View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17357_high_12 (Length: 372)

Name: NF17357_high_12
Description: NF17357
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17357_high_12
NF17357_high_12
[»] chr2 (46 HSPs)
chr2 (1-357)||(1912443-1912798)
chr2 (2-338)||(25337870-25338206)
chr2 (1-341)||(16379327-16379667)
chr2 (5-339)||(33174894-33175226)
chr2 (1-339)||(1706978-1707315)
chr2 (1-336)||(16378877-16379211)
chr2 (45-339)||(41754225-41754519)
chr2 (5-280)||(30966685-30966960)
chr2 (5-339)||(33770946-33771271)
chr2 (5-280)||(30966229-30966504)
chr2 (1-339)||(25433928-25434266)
chr2 (25-331)||(8256470-8256776)
chr2 (2-280)||(24818321-24818598)
chr2 (24-339)||(15619834-15620149)
chr2 (125-357)||(18098874-18099106)
chr2 (1-339)||(33174441-33174776)
chr2 (113-339)||(29804618-29804844)
chr2 (1-339)||(15639676-15640008)
chr2 (21-279)||(29259512-29259770)
chr2 (5-277)||(5399693-5399965)
chr2 (21-339)||(27882818-27883136)
chr2 (87-286)||(11388178-11388375)
chr2 (123-293)||(83000-83169)
chr2 (83-325)||(38898866-38899108)
chr2 (165-339)||(18447954-18448128)
chr2 (21-226)||(30963155-30963360)
chr2 (5-169)||(32377592-32377756)
chr2 (87-242)||(11394568-11394721)
chr2 (7-239)||(30963598-30963830)
chr2 (154-276)||(1953154-1953276)
chr2 (5-276)||(30961759-30962038)
chr2 (21-265)||(8073902-8074146)
chr2 (5-249)||(13191001-13191244)
chr2 (5-143)||(32377783-32377921)
chr2 (110-295)||(16541965-16542151)
chr2 (257-357)||(18098689-18098789)
chr2 (137-237)||(20502061-20502160)
chr2 (1-224)||(8181234-8181446)
chr2 (5-67)||(20502172-20502234)
chr2 (7-69)||(36924359-36924421)
chr2 (145-224)||(36924437-36924519)
chr2 (125-210)||(37552632-37552715)
chr2 (153-237)||(9909130-9909214)
chr2 (154-213)||(26864841-26864900)
chr2 (21-70)||(83222-83271)
chr2 (2-51)||(29804871-29804920)
[»] chr4 (85 HSPs)
chr4 (1-339)||(1645615-1645953)
chr4 (5-339)||(50398408-50398742)
chr4 (5-339)||(3169142-3169476)
chr4 (19-339)||(23942673-23942990)
chr4 (21-338)||(4127775-4128093)
chr4 (5-339)||(50398864-50399197)
chr4 (45-339)||(12691909-12692203)
chr4 (1-337)||(23943108-23943440)
chr4 (5-339)||(24629306-24629637)
chr4 (5-280)||(49998631-49998906)
chr4 (5-280)||(44471195-44471470)
chr4 (5-339)||(4127288-4127642)
chr4 (5-280)||(35871623-35871897)
chr4 (1-339)||(9423724-9424062)
chr4 (1-337)||(21067220-21067556)
chr4 (102-337)||(53996082-53996317)
chr4 (11-280)||(44470751-44471019)
chr4 (1-340)||(14351730-14352069)
chr4 (2-242)||(7678489-7678729)
chr4 (5-325)||(51331153-51331471)
chr4 (5-280)||(23350153-23350428)
chr4 (84-339)||(29628617-29628871)
chr4 (110-325)||(21220306-21220521)
chr4 (68-338)||(24628910-24629183)
chr4 (5-277)||(14572024-14572292)
chr4 (1-339)||(21067673-21068005)
chr4 (12-339)||(8467690-8468003)
chr4 (40-209)||(50814730-50814899)
chr4 (22-339)||(31817740-31818056)
chr4 (137-337)||(1464085-1464285)
chr4 (96-272)||(15306052-15306234)
chr4 (186-357)||(53854858-53855029)
chr4 (5-273)||(17628513-17628781)
chr4 (94-276)||(13613857-13614038)
chr4 (113-339)||(31817376-31817602)
chr4 (123-280)||(14571709-14571866)
chr4 (21-239)||(27026539-27026756)
chr4 (14-276)||(27578788-27579050)
chr4 (126-235)||(27029317-27029426)
chr4 (21-209)||(27578343-27578531)
chr4 (110-339)||(4185650-4185880)
chr4 (5-239)||(13266122-13266356)
chr4 (23-325)||(17028824-17029126)
chr4 (126-280)||(17029325-17029479)
chr4 (1-106)||(7381436-7381541)
chr4 (1-101)||(40607105-40607205)
chr4 (5-100)||(15268043-15268138)
chr4 (123-237)||(33764898-33765012)
chr4 (1-147)||(53854713-53854859)
chr4 (114-271)||(42838628-42838787)
chr4 (5-80)||(35477855-35477930)
chr4 (9-147)||(14571562-14571700)
chr4 (135-273)||(24271551-24271690)
chr4 (110-213)||(20306139-20306239)
chr4 (1-73)||(4414253-4414325)
chr4 (125-213)||(23091501-23091589)
chr4 (127-237)||(4186205-4186315)
chr4 (137-339)||(26200287-26200492)
chr4 (154-239)||(43928982-43929067)
chr4 (157-269)||(45682209-45682321)
chr4 (126-237)||(44831035-44831146)
chr4 (159-273)||(23976243-23976357)
chr4 (176-292)||(17506367-17506484)
chr4 (137-221)||(34554483-34554567)
chr4 (160-280)||(41869913-41870033)
chr4 (12-60)||(53996007-53996055)
chr4 (19-145)||(27578170-27578296)
chr4 (127-209)||(52048659-52048740)
chr4 (21-111)||(31817024-31817114)
chr4 (224-338)||(33987160-33987274)
chr4 (110-210)||(17629033-17629132)
chr4 (160-200)||(39902478-39902518)
chr4 (141-272)||(53391890-53392021)
chr4 (20-58)||(2499387-2499425)
chr4 (5-43)||(50399336-50399374)
chr4 (217-294)||(20309600-20309676)
chr4 (204-292)||(10165937-10166025)
chr4 (123-179)||(33294880-33294936)
chr4 (1-72)||(29628520-29628591)
chr4 (246-277)||(35477801-35477832)
chr4 (76-158)||(11828426-11828508)
chr4 (5-70)||(5810039-5810104)
chr4 (21-82)||(52048563-52048624)
chr4 (14-54)||(33294771-33294811)
chr4 (63-119)||(50399279-50399335)
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (5-339)||(20057595-20057929)
chr1 (5-339)||(20054412-20054746)
chr1 (5-339)||(20054868-20055202)
chr1 (5-339)||(20055324-20055658)
chr1 (5-339)||(20055780-20056114)
chr1 (5-339)||(20056236-20056570)
chr1 (5-339)||(20057139-20057473)
chr1 (5-339)||(20845537-20845871)
chr1 (2-331)||(52250150-52250479)
chr1 (5-339)||(16451809-16452143)
chr1 (5-339)||(16460962-16461296)
chr1 (5-339)||(20053956-20054290)
chr1 (5-331)||(43057399-43057725)
chr1 (5-339)||(20056692-20057017)
chr1 (5-324)||(50002583-50002902)
chr1 (5-339)||(38340842-38341176)
chr1 (5-339)||(43056941-43057274)
chr1 (5-325)||(50002951-50003271)
chr1 (5-277)||(35759484-35759756)
chr1 (5-329)||(51372750-51373074)
chr1 (5-277)||(46693611-46693884)
chr1 (5-211)||(20060216-20060422)
chr1 (59-277)||(35760844-35761062)
chr1 (67-325)||(12883474-12883732)
chr1 (111-325)||(31822645-31822859)
chr1 (10-338)||(30872828-30873158)
chr1 (110-286)||(50002266-50002442)
chr1 (126-280)||(20061188-20061342)
chr1 (76-335)||(7548033-7548290)
chr1 (97-331)||(2634868-2635102)
chr1 (2-177)||(52250641-52250816)
chr1 (2-177)||(52250978-52251153)
chr1 (127-280)||(2328310-2328463)
chr1 (21-277)||(23180728-23180984)
chr1 (108-276)||(12727990-12728159)
chr1 (110-331)||(16907178-16907399)
chr1 (111-336)||(10820531-10820758)
chr1 (1-120)||(7547792-7547911)
chr1 (96-276)||(2634464-2634645)
chr1 (5-101)||(31822995-31823091)
chr1 (142-206)||(31823097-31823161)
chr1 (5-68)||(35759940-35760003)
chr1 (115-237)||(16440565-16440687)
chr1 (2-151)||(35009881-35010018)
chr1 (137-339)||(2739457-2739660)
chr1 (1-63)||(39582553-39582615)
chr1 (129-264)||(842933-843068)
chr1 (153-211)||(16410747-16410805)
chr1 (5-58)||(49996556-49996609)
chr1 (21-193)||(7229835-7230007)
chr1 (168-206)||(46411173-46411211)
chr1 (21-58)||(46411030-46411067)
[»] chr8 (58 HSPs)
chr8 (1-338)||(8080214-8080551)
chr8 (5-339)||(27022215-27022548)
chr8 (5-339)||(22548425-22548759)
chr8 (1-303)||(2044030-2044332)
chr8 (5-339)||(22548871-22549205)
chr8 (5-339)||(12827130-12827464)
chr8 (5-338)||(22026316-22026650)
chr8 (20-339)||(32292333-32292652)
chr8 (1-339)||(27925835-27926172)
chr8 (2-339)||(41658978-41659314)
chr8 (5-280)||(25147531-25147805)
chr8 (21-337)||(33852150-33852466)
chr8 (5-270)||(17103086-17103352)
chr8 (5-272)||(10844491-10844758)
chr8 (85-339)||(22840486-22840739)
chr8 (94-338)||(6464875-6465119)
chr8 (20-339)||(28453275-28453593)
chr8 (2-280)||(12100687-12100963)
chr8 (123-339)||(10844819-10845035)
chr8 (4-239)||(41913006-41913241)
chr8 (5-280)||(34308355-34308630)
chr8 (5-280)||(25147962-25148236)
chr8 (5-280)||(34308811-34309090)
chr8 (4-197)||(31283527-31283719)
chr8 (21-277)||(21316002-21316257)
chr8 (1-339)||(30527354-30527689)
chr8 (110-280)||(25144767-25144937)
chr8 (154-339)||(27021904-27022093)
chr8 (142-325)||(28375067-28375250)
chr8 (89-276)||(27819206-27819393)
chr8 (5-120)||(32292096-32292211)
chr8 (5-235)||(15818892-15819121)
chr8 (5-186)||(25307855-25308034)
chr8 (114-242)||(3744671-3744799)
chr8 (108-280)||(15567535-15567707)
chr8 (97-340)||(1296943-1297185)
chr8 (114-231)||(3745145-3745262)
chr8 (26-266)||(22705181-22705424)
chr8 (178-325)||(29971450-29971597)
chr8 (137-276)||(30334916-30335055)
chr8 (1-92)||(6463415-6463507)
chr8 (165-339)||(6466647-6466820)
chr8 (139-339)||(6466193-6466392)
chr8 (5-176)||(10729722-10729893)
chr8 (126-241)||(28912847-28912962)
chr8 (159-224)||(15568035-15568100)
chr8 (19-67)||(34688044-34688092)
chr8 (10-152)||(29971308-29971448)
chr8 (126-179)||(10729683-10729736)
chr8 (164-236)||(17429539-17429611)
chr8 (5-57)||(22840425-22840477)
chr8 (232-323)||(44041842-44041933)
chr8 (5-43)||(27021865-27021903)
chr8 (9-67)||(29117444-29117502)
chr8 (139-185)||(34687920-34687966)
chr8 (168-210)||(36968434-36968476)
chr8 (5-82)||(15567885-15567962)
chr8 (21-65)||(12119229-12119273)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (5-339)||(10927279-10927613)
chr5 (5-339)||(17445331-17445665)
chr5 (5-339)||(42788522-42788855)
chr5 (5-339)||(34371548-34371882)
chr5 (9-339)||(27646715-27647045)
chr5 (5-339)||(15512888-15513223)
chr5 (1-277)||(1821904-1822180)
chr5 (53-339)||(10926870-10927156)
chr5 (1-331)||(20039348-20039676)
chr5 (2-339)||(2193752-2194077)
chr5 (1-339)||(39146875-39147206)
chr5 (5-280)||(2474400-2474675)
chr5 (5-277)||(3886477-3886749)
chr5 (5-277)||(8641911-8642182)
chr5 (49-337)||(21886066-21886354)
chr5 (21-280)||(189063-189322)
chr5 (5-339)||(34372004-34372338)
chr5 (5-280)||(22556531-22556807)
chr5 (5-280)||(3886933-3887208)
chr5 (5-280)||(22556964-22557240)
chr5 (5-280)||(2473954-2474219)
chr5 (1-265)||(29679979-29680236)
chr5 (10-285)||(8391203-8391477)
chr5 (123-331)||(34867734-34867942)
chr5 (27-339)||(18304367-18304679)
chr5 (21-237)||(24182138-24182353)
chr5 (11-261)||(18750078-18750328)
chr5 (49-275)||(30684476-30684702)
chr5 (1-331)||(1880025-1880350)
chr5 (123-276)||(30719799-30719952)
chr5 (128-339)||(4657992-4658202)
chr5 (5-195)||(11757157-11757347)
chr5 (137-276)||(2058664-2058803)
chr5 (142-309)||(11160694-11160861)
chr5 (153-273)||(16370732-16370852)
chr5 (124-230)||(4673466-4673572)
chr5 (21-213)||(20858434-20858625)
chr5 (96-339)||(5066858-5067100)
chr5 (137-292)||(42429129-42429283)
chr5 (10-146)||(8366595-8366729)
chr5 (110-311)||(32574639-32574840)
chr5 (5-70)||(30684887-30684952)
chr5 (5-70)||(30720136-30720201)
chr5 (23-115)||(187718-187810)
chr5 (1-104)||(38063701-38063803)
chr5 (159-273)||(43356650-43356762)
chr5 (195-280)||(22975076-22975161)
chr5 (165-237)||(39801498-39801571)
chr5 (123-175)||(5785902-5785954)
chr5 (155-273)||(21041550-21041668)
chr5 (5-54)||(21883961-21884010)
chr5 (19-58)||(5786062-5786101)
chr5 (21-74)||(34867979-34868032)
[»] chr6 (59 HSPs)
chr6 (5-338)||(20850258-20850591)
chr6 (5-339)||(11062222-11062555)
chr6 (1-339)||(20126054-20126392)
chr6 (5-339)||(23986193-23986527)
chr6 (5-275)||(9352062-9352332)
chr6 (5-337)||(20896563-20896896)
chr6 (5-280)||(17027407-17027682)
chr6 (1-336)||(21311910-21312245)
chr6 (5-280)||(13492784-13493060)
chr6 (5-280)||(13191389-13191664)
chr6 (5-319)||(23776397-23776710)
chr6 (127-339)||(3652422-3652634)
chr6 (1-339)||(2720435-2720774)
chr6 (5-336)||(17850857-17851188)
chr6 (5-339)||(2681096-2681426)
chr6 (27-339)||(6330811-6331122)
chr6 (4-340)||(14771594-14771930)
chr6 (5-280)||(7911873-7912148)
chr6 (5-277)||(17730985-17731261)
chr6 (1-338)||(21311452-21311789)
chr6 (5-325)||(2890715-2891033)
chr6 (5-213)||(13492394-13492603)
chr6 (76-276)||(16519967-16520167)
chr6 (5-280)||(7912305-7912580)
chr6 (11-336)||(17851313-17851638)
chr6 (136-333)||(27334103-27334300)
chr6 (136-333)||(27394843-27395040)
chr6 (123-325)||(15929532-15929734)
chr6 (141-294)||(31821704-31821857)
chr6 (42-325)||(33774915-33775200)
chr6 (21-239)||(1991589-1991807)
chr6 (1-176)||(2891166-2891340)
chr6 (89-276)||(9440269-9440456)
chr6 (2-176)||(28780209-28780383)
chr6 (203-339)||(3652915-3653051)
chr6 (12-335)||(20735636-20735958)
chr6 (1-140)||(3652658-3652797)
chr6 (102-324)||(20732535-20732751)
chr6 (135-240)||(15929234-15929339)
chr6 (125-273)||(28065831-28065982)
chr6 (5-225)||(28583013-28583234)
chr6 (124-273)||(32292887-32293034)
chr6 (5-230)||(9440733-9440958)
chr6 (1-129)||(3653048-3653172)
chr6 (186-280)||(9440485-9440579)
chr6 (22-276)||(17205338-17205591)
chr6 (125-197)||(12194406-12194478)
chr6 (9-74)||(11062030-11062095)
chr6 (137-236)||(3885098-3885194)
chr6 (117-237)||(30729827-30729947)
chr6 (5-85)||(31415965-31416044)
chr6 (136-239)||(10964340-10964443)
chr6 (5-55)||(6331244-6331294)
chr6 (5-63)||(27334305-27334363)
chr6 (5-63)||(27395045-27395103)
chr6 (114-196)||(33470916-33470998)
chr6 (1-39)||(31821664-31821702)
chr6 (14-58)||(3884977-3885021)
chr6 (194-273)||(32292508-32292585)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (2-339)||(50347682-50348019)
chr3 (2-339)||(32227094-32227431)
chr3 (1-337)||(30529625-30529960)
chr3 (11-353)||(25230587-25230929)
chr3 (11-353)||(25238174-25238516)
chr3 (1-339)||(20884989-20885326)
chr3 (1-351)||(25230120-25230470)
chr3 (1-351)||(25237707-25238057)
chr3 (9-339)||(28561682-28562011)
chr3 (2-339)||(11179907-11180243)
chr3 (2-331)||(13149972-13150301)
chr3 (2-339)||(39653100-39653437)
chr3 (5-339)||(16811317-16811649)
chr3 (2-319)||(32227457-32227773)
chr3 (1-339)||(37044971-37045306)
chr3 (5-338)||(14813886-14814219)
chr3 (5-339)||(16810861-16811195)
chr3 (5-280)||(31284152-31284427)
chr3 (5-319)||(14820110-14820424)
chr3 (1-339)||(2911031-2911358)
chr3 (2-232)||(13150427-13150657)
chr3 (4-235)||(25238559-25238790)
chr3 (1-223)||(4067232-4067454)
chr3 (5-277)||(27187205-27187478)
chr3 (21-277)||(8067278-8067534)
chr3 (87-325)||(39640887-39641125)
chr3 (5-239)||(32386610-32386844)
chr3 (21-280)||(25248106-25248366)
chr3 (1-319)||(25802420-25802738)
chr3 (123-305)||(25239071-25239253)
chr3 (5-275)||(7477191-7477461)
chr3 (5-275)||(7493881-7494151)
chr3 (76-279)||(41472297-41472499)
chr3 (130-312)||(32796936-32797118)
chr3 (89-339)||(25802964-25803214)
chr3 (23-279)||(41473993-41474249)
chr3 (89-339)||(29224260-29224510)
chr3 (1-72)||(25238999-25239070)
chr3 (127-209)||(26309987-26310069)
chr3 (108-239)||(31103937-31104070)
chr3 (269-339)||(39653556-39653626)
chr3 (5-72)||(41473744-41473811)
chr3 (5-207)||(3899868-3900070)
chr3 (227-331)||(13155302-13155404)
chr3 (11-186)||(53150694-53150869)
chr3 (4-58)||(25230972-25231026)
chr3 (160-207)||(3890046-3890093)
chr3 (21-83)||(18318847-18318909)
chr3 (139-185)||(43736731-43736777)
chr3 (1-37)||(18547439-18547475)
chr3 (126-210)||(47518319-47518400)
chr3 (160-213)||(15392572-15392625)
chr3 (160-213)||(15405608-15405661)
chr3 (160-213)||(15411017-15411070)
chr3 (160-213)||(15417433-15417486)
chr3 (245-277)||(32388847-32388879)
[»] scaffold0047 (3 HSPs)
scaffold0047 (5-339)||(17474-17808)
scaffold0047 (1-339)||(18007-18344)
scaffold0047 (266-357)||(17816-17907)
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (5-339)||(34405467-34405801)
chr7 (5-338)||(28495791-28496124)
chr7 (2-339)||(36422188-36422524)
chr7 (1-339)||(2611531-2611862)
chr7 (5-312)||(42515507-42515814)
chr7 (1-339)||(679753-680090)
chr7 (5-339)||(2189080-2189414)
chr7 (19-339)||(35474011-35474331)
chr7 (1-277)||(42515090-42515366)
chr7 (1-339)||(29038892-29039221)
chr7 (5-319)||(2193212-2193526)
chr7 (1-340)||(6747478-6747809)
chr7 (5-280)||(2941633-2941908)
chr7 (5-280)||(9124954-9125229)
chr7 (1-312)||(22529107-22529418)
chr7 (5-339)||(6718951-6719273)
chr7 (5-280)||(13125011-13125287)
chr7 (5-309)||(28495495-28495788)
chr7 (1-243)||(2465956-2466197)
chr7 (14-324)||(29357341-29357650)
chr7 (87-311)||(46425705-46425929)
chr7 (21-280)||(18833281-18833540)
chr7 (2-179)||(7646351-7646528)
chr7 (55-231)||(2465777-2465953)
chr7 (21-273)||(25182363-25182615)
chr7 (175-325)||(26957603-26957753)
chr7 (87-339)||(35527079-35527330)
chr7 (5-191)||(13122380-13122567)
chr7 (154-338)||(43233350-43233534)
chr7 (126-280)||(11517386-11517539)
chr7 (21-176)||(7646514-7646669)
chr7 (5-161)||(3305224-3305380)
chr7 (25-280)||(5406483-5406739)
chr7 (191-337)||(3305374-3305520)
chr7 (1-237)||(26421632-26421868)
chr7 (94-276)||(9623207-9623388)
chr7 (19-225)||(31406479-31406680)
chr7 (123-226)||(16192368-16192471)
chr7 (127-309)||(36015409-36015591)
chr7 (21-158)||(43776182-43776319)
chr7 (139-235)||(31743834-31743930)
chr7 (233-339)||(2463578-2463684)
chr7 (1-75)||(6747948-6748022)
chr7 (125-243)||(11372483-11372601)
chr7 (127-271)||(20966055-20966199)
chr7 (5-92)||(43233140-43233227)
chr7 (127-225)||(26421303-26421401)
chr7 (246-339)||(10430699-10430792)
chr7 (123-203)||(7461345-7461424)
chr7 (171-325)||(33316677-33316832)
chr7 (183-339)||(16811900-16812048)
chr7 (89-202)||(1628786-1628899)
chr7 (114-239)||(37672196-37672321)
chr7 (185-280)||(13124757-13124852)
chr7 (154-236)||(6585647-6585731)
chr7 (2-82)||(36422575-36422655)
chr7 (178-331)||(2489982-2490136)
chr7 (5-58)||(26419111-26419164)
chr7 (137-273)||(11372901-11373037)
chr7 (1-67)||(31743761-31743827)
chr7 (5-67)||(36015345-36015407)
chr7 (5-58)||(11372660-11372713)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (5-339)||(1156-1490)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (2-339)||(2678-3015)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (2-331)||(154701-155030)
scaffold0002 (2-74)||(154503-154575)
scaffold0002 (227-331)||(151584-151686)
[»] scaffold0333 (3 HSPs)
scaffold0333 (1-330)||(4506-4834)
scaffold0333 (1-338)||(4953-5294)
scaffold0333 (1-74)||(5323-5397)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (5-280)||(18961-19236)
scaffold0322 (217-279)||(18209-18271)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (5-280)||(2086-2361)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (2-280)||(10295-10572)
[»] scaffold0499 (1 HSPs)
scaffold0499 (5-282)||(1927-2204)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (8-280)||(107342-107614)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (5-280)||(105715-105990)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (5-280)||(162553-162829)
scaffold0022 (5-273)||(69691-69959)
scaffold0022 (5-176)||(163010-163181)
scaffold0022 (5-179)||(163167-163341)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (5-277)||(245084-245352)
scaffold0005 (123-280)||(245510-245667)
scaffold0005 (9-147)||(245676-245814)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (5-189)||(13409-13593)
[»] scaffold0557 (2 HSPs)
scaffold0557 (5-230)||(2150-2366)
scaffold0557 (226-339)||(686-799)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (2-176)||(14575-14749)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (163-331)||(23617-23785)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (134-317)||(3987-4170)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (158-280)||(142303-142425)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (5-312)||(26032-26338)
scaffold0036 (159-240)||(16071-16152)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (5-164)||(421-580)
[»] scaffold0442 (2 HSPs)
scaffold0442 (233-341)||(2439-2547)
scaffold0442 (5-49)||(1-45)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (10-134)||(1582-1706)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (94-211)||(14805-14922)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (164-236)||(45425-45497)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (68-157)||(246704-246793)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (5-52)||(62983-63030)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (19-72)||(37203-37256)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (160-213)||(44752-44805)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 46)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 1912798 - 1912443
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1912798 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaaacttcccggtaggtaacccatc 1912699  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1912698 caaagagtactccaagtcaatcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaa-gaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 1912600  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  1912599 ttcttataaatctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatccctctcattccgatgtgattcagttcctctaaaagctgttgagag 1912500  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactcccttatcctcgtcaaccgtg 357  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1912499 ccgctcattgtcgtaccttgtgcactggcgatcactcccttgtcctcgtcaaccgtg 1912443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 338
Target Start/End: Original strand, 25337870 - 25338206
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25337870 agcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcc 25337969  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 201  Q
     || | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25337970 caaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaat 25338069  T
Q  202 tcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagc 301  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  25338070 tcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacgacctcaggaaccctctcattccggtgtgattcagttcctctagaagctgtcaggagc 25338169  T
Q  302 cgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactcc 338  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  25338170 cgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactcc 25338206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16379667 - 16379327
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||    
T  16379667 aagcattgtcgaatgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttacagtgaaacttcccggtaggtcacccatc 16379568  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16379567 caaagattactccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 16379468  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    ||| |||||| || | |||||||||| |||| ||||||| ||   |||| ||||| |||||||||| || |||||| |||| | || || ||||||||||    
T  16379467 ttcgtataagtcttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcgggatccctctcattccaatttgattcggttcgtttataaactgttgggag 16379368  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccctt 341  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  16379367 ctgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccctt 16379327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 33175226 - 33174894
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  || ||||||||| |||||||  ||    
T  33175226 attgccgactgaccctacaaactaacacgagtctttccagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaat-ttcccggtaggtcacccatcataa 33175128  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33175127 gaatactccaagtcaaca-cgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 33175029  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||| | |  |||||||| ||| ||||||| |    
T  33175028 tataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcggcttgtctagaagttgtcgggagccac 33174929  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  33174928 tcattgtcatgccttgtgcaccggcgaccactccc 33174894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 1707315 - 1706978
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| |||||| | ||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||    
T  1707315 aagcattgccgactgaccctataaatcaacgcgaatctttttagcgtgttttgtattcactcgcacgcttaccgggaaacttcctggtaggtcacccatc 1707216  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||| ||||||||  || ||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1707215 caaagactacttcaagtcaaacactcttaactgtggagttcttatgagatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 1707116  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    |||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  1707115 ttcttataagtcttccttcaatcatgtagtctcatacctacacagtctcaggatc-ctctcattccgatgtgattcggttcctctagaaattgtcgggag 1707017  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||    
T  1707016 ccgctcattgtcgtgccttgtgcaccgacgaccactccc 1706978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16379211 - 16378877
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  16379211 aagcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttacccggaaacttcccgataggtcacccatc 16379112  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16379111 caaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaa 16379012  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    ||| |||||| || | |||||||||| |||||||||| | ||   |||| | ||| ||||||||||| ||||| || |||| |||| || ||||| |||     
T  16379011 ttcgtataagacttccttcaaccatgcagtctcatacttgcacggcctcggaatccctctcattccggtgtga-tcggttcatctataaactgttaggaa 16378913  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcact 336  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  16378912 ccgctcattgtcgtgtcttatgcaccggcgaccact 16378877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 45 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 41754519 - 41754225
Alignment:
Q  45 cgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttctta 144  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||| || | | |||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  41754519 cgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccgggaaactttccggtaggtcatccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttctta 41754420  T
Q  145 tggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacata 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||      
T  41754419 tggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacg 41754320  T
Q  245 acctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
     ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  41754319 gcctcaagaaccctctcattccggtgtgattcagttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 41754225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 30966960 - 30966685
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  30966960 attgccgactgactccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 30966861  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30966860 aattgctccaagttaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 30966761  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||||| ||| | |||||||||| |||| ||||| |  |   |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30966760 tataatccttccttcaaccatgcagtcccatacatgtacggcctcaggatccctctcattccgatgcgattcagtt 30966685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 33771271 - 33770946
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  33771271 attgccggctgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 33771172  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33771171 aattgctccaagtcaagcatgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 33771072  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    |||||||||   ||||||| || |||| |||         ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33771071 tataagcctttcttcaaccctgcagtcccat---------acctcaggaaccctctcattccggtgtgattcagttcctctagaagctgtcaggagccgc 33770981  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  33770980 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 33770946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 30966504 - 30966229
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  30966504 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccgagaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 30966405  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | |  ||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30966404 aattggtccaagtcaagcacgcttaactatggagttcttatggaatgagataccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 30966305  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| |||||||  |   |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30966304 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgcgattcagtt 30966229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 25433928 - 25434266
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||   |||||| || || ||| |||||||    
T  25433928 aagcattgccgactgaccctacaaaccaacacgaatcttttcagcgtgttttgtccttactcacacgcttaccagaaaacttccctgttggtcacccatc 25434027  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  25434028 caaagaccactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccagaaaggagatgcatcttgttgataaaggttgtatcaaacaa 25434127  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||  ||   |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||  ||||    
T  25434128 ttcttataagccttccttcaaccatgaagtcccataccagcacggcctcaggatccctctcattccggtgtgattcggttcgtttagaagctgtcaggag 25434227  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||    
T  25434228 ccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcggccactccc 25434266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 8256776 - 8256470
Alignment:
Q  25 accaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataac 124  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||  |||||| || | |||| |||||||| || | | |||||||||||  ||    
T  8256776 accaacatgagtcttttcagcgtattttgtcctcactcgcacgcttatcggaaaacttcccagcaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcac 8256677  T
Q  125 gcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaacca 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  8256676 gcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataagccttccttcaacca 8256577  T
Q  225 tgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgca 324  Q
    ||||||| ||||||||||   | ||| |||| |||||||||||  ||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8256576 tgtagtcccatacctacaaggcttcaagatccctctcattccggcgtgatttgattcctctagaagctgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgca 8256477  T
Q  325 ctggcga 331  Q
    | |||||    
T  8256476 ccggcga 8256470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24818598 - 24818321
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  24818598 agcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccaggaaacttcccggtaggtcacccatcc 24818499  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 201  Q
    ||| | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24818498 aaa-attgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaaaaagatgcatcttgttgatataggtagtactaaacaat 24818400  T
Q  202 tcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    |||||||||||| | || ||||||| |||| ||||| | ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24818399 tcttataagccttccttgaaccatgcagtcccatacatgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcagtt 24818321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15620149 - 15619834
Alignment:
Q  24 aaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataa 123  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||  |    
T  15620149 aaccaacacgagtcttttcagcgagttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaaacttcccagtaggtcacccatccaaagactactcaaagtcaagca 15620050  T
Q  124 cgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaacc 223  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| || | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||     
T  15620049 cgcttaattgtggagttcttatggattgggtttccaaaaagaagatgtatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcttgccttcaact 15619950  T
Q  224 atgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgc 323  Q
    ||| |||||||||| | ||   | || ||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  15619949 atgcagtctcatacttgcacggcatcgggatccctctcattctgatgtaattcggttcgtctataagctatcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgc 15619850  T
Q  324 actggcgatcactccc 339  Q
    || ||||| |||||||    
T  15619849 accggcgaccactccc 15619834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 125 - 357
Target Start/End: Original strand, 18098874 - 18099106
Alignment:
Q  125 gcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaacca 224  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  18098874 gcttaactatggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcatcccttcaacca 18098973  T
Q  225 tgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgca 324  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18098974 tgtagtctcatacctacacggcctcaggattcctctcattccgatgtgattcggttcctctataagctgtcgggagctgctcattgtcgtgccttgtgca 18099073  T
Q  325 ctggcgatcactcccttatcctcgtcaaccgtg 357  Q
    | ||||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  18099074 ccggcgatcactcccctgccctcgtcagccgtg 18099106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 33174776 - 33174441
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||  | | |||||| ||||  ||||||||||||||| |||  || |||||| || |||||||    
T  33174776 aagcattgtcgactgaccctacaaacaaacacgggtctttctagcatgttttttcctaactcgcacgcttaccgggaat-ttcccggtatgtcacccatc 33174678  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
      |||| |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33174677 ataagactactccaagtcaagcacgcttaactgcggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 33174578  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    ||||||||||||| | ||||||  ||||||| ||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  33174577 ttcttataagccttccttcaac--tgtagtcccatacctacacggcatcaggatccctctcattccgatgtgattcggttcgtctagaagctgtcgggag 33174480  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    |||||||||||| ||||   ||||| ||||| |||||||    
T  33174479 ccgctcattgtcatgccccttgcaccggcgaccactccc 33174441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 113 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 29804844 - 29804618
Alignment:
Q  113 caagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcc 212  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29804844 caagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattcttataagcc 29804745  T
Q  213 tactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtc 312  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  29804744 tgccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcgattcctctagaagctgtcgggagccgctcattatc 29804645  T
Q  313 gtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  29804644 gtgccttgtgcaccggcgaccactccc 29804618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15640008 - 15639676
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||    
T  15640008 aagcattgccgactgaccctaccaaccaacacgagtcttttctgcgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcgagaaacttcccagtaggtcacccatc 15639909  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||| |||| || | | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15639908 caaagactactccaagtcaagcacgcttaattgtggagttcttgtggattgggtttccaaaaagaagatgtatgttgttgatataggtagtaccaaacaa 15639809  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    ||| ||||||| | | |||||| |||      ||||| | || | |||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||| | |||||    
T  15639808 ttcctataagcgtgccttcaactatg------catacttccacagcctcgggatccctctcattctgatgtaattcggttcgtctataagctatcgggag 15639715  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  15639714 ccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 15639676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 279
Target Start/End: Original strand, 29259512 - 29259770
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || | | ||| |||||||    
T  29259512 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctcaaagtcaa 29259611  T
Q  121 taacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttca 220  Q
      |||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| | ||||    
T  29259612 gcacgcttaactatgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatatgtagtaccaaacaattttaataagccttccttca 29259711  T
Q  221 accatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagt 279  Q
    |||||| |||| ||||| |  |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29259712 accatgcagtcccatacttgtacggtctcaggatccctctcattccgatgtgattcagt 29259770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 277
Target Start/End: Original strand, 5399693 - 5399965
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| | ||||||| |||||||| ||    
T  5399693 attgtcgactgaccccacaaaccaacacaagtctttccagcgtgttttgttctcactcgcacgcttaccggaaaacttcctggtaggtcacccatcccaa 5399792  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5399793 aatttctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 5399892  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattca 277  Q
    ||||||||| | || ||||||  | || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  5399893 tataagcctcccttaaaccatacactcccatacttgcacgacctcaagatccctctcattccgatgtgattca 5399965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 339
Target Start/End: Original strand, 27882818 - 27883136
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaa 120  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||  || |||| |||||||| ||||||  | |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27882818 acaaaccaacaagattcttttcagcgtgttttgtcctgacttgcacacttaccgaaaaacttctcagtaggtcacctatccaaagactactccaagtcaa 27882917  T
Q  121 taacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttca 220  Q
      |||||||| ||| |||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  27882918 acacgcttaattgtggagttcttatggaacggcctacaaaaaagaagatgcatcttattgatatagataataccaaacaattcttataagcattccttca 27883017  T
Q  221 accatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgcctta 320  Q
    || ||| |||||||||| | ||   |||||||||| |||||||| || |||||||| || | | ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||     
T  27883018 acaatgcagtctcatacatgcacggcctcaggatccctctcatttcggtgtgattcggtacgtgtagaatctgacgggagccgctcattgtcgtgccttg 27883117  T
Q  321 tgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||| ||||| |||||||    
T  27883118 tgcaccggcgaccactccc 27883136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 87 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11388375 - 11388178
Alignment:
Q  87 gtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatatag 186  Q
    |||||| |||||||| || | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11388375 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 11388276  T
Q  187 gtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctcta 286  Q
    |||||||||||||||| || ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11388275 gtagtaccaaacaatt-ttttaagcattccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcatcaggatc-ctctcattccgatgtgattcggttcctcta 11388178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 123 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 83169 - 83000
Alignment:
Q  123 acgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaac 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  83169 acgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaaaaagattcatcttgttggtataggtagtaccaaacgattcttataagcataccttcaac 83070  T
Q  223 catgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctg 293  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  83069 catgtagtctcatacctgcacaatctcaggatccctctcatttcgacgtgattcagttgc-ctagaagctg 83000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 83 - 325
Target Start/End: Original strand, 38898866 - 38899108
Alignment:
Q  83 tccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgat 182  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  38898866 tccggtaggtcacctatccaaagactactctaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgtgttaccaaaaagaaaatgcatcttgttgat 38898965  T
Q  183 ataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcc 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||||||||   ||||| |||| ||||| |||||||||||||  | |      
T  38898966 ataggtagtaccaaacaattcttataagctctccttcaaccatgtagtctgatacctacacggcctcaagatcactctccttccgatgtgatttggcttg 38899065  T
Q  283 tctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcac 325  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||| || || |||||||||    
T  38899066 tctagaagttgtcgggagccactcattttcatgtcttatgcac 38899108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 165 - 339
Target Start/End: Original strand, 18447954 - 18448128
Alignment:
Q  165 aagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcatt 264  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| || |||||    
T  18447954 aagatgcatcttgttgatacaagtagtaccaaacaattcttataagtcttacttcaaccatgtagtcacatacctacacggcctcaggatccctatcatt 18448053  T
Q  265 ccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  18448054 ccgatgtgattcggttcctctaaaagctgtcgggaaccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 18448128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Original strand, 30963155 - 30963360
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |  | |||| || ||||| || | | |||||||||||    
T  30963155 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtattttatcctcactcgcacgctttccgagaaacttccaagaaggtcactcatcccaaaattgctccaagtcaa 30963254  T
Q  121 taacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttca 220  Q
      |||||||||||| || ||||||||   || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  30963255 gcacgcttaactgttgaattcttatgatttgggctaccaaaaataagatgcatcttgttgatataggtagtacctaacaattcttataagccttccttca 30963354  T
Q  221 accatg 226  Q
    | ||||    
T  30963355 atcatg 30963360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Original strand, 32377592 - 32377756
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  32377592 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagttttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaactttccggtaggtcacctatcccaa 32377691  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagat 169  Q
     | | |||||||||||  | |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  32377692 aattgctccaagtcaagcatgcttaactgtggagttcttttggaatgagctaccgaaaacaagat 32377756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11394721 - 11394568
Alignment:
Q  87 gtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatatag 186  Q
    |||||| |||||||| || | | |||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11394721 gtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaat-agctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 11394623  T
Q  187 gtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctaca 242  Q
    |||||||||||||||| || ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  11394622 gtagtaccaaacaatt-ttttaagcattccttcaaccatgtagtctcatacctaca 11394568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 239
Target Start/End: Original strand, 30963598 - 30963830
Alignment:
Q  7 tgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaaga 106  Q
    ||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| || |||| |||||| |  | |||| ||| |||| || |    
T  30963598 tgccgactgatcccacaaaccaaaacgagtcttttcactgtgttttgtcctcactcgcacggtttccgacaaacttcctagaaggtcacctatcccaaaa 30963697  T
Q  107 gtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattctta 206  Q
     | | |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30963698 ctccgccaagtcaagcacgcttaactgtggagttattatggtttgggctaccagaaagaagatgcatcttgttgatataggtagaaccatacaattctta 30963797  T
Q  207 taagcctactttcaaccatgtagtctcatacct 239  Q
    ||||  | | |||||||||| | |||| |||||    
T  30963798 taagttttccttcaaccatgcattctcttacct 30963830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 154 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 1953276 - 1953154
Alignment:
Q  154 ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcagga 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||| |||||||||||| ||  || ||||||    
T  1953276 ctaccaaaaagaagatgcatctagttgatataggtagtaccaaacaattcttataggtcttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacgacttcagga 1953177  T
Q  254 tctctctcattccgatgtgattc 276  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  1953176 tccctctcattccgatgtgattc 1953154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 276
Target Start/End: Original strand, 30961759 - 30962038
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  || | |||| |||||||| ||    
T  30961759 attgccgattgaccccacaaactaacacaagtcttttcactgtgttttgtcctcactcgcacgctttctgagaaactacccagaaggtcacccatcccaa 30961858  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | ||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||  |  |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  30961859 aattgctctaagtcaagcacgtttaactgtggagttcttatggtttcggctaccgaaaaaaatatgcatcttgttgatataggtagtaccaatcaaatct 30961958  T
Q  205 tataagcct--------actttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattc 276  Q
    |||||| ||         | |||||||||| | || ||||||||||   | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30961959 tataagacttccttaaatccttcaaccatgcaatcccatacctacacggcttcaggatctctctcattctgatgtgattc 30962038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8074146 - 8073902
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaa 120  Q
    |||||| ||||| ||| |||||| |||||||||| |||  || ||| |||  |||||||||||| || |||| || ||||| || | |   |||||||||    
T  8074146 acaaacaaacacaagttttttcatcgtgttttgttctcaatcacacacttttcgagaaactttctggaaggtcactcatcccaaaatttaaccaagtcaa 8074047  T
Q  121 taacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttca 220  Q
     || ||||| || | ||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  8074046 gaaggcttatctatggagttcttatgaaatgggctacaagaaagaagatgcatcttgttggtataggtagtaccaaacaattcttataagtctcccttca 8073947  T
