View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17367_low_4 (Length: 449)

Name: NF17367_low_4
Description: NF17367
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17367_low_4
NF17367_low_4
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (13-433)||(39811811-39812229)
chr2 (32-431)||(32246630-32247031)
chr2 (131-431)||(44312563-44312863)
chr2 (45-433)||(19344264-19344655)
chr2 (45-433)||(19349122-19349513)
chr2 (97-433)||(11098843-11099178)
chr2 (97-429)||(14291337-14291669)
chr2 (97-433)||(9296317-9296653)
chr2 (97-388)||(25398386-25398675)
chr2 (97-388)||(25403524-25403813)
chr2 (97-275)||(3491751-3491930)
chr2 (190-276)||(8040059-8040147)
chr2 (16-97)||(11098711-11098790)
chr2 (193-275)||(40738844-40738926)
chr2 (181-272)||(13569331-13569425)
chr2 (181-276)||(21629943-21630040)
chr2 (181-275)||(28259178-28259274)
chr2 (181-276)||(10445444-10445542)
chr2 (181-276)||(17865202-17865300)
chr2 (181-276)||(20522219-20522317)
chr2 (97-245)||(25407653-25407802)
chr2 (181-276)||(34682334-34682432)
chr2 (16-97)||(9296186-9296265)
chr2 (16-97)||(14291722-14291801)
chr2 (181-274)||(34388859-34388955)
chr2 (181-276)||(14699008-14699105)
chr2 (181-274)||(10707252-10707348)
chr2 (181-272)||(8390150-8390244)
chr2 (190-275)||(31056044-31056131)
chr2 (181-276)||(33528621-33528719)
chr2 (181-276)||(39482930-39483028)
chr2 (190-276)||(16940219-16940307)
chr2 (190-276)||(17010884-17010972)
chr2 (181-275)||(23078471-23078567)
chr2 (181-275)||(42039670-42039766)
chr2 (34-97)||(25409860-25409922)
chr2 (191-276)||(33118135-33118222)
chr2 (192-275)||(36757774-36757859)
chr2 (212-272)||(1345574-1345635)
chr2 (212-272)||(2838063-2838124)
chr2 (212-271)||(35215586-35215646)
chr2 (212-271)||(35217963-35218023)
chr2 (34-97)||(3491981-3492043)
chr2 (192-254)||(27149306-27149369)
chr2 (192-272)||(2869705-2869787)
chr2 (215-271)||(45332181-45332238)
chr2 (212-271)||(23452237-23452297)
chr2 (212-271)||(36558864-36558924)
chr2 (212-271)||(36561141-36561201)
[»] chr7 (56 HSPs)
chr7 (13-431)||(31109406-31109822)
chr7 (13-431)||(12396757-12397173)
chr7 (21-431)||(12406177-12406585)
chr7 (13-431)||(24024150-24024567)
chr7 (45-433)||(19992156-19992544)
chr7 (45-433)||(21812092-21812480)
chr7 (186-431)||(4866575-4866820)
chr7 (97-433)||(20357463-20357799)
chr7 (45-433)||(24266054-24266444)
chr7 (97-433)||(2057804-2058147)
chr7 (45-433)||(24261175-24261565)
chr7 (97-433)||(1533359-1533692)
chr7 (45-433)||(16884772-16885162)
chr7 (77-433)||(16879916-16880273)
chr7 (97-433)||(21639658-21639988)
chr7 (97-433)||(21645856-21646186)
chr7 (97-275)||(18408764-18408943)
chr7 (97-275)||(18413641-18413819)
chr7 (16-97)||(20357331-20357410)
chr7 (16-95)||(4873310-4873387)
chr7 (16-97)||(1533228-1533307)
chr7 (16-97)||(2058202-2058281)
chr7 (181-276)||(29159802-29159900)
chr7 (191-274)||(21983285-21983370)
chr7 (181-276)||(46516310-46516408)
chr7 (181-276)||(49091660-49091758)
chr7 (181-275)||(44848685-44848781)
chr7 (181-276)||(2647696-2647794)
chr7 (181-276)||(33332450-33332548)
chr7 (193-276)||(9190021-9190106)
chr7 (193-276)||(20284088-20284173)
chr7 (181-276)||(55947-56044)
chr7 (193-276)||(2580389-2580474)
chr7 (192-276)||(35960815-35960901)
chr7 (193-276)||(9185178-9185263)
chr7 (34-97)||(21640039-21640101)
chr7 (34-97)||(21646237-21646299)
chr7 (181-276)||(4796667-4796765)
chr7 (196-275)||(47263678-47263757)
chr7 (192-275)||(2479337-2479421)
chr7 (212-272)||(28617258-28617319)
chr7 (34-97)||(18408993-18409055)
chr7 (191-274)||(21988909-21988992)
chr7 (212-271)||(31155911-31155971)
chr7 (34-97)||(18413869-18413931)
chr7 (212-271)||(1049296-1049356)
chr7 (212-271)||(2935497-2935557)
chr7 (212-271)||(3035953-3036013)
chr7 (212-275)||(5817303-5817366)
chr7 (212-271)||(7351652-7351712)
chr7 (228-275)||(8153466-8153514)
chr7 (212-271)||(9027194-9027254)
chr7 (212-271)||(22108295-22108355)
chr7 (212-271)||(22137306-22137366)
chr7 (212-271)||(40550055-40550115)
chr7 (212-271)||(40552333-40552393)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (13-428)||(15044535-15044948)
chr5 (13-431)||(43592124-43592541)
chr5 (13-431)||(1456985-1457401)
chr5 (13-431)||(43598569-43598986)
chr5 (13-431)||(43604061-43604478)
chr5 (13-431)||(43609553-43609970)
chr5 (13-431)||(27444815-27445232)
chr5 (13-427)||(27449663-27450076)
chr5 (45-431)||(28807429-28807814)
chr5 (75-433)||(37556506-37556865)
chr5 (75-433)||(37561328-37561687)
chr5 (98-431)||(30631253-30631586)
chr5 (45-431)||(2785221-2785608)
chr5 (97-353)||(31180138-31180394)
chr5 (45-431)||(33791162-33791549)
chr5 (45-431)||(31396843-31397232)
chr5 (45-431)||(31401700-31402089)
chr5 (45-431)||(33768025-33768417)
chr5 (97-388)||(38192064-38192353)
chr5 (97-388)||(38219289-38219578)
chr5 (97-433)||(24135697-24136028)
chr5 (97-275)||(35387663-35387842)
chr5 (16-97)||(30631640-30631719)
chr5 (16-97)||(31180447-31180526)
chr5 (181-275)||(9353333-9353429)
chr5 (181-275)||(36932351-36932447)
chr5 (181-275)||(10281751-10281848)
chr5 (16-97)||(24136080-24136159)
chr5 (181-275)||(15464532-15464628)
chr5 (181-274)||(11916972-11917068)
chr5 (181-275)||(14520230-14520326)
chr5 (190-276)||(17003970-17004058)
chr5 (181-276)||(3880298-3880396)
chr5 (181-272)||(12084176-12084269)
chr5 (181-275)||(19588746-19588843)
chr5 (193-276)||(28832258-28832343)
chr5 (34-97)||(35387893-35387955)
chr5 (193-276)||(42127423-42127508)
chr5 (212-271)||(4410241-4410301)
chr5 (34-97)||(38219629-38219691)
chr5 (196-276)||(31300612-31300694)
chr5 (212-271)||(15552464-15552524)
chr5 (212-271)||(31179371-31179431)
chr5 (212-271)||(31542953-31543013)
chr5 (212-271)||(31545299-31545359)
chr5 (218-271)||(27910675-27910729)
chr5 (193-276)||(24553520-24553604)
chr5 (212-271)||(3373137-3373197)
chr5 (212-271)||(10749919-10749979)
chr5 (212-271)||(15354575-15354635)
[»] chr6 (38 HSPs)
chr6 (16-431)||(14737403-14737816)
chr6 (29-431)||(28184348-28184754)
chr6 (16-431)||(14742263-14742675)
chr6 (13-431)||(11856817-11857236)
chr6 (13-431)||(22010520-22010936)
chr6 (32-431)||(28155412-28155810)
chr6 (32-431)||(6438346-6438743)
chr6 (45-431)||(6005263-6005650)
chr6 (45-427)||(16838594-16838977)
chr6 (45-431)||(33330297-33330686)
chr6 (45-431)||(33335794-33336183)
chr6 (97-433)||(5674685-5675019)
chr6 (16-97)||(5674554-5674633)
chr6 (230-431)||(5343326-5343527)
chr6 (181-275)||(5757479-5757575)
chr6 (181-275)||(21356036-21356132)
chr6 (191-276)||(10077176-10077263)
chr6 (181-276)||(5572241-5572339)
chr6 (192-276)||(31086485-31086571)
chr6 (331-433)||(30125944-30126046)
chr6 (191-275)||(4629954-4630040)
chr6 (181-276)||(31979512-31979610)
chr6 (181-276)||(22963699-22963796)
chr6 (181-276)||(23824597-23824694)
chr6 (181-263)||(21801344-21801429)
chr6 (193-253)||(22709041-22709102)
chr6 (181-254)||(18232867-18232942)
chr6 (193-276)||(5017482-5017567)
chr6 (212-276)||(31936586-31936651)
chr6 (212-271)||(12195515-12195575)
chr6 (45-126)||(5343628-5343710)
chr6 (212-271)||(4816231-4816291)
chr6 (212-271)||(5273216-5273276)
chr6 (212-271)||(19704567-19704627)
chr6 (212-271)||(20915356-20915416)
chr6 (212-271)||(26932562-26932622)
chr6 (212-271)||(29754709-29754769)
chr6 (212-271)||(33309110-33309170)
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (13-431)||(9224230-9224646)
chr4 (13-431)||(9229017-9229433)
chr4 (32-431)||(45347658-45348057)
chr4 (17-431)||(51520302-51520715)
chr4 (32-431)||(45357138-45357536)
chr4 (32-431)||(5732507-5732907)
chr4 (32-431)||(3813869-3814266)
chr4 (69-431)||(18855572-18855933)
chr4 (145-431)||(56146664-56146951)
chr4 (97-433)||(24741786-24742121)
chr4 (99-433)||(29760488-29760821)
chr4 (13-103)||(18712589-18712677)
chr4 (193-275)||(28468542-28468625)
chr4 (16-97)||(24742174-24742253)
chr4 (16-97)||(29760874-29760954)
chr4 (181-276)||(10047378-10047476)
chr4 (181-276)||(39245993-39246091)
chr4 (181-276)||(36315230-36315327)
chr4 (181-276)||(36329439-36329536)
chr4 (181-275)||(31985635-31985730)
chr4 (181-276)||(16623293-16623391)
chr4 (181-275)||(5396672-5396768)
chr4 (190-276)||(38152449-38152537)
chr4 (193-278)||(5269204-5269291)
chr4 (181-275)||(3796519-3796616)
chr4 (191-274)||(5143260-5143345)
chr4 (191-274)||(5147678-5147763)
chr4 (190-276)||(24333808-24333896)
chr4 (181-274)||(3777550-3777645)
chr4 (190-270)||(6743425-6743507)
chr4 (181-276)||(16630680-16630778)
chr4 (193-276)||(25862035-25862120)
chr4 (212-271)||(16931789-16931849)
chr4 (212-271)||(16934143-16934203)
chr4 (212-271)||(22780373-22780433)
chr4 (212-271)||(44599838-44599898)
chr4 (181-254)||(39774305-39774380)
chr4 (191-276)||(54867183-54867269)
chr4 (212-271)||(6765117-6765177)
chr4 (212-271)||(7941596-7941656)
chr4 (212-271)||(18709164-18709224)
chr4 (212-271)||(22782738-22782798)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (13-431)||(34885-35301)
[»] chr1 (40 HSPs)
chr1 (13-430)||(41398084-41398498)
chr1 (13-377)||(41390485-41390843)
chr1 (32-431)||(25444931-25445329)
chr1 (32-431)||(44023716-44024112)
chr1 (32-431)||(39445345-39445742)
chr1 (32-431)||(1054854-1055251)
chr1 (97-433)||(24787280-24787619)
chr1 (45-431)||(43988314-43988705)
chr1 (97-388)||(24202686-24202973)
chr1 (32-171)||(25439738-25439875)
chr1 (97-275)||(19358760-19358939)
chr1 (97-275)||(19361349-19361528)
chr1 (97-275)||(19379989-19380168)
chr1 (16-96)||(24787148-24787226)
chr1 (181-275)||(26644898-26644994)
chr1 (190-276)||(47703946-47704034)
chr1 (181-275)||(19072928-19073025)
chr1 (181-275)||(19120818-19120915)
chr1 (181-276)||(16124516-16124614)
chr1 (181-276)||(27104372-27104470)
chr1 (181-275)||(3281708-3281804)
chr1 (190-276)||(9476260-9476348)
chr1 (190-276)||(13598397-13598485)
chr1 (190-276)||(29651810-29651898)
chr1 (34-97)||(24202573-24202635)
chr1 (183-275)||(37069770-37069864)
chr1 (190-276)||(775671-775759)
chr1 (193-276)||(47098837-47098922)
chr1 (181-275)||(13604624-13604720)
chr1 (181-275)||(21536570-21536666)
chr1 (379-431)||(41386594-41386646)
chr1 (193-276)||(32889438-32889523)
chr1 (212-272)||(47102874-47102935)
chr1 (212-271)||(9459419-9459479)
chr1 (212-271)||(9463246-9463306)
chr1 (212-271)||(16226386-16226446)
chr1 (34-97)||(19366112-19366174)
chr1 (34-97)||(19361237-19361298)
chr1 (212-271)||(23786058-23786118)
chr1 (212-271)||(51752582-51752642)
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (13-431)||(22173018-22173434)
chr3 (32-431)||(18656277-18656677)
chr3 (97-433)||(7167090-7167425)
chr3 (97-431)||(28503780-28504104)
chr3 (45-431)||(2676939-2677327)
chr3 (45-431)||(2672783-2673171)
chr3 (45-427)||(24967957-24968340)
chr3 (97-433)||(2671502-2671838)
chr3 (45-431)||(8512061-8512450)
chr3 (45-431)||(8516941-8517330)
chr3 (100-433)||(8738982-8739316)
chr3 (100-433)||(9091220-9091554)
chr3 (97-433)||(8477210-8477545)
chr3 (45-433)||(32475328-32475717)
chr3 (45-433)||(32480186-32480575)
chr3 (97-232)||(28501613-28501750)
chr3 (97-293)||(40372712-40372908)
chr3 (97-275)||(26928507-26928687)
chr3 (227-431)||(10207779-10207983)
chr3 (97-275)||(32143321-32143501)
chr3 (181-275)||(1305949-1306044)
chr3 (16-97)||(7167478-7167558)
chr3 (16-97)||(28501480-28501560)
chr3 (16-97)||(28503647-28503727)
chr3 (16-97)||(2671370-2671449)
chr3 (16-97)||(40372580-40372659)
chr3 (181-275)||(8370477-8370573)
chr3 (181-275)||(27974943-27975039)
chr3 (19-97)||(8477598-8477674)
chr3 (15-97)||(8738846-8738926)
chr3 (181-276)||(18552873-18552971)
chr3 (16-97)||(9091085-9091164)
chr3 (181-276)||(21711222-21711319)
chr3 (97-275)||(27452958-27453138)
chr3 (181-275)||(16264350-16264446)
chr3 (193-275)||(27986449-27986533)
chr3 (181-274)||(36029094-36029190)
chr3 (181-272)||(1736295-1736389)
chr3 (181-275)||(30709780-30709877)
chr3 (193-275)||(33386669-33386753)
chr3 (181-276)||(3715992-3716090)
chr3 (181-276)||(40592772-40592870)
chr3 (181-276)||(48438213-48438311)
chr3 (181-276)||(6794704-6794801)
chr3 (181-276)||(26298987-26299085)
chr3 (193-276)||(1417493-1417578)
chr3 (181-275)||(25795781-25795878)
chr3 (181-276)||(47923896-47923994)
chr3 (193-276)||(37466290-37466375)
chr3 (193-275)||(39039995-39040079)
chr3 (181-276)||(40844651-40844748)
chr3 (193-276)||(3328359-3328444)
chr3 (209-275)||(4386947-4387014)
chr3 (181-276)||(24695154-24695252)
chr3 (36-97)||(1306179-1306239)
chr3 (212-271)||(38210569-38210629)
chr3 (365-429)||(40372980-40373043)
chr3 (212-271)||(50494198-50494258)
chr3 (208-271)||(53894055-53894119)
chr3 (193-254)||(3323693-3323755)
chr3 (212-271)||(458483-458543)
chr3 (212-271)||(6063444-6063504)
chr3 (212-271)||(10621528-10621588)
chr3 (228-275)||(39153357-39153405)
[»] chr8 (48 HSPs)
chr8 (13-431)||(7289749-7290166)
chr8 (32-431)||(25328120-25328517)
chr8 (32-433)||(39784665-39785065)
chr8 (97-431)||(6311143-6311477)
chr8 (97-433)||(36979223-36979558)
chr8 (45-431)||(35745237-35745624)
chr8 (98-433)||(33037724-33038058)
chr8 (97-433)||(30655486-30655827)
