View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17303_low_25 (Length: 356)

Name: NF17303_low_25
Description: NF17303
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17303_low_25
NF17303_low_25
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (1-347)||(44903378-44903724)
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (1-344)||(26191393-26191733)
chr7 (91-344)||(26179301-26179551)
chr7 (1-344)||(19103226-19103566)
chr7 (84-341)||(26128778-26129032)
chr7 (130-344)||(26302059-26302277)
chr7 (83-341)||(26087992-26088247)
chr7 (83-341)||(26111780-26112035)
chr7 (1-344)||(26297573-26297916)
chr7 (123-344)||(26242647-26242868)
chr7 (84-268)||(26155414-26155598)
chr7 (7-341)||(26186376-26186707)
chr7 (123-341)||(26251095-26251313)
chr7 (109-231)||(26204130-26204252)
chr7 (109-231)||(26223768-26223890)
chr7 (111-231)||(26227234-26227354)
chr7 (111-179)||(26207673-26207741)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 44903378 - 44903724
Alignment:
Q  1 cagaagtttactattccttgtttggctcataccattgagatgagccgtctgcagcttcgcgattgggtgaggactacaaatgctgccacagcctattttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44903378 cagaagtttactattccttgtttgcctcataccattgagatgagccgtctgcagcttcgcgattgggtgaggactacaaatgctgccacagcctattttg 44903477  T
Q  101 aacccatttttgaatcggaggcaagaagttatgggacaatatgcaatagttttcatgaacttgaaagtgattatgagaaagttagtaaaactacaatggg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44903478 aaccaatttttgaatcggaggcaagaagttatgggacaatatgcaatagttttcatgaacttgaaagtgattatgagaaagttagtaaaactacaatggg 44903577  T
Q  201 gattaagtcttggagtgtaggaccagtttcaacttgggctaacaagaatgatgaaaggaagggcaataggggacacgtggagaagaacgttgaaaaagag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44903578 gattaagtcttggagtgtaggaccagtttcaacttgggctaacaagggtgatgaacggaagggcaataggggacacgtggagaagaacgttgaaaaagag 44903677  T
Q  301 agagaattgctaaattggcttaactcaaagcaaaatgagtctgtgtt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44903678 agagaattgctaaattggcttaactcaaagcaaaatgagtctgtgtt 44903724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 26191393 - 26191733
Alignment:
Q  1 cagaagtttactattccttgtttggctcataccattgagatgagccgtctgcagcttcgcgattgggtgaggactacaaatgctgccacagcctattttg 100  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| || ||||||| |||  |||||| | |||   |  ||| ||||||||||||||||||    
T  26191393 cagaaatttactattcctagttttcctcataccattgagatgacccctctgcagattcctgattggttaagggaaaagaatcctgccacagcctattttg 26191492  T
Q  101 aacccatttttgaatcggaggcaagaagttatgggacaatatgcaatagttttcatgaacttgaaagtgattatgagaaagttagtaaaactacaatggg 200  Q
    |||| |||| |||||| |||| || ||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||| ||||||| |||    
T  26191493 aaccaatttatgaatcagaggaaaaaagctatggcacactatacaatagttttcatgaactagaaagtgaatatgagaaactttgtaatactacaagggg 26191592  T
Q  201 gattaagtcttggagtgtaggaccagtttcaacttgggctaacaagaatgatgaaaggaagggcaataggggacacgtggagaagaacgttgaaaaagag 300  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||| ||| ||| | ||| ||||   || ||||| |    
T  26191593 gatcaaatcttggagtgtaggaccagtttcagcttgggctaaaaaggatgatgaaaagaagggtgataaggggcacatagaggagaa---tggaaaagtg 26191689  T
Q  301 agagaattgctaaattggcttaactcaaagcaaaatgagtctgt 344  Q
      ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26191690 gcagagtggctaaattggcttaactcaaagcaaaatgagtctgt 26191733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 91 - 344
Target Start/End: Original strand, 26179301 - 26179551
