View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17358_high_5 (Length: 287)

Name: NF17358_high_5
Description: NF17358
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17358_high_5
NF17358_high_5
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (14-287)||(39507-39780)
scaffold0010 (69-285)||(44656-44872)
scaffold0010 (44-189)||(4870-5015)
scaffold0010 (33-270)||(14298-14535)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (14-287)||(26091956-26092229)
chr7 (12-287)||(26115746-26116021)
chr7 (14-287)||(13965826-13966099)
chr7 (14-287)||(40924975-40925248)
chr7 (14-287)||(49155119-49155392)
chr7 (14-287)||(21755230-21755503)
chr7 (14-287)||(12459446-12459719)
chr7 (14-287)||(14283532-14283805)
chr7 (14-287)||(16947630-16947903)
chr7 (14-285)||(14140499-14140770)
chr7 (14-287)||(15343249-15343522)
chr7 (14-287)||(11385587-11385860)
chr7 (14-287)||(13024163-13024435)
chr7 (14-285)||(13676271-13676542)
chr7 (14-285)||(12798659-12798930)
chr7 (14-225)||(14261404-14261615)
chr7 (14-285)||(15099761-15100032)
chr7 (12-287)||(18051109-18051384)
chr7 (14-285)||(19149831-19150102)
chr7 (14-285)||(20749230-20749501)
chr7 (14-230)||(12203958-12204174)
chr7 (33-287)||(14957371-14957625)
chr7 (33-270)||(11550301-11550538)
chr7 (33-270)||(44788550-44788787)
chr7 (33-270)||(14335230-14335467)
chr7 (33-247)||(15146122-15146336)
chr7 (33-270)||(8710439-8710676)
chr7 (33-270)||(13688875-13689112)
chr7 (33-270)||(18180577-18180814)
chr7 (33-270)||(11234412-11234649)
chr7 (33-270)||(18587370-18587607)
chr7 (14-270)||(17703635-17703891)
chr7 (33-270)||(15158256-15158493)
chr7 (33-245)||(9591223-9591435)
chr7 (29-247)||(15627381-15627599)
chr7 (33-270)||(12690336-12690572)
chr7 (14-189)||(14042610-14042785)
chr7 (14-189)||(14352640-14352815)
chr7 (125-270)||(8200882-8201027)
chr7 (143-270)||(10873524-10873651)
chr7 (35-88)||(13459049-13459102)
chr7 (35-87)||(7826917-7826969)
chr7 (35-87)||(27104975-27105027)
chr7 (35-87)||(27173298-27173350)
chr7 (35-80)||(4442951-4442996)
chr7 (33-89)||(16726640-16726696)
chr7 (35-80)||(14207343-14207388)
chr7 (35-80)||(14216033-14216078)
chr7 (44-88)||(38356-38400)
[»] chr4 (45 HSPs)
chr4 (14-287)||(3261965-3262238)
chr4 (14-287)||(44659037-44659310)
chr4 (14-287)||(29450708-29450981)
chr4 (14-287)||(11204403-11204676)
chr4 (14-285)||(20892861-20893132)
chr4 (14-224)||(16150527-16150737)
chr4 (14-224)||(16154673-16154883)
chr4 (12-287)||(51603961-51604236)
chr4 (14-285)||(15073189-15073460)
chr4 (14-287)||(27903213-27903486)
chr4 (14-195)||(14993538-14993719)
chr4 (12-188)||(53750639-53750815)
chr4 (14-155)||(15266736-15266877)
chr4 (86-285)||(15354283-15354482)
chr4 (31-247)||(14696969-14697185)
chr4 (14-102)||(7357280-7357368)
chr4 (33-247)||(14162338-14162552)
chr4 (33-287)||(18224376-18224630)
chr4 (33-270)||(12479445-12479682)
chr4 (33-270)||(16233922-16234159)
chr4 (33-285)||(8389242-8389494)
chr4 (33-249)||(14683433-14683649)
chr4 (33-270)||(17092079-17092316)
chr4 (33-270)||(19634981-19635218)
chr4 (33-270)||(23958592-23958829)
chr4 (14-189)||(15946-16121)
chr4 (33-270)||(8050553-8050790)
chr4 (33-270)||(14300909-14301146)
chr4 (40-249)||(15144829-15145038)
chr4 (33-270)||(40475885-40476122)
chr4 (33-270)||(19775723-19775960)
chr4 (33-270)||(27714181-27714418)
chr4 (33-270)||(16250780-16251017)
chr4 (14-270)||(16350465-16350721)
chr4 (14-115)||(16219188-16219289)
chr4 (14-115)||(16222508-16222609)
chr4 (151-231)||(15258811-15258891)
chr4 (33-171)||(13513294-13513432)
chr4 (35-87)||(14999674-14999726)
chr4 (211-285)||(8708737-8708811)
chr4 (35-87)||(15290350-15290402)
chr4 (14-58)||(15354247-15354291)
chr4 (33-81)||(18604749-18604797)
chr4 (35-87)||(12340059-12340111)
chr4 (44-88)||(18546820-18546864)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (14-287)||(48425747-48426020)
chr1 (14-287)||(52988615-52988888)
chr1 (14-287)||(31537240-31537513)
chr1 (14-287)||(37679923-37680196)
chr1 (14-287)||(38910069-38910342)
chr1 (14-287)||(20297255-20297528)
chr1 (14-188)||(20074952-20075126)
chr1 (14-287)||(24096858-24097131)
chr1 (17-285)||(19857150-19857418)
chr1 (14-285)||(22015988-22016259)
chr1 (14-230)||(18710316-18710532)
chr1 (14-285)||(20833143-20833414)
chr1 (123-287)||(12200392-12200556)
chr1 (14-285)||(21739279-21739550)
chr1 (14-287)||(20854003-20854276)
chr1 (14-230)||(21742795-21743011)
chr1 (14-247)||(16378977-16379210)
chr1 (40-270)||(20081645-20081875)
chr1 (33-270)||(16347857-16348094)
chr1 (33-270)||(51330754-51330991)
chr1 (14-270)||(17042258-17042514)
chr1 (14-189)||(21751988-21752163)
chr1 (33-270)||(21833162-21833399)
chr1 (33-270)||(21842072-21842309)
chr1 (33-270)||(33388291-33388528)
chr1 (40-220)||(22496525-22496705)
chr1 (33-270)||(24785119-24785356)
chr1 (33-270)||(19109228-19109465)
chr1 (33-270)||(41350930-41351167)
chr1 (33-162)||(21228818-21228947)
chr1 (35-87)||(20828656-20828708)
chr1 (35-87)||(20928097-20928149)
chr1 (31-75)||(21045384-21045428)
chr1 (44-89)||(22401633-22401678)
chr1 (35-87)||(20528096-20528148)
chr1 (14-53)||(21961135-21961174)
chr1 (38-87)||(41215127-41215176)
chr1 (35-86)||(22133016-22133067)
chr1 (14-69)||(22435976-22436031)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (14-287)||(25850814-25851087)
chr5 (14-287)||(14884344-14884617)
chr5 (14-287)||(20345024-20345297)
chr5 (14-287)||(22505421-22505694)
chr5 (14-287)||(23078258-23078531)
chr5 (14-285)||(23563521-23563792)
chr5 (12-287)||(17266685-17266960)
chr5 (14-287)||(22464692-22464965)
chr5 (14-230)||(28892295-28892511)
chr5 (14-285)||(21561378-21561649)
chr5 (14-285)||(21983530-21983801)
chr5 (14-287)||(20778655-20778928)
chr5 (14-287)||(20824195-20824468)
chr5 (17-186)||(21631755-21631924)
chr5 (33-270)||(29473445-29473682)
chr5 (33-249)||(21882572-21882788)
chr5 (33-270)||(14997111-14997348)
chr5 (33-270)||(16359279-16359516)
chr5 (33-270)||(18781891-18782128)
chr5 (33-270)||(22330259-22330496)
chr5 (33-270)||(27521183-27521420)
chr5 (33-270)||(27613133-27613370)
chr5 (33-270)||(34569271-34569508)
chr5 (33-270)||(40711557-40711794)
chr5 (33-270)||(41773619-41773856)
chr5 (14-285)||(26736080-26736351)
chr5 (33-270)||(19772737-19772974)
chr5 (33-270)||(22350696-22350933)
chr5 (33-270)||(27665862-27666099)
chr5 (33-270)||(37288868-37289105)
chr5 (14-270)||(25429198-25429454)
chr5 (33-270)||(20803374-20803611)
chr5 (33-270)||(27682772-27683009)
chr5 (39-189)||(23474053-23474203)
chr5 (33-270)||(22137445-22137682)
chr5 (14-115)||(21332339-21332440)
chr5 (33-186)||(23460832-23460985)
chr5 (125-270)||(21342878-21343023)
chr5 (33-135)||(23525963-23526065)
chr5 (35-87)||(23508626-23508678)
chr5 (35-87)||(24584152-24584204)
chr5 (14-89)||(21410092-21410167)
chr5 (142-230)||(20311667-20311755)
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (14-287)||(28756776-28757049)
chr3 (14-287)||(10408425-10408698)
chr3 (14-287)||(47126401-47126674)
chr3 (14-287)||(12509882-12510155)
chr3 (14-287)||(11958580-11958853)
chr3 (14-287)||(16831927-16832200)
chr3 (17-287)||(16327111-16327381)
chr3 (14-287)||(16378333-16378606)
chr3 (14-278)||(12357926-12358190)
chr3 (12-287)||(8744787-8745062)
chr3 (14-285)||(31692584-31692855)
chr3 (14-287)||(18131746-18132018)
chr3 (14-287)||(24189761-24190034)
chr3 (14-285)||(17494105-17494377)
chr3 (12-287)||(13944481-13944756)
chr3 (14-190)||(11949324-11949500)
chr3 (14-285)||(12180803-12181074)
chr3 (14-230)||(17188888-17189104)
chr3 (14-285)||(31941362-31941633)
chr3 (35-285)||(12272797-12273047)
chr3 (14-230)||(14290931-14291147)
chr3 (14-195)||(16825678-16825861)
chr3 (14-285)||(12857894-12858165)
chr3 (14-228)||(10417444-10417658)
chr3 (14-167)||(13317933-13318086)
chr3 (14-285)||(15230062-15230333)
chr3 (14-285)||(15235930-15236201)
chr3 (91-285)||(14575445-14575639)
chr3 (14-247)||(15262117-15262350)
chr3 (33-270)||(15358547-15358784)
chr3 (33-287)||(15065518-15065772)
chr3 (33-270)||(12889173-12889410)
chr3 (33-270)||(13255154-13255391)
chr3 (33-270)||(24185654-24185891)
chr3 (33-270)||(10008064-10008301)
chr3 (33-270)||(15399946-15400183)
chr3 (33-270)||(15586821-15587058)
chr3 (33-270)||(15713485-15713722)
chr3 (33-270)||(16638237-16638474)
chr3 (33-270)||(43165139-43165376)
chr3 (33-270)||(48427911-48428148)
chr3 (14-189)||(12843513-12843688)
chr3 (33-270)||(10908674-10908911)
chr3 (33-270)||(16754130-16754367)
chr3 (33-270)||(20059483-20059720)
chr3 (33-249)||(14873997-14874213)
chr3 (33-249)||(15345674-15345890)
chr3 (33-270)||(3688407-3688644)
chr3 (33-270)||(6603199-6603436)
chr3 (33-270)||(26790842-26791079)
chr3 (33-270)||(53382447-53382684)
chr3 (33-249)||(16694649-16694865)
chr3 (33-270)||(5422359-5422596)
chr3 (14-224)||(15013168-15013378)
chr3 (33-270)||(16804376-16804613)
chr3 (44-270)||(14578848-14579074)
chr3 (14-84)||(35982841-35982911)
chr3 (35-87)||(8271830-8271882)
chr3 (35-87)||(13964786-13964838)
chr3 (35-87)||(30150014-30150066)
chr3 (14-75)||(11861033-11861094)
chr3 (35-87)||(15944026-15944078)
chr3 (35-87)||(22150168-22150220)
chr3 (33-89)||(23079446-23079502)
chr3 (209-287)||(13318096-13318174)
chr3 (35-87)||(6150284-6150336)
chr3 (35-87)||(17201292-17201344)
chr3 (125-270)||(17492315-17492460)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (14-287)||(11666-11939)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (14-287)||(41592-41865)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (14-287)||(28983805-28984078)
chr8 (14-287)||(28989024-28989297)
chr8 (14-287)||(16268838-16269111)
chr8 (52-287)||(27357430-27357665)
chr8 (14-287)||(22053757-22054030)
chr8 (14-287)||(31414146-31414419)
chr8 (14-287)||(22027894-22028167)
chr8 (14-285)||(29301040-29301311)
chr8 (14-279)||(19985082-19985347)
chr8 (14-285)||(21928324-21928595)
chr8 (14-285)||(22373765-22374036)
chr8 (14-285)||(20390982-20391253)
chr8 (40-270)||(19980878-19981108)
chr8 (17-247)||(22375071-22375300)
chr8 (33-270)||(19115311-19115548)
chr8 (14-247)||(22421506-22421739)
chr8 (33-270)||(32603056-32603293)
chr8 (44-270)||(21391505-21391731)
chr8 (44-270)||(21780831-21781057)
chr8 (44-270)||(21785999-21786225)
chr8 (33-270)||(17671655-17671892)
chr8 (33-270)||(20015896-20016133)
chr8 (36-189)||(22523538-22523691)
chr8 (33-249)||(18859509-18859725)
chr8 (33-270)||(22042738-22042975)
chr8 (33-270)||(30310777-30311014)
chr8 (33-249)||(22117808-22118024)
chr8 (33-249)||(22126592-22126808)
chr8 (44-249)||(21253877-21254082)
chr8 (14-249)||(22031035-22031270)
chr8 (40-270)||(21164178-21164408)
chr8 (33-270)||(22129250-22129487)
chr8 (36-247)||(22245651-22245862)
chr8 (36-247)||(22246069-22246280)
chr8 (14-189)||(22990037-22990212)
chr8 (40-249)||(15536315-15536524)
chr8 (33-270)||(19481705-19481942)
chr8 (35-87)||(20649990-20650042)
chr8 (35-87)||(21847972-21848024)
chr8 (35-87)||(16415180-16415232)
chr8 (35-87)||(22437384-22437436)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (14-268)||(20848067-20848321)
chr2 (14-287)||(19716728-19717001)
chr2 (14-279)||(23274060-23274325)
chr2 (17-285)||(23097732-23098000)
chr2 (12-287)||(12576812-12577087)
chr2 (14-285)||(23113184-23113455)
chr2 (38-247)||(24817575-24817784)
chr2 (33-270)||(17001476-17001713)
chr2 (33-249)||(11351441-11351657)
chr2 (33-270)||(22323072-22323309)
chr2 (33-270)||(24712510-24712747)
chr2 (33-270)||(27220492-27220729)
chr2 (33-270)||(44383300-44383537)
chr2 (33-270)||(9338058-9338295)
chr2 (33-270)||(9486692-9486929)
chr2 (33-270)||(16983716-16983953)
chr2 (40-249)||(21323003-21323212)
chr2 (35-270)||(24677963-24678198)
chr2 (46-287)||(23074322-23074563)
chr2 (33-246)||(27373769-27373982)
chr2 (14-249)||(24705193-24705428)
chr2 (44-270)||(23105469-23105695)
chr2 (33-270)||(10871326-10871563)
chr2 (33-270)||(21142771-21143008)
chr2 (14-84)||(19721291-19721361)
chr2 (33-270)||(23029191-23029428)
chr2 (33-270)||(24657388-24657625)
chr2 (33-270)||(24874480-24874717)
chr2 (14-270)||(22733485-22733741)
chr2 (46-186)||(23064973-23065113)
chr2 (40-186)||(22742703-22742849)
chr2 (33-270)||(24264846-24265083)
chr2 (33-270)||(45673742-45673979)
chr2 (14-89)||(30208631-30208706)
chr2 (33-270)||(23204790-23205027)
chr2 (35-87)||(22739386-22739438)
chr2 (14-89)||(19817504-19817579)
chr2 (35-80)||(22280771-22280816)
chr2 (35-80)||(25131275-25131320)
chr2 (125-270)||(41606209-41606352)
chr2 (33-81)||(23676583-23676631)
chr2 (179-279)||(23279243-23279343)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (14-287)||(514527-514800)
scaffold0001 (38-247)||(441550-441759)
scaffold0001 (14-189)||(495975-496150)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (14-287)||(29791-30064)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (14-287)||(24367092-24367365)
chr6 (14-279)||(10466164-10466429)
chr6 (14-285)||(19455717-19455988)
chr6 (14-287)||(18797382-18797655)
chr6 (14-285)||(14377232-14377503)
chr6 (14-285)||(21567307-21567578)
chr6 (14-230)||(24515730-24515946)
chr6 (14-285)||(19437696-19437967)
chr6 (14-287)||(15462028-15462301)
chr6 (14-176)||(19465971-19466133)
chr6 (14-285)||(21474294-21474565)
chr6 (14-285)||(25770538-25770809)
chr6 (14-287)||(34642902-34643175)
chr6 (14-285)||(19486610-19486879)
chr6 (33-273)||(5836563-5836803)
chr6 (14-189)||(23081213-23081388)
chr6 (14-270)||(18405260-18405516)
chr6 (33-270)||(2872137-2872374)
chr6 (14-287)||(16924956-16925229)
chr6 (33-270)||(29589774-29590011)
chr6 (14-243)||(30678340-30678569)
chr6 (36-247)||(23085163-23085374)
chr6 (33-246)||(16574623-16574836)
chr6 (33-270)||(16620544-16620781)
chr6 (33-270)||(27190145-27190382)
chr6 (33-270)||(27258858-27259095)
chr6 (17-193)||(18182686-18182862)
chr6 (65-189)||(20010821-20010945)
chr6 (40-238)||(22436610-22436808)
chr6 (33-270)||(28260532-28260769)
chr6 (33-270)||(28285147-28285384)
chr6 (33-270)||(28339281-28339518)
chr6 (14-249)||(27559285-27559520)
chr6 (40-270)||(19867396-19867626)
chr6 (33-270)||(24293117-24293354)
chr6 (33-270)||(28312339-28312576)
chr6 (33-270)||(25115261-25115498)
chr6 (35-87)||(16379710-16379762)
chr6 (35-87)||(16647306-16647358)
chr6 (35-87)||(16100907-16100959)
chr6 (33-81)||(22829721-22829769)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (14-287)||(318-591)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (12-287)||(67280-67555)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (14-287)||(8471-8744)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (17-287)||(263083-263353)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (14-287)||(5319-5592)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (14-264)||(30500-30750)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (14-287)||(10834-11107)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (14-287)||(9960-10233)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (14-287)||(21979-22252)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (14-287)||(65472-65745)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (14-285)||(442-713)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (17-279)||(203246-203508)
scaffold0003 (33-186)||(424266-424419)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (14-287)||(251479-251752)
scaffold0009 (33-81)||(230045-230093)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (14-285)||(979-1250)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (14-287)||(14980-15253)
scaffold0074 (17-247)||(6010-6240)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (14-285)||(20673-20944)
scaffold0222 (14-287)||(661-934)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (14-225)||(6957-7168)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (14-287)||(64776-65049)
scaffold0067 (14-287)||(49354-49627)
scaffold0067 (14-287)||(58388-58661)
scaffold0067 (14-230)||(29538-29754)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (14-285)||(9946-10217)
scaffold0243 (14-247)||(24119-24352)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (14-285)||(36798-37069)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (14-285)||(98757-99028)
scaffold0020 (14-285)||(175847-176117)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (14-285)||(325566-325837)
scaffold0004 (14-285)||(200642-200913)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (14-287)||(8-281)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (14-287)||(719-992)
scaffold0476 (14-247)||(10683-10916)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (14-230)||(1028-1244)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (17-285)||(151426-151694)
scaffold0011 (14-247)||(23707-23940)
scaffold0011 (35-87)||(73792-73844)
scaffold0011 (35-87)||(78173-78225)
scaffold0011 (35-87)||(182047-182099)
scaffold0011 (35-80)||(175708-175753)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (14-285)||(1485-1756)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (14-225)||(5383-5594)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (14-285)||(7603-7874)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (14-285)||(42557-42828)
scaffold0102 (40-270)||(50545-50775)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (14-287)||(5023-5296)
scaffold0348 (14-287)||(17658-17931)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (14-195)||(2126-2307)
scaffold0034 (14-287)||(70229-70502)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (14-270)||(12601-12857)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (14-225)||(9401-9612)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (14-285)||(11819-12090)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (14-285)||(1057-1328)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (17-287)||(39915-40185)
scaffold0114 (14-246)||(17523-17754)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (14-287)||(53597-53870)
[»] scaffold0523 (2 HSPs)
scaffold0523 (17-285)||(2730-2998)
scaffold0523 (14-65)||(11917-11968)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (14-230)||(63693-63909)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (14-285)||(29-300)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (14-285)||(29386-29657)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (14-287)||(94068-94341)
scaffold0029 (14-287)||(115419-115692)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (14-230)||(989-1205)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (14-230)||(5719-5935)
scaffold0035 (14-89)||(41282-41357)
scaffold0035 (209-287)||(5608-5686)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (14-287)||(1446-1719)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (14-287)||(28459-28732)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (17-230)||(50019-50232)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (22-230)||(20710-20918)
scaffold0261 (22-230)||(12530-12738)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (14-230)||(8636-8852)
scaffold0235 (14-230)||(18850-19066)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (14-285)||(43593-43864)
scaffold0104 (144-285)||(25075-25216)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (14-225)||(53966-54177)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (17-285)||(34196-34464)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (14-285)||(164575-164846)
scaffold0023 (14-249)||(47157-47391)
scaffold0023 (40-186)||(30774-30920)
scaffold0023 (125-247)||(151978-152100)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (28-230)||(110524-110726)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (28-285)||(60598-60855)
scaffold0046 (14-173)||(70079-70238)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (14-285)||(5040-5311)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (14-230)||(5516-5732)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (14-285)||(1580-1851)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (14-189)||(6431-6606)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (14-285)||(4263-4534)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (14-186)||(4478-4650)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (14-152)||(9195-9333)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (49-279)||(21716-21946)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (49-230)||(49086-49267)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (17-230)||(11744-11955)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (14-133)||(19143-19262)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (17-247)||(17775-18005)
scaffold0040 (14-170)||(111081-111237)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (38-247)||(9549-9758)
scaffold0018 (14-247)||(23472-23705)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (14-270)||(10332-10588)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (17-285)||(4947-5215)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (17-193)||(4069-4242)
scaffold0130 (33-270)||(7972-8211)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (95-287)||(25969-26161)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (14-249)||(29102-29337)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (14-249)||(17240-17475)
scaffold0017 (17-231)||(24219-24433)
scaffold0017 (40-245)||(195038-195243)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (14-247)||(4331-4564)
scaffold0621 (14-160)||(1-147)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (121-230)||(3451-3560)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (14-247)||(57788-58021)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (39-247)||(6770-6978)
scaffold0270 (39-247)||(13900-14108)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (14-230)||(1913-2129)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (36-247)||(15175-15386)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (14-247)||(216594-216827)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (33-270)||(1225-1462)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (33-270)||(10242-10479)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (14-247)||(14440-14673)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (14-247)||(13653-13886)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (14-287)||(36355-36628)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (33-270)||(22121-22358)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (36-285)||(26211-26460)
scaffold0042 (40-270)||(37020-37250)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (33-270)||(17811-18048)
scaffold0028 (33-270)||(11343-11580)
scaffold0028 (33-89)||(55059-55115)
scaffold0028 (152-270)||(53601-53719)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (14-118)||(2022-2126)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (14-189)||(55644-55819)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (33-247)||(2456-2670)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (35-189)||(14039-14193)
scaffold0120 (14-115)||(11293-11394)
scaffold0120 (35-87)||(25235-25287)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (33-218)||(8336-8521)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (33-270)||(8132-8369)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (41-270)||(13094-13323)
scaffold0080 (33-249)||(31778-31994)
scaffold0080 (41-270)||(10439-10668)
scaffold0080 (33-249)||(37244-37460)
scaffold0080 (44-247)||(54534-54737)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (33-270)||(3298-3535)
scaffold0044 (14-270)||(17034-17290)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (40-249)||(34915-35124)
scaffold0022 (14-247)||(41529-41762)
scaffold0022 (14-247)||(75249-75482)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (14-249)||(8118-8353)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (14-247)||(1886-2119)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (14-171)||(3524-3681)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (14-247)||(15319-15540)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (33-249)||(13317-13533)
scaffold0109 (33-270)||(41029-41266)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (44-247)||(24916-25119)
scaffold0218 (35-87)||(1147-1199)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (14-189)||(7913-8088)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (14-189)||(40681-40856)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (33-247)||(879-1093)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (95-285)||(1078-1260)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (14-247)||(552-785)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (36-189)||(4538-4691)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (44-249)||(11084-11289)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (14-79)||(51716-51781)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (44-171)||(14884-15011)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (33-270)||(15-252)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (33-186)||(7194-7347)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (36-189)||(104182-104335)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (34-270)||(674-910)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (14-285)||(18509-18780)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (40-171)||(13-144)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (44-247)||(8847-9047)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (33-270)||(11549-11786)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (33-270)||(21478-21715)
scaffold0081 (33-270)||(36902-37139)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (14-65)||(1781-1832)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (17-96)||(11076-11155)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (68-247)||(21413-21592)
scaffold0100 (14-71)||(16783-16840)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (33-186)||(962-1115)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (33-89)||(48720-48776)
[»] scaffold2062 (1 HSPs)
scaffold2062 (14-84)||(1051-1121)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (14-60)||(1661-1707)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (129-238)||(12569-12678)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (35-87)||(5499-5551)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (35-87)||(816-868)
scaffold0467 (35-87)||(13526-13578)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (35-87)||(26453-26505)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (35-87)||(35142-35194)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (35-87)||(24020-24072)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (35-87)||(8214-8266)
scaffold0021 (35-87)||(90559-90611)
scaffold0021 (35-87)||(21071-21123)
scaffold0021 (35-87)||(30647-30699)
[»] scaffold2165 (1 HSPs)
scaffold2165 (14-57)||(977-1020)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (14-89)||(15753-15828)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (14-85)||(2923-2994)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (35-87)||(2628-2680)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (35-87)||(7057-7109)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (14-60)||(1364-1410)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (125-270)||(3475-3620)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (35-80)||(3563-3608)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (33-74)||(171188-171229)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (35-87)||(4097-4149)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (35-87)||(6199-6251)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (35-87)||(1268-1320)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (35-87)||(5000-5052)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (35-87)||(26833-26885)
scaffold0008 (35-87)||(131684-131736)
[»] scaffold0789 (1 HSPs)
scaffold0789 (33-81)||(1-49)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (35-87)||(15967-16019)


Alignment Details
Target: scaffold0010 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 39507 - 39780
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39507 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 39606  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39607 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 39706  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39707 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaatt 39780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 69 - 285
Target Start/End: Original strand, 44656 - 44872
Alignment:
Q  69 gtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 168  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44656 gtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccaactaaggg 44755  T
Q  169 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggat 268  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | ||||| |||||||||    
T  44756 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatggat 44855  T
Q  269 gttatctttggaatgaa 285  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  44856 gttatttttgggatgaa 44872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5015 - 4870
Alignment:
Q  44 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||| | | | ||  ||||||| || || |    
T  5015 cctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgcttctaagttgggttttgttatgtcaaatatgaatggagaga 4916  T
Q  144 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4915 tggttgtcgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgt 4870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 14535 - 14298
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | | || || |  | |   |||||| | ||| | |||| |||    
T  14535 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgcgtttctgctttgggtcttgatttgtctggtat 14436  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  14435 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatttttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 14336  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  14335 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 14298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 26091956 - 26092229
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26091956 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 26092055  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26092056 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 26092155  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26092156 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaatt 26092229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 287
Target Start/End: Original strand, 26115746 - 26116021
Alignment:
Q  12 tcatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagtt 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26115746 tcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagtt 26115845  T
Q  112 gggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26115846 gggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatct 26115945  T
Q  212 atgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26115946 atgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaatt 26116021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 13965826 - 13966099
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13965826 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 13965925  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13965926 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctat 13966025  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13966026 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaatt 13966099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 40924975 - 40925248
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40924975 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 40925074  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  40925075 gtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatccat 40925174  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40925175 gtttggtagggattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaatt 40925248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 49155392 - 49155119
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  49155392 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 49155293  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  49155292 gtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctat 49155193  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  49155192 gtttggtagagattttgtgattgatttggtttgcctgccgttgacgggtatggatgttatttttggtatgaatt 49155119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21755503 - 21755230
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21755503 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 21755404  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21755403 gtttggatgtatctgatatggaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgaggtgtcctatatctat 21755304  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  21755303 gtttggtagagatttcgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaatt 21755230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12459719 - 12459446
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12459719 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactaattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 12459620  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |   ||||||  |||||||    
T  12459619 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttatctat 12459520  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12459519 gtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaatt 12459446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 14283532 - 14283805
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14283532 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttcattgctattatagacattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgg 14283631  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  14283632 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 14283731  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  14283732 gtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaatt 14283805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 16947630 - 16947903
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16947630 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 16947729  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||   |||||  | |||||    
T  16947730 gtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctat 16947829  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||| |||||  | || ||||||||  || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16947830 gtttggtagagactttgtagtcgacttagtttgcttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaatt 16947903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14140770 - 14140499
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  14140770 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 14140671  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  14140670 gtttgagtgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 14140571  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| ||| || | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  14140570 gtttggtagagattttgaggtagacttagtctgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaa 14140499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15343522 - 15343249
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  15343522 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 15343423  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  15343422 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtaaagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 15343323  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||||||| || | |||||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  15343322 gtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacattatttttggaatgaatt 15343249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 11385587 - 11385860
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  11385587 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgatgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 11385686  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||  ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  11385687 gtctgattgtatttgatatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcaggaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 11385786  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  11385787 gtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaatt 11385860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13024435 - 13024163
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  13024435 atcagaggtacttgtttctttaatag-actcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgg 13024337  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||  ||||||  | |||||    
T  13024336 gtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccgttgtctat 13024237  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||| |||||| || | || ||||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13024236 gtttggtagggattttttggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggtatgaatt 13024163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13676542 - 13676271
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13676542 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 13676443  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  13676442 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 13676343  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||| ||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  13676342 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaa 13676271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 12798659 - 12798930
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  12798659 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgg 12798758  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    ||||   | |||||    
T  12798759 gtctggttgtatctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactcaagctaagggttcagtaactacttctcttatttgtctaagttgtctgttgtctat 12798858  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| || | ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  12798859 gtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaa 12798930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 14261404 - 14261615
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| || || ||||||||||    
T  14261404 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgagcatataagttgg 14261503  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  14261504 gtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 14261603  T
Q  214 gtttggtagaga 225  Q
    ||||||||||||    
T  14261604 gtttggtagaga 14261615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 15099761 - 15100032
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  15099761 atcagatgtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 15099860  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||   | |||||    
T  15099861 gtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctat 15099960  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | ||  |||||||| |  | ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  15099961 gtttggtagagactttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaa 15100032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 287
Target Start/End: Original strand, 18051109 - 18051384
Alignment:
Q  12 tcatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagtt 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||| |||    
T  18051109 tcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggtt 18051208  T
Q  112 gggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatct 211  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||  |||||| || |||    
T  18051209 gggtttgattgtgtctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttct 18051308  T
Q  212 atgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||||||||||   | |||||||| ||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  18051309 atgtttggtagagattttgaagtagatttagtgtgtttaccgttgacggggatggatgttatttttgggatgaatt 18051384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19150102 - 19149831
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |    
T  19150102 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttag 19150003  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  19150002 gtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 19149903  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   |  || |||| ||| || | ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  19149902 gtttggtagagactttgaagtcaatctagtatgtttgcctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaa 19149831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20749501 - 20749230
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |    
T  20749501 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttag 20749402  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  20749401 gtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 20749302  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   |  || |||| ||| || | ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  20749301 gtttggtagagactttgaagtcaatctagtatgtttgcctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaa 20749230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 12203958 - 12204174