Q  221 accatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattc 265  Q
    ||| | ||| | ||||||| || || |||| |||| |||||||||    
T  8073946 accttatagacccatacctgcacaatctcatgatccctctcattc 8073902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13191244 - 13191001
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || |||||||   |||||||||||| | |||| ||| |||  ||    
T  13191244 attgtcgactgactccataaaccaacactagtctttttagcgtgttttgtccgcattcacacgctttttgagaaactttccagaaggtcacctatctcaa 13191145  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | || ||||||||  || | ||||| | ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13191144 aatttcttcaagtcaagcacacataactatggagttcttataaaatggactaccaaaaagaagatgcatcttgttggtatatgtagtaccaaacaattct 13191045  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctc 249  Q
    |||||| || | || ||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  13191044 tataagtcttccttgaaccatgcagtcttatacct-cataacctc 13191001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 143
Target Start/End: Original strand, 32377783 - 32377921
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| || |||| | |||||||| ||    
T  32377783 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaacttcccagtagatcacccatcccaa 32377882  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttctt 143  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  32377883 aattgctccaagtcaaacacgcttaactgtggagttctt 32377921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16542151 - 16541965
Alignment:
Q  110 ctccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaa-gatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttata 208  Q
    |||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16542151 ctccaagtcaaacacatttaactgtagagtttttatggaatgagctataaaaaaaaaagatacatcttgttgatataggtagtacaaaacaattattata 16542052  T
Q  209 agcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgtt 295  Q
    || || | |||||||||||||  ||||||||||| | |    ||||| || |||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||    
T  16542051 agtcttccttcaaccatgtagagtcatacctacacagctctgggatccctatcattctgatgtgattcggctcacctagaagctgtt 16541965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 257 - 357
Target Start/End: Original strand, 18098689 - 18098789
Alignment:
Q  257 ctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactcccttatcctcgtcaaccgt 356  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||||    
T  18098689 ctctcattccgatgtgattcgattcctctataagctgtcgggagccgctcaatgtcgtgccttgtgcaccggcgatcactcccctgccctcgtcagccgt 18098788  T
Q  357 g 357  Q
    |    
T  18098789 g 18098789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20502160 - 20502061
Alignment:
Q  137 agttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcata 236  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||    
T  20502160 agttcttatgaaatgggctaccaaaaa-aagaagcatcttgttgatatagaaagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccata 20502062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 8181234 - 8181446
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| ||  |||||| || |||||| |||||||    
T  8181234 aagcattgtcgactgac-ctgcaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcacgtttatcggaaaacttcccagtaggtcacccatc 8181332  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatgga----atgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaa 196  Q
    ||| || |||||||    |   |||||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||    
T  8181333 caacgactactcca---gatgcacgcttaactgtggagtttttatggaatatatgagctaccaa-----------atcttgttgatataggtagtaccaa 8181418  T
Q  197 acaattcttataagcctactttcaacca 224  Q
    |||||||||| ||| || | ||||||||    
T  8181419 acaattcttaaaagtcttccttcaacca 8181446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 20502234 - 20502172
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacg 67  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20502234 attgccgactgaccctacaaactaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacg 20502172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Original strand, 36924359 - 36924421
Alignment:
Q  7 tgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgct 69  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  36924359 tgccgactaactctacaaaccaacacgagtctttccagcgtgttttgtcctcactcgcacgct 36924421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 224
Target Start/End: Original strand, 36924437 - 36924519
Alignment:
Q  145 tggaatgagctaccaaaaa-gaagatgcatcttgttgatatag--gtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaacca 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  36924437 tggaatgggctaccaaaaaagaagatgcatcttgttgatatataagtaataccaaacaattcttataagccttccttcaacca 36924519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37552715 - 37552632
Alignment:
Q  125 gcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 210  Q
    |||||||||| || |||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37552715 gcttaactgtggaattcttacggaatgcgctgccaaaaagaaga-gcatcattttg-tatatgtagtaccaaacaattcttataag 37552632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9909214 - 9909130
Alignment:
Q  153 gctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatac 237  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||| ||  | ||||||||| |||||||||||    
T  9909214 gctaccaaaaagaagttgaatcttgttggtataggtagtaccaattaatcattataaaccctccttcaaccatatagtctcatac 9909130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Original strand, 26864841 - 26864900
Alignment:
Q  154 ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcct 213  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  26864841 ctaccaaatggaagatgcatcttgtcgatgtaggtagtaccaaagagttcttacaagcct 26864900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 83271 - 83222
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgctt 70  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  83271 acaaaccaacataagtcttatcaacgtgttttgtcctcactcgcacactt 83222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 29804920 - 29804871
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttt 51  Q
    ||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29804920 agcattgtcgactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttt 29804871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 85)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 1645615 - 1645953
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||    
T  1645615 aagcattgccaactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttacaaagaaacttcctggtaggtcacccatc 1645714  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1645715 caaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtaataccaaacaa 1645814  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||   ||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  1645815 ttcttataagtcttccttcaaccatgtagtcccatacctacacggcctcaagattcctctcattccgatgtgattcggttcctctagaagctgtcaggag 1645914  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  1645915 ccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 1645953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 50398408 - 50398742
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||  ||    
T  50398408 attgccgactgaccctacaaaccaacacgagtctttccagtgtattttgtcctcactcgcacgcttaccggtaaacttcccggtaggtcacccatcataa 50398507  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
    || |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50398508 gaatactccaagtcaagcacgcttaactatggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 50398607  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||| | |  |||||||| ||| |||||||||    
T  50398608 tataagccttccttcaaccatgtagtcctatacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcggcttgtctagaagttgtcgggagccgc 50398707  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  50398708 tcattgtcatgccttgtgcaccggcgaccactccc 50398742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3169476 - 3169142
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  3169476 attgccaactgaccctacaaaccaacacgagtattttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccaagaaactttctggtaggtcactcatccaaa 3169377  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
    || |||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3169376 gactactccaagtcaagcacgcttaagtgtggagttcttatggattgggttaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatttt 3169277  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    |||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||   ||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||| |||    
T  3169276 tataagtcttccttcaaccatgtagtcccatacctacacggcctcatgattcctctcattccgatgtgattcggttcctctataagctgtcaggagtcgc 3169177  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || || |||||||    
T  3169176 tcattgtcgtgtcttgtgcaccggtgaccactccc 3169142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 23942673 - 23942990
Alignment:
Q  19 ctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtc 118  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  23942673 ctacaaaccaacacgggtcctttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttatttggaaactttccggtaggtcatccatccaaagactactccaagtc 23942772  T
Q  119 aataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctacttt 218  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  23942773 aagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgtgctacaaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttcctt 23942872  T
Q  219 caaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgcct 318  Q
    ||||||||||||  ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||    
T  23942873 caaccatgtagttccatacctacacggccccaggatccctctcattccgatgtgattcggttcctctagaagctgtcagga---gctcattgtcgtgcct 23942969  T
Q  319 tatgcactggcgatcactccc 339  Q
    | ||||| ||||| |||||||    
T  23942970 tgtgcaccggcgaccactccc 23942990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 338
Target Start/End: Original strand, 4127775 - 4128093
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| || | | ||| ||| |||    
T  4127775 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccggaaaacttttcggtaggtcacccatcccaaaattgctctaagccaa 4127874  T
Q  121 taacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttca 220  Q
      |||||||||| |  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4127875 gcacgcttaactctgaagttcttatggaattggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttca 4127974  T
Q  221 accatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctc-tagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgcctt 319  Q
    ||||| ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4127975 accatatagtctcatgcctacatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcgattcctcttagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgcctt 4128074  T
Q  320 atgcactggcgatcactcc 338  Q
     ||||| ||||| ||||||    
T  4128075 gtgcaccggcgaccactcc 4128093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 50398864 - 50399197
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||  |  ||||||||| |||||||  ||    
T  50398864 attgccgactgaccctacaaaccaacacgagtctttccaacgtgttttgtcctcacttgcacgtttaccgggaat-tccccggtaggtcacccatcataa 50398962  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50398963 gaatactccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcgtgttgatataggtagtaccaaacaattct 50399062  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||  | ||||||    
T  50399063 tataagccttccttcaaccatgtaatctcatacctacacggtctcaggatccctctcattccgatgtgattcggcttgtctagaagttgtcagaagccgc 50399162  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  50399163 tcattgtcatgccttgtgcactggcgaccactccc 50399197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 45 - 339
Target Start/End: Original strand, 12691909 - 12692203
Alignment:
Q  45 cgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttctta 144  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||| || | | |||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  12691909 cgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccagtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttctta 12692008  T
Q  145 tggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacata 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||      
T  12692009 tggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacg 12692108  T
Q  245 acctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
     |||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  12692109 gcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 12692203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 23943108 - 23943440
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||    
T  23943108 aagcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggttggtcacccatc 23943207  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  23943208 caaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaatat 23943307  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    || ||||||| || | |||||||||   ||  ||||||||||   |||||||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||   |||    
T  23943308 tttttataagtcttccttcaaccat---gtgacatacctaca-cgcctcaggatccctatcattttgatgtgattcggttcctctagaagctgtcaagag 23943403  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactc 337  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  23943404 ccgctcattgtcgtgcctcatacaccggcgaccactc 23943440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 24629306 - 24629637
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |    || ||||||||| |||||||| ||    
T  24629306 attgccgactgaccccacaaactaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggt---ttcccggtaggtcacccatcccaa 24629402  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24629403 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggaattcttatggaacgaggtaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 24629502  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||| | | || ||||||| |||| ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||||    
T  24629503 tataagcattcctttaaccatgcagtcccatacctacacgacctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaagagccgc 24629602  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||    
T  24629603 tcattgtcgtgccttgtgaaccggcgaccactccc 24629637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 49998906 - 49998631
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  49998906 attgccgactgtccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 49998807  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49998806 aattgctccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 49998707  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    |||||| || | |||||||||| |||| ||| |||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  49998706 tataagtcttccttcaaccatgcagtcccatgcctacacagccttaggatccctctcattccgatgtgatttagtt 49998631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Original strand, 44471195 - 44471470
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| ||    
T  44471195 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtctttccagcatgttttgtcctcactcgcccgcttaccgggaaatttcccggtaggtcacccatcccaa 44471294  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44471295 aattgctccaaatcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 44471394  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    |||||| || | |||||||||||||||||||||||  |   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44471395 tataagtcttccttcaaccatgtagtctcatacctgtacggcctcaagatctctctcattccgatgtgattcagtt 44471470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 4127288 - 4127642
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| | |||||||| ||    
T  4127288 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccgggaaacttcccgatagctcacccatcccaa 4127387  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagt-------------------tcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatata 185  Q
     | | ||||||| |||| | |||||||||| ||||                   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4127388 aattgctccaagccaatcatgcttaactgtggagttcttatggaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatata 4127487  T
Q  186 ggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctc- 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  4127488 ggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaactatgtagtcccatacctacatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcggttcctct 4127587  T
Q  285 tagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4127588 tagaagttgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 4127642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 35871897 - 35871623
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  35871897 attgccgactgatcccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccgggaaactttccgataggtcacccatcccaa 35871798  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  35871797 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaa-atgcatcttgttgatataggtggtaccaaacaattca 35871699  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| |||||||  |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35871698 tataagccttccttcaaccatgaagtcccatacctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcagtt 35871623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 9423724 - 9424062
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||||| || |||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| || |||| || ||||||||| |||||||    
T  9423724 aagcattgccaacggaccgtacacaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttaacgggaaatttcccggtaggtcacccatc 9423823  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    | |||| |||||||| ||||  || ||||| |||  | ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9423824 ctaagactactccaattcaagcacacttaattgtgaaattcttatggaatgggctactagaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 9423923  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    || |||||||||| |||||||||||| |||| ||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  || |||||    
T  9423924 ttattataagccttctttcaaccatgcagtcccatacatgcacgacctcaggatccctctcattccggtgtgattcggttcgtctagaagtcgtcgggag 9424023  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    || ||| |||||||||||| ||||| | ||| |||||||    
T  9424024 ccactctttgtcgtgccttgtgcaccgacgaccactccc 9424062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21067556 - 21067220
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    ||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  21067556 aagcattgtggactgacccaacaaactaacacgagtcttttcagtgtgttttgtccccactcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtcacccctc 21067457  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| |||| ||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21067456 caaagactactccaagtcaagcacgcttaattgtggagtacttttagaatgagctaccggaaagaagatgcatcttgttgatatatgtagtaccaaataa 21067357  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    || |||| || || | |||||||||| |||||||||| | ||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||| ||| ||| |||||    
T  21067356 ttattattagtcttccttcaaccatgcagtctcatacatgcacgacctcgggatccctctcattccggtgtgattcgattcgtctataagttgtcgggag 21067257  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactc 337  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||    
T  21067256 ccgctcattatcgtgccttgtgcatcggcgaccactc 21067220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 102 - 337
Target Start/End: Original strand, 53996082 - 53996317
Alignment:
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 201  Q
    ||||| |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53996082 aaagactactccaagtcaagcacacttaactgtggagttcttatggaatgagataccaaaaagaagatgaatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 53996181  T
Q  202 tcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagc 301  Q
    | |||||||| | | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  53996182 ttttataagcattccttcaaccatgtagtcccatatctacatagcctcaggatccttctcattccgatgtgattcggttcctctaaaagttgttgggagc 53996281  T
Q  302 cgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactc 337  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  53996282 cgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactc 53996317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 280
Target Start/End: Original strand, 44470751 - 44471019
Alignment:
Q  11 gactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| || | | |    
T  44470751 gactgaccctacaaaccaacacgagtctttccagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcaaccatcccaaaattgc 44470850  T
Q  111 tccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 210  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44470851 tccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagtta-cgaacagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 44470949  T
Q  211 cctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||| |||||||||||  |||| ||||| |  | | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44470950 ccttctttcaaccatacagtcacatacttgtacagcgtcatgatctctctcattccgatgtgattcagtt 44471019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14352069 - 14351730
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| | | ||||||| || || |||||||||| |  ||||||| | |||||| | |||||    
T  14352069 aagcattgctgactgaccatacaaaccaacatgagtcttttcagcatattttgtcttcacttgcacgcttactggaaaactttgcagtaggtcatccatc 14351970  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14351969 caaagactactcgaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaataggataccaaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaaaaa 14351870  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
     ||||| |||||| | |||||||||| || ||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||  |||||||| ||| |||||    
T  14351869 ctcttacaagccttccttcaaccatgcagactcatacatgcacgacctcaggatccctctcattctggtgtgattcggtttgtctagaagttgtcgggag 14351770  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccct 340  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||    
T  14351769 ccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcaaccactccct 14351730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 7678489 - 7678729
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7678489 agcattgtcgactgaccccacaaacctacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcc 7678588  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 201  Q
     || | | |||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7678589 caaaattgctccaagtcaagcacacttaactgtggagttcttatggaataagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaat 7678688  T
Q  202 tcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctaca 242  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||    
T  7678689 tcttataagccttccttcaaccatgtagccccatacctaca 7678729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Original strand, 51331153 - 51331471
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| || ||||||||| |||||||  ||    
T  51331153 attgccgactgaccctacaaactaatacgagtcttt-cagtgtgttttgtcctcattcgcacgcttatcga-aaatttcccggtaggtcacccatcataa 51331250  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51331251 gaatactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgtatcttgttgatatagatagtaccaaacaattct 51331350  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||   ||||| |||  |||||||||||||||||||| | |  |||||||| | | |||| ||||    
T  51331351 tataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacacggcctcatgattcctctcattccgatgtgattcggcttgtctagaagttatagggaaccgc 51331450  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcac 325  Q
    ||||| || |||||| |||||    
T  51331451 tcattatcatgccttgtgcac 51331471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Original strand, 23350153 - 23350428
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||  |||||||| | |||||| ||    
T  23350153 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcacacgcttacagagaaacttctcggtaggtcatccatcccaa 23350252  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23350253 aattgctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatggaaggagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggaagtaccaaacaattct 23350352  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| | |||||  |   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23350353 tataagccttccttcaaccatgcagtcccctacctgtacggcctcaagatctctctcattccgatgtgattcagtt 23350428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 84 - 339
Target Start/End: Original strand, 29628617 - 29628871
Alignment:
Q  84 ccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgata 183  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||||    
T  29628617 ccggtaagtcacccatccaaagactactccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaca-aagacacatcttgttgata 29628715  T
Q  184 taggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcct 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29628716 taggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcctcaggatccctctcatttcgatgtgattcggttcct 29628815  T
Q  284 ctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  29628816 ctagaagctgtcagaagccactcattggcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 29628871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 110 - 325
Target Start/End: Original strand, 21220306 - 21220521
Alignment:
Q  110 ctccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 209  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21220306 ctccaagtcaaacacgcttaactgtgtagttcttatagaatgagttaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 21220405  T
Q  210 gcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcatt 309  Q
    || | | ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21220406 gcattccttcaaccatatagtttcatacctacatggcctcatgatccctctcattctgatgtgattcggttcctctagaagctgccgggagccgctcatt 21220505  T
Q  310 gtcgtgccttatgcac 325  Q
    |||||||||| |||||    
T  21220506 gtcgtgccttgtgcac 21220521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 338
Target Start/End: Original strand, 24628910 - 24629183
Alignment:
Q  68 cttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaag 167  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| |||||||| || | | |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  24628910 cttaccgagaaatttcgcggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaacgagctactgaaaagaag 24629009  T
Q  168 atgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccta---ctttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcatt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | || ||||||| |||| ||||||||||   |||||||| | ||||||||    
T  24629010 atgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctaattcctttaaccatgcagtcccatacctacacggcctcaggaaccctctcatt 24629109  T
Q  265 ccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactcc 338  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  24629110 ccggtgtgattcggttcctcaagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactcc 24629183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 277
Target Start/End: Original strand, 14572024 - 14572292
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || | |||| |||||||  ||    
T  14572024 attgccgactgaccccgcaaaccaacacgagtcttttcaccgtgttttgtcctcactcacacgctttccgagaaacttcccagaaggtcacccatctcaa 14572123  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | ||| |||||||  ||||||   ||| ||||||||||||  |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572124 aattgctctaagtcaagcacgctt---tgtggagttcttatggtttaggctacc-gaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 14572219  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattca 277  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14572220 tataagcctcccttcaaccatgtagtcccatacctacatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattca 14572292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21068005 - 21067673
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  21068005 aagcattgccgactaagcctacaaaccaacacgaattttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccggtaaacttcccggtaggtcacccatc 21067906  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||   || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21067905 caaagactacttcaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaatggactaccaaa---aaaatgtatcttgttgatataggtagcaccaaacaa 21067809  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    |||||||||| || | |||||||||| |||| ||||||| ||   |||| |||| ||   ||||| | |||||||| |||| |||| ||  ||| |||||    
T  21067808 ttcttataagtcttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcgggatttc---cattctggtgtgattcggttcgtctataatttgtcgggag 21067712  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  21067711 ccgctcattgtcgtgccttctgcaccggcgaccactccc 21067673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 339
Target Start/End: Original strand, 8467690 - 8468003
Alignment:
Q  12 actgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtact 111  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||   |||| |||||     | | | ||    
T  8467690 actgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcatgctttccgagaaacttcccataaggtcaccca-----aaattgct 8467784  T
Q  112 ccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagc 211  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||        | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  8467785 ccaagtcaagcacgcttaactgtggagttct--------gggctaccgaaaagaagatgcatcttgttggtataggtagtaccaaacaattcttataagt 8467876  T
Q  212 ctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgt 311  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||| || |||||| |||||| ||| ||| | ||||||||||   |||||||| || |||    
T  8467877 cttccttcaaccatgtagtctcatacctgcacagtctcaggatccctttcattctgatgtggttcggttgc-ctagaagctgccaggagccgcgcaatgt 8467975  T
Q  312 cgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||    
T  8467976 catgccttgtgcactggcgaccactccc 8468003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 209
Target Start/End: Original strand, 50814730 - 50814899
Alignment:
Q  40 ttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagt 139  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | |||||| || | | |||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  50814730 ttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccgggaaacttcccggtaggtcatccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagt 50814829  T
Q  140 tcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50814830 tcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataa 50814899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 339
Target Start/End: Original strand, 31817740 - 31818056
Alignment:
Q  22 caaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaat 121  Q
    |||||||||||||||| || |||| || ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||  | | ||||  ||||||| || | |||| ||||||||     
T  31817740 caaaccaacacgagtcatt-caacatgatttgtcctcactcgcacgctttccgcgaaacttcaccgaaggtcgcccatcctaaaactactacaagtcaag 31817838  T
Q  122 aacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaa 221  Q
     |||||||||| |  |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  31817839 cacgcttaactatgaagttcttatgaaatggactaccgaaaagaagatgcatcttgttggtataggtagtaccgaacaattcttataagccttccttcaa 31817938  T
Q  222 ccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttat 321  Q
    ||||| |||| ||||| | ||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||||  |||  | ||||||| | |||| ||| | |||||| |||||| |    
T  31817939 ccatgcagtcccatacatgcatgacctcataatccctcttattccgatgtgattcgattcgaccagaagctttcgggatccgtttattgtcatgccttgt 31818038  T
Q  322 gcactggcgatcactccc 339  Q
    |||  |||||||||||||    
T  31818039 gcatcggcgatcactccc 31818056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 137 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 1464285 - 1464085
Alignment:
Q  137 agttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcata 236  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||    
T  1464285 agttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagttttctttcaactatgtattctcata 1464186  T
Q  237 cctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcact 336  Q
    ||||||    | || |||| ||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| ||| |  ||||| |||||||| || ||||||||| ||||| ||||    
T  1464185 cctacacggtcgcatgatccctctcattctgatgtgattcggttcgtctaaaaggtgtcgaaagccgttcattgtcatgtcttatgcaccggcgaccact 1464086  T
Q  337 c 337  Q
    |    
T  1464085 c 1464085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 272
Target Start/End: Original strand, 15306052 - 15306234
Alignment:
Q  96 ccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacca 195  Q
    |||||| |||| | ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15306052 ccatcccaagattgctcaaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtttatataggtagtacca 15306151  T
Q  196 aa------caattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtg 272  Q
    ||      ||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15306152 aaattgctcaaatcttataagtcttctttcgaccatgtagtcccatacctacacagcctcaggatccctctcattctgatgtg 15306234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 186 - 357
Target Start/End: Original strand, 53854858 - 53855029
Alignment:
Q  186 ggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctct 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||   | ||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  53854858 ggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatatagtctcatacctacactgcttcatgatccctctcattccgatgtgattcggttcgtct 53854957  T
Q  286 agaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactcccttatcctcgtcaaccgtg 357  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| || | |||||||||| ||||    
T  53854958 ataagctgtcgggagccgctcattgtcgagccttgtacactggcaatcacttccctgtcctcgtcaatcgtg 53855029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17628781 - 17628513
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||   | ||| ||| |  | |||| |||||||  ||    
T  17628781 attgccgactgactccacataccaacacaagtctttccagtgtgttttgtcctcactcacacgctttatgggaatcttcctagaaggtcacccatctcaa 17628682  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | ||||||||||   ||||| |||||| || |||||||||  || |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17628681 aattgctccaagtcaggcacgctcaactgtggaattcttatgggttgggctatcgaaaagaagatgcatcttgttggtataggtagtaccaaacaattct 17628582  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtga 273  Q
    ||||||||||| |||||||||| | || | || || |||  |||| |||||||||||| || |||||||    
T  17628581 tataagcctaccttcaaccatgaaatcacttatctgcatggcctcgggatctctctcactctgatgtga 17628513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 276
Target Start/End: Original strand, 13613857 - 13614038
Alignment:
Q  94 acccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtac 193  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13613857 acccatccaaagactagtccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatagaatgaactaccgaaa-gaagatgcatcttgttgatataggtggtat 13613955  T
Q  194 caaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattc 276  Q
    |||||||||||||||||    | ||| |||||| |||||||| | | || |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  13613956 caaacaattcttataagtactccttctaccatggagtctcatgcatgcacaacctctggatccctctcattccattgtgattc 13614038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 113 - 339
Target Start/End: Original strand, 31817376 - 31817602
Alignment:
Q  113 caagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcc 212  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |     
T  31817376 caagtcaaacacgcttaattgtagagttcttaaggaatgggctgcggaaaagaagatgcattttgttggtataggtagtaccaaacaattattataaacg 31817475  T
Q  213 tactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtc 312  Q
    | | |||||||||| |||||||||| | ||  |||||| |||| |||| ||| |||||||||||   |  |||| ||  ||| |||| ||||||||||||    
T  31817476 ttccttcaaccatgaagtctcatacatgcacgacctcatgatccctcttatttcgatgtgattctccttgtctaaaaattgtcgggaaccgctcattgtc 31817575  T
Q  313 gtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
     |||||| |||||||| || |||||||    
T  31817576 atgccttgtgcactggtgaccactccc 31817602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Original strand, 14571709 - 14571866
Alignment:
Q  123 acgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaac 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  14571709 acgcttaactgtggagttcttatggtttaggctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcatcccttcaac 14571808  T
Q  223 catgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    |||| |||| ||||||||||    |||| |||| || |||||  ||||||||||||||    
T  14571809 catgaagtcccatacctacacggactcaagatccctttcattatgatgtgattcagtt 14571866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 27026756 - 27026539
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaa 120  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  || |||||||   |  |||||| |  | |||| |||| ||| || | | || ||||||||    
T  27026756 acaaacaaacacgagtcttttcagcgtgttttttcctcagtcacacgctttttggtaaacttcctagaaggtcacccttcccaaaattgcttcaagtcaa 27026657  T
Q  121 taacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttca 220  Q
      ||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  27026656 gcacgcttaactacgtagttcttatggaatgggctaccaaaaa-aagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaattcttataagccttccttca 27026558  T
Q  221 accatgtagtctcatacct 239  Q
    | | ||||||| |||||||    
T  27026557 atcgtgtagtcccatacct 27026539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 276
Target Start/End: Original strand, 27578788 - 27579050
Alignment:
Q  14 tgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactcc 113  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| | | ||||||| || | |||| || ||||| || |   ||||    
T  27578788 tgaccctacaaatcaacacaagtcttttcagcatgatttgtcctcactcgcacgctttctgggaaacttcccagaaggtcacgcatcccaaaatcgctcc 27578887  T
Q  114 aagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcct 213  Q
    |||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||  | |||||  |||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  27578888 aagttaagcacgcttaactgtgtagttcttatggatagggctactgaaaagaagatgtgtctaattgatatatgtagtaccaaacaattcttataagtct 27578987  T
Q  214 actttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattc 276  Q
     |  ||||||| ||||| |||||||||||  || | | |||| |||| |||||||||||||||    
T  27578988 tcagtcaaccaagtagtgtcatacctacacgactttaagatccctcttattccgatgtgattc 27579050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27029426 - 27029317
Alignment:
Q  126 cttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccat 225  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || | ||||| | |    
T  27029426 cttaactgtggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagtaccaaataattcttataagtcttccttcaatcgt 27029327  T
Q  226 gtagtctcat 235  Q
    ||||||||||    
T  27029326 gtagtctcat 27029317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 27578343 - 27578531
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaa 120  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||  ||  |||||| || | ||||  | ||||| || | |  || |||||||    
T  27578343 acaaaccatcacgagtcttttctgcgtgttttgtcctcactcgcacgcttgtcggaaaacttcccagaaggtcgctcatcccaaaattgttcgaagtcaa 27578442  T
Q  121 taacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 209  Q
      |||||||||| | ||||||||||||  || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  27578443 gcacgcttaactatggagttcttatggtttgggataccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagcaccaaataattcttataa 27578531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4185880 - 4185650
Alignment:
Q  110 ctccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 209  Q
    |||||||||||  |  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||     
T  4185880 ctccaagtcaagcatacttaactgtagagttcttgtagaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttggtatatgtggtatcaaacaattcttatat 4185781  T
Q  210 gcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtg-attcagttcctctagaagctgttgggagccgctcat 308  Q
    |  | | || |||||||  ||||||||||| |||  ||||| || | ||||||||  |||||| |||| ||||  |||||||||| |  ||||| |||||    
T  4185780 gtattcctttaaccatgccgtctcatacctgcatggcctcatgaaccctctcattttgatgtgaattcggttcacctagaagctgctatgagccactcat 4185681  T
Q  309 tgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    | || || ||| ||||  | |||||||||||    
T  4185680 tttcatgtcttgtgcaacgacgatcactccc 4185650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13266356 - 13266122
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||  ||  |||||| ||   |||| |||||||| ||    
T  13266356 attgtcgactgaccccacaaaccaacacaagtcttttcaacatgttttctcctcactcgcacacttttcggaaaacttcccaaaaggtcacccatcctaa 13266257  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | ||| |||||||  |||||||||||| | |||||| ||   || |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  13266256 aatttctcaaagtcaagcacgcttaactgtggggttcttgtgatttgggctaccgaaaataagatgcatcttattgatatagggagtactaaaaaattat 13266157  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacct 239  Q
    ||||||||| | |||||||||| | || |||||||    
T  13266156 tataagccttccttcaaccatgcattcccatacct 13266122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17029126 - 17028824
Alignment:
Q  23 aaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaata 122  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||  | |||| |||  |||||||||| ||   || | ||||||||  | | | |||||||||||      
T  17029126 aaaccaacagaagtcttttcaacatgttttctcctcattagcacacttttcgagaaacttcccataagtttacccatcccgaaattgctccaagtcaagc 17029027  T
Q  123 acgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaac 222  Q
    || ||||||| |  |||||||||||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||  |  | ||||||    
T  17029026 actcttaactatgaagttcttatggaataagctaggtaaaataagacgcatcttgttgatataggtagcacctaacaattcttacaaatcctccttcaac 17028927  T
Q  223 catgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatg 322  Q
     ||| |||| ||||| | ||   | |||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||   |||||| ||||||||| |||||| ||    
T  17028926 tatgcagtcccatacatgcaaggcttcaggatccctctcattccgatgtgattcagtttgcctagaagctgcaaggagcctctcattgtcatgccttgtg 17028827  T
Q  323 cac 325  Q
    |||    
T  17028826 cac 17028824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17029479 - 17029325
Alignment:
Q  126 cttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccat 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| || | |||||| ||    
T  17029479 cttaactgtggagttcttatggaataaggtaccaaaagtaatatgcatcttgttgatataggtagtactaaacaattattacaagtcttcattcaactat 17029380  T
Q  226 gtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    | |||| ||||| | ||  |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  17029379 gcagtcccatacttgcacgacctctagatccctctcattccgatgtaattcagtt 17029325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 7381541 - 7381436
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||||  | ||||    
T  7381541 aagcattgccgactgaccctacaaaccaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaacttctcggtaggtcgctcatc 7381442  T
Q  101 caaaga 106  Q
    ||||||    
T  7381441 caaaga 7381436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 40607205 - 40607105
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40607205 aagcattgccgactgattccacaaatcaacacgagttttttcagcgtattttgtcctcactcgaacgcttaccgataaactttccggtaggtcacccatc 40607106  T
Q  101 c 101  Q
    |    
T  40607105 c 40607105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 100
Target Start/End: Original strand, 15268043 - 15268138
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  15268043 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgagaaatttcccggtagctcacccatc 15268138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33765012 - 33764898
Alignment:
Q  123 acgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaac 222  Q
    |||||||| |||  |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || | | ||||    
T  33765012 acgcttaagtgtgaagttcttataaaatgagctacaaaaaagaagatgcatcttgttggtataggtagcaccaaacaattcttaaaagtcttcatccaac 33764913  T
Q  223 catgtagtctcatac 237  Q
    |||||||||| ||||    
T  33764912 catgtagtcttatac 33764898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 53854713 - 53854859
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||  |||||||  ||||||| || ||||    
T  53854713 aagcattgccgactaaccctacaaatcaacacgagtcttttcaacgtattttgtcatcactcgcacgtttaccggtaaactttttggtaggtcacacatc 53854812  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatgg 147  Q
    |||| | |||| |||||| |  | |||||||| | ||||||||||||    
T  53854813 caaaaactacttcaagtctaacatgcttaactatggagttcttatgg 53854859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 42838787 - 42838628
Alignment:
Q  114 aagtcaataacgcttaactgt-agagttcttatggaatgagctacc-aaaaagaa-gatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 210  Q
    |||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  42838787 aagtcaaacacgcttaactgtgaaagttcttatggaatgaactatcgaaaaagaaagatgcattttgttgatataggtagtaccaaacaatttttatacg 42838688  T