chr8 (97-433)||(4759991-4760327)
chr8 (97-433)||(18853083-18853420)
chr8 (97-433)||(18870477-18870811)
chr8 (45-433)||(10684116-10684506)
chr8 (97-433)||(10689058-10689394)
chr8 (97-275)||(1261871-1262050)
chr8 (193-275)||(26287902-26287985)
chr8 (193-275)||(26301159-26301242)
chr8 (193-275)||(26313153-26313236)
chr8 (97-275)||(31071146-31071326)
chr8 (13-97)||(6311532-6311614)
chr8 (16-97)||(18870345-18870424)
chr8 (16-97)||(30655880-30655959)
chr8 (16-97)||(10688924-10689003)
chr8 (16-97)||(18852951-18853030)
chr8 (32-109)||(25327994-25328070)
chr8 (190-276)||(26403240-26403328)
chr8 (16-97)||(33037592-33037671)
chr8 (181-275)||(4456028-4456124)
chr8 (15-97)||(4759857-4759938)
chr8 (181-272)||(7412344-7412437)
chr8 (181-275)||(19175755-19175851)
chr8 (181-276)||(23799577-23799675)
chr8 (193-276)||(4696609-4696694)
chr8 (34-97)||(1261758-1261820)
chr8 (181-276)||(5702483-5702581)
chr8 (181-272)||(6127224-6127318)
chr8 (212-273)||(9765852-9765914)
chr8 (16-97)||(36979611-36979689)
chr8 (193-276)||(19752407-19752492)
chr8 (36-97)||(31071035-31071095)
chr8 (212-271)||(43079877-43079937)
chr8 (212-271)||(43082248-43082308)
chr8 (209-275)||(6813683-6813750)
chr8 (34-97)||(26288121-26288183)
chr8 (34-97)||(26301378-26301440)
chr8 (34-97)||(26313372-26313434)
chr8 (34-97)||(7412569-7412629)
chr8 (212-245)||(18810982-18811015)
chr8 (212-271)||(44721118-44721178)
[»] scaffold0355 (3 HSPs)
scaffold0355 (69-431)||(9521-9879)
scaffold0355 (13-189)||(3671-3845)
scaffold0355 (333-412)||(28-107)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (32-433)||(206-605)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (45-431)||(148808-149195)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (45-431)||(2103-2490)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (45-433)||(14161-14551)
scaffold0197 (45-431)||(19017-19404)
[»] scaffold0188 (4 HSPs)
scaffold0188 (97-388)||(17869-18157)
scaffold0188 (97-275)||(23962-24141)
scaffold0188 (34-97)||(17756-17818)
scaffold0188 (34-97)||(23849-23911)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (207-433)||(181980-182206)
scaffold0009 (45-140)||(176829-176925)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (243-433)||(300-489)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (181-275)||(8420-8516)
scaffold0140 (212-271)||(22343-22403)
scaffold0140 (212-271)||(24618-24678)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (181-274)||(85684-85779)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (181-275)||(43962-44058)
scaffold0087 (181-275)||(36833-36929)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (190-276)||(5682-5770)
scaffold0006 (190-276)||(2491-2579)
scaffold0006 (181-275)||(133281-133377)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (181-276)||(10728-10826)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (379-431)||(34136-34188)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (193-275)||(45253-45337)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (181-272)||(17266-17360)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (212-271)||(269-329)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (392-433)||(13192-13233)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (212-245)||(11500-11533)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (212-271)||(69292-69352)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 433
Target Start/End: Original strand, 39811811 - 39812229
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39811811 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttaggtt-gagaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 39811909  T
Q  113 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatatt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39811910 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatatt 39812009  T
Q  213 ggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtcttg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  39812010 ggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggttcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttg 39812108  T
Q  313 tttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccact 412  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39812109 tttgtgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcact 39812208  T
Q  413 atcgcttgctccacacatctt 433  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  39812209 atcacttgctccacacatctt 39812229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 32 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 32247031 - 32246630
Alignment:
Q  32 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 131  Q
    ||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32247031 atggggtgtgtgcctttgatgagagtgtttcttaggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 32246933  T
Q  132 aaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctc 231  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32246932 aaagggtataatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctc 32246833  T
Q  232 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttct---ttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   ||  |||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  32246832 tcccccagattaggccatattggctgaacaaggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttcctttttttcttgcttatcttgtttatgctttggaatc 32246733  T
Q  329 tcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  32246732 tcttgtgtggttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcatagattaccactatcacttgctccacac 32246633  T
Q  429 atc 431  Q
    |||    
T  32246632 atc 32246630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 131 - 431
Target Start/End: Original strand, 44312563 - 44312863
Alignment:
Q  131 caaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312563 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 44312662  T
Q  230 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatct 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  44312663 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcgcttatcttgttt-tgctttggtatct 44312760  T
Q  330 c-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacac 428  Q
    | |||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44312761 ctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctccacac 44312860  T
Q  429 atc 431  Q
    |||    
T  44312861 atc 44312863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 45 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 19344655 - 19344264
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaa 142  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  19344655 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg- 19344557  T
Q  143 tctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaga 240  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19344556 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccctaga 19344457  T
Q  241 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtg 337  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||    
T  19344456 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttccttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 19344360  T
Q  338 gttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19344359 gttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattaccactatctcttgctccacacatctt 19344264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 45 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 19349513 - 19349122
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaa--acattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaa 142  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||||  ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  19349513 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg- 19349415  T
Q  143 tctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaga 240  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19349414 tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccctaga 19349315  T
Q  241 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtg 337  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||    
T  19349314 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttccttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 19349218  T
Q  338 gttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19349217 gttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattaccactatctcttgctccacacatctt 19349122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 97 - 433
Target Start/End: Original strand, 11098843 - 11099178
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||| | ||||  ||  ||||||||| |||    
T  11098843 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattgtttcttgtaacccttt 11098941  T
Q  195 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  11098942 gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-t 11099039  T
Q  294 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccat 391  Q
    ||||||    ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  11099040 tcctttcttccttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggaaaccat 11099137  T
Q  392 ttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11099138 tt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctt 11099178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 97 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14291669 - 14291337
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| |||    
T  14291669 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaacccttt 14291571  T
Q  195 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  14291570 gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-t 14291473  T
Q  294 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccat 391  Q
    ||||||   |||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14291472 tcctttcttgcttatcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacattagtctagggctgtttttgttgttgtttgcttggaaaccat 14291374  T
Q  392 ttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacaca 429  Q
    || | | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14291373 tt-tgcccattgattaccactatctcttgctccacaca 14291337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 97 - 433
Target Start/End: Original strand, 9296317 - 9296653
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||  |||||  ||| ||| ||||||||||||  ||  ||||||||| |||    
T  9296317 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtataa-gcttgaaggctattgtttcttgtaacccttt 9296415  T
Q  195 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  9296416 gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-t 9296513  T
Q  294 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccat 391  Q
    ||||||   |||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9296514 tcctttcttgcttttcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtttgcttggaaaccat 9296612  T
Q  392 ttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    || | ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  9296613 tt-tgctcatagattaccactaccttttgctccacacatctt 9296653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 25398675 - 25398386
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||| || || |||||||| |||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| ||||    
T  25398675 ttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttg 25398577  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttctt 293  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |    
T  25398576 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc-t 25398479  T
Q  294 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagac 388  Q
    ||||||   |||| |||||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25398478 tcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagac 25398386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 25403813 - 25403524
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||| || || |||||||| |||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| ||||    
T  25403813 ttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttg 25403715  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttctt 293  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| |    
T  25403714 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgagtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc-t 25403617  T
Q  294 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagac 388  Q
    ||||||   |||| |||||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25403616 tcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagac 25403524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3491930 - 3491751
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| || || ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| ||||    
