View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17330_low_28 (Length: 253)

Name: NF17330_low_28
Description: NF17330
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17330_low_28
NF17330_low_28
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (4-208)||(31204575-31204779)
chr1 (4-208)||(45960927-45961131)
chr1 (5-208)||(6071136-6071339)
chr1 (4-206)||(37184048-37184250)
chr1 (4-208)||(905871-906075)
chr1 (4-208)||(2793965-2794169)
chr1 (7-208)||(673255-673456)
chr1 (4-208)||(2405247-2405451)
chr1 (4-208)||(3797008-3797212)
chr1 (4-207)||(41058485-41058688)
chr1 (4-208)||(23022106-23022310)
chr1 (5-208)||(29643403-29643606)
chr1 (4-208)||(20398590-20398794)
chr1 (8-208)||(45941157-45941357)
chr1 (4-208)||(49853260-49853464)
chr1 (4-208)||(1950637-1950841)
chr1 (4-208)||(28110794-28110997)
chr1 (4-208)||(21107473-21107677)
chr1 (15-208)||(49498679-49498873)
chr1 (6-208)||(21018649-21018850)
chr1 (15-208)||(11668208-11668401)
chr1 (15-200)||(27331961-27332145)
chr1 (15-208)||(7635394-7635586)
chr1 (16-208)||(34732543-34732734)
chr1 (23-123)||(42022431-42022531)
chr1 (4-97)||(27536580-27536672)
chr1 (104-208)||(21434659-21434763)
chr1 (15-206)||(34066626-34066815)
chr1 (144-208)||(27355871-27355935)
chr1 (130-180)||(37891150-37891200)
chr1 (168-208)||(27355125-27355165)
chr1 (113-154)||(42022529-42022570)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (4-208)||(18824577-18824781)
chr8 (4-208)||(36710819-36711023)
chr8 (4-208)||(18826070-18826274)
chr8 (4-208)||(21279951-21280155)
chr8 (4-208)||(17930714-17930918)
chr8 (5-208)||(22174106-22174309)
chr8 (4-208)||(8911380-8911584)
chr8 (4-208)||(10663632-10663836)
chr8 (7-208)||(43682053-43682254)
chr8 (4-208)||(14421477-14421681)
chr8 (4-208)||(23643552-23643756)
chr8 (4-208)||(33419389-33419593)
chr8 (23-208)||(23619546-23619731)
chr8 (4-208)||(13196590-13196794)
chr8 (8-208)||(18721464-18721664)
chr8 (4-208)||(5980495-5980699)
chr8 (4-208)||(10498396-10498600)
chr8 (4-208)||(16953509-16953713)
chr8 (4-208)||(31284403-31284611)
chr8 (5-207)||(12582742-12582944)
chr8 (8-208)||(25594840-25595040)
chr8 (8-208)||(25591662-25591861)
chr8 (4-204)||(30784662-30784862)
chr8 (4-208)||(45155452-45155656)
chr8 (4-208)||(38248581-38248785)
chr8 (43-208)||(2560324-2560489)
chr8 (50-208)||(5538956-5539114)
chr8 (4-175)||(5613943-5614114)
chr8 (79-208)||(12516636-12516765)
chr8 (27-208)||(25230836-25231017)
chr8 (8-117)||(23613277-23613386)
chr8 (58-207)||(4868041-4868188)
chr8 (72-208)||(44027275-44027411)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (4-208)||(14016321-14016525)
chr5 (4-208)||(7624838-7625042)
chr5 (1-208)||(22937120-22937327)
chr5 (6-208)||(42062659-42062861)
chr5 (4-208)||(17664288-17664492)
chr5 (4-208)||(26292527-26292731)
chr5 (5-208)||(26907637-26907840)
chr5 (4-208)||(17748176-17748380)
chr5 (4-208)||(23043901-23044104)
chr5 (4-208)||(26895786-26895990)
chr5 (4-208)||(43491491-43491695)
chr5 (4-208)||(40582985-40583189)
chr5 (4-207)||(18952429-18952632)
chr5 (5-208)||(32837757-32837957)
chr5 (5-208)||(7270753-7270956)
chr5 (4-208)||(12058674-12058878)
chr5 (4-208)||(12087694-12087898)
chr5 (4-208)||(20055510-20055714)
chr5 (4-208)||(26752884-26753088)
chr5 (4-208)||(34133165-34133369)
chr5 (4-208)||(34143396-34143600)
chr5 (4-208)||(41876947-41877151)
chr5 (4-208)||(14375990-14376196)
chr5 (4-202)||(22130001-22130198)
chr5 (4-208)||(34831499-34831704)
chr5 (4-208)||(30066078-30066282)
chr5 (4-208)||(4099699-4099908)
chr5 (4-208)||(28787504-28787709)
chr5 (4-208)||(31863435-31863640)
chr5 (5-208)||(33551858-33552062)
chr5 (4-208)||(41306709-41306913)
chr5 (4-208)||(21332862-21333068)
chr5 (4-208)||(21335880-21336084)
chr5 (25-208)||(2837061-2837243)
chr5 (15-195)||(11959365-11959545)
chr5 (15-208)||(18239679-18239871)
chr5 (35-208)||(39192095-39192268)
chr5 (4-208)||(21914859-21915061)
chr5 (5-94)||(28441431-28441520)
chr5 (4-205)||(31575154-31575352)
chr5 (128-200)||(18765833-18765905)
chr5 (153-208)||(563442-563497)
chr5 (4-41)||(18032194-18032231)
chr5 (58-94)||(18765937-18765973)
[»] chr4 (67 HSPs)
chr4 (4-208)||(56195262-56195466)
chr4 (6-208)||(34320100-34320302)
chr4 (4-208)||(29324560-29324764)
chr4 (4-204)||(44809142-44809342)
chr4 (4-208)||(15812320-15812526)
chr4 (4-200)||(15405275-15405471)
chr4 (4-208)||(40493550-40493754)
chr4 (4-208)||(56198588-56198792)
chr4 (4-208)||(29545056-29545260)
chr4 (4-208)||(46955661-46955865)
chr4 (15-209)||(21419535-21419729)
chr4 (4-208)||(33926702-33926911)
chr4 (4-208)||(19820463-19820667)
chr4 (4-208)||(48637240-48637444)
chr4 (1-200)||(53009748-53009947)
chr4 (1-208)||(15163924-15164132)
chr4 (4-208)||(15431814-15432018)
chr4 (4-208)||(25961793-25961997)
chr4 (4-208)||(39501383-39501587)
chr4 (15-208)||(35509711-35509904)
chr4 (4-208)||(24150407-24150611)
chr4 (6-208)||(44164520-44164722)
chr4 (4-208)||(11195410-11195615)
chr4 (4-208)||(24044323-24044527)
chr4 (4-208)||(34017964-34018168)
chr4 (8-208)||(48415712-48415912)
chr4 (4-208)||(19827225-19827429)
chr4 (8-208)||(27014002-27014202)
chr4 (4-208)||(27677237-27677441)
chr4 (8-208)||(40903266-40903466)
chr4 (4-208)||(52531118-52531322)
chr4 (1-208)||(52006713-52006920)
chr4 (6-208)||(5681165-5681367)
chr4 (4-208)||(3718859-3719063)
chr4 (4-208)||(15430038-15430242)
chr4 (4-208)||(8877684-8877888)
chr4 (23-208)||(12238022-12238204)
chr4 (4-208)||(15436652-15436856)
chr4 (15-207)||(30392319-30392507)
chr4 (1-208)||(37103398-37103604)
chr4 (5-208)||(40794738-40794941)
chr4 (16-205)||(8874947-8875136)
chr4 (9-208)||(38283671-38283870)
chr4 (23-208)||(33408500-33408685)
chr4 (4-208)||(12782640-12782844)
chr4 (4-140)||(15438428-15438564)
chr4 (4-208)||(18673264-18673457)
chr4 (6-208)||(5672619-5672834)
chr4 (15-208)||(53094253-53094446)
chr4 (4-208)||(19859704-19859907)
chr4 (44-208)||(49270458-49270622)
chr4 (4-208)||(19864695-19864898)
chr4 (6-208)||(5670301-5670516)
chr4 (5-208)||(37739945-37740146)
chr4 (15-187)||(8448745-8448918)
chr4 (6-208)||(48014235-48014433)
chr4 (88-208)||(27679407-27679527)
chr4 (85-208)||(15446918-15447041)
chr4 (15-208)||(22172557-22172751)
chr4 (74-208)||(3797990-3798124)
chr4 (72-208)||(40616991-40617141)
chr4 (138-208)||(18911368-18911438)
chr4 (4-92)||(27691442-27691530)
chr4 (1-81)||(18911286-18911366)
chr4 (128-208)||(33493878-33493958)
chr4 (152-193)||(24410206-24410247)
chr4 (8-94)||(5677705-5677790)
[»] chr3 (81 HSPs)
chr3 (4-208)||(50461718-50461922)
chr3 (4-208)||(11784586-11784790)
chr3 (6-208)||(52199736-52199938)
chr3 (4-208)||(54723562-54723766)
chr3 (4-208)||(54719792-54719996)
chr3 (4-206)||(47054746-47054948)
chr3 (4-209)||(19301673-19301878)
chr3 (4-208)||(11190347-11190551)
chr3 (4-208)||(34984022-34984226)
chr3 (4-208)||(53815649-53815853)
chr3 (4-206)||(47051316-47051518)
chr3 (7-208)||(8461656-8461857)
chr3 (4-208)||(12561403-12561607)
chr3 (4-208)||(25443029-25443233)
chr3 (4-209)||(15195470-15195675)
chr3 (4-209)||(16184856-16185061)
chr3 (4-208)||(2775302-2775506)
chr3 (4-208)||(6434947-6435151)
chr3 (4-208)||(9392555-9392759)
chr3 (6-194)||(35412338-35412526)
chr3 (4-208)||(43809400-43809604)
chr3 (4-208)||(52988226-52988430)
chr3 (4-207)||(17040192-17040395)
chr3 (6-204)||(17141231-17141429)
chr3 (4-208)||(2778545-2778749)
chr3 (4-208)||(2873385-2873589)
chr3 (4-208)||(7486391-7486595)
chr3 (4-208)||(19304858-19305062)
chr3 (4-208)||(22417003-22417207)
chr3 (4-208)||(24125320-24125524)
chr3 (4-208)||(24128597-24128801)
chr3 (4-208)||(28008239-28008443)
chr3 (4-208)||(32367298-32367502)
chr3 (4-209)||(28265701-28265903)
chr3 (4-209)||(20728815-20729020)
chr3 (4-208)||(43926656-43926860)
chr3 (8-208)||(3840341-3840541)
chr3 (8-208)||(27091719-27091919)
chr3 (4-208)||(45896201-45896405)
chr3 (16-208)||(48064204-48064396)
chr3 (8-208)||(49743089-49743289)
chr3 (1-208)||(55035030-55035236)
chr3 (4-208)||(10106768-10106972)
chr3 (4-208)||(30690557-30690761)
chr3 (4-208)||(41976836-41977040)
chr3 (4-208)||(3293130-3293334)
chr3 (14-200)||(17528934-17529120)
chr3 (4-208)||(10884679-10884882)
chr3 (4-208)||(16243694-16243898)
chr3 (8-209)||(29344043-29344244)
chr3 (4-208)||(30220178-30220382)
chr3 (4-208)||(32287493-32287697)
chr3 (4-208)||(46884773-46884966)
chr3 (4-208)||(10881301-10881505)
chr3 (23-205)||(538666-538848)
chr3 (4-180)||(52309754-52309931)
chr3 (4-208)||(25584508-25584701)
chr3 (4-208)||(35751275-35751465)
chr3 (76-208)||(23298785-23298917)
chr3 (17-171)||(31857650-31857804)
chr3 (4-175)||(22783413-22783584)
chr3 (4-175)||(22787777-22787948)
chr3 (15-208)||(22993868-22994060)
chr3 (66-209)||(17531823-17531961)
chr3 (4-119)||(6922567-6922682)
chr3 (4-138)||(17544437-17544570)
chr3 (58-208)||(18542426-18542575)
chr3 (118-208)||(18644938-18645028)
chr3 (126-207)||(282362-282443)
chr3 (128-208)||(31549116-31549196)
chr3 (4-113)||(11636655-11636762)
chr3 (49-208)||(27308192-27308349)
chr3 (117-208)||(27308755-27308845)
chr3 (148-208)||(17545820-17545880)
chr3 (14-138)||(38386817-38386941)
chr3 (15-115)||(22360278-22360377)
chr3 (129-208)||(27298632-27298711)
chr3 (4-57)||(18645025-18645078)
chr3 (15-115)||(22370181-22370280)
chr3 (128-182)||(55032183-55032237)
chr3 (23-94)||(27298745-27298816)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (4-208)||(6603181-6603385)
chr7 (4-208)||(13449964-13450167)
chr7 (4-208)||(9864914-9865118)
chr7 (4-208)||(13842363-13842567)
chr7 (4-208)||(48645197-48645401)
chr7 (4-208)||(9132947-9133151)
chr7 (4-208)||(16165471-16165675)
chr7 (4-208)||(45287256-45287460)
chr7 (4-208)||(10468867-10469071)
chr7 (4-208)||(11398213-11398417)
chr7 (4-209)||(3068163-3068368)
chr7 (4-208)||(26136315-26136519)
chr7 (4-208)||(26144695-26144899)
chr7 (4-208)||(37166334-37166538)
chr7 (4-208)||(20080905-20081109)
chr7 (4-208)||(23225093-23225297)
chr7 (23-208)||(2441466-2441651)
chr7 (4-208)||(4695247-4695451)
chr7 (8-208)||(8276712-8276912)
chr7 (4-208)||(22611794-22611998)
chr7 (4-208)||(10344937-10345141)
chr7 (4-208)||(14683631-14683835)
chr7 (4-208)||(26557223-26557426)
chr7 (4-207)||(4596197-4596400)
chr7 (8-208)||(17730541-17730741)
chr7 (4-207)||(4546592-4546795)
chr7 (33-208)||(37415612-37415787)
chr7 (33-208)||(37423144-37423319)
chr7 (16-205)||(5242343-5242532)
chr7 (4-208)||(7227250-7227454)
chr7 (25-208)||(20594007-20594190)
chr7 (4-208)||(18562721-18562923)
chr7 (4-208)||(13809705-13809904)
chr7 (4-208)||(5796276-5796478)
chr7 (22-141)||(45290668-45290787)
chr7 (12-135)||(9273380-9273503)
chr7 (58-208)||(24917972-24918121)
chr7 (60-200)||(2090385-2090524)
chr7 (24-74)||(9080920-9080970)
chr7 (148-184)||(9271669-9271705)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (4-208)||(31427725-31427929)
chr2 (4-208)||(33310384-33310588)
chr2 (4-208)||(38015236-38015440)
chr2 (4-208)||(45453592-45453795)
chr2 (4-209)||(45456879-45457084)
chr2 (4-208)||(16178845-16179049)
chr2 (4-208)||(17876824-17877028)
chr2 (4-208)||(25821029-25821233)
chr2 (4-208)||(37937402-37937606)
chr2 (4-208)||(27266506-27266710)
chr2 (4-208)||(40259322-40259526)
chr2 (4-208)||(42368894-42369098)
chr2 (4-208)||(12219513-12219718)
chr2 (4-208)||(25959872-25960076)
chr2 (4-207)||(22630559-22630762)
chr2 (1-208)||(45493339-45493546)
chr2 (1-208)||(45501081-45501288)
chr2 (23-208)||(5666255-5666440)
chr2 (15-208)||(16790942-16791135)
chr2 (4-208)||(1386605-1386809)
chr2 (8-208)||(9188836-9189036)
chr2 (4-208)||(11348079-11348283)
chr2 (4-208)||(24234813-24235017)
chr2 (4-208)||(24238085-24238289)
chr2 (4-208)||(26365651-26365855)
chr2 (8-208)||(5105448-5105648)
chr2 (4-208)||(6826490-6826694)
chr2 (8-208)||(9185608-9185808)
chr2 (4-208)||(36808625-36808829)
chr2 (4-208)||(37279860-37280064)
chr2 (4-208)||(40781190-40781394)
chr2 (8-208)||(43208073-43208273)
chr2 (4-207)||(25870502-25870705)
chr2 (4-208)||(8888353-8888558)
chr2 (4-208)||(25139115-25139319)
chr2 (8-208)||(31586124-31586324)
chr2 (4-208)||(43723419-43723622)
chr2 (4-191)||(17876211-17876398)
chr2 (20-208)||(3875020-3875208)
chr2 (4-208)||(13972077-13972281)
chr2 (4-207)||(25873893-25874096)
chr2 (4-208)||(22020786-22020989)
chr2 (44-208)||(30274952-30275116)
chr2 (16-194)||(10600676-10600854)
chr2 (6-189)||(30926267-30926450)
chr2 (77-208)||(9966553-9966684)
chr2 (4-140)||(29440241-29440377)
chr2 (99-208)||(17874765-17874874)
chr2 (9-200)||(35521557-35521746)
chr2 (128-206)||(11187927-11188005)
chr2 (166-208)||(29440375-29440417)
chr2 (21-92)||(11187816-11187888)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (4-208)||(89505-89709)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (4-208)||(31072042-31072246)
chr6 (4-208)||(11125878-11126082)
chr6 (4-208)||(11401994-11402198)
chr6 (4-208)||(24399917-24400121)
chr6 (4-208)||(18856207-18856411)
chr6 (4-208)||(9839577-9839781)
chr6 (15-208)||(24410048-24410240)
chr6 (8-208)||(9953705-9953905)
chr6 (4-208)||(3596964-3597168)
chr6 (4-208)||(10289710-10289914)
chr6 (4-208)||(22561346-22561550)
chr6 (6-208)||(4512212-4512414)
chr6 (6-208)||(5738267-5738469)
chr6 (4-208)||(2378967-2379171)
chr6 (4-208)||(30655181-30655385)
chr6 (15-208)||(28230343-28230536)
chr6 (4-208)||(20185482-20185686)
chr6 (4-208)||(22150305-22150509)
chr6 (16-208)||(1125918-1126110)
chr6 (44-208)||(13946796-13946960)
chr6 (4-208)||(19475740-19475944)
chr6 (4-208)||(26942617-26942821)
chr6 (16-209)||(2846051-2846244)
chr6 (4-208)||(11247499-11247703)
chr6 (4-188)||(26898071-26898255)
chr6 (6-208)||(14281703-14281905)
chr6 (4-176)||(11188130-11188302)
chr6 (4-208)||(13004926-13005130)
chr6 (4-208)||(28107972-28108175)
chr6 (4-208)||(12988308-12988510)
chr6 (4-208)||(5259674-5259878)
chr6 (9-160)||(23388327-23388478)
chr6 (6-201)||(28111955-28112149)
chr6 (4-208)||(13021437-13021639)
chr6 (4-208)||(6512990-6513197)
chr6 (58-208)||(24371065-24371216)
chr6 (4-141)||(28665513-28665650)
chr6 (45-208)||(2372104-2372263)
chr6 (99-205)||(23384939-23385045)
chr6 (4-208)||(11192761-11192964)
chr6 (16-208)||(28848592-28848782)
chr6 (132-208)||(17106792-17106868)
chr6 (157-208)||(7128190-7128241)
chr6 (147-208)||(23007941-23008002)
chr6 (147-208)||(23780362-23780423)
chr6 (25-76)||(7918020-7918071)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (4-208)||(3187-3398)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (4-200)||(67715-67911)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (4-208)||(292759-292963)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (4-208)||(3465-3668)
[»] scaffold0270 (3 HSPs)
scaffold0270 (4-208)||(246-450)
scaffold0270 (4-81)||(3733-3810)
scaffold0270 (4-81)||(10863-10940)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (4-208)||(19131-19335)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (4-208)||(29101-29305)
scaffold0084 (4-186)||(19031-19213)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (4-208)||(62253-62457)
scaffold0035 (4-208)||(63604-63799)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (4-208)||(58863-59069)
[»] scaffold0520 (3 HSPs)
scaffold0520 (4-208)||(8401-8605)
scaffold0520 (4-183)||(4187-4366)
scaffold0520 (163-208)||(1730-1775)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (4-208)||(3971-4175)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (6-208)||(30832-31034)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (44-208)||(10185-10349)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (4-208)||(57772-57976)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (15-208)||(118628-118821)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (4-208)||(2255-2459)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (8-208)||(5581-5782)
[»] scaffold0757 (1 HSPs)
scaffold0757 (5-204)||(5089-5288)
[»] scaffold1785 (1 HSPs)
scaffold1785 (4-208)||(994-1189)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (23-208)||(197904-198087)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (4-208)||(19091-19288)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (120-208)||(14091-14179)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (15-200)||(9685-9869)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (4-113)||(1482-1591)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (6-110)||(24559-24663)
[»] scaffold1208 (1 HSPs)
scaffold1208 (61-151)||(1-91)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (4-84)||(26924-27004)
scaffold0080 (164-208)||(27005-27049)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (4-64)||(1-61)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (144-208)||(6-70)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (128-208)||(48586-48666)
scaffold0034 (49-94)||(48699-48743)
[»] scaffold1755 (1 HSPs)
scaffold1755 (153-208)||(6-61)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (163-208)||(248413-248458)
[»] scaffold1063 (1 HSPs)
scaffold1063 (161-208)||(2385-2434)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (4-39)||(84976-85011)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 31204575 - 31204779
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31204575 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 31204674  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31204675 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 31204774  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  31204775 taatc 31204779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 45961131 - 45960927
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45961131 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 45961032  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45961031 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 45960932  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  45960931 taatc 45960927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6071339 - 6071136
Alignment:
Q  5 ctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  6071339 ctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgccttttatatactgatcaaa 6071240  T
Q  105 tataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6071239 tataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggat 6071140  T
Q  205 aatc 208  Q
    ||||    
T  6071139 aatc 6071136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37184250 - 37184048
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37184250 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 37184151  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37184150 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgatcctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatagttagtctaggaatgga 37184051  T
Q  204 taa 206  Q
    |||    
T  37184050 taa 37184048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 906075 - 905871
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  906075 cctaattgaaccatgttattgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 905976  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  905975 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 905876  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  905875 taatc 905871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 2793965 - 2794169
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2793965 cctaattgaatcatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 2794064  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2794065 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 2794164  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  2794165 taatc 2794169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 673456 - 673255
Alignment:
Q  7 aattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaata 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  673456 aattgatccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgataaaata 673357  T
Q  107 taaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataa 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  673356 taaacatgatttagtgagaatgaatgactattgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataa 673257  T
Q  207 tc 208  Q
    ||    
T  673256 tc 673255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 2405247 - 2405451
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  2405247 cctaattgactcatgttgttgtgaaactcaatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgattttcatatcctgatcaa 2405346  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2405347 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccataacgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 2405446  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  2405447 taatc 2405451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3797212 - 3797008
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3797212 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 3797113  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3797112 atataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtttaggaatgga 3797013  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  3797012 taatc 3797008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 41058688 - 41058485
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41058688 cctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 41058589  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  41058588 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaatagggttagtctaggaatgga 41058489  T
Q  204 taat 207  Q
    ||||    
T  41058488 taat 41058485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23022310 - 23022106
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23022310 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttatatcctaatcaa 23022211  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23022210 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 23022111  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  23022110 taatc 23022106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29643606 - 29643403
Alignment:
Q  5 ctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaa 104  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  29643606 ctaattgaaccatattgctgtgaaactctatttattttgaatgacaatttagtttttattcaattaaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaa 29643507  T
Q  105 tataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggat 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29643506 tataaacatgatttagtgtgaacgaatgactactgaccctaactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttaatctaggaatggat 29643407  T
Q  205 aatc 208  Q
    ||||    
T  29643406 aatc 29643403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 20398590 - 20398794
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20398590 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 20398689  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20398690 atataaacatgatttagtgagaatgaatcactactgaccatagctttctactttgacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 20398789  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  20398790 taatc 20398794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Original strand, 45941157 - 45941357
Alignment:
Q  8 attgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatat 107  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45941157 attgaaccatgttgctgtgaaaccctatttattgtaaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatat 45941256  T
Q  108 aaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45941257 aaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataat 45941356  T
Q  208 c 208  Q
    |    
T  45941357 c 45941357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 49853464 - 49853260
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49853464 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 49853365  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49853364 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactaaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 49853265  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  49853264 taatc 49853260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1950841 - 1950637
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  1950841 cctaattgaaccatgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcat 1950742  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1950741 atataaatatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgtattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 1950642  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  1950641 taatc 1950637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 28110794 - 28110997
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  28110794 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatg-tttttatatcctgatcaa 28110892  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  28110893 atataaacatgatttaatgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaatagggttagtataggaatgga 28110992  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  28110993 taatc 28110997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21107677 - 21107473
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21107677 cctaattgaaccatgttgctgtcaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattaaattgttcttaatgctttttatattctgatcaa 21107578  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21107577 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccattgctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 21107478  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  21107477 taatc 21107473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 49498873 - 49498679
Alignment:
Q  15 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49498873 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 49498774  T
Q  115 atttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgactt-agacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49498773 atttagtgataatgaatgactactgaccatagctttctacttaagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatc 49498679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21018850 - 21018649
Alignment:
Q  6 taattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaat 105  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||||||    
T  21018850 taattgaacaatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaactgttcttaacgcttttt-tatcttgatcaaat 21018752  T
Q  106 ataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggata 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21018751 ataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttttaataaacagggttagtctaggaatggata 21018652  T
Q  206 atc 208  Q
    |||    
T  21018651 atc 21018649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11668401 - 11668208
Alignment:
Q  15 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11668401 catgttgctgtgaaactctatctattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcccgatcaaatataaacatg 11668302  T
Q  115 atttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  11668301 attttgtgagaattaatgactactgaccatagctttcaacttagaccgaattgaatttttcaaataaatatggttactctaggaatggataatc 11668208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27332145 - 27331961
Alignment:
Q  15 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 114  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| || | |||  |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  27332145 catgttgctatgaaactttatttcttgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttattaatgctttttatatactgatcacatataaacatg 27332047  T
Q  115 atttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaat 200  Q
    | ||  |||||| ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27332046 aattcatgagaatgaatgactactgaccataactttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaat 27331961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 208
Target Start/End: Original strand, 7635394 - 7635586
Alignment:
Q  15 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||| |||||    
T  7635394 catgttgatgtgaaactctatttcttatgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttagtgctttttatatgctgatcacatatatacatg 7635492  T
Q  115 atttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    | || ||||||| ||||||||| |||   || ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  7635493 aattcgtgagaatgaatgactattgatcataactttcaacttagacctgattgaattgttcaaataaacagggtcagtctaggaatagataatc 7635586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 34732734 - 34732543
Alignment:
Q  16 atgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatga 115  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |  | |    ||||||||||||    
T  34732734 atgttgctgtgaaactctatctattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatt-tttttatttattgacacgatataaacatga 34732636  T
Q  116 tttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34732635 tttcctgagaatgaatgactactgaccataactttcaacttaaacctaattgaattgttcaaataaacatagttagtctaggaatgaataatc 34732543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Original strand, 42022431 - 42022531
