View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17338_high_18 (Length: 319)

Name: NF17338_high_18
Description: NF17338
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17338_high_18
NF17338_high_18
[»] chr7 (107 HSPs)
chr7 (9-319)||(41317287-41317597)
chr7 (9-319)||(8153347-8153657)
chr7 (9-319)||(14069682-14069996)
chr7 (9-319)||(14379710-14380024)
chr7 (9-319)||(36146260-36146571)
chr7 (9-319)||(47675985-47676299)
chr7 (9-319)||(41648862-41649173)
chr7 (19-319)||(47673803-47674106)
chr7 (9-319)||(38671073-38671385)
chr7 (9-319)||(1113662-1113972)
chr7 (9-319)||(27347822-27348137)
chr7 (11-250)||(24525356-24525596)
chr7 (19-311)||(31732827-31733124)
chr7 (9-319)||(495836-496146)
chr7 (19-319)||(26417321-26417626)
chr7 (19-319)||(48491584-48491886)
chr7 (9-319)||(4586166-4586481)
chr7 (9-319)||(48489436-48489751)
chr7 (19-319)||(18126649-18126956)
chr7 (19-319)||(31105258-31105556)
chr7 (19-319)||(43864249-43864554)
chr7 (9-302)||(19502200-19502498)
chr7 (9-319)||(25615858-25616175)
chr7 (78-318)||(12097789-12098021)
chr7 (19-319)||(30024615-30024895)
chr7 (9-319)||(29991059-29991373)
chr7 (9-319)||(35853919-35854236)
chr7 (9-304)||(23555060-23555361)
chr7 (16-310)||(23564924-23565216)
chr7 (144-319)||(2360960-2361135)
chr7 (9-316)||(31518911-31519210)
chr7 (162-319)||(22269978-22270135)
chr7 (9-319)||(4178779-4179093)
chr7 (90-298)||(2759127-2759339)
chr7 (162-319)||(3259000-3259157)
chr7 (162-318)||(6431977-6432133)
chr7 (9-319)||(25766805-25767124)
chr7 (61-312)||(39731380-39731638)
chr7 (165-319)||(29608742-29608896)
chr7 (146-319)||(34310705-34310879)
chr7 (153-310)||(2390296-2390453)
chr7 (19-304)||(4253393-4253678)
chr7 (9-319)||(23343980-23344285)
chr7 (162-316)||(48599340-48599494)
chr7 (162-319)||(4508712-4508869)
chr7 (162-319)||(8359321-8359480)
chr7 (162-292)||(32358060-32358190)
chr7 (30-290)||(36574392-36574650)
chr7 (162-319)||(4510554-4510711)
chr7 (162-319)||(4512396-4512553)
chr7 (9-319)||(48408807-48409127)
chr7 (159-281)||(6359955-6360077)
chr7 (67-319)||(43504058-43504318)
chr7 (139-231)||(30814529-30814620)
chr7 (131-318)||(24789847-24790036)
chr7 (153-319)||(20343902-20344068)
chr7 (146-319)||(22328379-22328556)
chr7 (214-319)||(31518800-31518905)
chr7 (190-303)||(5116625-5116739)
chr7 (245-316)||(24525985-24526057)
chr7 (153-319)||(6592336-6592504)
chr7 (153-319)||(18388756-18388924)
chr7 (153-319)||(18392192-18392360)
chr7 (19-178)||(40808734-40808891)
chr7 (164-319)||(3904624-3904780)
chr7 (106-319)||(26639326-26639544)
chr7 (243-319)||(4538627-4538703)
chr7 (162-248)||(18396393-18396481)
chr7 (138-238)||(1560646-1560749)
chr7 (129-255)||(5513640-5513766)
chr7 (153-319)||(6594554-6594722)
chr7 (19-80)||(12097023-12097084)
chr7 (139-200)||(20284077-20284137)
chr7 (136-199)||(47263661-47263725)
chr7 (139-194)||(55936-55990)
chr7 (134-221)||(29159786-29159871)
chr7 (176-319)||(32060342-32060488)
chr7 (134-200)||(9190057-9190122)
chr7 (159-200)||(42331000-42331041)
chr7 (203-304)||(43363518-43363622)
chr7 (139-200)||(46516359-46516419)
chr7 (156-200)||(20297607-20297651)
chr7 (153-221)||(21983285-21983352)
chr7 (139-198)||(4796718-4796776)
chr7 (134-200)||(2580373-2580438)
chr7 (139-221)||(49091649-49091729)
chr7 (159-200)||(1049299-1049340)
chr7 (136-199)||(2479320-2479385)
chr7 (159-200)||(3035969-3036010)
chr7 (159-200)||(7471983-7472024)
chr7 (159-200)||(11759372-11759413)
chr7 (159-200)||(13099477-13099518)
chr7 (159-200)||(20299705-20299746)
chr7 (159-200)||(20626283-20626324)
chr7 (159-200)||(20630174-20630215)
chr7 (159-200)||(20642593-20642634)
chr7 (159-200)||(27306233-27306274)
chr7 (139-200)||(33332499-33332559)
chr7 (139-200)||(35960804-35960864)
chr7 (159-200)||(38394231-38394272)
chr7 (159-200)||(40836746-40836787)
chr7 (159-200)||(40946573-40946614)
chr7 (159-200)||(44724824-44724865)
chr7 (159-200)||(48457898-48457939)
chr7 (156-200)||(7094460-7094504)
chr7 (139-199)||(21988896-21988955)
chr7 (166-194)||(30814505-30814533)
[»] chr1 (113 HSPs)
chr1 (9-319)||(50167028-50167338)
chr1 (30-319)||(28265428-28265717)
chr1 (19-319)||(50169073-50169373)
chr1 (9-319)||(834018-834330)
chr1 (19-319)||(3846979-3847284)
chr1 (9-319)||(45644206-45644518)
chr1 (16-319)||(28220082-28220389)
chr1 (19-319)||(28223280-28223584)
chr1 (9-319)||(3156870-3157185)
chr1 (9-319)||(40122049-40122361)
chr1 (9-319)||(196758-197071)
chr1 (9-310)||(13137829-13138129)
chr1 (19-319)||(4552507-4552800)
chr1 (35-319)||(46064923-46065206)
chr1 (19-319)||(30476305-30476609)
chr1 (9-319)||(49918355-49918670)
chr1 (19-319)||(1833527-1833818)
chr1 (16-319)||(31659243-31659551)
chr1 (9-319)||(23555119-23555428)
chr1 (9-319)||(10925228-10925542)
chr1 (16-319)||(44455165-44455473)
chr1 (9-319)||(8550632-8550950)
chr1 (9-319)||(41360919-41361230)
chr1 (9-319)||(13659199-13659499)
chr1 (9-319)||(37559713-37560032)
chr1 (31-319)||(37503427-37503717)
chr1 (19-319)||(16455627-16455926)
chr1 (9-319)||(13316200-13316515)
chr1 (52-319)||(3189335-3189607)
chr1 (52-319)||(3198152-3198424)
chr1 (52-319)||(3206991-3207263)
chr1 (9-310)||(20762686-20762988)
chr1 (143-310)||(19754509-19754676)
chr1 (162-319)||(13547095-13547252)
chr1 (162-319)||(13549006-13549163)
chr1 (9-316)||(15820315-15820616)
chr1 (162-319)||(37168302-37168460)
chr1 (20-302)||(927842-928123)
chr1 (165-319)||(11348703-11348857)
chr1 (162-319)||(47255345-47255503)
chr1 (146-310)||(19752700-19752864)
chr1 (176-319)||(29136252-29136395)
chr1 (166-319)||(7482240-7482394)
chr1 (162-319)||(193616-193773)
chr1 (166-319)||(31925717-31925870)
chr1 (153-319)||(42297971-42298138)
chr1 (162-319)||(47115176-47115335)
chr1 (61-317)||(51765400-51765666)
chr1 (166-319)||(34603581-34603735)
chr1 (153-319)||(37033068-37033236)
chr1 (112-319)||(36683695-36683892)
chr1 (11-290)||(44650022-44650297)
chr1 (105-312)||(3460707-3460915)
chr1 (138-319)||(20622217-20622401)
chr1 (180-319)||(22079322-22079461)
chr1 (16-304)||(37282552-37282841)
chr1 (138-319)||(40282382-40282565)
chr1 (153-319)||(9987207-9987373)
chr1 (162-255)||(37876772-37876865)
chr1 (138-319)||(9036422-9036604)
chr1 (92-227)||(44646743-44646875)
chr1 (182-297)||(6808479-6808595)
chr1 (138-319)||(21053963-21054146)
chr1 (23-240)||(5459989-5460206)
chr1 (187-319)||(13938143-13938273)
chr1 (162-247)||(28242382-28242467)
chr1 (99-319)||(16914118-16914338)
chr1 (251-319)||(37879006-37879074)
chr1 (126-224)||(8871032-8871130)
chr1 (139-200)||(19072915-19072976)
chr1 (139-200)||(19120805-19120866)
chr1 (93-287)||(2262911-2263106)
chr1 (19-131)||(8870586-8870698)
chr1 (153-319)||(44203636-44203804)
chr1 (196-258)||(9109459-9109522)
chr1 (139-221)||(37069756-37069838)
chr1 (139-200)||(3281694-3281756)
chr1 (139-200)||(26644946-26645008)
chr1 (139-200)||(13598386-13598446)
chr1 (139-200)||(29651799-29651859)
chr1 (142-221)||(47703965-47704042)
chr1 (196-317)||(2926516-2926637)
chr1 (139-221)||(9476249-9476329)
chr1 (206-307)||(32471478-32471579)
chr1 (139-220)||(775660-775739)
chr1 (159-200)||(12302510-12302551)
chr1 (139-200)||(16124565-16124625)
chr1 (139-200)||(47098873-47098933)
chr1 (139-200)||(47102890-47102950)
chr1 (219-309)||(12318585-12318676)
chr1 (139-221)||(13604652-13604734)
chr1 (139-221)||(21536598-21536680)
chr1 (139-221)||(27104401-27104481)
chr1 (159-200)||(2510330-2510371)
chr1 (9-58)||(3189615-3189664)
chr1 (9-58)||(3198432-3198481)
chr1 (9-58)||(3207271-3207320)
chr1 (159-200)||(6823249-6823290)
chr1 (159-200)||(10399833-10399874)
chr1 (159-200)||(13358808-13358849)
chr1 (159-200)||(15294839-15294880)
chr1 (159-200)||(17324641-17324682)
chr1 (159-200)||(27336945-27336986)
chr1 (159-200)||(28207073-28207114)
chr1 (159-200)||(28840914-28840955)
chr1 (159-200)||(28998258-28998299)
chr1 (159-200)||(29003974-29004015)
chr1 (159-200)||(31735526-31735567)
chr1 (159-200)||(39462754-39462795)
chr1 (159-200)||(50307551-50307592)
chr1 (159-200)||(51750274-51750315)
chr1 (159-200)||(51752598-51752639)
chr1 (240-306)||(35109492-35109557)
[»] chr8 (81 HSPs)
chr8 (9-319)||(40321085-40321395)
chr8 (9-319)||(5689276-5689587)
chr8 (9-319)||(1345224-1345534)
chr8 (9-318)||(30143346-30143660)
chr8 (9-319)||(43036428-43036742)
chr8 (37-319)||(18141826-18142105)
chr8 (9-319)||(15212791-15213106)
chr8 (10-319)||(6598977-6599284)
chr8 (10-319)||(6674430-6674737)
chr8 (19-319)||(27811283-27811588)
chr8 (9-319)||(3303519-3303833)
chr8 (9-319)||(4731663-4731978)
chr8 (9-319)||(1292317-1292626)
chr8 (9-319)||(33352155-33352470)
chr8 (9-310)||(12702479-12702788)
chr8 (9-319)||(41366466-41366777)
chr8 (9-319)||(19491551-19491862)
chr8 (9-319)||(17982657-17982973)
chr8 (9-304)||(42498214-42498515)
chr8 (67-319)||(30291611-30291865)
chr8 (9-319)||(34254179-34254493)
chr8 (9-319)||(34256355-34256669)
chr8 (19-304)||(1746077-1746366)
chr8 (146-319)||(40221750-40221923)
chr8 (9-310)||(44303869-44304175)
chr8 (61-319)||(4743119-4743366)
chr8 (9-286)||(10015119-10015394)
chr8 (9-319)||(19945207-19945524)
chr8 (139-319)||(9765750-9765929)
chr8 (9-304)||(31218277-31218577)
chr8 (162-319)||(42434997-42435154)
chr8 (9-246)||(4733784-4734026)
chr8 (159-319)||(10930202-10930362)
chr8 (10-319)||(18105925-18106241)
chr8 (162-319)||(4283529-4283686)
chr8 (162-319)||(18655405-18655562)
chr8 (22-319)||(8965551-8965854)
chr8 (162-319)||(11383990-11384147)
chr8 (191-319)||(44353798-44353926)
chr8 (182-319)||(40328784-40328922)
chr8 (61-319)||(2627740-2628005)
chr8 (164-319)||(3772197-3772352)
chr8 (162-312)||(4162509-4162658)
chr8 (92-248)||(3073810-3073965)
chr8 (117-290)||(7597648-7597823)
chr8 (142-257)||(8153825-8153940)
chr8 (45-118)||(3051012-3051085)
chr8 (153-319)||(25689960-25690126)
chr8 (192-302)||(1822313-1822425)
chr8 (192-302)||(1856758-1856870)
chr8 (180-290)||(11712024-11712135)
chr8 (164-319)||(3439509-3439664)
chr8 (19-144)||(8153967-8154090)
chr8 (235-319)||(41364926-41365010)
chr8 (20-233)||(29796188-29796397)
chr8 (205-312)||(10929811-10929907)
chr8 (139-221)||(26403259-26403339)
chr8 (180-269)||(32902197-32902287)
chr8 (231-303)||(3231871-3231944)
chr8 (139-200)||(4696645-4696705)
chr8 (139-200)||(5702532-5702592)
chr8 (215-302)||(10240175-10240264)
chr8 (159-200)||(22684656-22684697)
chr8 (139-221)||(31071258-31071341)
chr8 (31-101)||(4162692-4162759)
chr8 (162-224)||(15290624-15290687)
chr8 (162-224)||(15470993-15471056)
chr8 (139-221)||(19175783-19175865)
chr8 (204-303)||(30909389-30909487)
chr8 (20-153)||(32902047-32902180)
chr8 (162-224)||(42575329-42575392)
chr8 (197-240)||(38863940-38863985)
chr8 (159-200)||(3874301-3874342)
chr8 (159-200)||(4424309-4424350)
chr8 (139-221)||(7412326-7412409)
chr8 (159-200)||(14419193-14419234)
chr8 (159-200)||(14808052-14808093)
chr8 (159-200)||(18810998-18811039)
chr8 (139-200)||(23799626-23799686)
chr8 (159-200)||(27829587-27829628)
chr8 (159-200)||(30480506-30480547)
[»] chr3 (122 HSPs)
chr3 (9-319)||(29196238-29196550)
chr3 (9-319)||(44700332-44700641)
chr3 (9-319)||(31314450-31314760)
chr3 (9-319)||(39153213-39153524)
chr3 (9-319)||(760852-761164)
chr3 (9-319)||(22834855-22835165)
chr3 (19-315)||(23391771-23392068)
chr3 (9-319)||(9666318-9666630)
chr3 (9-319)||(19683736-19684052)
chr3 (9-319)||(29813068-29813381)
chr3 (9-319)||(40734503-40734817)
chr3 (9-319)||(40735388-40735702)
chr3 (9-319)||(29682364-29682676)
chr3 (9-319)||(29810873-29811188)
chr3 (9-319)||(51398819-51399134)
chr3 (19-319)||(5236315-5236619)
chr3 (9-319)||(16499035-16499334)
chr3 (19-309)||(9581297-9581593)
chr3 (9-319)||(7762270-7762586)
chr3 (9-319)||(37408463-37408779)
chr3 (19-312)||(23410190-23410485)
chr3 (67-319)||(53921414-53921666)
chr3 (9-319)||(5257992-5258308)
chr3 (19-305)||(7764483-7764775)
chr3 (48-319)||(32744335-32744598)
chr3 (10-319)||(45095169-45095482)
chr3 (9-319)||(32891108-32891410)
chr3 (139-319)||(34491217-34491397)
chr3 (9-319)||(5260171-5260487)
chr3 (159-319)||(30236130-30236290)
chr3 (124-319)||(44331550-44331744)
chr3 (9-319)||(9635972-9636290)
chr3 (162-319)||(54593709-54593866)
chr3 (166-316)||(46173365-46173515)
chr3 (138-319)||(23200119-23200301)
chr3 (73-319)||(23197850-23198102)
chr3 (159-319)||(47304256-47304416)
chr3 (165-319)||(6095608-6095762)
chr3 (159-319)||(4569957-4570118)
chr3 (153-319)||(49199465-49199633)
chr3 (162-319)||(41819528-41819686)
chr3 (180-319)||(46860479-46860618)
chr3 (153-319)||(43401797-43401965)
chr3 (138-319)||(7779984-7780166)
chr3 (153-319)||(43403740-43403908)
chr3 (153-258)||(40913359-40913464)
chr3 (138-319)||(801096-801280)
chr3 (9-230)||(2074930-2075149)
chr3 (19-152)||(21350869-21350999)
chr3 (9-223)||(27305565-27305777)
chr3 (189-316)||(36018860-36018987)
chr3 (99-290)||(33191866-33192056)
chr3 (9-148)||(51351988-51352125)
chr3 (153-319)||(6716505-6716671)
chr3 (153-319)||(54635130-54635296)
chr3 (223-319)||(31340268-31340364)
chr3 (180-307)||(55301996-55302132)
chr3 (187-319)||(4055796-4055926)
chr3 (195-319)||(51352150-51352273)
chr3 (231-304)||(5433951-5434025)
chr3 (134-319)||(4075449-4075636)
chr3 (197-309)||(35138746-35138859)
chr3 (176-319)||(45282988-45283134)
chr3 (153-319)||(3617454-3617622)
chr3 (9-103)||(9634669-9634764)
chr3 (190-312)||(20937668-20937790)
chr3 (272-319)||(26386597-26386644)
chr3 (162-319)||(25637431-25637590)
chr3 (205-319)||(5373236-5373353)
chr3 (139-200)||(25795768-25795829)
chr3 (139-221)||(8370505-8370587)
chr3 (139-221)||(27974971-27975053)
chr3 (139-221)||(27986465-27986547)
chr3 (207-304)||(54739004-54739102)
chr3 (134-200)||(1417529-1417594)
chr3 (139-200)||(30709829-30709891)
chr3 (136-221)||(33386685-33386770)
chr3 (139-200)||(21711211-21711271)
chr3 (139-200)||(48438202-48438262)
chr3 (203-302)||(25491014-25491114)
chr3 (162-224)||(10209275-10209338)
chr3 (139-221)||(32143307-32143389)
chr3 (139-200)||(1736344-1736404)
chr3 (139-200)||(18552922-18552982)
chr3 (139-200)||(37466279-37466339)
chr3 (139-200)||(40592821-40592881)
chr3 (236-310)||(4386868-4386941)
chr3 (204-290)||(1313852-1313939)
chr3 (162-224)||(4598528-4598591)
chr3 (162-224)||(10056319-10056382)
chr3 (162-224)||(10058541-10058604)
chr3 (162-224)||(10060763-10060826)
chr3 (162-224)||(10062985-10063048)
chr3 (162-224)||(10065207-10065270)
chr3 (162-224)||(10211495-10211558)
chr3 (139-221)||(16264336-16264418)
chr3 (139-221)||(27452944-27453026)
chr3 (139-221)||(39040011-39040093)
chr3 (134-200)||(3716041-3716106)
chr3 (139-221)||(6794732-6794812)
chr3 (134-200)||(26298971-26299036)
chr3 (159-200)||(458499-458540)
chr3 (159-200)||(1313624-1313665)
chr3 (159-200)||(1321694-1321735)
chr3 (159-200)||(3859742-3859783)
chr3 (159-200)||(5886413-5886454)
chr3 (159-200)||(5899886-5899927)
chr3 (159-200)||(6484575-6484616)
chr3 (159-200)||(7606589-7606630)
chr3 (159-200)||(10958324-10958365)
chr3 (159-200)||(11168316-11168357)
chr3 (159-200)||(25389120-25389161)
chr3 (159-200)||(25688161-25688202)
chr3 (159-200)||(27635659-27635700)
chr3 (159-200)||(35919116-35919157)
chr3 (159-200)||(41849274-41849315)
chr3 (159-200)||(42990519-42990560)
chr3 (159-200)||(42992485-42992526)
chr3 (159-200)||(43421416-43421457)
chr3 (139-200)||(47923945-47924005)
chr3 (159-200)||(53894058-53894099)
chr3 (160-200)||(26720762-26720802)
[»] chr2 (80 HSPs)
chr2 (9-316)||(11067313-11067620)
chr2 (9-319)||(723595-723907)
chr2 (9-319)||(29867874-29868188)
chr2 (9-316)||(11151444-11151751)
chr2 (9-319)||(34139621-34139934)
chr2 (9-312)||(33162302-33162606)
chr2 (19-319)||(14633686-14633989)
chr2 (19-319)||(36317872-36318172)
chr2 (9-319)||(42362357-42362665)
chr2 (19-319)||(36773567-36773868)
chr2 (9-319)||(38312245-38312560)
chr2 (10-319)||(17057218-17057532)
chr2 (10-319)||(17085201-17085515)
chr2 (9-230)||(39284930-39285154)
chr2 (19-319)||(2334276-2334581)
chr2 (9-317)||(36987923-36988237)
chr2 (61-319)||(11690506-11690765)
chr2 (9-319)||(45099759-45100074)
chr2 (19-319)||(14202282-14202568)
chr2 (9-304)||(6594852-6595154)
chr2 (9-319)||(5723104-5723418)
chr2 (9-319)||(36205513-36205827)
chr2 (19-304)||(4502991-4503280)
chr2 (162-319)||(45726934-45727091)
chr2 (155-319)||(42288110-42288273)
chr2 (61-319)||(30833349-30833615)
chr2 (19-319)||(11049555-11049855)
chr2 (9-305)||(4484176-4484480)
chr2 (165-319)||(1631741-1631895)
chr2 (162-319)||(35446890-35447047)
chr2 (10-303)||(26353204-26353489)
chr2 (103-287)||(17490095-17490279)
chr2 (16-319)||(13121774-13122072)
chr2 (61-305)||(32289582-32289835)
chr2 (19-200)||(2838079-2838255)
chr2 (23-152)||(24885761-24885891)
chr2 (61-200)||(1345590-1345730)
chr2 (164-290)||(24398091-24398219)
chr2 (162-319)||(33648176-33648335)
chr2 (71-300)||(7815189-7815418)
chr2 (153-319)||(6266696-6266863)
chr2 (146-319)||(17450596-17450755)
chr2 (107-311)||(42019821-42020028)
chr2 (105-248)||(28672006-28672151)
chr2 (172-269)||(7451173-7451270)
chr2 (9-312)||(12123440-12123741)
chr2 (222-316)||(24885669-24885763)
chr2 (188-309)||(30218076-30218198)
chr2 (162-319)||(13656037-13656195)
chr2 (153-319)||(12647382-12647550)
chr2 (136-221)||(28259206-28259291)
chr2 (107-149)||(41446315-41446357)
chr2 (105-302)||(7596960-7597158)
chr2 (139-200)||(14699056-14699116)
chr2 (139-200)||(20522208-20522268)
chr2 (195-303)||(42261524-42261633)
chr2 (134-221)||(10445473-10445558)
chr2 (142-221)||(13569319-13569396)
chr2 (134-221)||(34682363-34682448)
chr2 (139-221)||(8390179-8390259)
chr2 (139-221)||(34388846-34388926)
chr2 (179-225)||(42412117-42412162)
chr2 (107-153)||(43406144-43406190)
chr2 (139-200)||(31056031-31056092)
chr2 (216-304)||(34811281-34811370)
chr2 (231-304)||(41446159-41446232)
chr2 (159-200)||(45279987-45280028)
chr2 (280-319)||(39284890-39284929)
chr2 (134-200)||(39482914-39482979)
chr2 (159-200)||(3022383-3022424)
chr2 (159-200)||(5375349-5375390)
chr2 (159-200)||(6264151-6264192)
chr2 (152-221)||(8040060-8040128)
chr2 (159-200)||(11739562-11739603)
chr2 (159-200)||(13910048-13910089)
chr2 (159-200)||(19502014-19502055)
chr2 (159-200)||(23452240-23452281)
chr2 (159-200)||(27105008-27105049)
chr2 (139-195)||(36757816-36757873)
chr2 (153-221)||(10707281-10707348)
[»] chr5 (86 HSPs)
chr5 (9-319)||(538030-538340)
chr5 (9-319)||(42428279-42428593)
chr5 (9-319)||(28750504-28750818)
chr5 (9-319)||(533774-534078)
chr5 (19-319)||(32636829-32637133)
chr5 (19-319)||(42426094-42426398)
chr5 (9-319)||(8565796-8566109)
chr5 (19-318)||(13488209-13488510)
chr5 (9-319)||(33831685-33831998)
chr5 (20-304)||(37439161-37439450)
chr5 (9-319)||(39468397-39468712)
chr5 (9-312)||(31182984-31183293)
chr5 (19-319)||(13239756-13240061)
chr5 (23-319)||(16452085-16452381)
chr5 (9-319)||(30682771-30683084)
chr5 (9-319)||(25412766-25413080)
chr5 (9-319)||(13343065-13343380)
chr5 (152-319)||(38747010-38747177)
chr5 (136-319)||(28278321-28278504)
chr5 (9-319)||(30182593-30182908)
chr5 (9-319)||(5887283-5887579)
chr5 (19-230)||(19806457-19806672)
chr5 (162-319)||(213470-213628)
chr5 (9-310)||(36073891-36074196)
chr5 (162-319)||(40147266-40147423)
chr5 (9-250)||(42926965-42927212)
chr5 (105-319)||(13695639-13695854)
chr5 (162-319)||(5058052-5058207)
chr5 (61-312)||(16409486-16409746)
chr5 (62-305)||(26177900-26178152)
chr5 (128-319)||(3075630-3075821)
chr5 (23-315)||(9049217-9049500)
chr5 (9-189)||(16649683-16649863)
chr5 (157-319)||(27637613-27637776)
chr5 (138-312)||(9789203-9789381)
chr5 (138-312)||(18441627-18441805)
chr5 (143-319)||(27015536-27015704)
chr5 (62-305)||(26170791-26171032)
chr5 (153-319)||(29751156-29751323)
chr5 (190-319)||(42309969-42310098)
chr5 (180-304)||(316782-316907)
chr5 (138-319)||(29720369-29720552)
chr5 (138-319)||(29722529-29722712)
chr5 (162-309)||(33906035-33906184)
chr5 (162-304)||(16640946-16641086)
chr5 (153-319)||(22536286-22536452)
chr5 (138-319)||(10593263-10593446)
chr5 (153-319)||(25078125-25078293)
chr5 (153-319)||(25136094-25136262)
chr5 (153-319)||(40380095-40380263)
chr5 (139-221)||(10281738-10281819)
chr5 (123-310)||(30802843-30803029)
chr5 (106-304)||(3325933-3326130)
chr5 (157-221)||(4160702-4160767)
chr5 (190-309)||(10054850-10054969)
chr5 (139-221)||(9353361-9353443)
chr5 (139-221)||(36932379-36932461)
chr5 (153-319)||(40382306-40382474)
chr5 (136-221)||(15464515-15464600)
chr5 (123-258)||(30793202-30793337)
chr5 (216-309)||(35616184-35616278)
chr5 (139-200)||(17004009-17004069)
chr5 (180-304)||(10700674-10700796)
chr5 (138-200)||(28832246-28832307)
chr5 (159-200)||(27910685-27910726)
chr5 (263-319)||(19806388-19806443)
chr5 (162-224)||(16544509-16544572)
chr5 (162-224)||(16546731-16546794)
chr5 (139-221)||(11917001-11917081)
chr5 (139-200)||(14520216-14520278)
chr5 (134-200)||(31300645-31300710)
chr5 (223-269)||(42926922-42926968)
chr5 (159-200)||(2175153-2175194)
chr5 (159-200)||(2724128-2724169)
chr5 (111-152)||(9299756-9299797)
chr5 (159-200)||(10529102-10529143)
chr5 (159-200)||(18466919-18466960)
chr5 (159-200)||(21684455-21684496)
chr5 (159-200)||(24127091-24127132)
chr5 (159-200)||(25921476-25921517)
chr5 (159-200)||(27912771-27912812)
chr5 (159-200)||(34477056-34477097)
chr5 (159-200)||(34479421-34479462)
chr5 (159-200)||(40221758-40221799)
chr5 (139-200)||(42127459-42127519)
chr5 (159-199)||(20505846-20505886)
[»] chr4 (112 HSPs)
chr4 (9-319)||(46147244-46147554)
chr4 (9-319)||(26175485-26175799)
chr4 (23-319)||(36994529-36994824)
chr4 (19-319)||(36463254-36463552)
chr4 (9-319)||(48893491-48893805)
chr4 (19-315)||(52467216-52467513)
chr4 (19-319)||(12739412-12739713)
chr4 (9-311)||(12743777-12744080)
chr4 (19-312)||(47038274-47038566)
chr4 (9-319)||(45687035-45687346)
chr4 (9-319)||(5871825-5872137)
chr4 (9-319)||(9927307-9927621)
chr4 (9-319)||(34570262-34570577)
chr4 (17-319)||(5429684-5429991)
chr4 (9-319)||(54199756-54200069)
chr4 (9-319)||(56178484-56178800)
chr4 (19-319)||(29254499-29254803)
chr4 (9-319)||(37740630-37740945)
chr4 (19-319)||(52095220-52095525)
chr4 (19-319)||(31474155-31474456)
chr4 (19-304)||(5369940-5370232)
chr4 (9-304)||(48143063-48143368)
chr4 (134-311)||(12745292-12745469)
chr4 (146-319)||(27416955-27417128)
chr4 (9-304)||(6542035-6542328)
chr4 (9-316)||(4587966-4588271)
chr4 (20-319)||(37229587-37229885)
chr4 (159-319)||(54883025-54883185)
chr4 (166-319)||(8665413-8665566)
chr4 (159-319)||(26364241-26364401)
chr4 (19-319)||(52082521-52082820)
chr4 (162-316)||(41964423-41964578)
chr4 (9-319)||(13992139-13992456)
chr4 (162-319)||(8648144-8648301)
chr4 (162-319)||(40632450-40632607)
chr4 (165-318)||(41639432-41639585)
chr4 (188-319)||(12745468-12745599)
chr4 (129-319)||(3913453-3913642)
chr4 (72-319)||(29999722-29999969)
chr4 (153-319)||(2209718-2209886)
chr4 (180-319)||(12073397-12073536)
chr4 (192-319)||(12747792-12747919)
chr4 (162-319)||(6655961-6656118)
chr4 (166-319)||(50673857-50674009)
chr4 (164-319)||(379385-379541)
chr4 (188-304)||(12744079-12744195)
chr4 (180-319)||(46703505-46703645)
chr4 (165-319)||(35662446-35662600)
chr4 (9-312)||(5207698-5207999)
chr4 (94-319)||(51337069-51337294)
chr4 (153-319)||(50262697-50262864)
chr4 (171-310)||(21688263-21688402)
chr4 (123-319)||(13009410-13009594)
chr4 (198-319)||(24969117-24969238)
chr4 (138-319)||(31495296-31495480)
chr4 (72-319)||(29056363-29056610)
chr4 (10-202)||(24969787-24969982)
chr4 (193-319)||(12119543-12119671)
chr4 (162-290)||(26699447-26699577)
chr4 (107-319)||(48142327-48142541)
chr4 (93-310)||(5349924-5350140)
chr4 (105-248)||(21703784-21703928)
chr4 (180-307)||(33989861-33989989)
chr4 (236-318)||(41639269-41639351)
chr4 (19-319)||(44967691-44967992)
chr4 (233-312)||(55085442-55085521)
chr4 (153-319)||(8393399-8393566)
chr4 (153-319)||(8395608-8395775)
chr4 (194-302)||(33089900-33090009)
chr4 (99-258)||(37754902-37755063)
chr4 (197-310)||(22882791-22882905)
chr4 (197-310)||(22934455-22934569)
chr4 (72-221)||(39593648-39593796)
chr4 (134-200)||(3796568-3796634)
chr4 (30-121)||(3913784-3913872)
chr4 (139-200)||(10047367-10047427)
chr4 (203-303)||(34112838-34112939)
chr4 (139-200)||(39245982-39246042)
chr4 (197-279)||(6677514-6677597)
chr4 (202-319)||(53345222-53345340)
chr4 (139-221)||(36315258-36315338)
chr4 (139-221)||(36329467-36329547)
chr4 (139-221)||(38152468-38152548)
chr4 (178-319)||(7124906-7125048)
chr4 (159-200)||(14787432-14787473)
chr4 (159-200)||(19096172-19096213)
chr4 (190-304)||(52065617-52065730)
chr4 (142-221)||(5396700-5396779)
chr4 (139-194)||(31985688-31985744)
chr4 (162-224)||(5136165-5136228)
chr4 (162-224)||(5138390-5138453)
chr4 (231-318)||(32091485-32091571)
chr4 (139-221)||(16623322-16623402)
chr4 (159-200)||(4215595-4215636)
chr4 (139-200)||(5269240-5269300)
chr4 (159-200)||(5635479-5635520)
chr4 (159-200)||(6765133-6765174)
chr4 (159-200)||(7941612-7941653)
chr4 (159-200)||(8631422-8631463)
chr4 (159-200)||(14789431-14789472)
chr4 (159-200)||(16455531-16455572)
chr4 (159-200)||(17662248-17662289)
chr4 (159-200)||(22800865-22800906)
chr4 (136-221)||(24333794-24333877)
chr4 (159-200)||(24879279-24879320)
chr4 (159-200)||(24880741-24880782)
chr4 (159-200)||(24889085-24889126)
chr4 (231-304)||(34788850-34788923)
chr4 (159-200)||(37089375-37089416)
chr4 (159-200)||(38928180-38928221)
chr4 (159-200)||(40637363-40637404)
chr4 (114-157)||(18912454-18912498)
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (9-319)||(9182879-9183194)
chr6 (31-319)||(33211060-33211348)
chr6 (19-319)||(26954149-26954448)
chr6 (9-319)||(28137259-28137571)
chr6 (9-304)||(33160199-33160500)
chr6 (19-319)||(16569038-16569329)
chr6 (9-319)||(5413243-5413556)
chr6 (9-319)||(31404523-31404837)
chr6 (9-319)||(30834382-30834700)
chr6 (16-319)||(5406058-5406362)
chr6 (16-319)||(5410383-5410687)
chr6 (19-319)||(16452186-16452493)
chr6 (10-319)||(3038776-3039066)
chr6 (162-319)||(21588936-21589093)
chr6 (162-319)||(21593669-21593826)
chr6 (9-254)||(5408918-5409167)
chr6 (61-319)||(2171428-2171694)
chr6 (166-319)||(2972949-2973102)
chr6 (153-306)||(603085-603238)
chr6 (176-319)||(17758028-17758171)
chr6 (162-319)||(26830129-26830286)
chr6 (180-319)||(3808732-3808872)
chr6 (176-319)||(17762995-17763138)
chr6 (162-319)||(5043632-5043790)
chr6 (180-319)||(22424850-22424990)
chr6 (22-200)||(14521543-14521722)
chr6 (138-319)||(3072739-3072923)
chr6 (72-319)||(4045428-4045669)
chr6 (138-319)||(412106-412291)
chr6 (138-319)||(6097430-6097603)
chr6 (195-304)||(25073588-25073698)
chr6 (153-319)||(27647866-27648032)
chr6 (138-319)||(16554874-16555058)
chr6 (138-319)||(16578497-16578681)
chr6 (138-319)||(16616699-16616883)
chr6 (138-319)||(16631430-16631614)
chr6 (138-319)||(16653117-16653301)
chr6 (164-281)||(26800630-26800748)
chr6 (153-319)||(25421310-25421478)
chr6 (139-221)||(5757507-5757589)
chr6 (153-319)||(6027251-6027419)
chr6 (136-221)||(21356019-21356104)
chr6 (134-200)||(31979496-31979561)
chr6 (139-200)||(10077214-10077274)
chr6 (153-224)||(34167180-34167252)
chr6 (159-258)||(5273219-5273320)
chr6 (162-224)||(13154015-13154078)
chr6 (112-147)||(28840299-28840334)
chr6 (162-224)||(33342110-33342173)
chr6 (162-224)||(34164958-34165021)
chr6 (159-200)||(1230252-1230293)
chr6 (159-200)||(4816234-4816275)
chr6 (139-200)||(5017518-5017578)
chr6 (139-200)||(5572290-5572350)
chr6 (159-200)||(11983032-11983073)
chr6 (159-200)||(14458770-14458811)
chr6 (159-200)||(14507179-14507220)
chr6 (263-319)||(16567201-16567258)
chr6 (159-200)||(19704570-19704611)
chr6 (159-200)||(20915359-20915400)
chr6 (159-200)||(30728827-30728868)
chr6 (197-248)||(2908534-2908586)
chr6 (196-247)||(9572667-9572719)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (9-319)||(148960-149260)
scaffold0006 (139-200)||(5671-5731)
scaffold0006 (139-198)||(2480-2538)
scaffold0006 (139-221)||(133309-133391)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (9-319)||(20263-20578)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (9-319)||(114607-114923)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (61-313)||(434544-434801)
scaffold0002 (195-303)||(490359-490468)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (61-319)||(920-1183)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (128-319)||(11562-11757)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (61-319)||(8634-8900)
scaffold0491 (61-319)||(11060-11326)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (162-319)||(7332-7489)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (176-319)||(18024-18166)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (20-279)||(27307-27566)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (211-319)||(80338-80446)
[»] scaffold1668 (1 HSPs)
scaffold1668 (9-157)||(1350-1499)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (162-267)||(10546-10651)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (151-319)||(2598-2768)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (136-221)||(8448-8533)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (162-224)||(3731-3794)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (134-200)||(10712-10777)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (203-313)||(25065-25175)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (162-319)||(6277-6436)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (159-200)||(79429-79470)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (159-200)||(52257-52298)
scaffold0005 (159-200)||(50258-50299)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (139-221)||(45239-45321)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (139-221)||(43990-44072)
scaffold0087 (139-200)||(36881-36943)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (159-200)||(1456-1497)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (159-200)||(29414-29455)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (159-200)||(69295-69336)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 107)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 41317287 - 41317597
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41317287 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaa 41317386  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41317387 accacaagcaaaagataaagagagaggagaaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 41317486  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41317487 tccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatggattacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaatt 41317586  T
Q  309 ttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||    
T  41317587 ttcccaatctc 41317597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 8153657 - 8153347
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8153657 ggagcaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgagcacaagcaacaacaataataacaacacctagatctgatctaataatcaaagtgaaaagctcaaa 8153558  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8153557 accacaagcaaaagataaagagagaagagaaataaacacaccaaagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 8153458  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8153457 tccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaatctcacaaagaacaaccctaatttctactcatt 8153358  T
Q  309 ttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||    
T  8153357 ttcccaatctc 8153347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 14069682 - 14069996
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14069682 ggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaataataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaa 14069781  T
Q  109 accacaagcaaaatataaag--agagaagagaa--acaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 204  Q
    |||||||||| || ||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14069782 accacaagcacaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatcttggggagagattga 14069881  T
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14069882 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 14069981  T
Q  305 cattttcccaatctc 319  Q
    | |||||||||||||    
T  14069982 ctttttcccaatctc 14069996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 14379710 - 14380024
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14379710 ggagcaaaggaaagtagtaactaatttcaaagtaaacacaagcaacaataataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaa 14379809  T
Q  109 accacaagcaaaatataaag--agagaagagaa--acaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 204  Q
    |||||||||| || ||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14379810 accacaagcacaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattga 14379909  T
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14379910 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 14380009  T
Q  305 cattttcccaatctc 319  Q
    | |||||||||||||    
T  14380010 ctttttcccaatctc 14380024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 36146260 - 36146571
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaaca-caagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  36146260 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaacaataataacaacatctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctaaa 36146359  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatct 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36146360 aaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatct 36146459  T
Q  208 ctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccca 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  36146460 ctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacagaaa-ttagcttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctaccca 36146558  T
Q  307 ttttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||    
T  36146559 ttttcccaatctc 36146571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 47675985 - 47676299
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  47675985 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaa 47676084  T
Q  109 accacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 204  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47676085 accacaagcaaaagataaatggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgatccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattga 47676184  T
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  47676185 tctctccattccactatcattgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaacaaccctaatttctacc 47676284  T
Q  305 cattttcccaatctc 319  Q
    ||||||| |||||||    
T  47676285 cattttctcaatctc 47676299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 41648862 - 41649173
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41648862 ggagcaaaggaaagtagtaactaatatcaaagtgaacacaagcaataacaacaatagcagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaa 41648961  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagag--aaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatc 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41648962 accacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatc 41649061  T
Q  207 tctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  41649062 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagc-taaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccaa 41649160  T
Q  307 ttttcccaatctc 319  Q
    |||| ||||||||    
T  41649161 tttttccaatctc 41649173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 47673803 - 47674106
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  47673803 aaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagca 47673902  T
Q  119 aaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaat 214  Q
    ||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  47673903 aaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgattcagttcggtccaacttgacttaatatgggg-agagattgatctctccaat 47674001  T
Q  215 ccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47674002 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctca 47674101  T
Q  315 atctc 319  Q
    |||||    
T  47674102 atctc 47674106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 38671073 - 38671385
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || ||| ||||||  || |||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38671073 ggagcaaaggaaaatagtaacaaaaatcaaagtgaacacaagcaacgacaataatgacaacacctagatcaaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaa 38671172  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagag--aaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatc 206  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||    
T  38671173 accacaagcaaaagataaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctattttgggggatagatttatc 38671272  T
Q  207 tctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccca 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38671273 tcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagtgatacaaatgtgttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccca 38671372  T
Q  307 ttttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||    
T  38671373 ttttcccaatctc 38671385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 1113972 - 1113662
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||    
T  1113972 ggagcaaaggaaagtggtaactaatatcaaagtaaacacaagcaataacaacaataataacacctagatctaatctaggaatcaaaatgaaaaacacaaa 1113873  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1113872 accacaagcaaaagataaagggagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgactcaattcggtcaaacttgacctaatatgggggagagattgatctc 1113773  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1113772 tccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttataagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatccatt 1113673  T
Q  309 ttcccaatctc 319  Q
    ||| |||||||    
T  1113672 ttctcaatctc 1113662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 27348137 - 27347822
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || ||||||| || |||||||||||| ||||||| ||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||| | |||    
T  27348137 ggagcaaaggaaagtagcaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaa 27348038  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27348037 aaccacaagcaaaagataaagtgagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 27347938  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 303  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  27347937 atctctgcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaatcctaatttctac 27347838  T
Q  304 ccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||||||    
T  27347837 ccattttcccaatctc 27347822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 24525356 - 24525596
Alignment:
Q  11 agcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaaca-caagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaa 109  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24525356 agcaaagaaaagtagtaatcaatatcaaagcaaacaacaagcaacaacaataataacaacacctagatcaaatttagtaatcaaagtgaaaagctcaaaa 24525455  T
Q  110 ccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctct 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24525456 ccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagttccgtccaacttgacctaatcttggggagagattgatctct 24525555  T
Q  210 ccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24525556 ccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 24525596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 311
Target Start/End: Original strand, 31732827 - 31733124
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc 117  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31732827 aaagtagtaaccaatttcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacctttagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagc 31732926  T
Q  118 aaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaa 213  Q
    |||| ||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31732927 aaaagataaagggagagaagagaggaacaaactcaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatctctccaa 31733026  T
Q  214 tccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttc 311  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31733027 tccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaccaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttc 31733124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 495836 - 496146
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    |||    
T  495836 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaaacaataacaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaatagaaa 495935  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    | ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  495936 atcacaagcaagagataaagagagaaaagaaacaaacacaccaaagattgttgacccggttctgtccaacttgacctactataggggagagattgatctc 496035  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  496036 tccaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaactaccctaatttctacccatt 496135  T
Q  309 ttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||    
T  496136 ttcccaatctc 496146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 26417626 - 26417321
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26417626 aaagtagtaaccaatatcaaagtaaccacaagcaataatcaacaataacagcacctagatataatctatgaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc 26417527  T
Q  118 aaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctcca 212  Q
    |||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26417526 aaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaagaaattgttgacccagtttggtccaatttgacctaacctgggg-agagattgatctctcca 26417428  T
Q  213 atccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcc 312  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26417427 atccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcc 26417328  T
Q  313 caatctc 319  Q
    |||||||    
T  26417327 caatctc 26417321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 48491886 - 48491584
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc 117  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||  ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  48491886 aaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacgcctagatctaatataggaatcaaaatgaaaagcacaaaaccacaagc 48491787  T
Q  118 aaaatataaag--agagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatc 215  Q
    |||| ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48491786 aaaagataaagggagagaagaggaacaaacacatcaaagattgtttaccaagtttgg-ccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatc 48491688  T
Q  216 cactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaa 315  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48491687 cactatcaatgagttctttcaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaa 48491588  T
Q  316 tctc 319  Q
    ||||    
T  48491587 tctc 48491584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4586481 - 4586166
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacatt-aataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |   |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4586481 ggagcaaaggaaagtggtaaccaatttcaaagtgaacacaagcaataataaacaataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaa 4586382  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
    |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  4586381 aaccacaaacaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacacgaaagattgtcgacccagttcggtccaagttgacataatatgggggagagattg 4586282  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4586281 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaatgggttacaaaaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctac 4586182  T
Q  304 ccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||||||    
T  4586181 ccattttcccaatctc 4586166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 48489751 - 48489436
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  48489751 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacatgagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaa 48489652  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaagag--agaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
    |||||||||||||| |||||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48489651 aaccacaagcaaaagataaagggcgagaagagaggaacaaacacaccaaagattgtttacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 48489552  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  48489551 atctctccaatccactatgaatgagttattgcaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttttcaaagaacaaccctaatttctac 48489452  T
Q  304 ccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||||||    
T  48489451 ccattttcccaatctc 48489436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18126956 - 18126649
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc 117  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18126956 aaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaagaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagc 18126857  T
Q  118 aaaatataaagagaga------agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctcc 211  Q
    |||| |||||| ||||      |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  18126856 aaaagataaagggagagaaaatagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccaggtcggtcaaacttgacctagtctgggggagagattgattcctcc 18126757  T
Q  212 aatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttc 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  18126756 aatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttgaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacacattttt 18126657  T
Q  312 ccaatctc 319  Q
    ||||||||    
T  18126656 ccaatctc 18126649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 31105258 - 31105556
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31105258 aaagtagtaatcaatatcaaagtaaacacaagcaacaaca---ataacaacaccaagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 31105354  T
Q  119 aaat-ataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatcca 217  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||| |||||  | | || |||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31105355 aaaagataaggagagaagagaaacaaacagaccaagaaatgtttacccagttcggtccaacttgatctactcttggggagagatttatctctccaatcca 31105454  T
Q  218 ctatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatc 317  Q
    | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31105455 ccatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaaaaatctaatttctacccattttcccaatc 31105554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 43864554 - 43864249
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc 117  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43864554 aaagtggtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagc 43864455  T
Q  118 aaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaa 213  Q
    |||| ||||||  ||||||||||  |||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43864454 aaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccatctattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggagagagattgatctctccaa 43864355  T
Q  214 tccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 313  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  43864354 tccactatcaattagtttttacaaagagatacaaatgggttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccacttttcc 43864255  T
Q  314 aatctc 319  Q
    ||||||    
T  43864254 aatctc 43864249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 19502498 - 19502200
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19502498 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaatacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaa 19502399  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagaga----agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
    |||||||||| || |||||| ||||    |||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||| |||||| || ||||| ||||||||||    
T  19502398 accacaagcacaaaataaagggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccacttcgttccaaacttgacttactctggaggagagattg 19502299  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19502298 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaaaaacaaccttaatttcta 19502200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 25616175 - 25615858
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||    
T  25616175 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcgaagtgaaaagcacaa 25616076  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaagagagaaga-----gaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagat 201  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  25616075 aaccacaagcacaagataaagagagaagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcgcccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagat 25615976  T
Q  202 tgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttct 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  25615975 tgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagcgcacatagaacaaacctaatttct 25615876  T
Q  302 acccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25615875 acccattttcccaatctc 25615858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 78 - 318
Target Start/End: Original strand, 12097789 - 12098021
Alignment:
Q  78 ctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa 177  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  12097789 ctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgacctagttcggtccaa 12097888  T
Q  178 cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||       ||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||    
T  12097889 cttgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta-caaagagtt-------agagatacaaatgggttacaagaaattaacttcaacaagc 12097980  T
Q  278 tcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatct 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12097981 tcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatct 12098021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 30024615 - 30024895
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30024615 aaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagca 30024714  T
Q  119 aaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccac 218  Q
     ||                    |||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30024715 gaa--------------------aaacacactaaagattgttgatccagttcggtccaacttgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccac 30024794  T
Q  219 tatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatct 318  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30024795 tatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttctcaatct 30024894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29991373 - 29991059
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||| || || ||  |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||| |||    
T  29991373 ggagcaaagaaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagtaataatcaacaataacaacacctagatctaatataggaatcaaagagaaaagcacaa 29991274  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    | |||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  29991273 a-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 29991175  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  29991174 gatctctccaatccactatcaatgagttattagaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaataacaaccctaatttcta 29991075  T
Q  303 cccattttcccaatctc 319  Q
     || |||||||||||||    
T  29991074 tcc-ttttcccaatctc 29991059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 35854236 - 35853919
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  || |||||||||||||  ||    
T  35854236 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaagcaaagtgaaaagcataa 35854137  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa---gagagaagaga--aacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||| ||||||| || |||||   |||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  35854136 aac-acaagcacaagataaaagggagagaagagagaaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 35854038  T
Q  201 ttgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttc 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35854037 ttgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttc 35853938  T
Q  301 tacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  35853937 taccctttttcccaatctc 35853919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 23555361 - 23555060
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||| | |||    
T  23555361 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtaaaaaacacaa 23555262  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
     ||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  23555261 taccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacatcaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 23555162  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23555161 gatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaggtacaaaagtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 23555062  T
Q  303 cc 304  Q
    ||    
T  23555061 cc 23555060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Original strand, 23564924 - 23565216
Alignment:
Q  16 agaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaa-ccaca 114  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||| |||||    
T  23564924 agaaaagtagtgaccaatatcaaagtaaccacaagcaacaaca---ataacaaaacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaatcacaaaaaccaca 23565020  T
Q  115 agcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaa 213  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||   ||||||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  23565021 agcaaaagataaatagagaagagaaacaaacacaccaagaaatgatta--ccagttcagtccaacttgacctactctaggagagagattgatctctccaa 23565118  T
Q  214 tccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctacccatttt 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || |||| ||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  23565119 tccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaagacctaatttctacctatttt 23565216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 144 - 319
Target Start/End: Original strand, 2360960 - 2361135
Alignment:
Q  144 acacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagat 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2360960 acacaccaaaggttattgacccagttcggttcaacttgacctaatctgggggagagattgatatctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagat 2361059  T
Q  244 acaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2361060 acaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 2361135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31519210 - 31518911
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| | |||| ||||||  |||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||         
T  31519210 ggagcaaataaaaatagtaattaatatcaatgtaatcataagcagcaacaataataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagc----- 31519116  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggg-gagagattgatct 207  Q
       |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  | | || | |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31519115 ---acaagcaaaagataaagaaagaagagaaacaaacacaccaagaaatgtttatccagttcggtccaacttgacctactctggggagagagattgatct 31519019  T
Q  208 ctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccat 307  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||  | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  31519018 ctccaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaac-tagcttcaataagctcacagagaacaaacctaatttctacctat 31518920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 22270135 - 22269978
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22270135 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatcagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 22270036  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22270035 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 22269978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4179093 - 4178779
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| ||||| |||||| ||   |||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||| | |||    
