View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17302_low_15 (Length: 412)

Name: NF17302_low_15
Description: NF17302
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17302_low_15
NF17302_low_15
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (1-364)||(4166922-4167286)
chr2 (1-362)||(3176941-3177303)
chr2 (1-365)||(26357576-26357941)
chr2 (1-365)||(44913661-44914031)
chr2 (1-364)||(39167208-39167566)
chr2 (1-365)||(4763627-4763995)
chr2 (1-362)||(33660216-33660569)
chr2 (1-323)||(43648084-43648407)
chr2 (1-364)||(29241984-29242341)
chr2 (49-366)||(33550875-33551191)
chr2 (1-264)||(41960940-41961204)
chr2 (4-364)||(19424484-19424831)
chr2 (8-365)||(37905708-37906067)
chr2 (4-363)||(13711465-13711820)
chr2 (1-364)||(19289162-19289521)
chr2 (12-364)||(4263926-4264280)
chr2 (23-366)||(19313850-19314188)
chr2 (1-364)||(11366219-11366584)
chr2 (1-323)||(33709071-33709394)
chr2 (13-367)||(4478365-4478717)
chr2 (1-364)||(2325217-2325573)
chr2 (4-364)||(31570576-31570937)
chr2 (30-362)||(44285951-44286283)
chr2 (1-364)||(18494120-18494471)
chr2 (3-364)||(27349789-27350142)
chr2 (1-362)||(43770687-43771039)
chr2 (59-362)||(36641988-36642293)
chr2 (1-365)||(41465508-41465865)
chr2 (70-364)||(17071646-17071940)
chr2 (1-296)||(5881607-5881893)
chr2 (70-364)||(17054005-17054299)
chr2 (59-283)||(45327801-45328025)
chr2 (1-366)||(35958907-35959256)
chr2 (91-362)||(41463780-41464051)
chr2 (125-368)||(33902064-33902305)
chr2 (3-235)||(31861981-31862214)
chr2 (1-294)||(7006777-7007054)
chr2 (3-169)||(19500756-19500923)
chr2 (107-222)||(18258233-18258348)
chr2 (4-83)||(41463432-41463512)
chr2 (1-99)||(41051139-41051238)
chr2 (219-337)||(41051263-41051382)
chr2 (311-364)||(41960883-41960936)
chr2 (326-366)||(17245120-17245160)
chr2 (329-364)||(34441934-34441969)
chr2 (7-76)||(18257383-18257453)
chr2 (181-235)||(19501760-19501813)
chr2 (316-360)||(18947598-18947642)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (1-365)||(36866761-36867126)
chr5 (1-367)||(40133382-40133749)
chr5 (4-364)||(36860423-36860785)
chr5 (1-365)||(21088580-21088942)
chr5 (1-367)||(699147-699514)
chr5 (1-364)||(38528048-38528411)
chr5 (1-363)||(22980794-22981157)
chr5 (1-364)||(12910350-12910719)
chr5 (1-364)||(30969135-30969499)
chr5 (1-364)||(8741696-8742062)
chr5 (1-366)||(31786457-31786823)
chr5 (4-362)||(5837557-5837916)
chr5 (1-365)||(7693229-7693585)
chr5 (4-364)||(19119859-19120220)
chr5 (3-362)||(25500739-25501099)
chr5 (3-364)||(9200233-9200586)
chr5 (1-366)||(15724488-15724852)
chr5 (1-362)||(27318299-27318660)
chr5 (1-367)||(35511293-35511655)
chr5 (1-364)||(22255181-22255546)
chr5 (1-364)||(27330306-27330668)
chr5 (1-364)||(39572819-39573175)
chr5 (57-366)||(23116090-23116399)
chr5 (1-364)||(22973893-22974257)
chr5 (1-352)||(33908245-33908596)
chr5 (3-365)||(22019631-22019985)
chr5 (1-363)||(31705423-31705785)
chr5 (1-363)||(32563150-32563504)
chr5 (1-364)||(35826297-35826658)
chr5 (24-364)||(1428997-1429320)
chr5 (1-364)||(35933902-35934260)
chr5 (102-362)||(26268076-26268336)
chr5 (8-293)||(5829972-5830249)
chr5 (1-285)||(15992351-15992636)
chr5 (1-367)||(14409152-14409504)
chr5 (1-292)||(7208675-7208966)
chr5 (1-303)||(23954613-23954904)
chr5 (1-364)||(17157842-17158208)
chr5 (1-306)||(42342791-42343085)
chr5 (1-293)||(35504436-35504729)
chr5 (7-360)||(8436970-8437323)
chr5 (125-364)||(5112250-5112488)
chr5 (1-364)||(24886102-24886451)
chr5 (1-213)||(2888256-2888469)
chr5 (51-306)||(6824343-6824598)
chr5 (107-364)||(14919446-14919704)
chr5 (15-364)||(13956187-13956520)
chr5 (152-323)||(28416490-28416661)
chr5 (1-217)||(25669733-25669940)
chr5 (3-355)||(43308473-43308818)
chr5 (1-364)||(8466745-8467090)
chr5 (1-141)||(25889593-25889734)
chr5 (1-100)||(28416362-28416462)
chr5 (210-306)||(25668707-25668803)
chr5 (279-365)||(26317774-26317860)
chr5 (1-63)||(43254156-43254219)
chr5 (287-366)||(16004474-16004554)
chr5 (316-364)||(22616494-22616542)
chr5 (227-367)||(11897999-11898139)
chr5 (125-170)||(11898148-11898193)
chr5 (327-363)||(10237415-10237451)
chr5 (8-99)||(26269074-26269166)
[»] chr7 (56 HSPs)
chr7 (1-365)||(4582893-4583258)
chr7 (49-364)||(43686016-43686330)
chr7 (1-364)||(32432432-32432791)
chr7 (1-364)||(9355648-9356012)
chr7 (1-364)||(32820875-32821239)
chr7 (1-365)||(37109846-37110213)
chr7 (11-365)||(27283718-27284073)
chr7 (1-364)||(18797304-18797666)
chr7 (1-364)||(31578886-31579255)
chr7 (1-367)||(8861257-8861624)
chr7 (4-364)||(30055501-30055863)
chr7 (7-366)||(5657309-5657669)
chr7 (1-364)||(21991611-21991966)
chr7 (1-362)||(25691366-25691729)
chr7 (4-365)||(6546493-6546855)
chr7 (1-367)||(11071177-11071542)
chr7 (1-363)||(24211717-24212081)
chr7 (1-364)||(17842406-17842772)
chr7 (9-365)||(12165726-12166074)
chr7 (4-365)||(15612584-15612945)
chr7 (1-362)||(23111167-23111531)
chr7 (8-364)||(41764907-41765264)
chr7 (1-235)||(15672581-15672819)
chr7 (1-366)||(10359036-10359402)
chr7 (1-362)||(29173518-29173861)
chr7 (5-350)||(22687228-22687566)
chr7 (1-365)||(37346996-37347360)
chr7 (1-364)||(7334769-7335132)
chr7 (1-363)||(43925081-43925434)
chr7 (1-348)||(48928119-48928466)
chr7 (1-231)||(37703320-37703551)
chr7 (11-364)||(10481578-10481934)
chr7 (68-363)||(38258521-38258816)
chr7 (1-364)||(31520563-31520909)
chr7 (48-363)||(33688132-33688446)
chr7 (23-267)||(44598738-44598980)
chr7 (4-337)||(26980325-26980642)
chr7 (111-362)||(27421313-27421563)
chr7 (1-220)||(26587914-26588126)
chr7 (1-231)||(46480951-46481182)
chr7 (1-323)||(35353124-35353447)
chr7 (91-363)||(48928477-48928748)
chr7 (150-362)||(44413351-44413564)
chr7 (109-252)||(37704244-37704387)
chr7 (8-364)||(12390478-12390816)
chr7 (1-148)||(44411362-44411510)
chr7 (13-294)||(32593040-32593304)
chr7 (1-134)||(37704387-37704521)
chr7 (49-163)||(38053637-38053751)
chr7 (215-364)||(26524364-26524513)
chr7 (1-121)||(34362000-34362121)
chr7 (258-367)||(34362228-34362337)
chr7 (297-362)||(8299192-8299257)
chr7 (329-364)||(241034-241069)
chr7 (315-361)||(10675331-10675377)
chr7 (316-366)||(23402371-23402421)
[»] chr1 (59 HSPs)
chr1 (1-362)||(238329-238690)
chr1 (1-364)||(2959744-2960108)
chr1 (1-364)||(10181823-10182188)
chr1 (1-353)||(47279196-47279549)
chr1 (1-362)||(15752027-15752389)
chr1 (1-366)||(27227301-27227659)
chr1 (1-323)||(32216092-32216415)
chr1 (3-365)||(38823209-38823572)
chr1 (1-364)||(16415641-16416006)
chr1 (4-365)||(7078882-7079255)
chr1 (1-354)||(28564599-28564951)
chr1 (8-365)||(30326775-30327133)
chr1 (1-364)||(18422647-18423004)
chr1 (1-364)||(34012198-34012557)
chr1 (1-365)||(47682310-47682674)
chr1 (1-351)||(4330288-4330641)
chr1 (8-364)||(15382929-15383286)
chr1 (1-365)||(23999342-23999708)
chr1 (1-366)||(42721033-42721396)
chr1 (1-366)||(27267016-27267378)
chr1 (1-359)||(27532798-27533155)
chr1 (1-364)||(1547283-1547631)
chr1 (1-354)||(37451292-37451645)
chr1 (4-323)||(51128896-51129216)
chr1 (8-364)||(8222127-8222480)
chr1 (1-364)||(19899584-19899949)
chr1 (1-364)||(30254420-30254783)
chr1 (1-364)||(32267030-32267394)
chr1 (3-341)||(9902872-9903211)
chr1 (1-362)||(27563721-27564084)
chr1 (1-362)||(28769651-28770013)
chr1 (1-364)||(39393379-39393744)
chr1 (1-364)||(3534928-3535283)
chr1 (1-363)||(10922724-10923087)
chr1 (8-282)||(25160710-25160985)
chr1 (1-367)||(3309141-3309513)
chr1 (1-364)||(15168085-15168456)
chr1 (1-323)||(46931448-46931770)
chr1 (1-364)||(11742184-11742530)
chr1 (1-362)||(41926161-41926516)
chr1 (1-363)||(14758038-14758392)
chr1 (1-264)||(22170807-22171071)
chr1 (56-362)||(33725472-33725778)
chr1 (1-323)||(27763126-27763449)
chr1 (36-294)||(40884879-40885137)
chr1 (13-364)||(37618729-37619076)
chr1 (152-364)||(48620633-48620845)
chr1 (12-365)||(31621376-31621734)
chr1 (47-303)||(38759584-38759846)
chr1 (1-168)||(48353735-48353902)
chr1 (1-168)||(1359751-1359919)
chr1 (1-146)||(21289817-21289960)
chr1 (216-364)||(21289661-21289816)
chr1 (1-121)||(31962855-31962977)
chr1 (311-364)||(22170750-22170803)
chr1 (298-364)||(30254854-30254920)
chr1 (326-364)||(4150497-4150535)
chr1 (327-365)||(43579241-43579279)
chr1 (316-364)||(13876919-13876967)
[»] scaffold0002 (5 HSPs)
scaffold0002 (1-364)||(134-492)
scaffold0002 (1-306)||(408250-408555)
scaffold0002 (127-341)||(94331-94545)
scaffold0002 (1-135)||(93922-94056)
scaffold0002 (312-364)||(408702-408754)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (1-364)||(3879759-3880123)
chr6 (3-362)||(21016940-21017294)
chr6 (29-366)||(7234884-7235220)
chr6 (1-364)||(4318642-4319007)
chr6 (3-364)||(5627391-5627754)
chr6 (4-362)||(29182165-29182522)
chr6 (1-364)||(1945833-1946199)
chr6 (1-364)||(8513233-8513585)
chr6 (7-363)||(20768087-20768440)
chr6 (1-303)||(6091002-6091306)
chr6 (1-365)||(33892832-33893187)
chr6 (1-362)||(6088910-6089260)
chr6 (107-364)||(7055142-7055399)
chr6 (78-362)||(30353256-30353540)
chr6 (107-306)||(15491673-15491872)
chr6 (1-367)||(33618831-33619197)
chr6 (1-100)||(7054592-7054693)
chr6 (243-364)||(18498433-18498555)
chr6 (326-364)||(11084162-11084200)
chr6 (316-364)||(19631749-19631797)
chr6 (327-367)||(24662201-24662241)
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (3-364)||(34132926-34133288)
chr3 (1-362)||(46297583-46297945)
chr3 (1-364)||(39282644-39283007)
chr3 (1-365)||(37203057-37203423)
chr3 (1-366)||(4015449-4015814)
chr3 (1-357)||(24488783-24489140)
chr3 (1-365)||(37157698-37158063)
chr3 (1-362)||(53228973-53229336)
chr3 (1-364)||(52040743-52041108)
chr3 (4-364)||(26941084-26941445)
chr3 (1-364)||(48354932-48355296)
chr3 (4-366)||(44891496-44891849)
chr3 (4-364)||(7327306-7327668)
chr3 (1-364)||(33378606-33378967)
chr3 (4-293)||(42505899-42506189)
chr3 (1-364)||(40552080-40552444)
chr3 (11-364)||(3655031-3655387)
chr3 (1-364)||(4761469-4761836)
chr3 (1-364)||(22450959-22451323)
chr3 (65-364)||(11466815-11467114)
chr3 (1-323)||(3362285-3362610)
chr3 (1-364)||(21193597-21193962)
chr3 (1-349)||(11357202-11357535)
chr3 (1-294)||(24707936-24708230)
chr3 (13-361)||(32373466-32373813)
chr3 (1-323)||(2007965-2008294)
chr3 (1-364)||(47481513-47481878)
chr3 (1-235)||(22622539-22622774)
chr3 (1-306)||(21009622-21009929)
chr3 (1-364)||(54505799-54506163)
chr3 (5-235)||(33698273-33698504)
chr3 (102-364)||(35844317-35844579)
chr3 (1-354)||(29099356-29099701)
chr3 (3-272)||(38591781-38592051)
chr3 (1-362)||(43975713-43976068)
chr3 (1-364)||(44186338-44186686)
chr3 (46-365)||(45174493-45174815)
chr3 (49-294)||(43348319-43348563)
chr3 (25-362)||(54828547-54828883)
chr3 (1-235)||(1089813-1090048)
chr3 (1-361)||(22445886-22446247)
chr3 (9-273)||(46994490-46994755)
chr3 (8-363)||(25579731-25580087)
chr3 (1-305)||(14586501-14586796)
chr3 (153-365)||(51212955-51213167)
chr3 (1-261)||(29163912-29164157)
chr3 (1-248)||(36012244-36012494)
chr3 (46-252)||(11835500-11835701)
chr3 (4-351)||(40935995-40936325)
chr3 (119-336)||(53176074-53176290)
chr3 (1-366)||(27480179-27480566)
chr3 (183-367)||(20373300-20373484)
chr3 (71-198)||(20373136-20373263)
chr3 (8-146)||(51212599-51212738)
chr3 (59-169)||(11357030-11357140)
chr3 (1-145)||(50475021-50475173)
chr3 (294-364)||(55343399-55343469)
chr3 (41-147)||(53811596-53811698)
chr3 (269-363)||(11835701-11835790)
chr3 (329-367)||(49359641-49359679)
chr3 (316-366)||(53811976-53812026)
chr3 (316-364)||(40640634-40640682)
chr3 (316-364)||(47930666-47930714)
chr3 (315-366)||(42204340-42204391)
chr3 (327-361)||(4556543-4556577)
chr3 (272-366)||(2613882-2613973)
chr3 (311-363)||(29163839-29163891)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (1-364)||(36694793-36695157)
chr8 (3-364)||(9864147-9864509)
chr8 (1-365)||(12876107-12876473)
chr8 (1-364)||(16446702-16447066)
chr8 (1-367)||(6098340-6098712)
chr8 (1-364)||(40862418-40862783)
chr8 (1-364)||(27082665-27083029)
chr8 (1-365)||(5299773-5300138)
chr8 (4-323)||(11727064-11727384)
chr8 (1-364)||(1204926-1205290)
chr8 (1-358)||(37970346-37970704)
chr8 (1-364)||(34894966-34895325)
chr8 (1-364)||(38643977-38644341)
chr8 (1-364)||(16222862-16223226)
chr8 (1-293)||(1149459-1149752)
chr8 (1-362)||(465843-466195)
chr8 (49-365)||(13307621-13307936)
chr8 (1-364)||(43643422-43643786)
chr8 (1-366)||(23854258-23854624)
chr8 (6-366)||(33906221-33906568)
chr8 (3-367)||(7890786-7891142)
chr8 (3-363)||(31933715-31934076)
chr8 (1-291)||(39098946-39099237)
chr8 (1-365)||(10555032-10555394)
chr8 (1-281)||(35459538-35459819)
chr8 (1-267)||(1953815-1954084)
chr8 (7-235)||(4132519-4132747)
chr8 (1-364)||(8803643-8803997)
chr8 (93-323)||(43025742-43025972)
chr8 (3-364)||(30654412-30654774)
chr8 (1-284)||(44869576-44869860)
chr8 (107-365)||(41910922-41911180)
chr8 (158-364)||(1150090-1150296)
chr8 (170-364)||(34952028-34952222)
chr8 (171-364)||(41362517-41362707)
chr8 (4-217)||(18259229-18259439)
chr8 (10-169)||(1149756-1149912)
chr8 (1-133)||(12587812-12587945)
chr8 (1-182)||(24823221-24823395)
chr8 (1-137)||(35859160-35859297)
chr8 (1-136)||(34951884-34952020)
chr8 (170-251)||(7998406-7998488)
chr8 (4-100)||(33198065-33198162)
chr8 (243-366)||(4133080-4133201)
chr8 (126-182)||(12585297-12585353)
chr8 (91-163)||(7998478-7998550)
chr8 (41-133)||(34463704-34463793)
chr8 (1-66)||(43025971-43026037)
chr8 (175-265)||(33197947-33198029)
chr8 (1-69)||(41362716-41362785)
chr8 (316-364)||(38110353-38110401)
chr8 (325-364)||(39099261-39099300)
chr8 (326-364)||(7998362-7998400)
chr8 (311-365)||(15009240-15009294)
chr8 (300-365)||(33197890-33197955)
chr8 (326-362)||(6446716-6446752)
chr8 (316-364)||(28220955-28221003)
[»] chr4 (66 HSPs)
chr4 (1-362)||(17167715-17168077)
chr4 (1-362)||(17173292-17173654)
chr4 (1-367)||(55240952-55241318)
chr4 (1-366)||(28002833-28003199)
chr4 (1-362)||(34947942-34948306)
chr4 (1-370)||(35020878-35021252)
chr4 (4-364)||(19089303-19089664)
chr4 (4-364)||(37663591-37663950)
chr4 (1-364)||(55477738-55478106)
chr4 (1-361)||(6864038-6864399)
chr4 (1-362)||(33341397-33341762)
chr4 (1-368)||(36493536-36493903)
chr4 (4-362)||(47253751-47254101)
chr4 (1-364)||(32912426-32912791)
chr4 (1-364)||(25700903-25701268)
chr4 (1-364)||(29584047-29584409)
chr4 (1-365)||(7703516-7703873)
chr4 (1-364)||(34361338-34361702)
chr4 (1-252)||(1815413-1815665)
chr4 (1-366)||(19440495-19440862)
chr4 (1-362)||(27396618-27396978)
chr4 (1-364)||(25184113-25184477)
chr4 (1-367)||(49375963-49376331)
chr4 (1-363)||(37775670-37776022)
chr4 (49-364)||(38011854-38012169)
chr4 (1-361)||(32592096-32592448)
chr4 (3-350)||(46888007-46888354)
chr4 (1-364)||(30002488-30002835)
chr4 (1-364)||(879395-879759)
chr4 (1-350)||(50764746-50765084)
chr4 (1-364)||(32579444-32579810)
chr4 (1-364)||(50697242-50697606)
chr4 (1-322)||(23761114-23761435)
chr4 (1-364)||(37287733-37288092)
chr4 (1-364)||(3042611-3042983)
chr4 (1-362)||(33816363-33816742)
chr4 (1-364)||(42199729-42200095)
chr4 (1-363)||(4597994-4598346)
chr4 (91-364)||(35025534-35025799)
chr4 (1-235)||(17272093-17272328)
chr4 (91-323)||(4934140-4934371)
chr4 (1-362)||(5047813-5048174)
chr4 (1-364)||(9139247-9139591)
chr4 (1-167)||(7152051-7152218)
chr4 (133-338)||(54499217-54499424)
chr4 (158-367)||(39397915-39398115)
chr4 (259-364)||(4205116-4205221)
chr4 (1-166)||(26896285-26896452)
chr4 (1-222)||(46883961-46884177)
chr4 (1-132)||(4205216-4205348)
chr4 (1-100)||(35025413-35025513)
chr4 (1-136)||(39400236-39400372)
chr4 (1-85)||(23431834-23431919)
chr4 (282-364)||(7152235-7152317)
chr4 (279-365)||(53124286-53124372)
chr4 (316-364)||(2704512-2704560)
chr4 (316-364)||(38812260-38812308)
chr4 (315-363)||(51204580-51204628)
chr4 (311-367)||(53337571-53337627)
chr4 (315-362)||(20097490-20097537)
chr4 (274-364)||(4396326-4396416)
chr4 (316-366)||(38811811-38811861)
chr4 (313-367)||(46884194-46884248)
chr4 (311-364)||(17272011-17272064)
chr4 (60-121)||(56050173-56050234)
chr4 (311-367)||(52516594-52516650)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (4-362)||(7889-8248)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (1-362)||(11908-12272)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (1-362)||(43959-44320)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-362)||(154467-154828)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (47-364)||(267282-267602)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-362)||(145836-146199)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (278-364)||(42348-42434)
scaffold0009 (179-220)||(100894-100935)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (315-367)||(12137-12189)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4167286 - 4166922
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4167286 tgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 4167187  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4167186 gttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 4167087  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4167086 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatat 4166987  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4166986 ttttgatactataatgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 4166922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3177303 - 3176941
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||  || ||||||||     
T  3177303 tgtttgatttattttcaaattgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaatgcttgtaatatcttggacttacatgtactattttata 3177204  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3177203 gttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaa 3177104  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||| || ||    
T  3177103 ttagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgcgtgttactcaaaacat 3177004  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3177003 ttttgatattatagtattaacttcatcagaaaagtcattttcgtaacttcaccatagaatttt 3176941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26357941 - 26357576
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26357941 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaaatactattttatc 26357842  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26357841 gttggcatctttaacatgcaaacacatttgataatattatgtgatagttttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaa 26357742  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||  |||||||| | |||||||||| |||   ||| || ||| ||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| | |     
T  26357741 ttagattaagtgtgatcttgttaatatgatgaattgataactctataagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcactacag 26357642  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    |||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26357641 ttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccataaaattttcca 26357576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 44914031 - 44913661
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcat---ctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattatttt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  44914031 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcattttctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactatttt 44913932  T
Q  97 atcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggat 195  Q
    |||| || | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  44913931 atcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggggtgttacacttaaaacaatgtatgat 44913832  T
Q  196 aaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattat-gaggactaaacttttgatgccattgtataaac-agtggggtgttactca 293  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||| | ||||||| ||| |||| || |||| |||| |||||||||||    
T  44913831 aaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgggggattgaactttttatgtcattttacaaacaagtgaggtgttactca 44913732  T
Q  294 caatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44913731 caacatttttgatactacagtgttaactt-cacataaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 44913661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 39167208 - 39167566
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||  || |||||||||    
T  39167208 tgttttattcatttttaaattgttgattactgattcataattaatagtaattcatctagtaatgctagcaacaatttggacttacatgtactattttatc 39167307  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  39167308 gttgacatctttaacatacaaacagagttgatgatattatgtgatagtt------gttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaa 39167401  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  39167402 ttagaataagtgtattcttgttactctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttactcacaatac 39167501  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||||| |  |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  39167502 ttttgatactattctgttaacttcatcaaaaaaatcattctcgtgacttcaccataaaattttcc 39167566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4763995 - 4763627
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||||    
T  4763995 tgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcaactagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttatc 4763896  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |  | |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4763895 gttagcatctttaacatgcaaaaagaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgctacacttgaaacaaggtagaataaaa 4763796  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| | |||||| |||||||||||| | ||| |||| | ||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | |     
T  4763795 ttagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgattatactatgggaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactacag 4763696  T
Q  300 ttttgatactctag---tgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    ||||| |  | |||   |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  4763695 ttttgttgatatagtgttgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcatcatagaattttcca 4763627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 33660216 - 33660569
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||| |||||||||    
T  33660216 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctcagacttacagatactattttatc 33660315  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33660316 gttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgg---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 33660406  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |     
T  33660407 ttagattaagtgtattcctgttaatctaatgaattgatgatactaagaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagttgggtgttactcacaacac 33660506  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||||||  | ||||||||||||    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33660507 ttttgatgttatagtgttaacttaactagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaatttt 33660569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 43648084 - 43648407
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  43648084 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcgacatcttggacttacaagtgctattttatc 43648183  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||  ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  43648184 gttgaaatctttaacatggaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgtggtgttacacttataacaaggtatgataaaa 43648283  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| | ||| ||||| |||| ||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||  | ||    
T  43648284 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattatacaaacagtgaggtgttactcattacat 43648383  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttc 323  Q
    |||||||  | |||||||||||||    
T  43648384 ttttgatgttatagtgttaacttc 43648407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 29241984 - 29242341
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| | ||| |||||||||||||||||        |||||||||||||||  || |||| ||||    
T  29241984 tgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatt-------catcttggacttacaggtactattgtatc 29242076  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29242077 gttgacatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 29242176  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| | |||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  29242177 ttagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgataccactgtacaaacagtggggtgttacgcactatat 29242276  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||| ||  | |||| ||||||||  || ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29242277 tttttatgttatagttttaacttcaccaaaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattttcc 29242341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 49 - 366
Target Start/End: Original strand, 33550875 - 33551191
Alignment:
Q  49 attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagtt 148  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || |||||||||| |||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||     
T  33550875 attcatctagtaatgcttgcaacatattggactttcaagtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacg-tagtc 33550973  T
Q  149 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgag 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| |||||     
T  33550974 ttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaacgtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaa 33551073  T
Q  249 gactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgactt 348  Q
    |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||  | |||||||||||||   | |||||||||| || ||||||    
T  33551074 gaccgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcactacatttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtcattctcatgactt 33551173  T
Q  349 caccatagaattttccat 366  Q
    |||| |||||||||||||    
T  33551174 caccgtagaattttccat 33551191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 41961204 - 41960940
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41961204 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatc 41961105  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41961104 gttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaa 41961005  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatg 264  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  41961004 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactgaacttttgatg 41960940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 19424484 - 19424831
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  || |||             
T  19424484 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcaggtactat--------- 19424574  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 202  Q
         ||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19424575 -----ctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaatta 19424669  T
Q  203 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttt 302  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  19424670 gattaagcgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactatataaacaatggggtgttactcacaacacttt 19424769  T
Q  303 tgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||  | |||||||||||||  |||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  19424770 tgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagccattctcatgacttcaccataaaattttcc 19424831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 37906067 - 37905708
Alignment:
Q  8 ttcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||  | ||||||||||  ||       
T  37906067 ttcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaattcttgcaacatcttggacttacatgtgttattttatcattggaa 37905968  T
Q  107 tctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtgggg--tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaga 204  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  37905967 tctttaacatgcaaacagagttaatgatattatgcgatagttttaagtgttacactttgtggggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattaga 37905868  T
Q  205 ttaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttg 304  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||   | ||||||     
T  37905867 ttaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttacatttttt 37905768  T
Q  305 atactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    ||  | |||||||||||||  || |||| |||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  37905767 atgttatagtgttaacttcacca-aaaaatcatttttataacttcaccatagaattttcca 37905708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13711820 - 13711465
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||    
T  13711820 ttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtattgtttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgct 13711721  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 202  Q
    | | |||||||||| || | | ||||| |||||| |||| ||||| |||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |     |||||||||    
T  13711720 ggcatctttaacatgcatacagagttgctgatatcatgtcatagtcttaactattatactttatggggtgttacacttaaaacatg-----ataaaatta 13711626  T
Q  203 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttt 302  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||| | |||    
T  13711625 gattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgataccatgtggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacacttt 13711526  T
Q  303 tgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttc 363  Q
    |||| || || ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  13711525 tgatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctgatgacttcaccatagaattttc 13711465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 19289162 - 19289521
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgttattat-tgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  19289162 tgtttaattcatttttaaattgttaatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtattattttatt 19289261  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    |  |   |||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  19289262 gtcggaatctttaacatgcacacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacatttataacaatgtaggataaaa 19289361  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| |||||||| ||| | ||| | |||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||    
T  19289362 ttagattaagtgtagtcttattaatctgatgagttgatgatactgtgagaacttaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcattatat 19289461  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||  | ||||||||||||| ||| |||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  19289462 ttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcat-----tgacttcaccatagaattttcc 19289521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 364
Target Start/End: Original strand, 4263926 - 4264280
Alignment:
Q  12 tttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctt 110  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||  || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  || |||||||| | || | ||||    
T  4263926 tttttaaattgttgattactgatcaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatctt 4264025  T
Q  111 taacatacaaatatagttgatgatattatgt-gatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaa 209  Q
    |||||| |||| | ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4264026 taacatgcaaacagagttgctgatatcatgttgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 4264125  T
Q  210 tgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatact 309  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||  |||| ||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||    
T  4264126 tgtattcttcttaatatgatgaattgataatactatggagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttactcacaacacttttgatgct 4264225  T
Q  310 ctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
     ||||||||||||   ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  4264226 atagtgttaactttaccagaaaagtcattatgatgacttcaccatagaattttcc 4264280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19314188 - 19313850
Alignment:
Q  23 ttattattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaa---tattattttatcgctgacctctttaacataca 119  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    || ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  19314188 ttattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgca 19314089  T
Q  120 aatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttg 219  Q
    || ||||||| |||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  19314088 aacatagttgctgatatcatgtgatagt-------gttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttg 19313996  T
Q  220 ttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaa 319  Q
    ||| |||||||||||| | ||| ||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||  |||||||||||||| | ||||||| || || ||||||    
T  19313995 ttaatctgatgaattgatgatactat-aggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtaaggtgttactcacaacacttttgatgctataatgttaa 19313897  T
Q  320 cttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
    ||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  19313896 cttcaccagaaaagtcattctaatgacttcaccatagaattttccat 19313850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 11366219 - 11366584
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  11366219 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttat 11366318  T
Q  99 cgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    || |||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||| || ||||||    
T  11366319 cgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgtttagaacaagatatgataaa 11366418  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||| |||| || ||| |||| | |||||||||  | |    
T  11366419 attatattaaatgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattatacaaatagtgagatgttactcattaca 11366518  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||  | ||||||||| |||  || |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||    
T  11366519 tttttgatgttatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattcttatgatttcaccatagaattttcc 11366584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 33709071 - 33709394
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  33709071 tgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaagtactattttatc 33709170  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
      |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33709171 attgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 33709270  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||  | ||| | ||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||| ||| |     
T  33709271 ttagattaagcgtattcttgttaatctgaatatttgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtactaacagtggagtgttactcgcaacac 33709370  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttc 323  Q
    |||||||  | |||||||||||||    
T  33709371 ttttgatgttatagtgttaacttc 33709394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4478717 - 4478365
Alignment:
Q  13 ttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctcttt 111  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||  || | |||||    
T  4478717 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatcttt 4478618  T
Q  112 aacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaaat 210  Q
    |||||  ||| | ||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  4478617 aacatggaaacagagttggtgatatcatgtgatagacttaagtgttacactttgtg-----ttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagt 4478523  T
Q  211 gtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactc 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| | |||||||  |     
T  4478522 gtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgccactgtacaaacaatggagtgttactcacaacacttttgatgtta 4478423  T
Q  311 tagtgttaacttcctcagaaaagtcattttc-gtgacttcaccatagaattttccatt 367  Q
    |||||||||||||  || |||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  4478422 tagtgttaacttcaccaaaaatatcattttctatgacttcactatagaattttccatt 4478365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 2325217 - 2325573
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  2325217 tgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 2325316  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2325317 gttgtaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaa 2325416  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | |||||        ||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||  | ||    
T  2325417 ttagattaagtgtagtcttgttaatttgatg--------atactatgaggactgaacttttgatgccagtgtacaaacaatggggtgttactcaatacat 2325508  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    || ||||  | || ||||||||||   ||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||    
T  2325509 ttatgatgttatattgttaacttcacgagaaaagtcattcacataacttcaccatagaattttcc 2325573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 31570576 - 31570937
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| |    
T  31570576 ttgattcatttttaaatatttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgtt 31570675  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 202  Q
    | | ||||||||||  ||| | ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31570676 ggcatctttaacatgtaaacagagttgttgatatcatgtgacagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaatta 31570775  T
Q  203 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttt 302  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||  | ||| |||| ||||| ||||||||||| || | || ||| |||||||||||||| |||| | |||    
T  31570776 gattaagtgtattcttgttaatctgatgaattcatgatactatgtggactgaacttttgatgtcactataaaaatagtggggtgttacttacaacacttt 31570875  T
Q  303 tgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    | ||  | ||||||||| |||  ||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||    
T  31570876 taatgttatagtgttaatttcaccagaaaagttattctcataacttcaccatagaattttcc 31570937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44286283 - 44285951
Alignment:
Q  30 tgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttg 129  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |  | | |||||||| |||| | |||||    
T  44286283 tgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagttg 44286184  T
Q  130 atgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgat 229  Q
     |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  44286183 ttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctgat 44286084  T
Q  230 gaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcaga 329  Q
    |||||  | ||| |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||| | | || ||| ||| | ||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  44286083 gaatttatgatactatgtggactaaacttttgatgccactatacaaacagtgagatattgctcgcaacacttttgatgctatagtgttaacttcatcaga 44285984  T
Q  330 aaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    ||| |||||  | |||||||||| || ||||||    
T  44285983 aaaatcattcgcatgacttcaccgtataatttt 44285951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 18494120 - 18494471
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  18494120 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatc 18494219  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| | ||| | |||||| |||||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18494220 gttggcatctttaacatgcaaacagagtcgttgatatcatgtgatagtcttaagtgtgactctttgtgaggt-ttacacttaatacaaggtaggataaaa 18494318  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    |||||| || |||||||| || | |||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| |            |||||||||||||||||| |     
T  18494319 ttagatcaagtgtattctagtgaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtc------------gtggggtgttactcacaacac 18494406  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18494407 ttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccacagaattttcc 18494471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 364
Target Start/End: Original strand, 27349789 - 27350142
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||     
T  27349789 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgt 27349888  T
Q  102 tgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 201  Q
    ||   |||||||| | |||| | ||||  |||||| ||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27349889 tggaatctttaacttgcaaacagagttcctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaatt 27349979  T
Q  202 agattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatattt 301  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| || | ||||| ||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27349980 agattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgtggtgttactcacaacattt 27350078  T
Q  302 ttgatactctagtgttaacttcctcagaaaa-gtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||| || |||||||||||||  || ||||  | |||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  27350079 ttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaatattattttaatgacttcaccataaaattttcc 27350142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 43770687 - 43771039
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  | ||| ||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||     
T  43770687 tgtttgattcatttttaaattgttgatttctaattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaagatactattttatt 43770786  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43770787 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaa 43770877  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  43770878 ttaaattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtgttactcacaacac 43770977  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||||||  | |||||||||||||  || |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  43770978 ttttgatgttatagtgttaacttcacca-aaaaatcattctaatgacttcaccatagaatttt 43771039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 59 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 36642293 - 36641988
Alignment:
Q  59 taatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgtta 158  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||   || |||||||||| || | ||||||||||  ||| | ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||    
T  36642293 taatgcttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgtta 36642194  T
Q  159 cactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa--ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaac 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||||||| |||    
T  36642193 cactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaac 36642094  T
Q  257 ttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatag 356  Q
    |||||||| || |||| |||||||| |||||||||| ||| | ||||||| || |||| |||| |||  ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  36642093 ttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcgcaacacttttgatgctatagtattaatttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatag 36641994  T
Q  357 aatttt 362  Q
    ||||||    
T  36641993 aatttt 36641988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 41465865 - 41465508
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  41465865 tgttcgattcaattttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 41465766  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41465765 gttggcatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaa 41465666  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |  | |||||| | ||| |||||||| | |||||||  ||||| |||||||||| |||  ||        | ||||| ||||||| | |     
T  41465665 ttagattaagttcagtcttgtgaatctaatgaattgatgatattatagggactgaacttttgataccagcgt--------tagggtgctactcactacac 41465574  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
     |||||| || |||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  41465573 ctttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcca 41465508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 70 - 364
Target Start/End: Original strand, 17071646 - 17071940
Alignment:
Q  70 acatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggg 169  Q
    |||||||||| |||||  || |||||||||| ||   |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17071646 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 17071745  T
Q  170 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccatt 269  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| |||||  ||  ||||||||||| ||||    
T  17071746 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaataccgaacttttgatgtcatt 17071845  T
Q  270 gtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||| ||| | || | ||||||| || | ||||||| |  | |||||||||||||  || ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  17071846 gtacaaataatgagatgttacttactacatttttgttgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattttcc 17071940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5881893 - 5881607
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||     
T  5881893 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgaataatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatt 5881794  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| | | ||| |||||| ||||||         ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  5881793 gttgacatctttaacatgcaaacaaaattgttgatatcatgtga---------gtgttacactttgtgaggtattacacttaaaacaaggtatgataaa- 5881704  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaa 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| || | ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5881703 ttagattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactcaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaa 5881607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 70 - 364
Target Start/End: Original strand, 17054005 - 17054299
Alignment:
Q  70 acatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggg 169  Q
    |||||||||| |||||  || |||||||||| ||    ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17054005 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgtggg 17054104  T
Q  170 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccatt 269  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||| | |||||||||  ||   |||||||||| ||||    
T  17054105 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaataccgnacttttgatgtcatt 17054204  T
Q  270 gtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||| ||||| || | ||||||| || | |||||||||  | |||| ||||||||  || ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  17054205 gtacaaacaatgagatgttacttactacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaagtcattcgcatgacttcaccatagaattttcc 17054299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 59 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45328025 - 45327801
Alignment:
Q  59 taatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgtta 158  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  45328025 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgtta 45327926  T
Q  159 cactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaactt 258  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||    
T  45327925 cactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaactt 45327826  T
Q  259 ttgatgccattgtataaacagtggg 283  Q
    |||||| ||  ||||||||| ||||    
T  45327825 ttgatgtcaccgtataaacaatggg 45327801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 35959256 - 35958907
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |     || |||||||||    
T  35959256 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacatg----tactattttatc 35959161  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  35959160 gttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaactgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggat-aaa 35959062  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||| ||||| || | |||||||| | ||||||||||        |||    || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||  | ||    
