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Alignment Overview

Query: NF17363_high_15 (Length: 301)

Name: NF17363_high_15
Description: NF17363
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17363_high_15
NF17363_high_15
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (28-275)||(19704916-19705163)
chr6 (28-275)||(18317753-18317998)
chr6 (28-273)||(2629234-2629477)
chr6 (28-227)||(5275727-5275926)
chr6 (28-275)||(12195857-12196102)
chr6 (28-275)||(30034949-30035194)
chr6 (28-275)||(30966925-30967170)
chr6 (28-274)||(26932913-26933156)
chr6 (28-275)||(17011781-17012017)
chr6 (34-275)||(17852275-17852514)
chr6 (28-275)||(22858296-22858534)
chr6 (28-192)||(20526548-20526708)
chr6 (106-192)||(30445318-30445404)
chr6 (106-192)||(30443111-30443195)
chr6 (40-83)||(12158532-12158575)
chr6 (236-272)||(20526744-20526780)
chr6 (36-81)||(30443022-30443069)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (1-275)||(31735869-31736140)
chr1 (28-275)||(15295192-15295437)
chr1 (28-275)||(47905958-47906201)
chr1 (1-226)||(27337332-27337557)
chr1 (28-275)||(17324980-17325225)
chr1 (28-275)||(39931764-39932008)
chr1 (28-227)||(24325349-24325548)
chr1 (28-275)||(9463594-9463838)
chr1 (58-275)||(21948535-21948751)
chr1 (28-224)||(48664854-48665050)
chr1 (28-275)||(9459767-9460011)
chr1 (28-275)||(27339478-27339728)
chr1 (31-224)||(2949617-2949810)
chr1 (28-211)||(6115532-6115716)
chr1 (28-227)||(28998643-28998842)
chr1 (28-227)||(29004359-29004558)
chr1 (28-216)||(45693834-45694022)
chr1 (28-218)||(4131690-4131880)
chr1 (1-214)||(6997189-6997395)
chr1 (64-224)||(6996067-6996221)
chr1 (138-275)||(46432072-46432207)
chr1 (28-141)||(46432521-46432634)
chr1 (28-179)||(16561133-16561284)
chr1 (106-192)||(11693580-11693666)
chr1 (148-227)||(2510722-2510801)
chr1 (106-192)||(13785662-13785748)
chr1 (160-273)||(26520463-26520580)
chr1 (109-192)||(14352759-14352842)
chr1 (165-227)||(6115479-6115541)
chr1 (109-192)||(10115572-10115653)
chr1 (106-156)||(32260833-32260883)
chr1 (36-85)||(32260746-32260795)
chr1 (99-145)||(13112047-13112093)
chr1 (36-83)||(11693706-11693753)
chr1 (36-85)||(13785786-13785835)
chr1 (36-76)||(10115466-10115506)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (1-275)||(27912194-27912467)
chr5 (1-275)||(18468673-18468944)
chr5 (28-275)||(25803709-25803953)
chr5 (26-275)||(18511556-18511802)
chr5 (1-275)||(18509661-18509932)
chr5 (22-275)||(27910131-27910382)
chr5 (28-275)||(3373383-3373628)
chr5 (1-275)||(26098593-26098866)
chr5 (28-275)||(15551927-15552172)
chr5 (46-275)||(10586549-10586776)
chr5 (28-275)||(26097423-26097670)
chr5 (28-275)||(18596328-18596584)
chr5 (106-275)||(18466453-18466617)
chr5 (28-209)||(21288531-21288713)
chr5 (33-178)||(17415748-17415893)
chr5 (106-275)||(15143262-15143425)
chr5 (28-130)||(6661929-6662031)
chr5 (159-227)||(40221340-40221408)
chr5 (28-85)||(40221284-40221341)
chr5 (28-80)||(18466413-18466465)
chr5 (31-80)||(15143225-15143274)
chr5 (150-192)||(6661594-6661636)
chr5 (237-275)||(40221423-40221461)
chr5 (36-85)||(5779168-5779217)
chr5 (106-179)||(32520241-32520316)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (4-275)||(22132741-22133009)
chr4 (2-275)||(14787775-14788045)
chr4 (2-275)||(5100719-5100988)
chr4 (28-275)||(22134972-22135217)
chr4 (28-227)||(56030191-56030390)
chr4 (28-227)||(24347961-24348159)
chr4 (28-227)||(44600227-44600426)
chr4 (28-275)||(17662580-17662824)
chr4 (42-273)||(30136331-30136560)
chr4 (28-176)||(47211158-47211306)
chr4 (28-267)||(38890478-38890699)
chr4 (28-192)||(10112628-10112787)
chr4 (133-275)||(19322547-19322689)
chr4 (28-192)||(9022062-9022225)
chr4 (28-180)||(9863501-9863650)
chr4 (106-192)||(54929094-54929180)
chr4 (157-275)||(53405001-53405118)
chr4 (106-185)||(10979676-10979755)
chr4 (28-85)||(14789512-14789569)
chr4 (28-127)||(19322410-19322510)
chr4 (36-192)||(38209098-38209259)
chr4 (109-168)||(29609838-29609897)
chr4 (106-157)||(5516701-5516752)
chr4 (201-275)||(47211088-47211160)
chr4 (106-145)||(14647175-14647214)
chr4 (40-75)||(29609948-29609983)
chr4 (237-275)||(18709513-18709551)
chr4 (36-85)||(54929220-54929267)
chr4 (42-82)||(5516793-5516833)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (1-275)||(20299130-20299401)
chr7 (1-275)||(7092521-7092793)
chr7 (28-275)||(1849667-1849912)
chr7 (28-275)||(7094768-7095013)
chr7 (1-275)||(28487224-28487496)
chr7 (1-275)||(31156253-31156525)
chr7 (1-275)||(38395961-38396233)
chr7 (28-275)||(1606173-1606417)
chr7 (28-275)||(3035417-3035664)
chr7 (28-275)||(11756927-11757171)
chr7 (1-275)||(7349621-7349892)
chr7 (4-275)||(7470368-7470643)
chr7 (31-275)||(20625739-20625981)
chr7 (31-275)||(20629630-20629872)
chr7 (31-275)||(20642049-20642291)
chr7 (28-275)||(7472326-7472572)
chr7 (28-275)||(28485263-28485509)
chr7 (28-226)||(47865330-47865528)
chr7 (28-275)||(7352000-7352244)
chr7 (28-275)||(18345239-18345484)
chr7 (28-275)||(37412470-37412714)
chr7 (28-275)||(21470637-21470881)
chr7 (34-227)||(24258166-24258358)
chr7 (28-275)||(21989855-21990098)
chr7 (28-275)||(38393685-38393929)
chr7 (28-275)||(42331341-42331591)
chr7 (98-275)||(13099818-13099993)
chr7 (106-227)||(43253914-43254035)
chr7 (28-275)||(3676999-3677227)
chr7 (28-174)||(443328-443474)
chr7 (130-272)||(20297163-20297302)
chr7 (29-192)||(40281824-40281989)
chr7 (106-192)||(12310442-12310528)
chr7 (36-85)||(20297108-20297157)
chr7 (36-84)||(10690684-10690732)
chr7 (106-153)||(12484976-12485023)
chr7 (106-153)||(12506407-12506454)
chr7 (34-80)||(43254023-43254069)
chr7 (120-201)||(10690773-10690854)
chr7 (106-153)||(12657600-12657647)
chr7 (237-275)||(443504-443542)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (28-273)||(1737-1980)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (1-275)||(457925-458197)
chr3 (28-275)||(746424-746668)
chr3 (28-227)||(4104282-4104481)
chr3 (1-275)||(53915836-53916107)
chr3 (28-275)||(25533109-25533351)
chr3 (1-275)||(42991928-42992199)
chr3 (28-276)||(51943044-51943289)
chr3 (28-275)||(10621882-10622125)
chr3 (28-275)||(455575-455820)
chr3 (28-275)||(1313084-1313327)
chr3 (28-275)||(27635968-27636210)
chr3 (28-223)||(41848806-41849001)
chr3 (28-275)||(42989954-42990199)
chr3 (31-275)||(53918004-53918245)
chr3 (109-192)||(11066346-11066429)
chr3 (28-85)||(6561615-6561672)
chr3 (109-181)||(54287487-54287559)
chr3 (111-176)||(53974011-53974077)
chr3 (106-176)||(11072731-11072801)
chr3 (236-275)||(6561689-6561728)
chr3 (36-85)||(53974148-53974197)
chr3 (36-82)||(11072644-11072690)
chr3 (106-153)||(5535882-5535929)
chr3 (237-275)||(41849021-41849059)
[»] chr2 (18 HSPs)
chr2 (1-227)||(35215983-35216209)
chr2 (28-227)||(42452451-42452650)
chr2 (28-227)||(23452628-23452827)
chr2 (28-227)||(35218364-35218563)
chr2 (28-227)||(42923893-42924092)
chr2 (28-275)||(27583667-27583905)
chr2 (36-192)||(28568584-28568740)
chr2 (106-192)||(15693669-15693755)
chr2 (28-156)||(27136367-27136503)
chr2 (33-121)||(34575608-34575696)
chr2 (107-192)||(7502638-7502723)
chr2 (106-177)||(39286971-39287042)
chr2 (106-185)||(41304806-41304884)
chr2 (131-227)||(34575528-34575617)
chr2 (106-184)||(41303457-41303535)
chr2 (36-85)||(28568346-28568395)
chr2 (36-82)||(15693583-15693629)
chr2 (36-85)||(41303573-41303623)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (2-275)||(51685-51955)
scaffold0005 (28-85)||(50161-50218)
scaffold0005 (106-145)||(170076-170115)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (28-275)||(608472-608720)
chr8 (31-275)||(15808967-15809208)
chr8 (28-275)||(28283567-28283811)
chr8 (1-275)||(41384468-41384738)
chr8 (28-227)||(43529873-43530072)
chr8 (28-227)||(3873752-3873952)
chr8 (28-275)||(41382421-41382666)
chr8 (28-184)||(32339096-32339252)
chr8 (28-143)||(3265635-3265750)
chr8 (177-275)||(181434-181530)
chr8 (106-192)||(11701364-11701447)
chr8 (109-180)||(13986214-13986285)
chr8 (36-82)||(13986328-13986374)
chr8 (36-80)||(11701435-11701479)
chr8 (237-275)||(32339260-32339298)
chr8 (36-85)||(30679208-30679256)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (28-275)||(11815-12059)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (28-275)||(78885-79131)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (21-174)||(4541-4694)
scaffold0133 (236-275)||(4722-4761)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (28-141)||(2070-2183)
scaffold0468 (169-227)||(2022-2080)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (1-120)||(1-120)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (109-179)||(57836-57905)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (130-177)||(1971-2018)