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  12203958 atcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgg 12204057  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| | | ||   |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  12204058 gtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactctagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 12204157  T
Q  214 gtttggtagagattttg 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  12204158 gtttggtagagattttg 12204174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14957625 - 14957371
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  14957625 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 14957526  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  14957525 gaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 14957426  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || |||||||    
T  14957425 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaatt 14957371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 11550301 - 11550538
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  11550301 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcttttgattgtgtatctgccttgggtcttgatttgtctgatat 11550400  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  11550401 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 11550500  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  11550501 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 11550538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 44788550 - 44788787
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| ||||||||||    
T  44788550 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatat 44788649  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  44788650 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 44788749  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  44788750 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 44788787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 14335467 - 14335230
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  14335467 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 14335368  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  14335367 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 14335268  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  14335267 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 14335230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 247
Target Start/End: Original strand, 15146122 - 15146336
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||| | | | | || |||||    
T  15146122 ttaatagaacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttgctttgtcggatat 15146221  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||  | | |||||| |||||||||||| |   ||||||| |    
T  15146222 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttcgaaatgtcctttatctatgtttgatcttgattttgag 15146321  T
Q  233 attgatttagtttgt 247  Q
    |||||| | ||||||    
T  15146322 attgatatggtttgt 15146336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8710676 - 8710439
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  8710676 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 8710577  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  8710576 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 8710477  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  8710476 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 8710439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 13689112 - 13688875
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  13689112 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtgtctgctttgggtcttgatttgtctgatat 13689013  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  13689012 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 13688913  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  13688912 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 13688875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18180814 - 18180577
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  ||||||||||    
T  18180814 ttaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttatctgatat 18180715  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  18180714 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 18180615  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  18180614 atggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgt 18180577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 11234412 - 11234649
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  11234412 ttaataatactcctttagttgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatat 11234511  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  11234512 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 11234611  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  11234612 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 11234649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 18587370 - 18587607
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  18587370 ttaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 18587469  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  18587470 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 18587569  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  18587570 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 18587607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 17703635 - 17703891
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   ||||    
T  17703635 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17703734  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||| ||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||    
T  17703735 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 17703834  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    ||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  17703835 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 17703891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 15158256 - 15158493
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  15158256 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 15158355  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||        
T  15158356 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaaa 15158455  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  15158456 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 15158493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9591435 - 9591223
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |  | ||||  | |   | |||| | ||| | ||||||||    
T  9591435 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtctgatat 9591336  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | |||||||      
T  9591335 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgaa 9591236  T
Q  233 attgatttagttt 245  Q
    || ||||||||||    
T  9591235 atggatttagttt 9591223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15627599 - 15627381
Alignment:
Q  29 ttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctg 128  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||| |||||   || ||||||| | ||| | ||      
T  15627599 ttctttgatagtactcctttaattactattattgatactggtgatacgcattgttttattgccgttgattgtgctcctatgttgggtcttgatatgtcga 15627500  T
Q  129 atatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattt 228  Q
     |||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||| || || |||||| | || |||||   |||| || |  | ||||||||| |||| ||    
T  15627499 gtatgaatgaggaaatggttttcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctttagtgtgtctaaggtgttctttgccgatgtttggtcgagactt 15627400  T
Q  229 tgtgattgatttagtttgt 247  Q
    ||  |||||||||||||||    
T  15627399 tgaaattgatttagtttgt 15627381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12690572 - 12690336
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  12690572 ttaataatactcctttagttgctattatt-atactagtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 12690474  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||   | || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  12690473 gagttgagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 12690374  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  12690373 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 12690336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14042785 - 14042610
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  14042785 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgg 14042686  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 189  Q
    || | | | | ||  |||| || || || |||||||| ||||||| |||||||||||  || || |||||||||||    
T  14042685 gtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgt 14042610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14352815 - 14352640
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  14352815 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgg 14352716  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 189  Q
    || | | | | ||  |||| || || || |||||||| ||||||| |||||||||||  || || |||||||||||    
T  14352715 gtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgt 14352640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8201027 - 8200882
Alignment:
Q  125 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 224  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |    
T  8201027 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 8200928  T
Q  225 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    ||||||  || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  8200927 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 8200882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10873651 - 10873524
Alignment:
Q  143 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttag 242  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||||    
T  10873651 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 10873552  T
Q  243 tttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    |||||||  | ||||  |||||||||||    
T  10873551 tttgtctacctttgagtggtatggatgt 10873524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 13459102 - 13459049
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 88  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13459102 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatt 13459049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 7826969 - 7826917
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7826969 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 7826917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 27104975 - 27105027
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27104975 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 27105027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 27173350 - 27173298
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27173350 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 27173298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 4442996 - 4442951
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 80  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4442996 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 4442951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 89
Target Start/End: Original strand, 16726640 - 16726696
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattg 89  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  16726640 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgctttattg 16726696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14207388 - 14207343
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 80  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  14207388 aatagtactcctttaattgcaattattaatactggcgctactcatt 14207343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14216078 - 14216033
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 80  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  14216078 aatagtactcctttaattgcaattattaatactggcgctactcatt 14216033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 38356 - 38400
Alignment:
Q  44 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 88  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||    
T  38356 cctttaattgctattatagatactggagctacgcattcttttatt 38400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 45)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 3261965 - 3262238
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3261965 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 3262064  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3262065 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 3262164  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3262165 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaatt 3262238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 44659037 - 44659310
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44659037 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 44659136  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44659137 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 44659236  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44659237 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaatt 44659310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 29450708 - 29450981
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29450708 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 29450807  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29450808 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 29450907  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  29450908 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaatt 29450981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 11204403 - 11204676
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  11204403 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttag 11204502  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  11204503 gtttggatgtatctggtatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctaaatctat 11204602  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11204603 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaatt 11204676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20893132 - 20892861
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  20893132 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 20893033  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  || ||||||||||||    
T  20893032 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtatcctatatctat 20892933  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || | ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20892932 gtttggtagagattttgtggttgatctagtttgcttgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaa 20892861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16150737 - 16150527
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16150737 atcagatgtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgg 16150638  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||  | |||||    
T  16150637 gtttggttgtttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctat 16150538  T
Q  214 gtttggtagag 224  Q
    |||||||||||    
T  16150537 gtttggtagag 16150527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16154883 - 16154673
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16154883 atcagatgtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgg 16154784  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||  | |||||    
T  16154783 gtttggttgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctat 16154684  T
Q  214 gtttggtagag 224  Q
    |||||||||||    
T  16154683 gtttggtagag 16154673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 287
Target Start/End: Original strand, 51603961 - 51604236
Alignment:
Q  12 tcatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagtt 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||  |    
T  51603961 tcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaact 51604060  T
Q  112 gggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatct 211  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||  |||||| || |||    
T  51604061 gggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttct 51604160  T
Q  212 atgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||||||||||   | || ||||||||| || |  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  51604161 atgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtttgccgctgacgggaatggatgttatttttgggatgaatt 51604236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15073460 - 15073189
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||    
T  15073460 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcacataagttgg 15073361  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
     | ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||   |||||| | |||||    
T  15073360 ctctggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtcagtttgagttgtcctttgtctat 15073261  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   ||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15073260 gtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtctgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaa 15073189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27903486 - 27903213
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  27903486 atcagaggtacatgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 27903387  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||  | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |   ||||||  | |||||    
T  27903386 gtctgattatatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctat 27903287  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |||| ||| ||| ||||||| || || |||||||    
T  27903286 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatgaatgttattttagggatgaatt 27903213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 14993538 - 14993719
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  14993538 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctcttcattatttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 14993637  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 195  Q
    || | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14993638 gtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtct 14993719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 53750639 - 53750815
Alignment:
Q  12 tcatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagtt 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||  |    
T  53750639 tcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaact 53750738  T
Q  112 gggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 188  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  53750739 gggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttg 53750815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15266877 - 15266736
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  15266877 atcagaggtagttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtactactcattgtttcattgatgttgattgtgcttataagttgg 15266778  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaa 155  Q
    || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15266777 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaa 15266736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 285
Target Start/End: Original strand, 15354283 - 15354482
Alignment:
Q  86 attgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctc 185  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15354283 attgatattgattgtgtatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctacgggttcagtaactacttctc 15354382  T
Q  186 ttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    ||||||||||    ||||   | ||||||||||||||||| |||    | || ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15354383 ttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagagactttaaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaa 15354482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14697185 - 14696969
Alignment:
Q  31 ctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgat 130  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||    
T  14697185 ctttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaat 14697086  T
Q  131 atgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcag-tgtcctatatctatgtttggtagagatttt 229  Q
    ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||  || |||||  | |||||||||||| ||||||||    
T  14697085 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtg-cttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgagatttt 14696987  T
Q  230 gtgattgatttagtttgt 247  Q
    |  |||||||||||||||    
T  14696986 gaaattgatttagtttgt 14696969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 7357368 - 7357280
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgc 102  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7357368 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgc 7357280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14162552 - 14162338
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||| ||||| | |||||||| | | | | | ||||||||    
T  14162552 ttaataatactcctttagttgctattattgataccggtgctacgcatagttttattgctcttgattgtgcttctaagttggatcttgctatgtctgatat 14162453  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |   ||||||| | ||||||| || | | |||||||      
T  14162452 gaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcctttgtctatgtatgatcgtgattttgaa 14162353  T
Q  233 attgatttagtttgt 247  Q
    || ||||||||||||    
T  14162352 atggatttagtttgt 14162338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 287
Target Start/End: Original strand, 18224376 - 18224630
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  18224376 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 18224475  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  18224476 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 18224575  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||||| || || |||||||    
T  18224576 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgttattttgggtatgaatt 18224630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12479682 - 12479445
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  12479682 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 12479583  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  12479582 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 12479483  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  12479482 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 12479445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 16233922 - 16234159
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  16233922 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 16234021  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  16234022 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 16234121  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  16234122 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 16234159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8389494 - 8389242
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  8389494 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 8389395  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  8389394 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttcactcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 8389295  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || ||||||||    
T  8389294 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggaatgaa 8389242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14683649 - 14683433
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  14683649 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 14683550  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  14683549 gaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 14683450  T
Q  233 attgatttagtttgtct 249  Q
    || ||||||||||||||    
T  14683449 atggatttagtttgtct 14683433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 17092079 - 17092316
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  17092079 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgttttgtctgatat 17092178  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  17092179 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 17092278  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  17092279 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 17092316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19635218 - 19634981
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  19635218 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 19635119  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||| ||| | |||||||      
T  19635118 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgttcggtcgtgattttgaa 19635019  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  19635018 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 19634981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23958829 - 23958592
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  23958829 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 23958730  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  23958729 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 23958630  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  23958629 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 23958592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Original strand, 15946 - 16121
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  15946 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgg 16045  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 189  Q
    || |   | | ||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  16046 gtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 16121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 8050553 - 8050790
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  8050553 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 8050652  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | | |||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  8050653 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 8050752  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  8050753 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 8050790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 14300909 - 14301146
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  14300909 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 14301008  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | ||||| |||||| | ||||| |      
T  14301009 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgatttcgaa 14301108  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  14301109 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 14301146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 249
Target Start/End: Original strand, 15144829 - 15145038
Alignment:
Q  40 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  15144829 tactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 15144928  T
Q  140 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 239  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||    
T  15144929 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 15145028  T
Q  240 tagtttgtct 249  Q
    ||||||||||    
T  15145029 tagtttgtct 15145038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 40476122 - 40475885
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  40476122 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 40476023  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  40476022 gaatggagagatggtggtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 40475923  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  40475922 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 40475885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 19775723 - 19775960
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  19775723 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 19775822  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||  | ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  19775823 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 19775922  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  19775923 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 19775960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27714418 - 27714181
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  27714418 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 27714319  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||| | | |||||||||||| | ||||| |      
T  27714318 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 27714219  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  27714218 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 27714181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 16250780 - 16251017
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  16250780 ttaataatactcatttagttgctattattgatactaatgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatat 16250879  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  16250880 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 16250979  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  16250980 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 16251017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 16350465 - 16350721
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| | | || ||||  | ||  ||||    
T  16350465 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctatgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 16350564  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | ||| | || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  16350565 gtcttgatttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 16350664  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || |||| | ||||| |  || ||| ||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  16350665 gtctggtcgtgatttcgaaatggatctagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 16350721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 16219289 - 16219188
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  16219289 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacacactgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 16219190  T
Q  114 gt 115  Q
    ||    
T  16219189 gt 16219188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 16222609 - 16222508
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  16222609 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacacactgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 16222510  T
Q  114 gt 115  Q
    ||    
T  16222509 gt 16222508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15258891 - 15258811
Alignment:
Q  151 tgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgt 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| |||||    
T  15258891 tgaaactccagctaagagttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgt 15258811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 13513432 - 13513294
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |  | ||||  | |   | |||| | ||| | ||||||||    
T  13513432 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtctgatat 13513333  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 171  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13513332 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 13513294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 14999726 - 14999674
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14999726 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 14999674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8708811 - 8708737
Alignment:
Q  211 tatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8708811 tatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgtcgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaa 8708737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 15290350 - 15290402
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15290350 aatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcattcttttat 15290402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Original strand, 15354247 - 15354291
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctatt 58  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15354247 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgatatt 15354291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 81
Target Start/End: Original strand, 18604749 - 18604797
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattg 81  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18604749 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 18604797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 12340059 - 12340111
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  12340059 aatagtactcctttgattgcgattattgatattggtcctactcattcttttat 12340111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Original strand, 18546820 - 18546864
Alignment:
Q  44 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttatt 88  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||    
T  18546820 cctttaattgctattatagatactggagctacgcattcttttatt 18546864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 48426020 - 48425747
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  48426020 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 48425921  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48425920 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 48425821  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48425820 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaatt 48425747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 52988888 - 52988615
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  52988888 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 52988789  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52988788 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 52988689  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52988688 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaatt 52988615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 31537240 - 31537513
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31537240 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 31537339  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31537340 gtttggatgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 31537439  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31537440 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaatt 31537513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 37680196 - 37679923
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  37680196 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctattcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 37680097  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37680096 gtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 37679997  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37679996 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaatt 37679923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 38910069 - 38910342
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38910069 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 38910168  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38910169 gtttggatgtatctgatatgaaagggaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 38910268  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  38910269 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaatt 38910342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20297528 - 20297255
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20297528 atcagaggtactggtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 20297429  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  20297428 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatttat 20297329  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20297328 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatctttggaatgaatt 20297255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Original strand, 20074952 - 20075126
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20074952 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 20075051  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20075052 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 20075126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 24096858 - 24097131
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24096858 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 24096957  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||   |||||  | |||||    
T  24096958 gtttggatgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctat 24097057  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||| |||||  | || ||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24097058 gtttggtagagactttgtagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttagaatgaatt 24097131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19857418 - 19857150
Alignment:
Q  17 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  19857418 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgtgcttataagttgggta 19857319  T
Q  117 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 216  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||  | ||||||||    
T  19857318 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcctaaggtgtccgttgtctatgtt 19857219  T
Q  217 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    ||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||    
T  19857218 tggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgactggtatggatgatatttttgggatgaa 19857150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 22015988 - 22016259
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  22015988 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgg 22016087  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  22016088 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 22016187  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | ||  |||||||| |  | ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  22016188 gtttggtagagactttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaa 22016259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18710532 - 18710316
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||     
T  18710532 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattataaacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgc 18710433  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  18710432 gtctggttgtatctgatatgagaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 18710333  T
Q  214 gtttggtagagattttg 230  Q
    |||||||||||| ||||    
T  18710332 gtttggtagagactttg 18710316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 20833143 - 20833414
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||    
T  20833143 atcagaggtacttgtttctttaatattattcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgttcttataagttgg 20833242  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  20833243 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagataagggttcattaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 20833342  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  20833343 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaa 20833414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 123 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12200556 - 12200392
Alignment:
Q  123 tatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12200556 tatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtag 12200457  T
Q  223 agattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  12200456 agattttgtgattgatttagtgtgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaatt 12200392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 21739279 - 21739550
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  21739279 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 21739378  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  21739379 gtcttgttttatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 21739478  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| || | ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  21739479 gtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaa 21739550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 20854003 - 20854276
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  20854003 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 20854102  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |   ||||||  | |||||    
T  20854103 gcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctat 20854202  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |||  ||| ||||||||||| || || |||||||    
T  20854203 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttgggaatggatgttattttcgggatgaatt 20854276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 21742795 - 21743011