T  3491930 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttg 3491832  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3491831 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 3491751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 8040147 - 8040059
Alignment:
Q  190 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8040147 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 8040059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Original strand, 11098711 - 11098790
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11098711 caaaggagggaaccaaa-gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 11098790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 40738926 - 40738844
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40738926 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctc-cccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt 40738844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13569425 - 13569331
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 272  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  13569425 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 13569331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 21630040 - 21629943
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21630040 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 21629943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 28259178 - 28259274
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  28259178 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 28259274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 10445444 - 10445542
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  10445444 tcttgtaactcttttgtaacactttcataatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttg 10445542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17865300 - 17865202
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt-ggctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17865300 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaatcttg 17865202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20522317 - 20522219
Alignment:
Q  181 tcttgtaacc-ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20522317 tcttgtaacccttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 20522219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25407802 - 25407653
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||| || || |||||||| |||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| ||||    
T  25407802 ttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttg 25407704  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattagg 245  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25407703 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 25407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 34682334 - 34682432
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34682334 tcttgtaactcttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 34682432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Original strand, 9296186 - 9296265
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9296186 caaaggagggaaccaaa-gggttgagtgtctttgtagaaagtgtctattgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 9296265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 14291801 - 14291722
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14291801 caaaggagggaaccaaa-gggttgagcgtctttgtagatagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 14291722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34388955 - 34388859
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 274  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  34388955 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatct 34388859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 14699008 - 14699105
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14699008 tcttgtaactcttttgtaac-ctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 14699105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 274
Target Start/End: Original strand, 10707252 - 10707348
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 274  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10707252 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 10707348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 272
Target Start/End: Original strand, 8390150 - 8390244
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 272  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  8390150 tcttgtaactcttttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaat 8390244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31056131 - 31056044
Alignment:
Q  190 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  31056131 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaatctt 31056044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 33528621 - 33528719
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33528621 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 33528719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 39483028 - 39482930
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  39483028 tcttgtaactcttttgtaacattttcatcatagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 39482930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Original strand, 16940219 - 16940307
Alignment:
Q  190 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  16940219 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 16940307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Original strand, 17010884 - 17010972
Alignment:
Q  190 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  17010884 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 17010972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 23078471 - 23078567
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  23078471 tcttgtaactctttctaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggatcgaactgggtcaacattctt 23078567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 42039670 - 42039766
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  42039670 tcttgtaactcttcgtaacactttcatcatagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactagatcaacaatctt 42039766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 25409922 - 25409860
Alignment:
Q  34 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25409922 gggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggtt-gggaaaaacattgtaaacaccttgggt 25409860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 33118222 - 33118135
Alignment:
Q  191 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||    
T  33118222 ttttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagccaacaatcttg 33118135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 275
Target Start/End: Original strand, 36757774 - 36757859
Alignment:
Q  192 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  36757774 tttgaaacactttcatcatactggattggagagctgttatcccccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 36757859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 272
Target Start/End: Original strand, 1345574 - 1345635
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 272  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  1345574 tggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 1345635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 272
Target Start/End: Original strand, 2838063 - 2838124
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 272  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  2838063 tggattggagatgtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 2838124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 35215646 - 35215586
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  35215646 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 35215586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 35218023 - 35217963
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  35218023 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 35217963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 3492043 - 3491981
Alignment:
Q  34 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  3492043 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggtt-ggaaaaaacattgtaaacaccttgggt 3491981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 254
Target Start/End: Original strand, 27149306 - 27149369
Alignment:
Q  192 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 254  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  27149306 tttgtatcactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatagtaggtcatattgg 27149369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 272
Target Start/End: Original strand, 2869705 - 2869787
Alignment:
Q  192 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 272  Q
    |||||| ||||||| || || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  2869705 tttgtatcactttcatcttagtggattggagagctactctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaat 2869787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 45332238 - 45332181
Alignment:
Q  215 attggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  45332238 attggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 45332181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 23452297 - 23452237
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  23452297 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 23452237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 36558924 - 36558864
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  36558924 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 36558864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 36561201 - 36561141
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  36561201 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 36561141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Original strand, 31109406 - 31109822
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109406 tagcaaaggagggaaccatatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 31109504  T
Q  113 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatatt 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109505 gtgagagtgggaaaatatcaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgcaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatatt 31109604  T
Q  213 ggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtcttg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   | || |||||    
T  31109605 ggattggagagctgctctctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttccttttcttgtttatcttg 31109704  T
Q  313 tttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccact 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31109705 tttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactag-ttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcact 31109803  T
Q  413 atcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||| |||||| ||||||||    
T  31109804 atcacttgctgcacacatc 31109822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12397173 - 12396757
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12397173 tagcaaaggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatatt 12397076  T
Q  113 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatat 211  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12397075 gtgatagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagattaaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatat 12396976  T
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtctt 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12396975 tggattggagagctgttctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccctttaccgcttatctt 12396877  T
Q  312 gtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattacca 410  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396876 gttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattacca 12396778  T
Q  411 ctatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  12396777 ctatctcttgctccacacatc 12396757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 21 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12406585 - 12406177
Alignment:
Q  21 gagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagt 120  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12406585 gagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttggcttttagggttcatattgtgagagt 12406488  T
Q  121 gggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagag-tcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattgg 219  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406487 ggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattgg 12406388  T
