View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17262_low_2 (Length: 607)

Name: NF17262_low_2
Description: NF17262
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17262_low_2
NF17262_low_2
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (10-570)||(11991-12558)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (10-570)||(16150639-16151207)
chr7 (11-570)||(16530556-16531124)
chr7 (11-570)||(16634538-16635106)
chr7 (11-570)||(20106814-20107356)
chr7 (11-557)||(16760940-16761479)
chr7 (297-570)||(15064566-15064839)
chr7 (297-570)||(824432-824705)
chr7 (371-570)||(15917905-15918104)
chr7 (153-570)||(13672510-13672934)
chr7 (11-264)||(15064302-15064555)
chr7 (11-264)||(824168-824421)
chr7 (11-264)||(15921412-15921664)
chr7 (153-570)||(18594403-18594830)
chr7 (153-570)||(18616854-18617281)
chr7 (361-570)||(16466752-16466960)
chr7 (366-570)||(8716738-8716941)
chr7 (366-570)||(13656807-13657010)
chr7 (366-570)||(18286499-18286702)
chr7 (366-567)||(14549970-14550170)
chr7 (44-264)||(48803270-48803490)
chr7 (363-570)||(48802995-48803202)
chr7 (73-264)||(13656545-13656736)
chr7 (183-264)||(8716586-8716667)
chr7 (183-264)||(18286347-18286428)
chr7 (183-245)||(14549818-14549880)
chr7 (190-264)||(16467026-16467100)
chr7 (409-538)||(4311654-4311783)
chr7 (409-472)||(14222936-14222999)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (10-570)||(121890-122450)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (10-570)||(18071421-18071989)
chr5 (10-570)||(20596976-20597544)
chr5 (10-570)||(20603273-20603841)
chr5 (10-570)||(20609592-20610160)
chr5 (10-570)||(20791919-20792487)
chr5 (10-570)||(26846177-26846738)
chr5 (11-570)||(25117280-25117849)
chr5 (11-570)||(25176371-25176940)
chr5 (13-557)||(20439313-20439865)
chr5 (289-570)||(30760776-30761059)
chr5 (10-560)||(22946968-22947499)
chr5 (153-570)||(24954311-24954738)
chr5 (366-570)||(22318621-22318824)
chr5 (20-239)||(23520623-23520842)
chr5 (366-570)||(15734408-15734611)
chr5 (366-570)||(20621037-20621240)
chr5 (366-570)||(23746925-23747128)
chr5 (366-570)||(25007920-25008123)
chr5 (44-439)||(21386881-21387254)
chr5 (477-570)||(21387268-21387361)
chr5 (183-264)||(15734256-15734337)
chr5 (183-264)||(25008194-25008275)
chr5 (11-111)||(30764707-30764807)
chr5 (189-264)||(22318895-22318970)
chr5 (183-264)||(23746773-23746854)
chr5 (183-264)||(20620885-20620966)
chr5 (157-233)||(30764587-30764663)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (10-570)||(22129-22697)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (10-570)||(22165440-22166008)
chr3 (10-570)||(16654226-16654795)
chr3 (10-570)||(10603669-10604237)
chr3 (10-570)||(4369211-4369752)
chr3 (11-556)||(12161214-12161767)
chr3 (29-570)||(17386313-17386833)
chr3 (10-293)||(12423770-12424052)
chr3 (11-570)||(13505649-13506218)
chr3 (29-526)||(3278026-3278504)
chr3 (10-264)||(14446985-14447239)
chr3 (10-263)||(20157877-20158130)
chr3 (289-570)||(15945412-15945695)
chr3 (26-570)||(13693432-13693957)
chr3 (295-566)||(20157593-20157864)
chr3 (295-570)||(3340353-3340630)
chr3 (10-183)||(18979465-18979638)
chr3 (153-570)||(15643732-15644159)
chr3 (153-570)||(10161322-10161749)
chr3 (366-570)||(13196566-13196769)
chr3 (366-570)||(7599230-7599433)
chr3 (373-570)||(10145892-10146088)
chr3 (366-570)||(13689541-13689744)
chr3 (366-570)||(12188212-12188415)
chr3 (366-570)||(13188554-13188757)
chr3 (373-570)||(13137306-13137502)
chr3 (366-570)||(15630093-15630296)
chr3 (366-570)||(12194626-12194829)
chr3 (366-570)||(16374616-16374819)
chr3 (296-516)||(14446755-14446972)
chr3 (11-255)||(3340651-3340895)
chr3 (26-255)||(15945114-15945343)
chr3 (77-264)||(13196840-13197027)
chr3 (174-264)||(7599069-7599159)
chr3 (174-264)||(13188828-13188918)
chr3 (183-264)||(13137580-13137661)
chr3 (183-264)||(15630367-15630448)
chr3 (174-245)||(10145724-10145795)
chr3 (174-264)||(12188486-12188576)
chr3 (174-264)||(12194900-12194990)
chr3 (183-265)||(16374889-16374971)
chr3 (314-368)||(12423714-12423768)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (10-570)||(21393-21961)
[»] chr4 (11 HSPs)
chr4 (10-570)||(3353129-3353695)
chr4 (10-264)||(15864042-15864296)
chr4 (295-541)||(15261251-15261497)
chr4 (153-570)||(13821562-13821989)
chr4 (296-570)||(15864309-15864583)
chr4 (366-570)||(22109834-22110037)
chr4 (366-570)||(15253219-15253423)
chr4 (153-255)||(15261518-15261620)
chr4 (11-126)||(16680906-16681021)
chr4 (183-264)||(22109682-22109763)
chr4 (174-264)||(15253058-15253148)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (10-570)||(3988619-3989166)
chr1 (11-570)||(8651563-8652104)
chr1 (153-557)||(20392145-20392557)
chr1 (10-567)||(19876814-19877351)
chr1 (20-570)||(20072068-20072599)
chr1 (153-570)||(21799808-21800235)
chr1 (11-409)||(19783544-19783935)
chr1 (371-570)||(20236360-20236558)
chr1 (11-264)||(8948864-8949120)
chr1 (399-570)||(8948686-8948859)
chr1 (174-264)||(20236194-20236284)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (10-570)||(19766004-19766575)
chr8 (89-570)||(29333200-29333688)
chr8 (20-570)||(21099949-21100504)
chr8 (10-293)||(22289577-22289860)
chr8 (297-567)||(11348086-11348357)
chr8 (10-413)||(22830439-22830823)
chr8 (295-570)||(21826188-21826465)
chr8 (11-264)||(21942877-21943130)
chr8 (11-264)||(22368498-22368751)
chr8 (11-264)||(11348368-11348621)
chr8 (366-570)||(22100762-22100965)
chr8 (296-570)||(21942590-21942864)
chr8 (366-570)||(16419737-16419940)
chr8 (366-570)||(22098097-22098300)
chr8 (366-570)||(8313342-8313545)
chr8 (366-570)||(21380967-21381170)
chr8 (366-570)||(21954953-21955156)
chr8 (366-570)||(22034667-22034870)
chr8 (366-570)||(8323988-8324191)
chr8 (297-570)||(22368762-22369035)
chr8 (360-570)||(22289893-22290101)
chr8 (11-255)||(21825923-21826167)
chr8 (26-264)||(22034941-22035179)
chr8 (408-557)||(22831958-22832107)
chr8 (11-177)||(21267876-21268042)
chr8 (174-264)||(22101036-22101126)
chr8 (174-264)||(21954792-21954882)
chr8 (183-264)||(8313190-8313271)
chr8 (183-264)||(8324262-8324343)
chr8 (183-245)||(17132521-17132583)
chr8 (183-264)||(21380815-21380896)
chr8 (189-264)||(22097951-22098026)
chr8 (189-245)||(16420030-16420086)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (14-570)||(681-1218)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (10-569)||(24821239-24821783)
chr2 (297-570)||(17867185-17867459)
chr2 (11-557)||(25372134-25372640)
chr2 (51-570)||(23160509-23161038)
chr2 (51-570)||(23571766-23572295)
chr2 (295-570)||(116308-116584)
chr2 (11-570)||(27630018-27630587)
chr2 (153-570)||(24796429-24796856)
chr2 (153-570)||(16774310-16774737)
chr2 (366-570)||(22045797-22046000)
chr2 (366-570)||(25356386-25356589)
chr2 (366-570)||(27626468-27626671)
chr2 (388-541)||(27769966-27770119)
chr2 (366-570)||(12751-12954)
chr2 (360-570)||(26192758-26192968)
chr2 (325-570)||(25368757-25369002)
chr2 (366-570)||(25145927-25146131)
chr2 (46-261)||(25368999-25369214)
chr2 (11-264)||(24169890-24170143)
chr2 (366-567)||(24170208-24170409)
chr2 (166-264)||(17867470-17867568)
chr2 (153-255)||(116185-116287)
chr2 (183-264)||(13025-13106)
chr2 (183-264)||(22046071-22046152)
chr2 (183-264)||(25356234-25356315)
chr2 (183-264)||(27626316-27626397)
chr2 (11-126)||(116043-116158)
chr2 (11-66)||(22870277-22870332)
chr2 (405-555)||(25339253-25339403)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (10-569)||(19405-19945)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (11-561)||(21561595-21562153)
chr6 (289-561)||(11218406-11218678)
chr6 (11-264)||(18446746-18446999)
chr6 (153-570)||(22166689-22167116)
chr6 (153-570)||(20017374-20017801)
chr6 (11-541)||(20168744-20169282)
chr6 (189-557)||(22768279-22768655)
chr6 (366-570)||(18010720-18010924)
chr6 (366-570)||(24856381-24856584)
chr6 (296-570)||(18447012-18447285)
chr6 (361-570)||(25966513-25966721)
chr6 (399-570)||(30672884-30673053)
chr6 (73-245)||(18010460-18010632)
chr6 (174-264)||(8725412-8725502)
chr6 (183-264)||(24856655-24856736)
chr6 (375-555)||(23518889-23519069)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (11-570)||(3191-3744)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (11-570)||(19109-19651)
scaffold0004 (12-239)||(253244-253485)
scaffold0004 (402-570)||(253021-253189)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (10-338)||(23868-24203)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (11-561)||(25532-26080)
[»] scaffold0402 (1 HSPs)
scaffold0402 (10-570)||(6423-6964)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (11-541)||(24081-24619)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (295-560)||(90087-90352)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (11-570)||(29020-29574)
[»] scaffold0059 (2 HSPs)
scaffold0059 (11-264)||(10685-10938)
scaffold0059 (11-264)||(18686-18939)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (11-264)||(234460-234713)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (20-567)||(8123-8676)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (11-570)||(7630-8169)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (11-264)||(43972-44225)
scaffold0037 (11-264)||(51361-51614)
scaffold0037 (296-570)||(44238-44510)
scaffold0037 (296-570)||(51627-51899)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (11-264)||(132168-132421)
scaffold0026 (296-500)||(132431-132635)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (371-566)||(3-197)
[»] scaffold0020 (4 HSPs)
scaffold0020 (366-568)||(115521-115721)
scaffold0020 (366-568)||(119825-120025)
scaffold0020 (11-264)||(115193-115450)
scaffold0020 (11-264)||(119497-119754)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (11-263)||(32965-33217)
scaffold0117 (362-570)||(32714-32921)
[»] scaffold1095 (2 HSPs)
scaffold1095 (74-264)||(1879-2067)
scaffold1095 (295-568)||(2079-2352)
[»] scaffold0375 (2 HSPs)
scaffold0375 (363-570)||(11400-11607)
scaffold0375 (39-264)||(11107-11332)
[»] scaffold1879 (2 HSPs)
scaffold1879 (366-570)||(58-262)
scaffold1879 (73-264)||(327-518)
[»] scaffold0473 (2 HSPs)
scaffold0473 (366-570)||(12912-13115)
scaffold0473 (174-264)||(12751-12841)
[»] scaffold0346 (2 HSPs)
scaffold0346 (11-239)||(5039-5267)
scaffold0346 (371-570)||(4727-4926)
[»] scaffold0216 (2 HSPs)
scaffold0216 (363-570)||(10288-10494)
scaffold0216 (44-264)||(10000-10220)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (10-157)||(1701-1848)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (366-570)||(38876-39080)
scaffold0116 (11-264)||(39145-39398)
[»] scaffold1571 (2 HSPs)
scaffold1571 (366-503)||(1496-1633)
scaffold1571 (183-265)||(1344-1426)
[»] scaffold1620 (2 HSPs)
scaffold1620 (366-570)||(131-335)
scaffold1620 (11-239)||(425-653)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (456-570)||(7759-7872)
[»] scaffold0577 (3 HSPs)
scaffold0577 (464-570)||(5587-5692)
scaffold0577 (366-469)||(4980-5083)
scaffold0577 (174-264)||(4819-4909)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (136-256)||(54916-55036)
[»] scaffold0231 (2 HSPs)
scaffold0231 (175-261)||(21620-21706)
scaffold0231 (366-463)||(21792-21889)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (11-87)||(20234-20310)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (493-570)||(28-107)
[»] scaffold1400 (1 HSPs)
scaffold1400 (11-111)||(49-149)
[»] scaffold0566 (1 HSPs)
scaffold0566 (409-472)||(1537-1600)


Alignment Details
Target: scaffold0230 (Bit Score: 448; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 570
Target Start/End: Original strand, 11991 - 12558
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11991 gggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagaccctt 12090  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12091 atctttatgaacttcattaagccccatccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaaca 12190  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaaga--------tgcaccaagaaga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||        |||||||||||||    
T  12191 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccccaggtacatgaagaacacgataatgaaggcgaggaagatgcacatttgcaccaagaaga 12290  T
Q  302 ggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgag 401  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12291 ggaaggtgcacaattgtaccatgatgaggagcaccatgaccatgattccggataaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgag 12390  T
Q  402 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12391 aggataagcaccaagcaactaaggcaatgtgttgaattgtcgggactaaggaattatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 12490  T
Q  502 ttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12491 ttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg-aaaatgtgagctt 12558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 448; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 16151207 - 16150639
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16151207 gggtggtatcatcgcatacatagctaggcaattgagagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagaccctt 16151108  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16151107 atctttatgaacttcattaagccccatccacccatgtcctacgcactcaaactccatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaaca 16151008  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcac--------caagaaga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||        ||||||||    
T  16151007 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccccaggtacatgaagaacacgataatgaaggcgaggaagatgcacatttgcaccaagaaga 16150908  T
Q  302 ggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgag 401  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16150907 ggaaggtgcacaattgtaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggataaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgag 16150808  T
Q  402 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16150807 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaattatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 16150708  T
Q  502 ttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16150707 ttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 16150639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 570
Target Start/End: Original strand, 16530556 - 16531124
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| || || ||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  16530556 ggtggtatcataacatacatagttaggcaactaggagtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacaccctta 16530655  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| |||||| ||||| || |  || |  ||| |    ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  16530656 tctctatgaatttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgatattactgcctaacccatctcagactaacac 16530755  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgca--------ccaagaagag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| |||| | ||| | ||||  | ||||| ||||        ||||||||||    
T  16530756 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgcatgtagaacagaat-aggaagacgtggaaggtgcacaattgcaccaagaagag 16530854  T
Q  303 gaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgaga 402  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16530855 gaaggtgcacaattacaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgaga 16530954  T
Q  403 ggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgct 502  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16530955 ggataagcaccgagcaagaaaggcaaggtattgaattgatgggactaaggaatgatgtcctacggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgct 16531054  T
Q  503 tcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  16531055 tccgaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatgacaaaaatgtgagctt 16531124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 16635106 - 16634538
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| || || ||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  16635106 ggtggtatcataacatacatagttaggcaactaggagtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacaccctta 16635007  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| |||||| ||||| || |  || |  ||| |    ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  16635006 tctctatgaatttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgatattactgcctaacccatctcagactaacac 16634907  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcac--------caagaagag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| |||| | ||| | ||||  | ||||| |||||        |||||||||    
T  16634906 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgcatgtagaacagaat-aggaagacgtggaaggtgcacaattgcaccaagaagag 16634808  T
Q  303 gaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgaga 402  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16634807 gaaggtgcacaattacaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgaga 16634708  T
Q  403 ggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgct 502  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16634707 ggataagcaccgagcaagaaaggcaaggtattgaattgatgggactaaggaatgatgtcctacggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgct 16634608  T
Q  503 tcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  16634607 tccgaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatgacaaaaatgtgagctt 16634538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 570
Target Start/End: Original strand, 20106814 - 20107356
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |    
T  20106814 ggtggtatcatcacatacatagctaggaaattgggagtgggtgaagaccaggggataaacaagattgaggaaaacaataggcttaacatagagactctca 20106913  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20106914 tctctatgaacttcattaaacctcgtccccccatgacctatacacttaaactcaatgtgcccgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacac 20107013  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcaccaagaagaggaaggtgc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||||||  ||| || || |                   |||||||||||||     
T  20107014 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatgtttcgcaggtgcatgaagagcacattgctgga-------------------gaagaggaaggtgt 20107094  T
Q  311 acgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagc 410  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||    
T  20107095 acacttgcaccatgctgaggagcaccatgaccatgataccggaggaaacaatgataatgaaagatgggcatggatgcacatagaggttgagaggataagc 20107194  T
Q  411 accaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcaca 510  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||| || || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20107195 accgtgcaacaaaggcaaggtgttgagttatccggactacgaaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaaca 20107294  T
Q  511 tgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaa--aaatgtgagctt 570  Q
    ||||||| || ||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  20107295 tgatgcaacacttcaacctccaaggtcctccttatggacctcaatgaatcaaatgtgagctt 20107356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 16761479 - 16760940
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||| ||| | ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16761479 ggtggtatcataacatacatagctaggcaactaggagtgagtgaagaccaagagataaacaagattaagggaaacaataggctaaacataaacaccctta 16761380  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| |||||| ||||| || |  || |  ||| |    ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  16761379 tctctatgaatttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgattttactgcctaacccatctcggactaacac 16761280  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcac--------caagaagag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| |||| | ||| ||||||  | ||||| |||||        ||||| |||    
T  16761279 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgcatgtagaacagaataatgaagacgtggaaggtgcacacttgcaccaagaggag 16761180  T
Q  303 gaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgaga 402  Q
    |||||||||| ||||||||||||               | |||||   || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16761179 gaaggtgcacaattgcaccatga---------------ccatgatgaaggtgaaacaaacgtaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgaga 16761095  T
Q  403 ggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgct 502  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16761094 ggataagcacctagcaactaaggcaaggtgttgaattgttgtgactaaggaattatgtcctatggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatact 16760995  T
Q  503 tcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatga 557  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16760994 tcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatga 16760940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 297 - 570
Target Start/End: Original strand, 15064566 - 15064839
Alignment:
Q  297 gaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgagg 396  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||||| || |||| || |||| ||  ||||| |||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  15064566 gaagaggaaggtgcacacttgcaccaagaagaggatcaccatgaccatgaaaccggaggaaacaatgataataaaagatggacatggatgcaaaccgagg 15064665  T
Q  397 ccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataacca 496  Q
      || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15064666 ttgaaaggataagcaccgagcaactacggcaaggtgttgaattatcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataacca 15064765  T
Q  497 aatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15064766 aatgctttggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 15064839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 297 - 570
Target Start/End: Original strand, 824432 - 824705
Alignment:
Q  297 gaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactgga-gaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgag 395  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| || ||||| |||||| || |||| || ||| ||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||| || |||    
T  824432 gaagaggaaggtgcacacctgcaccaagaagaggatcaccatgaccatgaaaccggacgaaac-aatgataatgaaagatggacatggatgcaaactgag 824530  T
Q  396 gccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataacc 495  Q
    |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  824531 gttgaaaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattatcgggactaaggaatgatgtcctaaggggaaaccgcatatccgaagaaaataacc 824630  T
Q  496 aaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  824631 aaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 824705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 371 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 15918104 - 15917905
Alignment:
Q  371 aagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggc 470  Q
    ||||||| ||| |||||| || ||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15918104 aagatggacatcgatgcaaactgaggttgaaaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattatcgggactaaggaatgatgtcctaaggggc 15918005  T
Q  471 aaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15918004 aaccgcatattcgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccacggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 15917905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 153 - 570
Target Start/End: Original strand, 13672510 - 13672934
Alignment:
Q  153 cactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccaca 252  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13672510 cactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgatgatgacccaca 13672609  T
Q  253 ggt--acat-gaagaaaacaatgatgaaggtgaggaaga-----tgcaccaagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaat 344  Q
    |||  |||| ||| |  | ||||| |||   ||||  |      |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||  |    
T  13672610 ggtgcacatagaacagcataatgaagaaacagagggtgcacacttgcatcaagaagaggaaggtgctcaactgcaccatgatgaggaacaccatgaccct 13672709  T
Q  345 gatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgg 444  Q
     ||   || |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |    
T  13672710 aatgaaggtgaaacaaatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatctg 13672809  T
Q  445 gactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctcccta 544  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||| || || ||| ||||    
T  13672810 ggctaagaaatgatgtcctacggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttgcaccttcagggccctaccta 13672909  T
Q  545 tagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    | || |||||| ||||||||||||||    
T  13672910 tggacctcaat-aaaaatgtgagctt 13672934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Original strand, 15064302 - 15064555
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15064302 ggtggtatcatcatatacatagttaggcaattgggagtgggtgaagaccaagggattaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagaggccctta 15064401  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| | |||||||||| || |  || ||||||||| ||||  |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15064402 tctctttgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacacttaaacccaacgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacac 15064501  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | | ||||||||||||||    
T  15064502 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatagttcgcaggtacatgaaga 15064555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Original strand, 824168 - 824421
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  824168 ggtggtatcatcacatacatagttaggcaattgggagtgggtgaagaccaagggattaacaagattgaggaaaacaataggcttaacatagaggccctta 824267  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    |||||||||||||||| || |  || ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  824268 tctttatgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacacttaaactcaatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacac 824367  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  | | ||||||||||||||    
T  824368 cgaggtggaagaaaatttgttttatattggtgatagttcgcaggtacatgaaga 824421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15921664 - 15921412
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15921664 ggtggtatcatcacatacatagttaggcaattgggagtgggtgaagaccaagggataac-aagattgagggaaacaataggcttaacatagagaccctta 15921566  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| | |||||||||| || |  || ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15921565 tctctttgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacacttaaactcaatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacac 15921466  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | | ||||||||||||||    
T  15921465 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatagttcgcaggtacatgaaga 15921412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 153 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 18594830 - 18594403
Alignment:
Q  153 cactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccaca 252  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18594830 cactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgatgatgacccaca 18594731  T
Q  253 ggtaca---tgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaaga-----tgcaccaagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaat 344  Q
    ||| ||   |||| |  | ||||| |||   | ||  |      |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||  |    
T  18594730 ggtgcacattgaacagcataatgaagaaacagcgggtgcacacttgcatcaagaagaggaaggtgcacaactgcaccatgatgaggaccaccatgaccct 18594631  T
Q  345 gatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgg 444  Q
     ||   || |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||||||||  |||||| |||||||||||||||| |   |     
T  18594630 aatgaaggtgaaacaaatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcactgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatga 18594531  T
Q  445 gactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctcccta 544  Q
    |  ||||  | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  18594530 gcataagacacgatgtccaaaggagcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccata 18594431  T
Q  545 tagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    | || |||||||  ||||||||||||||    
T  18594430 tggacctcaatgataaaaatgtgagctt 18594403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 153 - 570
Target Start/End: Original strand, 18616854 - 18617281
Alignment:
Q  153 cactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccaca 252  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18616854 cactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgatgatgacccaca 18616953  T
Q  253 ggtaca---tgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaaga-----tgcaccaagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaat 344  Q
    ||| ||   |||| |  | ||||| |||   | ||  |      |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||  |    
T  18616954 ggtgcacattgaacagcataatgaagaaacagcgggtgcacacttgcatcaagaagaggaaggtgcacaactgcaccatgatgaggaccaccatgaccct 18617053  T
Q  345 gatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgg 444  Q
     ||   || |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||||||||  |||||| |||||||||||||||| |   |     
T  18617054 aatgaaggtgaaacaaatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcactgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatga 18617153  T
Q  445 gactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctcccta 544  Q
    |  ||||  | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  18617154 gcataagacacgatgtccaaaggagcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccata 18617253  T
