaatctaattggaaataccaaaagggtcttat-ataaagggacaaaa 5854587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 472 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 5858377 - 5858297
Alignment:
Q  472 tataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  5858377 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 5858297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 369 - 470
Target Start/End: Original strand, 18114282 - 18114385
Alignment:
Q  369 taaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaa 466  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  | ||||||||||| ||  |||||| |  |||||||||||||    
T  18114282 taaacttgtttgtaatttctattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttaatatatgttttcaatataatatttaatgctgattgaagaaaa 18114381  T
Q  467 agat 470  Q
    ||||    
T  18114382 agat 18114385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 470
Target Start/End: Original strand, 22940637 - 22940733
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct-ttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagat 470  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || | ||||  || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22940637 tgtttgtaattactattgcttttacagttttattctcttcagagagtattagtttatgtttccaacataatatttattattgattgaagaaaaagat 22940733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 381 - 528
Target Start/End: Original strand, 46271175 - 46271321
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||    
T  46271175 taattactattgtttttacaattttattcttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattattgatagaagaaaaa-atgcaaaataa 46271273  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    | |  | ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  46271274 ata-agatatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaa 46271321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19349357 - 19349258
Alignment:
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||    
T  19349357 tatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaataccaaatgggtcttataaaaa 19349258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 444 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 38505948 - 38505850
Alignment:
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||    
T  38505948 tatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtatttggaaatatcaaaggagtcttataaaaa 38505850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 414 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 8905591 - 8905462
Alignment:
Q  414 aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||     |||||||||||||||| ||    
T  8905591 aaagagagttagtttatgtttttgacatgttatttattgctga-tgaagaaaaagatgtataataaatagggaaatatggataaagaaataattaatata 8905493  T
Q  514 cttagaaataacaaagaagtcttataaaaaa 544  Q
     ||  ||||| ||||||  ||||||||||||    
T  8905492 gtttaaaatagcaaagatatcttataaaaaa 8905462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 416 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 13054866 - 13054802
Alignment:
Q  416 agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  13054866 agagagttggtttatgttttcaacatagtatttattgttgattgtagaaaaagatgcaaaataaa 13054802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 530
Target Start/End: Original strand, 15624709 - 15624869
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattg---aagaaaaaga 469  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||| || |||||| |||  ||  |||||| | |||||||   || |||||||    
T  15624709 tgtttgtaattactattattttgataattttatcctttaagaaagagagttagtgtatgttgtcattatagtatttaatgttgattgaaaaaaaaaaaga 15624808  T
Q  470 tgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaaga 530  Q
    | || |||||| || ||||||   |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  15624809 tataaaataaatagaggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttgaaaataccaaaga 15624869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 385 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 43789869 - 43789705
Alignment:
Q  385 tactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat-gt----tatttattattgattgaagaaaaagatgtataata 478  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||    
T  43789869 tactattgtttttccaaatttatcctcaagagagagagttagtttatgttttcaacatagtacagtatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaata 43789770  T
Q  479 aacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    || | |||||||   |||| ||||||||||||||| || ||| || |||||  ||||| ||||||    
T  43789769 aataagggtatgttggtaatgaaataattaatgtaattggaactaccaaaggggtcttttaaaaa 43789705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 366 - 480
Target Start/End: Original strand, 2606722 - 2606841
Alignment:
Q  366 tattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta------aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattg 459  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||      |||||||  || ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||    
T  2606722 tattaaatttgtttgtaattagtattgtttttacgattttatcctttaagagagaaagagatatgctttatattttcaacatagtatttattgttgattg 2606821  T
Q  460 aagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    || ||||| ||||| ||||||    
T  2606822 aa-aaaaaaatgtaaaataaa 2606841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #193
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 543
Target Start/End: Original strand, 9411210 - 9411366
Alignment:
Q  388 tattgtttttacaattttatc-ctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagggg 486  Q
    |||| |||||||||||||||| || | | | |||||| |||||| ||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||| || | |||||  | |||    
T  9411210 tattatttttacaattttatctctatgagaaagagttagtttatattttcaatatagtgtttattgttgattgaagaaaaagctgcaaaataattaaggg 9411309  T
Q  487 tatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||  | |||||||||||    
T  9411310 tatattggtaaagaaataattaatgtaattggaaatatcaaatgaatcttataaaaa 9411366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #194
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 359 - 414
Target Start/End: Original strand, 8946443 - 8946498
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 414  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  8946443 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacatttttattctttaa 8946498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #195
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 380 - 475
Target Start/End: Original strand, 25968416 - 25968512
Alignment:
Q  380 gtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagt--tggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtata 475  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||   | ||||||||||||||| || ||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  25968416 gtaatcactattgtttttacaattttatt-tttaagagaaagaactagtttatgttttcaacgtgctatttattactagttgaagaaaaagatgtata 25968512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #196
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 416 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 37000831 - 37000730
Alignment:
Q  416 agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattg-aagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtac 514  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||  |||||||| |||||||    ||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  37000831 agagagttggtttatgttttaacaatagtatttattgttgattgtccaaaaaagatgtaaaataattaggggtatgtttgtaaagaaataattaatgcac 37000732  T
Q  515 tt 516  Q
    ||    
T  37000731 tt 37000730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #197
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 359 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 9413609 - 9413517
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttatt 451  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| | |||  |||||||||||||||| || ||||||||  | |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  9413609 atatttgtattaaagttgtttgcaatcattatcatttttacaattttatctttgaaaagagatatagtttatattttcaacatactatttatt 9413517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #198
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 38509126 - 38509067
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaac 439  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||   ||||||||||||||    
T  38509126 taattactattgtttttacaatttcatccttaaaagagagagtaaatttatgttttcaac 38509067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #199
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 543
Target Start/End: Original strand, 45809870 - 45809913
Alignment:
Q  500 aaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  45809870 aaataattaatgtacttataaataccaaagaggtcttataaaaa 45809913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #200
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 299 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 5966869 - 5966749
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| | |||| |||||||||| ||| |||||| |||  | ||| | | ||||  |||||||||||| ||||| ||||    
T  5966869 tactacctctgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataatcggatttaagaaaattgaaatt-gaaataaagttgtttgtaatta-tattgctttt 5966772  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagaga 420  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  5966771 acaattttatcctttaagagaga 5966749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #201
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 377 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 10332404 - 10332366
Alignment:
Q  377 tttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa 415  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  10332404 tttgtaattattattatttttacaattttatcctttaaa 10332366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 332 - 397
Target Start/End: Original strand, 11351475 - 11351541
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaata-tttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  11351475 aaaaaataacgggaattaagatagtgaatattttatattaaatatgtttgtaattattattattttt 11351541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 429 - 523
Target Start/End: Original strand, 39647664 - 39647758
Alignment:
Q  429 atgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
    |||||||| | |||||||| |||   ||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||||| || ||||||    
T  39647664 atgttttctatatgttattcattgccgattgaagaaaaatatatgtaataaataggagtatgtatgtaaagaaatggttaatgtagttggaaata 39647758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 494 - 543
Target Start/End: Original strand, 18114595 - 18114644
Alignment:
Q  494 gtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  18114595 gtaaagaattaattagtgtacttagaaatatccaagaggtcttataaaaa 18114644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #205
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 366 - 415
Target Start/End: Original strand, 23932941 - 23932990
Alignment:
Q  366 tattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa 415  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23932941 tattaaatttgtttgtaattagtattgtttttataattttattctttaaa 23932990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #206
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 455 - 544
Target Start/End: Original strand, 43589318 - 43589406
Alignment:
Q  455 gattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaa 544  Q
    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||  |||||| |||||   ||||||||||||    
T  43589318 gattgaagaaaaa-atataaaataaataggggtatgttagtaaagaattaattaatgtactgtgaaatatcaaagggttcttataaaaaa 43589406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #207
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 494 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 47754118 - 47754069
Alignment:
Q  494 gtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||||    
T  47754118 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaa 47754069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #208
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 52001409 - 52001328
Alignment:
Q  463 aaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaaga-aataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||  ||||| | ||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  52001409 aaaaagatgtaaaataaatagaggtatgctggtaaaaataataattaatgtagttgaaaatgccaaagaagtcttataaaaa 52001328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 170; Significance: 1e-90; HSPs: 174)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 299 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 12930616 - 12930363
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12930616 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 12930517  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  12930516 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 12930417  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaa 551  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  12930416 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaagggacaa 12930363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 27529524 - 27529279
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27529524 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 27529425  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  27529424 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 27529325  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||    
T  27529324 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaa 27529279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 299 - 546
Target Start/End: Original strand, 35569393 - 35569641
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||| |||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35569393 tactacatccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 35569492  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  35569493 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 35569592  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  35569593 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaagg 35569641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 7607373 - 7607620
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7607373 tactacctccgtccctaattatagggtccttttaaaaaaataatgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 7607472  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  7607473 acaattttatcatttaagagagagtgttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 7607572  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||| ||| | || |||||| |||||| |||| |||||||    
T  7607573 aaagaaataattcatgcagttggaaatagcaaagaggtctcataaaaa 7607620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 299 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 3024878 - 3024627
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |    
T  3024878 tactacctccgtccttaattatagggcccttttaaaaaataacgggaattaagatagtgaatgtttgtattaaatatatttgtaattagtattgtttt-a 3024780  T
Q  399 caattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaa 498  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||  |||||||    
T  3024779 caattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaataggggcatatatgtaaa 3024680  T
Q  499 gaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    |||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3024679 gaaataattaatatagttggaaatagcaaagaagtcttata-aaaagggacaaa 3024627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 1575015 - 1574770
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1575015 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 1574916  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| | || ||||| ||| ||||||    
T  1574915 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaataatatgtatatttaataggggcatgtatgtaa 1574816  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||    
T  1574815 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaa 1574770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 4857107 - 4856848
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttta-aaaaataata---ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtt 394  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  ||||||  ||||||| ||   |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  4857107 tactacctccgtccctaattataggaccattttggaaaaatattaacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtt 4857008  T
Q  395 tttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgca 492  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  4857007 tttacaattttatcctttaagagagatggttggtttaggttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaataggggaatgta 4856908  T
Q  493 tgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4856907 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagacgtcttata-aaaagggacaaaa 4856848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 11647575 - 11647829
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11647575 tactacctccctccttaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 11647674  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || | ||| ||| ||||||    
T  11647675 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaataagggcatgtatgtaa 11647774  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  11647775 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 11647829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 302 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 30895855 - 30895602
Alignment:
Q  302 tacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttaca 400  Q
    |||||||| || ||||||||| | | |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30895855 tacctccgtccctaattatagcgcccttttgaaaaaataacaggaattaagataatggatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttaca 30895756  T
Q  401 attttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaa 498  Q
    | ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||    
T  30895755 aatttatccttcaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaa 30895656  T
Q  499 gaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  30895655 gaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 30895602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 298 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 23920029 - 23919783
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattataggg-tcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||  |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23920029 gtactacctccgtccctaattatagggctcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 23919930  T
Q  397 tacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||    
T  23919929 tacaattttatcttttaagagaaagatggtttatgttttcaacatattatttattgttgatggaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgta 23919830  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  23919829 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagagtcttataaaaa 23919783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 47323268 - 47323524
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  47323268 tactacctccgtccctaattatagggtctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgttttt 47323367  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| ||||    
T  47323368 acaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataagggcatgtatgt 47323467  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||| |||||  | |||| ||||||||||||||    
T  47323468 aaagaaataattaatgtagttgaaaataagaaagagattttat-aaaaagggacaaaa 47323524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 297 - 553
Target Start/End: Original strand, 6799283 - 6799539
Alignment:
Q  297 agtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttt 395  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  6799283 agtactacctccgtcccaaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 6799382  T
Q  396 ttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||    
T  6799383 ttacaattttatcctttaagagagagatagtttatgctttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatatatgt 6799482  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  6799483 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagagatcttat-aaaaagggacaaaa 6799539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 32759854 - 32759609
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||| |||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||  || |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  32759854 tactccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatggtggatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 32759755  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  32759754 acaattttatcctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 32759655  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||    
T  32759654 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 32759609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 43280000 - 43279747
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||| |||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43280000 tactacatccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 43279901  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| ||||||    
T  43279900 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaata-gggcatgtatgtaa 43279802  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  43279801 agaaataattaatgtagtaggaaatagtaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 43279747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 8612359 - 8612570
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  8612359 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 8612458  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |    
T  8612459 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtcaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttat-a 8612557  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  8612558 aaaagggacaaaa 8612570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 25247475 - 25247686
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  25247475 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 25247574  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  25247575 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 25247673  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  25247674 aaaagggacaaaa 25247686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 29064241 - 29064452
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  29064241 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgaaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 29064340  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  29064341 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 29064439  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  29064440 aaaagggacaaaa 29064452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 31200148 - 31200359
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  31200148 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 31200247  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  31200248 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 31200346  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  31200347 aaaagggacaaaa 31200359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 39197971 - 39197760
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  39197971 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 39197872  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||     
T  39197871 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagagtcttata- 39197773  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  39197772 aaaagggacaaaa 39197760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 39871397 - 39871608
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  39871397 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 39871496  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  39871497 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 39871595  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  39871596 aaaagggacaaaa 39871608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 299 - 539
Target Start/End: Original strand, 21870075 - 21870318
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattataggg-tcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| || |||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21870075 tactacttccgtccttaattatagggctcttttggaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgttttt 21870174  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||    
T  21870175 acaaatttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttatcgttgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgt 21870274  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttata 539  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||    
T  21870275 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata 21870318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19920824 - 19920614
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  19920824 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttaca-ttttatcctttaagagagaattgatttatg 19920726  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||      
T  19920725 ttttcaacatgatatttattaatgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggg 19920626  T
Q  532 gtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||    
T  19920625 gtcttataaaaa 19920614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 36697915 - 36698117
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  36697915 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 36698014  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  36698015 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagtggtcttataa 36698114  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  36698115 aaa 36698117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 41803209 - 41803458
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||  |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41803209 tactacctctgtcctttattataggaccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 41803308  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatg--tataataaacaggggtatgcat 493  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||    
T  41803309 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatataataaataggggcatgtat 41803408  T
Q  494 gtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||| | || ||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  41803409 gtaaagaaataattattatagttgaaaataataaaggggtcttataaaaa 41803458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 1275517 - 1275728
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  1275517 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 1275616  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||| |    
T  1275617 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttat-a 1275715  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  1275716 aaaagggacaaaa 1275728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 29285821 - 29286032
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  29285821 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttagaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 29285920  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||| |    
T  29285921 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttat-a 29286019  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  29286020 aaaagggacaaaa 29286032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 32872159 - 32872370
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  32872159 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 32872258  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||| |    
T  32872259 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttat-a 32872357  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  32872358 aaaagggacaaaa 32872370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 34978861 - 34979072
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  34978861 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 34978960  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||| |    
T  34978961 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatttagttggaaataacaaaggggtcttat-a 34979059  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  34979060 aaaagggacaaaa 34979072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 40300483 - 40300272
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  40300483 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 40300384  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||     
T  40300383 tgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttata- 40300285  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  40300284 aaaagggacaaaa 40300272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 43081549 - 43081294
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||   ||| |||||||||  |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43081549 tactacctccgtccctaattataaggctttttgaaaaaataacgggaattaagatggtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 43081450  T
Q  399 caattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    ||||||||||||||||  || || ||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  43081449 caattttatcctttaagaaaaagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 43081350  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||    
T  43081349 aagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttata-aaaagggacaaaa 43081294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 44547679 - 44547468
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||    
T  44547679 ggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaaca 44547580  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||     
T  44547579 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagagatcttata- 44547481  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  44547480 aaaagggacaaaa 44547468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 2289755 - 2290011
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | |||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  2289755 tactacctccgtccgtaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatattt 2289854  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  2289855 acaattttatcttttaagagagagagttcgtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaataaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 2289954  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||   ||||||  ||||||||||||||    
T  2289955 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtctta-gaaaaagggacaaaa 2290011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 304 - 553
Target Start/End: Original strand, 42298172 - 42298421
Alignment:
Q  304 cctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaat 402  Q
    |||||| || |||||||||| || |||| ||||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  42298172 cctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattatttttacaat 42298271  T
Q  403 tttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaa 502  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  42298272 tttatcctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaa 42298371  T
Q  503 taattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||| || || |||||| |||||  |||||||  |||||||||||||    
T  42298372 taattaatatagttggaaatagcaaaggggtcttat-gaaaagggacaaaa 42298421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 8291156 - 8290945
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  8291156 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 8291057  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||   ||||||||     
T  8291056 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgggtcttata- 8290958  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  8290957 aaaagggacaaaa 8290945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 299 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 21119856 - 21119608
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||| ||| || |||| |||||||||  | |||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21119856 tactacctccgtccctaattacaggatccttttgaaaaaataaaggaaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 21119757  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||| ||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21119756 acaattttatcatttaagagagataattagtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaacaatgtataataaataggggcatgcatgt 21119657  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaa 544  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||    
T  21119656 aaagaaataattaatgtaattggaaataacaaacgagtcttataaaaaa 21119608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 299 - 508
Target Start/End: Original strand, 24299943 - 24300155
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| |  ||||||||| | | |||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24299943 tactacctccgtctctaattatagagcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 24300042  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  24300043 ataattttatcctttaaaagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttgttgctaattgaagaaaaagatgtataataaatatgggtatgtatgt 24300142  T
Q  496 aaagaaataatta 508  Q
    |||||||||||||    
T  24300143 aaagaaataatta 24300155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 31458250 - 31458039
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || || | |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  31458250 ggaattaagatagtggatgtctgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 31458151  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||     
T  31458150 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata- 31458052  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  31458051 aaaagggacaaaa 31458039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 33858651 - 33858861
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  33858651 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 33858750  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  33858751 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatcaatgtagttggaaataacaaag-ggtcttat-a 33858848  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  33858849 aaaagggacaaaa 33858861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 36646421 - 36646632
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||| ||||    
T  36646421 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgtttttaaca 36646520  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  36646521 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 36646619  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  36646620 aaaagggacaaaa 36646632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 41025880 - 41026091
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  41025880 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 41025979  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||   ||||||| |    
T  41025980 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgggtcttat-a 41026078  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  41026079 aaaagggacaaaa 41026091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 332 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 48009200 - 48008982
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagt----tggtt 427  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    || ||    
T  48009200 aaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtatttaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagtgagttgatt 48009101  T
Q  428 tatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaa 527  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  48009100 tatgctttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtatttggaaataacaa 48009001  T
Q  528 agaagtcttataaaaaagg 546  Q
    ||   ||||||||||||||    
T  48009000 agggttcttataaaaaagg 48008982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 2006728 - 2006526
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  2006728 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 2006629  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  || |||||||    
T  2006628 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagccttataa 2006529  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  2006528 aaa 2006526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 48521279 - 48521077
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  48521279 ggaattaagatagtggatatttgcattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 48521180  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  48521179 tattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataa 48521080  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  48521079 aaa 48521077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 9140272 - 9140528
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||| | || |||||||| || | |||| |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9140272 tactacctctgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgttttt 9140371  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  9140372 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaagaggggcatgtatgt 9140471  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  9140472 aaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttat-aaaaagggacaaaa 9140528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 10475965 - 10475752
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  10475965 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagtattggttta 10475866  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||    
T  10475865 tgttttcaacatgtcatttattgctaattgaagaaaaagatgtataatatatagggtcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaatagcaaag 10475766  T
Q  530 aagtcttataaaaa 543  Q
      ||||||||||||    
T  10475765 gggtcttataaaaa 10475752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 314 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 45907526 - 45907296
Alignment:
Q  314 taattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 412  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45907526 taattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 45907427  T
Q  413 aaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgt 512  Q
    || ||||| ||| ||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  45907426 aagagagaattgatttatgtttccaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatacatgtaaaaaaataattaatgt 45907327  T
Q  513 acttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | || ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  45907326 agttggaaataataaaggggtcttataaaaa 45907296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 6387578 - 6387367
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  6387578 ggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 6387479  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||     
T  6387478 ttttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagaggtcttata- 6387380  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  6387379 aaaagggacaaaa 6387367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 17491768 - 17491557
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  17491768 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 17491669  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||     
T  17491668 tgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata- 17491570  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  17491569 aaaagggacaaaa 17491557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 17561446 - 17561657
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  17561446 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 17561545  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  17561546 tgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 17561644  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  17561645 aaaagggacaaaa 17561657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 296 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 26736787 - 26736522
Alignment:
Q  296 tagtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtt 394  Q
    |||||||||||||  || |||||||| |  | |||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26736787 tagtactacctccatccctaattataagacccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 26736688  T
Q  395 tttacaattttatcctttaaaagagag--------ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagggg 486  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26736687 tttacaattatatccttgaagagagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggg 26736588  T
Q  487 tatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  26736587 catgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgagtcttata-aaaagggacaaaa 26736522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 32814686 - 32814475
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |  ||| ||||||||||||||||    
T  32814686 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaatgttagtttatgttttcaaca 32814587  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||     
T  32814586 tattatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaatagggtcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttata- 32814488  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  32814487 aaaagggacaaaa 32814475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 38361412 - 38361193
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||    
T  38361412 aaaaaataatgggaattaagacagtgaatatttgtgttaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat-cattgagagagagttggtttatg 38361314  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| |   | ||| ||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||    
T  38361313 ttttcaacatgttatttatagctgattgaagaaaaagatatataataaatattagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagctcgaaatagcaaagaa 38361214  T
Q  532 gtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  38361213 gtcttat-aaaaagggacaaaa 38361193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 28016285 - 28016532
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||| |||| || |||||||| || | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28016285 tactacttccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 28016384  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  28016385 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaagaaaaaggtgtataataaataggggcatgtatgt 28016484  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  |||| | |||||||||||    
T  28016485 aaagaaataattaatgtagttggaaatataaaaggaatcttataaaaa 28016532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 7449521 - 7449311
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga-gttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||||    
T  7449521 ggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgattttacaattttatcctttaagaaaaatgttagtttatgttttcaacat 7449422  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||| |    
T  7449421 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttata-a 7449323  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  7449322 aaagggacaaaa 7449311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 7703605 - 7703806
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| | ||||||||||||||    
T  7703605 ggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaggaaagaaggttag-ttatgttttcaaca 7703703  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  7703704 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataa 7703803  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  7703804 aaa 7703806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 299 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 19619331 - 19619105
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattataggg-tcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | || ||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  19619331 tactacctccgtccctaattatagagctcttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaaatactattgttttt 19619232  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19619231 acaattttatcctttaagagagagggttggtttatatttgcaacatgttatttgttgctaattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgt 19619132  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaat 522  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||    
T  19619131 aaaaaaataattaatgtagttggaaat 19619105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 41252146 - 41252356
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa-aagagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||| ||    
T  41252146 ggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaataaggttagtttatgttttcaagat 41252245  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||    
T  41252246 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttat-aa 41252344  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  41252345 aaagggacaaaa 41252356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 26255348 - 26255137
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  26255348 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactaatgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 26255249  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||     
T  26255248 tgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaatggtcttata- 26255150  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  26255149 aaaagggacaaaa 26255137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 299 - 539
Target Start/End: Original strand, 44780132 - 44780373
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattataggg-tcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||   ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44780132 tactacctccgtccttaattatatggctcttttaaaaaaataacgagaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 44780231  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||    
T  44780232 acaattttatcttttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattga--aaaaaaatctataataaataggggcatgcatgt 44780329  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttata 539  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||| |||| |||||    
T  44780330 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaataagttttata 44780373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 314 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 38736733 - 38736503
Alignment:
Q  314 taattatagggtcatttt--aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 411  Q
    |||||||||| || ||||  ||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  38736733 taattataggatccttttgaaaaaaataacaggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattatcattgtttttacaattttattctt 38736634  T
Q  412 taaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatg 511  Q
    ||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  38736633 taagagaaggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatg 38736534  T
Q  512 tacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    || ||  |||||  |||| |||||||||||||    
T  38736533 tagttgaaaatagaaaag-agtcttataaaaa 38736503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 332 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 9998551 - 9998353
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagt--tggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   ||  | |    
T  9998551 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagagagagggatgaataa 9998452  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  9998451 tgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 9998353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 299 - 498
Target Start/End: Original strand, 20950779 - 20950978
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||  | |||| ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  20950779 tactacccccgtccctaattataggacccttttgaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgttttta 20950878  T
Q  399 caattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaa 498  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  20950879 caattttatcctttaagagagaattgatttatgttttcaacatgttatttattgcttattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgcatgtaaa 20950978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 343 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 38428399 - 38428212
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  38428399 ggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 38428300  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    | ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38428299 gctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttagaaataacaaag 38428212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 38858550 - 38858340
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||  | ||    
T  38858550 ggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttcgtttatgtttttcatat 38858451  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |    
T  38858450 gttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata-a 38858352  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  38858351 aaagggacaaaa 38858340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 788197 - 787984
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| ||||    
T  788197 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaggagagagggttgattta 788098  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||||| ||||||||||| || || |||||| ||||     
T  788097 tgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagaagtataataaataagggcatgtatgtaaaaaaataattaatatagttggaaatagcaaat 787998  T
Q  530 aagtcttataaaaa 543  Q
     |||||||||||||    
T  787997 gagtcttataaaaa 787984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 47657450 - 47657659
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||||||    
T  47657450 ggaattaagatagtggatatttatattaaatatatttataattactattgtttttacaattttatcttttaagacagaattgatttatgttttcaacatg 47657549  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
     ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| |||    
T  47657550 atatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttat-aaa 47657648  T
Q  543 aagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||    
T  47657649 aagggacaaaa 47657659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7400384 - 7400179
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-----agagagttggtttatgttttca 437  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||| ||||||    
T  7400384 ggaattaagatagtggatatttgcattaaagttgtttgtaatccttattgtttttacaattttatcctttaattagagagaaagttggtttatattttca 7400285  T
Q  438 acatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtctta 537  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  7400284 acatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtctta 7400185  T
Q  538 taaaaa 543  Q
    ||||||    
T  7400184 taaaaa 7400179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 29642928 - 29643138
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||| |    
T  29642928 ggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaata 29643027  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||  ||||||| |    
T  29643028 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataac-aaggggtcttat-a 29643125  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  29643126 aaaagggacaaaa 29643138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 345 - 543
Target Start/End: Original strand, 36711085 - 36711284
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||  ||||||||||||||||||    
T  36711085 aattaaaatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggtcagtttatgttttcaacatg 36711184  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  36711185 ttatttattgttgattgaaaaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaa 36711283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 344 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 12130298 - 12130131
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacat 441  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12130298 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatg--atcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacat 12130201  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatg 511  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12130200 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatg 12130131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 21295403 - 21295193
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  21295403 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 21295304  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||| |    
T  21295303 gctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttata-a 21295205  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  21295204 aaagggacaaaa 21295193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 29177053 - 29177247
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | |||||| |||||  ||||    
T  29177053 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgat 29177152  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  29177153 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttat-aaaaagggacaaaa 29177247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 311 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 37913361 - 37913117
Alignment:
Q  311 ccttaattataggg-tcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcc 409  Q
    ||||||||||| || || ||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37913361 ccttaattataaggctcttttgaaaaaataacggtaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcc 37913262  T
Q  410 ttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataatt 507  Q
    ||||  |||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  37913261 tttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataatt 37913162  T
Q  508 aatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||| || ||||||  |||   ||||||| ||||||||||||||    
T  37913161 aatgtagttggaaatagaaaatgggtcttat-aaaaagggacaaaa 37913117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 343 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 17327124 - 17326952
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||  |||||||||||||||    
T  17327124 ggaattaagatagtggatatttgtattaaggttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttaatttatgttttcaaca 17327025  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17327024 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 17326952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 299 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 23364312 - 23364080
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  23364312 tactatctccgtccctaattatagggccctttttaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatatttgtagttactattgttttt 23364213  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| | | | ||| ||||    
T  23364212 acaaatttatcctttaagagagaaagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgatcgaagaaaaagatgaataataaataagagcatgtatgt 23364113  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  23364112 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 23364080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 299 - 544
Target Start/End: Original strand, 27881827 - 27882075
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| |||| |||||||||   ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  27881827 tactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgtgaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtagttactattgttttt 27881926  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| || |  ||| ||||    
T  27881927 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatatataataaatagagacatgtatgt 27882026  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaa 544  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  27882027 aaaaaaataattaatgtagttagaaatataaaaggtgtcttataaaaaa 27882075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 299 - 523
Target Start/End: Original strand, 30737751 - 30737979
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  30737751 tactatctccgtccttaattataaggtcattttaaaaaaataacgggaactaagatagtagatatttgtattaaatacgtttgtaattactattgttttt 30737850  T
Q  398 acaattttatccttt-------aaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatg 490  Q
    |||||||||||||||       ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||       
T  30737851 acaattttatcctttaagaaaaaaaagagggttggtttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggt--- 30737947  T
Q  491 catgtaaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
     |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  30737948 -atgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 30737979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 361 - 546
Target Start/End: Original strand, 7400523 - 7400710
Alignment:
Q  361 atttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgatt 458  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7400523 atttgtattgaagatgtttgtaatcactattgtttttacaagtttatcctttaaaagaaagaattaatttatgttttcaacatgctatttattgttgatt 7400622  T
Q  459 gaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||| | ||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7400623 gaagaaaaagatgtataataaataagggtatgcaaataaagaaataattaatgcagttgaaaataacaaagaggtcttataaaaaagg 7400710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 347 - 528
Target Start/End: Original strand, 18112955 - 18113138
Alignment:
Q  347 ttaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgtt 444  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  18112955 ttaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgtt 18113054  T
Q  445 atttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  18113055 atttaatgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaa 18113138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 44719375 - 44719178
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||    
T  44719375 ggaatgaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctt---aagagagttggtttatgttttccatatg 44719279  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| || |||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||    
T  44719278 ctatttattgttgattgaagaaaaagatttacaataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagacgtcttataaaa 44719179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 43440910 - 43441105
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattga 456  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||  |||    
T  43440910 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctga 43441009  T
Q  457 ttgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||| || ||||||   ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  43441010 ttgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtttgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagataatgagtcttat-aaaaagggacaaaa 43441105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 314 - 478
Target Start/End: Original strand, 21870846 - 21871013
Alignment:
Q  314 taattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 412  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  21870846 taattatagggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttttacaaatttatccttc 21870945  T
Q  413 a--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataata 478  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21870946 aagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttatcgttgattgaagaaaaagatgaataata 21871013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Original strand, 43093181 - 43093403
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagag--agttggttta 429  Q
    |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||||||||    
T  43093181 aaaaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattataattgtttttacaaatttatccttcaagagagagagttggttta 43093280  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||     
T  43093281 tattttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataactaatgtagttggaaatagcaaat 43093380  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
     ||| |||| ||||||||||||||    
T  43093381 gagttttat-aaaaagggacaaaa 43093403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 299 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 16957932 - 16957749
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||||| || || ||||||||| | | |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16957932 tactaccttcgtccctaattatagagcccttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgttttt 16957833  T
Q  398 acaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16957832 acaattttatcgtttaaagagatggttgatttatgttttcaatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaa 16957749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 299 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 26843069 - 26842845
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattataggg-tcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  || ||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26843069 tactacctccgtccctaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 26842970  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgt-------tttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggta 488  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||       |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  26842969 acaattttatcctttaagaaagagggttggtttatgttttcaagtttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggca 26842870  T
Q  489 tgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    || ||| ||||||||||||||||||    
T  26842869 tgtatggaaagaaataattaatgta 26842845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 34012319 - 34012513
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  ||||    
T  34012319 atatttgtattaaagttgtttgtaatcaatattgtttttacaattttatccttaaaagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgat 34012418  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  34012419 tgaagaaaaaaatgtataacaaataggggcttgtatgtaaagaaataattaatgtacttggaaatagcaaaagagtcttat-aaaaagggacaaaa 34012513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 349 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 41787495 - 41787301
Alignment:
Q  349 aagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttattt 448  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41787495 aagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaggttggtttatgttttaaacatgttattt 41787396  T
Q  449 attattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaa 544  Q
    |||   ||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||  | ||||||||||||    
T  41787395 attgccgattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaa-aaataattaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttataaaaaa 41787301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 299 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 23109365 - 23109148
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | | || |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  23109365 tactacctccgtccctaattataggaccctattgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacaatttttttt 23109266  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | ||  ||  ||||    
T  23109265 acaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataaggacatatatgt 23109166  T
Q  496 aaagaaataattaatgta 513  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23109165 aaagaaataattaatgta 23109148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 23320908 - 23320702
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  23320908 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 23320809  T
Q  441 tgttatttattattgattg----aagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtctt 536  Q
    ||||||||||| |||||||    || |||||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  |||||    
T  23320808 tgttatttattgttgattgaaaaaaaaaaaagatgtataataaataaggacatgtatgtaaagaaataattgatgtagttggaaataacaaaggggtctt 23320709  T
Q  537 ataaaaa 543  Q
    |||||||    
T  23320708 ataaaaa 23320702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 334 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 28060978 - 28060769
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgt 432  Q
    ||||| || |||||||||| |  | ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  28060978 aaaatcatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagaaagagagttagtttatgt 28060879  T
Q  433 tttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaag 532  Q
    |||| | ||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |    
T  28060878 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtaggtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag-gg 28060780  T
Q  533 tcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||    
T  28060779 tcttataaaaa 28060769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 332 - 461
Target Start/End: Original strand, 32117998 - 32118127
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32117998 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttattacaattttatcctttaagagagagttggtttatg 32118097  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaa 461  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32118098 ttttcaacatgttatttattgttgattgaa 32118127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 342 - 553
Target Start/End: Original strand, 41002938 - 41003149
Alignment:
Q  342 aggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | |||||||||||| | |    
T  41002938 aggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagatagtttatgttttccata 41003037  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    || || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    |||||| |    
T  41003038 tgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatggatcttat-a 41003136  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  41003137 aaaagggacaaaa 41003149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 9036714 - 9036924
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  9036714 ggaattaagaaagtgtatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 9036813  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | ||||||||  | |||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||    
T  9036814 gctatttattgctaattgtagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaacaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aa 9036912  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  9036913 aaagggacaaaa 9036924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 298 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 41444501 - 41444253
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    |||||||||||| || |||||||| | || |||| |||||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  41444501 gtactacctccgtccctaattataagatccttttgaaaaaataacgggaattgagatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttt 41444402  T
Q  397 tacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    ||||| |||||  || || |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  || |  || ||||||||| |||||||| | ||| ||| |||    
T  41444401 tacaaatttattattcaagagagagtgttagtttatgttttcaacatgttatttattgctggtataataaaaagatgaataataaataagggcatgtatg 41444302  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  41444301 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 41444253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 345 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 25951083 - 25950872
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||| || |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||    
T  25951083 aattaagatagtggatatttgtattaacgttatttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgattagtttatgttttcaacatg 25950984  T
Q  443 ttatttattattgattgaag--aaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    |||||||||  | |||||||  ||||| |||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| || || ||| |||||  ||||||| |    
T  25950983 ttatttattgctaattgaagaaaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggatatagcaaaggggtcttat-a 25950885  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  25950884 aaaagggacaaaa 25950872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 365 - 542
Target Start/End: Original strand, 31802929 - 31803105
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaa 464  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||    
T  31802929 gtattaaatttgtttataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttagtttatgttttcaacataatatttattgtttattaaagaa 31803027  T
Q  465 aaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||||||||||||    
T  31803028 aaagatgcaaaataaataggggtatggaggtaaagaaataattaatataattggaaatagcaaagcagtcttataaaa 31803105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 426 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 17317609 - 17317483
Alignment:
Q  426 tttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataac 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17317609 tttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataac 17317510  T
Q  526 aaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  17317509 aaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 17317483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 334 - 541
Target Start/End: Original strand, 46266151 - 46266358
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta---aaagagagttggtttat 430  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||| ||||||    
T  46266151 aaaatcatgggaattaagatagtgaatatttgtattaaagatgtttgcaatcactattgtttttacaatttaatcctttatatatagagagttagtttat 46266250  T
Q  431 gttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaaga 530  Q
    |||||||||||| |||||||   |||||||||   |||| |||||||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||     
T  46266251 gttttcaacatgatatttatagctgattgaag---aagaagtataataaataggggcttgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaagg 46266347  T
Q  531 agtcttataaa 541  Q
     ||||||||||    
T  46266348 ggtcttataaa 46266358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 343 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 31581931 - 31581726
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||| || | | |||||||| |||||| ||||| | |     
T  31581931 ggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttataattttatctttaagagagagagttagtttatattttccatac 31581832  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataac-aaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||  |||||||||    
T  31581831 gttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggggtcttataa 31581732  T
Q  541 aaaagg 546  Q
    ||||||    
T  31581731 aaaagg 31581726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 361 - 543
Target Start/End: Original strand, 45778021 - 45778208
Alignment:
Q  361 atttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgatt 458  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| ||  || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  45778021 atttgtattaaagatgtttgtaatcactattatttttataattttatcttttaagagaaagaattagtttatgttttcaacatgctatttattgttgatt 45778120  T
Q  459 gaagaaaaagatgtataataaacag----gggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||  |||||||||||| |     ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  45778121 gaagaaaat-atgtataataaataaataagggtatgcaagtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaa 45778208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 9303902 - 9303688
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-----agagagttggtttatgttttca 437  Q
    |||||||||| | || |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |     |||||||| ||||||||||||     
T  9303902 ggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagagaaatagagagttagtttatgttttcc 9303803  T
Q  438 acatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtctta 537  Q
    | ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||  | ||||    
T  9303802 atatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgtaaatagcaaaggggactta 9303703  T
Q  538 taaaaaagggacaaaa 553  Q
    | ||||||||||||||    
T  9303702 t-aaaaagggacaaaa 9303688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 298 - 465
Target Start/End: Original strand, 27325907 - 27326076
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27325907 gtactacctccgtcactaattatagggcccttttgaaaaaataa-cggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatttctattgtttt 27326005  T
Q  397 tacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaa 465  Q
    || ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27326006 tataattttatcctttaagatagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaa 27326076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 30534917 - 30534748
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  30534917 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaa 30534819  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
     | |||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  30534818 taagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaaggagtcttata-aaaagggacaaa 30534748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 381 - 546
Target Start/End: Original strand, 19845490 - 19845658
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa---agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataat 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  19845490 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaat 19845589  T
Q  478 aaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    ||| | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  19845590 aaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaaagg 19845658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 415 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 26299494 - 26299357
Alignment:
Q  415 aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtac 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||     
T  26299494 aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtag 26299395  T
Q  515 ttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  26299394 ttagaaatagtaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 26299357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 334 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 9299362 - 9299139
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-----agagagttggttt 428  Q
    ||||| || |||||||| | | || |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |     |||||||| ||||    
T  9299362 aaaatcatgggaattaaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagagaaatagagagttagttt 9299263  T
Q  429 atgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    |||||||| | ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  9299262 atgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaa 9299163  T
Q  529 gaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||    
T  9299162 ggggacttat-aaaaagggacaaaa 9299139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 314 - 537
Target Start/End: Original strand, 17878131 - 17878346
Alignment:
Q  314 taattatagggtcattttaaaaa-ataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 412  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||||  |||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17878131 taattatagggttcttttgaaaatataacgggaattaagatggtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatccttt 17878230  T
Q  413 aaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaat 510  Q
    || |||||  |||||||||||||||||          ||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| | |||||||||    
T  17878231 aagagagagggttggtttatgttttca----------tattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata-gggcatgtatgtaaaaatataattaat 17878319  T
Q  511 gtacttagaaataacaaagaagtctta 537  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17878320 gtagttagaaataacaaagaggtctta 17878346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 34896110 - 34895899
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  34896110 ggaattaagaaaataaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 34896011  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaa-agatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    | ||||||||  | |||||||||||  ||||||||||||| | || |||| ||||| |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||| |    
T  34896010 gctatttattgctaattgaagaaaattgatgtataataaataaggatatgtatgtacagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagagatcttat-a 34895912  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  34895911 aaaagggacaaaa 34895899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 42887903 - 42888066
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  42887903 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataa 42888002  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||    
T  42888003 ataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggtaataccaaaggggtcttataaaaa 42888066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 359 - 538
Target Start/End: Original strand, 10538931 - 10539116
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgatt 458  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  10538931 atatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaattttatcctttaatagagagttagtttatgttttcaacatgctatttattgctgatt 10539030  T
Q  459 gaa------gaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttat 538  Q
    |||       ||||| ||||| |||||| | ||||||  | |||||||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||    
T  10539031 gaaaaaaagaaaaaaaatgtaaaataaataagggtatttaggtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttat 10539116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 386 - 528
Target Start/End: Original strand, 3796058 - 3796202
Alignment:
Q  386 actattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacag 483  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||| ||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  3796058 actattgtttttacaattttatcttttaaaagagagaattaatttatgtttttaacatattatttattgctgatggaagaaaaagatgtaaaataaatag 3796157  T
Q  484 gggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3796158 aggtatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaa 3796202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 381 - 553
Target Start/End: Original strand, 32964218 - 32964390
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  32964218 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataa 32964317  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    | | |||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  32964318 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaggactcttat-aaaaagggacaaaa 32964390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 382 - 552
Target Start/End: Original strand, 49044944 - 49045114
Alignment:
Q  382 aattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||     
T  49044944 aattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataat 49045043  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
     | ||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  49045044 taagggtatattggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaagaggtcttat-aaaaagggacaaa 49045114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 382 - 552
Target Start/End: Original strand, 32699530 - 32699698
Alignment:
Q  382 aattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaac 481  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| || ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||     
T  32699530 aattattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaat 32699628  T
Q  482 aggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  32699629 aagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaa 32699698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 344 - 510
Target Start/End: Original strand, 47534689 - 47534853
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgt 443  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| | ||||    
T  47534689 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattgttgtttttacaattttatcc-ttaagagagagttattttatgttttccatatgt 47534787  T
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaat 510  Q
    ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  47534788 tatttattgctaattgaagaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 47534853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 299 - 432
Target Start/End: Original strand, 33381358 - 33381494
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33381358 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 33381457  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgt 432  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  33381458 acaattttatcctttaagagagatggttggtttatgt 33381494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 417 - 553
Target Start/End: Original strand, 9233436 - 9233571
Alignment:
Q  417 gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtactt 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  | ||||| |||||||||||||| ||    
T  9233436 gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatatacgtaaataaataattaatgtagtt 9233535  T
Q  517 agaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
     |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  9233536 ggaaatagcaaatgagtcttat-aaaaagggacaaaa 9233571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 334 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 21587669 - 21587534
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatg 431  Q
    ||||| |||| |||||||| |||  |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||||||    
T  21587669 aaaatcatagaaattaagaaaattgatatttatattaaatttgtttgcaattactattgtttttacaattttattttttaaaagagagaatttgtttatg 21587570  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaa 467  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21587569 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa 21587534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 387 - 543
Target Start/End: Original strand, 24210979 - 24211134
Alignment:
Q  387 ctattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagggg 486  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||  ||||    
T  24210979 ctattgtttttacaattttatcttaaaaaagagagttagtttatattttcaacttgt-atttattgttgattaaaaaaaaagatgtataataaatcgggg 24211077  T
Q  487 tatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||| |  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||    
T  24211078 tatgtagataaagaaataattaatgtagtttaaaataacaaagagatcttataaaaa 24211134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 390 - 546
Target Start/End: Original strand, 46414835 - 46414994
Alignment:
Q  390 ttgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaa-agatgtataataaacagggg 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  46414835 ttgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctattttttgctgattgaagaaaaaagatgtataataaataggag 46414934  T
Q  487 tatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||  ||||||||||||||||    
T  46414935 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaaagg 46414994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 24504898 - 24504735
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||  ||| | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  24504898 taattactattgtttttacaattttatccttaagcgagagagttaatttctattttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataa 24504799  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||    
T  24504798 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaa 24504735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 359 - 543
Target Start/End: Original strand, 18751788 - 18751970
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgatt 458  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||| |||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||    
T  18751788 atatttgtattaaagttgtatttaatcactattatttttacaattttattctt-aagagatagttggtttatgttttccatatgctatttattgttaatt 18751886  T
Q  459 gaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| || ||  ||||||||||||    
T  18751887 gaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaa-aaataattaatgtagttgaaaatagcagagtggtcttataaaaa 18751970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 388 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 19293045 - 19292889
Alignment:
Q  388 tattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagggg 486  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | | ||| ||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| | |||    
T  19293045 tattgtttttacaattttattcttaagagagatagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaggg 19292946  T
Q  487 tatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  19292945 tatgttagtaaagaaataattaatgtacttagaaatactaaaggggtcttataaaaa 19292889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 40120994 - 40121244
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttta-aaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||| |||  ||| | ||| ||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  40120994 tactacctccgtctctaattatagggcccttttggaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtggtaataaatttgtttgtaattactattgtattt 40121093  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagt--tggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataa--taaacaggggtatgcat 493  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   | |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||       
T  40121094 acaattttatcctttaagagagagaaatagtttatgttttcaacatagtatttaatatcgattgaagaaaaagatatataaaataaataggggaatgtcg 40121193  T
Q  494 gtaaaga-aataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||| | |||||||||||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||    
T  40121194 gtaaaaataataattaatgtacttggaaatactaaaggggtcttataaaaa 40121244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 2345366 - 2345529
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  2345366 taattaatattgtttttacaattttatccttaagaaaaagaattaatttatgttttcaacataatatttattattgattgaagaaaaaggtgcaaaataa 2345465  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | |||||||  |||||| |||||||||||||| || |||||| ||||  |||||| ||||||    
T  2345466 ataagggtatgtttgtaaataaataattaatgtatttggaaatatcaaatgagtcttttaaaaa 2345529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 359 - 535
Target Start/End: Original strand, 2470876 - 2471054
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaag--agagttggtttatgttttcaacatgttatttattattga 456  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  | |    
T  2470876 atatttgtattaaatatatttataattactattgtttttataatattatcctttaagagtgagagttgatttctgttttcaacatgttacttattgctaa 2470975  T
Q  457 ttgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtct 535  Q
    || ||||||||||||||||||||| |  |||||  ||| |||||| ||||||||||| || |||||  |||||| ||||    
T  2470976 ttaaagaaaaagatgtataataaataaaggtatatatgaaaagaattaattaatgtagttggaaattgcaaagatgtct 2471054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 27813714 - 27813551
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  27813714 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgtaaaataa 27813615  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | ||||| |   ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||  ||||||||||||    
T  27813614 ataagggtaggttggtaaagaaataattaatatacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaa 27813551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 382 - 552
Target Start/End: Original strand, 44510168 - 44510337
Alignment:
Q  382 aattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||     
T  44510168 aattactattgtttt-acaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataag 44510266  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
     | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  44510267 taagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaa 44510337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 29629967 - 29629768
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttt----tcaa 438  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    || |    
T  29629967 ggaattaagaaagtgaatgtttgtattaaagttgtttgtaatcacaattgtttttgcaattttatcc-ttaaaagagagttgatttatgttttccatcca 29629869  T
Q  439 catgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttat 538  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||     |||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||   ||||||    
T  29629868 tatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggg----acatgtaaagaaataattattgtagttgaaaataacagagggatcttat 29629773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 365 - 553
Target Start/End: Original strand, 22991552 - 22991739
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaaga 463  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  22991552 gtattaaatttgtttataattactattgtttttaca-ttttatcctaaagagagagagttagtttatgttttcaacataatatttattgttgatcgaaga 22991650  T
Q  464 aaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||    |||||| ||||||||||||||    
T  22991651 aaaagatgcaaaataaataggggtatggtgataaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaatggatcttat-aaaaagggacaaaa 22991739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 9682815 - 9682645
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||   ||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  9682815 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaagaaaaa-atgtaaaataa 9682717  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||  |||||||| ||||||||||||    
T  9682716 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttata-aaaagggacaaa 9682645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 5524782 - 5524993
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta---aaagagagttggtttatgttttcaac 439  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   | ||||||||| ||||||||||| |     
T  5524782 ggaattaagaaagtgaatatttgcattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttgatttatgttttccat 5524881  T
Q  440 atgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttata 539  Q
    |||  |||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||   ||| ||  || ||||||||||||||||||| ||  |||||  |||  ||||||||     
T  5524882 atg-catttattgctgattaaagaaaaagatatataataaatgagggcatatatataaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaatgagtcttat- 5524979  T
Q  540 aaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||    
T  5524980 aaaaagggacaaaa 5524993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 381 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 35888524 - 35888378
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  35888524 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaa 35888426  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
     | |||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  35888425 taagggtatgttggtaaagaaataattaatgttcttggaaataccaaa 35888378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 45722221 - 45722058
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||    
T  45722221 taattaccattatttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaaaaaaagatgcaaaataa 45722122  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | |||| ||   |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||    
T  45722121 ataagggtgtgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaagagatcttataaaaa 45722058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 388 - 543
Target Start/End: Original strand, 3881371 - 3881527
Alignment:
Q  388 tattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagggg 486  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| | |||    
T  3881371 tattgtttttaaaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaataaaaagatgtaaaataaataaggg 3881470  T
Q  487 tatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||   ||||| |||||||  ||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||    