[»] scaffold0474 (1 HSPs)
scaffold0474 (36-85)||(10443-10492)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19705163 - 19704916
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19705163 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 19705064  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19705063 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 19704964  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
            |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19704963 aaaaaaaagaaacgtatcttaagtgtgatattcgttccaaatttatga 19704916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 18317753 - 18317998
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18317753 ttgtagtatgactcaaaatttgaaggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 18317852  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18317853 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 18317952  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18317953 aaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatga 18317998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2629477 - 2629234
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629477 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 2629378  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2629377 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 2629278  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttat 273  Q
             |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  2629277 gaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtagtatttgttccaaatttat 2629234  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 5275926 - 5275727
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5275926 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 5275827  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5275826 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 5275727  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12196102 - 12195857
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12196102 ttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggac 12196003  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12196002 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 12195903  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12195902 aaaaaaa--aaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 12195857  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 30035194 - 30034949
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  30035194 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttatagac 30035095  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30035094 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagatattctttcactgaaggag 30034995  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  30034994 aaaataa--aaacgtatcttcaatgtgatatttgttccaaatttatga 30034949  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 30966925 - 30967170
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30966925 ttgtagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 30967024  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30967025 aataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttaatgcaaatatattttgaaagcgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 30967124  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  30967125 aaaaaaa--aaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 30967170  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26933156 - 26932913
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  26933156 ttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatattattatggac 26933057  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26933056 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 26932957  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatg 274  Q
             ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26932956 aaaaaa---aaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatg 26932913  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 17011781 - 17012017
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||         ||   |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  17011781 ttgtagtatgacttaaaatttgatggatgaagaatattattgctaaaaatataaaagtttgttttaaa---tattttgtgtagaaaatatatttatggac 17011877  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |     
T  17011878 aataaatatatttttgtaccgtatgatggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaaaaa 17011977  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17011978 a--------aaacgtatcttcagagtgatgttcgttccaaatttatga 17012017  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 275
Target Start/End: Original strand, 17852275 - 17852514
Alignment:
Q  34 tatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgt--tgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaata 131  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||||       ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17852275 tatgactcaaaatttgatg-atggagaatattgtgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaa--tattttatgctgaaaatatatttatggacaata 17852371  T
Q  132 aatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnn 231  Q
    |||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||        
T  17852372 aatatatttttgtaccttatgaagaactatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattatttcactgaaagagaaga 17852471  T
Q  232 nnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
         ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17852472 aaaaaaaaagtatcttc-gtgtggtattcgttccaaatttatga 17852514  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22858534 - 22858296
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||        ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22858534 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttaataaaaatataaaagatttgttttaaatatactttgtgctgaaaatatatttatggac 22858435  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||        |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22858434 aataaatatatttttgtaccgtatgaaagaagattagatgcaaatatattttgaaagggaa--------ttttgatgcaaatattctttcattgaaggag 22858343  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
            ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  22858342 -aaaaaaagaaacgtatcttcaacgtgatatacgttccaaatttatga 22858296  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Original strand, 20526548 - 20526708
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||| |||||||||||||||||||       
T  20526548 ttgtagtatgactcaaaatttgatgggtgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttatgctgaaaatatatttatg--- 20526644  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatata-ttttgaaagggaatatt 192  Q
      || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20526645 --tacatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttgaaagagaatatt 20526708  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 192
Target Start/End: Original strand, 30445318 - 30445404
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  30445318 tgctgaaaatatatttatgaacaataaatatatttttgtaccatatgaaggaagatttgatgcaaatatattttaaaaaggaatatt 30445404  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 192
Target Start/End: Original strand, 30443111 - 30443195
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||| | ||||||    
T  30443111 tgctgaaaatatatttatggacaa--aatatatgtttgtaccgtataaaggaagatttgatgcaaatgtatttttaaaagaaatatt 30443195  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 83
Target Start/End: Original strand, 12158532 - 12158575
Alignment:
Q  40 tcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaa 83  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  12158532 tcaaaatttgatgaatgaagaagattgttgctaaaaatataaaa 12158575  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 272
Target Start/End: Original strand, 20526744 - 20526780
Alignment:
Q  236 gaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaattta 272  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20526744 gaaacgcatcttcaatgtgatattcgttccaaattta 20526780  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 81
Target Start/End: Original strand, 30443022 - 30443069
Alignment:
Q  36 tgactcaaaattt--gatggaagaagaatattgttgctaaaaatataa 81  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  30443022 tgactcaaaatttatgatggatgaagaatattgttgttaaaaatataa 30443069  T