Q  545 tagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    | || |||||||  ||||||||||||||    
T  18617254 tggacctcaatgataaaaatgtgagctt 18617281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 361 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 16466960 - 16466752
Alignment:
Q  361 atgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgt 460  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  16466960 atgacaatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacagaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgt 16466861  T
Q  461 cctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaa 560  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||| || |||||| ||||    
T  16466860 cctacggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaacacttcaacctccatggccctccctatggacctcaat-aaaa 16466762  T
Q  561 atgtgagctt 570  Q
    ||||||||||    
T  16466761 atgtgagctt 16466752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Original strand, 8716738 - 8716941
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  8716738 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctac 8716837  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  8716838 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 8716936  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  8716937 agctt 8716941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Original strand, 13656807 - 13657010
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||   | |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  13656807 aatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaaggaatgatgtcctaa 13656906  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | || || ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  13656907 gaggcaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgcttcggaacatgatggaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 13657005  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  13657006 agctt 13657010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Original strand, 18286499 - 18286702
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  18286499 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctac 18286598  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  18286599 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgctttggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 18286697  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  18286698 agctt 18286702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 366 - 567
Target Start/End: Original strand, 14549970 - 14550170
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||| ||||||||     
T  14549970 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaataatgtcctac 14550069  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  14550070 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 14550168  T
Q  566 ag 567  Q
    ||    
T  14550169 ag 14550170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 44 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 48803490 - 48803270
Alignment:
Q  44 ggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagacccttatctttatgaacttcattaagcaccgtccaccca 143  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |    ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  48803490 ggagtgggtgaggacgaggggataaatccaattgagggcaacaataggcttaacattgaaaccctcatttctatgaatttcattaagcatcgtccaccca 48803391  T
Q  144 tgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttga 243  Q
    || | || ||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  48803390 tgacttatgcacttaaactcaatgtgcctcttttgtttctacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttggtga 48803291  T
Q  244 tgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    || | ||||||||||||||||    
T  48803290 tggttcacaggtacatgaaga 48803270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 363 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 48803202 - 48802995
Alignment:
Q  363 gaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcc 462  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |    
T  48803202 gaaaatggaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgttc 48803103  T
Q  463 taaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaat 562  Q
    || |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  48803102 tacggggcaaccgcatcaccgaagagaataatcaaatgcttcggaacatgatgcaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaacaat 48803003  T
Q  563 gtgagctt 570  Q
    ||||||||    
T  48803002 gtgagctt 48802995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Original strand, 13656545 - 13656736
Alignment:
Q  73 aattgagggaaacaataggcttaacataaagacccttatctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcct 172  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||| | | |||||| ||||||||||  | |||||||||| | || |||||  ||||   | | |||    
T  13656545 aattgagggcaacaataggcttaatattgaaacccttgtatctatgaatttcattaagcttcatccacccatgacttatgcacttcaacttcgtatacct 13656644  T
Q  173 attttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
     ||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  13656645 cttttgtttctgcttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaggcgaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 13656736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Original strand, 8716586 - 8716667
Alignment:
Q  183 tactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  8716586 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 8716667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Original strand, 18286347 - 18286428
Alignment:
Q  183 tactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  18286347 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 18286428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 245
Target Start/End: Original strand, 14549818 - 14549880
Alignment:
Q  183 tactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatg 245  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  14549818 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatg 14549880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16467100 - 16467026
Alignment:
Q  190 taacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  16467100 taacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 16467026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 409 - 538
Target Start/End: Original strand, 4311654 - 4311783
Alignment:
Q  409 gcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattg-tcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggc 507  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||| || |||   ||| |||| || |||||||| ||      
T  4311654 gcaccgagcaacaaaaacaaggtgttgaaatggtcggga-taagaaacgatgtcctaaggggcaatcgaataaatgaataaaacaatcaaatgctccgaa 4311752  T
Q  508 acatgatgcaccattttcacctccaaggtcc 538  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  4311753 acatgatgcaacaccttcacctccaaggtcc 4311783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 409 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 14222999 - 14222936
Alignment:
Q  409 gcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattg-tcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaa 472  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  14222999 gcaccaagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcggg-ctaagaaacgatgtcctaaggggcaa 14222936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 441; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 570
Target Start/End: Original strand, 121890 - 122450
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  121890 gggtggtataatcacatacatagctcggcaattgggagtgggtgaggaccaaggaattaccaaaattaagggaaacaataggcttaacatagagaccctt 121989  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  121990 atctttatgaacctcattaagcctcgtccacccatgtcttacacactcaaactcaatgtgcctatattgattatactttctaacccatctcggactaaca 122089  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcaccaagaagaggaaggtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122090 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaacacgataatgaaggtgaggaagatgcaccaagaagaggaaggtg 122189  T
Q  310 cacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataag 409  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  122190 tacaattgcaccaggatgaggagcaccatgaccatgataccagagaaacaaacgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgaggggataag 122289  T
Q  410 caccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcac 509  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  122290 caccaagcaactaaggtaaggtgttgaattgtcgggactaaggaataatgtcctaacgggcgaccgcatatccgaagaaaataacaaaatgcttcggaac 122389  T
Q  510 atgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  122390 atgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 122450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 436; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 570
Target Start/End: Original strand, 18071421 - 18071989
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18071421 gggtggtatcatcacatacatacctaggcaattaggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaccaataggcttaacataaagaccctt 18071520  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
     ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18071521 ctctttatgaacttcattaagccccatccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaaca 18071620  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagat--------gcaccaagaaga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||        ||||||||||||    
T  18071621 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaacacgataatgaaggcgaggaagatgcacattagcaccaagaaga 18071720  T
Q  302 ggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgag 401  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  18071721 ggaaggtgcacaattgtaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggataaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggactag 18071820  T
Q  402 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18071821 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaattatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatac 18071920  T
Q  502 ttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18071921 ttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctacctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 18071989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 20597544 - 20596976
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20597544 gggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgagagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagaccctt 20597445  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20597444 atctttatgaacttcattaagccccatccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaaca 20597345  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaaga--------tgcaccaagaaga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||        |||||||||||||    
T  20597344 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaacacgataatgaaggcgaggaagatgcatatttgcaccaagaaga 20597245  T
Q  302 ggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgag 401  Q
    |||||||| || |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  20597244 ggaaggtggacaattgtaccatgataaggagcaccatgaccatgatgccggataaacaaatgaaaatgcaagacgggcatggatgcctaacgaggccgag 20597145  T
Q  402 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20597144 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaattatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatac 20597045  T
Q  502 ttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20597044 ttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctacctatagaactcaatgaacaatgtgagctt 20596976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 20603841 - 20603273
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20603841 gggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgagagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagaccctt 20603742  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20603741 atctttatgaacttcattaagccccatccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaaca 20603642  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaaga--------tgcaccaagaaga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||        |||||||||||||    
T  20603641 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaacacgataatgaaggcgaggaagatgcatatttgcaccaagaaga 20603542  T
Q  302 ggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgag 401  Q
    |||||||| || |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  20603541 ggaaggtggacaattgtaccatgataaggagcaccatgaccatgatgccggataaacaaatgaaaatgcaagacgggcatggatgcctaacgaggccgag 20603442  T
Q  402 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20603441 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaattatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatac 20603342  T
Q  502 ttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20603341 ttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctacctatagaactcaatgaacaatgtgagctt 20603273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 20610160 - 20609592
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20610160 gggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgagagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagaccctt 20610061  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20610060 atctttatgaacttcattaagccctatccacccatgtcctacgcactcaaactcaatatgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaaca 20609961  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaaga--------tgcaccaagaaga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||        |||||||||||||    
T  20609960 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaacacgataatgaaggcgaggaagatgcatatttgcaccaagaaga 20609861  T
Q  302 ggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgag 401  Q
    |||||||| || |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  20609860 ggaaggtggacaattgtaccatgataaggagcaccatgaccatgatgccggataaacaaatgaaaatgcaagacgggcatggatgcctaacgaggccgag 20609761  T
Q  402 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 501  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20609760 aggataagcaccaagcaactaagacaaggtgttgaattgtcgggactaaggaattatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatac 20609661  T
Q  502 ttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20609660 ttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctacctatagaactcaatgaacaatgtgagctt 20609592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 20792487 - 20791919
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20792487 gggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggagtacaaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagaccctt 20792388  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20792387 atctttatgaacttcattaagccccatccacccatgtcctacacactcaaactcattgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaaca 20792288  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcac--------caagaaga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||  ||||||||||||        ||||||||    
T  20792287 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggcacatgaagaacacgataatgaaggcaaggaagatgcacatttgcaccaagaaga 20792188  T
Q  302 ggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgag 401  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20792187 ggaaggtgcacaattgtaccatgataaggagcaccatgaccatgatgccggataaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatacagaggccgag 20792088  T
Q  402 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 501  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20792087 aggataagcaccaagaaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaattatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaaggaaataaccaaatgc 20791988  T
Q  502 ttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20791987 ttcggaacatgatgcaccatcttcacctccaaggtcctacctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 20791919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 570
Target Start/End: Original strand, 26846177 - 26846738
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26846177 gggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaacaacattgagggaaacaataggcttaacatagagaccctt 26846276  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  26846277 atctttatgaacttcattaagccccgtccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatcttggaataaca 26846376  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaaga--------tgcaccaagaaga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  26846377 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatcatccataggtacatgaagaacacgatgatgaaggtgaggaagatgaacatttgcaccaagaaga 26846476  T
Q  302 ggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgag 401  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26846477 ggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggagaaaccaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcacaccgaggtcgag 26846576  T
Q  402 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 501  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26846577 aggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgtcgggaccaaggaatgatgtcctaaagggaaaccgcatatctgaagaaaataactaaatgc 26846676  T
Q  502 ttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||| |||||       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26846677 ttcggaacatg-------attttcacctccaaggtcctccctatagacctcaatgaaaaatgtgagctt 26846738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 25117849 - 25117280
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| || || |||||||||||| || | |||||| |||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  25117849 ggtggtatcataacatacatagctaggaaactaggagtgagtgaagaccaagagataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacaccctta 25117750  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| |||||| ||||| || |  ||    ||| |    ||  ||||||||||||| ||||| | ||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  25117749 tctctatgaatttcataaaacctcgaatcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccactttgatattactgcctaacccatctcggactaacac 25117650  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaa---aacaatgatga------aggtgaggaagatgcaccaagaaga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||   |||||||| ||      |||||   ||  |||||||||||||    
T  25117649 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgcatgtagaacagaacaatgaagacatggaaggtgcacaat-tgcaccaagaaga 25117551  T
Q  302 ggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgag 401  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| || |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |    
T  25117550 ggaaggtgcacaattgcacaatgatgagaagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatattgaggtcggg 25117451  T
Q  402 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 501  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25117450 aggataagcaccgagtaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggactaaggaatgatgtccaacggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 25117351  T
Q  502 ttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  25117350 ttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatgataaaaatgtgagctt 25117280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 25176940 - 25176371
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| || || |||||||||||| || | |||||| |||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  25176940 ggtggtatcataacatacatagctaggaaactaggagtgagtgaagaccaagagataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacaccctta 25176841  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| |||||| ||||| || |  ||    ||| |    ||  ||||||||||||| ||||| | ||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  25176840 tctctatgaatttcataaaacctcgaatcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccactttgatattactgcctaacccatctcggactaacac 25176741  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaa---aacaatgatga------aggtgaggaagatgcaccaagaaga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||   |||||||| ||      |||||   ||  |||||||||||||    
T  25176740 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgcatgtagaacagaacaatgaagacatggaaggtgcacaat-tgcaccaagaaga 25176642  T
Q  302 ggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgag 401  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| || |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |    
T  25176641 ggaaggtgcacaattgcacaatgatgagaagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatattgaggtcggg 25176542  T
Q  402 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 501  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25176541 aggataagcaccgagtaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggactaaggaatgatgtccaacggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 25176442  T
Q  502 ttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  25176441 ttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatgataaaaatgtgagctt 25176371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 20439865 - 20439313
Alignment:
Q  13 tggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagacccttatc 112  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| | || ||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  20439865 tggtatcataacatacatagctaggcaactaggcgtgagtgatgaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacacccttatc 20439766  T
Q  113 tttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccg 212  Q
    | |||||| ||||| || |  ||    ||| |    ||    ||||| || |||||||| | ||||||  || |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  20439765 tctatgaatttcataaaacctcgaatcccctttgtttatatgctcaagcttaatgtgcccactttgatattattgcctaacccatctcggactaacaccg 20439666  T
Q  213 aggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcac--------caagaagagga 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  |||| |   | ||||||  | ||||| |||||        |||||||||||    
T  20439665 aggtggaagaaaatttgttgtatgttgatgatgacccacaggtgcatatagaacagcctaatgaagacgtggaaggtgcacacccgcaccaagaagagga 20439566  T
Q  305 aggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagagg 404  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |  ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20439565 aggtgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatgaccacaatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgagagg 20439466  T
Q  405 ataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttc 504  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20439465 ataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaattggaataaggaatgatgtccaacggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttc 20439366  T
Q  505 ggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatga 557  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||    
T  20439365 ggaacatgatgcaccactttcacctcgaaggtcctccatatggacctcaatga 20439313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 289 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 30761059 - 30760776
Alignment:
Q  289 tgcaccaagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgca 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30761059 tgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatgaccataatgaagaagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgca 30760960  T
Q  389 taccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaa 488  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  30760959 taccgaggtcgagaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggactaagaaatgatgtccgaaggggtaaccgcatatccgaagaa 30760860  T
Q  489 aataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  30760859 aataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgataaaaatgtgagctt 30760776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 560
Target Start/End: Original strand, 22946968 - 22947499
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |   | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22946968 gggtggtatcatcacctatatagctaggaagttgggagtgggtgaggaccaagggataaatcagattgagggcaacaataggcttaacatagagaccctt 22947067  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    || | |||||||||||| ||||  | ||| ||  || | || | |||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22947068 atttctatgaacttcatcaagcctcatccgcctgtggcatatgaactcaagctcaatgtgcctcttttatttatactttctaacccatctcggactaaca 22947167  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcaccaagaagaggaaggtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||   ||  ||||| |||                ||||||||    
T  22947168 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggtccacaggtacatgaagagcaca---atctaggtgtgga----------------ggaaggtg 22947248  T
Q  310 cacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataag 409  Q
    ||   |||||||||| ||||||||||||| || |||| || |||| || |  |||||||| ||||||| |||||||||| || ||||   ||||||||||    
T  22947249 caaacttgcaccatgttgaggagcaccatgaccatgacaccggaggaaaatttgaaaatgaaagatggccatggatgcaaacggaggtttagaggataag 22947348  T
Q  410 caccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcac 509  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  | ||    
T  22947349 caccaagcaacaaaggcaaggtgttgaaatatccggggtaagaaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagagaataataaaatgctttagaac 22947448  T
Q  510 atgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaa 560  Q
    |||||||| ||| |  | |||||||||||| | ||| || |||||||||||    
T  22947449 atgatgcaacatctcaatctccaaggtccttcttatggacctcaatgaaaa 22947499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 153 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 24954738 - 24954311
Alignment:
Q  153 cactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccaca 252  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24954738 cactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgatgatgacccaca 24954639  T
Q  253 ggt--acat-gaagaaaacaatgatgaaggtgaggaaga-----tgcaccaagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaat 344  Q
    |||  |||| ||| |  | ||||| |||   ||||  |      |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||||| ||  |    
T  24954638 ggtgcacatagaacagcataatgaagaaatagagggtgcacacttgcatcaagaagaggaaggtgctcaactgcaccatgataaggaacaccatgaccct 24954539  T
Q  345 gatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgg 444  Q
     ||   || |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |         
T  24954538 aatgaaggtgaaacaaatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcataa 24954439  T
Q  445 gactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctcccta 544  Q
    |  ||||  | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  24954438 gcataagacaggatgtccaaaggggcaaccgcatatctgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccata 24954339  T
Q  545 tagaactcaat--gaaaaatgtgagctt 570  Q
    | || ||||||   ||||||||||||||    
T  24954338 tggacctcaataataaaaatgtgagctt 24954311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 22318824 - 22318621
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||    
T  22318824 aatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgacgtcctaa 22318725  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  22318724 ggggcaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 22318626  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  22318625 agctt 22318621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23520842 - 23520623
Alignment:
Q  20 atcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagacccttatctttatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||    
T  23520842 atcacttacatagctaggcaatttggggttggtgaggaccaaggaattaaaaggattgagggaaacaataggcttaacatagatacccttgtctctatga 23520743  T
Q  120 acttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtgga 219  Q
    ||||||| || |  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23520742 acttcatcaaacctcgtccacccatgtcctatacactcaagctcaatgtgcctattctaattgcacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 23520643  T
Q  220 agaaaatttgttgtatgttg 239  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23520642 agaaaatttgttgtatgttg 23520623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Original strand, 15734408 - 15734611
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  15734408 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctac 15734507  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  15734508 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 15734606  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  15734607 agctt 15734611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Original strand, 20621037 - 20621240
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  20621037 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatgtcctac 20621136  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||| || || ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  20621137 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttacaccttcagggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 20621235  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  20621236 agctt 20621240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Original strand, 23746925 - 23747128