Alignment:
Q  91 gcctattttgaacccatttttgaatcggaggcaagaagttatgggacaatatgcaatagttttcatgaacttgaaagtgattatgagaaagttagtaaaa 190  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |    
T  26179301 gcctattttgaaccaatgtttgaatcagagaaaagaagttatggaacactatacaatagttttcatgaacttgaaagtgattatgaaaaattaagtaaca 26179400  T
Q  191 ctacaatggggattaagtcttggagtgtaggaccagtttcaacttgggctaacaagaatgatgaaaggaagggcaataggggacacgtggagaagaacgt 290  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||  |||| ||| ||||||||| |  ||| |||| |    
T  26179401 ctacaatggggatcaaaacttggagtgtaggaccagtttcagcttggactaacaaggatggtgaaaaaaaggccaaaaggggacacat--agaggaac-t 26179497  T
Q  291 tgaaaaagagagagaattgctaaattggcttaactcaaagcaaaatgagtctgt 344  Q
    || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26179498 tggaaaagaggaagaatggctaaattggcttaactcaaagcaaaatgagtctgt 26179551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19103566 - 19103226
Alignment:
Q  1 cagaagtttactattccttgtttggctcataccattgagatgagccgtctgcagcttcgcgattgggtgaggactacaaatgctgccacagcctattttg 100  Q
    ||||| |||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||  |||||| | || || |  ||| ||| ||| ||||||||||    
T  19103566 cagaaatttacggttcctggtttgcctcataccattgagatgactcctctgcagcttcctgattggttaagaacaaagaattctgtcactgcctattttg 19103467  T
Q  101 aacccatttttgaatcggaggcaagaagttatgggacaatatgcaatagttttcatgaacttgaaagtgattatgagaaagttagtaaaactacaatggg 200  Q
    |||| || |||||||| |||  |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| || |||| |||||| ||||    
T  19103466 aaccaatgtttgaatcagagaaaagaagttatggaacactatacaatagttttcatgaactggaaagtgattatgtaaaacttggtaagactacattggg 19103367  T
Q  201 gattaagtcttggagtgtaggaccagtttcaacttgggctaacaagaatgatgaaaggaagggcaataggggacacgtggagaagaacgttgaaaaagag 300  Q
    ||| || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  |||| || |||||| ||||| ||| |||   | | |||||||    
T  19103366 gatcaaatcttggtgtgtaggaccagtttcagctagggctaacaaggatgatgaaaaaaaggccagtagggggcacgtagaggaga---tcggaaaagag 19103270  T
Q  301 agagaattgctaaattggcttaactcaaagcaaaatgagtctgt 344  Q
      ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19103269 gaagagtggctaaattggcttaactcaaagcaaaatgagtctgt 19103226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 84 - 341
Target Start/End: Original strand, 26128778 - 26129032
Alignment:
Q  84 tgccacagcctattttgaacccatttttgaatcggaggcaagaagttatgggacaatatgcaatagttttcatgaacttgaaagtgattatgagaaagtt 183  Q
    |||||| |||||||||||| | |||| ||||||  ||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||    
T  26128778 tgccactgcctattttgaagcaatttatgaatcacagaaaagaagttatggaacactatgcaatagttttcatgaactggaaagtgattatgaaaacatt 26128877  T
Q  184 agtaaaactacaatggggattaagtcttggagtgtaggaccagtttcaacttgggctaacaagaatgatgaaaggaagggcaataggggacacgtggaga 283  Q
     |||| |||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| | |||     
T  26128878 tgtaacactaccttggggatcaaatcttggagtgtaggaccagtttcatcatgggctaacaaggatgatgaaaacaaggggaataggggacacatagagg 26128977  T
Q  284 agaacgttgaaaaagagagagaattgctaaattggcttaactcaaagcaaaatgagtc 341  Q
    ||    ||| |||||||  ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26128978 ag---cttggaaaagaggcagactggttaaattggcttaactcaaagcaaaatgagtc 26129032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 130 - 344
Target Start/End: Original strand, 26302059 - 26302277
Alignment:
Q  130 tatgggacaatatgcaatagttttcatgaacttgaaagtgattatgagaaagttagtaaaactacaatggggattaagtcttggagtgtaggaccagttt 229  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||| || || ||||||| ||||||||||||||    
T  26302059 tatggaacactatacaatagttttcatgaacttgaaagtgattatgtgaaacttagtcaaacaacaatgggaatcaaatcttggaatgtaggaccagttt 26302158  T
Q  230 caacttgggctaacaagaatgatgaaaggaagggcaataggggaca----cgtggagaagaacgttgaaaaagagagagaattgctaaattggcttaact 325  Q
    |   ||||||||||||||| |||||||| |||    ||||||||||    || |||||||||| ||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  26302159 ctgtttgggctaacaagaaggatgaaagcaagactcataggggacacgcgcgcggagaagaactttggaaaagaaacagaattggtaaattggcttaact 26302258  T
Q  326 caaagcaaaatgagtctgt 344  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26302259 caaagcaaaatgagtctgt 26302277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 83 - 341
Target Start/End: Original strand, 26087992 - 26088247
Alignment:
Q  83 ctgccacagcctattttgaacccatttttgaatcggaggcaagaagttatgggacaatatgcaatagttttcatgaacttgaaagtgattatgagaaagt 182  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||  ||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  26087992 ctgccactgcctattttgaaacaatttttgaatcagagaaaattagttatggaacactatacaatagttttcatgaactggaaagtgattatgaaaaact 26088091  T
Q  183 tagtaaaactacaatggggattaagtcttggagtgtaggaccagtttcaacttgggctaacaagaatgatgaaaggaagggcaataggggacacgtggag 282  Q
    | | |  |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | |||    
T  26088092 tggaagcactacaatggggatcaaatcttggagtgtagggccagtttcagcttggaccaacaagaatgatgaaaaaaaggccaataggggacacatagag 26088191  T
Q  283 aagaacgttgaaaaagagagagaattgctaaattggcttaactcaaagcaaaatgagtc 341  Q
     ||    ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26088192 gag---cttggaaaagaggaagagtggctaaattggcttaactcaaaggaaaatgagtc 26088247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 83 - 341
Target Start/End: Original strand, 26111780 - 26112035
Alignment:
Q  83 ctgccacagcctattttgaacccatttttgaatcggaggcaagaagttatgggacaatatgcaatagttttcatgaacttgaaagtgattatgagaaagt 182  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||  ||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  26111780 ctgccactgcctattttgaaacaatttttgaatcagagaaaattagttatggaacactatacaatagttttcatgaactggaaagtgattatgaaaaact 26111879  T
Q  183 tagtaaaactacaatggggattaagtcttggagtgtaggaccagtttcaacttgggctaacaagaatgatgaaaggaagggcaataggggacacgtggag 282  Q
    | | |  |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | |||    
T  26111880 tggaagcactacaatggggatcaaatcttggagtgtagggccagtttcagcttggaccaacaagaatgatgaaaaaaaggccaataggggacacatagag 26111979  T
Q  283 aagaacgttgaaaaagagagagaattgctaaattggcttaactcaaagcaaaatgagtc 341  Q
     ||    ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26111980 gag---cttggaaaagaggaagagtggctaaattggcttaactcaaaggaaaatgagtc 26112035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 26297573 - 26297916
Alignment:
Q  1 cagaagtttactattccttgtttggctcataccattgagatgagccgtctgcagcttcgcgattgggtgaggactacaaatgctgccacagcctattttg 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||  |||   |  || |||   || |||  |||||    
T  26297573 cagaaatttacaattccttgtttacctcataccattgagatgacacgtctgcagcttcataattgggaaagggaaaacaacgctatgacggccatttttg 26297672  T
Q  101 aacccatttttgaatcggaggcaagaagttatgggacaatatgcaatagttttcatgaacttgaaagtgattatgagaaagttagtaaaactacaatggg 200  Q
    |||| || | |||||| | || |||||| |||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||    