T  4179093 ggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgtaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaa 4178994  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||  ||||| |||||||||    
T  4178993 a-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacctagtttggttcaaacttgacctgctctggaggagagatt 4178895  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    || || | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4178894 gaactgttcaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttcccaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 4178796  T
Q  303 cccattttcccaatctc 319  Q
    ||  |||||||||||||    
T  4178795 ccttttttcccaatctc 4178779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 90 - 298
Target Start/End: Original strand, 2759127 - 2759339
Alignment:
Q  90 tcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaagagaga----agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacct 185  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||    ||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  2759127 tcaaagttaaaagcacaaaaccataagcaaaagataaagggagagaagagagaaagaaacacaccaatgattgttgaccaagttcggtccaacttgacct 2759226  T
Q  186 aatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaag 285  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||  ||||| ||||||||    
T  2759227 aatctggggaagagattgatatctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaag 2759326  T
Q  286 aacaaccctaatt 298  Q
    |||||||||||||    
T  2759327 aacaaccctaatt 2759339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3259157 - 3259000
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3259157 acccagttcggttcaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaatgagttacaataa 3259058  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3259057 attagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctagtttctacccattttcccaatctc 3259000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 162 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6432133 - 6431977
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6432133 acccagttcggtccaacttgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 6432034  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatct 318  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6432033 attagcttcaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccattttcccaatct 6431977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 25766805 - 25767124
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | | ||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||| | |||    
T  25766805 ggagcaaagaaaagtagtaaccaataacaaagtgagcgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggtatcaaagtgaaaaacacaa 25766904  T
Q  108 aaccacaagcaaaat-ataaa---gagagaa--gagaaacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagag 199  Q
    | | ||||||||||  |||||   |||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| || ||||||||| ||||| ||||||    
T  25766905 atc-acaagcaaaaagataaaagggagagaatagagaaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggtctaaacttgacctactctggaggagag 25767003  T
Q  200 attgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatggg-ttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatt 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25767004 attgaactctccaatccactatcaatgagttcttcaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatt 25767103  T
Q  299 tctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||| |||| ||||||||    
T  25767104 tctacccttttttccaatctc 25767124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 61 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 39731638 - 39731380
Alignment:
Q  61 aataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaaag 154  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||    ||| ||||||  ||||||| |||||||||    
T  39731638 aataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaag 39731540  T
Q  155 attattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatggg 252  Q
    ||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |    
T  39731539 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagag 39731440  T
Q  253 ttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcc 312  Q
    |||||| || |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39731439 ttacaagaaattagatctgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcc 39731380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 165 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29608896 - 29608742
Alignment:
Q  165 cagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaactt 264  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||    
T  29608896 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatt 29608797  T
Q  265 agctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29608796 agcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 29608742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 146 - 319
Target Start/End: Original strand, 34310705 - 34310879
Alignment:
Q  146 acaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagata 244  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  34310705 acaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagata 34310804  T
Q  245 caaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||| ||||||| || |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34310805 caaatgtgttacaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 34310879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2390453 - 2390296
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatggg 252  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2390453 agattattcacctagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatatatgagttattacaaagagatacaaatggg 2390354  T
Q  253 ttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 310  Q
    |||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390353 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 2390296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 304
Target Start/End: Original strand, 4253393 - 4253678
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| | || ||||||||| |||||| || | ||||||||||| ||  |||||| | ||||||  ||||| ||||||||    
T  4253393 aaagtattaaccaatatcaaagtaacctcaggcaacaacaataataaaaa-acctagatctaatatagaaatcaa-gcgaaaagtacaaaagcacaagca 4253490  T
Q  119 aaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccac 218  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||||||||  | | || ||| |||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  4253491 aacgataaagagtgaagagaaacaaacacaccaagaaatgtttacctagttcggtccaaattgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccat 4253590  T
Q  219 tatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||  || |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4253591 tatcaatgagttctttccaaagagatataaaagggttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacc 4253678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 23344285 - 23343980
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||| | |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||||    
T  23344285 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatccaagtaaccacaagcaacaaca---ataacaaaacctagatttaatctacgaatcaaagtgaaaaacacaaa 23344189  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||| |||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||  | | || |||  ||| |||||||||||||||| |||  |||||||||| || ||    
T  23344188 accgcaagaaagagataaagagagaagagaaacatacacaccaagaaatgtttaccttgttcggtccaacttgacctactct--gggagagattaatttc 23344091  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaa-caaccctaatttctacccat 307  Q
    ||||||| | |||||||||||| | ||||||| |||| || ||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |    
T  23344090 tccaatctattatcaatgagttctcacaaagatatactaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctaccc-t 23343992  T
Q  308 tttcccaatctc 319  Q
    ||||| ||||||    
T  23343991 tttccaaatctc 23343980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 162 - 316
Target Start/End: Original strand, 48599340 - 48599494
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  48599340 acccagttcggtccaacttgatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagctcttccaaagagatacaaatgagttacaagaa 48599439  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaat 316  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48599440 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaat 48599494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Original strand, 4508712 - 4508869
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4508712 acccagttcggtccaacttaacctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 4508811  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4508812 attagcttcaataagctcacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctc 4508869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Original strand, 8359321 - 8359480
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatac-aaatgggttacaaa 259  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  8359321 acccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaag 8359420  T
Q  260 aacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    || |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8359421 aaattagtttaaacaagctcacaaagaaaaaccctaatttctacccattttcccaatctc 8359480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 162 - 292
Target Start/End: Original strand, 32358060 - 32358190
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32358060 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 32358159  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaacc 292  Q
     |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  32358160 attagcttcaacaagctcacaaagcacaacc 32358190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 290
Target Start/End: Original strand, 36574392 - 36574650
Alignment:
Q  30 caatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaaga 129  Q
    |||||||||||||| | || || ||||||  ||||||||  | |||||||||||||  |||||| ||||||| | |||||||||||| |||| |||||||    
T  36574392 caatatcaaagtaatctcaggccacaacaacaataacaaact-tagatctaatctaggaatcaa-gtgaaaaacacaaaaccacaagaaaaagataaaga 36574489  T
Q  130 gagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagt 229  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  | | || |||||||||||||||| |||||||| |||  ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36574490 gagaagaaaaacaaacacatcaagaaatgtttacccagtttggtccaaattgacctactct-agggatggattgatctctccaaaccactatcaatgagt 36574588  T
Q  230 t-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaa 290  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  36574589 tctttacaaagagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaa 36574650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Original strand, 4510554 - 4510711
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  4510554 acccagtacggtccaacttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttacaagaa 4510653  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4510654 attagcttcaataaactcacaaagaacaaccttaatttctacccattttccaaatctc 4510711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Original strand, 4512396 - 4512553
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  4512396 acccagtacggtccaacttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatcaatgagttcttataaagagatacaaatgggttacaagaa 4512495  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4512496 attagcttcaataaactcacaaagaacaaccttaatttctacccattttccaaatctc 4512553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 48409127 - 48408807
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| ||||| |||||| |   ||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||    
T  48409127 ggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggtatcaaagtgaaaagcacaa 48409028  T
Q  108 aaccacaagcaaaat-ataaa---gagagaagaga--aacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagag 199  Q
    | | ||||||||||  |||||   |||||||||||  |||||||||||||| | ||| || |||||||| |||| || |||||| || ||||| ||||||    
T  48409027 atc-acaagcaaaaagataaaagggagagaagagagaaacaaacacaccaagaaattgttcacccagttcggtctaaacttgacatactctggaggagag 48408929  T
Q  200 attgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaa-gagatacaaatggg-ttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaat 297  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||  ||||    
T  48408928 attaaactctccaatccactatcaatgagttatttcaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagtttacaaagaacaacattaat 48408829  T
Q  298 ttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  48408828 ttctaccctttttcccaatctc 48408807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 159 - 281
Target Start/End: Original strand, 6359955 - 6360077
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaa 258  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6359955 ttgacccagttcgatccaacttgacctaatatggggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaa 6360054  T
Q  259 aaacttagctttgacaagctcac 281  Q
     || |||||||  ||||||||||    
T  6360055 gaaattagcttcaacaagctcac 6360077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 319
Target Start/End: Original strand, 43504058 - 43504318
Alignment:
Q  67 aacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaa-agattat 159  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||    ||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||| |    
T  43504058 aacagctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgt 43504156  T
Q  160 tgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatac-aaatgggttac 256  Q
    | |||||||| | ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||    
T  43504157 tcacccagttcgatccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttac 43504256  T
Q  257 aaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    || || |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43504257 aagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 43504318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 139 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30814620 - 30814529
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttt 231  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30814620 aacaaacacaccaaa-attgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttt 30814529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 131 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 24790036 - 24789847
Alignment:
Q  131 agaagagaaacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgag 228  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| |||    
T  24790036 agaagaaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatagtactctccaatccactatcaaagag 24789937  T
Q  229 tttttac-aaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatct 318  Q
    ||||||| |||| ||||||||   ||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24789936 tttttacaaaagggatacaaa-atgttacaagaaattagctttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttaccc-ttttcccaatct 24789847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 20344068 - 20343902
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtttttac-aaagagatacaaatg 250  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||      
T  20344068 agattgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa-a 20343970  T
Q  251 ggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20343969 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 20343902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 146 - 319
Target Start/End: Original strand, 22328379 - 22328556
Alignment:
Q  146 acaccaaagattattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagat 243  Q
    |||||||| | |||| |||||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||  || |||||||||    
T  22328379 acaccaaaaaatatttacccagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatctctcaaatccactattaatgacttccttgcaaagagat 22328478  T
Q  244 acaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatt-ttcccaatctc 319  Q
    ||||| | ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||    
T  22328479 acaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttctaacctttcttcccaatctc 22328556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 214 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 31518905 - 31518800
Alignment:
Q  214 tccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 313  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31518905 tccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaactagcttcaataagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttccc 31518806  T
Q  314 aatctc 319  Q
    ||||||    
T  31518805 aatctc 31518800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5116739 - 5116625
Alignment:
Q  190 tgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac 288  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| || ||| |||  |||| ||  | ||||||    
T  5116739 tgggggagagatttatctctccaattcactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggtttacaataaattatcttcaacaaactatccaagaac 5116640  T
Q  289 aaccctaatttctac 303  Q
    || ||||||||||||    
T  5116639 aaacctaatttctac 5116625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 316
Target Start/End: Original strand, 24525985 - 24526057
Alignment:
Q  245 caaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaat 316  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24525985 caaatgagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttcccaat 24526057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Original strand, 6592336 - 6592504
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttac-aaagagatacaaa 248  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||    
T  6592336 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 6592434  T
Q  249 tgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
      |||||||| || ||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6592435 gaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccca-tttcccaatctc 6592504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Original strand, 18388756 - 18388924
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttac-aaagagatacaaa 248  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||    
T  18388756 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 18388854  T
Q  249 tgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
      |||||||| || ||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18388855 gaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc 18388924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Original strand, 18392192 - 18392360
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttac-aaagagatacaaa 248  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||    
T  18392192 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 18392290  T
Q  249 tgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
      |||||||| || ||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18392291 gaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc 18392360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 40808891 - 40808734
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||  | |||| | |||||||  |  ||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  40808891 aaagtagtaacaaatatcaaagtattctcaagcaacaacaataataacag-acctaggtttaatctaggacccaa-gtgtaaaacacaaaaccacaagca 40808794  T
Q  119 aaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaac 178  Q
    ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||| || ||||| ||||||||    
T  40808793 aaagatatagagagaaaagaaacaaacacaccaaaaaatatttactcagttcggtccaac 40808734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 319
Target Start/End: Original strand, 3904624 - 3904780
Alignment:
Q  164 ccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||| ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  3904624 ccagttcggtccaacaatgacctactctgagggagagattgatctctctgat-cactatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaagtgttacaagaa 3904722  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||  ||  | | |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3904723 attacattcaataggctctcaaagaacaaaacctaatttcta-ccattttcccaatctc 3904780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 26639544 - 26639326
Alignment:
Q  106 aaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaac-ttgacctaatctgggggagagattga 204  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| || | |||||| ||| ||||  |||| || | ||| |||||||||||    
T  26639544 aaaaccacaagcaaaaggtaaagagataagagaaacaaacgcaccaagaattttttagccagttcggtacaacaatgacatactatggaggagagattga 26639445  T
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaa----agagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaattt 299  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||| |||||||    | | ||||||| ||||||||| || ||| | |  |||| ||| | |||||||  ||||||||    
T  26639444 tctctctaatccattatcaaagagttatttacaatgatatatatacaaaagggttacaagaaattaacatcaacaaactctccaagaacatacctaattt 26639345  T
Q  300 ctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||| |||||||| |||||||    
T  26639344 cta-ccattttcacaatctc 26639326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 319
Target Start/End: Original strand, 4538627 - 4538703
Alignment:
Q  243 tacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  | ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4538627 tacaaatgggttacaagaaattagcttaaaaaatttcataaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctc 4538703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18396481 - 18396393
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaac-ttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaa 248  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  18396481 acccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatcaatgaattctttataaagagatacaaa 18396393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 238
Target Start/End: Original strand, 1560646 - 1560749
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttttta 234  Q
    ||||||| ||||||| |||||  | |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  1560646 aaacaaatacaccaagagattggttacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 1560745  T
Q  235 caaa 238  Q
    ||||    
T  1560746 caaa 1560749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 255
Target Start/End: Original strand, 5513640 - 5513766
Alignment:
Q  129 agagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgag 228  Q
    |||||||||||||||||||  |||  | | || ||||||||  |||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| || | ||||||||    
T  5513640 agagaagagaaacaaacacgtcaagaaatgtttacccagttcagtccaaattgacctactctggaggtgagattgat-tctccaattcagtgtcaatgag 5513738  T
Q  229 tt-tttacaaagagatacaaatgggtta 255  Q
    || |||||||||||||| ||| ||||||    
T  5513739 ttctttacaaagagatataaaagggtta 5513766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Original strand, 6594554 - 6594722
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttac-aaagagatacaaa 248  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||    
T  6594554 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 6594652  T
Q  249 tgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
      |||||||| || ||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6594653 gaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc 6594722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 12097023 - 12097084
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatcta 80  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  12097023 aaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaatcaacaacaataacaacaacacctagatcta 12097084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 20284077 - 20284137
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20284077 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 20284137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 199
Target Start/End: Original strand, 47263661 - 47263725
Alignment:
Q  136 agaaacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagag 199  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  47263661 agaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagag 47263725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 194
Target Start/End: Original strand, 55936 - 55990
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggg 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  55936 aacaaacacaccaa-gattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg 55990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 221
Target Start/End: Original strand, 29159786 - 29159871
Alignment:
Q  134 agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||   | ||||||||||||||||    
T  29159786 agaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagaga-gcagctctccaatccactat 29159871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 319
Target Start/End: Original strand, 32060342 - 32060488
Alignment:
Q  176 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttacaaa---gagatacaaatgggttacaaaaacttagcttt 270  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   | ||||| ||  |||||||| || ||||| ||    
T  32060342 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaaggggatac-aagaggttacaagaaattagc-tt 32060439  T
Q  271 gacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  32060440 gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc 32060488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 9190122 - 9190057
Alignment:
Q  134 agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  9190122 agaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagaga 9190057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 42331000 - 42331041
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42331000 ttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagaga 42331041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 304
Target Start/End: Original strand, 43363518 - 43363622
Alignment:
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaa--gagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaattt 299  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||| || |||| ||  |||||||| | |||||||| ||||||||    
T  43363518 gatctatccacttcactatcaatgagttatttacaaatagagatacaaaagagttacaataaattagtttcaacaagctctccaagaacaaacctaattt 43363617  T
Q  300 ctacc 304  Q
    |||||    
T  43363618 ctacc 43363622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 46516419 - 46516359
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  46516419 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagaga 46516359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20297651 - 20297607
Alignment:
Q  156 ttattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20297651 ttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 20297607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 221
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983352
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 21983352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4796776 - 4796718
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggaga 198  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  4796776 aacaaacacaccaa-gattgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggaga 4796718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 200
Target Start/End: Original strand, 2580373 - 2580438
Alignment:
Q  134 agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  2580373 agaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagaga 2580438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Original strand, 49091649 - 49091729
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||    
T  49091649 aacaaacgcaccaa-gattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagaga-gcaactctccaatccactat 49091729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 1049299 - 1049340
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  1049299 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 1049340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 199
Target Start/End: Original strand, 2479320 - 2479385
Alignment:
Q  136 agaaacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatct-gggggagag 199  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||||| |||||||||    
T  2479320 agaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctagggggagag 2479385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3036010 - 3035969
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3036010 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 3035969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 7471983 - 7472024
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7471983 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 7472024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11759413 - 11759372
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11759413 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 11759372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 13099477 - 13099518
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13099477 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 13099518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20299746 - 20299705
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20299746 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 20299705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20626324 - 20626283
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20626324 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 20626283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20630215 - 20630174
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20630215 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 20630174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20642634 - 20642593
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20642634 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 20642593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 27306233 - 27306274
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  27306233 ttgacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagaga 27306274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 33332559 - 33332499
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||||    
T  33332559 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagaga 33332499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 35960804 - 35960864
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  35960804 aacaaacacaccaa-gattgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagaga 35960864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 38394272 - 38394231
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38394272 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 38394231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 40836746 - 40836787
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40836746 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 40836787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40946614 - 40946573
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40946614 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 40946573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 44724865 - 44724824
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  44724865 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 44724824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 48457939 - 48457898
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  48457939 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 48457898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 200
Target Start/End: Original strand, 7094460 - 7094504
Alignment:
Q  156 ttattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7094460 ttattgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagaga 7094504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 199
Target Start/End: Original strand, 21988896 - 21988955
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagag 199  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  21988896 aacaaacacaccga-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagag 21988955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 30814533 - 30814505
Alignment:
Q  166 agtttggtccaacttgacctaatctgggg 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30814533 agtttggtccaacttgacctaatctgggg 30814505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 113)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 50167028 - 50167338
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  50167028 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagaaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagttcaaa 50167127  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50167128 accacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgacctagttcggtccaacttgagctaatctgggggagagattgatctc 50167227  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  50167228 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaataacaaccctaatttctactaatt 50167327  T
Q  309 ttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||    
T  50167328 ttcccaatctc 50167338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 30 - 319
Target Start/End: Original strand, 28265428 - 28265717
Alignment:
Q  30 caatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaaga 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  28265428 caatatcaaagtgaacacaagcaacaacaataataacaacatctagatctaatctagtaatcaaagtaaaaagctcaaaaccacaaccaaaagataaaga 28265527  T
Q  130 gagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28265528 gagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagt 28265627  T
Q  230 ttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28265628 tcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacctattttcccaatctc 28265717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 50169073 - 50169373
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50169073 aaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaacaacaataataacaacacctatatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 50169172  T
Q  119 aaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  50169173 aaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgatccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccac 50169272  T
Q  219 tatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatct 318  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50169273 tatcaatgagtacttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatct 50169372  T
Q  319 c 319  Q
    |    
T  50169373 c 50169373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 834018 - 834330
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  834018 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaataacaacaataacaacaccaagatctaatctgggaatcaaagtgaaaagctcaaa 834117  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagag--aaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatc 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  834118 accacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagagatagatc 834217  T
Q  207 tctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  834218 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctatcca 834317  T
Q  307 ttttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||    
T  834318 ttttcccaatctc 834330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 3846979 - 3847284
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataa---caacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaa 115  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3846979 aaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaataataataacaacacctagatctaatatagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaa 3847078  T
Q  116 gcaaaatataaagagagaagag--aaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaa 213  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3847079 gcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctggggaagagatggatctctccaa 3847178  T
Q  214 tccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3847179 tccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaaaaatttagcttaaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 3847278  T
Q  314 aatctc 319  Q
    ||||||    
T  3847279 aatctc 3847284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 45644206 - 45644518
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaaca-caagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  45644206 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaacaataataacaacatctagatctaatctagcaatcaaagtgaaaagctcaa 45644305  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatct 207  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45644306 aaccacaaacaaaagataaagagagaagagaaacaagcacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagatattgatct 45644405  T
Q  208 ctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||    
T  45644406 ctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttgcaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctatcca 45644505  T
Q  307 ttttcccaatctc 319  Q
    ||||| |||||||    
T  45644506 ttttctcaatctc 45644518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 16 - 319
Target Start/End: Original strand, 28220082 - 28220389
Alignment:
Q  16 agaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaa 115  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28220082 agaaaattagtaaccaatattaaagtgaacacaaacaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaa 28220181  T
Q  116 gcaaaatataaag--agagaagagaa--acaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctcc 211  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28220182 gcaaaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctcc 28220281  T
Q  212 aatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttc 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28220282 aatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttc 28220381  T
Q  312 ccaatctc 319  Q
    | ||||||    
T  28220382 cgaatctc 28220389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 28223280 - 28223584
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  28223280 aaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagca 28223379  T
Q  119 aaatataaag--agagaagagaa--acaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaat 214  Q
    ||| ||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28223380 aaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaat 28223479  T
Q  215 ccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28223480 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcagaaagatcaaccataatttctacccattttccca 28223579  T
Q  315 atctc 319  Q
    |||||    
T  28223580 atctc 28223584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3157185 - 3156870
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  3157185 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaa 3157086  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3157085 aaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattg 3156986  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3156985 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctac 3156886  T
Q  304 ccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||| |||||||    
T  3156885 ccattttctcaatctc 3156870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 40122049 - 40122361
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40122049 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatctaagtgaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaagctcaaa 40122148  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40122149 accacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctc 40122248  T
Q  209 tccaatccac--tatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccca 306  Q
    || |||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||| || || |||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  40122249 tctaatccactatatcaaagagttcttacaaagtgatacaaatgagttataagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttcgaccca 40122348  T
Q  307 ttttcccaatctc 319  Q
    |||| ||||||||    
T  40122349 tttttccaatctc 40122361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 196758 - 197071
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  196758 ggagcaaaggaaaatagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaataataacaacacctacatctaatctagtaatcaaagtgagaagctcaaa 196857  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagaga--agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatct-gggggagagattgat 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  196858 accacaagcaaaagataaagagagaagagagaaaaaaacacaccaaagattgttgatccagttcggtccaacttgacctaatctggggggagagataaat 196957  T
Q  206 ctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  196958 ctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgagttacaagaaattaacttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacca 197057  T
Q  306 attttcccaatctc 319  Q
    |||||| |||||||    
T  197058 attttctcaatctc 197071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 13137829 - 13138129
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13137829 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaacctcaaa 13137928  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  13137929 accacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacatcaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctactctaggggagagattgctctc 13138028  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  13138029 ttcaatccactatcaatgtgttcttacaaagagatgcaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacga-cctaatttctatccatt 13138127  T
Q  309 tt 310  Q
    ||    
T  13138128 tt 13138129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 4552507 - 4552800
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4552507 aaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagtaacaacaataataacaacacatagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 4552606  T
Q  119 aaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccac 218  Q
    ||| |||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  4552607 aaagataaaga-------gaaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgagggagagattgatctctccaatccat 4552699  T
Q  219 tatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatct 318  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4552700 tatcaatgagttcttacaaagggatacaaaggggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaggacaaacctaatttctacccattttctcaatct 4552799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 35 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 46065206 - 46064923
Alignment:
Q  35 tcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaagagagaa 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46065206 tcaaagtaaatacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctactaat-aatgtgaaaggctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaa 46065108  T
Q  135 gagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttttta 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  46065107 gagaaacaaacacaccaaagattgtttacccagttcgatccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatgaatgagttctta 46065008  T
Q  235 caaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||  || |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  46065007 caaagagatacacatgagttacaagaaattagcttcaacgagctcacaaagaacaaacctaatttttatccattttcccaatctc 46064923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 30476305 - 30476609
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30476305 aaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacttagacctaatctaataatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagta 30476404  T
Q  119 aaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaat 214  Q
    ||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || ||||| |||||||||||| ||||||    
T  30476405 aaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttaacctcatatggggtagagattgatctgtccaat 30476504  T
Q  215 ccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 314  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30476505 ccagtatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaataaattatcttcaacaagttcataaagaacaaccctaatttctacctattttccca 30476604  T
Q  315 atctc 319  Q
    |||||    
T  30476605 atctc 30476609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 49918670 - 49918355
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || ||| ||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  49918670 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctatatctaatctaggaatcaaaatgaaaagcacaa 49918571  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
    | |||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49918570 atccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattg 49918471  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49918470 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctac 49918371  T
Q  304 ccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||| |||||||    
T  49918370 ccattttctcaatctc 49918355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 1833818 - 1833527
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1833818 aaagtcgtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaactacaagca 1833719  T
Q  119 aaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccac 218  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||         ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1833718 aaagataaagagagaaaataaacaaacacaccaaagatt---------gtttggtccaatttgacctaatctggtggagagattgatctctccaatccac 1833628  T
Q  219 tatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatct 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  | |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1833627 tatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaatttagcttcaatagattcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatct 1833528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 31659551 - 31659243
Alignment:
Q  16 agaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccaca 114  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| || ||  |||||||||| || |||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| |    
T  31659551 agaaaagtagtaaccaatatcaaaatgaacacaagcaataatcaacaataacaacaccttgatctaatctaggaatcaaagtaaaaagcacaaaaccata 31659452  T
Q  115 agcaaaatataaa----gagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctc 210  Q
    ||||||| |||||    |||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31659451 agcaaaagataaaaggagagaaaagaggaataaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgagggagagattgatctctc 31659352  T
Q  211 caatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 310  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31659351 caatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacagccctaatttctacccatttt 31659252  T
Q  311 cccaatctc 319  Q
     ||||||||    
T  31659251 tccaatctc 31659243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 23555119 - 23555428
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  23555119 ggagcaaagaaaagtagtaatcaatgtcaaagtaaacacaagcaacaacaacaataacaacacctagatctaatttaggaatcatagtgaaaagctcaaa 23555218  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | | || || ||||| | |||||||||||||| | | ||||||||||||| |||    
T  23555219 accacaagcaaaacataaagagagaagagaaacaaacgcaccaagaaatgtttactcagttcgatccaacttgacctactat-ggggagagattgaactc 23555317  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23555318 tccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttataagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 23555417  T
Q  309 ttcccaatctc 319  Q
    || ||||||||    
T  23555418 tttccaatctc 23555428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 10925542 - 10925228
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  10925542 ggagcaaaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagggaaaaactcaa 10925443  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatct 207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  10925442 aaccacaagcaaaagataaagagagaagataaacaaacacatcaaagattgttgacccagttcgatccaactttacctaatctaggggagagattgattt 10925343  T
Q  208 ctccaatccactatcaatga---gtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    ||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  10925342 ctccaatccactatcaatgaattcttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctatc 10925243  T
Q  305 cattttcccaatctc 319  Q
    ||||||  |||||||    
T  10925242 cattttttcaatctc 10925228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 44455473 - 44455165
Alignment:
Q  16 agaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccaca 114  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| |    
T  44455473 agaaaagtggtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccaaa 44455374  T
Q  115 agcaaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctc 210  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44455373 agcaaaagataaaggaagagaagagaggaacaaacacaccaaagatcgttgacccagttcggtcaaacttgacctaatctgggggagagattgatctctc 44455274  T
Q  211 caatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44455273 caatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgagttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 44455174  T
Q  311 cccaatctc 319  Q
    |||||||||    
T  44455173 cccaatctc 44455165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 8550632 - 8550950
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| | |||    
T  8550632 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaa 8550731  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaagagagaagag------aaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    || |||||||| || ||||||||||||||       |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  8550732 aatcacaagcacaagataaagagagaagaagagagaaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 8550831  T
Q  201 ttgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8550832 ttgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttc 8550931  T
Q  301 tacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8550932 tacccattttcccaatctc 8550950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 41361230 - 41360919
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  41361230 ggagcaaaggaaagtattaatcaatatcaaagtaaacacaagtaacaacaacaataacaacacctatatctaatctaggaatcaaagtaaaaagctcaaa 41361131  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatct 207  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  41361130 accacaaacaaaagataaagtgagaaaagaaacaaacacaccaagatattgttgacctagttcggtccaatatgacctactatgggggagatattgatct 41361031  T
Q  208 ctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccat 307  Q
    ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41361030 ctttaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccat 41360931  T
Q  308 tttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||    
T  41360930 tttcccaatctc 41360919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 13659199 - 13659499
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||         |||||||| ||| ||||||||||  ||||||| |||||||  ||||    
T  13659199 ggagcaaaggaaagtagtaaccaacatcaaagtaaacacaagcaa---------taacaacacctaaatctaatctaggaatcaaa-tgaaaagtacaaa 13659288  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13659289 accacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaatacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttaacctactctgggggagagattgatctc 13659388  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  13659389 tccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaacaaccctaatttctatccgtt 13659488  T
Q  309 ttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||    
T  13659489 ttcccaatctc 13659499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 37559713 - 37560032
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaa-tctattaatcaaagtgaaaagctca 106  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||    
T  37559713 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaaatctaggaatcaaagtgaaaagcaca 37559812  T
Q  107 aaaccacaagcaaaatataaag---agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatct-gggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37559813 aaaccacaagcaaaagataaaggggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctagggggagaga 37559912  T
Q  201 ttgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagcttt-gacaagctcacaaagaacaaccctaattt 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  37559913 ttgatctctccaattcactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttcaacaagttcacaaagaacaactctaattt 37560012  T
Q  300 ctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  37560013 ctacccattttcctaatctc 37560032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 319
Target Start/End: Original strand, 37503427 - 37503717
Alignment:
Q  31 aatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaag- 128  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||  |||| ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||     
T  37503427 aatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaatatcaacacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaaccgcaagcaaaagataaagg 37503526  T
Q  129 -agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaat 225  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37503527 gagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacctagttcgatccaacttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaat 37503626  T
Q  226 gagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37503627 gagttcttacaaagagatacaa---ggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttttacccattttcccaatctc 37503717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16455926 - 16455627
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  16455926 aaagtagtaaccaatatcaaagtaaacgtaagcaacaacaataataacaacatatagatctaatctggtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagta 16455827  T
Q  119 aaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccac 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | | || || ||||||||||||| |||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16455826 aaagataaagagagaagagaaacaaatacaccaagaaatgtttacacagtttggtccaatttgaccgactatgggagagagattgatctctccaatccac 16455727  T
Q  219 tatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatct 318  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||  |||| ||  |||||||||  ||||||| |||||||    
T  16455726 tatcaatgagttcttacacagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcac-tagaaaaaatctaatttctcaccattttaccaatct 16455628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 13316200 - 13316515
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||| | |||    
T  13316200 ggagcaaaggaaagtagtaatcaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaa 13316299  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  13316300 a-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaactcactaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 13316398  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13316399 gaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 13316498  T
Q  303 cccattttcccaatctc 319  Q
    ||| |||||||||||||    
T  13316499 ccctttttcccaatctc 13316515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 52 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3189607 - 3189335
Alignment:
Q  52 aacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacac 147  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||    
T  3189607 aacaacaataataataacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacac 3189508  T