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Target: chr1 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31736140 - 31735869
Alignment:
Q  1 actaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagata 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||    
T  31736140 actaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggaaggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 31736041  T
Q  101 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31736040 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 31735941  T
Q  201 tatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31735940 gatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaa---aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 31735869  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15295437 - 15295192
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295437 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 15295338  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15295337 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagcgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 15295238  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15295237 aaaaaaa--aaatgtatcttcagtgtggtattcgttcctaatttatga 15295192  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 47905958 - 47906201
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47905958 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 47906057  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  47906058 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggag 47906157  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  47906158 aaaaa----aaaagtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 47906201  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27337557 - 27337332
Alignment:
Q  1 actaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagata 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||       |||| |||    
T  27337557 actaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactccaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatatataagatttgtttcaaatata 27337458  T
Q  101 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337457 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 27337358  T
Q  201 tatgcaaatattctttcactgaagga 226  Q
     ||||||||||||||| |||||||||    
T  27337357 gatgcaaatattctttaactgaagga 27337332  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17325225 - 17324980
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17325225 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgagttgaaaatatatttatggac 17325126  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17325125 aataaatatatttttgtaccgtatgaaaaacgatttgatgcaaatatattttgcaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 17325026  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17325025 aaaaaaa--aaacgtatcttcagggtgatattcgttccaaatttatga 17324980  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 39931764 - 39932008
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39931764 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 39931863  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  39931864 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatacttttgatgcaaatattcttttattgaaggag 39931963  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39931964 aaaaaa---aaacgtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatga 39932008  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 227
Target Start/End: Original strand, 24325349 - 24325548
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24325349 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggac 24325448  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24325449 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagtgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 24325548  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9463838 - 9463594
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463838 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 9463739  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9463738 aataaatatatttttatatcgtatgaagaacaatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggag 9463639  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  9463638 aaaaaa---aaacgtatcttcattgtggtatttgttccaaatttatga 9463594  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 58 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21948751 - 21948535
Alignment:
Q  58 agaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagga 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21948751 agaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaa 21948652  T
Q  158 cgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgata 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||         |||||||||||||||||| ||    
T  21948651 cgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcacagaaggaggaaaaaaa-aaacgtatcttcagtgtggta 21948553  T
Q  258 ttcgttccaaatttatga 275  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21948552 ttcgttccaaatttatga 21948535  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 224
Target Start/End: Original strand, 48664854 - 48665050
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48664854 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 48664953  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaag 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  48664954 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcacatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaag 48665050  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9460011 - 9459767
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9460011 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 9459912  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9459911 aataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggag 9459812  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  9459811 aaaaaa---aaacgtatcttcattgtggtatttgttccaaatttatga 9459767  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27339728 - 27339478
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatat----ttat 123  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||    ||||    
T  27339728 ttgtagtatgactccaaatttgacggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatatatttat 27339629  T
Q  124 ggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27339628 ggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 27339529  T
Q  224 ggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    |||         | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27339528 ggaaaaaaaaaag-aacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 27339478  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2949810 - 2949617
Alignment:
Q  31 tagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 130  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949810 tagtatgactcaaaatttcatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 2949711  T
Q  131 aaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaag 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2949710 aaatatatttttgtattgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatacaaatattctttcactgaag 2949617  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6115716 - 6115532
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaa-tttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatgga 126  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115716 ttgtaggatgactcaaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgga 6115617  T
Q  127 caataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115616 caataaatatatttttgtatcgtatgaatgacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatat 6115532  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28998842 - 28998643
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998842 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 28998743  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28998742 aataaatacatttttgtaccgtacgaagaaatatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 28998643  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29004558 - 29004359
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004558 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 29004459  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29004458 aataaatacatttttgtaccgtacgaagaaatatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 29004359  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 45694022 - 45693834
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45694022 ttgtactatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttatggac 45693923  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattcttt 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45693922 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaataatatattttttatgcaaatattcttt 45693834  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4131880 - 4131690
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  4131880 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaacatatatttatggac 4131781  T
Q  128 aa-taaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttca 218  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  4131780 aaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattata-ttttgatgcaaatattctttca 4131690  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 6997189 - 6997395
Alignment:
Q  1 actaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagata 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||       |||| |||    
T  6997189 actaatttagagtcaaggtggagaatgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 6997288  T
Q  101 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 200  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||    
T  6997289 ttttgtgctaaaaatata-ttatggacaataaatatatttttataccgtatgaagaacgatttgatgcaaa------ttgaaagagaatattatattttt 6997381  T
Q  201 tatgcaaatattct 214  Q
     |||||||||||||    
T  6997382 gatgcaaatattct 6997395  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Original strand, 6996067 - 6996221
Alignment:
Q  64 ttgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgattt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  6996067 ttgttgctaaaaatataaaagacttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaatacatatatttttgtaccgtatgaagaacgattt 6996166  T
Q  164 gatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaag 224  Q
    |||| |||      |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6996167 gatgtaaa------ttgaaagggaatattatatttttgttgcaaatattctttcactgaag 6996221  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 138 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 46432207 - 46432072
Alignment:
Q  138 tttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnnga 237  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         |    
T  46432207 tttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaa--a 46432110  T
Q  238 aacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  46432109 aacgtatcttcactgtggtatttgttccaaatttatga 46432072  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 46432634 - 46432521
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432634 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 46432535  T
Q  128 aataaatatatttt 141  Q
    ||||||||||||||    
T  46432534 aataaatatatttt 46432521  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 179
Target Start/End: Original strand, 16561133 - 16561284
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |       |||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16561133 ttgttgtatgattcaaaatttgttggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttattgac 16561232  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatatttt 179  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  16561233 aataaatatctttttgtaccgtatgaaggaatatttgaaacaaatatatttt 16561284  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11693666 - 11693580
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11693666 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagggaatatt 11693580  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2510801 - 2510722
Alignment:
Q  148 gtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2510801 gtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 2510722  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13785748 - 13785662
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 192  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13785748 tgctgaaaatatatttatagatagtaaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaaaggaatatt 13785662  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26520580 - 26520463
Alignment:
Q  160 atttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag----nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtga 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||            |||| |||||||||||||||    
T  26520580 atttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaagaagaaaaaaacaaaagaaatgtatcttcagtgtga 26520481  T
Q  256 tattcgttccaaatttat 273  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26520480 tattcgttccaaatttat 26520463  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 192
Target Start/End: Original strand, 14352759 - 14352842
Alignment:
Q  109 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 192  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14352759 tgaaaatatatttatgaatagtaaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagggaatatt 14352842  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6115541 - 6115479
Alignment:
Q  165 atgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6115541 atgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggag 6115479  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 192
Target Start/End: Original strand, 10115572 - 10115653
Alignment:
Q  109 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10115572 tgaaaatatatttatggacaataaatat--ttttatcccgtatgaaggaatatttgatgcaaatatatttttaaacggaatatt 10115653  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 156
Target Start/End: Original strand, 32260833 - 32260883
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagg 156  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32260833 tgctgaaaatatatttatgaacaataaatatatttttgtaccgtatgaagg 32260883  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 85
Target Start/End: Original strand, 32260746 - 32260795
Alignment:
Q  36 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32260746 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattgttgctaaaaatataaaaga 32260795  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 13112093 - 13112047
Alignment:
Q  99 tattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 145  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13112093 tattttatgctgaaaatatattcatggacaataaatatatttttgta 13112047  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 11693753 - 11693706
Alignment:
Q  36 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaa 83  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  11693753 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattattgctaaaattataaaa 11693706  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 13785835 - 13785786
Alignment:
Q  36 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 85  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13785835 tgactcaaaaattgatggatggagaatattgtcgctaaaaatatgaaaga 13785786  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 10115466 - 10115506
Alignment:
Q  36 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaa 76  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  10115466 tgactcaaaatttgatggattaagaatattgttgcaaaaaa 10115506  T

