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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1733-Insertion-5 (Length: 587)

Name: NF1733-Insertion-5
Description: NF1733
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1733-Insertion-5
NF1733-Insertion-5
[»] chr7 (3 HSPs)
chr7 (8-587)||(43076011-43076592)
chr7 (8-587)||(43086238-43086819)
chr7 (8-587)||(43089909-43090490)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 513; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 513; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 43076592 - 43076011
Alignment:
Q  8 attaccatatttttgttcgttgtcctgcttttatcacatttggtccaagaagtaacggtattagcgtcggtgatagcggcgctgttaagtatcagattgt 107  Q
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T  43076592 attaccatatttttgttcgttgtcctgcttttatcacgtttggtccaagaagtaacggtattagcgtcggtgatagcggcgctgttaagtatcagattgt 43076493  T
Q  108 tcaacggtgcactgtcagtgtttgatagtcaacgatgttgagtatattgtgtttcactccttcctctattcttctctgcttctggtatattactctgttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43076492 tcaacggtgcactgtcagtgtttgatagtcaacgatgttgagtatattgtgtttcactccttcctctattcttctctgcttctggtatattactctgttt 43076393  T
Q  208 ag---taatgtttcattttacacgtattcttcttattttctaccacggtatttgaattgtacattttgttgttgttattattacatataatttattgtta 304  Q
    ||   |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43076392 agtaataatgtttcattttacacgta---ttcttattttctaccacggtatttgaattgtacattttgttgttgttattattacatataatttattgtta 43076296  T
Q  305 tagaataaaaattcacttggagctatatgtgaaaaattgatggaggagatagagatgtgtagnnnnnnnttgtaatatgtactgtaagtttgtaacactg 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43076295 tagaataaaaattcacttggagctatatgtgaaaaattgatggaggagatagagatgtgtagaaaaaaattgtaatatgtactgtaagtttgtaacactg 43076196  T
Q  405 tcatttgaggtgaatcaatacattaataaaataa--ttttgtgtcaatttggatagaagatgtgttgttttgctttattctttacttatgaatattcatg 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43076195 tcatttgaggtgaatcaatacattaataaaataattttttgtgtcaatttggatagaagatgtgttgttttgctttattctttacttaagaatattcatg 43076096  T
Q  503 aatataatggatgattcgtttattatttgcttttggttactttttattggttatgcttacttatgcatgtgtatatccttgtcta 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43076095 aatataatggatgattcgtttattatttacttttggttactttttattggttatgcttacttatgcatgtgtatatccttgtcta 43076011  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 513; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 43086819 - 43086238
Alignment:
Q  8 attaccatatttttgttcgttgtcctgcttttatcacatttggtccaagaagtaacggtattagcgtcggtgatagcggcgctgttaagtatcagattgt 107  Q
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T  43086819 attaccatatttttgttcgttgtcctgcttttatcacgtttggtccaagaagtaacggtattagcgtcggtgatagcggcgctgttaagtatcagattgt 43086720  T
Q  108 tcaacggtgcactgtcagtgtttgatagtcaacgatgttgagtatattgtgtttcactccttcctctattcttctctgcttctggtatattactctgttt 207  Q
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T  43086719 tcaacggtgcactgtcagtgtttgatagtcaacgatgttgagtatattgtgtttcactccttcctctattcttctctgcttctggtatattactctgttt 43086620  T
Q  208 ag---taatgtttcattttacacgtattcttcttattttctaccacggtatttgaattgtacattttgttgttgttattattacatataatttattgtta 304  Q
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T  43086619 agtaataatgtttcattttacacgta---ttcttattttctaccacggtatttgaattgtacattttgttgttgttattattacatataatttattgtta 43086523  T
Q  305 tagaataaaaattcacttggagctatatgtgaaaaattgatggaggagatagagatgtgtagnnnnnnnttgtaatatgtactgtaagtttgtaacactg 404  Q
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T  43086522 tagaataaaaattcacttggagctatatgtgaaaaattgatggaggagatagagatgtgtagaaaaaaattgtaatatgtactgtaagtttgtaacactg 43086423  T
Q  405 tcatttgaggtgaatcaatacattaataaaataa--ttttgtgtcaatttggatagaagatgtgttgttttgctttattctttacttatgaatattcatg 502  Q
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T  43086422 tcatttgaggtgaatcaatacattaataaaataattttttgtgtcaatttggatagaagatgtgttgttttgctttattctttacttaagaatattcatg 43086323  T
Q  503 aatataatggatgattcgtttattatttgcttttggttactttttattggttatgcttacttatgcatgtgtatatccttgtcta 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43086322 aatataatggatgattcgtttattatttacttttggttactttttattggttatgcttacttatgcatgtgtatatccttgtcta 43086238  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 513; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 43090490 - 43089909
Alignment:
Q  8 attaccatatttttgttcgttgtcctgcttttatcacatttggtccaagaagtaacggtattagcgtcggtgatagcggcgctgttaagtatcagattgt 107  Q
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T  43090490 attaccatatttttgttcgttgtcctgcttttatcacgtttggtccaagaagtaacggtattagcgtcggtgatagcggcgctgttaagtatcagattgt 43090391  T
Q  108 tcaacggtgcactgtcagtgtttgatagtcaacgatgttgagtatattgtgtttcactccttcctctattcttctctgcttctggtatattactctgttt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43090390 tcaacggtgcactgtcagtgtttgatagtcaacgatgttgagtatattgtgtttcactccttcctctattcttctctgcttctggtatattactctgttt 43090291  T
Q  208 ag---taatgtttcattttacacgtattcttcttattttctaccacggtatttgaattgtacattttgttgttgttattattacatataatttattgtta 304  Q
    ||   |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43090290 agtaataatgtttcattttacacgta---ttcttattttctaccacggtatttgaattgtacattttgttgttgttattattacatataatttattgtta 43090194  T
Q  305 tagaataaaaattcacttggagctatatgtgaaaaattgatggaggagatagagatgtgtagnnnnnnnttgtaatatgtactgtaagtttgtaacactg 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43090193 tagaataaaaattcacttggagctatatgtgaaaaattgatggaggagatagagatgtgtagaaaaaaattgtaatatgtactgtaagtttgtaacactg 43090094  T
Q  405 tcatttgaggtgaatcaatacattaataaaataa--ttttgtgtcaatttggatagaagatgtgttgttttgctttattctttacttatgaatattcatg 502  Q
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T  43090093 tcatttgaggtgaatcaatacattaataaaataattttttgtgtcaatttggatagaagatgtgttgttttgctttattctttacttaagaatattcatg 43089994  T
Q  503 aatataatggatgattcgtttattatttgcttttggttactttttattggttatgcttacttatgcatgtgtatatccttgtcta 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43089993 aatataatggatgattcgtttattatttacttttggttactttttattggttatgcttacttatgcatgtgtatatccttgtcta 43089909  T

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