T  35959061 ttatattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattg--------atg----ctgaacttttaatgtcattgtacaaacagtggggtgttgctcattacat 35958974  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
    |||| ||  | |||||  ||||||  || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  35958973 tttttatgttatagtggcaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcatcatagaattttccat 35958907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 91 - 362
Target Start/End: Original strand, 41463780 - 41464051
Alignment:
Q  91 tattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggt 190  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  41463780 tattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttacattttgtgaggtgttacaattaaaacaaagt 41463879  T
Q  191 aggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttac 290  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  41463880 atgataaaattatattaaaagtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtgttac 41463979  T
Q  291 tcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||||| | |||||||  | |||| ||||||||  || ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  41463980 tcacaacacttttgattttatagtattaacttcaccaaaaatgtcattctcacgacttcaccatagaatttt 41464051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 125 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 33902305 - 33902064
Alignment:
Q  125 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagt 224  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  33902305 agttaatgatattatgtgatactattaagtgttacactttgtggggtgctacccttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaatatagtcttgttaat 33902206  T
Q  225 ctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcc 324  Q
    |||||||| || | ||| | |||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||||| | ||||||  ||   |||||||||||||     
T  33902205 ctgatgaactgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtattactcactacattttt--tatgttagtgttaacttca 33902108  T
Q  325 tcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccattc 368  Q
     ||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||||||||    
T  33902107 ccagaaaagtcattctaacgacttcatcatagaattttccattc 33902064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31862214 - 31861981
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgc 101  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||||| |     
T  31862214 tttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtctacaatatcttggacttacaagtactattttattgt 31862115  T
Q  102 tgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 201  Q
     |   || ||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| | |||||||    
T  31862114 cggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaatgtatgttaaaatt 31862015  T
Q  202 agattaaatgtattcttgttagtctgatgaattg 235  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  31862014 agattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattg 31861981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 7006777 - 7007054
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  7006777 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatc 7006876  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||| | ||||                 |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7006877 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatattcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaa 7006959  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcac 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| | ||| |||| | |||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||    
T  7006960 ttagattaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgatactatgggaactaaacttttgatgctactgtacaaacagtgggatgttactcac 7007054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 169
Target Start/End: Original strand, 19500756 - 19500923
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||  || ||||||||||     
T  19500756 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaaattacatgtactattttatcgt 19500855  T
Q  102 tgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggg 169  Q
    | || ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19500856 taacatctttaacatgtaaatagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggg 19500923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 222
Target Start/End: Original strand, 18258233 - 18258348
Alignment:
Q  107 tctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 206  Q
    |||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18258233 tctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaaaaatgtaggataaaattagatt 18258332  T
Q  207 aaatgtattcttgtta 222  Q
    || | |||||||||||    
T  18258333 aagtttattcttgtta 18258348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 83
Target Start/End: Original strand, 41463432 - 41463512
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggactta 83  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  41463432 ttgattcatttttaaattattaattattgattaatgatcaatagtaatttatctattaatgtttacaacatcttagactta 41463512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 41051139 - 41051238
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||   ||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  41051139 tgtttgattcatttttgaattgttgattattgattaatgatcaataacaattcatctagcaatgcttacaacatcttgaacttacaggtactattttatc 41051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 337
Target Start/End: Original strand, 41051263 - 41051382
Alignment:
Q  219 gttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgcca-ttgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgtt 317  Q
    |||| |||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| ||||  ||||||  ||||| | ||||||| || |||| ||    
T  41051263 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactggtacaaatagtgaagtgttatacacaacacttttgatgctatagtatt 41051362  T
Q  318 aacttcctcagaaaagtcat 337  Q
    | |||| |||||||||||||    
T  41051363 agcttcatcagaaaagtcat 41051382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 311 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41960936 - 41960883
Alignment:
Q  311 tagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  41960936 tagtgttaacttcatcaaaaaagtcatttctatgacttcaccatagaattttcc 41960883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 366
Target Start/End: Original strand, 17245120 - 17245160
Alignment:
Q  326 cagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17245120 cagaaaagtcattctcgcgacttcaccatagaattttccat 17245160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Original strand, 34441934 - 34441969
Alignment:
Q  329 aaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34441934 aaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 34441969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 76
Target Start/End: Original strand, 18257383 - 18257453
Alignment:
Q  7 attcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatctt 76  Q
    ||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18257383 attcattttaaaattgtcgattactgattaatgataaataataattcatctagtaatgcttgcaacatctt 18257453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 235
Target Start/End: Original strand, 19501760 - 19501813
Alignment:
Q  181 aaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattg 235  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  19501760 aaaacaaagtagaataaaattagattaaatgtagt-ttgttaatctgatgaattg 19501813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Original strand, 18947598 - 18947642
Alignment:
Q  316 ttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatt 360  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18947598 ttaacttcaccagaaaagttattttcatgacttcaccatagaatt 18947642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 36867126 - 36866761
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36867126 tgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 36867027  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36867026 gttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 36866927  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36866926 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatcgggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaatat 36866827  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    |||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36866826 ttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 36866761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40133749 - 40133382
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40133749 tgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 40133650  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40133649 gttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 40133550  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  40133549 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatattatggggactgaacttttgatgccattgtacaaatagtggggtgttactcacaacat 40133450  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccatt 367  Q
    |||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40133449 ttttgatactataatgttaacttcaccacaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccatt 40133382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36860785 - 36860423
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36860785 ttgattcatttttaaattgttgattactaattcatgattaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgtt 36860686  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacactt-aaaacaaggtaggataaaatt 201  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  36860685 gacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaaaaaaggtaggataaaatt 36860586  T
Q  202 agattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatattt 301  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36860585 agattaaatgtactcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattt 36860486  T
Q  302 ttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    || ||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36860485 tttatactatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 36860423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Original strand, 21088580 - 21088942
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgttattattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  21088580 tgtttgattcatttttaaattg--attatttattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggatttacagatgttattttatcg 21088677  T
Q  101 ctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaat 200  Q
     || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21088678 ttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaagt 21088777  T
Q  201 tagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  21088778 tagattaaatgtattcttgttagtatgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgtcactcacaacatt 21088877  T
Q  301 tttgatactctagtgttaacttc-ctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    ||| |||||  ||| |||||||| |  | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21088878 ttttatactacagt-ttaacttcaccaaaaaaagtcattttcgtgacttcatcgtagaattttcca 21088942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 699514 - 699147
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  699514 tgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatc 699415  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  699414 gttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggagtgttacacttaaaataaggtatgataaaa 699315  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  699314 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcactagat 699215  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccatt 367  Q
    |||| || || ||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||| |||||| ||||    
T  699214 tttttatgctatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcataacttcaccataaaatttttcatt 699147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 38528048 - 38528411
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  38528048 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatc 38528147  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||  ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  38528148 gttgatatctttaacatgtaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaagataaaa 38528247  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| || | |||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||  | |     
T  38528248 ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatga-gactgaacttttgatgtcactgtataaacaatggggtgttactcattacaa 38528346  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||  | ||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38528347 ttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaaccattttcatgacttcaccatagaattttcc 38528411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22981157 - 22980794
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22981157 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgattgcaacatcttggacttacatatactattttatc 22981058  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22981057 gttggcatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 22980958  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||  |||    
T  22980957 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgctcaaacagtggggtattactcactgtat 22980858  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttc 363  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| || | |||||| |||| |||||||    
T  22980857 ttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttcatcataaaattttc 22980794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 12910719 - 12910350
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||     
T  12910719 tgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattgtatt 12910620  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12910619 gttggcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 12910520  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgcc-----attgtataaacagtggggtgttactcac 294  Q
    ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||| |     | |||| ||||||||||||||||| |||    
T  12910519 ttagattaagtgtagtcatgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtactgtacaaacagtggggtgttacgcac 12910420  T
Q  295 aatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
     |||||||||||  | |||| ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12910419 tatatttttgatgttatagttttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 12910350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 30969135 - 30969499
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||     
T  30969135 tgtttgattcatttttaaattgtggattactgattaatgattaatagtaactcatctagtaatacttgcagcatcttgaacttatagatactattttatt 30969234  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30969235 gttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaa 30969334  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |     
T  30969335 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtataaatagtggggtgttactcacaacac 30969434  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||  | |||||||||||||  |||| || ||||| || ||||||||   |||||||||||    
T  30969435 ttttgatgttatagtgttaacttcaccagataaatcattctcatgacttcattgtagaattttcc 30969499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 8741696 - 8742062
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||  || |||||||||    
T  8741696 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtgatgcttgcaacattttggacttacatgtactattttatc 8741795  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatatt-atgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    | |||| |||||||||| |||| | ||||| | ||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  8741796 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgctcataatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgacaaa 8741895  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagt-ggggtgttactcacaat 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| | ||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||     
T  8741896 attagattaattgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccattgtacaaacaatgggggtgttactcacaac 8741995  T
Q  298 atttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    | ||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  8741996 acttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 8742062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 31786457 - 31786823
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  31786457 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 31786556  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31786557 gttggcatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaagataggataaaa 31786656  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| || | |||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||   | ||||| | ||    
T  31786657 ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggcagtgctcactacat 31786756  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
    |||| || || |||||||||||||  || |||||||||| ||   ||||||| ||||||||||||||    
T  31786757 ttttcatgctatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcactacttcactatagaattttccat 31786823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5837916 - 5837557
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || |||||| ||| |    
T  5837916 ttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttgcaggtactattttgtcgtt 5837817  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 202  Q
    | | |||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5837816 gtcatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaatgtaggattaaatta 5837717  T
Q  203 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttt 302  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||| | ||| ||||  |||| || |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5837716 gattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactatggagactgaaattttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttt 5837617  T
Q  303 tgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||| || |||||||| ||||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||    
T  5837616 tgatgctatagtgttaccttcaccagaaaagtcattctcatgaattcaccgtagaatttt 5837557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7693585 - 7693229
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7693585 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtattattttatc 7693486  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| | ||||| | |||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7693485 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgctaatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaa 7693395  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    |||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||| | ||| || ||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |     
T  7693394 ttagattaagcgtattcatgttaatctaatgaattgatgatactaagaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtgggatgttactcacaacac 7693295  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    |||||||  | |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7693294 ttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttaatgacttcaccatagaattttcca 7693229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19120220 - 19119859
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |  || |||||||||| |    
T  19120220 ttgattcatttttaaattgttgatcactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagactttgaggtactattttatcgtt 19120121  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 202  Q
    | | |||||||||| ||||   ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19120120 ggcatctttaacatgcaaacggagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttatacttaaaacaaggtaggataaaatta 19120021  T
Q  203 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttt 302  Q
    || ||| | ||||||||||| |||||||||||| | | | |||| ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||| | |||    
T  19120020 gagtaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgacactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactagcaacacttt 19119921  T
Q  303 tgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||| || |||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19119920 tgatgctatagtgttaacttcaccacaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 19119859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 362
Target Start/End: Original strand, 25500739 - 25501099
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgc 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||     
T  25500739 tttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaacagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgt 25500838  T
Q  102 tgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 201  Q
    || | ||||||||||  ||| | ||||| |||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25500839 tggcatctttaacatctaaagaaagttgctgatatcatgtgatgatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 25500938  T
Q  202 agattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatattt 301  Q
    | ||||| | ||||||||||| |||||||||||| | ||| |||  ||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||| |||||| | ||    
T  25500939 aaattaagtttattcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggacttaacttttgatggcagtgtacaaacagtgaggtgttattcacaacactt 25501038  T
Q  302 ttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    ||||| || ||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25501039 ttgatgctatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 25501099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 9200586 - 9200233
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||     
T  9200586 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttatagatactattttatcgt 9200487  T
Q  102 tgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 201  Q
    || | |||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9200486 tggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggaatgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 9200396  T
Q  202 agattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatattt 301  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||| | ||    
T  9200395 agattaaatgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaagaggactaaacttttgatgtcactgtacaaactgtggggtgttactcacaacactt 9200296  T
Q  302 ttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||  | |||||||||||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  9200295 ttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagttattttaatgacttcaccataaaattttcc 9200233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 15724852 - 15724488
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||| || ||||||||     
T  15724852 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaatattttggacttacaagtactattttata 15724753  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| ||||||||||  ||| | ||||| |||||| || ||||||| |||| || ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  15724752 gttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaa 15724653  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||| | |||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  15724652 ttaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatg-ggactgaac-tttgatgtcattgtataaacagtggggtgttactcacaaaac 15724555  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
    |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  15724554 ttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttccat 15724488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 27318299 - 27318660
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaa-ttgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    || ||||||||    
T  27318299 tgtttgattcatttttaaaattgttgatttttgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatcttaaacttatg--tactattttat 27318396  T
Q  99 cgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    || |||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27318397 cgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaa 27318496  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| | |    
T  27318497 attagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactgtgagaactaaacttttgatgtcattgtacaaacagtggtgtgttactcactaca 27318596  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||| | |||||||    
T  27318597 ttttttatgttttagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccgttgaatttt 27318660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Original strand, 35511293 - 35511655
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  35511293 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatc 35511392  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  35511393 gttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaa 35511487  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||| || | || ||||||||| ||||||||||| | |     
T  35511488 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattggtgatagtatgatgactgaacttttgatgtcactttacaaacagtggagtgttactcactacag 35511587  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccatt 367  Q
    | |||||  | || |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35511588 tgttgatgttataatgttaacttcatcagaaacgtcattttcatgacttcaccataggattttccatt 35511655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22255546 - 22255181
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  22255546 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaaggcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 22255447  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   | |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||| |||||    
T  22255446 gttggaatatttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagttttaagtgttacactttgtgtggtgttacgcttataacaaaataggctaaaa 22255347  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata- 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | |     
T  22255346 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgataatatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggggtgttactcattacat 22255247  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||  | || ||||||||||  || |||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||    
T  22255246 tttttgatgttataatgttaacttcaccaaaaaagttatttttatgacttcaccgtagagttttcc 22255181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 27330668 - 27330306
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||  |||||||     
T  27330668 tgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttatt 27330569  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||  |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27330568 gttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaa 27330469  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||| |     
T  27330468 ttagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtaaggtgttact--caacac 27330371  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||  | |||||||||||||  |||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  27330370 ttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttcc 27330306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 39573175 - 39572819
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  39573175 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 39573076  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
      || | ||||||||| |        |||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39573075 attggcatctttaacaga--------gttgttgatatcatgtgatagtctcgagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 39572984  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | ||| |||||| ||| ||||||||||| || || | ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  39572983 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtggagtgttactcacaacat 39572884  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||| ||| | |||| |||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39572883 tttttatattatagtattaacttaactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 39572819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 57 - 366
Target Start/End: Original strand, 23116090 - 23116399
Alignment:
Q  57 agtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgt 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23116090 agtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 23116189  T
Q  157 tacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaac 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||| | ||| ||||   ||| |||    
T  23116190 tacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactatgtaaactgaac 23116289  T
Q  257 ttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatag 356  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||  | || |||||||||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23116290 ttttgattccactgtacaaacagtggggtgctactcactacagttttgatgttataatgttaacttcataaaaaaagtcattttcatgacgtcaccatag 23116389  T
Q  357 aattttccat 366  Q
    ||||||||||    
T  23116390 aattttccat 23116399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 22973893 - 22974257
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  22973893 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 22973992  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    |  ||  |||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  22973993 gtcgaaatctttaacatgcaaacagagttgataatattatgtaatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacgcttataacaagataggataaaa 22974092  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| | ||| |||||| | | |||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||  |  |    
T  22974093 ttagattaagtgtagtcttgttattctgatgagttgatgataatatgagaattgaacttttgatgttattgtacaaacagtgggatgttactcattactt 22974192  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||  | |||||||||||||  || |||| ||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  22974193 ttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttcaccatagaattttcc 22974257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 33908596 - 33908245
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  33908596 tgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaatt-atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 33908498  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  33908497 gttggcatctttaacatacaaacatagttgacgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaa 33908398  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| || | |||||||| |||||  ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||| | |     
T  33908397 ttagattaagtgcagtcttgttaatctgaataattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggagtgctactcactacac 33908298  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcacc 352  Q
    |||||||  | ||||||| |||||  ||||||  ||||| || ||||||||||    
T  33908297 ttttgatgatatagtgttgacttcaccagaaagttcattctcatgacttcacc 33908245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 22019985 - 22019631
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  22019985 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttagacttacaagtattattttatcgt 22019886  T
Q  102 tgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 201  Q
    || | |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||         |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22019885 tggcatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtga---------gtgttatactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatt 22019795  T
Q  202 agattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatattt 301  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||| || | ||| || | ||||| ||||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  22019794 agattaagtgtattcttgttaatatgatgaagtgatgatactaaggggacttaacttttgatgtcactatacaaacaatggggtgttactcacaacactt 22019695  T
Q  302 ttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    ||||| || |||| ||||||||  ||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||    
T  22019694 ttgattctatagttttaacttcaccagaaaagtcattctaataacttcaccatagaaatttcca 22019631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 31705423 - 31705785
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||    
T  31705423 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtactattttatc 31705522  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
      ||   |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  31705523 tttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatggtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaa 31705622  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| || |||||||  |||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||   | ||    
T  31705623 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactggacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttacat 31705721  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttc 363  Q
    |||||||  | |||||||||||||  || |||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  31705722 ttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattttc 31705785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 32563504 - 32563150
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  32563504 tgtttgattcatttttaaattgttaattgctgattaatgatcaataataatttatctagtaattcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 32563405  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | ||| |||||| |||| | ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32563404 gttggcatctataacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtgggctgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 32563314  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||| ||||||||||| || |||| | ||||||| ||||||||||||| |     
T  32563313 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggggactgaacttttgatgtcactgtacagacagtggagtgttactcacaacac 32563214  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttc 363  Q
    |||||||  | ||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32563213 ttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaaatcattttaatgacttcaccatagaattttc 32563150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 35826297 - 35826658
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  35826297 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 35826396  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||  ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  35826397 gttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta--tgataatcttaagggttacactttgtggagtgttacgcttaaaacaatgtagaataaaa 35826494  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    |||||||||||||  | |||||| ||| ||||| || | ||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||  ||||||||||  | ||    
T  35826495 ttagattaaatgtggtattgttaatct-atgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgaagtgttactcagtacat 35826593  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||  | |||| ||||||||   | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  35826594 ttttgatgttatagtattaacttcacaaaaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcc 35826658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 364
Target Start/End: Original strand, 1428997 - 1429320
Alignment:
Q  24 tattattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaata 123  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| || | |||||||||| ||||||    
T  1428997 tattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaata 1429096  T
Q  124 tagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttag 223  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||||||                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  1429097 aagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgt-----------------tacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaa 1429179  T
Q  224 tctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttc 323  Q
    | |||||||||| | ||| ||||  |||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  1429180 tttgatgaattgatgatactatggagactgaatttttgatgccagtgtacaaacagtggggtgttactcactatatttttgatgctatagtgttaacttc 1429279  T
Q  324 ctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
      || || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1429280 accaaaagagtcattttcatgacttcaccatagatttttcc 1429320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 35934260 - 35933902
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||     
T  35934260 tgtttgaatcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcaactagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttatt 35934161  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaa 198  Q
    | |||| ||||||||||  ||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35934160 gttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 35934061  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||  ||||  ||||||||||||| |        |||| |||||||||||||| |    
T  35934060 actagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactggacttttgatgccact-------aagtgaggtgttactcacaaca 35933968  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
     ||||||| || ||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  35933967 cttttgattctatagtgttaacttcatcaaaaaaatcattctcatgacttcaccatacaattttcc 35933902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 102 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26268336 - 26268076
Alignment:
Q  102 tgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 201  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26268336 tgacatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgcggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaatt 26268237  T
Q  202 agattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatattt 301  Q
     |||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| || | ||    
T  26268236 tgattaattgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactcaaaacactt 26268137  T
Q  302 ttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    ||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||  |||||||||    
T  26268136 ttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcactgtagaatttt 26268076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5830249 - 5829972
Alignment:
Q  8 ttcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||       
T  5830249 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaa 5830150  T
Q  107 tctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 206  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  5830149 tctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaatgagatt 5830050  T
Q  207 aaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactca 293  Q
    || |||| |||||||         ||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||    
T  5830049 aagtgtagtcttgtt---------aattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactca 5829972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 15992351 - 15992636
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||    
T  15992351 tgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttatc 15992450  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| | ||||  |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||    
T  15992451 gttggcatctttaacatgcaaacagagttcctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttgcactcaaatcaaggtagaataaaa 15992550  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggt 285  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  15992551 ttagatcaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggt 15992636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Original strand, 14409152 - 14409504
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||  ||| | ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14409152 tgttcgattcatttttaaattgttgattgctgaataatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaagtactattttatc 14409251  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||               ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14409252 gttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagagta--------------gttacacttaaaacaaggtagaataaaa 14409337  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| || | |||||||| |||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||| ||||||| | ||    
T  14409338 ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgag-actgaacttttgatgccaccgtattaagagtggggtgctactcactacat 14409436  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccatt 367  Q
    |||||||  | ||||||| |||||  ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14409437 ttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttccatt 14409504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 7208675 - 7208966
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  7208675 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatc 7208774  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   |||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  7208775 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgaaaatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgtttataacaaggtaggataaaa 7208874  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactc 292  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||| || |||| |||| || |||||||||||    
T  7208875 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcaatgtacaaacggtagggtgttactc 7208966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 23954613 - 23954904
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgttattattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||      |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||     ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23954613 tgtttaattcatttttaaattgtt------gattaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgtt-----catcttgcacttacaaatattattttatcg 23954701  T
Q  101 ctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaat 200  Q
     || | | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23954702 ttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaat 23954800  T
Q  201 tagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgcca-ttgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    |||||||| |||| |||||||| | |||||||||| | ||| ||||   ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23954801 tagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggaaactgaacttttgatgccactagtaaaaacagtggggtgttactcactatat 23954900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 17157842 - 17158208
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  17157842 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatc 17157941  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||  |||||| ||| |||| | ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||    
T  17157942 gttgaaatctttatcatgcaaacagagttgataatattatgtgatggtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataataaggtaagatacaa 17158041  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||  | ||| ||| | |||  ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||  | ||    
T  17158042 ttatactaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactataatgac-gaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacat 17158140  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttc---ctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||| ||  | |||||||||||||      | |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17158141 tttttatgttatagtgttaacttcacaaaaaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattttcc 17158208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 42343085 - 42342791
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |  |||||||||    
T  42343085 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtcctattttatc 42342986  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| | |||||||||||| |||||         ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  42342985 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggtgtattacacttaaaacaa-gtaagataaaa 42342896  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| || | |||  ||  |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  42342895 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaagggga--aattttttgatgtcactgtataaacagtggggtattactcacaacat 42342798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 35504729 - 35504436
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  35504729 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 35504630  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||  |||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||    
T  35504629 gttgaaatctttaacatgcaaacagatttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataatatggtaggataaaa 35504530  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactca 293  Q
    ||| ||||| |||| |||||||| | |||||||||| | ||| ||| | || | ||||||||||| |||  || |||| ||| |||||||||||    
T  35504529 ttatattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgattgaacttttgatgtcatcatacaaacggtgaggtgttactca 35504436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8437323 - 8436970
Alignment:
Q  7 attcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgac 105  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||| || |    
T  8437323 attcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggc 8437224  T
Q  106 ctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagat 205  Q
     |||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8437223 atctttaacattcaaacagagttgatcatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaaacaaggcaggataaaattagat 8437124  T
Q  206 taaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttga 305  Q
    |||   || | |||| | |||||||  ||| | |||| ||||||||| ||||||||||| || |||| ||||| |||| |||||||||| | | ||| ||    
T  8437123 taagcatagttttgtaaatctgatg-gttgatgatataatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatgggatgttactcactacactttgga 8437025  T
Q  306 tactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatt 360  Q
      || ||||||||| |||  || |||| ||||| || |||||||||  |||||||    
T  8437024 agctatagtgttaatttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcacattagaatt 8436970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 125 - 364
Target Start/End: Original strand, 5112250 - 5112488
Alignment:
Q  125 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagt 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | || |||||||| |    
T  5112250 agttgatgatattatgtgaaagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgttaat 5112348  T
Q  225 ctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcc 324  Q
     | |||||||| | ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||| ||||||||     
T  5112349 ttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactatattttttatgttatagtattaacttca 5112448  T
Q  325 tcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
     || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5112449 ccaaaaaagtcattttcatgacttcaccataaaattttcc 5112488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 24886451 - 24886102