T  26297673 aaccaatgtatgaatcagcggaaagaagctatgggtcactatacaacagttttcatgaacttgaaagtgattatgagaaactttttaaaactacaatcgg 26297772  T
Q  201 gattaagtcttggagtgtaggaccagtttcaacttgggctaacaagaatgatgaaaggaagggcaataggggacacgtggagaagaacgttgaaaaagag 300  Q
     || ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||| | ||||| | | | | |||| |     
T  26297773 aatcaagtcatggagtgtcggaccagtttcagcctgggctaacaaggatgatgaaagaaaggctaataggggacacattgagaaaagcttaggaaaacat 26297872  T
Q  301 agagaattgctaaattggcttaactcaaagcaaaatgagtctgt 344  Q
    | ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  26297873 acagaattgctaaattggcttaattcgaaggaaaatgaatctgt 26297916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 123 - 344
Target Start/End: Original strand, 26242647 - 26242868
Alignment:
Q  123 aagaagttatgggacaatatgcaatagttttcatgaacttgaaagtgattatgagaaagttagtaaaactacaatggggattaagtcttggagtgtagga 222  Q
    |||||| |||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || || || || |||||||| |||    
T  26242647 aagaagctatgggtcactatacaacagttttcatgaacttgaaagtgattatgagaatcttagtaaaactacaatcggaatcaaatcatggagtgtcgga 26242746  T
Q  223 ccagtttcaacttgggctaacaagaatgatgaaaggaagggcaataggggacacgtggagaagaacgttgaaaaagagagagaattgctaaattggctta 322  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||  ||||||||||||  |||||| | | | | |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  26242747 ccagtttcagcctgggctaacaaggatgataaaagaaaggcgaataggggacacacggagaaaagcataggaaaacagacagaattgctaaattggctta 26242846  T
Q  323 actcaaagcaaaatgagtctgt 344  Q
    ||   |||||||||||||||||    
T  26242847 acctgaagcaaaatgagtctgt 26242868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 268
Target Start/End: Original strand, 26155414 - 26155598
Alignment:
Q  84 tgccacagcctattttgaacccatttttgaatcggaggcaagaagttatgggacaatatgcaatagttttcatgaacttgaaagtgattatgagaaagtt 183  Q
    |||||| |||||||||||| | |||| ||||||  ||  |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  26155414 tgccactgcctattttgaagcaatttatgaatcacagaaaagaagttatggaacactatacaatagttttcatgaactggaaagtgattatgaaaaactt 26155513  T
Q  184 agtaaaactacaatggggattaagtcttggagtgtaggaccagtttcaacttgggctaacaagaatgatgaaaggaagggcaata 268  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  26155514 agtaacactaccatggggatcaaaacttggagtgtaggaccagtttcatcatgggctaacaaggatgatgaaaagaagggcaata 26155598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 341
Target Start/End: Original strand, 26186376 - 26186707
Alignment:
Q  7 tttactattccttgtttggctcataccattgagatgagccgtctgcagcttcgcgattgggtgaggactacaaatgctgccacagcctattttgaaccca 106  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||  | |||||||||||  |||||| |  |||| |   || || |||| || |||| | |||| |    
T  26186376 tttactattcatggtttgcctcatactattgagatgactcctctgcagcttcctgattggttagggacaaatcattctaccactgcatattataaaccaa 26186475  T
Q  107 tttttgaatcggaggcaagaagttatgggacaatatgcaatagttttcatgaacttgaaagtgattatgagaaagttagtaaaactacaatggggattaa 206  Q
    |||||||||| |||  || |||||| || ||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| ||||||| ||||   ||||||| ||    
T  26186476 tttttgaatcagagaaaaaaagttacggaacactatacaatagttttcatgaactggagagtgattataaaaaacttagtaacactatcttggggatcaa 26186575  T
Q  207 gtcttggagtgtaggaccagtttcaacttgggctaacaagaatgatgaaaggaagggcaataggggacacgtggagaagaacgttgaaaaagagagagaa 306  Q
     || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||    ||| | |||||  |||     
T  26186576 atcatggagtgtaggaccagtttcatcattggctaacaaggatgatgaaaagaagggtaataggggacacatggaggag---cttgcagaagaggaagag 26186672  T