T  3881471 tatgttggtaaaaaaataatctatgtacttgaaaatatcaaaggagtcttataaaaa 3881527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 445 - 543
Target Start/End: Original strand, 31769220 - 31769318
Alignment:
Q  445 atttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  31769220 atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaa 31769318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 375 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 33342356 - 33342189
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtat 474  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||      
T  33342356 tgtttataattactattgtttttacaattaaatcatttaagagagagttagtttatattttcaacatagtatttattgttgattgaagaaaaatatgtga 33342257  T
Q  475 aataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||| |  | || |    |||||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||    
T  33342256 aataaataaagttacgttaataaagaaataattaatataattagaaataactaa-aaatcttataaaaa 33342189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 43934803 - 43934642
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| ||   ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||  || | |||||    
T  43934803 taattacaattgtttttacaattttatccttaagagagagggtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa--tgcaaaataa 43934706  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  43934705 ataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaagatgtcttataaaaa 43934642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 365 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 21135478 - 21135371
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaaga 463  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  21135478 gtattaaatttgtatgtaattaccattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 21135379  T
Q  464 aaaagatg 471  Q
    ||||||||    
T  21135378 aaaagatg 21135371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 3776043 - 3775874
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  | |||||    
T  3776043 taattactattgtttttacaatattatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatacaaaataa 3775944  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaata------attaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | ||||||    |||||||||||      ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  3775943 ataagggtatattggtaaagaaataaattatattaatgtacttgaaaataccaaagaggtcttataaaaa 3775874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 381 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 37915356 - 37915195
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||   ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  37915356 taattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataa 37915258  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    | | |||||||   |||||||||||||||||||||||  ||| | ||||  ||||||||||||    
T  37915257 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaacatcaaatgagtcttataaaa 37915195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 311 - 411
Target Start/End: Original strand, 12616162 - 12616263
Alignment:
Q  311 ccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcc 409  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12616162 ccttaattatagggcacttttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactaatgtttttacaaatttatcc 12616261  T
Q  410 tt 411  Q
    ||    
T  12616262 tt 12616263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 377 - 524
Target Start/End: Original strand, 20182099 - 20182245
Alignment:
Q  377 tttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataa 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| || || ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || || ||    
T  20182099 tttgtaattactattgtttttacaatcttatccttacagagagatttagtgtatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatatatagaa 20182198  T
Q  477 taaacaggggtatgcat-gtaaagaaataattaatgtacttagaaataa 524  Q
    |||| | ||||||  || |||||||| | ||||||||| || |||||||    
T  20182199 taaataagggtat--atggtaaagaattcattaatgtatttggaaataa 20182245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 381 - 521
Target Start/End: Original strand, 23802006 - 23802146
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||   ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  23802006 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataa 23802104  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaa 521  Q
    | | |||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23802105 atatgggtgtgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaa 23802146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 381 - 513
Target Start/End: Original strand, 33683007 - 33683140
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||    
T  33683007 taattaatattgcttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacctaatatttattgttgattgaagaaaatgatgcaaaataa 33683106  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  33683107 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgta 33683140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 33682925 - 33682757
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  33682925 taattactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagtaaatttatgttttcaatataat-tttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaa 33682829  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtactt-agaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
     | |||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  33682828 taagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaaacaccaaaggggtcttat-aaaaagggacaaa 33682757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 345 - 513
Target Start/End: Original strand, 49110813 - 49110983
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaga--gagttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| |||  ||| |  |||||||||| ||||||    
T  49110813 aattaagaaaattgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgattttacaattttatcacttaagagagtgagctattttatgtttttaacatg 49110912  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaaga-aataattaatgta 513  Q
    |||||||||    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| | ||||| | |||||||||||||    
T  49110913 ttatttattgccaattgaag-aaaagatgtataataaatagggatatgtaagtaaaaataataattaatgta 49110983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 425 - 543
Target Start/End: Original strand, 10071242 - 10071360
Alignment:
Q  425 gtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataa 524  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||     
T  10071242 gtttatattttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgaaaatag 10071341  T
Q  525 caaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||| | ||||||||||||    
T  10071342 caaataggtcttataaaaa 10071360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 343 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 20075099 - 20075005
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttc 436  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||    
T  20075099 ggaattaagaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttc 20075005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 419 - 504
Target Start/End: Original strand, 32811293 - 32811378
Alignment:
Q  419 gagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaata 504  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||   |||||||||||    
T  32811293 gagttggtttatgttttcaacatagtatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaata 32811378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 365 - 543
Target Start/End: Original strand, 12631620 - 12631803
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-----aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattg 459  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||||||| || |||| |||||||| |     ||||| |||| |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||    
T  12631620 gtattaaatttgtttatgattactattgttcttgcaatgttatccttaagagagaaagatagttagtttatattttcaacataatatttattgttgattg 12631719  T
Q  460 aagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| |||||   |||||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||   ||||||||||||    
T  12631720 aagaaaaagatgcaaaataaataggagtatggtggtaaagaaatgattaatgtaattgaaaataccaaattggtcttataaaaa 12631803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 375 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 28017164 - 28016994
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| |||  | ||||||||||| ||  |||||| | |||||||||||||||||| |    
T  28017164 tgtttgtaattgctattgtttttataattttatccgttaagaaagagggttaatgtatgttttcaatataatatttaatgttgattgaagaaaaagatat 28017065  T
Q  473 ataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | |||||| |||||| |     | ||||| ||||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||||    
T  28017064 aaaataaataggggtgtattgatcaagaattaattaatgtacttgaaaataccaaataaatcttataaaaa 28016994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 420 - 513
Target Start/End: Original strand, 3478814 - 3478907
Alignment:
Q  420 agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    |||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  3478814 agttagtttatgtttttaacatagtatttattgttgattgaataaaaagatataaaataaataggggtatgttagtaaagaaataattaatgta 3478907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 381 - 529
Target Start/End: Original strand, 46415118 - 46415266
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |   |||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||    
T  46415118 taattattattgtttttacaattttattcttaagggagagagttagtttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa-aaaaagatgcaaaataa 46415216  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    | | |||||||   |||||||||||||| | ||| || |||||| |||||    
T  46415217 ataagggtatgatggtaaagaaataattgaagtaattggaaataccaaag 46415266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Original strand, 8782033 - 8782207
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-----agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtata 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |     |||||||   |||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |    
T  8782033 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagagtaaatttaagttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaa 8782131  T
Q  476 ataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    ||||| |  ||||||   |||||||||||||||||||| || |||| | |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  8782132 ataaataaaggtatgttggtaaagaaataattaatgtatttggaaacaccaaaggggtcttat-aaaaagggacaaa 8782207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 299 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 46148728 - 46148485
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattt-taaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||  |||||||||| |||  ||| |  || ||||  ||||  |||||||||||| ||||    
T  46148728 tactacctccgtccctaattataaggtcttttataaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttgataattactattggtttt 46148629  T
Q  398 acaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg-t 495  Q
    |||||||||||||| | | | ||||||  ||||||||||||| ||   ||||| | || |||||||||||| ||  | |||||| ||||||||| ||| |    
T  46148628 acaattttatccttaagagatagagttaatttatgttttcaatatagaatttaatgttaattgaagaaaaatatacaaaataaataggggtatg-atgat 46148530  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
     || || ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  46148529 gaaaaattaattaatgcacttggaaataacaaaggggtcttataa 46148485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 19497506 - 19497291
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-----aaagagagttggttt 428  Q
    |||||||| |||||||||| |||   || | ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |     | ||| |||  ||||    
T  19497506 aaaataatgggaattaagaaaattggtagtagtattaaatttgtttataattcctattgtttttacaattttatccttaagagagagagaaagtcagttt 19497407  T
Q  429 atgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    |||||||||| ||  || ||||| |||||| ||| |||||||| | || ||| ||||||||    |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19497406 atgttttcaatatagtacttattgttgatttaagtaaaagatgcaaaacaaataggggtatcttagtaaagaaataattaatgtaattgaaaatatcaaa 19497307  T
Q  529 gaagtcttataaaaaa 544  Q
    |   ||||||||||||    
T  19497306 gggatcttataaaaaa 19497291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 460 - 543
Target Start/End: Original strand, 32643658 - 32643741
Alignment:
Q  460 aagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||    
T  32643658 aagaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaatatgtcttataaaaa 32643741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 543
Target Start/End: Original strand, 12616280 - 12616369
Alignment:
Q  454 tgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||   |||||||||||    
T  12616280 tgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaagggatcttataaaaa 12616369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 34693614 - 34693465
Alignment:
Q  382 aattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaa-gaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | | | ||||||| |||||||||| || ||  |||||||| |||||||||  ||||| ||| | |||||    
T  34693614 aattactattatttttacaattttatccttaagagatagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaacaaaaaaaatgcaaaataa 34693515  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    | | |||||||   ||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||    
T  34693514 ataagggtatgttggtaaagaaaaaattaatgtacttgaaaatatcaaag 34693465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 359 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 43008345 - 43008254
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttatt 451  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| || |||||    
T  43008345 atatttgtattaaagatatttgtaatcactactgtttttacaa-tttatactttaagagaaagttagtttaagttttcaacatgataattatt 43008254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 422
Target Start/End: Original strand, 34900780 - 34900842
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagt 422  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34900780 atatttgtattaaaattgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatcc-ttaaaagagagt 34900842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 426 - 529
Target Start/End: Original strand, 40299186 - 40299288
Alignment:
Q  426 tttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataac 525  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| | |||||||   ||||| |||||||||||||||||  ||||| |    
T  40299186 tttatgttttcaacataatatttattcttgattgaa-aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaaaaaataattaatgtacttgaaaatacc 40299284  T
Q  526 aaag 529  Q
    ||||    
T  40299285 aaag 40299288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 381 - 467
Target Start/End: Original strand, 47649001 - 47649088
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaa 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||    
T  47649001 taattactattgtttttacaattttattcttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa 47649088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 409
Target Start/End: Original strand, 10071851 - 10071917
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcc 409  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  10071851 ggaattaagaaaattgatatttgtattaaagttgtttgtaattattatggtttttacaattttatcc 10071917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 377 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 25530793 - 25530689
Alignment:
Q  377 tttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtat 474  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||| || |||||||| |||||  |||||| | |||||||||  ||||||| ||     
T  25530793 tttgtaattacaattgtttttataattttatcttttaagagagaatgttagtgtatgttttgaacatagtatttaatgttgattgaaataaaagatataa 25530694  T
Q  475 aataa 479  Q
    |||||    
T  25530693 aataa 25530689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 441
Target Start/End: Original strand, 31137220 - 31137288
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||    
T  31137220 tgtttgtaattgttatttcttttacaattttatcctttaagagagagggttggtgtatgttttcaacat 31137288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 492 - 553
Target Start/End: Original strand, 33381509 - 33381569
Alignment:
Q  492 atgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  33381509 atgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 33381569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 385 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 18312396 - 18312303
Alignment:
Q  385 tactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||| || || |||||||||||||   |||||| |  | ||||||||||||||| || ||||||    
T  18312396 tactattgtttttacaattttatcattt--aagagatttagtgtatgttttcaacacaatatttaatgctaattgaagaaaaagatataaaataaa 18312303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 496 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 20074987 - 20074940
Alignment:
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||    
T  20074987 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 20074940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 381 - 411
Target Start/End: Original strand, 6910638 - 6910668
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctt 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6910638 taattactattgtttttacaattttatcctt 6910668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 381 - 411
Target Start/End: Original strand, 32643627 - 32643657
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctt 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32643627 taattactattgtttttacaattttatcctt 32643657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 362 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 34037544 - 34037502
Alignment:
Q  362 tttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattt 404  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34037544 tttgtattaaagttgtttgtaattactcttgtttttacaattt 34037502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 513
Target Start/End: Original strand, 4700530 - 4700599
Alignment:
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    |||||||| ||||||||| ||| | ||||||| |||| || | ||| || ||||||||||||||||||||    
T  4700530 tatttattgttgattgaaaaaatatatgtatagtaaatagagttatacacgtaaagaaataattaatgta 4700599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 162; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 164510 - 164265
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  164510 tactacctccgtccctaattataggatcgttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 164411  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  164410 acaattttattctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 164311  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  164310 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaa 164265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 162; Significance: 6e-86; HSPs: 167)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7940748 - 7940503
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7940748 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 7940649  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||    
T  7940648 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaa 7940549  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||    
T  7940548 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 7940503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 302 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 32964425 - 32964174
Alignment:
Q  302 tacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttaca 400  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  32964425 tacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttaca 32964326  T
Q  401 attttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaaga 500  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||| |||||||||    
T  32964325 attttatcctttaagagagtgatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgcataattaatagggacatgtatgtaaaga 32964226  T
Q  501 aataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  32964225 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttata-aaaagggacaaaa 32964174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 13759188 - 13759442
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13759188 tactacctccgtccttaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatggtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 13759287  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  13759288 acagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 13759387  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    | |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13759388 aaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttat-aaaaagggacaaaa 13759442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 10511211 - 10511466
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10511211 tactacctccgtccctaattatagggccattttaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 10511310  T
Q  399 caattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||    
T  10511311 caattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagagcatgtatgta 10511410  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  10511411 aagaaataattaatgtagttgaaaataggaaatgagtcttat-aaaaagggacaaaa 10511466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 12744122 - 12743875
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12744122 tactacctctgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataatgagaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 12744023  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| ||||    
T  12744022 acaattttatcctttaaaagagagggttgttttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatagggacatgtatgt 12743923  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| | || |||||| ||||  |||||||||||||    
T  12743922 aaagaaataattaatgcagttggaaatagcaaacgagtcttataaaaa 12743875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Original strand, 43060184 - 43060406
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  43060184 aaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagggatggttta 43060283  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||     
T  43060284 tgttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaa 43060383  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
      ||||||| ||||||||||||||    
T  43060384 gggtcttat-aaaaagggacaaaa 43060406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 297 - 543
Target Start/End: Original strand, 20141998 - 20142245
Alignment:
Q  297 agtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttt 395  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20141998 agtactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 20142097  T
Q  396 ttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | || ||||| ||| ||||    
T  20142098 ttacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgt 20142197  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  20142198 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 20142245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 9020991 - 9020746
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||| |||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9020991 tactccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 9020892  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  9020891 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 9020792  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||    
T  9020791 agaaataattaatgtagatggaaatagcaaaggagtcttataaaaa 9020746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 314 - 553
Target Start/End: Original strand, 27873099 - 27873340
Alignment:
Q  314 taattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 412  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27873099 taattatagggtcattttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 27873198  T
Q  413 aaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaat 510  Q
    || ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27873199 aagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgcatgtaaagaaataattaat 27873298  T
Q  511 gtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||| || ||||||  |||   ||||||| ||||||||||||||    
T  27873299 gtagttggaaataggaaaagggtcttat-aaaaagggacaaaa 27873340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 34332516 - 34332259
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  |||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34332516 tactacctccgtccctaattataagaccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 34332417  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||| ||| ||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34332416 acaattatattcttgaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgt 34332317  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  34332316 aaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaaggggacaaaa 34332259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 20987954 - 20988199
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||   |||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20987954 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaatagcgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 20988053  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  20988054 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 20988153  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||| | ||||||||||||    
T  20988154 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaaggtcttataaaaa 20988199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 22527945 - 22527734
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||    
T  22527945 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaaca 22527846  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||     
T  22527845 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata- 22527747  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  22527746 aaaagggacaaaa 22527734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 23285301 - 23285077
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag----ttggtt 427  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||    
T  23285301 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagagttggtt 23285202  T
Q  428 tatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaa 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  23285201 tatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattattgtagttggaaataacaa 23285102  T
Q  528 agaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||    
T  23285101 aggggtcttata-aaaagggacaaaa 23285077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 14913945 - 14913691
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||| |||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14913945 tactccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 14913846  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  14913845 acaattttatcctttaagagatagatgatttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 14913746  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  14913745 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 14913691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 14649449 - 14649236
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagt--tggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  14649449 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagtgttggttta 14649350  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  14649349 tgttttcaacatgttatttattgctgattgaataaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaag 14649250  T
Q  530 aagtcttataaaaa 543  Q
      ||||||||||||    
T  14649249 gggtcttataaaaa 14649236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 1266202 - 1265991
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  1266202 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 1266103  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||     
T  1266102 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata- 1266004  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  1266003 aaaagggacaaaa 1265991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 10734305 - 10734516
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  10734305 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaaacactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 10734404  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  10734405 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 10734503  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  10734504 aaaagggacaaaa 10734516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 299 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 20186799 - 20186544
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||| |||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20186799 tacttcctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 20186700  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  20186699 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaataggggtatgtatgt 20186600  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  |||   ||||||| |||||||||||||    
T  20186599 aaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttat-aaaaagggacaaa 20186544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 4194976 - 4194724
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||   ||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  4194976 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaa--tgtttgtaattactattattttt 4194879  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  4194878 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacattttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 4194779  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||    
T  4194778 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtctta-caaaaagggacaaaa 4194724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 34889017 - 34889264
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34889017 tactacatccgtccttaattatagagtctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttttattaaatatgtttgtaattactattgttttt 34889116  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||| | ||| ||| ||||    
T  34889117 acaattttatcctttaaaagagagagttgatttatgtattcaacatgttatttattgctggttgaaaaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgt 34889216  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  34889217 aaagaaataattaatgtagttggaaataggaaagatgtcttataaaaa 34889264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 299 - 542
Target Start/End: Original strand, 4976028 - 4976275
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  4976028 tactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgctttt 4976127  T
Q  398 acaattttatccttta----aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcat 493  Q
    ||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || || ||| ||    
T  4976128 acaattttatcctttaagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaagatgtataataaatagaggcatgtat 4976226  T
Q  494 gtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||  ||||||||||    
T  4976227 gtaaagaaataattaatgtagctggaaatagcaaagagatcttataaaa 4976275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 21239396 - 21239150
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21239396 tactacctccgtctctaattataggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgcattaaatatgttcgtaattactattgttttta 21239297  T
Q  399 caattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21239296 caattttatcttttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttgtttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatgta 21239197  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  21239196 aagaagtaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 21239150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 314 - 541
Target Start/End: Original strand, 31507375 - 31507605
Alignment:
Q  314 taattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 412  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31507375 taattataaggtccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttt 31507474  T
Q  413 aaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaat 510  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  31507475 aatagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaat 31507574  T
Q  511 gtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    ||| || |||||| |||||| ||||||||||    
T  31507575 gtagttggaaatagcaaagaggtcttataaa 31507605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 31889146 - 31888944
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  31889146 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 31889047  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  31889046 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataa 31888947  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  31888946 aaa 31888944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 299 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 40643392 - 40643142
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattat-agggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||| | ||| |||||||||  |||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40643392 tactacctccgtccctaattatcagggccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 40643293  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  40643292 acaattttatcctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 40643193  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  40643192 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaagg 40643142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 299 - 541
Target Start/End: Original strand, 23285815 - 23286060
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt--aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| | ||||  |||||||||  |||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23285815 tactacctccgtctctaattatagggccctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttt 23285914  T
Q  397 tacaattttatcctttaaaagaga-gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||    
T  23285915 tacaattttatcctttaagagagatgattgtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgt 23286014  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||    
T  23286015 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagatgtcttataaa 23286060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 17674442 - 17674653
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  17674442 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 17674541  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||| |    
T  17674542 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttat-a 17674640  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  17674641 aaaagggacaaaa 17674653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 28041135 - 28041346
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  28041135 ggaattaagatagtggatatttgtattacagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 28041234  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  28041235 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 28041333  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  28041334 aaaagggacaaaa 28041346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Original strand, 28140693 - 28140906
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttat 430  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||    
T  28140693 aaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttaagagagagtgttggtttat 28140792  T
Q  431 gttttcaacatgttatttat-tattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  28140793 gttttcaacatgttatttatccgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaag 28140892  T
Q  530 aagtcttataaaaa 543  Q
      ||||||||||||    
T  28140893 gggtcttataaaaa 28140906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 32478391 - 32478180
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||| |||||||||    
T  32478391 ggaattaatataatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatattttcaaca 32478292  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||     
T  32478291 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata- 32478193  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  32478192 aaaagggacaaaa 32478180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 296 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 9065208 - 9064958
Alignment:
Q  296 tagtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtt 394  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| || | |||| |||||||||  |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9065208 tagtactatctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 9065109  T
Q  395 tttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgca 492  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |    
T  9065108 tttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgta 9065009  T
Q  493 tgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  ||||||||||||    
T  9065008 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 9064958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 296 - 543
Target Start/End: Original strand, 9268029 - 9268279
Alignment:
Q  296 tagtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtt 394  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9268029 tagtactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 9268128  T
Q  395 tttacaattttatccttt--aaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgca 492  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  9268129 tttacaattttatcctttaaaaaatagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgatcgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 9268228  T
Q  493 tgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  ||||||||||||    
T  9268229 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 9268279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 299 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 16441227 - 16440984
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||| |||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16441227 tactccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 16441128  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| || || || ||| ||||||    
T  16441127 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaaaatgtataattaatagaggcatgtatgtaa 16441028  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||    
T  16441027 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 16440984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 345 - 553
Target Start/End: Original strand, 42561135 - 42561344
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  42561135 aattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacatg 42561234  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||| |||    
T  42561235 ttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttat-aaa 42561333  T
Q  543 aagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||    
T  42561334 aagggacaaaa 42561344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 299 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 3028313 - 3028056
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || | ||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3028313 tactacctccgtcccttattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatttttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 3028214  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagt----tggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcat 493  Q
    |||||||||| |||||| ||||||     || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||    
T  3028213 acaattttattctttaagagagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataattaataggggcatgtat 3028114  T
Q  494 gtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  3028113 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttata-aaaagggacaaa 3028056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 4984900 - 4985111
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  4984900 ggaattaagatagtggatatttgtattatagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 4984999  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||| |    
T  4985000 tgttatttattattgattgaagaaaaagatctataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttat-a 4985098  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  4985099 aaaagggacaaaa 4985111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 6673012 - 6673223
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  6673012 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 6673111  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||| |    
T  6673112 tattatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagaggtcttat-a 6673210  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  6673211 aaaagggacaaaa 6673223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 15190599 - 15190810
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  15190599 ggaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttataatcactattgtttttacaattttatcatttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 15190698  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  15190699 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 15190797  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  15190798 aaaagggacaaaa 15190810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 34662457 - 34662246
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  34662457 ggaaataagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 34662358  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||     
T  34662357 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata- 34662259  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  34662258 aaaagggacaaaa 34662246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 332 - 528
Target Start/End: Original strand, 13703583 - 13703778
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  13703583 aaaaaatattaggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtatttacaattttattttttaaaagagagttggtttat- 13703681  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||    
T  13703682 ttttcaacatgttatttattgttgtttgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttaaaaatagcaaa 13703778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 22658032 - 22657810
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggttta 429  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||    
T  22658032 aaaaaattaaagaaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagaaagagggttggctta 22657933  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||    
T  22657932 tgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaag 22657833  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
       ||||||| |||||||||||||    
T  22657832 ggatcttata-aaaagggacaaaa 22657810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 296 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 7735136 - 7734876
Alignment:
Q  296 tagtactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa--taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgt 393  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || | |||| |||||  |||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7735136 tagtactacctccgtccctaattatatggcccttttgaaaaaagtaacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgt 7735037  T
Q  394 ttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgc 491  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  7735036 ttttacaattttatcctttaaaaaatagggttgggttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgt 7734937  T
Q  492 atgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  7734936 atgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataaaaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 7734876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 299 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 9264271 - 9264025
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9264271 tactacctccgtctttaattataaggtctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 9264172  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| || |    
T  9264171 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagagcatgtatat 9264072  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  |||  ||||||||||||    
T  9264071 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaa 9264025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 299 - 546
Target Start/End: Original strand, 40951782 - 40952032
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||||||||  | |||||||| | || |||| |||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40951782 tactacctccgttcctaattatacgatccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgttttt 40951881  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||| ||||||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||    
T  40951882 acaaatttatccttcaagagagagagttggtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgt 40951981  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40951982 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaaagg 40952032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 13862779 - 13862990
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  13862779 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 13862878  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |||| |    
T  13862879 tgttatttattgttgacagaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaaggagttttat-a 13862977  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  13862978 aaaagggacaaaa 13862990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 314 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 14619532 - 14619300
Alignment:
Q  314 taattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 412  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14619532 taattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatctttt 14619433  T
Q  413 aa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaat 510  Q
    ||  ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14619432 aagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 14619333  T
Q  511 gtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||| || ||||||  ||||  ||||||||||||    
T  14619332 gtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 14619300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 16153039 - 16153250
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||| |    
T  16153039 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaata 16153138  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||| |    
T  16153139 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttat-a 16153237  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  16153238 aaaagggacaaaa 16153250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 296 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 35547562 - 35547303
Alignment:
Q  296 tagtactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtt 394  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || | |||| ||||| |||  |||||||||||| || |||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||    
T  35547562 tagtactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaagtaacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatatttgtaattactattatt 35547463  T
Q  395 tttacaattttatcctttaaaa--gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgca 492  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  35547462 tttacaattttatcctttaagaatgagggttggcttatgttttcaacattttatttattgcttattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgta 35547363  T
Q  493 tgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||  ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35547362 tgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagaggtcttata-aaaagggacaaaa 35547303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 301 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 21750226 - 21750011
Alignment:
Q  301 ctacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttac 399  Q
    ||||||||| ||||||||||| | || |||||||||| |||  |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  21750226 ctacctccgtccttaattataagatccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtaaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttat 21750127  T
Q  400 aattttatccttt--aaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||    
T  21750126 aattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaa 21750027  T
Q  498 agaaataattaatgta 513  Q
    ||||||||| ||||||    
T  21750026 agaaataatcaatgta 21750011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 332 - 528
Target Start/End: Original strand, 38371747 - 38371943
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||| | |||||||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  38371747 aaaaaataatggaaattaagattgtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattaatattatttttacaattttattctttaatagagagatggtttatg 38371846  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  38371847 ttttcaacatgttatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 38371943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 41641352 - 41641137
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  41641352 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 41641253  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataat----taatgtacttagaaataacaaagaagtctt 536  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    ||||||| || ||||||||||||  |||||    
T  41641252 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaattaatgtagttggaaataacaaaggggtctt 41641153  T
Q  537 ataaaaaagggacaaaa 553  Q
    || ||||||||||||||    
T  41641152 at-aaaaagggacaaaa 41641137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 3686538 - 3686740
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |  ||| |||||| |||||||||    
T  3686538 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaataaggttagtttatattttcaaca 3686637  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||    
T  3686638 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataa 3686737  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  3686738 aaa 3686740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 345 - 553
Target Start/End: Original strand, 4753004 - 4753213
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||    
T  4753004 aattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatg 4753103  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||  || ||||||| | ||||||| |||    
T  4753104 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaattaacaaaaatgtcttat-aaa 4753202  T
Q  543 aagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||    
T  4753203 aagggacaaaa 4753213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 349 - 553
Target Start/End: Original strand, 8283898 - 8284103
Alignment:
Q  349 aagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttat 446  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||||||  |||    
T  8283898 aagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttagcttatgttttcaacattctat 8283997  T
Q  447 ttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  ||||||| |||||||    
T  8283998 ttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttat-aaaaagg 8284096  T
Q  547 gacaaaa 553  Q
    |||||||    
T  8284097 gacaaaa 8284103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 334 - 546
Target Start/End: Original strand, 15521717 - 15521931
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatg 431  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||    
T  15521717 aaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 15521816  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||      
T  15521817 ttttcaacatgttatttattgttgattgaaggaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 15521916  T
Q  532 gtcttataaaaaagg 546  Q
     ||||||||||||||    
T  15521917 atcttataaaaaagg 15521931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 299 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 20518139 - 20517925
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20518139 tactacctccgtccctaattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 20518040  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||||  |||| ||  ||||||    
T  20518039 ataattttatcctttaga-gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaagaatgtataataaatgggggcatatatgtaa 20517941  T
Q  498 agaaataattaatgta 513  Q
    ||||||||||||||||    
T  20517940 agaaataattaatgta 20517925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 345 - 553
Target Start/End: Original strand, 23092426 - 23092635
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||    
T  23092426 aattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgttgttacaattttatcctttaagagacataattggtttatgttttcaacatg 23092525  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| || |||| |||    
T  23092526 ttatttattgctgattgaagaaaaagttgtataaaaaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtattat-aaa 23092624  T
Q  543 aagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||    
T  23092625 aagggacaaaa 23092635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 299 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 14436100 - 14435883
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | |||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14436100 tactacctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 14436001  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |  |  ||||||||    
T  14436000 acaattttatcttttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtattataaataatgacatgcatgt 14435901  T
Q  496 aaagaaataattaatgta 513  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  14435900 aaaaaaataattaatgta 14435883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 39121429 - 39121685
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattataggg-tcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||| ||||||||   |||||||||||| || | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39121429 tactacctccgtccctaattataaggctcttttaaaaaaatagcgggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttataattactattgttttt 39121528  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  39121529 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattatatttattgctgatttaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 39121628  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  39121629 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttat-aaaaagggacaaaa 39121685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 24307925 - 24308136
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  24307925 ggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttttaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaaatagttgatttatgttttcaaca 24308024  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||   ||||||| |    
T  24308025 tgttatttattacttattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaacaattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttat-a 24308123  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  24308124 aaaagggacaaaa 24308136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 24365398 - 24365187
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  24365398 ggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttttaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaaatagttgatttatgttttcaaca 24365299  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||   ||||||||     
T  24365298 tgttatttattacttattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaacaattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttata- 24365200  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  24365199 aaaagggacaaaa 24365187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 299 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 39759185 - 39758957
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  39759185 tactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatgtttgtattaaatatgtttgtaattacaattgttttt 39759086  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||| ||||||||| || |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||    
T  39759085 acaaatttatccttcaagagagaaagttggtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgt 39758986  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataa 524  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||    
T  39758985 aaagaaataattaatgtagttggaaataa 39758957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 25600844 - 25601046
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  25600844 ggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 25600943  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||    
T  25600944 tattatttattgttgattgaataaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataaaaaaggggtcttataa 25601043  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  25601044 aaa 25601046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 297 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 35039296 - 35039039
Alignment:
Q  297 agtactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    ||||||||||||| |  |||||||| || | |||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35039296 agtactacctccgtcgctaattataaggcccttttaaaaaataacgcgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 35039197  T
Q  397 tacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    ||||| |||||| || |  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | ||  ||  |||    
T  35039196 tacaaatttatcattcaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataaggacatatatg 35039097  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||| |  |||||| ||||||||||||||    
T  35039096 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaatatcttat-aaaaagggacaaaa 35039039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 343 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 5528227 - 5528022
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||  |||  |||||||||||||||    
T  5528227 ggaattaaaatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactactgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttaatttatgttttcaaca 5528128  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||    
T  5528127 tgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataa 5528028  T
Q  541 aaaagg 546  Q
    ||||||    
T  5528027 aaaagg 5528022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 356 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 14571524 - 14571329
Alignment:
Q  356 tgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattg 455  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||    
T  14571524 tgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcacaattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttagtttatgttttgcatatgttattcattgttg 14571426  T
Q  456 attgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14571425 attgaagaaaaatatgtataataagtaggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaagtcttat-gaaaagggacaaaa 14571329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Original strand, 18615835 - 18616061
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag------ttgg 425  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||      ||||    
T  18615835 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattaattttacaattttatcctttaagagagagatagagttgg 18615934  T
Q  426 tttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataac 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||| ||||||||||||||||| |||| || |||||| |    
T  18615935 tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatatggacatgtatgtaaagaaataattattgtagtttgaaatagc 18616034  T
Q  526 aaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  18616035 aaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 18616061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 7951813 - 7951603
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  7951813 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 7951714  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |    
T  7951713 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata-a 7951615  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  7951614 aaagggacaaaa 7951603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 299 - 509
Target Start/End: Original strand, 8144459 - 8144672
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattataggg-tcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8144459 tactacctccgtccctaattataaggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 8144558  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||| |||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||    
T  8144559 acaattttatcctttaagaaagatggttggcttatgtttttaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataattaggggcatgtatgt 8144658  T
Q  496 aaagaaataattaa 509  Q
    ||||||||||||||    
T  8144659 aaagaaataattaa 8144672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 13661095 - 13660903
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgatt 458  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  |||||    
T  13661095 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgatt 13660997  T
Q  459 gaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  13660996 gaagaaaaagatgtataataaataggggtatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 13660903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 347 - 553
Target Start/End: Original strand, 19571726 - 19571933
Alignment:
Q  347 ttaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgtt 444  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  |    
T  19571726 ttaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaccattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattat 19571825  T
Q  445 atttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaa 544  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| || || ||||||  |||   ||||||| |||||    
T  19571826 atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtgtgtaaagaaataattaatatagttggaaatagtaaatgggtcttat-aaaaa 19571924  T
Q  545 gggacaaaa 553  Q
    |||||||||    
T  19571925 gggacaaaa 19571933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 344 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 39985023 - 39984820
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  39985023 gaattaagatagcggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacat 39984924  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa--acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttata 539  Q
      ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | || |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||  |||||||||    
T  39984923 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagagaggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttata 39984824  T
Q  540 aaaa 543  Q
    ||||    
T  39984823 aaaa 39984820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 343 - 542
Target Start/End: Original strand, 41383957 - 41384157
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  41383957 ggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttgtccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 41384056  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  41384057 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 41384156  T
Q  542 a 542  Q
    |    
T  41384157 a 41384157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 16127495 - 16127301
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  16127495 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 16127396  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16127395 tgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttata-aaaagggacaaaa 16127301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 344 - 552
Target Start/End: Original strand, 32617561 - 32617770
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||||    
T  32617561 gaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttgtcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacat 32617660  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
      ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||   ||||||| ||    
T  32617661 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtatattaaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttat-aa 32617759  T
Q  542 aaagggacaaa 552  Q
    |||||||||||    
T  32617760 aaagggacaaa 32617770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 41418606 - 41418352
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||  || | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  41418606 tactacctccgtccctaattatgaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgttttt 41418507  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||| ||||    
T  41418506 acaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaatattctatttattgttgattgaagaaaatgatgtataataaata--tgtatgtatgt 41418409  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||   ||||||| ||||||||||||||    
T  41418408 aaagaaataattaatgtatttagaaatagaaaaagggtcttat-aaaaagggacaaaa 41418352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 332 - 545
Target Start/End: Original strand, 15774836 - 15775051
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||    
T  15774836 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttgactta 15774935  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||||| |  ||||||| |||     
T  15774936 tgttttcaacattctatttattgttgattaaagaaaaagatgtacaataaataggggcatatatgtaaaaaaataattaatgtagtcggaaataaaaaat 15775035  T
Q  530 aagtcttataaaaaag 545  Q
     | | |||||||||||    
T  15775036 gaattttataaaaaag 15775051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 3497601 - 3497795
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  3497601 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatattatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 3497700  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  3497701 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 3497795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 9828629 - 9828435
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  9828629 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 9828530  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  9828529 tgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 9828435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 40004210 - 40004404
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  40004210 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 40004309  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  40004310 tgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 40004404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 359 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 40738646 - 40738459
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt-taaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  | ||    
T  40738646 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttatgagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctcat 40738547  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaag 545  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||  ||||||||||||||    
T  40738546 tgaagaaaaagatgtataataaatagaggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaaag 40738459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 332 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 11781018 - 11780862
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  11781018 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatgtgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagagttggctta 11780919  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagggg 486  Q
    | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11780918 tattttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtacaataaacagggg 11780862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 359 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 186334 - 186148
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  186334 atatttgtattaaatttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 186235  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaa 544  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||   |||||||||||||    
T  186234 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatgacaaaatggtcttataaaaaa 186148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 388 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 12806854 - 12806697
Alignment:
Q  388 tattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggg 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12806854 tattgtttttacaattttatcctttaaaagagagggttgttttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaataggg 12806755  T
Q  486 gtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| | || |||||| ||||  |||||||||||||    
T  12806754 gcatgtatgtaaagaaataattaatgcagttggaaatagcaaacgagtcttataaaaa 12806697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 296 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 17714869 - 17714645
Alignment:
Q  296 tagtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtt 394  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||   | |||| ||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  17714869 tagtattacctccgtccctaattatagaacctttttgaaaaaattatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttctgattactattgtt 17714770  T
Q  395 tttacaattttatcctttaaaagaga---gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattg---aagaaaaagatgtataataaacaggggta 488  Q
    || ||||||||||  ||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   || |||||||||||||||||| ||||| |    
T  17714769 ttgacaattttattttttaagagagagatgatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaaaaagatgtataataaataggggca 17714670  T
Q  489 tgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  17714669 tgtatgtaaagaaataattaatgta 17714645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 344 - 553
Target Start/End: Original strand, 3160312 - 3160522
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||  | |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||    
T  3160312 gaatcaagatagtgaatatttgtgttaaagttttttgtaaacactattgtttttacaaatttatcctttaagagagatggttagtttatgttttcaacat 3160411  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||||| | |||||| ||    
T  3160412 actatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaaaaattaatgtaattgaaaatagcaaaggaatcttat-aa 3160510  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  3160511 aaagggacaaaa 3160522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 359 - 546
Target Start/End: Original strand, 38161581 - 38161769
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38161581 atatttgtattaaagttgtttgcaatcaccgttgattttacaattttatcctttagagatagagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgat 38161680  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    |||||||||| ||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  38161681 tgaagaaaaaaatgtatagtaagtaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaaagg 38161769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 343 - 527
Target Start/End: Original strand, 17592586 - 17592771
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||| | |    
T  17592586 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatc-tttaagagagagaattagtttatgttttccata 17592684  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaa 527  Q
    || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17592685 tgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaa 17592771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 32147529 - 32147335
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaa-gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||||  | ||| || |||||  ||||    
T  32147529 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgcttttacaattttatccttaagagtgagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgat 32147430  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  32147429 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttata-aaaagggacaaaa 32147335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 41686938 - 41687099
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  41686938 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaa 41687036  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  41687037 taagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggagtcttataaaaa 41687099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 388 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 20987955 - 20987789
Alignment:
Q  388 tattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20987955 tattgtttttacaattttatcctttaagaaatagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 20987856  T
Q  486 gtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  20987855 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 20987789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 375 - 553
Target Start/End: Original strand, 22581552 - 22581730
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgta 473  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  ||||| || |||||||||||    
T  22581552 tgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagagagagagttcgtttatgttttccatatgttatttattgctgattcaaaaaaaagatgta 22581651  T
Q  474 taataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22581652 taataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagaaatcttat-aaaaagggacaaaa 22581730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 31158227 - 31158419
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgatt 458  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  | |||    
T  31158227 atatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttataattttatcctt-aagagagagttggtttatgttttccatatgctatttattgcttatt 31158325  T
Q  459 gaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  31158326 gaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtaattgaaaatagaaaagtggtcttat-aaaaagggacaaaa 31158419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 359 - 543
Target Start/End: Original strand, 14570691 - 14570874
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgatt 458  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||    
T  14570691 atatttgtattaaagttgtttataatcacaattattttaacaattttatcctt-aagagagagttagtttatgttttccatatgctattcattgttgatt 14570789  T
Q  459 gaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  14570790 gaagaaaaatatgtataataagtaggggcatatatgtaaagaaataattaatgtaattgaaaataacaaaggagtcttataaaaa 14570874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 25837222 - 25837059
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||    
T  25837222 taattactattgtttttacaattttatccttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaaaaaaagatgcaaaataa 25837123  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||||    
T  25837122 ataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaagggatcttataaaaa 25837059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 297 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 37034445 - 37034238
Alignment:
Q  297 agtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttt 395  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || | |||| |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||    
T  37034445 agtactacctccgtccctaattataaggaccttttgaaaaaataaccgaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtgtgtaa--actattgttt 37034348  T
Q  396 ttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcat 493  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| || || ||| ||    
T  37034347 ttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtat 37034248  T
Q  494 gtaaagaaat 503  Q
     |||||||||    
T  37034247 ttaaagaaat 37034238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 365 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 3629132 - 3628983
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaa 464  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3629132 gtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatgttatcctttaagctagagttagtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaagaa 3629033  T
Q  465 aaaga-tgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    ||| | | ||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3629032 aaaaattatataataaataagggtgtgcaagtaaagaaataattaatgta 3628983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 332 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 30183104 - 30182958
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagata-atgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggttt 428  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||    
T  30183104 aaaaaataacgggaattaagatagatga-tatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggctt 30183006  T
Q  429 atgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataat 477  Q
    |||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  30183005 atgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaa-atgtataat 30182958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 366 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 14789782 - 14789602
Alignment:
Q  366 tattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaa 464  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||  ||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||    
T  14789782 tattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagggttaatttatgttttctatatgctatttattgctgattgaagaa 14789683  T
Q  465 aaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaag 545  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||| || ||| ||||||||||||||    
T  14789682 aaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtaattgaaaatagcagagaggtcttataaaaaag 14789602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 298 - 451
Target Start/End: Original strand, 42030338 - 42030493
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||||||||| || || ||||| || | ||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42030338 gtactacctccgtccctagttataaggccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 42030437  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttatt 451  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||    
T  42030438 acaattttatcctttaagaaggagagttagcttatgttttcaacattctatttatt 42030493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 26605400 - 26605618
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa---------agagagttggtttatgtt 433  Q
    |||||||||| | || |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |         |||||||| |||||||||    
T  26605400 ggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagagagagagagagagagttagtttatgtt 26605499  T
Q  434 ttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagt 533  Q
    ||| | ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||    
T  26605500 ttccatatgttatttattgctgattcaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatatcaaaggggt 26605599  T
Q  534 cttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  26605600 cttat-aaaaagggacaaaa 26605618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 1303400 - 1303561
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||    
T  1303400 taattactattatttttacaattttatcctt-aagagagagttagtttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaagaaaacgatgcaaaataaa 1303498  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     | |||||||   |||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| |||||||||    
T  1303499 taagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaatactaaagaagttttataaaaa 1303561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 23286282 - 23286469
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||| ||||| | ||| || |       |||    
T  23286282 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatattttccatatgctact-------gat 23286374  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  23286375 tgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataaaaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 23286469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 381 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 24170348 - 24170175
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataata 478  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| || || ||||||  || |||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24170348 taatcactactgtttttacaattttatc-ttaaagagagagaattagtttatgttttctatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 24170250  T
Q  479 aacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa-gaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    || ||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||    
T  24170249 aataggagcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagatcttat-aaaaagggacaaaa 24170175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 365 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 5283277 - 5283099
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaaga 463  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  | ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  5283277 gtattaaatttgtatgtaattactattgtttttacaattttatccttaagaaagatagttaatctatgttttcaacatagtatttattgttgattgaaga 5283178  T
Q  464 aaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||| | |||||| | ||||| |   |||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  5283177 aaaagatgcaaaataaaaaagggta-gttggtaaagaaataattaatgtatttggaaatacaaaaaaagtcttataaaaa 5283099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 6328626 - 6328789
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  6328626 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataa 6328725  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||  |||||||||||    
T  6328726 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatatatttggaaatatcaaagagatcttataaaaa 6328789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 28414507 - 28414670
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  28414507 taattattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataa 28414606  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | |||||||   |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||  ||||||||||||    
T  28414607 ataagggtatgttggtaaagaaatgattaatttacttcgaaataccaaagtggtcttataaaaa 28414670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 16926666 - 16926506
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||    
T  16926666 taattactattgtttttacaattttatccttaagagaagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaa 16926567  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
     | ||||| |   ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||    
T  16926566 taagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaa 16926506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 299 - 426
Target Start/End: Original strand, 26889593 - 26889721
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||| |||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26889593 tactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 26889692  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggt 426  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26889693 acaattttatcctttaaaagagaattggt 26889721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 31657898 - 31657727
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||  || | |||||    
T  31657898 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaagtgcaaaataa 31657799  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  31657798 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttata-aaaagggacaaa 31657727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 359 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 33639527 - 33639343
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | |||| |||||||||||| | ||| ||||||||  ||||    
T  33639527 atatttatattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttaagagataaagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgat 33639428  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| | |||||||||||||| ||  |||||  |||  ||||||||||||    
T  33639427 tgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtagaaaaataattaatgtagttgaaaatagtaaatgagtcttataaaa 33639343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 416 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 39180639 - 39180504
Alignment:
Q  416 agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtact 515  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  39180639 agagagttaatttatgttttcaacatgttatttattgatgatttaagaaaaagatgtataataattagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 39180540  T
Q  516 tagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | ||||||||||| | || |||| |||||||||||||    
T  39180539 tggaaataacaaaaatgttttat-aaaaagggacaaa 39180504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 8950029 - 8949866
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||  ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||| | |||||    
T  8950029 taattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataa 8949930  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | ||||| |   ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  8949929 ataagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggagtcttataaaaa 8949866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 344 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 15675027 - 15674920
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgt 443  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15675027 gaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgcttttacaattttatcttttaagagagagttagtttatattttcaacatgt 15674928  T
Q  444 tatttatt 451  Q
    ||||||||    
T  15674927 tatttatt 15674920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 381 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 15559751 - 15559581
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-----agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtata 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |     ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  15559751 taattactattgtttttacaattttattcttaagagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaa 15559652  T
Q  476 ataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    ||||  | |||||||    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15559651 ataactaagggtatgttgataaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaagaggtcttataaaaaagg 15559581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Original strand, 16285013 - 16285184
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaga--gagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataata 478  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||  || ||  ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||| | ||||    
T  16285013 taattattattgtttttacaattttatcctt-aagagattgaattaatttatgttttcaacataatatttattgtttattgaagaaaaagatgcaaaata 16285111  T
Q  479 aacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    || | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  16285112 aataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaa 16285184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 384 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 11432527 - 11432353
Alignment:
Q  384 ttactattgtttttacaattttatcctttaaa-------agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataa 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |       ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  11432527 ttactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcagaa 11432428  T
Q  477 taaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    |||| | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||| ||||||||||||    
T  11432427 taaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaagggatcttata-aaaagggacaaa 11432353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 381 - 553
Target Start/End: Original strand, 35784743 - 35784912
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||  || | ||||||    
T  35784743 taattattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaaaaaaac-tgcaaaataaa 35784840  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
     | |||||||   |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35784841 taagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaacatcaaagaagtcttat-aaaaagggacaaaa 35784912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 345 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 12098811 - 12098642
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||| |||| |||||     
T  12098811 aattaagaaaattgatatttgtattaaagttgtttgta-tcacaattgtttttacaattttatcctttaagagagatagctagtttatatttttaacatt 12098713  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
     ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  12098712 ctatttattgctcattgaagaaaaagatgtttaataaagaggggtatgtaagtaaaaaaataattaatgta 12098642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 13236153 - 13235985
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  13236153 taattactattatttttacaattttatcctt-aagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaa 13236056  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
     |  ||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||||    
T  13236055 taatggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttagaaacatcaaaggggtcttata-aaaagggacaaa 13235985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 31642401 - 31642238
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||  ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||| | |||||    
T  31642401 taattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataa 31642302  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | ||||| |   ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||||||    
T  31642301 ataagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaa 31642238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 382 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 39971227 - 39971057
Alignment:
Q  382 aattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||     
T  39971227 aattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaagaaaaagatgcaaaataat 39971128  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
     | |||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||   ||||||| ||||||||||||    
T  39971127 taagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaagggatcttata-aaaagggacaaa 39971057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 381 - 546
Target Start/End: Original strand, 23259961 - 23260127
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | | | || |||  ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||    
T  23259961 taattaatattgtttttacaattttatccttaagagaaagtgttaatttatgttttcaacataatatttattgttggttgaagaaaaagatgcaaaataa 23260060  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    | | | ||||    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  23260061 ataagagtatattagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggaatcttataaaaaagg 23260127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 377 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 37206338 - 37206170
Alignment:
Q  377 tttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtat 474  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   ||| || ||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||||| || ||     
T  37206338 tttgtaattactattatttttacaattttatcctttaaaaaagcaggttagtgtatgttttcaacataatatttaatgctgattgaagaaaaatatataa 37206239  T
Q  475 aataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||| |  ||||| |||| |  |||||||||||    
T  37206238 aataaacaggggtatgtttgtaaagaatcaattaatgtacatgaaaatatcaaaaagttcttataaaaa 37206170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 24857769 - 24857599