Alignment:
Q  23 tgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtg 122  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42022431 tgtgaaattctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtg 42022530  T
Q  123 a 123  Q
    |    
T  42022531 a 42022531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 27536672 - 27536580
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagttttt-atttaattcaattgttcttaatgctttttatatcct 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27536672 cctaattgatccatgttgttgtgaaact--atttattattaatgacaatctagttttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcct 27536580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21434763 - 21434659
Alignment:
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  21434763 atataaacatgttttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttatacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatgaa 21434664  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  21434663 taatc 21434659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 34066815 - 34066626
Alignment:
Q  15 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||    |||||| | ||    
T  34066815 catgttgttgtgaaactctatttcttgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatatattaacaccatataatc-tg 34066718  T
Q  115 atttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataa 206  Q
    | |  |  |||  ||||||||||| ||  |||||| | ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34066717 aatcggcaagattgaatgactactaaccatagcttacaacttatacctaatttgattgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataa 34066626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 27355935 - 27355871
Alignment:
Q  144 tagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27355935 tagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatggataatc 27355871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37891200 - 37891150
Alignment:
Q  130 atgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaata 180  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37891200 atgactactgaccctagcttacgacttagacttaattgaattgttcaaata 37891150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 27355165 - 27355125
Alignment:
Q  168 aattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  27355165 aattgttctaataaacatggttagtgtaggaatagataatc 27355125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 154
Target Start/End: Original strand, 42022529 - 42022570
Alignment:
Q  113 tgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgac 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  42022529 tgatttagtgagaacgaatgactactgaccatatctttcgac 42022570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18824781 - 18824577
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18824781 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 18824682  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18824681 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 18824582  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  18824581 taatc 18824577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 36711023 - 36710819
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36711023 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 36710924  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36710923 atataagcatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttggacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 36710824  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  36710823 taatc 36710819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18826274 - 18826070
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18826274 cctaattgatccatgttactgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 18826175  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18826174 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaa 18826075  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  18826074 taatc 18826070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21280155 - 21279951
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21280155 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattgttaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 21280056  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21280055 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctaactctcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttggtctaggaatgga 21279956  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  21279955 taatc 21279951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 17930714 - 17930918
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  17930714 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaa 17930813  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17930814 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctagtaaacatggttagtataggaatgga 17930913  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  17930914 taatc 17930918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22174309 - 22174106
Alignment:
Q  5 ctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22174309 ctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgaccatctagtttttattcaattcaattattcttaatgctttttatatgctgatcaaa 22174210  T
Q  105 tataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22174209 tataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattaaattgttctaataaacatggttaatctaggaatggat 22174110  T
Q  205 aatc 208  Q
    ||||    
T  22174109 aatc 22174106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 8911380 - 8911584
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8911380 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgtttttaatgctttttatatcctgatcaa 8911479  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8911480 atataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgca 8911579  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  8911580 taatc 8911584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 10663632 - 10663836
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||    
T  10663632 cctaattgactcatgttgctgtgaaactctatttattctgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgatttttatatcatgatcaa 10663731  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10663732 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 10663831  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  10663832 taatc 10663836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 43682254 - 43682053
Alignment:
Q  7 aattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaata 106  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43682254 aattgaaccatgttgttgtgaaattttatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaata 43682155  T
Q  107 taaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataa 206  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43682154 taaatatgatttagtgagaacgaatgactaccgaccctagctttcgacttagacctaattgaaatgttctaataaacatggttagtctaggaatggataa 43682055  T
Q  207 tc 208  Q
    ||    
T  43682054 tc 43682053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 14421477 - 14421681
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14421477 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctattaattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 14421576  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14421577 atataaagatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatgga 14421676  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  14421677 taatc 14421681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 23643552 - 23643756
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  23643552 cctaattgatccatgttgctgtgaaactgtatttattctgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctgtttatatcctgataaa 23643651  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23643652 aaataaacatgacttagtgagaacgaatgactactgaccctagcttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatgtttagtctaggaatgga 23643751  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  23643752 taatc 23643756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 33419389 - 33419593
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| | |||||    
T  33419389 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaatttaattgttcttaaagctctttatatcatgatcaa 33419488  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33419489 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccctagctttcgacttagaccgaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgta 33419588  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  33419589 taatc 33419593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23619731 - 23619546
Alignment:
Q  23 tgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtg 122  Q
    ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23619731 tgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtg 23619632  T
Q  123 agaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23619631 agaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacataattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 23619546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 13196590 - 13196794
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13196590 cctaatggatccatgttgctgtgaaactatatttattgtgaacgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttatatcctgatcaa 13196689  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13196690 ataaaaacatgatttagtgagaacgaatgactaccgaccataactttcgacttaaacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 13196789  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  13196790 taatc 13196794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18721664 - 18721464
Alignment:
Q  8 attgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatat 107  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18721664 attgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatactgatcaaatat 18721565  T
Q  108 aaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18721564 aaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattattctaataaacatggttagtctaggaatggataat 18721465  T
Q  208 c 208  Q
    |    
T  18721464 c 18721464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5980699 - 5980495
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5980699 cctaattgatccatgttgctgtgaaaatctatttattgtgaatgtcaatctagtttttattcaattaaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 5980600  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  |||||    
T  5980599 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccataactttcgacttagacctaattgacttgttctaataaacaagtttagtctagatatgga 5980500  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  5980499 taatc 5980495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10498600 - 10498396
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10498600 cctaattgattcatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaagtcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 10498501  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10498500 atataaatataatttagtgagaacgaacgactactgatcatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtcttggaatgga 10498401  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  10498400 taatc 10498396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 16953509 - 16953713
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16953509 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 16953608  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16953609 atataaatatgatttagtgagaatgaatgactacttaccatagctttctacttagacagaattgaattgttcttataaacagggttagtctaggaatgga 16953708  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  16953709 taatc 16953713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 31284403 - 31284611
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatat----cctaa 99  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||| |    
T  31284403 cctaattgactcatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatatatcctga 31284502  T
Q  100 tcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31284503 tcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagccttcgacttagacctaattgaattgttgtaataaacatggttagtctaggaa 31284602  T
Q  200 tggataatc 208  Q
    |||||||||    
T  31284603 tggataatc 31284611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Original strand, 12582742 - 12582944
Alignment:
Q  5 ctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaa 104  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12582742 ctaattgaactatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaa 12582841  T
Q  105 tataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggat 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  12582842 tataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatagat 12582941  T
Q  205 aat 207  Q
    |||    
T  12582942 aat 12582944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25595040 - 25594840
Alignment:
Q  8 attgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatat 107  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  25595040 attgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaagtat 25594941  T
Q  108 aaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25594940 aaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgatttgttctaataatcatggttagtctaggaatggataat 25594841  T
Q  208 c 208  Q
    |    
T  25594840 c 25594840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25591861 - 25591662
Alignment:
Q  8 attgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatat 107  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||  | |||||||||    
T  25591861 attgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcacttgttcttaatgttttttatattatgatcaaatat 25591762  T
Q  108 aaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25591761 aaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagcttt-tacttagacaaaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatggataat 25591663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 204
Target Start/End: Original strand, 30784662 - 30784862
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  30784662 cctaattgaaacatgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaa 30784761  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  30784762 atataaacatgaattcgtgagaatgaatgactattgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttcaaataaacatgaataatctaggaatgga 30784861  T
Q  204 t 204  Q
    |    
T  30784862 t 30784862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 45155656 - 45155452
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |        
T  45155656 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgacacc 45155557  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45155556 atataaacatgatttcgtggaaatgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctattaaacatggttagtctaggaatgga 45155457  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  45155456 taatc 45155452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 38248785 - 38248581
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |        
T  38248785 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgacacc 38248686  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||    
T  38248685 atataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactgaccatagcttacgacttagacctaattgaattgttctaataaacatagatagtctaggtttgga 38248586  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  38248585 taatc 38248581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 208
Target Start/End: Original strand, 2560324 - 2560489
Alignment:
Q  43 taatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgact 142  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  2560324 taatgaaaatctagtttttattcaattcaattgtttataatcctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgataacgaatgactactgacc 2560423  T
Q  143 ctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
     | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  2560424 atggttttcgacttagacctaactgaattgttctaatacagatggttagtctaggaatggataatc 2560489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5539114 - 5538956
Alignment:
Q  50 aatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctt 149  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  5539114 aatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatactgatcaaatataaaaatgattaagtgagaatgaatgactactgaccatagctt 5539015  T
Q  150 tcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    || ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5539014 tctacttagacaaaattgaattgttctaataaacatgattagtctaggaatgaataatc 5538956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 5614114 - 5613943
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  5614114 cctaattgaaacatgttgatgtgaaactctatttattgtggatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatacccttatcaa 5614015  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttc 175  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||   | ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5614014 atataaacatgatttcgtgagaatgaatgactgctgaccacaactttcaacttagacttaattgaattgttc 5613943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 79 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12516765 - 12516636
Alignment:
Q  79 ttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaa 178  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12516765 ttaatgctttttatatcttgatcaaatataaacataatttagtgagaacgaatggctactgaccatagcttttaacttagacctaattgaattgttctaa 12516666  T
Q  179 taaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12516665 taaacatggttagtctaggaatggataatc 12516636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 208
Target Start/End: Original strand, 25230836 - 25231017
Alignment:
Q  27 aaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaa---tataa-acatgatttagtg 122  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    |||| |   ||||| | ||||||| |||    
T  25230836 aaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttatat----atcacaccgtataatatatgatttcgtg 25230931  T
Q  123 agaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25230932 agaatgaatgactactgaccgtaactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagcttaggaatggataatc 25231017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 117
Target Start/End: Original strand, 23613277 - 23613386
Alignment:
Q  8 attgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatat 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23613277 attgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatat 23613376  T
Q  108 aaacatgatt 117  Q
    ||||||||||    
T  23613377 aaacatgatt 23613386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 4868041 - 4868188
Alignment:
Q  58 ttttatttaattcaattgttcttaatgctttttat---atcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgac 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||  || ||||| ||    
T  4868041 ttttattcaattcaattgttcttaatgctttttattatatcctgatcaaatataaagatgaattcgtgagaatgaatgactattgaccataactttcaac 4868140  T
Q  155 ttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 207  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||    
T  4868141 ttaggcctaattgaattgttcaaataaa-----ttagtctaggaatggataat 4868188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 44027411 - 44027275
Alignment:
Q  72 attgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaatt 171  Q
    |||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||   ||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  44027411 attgttattaatgttttttatatcatgatcaaatataaatatgatttactgagaacgaatgattactgatcatagtttttgacttagacttaattgaatt 44027312  T
Q  172 gttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
     |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  44027311 tttctaataaacatgattaggttaggaatgaataatc 44027275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14016525 - 14016321
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14016525 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 14016426  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14016425 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 14016326  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  14016325 taatc 14016321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 7624838 - 7625042
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7624838 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 7624937  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7624938 atataaacatgatttagtgagaacaaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaa 7625037  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  7625038 taatc 7625042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22937327 - 22937120
Alignment:
Q  1 aatcctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaat 100  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22937327 aatcctaattgaaccaagttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcattttatatcctgat 22937228  T
Q  101 caaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22937227 caaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaat 22937128  T
Q  201 ggataatc 208  Q
    ||||||||    
T  22937127 ggataatc 22937120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Original strand, 42062659 - 42062861
Alignment:
Q  6 taattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaat 105  Q
    ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42062659 taattgaaccaagttgcagtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaat 42062758  T
Q  106 ataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggata 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42062759 ataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggata 42062858  T
Q  206 atc 208  Q
    |||    
T  42062859 atc 42062861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 17664288 - 17664492
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17664288 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 17664387  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17664388 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagatctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatcga 17664487  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  17664488 taatc 17664492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 26292527 - 26292731
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  26292527 cctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactatttatatcctgatcaa 26292626  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26292627 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactaccgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgta 26292726  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  26292727 taatc 26292731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26907840 - 26907637
Alignment:
Q  5 ctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaa 104  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  26907840 ctaattgaaacatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagttttaattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaaa 26907741  T
Q  105 tataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26907740 tataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacttaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggat 26907641  T
Q  205 aatc 208  Q
    ||||    
T  26907640 aatc 26907637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 17748176 - 17748380
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17748176 cctaattgattcatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 17748275  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17748276 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagaactaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 17748375  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  17748376 taatc 17748380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 23043901 - 23044104
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23043901 cctaattgaaccatgttgttatgaaa-tctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 23043999  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23044000 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactggccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaa 23044099  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  23044100 taatc 23044104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26895990 - 26895786
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  26895990 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttctatttaattcagttgttcttaatgctttttatatcttgatcaa 26895891  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26895890 atataaacatgatttagtgagaacgattgactactgaccatagctttcgacttagacataattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 26895791  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  26895790 taatc 26895786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 43491491 - 43491695
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  43491491 cctaattgaaacatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttattaatgctttttatatcctgatcaa 43491590  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43491591 atataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 43491690  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  43491691 taatc 43491695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 40582985 - 40583189
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40582985 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 40583084  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  40583085 atataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattaaattgttctaataaagatggttagtctaggaataga 40583184  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  40583185 taatc 40583189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 18952429 - 18952632
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  18952429 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgtttttaatgctttttatattctgatcaa 18952528  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18952529 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactaatgaccatagctttcgacttagatctaattgaattgttctaataaacatggttagtttaggaatgga 18952628  T
Q  204 taat 207  Q
    ||||    
T  18952629 taat 18952632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Original strand, 32837757 - 32837957
Alignment:
Q  5 ctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaa 104  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  32837757 ctaattgaaccattttgctgtgaaactctatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttc--aatgctttttatatcctgatcaaa 32837854  T
Q  105 tataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggat 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32837855 tataaacatgattt-gtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggat 32837953  T
Q  205 aatc 208  Q
    ||||    
T  32837954 aatc 32837957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Original strand, 7270753 - 7270956
Alignment:
Q  5 ctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaa 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  7270753 ctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttctattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctggtcaaa 7270852  T
Q  105 tataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggat 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  7270853 tataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttctaacaaacatggttagtctatgaatggat 7270952  T
Q  205 aatc 208  Q
    ||||    
T  7270953 aatc 7270956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12058878 - 12058674
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  || | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12058878 cctaattgattcatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacattctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctggtcaa 12058779  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12058778 atataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttaaacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 12058679  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  12058678 taatc 12058674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 12087694 - 12087898
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12087694 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactttattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 12087793  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12087794 atataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 12087893  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  12087894 taatc 12087898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 20055510 - 20055714