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Target: chr5 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 27912194 - 27912467
Alignment:
Q  1 actaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagata 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||    
T  27912194 actaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 27912293  T
Q  101 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912294 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaaaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 27912393  T
Q  201 tatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27912394 gatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaa-aaacgtatcttcagtgtgatatttgttccaaatttatga 27912467  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 18468673 - 18468944
Alignment:
Q  1 actaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagata 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||       |||| |||    
T  18468673 actaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatatttttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 18468772  T
Q  101 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468773 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 18468872  T
Q  201 tatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18468873 gatgcaaatattctttcactgaaggagaaaata---aaaagtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 18468944  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 25803709 - 25803953
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803709 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 25803808  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25803809 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 25803908  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25803909 aaaaaa---aaacgtatcttcagtgtaatatttgttccaaatttatga 25803953  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 26 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18511802 - 18511556
Alignment:
Q  26 ttttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatgg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511802 ttttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 18511703  T
Q  126 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagg 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18511702 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 18511603  T
Q  226 agnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    ||         ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18511602 agaaaaaa---aaacgtatctttagtgtggtattcgttccaaatttatga 18511556  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18509932 - 18509661
Alignment:
Q  1 actaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagata 100  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       | || |||    
T  18509932 actaatttaaagtcaaggtggagaatggtgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcgaatata 18509833  T
Q  101 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509832 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 18509733  T
Q  201 tatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  18509732 gatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaa---aaacgtatcttcagtgtggtattcatcccaaatttatga 18509661  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 275
Target Start/End: Original strand, 27910131 - 27910382
Alignment:
Q  22 agaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatattt 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27910131 agaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatattt 27910230  T
Q  122 atggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27910231 atggacaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactg 27910330  T
Q  222 aaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    ||||||         ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27910331 aaggagaaaaaaa--aaaagtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 27910382  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3373628 - 3373383
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3373628 ttgtagtatgactcagaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggac 3373529  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3373528 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaaggag 3373429  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  3373428 aaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 3373383  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26098866 - 26098593
Alignment:
Q  1 actaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagata 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||       |||| |||    
T  26098866 actaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 26098767  T
Q  101 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26098766 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 26098667  T
Q  201 tatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
     || |||| ||||||||| ||||||||         ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  26098666 gatacaaaaattctttcattgaaggagaaataaaa-aaacgtatcttcaatgtggtattcgttccaattttatga 26098593  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 15551927 - 15552172
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15551927 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaagatatatttatggac 15552026  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15552027 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatgacatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 15552126  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  15552127 aaaaaaa--aaacgtatcttcagcgtggtatttgttccaaatttatga 15552172  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 46 - 275
Target Start/End: Original strand, 10586549 - 10586776
Alignment:
Q  46 tttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 145  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10586549 tttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 10586648  T
Q  146 tcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatc 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||    
T  10586649 tcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaa--aaacgtatc 10586746  T
Q  246 ttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10586747 ttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 10586776  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 26097423 - 26097670
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |       |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26097423 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttgtactgaaaatatatttatggac 26097522  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttga--aagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagg 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26097523 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaagaaggaaatgttatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 26097622  T
Q  226 agnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    ||         ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26097623 aggaaaaaa--aaatgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatga 26097670  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 18596328 - 18596584
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18596328 ttgtactatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatggac 18596427  T
Q  128 aataa-----------atatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattcttt 216  Q
    |||||           ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  18596428 aataaatataccataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatacaaatattctat 18596527  T
Q  217 cactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    |||||||||||         |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18596528 cactgaaggagaaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatga 18596584  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 106 - 275
Target Start/End: Original strand, 18466453 - 18466617
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgc 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18466453 tgctaaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 18466552  T
Q  206 aaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    ||||||||||||||| ||||||         ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18466553 aaatattctttcactaaaggagaaaa-----aaaagtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 18466617  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 209
Target Start/End: Original strand, 21288531 - 21288713
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288531 ttgtagtataactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaataaaaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 21288630  T
Q  128 aataaatatatttttg-tatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaat 209  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21288631 aataaatatattttcggtaccgtatgaagaacgattttatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaat 21288713  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17415893 - 17415748
Alignment:
Q  33 gtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataa 132  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17415893 gtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttatggacaataa 17415794  T
Q  133 atatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattt 178  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17415793 atatatttttgtactgtatgaaggaaaatttgatgcaaatatattt 17415748  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 275
Target Start/End: Original strand, 15143262 - 15143425
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgc 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| ||||    
T  15143262 tgctaaaaatatatttatggacaataaatacatttttgtaccatatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaata-------tttgatgc 15143354  T
Q  206 aaatattctttcactgaagga-gnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    ||||||||||||||||||| | |        ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  15143355 aaatattctttcactgaagaaggggaaaaaagaaacgtatcttcagcgtgatatccgttacaaatttatga 15143425  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 6662031 - 6661929
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |       |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6662031 ttgtagtatgacttaaaacttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatggac 6661932  T
Q  128 aat 130  Q
    |||    
T  6661931 aat 6661929  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Original strand, 40221340 - 40221408
Alignment:
Q  159 gatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  40221340 gatttgtttcaaatatattttgaaaaggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgcaggag 40221408  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 85
Target Start/End: Original strand, 40221284 - 40221341
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221284 ttgtagtatgactcaaaatttaattgatgaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 40221341  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Original strand, 18466413 - 18466465
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatata 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18466413 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 18466465  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Original strand, 15143225 - 15143274
Alignment:
Q  31 tagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatata 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15143225 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 15143274  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6661636 - 6661594
Alignment:
Q  150 atgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 192  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6661636 atgaaggaagatttgaagtaaatatattttgaaagggaatatt 6661594  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 275
Target Start/End: Original strand, 40221423 - 40221461
Alignment:
Q  237 aaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  40221423 aaacgtatcttcagtgtgatatccgttctaaatttatga 40221461  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 5779217 - 5779168
Alignment:
Q  36 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 85  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  5779217 tgacttaaaatttgatagatgaagaagattattgctaaaaatataaaaga 5779168  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 179
Target Start/End: Original strand, 32520241 - 32520316
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaa--tatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatatttt 179  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||| |||||||    
T  32520241 tgctgaaaatatatttatgtagagtaaaaatatatttttgtaccgtacgaagaaaaatttgatgcaaacatatttt 32520316  T