Q  220 agagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtcttgtttatgc 319  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  12406387 agagctattctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgttt-tgc 12406290  T
Q  320 tttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgct 418  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12406289 tttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctct 12406190  T
Q  419 tgctccacacatc 431  Q
    |||||||||||||    
T  12406189 tgctccacacatc 12406177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Original strand, 24024150 - 24024567
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  24024150 tagcaaaggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgg-aaaaacattgtaatcaccgtgggttttagggttcatcgt 24024247  T
Q  113 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatatt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24024248 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaacattttgtaacactttctcatatt 24024347  T
Q  213 ggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtg-ttttgttctttcctttaccgcttgtctt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||   |||| ||||    
T  24024348 ggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgtttttgttcttccttttcttgcttatctt 24024447  T
Q  312 gtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactag-cttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattacc 409  Q
    |||||||| |||  | ||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024448 gtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatatactagtcata-ggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattacc 24024545  T
Q  410 actatcgcttgctccacacatc 431  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  24024546 actatcacttgctccacacatc 24024567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 45 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 19992544 - 19992156
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatc 144  Q
    ||||| || |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  19992544 ctttgatgtgagtgtttcttaggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tc 19992446  T
Q  145 taggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagatta 243  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19992445 tagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagatta 19992346  T
Q  244 ggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc-tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||  | ||| |||||||||||    
T  19992345 ggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttt 19992247  T
Q  342 tgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  19992246 tgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtaagcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcacctgctccacacatctt 19992156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 45 - 433
Target Start/End: Original strand, 21812092 - 21812480
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatc 144  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21812092 ctttgatgagagtgtttcttaggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tc 21812190  T
Q  145 taggctttgtttatgtgtaaagctt-ga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagatt 242  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21812191 tagggtttgttcatgtgtaaagctttgacaagctagagtcttggaaccttttgtaagactt-cacatattggattggaaagctgctctctcccccagatt 21812289  T
Q  243 aggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttcctttaccgcttgtcttgtttatgctt-tggaatctcttgtgtggtt 340  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||| |  | ||| ||||||||||    
T  21812290 aggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttcttttaccgtttatcttgtttatgcttgttaactct-ttgtgtggtt 21812388  T
Q  341 ttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21812389 ttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattaccactatctcttgctccacacatctt 21812480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 186 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 4866820 - 4866575
Alignment:
Q  186 taaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgtt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4866820 taaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgtt 4866722  T
Q  286 ttgttctttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatc-tcttgtgtgg-ttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttg 383  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||    
T  4866721 ttgttcttccttttaccgcttatcttgttt-tgctttggtatctttttgtgtggtttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttg 4866623  T
Q  384 gagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4866622 gagaccatttgtcctcattgattaccactatctcttgctccacacatc 4866575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 97 - 433
Target Start/End: Original strand, 20357463 - 20357799
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| |||    
T  20357463 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcatgttcttgtgtaaagcttgaaggctattgtttcttgtaacccttt 20357562  T
Q  195 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||     
T  20357563 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtattttgttcttc 20357661  T
Q  295 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccatt 392  Q
    | |||   |||| |||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20357662 cttttcttgcttatcttgtt--tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttagcttggagaccatt 20357759  T
Q  393 tgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20357760 tg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatctt 20357799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 45 - 433
Target Start/End: Original strand, 24266054 - 24266444
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  |    
T  24266054 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-t 24266152  T
Q  144 ctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 241  Q
    ||||| |||  |  |||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24266153 ctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 24266252  T
Q  242 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| ||||||    
T  24266253 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 24266349  T
Q  339 ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
     |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24266350 atttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctt 24266444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 97 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 2058147 - 2057804
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaa-gggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttt 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| | || | ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| ||    
T  2058147 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaatgctattgtttcttgtaaccctt 2058049  T
Q  194 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttct 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  2058048 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttct 2057950  T
Q  293 ttcctttaccgcttgtcttg----tttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggag 386  Q
    | | ||||  |||| |||||    ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || || ||  |||||| | ||||||||||||| |||||||     
T  2057949 tccttttattgcttatcttgtttttttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcggtttttgttgttgtttgcttggaa 2057850  T
Q  387 accatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2057849 accatttg-actcatagattaccactatctcttgctccacacatctt 2057804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 433
Target Start/End: Original strand, 24261175 - 24261565
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 143  Q
    ||||| ||||||||  |||| |||| || ||| ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  |    
T  24261175 ctttgatgagagtgaatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcatcttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-t 24261273  T
Q  144 ctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 241  Q
    ||||| |||  |  |||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24261274 ctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 24261373  T
Q  242 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| ||||||    
T  24261374 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 24261470  T
Q  339 ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
     |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24261471 atttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctt 24261565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 433
Target Start/End: Original strand, 1533359 - 1533692
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttat-gtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttt 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||||| ||||| | ||||  ||  ||||||||| ||    
T  1533359 ttttagggttcatattgtgagagtgggaaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaa-gcttgcaagctattgtttcttgtaaccctt 1533457  T
Q  194 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttc 291  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  1533458 tgtaacactttcatcatattggattggagagatgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttatt-ggtgtgtttgttc 1533556  T
Q  292 tttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggct-gttttgttgttgttggcttggagacca 390  Q
    ||| ||||   |||| | |||||  ||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||||||| ||      
T  1533557 ttt-ctttcttgcttatattgtt--tgctttgtattctctt-tgtggtgttgctctacactagactggggctggttttgttgttgtt-gcttggaaac-- 1533649  T
Q  391 tttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  1533650 ttttttctcattgattaccactatattttgctccacacatctt 1533692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 16885162 - 16884772
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaat-accaaagggtagaa 142  Q
    ||||| ||||||||  |||| |||| || ||| ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||||||      
T  16885162 ctttgatgagagtgaatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcatcttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaatttatcaaagggtagg- 16885064  T
Q  143 tctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 241  Q
    |||||| |||  |  |||||||||||||| | |||||| |||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16885063 tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactctttgtaaaacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 16884964  T
Q  242 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| ||||||    
T  16884963 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 16884867  T
Q  339 ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
     |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16884866 atttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctt 16884772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 77 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 16880273 - 16879916
Alignment:
Q  77 aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaat-accaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-agg 174  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||||||  |||||| |||  |  |||||||||||||| | |    
T  16880273 aacattgtaatcatcttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaatttatcaaagggtagg-tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataag 16880175  T
Q  175 ctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 274  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16880174 ctagattcttgtaactctttgtaaaacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatct 16880075  T
Q  275 tgttcggtgttttgttc--tttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgt 370  Q
    || | ||||||||||||  |||| |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  16880074 tgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgt 16879980  T
Q  371 tgttg-ttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    ||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16879979 tgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctt 16879916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21639988 - 21639658
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| || || ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| ||||    
T  21639988 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttg 21639890  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttctt 293  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |    
T  21639889 taacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc-t 21639792  T
Q  294 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccatt 392  Q
    ||||||   |||| |||||||  ||||||| | |||||  |||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  21639791 tcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagacactt 21639697  T