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20055510 cctaattgatttatgttgctgtgaaactctatttatcgtgaatgacaatcaagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 20055609  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20055610 atataaacatgatttagtgagaaagaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 20055709  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  20055710 taatc 20055714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26753088 - 26752884
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26753088 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 26752989  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26752988 atataaacatgatttagtgagaatgaattactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 26752889  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  26752888 taatc 26752884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 34133369 - 34133165
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34133369 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactttattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 34133270  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34133269 atataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 34133170  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  34133169 taatc 34133165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 34143600 - 34143396
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34143600 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactttattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 34143501  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34143500 atataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 34143401  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  34143400 taatc 34143396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41877151 - 41876947
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  41877151 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgtttttaatgctttttatatcctgatcaa 41877052  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41877051 atataaacatgatttagtgagaaagaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 41876952  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  41876951 taatc 41876947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14376196 - 14375990
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtga--aactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatc 101  Q
    |||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  14376196 cctaattgaaacatgttgctgtgagaaactttatttattgcgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttgttatattctgatc 14376097  T
Q  102 aaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14376096 aaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatg 14375997  T
Q  202 gataatc 208  Q
    |||||||    
T  14375996 gataatc 14375990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 22130001 - 22130198
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22130001 cctaattgatccatattgctgtgaaactctatttattatgaatgacaatctagtttttatc-aattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 22130099  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgg 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22130100 atataaacatgattttgtgagattgaatgactacggaccctagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtttaggaatgg 22130198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 34831499 - 34831704
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgcttttt-atatcctaatca 102  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  34831499 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttttatttcctgatca 34831598  T
Q  103 aatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34831599 aatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgg 34831698  T
Q  203 ataatc 208  Q
    ||||||    
T  34831699 ataatc 34831704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 30066078 - 30066282
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  30066078 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattattcttaatgctttttatatcttgatcaa 30066177  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  30066178 atataaacatgatttaatgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaaatgaattgttctaacaaacatggttagtctaggagtgga 30066277  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  30066278 taatc 30066282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 4099908 - 4099699
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaatt-----gttcttaatgctttttatatccta 98  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||||||||||||||||||     
T  4099908 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctg 4099809  T
Q  99 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4099808 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttatacataattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 4099709  T
Q  199 atggataatc 208  Q
    ||||||||||    
T  4099708 atggataatc 4099699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 28787709 - 28787504
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28787709 cctaattgaatcatgttgctgtgaaagtctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 28787610  T
Q  104 atataaac-atgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgg 202  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28787609 atataaactatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagttttctacttggacataattgaattgttctaataaacaaggttagtctaggaatgg 28787510  T
Q  203 ataatc 208  Q
    ||||||    
T  28787509 ataatc 28787504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 31863435 - 31863640
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaa-tgctttttatatcctaatca 102  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31863435 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactttatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaaatgctttttatatcctgatca 31863534  T
Q  103 aatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31863535 aatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattattctaataaacatggttagtctaggaatgg 31863634  T
Q  203 ataatc 208  Q
    ||||||    
T  31863635 ataatc 31863640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Original strand, 33551858 - 33552062
Alignment:
Q  5 ctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33551858 ctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaa 33551957  T
Q  105 -tataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  33551958 atataaacatgatttagtgataatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttctaacaaatatggtcagtctaggaatgga 33552057  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  33552058 taatc 33552062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41306913 - 41306709
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41306913 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctaatttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 41306814  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41306813 atataaacatgatttaataagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggtatgga 41306714  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  41306713 taatc 41306709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21333068 - 21332862
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  21333068 cctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgctcttaatgctttttatatcatgatcaa 21332969  T
Q  104 atat--aaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatg 201  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21332968 atataaaaagatgatttagtgagaataaatgactactgactatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctatgaatg 21332869  T
Q  202 gataatc 208  Q
    |||||||    
T  21332868 gataatc 21332862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21336084 - 21335880
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21336084 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaataacaatatagttttaattcaattcaattgctcttaatgctttttatatcctgatcaa 21335985  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  21335984 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgactataactttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctataaatgga 21335885  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  21335884 taatc 21335880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 208
Target Start/End: Original strand, 2837061 - 2837243
Alignment:
Q  25 tgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgag 124  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  2837061 tgaaactctatt-attgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcccgatcaaatataaacatgatttagtcag 2837159  T
Q  125 aacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    || ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  2837160 aatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtttatgaatggataatc 2837243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11959545 - 11959365
Alignment:
Q  15 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 114  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11959545 catgttgctgttaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat-ctgatcaaatataaacatg 11959447  T
Q  115 atttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacc-taattgaattgttctaataaacatggttagtcta 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11959446 atttagtgagaacgaatgactactaaccatagcgttcgacttagaccttaattgaattgttctaataaacatggttagtcta 11959365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18239871 - 18239679
Alignment:
Q  15 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 114  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18239871 catgttattgtgaaactctatctattgtgaatgaaaatctactttttattaaattcaattgttcttcatgctttttatatccta-tcaaatataaacatg 18239773  T
Q  115 atttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18239772 atttcgtgagaatgaatgactactgaccatagctttgaacttagacctaattgaattgttcaaataaacaaggctagtctaggaatggataatc 18239679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 35 - 208
Target Start/End: Original strand, 39192095 - 39192268
Alignment:
Q  35 tttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgac 134  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  39192095 tttattgtgaatgataatctaatttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttaatgagaacaaatgac 39192194  T
Q  135 tactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    || ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39192195 tattgaccatagctttcgacctagatctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatagataatc 39192268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 21914859 - 21915061
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| | ||   |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  21914859 cctaattgaaccatgttgctatgaaactctatt-attgtgaaaatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttaatgatttttatagcctgatcaa 21914956  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  21914957 atataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatgaa 21915056  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  21915057 taatc 21915061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 28441520 - 28441431
Alignment:
Q  5 ctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatat 94  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  28441520 ctaattgaaacatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatattttttatat 28441431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 205
Target Start/End: Original strand, 31575154 - 31575352
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  | | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||     
T  31575154 cctatttgaaccatgttgttgtgaaactctatttcatgtgaatatcaatctagtttt-atttaattcaattgttcataatgctttttatatactgatcac 31575252  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttag--acctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatg 201  Q
    |||| ||||| | || | ||||| ||||   |||| | | |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  |||||    
T  31575253 atat-aacataaattcgagagaatgaat---tactaattatagctttcaacttagacacctaattgaattgttcaaataaacagggttattctgagaatg 31575348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18765905 - 18765833
Alignment:
Q  128 gaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaat 200  Q
    ||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18765905 gaatgactactaatcctagcttacgacttagacctatttgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaat 18765833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 563497 - 563442
Alignment:
Q  153 acttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  563497 acttagacctaattgaattgttcaactaaacaaggttagtctaggaatgaataatc 563442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 41
Target Start/End: Original strand, 18032194 - 18032231
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttatta 41  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18032194 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttatta 18032231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18765973 - 18765937
Alignment:
Q  58 ttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatat 94  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18765973 ttttattcaattcaattgtttttaatgctttttatat 18765937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 67)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 56195262 - 56195466
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  56195262 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 56195361  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56195362 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 56195461  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  56195462 taatc 56195466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 34320302 - 34320100
Alignment:
Q  6 taattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaat 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34320302 taattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaat 34320203  T
Q  106 ataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggata 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34320202 ataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggata 34320103  T
Q  206 atc 208  Q
    |||    
T  34320102 atc 34320100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 29324560 - 29324764
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29324560 cctaattgatccatgttgctgtgaaactcgatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 29324659  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29324660 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 29324759  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  29324760 taatc 29324764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44809342 - 44809142
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44809342 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaatttcattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 44809243  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44809242 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 44809143  T
Q  204 t 204  Q
    |    
T  44809142 t 44809142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15812526 - 15812320
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattat--taatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatc 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15812526 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattatattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatc 15812427  T
Q  102 aaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15812426 aaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatg 15812327  T
Q  202 gataatc 208  Q
    |||||||    
T  15812326 gataatc 15812320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15405471 - 15405275
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  15405471 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcgtgatcaa 15405372  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15405371 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagaccgaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaat 15405275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 40493754 - 40493550
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40493754 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 40493655  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40493654 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgta 40493555  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  40493554 taatc 40493550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 56198588 - 56198792
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  56198588 cctaattgattcatgtttctgtgaaactctatttattattaatgacaatctaatttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 56198687  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  56198688 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaa 56198787  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  56198788 taatc 56198792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29545260 - 29545056
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29545260 cctaattgaaacatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 29545161  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29545160 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactggccctaacttttgacttacacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 29545061  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  29545060 taatc 29545056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 46955865 - 46955661
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  46955865 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaatttaattgttcttaatgctttttatattatgatcaa 46955766  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46955765 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccataactttcgatttagacctaattgaattgttctaataaacatggttaatctaggaatgga 46955666  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  46955665 taatc 46955661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 209
Target Start/End: Original strand, 21419535 - 21419729
Alignment:
Q  15 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21419535 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatg 21419634  T
Q  115 atttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatct 209  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21419635 atttagtgagaacgagcgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataagcatggttagtctaggaatggataatct 21419729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 33926702 - 33926911
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  33926702 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatatcctgatcaa 33926801  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaa-----tgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33926802 atataaacatgatttagtgagaacgaatgacttgactactgaccctagctttcgacttagatctaattgaactgttctaataaacatgattagtctagga 33926901  T
Q  199 atggataatc 208  Q
    ||||||||||    
T  33926902 atggataatc 33926911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 19820463 - 19820667
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19820463 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 19820562  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19820563 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgactatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 19820662  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  19820663 taatc 19820667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 48637240 - 48637444
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48637240 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 48637339  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48637340 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 48637439  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  48637440 taatc 48637444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 53009947 - 53009748
Alignment:
Q  1 aatcctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaat 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  53009947 aatcctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgataatctaggttttattcaattcaattgttcttaatactttttatatcctgat 53009848  T
Q  101 caaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53009847 caaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaat 53009748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 15163924 - 15164132
Alignment:
Q  1 aatcctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15163924 aatcctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaattacaatctagtttttattcaattctattgttcttaatgttttttatatcctgat 15164023  T
Q  101 caaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagg-aa 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15164024 caaatataatcatgatttagtgagaacgaatgactactgaccttagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaaa 15164123  T
Q  200 tggataatc 208  Q
    |||||||||    
T  15164124 tggataatc 15164132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 15431814 - 15432018
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15431814 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaa 15431913  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15431914 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgatcatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 15432013  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  15432014 taatc 15432018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 25961793 - 25961997
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25961793 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactatattaattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaaagctttttatatcctgatcaa 25961892  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25961893 atataaaaatgatttaatgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 25961992  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  25961993 taatc 25961997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 39501383 - 39501587
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39501383 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 39501482  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39501483 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 39501582  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  39501583 taatc 39501587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 208
Target Start/End: Original strand, 35509711 - 35509904
Alignment:
Q  15 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  35509711 catgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgattaaatataaacatg 35509810  T
Q  115 atttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35509811 atttagtaagaacgaatgactactgaccctagctttcgaattagacctaattgaattgttctaataaacatcgttagtctaggaatggataatc 35509904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 24150407 - 24150611
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24150407 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 24150506  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24150507 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtccaggaatgga 24150606  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  24150607 taatc 24150611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Original strand, 44164520 - 44164722
Alignment:
Q  6 taattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaat 105  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  44164520 taattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttatttatttcaattgttcttaatgttttttatattctgatcaaat 44164619  T
Q  106 ataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggata 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44164620 ataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgactatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggata 44164719  T
Q  206 atc 208  Q
    |||    
T  44164720 atc 44164722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 11195410 - 11195615
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaa-ctctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatca 102  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  11195410 cctaattgaaccatgttgctgtgaaaactctatttattgtgagtgacaatctggtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcatgatca 11195509  T
Q  103 aatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  11195510 aatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctacttgaattgttctaataaacatggttagtttaggaatga 11195609  T
Q  203 ataatc 208  Q
    ||||||    
T  11195610 ataatc 11195615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24044527 - 24044323
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24044527 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 24044428  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24044427 atataaacatgatttagtgagaatgaattactacttaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 24044328  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  24044327 taatc 24044323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 34018168 - 34017964
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  34018168 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacagtctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaa 34018069  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34018068 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 34017969  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  34017968 taatc 34017964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 48415912 - 48415712
Alignment:
Q  8 attgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatat 107  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48415912 attgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatat 48415813  T
Q  108 aaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48415812 aaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaatttttctaataataatggttagtctaggaatggataat 48415713  T
Q  208 c 208  Q
    |    
T  48415712 c 48415712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 19827225 - 19827429
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19827225 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 19827324  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19827325 atacaaacatgatttagtgagaatgaatgactactaaccatagctttctacttagactgaatggaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 19827424  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  19827425 taatc 19827429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Original strand, 27014002 - 27014202
Alignment:
Q  8 attgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatat 107  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  27014002 attgaaccatgttgttgtgaaaatctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatattctgatcaaatat 27014101  T
Q  108 aaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27014102 aaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatggataat 27014201  T
Q  208 c 208  Q
    |    
T  27014202 c 27014202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 27677441 - 27677237
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27677441 cctaattgaaccatgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttgttcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaa 27677342  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27677341 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattaaattattctaataaacaaggttagtctaggaatgga 27677242  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  27677241 taatc 27677237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 40903466 - 40903266
Alignment:
Q  8 attgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatat 107  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  40903466 attgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatat 40903367  T
Q  108 aaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  40903366 aaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaattgataat 40903267  T
Q  208 c 208  Q
    |    
T  40903266 c 40903266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 52531322 - 52531118
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  52531322 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttctgaatgctttttatatcctgatcaa 52531223  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52531222 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactattgaccatagctttttacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 52531123  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  52531122 taatc 52531118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 52006920 - 52006713
Alignment:
Q  1 aatcctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  52006920 aatcctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatctattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcgattgttcttaatgttttttatatcttgat 52006821  T
Q  101 caaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  52006820 caaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacaggtttagtctaggaat 52006721  T
Q  201 ggataatc 208  Q
    ||||||||    
T  52006720 ggataatc 52006713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Original strand, 5681165 - 5681367
Alignment:
Q  6 taattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaat 105  Q
    |||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  5681165 taattgaatcatattgctgtgaaactcaatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaat 5681264  T
Q  106 ataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggata 205  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5681265 ataaacatgatttagccataacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataagcatggttagtgtaggaatggata 5681364  T
Q  206 atc 208  Q
    |||    
T  5681365 atc 5681367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 3718859 - 3719063
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3718859 cctaattgaaccatattgctgtgaaactctatttattgtgaatgaaaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttatatcctgatcaa 3718958  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3718959 atataaacatgatttagtgagaatgaatgattactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 3719058  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  3719059 taatc 3719063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15430242 - 15430038
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15430242 cctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgactatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 15430143  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||  || ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15430142 atataaacatgatttaatgaaaatgaacgactactgaccataactttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 15430043  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  15430042 taatc 15430038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8877888 - 8877684
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  |||| || ||||||||||||| |||| |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8877888 cctaattgaaacatgctgctgtgaaactctatctattgtagatgacaatcaagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 8877789  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8877788 atataaacatgatttagtgggaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagatttaattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatgga 8877689  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  8877688 taatc 8877684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 208
Target Start/End: Original strand, 12238022 - 12238204
Alignment:
Q  23 tgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatc--ctaatcaaatataaacatgatttag 120  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  12238022 tgtgaaactttatttattgtgaatgacaatctagtttttatt-----caattgttcttaatgctttttatatctcctgatcaaatataaacatgatttag 12238116  T
Q  121 tgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12238117 tgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 12238204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15436856 - 15436652
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15436856 cctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgactatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 15436757  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||  || ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  15436756 atataaacatgatttaatgaaaatgaacgactactgaccataactttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgta 15436657  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  15436656 taatc 15436652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 207
Target Start/End: Original strand, 30392319 - 30392507
Alignment:
Q  15 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  30392319 catgttgctgtgaaactctatttattatgaatgacaatctagtttttattcatctcaattgt----aatgctttttatatcttaatcaaatataaatatg 30392414  T
Q  115 atttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30392415 atttagtgagaacgaatgactactgaccctagcttttgaattagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataat 30392507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37103604 - 37103398
Alignment:
Q  1 aatcctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||  |    
T  37103604 aatcctaattgaaccatgttgctggtaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttattaatgctttatatatcctggt 37103505  T
Q  101 caaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37103504 caaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaaca-ggttagtctaggaat 37103406  T
Q  201 ggataatc 208  Q
    ||||||||    
T  37103405 ggataatc 37103398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Original strand, 40794738 - 40794941
Alignment:
Q  5 ctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaa 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40794738 ctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcgattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaa 40794837  T
Q  105 tataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggat 204  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40794838 tataaatatgatttagtgagaatgaatgactactgaccataactttctacttaaacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggat 40794937  T
Q  205 aatc 208  Q
    ||||    
T  40794938 aatc 40794941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8875136 - 8874947
Alignment:
Q  16 atgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatga 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| |    
T  8875136 atgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatcacttgatcaaatataaacataa 8875037  T
Q  116 tttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggata 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8875036 tttagtgagaatgaatgactaccgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatggata 8874947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 38283870 - 38283671
Alignment:
Q  9 ttgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatata 108  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38283870 ttgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatata 38283771  T
Q  109 aacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| | |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38283770 aacctgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctactgatagaatattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatc 38283671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33408685 - 33408500
Alignment:
Q  23 tgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtg 122  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33408685 tgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaactcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcagatataaacatgatttagtg 33408586  T
Q  123 agaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||| |||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33408585 agaatgaatgattactgaccatagctgtctacttagacctaattgagttgttcaaataaacattgttagtctaggaatagataatc 33408500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 12782640 - 12782844
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  12782640 cctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgagtgacaatcttgtttttattcatttcagttgttcttaatactttttatattctgatcaa 12782739  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12782740 atataaacatgatttagtaaaaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacggaattgaattgttctaataaacagggttagtctatgaatgga 12782839  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  12782840 taatc 12782844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 15438428 - 15438564
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15438428 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 15438527  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactga 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15438528 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactga 15438564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18673457 - 18673264
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| ||||           ||||||||||||||||| |||||    
T  18673457 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaatt-----------aatgctttttatatcctgatcaa 18673369  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18673368 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacgtaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 18673269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Original strand, 5672619 - 5672834
Alignment:
Q  6 taattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaat--gacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5672619 taattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 5672718  T
Q  104 atataaac-----------atgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagt 192  Q
    ||||||||           ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5672719 atataaacaagatttagtgatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagttttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagt 5672818  T
Q  193 ctaggaatggataatc 208  Q
    ||||||||||||||||    
T  5672819 ctaggaatggataatc 5672834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 208
Target Start/End: Original strand, 53094253 - 53094446
Alignment:
Q  15 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  | |    |||||||||||    
T  53094253 catgttgctgtgaaactctatctattgtgaatgacaatctaatttttattcaattaaattgttcttaatgctttttatatattgacaccatataaacatg 53094352  T
Q  115 atttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53094353 atttcgtgagaacgaattactactgaccatagttttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatggataatc 53094446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19859907 - 19859704
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |        
T  19859907 cctaattgaactatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgaca-tctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgacacc 19859809  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859808 atataaacatgatttagtgagaatgaataactactgaccatagctttctacttaaacttaattaagttgttttaataaacatggttagtctaggaatgga 19859709  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  19859708 taatc 19859704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 44 - 208
Target Start/End: Original strand, 49270458 - 49270622
Alignment:
Q  44 aatgacaatctagtttttatttaattcaatt---gttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactga 140  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49270458 aatgacaatctagtttttattcaattcaattattgttcttaatgctttttatattct---caaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactga 49270554  T
Q  141 ctctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  49270555 tcatagctttcgacttagacctaattgaattgttctcataaacatggttagtatatgaatgaataatc 49270622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19864898 - 19864695
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |        
T  19864898 cctaattgaaccatgtagctgtgaaactctatttattgtgaatgaca-tctaatttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgacacc 19864800  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19864799 atataaacatgatttagtgagaatgaataactactgaccatagctttctacttaaacttaattaagttgttttaataaacatggttagtctaggaatgga 19864700  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  19864699 taatc 19864695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Original strand, 5670301 - 5670516
Alignment:
Q  6 taattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaat--gacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5670301 taattgaaccatattgctgtgaaactctatttattgtgaatatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 5670400  T
Q  104 atataaacatgatttagtg-----------agaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagt 192  Q
    ||||||||| |||||||||           |||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5670401 atataaacaagatttagtgatgatttagaaagaatgaatgactactgaccatagttttctacttagacagaattaaattgttctaataaacagggttagt 5670500  T
Q  193 ctaggaatggataatc 208  Q
    ||||||||||||||||    
T  5670501 ctaggaatggataatc 5670516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37740146 - 37739945
Alignment:
Q  5 ctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaa 104  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| | |||   ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  37740146 ctaattgaatcatgttgttgtgaaactctatt-attgtgaatattaatctagtttt-attcaattcaattgttgttaatgctttttatattctaatcaaa 37740049  T
Q  105 tataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggat 204  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  37740048 tataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactaaccatagctttcaacttagacctaatcgaatttttcaaataaactgggttaatctatgaatggat 37739949  T
Q  205 aatc 208  Q
    ||||    
T  37739948 aatc 37739945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8448918 - 8448745
Alignment:
Q  15 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  8448918 catgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattattgttaatgctttttatatcttgatcaaatataaacatc 8448819  T
Q  115 atttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacct-aattgaattgttctaataaacatgg 187  Q
    |||| || |||| ||||||||||||    |||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  8448818 atttcgtaagaatgaatgactactggtcatagctttctacttagacctaaattgaattgctcaaataaacatgg 8448745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 48014433 - 48014235
Alignment:
Q  6 taattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaat 105  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||| | |||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  48014433 taattgaaccatgttgctgtgaaactatatt-attgtcaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttaatgctttttat--cctgatcaaat 48014338  T
Q  106 ataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggata 205  Q
    ||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||  || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  48014337 ataaatatgaattcgtgagaatgaataactactgaccataactttcaactttgacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtttaggaatggata 48014238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 88 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 27679527 - 27679407
Alignment:
Q  88 tttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatgg 187  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  27679527 tttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaacatagctttctacttatacagaattgaattgttctaataaacaagg 27679428  T
Q  188 ttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  27679427 ttagtctaggaatggataatc 27679407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15447041 - 15446918
Alignment:
Q  85 ctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaaca 184  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15447041 ctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaattactactgaccataactttctacttagactgaattgaattgttctaataaaca 15446942  T
Q  185 tggttagtctaggaatggataatc 208  Q
     |||||||||| ||||||||||||    
T  15446941 gggttagtctatgaatggataatc 15446918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22172751 - 22172557
Alignment:
Q  15 catgttgttgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaaca 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||| |||  |||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||| || |||| |||||| ||    
T  22172751 catgttgttgtgaaactctgtttcatatatgaatatcaatatagttttgattcaattcaattgttattaatgatttttatatactgatcacatataa-ca 22172653  T
Q  113 tgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||| || ||||||| |||||| |||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22172652 tgaattcgtgagaatgaatgattactgaccatagctttcaacttagaccttattgaattgttcaaataaacagggttagtctatgaatggataatc 22172557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3798124 - 3797990
Alignment:
Q  74 tgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgt 173  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  3798124 tgttgttaatactttttatatcctgatcacatataaacatgatttaatgagaatgaatgactactgaccatagctttctatttagacagaattgaattgt 3798025  T
Q  174 tctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  3798024 tctaataaacagggttaatctaggaatgaataatc 3797990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 40617141 - 40616991
Alignment:
Q  72 attgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaat--------------gactactgactctagctttcgactta 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||              ||||||||||  |||||||| |||||    
T  40617141 attgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaattagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctactta 40617042  T
Q  158 gacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40617041 gagagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatc 40616991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 208
Target Start/End: Original strand, 18911368 - 18911438
Alignment:
Q  138 tgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18911368 tgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 18911438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 27691530 - 27691442
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttat 92  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27691530 cctaattgaatcatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttat 27691442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 18911286 - 18911366
Alignment:
Q  1 aatcctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttctta 81  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18911286 aatcctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttctta 18911366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 33493958 - 33493878
Alignment:
Q  128 gaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||||||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  33493958 gaatgactactgaccatagcttacaatttagacctaattgaattgttcaaataaacagagttagtctaggaatagataatc 33493878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24410247 - 24410206
Alignment:
Q  152 gacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtc 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24410247 gacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtc 24410206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 5677790 - 5677705
Alignment:
Q  8 attgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatat 94  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  | | |||  |||||||| ||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5677790 attgaaccatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttactcaattcatctgttcttaatgctttttatat 5677705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 81)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 50461922 - 50461718
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50461922 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 50461823  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50461822 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaa 50461723  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  50461722 taatc 50461718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 11784586 - 11784790
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  11784586 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcac 11784685  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11784686 atataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccttagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 11784785  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  11784786 taatc 11784790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Original strand, 52199736 - 52199938
Alignment:
Q  6 taattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaat 105  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52199736 taattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaat 52199835  T
Q  106 ataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggata 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52199836 ataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggata 52199935  T
Q  206 atc 208  Q
    |||    
T  52199936 atc 52199938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 54723562 - 54723766
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54723562 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 54723661  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54723662 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 54723761  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  54723762 taatc 54723766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 54719792 - 54719996
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  54719792 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaa 54719891  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54719892 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 54719991  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  54719992 taatc 54719996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 206
Target Start/End: Original strand, 47054746 - 47054948
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||    
T  47054746 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttattaatgttttttatatcctggtcaa 47054845  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47054846 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaaagga 47054945  T
Q  204 taa 206  Q
    |||    
T  47054946 taa 47054948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19301878 - 19301673
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19301878 cctaattgatccatgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttaaatcctgatcaa 19301779  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19301778 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactacagaccctagctttcaacttagacataattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 19301679  T
Q  204 taatct 209  Q
    ||||||    
T  19301678 taatct 19301673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 11190347 - 11190551
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11190347 cctaattgaatcatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 11190446  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11190447 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtcgaggaatgga 11190546  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  11190547 taatc 11190551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 34984226 - 34984022
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34984226 cctaattgaaacatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 34984127  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34984126 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactaccgactctaactttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaagaatgga 34984027  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  34984026 taatc 34984022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 53815649 - 53815853
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53815649 cctaattgattcatgttgctgtaaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 53815748  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53815749 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 53815848  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  53815849 taatc 53815853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 206
Target Start/End: Original strand, 47051316 - 47051518
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||    
T  47051316 cctaattgatccatggtgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttattaatgttttttatatcctggtcaa 47051415  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47051416 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaaagga 47051515  T
Q  204 taa 206  Q
    |||    
T  47051516 taa 47051518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8461857 - 8461656
Alignment:
Q  7 aattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaata 106  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8461857 aattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgtgcttaatgctttttatatcctgatcaaata 8461758  T
Q  107 taaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8461757 taaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataa 8461658  T
Q  207 tc 208  Q
    ||    
T  8461657 tc 8461656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12561607 - 12561403
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12561607 cctaattgattcatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattgaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 12561508  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12561507 atataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 12561408  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  12561407 taatc 12561403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25443233 - 25443029
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25443233 cctaattgattcatgtttctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 25443134  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25443133 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 25443034  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  25443033 taatc 25443029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15195675 - 15195470
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  15195675 cctaattgaaccatgttgctatgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttattgctttttatatcctgattaa 15195576  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15195575 atataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgtgctaataaacatggttagtctaggaatgga 15195476  T
Q  204 taatct 209  Q
    ||||||    
T  15195475 taatct 15195470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16185061 - 16184856
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  16185061 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctaatttttattcaattcaattgttgttaatgttttttatatcctgatcaa 16184962  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16184961 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 16184862  T
Q  204 taatct 209  Q
    ||||||    
T  16184861 taatct 16184856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 2775302 - 2775506
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2775302 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 2775401  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2775402 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 2775501  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  2775502 taatc 2775506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6435151 - 6434947
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  6435151 cctaattaattcatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaa 6435052  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6435051 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaa 6434952  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  6434951 taatc 6434947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 9392555 - 9392759
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  9392555 cctaattgaagcatattgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaa 9392654  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9392655 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgatcctagctttcgacttagatctaattgatttgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 9392754  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  9392755 taatc 9392759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 194
Target Start/End: Original strand, 35412338 - 35412526
Alignment:
Q  6 taattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaat 105  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35412338 taattgatctatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaat 35412437  T
Q  106 ataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtct 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35412438 ataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtct 35412526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 43809400 - 43809604
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  43809400 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatatcctgatcaa 43809499  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43809500 atataaacatgatttagtgtgaacgaatgactactgaccataactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaa 43809599  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  43809600 taatc 43809604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 52988226 - 52988430