Q  211 cctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgt 271  Q
     || | || ||| |||||||||||||| |||| |  ||||||||| ||||||||| |||||    
T  42838687 tcttccttgaactatgtagtctcatacttacacagtctcaggatc-ctctcattctgatgt 42838628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 35477930 - 35477855
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaac 80  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  35477930 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctctctcgcacgtttaccgagaaac 35477855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 147
Target Start/End: Original strand, 14571562 - 14571700
Alignment:
Q  9 ccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagt 108  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| ||   || | |||||||   | | |    
T  14571562 ccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcacacactttccgagaaacttcccaaaagatcacccatctcgaaatt 14571661  T
Q  109 actccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatgg 147  Q
     |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  14571662 gctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgg 14571700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 273
Target Start/End: Original strand, 24271551 - 24271690
Alignment:
Q  135 agagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag-cctactttcaaccatgtagtctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| | | |||||| ||||||||||||||    
T  24271551 agagttcttatggaatgggctacccaaaa-aatatgcatcttgttcgtataggtagtatcaaataattcttatatgtcttacttt-aaccatgtagtctc 24271648  T
Q  234 atacct--acataacctcaggatctctctcattccgatgtga 273  Q
    ||||||  |||  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24271649 atacctgcacacgacctcaggaaccctctcattccgatgtga 24271690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 213
Target Start/End: Original strand, 20306139 - 20306239
Alignment:
Q  110 ctccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 209  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||| |||| | |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20306139 ctccaagtcaagcacgcttaaccgtgtagttcttatgaaatgggataccaaaaaga---tgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataa 20306235  T
Q  210 gcct 213  Q
    ||||    
T  20306236 gcct 20306239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 4414253 - 4414325
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttacc 73  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4414253 aagcattgccgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctgactcgcacgcttacc 4414325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 213
Target Start/End: Original strand, 23091501 - 23091589
Alignment:
Q  125 gcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcct 213  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23091501 gcttaactgtggagtttttatagaataagctaccagaaagaagatgcatcttgttaatatatgtagtaccaaacaatttttatacgcct 23091589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4186315 - 4186205
Alignment:
Q  127 ttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatg 226  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| | | || || |||     
T  4186315 ttaactgtgtagttcttatgcaatgggctaccaaaaagaagatgaatcttgttcatgtaggtagtaccaaatcattcttataagcattcctttaaacatt 4186216  T
Q  227 tagtctcatac 237  Q
    |||||||||||    
T  4186215 tagtctcatac 4186205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 339
Target Start/End: Original strand, 26200287 - 26200492
Alignment:
Q  137 agttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagc--ctactttcaaccatgtagtctca 234  Q
    |||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||||  || | ||||||||||  ||| ||    
T  26200287 agttcttatggtttcggctaccacaaagaatatgcatcttgtttgtatagttagtatcaaacaattgttataagcctcttccttcaaccatgatgtccca 26200386  T
Q  235 tacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtg-attcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatc 333  Q
    |||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||| | |||| ||| || || |||||| ||||| | ||| |    
T  26200387 tacctacacaatatcaggatccctctcattctgatgtgaattcagtttgcctagaagctgttagaagccactctttatcatgccttgtgcaccgacgacc 26200486  T
Q  334 actccc 339  Q
    ||||||    
T  26200487 actccc 26200492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 239
Target Start/End: Original strand, 43928982 - 43929067
Alignment:
Q  154 ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacct 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| | | ||| ||||  |||||||||||||    
T  43928982 ctaccaaaaagaagatgcatcttgttggtatatgtagtaccaaacaattcttgtaagctttccttcgaccaaatagtctcatacct 43929067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 45682321 - 45682209
Alignment:
Q  157 ccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatct 256  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||  | |||  ||||| |||||    
T  45682321 ccaaaaagaaaatgcatcttgttggtatagataataccaaataattcttataaaccttcattcaatcatgtagtcccatatatgcatggcctcaagatct 45682222  T
Q  257 ctctcattccgat 269  Q
    |||||||||||||    
T  45682221 ctctcattccgat 45682209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44831146 - 44831035
Alignment:
Q  126 cttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccat 225  Q
    |||||||||  ||||| |||| |||| |||||| ||||||| || |||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||    
T  44831146 cttaactgtgaagttcatatgaaatgggctaccgaaaagaatatacatcttgttagtttaggtagtaccaaacaatttttataagcttcccttcaaccat 44831047  T
Q  226 gtagtctcatac 237  Q
    ||| ||||||||    
T  44831046 gtaatctcatac 44831035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 273
Target Start/End: Original strand, 23976243 - 23976357
Alignment:
Q  159 aaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctct 258  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||| |||| || | |||||||||||  || |||||   ||    
T  23976243 aaaaagaagatgcatcttgttagtataggtagtaccaaacaattcttataactcttccttcaatcatgcagacccatacctacatggccccaggaaacct 23976342  T
Q  259 ctcattccgatgtga 273  Q
    |||||| ||||||||    
T  23976343 ctcatttcgatgtga 23976357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 17506484 - 17506367
Alignment:
Q  176 tgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgt-gat 274  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||| || |||| | |||||||| | ||| |||||| |||| ||||||||| ||||| |||    
T  17506484 tgttgatataggtagtactatacaattcttataagtcttcttttaatcatgcactctcatacatgcatgacctcatgatccctctcattctgatgtagat 17506385  T
Q  275 tcagttcctctagaagct 292  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  17506384 ttagttcgtctagaagct 17506367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34554567 - 34554483
Alignment:
Q  137 agttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaa 221  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||    
T  34554567 agttcttatggaatggtctaccaaaaataaaatgcatcttgctggtataggtagtgtcaaacaattcttataagcattctttcaa 34554483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41870033 - 41869913
Alignment:
Q  160 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctc 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||| |||| |||| ||||  |  | |  ||||||||| |||    
T  41870033 aaaagaagatgcgtcttgttgatataggtagtatcatacaattcttataagtcttccttcaatcatgcagtcccatatatgtacagtctcaggatccctc 41869934  T
Q  260 tcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||| |||||||||||| ||||    
T  41869933 tcactccgatgtgatttagtt 41869913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 60
Target Start/End: Original strand, 53996007 - 53996055
Alignment:
Q  12 actgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgc 60  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53996007 actgaccctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgc 53996055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 145
Target Start/End: Original strand, 27578170 - 27578296
Alignment:
Q  19 ctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtc 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || | | ||||||| ||   |||| || ||||| || | | |||||||||    
T  27578170 ctacaacccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgttttcagggaaacttcccataaggtcactcatcccaaaactgctccaagtc 27578269  T
Q  119 aataacgcttaactgtagagttcttat 145  Q
    ||  ||||||||||||  |||||||||    
T  27578270 aagcacgcttaactgtgaagttcttat 27578296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 209
Target Start/End: Original strand, 52048659 - 52048740
Alignment:
Q  127 ttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 209  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  52048659 ttaactgtggagttcttatggaatgacttac-aaaatgaagatgcatcttgttagtatacgtagtatcaaacaattcttataa 52048740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 111
Target Start/End: Original strand, 31817024 - 31817114
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtact 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| | | ||||||| || | | || ||||||||||||| ||||    
T  31817024 acaaaccagcacgagtcttttcaacatgttttgtcctcactcgtacgctttctgggaaacttcccagaatgtcacccatccaaagactact 31817114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 338
Target Start/End: Original strand, 33987160 - 33987274
Alignment:
Q  224 atgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgc 323  Q
    |||||||| ||||||| ||  | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    ||| ||||||||||| |||||| |||    
T  33987160 atgtagtcacatacctgcacgatctcatgatccctctcattccgatgtgattcagtttgcctagaagctgccaagagtcgctcattgtcatgccttgtgc 33987259  T
Q  324 actggcgatcactcc 338  Q
    |||| ||| ||||||    
T  33987260 actgacgaccactcc 33987274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17629132 - 17629033
Alignment:
Q  110 ctccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 209  Q
    |||||||||||  | |||||| ||| || ||||| |||| || ||| | |||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17629132 ctccaagtcaagcatgcttaa-tgtggaattcttttggattgggcttctaaaaagaagaggcatcttattagtataggtagtaccaaacaattcttataa 17629034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 200
Target Start/End: Original strand, 39902478 - 39902518
Alignment:
Q  160 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39902478 aaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaa 39902518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 53392021 - 53391890
Alignment:
Q  141 cttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcataccta 240  Q
    |||||||  ||| ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||| |   |||||||||| ||||||||||       
T  53392021 cttatggtctgaactaccgaaaaaaatatgtatcttgttgatatagatggtatcaaacaatttttataagcatttcttcaaccatgcagtctcatactct 53391922  T
Q  241 cataacctcaggatctctctcattccgatgtg 272  Q
     | ||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  53391921 tacaacttcaagatctctctcattctgatgtg 53391890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 58
Target Start/End: Original strand, 2499387 - 2499425
Alignment:
Q  20 tacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctc 58  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2499387 tacaaaccaacacgcgtcttttcaacgtgttttgtcctc 2499425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 50399374 - 50399336
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttca 43  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50399374 attgccgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttca 50399336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 294
Target Start/End: Original strand, 20309600 - 20309676
Alignment:
Q  217 ttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgt 294  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |  |||| |||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  20309600 ttcaaccatgtagtcacatacctgcaaagtctcatgatccctctcattccgatgtgattcggtttc-ctagaagctgt 20309676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 10166025 - 10165937
Alignment:
Q  204 ttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagct 292  Q
    |||||||||| | |||||| ||| |||| ||||||| ||   ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  10166025 ttataagccttcattcaacaatgcagtcccatacctgcaatgcctcatgatctttctcattccgatgtgattcggttcgtctaaaagct 10165937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 179
Target Start/End: Original strand, 33294880 - 33294936
Alignment:
Q  123 acgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgtt 179  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  33294880 acgctttactgtggagttcttatggagtgaactacaaaaaagaagatgcattttgtt 33294936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 29628520 - 29628591
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttac 72  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||||| |||| || |||||    
T  29628520 aagcattgccgactgatcctacaaatcaacacgagttttttcagcgtattttatcctcactcgtacacttac 29628591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 35477832 - 35477801
Alignment:
Q  246 cctcaggatctctctcattccgatgtgattca 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35477832 cctcaggatctctctcattccgatgtgattca 35477801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 158
Target Start/End: Original strand, 11828426 - 11828508
Alignment:
Q  76 gaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctacc 158  Q
    |||| ||||| | |||| |||||||| || | | |||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11828426 gaaattttccagaaggtcacccatcccaaaaatgctccaagtaaagcacgcttaactgtggagttcttatggaaggagctacc 11828508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 5810104 - 5810039
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgctt 70  Q
    |||||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  5810104 attgccgactaaccccacaaatcaacatgagtcttttcagcgtgttttatcctcactcacacgctt 5810039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Original strand, 52048563 - 52048624
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactt 82  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||| |||  ||||||||||    
T  52048563 acaaaccaacatgaatcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcactcttttcgagaaactt 52048624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 54
Target Start/End: Original strand, 33294771 - 33294811
Alignment:
Q  14 tgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgt 54  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33294771 tgacgctacaacccaacacgagtcttttcagcgtgttttgt 33294811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 50399335 - 50399279
Alignment:
Q  63 gcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtca 119  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||  |||| ||||||||||||    
T  50399335 gcacgcttaccgggaaacttcccagtaggtcacccatcataagaatactccaagtca 50399279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 20057595 - 20057929
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  20057595 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 20057694  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20057695 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 20057794  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||   |||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20057795 tataagccttctttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcatttcggtgtgattcagttcctctagaagctgttaggagccgc 20057894  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  20057895 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 20057929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 20054412 - 20054746
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  20054412 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 20054511  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054512 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 20054611  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||   |||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20054612 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgc 20054711  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  20054712 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 20054746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 20054868 - 20055202
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  20054868 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 20054967  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054968 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 20055067  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||   |||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20055068 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgc 20055167  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  20055168 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 20055202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 20055324 - 20055658
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  20055324 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 20055423  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20055424 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 20055523  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||   |||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20055524 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgc 20055623  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  20055624 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 20055658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 20055780 - 20056114
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  20055780 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 20055879  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20055880 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 20055979  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||   |||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20055980 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgc 20056079  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  20056080 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 20056114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 20056236 - 20056570
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  20056236 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 20056335  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20056336 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 20056435  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||   |||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20056436 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgc 20056535  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  20056536 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 20056570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 20057139 - 20057473
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  20057139 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 20057238  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20057239 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 20057338  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||   |||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20057339 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgc 20057438  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  20057439 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 20057473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 20845537 - 20845871
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  20845537 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 20845636  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20845637 aatttctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaacaaacaattct 20845736  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||   |||||||| |  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20845737 tataagccttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacggcctcaggaaccgtctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgc 20845836  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  20845837 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 20845871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 52250479 - 52250150
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |    
T  52250479 agcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccattc 52250380  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 201  Q
     || | | || ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52250379 caaaattgcttcaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaat 52250280  T
Q  202 tcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagc 301  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||   ||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  52250279 tcttataagccttccttcgaccatgtagtcccatacctacaaggcctcatgatccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcgggagc 52250180  T
Q  302 cgctcattgtcgtgccttatgcactggcga 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  52250179 cgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcga 52250150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 16451809 - 16452143
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16451809 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcatcacgcgcacgcttattggaaaactttccggtaggtcacccatcccaa 16451908  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16451909 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgaactaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattct 16452008  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||| | ||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  16452009 tataagctttccttcaaccatgtagtcccctacctacaaggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcgattcctctagaagctgtcgggagccgc 16452108  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  16452109 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 16452143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 16460962 - 16461296
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16460962 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcatcacgcgcacgcttattggaaaactttccggtaggtcacccatcccaa 16461061  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16461062 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgaactaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattct 16461161  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||| | ||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  16461162 tataagctttccttcaaccatgtagtcccctacctacaaggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcgattcctctagaagctgtcgggagccgc 16461261  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  16461262 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 16461296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 20053956 - 20054290
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  20053956 attgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacgcttaccagaaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 20054055  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054056 aattgctcctagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 20054155  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||   |||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20054156 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgc 20054255  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  20054256 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 20054290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Original strand, 43057399 - 43057725
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||||| || |||||| ||| |||||||    
T  43057399 attgctgactgacaatacaaaccaacacaagtctttttagcgtgttttgttctcactcacatgcttaccgggaaacttcccagtaggtcaccgatccaaa 43057498  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43057499 gaccactccaagtcaatcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaattct 43057598  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  43057599 tataagccttccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcggttcctctaaaagctgtcgggagccgc 43057698  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcga 331  Q
    |||||| | |||||| ||||| |||||    
T  43057699 tcattggcatgccttgtgcaccggcga 43057725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 20056692 - 20057017
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  20056692 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 20056791  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20056792 aattgctccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 20056891  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
     |||||||| | ||||||| || |||| |||         ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20056892 cataagccttccttcaaccctgcagtcccat---------acctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgc 20056982  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  20056983 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 20057017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 324
Target Start/End: Original strand, 50002583 - 50002902
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | |||||| ||    
T  50002583 attgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggggaacttcccggtaggtcatccatcccaa 50002682  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||| | |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50002683 aattgctccaagtcaaacacgcttaactatggagttcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 50002782  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||    
T  50002783 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatgcctacacggcctcaggatctctctcattccgatgtgattcggctcctctagaagatgtcgggagccgc 50002882  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgca 324  Q
    |||||||| |||||| ||||    
T  50002883 tcattgtcatgccttgtgca 50002902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 38341176 - 38340842
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||| ||    
T  38341176 attgccgactgaccccataaaccaacacgagtcttttccgcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccagtaggtcacccatcccaa 38341077  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38341076 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaatgaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 38340977  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||   |||||||| |  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  | ||||||    
T  38340976 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccatctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcagtagccgc 38340877  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  38340876 tcattgtcgtgccttgtgcaccggtgaccactccc 38340842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 43056941 - 43057274
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||    
T  43056941 attgccgactgaccctacaaaccaacacaagttttttcagtgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccgggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 43057040  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
    ||  |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43057041 gaccactctaagtcaatcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaattct 43057140  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    | ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| ||||| |||    
T  43057141 tctaagccttccttcaaccatgtagtcacatacctacacggccttaggatc-ccctcattctgatgtgattcggttcctctagaaattgtcgggagtcgc 43057239  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||    
T  43057240 tcattgtcatgccttgtgcaccggcaaccactccc 43057274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Original strand, 50002951 - 50003271
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  50002951 attgctgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatccaaa 50003050  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  50003051 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttttggaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattat 50003150  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    |||||| || | || ||||||| ||||  |||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  50003151 tataagtctccctttaaccatgcagtcctatacctgcatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcggttcctttagaagctgtcgggagccgc 50003250  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcac 325  Q
     |||| || |||||| |||||    
T  50003251 acattatcatgccttttgcac 50003271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 277
Target Start/End: Original strand, 35759484 - 35759756
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||| ||    
T  35759484 attgccgactgaccccaaaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgaaaaacttcccggtaggtcaccaatcccaa 35759583  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     |   |||||||||||  ||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35759584 aatagctccaagtcaagcacgtttaactatgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 35759683  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattca 277  Q
    ||||||| | | |||||||||| |||| ||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35759684 tataagctttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattca 35759756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 329
Target Start/End: Original strand, 51372750 - 51373074
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||| | | ||||| |||||||| ||    
T  51372750 attgccgattgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcggattttgtcctcactcgcacgcttaccgaaaaacttcctgataggtcacccatcccaa 51372849  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  51372850 aattgctcaaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaataagatgcatcttgtcgatataggtagtactaaacaattct 51372949  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | |||||||||  |||| |||||||  ||  |||| ||||| |||||||||   |||||||  || | |||||||| ||| ||||| |||    
T  51372950 tataagccttccttcaaccatacagtcacatacctgtatggcctcgggatccctctcattctagtgtgatttggtacgtctagaagatgtcgggagtcgc 51373049  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggc 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  51373050 tcattgtcgtgccttatgcactggc 51373074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 277
Target Start/End: Original strand, 46693611 - 46693884
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  46693611 attgtcgactgaccccacaaaccaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcataccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaa 46693710  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46693711 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttattatgaaatgagataccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatttt 46693810  T
Q  205 tataagcctactttcaaccat-gtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattca 277  Q
    ||||||||| | |||||||||   |||| ||||| | ||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  46693811 tataagccttccttcaaccatcacagtcccatacatgcacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattca 46693884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 211
Target Start/End: Original strand, 20060216 - 20060422
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  20060216 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtctttccatcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 20060315  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | |  ||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060316 aattgatccaagtcaagcacacttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 20060415  T
Q  205 tataagc 211  Q
    |||||||    
T  20060416 tataagc 20060422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 59 - 277
Target Start/End: Original strand, 35760844 - 35761062
Alignment:
Q  59 gctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctacc 158  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| || | | |||||||||||  ||||||||||   ||||||| |||||||||||||||    
T  35760844 gctcgcacgcttaccgggaaacttcccgataggttacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactacggagttctcatggaatgagctacc 35760943  T
Q  159 aaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||| ||    
T  35760944 aaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacggcctcaggatccct 35761043  T
Q  259 ctcattccgatgtgattca 277  Q
    |||||||||||||||||||    
T  35761044 ctcattccgatgtgattca 35761062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 67 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12883732 - 12883474
Alignment:
Q  67 gcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaa 166  Q
    |||||| | ||||||| || |||||| | ||||||||| | |||| ||||||||  || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12883732 gcttactgggaaacttcccagtaggtcatccatccaaaaactacttcaagtcaaacacacttaactgtggagtttttatggaatgagctaccaaaaagaa 12883633  T
Q  167 gatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattcc 266  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||| |||| |||| ||||||| || | |||| |||||  |||||||||    
T  12883632 aatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtattccttcaatcatgcagtcccatacctgcacagcctcgggatccatctcattcc 12883533  T
Q  267 gatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcac 325  Q
    | |||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12883532 ggtgtgattcggttcgtctagaagctgtcgagagccgctcattgtcgtgccttgtgcac 12883474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 111 - 325
Target Start/End: Original strand, 31822645 - 31822859
Alignment:
Q  111 tccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  31822645 tccaagtcaaaaacgcttaactgtggagttcttttggattgagctaccgaaaagaagatgcatattgttgatatatgtagtaccaaataattcttataaa 31822744  T
Q  211 cctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattg 310  Q
     || | ||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  31822745 tcttccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcctcatgatccctctcattctgatgtgatttggttgctctagaagctgttgggagccgctcatta 31822844  T
Q  311 tcgtgccttatgcac 325  Q
    ||||||||| |||||    
T  31822845 tcgtgccttctgcac 31822859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 338
Target Start/End: Original strand, 30872828 - 30873158
Alignment:
Q  10 cgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcg---cacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaaga 106  Q
    |||||||| |||||||  |||| || |||||||||| |||||||||||| ||||   ||   ||  || |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  30872828 cgactgaccctacaaattaacatgaatcttttcaacatgttttgtcctcactcgtcacatatttttcgtgaaacttttcagtaggtcacccatccaaaga 30872927  T
Q  107 gtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattctta 206  Q
     |||| ||||||||  | |||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30872928 ctactgcaagtcaagcatgcttaattgtggagttcttatagaatggactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaattctta 30873027  T
Q  207 taagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctc 306  Q
     ||| || | |||||||||  |||||||||||| ||   |||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||  || | | ||||||||    
T  30873028 aaagtcttccttcaaccatacagtctcatacctgcacggcctcagaatccctctcattccggtgtgattcggttcgtctagaaattg-tcgaagccgctc 30873126  T
Q  307 attgtcgtgccttatgcactggcgatcactcc 338  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||    
T  30873127 attgtcgtgccttgtgcaccgacgaccactcc 30873158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 110 - 286
Target Start/End: Original strand, 50002266 - 50002442
Alignment:
Q  110 ctccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 209  Q
    |||||||||||  || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50002266 ctccaagtcaagcacactcaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgataaaggtagtaccaaacaattcttataa 50002365  T
Q  210 gcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctcta 286  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||| ||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50002366 gccttccttcaaccatgtagtcccatgcctacacggcctcatgatccctctcattccgatgtgattcggttcctcta 50002442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 126 - 280
Target Start/End: Original strand, 20061188 - 20061342
Alignment:
Q  126 cttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccat 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  20061188 cttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccat 20061287  T
Q  226 gtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    | |||| ||||||| ||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20061288 gcagtcccatacctgcacgacctcaggatccctctcattctgatgtgattcagtt 20061342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7548290 - 7548033
Alignment:
Q  76 gaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatct 175  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  7548290 gaaacttctcggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagtacgcttaattgtggagttcttatcaaatgggctaccaaaaagaatatgcatct 7548191  T
Q  176 tgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgatt 275  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || | || || ||||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||| | ||||||||    
T  7548190 tgttgatatagttaataccaaacaatttttataagtcttcctttaatcatgtagtctcatacctacacggcctcatgatccctctcattgcaatgtgatt 7548091  T
Q  276 cagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcac 335  Q
    |||||  | | |||| |||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  7548090 cagtt--tgtcgaagttgtcaggagccgttcattgtcgtgccttgtgcaccggtgatcac 7548033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2635102 - 2634868
Alignment:
Q  97 catccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaa 196  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2635102 catccaaagattactccaagccaaacacgcttaactgtggagttcttattgaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttggtataggtagtaccaa 2635003  T
Q  197 acaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttg 296  Q
    ||||||||||| ||    | |||||||||| |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||   ||||||| || |     
T  2635002 acaattcttatgagttatccttcaaccatgcagtcccatacctgcacaacctcatgatccctctcattccgatgtgattcgatttgcctagaagttgcta 2634903  T
Q  297 ggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcga 331  Q
    |||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||    
T  2634902 ggagccacacattgtcatgccttgtgcaccggcga 2634868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 52250816 - 52250641
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  52250816 agcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcttcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcc 52250717  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttg 177  Q
     || | | || ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52250716 caaaattgcttcaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 52250641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 52251153 - 52250978
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  52251153 agcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcttcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcc 52251054  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttg 177  Q
     || | | || ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52251053 caaaattgcttcaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttg 52250978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 127 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2328463 - 2328310
Alignment:
Q  127 ttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatg 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2328463 ttaactgtggagttcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatg 2328364  T
Q  227 tagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
     |||| |||||||  |   |||||  || ||||||||||| |||||||||||||    
T  2328363 cagtcccatacctgtacggcctcataatttctctcattccaatgtgattcagtt 2328310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23180984 - 23180728
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaa 120  Q
    |||||||||||  |||||||||| | ||||||||| || |||||||  ||   || ||||||||| | ||||||||||||| || | | |||||||||||    
T  23180984 acaaaccaacattagtcttttcagcatgttttgtcgtcactcgcacattttttgaaaaactttccagaaggtaacccatcccaaaatttctccaagtcaa 23180885  T
Q  121 taacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttca 220  Q
      |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||    
T  23180884 gcacgcttaattgtggaattcttatggaatgggctagcgaatagaagatacatcttgttgatataggtagtaccaagcaattcttataatcattccttca 23180785  T
Q  221 accatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattca 277  Q
    |||| |||||| ||| ||||||   | ||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  23180784 accacgtagtcccattcctacacggcttcaagatccctctcattccaatgtgattca 23180728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12728159 - 12727990
Alignment:
Q  108 tactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagt-accaaacaattctta 206  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12728159 tactccaagtcaagcatgcttaactgtggagttcttatggaatgtgctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggcagtaaccaaacaattctta 12728060  T
Q  207 taagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattc 276  Q
    |||| || | ||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||| ||| || ||||| | |||||||||    
T  12728059 taagtcttccttcaaccatgttgtcccatacctacacagtctcagaatccctttcatttcaatgtgattc 12727990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16907399 - 16907178
Alignment:
Q  110 ctccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 209  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||||||| | |||||  | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16907399 ctccaagtcaaacacgcttaactatggagttcttgtagaatggaccactgaaaagaagatgtatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 16907300  T
Q  210 gcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcatt 309  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||| || |  ||||  ||| ||||||||  ||| |||||  |||   ||||||||||   ||||||||| |||    
T  16907299 gccttctttcaaccatgcagtttcatacctgcacagtctcaaaatccctctcattttgatatgatttggtttgcctagaagctgccaggagccgctgatt 16907200  T
Q  310 gtcgtgccttatgcactggcga 331  Q
    ||| || ||| |||||||||||    
T  16907199 gtcatgtcttgtgcactggcga 16907178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10820758 - 10820531
Alignment:
Q  111 tccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctacc--aaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttata 208  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  | |||||||| ||||||  | |  ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10820758 tccaagtcaagcacgcttaactgtgaatttcttatgaaatgagtcatcgaaaaaaaaagatgtatcttattgatataggtagtaccaaacaattcttata 10820659  T
Q  209 agcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcat 308  Q
    |  || | |||||||||||||||  |||| ||||   |||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||| || ||||| ||||    
T  10820658 aatcttccttcaaccatgtagtccaatacatacaccgcctcataatccctctcactccgatgtgattcggttcatctagaagttgtcggtagccgttcat 10820559  T
Q  309 tgtcgtgccttatgcactggcgatcact 336  Q
    |||| ||| || ||||| ||||| ||||    
T  10820558 tgtcatgctttgtgcaccggcgaccact 10820531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 7547911 - 7547792
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7547911 aagcattgtcgactgaccctacaaatcaacacgagacttttcagtgtgttttgtccttactcgcacgcttatcgaaaaactttccggtaggtcacccatc 7547812  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaa 120  Q
    |||| | |||||||||||||    
T  7547811 caaacactactccaagtcaa 7547792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2634645 - 2634464
Alignment:
Q  96 ccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacca 195  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||  ||||||||| ||||   ||| | ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  2634645 ccatccaaagactactccaagtcaagcacgtttaacagtgaagttcttattgaatagactatcgaaaagaagatgcatcttgtttgtatagctagtacca 2634546  T
Q  196 aacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggat-ctctctcattccgatgtgattc 276  Q
    ||||||||||  |||||| | || || |||| | |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  2634545 aacaattcttgcaagccttcctttaatcatgcaatctcatacatacacaacctcaggatcccctctcatttcgatgtgattc 2634464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 101
Target Start/End: Original strand, 31822995 - 31823091
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  31822995 attgctgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcatgcttaccgagaaacttcccagtaggtcacccatcc 31823091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 206
Target Start/End: Original strand, 31823097 - 31823161
Alignment:
Q  142 ttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattctta 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31823097 ttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcattttattgatataggtagtaccaaataattctta 31823161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 68
Target Start/End: Original strand, 35759940 - 35760003
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgc 68  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35759940 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcgctcgcacgc 35760003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 237
Target Start/End: Original strand, 16440565 - 16440687