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  24886451 tgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 24886352  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||                 ||||| || ||||||||||||||    
T  24886351 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttac-----------------acttataataaggtaggataaaa 24886269  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | |||||| ||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||    
T  24886268 ttagattaagtgtagtcttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacat 24886169  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaactt--cctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||  | |||| |||||||  ||  | |||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||    
T  24886168 ttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaaagtcattctcatgatttcaccataaaattttcc 24886102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 2888256 - 2888469
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  || |||||||||    
T  2888256 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttggacttacaggtactattttatc 2888355  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| |||| ||||||||||  ||||||    
T  2888356 gttgacatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatctgatagtcttaagtgttacactttatggaatgttaaacttgaaacaaggtaaaataaaa 2888455  T
Q  200 ttagattaaatgta 213  Q
    ||||||||| ||||    
T  2888456 ttagattaagtgta 2888469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 51 - 306
Target Start/End: Original strand, 6824343 - 6824598
Alignment:
Q  51 tcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagtttt 150  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||  |||| |||||||  |||| |||||||||| |||| | ||||| | ||||  ||||||||| ||    
T  6824343 tcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatct-tgacatctttaacatgcaaacagagttgct-atatcttgtgatagtctt 6824440  T
Q  151 aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgagga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||| ||    
T  6824441 aagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattgatgatactatgaaga 6824540  T
Q  251 ct--aaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgat 306  Q
    ||  | |||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  6824541 ctgaacacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgat 6824598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 107 - 364
Target Start/End: Original strand, 14919446 - 14919704
Alignment:
Q  107 tctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 206  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14919446 tctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatttgtgaggtgttacacttataataaggtaggataaaattagatt 14919545  T
Q  207 aaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgat 306  Q
    || |||| | |||||| | |||||| ||| | ||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||    
T  14919546 aagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatataaacagtgaggtgttactcattacatttttgat 14919645  T
Q  307 actctagtgttaacttcctc-agaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
      | || |||||||||| || | |||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  14919646 gttataatgttaacttcatcaaaaaaaataattctcatgacttcaccatataattttcc 14919704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 364
Target Start/End: Original strand, 13956187 - 13956520
Alignment:
Q  15 ttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaa 113  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || |||||||||| || | |||||||    
T  13956187 ttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaa 13956286  T
Q  114 catacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgta 213  Q
    ||| |||| | | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||| || |    
T  13956287 catgcaaacaaatttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacgctttgtagggtgttacacttgaaacaagataaaataaaattagattaagtgaa 13956386  T
Q  214 ttcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctag 313  Q
     | |||||| |||||||||||| | |||  ||                |||| | |||| |||||||| |||||||||||| | | |||||||  | |||    
T  13956387 gttttgttaatctgatgaattgatgatac-at----------------atgcaagtgtacaaacagtgaggtgttactcactacagttttgatgttatag 13956469  T
Q  314 tgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13956470 tgttaacttcatgagaaaagtcattttcatgacttcaccgtagaattttcc 13956520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 323
Target Start/End: Original strand, 28416490 - 28416661
Alignment:
Q  152 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggac 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |  ||     
T  28416490 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattaaggagat 28416589  T
Q  252 taaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttc 323  Q
    | |||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  28416590 tgaacttttgattccactgtacaaacagtgggatgttactcacaatacttttgatattatagtgttaacttc 28416661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25669940 - 25669733
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||  || |||||||||    
T  25669940 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatc 25669841  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| | |||||||||||| |||||         |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25669840 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatgtg---------agtgttacac-ttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaa 25669751  T
Q  200 ttagattaaatgtattct 217  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  25669750 ttagattaagtgtattct 25669733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 355
Target Start/End: Original strand, 43308473 - 43308818
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgc 101  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||| |     
T  43308473 tttgattcgtttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttattgt 43308572  T
Q  102 tgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 201  Q
     |   |||||||||| |||  | ||||||||||||        ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  43308573 cggaatctttaacatgcaagaagagttgatgatat--------agtcttaagtgttacacttttcagggtgttacacttataacaaggtaagataaaatt 43308664  T
Q  202 agattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatattt 301  Q
    ||||||| | || | ||||||  ||||||| ||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||  | ||||    
T  43308665 agattaagtatagttttgttaagctgatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacgaacagt-gggtgttattcattacattt 43308763  T
Q  302 ttgatactctagtgttaac-ttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccata 355  Q
    |||||  | || ||||||| || || | |||||||||| || |||||||||||||    
T  43308764 ttgatgttataatgttaactttactaaaaaaagtcattctcatgacttcaccata 43308818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8467090 - 8466745
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8467090 tgtttgattcatttttaaactgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaataatattttatc 8466991  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | | ||  |||||| ||  ||| | ||||| |||||| || ||||||| |||||||||||| ||                 |||||||||||| ||||||    
T  8466990 gtt-acacctttaatatgtaaacagagttggtgatatcatatgatagtcttaagtgttacattt-----------------aaaacaaggtagaataaaa 8466909  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||| | ||| |||| ||| | |||||||||| ||| |||| ||| || ||||||||| |||||| |     
T  8466908 ttaaattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgataccactgtacaaagag-ggggtgttattcacaacac 8466810  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||  |  ||||||||||||  ||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||    
T  8466809 ttttgatgttacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacctcatcatagaattttcc 8466745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25889734 - 25889593
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  || ||||||||     
T  25889734 tgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctttcaacatcttggatttacaggtactattttatt 25889635  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgt 141  Q
    | ||   |||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  25889634 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgt 25889593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 28416362 - 28416462
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  28416362 tgtttgattcttttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatc 28416461  T
Q  100 g 100  Q
    |    
T  28416462 g 28416462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25668803 - 25668707
Alignment:
Q  210 tgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgat 306  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| | ||| || | ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  25668803 tgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgccactgttcaaacagtggggtgttactcacaacacttttgat 25668707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 365
Target Start/End: Original strand, 26317774 - 26317860
Alignment:
Q  279 gtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||  | |||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26317774 gtggggtgttactcgttatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcatcatagaattttcca 26317860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 43254219 - 43254156
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatg 63  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  43254219 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 43254156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 366
Target Start/End: Original strand, 16004474 - 16004554
Alignment:
Q  287 ttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtc-attttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
    |||||||||| |||||||||  | |||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  16004474 ttactcacaacatttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcaattctcatgactttaccatagaattttccat 16004554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22616542 - 22616494
Alignment:
Q  316 ttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22616542 ttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 22616494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11898139 - 11897999
Alignment:
Q  227 gatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctc 326  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||| ||||||||||||    | ||||||| || || | |||||||   |    
T  11898139 gatgaattgatgatactatgaggactaaacttttgatgtcactgtacaactagtagggtgttactcagtgcacttttgatgctataatattaactttacc 11898040  T
Q  327 agaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccatt 367  Q
    |||||||| ||| || |||||||||| || |||||| ||||    
T  11898039 agaaaagttattatcatgacttcaccctaaaatttttcatt 11897999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 11898193 - 11898148
Alignment:
Q  125 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtgggg 170  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  11898193 agttgatgatgttatgtgatattcttaagggttacactttgtgggg 11898148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 10237451 - 10237415
Alignment:
Q  327 agaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttc 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10237451 agaaaagtcattttcatgacttcacaatagaattttc 10237415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 26269166 - 26269074
Alignment:
Q  8 ttcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| | | |||||| |||||||| || || |||||||||  |||||||  || |||||||||    
T  26269166 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtattgcttacaacatcttaaacttacaggtactattttatc 26269074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 56)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 4583258 - 4582893
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4583258 tgtttaattcatttttaaattgttgatgactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattatttgatc 4583159  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4583158 gttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaa 4583059  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  4583058 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacat 4582959  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    |||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4582958 ttttgatactatagtattaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 4582893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 49 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 43686330 - 43686016
Alignment:
Q  49 attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagtt 148  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43686330 attcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtt 43686231  T
Q  149 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgag 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |    
T  43686230 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactatagg 43686131  T
Q  249 gactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgactt 348  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  43686130 gactgaacttttgatgccattgtacaaacagt-gggtgttactcacaacatttttgatattatagtgttaacttcacccaaaaagtcattttcgtgactt 43686032  T
Q  349 caccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||||||||||    
T  43686031 caccatagaattttcc 43686016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 32432791 - 32432432
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||||||||    
T  32432791 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattcatgattaataataattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatc 32432692  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | ||||||| || |||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32432691 gttggcatctttaatatgcaaacagtgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 32432592  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  32432591 ttatattaactgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgtcattgtacaaacaatggggtgttactcacaacat 32432492  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||     |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32432491 ttttga-----tagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 32432432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 9355648 - 9356012
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  9355648 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatc 9355747  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9355748 gttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggatgaaa 9355847  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    ||| |||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| || ||||| | ||    
T  9355848 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaacgataatatgagaactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtattgctcactacat 9355947  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||| || || ||||||||| |||  || ||  |||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  9355948 tttttatgctatagtgttaaattcaccaaaatggtcattctcatgacttcaccataaaattttcc 9356012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 32820875 - 32821239
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  32820875 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgatgaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 32820974  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   |||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32820975 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaa 32821074  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
     || ||||| |||| |||||||| ||| |||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||    
T  32821075 ctaaattaactgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacat 32821174  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||  | || ||||||||||  || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32821175 ttttgatgttatattgttaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcc 32821239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 37110213 - 37109846
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  37110213 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 37110114  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagg--taggataa 197  Q
    | |||  |||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||    
T  37110113 gttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtataggataa 37110014  T
Q  198 aattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaat 297  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  |     
T  37110013 aattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattac 37109914  T
Q  298 atttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    |||||| ||  | |||||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37109913 attttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcca 37109846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 27284073 - 27283718
Alignment:
Q  11 atttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctct 109  Q
    ||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||   |||    
T  27284073 atttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatct 27283974  T
Q  110 ttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaa 209  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  27283973 ttaacatgcaaacatagttgataatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaag 27283874  T
Q  210 tgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatact 309  Q
    | || |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||  | |||||||||  |    
T  27283873 tatagtcttgttaatctgataaattgataatactatgaggactgaacttttgatttcattgtacaaacggtggggtgttactcattacatttttgatgtt 27283774  T
Q  310 ctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
     |||||||||||||  || |||| |||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  27283773 atagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttataacttcaccatagaattttcca 27283718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18797666 - 18797304
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  18797666 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatt 18797567  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    |  |   |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18797566 gtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttataacaaggtaggataaaa 18797467  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| | ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||    
T  18797466 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacat 18797367  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||  ||   |||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18797366 tttt--tatgttagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 18797304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 31578886 - 31579255
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31578886 tgtttgattcatttttaaattattgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatc 31578985  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31578986 gttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttatacttataacaaggtaggataaaa 31579085  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgta-----taaacagtggggtgttactcac 294  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||     |||||||||||||||||||||     
T  31579086 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcattgtataaattaaacagtggggtgttactcat 31579185  T
Q  295 aatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
     | |||||||||  | |||||||||||||  || |||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  31579186 tacatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaattattcttatgacttcaccatagaattttcc 31579255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8861624 - 8861257
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  8861624 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtaatgcatgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 8861525  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   |||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8861524 gttggtatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatggtcttgagtgttacactttgcggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 8861425  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| | ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| || |     
T  8861424 ttagattaaatgtattgttgttaatctgattaattgatgatactatggggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttattcataacac 8861325  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccatt 367  Q
    ||||||| || |||||||||||||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8861324 ttttgatgctatagtgttaacttcgcgagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccatt 8861257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30055863 - 30055501
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| |    
T  30055863 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtt 30055764  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 202  Q
    |   |||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  30055763 ggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaatta 30055664  T
Q  203 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttt 302  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||  | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | | |||    
T  30055663 gattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattt 30055564  T
Q  303 tgatactctagtgttaacttcctc-agaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||| | ||||||||||||| || | |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  30055563 tgatattatagtgttaacttcatcaaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc 30055501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 366
Target Start/End: Original strand, 5657309 - 5657669
Alignment:
Q  7 attcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgac 105  Q
    ||||||||||||||| || |||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||| || |    
T  5657309 attcatttttaaatttttgattactcattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggc 5657408  T
Q  106 ctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagat 205  Q
     |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  5657409 atctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtattacactttgtgggctgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaaat 5657508  T
Q  206 taaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttga 305  Q
    ||| |||||| |||||| | |||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5657509 taagtgtatttttgttaatatgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttga 5657608  T
Q  306 tactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
    |  | |||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  5657609 tgttatagtgttaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccat 5657669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21991966 - 21991611
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||| ||| |||||||||||     || |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  21991966 tgtttgattcatttttaaattgttgattaatgat----gatcaatagtaattcatct-----tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 21991876  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21991875 gttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 21991776  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||| |     
T  21991775 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgacactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaa 21991676  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||| || |||||||||||||  || |||| ||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  21991675 ttttgatgctatagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgacttcaccctagaattttcc 21991611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 25691366 - 25691729
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||||||||||    
T  25691366 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacattttgaacttacatgtgttattttatc 25691465  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | | || |||||||| | |||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25691466 gttaacatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 25691565  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggt-gttactcacaata 298  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| ||| || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||  ||||||||||||    
T  25691566 ttagattaaatgtatttttgttaatatgatgaattgataatactataagaactgaactgttgatgccactgtacaaacagtgaggtaattactcacaata 25691665  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
     |||||||  | |||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  25691666 cttttgatgttatagtgttaacttcacgagaaaagtcattctcatgacttcaccataaaatttt 25691729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 6546855 - 6546493
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||  || |||||||||| |    
T  6546855 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcctcatcttagacttacaggtactattttatcgtt 6546756  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 202  Q
    | | ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6546755 ggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgataatattaagtgttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 6546656  T
Q  203 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttt 302  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||   | |||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||||||| ||| | |||    
T  6546655 gattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggatagtaaacttttgatgttactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacacttt 6546556  T
Q  303 tgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    |||| || |||||||||||||   |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  6546555 tgatgctatagtgttaacttcactagaaaaatcattcttatgacttcaccatagaattttcca 6546493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11071542 - 11071177
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11071542 tgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaggtattattttatc 11071443  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   |||||||||| | || | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11071442 gttg---tctttaacatgcgaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaa 11071346  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    |||||||||  ||| | |||||| |||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||| | ||||    
T  11071345 ttagattaagcgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtgttactcgctatat 11071246  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagt-cattttcgtgacttcaccatagaattttccatt 367  Q
    |||||||  | ||||  ||||||   || |||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11071245 ttttgatgatatagtactaactttaccaaaaaaatacattttcatgacttcaccatagaattttgcatt 11071177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24212081 - 24211717
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||    
T  24212081 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttat 24211982  T
Q  99 cgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    || ||   |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24211981 cgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtaggatgttacacttagaacaaggtatgataaa 24211882  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||||| | ||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | |    
T  24211881 attatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccattctataaacagtagggtgttactcattaca 24211782  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttc 363  Q
    ||||||||  | |||||||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  24211781 tttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttc 24211717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 17842406 - 17842772
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  17842406 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 17842505  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagg--taggataa 197  Q
    | |||  |||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||  ||||||||    
T  17842506 gttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacgcttataacaaggtataggataa 17842605  T
Q  198 aattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaat 297  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||| | |||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  |     
T  17842606 aattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattataatgactgagcttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattac 17842705  T
Q  298 atttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||| ||  | |||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17842706 attttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcc 17842772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 12166074 - 12165726
Alignment:
Q  9 tcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacct 107  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || | |    
T  12166074 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtcat 12165975  T
Q  108 ctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatta 207  Q
    ||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12165974 ctttaacatgcaaacagagttgctgatattatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagatta 12165884  T
Q  208 aatgtattcttgttagtctgatgaattgttaata-ttatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgat 306  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||    
T  12165883 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacttaag-ggacttaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacactttggat 12165785  T
Q  307 actctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
     || |||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  12165784 gctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttaacgacttcaccgtagaattttcca 12165726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 365
Target Start/End: Original strand, 15612584 - 15612945
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||  |    
T  15612584 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcatt 15612683  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 202  Q
    | | |||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15612684 ggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 15612783  T
Q  203 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttt 302  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| || |  ||    
T  15612784 aattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatagggactgaacttttgatgccactctacaaacactggggtgttactcataaca-ctt 15612882  T
Q  303 tgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    ||||  | |||||||||||||   ||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15612883 tgatgttatagtgttaacttcacaagaaacgttattctcatgacttcaccatagaattttcca 15612945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23111531 - 23111167
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| || ||||||||| || |||||  || |||||||||    
T  23111531 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgatttatgatcaatagtaattcttctagtaatgctttcaacatctttgatttacatgtactattttatc 23111432  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagg--ataa 197  Q
    | ||   |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||    
T  23111431 gttgttatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaagtatgatataa 23111332  T
Q  198 aattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaat 297  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| | ||| || || |  | ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  23111331 aattagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactacgatggttgaacttttgatgccattgtacaaatagtggtgtgttactcacaat 23111232  T
Q  298 atttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||||||||  | |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23111231 atttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattttcatgacttcaccacagaatttt 23111167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 364
Target Start/End: Original strand, 41764907 - 41765264
Alignment:
Q  8 ttcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  || ||||| |||| || |     
T  41764907 ttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaataataattcatccagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatgtactatttcatcgttggca 41765006  T
Q  107 tctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 206  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41765007 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagagtaaaattagatt 41765106  T
Q  207 aaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgat 306  Q
    || || | |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||    
T  41765107 aagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgat 41765206  T
Q  307 actctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
     || |||| || ||||  |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  41765207 gctatagtattgactttatcagaaaagtcattctcatgacttcaccatggaattttcc 41765264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15672581 - 15672819
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttaca---aatattatttt 96  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   | |||||||||    
T  15672581 tgtttaattcatttttaaattgttgattattgatgcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattatttt 15672680  T
Q  97 atcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggata 196  Q
    |||| || | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15672681 atcgttggcatctttaacattcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggata 15672780  T
Q  197 aaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattg 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15672781 aaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattg 15672819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 10359036 - 10359402
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| || || ||||||    
T  10359036 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaaatcatttagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactaatttatc 10359135  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10359136 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgttgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaa 10359235  T
Q  200 ttaga-ttaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    ||||| |||| |||| |||||||  |||||||||||| | ||| ||| | |||| ||||||||||| || |||||||| ||| || |||||||||| | |    
T  10359236 ttagatttaagtgtagtcttgttgatctgatgaattgatgatactatca-gactgaacttttgatgtcactgtataaatagtaggatgttactcactaca 10359334  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
     ||||||| || ||   |||| ||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  10359335 cttttgatgctataagattaattttaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttccat 10359402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29173861 - 29173518
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  29173861 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatc 29173762  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||                 |||||||||||||||||||    
T  29173761 gttggcat-tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtaacactt-----------------aaaacaaggtaggataaaa 29173680  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |     
T  29173679 ttagattaagtgtattcttgttagtttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacac 29173580  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||    
T  29173579 ttttgatactacagtgttaacttcaccagaaaagtcattcatgtgacttca-catagaatttt 29173518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22687566 - 22687228
Alignment:
Q  5 tgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctg 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||    
T  22687566 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctattaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttg 22687467  T
Q  104 acctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 203  Q
     | || |||||| |        |||| |||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22687466 gcatccttaacaga--------gttgttgatatcatgagatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 22687375  T
Q  204 attaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatattttt 303  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||| |||||||||| ||| || | ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22687374 attaagtgtattattgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgataccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacattttt 22687275  T
Q  304 gatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttca 350  Q
    |||  | ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  22687274 gatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcatgacttca 22687228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 37347360 - 37346996
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37347360 tgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatc 37347261  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
      || | |||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  37347260 attggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaaa 37347162  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| || ||||| | | || ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||  ||||    
T  37347161 ttagattaagtgtagtcctgttaatttaataaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcattatat 37347062  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    |||||||  | |||| ||||||||  || |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37347061 ttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccataaaattttcca 37346996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 7335132 - 7334769
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || ||||||||     
T  7335132 tgtttgattcatttttaaattattgatttctgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatt 7335033  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    |  |   |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7335032 gtcggaatctttaacattcaaac-tagttgatgatattatctgataatcttaagtgttacactctgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaa 7334934  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||| | ||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||    
T  7334933 ttagattaagtgtagtcttgttaagctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacat 7334834  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
     ||| ||  | ||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  7334833 attttatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattctcacgacttcaccgtagaattttcc 7334769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 43925434 - 43925081
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||      ||||||||||    
T  43925434 tgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacgta------ttattttatc 43925341  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| || |||||| ||| || ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  43925340 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgattgtattaagtattaaacgttgtgaggtgttgcacttaaaacaaggtatgataaaa 43925241  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| | ||| ||||  |||| ||||||||||| ||||||    |||||| |||||||||||||| ||    
T  43925240 ttagattaagtgtattattgttagtctgat-agttgatgatactatgtagactgaacttttgatgtcattgt----acagtgaggtgttactcacaacat 43925146  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttc-ctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttc 363  Q
    |||| |||||  | |||||||||| || | |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  43925145 tttttatactacaatgttaacttcactaaaaaaaatcattttcgtgactttaccgtagaattttc 43925081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 48928119 - 48928466
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||    
T  48928119 tgttcgatttatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactatttcatc 48928218  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | | |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48928219 gttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaa 48928318  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| || | |||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||  ||| ||| ||||||||| ||||||| | |     
T  48928319 ttagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctactcactacac 48928417  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgactt 348  Q
    |||||||  | ||||||| |||||  ||||||||||||| || ||||||    
T  48928418 ttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgactt 48928466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 37703320 - 37703551
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37703320 tgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatc 37703419  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||    
T  37703420 gttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtggtacactttgtgggatgttacacttaaaataagatatgataaaa 37703519  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatga 231  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| ||||||||    
T  37703520 ttagattaagtgtagtcttattaatctgatga 37703551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10481934 - 10481578
Alignment:
Q  11 atttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctct 109  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | ||   |||    
T  10481934 atttttaaattgttaattactgattaacgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacggatactattttattgttggaatct 10481835  T
Q  110 ttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaa 209  Q
    || |||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  10481834 ttgacatgcaaagagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaag 10481735  T
Q  210 tgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagt-ggggtgttactcacaatatttttgatac 308  Q
     ||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||| | |||| || |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||      
T  10481734 cgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactataaagactgaatttttgatgtcattgtacaaacagtgggggtgttactcattatattttttatgt 10481635  T
Q  309 tctagtgttaacttc-ctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    | |||||||||||||  | | |||||||||| || | |||| |||||||||||||||    
T  10481634 tatagtgttaacttcattaaaaaaagtcattctcctaactttaccatagaattttcc 10481578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 38258816 - 38258521
Alignment:
Q  68 caacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtg 167  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||| ||   |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38258816 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 38258717  T
Q  168 gggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgcca 267  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| | ||||||||||| ||    
T  38258716 gggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtca 38258617  T
Q  268 ttgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttc 363  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||  | |||||| ||  | |||||||||||||  || |||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  38258616 ttgtacaaacggtgtggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgacttcaccgtagaattttc 38258521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 31520563 - 31520909
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  31520563 tgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatc 31520662  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||                 |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31520663 gttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaa 31520745  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | | |||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  31520746 ttagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggagtgttactcactatat 31520844  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||  | |||| ||||||||  || ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  31520845 ttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcatcataaaattttcc 31520909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 48 - 363
Target Start/End: Original strand, 33688132 - 33688446
Alignment:
Q  48 aattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagt 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||| |||||||| | |||| | ||||| |||||| || |||||||    
T  33688132 aattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagt 33688231  T
Q  148 tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatga 247  Q
     || | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||      
T  33688232 cttgaatgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatag 33688331  T
Q  248 ggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgact 347  Q
     |||| |||||||||||||| || | ||||||| || ||||||||| || | |||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||| || | |||    
T  33688332 agactgaacttttgatgccactggacaaacagtaggatgttactcataacacttttgatgttatagtgttaacttac-cagaaaagtcattctcataact 33688430  T
Q  348 tcaccatagaattttc 363  Q
    |||||||| |||||||    
T  33688431 tcaccatataattttc 33688446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 44598980 - 44598738
Alignment:
Q  23 ttattattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaat 122  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| || | |||||||||| ||||     
T  44598980 ttattattgattaatgatcaatagt--ttcatctagtaatgcttgtaacatcttagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaac 44598883  T
Q  123 atagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgtta 222  Q
    | ||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44598882 agagttgttgatatcatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattcttgtta 44598783  T
Q  223 gtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgcca 267  Q
     |||||||||||  | ||| |||| ||| | || |||||||||||    
T  44598782 atctgatgaatttatgatactatggggattgaatttttgatgcca 44598738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 26980642 - 26980325
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| ||   ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |    
T  26980642 ttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaacaataattcatctagtaatacttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgtt 26980543  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 202  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||                 |||||||||||| |||||||||    
T  26980542 gacatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt-----------------aaaacaaggtagaataaaatta 26980460  T
Q  203 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttt 302  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| | |||    
T  26980459 gattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgccactgtacaaaccgtggggtgttactcacaacacttt 26980360  T
Q  303 tgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcat 337  Q