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52988226 cctaattgactcatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 52988325  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52988326 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 52988425  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  52988426 taatc 52988430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17040395 - 17040192
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  17040395 cctaattgatccatgctgatgtgaaactttatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactatttatatcctgatcaa 17040296  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17040295 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 17040196  T
Q  204 taat 207  Q
    ||||    
T  17040195 taat 17040192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Original strand, 17141231 - 17141429
Alignment:
Q  6 taattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaat 105  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17141231 taattgaaacatgttattgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaat 17141330  T
Q  106 ataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17141331 ataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccataactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggat 17141429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 2778545 - 2778749
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2778545 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 2778644  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2778645 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 2778744  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  2778745 taatc 2778749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 2873385 - 2873589
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2873385 cctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 2873484  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  2873485 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaagaatgga 2873584  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  2873585 taatc 2873589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 7486391 - 7486595
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7486391 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 7486490  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7486491 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 7486590  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  7486591 taatc 7486595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19305062 - 19304858
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19305062 cctaattgatccatgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttaaatcctgatcaa 19304963  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19304962 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactattgaccctagctttcaacttagacataaatgaattgttctaatgaacatggttagtataggaatgga 19304863  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  19304862 taatc 19304858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22417207 - 22417003
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22417207 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 22417108  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22417107 atataaacataatttagtgagaacgaatgactactgaccatagcgttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 22417008  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  22417007 taatc 22417003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 24125320 - 24125524
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24125320 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 24125419  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24125420 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 24125519  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  24125520 taatc 24125524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 24128597 - 24128801
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24128597 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 24128696  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24128697 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 24128796  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  24128797 taatc 24128801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 28008443 - 28008239
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28008443 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattaaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 28008344  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28008343 atataaacatgatttagtgagaacaaataactactaaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaatatggttagtctaggaatgga 28008244  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  28008243 taatc 28008239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 32367502 - 32367298
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32367502 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttgtatcctgatcaa 32367403  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32367402 atataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 32367303  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  32367302 taatc 32367298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Original strand, 28265701 - 28265903
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28265701 cctaattgattcatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 28265800  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28265801 atataaacatgatttagtgagaacgaat---tactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatgattagtctaggaatgga 28265897  T
Q  204 taatct 209  Q
    ||||||    
T  28265898 taatct 28265903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20729020 - 20728815
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20729020 cctaattgaaccacgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatccttatcaa 20728921  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20728920 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 20728821  T
Q  204 taatct 209  Q
    ||||||    
T  20728820 taatct 20728815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 43926656 - 43926860
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43926656 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtaaatgacaatctagtttttattcaattcagttgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 43926755  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43926756 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacaaggttagtctaggaatgga 43926855  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  43926856 taatc 43926860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Original strand, 3840341 - 3840541
Alignment:
Q  8 attgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatat 107  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3840341 attgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatat 3840440  T
Q  108 aaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3840441 aaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattattctaataatcatggttagtctaggaatggataat 3840540  T
Q  208 c 208  Q
    |    
T  3840541 c 3840541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Original strand, 27091719 - 27091919
Alignment:
Q  8 attgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatat 107  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  27091719 attgattcatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagttttaattcaattcaattgttgttaatgctttttatattctgatcaaatat 27091818  T
Q  108 aaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27091819 aaacatgatttagtgagaacgaataactactgaccatagctttcgacttagacctaattaacttgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 27091918  T
Q  208 c 208  Q
    |    
T  27091919 c 27091919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 45896201 - 45896405
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45896201 cctaattgaaccatattgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 45896300  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45896301 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgagttgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 45896400  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  45896401 taatc 45896405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 48064396 - 48064204
Alignment:
Q  16 atgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatga 115  Q
    |||||| ||||||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48064396 atgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatga 48064297  T
Q  116 tttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48064296 tttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagatctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatggataatc 48064204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 49743289 - 49743089
Alignment:
Q  8 attgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatat 107  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49743289 attgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatat 49743190  T
Q  108 aaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  49743189 aaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtttaggaatggataat 49743090  T
Q  208 c 208  Q
    |    
T  49743089 c 49743089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 55035236 - 55035030
Alignment:
Q  1 aatcctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaat 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  55035236 aatcctaattgaaacatgttgttgtgaaactctatttgttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatc-tgat 55035138  T
Q  101 caaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55035137 caaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacatgattagtctaggaat 55035038  T
Q  201 ggataatc 208  Q
    ||||||||    
T  55035037 ggataatc 55035030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10106972 - 10106768
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10106972 cctaattgaaccatgttgctatgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 10106873  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10106872 atataagcatgatttagtgagaatgaatgactactgaccataactttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 10106773  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  10106772 taatc 10106768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 30690557 - 30690761
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30690557 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttactgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 30690656  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30690657 atataaatatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttataataaacagggttagtctaggaatgga 30690756  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  30690757 taatc 30690761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 41976836 - 41977040
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  41976836 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgctcttaatgctttttatatcctgatcaa 41976935  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41976936 atataaacatgatttagtgagaatgaataactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacatgattagtctatgaatgga 41977035  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  41977036 taatc 41977040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3293334 - 3293130
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3293334 cctaattgaaacatgttgatgtgaaactctatctattgtgaatgacaatctagtttttattcaactcaaatgttcttaatgctttttatatcctagtcaa 3293235  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  3293234 atataaacatgatttcgtgagaacgaatgactactaaccctagccttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatgaa 3293135  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  3293134 taatc 3293130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 17529120 - 17528934
Alignment:
Q  14 ccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacat 113  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  17529120 ccatgctgctgtgaaactctatttattgtgaatgtcaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttatattttgatcaaatataaacat 17529021  T
Q  114 gatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaat 200  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17529020 gatttagtgataacgaatgactattgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaat 17528934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 10884679 - 10884882
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||     
T  10884679 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttt-atatcccgatcat 10884777  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10884778 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 10884877  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  10884878 taatc 10884882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 16243694 - 16243898
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16243694 cctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgatttttatatcctgatcaa 16243793  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  16243794 ccgtaaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaatagggttagtctaggaataga 16243893  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  16243894 taatc 16243898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29344244 - 29344043
Alignment:
Q  8 attgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatat 107  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29344244 attgaaccatgttgctgtcaaactctatttattgtgaatgacaatccagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatat 29344145  T
Q  108 aaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 207  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  29344144 aaacatgatttagttagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattattctaataatcatggttagtctaggaatgaataat 29344045  T
Q  208 ct 209  Q
    ||    
T  29344044 ct 29344043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 30220382 - 30220178
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  30220382 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactatatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctctttatatccttatcaa 30220283  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  30220282 atataaagatgatttggtgagagtgaatgactactgaccatagctttcaacttaaacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctatgaatgga 30220183  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  30220182 taatc 30220178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 32287697 - 32287493
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | |        
T  32287697 cctaattgaaccatgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatattgacacc 32287598  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32287597 atataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactaaccatagcttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 32287498  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  32287497 taatc 32287493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 46884773 - 46884966
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||             
T  46884773 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat--------- 46884863  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  46884864 --ataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttggtctagaaatgga 46884961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 10881301 - 10881505
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||    
T  10881301 cctaattgactcatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttattagtgttttttatatcctgatcaa 10881400  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10881401 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactaaccatagctttatacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttaatctaggaatgga 10881500  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  10881501 taatc 10881505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 205
Target Start/End: Original strand, 538666 - 538848
Alignment:
Q  23 tgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtg 122  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  538666 tgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtg 538765  T
Q  123 agaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggata 205  Q
    |||| |||| |||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  538766 agaatgaattactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgtttaaataaacaggtttagtctagcaatggata 538848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 52309931 - 52309754
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgct-ttttatatcctaatca 102  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  52309931 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttttatttcctgatca 52309832  T
Q  103 aatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaata 180  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52309831 aatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgacaatagttttctacttagacctaattgaattgttcaaata 52309754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 25584508 - 25584701
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  25584508 cctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaa 25584607  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||           |||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25584608 atataaacatgatttagtga-----------tactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtccaggaatgga 25584696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 35751275 - 35751465
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  35751275 cctaattgatccatgttcctgcgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaa 35751374  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||              ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35751375 atataaa--------------aacaaatgactactgagtctagctttcaacttagacctaattgagttgttctaataaacatggttagtctaggaatgaa 35751460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 76 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23298917 - 23298785
Alignment:
Q  76 ttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttc 175  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23298917 ttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacataattgaattgttc 23298818  T
Q  176 taataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23298817 taataaacatcgttagtctaggaatggataatc 23298785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 171
Target Start/End: Original strand, 31857650 - 31857804
Alignment:
Q  17 tgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgat 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  31857650 tgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaagatgat 31857749  T
Q  117 ttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaatt 171  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  31857750 ttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaatt 31857804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Original strand, 22783413 - 22783584
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22783413 cctaattgaaacatgttgatgtgaaactctatttattgtggatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatacccttatcaa 22783512  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttc 175  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||   | ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22783513 atataaacatgatttcgtgagaatgaatgactgctgaccacaactttcaacttagacttaattgaattgttc 22783584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Original strand, 22787777 - 22787948
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22787777 cctaattgaaacatgttgatgtgaaactctatttattgtggatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatacccttatcaa 22787876  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttc 175  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||   | ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22787877 atataaacatgatttcgtgagaatgaatgactgctgaccacaactttcaacttagacttaattgaattgttc 22787948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22994060 - 22993868
Alignment:
Q  15 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 114  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| | |||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||    
T  22994060 catgttgctgtaaaactctatttattgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaatttttcttaatgttttttatatacttatcagatataaacatg 22993962  T
Q  115 atttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    | || ||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22993961 aattcgtgagagtgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggtaagtttaggaatggataatc 22993868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 66 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17531961 - 17531823
Alignment:
Q  66 aattcaattgttcttaatgcttttt-atatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaa 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17531961 aattcaattgttcttaatgcttttttatatc-tgatcaaatataaacataatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaa 17531863  T
Q  165 ttgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatct 209  Q
    ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17531862 ttgaat-----taataaacatggttagtctaggaatggataatct 17531823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Original strand, 6922567 - 6922682
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  6922567 cctaattgatctatgttgatgtgaaactctatttattatgaatgacaatttagtttttattcaattcgattgtgcttaatgctttttatatcctgatcaa 6922666  T
Q  104 atataaacatgattta 119  Q
    ||||||||||||||||    
T  6922667 atataaacatgattta 6922682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 138
Target Start/End: Original strand, 17544437 - 17544570
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  17544437 cctaattgaaacatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttt-attcaattcaattgatcttaatgttttttatatcctgatcaa 17544535  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactact 138  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  17544536 atataaacatgaattcgtgagaatgaatgactact 17544570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 208
Target Start/End: Original strand, 18542426 - 18542575
Alignment:
Q  58 ttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgactta 157  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||  || ||||| |||||    
T  18542426 ttttattcaattcaattgttcttaatgatttttatatactgatcacatataa-catgaatttgtgagaatgaatgactaatgaccataactttcaactta 18542524  T
Q  158 gacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18542525 gacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatggataatc 18542575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 118 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18645028 - 18644938
Alignment:
Q  118 tagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18645028 tagtgagaacgaatgactactgaccttagctttcgacttaaacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggacaatc 18644938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 282443 - 282362
Alignment:
Q  126 acgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 207  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  282443 acgaatgactactgaccctaacttttgacttagacctaattgaattgttcgaataaacatggttagtctaggaatggataat 282362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 208
Target Start/End: Original strand, 31549116 - 31549196
Alignment:
Q  128 gaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31549116 gaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagaaatggataatc 31549196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Original strand, 11636655 - 11636762
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  11636655 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatt-attgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgattaa 11636752  T
Q  104 atataaacat 113  Q
    ||||||||||    
T  11636753 atataaacat 11636762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 27308349 - 27308192
Alignment:
Q  49 caatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagct 148  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |    |||||| | ||| || || ||| |||||||||||||||||||| |    
T  27308349 caatctagtttt-attcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgacactatataa-cttgaattggtaagatcgaatgactactgactctagtt 27308252  T
Q  149 ttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| |||||||    
T  27308251 tatgactaagacctaattgaattgttcaaataaacaaggttaatcaaggaatagataatc 27308192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 27308845 - 27308755
Alignment:
Q  117 ttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27308845 ttagtaagatcgaatgaccactgaccctagcttacgacttagacctaattgagttgttcaaataaacatgg-tagtctaggaatagataatc 27308755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 208
Target Start/End: Original strand, 17545820 - 17545880
Alignment:
Q  148 tttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17545820 tttcaacttagacctaattgaattattcaaataaacagggttagtctaggaatggataatc 17545880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 138
Target Start/End: Original strand, 38386817 - 38386941
Alignment:
Q  14 ccatgttgttgtgaaactctattt-at-tattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaac 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||  |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||  |||||||    
T  38386817 ccatgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatatcaattcagtttt-attcaattcaattgtt-ttaatgctttttatatactgatcatgtataaac 38386914  T
Q  112 atgatttagtgagaacgaatgactact 138  Q
    |||| || ||||||| |||||||||||    
T  38386915 atgaattcgtgagaatgaatgactact 38386941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 115
Target Start/End: Original strand, 22360278 - 22360377
Alignment:
Q  15 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 114  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || | |||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||    
T  22360278 catgttgatgtgaaactcaatttcttgtgaatatcaatcta-tttatattcaattcaattgttcttaatgttttttatatactgatcatatataaacatg 22360376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 27298711 - 27298632
Alignment:
Q  129 aatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||||| ||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||| || |||| |||||||    
T  27298711 aatgattactgaccctagcttacaacttagacataattgaattgttcaaataaatacggttagtttatgaatagataatc 27298632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 18645078 - 18645025
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagt 57  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18645078 cctaattgaaccaagttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagt 18645025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 115
Target Start/End: Original strand, 22370181 - 22370280
Alignment:
Q  15 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 114  Q
    |||||||||||||||||| |||| |  | |||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||  | |||| |||||||||||    
T  22370181 catgttgttgtgaaactcaatttctcgtgaatatcaatcta-tttatattcaattcaattgttcttaatgttttttgtataatgatcacatataaacatg 22370279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 55032237 - 55032183
Alignment:
Q  128 gaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaa 182  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  55032237 gaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaactgttctaataaa 55032183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 27298816 - 27298745
Alignment:
Q  23 tgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgct-ttttatat 94  Q
    ||||||||||||||  || | |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27298816 tgtgaaactctattgcttgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttaatgcttttttatat 27298745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 6603181 - 6603385
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6603181 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 6603280  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603281 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactattgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 6603380  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  6603381 taatc 6603385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13450167 - 13449964
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13450167 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 13450068  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13450067 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgac-ccagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 13449969  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  13449968 taatc 13449964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9865118 - 9864914