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  21742795 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgg 21742894  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||   ||||   | |||||    
T  21742895 gtctgattgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaactacgtctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctat 21742994  T
Q  214 gtttggtagagattttg 230  Q
    |||||||||||| ||||    
T  21742995 gtttggtagagactttg 21743011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16379210 - 16378977
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  16379210 atcagaggtacatgttactttgatggtactcctttaattgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 16379111  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    ||   | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |    |||||| | |||||    
T  16379110 gtcatgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcctttgtctat 16379011  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 247  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||    
T  16379010 gtttggtcgtgattttgagattgatttggtttgt 16378977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Original strand, 20081645 - 20081875
Alignment:
Q  40 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  20081645 tactcctttagttgctattattgatactggtactacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 20081744  T
Q  140 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 239  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||||| ||| ||||    
T  20081745 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatt 20081844  T
Q  240 tagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    ||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  20081845 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 20081875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 16347857 - 16348094
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  16347857 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 16347956  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  16347957 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 16348056  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  16348057 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 16348094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 51330754 - 51330991
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  51330754 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 51330853  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  51330854 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 51330953  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  51330954 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 51330991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 17042258 - 17042514
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   ||||    
T  17042258 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17042357  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |  | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||    
T  17042358 gccttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 17042457  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    ||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  17042458 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 17042514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21752163 - 21751988
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  21752163 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 21752064  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 189  Q
    || | | | | ||| ||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  21752063 gtcttgctatgtctaatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 21751988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21833399 - 21833162
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  21833399 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatggctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 21833300  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| |||||||||||||| | |||||        
T  21833299 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtctgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgatttcaaa 21833200  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  21833199 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 21833162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21842309 - 21842072
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||  | |   || ||| | ||| | ||||||||    
T  21842309 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttaggtcttgatttgtctgatat 21842210  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||| | | |||||||||||| | |||||||      
T  21842209 gaatggagagattgttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcatttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 21842110  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  21842109 atggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgt 21842072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 33388291 - 33388528
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  33388291 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 33388390  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  33388391 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 33388490  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  33388491 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 33388528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 220
Target Start/End: Original strand, 22496525 - 22496705
Alignment:
Q  40 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  22496525 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctacattgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 22496624  T
Q  140 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggt 220  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | ||||||||||||    
T  22496625 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 22496705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 24785119 - 24785356
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | |   |||||| | | | ||||||||||    
T  24785119 ttaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgctacacattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttatctgatat 24785218  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || ||||| ||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  24785219 gaatggagagatggtcgttgaaattccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 24785318  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||| | ||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  24785319 atggatctggtttgtctacctttgagcggtatggatgt 24785356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19109465 - 19109228
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    ||| ||||| | |   ||| || | ||| | ||||||||    
T  19109465 ttaataatactcctttagttgctattattgacactggtgctatgcattgttttattgcctatgattgtgcttctgctttgagtcttgatttgtctgatat 19109366  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | ||||||||||||   |||||||      
T  19109365 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcatgattttgaa 19109266  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  19109265 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 19109228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 41350930 - 41351167
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||    
T  41350930 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatat 41351029  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||    |||||||| || ||| || | |||||| | ||||||||| || | |||||||      
T  41351030 gaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtgattttgaa 41351129  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||| ||  | ||||  |||||||||||    
T  41351130 atggatttagtttgcctacctttgagtggtatggatgt 41351167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Original strand, 21228818 - 21228947
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  21228818 ttaatattactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgatttgtctgatat 21228917  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagc 162  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||    
T  21228918 gaatggagagatggttgtcgaaactccagc 21228947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 20828656 - 20828708
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20828656 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 20828708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 20928149 - 20928097
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20928149 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 20928097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 75
Target Start/End: Original strand, 21045384 - 21045428
Alignment:
Q  31 ctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 75  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21045384 ctttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 21045428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22401678 - 22401633
Alignment:
Q  44 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattg 89  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22401678 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattg 22401633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 20528148 - 20528096
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20528148 aatagtactcctttgattgcaattattgatcctggtgctactcattcttttat 20528096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 21961174 - 21961135
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattg 53  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21961174 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattg 21961135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 87
Target Start/End: Original strand, 41215127 - 41215176
Alignment:
Q  38 agtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41215127 agtactccttggattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 41215176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 86
Target Start/End: Original strand, 22133016 - 22133067
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 86  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22133016 aatagtaatcctttgattgcaattattgataccggtgctactcattctttta 22133067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 69
Target Start/End: Original strand, 22435976 - 22436031
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactgg 69  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22435976 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactgg 22436031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25851087 - 25850814
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25851087 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 25850988  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25850987 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaaggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 25850888  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25850887 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatgaatgttatttttggaatgaatt 25850814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 14884344 - 14884617
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14884344 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 14884443  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14884444 gtttagatgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 14884543  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14884544 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtcttccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaatt 14884617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20345297 - 20345024
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20345297 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 20345198  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  20345197 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatcttt 20345098  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20345097 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaatt 20345024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22505694 - 22505421
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22505694 atcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 22505595  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22505594 gtttggatgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctat 22505495  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |  | ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22505494 gtttcatagagattttgtggtggatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaatt 22505421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 23078258 - 23078531
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  23078258 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgcaattgaatgtgcttataagttgg 23078357  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||   |||||  | |||||    
T  23078358 gtttggatgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctat 23078457  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| || ||||| || | ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23078458 gtttggtagagactttgtagttgatctaatttgtttgccgttgtcgggtatggatgttatttttgggatgaatt 23078531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 23563521 - 23563792
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23563521 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgatattatagaaactggtgctactcaatgtttaattgctattgaatgtgcatataagttgg 23563620  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||| |  | |||||    
T  23563621 gtatggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtacgttgtctat 23563720  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23563721 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccattgacgggtatggatgttatttttgggatgaa 23563792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 287
Target Start/End: Original strand, 17266685 - 17266960
Alignment:
Q  12 tcatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagtt 111  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||| |||    
T  17266685 tcatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggtt 17266784  T
Q  112 gggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatct 211  Q
    |||||||  ||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||  |||||| || |||    
T  17266785 gggtttgtttgtgtctaacatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttct 17266884  T
Q  212 atgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||||||||||   | || ||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  17266885 atgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaatt 17266960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22464965 - 22464692
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  22464965 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 22464866  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |   ||||||  | |||||    
T  22464865 gcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctat 22464766  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |||  ||| ||||||||||| || || |||||||    
T  22464765 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtatgtctaccgttgttgggaatggatgttattttcgggatgaatt 22464692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 28892295 - 28892511
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  28892295 atcagaggtacttgtttctttaatggtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 28892394  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||   ||||||  | |||||    
T  28892395 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctat 28892494  T
Q  214 gtttggtagagattttg 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  28892495 gtttggtagagattttg 28892511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 21561378 - 21561649
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |    
T  21561378 atcagaggtacttgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttag 21561477  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| | | ||   |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||   |||||  | |||||    
T  21561478 gtatggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctat 21561577  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  21561578 gtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccattgacgggtgtggatgtaatctttgggatgaa 21561649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 21983530 - 21983801
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  21983530 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattactattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 21983629  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| | | ||   |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||   |||||  | | |||    
T  21983630 gtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtttat 21983729  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||| ||| || | ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21983730 gtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaa 21983801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20778928 - 20778655
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  20778928 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 20778829  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |  |   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |   ||||||  | |||||    
T  20778828 gcctaattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctat 20778729  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |||  ||| ||||||||||| || || |||||||    
T  20778728 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaatt 20778655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20824468 - 20824195
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | || ||||| ||||||||||    
T  20824468 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgg 20824369  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |   ||||||  | |||||    
T  20824368 gtctgattatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtttaaggtgtccgttgtctat 20824269  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||| | | | |||||||| |||||  | |||  ||| ||||||||||| || || |||||||    
T  20824268 gtttggtagagatttcgaggtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaatt 20824195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 186
Target Start/End: Original strand, 21631755 - 21631924
Alignment:
Q  17 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 116  Q
    |||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||     
T  21631755 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctgttgattgtgcttctaagttgggtc 21631854  T
Q  117 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 186  Q
    | | | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  21631855 ttgttatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21631924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 29473445 - 29473682
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  29473445 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 29473544  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  29473545 gaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 29473644  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  29473645 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 29473682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21882788 - 21882572
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||    
T  21882788 ttaataatactcctttagttggtattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgctatgtctgatat 21882689  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||||||| |    
T  21882688 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgag 21882589  T
Q  233 attgatttagtttgtct 249  Q
    || ||||||||||||||    
T  21882588 atggatttagtttgtct 21882572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 14997111 - 14997348
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  14997111 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 14997210  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  14997211 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 14997310  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  14997311 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 14997348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16359516 - 16359279
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  16359516 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 16359417  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  16359416 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 16359317  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  16359316 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 16359279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18782128 - 18781891
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  18782128 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 18782029  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  18782028 gaatggagagatggttgttgaaactccagctaagggttccgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 18781929  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || |||| |||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  18781928 atggattaagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 18781891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 22330259 - 22330496
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  22330259 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 22330358  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  22330359 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 22330458  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  22330459 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 22330496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27521420 - 27521183
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  27521420 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttggtttgtctgatat 27521321  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  27521320 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 27521221  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  27521220 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 27521183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27613370 - 27613133
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  27613370 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 27613271  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  27613270 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 27613171  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  27613170 atggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgt 27613133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 34569508 - 34569271
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  34569508 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 34569409  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  34569408 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 34569309  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  34569308 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 34569271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 40711794 - 40711557
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  40711794 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 40711695  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  40711694 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 40711595  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  40711594 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 40711557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 41773856 - 41773619
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  41773856 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 41773757  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | ||| || | |||||||||||| | |||||||      
T  41773756 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtactttgtctatgtttggtcgcgattttgaa 41773657  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  41773656 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 41773619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 26736080 - 26736351
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| | || |||||    
T  26736080 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgcttctatgttgg 26736179  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | | | | ||  ||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||  || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||    
T  26736180 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggtttggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcctttgtctat 26736279  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    ||||| | | |||||||  |||||||| |||||| |  | ||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26736280 gtttgatcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgatccttggaatgaa 26736351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19772974 - 19772737
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  19772974 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 19772875  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  19772874 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 19772775  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  19772774 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 19772737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22350933 - 22350696
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  22350933 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 22350834  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  22350833 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcgattttgaa 22350734  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  22350733 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 22350696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 27665862 - 27666099
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  27665862 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 27665961  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||  |||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  27665962 gaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 27666061  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  27666062 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 27666099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 37288868 - 37289105
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  37288868 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatat 37288967  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | ||| |||||||| | ||||| |      
T  37288968 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctttgtttggtcgtgatttcgaa 37289067  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  37289068 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 37289105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 25429454 - 25429198
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||   || ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| | |||   ||||||||    
T  25429454 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattttgctactaagttgg 25429355  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | | | | | ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||  | |||||    
T  25429354 gtcttgttatgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtctat 25429255  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    ||||| | | ||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  25429254 gtttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgt 25429198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20803611 - 20803374
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | ||  |||||| | | | | ||||||||    
T  20803611 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtctcgctttgtctgatat 20803512  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  20803511 gaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 20803412  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  20803411 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 20803374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 27682772 - 27683009
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | | ||||||    
T  27682772 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtttgatat 27682871  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  27682872 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 27682971  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || |||||||| |||||  | ||||  |||||||||||    
T  27682972 atggatttagtgtgtctacctttgagcggtatggatgt 27683009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23474203 - 23474053
Alignment:
Q  39 gtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagg 138  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | | |||||||||| ||| | |  |  ||||||| ||    
T  23474203 gtacacctttagttgctattattgataccggtgctacacattgttttattgctattgattgtacttctaagttgggtctggctatgacgaatatgaatgg 23474104  T
Q  139 ggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 189  Q
     || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  23474103 agagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 23474053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22137682 - 22137445
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  22137682 ttaataatactcctttagttgctattattgataatggtgatacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 22137583  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | | |||||||||| | |||||||      
T  22137582 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtgattttgaa 22137483  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  22137482 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 22137445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 115
Target Start/End: Original strand, 21332339 - 21332440
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  21332339 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 21332438  T
Q  114 gt 115  Q
    ||    
T  21332439 gt 21332440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23460985 - 23460832
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  23460985 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacccatgtttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatttgtctgatat 23460886  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 186  Q
    ||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  23460885 gaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23460832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 270
Target Start/End: Original strand, 21342878 - 21343023
Alignment:
Q  125 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 224  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||| | | |    
T  21342878 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttgatcgtg 21342977  T
Q  225 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    ||||||  || |||||||||||| |  ||||||  |||||||||||    
T  21342978 attttgaaatggatttagtttgtataccattgaacggtatggatgt 21343023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 23526065 - 23525963
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | | || ||||| | || ||||||| | ||| | ||||||||    
T  23526065 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctacgttgggtcttgatatgtctgatat 23525966  T
Q  133 gaa 135  Q
    |||    
T  23525965 gaa 23525963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 23508678 - 23508626
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23508678 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 23508626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 24584204 - 24584152
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24584204 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 24584152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21410167 - 21410092
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattg 89  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21410167 atcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactatcatagatactggtgctacatattgttttattg 21410092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20311755 - 20311667
Alignment:
Q  142 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 230  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||| || || |||||||| || ||  || |||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  20311755 aatggttgtcgaaaccccaactaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttg 20311667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28757049 - 28756776
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28757049 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 28756950  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28756949 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctacggtgtcctatatctat 28756850  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28756849 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaatt 28756776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10408698 - 10408425
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10408698 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 10408599  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10408598 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtgtgcggtgtcctatatctat 10408499  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  10408498 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaatt 10408425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 47126674 - 47126401
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  47126674 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 47126575  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47126574 gtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 47126475  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  47126474 gtttggtagagattttgtaattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaatt 47126401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 12509882 - 12510155
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12509882 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 12509981  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||    
T  12509982 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagatttcagcaaccacttctctggtttgtttggggtgtcttatatctat 12510081  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  12510082 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaatt 12510155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 11958580 - 11958853
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  11958580 atcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 11958679  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  11958680 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 11958779  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || || |||||||    
T  11958780 gtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttgtcgttgtcgggtatggatgttattttcggtatgaatt 11958853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 16831927 - 16832200
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  16831927 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 16832026  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  16832027 gtttgattgtatctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 16832126  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||||||| || | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  16832127 gtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttatttttggaatgaatt 16832200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 287
Target Start/End: Original strand, 16327111 - 16327381
Alignment:
Q  17 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||||||    
T  16327111 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtt 16327210  T
Q  117 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 216  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  16327211 tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtt 16327310  T
Q  217 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  || | ||| |||| ||||||||||| || || |||||||    
T  16327311 tggtagagatttcgtggttgatttagtttgcttgccgttgtcgggaatggatgttattttcgggatgaatt 16327381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 16378333 - 16378606
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  16378333 atcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattgctatcatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 16378432  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||    
T  16378433 gtttgattgtatctgatattaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatatctat 16378532  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||||||| || | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  16378533 gtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaatt 16378606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 278
Target Start/End: Original strand, 12357926 - 12358190
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12357926 atcagaggtacttgtttctttaatagtacacctttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 12358025  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  12358026 gtctggttgtatctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 12358125  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttg 278  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||    
T  12358126 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttagcgttgacgggtatggatgttatttttg 12358190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 287
Target Start/End: Original strand, 8744787 - 8745062
Alignment:
Q  12 tcatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagtt 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||| |||    
T  8744787 tcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggtt 8744886  T
Q  112 gggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatct 211  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||  |||||| || |||    
T  8744887 gggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttct 8744986  T
Q  212 atgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||||||||||   | || ||||||||| || |  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  8744987 atgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtttgccgctgacgggaatggatgttatttttgggatgaatt 8745062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 31692584 - 31692855
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  31692584 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagtcgg 31692683  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||  | |||||    
T  31692684 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctat 31692783  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||| ||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  31692784 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaa 31692855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 18131746 - 18132018
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18131746 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagac-ctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 18131844  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||   | |||||    
T  18131845 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctat 18131944  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||| | ||   | || ||||| ||| |  | |||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  18131945 gtttggtagagactatgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggtatggatgttattttttggatgaatt 18132018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24190034 - 24189761
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||| ||||    
T  24190034 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgg 24189935  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||  ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  24189934 gtttgattgtatctgatatgaagggagagatggttgttgagactccagctaagggttcagtgactacttttctcgtttgtttgaggtgtcctatatctat 24189835  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||||| | |  |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24189834 gtttggtagagattttgaggtagacttagtttttttaccgctgacgggaatggatgttatttttggaatgaatt 24189761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 17494377 - 17494105
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  17494377 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataaattgg 17494278  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttg-aaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatcta 212  Q
    || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    |||||  | ||||    
T  17494277 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaaactccagctaagggttcagtaactaattctcttgtttgtctaagatgtccgttgtcta 17494178  T
Q  213 tgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    ||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  17494177 tgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatgtatgttatttttgggatgaa 17494105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13944756 - 13944481
Alignment:
Q  12 tcatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagtt 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||  |    