    |||| || || ||||||||||  || |||||||||    
T  26980359 tgatgctataatgttaacttcaccataaaagtcat 26980325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 111 - 362
Target Start/End: Original strand, 27421313 - 27421563
Alignment:
Q  111 taacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaat 210  Q
    |||||| |||| | ||||| |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  27421313 taacatgcaaacagagttgctgatatcatacgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagt 27421412  T
Q  211 gtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactc 310  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  | ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||  |     
T  27421413 gtattcttgttaatctgataaatttatgatattat-aggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcacaacacttttgatgtta 27421511  T
Q  311 tagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  27421512 tagtgttaacttcaccaaaaaaatcattatcacgacttcaccatagaatttt 27421563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 26587914 - 26588126
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26587914 tgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcctgcaacatcttggacttacatgtattattttatc 26588013  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | ||||||||| |        |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26588014 gttggcatctttaacaga--------gttgttgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 26588105  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgt 220  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  26588106 ttagattaagtgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 46480951 - 46481182
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  46480951 tgttttatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 46481050  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  46481051 gttgacatctttaacatgcaaacaaagttaatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatgagatgttacacttaaaacaatgtagaataaaa 46481150  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatga 231  Q
    ||| || || | || |||||||| ||||||||    
T  46481151 ttacatcaagtatagtcttgttaatctgatga 46481182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 35353447 - 35353124
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||    
T  35353447 tgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtgattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatc 35353348  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggta--ggataa 197  Q
    | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||     
T  35353347 gttgacatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgagatagtcttaagtgttacattttctggggtgttacacttaaaacaaggtaagtgttac 35353248  T
Q  198 aattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggac-taaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaa 296  Q
    |  |||    |||| | |||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||  ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||| ||||||| |    
T  35353247 atctag---taatgcagtcttgttaatctgatgaattggtgatactatggggacagaaacttttgattccatcgtacaaacaatggggtgctactcacta 35353151  T
Q  297 tatttttgatactctagtgttaacttc 323  Q
     | ||||||| || ||||||| |||||    
T  35353150 cacttttgatgctatagtgttgacttc 35353124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 91 - 363
Target Start/End: Original strand, 48928477 - 48928748
Alignment:
Q  91 tattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggt 190  Q
    |||||||||| || | | |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||||| || ||    
T  48928477 tattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaataatgt 48928576  T
Q  191 aggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttac 290  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||  ||| ||| ||||||||| |||    
T  48928577 aggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactatg-ggactgaacttttgatggcaccgtacaaatagtggggtgctac 48928675  T
Q  291 tcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttc 363  Q
    |||| | | |||||||  | ||||||| |||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  48928676 tcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccataaaattttc 48928748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 150 - 362
Target Start/End: Original strand, 44413351 - 44413564
Alignment:
Q  150 taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgagg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||   ||| ||||  |    
T  44413351 taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactatggag 44413450  T
Q  250 actaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttc-ctcagaaaagtcattttcgtgactt 348  Q
    ||  ||||||||||  || |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||  | | ||||||||||||| ||||||    
T  44413451 accgaacttttgatttcagtgtacaaacattggggtgttactcactatatttttgatgttatagtgttaacttcattaaaaaaagtcattttcatgactt 44413550  T
Q  349 caccatagaatttt 362  Q
     |||||||||||||    
T  44413551 taccatagaatttt 44413564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 109 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 37704387 - 37704244
Alignment:
Q  109 tttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaa 208  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37704387 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaa 37704288  T
Q  209 atgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggact 252  Q
     |||| |||||||| |||||| ||||| | ||| |||| |||||    
T  37704287 gtgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatggggact 37704244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 364
Target Start/End: Original strand, 12390478 - 12390816
Alignment:
Q  8 ttcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacc 106  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||  || |     
T  12390478 ttcatttttaaattgtcaattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaatggttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggca 12390577  T
Q  107 tctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 206  Q
    |||||||||| |||    |||||||||||||||||||  || ||||||||                 ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  12390578 tctttaacatgcaagctgagttgatgatattatgtga--gtcttaagtgt-----------------tacacttaaaagaaggtagaataaaattagatt 12390658  T
Q  207 aaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgat 306  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||  ||||||||||| || || | |||||||||| |||||||||  | | |||||||    
T  12390659 aagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggacataacttttgatgtcactgcacaaacagtgggatgttactcattacacttttgat 12390758  T
Q  307 actctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
      | |||||||||||||  || |||||||  | |  ||||||||||||||||||||||    
T  12390759 gttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcgatctgatgacttcaccatagaattttcc 12390816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 44411362 - 44411510
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||| | |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44411362 tgtttcattcatttttaaattgttgattactgattaatggtcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagataatattttatc 44411461  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagtt 148  Q
    | || | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  44411462 gttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtt 44411510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 294
Target Start/End: Original strand, 32593040 - 32593304
Alignment:
Q  13 ttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctcttt 111  Q
    |||||||||||| |||  ||||| |||||  || |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||||| || |||| |||||    
T  32593040 ttttaaattgttgattgctgattaatgatccatagtaatttatctagtaatatttgtaacatcttggacttacatgtactattttaacgttgacatcttt 32593139  T
Q  112 aacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatg 211  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||                 |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32593140 aacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaaatg 32593222  T
Q  212 tattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcac 294  Q
     | | ||| || |||||||||||| | ||| | ||| |||| |||||||||| |||   |||||||||||||||| |||||||    
T  32593223 cagttttgataatctgatgaattgatgatactgtga-gactgaacttttgataccaccatataaacagtggggtgctactcac 32593304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 37704521 - 37704387
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| ||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37704521 tgtttgattcatttgtaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatc 37704422  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgat 134  Q
    | || | |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37704421 gttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgat 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 38053751 - 38053637
Alignment:
Q  49 attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagtt 148  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| | ||   |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  38053751 attcatcaaataatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 38053652  T
Q  149 ttaagtgttacactt 163  Q
    |||||||||||||||    
T  38053651 ttaagtgttacactt 38053637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 364
Target Start/End: Original strand, 26524364 - 26524513
Alignment:
Q  215 tcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagt 314  Q
    |||||||| | |||| ||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||| || | ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||  | ||||    
T  26524364 tcttgttaatatgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgccactgcacaaacaatggagtgttagtcacaacatttttgatgttatagt 26524463  T
Q  315 gttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26524464 gttaacatcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 26524513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 34362000 - 34362121
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgttatt-attgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  34362000 tgtttgattcatttttaaattgttaatgactgattaatgatcaaaagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatc 34362099  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaa 121  Q
    | |||  | |||||||| ||||    
T  34362100 gttgatatttttaacatgcaaa 34362121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 258 - 367
Target Start/End: Original strand, 34362228 - 34362337
Alignment:
Q  258 tttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccataga 357  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| |  |||||||||||| || | | |||||||||||    
T  34362228 tttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaactttcctagaaaagtcattctcataatttcaccataga 34362327  T
Q  358 attttccatt 367  Q
    ||||||||||    
T  34362328 attttccatt 34362337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 297 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8299257 - 8299192
Alignment:
Q  297 tatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8299257 tatttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 8299192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 329 - 364
Target Start/End: Original strand, 241034 - 241069
Alignment:
Q  329 aaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  241034 aaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 241069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 361
Target Start/End: Original strand, 10675331 - 10675377
Alignment:
Q  315 gttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattt 361  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10675331 gttaatttcatcagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattt 10675377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 366
Target Start/End: Original strand, 23402371 - 23402421
Alignment:
Q  316 ttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  23402371 ttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcgccatagaattttccat 23402421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 59)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 238329 - 238690
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  238329 tgtttgattcatttttaaattgtggattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatattattttatc 238428  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  238429 gttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaa 238528  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| ||    
T  238529 ttagattaagtgtattcttgttagtctgattaattgttgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-ggatgttactcacaacat 238627  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  238628 ttttaatactatagtgttaacttcaccaaaaaagttattttcgtgacttcactatagaatttt 238690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2960108 - 2959744
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2960108 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatc 2960009  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2960008 gttggcatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaa 2959909  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||| | | | |||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||| || | |     
T  2959908 ttagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgacactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgggatgttacttactacag 2959809  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2959808 ttttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 2959744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 10181823 - 10182188
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaa-tattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || |||| |||    
T  10181823 tgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaggtactattgtat 10181922  T
Q  99 cgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
     | || | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10181923 tgttgtcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 10182022  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |||    
T  10182023 attagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggcgtgttacgcactata 10182122  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||| ||  |  ||| ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10182123 ttttttatgttacagttttaacttcaccaaaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 10182188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 47279549 - 47279196
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  47279549 tgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctaataatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatt 47279450  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47279449 gttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggatgttacaattaaaacaaggtaggataaaa 47279350  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  47279349 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttcgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacac 47279250  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcacca 353  Q
    |||||||| | || ||||||||||  || |||| ||||| || |||||||||||    
T  47279249 ttttgatagtataatgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcacca 47279196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15752389 - 15752027
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||    
T  15752389 tgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaaaaattgcaacttcttggacttacatgtattattttgtc 15752290  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   | |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15752289 gttggaatttttaacatgcaaacagagttaatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaa 15752190  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  15752189 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttactcactatat 15752090  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||| ||  | |||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15752089 tttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 15752027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 27227301 - 27227659
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27227301 tgtttaattcatttttaaatggttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatc 27227400  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27227401 gttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatcatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 27227500  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||      |  | ||    
T  27227501 ttagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtgaggtg------agtacat 27227594  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
    ||||  ||  ||||||||||||||  || |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  27227595 tttt--tatgctagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttccat 27227659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 32216415 - 32216092
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32216415 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 32216316  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   |||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32216315 gttggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 32216216  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    || |||||| | || | |||||| ||| |||||||| | ||| || ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||    
T  32216215 tttgattaagtttagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactacat 32216116  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttc 323  Q
    |||||||  | |||||||||||||    
T  32216115 ttttgatgttatagtgttaacttc 32216092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 38823572 - 38823209
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgc 101  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||  |||||||||||||     
T  38823572 tttgtttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacaggtattattttatcgt 38823473  T
Q  102 tgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 201  Q
    || | ||| |||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  38823472 tggcatctctaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgttgggtgttacacttaaaataaagtaggataaaatt 38823373  T
Q  202 agattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatattt 301  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||| | ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| ||| | ||    
T  38823372 agattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgacactgtacaaatagtggggtgttactcgcaacaatt 38823273  T
Q  302 ttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    ||||| || ||||||||||||   ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  38823272 ttgatgctatagtgttaacttaaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcca 38823209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16416006 - 16415641
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  16416006 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 16415907  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16415906 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaa 16415807  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaaca-gtggggtgttactcacaata 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| | ||| ||||| | || |||||||||||||| |||| |||||  | ||||||||||||| | |    
T  16415806 ttagattaagtgtagtcttgttaatctaatgaattgatgatactatgatggctgaacttttgatgccactgtacaaacatttagggtgttactcactaca 16415707  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
     ||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  16415706 cttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccttagaattttcc 16415641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 365
Target Start/End: Original strand, 7078882 - 7079255
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||| |    
T  7078882 ttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttagacttacatatactattttatcgtt 7078981  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 202  Q
    | | |||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7078982 ggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtcttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 7079081  T
Q  203 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaac-----------agtggggtgttact 291  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||           ||||||||||||||    
T  7079082 gattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaggtgttagtggggtgttact 7079181  T
Q  292 cacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    ||||| | |||||||| | |||||||||||||  || |||||||||| || |||||| |||||| |||||||||    
T  7079182 cacaacacttttgatattatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattatcatgactttaccataaaattttcca 7079255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 28564599 - 28564951
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  28564599 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtattattttatc 28564698  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||| | |||||||    
T  28564699 gttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtt--aagtgttacactttacggggtgttatgcttataacaaggcatgataaaa 28564796  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||  | ||    
T  28564797 ttagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtaaggtgttactcattacat 28564896  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccat 354  Q
    |||||||  | ||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||    
T  28564897 ttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaaatcattttcataacttcaccat 28564951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 365
Target Start/End: Original strand, 30326775 - 30327133
Alignment:
Q  8 ttcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||       
T  30326775 ttcatttttaaattgttgattactgattgatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtattattttatcgttggaa 30326874  T
Q  107 tctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 206  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  30326875 tctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagatt 30326974  T
Q  207 aaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgat 306  Q
    || |||| | |||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| || |||| |||||||  | |||||||||    
T  30326975 aagtgtagttttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgctattgtacaaacggttgggtattactcattacatttttgat 30327074  T
Q  307 actctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
      | ||||||||| |||   | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  30327075 gttatagtgttaaattcacaaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattttcca 30327133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18423004 - 18422647
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgttattattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||      |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |  | ||||||||    
T  18423004 tgtttgattcatttttaaattgtt------gattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgcttttttatcg 18422911  T
Q  101 ctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaat 200  Q
     ||   |||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  18422910 ttggaatctttaacatgcaaacggaggtgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcatataacaaggtaggataaaat 18422811  T
Q  201 tagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatt 300  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||   |||||    
T  18422810 tagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcgttatatt 18422711  T
Q  301 tttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||  | |||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18422710 tttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttcc 18422647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 34012198 - 34012557
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  34012198 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatatactattttatc 34012297  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34012298 gttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaa 34012392  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| | |     
T  34012393 ttagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacag 34012492  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    | |||||  | ||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34012493 tgttgatgttatagtgttaacttcatcataaacgtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 34012557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Original strand, 47682310 - 47682674
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  47682310 tgtttaattcttttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 47682409  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  47682410 gttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcagaataaaa 47682509  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggg-gtgttactcacaata 298  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| | |||||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||||||||| |    
T  47682510 ttagtttaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggaatgaacttttgataccactgtacaagcagtgggagtgttactcacaaca 47682609  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    |||||  ||  ||||||||||||||  || |||||||| | || ||||||||||||| |||||||||    
T  47682610 ttttt--tatgctagtgttaacttcaccaaaaaagtcactctcatgacttcaccataaaattttcca 47682674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4330641 - 4330288
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  4330641 tgtttgattcatttttatattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacaagtactattttatc 4330542  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
      |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4330541 tttgacatctttaacatgcaaaaagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 4330442  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagt-ggggtgttactcacaata 298  Q
    ||||||||| || | |||||||| |||||| ||||| | ||| ||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||| | |    
T  4330441 ttagattaagtgcagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatcccactgtacaaacattgggggtgttactcactaca 4330342  T
Q  299 tttttgatactctagtg-ttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcac 351  Q
     ||||||| || ||||| ||| |||| |||||||||||||| || | |||||||    
T  4330341 cttttgatgctatagtgtttatcttcatcagaaaagtcattctcataacttcac 4330288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15383286 - 15382929
Alignment:
Q  8 ttcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||| || || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||| ||       
T  15383286 ttcatttttaaattgttgattgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaa 15383187  T
Q  107 tctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 206  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15383186 tctttaacatgcatacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatt 15383087  T
Q  207 aaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgat 306  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||| | ||| || || |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||  | |||||||||    
T  15383086 aagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactacgatgactgaacttttgatgacattgtacaaacggtgggatgttactcattacatttttgat 15382987  T
Q  307 actctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
      | ||||||||| |||  || ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  15382986 gttatagtgttaatttcaccaaaaaagtcatttttataacttcaccatagaattttcc 15382929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23999708 - 23999342
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  23999708 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttat 23999609  T
Q  99 cgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    || |||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  23999608 cgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaa 23999509  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||   |||    
T  23999508 attatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcgttata 23999409  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||  || |||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  23999408 ttttttatgttgtagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccataaaattttcca 23999342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 42721396 - 42721033
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| | ||| ||||| ||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  42721396 tgtttgattcatttttaaattattgattactcattaatgatcaatagtaattaatctagtaataattgcaacatcttggacttacatgtaatattttatc 42721297  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   |||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42721296 gttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattacgtgataatcttaagtgttatactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaa 42721200  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||| | |||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42721199 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgttactgtacaaacagtggggtgttactcactatat 42721100  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
    |||| ||  | ||| | |||||||  || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42721099 tttttatgatatagggctaacttcaccaaaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttccat 42721033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 27267016 - 27267378
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| || || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  27267016 tgtttaattcatttttaaattattgattattgattaattatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatc 27267115  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  27267116 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacactcaaaacaaggta-gattaaa 27267214  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||  |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||| | ||    
T  27267215 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttaatgccactgtacaaacagtggggtgtcactcactacat 27267314  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
    ||||  ||  ||||||||||||||  || |||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||||    
T  27267315 tttt--tatgctagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttca-catataattttccat 27267378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 27532798 - 27533155
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  27532798 tgtttgattcattttt-aattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 27532896  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||| | |||| | | ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27532897 gttggcatctttaacttgcaaacagaattgctgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 27532996  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||| | |||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||||     
T  27532997 tt-gattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgccactgtacaaagagtgggttgttacccacaatac 27533095  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaat 359  Q
    ||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||| || | |||| | ||||||||    
T  27533096 ttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataactttatcatagaat 27533155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1547631 - 1547283
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  1547631 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 1547532  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   ||||||||| |        |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1547531 gttggtatctttaacaga--------gttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaa 1547440  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||        ||| |||||| ||| |||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  1547439 ttagattaagtgtatttttgttaatctgatg--------atactatgagaactgaacttttgatgccactgcacaaacagtggagtgttactcacaacat 1547348  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||| ||  | |||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1547347 tttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 1547283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 37451645 - 37451292
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37451645 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatc 37451546  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  37451545 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttttgaggtgttacacttataacaaggtcagataaaa 37451446  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | |||| ||||| | ||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||| |  | ||    
T  37451445 ttagattaagtgtagtcttgttaatatgataaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttacttattacat 37451347  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccat 354  Q
    |||||||  | ||||||||||||   || ||||||||||||  ||||||||||||    
T  37451346 ttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaagtcatttttatgacttcaccat 37451292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 51129216 - 51128896
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| |    
T  51129216 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 51129117  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 202  Q
    ||  |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  51129116 gaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaattgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtatgataaaatta 51129017  T
Q  203 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttt 302  Q
     ||||| |||| |||||||| | |||||||||| | ||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||  | |||||    
T  51129016 tattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacatttt 51128917  T
Q  303 tgatactctagtgttaacttc 323  Q
    | ||  | |||||||||||||    
T  51128916 ttatgttatagtgttaacttc 51128896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8222480 - 8222127
Alignment:
Q  8 ttcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||       
T  8222480 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaata-taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaa 8222382  T
Q  107 tctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 206  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8222381 tctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagatt 8222282  T
Q  207 aaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgat 306  Q
    || |||| |||||||| | |||||||||| | ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||  | |||||||||    
T  8222281 aagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgt---aacggtgtggtgttactcattacatttttgat 8222185  T
Q  307 actctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
      | |||||||||||||   | ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  8222184 gttatagtgttaacttcactaaaaaggtcatttttatgacttcaccgtagaattttcc 8222127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 19899584 - 19899949
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  19899584 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttat 19899683  T
Q  99 cgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    || ||   |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| ||||||    
T  19899684 cgttggaatctttaacatgcaaatagagttggtgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaatgtatgataaa 19899783  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||||| | ||| |||||||  | |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||   | |    
T  19899784 attatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggttgaacttttgatgccattctacaaacagtgaggtgttactcgttaca 19899883  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||  | |||||||||||||  || |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  19899884 tttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattattatgacttcaccatagaattttcc 19899949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30254783 - 30254420
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30254783 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatc 30254684  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   |||||||||| |||| | |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  30254683 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgttattatgtgacagtcttaagtgttacactttatagggtgttatgcttataacaaggtaggataaaa 30254584  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| | || |||||||| |||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| | || |||||||  | ||    
T  30254583 ttagattaagtctagtcttgttaatctgatgaattgatgatactttgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagt-gtgtattactcattacat 30254485  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||  | || ||||||||||  || |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||    
T  30254484 ttttgatgttatattgttaacttcaacaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattttcc 30254420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 32267394 - 32267030
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||     
T  32267394 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacctacaggtactattttata 32267295  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  32267294 gttggaatatttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggagtgttacgcttataacaaggtaggataaaa 32267195  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||  ||| | ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||    
T  32267194 ttagattaagtgtaatcttgttaatctgatgggttgatgataatatgaggagtgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacat 32267095  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||  | || ||||||||||   | |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  32267094 ttttgatgttatattgttaacttcacaaaaaaagtcattcttatgacttcaccataaaattttcc 32267030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 341
Target Start/End: Original strand, 9902872 - 9903211
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||   || ||||||||||     
T  9902872 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtagtgcttgcagcatcttggacttactggtactattttatcgt 9902971  T
Q  102 tgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 201  Q
    || | |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  9902972 tgtcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaatgtaagataaaatt 9903071  T
Q  202 agattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatattt 301  Q
    ||||||| |||| |||||||| | |||||||||| | ||| |||| ||| | ||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| | | ||    
T  9903072 agattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatagtatgtggattgaacttttgatgtcactgtacaaacagcggggtgttactcactacagtt 9903171  T
Q  302 ttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttc 341  Q
    |||||  | ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  9903172 ttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattttc 9903211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 27563721 - 27564084
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27563721 tgtttgattcttttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatatactattttatc 27563820  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |  | |||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27563821 gtttgcatctttaacatgcaaacagagttgatgaaattatatgatagtcttaagtgttcctctttgtggggtattatacttaaaacaaggtaggataaaa 27563920  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||| ||||||||||| || | || ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27563921 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatcggaactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactcactatat 27564020  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttc-ctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||| |   | ||||||||||||| || | |||| |||||||| | |||||||| |||||||||    
T  27564021 ttttaaagttatagtgttaacttcactaaaaaaaatcattttcataacttcaccgtagaatttt 27564084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28770013 - 28769651
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  28770013 tgtttgattcatttttaaattgttgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 28769914  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    | |||  |||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||    
T  28769913 gttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgatgatattatgtgatagtcttaagcgttacactttgtgggggtgttacgtttataacaaggtatgataaa 28769814  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| | ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||  | |    
T  28769813 attagattaagtgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggaccgaacctttgatgccattgtacaaacggt-gggtgttactcattaca 28769715  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    ||||||||    |||||||||||||   | |||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  28769714 tttttgatgtcatagtgttaacttcacaaaaaaagttatttttatgacttcaccatagaatttt 28769651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 39393744 - 39393379
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || |||||||||    
T  39393744 tgttttattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggatttaccggtactattttatc 39393645  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaa 198  Q
      || | ||||||||||  ||| | ||||| | |||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39393644 attggcatctttaacatggaaacagagttgctaatatcatatgatagtcttaagtgttacactttgtaggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 39393545  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||  | ||| |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||  || |||||||||| |    
T  39393544 attagatgaagtgtattcttgttaatctgatgaatttatgatactatggggattaaacttttgatgccactgtacaaacaatgaagtattactcacaaca 39393445  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
     ||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||| |||||||||||    
T  39393444 cttttgatgctatagtgttaacttcattagaaaagtcattctcataacttcaccgtagaattttcc 39393379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3535283 - 3534928
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||    
T  3535283 tgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatc 3535184  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3535183 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgt---------aagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaa 3535093  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| || || | |||||||  |||||||||||||| |     
T  3535092 ttagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgataatattaaggggactgaacttttgatgtcactgcacaaacagtaaggtgttactcacaacac 3534993  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||  | |||||||||||||   |||||| | ||| |  ||||||||  ||||||||||||    
T  3534992 ttttgatgttatagtgttaacttcactagaaaattaattctaatgacttcataatagaattttcc 3534928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 10923087 - 10922724
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||     
T  10923087 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacagatactattttatt 10922988  T
Q  100 g-ctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    | | ||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  10922987 gtcagaa-tctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacccttataacaaggtatgataaa 10922889  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    || ||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| | ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  | |    
T  10922888 ataagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtcttactcattaca 10922789  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttc 363  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||  || |||| ||||| || ||| ||||||||| |||||||    
T  10922788 ttttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgatttcaccataaaattttc 10922724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25160985 - 25160710
Alignment:
Q  8 ttcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||       
T  25160985 ttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaa 25160886  T
Q  107 tctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 206  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  25160885 tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaatgagatt 25160786  T
Q  207 aaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtgg 282  Q
    || |||| |||| ||| ||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25160785 aagtgtagtcttattaatctaatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacggtgg 25160710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3309513 - 3309141
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   || |||||||||    
T  3309513 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacgggtactattttatc 3309414  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtgg-----ggtgttacacttaaaacaaggtagga 194  Q
    | || | ||||||||||||||| | ||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||      ||||||||| ||||||||| |||||     
T  3309413 gttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacacttagtgtagtgaggtgttacatttaaaacaaagtaggt 3309314  T
Q  195 taaaa-ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactca 293  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| || | |||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  3309313 taaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagattgaacttttgataccactgtacaaacagt-gggtgttactca 3309215  T
Q  294 caatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccatt 367  Q
    ||| | |||||||  | ||||||||||||   ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  3309214 caacacttttgatgttatagtgttaactttaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattttccatt 3309141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15168456 - 15168085
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  15168456 tgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttgtacttacatgtactattttatc 15168357  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15168356 gttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagccttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 15168257  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgc-------cattgtataaacagtggggtgttactc 292  Q
    ||||||||| || | |||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||||||       ||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  15168256 ttagattaactgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaacgtacaaacagtggggtgctactc 15168157  T
Q  293 acaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    || | | ||||||| || ||||||| |||||  |||||||  |||| || | ||||||| ||||||||||||    
T  15168156 actacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaagcattctcatcacttcacgatagaattttcc 15168085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 46931770 - 46931448
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  46931770 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataatatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttat 46931671  T