Q  148 accaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagataca 246  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3189507 accaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagataca 3189408  T
Q  247 aatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    || | ||||||  || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  3189407 aaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctc 3189335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 52 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3198424 - 3198152
Alignment:
Q  52 aacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacac 147  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||    
T  3198424 aacaacaataataataacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacac 3198325  T
Q  148 accaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagataca 246  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3198324 accaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagataca 3198225  T
Q  247 aatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    || | ||||||  || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  3198224 aaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctc 3198152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 52 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3207263 - 3206991
Alignment:
Q  52 aacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacac 147  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||    
T  3207263 aacaacaataataataacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacac 3207164  T
Q  148 accaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagataca 246  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3207163 accaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagataca 3207064  T
Q  247 aatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    || | ||||||  || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  3207063 aaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttataccctttttccaaatctc 3206991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20762988 - 20762686
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  ||     ||||||||| |||    
T  20762988 ggagcaaaggaaagtattaaccaatatcaaagtgaattcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaa-----gtgaaaagcacaa 20762894  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||    
T  20762893 aaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattggtcacctagttcggtccaaacttgacctactctgtaggagagatt 20762794  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20762793 gatctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 20762694  T
Q  303 cccatttt 310  Q
    ||| ||||    
T  20762693 cccttttt 20762686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 143 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19754676 - 19754509
Alignment:
Q  143 aacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagaga 242  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19754676 aacacaccaaaaattgttgacccacttcggtccaacttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaga 19754577  T
Q  243 tacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 310  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19754576 tacaaatcggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 19754509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Original strand, 13547095 - 13547252
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13547095 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 13547194  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
      ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547195 aatagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 13547252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Original strand, 13549006 - 13549163
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  13549006 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacatgaa 13549105  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13549106 attaggtttaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 13549163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15820616 - 15820315
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||      |||||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||||||| |    
T  15820616 ggagcaaaggaaagtagtaactaatatcaaagtaaacacaagcaacaaca------acaacacctagatctaatataggaatcaaatagaaaagctcata 15820523  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    | |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  | | || ||| |||| | |||||||||||||| |||||  |||||||| |||||    
T  15820522 aacacaagcaatggataaggagagaagagaaacaaacacaccaataaatgtttacctagttcgatccaacttgacctactctggatgagagatttatctc 15820423  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    | |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  15820422 ttcaatgcactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttttacccatc 15820323  T
Q  309 ttcccaat 316  Q
    || |||||    
T  15820322 tttccaat 15820315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 37168460 - 37168302
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatac-aaatgggttacaaaa 260  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  37168460 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaaga 37168361  T
Q  261 acttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37168360 aattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 37168302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 302
Target Start/End: Original strand, 927842 - 928123
Alignment:
Q  20 aagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctat-taatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||   | ||||| |  |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  927842 aagtggtaaccaatatcaaagtaatcacaaacaacaaca---acaacaaaacttagatctaatatagataatcaaagtgaaaagttcaaaaccacaaaca 927938  T
Q  119 aaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  | | || |||||||| |||| |||||||||||   ||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  927939 aaagataaagagagaagagaaacaaacacacaaagaaatgtttacccagttcggtctaacttgacctaccttggggaagaggttggtctctctaatccac 928038  T
Q  219 tatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttcta 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  928039 tattaatgagtttttacaaagagatccaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttcta 928123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 165 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 11348857 - 11348703
Alignment:
Q  165 cagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaactt 264  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  11348857 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttagaaagagatacaaatgggttacaagaaatt 11348758  T
Q  265 agctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11348757 agcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctc 11348703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Original strand, 47255345 - 47255503
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaa 260  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47255345 acccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaaga 47255444  T
Q  261 acttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47255445 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctc 47255503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19752864 - 19752700
Alignment:
Q  146 acaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatac 245  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19752864 acacaaaagattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatatgggagagagattgatctctccaatcctctatcaatgagttcttacaaagagatac 19752765  T
Q  246 aaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 310  Q
    |||| |||||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19752764 aaatcggttacaagaaattagcttcaacaagctcgcaaagaacaaccctaatttctacccatttt 19752700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 176 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29136395 - 29136252
Alignment:
Q  176 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaa 275  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||  ||||    
T  29136395 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatcaatgagttcttacaaagaaatacaaatgggttccaagaaattagcttcaacaa 29136296  T
Q  276 gctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29136295 gctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 29136252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 166 - 319
Target Start/End: Original strand, 7482240 - 7482394
Alignment:
Q  166 agtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatac-aaatgggttacaaaaactt 264  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  7482240 agttcggtccaacttgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaatt 7482339  T
Q  265 agctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7482340 agcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttacccaatctc 7482394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 193773 - 193616
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  193773 acccagttcggtccaacttgacatactctggagaagagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgagttacaagaa 193674  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  193673 attagcttcaacaagctaataaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctc 193616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 166 - 319
Target Start/End: Original strand, 31925717 - 31925870
Alignment:
Q  166 agtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaactta 265  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  31925717 agttcggtccaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatta 31925816  T
Q  266 gctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31925817 gcttcaacaagctcacaatgaacatccctaatttctacccatttttccactctc 31925870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Original strand, 42297971 - 42298138
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgg 251  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  42297971 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatga 42298070  T
Q  252 gttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42298071 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctc 42298138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 47115335 - 47115176
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaa-tgggttacaaa 259  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  47115335 acccagttcggtccaacaatgacctactctggagcagagattgatctctccaatccactatcaatgggtttttacaaagagatacaaaatgggttacaag 47115236  T
Q  260 aacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47115235 aaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttcccaatctc 47115176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 51765666 - 51765400
Alignment:
Q  61 aataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaaag 154  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||    ||| ||||||  ||||||| |||||||||    
T  51765666 aataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaag 51765568  T
Q  155 attattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatac-aaatgg 251  Q
    ||| || |||||||| ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||    
T  51765567 attgttcacccagttcggtccaaacttgtcctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggg 51765468  T
Q  252 gttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaa-gaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatc 317  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  51765467 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatc 51765400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 34603735 - 34603581
Alignment:
Q  166 agtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagat-acaaatgggttacaaaaactt 264  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || ||    
T  34603735 agttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccaccatcaatgagttcttacaaagagataaaaaatgggttacaagaaatt 34603636  T
Q  265 agctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  34603635 agcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttttcaatctc 34603581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Original strand, 37033068 - 37033236
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaa-tg 250  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||  ||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  37033068 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatgcaaaatg 37033167  T
Q  251 ggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    | |||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37033168 gattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 37033236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 112 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 36683892 - 36683695
Alignment:
Q  112 acaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctc 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  36683892 acaagcaaaagataaagagagaagacaaacaaacacaccaagagatgttt-actcagttcggtctaacttgacctactctgggggagagattgatttcta 36683794  T
Q  211 caatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 310  Q
    |||||||||||||||||||| |          |||||||| ||||||| || |||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  36683793 caatccactatcaatgagttct----------tacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaataaacctaatttctacctatttt 36683704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 290
Target Start/End: Original strand, 44650022 - 44650297
Alignment:
Q  11 agcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaac 110  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| || | || | ||||||||| ||  |||||||| | ||| ||||||  ||  ||| |||||||||||| |||||     
T  44650022 agcaaagaaaagtagtaaccaatattaatgaaacctcaagcaacaccaaaaataacaa-acctaaatctaacatagaaat-aaagtgaaaagcacaaaat 44650119  T
Q  111 cacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctc 210  Q
    ||||||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||||| | |||| ||| |||| ||||||| |||||||| | | ||| ||||||||||||||     
T  44650120 cacaagcaaaagataaaga---aagagaaacaaacgcaccaaaaaatatttacctagttcggtccaaattgacctacttttgggaagagattgatctctt 44650216  T
Q  211 caatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaa 290  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |  |||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  44650217 caatccactattaatgaattatttacaaagagatataaaagatttacaataaattagcgttaacaaactcacaaagaacaa 44650297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3460915 - 3460707
Alignment:
Q  105 caaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 204  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  | | || ||| | ||||||| || |||||||| ||| ||  ||| |||||    
T  3460915 caaaaccacaaacaaaagataaagagagaagagaaacaaacacattaagaaatgtttacctaatttggtctaaattgacctactctagga-agatattga 3460817  T
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttcta 302  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3460816 tctctccaatcgactatcaatatgttctttacaaagatatacaaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttcta 3460717  T
Q  303 cccattttcc 312  Q
    ||| ||||||    
T  3460716 ccctttttcc 3460707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Original strand, 20622217 - 20622401
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac 235  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20622217 aaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 20622316  T
Q  236 ---aaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
       |||| ||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20622317 aaaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 20622401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 180 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 22079461 - 22079322
Alignment:
Q  180 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagct 278  Q
    ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||    
T  22079461 tgacctactttggaggagaaattgatctctccaatccaatatcaatgagttctttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaagct 22079362  T
Q  279 cacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22079361 cacaaagaacaaacataatttcta-ccatttttccaatctc 22079322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 304
Target Start/End: Original strand, 37282552 - 37282841
Alignment:
Q  16 agaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaa 115  Q
    ||||||||| |||  ||||| ||||||| |||||| | |||||  |||||||| | ||||||||||||||  |||||  ||||||| | |||||||||||    
T  37282552 agaaaagtaataattaatatgaaagtaaccacaagtaccaacaacaataacaa-acctagatctaatctagaaatcag-gtgaaaaacgcaaaaccacaa 37282649  T
Q  116 gcaaaat-ataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaat 214  Q
    | ||||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||| | | || | | ||||  |||||| |||||||| ||    ||||||||| |||||||||||    
T  37282650 gaaaaaagagaaatagagaagagaaacaaacgcaccaaaaaatgtttatctagttcagtccaaattgacctactccaaaggagagatttatctctccaat 37282749  T
Q  215 ccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 304  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | || |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  37282750 ccactactaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttaccataaattagcttcaacaagctcacaaggaacaaaccctaatttatacc 37282841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 40282565 - 40282382
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac 235  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  40282565 aaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 40282466  T
Q  236 -aaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||| ||||||||  |||||||| || |||| || |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40282465 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 40282382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 9987373 - 9987207
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatg 250  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||      
T  9987373 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttgcaaaagggatacaaa-a 9987275  T
Q  251 ggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||| ||| || |||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9987274 ggttgcaagaaattagattagacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 9987207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 255
Target Start/End: Original strand, 37876772 - 37876865
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggtta 255  Q
    |||||||| ||| ||||||||  || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37876772 acccagttcggttcaacttgatgtactctggaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgggtta 37876865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 9036604 - 9036422
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac 235  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  9036604 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctcgaggagagattgtactcttcaatccactatcaaagagttcttac 9036505  T
Q  236 -aaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||| ||||||||  |||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9036504 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 9036422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 227
Target Start/End: Original strand, 44646743 - 44646875
Alignment:
Q  92 aaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctg 191  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||   ||||||||||||| ||||||| | |||| ||| |||| ||||||| |||||||| | |     
T  44646743 aaagtgaaaagcacaaaatcacaagcaaaagataaaga---aagagaaacaaacgcaccaaaaaatatttacctagttcggtccaaattgacctactttt 44646839  T
Q  192 ggggagagattgatctctccaatccactatcaatga 227  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  44646840 gggaagagattgatctcttcaatccactattaatga 44646875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 182 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6808595 - 6808479
Alignment:
Q  182 acctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctca 280  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||  ||||||||     
T  6808595 acctactctgaggaagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaagaagttagcttcaacaagctct 6808496  T
Q  281 caaagaacaaccctaat 297  Q
    | |||||||| ||||||    
T  6808495 ccaagaacaaacctaat 6808479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 21054146 - 21053963
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac 235  Q
    ||||||| ||||||| |||||  | |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21054146 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 21054047  T
Q  236 -aaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||| ||||||||  |||| ||| || |||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21054046 aaaagggatacaaa-aggttgcaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacac-ttttcccaatctc 21053963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5460206 - 5459989
Alignment:
Q  23 tagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaat 122  Q
    |||||| |||||||||| ||| | ||| ||||||||  || ||||| | ||||||| ||||||  || |||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  5460206 tagtaaccaatatcaaaataatctcaaacaacaacaacaagaacaa-acctagatcgaatctaggaa-caaaatgtaaagcacaaaaccacaagcaaaag 5460109  T
Q  123 ataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaac-ttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||  | | || ||| ||||  | |||||  ||| ||| ||| |  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5460108 ataaagagagaatagaaacaaacacaacaagaaatgtttacctagttcagcccaacaatgatctactctagatgagagattgatctctccaatctactat 5460009  T
Q  222 caatgagtt-tttacaaaga 240  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  5460008 caatgagttctttacaaaga 5459989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 187 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13938273 - 13938143
Alignment:
Q  187 atctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttt-ttacaaagagatac-aaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaa 284  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||| || |||  ||| ||||| || | ||    
T  13938273 atctgggggagaga--gatctctccaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaaaaggttacaagaaattatattttacaagttctccaa 13938176  T
Q  285 gaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13938175 gaacaa-cctaatttctaccca-tttcccaatctc 13938143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28242467 - 28242382
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaa 247  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28242467 acccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaa 28242382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 319
Target Start/End: Original strand, 16914118 - 16914338
Alignment:
Q  99 aaagctcaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctg-ggggag 197  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |  ||| || |||||||| ||||  | || ||||| |||  |||||     
T  16914118 aaagcacaaaaccgcaagcaaaagataaagagagaagagacacaaacacacatagaattgtttacccagttcggtctgaatttacctactctaaggggaa 16914217  T
Q  198 agattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaa-aaacttagctttgacaagctcacaaagaacaacccta 295  Q
    |||   ||| || || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  ||| |||| | |||||||| | ||    
T  16914218 agac--atccctgcacttcactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttagaagaaacttagcttcaacaggctctccaagaacaaacata 16914315  T
Q  296 atttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||| |||||| ||||||||||||    
T  16914316 atttttaccca-tttcccaatctc 16914338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 319
Target Start/End: Original strand, 37879006 - 37879074
Alignment:
Q  251 ggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37879006 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctc 37879074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 224
Target Start/End: Original strand, 8871032 - 8871130
Alignment:
Q  126 aagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 224  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||  | | || || || || ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8871032 aagagagaaaagaaacaaacataccaataaatgtttactcaattcggtccaacttggcctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 8871130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 19072915 - 19072976
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19072915 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 19072976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 19120805 - 19120866
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19120805 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 19120866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 287
Target Start/End: Original strand, 2262911 - 2263106
Alignment:
Q  93 aagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctg 191  Q
    ||||||||| | |||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||  | | || || ||||| || |||||  |||||||  ||     
T  2262911 aagtgaaaaacccaaatccacaaacaaaag-taaagagagaagaaaaacaaacataccaagaaatgtttactcagttcggaccaacaatgacctacccta 2263009  T
Q  192 ggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaa 287  Q
     |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| || ||| |||  |||||||||| |||||    
T  2263010 agggaaagattgatctcttcaatccactatcaataagttctttacaaaaagatataaaagggttacaagaaattatcttcaacaagctcaccaagaa 2263106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 131
Target Start/End: Original strand, 8870586 - 8870698
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| |||| ||| || || | ||||||| ||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  8870586 aaagtagtaactagtatcaaagtaatcacaagcaaaaacaataaaaaaaaaacctagatcaaatctaggaatcaaagtgaaaaatacaaaaccacaagca 8870685  T
Q  119 aaatataaagaga 131  Q
    ||| |||||||||    
T  8870686 aaagataaagaga 8870698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 44203804 - 44203636
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttac-aaagagatacaaa 248  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||    
T  44203804 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 44203706  T
Q  249 tgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
      |||||||| || ||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  44203705 gaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc 44203636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 258
Target Start/End: Original strand, 9109459 - 9109522
Alignment:
Q  196 agagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaa 258  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  9109459 agagattgatctctccaatacactatcaacgtgttctttacaaagagatacaaaagggttacaa 9109522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Original strand, 37069756 - 37069838
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  37069756 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcatctctccgatccactat 37069838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 3281694 - 3281756
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3281694 aacaaacacatcaaaagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 3281756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26645008 - 26644946
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26645008 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 26644946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 13598386 - 13598446
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13598386 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 13598446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 29651799 - 29651859
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  29651799 aacaaacacaccaa-gatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 29651859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47704042 - 47703965
Alignment:
Q  142 aaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  47704042 aaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 47703965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2926637 - 2926516
Alignment:
Q  196 agagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccct 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  || ||||||||| ||||  |||||||| || ||| |||| ||||| ||   ||| |||| |||    
T  2926637 agagattgatctctccaatccactaccaatgaattcgtttcaaagagatgcaaaaaggttacaataaattaactttaacaagttcttcaagcacaaacct 2926538  T
Q  295 aatttctacccattttcccaatc 317  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    
T  2926537 aatttcta-ccatttttccaatc 2926516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Original strand, 9476249 - 9476329
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||   | ||||||||||||||||    
T  9476249 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagaga-gcagctctccaatccactat 9476329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 32471579 - 32471478
Alignment:
Q  206 ctctccaatccactatcaatgagttt-ttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||| || ||| |||  || || || |||||||||| |||||||| ||||    
T  32471579 ctctcgaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagagttgcaataaattaacttcaac-agttctcaaagaacaaacctaatttatacc 32471481  T
Q  305 cat 307  Q
    |||    
T  32471480 cat 32471478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 220
Target Start/End: Original strand, 775660 - 775739
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccacta 220  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  775660 aacaaacacatcaa-gattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagt-agctctccaatccacta 775739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 12302510 - 12302551
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12302510 ttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagaga 12302551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16124625 - 16124565
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16124625 aacaaacacaccaa-gattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 16124565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 47098933 - 47098873
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  47098933 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagaga 47098873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 47102950 - 47102890
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  47102950 aacaaacacaccaaa-attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagaga 47102890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 219 - 309
Target Start/End: Original strand, 12318585 - 12318676
Alignment:
Q  219 tatcaatgagtttttaca-aagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattt 309  Q
    |||||||||||| ||| | |||| |||||||  |||||||| || |||||||  |||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||    
T  12318585 tatcaatgagttcttaaagaagacatacaaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctctccatgaacaaacctaatttctacccattt 12318676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13604734 - 13604652
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  13604734 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 13604652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21536680 - 21536598
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  21536680 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 21536598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27104481 - 27104401
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  27104481 aacaaacacaccaa-gattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 27104401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 2510330 - 2510371
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2510330 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 2510371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 3189664 - 3189615
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaaca 58  Q
    |||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3189664 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtgaacacaagcaacaaca 3189615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 3198481 - 3198432
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaaca 58  Q
    |||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3198481 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtgaacacaagcaacaaca 3198432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 3207320 - 3207271
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaaca 58  Q
    |||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3207320 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtgaacacaagcaacaaca 3207271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6823290 - 6823249
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6823290 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 6823249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 10399833 - 10399874
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10399833 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 10399874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13358849 - 13358808
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13358849 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 13358808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 15294839 - 15294880
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15294839 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 15294880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 17324641 - 17324682
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17324641 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 17324682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 27336945 - 27336986
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27336945 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 27336986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 28207073 - 28207114
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28207073 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 28207114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 28840955 - 28840914
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28840955 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 28840914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 28998258 - 28998299
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28998258 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 28998299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 29003974 - 29004015
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29003974 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 29004015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 31735526 - 31735567
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31735526 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 31735567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 39462795 - 39462754
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  39462795 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 39462754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 50307551 - 50307592
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  50307551 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 50307592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 51750315 - 51750274
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  51750315 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 51750274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 51752639 - 51752598
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  51752639 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 51752598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 35109557 - 35109492
Alignment:
Q  240 agatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccca 306  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||  | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  35109557 agatacaaataggttacaagaaattagctt--aaaagctcacaaagaacaaaccttaatttctaccca 35109492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 81)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 40321395 - 40321085
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40321395 ggagcaaaggaaagtagcaatcaatatcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaa 40321296  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40321295 accacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacatcaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 40321196  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40321195 tccaatccactatcaaagagtttttacaaagagatactaatgggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccatt 40321096  T
Q  309 ttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||    
T  40321095 ttcccaatctc 40321085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 5689587 - 5689276
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaaca-caagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  5689587 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaacaataataacaacatctaaatctaatttagtaatcaaagtgaaaagctcaa 5689488  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatct 207  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5689487 aaccacaagtaaaagataaagagagaagagaaacaaacacatcaaagattgttgacccagttcggtccaacttgaccaaatctgggggagagattgatct 5689388  T
Q  208 ctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  5689387 ctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagcaccaccttaatttctacccat 5689288  T
Q  308 tttcccaatctc 319  Q
    ||| ||||||||    
T  5689287 ttttccaatctc 5689276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 1345224 - 1345534
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1345224 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaaacaacaacaataataataacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaatctcaaa 1345323  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  1345324 atcacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgacctagttcggtctaacttgacctactctgggggagagattgaactc 1345423  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| || |||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1345424 ttcaatccactatcaatgagttctttcaaagagatacatatgggttacaagaaattagcttcaataaactcacaaagaacaaccctaatttctacacatt 1345523  T
Q  309 ttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||    
T  1345524 ttcccaatctc 1345534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30143660 - 30143346
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30143660 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaa 30143561  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30143560 aaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgactcagttcagttcaacttgaccttatctgggggagagattg 30143461  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30143460 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 30143361  T
Q  304 ccattttcccaatct 318  Q
    |||||||||||||||    
T  30143360 ccattttcccaatct 30143346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 43036742 - 43036428
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  43036742 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataacaacaccacctagatctaatctagtaaccaaagtgaaaagctcaaa 43036643  T
Q  109 accacaagcaaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 204  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43036642 accacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggaggagagattga 43036543  T
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| || |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43036542 tctctcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgaattacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 43036443  T
Q  305 cattttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||||    
T  43036442 cattttcccaatctc 43036428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 37 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18142105 - 18141826
Alignment:
Q  37 aaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaagagagaaga 136  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18142105 aaagtaaacacaagcaacaataataataacaacacctacatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagagagcaga 18142006  T
Q  137 gaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttaca 236  Q
    ||||||| ||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18142005 gaaacaagcacaccaaag--tgttggcccagtttggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaagagttcttaca 18141908  T
Q  237 aagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||| |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18141907 aagtgatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-cctaatttctacccattttcacaatctc 18141826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15213106 - 15212791
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||  ||||||| || || |||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  15213106 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcaccttgatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaa 15213007  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
    | |||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15213006 agccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 15212907  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 303  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15212906 atctctccaatccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctac 15212807  T
Q  304 ccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||||||    
T  15212806 ccattttcccaatctc 15212791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6599284 - 6598977
Alignment:
Q  10 gagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaa 109  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6599284 gagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaacaa---taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaa 6599188  T
Q  110 ccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6599187 ccacaagaaaaagataaagggagaagagaaacaaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctc 6599088  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  6599087 tctaatccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaacttaatttctacccatt 6598988  T
Q  309 ttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||    
T  6598987 ttcccaatctc 6598977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6674737 - 6674430
Alignment:
Q  10 gagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaa 109  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6674737 gagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaacaa---taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaa 6674641  T
Q  110 ccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6674640 ccacaagaaaaagataaagggagaagagaaacaaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctc 6674541  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  6674540 tctaatccactatcaatgagttcttacaaaagtatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcgcaaagaacaaacttaatttctacccatt 6674441  T
Q  309 ttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||    
T  6674440 ttcccaatctc 6674430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 27811588 - 27811283
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc 117  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27811588 aaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatttaggaatcaaagtgaaaagcacaaaatcacaagc 27811489  T
Q  118 aaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaa 213  Q
    |||| ||||||  |||||||||   || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27811488 aaaagataaagcaagagaagaggggaaaaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaa 27811389  T
Q  214 tccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 313  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27811388 tccactatcaatgggttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 27811289  T
Q  314 aatctc 319  Q
    ||||||    
T  27811288 aatctc 27811283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 3303519 - 3303833
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatcta----ttaatcaaagtgaaaagct 104  Q
    |||||| || ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    | |||||||||||||||      
T  3303519 ggagcaaaggaaagtggtaaccaatatcaaaacaaacacaagcaacaacaataataactacacctagatctaatctaggaatcaatcaaagtgaaaagta 3303618  T
Q  105 caaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 204  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3303619 caaaatcacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgtttacccagttcggtccaacttgacctactgtgggggagagattga 3303718  T
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3303719 tctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattaggttaaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctacc 3303818  T
Q  305 cattttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||||    
T  3303819 cattttcccaatctc 3303833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4731978 - 4731663
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  4731978 ggagcaaaggaaagtagtaaccgatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaa 4731879  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  4731878 aaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtccaacttgaccgaatctgggggagagatcg 4731779  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4731778 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagagcaaccctaatttctac 4731679  T
Q  304 ccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||||||    
T  4731678 ccattttcccaatctc 4731663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 1292317 - 1292626
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1292317 ggagcaaagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagtagtaacaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaa 1292416  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||  ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||    
T  1292417 accacgagcaaaagataaggagagaagagaaacaaacacaccaagaaatgtttgcccagttcggtccaacttgacctactct-ggggagagatttatttc 1292515  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1292516 tcaaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctacccatt 1292615  T
Q  309 ttcccaatctc 319  Q
    ||| |||||||    
T  1292616 ttctcaatctc 1292626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 33352470 - 33352155
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| | |||    
T  33352470 ggagcaaaggaaagtaataaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctaaatctaatctagaaatcaaagtgaaaaacacaa 33352371  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
    | |||||||||||| |||||  |||| ||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33352370 atccacaagcaaaagataaaaggagataagagaggaacaaacacatcaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 33352271  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  33352270 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattaggttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttttac 33352171  T
Q  304 ccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||||||    
T  33352170 ccattttcccaatctc 33352155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 12702479 - 12702788
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaac---atctagatctaatctattaa-tcaaagtgaaaagct 104  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||  || |||||||||||| |     
T  12702479 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacgacacctagatctaatctagaaaatcaaagtgaaaaaca 12702578  T
Q  105 caaaaccacaagcaaaatataaagagaga----agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12702579 caaaaccacaagcacaagataaagggagagaagagagaaacaaacataccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctaggggagaga 12702678  T
Q  201 ttgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttc 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12702679 ttgatctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagacacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttc 12702778  T
Q  301 tacccatttt 310  Q
    ||||| ||||    
T  12702779 tacccttttt 12702788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 41366466 - 41366777
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  41366466 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaataacaacaataacaacacctagatctaatataggaatcaaagtgaaaagcacaaa 41366565  T
Q  109 accacaagcaaaatataaa-gagagaagagaaacaaa-cacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatc 206  Q
    ||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  41366566 accacaaacaaaagataaatgggagaagagaaacaaaacacaccaaagattgttgtcccagttcggtccaacttgacctaatctaggg-agagattgatc 41366664  T
Q  207 tctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccca 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| || || |||||||  ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  41366665 tctccaatccactataaatgagttcttacaaagggatacaaataggttaaaagaaattagcttaaacaagcttacaaagaacaaacataatttctaccca 41366764  T
Q  307 ttttcccaatctc 319  Q
    ||||| |||||||    
T  41366765 ttttctcaatctc 41366777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 19491551 - 19491862
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  19491551 ggagcaaaggaaagtattaatcaatatcaaagtaaacacaagtaacaacaacaataacaacacctatatctaatctaggaatcaaagtaaaaagctcaaa 19491650  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatct 207  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19491651 accacaaacaaaagataaagtgagaaaagaaacaaacacaccaagatattgttgacctagttcggtccaatatgacctactatgggggagatattgatct 19491750  T
Q  208 ctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccat 307  Q
    ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19491751 ctttaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccat 19491850  T
Q  308 tttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||    
T  19491851 tttcccaatctc 19491862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 17982973 - 17982657
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || || ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  17982973 ggagcaaaggaacgtagtaaccaataacaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaa 17982874  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  17982873 a-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 17982775  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17982774 gaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 17982675  T
Q  303 ccc-attttcccaatctc 319  Q
    |||  |||||||||||||    
T  17982674 cccttttttcccaatctc 17982657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 42498515 - 42498214
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaac-attaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||  |  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| | |||    
T  42498515 ggagcaaaggaaagtagcaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataattaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaa 42498416  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  42498415 aaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagggaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 42498316  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42498315 gatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 42498216  T
Q  303 cc 304  Q
    ||    
T  42498215 cc 42498214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 67 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 30291865 - 30291611
Alignment:
Q  67 aacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgaccca 166  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  30291865 aacatctaaatctaatctagtaatcaaagtggaaagttcaaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgattca 30291766  T
Q  167 gtttggtccaacttgacctaatctgg-gggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaactta 265  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||| ||||||| || |||    
T  30291765 gttcggtccaacttggcataatctggagggagagattgatctctccaatccactatcaaagaattcttacaaagtgatacaaatgagttacaagaaatta 30291666  T
Q  266 gctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30291665 gcttcaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatctc 30291611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 34254179 - 34254493
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  34254179 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaa 34254278  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    | |||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||| | |||||||||    
T  34254279 a-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagatt 34254377  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34254378 gatctctccaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 34254477  T
Q  303 cccattttcccaatctc 319  Q
    ||| |||||||||||||    
T  34254478 ccc-ttttcccaatctc 34254493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 34256355 - 34256669
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  34256355 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaa 34256454  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    | |||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||| | |||||||||    
T  34256455 a-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagatt 34256553  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34256554 gatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 34256653  T
Q  303 cccattttcccaatctc 319  Q
     ||||||| ||||||||    
T  34256654 -ccatttttccaatctc 34256669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 304
Target Start/End: Original strand, 1746077 - 1746366
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc 117  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  1746077 aaagtagtaaccaataacaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtcaaaagcgcaaa-ccacaagc 1746175  T
Q  118 aaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctcca 212  Q
    ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  1746176 aaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaacgattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctcca 1746275  T
Q  213 atccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1746276 atccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 1746366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 40221923 - 40221750
Alignment:
Q  146 acaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatac 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40221923 acaccaaagattattgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatac 40221824  T
Q  246 aaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||| || |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40221823 aaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttaccaatctc 40221750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44304175 - 44303869
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  44304175 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaa 44304076  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    | |||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||| |||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  44304075 a-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacctagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagatt 44303977  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  44303976 gaactctccaatccactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccttaatttcta 44303877  T
Q  303 cccatttt 310  Q
    ||| ||||    
T  44303876 cccttttt 44303869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 61 - 319
Target Start/End: Original strand, 4743119 - 4743366
Alignment:
Q  61 aataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattatt 160  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4743119 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcgaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgtt 4743218  T