T  13944756 tcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaact 13944657  T
Q  112 gggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatct 211  Q
    |||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||  |||||| || |||    
T  13944656 gggtttgattgtgtctgatatggaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctagtttgcttgaggtgtccaatttct 13944557  T
Q  212 atgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||||||||||   | || |||||||||||  | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  13944556 atgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtctaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaatt 13944481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 11949324 - 11949500
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||    
T  11949324 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtggttataagttgg 11949423  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtt 190  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11949424 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtt 11949500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12181074 - 12180803
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12181074 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 12180975  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     |||||  | |||||    
T  12180974 gtctgtttgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgacactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtccaagatgtccgttgtctat 12180875  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||| | |  | ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  12180874 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttctttaccgttgacgggtatggttgttatctttgggatgaa 12180803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17189104 - 17188888
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||| ||||    
T  17189104 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacacgggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgg 17189005  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||  ||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  17189004 gtttgattgtatctgatatggagggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtttgtttgaggtgtcctatatctat 17188905  T
Q  214 gtttggtagagattttg 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  17188904 gtttggtagagattttg 17188888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 31941633 - 31941362
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31941633 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactcattttttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 31941534  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||   ||| ||  | |||||    
T  31941533 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtctagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgcccgttgtctat 31941434  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||| ||||| ||||   | || ||||| ||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  31941433 gtttggcagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaa 31941362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12273047 - 12272797
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatga 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| | ||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12273047 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgactatgcatttaagttgggtctggttgtatctgatatga 12272948  T
Q  135 aaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgat 234  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   |    
T  12272947 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagt 12272848  T
Q  235 tgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
     ||| |||||||| |  | ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  12272847 cgatctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaa 12272797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 14290931 - 14291147
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  14290931 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 14291030  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  14291031 gtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctat 14291130  T
Q  214 gtttggtagagattttg 230  Q
    |||||||||||| ||||    
T  14291131 gtttggtagagactttg 14291147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 16825678 - 16825861
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaata--gtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagtt 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||    
T  16825678 atcagaggtacttgtttctttaatatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagtt 16825777  T
Q  112 gggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 195  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16825778 gggtctggttgtatctgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 16825861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 12857894 - 12858165
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||| | | |  ||||| ||||||||||    
T  12857894 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctagttattgtttcattgctgtggtttgtgcatataagttgg 12857993  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
     | ||| | ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  12857994 ttctggttatatctgatatgaatggagaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 12858093  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    ||||||||| || ||||   ||||| | || ||| || | |||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  12858094 gtttggtagtgactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgatgggtatggatgtaatctttgggatgaa 12858165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Original strand, 10417444 - 10417658
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||| | | || ||||| ||||||||||    
T  10417444 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgg 10417543  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||   ||||||  | |||||    
T  10417544 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctat 10417643  T
Q  214 gtttggtagagattt 228  Q
    |||||||||||||||    
T  10417644 gtttggtagagattt 10417658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Original strand, 13317933 - 13318086
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  13317933 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 13318032  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagg 167  Q
    | |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318033 gcttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 13318086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15230333 - 15230062
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | |||| | ||| ||||||||||    
T  15230333 atcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgattttgcatataagttgg 15230234  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| | | ||   |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  15230233 gtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 15230134  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||| ||||||||||||   ||||| | || ||| || | || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15230133 gttttgtagagattttgaagttgatcttgtatgtttgccgttaacgggtatggatgtaatctttgggatgaa 15230062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15236201 - 15235930
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | |||| | ||| ||||||||||    
T  15236201 atcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgattttgcatataagttgg 15236102  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| | | ||   |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  15236101 gtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 15236002  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||| ||||||||||||   ||||| | || ||| || | || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15236001 gttttgtagagattttgaagttgatcttgtatgtttgccgttaacgggtatggatgtaatctttgggatgaa 15235930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 91 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14575639 - 14575445
Alignment:
Q  91 tattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtt 190  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14575639 tattgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtt 14575540  T
Q  191 tgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | ||  |||||||| |  | ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14575539 tgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttggaatgaa 14575445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15262350 - 15262117
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  15262350 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 15262251  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||    
T  15262250 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaatggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 15262151  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 247  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||    
T  15262150 gtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgt 15262117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15358784 - 15358547
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  15358784 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 15358685  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  15358684 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 15358585  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  15358584 atggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgt 15358547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15065772 - 15065518
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  15065772 ttaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatat 15065673  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||| || || |||||||| |||||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||||| |    
T  15065672 gaatggagagatggttgtcgaatctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtttgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgag 15065573  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  |||| |||||||    
T  15065572 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaatt 15065518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12889410 - 12889173
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  12889410 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 12889311  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  12889310 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 12889211  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  12889210 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 12889173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 13255391 - 13255154
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  13255391 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 13255292  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  13255291 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 13255192  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  13255191 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 13255154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24185891 - 24185654
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  24185891 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 24185792  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||  || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  24185791 gaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 24185692  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  24185691 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 24185654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10008301 - 10008064
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  10008301 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 10008202  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  10008201 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcgatttcgaa 10008102  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  10008101 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 10008064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 15399946 - 15400183
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  15399946 ttaataatactcctttggttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 15400045  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  15400046 gaatggagagatggttgtcgaaactccagcttagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 15400145  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  15400146 atggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgt 15400183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 15586821 - 15587058
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  15586821 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 15586920  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  15586921 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 15587020  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  15587021 atggatttagtttgtctacctttgaatggtatggatgt 15587058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 15713485 - 15713722
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  15713485 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 15713584  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  15713585 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 15713684  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  15713685 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 15713722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16638474 - 16638237
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  16638474 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 16638375  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  16638374 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 16638275  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  16638274 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 16638237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 43165376 - 43165139
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  43165376 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 43165277  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  43165276 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 43165177  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  43165176 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 43165139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 48428148 - 48427911
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  48428148 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 48428049  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  48428048 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 48427949  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  48427948 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 48427911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Original strand, 12843513 - 12843688
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  12843513 atcagaggtacttgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 12843612  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 189  Q
     | | | | | ||  ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  12843613 atcttgctatgtcaaatatgaatggagagatgattgttgaaactccagctaatggttcagtgactacttctcttgt 12843688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10908911 - 10908674
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  10908911 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 10908812  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| |  |||| |      
T  10908811 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtcatttcgaa 10908712  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  10908711 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 10908674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 16754130 - 16754367
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||    
T  16754130 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatat 16754229  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  16754230 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctctgtctatgtttggtcgtgattttgaa 16754329  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  16754330 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 16754367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 20059483 - 20059720
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||    
T  20059483 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatat 20059582  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  20059583 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 20059682  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  20059683 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 20059720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 249
Target Start/End: Original strand, 14873997 - 14874213
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | ||| | ||| ||||    
T  14873997 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatatgtctaatat 14874096  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || |  || || | |||||||||||| | ||||||| |    
T  14874097 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaaagttctttgtctatgtttggtcgtgattttgag 14874196  T
Q  233 attgatttagtttgtct 249  Q
    || ||||||||||||||    
T  14874197 atggatttagtttgtct 14874213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 249
Target Start/End: Original strand, 15345674 - 15345890
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  15345674 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 15345773  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  15345774 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 15345873  T
Q  233 attgatttagtttgtct 249  Q
    || ||||||||||||||    
T  15345874 atggatttagtttgtct 15345890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 3688644 - 3688407
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |   || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  3688644 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttccgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 3688545  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  3688544 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 3688445  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  3688444 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 3688407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 6603436 - 6603199
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||    
T  6603436 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacccattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatat 6603337  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || ||||||||  ||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  6603336 gaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 6603237  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  6603236 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 6603199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 26790842 - 26791079
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  |     |||||| | ||| | ||||||||    
T  26790842 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgttttcgattgtgtttccgctttgggtcttgatttgtctgatat 26790941  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  26790942 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 26791041  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  26791042 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 26791079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 53382447 - 53382684
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||    
T  53382447 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatat 53382546  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  53382547 gaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 53382646  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  53382647 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 53382684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16694865 - 16694649
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |  ||||||| | ||| | ||||||||    
T  16694865 ttaataatactcccttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgcgttgggtcttgatttgtctgatat 16694766  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  16694765 gaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttctgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 16694666  T
Q  233 attgatttagtttgtct 249  Q
    || ||||||||||||||    
T  16694665 atggatttagtttgtct 16694649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 5422359 - 5422596
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || || |  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  5422359 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgcgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 5422458  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||  |||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||| | | |||||||||||| | |||||||      
T  5422459 gaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 5422558  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  5422559 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 5422596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 15013168 - 15013378
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| |||| |||||||| |  ||| |||||   ||||||||    
T  15013168 atcagaggtacatgtttcattaatagcactcctttaattactattatagatactagtgttacacatttttttattgttgctgattgtgctactaagttgg 15013267  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | | | | ||   |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||  || |||||||| | || ||    
T  15013268 gtcttgttatgtcgtctatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgat 15013367  T
Q  214 gtttggtagag 224  Q
    |||||||||||    
T  15013368 gtttggtagag 15013378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 16804376 - 16804613
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | | ||||||    
T  16804376 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtttgatat 16804475  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| || ||  |||  |||| | | |||||||||||| | |||||||      
T  16804476 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgcttgcgatgtcttctgtctatgtttggtcgtgattttgaa 16804575  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  16804576 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 16804613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 14578848 - 14579074
Alignment:
Q  44 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 143  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| |     | ||  ||||||| || || |    
T  14578848 cctttagttactattattgatcctagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttcccatgtcaaatatgaatggagaga 14578947  T
Q  144 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||| |    |||||| | |||||||||| | | |||||||  |||||||| ||    
T  14578948 tggttgtcgaaactccagctaagggttcagtaactacttctatagtatgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgatttggt 14579047  T
Q  244 ttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    |||| || | ||||  |||||||||||    
T  14579048 ttgtttgcctttgagtggtatggatgt 14579074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 35982911 - 35982841
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttt 84  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  35982911 atcagagatacttgtttctttaatagtactcttttaattgctattatagatactggtactactcattgttt 35982841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 8271830 - 8271882
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8271830 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 8271882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 13964786 - 13964838
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13964786 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 13964838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 30150066 - 30150014
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30150066 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 30150014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 11861094 - 11861033
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 75  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11861094 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 11861033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 15944026 - 15944078
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15944026 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcattcttttat 15944078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 22150168 - 22150220
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22150168 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctagtcattcttttat 22150220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 89
Target Start/End: Original strand, 23079446 - 23079502
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattg 89  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  23079446 ttaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgcaacacattgttttattg 23079502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 287
Target Start/End: Original strand, 13318096 - 13318174
Alignment:
Q  209 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| | || |||||  | |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13318096 tctatgtttggtagagattttgaggttgatcttgtatgtctaccgttgatgggtatggatgttatttttgggatgaatt 13318174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 6150284 - 6150336
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6150284 aatagtactcatttgattgcaattattgatattggtgctactcattcttttat 6150336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 17201344 - 17201292
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17201344 aatagtactccattgattgcaattattgatactagtgctactcattcttttat 17201292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17492460 - 17492315
Alignment:
Q  125 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 224  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||| ||| |    |||||  | | |||||||| | | |    
T  17492460 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagagttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtttatgtttgatcgtg 17492361  T
Q  225 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  17492360 attttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgt 17492315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11939 - 11666
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11939 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 11840  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11839 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 11740  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  11739 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaatt 11666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41865 - 41592
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41865 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 41766  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  41765 gtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatccat 41666  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41665 gtttggtagggattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaatt 41592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28984078 - 28983805
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28984078 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 28983979  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28983978 gtttggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 28983879  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28983878 gtttggtagagattttgtgattgacttggtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaatt 28983805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28989297 - 28989024
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28989297 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 28989198  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28989197 gtttggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgatactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 28989098  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28989097 gtttggtagagattttgtgattgacttggtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaatt 28989024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 16268838 - 16269111
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16268838 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 16268937  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  16268938 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgcttgtctggggtgtcctatatctat 16269037  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| || || |||||||    
T  16269038 gtttggtagagatttcgtggttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttattttcgggatgaatt 16269111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 52 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27357665 - 27357430
Alignment:
Q  52 tgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgtt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27357665 tgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgtt 27357566  T
Q  152 gaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  27357565 gaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgc 27357466  T
Q  252 cattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27357465 cgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaatt 27357430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22054030 - 22053757
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  22054030 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 22053931  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  22053930 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgaggtgtcctacatctat 22053831  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22053830 gtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaatt 22053757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 31414146 - 31414419
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  31414146 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctaatgaatgtgcttataagttgg 31414245  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||   |||||  | |||||    
T  31414246 gtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctat 31414345  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||| |||||    || ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31414346 gtttggtagagactttgtagccgacttagtttgtttgtcgttgacgagtatggatgttatttttggaatgaatt 31414419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 22027894 - 22028167
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22027894 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgg 22027993  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |   ||||||  | |||||    
T  22027994 gtttggttttatcttatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccattgtctat 22028093  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| ||| || | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  22028094 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtatgtttgccgttgacgggtatgaatgttatttttgggatgaatt 22028167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 29301040 - 29301311
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  29301040 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 29301139  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||  | |||||    
T  29301140 gtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgagttgtccgttgtctat 29301239  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| || | ||  ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  29301240 gtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttgccgttatcgggtatggatgtaatttttgggatgaa 29301311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19985347 - 19985082
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  19985347 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgg 19985248  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  19985247 gtttggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 19985148  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttgg 279  Q
    |||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| |||| ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  19985147 gtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgtcgttgacgaatatggatgtaatctttgg 19985082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21928595 - 21928324
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  21928595 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 21928496  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||| |  | |||||    
T  21928495 gtctggttatatctgatatgaatggcgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagctgtgcgttgtctat 21928396  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| || | ||||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  21928395 gtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatataatttttgggatgaa 21928324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22374036 - 22373765
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  22374036 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatagtttcattgatgttgattgtgcatataagttgg 22373937  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | | | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  22373936 gtctagttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 22373837  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    ||||| |||||| ||||   ||||| | || ||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  22373836 gtttgatagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccatcgacaggtatggatgtaatctttgggatgaa 22373765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20391253 - 20390982
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||| | || | ||||  ||||||||||    
T  20391253 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctattattgatactggtgctacacattgattcattgctgttaattgtgaatataagttgg 20391154  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| | | ||   ||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||   ||||   | |||||    
T  20391153 gtctggttatgtcaagtattagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtctgttgtctat 20391054  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||||||||   ||||| | || ||| || | |||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  20391053 gtttggtagagattttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgatgggtatggatgtaatctttgggatgaa 20390982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19981108 - 19980878
Alignment:
Q  40 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  19981108 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 19981009  T
Q  140 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 239  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||||| ||| ||||    
T  19981008 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatt 19980909  T
Q  240 tagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    ||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  19980908 tagtttgtctacccttgagcggtatggatgt 19980878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Original strand, 22375071 - 22375300
Alignment:
Q  17 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 116  Q
    |||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||     
T  22375071 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgatattgattgtgcttctaagttgggtc 22375170  T
Q  117 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 216  Q
    | | | | ||  ||||||| || || ||||| || ||||||||| |||||||||| || || |||||||  || ||| |    |||||| | ||||||||    
T  22375171 ttgctatgtcgaatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctc-cgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtt 22375269  T
Q  217 tggtagagattttgtgattgatttagtttgt 247  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  22375270 tggtagagattttgaaattgatttggtttgt 22375300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19115548 - 19115311
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  19115548 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 19115449  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || ||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  19115448 gaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 19115349  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  19115348 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 19115311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 22421506 - 22421739
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  22421506 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 22421605  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| |||||||    
T  22421606 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctat 22421705  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 247  Q
    ||||| | | |||||||  ||||| || ||||||    
T  22421706 gtttgatcgtgattttgaaattgacttggtttgt 22421739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 32603293 - 32603056
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  32603293 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 32603194  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  32603193 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggttgtgattttgaa 32603094  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  32603093 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 32603056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 21391505 - 21391731
Alignment:
Q  44 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||    
T  21391505 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21391604  T
Q  144 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||    
T  21391605 tggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagt 21391704  T
Q  244 ttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || |||  | ||||  |||||||||||    
T  21391705 ttttctacctttgagtggtatggatgt 21391731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 21780831 - 21781057
Alignment:
Q  44 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||    
T  21780831 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21780930  T
Q  144 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||    
T  21780931 tggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagt 21781030  T
Q  244 ttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || |||  | ||||  |||||||||||    
T  21781031 ttttctacctttgagtggtatggatgt 21781057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 21785999 - 21786225
Alignment:
Q  44 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||    
T  21785999 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21786098  T
Q  144 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||    
T  21786099 tggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagt 21786198  T
Q  244 ttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || |||  | ||||  |||||||||||    
T  21786199 ttttctacctttgagtggtatggatgt 21786225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 17671655 - 17671892
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  17671655 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 17671754  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  17671755 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 17671854  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  17671855 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 17671892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 20015896 - 20016133
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  20015896 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 20015995  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  20015996 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 20016095  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || | ||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  20016096 atgggtttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 20016133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22523691 - 22523538
Alignment:
Q  36 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaa 135  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  |||||||    
T  22523691 atagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaa 22523592  T
Q  136 aggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 189  Q
     || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  22523591 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 22523538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18859725 - 18859509
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  18859725 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 18859626  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  18859625 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 18859526  T
Q  233 attgatttagtttgtct 249  Q
    || ||||||||||||||    
T  18859525 atggatttagtttgtct 18859509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22042975 - 22042738