Alignment:
Q  115 agtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccta 214  Q
    ||||||| || ||||||| |  |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||     
T  16440565 agtcaatcacacttaactttgaagttattatagaatgagctaccaaaaagaatatgcatcttgttgttatcggtagtagcaaacagttcttataagtctt 16440664  T
Q  215 ctttcaaccatgtagtctcatac 237  Q
      |||||||||||| || |||||    
T  16440665 tcttcaaccatgtattcccatac 16440687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 151
Target Start/End: Original strand, 35009881 - 35010018
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||  |||||||||||||            |||| |||| ||  |||||||| ||||||||    
T  35009881 agcattgccgactgaccctacaaacgaacatgagttttttcagtgtgttttgtcctc------------accgggaaaattctcggtaggtcacccatcc 35009968  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatg 151  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35009969 aaagactactccaagtcaagcacgcttaaccgtggagttcttatggaatg 35010018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2739660 - 2739457
Alignment:
Q  137 agttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcata 236  Q
    ||||||||||||||   |||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||    | ||||||  |||||||||    
T  2739660 agttcttatggaatagactataaaaaagaagatacatattgttgatatatgtagtgctaaacaattcttataagtctttccttaaccatacagtctcata 2739561  T
Q  237 cctacataacctcaggatctctctcattccgatgt-gattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcac 335  Q
    |||| | |||| |||| |  ||||||||  ||||| |||||| |||  ||||||||||   |||| |||| |||||| |||||||||||  | |||||||    
T  2739560 cctatacaaccccagggttcctctcattttgatgtggattcaattcacctagaagctgacaggagtcgcttattgtcatgccttatgcatcgacgatcac 2739461  T
Q  336 tccc 339  Q
    ||||    
T  2739460 tccc 2739457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 39582615 - 39582553
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcg 63  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  39582615 aagcattgccgactgatcctacaaaccaaaacgagtcttctcagcgtgttttgtcctcactcg 39582553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 264
Target Start/End: Original strand, 842933 - 843068
Alignment:
Q  129 aactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgta 228  Q
    |||||| |||||||||||  | || ||| ||||||||| |||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| | | || | ||||| |||| |    
T  842933 aactgttgagttcttatgtgacgatctatcaaaaagaacatgcatcttgttggaatggatagtaccaaacaattcttacacgacttccttcaatcatgca 843032  T
Q  229 gtctcatacctacataacctcaggatctctctcatt 264  Q
    | | ||||||||||  | |||| |||| ||||||||    
T  843033 gacacatacctacacgatctcatgatccctctcatt 843068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 211
Target Start/End: Original strand, 16410747 - 16410805
Alignment:
Q  153 gctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagc 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||||||||    
T  16410747 gctaccaaaaacaagatgcatcttgttggtattggtagtagtaaataattcttataagc 16410805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 58
Target Start/End: Original strand, 49996556 - 49996609
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctc 58  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  49996556 attgccgactgaccccacaaactaacaagagtcttttcagcgtgttttgtcctc 49996609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 193
Target Start/End: Original strand, 7229835 - 7230007
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaa 120  Q
    ||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||||| ||  |||||||  ||| |||||||     |||| ||| |||| || | | |||||||||||    
T  7229835 acaaagcaacacgagttttttcagcatgttttatcctcactttcacgcttttcgaaaaactttatataaggtcaccaatcctaaaattgctccaagtcaa 7229934  T
Q  121 taacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtac 193  Q
      | ||||| || | ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  7229935 acatgcttatctatggagttcttatgtaatgaactaccgaaatgaagatgcttcgtgttgatatagttagtac 7230007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Original strand, 46411173 - 46411211
Alignment:
Q  168 atgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattctta 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46411173 atgcatcttattgatataggtagtaccaaataattctta 46411211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 58
Target Start/End: Original strand, 46411030 - 46411067
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctc 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  46411030 acaaaccaacacgagtcttttcaatttgttttgtcctc 46411067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 58)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 8080214 - 8080551
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  8080214 aagcattgtcgactggccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaaacttcctagtaggttacccatc 8080313  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8080314 caaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaatgggctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 8080413  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    ||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  8080414 ttcttatcagctttccttcaaccatgtagtcccatacctacacggcttcaggatccctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttaagag 8080513  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactcc 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  8080514 ccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactcc 8080551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 27022215 - 27022548
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  27022215 attgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtctttttagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccaa-aaactttccagtaggtcacccatcccaa 27022313  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27022314 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctgccgaaaataagatgcatgttgttgatataggtagtaccaaacaattct 27022413  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  27022414 tataagccttctttcaaccatgtagtcccatacctacatggcctcaagatccctctcattccgatgtgattcggctcctctagaagctgtcgggagccgc 27022513  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  27022514 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 27022548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 22548425 - 22548759
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  22548425 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 22548524  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22548525 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttattatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 22548624  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    |||||  || | |||||||||| |||| ||||||| || | |||||||| | ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||    
T  22548625 tataaaacttccttcaaccatgcagtcacatacctgcacagcctcaggaaccctctcattccggtgtgattaggttcctctagaagctgtcaggagccgc 22548724  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22548725 tcattgtagtgccttgtgcactggcgaccactccc 22548759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 2044332 - 2044030
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||  ||||| |||||||    
T  2044332 aagcattggtgactgaccctacaaaccaatacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaacttcccattaggtcacccatc 2044233  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2044232 caaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttattatggaatgggctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaa 2044133  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||    
T  2044132 ttcttataagccttccttcaaccatgtagtctcatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtgattctgttcctctagaagttgtcggaag 2044033  T
Q  301 ccg 303  Q
    |||    
T  2044032 ccg 2044030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 22548871 - 22549205
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  22548871 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtctgttcagcgtgttttatcctcactcgcacgcttactgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 22548970  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22548971 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagtttttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 22549070  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    |||||| || | |||||||||| |||| ||||||| || | ||||||||   ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  22549071 tataagtcttccttcaaccatgcagtcacatacctgcacagcctcaggaagcctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgc 22549170  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22549171 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 22549205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 12827130 - 12827464
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  12827130 attgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttaaaagtgttttaacctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 12827229  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12827230 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaattct 12827329  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||  ||||||||    
T  12827330 tataagccttccttcaaccaagtagtcccatacctacaaggcctcaggatccctctcattccggcgtgattcggttcttctagaagcagtcaggagccgc 12827429  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12827430 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgatcactccc 12827464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22026650 - 22026316
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgtttt-gtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaa 103  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| |    
T  22026650 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgtttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccgataggttacccatccca 22026551  T
Q  104 agagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 203  Q
    | | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22026550 atattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 22026451  T
Q  204 ttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccg 303  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||   ||||| || | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  22026450 ttataagccttcattcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcacgaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccg 22026351  T
Q  304 ctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactcc 338  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||    
T  22026350 ctcattgtcatgccttgtgcaccggcgaccactcc 22026316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 20 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 32292652 - 32292333
Alignment:
Q  20 tacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  32292652 tacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccggaaaacttcccggtagatcacccatccaaagactactccaagtca 32292553  T
Q  120 ataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttc 219  Q
    |  |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  32292552 agcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctagcaaaaagaagatgcaacttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataagcattccttc 32292453  T
Q  220 aaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgcctt 319  Q
    ||||||| |||| ||||| | ||   |||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  32292452 aaccatgcagtcccatacttgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaaactatcgggagccgctcattgtcgtgcctt 32292353  T
Q  320 atgcactggcgatcactccc 339  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  32292352 gtgcaccggcgatcactccc 32292333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27926172 - 27925835
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||  | |||||||    
T  27926172 aagcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtacctcacccatc 27926073  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    | || | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27926072 ccaa-attgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 27925974  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||| |||| ||||||| ||   |||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  27925973 ttcttataatccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggag 27925874  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||    
T  27925873 ccgctcattgtcgtgccttgtgcaccagcgaccactccc 27925835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Original strand, 41658978 - 41659314
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  41658978 agcattgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttacagggaaacttcccggtaggtcacctatcc 41659077  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 201  Q
     || | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41659078 caaaattgctccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatgtaatgagctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 41659177  T
Q  202 tcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagc 301  Q
    ||||||||| || | |||||||||| |||| ||||||| ||  || |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41659178 tcttataagtcttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacgacatcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcgggagc 41659277  T
Q  302 cgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    | |||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||    
T  41659278 cactcattgtcgtg-cttgtgcaccggcgaccactccc 41659314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25147805 - 25147531
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  25147805 attgccgactgaccc-acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtactcactcgcacgcttatcaggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 25147707  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25147706 aattgctccaagtcaagcacgattaactatggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagcaccaaacaattct 25147607  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25147606 tataagccttccttcaaccatgcagtctcatacctacacagtcttaggatctctctcattccgatgtgatttagtt 25147531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 337
Target Start/End: Original strand, 33852150 - 33852466
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaa 120  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  33852150 acaaatcaacatgagtctttttagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcatgaaactttccgataggtcacccatccaaagactactccaagtcaa 33852249  T
Q  121 taacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttca 220  Q
      |||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||    
T  33852250 gcacgcttaattgtgaagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatacatcttgttaatataggtagtaccaaacaattcttataagttttccttca 33852349  T
Q  221 accatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgcctta 320  Q
    |||||  |||||||||||| ||    ||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||     
T  33852350 accatacagtctcatacctgcacggtctcgggatccctctcattctggtgtgattcagttcctcttgaagttatcgggagccgctcattgtcgtgccttg 33852449  T
Q  321 tgcactggcgatcactc 337  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  33852450 tgcaccggcgaccactc 33852466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17103352 - 17103086
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggt-aacccatccaa 103  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  17103352 attgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcaacccatccca 17103253  T
Q  104 agagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 203  Q
    | | | |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17103252 aaattgctccaagtcaagcacgcttaaccgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcagcttgttgatataggcagtaccaaacaattc 17103153  T
Q  204 ttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatg 270  Q
    ||||||| || | |||||||||| ||||||||||||  |   |||||||||||||||||||||||||    
T  17103152 ttataagtcttccttcaaccatgcagtctcatacctgtacggcctcaggatctctctcattccgatg 17103086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 272
Target Start/End: Original strand, 10844491 - 10844758
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  10844491 attgtcgactgaccctacaaacaaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccgagaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 10844590  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | || ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  10844591 aattgcttcaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaactct 10844690  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtg 272  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||   |||||||| | ||||||||||| ||||    
T  10844691 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcaaggcctcaggaaccctctcattccggtgtg 10844758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 339
Target Start/End: Original strand, 22840486 - 22840739
Alignment:
Q  85 cggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatat 184  Q
    |||||||| ||||||||||||| || || |||||||  | | ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22840486 cggtaggtcacccatccaaagactaatctaagtcaagcatgatta-ctgtggagttcttatggaatgagctaacaaaaagaagatgcatcttgttgatat 22840584  T
Q  185 aggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctc 284  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22840585 agatagtaccaaacaattcttataagtcttcattcgaccatgtagtctcatacctacaaagcctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttactc 22840684  T
Q  285 tagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    |||||| | | |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  22840685 tagaagttatcgggagccgctcattatcgtgtcttatgcaccggcgaccactccc 22840739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 94 - 338
Target Start/End: Original strand, 6464875 - 6465119
Alignment:
Q  94 acccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtac 193  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6464875 acccatccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttgttatggaatgagctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtac 6464974  T
Q  194 caaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctg 293  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||   ||||| |||  |||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||    
T  6464975 caaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagttccatacctacacggcctcatgattcctctcattccaatgtgattcgattactctagaagttg 6465074  T
Q  294 ttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactcc 338  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  6465075 ttgggagccgctcattatcgtgccttgtgcaccggcgaccactcc 6465119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 28453593 - 28453275
Alignment:
Q  20 tacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtca 119  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||  ||||    ||||||| |  |||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  28453593 tacaaacaaacacgactcttttcagcatgttttgtcctcactcgcagtcttattaggaaacttccgagtaggtcatccatccaaagactactccaagtca 28453494  T
Q  120 ataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttc 219  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||    
T  28453493 agcacgcttaactgtagagttcttatggaatgggctaccataaagaagatgcatcttgttaatataggtagtataaaacaattcttataagttttctttc 28453394  T
Q  220 aaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgcctt 319  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28453393 aaccatgaagtctcatacctgcacgacctcgggatccctctcattccggtgtgattcag-tcatctaaaagttgtcgggagccgctcattgtcgtgcctt 28453295  T
Q  320 atgcactggcgatcactccc 339  Q
     ||||| ||| | |||||||    
T  28453294 gtgcaccggcaaccactccc 28453275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12100963 - 12100687
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12100963 agcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttacgaggaaacttcccggtaggtcacccatcc 12100864  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 201  Q
    ||| | | |||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  12100863 aaa-attgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggtagtaccaaacaaa 12100765  T
Q  202 tcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    |||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||  |   ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12100764 tcttataagcttgccttcaaccatgcagtctcatacctgtacggcctcaggatct-tctcatttcgatgtgattcagtt 12100687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 123 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10845035 - 10844819
Alignment:
Q  123 acgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaac 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  10845035 acgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaac 10844936  T
Q  223 catgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatg 322  Q
    |||| |||| ||||||| ||   |||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  10844935 catgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtg 10844836  T
Q  323 cactggcgatcactccc 339  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  10844835 caccggcgaccactccc 10844819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41913241 - 41913006
Alignment:
Q  4 cattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaa 103  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||| || |||||||    
T  41913241 cattgtcgactgaccctataaactaacacgagttttttcaacgtgttttgtcctcacttgcacgcttaccaagaaactttctagtaggtcactcatccaa 41913142  T
Q  104 agagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 203  Q
    ||| |||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41913141 agactacttcaagtcaagcacgcttaactgcggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagacgcatcttgttgatataggtagcaccaaacaattc 41913042  T
Q  204 ttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacct 239  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||    
T  41913041 ttataagccttctttcaaacatgcagtcccatacct 41913006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Original strand, 34308355 - 34308630
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||    
T  34308355 attgccgactgaccccacaaaccagcacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacatgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatctcaa 34308454  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | ||||||| |||  |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34308455 aattgctccaagccaagcacgcttaagtgtggagttcttatggaataggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacagttct 34308554  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||||||||| | |||||||||  |||||||||| |  |   |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  34308555 tataagccttccttcaaccatacagtctcatacttgtacggcctcaggatccctttcattccgatgtgattcagtt 34308630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25148236 - 25147962
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| || ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  25148236 attgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgacctcactcgcacgtttatcg-gaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 25148138  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25148137 aattgctcaaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaatatgcatcttgttgatataggtaagaccaaacaattct 25148038  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||||||||| | |||||| |   |||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  25148037 tataagccttccttcaacgacacagtcccatacctacacgacctcgggatccctctcattcttatgtgattcagtt 25147962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Original strand, 34308811 - 34309090
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||    
T  34308811 attgctgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacatgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatctcaa 34308910  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttg----atataggtagtaccaaacaa 200  Q
     | | ||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||     
T  34308911 aattgctccaagccaagcacgcttaactgtggagttcttatggaataggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatatataggtagtaccaaacag 34309010  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||||||||||||| | |||||||||  |||||||||| |  |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34309011 ttcttataagccttccttcaaccatacagtctcatacttgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcagtt 34309090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 197
Target Start/End: Original strand, 31283527 - 31283719
Alignment:
Q  4 cattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaa 103  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31283527 cattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgcgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatccaa 31283626  T
Q  104 agagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaa 197  Q
    | | | ||| |||||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31283627 a-attgctcaaagtcaagcacacttaactgtggagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaa 31283719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Original strand, 21316002 - 21316257
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||| | | || | |||||||||||||    
T  21316002 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccg-gaaacttcgcggtaggtcacccttaccaaaattactccaagtcaa 21316100  T
Q  121 taacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttca 220  Q
      || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | || |    
T  21316101 gcacacttaactgtggagttcttatgaaatgagctactgaaaagacgatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttttaagcgctcattta 21316200  T
Q  221 accatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattca 277  Q
    |||||  |||||||||||| ||   ||| |||||| |||||||  ||||||||||||    
T  21316201 accatacagtctcatacctgcacggccttaggatccctctcatcgcgatgtgattca 21316257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 30527354 - 30527689
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||||| | |||||||    
T  30527354 aagcattgtcgactgatcctacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttatcctcactcgcacgcttaccgggaagttttcaggtagatcacccatc 30527453  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| ||||| |||||||  |  ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  30527454 caaagattactcaaagtcaaacaatcttaactgtggagttcttatgaaatgggctacccaaaagaagatgtatcttattgatgtaagtggtaccaaacaa 30527553  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    |||||||||| ||   ||||| |||| |||||||||| |||    |||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| || || |  || |    
T  30527554 ttcttataagtct-ggttcaaacatgcagtctcatacgtac--ggcctcggaatccctctcattccagtgtgattcagttcatctataaactatcagggg 30527650  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||| |||||||||| || ||||| | ||| |||||||    
T  30527651 ccgctaattgtcgtgcattgtgcaccgacgaccactccc 30527689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 110 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25144937 - 25144767
Alignment:
Q  110 ctccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 209  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25144937 ctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgctgatataggtagtaccaaacaattcttataa 25144838  T
Q  210 gcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    |||| | ||||| |||| | || ||||||| ||  |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25144837 gcctgccttcaatcatgcaatcccatacctgcacgacctcgagatctctctcattctgatgtgattcagtt 25144767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 339
Target Start/End: Original strand, 27021904 - 27022093
Alignment:
Q  154 ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcagga 253  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  27021904 ctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcttatacctacatggcctcagga 27022003  T
Q  254 tctctc----tcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    || |||    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||  |||| |||||||    
T  27022004 tccctctcattcattccgatgtgattcggctcctctagaagttgtcgggagccactcattgtcgtgccttgtgcacccgcgaccactccc 27022093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 142 - 325
Target Start/End: Original strand, 28375067 - 28375250
Alignment:
Q  142 ttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctac 241  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| |    
T  28375067 ttatggaaagagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatgtaggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaatcatgcagtctcatacctgc 28375166  T
Q  242 ataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcac 325  Q
    |   |||||||||| ||||||||  | ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28375167 acggcctcaggatccctctcattatggtgtgattcgtttcgtctagaagctgtcgggagccgctaattgtcgtgccttgtgcac 28375250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 27819206 - 27819393
Alignment:
Q  89 aggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 188  Q
    |||| ||||||||||| | ||||| |||||||  || ||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27819206 aggtcacccatccaaatactactcaaagtcaaacacacttaactgtggagtttttatggaatgagctattgaaaagaagatgcattttgttgatataggt 27819305  T
Q  189 agtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattc 276  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| | ||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  27819306 agtaccaaacaattcttattagccttccttcaaccatgaagtctcatacttgcatgacttcatgatccctctcattctgatgtgattc 27819393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 32292211 - 32292096
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  32292211 attgccgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatccaaa 32292112  T
Q  105 gagtactccaagtcaa 120  Q
    || |||||||||||||    
T  32292111 gactactccaagtcaa 32292096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 15818892 - 15819121
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| |||  || ||||||| || | ||||  ||||||||||    
T  15818892 attgccgactggccccacaaaccaacacaagtcttttcagtgtgctttgtcctcactcgcacacttttcgggaaacttcccagaaggtcgcccatccaaa 15818991  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
    |  |||||||||||||  |   |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |    
T  15818992 gcctactccaagtcaagcaaatttaactgt-gagttcttatggaatgtgctaccgaaaagaagatgcatcatgttgatatatgtagtaccaaacaatttt 15819090  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcat 235  Q
    | ||||| | | ||||||||||| |||||||    
T  15819091 tctaagcattccttcaaccatgttgtctcat 15819121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 25308034 - 25307855
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  ||| || |||||||||||    
T  25308034 attgccgactgatcccataaatcaacacgagtcttttcagcgtactttgtcctcactcgcacgcttgccgaaaaactttcaagtacgtcacccatccaaa 25307935  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatatag 186  Q
    || ||| |||||||||  | |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25307934 gactacaccaagtcaagcaagcttaactgtggagttcttacagaatgggctaccaaaa--aagatgtatcttgttgatatag 25307855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3744799 - 3744671
Alignment:
Q  114 aagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcct 213  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  3744799 aagttaataaagcttaattgtagagttcttatgaaatgtgctaccaaaaagaaggtgcatattgttggtataggtagtgtcaaacaattcttataagtct 3744700  T
Q  214 actttcaaccatgtagtctcatacctaca 242  Q
     | |||||||||| |||| ||||||||||    
T  3744699 tccttcaaccatgcagtcccatacctaca 3744671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 280
Target Start/End: Original strand, 15567535 - 15567707
Alignment:
Q  108 tactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttat 207  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||    
T  15567535 tactccaagtcaaacacgattaactgcggagttcttatgaaatgaactaccaaaaagaagatgtatcttgttggtatatgtagtgtcaaacaattcttat 15567634  T
Q  208 aagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    |||||| | ||| ||||||  |||| |||| | |   |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15567635 aagccttccttccaccatgatgtctaatacttgcgcgatgtcaagatctctctcattccgatgtgattcagtt 15567707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1297185 - 1296943
Alignment:
Q  97 catccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaa 196  Q
    |||||||||| |||| ||||||||  || ||||||| | ||||||||||  |||| | |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  1297185 catccaaagattacttcaagtcaaacacacttaactatggagttcttatataatgggataccgaaaagaatataaatcttgttggtataggtagtaccaa 1297086  T
Q  197 acaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttg 296  Q
    ||||||||||||||  |   |||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| | | |||||| |  |||||||||  ||| || |||||||||||     
T  1297085 acaattcttataagttttacttcaaccatgcagtctcatacctgcatgatctcagaacccctctcactttgatgtgatttggttgct-tagaagctgtta 1296987  T
Q  297 ggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccct 340  Q
     ||||||| ||||||| || ||| ||||| ||  ||||||||||    
T  1296986 tgagccgcgcattgtcatgtcttgtgcaccggtcatcactccct 1296943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3745262 - 3745145
Alignment:
Q  114 aagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcct 213  Q
    |||||||  |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  |    
T  3745262 aagtcaagcacgcttgactgtggagttattatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatattgttggtataggtagtactaaacagttcttataagttt 3745163  T
Q  214 actttcaaccatgtagtc 231  Q
     | |||||||||||||||    
T  3745162 tccttcaaccatgtagtc 3745145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22705424 - 22705181
Alignment:
Q  26 ccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaag--------------agtact 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |  |||||| ||||||||| |||| |||||||              | ||||    
T  22705424 ccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactggcacgcttactggaaaacttcccggtaggtcacccgtccaaagctactcattcaaagactact 22705325  T
Q  112 ccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagc 211  Q
    |||||||||  ||||||||||||        ||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22705324 ccaagtcaagcacgcttaactgt--------tatggaatgggttaccaaaaaga---tgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataacc 22705236  T
Q  212 ctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattcc 266  Q
    || | ||||| |||  |||| ||||||||||   | |||||||| ||||||||||    
T  22705235 cttccttcaatcatccagtcccatacctacacggcttcaggatccctctcattcc 22705181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 178 - 325
Target Start/End: Original strand, 29971450 - 29971597
Alignment:
Q  178 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattca 277  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||  |||| |||||||||||    
T  29971450 ttgatatagatagtatcaaacaattcttataaatcttccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcctcaggatccttccaattctgatgtgattca 29971549  T
Q  278 gttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcac 325  Q
    |||| |||| || |||| |||| || ||||||| | ||||||||||||    
T  29971550 gttcgtctaaaaactgtcgggaaccactcattgccatgccttatgcac 29971597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 276
Target Start/End: Original strand, 30334916 - 30335055
Alignment:
Q  137 agttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcata 236  Q
    |||| ||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||| || |||| ||||    
T  30334916 agttattatgaattgagctatcgaaaagaagatgtatcttgttggtataggtagtatcaaacaatttttataagtcttctttcaaccttgcagtcgcata 30335015  T
Q  237 cctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattc 276  Q
    ||| || |  |||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  30335016 cctgcacagtctcaggatccatctaattccgatgtgattc 30335055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 6463415 - 6463507
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaa-ccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggt 92  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  6463415 aagcattgtcgactgaccctaaaaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaagttttctggtaggt 6463507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 6466820 - 6466647
Alignment:
Q  165 aagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcatt 264  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| |||  ||||||  || |  ||||| ||| ||||||||    
T  6466820 aagatgcatcttgttggtataggtagtaccaaacaatttttataagtctccttt-aaccatgcagttccatacccgcacagtctcagaatccctctcatt 6466722  T
Q  265 ccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    | ||| |||||  |||   || ||||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||    
T  6466721 ctgatatgatttggtttgcctggaagctgtcaggagctgctcattgtcatgccttgtgcactggcaaccactccc 6466647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 6466392 - 6466193
Alignment:
Q  139 ttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacc 238  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||| || ||||||||| |||||     
T  6466392 ttcttatgaaatga-ctaccaaaaggaagatgcaacttgttggtataagtagtaccaaacaattcatattagtatacttttaaacatgtagtcccataca 6466294  T
Q  239 tacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactcc 338  Q
    | ||    ||||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||   |||||  || |  ||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| ||||||    
T  6466293 tgcactctctcagaattcctctcattctgatgtgattcaatttgcctagacactatcaggagccgctcactgtcatgctttgtgcaccggcgaccactcc 6466194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10729893 - 10729722
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| |   || | || ||   |||| ||||||| |||    
T  10729893 attgccaactaactcttcaaaataacacgagtcttttcagcgtgctttgtccacactcgcacgctttctaggatatttcccataaggtcacccatcaaaa 10729794  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatctt 176  Q
    || ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||  |||| ||||||||||||    
T  10729793 gactactccaagtctatcacgcttaattgtggagttcttatggaatgggtaacagaaaacaagatgcatctt 10729722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 241
Target Start/End: Original strand, 28912847 - 28912962
Alignment:
Q  126 cttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccat 225  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||| | || |||||| |||||||||||||| |||| || || || || |||||||||||| | || ||||||| |||    
T  28912847 cttaactgtggagttattatagaatgggatatcaaaaataagatgcatcttgtcgatacagataatatcagacaattcttatatgacttctttcaatcat 28912946  T
Q  226 gtagtctcatacctac 241  Q
    | ||| ||||||||||    
T  28912947 gcagtgtcatacctac 28912962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 224
Target Start/End: Original strand, 15568035 - 15568100
Alignment:
Q  159 aaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaacca 224  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| || | ||||||||    
T  15568035 aaaaaaaagatgcatcttgttgatataggtcataccaaacaattgttataagtcttccttcaacca 15568100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 34688092 - 34688044
Alignment:
Q  19 ctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacg 67  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  34688092 ctacaaaccaacatgagtcttttcaacgtgttttgtcctcattcgcacg 34688044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 152
Target Start/End: Original strand, 29971308 - 29971448
Alignment:
Q  10 cgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagta 109  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| |||||| | |||||||||||| || ||| | |||  |||||| ||  | |||||| |||||| |||||| ||    
T  29971308 cgactgactttatagaccaacacgagttttttcagcatgttttgtcctcacttgcatgtttattgagaaattt--cagtaggtcacccatacaaagacta 29971405  T
Q  110 ctccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatga 152  Q
     ||||||||||  ||| ||||||||  |||| |||||||||||    
T  29971406 ttccaagtcaaacacgtttaactgtgaagtttttatggaatga 29971448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 179
Target Start/End: Original strand, 10729683 - 10729736
Alignment:
Q  126 cttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgtt 179  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10729683 cttaattgtggagtccttatggaataggctaccaaaaagaagatgcatcttgtt 10729736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17429611 - 17429539
Alignment:
Q  164 gaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || | |||||| ||| |||| ||||    
T  17429611 gaagatacatcttgttgatataggtagtaccaaataatactcataagtcttccttcaacaatgcagtcacata 17429539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 22840425 - 22840477
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcct 57  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22840425 attgtcgactgaccatacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcct 22840477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 44041933 - 44041842
Alignment:
Q  232 tcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgc 323  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||   ||| ||||||   ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  44041933 tcatacctacacaacctcatgatccctctcattctgatgtgattcggtttgcctataagctgccaggaaccgcacattgtcatgccttatgc 44041842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 43
Target Start/End: Original strand, 27021865 - 27021903
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttca 43  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27021865 attgccgactgacttcacaaaccaacacgagtcttttca 27021903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 29117502 - 29117444
Alignment:
Q  9 ccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacg 67  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||||||||    
T  29117502 ccgaccgaccctacaaaccaacacgagtcttttcaggatgatttgtcctcactcgcacg 29117444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 34687966 - 34687920
Alignment:
Q  139 ttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatata 185  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34687966 ttcttatggaataacctaccaaaaagaagatgcatctttttggtata 34687920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 210
Target Start/End: Original strand, 36968434 - 36968476
Alignment:
Q  168 atgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 210  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  36968434 atgcatcttgttgatataagtagcaccaatcaattcttataag 36968476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Original strand, 15567885 - 15567962
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactt 82  Q
    ||||||||||| | | ||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||  || |||||||||||    
T  15567885 attgccgactggccccacatactaacacgggtctttttaacgtgttttgtcctcactctcacattttccgagaaactt 15567962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 65
Target Start/End: Original strand, 12119229 - 12119273
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgca 65  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  12119229 acaaaccaacacgagtattttcaatgtgctttgtcctcactcgca 12119273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 10927279 - 10927613
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  10927279 attgtcgaccgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcattcacacgcttaccgaaaaacttcccggtcggtcacccatccaaa 10927378  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
    || |||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10927379 gactactccaagtcaagcacgtttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 10927478  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  10927479 tataagccttccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcctcaagatccctctcattccgatgtgattcggttcctctataagttgttgggagctgc 10927578  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  10927579 tcattgtcgtgccttgtgcaccgacgatcactccc 10927613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 17445331 - 17445665
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  17445331 attgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 17445430  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17445431 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggatttcttatggaatgagctaccgataagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 17445530  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17445531 tataagccttccttcaaccatgtagtcccatgcctacacggcctcaggatccctctcatttcgatgtgattcggttcctctagaagttgttgggagccgc 17445630  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    |||||| | |||||| ||||| | ||| |||||||    
T  17445631 tcattgccatgccttgtgcaccgtcgaccactccc 17445665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 42788522 - 42788855
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||    
T  42788522 attgtcgactgactccacaaaccaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcaagcttaccgagaaacttcccggtaggtcacctatcccaa 42788621  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42788622 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttgtggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 42788721  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  42788722 tataagtcttctttcaaccatgtagtcccaatcctacacggcctcaggatccctctcattccgttgtgattcggttcctctagaagttgtcgagagccgc 42788821  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  42788822 tca-tgttgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 42788855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 34371882 - 34371548