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||   ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| || | |||||    
T  24857769 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaag-tgcaaaataa 24857671  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | ||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  24857670 ataagggtacgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacatcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaa 24857599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 433 - 553
Target Start/End: Original strand, 26674480 - 26674599
Alignment:
Q  433 tttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaag 532  Q
    |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||  ||    
T  26674480 tttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtctgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgag 26674579  T
Q  533 tcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  26674580 tcttat-aaaaagggacaaaa 26674599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 433 - 553
Target Start/End: Original strand, 26946086 - 26946205
Alignment:
Q  433 tttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaag 532  Q
    |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||  ||    
T  26946086 tttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtctgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgag 26946185  T
Q  533 tcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  26946186 tcttat-aaaaagggacaaaa 26946205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 375 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 37700314 - 37700144
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||   || || ||||||||||| ||  |||||| |  ||||||||||||| ||| |    
T  37700314 tgtttgtaatcaccattgtttttacaattttatcctttaagagagaaaattagtatatgttttcaatatagtatttaatgctgattgaagaaaatgatat 37700215  T
Q  473 ataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | |||||| |||| ||||   |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  37700214 aaaataaatagggatatgttggtaaagaattaattaatgtactcggaaatatcaaaggagtcttataaaaa 37700144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 21069851 - 21069680
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataata 478  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  ||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||    
T  21069851 taattactattatttttacaattttatcctt-aagagaggtagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaata 21069753  T
Q  479 aacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    || | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||||||    
T  21069752 aataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaatggtcttata-aaaagggacaaa 21069680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 39692477 - 39692638
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||| || ||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  39692477 taattattgttgtttttacaattttattctt-aagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaa 39692575  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     | |||||||   |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||    
T  39692576 taagggtatgttagtaaagaaataattgatgtacttaaaaatatcaaatgagtcatataaaaa 39692638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 345 - 490
Target Start/End: Original strand, 26076175 - 26076320
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||| |||  |||| |||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||     
T  26076175 aattaagaaaattgatatctgtattaaatttgtttctaattattattatttttacaattttattctttaagaaagagagttagtttgtgttttcaacata 26076274  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatg 490  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||    
T  26076275 ttatttattgctgattgaggaaaaag--gtataataaacaagggtatg 26076320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 422 - 543
Target Start/End: Original strand, 26894739 - 26894859
Alignment:
Q  422 ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaa 521  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  26894739 ttggtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaat-attaatgtagttggaaa 26894837  T
Q  522 taacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    || ||||   ||||||||||||    
T  26894838 tagcaaatgggtcttataaaaa 26894859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 449 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 13735794 - 13735700
Alignment:
Q  449 attattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaa 544  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  13735794 attattgattgaagaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaaa 13735700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 426 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 20187248 - 20187158
Alignment:
Q  426 tttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtactt 516  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  20187248 tttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcataataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtactt 20187158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 334 - 513
Target Start/End: Original strand, 9438866 - 9439049
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa---agagagttggtttat 430  Q
    ||||| |||| |||||||| | |  |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||   ||||| || |||| |    
T  9438866 aaaattatagaaattaagaaagttgatatttttattaaatttgtttgtaattattattgtttttacaatttttttcttttaagagagagaattagtttgt 9438965  T
Q  431 gttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaaga-tgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||| | ||||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||||||    
T  9438966 gttttcaacatgctatttattgctgatcaaagaaaaaaagtgtataataaatagggatatgtaggtaaaaaaataattaatgta 9439049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 359 - 512
Target Start/End: Original strand, 8100194 - 8100348
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattga 456  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||| || ||| |||||||||||||||||||||||  |||    
T  8100194 atatttgtattaaatttgtttgtaatccctattggttttacaattttatcatttaggataaagaattagtt-atgttttcaacatgttatttattgatga 8100292  T
Q  457 ttgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgt 512  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| | | ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  8100293 ttgaaaaaaaaaatgtatgataaataagagtatgtaagtaaagaagtaattaatgt 8100348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 377 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 30117333 - 30117164
Alignment:
Q  377 tttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtat 474  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||  || || ||||||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||| |||    
T  30117333 tttgtaattgctattgtttt-acaattttatattttaaaagataggattagtgtatgttttcaacatagtatttaatgttgatcgaagaaaaagatatat 30117235  T
Q  475 aa--taaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||  |||| || ||| ||   |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  30117234 aaaataaatagaggtttgttggtaaagaattaattaatgtacttacaaatatcaaaggagtcttataaaaa 30117164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 299 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 12807220 - 12807129
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattacta 389  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12807220 tactacctccgtccctaattatagagtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacta 12807129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 18251234 - 18251067
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctt-----taaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtata 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||      || |||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  18251234 taattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagagagttagtttatgttttcaatatagtatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaa 18251135  T
Q  476 ataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | ||| | ||||||    ||||| ||||||||||| || || |||||| |||||  ||||| ||||||    
T  18251134 agaaataagggtatcttggtaaaaaaataattaatttaattggaaataccaaaggggtcttttaaaaa 18251067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 471
Target Start/End: Original strand, 2328408 - 2328528
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgt 443  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||       |||    
T  2328408 gaatttagaaaatggatatttgcattaaagttgttagtaatcactattgattttacaattttatcctttaagagagagttaatttatgtt-------tgt 2328500  T
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatg 471  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2328501 tatttattattaattgaagaaaaagatg 2328528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 356 - 436
Target Start/End: Original strand, 13958649 - 13958730
Alignment:
Q  356 tgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttc 436  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||    
T  13958649 tgaatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaaaagagagagttagtttatattttc 13958730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 389 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 27834150 - 27834010
Alignment:
Q  389 attgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggt 487  Q
    |||||||||||||||||||| || | | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||   | ||    
T  27834150 attgtttttacaattttatcattaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgaaaaataaatgagagt 27834051  T
Q  488 atgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    |||   |||||||||||||||||| | || |||||| ||||    
T  27834050 atgttggtaaagaaataattaatgcatttggaaataccaaa 27834010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 377 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 16099448 - 16099279
Alignment:
Q  377 tttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattg---attgaagaaaaagatgta 473  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||  ||||||| | ||   |||||||||||  || ||    
T  16099448 tttgtaattgttattgtttttacaattttatcctttaagagagggttagtgtatgttttcaacatagtatttatcaatgctaattgaagaaaataatata 16099349  T
Q  474 taataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     |||||| |||||| ||   |||||||| |||||||| ||||| || ||| |||||   |||||||||||    
T  16099348 aaataaataggggtgtgttggtaaagaattaattaatctacttggagatatcaaagggatcttataaaaa 16099279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 332 - 470
Target Start/End: Original strand, 35495044 - 35495182
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||  ||| | ||| ||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |  | |||     
T  35495044 aaaaaataacaggaattaagaaaattgataatggtaataaatttatttgtaattactattgattttacaattttatcctttaagagaaaggtaatgtata 35495143  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagat 470  Q
    ||||||| ||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  35495144 ttttcaaaatagtatttaatgttgattgaagaaaaagat 35495182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 9727584 - 9727498
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaa 467  Q
    |||| |||||| |||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  9727584 taatcactattatttttataattatatcttttaagagagagttagtttatgtttttaacatgctatttattgttgattgaaaaaaaa 9727498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 381 - 467
Target Start/End: Original strand, 8356362 - 8356449
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaa 467  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    
T  8356362 taattactgttgtttttacaattttatacttaaaagatagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaaaaaaa 8356449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 26699537 - 26699368
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||   ||  | |||||||| |||||  |||||| | ||||||||||||||||||      
T  26699537 tgtttgtaattaatattgtttttataattttatgctttaagagagatgattattgtatgttttgaacatagtatttaatgttgattgaagaaaaagatag 26699438  T
Q  473 ataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | |||||| ||||||||     |||| || |||||||| ||||| |||||| ||||| ||| |||||||||    
T  26699437 aaaataaataggggtatattgataaataattaattaatatacttcgaaatatcaaag-agttttataaaaa 26699368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 26969270 - 26969101
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||   ||  | |||||||| |||||  |||||| | ||||||||||||||||||      
T  26969270 tgtttgtaattaatattgtttttataattttatgctttaagagagatgattattgtatgttttgaacatagtatttaatgttgattgaagaaaaagatag 26969171  T
Q  473 ataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | |||||| ||||||||     |||| || |||||||| ||||| |||||| ||||| ||| |||||||||    
T  26969170 aaaataaataggggtatattgataaataattaattaatatacttcgaaatatcaaag-agttttataaaaa 26969101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 4902951 - 4902849
Alignment:
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||        ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||| ||    
T  4902951 gttatttattgttgattcaagaaaaagatgtataataaataggg--------gtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttat-aa 4902861  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  4902860 aaagggacaaaa 4902849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 385 - 523
Target Start/End: Original strand, 16636825 - 16636967
Alignment:
Q  385 tactattgtttttacaatt---ttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| | | ||||||||  ||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  16636825 tactattgtttttacaattattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatgtattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaa 16636924  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
     | | |||||   |||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  16636925 taagagtatgttggtaatgaaataattaatgtacgtggaaata 16636967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 20988306 - 20988250
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattact 388  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20988306 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattact 20988250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 375 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 13335508 - 13335339
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||   ||  | |||| ||| |||||  |||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  13335508 tgtttgtaattaatattgcttttacaattttatcctttacgagagatgattattgtatgctttgaacatagtatttaatgctgattgaagaaaaagatat 13335409  T
Q  473 ataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | |||||| || ||||||   ||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||   ||||||||||||    
T  13335408 aaaataaatagcggtatgttggtaaa-aattaattaatatacttggaaataccaaatgggtcttataaaaa 13335339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 10561316 - 10561242
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagag 419  Q
    |||||||| |||  |||||| || ||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10561316 aattaagaaaattgatatttctaataaatttgtttgtaattattattgtttttataattttatccttaaaaagag 10561242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 452
Target Start/End: Original strand, 24875950 - 24876028
Alignment:
Q  375 tgtttgtaatt-actattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttatta 452  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  24875950 tgtttgtaattcattattgtttttacaattttattttttaaaagaaagttagtttatgttttaaacttagtatttatta 24876028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 432 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 35998671 - 35998613
Alignment:
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatg 490  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||    
T  35998671 ttttcaacataatatttattattgattgaagaaaaatatgtaaaataaataagggtatg 35998613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 359 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 39181956 - 39181902
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta 413  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39181956 atatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcattta 39181902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 10116803 - 10116631
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaa--gagagttggtttatg-ttttcaacatgttatttattattgattgaag-aaaaagat 470  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||   ||| |||||| |||  ||||||   |||||||||| ||||||||    
T  10116803 tgtttgtaataactattgtttttacaattttatcatttaagagggagggttggcgcatgtttttcagcatagtatttaaagttgattgaagaaaaaagat 10116704  T
Q  471 gtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     || |||||| |  ||||||   |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||  | |||||||||||    
T  10116703 ataaaataaataatggtatgatggtaaagaattaattaatgtatttggaaataccaaaagaatcttataaaaa 10116631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 359 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 4903018 - 4902966
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 411  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4903018 atatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatcctt 4902966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 366 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 7408926 - 7408878
Alignment:
Q  366 tattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 414  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7408926 tattaaatttgtttgtaattactattgtttatacaattttatcttttaa 7408878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 454 - 530
Target Start/End: Original strand, 7956578 - 7956654
Alignment:
Q  454 tgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaaga 530  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||   |||||||| |||||||| || || |||||| ||||||    
T  7956578 tgattgaagaaaaagatatacaataaataggggtatggtggtaaagaattaattaatatatttggaaatagcaaaga 7956654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 382 - 438
Target Start/End: Original strand, 9264756 - 9264811
Alignment:
Q  382 aattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaa 438  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9264756 aattattattgtttttacaattttat-ttttaagagagagttagtttatgttttcaa 9264811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 473 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 30182204 - 30182125
Alignment:
Q  473 ataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||   ||||||| ||||||||||||||    
T  30182204 ataataaatagggccatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttat-aaaaagggacaaaa 30182125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 7001516 - 7001445
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttatt 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||   ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  7001516 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatt 7001445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 414
Target Start/End: Original strand, 7956415 - 7956530
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    |||||| |||| || |||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||| ||| || | |  || ||||  ||||| ||||||| ||||||||||    
T  7956415 tactacatccgtccataattataggatccttttgaaaaataacaggaattaagaaaattaaaagtgataataaatttgtttttaattacaattgttttta 7956514  T
Q  399 caattttatcctttaa 414  Q
    ||| ||| || |||||    
T  7956515 caaatttgtcttttaa 7956530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 510
Target Start/End: Original strand, 21591812 - 21591878
Alignment:
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaat 510  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||   ||||| |||||||||||    
T  21591812 tatttattgttgattgaagaaaaatatgtaaaataaatatgggtatgttggtaaaaaaataattaat 21591878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 444 - 510
Target Start/End: Original strand, 21595929 - 21595995
Alignment:
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaat 510  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||   ||||| |||||||||||    
T  21595929 tatttattgttgattgaagaaaaatatgtaaaataaatatgggtatgttggtaaaaaaataattaat 21595995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 37330994 - 37331056
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 407  Q
    |||||||| |||  |||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37330994 aattaagaaaattgatatttgtcttaaatttgtttgtaattactgatgtttttacaattttat 37331056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 158; Significance: 1e-83; HSPs: 219)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 20621425 - 20621670
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20621425 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 20621524  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  20621525 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 20621624  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  20621625 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 20621670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 45513376 - 45513621
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  | |||| |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  45513376 tactacctccgtccttaattataggacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactatcgttttt 45513475  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  45513476 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 45513575  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  45513576 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 45513621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 10015530 - 10015775
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10015530 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 10015629  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  10015630 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacgtgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 10015729  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  10015730 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 10015775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 19897577 - 19897822
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19897577 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 19897676  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  19897677 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 19897776  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||    
T  19897777 agaaataattaaagtagttggaaatagtaaaggagtcttataaaaa 19897822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Original strand, 53361628 - 53361850
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagt--tggttta 429  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||    
T  53361628 aaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaggtggttta 53361727  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  53361728 tgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttagaaataacaaaa 53361827  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
     |||||||| ||||||||||||||    
T  53361828 gagtcttat-aaaaagggacaaaa 53361850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 8322221 - 8321967
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  8322221 tactacctccgtccttaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 8322122  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  8322121 acagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 8322022  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  8322021 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 8321967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 48910134 - 48909914
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  48910134 aaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttattatttaagagagagttggtttatg 48910035  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |     
T  48910034 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaagtag 48909935  T
Q  532 gtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  48909934 gtcttata-aaaagggacaaaa 48909914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 17753274 - 17753530
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17753274 tactatctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 17753373  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  17753374 acaattttatcctttaagagaaatggttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 17753473  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  17753474 aaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaagggtcttat-aaaaagggacaaaa 17753530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 19054594 - 19054850
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19054594 tactatctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 19054693  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  19054694 acaattttatcctttaagagaaatggttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 19054793  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  19054794 aaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaagggtcttat-aaaaagggacaaaa 19054850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 49383607 - 49383394
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  49383607 aaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagagttgattta 49383508  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  49383507 tgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattattgtagttggaaataacaaag 49383408  T
Q  530 aagtcttataaaaa 543  Q
      ||||||||||||    
T  49383407 gggtcttataaaaa 49383394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 31187054 - 31186809
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  31187054 tactatctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgttttt 31186955  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||    
T  31186954 acaattttatcctttaagagaaagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaa 31186855  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  31186854 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 31186809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 43158477 - 43158722
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt--aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  43158477 tactacctccgtccttaattataggg-catttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 43158575  T
Q  397 tacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||||    
T  43158576 tacaattttatcctttaagagagaaatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagggacatgtatgta 43158675  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    || |||||||||||||| || |||||| |||||   |||||||||||    
T  43158676 aaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaa 43158722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 299 - 552
Target Start/End: Original strand, 15996514 - 15996767
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15996514 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 15996613  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | || ||||| ||| ||||||    
T  15996614 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgtaa 15996713  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  15996714 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaa 15996767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 21459246 - 21459024
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggttta 429  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  21459246 aaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttgacaattttatcctttacgatatagagttggttta 21459147  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21459146 tgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag 21459047  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
      ||| ||| ||||||||||||||    
T  21459046 gtgtcctat-aaaaagggacaaaa 21459024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 43686799 - 43686552
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| || | |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43686799 tactacctccgtccctaattataaggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 43686700  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43686699 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgt 43686600  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||  ||| | ||||||||||||    
T  43686599 aaataaataattaatgtagttggaaatagaaaaaaggtcttataaaaa 43686552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 553
Target Start/End: Original strand, 50433126 - 50433384
Alignment:
Q  297 agtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttt 395  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50433126 agtactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 50433225  T
Q  396 ttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcat 493  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  50433226 ttacaattttatcctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 50433325  T
Q  494 gtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  | ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  50433326 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaataggggtcttat-aaaaagggacaaaa 50433384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 346 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 10221180 - 10220974
Alignment:
Q  346 attaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgtta 445  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  10221180 attaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgata 10221081  T
Q  446 tttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaag 545  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10221080 tttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatataaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttata-aaaag 10220982  T
Q  546 ggacaaaa 553  Q
    ||||||||    
T  10220981 ggacaaaa 10220974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 296 - 553
Target Start/End: Original strand, 28673032 - 28673289
Alignment:
Q  296 tagtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtt 394  Q
    |||||||||||||| || ||||||||    | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  28673032 tagtactacctccgtccctaattataaaacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactgttgtt 28673131  T
Q  395 tttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||    
T  28673132 tttacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctggttgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatg 28673231  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  28673232 taaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaagaggtcttat-aaaaagggacaaaa 28673289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 47067232 - 47066976
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47067232 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 47067133  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| | ||| ||| ||||    
T  47067132 acaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaatgatgaataataaataagggcatgtatgt 47067033  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  47067032 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttata-aaaagggacaaaa 47066976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 303 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 52044781 - 52044539
Alignment:
Q  303 acctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaa 401  Q
    ||||||| || |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  52044781 acctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaa 52044682  T
Q  402 ttttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaa 501  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||  ||||||||||    
T  52044681 ttttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagggacatatatgtaaagaa 52044582  T
Q  502 ataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaa 544  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||   |||||||||||||    
T  52044581 ataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaaa 52044539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 9499281 - 9499492
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  9499281 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagagagaaggttagtttatgttttcaaca 9499380  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  9499381 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 9499479  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  9499480 aaaagggacaaaa 9499492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 43868356 - 43868145
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  43868356 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 43868257  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||     
T  43868256 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttata- 43868158  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  43868157 aaaagggacaaaa 43868145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 43978456 - 43978211
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||| |||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  | |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  43978456 tactccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 43978357  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  43978356 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 43978257  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||    
T  43978256 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaataagtcttataaaaa 43978211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Original strand, 50726559 - 50726770
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||  |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  50726559 aaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaattggtttatg 50726658  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||      
T  50726659 ttttcaacatgatatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggg 50726758  T
Q  532 gtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||    
T  50726759 gtcttataaaaa 50726770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 50786289 - 50786078
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||  |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  50786289 aaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaattggtttatg 50786190  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||      
T  50786189 ttttcaacatgatatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggg 50786090  T
Q  532 gtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||    
T  50786089 gtcttataaaaa 50786078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 334 - 553
Target Start/End: Original strand, 7251057 - 7251277
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatg 431  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||    
T  7251057 aaaatcattggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 7251156  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |    
T  7251157 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatga 7251256  T
Q  532 gtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  7251257 gtcttat-aaaaagggacaaaa 7251277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 10656989 - 10656733
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| || | |||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10656989 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgtgaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 10656890  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  10656889 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 10656790  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  10656789 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 10656733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 332 - 546
Target Start/End: Original strand, 46049761 - 46049975
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  46049761 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaattggtttatg 46049860  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||       
T  46049861 ttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatacatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagg 46049960  T
Q  532 gtcttataaaaaagg 546  Q
    |||||||||||||||    
T  46049961 gtcttataaaaaagg 46049975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 53164461 - 53164205
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||| |||| || ||||||||  ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53164461 tactacatccgtccctaattataatgtccttttgaaaaaataatgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 53164362  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||    
T  53164361 acaattttatcctttaagaaagatggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgcataataaatagaggcatgtatgt 53164262  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53164261 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaagtcttat-aaaaagggacaaaa 53164205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 32467678 - 32467467
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| |||||| |||||||||    
T  32467678 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttacgaaagaaggttagtttatattttcaaca 32467579  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||     
T  32467578 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata- 32467480  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  32467479 aaaagggacaaaa 32467467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 49126982 - 49127193
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||||||    
T  49126982 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaagattagtttatgttttcaaca 49127081  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||| |    
T  49127082 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattattgtagttggaaataacaaaggagtcttat-a 49127180  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  49127181 aaaagggacaaaa 49127193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 52291168 - 52291413
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||||| || |||||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  52291168 tactaccttcgtccttaattatagggcccttttgaaaaaataaagggaattaagatagtggatttttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 52291267  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  52291268 acaattttattctttaagagagagataatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaataggggcatgtatgtaa 52291367  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||||    
T  52291368 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaa 52291413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 299 - 546
Target Start/End: Original strand, 17698773 - 17699021
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||  |||||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17698773 tactacctccatccttaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 17698872  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||  || ||||||    
T  17698873 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacacgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtttaattaataggggcgtgtatgtaa 17698972  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    | |||||||||||||| || |||||| |||||   ||||||||||||||    
T  17698973 aaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaaagg 17699021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 314 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 27688266 - 27688028
Alignment:
Q  314 taattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 412  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27688266 taattatatggtccttttgaaaaaataacgggaattaagacagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 27688167  T
Q  413 aaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgt 512  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || | ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27688166 aagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattactaattgaagaaaaatatgtataat-aataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 27688068  T
Q  513 acttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    | || |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  27688067 agttggaaatagcaaatgagtcttat-aaaaagggacaaaa 27688028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Original strand, 48887719 - 48887941
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagag--agttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  48887719 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaagtattattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggttta 48887818  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||    
T  48887819 tgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaacaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaag 48887918  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
     |||||||| ||||||||||||||    
T  48887919 cagtcttat-aaaaagggacaaaa 48887941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 31531195 - 31531397
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  31531195 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 31531294  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||    
T  31531295 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaatgtcttataa 31531394  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  31531395 aaa 31531397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 302 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 33212691 - 33212438
Alignment:
Q  302 tacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttaca 400  Q
    |||||||| || |||||||| | || |||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33212691 tacctccgtccctaattataagatccttttaaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 33212592  T
Q  401 attttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaa 498  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||    
T  33212591 attttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaa 33212492  T
Q  499 gaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||  | ||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33212491 gaaataattaatgtagatggaaatagaaaagaaatcttat-aaaaagggacaaaa 33212438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 298 - 553
Target Start/End: Original strand, 46845230 - 46845487
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    |||||||||||| || |||||||| || | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46845230 gtactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 46845329  T
Q  397 tacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  46845330 tacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattatatctattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 46845429  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  46845430 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 46845487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 345 - 543
Target Start/End: Original strand, 12050181 - 12050379
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgtt 444  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  12050181 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttgagagagaattggtttatgttttcaacatgat 12050280  T
Q  445 atttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||    
T  12050281 atttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaa 12050379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 342 - 553
Target Start/End: Original strand, 32962888 - 32963099
Alignment:
Q  342 aggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaac 439  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||||    
T  32962888 aggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt-acaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaac 32962986  T
Q  440 atgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttata 539  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||     
T  32962987 atgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttgcaaataacaaaggggtcttat- 32963085  T
Q  540 aaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||    
T  32963086 aaaaagggacaaaa 32963099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 297 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 48214050 - 48213800
Alignment:
Q  297 agtactacctccgcccttaattataggg-tcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttt 395  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||    
T  48214050 agtactacctccgtccctaattatagggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattattt 48213951  T
Q  396 ttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || | ||| ||  ||||    
T  48213950 ttacaagtttatcctttaagagagaaatggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataattaatatgggcatatatgt 48213851  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||| |||||||||||    
T  48213850 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcctataaaaaagg 48213800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 7181603 - 7181392
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  7181603 ggaattaagataggggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 7181504  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||     
T  7181503 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata- 7181405  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  7181404 aaaagggacaaaa 7181392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 299 - 528
Target Start/End: Original strand, 13809548 - 13809780
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || |||| |||||||||  |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13809548 tactacctccatccttaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgttttt 13809647  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||| ||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13809648 acaattttattcttcaagagagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgt 13809747  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  13809748 aaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 13809780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 22103713 - 22103924
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  22103713 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 22103812  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  22103813 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 22103911  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  22103912 aaaagggacaaaa 22103924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 23700569 - 23700780
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  23700569 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 23700668  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  23700669 tgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 23700767  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  23700768 aaaagggacaaaa 23700780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 23719024 - 23719235
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  23719024 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 23719123  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  23719124 tgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 23719222  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  23719223 aaaagggacaaaa 23719235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 23737480 - 23737691
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  23737480 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 23737579  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  23737580 tgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 23737678  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  23737679 aaaagggacaaaa 23737691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 26221541 - 26221330
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  26221541 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 26221442  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||     
T  26221441 tgttatttattgttgattgaagagaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttata- 26221343  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  26221342 aaaagggacaaaa 26221330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 45253026 - 45252815
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  45253026 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 45252927  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||     
T  45252926 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttata- 45252828  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  45252827 aaaagggacaaaa 45252815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 46703280 - 46703069
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || | |||| ||||||||||||||||    
T  46703280 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaaagttagtttatgttttcaaca 46703181  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||     
T  46703180 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttagaaataacaaaggggtcttata- 46703082  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  46703081 aaaagggacaaaa 46703069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 52673440 - 52673229
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  52673440 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 52673341  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||   ||||||||     
T  52673340 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaggtggaaataacaaatgggtcttata- 52673242  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  52673241 aaaagggacaaaa 52673229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 54782701 - 54782912
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |  ||| ||||||||||||||||    
T  54782701 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaaggttagtttatgttttcaaca 54782800  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  54782801 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 54782899  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  54782900 aaaagggacaaaa 54782912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 314 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 2993540 - 2993301
Alignment:
Q  314 taattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 412  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||  |||| |||| || |  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2993540 taattatatggtccttttaaaaaaataacgggaactaaggtagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttt 2993441  T
Q  413 aaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgt 512  Q
    || |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2993440 aagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 2993341  T
Q  513 acttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    | ||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  2993340 aattgaaaataacaaatgagtcttata-aaaagggacaaaa 2993301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 299 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 32978777 - 32978530
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||| |||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32978777 tactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 32978678  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| || ||||  || ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32978677 acaattttatcctttaagagagaattgatttatgttttcaatatgatatttattgttgattaaaaaaaattatatataataaataggggcatgcatgtaa 32978578  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  32978577 agaaataattaatgtagttggaaataacaaag-ggtcttataaaaaagg 32978530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 359 - 543
Target Start/End: Original strand, 45323889 - 45324073
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgatt 458  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  45323889 atatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatattatttattgttgatt 45323988  T
Q  459 gaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  45323989 gaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 45324073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 1641884 - 1642094
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga-gttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||||    
T  1641884 ggaattaagatagtagatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaatgttagtttatgttttcaacat 1641983  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||    
T  1641984 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagaagtcttat-aa 1642082  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  1642083 aaagggacaaaa 1642094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 7051504 - 7051715
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  7051504 ggaattaagatagtgggtatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 7051603  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||| |    
T  7051604 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttat-a 7051702  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  7051703 aaaagggacaaaa 7051715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 21756739 - 21756528
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||| |||||||||    
T  21756739 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaaca 21756640  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||     
T  21756639 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataataaagaggtcttata- 21756541  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  21756540 aaaagggacaaaa 21756528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 35165747 - 35165957
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  35165747 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtagtcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 35165846  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  35165847 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag-ggtcttat-a 35165944  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  35165945 aaaagggacaaaa 35165957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 35711537 - 35711317
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||    
T  35711537 aaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaattcatttgtg 35711438  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||      
T  35711437 ttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggg 35711338  T
Q  532 gtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  35711337 atcttata-aaaagggacaaaa 35711317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 299 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 38071494 - 38071243
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttta--aaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    |||||||||||  | |||||||||| || |||||  ||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  38071494 tactacctccgttcctaattataggatccttttagaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttt 38071395  T
Q  397 tacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||    
T  38071394 tacaattttatcttttaagagagaggattggtttatgctttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatg 38071295  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  38071294 taaagaaataattaatatagttagaaatagcaaatgagtcttataaaaaagg 38071243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 43701431 - 43701220
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||| |||||||||    
T  43701431 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaaca 43701332  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||     
T  43701331 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtacaataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttata- 43701233  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  43701232 aaaagggacaaaa 43701220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 45048806 - 45049017
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||| |||||||||    
T  45048806 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaaca 45048905  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |    
T  45048906 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttat-a 45049004  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  45049005 aaaagggacaaaa 45049017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 46878223 - 46878434
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||| |||||||||    
T  46878223 ggaattaagataaaggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaaca 46878322  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||| |    
T  46878323 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttat-a 46878421  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  46878422 aaaagggacaaaa 46878434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 304 - 553
Target Start/End: Original strand, 50517266 - 50517517
Alignment:
Q  304 cctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaat 402  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50517266 cctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaat 50517365  T
Q  403 tttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaaga 500  Q
    ||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||    
T  50517366 tttatcctttaagggggagggttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataaggacatgtatgtaaaga 50517465  T
Q  501 aataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| |||||| || |||| ||||||||||||||    
T  50517466 aataattaatgtagttgaaaatagcaaagaggtattat-aaaaagggacaaaa 50517517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 314 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 51489649 - 51489410
Alignment:
Q  314 taattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta 413  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51489649 taattatagggccttttgaaaaaataatgggaattaagataggggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta 51489550  T
Q  414 aaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatg 511  Q
    | |||||  | | |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |   | ||| ||||||||||||||||||||    
T  51489549 agagagagggatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgatggaagaaaaagatgtataataaataaatgcatgtatgtaaagaaataattaatg 51489450  T
Q  512 tacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    || ||  ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  51489449 tagttgaaaatagcaaacaagtcttat-aaaaagggacaaa 51489410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 1450506 - 1450284
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||    
T  1450506 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttagcctttaagaaagagggttggctta 1450407  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||    
T  1450406 tgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaag 1450307  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
      |||||||| |||||||||||||    
T  1450306 gggtcttata-aaaagggacaaaa 1450284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 25148708 - 25148501
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||||||    
T  25148708 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaaattagtttatgttttcaaca 25148609  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  25148608 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg----gcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 25148514  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  25148513 aaaagggacaaaa 25148501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 299 - 522
Target Start/End: Original strand, 12906151 - 12906377
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12906151 tactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtagttactattgttttt 12906250  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  12906251 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 12906350  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaat 522  Q
    |||||||||||||||||| || |||||    
T  12906351 aaagaaataattaatgtagttggaaat 12906377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 23776236 - 23776490
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||||| || || ||||||||||| | |||| |||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23776236 tactaccttcgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 23776335  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||    
T  23776336 acaattttattctttaatagagagggttggattatgttttcaac--gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgt 23776433  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  23776434 aaagaaacaattaatgtagttgtaaataacaaaggagtcttat-aacaagggacaaaa 23776490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 45746031 - 45745829
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||| |    
T  45746031 ggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaata 45745932  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  45745931 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataa 45745832  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  45745831 aaa 45745829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 343 - 542
Target Start/End: Original strand, 54604372 - 54604573
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||| ||||||||||||||||    
T  54604372 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaatgaatgttagtttatgttttcaaca 54604471  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||    
T  54604472 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatggatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataa 54604571  T
Q  541 aa 542  Q
    ||    
T  54604572 aa 54604573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 25148906 - 25149117
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||| |||||||||    
T  25148906 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgcaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaaca 25149005  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||| |    
T  25149006 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttat-a 25149104  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  25149105 aaaagggacaaaa 25149117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 30040801 - 30041012
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  30040801 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 30040900  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||   ||||||| |    
T  30040901 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgaaaataacaaaatggtcttat-a 30040999  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  30041000 aaaagggacaaaa 30041012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 54107606 - 54107395
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  54107606 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 54107507  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||  ||||||||     
T  54107506 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataataaaggggtcttata- 54107408  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  54107407 aaaagggacaaaa 54107395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 332 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 6784726 - 6784543
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  6784726 aaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtgttaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagagttggctta 6784627  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6784626 tgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 6784543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 20656094 - 20656296
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  20656094 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaataactattgcttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 20656193  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  20656194 tgttatttatcgttgattgaagaaaaagatgtataataaattggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataa 20656293  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  20656294 aaa 20656296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 349 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 46861867 - 46861662
Alignment:
Q  349 aagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttat 446  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  46861867 aagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttattatttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttat 46861768  T
Q  447 ttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  46861767 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttata-aaaagg 46861669  T
Q  547 gacaaaa 553  Q
    |||||||    
T  46861668 gacaaaa 46861662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 26593549 - 26593760
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  26593549 ggaattaagataatagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 26593648  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||| |    
T  26593649 tgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagagtcttat-a 26593747  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  26593748 aaaagggacaaaa 26593760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 8547168 - 8546946
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggttta 429  Q
    |||||||||  | |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  8547168 aaaaaataacggaaattaagatagtgcgtatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttgacaattttatcctttaagagagagagttggttta 8547069  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  8547068 tgttttcaacctgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtatagtaaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaat 8546969  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
      |||||||| |||||||||||||    
T  8546968 gggtcttata-aaaagggacaaaa 8546946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 14759132 - 14758880
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||||||||  | |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14759132 tactacctccgttcataattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 14759033  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||| || || || |   ||||||    
T  14759032 acaattttatcttttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtataattaatagaggca--aatgtaa 14758935  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  14758934 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttat-aaaaagggacaaaa 14758880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 343 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 44544034 - 44543823
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  44544034 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttcgtttatgttttccatat 44543935  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |    
T  44543934 gttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata-a 44543836  T
Q  542 aaagggacaaaag 554  Q
    |||||||||||||    
T  44543835 aaagggacaaaag 44543823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 344 - 553
Target Start/End: Original strand, 53686782 - 53686992
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  53686782 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacat 53686881  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
      ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||  |||||||| ||    
T  53686882 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgcataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttat-aa 53686980  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  53686981 aaagggacaaaa 53686992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 36005756 - 36005554
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||| | |    
T  36005756 ggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagagagagagttagtttatgttttccata 36005657  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  36005656 tgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataa 36005557  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  36005556 aaa 36005554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 343 - 552
Target Start/End: Original strand, 9780024 - 9780233
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  9780024 ggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattattattgtttttacaatattatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 9780123  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||    
T  9780124 gctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttat-aa 9780222  T
Q  542 aaagggacaaa 552  Q
    |||||||||||    
T  9780223 aaagggacaaa 9780233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 346 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 32569247 - 32569039
Alignment:
Q  346 attaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgt 443  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||| | |||  ||| |||||||||||||||||||    
T  32569247 attaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattatttttacaattttatcatttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgt 32569148  T
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||    
T  32569147 tatttattgtcgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttata-aaa 32569049  T
Q  544 agggacaaaa 553  Q
    ||||||||||    
T  32569048 agggacaaaa 32569039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 42390643 - 42390899
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42390643 tactacctccgtccctaattataggatcattttgaaaaaataacgagaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 42390742  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
     |||||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||    
T  42390743 gcaattttatcatttaagagagagagttagtttatgttttcaacatgtaatttattgcaaattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgt 42390842  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||| |||||||||||| | || || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42390843 aaataaataattaatgcagttggagataacaaagatgtcttat-aaaaagggacaaaa 42390899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 42801521 - 42801777
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  | |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42801521 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 42801620  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    | ||||||||||||||  |||||| ||| | |||| ||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  42801621 ataattttatcctttaagaaagagggttagcttatattttcaatattctatttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 42801720  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  |||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  42801721 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagttttat-aaaaagggacaaaa 42801777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 35867867 - 35868078
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    ||||||||||||  | |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  35867867 ggaattaagatagggcatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 35867966  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||| |    
T  35867967 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtgtgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttat-a 35868065  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  35868066 aaaagggacaaaa 35868078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 299 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 40919252 - 40919025
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||| |||| || |||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40919252 tactacatccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 40919153  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||   |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  40919152 acaattttatcctttaagaaagagggttatcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgt 40919053  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  40919052 aaaaaaataattaatgtagttggaaata 40919025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 332 - 513
Target Start/End: Original strand, 43557226 - 43557409
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||  |||||||||    
T  43557226 aaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttattatttaagagagaaggttggttta 43557325  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||| |||||||||    
T  43557326 tgttttcaacatgttatttattggtaattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaatgattaatgta 43557409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 4024288 - 4024094
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | |||||| |||||  ||||    
T  4024288 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgat 4024189  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  4024188 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 4024094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 16435038 - 16435232
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  16435038 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgat 16435137  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  16435138 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 16435232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 302 - 553
Target Start/End: Original strand, 35572200 - 35572450
Alignment:
Q  302 tacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttaca 400  Q
    |||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  35572200 tacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataaagggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttataattactattgattttaca 35572299  T
Q  401 attttatccttta----aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||    
T  35572300 attttatcctttaagggagagagagttggtttatgttttcaacatgtcatttactgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagg-----ttatgta 35572394  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  35572395 aagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttat-aaaaagggacaaaa 35572450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 299 - 541
Target Start/End: Original strand, 41992279 - 41992509
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  41992279 tactacctccgtccctaattataaggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 41992378  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    |||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||    
T  41992379 acaattttatcct-------------ggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatatatgtaa 41992465  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||    
T  41992466 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaa 41992509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 299 - 513
Target Start/End: Original strand, 1084693 - 1084910
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||| || |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1084693 tactacctccgtccctaactatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttttattaaatatctttgtaattactattgttttt 1084792  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagt--tggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||   | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||    
T  1084793 acaattttaccctttaagagagagagatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgt 1084892  T
Q  496 aaagaaataattaatgta 513  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1084893 aaagaaataattaatgta 1084910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 297 - 523
Target Start/End: Original strand, 4759086 - 4759317
Alignment:
Q  297 agtactacctccgcccttaattatagggtcatttt--aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtt 394  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |  | ||||  |||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4759086 agtactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaaataacgcgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 4759185  T
Q  395 tttacaattttatcctttaaaagagag---ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgc 491  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||   |||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  4759186 tttacaattttatcctttaagaaagagggtttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgt 4759285  T
Q  492 atgtaaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  4759286 atgtaaaaaaataattaatgtagttggaaata 4759317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 386 - 543
Target Start/End: Original strand, 12683009 - 12683168
Alignment:
Q  386 actattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacag 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12683009 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatag 12683108  T
Q  484 gggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||    
T  12683109 gggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 12683168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 33361501 - 33361688
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattga 456  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  33361501 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctga 33361600  T
Q  457 ttgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||        |||||||||||||||||||| || |||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  33361601 ttgaagaaaaagatgtataataagtaggg--------gtaaagaaataattaatgtagttggaaaaagcaaagaggtcttat-aaaaagggacaaaa 33361688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 17591330 - 17591540
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  17591330 ggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatctttaagatagagagttagtttatgttttccatat 17591429  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||    
T  17591430 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aa 17591528  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  17591529 aaagggacaaaa 17591540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 50647729 - 50647939
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  50647729 ggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 50647828  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||    
T  50647829 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aa 50647927  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  50647928 aaagggacaaaa 50647939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 52059030 - 52059240
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  52059030 ggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtttgtttatgttttccatat 52059129  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||    
T  52059130 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaagtaattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aa 52059228  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  52059229 aaagggacaaaa 52059240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 37728965 - 37728764
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  37728965 ggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtatttacaattttatctttaagagagagagttagtttatgttttccatat 37728866  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  37728865 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 37728766  T
Q  542 aa 543  Q
    ||    
T  37728765 aa 37728764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 296 - 553
Target Start/End: Original strand, 46862102 - 46862361
Alignment:
Q  296 tagtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtt 394  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |  | |||| |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  46862102 tagtactaccttcgtccctaattataagacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattattactgtt 46862201  T
Q  395 tttacaattttatcctttaaaa--gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgca 492  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||| ||||  |||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |    
T  46862202 tttacaattttatcctttaagaaggagggttgacttatgttttcaatattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgta 46862301  T
Q  493 tgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  46862302 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataaaaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 46862361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 302 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 50730621 - 50730367
Alignment:
Q  302 tacctccgcccttaattatagggtcatttt--aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttac 399  Q
    ||||||||  |||||||||| | || ||||  ||||||||||   |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  50730621 tacctccgttcttaattataagatccttttgaaaaaaataatgaaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttat 50730522  T
Q  400 aattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||||| || |  ||| ||||||    
T  50730521 aattttatcctttaagagagatagatggtttatgttttcaacatgttatttgttgctgatcgaagaaaaatatgtataataaatagagacatgtatgtaa 50730422  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  50730421 agaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagagtcttat-aaaaagggacaaaa 50730367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 302 - 553
Target Start/End: Original strand, 50782233 - 50782487
Alignment:
Q  302 tacctccgcccttaattatagggtcatttt--aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttac 399  Q
    ||||||||  |||||||||| | || ||||  ||||||||||   |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  50782233 tacctccgttcttaattataagatccttttgaaaaaaataatgaaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttat 50782332  T
Q  400 aattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||||| || |  ||| ||||||    
T  50782333 aattttatcctttaagagagatagatggtttatgttttcaacatgttatttgttgctgatcgaagaaaaatatgtataataaatagagacatgtatgtaa 50782432  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  50782433 agaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagagtcttat-aaaaagggacaaaa 50782487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 33868684 - 33868490
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  33868684 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 33868585  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  33868584 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataactaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 33868490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 36099216 - 36099007
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || ||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  36099216 ggaattaagaaagtggataattgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 36099117  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||    
T  36099116 gctatttatcgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaag-ggtcttat-aa 36099019  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  36099018 aaagggacaaaa 36099007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 366 - 543
Target Start/End: Original strand, 49383640 - 49383819
Alignment:
Q  366 tattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaaga 463  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  49383640 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaatagagagggttggtttatgtttttaacatgttatttattgctgattgaaga 49383739  T
Q  464 aaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||| || ||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||| | || |||||| |||| | ||||||||||||    
T  49383740 aaaaaatatataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaatgcagttggaaatagcaaaaaggtcttataaaaa 49383819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 20862449 - 20862238
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa---agagagttggtttatgttttcaac 439  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |   |||||||| |||||||||||| |     
T  20862449 ggaattaagaaaatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgcttttacaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccat 20862350  T
Q  440 atgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttata 539  Q
    ||| |||| |||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||    
T  20862349 atgctatt-attgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata 20862251  T
Q  540 aaaaagggacaaaa 553  Q
     |||||||||||||    
T  20862250 -aaaagggacaaaa 20862238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 36317456 - 36317650
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||| ||||    
T  36317456 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccttatgctatttattactgat 36317555  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  36317556 tgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtgaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttat-aaaaagggacaaaa 36317650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 299 - 467
Target Start/End: Original strand, 41750927 - 41751097
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | || |||| ||||||||  |||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41750927 tactacctccgtccttaattatatgatccttttgaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttta 41751026  T
Q  399 caattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaa 467  Q
    |||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  41751027 caattttatcctttgagagagaaagttggtttatgttttcaacatgttatttaatgttgattgaaaaaaaa 41751097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 299 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 54866570 - 54866388
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||||||| || |||||||| | || |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  54866570 tactacctccgtccctaattataagatccttttgaaaaataatggaaattaagatagtgaatatttatattaattatgtttgtaattactattgttttta 54866471  T
Q  399 caattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  54866470 caattttatcttttaataaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 54866388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 298 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 25879437 - 25879256
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||||||||| || ||||||| |   | ||| |||||||||  |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  25879437 gtactacctccgtccctaattatggacacttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgcattaaatatgtttgcaattactattgttttt 25879338  T
Q  398 acaattttatcctttaaaaga--gagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataat 477  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25879337 acaattttatcttttaagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaagatgtataat 25879256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 344 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 26058790 - 26058588
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacat 441  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||||||    
T  26058790 gaattaagatattggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 26058691  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    ||||||     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||| || |||||||||||   |||||||| |    
T  26058690 gttattg----ttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtata----taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttata-a 26058600  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  26058599 aaagggacaaaa 26058588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 10045092 - 10044892
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  10045092 ggaattaagaaagtggatatttgcattaaagctgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctgaagagagagagttagtttatgttttccatat 10044993  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  10044992 gctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag-ggtcttataaa 10044894  T
Q  542 aa 543  Q
    ||    
T  10044893 aa 10044892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 332 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 33976743 - 33976549
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    ||||||||| || |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | |  ||  || ||||||    
T  33976743 aaaaaataacagaaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtagttactattgcttttataattttatcctttgagatgga--tgatttatg 33976646  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  33976645 ttttcaacatgttatttatggctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 33976549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 360 - 543
Target Start/End: Original strand, 22832411 - 22832595
Alignment:
Q  360 tatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgatt 458  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||    
T  22832411 tatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattactgatt 22832510  T
Q  459 gaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  22832511 gaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 22832595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 359 - 546
Target Start/End: Original strand, 26306408 - 26306596
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||  ||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  26306408 atatttgtattaaagttgtttgcaatcactattgtttttacaattttatccttaagcgagagagttaatttatgttttccatatgctacttattgctgat 26306507  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26306508 taaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaaagg 26306596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 14428845 - 14428652
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  14428845 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 14428746  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  14428745 tgaagaaaaagatgtataataaata-gggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataagaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 14428652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 344 - 480
Target Start/End: Original strand, 19350162 - 19350300
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa--agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19350162 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttataaatttatccttcaaaagagagagttggtttatgttttcaacat 19350261  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19350262 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaa 19350300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 332 - 510
Target Start/End: Original strand, 24087111 - 24087288
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggttta 429  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||  ||    
T  24087111 aaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtgttaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttggccta 24087210  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaat 510  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||   ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24087211 tgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaatatgt---ataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 24087288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 334 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 53271852 - 53271643
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgt 432  Q
    ||||| || |||||||||| |  | ||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | || ||||| ||||||||    
T  53271852 aaaattatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcac-attgtttttacaattttatccttaagagagggagttagtttatgt 53271754  T
Q  433 tttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaag 532  Q
    |||| | |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||       
T  53271753 tttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggga 53271654  T
Q  533 tcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||    
T  53271653 tcttataaaaa 53271643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 312 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 23308223 - 23308059
Alignment:
Q  312 cttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 410  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23308223 cttaattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagacagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcct 23308124  T