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | |||| ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  22042975 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatttcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatat 22042876  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||  || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  22042875 gattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 22042776  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  22042775 atggatttagtttgtctacctttgaacggtatggatgt 22042738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 30310777 - 30311014
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  30310777 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 30310876  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  30310877 gaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 30310976  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  30310977 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 30311014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 249
Target Start/End: Original strand, 22117808 - 22118024
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||  |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  22117808 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatcgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 22117907  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  22117908 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 22118007  T
Q  233 attgatttagtttgtct 249  Q
    || ||||||||||||||    
T  22118008 atggatttagtttgtct 22118024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 249
Target Start/End: Original strand, 22126592 - 22126808
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  22126592 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 22126691  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  22126692 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgattacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 22126791  T
Q  233 attgatttagtttgtct 249  Q
    || ||||||||||||||    
T  22126792 atggatttagtttgtct 22126808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21254082 - 21253877
Alignment:
Q  44 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||    
T  21254082 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattattttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21253983  T
Q  144 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| ||||| ||    
T  21253982 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttggt 21253883  T
Q  244 ttgtct 249  Q
    ||||||    
T  21253882 ttgtct 21253877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22031270 - 22031035
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   ||||    
T  22031270 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22031171  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||    
T  22031170 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctat 22031071  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtct 249  Q
    |||||||   ||||| |  || ||||||||||||||    
T  22031070 gtttggtcatgatttcgaaatggatttagtttgtct 22031035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Original strand, 21164178 - 21164408
Alignment:
Q  40 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  | ||||| | |   |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  21164178 tactcctttagttgctattattgatactgatgctacgcattgttttattgctttcaattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatatgaatgga 21164277  T
Q  140 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 239  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| | ||| || |    
T  21164278 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggact 21164377  T
Q  240 tagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    ||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  21164378 tagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 21164408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 22129250 - 22129487
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  22129250 ttaataatactgctttagttgctattattgatactggtgttacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 22129349  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  22129350 gaatggacagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 22129449  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  22129450 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 22129487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 247
Target Start/End: Original strand, 22245651 - 22245862
Alignment:
Q  36 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaa 135  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  |||||||    
T  22245651 atagtacacctttaatttatattattcatattagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaa 22245750  T
Q  136 aggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgatt 235  Q
     ||  | |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||  |    |||||| | |||||||||||| |||||||||  |||    
T  22245751 tggatagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaatt 22245850  T
Q  236 gatttagtttgt 247  Q
     |||| ||||||    
T  22245851 aatttggtttgt 22245862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 247
Target Start/End: Original strand, 22246069 - 22246280
Alignment:
Q  36 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaa 135  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  |||||||    
T  22246069 atagtacacctttaatttatattattcatattagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaa 22246168  T
Q  136 aggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgatt 235  Q
     ||  | |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||  |    |||||| | |||||||||||| |||||||||  |||    
T  22246169 tggatagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaatt 22246268  T
Q  236 gatttagtttgt 247  Q
     |||| ||||||    
T  22246269 aatttggtttgt 22246280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 22990212 - 22990037
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | ||  ||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||    
T  22990212 atcagaggtacatgttattttgacagtacacctttagttgctattattgatactagtgctaaacattgttttattgctattgattgtgcttcaaagttgg 22990113  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 189  Q
    || | | | | ||  ||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  22990112 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagggttcggtgactacttctcttgt 22990037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15536524 - 15536315
Alignment:
Q  40 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 139  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || | ||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||     
T  15536524 tactccgttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattatgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 15536425  T
Q  140 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 239  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| | |  |||||| | ||||| |||||| | |||||||  || ||||    
T  15536424 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttacgttgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaaatggatt 15536325  T
Q  240 tagtttgtct 249  Q
    ||||||||||    
T  15536324 tagtttgtct 15536315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 19481705 - 19481942
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||    
T  19481705 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatat 19481804  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||    |||||||| || ||| || | |||||| | ||||||||| || | |||||||      
T  19481805 gaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtgattttgaa 19481904  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||| ||  | ||||  |||||||||||    
T  19481905 atggatttagtttgcctacctttgagtggtatggatgt 19481942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 20649990 - 20650042
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20649990 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 20650042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 21847972 - 21848024
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21847972 aatagtactcttttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 21848024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 16415232 - 16415180
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16415232 aatagtattccattgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 16415180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 22437436 - 22437384
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  22437436 aatagtactcctttgattgcgattattgatactgatgttactcattcttttat 22437384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20848321 - 20848067
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20848321 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 20848222  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20848221 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 20848122  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggat 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  20848121 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttgatgggtatggat 20848067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 19716728 - 19717001
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19716728 atcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 19716827  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||   |||||  | |||||    
T  19716828 gtttagttgtatctgatttgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctat 19716927  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19716928 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaatt 19717001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23274325 - 23274060
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23274325 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 23274226  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  23274225 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 23274126  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttgg 279  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||| ||||||||||| |||||    
T  23274125 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgg 23274060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 285
Target Start/End: Original strand, 23097732 - 23098000
Alignment:
Q  17 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 116  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| | ||||||||||     
T  23097732 agaggtacttgattctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatttaagttgggtc 23097831  T
Q  117 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 216  Q
    ||| |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  23097832 tggttgtaactgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtt 23097931  T
Q  217 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| |||||  | |||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  23097932 tggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggtatggatgtcatttttggaatgaa 23098000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12577087 - 12576812
Alignment:
Q  12 tcatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagtt 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  |    
T  12577087 tcatcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcctataaact 12576988  T
Q  112 gggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatct 211  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||  ||  |||||| || |||    
T  12576987 gggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaatgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttct 12576888  T
Q  212 atgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||||||||||   | || ||||| ||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  12576887 atgtttggtagagattttgaagtagacttagtgtgtttaccgttgacggggatggatgttatttttgggatgaatt 12576812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 23113455 - 23113184
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||| ||||    
T  23113455 atcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataaattgg 23113356  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| | | ||   |||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||   |||||  | |||||    
T  23113355 gtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctat 23113256  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||| ||| || | ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23113255 gtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaa 23113184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 247
Target Start/End: Original strand, 24817575 - 24817784
Alignment:
Q  38 agtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaag 137  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||| |     | ||  ||||||| |    
T  24817575 agtactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatg 24817674  T
Q  138 gggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattga 237  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24817675 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgagattga 24817774  T
Q  238 tttagtttgt 247  Q
    ||| ||||||    
T  24817775 tttggtttgt 24817784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17001713 - 17001476
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| ||||||||||    
T  17001713 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatat 17001614  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  17001613 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 17001514  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  17001513 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 17001476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 249
Target Start/End: Original strand, 11351441 - 11351657
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  11351441 ttaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtctagatatgtctgatat 11351540  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  11351541 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 11351640  T
Q  233 attgatttagtttgtct 249  Q
    || ||||||||||||||    
T  11351641 atggatttagtttgtct 11351657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 22323072 - 22323309
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  22323072 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 22323171  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  22323172 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 22323271  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  22323272 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 22323309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24712747 - 24712510
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  24712747 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 24712648  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  24712647 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 24712548  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  24712547 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 24712510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27220729 - 27220492
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  27220729 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 27220630  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  27220629 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 27220530  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  27220529 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 27220492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 44383300 - 44383537
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  44383300 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtctgatat 44383399  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  44383400 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 44383499  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  44383500 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 44383537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 9338295 - 9338058
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  9338295 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 9338196  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  9338195 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 9338096  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  9338095 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 9338058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 9486929 - 9486692
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  9486929 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 9486830  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  9486829 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 9486730  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  9486729 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 9486692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16983953 - 16983716
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  16983953 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 16983854  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  16983853 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 16983754  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  16983753 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 16983716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 249
Target Start/End: Original strand, 21323003 - 21323212
Alignment:
Q  40 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||  ||     
T  21323003 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattgga 21323102  T
Q  140 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 239  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| | ||| ||||    
T  21323103 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatt 21323202  T
Q  240 tagtttgtct 249  Q
    ||||||||||    
T  21323203 tagtttgtct 21323212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24678198 - 24677963
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatga 134  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | ||| | ||||||||||    
T  24678198 aataatactcctttagttgctattaatgatactggtgctaggcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtctagatatgtctgatatga 24678099  T
Q  135 aaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgat 234  Q
    | || || |||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||||||| |||    
T  24678098 atggagagatggttgtcgaaacttcagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagat 24677999  T
Q  235 tgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
     ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  24677998 ggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 24677963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23074563 - 23074322
Alignment:
Q  46 tttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||| | | | | ||||||||||| || || |||    
T  23074563 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatg 23074464  T
Q  146 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagttt 245  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| |   ||||||| ||||||||| ||||    
T  23074463 gttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcttgattttgagattgatttggttt 23074364  T
Q  246 gtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||  | ||||  ||||||||||| ||  |||| |||||||    
T  23074363 gtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaatt 23074322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27373982 - 27373769
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  27373982 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 27373883  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  27373882 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 27373783  T
Q  233 attgatttagtttg 246  Q
    || |||||||||||    
T  27373782 atggatttagtttg 27373769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 24705193 - 24705428
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | ||  ||||    
T  24705193 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 24705292  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | ||| | ||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||    
T  24705293 gtcttgatttgtctgatatgaatgcagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtaactacttctctcgtatgtttgagatgccctttgtctat 24705392  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtct 249  Q
    ||||||| | |||||||  || ||||||||||||||    
T  24705393 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtct 24705428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 270
Target Start/End: Original strand, 23105469 - 23105695
Alignment:
Q  44 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 143  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||    
T  23105469 cctttagttgctattattgttactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 23105568  T
Q  144 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||    
T  23105569 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagt 23105668  T
Q  244 ttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    ||||||  | ||||  |||||||||||    
T  23105669 ttgtctacctttgatcggtatggatgt 23105695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10871563 - 10871326
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  10871563 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 10871464  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||| | | |||||||||||| | ||||| |      
T  10871463 gaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcgtttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 10871364  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  10871363 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 10871326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 21142771 - 21143008
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  21142771 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtctgatat 21142870  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  21142871 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 21142970  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  21142971 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 21143008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Original strand, 19721291 - 19721361
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttt 84  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19721291 atcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 19721361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 23029191 - 23029428
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  23029191 ttaataatactcccttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 23029290  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || |  |||||||| |||| ||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| | |    
T  23029291 gaatggagtgatggttgtcgaaaatccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgag 23029390  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  23029391 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 23029428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 24657388 - 24657625
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| | | || ||||  | ||  |||| | | ||| | ||||||||    
T  24657388 ttaataatactccattagttgctattattgatacagctgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttggatcttgatttgtctgatat 24657487  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  24657488 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 24657587  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  24657588 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 24657625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 24874480 - 24874717
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  24874480 ttaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 24874579  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||| || ||| |  | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  24874580 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggtttcggtgactacttctctcgtatgtttcaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 24874679  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  24874680 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 24874717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 22733485 - 22733741
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||   || ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| | |||| |||||   ||||||||    
T  22733485 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcgttgatttattgcttttgattgtgctactaagttgg 22733584  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | |   | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||  | |||||    
T  22733585 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtataagatgtcccttgtctat 22733684  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    ||||| | | ||||||  ||||||||| ||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  22733685 gtttgatcgtgattttcagattgatttggtttgtctagctttgagtggtatggatgt 22733741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23065113 - 23064973
Alignment:
Q  46 tttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||| | | | | ||||||||||| || || |||    
T  23065113 tttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatg 23065014  T
Q  146 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 186  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  23065013 gttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23064973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 186
Target Start/End: Original strand, 22742703 - 22742849
Alignment:
Q  40 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 139  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  22742703 tactcctttagttgctattattggtactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 22742802  T
Q  140 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 186  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  22742803 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22742849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24265083 - 24264846
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  24265083 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 24264984  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||  ||  | |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | | |||||||||| | ||||| |      
T  24264983 gagtggatagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtgatttcgaa 24264884  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  24264883 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 24264846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 45673742 - 45673979
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  45673742 ttaataatactcctttagttgctattattgataatggagctacgcattgttttattgctttcgattgtgattctgctttgggtcttgttttgtctgatat 45673841  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||| | | |||||||||||| | |||||||      
T  45673842 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcttttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 45673941  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    ||  |||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  45673942 atgaatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 45673979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 89
Target Start/End: Original strand, 30208631 - 30208706
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattg 89  Q
    |||| |||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  30208631 atcaaaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattatagatactggtgctacacattgttttattg 30208706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23205027 - 23204790
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  || ||| | |  | ||||  | |   |||||| | ||||| ||||||||    
T  23205027 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgcatttttgctttccattgtgtttctgctttgggtcttgatgtgtctgatat 23204928  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||   ||  |||||| | ||||||  |||| | ||||||||     
T  23204927 gaatggagagatggttgtcgatactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgctcgcgatgtcctttgtctatggatggtcgtgattttgta 23204828  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  23204827 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 23204790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 22739386 - 22739438
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22739386 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 22739438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 19817579 - 19817504
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattg 89  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19817579 atcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactactacagatactggtgctacacattgctttattg 19817504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 22280816 - 22280771
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 80  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22280816 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctagtcatt 22280771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 25131320 - 25131275
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 80  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25131320 aatagtactcatttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 25131275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 270
Target Start/End: Original strand, 41606209 - 41606352
Alignment:
Q  125 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 224  Q
    ||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |    
T  41606209 tctgatatgaatggagagatggt-gtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcct-tgtctatgtttggtcgtg 41606306  T
Q  225 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    |||| |  || |||||||||||||| || ||||  |||||||||||    
T  41606307 atttcgaaatggatttagtttgtctatctttgagcggtatggatgt 41606352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 23676631 - 23676583
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattg 81  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23676631 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattg 23676583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23279343 - 23279243
Alignment:
Q  179 acttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttg 278  Q
    |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||    
T  23279343 acttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttg 23279244  T
Q  279 g 279  Q
    |    
T  23279243 g 23279243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 514527 - 514800
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  514527 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 514626  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  514627 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctat 514726  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  514727 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaatt 514800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 441759 - 441550
Alignment:
Q  38 agtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaag 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| ||||| | ||| |||||| |   | | ||  ||||||| |    
T  441759 agtactcctttagttgctattattgatactggtgctacggattgttttattgctcttgattgtgcttctaaattgggtcttactatgtcaaatatgaatg 441660  T
Q  138 gggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattga 237  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  441659 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagatttttagattga 441560  T
Q  238 tttagtttgt 247  Q
    ||| ||||||    
T  441559 tttggtttgt 441550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 496150 - 495975
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||    
T  496150 atcagaggtacatgttattttgatagtagacctttagttgctattattgatactagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttcgaagttgg 496051  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 189  Q
    || | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  496050 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 495975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30064 - 29791
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  30064 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgg 29965  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29964 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaagaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctat 29865  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  29864 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgttgttgggtatggatgtgatttttggaatgaatt 29791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24367365 - 24367092
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  24367365 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattaatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatatcagttgg 24367266  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24367265 gtccggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggattcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctat 24367166  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24367165 ctttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgttcacgggtatggatgttatctttggtatgaatt 24367092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 279
Target Start/End: Original strand, 10466164 - 10466429
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10466164 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgttgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgg 10466263  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |   |||||   |||||||    
T  10466264 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtctgttatctat 10466363  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttgg 279  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  10466364 gtttggtagggactttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgg 10466429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19455988 - 19455717
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19455988 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 19455889  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||| |  | |||||    
T  19455888 gtctggttgtatctgatatgaaaggtgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgttcgttgtctat 19455789  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19455788 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaa 19455717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18797655 - 18797382
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  18797655 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 18797556  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  || ||||||||||||    
T  18797555 gtttgattgtatctgacatgaaaggagagatggttgttgaaactctagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtttcctatatctat 18797456  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||| ||||||| | | || ||||| ||| |  |  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18797455 gtttggtagggattttgaggtagacttagtgtgtttaccgctgacgggtatggatgttatttttgggatgaatt 18797382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 14377232 - 14377503
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14377232 atcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 14377331  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||   |||||   | |||||    
T  14377332 gtttggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagcaaagggtttagtagctacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctat 14377431  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| || |   | || ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14377432 gtttggtagagacttcgaagtcgacttagtttgtttgtcgttgatgggtatggatgttatttttggaatgaa 14377503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 21567307 - 21567578
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||| ||| ||||||    
T  21567307 atcagaggtacttgtttctttaatagtacttattcaattgctattatagacactggtactactcattgtttcattgctttagaatgtgcatattagttgg 21567406  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||  |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  21567407 gtttgattgtaactgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 21567506  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||| |||||  | ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21567507 gtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgtcatttttggaatgaa 21567578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 24515730 - 24515946
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24515730 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgtgcttataagttgg 24515829  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  24515830 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagttaagtgttcattaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 24515929  T
Q  214 gtttggtagagattttg 230  Q
    |||||||||||| ||||    
T  24515930 gtttggtagagactttg 24515946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19437967 - 19437696
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||     
T  19437967 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttga 19437868  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||  | | |||    
T  19437867 gtctagttgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtttat 19437768  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    ||||| |||||| ||||   | || ||||||||| |  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  19437767 gtttgttagagactttgaagtcgacttagtttgttttcctttgactggtatggatgttatttttgggatgaa 19437696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15462301 - 15462028
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  15462301 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 15462202  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||   ||||||  |||||||    
T  15462201 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttatctat 15462102  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |||  ||| |||||||||||||| || |||||||    
T  15462101 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttatcttcgggatgaatt 15462028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19466133 - 19465971
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19466133 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 19466034  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaa 176  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19466033 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaa 19465971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21474565 - 21474294
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  21474565 atcagaggtatttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttgattgttgttgattgtgcatataagttgg 21474466  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| | | |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||   |||||  | |||||    
T  21474465 gtctggttatgtctgatatgaatagaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcatgtttgtttgagttgtccattgtctat 21474366  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   ||||| | || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21474365 gtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgtcgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaa 21474294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 25770809 - 25770538
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  25770809 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctattcattgtttcattgttgttgattgtgcttataagttgg 25770710  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| | | ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  25770709 gtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaatctccagcaaagggttcaatcactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 25770610  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   ||||  | || ||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  25770609 gtttggtagagactttgaagttgaccttgtatgtttgccattgacgggtatggatgtaatctttgggatgaa 25770538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 34642902 - 34643175
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | || ||||| |||||  |||    
T  34642902 atcagaggtacttgtttctttaatagtatccctttaatcgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcttataaactgg 34643001  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  34643002 gtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctat 34643101  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||| |||||||   | ||  |||||||  |  | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  34643102 gtttggtagggattttgaagtagacctagtttgcttacctttgacggggatggatgttatatttgggatgaatt 34643175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 19486610 - 19486879
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  19486610 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgttattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 19486709  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || |||   | ||   |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||   ||||   | |||||    