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Target: chr4 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22133009 - 22132741
Alignment:
Q  4 aatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattt 103  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||    
T  22133009 aatttggagtcaaggtggagaatgttgtagtatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 22132910  T
Q  104 tgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22132909 tgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgat 22132810  T
Q  204 gcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22132809 gcaaatattctttcactgaaggagaaaaaa---aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 22132741  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14788045 - 14787775
Alignment:
Q  2 ctaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatat 101  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||       |||| ||||    
T  14788045 ctaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatat 14787946  T
Q  102 tttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttt 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14787945 tttgtggtgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttg 14787846  T
Q  202 atgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14787845 atgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaa---aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatga 14787775  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 275
Target Start/End: Original strand, 5100719 - 5100988
Alignment:
Q  2 ctaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatat 101  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||    
T  5100719 ctaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatat 5100818  T
Q  102 tttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5100819 tttgtgctgaaaatatatttatggacaacaaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttg 5100918  T
Q  202 atgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  5100919 atgcaaatattctttcactgaaggagaaaaa----aaacgtatcttcaatctggtattcgttccaaatttatga 5100988  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22135217 - 22134972
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135217 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 22135118  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22135117 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgattcaaatattctttcactgaaggag 22135018  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22135017 aaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 22134972  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 227
Target Start/End: Original strand, 56030191 - 56030390
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030191 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 56030290  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  56030291 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttggtgcaaatattctttcactgaaggag 56030390  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 227
Target Start/End: Original strand, 24347961 - 24348159
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24347961 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgc-gaaaatatatttatggac 24348059  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24348060 aataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 24348159  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44600426 - 44600227
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44600426 ttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggac 44600327  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44600326 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttaaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 44600227  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17662824 - 17662580
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662824 ttgtagtatgactacaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 17662725  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17662724 aataaatatatttttgtaccgtacgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 17662625  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17662624 aaaaaa---aaaagtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 17662580  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 42 - 273
Target Start/End: Original strand, 30136331 - 30136560
Alignment:
Q  42 aaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttt 141  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30136331 aaaatttgatgaatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttt 30136430  T
Q  142 tgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacg 241  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||         |||||    
T  30136431 tgtactgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttaaaagagaatattatatttttgattcaaatattctttcattgaaggagaaaaaaa--aaacg 30136528  T
Q  242 tatcttcagtgtgatattcgttccaaatttat 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30136529 tatcttcagtgtgatattcgttctaaatttat 30136560  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47211306 - 47211158
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47211306 ttgtagtatgacttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctcaaaatatatttatggac 47211207  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatat 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47211206 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatat 47211158  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 38890699 - 38890478
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||                |||||  |  ||||||||||||||||    
T  38890699 ttgtagcatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaga----------------tttgt--ttcaaatatatttatggac 38890618  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaaggg-aatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagga 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38890617 aataaatatatttttgtattgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactaaagga 38890518  T
Q  227 gnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaa 267  Q
    |        |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  38890517 g-aaaaaaagaaatgtatcttcaatgtgatattcgttccaa 38890478  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Original strand, 10112628 - 10112787
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10112628 ttgtagtatgacttaaaatttgttgaatgaagaatattgttgctaaaaatataaaag----gtttcaaatatattttgtgctgaaactatatttatggac 10112723  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  10112724 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgtaaatata-tttgaaagagaatatt 10112787  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 133 - 275
Target Start/End: Original strand, 19322547 - 19322689
Alignment:
Q  133 atatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnn 232  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||         
T  19322547 atatatttttgtactgtataaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaa 19322646  T
Q  233 nnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
       |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19322647 aaagaaatgtatcttcaatgtgatattcattccaaatttatga 19322689  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Original strand, 9022062 - 9022225
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||  |||||||||| | |||||||||| ||       |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  9022062 ttgtagtatgattcaaaattttatggatgagaaatattgttgttgaaaatataaatgatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttatg-ac 9022160  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 192  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9022161 aataaatatatttttctaccgtatgaagaaagatttgatgcaaatatattttaaaagggaatatt 9022225  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Original strand, 9863501 - 9863650
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||       |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  9863501 ttgtaatatgactcaaaatttgttggatgaaatatattgttactaaaaatataaatgatttgtttcaaacatattttgtgctaaaaatatatttatgaac 9863600  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttg 180  Q
    |||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9863601 aataaatatatttttgt---gcatgaaggaagatttgatgcaaatatattttg 9863650  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 54929180 - 54929094
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  54929180 tgctgaaaatatatttatggacaaaaaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaataggaatatt 54929094  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 275
Target Start/End: Original strand, 53405001 - 53405118
Alignment:
Q  157 acgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgat 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||         |||||||| ||||||||| |    
T  53405001 acgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaaaattatatttttgatgcaaatattctttcactaaaggagaaaaaaaa-aaacgtattttcagtgtggt 53405099  T
Q  257 attcgttccaaatttatga 275  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  53405100 atttgttccaaatttatga 53405118  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 185
Target Start/End: Original strand, 10979676 - 10979755
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10979676 tgctgaaaatatatttatggacaacaaatatatttttgtgctgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagg 10979755  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 14789569 - 14789512
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14789569 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaataatgttgctaaaaatataaaaga 14789512  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 127
Target Start/End: Original strand, 19322410 - 19322510
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaata-ttgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatgga 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||        ||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19322410 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattttttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttatactgaaaatatatttatgga 19322509  T
Q  127 c 127  Q
    |    
T  19322510 c 19322510  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 38209259 - 38209098
Alignment:
Q  36 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatg--gacaata-- 131  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||        ||| ||||||||||||  ||  | |||  ||  || ||||      
T  38209259 tgactcaaaatttgatggatgaaaaatattgttgttaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgcttcaagaagattgttgttgaaaatata 38209160  T
Q  132 aatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatat-tttgaaagggaatatt 192  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38209159 aatatatttttgtactgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatatttgaaaaggaatatt 38209098  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 29609897 - 29609838
Alignment:
Q  109 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgc 168  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29609897 tgaaaatatatttatgaagagtaaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgc 29609838  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 5516752 - 5516701
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagga 157  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5516752 tgctaaaaatatatttatagataataaatatatttttttatcgtatgaagga 5516701  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 47211160 - 47211088
Alignment:
Q  201 tatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  47211160 tatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 47211088  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 14647214 - 14647175
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 145  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14647214 tgctgaaaatatattcatggacaacaaatatatttttgta 14647175  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 29609983 - 29609948
Alignment:
Q  40 tcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaa 75  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29609983 tcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaa 29609948  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18709551 - 18709513
Alignment:
Q  237 aaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18709551 aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 18709513  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 54929267 - 54929220
Alignment:
Q  36 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 85  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  54929267 tgacttaaaatttgatggaa--ataatattgttgctaaaaatataaaaga 54929220  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 5516833 - 5516793
Alignment:
Q  42 aaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaa 82  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  5516833 aaaatttgatgaatggagaatattgttgctaaaaatataaa 5516793  T