Q  393 tgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
      | ||||| ||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  21639696 --tactcatagattaccactcccttttgctccacacatctt 21639658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 21646186 - 21645856
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| || || ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| |||     
T  21646186 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttt 21646088  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttctt 293  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |    
T  21646087 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc-t 21645990  T
Q  294 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccatt 392  Q
    ||||||   |||| |||||||  || |||| | |||||  |||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  21645989 tcctttcttgcttatcttgtt--tgttttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagacactt 21645895  T
Q  393 tgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
      | ||||| ||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  21645894 --tactcatagattaccactcccttttgctccacacatctt 21645856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18408943 - 18408764
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||| |||||  |||||  ||||||| ||||| | | ||   | ||||||||| ||||    
T  18408943 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagttatttttcttgtaaccctttg 18408845  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408844 taacactttcatcatactggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 18408764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18413819 - 18413641
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||| |||||  |||||  ||||||| ||||| |  |||   | ||||||||| ||||    
T  18413819 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaatctatttttcttgtaaccctttg 18413721  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18413720 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccc-agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 18413641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Original strand, 20357331 - 20357410
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20357331 caaaggagggaaccaaa-gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 20357410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 4873387 - 4873310
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 95  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4873387 caaaggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattgtaatcaccttgg 4873310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Original strand, 1533228 - 1533307
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1533228 caaaggagggaaccaaa-gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 1533307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 2058281 - 2058202
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2058281 caaaggagggaaccaaa-gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 2058202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 29159900 - 29159802
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29159900 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 29159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 191 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21983370 - 21983285
Alignment:
Q  191 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 274  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21983370 ttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21983285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 46516310 - 46516408
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  46516310 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 46516408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 49091758 - 49091660
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  49091758 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctcttccccagattaggtcatattggactaaactgggtcaacaatcttg 49091660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 44848685 - 44848781
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  44848685 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 44848781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 2647696 - 2647794
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatatt-ggctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  2647696 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaatcttg 2647794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 33332450 - 33332548
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  33332450 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatcttg 33332548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 276
Target Start/End: Original strand, 9190021 - 9190106
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9190021 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9190106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20284173 - 20284088
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20284173 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 20284088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 56044 - 55947
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  56044 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttg 55947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2580474 - 2580389
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  2580474 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 2580389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 35960901 - 35960815
Alignment:
Q  192 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  35960901 tttgtaacactttcatcatagtggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaatcttg 35960815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 276
Target Start/End: Original strand, 9185178 - 9185263
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9185178 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9185263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 21640101 - 21640039
Alignment:
Q  34 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21640101 gggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggtt-gggaaaaacattgtaaacaccttgggt 21640039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 21646299 - 21646237
Alignment:
Q  34 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21646299 gggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggtt-gggaaaaacattgtaaacaccttgggt 21646237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 4796667 - 4796765
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||||    
T  4796667 tcttgtaactcttttgtaacaatttcatcatagtggatttgagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaatcttg 4796765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 47263757 - 47263678
Alignment:
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  47263757 taacactttcatcatagtggattggagagctgc--tctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47263678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2479421 - 2479337
Alignment:
Q  192 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  2479421 tttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctc-cccctagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 2479337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 272
Target Start/End: Original strand, 28617258 - 28617319
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  28617258 tggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaat 28617319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 18409055 - 18408993
Alignment:
Q  34 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18409055 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggtt-gggaaaaacattgtaaacaccttgggt 18408993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21988992 - 21988909
Alignment:
Q  191 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 274  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||  | |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21988992 ttttgtaacactttcatcaaagtggattggagagttgctctc--ctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21988909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31155971 - 31155911
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31155971 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31155911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 18413931 - 18413869
Alignment:
Q  34 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18413931 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggtt-gggaaaaacaatgtaaacaccttgggt 18413869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1049356 - 1049296
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  1049356 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 1049296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 2935497 - 2935557
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  2935497 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 2935557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 3035953 - 3036013
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  3035953 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 3036013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 275
Target Start/End: Original strand, 5817303 - 5817366
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||| || |||||||||    
T  5817303 tggattggagagctgctctct-ccccagagtaggtcatattggaccgaactgagttaacaatctt 5817366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7351712 - 7351652
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  7351712 tggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 7351652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 228 - 275
Target Start/End: Original strand, 8153466 - 8153514
Alignment:
Q  228 tctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  8153466 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaatctt 8153514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 9027254 - 9027194
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9027254 tggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9027194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 22108295 - 22108355
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22108295 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22108355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 22137306 - 22137366
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22137306 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22137366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 40550055 - 40550115
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  40550055 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 40550115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 40552333 - 40552393
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  40552333 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 40552393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 15044948 - 15044535
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044948 tagcaaaggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 15044850  T
Q  113 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatatt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044849 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatatt 15044750  T
Q  213 ggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtcttg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||   |||| |||||    
T  15044749 ggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttccttttcttgcttatcttg 15044651  T
Q  313 tttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccact 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044650 tttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgttggtttggagaccatttgttctcattgattaccact 15044551  T
Q  413 atcgcttgctccacac 428  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  15044550 atcacttgctctacac 15044535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 43592541 - 43592124
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43592541 tagcaaaggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatatt 43592444  T
Q  113 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatat 211  Q
      ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592443 aagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatat 43592344  T
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtctt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||| | ||| ||||    
T  43592343 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatctt 43592245  T