T  19486710 gtctggtcatgtcaagtatgagtagagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctat 19486809  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||| ||| || |  |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19486810 gtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgcc--tgacgggtatggatgtaatctttgggatgaa 19486879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 273
Target Start/End: Original strand, 5836563 - 5836803
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| ||||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  5836563 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttatactttgggtcttgatttgtctgatat 5836662  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  5836663 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactaccactctagtatgtttgaaatgtcctttttctatgtttggtcgtgattttgaa 5836762  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttat 273  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||||||    
T  5836763 atggatttagtttgtctccctttgagcggtatggatgttat 5836803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23081388 - 23081213
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  23081388 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 23081289  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 189  Q
    |||| | | | ||  |||| || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23081288 gttttgctatgtcaaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgt 23081213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 18405260 - 18405516
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||   ||||||||    
T  18405260 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctatgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 18405359  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| ||   |||||  | |||||    
T  18405360 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcccttgtctat 18405459  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    ||||| | | |||||||  ||| |||| ||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  18405460 gtttgattgtgattttgaaattaatttggtttgtctgcctttgagtggtatggatgt 18405516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 2872137 - 2872374
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  2872137 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 2872236  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  2872237 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 2872336  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  2872337 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 2872374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 16924956 - 16925229
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | ||  ||||    
T  16924956 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 16925055  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||| || || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  16925056 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccagctaagggatcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttttctat 16925155  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||| | |||||||  || |||||||||||| || | ||||  |||||||| || ||| |||| |||||||    
T  16925156 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtttgcctttgagtggtatggacgtcatccttggtatgaatt 16925229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 29589774 - 29590011
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  29589774 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 29589873  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  29589874 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 29589973  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  29589974 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 29590011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 30678340 - 30678569
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||| || ||| ||||| | ||||||||    
T  30678340 atcagaggtacatgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatatttgtgctacgcgttgttttattgctactgattgtgcttctaagttgg 30678439  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | | | | ||   |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| || |||||| ||||| |  | || ||    
T  30678440 gtcttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggttactacttctctagtgtgtctgaagtgttcgttgtcgat 30678539  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagt 243  Q
    ||||||| |||| ||||   ||||||||||    
T  30678540 gtttggtcgagactttgaagttgatttagt 30678569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 247
Target Start/End: Original strand, 23085163 - 23085374
Alignment:
Q  36 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaa 135  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||| | ||| | |||||||||| |   | | ||   ||||||    
T  23085163 atagtactcctttagtttctattattgaaactggtgctacacattgttttattgttgttgattatgcttctaagttgggtcttactatgtcaagtatgaa 23085262  T
Q  136 aggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgatt 235  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  23085263 tggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgaaatt 23085362  T
Q  236 gatttagtttgt 247  Q
    ||||| ||||||    
T  23085363 gatttggtttgt 23085374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16574836 - 16574623
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  16574836 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 16574737  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  16574736 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 16574637  T
Q  233 attgatttagtttg 246  Q
    || |||||||||||    
T  16574636 atggatttagtttg 16574623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 16620544 - 16620781
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  16620544 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 16620643  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  16620644 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 16620743  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||| ||  | ||||  |||||||||||    
T  16620744 atggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgt 16620781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27190382 - 27190145
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | || |||||    
T  27190382 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgagttgtcagatat 27190283  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | ||||| |||||| | |||||||      
T  27190282 gaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaa 27190183  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  27190182 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 27190145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 27258858 - 27259095
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | || |||||    
T  27258858 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgagttgtcagatat 27258957  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | ||||| |||||| | |||||||      
T  27258958 gaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaa 27259057  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  27259058 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 27259095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Original strand, 18182686 - 18182862
Alignment:
Q  17 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 116  Q
    |||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||| |||||| ||||| | ||||||||||     
T  18182686 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacacatttccttattgctattgattgtgcttctaagttgggtc 18182785  T
Q  117 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 193  Q
    | | | | ||  ||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  18182786 ttgctatgtcaaatatgaatggagagatggtagtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgt 18182862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 189
Target Start/End: Original strand, 20010821 - 20010945
Alignment:
Q  65 actggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagcta 164  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||  |    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20010821 actggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcttataagttgggcctaatcgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagcca 20010920  T
Q  165 agggttcagtaaccacttctcttgt 189  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  20010921 agggttcagtaactacttctcttgt 20010945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22436808 - 22436610
Alignment:
Q  40 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  22436808 tactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 22436709  T
Q  140 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgat 238  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | ||| || | |||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  22436708 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgttctttgtctatgtttggtcgtgattttgagattgat 22436610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 28260532 - 28260769
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||    
T  28260532 ttaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatat 28260631  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  28260632 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 28260731  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  28260732 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 28260769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28285384 - 28285147
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||    
T  28285384 ttaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatat 28285285  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  28285284 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 28285185  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  28285184 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 28285147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 28339281 - 28339518
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||    
T  28339281 ttaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatat 28339380  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  28339381 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 28339480  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  28339481 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 28339518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 27559285 - 27559520
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   ||||    
T  27559285 atcagaggtacttgttatattaataatactccatttgttgctattattgataatggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27559384  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  27559385 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 27559484  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtct 249  Q
    ||||||| | |||||||  || ||||||||||||||    
T  27559485 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtct 27559520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19867626 - 19867396
Alignment:
Q  40 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 139  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||  | | | | ||| ||||||| |      
T  19867626 tactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctaccttgggccttgttatgtcttatatgaatgaa 19867527  T
Q  140 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 239  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| | ||| ||||    
T  19867526 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatt 19867427  T
Q  240 tagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    ||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  19867426 tagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 19867396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 24293117 - 24293354
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  24293117 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcacggttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 24293216  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||        
T  24293217 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaaa 24293316  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  24293317 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 24293354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28312576 - 28312339
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |  | ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||    
T  28312576 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcaattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatat 28312477  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  28312476 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatttttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 28312377  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  28312376 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 28312339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 25115498 - 25115261
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   | |||| | ||| | ||||||||    
T  25115498 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtactacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtctgatat 25115399  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  25115398 gaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 25115299  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  25115298 atggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgt 25115261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 16379710 - 16379762
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16379710 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 16379762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 16647306 - 16647358
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16647306 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 16647358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 16100959 - 16100907
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16100959 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcatttttttat 16100907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 81
Target Start/End: Original strand, 22829721 - 22829769
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattg 81  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22829721 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 22829769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 591 - 318
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  591 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctagtcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgg 492  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  491 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctat 392  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  391 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggaggtgatttttggaatgaatt 318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 287
Target Start/End: Original strand, 67280 - 67555
Alignment:
Q  12 tcatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagtt 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| |||| ||||||||    
T  67280 tcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgccttagaaagtgcatataagtt 67379  T
Q  112 gggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatct 211  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  67380 gggtttgattgtatccgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatct 67479  T
Q  212 atgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || | ||| |||||||||| ||||| || || |||||||    
T  67480 atgtttggtagagattttgtggttgatctagtttgcttgccgttgtcgggtatggacgttattttcgggatgaatt 67555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8744 - 8471
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  8744 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgg 8645  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  8644 gtttggttgtatctgatataaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctat 8545  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| ||| || | |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8544 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtatgtttgccgttgacgtgtatggatgttatttttgggatgaatt 8471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 263353 - 263083
Alignment:
Q  17 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||||||    
T  263353 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtt 263254  T
Q  117 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 216  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  263253 tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtt 263154  T
Q  217 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||||| | | || ||||||||| || | |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  263153 tggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttatttttggaatgaatt 263083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 5319 - 5592
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5319 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 5418  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||  ||||||  | | |||    
T  5419 gtatggatgtatctgatatgaaaagagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccattgtttat 5518  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||| || ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5519 gtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttgccgttgtcgcgtatggatgttatttttgggatgaatt 5592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 264
Target Start/End: Original strand, 30500 - 30750
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30500 atcagaggtacttgtttctttaaaagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgatattgaatgtgcatataagttgg 30599  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  30600 gtttggttgtatctgatatgaaaggggtaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctat 30699  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtat 264  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| || | ||| |||||||    
T  30700 gtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttgccgttgtcgggtat 30750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11107 - 10834
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | | ||| |||| ||||||||||    
T  11107 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatttttttagaaagtgcatataagttgg 11008  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  11007 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatacttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctat 10908  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||  || | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10907 gtttggtagggactttgtggttgatttagtttgcttgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaatt 10834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 9960 - 10233
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  9960 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 10059  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  10060 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtacagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctat 10159  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||||||| || | |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||    
T  10160 gtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttattttttgaatgaatt 10233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22252 - 21979
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||    
T  22252 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattggtattatagatactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcatatatgttgg 22153  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  22152 gtttggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactttagctaagtgttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctat 22053  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||| || |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22052 gtttggtagagattttgaggtcgatttagtttgtttgccgctgacgggtatggatgttatttttggaatgaatt 21979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 65472 - 65745
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||| ||||||||||    
T  65472 atcagaggtacttgtttctttaatagtacacctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttccttgctttagaatgtgcatataagttgg 65571  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||||| ||    
T  65572 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtcctatatccat 65671  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||||||||   |||| ||||| ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  65672 gtttggtagagattttgaagttgacttagtatgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaatt 65745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 713 - 442
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  713 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 614  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  613 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccatctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 514  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  513 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatggatgttatttttgggatgaa 442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 203508 - 203246
Alignment:
Q  17 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||||||    
T  203508 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtt 203409  T
Q  117 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 216  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  203408 tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtt 203309  T
Q  217 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttgg 279  Q
    |||||||||||||| | | || ||||||||| || | |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  203308 tggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttatttttgg 203246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 424419 - 424266
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||     || ||||  | |   ||| || | ||| | ||||||||    
T  424419 ttaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcctacgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatat 424320  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 186  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  424319 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 424266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 251752 - 251479
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  251752 atcagaggtacttgtttctttaatagtacttctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 251653  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||   |||||  | |||||    
T  251652 gtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctat 251553  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  251552 gtttggtagagactttgtagtcgatctagtttgtttgccgttgtcgggtatggatgttatttttgggatgaatt 251479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 81
Target Start/End: Original strand, 230045 - 230093
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattg 81  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  230045 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 230093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1250 - 979
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1250 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 1151  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||   | |||||    
T  1150 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaattgttgttgaaactccagttaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctat 1051  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1050 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaa 979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15253 - 14980
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15253 atcagaggtacttgtttcttttatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgg 15154  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||   ||||||  | |||||    
T  15153 gtttgattgtatttgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagcaactacttctctagtttgtctaaggtgtccattgtctat 15054  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||| ||||||||||||   | || ||||||||| || | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15053 gtttcgtagagattttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgatgggtatggatgttatttttggaatgaatt 14980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6240 - 6010
Alignment:
Q  17 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 116  Q
    |||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||| | ||||| | ||||||||||     
T  6240 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactgatgctacgcattgttttaatgctatttattgtgcttctaagttgggtc 6141  T
Q  117 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 216  Q
    |   | | ||  |||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |    |||||| | || |||||    
T  6140 ttactatgtcgaatatgaaaggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtcaatgtt 6041  T
Q  217 tggtagagattttgtgattgatttagtttgt 247  Q
    |||| ||||| |||  |||||||| ||||||    
T  6040 tggtcgagatgttgaaattgatttggtttgt 6010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20944 - 20673
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20944 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 20845  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||  | |||||    
T  20844 gtctggtcgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctat 20745  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  20744 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaa 20673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 661 - 934
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||||| |||||| |||    
T  661 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaaactggtgctacacaatgtttaattgctatagaatgtgcatataagatgg 760  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || |  |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  | |||||  | |||||    
T  761 gtataaaaatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaaatgtccgttgtctat 860  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||| ||||||| ||||   | || |||||| || |  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  861 gtttagtagagactttgaagtcgacttagttggttttccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaatt 934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7168 - 6957
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7168 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 7069  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||  | |||||    
T  7068 gtttggttgtttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctat 6969  T
Q  214 gtttggtagaga 225  Q
    ||||||||||||    
T  6968 gtttggtagaga 6957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 64776 - 65049
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||     
T  64776 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttga 64875  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
     ||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||  | |||||    
T  64876 atttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagcaaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctat 64975  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  64976 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaatt 65049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 49354 - 49627
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||     
T  49354 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttga 49453  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
     ||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||  | |||||    
T  49454 atttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctat 49553  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  49554 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaatt 49627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 58388 - 58661
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||     
T  58388 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttga 58487  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
     ||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||  | |||||    
T  58488 atttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctat 58587  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  58588 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaatt 58661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29754 - 29538
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  29754 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcaatgtttgattgctgttgattgtgcatataagttgg 29655  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  29654 gtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctat 29555  T
Q  214 gtttggtagagattttg 230  Q
    |||||||||||| ||||    
T  29554 gtttggtagagactttg 29538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 9946 - 10217
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  9946 atcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatttgcttataagttgg 10045  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    |||||  | |||||    
T  10046 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgtctaagatgtccgttgtctat 10145  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||| ||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10146 gtttagtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaa 10217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 24119 - 24352
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||| |    
T  24119 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttag 24218  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||  || ||   |||||| | |||||    
T  24219 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgcgtttgagatgtcctttgtctat 24318  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 247  Q
    ||||| | | ||||||  ||||||||| ||||||    
T  24319 gtttgatcgtgattttaggattgatttggtttgt 24352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 37069 - 36798
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||    
T  37069 atcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatacaagttgg 36970  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  36969 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 36870  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  36869 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgatatttttgggatgaa 36798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 98757 - 99028
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||    
T  98757 atcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattactattgaatgtgcttataagttgg 98856  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   |||| |  | |||||    
T  98857 gtctggttgtatctaatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgttcgttgtctat 98956  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  98957 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaa 99028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 176117 - 175847
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  176117 atcagaggtacttatttcttta-tagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 176019  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  176018 gtctggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 175919  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||||||||   | ||| | || ||| || | ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  175918 gtttggtagagattttgaagtcgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaa 175847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 325837 - 325566
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  325837 atcagaggtacttgtttctttaatattactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 325738  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||   | |||||    
T  325737 gtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctat 325638  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||| ||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  325637 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaa 325566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 200642 - 200913
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  200642 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactagtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgg 200741  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| | | ||   |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||   ||||   | |||||    
T  200742 gtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgatttgtctgttgtctat 200841  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||| ||| || | ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  200842 gtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaa 200913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 8 - 281
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||     
T  8 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctattcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttga 107  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  108 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctat 207  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||| ||| || |||||| | |||||||||||| || | ||| |||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  208 gtttgttagggactttgtggtggatttagtttgtttgccgttgtcgggtatgaatgtgatttttggtatgaatt 281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 719 - 992
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  719 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 818  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||    
T  819 gtttgattgtatctgatatgaaaggagagatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtgactacttcccttgtttgtttgaggtgtcctctatctat 918  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||| ||||||| | | || |||||||||||  | |||||||| |||||||| || ||||| |||||||    
T  919 gtttggtagggattttgaggtagacttagtttgtctaccgttgacgggaatggatgtcatttttgggatgaatt 992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10916 - 10683
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  10916 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgg 10817  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | | | | ||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||  | |||||    
T  10816 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtccattgtctat 10717  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 247  Q
    ||||||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  10716 gtttggtcgtgattttgaaattgatttagtttgt 10683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 1028 - 1244
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1028 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 1127  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||  | |||||    
T  1128 gtctggttgtatatgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctat 1227  T
Q  214 gtttggtagagattttg 230  Q
    |||||||||||| ||||    
T  1228 gtttggtagagactttg 1244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 151694 - 151426
Alignment:
Q  17 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 116  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  151694 agaggtatttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtt 151595  T
Q  117 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 216  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||  | ||||||||    
T  151594 tggttgtatcttatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtt 151495  T
Q  217 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||  |||   | || ||||||||| |    |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  151494 tggtagagacattgaagtcgacttagtttgtttacagttgacgggtatggatgttatttttgggatgaa 151426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 23707 - 23940
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  23707 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 23806  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    ||| || | |||||    
T  23807 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttgtctat 23906  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 247  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||    
T  23907 gtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgt 23940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 73792 - 73844
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73792 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttttat 73844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 78173 - 78225
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78173 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttttat 78225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 182099 - 182047
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  182099 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 182047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 80
Target Start/End: Original strand, 175708 - 175753
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 80  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  175708 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 175753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 1485 - 1756
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  1485 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgg 1584  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  1585 gtctggttgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 1684  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | ||| | |||||| |  | ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  1685 gtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaa 1756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 5383 - 5594
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5383 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 5482  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||   | |||||    
T  5483 gtctggttgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctat 5582  T
Q  214 gtttggtagaga 225  Q
    ||||||||||||    
T  5583 gtttggtagaga 5594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 7874 - 7603
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  7874 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgg 7775  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  7774 gtctggttgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 7675  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | ||| | |||||| |  | ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  7674 gtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaa 7603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 42828 - 42557
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||| ||||||||||    
T  42828 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttatttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgtagttgattgtgcatataagttgg 42729  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  42728 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 42629  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  ||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  42628 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccattgacaggtatggatgtaatttttgggatgaa 42557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Original strand, 50545 - 50775
Alignment:
Q  40 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  50545 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctaccttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 50644  T
Q  140 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 239  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||||| ||| ||||    
T  50645 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatt 50744  T
Q  240 tagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    ||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  50745 tagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 50775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 5023 - 5296
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  5023 atcagaggtacttgtttctttaatactactcctttaattgatattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 5122  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | | |   ||||||  | |||||    
T  5123 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctctttaaggtgtccgttgtctat 5222  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||| |||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5223 gtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaatt 5296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 17658 - 17931
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  17658 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacattggtgctacttattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 17757  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |   | |||   |  ||||    
T  17758 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggagtcagttgactat 17857  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||| |||||  | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  17858 gtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggaataaatt 17931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 2126 - 2307
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||    