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9865118 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatgtagtttttattcaattcaattgttcttattgctttttatatcctgatcaa 9865019  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9865018 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 9864919  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  9864918 taatc 9864914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 13842363 - 13842567
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13842363 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 13842462  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13842463 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctctcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaataga 13842562  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  13842563 taatc 13842567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 48645197 - 48645401
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48645197 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaaatcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 48645296  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48645297 atataaacatgatttagtgataacgaatgactactgaccatagcttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 48645396  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  48645397 taatc 48645401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9133151 - 9132947
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9133151 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttctatatcctgatcaa 9133052  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9133051 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaatggaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 9132952  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  9132951 taatc 9132947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 16165471 - 16165675
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16165471 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaa 16165570  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  16165571 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattattctaataaacatggttaatctaggaatggg 16165670  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  16165671 taatc 16165675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 45287460 - 45287256
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45287460 cctaattgattcatgttgctgtgaaactttatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 45287361  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45287360 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 45287261  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  45287260 taatc 45287256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 10468867 - 10469071
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10468867 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgtttttaatgctttttatatcctgatcaa 10468966  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10468967 atataaacatgatttcgtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaataga 10469066  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  10469067 taatc 10469071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11398417 - 11398213
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||| || |||||    
T  11398417 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttgttcagttcaattgttctgaatgttttttatattctgatcaa 11398318  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  11398317 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaagagtgga 11398218  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  11398217 taatc 11398213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3068368 - 3068163
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3068368 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaataacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 3068269  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3068268 atataatcatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaatatacatggttagtctaggaatgga 3068169  T
Q  204 taatct 209  Q
    ||||||    
T  3068168 taatct 3068163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26136519 - 26136315
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26136519 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 26136420  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26136419 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacgtaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 26136320  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  26136319 taatc 26136315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26144899 - 26144695
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26144899 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 26144800  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26144799 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacgtaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 26144700  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  26144699 taatc 26144695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37166538 - 37166334
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  37166538 cctaattgagccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaacgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaa 37166439  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37166438 atataaatatgatttagtgagaacgaacgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 37166339  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  37166338 taatc 37166334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20081109 - 20080905
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  || |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20081109 cctaattgaaacaagttgctgtgaaactctatttattgtgaatgataatctaatttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 20081010  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20081009 atataaacatgatttagtgagaacgaatggctactgaccctagctttcgacttagacctaattgagttgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 20080910  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  20080909 taatc 20080905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23225297 - 23225093
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23225297 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 23225198  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23225197 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 23225098  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  23225097 taatc 23225093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2441651 - 2441466
Alignment:
Q  23 tgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtg 122  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2441651 tgtgaaactttatttattatcaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtg 2441552  T
Q  123 agaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2441551 agaacgaaagactactgaccctagctttcgacttagacataattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 2441466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 4695247 - 4695451
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4695247 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttattaatgctttttatatcctgatcaa 4695346  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4695347 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacacatttgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 4695446  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  4695447 taatc 4695451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Original strand, 8276712 - 8276912
Alignment:
Q  8 attgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatat 107  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8276712 attgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgttaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatat 8276811  T
Q  108 aaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8276812 aaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaattgataat 8276911  T
Q  208 c 208  Q
    |    
T  8276912 c 8276912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22611998 - 22611794
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  22611998 cctaattgaaacatgttgttgcgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattttgatcaa 22611899  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22611898 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttacacctaattgaattattctaataaacatggttagtctaggaatgaa 22611799  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  22611798 taatc 22611794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 10344937 - 10345141
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| | |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10344937 cctaattgaaacatgttgctttgaaactctacttattgtgaatgataatctagtttttattccattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaa 10345036  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10345037 atataaacatgatttagtgagaacgactgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaagaatgga 10345136  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  10345137 taatc 10345141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14683835 - 14683631
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| | | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14683835 cctaattgaaccatgtttctgtgaaactttatttactgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 14683736  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14683735 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactagtgaccataacttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgca 14683636  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  14683635 taatc 14683631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 26557223 - 26557426
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26557223 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttaatgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttt-atatcctaatcaa 26557321  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  26557322 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtttaggaatgga 26557421  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  26557422 taatc 26557426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4596400 - 4596197
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4596400 cctaattgaaccatgttgctctgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 4596301  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  4596300 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactattgaccatagttttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgaa 4596201  T
Q  204 taat 207  Q
    ||||    
T  4596200 taat 4596197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Original strand, 17730541 - 17730741
Alignment:
Q  8 attgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatat 107  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17730541 attgaaccatgttgctgtgaaactctacttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgatttttatatcctgatcaaatat 17730640  T
Q  108 aaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 207  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17730641 aaacatgatttagtgaaaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataat 17730740  T
Q  208 c 208  Q
    |    
T  17730741 c 17730741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 4546592 - 4546795
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4546592 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaattacaatctagttttcattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaa 4546691  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4546692 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccattgctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 4546791  T
Q  204 taat 207  Q
    ||||    
T  4546792 taat 4546795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 33 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37415787 - 37415612
Alignment:
Q  33 tatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatg 132  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37415787 tatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgtttttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatg 37415688  T
Q  133 actactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37415687 actactaaccctaactttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 37415612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 33 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37423319 - 37423144
Alignment:
Q  33 tatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatg 132  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37423319 tatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgtttttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatg 37423220  T
Q  133 actactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37423219 actactaaccctaactttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 37423144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5242532 - 5242343
Alignment:
Q  16 atgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatga 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  5242532 atgttgttgtgaaactctatctattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatagaatataaacatga 5242433  T
Q  116 tttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggata 205  Q
    ||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5242432 tttcgtgataatgaatgactgctgaccctagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtccaagaatggata 5242343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 7227250 - 7227454
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7227250 cctaattgaaacatgttgctatgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 7227349  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  7227350 atataaacattatttcgtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgagttgttcaaataaacatggctagcctagcaatgga 7227449  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  7227450 taatc 7227454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 208
Target Start/End: Original strand, 20594007 - 20594190
Alignment:
Q  25 tgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgag 124  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  20594007 tgaaactctatttattgtgaatgacattctagttcttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaatatgatttagtgag 20594106  T
Q  125 aacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    || ||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  20594107 aatgaatgactactgaccataactttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtgtaagaatggataatc 20594190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18562923 - 18562721
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| | |  | |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  18562923 cctaattgaaccatgctgttgtaaaactctatt-attataattatctatctagtttt-attcaattcagttgttcttaatgctttttatatccttataaa 18562826  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  18562825 atataaacatgttttattgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaattaaacagggttagtctaggaatgga 18562726  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  18562725 taatc 18562721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13809904 - 13809705
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  13809904 cctaattgaaacatgttgatgtgaaactctatctattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattatgatcaa 13809805  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||| || |  |||||||| ||| |||||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13809804 atataaacatgatttcatgagaatgaatgactattggccatagctttcaactcagaccta-----attgttcaaataaacatggttagtctaggaatgga 13809710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 5796276 - 5796478
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  5796276 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactc-atctattatgaataacaatctagtttt-attcaattcaattattcttaatgttttttatatcctgatcaa 5796373  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||  |||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| | |||||||||| ||||| |    
T  5796374 atataaacatgattttgtgagaatgaatacctgctgaccatagctttcaacttagacctaattgagtttttcaaataaaaagggttagtctatgaatgaa 5796473  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  5796474 taatc 5796478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 45290787 - 45290668
Alignment:
Q  22 ttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagt 121  Q
    |||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45290787 ttgtaaaactctctttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagt 45290688  T
Q  122 gagaacgaatgactactgac 141  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  45290687 gagaacgaatgactactgac 45290668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 9273503 - 9273380
Alignment:
Q  12 atccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaac 111  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  9273503 atccatgttgctgtgaaactatatttattgtgaatgactatctagtttttattcaattcaattgttcttaatattttttatatcctgatcaaatataaac 9273404  T
Q  112 atgatttagtgagaacgaatgact 135  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  9273403 atgatttagtgagaatgaatgact 9273380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 208
Target Start/End: Original strand, 24917972 - 24918121
Alignment:
Q  58 ttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgactta 157  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||| || || || | ||||||||||||||   ||||||| |||||    
T  24917972 ttttattcaatccaattgttcttaatgctttttatatactaatcatatgt-aacatgaattcgtaagtatgaatgactactgaccaaagctttcaactta 24918070  T
Q  158 gacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||| |||||| ||||||| | |||||| || | ||||| ||||||||||||    
T  24918071 gacataattggattgttcaattaaacagggcttgtctatgaatggataatc 24918121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 200
Target Start/End: Original strand, 2090385 - 2090524
Alignment:
Q  60 ttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttaga 159  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || |||| |||||| ||||| || ||||| | ||||| |||| |||  || ||||| ||||| |    
T  2090385 ttattcaattcaattgttcttaattttttttatatactgatcatatataa-catgaatttgtgagtatgaatgcctaccgacaataactttcaacttaaa 2090483  T
Q  160 cctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaat 200  Q
     ||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  2090484 tctaattggattgttcaaataaacaggggtagtctaggaat 2090524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 74
Target Start/End: Original strand, 9080920 - 9080970
Alignment:
Q  24 gtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaatt 74  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9080920 gtgaaactctatttattgtcaatgacaatctagtttttattcaattcaatt 9080970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 9271705 - 9271669
Alignment:
Q  148 tttcgacttagacctaattgaattgttctaataaaca 184  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9271705 tttctacttagacctaattgaattgttctaataaaca 9271669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 31427929 - 31427725
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31427929 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 31427830  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31427829 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttaatctaggaatgga 31427730  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  31427729 taatc 31427725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 33310384 - 33310588
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33310384 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 33310483  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33310484 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttggacttagacctaattgaattgttctaataaacatagttagtctaggaatgga 33310583  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  33310584 taatc 33310588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 38015236 - 38015440
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  38015236 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcatgatcaa 38015335  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38015336 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgactttgacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 38015435  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  38015436 taatc 38015440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 45453592 - 45453795
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45453592 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 45453691  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45453692 atataa-catgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 45453790  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  45453791 taatc 45453795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Original strand, 45456879 - 45457084
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  45456879 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatccaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgattaa 45456978  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45456979 atataaacatgatttagttagaacgaatgactactgaccctagttttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatgga 45457078  T
Q  204 taatct 209  Q
    ||||||    
T  45457079 taatct 45457084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 16178845 - 16179049
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16178845 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 16178944  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16178945 atataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctaactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 16179044  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  16179045 taatc 16179049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 17876824 - 17877028
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  17876824 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaattctttttatatcctggtcaa 17876923  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17876924 atataaacatgatttagtgagaacgaattactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 17877023  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  17877024 taatc 17877028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25821233 - 25821029
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25821233 cctaattgaaacatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 25821134  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25821133 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcaacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 25821034  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  25821033 taatc 25821029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37937606 - 37937402
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37937606 cctaattgacacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattgaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 37937507  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37937506 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacataattgaattattctaataaacatggttagtttaggaatgga 37937407  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  37937406 taatc 37937402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 27266506 - 27266710
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  27266506 cctaattgatccatgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattaaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaa 27266605  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27266606 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactaccgaccatagatttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaagaatgga 27266705  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  27266706 taatc 27266710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 40259526 - 40259322
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40259526 cctaattgactcatgttgttgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 40259427  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40259426 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagttttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtttaggaatgga 40259327  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  40259326 taatc 40259322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 42369098 - 42368894
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42369098 cctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 42368999  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42368998 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 42368899  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  42368898 taatc 42368894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 12219513 - 12219718
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12219513 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 12219612  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatg-actactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgg 202  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12219613 atataaatatcatttagtgagaacgaatgaactactgaccctagctttcgacttaaacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgg 12219712  T
Q  203 ataatc 208  Q
    ||||||    
T  12219713 ataatc 12219718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25960076 - 25959872
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25960076 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 25959977  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25959976 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 25959877  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  25959876 taatc 25959872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 22630559 - 22630762
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22630559 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaactgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 22630658  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  22630659 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactaaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacattgttagtctaagaatgga 22630758  T
Q  204 taat 207  Q
    ||||    
T  22630759 taat 22630762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 45493546 - 45493339
Alignment:
Q  1 aatcctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaat 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45493546 aatcctaattgactcatgttgctgtaaaactctatttattgtgaatgataatttagtttttattcagttcaattgttcttaatgctttttatatcctgat 45493447  T
Q  101 caaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45493446 caaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctaactttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaat 45493347  T
Q  201 ggataatc 208  Q
    ||||||||    
T  45493346 ggataatc 45493339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 45501288 - 45501081
Alignment:
Q  1 aatcctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaat 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45501288 aatcctaattgactcatgttgctgtaaaactctatttattgtgaatgataatttagtttttattcagttcaattgttcttaatgctttttatatcctgat 45501189  T
Q  101 caaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45501188 caaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctaactttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaat 45501089  T
Q  201 ggataatc 208  Q
    ||||||||    
T  45501088 ggataatc 45501081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 208
Target Start/End: Original strand, 5666255 - 5666440
Alignment:
Q  23 tgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtg 122  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5666255 tgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtg 5666354  T
Q  123 agaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5666355 agaacgaacgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaatagttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 5666440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16791135 - 16790942
Alignment:
Q  15 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  16791135 catgttgttgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatg 16791036  T
Q  115 atttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16791035 atttaatgagaacgaatgactactgaccatagctttcggcttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 16790942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1386809 - 1386605