Q  99 cgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    || |||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||||||| ||||||    
T  46931670 cgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgct--gaacaaggtatgataaa 46931573  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| || || |||||||||| || || |||||||||||| |||||||  | |    
T  46931572 attatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatattatgagggctgaatttttgatgccgttctacaaacagtggggtattactcattaca 46931473  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttc 323  Q
    ||||||||  | |||||||||||||    
T  46931472 tttttgatgttatagtgttaacttc 46931448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 11742184 - 11742530
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  11742184 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 11742283  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||                 ||||||||||| |||||||    
T  11742284 gttgacatctttaacatacaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaattgttacactt-----------------aaaacaaggtaagataaaa 11742366  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |     
T  11742367 ttagattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatattatg-ggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttacttacaacac 11742465  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| || | ||||||| ||| ||||||||    
T  11742466 ttttgataatatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttcacgataaaattttcc 11742530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 41926516 - 41926161
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||| ||||||||  || |||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||||||     
T  41926516 tgtttgattcaattttaaatcattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg-aatatcttggacttacaagtactattttatt 41926418  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41926417 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatttaata------agtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaa 41926324  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| |||  ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||| | |||||||| ||||    
T  41926323 ttagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttgtgatgccactgtacaaacagtgggatattactcactatat 41926224  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||||||  | |||| |||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  41926223 ttttgatgttatagtattaacttcatcaaaaaaatcattttcataacttcaccatagaatttt 41926161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14758392 - 14758038
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  14758392 tgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 14758293  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||         ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14758292 gttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaa---------tttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 14758202  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| || | |||||||| ||| |||||||| | | | |||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||| | |     
T  14758201 ttagattaagtgcagtcttgttaatctaatgaattgatgaaactatggggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagttgtgtgctactcactacac 14758102  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttc 363  Q
    |||||||  | ||||||| |||||  ||||||||||||| || |||||||||| || |||||||    
T  14758101 ttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccgtaaaattttc 14758038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22171071 - 22170807
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  22171071 tgtttgatttatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaatttatctaataatgtttgcaacatcttagacttacaagaattattttatc 22170972  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  22170971 gttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttgaaacaaggtaggatgaaa 22170872  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatg 264  Q
    ||||||||| |||| | || ||| ||| |||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||    
T  22170871 ttagattaagtgtagtgttattaatctaatgaattgatgatattatgtagactgaacttttgatg 22170807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 362
Target Start/End: Original strand, 33725472 - 33725778
Alignment:
Q  56 tagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtg 155  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||  || |||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  33725472 tagtaatgtttgcaacattttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaaatg 33725571  T
Q  156 ttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaa 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||| | ||| |||||||||| ||    
T  33725572 ttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaa 33725671  T
Q  256 cttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccata 355  Q
    ||||||||||||    | ||| |||||| || ||||||  | | |||||||  | ||| ||| |||||   |||||||||||| || |||||| ||||||    
T  33725672 cttttgatgccaccaaagaaatagtgggctgctactcaatacacttttgatgatatagcgttgacttcactagaaaagtcattctcttgactttaccata 33725771  T
Q  356 gaatttt 362  Q
    |||||||    
T  33725772 gaatttt 33725778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 27763126 - 27763449
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  27763126 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatatttatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacagatactattttat 27763225  T
Q  99 cgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    || ||   |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| ||||||    
T  27763226 cgttggaatctttaacatgcaaatagagttgattatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttacgcttagaactaggtatgataaa 27763325  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||| | ||| ||||||| ||  |||||||||| |||| || ||||  | ||||||||||||  | |    
T  27763326 attagattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatactatgagggctggacttttgatgtcattctacaaactat-gggtgttactcattaca 27763424  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttc 323  Q
    ||||||||  | |||||||||||||    
T  27763425 tttttgatgttatagtgttaacttc 27763449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40885137 - 40884879
Alignment:
Q  36 atgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgata 135  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||   | | |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  40885137 atgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgatgata 40885038  T
Q  136 ttatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattg 235  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || | |||||||| ||||||||||||    
T  40885037 ttatgcgatagtcttaagtgttacacttttcggaatgttacacttaaaacaagataggataaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattg 40884938  T
Q  236 ttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcac 294  Q
       ||| |||  ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||    
T  40884937 aagatactatagggactgaacttttgatgccaccgtacaaacagtggggtgctactcac 40884879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 364
Target Start/End: Original strand, 37618729 - 37619076
Alignment:
Q  13 ttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctcttt 111  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| | |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||   |||||    
T  37618729 ttttaaattgttgattattgattaatggtcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatcttt 37618828  T
Q  112 aacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatg 211  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||| |||         |||||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37618829 aacatgcaaacagagttgatgatattatatga---------gtgttacactttatgggatgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtg 37618919  T
Q  212 tattcttgttagtctgatgaattgttaatat--tatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtg--ttactcacaatatttttgata 307  Q
    || | |||||| |||||||||||| | ||||  |||||| ||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||  |||||||  | |||||||||     
T  37618920 tagtattgttaatctgatgaattgatgatatactatgagaactgaacttttgatgtcattttacaaacagtggggtgttttactcattaaatttttgatg 37619019  T
Q  308 ctctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
     | |||||||||||||  || |||||||||| |  | ||||||||||||||||||||    
T  37619020 ttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaattttcc 37619076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 152 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 48620845 - 48620633
Alignment:
Q  152 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggac 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| || | ||||    
T  48620845 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggac 48620746  T
Q  252 taaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcac 351  Q
    | ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  | || ||||||||||   ||||||||||||||  | ||||||     
T  48620745 tgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttttgatgttatattgttaacttcacaagaaaagtcattttaataacttcaa 48620646  T
Q  352 catagaattttcc 364  Q
    |||||||||||||    
T  48620645 catagaattttcc 48620633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 365
Target Start/End: Original strand, 31621376 - 31621734
Alignment:
Q  12 tttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctt 110  Q
    ||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||  || |||||||||| || | ||||    
T  31621376 tttttaaattgttgattgatgattaatgatcaatagtagttcatctactaatgcttgcaacatattgaacttacatgtactattttatcgttggcatctt 31621475  T
Q  111 taacata-----caaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagat 205  Q
    |||| ||     |||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31621476 taacttaacatgcaaacatagttgttgatattatgcgatagtcttaagtgtcacacttc-tggggtattgcacttaaaacaaggtaggataaaattagat 31621574  T
Q  206 taaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttga 305  Q
    ||| || | |||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||| || |||||||||||  ||| ||| || |||||| ||||||  | |  |||||    
T  31621575 taagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaatttttgatgccaccgtacaaatagcggggtgctactcaatacacctttga 31621674  T
Q  306 tactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    |  | ||||||| |||||   |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  31621675 tgttatagtgttgacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttcca 31621734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 38759846 - 38759584
Alignment:
Q  47 taattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatag 146  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  38759846 taattaatctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgatag 38759747  T
Q  147 ttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatg 246  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||| | || ||| | |||||||||| | |||||| |    
T  38759746 tctcaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataagatatgataaaattaaattaaatgtagttttattaatatgatgaattgatgatattacg 38759647  T
Q  247 agga----ctaaacttttgatgccattgtataaac--agtggggtgttactcacaatattttt 303  Q
    | ||    || ||||||||||| || |||| ||||  || | |||||||||||| ||||||||    
T  38759646 aagactggctgaacttttgatgtcactgtacaaacagagcgaggtgttactcactatattttt 38759584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 48353902 - 48353735
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  48353902 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatc 48353803  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtgg 168  Q
    | |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  48353802 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt-agtgttacactttgtgg 48353735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 1359751 - 1359919
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||  || |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||  || |||||||||    
T  1359751 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcgatagtaattcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggtactattttatc 1359850  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtgg 168  Q
    | ||   |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1359851 gttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgataatcttaagtgttacactttgtgg 1359919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21289960 - 21289817
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21289960 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttataagtgttattttatc 21289861  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatag 146  Q
    | || | ||||||| || |||| | |||   ||||||||||||||||    
T  21289860 gttggcatctttaatatgcaaacagagt---tgatattatgtgatag 21289817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 216 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21289816 - 21289661
Alignment:
Q  216 cttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaa-------tatttttgatac 308  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| |||  ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |       |||| || ||      
T  21289816 cttgttaatctgatgaattgatgatactatagggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacattttttattatttatga 21289717  T
Q  309 tctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||    
T  21289716 tatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcacaatagatttttcc 21289661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 31962977 - 31962855
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaa-ttgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||  |||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  31962977 tgtttgatttatttttaaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtagttcatctaataatgcttgcaacatcttaaacttacatatattattttat 31962878  T
Q  99 cgctgacctctttaacatacaaa 121  Q
    || |||  |||||||||| ||||    
T  31962877 cgttgatttctttaacatgcaaa 31962855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22170803 - 22170750
Alignment:
Q  311 tagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22170803 tagtgttaacttcattagaaaagtcattttcatgatttcaccatagaattttcc 22170750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30254920 - 30254854
Alignment:
Q  298 atttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||||  | ||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  30254920 atttttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattattatgacttcaccatagaattttcc 30254854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 326 - 364
Target Start/End: Original strand, 4150497 - 4150535
Alignment:
Q  326 cagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4150497 cagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcc 4150535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 327 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 43579279 - 43579241
Alignment:
Q  327 agaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  43579279 agaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcca 43579241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 364
Target Start/End: Original strand, 13876919 - 13876967
Alignment:
Q  316 ttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13876919 ttaacttcaccataaaagtcattttcataacttcaccatagaattttcc 13876967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 5)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 492 - 134
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||      |||||||||    
T  492 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacgtac------tattttatc 399  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  398 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaataagataggataaaa 299  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  298 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggagtgttactcacaacat 199  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  198 tttttatactacagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 408250 - 408555
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  408250 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 408349  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   |||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  408350 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttccactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaa 408449  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||  |||| || |||| ||  |||||||||||  | ||    
T  408450 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gaggactgaacttttgatttcattttacaaacggtaaggtgttactcattacat 408548  T
Q  300 ttttgat 306  Q
    |||||||    
T  408549 ttttgat 408555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 127 - 341
Target Start/End: Original strand, 94331 - 94545
Alignment:
Q  127 ttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtct 226  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||    
T  94331 ttgatgatattatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatct 94430  T
Q  227 gatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctc 326  Q
     |||||||| | ||| |||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||  | || |||||||||| ||    
T  94431 catgaattgatgatagtatggggaccaaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactacaattttgatgttataatgttaacttcatc 94530  T
Q  327 agaaaagtcattttc 341  Q
    |||||||||||||||    
T  94531 agaaaagtcattttc 94545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 93922 - 94056
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  93922 tgtttgattca-ttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatc 94020  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgata 135  Q
    | |||| |||||||||| |||| | | |||||||||    
T  94021 gttgacatctttaacatgcaaacaaatttgatgata 94056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 364
Target Start/End: Original strand, 408702 - 408754
Alignment:
Q  312 agtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||||||  || |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  408702 agtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattttcc 408754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 3879759 - 3880123
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3879759 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatc 3879858  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3879859 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaa 3879958  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |     
T  3879959 ttagaataagtatattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcacaacac 3880058  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3880059 ttttgatactataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcgtgacttcaccatagaattttcc 3880123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 362
Target Start/End: Original strand, 21016940 - 21017294
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgc 101  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||      ||||||||||     
T  21016940 tttgattcatttataaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacgtac------tattttatcgt 21017033  T
Q  102 tgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 201  Q
    |||| | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21017034 tgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataacgtaggataaaatt 21017133  T
Q  202 agattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatattt 301  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  21017134 agattaagtttattcttgttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccattgtacaaataatggggtgttactcacaacattt 21017233  T
Q  302 ttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    || |||||  | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21017234 tttatactacaatgttaacttcaccaaaaaagtcattttcgtgacttcaccgtataatttt 21017294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 366
Target Start/End: Original strand, 7234884 - 7235220
Alignment:
Q  29 ttgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagtt 128  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| || | | |||||||| |||| ||||||    
T  7234884 ttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagtt 7234983  T
Q  129 gatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctga 228  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||    
T  7234984 gatgatattatgcgatagtcttaagcgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctga 7235083  T
Q  229 tgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcag 328  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||  | ||||||| |||||  | |    
T  7235084 tgaattgataatactatga-gactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctactcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccgg 7235182  T
Q  329 aaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  7235183 aaaagtcattctcataacttcaccatagaattttccat 7235220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 4318642 - 4319007
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   || ||||| |||    
T  4318642 tgtttgatttatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactttcccgtactatttcatc 4318741  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| ||||||||||  ||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4318742 gttgacatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 4318841  T
Q  200 -ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| | ||| |||| ||  | ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| || |    
T  4318842 attagattaagtgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgggggttgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcataaca 4318941  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
     |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4318942 cttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 4319007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 5627754 - 5627391
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  5627754 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcacctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcg 5627655  T
Q  101 ctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaat 200  Q
     |||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||||||||    
T  5627654 ttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaat 5627555  T
Q  201 tagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatt 300  Q
    || ||||| |||| ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||  |||||    
T  5627554 tatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgataatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattatatt 5627455  T
Q  301 tttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||| ||  | |||||||||||||  || |||||||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  5627454 ttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccttagaattttcc 5627391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 29182522 - 29182165
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |   |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |    
T  29182522 ttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatca---gtaattcatctagtaatacttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgtt 29182426  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtgggg-tgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 201  Q
    | | |||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  29182425 ggcatctttaacctgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggggtgttacacttaaaatatggtaggataaaatt 29182326  T
Q  202 agattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatattt 301  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | ||| ||||  |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  29182325 agattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgataatatggagactgaacttttgatgacactgtataaacagtggggtgttactcacaacactt 29182226  T
Q  302 ttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||||  | ||||||||||||| |||  ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  29182225 ttgatgttatagtgttaacttcatcaataaaatcattctcatgacttcaccataaaatttt 29182165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1946199 - 1945833
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  || ||||||||    
T  1946199 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctaataatgcttgtaacatcttggacttacatgtactattttat 1946100  T
Q  99 cgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    || ||   |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  1946099 cgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaa 1946000  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||   |||||||||  | ||| ||||||| || ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||  | |    
T  1945999 attatattaagtgtagtcttgttaacttgatgaattcatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattaca 1945900  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttc-ctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||  | ||||||||||||| |  | |||||||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  1945899 tttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaagtcattcttatgacttcaccgtagaattttcc 1945833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8513585 - 8513233
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgttattattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||      |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||   || |||||||||     
T  8513585 tgtttgattcatttttaaattgtt------gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaagattttggacttaccggtactattttatca 8513492  T
Q  101 ctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa- 199  Q
     || | ||||||||||  ||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||      ||||||||||||||||||     
T  8513491 ttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgtta------aaacaaggtaggataaaaa 8513398  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    |||||| || ||||||||||||| | |||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  8513397 ttagatcaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacaacac 8513298  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  8513297 ttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 8513233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 20768440 - 20768087
Alignment:
Q  7 attcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgac 105  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||||||||| ||||    
T  20768440 attcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttgac 20768341  T
Q  106 ctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagat 205  Q
     |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20768340 atctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatgatcttaagtgttacactttatgggatgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagat 20768241  T
Q  206 taaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttga 305  Q
    |||  ||| |||||||| |||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||||| |  | ||||| | || || ||||||| | | ||||||    
T  20768240 taa--gtaatcttgttaatctgatgaattaatgatactatgaggactgaacttttgatgccact-aacaaacaat-ggatgctactcactacacttttga 20768145  T
Q  306 tactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttc 363  Q
    | || ||||||| |||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20768144 tgctatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttc 20768087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 6091002 - 6091306
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  6091002 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 6091101  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    | |    ||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6091102 gtttgaatctttaatatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgttgggtgttacgcttaaaacaaggtatgataaa 6091201  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||| | ||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| | |    
T  6091202 attagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgagtactgaacttttgatggcattgtacaaacaatggtgtgttactcactaca 6091301  T
Q  299 ttttt 303  Q
    |||||    
T  6091302 ttttt 6091306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Original strand, 33892832 - 33893187
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  33892832 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 33892931  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| ||||   ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33892932 gttggcatctttaacatgcaaactgagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttatacataaaacaaggtaggataaaa 33893022  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| || | ||||| ||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |     
T  33893023 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaag-ggactgaacttttaatatcattgtacaaatagtggggtgttactcacaacac 33893121  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    |||||||  | |||||||||||||   | |||| | ||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  33893122 ttttgatgttatagtgttaacttcactaaaaaaattattctaatgactttaccatagaattttcca 33893187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 6089260 - 6088910
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgttattattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||      |||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||   || ||||||||||    
T  6089260 tgtttgattcatttttaaattgtt------gattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacattttggacttactggtactattttatcg 6089167  T
Q  101 ctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa- 199  Q
     || | ||||||||||  ||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || |||| | ||||||      ||||||||||||||||||     
T  6089166 ttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttataccttgtagagtgtta------aaacaaggtaggataaaaa 6089073  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    |||||| ||   ||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||  |||| |||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| |     
T  6089072 ttagatcaaggatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggtgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggcgttactcacaacac 6088973  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6088972 ttttgatactatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaatttt 6088910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 107 - 364
Target Start/End: Original strand, 7055142 - 7055399
Alignment:
Q  107 tctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 206  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  7055142 tctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagcgtgttacacttagaacaaggtatgataaaattatatt 7055241  T
Q  207 aaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgat 306  Q
    || |||| ||||||||  ||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||| |||| || ||| |||| ||||||||| |  |||||||| ||    
T  7055242 aagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtgaggtgttactaattatattttttat 7055341  T
Q  307 actctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
      | |||||||||||||  || |||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||    
T  7055342 gttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccataaaattttcc 7055399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 362
Target Start/End: Original strand, 30353256 - 30353540
Alignment:
Q  78 gacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttaca 177  Q
    ||||||||  || |||||||||| |||| | |||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30353256 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttaca 30353355  T
Q  178 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaac 277  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||| | ||| ||||  |||| |||| | ||||||| |||| ||||    
T  30353356 cttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgatactatggagactgaactatcgatgccactgtacaaac 30353455  T
Q  278 agtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||| | | |||||| ||| | |||||||  | || ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  30353456 agtgagatattactcgcaacacttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 30353540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 107 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15491872 - 15491673
Alignment:
Q  107 tctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 206  Q
    |||||||||| |||| | | ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15491872 tctttaacatccaaacagaattgctgatatcatgtgatatttttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagatt 15491773  T
Q  207 aaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgat 306  Q
    || || |||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| || |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15491772 aagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatgccactgtacaaatagtggggtgttactcacaacacttttgat 15491673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33619197 - 33618831
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgat---tcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattatttt 96  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||  ||||   | ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||    
T  33619197 tgttcgattcatttttaaattgttgattgctgatcattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacatgtactatttt 33619098  T
Q  97 atcgctgacctctttaacata-----caaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggta 191  Q
    |||| || | |||||||| ||     |||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||  | ||||||||||||        ||||    
T  33619097 atcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatactcttaagtgtcacacttc-tagggtgttacact--------ggta 33619007  T
Q  192 ggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttact 291  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||||||||||||  ||| ||| | |||| || ||||    
T  33619006 ggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagaactgaacttttgatgccaccgtacaaataatgggttgctact 33618907  T
Q  292 cacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccatt 367  Q
    ||| | | ||||||| |  ||||||| |||||  |||||||||  ||  | |||||||||| ||||||||||||||    
T  33618906 cactacacttttgatgcgatagtgttgacttcaccagaaaagtatttcccatgacttcaccgtagaattttccatt 33618831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 7054592 - 7054693
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  7054592 tgtttgattcatctttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacagttactattttat 7054691  T
Q  99 cg 100  Q
    ||    
T  7054692 cg 7054693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18498555 - 18498433
Alignment:
Q  243 tatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagt-ggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttc 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| |||| || |||||||| ||||| | | ||||||| || || ||||||||||  ||| ||||||||| ||    
T  18498555 tatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaactgtgggggtgttgctcactacacttttgatgctataatgttaacttcaccaggaaagtcattctc 18498456  T
Q  342 gtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
     ||||||||| ||||| ||||||    
T  18498455 atgacttcactatagatttttcc 18498433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 326 - 364
Target Start/End: Original strand, 11084162 - 11084200
Alignment:
Q  326 cagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11084162 cagaaaagttattttcatgacttcaccatagaattttcc 11084200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19631797 - 19631749
Alignment:
Q  316 ttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  19631797 ttaacttcaccagaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc 19631749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 367
Target Start/End: Original strand, 24662201 - 24662241
Alignment:
Q  327 agaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccatt 367  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  24662201 agaaaagtcattatcatgactttaccatagaattttccatt 24662241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 34133288 - 34132926
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||     
T  34133288 tttgattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgt 34133189  T
Q  102 tgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 201  Q
    || | |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34133188 tggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 34133089  T
Q  202 agattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatattt 301  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34133088 atattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattt 34132989  T
Q  302 ttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||| ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34132988 ttgatactatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattttcgtgacttcattatagaattttcc 34132926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 46297583 - 46297945
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46297583 tgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatc 46297682  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46297683 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaag 46297782  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    || |||||| |||| | |||||| ||| |||||||| | ||| || | ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  46297783 tttgattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacggggactgaacttttgacgccattgtacaaacagtggtgtgttactcactatat 46297882  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||||||  | |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46297883 ttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaatttt 46297945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 39283007 - 39282644
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||     
T  39283007 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggatttacagatactattttatt 39282908  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39282907 gttgacatctttaacaggcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaa 39282808  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| | | ||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |     
T  39282807 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaatggatgataatatgagaactgaacttttgatgccactgtataaacagtggggtattactcac-acag 39282709  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||  | ||||||||| ||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39282708 ttttgatgttatagtgttaattttatcagaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcc 39282644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 37203423 - 37203057
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||  || |||||||||    
T  37203423 tgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgatatattggacttacaggtactattttatc 37203324  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaata-tagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
      |||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  37203323 attgacatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgatacactaaaaataaggtaggataaa 37203224  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  37203223 attagattaagtgtagtcttgttaatcttatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcactaca 37203124  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
     |||||||  | ||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37203123 attttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaaatcatttttatgacttcaccatagaattttcca 37203057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4015814 - 4015449
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||| |    
T  4015814 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttacc 4015715  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| | ||||| |||||  ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4015714 gttggcatctttaacatgcaaaca-agttgttgatacaatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaa 4015616  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| || | || ||||||| ||||||||||||||| |     
T  4015615 ttagactaattatattcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactctacaaacagttgggtgttactcacaacac 4015516  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  4015515 ttttgatgctatagtgttaacttcatcagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccat 4015449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 24488783 - 24489140
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | | ||||||||     
T  24488783 tgtttgattcatttttaaattattgattattgattcatgattaatagtaatgcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttactgacactattttatt 24488882  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24488883 gttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttacaccttgtgaggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaa 24488982  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||||||||| ||    
T  24488983 ttagattaagtgtattcttgttagtctgatgaattgatgataatatggggactgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtggaatgttactcacaacat 24489082  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccataga 357  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||   | |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24489083 ttttaatactatagtcttaacttcacaaaaaaaatcattttcgtgacttcaccgtaga 24489140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 37158063 - 37157698
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||  || |||||||||    
T  37158063 tgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgacatattggacttacatgtactattttatc 37157964  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaata-tagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
      || | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  37157963 attggcatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaataaggtaggataaa 37157864  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||| || ||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | |    
T  37157863 attagattaagtgtagtcttgttaatcttataaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactgta-caacagtggggtgttactcactaca 37157765  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
     |||||||  | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37157764 attttgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagccattttcatgacttcaccatagaattttcca 37157698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 53228973 - 53229336
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  53228973 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtattattttatc 53229072  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53229073 gttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatactatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggagttacacttaaaataaggtaggataaaa 53229172  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtg-gggtgttactcacaata 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||||||| ||||| | |    
T  53229173 ttagattaactgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacattgagggtgttgctcactaca 53229272  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
     ||||||| || ||||||||| |||  ||||||| | |||||| |||||||||| || ||||||    
T  53229273 cttttgatgctatagtgttaatttcaccagaaaaataattttcatgacttcaccttaaaatttt 53229336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 52040743 - 52041108
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  52040743 tgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaataatcattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 52040842  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52040843 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaa 52040942  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaaca-gtggggtgttactcacaata 298  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||| | || |||||  ||||| ||||||||| | |    
T  52040943 ttagattaagtgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgccactatacaaacatttggggagttactcactaca 52041042  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
     |||||||  | |||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||    
T  52041043 cttttgatgttatagtattaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcacctcagaattttcc 52041108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 26941084 - 26941445
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| |    
T  26941084 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 26941183  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 202  Q
    |   |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  26941184 ggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagttttaagtgttacactttatgaggtattacgcttataacaaggtaggataaaatta 26941283  T
Q  203 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttt 302  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||  | |||  ||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  26941284 gattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattaatgataccatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattataattt 26941383  T
Q  303 tgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||  | |||||||||||||  || |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  26941384 tgattttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccatagaattttcc 26941445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 48355296 - 48354932
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  48355296 tgtttgattcatttttaaattgttgcttactgattaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacagatactattttatt 48355197  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    |  |   |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  48355196 gtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggtatgttacatttataacaaggtaggataaaa 48355097  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||| | ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||    
T  48355096 ttagactaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgagaactgaacttttgatgccattgtacaaacaatggggtgttactcattacat 48354997  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||| ||| | |||||||||||||  || |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  48354996 ttttaatattatagtgttaacttcaccataaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 48354932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 44891849 - 44891496
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |  || |||||||||| |    
T  44891849 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgtaggtactattttatcgtt 44891750  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 202  Q
    ||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44891749 gacatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 44891650  T
Q  203 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttt 302  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||||| | |||    
T  44891649 gattaagtgtattcttgttaatctgattaattgatgatactatgtggactaaacttttgatgcc---------acagtgggatgttactcacaacacttt 44891559  T
Q  303 tgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
    ||||  | |||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  44891558 tgatgttatagtgttaacttcacca-aaaagtcattttcatgacttcaccgtataattttccat 44891496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 7327306 - 7327668