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  23746925 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctac 23747024  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| || ||||||    
T  23747025 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aacaatgtg 23747123  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  23747124 agctt 23747128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 25008123 - 25007920
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  25008123 aatgaaagatggacatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctac 25008024  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  25008023 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgtttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 25007925  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  25007924 agctt 25007920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 439
Target Start/End: Original strand, 21386881 - 21387254
Alignment:
Q  44 ggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagacccttatctttatgaacttcattaagcaccgtccaccca 143  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |    ||||||||| |||||||| ||||||||  | ||||| || | |||||||||||||||||| ||||| || |    
T  21386881 ggagtgggtgaggacaaagggataaatccaattgagggcaacaatagacttaacattgaaaccctcatttctatgaacttcattaagcatcgtccgccta 21386980  T
Q  144 tgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttga 243  Q
    || | || | ||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||   || | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  21386981 tggcatatgaactcaaactcaatgtgcctattttatttctacttcctaacc---cttggactaacaccgaggtggaagcaaattttttgtatgttggtga 21387077  T
Q  244 tgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcaccaagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaa 343  Q
    |||||| |||||||||| ||   |||||| |   ||||||                ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || |    
T  21387078 tgatcctcaggtacatggagtgcacaatgtt---ggtgag----------------gaggaaggtgcaaacttgcaccatgatgaggagcaccatgacca 21387158  T
Q  344 tgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaatt 439  Q
    ||| ||| ||||||    |||||||| ||| |||||||||||||| || ||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  21387159 tgacacttgagaaaactttgaaaatgaaaggtgggcatggatgcaaactgaggttgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtattgaatt 21387254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 477 - 570
Target Start/End: Original strand, 21387268 - 21387361
Alignment:
Q  477 atatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||| | || || ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  21387268 atatccgaagagaataatcaaatgctttggaacatgatggagcacttccacctccaaggtcctccttatggacctcaatgaaaaatgtgagctt 21387361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Original strand, 15734256 - 15734337
Alignment:
Q  183 tactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  15734256 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 15734337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25008275 - 25008194
Alignment:
Q  183 tactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  25008275 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 25008194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 30764807 - 30764707
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||| | |||||  |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  30764807 ggtggtatcataacatacatagctaggcaactaggagttagtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacaccctta 30764708  T
Q  111 t 111  Q
    |    
T  30764707 t 30764707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22318970 - 22318895
Alignment:
Q  189 ctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  22318970 ctaacccatctcggactaacaccgaggtggaggcaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 22318895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Original strand, 23746773 - 23746854
Alignment:
Q  183 tactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgat-gatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||    
T  23746773 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatagat-tacaggtacatgaaga 23746854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Original strand, 20620885 - 20620966
Alignment:
Q  183 tactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  20620885 tacttcctaacccatctcggactaaccccaaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 20620966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30764663 - 30764587
Alignment:
Q  157 caaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgt 233  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30764663 caaactcaacgtgcccattttgatattattgtctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagcgaatttgttgt 30764587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 432; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 22697 - 22129
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22697 gggtggtatcatcacatacatagctagacacttgggagagggtgaggaccaagggattaacaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagaccttt 22598  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22597 atctttatgaacttcattaagccccgttcgcccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaaca 22498  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcac--------caagaaga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||        ||||||||    
T  22497 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaacacgataatgaaggcgaggaagatgcacatttgcaccaagaaga 22398  T
Q  302 ggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgag 401  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22397 ggaaggtgcacaattgtaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggataaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgag 22298  T
Q  402 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22297 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 22198  T
Q  502 ttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22197 ttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagacctcattgaaaaatgtgagctt 22129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 428; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 22166008 - 22165440
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22166008 gggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaatggattaccaaaattgaggaaaacaataggcttaacatagagaccctt 22165909  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22165908 atctttatgaacttcattaagccccatccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattataccttctaacccatctcggactaaca 22165809  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaaga--------tgcaccaagaaga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||        |||||||||||||    
T  22165808 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaacacgataatgaaggcgagaaagatgcacatttgcaccaagaaga 22165709  T
Q  302 ggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgag 401  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  22165708 ggaaggtgcacaattgtaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggataaacaaatgaaaatgcaagatgagcatggatgcataccgaggactag 22165609  T
Q  402 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165608 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaattatgtcctaaagggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 22165509  T
Q  502 ttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165508 ttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctacctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 22165440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 570
Target Start/End: Original strand, 16654226 - 16654795
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16654226 gggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattactaaatttgagggaaacaataggcttaacatagagaccctt 16654325  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactc-aaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaac 208  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16654326 atctttatgaacttcattaagccccatccacccatgtcctacgcactcaaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaac 16654425  T
Q  209 accgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaaga--------tgcaccaagaag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||        ||||||||||||    
T  16654426 accgaggtgtaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaacacgataatgaaggcgaggaagatgcacatttgcaccaagaag 16654525  T
Q  301 aggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccga 400  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16654526 aagaaggtgcacaattgtaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggataaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccga 16654625  T
Q  401 gaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatg 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16654626 gaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgatgaattgtcgagactaaggaattatgtcctaaggggcaatcgcatatccgaagaaaataatcaaatg 16654725  T
Q  501 cttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16654726 cttcggaacatgatgcaccatcttcacctccaaggtcctacctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 16654795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 10604237 - 10603669
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10604237 gggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattacaaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagaccctt 10604138  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10604137 atctttatgaacttcattaagccccatccacccatgtcctacacactcaaactcattgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaaca 10604038  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagat--------gcaccaagaaga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||        ||||||||||||    
T  10604037 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatattgttgatgatccacaggtacatgaagaacacgataatgaaggcgaggaagatgcacatttgcaccaagaaga 10603938  T
Q  302 ggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgag 401  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  10603937 ggaaggtgcacaattgtaccatgataaggagcaccatgaccatgatgccggataaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatactgaggctgag 10603838  T
Q  402 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 501  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10603837 aggataaacaccaagcaactaagggaaggtgtggaattgtcgggactaaggaattatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 10603738  T
Q  502 ttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10603737 ttcggaacatgatgcaccatcttcacctccaaggtcctacctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 10603669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 570
Target Start/End: Original strand, 4369211 - 4369752
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  4369211 gggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaacaacattgagggaatcaataggctttacatagagaccctt 4369310  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4369311 atctttatgaacttcattaagccccgtccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcttattttaattatactttctaacccatctcggactaaca 4369410  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcaccaagaagaggaaggtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||                   ||||||    
T  4369411 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaacacgataatgaaggcgagg-------------------aaggtg 4369491  T
Q  310 cacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataag 409  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4369492 cgcaattgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggataaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataag 4369591  T
Q  410 caccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcac 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  4369592 caccaagcaactaaggcaaggtgttgaattttcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcagaac 4369691  T
Q  510 atgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4369692 atgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 4369752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 12161767 - 12161214
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||| | | |||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  12161767 ggtggtatcatcacatacatagctgggctactaggagtgagtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggttaaacatagagaccctta 12161668  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| |||||| ||||| || |  || |  ||| |    ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||  || |||||||||| ||||||||    
T  12161667 tctctatgaatttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgatcttactgccttacccatctcggactaacac 12161568  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcac--------caagaagag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| | |||| |||| | ||| ||||||  ||||||| |||||        |||||||||    
T  12161567 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacagatgcatgtagaacataataatgaagacgaggaaggtgcacacttgcaccaagaagag 12161468  T
Q  303 gaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgaga 402  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12161467 gaaggtgcacaattgcatcatgatgaggagcaccatgactatgatgacggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgaga 12161368  T
Q  403 ggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgct 502  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12161367 ggataaacaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgacgggactaaggaatgatgtcctaagtggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgct 12161268  T
Q  503 tcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg 556  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  12161267 tcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatg 12161214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 29 - 570
Target Start/End: Original strand, 17386313 - 17386833
Alignment:
Q  29 atagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagacccttatctttatgaacttcatta 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17386313 atagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacccttatctctatgaacttcatta 17386412  T
Q  129 agcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaattt 228  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  17386413 agcatcgtccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaaatt 17386512  T
Q  229 gttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcaccaagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatga 328  Q
      | ||||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||||| |  ||                 |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17386513 aatatatgttggtgaaggttcacaggtacatgaagagaacaatgct--ag-----------------agaagaggaaggtgcacacttgcaccatgatga 17386593  T
Q  329 ggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaa 428  Q
    |||||||||| || ||||| | |||  ||  |||| ||||| ||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  17386594 ggagcaccatgaccatgatgccggaagaaataatg-aaatgaaagatgggcatggatacacacctaggttgagaggataagcaacgagcaacaaaggcaa 17386692  T
Q  429 ggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacc 528  Q
    ||||||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    |||||||| || || ||||    
T  17386693 ggtgttgaattatccgggctacgaaatgatgtccttaggggcaaccgcatctccgaagataataaccaaatgcttcgaattatgatgcaacacttccacc 17386792  T
Q  529 tccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||| | |||||||||||    
T  17386793 tccaaggtcctccttatggacctcaatg-ataatgtgagctt 17386833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12424052 - 12423770
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12424052 gggtggtatcatcacatacatagataggcaattgggagtgggtgaggaccacgggattaacaacattgagggaaacaataggcttaacatagagaccctt 12423953  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  12423952 atctttatgaacttcattaagccccgtccacccatgtcctacacattcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacacatctcggactaaca 12423853  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcac 293  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||  ||||||||||||    
T  12423852 ccgaggtggaagaaaatttcttttatgttgttgatgatccacaggtacatg-agaacacgatgatgaaggcaaggaagatgcac 12423770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 13506218 - 13505649
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| || || |||||||||||||  || || |||  ||| ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||    
T  13506218 ggtggtatcataacatacatagctaggcggttaggcgtgattgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactcaacatagaaaccctta 13506119  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| |||||| ||||| || | |||    ||| |    ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||| || |  ||||||||||||| ||||||||    
T  13506118 tctctatgaatttcataaaaccccgaatcccctttgtttatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacac 13506019  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggt--acat-gaagaaaacaatgatgaaggtgaggaaga-----tgcaccaagaagag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  |||| ||| || | ||||| ||||  || |  |      ||||||||||||||    
T  13506018 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgcacatagaacaacataatgaagaagcagaaggtgcacgcttgcaccaagaagag 13505919  T
Q  303 gaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgaga 402  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||   || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||| |    
T  13505918 gaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatacaagatgggcatggatgaaaaccgaggtcgaaa 13505819  T
Q  403 ggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgct 502  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13505818 ggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaatgatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaacaaccaaatgct 13505719  T
Q  503 tcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | |||||  ||||||||||||||    
T  13505718 tcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggaccacaatgataaaaatgtgagctt 13505649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 526
Target Start/End: Original strand, 3278026 - 3278504
Alignment:
Q  29 atagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagacccttatctttatgaacttcatta 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||  || ||||||||||||  ||| |||||| ||||||| || | |||||| |||||||    
T  3278026 atagctaggcaattgggagtgggtgagaaccaagggataaacatgatcgagggaaacaatttgctaaacatagagaccctcatttctatgaatttcatta 3278125  T
Q  129 agcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaattt 228  Q
    |||| | |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3278126 agcatcatccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctcttttatttatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaattt 3278225  T
Q  229 gttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcaccaagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatga 328  Q
    | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||| ||                    |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3278226 gatgtatgttggtgatggttcacaggtacatgaagagcacaatgttg-------------------gagaagaggaaggtgcacacttgcaccatgatga 3278306  T
Q  329 ggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaa 428  Q
    ||| |||||| || |||||   |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  3278307 ggaacaccatgaccatgatgtcggagaaaacaatgaaaatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggttgagaggataaacaccaagcaacaaagacaa 3278406  T
Q  429 ggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttca 526  Q
    ||||||||||| || ||  |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  3278407 ggtgttgaattatccgggataagaaatgatgtcataagaggcaaccgcatatccgaagagaataatcaaatgcttcggaacatgatgcaacactttca 3278504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14447239 - 14446985
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14447239 gggtggtattatcacatacatagctaggcaattgggggtgggtgaggaccaagggataaacaaaattgagggtaacaatagacttaacatagagaccctt 14447140  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14447139 atctctatgaacttcattaagcatcatccacccatgtcctacacactcaaactcgatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaaca 14447040  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14447039 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 14446985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 20158130 - 20157877
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20158130 gggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagaccctt 20158031  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| | |||||||    
T  20158030 atctctatgaactttattaagcactgtccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttatttgtacttcctaacccatcttggactaaca 20157931  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaag 263  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20157930 ccgaggtgaaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacatgtacatgaag 20157877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 289 - 570
Target Start/End: Original strand, 15945412 - 15945695
Alignment:
Q  289 tgcaccaagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgca 388  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15945412 tgcaccacgaagaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggaacaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgca 15945511  T
Q  389 taccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaa 488  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15945512 taccgaggtcgagaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaatgatgtccaacggggcaaccgcatatccgaagaa 15945611  T
Q  489 aataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  15945612 aacaaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgataaaaatgtgagctt 15945695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 570
Target Start/End: Original strand, 13693432 - 13693957
Alignment:
Q  26 tacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagacccttatctttatgaacttca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||    
T  13693432 tacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggatcaacaagattgaggggaataataggcttaacatagagatccttgtctctatgaacttca 13693531  T
Q  126 ttaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaa 225  Q
    |||| |  || ||||||||| | ||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  13693532 ttaaacctcgaccacccatgacttatacactcaagctcaacgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcagactaacaccgaggtggatgaaaa 13693631  T
Q  226 tttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcaccaagaagaggaaggtgcacgattgcaccatga 325  Q
    |||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||  ||| ||  |||                   |||| |||||||||||  |||||||||||    
T  13693632 tttgttgtatgttggtgacgactcgcaggtacatgaagagcacattgcggaa-------------------gaagcggaaggtgcacacttgcaccatga 13693712  T
Q  326 tgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaagg 425  Q
    |||||||||||||  | ||||||  |||| ||  || ||  ||| ||||||| |||||||| | |||||||  || |||||||||||| |||||| ||||    
T  13693713 tgaggagcaccatggccatgatatcggaggaaacaacgatcatgaaagatggacatggatgtaaaccgaggttgaaaggataagcaccgagcaacaaagg 13693812  T
Q  426 caaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttc 525  Q
    |||||||||||| | || |||||  | ||||||||||||| |||||||| |||   |||||| ||||| |||||||||||| |||||||| | ||  |      
T  13693813 caaggtgttgaactatccggactccgaaatgatgtcctaaagggcaaccacatcatcgaagagaataatcaaatgcttcggaacatgatgaaacacctca 13693912  T
Q  526 acctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13693913 acctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaatgtgagctt 13693957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 295 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 20157864 - 20157593
Alignment:
Q  295 aagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccga 394  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  20157864 aagaagaggaaggtgcacacttgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggagaaaacaatgaaaatgaaagatgagcatggatacataccga 20157765  T
Q  395 ggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataac 494  Q
    ||  ||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20157764 ggtggagaggataagcaccgagaaacaaaggcagggtgttgaattttcaggattaagaaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatcccaagaaaataac 20157665  T
Q  495 caaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtga 566  Q
    |||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20157664 caaatgcttcagaacatgatgcaacactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaatgtga 20157593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 295 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 3340630 - 3340353
Alignment:
Q  295 aagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccga 394  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3340630 aagaagcggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccga 3340531  T
Q  395 ggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataac 494  Q
    || ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3340530 ggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaatgatgtccaacggggcaaccgcatatccgaagaaaacaac 3340431  T
Q  495 caaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | |||||  ||||||||||||||    
T  3340430 caaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggaccccaatgataaaaatgtgagctt 3340353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18979638 - 18979465
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18979638 gggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgcgagttggtgaggaccaagggattaacaaaattgagggaaacaatagggttaacatagagaccctt 18979539  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattat 183  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18979538 atctttatgaacttcattaagccccgtccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattat 18979465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 153 - 570
Target Start/End: Original strand, 15643732 - 15644159
Alignment:
Q  153 cactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccaca 252  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15643732 cactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgctgatgacccaca 15643831  T
Q  253 ggt--acatgaagaaaac-aatgatgaaggtgaggaaga-----tgcaccaagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaat 344  Q
    |||  ||||  || |  | ||||| |||   ||||| |      |||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||   ||||| ||  |    
T  15643832 ggtgcacatagagcagcctaatgaagaaacagaggatgcacacttgcatcaggaagaggaaggtgcacaactgcaccatgatgaggcataccatgaccct 15643931  T
Q  345 gatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgg 444  Q
     ||   |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||  || || |||| ||||||||||| |||||||||||||||| | | |     
T  15643932 aatgaagatgaaacaaatgaggatgcaagatgggcatggatgactaccgaggttgaaagaataaacaccaagcaacaaaggcaaggtgttgaactcttga 15644031  T
Q  445 gactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctcccta 544  Q
    |  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  15644032 gcataaggcatgatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccata 15644131  T
Q  545 tagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    | || |||||||  ||||||||||||||    
T  15644132 tggacctcaatgataaaaatgtgagctt 15644159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 153 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 10161749 - 10161322
Alignment:
Q  153 cactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccaca 252  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10161749 cactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgcactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgctgatgacccaca 10161650  T
Q  253 ggtacatgaagaa-aac--aatgatgaaggtgaggaaga-----tgcaccaagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaat 344  Q
    ||| ||   |||| |||  ||||| |||   ||||| |      |||| |  |||||||||||||||| | |||||||||| ||||   ||||| || ||    
T  10161649 ggtgcacatagaacaacctaatgaagaaacagaggatgcacacttgcatccggaagaggaaggtgcacaactgcaccatgaagaggcataccatgaccat 10161550  T
Q  345 gatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgg 444  Q
     ||   |  ||||||||||   ||||||||||||||||||||  ||||||||  || || |||| |||| |||||| |||||||||||||||| |   |     
T  10161549 aatgaagatgaaacaaatgcggatgcaagatgggcatggatgactaccgaggttgaaagaataaacaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatga 10161450  T
Q  445 gactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctcccta 544  Q
    |  ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  10161449 gcataaggcatgatgtccaaaagggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccata 10161350  T
Q  545 tagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    | || |||||||  ||||||||||||||    
T  10161349 tggacctcaatgataaaaatgtgagctt 10161322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 13196769 - 13196566
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  13196769 aatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccaggctaaggaatgatgtcctaa 13196670  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  13196669 gaggcaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgcttcagaacatgatgcaacatttccacctccaaggtcctccctatggaactcaat-aaaaatgtg 13196571  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  13196570 agctt 13196566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Original strand, 7599230 - 7599433