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||| ||    
T  34371882 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccagtaggtcacccatcccaa 34371783  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34371782 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggtgttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 34371683  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    | ||||| | | |||||||||| |||| || ||||  |   |||  ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  34371682 tttaagcattccttcaaccatgcagtcccacacctgtacggccttgggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgc 34371583  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  34371582 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 34371548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 9 - 339
Target Start/End: Original strand, 27646715 - 27647045
Alignment:
Q  9 ccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagt 108  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||  | ||||||| ||||||||| |||||| |||||| |    
T  27646715 ccgactgaccatacaaaccaacatgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacgtttattgggaaacttcccggtaggtcacccatgcaaagact 27646814  T
Q  109 actccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttata 208  Q
    |||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27646815 actccaagacaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgttataggtagtaccaaacaattcttata 27646914  T
Q  209 agcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcat 308  Q
    ||||| | ||||||||||||| | ||||||||||   ||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  27646915 agccttccttcaaccatgtagccccatacctacacggccctaggatccctctcattccgatgtgattcggttcctctagaagctgtcgggagccgcacat 27647014  T
Q  309 tgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    || |||||||| ||||| ||| | |||||||    
T  27647015 tggcgtgccttgtgcaccggcaaccactccc 27647045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 15512888 - 15513223
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||| ||    
T  15512888 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtattttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcatccatcccaa 15512987  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | || ||||||||  ||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15512988 aattgcttcaagtcaagcacgtttaattgtggagttcttatggaatgagataccaaaaagaagatgcatcttgttgatattggtagtacc-aacaattct 15513086  T
Q  205 tataagccta--ctttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagcc 302  Q
    ||||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||    
T  15513087 tataagcatattccttcaaccatgtagtcccatacctacacagcctaatgatccctctcattccgatgtgattcggttcctctaaaaactgtcgggagcc 15513186  T
Q  303 gctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  15513187 gctcattatcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 15513223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1822180 - 1821904
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  1822180 aagcattgttgaccgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcattcacacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatc 1822081  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1822080 caaagactactccaagtcaagcacgcttaaatgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 1821981  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattca 277  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||  |||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  1821980 ttcttataagccttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacgaccttaagatctctctcattccgatgtaattca 1821904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 53 - 339
Target Start/End: Original strand, 10926870 - 10927156
Alignment:
Q  53 gtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatga 152  Q
    |||||| ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  10926870 gtcctcactcacacgcttaccaggaaacttcccggtaggtcacccatccaaagactactccaagtcaagcacgtttaactgtggagttcttatggaatgg 10926969  T
Q  153 gctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcagg 252  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  10926970 actaccaaaaggaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacacgacctcagg 10927069  T
Q  253 atctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  10927070 atccctctcattctgatgtgattcggttcctctataagctgtcgggagctactcattgtcgtgccttgtgcaccgacgatcactccc 10927156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 20039348 - 20039676
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||| |||    
T  20039348 aagcattgccaactga-tcaacaaaccaacatgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccaataggtcaccaatc 20039446  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20039447 caaagactactctaagtcaagcacacttaactgtagagttcttatggaatgggctaccaaaa-gaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 20039545  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||    
T  20039546 ttcttataagccttccttcaactatgtagtcctatacctacacggcctcatgatccctctcattccgatgtgattcggtttgtctagaagctgtcgggag 20039645  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcga 331  Q
    | |||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  20039646 ctgctcattgtcatgccttgtgcaccggcga 20039676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2194077 - 2193752
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||            |||||| ||||||||    
T  2194077 agcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccg------------gtaggtcacccatcc 2193990  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 201  Q
     || | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2193989 caaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaat 2193890  T
Q  202 tcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagc 301  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||   ||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  2193889 tcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggcctcatgatccctctcattccggcgtgattcggttcctctagaagctgtcgggagc 2193790  T
Q  302 cgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  2193789 cgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 2193752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 39147206 - 39146875
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||||        || || |||||| |||||||    
T  39147206 aagcattgccgattgaccctacaaaccaacatgagtctttctagcgttttttgtcctctctcgcacgcttact-------ttcccagtaggtcacccatc 39147114  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
      | || |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  39147113 atacgactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttaatataagtagtatcaaacaa 39147014  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  39147013 ttcttataagtctaccttcaaccatgtagtcccatacctacacggcctcatgatccctctcatttcgatgtgattcagttcctctagaagttgtcaggag 39146914  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39146913 ccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgatcactccc 39146875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2474675 - 2474400
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  2474675 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttttcctcactcgcatgcttaccgggaaactttccggtaggtcacccatctcaa 2474576  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2474575 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 2474476  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    | |||| || | |||||||||| |||| |||| ||  |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2474475 tttaagtcttccttcaaccatgcagtcccatatctgtacgaccttaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 2474400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 277
Target Start/End: Original strand, 3886477 - 3886749
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3886477 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactgggaaacttcccggtaggtcacccatccaaa 3886576  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | ||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3886577 aattgctccacgtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattca 3886676  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattca 277  Q
    ||||||| | | ||| |||||| |||| ||||| |  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3886677 tataagcattccttctaccatgcagtcccatacttgtacgacctcaggatccctctcattccgatgtgattca 3886749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 277
Target Start/End: Original strand, 8641911 - 8642182
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||  ||    
T  8641911 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaaacttcccg-taggtcacccatcttaa 8642009  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8642010 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattct 8642109  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattca 277  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||   ||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  8642110 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggccttaggatccctctcattctgatgtgattca 8642182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 49 - 337
Target Start/End: Original strand, 21886066 - 21886354
Alignment:
Q  49 ttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatgga 148  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||| || | | |||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||    
T  21886066 ttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccagtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacacttaactttggagttcttatgga 21886165  T
Q  149 atgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacct 248  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| || |||||    
T  21886166 atgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatatgtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacaacct 21886265  T
Q  249 caggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactc 337  Q
    ||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  21886266 caggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctaccaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactc 21886354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 189322 - 189063
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||||    
T  189322 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccgggaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 189223  T
Q  121 taacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttca 220  Q
      | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  189222 gcatgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatacatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttca 189123  T
Q  221 accatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    |||||| |||| ||||| |  |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  189122 accatgcagtcccatacatgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcagtt 189063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 34372338 - 34372004
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||  |||||| ||||||||| ||| |||| ||    
T  34372338 attgccgactgacgccataaaccaacacgagtattttcagcgtgttttttcctcactcgcacgcttatcggaaaacttcccggtaggtcaccaatcccaa 34372239  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34372238 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 34372139  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    | ||||| | | ||||||||||||||| ||||| |  |   |||  ||| | ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  34372138 tttaagcattccttcaaccatgtagtcccatacttgtacggccttgggaaccctctcattctggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgc 34372039  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  34372038 tcattgtcctgccttgtgcaccggcgaccactccc 34372004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22556807 - 22556531
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtctttt-caacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaa 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |    
T  22556807 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttacagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaaacttcctggtaggtcacccatccca 22556708  T
Q  104 agagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 203  Q
    | | | ||||||||||   ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22556707 aaattgctccaagtcagccacgcttaactgtgaagttcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 22556608  T
Q  204 ttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
     ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||   |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22556607 atataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccgatgtgattcagtt 22556531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Original strand, 3886933 - 3887208
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || |||||| |||||||||||    
T  3886933 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttgtcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactgggaaacttcccagtaggtcacccatccaaa 3887032  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  3887033 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaatgagttaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaataattca 3887132  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    |||||| || | |||||||||| |||| |||||||  |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3887133 tataagtcttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacggcctcaggatcactctcattccgatgtgattcagtt 3887208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22557240 - 22556964
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtctttt-caacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaa 103  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  22557240 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttacagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatccca 22557141  T
Q  104 agagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 203  Q
    | | | ||||||||||   ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22557140 aaattgctccaagtcaggcacgcttaactgtgaagttcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatattggtagtaccaaacaattc 22557041  T
Q  204 ttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
     ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||   ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22557040 atataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcatgaactctctcattccgatgtgattcagtt 22556964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2474219 - 2473954
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||          ||||| |||||||| ||    
T  2474219 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggga----------taggtcacccatcccaa 2474130  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2474129 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggcagtaccaaacaattct 2474030  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||| |||  |  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2474029 tataagccttccttcaaccatgcagtctcatgcctgtacgaccttaggatccctctcattccgatgtgattcagtt 2473954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 29679979 - 29680236
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| || |||||||  ||| |||| |||||||    
T  29679979 aagcattgccgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcatttgcacgcttatcgggaaacttctcggaaggtcacccatc 29680078  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         
T  29680079 caaagactactccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatgtaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtattacca----- 29680173  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattc 265  Q
      ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  29680174 --cttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacacggcctcaagatctctctcattc 29680236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 285
Target Start/End: Original strand, 8391203 - 8391477
Alignment:
Q  10 cgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagta 109  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| || | |     
T  8391203 cgactgaccccacaaatcaacacgagtcttctcagcgtgttttgtcctcactcgcacgtttatcgagaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattg 8391302  T
Q  110 ctccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 209  Q
    |||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  8391303 ctccaagtcaagcacgcttaactatggagttcttatggaattagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatacagg-agtaccaaacaattcttataa 8391401  T
Q  210 gcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctct 285  Q
    | || | ||||| ||||||||||||| ||||||   |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8391402 gtcttccttcaatcatgtagtctcatgcctacacggcctcagaatccctctcattccgatgtgattcggtttctct 8391477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 123 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 34867942 - 34867734
Alignment:
Q  123 acgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaac 222  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34867942 acgcttaactatggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaac 34867843  T
Q  223 catgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatg 322  Q
    |||| |||| ||||||| ||   |||||||| | ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  34867842 catgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcttctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtg 34867743  T
Q  323 cactggcga 331  Q
    ||| |||||    
T  34867742 caccggcga 34867734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18304679 - 18304367
Alignment:
Q  27 caacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgc 126  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||  || | | |||||||  |   |||| |||||||  || | | |||||||||||  | ||    
T  18304679 caacacgagtttgttcagcgtgttttgtcctcactcgcacaatttctgtgaaacttctcaaaaggtcacccatcacaaaattgctccaagtcaaacatgc 18304580  T
Q  127 ttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatg 226  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    ||| |||||    
T  18304579 ttaactgtggaattcttatggaatgagctaccgaaaagaatatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatttatataagcttttcatcatccatg 18304480  T
Q  227 tagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcact 326  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  18304479 tagtcccatacctacacgacctcaggatccttctcattccgttgtgatttggttcgtctagaagctgtcgggagccgctcattgtcgtgtcttgtgcacc 18304380  T
Q  327 ggcgatcactccc 339  Q
    |||||||||||||    
T  18304379 ggcgatcactccc 18304367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 237
Target Start/End: Original strand, 24182138 - 24182353
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaa 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||   | |||| |||||||| || | | |||||||||||    
T  24182138 acaaaccaacacgaatcttttcaacgtgttttatcctcactcgcacactttccgagaaactttttagaaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 24182237  T
Q  121 taacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttca 220  Q
      ||||||||||||  |||| ||||||  || | ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  24182238 ccacgcttaactgttaagttattatggtttggggtacc-gaaagaagatgcatcttgttggtatagatagtaccaaataattcttataagccttccttca 24182336  T
Q  221 accatgtagtctcatac 237  Q
    ||||| | |||||||||    
T  24182337 accatttcgtctcatac 24182353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 261
Target Start/End: Original strand, 18750078 - 18750328
Alignment:
Q  11 gactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtac 110  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| |  | |||||| |  | |||| |||||||| || | | |    
T  18750078 gactgaccccacaaaccaactcgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacactttctaaaaaacttcctagaaggtcacccatcctaaaattgc 18750177  T
Q  111 tccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 210  Q
    ||||||||||  ||| |||| | | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  18750178 tccaagtcaagtacgattaattatggagttcttatggaataagctaccgaaaagaagatgcatctttttggtataggtagtaccaaacaattgttataat 18750277  T
Q  211 cctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctc 261  Q
    ||| | |||||||||| |||  || |||| ||  || ||||||||||||||    
T  18750278 ccttccttcaaccatgcagttccaaacctgcacgacttcaggatctctctc 18750328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 275
Target Start/End: Original strand, 30684476 - 30684702
Alignment:
Q  49 ttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatgga 148  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||||||||||| | | |||| |||||||| || | | ||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||||     
T  30684476 ttttgtccttactcgcacgcttttcgagaaacttttcagaaggtcacccatcccaaaattgctccaagttgagcacgcttaactgtggagttcttatggt 30684575  T
Q  149 atgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacct 248  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||  ||  ||||| | || |||||    
T  30684576 ttgacctaccgaaaagaagatgcatcttgtttttatagatagtaccaaacaattcatataagcctcccttcaacaatgatgttccatacttgcacaacct 30684675  T
Q  249 caggatctctctcattccgatgtgatt 275  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||    
T  30684676 caggatccccctcattccgatgtgatt 30684702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 1880350 - 1880025
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||   |||||| |  ||| || | | |||    
T  1880350 aagcattgtcgacggaccttacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgctcgcttaccataaaacttcctagtaagtcatctatc 1880251  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||| | ||| |||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||   ||||    
T  1880250 caaatattacaccaactcatgcacgcttaactgtagagttcttgtggaatagactaccaaaaagaatatgcat-ttgttaatataggaagtactggacaa 1880152  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    ||||||     || | |||||||||| |||| |||| || ||    |||  |||| ||||||||| | |||||||  |||  |||||||| |||||||||    
T  1880151 ttctta----acttccttcaaccatgcagtcacataactgcacggtctcgagatccctctcattctggtgtgatttggtttgtctagaagttgttgggag 1880056  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcga 331  Q
     | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1880055 tcactcattgtcgtgccttatgcaccggcga 1880025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 276
Target Start/End: Original strand, 30719799 - 30719952
Alignment:
Q  123 acgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaac 222  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  30719799 acgcttaattgtggagttcttatggtttgacctaccgaaaagaagatgcatcttgtttttataggtagtaccaaacaattcatataagccttccttcaac 30719898  T
Q  223 catgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattc 276  Q
     |||  ||| ||||| | || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  30719899 aatgatgtcccatacttgcacaacctcaggatccctctcattctgatgtgattc 30719952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 339
Target Start/End: Original strand, 4657992 - 4658202
Alignment:
Q  128 taactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgt 227  Q
    |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  || | ||||||||||     
T  4657992 taactgtgaagttcttatggaatggactaccaaaaagaagatgcatgttgttgttataggtagtatcaaacaagtcttataa-tcttcgttcaaccatga 4658090  T
Q  228 agtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactg 327  Q
    |||||||||||| ||     ||| |||| |||| ||| |||||||||||||||   ||||| |||||  |||| || |||||||| ||| ||||||||||    
T  4658091 agtctcatacctgcacggtttcaagatccctcttatttcgatgtgattcagtttgcctagaggctgtcaggagtcggtcattgtcatgcattatgcactg 4658190  T
Q  328 gcgatcactccc 339  Q
    |||| |||||||    
T  4658191 gcgaccactccc 4658202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 195
Target Start/End: Original strand, 11757157 - 11757347
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| | ||  ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||   |    
T  11757157 attgccgactgaccccgcaaaccaacaagagtcttttaagcggatttcgtcctcactcacacgcttaccgaaaaatttcccggtaggtcacccatctcga 11757256  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacca 195  Q
     | | ||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11757257 aattgctgtaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggattgaactaccgaaaagaagatgcattttgttgatataagtagtacca 11757347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 137 - 276
Target Start/End: Original strand, 2058664 - 2058803
Alignment:
Q  137 agttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcata 236  Q
    ||||||||||||||| ||||   || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||| |||  |||||||||    
T  2058664 agttcttatggaatgtgctatttaacagaatttgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcatataagtcttccttcaatcatccagtctcata 2058763  T
Q  237 cctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattc 276  Q
     || ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2058764 gctgcatgacttcaggatctctctcaatccgatgtgattc 2058803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 309
Target Start/End: Original strand, 11160694 - 11160861
Alignment:
Q  142 ttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctac 241  Q
    ||||||||||| ||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||    
T  11160694 ttatggaatgaactacgtgaaagaatatgcatcttgttgacatagatagtaccaaacaattattataagccttccttcaactatgtagtgtcatacctac 11160793  T
Q  242 ataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcatt 309  Q
    |  || ||| |||| ||||||||||||||  |||| |||| |||| ||  ||| || |||||||||||    
T  11160794 acgacttcatgatccctctcattccgatgcaattcggttcatctaaaaattgtcggaagccgctcatt 11160861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 273
Target Start/End: Original strand, 16370732 - 16370852
Alignment:
Q  153 gctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcagg 252  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||| ||||||||||  | |||||    
T  16370732 gctaccaaaaagaagatacgtcttgttgatataagtagtaccaaacaattcttataagttttccttcaaccatgcagtcttatacctacatggcatcagg 16370831  T
Q  253 atctctctcattccgatgtga 273  Q
    | | |||||||| ||||||||    
T  16370832 aaccctctcatttcgatgtga 16370852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 230
Target Start/End: Original strand, 4673466 - 4673572
Alignment:
Q  124 cgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaacc 223  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| || | ||||| |    
T  4673466 cgcttaactgtggagttcttatggaatgaaataccaaaaagaatatgcatcttgttgatacaggtgctaccaaataattcttataagacttccttcaatc 4673565  T
Q  224 atgtagt 230  Q
    |||||||    
T  4673566 atgtagt 4673572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 20858434 - 20858625
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaa 120  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||||  |   |||||| || | |||| |||   ||||||  | |||||||||||    
T  20858434 acaaatcaacacgagtattttcagcgtgttttgtcctcactagcatgcttttcagaaaacttcccagaaggtcaccatcccaaagt-tgctccaagtcaa 20858532  T
Q  121 taacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcct 213  Q
      |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  20858533 gcaaccttaactatggagttcttatggaatgagctacagaaaagaagaagcatcttgttgatatagaaaataccaaacaattcttataagcct 20858625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 339
Target Start/End: Original strand, 5066858 - 5067100
Alignment:
Q  96 ccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacca 195  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||  ||| |||| ||| ||||| ||||| |||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  5066858 ccattcaaagactactccaaggcaaacacgtttaattgtggagtttttatgaaatagactaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatatagataatacca 5066957  T
Q  196 aacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgtt 295  Q
    |||||||||||||||  | | || || |||  |||||||||| | ||   |||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||  |||||||| ||      
T  5066958 aacaattcttataagttttcctttaatcatacagtctcatacatgcacggcctcgggatctctctcattctggtgtgattcgatttgtctagaagttg-c 5067056  T
Q  296 gggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    | |||||||||||||| ||| |||  |||| ||||| |||||||    
T  5067057 gagagccgctcattgttgtgtcttgcgcaccggcgaccactccc 5067100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 42429283 - 42429129
Alignment:
Q  137 agttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcata 236  Q
    |||||||||| || | |||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||  || ||||    
T  42429283 agttcttatgtaacgggctacggaaaagaatatgcatattgttgataaaggtagtaccaaacaattcttataagtcctccttcaaccatgtgttcacata 42429184  T
Q  237 cctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagct 292  Q
    ||||||    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  42429183 cctacacggtctcaggatc-ctcttattccgatgtgattcggttcgtctaaaagct 42429129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8366729 - 8366595
Alignment:
Q  10 cgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagta 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||  |  |||||| || |||||| ||||||||||| | ||    
T  8366729 cgactgac-ctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcgtcactcac-cgcttattggaaaacttcccagtaggtcacccatccaaatacta 8366632  T
Q  110 ctccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatg 146  Q
    || ||| ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  8366631 cttcaaatcaaacacgcttaactatagagttcttatg 8366595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 311
Target Start/End: Original strand, 32574639 - 32574840
Alignment:
Q  110 ctccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 209  Q
    |||||||||||  |||||||||| |  |||| |||| |  || ||||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  32574639 ctccaagtcaagcacgcttaactatgaagttattatagtttgggctaccaaaagaaagatgcattttgtttgtataggtagtaccaaacaattcctataa 32574738  T
Q  210 gcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgt-gattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcat 308  Q
    |||| |||| |||| || |||||||||||||||  || || | | | || |||||| ||| | ||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  32574739 gccttcttt-aaccgtgcagtctcatacctacacgacatctgaaaccctttcattctgatttggatttggttcgtctagaagctgtcaggagccgctcat 32574837  T
Q  309 tgt 311  Q
    |||    
T  32574838 tgt 32574840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 70
Target Start/End: Original strand, 30684887 - 30684952
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgctt 70  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30684887 attgccgattgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcgcttgcacgctt 30684952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 70
Target Start/End: Original strand, 30720136 - 30720201
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgctt 70  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30720136 attgtcgattgactccacaaaccaacaggagtcttttcagcgtgttttgtcctcgctcgcacgctt 30720201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 187810 - 187718
Alignment:
Q  23 aaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  | ||| || || ||| |||||| ||||||||    
T  187810 aaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaacttctcagtatgtcacacattcaaagactactccaa 187718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 38063701 - 38063803
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||||| || |||||| |||||||    
T  38063701 aagcattgtcgaatgaccctacacaccaacacgagt-ttttcagcgtattttgtcctcattcgcacgcttaccggaaaacttcccagtaggtcacccatc 38063799  T
Q  101 caaa 104  Q
    ||||    
T  38063800 caaa 38063803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 273
Target Start/End: Original strand, 43356650 - 43356762
Alignment:
Q  159 aaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctct 258  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | |   |||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||| | ||    
T  43356650 aaaaagaagatgcatattgttggtttaggttgtaccaaacaattcttataagtc-atcctcaatcatgcagtctcatacctgcatgatctcagga-ccct 43356747  T
Q  259 ctcattccgatgtga 273  Q
    |||||||||||||||    
T  43356748 ctcattccgatgtga 43356762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 280
Target Start/End: Original strand, 22975076 - 22975161
Alignment:
Q  195 aaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||||||| |||| ||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22975076 aaacaattcttataagcttttcttcaaccatgcagtcacatacctgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcagtt 22975161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 39801498 - 39801571
Alignment:
Q  165 aagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattctta-taagcctactttcaaccatgtagtctcatac 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| || |||| |||||| |||||||||||    
T  39801498 aagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacgatttttagaaagtcttcttttaaccatatagtctcatac 39801571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Original strand, 5785902 - 5785954
Alignment:
Q  123 acgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatct 175  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5785902 acgcttaactgtggagttcttacggaacgagctaccaaaaagatgatgcatct 5785954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 273
Target Start/End: Original strand, 21041550 - 21041668
Alignment:
Q  155 taccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggat 254  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  | ||| || ||| ||| |||||||||||   | | ||||| |||||| |||||||| |||| ||||| |  ||    
T  21041550 taccaaaaagacgatgcatcttgtttgtgtagataatactaaataattcttataaattttcattcaaacatgtaatctcatacttacacaacctgataat 21041649  T
Q  255 ctctctcattccgatgtga 273  Q
     ||||||||||||||||||    
T  21041650 atctctcattccgatgtga 21041668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 54
Target Start/End: Original strand, 21883961 - 21884010
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgt 54  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21883961 attgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgt 21884010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 5786101 - 5786062
Alignment:
Q  19 ctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctc 58  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5786101 ctacaaaccaatacgagtcttttcaatgtgttttgtcctc 5786062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 34868032 - 34867979
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccg 74  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||  || ||||||||||||    
T  34868032 acaaatcaacacgagtctttttagcgtgttttgtccttacttgcacgcttaccg 34867979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 59)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20850591 - 20850258
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  20850591 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 20850492  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20850491 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacaaaacaattct 20850392  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||   ||||| || | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20850391 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcatgaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgc 20850292  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactcc 338  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  20850291 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactcc 20850258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 11062555 - 11062222
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| | | |||||| |||||||||||||| ||| |  | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11062555 attgccgactgactctataaatcaacacaaattttttcagcgtgttttgtcctcactcacgggtttatcgggaaactttccgataggtcacccatccaaa 11062456  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11062455 gactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacaaaacacttct 11062356  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  11062355 tataagccttccttcaaccatgtagtttcatacctacacagcctcaggatc-ctctcatgtcgatgtgattcggttcctctagaaactgtcgggagccgc 11062257  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || |||||||    
T  11062256 tcattgtcgtgccttgtgcaccggtgaccactccc 11062222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 20126054 - 20126392
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||   |||||||  |||||     
T  20126054 aagcattgtcgacggaccctacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacgcttactgggaaacttctaggtaggtcgcccatt 20126153  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20126154 caaagactactccaagtcaagcacgcttaattgtggaattcttatggaatgtgctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacca 20126253  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||  ||||    
T  20126254 ttcttataagccttccttcaaccatgtagtctcatacctacacagccttaggatccctctcattccgatgtgattcagcttgtctagaagttgtcaggag 20126353  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  20126354 ccgctcattgtcatgccttgtgcaccggcgaccactccc 20126392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 23986193 - 23986527
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || | |||| |||||||| ||    
T  23986193 attgccgactgaccccacaaaccaacacaagtcttttcagcgtgtcttctcctcactcgcacgctttccgtgaaacttcccagaaggtcacccatcccaa 23986292  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  || |||||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23986293 aattgctccaagtcaagcacacttaactgtgaagttcttatggtttgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttcatataggtagtaccaaacaattct 23986392  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23986393 tataagcctaccttcaaccatgtagtcccatacctacacggcctccggatccctctcattccgatgtgattcggttcctctagaagctgtcgggagccgc 23986492  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    |||||||| |||||| ||||| | ||| |||||||    
T  23986493 tcattgtcatgccttgtgcaccgacgaccactccc 23986527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9352332 - 9352062
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||    
T  9352332 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaaacttccaggtaggtcacccatcccaa 9352233  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  9352232 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtttatataggtagtaccaaacaaatat 9352133  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgatt 275  Q
    |||||| || | ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  9352132 tataagtctcccttcgaccatgtagtctcatacctacacagcctcaggatccctctcatttcgatgtgatt 9352062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 337
Target Start/End: Original strand, 20896563 - 20896896
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttg-tcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaa 103  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||| ||||||| |||| || ||||||||| |||||||| |    
T  20896563 attgccggctgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagtgtgtttttctcctcactcgcacacttaccgggaaatttcccggtaggtcacccatccca 20896662  T
Q  104 agagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 203  Q
    | | | ||||||| |||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20896663 aaattgctccaagccaagcacgcttaaccgtggagttcttatggaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 20896762  T
Q  204 ttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccg 303  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||||||||||||||| | |  |||||||| ||| ||||||||    
T  20896763 ttataagccttccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcctaaggatccctctcattccgatgtgattcggcttgtctagaagttgtcgggagccg 20896862  T
Q  304 ctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactc 337  Q
    ||||||||| |||||| ||||  ||||| |||||    
T  20896863 ctcattgtcatgccttgtgcaacggcgaccactc 20896896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Original strand, 17027407 - 17027682
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  17027407 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 17027506  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17027507 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgaatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 17027606  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||   |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17027607 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctctggatccctctcattccgatgtgatttagtt 17027682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 21312245 - 21311910
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||  ||| ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||    
T  21312245 aagcattgtcgactgaccctacaaaccaacaccagtcttttcaatgtgttttgtcttcacttacacacttaccgggaaacttcccggtaggtcactcatc 21312146  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
      |||| | |||||||||||  ||| |||||| | || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21312145 ataagactgctccaagtcaagcacgtttaactatggatttcttatgaaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacctaacaa 21312046  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| || | ||||| || | ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  21312045 ttcttataagccttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacagcctcatgaaccctctcattctggtgtgattcagttcctttagaagctatcgggag 21311946  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcact 336  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  21311945 tcgctcattgttgtgccttgtgcactggcgaccact 21311910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13493060 - 13492784
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgtttt-gtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaa 103  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |    
T  13493060 attgctgactgaccctacaaatcaacacgagtcttttcagcatgtttttgtcctcactcgcacgcttaccgggtaactttccggtaggtcacccatccca 13492961  T
Q  104 agagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 203  Q
    | | | ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13492960 aaattgctctaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaatta 13492861  T
Q  204 ttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  13492860 ttataagccttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacagcctcaggatccttctcattccgatatgattcagtt 13492784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Original strand, 13191389 - 13191664
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||| ||| |||||||  ||    
T  13191389 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagtgtattttgtcctcactcgcacgcttatcgggaaacttcccggttggtcacccatctcaa 13191488  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13191489 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaacgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 13191588  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13191589 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctacatagtcttaggatccctctcattccgatgtgatttagtt 13191664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 23776710 - 23776397
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||   ||||||| || |||||| | |||||| ||    
T  23776710 attgccgactgactccacaaaccaacacgaatcttttcagcgtgttttgtcgtcactcgcacgtttactaggaaacttcccagtaggtcatccatcccaa 23776611  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23776610 aattgctccaagtcaagtacgcttaa-tgtgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccagacgattct 23776512  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    |||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23776511 tataagtcttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggcctcaggatacctctcattccggcgtgattcagttcctctagaagctgtcggaagccgc 23776412  T
Q  305 tcattgtcgtgcctt 319  Q
    |||||||||| ||||    
T  23776411 tcattgtcgtacctt 23776397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 127 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3652634 - 3652422
Alignment:
Q  127 ttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatg 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3652634 ttaactgtggagttcttatggaatgaactaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcagacaattcttataagccttccttcaaccatg 3652535  T
Q  227 tagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcact 326  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  3652534 tagtcccatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtgattcggttcctctagaagctgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcacc 3652435  T
Q  327 ggcgatcactccc 339  Q
    | ||| |||||||    
T  3652434 gacgaccactccc 3652422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 2720435 - 2720774
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||  || || |||||||    
T  2720435 aagcattgccgactgaccctgcaaaccgacacgagtcttctcagcgtgttttgttctcactcgcacgcttatcgggaaacttcccaatatgtcacccatc 2720534  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctacc-aaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaaca 199  Q
    |||||| |||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2720535 caaagactactccaagtcaagcacacttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaaaaaagatgtgtcttgttaatataggtagtaccaaaca 2720634  T