T  2126 atcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgttcttataagttgg 2225  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 195  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2226 gtctggttgtatctgatatgaaaggggatatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 2307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 70502 - 70229
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||  ||| | | |||||||| ||||||||||    
T  70502 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttctttgctttagaatgtgcatataagttgg 70403  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |   ||||||  | |||||    
T  70402 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctat 70303  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  70302 gtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatgtatgttatttttgggatgaatt 70229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12857 - 12601
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  12857 atcaggggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 12758  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    |||||  | |||||    
T  12757 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaagttgtccattgtctat 12658  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    |||||||||||| ||||  ||  || | |||||| || | |||||||||||||||||    
T  12657 gtttggtagagactttgaaatcaatcttgtttgtttgccgttgacgggtatggatgt 12601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 9401 - 9612
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||    
T  9401 atcagaggtacttgtttcattaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtacttataagttgg 9500  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||    
T  9501 gtctggttgtatctgatatgaaacgggaaatagttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctat 9600  T
Q  214 gtttggtagaga 225  Q
    ||||||||||||    
T  9601 gtttggtagaga 9612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 12090 - 11819
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  12090 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggcgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 11991  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| | | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  11990 gtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctat 11891  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||| | |||| | ||||| | |||||| || | ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  11890 gtttggtagatactttgaggttgatcttgtttgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaa 11819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 1057 - 1328
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  |||||||||    
T  1057 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagctactggtgctactcattatttcattgttgttgattgtgcgcataagttgg 1156  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||  | |||||    
T  1157 gtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctat 1256  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1257 gtttggtagagactttgaagtggacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaa 1328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40185 - 39915
Alignment:
Q  17 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| | | ||| |||| ||||||||||| |    
T  40185 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacacaggtgctactcattgttttattgctttagaaagtgcatataagttggggt 40086  T
Q  117 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 216  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| |   ||||||  | ||||||||    
T  40085 tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggtttagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttgtctatgtt 39986  T
Q  217 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| |||||  | ||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  39985 tggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacaggtatggatgttagttttggaatgaatt 39915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Original strand, 17523 - 17754
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||  |  ||| |||||   ||||||||    
T  17523 atcagaggtacttgttatattaataatacacctttagttgctattattgatacaggtgctacgcattgtttcatttcttatgattgtgctactaagttgg 17622  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || |     |  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||    
T  17623 gtcttatcatgcctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggctcgctgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcct-tgtctat 17721  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttg 246  Q
    ||||| | | ||||||| ||| |||||||||||    
T  17722 gtttgatcgtgattttgagatggatttagtttg 17754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 53597 - 53870
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | || ||| ||| |||| |||||||| |    
T  53597 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaaactggtgctactcattgtttcaatgctatagaaagtgcatataagttag 53696  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    ||||   ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||   |||||  | |||||    
T  53697 gtttaattgtatctgaaatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctat 53796  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53797 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaatt 53870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 2998 - 2730
Alignment:
Q  17 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| | |||  ||||| ||||||||||||     
T  2998 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggggctactcattgtttcattgttgttgcttgtgcatataagttgggtc 2899  T
Q  117 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 216  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | ||||||||    
T  2898 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtt 2799  T
Q  217 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    ||||||||| ||||   | ||| |||| ||| || | ||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  2798 tggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatagatgtaatttttgggatgaa 2730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 65
Target Start/End: Original strand, 11917 - 11968
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 65  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11917 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 11968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 63693 - 63909
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  63693 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcttttaattgctattatagatactggtgttactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgg 63792  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  63793 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctat 63892  T
Q  214 gtttggtagagattttg 230  Q
    |||||||||||| ||||    
T  63893 gtttggtagagactttg 63909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 29 - 300
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  29 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatacgggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 128  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    ||| |  | |||||    
T  129 gtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtataagatgtacgttgtctat 228  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  229 gtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaa 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29657 - 29386
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||   |||| ||||| ||||||||||    
T  29657 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgcagttgattgtgcatataagttgg 29558  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| | | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  29557 gtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcacttgtttgtttgagttgtccattgtctat 29458  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| |||| | ||||| | || ||| || | ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  29457 gtttggtagagactttgaggttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaa 29386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 94068 - 94341
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||    
T  94068 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgg 94167  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||   ||||||  | |||||    
T  94168 gtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctat 94267  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||||||||   | |||||||| |||||  | |||  ||| ||||||||||| || || |||||||    
T  94268 gtttggtagagattttgaagtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaatt 94341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 115692 - 115419
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | | || ||||| |||||  | |    
T  115692 atcagaggtacttgtttctttaatagtatccctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataaactag 115593  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||    
T  115592 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgatatgtcctatatctat 115493  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||| |||||||   | |||||||||||  |  || ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  115492 gtttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttaccactgacggggatggatgttatatttgggatgaatt 115419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 989 - 1205
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  989 atcaaaggtacttgtttctttaatagtactcccttaattgctattatagacactagtgctactcattgttttattgctattgattgtgcatataagttgg 1088  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    |||||  | |||||    
T  1089 gtctggctgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttttctaagatgtccgttgtctat 1188  T
Q  214 gtttggtagagattttg 230  Q
    |||||||||||| ||||    
T  1189 gtttggtagagactttg 1205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5935 - 5719
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  5935 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgttattatagatactagtgctactcattgtttcattgctatttaatgtgcatataagttgg 5836  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    |||||  | |||||    
T  5835 gtctggttgtatctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctatgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctat 5736  T
Q  214 gtttggtagagattttg 230  Q
    |||||||||||| ||||    
T  5735 gtttggtagagactttg 5719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 89
Target Start/End: Original strand, 41282 - 41357
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattg 89  Q
    ||||||||||| | || | ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  41282 atcagaggtacatgttacattaatagtactcccttaattactattatagatactggtgctacacattgttttattg 41357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5686 - 5608
Alignment:
Q  209 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5686 tctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaatt 5608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 1446 - 1719
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | || | ||||| ||||||||||    
T  1446 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgg 1545  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||  | | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  1546 gtctgattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 1645  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||| ||||   ||||| | || ||| || | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  1646 gtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaatt 1719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Original strand, 28459 - 28732
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | || | ||||| ||||||||||    
T  28459 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgg 28558  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||  | | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  28559 gtctgattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 28658  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |||||||||||| ||||   ||||| | || ||| || | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  28659 gtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaatt 28732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 17 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 50232 - 50019
Alignment:
Q  17 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||      
T  50232 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggggc 50133  T
Q  117 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 216  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||  | ||||||||    
T  50132 tagttgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtt 50033  T
Q  217 tggtagagattttg 230  Q
    ||||||||| ||||    
T  50032 tggtagagactttg 50019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 230
Target Start/End: Original strand, 20710 - 20918
Alignment:
Q  22 tacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggat 121  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||| |||||| ||| |    
T  20710 tacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataaattgggtctggtt 20809  T
Q  122 gtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggta 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||||||||||    
T  20810 gtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggta 20909  T
Q  222 gagattttg 230  Q
    |||| ||||    
T  20910 gagactttg 20918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 230
Target Start/End: Original strand, 12530 - 12738
Alignment:
Q  22 tacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggat 121  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||| |||| | ||| |    
T  12530 tacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataaattggatctggtt 12629  T
Q  122 gtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggta 221  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||||||||||    
T  12630 gtatcaaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggta 12729  T
Q  222 gagattttg 230  Q
    |||| ||||    
T  12730 gagactttg 12738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 8636 - 8852
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |    
T  8636 atcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgtgcttataagttag 8735  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||  | |||||    
T  8736 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctat 8835  T
Q  214 gtttggtagagattttg 230  Q
    |||||||||||| ||||    
T  8836 gtttggtagagactttg 8852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 18850 - 19066
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |    
T  18850 atcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgtgcttataagttag 18949  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||  | |||||    
T  18950 gtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctat 19049  T
Q  214 gtttggtagagattttg 230  Q
    |||||||||||| ||||    
T  19050 gtttggtagagactttg 19066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 43593 - 43864
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  43593 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgg 43692  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| | | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||    
T  43693 gtctggttatgtctgatatgaatggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctat 43792  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||| | ||||   | ||| |||| ||| || |||||||||||||| |||| || ||||| |||||    
T  43793 gtttggtagatactttgaactcgatctagtatgtttgccattgacgggtatgaatgtaatttttgggatgaa 43864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 25216 - 25075
Alignment:
Q  144 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 243  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| |||||| | |||||| ||   |||||  | ||||||| |||||||||||||| | || | || ||    
T  25216 tggttgtcgaaactcgagctaagggttcgataactacttctttggtttgtttgagttgtccgttgtctatgtatggtagagattttgaggttaacttggt 25117  T
Q  244 ttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||| |  | |||||||| |||||||| ||| |||| |||||    
T  25116 ttgtttaccgttgacgggaatggatgtaatccttggtatgaa 25075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 54177 - 53966
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||     
T  54177 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgt 54078  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||   ||||||  | |||||    
T  54077 gtctggttgtatctgatatgaatgtagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctat 53978  T
Q  214 gtttggtagaga 225  Q
    ||||||||||||    
T  53977 gtttggtagaga 53966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 34464 - 34196
Alignment:
Q  17 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||||     
T  34464 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgaatatgtatataagttgggtc 34365  T
Q  117 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 216  Q
     || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||   ||||||  | ||||||||    
T  34364 cggttgtatctgatatgaaagtggaaatggttgttgaaattccagctaagggttcagtagctatttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtt 34265  T
Q  217 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    ||||| ||| ||||   | ||  |||||||| | || ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  34264 tggtaaagactttgaagtcgacctagtttgtttatcgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaa 34196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 164575 - 164846
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  164575 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgccattgaatgtgcttataagttgg 164674  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| |||   |||||   | |||||    
T  164675 gtctggttatatctgataagaaaggggaaatggttgttgaaactccagcaaatggttcaataactacttctcttgtttatctaaggtgtctattgtctat 164774  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    ||||||||| || |||  | | |||||||| ||| |  | |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  164775 gtttggtagggactttcaggtcgatttagtgtgtttaccgttgacgggaatagatgttatttttgggatgaa 164846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 47157 - 47391
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  47157 atcagaggtacttgttattttaatagtacacctttagttactattattgattctggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 47256  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || |   | | ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||| |||| ||||| || || ||||||||||| ||| |   ||||| | | |||||    
T  47257 gtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaa-ggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcttttgtctat 47355  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtct 249  Q
    ||||| | | |||||||  |||||||| ||||||||    
T  47356 gtttgatcgtgattttgaaattgatttggtttgtct 47391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 186
Target Start/End: Original strand, 30774 - 30920
Alignment:
Q  40 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | |   |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  30774 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatgga 30873  T
Q  140 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 186  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  30874 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 30920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 152100 - 151978
Alignment:
Q  125 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 224  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | |    
T  152100 tctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtg 152001  T
Q  225 attttgtgattgatttagtttgt 247  Q
    |||||| ||||||||| ||||||    
T  152000 attttgagattgatttggtttgt 151978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 110726 - 110524
Alignment:
Q  28 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatct 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| ||| |||    
T  110726 tttctttaatagtactcctttaattgctgttatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtgtct 110627  T
Q  128 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagatt 227  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| |    
T  110626 gatatgaaaggagaaatggttgttaaaactccggctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagact 110527  T
Q  228 ttg 230  Q
    |||    
T  110526 ttg 110524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 60855 - 60598
Alignment:
Q  28 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatct 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| | | | |||||    
T  60855 tttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatatct 60756  T
Q  128 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagatt 227  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | ||||||||||||||||| |    
T  60755 gatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagact 60656  T
Q  228 ttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||   | ||| |||| ||| || | ||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  60655 ttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaa 60598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 70238 - 70079
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  70238 atcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 70139  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcag 173  Q
    || | | | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70138 gtctagttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcag 70079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5311 - 5040
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  5311 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 5212  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||    |||||  | || ||    
T  5211 gtctggttatgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctgaggtttcagtaactatttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtcaat 5112  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | ||| | |||||| |  | ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  5111 gtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaa 5040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5732 - 5516
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||  | ||| ||||||||||    
T  5732 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgtttatgcatataagttgg 5633  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| | | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||   |||||  | |||||    
T  5632 gtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttatttgtttgacttgtccgttgtctat 5533  T
Q  214 gtttggtagagattttg 230  Q
    |||||||||||| ||||    
T  5532 gtttggtagagactttg 5516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1851 - 1580
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  1851 atcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgg 1752  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || ||| | | ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||   | |||  | |||||    
T  1751 gtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttcttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttctttgtttgagttttccactgtctat 1652  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| || | || |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  1651 gtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgttaacgggtatggatgtaatttttgggatgaa 1580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Original strand, 6431 - 6606
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  6431 atcagaggtacttgtttctataatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgg 6530  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 189  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  6531 gtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgt 6606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Original strand, 4263 - 4534
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  4263 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 4362  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || |   | | ||   |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||   |||||| | |||||    
T  4363 gtctacttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttgtttgtttgagttgtcctttgtctat 4462  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||||||||||| ||||   ||||| | || ||| || | ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||    
T  4463 gtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccgttgacgggtttggatgtaatccttgggatgaa 4534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Original strand, 4478 - 4650
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  4478 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaatttctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgg 4577  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 186  Q
    ||  || | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4578 gtcgggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 4650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 9195 - 9333
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9195 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 9294  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttg 152  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9295 gtcaggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttg 9333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21946 - 21716
Alignment:
Q  49 aattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggtt 148  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | | || ||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||     
T  21946 aattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataaattgggtttgattatatctgatatgaaaggagaaatggtc 21847  T
Q  149 gttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || |||||||||     
T  21846 gttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgttcggtagggattttgaggtagacttagtttgtt 21747  T
Q  249 tgtcattgacgggtatggatgttatctttgg 279  Q
    |  |  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  21746 taccgctgacgggaatggatgttatttttgg 21716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 230
Target Start/End: Original strand, 49086 - 49267
Alignment:
Q  49 aattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggtt 148  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  49086 aattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 49185  T
Q  149 gttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 230  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||   | ||||||||||||||||| ||||    
T  49186 gttgaaaatcaagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagactttg 49267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11955 - 11744
Alignment:
Q  17 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 116  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||     
T  11955 agagatacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaccatggtgctacacattgtttcattgctattgattgtgcatataagttgggtc 11856  T
Q  117 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 216  Q
    ||  |||  | | |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||   |||||| | ||||||||    
T  11855 tgattgt--caggtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtt 11758  T
Q  217 tggtagagattttg 230  Q
    ||||||||||||||    
T  11757 tggtagagattttg 11744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Original strand, 19143 - 19262
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19143 atcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 19242  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatg 133  Q
    |||||| |||||||| ||||    
T  19243 gtttggttgtatctgttatg 19262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18005 - 17775
Alignment:
Q  17 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 116  Q
    |||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||     
T  18005 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctgttgattgtgcgtctaagttgggtc 17906  T
Q  117 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 216  Q
    |   | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||||||||| ||| |    |||||| | ||||||||    
T  17905 ttactatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtt 17806  T
Q  217 tggtagagattttgtgattgatttagtttgt 247  Q
    |||| |||| ||||  |||||||| ||||||    
T  17805 tggtcgagactttgaaattgatttggtttgt 17775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Original strand, 111081 - 111237
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  111081 atcagaggtacatgttattttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 111180  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggtt 170  Q
    || | | | | ||  ||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  111181 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagtgatggttgtcgaaactccagctaagggtt 111237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 247
Target Start/End: Original strand, 9549 - 9758
Alignment:
Q  38 agtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaag 137  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||| |     | ||  ||||||| |    
T  9549 agtactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatg 9648  T
Q  138 gggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattga 237  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9649 gagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgagattga 9748  T
Q  238 tttagtttgt 247  Q
    ||| ||||||    
T  9749 tttggtttgt 9758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 23472 - 23705
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||  |||| | ||||||||    
T  23472 atcagaggtacgtgttattttgatagtactcctttagttgctattattgataatagtgctacgcattgttttattgctcttgatagtgcttctaagttgg 23571  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | | | | ||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||| |    |||| | |||||||    
T  23572 gtcttgctatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggcgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcatttatctat 23671  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 247  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  23672 gtttggtagagattttgagattgatttggtttgt 23705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 10332 - 10588
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | | || ||||| | ||  ||||    
T  10332 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgccacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 10431  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || |  || | |||| |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || | |||||| | |||||    
T  10432 gtctacatatgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctat 10531  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  10532 gtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 10588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5215 - 4947
Alignment:
Q  17 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 116  Q
    |||||||| | || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||     
T  5215 agaggtacatgttactttgatagtactcttttaattgctattattgatactggtgctacgcattgttttattggtgttgattgtgcttctaagttgggtc 5116  T
Q  117 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 216  Q
    | | | | |   ||||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||   ||||||| | || |||||    
T  5115 ttgttatgttaaatatgaatggagatatggtcgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaaggtgtcctttgtcgatgtt 5016  T
Q  217 tggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |||| |||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| |||| |||||    
T  5015 tggtcgagactttgaaattgatttagtttgtttgtctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaa 4947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Original strand, 4069 - 4242
Alignment:
Q  17 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||||     
T  4069 agaggtacttgtttctttaatagtactc---taattgctattattgacactggtgctacactttgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 4165  T
Q  117 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 193  Q
    ||| | | ||   |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4166 tggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttatcttgtttgt 4242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 7972 - 8211
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| || |  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  7972 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgattgggtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 8071  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccact--tctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 230  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||||||||  |||| || || |||  ||||| || ||| |||  ||| || | |||||||||||| | |||||||    
T  8072 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaacgttcggtgactacttctctctcgtatgtttgcgatgttctttgtctatgtttggtcgtgattttg 8171  T
Q  231 tgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
      || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  8172 aaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 8211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26161 - 25969
Alignment:
Q  95 gaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtc 194  Q
    |||||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  26161 gaatgtgcatataagttgggcctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtt 26062  T
Q  195 tgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    |   ||||||  | |||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |||| ||| ||||||||||| || || |||||||    
T  26061 taaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatggatgttattttcgggatgaatt 25969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 29102 - 29337
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | ||  ||||    
T  29102 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgctacgcattgatttattgctttcgattgtgtttctactttgg 29201  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | ||| ||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| |||||||    
T  29202 gtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctat 29301  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtct 249  Q
    ||||||| | |||||||  || ||||||||||||||    
T  29302 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtct 29337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 17240 - 17475
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | ||  ||||    
T  17240 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgg 17339  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| |||||||    
T  17340 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctat 17439  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtct 249  Q
    ||||||| | |||||||  || ||||||||||||||    
T  17440 gtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtct 17475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24433 - 24219
Alignment:
Q  17 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtt 116  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| | |||| ||||  |  || |||| |     
T  24433 agaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattatagatactagggctacacattgttttattgttgttgattgtgtttcgaaattggatc 24334  T
Q  117 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtt 216  Q
    | | | | ||  ||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| || || ||| |||||||| | || |||||    
T  24333 ttgttatgtcatatatgaatggagaaatggttgtcgaaaccccggctaagggttcagtgactacttctctagtatgcctgaagtgtcctttgtcgatgtt 24234  T
Q  217 tggtagagattttgt 231  Q
    |||||||||||||||    
T  24233 tggtagagattttgt 24219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 245
Target Start/End: Original strand, 195038 - 195243
Alignment:
Q  40 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||  ||     
T  195038 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattgga 195137  T
Q  140 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 239  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||  | ||||| | ||| ||||    
T  195138 gagatagttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggacgtgatttcgagatggatt 195237  T
Q  240 tagttt 245  Q
    ||||||    
T  195238 tagttt 195243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4564 - 4331
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  4564 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 4465  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | | | | ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||    
T  4464 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 4365  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 247  Q
    ||||| | | ||||||| ||| ||||| ||||||    
T  4364 gtttgatcgtgattttgagatcgatttggtttgt 4331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 147 - 1
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  147 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 48  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcca 160  Q
    || | | | | ||| ||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  47 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 230
Target Start/End: Original strand, 3451 - 3560
Alignment:
Q  121 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggt 220  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  3451 tgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggt 3550  T
Q  221 agagattttg 230  Q
    || |||||||    
T  3551 agggattttg 3560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 57788 - 58021
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||| |    
T  57788 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgttattgattgtgcttctaagttag 57887  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||    
T  57888 gtcttgctatgtcgaatatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 57987  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 247  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||    
T  57988 gtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgt 58021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6978 - 6770
Alignment:
Q  39 gtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagg 138  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| ||    
T  6978 gtactcctttaactgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatgg 6879  T
Q  139 ggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgat 238  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||     
T  6878 agaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgac 6779  T
Q  239 ttagtttgt 247  Q
    || ||||||    
T  6778 ttggtttgt 6770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14108 - 13900
Alignment:
Q  39 gtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagg 138  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| ||    
T  14108 gtactcctttaactgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatgg 14009  T
Q  139 ggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgat 238  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||  || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||     
T  14008 agaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgac 13909  T
Q  239 ttagtttgt 247  Q
    || ||||||    
T  13908 ttggtttgt 13900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2129 - 1913
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||   ||||||||    
T  2129 atcagaggtacatgtttcattaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctacgcattgttttattgttgctgattgtgctactaagttgg 2030  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || |   | | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||| | || ||  || |||||||| | || ||    
T  2029 gtcttattatgtcatatatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctttagtatgcttgaagtgtcctttgtcgat 1930  T
Q  214 gtttggtagagattttg 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  1929 gtttggtagagattttg 1913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 247
Target Start/End: Original strand, 15175 - 15386
Alignment:
Q  36 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaa 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||| |   | | ||  |||||||    
T  15175 atagtactcctttagttgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcaaatatgaa 15274  T
Q  136 aggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgatt 235  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| | || ||| |    | |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15275 tggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctttagtgtgtttaagatatcctttatctatgtttggtagatattttgagatt 15374  T
Q  236 gatttagtttgt 247  Q
    ||||| ||||||    
T  15375 gatttggtttgt 15386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 216594 - 216827
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | |  ||||| |    
T  216594 atcagaggtacatgttactttgatagtactactttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgttattgattgtacttcaaagttag 216693  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcag-tgtcctatatcta 212  Q
    || | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| | ||| |||||| | ||||    
T  216694 gtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtagaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgt-ttcagatgtcctttgtcta 216792  T
Q  213 tgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 247  Q
    || ||||| ||||||||   |||||||| ||||||    
T  216793 tgattggtcgagattttaaaattgatttggtttgt 216827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 1225 - 1462