Q  161 gacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaa 260  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          |||||||||||||||| |    
T  4743219 gacccagttcggtccaacttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttct----------tacaaatgggttacaaga 4743308  T
Q  261 acttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
      |||||||  |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4743309 ttttagcttcaacaaacacacaaagaacaaacctaa-ttctacccatttttccaatctc 4743366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10015394 - 10015119
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  10015394 ggagcagaggaaagtaataaccaatatcaaagtgaacacaagcaaaaacaataataacaatacctagatctaatttagtaatcaaagtgaaaagttcaaa 10015295  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatct 207  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||||||| | | || |||||||| ||||    
T  10015294 accacaagcaaaagataaggagagaagagaaacaaatacaccaagaaatgatt-acccagttcggtccaacttgacctactat-ggagagagatttatct 10015197  T
Q  208 ctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaaga 286  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||  |||||| ||||||||    
T  10015196 ctccaatccactatcaatgagttccta-aaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagcacacaaaga 10015119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 19945207 - 19945524
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||    
T  19945207 ggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcgaagtgaaaagcacaa 19945306  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||    
T  19945307 a-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctcgaggagagatt 19945405  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatg-ggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttct 301  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  19945406 gaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagtggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccataatttct 19945505  T
Q  302 accc-attttcccaatctc 319  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  19945506 acccttttttcccaatctc 19945524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 139 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 9765929 - 9765750
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaa 238  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9765929 aacaaacacaccaatgattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagc-agctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 9765831  T
Q  239 gagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765830 gagatacaaatgggttacaagaaattagctttgccaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 9765750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31218577 - 31218277
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || ||||||| || ||||| |||||| ||  ||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||    
T  31218577 ggagcaaaggaaagtagcaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaa 31218478  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    ||| | ||||| || |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  31218477 aac-ataagcacaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 31218379  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31218378 gaactctctaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 31218279  T
Q  303 cc 304  Q
    ||    
T  31218278 cc 31218277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Original strand, 42434997 - 42435154
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42434997 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 42435096  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42435097 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctc 42435154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4734026 - 4733784
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||| ||| ||  || |||| |||||||| |||    
T  4734026 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaaatgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatcaaatgtaggaaacaaaatgaaaagcacaa 4733927  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
    ||||||||| |||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4733926 aaccacaaggaaaagataaaggtagagaagagaggaacaaacacaccaaagactgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagatcg 4733827  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagataca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4733826 atctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagataca 4733784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 159 - 319
Target Start/End: Original strand, 10930202 - 10930362
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaa 258  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  10930202 ttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgtgttcttacaaagagatataaatgggttacaa 10930301  T
Q  259 aaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     || |||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10930302 gaaattagcttcaacgagctcacaaagagcaaccctaatttctatccattttcccaatctc 10930362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 319
Target Start/End: Original strand, 18105925 - 18106241
Alignment:
Q  10 gagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaa 109  Q
    ||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||    
T  18105925 gagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtaaacacaagcaataacaacaataacatcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaa 18106024  T
Q  110 ccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagatt----------attgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagag 199  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||            |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18106025 tcacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaacttgaccaaagaaacaaacacaccattgacccagttcggtccaacttgacctattctgggg-agag 18106123  T
Q  200 attgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaattt 299  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||  || |||    
T  18106124 attgatctctccaaac-actatcaatgagttcttacaaa-agatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcgcaaagaacaactatagttt 18106221  T
Q  300 ctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||| ||||||| ||||||||    
T  18106222 ctatccatttttccaatctc 18106241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4283686 - 4283529
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4283686 acccagttcggtccaacttgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 4283587  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4283586 attagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 4283529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18655562 - 18655405
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18655562 acccagttcggtccaacttgacctactttggaggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 18655463  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  18655462 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttctcaatctc 18655405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 319
Target Start/End: Original strand, 8965551 - 8965854
Alignment:
Q  22 gtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagct--------caaaaccac 113  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | |||||| |||||||  |||||| |||||||           |||||||||    
T  8965551 gtagtaaccaatatcaaagtaaccacaagcaacaacaacaataacaa-acctagatttaatctaggaatcaa-gtgaaaaaaaaaaaaaaacaaaaccac 8965648  T
Q  114 aagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaa 213  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  | | || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  8965649 aaacaaaagataaagagagaaaagaaacaaacacaccgataaatgtttacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagatttatctctccga 8965748  T
Q  214 tccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcc 312  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| || || ||| |||  |||| |||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  8965749 tgcactatcaatgagttcttacaaagagatataaaagggttataagaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttcta-cctttttcc 8965847  T
Q  313 caatctc 319  Q
    |||||||    
T  8965848 caatctc 8965854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 11384147 - 11383990
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  11384147 acccagttcggtccaacttaacctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatcaatgggttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaa 11384048  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11384047 attagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctc 11383990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 191 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 44353926 - 44353798
Alignment:
Q  191 gggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaa 290  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  44353926 gggggagagattgatcttttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaa 44353827  T
Q  291 ccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44353826 ccctaatttctacccattttcccaatctc 44353798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 182 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 40328922 - 40328784
Alignment:
Q  182 acctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatac-aaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctca 280  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||  |||||||||    
T  40328922 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattagtttaaacaagctca 40328823  T
Q  281 caaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40328822 caaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctc 40328784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 2628005 - 2627740
Alignment:
Q  61 aataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaa-a 153  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| |||||||||  ||||| ||||||| || |||||    ||| ||||||  ||||||| ||||||| |    
T  2628005 aataacaacacctagatctaatctaggaaacaa-gtgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaga 2627908  T
Q  154 gattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttaca-aagagatac-aaatg 250  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |    
T  2627907 gattattcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacacaagagatacaaaaag 2627808  T
Q  251 ggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     ||| ||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2627807 agttgcaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 2627740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3772352 - 3772197
Alignment:
Q  164 ccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaact 263  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||| ||||||| || |    
T  3772352 ccagtttggtccaacttgacctactctgagagatagattgatctctccaatccactatcaataaattcttacaaagatatacaaatgagttacaagaaat 3772253  T
Q  264 tagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||    
T  3772252 tagcttaaataagctcacaaagaacaaacctaatttctatcaattttctcaatctc 3772197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 162 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4162658 - 4162509
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  4162658 acccaattcggtccaacttgacctactcttggggagagattgatatctccaatcc-ctatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaa 4162560  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcc 312  Q
     |||||||  ||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4162559 attagcttcaacaagttctcaaagaacaaacctaacttctacccattttcc 4162509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 92 - 248
Target Start/End: Original strand, 3073810 - 3073965
Alignment:
Q  92 aaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctg 191  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |  | | || |||||||| || ||||||||||||| | ||    
T  3073810 aaagtgaagagtacaaaaccacaagcaaaagataaagagataagagaaacaaacacacatagaaatgtttacccagttcggcccaacttgacctactatg 3073909  T
Q  192 ggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaa 248  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3073910 ggg-agagattgatctctccaagccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaa 3073965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 7597823 - 7597648
Alignment:
Q  117 caaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatc 215  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||  | |||| | |||||| |||| |||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7597823 caaaagataaagagagaagagaaacacgcacatcaataaatatttatccagttcggtctaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatc 7597724  T
Q  216 cactatcaatg-agtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaa 290  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||| || ||| || || |||||||  |||||||| | ||||||||    
T  7597723 cactatcaatgcattctttacaaagagatacaaaaggattataagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaa 7597648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8153940 - 8153825
Alignment:
Q  142 aaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagag 241  Q
    |||||||||||| | |||| | ||| || |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  8153940 aaacacaccaaaaaatatttatccatttcggtccaacttgacctactctgaggaagagattgatctctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagat 8153841  T
Q  242 atacaaatgggttaca 257  Q
    ||||||| | ||||||    
T  8153840 atacaaaagagttaca 8153825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 118
Target Start/End: Original strand, 3051012 - 3051085
Alignment:
Q  45 cacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3051012 cacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagaaattaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 3051085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 25690126 - 25689960
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatg 250  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||      
T  25690126 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 25690028  T
Q  251 ggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  25690027 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttcta-cctttttcccaatctc 25689960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1822425 - 1822313
Alignment:
Q  192 ggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-a 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |    
T  1822425 ggggagagattgatctctccaattcactattagtgagttatttacaaatagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa 1822326  T
Q  290 accctaatttcta 302  Q
    ||| |||||||||    
T  1822325 accataatttcta 1822313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1856870 - 1856758
Alignment:
Q  192 ggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-a 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |    
T  1856870 ggggagagattgatctctccaattcactattagtgagttatttacaaatagatataaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa 1856771  T
Q  290 accctaatttcta 302  Q
    ||| |||||||||    
T  1856770 accataatttcta 1856758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 290
Target Start/End: Original strand, 11712024 - 11712135
Alignment:
Q  180 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagct 278  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||| || |||||||  |||||||    
T  11712024 tgacctactttgagggagagattgatctcttcaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaagggtttcaagaaattagcttcaacaagct 11712123  T
Q  279 cacaaagaacaa 290  Q
    | ||| ||||||    
T  11712124 ctcaaggaacaa 11712135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3439664 - 3439509
Alignment:
Q  164 ccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||  |||||||| ||    
T  3439664 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-aggttacaagaa 3439566  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3439565 attagc-ttgccaagttcataatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 3439509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 8154090 - 8153967
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||  ||| |||||||||| | |||||  ||| |||    
T  8154090 aaagtagtaatcaatatcaaagtaaccacaagcaacaacaataataacaa-acctagatgtaatctaggaat-aaagtgaaaaacacaaaattacatgca 8153993  T
Q  119 aaatataaagagagaagagaaacaaa 144  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||    
T  8153992 aaagataaacaaagaagagaaacaaa 8153967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 235 - 319
Target Start/End: Original strand, 41364926 - 41365010
Alignment:
Q  235 caaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41364926 caaagggatacaaatgtgttacaagaaattagcttaaacaaactcacaaagaacaaacctaatttctaccaattttcccaatctc 41365010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 29796188 - 29796397
Alignment:
Q  20 aagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaa 119  Q
    ||||| ||| || ||||||||||  | | |||||||||| |||||||||  | ||||| ||||||| |||| || ||| ||||| ||||| || ||||||    
T  29796188 aagtaataaccagtatcaaagtattctcgagcaacaacaataataacaatct-tagatttaatctagtaattaa-gtgtaaagcacaaaatcataagcaa 29796285  T
Q  120 aatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccac 218  Q
    || ||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||  || ||| |||| ||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  29796286 aagataaa-agagaagataaacaa-cacaccaaaaatgttt-accaagttcggtccaacaatgacctacattgggggagagattgatctctccaatccat 29796382  T
Q  219 tatcaatgagttttt 233  Q
    ||| |||||||||||    
T  29796383 tataaatgagttttt 29796397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 205 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10929907 - 10929811
Alignment:
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||           |||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  10929907 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagag-----------ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacataatttctacc 10929819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26403339 - 26403259
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  26403339 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 26403259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 269
Target Start/End: Original strand, 32902197 - 32902287
Alignment:
Q  180 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctt 269  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||   ||||||| || |||||||    
T  32902197 tgacctactcagggggagagattgatctctcaaattcactatcaatgaattctttagaaagagatacaaaaaagttacaagaaattagctt 32902287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 303
Target Start/End: Original strand, 3231871 - 3231944
Alignment:
Q  231 tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctac 303  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||  |||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  3231871 tttacaaagagatacaaaatggttaaaaaaaattagcttcaacaagctcacgaagaacaaagcctaatttctac 3231944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4696705 - 4696645
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||    
T  4696705 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagaga 4696645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5702592 - 5702532
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  5702592 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 5702532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 10240264 - 10240175
Alignment:
Q  215 ccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttcta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||   |||||||| || |||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10240264 ccactatcaatgagttctttacaaagagatccaacatggttacaagaaattagattcaacaagctcacaaagaacaaacccaaatttcta 10240175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 22684656 - 22684697
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22684656 ttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagaga 22684697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31071341 - 31071258
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa--gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  31071341 aacaaacacaccaaaaagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 31071258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 4162759 - 4162692
Alignment:
Q  31 aatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaa 101  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4162759 aatatcaaagtaatcacaaacaacaacaataataa-aac--ctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaa 4162692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15290687 - 15290624
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  15290687 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 15290624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15471056 - 15470993
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  15471056 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 15470993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19175865 - 19175783
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  19175865 aacaaacacacaaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcaactctccaatccactat 19175783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 30909487 - 30909389
Alignment:
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 303  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||| || |||| ||  |||||||| | ||||  || ||||||||||||    
T  30909487 atctctccaattcactatcaacgagtcattacaaagagatacaaa-gagttacaagaaattagtttaaacaagctctccaagagtaaacctaatttctac 30909389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Original strand, 32902047 - 32902180
Alignment:
Q  20 aagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaa 119  Q
    |||||||||  |||||||||| || | ||| ||||||||  || ||||| | ||||||||||||||  || ||| ||||||| | |||||||| ||||||    
T  32902047 aagtagtaactaatatcaaagcaacctcaaacaacaacaacaacaacaa-acctagatctaatctaggaaccaa-gtgaaaaacacaaaaccaaaagcaa 32902144  T
Q  120 aatataaa-gaga-gaagagaaacaaacacaccaaa 153  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  32902145 aagataaaagagaagaagagaaacaaacacagcaaa 32902180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Original strand, 42575329 - 42575392
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  42575329 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 42575392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38863985 - 38863940
Alignment:
Q  197 gagattgatctctccaatccactatcaatgagt--ttttacaaaga 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  38863985 gagattgatctctccaatccactatcaacgagttcttttacaaaga 38863940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3874342 - 3874301
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3874342 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 3874301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4424350 - 4424309
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4424350 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 4424309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Original strand, 7412326 - 7412409
Alignment:
Q  139 aacaaacacacca--aagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  7412326 aacaaacacaccatgaaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 7412409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 14419193 - 14419234
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14419193 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 14419234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14808093 - 14808052
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14808093 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 14808052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18811039 - 18810998
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18811039 ttgacccagttcggttcaaattgacctaatctgggggagaga 18810998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23799686 - 23799626
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  23799686 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagaga 23799626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27829628 - 27829587
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27829628 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 27829587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 30480506 - 30480547
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30480506 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 30480547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 122)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 29196238 - 29196550
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaaca-caagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  29196238 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctggtaatcaaagtgaaaagctcaa 29196337  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatct 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29196338 aaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatct 29196437  T
Q  208 ctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29196438 ctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttccaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccca 29196537  T
Q  307 ttttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||    
T  29196538 ttttcccaatctc 29196550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 44700332 - 44700641
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44700332 ggagcaaagaaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaa 44700431  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  44700432 accacaagcaaaggataaagagagaagagaaacaaacacacgaaagattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatgt-ggggagagattgatctc 44700530  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44700531 tccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 44700630  T
Q  309 ttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||    
T  44700631 ttcccaatctc 44700641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 31314760 - 31314450
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31314760 ggagcaaaggaaagtaataactaatattaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctaaatataatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaa 31314661  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  31314660 accacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgactcagttcggtccaacttgacctaatatgggggagatattgatctc 31314561  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31314560 tccaatccactatcaaagagttcttacaaaaagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagatcacaatgaacaaccctaatttctacccatt 31314461  T
Q  309 ttcccaatctc 319  Q
    ||| |||||||    
T  31314460 ttctcaatctc 31314450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 39153213 - 39153524
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||  || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39153213 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcggcagcaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaa 39153312  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatct 207  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39153313 accacaagcacaagataaagggagaagagaaacaaaacacaacaaagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagagattgttct 39153412  T
Q  208 ctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| || |||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39153413 ctccaatccactatcaatgagttcttataaagggatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaatgaacaaacctaatttctacccat 39153512  T
Q  308 tttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||    
T  39153513 tttcccaatctc 39153524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 761164 - 760852
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||  |||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  761164 ggagcaaaggaaagtagtaaccaaaatcaaagtgaactcaagcaataacaacaatagcagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaa 761065  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatc 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  761064 accacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttaacccatttcagtccaacttgacctaatctgggggagagattgatc 760965  T
Q  207 tctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  760964 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacagacctaatttctaccca 760865  T
Q  307 ttttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||    
T  760864 ttttcccaatctc 760852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 22834855 - 22835165
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  22834855 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaggtaataacaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaa 22834954  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatct 207  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22834955 accacaagcaaaagataaaggaagaagagaaagaaaacacaccaaatattgttgacc-agttcggtccaacttgacctaatatggcggagagattgatct 22835053  T
Q  208 ctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22835054 ctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccat 22835153  T
Q  308 tttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||    
T  22835154 tttcccaatctc 22835165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Original strand, 23391771 - 23392068
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaag-ctcaaaaccacaagc 117  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  23391771 aaagtaataaccaatatcaaagtgaacacaagaaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaaacacaaaaccacaagc 23391870  T
Q  118 aaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatcca 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23391871 aaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagatttatctctacaatcca 23391970  T
Q  218 ctatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaa 315  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  23391971 ctatcaaagagttcttgcaaagtgatacaaatgggttacaagaaattatcttaaacaagctcacaaagaacaaacttaatttctactcattttcccaa 23392068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 9666318 - 9666630
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaaca-caagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9666318 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaataacaagcaactacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaa 9666417  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatct 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  9666418 aaccacaagcaaaagataaagagataagagaaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaactttacctaatctgggggagagatcaatct 9666517  T
Q  208 ctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccca 306  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||| || ||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  9666518 ctccaatccactatcaaagaattcttacaaagaggtataaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctaccca 9666617  T
Q  307 ttttcccaatctc 319  Q
    |||| ||||||||    
T  9666618 tttttccaatctc 9666630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 19683736 - 19684052
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||    
T  19683736 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaataaaagtgaaaaacacaa 19683835  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| | ||| |||||||||    
T  19683836 aaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagatt 19683935  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19683936 gatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 19684035  T
Q  303 cccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||||||    
T  19684036 cccattttcccaatctc 19684052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29813381 - 29813068
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29813381 ggagcaaagaaaagtagtaactaatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaagaatcaaagtgaaaagctcaa 29813282  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaagagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgat 205  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29813281 aaccacaaccaaaagataaagggagaagagaggaacaaacacatcaaagattgttgacccagttcggtccaacatgaccaaatctgggggagagattgat 29813182  T
Q  206 ctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccc 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  29813181 ctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatgcaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacct 29813082  T
Q  306 attttcccaatctc 319  Q
    ||||| ||||||||    
T  29813081 atttttccaatctc 29813068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 40734817 - 40734503
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||  |  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||    
T  40734817 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagaaataataaaaaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgcaaagcacaa 40734718  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa-gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 204  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40734717 atccacaagcaaaagataaaggagagaagagaggaacaaacactccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattga 40734618  T
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| || |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40734617 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgtgttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 40734518  T
Q  305 cattttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||||    
T  40734517 cattttcccaatctc 40734503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 40735702 - 40735388
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||  ||||||| || ||||||||||| ||  || ||||||||||||| |||    
T  40735702 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaatataggaaccaaagtgaaaagcacaa 40735603  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaag-agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 204  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40735602 atccacaagcaaaagataaaggagagaagagaggaacaaatacaccaaagattgctgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 40735503  T
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40735502 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaactggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 40735403  T
Q  305 cattttcccaatctc 319  Q
    ||||||| |||||||    
T  40735402 cattttctcaatctc 40735388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29682676 - 29682364
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| ||| || ||||| || |||||||| ||||  |||| || || |||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||    
T  29682676 ggagcaaaggaaagtagtaatcaaaattaaagtgaatacaagcaataacaacaatagcagcacctagatctaacctaggaatcaaagtgaaaaactcaaa 29682577  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatc 206  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29682576 accacaagcaaaagataaagggagaagagagaaacatacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgatctaatctaggggagagattgatc 29682477  T
Q  207 tctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  29682476 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggtgacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacataatttctaccca 29682377  T
Q  307 ttttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||    
T  29682376 ttttcccaatctc 29682364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29811188 - 29810873
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29811188 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagagaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaa 29811089  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29811088 aaccacaagcaaaagataaagggagagaagagatgaacaaacacaccaaagattgttgacccaattcggtttaacttgacctaatctgggggagagattg 29810989  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  29810988 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaactctaatttctac 29810889  T
Q  304 ccattttcccaatctc 319  Q
      ||||||| ||||||    
T  29810888 atattttcctaatctc 29810873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 51399134 - 51398819
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||    
T  51399134 ggagcaaaggaaagtagaaaacaatatcaaagtgagcactagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagtacaa 51399035  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  51399034 aaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgaccaagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagataa 51398935  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  51398934 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcactaagaacaaccctaatttctac 51398835  T
Q  304 ccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||| ||||||||    
T  51398834 ccatttttccaatctc 51398819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 5236315 - 5236619
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc 117  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||  ||||| | |  ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5236315 aaagtagtaatcgatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataagagctcctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaatccacaagc 5236414  T
Q  118 aaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaa 213  Q
    |||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  5236415 aaaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagtttggtccaaattgacctaatctggggaa-agattgatctctcgaa 5236513  T
Q  214 tccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 313  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5236514 tccattatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 5236613  T
Q  314 aatctc 319  Q
    ||||||    
T  5236614 aatctc 5236619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16499334 - 16499035
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||         |||||||| ||| ||||||||||  ||||||| |||||||  ||||    
T  16499334 ggagcaaaggaaagtagtaaccaacatcaaagtaaacacaagcaa---------taacaacacctaaatctaatctaggaatcaaa-tgaaaagtacaaa 16499245  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16499244 accacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaatacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttaacctactctgggggagagattgatctc 16499145  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  16499144 tccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaa-aacaaccctaatttctatccgtt 16499046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9581593 - 9581297
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc 117  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9581593 aaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctatgaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagc 9581494  T
Q  118 aaaatataaagagaga----agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctcca 212  Q
    | || |||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9581493 acaaaataaagggagagaagagagaaacaaacacatcaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctcca 9581394  T
Q  213 atccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattt 309  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || || |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9581393 atccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttaaaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattt 9581297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 7762586 - 7762270
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||  |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||    
T  7762586 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagtaataatcaacaataacaacacctagatctaatttaggaatcaaagtgaaaagcacaa 7762487  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  7762486 aaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacatcatagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 7762387  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7762386 gatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 7762287  T
Q  303 cccattttcccaatctc 319  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  7762286 ccctttttctcaatctc 7762270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 37408779 - 37408463
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||| ||||| | ||||| ||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |    
T  37408779 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacta 37408680  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    || ||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  37408679 aatcacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagatt 37408580  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37408579 gatctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 37408480  T
Q  303 cccattttcccaatctc 319  Q
    ||| |||||||||||||    
T  37408479 ccctttttcccaatctc 37408463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 23410190 - 23410485
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaag--ctcaaaaccacaag 116  Q
    ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||||||||||||    
T  23410190 aaagtagtaacatatatcaaagtgaacacaagcaacaaaaatattaacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtaaaaaaaactcaaaaccacaag 23410289  T
Q  117 caaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatcc 216  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23410290 caaaagataaagagagaatataaacaaacacaccaaagattgttgacccaattcgttccaacttgacctaatttgggggagagatttatctctccaatcc 23410389  T
Q  217 actatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcc 312  Q
    | |||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||| |  || |||||||  |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  23410390 attatctaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttatacgaaattagcttaaacaagctcacaaagaataaacataatttctacccattttcc 23410485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 67 - 319
Target Start/End: Original strand, 53921414 - 53921666
Alignment:
Q  67 aacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgaccca 166  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | || | |||    
T  53921414 aacatcttgatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaaacaaaatataaagagagaagagaaacaaacacactaagaaatgtttatcca 53921513  T
Q  167 gtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttag 266  Q
    ||| |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||| || ||||    
T  53921514 gttcggtcaaacttgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaatgatacaaatgagttacaagaaattag 53921613  T
Q  267 ctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53921614 ctttaacaagctcacaaacaacaaacctaatttctacccatttttccaatctc 53921666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 5257992 - 5258308
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  5257992 ggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaa 5258091  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||    
T  5258092 a-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggagaagagatt 5258190  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5258191 gaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 5258290  T
Q  303 ccc-attttcccaatctc 319  Q
    |||  |||||||||||||    
T  5258291 cccttttttcccaatctc 5258308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7764775 - 7764483
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc 117  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  7764775 aaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatcttggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaac 7764676  T
Q  118 aaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaactt-gacctaatctgggggagagattgatctctcca 212  Q
    |||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| |||| || || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  7764675 aaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctcca 7764576  T
Q  213 atccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccc 305  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7764575 atccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc 7764483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 48 - 319
Target Start/End: Original strand, 32744335 - 32744598
Alignment:
Q  48 aagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacac 147  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  32744335 aagcaacaacaatgataacaacacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaa-------accacaagcaaaagataaagagatatgagaaacaaacac 32744427  T
Q  148 accaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaa 247  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  32744428 accaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggatagatttatctcttcaatccactatcaaagagttcttacaaagtgatacaa 32744527  T
Q  248 atgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||| ||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  32744528 atgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaa-actaatttctacccattttttcaatctc 32744598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 45095482 - 45095169
Alignment:
Q  10 gagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||  ||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| | ||| | ||||    
T  45095482 gagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacatagatctaatctatgaatcaaagagtaaaacacaaa 45095383  T
Q  109 accacaagcaaaatataaa--gagagaa--gagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
     |||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||| || ||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||    
T  45095382 -ccacaagcaaaagataaaaggagagaatagagaaacaaatacgccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattg 45095284  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  45095283 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta- 45095185  T
Q  304 ccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||||||    
T  45095184 ccattttcccaatctc 45095169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 32891410 - 32891108
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||         ||| ||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  32891410 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtaaacacaagcaacaaca---------acacctagatctaatataggaatcaaagtgaaaaactcaaa 32891320  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatct 207  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||| | |||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  32891319 accacaagcaaaagataaggagagaagagaaacaaacacaccaagaaatgatt-atccagttcggtccaacatgacctactccgggggagagatttatct 32891221  T
Q  208 ctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccca 306  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  32891220 ctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctaccca 32891121  T
Q  307 ttttcccaatctc 319  Q
    ||||| |||||||    
T  32891120 ttttctcaatctc 32891108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 139 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 34491397 - 34491217
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaa 238  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34491397 aacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaa 34491298  T
Q  239 gagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34491297 gagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 34491217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 5260171 - 5260487
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| ||||| |||||| |   ||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||    
T  5260171 ggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatttaggaatcaaagtgaaaagcacaa 5260270  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||||| | ||| | |||||||    
T  5260271 a-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactttggagaagagatt 5260369  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5260370 gaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 5260469  T
Q  303 ccc-attttcccaatctc 319  Q
    |||  |||||||||||||    
T  5260470 cccttttttcccaatctc 5260487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 159 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 30236290 - 30236130
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaa 258  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30236290 ttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaa 30236191  T
Q  259 aaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30236190 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 30236130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 124 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 44331744 - 44331550
Alignment:
Q  124 taaagagagaagagaaacaa-acacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc 222  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44331744 taaagagagaagagaaacaagagaaac--aagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc 44331647  T
Q  223 aatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44331646 aataagttcttacaaagagatacaaatggcttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcctaatctc 44331550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 9635972 - 9636290
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||    
T  9635972 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataa 9636071  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa---gagagaagaga--aacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    | | ||||||| || |||||   ||||| |||||  |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||| ||||||||| | ||| |||||||    
T  9636072 atc-acaagcacaagataaaagggagagcagagagaaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactttggaggagaga 9636170  T
Q  201 ttgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttc 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9636171 ttgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttc 9636270  T
Q  301 tacccattt-tcccaatctc 319  Q
    ||||| ||| ||||||||||    
T  9636271 tacccttttctcccaatctc 9636290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 54593866 - 54593709
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54593866 acccagtttggtccaacttgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaataa 54593767  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  54593766 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctgcacattttcccaatctc 54593709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 166 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 46173515 - 46173365
Alignment:
Q  166 agtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaactta 265  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  46173515 agttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatta 46173416  T
Q  266 gctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaat 316  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  46173415 gcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttaccaat 46173365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Original strand, 23200119 - 23200301
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttaca 236  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  23200119 aaacaaagacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttaca 23200218  T
Q  237 aagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    || ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  23200219 aaaagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaactctaatttctaccatttttcccaatctc 23200301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 319
Target Start/End: Original strand, 23197850 - 23198102
Alignment:
Q  73 tagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattattgaccca 166  Q
    |||||||||||||  || |||| |||||| | |||| ||||||||| || |||||    ||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||    
T  23197850 tagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaa-ccacaagcacaagataaaaggagagagaagaggaaaacaaagacaccaaagattgttcaccca 23197948  T
Q  167 gtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaactta 265  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| || |||    
T  23197949 gttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaaagggttacaagaaatta 23198048  T
Q  266 gctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  23198049 gctttgacaagttcacaaaaaacaactctaatttctaccatttttcccaatctc 23198102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 159 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 47304416 - 47304256
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaa 258  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  47304416 ttgacccagttcggtcaaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacgaagagatacagatgggttacaa 47304317  T
Q  259 aaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |  ||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  47304316 gatattaacttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctacccattttctcaatctc 47304256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 165 - 319
Target Start/End: Original strand, 6095608 - 6095762
Alignment:
Q  165 cagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaactt 264  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  6095608 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatt 6095707  T
Q  265 agctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    | |||  | ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6095708 aacttcaagaagtttacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctc 6095762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 159 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4570118 - 4569957
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttaca 257  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4570118 ttgacccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttaca 4570019  T
Q  258 aaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    | || |||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4570018 agaaattagcttcaataagctcacaatgaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 4569957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Original strand, 49199465 - 49199633
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaa-tg 250  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  49199465 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatg 49199564  T
Q  251 ggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49199565 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctc 49199633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Original strand, 41819528 - 41819686
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaa-tgggttacaaa 259  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||     
T  41819528 acccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaag 41819626  T
Q  260 aacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41819627 aaattagcttagacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 41819686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 180 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 46860618 - 46860479
Alignment:
Q  180 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctc 279  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||    
T  46860618 tgacctactctggaggaaagattgatctctccaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctc 46860519  T
Q  280 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  46860518 acaaagaacaaacctaatttctacccattttctcaatctc 46860479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Original strand, 43401797 - 43401965
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaa-tg 250  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||    
T  43401797 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaaaatg 43401896  T