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  1386809 cctaattgattcatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcatgatcaa 1386710  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1386709 atataaatatgatttagtgagaacgaacgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagaaatgga 1386610  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  1386609 taatc 1386605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9189036 - 9188836
Alignment:
Q  8 attgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatat 107  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9189036 attgaaccatgatgttgtgaaactctatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatat 9188937  T
Q  108 aaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9188936 aaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagatttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatggataat 9188837  T
Q  208 c 208  Q
    |    
T  9188836 c 9188836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11348283 - 11348079
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11348283 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactttatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 11348184  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11348183 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 11348084  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  11348083 taatc 11348079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 24234813 - 24235017
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24234813 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 24234912  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24234913 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatatctttctacttagacagaattgaattgttataataaacagggttagtctaggaatgga 24235012  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  24235013 taatc 24235017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 24238085 - 24238289
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24238085 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 24238184  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24238185 atataaacatgatttagtgagaatgaatggctactgaccatatctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 24238284  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  24238285 taatc 24238289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 26365651 - 26365855
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26365651 cctaattaaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 26365750  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26365751 atataaacatgatttagtgagaacgaattactactgaccctaactttcgacttatacctaattgaatttttctaataaacatggttagtttaggaatgaa 26365850  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  26365851 taatc 26365855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Original strand, 5105448 - 5105648
Alignment:
Q  8 attgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatat 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5105448 attgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatat 5105547  T
Q  108 aaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 207  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  5105548 aaacataatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtataggaatggataat 5105647  T
Q  208 c 208  Q
    |    
T  5105648 c 5105648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 6826490 - 6826694
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6826490 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 6826589  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6826590 atataaacatgatttagtgaaaatgaatgactactgaccatagctttctacttagaaagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 6826689  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  6826690 taatc 6826694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9185808 - 9185608
Alignment:
Q  8 attgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatat 107  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9185808 attgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatat 9185709  T
Q  108 aaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  9185708 aaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatgaataat 9185609  T
Q  208 c 208  Q
    |    
T  9185608 c 9185608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 36808829 - 36808625
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36808829 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctaatttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaa 36808730  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  36808729 atataaacatgatttagtaagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgta 36808630  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  36808629 taatc 36808625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 37280064 - 37279860
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37280064 cctaattgaaccatgttgccgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 37279965  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37279964 atataaatatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 37279865  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  37279864 taatc 37279860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 40781190 - 40781394
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40781190 cctaattgaaccatgttgctctgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 40781289  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40781290 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccacagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 40781389  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  40781390 taatc 40781394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 43208273 - 43208073
Alignment:
Q  8 attgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatat 107  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  43208273 attgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttatatcctgatcaaatat 43208174  T
Q  108 aaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  43208173 aaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgaataat 43208074  T
Q  208 c 208  Q
    |    
T  43208073 c 43208073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 25870502 - 25870705
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25870502 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaattacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaa 25870601  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25870602 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagacttgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 25870701  T
Q  204 taat 207  Q
    ||||    
T  25870702 taat 25870705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 8888353 - 8888558
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaa-tgctttttatatcctaatca 102  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  8888353 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaaatgctttttatatcctgatca 8888452  T
Q  103 aatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  8888453 aatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatga 8888552  T
Q  203 ataatc 208  Q
    ||||||    
T  8888553 ataatc 8888558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25139319 - 25139115
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  25139319 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaatttaattgttcctaatgctttttatatcctgatcaa 25139220  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  25139219 atgtaaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctcataatcatggttagtctaggaatgga 25139120  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  25139119 taatc 25139115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 31586324 - 31586124
Alignment:
Q  8 attgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatat 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31586324 attgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagttttgattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatat 31586225  T
Q  108 aaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 207  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31586224 aatcatgatttagtgagaatgaatgactactaaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatggataat 31586125  T
Q  208 c 208  Q
    |    
T  31586124 c 31586124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 43723419 - 43723622
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  43723419 cctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaataacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatc-tgatcaa 43723517  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43723518 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaactgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 43723617  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  43723618 taatc 43723622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17876398 - 17876211
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17876398 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttatcgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 17876299  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttag 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17876298 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacttaattgaattgttctaatacacatggttag 17876211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 208
Target Start/End: Original strand, 3875020 - 3875208
Alignment:
Q  20 tgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgattta 119  Q
    |||||||||||| | |||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3875020 tgttgtgaaactgtgtttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcttgatcaaatataaacatgattta 3875119  T
Q  120 gtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3875120 gtgagaacgaattactaccgaccctagctttcgacttagacctaattgaatttttctaataaacatggttagtataggaatggataatc 3875208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13972281 - 13972077
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||    
T  13972281 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgattgacaatatagttattattcaattcaactgttcttaatgttttttatatcatgatcaa 13972182  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13972181 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacctaattggatttttctaaaaaacatggttagtctaggaatgga 13972082  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  13972081 taatc 13972077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 25873893 - 25874096
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  25873893 cctaattgaaccatgttggtgtgaaactctatttattgtgaattacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatattctgatcaa 25873992  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25873993 atataaatatgatttagtgagaatgaatgactactgaccataactttctacttagacagacttgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 25874092  T
Q  204 taat 207  Q
    ||||    
T  25874093 taat 25874096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 22020786 - 22020989
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | |        
T  22020786 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatt-attgtgaatgacaatctagtttttattcaactcaattgttcttaatgctttttatatattgacacc 22020884  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22020885 atataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactgaccatagcttttgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 22020984  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  22020985 taatc 22020989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 44 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 30275116 - 30274952
Alignment:
Q  44 aatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactc 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  30275116 aatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgacca 30275017  T
Q  144 tagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30275016 tagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatggataatc 30274952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 194
Target Start/End: Original strand, 10600676 - 10600854
Alignment:
Q  16 atgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatga 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10600676 atgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagattttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatga 10600775  T
Q  116 tttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtct 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10600776 tttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacatgattagtct 10600854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 189
Target Start/End: Original strand, 30926267 - 30926450
Alignment:
Q  6 taattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaat 105  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  30926267 taattgaaacatgttgttgtgaaactctatctattgtgaatgtcaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaat 30926366  T
Q  106 ataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggtt 189  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30926367 ataaacatgattttgtgagaatgaatgactgctaaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggtt 30926450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 77 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9966684 - 9966553
Alignment:
Q  77 tcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  9966684 tcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagcttcctacttagacctaattgaattgttca 9966585  T
Q  177 aataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9966584 aataaacatggttagtctaggaatggataatc 9966553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 140
Target Start/End: Original strand, 29440241 - 29440377
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29440241 cctaattgactcatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaatttaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 29440340  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactga 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29440341 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactga 29440377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 99 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17874874 - 17874765
Alignment:
Q  99 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17874874 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacttaattgaattgttctaatacacatggttagtctagga 17874775  T
Q  199 atggataatc 208  Q
    ||||||||||    
T  17874774 atggataatc 17874765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 35521746 - 35521557
Alignment:
Q  9 ttgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatata 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  | |   |  |||||||||||| | | |||||||||||||||||||  |||||||| || || | |||||    
T  35521746 ttgaaccatgttgttgtgaaactctatttcatgtgggtatcaatctagtttt-actcaattcaattgttcttaatgtattttatatactgataatatata 35521648  T
Q  109 aacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaat 200  Q
    | ||||| || ||||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35521647 a-catgaattcgtgagaatgaaagactactgatcctagctttcaacttagacctaattgatttgttcaaataaacatggttagtctaggaat 35521557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 206
Target Start/End: Original strand, 11187927 - 11188005
Alignment:
Q  128 gaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataa 206  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11187927 gaatgactactgacattaactttcaacttatacctaattgaattgtttaattaaacatggttagtctaggaatggataa 11188005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 208
Target Start/End: Original strand, 29440375 - 29440417
Alignment:
Q  166 tgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29440375 tgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 29440417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 11187816 - 11187888
Alignment:
Q  21 gttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaa-ttgttcttaatgctttttat 92  Q
    |||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  11187816 gttgtgaaacactattttatataaatgtcaatctaatttttatttaattcaatttgtttctaatgctttttat 11187888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 89505 - 89709
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  89505 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 89604  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  89605 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctaacttttgacttagacctaattgaattgttttaataaacatggttagtctaggaatgga 89704  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  89705 taatc 89709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 31072042 - 31072246
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31072042 cctaattgatccatgttgctgcgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 31072141  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  31072142 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggctggtctaggaatgga 31072241  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  31072242 taatc 31072246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11126082 - 11125878
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11126082 cctaattgaaccatgttgttgtgaaactttatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 11125983  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11125982 atataaacatgatttagtgaaaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttttaataaacatggttagtctaggaatgga 11125883  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  11125882 taatc 11125878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 11401994 - 11402198
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11401994 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 11402093  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11402094 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacagggttaatctaggaatgga 11402193  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  11402194 taatc 11402198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 24399917 - 24400121
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24399917 cctaattgactcatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 24400016  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24400017 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactaaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 24400116  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  24400117 taatc 24400121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18856411 - 18856207
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18856411 cctaattgattcatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 18856312  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18856311 atataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 18856212  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  18856211 taatc 18856207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9839781 - 9839577
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  9839781 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatccttatcaa 9839682  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9839681 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgactatagctttctacttagacctaattgaattgttcaaataaatatggttagtctaggaatgga 9839582  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  9839581 taatc 9839577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 208
Target Start/End: Original strand, 24410048 - 24410240
Alignment:
Q  15 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24410048 catgttgctgtgaaactctatttatggtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatc-tgatcaaatataaacatg 24410146  T
Q  115 atttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24410147 atttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 24410240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Original strand, 9953705 - 9953905
Alignment:
Q  8 attgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatat 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9953705 attgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttgttaatgctttttatatcctgatcaaatat 9953804  T
Q  108 aaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9953805 aaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataat 9953904  T
Q  208 c 208  Q
    |    
T  9953905 c 9953905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3597168 - 3596964
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3597168 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattttgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 3597069  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3597068 atataaacatgatttagtgagaataaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 3596969  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  3596968 taatc 3596964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 10289710 - 10289914
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10289710 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaatacatttgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 10289809  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10289810 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacaaggttagtctaggaatgga 10289909  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  10289910 taatc 10289914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22561550 - 22561346
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22561550 cctaattgaatcatgttgctgtgaaactctatttattgtgaaggacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 22561451  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22561450 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactaacaatagctttctacttagacctaattgatttgttcaaataaacatggttagtctaggaatgga 22561351  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  22561350 taatc 22561346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Original strand, 4512212 - 4512414
Alignment:
Q  6 taattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaat 105  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||    
T  4512212 taattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttatctcgtgatcaaat 4512311  T
Q  106 ataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggata 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4512312 ataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagactgaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaata 4512411  T
Q  206 atc 208  Q
    |||    
T  4512412 atc 4512414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5738469 - 5738267
Alignment:
Q  6 taattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaat 105  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  5738469 taattgatctatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaat 5738370  T
Q  106 ataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggata 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5738369 ataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggata 5738270  T
Q  206 atc 208  Q
    |||    
T  5738269 atc 5738267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 2378967 - 2379171
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2378967 cctaattgaaccatattgatgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattattcttaatgctttttatatcctgatcaa 2379066  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2379067 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacaaaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 2379166  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  2379167 taatc 2379171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 30655181 - 30655385
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  30655181 cctaattgaaccatattgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcccgatcaa 30655280  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30655281 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccataactttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 30655380  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  30655381 taatc 30655385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 208
Target Start/End: Original strand, 28230343 - 28230536
Alignment:
Q  15 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28230343 catgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattattcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatg 28230442  T
Q  115 atttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28230443 atttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgatttgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatc 28230536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 20185482 - 20185686
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20185482 cctaattgaaccatgctgcagtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgatttttatatcctgatcaa 20185581  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20185582 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 20185681  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  20185682 taatc 20185686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22150509 - 22150305
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22150509 cctaattgaaccatgctgcagtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgatttttatatcctgatcaa 22150410  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22150409 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 22150310  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  22150309 taatc 22150305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1126110 - 1125918
Alignment:
Q  16 atgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatga 115  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1126110 atgttgctgtgaaactctattcattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatga 1126011  T
Q  116 tttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1126010 tttagtgagaaggaataactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatggataatc 1125918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 44 - 208
Target Start/End: Original strand, 13946796 - 13946960
Alignment:
Q  44 aatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactc 143  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||      
T  13946796 aatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaatatgatttagtgagaacaaatgactactgacca 13946895  T
Q  144 tagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13946896 taactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 13946960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 19475740 - 19475944
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19475740 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactttattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcatttgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 19475839  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19475840 atataaatatgatttagtgagaacgaacgactactgaccatagttttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagcctaggaatgga 19475939  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  19475940 taatc 19475944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26942821 - 26942617
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  26942821 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctcgtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaa 26942722  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26942721 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttttgataaacaaggttagtctaggaatgga 26942622  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  26942621 taatc 26942617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 2846051 - 2846244
Alignment:
Q  16 atgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatga 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||    
T  2846051 atgttgttgtgaaactctatatattgtgaataacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcatgataaaatataaacatga 2846150  T
Q  116 tttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatct 209  Q
    ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2846151 tttcgtgataatgaatgactactgaccctagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatct 2846244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 11247499 - 11247703
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11247499 cctaattgaaacatgttgctgtgaaagtctatctattgtgaatgataatctagtttttattaaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 11247598  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  11247599 atataaacatgattacgtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacataattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatgaa 11247698  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  11247699 taatc 11247703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26898255 - 26898071