Q  200 attcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttggga 299  Q
    ||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||| ||  ||||  ||||| ||||||||||| | |||||  |||| ||||||||||||  | |    
T  2720635 attcttataagtcttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacgaccttgggatccctctcattccggtatgatttggttcgtctagaagctgtccgaa 2720734  T
Q  300 gccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||    
T  2720735 gtcgctcattgtcgtgacttgtgcaccggcgaccactccc 2720774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 17851188 - 17850857
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||| |||   ||||||| || ||||||  ||||||| ||    
T  17851188 attgccgattgaccctacaaaccaacacgagtcttttcgacttgttttgtcctaactcgcacgcgtactaggaaacttcccagtaggtctcccatccgaa 17851089  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  17851088 gactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatagaatgggctaccagaaagaagatgcatcttgttgataaaggtagtaccaaacatatct 17850989  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||| ||| | |||| ||||||| |||| ||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| || ||||||    
T  17850988 tatcagcattcttttaaccatgcagtcccatacttgcacgacctcaggatccctctcattccggtgtgattcggttcgtctagaagttgtcggaagccgc 17850889  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcact 336  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  17850888 taattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccact 17850857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 2681096 - 2681426
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||   ||||||| || |||    |||||||| ||    
T  2681096 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttctcaacgtgttttgtcctcacttgcacgcttactaggaaacttcccagta----acccatcccaa 2681191  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | |  ||||| | ||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2681192 aattgttccaaattaagcacgcttaattgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatgggtagtaccaaacaattct 2681291  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    |||||| || | |||||||||| |||| || |||||||   |||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  2681292 tataagtcttcattcaaccatgcagtcccaaacctacacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaaactgtcaggagccgc 2681391  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| || || ||||| |||||||    
T  2681392 tcattgtcgtgccttgtgtaccggcgaccactccc 2681426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 27 - 339
Target Start/End: Original strand, 6330811 - 6331122
Alignment:
Q  27 caacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgc 126  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||| || || |||||||||| |||||  |||| ||||||| ||| |||  |||| ||||| |||||||  ||||    
T  6330811 caacacgagtctttctcgcgtgttttgtcatcacttgcacgcttactgagaatttttc-ggtaggtcaccaatcataagaatactcaaagtcaagcacgc 6330909  T
Q  127 ttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatg 226  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  6330910 ttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatattgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatg 6331009  T
Q  227 tagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcact 326  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |  |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  6331010 tagtctcatacctacacggcctcaggatccatctcattccgatgtgattcggcttgtctagaagttgtcgggagccgctcattgtcatgccttgtgcacc 6331109  T
Q  327 ggcgatcactccc 339  Q
    ||||| |||||||    
T  6331110 ggcgaccactccc 6331122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 340
Target Start/End: Original strand, 14771594 - 14771930
Alignment:
Q  4 cattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaa 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |  |||||| |  |||||| || |||||||    
T  14771594 cattgtcgactgactctacaaaccaacatgagtcttatcagcgtgttttgtcctcgctcgtacgtttactggtaaacttccgagtaggtcactcatccaa 14771693  T
Q  104 agagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 203  Q
    ||| ||||||| ||| |  || ||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14771694 agactactccacgtctagcacacttaactgtggagttcttatggaatagattaccaaaaagaatatggatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 14771793  T
Q  204 ttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccg 303  Q
    ||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||   | || ||||| |||||||||||  |||||||  ||| || ||||||||| ||||| ||    
T  14771794 ttataagtcttccttcaaccatgcagtctcatacctacacggcttcgggatccctctcattccggcgtgattcgcttcatcaagaagctgtcgggagtcg 14771893  T
Q  304 ctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccct 340  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  14771894 ctcattgtcgtgccttgcgcaccggcgatcactccct 14771930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7912148 - 7911873
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||    
T  7912148 attgtcgactgaccccacaaaccaacacaagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccgagaatcttcccggtaggtcacccatcccaa 7912049  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7912048 aattgctccaagtcaagcaagcataactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 7911949  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||||||  | | |||||||||| ||||  |||||| ||   ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7911948 tataagttttccttcaaccatgcagtcctatacctgcacggcctcgagatccctctcattccgatgtgattcagtt 7911873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 277
Target Start/End: Original strand, 17730985 - 17731261
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||  ||    
T  17730985 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtctttttagcgtgttttgtcctcacttgcacgcttaccgataaactttccggtaggtcacctatctcaa 17731084  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgc----atcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
     | | |||||||||||  |||||||| ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17731085 aattgctccaagtcaagcacgcttaaatgtggagttcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatctatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 17731184  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattca 277  Q
    |||||||||| || | || ||||||| |||| |||||||  |   |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17731185 ttcttataagtcttcctttaaccatgcagtcccatacctgaacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattca 17731261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21311789 - 21311452
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||| |||||||  |||| | ||||||||| |||||||    
T  21311789 aagcattgtcgattgaccctacaaaccaacacgagtccttacagcgtgttttgtcttcactcgcacacttaccggaaaacatcccggtaggtcacccatc 21311690  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
      |||| ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||    
T  21311689 ataagactactcaaagtcaagcacgcttaactgcggagttcttatggaatgagcttccaaaaagaagatggatcttgtttatctaggtaataccaaacaa 21311590  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    |||||||||| || | |||||||||| |||| ||||| |  |   ||||| || | ||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | | ||     
T  21311589 ttcttataaggcttccttcaaccatgcagtcccatacttgtacggcctcatgaaccctctcattccgatgtgattcgttttctctagaagctttcgagaa 21311490  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactcc 338  Q
    || ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  21311489 cctctcattgtcgttccttgtgcaccggcgaccactcc 21311452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Original strand, 2890715 - 2891033
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||  | |||||| |||||||| |     
T  2890715 attgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtctttttagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcgggaaacttctcagtaggtcacccatcctag 2890814  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | || | ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  2890815 tactatttcaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctactgaaaagaagaagcatctttttgatataggtagtccctaacaattct 2890914  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||| ||| | |||||||||| |||| ||||||| ||   |||| ||||| |||||||||  |||||||||  ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  2890915 tataaaccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcgggatc-ctctcattctaatgtgattcgattcctctagaa-ctgtcaggagccgc 2891012  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcac 325  Q
    ||||||||||| ||| |||||    
T  2891013 tcattgtcgtggcttgtgcac 2891033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13492603 - 13492394
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgt-cctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaa 103  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  13492603 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttttttcctcactcgcacgcttactgggaaacttcccggtaggtcacccatccca 13492504  T
Q  104 agagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 203  Q
    | | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13492503 aaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaattagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtaatatcaaacaattc 13492404  T
Q  204 ttataagcct 213  Q
    ||||||||||    
T  13492403 ttataagcct 13492394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 76 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16520167 - 16519967
Alignment:
Q  76 gaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatct 175  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||  || | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16520167 gaaacttcccggcaggtcacccatctcaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatct 16520068  T
Q  176 tgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgatt 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16520067 tgttgatataggtagtaccaaacaaatctcataagccttccttcgaccatgtagtctcatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtgatt 16519968  T
Q  276 c 276  Q
    |    
T  16519967 c 16519967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7912580 - 7912305
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||| || | |||| |||||| | ||    
T  7912580 attgccgactaaccccacaaaccaacatgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgtacgcttaacgggaaacttcccagcaggtcacccattccaa 7912481  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7912480 aattgctccaagtcaagcacgtttaactatggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattca 7912381  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||||||  | | |||||||||| |||| ||||||| ||   ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7912380 tataagttttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcgagatccctctcattccgatgtgattcagtt 7912305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 17851638 - 17851313
Alignment:
Q  11 gactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtac 110  Q
    |||||||  |||||||||| |||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||| || |  |||| | ||  ||| | |||||||| |||| |||    
T  17851638 gactgaccttacaaaccaatacgattctttttaccgtgttttgccctcgctcgcacgctaacgggaaaacctcccaatagatcacccatccgaagactac 17851539  T
Q  111 tccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 210  Q
    ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  17851538 tccaagtcaagcacgcttaattgtggagttcttatagaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgataaaggtagtaccaaacatatcttataag 17851439  T
Q  211 cctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattg 310  Q
    ||| |||| ||||||| |||| ||||| | ||   |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||    ||||||| |||     
T  17851438 ccttcttttaaccatgcagtcccatacttgcacggcctcgggatccctctcattccggtgtgattcggttcgtctagaagttgtctaaagccgctaatta 17851339  T
Q  311 tcgtgccttatgcactggcgatcact 336  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  17851338 tcgtgccttgtgcaccggcgaacact 17851313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 136 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27334300 - 27334103
Alignment:
Q  136 gagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcat 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||  |||    
T  27334300 gagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagattcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccatgcagttccat 27334201  T
Q  236 acctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatc 333  Q
    |||| ||  ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27334200 acctgcacgacctcaggaaccctctcgttccggtgtgattcagttcctctataagctgttgggagtcgttcattgtcgtgccttgtgcaccggcgatc 27334103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 136 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27395040 - 27394843
Alignment:
Q  136 gagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcat 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||  |||    
T  27395040 gagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagattcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagctttccttcaaccatgcagttccat 27394941  T
Q  236 acctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatc 333  Q
    |||| ||  ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27394940 acctgcacgacctcaggaaccctctcgttccggtgtgattcagttcctctataagctgttgggagtcgttcattgtcgtgccttgtgcaccggcgatc 27394843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 123 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15929734 - 15929532
Alignment:
Q  123 acgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaac 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  15929734 acgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcattttgttgatataggtagtaccaaataattcttataagccttcattcaac 15929635  T
Q  223 catgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatg 322  Q
    |||||||||  |||| ||||   | | ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  15929634 catgtagtccaatacatacaaggcattaggatctctcttattctgatgtgattcgattcatctagaagttgtccggagccgctcattgtcatgccttatg 15929535  T
Q  323 cac 325  Q
    |||    
T  15929534 cac 15929532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 141 - 294
Target Start/End: Original strand, 31821704 - 31821857
Alignment:
Q  141 cttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcataccta 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  31821704 cttatggaatgagctaccaaaaaaaagatgcatcttgttgatatagttagtaccaaataattcttataagcattccttcaaccatgtagtctcataccta 31821803  T
Q  241 cataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgt 294  Q
    |||  ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  31821804 catggcctcatgatccctctcattccgatgtgattcggtttctctagaagctgt 31821857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 325
Target Start/End: Original strand, 33774915 - 33775200
Alignment:
Q  42 caacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttc 141  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  || ||||||||| ||||||    
T  33774915 caacgtgttttttcctcactcgcacgcttaccgaaaaacttctcagtaggtcacccatccaaagactactgcaagtcaaacacacttaactgtggagttc 33775014  T
Q  142 ttatggaatgagctaccaaaaagaagatgca--tcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacct 239  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||| ||||| |    
T  33775015 ttatggaatggactatcaaaaagaagatgcatctcttgttgatataggtagcaccagacaattcttataatccttccttcaaccatgcggtcacatactt 33775114  T
Q  240 acataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcac 325  Q
     ||   ||||  |||| ||||||||||  ||||||||  ||  | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  33775115 gcacggcctcgcgatcactctcattccagtgtgattcgttttgtgtagaaactgttgggagctgctcattatcgtgccttgtgcac 33775200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1991807 - 1991589
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaa 120  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||  |||||| || ||| || ||||  ||  ||||||| | | |||| ||||||||||| | |||||||| ||||    
T  1991807 acaaatcaacacgagttttttcagcgtactttgtcttcactcacatgcttttcggaaaacttttcagaaggtcacccatccaaaaactactccaaatcaa 1991708  T
Q  121 taacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttca 220  Q
    ||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  1991707 taatgtttaactgtgaagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtttagatatgtaataccaaacaattcttgtaagccttcttcca 1991608  T
Q  221 accatgtagtctcatacct 239  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1991607 accatgtagtctcatacct 1991589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 2891166 - 2891340
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    |||||| |||||||    
T  2891166 aagcattgccgactgaccctacaaaccaacacgaatcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccg-gaaacatcgtagtaggtcacccatc 2891264  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatctt 176  Q
    |||||| |||||||| ||||  ||  |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  2891265 caaagactactccaaatcaagcacatttaactgtggagtttttatggaatgggctaccaaaacaaagatgcatctt 2891340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Original strand, 9440269 - 9440456
Alignment:
Q  89 aggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 188  Q
    |||| ||||||||||| | | |||||| ||||  || |||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  9440269 aggtcacccatccaaaaattgctccaaatcaagcacacttaactgtgaagttcttatggagtgagctaccgaaaagaaaatgcatcttgttgatataagt 9440368  T
Q  189 agtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattc 276  Q
    |||||| |||||||||||||||| | | |||||||||| |||  ||||||| ||  || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9440369 agtaccgaacaattcttataagctttcattcaaccatgcagttccatacctgcacgacttcaggatccctctcattccgatgtgattc 9440456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28780383 - 28780209
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    ||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||   |||||| ||||||||| ||||||||    
T  28780383 agcattgtcggctgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaaaatgttttatcctcactcgcacacttaccagaaaacttcccggtaggtcacccatcc 28780284  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatctt 176  Q
     || | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28780283 caaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaacaagatgcatctt 28780209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 203 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3653051 - 3652915
Alignment:
Q  203 cttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagcc 302  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||    
T  3653051 cttataagccttcgttcaaccatgcagtcccatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtgagtcggttcatctagaagctgtcgggagcc 3652952  T
Q  303 gctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  3652951 gctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 3652915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20735958 - 20735636
Alignment:
Q  12 actgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtact 111  Q
    |||||| | ||||||| || | |||||||| | ||||||||||||||  | ||| |||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||  ||||    
T  20735958 actgaccccacaaaccgacgcaagtctttttagcgtgttttgtcctcaattgcatgctttcctggaaacttccttgaaggttacccatccaaaggctact 20735859  T
Q  112 ccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagc 211  Q
    ||||| |||  || ||||||| | ||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20735858 ccaagccaaccacacttaactatggagtttttatagaatggactaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagtatcaaacaattcttataagc 20735759  T
Q  212 ctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgt 311  Q
    || | | ||| ||||||||| |||||||||| |  |||| |||| ||||||||  ||||||||   ||| | ||  ||| |||  |||| ||||||||||    
T  20735758 cttcctacaatcatgtagtcacatacctacacagtctcaagatccctctcattatgatgtgatctggttgc-ctgaaagttgtcaggagtcgctcattgt 20735660  T
Q  312 cgtgccttatgcactggcgatcac 335  Q
    |  ||||||||||| |||||||||    
T  20735659 caagccttatgcaccggcgatcac 20735636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 3652797 - 3652658
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||    
T  3652797 aagcattgtcaactgaccctacaaaccaacaagagtcttttcagctttttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaagcttcccggtaggtcacccatc 3652698  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagtt 140  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||||||| |||||    
T  3652697 caaagactactccaagtcaagcaagcttaactgtggagtt 3652658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20732751 - 20732535
Alignment:
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 201  Q
    ||||| |||||||||||||  || |||||| |||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  20732751 aaagactactccaagtcaagcactcttaaccgtagagtttttattgaatgggctaccgaaaagaatatgcatattattaatataggtagtaccaaataat 20732652  T
Q  202 tcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagc 301  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||       || | ||||||| ||||||||||||||||  ||| |  |||||| |||| |||||    
T  20732651 tcttataagccttcctacaaccatgtagtcacatacct-----gtcttaagatctctatcattccgatgtgatttggttgc-atagaaggtgttaggagc 20732558  T
Q  302 cgctcattgtcgtgccttatgca 324  Q
    ||||||||||| ||| |||||||    
T  20732557 cgctcattgtcatgctttatgca 20732535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 135 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15929339 - 15929234
Alignment:
Q  135 agagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctca 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||    
T  15929339 agagttcttatggaatgagctaccgaaaagaatatgcatcttattgatataggcattaccaaacaattcttataagcttttcttcaaccttgtagtctca 15929240  T
Q  235 taccta 240  Q
    ||||||    
T  15929239 taccta 15929234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 273
Target Start/End: Original strand, 28065831 - 28065982
Alignment:
Q  125 gcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaa---gatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaa 221  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  28065831 gcttaattgtggagttcttatggaataagctaccaaaaaaaaaaagatgcatcttgttgatagagatagtaccaaacaattcttataagctttcattcaa 28065930  T
Q  222 ccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtga 273  Q
     |||  ||||||||  |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28065931 tcatacagtctcatttctacacgaccttaggatccctctcattccgatgtga 28065982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28583234 - 28583013
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||   |||||||||| | ||| ||||||| | | |||||||||| | | ||||| ||| ||||    
T  28583234 attgccgactgaccccacaaactaacatgagtcttttcagtatgttttgtccccactcacacgctttctgggaaactttccagaaagtaactcatacaaa 28583135  T
Q  105 gagtact-ccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 203  Q
    || || | ||| |||||  || |||| |||| || |||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||    
T  28583134 gactaattccatgtcaaggacacttagctgtggatttcttatggaatgaactaccggaaagatgatgcatcttgttgatatagatcgtatcaaataattc 28583035  T
Q  204 ttataagcctactttcaaccat 225  Q
    |||||||||| | |||||||||    
T  28583034 ttataagccttcattcaaccat 28583013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 32293034 - 32292887
Alignment:
Q  124 cgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaacc 223  Q
    ||||||||| | ||||||||||  |||| | ||| ||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  32293034 cgcttaactatggagttcttat--aatgtgttactaaaaacaagatgtattttgttggtataggtagtaccaaacaattcttataagccttcattcaacc 32292937  T
Q  224 atgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtga 273  Q
    ||| |||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  32292936 atgcagtctcatacctgcacgatctaaggatttctctcattccaatgtga 32292887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 9440733 - 9440958
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||| || || ||||  ||  || ||||||| |  | |||| |||||||| ||    
T  9440733 attgccgactgaccccacaaaccagcacgagttttttcagcgtattttgtcatcacttgcacatttttcgggaaacttccaagaaggtcacccatcccaa 9440832  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | ||| |||||||  || |||||||||  |||||||||||  || |||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  9440833 aattgctcaaagtcaaacacacttaactgtgaagttcttatggtttgggctactgaaaagaaaatgcatcttgttgataaaagtagtaccaaagaattct 9440932  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagt 230  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||    
T  9440933 tataagcattccttcaaccatgtagt 9440958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3653172 - 3653048
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||| || |||||||  || ||||| |||||||    
T  3653172 aagcattgccgattgaccctacaaaccaatacgagtcttttcagcgtgttttgtcc----tcgcacgcttatcgggaaacttctcgataggtcacccatc 3653077  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgctta 129  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||    
T  3653076 caaagactactccaagtcaagcacgctta 3653048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 186 - 280
Target Start/End: Original strand, 9440485 - 9440579
Alignment:
Q  186 ggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9440485 ggtagtaccaaacaattcttataagccttcattcaaccatgaagtcccatacctgcacgacttcaggatccctctcattccgatgtgattcagtt 9440579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17205591 - 17205338
Alignment:
Q  22 caaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaat 121  Q
    |||| |||| |||||||||||   ||||||||| ||| |||||| | || |||| ||||||||    ||||  ||||||| || | |||||||| ||||     
T  17205591 caaatcaacgcgagtcttttcggtgtgttttgttctcactcgcatgttttccgaaaaactttcataaaggtctcccatcccaaaattactccaaatcaag 17205492  T
Q  122 aacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaa 221  Q
     | | |||||  | |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  || | |||||    
T  17205491 catgtttaacaatggagttcttatggaatgggctaccaaaac-aagatgaatcttgttggtaaaggtagtaccaaacaattcttataattcttcattcaa 17205393  T
Q  222 ccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattc 276  Q
     |||| ||| |||||||  |||   ||||  ||| |||| |||||||||||||||    
T  17205392 tcatgcagtttcataccaccatggtctcaaaatccctctaattccgatgtgattc 17205338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12194478 - 12194406
Alignment:
Q  125 gcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaa 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12194478 gcttaactgtggagttcttatggaatgaattataaaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagtgccaaa 12194406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11062095 - 11062030
Alignment:
Q  9 ccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccg 74  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11062095 ccgactaaccctacaaaccaacacgagtttttttagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccg 11062030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 236
Target Start/End: Original strand, 3885098 - 3885194
Alignment:
Q  137 agttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcata 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   || || |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| ||| |||||||||    
T  3885098 agttcttatggaataagctaccaaaaaga---tgtattttgttagtatatgtagtaccaaacaattcttttaagcattccttcaactatgcagtctcata 3885194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 237
Target Start/End: Original strand, 30729827 - 30729947
Alignment:
Q  117 tcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctact 216  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||| ||||   ||||| ||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||| || |  |     
T  30729827 tcaagaacgcttaactataaagttcttatagaattgactacccaaaagaagatcaatcatgtttatatacgtagtaccaaacaatttttatgagtcctcc 30729926  T
Q  217 ttcaaccatgtagtctcatac 237  Q
    ||||||||||  |||||||||    
T  30729927 ttcaaccatgctgtctcatac 30729947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 85
Target Start/End: Original strand, 31415965 - 31416044
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttcc 85  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||    
T  31415965 attgccgactgatcccacaaaccaacacga-tcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgtttttcgagaaactttcc 31416044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10964443 - 10964340
Alignment:
Q  136 gagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcat 235  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||  || || |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||   ||| |||||  ||||||||    
T  10964443 gagtttttatggattaagctaccaaaaagaatatttattttattgatatatgtagtaccaaacaattcttgtaagtctttcttctaccatacagtctcat 10964344  T
Q  236 acct 239  Q
    ||||    
T  10964343 acct 10964340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 55
Target Start/End: Original strand, 6331244 - 6331294
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtc 55  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  6331244 attgccgactgaccctacaaaccaacacgagtctttccagcatgttttgtc 6331294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 27334363 - 27334305
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcg 63  Q
    |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27334363 attgtcgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcg 27334305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 27395103 - 27395045
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcg 63  Q
    |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27395103 attgtcgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcg 27395045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 33470998 - 33470916
Alignment:
Q  114 aagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaa 196  Q
    |||||||  |||| ||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  33470998 aagtcaaacacgcataactgtggaattcttatgtaatgaactacaaaaaagaatatgcatcttgttagtataggtaataccaa 33470916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 31821664 - 31821702
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtctt 39  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31821664 aagcattgccgactgaccatacaaaccaacacgagtctt 31821702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Original strand, 3884977 - 3885021
Alignment:
Q  14 tgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctc 58  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  3884977 tgaccctacaaaccaacacaagtctttacatcgtgttttgtcctc 3885021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 32292585 - 32292508
Alignment:
Q  194 caaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtga 273  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| ||| || ||||||||||||| || || ||||| |  ||||||||||||||||||    
T  32292585 caaacaattcttataagtcttattttaacaatatagtctcataccttcacaatctcagaa--tctctcattccgatgtga 32292508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 50348019 - 50347682
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||  |||||||| ||||||||    
T  50348019 agcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttatcgggaaacttctcggtaggtcacccatcc 50347920  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 201  Q
     || | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50347919 caaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaat 50347820  T
Q  202 tcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagc 301  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||   |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  50347819 tcttataagccttccttcaaccaagtagtctcatacatacaaggcctcaggatccctctcattccggcgtgattcggttcctctagaagctgtcgggagc 50347720  T
Q  302 cgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  50347719 cgctcattgtcgttccttgtgcaccggcgatcactccc 50347682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Original strand, 32227094 - 32227431
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32227094 agcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaatgtgttttttcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcc 32227193  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 201  Q
     || | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32227194 caaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtacccaacaat 32227293  T
Q  202 tcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagc 301  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  32227294 tcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggccttaggatccctctcattccggcgtgattcggttcctctagaagttgttgggagc 32227393  T
Q  302 cgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32227394 cgctcattgttgtgccttgtgcactggcgaccactccc 32227431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 30529960 - 30529625
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||| || |||||| |||||||    
T  30529960 aagcattgccgactaaccctgcaaaccaacacaagtctttttagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttactgggaaactt-ccagtaggtcacccatc 30529862  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30529861 caaagactactccaagtcaagcacgcttaactatgaagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaaaaa 30529762  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  30529761 ttcttataagccttacttcaaccatgtagtctcatacctacacagcctcaggatccctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagttgtcgggag 30529662  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactc 337  Q
    | ||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  30529661 ctgcttattgtcgtgccttgtgcactgacgaccactc 30529625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 353
Target Start/End: Original strand, 25230587 - 25230929
Alignment:
Q  11 gactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||  |||| |||    
T  25230587 gactgaccctacaaaccaacacgagtctttccagcgtgttttgatctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccagtagggcacccatcataagactac 25230686  T
Q  111 tccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 210  Q
    ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25230687 tccaagtcaagcacgcttaattgttgagttcttatggaatgggctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataaa 25230786  T
Q  211 cctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattg 310  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  25230787 ccttccttcaaccatgtagtctcatacctacatggcctcaggatccctctcattccaatgtgatttggttcctctataagctgtcgggagctgctcattg 25230886  T
Q  311 tcgtgccttatgcactggcgatcactcccttatcctcgtcaac 353  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||| || ||||||||||    
T  25230887 tcgtgccttgtgcaccggagatcactcccataccctcgtcaac 25230929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 353
Target Start/End: Original strand, 25238174 - 25238516
Alignment:
Q  11 gactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtac 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||  |||| |||    
T  25238174 gactgaccctacaaaccaacacgagtctttccagcgtgttttgatctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccagtagggcacccatcataagactac 25238273  T
Q  111 tccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 210  Q
    ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25238274 tccaagtcaagcacgcttaattgttgagttcttatggaatgggctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataaa 25238373  T
Q  211 cctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattg 310  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  25238374 ccttccttcaaccatgtagtctcatacctacatggcctcaggatccctctcattccaatgtgatttggttcctctataagctgtcgggagctgctcattg 25238473  T
Q  311 tcgtgccttatgcactggcgatcactcccttatcctcgtcaac 353  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||| || ||||||||||    
T  25238474 tcgtgccttgtgcaccggagatcactcccataccctcgtcaac 25238516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 20884989 - 20885326
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||| || |||| || ||||||||| |||||||    
T  20884989 aagcattgcagactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctaacttgcacgcttaacgggaaatttcccggtaggtcacccatc 20885088  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||| | |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20885089 caaatactactccaagtcaagcacgcttaattgtggagttcttatggaatgtgctactaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaa 20885188  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  20885189 ttcttataagtcttccttcaaccatgtagtcacatacctacacgacctcaagatccctctcattgcgatgtgatt-ggttcctctagaagttgtcgggag 20885287  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20885288 ccgctcattggcgtgccttgtgcaccggcgatcactccc 20885326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 25230120 - 25230470
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| | | ||||| |||||||    
T  25230120 aagcattgtcgactgaccctacaaaccaacactagtctttccaacgtgttttgtcctcactcgctcgcttaccggaaaacttcctgataggtcacccatc 25230219  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
      |||| |||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25230220 ataagactactccaagtcaagcacgcataactgtggagttcttattgaatgggctaccaaaaagaagatgtatcttgttgatataggtagtaccaaataa 25230319  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| ||| |||||    
T  25230320 ttcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacacgacctcaggatccctctccttccgatgtgatttggttcctctataagatgtcgggag 25230419  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactcccttatcctcgtca 351  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  25230420 ccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggctatcactccctttccctcgtca 25230470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 25237707 - 25238057
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| | | ||||| |||||||    
T  25237707 aagcattgtcgactgaccctacaaaccaacactagtctttccaacgtgttttgtcctcactcgctcgcttaccggaaaacttcctgataggtcacccatc 25237806  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
      |||| |||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25237807 ataagactactccaagtcaagcacgcataactgtggagttcttattgaatgggctaccaaaaagaagatgtatcttgttgatataggtagtaccaaataa 25237906  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| ||| |||||    
T  25237907 ttcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacacgacctcaggatccctctccttccgatgtgatttggttcctctataagatgtcgggag 25238006  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactcccttatcctcgtca 351  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  25238007 ccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggctatcactccctttccctcgtca 25238057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 28562011 - 28561682
Alignment:
Q  9 ccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagt 108  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| |||| || | |    
T  28562011 ccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttccccgtaggtcacc-atcccaaaatt 28561913  T
Q  109 actccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttata 208  Q
     |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28561912 gctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttata 28561813  T
Q  209 agcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcat 308  Q
    ||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||   |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  28561812 agccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcagttcctctagaagttgtcagtagccgctcat 28561713  T
Q  309 tgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  28561712 tgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 28561682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Original strand, 11179907 - 11180243
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  11179907 agcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacacttaccgggaaacatcccggtaggtcacccatcc 11180006  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 201  Q
     || | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11180007 caaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaat 11180106  T
Q  202 tcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagc 301  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11180107 tcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggcctcaggatccctctcattccg-gctgattcggttcctctagaagctgtcgggagc 11180205  T
Q  302 cgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||    
T  11180206 cgctcattgtcgtaccttgtgcaccggcgaccactccc 11180243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 331
Target Start/End: Original strand, 13149972 - 13150301
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  13149972 agcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcacacttaccgagaaacttcccggtaggtcacccattc 13150071  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 201  Q
     || | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13150072 caaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatacaggtagtacccaacaat 13150171  T
Q  202 tcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagc 301  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||   |||||||| | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  13150172 tcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggcctcaggagccctctcattccggcgtgattcggttcctctagaagctgtcgagagc 13150271  T
Q  302 cgctcattgtcgtgccttatgcactggcga 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13150272 cgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcga 13150301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 39653437 - 39653100
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  39653437 agcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcc 39653338  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 201  Q
     || | | |||||||||||  || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39653337 caaaattgctccaagtcaagcacacttaactgtggagttctcatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtatccaacaat 39653238  T
Q  202 tcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagc 301  Q
    |||||||||| | | |||||||||| |||| ||||||| ||   |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  39653237 tcttataagctttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcagttcctctagaagctgtcaggagc 39653138  T
Q  302 cgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  39653137 cgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 39653100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16811649 - 16811317
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  16811649 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgt--tttgtcctcactcgcatgcttatcgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 16811552  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16811551 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggaattcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgaaataggtagtacccaacaattct 16811452  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| || |||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  16811451 tataagccttccttcaaccatggagtcccaaacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcgattcctctagaagctgtcgggagccgc 16811352  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  16811351 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 16811317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 32227773 - 32227457
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| || ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32227773 agcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcaatgtgttttttcctcactcgcacacttatcgggaaacttcccggtaggtcacccatcc 32227674  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 201  Q
     || | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32227673 caaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtacccaacaat 32227574  T
Q  202 tcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagc 301  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||   ||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  32227573 tcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggcctca-gatccctctcattccggcgtgattcggttcctctagaagctgtcgggagc 32227475  T
Q  302 cgctcattgtcgtgcctt 319  Q
    ||||||||||||||||||    
T  32227474 cgctcattgtcgtgcctt 32227457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 37045306 - 37044971
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| || ||| |   ||||||||| |||||||    
T  37045306 aagcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttatcgggaatc---ccggtaggtcacccatc 37045210  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  37045209 caaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatagggtaccaaaaagaagatgcaccttgttgatataggtattaccaaacaa 37045110  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    ||||||||||| | | ||||  ||||||||| || |||||||   |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  37045109 ttcttataagcattccttcattcatgtagtcccacacctacacggcctcaggatccctctcattcagatgtgattcggttcctctagaagctgtcgggag 37045010  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||    
T  37045009 ccgctcattggcgtgccttgtgcaccggtgaccactccc 37044971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14814219 - 14813886
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||    
T  14814219 attgccgactaaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcttcactcgcacgcttaccgggaaacctttcggtaggtcacccatcacaa 14814120  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  14814119 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaacgagctaccgaaaagaagatgcatcttattgatataggtagtaccaaacaattat 14814020  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||   |||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |  | ||||||    