Q  312 gtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattacca 410  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592244 gtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattacca 43592145  T
Q  411 ctatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  43592144 ctatctcttgctccacacatc 43592124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Original strand, 1456985 - 1457401
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1456985 tagcaaaggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatatt 1457082  T
Q  113 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagag-tcttgtaaccttttgtaacactttctcatat 211  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457083 gtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatat 1457182  T
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtctt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    ||| ||||    
T  1457183 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-ttcctttctttcttatctt 1457280  T
Q  312 gtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattacca 410  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457281 gtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattacca 1457380  T
Q  411 ctatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  1457381 ctatctcttgctccacacatc 1457401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 43598986 - 43598569
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43598986 tagcaaaggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatatt 43598889  T
Q  113 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatat 211  Q
      ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598888 aagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatat 43598789  T
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtctt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| | |||| | ||| ||||    
T  43598788 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatctt 43598690  T
Q  312 gtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattacca 410  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43598689 gtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattacca 43598590  T
Q  411 ctatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  43598589 ctatctcttgctccacacatc 43598569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 43604478 - 43604061
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43604478 tagcaaaggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatatt 43604381  T
Q  113 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatat 211  Q
      ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604380 aagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatat 43604281  T
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtctt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| | |||| | ||| ||||    
T  43604280 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatctt 43604182  T
Q  312 gtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattacca 410  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43604181 gtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattacca 43604082  T
Q  411 ctatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  43604081 ctatctcttgctccacacatc 43604061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 43609970 - 43609553
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43609970 tagcaaaggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatatt 43609873  T
Q  113 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatat 211  Q
      ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609872 aagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatat 43609773  T
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtctt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| | |||| | ||| ||||    
T  43609772 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatctt 43609674  T
Q  312 gtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattacca 410  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43609673 gtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattacca 43609574  T
Q  411 ctatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  43609573 ctatctcttgctccacacatc 43609553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27445232 - 27444815
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27445232 tagcaaaggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatatt 27445135  T
Q  113 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatat 211  Q
      ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27445134 aagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatat 27445035  T
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtctt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||| | ||| ||||    
T  27445034 tggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattgcctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatctt 27444936  T
Q  312 gtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattacca 410  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27444935 gtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttgtactcattgattacca 27444836  T
Q  411 ctatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  27444835 ctatctcttgctccacacatc 27444815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27450076 - 27449663
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27450076 tagcaaaggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatatt 27449979  T
Q  113 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatat 211  Q
      ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449978 aagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatat 27449879  T
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtctt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||| | ||| ||||    
T  27449878 tggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatctt 27449780  T
Q  312 gtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattacca 410  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27449779 gtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttgtactcattgattacca 27449680  T
Q  411 ctatcgcttgctccaca 427  Q
    ||||| |||||||||||    
T  27449679 ctatctcttgctccaca 27449663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 45 - 431
Target Start/End: Original strand, 28807429 - 28807814
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatc 144  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28807429 ctttgatgagagtgtttcttaggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tc 28807526  T
Q  145 taggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattag 244  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807527 tagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagattcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattag 28807625  T
Q  245 gccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc-tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtgg--tt 340  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||  | ||| ||| ||||  ||    
T  28807626 gccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgagtggtttt 28807724  T
Q  341 ttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28807725 ttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 28807814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 75 - 433
Target Start/End: Original strand, 37556506 - 37556865
Alignment:
Q  75 aaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-ag 173  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| |     
T  37556506 aaaacattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataa 37556604  T
Q  174 gctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatc 273  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37556605 gctagatacttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatc 37556704  T
Q  274 ttgttcggtgttttgttctttcc-tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacactag-cttagggctgttttgt 370  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  37556705 ttgctcggtgttttgttctttccatttaccgtttatcttgtttatgctt-gttagctcttagtgtggttttgctatacacaagtcatagg-ctgttttgt 37556802  T
Q  371 tgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  37556803 tgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatcactatcacttgctccacacatctt 37556865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 75 - 433
Target Start/End: Original strand, 37561328 - 37561687
Alignment:
Q  75 aaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-ag 173  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| |     
T  37561328 aaaacattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataa 37561426  T
Q  174 gctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatc 273  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37561427 gctagatacttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatc 37561526  T
Q  274 ttgttcggtgttttgttctttcc-tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacactag-cttagggctgttttgt 370  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||    
T  37561527 ttgctcggtgttttgttctttccatttaccgtttatcttgtttatgctt-gttagctcttagtgtggttttgctatacacaagtcatagg-ctgttttgt 37561624  T
Q  371 tgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  37561625 tgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatcactatcacttgctccacacatctt 37561687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 98 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 30631586 - 30631253
Alignment:
Q  98 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttg 195  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  30631586 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctatggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaaccctttg 30631487  T
Q  196 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  30631486 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgagtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-ttc 30631389  T
Q  296 ctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctct-tgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttg 394  Q
    ||||    ||| ||||||||||||||||  |||| | | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  30631388 ctttcttacttatcttgtttatgctttgttatctatatatgtgattttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtt-gcttgaaaaccatttg 30631290  T
Q  395 ttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30631289 ttctcatagattaccactatctcttgctccacacatc 30631253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 45 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 2785608 - 2785221
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  2785608 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-t 2785510  T
Q  144 ctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 241  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2785509 ctagggtttgttcatgagtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 2785410  T
Q  242 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| ||||||    
T  2785409 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 2785314  T
Q  339 ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  2785313 ttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatc 2785221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 97 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 31180394 - 31180138
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 194  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  31180394 ttttatggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgtct-tgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacccttt 31180296  T
Q  195 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31180295 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttt 31180197  T
Q  295 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta 353  Q
    | |||    ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31180196 c-tttctttcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacacta 31180138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 45 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 33791549 - 33791162
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  33791549 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-t 33791451  T
Q  144 ctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 241  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33791450 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctttcccccagat 33791351  T
Q  242 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctct-tgtgtgg 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||| || || |||||  ||||| |||  | |||| | |||||    
T  33791350 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctctatatgtgg 33791255  T
Q  339 ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  33791254 ttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatc 33791162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 431