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Target: chr7 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 20299130 - 20299401
Alignment:
Q  1 actaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagata 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||    
T  20299130 actaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatata 20299229  T
Q  101 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299230 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 20299329  T
Q  201 tatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  20299330 gatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaa---aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccatatttatga 20299401  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7092793 - 7092521
Alignment:
Q  1 actaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagata 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||    
T  7092793 actaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 7092694  T
Q  101 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092693 ttttgtgctgaagatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 7092594  T
Q  201 tatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||         ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7092593 gatgcaaatattctttcactgaaggaggaaaaaa--aattgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatga 7092521  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 1849667 - 1849912
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1849667 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 1849766  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1849767 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagatattctttcactgaaggag 1849866  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1849867 aaaaaaa--aaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 1849912  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7095013 - 7094768
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7095013 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 7094914  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7094913 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 7094814  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7094813 gaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatga 7094768  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 28487224 - 28487496
Alignment:
Q  1 actaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagata 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||    
T  28487224 actaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgcttcaaatata 28487323  T
Q  101 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487324 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatataattttgtatcgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 28487423  T
Q  201 tatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  28487424 gatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtatttgttctaaatttatga 28487496  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31156525 - 31156253
Alignment:
Q  1 actaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagata 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||    
T  31156525 actaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 31156426  T
Q  101 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31156425 tattgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 31156326  T
Q  201 tatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||         ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31156325 gatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaa--aaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 31156253  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 38395961 - 38396233
Alignment:
Q  1 actaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagata 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||    
T  38395961 actaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 38396060  T
Q  101 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396061 ttttgtgctgaaaatatatttatgtacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 38396160  T
Q  201 tatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  38396161 gatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaa--aaacgtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatga 38396233  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 1606173 - 1606417
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1606173 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggac 1606272  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1606273 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 1606372  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1606373 aaaaaa---aaacgaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 1606417  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 3035417 - 3035664
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035417 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 3035516  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3035517 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 3035616  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  3035617 aaagaaaaaaaacgtatcttcagtatggtatttgttccaaatttatga 3035664  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 11756927 - 11757171
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11756927 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 11757026  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11757027 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaactatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 11757126  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11757127 aaaaaa---aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 11757171  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7349892 - 7349621
Alignment:
Q  1 actaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagata 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||    
T  7349892 actaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 7349793  T
Q  101 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7349792 tattgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgcatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatattttt 7349693  T
Q  201 tatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
     | |||||||||||||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7349692 gaggcaaatattctttcactgaatgagaaaaaa---aaacgtatcttcagtgtgatatttgttccaaatttatga 7349621  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7470643 - 7470368
Alignment:
Q  4 aatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattt 103  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |       |||| ||||||    
T  7470643 aatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaacatttgtttcaaatatattt 7470544  T
Q  104 tgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7470543 tgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgat 7470444  T
Q  204 gcaaatattctttcactgaaggag----nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    ||||||||||||||| ||||||||             |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7470443 gcaaatattctttcattgaaggagaaaagaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatga 7470368  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Original strand, 20625739 - 20625981
Alignment:
Q  31 tagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20625739 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 20625838  T
Q  131 aaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||       
T  20625839 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaaggagcaa 20625938  T
Q  231 nnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
          |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20625939 aaaa--aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatga 20625981  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Original strand, 20629630 - 20629872
Alignment:
Q  31 tagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629630 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 20629729  T
Q  131 aaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||       
T  20629730 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaaggagcaa 20629829  T
Q  231 nnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
          |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20629830 aaaa--aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatga 20629872  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Original strand, 20642049 - 20642291
Alignment:
Q  31 tagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642049 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 20642148  T
Q  131 aaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||       
T  20642149 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaaggagcaa 20642248  T
Q  231 nnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
          |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20642249 aaaa--aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatga 20642291  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7472572 - 7472326
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472572 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 7472473  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7472472 aataaatatattattgtatcatatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggag 7472373  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  7472372 aaaaaaaa-aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 7472326  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 28485263 - 28485509
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485263 ttgtagtatgattcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 28485362  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  28485363 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaaggag 28485462  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  28485463 gaaaaaaa-acacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 28485509  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 226
Target Start/End: Original strand, 47865330 - 47865528
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47865330 ttgtagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 47865429  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagga 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47865430 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagga 47865528  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7352244 - 7352000
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7352244 ttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggac 7352145  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  7352144 aataaatatatttttgtatcgcatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgaggcaaatattctttcactgaatgag 7352045  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7352044 aaaaaa---aaacgtatcttcagtgtgatatttgttccaaatttatga 7352000  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 18345239 - 18345484
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  18345239 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttattgac 18345338  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18345339 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaatggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 18345438  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18345439 aaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 18345484  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 37412714 - 37412470
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412714 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 37412615  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  37412614 aataaatataattatgtaacgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattcttccactgaaggag 37412515  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37412514 aaaaaa---aaacgtatcttcagtgtgttattcgttccaaatttatga 37412470  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21470881 - 21470637
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21470881 ttgtagtttgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 21470782  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21470781 aataaatatatttttatatcgtatgaagaacgatttgatgcgaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 21470682  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  21470681 aaaaaa---aaacgtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatga 21470637  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Original strand, 24258166 - 24258358
Alignment:
Q  34 tatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24258166 tatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaa 24258265  T
Q  134 tatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24258266 tatatttttgtacagtatgaaggacga-ttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgtaaatattctttcactgaaggag 24258358  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 21989855 - 21990098
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  21989855 ttgtagtatgacccaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattgtgt--tgaaaatatatttatggac 21989952  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21989953 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 21990052  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21990053 gaaaaaa--aaacgtatcttctgtgtggtattcgttccaaatttatga 21990098  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 38393685 - 38393929
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||       |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38393685 ttgtagtatgattctaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatatataagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatttatttatggac 38393784  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  38393785 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatgttatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggtg 38393884  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
              ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  38393885 aaaaaat---aacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 38393929  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 42331591 - 42331341
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331591 ttgtagtatgacttaaaatttgatgaatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 42331492  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42331491 aataagtatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggag 42331392  T
Q  228 ---nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
                ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  42331391 aaagaaaaaaaaaaacgtatctttagtgtggtattcgttccaaatttatga 42331341  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 98 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13099993 - 13099818
Alignment:
Q  98 atattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099993 atattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatattttcgtaccgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatt 13099894  T
Q  198 ttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13099893 tttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatga 13099818  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 106 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43254035 - 43253914
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgc 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43254035 tgctaaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 43253936  T
Q  206 aaatattctttcactgaaggag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43253935 aaatattctttcactgaaggag 43253914  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 3676999 - 3677227
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||                
T  3676999 ttgtagtatgactcaaaatttgatagatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaat------------ 3677086  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
           ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3677087 -------atatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 3677179  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3677180 agaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 3677227  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 174
Target Start/End: Original strand, 443328 - 443474
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443328 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 443427  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatat 174  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  443428 aataaatatatttttgtaccgtctgaagaacaatttgatgcaaatat 443474  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 272
Target Start/End: Original strand, 20297163 - 20297302
Alignment:
Q  130 taaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnn 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||      
T  20297163 taaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaaggagaa 20297262  T
Q  230 nnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaattta 272  Q
           |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20297263 aaaa---aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaattta 20297302  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 40281989 - 40281824
Alignment:
Q  29 tgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaata--ttgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatgga 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||| |       |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40281989 tgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaagaatttgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatgga 40281890  T
Q  127 caataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 192  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  ||||||||| ||| ||||||||    
T  40281889 aaataaatatatttttgtaccgtatgaaagaatatttgatacggatatatttttaaaaggaatatt 40281824  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12310528 - 12310442
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 192  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  12310528 tgctgaaattatacttaaggacagttaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgtaaatatatttttaaaaggaatatt 12310442  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 85
Target Start/End: Original strand, 20297108 - 20297157
Alignment:
Q  36 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297108 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaga 20297157  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 84
Target Start/End: Original strand, 10690684 - 10690732
Alignment:
Q  36 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaag 84  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10690684 tgactcaaaatttgatggagggagaagattgttgctaaaaatataaaag 10690732  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 12485023 - 12484976
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatga 153  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  12485023 tgctgaaaatatatttatggatagcaaatatatttttgtatcgtatga 12484976  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 12506454 - 12506407
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatga 153  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  12506454 tgctgaaaatatatttatggatagcaaatatatttttgtatcgtatga 12506407  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 43254069 - 43254023
Alignment:
Q  34 tatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatata 80  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  43254069 tatgtctcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 43254023  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 201
Target Start/End: Original strand, 10690773 - 10690854
Alignment:
Q  120 ttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttt 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | | |||  ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  10690773 ttatgtacaataaatatatttttgtaccatgtgacagaatatttgatgcaaatatatttttaaaaggaatattttatatttt 10690854  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 12657647 - 12657600
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatga 153  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  12657647 tgctgaaaatatattcatggatagcaaatatatttttgtatcgtatga 12657600  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 275
Target Start/End: Original strand, 443504 - 443542
Alignment:
Q  237 aaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  443504 aaacgtatcttcagtgtggaattcgttccaaatttatga 443542  T

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Target: scaffold0511 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 28 - 273
Target Start/End: Original strand, 1737 - 1980
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1737 ttgtagtatgactcaaaatttgaaggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 1836  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 1936  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttat 273  Q
             |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1937 aaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttat 1980  T