T  14814019 tataagccttcctttaaccatgcagtctcatacctacacggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctctcagaagccgc 14813920  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactcc 338  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  14813919 taattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactcc 14813886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16811195 - 16810861
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  16811195 attgccgaccgaccccacaaaccaacacgaatcttttcagcgtattttgtcctcactcgcacgcttacggggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 16811096  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | || ||||||||  || ||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||    
T  16811095 aattgctacaagtcaagcacacttaaatgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtagatatagttagtacgcaacaattct 16810996  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| |  ||||||||| |||| |||| |||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  16810995 tataagccttccatcaaccatgcagtcccatatctacacggcctcaagatccctctcattccgatgtgattcgattcctctagaagctgtcgggagccgc 16810896  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  16810895 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 16810861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Original strand, 31284152 - 31284427
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||  ||  |||||| |||| |||| |||||||| ||    
T  31284152 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcggcgtgttttgtccccactcgcacgcttgtcggaaaacttcccggcaggtcacccatcccaa 31284251  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31284252 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 31284351  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31284352 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacgacctcaagatccctctcattccgatgtgattcagtt 31284427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 14820424 - 14820110
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  14820424 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcatgcttaccgggaaactttccgataggtcacccatcccaa 14820325  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | |  ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14820324 aattgttccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaacgagctaccgaaaataagatgcatcttgttgatataagtagtaccaaacaattct 14820225  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | || | || || || | ||||||||||    ||||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  14820224 tataagccttcctttagccgtgcagccccatacctacacgggctcaggaaccctctcattgcggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgc 14820125  T
Q  305 tcattgtcgtgcctt 319  Q
    ||||| |||||||||    
T  14820124 tcattatcgtgcctt 14820110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2911358 - 2911031
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||           ||| || ||||    
T  2911358 aagcattgtcgattgatcctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgagaa-----------ggtcactcatc 2911270  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2911269 caaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaatatgcatcttgttgatataggtaatatcaaacaa 2911170  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    || |||||| | | ||||||||||||| ||| ||||||| ||   |||| ||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||     
T  2911169 tttttataaccattctttcaaccatgtggtcccatacctgcacggcctcgggatccctctcattcaggtgtgattcggttcgtctagaagctgttaggat 2911070  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||| |||||||    
T  2911069 ccgcttattatcgtgtcttgtgcaccggcgaccactccc 2911031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 13150427 - 13150657
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    ||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13150427 agcattgtcgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcc 13150526  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 201  Q
     || | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13150527 caaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaat 13150626  T
Q  202 tcttataagcctactttcaaccatgtagtct 232  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13150627 tcttataagccttccttcaaccatgtagtct 13150657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Original strand, 25238559 - 25238790
Alignment:
Q  4 cattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaa 103  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||| ||| ||||| ||| ||||||    
T  25238559 cattgccgaccgaccatacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcatgcttaccaaaaaacttcccgataggtcaccaatccaa 25238658  T
Q  104 agagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 203  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25238659 agactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgataaagatagtaccaaacaattc 25238758  T
Q  204 ttataagcctactttcaaccatgtagtctcat 235  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  25238759 ttataagtcttccttcaaccatgtagtctcat 25238790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 4067232 - 4067454
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||   |||||||||||||||| | |||||    
T  4067232 aagcattgccgactgaccctacaaaccaacactggtcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcacgcttaccagaaaactttccggtaggtcatccatc 4067331  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4067332 caaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgtaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 4067431  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaacc 223  Q
    || ||||||| || | |||||||    
T  4067432 tttttataagtcttccttcaacc 4067454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 277
Target Start/End: Original strand, 27187205 - 27187478
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgtttt-gtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaa 103  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  27187205 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttttgtcctcactcgcacgcttatcgggaaacttcccggtaggtcacccatccca 27187304  T
Q  104 agagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 203  Q
    | | | ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27187305 aaattgctcaaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttagtgatataggtagtaccaaacaattc 27187404  T
Q  204 ttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattca 277  Q
    |||||||||| | || ||||||| |||| ||||| | || | |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27187405 ttataagccttcatttaaccatgcagtcccatacatgcacagcctcaggatccctctcattccaatgtgattca 27187478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8067534 - 8067278
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || | | |||||||||||    
T  8067534 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 8067435  T
Q  121 taacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttca 220  Q
      |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||    
T  8067434 gcacgcttaactatggagttcttatggaatgagctaccgaaaaaaagatgcatcttgttgatataggtagtactaaacaattcttataagccggccttca 8067335  T
Q  221 accatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattca 277  Q
    |||||| | || ||||||| ||   ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  8067334 accatgcaatcccatacctgcacggcctcagggtccctctcattccgatgtgattca 8067278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 87 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 39641125 - 39640887
Alignment:
Q  87 gtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatatag 186  Q
    |||||| ||| ||||||||| | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39641125 gtaggtcaccaatccaaagactgctccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttattgatatag 39641026  T
Q  187 gtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctcta 286  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||    
T  39641025 gtagtaccaaacaactcttataagtcttccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcctcaggatctctctcattctgatgtgattcgattcttcta 39640926  T
Q  287 gaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcac 325  Q
     ||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  39640925 aaagctgtcgggagccgttcattgtcatgtcttgtgcac 39640887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 239
Target Start/End: Original strand, 32386610 - 32386844
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  32386610 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtctttttagcgtgttttgtcctcactcggacgcttaccaagaaactttccggtgggtcacccatcccaa 32386709  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32386710 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaattagctactgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaattct 32386809  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacct 239  Q
    ||||||||| | |||||||||  |||| |||||||    
T  32386810 tataagccttccttcaaccatacagtcccatacct 32386844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25248366 - 25248106
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtctttt-caacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtca 119  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||  |||| ||||||||||||    
T  25248366 acaaatcaacacgagtctttttcaacgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgtgaaacttcccggtaggtcatccatcataagactactccaagtca 25248267  T
Q  120 ataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttc 219  Q
    |  ||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||     
T  25248266 agcacgctgaaccgtggagttattatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataaacattccttt 25248167  T
Q  220 aaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||   ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25248166 aaccatgcagtcccatacctgcacggccttagaatccctctcattccgatgtgattcagtt 25248106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 25802420 - 25802738
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||  ||||||| |||  |||||||||| |  | |||| |||| ||    
T  25802420 aagcattgttgactgaccctacaaaccaacacacgtcttttcagcgtgttttgaccttactcgcactcttttcgagaaacttcctagaaggtcacccgtc 25802519  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    | |||| |||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25802520 ctaagactactccaagtcaaacacgcttaactgtggatttcttatggaatgggctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacca 25802619  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    ||||||| ||||| |  | ||||||| ||||||||||||||||  || || |||| |||||||||| ||| || || | |||||||||||||||| ||||    
T  25802620 ttcttatcagccttccgttaaccatgcagtctcatacctacatggccacatgatccctctcattccaatgagactcggctcctctagaagctgttaggag 25802719  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgcctt 319  Q
    || |||||| || ||||||    
T  25802720 ccactcattctcatgcctt 25802738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 123 - 305
Target Start/End: Original strand, 25239071 - 25239253
Alignment:
Q  123 acgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaac 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||    
T  25239071 acgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaaaaattcttataagcgttccttcaac 25239170  T
Q  223 catgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgct 305  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25239171 catatagtcccatacctacacgacctcagaatccctctcataccggtgtgattcgattcctctagaagctgtcgggagccgct 25239253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7477461 - 7477191
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||   |||| | |||||| ||    
T  7477461 attgtcgactgaccccacataccaacatgagtcttttcaacgtgctttgttctcactcgcacgctttccgagaaatttcccataaggtcagccatcctaa 7477362  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
    || ||||| |||||||  | |||||| ||| ||||||||||||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7477361 gactactctaagtcaagcatgcttaaatgtggagttcttatggtttgggctaccgaaaagaagatgtatcttgttgatataagtagtaccaaaaaattct 7477262  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgatt 275  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||  || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  7477261 tataagccttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacgactttaggatccctctcattccgatgtgatt 7477191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7494151 - 7493881
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  || |||| || |  | |||| | |||| | ||    
T  7494151 attgtcgactgaccccacataccaacatgagtcttttcaacgtgctttgttctcactcgcacgctttacgggaaatttcctagaaggtcagccatgctaa 7494052  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
    ||  ||||||||||||  | |||||| ||| ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7494051 gacaactccaagtcaagcatgcttaaatgtggagttcttatggtttgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagtaccaaaaaattct 7493952  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgatt 275  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7493951 tataagccttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacgactttaggatctctctcattccgatgtgatt 7493881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41472499 - 41472297
Alignment:
Q  76 gaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatct 175  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || | |  | ||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41472499 gaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgtttcaagtcaagcacgtttaaccgtggagttcttatggaatgatctaccgaaaagaagatgcatct 41472400  T
Q  176 tgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgatt 275  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41472399 tgttgatatatgtagtaccaaacaattcttataag-cttccttcaaccatgcagtctcatacctgtacgacctcaggatccctctcattccgatgtgatt 41472301  T
Q  276 cagt 279  Q
    ||||    
T  41472300 cagt 41472297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 130 - 312
Target Start/End: Original strand, 32796936 - 32797118
Alignment:
Q  130 actgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtag 229  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||    
T  32796936 actgtggagttcttatggaatgtgctacaaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttgcttcaaccatgtag 32797035  T
Q  230 tctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtc 312  Q
    | ||||||||||||   ||||||||| |||| ||| ||||||||||| | |  |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  32797036 tttcatacctacatggtctcaggatccctcttatttcgatgtgattcggcttgtctagaagctgtcgggagccgttcattgtc 32797118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 89 - 339
Target Start/End: Original strand, 25802964 - 25803214
Alignment:
Q  89 aggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 188  Q
    |||| |||||||| |||| || ||||||||||  ||||||||||   ||||||||||| |||| | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||    
T  25802964 aggtcacccatcctaagactagtccaagtcaagcacgcttaactacggagttcttatgaaatgggataccgaaaagaagatacatcttgtttttataggt 25803063  T
Q  189 agtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctaga 288  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||   |||||||||| |||| ||||||||||  || | |||| | |||| |||||||| |||||| |||| ||||||    
T  25803064 agtaccaaacaattcttacaagtcttacttcaaccatgcagtcccatacctacacgacattaggaaccctcttattccgatatgattcggttcatctaga 25803163  T
Q  289 agctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||  |||| |||||||    
T  25803164 agctgttggaagccgctcattgttatgccttgtgcaccagcgaccactccc 25803214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41474249 - 41473993
Alignment:
Q  23 aaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaata 122  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||  || | |||||| |||| | ||||||||| |||| || |||||||| || | |  ||||||||||      
T  41474249 aaactaacatgagtcttttcaacatgttttgtattcacccgcacgattactgggaaactttctggtatgtcacccatcccaaaattgttccaagtcaagc 41474150  T
Q  123 acgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaac 222  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| |||||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || | || |||    
T  41474149 acgcttgactgtggagtttttatagaatgatccaccaaaaagaatatcaatcttgttgatataggaagtatcaaacaattcttataagtcttcctttaac 41474050  T
Q  223 catgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagt 279  Q
    |||  |||| |||||||  |  |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  41474049 catccagtcacatacctgaacgacctcaagatccctctcatttcgatgtgattcagt 41473993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 89 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 29224510 - 29224260
Alignment:
Q  89 aggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 188  Q
    |||| |||||||| || | | |||||||||||  |||||||| |||  |||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  29224510 aggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaattgtgaagttcttatggtttgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttagtataggt 29224411  T
Q  189 agtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtg-attcagttcctctag 287  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| || | || |||||| |||||| |||| ||| ||  |     
T  29224410 agtaccaaacaattcttataagtcttccttcaaccatgcagtctcatatctacatggcctcatgaaccctttcattctgatgtgaattcggttgct-gaa 29224312  T
Q  288 aagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||   |||||||||||||||| |||||| || |||||| | |||||||    
T  29224311 aagctgccaggagccgctcattgtcatgccttctgaactggcaaccactccc 29224260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 25238999 - 25239070
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttac 72  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25238999 aagcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttac 25239070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 209
Target Start/End: Original strand, 26309987 - 26310069
Alignment:
Q  127 ttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataa 209  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||| |||||||||||    
T  26309987 ttaactgtcgagttctaatggaatgagctaccataaagaagatgcatctttttggtatatgtagtaacaaaaaattcttataa 26310069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 239
Target Start/End: Original strand, 31103937 - 31104070
Alignment:
Q  108 tactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgag--ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattctt 205  Q
    ||||| |||||||  || ||||| |||  |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  31103937 tactcaaagtcaaagacacttaaatgtgaagttcttatggaatgagagctaccaaaaagaaaatgcatctagttggtatagatagtatcaaacaattctt 31104036  T
Q  206 ataagcctactttcaaccatgtagtctcatacct 239  Q
    ||||| || | || ||||||| | ||||||||||    
T  31104037 ataagtcttccttgaaccatgcaatctcatacct 31104070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 269 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 39653626 - 39653556
Alignment:
Q  269 tgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  39653626 tgtgattcagttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 39653556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 41473811 - 41473744
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttac 72  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  41473811 attggcgactgaccccacaaaccaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttac 41473744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3900070 - 3899868
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||   ||| |||||||   | |||||||||| | |||| |||||| | ||    
T  3900070 attgctgactgaccccacagatcaacacgagtcttttcaccttgttttgtccatactcacacgctttttgggaaactttccagaaggtcacccataccaa 3899971  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  | |||| | ||| |||||||||||   || | |  | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3899970 aattgctccaagtcaagcatgctttattgtggagttcttatgatttgtgttgtcgaaaaaaagatgcatcttgttggtatatgtagtaccaaacaattct 3899871  T
Q  205 tat 207  Q
    |||    
T  3899870 tat 3899868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 331
Target Start/End: Original strand, 13155302 - 13155404
Alignment:
Q  227 tagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcact 326  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||     
T  13155302 tagtcccatacctacaaggcctcaggatc-ctctcatttcggcgtgattcggttcctctagaagctgtcgaga-ccgctcattgtcgtgccttgtgcacc 13155399  T
Q  327 ggcga 331  Q
    |||||    
T  13155400 ggcga 13155404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 186
Target Start/End: Original strand, 53150694 - 53150869
Alignment:
Q  11 gactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtac 110  Q
    ||||||| | |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||   | |||||||  |   |||| |||||||| || | | |    
T  53150694 gactgaccccacaaactaacatgagtcttttcaacatgttttgtcctcactcgcccgctttttgggaaacttctcataaggtcacccatcccaaaattgc 53150793  T
Q  111 tccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatatag 186  Q
    ||||||| ||  ||| ||||||||  |||||||||| |||  |||||| |||| || |||||||||||| ||||||    
T  53150794 tccaagttaagcacggttaactgtgaagttcttatgaaattggctaccgaaaaaaatatgcatcttgttaatatag 53150869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 58
Target Start/End: Original strand, 25230972 - 25231026
Alignment:
Q  4 cattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctc 58  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25230972 cattgccgaccgaccatacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctc 25231026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3890093 - 3890046
Alignment:
Q  160 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttat 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  3890093 aaaaaaagatgcatcttgttgatatatgtagtagcaaacaattcttat 3890046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 18318909 - 18318847
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaacttt 83  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||    
T  18318909 acaaaccaacccgaatcttttcagcgtgttttgttctcactcgcacgctttgcgagaaacttt 18318847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 185
Target Start/End: Original strand, 43736731 - 43736777
Alignment:
Q  139 ttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatata 185  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  43736731 ttcttatgaaatgagctaccaacaagaagatgcatattgttgatata 43736777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 18547439 - 18547475
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtc 37  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18547439 aagcattgccgactgaccctacaaaccaacacgagtc 18547475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 210
Target Start/End: Original strand, 47518319 - 47518400
Alignment:
Q  126 cttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataag 210  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||| || || ||||  |||||||||||||||||    
T  47518319 cttaattgtaaagttattatggaatgagctactaaaaaaa---tgcatcttgttggtagagatagtttcaaacaattcttataag 47518400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15392625 - 15392572
Alignment:
Q  160 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcct 213  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15392625 aaaagaagtggcatcttgttggtaccggtaataccaaacaattcttataagcct 15392572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15405661 - 15405608
Alignment:
Q  160 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcct 213  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15405661 aaaagaagtggcatcttgttggtaccggtaataccaaacaattcttataagcct 15405608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15411070 - 15411017
Alignment:
Q  160 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcct 213  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15411070 aaaagaagtggcatcttgttggtaccggtaataccaaacaattcttataagcct 15411017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15417486 - 15417433
Alignment:
Q  160 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcct 213  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15417486 aaaagaagtggcatcttgttggtaccggtaataccaaacaattcttataagcct 15417433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 277
Target Start/End: Original strand, 32388847 - 32388879
Alignment:
Q  245 acctcaggatctctctcattccgatgtgattca 277  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32388847 acctcaggatccctctcattccgatgtgattca 32388879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 17474 - 17808
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  17474 attgccgactgaccctatgaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgaaaaactttcgagtaggtcacccatccaaa 17573  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17574 gagtactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaattgagctaccaaaaagaagatacatcctgttgatataggtagtaccaaacaattct 17673  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  17674 tataagctttccttcaaccatgtagtcccatacctacacggcctcaggatccctctcattctgatgtcattcggttcctcaagaagttgtcgggagccgc 17773  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  17774 tcattgtcgtgcctggtgcaccggcgaccactccc 17808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 18007 - 18344
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  18007 aagcattgtcgattgaccctacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttgtgtcctcactcgcacgtttaccgaaaaactttccaataggtcacccatc 18106  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18107 caaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaattagctaccaaaaa-aagatgcatcttgttgatataggtagtatcaaacaa 18205  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    |||||||||| || | |||||| |||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18206 ttcttataagtcttccttcaactatgtagtcacatacctacacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgtcgggag 18305  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||    
T  18306 ccgctcattgtcgtgcctggtgcaccagcgaccactccc 18344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 357
Target Start/End: Original strand, 17816 - 17907
Alignment:
Q  266 cgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactcccttatcctcgtcaaccgtg 357  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |  |||||||| |||||    
T  17816 cgatgtgattcggttcctctagaagctgtcgggagccgctcattgtcgtgcctcgtgcaccggcgaccactccccttccctcgtcagccgtg 17907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 34405467 - 34405801
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  34405467 attgtcgactgaccccacaaatcaacacgggtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 34405566  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34405567 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcctgttgatataggtagtacccaacaattct 34405666  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34405667 tataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggccttaggatccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcgggagccgc 34405766  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  34405767 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 34405801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28496124 - 28495791
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||| ||    
T  28496124 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccaataggtcacccatcccaa 28496025  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28496024 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacagttct 28495925  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  28495924 tataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacacggcctcaagatccctctcattccgatgtgattcgattcctctagaagttgttgggagccgc 28495825  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactcc 338  Q
    | ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  28495824 taattgttgtgccttgtgcaccggcgaccactcc 28495791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 36422524 - 36422188
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  36422524 agcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcc 36422425  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 201  Q
     || | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36422424 caa-attgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaat 36422326  T
Q  202 tcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagc 301  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  36422325 tcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggccttaggatccctctcattccggcgtgattcgattcctctagaagctgtcgggagc 36422226  T
Q  302 cgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  36422225 cgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 36422188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 2611531 - 2611862
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    |  ||   ||||||||| |||||||    
T  2611531 aagcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagagtgttttgtcctcactcgcacgctta----gttac---ccggtaggtcacccatc 2611623  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||| ||  |||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2611624 caaagactactccaagtaaagcacgcttaactatggagttcttatagaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgttatagatagtaccaaacaa 2611723  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2611724 ttcttataagccttccttccaccatatagtctcatacctacatgacctcaggacccctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgtcgggag 2611823  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  2611824 ccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 2611862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 42515814 - 42515507
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccg-gtaggtaacccatccaa 103  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||| |    
T  42515814 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccg-gaaaatttccatgtaggtcacccatccca 42515716  T
Q  104 agagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 203  Q
    | | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42515715 aaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacacttc 42515616  T
Q  204 ttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccg 303  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |    
T  42515615 ttataagccttccttcaaccatgtagtctcatacctacacggcctcaggatccctctcattctgatgtgattcggttcgtctagaagctgtcgggagctg 42515516  T
Q  304 ctcattgtc 312  Q
    |||||||||    
T  42515515 ctcattgtc 42515507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 680090 - 679753
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgtttt-gtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccat 99  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||| |||||| | |||||| ||||||| |||| |||| ||||||    
T  680090 aagcattgtagactgac-ctacaaaccaacatgagtcttttcagcgtgtttttgttctcactcgcatgtttaccgcgaaacttcccggcaggtcacccat 679992  T
Q  100 ccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaaca 199  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  679991 ccaaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgggctaccaaaaagaatatgcatcttgttgatataggtagtacc-aaca 679893  T
Q  200 attcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttggga 299  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  679892 attcttataagccttccttcagccatgtactcccatacctacacgacctcaggatccctctcattctgatgtgattcagttcctctagaagctgtcggga 679793  T
Q  300 gccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    || |||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||    
T  679792 gcagctcattgtcgtgctttgtgcatcggcgaccactccc 679753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2189414 - 2189080
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||    
T  2189414 attgccgactgtccccacaaatcaacacgagtcttctcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcactcatcccaa 2189315  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2189314 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtgccaaacaattct 2189215  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| || |||| || | |||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  2189214 tataagccttctttcaaccatgcagtcccacacctgcacagcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgc 2189115  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  2189114 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 2189080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 35474011 - 35474331
Alignment:
Q  19 ctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtc 118  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  35474011 ctacaaaccaacacaagtcatttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgagaaaattcccggtacgtcacccatccaaagactactccaagtc 35474110  T
Q  119 aataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctacttt 218  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||   ||    
T  35474111 aaacacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataagtagtactaaacaattcttataagtctttctt 35474210  T
Q  219 caaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgcct 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||   |  |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  35474211 caaccatgtagtctcatacctacacgacctaaggatccctctcattccggtgtgattcgactgttctagaagttgtcgggaaccgctcattgtcgtgcct 35474310  T
Q  319 tatgcactggcgatcactccc 339  Q
    | ||||| | ||| |||||||    
T  35474311 tgtgcaccgacgaccactccc 35474331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 42515366 - 42515090
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| || | |||| || |||||||    
T  42515366 aagcattgccgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcacccgcacgcttaccgaaaaagttcctggtatgtcacccatc 42515267  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42515266 caaagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccaaaaagaaaatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 42515167  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattca 277  Q
    |||||||||| || | ||||| |||| |||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42515166 ttcttataagtcttccttcaatcatgcagtctcatacctgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattca 42515090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 29038892 - 29039221
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||    
T  29038892 aagcattgccgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcagtcacacgcttaccgggaaacttaccggtaggtcatccatc 29038991  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29038992 caaagactactccaagtcaagcacgcttaaatgtagagttcttatggaatggattatcaaaaagaagatgcatgttgttgatataggtagtaccaaacaa 29039091  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||  |||||||||||||||||||| |||          |||| |||||    
T  29039092 ttcttgtaagcctccattcaaccatgtagtcacatatctacacggcctcaggatgcctctcattccgatgtgattcggtt---------tctgtcgggag 29039182  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  29039183 ccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgatcactccc 29039221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 2193526 - 2193212
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  2193526 attgccgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 2193427  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||| ||||  |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2193426 aattgctccaaatcaagcacgcttaactgtggagttcctatgaaatgagctaccgaatagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 2193327  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||    ||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||     
T  2193326 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggtctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagctgtcaggagccgt 2193227  T
Q  305 tcattgtcgtgcctt 319  Q
    |||||||||||||||    
T  2193226 tcattgtcgtgcctt 2193212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 6747478 - 6747809
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||        |||||| ||| ||||| |||||||    
T  6747478 aagcattgccgactgaccctacaaaccaacacaagtcttttcaacttgttttgtcctcactcgcaagc--------aaacttcccgataggtcacccatc 6747569  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||   |||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747570 caaagactacgataagtcaagcacgcttaactgtggagtttttatggaataggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 6747669  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||| |||||    
T  6747670 ttcttataatccttccttcaaccatgtagtatcatacctacacggcctcaggatccctctcattccaatgtgattcagcttgtctagaagttgtcgggag 6747769  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccct 340  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  6747770 ccgctcattgtcatgccttgtgcaccggcgaccactccct 6747809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Original strand, 2941633 - 2941908
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  2941633 attgccgactgaccgcacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttctcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 2941732  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2941733 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 2941832  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||  |   |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2941833 tatcagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacggcctcaggatccctctcattctgatgtgattcagtt 2941908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9125229 - 9124954
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  9125229 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 9125130  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9125129 aattgctccgagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 9125030  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||||||| | | || ||||||  |||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9125029 tataagctttcctttaaccatacagtctcatacctgcacggcctcaagatctctctcattccgatgtgattcagtt 9124954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 22529107 - 22529418
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||    
T  22529107 aagcattgtcgactgaccctacaaaccaacatgagtcttttcagcgtattttgtcctcactcacacgcttaccgagaaacttctcagtaggtcacccatc 22529206  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| || |||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  22529207 caaagactactccaagtcaaacacgcttaactgtgaagttcttttgtaatgagttactgaaaagaagatgcatcttgtttatatagatagtaccaaacat 22529306  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||| |  |||||    
T  22529307 ttcttataagccttccttcaaccatgtaggcccatacttacatgacctcaggatccctctcattcggatatgattcggttcgtctagaagcaggcgggag 22529406  T
Q  301 ccgctcattgtc 312  Q
    ||||||||||||    
T  22529407 ccgctcattgtc 22529418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Original strand, 6718951 - 6719273
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||| || || |||||||| ||    
T  6718951 attgctgactgaccccacaaaccaacacgattcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaagttcccgatatgtcacccatcccaa 6719050  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6719051 -attactccaagtcaagcacgcttaactctggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 6719149  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||           |||||||||    
T  6719150 tataagcattccttcaaccatgtagtcccatacctacacagcctcaggatccctctcattccaatgtgattcggttcctc-----------gggagccgc 6719238  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  6719239 tcattggcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 6719273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Original strand, 13125011 - 13125287
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgtttt-gtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaa 103  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  13125011 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcctttcagcgtgtttttgtcctcactcgcacgcttactgggaaacttcccggtaggtcacccatccca 13125110  T
Q  104 agagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 203  Q
    | | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13125111 aaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaattc 13125210  T
Q  204 ttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||   ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13125211 ttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcagggcctcaagatccctctcattccgatatgattcagtt 13125287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 309
Target Start/End: Original strand, 28495495 - 28495788
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||           |||||||| |||||||| ||    
T  28495495 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgggttttgtcctcactcgcacgctttcc-----------cggtaggtcacccatcccaa 28495583  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||    
T  28495584 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctacctaaaagaagatgcatcttgttgatataggtaaaactcaacaattct 28495683  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    |||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28495684 tataagtcttccttcaaccatgtagtcccatacctacacgacctcaggatccctctcattccgatgggattcgattcctctagaagctgttgggagccgc 28495783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2466197 - 2465956
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  2466197 aagcattgtcgactgac-ctacaaactaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcacttgcatgcttaccgggaaatttcccggtaggtcacccatc 2466099  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |  | | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2466098 ccgaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcaacttgttgatataggtagtaccaaacaa 2465999  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacat 243  Q
     |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2465998 ctcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacat 2465956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 324
Target Start/End: Original strand, 29357341 - 29357650
Alignment:
Q  14 tgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactcc 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  |||| ||||| |||| |||| | |||||  |||| |||||     
T  29357341 tgaccctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgctttgttctcactcgcacgcttttcgaggaacttaccggaaggtcatccatcttaagactactct 29357440  T
Q  114 aagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcct 213  Q
    |||||||  ||| ||||||||  |||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  29357441 aagtcaaacacggttaactgtgtagttcttatgaaacgggctatcgaaaagaagatgcatcttgttgatatagttagtaccaaacaattcttataaacat 29357540  T
Q  214 actttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcg 313  Q
     | |||||||||| |||| ||||||| ||  ||||| ||||  |||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  29357541 tccttcaaccatgcagtcccatacctgcacgacctcgggatacctctcatt-cggtgtgattcagttcatctagaagttgtcgggagccgctcattgtcg 29357639  T
Q  314 tgccttatgca 324  Q
    |||||||||||    
T  29357640 tgccttatgca 29357650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 87 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 46425929 - 46425705
Alignment:
Q  87 gtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatatag 186  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46425929 gtaggtcacccatcataagactactccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaataagataccgaaaagaagatgcatcttgttgatatag 46425830  T
Q  187 gtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctcta 286  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||||    
T  46425829 gtaataccaaacaattcttataagccttatttcaaccatgtagtcccatacctacatggtctcaggatccctctcattccgatgtgattcggcttgtcta 46425730  T
Q  287 gaagctgttgggagccgctcattgt 311  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||    
T  46425729 gaagctgtcgggagccgctctttgt 46425705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 18833540 - 18833281
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || | | ||| |||||||    
T  18833540 acaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgtttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctcaaagtcaa 18833441  T
Q  121 taacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttca 220  Q
      |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |  |||    
T  18833440 acacgcttaactgtggagttcttatgtaattagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtactaaacaattcatataagctttccctca 18833341  T
Q  221 accatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    |||||| |||  |||||||  |   |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18833340 accatgcagttccatacctgtacggcctcaggaaccctctcattccgatgtgattcagtt 18833281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 7646351 - 7646528
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7646351 agcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgagaaacttcccggtaggtcacccatcc 7646450  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgtt 179  Q
     || | | |||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7646451 caaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 7646528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2465953 - 2465777
Alignment:
Q  55 cctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagc 154  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| || ||||||||| |||||||| || | | |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2465953 cctcactcgcatgcttaccgggaaatttcccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagc 2465854  T