Q  411 ttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgta 473  Q
    |||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||    
T  23308123 ttaagagagagggttagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattaaaaaaaaagatgta 23308059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 381 - 544
Target Start/End: Original strand, 28810944 - 28811108
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  28810944 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataa 28811043  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaa 544  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28811044 ataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggagtcttataaaaaa 28811108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 345 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 41824358 - 41824159
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgt 443  Q
    |||||||| | || |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | |||     
T  41824358 aattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgc 41824259  T
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  41824258 tatttattgttgattcaagaaaaaagtgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagatgtcttataaaaa 41824159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 359 - 544
Target Start/End: Original strand, 26806181 - 26806367
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattga 456  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||  ||| |||||||||||| | ||| || |||||  |||    
T  26806181 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatcctt-aagagagaaggttagtttatgttttccatatgctacttattgctga 26806279  T
Q  457 ttgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaa 544  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  26806280 ttgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaaa 26806367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 381 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 38341162 - 38340992
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38341162 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaa 38341064  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
     | |||||||  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  38341063 taagggtatgtttgtaaagaattaattaatatacttcgaaatactaaagaggtcttgt-aaaaagggacaaaa 38340992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 334 - 528
Target Start/End: Original strand, 51283838 - 51284034
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgt 432  Q
    ||||| || |||||||||| |  | ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||| ||    
T  51283838 aaaatcatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttacgt 51283937  T
Q  433 tttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataat-aaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    |||| | ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  51283938 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 51284034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 39952523 - 39952313
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||  | ||    
T  39952523 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaatattatccttaagagagagagttagtttatgtttttcatat 39952424  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||   |||||||| |    
T  39952423 gctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttata-a 39952325  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  39952324 aaagggacaaaa 39952313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 44561519 - 44561682
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  44561519 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataa 44561618  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||    
T  44561619 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaa 44561682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 345 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 20877881 - 20877684
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgtt 444  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||| | |||||    
T  20877881 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattacttttacaattttattctt-aagagagagttagtttacgttttccatatgtt 20877783  T
Q  445 atttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| |  |||||||||||    
T  20877782 atttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaaagatcttataaaaa 20877684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 374 - 553
Target Start/End: Original strand, 43408543 - 43408724
Alignment:
Q  374 atgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgta 473  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43408543 atgtttataattagtattgtttttacaattttatc-tttaagagaaagacgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgta 43408641  T
Q  474 taataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtac----ttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||| || | ||| ||| |||||||||||||||||||||||    || |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  43408642 taattaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtacgtagttggaaataacaaatgggtcttat-aaaaagggacaaaa 43408724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 386 - 545
Target Start/End: Original strand, 44542301 - 44542462
Alignment:
Q  386 actattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacag 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  44542301 actattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataa 44542400  T
Q  484 gggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaag 545  Q
    |   ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||  ||| | ||||||||||||||    
T  44542401 gaacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataggaaaaatgtcttataaaaaag 44542462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 343 - 480
Target Start/End: Original strand, 37144271 - 37144411
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaac-atgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaac 439  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  37144271 ggaattaagatagtggatatttttattaaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagagagagagttgatttatgttttcaac 37144370  T
Q  440 atgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  37144371 atattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaa 37144411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 381 - 553
Target Start/End: Original strand, 47008325 - 47008497
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  47008325 taattactattgtttttacaattttatccttaagggagagagttaatttatgttttcaacataatatttattcttgattgaagaaaaagatgcaaaataa 47008424  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  47008425 ataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 47008497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 345 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 1572580 - 1572379
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgtt 444  Q
    |||||||| |||  |||||| |||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||| | |||||    
T  1572580 aattaagaaaattgatatttatattaaagttgtttgtaatcgttattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttccatatgtt 1572482  T
Q  445 atttattattgattg-aagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| ||||||||| || | ||| ||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||    
T  1572481 atttattgttgattggaaaaaaaaaatgtataatgaatatgggcatgtatctaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 1572382  T
Q  544 agg 546  Q
    |||    
T  1572381 agg 1572379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 417 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 49543854 - 49543728
Alignment:
Q  417 gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtactt 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  49543854 gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaaaaaaaagatgtatgataaacaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 49543755  T
Q  517 agaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     |||||| ||||  |||||||||||||    
T  49543754 ggaaatagcaaaagagtcttataaaaa 49543728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 334 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 54849625 - 54849429
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatg 431  Q
    ||||| || |||||||||| | || ||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||  ||||||    
T  54849625 aaaattattggaattaagaaagtggatatttacattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcatttaagagagatggttactttatg 54849526  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaag-aaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  54849525 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaatatgtataataaa-tggggcatgtatgtaaagaaatagttaatgtacttgaaaataacaaa 54849429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 346 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 52178050 - 52177880
Alignment:
Q  346 attaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacat-- 441  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   |||||||||| |||||||||      
T  52178050 attaagatagtggatatttgtattaaatatctttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaagattggtttatg-tttcaacattc 52177952  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
      ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  52177951 tctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 52177880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 29383312 - 29383065
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||  | |||| |||||||||  |||||||||| |||  ||| | ||| ||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  29383312 tactacctccgtccctaaatataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagaaaattgataatagtaataaatttgtttgtaattattattgttttt 29383213  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||| || ||||||  || |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||   ||    
T  29383212 acaattttatccttgaagagagagagttagtttatgttttcaatatagtatttaatattgattgaagaaaaagatataaaataaataagggtatgttggt 29383113  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||| |||||   |||||||||||    
T  29383112 aaagaattaattaatgtacttgaaaatatcaaagggatcttataaaaa 29383065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 25916655 - 25916451
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||  ||||| ||| | | ||    
T  25916655 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttcagagagagaattaatttatatttcccatat 25916556  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgc---atgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttat 538  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  | || ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||    
T  25916555 attatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaattgaggcatgcaatatgtaaagaaataattaatgtagttagaaatagcaaatgggtcttat 25916456  T
Q  539 aaaaa 543  Q
    |||||    
T  25916455 aaaaa 25916451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 379 - 543
Target Start/End: Original strand, 1111469 - 1111634
Alignment:
Q  379 tgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataat 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  1111469 tgtaattactattgtttttacaattttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaat 1111568  T
Q  478 aaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||| | ||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||    
T  1111569 aaataagggtatcttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaa 1111634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 343 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 25130898 - 25130702
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||||||| ||||||||||  | |||    
T  25130898 ggaattaagaaaatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatctc------gagagttgatttatgtttttcatatg 25130805  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa---acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttata 539  Q
     ||||||||  ||||| || |||||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  25130804 ctatttattgctgattaaataaaaagatgtataataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtaattggaaataacaaagaagacttata 25130705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 379 - 543
Target Start/End: Original strand, 27646127 - 27646292
Alignment:
Q  379 tgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataat 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  27646127 tgtaattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaat 27646226  T
Q  478 aaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||| | ||||||    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||    
T  27646227 aaataagggtatcttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagggtcttataaaaa 27646292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 299 - 414
Target Start/End: Original strand, 18658168 - 18658284
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18658168 tactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 18658267  T
Q  398 acaattttatcctttaa 414  Q
    |||||||||||||||||    
T  18658268 acaattttatcctttaa 18658284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Original strand, 48904086 - 48904257
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  48904086 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataa 48904185  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  48904186 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttat-aaaaagggacaaa 48904257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 34021818 - 34021981
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  34021818 taattattattgtttttacaattttatccttaagagatagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataa 34021917  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | |||||||   |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||    
T  34021918 ataagggtatgttagtaaagaaataattgatgtacttgaaaataccaaaggagtcttataaaaa 34021981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 365 - 528
Target Start/End: Original strand, 41392686 - 41392851
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaag--agagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaag 462  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  41392686 gtattaaatttgtttgtaattactattgtttttacaattatatcctttaagagatagagttggtttatattttcaacatagtatttattgttgattgaag 41392785  T
Q  463 aaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    ||||| |||   | |||| | |||||||    ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41392786 aaaaatatgggaagtaaataagggtatgttgataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 41392851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 393 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 55287460 - 55287342
Alignment:
Q  393 tttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgca 492  Q
    |||||||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||      
T  55287460 tttttacaattttatcctttat--gatagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagtaaaagatgtattataaacaggggtatgtt 55287363  T
Q  493 tgtaaagaaataattaatgta 513  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  55287362 cgtaaaaaaataattaatgta 55287342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Original strand, 17589699 - 17589870
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  17589699 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataa 17589798  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||| ||   |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  17589799 ataagggtgtgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgagtcttat-aaaaagggacaaa 17589870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 528
Target Start/End: Original strand, 29719534 - 29719682
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  29719534 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttgaacatactatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataa 29719633  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29719634 agaagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaa 29719682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 365 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 33290574 - 33290427
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaa 464  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| || ||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33290574 gtattaaatttgtttataattactattatttttacaattgtattctt-aagagagagttaatttatgttctcaacataatatttattattgattgaagaa 33290476  T
Q  465 aaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  33290475 aaagatgaaaaataaataggggtatggtggtaaagaaataattaatgta 33290427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 299 - 451
Target Start/End: Original strand, 39625197 - 39625352
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | |   |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39625197 tactacctccgtccctaattataggcccttaagaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 39625296  T
Q  399 caattttatccttta--aaagagagttggttta-tgttttcaacatgttatttatt 451  Q
    |||||||||||||||  | |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  39625297 caattttatcctttaagagagagagtttgtttatttttttcaacatgttatttatt 39625352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 359 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 46879255 - 46879069
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgatt 458  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |  |  |||||| |||| || ||||||||||| ||| ||||||||  | |||    
T  46879255 atatttgtattaaattcgtttgtaattactattgtttttacaatttatttttaaaaaagatagttagtgtatgttttcaatatgctatttattgcttatt 46879156  T
Q  459 gaagaaaaag--atgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||| || |||||||||||    
T  46879155 gaaaaaaaaataatgtatcataaacatgggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaaattcttataaaaa 46879069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 365 - 523
Target Start/End: Original strand, 54927897 - 54928057
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa--agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaag 462  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  54927897 gtattaaatttgtatgtaattactattgtttttataattttatcatttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 54927996  T
Q  463 aaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
    ||||||||| | |||||| |   |||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  54927997 aaaaagatgcaaaataaataaaagtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaata 54928057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 418 - 529
Target Start/End: Original strand, 18658320 - 18658432
Alignment:
Q  418 agagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt-aaagaaataattaatgtactt 516  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||| |||||||||||||| ||    
T  18658320 agagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaaaaaaataattaatgtagtt 18658419  T
Q  517 agaaataacaaag 529  Q
     |||||| |||||    
T  18658420 ggaaatagcaaag 18658432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 394 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 30820079 - 30819929
Alignment:
Q  394 ttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgc 491  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||| | |||||||     
T  30820079 ttttacaattttatcctt-aagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaagaaaaagatgtaaaataaataagggtatgt 30819981  T
Q  492 atgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||    
T  30819980 tagtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaa 30819929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 42755555 - 42755392
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  42755555 taattactattgtttttataattttatccttaaaagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataa 42755456  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | |  ||||||   |||||||||||||||||||| || |||||| |||| | ||||||||||||    
T  42755455 ataaaggtatgttggtaaagaaataattaatgtatttggaaataccaaaaaggtcttataaaaa 42755392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 381 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 8379891 - 8379725
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||| ||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||  | |||||    
T  8379891 taattactactgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaacataatattgattgttgattgaagaaaaaaattcaaaataa 8379792  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||    
T  8379791 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaatgggtcttataaaaaagg 8379725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Original strand, 42526448 - 42526619
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataata 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || || | ||||    
T  42526448 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaagaggtgcaaaata 42526546  T
Q  479 aacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    || | |||||||   |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||| | |||||||||||||    
T  42526547 aataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaatactaaagaggtcttgt-aaaaagggacaaa 42526619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 421 - 523
Target Start/End: Original strand, 46557747 - 46557849
Alignment:
Q  421 gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaa 520  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  46557747 gttggtttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaa 46557846  T
Q  521 ata 523  Q
    |||    
T  46557847 ata 46557849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 381 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 24813798 - 24813650
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||   ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  24813798 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagaaagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaa 24813700  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaaga 530  Q
     | |||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  24813699 taagggtatgttggtaaagaaatatttaatgtacttggaaatatcaaaga 24813650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 333 - 543
Target Start/End: Original strand, 16776660 - 16776873
Alignment:
Q  333 aaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa---agagagttggttta 429  Q
    ||||||||  |||||||||| ||| || | | ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||| ||| || ||    
T  16776660 aaaaataacgggaattaagaaaattaaaagtggtaataaatttgtttgtaattactattgtttttacaaatttgtccttttaagagagagggttagtgta 16776759  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    |||||||||  |  |||||| |  ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  16776760 tgttttcaatgtagtatttaatgctgattgaagaaaaagatataaaataaataggggtatattggtaaagaattaattaatgtacttggaaatagcaaag 16776859  T
Q  530 aagtcttataaaaa 543  Q
      ||||||||||||    
T  16776860 gggtcttataaaaa 16776873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 381 - 515
Target Start/End: Original strand, 4836516 - 4836649
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4836516 taattactattgtttttacgattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttatttttgattgaagaaaaagatgcaaaataaa 4836614  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtact 515  Q
     |  ||||||    |||| ||||||||||||||||    
T  4836615 taaaggtatgttactaaataaataattaatgtact 4836649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 344 - 543
Target Start/End: Original strand, 22527408 - 22527607
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||  |||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| | | | || ||| |||||||||| ||  |||    
T  22527408 gaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgttaggaatcactattgtttt-acaattttatccttaagagaaagtgttagtttatgtttccat-atg 22527505  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagg-ggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||  | |||||||||    
T  22527506 ctatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggagccatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgaatcttataaa 22527605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 36584919 - 36584753
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||   ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||   || | ||||||    
T  36584919 taattactattgtttttataattttatcctt-aagagagagtaaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaa---tgcaaaataaa 36584824  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
     | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  36584823 taagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaataagtcttata-aaaagggacaaa 36584753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 354 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 36600384 - 36600191
Alignment:
Q  354 aatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttatta 452  Q
    |||| |||||| |||||||   |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| | | |||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||     
T  36600384 aatggatatttatattaaagtcgtttgtaagtaccattgtttttacagttttatccttaagagagagagttagtttatgttttccttatgctatttattg 36600285  T
Q  453 ttgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
      |||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||| || ||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||| | || ||||||||||||    
T  36600284 ccgattcaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatataaagaagtaattaatgtagttgaaaatagcaaataggtgttataaaaaagg 36600191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 390 - 542
Target Start/End: Original strand, 48655072 - 48655225
Alignment:
Q  390 ttgtttttacaattttatcctttaaaag-agagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggta 488  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | | ||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  48655072 ttgtttttacaattttatacttaagatggagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataagggta 48655171  T
Q  489 tgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||   ||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||   ||||||||||    
T  48655172 tgttggtaaagaaataataaatgtactcaaaaataccaaagggatcttataaaa 48655225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 384 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 15095409 - 15095249
Alignment:
Q  384 ttactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaaca 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  15095409 ttactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaata 15095310  T
Q  483 ggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     |||||     ||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||   |||||||||||    
T  15095309 agggtagtttggtaaacaaataattaatgtacttgaaaatatcaaagggatcttataaaaa 15095249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 443 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 20848712 - 20848612
Alignment:
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   |||||||||||    
T  20848712 ttatttattgttgattgatgaaaaagatgtataataaatcggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaa 20848613  T
Q  543 a 543  Q
    |    
T  20848612 a 20848612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 45404588 - 45404426
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||   ||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  45404588 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataa 45404490  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||   ||||||||||||    
T  45404489 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaatgggtcttataaaaa 45404426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 386 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 31533576 - 31533438
Alignment:
Q  386 actattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagg 484  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   | ||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  31533576 actattatttttacaattttatccttaggagagaaagttagtttatgttttctatatgctatttattgcagattgaagaaaaagatgtataataaataga 31533477  T
Q  485 ggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  31533476 gacatgtatgtaaagaaataattaatatagttagaaata 31533438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 383 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 4564449 - 4564285
Alignment:
Q  383 attactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaa-gaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||||||||   |||||||| |||||||||  ||||||||| | ||||||    
T  4564449 attactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacacaatatttattgttgattgaataaaaaagatgcaaaataaa 4564350  T
Q  481 cagggg--tatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     | |||  ||||   ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  4564349 taagggtatatgttagtaaagaaataatcaatgtacttggaaatactaaagaggtcttataaaaa 4564285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 386 - 546
Target Start/End: Original strand, 7886890 - 7887051
Alignment:
Q  386 actattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagg 484  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| | | | |||||||  |||||||||  | ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  7886890 actattatttttacaattttattcttaagagaaagagttgacttatgtttttcatatgctatttattgctcattgaagaaaaagatgtataataaataga 7886989  T
Q  485 ggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||| || || |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  7886990 gacatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaaagg 7887051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 343 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 20849085 - 20848985
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  20849085 ggaattaggatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 20848986  T
Q  441 t 441  Q
    |    
T  20848985 t 20848985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 381 - 516
Target Start/End: Original strand, 12918661 - 12918797
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| || |||||||||||| ||| | |||||    
T  12918661 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagatagttaatttatattttcaatataatatttattgttaattgaagaaaaaaatgcaaaataa 12918760  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtactt 516  Q
    | | |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  12918761 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtactt 12918797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 42044077 - 42044238
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||   ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||  ||| | |||||    
T  42044077 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaa--atgcaaaataa 42044174  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| |  |||||||||||    
T  42044175 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatatacttggaaacaccaaaaagatcttataaaaa 42044238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 343 - 414
Target Start/End: Original strand, 12675207 - 12675278
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 414  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12675207 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaattttatcctttaa 12675278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 381 - 528
Target Start/End: Original strand, 28875075 - 28875222
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   | ||||||||  ||||| |||| || ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  28875075 taattactattgtttttacaattttatcttaagagagagagttaatttatatttttaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaa 28875174  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
     | |||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28875175 taagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttggaaatatcaaa 28875222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 35938582 - 35938468
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||||| |    
T  35938582 tgtttgtaattgttattgtttttacaattttatcctttaagagagatagttagtgtatgttttcaacatgataattaatgttgatcgaagaaaaagatat 35938483  T
Q  473 ataataaacaggggt 487  Q
    | |||||| ||||||    
T  35938482 aaaataaataggggt 35938468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 385 - 543
Target Start/End: Original strand, 48902536 - 48902694
Alignment:
Q  385 tactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacag 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| |     
T  48902536 tactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataa 48902634  T
Q  484 gggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     ||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||    
T  48902635 aggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaa 48902694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 381 - 542
Target Start/End: Original strand, 40215052 - 40215214
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||   |||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  40215052 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagaattaacttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataa 40215151  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    |   |||||||   ||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||  | ||||||||||    
T  40215152 atcagggtatgttggtaaagaaacaattaatgtacttgaaaataccaaaagaatcttataaaa 40215214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 444 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 9582393 - 9582285
Alignment:
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| || || |||||| ||||   |||||||| |||    
T  9582393 tatttatttttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatatagttggaaatagcaaaagggtcttata-aaa 9582295  T
Q  544 agggacaaaa 553  Q
    ||||||||||    
T  9582294 agggacaaaa 9582285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Original strand, 32969049 - 32969219
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||   ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  32969049 taattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataa 32969147  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||| ||    |||||||||||||||||||||| |||| | |||||   |||||| |||||||||||||    
T  32969148 ataagggtctgttgttaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaagggatcttat-aaaaagggacaaa 32969219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 366 - 486
Target Start/End: Original strand, 23650639 - 23650761
Alignment:
Q  366 tattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaaga 463  Q
    |||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| | |||| |||||||||||||||||  || |||||||| |||| |||    
T  23650639 tattaaatttgtttgtaattagtaatgtttttacaattttatcctttatgaaaaaaagttagtttatgttttcaacataatacttattattaattggaga 23650738  T
Q  464 aaaagatgtataataaacagggg 486  Q
    |||| | ||| |||||| |||||    
T  23650739 aaaataagtaaaataaatagggg 23650761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 31541236 - 31541070
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||   ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  31541236 taattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataa 31541138  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
        |||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  31541137 ----gggtatgttggtaaagatataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttat-aaaaagggacaaa 31541070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 511
Target Start/End: Original strand, 2764219 - 2764356
Alignment:
Q  374 atgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaa-gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| ||| || ||| |||| || ||||  ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||     
T  2764219 atgtatgtaattgctattgtttttaca-tttgatacttaaaaaagaaagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgc 2764317  T
Q  473 ataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatg 511  Q
    | |||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  2764318 aaaataaataagggtatgctggtaaagaaacaattaatg 2764356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 381 - 544
Target Start/End: Original strand, 34265547 - 34265717
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttg--------gtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||        |||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||     
T  34265547 taattactattgtttttacaattttattctt-aagagagagatgaataattagtttatgttttcaacatagtatttattgtcgattgaagaaaaagatgc 34265645  T
Q  473 ataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaa 544  Q
    | |||||| |  ||||||   |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  34265646 aaaataaataaaggtatgttagtaaagaaataattaatgtaattgaaaatatcaaagagatcttaaaaaaaa 34265717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 377 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 38364387 - 38364295
Alignment:
Q  377 tttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaa 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||| ||  |||| | | |||||||||||||||    
T  38364387 tttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagagttgttatatgttttcaaaatagtattcactgttgattgaagaaaaa 38364295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 539
Target Start/End: Original strand, 49543996 - 49544161
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgta 473  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||| || ||  |||||| | ||||||||||||||| ||  |    
T  49543996 tgttggtaattactattggttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgtttttaatatagtatttaatgttgattgaagaaaaatataca 49544095  T
Q  474 taataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttata 539  Q
     |||||| |||||||||   || || || ||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||    
T  49544096 aaataaataggggtatgatggtgaaaaattaattaatgcacttgaaaataacaaaggggtcttata 49544161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 381 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 34811527 - 34811380
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| | | | ||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||  ||| | |||||    
T  34811527 taattactattgcttt-acaattttatccttaagagaaagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaagaatgcaaaataa 34811429  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    | | | |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34811428 ataagagtatgttggtaaagaaataattaatgtacttagaaataccaaa 34811380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 416 - 552
Target Start/End: Original strand, 52693547 - 52693682
Alignment:
Q  416 agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtact 515  Q
    ||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| | |||||||    |||||||||||||||||||||    
T  52693547 agagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttgttaaagaaataattaatgtact 52693646  T
Q  516 tagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | |||||| ||||   ||||||| |||||||||||||    
T  52693647 tggaaataccaaaatggtcttat-aaaaagggacaaa 52693682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 482 - 553
Target Start/End: Original strand, 7462922 - 7462992
Alignment:
Q  482 aggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7462922 aggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttat-aaaaagggacaaaa 7462992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 540
Target Start/End: Original strand, 8503318 - 8503488
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgt----tatttattattgattgaagaaaaaga 469  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| | ||  ||||||||||||| || |    |||||| | ||||||||||||||| |    
T  8503318 tgttggtaattactattggttttacaattttatccttaagagagatatttaatttatgttttcaatatatatagtatttaatgttgattgaagaaaaata 8503417  T
Q  470 tgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    |  | |||||| |||||||||   || || || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8503418 tacaaaataaataggggtatgatggtgaaaaattaattaatgcgcttggaaataacaaagaagtcttataa 8503488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 381 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 31397990 - 31397930
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  31397990 taattactattgtttttacaattatatcctttaagagagagttgatttatatcttcaacat 31397930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 456 - 543
Target Start/End: Original strand, 39625693 - 39625780
Alignment:
Q  456 attgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||| |||||||||    
T  39625693 attgaagaaaaatatgtataataaatagagacatgcatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagttttataaaaa 39625780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 40048183 - 40048120
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt-aaaagagagttggtttatgttttca 437  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  40048183 tgtttgaaattactattgtttttacaattatatcctttaaaaagggagttggtttatattttca 40048120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 411 - 473
Target Start/End: Original strand, 54690375 - 54690435
Alignment:
Q  411 ttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgta 473  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  54690375 ttaagagagagttggtttatgttttcaaca--ttatttattggtgattgaagaaaaagatgta 54690435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 9582462 - 9582396
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcc 409  Q
    |||||||||| | || |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9582462 ggaattaagaaagtggatatttgtatcaaagttgtttggaattactattgtttttacaattttatcc 9582396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 470
Target Start/End: Original strand, 13702672 - 13702769
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaga--gagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagat 470  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||  | ||| || ||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||    
T  13702672 tgtttgtaattgctattcttttaacaattttatcctttaagagagggggttagtgtatgttttcaacatagtatttaatgctgattgaagaaaaagat 13702769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 472 - 546
Target Start/End: Original strand, 54690581 - 54690655
Alignment:
Q  472 tataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  54690581 tataataaatagaggcatgcatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagcaaagaggtcttataaaaaagg 54690655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 461
Target Start/End: Original strand, 21497634 - 21497715
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaa 461  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  21497634 taattattattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgtttttaacataatatttattgttgattgaa 21497715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 381 - 441
Target Start/End: Original strand, 22494483 - 22494544
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22494483 taattactattatttttacaattttatccttaagagagagagttgatttatgttttcaacat 22494544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 416 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 27067565 - 27067500
Alignment:
Q  416 agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaac 481  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||  | ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27067565 agagagtttgtttatgttttcaacatgctatttatggtagattgaataaaaaaatgtataataaac 27067500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 49791521 - 49791408
Alignment:
Q  314 taattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 412  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||| |||  | | | |||  |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  49791521 taattatagggtcattttaaaaaaataacgggaattgagaaaattgaaagtggtaacaaatttgtttgtaattactattgttttcataattttatctttt 49791422  T
Q  413 aaaagagagttggt 426  Q
    || |||||||||||    
T  49791421 aagagagagttggt 49791408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 460
Target Start/End: Original strand, 4073365 - 4073405
Alignment:
Q  420 agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattga 460  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4073365 agtttgtttatgttttcaacatgttatttattattgattga 4073405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 471 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7886532 - 7886460
Alignment:
Q  471 gtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||| | | | ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  7886532 gtataataaatatgagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggaatcttataaaaa 7886460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 426 - 480
Target Start/End: Original strand, 51486230 - 51486284
Alignment:
Q  426 tttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51486230 tttatattttcaacatgatatttatcgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaa 51486284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 471 - 543
Target Start/End: Original strand, 41751383 - 41751455
Alignment:
Q  471 gtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  41751383 gtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaacgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaa 41751455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 389
Target Start/End: Original strand, 46557689 - 46557745
Alignment:
Q  333 aaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattacta 389  Q
    ||||||||  |||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  46557689 aaaaataacgggaattaaaataatggatatatgtattaaatatgtttgtaattacta 46557745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 432 - 480
Target Start/End: Original strand, 48136964 - 48137012
Alignment:
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  48136964 ttttcaacatattatttattgttgatcgaagaaaaaaatgtataataaa 48137012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 414
Target Start/End: Original strand, 20084703 - 20084742
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 414  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20084703 tgtttgtaattgttattgtttttacaattttatcctttaa 20084742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 40048081 - 40047982
Alignment:
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| | | |||||   ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  40048081 tatttattgctgattgaagaaaaatatgtaaaataaataagtgtatgttagtaaataaataattaatgtagttgaaaataacaaaagagtcttgtaaaaa 40047982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 333 - 419
Target Start/End: Original strand, 16776521 - 16776607
Alignment:
Q  333 aaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagag 419  Q
    ||||||||  |||||||||| ||| || | | ||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  16776521 aaaaataacgggaattaagaaaattaaaagtggtaataaatttgtttgtaattattattgtttttacaaatttgtcctttaagagag 16776607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 299 - 372
Target Start/End: Original strand, 43408192 - 43408266
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaa 372  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  43408192 tactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaa 43408266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 543
Target Start/End: Original strand, 29454725 - 29454770
Alignment:
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||    
T  29454725 agaaataattaatgtacttggaaataccaaaggagacttataaaaa 29454770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 377 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 36824636 - 36824537
Alignment:
Q  377 tttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataa 476  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||  ||||||||  ||||| |||| || |||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  36824636 tttgtaatcactattgtttccataattttatc-tttacgagagagttaatttatatttttaagatgtt---tattgttgattgaagaaaaagatgtaaaa 36824541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 432 - 545
Target Start/End: Original strand, 52661651 - 52661763
Alignment:
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    ||||||||||  ||| |||| || |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||   ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||| ||    
T  52661651 ttttcaacatagtatatattttttattgaagaaaaatatgtaaaataaatatgagtatatttgtaaagaaatgattaatgtagtta-aaataccaaataa 52661749  T
Q  532 gtcttataaaaaag 545  Q
     |||||| ||||||    
T  52661750 atcttatgaaaaag 52661763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 157; Significance: 6e-83; HSPs: 174)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 296 - 543
Target Start/End: Original strand, 32522581 - 32522829
Alignment:
Q  296 tagtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtt 394  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32522581 tagtactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 32522680  T
Q  395 tttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  32522681 tttacaattttatcctttaagagagagttggcttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 32522780  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  32522781 taaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 32522829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 298 - 543
Target Start/End: Original strand, 23687904 - 23688150
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23687904 gtactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttt 23688003  T
Q  397 tacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  23688004 tacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 23688103  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  23688104 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 23688150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 18111716 - 18111961
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||| | || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18111716 tactacctctgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 18111815  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  18111816 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaa 18111915  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  18111916 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 18111961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 23487360 - 23487115
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23487360 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 23487261  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||    
T  23487260 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaa 23487161  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | |||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  23487160 aaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 23487115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 314 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 25058323 - 25058090
Alignment:
Q  314 taattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 412  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058323 taattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 25058224  T
Q  413 aaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgt 512  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||    
T  25058223 aagagatagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattaaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 25058124  T
Q  513 acttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    | || |||||| |||||| || ||||||||||||    
T  25058123 agttggaaatagcaaagaggttttataaaaaagg 25058090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 298 - 544
Target Start/End: Original strand, 9035279 - 9035526
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  9035279 gtactccctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 9035378  T
Q  397 tacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||    
T  9035379 tacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgta 9035478  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaa 544  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||||    
T  9035479 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaa 9035526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 33865283 - 33865536
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  33865283 tactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 33865382  T
Q  399 caattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaa 498  Q
    || ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||    
T  33865383 cagttttatcctttaagagatagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaa 33865482  T
Q  499 gaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33865483 gaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttat-aaaaagggacaaaa 33865536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 33980759 - 33980506
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  33980759 tactacctccgtccttgattatagggtccttttgaaaaaaaacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtctgtaattagtattgttttta 33980660  T
Q  399 caattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaa 498  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| |||||||    
T  33980659 caattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataagggcatgtatgtaaa 33980560  T
Q  499 gaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  33980559 gaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttata-aaaagggacaaaa 33980506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 296 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 40785191 - 40784932
Alignment:
Q  296 tagtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtt 394  Q
    |||||| ||||||| || |||||||| |  | |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  40785191 tagtaccacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgct 40785092  T
Q  395 tttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgca 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  40785091 tttacaattttatcctttaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttacttaatgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 40784992  T
Q  493 tgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  40784991 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttata-aaaagggacaaaa 40784932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 5783886 - 5784143
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5783886 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 5783985  T
Q  398 acaattttatcctttaaa---agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||    
T  5783986 acaattttatccttttaagagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatg 5784085  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||    |||||| ||||||||||||||    
T  5784086 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggatcttat-aaaaagggacaaaa 5784143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 299 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 8566498 - 8566255
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||| |||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8566498 tactacatccgtccctaattataggc-cattttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatgtgtttgtaattactattgttttt 8566400  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||    
T  8566399 acaattttatcctttatgagagagttggtttatgttttcaacatgtcatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatataa 8566300  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||    
T  8566299 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaa 8566255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 299 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 26016865 - 26016612
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||| |||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26016865 tactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 26016766  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26016765 acaattttatcctttaagagagaattgatttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaa 26016666  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||    
T  26016665 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagcggtcttata-aaaagggacaaa 26016612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 7683303 - 7683558
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | |||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7683303 tactacctccgtccataattataggacctttttaaaaaaataacgagaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 7683402  T
Q  398 acaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||| |||||    
T  7683403 acaattttatcctttaaagagagaattggtttatgttttcaacatgttatatatcgctgattgaaaaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgta 7683502  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  7683503 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttat-aaaaagggacaaaa 7683558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 2944013 - 2944267
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||| |||||| || ||||||||||  | |||||||||| |||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2944013 tactccctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 2944112  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  || ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2944113 acaattttatcctttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatatataataaataggggcatgcatgtaa 2944212  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  2944213 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 2944267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 5162602 - 5162346
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| || | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5162602 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 5162503  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  5162502 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 5162403  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  5162402 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 5162346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 50879 - 51090
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  50879 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 50978  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  50979 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 51077  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  51078 aaaagggacaaaa 51090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 4076425 - 4076214
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  4076425 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 4076326  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  || |||| |    
T  4076325 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtattat-a 4076227  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  4076226 aaaagggacaaaa 4076214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 299 - 542
Target Start/End: Original strand, 7682777 - 7683022
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7682777 tactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 7682876  T
Q  398 acaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||    
T  7682877 acaattttatcctttaaagagataattggtttatgttttcaacatgttatttatcgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgta 7682976  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||| |||||  |||||||||||    
T  7682977 aagaaataattaatgtagtcgaaaatagcaaaggggtcttataaaa 7683022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 299 - 552
Target Start/End: Original strand, 8072868 - 8073123
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||   |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8072868 tactaccttcgtccttaattataaggcttttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgttttt 8072967  T
Q  398 acaattttatcctttaaaa--gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  8072968 acaattttatcctttaaaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 8073067  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||| |||| |  |||||| |||||||||||||    
T  8073068 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaacagatcttat-aaaaagggacaaa 8073123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Original strand, 35143295 - 35143515
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  35143295 aaaaaataaccggaattaagatagtatatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttgtcctttaagagagagttggtttatg 35143394  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  35143395 ttttcaacatgttttttattggtgattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaataa 35143494  T
Q  532 gtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  35143495 gtcttat-aaaaagggacaaaa 35143515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 38878974 - 38878763
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  38878974 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 38878875  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||     
T  38878874 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaatgaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttata- 38878776  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  38878775 aaaagggacaaaa 38878763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 298 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 44747346 - 44747099
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44747346 gtactacctccgtccttaattataaggtccttttaaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 44747247  T
Q  397 tacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| |||    
T  44747246 tacaattttatcttttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaata-gggcatgtatg 44747148  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  ||||||||||||    
T  44747147 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 44747099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 299 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 39029473 - 39029226
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||| |||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39029473 tactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 39029374  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39029373 acaattttatcctttaagagagaattagtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaa 39029274  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    |||||| ||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  39029273 agaaat-attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaagg 39029226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 41014757 - 41014555
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||| |||||||||    
T  41014757 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatattttcaaca 41014658  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  41014657 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataa 41014558  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  41014557 aaa 41014555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Original strand, 257311 - 257524
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  257311 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttcttacaattttatcctttaagagagagggttggttta 257410  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  257411 tgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaag 257510  T
Q  530 aagtcttataaaaa 543  Q
      ||||||||||||    
T  257511 gggtcttataaaaa 257524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 658609 - 658396
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  658609 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttcttacaattttatcctttaagagagagggttggttta 658510  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  658509 tgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaag 658410  T
Q  530 aagtcttataaaaa 543  Q
      ||||||||||||    
T  658409 gggtcttataaaaa 658396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 844345 - 844132
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  844345 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttcttacaattttatcctttaagagagagggttggttta 844246  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  844245 tgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaag 844146  T
Q  530 aagtcttataaaaa 543  Q
      ||||||||||||    
T  844145 gggtcttataaaaa 844132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 299 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 31886967 - 31886737
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   | |||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31886967 tactacctccgtccttaattatagaacccttttaaaaaaataacgggaattaagataataaatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgttttt 31886868  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  31886867 acaattttatcctttaagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaatagaggcatgtatgtaa 31886768  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    | |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  31886767 aaaaataattaatgtagttgaaaataacaaa 31886737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 296 - 543
Target Start/End: Original strand, 45283528 - 45283776
Alignment:
Q  296 tagtactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttt 395  Q
    ||||||||||| || |||||||||| || || |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  45283528 tagtactaccttcgtccttaattatgggctc-ttttgaaaaataacgggaattaagacaatgaatatttatatcaaatatgtttgtaattattattgttt 45283626  T
Q  396 ttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcat 493  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||    
T  45283627 ttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtat 45283726  T
Q  494 gtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||| | |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  45283727 gtaaaaagataattaatgtagttggaaataacaaagatgtcttataaaaa 45283776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 8948135 - 8948346
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  8948135 ggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 8948234  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  8948235 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 8948333  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  8948334 aaaagggacaaaa 8948346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 14699705 - 14699494
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  14699705 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcgtttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 14699606  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||     
T  14699605 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttata- 14699507  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  14699506 aaaagggacaaaa 14699494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 18455973 - 18455762
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  18455973 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 18455874  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||     
T  18455873 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtgtgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata- 18455775  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  18455774 aaaagggacaaaa 18455762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 28191959 - 28192170
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  28191959 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttatacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 28192058  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  28192059 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 28192157  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  28192158 aaaagggacaaaa 28192170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 34490770 - 34490559
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  34490770 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 34490671  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||     
T  34490670 tgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata- 34490572  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  34490571 aaaagggacaaaa 34490559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 299 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 39406857 - 39406602
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||||   | |||| |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39406857 tactacctccgtccctaattatagaacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 39406758  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  39406757 acaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatattttttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgt 39406658  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||    
T  39406657 aaagaaataattaatgtagctggaaatagcaaaggggtcttata-aaaagggacaaa 39406602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 344 - 553
Target Start/End: Original strand, 8951213 - 8951423
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacat 441  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||||||    
T  8951213 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttccaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 8951312  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||| ||    
T  8951313 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagagtcttat-aa 8951411  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  8951412 aaagggacaaaa 8951423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Original strand, 32475006 - 32475222
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  32475006 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaattgatttatg 32475105  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||     
T  32475106 ttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggg----gcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagag 32475201  T
Q  532 gtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  32475202 gtcttat-aaaaagggacaaaa 32475222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 544
Target Start/End: Original strand, 35504364 - 35504567
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  35504364 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 35504463  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   |||||||||    
T  35504464 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataa 35504563  T
Q  541 aaaa 544  Q
    ||||    
T  35504564 aaaa 35504567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 1774595 - 1774390
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  1774595 ggaattaagatagtggatatatgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 1774496  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  1774495 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaatcattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataa 1774396  T
Q  541 aaaagg 546  Q
    ||||||    
T  1774395 aaaagg 1774390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Original strand, 18641150 - 18641363
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggttta 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||| |||    
T  18641150 aaaaaataataggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcctttaagaaagagggttggctta 18641249  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    |||||| |||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||  ||||    
T  18641250 tgttttaaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggttatgtatgtaaagaaataattaatttagttgaaaatagaaaag 18641349  T
Q  530 aagtcttataaaaa 543  Q
     |||||||||||||    
T  18641350 gagtcttataaaaa 18641363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 18754398 - 18754186
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||    
T  18754398 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaaca 18754299  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta-cttagaaataacaaagaagtcttata 539  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||   |||||||     
T  18754298 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtttggaaataacaaaagggtcttat- 18754200  T
Q  540 aaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||    
T  18754199 aaaaagggacaaaa 18754186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 8251717 - 8251928
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  8251717 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 8251816  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||   ||||||| |    
T  8251817 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttat-a 8251915  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  8251916 aaaagggacaaaa 8251928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 29598477 - 29598266
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  29598477 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 29598378  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||     
T  29598377 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaaatgtcttata- 29598279  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  29598278 aaaagggacaaaa 29598266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 343 - 552
Target Start/End: Original strand, 32675541 - 32675751
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||| |||||||||    
T  32675541 ggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaaca 32675640  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  32675641 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 32675739  T
Q  541 aaaagggacaaa 552  Q
    ||||||||||||    
T  32675740 aaaagggacaaa 32675751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 345 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 34568741 - 34568532
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  |||||||||||||||||    
T  34568741 aattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttattttatgttttcaacatg 34568642  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||| ||     
T  34568641 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaacaagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttat-aat 34568543  T
Q  543 aagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||    
T  34568542 aagggacaaaa 34568532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 36661710 - 36661912
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||    
T  36661710 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaaca 36661809  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||    
T  36661810 tgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatataaagaattaattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataa 36661909  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  36661910 aaa 36661912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 41616208 - 41615957
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaa-ataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| |||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  41616208 tactacctccgtctctaattatagggccattttgaaaatataacatgaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgcaattagtattgttttt 41616109  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagaga-gttgg-----tttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgc 491  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |     ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  41616108 acaattttatcctttaagagagatgtttgatttatttatgttttcaacatgttatttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaacaggggcatgt 41616009  T
Q  492 atgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  41616008 atgtaaagatataattaatgtagttgaaaataacaaagaaattttataaaaa 41615957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 374 - 553
Target Start/End: Original strand, 29806038 - 29806218
Alignment:
Q  374 atgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatg 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  29806038 atgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatg 29806137  T
Q  472 tataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  29806138 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 29806218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 343 - 546
Target Start/End: Original strand, 38183350 - 38183555
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  38183350 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 38183449  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||   |||||||||    
T  38183450 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataa 38183549  T
Q  541 aaaagg 546  Q
     |||||    
T  38183550 taaagg 38183555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 299 - 552
Target Start/End: Original strand, 16448492 - 16448747
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||| |||   ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16448492 tactaccttcgtccctaattataaggctattttaaaaaaataacttgaattaagatagtaaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 16448591  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||| ||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16448592 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaatattctatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgt 16448691  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  16448692 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttat-aaaaagggacaaa 16448747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 26980761 - 26980971
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  26980761 ggaattaagatagtggatattt-tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgattggtttatgttttcaaca 26980859  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  ||||||| |    
T  26980860 tgttatttattggtgatcgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaggggtcttat-a 26980958  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  26980959 aaaagggacaaaa 26980971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 529
Target Start/End: Original strand, 42598500 - 42598688
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  42598500 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaacgttagtttatgttttcaaca 42598599  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  42598600 tgttatttattgttgattgaaggaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag 42598688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 5774347 - 5774090
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||| | || | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5774347 tactacctccgtccctaattacaaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 5774248  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataat-aaacaggggtatgcatg 494  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| |||    
T  5774247 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataatggaataggggcatgtatg 5774148  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  5774147 taaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 5774090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 12255347 - 12255137
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||    
T  12255347 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatattatccttaagaaagagagttagtttatgttttccatat 12255248  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |    
T  12255247 gctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttata-a 12255149  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  12255148 aaagggacaaaa 12255137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 12260890 - 12260680
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||    
T  12260890 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatattatccttaagaaagagagttagtttatgttttccatat 12260791  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |    
T  12260790 gctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttata-a 12260692  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  12260691 aaagggacaaaa 12260680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 299 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 12825244 - 12825028
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | | |||| |||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12825244 tactacctccgtccctaattatagagcccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtgaatatttgtattaaatatgtttttaattactattgttttt 12825145  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  12825144 acaattttatcctttaagagagatagttggtttatgttttcaacatgttgtttattgctgattgaagaaaaatatgtat-ataaataggggcatgtatgt 12825046  T
Q  496 aaagaaataattaatgta 513  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12825045 aaagaaataattaatgta 12825028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 38967441 - 38967185
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||||||||  | |||||||| || | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38967441 tactacctccgttcctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattattattgttttt 38967342  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||  || || ||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  38967341 acaattttatcctttaagaaaaagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgt 38967242  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38967241 aaagaaataattcatgtagttggaaatagaaaagaggtcttata-aaaagggacaaaa 38967185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 343 - 529
Target Start/End: Original strand, 16117235 - 16117423
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  16117235 ggaattaagatagtcgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 16117334  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16117335 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag 16117423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 343 - 529
Target Start/End: Original strand, 16125494 - 16125682
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  16125494 ggaattaagatagtcgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 16125593  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16125594 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag 16125682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 302 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 24992810 - 24992566
Alignment:
Q  302 tacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttaca 400  Q
    |||||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24992810 tacctccgtccctaattataaggttattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 24992711  T
Q  401 attttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaa 498  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  24992710 attttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaatattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggagcatgaatgtaaa 24992611  T
Q  499 gaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     |||||||||||||| || ||||||  ||||  ||||||||||||    
T  24992610 aaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 24992566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 342 - 553
Target Start/End: Original strand, 28864291 - 28864502
Alignment:
Q  342 aggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | |    
T  28864291 aggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccata 28864390  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |    
T  28864391 tgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttat-a 28864489  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  28864490 aaaagggacaaaa 28864502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 13154180 - 13153970
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  13154180 ggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 13154081  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||| |    
T  13154080 gctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttata-a 13153982  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  13153981 aaagggacaaaa 13153970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 33745681 - 33745891
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag-ttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | | || || |||||||||||||||||    
T  33745681 ggaaataagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttgagaaaaaggttagtttatgttttcaacat 33745780  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||   |||||| ||    
T  33745781 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggatcttat-aa 33745879  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  33745880 aaagggacaaaa 33745891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 299 - 541
Target Start/End: Original strand, 38780881 - 38781125
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  38780881 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 38780980  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||    
T  38780981 ataattt-atcctttaagagagaggattgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgt 38781079  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    ||||||||||||| |||  || ||||||  ||||  ||||||||||    
T  38781080 aaagaaataattattgtggttggaaataggaaaggggtcttataaa 38781125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Original strand, 42985289 - 42985501
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggttta 429  Q
    |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  42985289 aaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggttta 42985388  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |  |  ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||     
T  42985389 tgttttcaatatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataat-aatatagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaa 42985487  T
Q  530 aagtcttataaaaa 543  Q
     |||||||||||||    
T  42985488 gagtcttataaaaa 42985501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 28579891 - 28579681
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||  |||||||||||||||    
T  28579891 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgttt-taatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttaatttatgttttcaaca 28579793  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||   |||||||     
T  28579792 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggatcttata- 28579694  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  28579693 aaaagggacaaaa 28579681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 36176887 - 36177098
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||  |||||||||||||||    
T  36176887 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttaatttatgttttcaaca 36176986  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||| |    
T  36176987 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatctatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttat-a 36177085  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  36177086 aaaagggacaaaa 36177098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Original strand, 11482893 - 11483115
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||    
T  11482893 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagaaagagggttggctta 11482992  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||  ||||    
T  11482993 tgttttcaacattctatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaag 11483092  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
      ||||||| ||||||||||||||    
T  11483093 tggtcttat-aaaaagggacaaaa 11483115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 334 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 11798866 - 11798647
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgt 432  Q
    ||||| || |||||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  11798866 aaaatcatgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 11798767  T
Q  433 tttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaag 532  Q
    |||| | ||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |    
T  11798766 tttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 11798667  T
Q  533 tcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  11798666 tcttata-aaaagggacaaaa 11798647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 44888978 - 44888731
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattataggg-tcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  || ||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  44888978 tactacctccgtccctaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattgctattattttt 44888879  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||| ||||||| ||||  ||| |||     
T  44888878 acaattttatcctttaagagagaaagttggtttatattttcaacatgttatttattgccgattgaagaaagagctgtgtaataaatagggtcatgtatga 44888779  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||    
T  44888778 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggagtcttataaaaa 44888731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 292 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 4778894 - 4778646
Alignment:
Q  292 aatctagtactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactat 390  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| | | ||||||||||| |||  | |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4778894 aatctagtactacctccgtccctaattatatgattattttaaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactat 4778795  T
Q  391 tgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggta 488  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  4778794 tgtttttacagttttatccattaagagagagggttggtttat-ttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataat-aataggggca 4778697  T
Q  489 tgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttata 539  Q
    |  |||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||  |||||||||    
T  4778696 tatatgtaaagaattaattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttata 4778646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 40741501 - 40741307
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  ||||    
T  40741501 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgat 40741402  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  40741401 tgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 40741307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 296 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 30140383 - 30140211
Alignment:
Q  296 tagtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtt 394  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30140383 tagtactacctccgtccctaattatagggtttttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 30140284  T
Q  395 tttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaa 465  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  30140283 tttacaattttatcctttaagaaagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaa 30140211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 44580616 - 44580874
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  | |||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  44580616 tactacctccgtccctaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 44580715  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaag--aaaaagatgtataataaacaggggtatgcat 493  Q
    ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||  ||||| |||||||||||| ||||| ||| ||    
T  44580716 acaattttatcctttaagagagatgaatggtttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaaaatgtataataaataggggcatgtat 44580815  T
Q  494 gtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  44580816 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 44580874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 343 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 16999250 - 16999039
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||| |||||||||    
T  16999250 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatcttttcaaca 16999151  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    ||||||||    
T  16999150 tgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatatagttggaaataacaaaaggatcttataa 16999051  T
Q  541 aaaagggacaaa 552  Q
    ||| ||||||||    
T  16999050 aaaggggacaaa 16999039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 43653988 - 43654198
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  43653988 ggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 43654087  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | ||||||||  | |||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||    