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |    
T  7327306 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgtt 7327405  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 202  Q
    | | |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||    
T  7327406 ggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactagaaagaaggtaggataaaaata 7327505  T
Q  203 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttt 302  Q
     ||||| ||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||||| || |||| ||| | ||| ||||||||||||| | |||    
T  7327506 aattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaataatggagtgttactcacaacacttt 7327605  T
Q  303 tgatactctagtg-ttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||  | ||||| ||||||||   | |||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  7327606 tgatgttatagtgtttaacttcactaaaaaagtcattctcataacttcaccatagaattttcc 7327668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 33378606 - 33378967
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  33378606 tgtttgattcatttttaaatcgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatc 33378705  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33378706 gttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgagattatgcgatagtcttaagtattacacttcttggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 33378805  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| || | |||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||  ||| ||| | ||||||  ||||||| | |     
T  33378806 ttagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgataatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaatattggggtactactcactacac 33378905  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||||| ||||||| |||   ||| |||||||||| || | ||||  ||||||||||||||    
T  33378906 ttttgatactatagtgttgact---tcacaaaagtcattctcataactttgccatagaattttcc 33378967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Original strand, 42505899 - 42506189
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| |    
T  42505899 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtt 42505998  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 202  Q
    |   |||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  42505999 ggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaatta 42506098  T
Q  203 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactca 293  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  42506099 gattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtattactca 42506189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 40552080 - 40552444
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  || |||||||||    
T  40552080 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcatggacttacatgtactattttatc 40552179  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||    
T  40552180 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacaatcctaagtgttacacgttgtgggatgttacgcttataacaagctaagataaaa 40552279  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||| ||||| |||| | |||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||  | ||    
T  40552280 ttaaattaagtgtagtgttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggagtgttactcattacat 40552379  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40552380 ttttgatgttatagtgttaacttctccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 40552444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Original strand, 3655031 - 3655387
Alignment:
Q  11 atttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcat--ctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacct 107  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| || || ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| ||   |    
T  3655031 atttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtgttattttatcgatggaat 3655130  T
Q  108 ctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatta 207  Q
    ||||||||| |||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3655131 ctttaacatgcaaacagagctgatgatatcatgtgatagttttaagtgttacattttgtggtgtgttacgcttctaacaaggtaggataaaattagatta 3655230  T
Q  208 aatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgata 307  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  | |||||| ||     
T  3655231 agtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacggtggggtgttactcattacattttttatg 3655330  T
Q  308 ctctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
     | ||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  3655331 ttatagtgttaactttatcaaaaaagtcatttttatgacttcaccataaaattttcc 3655387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 4761469 - 4761836
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||     
T  4761469 tgtttgattcattttcaaattgttgatttctgattaatgattaatagtaattcatctggtaatgtttgcaacattttggacttataggtactattttatt 4761568  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtgggg-tgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    |  |   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4761569 gtcggaatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgggggtgttatacttataacaaggtaggataaa 4761668  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || ||||| ||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||  | |    
T  4761669 attagattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgaagtgttactcattaca 4761768  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaactt--cctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||| | |||| |||||||  ||  | |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||    
T  4761769 tttttgatattatagtattaacttcaccaaaaaaaagtcaatctcatgaattcaccatagaattttcc 4761836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22451323 - 22450959
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||  ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  22451323 tgttcgattcatttttaaatttttgattgctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 22451224  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  22451223 gttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgatagtgttaaatgttacacttactggggtgttacacttaaaacaaggtaaggtaaaa 22451124  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| || | |||||||| | |||||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||||||||   || |||||||| |||| ||||||| | |     
T  22451123 ttagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccaccatacaaacagtgaggtgctactcactacac 22451024  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||| || ||||||| |||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22451023 ttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 22450959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 65 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11467114 - 11466815
Alignment:
Q  65 ttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacacttt 164  Q
    |||||||||||| ||||| ||  || |||||| ||| ||   |||| ||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  11467114 ttgcaacatcttagacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacacttt 11467015  T
Q  165 gtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatg 264  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||    
T  11467014 gtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatg 11466915  T
Q  265 ccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||  | |||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  11466914 ccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacacttgcgatgttatagtcttaacttcatcagaaaagtcattctcaagacttcaccatagaattttcc 11466815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3362610 - 3362285
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  || ||  ||||||||    
T  3362610 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatattggacttctaagtacaattttatc 3362511  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3362510 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgtttcacttaaaataaggtaggataaaa 3362411  T
Q  200 ttagatta--aatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaat 297  Q
    ||||||||  | |||| ||||||||   |||||||||| | |||  ||||||| | |||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||| ||    
T  3362410 ttagattaatagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgataccatgaggagtgaacttttgatgccactgtacaaatagtgggatgttactcactat 3362311  T
Q  298 atttttgatactctagtgttaacttc 323  Q
    |||| |||| || |||||||||||||    
T  3362310 atttctgatgctatagtgttaacttc 3362285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21193962 - 21193597
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||   || |||||||||    
T  21193962 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatttagtaatggttgcaacatcttgaacttacggctactattttatc 21193863  T
Q  100 gctgacc-tctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataa 197  Q
    | |||   |||||||||| |||| | ||||| |||||| || ||||||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21193862 g-tgagaatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtctttaagtgttatcctttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataa 21193764  T
Q  198 aattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||  ||| ||||| ||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||     
T  21193763 aattagattaaatgtattcttgttaatctgatgaattaatgataccatggggactgaacttttgatgtcactctacaaacagtggggtgttactcacaac 21193664  T
Q  298 atttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    | ||||||| |   ||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  21193663 acttttgattcaacagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactttaccatagaattttcc 21193597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 11357202 - 11357535
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  11357202 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatc 11357301  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||                 ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11357302 gttggtatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt-----------------tacacttaaaataaggtaggataaaa 11357384  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagt-ggggtgttactcacaata 298  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  11357385 ttagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgcaactgtacaaacagtgggggtgttactcactata 11357484  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttc 349  Q
     ||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||    
T  11357485 cttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttc 11357535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 24707936 - 24708230
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  || |||||||||    
T  24707936 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaatttatctaataatgcttgcaacttcttggacttacatgtactattttatc 24708035  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24708036 gttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgattgttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaa 24708135  T
Q  200 ttagattaaa--tgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcac 294  Q
    |||||| |||  |||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||| || ||  || |||||| ||||||||||||    
T  24708136 ttagatcaaaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgtcactg--tacacagtgaggtgttactcac 24708230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 32373813 - 32373466
Alignment:
Q  13 ttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctcttt 111  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||| |||||    
T  32373813 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttgacatcttt 32373714  T
Q  112 aacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatg 211  Q
    || || |||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32373713 aatatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtcacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 32373614  T
Q  212 tattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactct 311  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | |||  ||  ||    |||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||| | ||||||| || |    
T  32373613 tattcttgttaatatgatgaattgatgataccattggggtggaacttttgatgccactgtacaaacagt--ggagttactcacaacacttttgatgctat 32373516  T
Q  312 agtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattt 361  Q
    |||||||||||  |  ||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  32373515 agtgttaactttattggaaaagtcattctcatgacttcatcatagaattt 32373466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 2008294 - 2007965
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt--------attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatatta 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||        |||| ||||| ||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  2008294 tgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattactgattaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtacta 2008195  T
Q  93 ttttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtag 192  Q
    |||||||| || | |||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  2008194 ttttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgt-acacttaaaacgaggtag 2008096  T
Q  193 gataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactc 292  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| | ||  |||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  2008095 gataaaattagattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatgctatggggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactc 2007996  T
Q  293 acaatatttttgatactctagtgttaacttc 323  Q
    |||| | |||| |  || |||||||||||||    
T  2007995 acaacacttttaacgctatagtgttaacttc 2007965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 47481878 - 47481513
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  47481878 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaagtactattttat 47481779  T
Q  99 cgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    || |||  ||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||  |||||    
T  47481778 cgttgaaatctttaatatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaataaggtataataaa 47481679  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||   |||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||  | |    
T  47481678 attatattaagtgtagtcttgttaacatgatgaattgatgatactatgagggctaaacttttgatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattaca 47481579  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||  | |||||||||||||  || |||  |||||    ||||||||||||| ||||||||    
T  47481578 tttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaacatcattcctatgacttcaccataaaattttcc 47481513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22622539 - 22622774
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  22622539 tgtttgattcatttttaaatagttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 22622638  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22622639 gttgacatctttaacatccaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtatgataaaa 22622738  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattg 235  Q
    ||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  22622739 ttagattaagtgtagttttgttaatctgatgaattg 22622774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 21009622 - 21009929
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  21009622 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttat 21009721  T
Q  99 cgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    || ||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||||| || ||||||    
T  21009722 cgttggaatctttaacatgcaaatattgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaagttatgataaa 21009821  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||  | |    
T  21009822 attatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgataatatgagggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggggtgttactcattaca 21009921  T
Q  299 tttttgat 306  Q
    ||||||||    
T  21009922 tttttgat 21009929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 54506163 - 54505799
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  54506163 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataaatactattttat 54506064  T
Q  99 cgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    || ||   |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  54506063 cgttggaatctttaacatgcaaataaagtagatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaaggtatgataaa 54505964  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||  | |||| |||  | ||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||  | |    
T  54505963 attatattaagtgtagtcttgttaacccgatgtatttatgatactatgagg-ctgaatttttgatgtcattctataaataatggggtgttactcattaca 54505865  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||  | |||||||||||||  || |||||||||| | | ||||||| |||| ||||||||    
T  54505864 tttttgatgttatagtgttaacttcaacaaaaaagtcattcttgcgacttcatcataaaattttcc 54505799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33698504 - 33698273
Alignment:
Q  5 tgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctg 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  || |||||||||| ||    
T  33698504 tgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaatatcttagacttacaggtactattttatcgttg 33698405  T
Q  104 acctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 203  Q
     | |||||||||| |||| | |||||  ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698404 gcatctttaacatgcaaacagagttgccgatatcatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattag 33698305  T
Q  204 attaaatgtattcttgttagtctgatgaattg 235  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  33698304 attaagtgtattcttgttaatctgatgaattg 33698273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 102 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 35844579 - 35844317
Alignment:
Q  102 tgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-t 200  Q
    |||| ||||||||||  ||| | ||||  |||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  35844579 tgacatctttaacatggaaacaaagttactgatatcatgtgata-tcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaactaggtaggataaaaat 35844481  T
Q  201 tagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  35844480 tagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactaaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacatt 35844381  T
Q  301 tttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||| |  | |||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  35844380 tttgttgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaattttcc 35844317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 29099701 - 29099356
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||    
T  29099701 tgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatc 29099602  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |  | |||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  29099601 gttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgaaagtt---------acactttgtggggtgttacacttaaaataaggcacgataaaa 29099511  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||| | ||| || | ||||| |||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  29099510 ttaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatactaaggggactgaactttagatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcacgacat 29099411  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccat 354  Q
    |||| ||  | |||||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  29099410 tttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttcaccat 29099356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38592051 - 38591781
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||  | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||     
T  38592051 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttgtttaataatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatcgt 38591952  T
Q  102 tgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 201  Q
    || | ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38591951 tgtcatctttgacatgcaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtcacgttttgtggggtattacacttgaaacaagataggataaaatt 38591852  T
Q  202 agattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgta 272  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38591851 agattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgataataatatgtggacttaacttttgatgccattgta 38591781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 43975713 - 43976068
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  43975713 tgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactattttatc 43975812  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaata---tagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggata 196  Q
    | || | ||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||| ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  43975813 gttggcatctttaacatgtaaacaacatagttgatgatattatgcgatagt-------gttacactttctggggtgttacacttaaaacaagataagata 43975905  T
Q  197 aaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaa 296  Q
    |||||||||||| || | | |||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||| ||| ||||||| |    
T  43975906 aaattagattaagtgcaattttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggattaaacttttgatgtcatcgtacaaatagtggagtgctactcacta 43976005  T
Q  297 tatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
     | ||||||| || ||||||| |||   ||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  43976006 cacttttgatgctatagtgttgact---tcaaaaaagtcattctcatgacttcaccataaaatttt 43976068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 44186338 - 44186686
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |  || |||||||||    
T  44186338 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagacttagaggtactattttatc 44186437  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
      || | |||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||||                ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44186438 attggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtt----------------gtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaa 44186521  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||||| |||||| | |||||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |     
T  44186522 ttagattaagtgtatttttgttaatttgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtataaacagcggggtgttactcacaacac 44186621  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||| || |||||||||||||  || |||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  44186622 ttttgatgctatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctctcgacttcatcatagaattttcc 44186686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 46 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 45174815 - 45174493
Alignment:
Q  46 gtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgata 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||| || | ||||||||||  ||| | ||||| |||||| || | |||    
T  45174815 gtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatattata 45174716  T
Q  146 gttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatatta 244  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||    
T  45174715 gtcttaagtgttacactttgtagagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta 45174616  T
Q  245 tgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttact--cacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcg 342  Q
    || ||||| |||||||||||| | |||| ||||||||  ||||||||  ||||| | |||||||  | |||||||||||||  || |||||| ||| ||     
T  45174615 tggggactgaacttttgatgctactgtacaaacagtgaagtgttactcacacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagttattctca 45174516  T
Q  343 tgacttcaccatagaattttcca 365  Q
      ||||||||||| |||||||||    
T  45174515 caacttcaccataaaattttcca 45174493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 43348563 - 43348319
Alignment:
Q  49 attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagtt 148  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||     
T  43348563 attcatttagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtc 43348464  T
Q  149 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgag 248  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||  |     
T  43348463 ttaagtgtcacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta-aaa 43348365  T
Q  249 gactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcac 294  Q
    |||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||||| |||||    
T  43348364 gactgaacttttgatgccactaaacaaacagtggggtgttgctcac 43348319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 362
Target Start/End: Original strand, 54828547 - 54828883
Alignment:
Q  25 attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatat 124  Q
    |||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| | ||   | ||||||||||||| ||    
T  54828547 attactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaacat 54828646  T
Q  125 agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagt 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |    
T  54828647 agttgatgatattatttgatagttttaagtgttacactttgtgggatgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttcat 54828746  T
Q  225 ctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcc 324  Q
     |||||||||| | ||  ||||| || | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||  | |||||| ||  | ||||||||||||      
T  54828747 atgatgaattgatgatgctatgaagaatgaatttttgatgtcgttgtttaaacggtggggtgttactcattacattttt-atgttatagtgttaacttta 54828845  T
Q  325 tcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
     || |||| | |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  54828846 ccaaaaaaattatttttatgacttcaccataaaatttt 54828883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1090048 - 1089813
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |  || |||||||||    
T  1090048 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggattta-atgtactattttatc 1089950  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtgggg-tgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    | || | |||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1089949 gttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaa 1089850  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattg 235  Q
    |||||||| |||||| || ||||  |||||| |||||    
T  1089849 attagatttaatgtagtcctgttgatctgataaattg 1089813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Original strand, 22445886 - 22446247
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| |  || |||||||||    
T  22445886 tgtttgattcatatttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaatacttgcaacattttggacttaaaggtactattttatc 22445985  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22445986 gttggtatctttaatatgcaaaaatagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttatacattgt-gagtgttacacttaaaacaatgtaggataaaa 22446084  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatga-ggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    ||||||||| |||| |||| ||  | |||||||||| | ||| ||||| ||  | |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  22446085 ttagattaagtgtagtcttatttatatgatgaattgatgatactatgagggtttgaacttttgatgccactgtacaaa-agtggggtgttactcactata 22446183  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttc-ctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattt 361  Q
    ||||||||  | || |||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22446184 tttttgatgatataatgttaacttcaccaaaaaaagtcattttcatgacttcaccgtagaattt 22446247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 46994490 - 46994755
Alignment:
Q  9 tcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacct 107  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||| |  |   |    
T  46994490 tcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaat 46994589  T
Q  108 ctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatta 207  Q
    ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46994590 ctttagcatgcaaacataattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggcgttacacttataacaaggtaggataaaattagatta 46994689  T
Q  208 aatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtat 273  Q
    | |||| |||||||| ||  |||| ||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  46994690 agtgtagtcttgttaatcatatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtat 46994755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 25580087 - 25579731
Alignment:
Q  8 ttcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacc 106  Q
    ||||||||||||||||| |||   |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| |  ||   |||||||| || |     
T  25580087 ttcatttttaaattgttgattgcggattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttagatttataggtacagttttatcgttggca 25579988  T
Q  107 tctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 206  Q
    |||||||||| |||| | ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25579987 tctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactaaaaacaaggtaggataaaattagatt 25579888  T
Q  207 aaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgat 306  Q
    || |||||| |||||| ||| || || || | ||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |  ||||| |||||| | |||||||    
T  25579887 aagtgtatttttgttaatctaataaactgatgataatatggggactgaacttttgatgtcactgtataaatagtagaatgttattcacaacacttttgat 25579788  T
Q  307 actctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttc 363  Q
     || |||| ||||||||  ||||||| ||||| || | |||| |||||| |||||||    
T  25579787 gctatagtattaacttcaccagaaaaatcattctcataacttaaccataaaattttc 25579731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 305
Target Start/End: Original strand, 14586501 - 14586796
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||    
T  14586501 tgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccg-tactattttatc 14586599  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||  ||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14586600 gttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatacga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaag 14586690  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| || | |||| |||||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| |     
T  14586691 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggacaaaacttttgatatcactgtataaatagtgaggtgttactcacaacac 14586790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 153 - 365
Target Start/End: Original strand, 51212955 - 51213167
Alignment:
Q  153 gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggact 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||    
T  51212955 gtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggact 51213054  T
Q  253 aaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcacc 352  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | |||||| ||  |  ||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||    
T  51213055 caacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttgctcattacattttttatgttacagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcacc 51213154  T
Q  353 atagaattttcca 365  Q
    |||||||||||||    
T  51213155 atagaattttcca 51213167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29164157 - 29163912
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgttattattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||      |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  29164157 tgtttgatttatttttaaattgtt------gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttagacttacaagtactattttatcg 29164064  T
Q  101 ctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaat 200  Q
     |  | |||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29164063 ttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaat 29163973  T
Q  201 tagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttg 261  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | ||| || ||||||| ||||||||    
T  29163972 tagattaagtgtattcttattaatctgatgaattgatgatactaagaggactgaacttttg 29163912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36012494 - 36012244
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    || |||||||||    
T  36012494 tgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcagcattttggacttatcggtactattttatc 36012395  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatat-agttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aa 197  Q
    | || | ||||||||||  ||| |  ||||| |||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  36012394 gttggcatctttaacatggaaacaagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtgggatgttacactgaaaacaaggtaggataaa 36012295  T
Q  198 aattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgag 248  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  36012294 aattagattaggtgtattcttgttcatctgatgaattgatgatattatgag 36012244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 252
Target Start/End: Original strand, 11835500 - 11835701
Alignment:
Q  46 gtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgata 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||      || |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11835500 gtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttaacatc------atgcaaatagagttgatgatatcatgtgata 11835593  T
Q  146 gttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa-attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatatta 244  Q
    || |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||| | ||| ||    
T  11835594 gtcttaattgttacactttgtaggttgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgataaattgatgatacta 11835693  T
Q  245 tgaggact 252  Q
    || |||||    
T  11835694 tggggact 11835701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 40936325 - 40935995
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  |||| ||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  || |||||||||| |    
T  40936325 ttgatttatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttatcgtt 40936226  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 202  Q
    | | |||||||||| ||||   ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||                  ||| || || |||||||||||    
T  40936225 ggcatctttaacatgcaaacggagttgctaatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt------------------aaaaaaagttggataaaatta 40936144  T
Q  203 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttt 302  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||||| | | ||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| || |||||||||| ||| | |||    
T  40936143 tattaagtgtattcttgttaatctgatgaatagatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaatgaggtgttactcgcaacacttt 40936044  T
Q  303 tgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcac 351  Q
    |||| || |||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||    
T  40936043 tgatgctatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcac 40935995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 119 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 53176290 - 53176074
Alignment:
Q  119 aaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattctt 218  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  53176290 aaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatctt 53176191  T
Q  219 gttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgtta 318  Q
    |||| |||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||    ||||| |||| |||||||||  | |  |||||    
T  53176190 gttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgttattgtacaaacagtggaca-ttacttacaacatttttgatgttatgatgtta 53176092  T
Q  319 acttcctcagaaaagtca 336  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  53176091 acttcatcagaaaagtca 53176074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 27480179 - 27480566
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaa----catcttggacttacaaatattattt 95  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||   ||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| ||    ||| |||||||||||  || |||||    
T  27480179 tgttcgattcatttttaaattgttgatcgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgtttgtaattaacattttggacttacatgtactattt 27480278  T
Q  96 tatcgctgacctctttaacatacaaa----tatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacacttt---gtg----------gggtgttacac 178  Q
    ||||| || | |||||||||| ||||    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    |||          |||||||||||    
T  27480279 tatcgttggcatctttaacatgcaaacatatatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttctgggtgttacacttctgggtgttacac 27480378  T
Q  179 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaaca 278  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||||| ||  ||| |||||    
T  27480379 ttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaaca 27480478  T
Q  279 gtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
     | || || ||||||  ||| |||||||  | ||||||| ||||   || |||  ||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  27480479 attggatgctactcattatacttttgatgttatagtgttgactttaccaaaaatatcattctcatgacttcatcatagaattttccat 27480566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 367
Target Start/End: Original strand, 20373300 - 20373484
Alignment:
Q  183 aacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtgg 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| | |||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20373300 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgataccatgagaactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgg 20373399  T
Q  283 ggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccatt 367  Q
    ||||||||||   | |||||||||  | |||| ||||||||  || |||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||||    
T  20373400 ggtgttactcgttacatttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttatgacttcactataaaattttccatt 20373484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 198
Target Start/End: Original strand, 20373136 - 20373263
Alignment:
Q  71 catcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtgggg 170  Q
    ||||||||||||| |  || |||||||||| ||   |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  20373136 catcttggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttatggga 20373235  T
Q  171 tgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||||    
T  20373236 tattacgcttataacaaggtaggataaa 20373263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 146
Target Start/End: Original strand, 51212599 - 51212738
Alignment:
Q  8 ttcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| |  |       
T  51212599 ttcatttttaaattgttgatttttaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaa 51212698  T
Q  107 tctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatag 146  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  51212699 tctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag 51212738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 169
Target Start/End: Original strand, 11357030 - 11357140
Alignment:
Q  59 taatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgtta 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || | | ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  11357030 taatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcattggcatatttaacatacaaccagagttgatgatattatatgatagtcttgagtgtta 11357129  T
Q  159 cactttgtggg 169  Q
    |||||||||||    
T  11357130 cactttgtggg 11357140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 50475173 - 50475021
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggt-------aattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatatta 92  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||| |       |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  50475173 tgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtatta 50475074  T
Q  93 ttttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgata 145  Q
    |||||||  |||| ||||||| || |||| | | ||||||||||||| |||||    
T  50475073 ttttatccttgacatctttaatatgcaaacagatttgatgatattatatgata 50475021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 364
Target Start/End: Original strand, 55343399 - 55343469
Alignment:
Q  294 caatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55343399 caatatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 55343469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 147
Target Start/End: Original strand, 53811596 - 53811698
Alignment:
Q  41 taatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatg 140  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||   |||||||||| |||    ||||||||||||||||    
T  53811596 taatagtaattcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatgcaa----agttgatgatattatg 53811691  T
Q  141 tgatagt 147  Q
    |||||||    
T  53811692 tgatagt 53811698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 363
Target Start/End: Original strand, 11835701 - 11835790
Alignment:
Q  269 tgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttc 363  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||     |||||||||||  || |||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  11835701 tgtacaaacagtgaggtgttactcacaacacttttgata-----gtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttc 11835790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 367
Target Start/End: Original strand, 49359641 - 49359679
Alignment:
Q  329 aaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccatt 367  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49359641 aaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttccatt 49359679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 366
Target Start/End: Original strand, 53811976 - 53812026
Alignment:
Q  316 ttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  53811976 ttaacttcatcagaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttccat 53812026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 364
Target Start/End: Original strand, 40640634 - 40640682
Alignment:
Q  316 ttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40640634 ttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 40640682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 364
Target Start/End: Original strand, 47930666 - 47930714
Alignment:
Q  316 ttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47930666 ttaacttcaccagaaaaatcattttcatgacttcaccatagaattttcc 47930714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 315 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 42204391 - 42204340
Alignment:
Q  315 gttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||    
T  42204391 gttaacttcatcagaaaagtcattctcacgacttcacgatagaattttccat 42204340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 327 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 4556577 - 4556543
Alignment:
Q  327 agaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattt 361  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4556577 agaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattt 4556543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 272 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2613973 - 2613882
Alignment:
Q  272 ataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |  | |||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||   |||||||||||||||    
T  2613973 ataaatagtgtggtgttactcacaacacttttggtgttatagtgttaacttcaacaaaaaagtcattttaatgactt---catagaattttccat 2613882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 311 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 29163891 - 29163839
Alignment:
Q  311 tagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttc 363  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  29163891 tagtgttaacttcaccagaaaaatcattttaatgacttcaccataaaattttc 29163839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 36694793 - 36695157
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  36694793 tgtttgatttatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttggatttacatgtactattttatc 36694892  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36694893 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaa 36694992  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  36694993 ttagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacat 36695092  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36695093 ttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaattttcc 36695157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 9864509 - 9864147
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||||||     
T  9864509 tttgattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagttattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgt 9864410  T
Q  102 tgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 201  Q
    || | |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864409 tggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 9864310  T
Q  202 agattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatattt 301  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9864309 atattaagtgtattcttattagtctgatgaattgatgatattatggggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacattt 9864210  T
Q  302 ttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||| ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9864209 ttgatactatagtgttaatttcaccaaaaaagtcattttcgtgacttcattatagaattttcc 9864147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 12876473 - 12876107
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| |||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||  || |||||||||    
T  12876473 tgtttgatttattttcaaactgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaatgcctgtaacatcttggacttacatgtactattttatc 12876374  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagt-tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    | |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  12876373 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaa 12876274  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  12876273 attagattaagtgtatccttcttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagttgggtgttactcacaaca 12876174  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12876173 ttttttatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtgacttaaccatagaattttcca 12876107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 16446702 - 16447066
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  16446702 tgttagattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 16446801  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
      || | |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16446802 attggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaa 16446901  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |     
T  16446902 ttaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatggggactaaacttttgatgccattatacaaacagtggggtgttactcactacaa 16447001  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16447002 ttttgatgttatagtgttaactttatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 16447066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Original strand, 6098340 - 6098712
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat- 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||     
T  6098340 tgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattgtatt 6098439  T