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Target: chr3 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 457925 - 458197
Alignment:
Q  1 actaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagata 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||       |||| |||    
T  457925 actaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 458024  T
Q  101 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458025 ttttgtgctgaaaatatatttgtggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 458124  T
Q  201 tatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  458125 gatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 458197  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 746424 - 746668
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746424 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 746523  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  746524 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 746623  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  746624 aaaaaa---aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 746668  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4104481 - 4104282
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4104481 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatactttatgctgaaaatatatttatggac 4104382  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104381 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 4104282  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 53916107 - 53915836
Alignment:
Q  1 actaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagata 100  Q
    |||||||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||    
T  53916107 actaatttagagtcaaggcgaagaatgttgtagtatgactcaaaatttgagggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 53916008  T
Q  101 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53916007 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 53915908  T
Q  201 tatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  53915907 gatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaa---aaacgtatcttgagtgtggtattcgttccaaatttatga 53915836  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 25533109 - 25533351
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25533109 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttatggac 25533208  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25533209 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 25533308  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25533309 aaaa-----aaacgtatcttcagtgtgatatttgttctaaatttatga 25533351  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 42991928 - 42992199
Alignment:
Q  1 actaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagata 100  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||        |||| |||    
T  42991928 actaatttagagtcaaggtgaagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgttaaaaatataaaaggtttgtttcaaatata 42992027  T
Q  101 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42992028 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 42992127  T
Q  201 tatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
     ||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  42992128 gatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaa---aaacgtatcttcagtgtaatattaattccaaatttatga 42992199  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 28 - 276
Target Start/End: Original strand, 51943044 - 51943289
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943044 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 51943143  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  51943144 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgtaaatattctttcattgaaggag 51943243  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatgat 276  Q
             |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51943244 aaagaa---aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgat 51943289  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10622125 - 10621882
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  10622125 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaagatatatttatggac 10622026  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10622025 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 10621926  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  10621925 aaaaa----aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 10621882  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 455575 - 455820
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  455575 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttgtggac 455674  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  455675 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 455774  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  455775 aaaaaaa--aaacgtatcttcagtgcggtatttgttccaaatttatga 455820  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 1313084 - 1313327
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||       |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1313084 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaatgatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatggac 1313183  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1313184 aataaatatatttctgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 1313283  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1313284 aaaaa----aaaagtatctttagtgtgatattcgttccaaatttatga 1313327  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27636210 - 27635968
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27636210 ttgtagtatgatttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaatattagtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 27636111  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27636110 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 27636011  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27636010 aaaa-----aaatgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatga 27635968  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 223
Target Start/End: Original strand, 41848806 - 41849001
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41848806 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 41848905  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41848906 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaaggaatattatatttttgatgcaaatattctttaactgaa 41849001  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 42989954 - 42990199
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |       |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  42989954 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttttgctgaaagtatatttatggac 42990053  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42990054 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 42990153  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  42990154 aaaaaaa--aaatgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 42990199  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 53918245 - 53918004
Alignment:
Q  31 tagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  53918245 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaacatatatttatggacaat 53918146  T
Q  131 aaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 230  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||       
T  53918145 aaatatatttttttaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggagaaa 53918046  T
Q  231 nnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
          |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  53918045 aaa---aaacgtatcttcagtgtggtattcgtttcaaatttatga 53918004  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 192
Target Start/End: Original strand, 11066346 - 11066429
Alignment:
Q  109 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 192  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11066346 tgaaaatacatttatggacaataaatatatttttttaccatatgaaggaatatttgatgcaaatatatttttaaagagaatatt 11066429  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 85
Target Start/End: Original strand, 6561615 - 6561672
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 85  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561615 ttgtagtatgactcgaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 6561672  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 109 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 54287559 - 54287487
Alignment:
Q  109 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttga 181  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54287559 tgaaaatatatttatggataataaatacatttttgtactgtatgaaggaatatttgatgcaaatatattttga 54287487  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 53974077 - 53974011
Alignment:
Q  111 aaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatg-aaggacgatttgatgcaaatatat 176  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  53974077 aaaatatatttatagacaataaatatatttttgtaccgtatgaaaggaagatttgatgcaaatatat 53974011  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 176
Target Start/End: Original strand, 11072731 - 11072801
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatat 176  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  11072731 tgctgaaaatacatttatggacaacaaatagatttttgtaccgtattacggaagatttgatgcaaatatat 11072801  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 275
Target Start/End: Original strand, 6561689 - 6561728
Alignment:
Q  236 gaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561689 gaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 6561728  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 53974197 - 53974148
Alignment:
Q  36 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  53974197 tgactcaaaatttgatggatgaagaatgttgttgttaaaaatataaaaga 53974148  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 82
Target Start/End: Original strand, 11072644 - 11072690
Alignment:
Q  36 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaa 82  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  11072644 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattgttgcaaaaaatataaa 11072690  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 5535929 - 5535882
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatga 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  5535929 tgctgaaaatatatttatggacagaaaagatatatttgtatcgtatga 5535882  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 275
Target Start/End: Original strand, 41849021 - 41849059
Alignment:
Q  237 aaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  41849021 aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 41849059  T

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Target: chr2 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 18)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35216209 - 35215983
Alignment:
Q  1 actaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagata 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||    
T  35216209 actaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 35216110  T
Q  101 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216109 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 35216010  T
Q  201 tatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35216009 gatgcagatattctttcactgaaggag 35215983  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 227
Target Start/End: Original strand, 42452451 - 42452650
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452451 ttgtagtatgacttaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 42452550  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42452551 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 42452650  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23452827 - 23452628
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23452827 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttatgctgaaaataaatttatggac 23452728  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23452727 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 23452628  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35218563 - 35218364
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218563 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 35218464  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35218463 aataaatatatttttgtatcgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 35218364  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 42924092 - 42923893
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42924092 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 42923993  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42923992 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaagaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 42923893  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27583905 - 27583667
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27583905 ttgtagtatgactcaaattttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaagatatatttatgaac 27583806  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||       ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27583805 aataaatatatttttataccatatgaaggaatatttgatgcaaatatattttgaaaaggaata-------tttgatgcaaatattctttcactgaaggag 27583713  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
            |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27583712 --aaaaaagaaatgtatcttcagcgtgatatccgttccaaatttatga 27583667  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 28568740 - 28568584
Alignment:
Q  36 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaata 135  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||       |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28568740 tgactcaaaatttgatagatgaagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttcaaatatattttgttttgaaaatatatttatggacaataaata 28568641  T
Q  136 tatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 192  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28568640 tatttttgtatcgtgtgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 28568584  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 192
Target Start/End: Original strand, 15693669 - 15693755
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 192  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15693669 tgctgaaaatatatttatgggcaataaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaaggggatatt 15693755  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27136503 - 27136367
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctga--------aaatatat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||       |||| |||||||||| |||        ||||||||    
T  27136503 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattggtgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatataaatatat 27136404  T
Q  120 ttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagg 156  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27136403 ttatggaaaataaatatatttttgtaccgtatgaagg 27136367  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 34575696 - 34575608
Alignment:
Q  33 gtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatattt 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34575696 gtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttctaaatatattttgtgctgaaaatatattt 34575608  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 192
Target Start/End: Original strand, 7502638 - 7502723
Alignment:
Q  107 gctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 192  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7502638 gctgaaaatatatttatgaacaataaaaatatttttgtattgtatgacagaagatttgatgcaaatatatttttaaaggaaatatt 7502723  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 177
Target Start/End: Original strand, 39286971 - 39287042
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatatt 177  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||    
T  39286971 tgcttaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccatatgaatgaagatttgatgcaaatatatt 39287042  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 41304884 - 41304806
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagg 185  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  41304884 tgctgacaatatatttatggatagtaaatatatttttgta-catatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagg 41304806  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34575617 - 34575528
Alignment:
Q  131 aaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34575617 aaatatatttttgtaccatataaaggaaaatttgatgcaaatatattttgaaagggaata-------tttgatgcaaatattctttcactgaaggag 34575528  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 41303535 - 41303457
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaag 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||    
T  41303535 tgctgaaaatatatttatggacagtaaatataattttgtaccgtgtgaaggaagaattgattcaaatatatttttaaag 41303457  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 85
Target Start/End: Original strand, 28568346 - 28568395
Alignment:
Q  36 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28568346 tgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgttaaaaatataaaaga 28568395  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 82
Target Start/End: Original strand, 15693583 - 15693629
Alignment:
Q  36 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaa 82  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15693583 tgacttaaaatttgatggatgaataatattgttgctaaaaatataaa 15693629  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 41303623 - 41303573
Alignment:
Q  36 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgcta-aaaatataaaaga 85  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  41303623 tgactcagaatttgatggatgaagaagattgttgctaaaaaatataaaaga 41303573  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 275
Target Start/End: Original strand, 51685 - 51955
Alignment:
Q  2 ctaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatat 101  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||       |||| ||||    
T  51685 ctaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatat 51784  T
Q  102 tttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttt 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51785 tttgtggtgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttg 51884  T
Q  202 atgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51885 atgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaa---aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatga 51955  T