Q  251 ggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43401897 cgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 43401965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Original strand, 7779984 - 7780166
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac 235  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7779984 aaacaaagacaccaagagattgttcacccactttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttac 7780083  T
Q  236 -aaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7780084 aaaagagatacaaa-aggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 7780166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Original strand, 43403740 - 43403908
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaa-atg 250  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||    
T  43403740 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagataaaacatg 43403839  T
Q  251 ggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     ||||||| || | |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43403840 agttacaagaaatgagcttcaacaagctcacaaagaacaagcctaatttctacccattttcccaatctc 43403908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 153 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 40913464 - 40913359
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatggg 252  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  40913464 agattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttacaaagagatacaaatgag 40913365  T
Q  253 ttacaa 258  Q
    ||||||    
T  40913364 ttacaa 40913359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 801280 - 801096
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac 235  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  801280 aaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaatgagttcttac 801181  T
Q  236 -aaagagatac-aaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||||| ||| | ||||||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  801180 aaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 801096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 2074930 - 2075149
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |  ||||| || | | |||| |||||||  || ||| ||||||| | ||||    
T  2074930 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaaataaccacaagcaacaataacaataataa-acccagatttaatctaggaaacaa-gtgaaaaacacaaa 2075027  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |  | | || |||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2075028 accacaagcaaaagataaagagagaagagaaataaacacacccagaaatgtttacccagttcgatccaacttgacctactctcggggagagattgatctc 2075127  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtt 230  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  2075128 tcaaatccactatcaattagtt 2075149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 152
Target Start/End: Original strand, 21350869 - 21350999
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21350869 aaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaaacaacaaca---ataacaacacttagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcataaccacaagca 21350965  T
Q  119 aaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaa 152  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21350966 taagataaagtgagaagagaaacaaacacaccaa 21350999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 223
Target Start/End: Original strand, 27305565 - 27305777
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||  | | |||||||||| | ||||    
T  27305565 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaacaacaagcaacaacaacaataacca-acctagatctaatctaggagt-aaagtgaaaaacacaaa 27305662  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  | | |  || ||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  27305663 accacaaacaaaagataaatagagaagagaaacaaacacacaaagaaatgtatacacagttcggtccaaattgacctactttggaggagagattgatctc 27305762  T
Q  209 tccaatccactatca 223  Q
    |||||||||||||||    
T  27305763 tccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 36018987 - 36018860
Alignment:
Q  189 ctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaa-tgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaa 287  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||  ||||||||||||||||    
T  36018987 ctgggggagagattgacctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgagttacaagaaattaacttcaacaagctcacaaagaa 36018889  T
Q  288 caaccctaatttctacccattttcccaat 316  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36018888 caaccctaatttcaacccattttcccaat 36018860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 33192056 - 33191866
Alignment:
Q  99 aaagctcaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggag 197  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||| | | || ||| ||||| |||||||  ||||||  ||||| | ||    
T  33192056 aaagcacaaaaccacaaacaaaagataaatcgagaaaagaaacaaacacaccaaaaaatgtttaccaagttttgtccaacaatgacctcctctggag-ag 33191958  T
Q  198 agattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaa 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||||    
T  33191957 agattgatctctctaatccactatcaatgagttctttacaaagacata-aaat-ggttacaagaacttagcttcaacaagctctctaagaacaa 33191866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 148
Target Start/End: Original strand, 51351988 - 51352125
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| || ||  |||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||    
T  51351988 ggagcaaaggaaagtggtaaccaatatcaaagtaatcacaagcagcagcaacaataacaa-acctagatctaatctaggaatcaaa-tgaaaaacacaaa 51352085  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacaca 148  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51352086 accacaagtaaaagataaagagagaagagaaacaaacaca 51352125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6716671 - 6716505
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatg 250  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||      
T  6716671 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 6716573  T
Q  251 ggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6716572 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 6716505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 54635296 - 54635130
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatg 250  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||      
T  54635296 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 54635198  T
Q  251 ggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54635197 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 54635130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 319
Target Start/End: Original strand, 31340268 - 31340364
Alignment:
Q  223 aatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  31340268 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacctcaatttctaccaattttcccaatctc 31340364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 307
Target Start/End: Original strand, 55301996 - 55302132
Alignment:
Q  180 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggt---------tacaaaaacttagcttt 270  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||         ||||| || |||||||     
T  55301996 tgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgaattcttacaaagagatacaaataggttacaagaaatacaagaaattagcttc 55302095  T
Q  271 gacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccat 307  Q
     |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55302096 aacaaacttacaaagaacaaccctaatttctacccat 55302132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 319
Target Start/End: Original strand, 4055796 - 4055926
Alignment:
Q  187 atctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttt-ttacaaagagatacaaatg-ggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaa 284  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || ||| |||| ||||| || | ||    
T  4055796 atctgggggagaga--gatctcttcaatccactatcaatgagtttcttacaaagagatacaaaagaggttacaagaaattaacttttacaagttctccaa 4055893  T
Q  285 gaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4055894 gaacaa-cctaatttctaccca-tttcccaatctc 4055926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 319
Target Start/End: Original strand, 51352150 - 51352273
Alignment:
Q  195 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccc 293  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||| | |||||||||| |||| |||||    
T  51352150 gagagattgatctctcaaatccactctcaatgagttattacaaagaaatacaaat-ggttacaagaaattaactttaaaaagctcacaatgaacaaaccc 51352248  T
Q  294 taatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||| |||||  |||||||| ||||||    
T  51352249 taacttcta-tcattttcctaatctc 51352273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 231 - 304
Target Start/End: Original strand, 5433951 - 5434025
Alignment:
Q  231 tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5433951 tttacaaagagatataaaagggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacc 5434025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 319
Target Start/End: Original strand, 4075449 - 4075636
Alignment:
Q  134 agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaact-tgaccta-atctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttt 231  Q
    |||||||||||||||| |||| ||  | |||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4075449 agagaaacaaacacac-aaagtttggttacccagttcggcccaacaatgacctacatctgggggagag--tgatctctccaatccactatcaaagagttt 4075545  T
Q  232 -ttacaaagagatacaaatg-ggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaacc--ctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||| |||||||| | |||||||| || ||| |||| ||||| || | ||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4075546 cttacaaagtgatacaaaagaggttacaagaaattaacttttacaagttctctaagaacagcctaataatttctaccca-tttcccaatctc 4075636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 309
Target Start/End: Original strand, 35138746 - 35138859
Alignment:
Q  197 gagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaacccta 295  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||| || ||| |||  |||| ||||| |||||||| | ||    
T  35138746 gagattgttctcttccatccactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttgcaagaaattaacttcaacaaactcaccaagaacaaacata 35138845  T
Q  296 atttctacccattt 309  Q
    ||||||||||||||    
T  35138846 atttctacccattt 35138859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 45283134 - 45282988
Alignment:
Q  176 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtttttac----aaagagatacaaatgggttacaaaaacttagcttt 270  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||    |||| ||||||||  |||||||| || ||||| ||    
T  45283134 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-tt 45283037  T
Q  271 gacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45283036 gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 45282988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3617622 - 3617454
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttac-aaagagatacaaa 248  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||    
T  3617622 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 3617524  T
Q  249 tgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
      |||||||| || ||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3617523 gaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc 3617454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 103
Target Start/End: Original strand, 9634669 - 9634764
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagc 103  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9634669 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagc 9634764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20937790 - 20937668
Alignment:
Q  190 tgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac 288  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || ||| |||  |||||||| | || |||    
T  20937790 tgggggaacgattgatctctccaatcta-tatcaatgagttcttttcaaagagatacaaaagggttacaagaaattaacttcaacaagctctccaaaaac 20937692  T
Q  289 aaccctaatttctacccattttcc 312  Q
    || | ||||||||||| |||||||    
T  20937691 aaacataatttctacctattttcc 20937668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 319
Target Start/End: Original strand, 26386597 - 26386644
Alignment:
Q  272 acaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26386597 acaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctc 26386644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 25637590 - 25637431
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttac-aaagagatacaaatgggttaca 257  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||  |||||||    
T  25637590 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagaggttaca 25637492  T
Q  258 aaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    | || ||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25637491 agaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc 25637431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 205 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 5373353 - 5373236
Alignment:
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagttt-ttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttcta 302  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  5373353 tctctccaatccattggcaatgagttccttacaaagagatataaaagggttacaataaattagcttcaacaagctcaaaaagaacaaagcctaatttcta 5373254  T
Q  303 ccc-attttcccaatctc 319  Q
    |||  |||||||||||||    
T  5373253 cccttttttcccaatctc 5373236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 25795768 - 25795829
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25795768 aacaaacacaccaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 25795829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8370587 - 8370505
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  8370587 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 8370505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27975053 - 27974971
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  27975053 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 27974971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27986547 - 27986465
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  27986547 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 27986465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 304
Target Start/End: Original strand, 54739004 - 54739102
Alignment:
Q  207 tctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | |||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  54739004 tctccaatccactatcaatgagttctttacagagagatataaaagagttacataaa-ttagtttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctacc 54739102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1417594 - 1417529
Alignment:
Q  134 agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1417594 agaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 1417529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 30709891 - 30709829
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30709891 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 30709829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33386770 - 33386685
Alignment:
Q  136 agaaacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  33386770 agaaacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 33386685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 21711211 - 21711271
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21711211 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 21711271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 48438202 - 48438262
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48438202 aacaaacacaccaa-gattattgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 48438262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 302
Target Start/End: Original strand, 25491014 - 25491114
Alignment:
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttct 301  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||  || || || | |||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25491014 gatctctccacttcactatcaatgatttctttacaaagagatacaaaaggagtataagaaatcagcttcaacaagctctcaaagaacaaacctaatttct 25491113  T
Q  302 a 302  Q
    |    
T  25491114 a 25491114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10209338 - 10209275
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  10209338 acccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 10209275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Original strand, 32143307 - 32143389
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  32143307 aacaaacacaccaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 32143389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1736404 - 1736344
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1736404 aacaaacacaccaat-attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 1736344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18552982 - 18552922
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18552982 aacaaatacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 18552922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 37466279 - 37466339
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37466279 aacaaacacaccaa-gattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 37466339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40592881 - 40592821
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  40592881 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagaga 40592821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4386941 - 4386868
Alignment:
Q  236 aaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttt 310  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  4386941 aaagtgatacaaatgggttacaagaaattagctt--aaaagctcacaaagaacaaaacctaatttctactcatttt 4386868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 290
Target Start/End: Original strand, 1313852 - 1313939
Alignment:
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaa 290  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| || || ||| || |||||||| |||||||| | ||||||||    
T  1313852 atctctctaatccaatatcaatgagttcttttcaaagatatacaaaaggcttgcaagaaattagctttaacaagctctccaagaacaa 1313939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Original strand, 4598528 - 4598591
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  4598528 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 4598591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10056382 - 10056319
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  10056382 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 10056319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10058604 - 10058541
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  10058604 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 10058541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10060826 - 10060763
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  10060826 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 10060763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10063048 - 10062985
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  10063048 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 10062985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10065270 - 10065207
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  10065270 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 10065207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10211558 - 10211495
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  10211558 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 10211495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Original strand, 16264336 - 16264418
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  16264336 aacaaacacacaaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 16264418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Original strand, 27452944 - 27453026
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  27452944 aacaaacacaccaaaagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagc-agctctccaatccactat 27453026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39040093 - 39040011
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||  ||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||    
T  39040093 aacaaacacaccaaaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagaga-acaactctccaatccactat 39040011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3716106 - 3716041
Alignment:
Q  134 agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||||||    
T  3716106 agaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagaga 3716041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6794812 - 6794732
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  6794812 aacaaacacaccaa-gattgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 6794732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 200
Target Start/End: Original strand, 26298971 - 26299036
Alignment:
Q  134 agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||  |||| ||||||||||||||||    
T  26298971 agaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagaga 26299036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 458540 - 458499
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  458540 ttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagaga 458499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1313665 - 1313624
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  1313665 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 1313624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1321735 - 1321694
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  1321735 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 1321694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3859783 - 3859742
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3859783 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 3859742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5886454 - 5886413
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5886454 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 5886413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5899927 - 5899886
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5899927 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 5899886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6484616 - 6484575
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6484616 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 6484575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 7606589 - 7606630
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7606589 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 7606630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 10958324 - 10958365
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10958324 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 10958365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11168357 - 11168316
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11168357 ttgaccaagtttggtccaaattgacctagtctgggggagaga 11168316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25389161 - 25389120
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25389161 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 25389120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 25688161 - 25688202
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25688161 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 25688202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 27635659 - 27635700
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27635659 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 27635700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 35919116 - 35919157
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35919116 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 35919157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 41849315 - 41849274
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  41849315 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 41849274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 42990560 - 42990519
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  42990560 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 42990519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 42992526 - 42992485
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  42992526 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 42992485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 43421416 - 43421457
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  43421416 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 43421457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 47924005 - 47923945
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||  ||||||||||| |||||||||    
T  47924005 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagaga 47923945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 53894058 - 53894099
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  53894058 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 53894099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26720802 - 26720762
Alignment:
Q  160 tgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26720802 tgacccagttcggtccaaattgacctaatctaggggagaga 26720762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 80)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11067620 - 11067313
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11067620 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaa 11067521  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11067520 accacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgaccgagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 11067421  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    | ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11067420 ttcaatccattataaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagtacaacactaatttctacccatt 11067321  T
Q  309 ttcccaat 316  Q
    || |||||    
T  11067320 tttccaat 11067313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 723595 - 723907
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  723595 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaatcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaa 723694  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagag--aaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatc 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  723695 accacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatc 723794  T
Q  207 tctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  723795 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccca 723894  T
Q  307 ttttcccaatctc 319  Q
     ||| ||||||||    
T  723895 gttttccaatctc 723907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29868188 - 29867874
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29868188 ggagcaaagaaaagtagtaatcaattttaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaa 29868089  T
Q  109 accacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 204  Q
    |||||||||| || |||||  |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29868088 accacaagcacaagataaacggagagaagagagaaacaaacacatcaaagattattgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattga 29867989  T
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29867988 tctctccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 29867889  T
Q  305 cattttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||||    
T  29867888 cattttcccaatctc 29867874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Original strand, 11151444 - 11151751
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11151444 ggagcaaataaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaataataacaacagctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaa 11151543  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11151544 accacaaacaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaggttgatctc 11151643  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11151644 tccaatccactatctaagagttcttacaaagtgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctacccatt 11151743  T
Q  309 ttcccaat 316  Q
    ||||||||    
T  11151744 ttcccaat 11151751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 34139621 - 34139934
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34139621 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaataataacaagacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaa 34139720  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagaga--agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatc 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34139721 accacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatc 34139820  T
Q  207 tctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccc 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34139821 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagggatacatatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccc 34139920  T
Q  306 attttcccaatctc 319  Q
    |||||| |||||||    
T  34139921 attttctcaatctc 34139934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 33162302 - 33162606
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaaca-caagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33162302 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaa 33162401  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatct 207  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33162402 aaccacaagcaaaagataaatagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctaggggagagattgatct 33162501  T
Q  208 ctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccat 307  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33162502 ctctaatccactatcaatgagttcttacagagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccat 33162601  T
Q  308 tttcc 312  Q
    |||||    
T  33162602 tttcc 33162606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 14633686 - 14633989
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14633686 aaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaatca 14633785  T
Q  119 aaatataaagagaga--agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatcc 216  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633786 aaagataaagagagaatagagaaacaaacacaccaaagattgttgactcagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatcc 14633885  T
Q  217 actatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaa 315  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  14633886 actatctatgagttcttacaaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccattttaccaa 14633985  T
Q  316 tctc 319  Q
    ||||    
T  14633986 tctc 14633989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 36317872 - 36318172
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36317872 aaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacagcaataataacaacacctagatttaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagca 36317971  T
Q  119 aaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccac 218  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  36317972 aaagataaagaaagaagataaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctactctaagggagagattgatctctccaatccac 36318071  T
Q  219 tatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatct 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36318072 tatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatct 36318171  T
Q  319 c 319  Q
    |    
T  36318172 c 36318172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 42362665 - 42362357
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  42362665 ggagcaaaggaaagtagtaaccaaaatcaaagtgaactcaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaa 42362566  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatc 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42362565 accacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttgacccag----gtccaacttgacctaatctgggggagagatagatc 42362470  T
Q  207 tctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42362469 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccca 42362370  T
Q  307 ttttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||    
T  42362369 ttttcccaatctc 42362357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 36773868 - 36773567
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacac-aagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc 117  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  36773868 aaagtagtaaccaatatcaaagccaacaagaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaataaaaaagaaaagctcaaaaccacaagc 36773769  T
Q  118 aaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatcca 217  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36773768 aaaagataaagaaagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacataatctgggggagagattgatctctccaatcca 36773669  T
Q  218 ctatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatc 317  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  36773668 ctatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttattcccattttcccaatc 36773569  T
Q  318 tc 319  Q
    ||    
T  36773568 tc 36773567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 38312560 - 38312245
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  38312560 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaa 38312461  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38312460 aaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacatcaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacataatctgggggagagattg 38312361  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38312360 atctctccaatccactatcaatgagatcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctac 38312261  T
Q  304 ccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||||||    
T  38312260 ccattttcccaatctc 38312245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 319
Target Start/End: Original strand, 17057218 - 17057532
Alignment:
Q  10 gagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||    
T  17057218 gagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaa 17057317  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagaga----agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 204  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17057318 accacaagcaaaagataaagggagagacgagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagagattga 17057417  T
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17057418 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaacaaccctaatttctacc 17057517  T
Q  305 cattttcccaatctc 319  Q
    |||||| ||||||||    
T  17057518 catttttccaatctc 17057532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 319
Target Start/End: Original strand, 17085201 - 17085515
Alignment:
Q  10 gagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||    
T  17085201 gagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaa 17085300  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagaga----agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 204  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17085301 accacaagcaaaagataaagggagagacgagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagagattga 17085400  T
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17085401 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaaaaaattagcttcaacaagcttgcaaagaacaaccctaatttctacc 17085500  T
Q  305 cattttcccaatctc 319  Q
    |||||| ||||||||    
T  17085501 catttttccaatctc 17085515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39285154 - 39284930
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39285154 ggagcaaagaaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaa 39285055  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacacc---aaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgat 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39285054 accacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccattaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgat 39284955  T
Q  206 ctctccaatccactatcaatgagtt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39284954 ctctccaatccactatcaatgagtt 39284930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 2334276 - 2334581
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2334276 aaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctggtaatcaaagtgaaaacttcaaaaccacaagca 2334375  T
Q  119 aaatataaagagaga----agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaa 213  Q
     || |||||| ||||    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2334376 caagataaagggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcccccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaa 2334475  T
Q  214 tccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| | || |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2334476 tccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttactagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaacccttatttctacccattttccc 2334575  T
Q  314 aatctc 319  Q
    ||||||    
T  2334576 aatctc 2334581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 317
Target Start/End: Original strand, 36987923 - 36988237
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  36987923 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaa 36988022  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    | |||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  36988023 agccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 36988122  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36988123 gatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagttttgacaagctcacatagaacaaccctaatttcta 36988222  T
Q  303 cccattttcccaatc 317  Q
    ||| |||| ||||||    
T  36988223 cccttttttccaatc 36988237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 61 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 11690765 - 11690506
Alignment:
Q  61 aataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagattat 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  11690765 aataacaacacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaagataaagggagaagagaaacaaaacacaccaaagattgt 11690666  T
Q  160 tgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaa 259  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||     
T  11690665 tgatccagttcggtccaacttgacgtaatatgggggagaggttgatctctccaatccactatcaacgatttcttacaaagggatacaaatgggttacaag 11690566  T
Q  260 aacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11690565 aaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctc 11690506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 45100074 - 45099759
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  45100074 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaa 45099975  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    | | ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  45099974 atc-acaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 45099876  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45099875 gaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 45099777  T
Q  303 ccc-attttcccaatctc 319  Q
    |||  |||||||||||||    
T  45099776 cccttttttcccaatctc 45099759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 14202282 - 14202568
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14202282 aaagtagtaatcaatatcaaagtgaacgcaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcttaaaaccacaagca 14202381  T
Q  119 aaatataaagagagaagag--aaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatcc 216  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||         |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  14202382 aaagataaagagagaagagataaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggt---------cctaatcttggggagagattgatctctccaatct 14202472  T
Q  217 actatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaat 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||        ||| ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14202473 actatcaatgagttcttacaaag-------gatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacataatttctacccattttcccaat 14202565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 6594852 - 6595154
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  6594852 ggagcaaagtaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagtaataatcaacaataacagcacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaa 6594951  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa---gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagat 201  Q
    |||||||||||||| |||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  6594952 aaccacaagcaaaagataaaagggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagat 6595051  T
Q  202 tgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttct 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6595052 tgatctctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagattcaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttct 6595151  T
Q  302 acc 304  Q
    |||    
T  6595152 acc 6595154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 5723104 - 5723418
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||  ||||||| |||    
T  5723104 ggagcaaagtaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaaacaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaaaagaaaagcacaa 5723203  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaa--gagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    | |||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||| ||| | |||||||||    
T  5723204 a-ccacaagcaaaagataaaaggagagaatagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttaacctactctagaggagagatt 5723302  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  5723303 gatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaaaggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaagcctaatttcta 5723402  T
Q  303 cccattttcccaatctc 319  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  5723403 ccc-ttttctcaatctc 5723418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 36205513 - 36205827
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||    
T  36205513 ggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcagaa 36205612  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||    
T  36205613 a-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggatagatt 36205711  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    || ||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36205712 gaactctccaatccgctgtcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 36205810  T
Q  303 cccattttcccaatctc 319  Q
    ||  |||||||||||||    
T  36205811 ccatttttcccaatctc 36205827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 304
Target Start/End: Original strand, 4502991 - 4503280
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc 117  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4502991 aaagtagtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaac-acaagc 4503089  T
Q  118 aaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctcca 212  Q
    | || |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  4503090 acaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctcca 4503189  T
Q  213 atccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4503190 atccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 4503280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 45727091 - 45726934
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  45727091 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaa 45726992  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45726991 attagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccattttcccaatctc 45726934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 155 - 319
Target Start/End: Original strand, 42288110 - 42288273
Alignment:
Q  155 attattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggtt 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  42288110 attattgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggg-agagattgatctctccaatccattatcaatgagctcttacaaagaaatacaaatgggtt 42288208  T
Q  255 acaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42288209 acaataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctc 42288273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 61 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 30833615 - 30833349
Alignment:
Q  61 aataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaaag 154  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||    ||| ||||||  ||||||| |||||||||    
T  30833615 aataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaag 30833517  T
Q  155 attattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaa-gagatacaaatggg 252  Q
    ||| || ||||||||  |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  30833516 attgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaggg 30833417  T
Q  253 ttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctc 319  Q
    |||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  30833416 ttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctc 30833349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 11049855 - 11049555
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    | ||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11049855 aaagtagtaaccaatatcaaagtaatcataagcaacaacaataataa----acctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagtacaaaaccacaagca 11049760  T
Q  119 aaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccac 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | || ||||||||  |||||| |||||||| | ||  |||||||||||||| | ||||| ||    
T  11049759 aaatataaagagagaagagaaacaaacacacaaagaaatgtttacccagttcagtccaatttgacctattatgaaggagagattgatcttttcaatctac 11049660  T
Q  219 tatcaatgagtttttacaaagagatac-aaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaa---agaac-aaccctaatttctacccattttccc 313  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||  ||||||||||||   ||||| ||||||||||| || |||||||||     
T  11049659 tatcaatgagttcttacaaagagatactaaaagggttataagaaattagcttcaacaagctcacaaattagaacaaaccctaatttata-ccattttcct 11049561  T
Q  314 aatctc 319  Q
    ||||||    
T  11049560 aatctc 11049555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 305
Target Start/End: Original strand, 4484176 - 4484480
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| ||||| |||||| |   ||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||  ||    
T  4484176 ggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagca-aa 4484274  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| || |||||    ||| |||||   ||||||| |||||||||||| || ||||||||  |||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  4484275 aaccacaagcacaagataaaaggagagggaagaagaaaacaaagacaccaaagattgttcacccagttctgtccaaacttgacctactctggaggagaga 4484374  T
Q  201 ttgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaa-gagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaattt 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4484375 ttgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaattt 4484474  T
Q  300 ctaccc 305  Q
    ||||||    
T  4484475 ctaccc 4484480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 165 - 319
Target Start/End: Original strand, 1631741 - 1631895
Alignment:
Q  165 cagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaactt 264  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  1631741 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagatatt 1631840  T
Q  265 agctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1631841 agcttcaacaagctcacaaagaacaatcctaatttctacccatttttccaatctc 1631895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Original strand, 35446890 - 35447047
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35446890 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 35446989  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  35446990 attagattcaacaagatcacaaagaacaaccctaatttctaccaattttaccaatctc 35447047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26353489 - 26353204
Alignment:
Q  10 gagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaa 109  Q
    ||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||   ||||||| |  ||||||||||     |||||||||||||| | |||||    
T  26353489 gagcaaaggaaagtagtaaccaatattaaagtaatcacaaggaacaaca---ataacaaaacttagatctaat-----aatcaaagtgaaaaacacaaaa 26353398  T
Q  110 ccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctct 209  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||  || |||| ||| |||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||    
T  26353397 ccacaagcaaaagataaggagaggagagaaacaaacacacaaaaaatgttt-acccggttcggtccaacttgacctactctaagggagagagtgatctct 26353299  T
Q  210 ccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctac 303  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | ||||||| || |||||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26353298 ccaatccactatcaatgagtacttacaaaaagatacaaaagtgttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaaccttaatttctac 26353204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 103 - 287
Target Start/End: Original strand, 17490095 - 17490279
Alignment:
Q  103 ctcaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  ||  | | || |||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  17490095 ctcaaaaccacaagcaaatgataaagagagaagagaaacaaacatattaagaaatgtttacccagttcggtccaaattgacctactctaggggagagatt 17490194  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaa 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||    
T  17490195 gatctctacaatccactatcaatgagttcttacaaagagttacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa 17490279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13122072 - 13121774
Alignment:
Q  16 agaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaa 115  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||   ||||||  ||||  |||||||| | |||||| |||||||  |||||| ||||||| |  ||||||||||    
T  13122072 agaaaagtactaatcaatatcaaaataacatcaagcagtaacaacaataacaa-acctagatgtaatctagaaatcaa-gtgaaaaacataaaaccacaa 13121975  T
Q  116 gcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatc 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  | | || ||||| |  | |||||||| || || | ||| |||||||||||| ||| |||||    
T  13121974 gcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaacaataaatgtttacccaataag-tccaacttaacatagtttggaggagagattgatttcttcaatc 13121876  T
Q  216 cactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccca 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13121875 cactatcaatgagtttctacaaagagatacaaa--ggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttcta-ccattttccca 13121779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 32289835 - 32289582
Alignment:
Q  61 aataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaaag 154  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||    ||| ||||||  ||||||  |||||||||    
T  32289835 aataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaggacaccaaag 32289737  T
Q  155 a--ttattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaa-gagatacaaatg 250  Q
    |  || || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  32289736 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatttactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaag 32289637  T
Q  251 ggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccc 305  Q
     ||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32289636 agttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc 32289582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2838255 - 2838079
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2838255 aaagtagtaaccactatcaaagtaaacacaaacaacaacaacaataacaacacctagatataatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 2838156  T
Q  119 aaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||| |||||| ||||||||||      ||||||| | ||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  2838155 aaagataaagtgagaagagaa------acaccaagaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagaga 2838079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 24885891 - 24885761
Alignment:
Q  23 tagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaat 122  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  24885891 tagtaaccaatatcaaagtgaacacaagaaacaacaatgataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaag 24885792  T
Q  123 ataaagagagaagagaaac-aaacacaccaa 152  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24885791 ataaagggagaagagaaacaaaacacaccaa 24885761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1345730 - 1345590
Alignment:
Q  61 aataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaa-agattat 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  1345730 aataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaatcataagataaagtgagaagagaaacaaacacaccaagaaattgt 1345631  T
Q  160 tgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  1345630 tgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagaga 1345590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24398219 - 24398091
Alignment:
Q  164 ccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  24398219 ccagttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaa 24398120  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaa 290  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||    
T  24398119 attagcttcaacaagctcacaaagaacaa 24398091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 33648335 - 33648176
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaa 259  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||      
T  33648335 acccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggttacagg 33648236  T
Q  260 aacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  33648235 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaattttta-ccattttctcaatctc 33648176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 300
Target Start/End: Original strand, 7815189 - 7815418
Alignment:
Q  71 tctagatctaatctattaatcaaagtgaaaag-ctcaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtt 169  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||  | ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||    
T  7815189 tctagatctaatctaggaatcaa-gtgaaaaaacacaaaatcgcaagcaaaagataaagaaagaagagaaacaaacacaccaagaaatatttacccagtt 7815287  T
Q  170 tggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctt 269  Q
      |||||| ||||  || | | | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||    
T  7815288 cagtccaatttgatatactat-gtggagagattaatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctt 7815386  T
Q  270 tgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttc 300  Q
      |||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  7815387 caacaagcttctaaagaacaaaccctaatttc 7815418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6266863 - 6266696
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatg 250  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||      
T  6266863 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 6266765  T
Q  251 ggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6266764 ggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 6266696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 17450755 - 17450596
Alignment:
Q  146 acaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatac 245  Q
    |||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||    
T  17450755 acaccaaagattgttcacctagttcggtccaacttgacctactctgtgg-agagattgatctctccaatccactatcaatgagtt------------cac 17450669  T
Q  246 aaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  17450668 aaatgggttacaaaaa-ttagcttcaacaagctcacaaagaacaagcctaatctctacccatttttcaaatctc 17450596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 311
Target Start/End: Original strand, 42019821 - 42020028