T  43654088 gctatttattgctaattgtagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataataaagatgtcttat-aa 43654186  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  43654187 aaagggacaaaa 43654198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 343 - 552
Target Start/End: Original strand, 4631338 - 4631547
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  4631338 ggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 4631437  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||    
T  4631438 gttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aa 4631536  T
Q  542 aaagggacaaa 552  Q
    |||||||||||    
T  4631537 aaagggacaaa 4631547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 29279432 - 29279238
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| || ||    
T  29279432 atatttgtattaaaattttttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgttaat 29279333  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||    
T  29279332 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttata-aaaagggacaaaa 29279238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 343 - 546
Target Start/End: Original strand, 42218131 - 42218333
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||| ||||||||     
T  42218131 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagatgtttgcaatcactattgtttttacaattttatcttttaga-gagagttagtttatgtcttcaacatt 42218229  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||   ||||||||||    
T  42218230 atatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcttgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggatcttataaaa 42218329  T
Q  543 aagg 546  Q
    ||||    
T  42218330 aagg 42218333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 332 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 44021270 - 44021077
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||    
T  44021270 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatacgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggctta 44021171  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  44021170 tgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatctataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 44021077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 359 - 543
Target Start/End: Original strand, 17856578 - 17856763
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  17856578 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagatagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgat 17856677  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  17856678 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaagtaacaaaggggtcttataaaaa 17856763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 343 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 35203088 - 35202952
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  35203088 ggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaga-gagagttggtttatgttttcaacatg 35202990  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35202989 ttatttattgttgattgaagaaaaagatctataataaa 35202952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Original strand, 8797062 - 8797292
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgta--------attactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag-- 421  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||        ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||      
T  8797062 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttatatgtttataattactattgtttttacaattatatcctttaagagagaggg 8797161  T
Q  422 ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaa 521  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  8797162 ttggtttattttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatcggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaa 8797261  T
Q  522 taacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  8797262 taacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 8797292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 29321095 - 29321289
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||| ||||| | ||| ||||||||  | ||    
T  29321095 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatattttccatatgctatttattgctaat 29321194  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  29321195 tgaagaaaaagatgtatgataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 29321289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 360 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 5593654 - 5593470
Alignment:
Q  360 tatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgatt 458  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||| |||||    
T  5593654 tatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattactgatt 5593555  T
Q  459 gaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  5593554 gaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 5593470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 44502875 - 44502661
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-----agagagttggtttatgttttca 437  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |     |||||||| ||||||||||||     
T  44502875 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatccttaagagagagagagagttagtttatgttttcc 44502776  T
Q  438 acatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtctta 537  Q
    | ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||    
T  44502775 atatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtctta 44502676  T
Q  538 taaaaaagggacaaaa 553  Q
    || |||||||||||||    
T  44502675 ta-aaaagggacaaaa 44502661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 359 - 523
Target Start/End: Original strand, 44748263 - 44748429
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattga 456  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  |||    
T  44748263 atatttatattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctga 44748362  T
Q  457 ttgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  44748363 ttgaagaaaaagatgtataataaataaggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 44748429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 344 - 553
Target Start/End: Original strand, 2152026 - 2152235
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    ||||||||| | || |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | | |||||||| |||||||||||| | |||    
T  2152026 gaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatcgttaagagagagagttagtttatgttttccatatg 2152125  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
     ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||| | ||||||| |||    
T  2152126 ctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaataggtcttat-aaa 2152224  T
Q  543 aagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||    
T  2152225 aagggacaaaa 2152235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 299 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 45260520 - 45260304
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||||||| || |||||||| |    |||| ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  45260520 tactacctccgtccctaattatatgactcttttgaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattgttattgttttta 45260421  T
Q  399 caattttatcctttaaaag--agagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||||||| | ||  ||| ||| |    
T  45260420 caattttatcctttaagagataaagttggtttatgttttcaacatgttatttattgccgattgaagaaagagctgtataataaataaggtcatgtatgga 45260321  T
Q  497 aagaaataattaatgta 513  Q
    || ||||||||||||||    
T  45260320 aataaataattaatgta 45260304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 365 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 39463215 - 39463035
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaaga 463  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  39463215 gtattaaatttgtttgtaattactattgcttttacaattttatccttaagaaagagactaggtttatgttttcaacatagtatttattgttgattgaaga 39463116  T
Q  464 aaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaa 544  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||   |||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  39463115 aaaagatgtaaaataaataggggtatgttggtaaggaaataattaacgtagttggaaatgacaaaggggtcttataaaaaa 39463035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 332 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 110336 - 110184
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga----gttggtt 427  Q
    |||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    |||||||    
T  110336 aaaaaataatgggaattaagatcgtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatcttatcctttaagagagagagggttggtt 110237  T
Q  428 tatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  110236 tatgtttttaacatgttatttattggtgattgaaaaaaaatatgtataataaa 110184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 394 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 5951318 - 5951160
Alignment:
Q  394 ttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcat 493  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||    
T  5951318 ttttacaattttatcctttaagaggtagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtat 5951219  T
Q  494 gtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  5951218 gtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 5951160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 343 - 512
Target Start/End: Original strand, 21652266 - 21652441
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  21652266 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatttttattgtttttaccattttatcctttaaaagagagggttagtttatgttttcaaca 21652365  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaaca----ggggtatgcatgtaaagaaataattaatgt 512  Q
    |  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    | || ||| |||||||||||||||||||||    
T  21652366 taatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 21652441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 334 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 21137117 - 21136896
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaga--gagttggtttatg 431  Q
    ||||| || |||||||||| | |  ||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||||| |||  |||||  ||||||    
T  21137117 aaaatcatgggaattaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattatttttccaattttatcatttaagagatagagttaatttatg 21137018  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| || ||||| || |||||| ||||  |    
T  21137017 ttttcaacatgttatttattattcattgaagaaaaaaatgtataataaataggagtatgtaagtaaagaaatagttgatgtaattggaaatagcaaatga 21136918  T
Q  532 gtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||| |||| ||||    
T  21136917 gtcttataaaaaggggaaaaaa 21136896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 359 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 45425269 - 45425086
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgatt 458  Q
    |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  45425269 atatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttccatatgctatttattgttgatt 45425171  T
Q  459 gaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||  ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| | ||||||||||||    
T  45425170 gaagaaaaatatgtataataaataaggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaaaggtcttataaaaa 45425086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 44250920 - 44251116
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa---agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattg 455  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | |   |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||    
T  44250920 atatttgtattaaagttgtttgtaatcaatattatttttacaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctg 44251019  T
Q  456 attgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  44251020 attaaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 44251116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 343 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 5268221 - 5268050
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||  | |||| |||| |||| |||||||||||  ||||||  ||  |||||||||||||||    
T  5268221 ggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaaacattattatttt-acaaatttatcctttatgagagagaattaatttatgttttcaaca 5268123  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5268122 tattatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 5268050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 311 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 35203278 - 35203116
Alignment:
Q  311 ccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcc 409  Q
    |||||||||| | | |||||||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||       
T  35203278 ccttaattattgagccattttaaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttag-- 35203181  T
Q  410 tttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
          |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35203180 ------agagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaa 35203116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 345 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 40856047 - 40855846
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatg- 442  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | | | |||||| |||||||||||| | |||     
T  40856047 aattaagaaagtgaatatttatattaaaattgtttgtaattattattgtttttacaattttatctttaagataaagagttagtttatgttttccatatgt 40855948  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt-aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  40855947 ttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataagaatatgtatgtaaaaaaaataattaatgtagttagaaataacaaagaggtcttacaaa 40855848  T
Q  542 aa 543  Q
    ||    
T  40855847 aa 40855846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 11293867 - 11293696
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11293867 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataa 11293768  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
      | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11293767 gtaagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccgaaggagtcttata-aaaagggacaaa 11293696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 343 - 513
Target Start/End: Original strand, 36245697 - 36245869
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  36245697 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttctaatcacaattgtttttacaattttctccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 36245796  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt-aaagaaataattaatgta 513  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  36245797 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaaataattaatgta 36245869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 26990612 - 26990814
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttac-aattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||| |  ||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| |||||   |||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | |    
T  26990612 ggaattaagaaagcgaatatttgcattaaagttgtttgtaatcactatttttttttttaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccata 26990711  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    || || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   |||||||||    
T  26990712 tgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtatttggaaataacaaacgcgtcttataa 26990811  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  26990812 aaa 26990814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 359 - 552
Target Start/End: Original strand, 13568710 - 13568898
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | | ||||| | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||    
T  13568710 atatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagt-gatttatgttttccatatgctatttattgttgat 13568808  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13568809 ggaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag----aattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttat-aaaaagggacaaa 13568898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 345 - 553
Target Start/End: Original strand, 14583919 - 14584126
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgt 443  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||| | || |||||||||||  | ||||    
T  14583919 aattaagaaagtgaatatttgtattaaaattatttgtaatcacaattgtttttacaattttatccttaagagagaaaatttgtttatgtttttcatatgt 14584018  T
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| || |||||| ||||  |||||||| ||||    
T  14584019 tatttattggtaattgaagaaaa-gatatataataaacaggggcatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttat-aaaa 14584116  T
Q  544 agggacaaaa 553  Q
    ||||||||||    
T  14584117 agggacaaaa 14584126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 344 - 480
Target Start/End: Original strand, 44056855 - 44056990
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgt 443  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  | |||     
T  44056855 gaattaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagttagtttatgtttttcatatga 44056953  T
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  44056954 tatttattgttgatttaaaaaaaagatgtataataaa 44056990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 387 - 529
Target Start/End: Original strand, 31089750 - 31089893
Alignment:
Q  387 ctattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagggg 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | | |    
T  31089750 ctattgtttttacaattttatcctttaagagagagttagtttatgttttcaacatgctatttattactgattgaagaaaaatatgtataataaataagag 31089849  T
Q  487 tatgcatgtaaagaa-ataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    |||| | ||||| ||  ||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  31089850 tatgtaggtaaaaaatttaattaatgtagttaaaaataagaaag 31089893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 381 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 35179814 - 35179648
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  35179814 taattaatattgtttttacaattttatccttaagaaagagaattaatttatgttttcaacataatatttattattgattgaagaaaaaggtgcaaaataa 35179715  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    | |  ||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||||    
T  35179714 ataaaggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaaagg 35179648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 43292821 - 43292982
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  43292821 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaa 43292919  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     | | |||||   ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||    
T  43292920 taagagtatgttagtaaagaaataatgaatgtacttggaaatatcaaagagatcttataaaaa 43292982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 36786681 - 36786511
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  36786681 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataa 36786582  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  36786581 ataagggtatgttagtaaagaaataattaatctactt-ggaatatcaaatgagtcttat-aaaaagggacaaa 36786511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 365 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 17336647 - 17336469
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaaga 463  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  17336647 gtattaaatttgtatgtaattactattgtttt-acaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 17336549  T
Q  464 aaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||| | |||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||  |||||  ||| | ||||||||||||    
T  17336548 aaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatacaaaaaaggtcttataaaaa 17336469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 12802822 - 12802661
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  12802822 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaa 12802724  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     | ||||||     |||||||||||||||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||    
T  12802723 taagggtatattaataaagaaataattaatgtacttggaaataccataggggtcttataaaaa 12802661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 365 - 526
Target Start/End: Original strand, 25056707 - 25056868
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa--agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaag 462  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||      |||||||||||||||    
T  25056707 gtattaaatttgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaaaagagagagtttgtttatgttttcaacat----actattattgattgaag 25056802  T
Q  463 -aaaaagatgtataataaaca-ggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataaca 526  Q
     ||||| |||||||||||| | |||||||  | |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25056803 aaaaaaaatgtataataaatagggggtatataggtaaagaaataattaatgtagttggaaataaca 25056868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 426 - 543
Target Start/End: Original strand, 44580922 - 44581039
Alignment:
Q  426 tttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataac 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  44580922 tttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaatagttaatgtacttgaaaataac 44581021  T
Q  526 aaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||| |  |||||||||    
T  44581022 aaagaggcattataaaaa 44581039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 44165292 - 44165455
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||  ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||| | |||||    
T  44165292 taattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataa 44165391  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | ||||| |   ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  44165392 ataagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggagtcttataaaaa 44165455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 382 - 543
Target Start/End: Original strand, 5244451 - 5244613
Alignment:
Q  382 aattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||  |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  5244451 aattactattgtttttagaattttatccttaagagagagagttcatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaa 5244550  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     | |||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||    
T  5244551 taagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaa 5244613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 381 - 523
Target Start/End: Original strand, 23894731 - 23894872
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23894731 taattattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaa 23894829  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
     | || ||||   |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23894830 taaggatatgttagtaaagaaataattaatgtatttggaaata 23894872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 375 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 30512985 - 30512818
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtat 474  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| | |||| ||||||||||||  |||||| | || ||||||||||||||| ||     
T  30512985 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt--agagagagctagtttgtgttttcaacatagtatttaatgttcattgaagaaaaagatataa 30512888  T
Q  475 aataaacaggggtatgcatgtaaagaaa-taattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||| |||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||    
T  30512887 aataaataggggtatgttggtaaaaaaattaattaatgtacttgaaaataccaaaggggtcttataaaaa 30512818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 456 - 553
Target Start/End: Original strand, 7758808 - 7758904
Alignment:
Q  456 attgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7758808 attgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttat-aaaaagggacaaaa 7758904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 332 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 14625791 - 14625680
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||    
T  14625791 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagaaagaggattggctta 14625692  T
Q  430 tgttttcaacat 441  Q
    ||||||||||||    
T  14625691 tgttttcaacat 14625680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 334 - 543
Target Start/End: Original strand, 24260729 - 24260940
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatg 431  Q
    |||||||  |||||||||| ||| || | | ||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  || || ||||    
T  24260729 aaaataacgggaattaagaaaattaaaaatggtaataaatttgtttgtaattactattgcttttacaattctatcctttaaaagagagaattagtgtatg 24260828  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    ||||||| ||  |||||| || ||||||||||||||||| || |||||| | |||||||   ||||| || ||||||||| |||| |||||| |||||      
T  24260829 ttttcaagatagtatttaatactgattgaagaaaaagatataaaataaataagggtatgttggtaaaaaattaattaatgcacttggaaatatcaaaggg 24260928  T
Q  532 gtcttataaaaa 543  Q
     |||||||||||    
T  24260929 atcttataaaaa 24260940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 26626007 - 26625836
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||  ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||| | |||||    
T  26626007 taattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataa 26625908  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | | ||| |   ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26625907 ataagagtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggagtcttata-aaaagggacaaa 26625836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 332 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 28965730 - 28965643
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagag 419  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28965730 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagag 28965643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 36941482 - 36941320
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| | ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  36941482 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtagatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataa 36941384  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | |||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |  |||||||||||    
T  36941383 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatagatcttataaaaa 36941320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 359 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 11114018 - 11113829
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaga----gagttggtttatgttttcaacatgttatttattatt 454  Q
    |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    |||||| |||||||||| |||||| |||||||   |    
T  11114018 atatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttactattttatcctttaagagatagagagttgttttatgtttttaacatgatatttatcgct 11113919  T
Q  455 gattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaa---taattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |  ||||||||   |||||||| |  ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11113918 gattgaagaaaaagatgtataataaatagatgtatgtagataaagaaatagtaattaatatggttagaaatagcaaaagagtcttataaa 11113829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 365 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 23497960 - 23497779
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaa-- 461  Q
    ||||||||  ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||      
T  23497960 gtattaaatttgtatgcaattattattgtttttccaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaaa 23497861  T
Q  462 gaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||| | |||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||    
T  23497860 gaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttataaataccaaaagggtcttataaaaa 23497779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 382 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 13141670 - 13141511
Alignment:
Q  382 aattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaac 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||     
T  13141670 aattactattgtttttacaattttatc-tttaagagagagataatttatgttttcaacataatatttatttttgattgaa-aaaaagatgcaaaataaat 13141573  T
Q  482 aggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | || ||||    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | ||||||||||||    
T  13141572 aaggatatgttgataaagaaataattaatggacttaaaaatatcaaaaaggtcttataaaaa 13141511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 359 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 2767867 - 2767759
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgatt 458  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2767867 atatttgtattaaagatctttgtaatcactattgtttttacaatattattatttaagagataattattttatgttttcaacatgttatttatttttgatt 2767768  T
Q  459 gaagaaaaa 467  Q
    |||||||||    
T  2767767 gaagaaaaa 2767759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 343 - 546
Target Start/End: Original strand, 14548473 - 14548677
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||| |||| | ||    
T  14548473 ggaattaagaaagtgcatatttgtattaaagttgtttttaatcactattgtgtttacaattttatccttaaaagagatagtttatttatggtttccatat 14548572  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | ||||||||  ||||||||||  || |||||||||||| || || ||| ||||| | ||||||||||| || ||  ||||| ||||||  |||||||||    
T  14548573 gctatttattgctgattgaagaccaatatgtataataaatagaggcatgtatgtacataaataattaatatagttgaaaatagcaaagagatcttataaa 14548672  T
Q  542 aaagg 546  Q
    |||||    
T  14548673 aaagg 14548677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 23995790 - 23995620
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||   ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  23995790 taattactgttgtttttacaattttatccttgagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataa 23995692  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||  |||||||| ||||||||||||    
T  23995691 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttata-aaaagggacaaa 23995620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 403 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 40529497 - 40529354
Alignment:
Q  403 tttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaa 501  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||  ||| || |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  40529497 tttatccttaaaagagagagttagtttatgtttccat-atgctacttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 40529399  T
Q  502 ataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  40529398 ataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaaagg 40529354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 5110095 - 5109924
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataata 478  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||||||||| | ||||    
T  5110095 taattattattgtttttacaattttatcctt-aagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttatagttgattgaaaaaaaagatgcaaaata 5109997  T
Q  479 aacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    || | |||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||   |||||||| ||||||||||||    
T  5109996 aataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgggtcttata-aaaagggacaaa 5109924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 462 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 28965636 - 28965547
Alignment:
Q  462 gaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  28965636 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaagaggtcttata-aaaagggacaaa 28965547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 42747459 - 42747361
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  42747459 aattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattttttttacaattttattctttaagagagagggttggtttatattttcaacat 42747361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 342 - 476
Target Start/End: Original strand, 29738143 - 29738276
Alignment:
Q  342 aggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||  || | ||||| |||||| ||||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||| | ||    
T  29738143 aggaattaagaaattggatatttgtattaaagttgatggtaatcactattatttttacaattttgttctt-aagagagagttgatttatgttttccatat 29738241  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataa 476  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  29738242 gttatttatcgctgattgaagaaaaagatgtataa 29738276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 31618992 - 31619234
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtc-attttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||   ||||||||| |||  | | | ||| ||||  ||| | ||||| ||||| |||||    
T  31618992 tactacctccgtccttaattataggatccatttgaaaaaataacgagaattaagaaaattgaaaatggtaataaatttgtctataattgctatttttttt 31619091  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||| ||| ||| |  ||||||| || || ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| || || |||||| |||||| ||   ||||    
T  31619092 acaatttaatcatttga--gagagttagtgtacgttttcaacatattatttaatgttgattgaagaaaaa-atataaaataaataggggtgtgttggtaa 31619188  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||| || ||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||    
T  31619189 agaattagttaatgtacttggaaataccaaaaaggtcttataaaaa 31619234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 381 - 546
Target Start/End: Original strand, 41898317 - 41898485
Alignment:
Q  381 taattactattgttttt-acaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgt--tttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataa 476  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||  ||||| |  |||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||    
T  41898317 taattactattgttttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaa 41898415  T
Q  477 taaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    |||| | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  41898416 taaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaaagg 41898485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 299 - 392
Target Start/End: Original strand, 17851249 - 17851343
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattataggg-tcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattg 392  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17851249 tactacctccgtccctaattatagggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattg 17851343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 388 - 513
Target Start/End: Original strand, 39970555 - 39970683
Alignment:
Q  388 tattgtttttacaattttatcctttaaa---agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagg 484  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||   |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||| | |    
T  39970555 tattgtttttacaatttaatacttaaaagagagagagtttgtttatgttttcaacatagtatttattgttgatggaagaaaaatatgtaaaataaataag 39970654  T
Q  485 ggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    || |||   ||||||||||||||||||||    
T  39970655 ggcatgttggtaaagaaataattaatgta 39970683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 457 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 42885191 - 42885105
Alignment:
Q  457 ttgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||    
T  42885191 ttgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 42885105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 444 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 19176286 - 19176178
Alignment:
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| |||    
T  19176286 tatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttata-aaa 19176188  T
Q  544 agggacaaaa 553  Q
    ||||||||||    
T  19176187 agggacaaaa 19176178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 26502694 - 26502530
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-----agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtata 475  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |     ||||||||  ||||| |||||||| |  ||||||||   ||||||||||||||||||| |    
T  26502694 taatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagagttaatttatattttcaacgtaatatttatt---gattgaagaaaaagatgtaaa 26502598  T
Q  476 ataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||| | |||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  26502597 ataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacatagaaatacaaaaggggtcttataaaaa 26502530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 375 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 39970189 - 39970021
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| || ||||||||||| ||  |||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  39970189 tgtttgtaattgtcattgtttttacaattgtatcctttaaaagagagggttagtgtatgttttcaatataatatttactgctgattgaagaaaaagatat 39970090  T
Q  473 ataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | |||||| | |||| ||   |||||||| ||||||||||| || ||||||  |||||  |||||||||    
T  39970089 aaaataaataagggtgtgttggtaaagaattaattaatgtatttggaaatatgaaagagttcttataaa 39970021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 343 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 42885423 - 42885315
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct-tta--aaagagagttggtttatgttttcaac 439  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||  |||||  ||| ||||||||||||||     
T  42885423 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttcttaagaaagaacgttagtttatgttttcaat 42885324  T
Q  440 atgttattt 448  Q
    |||||||||    
T  42885323 atgttattt 42885315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 363 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 23425041 - 23424913
Alignment:
Q  363 ttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaa 461  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||  ||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||    
T  23425041 ttgtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaaaagagataattaatttatgttttcaagataatatttatggttgattgaa 23424942  T
Q  462 gaaaaagatgtataataaacaggggtatg 490  Q
    |||||||||| | |||||| | |||||||    
T  23424941 gaaaaagatgcaaaataaataagggtatg 23424913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 429 - 523
Target Start/End: Original strand, 9615956 - 9616050
Alignment:
Q  429 atgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
    |||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  9615956 atgttttacacatgttatatattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtagttaaagaaataattaacgtagtttgaaata 9616050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 293 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 5952587 - 5952482
Alignment:
Q  293 atctagtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactatt 391  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||| || |||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  5952587 atctaatactaccttcgtccctaattatatggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatatt 5952488  T
Q  392 gttttt 397  Q
    | ||||    
T  5952487 gatttt 5952482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 454 - 546
Target Start/End: Original strand, 17851345 - 17851437
Alignment:
Q  454 tgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||| || || ||||||  |||  ||||||||||||||||    
T  17851345 tgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatataaagaaataattaatatagttggaaatagtaaaagagtcttataaaaaagg 17851437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 401 - 478
Target Start/End: Original strand, 28929339 - 28929418
Alignment:
Q  401 attttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataata 478  Q
    |||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  28929339 attttatcttttaaaagagagactttgtttatgttttcaacatgctatttattgtttattggagaaaaagatgtataata 28929418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 420
Target Start/End: Original strand, 44580539 - 44580615
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga 420  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44580539 gaattaagaaagttaatatttgcattaaacttgtttgttatcactaatgtttttacaattttatcctttaaaagaga 44580615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 444 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 42220606 - 42220510
Alignment:
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||    
T  42220606 tatttattgttg-ttgaagaaaaatatgtataataaatagaagtatgtatataaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaagaagt-ttataaaa 42220510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 437
Target Start/End: Original strand, 7758713 - 7758808
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttca 437  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||    
T  7758713 ggaattaagataatggatagttgtattaaagttgtttgtaatcact-ttgtttttacgattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttca 7758808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 16894175 - 16894062
Alignment:
Q  302 tacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttaca 400  Q
    |||||||| |||||||||||   || |||| ||||||||||  ||||||||| |||  | | | ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16894175 tacctccgtccttaattataaaatccttttgaaaaaataatgagaattaagaaaattgaaaatggtaataaaattgtttgtaattactattgtttttaca 16894076  T
Q  401 attttatcctttaa 414  Q
    ||||||||||||||    
T  16894075 attttatcctttaa 16894062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 385
Target Start/End: Original strand, 34070969 - 34071058
Alignment:
Q  297 agtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaatt 385  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||| | | || |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34070969 agtactacctctgtccctaattatagggccctcttgaaaaaataacggaaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaatt 34071058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 451
Target Start/End: Original strand, 39112562 - 39112655
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagag-agttggtttatgttttcaacatgttatttatt 451  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||| |||| | || |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  39112562 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcatctaagagagaaattagtttatgtattcaacatgctatttatt 39112655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 45145446 - 45145297
Alignment:
Q  393 tttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgc 491  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||||     
T  45145446 tttttacaattttattcttaagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatatgtacaataaataaaggtatgt 45145347  T
Q  492 atgt-aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
       | ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  45145346 tgataaaaaaaataattaatgtatttaaaaataccaaaaaagtcttataa 45145297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 28741116 - 28740973
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgt 432  Q
    ||||| || |||||||| | | || ||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||  ||||| |    
T  28741116 aaaattatgggaattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttacaattattattgtttttacaattttatccttaagagcgagagttaatttatat 28741017  T
Q  433 tttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataa 476  Q
    |||| | || |||||||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  28741016 tttctatatattatttattgctcattgaaaaaaaagatgtataa 28740973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 382 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 36409809 - 36409710
Alignment:
Q  382 aattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| ||  |||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  36409809 aattactattgtttttacaattttattcttaagagagagaattaatttatgtttttaatatgatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaa 36409710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 466
Target Start/End: Original strand, 19700749 - 19700918
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||| ||||  |||||||  |||||||||| |||  | | | ||| || |  |||||||||||| || ||||||||    
T  19700749 tactacccccgtccctaattatagggtctttttggaaaataacgggaattaagaaaattgaaagtggtaatatatttgtttgtaattattactgttttta 19700848  T
Q  399 caattttatcctttaaaag--agagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaa 466  Q
    |||||||||||||||| ||  || ||| || |||||||| |||||  |||||| | ||||||||| ||||    
T  19700849 caattttatcctttaagagaaagggttagtgtatgttttgaacataatatttaatgttgattgaaaaaaa 19700918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 453 - 543
Target Start/End: Original strand, 37023179 - 37023269
Alignment:
Q  453 ttgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||   ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||| || |||||||||    
T  37023179 ttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatatacttgaaaatatcaaagaggttttataaaaa 37023269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 425 - 546
Target Start/End: Original strand, 13401789 - 13401909
Alignment:
Q  425 gtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataa 524  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | | ||| || ||| |||| || |||||||||     
T  13401789 gtttatattttcaacatgctatttattgct-attgaagaaaaagatgtataataaatagggttatatagggaaaaaagtaactaatatagttagaaatag 13401887  T
Q  525 caaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    || |||  ||||||||||||||    
T  13401888 cacagagatcttataaaaaagg 13401909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 411 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 29073807 - 29073738
Alignment:
Q  411 ttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29073807 ttaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaa 29073738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 428 - 543
Target Start/End: Original strand, 4348382 - 4348497
Alignment:
Q  428 tatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaa 527  Q
    ||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||| || |||||| | || ||||   |||||||| || | |||||||||  ||||| |||    
T  4348382 tatgttttcaacatagtatttaatactgattgaagaaaaagatataaaataaataaggatatgttggtaaagaattactgaatgtacttgaaaataccaa 4348481  T
Q  528 agaagtcttataaaaa 543  Q
    | | ||||||||||||    
T  4348482 atatgtcttataaaaa 4348497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 359 - 414
Target Start/End: Original strand, 41388546 - 41388601
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 414  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41388546 atatttgtattaaaattgtttgtgatgactattatttttacaattttatcctttaa 41388601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 42486282 - 42486245
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42486282 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatacttt 42486245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 381 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 5449646 - 5449587
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||||||    
T  5449646 taattattattgtttttacaattttat-ctttaagagagagttaatttatattttcaacat 5449587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 428 - 528
Target Start/End: Original strand, 25635979 - 25636079
Alignment:
Q  428 tatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaa 527  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| | ||| |||||||||||| || |  ||| ||||| ||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  25635979 tatgttttccacatgctatttattgctgattgaaaataaacatgtataataaatagagacatgtatgtacagaaataattaatatagttgaaaataacaa 25636078  T
Q  528 a 528  Q
    |    
T  25636079 a 25636079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 467
Target Start/End: Original strand, 15021174 - 15021268
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaa 467  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||   || || |||||||| |||||  | |||| | |||||||||||||||    
T  15021174 tgtttgtaattgttattgtttttacaattttaacctttaagagagatgattagtgtatgttttgaacataatctttaatgttgattgaagaaaaa 15021268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 16893885 - 16893811
Alignment:
Q  395 tttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaa 467  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||  ||| || ||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||    
T  16893885 tttacaattttatcttttaagagagaaagttagtgtatgttttcaacatagtatttaatgttgattgaagaaaaa 16893811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 40530398 - 40530336
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaatttt 405  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  40530398 ggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcacggttgtttttacaatttt 40530336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 444 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 5449300 - 5449231
Alignment:
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |  ||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  5449300 tatttattattgattgaagaaaatgatgcaaaataaataaaggtatgttggtaaaaaaataattaatgta 5449231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 365 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 19176920 - 19176844
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag-ttggtttatgttttcaacat 441  Q
    ||||||||  ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  19176920 gtattaaatttgtatgtaattaatactgtttttacaattttatcc-ttaagagagagattaatttatgttttcaacat 19176844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 425 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 19261061 - 19260972
Alignment:
Q  425 gtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataat-aaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    |||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||   ||||| ||||||||||||||    
T  19261061 gtttttgtttttaacataatatttattgttgattgaataaaaagatgtaaaataaaatagggatatgtcggtaaaaaaataattaatgta 19260972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 375 - 408
Target Start/End: Original strand, 19715659 - 19715692
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatc 408  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19715659 tgtttgtaattattattgtttttacaattttatc 19715692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 449
Target Start/End: Original strand, 34071077 - 34071110
Alignment:
Q  416 agagagttggtttatgttttcaacatgttattta 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34071077 agagagttggtttatgttttcaacatgctattta 34071110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 172)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 298 - 552
Target Start/End: Original strand, 12889948 - 12890202
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12889948 gtactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttt 12890047  T
Q  397 tacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  12890048 tacaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 12890147  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  12890148 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaa 12890202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 40788829 - 40789074
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||| |||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  40788829 tactacttccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttatattaaatatgtttataattactattgttttt 40788928  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  40788929 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 40789028  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  40789029 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 40789074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 22182664 - 22182918
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||| |||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22182664 tacttcctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 22182763  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  22182764 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttagtgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 22182863  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  22182864 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 22182918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 41004239 - 41003985
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  41004239 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtgattaatattgttttt 41004140  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    | ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  41004139 ataattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattaatgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatccatgtaa 41004040  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  41004039 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 41003985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 31751370 - 31751111
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31751370 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 31751271  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattg---aagaaaaagatgtataataaacaggggtatgca 492  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31751270 acaattttatcctttaagaaagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaaaaagatgtataataaataggggtatgca 31751171  T
Q  493 tgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  31751170 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 31751111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 13336496 - 13336741
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13336496 tactacctccgtccctaattatagggttcttttgaaaaaataacgggaattaatatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 13336595  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||    
T  13336596 acaattttatcttttaaaagagagttggtttatgtttttaacatgttatttattgttgattgaataaaatgatgtataataaataggggcatatatataa 13336695  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  13336696 agaaataattaatgtagttggaaataacaaaggaatcttataaaaa 13336741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 23465431 - 23465186
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23465431 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 23465332  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  23465331 acaattttatcctttaagagagaattggttaatattttcaacatgatatttattgatgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaa 23465232  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||    
T  23465231 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaa 23465186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 328 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 6007840 - 6007614
Alignment:
Q  328 ttttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagt--tgg 425  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||   |||    
T  6007840 ttttaaaaaataacgggaattaagataatatatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttcaagagagagaaatgg 6007741  T
Q  426 tttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataac 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6007740 tttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaaaatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttagaaataac 6007641  T
Q  526 aaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  6007640 aaaaatgttttat-aaaaagggacaaaa 6007614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 298 - 553
Target Start/End: Original strand, 11851926 - 11852181
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  11851926 gtactacctccgtccttaattatagagttcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttt 11852025  T
Q  397 tacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  11852026 tacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataattaataggggcatgcatgta 11852125  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    || |||||||||||||| || |||||| |||||   |||||| ||||||||||||||    
T  11852126 aataaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttat-aaaaagggacaaaa 11852181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 553
Target Start/End: Original strand, 19318792 - 19319050
Alignment:
Q  297 agtactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttt 395  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19318792 agtactacctctgtccctaattatagggtccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 19318891  T
Q  396 ttacaattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcat 493  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||   || ||    
T  19318892 ttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatattttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacgtgtat 19318991  T
Q  494 gtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  19318992 gtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttat-aaaaagggacaaaa 19319050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 40607966 - 40607744
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagt--tggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||    
T  40607966 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaggtggttta 40607867  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  40607866 tgttttaaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaag 40607767  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
      |||||||| |||||||||||||    
T  40607766 gggtcttata-aaaagggacaaaa 40607744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 8912615 - 8912869
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  8912615 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 8912714  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  8912715 acagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 8912814  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  8912815 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 8912869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 1748381 - 1748637
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  1748381 tactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagattatggatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattattttt 1748480  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||| ||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||    
T  1748481 acaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggtatgtatgt 1748580  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1748581 aaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaagaggtcttat-aaaaagggacaaaa 1748637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 343 - 546
Target Start/End: Original strand, 13197429 - 13197634
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  13197429 ggaattaagatagtggatatttgtattaaacttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 13197528  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  13197529 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataa 13197628  T
Q  541 aaaagg 546  Q
    ||||||    
T  13197629 aaaagg 13197634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 40680404 - 40680648
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  40680404 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataatgggaattaaaatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 40680503  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || || ||| ||||||    
T  40680504 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagaggcatgtatgtaa 40680603  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||| || || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  40680604 agaaataattaatataattggaaatagcaaag-ggtcttataaaaa 40680648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 15227890 - 15228144
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||| |||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15227890 tactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 15227989  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15227990 acaattttatccttcgagagagaattggtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaa 15228089  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  15228090 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 15228144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 314 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 20643763 - 20643533
Alignment:
Q  314 taattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 412  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  20643763 taattatagggcccttttgaaaaaataacaggaattaagatagcgaatatttgtattatatatgtttgtaattagtattctttttacaattttatctttt 20643664  T
Q  413 aaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgt 512  Q
    || |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || || ||| |||||||||||||||||||||    
T  20643663 aagagagagatgttttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 20643564  T
Q  513 acttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | || ||||||||||||  ||||||||||||    
T  20643563 agttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 20643533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 25624982 - 25624774
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||    
T  25624982 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaag-gttagtttatgttttcaacatg 25624884  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| ||    
T  25624883 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata-aa 25624785  T
Q  543 aagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||    
T  25624784 aagggacaaaa 25624774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 299 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 2060614 - 2060360
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2060614 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatatttgtaattactattgttttt 2060515  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| ||||    
T  2060514 acaattttatcctttaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagat-tataataaatatgggaatgtatgt 2060416  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||  ||| |||| |||||||||||||    
T  2060415 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtattat-aaaaagggacaaa 2060360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 34883632 - 34883843
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  34883632 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 34883731  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  34883732 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 34883830  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  34883831 aaaagggacaaaa 34883843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 17665786 - 17665575
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | ||||    
T  17665786 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaattttatcttttaagagagagatgatatatg 17665687  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |    
T  17665686 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataattaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagga 17665587  T
Q  532 gtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||    
T  17665586 gtcttataaaaa 17665575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 302 - 553
Target Start/End: Original strand, 26322035 - 26322288
Alignment:
Q  302 tacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttaca 400  Q
    |||||||| ||||||||||| || | |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26322035 tacctccgtccttaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 26322134  T
Q  401 attttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaa 498  Q
    |||||||||||||  |||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  26322135 attttatcctttaagaaagagggctggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggtgcatgtatgtaaa 26322234  T
Q  499 gaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||| || ||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  26322235 gaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttat-aaaaagggacaaaa 26322288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 1142997 - 1143253
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| | || |||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1142997 tactacctccgtccctaattataagatccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 1143096  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  1143097 acaattttatcctttaagaaagatggttggtttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgt 1143196  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  1143197 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagagtcttat-aaaaagggacaaaa 1143253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 38214776 - 38214531
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||||| || || ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38214776 tactaccttcgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 38214677  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||    
T  38214676 acaattttatcctttaagagagaaatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataattaatagggacatgtatgtaa 38214577  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  ||||   |||||||||||    
T  38214576 agaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaa 38214531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7531865 - 7531654
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  7531865 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatttgttttatg 7531766  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    |||| |||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||     
T  7531765 tttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaatgaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagag 7531666  T
Q  532 gtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||    
T  7531665 gtcttataaaaa 7531654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 323 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7666551 - 7666329
Alignment:
Q  323 ggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga-- 420  Q
    |||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||      
T  7666551 ggtcctttgaaaaaataacggaaattaagataatgaatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagtgaag 7666452  T
Q  421 gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaa 520  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  7666451 gttggtatatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtacaataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaa 7666352  T
Q  521 ataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||| ||||   ||||||||||||    
T  7666351 atagcaaatgcgtcttataaaaa 7666329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 11385909 - 11386163
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11385909 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 11386008  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||| || ||||  ||  ||||||    
T  11386009 acaattttatcctttaagtgagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattaaagaaaaaaatatataattaatagggacatatatgtaa 11386108  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  11386109 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaattagtcttat-aaaaagggacaaaa 11386163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 20252463 - 20252261
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  20252463 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 20252364  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  20252363 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataa 20252264  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  20252263 aaa 20252261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 298 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 41834706 - 41834457
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  41834706 gtactgcctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatactggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttt 41834607  T
Q  397 tacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  41834606 tacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttctacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgattaataggggcatgcatgta 41834507  T
Q  497 ---aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
       || |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||    
T  41834506 tgtaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaa 41834457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 344 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 1943826 - 1943625
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacat 441  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||||||    
T  1943826 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagatggttagtttatgttttcaacat 1943727  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  1943726 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 1943627  T
Q  542 aa 543  Q
    ||    
T  1943626 aa 1943625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 333 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 25523762 - 25523572
Alignment:
Q  333 aaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgt 432  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25523762 aaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttaatcctttaagagagggttggtttatgt 25523663  T
Q  433 tttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  || | ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25523662 tttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaaaatgtataataaattggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 25523572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 34113766 - 34113573
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgatt 458  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  34113766 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagataattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgatt 34113667  T
Q  459 gaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  34113666 gaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 34113573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 37229693 - 37229481
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  37229693 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 37229594  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||     
T  37229593 tgttatttattgttgattgaagaaaaaaatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata- 37229495  T
Q  541 aaaagggacaaaag 554  Q
    ||||||||||||||    
T  37229494 aaaagggacaaaag 37229481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 546
Target Start/End: Original strand, 41967988 - 41968192
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  41967988 ggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaaca 41968087  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  41968088 tgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaggaa-ttttataa 41968186  T
Q  541 aaaagg 546  Q
    ||||||    
T  41968187 aaaagg 41968192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 8990457 - 8990246
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  8990457 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatgttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 8990358  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   || |||| |    
T  8990357 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggttttat-a 8990259  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  8990258 aaaagggacaaaa 8990246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 20727642 - 20727853
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  20727642 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 20727741  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  20727742 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 20727840  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  20727841 aaaagggacaaaa 20727853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 36130812 - 36131023
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  36130812 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 36130911  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||| |    
T  36130912 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaaaggtcttat-a 36131010  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  36131011 aaaagggacaaaa 36131023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 343 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 32121197 - 32120987
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||| ||||    
T  32121197 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgtttttaaca 32121098  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||     
T  32121097 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttata- 32120999  T
Q  541 aaaagggacaaa 552  Q
    ||||||||||||    
T  32120998 aaaagggacaaa 32120987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 344 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 45474567 - 45474381
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacat 441  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||||||    
T  45474567 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 45474468  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  45474467 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 45474381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 342 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 41450770 - 41450558
Alignment:
Q  342 aggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaac 439  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||||    
T  41450770 aggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaac 41450671  T
Q  440 atgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttata 539  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||    
T  41450670 atgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttata 41450571  T
Q  540 aaaaagggacaaaa 553  Q
     |||||||||||||    
T  41450570 -aaaagggacaaaa 41450558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 5664891 - 5664680
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |  ||| ||||||||||| ||||    
T  5664891 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaatgttagtttatgtttttaaca 5664792  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||     
T  5664791 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaatgaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata- 5664693  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  5664692 aaaagggacaaaa 5664680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 8716676 - 8716887
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||| |||||||||    
T  8716676 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaaca 8716775  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||   ||||||| |    
T  8716776 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttat-a 8716874  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  8716875 aaaagggacaaaa 8716887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 11865026 - 11865274
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| || | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11865026 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 11865125  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaag-aaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||| |||    
T  11865126 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaagatgtataataaataggagcatgtatg 11865225  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  ||||||||||||    
T  11865226 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 11865274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 15404492 - 15404702
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  15404492 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 15404591  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  15404592 t-ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 15404689  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  15404690 aaaagggacaaaa 15404702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 299 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 19034708 - 19034465
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||    
T  19034708 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactatt---ttt 19034612  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagt--tggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||| |||||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  19034611 acaattttgtcctttaagagagagtgttgatttatcttttcaacatgttatttattgttgaatgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 19034512  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||   |||||||||||    
T  19034511 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa 19034465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 28840875 - 28840680
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattga 456  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  28840875 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctga 28840776  T
Q  457 ttgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  28840775 ttaaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattattgtagttggaaataacaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 28840680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 34062449 - 34062660
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  34062449 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 34062548  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||   |||||| |    
T  34062549 tgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataactaatgtagttggaaataacaaagggatcttat-a 34062647  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  34062648 aaaagggacaaaa 34062660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 7418758 - 7418535
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggttta 429  Q
    ||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||    
T  7418758 aaaaaataacagaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggctta 7418659  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||     
T  7418658 tgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaatgatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaa 7418559  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
      ||||| || |||||||||||||    
T  7418558 gggtcttttataaaagggacaaaa 7418535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 342 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 7492097 - 7491886
Alignment:
Q  342 aggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | | |||||| |||||||||||| | |    
T  7492097 aggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagttagtttatgttttccata 7491998  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||     
T  7491997 tgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttata- 7491899  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  7491898 aaaagggacaaaa 7491886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 299 - 542
Target Start/End: Original strand, 10399201 - 10399447
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattataggg-tcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || || ||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  10399201 tactacatccgtccttaattataaggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacttttattttt 10399300  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  10399301 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattactcattgaagaaaaagatgtatagtaaataggggcatgtatgt 10399400  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  |||  ||||||||||||    
T  10399401 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaa 10399447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Original strand, 32712559 - 32712770
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |  || ||||||    
T  32712559 aaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtagttagtattgattttacaattttatcctttaagagataaatgatttatg 32712658  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |    
T  32712659 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagga 32712758  T
Q  532 gtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||    
T  32712759 gtcttataaaaa 32712770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 42629617 - 42629414
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||||     
T  42629617 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaa------gttagtttatgttttcaacata 42629524  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| ||    
T  42629523 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataatatataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata-aa 42629425  T
Q  543 aagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||    
T  42629424 aagggacaaaa 42629414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 18375490 - 18375234
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||| | | | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18375490 tactacctccgtccctaattatggagcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 18375391  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagt--tggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||| |||||    || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  18375390 acaattttatcctttaagagagatgagtgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgt 18375291  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||| || ||  ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  18375290 aaagaaataattaatatagttgtaaatagcaaatgagtcttata-aaaagggacaaaa 18375234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 24345715 - 24345459
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24345715 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaataactattgttttt 24345616  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||  ||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  24345615 acaattttatcctttaagaaagagagctgacttatgctttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 24345516  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  |||   ||||||| ||||||||||||||    
T  24345515 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaagggtcttat-aaaaagggacaaaa 24345459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 16669879 - 16669668
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  16669879 ggaattaagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 16669780  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||   ||||||||     
T  16669779 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatgggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttata- 16669681  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  16669680 aaaagggacaaaa 16669668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 40680980 - 40680769
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  40680980 ggaattaagatggtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgattttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 40680881  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||  ||||||||     
T  40680880 tgttatttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatatagttgaaaataacaaaggggtcttata- 40680782  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  40680781 aaaagggacaaaa 40680769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 2200277 - 2200030
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2200277 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 2200178  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagt--tggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||| ||||  ||| ||||    
T  2200177 acaattttatcatttaagagagagtgttggtttctgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtacagtaaatagggtcatgtatgt 2200078  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  2200077 aaataaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 2200030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 334 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 4711988 - 4711769
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgt 432  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||  ||| ||||||||    
T  4711988 aaaatcatgggaattaagatactggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatctttaagaaagaaggttagtttatgt 4711889  T
Q  433 tttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaag 532  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |    
T  4711888 tttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 4711789  T
Q  533 tcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  4711788 ccttat-aaaaagggacaaaa 4711769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 24974064 - 24973842
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggttta 429  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| || ||||| |||    
T  24974064 aaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcctttaagaaaaagggttggctta 24973965  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||    
T  24973964 tgttttcaacattctatttattgctgatagaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaag 24973865  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
       |||||| ||||||||||||||    
T  24973864 ggatcttat-aaaaagggacaaaa 24973842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 298 - 513
Target Start/End: Original strand, 34944157 - 34944368
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  34944157 gtactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttt 34944256  T
Q  397 tacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||||    
T  34944257 tacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttc-----gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagggacatgtatgta 34944351  T
Q  497 aagaaataattaatgta 513  Q
    |||||||||||||||||    
T  34944352 aagaaataattaatgta 34944368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Original strand, 44573662 - 44573878
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  44573662 aaaaaataacggaaattaagatactgaatatttgta---aatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagatggatggtttatg 44573758  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||     
T  44573759 tttt-aacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagag 44573857  T
Q  532 gtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  44573858 gtcttat-aaaaagggacaaaa 44573878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 5255797 - 5255585
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggttta 429  Q
    |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||    
T  5255797 aaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggctta 5255698  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||||||| ||  |||||  ||||    
T  5255697 tgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataa-taatgtagttgaaaatagaaaag 5255599  T
Q  530 aagtcttataaaaa 543  Q
    | ||||||||||||    
T  5255598 aggtcttataaaaa 5255585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 38121250 - 38121506
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaatt-aagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||  ||| ||||||||||  |  |||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38121250 tactacctccgtccctaattataaagtccttttaaaaaaataacggaatttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 38121349  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||    
T  38121350 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgt 38121449  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  38121450 aaagaaataattaatgtagttggtaatagaaaatgagtcttat-aaaaagggacaaaa 38121506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 299 - 513
Target Start/End: Original strand, 45628620 - 45628837
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45628620 tactacctccgtccctaattataaagcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 45628719  T
Q  398 acaattttatccttt--aaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  45628720 acaattttaccctttaaaaaagagggttggcttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 45628819  T
Q  496 aaagaaataattaatgta 513  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45628820 aaagaaataattaatgta 45628837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 299 - 511
Target Start/End: Original strand, 30779740 - 30779955
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30779740 tactacctccgtccctaattataggatcattttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgttttt 30779839  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||| |||||| || || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||    
T  30779840 acaaatttatctttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgt 30779939  T
Q  496 aaagaaataattaatg 511  Q
    ||||||||||||||||    
T  30779940 aaagaaataattaatg 30779955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 334 - 543
Target Start/End: Original strand, 36021025 - 36021235
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatg 431  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||| |||||||    
T  36021025 aaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaatgttagtttatg 36021124  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||| |||| |    
T  36021125 ttttcgacatgttatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaataataaagga 36021223  T
Q  532 gtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||    
T  36021224 gtcttataaaaa 36021235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 299 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 7933718 - 7933504
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||  | |||| |||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7933718 tactacatccgttcttaattataggacccttttgaaaaaacaacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 7933619  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| || || ||| ||||    
T  7933618 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaacatgtataataaatagaggcatgtatgt 7933519  T
Q  496 aaagaaataattaat 510  Q
    |||  ||||||||||    
T  7933518 aaaacaataattaat 7933504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 349 - 553
Target Start/End: Original strand, 15435667 - 15435871
Alignment:
Q  349 aagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttat 446  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15435667 aagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattatatcatttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgtttt 15435766  T
Q  447 ttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||   ||||||| |||||||    
T  15435767 ttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaa-aaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttat-aaaaagg 15435864  T
Q  547 gacaaaa 553  Q
    |||||||    
T  15435865 gacaaaa 15435871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 22897643 - 22897433
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||    
T  22897643 ggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatattatccttaagaaagagagttagtttatgttttccatat 22897544  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  || |||| ||    
T  22897543 gctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggttttat-aa 22897445  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  22897444 aaagggacaaaa 22897433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 23789221 - 23789011
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  23789221 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 23789122  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |    
T  23789121 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata-a 23789023  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  23789022 aaagggacaaaa 23789011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 299 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 19353489 - 19353272
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| || |  ||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19353489 tactacctccgtccctaattataaggcctctttaaaaaaataaagggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgttttt 19353390  T
Q  398 acaattttatcctttaaaa--gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  19353389 acaattttatcctttaagaatgagtgttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 19353290  T
Q  496 aaagaaataattaatgta 513  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19353289 aaagaaataattaatgta 19353272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 1859811 - 1859590