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  7599230 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctac 7599329  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  7599330 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 7599428  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  7599429 agctt 7599433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 373 - 570
Target Start/End: Original strand, 10145892 - 10146088
Alignment:
Q  373 gatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaa 472  Q
    |||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||| |||||||    
T  10145892 gatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatgtcctacggggcaa 10145991  T
Q  473 ccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  10145992 ccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacatttacaccttcagggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtgagctt 10146088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Original strand, 13689541 - 13689744
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||   | |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  13689541 aatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaaggaatgatgtcctaa 13689640  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | || || ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  13689641 gaggcaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgcttcggaacatgatggaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 13689739  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  13689740 agctt 13689744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 12188415 - 12188212
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||     
T  12188415 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagaaccgagcaacaaaggcaaggtgttgacttatctgggctaagaaatgatgtcctac 12188316  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  12188315 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacatttacaccttcagggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 12188217  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  12188216 agctt 12188212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 13188757 - 13188554
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  13188757 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataggcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatgtcctac 13188658  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| || |||||| ||| |||||    
T  13188657 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacatttacaccttcagggccctccctatggacctcaat-aaatatgtg 13188559  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  13188558 agctt 13188554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 373 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 13137502 - 13137306
Alignment:
Q  373 gatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaa 472  Q
    |||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||  ||||||    
T  13137502 gatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctacagggcaa 13137403  T
Q  473 ccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  13137402 ccgcatatccaaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtgagctt 13137306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 15630296 - 15630093
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  | | ||| ||||||||||||     
T  15630296 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccaggcaaagaaatgatgtcctac 15630197  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  15630196 ggggcaaccgcatatccgaagaaaaaaaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 15630098  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  15630097 agctt 15630093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 12194829 - 12194626
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||   | |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||     
T  12194829 aatgaaaggtgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagaaccgagcaacaaaggcaaggtgttgacttatctgggctaagaaatgatgtcctac 12194730  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||  |||||||| || |||||| |||||||||    
T  12194729 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacatttacaccttcagggctctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 12194631  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  12194630 agctt 12194626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 16374819 - 16374616
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  16374819 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatgtcctac 16374720  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || || ||||| || || ||||||||| || ||  || |||||||||    
T  16374719 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgctttggaacatgatgcaacacttacaccttcagggccctccctatggacctatat-aaaaatgtg 16374621  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  16374620 agctt 16374616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 296 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 14446972 - 14446755
Alignment:
Q  296 agaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgag 395  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||| || ||||  | | ||  |  ||||| |||| ||||||| ||||||| || |  |||    
T  14446972 agaagaggaaggtgcacatttgcaccatgatgag---caccatgaccatgacgccgaaggcaacaatgacaatgaaagatggacatggatacacaatgag 14446876  T
Q  396 gccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataacc 495  Q
    |  ||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||| || |||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14446875 gttgagaggataagcaccgagcaaaaaagggaaggtgttgaattatccggactacgaaacgacgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataatc 14446776  T
Q  496 aaatgcttcggcacatgatgc 516  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  14446775 aaatgcttcggaacatgatgc 14446755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3340895 - 3340651
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| || || |||||||||||||  || || ||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||    
T  3340895 ggtggtatcataacatacatagctaggcggttaggcgtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaaccctta 3340796  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| |||||| ||||| || |  ||    ||| |    ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||| || |  ||||||||||||| ||||||||    
T  3340795 tctctatgaatttcataaaacctcgaatcccctttgtttatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacac 3340696  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  3340695 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggt 3340651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 255
Target Start/End: Original strand, 15945114 - 15945343
Alignment:
Q  26 tacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagacccttatctttatgaacttca 125  Q
    |||||||||||||| || || ||| |||| ||||||||| |   ||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  15945114 tacatagctaggcagttaggcgtgagtgaagaccaagggctatacaagattgagggaaacaataggctgaacatagaaacccttatctctatgaatttca 15945213  T
Q  126 ttaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaa 225  Q
    ||||    ||    ||| |    ||  | ||||| || ||||| |||||||||||  || |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15945214 ttaaaactcgaatcccctttgtttatacgctcaagcttaatgtacctattttgatattattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaa 15945313  T
Q  226 tttgttgtatgttgttgatgatccacaggt 255  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  15945314 tttgttgtatgttaatgatgacccacaggt 15945343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13197027 - 13196840
Alignment:
Q  77 gagggaaacaataggcttaacataaagacccttatctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattt 176  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  | |||||| | | |||||| ||||||||||  | |||||||||| | || |||||  ||||   | | ||| |||    
T  13197027 gagggcaacaataggcttaatattgaaacccttgtatctatgaatttcattaagcttcatccacccatgacttatgcacttcaacttcgtatacctcttt 13196928  T
Q  177 tgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    || || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  13196927 tgtttctgcttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaggcaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 13196840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 264
Target Start/End: Original strand, 7599069 - 7599159
Alignment:
Q  174 ttttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  7599069 ttttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 7599159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13188918 - 13188828
Alignment:
Q  174 ttttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  13188918 ttttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 13188828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13137661 - 13137580
Alignment:
Q  183 tactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  13137661 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 13137580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15630448 - 15630367
Alignment:
Q  183 tactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  15630448 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 15630367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 245
Target Start/End: Original strand, 10145724 - 10145795
Alignment:
Q  174 ttttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatg 245  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10145724 ttttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatg 10145795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12188576 - 12188486
Alignment:
Q  174 ttttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  12188576 ttttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgtagtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 12188486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12194990 - 12194900
Alignment:
Q  174 ttttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  12194990 ttttgtttttacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgtagtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 12194900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16374971 - 16374889
Alignment:
Q  183 tactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaa 265  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    ||||||||||||||||    
T  16374971 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttcttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaagaa 16374889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 12423768 - 12423714
Alignment:
Q  314 attgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaat 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||| |||||||||    
T  12423768 attgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggagaaaccaatgaaaat 12423714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 401; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 570
Target Start/End: Original strand, 21393 - 21961
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21393 gggtggtatcatcacatacatagctaggaaattgggagtgggtaaggaccaagggattaacaacattgagggaaacaataggcttaacatagagaccctt 21492  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21493 atctttatgaacttcattaagccccatccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaaca 21592  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgca--------ccaagaaga 301  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||        |||||||||    
T  21593 ctgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttaatgatccataggtacatga-gaacacgatgatgaaggcgaggaagatgcacatttgcaccaagaaga 21691  T
Q  302 ggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgag 401  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21692 ggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcactatgaccatgatgccggagaaaccaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgag 21791  T
Q  402 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 501  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21792 aggataagcaccgagcaacaaaggaaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 21891  T
Q  502 ttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactc-aatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21892 ttcagaacatgatgcaccattttgacctccaaggtcctccctatagaactcaaatgaaaaatgtgagctt 21961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 570
Target Start/End: Original strand, 3353129 - 3353695
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3353129 gggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaagaccaagggattaacaaaattgagggaaacaataggcttaacatagagaccctt 3353228  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3353229 atctctatgaacttcattaagccccgtccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattgtacttcctaacccatctcgaactaaca 3353328  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaag------------atgcaccaag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||             |||||||||    
T  3353329 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggcacatgaagaacacgatgatgaaggcgaggaaggaaggtgcatatttgcaccaag 3353428  T
Q  298 aagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggc 397  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      |||||   | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  3353429 aagaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcacc------atgatgacgaagaaaccaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcacaccgaggt 3353522  T
Q  398 cgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaa 497  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3353523 cgagaggataagtaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaagggaaaccgcatatccgaagaaaataaccaa 3353622  T
Q  498 atgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3353623 atgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagacctcaatgaaaaatgtgagctt 3353695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 264
Target Start/End: Original strand, 15864042 - 15864296
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15864042 gggtggtatcatcacgtacatatctaggcaattgggagtgggtgaggactaagggataaacaaaattgagggtaacaataggcttaacatagagaccctt 15864141  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    || | |||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15864142 atttctatgaacttcattaagcatcatacacccatttcctacacactcaaactcaatgtgcctgttttaattgtacttcctaacccatctcggactaaca 15864241  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15864242 ccgaggtggaagaaatttttttgtatgttattgatgatccacaggtgcatgaaga 15864296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 295 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 15261497 - 15261251
Alignment:
Q  295 aagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccga 394  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15261497 aagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgaataccga 15261398  T
Q  395 ggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataac 494  Q
    || ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15261397 ggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggcataaggaatgatgtccaacggggcaaccgcatatccgaagaaaacaac 15261298  T
Q  495 caaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctcc 541  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15261297 caaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctcc 15261251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 153 - 570
Target Start/End: Original strand, 13821562 - 13821989
Alignment:
Q  153 cactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccaca 252  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13821562 cactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgatgatgacccaca 13821661  T
Q  253 ggt--acat-gaagaaaacaatgatgaaggtgaggaaga-----tgcaccaagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaat 344  Q
    |||  |||| ||| |  | ||||| |||   ||||  |      |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||  |    
T  13821662 ggtgcacatagaacagcataatgaagaaacagagggtgcacacttgcatcaagaagaggaaggtgctcaactgcaccatgatgaggaacaccatgaccct 13821761  T
Q  345 gatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgg 444  Q
     ||   || |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |   |     
T  13821762 aatgaaggtgaaacaaatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatga 13821861  T
Q  445 gactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctcccta 544  Q
    |  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  13821862 gcataagacacgatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccata 13821961  T
Q  545 tagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    | || |||||||  ||||||||||||||    
T  13821962 tggacctcaatgataaaaatgtgagctt 13821989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 296 - 570
Target Start/End: Original strand, 15864309 - 15864583
Alignment:
Q  296 agaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgag 395  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  |  |||||||||  ||||||| ||||||| || |  |||    
T  15864309 agaagaggaaggtgcacatttgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgctggaggcaacaatgaaaataaaagatggacatggatacacaatgag 15864408  T
Q  396 gccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataacc 495  Q
    |  ||||||||||||||  |||||| | | |||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  15864409 gttgagaggataagcactgagcaacaatgacaaggtgttgaattatccggactacgaaacgatgtcctaaggggcaaccacatatccaaagaaaataact 15864508  T
Q  496 aaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  15864509 aaatgcttcggaacatgatgcaccacttccacctccaaggtcctccctatggacctccatgaaaaatgtgagctt 15864583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Original strand, 22109834 - 22110037
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||      
T  22109834 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatgtccttc 22109933  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||| || || ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  22109934 agggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttacaccttcagggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 22110032  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  22110033 agctt 22110037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Original strand, 15253219 - 15253423
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccg-aggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtccta 464  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| |||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  15253219 aatgaaagattggcatggatgcaaaccgcaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtccta 15253318  T
Q  465 aggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgt 564  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||    
T  15253319 aggggcaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgctccggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgt 15253417  T
Q  565 gagctt 570  Q
    ||||||    
T  15253418 gagctt 15253423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15261620 - 15261518
Alignment:
Q  153 cactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccaca 252  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  15261620 cactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccaca 15261521  T
Q  253 ggt 255  Q
    |||    
T  15261520 ggt 15261518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 16680906 - 16681021
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  16680906 ggtggtatcataacatacatagctaggcaactaggagtgagtgaagaccaagggataaagaagattgagggaaacaataggctaaacatagacaccctta 16681005  T
Q  111 tctttatgaacttcat 126  Q
    ||| |||||| |||||    
T  16681006 tctctatgaatttcat 16681021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Original strand, 22109682 - 22109763
Alignment:
Q  183 tactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  22109682 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 22109763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 264
Target Start/End: Original strand, 15253058 - 15253148
Alignment:
Q  174 ttttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| || ||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  15253058 ttttgtttctacttcctaatccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 15253148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 570
Target Start/End: Original strand, 3988619 - 3989166
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3988619 gggtggtatcatcacatacctagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaagcaataggcttaacatagagaccctt 3988718  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3988719 atctttatgaacttcattaagccccgtccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgtctattttgattatactttctaacccatctcggactaaca 3988818  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaaga--------tgcaccaagaaga 301  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||        |||||||||||||    
T  3988819 ccaaggtggaagaaaatatgttgtatgttgttgatgatccataggtacatgaagaacacgataatgaaggcgaggaagatgcacatttgcaccaagaaga 3988918  T
Q  302 ggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgag 401  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||                     | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3988919 ggaaggtgcacaattgcaccatgatg---------------------ccggataaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgag 3988997  T
Q  402 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3988998 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatctgaagaaaataaccaaatgc 3989097  T
Q  502 ttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3989098 ttcagaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 3989166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 570
Target Start/End: Original strand, 8651563 - 8652104
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8651563 ggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagaccctta 8651662  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  8651663 tctctatgaacttcattaaacctcgtccccccatggcctatacactcaaattcaatgtgcctattttaattatacttcctaacctatctcggactaacac 8651762  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcaccaagaagaggaaggtgc 310  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||  |||||| |  ||                 |||||||||||||||    
T  8651763 tgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcacaagtacatgaagagcacaatgtt--ag-----------------agaagaggaaggtgc 8651843  T
Q  311 acgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagc 410  Q
    ||  ||||||||| |||| ||||||||| || | ||| | |||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  || | |||||||    
T  8651844 acacttgcaccattatgatgagcaccatgacgaggatgccggaggaaacaatgagaatgaaagatgggcatggatgcacaccgaggttgaaatgataagc 8651943  T
Q  411 accaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcaca 510  Q
    ||| |||||| ||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  8651944 accgagcaacaaaggcaatgtgttgaactatcggg-ctaagaaatgatgtcctaagggacaaccgtatatccgaagagaataatcaaatgcttcggaaca 8652042  T
Q  511 tgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaa--aaatgtgagctt 570  Q
    ||||||| ||| |  ||||||||||| |||| ||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  8652043 tgatgcaacatctcaacctccaaggttctccttatggacctcaatgaatcaaatgtgagctt 8652104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 153 - 557
Target Start/End: Original strand, 20392145 - 20392557
Alignment:
Q  153 cactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccaca 252  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  20392145 cactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccaca 20392244  T
Q  253 ggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgc--------accaagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaat 344  Q
    ||| ||   |||| |   | ||||||  |  |||| |||        || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20392245 ggtgcacatagaacagcgtaatgaagaagcagaaggtgcccacttgcactaagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccataaccat 20392344  T
Q  345 gatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgg 444  Q
    |||   || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||    
T  20392345 gatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcacgatgggcatggatgaatatcgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgg 20392444  T
Q  445 gactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctcccta 544  Q
    || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20392445 gaataaggaacgatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagagaacaaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccata 20392544  T
Q  545 tagaactcaatga 557  Q
    | || ||||||||    
T  20392545 tggacctcaatga 20392557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 19877351 - 19876814
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| | |   |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||     
T  19877351 gggtggtatcatcacctataaagctaggaaattgggagtggatgagaaccaagggataaaccggattgagggcaacaatatgcttaacataccgaccctc 19877252  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    || | ||||||||||||| | |  | |||||| |||   ||  |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| |||||| |||||||    
T  19877251 atttctatgaacttcattcaacctcatccacctatgaaatatacactcaaactcaatgtgcctcttttatttctactttctaacctatctcggactaaca 19877152  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcaccaagaagaggaaggtg 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | ||||    ||||||||||||                |||||    
T  19877151 ccgaggtggaagaaaacttgttgtatgttggtgatgatccacaggtacatgaggagcaaaatgc---aggtgaggaaga----------------aggtg 19877071  T
Q  310 cacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataag 409  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||| || |||| || |||| ||    || ||||| |||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||    
T  19877070 caaacttgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgacaccggaggaaactttgcaaatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtccaaaggataag 19876971  T
Q  410 caccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcac 509  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||| | ||  | ||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| || |||||||||||  ||    
T  19876970 caccgagcaacaaagacaaggtgttgaactctccaggctaagaaatgatgtcctaaggggcaaccacatgaccgaagaaaacaatcaaatgcttcgaaac 19876871  T
Q  510 atgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 567  Q
    |||||| | || || ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||    
T  19876870 atgatggagcacttccacctccaaggtcctccttatggacctcaat-aaaaatgtgag 19876814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 20 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 20072599 - 20072068
Alignment:
Q  20 atcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagacccttatctttatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||    
T  20072599 atcacttacatagctaggcaatttggggttggtgaggaccaaggaattaaaaggattgagggaaacaataggcttaacatagatacccttgtctctatga 20072500  T
Q  120 acttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtgga 219  Q
    ||||||| || |  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20072499 acttcatcaaacctcgtccacccatgtcctatacactcaagctcaatgtgcctattctaattgcacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 20072400  T
Q  220 agaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcaccaagaagaggaaggtgcacgattgca 319  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||   |  || || ||||||                ||| ||| ||||||| | ||||    
T  20072399 agaaaattttttgtatgttgatgatgacccacaagtacataaag---agtataatcaaggtg----------------aagcggatggtgcacaaatgca 20072319  T
Q  320 ccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaa 419  Q
    |||  |||||||||||||| ||  ||||   |||| ||  ||| | |||| ||||||||||||||| || |  ||||  |||||||||| |||| || ||    
T  20072318 ccaaaatgaggagcaccatgaccctgatgtcggaggaatcaataacaatgaaagatgggcatggatacacaatgaggtagagaggataaacaccgagaaa 20072219  T
Q  420 ctaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcacc 519  Q
    | |||||||||||| | ||| || |||||| | ||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||||| |||| |||| || | |||||||| |    
T  20072218 caaaggcaaggtgtcggattatccggactatgaaatgaggtcctacggggcaaccgcatcaccaaagaaaataatcaaaggctttggaatatgatgcaac 20072119  T
Q  520 attttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    |  | ||||||||||| |||||||   || |||||||| ||||||||||||    
T  20072118 acctacacctccaaggccctccctgcggacctcaatgacaaatgtgagctt 20072068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 153 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 21800235 - 21799808
Alignment:
Q  153 cactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccaca 252  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21800235 cactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgctgatgacccaca 21800136  T
Q  253 ggt--acatgaagaaaac-aatgatgaaggtgaggaaga-----tgcaccaagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaat 344  Q
    |||  ||||  || |  | ||||| |||   ||||| |      |||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||||   ||||| ||  |    
T  21800135 ggtgcacatagagcagcctaatgaagaaacagaggatgcacacttgcatcaggaagaggaaggtgcacaactgcaccatgatgaggcataccatgaccct 21800036  T
Q  345 gatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgg 444  Q