Alignment:
Q  107 aaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgat 205  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | | || | ||| |||||||||||  | ||||| | ||||| ||||||||||    
T  42019821 aaaccacaggcaaaa-ataaagagagaagagaaacaaacacaccaagaagtgtttatccaatttggtccaacaataacctactatggggaagagattgat 42019919  T
Q  206 ctctccaatccactatcaatgag---tttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    ||||| ||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||  |||||||    |||||||| | ||| |||||    
T  42019920 ctctcaaattcactatcaatgagttttttttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttctacaagctttataagaacaaacataaattcta 42020019  T
Q  303 cccattttc 311  Q
    ||| |||||    
T  42020020 ccctttttc 42020028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28672151 - 28672006
Alignment:
Q  105 caaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagat-tattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| | || ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  28672151 caaaatcacaagcaaaggataaagagagaagagaaacaaacacac-aaagatatatttacctaattcggtccaacaatgacctactctggaggagagatt 28672053  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaa 248  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  28672052 gatctctccaatccactgtcagtgagttctttgtaaagagatacaaa 28672006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 7451270 - 7451173
Alignment:
Q  172 gtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctt 269  Q
    ||||||||||||||| | | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| || |||||||    
T  7451270 gtccaacttgacctactgtagaggagagattgatctctgcaatccactatcaatgagttattacaaagagatacaaatgaattacaagaaattagctt 7451173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 12123440 - 12123741
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||| | ||| ||||||||||  |||||| |||||||   ||||    
T  12123440 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaacctcaaacaacaacaacaataacaa-acctatatctaatctagaaatcaa-gtgaaaaatacaaa 12123537  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaac-ttgacctaatctgggggagagattgatct 207  Q
    | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  | |||| || ||||| ||||||||  |||| || ||||| | | |||  ||| |    
T  12123538 atcacaagcaaaagataaagagataagagaaacaaacacgccaagaaatatttactcagttcggtccaacaatgacttactctggagaaaaga--gattt 12123635  T
Q  208 ctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccca 306  Q
    |||   | |||||||| |||||| ||||||||  |||||||| | ||||||| || | |||||  ||||  ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    
T  12123636 ctctgcttcactatcattgagttctttacaaaatgatacaaaagagttacaagaaataagcttcaacaaaatcataaagaacaactctaatttatactca 12123735  T
Q  307 ttttcc 312  Q
    ||||||    
T  12123736 ttttcc 12123741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 222 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24885763 - 24885669
Alignment:
Q  222 caatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaat 316  Q
    ||||||||| ||||| || | |||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24885763 caatgagttcttacagaggggtacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctactcattttcccaat 24885669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 309
Target Start/End: Original strand, 30218076 - 30218198
Alignment:
Q  188 tctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaaga 286  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||  | |||||| | ||||    
T  30218076 tctgggggagtgattgatcttttcaacccactatcaatgaattatttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagcttcaataagctctccaaga 30218175  T
Q  287 acaaccctaatttctacccattt 309  Q
    |||| ||||| ||||||||||||    
T  30218176 acaaacctaacttctacccattt 30218198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Original strand, 13656037 - 13656195
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtttttac-aaagagatacaaatgggttacaa 258  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||| ||  ||||||||    
T  13656037 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatac-aagaggttacaa 13656135  T
Q  259 aaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     || ||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13656136 gaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc 13656195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Original strand, 12647382 - 12647550
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttac-aaagagatacaaa 248  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||    
T  12647382 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 12647480  T
Q  249 tgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
      |||||||| || ||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12647481 gaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc 12647550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28259291 - 28259206
Alignment:
Q  136 agaaacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  28259291 agaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagaga-gcagctctccaatccactat 28259206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 41446357 - 41446315
Alignment:
Q  107 aaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacac 149  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41446357 aaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacac 41446315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 302
Target Start/End: Original strand, 7596960 - 7597158
Alignment:
Q  105 caaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaac-ttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | |||| ||  |||| |||| |||  ||||||| ||||  |||||||  |    
T  7596960 caaaaacaaaagcaaaagataaagagagaagagaaataaacacaccaacaaatatttacttagttcggtctaacaatgacctactctgaaggagaga--g 7597057  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttct 301  Q
    ||||||||  || || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||| || |||| || |||||| ||| || |||| || ||||||||||    
T  7597058 atctctccgttctacaatcaatgagttctttacaaaaagatacaaaagacttacaagaaattagtttcgacaagttcataaggaacaaaacctaatttct 7597157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14699116 - 14699056
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14699116 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 14699056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 20522208 - 20522268
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20522208 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 20522268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 303
Target Start/End: Original strand, 42261524 - 42261633
Alignment:
Q  195 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagt-ttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccc 293  Q
    |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||| || |||||||  |||||||| | |||||||| |     
T  42261524 gagagaatgatctctccgcttcactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaact 42261623  T
Q  294 taatttctac 303  Q
    ||||||||||    
T  42261624 taatttctac 42261633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10445558 - 10445473
Alignment:
Q  134 agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  10445558 agaggaacaaacacaccaa-gattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 10445473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 221
Target Start/End: Original strand, 13569319 - 13569396
Alignment:
Q  142 aaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  13569319 aaacacaccaaa-attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 13569396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34682448 - 34682363
Alignment:
Q  134 agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  34682448 agaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 34682363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8390259 - 8390179
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  8390259 aacaaacacaccaaa-attgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagaga-gcagctctccaatccactat 8390179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Original strand, 34388846 - 34388926
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  34388846 aacaaacacaccga-gattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagt-agctctccaatccactat 34388926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 42412162 - 42412117
Alignment:
Q  179 ttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaat 225  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42412162 ttgacctactctgggg-agagattgatctctccaatccactatcaat 42412117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 43406190 - 43406144
Alignment:
Q  107 aaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaa 153  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  43406190 aaaccacaagcaacatataaagagaaaagagaaacaaacacatcaaa 43406144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 31056031 - 31056092
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||||||    
T  31056031 aacaaacacaccaaagattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagaga 31056092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 304
Target Start/End: Original strand, 34811281 - 34811370
Alignment:
Q  216 cactatcaatgagttt-ttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| || |||||||  |||||||| | |||| ||| | |||||||||||    
T  34811281 cactatcaatgagtttcttacaaagagatataaaagagttacaataaattagcttcaacaagctctctaagagcaatcttaatttctacc 34811370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 41446232 - 41446159
Alignment:
Q  231 tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||  ||| |||||||  |||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  41446232 tttataaagagatacaaaagggttacttaaaattagcttcaacaagctctcaaagaacaaacataatttctacc 41446159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 45279987 - 45280028
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  45279987 ttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagaga 45280028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 280 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 39284929 - 39284890
Alignment:
Q  280 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39284929 acaaagagcaaccctaatttctacccatttttccaatctc 39284890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 200
Target Start/End: Original strand, 39482914 - 39482979
Alignment:
Q  134 agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  39482914 agaggaacaaacacaccaa-gattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga 39482979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3022424 - 3022383
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3022424 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 3022383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 5375349 - 5375390
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5375349 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 5375390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 6264151 - 6264192
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6264151 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 6264192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 221
Target Start/End: Original strand, 8040060 - 8040128
Alignment:
Q  152 aagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  8040060 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 8040128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 11739562 - 11739603
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11739562 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 11739603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 13910048 - 13910089
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13910048 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 13910089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 19502014 - 19502055
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19502014 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 19502055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 23452240 - 23452281
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23452240 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 23452281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27105049 - 27105008
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27105049 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 27105008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36757873 - 36757816
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctggggg 195  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||    
T  36757873 aacaaacacaccaaaagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctggggg 36757816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10707348 - 10707281
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  10707348 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-acaactctccaatccactat 10707281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 86)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 538340 - 538030
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  538340 ggagcaaaggaaagtaataaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacatctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaa 538241  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  538240 accacaagcaaaagataaagagagaagagaaagaaacacaccaaagattgttgatccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctc 538141  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  538140 tccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagagcaaccttaatttctacccatt 538041  T
Q  309 ttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||    
T  538040 ttcccaatctc 538030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 42428279 - 42428593
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42428279 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaataataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaa 42428378  T
Q  109 accacaagcaaaatataaag--agagaagagaa--acaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 204  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42428379 accacaagcaaaagataaagggagagaaaagaagaacaaacacactaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattga 42428478  T
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  42428479 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaaaaaccataatttctacc 42428578  T
Q  305 cattttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||||    
T  42428579 cattttcccaatctc 42428593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 28750504 - 28750818
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  28750504 ggagcaaaggaaagtagtaaccaattttaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatccaagtgaaaagcacaaa 28750603  T
Q  109 accacaagcaaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 204  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28750604 accacaagcaaaatataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattattgacccaattcggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 28750703  T
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||  ||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28750704 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttacaggaaattaacttcaacaatttcataaagaacaaccctaatttctacc 28750803  T
Q  305 cattttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||||    
T  28750804 cattttcccaatctc 28750818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 534078 - 533774
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||      ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  534078 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtagacacaagcaacaataataataacaacaccta------atctagtaatcaaagtgaaaatctcaaa 533985  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  533984 accacaagcaaaagataaaaagagaagagaagcaaagacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctt 533885  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  533884 tccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaaaaaattagcttcaacaagctcacaaagaccaaccctaatttctacccatt 533785  T
Q  309 ttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||    
T  533784 ttcccaatctc 533774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 32637133 - 32636829
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    ||||||||||  ||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  32637133 aaagtagtaacaaatttcacactaaacacaagcaacatcaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaatcacaagca 32637034  T
Q  119 aaatataaagagag----aagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaat 214  Q
     || |||||| |||     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32637033 caagataaagggagggaagagagaaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaat 32636934  T
Q  215 ccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 314  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32636933 ccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccataatttctacccattttccca 32636834  T
Q  315 atctc 319  Q
    |||||    
T  32636833 atctc 32636829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 42426094 - 42426398
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42426094 aaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacatcaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 42426193  T
Q  119 aaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaat 214  Q
    ||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42426194 aaagataaagggagagaagagaggaacaaacacacaaaagattgttgacctagttcagtccaacttgacctaatcagggggagagattgatctctccaat 42426293  T
Q  215 ccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42426294 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctca 42426393  T
Q  315 atctc 319  Q
    |||||    
T  42426394 atctc 42426398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 8565796 - 8566109
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataa---caacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctc 105  Q
    |||||| || |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8565796 ggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaacacaagcaacaacaataataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctc 8565895  T
Q  106 aaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaa-caaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8565896 aaaaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaaacaaacacaccaa-gattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggtgagagattga 8565994  T
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8565995 tctctccaatccactatcaatgagttcttacagagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaagttctacc 8566094  T
Q  305 cattttcccaatctc 319  Q
    ||||||| |||||||    
T  8566095 cattttctcaatctc 8566109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13488510 - 13488209
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||| ||| |||| ||||||| ||||||| ||| | || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13488510 aaagtaataaccaatttcaaagtgaacacaatcaatagcaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagca 13488411  T
Q  119 aaatataaagagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatcc 216  Q
    ||| | |  |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13488410 aaagaaagggagagaagagaggaacaaagacacaaaagattattgacccagttcggtccaacttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatcc 13488311  T
Q  217 actatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaat 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13488310 actatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaat 13488211  T
Q  317 ct 318  Q
    ||    
T  13488210 ct 13488209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 33831998 - 33831685
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaa-gctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||| || || ||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  33831998 ggagcaaaggaaagtagtaaccaaaatcaaagtgaacacaagcaataacaacaatagcagcacctaaatctaatctaggaatcaaagtgaaaaagctcaa 33831899  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaagagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgat 205  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33831898 agccacaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaaaacaccaaagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatatgggggagagattgat 33831799  T
Q  206 ctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccc 305  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33831798 ctcttcaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccc 33831699  T
Q  306 attttcccaatctc 319  Q
    ||||| ||||||||    
T  33831698 atttttccaatctc 33831685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 37439450 - 37439161
Alignment:
Q  20 aagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaa 119  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  37439450 aagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctaggtctaatctagtaatcaaaatgaaaagcacaaaaccacaagcat 37439351  T
Q  120 aatataaagagaga----agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaat 214  Q
    || |||||| ||||    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37439350 aagataaagggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaat 37439251  T
Q  215 ccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37439250 ccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 37439161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 39468397 - 39468712
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  39468397 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagcacaa 39468496  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
    |||||| |||| || ||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  39468497 aaccacgagcacaagataaagggagagaagagaggaacaaacacactaaagattgttgacccagttcagtccaatttaacctaatatgggggagagattg 39468596  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39468597 atctctctaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctac 39468696  T
Q  304 ccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||||||    
T  39468697 ccattttcccaatctc 39468712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31183293 - 31182984
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31183293 ggagcaaaggaaagtagtaactaatatcaaagggaacacaagcaacaaaaataataacaacacctatatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaa 31183194  T
Q  109 accacaagcaa-----aatataaagagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagat 201  Q
    |||||||||||     || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31183193 accacaagcaattcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagaatgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagat 31183094  T
Q  202 tgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttct 301  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || ||| |||  |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  31183093 agatctctccaatccagtatcaatgagttcttacaaagggatacaaat-ggttacaagaaattaacttaaacaaactcacaaagaacaatcctaatttct 31182995  T
Q  302 acccattttcc 312  Q
    |||||||||||    
T  31182994 acccattttcc 31182984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13240061 - 13239756
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13240061 aaagtagtaaccaattttaaagtaaacacaagcaacaacaacaataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagca 13239962  T
Q  119 aaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaactt-gacctaatctgggggagagattgatctctccaa 213  Q
    ||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13239961 aaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaaaattgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaa 13239862  T
Q  214 tccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||    
T  13239861 tccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaaaaaccctaatttctaccattttttcc 13239762  T
Q  314 aatctc 319  Q
    ||||||    
T  13239761 aatctc 13239756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16452381 - 16452085
Alignment:
Q  23 tagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaat 122  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  16452381 tagtaaccaatattaacgtaaacacaagcaacaaca---ataacaacagttagatctaatctaggaatcaaattgaaaagctcaaaaccacaagcaaaaa 16452285  T
Q  123 a-taaag--agagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccact 219  Q
    | |||||  |||||||| |||||||||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16452284 aataaaggaagagaagataaacaaacacaccaagaaatgtttacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagagatttatctctccaatccact 16452185  T
Q  220 atcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16452184 atgaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcagaaagaacaaacttaatttctacccatttttccaatctc 16452085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 30682771 - 30683084
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  30682771 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaa 30682870  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
    |  ||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30682871 attcacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacc-agttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 30682969  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgag--tttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttct 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  30682970 atctctccaatccactatcaatgagtattcttacaaagaaatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaag---aaccctaatttct 30683066  T
Q  302 acccattttcccaatctc 319  Q
    |||| |||||||||||||    
T  30683067 accctttttcccaatctc 30683084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 25413080 - 25412766
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||| || ||  ||||||| || ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  25413080 ggagcaaaggaaattagtaatcaatatccaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctatatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaa 25412981  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    | |||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  25412980 a-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagatt 25412882  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25412881 gatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 25412782  T
Q  303 cccattttcccaatctc 319  Q
    ||| |||||||||||||    
T  25412781 ccc-ttttcccaatctc 25412766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13343380 - 13343065
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  13343380 ggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaa 13343281  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||||||    
T  13343280 a-ccacaagcaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacatcaaagattgttcacccagttcggtccaaacatgacctactctggaggagagatt 13343182  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13343181 gaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaaggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 13343083  T
Q  303 ccc-attttcccaatctc 319  Q
    |||  |||||||||||||    
T  13343082 cccttttttcccaatctc 13343065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 152 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 38747177 - 38747010
Alignment:
Q  152 aagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38747177 aagattattgacccagtttggtccaacttgacctgatctgagggagagattgatctctccaatcctctatcaatgagtttttccaaagagatacaaatgg 38747078  T
Q  252 gttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38747077 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 38747010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 136 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 28278504 - 28278321
Alignment:
Q  136 agaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac 235  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28278504 agaaagaaacacaccaagaattgttcacccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac 28278405  T
Q  236 aaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28278404 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccataatttctacccattttcccaatctc 28278321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 30182908 - 30182593
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| ||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||    
T  30182908 ggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgaatgcaaacaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaa 30182809  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    ||| ||||||| || |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||||    
T  30182808 aac-acaagcacaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcatccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagatt 30182710  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30182709 gaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatagaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 30182610  T
Q  303 cccattttcccaatctc 319  Q
    ||  |||||||||||||    
T  30182609 ccatttttcccaatctc 30182593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 5887283 - 5887579
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||| || |||    
T  5887283 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaataataacaacacctaaatctaatctagtaatcaaaatgaaaaacttaaa 5887382  T
Q  109 accac--aagcaaaatataaagagaga--agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 204  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5887383 accacaaaagcaaaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttgatccaattcggtccaacttgacctaatctgggggagagataga 5887482  T
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    ||||                  |||| |||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  5887483 tctc------------------agttcttacaaagtgatacaaatgggttgcaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaatctaatttctatc 5887564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19806672 - 19806457
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| |||| | ||||| |||| | |||| | || ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19806672 aaagtagtaaccaattttaaagtgaacataggcaatagcaataataacaacacctaaatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctaaaaaccacaagca 19806573  T
Q  119 aaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaat 214  Q
    ||| ||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19806572 aaagataaagggagagaagagaggaacaaacaccccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaat 19806473  T
Q  215 ccactatcaatgagtt 230  Q
    |||||||||| |||||    
T  19806472 ccactatcaaggagtt 19806457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 213628 - 213470
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaa 260  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  213628 acccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaaga 213529  T
Q  261 acttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213528 aattagctttaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 213470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 310
Target Start/End: Original strand, 36073891 - 36074196
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||| ||| ||||| |||||| ||  ||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  36073891 ggagcaaaggaaagtaataaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaa 36073990  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    | | |||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||||| | ||| |||||||||    
T  36073991 atc-acaagcaaaacataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcatccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagatt 36074089  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36074090 gaactctccaatccactatcaatgagttctt-caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaacaaccctaatttcta 36074188  T
Q  303 cccatttt 310  Q
    ||| ||||    
T  36074189 cccttttt 36074196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 40147423 - 40147266
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  40147423 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaa 40147324  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40147323 attagcttcaacaagctcacgaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 40147266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 42927212 - 42926965
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  42927212 ggagcaaaggaaagtagcaactaatatcaaagtaaacacaagcaacaacaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaactcaaa 42927113  T
Q  109 accacaagc------aaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    |||||||||      |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| | || | ||||||||    
T  42927112 accacaagcaaaagcaaaagataaggagataagagaaacaaacacaccaagaaatgtttacccagttcggtccaacttgacctactatgagagagagatt 42927013  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatg 250  Q
     || ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42927012 tatttcttcaatccactgtcaatgagttcttacaaagagatacaaatg 42926965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 319
Target Start/End: Original strand, 13695639 - 13695854
Alignment:
Q  105 caaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 204  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | | || ||| |||||||||||| |||||||| | ||| ||||||| | |    
T  13695639 caaaacaacaagcaaaggataaagagagaagagaaacaaacacaccaagaaatgtttacctagtttggtccaagttgacctactatggaggagagaataa 13695738  T
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttcta 302  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13695739 tctctctaatccactattaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttgta 13695838  T
Q  303 cccattttcccaatctc 319  Q
    ||| |||||||||||||    
T  13695839 ccc-ttttcccaatctc 13695854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 5058207 - 5058052
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5058207 acccagttcggtccaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggatacaagaa 5058108  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
      ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5058107 aatagcttcaacaagctcac--agaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 5058052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 61 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16409746 - 16409486
Alignment:
Q  61 aataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaaag 154  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||    ||| ||||||  ||||||| |||||||||    
T  16409746 aataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaag 16409648  T
Q  155 a--ttattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaa-gagatacaaatg 250  Q
    |  || || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  16409647 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaag 16409548  T
Q  251 ggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcc 312  Q
     ||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16409547 agttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttcc 16409486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 62 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26178152 - 26177900
Alignment:
Q  62 ataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaaaga 155  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||    ||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  26178152 ataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga 26178054  T
Q  156 --ttattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatgg 251  Q
      || || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |     
T  26178053 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaaagagatacaaaaga 26177954  T
Q  252 gttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccc 305  Q
    ||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26177953 gttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccc 26177900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 128 - 319
Target Start/End: Original strand, 3075630 - 3075821
Alignment:
Q  128 gagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | | || ||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  3075630 gagagaagagaaacaaacacaccaagaaatgttcacccaatttggtccaacttgacctactatgagggagagattgatctctccaattcactatcaacga 3075729  T
Q  228 gtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     || ||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  3075730 attcttacaaaaagatacaaatgggttacaagaaattagattcagcaagctcacaaagaacaaacctaatttctacctattttctcaatctc 3075821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 9049217 - 9049500
Alignment:
Q  23 tagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaat 122  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||| ||  ||| || ||||||| | |||||||||||||||||     
T  9049217 tagtaaccaatatcaaagtaaccacaagaaacaacaacaataacaa-atctaaatctaatatagaaattaa-gtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaag 9049314  T
Q  123 ataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc 222  Q
    |||      |||||||||||||||||||||| | | || | ||| || |||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  9049315 ata------gaagagaaacaaacacaccaaaaaatgtttatccatttcggtccaacttcacctactttgggggagatattgatctctccaatccactgtc 9049408  T
Q  223 aatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaa 315  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| || |||||||  ||||||||||||| |  ||| ||||||||||  |||||||||||    
T  9049409 aatgagttcttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaacaaacactaatttcta-tcattttcccaa 9049500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 189
Target Start/End: Original strand, 16649683 - 16649863
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| ||  |||||||| |||||||| |  | || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16649683 ggagcaaaggaaagtagtaaccacaatcaaagtgaacacaagtagtagcaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaa 16649782  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatc 189  Q
    ||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16649783 accacaagcaaaagataaacggaaaagagaaacaaacacaccaaggattgttgacctagtttggtccaacttgatctaatc 16649863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 157 - 319
Target Start/End: Original strand, 27637613 - 27637776
Alignment:
Q  157 tattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaa-tgggtt 254  Q
    |||| |||||||| ||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27637613 tattcacccagttcggtccaacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaatgggtt 27637711  T
Q  255 acaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||| || |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27637712 acaagaaattagtttaaacaagctcataaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctc 27637776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 312
Target Start/End: Original strand, 9789203 - 9789381
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaaaga--ttattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttttta 234  Q
    ||||||| ||||||||||  || || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9789203 aaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctta 9789302  T
Q  235 c-aaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcc 312  Q
    | ||||||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  9789303 caaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaacaaccttaatttctaccctttttcc 9789381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 312
Target Start/End: Original strand, 18441627 - 18441805
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaaaga--ttattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttttta 234  Q
    ||||||| ||||||||||  || || |||||||| ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18441627 aaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctta 18441726  T
Q  235 caaa-gagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcc 312  Q
    |||| |||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18441727 caaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaggaacaaccctaatttctaccctttttcc 18441805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 27015704 - 27015536
Alignment:
Q  143 aacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagaga 242  Q
    ||||||||||| | | || |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27015704 aacacaccaaaaaatgttcacccagttcggtccaacttgacctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatcaatgagttcttacaaagaga 27015605  T
Q  243 tacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||         |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27015604 tacaaatgggt--------attagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctc 27015536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26171032 - 26170791
Alignment:
Q  62 ataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaaaga 155  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||| ||||||| || |||||    ||| ||||||  ||||||| ||||||||||    
T  26171032 ataacaacacctagatctaatctaggaatcaaaatgaaaagcataaaac-acaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga 26170934  T
Q  156 --ttattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatggg 252  Q
      || || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||         |    
T  26170933 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaa-aga---------g 26170844  T
Q  253 ttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccc 305  Q
    |||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26170843 ttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaatcctaatttctaccc 26170791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Original strand, 29751156 - 29751323
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatg 250  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||      
T  29751156 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 29751254  T
Q  251 ggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29751255 ggttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 29751323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 319
Target Start/End: Original strand, 42309969 - 42310098
Alignment:
Q  190 tgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaaca 289  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||  ||||||||||||||| ||    
T  42309969 tgggggagagattgatctcgctaatccactatcaataagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagatca 42310068  T
Q  290 accctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    | | | ||||||||||| |||| |||||||    
T  42310069 aacttgatttctacccaatttctcaatctc 42310098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 316907 - 316782
Alignment:
Q  180 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagct 278  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| || |||||||  |||||||    
T  316907 tgacctactctaggggagagattgatccctccgatccattatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagcttcaacaagct 316808  T
Q  279 cacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    | | |||||||| |||||||||||||    
T  316807 ctccaagaacaaacctaatttctacc 316782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29720552 - 29720369
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac 235  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29720552 aaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 29720453  T
Q  236 -aaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||| ||||||||  |||||||| || |||| || |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29720452 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 29720369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29722712 - 29722529
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaactt-gacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac 235  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29722712 aaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaagagttcttac 29722613  T
Q  236 -aaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||| ||||||||  |||||||| || |||| || |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29722612 aaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 29722529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 309
Target Start/End: Original strand, 33906035 - 33906184
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaac-ttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaa 259  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||     
T  33906035 acccagctcggtccaacattgacctactctagggaagagattgatctttccaatctactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaggattacaag 33906134  T
Q  260 aacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattt 309  Q
    || ||||||| ||||||||| | ||| || | |||||||| |||||||||    
T  33906135 aagttagcttcgacaagctctccaagcactaacctaatttatacccattt 33906184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 304
Target Start/End: Original strand, 16640946 - 16641086
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| || || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| | ||||  | ||    
T  16640946 acccagttcggccctacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatca---agttcttacaaagagatacaaaagagttatcagaa 16641042  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 304  Q
     | |||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16641043 atcagcttcaacaagctcacaaagaacaaacactaatttctacc 16641086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Original strand, 22536286 - 22536452
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatg 250  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||      
T  22536286 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 22536384  T
Q  251 ggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22536385 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 22536452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 10593446 - 10593263
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttttta 234  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  10593446 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 10593347  T
Q  235 c-aaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    | |||| ||||||||  |||||||| || ||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  10593346 caaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttctcccaatctc 10593263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 25078293 - 25078125
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttac-aaagagatacaaa 248  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||    
T  25078293 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 25078195  T
Q  249 tgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
      |||||||| || ||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25078194 gaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc 25078125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 25136262 - 25136094
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttac-aaagagatacaaa 248  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||    
T  25136262 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 25136164  T
Q  249 tgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
      |||||||| || ||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25136163 gaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc 25136094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 40380263 - 40380095
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttac-aaagagatacaaa 248  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||    
T  40380263 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 40380165  T
Q  249 tgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
      |||||||| || |||| ||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40380164 gaggttacaagaaattag-tttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc 40380095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Original strand, 10281738 - 10281819
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  10281738 aacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 10281819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30803029 - 30802843
Alignment:
Q  123 ataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||| | | || |||| ||| ||||||||  ||||||| | || ||||||||  ||||||||   | || |||    
T  30803029 ataaagagagtagaaaaacaaacacacaaaaaaatgttaaccctgttcggtccaacaatgacctattgtgcgggagaga--gatctctctgcttcattat 30802932  T
Q  222 caatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 310  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||| || |||||| || |||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30802931 caacgagttctttacaaatagatacaaaaggattacaataaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaacctaa-ttctacccatttt 30802843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3326130 - 3325933
Alignment:
Q  106 aaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattga 204  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||| | |||| |||||||| ||   |||  ||||||| | || | |||| |||||    
T  3326130 aaaatcacaaacaaaagataaa-agagaagagaaa--aacacaccaaaaaatatttacccagttcggcgaaacaatgacctactatgtgagagatattga 3326034  T
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 303  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |  |||||||| || |||||||  ||||||||   ||||||||  |||||||||||    
T  3326033 tctctctaatccaccatcattgagttctttacaaagagatacacaatggttacaagaaattagcttcaacaagctcttcaagaacaaaactaatttctac 3325934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4160767 - 4160702
Alignment:
Q  157 tattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4160767 tatttacccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 309
Target Start/End: Original strand, 10054850 - 10054969
Alignment:
Q  190 tgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac 288  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| || || |||||||  |||| |||   ||||||    
T  10054850 tgggggagatattgatatctccaatacactatcaatgagttcattacaaagagatacaaa-aggttataagaaattagcttcaacaaactcttcaagaac 10054948  T
Q  289 aaccctaatttctacccattt 309  Q
    || | ||||||||||||||||    
T  10054949 aaacataatttctacccattt 10054969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9353443 - 9353361
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  9353443 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 9353361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36932461 - 36932379
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  36932461 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 36932379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 40382474 - 40382306
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttac-aaagagatacaaa 248  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||    
T  40382474 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 40382376  T
Q  249 tgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
      |||||||| || ||||| |||||||| |||| | |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  40382375 gaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaacttctaccc-ctttcccaatctc 40382306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 221
Target Start/End: Original strand, 15464515 - 15464600
Alignment:
Q  136 agaaacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  15464515 agaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 15464600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 30793337 - 30793202
Alignment:
Q  123 ataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  | | || |||  ||| ||||||||  |||| || ||| |||||||||  |||||||||| | ||||||    
T  30793337 ataaagagagtagagaaacaaacacaccaagaaatgtttaccttgttcggtccaacaatgacttactctaggggagaga--gatctctccacttcactat 30793240  T
Q  222 caatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaa 258  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30793239 caattagttctttacaaagagatacaaaatggttacaa 30793202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 35616278 - 35616184
Alignment:
Q  216 cactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattt 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| || ||| |||  || ||||| | |||||||| |||||||||||| |||||    
T  35616278 cactatcaatgagttctttacaaagaaatacaaaagggttacaagaaattaacttaaacgagctctccaagaacaaacctaatttctactcattt 35616184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 17004069 - 17004009
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17004069 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 17004009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 304
Target Start/End: Original strand, 10700674 - 10700796
Alignment:
Q  180 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagct 278  Q
    ||||||| | |||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||   |||| || || |||||||  |||||||    
T  10700674 tgacctactatgggggagaga--gatctctccacttcactatcaatgagttctttttaaagagatacaaaaatgttataagaa-ttagcttcaacaagct 10700770  T
Q  279 cacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    | | |||||||| |||||||||||||    
T  10700771 ctctaagaacaaacctaatttctacc 10700796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 200
Target Start/End: Original strand, 28832246 - 28832307
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28832246 aaacaaacacaccaa-gattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 28832307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27910726 - 27910685
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27910726 ttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagaga 27910685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19806443 - 19806388
Alignment:
Q  263 ttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19806443 ttagcttcaacaaactcacaaagaacaacc-taatttctacccatttttccaatctc 19806388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16544572 - 16544509
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  16544572 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 16544509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16546794 - 16546731
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  16546794 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 16546731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11917081 - 11917001
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  11917081 aacaaacacaccga-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 11917001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 14520216 - 14520278
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||    
T  14520216 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggaga 14520278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 31300710 - 31300645
Alignment:
Q  134 agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||| ||||||||    
T  31300710 agaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagaga 31300645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 42926968 - 42926922
Alignment:
Q  223 aatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctt 269  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  42926968 aatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctt 42926922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2175194 - 2175153
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2175194 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 2175153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2724169 - 2724128
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2724169 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 2724128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 9299797 - 9299756
Alignment:
Q  111 cacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaa 152  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9299797 cacaagcaaaagataaagagagaagagaaataagcacaccaa 9299756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 10529102 - 10529143