Q  99 ----cgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagga 194  Q
        || || | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6098440 gtatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagatagga 6098539  T
Q  195 taaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcac 294  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   ||| |||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  6098540 taaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatgaattgacgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggggtgttactcac 6098639  T
Q  295 aatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccatt 367  Q
     ||||||||||| || |||| ||||||||  || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6098640 tatatttttgatgctatagtattaacttcaccaaaaaagttattttcatgacttcaccatagaattttccatt 6098712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 40862783 - 40862418
Alignment:
Q  1 tgtttgattcattttt-aaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  40862783 tgtttgattcattttttaaattgtcgattactgatttatgacaaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttat 40862684  T
Q  99 cgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    || |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  40862683 cgttgacatctttaacatacaaacatagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttagaacaaagtaggataaa 40862584  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||| | |||  |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  40862583 attagattaagtgtatttttgttagtatgaaaaattgatgataccatga-gactgaacttttgatgccattgtacaaacagtggggtgttactcacaaca 40862485  T
Q  299 -tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
     ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40862484 ttttttgatattatagtgttaacttcaccagaaaagttattttcgtgacttcactatagaattttcc 40862418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 27082665 - 27083029
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  27082665 tgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgataagtagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 27082764  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  27082765 gttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgcggggtgttagacttaaaacatggtaagataaaa 27082864  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| | ||| |||||||||| ||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||| | |     
T  27082865 ttagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttaatgccactgcacaaacagtggggtgttactcactacac 27082964  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  27082965 ttttgatgctatagtgttaacttcaccagaaaagtcagtctgatgacttcaccatagaattttcc 27083029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Original strand, 5299773 - 5300138
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  5299773 tgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 5299872  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   |||||||||| |||| | | ||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5299873 gttgttatctttaacatgcaaacaaaattgctgatatcatttgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaa 5299972  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | ||| |||| |||| |     
T  5299973 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactataaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtagagtgctacttacaacac 5300072  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    ||||||| || ||||||||||||| | | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5300073 ttttgatgctatagtgttaacttcattaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcca 5300138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 11727384 - 11727064
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |    
T  11727384 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatatactattttatcgtt 11727285  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 202  Q
    | | |||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11727284 ggcatctttaacattcaaacaaagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaatta 11727185  T
Q  203 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttt 302  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| | || ||| |||||||||||||| |||| | |||    
T  11727184 gattaaatgtattcttgttaatttgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactatacaaatagtggggtgttacttacaacacttt 11727085  T
Q  303 tgatactctagtgttaacttc 323  Q
    ||||  | |||||||||||||    
T  11727084 tgatgttatagtgttaacttc 11727064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1205290 - 1204926
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  1205290 tgtttgattcatttttaaattgctgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 1205191  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | | |  |||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1205190 gttaaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaagataaaa 1205091  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | ||||||| || | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||    
T  1205090 ttagattaagtgtaatcttgttaatatgatgaactgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtgatgtgttactcactacat 1204991  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||| ||  | |||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||    
T  1204990 tttttatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccgtaaaattttcc 1204926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 37970346 - 37970704
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  37970346 tgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatt 37970445  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    |      |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37970446 gtaaggatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaa 37970545  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||    
T  37970546 ttagattaagtgtagtcttgttaatcatatgaattgatgatactatgagggctgaacttttgatggcattgtacaaacagtggggtgttactcattacat 37970645  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaa 358  Q
    |||||||  | |||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  37970646 ttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaa 37970704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 34895325 - 34894966
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||  || |||||| ||    
T  34895325 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttttc 34895226  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34895225 gttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaa 34895131  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| | |     
T  34895130 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatagtatgatgactgaacttttgatgccactttacaaacagtggagtgttactcactacag 34895031  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    | |||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34895030 tgttgatgttatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcc 34894966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 38644341 - 38643977
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  38644341 tgtttgatttatttttaaatttttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 38644242  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
      |||| |||||||| | |||| | ||||| |||||| || ||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38644241 attgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtcttgagtgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 38644142  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||  |||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||| |     
T  38644141 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccactagacaaacagtggggtgttactcacaacac 38644042  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||  | ||||||||||||   || |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  38644041 ttttgatgttatagtgttaacttgaccaaaaaagtcattctcatgatttcaccatagaattttcc 38643977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16223226 - 16222862
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  16223226 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 16223127  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
      ||   ||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  16223126 attggaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttttggggtgttacgtttaaaacaaggaaggataaaa 16223027  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||   ||||||| ||||    
T  16223026 ttagattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaactgtggggaactactcactatat 16222927  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||| ||  | ||||||||| |||  ||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||    
T  16222926 tttttatgttatagtgttaaattcaccagaaaagtcattctcatgatttcaccgtagaattttcc 16222862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Original strand, 1149459 - 1149752
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  1149459 tgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatc 1149558  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   |||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  1149559 gttggaatctttaacatgcaaacaaagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaa 1149658  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactca 293  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| | ||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1149659 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaggacagaacttttgatgtcattgtacaaacagtgggttgttactca 1149752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 466195 - 465843
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  466195 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtattattttatc 466096  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
      || | |||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  466095 attggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat-atgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaa 466006  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| || | ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  466005 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaatttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacac 465906  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||||||  | | |||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  465905 ttttgatgttatcgtgttaacttcaccacaaaagtcattttaatgacttcaccataaaatttt 465843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 49 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13307936 - 13307621
Alignment:
Q  49 attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagtt 148  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || |||||||||| |||| | |||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||||||     
T  13307936 attcatcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtc 13307838  T
Q  149 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgag 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| |    
T  13307837 ttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactatggg 13307738  T
Q  249 gactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgactt 348  Q
    |||| ||||||||||| || |||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||||  | |||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||    
T  13307737 gactgaacttttgatgtcactgtacaaatagtgaggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaatcattctcatgactt 13307638  T
Q  349 caccatagaattttcca 365  Q
    |||||||||||||||||    
T  13307637 caccatagaattttcca 13307621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 43643422 - 43643786
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  43643422 tgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 43643521  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    |  |   | |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  43643522 gtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaa 43643621  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    |||||| || |||| |||||||| |||||||| ||| | ||| ||||| || | |||||| |||| ||||||| ||||||| | ||||||||||  | ||    
T  43643622 ttagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacat 43643721  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||  | |||||||||||||  || || ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  43643722 ttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 43643786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 23854258 - 23854624
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  23854258 tgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatt 23854357  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    |  |   |||||||||| |||  | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  23854358 gtcggaatctttaacatgcaagcagagttgatgatattatgtgattgtcttaagtgttacactttatgcggtgttacacttataactaggtaagataaaa 23854457  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| | |||||| ||| |||| ||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||  | ||    
T  23854458 ttagattaattgtagtattgttaatctaatgagttgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgcacaaacagttgggtgttactcattacat 23854557  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
    |||| ||  | |||||||||||||  || |||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||    
T  23854558 tttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagacttttccat 23854624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 33906568 - 33906221
Alignment:
Q  6 gattcatttttaaattgttattattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgac 105  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||    
T  33906568 gattcatttttaaatt-tgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgac 33906470  T
Q  106 ctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagat 205  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  33906469 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttttggaatgttacccttaaaacaaggtatgataaaattagat 33906370  T
Q  206 taaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttga 305  Q
    ||| || | |||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||            |||||||||||||||| ||||||| | | |||| |    
T  33906369 taagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaactt------------tataaacagtggggtgctactcactacacttttaa 33906282  T
Q  306 tactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
    |||| ||||||| |||||  ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||    
T  33906281 tactatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcataatttcaccatagaattttccat 33906221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 367
Target Start/End: Original strand, 7890786 - 7891142
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||  || ||||||||||     
T  7890786 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgt 7890885  T
Q  102 tgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 201  Q
    ||   |||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| |    
T  7890886 tggaatctttaacatgcaaccagagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacgttgtggggtgttacgcttataacaaagtaagataaaact 7890985  T
Q  202 agattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatattt 301  Q
    ||||| | |||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||         |||||    
T  7890986 agattgagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggaccgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgt---------tattt 7891076  T
Q  302 ttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccatt 367  Q
    |||||  | |||||||||||||   | |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  7891077 ttgatgttatagtgttaacttcacaaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttttcatt 7891142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 363
Target Start/End: Original strand, 31933715 - 31934076
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgc 101  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| || |||||||| |     
T  31933715 tttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtctgcaatatcttagacttacaagtactattttattgt 31933814  T
Q  102 tgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 201  Q
    ||   || ||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  |||| ||||||||| |||||||||    
T  31933815 tggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgtgcggtattatgcttataacaaggtatgataaaatt 31933914  T
Q  202 agattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatattt 301  Q
    ||||||| |||| |||||||| || ||||||||| | ||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  31933915 agattaagtgtagtcttgttaatcggatgaattgatgatactataatgactgaacttttgatgtcattgtataaagagtggggtgttactcattatattt 31934014  T
Q  302 ttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttc 363  Q
    ||||||   |||||||||||||  || |||| ||||| || | |||||||  ||||||||||    
T  31934015 ttgatatcatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcataacttcacgttagaattttc 31934076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 39098946 - 39099237
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  39098946 tgtttgatgcatttttaaattattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacatatactattttatc 39099045  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| | |||||||| |||| | ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  39099046 gttgacatatttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgatactttgtgggatgttacacttaaaacagggtaagataaaa 39099145  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttact 291  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||    
T  39099146 ttagattaagtgtatttttgttaatctgatgaattgacgatactatgaggactgaacttttgatgctagtgtacaaagagtggggtgttact 39099237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Original strand, 10555032 - 10555394
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgttattattgattcatgattaatggt--aattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||  || ||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||||    
T  10555032 tgtttgattcatttttaaattgtt--tattacttaatgatcaatagtgtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttat 10555129  T
Q  99 cgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
     |  |   |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  10555130 tgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtc--aagtgttacgttttgtgaggtgttgcgcttataacaaggtaggataaa 10555227  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  | |    
T  10555228 attagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggagtgttactcattaca 10555327  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||  || |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  10555328 ttttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttcca 10555394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Original strand, 35459538 - 35459819
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||     
T  35459538 tgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacattttggacttacagatactattttatt 35459637  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    |  ||  ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | | |||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  35459638 gtcgaaatctttaacatacaaacagaattgatgatattatgtaatagtcttaagtgttataatctgtgggatgttacatttataacaaagtaggataaaa 35459737  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtg 281  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  35459738 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatattatgaggactgaacttttaatgtcattgtacaatcagtg 35459819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 1953815 - 1954084
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||  || |||||||||    
T  1953815 tgtttgattcattttaaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggatttacaggtactattttatc 1953914  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtgggg-tgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    | ||||  ||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1953915 gttgacaactttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtatgataaa 1954014  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgtta-atattatgaggactaaacttttgatgcca 267  Q
    |||||||| | |||| || | ||| |||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  1954015 attagatttagtgtagtcatattaatctgatgaattgatagatactatgagggctgaacttttgatgcca 1954084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 4132519 - 4132747
Alignment:
Q  7 attcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgac 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||   ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| || |    
T  4132519 attcatttttaaattgttgattacaaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggc 4132618  T
Q  106 ctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagat 205  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4132619 atctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttatgtgttacactttgtggggtgttacactt-aaacaaggtagaataaaattagat 4132717  T
Q  206 taaatgtattcttgttagtctgatgaattg 235  Q
    ||| |||| |||||||| | ||||||||||    
T  4132718 taagtgtagtcttgttaatttgatgaattg 4132747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 8803643 - 8803997
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  8803643 tgtttgattcatttttaaattgttcattactgattaatgatcaatagtatattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttat 8803742  T
Q  99 cgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    || ||   |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  8803743 cgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtattaagtgttacactttttagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaa 8803842  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||| | |||       | || ||||||||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||  | |    
T  8803843 attatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgata-------ggctgaacttttgatgtcattctacaaatagtggagtgttactcattaca 8803935  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||  | |||||||||||||  || |||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  8803936 tttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcat----atgacttcaccatagaattttcc 8803997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 93 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 43025972 - 43025742
Alignment:
Q  93 ttttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtag 192  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  43025972 ttttatcgttgacatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacattttgtggggtgttacagttaaaataaggtag 43025873  T
Q  193 gataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactc 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||  | ||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||| ||| ||    
T  43025872 gataaaattagattaaatgtattcttcttagtctgatgaattgatgatattatatgaactgaacttttaataccattgtacaaagagtggggtattaatc 43025773  T
Q  293 acaatatttttgatactctagtgttaacttc 323  Q
    |||| | |||||||||| ||  |||||||||    
T  43025772 acaacacttttgatactatatcgttaacttc 43025742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 364
Target Start/End: Original strand, 30654412 - 30654774
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| |||  || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  30654412 tttgattcatttt-aaattgttaattactgattaatgatcaataatatattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcg 30654510  T
Q  101 ctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaat 200  Q
     |||  | |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||    
T  30654511 ttgaaatttttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaatgtatggtaaaat 30654610  T
Q  201 tagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatt 300  Q
    || ||||| |||| ||||||||  |||||||| || | ||| ||||| | || ||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||  | |||    
T  30654611 taaattaagtgtagtcttgttaacctgatgaagtgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattcaacaaacagtggggtgttactcattacatt 30654710  T
Q  301 tttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||| ||  | |||||||||||||  || |||| ||| | |  ||||||||||||| ||||||||    
T  30654711 ttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcactcttatgacttcaccataaaattttcc 30654774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 44869860 - 44869576
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    || |||||||||    
T  44869860 tgtttgattcatttttaaattgttggttactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttatcggtactattttatc 44869761  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaa 198  Q
    | |||| ||||||||||  ||| | ||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||    
T  44869760 gttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacactttgtgggg-acaacacttaaaacaaggtaggataaaa 44869662  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtgggg 284  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||| | ||| ||||| || | ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  44869661 attagattaagtgtattattgttaatctgataaattgatgatactatgacgattgaacttttgatgtcattgtgcaaacagtgggg 44869576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 107 - 365
Target Start/End: Original strand, 41910922 - 41911180
Alignment:
Q  107 tctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 206  Q
    |||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41910922 tctttaacatgcaaacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatt 41911021  T
Q  207 aaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagt-ggggtgttactcacaatatttttga 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||  |||| || ||||||||| | |||   || ||| |||||||||||||| | | ||||||    
T  41911022 aaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgttgactgaatttttgatgctactgttataatagtgggggtgttactcacgacacttttga 41911121  T
Q  306 tactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    |  | |||| ||||||||  || |||| ||| | || |||||||| | ||||||||||||    
T  41911122 tgatatagtattaacttcaccaaaaaaatca-tatcatgacttcatcgtagaattttcca 41911180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 158 - 364
Target Start/End: Original strand, 1150090 - 1150296
Alignment:
Q  158 acactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaact 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| | ||| ||||| |||| ||||    
T  1150090 acactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgatgactgaact 1150189  T
Q  258 tttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccataga 357  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||  | |||||||||  | ||| |||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  1150190 tttgatgtcgttgtacaaacagtgggatgttactcattacatttttgatgttatagcgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccataga 1150289  T
Q  358 attttcc 364  Q
    |||||||    
T  1150290 attttcc 1150296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 170 - 364
Target Start/End: Original strand, 34952028 - 34952222
Alignment:
Q  170 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccatt 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||| | ||| ||   ||||| ||||||||||| || |    
T  34952028 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatactaaagggactgaacttttgatgtcact 34952127  T
Q  270 gtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||   |||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||    
T  34952128 gtacaaacagtgggctgttactcacaacacttttgatgatatagtgttaacttgaccagaaaagtcattttaatgactttactatagaattttcc 34952222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 171 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41362707 - 41362517
Alignment:
Q  171 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattg 270  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || || | || |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||| || |     
T  41362707 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggtctgaacttttgatgtcacta 41362608  T
Q  271 tataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    || ||| ||||||||||||||||| | |||||   ||  ||||||||||||||  || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  41362607 tacaaatagtggggtgttactcactacatttt---tatgctagtgttaacttcaccaaaaaagtcattttcataacttcaccatagaattttcc 41362517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18259439 - 18259229
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||  |||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||| |    
T  18259439 ttgattcatttttaaattgttgattactcattactgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgtt 18259340  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 202  Q
    ||| | |||||||| |||||  | ||| ||||||  |||||     ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18259339 gacatttttaacatgcaaattaaattgctgatatcttgtgac----ttaggtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtatgataaaatta 18259244  T
Q  203 gattaaatgtattct 217  Q
     ||||||||||||||    
T  18259243 aattaaatgtattct 18259229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 1149756 - 1149912
Alignment:
Q  10 catttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctc 108  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||   ||    
T  1149756 catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaatc 1149855  T
Q  109 tttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggg 169  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||||    
T  1149856 tttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgt----gtcttaagtgttacactttgtggg 1149912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 12587945 - 12587812
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  || |||||||||    
T  12587945 tgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaaatctttgacttacaggtactattttatc 12587846  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatga 133  Q
    | |||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  12587845 gttgacatctttaacatgcaaatagagttgatga 12587812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 24823221 - 24823395
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  24823221 tgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 24823320  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaa 182  Q
    | || | ||||||||        | ||||| |||||| |||||||| | || ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24823321 gttggcatctttaac--------agagttgttgatatcatgtgataatcttgagtattatactttgtggggtgttacacttaa 24823395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 35859297 - 35859160
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| || |||||||||    
T  35859297 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatctcgaacttacaagtactattttatc 35859198  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatatt 137  Q
    | || | |||||||||| |||| | | |||||||||||    
T  35859197 gttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatatt 35859160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 34951884 - 34952020
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||   |||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  34951884 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatgtagtaagacttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 34951983  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatat 136  Q
    | |||| |||||||||| |||| | ||||| ||||||    
T  34951984 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 34952020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7998488 - 7998406
Alignment:
Q  170 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggac 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  7998488 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgtattgatgatattatggggac 7998406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 33198162 - 33198065
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||  || ||||||||||    
T  33198162 ttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcg 33198065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 366
Target Start/End: Original strand, 4133080 - 4133201
Alignment:
Q  243 tatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcg 342  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||| || |||||  ||  ||||||||||||||  || |||||||||| |      
T  4133080 tatgaggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtcaggtattactcactatcttttt--tatgctagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctga 4133177  T
Q  343 tgacttcaccatagaattttccat 366  Q
    |||||| |||||| ||||||||||    
T  4133178 tgacttgaccataaaattttccat 4133201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12585353 - 12585297
Alignment:
Q  126 gttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaa 182  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12585353 gttgatgatgttatgtgatagtattaagtgttagattttgtggggtgttacacttaa 12585297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 7998550 - 7998478
Alignment:
Q  91 tattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactt 163  Q
    |||||||||| || | ||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7998550 tattttatcgttggcatctttaatatagaaacagagttgttgatattatgtgatagtattaagtgttacactt 7998478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 34463793 - 34463704
Alignment:
Q  41 taatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatga 133  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||   ||||||| |  ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | |||||||||    
T  34463793 taatagtaattcatttagtaatgcttgcaacat---ggacttataggtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgatga 34463704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 43026037 - 43025971
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgttt 66  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||    
T  43026037 tgtttgattcatttttaaattgttgatcactgattcatgatcaatagtaatttatctaataatgttt 43025971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 33198029 - 33197947
Alignment:
Q  175 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgc 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||    
T  33198029 acacttaaaacaaggtaggataaaatg--------tgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatggagactgaacttttgatgc 33197947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 41362785 - 41362716
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgca 69  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41362785 tgtttaattcatttttaaattgttgattactggttaatgatcaatagtaattcatctagtaatttttgca 41362716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 38110401 - 38110353
Alignment:
Q  316 ttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  38110401 ttaacttcatcagaaaaatcattttcatgacttcaccataaaattttcc 38110353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 325 - 364
Target Start/End: Original strand, 39099261 - 39099300
Alignment:
Q  325 tcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39099261 tcagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 39099300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 326 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 7998400 - 7998362
Alignment:
Q  326 cagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  7998400 cagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 7998362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15009294 - 15009240
Alignment:
Q  311 tagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  15009294 tagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcca 15009240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 33197955 - 33197890
Alignment:
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    ||||||| || |||| |||||||  |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33197955 ttttgatgctatagtattaacttaatcagaaaaattattctcatgacttcaccatagaattttcca 33197890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 326 - 362
Target Start/End: Original strand, 6446716 - 6446752
Alignment:
Q  326 cagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6446716 cagaaaagtcattatcatgacttcaccatagaatttt 6446752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 364
Target Start/End: Original strand, 28220955 - 28221003
Alignment:
Q  316 ttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  28220955 ttaacttcaccagaaaagtcattttcatgactttatcatagaattttcc 28221003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 66)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17168077 - 17167715
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  17168077 tgtttgattcatttttaaattattgattactaattaatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 17167978  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17167977 gttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaa 17167878  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  | ||| ||||  || | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  17167877 ttagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagaatgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacat 17167778  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17167777 ttttgatattataatgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtaacttcaccatagaatttt 17167715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17173654 - 17173292
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  17173654 tgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 17173555  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17173554 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaa 17173455  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  | ||| ||||  || | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  17173454 ttagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattaatgatactatggagattgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcacaacat 17173355  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17173354 ttttgatattataatgttaacttcatcagaaaagtcattttcgtaacttcaccatagaatttt 17173292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Original strand, 55240952 - 55241318
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  55240952 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaatttatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 55241051  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| | ||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55241052 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgacatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaa 55241151  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| | ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |     
T  55241152 ttagattaagtgtattcttctta-tctgataaattgatgatactatggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcgcaacaa 55241250  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccatt 367  Q
    |||||||| | |||| ||||||||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  55241251 ttttgataatatagtattaacttcactagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccatt 55241318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 28002833 - 28003199
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  28002833 tgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttagcaacatcttggacttacatgtactattttatc 28002932  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28002933 gttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 28003032  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| || | |||||||| || ||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||| ||  |||| || | |     
T  28003033 ttagattaagtgcagtcttgttaatccgatgaattgatgatactatgatgactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtggagtactactgactacac 28003132  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
    ||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  28003133 ttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttccat 28003199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 34947942 - 34948306
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34947942 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaacgatcaatagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatc 34948041  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagt--gttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataa 197  Q
    | || | |||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  34948042 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtacgttacactttgtggggtgttgcactttaaacaagataggataa 34948141  T
Q  198 aattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaat 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||     
T  34948142 aattagattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccactttacaaacagtggggtgttactcacaac 34948241  T
Q  298 atttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    | |||||||  | |||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  34948242 acttttgatgttatagtgttaacttcgccagaaaagtcattctcatgacttcaccataaaatttt 34948306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 35020878 - 35021252
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatg----gtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |||     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  35020878 tgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatatatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattt 35020977  T
Q  96 tatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat 195  Q
    ||||| ||   |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35020978 tatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaggat 35021077  T
Q  196 aaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcaca 295  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||| | ||| || |||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||     
T  35021078 aaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatactacgaggacgaaacttttgacgccaatgtacaaacagtggtgtgttactcact 35021177  T
Q  296 atatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccattcaa 370  Q
    | |||||||||  | || ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  35021178 acatttttgatgttataatgttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccatagaattttcctttcaa 35021252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 19089303 - 19089664
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| |    
T  19089303 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtt 19089402  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 202  Q
    ||  |||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | || | ||||||||||||||||||    
T  19089403 gaaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcatatagcaaggtaggataaaatta 19089502  T
Q  203 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttt 302  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||  | | |||    
T  19089503 gattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattatacaaacagtggggtgttactcattacaattt 19089602  T
Q  303 tgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  19089603 tgatattatagtgttaacttcatcaaaaaagttattcttatgacttcaccatagaattttcc 19089664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 364
Target Start/End: Original strand, 37663591 - 37663950
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| |    
T  37663591 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtt 37663690  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 202  Q
    |   |||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  37663691 ggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaatta 37663790  T
Q  203 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttt 302  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | | |||    
T  37663791 gattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacagttt 37663890  T
Q  303 tgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    | ||    ||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  37663891 taat--gttagtgttaacttcatcaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc 37663950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 55477738 - 55478106
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||    
T  55477738 tgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatc 55477837  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  55477838 gttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttcagtgttacacgttgtggggtgttacacttataacaagttaggataaaa 55477937  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgt----ataaacagtggggtgttactcaca 295  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    | ||||||||| |||||||||       
T  55477938 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacaaacagtggagtgttactcgtt 55478037  T
Q  296 atatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    | |||||||||  | |||||||||||||  || |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  55478038 acatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttcc 55478106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 6864399 - 6864038
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6864399 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattattttatc 6864300  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  6864299 gttgtaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtatgataaaa 6864200  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||| || ||||| |||  | ||    
T  6864199 ttaaattaaatgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactatgaggactggacttttgatgctattgtacaaaaagttggatgttattcattaaat 6864100  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattt 361  Q
    |||||||  | ||||| |||||||  || |||||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  6864099 ttttgatgttatagtgataacttcaccaaaaaagtcattctcatgacatcaccatacaattt 6864038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 33341762 - 33341397
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  33341762 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatc 33341663  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33341662 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 33341563  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactc---acaa 296  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||   ||||    
T  33341562 ttatattaagtatattcttgttaatctgatgaattgatgatactatg-ggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttcctcgcaacaa 33341464  T
Q  297 t-atttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    | | |||||||  | ||||||||| |||  ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  33341463 tcaattttgatgatatagtgttaatttcaccagaaaaatcattctcatgacttcactatagaatttt 33341397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 36493536 - 36493903
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtta-ttattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  36493536 tgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatcttagacttacagatactattttatc 36493635  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  36493636 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaaa 36493734  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | | |||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  36493735 ttagattaagtgtagtcttgttaatttaatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcactatat 36493834  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccattc 368  Q