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Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 85
Target Start/End: Original strand, 50161 - 50218
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50161 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaataatgttgctaaaaatataaaaga 50218  T

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Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 145
Target Start/End: Original strand, 170076 - 170115
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 145  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  170076 tgctgaaaatatattcatggacaacaaatatatttttgta 170115  T

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Target: chr8 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 608472 - 608720
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608472 ttgtagtatcactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 608571  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608572 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatattttatgcaaatattctttcactgaaggag 608671  T
Q  228 nnnnnnnnga-aacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  608672 aaaaaaaaaagaacgtatcttcggtgtgatatttgttccaaatttatga 608720  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 275
Target Start/End: Original strand, 15808967 - 15809208
Alignment:
Q  31 tagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15808967 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatggacaat 15809066  T
Q  131 aaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnn 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||       
T  15809067 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 15809166  T
Q  231 nnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
          |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15809167 aaa---aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 15809208  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 28283811 - 28283567
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283811 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatatttttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 28283712  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28283711 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagtgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 28283612  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28283611 aaaaaa---aaacgtatcttcagtgtaatatttgttccaaatttatga 28283567  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 41384468 - 41384738
Alignment:
Q  1 actaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagata 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       | || |||    
T  41384468 actaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatata 41384567  T
Q  101 ttttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt 200  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41384568 ttttatactgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattata-tttt 41384666  T
Q  201 tatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    |||||||||||||||||| |||||||          |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41384667 tatgcaaatattctttcattgaagga---aaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatga 41384738  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 227
Target Start/End: Original strand, 43529873 - 43530072
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43529873 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 43529972  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43529973 aataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgctaatattctttcactgaaggag 43530072  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 227
Target Start/End: Original strand, 3873752 - 3873952
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873752 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 3873851  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaagga-cgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagga 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3873852 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagga 3873951  T
Q  227 g 227  Q
    |    
T  3873952 g 3873952  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 41382421 - 41382666
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||       | || ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  41382421 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgttaaaaatataaaagatttgtttcgaatatattttatactgaaaatatatttatggac 41382520  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41382521 aataaatatatttttgtaccgtatgaacaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaatgag 41382620  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41382621 aaaaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatga 41382666  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 184
Target Start/End: Original strand, 32339096 - 32339252
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339096 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 32339195  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaag 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339196 aataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaag 32339252  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3265750 - 3265635
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3265750 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 3265651  T
Q  128 aataaatatatttttg 143  Q
    ||||||||||| ||||    
T  3265650 aataaatatatgtttg 3265635  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 275
Target Start/End: Original strand, 181434 - 181530
Alignment:
Q  177 tttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggagnnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||         |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  181434 tttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactaaaggagaagaaaa--aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatga 181530  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11701447 - 11701364
Alignment:
Q  106 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 192  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||   ||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11701447 tgctgaaaatatatttatggtcagtaaatatatttttgtaccgtat---ggaagaattgatgtaaatatatttttaaagggaatatt 11701364  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 13986285 - 13986214
Alignment:
Q  109 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttg 180  Q
    |||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13986285 tgaaaatatatttatggatagttaataaatttttgtaccgcatgaaagaagatttgatgcaaatatattttg 13986214  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 13986374 - 13986328
Alignment:
Q  36 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaa 82  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13986374 tgactcaaaattttatggatgaagaagattgttgctaaaaatataaa 13986328  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 11701479 - 11701435
Alignment:
Q  36 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatata 80  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  11701479 tgactcaaaatttgatggacgaagaagattgttgctgaaaatata 11701435  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 275
Target Start/End: Original strand, 32339260 - 32339298
Alignment:
Q  237 aaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  32339260 aaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatga 32339298  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 30679256 - 30679208
Alignment:
Q  36 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 85  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  30679256 tgactcaaaatttgatggatgaagaata-tgttggtaaaaataaaaaaga 30679208  T

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Target: scaffold0154 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12059 - 11815
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12059 ttgtagtatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 11960  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11959 aataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 11860  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11859 aaaaaa---aaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatga 11815  T

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Target: scaffold0031 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 78885 - 79131
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||     
T  78885 ttgtagtatgacttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtctcaaatatattttctgctaaaaatatatttatggat 78984  T
Q  128 aataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  78985 aataaatatatttttgtactgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 79084  T
Q  228 nnnnnnnngaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
             ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  79085 gaaaaaaa-aaatgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatga 79131  T

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Target: scaffold0133 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 174
Target Start/End: Original strand, 4541 - 4694
Alignment:
Q  21 gagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatt 120  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       | || |||||| ||||||||||||||||    
T  4541 gagaatgttgcagtataactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatatatttcgtgctgaaaatatatt 4640  T
Q  121 tatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatat 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4641 tatggacaatatatatatttttgtactgtatgaaggacaatttgatgcaaatat 4694  T

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Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 275
Target Start/End: Original strand, 4722 - 4761
Alignment:
Q  236 gaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4722 gaaacgtatcttcagtgtgatattcgtttcaaatttatga 4761  T

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Target: scaffold0468 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2183 - 2070
Alignment:
Q  28 ttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagatattttgtgctgaaaatatatttatggac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2183 ttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 2084  T
Q  128 aataaatatatttt 141  Q
    ||||||||||||||    
T  2083 aataaatatatttt 2070  T

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Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2080 - 2022
Alignment:
Q  169 aaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaaggag 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2080 aaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggag 2022  T

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Target: scaffold1674 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 120 - 1
Alignment:
Q  1 actaatttggagtcaaggttgagaattttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagannnnnnncaaagata 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||    
T  120 actaatttagagtcaaggtggagaatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 21  T
Q  101 ttttgtgctgaaaatatatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20 ttttgtgctgaaaatatatt 1  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 57905 - 57836
Alignment:
Q  109 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatatttt 179  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  57905 tgaaaatatatgtatgaacaataaatatatttttgtaccgtatgaa-gaaaatttgatgcaaatatatttt 57836  T

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Target: scaffold0533 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2018 - 1971
Alignment:
Q  130 taaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatatt 177  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  2018 taaatatatttttgtatcatatgaaggaatatttgatacaaatatatt 1971  T

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Target: scaffold0474 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0474
Description:

Target: scaffold0474; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 85
Target Start/End: Original strand, 10443 - 10492
Alignment:
Q  36 tgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaaga 85  Q
    |||||||||||||||||||  || || ||||||| |||||||||||||||    
T  10443 tgactcaaaatttgatggataaaaaagattgttgttaaaaatataaaaga 10492  T

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