Target Start/End: Original strand, 31396843 - 31397232
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |    
T  31396843 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggatgggaaaatgccaaagggtaga-t 31396941  T
Q  144 ctaggctttgttta--tgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 239  Q
    ||||| ||| ||    |||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31396942 ctagggttttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 31397041  T
Q  240 attaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttt-tgttctttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtg 337  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  |||| |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||    
T  31397042 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgtttgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 31397138  T
Q  338 gttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    |||||||| |||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  31397139 gttttgctttacattaggctta-ggatgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatc 31397232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 431
Target Start/End: Original strand, 31401700 - 31402089
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |    
T  31401700 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggatgggaaaatgccaaagggtaga-t 31401798  T
Q  144 ctaggctttgttta--tgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 239  Q
    ||||  ||| ||    |||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31401799 ctagagttttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccat 31401898  T
Q  240 attaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgt 336  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| ||||    
T  31401899 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgt 31401994  T
Q  337 ggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  31401995 ggttttgctttacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatc 31402089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 33768417 - 33768025
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtga--gagt-gggaaaatacc--aaagggt 138  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||   | || ||||||||| |  |||||||    
T  33768417 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattattggttcatagtgtggaggggtagggaaaataaccgaaagggt 33768318  T
Q  139 agaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccc 236  Q
    ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33768317 agg-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctcccccc 33768219  T
Q  237 cagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctct-tg 333  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||| || || || ||  ||||| |||  | |||| |     
T  33768218 cagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcctg--tatgc-ttgttagctctata 33768123  T
Q  334 tgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  33768122 tgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggtcatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatc 33768025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 97 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 38192353 - 38192064
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||| |||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| ||||    
T  38192353 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttg 38192255  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttctt 293  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |    
T  38192254 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc-t 38192157  T
Q  294 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagac 388  Q
    ||||||   |||| |||||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38192156 tcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagac 38192064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 97 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 38219578 - 38219289
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||| |||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| ||||    
T  38219578 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttg 38219480  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttctt 293  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |    
T  38219479 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc-t 38219382  T
Q  294 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagac 388  Q
    ||||||   |||| |||||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38219381 tcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctcttgtgtggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggagac 38219289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24136028 - 24135697
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| ||||    
T  24136028 ttttagggttcacattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttg 24135930  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttctt 293  Q
    |||||||||| || || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  24135929 taacactttcatcttagtgcattggatagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgtgtttgttctt 24135831  T
Q  294 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccattt 393  Q
     | |||   |||| |||||||  ||||||| | | |||  |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |    
T  24135830 ccttttctagcttatcttgtt--tgctttgtattatct--tgtggtgttgctctacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagac--tct 24135737  T
Q  394 gttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
     | ||||| ||||||||||  |  ||||||||||||||||    
T  24135736 ttactcatagattaccactcccttttgctccacacatctt 24135697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35387842 - 35387663
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||| |||||  || ||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| ||||    
T  35387842 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttattcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttg 35387744  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35387743 taacactttcatcatagtagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaattgggtcaacaatctt 35387663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 30631719 - 30631640
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30631719 caaaggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 30631640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 31180526 - 31180447
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31180526 caaaggagggaaccaaa-gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 31180447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 9353333 - 9353429
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9353333 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9353429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 36932351 - 36932447
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36932351 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 36932447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10281848 - 10281751
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10281848 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 10281751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 24136159 - 24136080
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24136159 caaaggagggaaccaaa-gggttgagtgtctttgtagaaagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 24136080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15464628 - 15464532
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15464628 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 15464532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 274
Target Start/End: Original strand, 11916972 - 11917068
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 274  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11916972 tcttgtaactcttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 11917068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14520326 - 14520230
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14520326 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattgaagagctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 14520230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Original strand, 17003970 - 17004058
Alignment:
Q  190 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||| || |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  17003970 cttttgaaatactttcatcatagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 17004058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3880396 - 3880298
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  3880396 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgcctcagattaggtcatattggacagaactgaatcaacaatcttg 3880298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 272
Target Start/End: Original strand, 12084176 - 12084269
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 272  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||||||    
T  12084176 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaat 12084269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19588843 - 19588746
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19588843 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19588746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 28832343 - 28832258
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  28832343 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaatcttg 28832258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 35387955 - 35387893
Alignment:
Q  34 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35387955 gggttgagtgtctttgtagagagggtctcttggg-ttggaaaaaacattgtaatcaccttgggt 35387893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 276
Target Start/End: Original strand, 42127423 - 42127508
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  42127423 ttgtaacactttcatcttagtggattggggggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatcttg 42127508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 4410241 - 4410301
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  4410241 tggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 4410301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 38219691 - 38219629
Alignment:
Q  34 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  38219691 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggtt-gggaaaaacattgtaaacaccttgggt 38219629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 276
Target Start/End: Original strand, 31300612 - 31300694
Alignment:
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||| |||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31300612 taacactttcatcttagtggattggagagtttctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 31300694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 15552464 - 15552524
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  15552464 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 15552524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31179431 - 31179371
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31179431 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31179371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 31542953 - 31543013
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31542953 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31543013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 31545299 - 31545359
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31545299 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31545359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 271
Target Start/End: Original strand, 27910675 - 27910729
Alignment:
Q  218 ggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  27910675 ggagagctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 27910729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 276
Target Start/End: Original strand, 24553520 - 24553604
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||||||| || || |||| ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  24553520 ttgtaacactttcatcttagtggagtggag-gctgctctctcccatagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttg 24553604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3373197 - 3373137
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  3373197 tggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 3373137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 10749919 - 10749979
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  10749919 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 10749979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15354635 - 15354575