     ||   |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||  || || |||| |||| |||||| |||||||||||||||| |   |     
T  21800035 aatgaagatgaaacaaatgaggatgcaagatgggcatggatgactaccgaggttgaaagaataaacaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatga 21799936  T
Q  445 gactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctcccta 544  Q
    |  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  21799935 gcataaggcatgatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccata 21799836  T
Q  545 tagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    | || |||||||  ||||||||||||||    
T  21799835 tggacctcaatgataaaaatgtgagctt 21799808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 409
Target Start/End: Original strand, 19783544 - 19783935
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  19783544 ggtggtatcatcatatacatagctgggcaactaggagtgagtgaggaccaaggtataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacaccctta 19783643  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| |||||||||||| || |  || |  ||| |    ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||    
T  19783644 tctctatgaacttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgattttactttctaacctatctctgactaacac 19783743  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaag--------atgcaccaagaagag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| |||| || || ||||||  |||||||         ||||||||||||||    
T  19783744 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgcatgtagaacacgataatgaagacgaggaaggtgcacacttgcaccaagaagag 19783843  T
Q  303 gaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgaga 402  Q
    |||||||||| |||||||||||               ||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19783844 gaaggtgcacaattgcaccatg---------------accgtgatgccggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgaga 19783928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 371 - 570
Target Start/End: Original strand, 20236360 - 20236558
Alignment:
Q  371 aagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggc 470  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||    
T  20236360 aagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaaggggc 20236459  T
Q  471 aaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  20236460 aaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtgagctt 20236558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8949120 - 8948864
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagcta--ggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattac-caaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccc 107  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8949120 ggtggtatcatcacatacatagctataggcaattgggagtggatgaagaccaagggataaaacaagattgagggaaacaataagcttaacatagagaccc 8949021  T
Q  108 ttatctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaa 207  Q
    | |||| ||||||||||||||| |  ||||| | |||| | ||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  8949020 tcatctctatgaacttcattaaacctcgtccccacatggcatatacatttaaactcaatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaa 8948921  T
Q  208 caccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | | || |||||||||||    
T  8948920 caccgaggttgaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcgcaagtacatgaaga 8948864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 399 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 8948859 - 8948686
Alignment:
Q  399 gagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaa 498  Q
    ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||| || || |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  8948859 gagagaataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgagttatccggactacgaaatgatgtcctaagaggcaaccgcatatcaatagaaaataatcaaa 8948760  T
Q  499 tgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaa--aaatgtgagctt 570  Q
    ||||||   |||||||||| || || |||||||||| |||||| ||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  8948759 tgcttcataacatgatgcaacacttccacctccaagatcctccttatggacctcaatgaatcaaatgtgagctt 8948686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 174 - 264
Target Start/End: Original strand, 20236194 - 20236284
Alignment:
Q  174 ttttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||  |||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  20236194 ttttgtttctacttcctaacccatctcggactaaccccaaggtggagaaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 20236284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 570
Target Start/End: Original strand, 19766004 - 19766575
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgaggg---aaacaataggcttaacataaagacc 106  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||| ||||||||||||||| |||||    
T  19766004 gggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaacaaaattgagaagaaaaaaaataggcttaacatagagacc 19766103  T
Q  107 cttatctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtacta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  19766104 cttatctttatgaacttcattaagcctcgtccacccatgtcctacacactcaaactaaatgtgcctattttgattttactttctaacccatctcagacta 19766203  T
Q  207 acaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaaga--------tgcaccaaga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||        ||||||||||    
T  19766204 acaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaacacgatgatgaaggagaggaagatgcacatttgcaccaaga 19766303  T
Q  299 agaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggcc 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  19766304 agaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggagaaaccaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcaaacagaggtc 19766403  T
Q  399 gagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaa 498  Q
    |||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  19766404 gagaagataagcaccgagcaaaaaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaagggaaatcgcatatccgaagaaaataaccaaa 19766503  T
Q  499 tgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  19766504 tgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaagtcctccctatgaacctcaatgaaaaatgtgagctt 19766575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 89 - 570
Target Start/End: Original strand, 29333200 - 29333688
Alignment:
Q  89 aggcttaacataaagacccttatctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatacttt 188  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29333200 aggcttaacatagagacccttatctttatgaacttcattaagccccatccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatacttt 29333299  T
Q  189 ctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaaga 288  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||    
T  29333300 ctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatga-gaacacgatgatgaaggcgaggaaga 29333398  T
Q  289 tgca--------ccaagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggca 380  Q
    ||||        |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29333399 tgcacatttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaagagcaccatgaccatgatgcaggagaaaccaatgaaaatgcaagatgggca 29333498  T
Q  381 tggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatat 480  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29333499 tggatgcataccgaggtcgagaggataagcaccgagcaactaacgcaaagtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggaaaccgcatat 29333598  T
Q  481 ccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29333599 ccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatggtgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcgatgaaaaatgtgagctt 29333688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 20 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 21100504 - 21099949
Alignment:
Q  20 atcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagacccttatctttatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||    
T  21100504 atcacttacatagctaggcaatttggggttggtgaggaccaaggaattaaaaggattgagggaaacaataggcttaacatagatacccttgtctctatga 21100405  T
Q  120 acttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtgga 219  Q
    ||||||| || |  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21100404 acttcatcaaacctcgtccacccatgtcctatacactcaagctcaatgtgcctattctaattgcacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 21100305  T
Q  220 agaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcac-----caagaagaggaaggtgcacga 314  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| | |  |  | ||| |||||||     ||  | ||||||||||||| |    
T  21100304 agaaaatttgttgtatgttgatgatgacccacaggtacatgaagagcataatcaaggtgaagcggatgatgcacacttgcaccatgaggaaggtgcacaa 21100205  T
Q  315 ttgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcacca 414  Q
     |||||||  |||||||||||||| ||  ||||   |||| ||  ||| | |||| ||||||||||||||| || |  ||||  |||||||||| ||||     
T  21100204 atgcaccaaaatgaggagcaccatgaccctgatgtcggaggaatcaataacaatgaaagatgggcatggatacacaatgaggtagagaggataaacaccg 21100105  T
Q  415 agcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgat 514  Q
    |||||| |||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  21100104 agcaacaaaggcaaggtgtcggattatccggactaagaaatgatgtcctacggggcaaccgcatcaccgaagaaaataatcaaatgcttcggaatatgat 21100005  T
Q  515 gcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||| ||  | ||||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||    
T  21100004 gcaacacctacacctccaaggccctccctgcagacctcaatgacaaatgtgagctt 21099949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 293
Target Start/End: Original strand, 22289577 - 22289860
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22289577 gggtggtatcatcacctatatagctaggcaattgagagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagaccctt 22289676  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||| |||||||    
T  22289677 atctctatgaacttcattaatcatcgtccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctatctcatctcggactaaca 22289776  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcac 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||| || ||  ||||||| |||||    
T  22289777 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcacaggtacatgaagagcacaatgctggagaagaggaaggtgcac 22289860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 297 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 11348357 - 11348086
Alignment:
Q  297 gaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgagg 396  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||||| || |||| || |||| ||  ||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  11348357 gaagaggaaggtgcacacttgcaccaagaagaggatcaccatgaccatgaaaccggaggaaacaatgataatgaaagatggacatggatgcaaaccgagg 11348258  T
Q  397 ccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataacca 496  Q
      || |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348257 ttgaaaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgtcaaattatcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataacca 11348158  T
Q  497 aatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctat-agaactcaatgaaaaatgtgag 567  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11348157 aatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctataagaactcaatgcaaaatgtgag 11348086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 413
Target Start/End: Original strand, 22830439 - 22830823
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22830439 gggtggtatcatcacatatatagcaaggcaattgagagtgagtgagaaccaagggataaacaagattgagggaaacaataagcttaacatagagaccctt 22830538  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  22830539 atctctatgaacttcattaagcatcgtccacccatgacatatacactcaaactcaatgtgcatattttaattatacttcctaacccatctcggactaata 22830638  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcaccaagaagaggaaggtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||| ||                    ||||||||||||||    
T  22830639 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcacaggtacatgaagagcacaatgctg-------------------gagaagaggaaggtg 22830719  T
Q  310 cacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataag 409  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||  | || ||||  |||||||||||    
T  22830720 cacacttgcaccatgatgaggagcaccatgactatgatgccggaggaatcaatgaaaatgaaagatgggcatggataaacactgaggttgagaggataag 22830819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 295 - 570
Target Start/End: Original strand, 21826188 - 21826465
Alignment:
Q  295 aagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccga 394  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21826188 aagaagaggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatgcacgatgggcatggatgaataccga 21826287  T
Q  395 ggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataac 494  Q
    || ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  21826288 ggtcgaaaggataaccaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaacgatgtccaaaggggcaaccacatatccgaagaaaacaac 21826387  T
Q  495 caaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | |||||  ||||||||||||||    
T  21826388 caaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggaccccaatgataaaaatgtgagctt 21826465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21943130 - 21942877
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21943130 ggtggtatcatcacatacatagttaggcaattgggagtgggtgaagaccaatggattaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagaggccctta 21943031  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| |||||||||||| || |  || ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21943030 tctctatgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacacttaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacac 21942931  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||    
T  21942930 cgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggttcgcaggtacatgaaga 21942877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Original strand, 22368498 - 22368751
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  22368498 ggtggtatcatcacatacatagttaggcaattgagagtgggtgaagaccaagggattaacaagattgagggaaaaaataggcttaacatagaggccctta 22368597  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| ||||||||| || || |   | ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22368598 tctctatgaactttataaaaccttgaccacccatggcctatacacttaaactcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacac 22368697  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | | ||||||||||||||    
T  22368698 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatagttcgcaggtacatgaaga 22368751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11348621 - 11348368
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11348621 ggtggtatcatcacagacatagttaggcaattgggagtgggtgaagaccaatggattaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagaggccctta 11348522  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| | |||| ||||| || |  || ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11348521 tctctttgaaattcataaaacctcgaccacccatggcctatacacttaaactcaatgtgcctgttttaattatacttcctaacccatctcggactaacac 11348422  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | | ||||||||||||||    
T  11348421 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatagttcgcaggtacatgaaga 11348368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 22100965 - 22100762
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  22100965 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaa 22100866  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  22100865 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggtcctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 22100767  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  22100766 agctt 22100762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 296 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 21942864 - 21942590
Alignment:
Q  296 agaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgag 395  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||| || |||| || |||| ||  ||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  21942864 agaagaggaaggtgcacacttgcaccaagaggaggagcaccatgaccatgaaaccggaggaaacaatgataatgaaagatggacatggatgcaaaccgag 21942765  T
Q  396 gccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataacc 495  Q
    |  || |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |  || ||  | |||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||    
T  21942764 gttgaaaggataagcaccgagtaacaaaggcaaggtgttgaattatgagggctccgaaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatctaaatagaataacc 21942665  T
Q  496 aaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||    
T  21942664 aaatgcttcggaacatgatgcaacacttccacctccaaggtcccctctatggacctcaatgaaaaatgtgagctt 21942590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 16419940 - 16419737
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||   | |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  16419940 aatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaaggaatgatgtcctaa 16419841  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  16419840 gaggcaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 16419742  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  16419741 agctt 16419737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Original strand, 22098097 - 22098300
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||   | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  22098097 aatgaaagatgggcatggatgcaaatcgaggtacaaaggataagcactgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaa 22098196  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  22098197 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggtcctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 22098295  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  22098296 agctt 22098300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Original strand, 8313342 - 8313545
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||      
T  8313342 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatgtccttc 8313441  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  8313442 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccacatgcttcggaacatgatgcaacatttacaccttcagggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 8313540  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  8313541 agctt 8313545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Original strand, 21380967 - 21381170
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  21380967 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgtcgaattatctgggctaagaaatgatgtcctac 21381066  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  21381067 gaggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 21381165  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  21381166 agctt 21381170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Original strand, 21954953 - 21955156
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||   | |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  21954953 aatgaaagatgggcatggatccaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaa 21955052  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  21955053 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttaggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 21955151  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  21955152 agctt 21955156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 22034870 - 22034667
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||   | || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  22034870 aatgaaagattggcatggatgcaaaccgaggtacaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaa 22034771  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||    
T  22034770 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataatcaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaagttcctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 22034672  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  22034671 agctt 22034667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 8324191 - 8323988
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  8324191 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatgtcctac 8324092  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || || ||||| || || ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  8324091 gaggcaaccgcatatccgaagaaaataaccgaatgcttcggaacatgatgcaacacttacaccttcagggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 8323993  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  8323992 agctt 8323988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 297 - 570
Target Start/End: Original strand, 22368762 - 22369035
Alignment:
Q  297 gaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgagg 396  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||||| || |||| || | || ||  ||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  22368762 gaagaggaaggtgcacacttgcaccaagaagaggatcaccatgaccatgaaaccgtaggaaacaatgataatgaaagatggacatggatgcaaaccgagg 22368861  T
Q  397 ccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataacca 496  Q
      || |||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||| |  || ||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22368862 ttgaaaggatatgcaccgagtaacaaaggcaaggtgttgaattatgagggctccgaaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccaaagagaataacca 22368961  T
Q  497 aatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||| |||| |||||||||| || || |||||||| ||||| | |||| || || | ||||||||||||||||    
T  22368962 aatgcatcggaacatgatgcaacacttccacctccagggtcccctctatggaccttagtgaaaaatgtgagctt 22369035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 360 - 570
Target Start/End: Original strand, 22289893 - 22290101
Alignment:
Q  360 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatg 459  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| || || ||||| |||||||    
T  22289893 aatgaaaatgaaagatgggcatgaatgcaaactgaggttgagaggataagcaccgagcaacaaaggcaagatgttgaattatccgggctaagaaatgatg 22289992  T
Q  460 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 559  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||||| || ||| || ||||||| |     
T  22289993 tcct-aggggcaaccgcatatccgaagagcataatcaaatgcttcggaacatggtgcaacacttccacctccaaggtcccccttatggacctcaatg-at 22290090  T
Q  560 aatgtgagctt 570  Q
    |||||||||||    
T  22290091 aatgtgagctt 22290101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 255
Target Start/End: Original strand, 21825923 - 21826167
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| || || |||||||||||||  || || ||| |||| || |||||||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||    
T  21825923 ggtggtatcataacatacatagctaggcggttcggcgtgagtgaagatcaagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaaccctta 21826022  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| |||||| ||||| ||   |||    ||| |    ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||| || |  ||||||||||||| ||||||||    
T  21826023 tctctatgaatttcataaaaacccgaatcccctttgtttatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacac 21826122  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggt 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  21826123 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggt 21826167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22035179 - 22034941
Alignment:
Q  26 tacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagacccttatctttatgaacttca 125  Q
    |||||||||||| | || || ||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |   |||||| ||||    
T  22035179 tacatagctaggaagttaggcgtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagaaacccttgttgctatgaatttca 22035080  T
Q  126 ttaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaa 225  Q
    |||||   |  ||||||||| | || |||||  | ||     | ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22035079 ttaagattcacccacccatgacttatgcacttcagctttgcatacctcttttgtttctacttcctaacccatctcgtactaaccccgaggtggaggaaaa 22034980  T
Q  226 tttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    |||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  22034979 tttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 22034941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 408 - 557
Target Start/End: Original strand, 22831958 - 22832107
Alignment:
Q  408 agcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggc 507  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||  |  | ||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||||| |||||      
T  22831958 agcaccgagcaacaaaggcaagatgttgaattacccaggctaagaaatgatgtcctaaggggcaaccacatcttcgaagagaataatcaaatacttcgaa 22832057  T
Q  508 acatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatga 557  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  22832058 acatgatgcaacacttccacctccaaggtcctccttatggacctcaatga 22832107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Original strand, 21267876 - 21268042
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| || || | ||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||| |    ||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||    
T  21267876 ggtggtatcattaccttcattgctaggaagtttggagtgggtgaggacaaagggataaatccaattgagggcaacaataggcttaacattgaaaccctta 21267975  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctatttt 177  Q
    | | |||||| ||||||||||| | |||||||||| | || ||||| |||||||| |||||| ||||    
T  21267976 tttctatgaatttcattaagcatcatccacccatgacttatgcacttaaactcaacgtgcctctttt 21268042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22101126 - 22101036
Alignment:
Q  174 ttttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  22101126 ttttgtttatacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 22101036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 264
Target Start/End: Original strand, 21954792 - 21954882
Alignment:
Q  174 ttttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  21954792 ttttgtttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 21954882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Original strand, 8313190 - 8313271
Alignment:
Q  183 tactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  8313190 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 8313271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8324343 - 8324262
Alignment:
Q  183 tactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  8324343 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 8324262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 245
Target Start/End: Original strand, 17132521 - 17132583
Alignment:
Q  183 tactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatg 245  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  17132521 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatg 17132583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Original strand, 21380815 - 21380896
Alignment:
Q  183 tactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  21380815 tacttcctaacccttctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 21380896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 264
Target Start/End: Original strand, 22097951 - 22098026
Alignment:
Q  189 ctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  22097951 ctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggagaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 22098026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16420086 - 16420030
Alignment:
Q  189 ctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatg 245  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  16420086 ctaacccatcttggactaacaccgaggtggaggcgaatttgttgtatgttggtgatg 16420030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 570
Target Start/End: Original strand, 681 - 1218
Alignment:
Q  14 ggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagacccttatct 113  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  ||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  681 ggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaacaacattgaggaaattaataggcataacatagagacacttatct 780  T
Q  114 ttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccga 213  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  781 ttatgaacttcattaggccccgtccacccatgtcctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccga 880  T
Q  214 ggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcaccaagaagaggaaggtgcacg 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||                   |||||||||||||||     
T  881 ggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatga-gaacacgatgatgaag-------------------aagaggaaggtgcaca 960  T
Q  314 attgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaa-gatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcac 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  961 attgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggagaaaccaataaaaatgcaaagatgggcatggatgcataccgaggtcgggaggataagcat 1060  T
Q  413 caagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatg 512  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  1061 cgagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaataaaataaccaaatacttcggaacatg 1160  T
Q  513 atgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1161 atgcaccattttcacctccaaggtcctccttatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 24821783 - 24821239