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  ||||||||    
T  1859811 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaaatttatccttcaagagagagaattggttta 1859712  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |  || ||| | |||||||||||||||||||| || |||||| ||||     
T  1859711 tattttcaacatcttatttattgttgattgaagaaaaaaatgaataataaata-aggcatgtaggtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaat 1859613  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
     |||||||| ||||||||||||||    
T  1859612 gagtcttat-aaaaagggacaaaa 1859590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 362 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 8782700 - 8782517
Alignment:
Q  362 tttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattg 459  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  8782700 tttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattg 8782601  T
Q  460 aagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||||| | |   ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||  |||||||||||||    
T  8782600 aagaaaaagatgtataataaatatgttcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataggaaaatagtcttataaaaa 8782517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 1360027 - 1359833
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  1360027 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 1359928  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  1359927 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 1359833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 8841458 - 8841652
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | |||||| |||||  ||||    
T  8841458 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgat 8841557  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  8841558 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 8841652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 16805592 - 16805786
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  16805592 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 16805691  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  16805692 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 16805786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 16844874 - 16845068
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  16844874 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 16844973  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  16844974 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 16845068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 361 - 553
Target Start/End: Original strand, 18374505 - 18374697
Alignment:
Q  361 atttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgatt 458  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  |||||    
T  18374505 atttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt-atcttttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgatt 18374603  T
Q  459 gaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18374604 gaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggagtcttat-aaaaagggacaaaa 18374697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 299 - 540
Target Start/End: Original strand, 40173142 - 40173380
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || | |||||| | || |||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  40173142 tactacctccgtcccttattatatgatccttttgaaaaaataacgggaattaagatcgtgaatatttatattaaatatgtttataattactattgttttt 40173241  T
Q  398 acaattttatcctttaaaag--agagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||  |||||       ||    
T  40173242 acaattttatcctttaagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataagtagggg------ggt 40173335  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||  ||||||||||    
T  40173336 aaagaaataattattgtagttggaaataacaaatgagtcttataa 40173380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 15917820 - 15918074
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||||| | || |||||||| |||  ||| |||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  15917820 tactacctctgtccctaattataaggttttttaaaaaaataacgggaattaagatagtgaatattagtattaaatatgtttgtaattactatt-atttta 15917918  T
Q  399 caattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    || ||||| ||||||  | ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||  | | |||||    
T  15917919 cagttttaccctttaagagagagagttgatttacgttttgaacatgttatttattactgattgaagaaaaaaatgtataataaataaggacaagtatgta 15918018  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  15918019 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttat-aaaaagggacaaaa 15918074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 299 - 544
Target Start/End: Original strand, 8030758 - 8030993
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattataggg-tcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| || ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||    
T  8030758 tactaactccgtctttaattatagggatcttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattgaatatgtttgtaatttctattattttt 8030857  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||           ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  8030858 acaattttatcgtttaagagagagttggttt-----------atgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 8030946  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaa 544  Q
    | |||||||||||||| || |||||| |||||   ||||||||||||    
T  8030947 aaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtgatcttataaaaaa 8030993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 2438461 - 2438267
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  2438461 atatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 2438362  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  2438361 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 2438267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 16108260 - 16108470
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||| ||||| | ||    
T  16108260 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatattttccatat 16108359  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||    
T  16108360 gctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aa 16108458  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  16108459 aaagggacaaaa 16108470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 16456673 - 16456867
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || ||||| |||||    
T  16456673 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagacagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgat 16456772  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  16456773 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatgacaaaagggtcttat-aaaaagggacaaaa 16456867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 39833800 - 39833994
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  39833800 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 39833899  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  39833900 tgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 39833994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 378 - 513
Target Start/End: Original strand, 3670309 - 3670446
Alignment:
Q  378 ttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtata 475  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3670309 ttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtata 3670408  T
Q  476 ataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  3670409 ataaataggggcatgtatgtaaagaattaattaatgta 3670446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 359 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 11201919 - 11201734
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaa-gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  11201919 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagtgagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 11201820  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||    
T  11201819 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagtgtcttataaaaa 11201734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 299 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 30466423 - 30466247
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||| || ||| |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30466423 tactacctccgtccctaattacagtgtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 30466324  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    |||| ||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30466323 acaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgt 30466247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 345 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 5070557 - 5070389
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||      
T  5070557 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaactactattgtttttataattttattctttaagagagatggttggtttatgttttcaaca-- 5070460  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5070459 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatataggcatgtatgtaaataaataattaatgta 5070389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 334 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 27560467 - 27560248
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgt 432  Q
    ||||| || |||||||||| | |  ||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||    
T  27560467 aaaatcatgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtatgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagaaagagagttaatttatgt 27560368  T
Q  433 tttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaag 532  Q
    |||  | |||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |    
T  27560367 ttttcatatgttacttattgatgattgaagaaaaatatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggg 27560268  T
Q  533 tcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  27560267 tcttata-aaaagggacaaaa 27560248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 9697942 - 9698136
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||| ||||  | ||  || |||||  ||||    
T  9697942 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatatttttcatatactacttattgctgat 9698041  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  9698042 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 9698136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 12620073 - 12619858
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagt----tggtt 427  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||     |||||    
T  12620073 aaaaaataatggtaattaagatagtgactatttgtattaaatatatttgtaattactattgttttcacaattttgtcctttaagagagagagagatggtt 12619974  T
Q  428 tatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaa 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| || ||||||||| | | | ||  || |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  12619973 tatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaatatatataataaatatgagcatttatataaagaaataattaatgtacttggaaatagcaa 12619874  T
Q  528 agaagtcttataaaaa 543  Q
    |  ||| |||||||||    
T  12619873 aagagttttataaaaa 12619858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 343 - 513
Target Start/End: Original strand, 3060405 - 3060577
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  3060405 ggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttgacttatgttttcaaca 3060504  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    |  ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3060505 ttctatttattgctgattaaagaaaaagatatataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 3060577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 43701185 - 43701021
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataata 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  43701185 taattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 43701086  T
Q  479 aacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    || ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  ||||||||||||    
T  43701085 aataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 43701021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 344 - 527
Target Start/End: Original strand, 19630976 - 19631160
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||  | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | |||    
T  19630976 gaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttatttctaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatg 19631075  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaa 527  Q
     ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19631076 ctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaa 19631160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 344 - 527
Target Start/End: Original strand, 19827877 - 19828061
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||  | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | |||    
T  19827877 gaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttatttctaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatg 19827976  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaa 527  Q
     ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19827977 ctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaa 19828061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 17408095 - 17408289
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||  || |||||  ||||    
T  17408095 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatactacttattgctgat 17408194  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||    
T  17408195 tgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttat-aaaaagggacaaaa 17408289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 344 - 528
Target Start/End: Original strand, 15353249 - 15353430
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgt 443  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  ||||| ||||||||||      
T  15353249 gaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcgttt--aagagagttaatttattttttcaacatac 15353346  T
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  15353347 tatttattgttgattgaag-aaaagatatataataaataggggcatgtttgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 15353430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 375 - 553
Target Start/End: Original strand, 29239410 - 29239588
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgta 473  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||||||||||||||||||    
T  29239410 tgtttgtaatcactattgtttttagaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgta 29239509  T
Q  474 taataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  29239510 taataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 29239588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 359 - 514
Target Start/End: Original strand, 1422224 - 1422379
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| |||||    
T  1422224 atatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatgcttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgat 1422323  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtac 514  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1422324 tgaagaaaaatatgtataataaata-gggcatgcatgtaaagaaataattaatgtac 1422379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 359 - 528
Target Start/End: Original strand, 7116100 - 7116270
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||  ||||    
T  7116100 atatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgat 7116199  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  7116200 tcaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 7116270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 416 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 12873167 - 12873037
Alignment:
Q  416 agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtact 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| | || | |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  12873167 agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagacgtataatagatagtgatatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 12873068  T
Q  516 tagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    | |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  12873067 tggaaataacaagggggtcttataaaaaagg 12873037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 348 - 543
Target Start/End: Original strand, 29830545 - 29830742
Alignment:
Q  348 taagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta---aaagagagttggtttatgttttcaacatgtt 444  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   | ||| |||| ||||||||||||||  || |    
T  29830545 taagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcatttagagagagatagttagtttatgttttcaatttgct 29830644  T
Q  445 atttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||  |  | || ||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||||||||    
T  29830645 atttgatgcttatcgaagaaaaagatgtatagtaaataggggtatgtgtgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaatg-agtcttataaaaa 29830742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 12360707 - 12360498
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | | | | |||| |||| | ||||| | ||    
T  12360707 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagctgtttgtaatcattattgtttttacaattttatccttaagagacaaagttagtttctattttccatat 12360608  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
     ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||   |||||||| |    
T  12360607 attatttattgttgatttaagaaaaagatgtataataat-aggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttata-a 12360510  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  12360509 aaagggacaaaa 12360498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 345 - 528
Target Start/End: Original strand, 18223686 - 18223872
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||||||||  ||    
T  18223686 aattaagaaagttaatatttgtattaaagttgtttgtgatcactattgtttttacaattttatcatttaagagagttagttagtttatgttttcaaagtg 18223785  T
Q  443 ttatttattattgattg-aagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  18223786 atatttattgttgattgaaagaaaaagatgtataataaaaatgggtatataagtaaataaataattaatatagttggaaataacaaa 18223872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 299 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 8295606 - 8295374
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    |||| |||||||||  ||||||| |||| || |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  8295606 tactacctccgtccctaattataggacgtttttgaaaaaataacgggaattatgatagtggatatttgtatgaaatatgtatgtaattactattgttttt 8295507  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||             ||||  |||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||    
T  8295506 acaattttatcctttaagagagatggttggtttatgttttcaaca-------------tgatcaaagaaaaatatgtataataaatatgggtatgtatgt 8295420  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||  |||||| ||||    
T  8295419 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttgtaaa 8295374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 23083750 - 23083544
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttat---cctttaaa---agagagttggtttatgttttc 436  Q
    |||||||||| | || |||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||   |||| | |   |||||||||||||||||||||    
T  23083750 ggaattaagaaagtggatatttgtattagagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttaatattccttaagagagagagagttggtttatgttttc 23083651  T
Q  437 aacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtctt 536  Q
     | || |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||   |||||    
T  23083650 catatcttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgtaaaaaaattattaatgtagttcgaaatagcaaatgggtctt 23083551  T
Q  537 ataaaaa 543  Q
    |||||||    
T  23083550 ataaaaa 23083544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 345 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 15571436 - 15571228
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgt 443  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | |||     
T  15571436 aattaagaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttatagttttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgc 15571337  T
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||   ||| || ||||||||||||||||||| || |||||| ||||    |||||| ||||    
T  15571336 tatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggaacatgtatctaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggatcttat-aaaa 15571238  T
Q  544 agggacaaaa 553  Q
    ||||||||||    
T  15571237 agggacaaaa 15571228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 388 - 543
Target Start/End: Original strand, 13215649 - 13215805
Alignment:
Q  388 tattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagggg 486  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  13215649 tattatttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataaggg 13215748  T
Q  487 tatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||    
T  13215749 tatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaagggtcttataaaaa 13215805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 343 - 480
Target Start/End: Original strand, 44436269 - 44436408
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||| |    
T  44436269 ggaattaagatagtgtatatttgtattaaagttgtttgtaaacactattgtttttacaaatttatcttttaagaaagagagttagtttatgttttcaaga 44436368  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44436369 tactatatattgttgattgaagaaaaagatgtataataaa 44436408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 382 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 3095512 - 3095342
Alignment:
Q  382 aattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||     
T  3095512 aattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataat 3095413  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
     | || ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3095412 taaggatatgttggtaaagaaataattaatttacttagaaatatcaaagaggtcttata-aaaagggacaaa 3095342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 31633670 - 31633833
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  31633670 taattactattgtttttacaattttgtccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataa 31633769  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | |||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||    
T  31633770 ataagggtatgttagtaaataaataattaatgtacttggaaatacaaaaggggtcttataaaaa 31633833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 40544540 - 40544367
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattg--aagaaaaagatgtataat 477  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |  || ||||||||| | |||    
T  40544540 taattactattgtttttataattttatccttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgatcggaaaaaaaaagatgcaaaat 40544441  T
Q  478 aaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  40544440 aaataagggtatgccggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaatgagtcttata-aaaagggacaaa 40544367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 45151987 - 45151790
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt----acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattatt 454  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |    
T  45151987 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactatagtttttttttacaattttatcctt-aagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgct 45151889  T
Q  455 gattgaagaaaaa-gatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| ||| ||||||| | |||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  45151888 gattgaagaaaaaagatatataataaataagggcatgtatgtaaaaatataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttata-aaaagggacaaaa 45151790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 343 - 510
Target Start/End: Original strand, 16809001 - 16809168
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||    
T  16809001 ggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaaagagagagttagtttatattttcaaaat 16809100  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaat 510  Q
    || ||||| |   ||||||| ||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||| |||||||||||    
T  16809101 gtaatttaatgccgattgaa-aaaaagatgtatattaaatagagacatgtatgtaaataaataattaat 16809168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 343 - 510
Target Start/End: Original strand, 16848282 - 16848449
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||| ||    
T  16848282 ggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaaagagagagttagtttatattttcaaaat 16848381  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaat 510  Q
    || ||||| |   ||||||| ||||||||||||| |||| || |  ||| ||||||| |||||||||||    
T  16848382 gtaatttaatgccgattgaa-aaaaagatgtatattaaatagagacatgtatgtaaataaataattaat 16848449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 30858152 - 30857981
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  30858152 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataa 30858053  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  30858052 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacatggaaataccaaaagagtcttata-aaaagggacaaa 30857981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 382 - 552
Target Start/End: Original strand, 36750708 - 36750878
Alignment:
Q  382 aattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||| ||  ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||     
T  36750708 aattacaattttttttacaattttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataat 36750807  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
     | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  36750808 taagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaagaggtcttat-aaaaagggacaaa 36750878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 299 - 513
Target Start/End: Original strand, 14493555 - 14493769
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||  | | | |||  |||  |||||||||||||||||||||| |    
T  14493555 tactacctccgtccctaattatagggtcatttaaaaaaataacgggaattaagaaaattgaaagtggtaacaaatttgtttgtaattactattgttttca 14493654  T
Q  399 caattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaa 498  Q
     ||||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| ||  |||||| | |||||||||||||| | | || |||||| |||||||||   |||||    
T  14493655 taattttatcttttaagagggagttagtgtatattttcaatataatatttaattttgattgaagaaaaggttataaaataaataggggtatgttggtaaa 14493754  T
Q  499 gaaataattaatgta 513  Q
    ||| |||||||||||    
T  14493755 gaattaattaatgta 14493769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 299 - 432
Target Start/End: Original strand, 16636362 - 16636496
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaat-aataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||| |||| |||||| |||  ||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16636362 tactacatccgtctttaattatagggtccttttgaaaaattaatgagaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 16636461  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgt 432  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16636462 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgt 16636496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 378 - 546
Target Start/End: Original strand, 9040926 - 9041095
Alignment:
Q  378 ttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataa 476  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | | | |||| |||||||||||  | ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||    
T  9040926 ttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagatatagttagtttatgtttttcatatgttatttattgctgattcaagaaaaaaatgtataa 9041025  T
Q  477 taaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| |||| |||||| || ||  ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9041026 taaataggggcatgtatgtaaaaaaatcattaatatagttgaaaataacaaacgagtcttataaaaaagg 9041095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 305 - 542
Target Start/End: Original strand, 11083431 - 11083671
Alignment:
Q  305 ctccgcccttaattatagggtcattttaa-aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaatt 403  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||| |||  | | | ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11083431 ctccgtccctaattatagggtcatcttaacaaaattacgggaattaagaaaattgaaagtggtaataaatttgtttgtaattgctattgtttttacaatt 11083530  T
Q  404 ttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaa 501  Q
    ||||||||||| |||||  |||  | ||| |||||| |||  |||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||  ||||||||    
T  11083531 ttatcctttaagagagagggttaatgtatattttcagcatagtatttaatgctgattgaagaaaaagatataaaataaacagtggtgtgctggtaaagaa 11083630  T
Q  502 ataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
     ||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||||    
T  11083631 ttaattaatgtacttgaaaatattaaagaggtcttataaaa 11083671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Original strand, 2788161 - 2788331
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||    
T  2788161 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaggaaaaa-atgtaaaataa 2788259  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||||||   | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  2788260 ataagggtatgttggcaaagaaataagtaatgtacttggaaataccaaagtggtcttat-aaaaagggacaaa 2788331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 359 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 29831002 - 29830835
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaga--gagttggtttatgttttcaacatgttatttattattga 456  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29831002 atatttgtattaaatttgtttgtaattattatt--ttttacaattttatcatttaagagaaagagtttgtttatgttttcaacatgttatttattgttga 29830905  T
Q  457 ttgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaa 527  Q
      | ||||||| |||||||||||| |  |||||| | ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||    
T  29830904 cggtagaaaaa-atgtataataaataaaggtatgtaagtaaaaaaataattaatgtagtttaaaataacaa 29830835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Original strand, 30830166 - 30830336
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||   ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  30830166 taattattattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcagaataa 30830264  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  30830265 ataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaacaccaaagaagtcttat-aaaaagggacaaa 30830336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 375 - 543
Target Start/End: Original strand, 12296244 - 12296415
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag----ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagat 470  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    || || ||||||||||| ||  |||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  12296244 tgtttgtaatcactattgtttttacaattttaccctttaagagagagagagttagtatatgttttcaatatagtattaatg-ttgattgaaaaaaaagat 12296342  T
Q  471 gtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     || |||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  12296343 ataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttggaaatatcaaagatgtcttataaaaa 12296415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 360 - 513
Target Start/End: Original strand, 7461290 - 7461442
Alignment:
Q  360 tatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattg 459  Q
    |||||||||||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||    
T  7461290 tatttgtattaaagttgtttgaaatcactatcgtttttacaattttatcttttaga-gagagttaatttatgttttcaatatactatttattgttgattg 7461388  T
Q  460 aagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    |||||||| || ||||||||| | | | ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7461389 aagaaaaatatatataataaatatgagcatgtatgtaaaaaaataattaatgta 7461442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 416 - 553
Target Start/End: Original strand, 10757837 - 10757973
Alignment:
Q  416 agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtact 515  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  |||||||||||||| |||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  10757837 agagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataagagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 10757936  T
Q  516 tagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  10757937 tggaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 10757973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 381 - 529
Target Start/End: Original strand, 18970552 - 18970701
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||| ||| | |||||    
T  18970552 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaaaatgcaaaataa 18970651  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    | | ||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18970652 ataagggtaggttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaag 18970701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 12873719 - 12873560
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12873719 taattactattgtttttacaaatttatcctt---aagagagttagtttatgtttttaacataatatttattattgattgaagaaaaagatgcaaaataaa 12873623  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     | || |||     |||||||||||| |||||| ||  ||||  |||||| ||||||||||||    
T  12873622 taaggttatattgataaagaaataataaatgtaattgaaaatttcaaagaggtcttataaaaa 12873560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Original strand, 41494445 - 41494616
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  41494445 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagaattaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataa 41494544  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  ||| |||| |||||||||||||    
T  41494545 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagagttttat-aaaaagggacaaa 41494616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 385 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 6028552 - 6028393
Alignment:
Q  385 tactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacag 483  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |     
T  6028552 tactattgtttttataattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatataaaataaataa 6028453  T
Q  484 gggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||   |||||| |||| | ||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||    
T  6028452 gggtatgttggtaaaggaatattaaatgtacttggaaataccaaataggtcttataaaaa 6028393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 382 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 41422725 - 41422555
Alignment:
Q  382 aattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  41422725 aattactattgtttttacaattttatccttaagagagagaatttatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaa 41422626  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
     | |||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  ||| |||| |||||||||||||    
T  41422625 taagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagagttttat-aaaaagggacaaa 41422555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 423 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 7447036 - 7446946
Alignment:
Q  423 tggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  7447036 tggtttatgttttcaacatattatttattgcagattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataagtaatgta 7446946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 378 - 480
Target Start/End: Original strand, 40348225 - 40348326
Alignment:
Q  378 ttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataat 477  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||| || |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40348225 ttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagaa-agaattagtttatgtttttcatatgttatttattattgattgaaaaaaaagatgtataat 40348323  T
Q  478 aaa 480  Q
    |||    
T  40348324 aaa 40348326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 359 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 8867818 - 8867712
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgatt 458  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  8867818 atatttctattaaatttgtttgtaattactattatttttacgattttatcctttaagagagag--agtttatgttttcaacatgctatttattgttaatt 8867721  T
Q  459 gaagaaaaa 467  Q
    |||||||||    
T  8867720 gaagaaaaa 8867712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 378 - 543
Target Start/End: Original strand, 6650975 - 6651142
Alignment:
Q  378 ttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtata 475  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||  || |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  6650975 ttgtaatttttattgtttttacaattttatcattcaaaagagagaattagagtatgttttcaacgtgttatttattgttgattgaggaaaaaaatgtata 6651074  T
Q  476 ataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||| || | |||  | ||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||   ||||||||||    
T  6651075 ataaatagagatatatacgtaaaaaaataattaatgtaattgaaaatagcaaagagaccttataaaaa 6651142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 9701284 - 9701113
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||  ||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||  || | |||||    
T  9701284 taattactattgtttttacaattttatccttaagagatagaattaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaattgcaaaataa 9701185  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||||||    
T  9701184 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttata-aaaagggacaaa 9701113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 430 - 553
Target Start/End: Original strand, 26334717 - 26334840
Alignment:
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||    
T  26334717 tgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaacgaagttagaaataaaaaag 26334816  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
      ||||||  ||||||||||||||    
T  26334817 gggtcttaataaaaagggacaaaa 26334840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 28566365 - 28566202
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||  | |||||    
T  28566365 taattagtattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcagcataatatttattgttgattgaagaaaaagattcaaaataa 28566266  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | | |||||   ||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||  |||||||||||||    
T  28566265 ataagagtatgttagtaaataaataattaatgtatttgaaaataccaaatgagtcttataaaaa 28566202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 383 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 43700833 - 43700668
Alignment:
Q  383 attactattgtttttacaattttatcctttaaa---agagag-ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataata 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |   |||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  43700833 attactattgtttttacaattttatccttaagagagagagaggttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaata 43700734  T
Q  479 aacaggggtatgcatgt-aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    || | |||||||   || ||| ||| |||||||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||    
T  43700733 aataagggtatgttggtaaaaaaaaaaattaatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaa 43700668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 375 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 11121205 - 11121065
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaag--agagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||   ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  11121205 tgtttgtaattactactgtttttacaattttatcatttaagagggagagttggtgtatgttttcaacataacatttaatgttgattgaataaaaagatgt 11121106  T
Q  473 ataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    | |||||| | | |||||   |||||||| ||| |||||||    
T  11121105 aaaataaataagtgtatgttggtaaagaattaactaatgta 11121065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 381 - 542
Target Start/End: Original strand, 11944461 - 11944623
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataata 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  ||  || |||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11944461 taattactattgtttttacaattttatc-tttaagagaaagaattaattcatgttttcaacataatatttatcgttgattgaagaaaaagatgtaaaata 11944559  T
Q  479 aacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    || |  | ||||   ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||   ||||||||||    
T  11944560 aataaagatatgttggtaaagaaataataaatatacttagaaataccaaagggatcttataaaa 11944623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Original strand, 34432024 - 34432194
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||   ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  34432024 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagggagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataa 34432122  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | || |||    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  34432123 ataaggatatattggtaaagaaataattaatgtacttggaaacatcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaa 34432194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 444 - 543
Target Start/End: Original strand, 4897630 - 4897729
Alignment:
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  4897630 tatttaatcttgattgaagaaaaagatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttcgaaatatcaaagaggtcttataaaaa 4897729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 444 - 543
Target Start/End: Original strand, 4945024 - 4945123
Alignment:
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  4945024 tatttaatcttgattgaagaaaaagatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttcgaaatatcaaagaggtcttataaaaa 4945123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 365 - 507
Target Start/End: Original strand, 22302593 - 22302738
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaaca---tgttatttattattgattgaa 461  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||  | |   | ||||||||| || ||||||    
T  22302593 gtattaaatttgtttgtaattattattatttttacaattttatcctttaagatagtgttagtttatgtttttgatatattattatttattgttaattgaa 22302692  T
Q  462 gaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataatt 507  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||   ||||||||||||||    
T  22302693 gaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataatt 22302738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 427 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 32511186 - 32511061
Alignment:
Q  427 ttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataaca 526  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |   ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  32511186 ttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatacgaacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagca 32511087  T
Q  527 aagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||    
T  32511086 aataggtcttat-aaaaagggacaaaa 32511061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 18294205 - 18294036
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | ||||||| |||||||||| |  ||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  18294205 taattactattgtttttacaattttattcttaagagaaagagttgatttatgttttta--ataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataa 18294108  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | |  |||||    |||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  18294107 ataaaggtatattcgtaaagaaataattaatgtaattggaaattccaaa-aagtcttttaaaaaaggtacaaa 18294036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 430 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 44017904 - 44017791
Alignment:
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  44017904 tgttttcaagatgctatttattactaattgaagaagaatatgtataataaataggggtatgtaagtaaataaataattaatgtagctggaaatagcaaag 44017805  T
Q  530 aagtcttataaaaa 543  Q
      ||||||||||||    
T  44017804 gggtcttataaaaa 44017791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 299 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 13598814 - 13598582
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||  |||||||||  |||||||||| |||  ||| |  || ||||  |||| ||||||||||||| ||||    
T  13598814 tactacctccgtccctaattatagggccctttagaaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtgataataaatctgttggtaattactattggtttt 13598715  T
Q  398 acaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||| ||| | | | ||||||  ||||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||   ||     
T  13598714 acaattttattcttaagagatagagttaatttatgttttcaatatagtatttaatgttgattgaagaaaaatatccaaaataaataggggtatgatggtg 13598615  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    || || ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13598614 aaaaattaattaatgcacttggaaataacaaag 13598582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 381 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 21838830 - 21838695
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataata 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |   ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||    
T  21838830 taattactattgtttttacaattttatc-tttaagagagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaata 21838733  T
Q  479 aacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtactt 516  Q
    || | |||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  21838732 aataagggtatgttgataaagaaataattaatgtactt 21838695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 375 - 541
Target Start/End: Original strand, 26273372 - 26273540
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||   || || |||||||  |||||  |||||| | ||||||||||||||| || |    
T  26273372 tgtttgtaattgctattgttattacaattttatcctttaagagagatgattagtgtatgtttctaacatcatatttaatgttgattgaagaaaaaaatat 26273471  T
Q  473 ataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | |||||| || | | ||   |||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||  ||||||||||    
T  26273472 aaaataaatagagatgtgttagtaaagaattaattaatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaa 26273540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 27725513 - 27725679
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatt---tattattgattgaagaaaaagatgtataa 476  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| || | |||||||| |  ||||| ||||||||||  || |   |||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  27725513 taattattattgtttttacaatttcatctttaagaaagagagatactttatattttcaacatcataatacttattgttgattgaggaaaaagatgtaaaa 27725612  T
Q  477 taaacaggggtatgcatg-taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||| | ||||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  27725613 taaataagggta-gattgataaagaaataattaatgtacttaaaaatatcaaagaggtcttataaaaa 27725679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 4408600 - 4408764
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaag-aaaaagatgtataata 478  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||  ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||| | ||||    
T  4408600 taattattattgtttttacaattttatccttaagagagagaattaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaaatatgcaaaata 4408699  T
Q  479 aacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    || |   |||||    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  |||||||||||    
T  4408700 aataaaagtatgttgataaagaaataattaatctacttggaaataccaaagatatcttataaaaa 4408764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 377 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 25888497 - 25888342
Alignment:
Q  377 tttgtaattacta-ttgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgta 473  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| || |||  ||||| ||| ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  25888497 tttgtaattactgcttgtttttataattatatcctttaagagcgagacttggtatatatttccaacatagtatttatttttgattgaagaaaaatgtgta 25888398  T
Q  474 taataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
     |||||| | | |||||   ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25888397 aaataaataagtgtatgttggtaaaaaaataattaatgtagttaaaaataacaaag 25888342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 12969728 - 12969562
Alignment:
Q  379 tgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataa 476  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||  ||||| ||| |||||||     |||||| |  |||||||||||||| || || ||    
T  12969728 tgtaattactattgtttttataaatttgtcctttaagagagagagttggtgtatattttcaatgcagtatttaatgctgattgaagaaaaaaatataaaa 12969629  T
Q  477 taaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||| |||||||||   |||||||| |||||||| || ||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  12969628 taaataggggtatgttggtaaagaattaattaatatatttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 12969562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 332 - 396
Target Start/End: Original strand, 26334658 - 26334722
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26334658 aaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 26334722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 3904677 - 3904527
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaag 462  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||  | ||||||||| ||||| |||| ||||   ||||||||  |||||||||    
T  3904677 gtattaaatttgtttgcaattactattgtttttataattatatcatttaagagagagagttgatttatatttttaacaaagtatttattgctgattgaag 3904578  T
Q  463 aaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    ||||| ||||| |||||| |  ||||||   ||| | ||||||||||||||    
T  3904577 aaaaatatgtaaaataaataatggtatgtcagtacataaataattaatgta 3904527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 332 - 435
Target Start/End: Original strand, 4897427 - 4897530
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  | | | ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||    
T  4897427 aaaaaataatgggaattaagaaaattgaaaatagtaataaatttgtttgtaatcactattgtttttataattttgtcctttaagagagagttagtgtatg 4897526  T
Q  432 tttt 435  Q
    ||||    
T  4897527 tttt 4897530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 332 - 435
Target Start/End: Original strand, 4944821 - 4944924
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  | | | ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||    
T  4944821 aaaaaataatgggaattaagaaaattgaaaatagtaataaatttgtttgtaatcactattgtttttataattttgtcctttaagagagagttagtgtatg 4944920  T
Q  432 tttt 435  Q
    ||||    
T  4944921 tttt 4944924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 421
Target Start/End: Original strand, 16807078 - 16807124
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag 421  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16807078 tgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag 16807124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 421
Target Start/End: Original strand, 16846359 - 16846405
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag 421  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16846359 tgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag 16846405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 553
Target Start/End: Original strand, 24300281 - 24300346
Alignment:
Q  487 tatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  24300281 tatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 24300346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 32511251 - 32511185
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 411  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  32511251 aattaagaaagtgaaaatttgtattaaaattgtttgtaattactgttgtttttacgattttatcctt 32511185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 366 - 546
Target Start/End: Original strand, 36556204 - 36556389
Alignment:
Q  366 tattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-----agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattga 460  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||      |||||||| ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||    
T  36556204 tattaaatttgtttgtaattactattgtttttacaattatatctttttaagagagggagagttgatttatattgtcaacataatatttattgttgattga 36556303  T
Q  461 agaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    ||| | | ||||| |||||| |  |||| |   ||||| | ||||||||| || ||  ||||||||||  || |||||||||||||    
T  36556304 agacagatatgtaaaataaataaaggtaagttagtaaatatataattaatatagttgaaaataacaaacgagccttataaaaaagg 36556389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 366 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 44417631 - 44417450
Alignment:
Q  366 tattaaacatgtttgtaattactatt---gtttttacaattttatcctttaaaaga--gagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattga 460  Q
    |||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||  |||  |||||    ||||||||||||||  |||||| | |||| |||    
T  44417631 tattaaatttgtttgtaattactattattgtttttacaattttatcccttatgagaaagagttacactatgttttcaacatagtatttactgttgactga 44417532  T
Q  461 agaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||| || |||||| |||  ||||   |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||| ||||    
T  44417531 agaaaaagatata-aataaataggaatatgttggtaaagaaataattaatgtagttgaaaataccaaagagatcttatgaaaa 44417450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 8056175 - 8056071
Alignment:
Q  377 tttgtaattactattgttttt-acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtata 475  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| || ||| ||||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||| || |    
T  8056175 tttgtaattgttattgtttttcacaattttatcttttaagagagggttagtgtatattttcaacataatatttaatgctgattgaagaaaaagatataaa 8056076  T
Q  476 ataaa 480  Q
    |||||    
T  8056075 ataaa 8056071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 15079398 - 15079299
Alignment:
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||| ||| |||||| || |||||  ||||  ||||||||||||    
T  15079398 ttatttattgttgattgaagaaaaa-atgtaaaataaataggggtatatttgtaaagaaaaaataaatgtagttggaaatgtcaaatgagtcttataaaa 15079300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 492 - 553
Target Start/End: Original strand, 44436756 - 44436816
Alignment:
Q  492 atgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  44436756 atgtaaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaatgagtcttat-aaaaagggacaaaa 44436816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 40544746 - 40544653
Alignment:
Q  388 tattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||  | |  ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  40544746 tattgtttttccaattttatcctt-aatagagatggctaatttatcttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgaaaaataaa 40544653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 473 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 30466225 - 30466155
Alignment:
Q  473 ataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||| | ||| ||| ||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  30466225 ataataaataagggcatgtatgaaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 30466155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 155; Significance: 9e-82; HSPs: 109)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 299 - 552
Target Start/End: Original strand, 31149987 - 31150240
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31149987 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtttatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 31150086  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  31150087 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 31150186  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  31150187 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaa 31150240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 13866891 - 13866646
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13866891 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 13866792  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||    
T  13866791 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacttgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaa 13866692  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||   ||||||||||||    
T  13866691 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaa 13866646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 298 - 546
Target Start/End: Original strand, 31487109 - 31487360
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31487109 gtactacctccgtccctaattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 31487208  T
Q  397 tacaattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  31487209 tacaatttaatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 31487308  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||  |||||  |||||||||||||||    
T  31487309 taaagaaataattaatgtagttggaaattgcaaaggggtcttataaaaaagg 31487360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 20449920 - 20450176
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattataggg-tcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||| |||  || ||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  20449920 tactacctccgtccctaattaaaggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttg 20450019  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||    
T  20450020 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 20450119  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  20450120 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 20450176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Original strand, 13647902 - 13648124
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagt--tggttta 429  Q
    |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||    
T  13647902 aaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaggtggttta 13648001  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  13648002 tgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatttataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaat 13648101  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
     |||||||| ||||||||||||||    
T  13648102 gagtcttat-aaaaagggacaaaa 13648124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Original strand, 34915316 - 34915538
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  34915316 aaaaaataacgggaattgagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggttta 34915415  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  34915416 tgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaag 34915515  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
      | ||||| ||||||||||||||    
T  34915516 gggacttat-aaaaagggacaaaa 34915538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 402362 - 402616
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  402362 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 402461  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  402462 acagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 402561  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  402562 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 402616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 8670431 - 8670177
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||||   | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  8670431 tactacctccgtccctaattatagtacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 8670332  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  8670331 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 8670232  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  8670231 agaaataattaatgcagttgaaaatagcaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 8670177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 299 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 9342136 - 9341886
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9342136 tactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 9342037  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  9342036 acaattttatcctttaagaaagaaggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 9341937  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  9341936 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaagg 9341886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 34126437 - 34126183
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34126437 tactccctccgtccttaaatataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 34126338  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34126337 acaattttatcttttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggtatgcatgtaa 34126238  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||    
T  34126237 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagccttat-aaaaagggacaaaa 34126183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 1729842 - 1730097
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt--aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    |||| |||||| || ||||||||||| | ||||  |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1729842 tactccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 1729941  T
Q  397 tacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||    
T  1729942 tacaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgta 1730041  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  1730042 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaagggacaaaa 1730097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 34301616 - 34301827
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||    
T  34301616 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttggtttatgttttcaaca 34301715  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  34301716 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 34301814  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  34301815 aaaagggacaaaa 34301827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 11847835 - 11847613
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagt--tggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||    
T  11847835 aaaaaataacgggaattaagatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaggtggttta 11847736  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  11847735 tgttttcaatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaag 11847636  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
      |||||||| |||||||||||||    
T  11847635 gggtcttata-aaaagggacaaaa 11847613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 15498925 - 15498671
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15498925 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 15498826  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  15498825 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 15498726  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||  | ||||||| |||||||||||||    
T  15498725 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttata-aaaagggacaaaa 15498671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Original strand, 925708 - 925928
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  925708 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaattgttttatg 925807  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||      
T  925808 ttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggg 925907  T
Q  532 gtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  925908 atcttat-aaaaagggacaaaa 925928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 299 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 2090957 - 2090730
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||||| || || |||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2090957 tactacctacgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 2090858  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2090857 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgt 2090758  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||    
T  2090757 aaagaaataattaatgtagttggaaata 2090730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 23604760 - 23604513
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23604760 tactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataatgagaattaagatagtgaatatttgtattagatatgtttgtaattactattgttttt 23604661  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| ||  ||||    
T  23604660 acaattttatcttttaagagagagagttggattatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtgtaataaataagggcatatatgt 23604561  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||| |||||  ||||||||||||    
T  23604560 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaa 23604513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 311 - 553
Target Start/End: Original strand, 1147020 - 1147262
Alignment:
Q  311 ccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcc 409  Q
    |||||||||||||  | |||| |||||| ||  |||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1147020 ccttaattataggacccttttgaaaaaacaacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcc 1147119  T
Q  410 tttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaa 509  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1147120 tttaagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaa 1147219  T
Q  510 tgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||| || |||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  1147220 tgtagttggaaatagcaaaagggtcttat-aaaaagggacaaaa 1147262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 304 - 546
Target Start/End: Original strand, 19097547 - 19097790
Alignment:
Q  304 cctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaat 402  Q
    |||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19097547 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaat 19097646  T
Q  403 tttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaa 502  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  19097647 tttatcctttaagagagaattggtttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatataaagaaa 19097746  T
Q  503 taattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  19097747 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaagg 19097790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 25045382 - 25045638
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| || | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25045382 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 25045481  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  25045482 acaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattatatctattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 25045581  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  25045582 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 25045638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 31091741 - 31091496
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  31091741 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 31091642  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | || ||||| ||| ||||||    
T  31091641 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgtaa 31091542  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | |||||||||||||| || |||||| ||||   ||||||||||||    
T  31091541 aaaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaa 31091496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 298 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 390618 - 390365
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  390618 gtactacc-ccgtccttaattatagggccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 390520  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaag-aaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    ||||||||||  ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || | ||| ||| |||||    
T  390519 acaattttat-ttttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaaatgtataattaatatgggcatgtatgta 390421  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||| || || |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  390420 aagaaataattaatatagttggaaatagcaaagatgtcttat-aaaaagggacaaaa 390365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 25197405 - 25197203
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  25197405 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 25197306  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   |||||||||    
T  25197305 tgttaattattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataa 25197206  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  25197205 aaa 25197203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 296 - 553
Target Start/End: Original strand, 16272704 - 16272961
Alignment:
Q  296 tagtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtt 394  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  16272704 tagtacttcctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatt 16272803  T
Q  395 tttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||    
T  16272804 tttacaattttatcctttaacaaagagttgatttttgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatg 16272903  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||| |||||  ||||| | ||||||||||||||    
T  16272904 taaagaaataattgatgtagttggaaatagcaaaggggtctt-ttaaaaagggacaaaa 16272961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 17227267 - 17227523
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |  | |||||||||| |||  |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17227267 tactacctccgtctttaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattgaatatgtttgtaattactattgttttt 17227366  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  17227367 acaattttatcctttaagaaagatggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 17227466  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  17227467 aaagaaataattaatgtagttagaaatagaaaataggtcttat-aaaaagggacaaaa 17227523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 299 - 552
Target Start/End: Original strand, 13690471 - 13690726
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||||| || || |||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13690471 tactaccttcgtccctaattataaggttcttttaaaaaaataagaggaattaagataatgaatatttatattaaatgtgtttgtaattactattgttttt 13690570  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  13690571 acaattttatcttttaagaaagagggttggcttatgttttcatcattatatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 13690670  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13690671 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaataagtcttat-aaaaagggacaaa 13690726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 7772474 - 7772227
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| || | |||| |||||||||   ||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  7772474 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgtgaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 7772375  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  7772374 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 7772275  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  ||||  ||||||||||||    
T  7772274 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 7772227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 299 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 20373331 - 20373123
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20373331 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 20373232  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||    
T  20373231 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgcatataa 20373132  T
Q  498 agaaataat 506  Q
    |||||||||    
T  20373131 agaaataat 20373123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 6147636 - 6147434
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  6147636 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 6147537  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||    
T  6147536 tattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataa 6147437  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  6147436 aaa 6147434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 12144041 - 12143821
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12144041 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattgctattgtttttacaattttatcctttaagagagaattggtttatg 12143942  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |||||      
T  12143941 ttttcaacatgatatttattgctgattaaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatatagttgaaaatagcaaaggg 12143842  T
Q  532 gtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    || |||| ||||||||||||||    
T  12143841 gttttat-aaaaagggacaaaa 12143821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 23397924 - 23398125
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  23397924 ggaattaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 23398023  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  23398024 gctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 23398123  T
Q  542 aa 543  Q
    ||    
T  23398124 aa 23398125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 528
Target Start/End: Original strand, 25024290 - 25024477
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  25024290 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacatttttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 25024389  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25024390 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 25024477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 15355295 - 15355540
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15355295 tactacctccgtccctaattatagggccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaccattgttttta 15355394  T
Q  399 caattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| |||||    
T  15355395 caattttatcctttaagagagagaattaaattatgttttcaacatgttatttattgttcattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgta 15355494  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||| ||||||||||||| ||  ||||| ||| |  ||||||||||||    
T  15355495 aag-aataattaatgtagttgaaaatagcaatggggtcttataaaaa 15355540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Original strand, 31711623 - 31711834
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| || |||||     
T  31711623 aaaaaataacaggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatatttgtaattagtattgtatttacaattttattctttaagagagagatgatttata 31711722  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || |||||| |||||      
T  31711723 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatatataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaaggg 31711822  T
Q  532 gtcttataaaaa 543  Q
     |||||||||||    
T  31711823 atcttataaaaa 31711834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 33488084 - 33487882
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  33488084 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 33487985  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||||    
T  33487984 tattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataa 33487885  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  33487884 aaa 33487882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 287198 - 287409
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  287198 ggaattaatatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 287297  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||   |||||| |    
T  287298 tgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataactgatgtagttggaaataacaaagggatcttat-a 287396  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  287397 aaaagggacaaaa 287409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 30248900 - 30248689
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||| |||||||||    
T  30248900 ggaattaaaatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaaca 30248801  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||     
T  30248800 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggtgcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttata- 30248702  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  30248701 aaaagggacaaaa 30248689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 347 - 544
Target Start/End: Original strand, 15966950 - 15967149
Alignment:
Q  347 ttaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgtt 444  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  |    
T  15966950 ttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattct 15967049  T
Q  445 atttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaa 544  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  |||||||||||||    
T  15967050 atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaa 15967149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 343 - 528
Target Start/End: Original strand, 17175249 - 17175436
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||| ||||    
T  17175249 ggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaagttggtttatgttttgaaca 17175348  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  17175349 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatataaagaaataattaatgttgttggaaataacaaa 17175436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 23578166 - 23578412
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23578166 tactacctccgttctta-ttatagggtatttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 23578264  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  23578265 acaattttatcttttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttatttttgattaaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgt 23578364  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||| ||||||||||| || ||  ||||||||||  | |||||||||||    
T  23578365 aaaaaaataattaatatagttgaaaataacaaatgaatcttataaaaa 23578412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 16122551 - 16122305
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  | |||| ||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16122551 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttttaattactattgttttta 16122452  T
Q  399 caattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||    
T  16122451 caattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtatgta 16122352  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||  |||||||||||||    
T  16122351 aagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaa 16122305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 12105848 - 12106059
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  12105848 ggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttattctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 12105947  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||  ||||||| |    
T  12105948 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgtaaagaaataattaatttagttggaaataacaaaggggtcttat-a 12106046  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  12106047 aaaagggacaaaa 12106059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 1779829 - 1780039
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  1779829 ggaattaagaaaatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaatattatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 1779928  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||    
T  1779929 gctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttat-aa 1780027  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  1780028 aaagggacaaaa 1780039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 344 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 5457664 - 5457463
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacat 441  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||||||    
T  5457664 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 5457565  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||    
T  5457564 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaaacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 5457465  T
Q  542 aa 543  Q
    ||    
T  5457464 aa 5457463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 388 - 546
Target Start/End: Original strand, 9660506 - 9660666
Alignment:
Q  388 tattgtttttacaattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggg 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  9660506 tattgtttttacaattttatcctttaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaaaatgtataataaataggg 9660605  T
Q  486 gtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  9660606 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaaagg 9660666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Original strand, 19418897 - 19419119
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||    
T  19418897 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggctta 19418996  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||    
T  19418997 tgttttcaacattctatttattgctgattgaaaaaagagatgtacaataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaag 19419096  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
       |||||| ||||||||||||||    
T  19419097 ggatcttat-aaaaagggacaaaa 19419119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 8743423 - 8743229
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||  | ||| || |||||  ||||    
T  8743423 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgat 8743324  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  8743323 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtacttggaaataacaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 8743229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 332 - 523
Target Start/End: Original strand, 13010893 - 13011086
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||  |||    
T  13010893 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatgactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttgactta 13010992  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
    ||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  13010993 tgttttcaacattctatttattgcttattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttggaaata 13011086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 344 - 541
Target Start/End: Original strand, 10195779 - 10195978
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacat 441  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||||||    
T  10195779 gaattaacatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 10195878  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |  || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  10195879 attatttattgttgattgaagaaaaaaatatataataaataatggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 10195978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 332 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 33773843 - 33773626
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag----ttggtt 427  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    ||| ||    
T  33773843 aaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaattttatcatttaagagagagagagttgatt 33773744  T
Q  428 tatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaa 527  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||| || |||||| |||    
T  33773743 tatgttttcaacatgttatttgttgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtagagaaataattaatgtagttggaaatagcaa 33773644  T
Q  528 agaagtcttataaaaaag 545  Q
    |   || |||||||||||    
T  33773643 aatggtattataaaaaag 33773626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 9388574 - 9388786
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa---agagagttggtttatgttttcaac 439  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |   |||||||| |||||||||||| |     
T  9388574 ggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccat 9388673  T
Q  440 atgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttata 539  Q
    ||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||     
T  9388674 atgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat- 9388772  T
Q  540 aaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||    
T  9388773 aaaaagggacaaaa 9388786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 357 - 513
Target Start/End: Original strand, 5576178 - 5576334
Alignment:
Q  357 gaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattga 456  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5576178 gaatatttgtattgaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagtgagagttagtttatgttttcaacatgttatttattgttga 5576277  T
Q  457 ttgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5576278 ttgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaaaaaataattaatgta 5576334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 34741718 - 34741508
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  34741718 ggaattaagaaagtcaatatttgtattaaagttgtttttaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 34741619  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||   |||||||| |    
T  34741618 gctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtaggtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttata-a 34741520  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  34741519 aaagggacaaaa 34741508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 230891 - 231101
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | | |  ||| ||||||||||||||||    
T  230891 ggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaataaggttagtttatgttttcaaca 230990  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||   ||||||| |    
T  230991 tgttatttattgttgactgaagaaaaagatgtataataaatacgggcatgtaggtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaa-tggtcttat-a 231088  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  231089 aaaagggacaaaa 231101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 15126700 - 15126506
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgatt 458  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  15126700 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttcatcctttaga-gagaattggtttatgttttcaacatgctatttattgctgatt 15126602  T
Q  459 gaagaaaaaga--tgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    | ||||||| |  | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15126601 gtagaaaaaaaaatctataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatatagttgaaaatagcaaagaagtcttat-caaaagggacaaaa 15126506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 18105956 - 18106157
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | ||| |||| ||| || ||||| | ||    
T  18105956 ggaattaagaaagtgaatatttatattaaaattgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatccttaagagagaaagttagttcatattttccatat 18106055  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||    
T  18106056 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatagggacgtgcatgtaaagaaataattaatgtacttggaaataacaaaagggtcttataaa 18106155  T
Q  542 aa 543  Q
    ||    
T  18106156 aa 18106157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 375 - 528
Target Start/End: Original strand, 9299246 - 9299400
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9299246 tgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaacagagatagtttgtttatgttttaaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgt 9299345  T
Q  473 ataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    |||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  9299346 ataataaataagggtatgc-tggaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaa 9299400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 359 - 540
Target Start/End: Original strand, 345547 - 345729
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||  || |    
T  345547 atatttatattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctggt 345646  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  345647 tgaagaaagagatgtataataaataggcgcatgtatgtaaagaaatagttaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttataa 345729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 3177431 - 3177222
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||| | || ||||||| ||||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||| || ||||| | |||    
T  3177431 ggaattaagaaagtggatatttgcattaaagttgtttgtaaccactattttttttacaattttatcctt-aagagagagttagttcatattttccatatg 3177333  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||   ||||||||||    
T  3177332 atatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtacgtaaagaaataattaatgtaattgaaaatagcaaagggatcttataaaa 3177233  T
Q  543 aagggacaaaa 553  Q
    || ||||||||    
T  3177232 aaaggacaaaa 3177222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 388 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 345071 - 344915
Alignment:
Q  388 tattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagggg 486  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  345071 tattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggga 344972  T
Q  487 tatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||    
T  344971 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 344915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 6418123 - 6417926
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||  | ||    
T  6418123 ggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattggttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgtttttcatat 6418024  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | || |||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||    | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  6418023 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatag----aggcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 6417928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 359 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 235993 - 235825
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag-ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  235993 atatttgtattaaaattgttcgtaatcactattgtttttacaattttgtcatttaagagaaatattagtttatgttttcaacatgttatttattgttgat 235894  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    ||  |||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  235893 tg--gaaaaaaatgtataataaataggggtatgtaggtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaa 235825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 366 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 32615216 - 32615054
Alignment:
Q  366 tattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaa 464  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  32615216 tattaaatttgtttataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaa 32615117  T
Q  465 aaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    ||| ||| | |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  32615116 aaa-atgcaaaataaataggggtatggttgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaa 32615054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 300 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 11104850 - 11104699
Alignment:
Q  300 actacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgt---attaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |  ||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11104850 actacctccgtccctaattatagggtcattttaaaaaataacggaaattaagatagtagatatttgttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 11104751  T
Q  397 tacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttat 446  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  11104750 tacaattttatcatttaagagagagaattggtttatgttttaaacatgttat 11104699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 343 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 15287390 - 15287205
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  15287390 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatctctattgtttttacaattttatccttaatatagagagttagtttatgttttccatat 15287291  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    | ||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| | ||  ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15287290 gctatttattgctgattgaagaaaaatatatataataaata-ggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 15287205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 382 - 552
Target Start/End: Original strand, 6418476 - 6418646
Alignment:
Q  382 aattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  6418476 aattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaa 6418575  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