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10529102 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 10529143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18466960 - 18466919
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18466960 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 18466919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 21684455 - 21684496
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21684455 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 21684496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24127132 - 24127091
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24127132 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 24127091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 25921476 - 25921517
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25921476 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 25921517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27912812 - 27912771
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27912812 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 27912771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 34477056 - 34477097
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  34477056 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 34477097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 34479421 - 34479462
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  34479421 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 34479462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40221799 - 40221758
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40221799 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 40221758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 42127519 - 42127459
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||||    
T  42127519 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagaga 42127459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 199
Target Start/End: Original strand, 20505846 - 20505886
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagag 199  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20505846 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagag 20505886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 112)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 46147244 - 46147554
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46147244 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaacaacaataataacaatacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaa 46147343  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  46147344 accacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggggagagattgatgtc 46147443  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46147444 tccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaaccctaatttctacccatt 46147543  T
Q  309 ttcccaatctc 319  Q
    || ||||||||    
T  46147544 tttccaatctc 46147554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 26175485 - 26175799
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26175485 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaatagcaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaa 26175584  T
Q  109 accacaagcaaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 204  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26175585 accacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 26175684  T
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26175685 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctccc 26175784  T
Q  305 cattttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||||    
T  26175785 cattttcccaatctc 26175799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 23 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 36994824 - 36994529
Alignment:
Q  23 tagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaat 122  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  36994824 tagtaatcaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcaaaag 36994725  T
Q  123 ataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36994724 ataaagagagaagagaaacaaacacgccaaa-attgttgacccagttcggtccaacttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc 36994626  T
Q  223 aatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36994625 aatgagttcttacaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccattttcccaatctc 36994529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 36463254 - 36463552
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36463254 aaagtaataaccaatatcaaagtaaacacaagcaacaacaataataacaacacctagatctaatttggtaatcaaagcgaaaaactcaaaaccacaagca 36463353  T
Q  119 aaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccac 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36463354 aaagataaagagagaagagaaacaaacac--caaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccac 36463451  T
Q  219 tatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatct 318  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  36463452 tgtcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacagccctaatttctatccattttcccaatct 36463551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 48893491 - 48893805
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || |||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  48893491 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaataacaacaataacagcacctagatctaatccaagaatcaaagtgaaaagcacaaa 48893590  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48893591 atcacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 48893690  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaa----gaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  |||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  48893691 tccaatccactatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaacaatgaacaaccctaatttctacc 48893790  T
Q  305 cattttcccaatctc 319  Q
    ||||||| |||||||    
T  48893791 cattttctcaatctc 48893805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 315
Target Start/End: Original strand, 52467216 - 52467513
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaa-caacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc 117  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52467216 aaagtggtaaccaatatcaaagtaaagacaagcaatcatcaataataacaacacatagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc 52467315  T
Q  118 aaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatcca 217  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52467316 aaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatcca 52467415  T
Q  218 ctatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaa 315  Q
    |||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52467416 ctatcaaaaagttattacaaagtgatacaaatgggttacaagatattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaa 52467513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 12739412 - 12739713
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12739412 aaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaataa---taataacaacacctagatctaatcaagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagca 12739508  T
Q  119 aaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaat 214  Q
    ||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12739509 aaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaat 12739608  T
Q  215 ccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 314  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12739609 ccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctatccattttccca 12739708  T
Q  315 atctc 319  Q
    |||||    
T  12739709 atctc 12739713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 311
Target Start/End: Original strand, 12743777 - 12744080
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12743777 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaa---taataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaa 12743873  T
Q  109 accacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 204  Q
    || |||||||||| |||||  |||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12743874 actacaagcaaaagataaaaggagaaaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattga 12743973  T
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12743974 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 12744073  T
Q  305 cattttc 311  Q
     ||||||    
T  12744074 tattttc 12744080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 312
Target Start/End: Original strand, 47038274 - 47038566
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47038274 aaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaaacaataacaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagca 47038373  T
Q  119 aaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccac 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47038374 aaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccac 47038473  T
Q  219 tatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcc 312  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||| | |||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47038474 tatcaatgagtccttacaaacagatacaaat-gattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcc 47038566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 45687035 - 45687346
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaaca-caagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45687035 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagcaaacaacaagcaacaacaataataacaacacctagatc-aatctagtaatcaaagtgaaaagctcaa 45687133  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatct 207  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  45687134 aaccacaagcaacagataaagagagaaaagaaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacataatatggaggagagatagatct 45687233  T
Q  208 ctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccca 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  45687234 ctccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgagttataagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttccca 45687333  T
Q  307 ttttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||    
T  45687334 ttttcccaatctc 45687346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 5872137 - 5871825
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5872137 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaaacaacaacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagctcaaa 5872038  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaa--caaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatc 206  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5872037 accaaaagcaaaagatagagagagaagagagaatcaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtcaaacttgacctaatctgggggagagattgatc 5871938  T
Q  207 tctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccca 306  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5871937 tctctaatccactatcaaagagttcttgcaaagtgataaaaatgggttacaagaaatttgcttaaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctaccca 5871838  T
Q  307 ttttcccaatctc 319  Q
    |||| ||||||||    
T  5871837 tttttccaatctc 5871825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 9927307 - 9927621
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| || |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||    
T  9927307 ggagcaaaggaaagtagttaccaatatcaaagtaaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatttaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaa 9927406  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaag-agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 204  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9927407 atccacaagcaaaagataaaggagagaatagaggaacaaacacaccaaagattgttgactcagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 9927506  T
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9927507 tctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 9927606  T
Q  305 cattttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||||    
T  9927607 cattttcccaatctc 9927621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 34570262 - 34570577
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||| | ||||||| ||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  34570262 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaaatgaacacaaacaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaagaatcaaagtgaaaagcacaa 34570361  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34570362 aaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcgatccaacttaacctaatctgggggagagattg 34570461  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34570462 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaattgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctac 34570561  T
Q  304 ccattttcccaatctc 319  Q
    | ||||||||||||||    
T  34570562 ctattttcccaatctc 34570577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 5429991 - 5429684
Alignment:
Q  17 gaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaa 115  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5429991 gaaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaaacaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaa 5429892  T
Q  116 gcaaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctcc 211  Q
    | |||| ||||||  ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5429891 gtaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacatcaaagattgttgacccagttcggtccaacttaacctaatctgggggagagattgatctctcc 5429792  T
Q  212 aatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttc 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5429791 aatccactatcaatgagttcttacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacgaagaataaccctaatttctactcattttc 5429692  T
Q  312 ccaatctc 319  Q
    ||||||||    
T  5429691 ccaatctc 5429684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 54199756 - 54200069
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  54199756 ggagcaaaggaaagtagtaaccagtatcaaagtgaacacaagcaataatcagcaataacatcacctagatctaatctaagaatcaaagtgaaaagcacaa 54199855  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaag-agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattga 204  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54199856 atccacaagcaaaatataaaggagagaagagaggaacaaacacaccaaaaattgttgacccagttcg-tccaacttgacctaatctgggggagagaatga 54199954  T
Q  205 tctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54199955 tctctctaattcactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 54200054  T
Q  305 cattttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||||    
T  54200055 cattttcccaatctc 54200069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 56178484 - 56178800
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacatt-aataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |   |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||    
T  56178484 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataataaacaataacaacacctagatctaatctaggaatgaaagtgaaaagcacaa 56178583  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  56178584 aaccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 56178683  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  56178684 gatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 56178783  T
Q  303 cccattttcccaatctc 319  Q
    ||| |||||||||||||    
T  56178784 ccctttttcccaatctc 56178800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29254803 - 29254499
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  29254803 aaagtagtaaccaatattaaagtgaacacaaacaacgacaataataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagca 29254704  T
Q  119 aaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaat 214  Q
    ||| |||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  29254703 aaagataaatggagagaatagaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatttgggagagagattgatctctccaat 29254604  T
Q  215 ccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccca 314  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || ||| |||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  29254603 ccactatcaacgagttcttacaaagagacacaaatgggttgcaagaaattaacttcaacaagctcataaaaaacaactctaatttctacccaatttccca 29254504  T
Q  315 atctc 319  Q
    |||||    
T  29254503 atctc 29254499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 37740945 - 37740630
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| |||| || ||| || ||  ||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||    
T  37740945 ggagcacaggaaagtagtaatcaatatcaaagtgaacagaatcaataatcaacaataacagcacctagatctaatgtaggaatcaaagtgaaaagcacaa 37740846  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37740845 aaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacacaaaaaattgttgacacagttcggtccaacttgaccaaatctgggggagagattg 37740746  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  37740745 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttatac 37740646  T
Q  304 ccattttcccaatctc 319  Q
    || |||||| ||||||    
T  37740645 cctttttccaaatctc 37740630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 52095220 - 52095525
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc 117  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||  |||||||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||     
T  52095220 aaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaagtaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggagtcaaagagaaaagcacaaaaccacaagg 52095319  T
Q  118 aaaatataaa--gagagaagag--aaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtcc-aacttgacctaatctgggggagagattgatctctcca 212  Q
    |||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  52095320 aaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaaaattgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactctggaggagagattgatctctcca 52095418  T
Q  213 atccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcc 312  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52095419 atccactatcaaagatttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcc 52095518  T
Q  313 caatctc 319  Q
    |||||||    
T  52095519 caatctc 52095525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 31474456 - 31474155
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| || ||||     
T  31474456 aaagtagtaatcaatatcaaagtaaacacaaacaacaacaacaataacaacacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaagcacaaaatcaaaagct 31474357  T
Q  119 aaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagat-tattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatcca 217  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  31474356 aaagataaagggagaagagaaacaaacacacc-aagatatgtttacccagttcggtccaacttgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaa 31474258  T
Q  218 ctatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaat 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  31474257 ctatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaaactcaaaaagaacaagacctaatttctacccattttctcaat 31474158  T
Q  317 ctc 319  Q
    |||    
T  31474157 ctc 31474155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 304
Target Start/End: Original strand, 5369940 - 5370232
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc 117  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5369940 aaagtagtaatcaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagc 5370039  T
Q  118 aaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctcca 212  Q
    |||| |||||  |||||||||||  |||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  5370040 aaaagataaaaggagagaagagataaacaaacacatcaaagattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctcta 5370139  T
Q  213 atccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagc-tttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5370140 gtccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacc 5370232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 48143368 - 48143063
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaa----gc 103  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    ||    
T  48143368 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaaaaagc 48143269  T
Q  104 tcaaaaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggaga 198  Q
     ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  48143268 acaaaatcacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggaga 48143169  T
Q  199 gattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  48143168 gattgatctctccaatccactatcaatgagttcttatgaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatt 48143069  T
Q  299 tctacc 304  Q
    ||||||    
T  48143068 tctacc 48143063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 134 - 311
Target Start/End: Original strand, 12745292 - 12745469
Alignment:
Q  134 agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttttt 233  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12745292 agaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttctt 12745391  T
Q  234 acaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12745392 acaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacctattttc 12745469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 319
Target Start/End: Original strand, 27416955 - 27417128
Alignment:
Q  146 acaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatac 245  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27416955 acaccaaagattgttgactcagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatac 27417054  T
Q  246 aaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27417055 aaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacacattttaccaatctc 27417128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 6542035 - 6542328
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| | ||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||    
T  6542035 ggagcaaaggaaagtaataaccaatatcaaagtaatcacaagcaacaaca---ataacaaaacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaaacacaaa 6542131  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | | || |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6542132 atcacaagaaaaagataaagagataagagaaacaaacacaccaagaaatgtttacccagttcggtccaacttgacctaccctgggggagagattgatctc 6542231  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || | |||| || |||| ||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  6542232 tccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaaaggctaacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttctacc 6542328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4588271 - 4587966
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || ||| |||||| || |||||||| || ||||| ||||||||   ||||||| | | | ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  4588271 ggagcaaaggaaaatagtaaccactatcaaagcaatcacaaacaacaaca---ataacaaaaccaatatctaatataggaatcaaagtgaaaagcacaaa 4588175  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   | | || ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||    
T  4588174 atcacaagcaaaagataaagagagaggagaaacaaacacaccatgaaatgtttacccagtttggtccaacttcacctattatgggggagagattgttctc 4588075  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccat 307  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||  ||||||| ||||||||| || | |||||||||||  |    
T  4588074 tccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagcttacaaagaacaaatcttaatttctaccttt 4587975  T
Q  308 tttcccaat 316  Q
    |||||||||    
T  4587974 tttcccaat 4587966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 319
Target Start/End: Original strand, 37229587 - 37229885
Alignment:
Q  20 aagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaa 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||  |||||| | | ||||||||||| ||  ||| |||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  37229587 aagtagtaaccaatatcaaagtaacaacaagcaataacaacaataacca-acctagatctaatttaggaat-aaagtgaaaagcacaaaaccataagtaa 37229684  T
Q  120 aatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccact 219  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||  | | || ||| |||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  37229685 aagataaagagagaagagaaacaaacacgccaagaaatgtttacctagttcggtccaacttgacctactatgagggagagattgatctctccaatccact 37229784  T
Q  220 atcaatgagtttttacaaagagata-caaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaaca-accctaatttctacccattttcccaatc 317  Q
    || |||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37229785 ataaatgagttcttacaaagagatataaaaagggttacaacaaatttgctttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttcta-ccattttcccaatc 37229883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 159 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 54883185 - 54883025
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaa 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54883185 ttgacccagttcggtccaacttgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaa 54883086  T
Q  259 aaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     || |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54883085 gaaattagcttcaacaagctcacaaaaaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 54883025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 166 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 8665566 - 8665413
Alignment:
Q  166 agtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaactta 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  8665566 agtttggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatta 8665467  T
Q  266 gctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8665466 gcttcaacaagctctcaaagaacaaccctaatttctacccattttcccattctc 8665413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 159 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 26364401 - 26364241
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaa 258  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26364401 ttgacccagttcagtcaaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactattaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaa 26364302  T
Q  259 aaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26364301 gaaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 26364241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 52082521 - 52082820
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc 117  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| || |||||||| |||||  |||||||  |||||||  ||||||||||||    
T  52082521 aaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacagcacctagatcttatctaggaatcaaaaagaaaagcataaaaccacaagc 52082620  T
Q  118 aaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctcca 212  Q
    |||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||  | |||| || ||||||||| ||||| ||||||| |||||||        
T  52082621 aaaagataaaaggagagaagagataaacaaacacaccaaagattgttcacccaaatcggtctaaacttgacctactctggaggagagaatgatctc---- 52082716  T
Q  213 atccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcc 312  Q
       ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52082717 ---cactatcaaagatttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaacaaccctagtttctacccattttcc 52082813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 162 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41964578 - 41964423
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatac-aaatgggttacaaaa 260  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  41964578 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagggatacaaaatgggttacaata 41964479  T
Q  261 acttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaat 316  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41964478 aattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaat 41964423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 13992139 - 13992456
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| ||||| |||||| |   ||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||    
T  13992139 ggagcaaaggaaagtagtaaccaataacaaagtgagtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggtatcaaagtgaaaagcacaa 13992238  T
Q  108 aaccacaagcaaaat-ataaa---gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    | | ||||||||||  |||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  13992239 atc-acaagcaaaaagataaaagggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 13992337  T
Q  201 ttgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttc 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13992338 ttgaactctccaatccactatcaatgagttcttac-aagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttc 13992436  T
Q  301 taccc-attttcccaatctc 319  Q
    |||||  |||||||||||||    
T  13992437 tacccttttttcccaatctc 13992456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 8648301 - 8648144
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  8648301 acccagtttggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttataagaa 8648202  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8648201 attagcttcaacaaactcacaatgaacaaccctaatttctatccattttcccattctc 8648144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 40632607 - 40632450
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| ||||||||||||| || | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  40632607 acccagttcggtccaacttgacttactttagaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaataggttacaagaa 40632508  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40632507 attagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccattttcccaatctc 40632450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 165 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41639585 - 41639432
Alignment:
Q  165 cagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaactt 264  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  41639585 cagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcgatgagttcttacaaatagatacaaatgggttacaagaaatt 41639486  T
Q  265 agctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatct 318  Q
    |||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41639485 agcttcaaaaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatct 41639432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 188 - 319
Target Start/End: Original strand, 12745468 - 12745599
Alignment:
Q  188 tctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaa 287  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||    
T  12745468 tctggggaagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaa 12745567  T
Q  288 caaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12745568 caaccctaatttctacccattttcctaatctc 12745599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 129 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3913642 - 3913453
Alignment:
Q  129 agagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgag 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| || || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3913642 agagaagagaaacgaacacaccaaagattgttgacccagttcgatacaactttacatactctaggg-agagattgatctctccaatccactatcaatgag 3913544  T
Q  229 tttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| || || |||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3913543 ttcttacaaagatatacaaatgggttaaaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaacagctctaatttctactcattttcccaatctc 3913453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 319
Target Start/End: Original strand, 29999722 - 29999969
Alignment:
Q  72 ctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccag 167  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||| | |||| |||||||||||| | |||  |||||||||||  |||||||||||||| |    || ||||||    
T  29999722 ctagatctaatctaggaatcaaagagaaaaacacaaa-ccacaagcaaaagacaaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaatg----ttcacccag 29999816  T
Q  168 tttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatgggttacaaaaactta 265  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||| || |||    
T  29999817 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaaaaagatacaaaagagttacaagaaatta 29999916  T
Q  266 gctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29999917 gctttgacatgttcacaaagaacaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 29999969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 2209886 - 2209718
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaa-tg 250  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  2209886 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatg 2209787  T
Q  251 ggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2209786 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaaaaaccctaatttctacccattttcccaatctc 2209718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 180 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12073536 - 12073397
Alignment:
Q  180 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctc 279  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||    
T  12073536 tgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaataaattagcttcaacaagctc 12073437  T
Q  280 acaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12073436 acaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctc 12073397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 192 - 319
Target Start/End: Original strand, 12747792 - 12747919
Alignment:
Q  192 ggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaac 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12747792 ggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcatacaaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaac 12747891  T
Q  292 cctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12747892 cctaatttctatccattttcccaatctc 12747919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6656118 - 6655961
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  6656118 acccaattcggtccaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaa 6656019  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  6656018 attagcttcaacaagttcacaaagaacaaccttaatttctacccattttttcaatctc 6655961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 166 - 319
Target Start/End: Original strand, 50673857 - 50674009
Alignment:
Q  166 agtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaactta 265  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  50673857 agttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatta 50673956  T
Q  266 gctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  50673957 gcttcaacaagctcacaaag-acaatcctaatttctactcattttctcaatctc 50674009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 164 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 379541 - 379385
Alignment:
Q  164 ccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaac 262  Q
    |||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||     
T  379541 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaattagttcttacaaagcgatacaaatgggttacaagaaa 379442  T
Q  263 ttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  379441 ttagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttctcaatctc 379385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 188 - 304
Target Start/End: Original strand, 12744079 - 12744195
Alignment:
Q  188 tctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaa 287  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  12744079 tctggggaagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaa 12744178  T
Q  288 caaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||||    
T  12744179 caaccctaatttctacc 12744195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 180 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 46703645 - 46703505
Alignment:
Q  180 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaa-tgggttacaaaaacttagctttgacaagct 278  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||  |||||||    
T  46703645 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactataaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagct 46703546  T
Q  279 cacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46703545 cacaaagaacaaccctaatttctactcattttcccaatctc 46703505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 165 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 35662600 - 35662446
Alignment:
Q  165 cagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaactt 264  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||    
T  35662600 cagttcggtccaacttgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaatt 35662501  T
Q  265 agctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  35662500 agcttcaacaaactcataaagaacaaccctaatttctacccattttttcaatctc 35662446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 312
Target Start/End: Original strand, 5207698 - 5207999
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || ||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||||   ||| ||| | ||||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||||    
T  5207698 ggagcaaaggaaagtagtaattgatatcaaagtaacctcaagcaacaaca---atatcaa-acctagatctaatttaggaatcaa-gtgaaaagcacaaa 5207792  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaa--cacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatc 206  Q
    |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | | || ||||| ||  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5207793 accacatgcaacagataaatagagaagagaaacaaatacacaccaataaatgtttacccaattcagtccaaattgacctactctgggagagagattgatc 5207892  T
Q  207 tctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 305  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | | ||||| ||| || |||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5207893 tttccaatccactatcaatgagttcttacaaatagatatacaagggttgcaataaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctaccc 5207992  T
Q  306 attttcc 312  Q
     ||||||    
T  5207993 tttttcc 5207999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 51337294 - 51337069
Alignment:
Q  94 agtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctggg 193  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||   | | || |||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  51337294 agtgaagagcacaaaatcacaagcaaaagataaaaagagaagataaacaaacacaccacgaaatgtttacccagttcggtccaacttgacctaatgtgtg 51337195  T
Q  194 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaa--c 291  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| || || ||| |||  | |||||||||||||||||  |    
T  51337194 ggagagattgatctctctaatacactatcaatgagttcttaaaaagagatacaaaagggttataataaattatctt--aaaagctcacaaagaacaaatc 51337097  T
Q  292 cctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||||    
T  51337096 cgtaatttctaccctttttctcaatctc 51337069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Original strand, 50262697 - 50262864
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgg 251  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50262697 agattgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgg 50262796  T
Q  252 gttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  50262797 gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccgtaatttcgatccattttcccaatctc 50262864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 171 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21688402 - 21688263
Alignment:
Q  171 ggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagcttt 270  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||     
T  21688402 ggtctaacttgacctaatctaggggagggattgatctctccaattcattatcaatgagttcttccgaagagatacaaatgagttacaaaaaattagtttc 21688303  T
Q  271 gacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 310  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21688302 aacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 21688263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 319
Target Start/End: Original strand, 13009410 - 13009594
Alignment:
Q  123 ataaagagagaagagaaacaaa-cacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  13009410 ataaagggagaagagaaacaaaacacgccaaagattgttgacacagttcggtctaacttgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccactat 13009509  T
Q  222 caatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||| |             |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13009510 caatgagttcttacaaagggatacaaatgttttacaaga-------------aagctcacgaagaacaaacctaatttctacccattttcacaatctc 13009594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 198 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 24969238 - 24969117
Alignment:
Q  198 agattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaat 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||  |||||    
T  24969238 agatttatctctccaatccactatcaattagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaatctaat 24969139  T
Q  298 ttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  24969138 ttctacccatttttccaatctc 24969117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Original strand, 31495296 - 31495480
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac 235  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31495296 aaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatcaactatcaatgagttcttac 31495395  T
Q  236 -aaagagatac-aaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||||| ||| | ||||||| || |||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31495396 aaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaatcctaatttctaccc-ttttcccaatctc 31495480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29056610 - 29056363
Alignment:
Q  72 ctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttg 171  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | | || || ||||| |    
T  29056610 ctagatctaatctaggaatcaa-gtgaaaaacacaaaaccacaaacaaaagataaagagaaaagagaaacaaacacaccaagaagtgtttacacagttcg 29056512  T
Q  172 gtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatga-gtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagcttt 270  Q
    ||| || | ||||||  ||||| ||||||| | |||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| || || ||| || |||| | |    
T  29056511 gtcaaaatggacctacactgggtgagagataggtctctctaatccattatcaatgaggttgttacaaagagatataaaaggattgcaagaaattagttct 29056412  T
Q  271 gacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||| |||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  29056411 aacaagcacacaaagaacaaactctaattccta-ccattttcccaatctc 29056363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24969982 - 24969787
Alignment:
Q  10 gagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaag---ctca 106  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||  ||     ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    ||||    
T  24969982 gagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaaataatcacaaccaacaacaagaaagtagacacctagatctaatctactaatctaagtgaaaaaaaactca 24969883  T
Q  107 aaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    |||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||  | | || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24969882 aaaccataagcaaacgataaagtgagaagagaaacaaacacaccaagaaatgtttacccagttcggtccaacttgacctactctgggggatagatt 24969787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 193 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 12119671 - 12119543
Alignment:
Q  193 gggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||  | ||| ||||||||||| ||    
T  12119671 gggagagattgatctctccaatccactataaatgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaa 12119572  T
Q  291 ccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    || |||||||||| | |||| ||||||||    
T  12119571 ccataatttctactcttttttccaatctc 12119543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 290
Target Start/End: Original strand, 26699447 - 26699577
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaa 259  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||     
T  26699447 acccagttcggtccaacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattataaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaag 26699546  T
Q  260 aacttagctttgacaagctcacaaagaacaa 290  Q
    || |||||||  |||||||||||||||||||    
T  26699547 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa 26699577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 319
Target Start/End: Original strand, 48142327 - 48142541
Alignment:
Q  107 aaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatc 206  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||| || |   ||||| |||||||| | | ||| |||||||||||    
T  48142327 aaaccacaatcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaaaaatgtttacctagctctctccaaattgacctactgtaggg-agagattgatc 48142425  T
Q  207 tctccaatccactat--caatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttcta 302  Q
    | || |||| |||||  ||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48142426 tttcaaatctactatatcaatgagttctttacaaagagatatacaagggttacaagaaactagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttcta 48142525  T
Q  303 cccattttcccaatctc 319  Q
      ||| |||||||||||    
T  48142526 -tcatgttcccaatctc 48142541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5350140 - 5349924
Alignment:
Q  93 aagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctg 191  Q
    ||||||||| | ||| || |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | | || ||||| ||  |||||||  ||||||| ||||    
T  5350140 aagtgaaaaacacaagactacaaacaaaagataacgagagaagagaaacaaacacaccaataaatgtttacccaattcagtccaacaatgacctactctg 5350041  T
Q  192 ggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaa 290  Q
    ||| |||||  |||||||||  | || |||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||||  | ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  5350040 ggg-agaga--gatctctccgcttcattatcaacgagttctttacaaagagatacaaacgagctacaaggaattagcttcgacaagttcacaaagaacaa 5349944  T
Q  291 ccctaatttctacccatttt 310  Q
     |||||||||||||||||||    
T  5349943 acctaatttctacccatttt 5349924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 248
Target Start/End: Original strand, 21703784 - 21703928
Alignment:
Q  105 caaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaac-ttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | | || |||||||| |||| |||  ||||||| | | ||||| ||||||    
T  21703784 caaaatcacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacatcaagaaatgtttacccagttcggtcaaacaatgacctactat-ggggatagattg 21703882  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaa 248  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21703883 atatctccaatccactgtcaatgagttctttacaaaaagatacaaa 21703928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 33989989 - 33989861
Alignment:
Q  180 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagct 278  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| || |||||| || |||||||  |||| ||    
T  33989989 tgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactattaacgagttatttacaaagagatacaaaaggattacaagaaattagcttcaacaaact 33989890  T
Q  279 cacaaagaacaaccctaatttctacccat 307  Q
    | | |||||||| |||| ||||| |||||    
T  33989889 ctctaagaacaaacctagtttcttcccat 33989861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 236 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41639351 - 41639269
Alignment:
Q  236 aaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatct 318  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41639351 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagtttacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatct 41639269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 44967691 - 44967992
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||  | ||| || |  || ||||||||||  |||||| ||| ||| | ||||||||||| ||    
T  44967691 aaagtagtaactaatatcaaagtaacctcaagcaacaacaacactaataa-acatatatctaatctaaaaatcaa-gtgtaaaacacaaaaccacaatca 44967788  T
Q  119 aaat-ataaagagagaagagaaacaaac-acaccaaagattattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatc 215  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||  |||| ||  | | || |||||| | ||||||||  |||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  44967789 aaattataaagagagaggagaaacaaaatacacaaagaaatgtttacccaggtcggtccaacagtgacttattctgggggagagattgatccctctaatc 44967888  T
Q  216 cactatcaatgag-tttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccc 313  Q
     ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||   ||||||| | |||| | || ||||||||||| ||||||||||    
T  44967889 tactctcaacgagttttttacaaagagatacaaat-ggttacaagaaattggcttcagcaagctctccaagagcaaaacctaatttcta-ccattttccc 44967986  T
Q  314 aatctc 319  Q
    ||||||    
T  44967987 aatctc 44967992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 233 - 312
Target Start/End: Original strand, 55085442 - 55085521
Alignment:
Q  233 tacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcc 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  55085442 tacaaagagatacaaatggtttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacctattttcc 55085521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 8393566 - 8393399
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtttttac-aaagagatacaaat 249  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||     
T  8393566 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa- 8393468  T
Q  250 gggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||| || ||||| |||||| | |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8393467 aggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 8393399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 8395775 - 8395608
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtttttac-aaagagatacaaat 249  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||     
T  8395775 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaa- 8395677  T
Q  250 gggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||| || ||||| |||||| | |||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8395676 aggttacaagaaattagc-ttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 8395608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 194 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 33090009 - 33089900
Alignment:
Q  194 ggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaacc 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| || || |||||||  |||||||| | |||||||| |    
T  33090009 ggagagattgatctctctaatccactatcaatgagttctttacagagagatacaaaatggttataataaattagcttcaacaagctctccaagaacaaac 33089910  T
Q  293 ctaatttcta 302  Q
     |||||||||    
T  33089909 ataatttcta 33089900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 258
Target Start/End: Original strand, 37754902 - 37755063
Alignment:
Q  99 aaagctcaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggag 197  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| ||  | |||| | ||||||| ||| |||  | ||||| | ||||||||    
T  37754902 aaagcccaaaaccacaaacataagataaagagagaagaaaaacaaacacactaagaaatatttatccagtttagtctaacaattacctactatgggggag 37755001  T
Q  198 agattgatctctccaatccactatcaatgag-tttttacaaagagatacaaatgggttacaa 258  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  37755002 agattgatctcttcaaaccattatcaatgagttttttagaaagagataaaaaaaggttacaa 37755063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 310
Target Start/End: Original strand, 22882791 - 22882905
Alignment:
Q  197 gagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaacccta 295  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||  |||| ||| | |||||||| ||||    
T  22882791 gagattgatttctctaatccactaccaatgagttctttacgaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaaactctccaagaacaaaccta 22882890  T
Q  296 atttctacccatttt 310  Q
    |||| || |||||||    
T  22882891 atttttatccatttt 22882905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 310
Target Start/End: Original strand, 22934455 - 22934569
Alignment:
Q  197 gagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaacccta 295  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||  |||| ||| | |||||||| ||||    
T  22934455 gagattgatttctctaatccactaccaatgagttctttacgaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaaactctccaagaacaaaccta 22934554  T
Q  296 atttctacccatttt 310  Q
    |||| || |||||||    
T  22934555 atttttatccatttt 22934569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 221
Target Start/End: Original strand, 39593648 - 39593796
Alignment:
Q  72 ctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttg 171  Q
    ||||||||||||||  || ||||   |||||| ||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||||||||  |||||| |||||||||     
T  39593648 ctagatctaatctagaaaccaaatgtaaaagcacaaaaccgcaagcaaaagataagaagagaggagacacaaacacaccaagaattatttacccagttta 39593747  T
Q  172 gtccaac-ttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||  ||  ||| |||||||||||||  |||||||||| | ||||||    
T  39593748 gtccaacaatggtctactctgggggagaga--gatctctccacttcactat 39593796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3796634 - 3796568
Alignment:
Q  134 agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  3796634 agaggaacaaacacaccaaagattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagaga 3796568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 3913872 - 3913784
Alignment:
Q  30 caatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   |||| | |||||| ||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  3913872 caatatcaaagtaaacacaagcaataaca---ataagagcatctatatctaatctaggaatcaaagtgaaaagtataaaaccacaagtaaaa 3913784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 10047367 - 10047427
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10047367 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 10047427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 34112939 - 34112838
Alignment:
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttct 301  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  || |||||||  |||||||| |  ||||||| | ||||||||    
T  34112939 gatctctccacttcactatcaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttacatgaaattagcttcaacaagctctcctagaacaaacataatttct 34112840  T
Q  302 ac 303  Q
    ||    
T  34112839 ac 34112838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 39245982 - 39246042
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  39245982 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 39246042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6677597 - 6677514
Alignment:
Q  197 gagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctc 279  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||  ||||||||    
T  6677597 gagattgatctctcaaatccattatcaaagacttctttacaaagatatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctc 6677514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 53345340 - 53345222
Alignment:
Q  202 tgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaa-caaccctaattt 299  Q
    ||||| || ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| || |||| ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  53345340 tgatccctacaatccaatattaatgagttctttacaaaaagatataaaagggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaatcaaccttaattt 53345241  T
Q  300 ctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||  ||||||| |||||||    
T  53345240 cta-tcattttctcaatctc 53345222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36315338 - 36315258
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  36315338 aacaaacacaccaa-gaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 36315258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36329547 - 36329467
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  36329547 aacaaacacaccaa-gaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 36329467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38152548 - 38152468
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  38152548 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 38152468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 7125048 - 7124906
Alignment:
Q  178 cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttac-aaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgaca 274  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||| ||  |||||||| || |||| |||||||    