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  24821783 gggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaacaaaattgagggaaacaataggcttaa-----agaccctt 24821689  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24821688 atctctatgaacttcattaagcctcgtccacccatgttctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattgtacttcctaacccatctcggactaaca 24821589  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaag--------atgcaccaagaaga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||         |||||||||||||    
T  24821588 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccataggtacatgaagaacacgatgatgaaggcgaggaaggtgcacacttgcaccaagaaga 24821489  T
Q  302 ggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgag 401  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||| ||||||||||||||||                   || ||||    
T  24821488 ggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggagaaaccaatgaaaatgcaagat-------------------ggtcgag 24821408  T
Q  402 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaag-aaaataaccaaatg 500  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24821407 aggataagcaccgagcatcaaaggcaaggtgttgaattatcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaaataaccaaatg 24821308  T
Q  501 cttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagct 569  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  24821307 cttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaatgtgagct 24821239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 297 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 17867459 - 17867185
Alignment:
Q  297 gaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgagg 396  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||||| || |||| ||||||| || |||||| |||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  17867459 gaagaggaaggtgcacacttgcaccaagaagaggatcaccatgaccatgaaactggaggaaaaaatgataatgaaagatggacatggatgcgaaccgagg 17867360  T
Q  397 ccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataacca 496  Q
      || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17867359 ttgaaaggataagcaccgagcaactaaggctaggtgttgaattatcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatacccgaagaaaataacca 17867260  T
Q  497 aatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctat-agaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17867259 aatgcttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctataagaactcaatgaaaaatgtgagctt 17867185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 25372640 - 25372134
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| || || | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25372640 ggtggtatcattaccttcatagctgggcaattgagagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggtttaacatatagaccctta 25372541  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25372540 tctctatgaacttcattaagcatcgtccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacac 25372441  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcaccaagaagaggaaggtgc 310  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| | | ||||||||||||||||  |||||| ||                    |||||||||||||||    
T  25372440 cgaggtggaagaaaatttgatatatgttggtgaaggttcacaggtacatgaagagcacaatgttg-------------------gagaagaggaaggtgc 25372360  T
Q  311 acgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagc 410  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||| || ||||| | |||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| ||                     |    
T  25372359 acacttgcaccatgatgaggagcaacatgaccatgatgccggaggaaacaatgaaaatgaaagatgggcatggataca---------------------c 25372281  T
Q  411 accaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcaca 510  Q
    ||| |||||| |||||||||| ||||||| || || ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||    
T  25372280 accgagcaacaaaggcaaggtattgaattatccgggctacgaaatgatgtccttaggggaaaccgcatctccgaagagaataatcaaatgcttcggagca 25372181  T
Q  511 tgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatga 557  Q
    ||||||| || || ||||||||||||| ||| ||| || ||||||||    
T  25372180 tgatgcaacacttccacctccaaggtcatccttatggacctcaatga 25372134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 51 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 23161038 - 23160509
Alignment:
Q  51 gtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagacccttatctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtccta 150  Q
    |||| ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||| |||||| ||||| || | |||    ||| |    ||    
T  23161038 gtgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactcaacatagatacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatcccctttgttta 23160939  T
Q  151 cgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatcca 250  Q
      ||||||| ||||||||||| | ||||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  23160938 tacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttcatgatgaccca 23160839  T
Q  251 caggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcac--------caagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataaca 342  Q
    ||||| ||   |||  |  || ||||||  |  |||| |||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  23160838 caggtgcacatagaccaacatcatgaagaagcagaaggtgcacacttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatgacc 23160739  T
Q  343 atgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtc 442  Q
     ||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |       
T  23160738 ctgatgaaggtgacacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagtaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactaat 23160639  T
Q  443 gggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccc 542  Q
    |||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  23160638 gggcataaggaacgatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaacaaccaaatgcttcagaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctcca 23160539  T
Q  543 tatagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    ||| || | |||||  ||||||||||||||    
T  23160538 tatggaccccaatgataaaaatgtgagctt 23160509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 51 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 23572295 - 23571766
Alignment:
Q  51 gtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagacccttatctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtccta 150  Q
    |||| ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||| |||||| ||||| || | |||    ||| |    ||    
T  23572295 gtgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactcaacatagatacccttatctctatgaatttcataaaaccccgaatcccctttgttta 23572196  T
Q  151 cgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatcca 250  Q
      ||||||| ||||||||||| | ||||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  23572195 tacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttcatgatgaccca 23572096  T
Q  251 caggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcac--------caagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataaca 342  Q
    ||||| ||   |||  |  || ||||||  |  |||| |||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  23572095 caggtgcacatagaccaacatcatgaagaagcagaaggtgcacacttgcaccaagaagaggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatgacc 23571996  T
Q  343 atgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtc 442  Q
     ||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |       
T  23571995 ctgatgaaggtgacacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagtaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactaat 23571896  T
Q  443 gggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccc 542  Q
    |||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  23571895 gggcataaggaacgatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaacaaccaaatgcttcagaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctcca 23571796  T
Q  543 tatagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    ||| || | |||||  ||||||||||||||    
T  23571795 tatggaccccaatgataaaaatgtgagctt 23571766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 295 - 570
Target Start/End: Original strand, 116308 - 116584
Alignment:
Q  295 aagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccga 394  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||| || || || ||   | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  116308 aagaagagaaaggtgcacaattgcaccatgaggaagagcac-atgaccataatgaagaagaaacaaatgaaaatgcgagatgggcatggatgcataccga 116406  T
Q  395 ggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataac 494  Q
    || |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116407 ggtcgagaggataagcatcgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggactaaggaatgatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataac 116506  T
Q  495 caaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  116507 caaatgtttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgataaaaatgtgagctt 116584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 570
Target Start/End: Original strand, 27630018 - 27630587
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |  || || ||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||    
T  27630018 ggtggtatcataacatacatagctagacggttaggcgtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactcaacatagaaaccctta 27630117  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| |||||| ||||| || | |||    ||| |    ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||| || |  ||||||||||||| ||||||||    
T  27630118 tctctatgaatttcataaaaccccgaatcccctttgtttatacactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaacccatctcggactaacac 27630217  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcac--------caagaagag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || ||   |||  |  || ||||||  |  |||| |||||        |||||||||    
T  27630218 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttcatgatgacccacaagtgcacatagaccaacatcatgaagaagcagaaggtgcacacttgcaccaagaagag 27630317  T
Q  303 gaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgaga 402  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||   || || ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |    
T  27630318 gaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatgaccctgatgaaggtgacacacatgaaaatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaa 27630417  T
Q  403 ggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgct 502  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |   |||  |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27630418 gaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactaatgggcataaggaacaatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaacaaccaaatgct 27630517  T
Q  503 tcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | |||||  ||||||||||||||    
T  27630518 tcggaaaatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggaccccaatgataaaaatgtgagctt 27630587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 153 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 24796856 - 24796429
Alignment:
Q  153 cactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccaca 252  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  24796856 cactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgatgatgacccgca 24796757  T
Q  253 ggt--acat-gaagaaaacaatgatgaaggtgaggaaga-----tgcaccaagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaat 344  Q
    |||  |||| ||| |  | ||||| |||   ||||| |      |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||  |    
T  24796756 ggtgcacatagaacagcataatgaagaaacagaggatgcacacttgcatcaagaagaggaaggtgctcaactgcaccatgatgaggaacaccatgaccct 24796657  T
Q  345 gatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgg 444  Q
     ||   || |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||| |||| |||||| |||||||||||||||| |   |     
T  24796656 aatgaaggtgaaacaaatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataaacaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatga 24796557  T
Q  445 gactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctcccta 544  Q
    |  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  24796556 gcataaggcatgatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccata 24796457  T
Q  545 tagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    | || |||||||  ||||||||||||||    
T  24796456 tggacctcaatgataaaaatgtgagctt 24796429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 153 - 570
Target Start/End: Original strand, 16774310 - 16774737
Alignment:
Q  153 cactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccaca 252  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16774310 cactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgatgatgacccaca 16774409  T
Q  253 ggt--acat-gaagaaaacaatgatgaaggtgaggaaga-----tgcaccaagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaat 344  Q
    |||  |||| ||| |  | ||||| |||   ||||  |      |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||  |    
T  16774410 ggtgcacatagaacagcataatgaagaaacagagggtgcacacttgcatcaagaagaggaaggtgctcaactgcaccatgatgaggaacaccatgaccct 16774509  T
Q  345 gatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgg 444  Q
     ||   || |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |   |     
T  16774510 aatgaaggtgaaacaaatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatga 16774609  T
Q  445 gactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctcccta 544  Q
    |  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16774610 gcataagacacgatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgattcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccata 16774709  T
Q  545 tagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    | || |||||||  ||||||||||||||    
T  16774710 tggacctcaatgataaaaatgtgagctt 16774737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 22046000 - 22045797
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  22046000 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaa 22045901  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  22045900 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 22045802  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  22045801 agctt 22045797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Original strand, 25356386 - 25356589
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  25356386 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaa 25356485  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  25356486 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 25356584  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  25356585 agctt 25356589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Original strand, 27626468 - 27626671
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||      
T  27626468 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatgtccttc 27626567  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||| || || ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  27626568 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttacaccttcagggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 27626666  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  27626667 agctt 27626671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 388 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 27770119 - 27769966
Alignment:
Q  388 ataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaaga 487  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27770119 ataccgaggtcgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaatgatgtccaacggggcaaccgcatatccgaaga 27770020  T
Q  488 aaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctcc 541  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27770019 aaacaaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctcc 27769966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 12954 - 12751
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | || ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| || || ||||  |||||||||||||    
T  12954 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaagaataagcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaattatccgggctaataaatgatgtcctaa 12855  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  12854 ggggcaaccgcatatccaaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaacctccaaggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 12756  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  12755 agctt 12751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 360 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 26192968 - 26192758
Alignment:
Q  360 aatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatg 459  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||  || |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |  || ||  | |||||||    
T  26192968 aatgataatgaaagatggacatggatgcaaaccgaggttgaaaggataagcaccgagtaacaaaggcaaggtgttgaattatgagggctccgaaatgatg 26192869  T
Q  460 tcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa 559  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||| ||||| | |||| || ||||||||||    
T  26192868 tcctaaggggcaaccacatatccaaagagaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttccacctccagggtcccctctatggacctcaatgaaa 26192769  T
Q  560 aatgtgagctt 570  Q
    |||||||||||    
T  26192768 aatgtgagctt 26192758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 325 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 25369002 - 25368757
Alignment:
Q  325 atgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaag 424  Q
    |||||||||||||| || |||| || |||| ||    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||| |||||| |||    
T  25369002 atgaggagcaccatgaccatgacaccggagcaaactttgaaaatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggttcagaggataagcaccgagcaacaaag 25368903  T
Q  425 gcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccatttt 524  Q
    ||||| ||||||| | |  || | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| ||| |     
T  25368902 gcaagatgttgaaatattcgggcaaagaaatgatgtcctaagggccaaccgcatatccgaagagaataatcaaatgcttcagaacatgatgcaacatctc 25368803  T
Q  525 cacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
     |||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||    
T  25368802 aacctccaaggtcctccttatggacctcaatgaataatgtgagctt 25368757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 25146131 - 25145927
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |  ||||   | ||||| |||||| ||||||  ||||||| ||| ||||| ||  |  |||| || || ||||||     
T  25146131 aatgaaagatgggcatggatgcaaaatgaggtacaaaggattagcaccgagcaacagaggcaagttgtcgaattatccagtttaagaaacgaagtcctac 25146032  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25146031 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccacttccacctccaaggtcctccctatcgacctcaatgaaaaatgtg 25145932  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  25145931 agctt 25145927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 46 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25369214 - 25368999
Alignment:
Q  46 agtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagacccttatctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatg 145  Q
    ||||||||||||| ||||||| |    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || |  ||||||||||||||||  | ||| ||||||    
T  25369214 agtgggtgaggacgaagggataaattcaattgagggcaacaataggcttaacatagggaccctcatttccatgaacttcattaagcgtcatccgcccatg 25369115  T
Q  146 tcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatg 245  Q
     | || |||||||| |||||||||  | | ||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  25369114 gcttatgcactcaagctcaatgtgattctattatttatgcttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagacaatttgttgtatgttggtgata 25369015  T
Q  246 atccacaggtacatga 261  Q
     |||||||||||||||    
T  25369014 ttccacaggtacatga 25368999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Original strand, 24169890 - 24170143
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| || || | ||| |||||| | || ||||||||||| ||| | ||||| ||   ||||||||||| ||||||||| |||||  | ||||| |    
T  24169890 ggtggtatcattaccttcattgctaggaagtttggagtgggtgaagacgaggggataactccaattgagggaatcaataggctaaacattgaaaccctca 24169989  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    | | |||||| |||||||| |  | |||||||||| | || |||||  |||| || || ||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24169990 tttctatgaatttcattaaacttcatccacccatgacttatgcacttcaacttaacgtacctattttgtttctacttcctaacccatctcggactaacac 24170089  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  24170090 cgaggtggaagcaaattttttgtatgttggtgatggttcacaggtacatgaaga 24170143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 366 - 567
Target Start/End: Original strand, 24170208 - 24170409
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||   | ||||| |||||  |||||| |||||||||||| ||| | || || ||||| || |||||||||     
T  24170208 aatggaagatggtcatggatgcaaactgaggtacaaaggattagcactgagcaacaaaggcaaggtgtcgaactatccgggctaagaaacgatgtcctac 24170307  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24170308 ggggcaaccacatatccgaagtgaataatcaaatgcttcggaacatgatacaccatctcaacctccacggtcctccctatggacctcaatgaaaaatgtg 24170407  T
Q  566 ag 567  Q
    ||    
T  24170408 ag 24170409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 166 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17867568 - 17867470
Alignment:
Q  166 tgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | | || |||||||||||    
T  17867568 tgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatagttcgcaagtacatgaaga 17867470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 255
Target Start/End: Original strand, 116185 - 116287
Alignment:
Q  153 cactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccaca 252  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||| || |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  116185 cactcaagctcaatgtgcccactttgattttattgcctaactcatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccaca 116284  T
Q  253 ggt 255  Q
    |||    
T  116285 ggt 116287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13106 - 13025
Alignment:
Q  183 tactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  13106 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 13025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22046152 - 22046071
Alignment:
Q  183 tactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  22046152 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 22046071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Original strand, 25356234 - 25356315
Alignment:
Q  183 tactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  25356234 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 25356315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Original strand, 27626316 - 27626397
Alignment:
Q  183 tactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  27626316 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 27626397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 116043 - 116158
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| || || |||||||||||||  || || ||| |||| || |||||||| | ||| || ||||| |||||||| || |||||| | |||||||    
T  116043 ggtggtatcataacatacatagctaggcggttaggcgtgagtgaagatcaagggataaacaagatcgagggtaacaatagactaaacatagaaaccctta 116142  T
Q  111 tctttatgaacttcat 126  Q
    ||| |||||| |||||    
T  116143 tctctatgaatttcat 116158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 66
Target Start/End: Original strand, 22870277 - 22870332
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggat 66  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  22870277 ggtggtatcatcacatacatagctgggcaactaggagtgagtgaggaccaagggat 22870332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 25339403 - 25339253
Alignment:
Q  405 ataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttc 504  Q
    ||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||   || ||  |||||||||||| ||||||||| |||||  | || ||||| |||||||||||      
T  25339403 ataagcaccgagcaacaaatacaaggtgttgaaatggacgggctgcggaatgatgtccaaaggggcaatcgcatgactgaggaaaacaaccaaatgctct 25339304  T
Q  505 ggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaat 555  Q
    || |||||||||| ||  |||| || |||||||| || ||| || ||||||    
T  25339303 ggaacatgatgcaacaccttcatctgcaaggtcccccttatggacctcaat 25339253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 19945 - 19405
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |    
T  19945 gggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaacaaaattgagggaaacaataggcttaacat---------t 19855  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19854 atctctatgaacttcattaagcctcgtccacccatgttctacacactcaaactcaatgtgcctattttgattgtactttctaacccatctcggactaaca 19755  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaag--------atgcaccaagaaga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||         |||||||||||||    
T  19754 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccataggtacatgaagaacacgatgatgaaggcgaggaaggtgcacacttgcaccaagaaga 19655  T
Q  302 ggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgag 401  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||| ||||||||||||||||                   || ||||    
T  19654 ggaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggagaaaccaatgaaaatgcaagat-------------------ggtcgag 19574  T
Q  402 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaag-aaaataaccaaatg 500  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19573 aggataagcaccgagcatcaaaggcaaggtgttgaattatcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaaataaccaaatg 19474  T
Q  501 cttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagct 569  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  19473 cttcggaacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaatgtgagct 19405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 21562153 - 21561595
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||    
T  21562153 ggtggtatcatcacatacatagctgggcaactaggagtgagtgaggaccaaggaataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacgccctta 21562054  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    | | |||||||||||| || |   | |  ||| |    ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  21562053 tttctatgaacttcataaaaccttgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgattttacttcctaacccatttcggactaacac 21561954  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcac--------caagaagag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | || |||| |||  || |||||||||  ||||||| |||||        |||||||||    
T  21561953 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccaaatgtgcatgtagaccacgatgatgaagacgaggaaggtgcacacttgcaccaagaagag 21561854  T
Q  303 gaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgaga 402  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21561853 gaaggtgcacaattgcaccatgatgaggagcatcatgaccgtgatgccggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatatcgaggtcgaga 21561754  T
Q  403 ggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgct 502  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21561753 ggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgtcaggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgct 21561654  T
Q  503 tcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaa 561  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  21561653 tcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatggaaaa 21561595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 289 - 561
Target Start/End: Original strand, 11218406 - 11218678
Alignment:
Q  289 tgcaccaagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgca 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  11218406 tgcaccaagaagaggaaggtgcacaactgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggagaaacaaatgaaaatgtaatatgggcatggatgca 11218505  T
Q  389 taccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaa 488  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11218506 tactgaggtcgagaggataagcacctagtaactaatgtaaggtgttgaattgtctggactaaggaatgatgtcctaagtggcaaccgcatatccgaagaa 11218605  T
Q  489 aataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaa 561  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  11218606 aataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaa 11218678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Original strand, 18446746 - 18446999
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18446746 ggtggtatcatcacataaatagctaggaaattgggagtgggtgaagaccaagggatcaacaagattgaggtaaacaataggcttaacatagagaccctta 18446845  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| |||||||||||| || |  || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18446846 tctctatgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacactcaaactcaatgtgcctgttttcattatacttcctaacccatctcgaactaacac 18446945  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||    
T  18446946 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcgcaggtacatgaaga 18446999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 153 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 22167116 - 22166689
Alignment:
Q  153 cactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccaca 252  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22167116 cactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgatgatgacccaca 22167017  T