     | |||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6418576 taagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaagaggtcttat-aaaaagggacaaa 6418646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 367 - 513
Target Start/End: Original strand, 17952167 - 17952315
Alignment:
Q  367 attaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaa 464  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||    
T  17952167 attaaatatgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacaatctatttattgctgattgaagaa 17952266  T
Q  465 aaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    ||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  17952267 aaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaaaaaatatttaatgta 17952315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 381 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 27581600 - 27581435
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  27581600 taattactgttgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataa 27581501  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaag 545  Q
    | |  | ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||    
T  27581500 ataaagatatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaagagatcttataaaaaag 27581435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Original strand, 22998868 - 22999039
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  22998868 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataa 22998967  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  22998968 ataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttat-aaaaagggacaaa 22999039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 23789536 - 23789365
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  23789536 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataa 23789437  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  23789436 ataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttata-aaaagggacaaa 23789365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 8217544 - 8217705
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  8217544 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaa 8217642  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     | || ||||   |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||    
T  8217643 taaggatatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagagtcttataaaaa 8217705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 388 - 553
Target Start/End: Original strand, 11656174 - 11656341
Alignment:
Q  388 tattgtttttacaattttatcctt---taaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagg 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||     | ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |      
T  11656174 tattgtttttacaattttatccttatgagagagagagttggtttatgttttccatatgctatttattgtttattgaagaaaaagatgtataataaataaa 11656273  T
Q  485 ggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  11656274 agcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 11656341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 366 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 4823198 - 4823043
Alignment:
Q  366 tattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaa 465  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  4823198 tattaaatttgtatgtaattactattgtttttataattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaa 4823100  T
Q  466 aagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
    || ||| | |||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  4823099 aa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtatttggaaata 4823043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 359 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 8175892 - 8175711
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattga 456  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||| | ||  ||||||||  |||    
T  8175892 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttcaagagagagagttagtttatgttttccatatactatttattgctga 8175793  T
Q  457 ttgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaa 544  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||      ||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||    
T  8175792 ttgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaag------ttaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaa 8175711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 379 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 11162069 - 11161899
Alignment:
Q  379 tgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa---agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtata 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |    
T  11162069 tgtaattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaa 11161970  T
Q  476 ataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    ||||| | ||||| |   |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||   |||||||||||||||    
T  11161969 ataaataagggtacgttggtaaagaattaattaatgtacttgtaaataccaaaagggtcttataaaaaagg 11161899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 382 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 4175455 - 4175285
Alignment:
Q  382 aattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||   |||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  4175455 aattactattatttttacaattttatccttaagagagagagttaacttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaa 4175356  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
     | |||||||   ||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4175355 taagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtatttggaaatatcaaagaggtcttata-aaaagggacaaa 4175285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 22710478 - 22710309
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  22710478 taattactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaa 22710380  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
     | ||||||    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||   ||||||| |||||||||||||    
T  22710379 taagggtattttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagggtcttat-aaaaagggacaaa 22710309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 375 - 542
Target Start/End: Original strand, 8646021 - 8646190
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||  | |||| | |||||||||||||||||| |    
T  8646021 tgtttgcaattactattgtttttacaaatttgttctttaagaaagagagttagtgtatgttttcaatataatgtttaatgttgattgaagaaaaagatat 8646120  T
Q  473 ataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    | |||||| |||||||||   ||||| || |||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||    
T  8646121 aaaataaataggggtatggtggtaaaaaattaattaatgtacttggaaatagcaaatgagtcttataaaa 8646190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 385 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 13901850 - 13901690
Alignment:
Q  385 tactattgtttttacaattttatcctttaaaaga--gagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaaca 482  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||| | ||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  13901850 tactattgtttttacatttttatcctttaagagaaagagttagtttatgttttcgaaatgatatttcttgttgattgaagaaaaatatgtaaaataaata 13901751  T
Q  483 ggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     |||||||   ||||||||||||||||| || || |||||| |||||  ||||| ||||||    
T  13901750 tgggtatgttggtaaagaaataattaatataattggaaataccaaaggggtcttgtaaaaa 13901690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Original strand, 28236026 - 28236195
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |   ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||  || | |||||    
T  28236026 taattactattgtttttacaattttatccttaagaaagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaacaaaaa--tgcaaaataa 28236123  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28236124 ataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaacaccaaagaagtcttat-aaaaagggacaaa 28236195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 461 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 29036258 - 29036167
Alignment:
Q  461 agaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29036258 agaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaagtcttata-aaaagggacaaaa 29036167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 14630115 - 14629954
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||| ||  |||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  14630115 taattattattatttttacaattttatcctt-aagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaagaaaaagatgcaaaataaa 14630017  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     | |||||||   ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||| || |||||||||    
T  14630016 taagggtatgttagtaaagaaataattaatctacttgaaaataccaaagaggtattataaaaa 14629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 9038854 - 9038685
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||   ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||  || | |||||    
T  9038854 taattactattgtttttataattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa--tgcaaaataa 9038757  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||  |||||||| ||||||||||||    
T  9038756 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttata-aaaagggacaaa 9038685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 420 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 11840544 - 11840451
Alignment:
Q  420 agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   ||||| |||||| |||||||    
T  11840544 agttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagtaaaagatgtattataaacaggggtatgttcgtaaaaaaataactaatgta 11840451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 346 - 553
Target Start/End: Original strand, 22852119 - 22852326
Alignment:
Q  346 attaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgtt 444  Q
    ||||||| | || |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||| ||||  | ||  |    
T  22852119 attaagaaagtggatatttgt-ttaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatatttttcatatact 22852217  T
Q  445 atttattattgattg-aagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||  |||||| || ||||| |||||||| ||| ||||  ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||  |||||| ||||    
T  22852218 atttattgctgattgaaaaaaaaaaatgtataacaaatagggacatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaatagcaaagagatcttat-aaaa 22852316  T
Q  544 agggacaaaa 553  Q
    ||||||||||    
T  22852317 agggacaaaa 22852326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 381 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 27310646 - 27310482
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27310646 taattactgttgtttttataattttatcctt-aagagagatttaatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaa 27310548  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
     |  ||||||     |||||||||||||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  27310547 taaaggtatgttgacaaagaaataattaatgtatttggaaataccaaaggaatcttataaaaaagg 27310482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 381 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 11200808 - 11200672
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  11200808 taattactattgattttacaattgtatccttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataa 11200709  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtactt 516  Q
    | | |||||||   |||||||| ||||||||||||||    
T  11200708 ataagggtatgttggtaaagaattaattaatgtactt 11200672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 416 - 543
Target Start/End: Original strand, 29293658 - 29293785
Alignment:
Q  416 agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtact 515  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  29293658 agagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgatgaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtact 29293757  T
Q  516 tagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | |||||| ||||   ||||||||||||    
T  29293758 tggaaataccaaaagggtcttataaaaa 29293785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 388 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 23923698 - 23923534
Alignment:
Q  388 tattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   |||||| || |||||||| || ||  |||||||  ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||    
T  23923698 tattgtttttacaattttatccttaaaggtagagttagtatatgtttttaatataatatttatggttgattgaagaaaaatatgcaaaataaataggggt 23923599  T
Q  488 atgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||   ||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  23923598 atggtggtaaagaaatatttaatgtaattgaaaataccaaaagagtcttata-aaaagggacaaaa 23923534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 417 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 13446131 - 13446006
Alignment:
Q  417 gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgta-taataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtact 515  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||| |    
T  13446131 gagagttagtttatgttttcaatatagtatttattattgattgaagaaaaagatacagaaataaataggggtatgcttgtaa--aaataattaatgtaat 13446034  T
Q  516 tagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | |||||| ||||  |||||||||||||    
T  13446033 tggaaatatcaaaatagtcttataaaaa 13446006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Original strand, 28980678 - 28980850
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa---agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataat 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |||||||   ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||    
T  28980678 taattactattgtttttacaattttatccttgagagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaat 28980776  T
Q  478 aaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    ||| | | |||||   ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  28980777 aaataagagtatgttggtaaagaaataattaatttacttggaaacaccaaaggggtcttat-aaaaagggacaaa 28980850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 375 - 470
Target Start/End: Original strand, 6840088 - 6840183
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagat 470  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  | |||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  6840088 tgtttgtaattgctattgtttttacaattttatcctataagagagtgttaatgtatgttttcaacatattatttaatgctgattgaagaaaaagat 6840183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 299 - 540
Target Start/End: Original strand, 23282543 - 23282789
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt--aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||   |||||||||  |||||||||| |||  ||| |  || ||||  |||| |||||||| |||| |||    
T  23282543 tactacctccgtccctaattatagggccctttagaaaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtgataataaatttgttggtaattaccattggttt 23282642  T
Q  397 tacaattttatccttta---aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcat 493  Q
    ||||||||||||||| |   ||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||||||| |   | |||||| |||||||||       
T  23282643 tacaattttatccttaagagaaagagagttaatttatgttttcaatatagtatttaatgttgattgaagaaaaataaacaaaataaataggggtatgatg 23282742  T
Q  494 gtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    || || || ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  23282743 gtgaaaaattaattaatgcacttggaaataacaaaggggtcttataa 23282789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 366 - 546
Target Start/End: Original strand, 33012473 - 33012654
Alignment:
Q  366 tattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaa 464  Q
    |||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  33012473 tattaaatttgtttataattaatattgtttttacaattttgtctttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaa 33012572  T
Q  465 aaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    ||| ||| | |||||| |  | ||||    ||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  33012573 aaaaatgcaaaataaataaagttatgttgataaagaaatgattaaggcacttgaaaatatcaaatgagtcttataaaaaagg 33012654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 343 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 29036327 - 29036259
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 411  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29036327 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt 29036259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 360 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 26211135 - 26211032
Alignment:
Q  360 tatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa----aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattg 455  Q
    |||||||| ||||  ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26211135 tatttgtactaaagttgtttataatcactaatatttttacaattttatcctttaagagaaagagatttagtttatgttttcaacatgttatttattactg 26211036  T
Q  456 attg 459  Q
    ||||    
T  26211035 attg 26211032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 332 - 461
Target Start/End: Original strand, 2746317 - 2746448
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggttta 429  Q
    |||||||||| | |||||| | |||  ||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||  || | |||    
T  2746317 aaaaaataatggaaattaaaaaaattgatagttgtaataaatttgtttgtaattattattgtttttacaaatttatcctttaagagagagaattagctta 2746416  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaa 461  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||||||    
T  2746417 tgttttcaacatagtatttaatgttgattgaa 2746448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Original strand, 13321151 - 13321320
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||   ||||||||||||| ||  |||||||| ||  ||||||||||| ||| | |||||    
T  13321151 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagatagtaaatttatgttttcaatataatatttattgtt-tttgaagaaaaa-atgcaaaataa 13321248  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  13321249 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacacgaaaggggtcttat-aaaaagggacaaa 13321320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 538
Target Start/End: Original strand, 493510 - 493661
Alignment:
Q  388 tattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagggg 486  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||||||| ||  | ||||||||||||    
T  493510 tattgattttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttaatgttgattgaagaaaaatatacaaaataaacagggg 493609  T
Q  487 tatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttat 538  Q
    ||||   || || || ||||||||| |||| ||| ||||||||  |||||||    
T  493610 tatgatggtgaaaaattaattaatgcacttggaagtaacaaaggggtcttat 493661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 430 - 544
Target Start/End: Original strand, 8637148 - 8637262
Alignment:
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| | |||||||   |||||||||| |||||| |||||  ||||| |||||    
T  8637148 tgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaatgattaatatacttgaaaatagcaaag 8637247  T
Q  530 aagtcttataaaaaa 544  Q
      |||||||||||||    
T  8637248 gggtcttataaaaaa 8637262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 468 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 11104698 - 11104614
Alignment:
Q  468 gatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  11104698 gatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtattat-aaaaagggacaaaa 11104614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 510
Target Start/End: Original strand, 32982442 - 32982575
Alignment:
Q  377 tttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataa 476  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||  |||||| | |||||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  32982442 tttgtaatcacaattatttttacaattttatcttttgagggagagtaagtttatatattcaacgtgttatttatcggtgattgaagaaaaatatgtataa 32982541  T
Q  477 taaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaat 510  Q
    |||| | || |||| | ||||  |||||||||||    
T  32982542 taaataaggatatgtaggtaattaaataattaat 32982575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 413 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 17545439 - 17545389
Alignment:
Q  413 aaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaaga 463  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17545439 aaaagagagttagtttttgttttcaacatgttatttattgttgattgaaga 17545389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 419 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 8595707 - 8595646
Alignment:
Q  419 gagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8595707 gagttagtttatgttttcaacataatattgattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaa 8595646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 332 - 386
Target Start/End: Original strand, 9660167 - 9660221
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaatta 386  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  9660167 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatta 9660221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 395 - 490
Target Start/End: Original strand, 7847150 - 7847246
Alignment:
Q  395 tttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatg 490  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||    
T  7847150 tttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttcaatatagtttttaatattgattgaagaaaaatatacaaaataaataggggtatg 7847246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 493 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 5575476 - 5575426
Alignment:
Q  493 tgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||||    
T  5575476 tgtaaagaaataattaatgcacttgaaaatatcaaaaaagtcttataaaaa 5575426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 343 - 389
Target Start/End: Original strand, 11655853 - 11655899
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattacta 389  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11655853 ggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattacta 11655899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 494 - 543
Target Start/End: Original strand, 2365030 - 2365079
Alignment:
Q  494 gtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||    
T  2365030 gtaaagaaataattagtgtacttgaaaatatcaaaggagtcttataaaaa 2365079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 154; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 6351 - 6596
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6351 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 6450  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  6451 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaa 6550  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  6551 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 6596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 150; Significance: 8e-79; HSPs: 218)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 625708 - 625953
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||||   ||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  625708 tactacctccgtccctaattataggatctttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 625807  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  625808 acaattttatcctttaagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 625907  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  625908 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 625953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 13620595 - 13620840
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13620595 tactatctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 13620694  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||    
T  13620695 acaattttatcctttaagagagagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaa 13620794  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  13620795 aaaaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaa 13620840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 302 - 546
Target Start/End: Original strand, 13389654 - 13389898
Alignment:
Q  302 tacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttaca 400  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13389654 tacctccgtccttaattatatggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtagttagtattgtttttaca 13389753  T
Q  401 attttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaaga 500  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||    
T  13389754 attttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaaga 13389852  T
Q  501 aataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13389853 aataattaatgtagttgaaaatagcaaaggagtcttataaaaaagg 13389898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 20789195 - 20788973
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggttta 429  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||   ||||||||    
T  20789195 aaaaaataatggaaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattgctattgtttttacaactttatcctttaagagagataattggttta 20789096  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20789095 tgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgcatataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag 20788996  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
     ||||||||| |||||||||||||    
T  20788995 gagtcttata-aaaagggacaaaa 20788973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 37174097 - 37173875
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggttta 429  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  37174097 aaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacagttttatcctttaagagagaggattggttta 37173998  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  37173997 tgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag 37173898  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
      |||||||| |||||||||||||    
T  37173897 gggtcttata-aaaagggacaaaa 37173875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 14793764 - 14794009
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| | |||| |||||| ||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14793764 tactacctccgttcctaattatagggcccttttcaaaaaacaacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 14793863  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  14793864 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 14793963  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  14793964 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 14794009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 52978235 - 52978024
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||    
T  52978235 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagaaagaaggttggtttatgttttcaaca 52978136  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||     
T  52978135 tgttatttattgttgattgaagaaaaggatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttata- 52978037  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  52978036 aaaagggacaaaa 52978024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 553
Target Start/End: Original strand, 36129828 - 36130085
Alignment:
Q  297 agtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttt 395  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| || |||| ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  36129828 agtactacctccgtcct-aattataggatccttttgaaaaaataatgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtctgtaattactattgttt 36129926  T
Q  396 ttacaattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcat 493  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  36129927 ttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgtttccaacatgttatctattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 36130026  T
Q  494 gtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||    
T  36130027 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttat-aaaaagggacaaaa 36130085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 297 - 543
Target Start/End: Original strand, 37776473 - 37776720
Alignment:
Q  297 agtactacctccgcccttaattataggg-tcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttt 395  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  || ||| |||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37776473 agtactacctccgttcttaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgttt 37776572  T
Q  396 ttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || ||| | ||| ||||    
T  37776573 ttacaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataattaataggagcatgtatgt 37776672  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||    
T  37776673 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaa 37776720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 17339376 - 17339120
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17339376 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 17339277  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  17339276 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttgaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtatgataaataggggcatgtatgt 17339177  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  17339176 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 17339120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 300 - 553
Target Start/End: Original strand, 36900852 - 36901104
Alignment:
Q  300 actacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  36900852 actacctccgtccctaattatagggccattttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 36900951  T
Q  399 caattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaa 498  Q
    ||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||    
T  36900952 caattttatcctt-aagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaa 36901050  T
Q  499 gaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||    
T  36901051 gaaataattaatgtagttggaaatagcaagggagtctta-caaaaagggacaaaa 36901104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 343 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 44295042 - 44294837
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  44295042 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 44294943  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  44294942 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataa 44294843  T
Q  541 aaaagg 546  Q
    ||||||    
T  44294842 aaaagg 44294837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 10588327 - 10588116
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  10588327 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 10588228  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||     
T  10588227 tgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttata- 10588129  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  10588128 aaaagggacaaaa 10588116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 305 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 48030603 - 48030355
Alignment:
Q  305 ctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaatt 403  Q
    ||||| |||||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48030603 ctccgtccttaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 48030504  T
Q  404 ttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaat 503  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  48030503 ttatcctttaagagagaattggtttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaat 48030404  T
Q  504 aattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||| || |||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  48030403 aattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 48030355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 311 - 540
Target Start/End: Original strand, 52850205 - 52850437
Alignment:
Q  311 ccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcc 409  Q
    |||||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52850205 ccttaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcc 52850304  T
Q  410 tttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataatt 507  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  52850305 tttaagagagatagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 52850404  T
Q  508 aatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||| || || ||||||||||||  |||||||||    
T  52850405 aatatagttggaaataacaaaggggtcttataa 52850437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 311 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 55876664 - 55876431
Alignment:
Q  311 ccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcc 409  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55876664 ccttaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcc 55876565  T
Q  410 tttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaa 509  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  55876564 tttaaaagagaattggtttatgttttcatcatgatatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataagggcatgcatgtaaaaaaataattaa 55876465  T
Q  510 tgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||| || |||||| ||||| | |||||||||||    
T  55876464 tgtagttggaaatagcaaaggaatcttataaaaa 55876431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 314 - 553
Target Start/End: Original strand, 20454938 - 20455177
Alignment:
Q  314 taattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 412  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20454938 taattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatccttt 20455037  T
Q  413 aaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgt 512  Q
    || |||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20455038 aagagagagatgatttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgt 20455137  T
Q  513 acttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    | || |||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  20455138 agttggaaatggcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 20455177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 298 - 553
Target Start/End: Original strand, 26625742 - 26625997
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||  | |||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26625742 gtactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 26625841  T
Q  397 tacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26625842 tataattttatcctttaagagagaattgatttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgta 26625941  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  26625942 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 26625997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 343 - 552
Target Start/End: Original strand, 35675704 - 35675914
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  35675704 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 35675803  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |    
T  35675804 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttat-a 35675902  T
Q  541 aaaagggacaaa 552  Q
    ||||||||||||    
T  35675903 aaaagggacaaa 35675914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 47683386 - 47683140
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  47683386 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatattagtattaaatatgtttgcaattactattattttt 47683287  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| ||||    
T  47683286 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaggtgtataat-aataggggcatgtatgt 47683188  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||    
T  47683187 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaaagtcttataaaaa 47683140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 37842471 - 37842217
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||| |||||| | |||||||||||  | |||||||||| |||  |||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37842471 tacttcctccgtctttaattataggacctttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 37842372  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  37842371 acaattttatcctttaagagagaattggtttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaa 37842272  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  37842271 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 37842217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 299 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 40809854 - 40809604
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattataggg-tcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  || ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40809854 tactacctccgtccataattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 40809755  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||| ||||    
T  40809754 acaattttatcttttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagttgtattataaatagggacatgtatgt 40809655  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  | ||||||||||||||    
T  40809654 aaataaataattaatgtagttaaaaatagcaaaagaatcttataaaaaagg 40809604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Original strand, 30049857 - 30050070
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||    
T  30049857 aaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttgcttta 30049956  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  30049957 tgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattattgtagttggaaataacaaag 30050056  T
Q  530 aagtcttataaaaa 543  Q
      ||||||||||||    
T  30050057 gggtcttataaaaa 30050070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 36991212 - 36990956
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | || | |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  36991212 tactacctccgtccctaattataggacccttctgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 36991113  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  36991112 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttgaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtatgataaataggggcatgtatgt 36991013  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  36991012 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 36990956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 314 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 41620795 - 41620565
Alignment:
Q  314 taattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 412  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41620795 taattatagagtcattttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaattttatccttt 41620696  T
Q  413 aaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgt 512  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  41620695 aagagatagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatgaagacatgtatgtaaagaaataattaatgt 41620596  T
Q  513 acttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | || |||||| |||| | ||||||||||||    
T  41620595 agttggaaatagcaaaaatgtcttataaaaa 41620565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 299 - 540
Target Start/End: Original strand, 6462430 - 6462673
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6462430 tactacctccgtccataattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgttttt 6462529  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||    
T  6462530 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataat-aataggggcatgtatgt 6462628  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||||||||    
T  6462629 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaaaggtcttataa 6462673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 6753778 - 6753567
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||| ||||    
T  6753778 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgtttttaaca 6753679  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||     
T  6753678 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttata- 6753580  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  6753579 aaaagggacaaaa 6753567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 20285805 - 20286016
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||    
T  20285805 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaaca 20285904  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||    ||||||| |    
T  20285905 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaagagggtcttat-a 20286003  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  20286004 aaaagggacaaaa 20286016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 46950288 - 46950043
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | | |||||||| |||  | |||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||     
T  46950288 tactacctccgtccctaattatagggccctcttaaaaaaataacggaaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttctaattagtattgttttc 46950189  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  46950188 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 46950089  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||    
T  46950088 ataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaa 46950043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 56432817 - 56432569
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  56432817 tactatctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 56432718  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaag-aaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| | ||| ||| |||    
T  56432717 acaattttatcctttaagagagagagttggattatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaaatgtattataaataagggcatgtatg 56432618  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||    
T  56432617 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaa 56432569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 333 - 553
Target Start/End: Original strand, 45096941 - 45097160
Alignment:
Q  333 aaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgt 432  Q
    ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  45096941 aaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaattggtttatgt 45097040  T
Q  433 tttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaag 532  Q
    |||||| ||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||       
T  45097041 tttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaatcatgtataataaataagggtatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggga 45097140  T
Q  533 tcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  45097141 tcttat-aaaaagggacaaaa 45097160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 345 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 15241730 - 15241521
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||    
T  15241730 aattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatg 15241631  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||    
T  15241630 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttata-aa 15241532  T
Q  543 aagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||    
T  15241531 aagggacaaaa 15241521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 343 - 554
Target Start/End: Original strand, 43387777 - 43387989
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  43387777 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 43387876  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||  ||||||| |    
T  43387877 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaagtaacaaaggggtcttat-a 43387975  T
Q  541 aaaagggacaaaag 554  Q
    ||||||||||||||    
T  43387976 aaaagggacaaaag 43387989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 334 - 553
Target Start/End: Original strand, 50424629 - 50424849
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatg 431  Q
    ||||| || |||||||||||| || |||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||    
T  50424629 aaaatcatgggaattaagatagtggatatgtgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatg 50424728  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  |    
T  50424729 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaaga 50424828  T
Q  532 gtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  50424829 gtcttat-aaaaagggacaaaa 50424849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Original strand, 50602871 - 50603083
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagag--agttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||    
T  50602871 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttattctttaagagagatagttggatta 50602970  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||     
T  50602971 tgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaa 50603069  T
Q  530 aagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||    
T  50603070 aagtcttataaaaa 50603083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 54676801 - 54676589
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||    
T  54676801 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaaca 54676702  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataac-aaagaagtcttata 539  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||     
T  54676701 tattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaggggtcttat- 54676603  T
Q  540 aaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||    
T  54676602 aaaaagggacaaaa 54676589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Original strand, 18706417 - 18706637
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  18706417 aaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttataattattattatatttacaattttatcctttaagagagagatcgtttatg 18706516  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  |    
T  18706517 ttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtgtgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaga 18706616  T
Q  532 gtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  18706617 gtcttat-aaaaagggacaaaa 18706637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 24754331 - 24754120
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  24754331 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttattacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 24754232  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||     
T  24754231 tgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttata- 24754133  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  24754132 aaaagggacaaaa 24754120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 30771775 - 30771575
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  30771775 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 30771676  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  30771675 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataa 30771576  T
Q  541 a 541  Q
    |    
T  30771575 a 30771575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 296 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 31937377 - 31937118
Alignment:
Q  296 tagtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtt 394  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31937377 tagtactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 31937278  T
Q  395 tttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgca 492  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  31937277 tttacaattttatcatttaagaaagagtgttagattatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgta 31937178  T
Q  493 tgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||  ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31937177 tgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagaggtcttata-aaaagggacaaaa 31937118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 32032775 - 32032986
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  32032775 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 32032874  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||  ||||||| |    
T  32032875 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagctggaaataacaaaggggtcttat-a 32032973  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  32032974 aaaagggacaaaa 32032986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 37352796 - 37352585
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  37352796 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctctaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 37352697  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||     
T  37352696 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaaggtcttata- 37352598  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  37352597 aaaagggacaaaa 37352585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 333 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 38027395 - 38027183
Alignment:
Q  333 aaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttat 430  Q
    ||||||||  |||||||||||| || |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||    
T  38027395 aaaaataactggaattaagatagtggatatttatattaaatatttttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaggattggtttat 38027296  T
Q  431 gttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaaga 530  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||     
T  38027295 gttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagg 38027196  T
Q  531 agtcttataaaaa 543  Q
     ||||||||||||    
T  38027195 ggtcttataaaaa 38027183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 45742590 - 45742801
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  45742590 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 45742689  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||   ||||||| |    
T  45742690 tgttatttattgttgatggaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttat-a 45742788  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  45742789 aaaagggacaaaa 45742801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 345 - 543
Target Start/End: Original strand, 47228514 - 47228714
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||    
T  47228514 aattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatg 47228613  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||    
T  47228614 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaa 47228713  T
Q  543 a 543  Q
    |    
T  47228714 a 47228714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 53276970 - 53277181
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  53276970 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 53277069  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||| |    
T  53277070 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttat-a 53277168  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  53277169 aaaagggacaaaa 53277181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 29427742 - 29427539
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  29427742 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 29427643  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  29427642 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtatattaaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataa 29427543  T
Q  541 aaaa 544  Q
    ||||    
T  29427542 aaaa 29427539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 344 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 37357694 - 37357484
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacat 441  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||  ||| |||||||||||||||||    
T  37357694 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctctaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 37357595  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| |    
T  37357594 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaaggtcttata-a 37357496  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  37357495 aaagggacaaaa 37357484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 50450964 - 50451211
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50450964 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatctgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 50451063  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagt--tggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||  ||||    
T  50451064 acaattttatcctttaagagtgaggaatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatatatgt 50451163  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||  ||||  ||||||||||||    
T  50451164 aaagaaataattaatgtagttttaaatagtaaaggggtcttataaaaa 50451211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 17609806 - 17610016
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga-gttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||| |||||||||||||||||    
T  17609806 ggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgcttgtaatcactattgtttttacaattttattctttaagaaaaatgttagtttatgttttcaacat 17609905  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||    
T  17609906 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttat-aa 17610004  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  17610005 aaagggacaaaa 17610016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 334 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 33413780 - 33413566
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatg 431  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||| |||||||    
T  33413780 aaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatg 33413681  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||      
T  33413680 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggg 33413581  T
Q  532 gtcttataaaaaagg 546  Q
     ||||||||||||||    
T  33413580 atcttataaaaaagg 33413566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 33988536 - 33988787
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||||||  || ||||||||||  | ||| |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  33988536 tactacctccatccctaattataggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 33988635  T
Q  399 caattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaa 498  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||     
T  33988636 caattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa- 33988734  T
Q  499 gaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
     ||||||||||| || || |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  33988735 -aaataattaatatagttggaaatagcaaagaggtcttat-aaaaagggacaaaa 33988787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 25123983 - 25124231
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt--aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| ||||  |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25123983 tactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 25124082  T
Q  397 tacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  25124083 tacaattttatcctttaataaagagggttgacttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 25124182  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||| |||||||||||| | || ||||||  ||||  ||||||||||||    
T  25124183 taaataaataattaatgaagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 25124231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 342 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 51536421 - 51536209
Alignment:
Q  342 aggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaac 439  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||||    
T  51536421 aggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaac 51536322  T
Q  440 atgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttata 539  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||||    
T  51536321 atgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataataaagaggtcttata 51536222  T
Q  540 aaaaagggacaaaa 553  Q
     |||||||||||||    
T  51536221 -aaaagggacaaaa 51536209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 55562865 - 55563121
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| || | |||| |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55562865 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 55562964  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  55562965 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 55563064  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  55563065 aaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 55563121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 9328024 - 9328235
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  9328024 ggaattaagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 9328123  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||| |    
T  9328124 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttat-a 9328222  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  9328223 aaaagggacaaaa 9328235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 36392107 - 36391896
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  36392107 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 36392008  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||     
T  36392007 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata- 36391909  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  36391908 aaaagggacaaaa 36391896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 47299022 - 47299233
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  47299022 ggaattaagatagtaaatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 47299121  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  47299122 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 47299220  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  47299221 aaaagggacaaaa 47299233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 298 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 54624099 - 54623843
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    |||||||||||| || |||||||| || |||||| |||||| ||| | |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  54624099 gtactacctccgtccctaattatatggccattttgaaaaaaaaatggaaattaagatagtaaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 54624000  T
Q  397 tacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaaca-tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||    
T  54623999 tacaattttatcctttaagagaaagatggtttatgttttcaacattgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataattaataggggcatgtatgt 54623900  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||| ||||||||||||||  | |||||| |||   |||||||| ||||||||||||||    
T  54623899 aaataaataattaatgtaggtggaaatagcaagtgagtcttat-aaaaagggacaaaa 54623843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 343 - 552
Target Start/End: Original strand, 20391222 - 20391432
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||| |    
T  20391222 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaata 20391321  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||| |    
T  20391322 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttat-a 20391420  T
Q  541 aaaagggacaaa 552  Q
    ||||||||||||    
T  20391421 aaaagggacaaa 20391432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 20767955 - 20768211
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt--aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    ||||||||||| || |||||||| | |||||||  |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20767955 tactacctccgtccctaattataag-tcatttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 20768053  T
Q  397 tacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||    
T  20768054 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatg 20768153  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||  |||||  |||||| ||||||||||||||    
T  20768154 taaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagagatcttat-aaaaagggacaaaa 20768211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 37518267 - 37518056
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  37518267 aaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgaaattaatattgtttttacaattttatcctttaagagagagatgatttatg 37518168  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||      
T  37518167 tcttcaacatattatttattattgatcgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgaatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggg 37518068  T
Q  532 gtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||    
T  37518067 gtcttataaaaa 37518056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 332 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 37522483 - 37522272
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatg 431  Q
    |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  37522483 aaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgaaattaatattgtttttacaattttatcctttaagagagagatgatttatg 37522384  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||      
T  37522383 tcttcaacatattatttattattgatcgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgaatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggg 37522284  T
Q  532 gtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||    
T  37522283 gtcttataaaaa 37522272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 299 - 486
Target Start/End: Original strand, 54535921 - 54536111
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54535921 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 54536020  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagggg 486  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  54536021 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggg 54536111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 311 - 553
Target Start/End: Original strand, 48241401 - 48241645
Alignment:
Q  311 ccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcc 409  Q
    |||||||||||||  | |||| ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48241401 ccttaattataggacccttttgaaaaaataacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcc 48241500  T
Q  410 tttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataatt 507  Q
    ||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  48241501 tttatgagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttactggtgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataatt 48241600  T
Q  508 aatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||| || || |||||| |||| |  |||||| || |||||||||||    
T  48241601 aatatagttggaaatagcaaaaagatcttat-aagaagggacaaaa 48241645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 314 - 553
Target Start/End: Original strand, 51717853 - 51718093
Alignment:
Q  314 taattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta 413  Q
    ||||||||||  | |||| ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51717853 taattataggacctttttgaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtatgtaattactattgtttttacaattttatccttta 51717952  T
Q  414 aaa--gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatg 511  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| | ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  51717953 aaaaagagagttggtttatgttttcaacctgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatatggacatgtatgtaaagaaataattaatg 51718052  T
Q  512 tacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    || ||  ||||| |||||  || |||| ||||||||||||||    
T  51718053 tagttgaaaatagcaaaggggtattat-aaaaagggacaaaa 51718093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 314 - 528
Target Start/End: Original strand, 55014721 - 55014937
Alignment:
Q  314 taattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 412  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  55014721 taattataggatccttttgaaaaaataac-ggaattaaaataatgcatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatctttt 55014819  T
Q  413 aaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaat 510  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  55014820 aagagagatggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaat 55014919  T
Q  511 gtacttagaaataacaaa 528  Q
    ||| || |||||| ||||    
T  55014920 gtagttggaaatagcaaa 55014937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 23777543 - 23777787
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||| | || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  23777543 tactacctctgtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgttataaatatgtttgtaattagtatt-ttttt 23777641  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| || |||    
T  23777642 acaattttatcctttaagagagatatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatataa 23777741  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||   ||||||||||||    
T  23777742 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaa 23777787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 34273003 - 34273214
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  34273003 ggaactaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 34273102  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||| |    
T  34273103 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtatgataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttat-a 34273201  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  34273202 aaaagggacaaaa 34273214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 47807113 - 47806902
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||   || ||||||||||||||||    
T  47807113 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaagattagtttatgttttcaaca 47807014  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||     
T  47807013 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata- 47806915  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  47806914 aaaagggacaaaa 47806902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 332 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 18882617 - 18882399
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  18882617 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagagttggctta 18882518  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagggg--tatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaa 527  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||    
T  18882517 tgttttcaacattatatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaa 18882418  T
Q  528 agaagtcttataaaaaagg 546  Q
    ||| || ||| ||||||||    
T  18882417 agaggttttagaaaaaagg 18882399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 299 - 513
Target Start/End: Original strand, 20761564 - 20761781
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt--aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    ||||||||||| || |||||||| | |||||||  |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20761564 tactacctccgtccctaattataag-tcatttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 20761662  T
Q  397 tacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||    
T  20761663 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatg 20761762  T
Q  495 taaagaaataattaatgta 513  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20761763 taaagaaataattaatgta 20761781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 37364770 - 37364583
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  37364770 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctctaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 37364671  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37364670 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 37364583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 314 - 553
Target Start/End: Original strand, 38899799 - 38900038
Alignment:
Q  314 taattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 412  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  38899799 taattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatattggatatttgtattaaatatatttgtaattaatgttgtttttacaattttatccttt 38899898  T
Q  413 aaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgt 512  Q
    || |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| || ||||| ||||||||||||    
T  38899899 aagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatatataattaataggggcatgtatataaaggaataattaatgt 38899998  T
Q  513 acttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    | || |||||| |||||   |||||| ||||||||||||||    
T  38899999 agttggaaatagcaaagtgatcttat-aaaaagggacaaaa 38900038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 47311553 - 47311332
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||    
T  47311553 aaaaaataacgggaattaagata-tggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaggaaagagggttggctta 47311455  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||     
T  47311454 tgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaa 47311355  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||| |||| ||||||||||||||    
T  47311354 aagtgttat-aaaaagggacaaaa 47311332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 343 - 552
Target Start/End: Original strand, 49228502 - 49228712
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |  ||| ||||||||||||||||    
T  49228502 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaataaggttagtttatgttttcaaca 49228601  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  49228602 tgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtttgaaataacaaaggggtcttat-a 49228700  T
Q  541 aaaagggacaaa 552  Q
    ||||||||||||    
T  49228701 aaaagggacaaa 49228712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 360 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 50352300 - 50352106
Alignment:
Q  360 tatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50352300 tatttgtaataaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgat 50352201  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  50352200 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 50352106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 4036077 - 4035867
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  4036077 ggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 4035978  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |    
T  4035977 gctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata-a 4035879  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  4035878 aaagggacaaaa 4035867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 345 - 553
Target Start/End: Original strand, 5375344 - 5375552
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||  ||| ||||||||||||||||||    
T  5375344 aattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccgttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatg 5375443  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |||    
T  5375444 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggca-gtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aaa 5375541  T
Q  543 aagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||    
T  5375542 aagggacaaaa 5375552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 311 - 546
Target Start/End: Original strand, 16545735 - 16545972
Alignment:
Q  311 ccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcc 409  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| |||   ||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  16545735 ccttaattatatgatcattttaaaaaaataacgagaattaaaatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatct 16545834  T
Q  410 tttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataatt 507  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||    
T  16545835 tttaagagagaaggttggtttatcttttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaata-gggcatgtatgtaaagaaataatt 16545933  T
Q  508 aatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    |||||| || |||||| ||||  | ||||||||||||||    
T  16545934 aatgtaattggaaatatcaaatgattcttataaaaaagg 16545972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 314 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 18004224 - 18004009
Alignment:
Q  314 taattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 412  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  18004224 taattatagggcccttttgaaaaaataacaggaattaagatagcgaatatttgtattatatatgtttgtaattagtattctttttacaattttatctttt 18004125  T
Q  413 aaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgt 512  Q
    || |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || || ||| |||||||||||||||||| ||    
T  18004124 aagagagagatgttttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaaggt 18004025  T
Q  513 acttagaaataacaaa 528  Q
    | ||  ||||||||||    
T  18004024 agttgaaaataacaaa 18004009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 375722 - 375466
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||| |||| || |||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  375722 tactacatccgtccataattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 375623  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  375622 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcagcattctatttattgctgattgaagaaaaaaatatataataaataggggcatgtatgt 375523  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  ||||   |||||| ||||||||||||||    
T  375522 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttat-aaaaagggacaaaa 375466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 302 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 34963678 - 34963450
Alignment:
Q  302 tacctccgcccttaattatagggtcatttt--aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttac 399  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||  |||  |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  34963678 tacctccgtccttaattataggatcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgcaattattattggttttac 34963579  T
Q  400 aattttatcctttaaaagagag-ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaa 498  Q
    ||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || || ||| |||||||    
T  34963578 aattttatcctttaagagagagagttgtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat-aatagaggcatgtatgtaaa 34963480  T
Q  499 gaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  34963479 gaaataattaatgtagttggaaataacaaa 34963450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 342 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 51336047 - 51335835
Alignment:
Q  342 aggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaac 439  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||    
T  51336047 aggaattaagataatagatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttttacaaatttatccttcaagagagggagttggtttatgttttcaac 51335948  T
Q  440 atgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttata 539  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||  ||||||||    
T  51335947 atgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttata 51335848  T
Q  540 aaaaagggacaaaa 553  Q
     |||||||||||||    
T  51335847 -aaaagggacaaaa 51335835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 54877755 - 54877998
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  | |||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  54877755 tactacctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagagagtgaatatttttattaaatatgtttgtaattactattattttt 54877854  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||| | ||| ||| ||||||    
T  54877855 acaattttatcttttaagagagtgttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattga--aaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaa 54877952  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  |||  |||||||||||||    
T  54877953 agaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaa 54877998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 301 - 553
Target Start/End: Original strand, 28298111 - 28298366
Alignment:
Q  301 ctacctccgcccttaattataggg-tcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttac 399  Q
    ||||||||| || |||||||| || || ||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28298111 ctacctccgtccctaattataaggctcttttaaaaaaataacgagaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttac 28298210  T
Q  400 aattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattg-aagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| || || ||| |||||    
T  28298211 aattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgtcgattgaaaaaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgta 28298310  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  28298311 aagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttat-aaaaagggacaaaa 28298366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 30745584 - 30745794
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| | | |  ||| |||||||||||||||     
T  30745584 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcatt-ttgtttttacaattttatcctttaagaaataatgttagtttatgttttcaacc 30745682  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  30745683 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttat-a 30745781  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  30745782 aaaagggacaaaa 30745794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 345 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 4455313 - 4455102
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||    
T  4455313 aattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatg 4455214  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaa-gatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  4455213 ttatttattgttgattgaaaaaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 4455114  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    || || ||||||    
T  4455113 aagggaacaaaa 4455102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 345 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 8344156 - 8343949
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||    
T  8344156 aattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatg 8344057  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||| |||| |||    
T  8344056 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcat--atgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagagttttat-aaa 8343960  T
Q  543 aagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||    
T  8343959 aagggacaaaa 8343949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 25475067 - 25474867
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||||| || ||||||   |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||    
T  25475067 ggaattaagatagtggatatttactttaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagagataattagtttatgttttcaacatg 25474968  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||    
T  25474967 ttatttattgttgattgaagaaaaagacgtataataaataggattatgtatgtaaagaaataattaatgtacttgaaaataacaaaagagtcttataaaa 25474868  T
Q  543 a 543  Q
    |    
T  25474867 a 25474867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 1028771 - 1028569
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  1028771 ggaattaagatagtggatatttgtattaaatttatttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 1028672  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||    
T  1028671 tgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataa 1028572  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  1028571 aaa 1028569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 302 - 553
Target Start/End: Original strand, 39114631 - 39114884
Alignment:
Q  302 tacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttaca 400  Q
    |||||||| || |||||||| || | |||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  39114631 tacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtatttaca 39114730  T
Q  401 attttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaa 498  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||| |||||||    
T  39114731 attttatcctttaagaaagatggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataagagcatgtatgtaaa 39114830  T
Q  499 gaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||| || ||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  39114831 gaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttat-aaaaagggacaaaa 39114884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 50534136 - 50533934
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||   || ||||||||||||||||    
T  50534136 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaagtttagtttatgttttcaaca 50534037  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||    
T  50534036 tgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataa 50533937  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  50533936 aaa 50533934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 422713 - 422914
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga-gttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||||||||||||||    
T  422713 ggaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaatgttagtttatgttttcaacat 422812  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||    
T  422813 gttatttattgttgatcgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 422912  T
Q  542 aa 543  Q
    ||    
T  422913 aa 422914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 299 - 503
Target Start/End: Original strand, 30523764 - 30523969
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  | |||||||||| |||  |||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  30523764 tactacctccgtccctaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 30523863  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| ||||||    
T  30523864 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaatatgggcatgtatgtaa 30523963  T
Q  498 agaaat 503  Q
    ||||||    
T  30523964 agaaat 30523969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 344 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 49793341 - 49793133
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgt 443  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49793341 gaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttctaattacaattgtttttacaaatttatccttcaagagagagttggtttatgttttcaacatgt 49793242  T
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| | ||  ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||| | || |||| ||||    
T  49793241 tatttattgctgattcaagaaaaagatgaataataaataaggaaatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaaggttttat-aaaa 49793143  T
Q  544 agggacaaaa 553  Q
    ||||||||||    
T  49793142 agggacaaaa 49793133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 53630044 - 53629843
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  53630044 ggaattaagaaagcgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 53629945  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  53629944 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaa 53629845  T
Q  542 aa 543  Q
    ||    
T  53629844 aa 53629843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 357 - 553
Target Start/End: Original strand, 9808396 - 9808593
Alignment:
Q  357 gaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattatt 454  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  9808396 gaatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaaatttatccttcaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgct 9808495  T
Q  455 gattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  9808496 gattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 9808593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 29014109 - 29014319
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  29014109 ggaattaagaaagcgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 29014208  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||| ||    
T  29014209 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttat-aa 29014307  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  29014308 aaagggacaaaa 29014319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 332 - 480
Target Start/End: Original strand, 46480793 - 46480943
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggttta 429  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  46480793 aaaaaataacatgaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatggttggttta 46480892  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||    
T  46480893 tgttttcaacatgttatttattgttgattggagaaaaaaatatataataaa 46480943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 55632060 - 55632254
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  55632060 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgat 55632159  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  55632160 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 55632254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 299 - 513
Target Start/End: Original strand, 29460444 - 29460661
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| || | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  29460444 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattagatatgtttgtaattattattgttttt 29460543  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||    
T  29460544 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 29460643  T
Q  496 aaagaaataattaatgta 513  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29460644 aaagaaataattaatgta 29460661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 298 - 543
Target Start/End: Original strand, 49373433 - 49373679
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  49373433 gtactacatccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatctgtattaaatatgtttgcaattactattgtttt 49373532  T
Q  397 tacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||| |||||||||||   |||||||||||||  ||||| |||||| ||||| ||| |||    
T  49373533 tacaattttatcctttaagagatatggttggtttatgttatcaagatgttatttatagctgattgaagaaaa--atgtacaataaataggggcatgtatg 49373630  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  49373631 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 49373679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 332 - 552
Target Start/End: Original strand, 29519938 - 29520158
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||    
T  29519938 aaaaaataacgggaattaagatagtggataaa-gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagttggctta 29520036  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||    
T  29520037 tgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaag 29520136  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
      ||||||| |||||||||||||    
T  29520137 gggtcttat-aaaaagggacaaa 29520158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 359 - 552
Target Start/End: Original strand, 5743460 - 5743653
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||  | |||||| |||||  ||||    
T  5743460 atatttgtattaaagttgtctgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagaaagagagttagtttatgtttttcatatgttacttattgatgat 5743559  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  5743560 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaa 5743653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 301 - 543
Target Start/End: Original strand, 15500353 - 15500598
Alignment:
Q  301 ctacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttac 399  Q
    ||||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||  |||||||||||| |  |||||  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  15500353 ctacctccgtccttaattataggacttttttgaaaaaataacgggaattaagatactagatattcatattaaatatgtttataattactattatttttac 15500452  T
Q  400 aattttatcctttaaaagagagt--tggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||  ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  || | |||  |||||    
T  15500453 aattttatcctttatgagagaggggtggtttatgttttcaacatgttatttattactaattgaagaaaaagatgtataataaatcggagcatgtgtgtaa 15500552  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||  |||||||||||||    
T  15500553 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttataaaaa 15500598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 377 - 543
Target Start/End: Original strand, 38405643 - 38405805
Alignment:
Q  377 tttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtat 474  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38405643 tttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattactgattgaagaaaaagatgtat 38405742  T
Q  475 aataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||      |||||||||||  |||||||||||||    
T  38405743 aataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatg------gaaataacaaatgagtcttataaaaa 38405805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 359 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 39144640 - 39144455
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||   ||| || |||||  ||||    
T  39144640 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccgtatgctacttattgctgat 39144541  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  39144540 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaa 39144455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 39671023 - 39670775
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  | |||| |||||||||  | |||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39671023 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 39670924  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattg-aagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |      
T  39670923 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaaaaaaaagatgtataataaataggggtatgtaga 39670824  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  39670823 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaa 39670775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 342 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 1859396 - 1859186
Alignment:
Q  342 aggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | |    
T  1859396 aggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccata 1859297  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    || || |||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||     
T  1859296 tgatacttattgctg-ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttata- 1859199  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  1859198 aaaagggacaaaa 1859186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 2615744 - 2615940
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa---agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattg 455  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |   |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||  ||    
T  2615744 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctg 2615843  T
Q  456 attgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  2615844 attgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaaggtcttat-aaaaagggacaaaa 2615940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 334 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 20747431 - 20747221
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgt 432  Q
    ||||| || |||||||||| |  | ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  20747431 aaaattatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgt 20747332  T
Q  433 tttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaag 532  Q
    |||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||       
T  20747331 tttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggga 20747232  T
Q  533 tcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||    
T  20747231 tcttataaaaa 20747221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 343 - 513
Target Start/End: Original strand, 34948437 - 34948607
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||   |||    
T  34948437 ggaattaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcaatattgtttttacaattttatcttttaagagagagttgatttatgttttccgtatg 34948536  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  34948537 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 34948607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 343 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 1173814 - 1173642
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  1173814 ggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaaca 1173715  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    |  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  1173714 ttctatttattgctgattgaagaaaaggatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgta 1173642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 332 - 502
Target Start/End: Original strand, 45850497 - 45850669
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggttta 429  Q
    |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||    