T  7125048 cttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatac-aagaggttacaagaaattag-tttgaca 7124951  T
Q  275 agctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    || |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7124950 agttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc 7124906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 14787432 - 14787473
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14787432 ttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagaga 14787473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19096213 - 19096172
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19096213 ttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagaga 19096172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 52065730 - 52065617
Alignment:
Q  190 tgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttt-ttacaaagagatac-aaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaa 287  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||| |||  ||||||  | |||||| | |||||    
T  52065730 tgggggagaga--gatctctccacttcactatcaatgagtttctaacaaagagatacaaaaggggttacagaaaaatagcttcaataagctctctaagaa 52065633  T
Q  288 caaccctaatttctacc 304  Q
    ||| |||||||||||||    
T  52065632 caa-cctaatttctacc 52065617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5396779 - 5396700
Alignment:
Q  142 aaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  5396779 aaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagaga-gcagctctccaatccactat 5396700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31985744 - 31985688
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggg 194  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  31985744 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg 31985688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5136228 - 5136165
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  5136228 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 5136165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5138453 - 5138390
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  5138453 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 5138390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 32091571 - 32091485
Alignment:
Q  231 tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatct 318  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| || |||| ||  |||| ||| | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  32091571 tttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagtttcaacaaactctccaagaacaaacctaatttcta-gcattttcccaatct 32091485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16623402 - 16623322
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  16623402 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagaga-gcagctctccaatccactat 16623322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4215636 - 4215595
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4215636 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 4215595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5269300 - 5269240
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5269300 aacaaacacaacaa-gattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 5269240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 5635479 - 5635520
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5635479 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 5635520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6765174 - 6765133
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6765174 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 6765133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7941653 - 7941612
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7941653 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 7941612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 8631422 - 8631463
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8631422 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 8631463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 14789431 - 14789472
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14789431 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 14789472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16455572 - 16455531
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16455572 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 16455531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 17662248 - 17662289
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17662248 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 17662289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 22800865 - 22800906
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22800865 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 22800906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 221
Target Start/End: Original strand, 24333794 - 24333877
Alignment:
Q  136 agaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||||||||||||||| |||| || || ||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  24333794 agaaacaaacacaccaa-gattgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagaga-gcagctctccaatccactat 24333877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24879320 - 24879279
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24879320 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 24879279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24880782 - 24880741
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24880782 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 24880741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24889126 - 24889085
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24889126 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 24889085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 304
Target Start/End: Original strand, 34788850 - 34788923
Alignment:
Q  231 tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacc 304  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| || ||| |||  |||||||| | |||| ||| |||||||||||||    
T  34788850 tttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattaacttcaacaagctctccaagagcaatcctaatttctacc 34788923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 37089375 - 37089416
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37089375 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 37089416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 38928180 - 38928221
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38928180 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 38928221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40637404 - 40637363
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40637404 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 40637363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18912498 - 18912454
Alignment:
Q  114 aagcaaaatataaagagagaagagaaaca-aacacaccaaagatt 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  18912498 aagcaaaatataaagagagaagagaaaaacaacacaccaaggatt 18912454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 9182879 - 9183194
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||    
T  9182879 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgaacacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagtacaa 9182978  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaag--agagaagagaa--acaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  9182979 aaccacaagcaaaagataaagggagagaagagagggacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacataatctggaggagagattg 9183078  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9183079 atctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaacaaccctaatttctac 9183178  T
Q  304 ccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||| |||||||    
T  9183179 ccattttctcaatctc 9183194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 319
Target Start/End: Original strand, 33211060 - 33211348
Alignment:
Q  31 aatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaagag 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33211060 aatattaaagtaaacacaagcaataacaacaataataacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaatcacaaaaccacaagcaaaagataaagag 33211159  T
Q  131 agaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt 230  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  33211160 agaagagaaacaaacataccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattataaatgagtt 33211259  T
Q  231 tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33211260 cttacaaagagatacaaatgagctacaagaaattaacttcatcaagctcacaaagaacaaccataatttctaccaattttcccaatctc 33211348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 26954149 - 26954448
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||| || ||||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  26954149 aaagtagtaaccaatttcaaagtaaacataagaaataacaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagaa 26954248  T
Q  119 aaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccac 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26954249 aaatgtaaagagagaagagaaacaaagtcaccaaagattgttgacctagttcggtccaacttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccac 26954348  T
Q  219 tatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatct 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  26954349 tatcaatgagttcttacaaagagatacagatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttata-ccaatttcccaatct 26954447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 28137259 - 28137571
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||| || |    
T  28137259 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtaaacacaagcaataacgacaataacaacacatagatctaatataggaatcaaagtgaaaagcacata 28137358  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaac--aaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatc 206  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||   ||||| |||||  | | || || || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28137359 accacaagcaaaagataaagggagaagataaaacaaaacataccaagaaatgttcacacaattcggtccaacttgacctactctgggggagagattgatc 28137458  T
Q  207 tctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28137459 tctccaatccactatcaatgagttcttacaaagaaatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccca 28137558  T
Q  307 ttttcccaatctc 319  Q
    |||||||| ||||    
T  28137559 ttttcccattctc 28137571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Original strand, 33160199 - 33160500
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || ||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  33160199 ggagcaaaggaaaatagtaaccaatttcaaagtaaatacaagcaacaacaatattaacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaa 33160298  T
Q  109 accacaagcaaaatataaa---gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    ||||||| ||||| |||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||  || ||||| |||||||||    
T  33160299 accacaaacaaaagataaaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagtttggtccaaacttgaaatactctggaggagagatt 33160398  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  33160399 gatctctccaatccaccatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaactctaatttcta 33160498  T
Q  303 cc 304  Q
    ||    
T  33160499 cc 33160500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16569329 - 16569038
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 118  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||  |||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16569329 aaagtagtaaccaaaatcaaagtgaactcaagcaataacaacaatagcagcacctagatctaatctagaaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagca 16569230  T
Q  119 aaatataaagagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatcc 216  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16569229 aaagataaagagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatcc 16569130  T
Q  217 actatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaa 315  Q
    |||||||||||||| |||||||            |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  16569129 actatcaatgagttcttacaaa------------ggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaa 16569042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 5413243 - 5413556
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  5413243 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaa 5413342  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    | |||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  5413343 a-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 5413440  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5413441 gatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaacaaccctaatttcta 5413540  T
Q  303 cccattttcccaatctc 319  Q
     || |||||||||||||    
T  5413541 -cctttttcccaatctc 5413556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 31404523 - 31404837
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||| | ||||| |||    
T  31404523 ggagcaaaggaaaatagtaatcaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagaggaaagcacaa 31404622  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    | |||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||    
T  31404623 a-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagatt 31404721  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31404722 gatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta 31404821  T
Q  303 cccattttcccaatctc 319  Q
     ||||||||||||||||    
T  31404822 -ccattttcccaatctc 31404837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 30834382 - 30834700
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctca- 106  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||| |||||| ||  ||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||   ||     
T  30834382 ggagcaaaggaaaatagtaaccaataacaaagtgaatgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctatgaatcaaagtgaaaaaaacac 30834481  T
Q  107 aaaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagat 201  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  30834482 aaaccacaagcaaaatataaaaggagagaagagataaacaaacacaccaaagattattcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagat 30834581  T
Q  202 tgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttct 301  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30834582 tgaactctccaatccactatcaatgagttcttccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttct 30834681  T
Q  302 accc-attttcccaatctc 319  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  30834682 acccttttttcccaatctc 30834700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 319
Target Start/End: Original strand, 5406058 - 5406362
Alignment:
Q  16 agaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaa 115  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| ||  | ||||| | || ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  5406058 agaaaagtagtaaccaatattaaagtgagcacaagcaataa--tcaataatagcacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaa-ccacaa 5406154  T
Q  116 gcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctc 210  Q
     ||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5406155 acaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctc 5406254  T
Q  211 caatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5406255 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccatttt 5406353  T
Q  311 cccaatctc 319  Q
    |||||||||    
T  5406354 cccaatctc 5406362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 319
Target Start/End: Original strand, 5410383 - 5410687
Alignment:
Q  16 agaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaa 115  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| ||  | ||||| | || ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  5410383 agaaaagtagtaaccaatattaaagtgagcacaagcaataa--tcaataatagcacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaaa-ccacaa 5410479  T
Q  116 gcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctc 210  Q
     ||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5410480 acaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctc 5410579  T
Q  211 caatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5410580 caatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttcta-ccatttt 5410678  T
Q  311 cccaatctc 319  Q
    |||||||||    
T  5410679 cccaatctc 5410687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 319
Target Start/End: Original strand, 16452186 - 16452493
Alignment:
Q  19 aaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagc 117  Q
    |||||||||| ||||| |||||| || |||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16452186 aaagtagtaaccaataacaaagtgaatacaagcaataatcaacaataacatcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagc 16452284  T
Q  118 aaaa-tataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctcc 211  Q
    |||| ||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  16452285 aaaaatataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctcc 16452384  T
Q  212 aatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccc-atttt 310  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16452385 aatccactatcaatgagttcttccaaagagatatgaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttt 16452484  T
Q  311 cccaatctc 319  Q
    |||||||||    
T  16452485 cccaatctc 16452493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 319
Target Start/End: Original strand, 3038776 - 3039066
Alignment:
Q  10 gagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaaca-caagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    ||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  3038776 gagcaaaggaaagtaataaccaatatcaaagcaaacaacaagtaacaacaataataacaacacctagatctaatatagtaatcaaagtgaaaagttcaaa 3038875  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||                    |||||||||||||||||||| |||||    
T  3038876 accacaagcaaaagataaagagagaaaagaaacaaacacaccaaagattgttga--------------------cctaatctgggggagagattaatctc 3038955  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  3038956 tccaatccactattaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaagctcacaatgaacaaccctaatttctaccaatt 3039055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 21589093 - 21588936
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21589093 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 21588994  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21588993 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 21588936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 21593826 - 21593669
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21593826 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 21593727  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21593726 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 21593669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 254
Target Start/End: Original strand, 5408918 - 5409167
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||    
T  5408918 ggagcaaaggaaagtagtaaccaatatcaaagtgagcacaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagagaaaagcacaa 5409017  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    | |||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  5409018 a-ccacaagcaaaagataaaaggagagaagagagaaacaaacacaccaaagattgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagatt 5409115  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggtt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5409116 gatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 5409167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 61 - 319
Target Start/End: Original strand, 2171428 - 2171694
Alignment:
Q  61 aataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagct-ca-aaaccacaagcaaaatataaa---gagagaagaga--aacaaacacaccaa- 152  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||    || ||| |||||||| || |||||   |||||||||||  |||||| |||||||     
T  2171428 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaaaaacataaaacacaagcacaagataaaagggagagaagagataaacaaatacaccaag 2171527  T
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgg 251  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  2171528 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaa-gg 2171626  T
Q  252 gttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2171627 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctc 2171694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 166 - 319
Target Start/End: Original strand, 2972949 - 2973102
Alignment:
Q  166 agtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaactta 265  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  2972949 agttcggtcgaacttgacctactcttgaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaatta 2973048  T
Q  266 gctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2973049 gcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctacccattttcccaatctc 2973102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 306
Target Start/End: Original strand, 603085 - 603238
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatggg 252  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  603085 agattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaatggg 603184  T
Q  253 ttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccca 306  Q
    |||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  603185 ttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaacacaaatttctaccca 603238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 176 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 17758171 - 17758028
Alignment:
Q  176 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaa 275  Q
    ||||||| ||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||    
T  17758171 aacttgaactactctagaggggagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaa 17758072  T
Q  276 gctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17758071 gctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 17758028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Original strand, 26830129 - 26830286
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  26830129 acccagttcagtcaaacttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatggattacaagaa 26830228  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26830229 attagcttcaacaagctcacaaagaacaactctaatttctacccatttttccaatctc 26830286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 180 - 319
Target Start/End: Original strand, 3808732 - 3808872
Alignment:
Q  180 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatac-aaatgggttacaaaaacttagctttgacaagct 278  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||  |||||||    
T  3808732 tgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagct 3808831  T
Q  279 cacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3808832 cacaaagaacaaccctaatttctacctattttcccaatctc 3808872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 176 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 17763138 - 17762995
Alignment:
Q  176 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaa 275  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||    
T  17763138 aacttgatctactctggaggagagattgatcactccaatccactatcaatgagttcttccaaaaagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaa 17763039  T
Q  276 gctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17763038 gctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttctcaatctc 17762995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 5043790 - 5043632
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaa 260  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  5043790 acccagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaaga 5043691  T
Q  261 acttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  5043690 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacctaatttctactcattttctcaatctc 5043632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 319
Target Start/End: Original strand, 22424850 - 22424990
Alignment:
Q  180 tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaa--tgggttacaaaaacttagctttgacaagc 277  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||  ||||||    
T  22424850 tgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagc 22424948  T
Q  278 tcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22424949 tcacaaagaacaaccctaatttctacccatttttccaatctc 22424990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 200
Target Start/End: Original strand, 14521543 - 14521722
Alignment:
Q  22 gtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaa 121  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14521543 gtagtaaccaatttcaaagtaaacacaagcaacaacaataacaacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcataa 14521642  T
Q  122 tataaagagagaagagaaacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
     |||||| ||||| ||||| ||||||||||| | | | |||||| |||| |||||||  ||||||| ||| | |||||||    
T  14521643 gataaagtgagaaaagaaataaacacaccaagaaaatgttgacctagttcggtccaatatgacctactctcgaggagaga 14521722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Original strand, 3072739 - 3072923
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac 235  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  3072739 aaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatcaatgagttcttac 3072838  T
Q  236 -aaagagatac-aaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||||| ||| | ||||||| || |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3072839 aaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaccctaatttcta-ccattttcccaatctc 3072923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4045669 - 4045428
Alignment:
Q  72 ctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttg 171  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||   ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |  | ||| |||| |    
T  4045669 ctagatctaatctaagaatcaa-gtgaaaaaaacaaaaccacgagtaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaagaaatgcttacctagttcg 4045571  T
Q  172 gtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagcttt 270  Q
    |||||      |||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||||| || |||||||     
T  4045570 gtcca------cctactttggggtagaaattgatctctccaatccactatcaatgagttatttacaaagagatataaaatgattacaagaaattagcttc 4045477  T
Q  271 gacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4045476 aacaagctcataaagaacaaaccctaatttcta-ccattttcccaatctc 4045428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 412291 - 412106
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaaaga--ttattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttttta 234  Q
    ||||||| ||||||||||  || || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  412291 aaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaatgagttctta 412192  T
Q  235 c-aaagagatac-aaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    | |||||||||| ||| | ||||||| || |||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  412191 caaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgataagttcacaatgaacaaccctaatttcta-cctttttcccaatctc 412106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Original strand, 6097430 - 6097603
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaaaga--ttattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagttttta 234  Q
    ||||||| ||||||||||  || || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6097430 aaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttctta 6097529  T
Q  235 caaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||| |||         ||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6097530 caaa-aga---------gttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaatcctaatttcta-ccatttttccaatctc 6097603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 25073698 - 25073588
Alignment:
Q  195 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccc 293  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||| ||  |    
T  25073698 gagagattgatttctctaatccactatcaatgagttctttacatagagatacaaaagggttacaataaaatagctttaacaagctcacgaagaataaatc 25073599  T
Q  294 taatttctacc 304  Q
    |||||||||||    
T  25073598 taatttctacc 25073588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 27648032 - 27647866
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatg 250  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||      
T  27648032 agattgttcacccagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaagagttcttacaaaagggatacaaa-a 27647934  T
Q  251 ggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27647933 ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 27647866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16555058 - 16554874
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaaaga--ttattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttttt 233  Q
    ||||||| ||||||||||  || || |||||||| ||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16555058 aaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttctt 16554959  T
Q  234 ac-aaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    || |||| ||||||||  |||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16554958 acaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 16554874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Original strand, 16578497 - 16578681
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaaaga--ttattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttttt 233  Q
    ||||||| ||||||||||  || || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16578497 aaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttctt 16578596  T
Q  234 ac-aaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    || |||| ||||||||  |||||||| || ||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16578597 acaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 16578681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16616883 - 16616699
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaaaga--ttattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttttt 233  Q
    ||||||| ||||||||||  || || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16616883 aaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttctt 16616784  T
Q  234 ac-aaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    || |||| ||||||||  |||||||| || ||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16616783 acaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 16616699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16631614 - 16631430
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaaaga--ttattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttttt 233  Q
    ||||||| ||||||||||  || || |||||||| ||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16631614 aaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttctt 16631515  T
Q  234 ac-aaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    || |||| ||||||||  |||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16631514 acaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctaccc-ttttcccaatctc 16631430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16653301 - 16653117
Alignment:
Q  138 aaacaaacacaccaaaga--ttattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttttt 233  Q
    ||||||| ||||||||||  || || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16653301 aaacaaatacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttctt 16653202  T
Q  234 ac-aaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    || |||| ||||||||  |||||||| || ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16653201 acaaaagggatacaaa-aggttacaagaaattagc-ttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttaccc-ttttcccaatctc 16653117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 26800748 - 26800630
Alignment:
Q  164 ccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatac-aaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| ||    
T  26800748 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aatgagttcttacaaagagatacaaaattagttacaagaa 26800650  T
Q  262 cttagctttgacaagctcac 281  Q
     |||||||  ||||||||||    
T  26800649 attagcttcaacaagctcac 26800630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 25421478 - 25421310
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttac-aaagagatacaaa 248  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||    
T  25421478 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 25421380  T
Q  249 tgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
      |||||||| || ||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25421379 gaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc 25421310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5757589 - 5757507
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  5757589 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 5757507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6027419 - 6027251
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttac-aaagagatacaaa 248  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||    
T  6027419 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aa 6027321  T
Q  249 tgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
      |||||||| || ||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6027320 gaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc 6027251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 221
Target Start/End: Original strand, 21356019 - 21356104
Alignment:
Q  136 agaaacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||||    
T  21356019 agaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagaga-gcagctctccaatccactat 21356104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 200
Target Start/End: Original strand, 31979496 - 31979561
Alignment:
Q  134 agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  31979496 agaggaacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagaga 31979561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 10077274 - 10077214
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10077274 aacaaacacaccaa-gattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 10077214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34167252 - 34167180
Alignment:
Q  153 agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 224  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  34167252 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 34167180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 258
Target Start/End: Original strand, 5273219 - 5273320
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatca-atgagttt--ttacaaagagatacaaatgggtta 255  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||   | | |||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||    
T  5273219 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga-gcagccctccaatccactataagatgagtttcgttacaaagagaaatcaatgggtta 5273317  T
Q  256 caa 258  Q
    |||    
T  5273318 caa 5273320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13154078 - 13154015
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  13154078 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 13154015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 147
Target Start/End: Original strand, 28840299 - 28840334
Alignment:
Q  112 acaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacac 147  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840299 acaaacaaaatataaagagagaagagaaacaaacac 28840334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Original strand, 33342110 - 33342173
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  33342110 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 33342173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34165021 - 34164958
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  34165021 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaa 34164958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 1230252 - 1230293
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  1230252 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 1230293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 4816234 - 4816275
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4816234 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 4816275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5017578 - 5017518
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||    
T  5017578 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagaga 5017518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5572350 - 5572290
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  5572350 aacaaacacaccaa-gattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagaga 5572290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 11983032 - 11983073
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11983032 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 11983073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 14458770 - 14458811
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14458770 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 14458811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 14507179 - 14507220
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14507179 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 14507220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16567258 - 16567201
Alignment:
Q  263 ttagctttgacaagctcacaaagaacaac-cctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16567258 ttagcttaaacaagctcacaaaaaacaaaacctaatttctaaccattttcccaatctc 16567201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 19704570 - 19704611
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19704570 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 19704611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 20915359 - 20915400
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20915359 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 20915400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 30728827 - 30728868
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  30728827 ttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgcgggagaga 30728868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2908586 - 2908534
Alignment:
Q  197 gagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaa 248  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  2908586 gagattgatttcttcaatccactatcaatgagttctttacaataagatacaaa 2908534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9572719 - 9572667
Alignment:
Q  196 agagattgatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaa 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||    
T  9572719 agagattgatctctgcaatccactatcaatgggttcttaacaaagagttacaa 9572667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 148960 - 149260
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaa 108  Q
    |||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||         |||||||| ||| ||||||||||  ||||||| |||||||  ||||    
T  148960 ggagcaaaggaaagtagtaaccaacatcaaagtaaacacaagcaa---------taacaacacctaaatctaatctaggaatcaaa-tgaaaagtacaaa 149049  T
Q  109 accacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctc 208  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  149050 accacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaatacaccaaagattgttgacccagttcggtccaacttaacctactctgggggagagattgatctc 149149  T
Q  209 tccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  149150 tccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatataaatgggtaacaagaaattagcttcaacaagcttacaaaaaacaaccctaatttctatccgtt 149249  T
Q  309 ttcccaatctc 319  Q
    |||||||||||    
T  149250 ttcccaatctc 149260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Original strand, 5671 - 5731
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5671 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga 5731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 198
Target Start/End: Original strand, 2480 - 2538
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggaga 198  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  2480 aacaaacacaccaa-gattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggaga 2538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 133391 - 133309
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||  ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  133391 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagaga-gcagctctccaatccactat 133309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 20263 - 20578
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaac-attaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || || ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||  |  ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||| | |||    
T  20263 ggagcaaaggaaggtagtaaccaatgtcaaagtgaacacaagcaataattaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaa 20362  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaag--agagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 203  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20363 aaccacaagcaaaagataaagggagagaagagaggaacaaacacaccaaaaattgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgggggagagattg 20462  T
Q  204 atctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctac 303  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||| ||||| |||||||||| |    
T  20463 atctctccaatccaatatcaaagagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaaaaacaaacctaatttctgc 20562  T
Q  304 ccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||||||||||    
T  20563 tcattttcccaatctc 20578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 114923 - 114607
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaa-cattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||  |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  114923 ggagcaaaggaaagtaataaccaatatcaaagtgaacacaatcaataatcaacaataacaacacctatatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaa 114824  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatt 202  Q
    ||| ||||| |||| |||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||| || | |||||| |||| || ||| ||||| ||||| |||||||||    
T  114823 aacaacaagaaaaagataaaaggagagaagagagaaacaagcacaccaaagattgttcatccagttcggtctaaacttaacctactctggaggagagatt 114724  T
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttcta 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  114723 gatctctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagcgttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccttaatttcta 114624  T
Q  303 cccattttcccaatctc 319  Q
    ||| |||||||||||||    
T  114623 ccctttttcccaatctc 114607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 61 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 434801 - 434544
Alignment:
Q  61 aataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaa---gagagaagaga--aacaaacacaccaaaga 155  Q
    ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||   |||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  434801 aataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaac-acaagcacaagataaaagggagagaagagagaaacaaacacaccaaata 434703  T
Q  156 ttattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggtt 254  Q
    || || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  434702 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaaagggtt 434603  T
Q  255 acaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttccc 313  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  434602 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccctttttccc 434544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 303
Target Start/End: Original strand, 490359 - 490468
Alignment:
Q  195 gagagattgatctctccaatccactatcaatgagt-ttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccc 293  Q
    |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||| || |||||||  |||||||| | |||||||| |     
T  490359 gagagaatgatctctccgcttcactatcaatgagtactttacaaagatatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagctctccaagaacaaact 490458  T
Q  294 taatttctac 303  Q
    ||||||||||    
T  490459 taatttctac 490468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 61 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 1183 - 920
Alignment:
Q  61 aataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaa--gagagaagaga--aacaaa-cacaccaaaga 155  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  1183 aataacaccacctagatctaatctaggtatcaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcaaagtataaaaggagagaagagagaaacaaaacacaccaaaga 1085  T
Q  156 ttattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggtt 254  Q
    || || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  1084 ttgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaatgagttgtt-caaagagatacaaaagggtt 986  T
Q  255 acaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctaccc-attttcccaatctc 319  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  985 acaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttttcccaatctc 920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 128 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 11757 - 11562
Alignment:
Q  128 gagagaagaga--aacaaacacaccaa-agattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatca 223  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11757 gagagaagagataaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatca 11658  T
Q  224 atgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11657 atgagttcttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaacaaccctaatttctaccatttttcccaatctc 11562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 61 - 319
Target Start/End: Original strand, 8634 - 8900
Alignment:
Q  61 aataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaaag 154  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||    ||| ||||||  ||||||| |||||||||    
T  8634 aataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaa-ccacaagcacaagataaaagaagagggaagaggaaaacaaagacaccaaag 8732  T
Q  155 attattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttac-aaagagatacaaatggg 252  Q
    ||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  8733 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaaggg 8832  T
Q  253 ttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctc 319  Q
    |||||| || |||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8833 ttacaagaaattagattttataagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctc 8900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 61 - 319
Target Start/End: Original strand, 11060 - 11326
Alignment:
Q  61 aataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaaaatataaa----gagagaagag--aaacaaacacaccaaag 154  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| ||||||||| || |||||    ||| ||||||  ||||||| |||||||||    
T  11060 aataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaaacacaaa-ccacaagcacaagataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaag 11158  T
Q  155 attattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaa-gagatacaaatggg 252  Q
    ||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  11159 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaacgagttcttacaaaagagatacaaaaggg 11258  T
Q  253 ttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattt-tcccaatctc 319  Q
    |||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11259 ttacaagaaattagattttacaagttcacaaagaacaaccctaatttctacccttttctcccaatctc 11326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 7489 - 7332
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7489 acccagttcggtccaacttaacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatcaatgagttcttacaaagagatacaaatgggttacaagaa 7390  T
Q  262 cttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7389 attagcttcaacaagctcacaaagaacaaccttaatttctacccatttttccaatctc 7332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 176 - 319
Target Start/End: Original strand, 18024 - 18166
Alignment:
Q  176 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaa 275  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||    
T  18024 aacttgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttt-acaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaa 18122  T
Q  276 gctcacaaagaacaaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18123 gctcacaatgaacaaccctaatttctaccaattttcccactctc 18166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 279
Target Start/End: Original strand, 27307 - 27566
Alignment:
Q  20 aagtagtaaacaatatcaaagtaaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaaaaccacaagcaa 119  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| | |||||| ||| | |||||||||  | ||||   ||||||  |||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  27307 aagtagtaaccaatatgaaagtaacctcaagcagcaaaaataataacaaact-tagaagaaatctaggaatcaa-gtgaaaaacacaaaaccacaagcaa 27404  T
Q  120 aatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaact-tgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccac 218  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||||| |||  | | || ||| | || ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27405 aaggtaaagagagaagagaaataaacacatcaataaatgtttacctaattcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccac 27504  T
Q  219 tatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctc 279  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||    
T  27505 tatcaataagttatttacaaagagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctc 27566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 211 - 319
Target Start/End: Original strand, 80338 - 80446
Alignment:
Q  211 caatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 310  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80338 caattcactatctatgagttcttacaaaaagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaccctaatttctacccatttt 80437  T
Q  311 cccaatctc 319  Q
    |||||||||    
T  80438 cccaatctc 80446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1668 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1668
Description:

Target: scaffold1668; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 157
Target Start/End: Original strand, 1350 - 1499
Alignment:
Q  9 ggagcagagaaaagtagtaaacaatatcaaagt-aaacacaagcaacaacattaataacaacatctagatctaatctattaatcaaagtgaaaagctcaa 107  Q
    |||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| || ||||   |||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| |  ||    
T  1350 ggagcaaaggaaagtagtaatcaatattaaagttaaacacaagtaataacaacgataacagcacctagatctaatctaggaattaaagtgaaaaacataa 1449  T
Q  108 aaccacaagcaaaatataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagatt 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1450 aaccacaagcaaaagataaagagagaagagaaacaaacacaccaaagatt 1499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 162 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10651 - 10546
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaatgagtttttacaaagagatacaaatgggttacaaaaa 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  10651 acccagttcggtccaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaacgagttcttacaaagagatacaaaatggttacaataa 10552  T
Q  262 cttagc 267  Q
     |||||    
T  10551 attagc 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 319
Target Start/End: Original strand, 2598 - 2768
Alignment:
Q  151 aaagattattgacccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttac-aaagagataca 246  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||     
T  2598 aaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac- 2696  T
Q  247 aatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    ||  |||||||| || ||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2697 aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc 2768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8533 - 8448
Alignment:
Q  136 agaaacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  8533 agaaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 8448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Original strand, 3731 - 3794
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 224  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3731 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaa 3794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 200
Target Start/End: Original strand, 10712 - 10777
Alignment:
Q  134 agagaaacaaacacaccaaagattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  10712 agaggaacaaacacaccaa-gattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagaga 10777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25175 - 25065
Alignment:
Q  203 gatctctccaatccactatcaatgagtt-tttacaaagagatacaaatgggttacaaaaacttagctttgacaagctcacaaagaacaaccctaatttct 301  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||  |||| ||| ||||||||||  ||| |||||    
T  25175 gatctctctacttcactatcaatgagttctttacaaagagatacaaaaaggttacaagaaattaccttcaacaaactctcaaagaacaaaactagtttct 25076  T
Q  302 acccattttccc 313  Q
    | ||||||||||    
T  25075 a-ccattttccc 25065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6436 - 6277
Alignment:
Q  162 acccagtttggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-tttac-aaagagatacaaatgggttaca 257  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| || || |||||    
T  6436 acccagttcggtccaaacttaacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaagggatac-aagggcttaca 6338  T
Q  258 aaaacttagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctc 319  Q
    | || ||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6337 agaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc 6277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 79470 - 79429
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  79470 ttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagaga 79429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 52298 - 52257
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  52298 ttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagaga 52257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 50299 - 50258
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  50299 ttgacccagttaggtccaaattgacctagtctgggggagaga 50258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Original strand, 45239 - 45321
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  45239 aacaaacacaccaaaagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 45321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44072 - 43990
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat 221  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  44072 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagaga-gcagctctccaatccactat 43990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 36943 - 36881
Alignment:
Q  139 aacaaacacaccaaa-gattattgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||    
T  36943 aacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagaga 36881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 1456 - 1497
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  1456 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 1497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 29455 - 29414
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29455 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 29414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Original strand, 69295 - 69336
Alignment:
Q  159 ttgacccagtttggtccaacttgacctaatctgggggagaga 200  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  69295 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaga 69336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University