Q  253 ggt--acat-gaagaaaacaatgatgaaggtgaggaaga-----tgcaccaagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaat 344  Q
    |||  |||| ||| |  | ||||| |||   ||||  |      |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||  |    
T  22167016 ggtgcacatagaacagcataatgaagaaacagagggtgcacacttgcatcaagaagaggaaggtgctcaactgcaccatgatgaggaacaccatgaccct 22166917  T
Q  345 gatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgg 444  Q
     ||   || |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |   |     
T  22166916 aatgaaggtgaaacaaatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatga 22166817  T
Q  445 gactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctcccta 544  Q
    |  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  22166816 gcataagacacgatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccata 22166717  T
Q  545 tagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    | || |||||||  ||||||||||||||    
T  22166716 tggacctcaatgataaaaatgtgagctt 22166689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 153 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 20017801 - 20017374
Alignment:
Q  153 cactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccaca 252  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20017801 cactccaactcaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgatgatgacccaca 20017702  T
Q  253 ggt--acat-gaagaaaacaatgatgaaggtgaggaaga-----tgcaccaagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaat 344  Q
    |||  |||| ||| |  | ||||| |||   ||||  |      |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||  |    
T  20017701 ggtgcacatagaacagcataatgaagaaacagagggtgcacacttgcatcaagaagaggaaggtgctcaactgcaccatgatgaggaacaccatgaccct 20017602  T
Q  345 gatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgg 444  Q
     ||   || |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |   |     
T  20017601 aatgaaggtgaaacaaatgaagatgcaagatgggcatggatgactaccgaggtcgaaagaataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatga 20017502  T
Q  445 gactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctcccta 544  Q
    |  ||||  | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20017501 gcataagacacgatgtccaaaggggcaactgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccata 20017402  T
Q  545 tagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    | || |||||||  ||||||||||||||    
T  20017401 tggacctcaatgataaaaatgtgagctt 20017374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 541
Target Start/End: Original strand, 20168744 - 20169282
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||| ||| || ||| |||| |||| |||||| | |||||| ||||| |||||||| || |||||| | || || |    
T  20168744 ggtggtatcatcacatacatagctgggcgattcggtgtgagtgaagacctagggataaacaaaatcgagggtaacaatagactaaacatagaaactctca 20168843  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccg--tccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaac 208  Q
    ||| |||||| ||||| ||    ||  ||| || ||||| || |||||| |||| |||||||| || |||||| || |  |||||||| |||| ||||||    
T  20168844 tctctatgaatttcataaaaactcgagtcc-cctatgtc-tatgcactccaactaaatgtgcccatcttgattttattgcctaacccacctcgaactaac 20168941  T
Q  209 accgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaac---aatgatgaaggtgaggaaga-----tgcaccaagaag 300  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||   |||| |    ||||| |||   ||||| |      |||| |||||||    
T  20168942 accgaggtggaagcaaatttgttgtacgttgctgatgacccacaggtgcacatagaacagcctaatgaagaaacagaggatgcacacttgcatcaagaag 20169041  T
Q  301 aggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataac---aatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggc 397  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||| ||   ||||| | ||   ||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||     
T  20169042 aggaaggtgcacaaatgcaccatgatgaggaataccatgaccctaatgaaaatg---aaacaaatgaagatgcgagatgggcatggatgactaccgaggt 20169138  T
Q  398 cgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaa 497  Q
     || || |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |   | |  ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20169139 tgaaagaataaacaccaagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatgagcataaggcatgacgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaa 20169238  T
Q  498 atgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctcc 541  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20169239 atgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctcc 20169282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 189 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 22768655 - 22768279
Alignment:
Q  189 ctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggt--acatgaagaaa-acaatgatgaaggtgagga 285  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||  || |  | ||||| |||   |||||    
T  22768655 ctaacccatctcgaactaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtatgttgaagatgacccacaggtgcacatagagcagcataatgaagaaacagagga 22768556  T
Q  286 aga-----tgcaccaagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggca 380  Q
     |      |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||| ||  | ||   |  |||||||||||| |||| ||||||| |    
T  22768555 tgcacacttgcatcaagaagaggaaggtgcacaactgcaccatgatgaggaataccatgaccctaatgaagatgaaacaaatgaagatgcgagatgggaa 22768456  T
Q  381 tggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatat 480  Q
    ||||||  ||||||||  || || |||| |||| |||||| |||||||||||||||| |   | |  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22768455 tggatgactaccgaggttgaaagaataaacaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactcatgagcataaggcatgatgtccaaaggggcaaccgcatat 22768356  T
Q  481 ccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatga 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  22768355 ccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatga 22768279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Original strand, 18010720 - 18010924
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |  ||||   | |||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||| || ||  |||| || |||||||||     
T  18010720 aatgaaagatgggcatggatgcaaaatgaggtacaaaggataagcaccgagcaacagaggcaaggtgtcgaattatccggtttaagaaacgatgtcctac 18010819  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18010820 ggggcaaccgcatatccgaacaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaatgtg 18010919  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  18010920 agctt 18010924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 24856584 - 24856381
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||      
T  24856584 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatgtccttc 24856485  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||| || || ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  24856484 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttacaccttcagggccctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 24856386  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  24856385 agctt 24856381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 296 - 570
Target Start/End: Original strand, 18447012 - 18447285
Alignment:
Q  296 agaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgag 395  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||| || |||| || | || ||  ||||| |||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  18447012 agaagaggaaggtgcacacttgcaccaagaggaggagcaccatgaccatgaaaccgaaggaaacaatgataatgaaagatggacatggatacaaaccgag 18447111  T
Q  396 gccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataacc 495  Q
    |  || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||  | ||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18447112 gttgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatcagggctccgaaatgattccctaaggggcaacc-catatccgaagagaataacc 18447210  T
Q  496 aaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| |  ||| || || ||||||||||||||||||    
T  18447211 aaatgcttcggaacatgatgcaacacttccacctccaaggtcccctttatggaccttaatgaaaaatgtgagctt 18447285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 361 - 570
Target Start/End: Original strand, 25966513 - 25966721
Alignment:
Q  361 atgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgt 460  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  25966513 atgataatgaaagatgagcatggatgcaaactgaagttgagaggataagcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatgt 25966612  T
Q  461 cctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaa 560  Q
    | |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||  ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| | |    
T  25966613 cataagaggcaaccgcatgaccgaagaaaataaccaaatgcttcagaacatgatggagcaaattcacctccaaggtcctccttatggacctcaatg-ata 25966711  T
Q  561 atgtgagctt 570  Q
    ||||||||||    
T  25966712 atgtgagctt 25966721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 399 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 30673053 - 30672884
Alignment:
Q  399 gagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaa 498  Q
    ||||||||||| | | |||||| |||| ||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||| ||||    
T  30673053 gagaggataagaatcgagcaacaaaggaaaggtgttgaattatccgggctaggaaatgatgtcctaagaggcaaccacatatccgaagtgaataatcaaa 30672954  T
Q  499 tgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    || ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||| | |||||||||||    
T  30672953 tgtttcggaacatgatgca-catttccacctccaaggtcctccttatgggcctcaatg-ataatgtgagctt 30672884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 245
Target Start/End: Original strand, 18010460 - 18010632
Alignment:
Q  73 aattgagggaaacaataggcttaacataaagacccttatctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcct 172  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||  | ||||| || | |||||| ||||| || |  | |||||||||| | || |||||| |||| ||| | |||    
T  18010460 aattgagggaaacaacatgctaaacattgaaaccctcatttctatgaatttcatcaaacttcatccacccatgacttatgcactccaacttaatatacct 18010559  T
Q  173 attttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatg 245  Q
    |||||  || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18010560 attttctttctacttcctaacccatctcggactaacaccaaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatg 18010632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8725502 - 8725412
Alignment:
Q  174 ttttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  8725502 ttttgtttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 8725412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24856736 - 24856655
Alignment:
Q  183 tactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  24856736 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 24856655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 23519069 - 23518889
Alignment:
Q  375 tgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaacc 474  Q
    |||||||||||||| ||||| |   | || ||||||||| || ||| ||| |||||||||||| | ||  | ||||| |||||||||| |||| |||| |    
T  23519069 tgggcatggatgcaaaccgaagttcaaagaataagcaccgagtaacaaagacaaggtgttgaaatctccaggctaagaaatgatgtccaaaggagcaatc 23518970  T
Q  475 gcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaat 555  Q
     |||  |||||||||||||  |||| || ||| |||||||||| ||  ||||||| |||||||| || ||| || ||||||    
T  23518969 acatgaccgaagaaaataataaaattctccggaacatgatgcaacaacttcacctacaaggtccaccttatggacctcaat 23518889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 3744 - 3191
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  3744 ggtggtatcatcacatacatagctgggcaactaggagtgagtgaggaccaaggaataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacaccctta 3645  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| |||||||||||| || |  || |  ||| |    ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  3644 tctctatgaacttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgattttacttcctaacccatctcggactaacac 3545  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcac--------caagaagag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| |||| || || ||||||  ||||||| |||||        |||||||||    
T  3544 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgcatgtagaacacgataatgaagacgaggaaggtgcacacttgcaccaagaagag 3445  T
Q  303 gaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgaga 402  Q
    |||||||||| ||||||||||||               |  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3444 gaaggtgcacaattgcaccatga---------------ccgtgatgccggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgaga 3360  T
Q  403 ggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgct 502  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3359 ggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgacgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgct 3260  T
Q  503 tcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatga-aaaatgtgagctt 570  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  3259 tcggaacatgatgcaccactttcaccttcaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaaatgtgagctt 3191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 19651 - 19109
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| || |||| |||||  || ||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||    
T  19651 ggtggtatcatcacatacatagctgggtaattaggagttagttaggaccaagggataaacaagattgagggtaacaataggctaaacatagataccctta 19552  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| |||||| ||||| || |  || |  ||| |    ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19551 tctctatgaatttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgattttacttcctaacccatctcggactaacac 19452  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcaccaagaagaggaaggtgc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||| || ||||||||||   ||||||                ||||||    
T  19451 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgatgatgacccacaaatacatgaagaacacgatgatgaagg---ggaaga----------------aggtgc 19371  T
Q  311 acgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagc 410  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19370 acaattgcaccatgatgaggagcatcattaccgtgatgccggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatgccgaggtcgagaggataagc 19271  T
Q  411 accaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcaca 510  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19270 accgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaagaaatgatgtcctaagcggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaaca 19171  T
Q  511 tgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaa--aatgtgagctt 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||    
T  19170 tgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaacaatgtgagctt 19109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 253485 - 253244
Alignment:
Q  12 gtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagac------ 105  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||          
T  253485 gtggtatcatcacatacatagctaggaaattgggagtgggtgaggacctagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagacaaggtg 253386  T
Q  106 cct--------tatctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccat 197  Q
    |||        | ||| |||||||||||| || |  || || ||| ||   ||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  253385 cctgtggaaactgtctctatgaacttcataaaacctcgaccccccttggattatacactcaaactcaacgtgcctgttttgattatacttcctaacccat 253286  T
Q  198 ctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 239  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  253285 ctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 253244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 402 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 253189 - 253021
Alignment:
Q  402 aggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgc 501  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | || ||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||     
T  253189 aggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaactatccggactcataaatgatgtcctaaagggcaaccacatcaccgaagagaataatcaaatgt 253090  T
Q  502 ttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||| |||||||||| ||  |  ||||||| ||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||    
T  253089 ttcggaacatgatgcaacacctcaacctccacggtcctcactatggacctcaacgaaaaatgtgagctt 253021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 10 - 338
Target Start/End: Original strand, 23868 - 24203
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  23868 gggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaattaataggcttaacatagagaccctt 23967  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23968 atctttatgaacttcattaggccccgtccacccatgtcttacacactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcggactaaca 24067  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaaga-------tgcaccaagaagag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||       |||||||||||| |    
T  24068 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaacacgatgatgaaggcgaggaagatgcacattgcaccaagaaggg 24167  T
Q  303 gaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccat 338  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24168 gaaggtgcacaattgcaccatgctgaggagcaccat 24203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 26080 - 25532
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  26080 ggtggtatcatcacatacatagctgggcaattaggagtg----aggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagaaaccctta 25985  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| |||||||||||| || |  || |  ||| |    ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  25984 tctctatgaacttcataaaacctcgactcccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcccattttgatcttactgcctaacccatctcggactaacac 25885  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgca--------ccaagaagag 302  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||      |||| |||||||| |||| |||| ||||| ||||||    ||||| ||||        |||||||||     
T  25884 cgaggtggaagaaaatttgctgtatg------atgacccacaggtgcatgtagaacacaataatgaagacatggaaggtgcaaaattgcaccaagaagat 25791  T
Q  303 gaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgaga 402  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25790 gaaggtgcacaactgcaccatgatgaggagcaccatgaccgtgatgccggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcatactgaggtcgaga 25691  T
Q  403 ggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgct 502  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25690 ggataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaatcgacaggactaaggaataatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgct 25591  T
Q  503 tcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaa 561  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  25590 tcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggaccttaatgaaaaa 25532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0402 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0402
Description:

Target: scaffold0402; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 570
Target Start/End: Original strand, 6423 - 6964
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    |||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6423 gggtggcatcatcacctatatagctagccaattgggagtgggtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagaccctt 6522  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaaca 209  Q
    |  | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6523 aattctatgaacttcattaagcatcgtccacccatgacctatacactcaaactcaatgtggctatattaattatacttcctaacccatctcggactaaca 6622  T
Q  210 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcaccaagaagaggaaggtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||   |||||| ||                    ||||||||||||||    
T  6623 ccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcacaggtacatgaagtgcacaatgctg-------------------gagaagaggaaggtg 6703  T
Q  310 cacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataag 409  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| ||    |||||||| ||||| |||||||||| | || ||||   | | ||||||    
T  6704 cacacttgcaccatgatgaggagcaccatgaccatgatgccggaggaaactttgaaaatgaaagatcggcatggatgtaaactgaggtacaaatgataag 6803  T
Q  410 caccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcac 509  Q
    |||| |||||  || ||||| ||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||    
T  6804 caccgagcaataaaagcaagatgttgaattattcgggctaagaaatgatgtcctaaggggaaaccacatatccgaagagaataatcaaatgcttcgaaac 6903  T
Q  510 atgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    |||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  6904 atgatgcaacatctcaacctccaaggtccaccctatggacctcaataaaaaatgtgagctt 6964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 541
Target Start/End: Original strand, 24081 - 24619
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| || || |||||||||||||  || || ||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||    
T  24081 ggtggtatcataacatacatagctaggcggttaggcgtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggtaacaatagactaaacatagaaaccctta 24180  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| |||||| ||| | || |  ||    ||| |    ||  ||||||| || |||||||||||||||||  || |  ||||||||||||| ||||||||    
T  24181 tctctatgaatttcctaaaacctcgaatcccctttgtttatacactcaagcttaatgtgcctattttgatattattacctaacccatctcggactaacac 24280  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggt--acatgaagaaa-acaatgatgaaggtgaggaaga-----tgcaccaagaagag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||  || |  | ||||| ||||  || |  |      ||||||||||||||    
T  24281 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgcacatagagcagcataatgaagaagcagacggtgcacacttgcaccaagaagag 24380  T
Q  303 gaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgaga 402  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||| |    
T  24381 gaagatgcacaattgcaccatgatgaggagcaccataaccatgatgaaggtgaaacaaatgaaaatacaagatgggaatggatgcatactgaggtcgaaa 24480  T
Q  403 ggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgct 502  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24481 ggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggactaaggaatgatgtccaaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgct 24580  T
Q  503 tcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctcc 541  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24581 tcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctcc 24619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 295 - 560
Target Start/End: Original strand, 90087 - 90352
Alignment:
Q  295 aagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccga 394  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| || |||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90087 aagaagaggaaggtgcacaattgcagcatgatgaggaacaccatgaccatgatgacagagacacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccga 90186  T
Q  395 ggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataac 494  Q
    || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90187 ggacgagaggataaacaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattgacgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataac 90286  T
Q  495 caaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaa 560  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  90287 caaatgcttcgaaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccctatggacctcaataaaaa 90352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 570
Target Start/End: Original strand, 29020 - 29574
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| || || |||||||||||| || | || ||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  29020 ggtggtatcataacatacatagctaggaaactaggcgtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagaaaccctta 29119  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| |||||| ||||| || |  ||    ||| |    ||  | ||||| ||||||||||| | ||||||  || |  ||||||||||||| ||||||||    
T  29120 tctctatgaatttcataaaacctcgaatcccctttgtttatacgctcaagctcaatgtgccaactttgatattattgcctaacccatctcggactaacac 29219  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcac--------caagaagag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |    |||| |  || ||||||  | ||||| |||||        |||||||||    
T  29220 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttaatgatgacccacaggtgcccatagaacagcataatgaagacgtggaaggtgcacacccgcaccaagaagag 29319  T
Q  303 gaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgaga 402  Q
    |||||||||| ||||||||||||         ||||||   |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29320 gaaggtgcacaattgcaccatga---------ccataa---tgac---ggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggtcgaga 29404  T
Q  403 ggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgct 502  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29405 ggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattaatgggaataaggaatgatgtccaacggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgct 29504  T
Q  503 tcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  29505 tcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgataaaaatgtgagctt 29574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Original strand, 10685 - 10938
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10685 ggtggtatcatcacatatatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagaccctta 10784  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  10785 tctctatgaacttcattaaacatcgtccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaa 10884  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  10885 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcacaggtacatgaaga 10938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Original strand, 18686 - 18939
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18686 ggtggtatcatcacatatatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagaccctta 18785  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  18786 tctctatgaacttcattaaacatcgtccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaa 18885  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  18886 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcacaggtacatgaaga 18939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 234713 - 234460
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  234713 ggtggtatcatcacatatatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagaccctta 234614  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  234613 tctctatgaacttcattaaacatcgtccacccatgacctatacactcaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacaa 234514  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  234513 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcacaggtacatgaaga 234460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 158; Significance: 9e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 20 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 8676 - 8123
Alignment:
Q  20 atcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagacccttatctttatga 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||||||||| ||||  |  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||    
T  8676 atcacttacatagctaggcaatttggggttggtaaggaccaaggaattaaaaggatttagggaaacaataggcttaacatagatacccttgtctctatga 8577  T
Q  120 acttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtgga 219  Q
    ||||||| || |  |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8576 acttcatcaaacctcgtccacccatgtcctatacactcaagctcaatgtgcctattctaattgcacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtgga 8477  T
Q  220 agaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcac-----caagaagaggaaggtgcacga 314  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| | |  |  | ||| |||||||     ||  | ||||||||||||| |    
T  8476 agaaaatttgttgtatgttgatgatgacccacaggtacatgaagagcataatcaaggtgaagcggatgatgcacacttgcaccatgaggaaggtgcacaa 8377  T
Q  315 ttgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggat-aagcacc 413  Q
     |||||||  ||||||| |||||| ||  ||||   |||| ||  ||| | |||| ||||||||||||||| || |  ||||  |||||||| || ||||    
T  8376 atgcaccaaaatgaggaacaccatgaccctgatgtcggaggaatcaataacaatgaaagatgggcatggatacacaatgaggtagagaggataaaacacc 8277  T
Q  414 aagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatga 513  Q
     |||||| |||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  8276 gagcaacaaaggcaaggtgtcggattatccggactaagaaatgatgtcctacggggcaaccgcatcaccgaagaaaataatcaaatgcttcggaatatga 8177  T
Q  514 tgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgag 567  Q
    |||| ||  | ||||||||||| ||||| |   || |||||||| |||||||||    
T  8176 tgcaacacctacacctccaaggccctccatgcggacctcaatgacaaatgtgag 8123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 8169 - 7630
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||| ||||     
T  8169 ggtggtatcataacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggatcaacaagattaaggggaataataggcttaacatagagatccttg 8070  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| ||||||||||||||| |  || ||||||||| | ||  |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  8069 tctctatgaacttcattaaacctcgaccacccatggcttatacactcaaa-tcaacgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacac 7971  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaaaacaatgatgaaggtgaggaagatgcaccaagaagaggaaggtgc 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | || |||||||||||  ||| ||  |||                   |||| ||||| |||    