T  45850497 aaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggctta 45850596  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaa 502  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  45850597 tgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 45850669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 380 - 552
Target Start/End: Original strand, 41191449 - 41191622
Alignment:
Q  380 gtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataat 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41191449 gtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataat 41191548  T
Q  478 aaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  41191549 aaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttat-aaaaagggacaaa 41191622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 344 - 543
Target Start/End: Original strand, 37639673 - 37639873
Alignment:
Q  344 gaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt--aaaagagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  37639673 gaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 37639772  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
      ||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||| | ||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  ||||||||||    
T  37639773 tctatttattgccgattgaacaaaaatatgtataataaata-ggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaa 37639871  T
Q  542 aa 543  Q
    ||    
T  37639872 aa 37639873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 332 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 45921692 - 45921473
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||    
T  45921692 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaattttatcctttaagagagagggttaattta 45921593  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||   |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||  |||     
T  45921592 tgtttt---catgttatttattgctgattgaataaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgcaaataggaaat 45921496  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
     |||||||| ||||||||||||||    
T  45921495 gagtcttat-aaaaagggacaaaa 45921473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 345 - 543
Target Start/End: Original strand, 4094759 - 4094958
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgt 443  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||| |||||||||||| | |||     
T  4094759 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagggttagtttatgttttccatatgc 4094858  T
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||   ||||||||||||    
T  4094859 tatttattgttgattgaagagaaagatgtataataaatagagatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaatggtcttataaaaa 4094958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 4416217 - 4416007
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || |||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  4416217 ggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtattattgtttttacagttttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 4416118  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| |    
T  4416117 gctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata-a 4416019  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  4416018 aaagggacaaaa 4416007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 52870880 - 52870686
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || |||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  52870880 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagaattagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 52870781  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||| |||||||||||||    
T  52870780 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtaggtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttata-aaaagggacaaaa 52870686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 334 - 553
Target Start/End: Original strand, 19281866 - 19282076
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatg 431  Q
    ||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| |||||||    
T  19281866 aaaatcatgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatg 19281965  T
Q  432 ttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaa 531  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||           |||||||||||||||||||||| || |||||||||||       
T  19281966 ttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataaa---------ttatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagg 19282055  T
Q  532 gtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  19282056 gtcttat-aaaaagggacaaaa 19282076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 343 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 18018911 - 18018739
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  18018911 ggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttgacttatgttttcaaca 18018812  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    |  ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18018811 ttctatttattgctgattaaagaaaaagatatataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 18018739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 299 - 468
Target Start/End: Original strand, 41191275 - 41191447
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| || | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41191275 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 41191374  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaag 468  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  41191375 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaag 41191447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 25708480 - 25708674
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  25708480 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 25708579  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||| |||||| ||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  25708580 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaacaaaaaatcaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 25708674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 299 - 470
Target Start/End: Original strand, 32898978 - 32899152
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| || | |||| |||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32898978 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 32899077  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagat 470  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||    
T  32899078 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagat 32899152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 359 - 543
Target Start/End: Original strand, 4549690 - 4549875
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  4549690 atatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 4549789  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||   ||||||||||||    
T  4549790 tgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaaaa 4549875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 6083536 - 6083335
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  6083536 ggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatctttaagagagagagttagtttatgttttccatat 6083437  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||  ||||||||||    
T  6083436 gctatttattgttgattcaagaaaaagatgtataataaatagagctatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaa 6083337  T
Q  542 aa 543  Q
    ||    
T  6083336 aa 6083335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 336 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 49329750 - 49329540
Alignment:
Q  336 aataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgtt 433  Q
    ||||| || |||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| | ||||  |||||||    
T  49329750 aataacagaaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacttttgtttttacaattttatcatttaagaaagtgggttgacttatgtt 49329651  T
Q  434 ttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagt 533  Q
    ||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||  |||    
T  49329650 ttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataaaggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataaaaaatgagt 49329551  T
Q  534 cttataaaaaa 544  Q
    |||||||||||    
T  49329550 cttataaaaaa 49329540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 39184523 - 39184315
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||| | || |||||| |||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||     
T  39184523 ggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtgatcactattgtttttacaattttatcctt-aaaagagagttagtttatgttttccatata 39184425  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    |||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  ||||||| ||    
T  39184424 ttatttattgctagttgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtaggtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagagatcttata-aa 39184326  T
Q  543 aagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||    
T  39184325 aagggacaaaa 39184315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Original strand, 13498309 - 13498480
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaa-gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  13498309 taattactattgtatttacaattttatccttaaaaaagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataa 13498408  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  13498409 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgagtcttat-aaaaagggacaaa 13498480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 342 - 470
Target Start/End: Original strand, 33501712 - 33501842
Alignment:
Q  342 aggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaac 439  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||||    
T  33501712 aggaattaagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaac 33501811  T
Q  440 atgttatttattattgattgaagaaaaagat 470  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33501812 atgttatttattgttgattgaagaaaaagat 33501842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 299 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 23623933 - 23623753
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattataggg-tcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  || ||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23623933 tactacctccgtccctaattatatgactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattg-tttt 23623835  T
Q  398 acaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataat 477  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  23623834 acaattttatcctttaagaaagataattggtttatatttttaacatgttatttattgctgattgaataaaaatatgtataat 23623753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 356 - 523
Target Start/End: Original strand, 39184048 - 39184217
Alignment:
Q  356 tgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattat 453  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||  |||||| | |    
T  39184048 tgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatcctttaagatagagaattagtttatgttttcaacataatatttactgt 39184147  T
Q  454 tgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
     ||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  39184148 cgattgaagaaaaatatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaatagttaatgtagttggaaata 39184217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 26866646 - 26866849
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa---agagagttggtttatgttttcaac 439  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |   ||| |||| |||||||||||| |     
T  26866646 ggaattaagaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagagagagatagttagtttatgttttccat 26866745  T
Q  440 atgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttata 539  Q
    ||| ||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||  ||||||||    
T  26866746 atgctatttattgctgatacaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttata 26866845  T
Q  540 aaaa 543  Q
    ||||    
T  26866846 aaaa 26866849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 365 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 28495615 - 28495455
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaag 462  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||     
T  28495615 gtattaaatttgtttgtaattactattgcttttacaattttatcctttaagagagagatttagtttatattttcaacataatatttattgttgattgaat 28495516  T
Q  463 aaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||   ||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  28495515 aaaaagatgtaaaataaataggggtatgttggtaaataaataattaatgaacttggaaata 28495455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 311 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 4143673 - 4143549
Alignment:
Q  311 ccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcc 409  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4143673 ccttaattataggatccttttgaaaaaataacgagaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaattttatcc 4143574  T
Q  410 tttaaaagagagttggtttatgttt 434  Q
    ||||| |||||| || |||||||||    
T  4143573 tttaagagagagatgatttatgttt 4143549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 379 - 542
Target Start/End: Original strand, 26889722 - 26889884
Alignment:
Q  379 tgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataata 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  |||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||    
T  26889722 tgtaattactattgtttttacaattttatcctt-aagagggagttaatttatgtttttaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaata 26889820  T
Q  479 aacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    || | |||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||   |||||||||||    
T  26889821 aataagggtatgtttgtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgtgtcttataaaa 26889884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Original strand, 52181009 - 52181178
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||| | ||||||    
T  52181009 taattactattgtttttacaattttatccttgaga-gagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaa 52181107  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
     | ||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  52181108 taagggtaggttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggagtcttat-aaaaagggacaaa 52181178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 384 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 29509016 - 29508848
Alignment:
Q  384 ttactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaaca 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  29509016 ttactattgtttttacaattttatccttaaaagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattattgattgaagaaaaagatgcaaaataaata 29508917  T
Q  483 ggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
     |||| ||   ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||||||    
T  29508916 agggtttgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaatatcaaaatggtcttata-aaaagggacaaa 29508848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 299 - 414
Target Start/End: Original strand, 5734387 - 5734503
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5734387 tactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 5734486  T
Q  398 acaattttatcctttaa 414  Q
    |||||||||||||||||    
T  5734487 acaattttatcctttaa 5734503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 382 - 552
Target Start/End: Original strand, 23390172 - 23390342
Alignment:
Q  382 aattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||| || ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  23390172 aattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaa 23390271  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
     | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  23390272 taagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggagatttat-aaaaagggacaaa 23390342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 299 - 437
Target Start/End: Original strand, 49489880 - 49490019
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49489880 tactacctccgtccctaattataggacacttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 49489979  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttca 437  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||    
T  49489980 acaattttatcctttaagagagtgttgatttattttttca 49490019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 401 - 552
Target Start/End: Original strand, 49490011 - 49490161
Alignment:
Q  401 attttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaaga 500  Q
    ||||| || ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||    
T  49490011 attttttcatttaagagagtgttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgtagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaaga 49490110  T
Q  501 aataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    ||||||||||||| || ||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  49490111 aataattaatgtagttggaaataggaaaggggtcttat-aaaaagggacaaa 49490161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 416 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 20286228 - 20286098
Alignment:
Q  416 agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtact 515  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||| |    
T  20286228 agagagttgatttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatatatgtaatgaaataattaatgtagt 20286129  T
Q  516 tagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    | ||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  20286128 tggaaatagtaaataagtcttataaaaaagg 20286098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 359 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 31071932 - 31071779
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgatt 458  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||| | ||| | || |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31071932 atatttgtattaaat-tgtttgtaatcactgttacttttataattttatcctttgagagataattagtttttgttttcagcatgttatttattgttgatt 31071834  T
Q  459 gaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31071833 gaagaaaaagatgtataataaataaggatatgtatgtaaaaaaataattaatgta 31071779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 359 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 52966331 - 52966160
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattga 456  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||  | ||| ||||||||  | |    
T  52966331 atatttgtattaaagttatttgtaatccctattatttttacaattttatcctt-aaaagaggaagttagtttatgttttacatatgatatttattgctaa 52966233  T
Q  457 ttgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  52966232 ttgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaag 52966160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 390 - 543
Target Start/End: Original strand, 48149017 - 48149172
Alignment:
Q  390 ttgtttttacaattttatcctttaaaa--gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggt 487  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || ||     
T  48149017 ttgtttttataattttatcctctaaaatagagagttgatttatgctctcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataatatatagaggc 48149116  T
Q  488 atgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||   ||||||||||||    
T  48149117 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaagggtcttataaaaa 48149172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Original strand, 6629299 - 6629467
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  6629299 taattactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaa 6629396  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
     | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||| |||||||||||||    
T  6629397 taagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagcgtcttat-aaaaagggacaaa 6629467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 379 - 553
Target Start/End: Original strand, 28501208 - 28501381
Alignment:
Q  379 tgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataat 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  28501208 tgtaattactattgtttttacaattttatccttaagagagcgagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaat 28501307  T
Q  478 aaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||| |  |||||    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  28501308 aaata-aggtatcttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttat-aaaaagggacaaaa 28501381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 30868621 - 30868786
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa---agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataat 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| || |||||| ||||||||| | |||    
T  30868621 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaaaaaaaagatgcaaaat 30868720  T
Q  478 aaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||| | ||||| |   |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||    
T  30868721 aaataagggtacgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaggagtcttataaaaa 30868786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 314 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 55777175 - 55777056
Alignment:
Q  314 taattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta 413  Q
    ||||||||||  | ||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55777175 taattataggaccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcattta 55777076  T
Q  414 aaagagagttggtttatgtt 433  Q
    | ||| | ||||||||||||    
T  55777075 agagataattggtttatgtt 55777056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 345 - 553
Target Start/End: Original strand, 17678305 - 17678514
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgt 443  Q
    |||||||| | || |||||| ||||||   |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| | | |||| ||| |||||||||||| | ||      
T  17678305 aattaagaaagtggatatttatattaatgttgtttgaaatcactattatttttacaattttatccttaagagagagtgttagtttatgttttccatatta 17678404  T
Q  444 tatttattattgattgaag-aaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||  || ||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||| |||    
T  17678405 tatttattgctgattgaaggaaaaagatgtataataaatagggacatatatataaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaataagtcttat-aaa 17678503  T
Q  543 aagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||    
T  17678504 aagggacaaaa 17678514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 297 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 39880037 - 39879919
Alignment:
Q  297 agtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttt 395  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39880037 agtactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatacttgtattaaatatgtttataattactattgttt 39879938  T
Q  396 ttacaattttatcctttaa 414  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39879937 ttacaattttatcctttaa 39879919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 359 - 480
Target Start/End: Original strand, 3168236 - 3168356
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgatt 458  Q
    |||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||  ||||||    
T  3168236 atatttatattaaaattgttcgtaatcactattgtttttacaattttatcatttaagagagagtta-tttatgttttcaacatactatttatcgttgatt 3168334  T
Q  459 gaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3168335 gaagaaaaagatgtataataaa 3168356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 334 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 6807608 - 6807492
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatg 431  Q
    ||||| || |||||||| ||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| |||||||    
T  6807608 aaaatcatgggaattaaaatagtggatatttgtattaaaaatgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatg 6807509  T
Q  432 ttttcaacatgttattt 448  Q
    |||||||||||||||||    
T  6807508 ttttcaacatgttattt 6807492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 365 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 13138956 - 13138773
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaga--gagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaag 462  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||  |||  |||||||||||| |||| |||||  |||||||  || |||||||    
T  13138956 gtattaaatatgtttgtaattattattgttttttcaattatatcttttacgagatagagttggtttatatttt-aacataatatttatcgttaattgaag 13138858  T
Q  463 aaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaaggg 547  Q
    ||||| ||||| |||||| | |||||||   |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13138857 aaaaatatgtaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgagtcttataaaaaaggg 13138773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 356 - 528
Target Start/End: Original strand, 20180715 - 20180888
Alignment:
Q  356 tgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattatt 454  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||| | ||||| |||  ||||  ||||||||  |    
T  20180715 tgaatatttatattaaagttgtttgtaattaatattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagattatgcttttcacatactatttattgct 20180814  T
Q  455 gattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    ||| ||||||||| |  ||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20180815 gatcgaagaaaaaaaattataataaatagtggtatgtatgaaaagaaataattaatgtaattaaaaataacaaa 20180888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 381 - 529
Target Start/End: Original strand, 47109643 - 47109792
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  || |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  47109643 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaattcatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataa 47109742  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    | | ||||| |   |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  47109743 ataagggtaagttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaag 47109792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 418 - 529
Target Start/End: Original strand, 5734539 - 5734651
Alignment:
Q  418 agagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt-aaagaaataattaatgtactt 516  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||| |||||||||||||| ||    
T  5734539 agagttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaaaaaaataattaatgtagtt 5734638  T
Q  517 agaaataacaaag 529  Q
     |||||| |||||    
T  5734639 ggaaatagcaaag 5734651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 13549193 - 13549023
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||   ||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13549193 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaagaaaaa-atgtaaaataa 13549095  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||  |||||||| ||||||||||||    
T  13549094 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttata-aaaagggacaaa 13549023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 314 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 55841355 - 55841236
Alignment:
Q  314 taattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta 413  Q
    ||||||||||  | ||| |||||||||   ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55841355 taattataggaccttttaaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcattta 55841256  T
Q  414 aaagagagttggtttatgtt 433  Q
    | ||| | ||||||||||||    
T  55841255 agagataattggtttatgtt 55841236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 17468102 - 17467942
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| || |||||| ||||||||  | ||||||    
T  17468102 taattactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaa-aaaaagattcaaaataaa 17468005  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     | |||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||   |||||||||||    
T  17468004 taagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaagggatcttataaaaa 17467942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 36211494 - 36211300
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaa--gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattga 456  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  36211494 atatttgtattaaaattatttgaaatcactgttgtttttacaattttatcttttaagatcgagagttagtttatgttttcaacatattattcattgttga 36211395  T
Q  457 ttgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    || | |||||||||| |||| ||| | | ||||  | ||||||||||||||| |||| || |||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  36211394 ttaatgaaaaagatgaataaaaaatatgagtatttaggtaaagaaataattattgtagttggaaatagcatag-agtcttat-aaaaagggacaaaa 36211300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 381 - 513
Target Start/End: Original strand, 48801442 - 48801575
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| | | | |||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  48801442 taattattatagtttttacaattttatccttaagagaaagagttagtttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataa 48801541  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    | | |||||||   |||||||||||| |||||||    
T  48801542 ataagggtatgttggtaaagaaataactaatgta 48801575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 381 - 549
Target Start/End: Original strand, 6656568 - 6656736
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |   | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6656568 taattaatattgtttttacaattttatcttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaa 6656667  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggac 549  Q
     | ||  ||     |||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| |||||    
T  6656668 taaggacatattgataaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaaggggac 6656736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 375 - 516
Target Start/End: Original strand, 8418162 - 8418305
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||||||| || |    
T  8418162 tgttagtaattagtattgtttttacaattctatcctttaagagagtaagttagtttatattttcaacatactatttaatgttgattgaagaaaaaaatat 8418261  T
Q  473 ataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtactt 516  Q
    | |||||| |||||||||   |||||||| ||||||||||||||    
T  8418262 aaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtactt 8418305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 382 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 18872930 - 18872760
Alignment:
Q  382 aattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||| || ||  |||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||    
T  18872930 aattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatacaaaataaa 18872831  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
     | |||||||   ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||   ||||||| ||||||||||||    
T  18872830 taagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacctggaaatatcaaagggatcttata-aaaagggacaaa 18872760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 30010675 - 30010836
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  30010675 taattactattgtttttacaattttatccttgagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataa 30010773  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | | || ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  30010774 ataaggatatgttggtaaagaaataattaatatacttagaaataccaaa-aggtcttataaaaa 30010836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 381 - 551
Target Start/End: Original strand, 41333873 - 41334044
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || | | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  41333873 taattattattgtttttacaattttatctttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataa 41333972  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaa 551  Q
    | | |||||||   ||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||   || |||||||| |||||||    
T  41333973 ataagggtatgttagtaaaaaaataattaatatacttggaaatgccaaagggatcctataaaaaggggacaa 41334044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 32684809 - 32684648
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  32684809 taattattattgtttttacaattttatccttaagaa-agagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaa 32684711  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     | |||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||    
T  32684710 taagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaaccggtcttataaaaa 32684648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 365 - 467
Target Start/End: Original strand, 42598519 - 42598621
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaa 464  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| || ||||| ||||||||| ||    
T  42598519 gtattaaatttgtttgtagttactattgtttttacaattttatcctttaagagagagttagtttatggtttcaatatgctacttattgttgattgaaaaa 42598618  T
Q  465 aaa 467  Q
    |||    
T  42598619 aaa 42598621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 420
Target Start/End: Original strand, 27009592 - 27009704
Alignment:
Q  311 ccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaac-atgtttgtaatt-actattgtttttacaattttat 407  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27009592 ccttaattatagggcccttttgaaaaaataataagaattaagatagtggatatttatattaaaatatgtttgtaatttactattgtttttacaattttat 27009691  T
Q  408 cctttaaaagaga 420  Q
    ||||||| |||||    
T  27009692 cctttaagagaga 27009704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 381 - 528
Target Start/End: Original strand, 53564179 - 53564327
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||  ||||||||||||| ||  |||||||| |||||| |||||||| ||| | |||||    
T  53564179 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaagaaaaatatgcaaaataa 53564278  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  53564279 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatctacttggaaatatcaaa 53564327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 420 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 53906191 - 53906099
Alignment:
Q  420 agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgt 512  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  53906191 agttagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaatgatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaatagttaatgt 53906099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 381 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 20783400 - 20783266
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  20783400 taattactattatttttacaattttatcctt-aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttttttgaagaaaaagatgcaaaataaa 20783302  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtactt 516  Q
     |  ||||||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  20783301 taatggtatgtttgtaatgaaataattaatatactt 20783266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 37780038 - 37780199
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  37780038 taattactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaa 37780135  T
Q  481 caggggtatgcatgt-aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     | | |||||   || ||| |||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||    
T  37780136 taagagtatgttggtaaaaaaaataattaatgtatttggaaacaccaaagaagtcttataaaaa 37780199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 385 - 516
Target Start/End: Original strand, 49613987 - 49614118
Alignment:
Q  385 tactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagg 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||| |||||||  |  |||||| | |||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  49613987 tactattgtttttacaattttatccttgaagagagagttattttatattttcaatgtagtatttaatgttgagtgaagaaaaagatgtagaataaatagg 49614086  T
Q  485 ggtatgcatgtaaagaaataattaatgtactt 516  Q
    ||||||   |||||||| |||| |||||||||    
T  49614087 ggtatgttggtaaagaattaatgaatgtactt 49614118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 334 - 468
Target Start/End: Original strand, 51329557 - 51329692
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgt 432  Q
    ||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||| | || |||||| |    
T  51329557 aaaattatgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagataattagtttatat 51329656  T
Q  433 tttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaag 468  Q
    |||  | ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  51329657 ttttcatatgttatttattgctgattgaagaaaaag 51329692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 3085656 - 3085497
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||   |||||||||| || ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  3085656 taattactattgtttttacaattttatcc-ttgagagagagtaaatttatgtttttaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaa 3085559  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| |||||||||||||    
T  3085558 taagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacactaaag-agtcttataaaaa 3085497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 21265433 - 21265263
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa---agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataat 477  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   | |||||   ||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||    
T  21265433 taattactattgtttttacaattttatccttaaaagagaaagagtaaatttatgttttcagtataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaat 21265335  T
Q  478 aaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    ||| | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||   |||||||||||||    
T  21265334 aaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaagaggtctt---aaaaagggacaaa 21265263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 375 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 706766 - 706658
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||   || ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  706766 tgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagatagataattagtttatgtttttaacatgctatttattatttattaaagaaaaatatgt 706667  T
Q  473 ataataaac 481  Q
    |||||||||    
T  706666 ataataaac 706658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 375 - 481
Target Start/End: Original strand, 729851 - 729959
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||   || ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  729851 tgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagatagataattagtttatgtttttaacatgctatttattatttattaaagaaaaatatgt 729950  T
Q  473 ataataaac 481  Q
    |||||||||    
T  729951 ataataaac 729959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 35909856 - 35909684
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaaga-tgtataata 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||||| | |  | ||||    
T  35909856 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttggttgaagaaaaaaaatacaaaata 35909757  T
Q  479 aacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    || | |||||||   |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  35909756 aataagggtatgttggtaaagaaataattaatggacttggaaataccaaaagagtcttata-aaaagggacaaa 35909684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 311 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 10497651 - 10497417
Alignment:
Q  311 ccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcc 409  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||| |||  | | |  || ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10497651 ccttaattatatg-tcattttgaaaaaataatgggaattaagaaaattgaaagtgataataaatttgtttataattactattatttttacaattttatcc 10497553  T
Q  410 tttaaaagagagt--tggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataatt 507  Q
    ||||| |||||    | || |||||||| |||||  |||||| | |||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||   |||||||| |||||    
T  10497552 tttaagagagaagactagtgtatgtttttaacatagtatttaatgttgattgaagaaaaggatataaaataaataggggtatgttggtaaagaactaatt 10497453  T
Q  508 aatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||| || |||| | |||| |  |||||||||||    
T  10497452 aatgtatttggaaaaaccaaatagatcttataaaaa 10497417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 435 - 543
Target Start/End: Original strand, 42528469 - 42528577
Alignment:
Q  435 tcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtc 534  Q
    |||||||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||    
T  42528469 tcaacatactatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataattaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtc 42528568  T
Q  535 ttataaaaa 543  Q
    |||||||||    
T  42528569 ttataaaaa 42528577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 299 - 398
Target Start/End: Original strand, 48148663 - 48148763
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||||||||||  |||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  48148663 tactacctccgtccttaattatagtgcccttttgaaaaaataatataaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 48148762  T
Q  398 a 398  Q
    |    
T  48148763 a 48148763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 420 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 18879671 - 18879581
Alignment:
Q  420 agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaat 510  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| | |||||||||||| | | ||||| | |||||||||||||||||    
T  18879671 agttgttttatgttttcaacatgttatttattgatgatagaagaaagaaatgtataataaataagagtatgtaggtaaagaaataattaat 18879581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 375 - 510
Target Start/End: Original strand, 26169770 - 26169906
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaga--gagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    ||||||| || || ||| |||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||| ||| |    
T  26169770 tgtttgttatcacaattatttttacagttttatcctttaaaaaaaagagttagtttatgttttcaacatgatatt-attgttgtttgaagaaaatgatat 26169868  T
Q  473 ataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaat 510  Q
    |||||||| | || |||| | ||||| |||||||||||    
T  26169869 ataataaatatggttatgaaggtaaataaataattaat 26169906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 463 - 553
Target Start/End: Original strand, 36040868 - 36040957
Alignment:
Q  463 aaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  36040868 aaaaagatgtataataaataggggtatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggaatcttat-aaaaagggacaaaa 36040957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 474 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 23621578 - 23621506
Alignment:
Q  474 taataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  23621578 taataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaagg 23621506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 444 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 39797584 - 39797477
Alignment:
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| |||    
T  39797584 tatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttata-aaa 39797486  T
Q  544 agggacaaa 552  Q
    |||||||||    
T  39797485 agggacaaa 39797477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 451
Target Start/End: Original strand, 5840103 - 5840187
Alignment:
Q  366 tattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttatt 451  Q
    |||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5840103 tattaaatttgtttataattattattatttttacaattttatcc-ttaagagagagttagtttatgtttttaacatgatatttatt 5840187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 529
Target Start/End: Original strand, 6595556 - 6595705
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||||||| | | ||| |    
T  6595556 taattattattgtttttataaatttatctttaagaaagagagttagtttatgttttcaacaatttatttatggttgatcgaagaaaaagaagcaaaatta 6595655  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    | | |||||||    |||||||| |||||||||| ||  |||||||||||    
T  6595656 ataagggtatgttgataaagaaaaaattaatgtaattgaaaataacaaag 6595705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 50649140 - 50648972
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag------ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtat 474  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||      || || |||||||| |||||  |||||| | ||||| ||||||||| || ||     
T  50649140 taattgctattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttaattagtgtatgtttttaacatagtatttaatgttgatcgaagaaaaatatataa 50649041  T
Q  475 aataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||  ||||| |    |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  50649040 aataaatgggggtgtattggtaaagaattaattaatgtatttagaaataccaaatgagtcttataaaaa 50648972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 465 - 553
Target Start/End: Original strand, 468413 - 468500
Alignment:
Q  465 aaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||  ||||| | ||||||||||||||    
T  468413 aaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtctt-ttaaaaagggacaaaa 468500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 385 - 480
Target Start/End: Original strand, 19596268 - 19596364
Alignment:
Q  385 tactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||  || |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19596268 tactattgcttttacaattttatccttaagagagatagttaattcatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaa 19596364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 543
Target Start/End: Original strand, 24073013 - 24073112
Alignment:
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| | |||||||   ||||||||||||||||| || || |||||| |||||   |||||||||||    
T  24073013 tatttattattgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatataattggaaataccaaagggatcttataaaaa 24073112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 444 - 539
Target Start/End: Original strand, 50622480 - 50622575
Alignment:
Q  444 tatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttata 539  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |  |||||    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||    
T  50622480 tatttattgttgattgaagaaaaggatgtaaaataaataatggtatcttggtaaagaaataattaatatatttagaaataccaaagatgtcttata 50622575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 553
Target Start/End: Original strand, 11469142 - 11469231
Alignment:
Q  463 aaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  11469142 aaaaatatgtataataaataggggtatatatataaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttat-aaaaagggacaaaa 11469231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 11522319 - 11522230
Alignment:
Q  463 aaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  11522319 aaaaatatgtataataaataggggtatatatataaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttata-aaaagggacaaaa 11522230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 425 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 51787701 - 51787603
Alignment:
Q  425 gtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
    |||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||||| |||||||| || || ||| |  |||| ||||||||||| || |||||||||    
T  51787701 gtttatgttttcaacatactatttatcgctgattgaagaaaaagatgcataataaatagaggaatgtaaataaaaaaataattaatatagttagaaata 51787603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 454 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 38613547 - 38613458
Alignment:
Q  454 tgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||    
T  38613547 tgattgaagaaaaatatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgagtcttataaaaa 38613458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 365 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 55969053 - 55968949
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaag 462  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | | | |  |||| |||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||    
T  55969053 gtattaaagttgtttgtaatcactattggttttacaattttatccttaagagggggaagttagtttatgttttccatgtgctatttattgttgattgaag 55968954  T
Q  463 aaaaa 467  Q
    |||||    
T  55968953 aaaaa 55968949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 429 - 522
Target Start/End: Original strand, 7326036 - 7326133
Alignment:
Q  429 atgttttcaacatgttatttattattgattgaag----aaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaat 522  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    ||||| |||||||||||| | || |||| | |||||||||| ||||||||| || |||||    
T  7326036 atgttatcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaaaatatgtataataaataaggatatgtaggtaaagaaatcattaatgtagttggaaat 7326133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 480
Target Start/End: Original strand, 26186516 - 26186623
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    |||||||||| || ||| |||||||| ||||||| |||||  || |||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||  || |    
T  26186516 tgtttgtaatcacaattatttttacagttttatcatttaagaaaaagagtaagtttatgttttcaacaagatatttattgttgatcgaagaaaataatat 26186615  T
Q  473 ataataaa 480  Q
    ||||||||    
T  26186616 ataataaa 26186623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 421
Target Start/End: Original strand, 54158710 - 54158766
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag 421  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  54158710 gtattaaatttgtttgtaattactattatttttacaattttatccttttagagagag 54158766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 543
Target Start/End: Original strand, 22130324 - 22130497
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || || ||||||  ||  | ||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||| |    
T  22130324 tgtttgtaattataattgtttt-acaattttatctttgaagagagaggattattgtatgttttcaacatagtatttaatgttgattgaagaaaaagatat 22130422  T
Q  473 ataa----taaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | ||    |||| |||||||||   ||||| || |||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  22130423 aaaataattaaataggggtatgttagtaaacaactaattaatatactaggaaatactaaagaggtcttataaaaa 22130497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 381 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 9030150 - 9030093
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  9030150 taattactattgtttttacaatttcaacattttaaagagagttattttatgttttcaa 9030093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 464
Target Start/End: Original strand, 22294307 - 22294399
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaaca-tgt--tatttattattgattgaagaa 464  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||  |||||||| ||||||||||||    
T  22294307 tgtttgtatttaatattgtttttactattttgccctttaagagagagttagtttatgtttttaaaattgtagtatttattgttgattgaagaa 22294399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 381 - 441
Target Start/End: Original strand, 50621563 - 50621624
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctt-taaaagagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| |||||    
T  50621563 taattattattgtttttacaattttatccttaaaaaagagagttaatttatgttttgaacat 50621624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 381 - 512
Target Start/End: Original strand, 7776767 - 7776902
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-----aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtata 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |     | |||||||   ||||||||||||| ||  |||||||| | ||||||||||||| ||| | |    
T  7776767 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgtcgattgaagaaaaa-atgcaaa 7776865  T
Q  476 ataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgt 512  Q
    ||||| | |||||||    |||||||||| |||||||    
T  7776866 ataaataagggtatgttgctaaagaaatatttaatgt 7776902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #213
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 472 - 528
Target Start/End: Original strand, 46481303 - 46481359
Alignment:
Q  472 tataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  46481303 tataataaataggggctttcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaa 46481359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #214
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 38616058 - 38615984
Alignment:
Q  366 tattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||  ||||||||||||||||    
T  38616058 tattaaatttgtttataattactattatttttacaattttat-ctttaagggagaattaatttatgttttcaacat 38615984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #215
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 470 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 38319729 - 38319655
Alignment:
Q  470 tgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaa 544  Q
    |||| |||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  ||||||||||||    
T  38319729 tgtacaataaataggactatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagagctcttataaaaaa 38319655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #216
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 488 - 546
Target Start/End: Original strand, 51329697 - 51329755
Alignment:
Q  488 atgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagg 546  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  51329697 atgtatgtaaaaaaataattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaaaagg 51329755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #217
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 366 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 20128732 - 20128631
Alignment:
Q  366 tattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaa 465  Q
    |||||||  ||||||||| |||| ||| |||| || ||||||| | ||| | ||||||  |||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||    
T  20128732 tattaaatttgtttgtaactactcttggtttttcagttttatcttctaagatagagttcatttatgtttttaacaaaatatttattgttgattgaagaaa 20128633  T
Q  466 aa 467  Q
    ||    
T  20128632 aa 20128631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #218
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 495 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 30191815 - 30191766
Alignment:
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaa 544  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  30191815 taaagaattaattaatgtacttcgaaatatcaaatgagtcttataaaaaa 30191766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 298 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 3736 - 3479
Alignment:
Q  298 gtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3736 gtactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 3637  T
Q  397 tacaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatg 494  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  3636 tacaattttatcctttaagaaagagggttggattatgtttttaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaatcggggcatgcatg 3537  T
Q  495 taaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  3536 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 3479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0907 (Bit Score: 142; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0907
Description:

Target: scaffold0907; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 4316 - 4561
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4316 tactacctccgtccctaattatagggtctttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 4415  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  4416 acagttttatcctttaagagagagatgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 4515  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  4516 agaaataattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 4561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 4404 - 4649
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  4404 tactacctccgtccttaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattaatattgttttt 4503  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  4504 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 4603  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||||||||||||| || || |||||| ||||  |||||||||||||    
T  4604 agaaataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaa 4649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 138; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 45967 - 45722
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| | |||| |||||| ||  |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  45967 tactacctccgttcctaattatagggcccttttcaaaaaacaacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 45868  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||    
T  45867 acaattttatcctttaagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa 45768  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  45767 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 45722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 132; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 345 - 553
Target Start/End: Original strand, 258908 - 259117
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||    
T  258908 aattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatg 259007  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||    
T  259008 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagagatcttat-aaa 259106  T
Q  543 aagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||    
T  259107 aagggacaaaa 259117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 131; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 18797 - 18538
Alignment:
Q  295 ctagtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgt 393  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18797 ctagtactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgt 18698  T
Q  394 ttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgc 491  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||     
T  18697 ttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat-aataggggcatgt 18599  T
Q  492 atgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  18598 atgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttat-aaaaagggacaaaa 18538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 130; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 48951 - 48706
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  48951 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagataatagatatttgtattaaatatgtttgtgattaatattgttttt 48852  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||| | ||  ||||||    
T  48851 acaattttatcctttaagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattaatgtttgaagaaaaagatgtataattaataggagcatctatgtaa 48752  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||    
T  48751 agaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaa 48706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 5450 - 5192
Alignment:
Q  295 ctagtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgt 393  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5450 ctagtactacctccgtccctaat-ataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgt 5352  T
Q  394 ttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgc 491  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||     
T  5351 ttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat-aataggggcatgt 5253  T
Q  492 atgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  5252 atgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttat-aaaaagggacaaaa 5192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0549 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0549
Description:

Target: scaffold0549; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 295 - 553
Target Start/End: Original strand, 9920 - 10178
Alignment:
Q  295 ctagtactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgt 393  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9920 ctagtactacctccgtccctaat-ataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgt 10018  T
Q  394 ttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgc 491  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||     
T  10019 ttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat-aataggggcatgt 10117  T
Q  492 atgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  10118 atgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttat-aaaaagggacaaaa 10178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0649 (Bit Score: 126; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0649
Description:

Target: scaffold0649; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 4082 - 4293
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  4082 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 4181  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  4182 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtcaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 4280  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  4281 aaaagggacaaaa 4293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 126; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 345 - 543
Target Start/End: Original strand, 6926 - 7126
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatg 442  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||    
T  6926 aattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatg 7025  T
Q  443 ttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||    
T  7026 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaa 7125  T
Q  543 a 543  Q
    |    
T  7126 a 7126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0883 (Bit Score: 124; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0883
Description:

Target: scaffold0883; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 332 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 1984 - 1763
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggttta 429  Q
    |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  1984 aaaaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggttta 1885  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    |||||||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  1884 tgttttcaacatattttttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagctggaaatagcaaag 1785  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
      |||||||| ||||||||||||    
T  1784 gggtcttata-aaaagggacaaa 1763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 124; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 332 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 45777 - 45556
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggttta 429  Q
    |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  45777 aaaaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggttta 45678  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaag 529  Q
    |||||||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  45677 tgttttcaacatattttttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagctggaaatagcaaag 45578  T
Q  530 aagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
      |||||||| ||||||||||||    
T  45577 gggtcttata-aaaagggacaaa 45556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 122; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 5070 - 5281
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  5070 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagctgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 5169  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |    
T  5170 tgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttat-a 5268  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  5269 aaaagggacaaaa 5281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 14133 - 14334
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  14133 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagatgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 14232  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||    
T  14233 tgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgta-taggaaataacaaaggggtcttataa 14331  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  14332 aaa 14334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 122; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 31471 - 31682
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  31471 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 31570  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| |    
T  31571 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-a 31669  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  31670 aaaagggacaaaa 31682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 122; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Original strand, 51466 - 51677
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  51466 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcaccattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 51565  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||| |    
T  51566 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttat-a 51664  T
Q  541 aaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||    
T  51665 aaaagggacaaaa 51677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 117; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 314 - 553
Target Start/End: Original strand, 355057 - 355296
Alignment:
Q  314 taattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 412  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  355057 taattataggaccattttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgttattactattgtttttacaattttatccttt 355156  T
Q  413 aaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgt 512  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  355157 aagagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaggaaaattatgtataataaataggggcaagtatgtaaagaaataattaatgt 355256  T
Q  513 acttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    | ||  ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  355257 agttgaaaatagcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 355296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 92415 - 92307
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaa--gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattga 456  Q
    ||||| ||||||||  | |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |  || ||||  || |||||||||||||  |||||||| || |    
T  92415 atattagtattaaatttatttgtaattcatattctttttacaattttatcctttaagatcgaaagttaattaatgttttcaacataatatttatttttta 92316  T
Q  457 ttgaagaaa 465  Q
    | |||||||    
T  92315 tcgaagaaa 92307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0604 (Bit Score: 116; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0604
Description:

Target: scaffold0604; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Original strand, 3525 - 3778
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    |||| |||||| || ||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3525 tactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactactgttttt 3624  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaa 497  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3625 acaattttatcctttaagagagaattgatttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaa 3724  T
Q  498 agaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||| |||||| || || |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  3725 agaaat-attaatatagttggaaatagcaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 3778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0576 (Bit Score: 116; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0576
Description:

Target: scaffold0576; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 299 - 543
Target Start/End: Original strand, 285 - 530
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttta 398  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  285 tactacctccgtccctaattatagggccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaccattgttttta 384  T
Q  399 caattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgta 496  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| |||||    
T  385 caattttatcctttaagagagagaattaaattatgttttcaacatgttatttattgttcattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgta 484  T
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    ||| ||||||||||||| ||  ||||| ||| |  ||||||||||||    
T  485 aag-aataattaatgtagttgaaaatagcaatggggtcttataaaaa 530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 116; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 47892 - 47682
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  47892 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 47793  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |    
T  47792 gctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttata-a 47694  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  47693 aaagggacaaaa 47682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 113; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 343 - 543
Target Start/End: Original strand, 24416 - 24616
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  24416 ggaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaaca 24515  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||    
T  24516 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggg--cgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataa 24613  T
Q  541 aaa 543  Q
    |||    
T  24614 aaa 24616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 113; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 343 - 552
Target Start/End: Original strand, 61637 - 61847
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||| ||||||| |    
T  61637 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaata 61736  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||| |    
T  61737 tgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacataggggtcttat-a 61835  T
Q  541 aaaagggacaaa 552  Q
    ||||||||||||    
T  61836 aaaagggacaaa 61847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 111; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 328 - 523
Target Start/End: Original strand, 9195 - 9392
Alignment:
Q  328 ttttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttgg 425  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||     
T  9195 ttttgaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttga 9294  T
Q  426 tttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
     |||| ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  9295 cttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 9392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 111; Significance: 2e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 299 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 94083 - 93827
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||  || |||||||| || | |||| |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  94083 tactacctccatccctaattataaggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaactactattgttttt 93984  T
Q  398 acaattttatcctttaa--aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgt 495  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  93983 acaattttaacctttaagaaagagggttggtttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgt 93884  T
Q  496 aaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||| |||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  93883 aaagaaataattaatgtagttgaaaataaaaaaggagttctat-aaaaagggacaaaa 93827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 365 - 543
Target Start/End: Original strand, 103870 - 104048
Alignment:
Q  365 gtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaaga 463  Q
    ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| || | || ||| |||||  ||| |||| |||||| | ||    
T  103870 gtattaaatttgtttataattgctattgtttttacaattttatccttaaaagggagagttagtgtttggttt-aacataatatatattgttgattaagga 103968  T
Q  464 aaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||| | | |||| |||||||||   ||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||   |||||||||||    
T  103969 aaaagatgcaaattaaataggggtatggtggtaaagaaatatttaatgtaattgaaaatatcaaaggtttcttataaaaa 104048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 92647 - 92510
Alignment:
Q  391 tgtttttacaattttatcctttaaaagag----agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagggg 486  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    |||| || |||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||| |   | |||||| | |      
T  92647 tgtttttataattttatcctttaaaagagacaaagttcgtctatgtttttaacatgctatttattgttgattgaa-aaaaata---aaaataaaaatgaa 92552  T
Q  487 tatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaa 528  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  92551 tatgcaggtaaagaaataattaatgtatttaaaaatagcaaa 92510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 110; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 343 - 513
Target Start/End: Original strand, 9538 - 9710
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||    
T  9538 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaaca 9637  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgta 513  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9638 tattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgta 9710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 107; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 332 - 523
Target Start/End: Original strand, 19732 - 19925
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggttta 429  Q
    |||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||    
T  19732 aaaaaataacgggaattaagatagaggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggctta 19831  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaata 523  Q
    ||||||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19832 tgttttcaacattcaatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 19925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0368 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0368
Description:

Target: scaffold0368; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 343 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 8470 - 8261
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaaca 440  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||| |||||||||||||| |    
T  8470 ggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtntttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaata 8371  T
Q  441 tgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataa 540  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  ||||||| |    
T  8370 tgttatttattgttgattgaagaaaaatat-tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaatggggtcttat-a 8273  T
Q  541 aaaagggacaaa 552  Q
    ||||||||||||    
T  8272 aaaagggacaaa 8261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 100; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 303 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 24501 - 24303
Alignment:
Q  303 acctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaat 402  Q
    ||||||| || |||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24501 acctccgtccctaattataggatcttttagaaaaataatgggaattaagttaatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 24402  T
Q  403 tttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaa 502  Q
    ||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||||||| || || ||| ||||||| |||    
T  24401 tttatcctttaa-----ggttggtttatgttttcaacatgttatatattggcgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaataaa 24307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 100; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 12316 - 12106
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  12316 ggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 12217  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||| |    
T  12216 gctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttata-a 12118  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  12117 aaagggacaaaa 12106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 100; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 343 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 118098 - 117888
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacat 441  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| | ||    
T  118098 ggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttagtttatgttttccatat 117999  T
Q  442 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaa 541  Q
    | || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||  |||||||| |    
T  117998 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttata-a 117900  T
Q  542 aaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||    
T  117899 aaagggacaaaa 117888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 299 - 479
Target Start/End: Original strand, 40606 - 40789
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt--aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttt 396  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  40606 tactacctccgtccctaattataggg-catttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttttattaaatatgtttgtaattactcttatttt 40704  T
Q  397 tacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  40705 tacaattttattctttaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataa 40789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 98; Significance: 9e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 296 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 5059 - 4804
Alignment:
Q  296 tagtactacctccgcccttaattatagggtcattttaaaaaa-taataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtt 394  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||| || |||||||||| |||   || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  5059 tagtactacc-ccgtccctaattataggatccttttaaaaaaataacgagagttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgct 4961  T
Q  395 tttacaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgca 492  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||  |||||||| || |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |    
T  4960 tttacaa-tttatcctttaagagagagggttggtttttg-tttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataat-aataggggcatgta 4864  T
Q  493 tgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||   |||||| ||||||||||||||    
T  4863 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttat-aaaaagggacaaaa 4804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 482 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 4792 - 4722
Alignment:
Q  482 aggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  4792 aggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata-aaaagggacaaaa 4722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 359 - 553
Target Start/End: Original strand, 65439 - 65633
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || |||||||||||| | ||| || |||||  ||||    
T  65439 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagaattagtttatgttttccatatgctacttattgctgat 65538  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    | ||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  65539 taaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttat-aaaaagggacaaaa 65633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 88; Significance: 8e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 388 - 522
Target Start/End: Original strand, 8410 - 8545
Alignment:
Q  388 tattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacagggg 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  8410 tattgtttttacaattttatccttttaagagagagttggtttatgttatcaacatgttacttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaataaggg 8509  T
Q  487 tatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaat 522  Q
     |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8510 catgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaat 8545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 299 - 443
Target Start/End: Original strand, 13303 - 13450
Alignment:
Q  299 tactacctccgcccttaattatagggtcatttt-aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 397  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||   ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13303 tactacctccgtccctaattatagagccattttgaaaaaataacgtgaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 13402  T
Q  398 acaattttatcctttaaaagaga--gttggtttatgttttcaacatgt 443  Q
    ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13403 acaattttatcatttaagagagaaggttggtttatgttttcaacatgt 13450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 388
Target Start/End: Original strand, 8080 - 8136
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattact 388  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8080 aaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattact 8136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 416 - 553
Target Start/End: Original strand, 1306 - 1442
Alignment:
Q  416 agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtact 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  1306 agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaatcggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagt 1405  T
Q  516 tagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    | |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  1406 tggaaatagcaaaggagtctcat-aaaaagggacaaaa 1442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 332 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 18618 - 18481
Alignment:
Q  332 aaaaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaga--gagttggttta 429  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||| |||||    
T  18618 aaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagagagggggtttgttta 18519  T
Q  430 tgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaa 467  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  18518 tgttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaa 18481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 72; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 360 - 542
Target Start/End: Original strand, 32965 - 33148
Alignment:
Q  360 tatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgatt 458  Q
    ||||| |||||||  | |||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  32965 tatttctattaaagttctttgtaatcagtattgtttttacaattttatcctcaaaagagatagttagtttatgttttcaacaatatatttattgttgatt 33064  T
Q  459 gaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaa 542  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||   |||||||||||    
T  33065 gaagaaaaatatgtaaaataaataggggtatggcagtaaagaaataattaatgcagttagaaataccaaaatggtcttataaaa 33148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 366 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 22119 - 22031
Alignment:
Q  366 tattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattga 456  Q
    |||||||  |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||| |||||  |||||||| ||||    
T  22119 tattaaatttgtttgtaattattattatgtttacaattttatcctttaaa--agagttagtttattttttaaacatagtatttattgttga 22031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 17678 - 17507
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||    
T  17678 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataa 17579  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| ||||||||||||    
T  17578 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttata-aaaagggacaaa 17507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 65; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 246669 - 246499
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaa-agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||| | | | |||||    
T  246669 taattactattgtttttacaattttatccttaaaagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-aagcaaaataa 246571  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  246570 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttat-aaaaagggacaaa 246499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 62; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 343 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 34355 - 34155
Alignment:
Q  343 ggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta---aaagagagttggtttatgttttcaac 439  Q
    |||||||||| | || |||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||||    ||||||||  |     
T  34355 ggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatccttaagggaaagagagtt----tatgtttttcat 34260  T
Q  440 atgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttata 539  Q
    ||   |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||  | |||||||    
T  34259 atcccatttattaatgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagaatcttata 34160  T
Q  540 aaaaa 544  Q
    |||||    
T  34159 aaaaa 34155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 62; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 381 - 552
Target Start/End: Original strand, 36188 - 36357
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataa 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |   ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||  || | |||||    
T  36188 taattactattgtttttacaattttatccttaagaaagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaacaaaaa--tgcaaaataa 36285  T
Q  480 acaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaa 552  Q
    | | |||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  36286 ataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaacaccaaagaagtcttat-aaaaagggacaaa 36357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 59; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 381 - 543
Target Start/End: Original strand, 11485 - 11645
Alignment:
Q  381 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaa 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||  ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||| ||| | ||||||    
T  11485 taattactattgtttttacaattttatactt-aagagaggattaatttatgttttcaacataatatttattgtt-attgaagaaaaaaatgcaaaataaa 11582  T
Q  481 caggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
     | |||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||    
T  11583 taagggtatgttagtaaataaataattaatgtacttaaaaataccaaaggggtcttataaaaa 11645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 51; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 425 - 543
Target Start/End: Original strand, 9534 - 9652
Alignment:
Q  425 gtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataa 524  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||  ||||  ||||||||  ||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||     
T  9534 gtttatgttttccatatgctatttattgctgatataagaaaaatgtgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 9633  T
Q  525 caaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9634 caaagaagtcttataaaaa 9652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 411
Target Start/End: Original strand, 9059 - 9136
Alignment:
Q  334 aaaataataggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 411  Q
    ||||| || |||||||| | | || |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9059 aaaatcatgggaattaaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatcctt 9136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 49; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 359 - 543
Target Start/End: Original strand, 156202 - 156389
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgat 457  Q
    ||||||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||| || |||||| ||||  | ||| ||||||||| ||||    
T  156202 atatttgtactaaagttttttgtaatcactattgtttttacaattttatcctgaagagagagaattagtttatatttttcatatgctatttattactgat 156301  T
Q  458 tgaagaaaaagatgtataataaacaggggtatgcatgtaaagaa--ataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||  ||  ||||||||||  |||||||||||  ||  ||||||||||   ||||||||||||    
T  156302 tgaagaaaaatatgtataatgaatagggtcatctatgtaaagaaatataattaatgtggttgaaaataacaaacgggtcttataaaaa 156389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 366 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 733 - 619
Alignment:
Q  366 tattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaa 465  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||| || ||  |||||||| ||||| |||||||    
T  733 tattaaatttgtttgtagttactattgattttacaattttatcctatatgagagagttagtttttgtttttaatatagtatttattgttgatcgaagaaa 634  T
Q  466 aagatgtataataaa 480  Q
    |  ||||| ||||||    
T  633 acaatgtaaaataaa 619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 366 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 7197 - 7083
Alignment:
Q  366 tattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaa 465  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||| || ||  |||||||| ||||| |||||||    
T  7197 tattaaatttgtttgtagttactattgattttacaattttatcctatatgagagagttagtttttgtttttaatatagtatttattgttgatcgaagaaa 7098  T
Q  466 aagatgtataataaa 480  Q
    |  ||||| ||||||    
T  7097 acaatgtaaaataaa 7083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 377 - 470
Target Start/End: Original strand, 1953 - 2050
Alignment:
Q  377 tttgtaattactattgtttttacaattttatccttta----aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagat 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    | |||||||| || ||| |||| |||||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  1953 tttgtaattactattgtttttacaattttattctttaagagagagagagttagtgtatatttttaacatagtatttaatgttgattgaagaaaaagat 2050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 377 - 543
Target Start/End: Original strand, 5494 - 5661
Alignment:
Q  377 tttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtat 474  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||  | |||||||| || ||| |||| |||||  |||||| | ||||| ||||||||||||  |     
T  5494 tttgtaattactattgcttttacaatttcattctttaagagagagagttagtgtatatttttaacatagtatttaatgttgatcgaagaaaaagat-aaa 5592  T
Q  475 aataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    |||||| |||||||||   |||||||| |||||||  ||||| |||||  ||||  | |||||||||||    
T  5593 aataaataggggtatgttggtaaagaattaattaaattacttggaaatcccaaatgaatcttataaaaa 5661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 421
Target Start/End: Original strand, 13112 - 13187
Alignment:
Q  345 aattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag 421  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13112 aattaagaaagtaaatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttat-ctttaagagagag 13187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2116 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold2116
Description:

Target: scaffold2116; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 497 - 553
Target Start/End: Original strand, 1 - 56
Alignment:
Q  497 aagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaaagggacaaaa 553  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  1 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat-aaaaagggacaaaa 56  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 47376 - 47206
Alignment:
Q  375 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagag--agttggtttatgttttcaacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgt 472  Q
    ||||||||||  |||||||||||||  |||||| |||||| ||||  |||| || ||||||||||| ||  |||||| |  || ||||||||||| ||      
T  47376 tgtttgtaatcgctattgtttttacccttttattctttaagagagtgagttagtgtatgttttcaatatagtatttaatgctggttgaagaaaaaaataa 47277  T
Q  473 ataataaacaggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtacttagaaataacaaagaagtcttataaaaa 543  Q
    | |||||| ||| |||||   |||||||| |||| |||||||||  ||||| | |||| |||||| |||||    
T  47276 aaaataaataggagtatgttggtaaagaattaataaatgtacttgaaaatacctaagatgtcttacaaaaa 47206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 341 - 395
Target Start/End: Original strand, 17500 - 17554
Alignment:
Q  341 taggaattaagataatgaatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttt 395  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  17500 taggaattaagaaaatggatatttgcattaaagttgtttgtaatcactattgttt 17554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0263 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0263
Description:

Target: scaffold0263; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 13787 - 13679
Alignment:
Q  359 atatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaa--gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattattga 456  Q
    ||||| ||||||||  | |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |  || ||||  || |||||||||||||  |||||||| || |    
T  13787 atattagtattaaatttatttgtaattcatattctttttacaattttatcctttaagaccgaaagttaattaatgttttcaacataatatttatttttta 13688  T
Q  457 ttgaagaaa 465  Q
    | |||||||    
T  13687 tcgaagaaa 13679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University