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26898255 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactatatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttgttatatcctgatcaa 26898156  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggt 188  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26898155 atttaaacatgatttagtgacaacgaatgactactgaccctagctttcgaattagacctaattaagttgttctaataaacatggt 26898071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14281905 - 14281703
Alignment:
Q  6 taattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  | |    ||    
T  14281905 taattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattttgaataacaatctagtttttattcaattcaattgttcttattgctttttatatattgacaccat 14281806  T
Q  106 ataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggata 205  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14281805 ataaacatgatttcgttagaatgaatgactactgaccataactttcgacttagacctaattcaattgttctaataaacatggttagtctaggaattgata 14281706  T
Q  206 atc 208  Q
    |||    
T  14281705 atc 14281703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11188302 - 11188130
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11188302 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaa 11188203  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttct 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  11188202 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttaaacagaattgaattgttct 11188130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 13004926 - 13005130
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||  | |        
T  13004926 cctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtaaatgacaatctagtttttattgaatttaattgttcttgatcctttttatatattgacacc 13005025  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  13005026 atataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactggccataactttcgacttagacctaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaataga 13005125  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  13005126 taatc 13005130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 28108175 - 28107972
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |        
T  28108175 cctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttactatgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgacact 28108076  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  28108075 atataaacatgatttagagagaatgaatgactaatgatcatagcttt-gacttagacctaattgaattgttctaataaacacggttagtcatggaatgga 28107977  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  28107976 taatc 28107972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12988510 - 12988308
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||| | |||  |||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12988510 cctaattgaaccatgttgctgtgaagctctatt-attgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaatatttcttaatgctttttatatcctgatcaa 12988413  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12988412 atataaacatgatttcgtgagaatgaatgactactgaccataactttcaacttagacataattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatgga 12988313  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  12988312 taatc 12988308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 5259674 - 5259878
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |        
T  5259674 cctaattgaaacatgttgttgtgaaactctatctattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttagatattgacacc 5259773  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||     
T  5259774 atataaacatgattctgtaagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacagggttagtctaggaatggg 5259873  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  5259874 taatc 5259878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23388478 - 23388327
Alignment:
Q  9 ttgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatata 108  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23388478 ttgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatata 23388379  T
Q  109 aacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagac 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  23388378 aacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagac 23388327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28112149 - 28111955
Alignment:
Q  6 taattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||    ||    
T  28112149 taattgaaccatgttgttgtgaaactctatttactgtgaatgacaaactagtttttattcaagtcaattgttcttaatgctttttatatattaacactat 28112050  T
Q  106 ataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatg 201  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28112049 ataaacatgatttagtgagattgaatgactactaaccatagc-ttcgacttagaccaaattgaattgatctaataaacatggttagtctaggaatg 28111955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13021639 - 13021437
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | |||  |||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||    
T  13021639 cctaattgaaccatgttgttgtgaagctctatt-attgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaatatttcttaatgctttttatatcttgatcaa 13021542  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13021541 atataaacatgatttcgtaagaatgaatgactactgatcataactttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatcgttagtctaggaatgga 13021442  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  13021441 taatc 13021437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 6512990 - 6513197
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatc-- 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||  | |        
T  6512990 cctaattgaaccatgttgttgtgac-ctctatttattgtgaatgacaatctagtttttactcaattcaattgttcttaatactttttatatattgacacc 6513088  T
Q  102 --aaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaa 199  Q
      | |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6513089 atatatataaacatgatttcatgagaatgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctacgaa 6513188  T
Q  200 tggataatc 208  Q
    || ||||||    
T  6513189 tgaataatc 6513197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 58 - 208
Target Start/End: Original strand, 24371065 - 24371216
Alignment:
Q  58 ttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgactta 157  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  24371065 ttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatataatgagaatgaatgactactgaccatagctttcaactta 24371164  T
Q  158 gacctaattgaa-ttgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24371165 gacctaattgaatttgttcaaataaaccgggttagtctaggaatggataatc 24371216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 28665650 - 28665513
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||    
T  28665650 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatattttttatatcatgatcaa 28665551  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgac 141  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28665550 ataaaaacatgatttagtgagaacgaatgactactgac 28665513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 2372104 - 2372263
Alignment:
Q  45 atgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactct 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |    |||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||       
T  2372104 atgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgttttttatatattgacaccatataaacgtgatttcgtgagaattgatgactactgac--- 2372200  T
Q  145 agctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2372201 -gctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctatgaatgaataatc 2372263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 23385045 - 23384939
Alignment:
Q  99 atcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctagga 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23385045 atcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctagga 23384946  T
Q  199 atggata 205  Q
    |||||||    
T  23384945 atggata 23384939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11192964 - 11192761
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| | |||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11192964 cctaattgaatcatattgttgtgaaactctatt-attgtgaatatcaatctagtttt-attcaatttaattgttcttaatgctttctatatgctaatcaa 11192867  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttc-gacttagacctaattgaattgttctaataaacatgg----ttagtctagga 198  Q
    ||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    |||||||||||    
T  11192866 atataaacatgatttcgtga----gaatgactactgaccataggtttcacacttagacctaattgaaatgttcaaataaacagggttaattagtctagga 11192771  T
Q  199 atggataatc 208  Q
     |||||||||    
T  11192770 ttggataatc 11192761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 28848592 - 28848782
Alignment:
Q  16 atgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatga 115  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||| |||  |||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| |||||| | |||    
T  28848592 atgttgttgtgaaactctgtttcatatgaatatcaatataggttt-attcaattcaactgttcttaatgttttttatatactgatcatatataacc-tga 28848689  T
Q  116 tttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
     || ||||||| |||||||| ||||   |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28848690 attcgtgagaatgaatgactgctgaacatagctttcaactcagacctaattgaattgttcaaataaacaaggttagtctaggaatagataatc 28848782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17106868 - 17106792
Alignment:
Q  132 gactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||||||||||  || ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17106868 gactactgaccataactttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatc 17106792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 208
Target Start/End: Original strand, 7128190 - 7128241
Alignment:
Q  157 agacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7128190 agacctaactgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 7128241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Original strand, 23007941 - 23008002
Alignment:
Q  147 ctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23007941 ctttcaacttagacctaactgaactgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatc 23008002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23780423 - 23780362
Alignment:
Q  147 ctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23780423 ctttcaacttagacctaactgaactgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatc 23780362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 7918071 - 7918020
Alignment:
Q  25 tgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgt 76  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7918071 tgaaactctatctattatgaatggcaatctagtttttattcaattcatttgt 7918020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3398 - 3187
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3398 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 3299  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgact-------ctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctag 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3298 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctac 3199  T
Q  197 gaatggataatc 208  Q
    ||||||||||||    
T  3198 gaatggataatc 3187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 67911 - 67715
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  67911 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 67812  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaat 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67811 atataaatatgatttagtgagaacgaatgactaccgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaat 67715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 292759 - 292963
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  292759 cctaattgaaacatgttgctgtgaaattctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 292858  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  292859 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgacgatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtataggaatgga 292958  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  292959 taatc 292963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 3668 - 3465
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  || |||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3668 cctaattgaaacaagttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaa-ctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 3570  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3569 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttaacctaggaatgga 3470  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  3469 taatc 3465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 450 - 246
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  450 cctaattgatccatgttgctgtgaaactatatttattattaattacaatttagtttttattcaattcaattgttcttattgctctttatatcctgatcaa 351  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  350 atataaacatgaattagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcgacttagatataattgaattgttctgataaacatggttagtctaggaatgga 251  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  250 taatc 246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 3810 - 3733
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttctta 81  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3810 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttctta 3733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 10940 - 10863
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttctta 81  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10940 cctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttctta 10863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 19131 - 19335
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19131 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 19230  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19231 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 19330  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  19331 taatc 19335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 29101 - 29305
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29101 cctaattgattcatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 29200  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29201 atataaatatgatttagtgagaacgaaagactactgaccataactttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 29300  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  29301 taatc 29305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Original strand, 19031 - 19213
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19031 cctaattgattcatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 19130  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatg 186  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19131 atataaatatgatttagtgagaacgaacgactactgaccatagctttcgacttatacctaattgaattgttctaataaacatg 19213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 62253 - 62457
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  62253 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 62352  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  62353 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 62452  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  62453 taatc 62457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 63604 - 63799
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||        ||| |||||    
T  63604 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacattctagtttttattcaattcaattgttcttaatgct--------cctgatcaa 63695  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  63696 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcga-ttagacctaattgtattgttttaataaacatggttagtctaggaatgga 63794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 59069 - 58863
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  59069 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 58970  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaa--ttgttctaataaacatggttagtctaggaatg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  58969 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactaaccctaactttcgacttagacctaattgaatttttttctaataaacatggttagtctaggaatg 58870  T
Q  202 gataatc 208  Q
    |||||||    
T  58869 gataatc 58863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8605 - 8401
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8605 cctaattgaaccatgttgatgtgaaacactatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatgctttttatatcctaatcaa 8506  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8505 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacttggttagtctaggaatgga 8406  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  8405 taatc 8401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4366 - 4187
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4366 cctaattgaaccatgttgatgtgaaacactatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattattcttaaagctttttatatcctaatcaa 4267  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaac 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4266 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaac 4187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1775 - 1730
Alignment:
Q  163 aattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1775 aattgaattattctaataaacagggttagtctaggaatggataatc 1730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 4175 - 3971
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4175 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgaaaatctagtttttattcaattcaactgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 4076  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4075 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacataattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatgga 3976  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  3975 taatc 3971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 208
Target Start/End: Original strand, 30832 - 31034
Alignment:
Q  6 taattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaat 105  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30832 taattgtttcatgttgttgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatgctttttatatcctgatcaaat 30931  T
Q  106 ataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggata 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30932 ataaatatgatttagtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgatttgttctaataaacatggttagtctaggaatgtata 31031  T
Q  206 atc 208  Q
    |||    
T  31032 atc 31034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 44 - 208
Target Start/End: Original strand, 10185 - 10349
Alignment:
Q  44 aatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactc 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10185 aatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacaggatttagtgagaacgaatgactactgaccc 10284  T
Q  144 tagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10285 tagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtcaaggaatggataatc 10349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 57976 - 57772
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||| || |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  57976 cctaatcgaaccatgttactgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgtttttaatgttttttatatcctgatcaa 57877  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  57876 atataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttctaataaaaatggttagtctagaaatgga 57777  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  57776 taatc 57772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 118821 - 118628
Alignment:
Q  15 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  118821 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatatcctgatcaaatataaacatg 118722  T
Q  115 atttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  118721 aattcgtgagaatgaatgactactgaccatagctttcaacttagacctaattgaattgttcaaataaacatggttagtctaggaatggataatc 118628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 2459 - 2255
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  2459 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctaatgtttattcaattcaattgttcttaatgctttttgcatcctgatcaa 2360  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2359 atataaatatgatttattgagaacgaattactactggccctagatttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttaatctaggaatgga 2260  T
Q  204 taatc 208  Q
    |||||    
T  2259 taatc 2255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 5782 - 5581
Alignment:
Q  8 attgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagttttt-atttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaata 106  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5782 attgaaccatgttgctgtgaaaccctatttattgtaaatgacaatctagttttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaata 5683  T
Q  107 taaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataa 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5682 taaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataatcatggttagtctaggaatggataa 5583  T
Q  207 tc 208  Q
    ||    
T  5582 tc 5581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0757 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0757
Description:

Target: scaffold0757; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 204
Target Start/End: Original strand, 5089 - 5288
Alignment:
Q  5 ctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaa 104  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  5089 ctaatagaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaactgtttttaatgctttttatatccttatcaaa 5188  T
Q  105 tataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggat 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5189 tataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattaaattgttctaataaatagggttagtctaggaatggat 5288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1785 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1785
Description:

Target: scaffold1785; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 994 - 1189
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||        ||| |||||    
T  994 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacattctagtttttattcaattcaattgttcttaatgct--------cctgatcaa 1085  T
Q  104 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgga 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1086 atataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgaccctagctttcga-ttagacctaattgtattgttttaataaacatggttagtctaggaatgga 1184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 208
Target Start/End: Original strand, 197904 - 198087
Alignment:
Q  23 tgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtg 122  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  197904 tgtgaaactct--ttattatgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaatataaacatgatttagtg 198001  T
Q  123 agaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  198002 agaatgaatgactactgaccatagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacaggaatagtctaggaatggataatc 198087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 208
Target Start/End: Original strand, 19091 - 19288
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagttttt-atttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatca 102  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||    
T  19091 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagttttttattcaattcaattgttcataatgcttgttatatcttgatca 19190  T
Q  103 aatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgg 202  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||    
T  19191 aatataa-catgatttagtgagaacgaatgactactgaccataactttcgactgagacctaattgaattgttct-------atggttagtctaggaatgg 19282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 120 - 208
Target Start/End: Original strand, 14091 - 14179
Alignment:
Q  120 gtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14091 gtgagaacgaatgactactgaccatagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 14179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 200
Target Start/End: Original strand, 9685 - 9869
Alignment:
Q  15 catgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| |||||||    
T  9685 catgttgctgtgaaactctatttcttatgaatatcaatatagtttt-attcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgatcacataaaaacatg 9783  T
Q  115 atttagtgagaacgaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaat 200  Q
    | || ||||||| |||||| || ||||  || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||    
T  9784 aattcgtgagaatgaatgattattgaccataactttcaacttagacctaattgaattgatcgaataaacagagttagtctaggaat 9869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 113
Target Start/End: Original strand, 1482 - 1591
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaa 103  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1482 cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgtatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaa 1581  T
Q  104 atataaacat 113  Q
    ||||||||||    
T  1582 atataaacat 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 110
Target Start/End: Original strand, 24559 - 24663
Alignment:
Q  6 taattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaat 105  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24559 taattgaaccatgttgttgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatcctgatcaaat 24658  T
Q  106 ataaa 110  Q
    |||||    
T  24659 ataaa 24663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 151
Target Start/End: Original strand, 1 - 91
Alignment:
Q  61 tatttaattcaattgttcttaatgctttttatatcctaatcaaatataaacatgatttagtgagaacgaatgactactgactctagctttc 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  1 tattcaattcaattgttcttaatgctttttatattctgatcaaatataaacatgatttagtgagaatgaatgactactgaccatagctttc 91  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 84
Target Start/End: Original strand, 26924 - 27004
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatg 84  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26924 cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttgtttaattcaattgttcttaatg 27004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 208
Target Start/End: Original strand, 27005 - 27049
Alignment:
Q  164 attgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27005 attgaattgttctaataaatagggttagtctaggaatggataatc 27049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 61 - 1
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatt 64  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61 cctaattgatctatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 6 - 70
Alignment:
Q  144 tagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6 tagctttctacttagacagaattgaattgttctaataaacagggttagtctaggaatggataatc 70  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 48666 - 48586
Alignment:
Q  128 gaatgactactgactctagctttcgacttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  48666 gaatgactactgaccctagcttacaactttgacctaattgaattgttcaagtaaacaaggttagcctaggaatggataatc 48586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 48743 - 48699
Alignment:
Q  49 caatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatat 94  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48743 caatctagtttt-attcaattcaattgttcttaatgctttttatat 48699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1755 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1755
Description:

Target: scaffold1755; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 208
Target Start/End: Original strand, 6 - 61
Alignment:
Q  153 acttagacctaattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  6 acttagacctaattgaattgttctaataaatagggttagtctaggaatggataatc 61  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 208
Target Start/End: Original strand, 248413 - 248458
Alignment:
Q  163 aattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatggataatc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  248413 aattgaattgttctaataaacatggttagtctaggaatgaataatc 248458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1063 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1063
Description:

Target: scaffold1063; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 208
Target Start/End: Original strand, 2385 - 2434
Alignment:
Q  161 ctaattgaattgttctaataaacatggt--tagtctaggaatggataatc 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2385 ctaactgaattgttctaataaacatggttatagtctaggaatggataatc 2434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 39
Target Start/End: Original strand, 84976 - 85011
Alignment:
Q  4 cctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttat 39  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  84976 cctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttat 85011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University