T  7970 cgagctggaagaaaatttgttgtatgttggtgacgactcgcaagtacatgaagagcacattgtggaa-------------------gaagcggaagatgc 7890  T
Q  311 acgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagc 410  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||  | ||||||  |||| ||  || ||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  7889 acacttgcaccatgaggaggagcaccatggccatgatatcggaggaaacaacgatcatgaaagatggacatggatgcaaaccgaggttgaaaggataagc 7790  T
Q  411 accaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcaca 510  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||| | || |||||  | ||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| | |||    
T  7789 accgaacaacaaaggcaaggtgttgaactatccggactccgaaataatgtcctaaagggcaaccgcatcaccgaagagaataatcaaatgcttcagaaca 7690  T
Q  511 tgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||||| ||  |  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  7689 tgatgcaacacctcaacttccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaatgtgagctt 7630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Original strand, 43972 - 44225
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43972 ggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagaccctta 44071  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| |||||||||||| || |  || ||||||||| | ||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  44072 tctctatgaacttcataaaacctcgaccacccatggcatatacactaaaaatcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacac 44171  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||    
T  44172 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcgcaggtacatgaaga 44225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Original strand, 51361 - 51614
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51361 ggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagagaccctta 51460  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| |||||||||||| || |  || ||||||||| | ||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  51461 tctctatgaacttcataaaacctcgaccacccatggcatatacactaaaaatcaatgtgcctgttttgattatacttcctaacccatctcggactaacac 51560  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||    
T  51561 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggttcgcaggtacatgaaga 51614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 296 - 570
Target Start/End: Original strand, 44238 - 44510
Alignment:
Q  296 agaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgag 395  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |  ||| |||||||| || |||| || |||| ||  ||||| |||| || |||| |||||||  | ||||||    
T  44238 agaagaggaaggtgcacacttgcaccaagtggagaagcaccatgaccatgaaaccggaggaaacaatgataatgaaatatggacatggatataaaccgag 44337  T
Q  396 gccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataacc 495  Q
    |  || |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || ||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  44338 gttgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaagtgttgaattatcagggctccgaaatgatgtcctaaggggcaacc-catatccgaagagaataacc 44436  T
Q  496 aaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||||||||| |||||||  | || || |||||||||||||| || ||| || |||||| ||||||||||||||    
T  44437 aaatgcttcggaacatgatataacacttccacctccaaggtcc-ccttatggacctcaataaaaaatgtgagctt 44510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 296 - 570
Target Start/End: Original strand, 51627 - 51899
Alignment:
Q  296 agaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgag 395  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |  ||| |||||||| || |||| || |||| ||  ||||| |||| || |||| |||||||  | ||||||    
T  51627 agaagaggaaggtgcacacttgcaccaagtggagaagcaccatgaccatgaaaccggaggaaacaatgataatgaaatatggacatggatataaaccgag 51726  T
Q  396 gccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataacc 495  Q
    |  || |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || ||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  51727 gttgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaagtgttgaattatcagggctccgaaatgatgtcctaaggggcaacc-catatccgaagagaataacc 51825  T
Q  496 aaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    ||||||||||| |||||||  | || || |||||||||||||| || ||| || |||||| ||||||||||||||    
T  51826 aaatgcttcggaacatgatataacacttccacctccaaggtcc-ccttatggacctcaataaaaaatgtgagctt 51899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 138; Significance: 8e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Original strand, 132168 - 132421
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||     
T  132168 ggtggtatcatcacgtacatagttaggcaattgagagtgggtgaagaccaagggattaacaagattgagggtaacaataggcttaacatagaggcccttt 132267  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| | |||||||||| || |  || ||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  132268 tctctttgaacttcataaaacctcgaccacccatggcctatacacttaaactcaatgtgcctattttaattatacttcctaacccatctcggactaacac 132367  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | | ||||||||||||||    
T  132368 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatagttcgcaggtacatgaaga 132421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 296 - 500
Target Start/End: Original strand, 132431 - 132635
Alignment:
Q  296 agaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgag 395  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||  |||| |||||| || |||| || | || ||  ||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  132431 agaaaaggaaggtgcacaattgcaccaagaaaaggatcaccatgaccatgaaaccgaaggaaacaatgataatgaaagatggacatggatgcaaaccgag 132530  T
Q  396 gccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataacc 495  Q
    |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132531 gttgaaaggataagcaccgagcaactaaggcaaggtgttgaattatcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataacc 132630  T
Q  496 aaatg 500  Q
    |||||    
T  132631 aaatg 132635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 371 - 566
Target Start/End: Original strand, 3 - 197
Alignment:
Q  371 aagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggc 470  Q
    ||||||||||||||| || || ||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||    
T  3 aagatgggcatggatacaaactgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaaggggc 102  T
Q  471 aaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtga 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  103 aaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcagaacatgatgcaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaat-aaaaatgtga 197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 366 - 568
Target Start/End: Original strand, 115521 - 115721
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  115521 aatgaaagatgagcatggatgcaaaccgaggaacaaaggataagcaccgagcaac-aaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaa 115619  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  115620 ggggaaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 115718  T
Q  566 agc 568  Q
    |||    
T  115719 agc 115721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 366 - 568
Target Start/End: Original strand, 119825 - 120025
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  119825 aatgaaagatgagcatggatgcaaaccgaggaacaaaggataagcaccgagcaac-aaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaa 119923  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  119924 ggggaaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttccacctccaaggtcctccctatggacctcaat-aaaaatgtg 120022  T
Q  566 agc 568  Q
    |||    
T  120023 agc 120025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Original strand, 115193 - 115450
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaata----ggcttaacataaagacc 106  Q
    |||||||| || || | |||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||| |    ||||||||| |||||||    ||||||||||  | |||    
T  115193 ggtggtatcattaccttcatagctaggaagtttggagtgggtgaggacgaagggataaatccaattgagggcaacaatatataggcttaacattgaaacc 115292  T
Q  107 cttatctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtacta 206  Q
    ||  | | |||||| ||||||||||  | |||||||||| | || ||||| |||||   | | ||| ||||| || | ||| ||||||||||||| | ||    
T  115293 ctcttttctatgaatttcattaagcttcatccacccatgacttatgcacttaaacttcgtatacctcttttgtttctgcttcctaacccatctcggatta 115392  T
Q  207 acaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  115393 acaccgaggtggaggcaaatttgttgtatgttggtgatggatcacaggtacatgaaga 115450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Original strand, 119497 - 119754
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaata----ggcttaacataaagacc 106  Q
    |||||||| || || | ||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||| |    ||||||||| |||||||    ||||||||||  | |||    
T  119497 ggtggtatcattaccttcattgctaggaagtttggagtgggtgaggacgaagggataaatccaattgagggcaacaatatataggcttaacattgaaacc 119596  T
Q  107 cttatctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtacta 206  Q
    ||  | | |||||| ||||||||||  | |||||||||| | || ||||| |||||   | | ||| ||||| || | ||| ||||||||||||| | ||    
T  119597 ctcttttctatgaatttcattaagcttcatccacccatgacttatgcacttaaacttcgtatacctcttttgtttctgcttcctaacccatctcggatta 119696  T
Q  207 acaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  119697 acaccgaggtggaggcaaatttgttgtatgttggtgatggatcacaggtacatgaaga 119754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33217 - 32965
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| || || | ||| |||||| | || ||||||||||||||| || |||| |    ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| |    
T  33217 ggtggtatcattaccttcattgctaggaagtttggagtgggtgaggacgaatggataaatccaattgagggcaacaataggcttaacattgaaaccctca 33118  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  33117 tttctatgaacttcattaagcatcgtccacccatgacttatgcactcaaactcaatatgcctcttttgtttctacttcctaacccatctcgcactaacac 33018  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaag 263  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  33017 cgaggtggaagcaaatttgttgtatgttggtgatggttcacagctacatgaag 32965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 362 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 32921 - 32714
Alignment:
Q  362 tgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtc 461  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | || || ||||| |||||||||    
T  32921 tgaaaatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgagcaac-aaggcaaggtgttgaactatccgggctaagaaatgatgtc 32823  T
Q  462 ctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaa 561  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  32822 ctacggggcaaccgcatatccgaagagaataattaaattcttcggaacatgatgcaacatctcaacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaa 32723  T
Q  562 tgtgagctt 570  Q
    |||||||||    
T  32722 tgtgagctt 32714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 74 - 264
Target Start/End: Original strand, 1879 - 2067
Alignment:
Q  74 attgagggaaacaataggcttaacataaagacccttatctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgccta 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| || |  || || |||||| | ||  ||||||||||||||||| ||     
T  1879 attgagggaaacaataggcttaacatagagacccttgtct--atgaacttcataaaacctcgaccccccatggcttatacactcaaactcaatgtgactg 1976  T
Q  174 ttttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  1977 ttttgattatacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatgattcgcaggtacatgaaga 2067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 295 - 568
Target Start/End: Original strand, 2079 - 2352
Alignment:
Q  295 aagaagaggaaggtgcacgattgcaccatgatgaggagcaccataacaatgatactggagaaacaaatgaaaatgcaagatgggcatggatgcataccga 394  Q
    |||||| |||||||||||  |||||| ||||  |||||||||| ||| ||||||   ||| ||  ||||| || | ||||||| |||||||||| |||||    
T  2079 aagaagcggaaggtgcacacttgcactatgagaaggagcaccaaaaccatgataacagaggaaataatgataaagaaagatggacatggatgcaaaccga 2178  T
Q  395 ggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataac 494  Q
    ||  || |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| || || ||  | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||     
T  2179 ggttgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaagatgttgaattatccgggctccgaaatgatgtcctaaggggcaaccacatcgccgaagagaataat 2278  T
Q  495 caaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagc 568  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||  |  ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  2279 caaatgattcggaacatgatgcaacacctcaacctccaaggtcctcgctatggacctcaatgaaaaatgtgagc 2352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 363 - 570
Target Start/End: Original strand, 11400 - 11607
Alignment:
Q  363 gaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcc 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||    
T  11400 gaaaatgcaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaattattcgggctaagaaatgatgtcc 11499  T
Q  463 taaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaat 562  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| | ||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  11500 taaggggcaatcacatatccgaagaaaataatcgaatgcttcggaacatgatgtaacatctcaacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaat 11599  T
Q  563 gtgagctt 570  Q
     |||||||    
T  11600 ctgagctt 11607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 264
Target Start/End: Original strand, 11107 - 11332
Alignment:
Q  39 aattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagacccttatctttatgaacttcattaagcaccgtcc 138  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||| |    ||||||||| |||||||||||||||||  | || || || | |||||| ||||||||||  |||||    
T  11107 aatttggagtgggtgaggacgaggggataaatccaattgagggcaacaataggcttaacattgaaacactcatttctatgaatttcattaagcttcgtcc 11206  T
Q  139 acccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgtt 238  Q
    ||||||| | || ||||| ||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11207 acccatgacttatgcacttaaactaaatgtgccccttttgtttctactttctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagcgaatttgttgtatgtt 11306  T
Q  239 gttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    | |||||   ||||||||||||||||    
T  11307 ggtgatggatcacaggtacatgaaga 11332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1879 (Bit Score: 101; Significance: 9e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold1879
Description:

Target: scaffold1879; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 262 - 58
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |  ||||   | ||||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||| || ||  |||| || |||||||||     
T  262 aatgaaagatgggcatggatgcaaaatgaggtacaaaggattagcaccgagcaacagaggcaaggtgtcgaattatccggtttaagaaacgatgtcctac 163  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  162 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaccacttccacctccaaggtccaccctatggacctcaatgaaaaatgtg 63  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  62 agctt 58  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1879; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 73 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 518 - 327
Alignment:
Q  73 aattgagggaaacaataggcttaacataaagacccttatctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcct 172  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||  | ||||| || | |||||| ||||| || |  | |||||||||| | || |||||  |||| ||| | |||    
T  518 aattgagggaaacaacatgctaaacattgaaaccctcatttctatgaatttcatcaaacttcatccacccatgacttatgcacttcaacttaatatacct 419  T
Q  173 attttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  418 attttgtttctacttcctaacccatctcggactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatggtccacaggtacaggaaga 327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 101; Significance: 9e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Original strand, 12912 - 13115
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||    ||||| |||||||||||||    
T  12912 aatgtaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaattatccaagctaagaaatgatgtcctaa 13011  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || || |||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||    
T  13012 ggggcaaccgcatatccgaagagaataaccaaatgcttcggaccatgatgcaacacttccacctccaaggtcctcccgatggacctcaat-aaaaatgtg 13110  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  13111 agctt 13115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 264
Target Start/End: Original strand, 12751 - 12841
Alignment:
Q  174 ttttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  12751 ttttgtttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaattagttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 12841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 101; Significance: 9e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5267 - 5039
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||     
T  5267 ggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgagtgaagaccaatggataaacaagattgagggaaacaataggcttaacatagaaactcttg 5168  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    ||| |||||||||||| || |  || | |||| |    ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5167 tctctatgaacttcatcaaacctcgactaccctttgtttatacactcaaactcaacgtgcctattttaattttacttcctaacccatctcggactaacac 5068  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5067 cgaggtggaagagaatttgttgtatgttg 5039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 371 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 4926 - 4727
Alignment:
Q  371 aagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaaggggc 470  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||  || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  ||||    ||||||||||||||||||    
T  4926 aagatggacatggatgcaaaccgaggttgaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccagactccaaaatgatgtcctaaggggc 4827  T
Q  471 aaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtgagctt 570  Q
    |||| |||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  4826 aaccacatcaccgaagagaataatcaaatgcttcggcacatgatgcaacacctaaacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaattgtgagctt 4727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 363 - 570
Target Start/End: Original strand, 10288 - 10494
Alignment:
Q  363 gaaaatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcc 462  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||  | || ||| ||||||    
T  10288 gaaaatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggtttagaaataatgtcc 10387  T
Q  463 taaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaat 562  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |  |||||||||||||||||| || | ||||||||||     
T  10388 taaggggcaatcgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaacatgatgcaacacttccgactccaaggtcctccctatggaccccaatgaaaaa- 10486  T
Q  563 gtgagctt 570  Q
    ||||||||    
T  10487 gtgagctt 10494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 264
Target Start/End: Original strand, 10000 - 10220
Alignment:
Q  44 ggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagacccttatctttatgaacttcattaagcaccgtccaccca 143  Q
    ||||||||||||||| || |||| |    ||||||||| |||||||||||||||||  | ||| |  | | |||||| ||||||||||  | ||||||||    
T  10000 ggagtgggtgaggacgaacggataaatccaattgagggcaacaataggcttaacattgaaaccttcctttctatgaatttcattaagcttcatccaccca 10099  T
Q  144 tgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttga 243  Q
    || | || | | | ||||||||| | ||| ||||| || ||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  10100 tgacatatgaaattaaactcaatatacctcttttgtttctacttcctgacccatctcggactaacactgaggtggaagcaaatttgttgtatgttggtga 10199  T
Q  244 tgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||   ||||||||||||||||    
T  10200 tggatcacaggtacatgaaga 10220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 96; Significance: 9e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 157
Target Start/End: Original strand, 1701 - 1848
Alignment:
Q  10 gggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctt 109  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1701 gggtggtatcatcacatacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaaaattgagggtaacaataggcttaacatagagaccctt 1800  T
Q  110 atctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactc 157  Q
    |||| ||||||||||||||| || | | |||||| ||||||| |||||    
T  1801 atctctatgaacttcattaatcatcatacacccacgtcctacacactc 1848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 39080 - 38876
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||   | ||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||| | || ||  |||| || |||||||||     
T  39080 aatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggattagcaccgagcaacaaaggcaaggtgtcgaactatccggtttaagaaacgatgtcctac 38981  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38980 ggggtaaccgcatatccgaagagaataatcaaatgcttcggaacatgatgcaacatctcaacctccaaggtcctccctatggacctcaatgaaaaatgtg 38881  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  38880 agctt 38876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 39398 - 39145
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| || || | |||||||||| | || ||| ||||||| ||  ||||||| ||   |||||||||||||||||| || |||||  | ||||| |    
T  39398 ggtggtatcattaccttcatagctaggaagtttggaatgggtgaagaagaagggataactccaattgagggaaacaatagactaaacattgaaaccctca 39299  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    | | |||||| |||||||| |  | |||||||||| | || |||||  |||| || || ||| ||||| || ||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  39298 tttctatgaatttcattaaacttcatccacccatgacttatgcacttcaacttaacgtacctcttttgtttctacttcctaacccatcttggactaacac 39199  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||    
T  39198 cgaggtggaagcaaatttgttgtatgttggtgatggtccataggtatatgaaga 39145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1571 (Bit Score: 86; Significance: 8e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold1571
Description:

Target: scaffold1571; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 366 - 503
Target Start/End: Original strand, 1496 - 1633
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||     
T  1496 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatctgggctaagaaatgatgtcctac 1595  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgctt 503  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1596 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgctt 1633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1571; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 265
Target Start/End: Original strand, 1344 - 1426
Alignment:
Q  183 tactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaagaa 265  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||    
T  1344 tacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaagaa 1426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1620 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold1620
Description:

Target: scaffold1620; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 366 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 335 - 131
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||   | |||||||||||| |||||| ||||||||| |  ||| | || || ||||| || ||||||||||    
T  335 aatgaaagatgggcatggatgcaaactgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggcgaggaactatccgggctaagaaacgatgtcctaa 236  T
Q  466 ggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatgtg 565  Q
     | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||  |  |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  235 agcgcaaccgcatatccgaagagaataatcaaatgcttcggaacatgatgcaacacctcaacctccaaggtcctccctacggacctcaatgaaaaatgtg 136  T
Q  566 agctt 570  Q
    |||||    
T  135 agctt 131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1620; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 653 - 425
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| || || | ||| |||||| | || ||||||||||| ||| ||||||| |    ||||||||| ||||||| ||| |||||  | ||||| |    
T  653 ggtggtatcattaccttcattgctaggaagtttggagtgggtgaagacaaagggataaatccaattgaggggaacaatatgctaaacattgaaaccctca 554  T
Q  111 tctttatgaacttcattaagcaccgtccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacac 210  Q
    | | |||||| ||||| || |  | |||||||||| | || |||||  |||| ||  ||| | ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  553 tttctatgaatttcataaaacttcatccacccatgacttatgcacttcaacttaacatgcttcttttgtttctacttcctaacccatctcggactaacac 454  T
Q  211 cgaggtggaagaaaatttgttgtatgttg 239  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||    
T  453 ggaggtggaagcaaatttgttgtatgttg 425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 456 - 570
Target Start/End: Original strand, 7759 - 7872
Alignment:
Q  456 gatgtcctaaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaat 555  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  7759 gatgtcctacggggcaagcgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggaatatgatgcacca-ttccacctccaaggtcctccctatggacctccat 7857  T
Q  556 gaaaaatgtgagctt 570  Q
    |||||||||||||||    
T  7858 gaaaaatgtgagctt 7872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0577
Description:

Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 464 - 570
Target Start/End: Original strand, 5587 - 5692
Alignment:
Q  464 aaggggcaaccgcatatccgaagaaaataaccaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatgaaaaatg 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||  ||| |||||||||||||||| || ||| || |||||||    
T  5587 aaggggcaaccgcatatccgaagaaaataacaaaatgcttcggaacatgatgcaacacttcaaccgccaaggtcctccctatggacctccat-aaaaatg 5685  T
Q  564 tgagctt 570  Q
    |||||||    
T  5686 tgagctt 5692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 366 - 469
Target Start/End: Original strand, 4980 - 5083
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcctaa 465  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||    
T  4980 aatgaaagatgggcatggatgcaaaccgaggtacaaaggataagcaccgagcaacaaaggcaaggtgttgaattatccgggctaagaaatgatgtcctaa 5079  T
Q  466 gggg 469  Q
    ||||    
T  5080 gggg 5083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 264
Target Start/End: Original strand, 4819 - 4909
Alignment:
Q  174 ttttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatgaaga 264  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||    
T  4819 ttttgtttctacttcctaacccatctcggactaaccccgaggtggaggaaaatttgttgtatgttggtgatggattacaggtacatgaaga 4909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 256
Target Start/End: Original strand, 54916 - 55036
Alignment:
Q  136 tccacccatgtcctacgcactcaaactcaatgtgcctattttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtat 235  Q
    |||||||||| | || |||||  |||| ||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54916 tccacccatgacttatgcacttcaacttaatatacctattttgtttctacttcctaacccatctcggattaacaccgaggtggaagcaaatttgttgtat 55015  T
Q  236 gttgttgatgatccacaggta 256  Q
    |||| ||||| ||||||||||    
T  55016 gttggtgatggtccacaggta 55036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 261
Target Start/End: Original strand, 21620 - 21706
Alignment:
Q  175 tttgattatactttctaacccatctcgtactaacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttgttgatgatccacaggtacatga 261  Q
    |||||||||  || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  21620 tttgattatctttcctaacccatctcggaataacaccgaggtggaagaaaatttgttgtatgttggtgatgttccacaggttcatga 21706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 366 - 463
Target Start/End: Original strand, 21792 - 21889
Alignment:
Q  366 aatgcaagatgggcatggatgcataccgaggccgagaggataagcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattgtcgggactaaggaatgatgtcct 463  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |  | || |||||||| ||||||||    
T  21792 aatgaaagatgggcatggatgcaaacggaggttcagaggataagcaccgaacaacaaaggcaaggtgttgaaataaccgggctaaggaacgatgtcct 21889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 20310 - 20234
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaa 87  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  20310 ggtggtatcatcacatacatagctagtcaattgggagtgggtgaggaccaagggataaacaaaatcgagggaaacaa 20234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 493 - 570
Target Start/End: Original strand, 28 - 107
Alignment:
Q  493 accaaatgcttcggcacatgatgcaccattttcacctccaaggtcctccctatagaactcaatg--aaaaatgtgagctt 570  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  28 accaaatgcttcggaacatgatgcaccactttcacctccaaggtcctccatatggacctcaatgataaaaatgtgagctt 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1400 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1400
Description:

Target: scaffold1400; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 149 - 49
Alignment:
Q  11 ggtggtataatcacgtacatagctaggcaattgggagtgggtgaggaccaagggattaccaaaattgagggaaacaataggcttaacataaagaccctta 110  Q
    |||||||| || || ||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  149 ggtggtatcataacatacatagttaggcaactaggagtgagtgaagaccaagggataaacaagattgagggaaacaataggctaaacatagacaccctta 50  T
Q  111 t 111  Q
    |    
T  49 t 49  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 409 - 472
Target Start/End: Original strand, 1537 - 1600
Alignment:
Q  409 gcaccaagcaactaaggcaaggtgttgaattg-tcgggactaaggaatgatgtcctaaggggcaa 472  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1537 gcaccgagcaacaaagacaaggtgttgaaatgatcggg-ctaagaaatgatgtcctaaggggcaa 1600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University