Q  155 taccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtc 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2465853 taccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaactcttataagccttccttcaaccatgtagtc 2465777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25182615 - 25182363
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaa 120  Q
    |||| |||| |||||| |||| | ||||||||| |||| |||| ||||||   ||||||||| || | ||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  25182615 acaacccaatacgagtttttttagcgtgttttgccctcactcgaacgctttttgagaaacttcccagaaggtcctccatccaaagactactccaagtcaa 25182516  T
Q  121 taacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttca 220  Q
      || |||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  25182515 acacacttaactgtgaagttcttatggaatgagttaccgaaaataagatgtatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagtcttccttca 25182416  T
Q  221 accatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtga 273  Q
    |||||| |||||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  25182415 accatgcagtctcatacttgcacagtctcaggatctctctcattccgatgtga 25182363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 175 - 325
Target Start/End: Original strand, 26957603 - 26957753
Alignment:
Q  175 ttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26957603 ttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttctttcaaccatgtagttccatacctacacagcctcaagatccctctcattccgatgtgat 26957702  T
Q  275 tcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcac 325  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26957703 tcggttcctctagaagttgtcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcac 26957753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 339
Target Start/End: Original strand, 35527079 - 35527330
Alignment:
Q  87 gtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatatag 186  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  35527079 gtaggtcacccatgcaaagactactccaagtcaagcatgcttaactgtggagttcctatggaatggactactgaaaagaatatgcatcttgttgatatag 35527178  T
Q  187 gtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctcta 286  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||  | ||  ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  35527179 gtagcaccaaacaattcttataagccttctttcaaccaaccagtcccatatttgcacgacctcgggatccctctcatttcggtgtgattcggttcgtcta 35527278  T
Q  287 gaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | ||| |||||||    
T  35527279 gaagctgttgggagccgctcattg-cgtgtcttgtgcaccgacgaccactccc 35527330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 191
Target Start/End: Original strand, 13122380 - 13122567
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgtttt-gtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaa 103  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  13122380 attgccgattgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatccca 13122479  T
Q  104 agagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagt 191  Q
    | | | |||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13122480 aaattgctccaaatcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatatatgtagt 13122567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 43233534 - 43233350
Alignment:
Q  154 ctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcagga 253  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || ||||||  |||| ||||||||||   ||||| ||    
T  43233534 ctaccgaaaaaaagatgcatcttgttgatatagatagtaccaaacaattcttataagtcttcctttaaccatacagtcacatacctacacggcctcatga 43233435  T
Q  254 tctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactcc 338  Q
    || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  43233434 tccctctcatttcggtgtgattcggttcctctagaagctgttaggagccgctcattgtcgtgccttatgcaccggcgaccactcc 43233350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 126 - 280
Target Start/End: Original strand, 11517386 - 11517539
Alignment:
Q  126 cttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccat 225  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  11517386 cttaactgcggagttcttatggaatgagctaccgaaaagtagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttc-accat 11517484  T
Q  226 gtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    | |||| |||||||  |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11517485 gcagtcccatacctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcagtt 11517539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7646669 - 7646514
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||||    
T  7646669 acaaaccaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcggaaaactttccggtaggtcacccatcccaaaattgctccaagtcaa 7646570  T
Q  121 taacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatctt 176  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  7646569 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagttaccgaaaacaagatgcatctt 7646514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 161
Target Start/End: Original strand, 3305224 - 3305380
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3305224 attgctgactgatcctacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgttctcactcgcactcttaccaggaaactttccggtaggtcacccatccaaa 3305323  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaa 161  Q
    || |||||||| ||||  ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  3305324 gactactccaaatcaagcacgcttaactgtgaagtttttatgtaatgagctaccaaa 3305380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 280
Target Start/End: Original strand, 5406483 - 5406739
Alignment:
Q  25 accaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttac-cgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataa 123  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||   ||  ||||||||| | | || | |||||| || | | ||| |||||||  |    
T  5406483 accaacacgagtgttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacgttttttcggaaaactttccagaaagtcatccatcccaaaattgctcaaagtcaagca 5406582  T
Q  124 cgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaacc 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||    
T  5406583 cgcttaactgtggagttcttatggtttgggcaaccaaaaataagatgcatcttgttgatataggtaataccaaacaattcttataaatcttccttcaacc 5406682  T
Q  224 atgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||| |||| ||||||  ||  || | |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  5406683 atgcagtcccataccggcacgactttaggatccctatcattccgatgtgattcagtt 5406739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 191 - 337
Target Start/End: Original strand, 3305374 - 3305520
Alignment:
Q  191 taccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaag 290  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3305374 taccaaacaattctcataagccttcattcaaccatgtagtcccatacttacacggcctcaggatccccctcatttcgatgtgattcggttcctctagaag 3305473  T
Q  291 ctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactc 337  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  3305474 ctgtcgggagctgctcattgtcgtgccttatccaccggcgaccactc 3305520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 26421632 - 26421868
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| |||||  | |  ||||||||| ||| || | || || |||||||| ||   |||| ||| |||    
T  26421632 aagcaatgacgactgaccctacataccaacacgagtattttcggcattctttgtcctcactcacatgttttccaagaaacttcccataaggtcaccaatc 26421731  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    |||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  26421732 caaagactactcgaagccaaacacgcttaactgtgtagttcttatggaatgggctaccgaaaagaagattcatcttgttggtatagggagtacctaacaa 26421831  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatac 237  Q
    ||||||| |||||   |||||||||| ||||||||||    
T  26421832 ttcttatgagccttacttcaaccatgcagtctcatac 26421868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9623388 - 9623207
Alignment:
Q  94 acccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtac 193  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  9623388 acccatccaaagactagtccaagtcaaacacgcttaactgtggagttcttatagaatgaactaccgaaa-gaagatgcatcttgttgatataggtggtat 9623290  T
Q  194 caaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattc 276  Q
    |||||||||||||||||    | ||| |||||| |||||||| | | || |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  9623289 caaacaattcttataagtactccttctaccatggagtctcatgcatgcacaacctctggatccctctcattccattgtgattc 9623207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 31406479 - 31406680
Alignment:
Q  19 ctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtc 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||| |  |||||| | |  | |||  ||||||||||||| ||||||||  |    
T  31406479 ctacaaaccaacacatgtcttttcagcatgttttgtcctcactcacacgctttctaagaaacgt-ctagaaggccacccatccaaagactactccaaagc 31406577  T
Q  119 aataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctacttt 218  Q
    |    ||||||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |  ||||    
T  31406578 a----cgcttaactgtggagttcttatgaaacgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtaacaccaaacaattctaataagtcatcttt 31406673  T
Q  219 caaccat 225  Q
    |||||||    
T  31406674 caaccat 31406680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16192471 - 16192368
Alignment:
Q  123 acgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaac 222  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||     
T  16192471 acgcttcactgtatagttcttatggaatgggctaccaaaacgaagatgcatcttgttgatgtaggtaataccaaacaattcttataatccttcattcaat 16192372  T
Q  223 catg 226  Q
    ||||    
T  16192371 catg 16192368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 127 - 309
Target Start/End: Original strand, 36015409 - 36015591
Alignment:
Q  127 ttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatg 226  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  36015409 ttaactgtgaagttcttatggaatgggctatttaaaagaagaggcatcttgttgatatatgtagtaccaaacaattcttttaagctttccttcaaccatg 36015508  T
Q  227 tagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcatt 309  Q
     |||||||||| | ||   |||  ||||| ||||||||||| |||||||  |||| |||| || || | | ||||||||||||    
T  36015509 gagtctcatacttgcactgccttgggatccctctcattccggtgtgatttggttcgtctataaactttcgagagccgctcatt 36015591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 158
Target Start/End: Original strand, 43776182 - 43776319
Alignment:
Q  21 acaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |  |||||| || | |||| |||||| | || | | |||||||||||    
T  43776182 acaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcttcattcgcacgcttactggaaaacttccccgcaggtcacccattccaaaattgctccaagtcaa 43776281  T
Q  121 taacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctacc 158  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43776282 gcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctacc 43776319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 235
Target Start/End: Original strand, 31743834 - 31743930
Alignment:
Q  139 ttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcat 235  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| | | |||||||||| ||||||||    
T  31743834 ttcttatggaatgggctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatatagatagcaccaaaccattcttataagcattccttcaaccatgcagtctcat 31743930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 233 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2463684 - 2463578
Alignment:
Q  233 catacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgat 332  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||     
T  2463684 catacctacatggcctcaggaaccctctcattccggtgtgtttcggttcctctagaagctgttaggagccgttcattgtcgtgccttgtgcaccggcgac 2463585  T
Q  333 cactccc 339  Q
    |||||||    
T  2463584 cactccc 2463578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 6747948 - 6748022
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccga 75  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6747948 aagcattgccgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccga 6748022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11372601 - 11372483
Alignment:
Q  125 gcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaacca 224  Q
    |||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11372601 gcttaactttggagttcttatggtttgagctaccaaaaataacatgcatcatgttggtacaggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaacca 11372502  T
Q  225 tgtagtctcatacctacat 243  Q
    |  | | ||||||||||||    
T  11372501 tacaatttcatacctacat 11372483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20966199 - 20966055
Alignment:
Q  127 ttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatg 226  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||| |  | ||||| ||||    
T  20966199 ttaactgtgaagttcttatggaatgagctaccgaaaataatatacatcttgttggtataggtattacaaaataattcttataagtcatccttcaatcatg 20966100  T
Q  227 tagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgt 271  Q
     ||||||||||||| ||  ||||| || | |||||||||||||||    
T  20966099 cagtctcatacctagatggcctcaagaccactctcattccgatgt 20966055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 43233227 - 43233140
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggt 92  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||||    
T  43233227 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaacttctcggtaggt 43233140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 127 - 225
Target Start/End: Original strand, 26421303 - 26421401
Alignment:
Q  127 ttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccat 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | |||||||||    
T  26421303 ttaactgtggagttcttatggaatggactaccgaaaaaaatatgcatcttgttgatataggtagtatcaagcaattcttataagtcttccttcaaccat 26421401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10430792 - 10430699
Alignment:
Q  246 cctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  10430792 cctcaggaaccctctcattccggtgtgatacggttcctctagaagctgtcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 10430699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 203
Target Start/End: Original strand, 7461345 - 7461424
Alignment:
Q  123 acgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  7461345 acgcttaactgtagagttcttatg-aatgaactaccaaaaagaagatgtatcttgtttatatagttagtatcaaacaattc 7461424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33316832 - 33316677
Alignment:
Q  171 catcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatg 270  Q
    ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||| ||  || |||  || | |||||||||||||    
T  33316832 catcttgttgatataagtattgtcaaacaattcttataatttttccttcaaccatgtagtctcatacctgcacgacatcaaaatttatctcattccgatg 33316733  T
Q  271 t-gattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcac 325  Q
    | |||||||||  ||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  33316732 tggattcagtttgtctagaagctgtcatgagccgctcgttgtcatgccttgtgcac 33316677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 339
Target Start/End: Original strand, 16811900 - 16812048
Alignment:
Q  183 ataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcc 282  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||   ||  ||     |||||||||| |||||||||| ||| |    
T  16811900 atagatagtacaaaacaattcttataagcattccttcaaccatgtagtctcatacctac---acggca-----tctctcattctgatgtgattcggtttc 16811991  T
Q  283 tctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| | |||||||    
T  16811992 tttagaagccgtcgggagccgctcattggcgtgtcttgtgcaccggcaaccactccc 16812048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1628899 - 1628786
Alignment:
Q  89 aggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggt 188  Q
    |||| |||||||| || | | ||||||| |||  || ||||||| | |||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  1628899 aggtcacccatcccaaaattgctccaagccaaatacacttaactatggagttcttatggtatgggcttcaaaaaagaagatgcatcttgttgatatcgat 1628800  T
Q  189 agtaccaaacaatt 202  Q
    ||||||||||||||    
T  1628799 agtaccaaacaatt 1628786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37672321 - 37672196
Alignment:
Q  114 aagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcct 213  Q
    |||||||  ||||||||||||  | |||||||| ||| | ||| |||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||| |||    
T  37672321 aagtcaaacacgcttaactgtgtatttcttatgaaatcaactaacaaaaagaagttgcatcttgttggtacaagtagtaccaaacaattattataaacct 37672222  T
Q  214 actttcaaccatgtagtctcatacct 239  Q
      || |||||||| ||||| ||||||    
T  37672221 ttttgcaaccatgcagtcttatacct 37672196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 280
Target Start/End: Original strand, 13124757 - 13124852
Alignment:
Q  185 aggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||   ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||    
T  13124757 aggtagtaccacacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaagatccctctcattccaatatgattcagtt 13124852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6585731 - 6585647
Alignment:
Q  154 ctaccaaaaagaagatgcatctt--gttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcata 236  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||| | |||||||    
T  6585731 ctaccaaaaggaagatgtatcttttgttgatataggtagtaccaaacaatttttataagtcttctttcaatcatgcaatctcata 6585647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 36422655 - 36422575
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactt 82  Q
    ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||    
T  36422655 agcattgtcgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagtgtgttttgtcctcactcgcacacttgccgggaaactt 36422575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2490136 - 2489982
Alignment:
Q  178 ttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtg-attc 276  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | | ||||| |||| |||| ||||| | || || |||| ||| || ||||||  |||||| ||||    
T  2490136 ttgatataggtagtaacaaacacttcttataagcattccttcaatcatgcagtcacatacgtgcacaatctcaagatttcactcatttagatgtgaattc 2490037  T
Q  277 agttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcga 331  Q
    | |||  ||||||| |||  ||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  2490036 aattcacctagaagttgtcaggaaccgctcattgtcatgccttgtgcaccggcga 2489982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 58
Target Start/End: Original strand, 26419111 - 26419164
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctc 58  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26419111 attgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacatgttttgtcctc 26419164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11373037 - 11372901
Alignment:
Q  137 agttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcata 236  Q
    |||||||||||  |  ||||| ||||||||||  |||||||||| ||||| || ||  |||||||||||| ||| || | |||||||||| | |||||||    
T  11373037 agttcttatggtttaggctacgaaaaagaagactcatcttgttggtatagatactatgaaacaattcttacaagtcttcattcaaccatgcaatctcata 11372938  T
Q  237 cctacataacctcaggatctctctcattccgatgtga 273  Q
    |||||||  ||| |||| | ||||||||  |||||||    
T  11372937 cctacatggccttaggaaccctctcattttgatgtga 11372901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 31743761 - 31743827
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacg 67  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||    
T  31743761 aagcattgtcgactaaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgcgttgacctcactcgcacg 31743827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 67
Target Start/End: Original strand, 36015345 - 36015407
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacg 67  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| ||||    
T  36015345 attgccgactaactctacaaactaacacgagtctttttagcgtattttgtcctcactcacacg 36015407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 11372713 - 11372660
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctc 58  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11372713 attgctgagtgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctc 11372660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 1490 - 1156
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  1490 attgtcgactgacgccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 1391  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1390 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtttatataggtagtaccaaacaattct 1291  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgc 304  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| |||  |||||||| |  |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  1290 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcatggcctcaggaaccgtctcattccggtgtgattcggttcctctagaagttgtcaggagccgc 1191  T
Q  305 tcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  1190 tcattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactccc 1156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3015 - 2678
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  3015 agcattgccgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtctcccatcc 2916  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 201  Q
     || | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2915 caaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaatatgcatcttgttgatataggtagtacccaacaat 2816  T
Q  202 tcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagc 301  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||    
T  2815 tcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacacggcctcaggatccctctcatttcgatgtgattcgattcctctagaagttgtcgggagc 2716  T
Q  302 cgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactccc 339  Q
    | |||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||    
T  2715 cactcattgtcgtgccttgtgctccggcgaccactccc 2678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 155030 - 154701
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  155030 agcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactagcacacttaccgagaaacttcccggtaggtcacccattc 154931  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 201  Q
     || | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  154930 caaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctactgaaaagaagatgcatcttgttgatacaggtagtacccaacaat 154831  T
Q  202 tcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagc 301  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||   |||||||| | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  154830 tcttataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctacaaggcctcaggagccctctcattccggcgtgattcggttcctctagaagctgtcgagagc 154731  T
Q  302 cgctcattgtcgtgccttatgcactggcga 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  154730 cgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcga 154701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 154575 - 154503
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccg 74  Q
    ||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  154575 agcattgtcgactgaccccacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccg 154503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 151686 - 151584
Alignment:
Q  227 tagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcact 326  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||     
T  151686 tagtcccatacctacaaggcctcaggatc-ctctcatttcggcgtgattcggttcctctagaagctgtcgaga-ccgctcattgtcgtgccttgtgcacc 151589  T
Q  327 ggcga 331  Q
    |||||    
T  151588 ggcga 151584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 4834 - 4506
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  4834 aagcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatc 4735  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    | || | | |||||||| ||  || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4734 ccaa-attgctccaagttaagcacacttaactgtggagttcttataaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 4636  T
Q  201 ttcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggag 300  Q
    ||||| ||| ||| | |||||||||| |||| ||||||| |||  |||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  4635 ttcttctaaaccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcatggcctcaggaaccctctccttccgatgtgattcggttcctctagaagctgtcaggag 4536  T
Q  301 ccgctcattgtcgtgccttatgcactggcg 330  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4535 ccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcg 4506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5294 - 4953
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatc 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| || | ||||||| |||||||    
T  5294 aagcattgtcgactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaatttccaggtaggtcacccatc 5195  T
Q  101 caaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaa 200  Q
    | || | | |||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5194 ccaa-attgctccaagttaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaa 5096  T
Q  201 t-----tcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgtt 295  Q
    |     |||| ||| ||| | |||||||||| |||| ||||||| |||  |||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||     
T  5095 ttcttctcttttaaaccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcatggcctcaggaaccctctcattccggtgtgattcggttcctctagaagttgtc 4996  T
Q  296 gggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgatcactcc 338  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  4995 aggagccgctaattgtcgtgccttgtgcaccggcgaccactcc 4953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 5397 - 5323
Alignment:
Q  1 aagcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtg-ttttgtcctcgctcgcacgcttaccg 74  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||    
T  5397 aagcattgtcgacttaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgtttttgtcctcactcgcacacttaccg 5323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19236 - 18961
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  19236 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 19137  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19136 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgaaatgagctaccgaaaagaagatgaatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 19037  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||   |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19036 tataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctctggatccctctcattccgatgtgatttagtt 18961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 279
Target Start/End: Original strand, 18209 - 18271
Alignment:
Q  217 ttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagt 279  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||   |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18209 ttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctctggatccctctcattccgatgtgattcagt 18271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Original strand, 2086 - 2361
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  2086 attgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaatgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccggaaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 2185  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2186 aattgctccaagtcaagcacgcttaactattgagttcttatggaataagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 2285  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||   ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2286 tataagccttccttcaaccatgtagtcccatacctgcacggccttaggatccttctcattccgatgtgattcagtt 2361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 10572 - 10295
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10572 agcattgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccaggaaacttcccggtaggtcacccatcc 10473  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaat 201  Q
    ||| | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10472 aaa-attgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaaaaagatgcatcttgttgatataggtagtactaaacaat 10374  T
Q  202 tcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    |||||||||||| | || ||||||| |||| ||||| | ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10373 tcttataagccttccttgaaccatgcagtcccatacatgcacggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcagtt 10295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0499 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 282
Target Start/End: Original strand, 1927 - 2204
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  1927 attgtcgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtattttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 2026  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2027 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 2126  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcc 282  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||   |||||||| | || |||||| | |||||||| |||||    
T  2127 tataagccttccttcaaccatgcagtctcatacctgcacggcctcaggaaccctttcattctggtgtgattcggttcc 2204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 280
Target Start/End: Original strand, 107342 - 107614
Alignment:
Q  8 gccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagag 107  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||| || |     
T  107342 gccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacgcttaccgggaaacttcccggtacgtcacccatcccaaaat 107441  T
Q  108 tactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttat 207  Q
    | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  107442 tgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatattggtagtatcaaacaattcttat 107541  T
Q  208 aagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    |||||| | |||||||||| |||| |||||||  |   |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  107542 aagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgtacggcctcagaatccctctcattccgatgtgattcagtt 107614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 105990 - 105715
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||||| || ||||| ||    
T  105990 attgccgactgaccctataaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttaccaggaaacttctcggtaggtcacacatcccaa 105891  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  105890 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcattttgttgatataggtagtaccaaacaattct 105791  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||||||||| | ||||||| || |||  |||||||  |   |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  105790 tataagccttccttcaaccctgcagttccatacctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtgatttagtt 105715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 280
Target Start/End: Original strand, 162553 - 162829
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtctttt-caacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaa 103  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| | ||||||| || ||||| |    
T  162553 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtctttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttatcgcgaaacttccaggtaggtcactcatccca 162652  T
Q  104 agagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattc 203  Q
    |   | |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  162653 aagttgctccaagtcaagcacgcttaactgcggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttaatataggtagtaccaaacaattc 162752  T
Q  204 ttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    ||||||| || | |||||||||| |||| |||||||  |   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  162753 ttataagtcttccttcaaccatgcagtcacatacctgtacggcctcaggatccctctcattccgatgtaattcagtt 162829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 273
Target Start/End: Original strand, 69691 - 69959
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||| ||||||| || | |||||| || | |||| |||||||||||    
T  69691 attgccgactgaaccaacaaaccaacacgagtctttttagcgtggtttgtcatcactcacacgctttcccataaacttccctgaaggtcacccatccaaa 69790  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
    || |||||| ||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  69791 gactactcctagtcaagcccgcataactgtggagttcttatggaatgagctaatgaaaaaaagatgcatcatgttgatataggtagtaccaaacaattat 69890  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtga 273  Q
    ||||||| | | |||||| ||| |||||||||||| ||||  || |||||| ||||||||  |||||||    
T  69891 tataagcattccttcaacgatgcagtctcatacctgcatagtcttaggatccctctcattatgatgtga 69959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Original strand, 163010 - 163181
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||    
T  163010 attgccgactggccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgaacgcttaccgagaaacttcccgataggtcacccatcccaa 163109  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatctt 176  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  163110 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaacaagatgcatctt 163181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 163341 - 163167
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||  |||||||| |||||||| ||    
T  163341 attgtcgacagaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttactgggaaacttctcggtaggtcacccatcccaa 163242  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgtt 179  Q
     | | |||||||||||  |||||||||||| || ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  163241 aattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggaattcttaaagaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgtt 163167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 245352 - 245084
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || | |||| |||||||  ||    
T  245352 attgccgactgaccccgcaaaccaacacgagtcttttcaccgtgttttgtcctcactcacacgctttccgagaaacttcccagaaggtcacccatctcaa 245253  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | | ||| |||||||  ||||||   ||| ||||||||||||  |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  245252 aattgctctaagtcaagcacgctt---tgtggagttcttatggtttaggctacc-gaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 245157  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattca 277  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  245156 tataagcctcccttcaaccatgtagtcccatacctacatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattca 245084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 245667 - 245510
Alignment:
Q  123 acgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaac 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  245667 acgcttaactgtggagttcttatggtttaggctactgaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcatcccttcaac 245568  T
Q  223 catgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    |||| |||| ||||||||||    |||| |||| || |||||  ||||||||||||||    
T  245567 catgaagtcccatacctacacggactcaagatccctttcattatgatgtgattcagtt 245510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 245814 - 245676
Alignment:
Q  9 ccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagt 108  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| ||   || | |||||||   | | |    
T  245814 ccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcactcacacactttccgagaaacttcccaaaagatcacccatctcgaaatt 245715  T
Q  109 actccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatgg 147  Q
     |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  245714 gctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatgg 245676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 189
Target Start/End: Original strand, 13409 - 13593
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  13409 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcgcacgcttacaaagaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 13508  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggta 189  Q
     | | ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13509 aattgctcaaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaagaagatgcatcttgttgatataggta 13593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0557
Description:

Target: scaffold0557; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2366 - 2150
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||         ||||||| |||||||  ||    
T  2366 attgtcgactgatcctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttctcctcactcgcacgcttaccgag---------ggtaggtcacccatcataa 2276  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
    || ||||||| |||||  | |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2275 gactactccatgtcaagcatgcttaactgtggagttcttaaggaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgtttatatagggagtaccaaacaattct 2176  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagt 230  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||    
T  2175 tataagccttccttcaaccatgtagt 2150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 799 - 686
Alignment:
Q  226 gtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcac 325  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  799 gtagtcccatacctacatggcctcaggatccctctcattccgatgtgattcggttcctctataagttgtcgggagccgctcattgtcgtaccttgtgcac 700  T
Q  326 tggcgatcactccc 339  Q
      ||| ||||||||    
T  699 cagcggtcactccc 686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 176
Target Start/End: Original strand, 14575 - 14749
Alignment:
Q  2 agcattgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatcc 101  Q
    ||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14575 agcattgtcggctgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcatgttttgtcctcactcgcacacttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcc 14674  T
Q  102 aaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatctt 176  Q
     || | | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14675 caaaattgctccaagtcaagcacgcttaactgtggagttcttatggaatgagctaccgaaaacaagatgcatctt 14749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 163 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23785 - 23617
Alignment:
Q  163 agaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctca 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||   ||||| || | ||||||    
T  23785 agaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagccttccttcaaccatgcagtcccatacctgcacggcctcaagaaccctctca 23686  T
Q  263 ttccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcga 331  Q
    || || |||||||| ||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23685 tttcggtgtgattcggttcctctagatgccatcaggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcga 23617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 317
Target Start/End: Original strand, 3987 - 4170
Alignment:
Q  134 tagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctc 233  Q
    ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||| |    
T  3987 tagagctcttataaaatgggctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatacaggtagtaccaaacaattcttataagcattccttcaacaatgcagtccc 4086  T
Q  234 atacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgcc 317  Q
    |||||| ||   |||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |   |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  4087 atacctgcacggcctcgggatccctctcattctggtgtgattcaatagatctagaagttgttgggagtcgctcatagtcgtgcc 4170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 158 - 280
Target Start/End: Original strand, 142303 - 142425
Alignment:
Q  158 caaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctc 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||| |||| ||||||| ||   |||||||||| |    
T  142303 caaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataaacattccttcaaccatgaagtcccatacctgcacggcctcaggatccc 142402  T
Q  258 tctcattccgatgtgattcagtt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  142403 tctcattccgatgtgattcagtt 142425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26338 - 26032
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    |||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||||  ||||||||||||    || | || ||||| ||    
T  26338 attgccgattgatcctacaaatcaacacgagtcttttcagcgtgttatgttctccctcgcaagcttttcgagaaactttctataagctcactcatcctaa 26239  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattct 204  Q
     | |||||||||||||  || ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||      
T  26238 aaatactccaagtcaagcacacttaactg--gagttcttataaaatgagctaccaaaaagaagatgcatcatgttgatatatgtagtaccaaaaaatttg 26141  T
Q  205 tataagcctactttcaaccatgtagtctcatacctacataacctcaggatctctctcattccgatgt-gattcagttcctctagaagctgttgggagccg 303  Q
    ||||||||    | |||||||| ||||||| |||| ||   ||| |||||| ||||| ||| |||||  |||| ||||  ||| |||||||  |||||||    
T  26140 tataagccattatgcaaccatgaagtctcacacctgcacggccttaggatccctctctttctgatgtaaattcggttcgcctataagctgtcaggagccg 26041  T
Q  304 ctcattgtc 312  Q
    |||||||||    
T  26040 ctcattgtc 26032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16152 - 16071
Alignment:
Q  159 aaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcataccta 240  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |  | |||||| ||| | |||||||||||    
T  16152 aaaaaaaagaggcatcatgttgatatagatagcaccaaacaattcttacaagtcatcattcaactatgcaatctcataccta 16071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 580 - 421
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaa 104  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| ||    
T  580 attgccgactgaccccacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgttttgtcctcactcacatgcttatcgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaa 481  T
Q  105 gagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaag 164  Q
     | | ||||| |||||  |||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  480 aattgctccatgtcaagcacgcttaactatggagattttatggaatgagctaccgaaaag 421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0442 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0442
Description:

Target: scaffold0442; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 233 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2547 - 2439
Alignment:
Q  233 catacctacataacctcaggatctctctcattccgatgtgattcagttcctctagaagctgttgggagccgctcattgtcgtgccttatgcactggcgat 332  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2547 catacctacatggcctcaggatccctctcattctgatgtgattcggttcctctataagttttcgggagccgctcattgtcgtgccttgtgcaccggcgat 2448  T
Q  333 cactccctt 341  Q
    |||||||||    
T  2447 cactccctt 2439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0442; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 45 - 1
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgt 49  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45 attgcctactgaccctacaaaccaacacgagtcttttcagcgtgt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 134
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1706
Alignment:
Q  10 cgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagta 109  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || | |     
T  1582 cgactgaccccacaaaccaacacgagtctttttagcgtgttttgtcctcactcacatgcttaccgggaaacttcccggtaggtcacccatcccaaaattg 1681  T
Q  110 ctccaagtcaataacgcttaactgt 134  Q
    |||||||||||  ||||||||||||    
T  1682 ctccaagtcaagcacgcttaactgt 1706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14922 - 14805
Alignment:
Q  94 acccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctaccaaaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtac 193  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||  |||||||||  |||||  |||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  14922 acccatccaaagaccactccaagtcaaacatgcttaactgtgaagttcttattcaatgaattaccgaaaagacgatgcatcttattgatataggtattac 14823  T
Q  194 caaacaattcttataagc 211  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14822 caaacaattcttataagc 14805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 45497 - 45425
Alignment:
Q  164 gaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcctactttcaaccatgtagtctcata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | |||||| |||||||| ||||    
T  45497 gaagatacatcttgttgatataggtagtaccaaataattctcataagtcttccttcaacaatgtagtcacata 45425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 157
Target Start/End: Original strand, 246704 - 246793
Alignment:
Q  68 cttaccgagaaactttccggtaggtaacccatccaaagagtactccaagtcaataacgcttaactgtagagttcttatggaatgagctac 157  Q
    ||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| | ||  ||| |||| | ||||||||||||||| || |||||    
T  246704 cttaccgggaaacttaccagtaggtcacccatccaaagactactccaaattaagcacgattaattatagagttcttatggattgggctac 246793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 52
Target Start/End: Original strand, 62983 - 63030
Alignment:
Q  5 attgccgactgactctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgtttt 52  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  62983 attgccgactgaccccacaaaccaatacgagtcttttcagcgtgtttt 63030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 72
Target Start/End: Original strand, 37203 - 37256
Alignment:
Q  19 ctacaaaccaacacgagtcttttcaacgtgttttgtcctcgctcgcacgcttac 72  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||    
T  37203 ctacaaaccaacacgaatcttttcagcgtgtttttccctcactcgcacgtttac 37256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 213
Target Start/End: Original strand, 44752 - 44805
Alignment:
Q  160 aaaagaagatgcatcttgttgatataggtagtaccaaacaattcttataagcct 213  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  44752 aaaagaagtggcatcttgttggtaccggtaataccaaacaattcttataagcct 44805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University