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| | | || | ||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  1225 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgtattgctttattgctttcgactttgtttctactttgggtcttgatttttctgatat 1324  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||||| |    
T  1325 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgag 1424  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  1425 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 1462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10479 - 10242
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  10479 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 10380  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  10379 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 10280  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  10279 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 10242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 14440 - 14673
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | || |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||   ||||||||    
T  14440 atcagaggtacatgttactttgatattactcctttaatagcttttattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgctcctaagttgg 14539  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | | |    |||||| | |||||    
T  14540 gtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtatttaagatgtcctttgtctat 14639  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 247  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||    
T  14640 gtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgt 14673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 13653 - 13886
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  13653 atcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattgatgctacacattgttctattgctattgattgtgcttctaagttgg 13752  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | | | | ||  ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||  |    |||||  | |||||    
T  13753 gtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagagttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtccattgtctat 13852  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 247  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  13853 gtttggtcgagattttaaaattgatttagtttgt 13886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36628 - 36355
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | | || ||||  | ||  ||||    
T  36628 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttcattgctttcgattgtgtttctactttgg 36529  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||    
T  36528 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctat 36429  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaatt 287  Q
    ||||||| | |||||||  || ||| ||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  |||| |||||||    
T  36428 gtttggtcgtgattttgaaatggatctagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaatt 36355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22358 - 22121
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  22358 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 22259  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  22258 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 22159  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  22158 atggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgt 22121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26460 - 26211
Alignment:
Q  36 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaa 135  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | |||| ||||| | |||||||||| |   | | ||  |||||||    
T  26460 atagtactcttttagttgctattattgatattggtgctacgcaatgttttattgttgttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaa 26361  T
Q  136 aggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgatt 235  Q
     || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||    |||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||    
T  26360 tggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtcgagactttgaaatt 26261  T
Q  236 gatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    ||||| |||||| || | ||||  || |||||||| ||| |||| |||||    
T  26260 gatttggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaa 26211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 40 - 270
Target Start/End: Original strand, 37020 - 37250
Alignment:
Q  40 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| ||||||||||||| ||     
T  37020 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatgga 37119  T
Q  140 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 239  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | |||||   ||| || |    
T  37120 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgatatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaagatggact 37219  T
Q  240 tagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    ||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  37220 tagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 37250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18048 - 17811
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||| ||||  | |   ||| || | ||| | ||||||||    
T  18048 ttaataatactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatat 17949  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  17948 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 17849  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||| ||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  17848 atggatttggtttgtctacctttgagcggtatggatgt 17811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11580 - 11343
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||| ||||  | |   ||| || | ||| | ||||||||    
T  11580 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatat 11481  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  11480 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 11381  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||| ||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  11380 atggatttggtttgtctacctttgagcggtatggatgt 11343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 55115 - 55059
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattg 89  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55115 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattg 55059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 53719 - 53601
Alignment:
Q  152 gaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgt 251  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||| ||||||||      
T  53719 gaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgtctac 53620  T
Q  252 cattgacgggtatggatgt 270  Q
    | ||||  |||||||||||    
T  53619 ctttgagcggtatggatgt 53601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 118
Target Start/End: Original strand, 2022 - 2126
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | || ||||| ||||||||||    
T  2022 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgg 2121  T
Q  114 gtttg 118  Q
    |||||    
T  2122 gtttg 2126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Original strand, 55644 - 55819
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  55644 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgg 55743  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 189  Q
    || |   | | ||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  55744 gtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 55819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 247
Target Start/End: Original strand, 2456 - 2670
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||   |||||||||| | | | | ||||||||    
T  2456 ttaataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattcttttattgcttatgaatgtgctactaagttgggtcttgttatgtctgatat 2555  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| |    
T  2556 gaatggagacatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgag 2655  T
Q  233 attgatttagtttgt 247  Q
    || ||||| ||||||    
T  2656 atagatttggtttgt 2670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14193 - 14039
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatga 134  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||| | | | | ||||||||||    
T  14193 aatagtacacctttagttgctattattgatagtggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctgatatga 14094  T
Q  135 aaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 189  Q
    | || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  14093 atggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 14039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 11394 - 11293
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||   ||||||||    
T  11394 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 11295  T
Q  114 gt 115  Q
    ||    
T  11294 gt 11293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 25287 - 25235
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25287 aatagtactcctttaattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 25235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8521 - 8336
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||    
T  8521 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatat 8422  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttg 218  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||| ||   |||||| | ||||||||||    
T  8421 gaatggagaaatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcctttgtctatgtttg 8336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8369 - 8132
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||  | |   || ||| | ||  | ||||||||    
T  8369 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtatctgctttaggtcttgaattgtctgatat 8270  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||| |||||  | |||||||||||| | |||||||      
T  8269 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcattgtccgttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 8170  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  8169 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 8132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 270
Target Start/End: Original strand, 13094 - 13323
Alignment:
Q  41 actcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggg 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || |    
T  13094 actcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgatttataaatatcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggag 13193  T
Q  141 aaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgattt 240  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| || ||||||||||| | |||||||  || |||||    
T  13194 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttaactatgtttggtcgtgattttgaaatggattt 13293  T
Q  241 agtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    |||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  13294 agtttgtctacctttgagcggtatggatgt 13323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31994 - 31778
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | | || ||||| | |   |||||| | | | | | ||||||    
T  31994 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtttgatat 31895  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  31894 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgat 31795  T
Q  233 attgatttagtttgtct 249  Q
    || ||||||||||||||    
T  31794 atggatttagtttgtct 31778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 270
Target Start/End: Original strand, 10439 - 10668
Alignment:
Q  41 actcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggg 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || |    
T  10439 actcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattactttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggag 10538  T
Q  141 aaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgattt 240  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| || ||||||||||| | |||||||  || |||||    
T  10539 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttaactatgtttggtcgtgattttgaaatggattt 10638  T
Q  241 agtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    |||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  10639 agtttgtctacctttgagcggtatggatgt 10668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37460 - 37244
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | | || ||||| | |   |||||| | | | | | ||||||    
T  37460 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtttgatat 37361  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||  | ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  37360 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttctgttactacttctctcttatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgat 37261  T
Q  233 attgatttagtttgtct 249  Q
    || ||||||||||||||    
T  37260 atggatttagtttgtct 37244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 54737 - 54534
Alignment:
Q  44 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 143  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||   |||||||||| |     | ||| ||||||| || ||||    
T  54737 cctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttttcatgtctaatatgaatggagaaa 54638  T
Q  144 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||    
T  54637 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttttctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagt 54538  T
Q  244 ttgt 247  Q
    ||||    
T  54537 ttgt 54534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 3535 - 3298
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  3535 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatat 3436  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  3435 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 3336  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  3335 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 3298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17290 - 17034
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||   ||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   ||||    
T  17290 atcagaggtacttgttatattaataaaactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17191  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| || ||| |    || ||| |||||||    
T  17190 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttaagatgccctttatctat 17091  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    |||| || | |||||||  || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  17090 gtttagtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 17034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 249
Target Start/End: Original strand, 34915 - 35124
Alignment:
Q  40 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  34915 tactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 35014  T
Q  140 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatt 239  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||    
T  35015 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatt 35114  T
Q  240 tagtttgtct 249  Q
    ||||||||||    
T  35115 tagtttgtct 35124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 41762 - 41529
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  41762 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 41663  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | | | | |   |||||||  | || ||||||||  ||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |    |||||| | |||||    
T  41662 gtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 41563  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 247  Q
    ||||| | | |||||||  ||||| |||||||||    
T  41562 gtttgatcgtgattttgaaattgacttagtttgt 41529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 75482 - 75249
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  75482 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 75383  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | | | | |   |||||||  | || ||||||||  ||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |    |||||| | |||||    
T  75382 gtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 75283  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 247  Q
    ||||| | | |||||||  ||||| |||||||||    
T  75282 gtttgatcgtgattttgaaattgacttagtttgt 75249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8353 - 8118
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||  | | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| |||||   | ||| ||    
T  8353 atcagaggtacttgttattgtgatagtacgcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttttgattgtgctacttagtcgg 8254  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    |  | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||    
T  8253 gacttgatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 8154  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtct 249  Q
    ||||| | | ||||||| |||| |||| ||||||||    
T  8153 gtttgatcgtgattttgagattcatttggtttgtct 8118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2119 - 1886
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    |||||| |||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||||   ||||||||    
T  2119 atcagaagtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 2020  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || |   | | ||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||    
T  2019 gtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 1920  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 247  Q
    ||||| | | ||||||| ||||||| | ||||||    
T  1919 gtttgatcgtgattttgagattgatatggtttgt 1886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3681 - 3524
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||    
T  3681 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctatcattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 3582  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 171  Q
    || | | | | ||| ||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3581 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttc 3524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15540 - 15319
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||     
T  15540 atcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttg- 15442  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
               ||  |||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | ||||     
T  15441 -----------tcaaatatgaaaggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctac 15353  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 247  Q
    | ||||| |||||||||  |||||||| ||||||    
T  15352 gattggtcgagattttgaaattgatttggtttgt 15319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 249
Target Start/End: Original strand, 13317 - 13533
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  13317 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgatttgtctgatat 13416  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| |  || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| |||| ||| ||||| | |||||||      
T  13417 gaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttatcaatggttggtcgtgattttgaa 13516  T
Q  233 attgatttagtttgtct 249  Q
    || ||||||||||||||    
T  13517 atggatttagtttgtct 13533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 41266 - 41029
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| | | || | ||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  41266 ttaataatactcctttagttgctattattgacactggggctacgcattgctttattgctttggattatgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 41167  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  41166 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaa 41067  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  41066 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 41029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 247
Target Start/End: Original strand, 24916 - 25119
Alignment:
Q  44 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||   |||||  ||| | |   | ||||||||||| || ||||    
T  24916 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagtcaggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 25015  T
Q  144 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||| |    |||||| |||||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||    
T  25016 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacatctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagt 25115  T
Q  244 ttgt 247  Q
    ||||    
T  25116 ttgt 25119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 1147 - 1199
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1147 aatagtactcctttgattgcaattatagatactggtgctactcattcttttat 1199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Original strand, 7913 - 8088
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||   |||| |||    
T  7913 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctattgattgtgctactaaggtgg 8012  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 189  Q
    || | | | | ||| |||| || || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  8013 gtcttgctatgtctaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgaaaacttctcttgt 8088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Original strand, 40681 - 40856
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    |||||||||||||  |  ||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||   ||||||||    
T  40681 atcagaggtacttgctattttgatagtacacctttagttgccattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 40780  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 189  Q
    || | | | | ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||||||    
T  40781 gtcttgttatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgt 40856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1093 - 879
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  1093 ttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttcttttttgggtcttgttttgtctgatat 994  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| | || ||  |  |||||||| | |||||||||| | | ||||||| |    
T  993 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctgtcgtatgcttaaagtgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgag 894  T
Q  233 attgatttagtttgt 247  Q
    ||||| || ||||||    
T  893 attgaattggtttgt 879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 1260 - 1078
Alignment:
Q  95 gaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtc 194  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||    
T  1260 gaatgtgcatataagttgggtctggttgtatccgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggtt--------acttctcttgtttgtc 1169  T
Q  195 tgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    |    ||||   | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1168 taagatgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaa 1078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 552 - 785
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||   || ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||   ||| ||||    
T  552 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaaattgg 651  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | |   | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |    |||||| | |||||    
T  652 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttctgtgactacttcacttgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 751  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 247  Q
    ||||| | | ||||||| ||||||| | ||||||    
T  752 gtttgatcgtgattttgagattgatatggtttgt 785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4691 - 4538
Alignment:
Q  36 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaa 135  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||| | | | | ||| |||||||    
T  4691 atagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaa 4592  T
Q  136 aggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 189  Q
     || || |||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||| |||||    
T  4591 tggagagatggttgtcgaaactccagctgagggttcggtgactacttcccttgt 4538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 249
Target Start/End: Original strand, 11084 - 11289
Alignment:
Q  44 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 143  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||    
T  11084 cctttagtttctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 11183  T
Q  144 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| ||||| ||    
T  11184 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttggt 11283  T
Q  244 ttgtct 249  Q
    ||||||    
T  11284 ttgtct 11289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 51781 - 51716
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcat 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  51781 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactcgtgctactcat 51716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15011 - 14884
Alignment:
Q  44 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||    
T  15011 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 14912  T
Q  144 tggttgttgaaactccagctaagggttc 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14911 tggttgtcgaaactccagctaagggttc 14884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 252 - 15
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  252 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttttttgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 153  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||  || || |||||||| || ||| ||   |||||| ||||||||||||||   |||||||      
T  152 gaatggagagatggtcgtcgaaacttcagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcatgattttgaa 53  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  52 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 15  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 7347 - 7194
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||    
T  7347 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 7248  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 186  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  7247 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 7194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 104335 - 104182
Alignment:
Q  36 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaa 135  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||||   | | | ||  |||||||    
T  104335 atagtacacctttagtttctattattgataatggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaatttgggtcctgttatgtcaaatatgaa 104236  T
Q  136 aggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 189  Q
     || || |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  104235 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctcttgt 104182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 270
Target Start/End: Original strand, 674 - 910
Alignment:
Q  34 taatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatg 133  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | |||||||||    
T  674 taataatactcattaagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 773  T
Q  134 aaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtga 233  Q
    || || || |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||   | | |||||| ||| |||||||||| | |||||||  |    
T  774 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctctcgtatgatagaaatgtcctttatatatgtttggtcgtgattttgaaa 873  T
Q  234 ttgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    | ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  874 tggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18780 - 18509
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgg 113  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   ||||    
T  18780 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgatattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18681  T
Q  114 gtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctat 213  Q
    || | ||  | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |    |||||| | |||||    
T  18680 gtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctat 18581  T
Q  214 gtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 285  Q
    ||||| | | |||||||  |||||||| |||||| |  | ||||  ||||||||||| ||| |||| |||||    
T  18580 gtttgattgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaa 18509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 144 - 13
Alignment:
Q  40 tactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggg 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || | ||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||     
T  144 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattatgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 45  T
Q  140 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 171  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9047 - 8847
Alignment:
Q  44 cctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaa 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| |  | | |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||    
T  9047 cctttagttgctattattgatactggtgctacacatt---ttattgcttattattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 8951  T
Q  144 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 243  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||    
T  8950 tggttgtcgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtgattttgagatggatttagt 8851  T
Q  244 ttgt 247  Q
    ||||    
T  8850 ttgt 8847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Original strand, 11549 - 11786
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  11549 ttaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 11648  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||| || ||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| ||||||||||| || | |||||||      
T  11649 gaatggagatatggttttttaaactccagctaagggttcggtgactacttgtctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttagtcgtgattttgaa 11748  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    ||  |||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  11749 atgaatttagtttgtctacccttgagcggtatggatgt 11786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21715 - 21478
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | |||||| |    
T  21715 ttaataatactcccttagttgctattattgatatcggtgctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgattt 21616  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| || | | |||| | |||||||||||| | ||||| | |    
T  21615 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgag 21516  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  21515 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 21478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 37139 - 36902
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | |||||| |    
T  37139 ttaataatactcccttagttgctattattgatatcggtgctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgattt 37040  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 232  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| || | | |||| | |||||||||||| | ||||| | |    
T  37039 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgag 36940  T
Q  233 attgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    || ||||||||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  36939 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 36902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 65
Target Start/End: Original strand, 1781 - 1832
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 65  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1781 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 1832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 11155 - 11076
Alignment:
Q  17 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattga 96  Q
    |||||||| | || |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  11155 agaggtacatgttactttgatagtactcatttaattgttattattgatactggtactactcattgttttattgctattga 11076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 247
Target Start/End: Original strand, 21413 - 21592
Alignment:
Q  68 ggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagg 167  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||  | | | | ||   |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21413 ggtgctacgcattgttttattgctactgattgtgcttctaagttgggccttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagg 21512  T
Q  168 gttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 247  Q
    |||| || || |||||||| || |||||| |||||||  | || ||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||    
T  21513 gttcggtgactacttctctagtgtgtctgaagtgtccgttctcgatgtttggtcgagactttgaagttgatttagtttgt 21592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 71
Target Start/End: Original strand, 16783 - 16840
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 71  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16783 atcagaggtacatgtttctttaattgtactcctttaattgctattattgatactggtg 16840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 186
Target Start/End: Original strand, 962 - 1115
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 132  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||| ||    
T  962 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgacat 1061  T
Q  133 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 186  Q
    ||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||| || || ||||||||    
T  1062 gaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggtgactacttctct 1115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 48776 - 48720
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattg 89  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48776 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattg 48720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2062 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2062
Description:

Target: scaffold2062; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1121
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttt 84  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||    
T  1051 atcagaggtacttgtttctttaataatacgcctttaattgctattatagacactagtgttactcattgttt 1121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 60
Target Start/End: Original strand, 1661 - 1707
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattat 60  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1661 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 1707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12678 - 12569
Alignment:
Q  129 atatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattt 228  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||    
T  12678 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 12579  T
Q  229 tgtgattgat 238  Q
    || |||||||    
T  12578 tgagattgat 12569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 5499 - 5551
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5499 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 5551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 816 - 868
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  816 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 13526 - 13578
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13526 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 13578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 26505 - 26453
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26505 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 26453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 35194 - 35142
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35194 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 35142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 24072 - 24020
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24072 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 24020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 8266 - 8214
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8266 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 8214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 90611 - 90559
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  90611 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 90559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 21071 - 21123
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21071 aatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcattcttttat 21123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 30647 - 30699
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30647 aatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcattcttttat 30699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2165 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2165
Description:

Target: scaffold2165; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 57
Target Start/End: Original strand, 977 - 1020
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctat 57  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  977 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 1020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 89
Target Start/End: Original strand, 15753 - 15828
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattg 89  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15753 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgcaattattgatactggtgctacgcattgtttaattg 15828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 2994 - 2923
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttt 85  Q
    ||||||||||||| ||   |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2994 atcagaggtacttgttatattaataatactccattagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttt 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 2680 - 2628
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2680 aataatactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 2628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 7057 - 7109
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  7057 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctacttattcttttat 7109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 1410 - 1364
Alignment:
Q  14 atcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattat 60  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1410 atcagaggtacttgtttcttgaatagtactcctttaatagctattat 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 3620 - 3475
Alignment:
Q  125 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 224  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | |    
T  3620 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactgcagctaaggtttcggtaactatttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtg 3521  T
Q  225 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgt 270  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  3520 attttgaaattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgt 3475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 3608 - 3563
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 80  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3608 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcatt 3563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 171229 - 171188
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 74  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  171229 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 171188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 4097 - 4149
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4097 aatagtactccgttgattgcaattatcgatactggtgctactcattcttttat 4149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 6199 - 6251
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6199 aatagtactactttgattgcaataattgatactggtgctactcattcttttat 6251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 1320 - 1268
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1320 aatagtactcttttgatttcaattattgatactggtgctactcattcttttat 1268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 5000 - 5052
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  5000 aataatactcctttgattgcaattatcgatactggtgctactcattcttttat 5052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 26885 - 26833
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  26885 aatagtactcctttgattgcaattattgatactgttgctacttattcttttat 26833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Original strand, 131684 - 131736
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  131684 aatagaactcctttgattgcaattattgatacttgtgctactcattattttat 131736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0789 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:

Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 49 - 1
Alignment:
Q  33 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattg 81  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  49 ttaataatactcctttaagtgctataattgatagtggtgctacgcattg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 16019 - 15967
Alignment:
Q  35 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 87  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  16019 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgttacttattcttttat 15967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University