Q  307 ttgctaaattggcttaactcaaagcaaaatgagtc 341  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26186673 tggctaaattggcttaactcaaagcaaattgagtc 26186707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 123 - 341
Target Start/End: Original strand, 26251095 - 26251313
Alignment:
Q  123 aagaagttatgggacaatatgcaatagttttcatgaacttgaaagtgattatgagaaagttagtaaaactacaatggggattaagtcttggagtgtagga 222  Q
    |||||| |||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||| |||||| || || || || |||||||| |||    
T  26251095 aagaagctatgggtcactatacaacagttttcatgaacttgaaaatgattacgagaagctttgtaaaagtacaattggaatcaaatcatggagtgtcgga 26251194  T
Q  223 ccagtttcaacttgggctaacaagaatgatgaaaggaagggcaataggggacacgtggagaagaacgttgaaaaagagagagaattgctaaattggctta 322  Q
    ||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||| | | | | |||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  26251195 ccagtttctgcctgggctaacaaggatgatgaaagaaaggcgaataggggacacatggagaaaagcttaggaaaacagacagaattgcttaattggctta 26251294  T
Q  323 actcaaagcaaaatgagtc 341  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  26251295 actcgaagcaaaatgagtc 26251313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 231
Target Start/End: Original strand, 26204130 - 26204252
Alignment:
Q  109 tttgaatcggaggcaagaagttatgggacaatatgcaatagttttcatgaacttgaaagtgattatgagaaagttagtaaaactacaatggggattaagt 208  Q
    |||||||| |||  |||||| | ||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| || |    
T  26204130 tttgaatcagagaaaagaagctttggaacactatacaatagttttcatgaactagaaagtgattatgagaaacttggtaaaactacaatagggatcaaat 26204229  T
Q  209 cttggagtgtaggaccagtttca 231  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    
T  26204230 cttggagtataggaccggtttca 26204252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 231
Target Start/End: Original strand, 26223768 - 26223890
Alignment:
Q  109 tttgaatcggaggcaagaagttatgggacaatatgcaatagttttcatgaacttgaaagtgattatgagaaagttagtaaaactacaatggggattaagt 208  Q
    |||||||| |||  |||||| | ||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| || |    
T  26223768 tttgaatcagagaaaagaagctttggaacactatacaatagttttcatgaactagaaagtgattatgagaaacttggtaaaactacaatagggatcaaat 26223867  T
Q  209 cttggagtgtaggaccagtttca 231  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    
T  26223868 cttggagtataggaccggtttca 26223890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 231
Target Start/End: Original strand, 26227234 - 26227354
Alignment:
Q  111 tgaatcggaggcaagaagttatgggacaatatgcaatagttttcatgaacttgaaagtgattatgagaaagttagtaaaactacaatggggattaagtct 210  Q
    |||||| |||| || ||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||  ||   || |  ||||||||||| ||  |     
T  26227234 tgaatcagagggaaaaagttatggaactttatgcaatagctttcacgaacttgaaggtgattatgagaatctttacaagagcacaatggggatcaaagca 26227333  T
Q  211 tggagtgtaggaccagtttca 231  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26227334 tggagtgtaggaccagtttca 26227354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 179
Target Start/End: Original strand, 26207673 - 26207741
Alignment:
Q  111 tgaatcggaggcaagaagttatgggacaatatgcaatagttttcatgaacttgaaagtgattatgagaa 179  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||  || ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26207673 tgaatcggagggaagaagctatggaactctaagcaatagctttcacgaacttgaaggtgattatgagaa 26207741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University