    |||||||  | |||| ||||||||  || |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  36493835 ttttgatggtatagtattaacttcaccaaaaaagttattttcatgacttcaccatagaatttttcattc 36493903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 47254101 - 47253751
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  || |||||||| | |    
T  47254101 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttattgtt 47254002  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 202  Q
    | | |||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47254001 ggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 47253902  T
Q  203 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttt 302  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||        ||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||| | |||    
T  47253901 aattaagtgtattcttgttaatctgatg--------atactatgaggactgaacttttgatgtcactgtataaacaat-gggtgttactcacaacacttt 47253811  T
Q  303 tgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    ||||  | |||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  47253810 tgatgatatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 47253751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 32912426 - 32912791
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  32912426 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttat 32912525  T
Q  99 cgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    || |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  32912526 cgttgaaatctttaacatacaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaa 32912625  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||  || ||||||||||  |||| || ||| | | ||||||||||||  | |    
T  32912626 attatattaagtgtagtcttgttaacctgataaattgatgatattatgagtgctgaacttttgatatcattctacaaatactagggtgttactcattaca 32912725  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||  | |||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  32912726 tttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc 32912791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 25700903 - 25701268
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||| |||||| ||||| || ||||  ||| |||||||||    
T  25700903 tgtttgattcatttttaaattgtacattattgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaaaatcttagatttacggatactattttatc 25701002  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtgggg-tgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    | |||| |||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25701003 gttgacttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgttatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaa 25701102  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||||||| | |||| || ||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||| | |    
T  25701103 attagatttagtgtagtcctgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtagggtgttactcactaca 25701202  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
     |||||||  | || |||||||||   || |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  25701203 cttttgatgttataatgttaactttaccaaaaaagtcattatcatgacttcaccataaaattttcc 25701268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 29584047 - 29584409
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||  |||||||     
T  29584047 tgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttatt 29584146  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||  |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  29584147 gttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgtaacacttaaaacaaggtagaataaaa 29584246  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| |     
T  29584247 ttagattaagtgtattctcattaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccattgtacaaacagtgaggtgttact--caacac 29584344  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||  | |||||||||||||  |||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  29584345 ttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttcc 29584409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7703873 - 7703516
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  7703873 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttatc 7703774  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||| | |||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7703773 gttggcatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtagaataaaa 7703674  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||        ||| |||| ||||| ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||| |     
T  7703673 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatg--------atactatggggactgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactgacaacac 7703582  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    |||||||  | |||||||||||||  ||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||    
T  7703581 ttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgactttaacatagaattttcca 7703516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 34361338 - 34361702
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||||||    
T  34361338 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttat 34361437  T
Q  99 cgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    || ||   |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  34361438 cgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagctttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaa 34361537  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||| ||||| |||| | ||||||  | ||||||||| | ||||||||||| || ||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||  | |    
T  34361538 attatattaagtgtaattttgttaaccggatgaattgatgatattatgagg-ctgaacttttaatgtcattctacaaacagtggggtgttactcattaca 34361636  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||  || |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  34361637 ttttttatgttatagtgttaacttcaccaaaaaagtcattcttatgacttcaccatagaattttcc 34361702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1815665 - 1815413
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  1815665 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggatttacaggtactattttatc 1815566  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1815565 gttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacccttaaaacaaggtaggataaaa 1815466  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggact 252  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||| | ||| ||||||||||    
T  1815465 ttagagtaaatgtagtcttgttaatatgatgaattgatgatactatgaggact 1815413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 19440495 - 19440862
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  19440495 tgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 19440594  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
      ||   |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |||||||    
T  19440595 attggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgttataaacttaagggttacacgttgtggggtgttacgcttataacaagctaagataaaa 19440694  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||  | ||    
T  19440695 ttagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgatgccattgtacaaacggtggagtgttaatcattacat 19440794  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgac-ttcaccatagaattttccat 366  Q
    |||||||  | |||||||||| ||  || |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  19440795 ttttgatgttatagtgttaacatcaccaaaaaagtcattctcatgactttcaccatagaattttccat 19440862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27396978 - 27396618
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |  ||  | ||||||    
T  27396978 tgtttgattcatttttaaattgttgattac--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataggtaccactttatc 27396881  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| |  |||| |||||| ||| ||| || |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27396880 gttgacatctttaacatgcaaacagcgttgctgatatcatgcgatggtcttaagtgtgacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtagaataaaa 27396781  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| || |     
T  27396780 ttaaattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggacgaaacttttgatgtcattgtacaaacagtagggtgttactcataacac 27396681  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||| || || || ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27396680 ttttaatgctataatgttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 27396618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 25184477 - 25184113
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  25184477 tgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 25184378  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    |  |   | |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  25184377 gtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaa 25184278  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    |||||| || |||| |||||||| |||||||| ||| | ||| ||||| || | |||||| |||| ||||||| ||||||| | ||||||||||  | ||    
T  25184277 ttagatcaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattgaactttggatgtcattgtacaaacagtagagtgttactcattacat 25184178  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||  | |||||||||||||  || || ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25184177 ttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaatagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 25184113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 49376331 - 49375963
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||  || |||||||||    
T  49376331 tgtttaattcatttttaaattcttgattactgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacttcttggacttacatgtactattttatc 49376232  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||   ||||||| ||||| || ||||||    
T  49376231 gttgacatctttaacatccaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaatcaaggcagaataaaa 49376132  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    |||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| | |     
T  49376131 ttagatcaagcgtaatcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaagactgaacttttgatgccactgtacaagcagtggggtgttactcacgacac 49376032  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcag-aaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccatt 367  Q
    ||||||| || || ||||||||||  ||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  49376031 ttttgatgctataatgttaacttcaccagaaaaagtcattctcatgacttcaccgtagaattttccatt 49375963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 37776022 - 37775670
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  37776022 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 37775923  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   |||||||||| |||| | ||||| |||||| ||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37775922 gttggtatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaa 37775832  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||  |||    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  37775831 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta--aggggggaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaacat 37775734  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttc 363  Q
    |||| ||| | ||||| |||||||  || |||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  37775733 ttttaatattatagtgctaacttcaccaaaaaaatcattttaatgacttcaccgtagaattttc 37775670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 49 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 38012169 - 38011854
Alignment:
Q  49 attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagtt 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||| | || | | |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  38012169 attcatctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 38012070  T
Q  149 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgag 248  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  38012069 ttaagcgttacactttctgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgataatattatggg 38011970  T
Q  249 gactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgactt 348  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| || |||| | | |||||||  | ||||||| |||||  ||||||||||||| || ||| ||    
T  38011969 gactgaacttttgatggcaccgtacaaacagtggggtgctattcactacacttttgatgttatagtgttgacttcaccagaaaagtcattctcatgattt 38011870  T
Q  349 caccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||||||||||    
T  38011869 caccatagaattttcc 38011854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 32592448 - 32592096
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||  || |||||||||    
T  32592448 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaacgatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacatcttgaacttacaggtactattttatc 32592349  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    |  ||| |||||||||| |||| | ||||| ||| || || |||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32592348 gtagacatctttaacatgcaaacaaagttgctgaaatcatatga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 32592258  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| || | ||||| ||||||||||| || | || ||||||||| ||||||||| ||| |     
T  32592257 ttaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactaaggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtggagtgttactctcaacac 32592158  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattt 361  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||||| ||| |||||    
T  32592157 ttttgatactgtagtgttaacttcatcaaaaaagtcattataatgacttcacaataaaattt 32592096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 350
Target Start/End: Original strand, 46888007 - 46888354
Alignment:
Q  3 tttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgc 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||  || ||||||||||     
T  46888007 tttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttggatttacaggtactattttatcgt 46888106  T
Q  102 tgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 201  Q
    || | |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46888107 tggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgatagtct-aagtgttacgttttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaatt 46888205  T
Q  202 agattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatattt 301  Q
    ||||||| |||| | |||||| |||||||||||    ||| |||| ||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||||| |||||||| | | ||    
T  46888206 agattaagtgtagttttgttaatctgatgaattaacgatagtatggggactgaacttttgatgccgctgtacaaatagtggggtattactcactacaatt 46888305  T
Q  302 ttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttca 350  Q
    |||||  | |||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  46888306 ttgatgttatagtattaacttcatcagaaaagttattttcttgacttca 46888354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 30002488 - 30002835
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  || |||||||||    
T  30002488 tgtttgattcatttttaaattgtttattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttaaatgtactattttatc 30002587  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30002588 gttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaa 30002678  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||        ||| || || |||| ||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| |     
T  30002679 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatg--------atactaagaagactgaacttttgatgtcactgtacaaacagtgaggtgttactcacaacac 30002770  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  30002771 ttttgatgctacagtgttaacttcaccagaaaaatcattttaatgacttcaccatagagttttcc 30002835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 879395 - 879759
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  879395 tgtttgattcatttttaaattgttgattacttattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatt 879494  T
Q  100 g-ctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    | | ||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  879495 gtcagaa-tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaaatgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaa 879593  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||||||||  |||| |||||||| |||||||| ||| | ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||  | |    
T  879594 attagattatgtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatgaagattaaacttttgatgtcattgtacaaacaatgaggtgttactcattaca 879693  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||  | ||||||| |||||  || |||| | ||| || |||||||||| || ||||||||    
T  879694 tttttgatgttatagtgtttacttcaccaaaaaaattattctcatgacttcaccttaaaattttcc 879759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 50765084 - 50764746
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  50765084 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 50764985  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| |||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||          |||||||||||    
T  50764984 gttgacatctttaacttgcaaacatagttgctgatatcatgtgataatattgagtgtttcactttgtggggtgttacac----------gtaggataaaa 50764895  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| |||||||| | ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  50764894 ttagattaaatgtattcttgttaatctaatgaattgatgatactatgaggattgaacttttgatgtcaccgtacaaacagtggggtgttactcacaacac 50764795  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttca 350  Q
    |||||||    ||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||||    
T  50764794 ttttgat--gttagtgttaacttcatcaaaaaagttattctcatgacttca 50764746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 32579810 - 32579444
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  32579810 tgtttgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 32579711  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32579710 gttgacatttttaacatgcaaacatagttgatgatattataagatagtcttaagagttacactttctgaggtcttacacttaaaacaaggtaggataaaa 32579611  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgt---ataaacagtggggtgttactcacaa 296  Q
    ||||||||| |  | || ||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||  ||   | ||||| ||||||| |||||||      
T  32579610 ttagattaagtacagtcatgttaatctgatgaactgataatactatga-gactaaacttttgatggcaccgtacaacaaacactggggtgctactcactg 32579512  T
Q  297 tatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
     | |||||||  | || |||| |||||  ||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||    
T  32579511 cacttttgatgttataatgttgacttcaccagaaaagtcattctcagaacttcaccataaaattttcc 32579444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 50697606 - 50697242
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  || |||||||||    
T  50697606 tgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggaattacaggtactattttatc 50697507  T
Q  100 gctgacctctttaacata-caaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    | ||   ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  50697506 gttggaatctttaacattgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtgtggtgttacgcttataacaaggtaggataaa 50697407  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| || ||| | | ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||   |||    
T  50697406 attatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatacta-gagaattgaacttttgatgtcattgtacaaacggtagggtgttactcgttata 50697308  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||| ||  | ||||||| |||||   | |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  50697307 ttttttatgttatagtgtttacttcactaaaaaaatcatttttatgacttcaccgtagaattttcc 50697242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23761435 - 23761114
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||    
T  23761435 tgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtacaattttatc 23761336  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | ||   |||||||| | |||| | ||||| |||||| ||| |||||| |||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23761335 gttggtatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaaatgtgacactttatgaggtgttacacttaaaacaaggtag-ataaaa 23761237  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||||| || | || |||||||| |||||||||||||| |     
T  23761236 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactatggggactgaacttttgatgtcactatacaaacagtgaggtgttactcacaacac 23761137  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaactt 322  Q
    |||||||  | ||||||||||||    
T  23761136 ttttgatgttatagtgttaactt 23761114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 37288092 - 37287733
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  37288092 tgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgctcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 37287993  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt-ggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aa 197  Q
    | || | |||| ||||| |||| | ||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| | ||    
T  37287992 gttggcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgctagtcttaagtgttacattttgtgggggcgttacacttaaaacaaagtaggttaaa 37287893  T
Q  198 aattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaat 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||        |||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  37287892 aattagattaagtgtattcttgttaatcttatg--------atattatgaggattgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaac 37287801  T
Q  298 atttttgatactctagtgttaac-ttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    | |||||||  | |||||||||| || |  | |||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  37287800 acttttgatgttatagtgttaactttaccaaaaaaagtcattctcattacttcaccatagaattttcc 37287733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3042983 - 3042611
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  || |||||||||    
T  3042983 tgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatgttggacttacatgtactattttatc 3042884  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||  |||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||    
T  3042883 gttgaaatctttaacaagcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataataaggtatgataaaa 3042784  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattg--------ttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttact 291  Q
    ||| ||||| |||| |||||||| | ||||||||||        || ||| | | | |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  3042783 ttatattaagtgtaatcttgttaatatgatgaattgatgatacattgatactctaatgactgaatttttgatgtcattgtataaacggtggggtattact 3042684  T
Q  292 cacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||  | |||||  ||  | |||||||||||||  || |||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  3042683 cattacattttgtatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcatttttatgatttcaccatagaattttcc 3042611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 33816363 - 33816742
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||    
T  33816363 tgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgaactattttatc 33816462  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttg-----------------tggggtgttacacttaa 182  Q
    | |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||                 |||||||||||||||||    
T  33816463 gttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacactttctggggtgttacacttaa 33816562  T
Q  183 aacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtgg 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||| ||||| | ||| ||||  |||| ||||||||||||||  ||||||| ||||     
T  33816563 aacaaggtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgataaattgatgatactatggagactgaacttttgatgccaccgtataaatagtga 33816662  T
Q  283 ggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||| ||||||| | | ||||||| ||  | |||| |||||  ||||||| ||||| || |||||| | |||| ||||||    
T  33816663 ggtgctactcactacacttttgatgctacaatgttgacttcaccagaaaaatcattctcatgacttaagcatataatttt 33816742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 42200095 - 42199729
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaa-tattatttta 97  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||| ||||| ||||  | | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42200095 tgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatgaacagtagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaggtattatttta 42199996  T
Q  98 tcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataa 197  Q
    ||| ||   |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  42199995 tcgttggaatctttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataa 42199896  T
Q  198 aattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaat 297  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||| ||| |||| || ||| | |||||| |||||||  |     
T  42199895 aattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgagggctgaactttttatgtcattctacaaataatggggtattactcattac 42199796  T
Q  298 atttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||||  | |||| ||||||||  || |||| ||||| |  ||| ||||||||||| ||||||    
T  42199795 atttttgatgttatagtattaacttcaccaaaaaaatcattcttatgatttcaccatagatttttcc 42199729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 4598346 - 4597994
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||    
T  4598346 tgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattaatctaataatgcttgcaacatcttggatttaaatgtattattttatc 4598247  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | ||||||||||  ||| | ||||| |||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  4598246 gttggcatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaa-gcaggataaaa 4598157  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||| | |   || | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  4598156 ttaaattaagtgtattcttgttaatatgatgaattgatgagtctaaggggactgaacttttgatgccactgtacaaacagtggggtgttactcacaaca- 4598058  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttc 363  Q
     ||||||  | |||||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  4598057 ctttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaagtcattctaatgacttcaccataaaattttc 4597994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 91 - 364
Target Start/End: Original strand, 35025534 - 35025799
Alignment:
Q  91 tattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggt 190  Q
    |||||||||| || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  35025534 tattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgtgacacttaaaacaagat 35025633  T
Q  191 aggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttac 290  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||        ||| || ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||    
T  35025634 aggataaaattatattaaatgcagtcttgttaatctgatg--------atactacgaggactgaacttttgatgtcaacgtataaacagtggggtgctac 35025725  T
Q  291 tcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||| | | ||||||| || ||||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35025726 tcactacacttttgatgctatagtgttgacttcaccagaaaaatcattttcatgacttcagcatagaattttcc 35025799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17272328 - 17272093
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  17272328 tgtttgattcatttttaaatcgttcattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 17272229  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||  ||||||| || |||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17272228 gttgaaatctttaatatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaa 17272129  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattg 235  Q
    ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||    
T  17272128 ttagattaagtgtattctcattaatctgatgaattg 17272093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 91 - 323
Target Start/End: Original strand, 4934140 - 4934371
Alignment:
Q  91 tattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggt 190  Q
    |||||||||| || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  4934140 tattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttggacttaaaacaaggt 4934239  T
Q  191 aggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagt-ggggtgtta 289  Q
    || ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| || | ||| |||||||| | |||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||    
T  4934240 agaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgatactatgaggattgaacttttgatgccagtgtacaaacaatgggggtgtta 4934339  T
Q  290 ctcacaatatttttgatactctagtgttaacttc 323  Q
    ||||| | |||||| |||  ||||||||||||||    
T  4934340 ctcactacattttttata--ctagtgttaacttc 4934371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 5047813 - 5048174
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||  ||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||  || ||||||||     
T  5047813 tgttcgattcatttttaaattgtttattgttgattactgatcaataataatttatctagtaaaacttgcaacatcttggacttacatgtactattttatt 5047912  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  5047913 gttggcatctttaacatgcaaacatagtttatgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgcggg-tattacacttaaaacaaggtaggataaaa 5048011  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| | ||| |||| | ||| ||||||||||  ||| ||| |||||||| |||  ||||||| | |     
T  5048012 ttagattaaatgcagtcttgttaatctcatgaattgatgatactatgggaactgaacttttgatatcatcgtacaaacagtgtggtcctactcactacac 5048111  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||||||  | ||| ||| |||||  ||||||| ||||| || | ||||||  ||||||||||    
T  5048112 ttttgatgttatagagttgacttcaccagaaaaatcattctcataacttcattatagaatttt 5048174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 9139591 - 9139247
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgttattattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcg 100  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||  ||||||    
T  9139591 tgtttgattcatttttaaattag-attattgattaatgatcaatagtaattcgtctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactacgttatcg 9139493  T
Q  101 ctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaat 200  Q
     || | |||||||||| |||| | |||| ||                 |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9139492 ttggcatctttaacatgcaaacagagtttatc----------------ttaagtgttacactttgtagggtgttacagttaaaacaaggtaggataaaat 9139409  T
Q  201 tagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatt 300  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| | ||| |||| ||| | ||||||| ||| || |||| |||| ||||||||||||||||  ||||    
T  9139408 tagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactatggggattgaactttttatgtcactgtacaaacggtggggtgttactcac--tatt 9139311  T
Q  301 tttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||| || || ||  |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9139310 ttttatgctataacgttaacttcaccaaaaaagtcaatttcatgacttcaccatagaattttcc 9139247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 7152051 - 7152218
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  || |||||||||    
T  7152051 tgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacaggtactattttatc 7152150  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtg 167  Q
    | |||| | |||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  7152151 gttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtattaagtgttatactttgtg 7152218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 133 - 338
Target Start/End: Original strand, 54499217 - 54499424
Alignment:
Q  133 atattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 231  Q
    |||| |||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||    
T  54499217 atatcatgtgatagtcttaaaagttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatga 54499316  T
Q  232 attgttaatattatgaggactaaacttttgatgccatt-gtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaa 330  Q
    |||| | ||| |||   |||| ||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||  |||||    
T  54499317 attgatgatactatagagactgaacttttgatgtcattagtacaaacggtggggtgttactcacaacacttttgatgctatagtgttaacttcaccagaa 54499416  T
Q  331 aagtcatt 338  Q
    ||||||||    
T  54499417 aagtcatt 54499424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 158 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39398115 - 39397915
Alignment:
Q  158 acactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaact 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||| | ||| |  || |||| ||||    
T  39398115 acactttgtggggtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgtt---------aattgatgatactgagaagactgaact 39398025  T
Q  258 tttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccataga 357  Q
    ||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||  | |||||||||||||  || |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  39398024 tttgatgtcactgtacaaacaatggggtgttactcacaacacttttaatgttatagtgttaacttcaccataaaagtcattctaatgacttcaccataga 39397925  T
Q  358 attttccatt 367  Q
    ||||||||||    
T  39397924 attttccatt 39397915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4205221 - 4205116
Alignment:
Q  259 ttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaa 358  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4205221 ttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttattcagaacatttttgatattatagtgttaacttcatcagaaaagtcattttcctgacttcaccatagaa 4205122  T
Q  359 ttttcc 364  Q
    ||||||    
T  4205121 ttttcc 4205116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26896452 - 26896285
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatctt-ggacttacaaatattatttta 97  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||    
T  26896452 tgttcgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgtttgcaacattttcggacttacaagtactatttta 26896353  T
Q  98 tcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgt 166  Q
    ||| |||  | |||||||| |||||| | ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26896352 tcgttgaaat-tttaacatgcaaatagacttgatcatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgt 26896285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 46883961 - 46884177
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||    
T  46883961 tgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc--ggacttac--atactattttatc 46884056  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
      ||   | |||||||| |||| | | || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||  |||| |||||| || |||||||    
T  46884057 tttggaatttttaacatgcaaacaaaatttatgatattatgtgatag-tttaagtgttacattttgtgagatgtta-gcttataacaagatatgataaaa 46884154  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgtta 222  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||    
T  46884155 ttagattaagtgtagtctcgtta 46884177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 4205348 - 4205216
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  4205348 tgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 4205249  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatg 132  Q
    | || | |||||||||| |||| | ||||||||    
T  4205248 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgatg 4205216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 35025413 - 35025513
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  35025413 tgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatc 35025512  T
Q  100 g 100  Q
    |    
T  35025513 g 35025513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 39400372 - 39400236
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||  ||||||||    
T  39400372 tgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtcattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaaggtaccattttatc 39400273  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatat 136  Q
    | || | |||||||||| |||| | ||||| ||||||    
T  39400272 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat 39400236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 23431919 - 23431834
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttaca 85  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| | ||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23431919 tgtttgatgcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctactaatgcttgcaacatcttggacttaca 23431834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 282 - 364
Target Start/End: Original strand, 7152235 - 7152317
Alignment:
Q  282 gggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  | || |||||||||   |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  7152235 gggtgttactcactatacttttgatgttataatgttaactttaccagaaaagtcattagcatgacttcaccatagaattttcc 7152317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 53124372 - 53124286
Alignment:
Q  279 gtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcca 365  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||  || |||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  53124372 gtggggtgttactcattatatttttgatgttatagtgttaacttcaccaaaaaaatcattttaatgacttcatcatataattttcca 53124286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2704560 - 2704512
Alignment:
Q  316 ttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2704560 ttaacttcaccagaaaagtcattttcatgacttcaccataaaattttcc 2704512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 364
Target Start/End: Original strand, 38812260 - 38812308
Alignment:
Q  316 ttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  38812260 ttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaattttcc 38812308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 51204628 - 51204580
Alignment:
Q  315 gttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttc 363  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  51204628 gttaacttcaccagaaaagtcatttttatgacttcaccatagaattttc 51204580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 367
Target Start/End: Original strand, 53337571 - 53337627
Alignment:
Q  311 tagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccatt 367  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  53337571 tagtgttaactttatcagaaaaatcattatcatgactttaccatagaattttccatt 53337627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 315 - 362
Target Start/End: Original strand, 20097490 - 20097537
Alignment:
Q  315 gttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20097490 gttaacttcaccagaaaagtcattctcatgacttcaccatagaatttt 20097537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4396416 - 4396326
Alignment:
Q  274 aaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||| |||||||||||||||  | |||||| ||  | |||||||||||||   | ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  4396416 aaacggtggggtgttactcattacattttttatgttatagtgttaacttcactaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattttcc 4396326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 38811861 - 38811811
Alignment:
Q  316 ttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccat 366  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  38811861 ttaacttcaccagaaaaatcattctcatgacttcaccatagaattttccat 38811811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 367
Target Start/End: Original strand, 46884194 - 46884248
Alignment:
Q  313 gtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccatt 367  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  46884194 gtgttaacttcgccaaaaaagtcatttttatgacttcactatagaattttccatt 46884248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 17272064 - 17272011
Alignment:
Q  311 tagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  17272064 tagtgttaacttcaccagaaaagtcattcccacgacttcaccatagaattttcc 17272011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 56050234 - 56050173
Alignment:
Q  60 aatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaa 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  56050234 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaacatgcaaa 56050173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 311 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 52516650 - 52516594
Alignment:
Q  311 tagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccatt 367  Q
    |||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||    
T  52516650 tagtgttaacttcaccataaaagtcattctcatgacttcaccataaaatttttcatt 52516594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8248 - 7889
Alignment:
Q  4 ttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgct 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| |    
T  8248 ttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgtt 8149  T
Q  103 gacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatta 202  Q
    |   |||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||    
T  8148 ggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaagttaggataaaatta 8049  T
Q  203 gattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatatttt 302  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | | |||    
T  8048 gattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaacttttgatgtcattgtacaaacagtggggtgttactcattacaattt 7949  T
Q  303 tgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    ||||  | ||||||||||||| ||| |||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  7948 tgatgttatagtgttaacttcatcaaaaaagtcattcttataacttcaccatagaatttt 7889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12272 - 11908
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  12272 tgtttgatt-atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatc 12174  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | || | |||||||||| |||| | ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12173 gttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaa 12074  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattg-tataaacagt-ggggtgttactcacaat 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||| | ||||||||||||||||     
T  12073 ttagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatattatgaggactgaacttttgataccactgatacaaacaatgggggtgttactcacaac 11974  T
Q  298 atttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattt-tcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    | |||| ||  | | ||||||| |||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11973 acttttaatgttatggtgttaatttcaccagaaaagtcatttctcatgacttcaccatagaatttt 11908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 44320 - 43959
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||||||||    
T  44320 tgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatc 44221  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||  |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || |||||||    
T  44220 gttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagctt-aagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaa 44122  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||  | ||    
T  44121 ttatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacat 44022  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||||||| | ||| |||||||||  || ||||||| || |   |||||||||||||||||||    
T  44021 ttttgatattatagcgttaacttcaccaaaaaagtctttcttacgacttcaccatagaatttt 43959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 154467 - 154828
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatc 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||  || |||||||||    
T  154467 tgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatc 154566  T
Q  100 gctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa 199  Q
    | |||  |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || |||||||    
T  154567 gttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagctt-aagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaa 154665  T
Q  200 ttagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaatat 299  Q
    ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||  | ||    
T  154666 ttatattaaatgtagtcttattaatctgatgaattgatgatactatgaggactgaactttttatgccattgtacaaacaacggggtgttactcattacat 154765  T
Q  300 ttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    |||||||| | ||| |||||||||  || ||||||| || |   |||||||||||||||||||    
T  154766 ttttgatattatagcgttaacttcaccaaaaaagtctttcttacgacttcaccatagaatttt 154828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 267602 - 267282
Alignment:
Q  47 taattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatag 146  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  267602 taattcatctagtaattcttgcagcatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 267503  T
Q  147 t-tttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattat 245  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||| |||||||| | |||||||    
T  267502 tctttaagtgttacactttgtgggatgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgatattat 267403  T
Q  246 gaggactaaacttttgatgccattgta-taaacagtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaa-cttcctcagaaaagtcattttcgt 343  Q
       |||| ||||||||||| || ||||  ||||||| || |||||||||| ||||||||||| || |||||| ||  || |  | |||| | |||||| |    
T  267402 agagactgaacttttgatgacactgtacaaaacagttggatgttactcactatatttttgatgctatagtgtaaatattaccaaaaaaaataattttcat 267303  T
Q  344 gacttcaccatagaattttcc 364  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  267302 gacttcaccatagaattttcc 267282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 145836 - 146199
Alignment:
Q  1 tgtttgattcatttttaaattgtt-attattgattcatgattaatggta-attcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttat 98  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  145836 tgtttaattcatttttaaattttttattactgattaatgatcaattgtatattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacagacactattttat 145935  T
Q  99 cgctgacctctttaacatacaaatatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa 198  Q
    || ||   |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  145936 cgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaa 146035  T
Q  199 attagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttaatattatgaggactaaacttttgatgccattgtataaacagtggggtgttactcacaata 298  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||||| | ||| ||||| | || ||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||||||  | |    
T  146036 attatattaagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactatgaaggctgaacttttgatgtcattctacaaataatggggtgttactcattaca 146135  T
Q  299 tttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaatttt 362  Q
    ||||| ||  | || |||||||||   || |||| ||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  146136 ttttttatgttataatgttaacttaaccaaaaaaatcattcttatgacttcaccgtagaatttt 146199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 42434 - 42348
Alignment:
Q  278 agtggggtgttactcacaatatttttgatactctagtgttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttcc 364  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  | |||||||||||||  ||||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  42434 agtggggtgttactcacaacacttttgatgttatagtgttaacttcaccagaaaaattattctcatgacttcaccataaaattttcc 42348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 100935 - 100894
Alignment:
Q  179 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  100935 ttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgt 100894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 367
Target Start/End: Original strand, 12137 - 12189
Alignment:
Q  315 gttaacttcctcagaaaagtcattttcgtgacttcaccatagaattttccatt 367  Q
    |||||||||  ||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||    
T  12137 gttaacttcaccagaaaagtcattctcataacttcatcatagaattttccatt 12189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University