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  15354635 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 15354575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 431
Target Start/End: Original strand, 14737403 - 14737816
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtg 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737403 caaaggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtg 14737500  T
Q  116 agagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattgga 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737501 agagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattgga 14737600  T
Q  216 ttggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtcttgttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14737601 ttggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggatcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgttt 14737699  T
Q  316 atgctttggaatctc--ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccacta 413  Q
     |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14737700 -tgctttggtatctcttttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcacta 14737798  T
Q  414 tcgcttgctccacacatc 431  Q
    || |||||||||||||||    
T  14737799 tcacttgctccacacatc 14737816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 29 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28184754 - 28184348
Alignment:
Q  29 caaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaa--cattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaa 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28184754 caaatgggttgagggtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaaaacatagtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaa 28184655  T
Q  127 ataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctg 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28184654 ataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtgttgtaaccttttgtaacactttctcatattagattggagagctg 28184555  T
Q  227 ctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc-ctttaccgcttgtcttgtttatgctttgga 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28184554 ctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttctttttaccgcttatcttgtttatgctttgga 28184456  T
Q  326 atctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagacca--tttgttctcattgattaccactatcgcttgctc 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  28184455 atctcttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttttgttctcattgattatcactatcacttgctc 28184356  T
Q  424 cacacatc 431  Q
    ||||||||    
T  28184355 cacacatc 28184348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 16 - 431
Target Start/End: Original strand, 14742263 - 14742675
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtg 115  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14742263 caaaggagggaaccaa-tgggttaagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcactttgggttttagggttcatagtgtg 14742360  T
Q  116 agagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattgga 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742361 agagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattgga 14742460  T
Q  216 ttggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtcttgttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14742461 ttggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttcttttaccgcttatcttgttt 14742559  T
Q  316 atgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactat 414  Q
     |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14742560 -tgctttgatatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtatgcttggagaccatttgttctcattgattatcactat 14742658  T
Q  415 cgcttgctccacacatc 431  Q
    | |||||||||||||||    
T  14742659 cacttgctccacacatc 14742675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 11857236 - 11856817
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11857236 tagcaaaggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatatt 11857139  T
Q  113 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagag-tcttgtaaccttttgtaacactttctcatat 211  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11857138 gtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatat 11857039  T
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtg---ttttgttctttcctttaccgcttgt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||| | |||| |||||||    
T  11857038 tggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgtttttttgttcttccttttatcgcttgt 11856940  T
Q  309 cttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgatta 407  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11856939 cttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgatta 11856841  T
Q  408 ccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  11856840 ccactatctcttgctccacacatc 11856817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Original strand, 22010520 - 22010936
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22010520 tagcaaaggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatatt 22010617  T
Q  113 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatat 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010618 gtgagagtggggaaatatcaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatat 22010717  T
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtctt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||| ||||    
T  22010718 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcgcttatctt 22010816  T
Q  312 gtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattacca 410  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010817 gttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattacca 22010915  T
Q  411 ctatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  22010916 ctatcacttgctccacacatc 22010936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 32 - 431
Target Start/End: Original strand, 28155412 - 28155810
Alignment:
Q  32 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 131  Q
    ||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155412 atggggtgtgtgcctttgatgagagtgtttcttaggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 28155510  T
Q  132 aaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctc 231  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155511 aaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctaaattcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctc 28155609  T
Q  232 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc-tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc 330  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |  | |||    
T  28155610 tcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttccatttaccgtttatcttgtttatgctt-gttagctc 28155708  T
Q  331 tt-gtgtggttttgctatacactag-cttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacac 428  Q
    || ||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28155709 ttagtgtggttttgctatacacaagtcatagg-ctgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgctctcattgattatcactatcacttgctccacac 28155807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 32 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6438743 - 6438346
Alignment:
Q  32 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 131  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438743 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 6438645  T
Q  132 aaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 230  Q
    |||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6438644 aaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctct 6438547  T
Q  231 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc-tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatct 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||  | ||    
T  6438546 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggacaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagct 6438448  T
Q  330 c-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacac 428  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6438447 ctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccattggttctcattgattaccactatcacttgctccacac 6438349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6005650 - 6005263
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  6005650 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-t 6005552  T
Q  144 ctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 241  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6005551 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 6005452  T
Q  242 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| ||||||    
T  6005451 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 6005356  T
Q  339 ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  6005355 ttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatc 6005263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 45 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 16838977 - 16838594
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  16838977 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 16838879  T
Q  144 ctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 241  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838878 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 16838779  T
Q  242 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 338  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| ||||||    
T  16838778 taagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 16838683  T
Q  339 ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccaca 427  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||    
T  16838682 ttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttgaaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccaca 16838594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 431
Target Start/End: Original strand, 33330297 - 33330686
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  33330297 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 33330395  T
Q  144 ctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 241  Q
    ||||| |||  | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33330396 ctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 33330495  T
Q  242 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttccttt--accgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||  |  | || ||||| |||||| |||  | ||||| ||||||    
T  33330496 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgtgg 33330592  T
Q  339 -ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
     |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  33330593 tttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatc 33330686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 431
Target Start/End: Original strand, 33335794 - 33336183
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  33335794 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 33335892  T
Q  144 ctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 241  Q
    ||||| |||  | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33335893 ctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 33335992  T
Q  242 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttccttt--accgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 338  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||  |  | || ||||| |||||| |||  | ||||| ||||||    
T  33335993 taggtcacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgtgg 33336089  T
Q  339 -ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
     |||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  33336090 tttttactatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagtttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatc 33336183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 97 - 433
Target Start/End: Original strand, 5674685 - 5675019
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttat-gtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttt 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||||| ||||| | ||||  ||  ||||||||| ||    
T  5674685 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaa-gcttgcaagctattgtttcttgtaaccctt 5674783  T
Q  194 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttc 291  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||    
T  5674784 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatc-tctttggtgtgtttgttc 5674882  T
Q  292 tttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggct-gttttgttgttgttggcttggagacca 390  Q
    ||| ||||   |||| | |||||  ||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||  | ||| ||      
T  5674883 ttt-ctttcttgcttatattgtt--tgctttgtattctctt-tgtggtgttgctctacactagactagggctggttttgttgttgttgcttgggaaac-- 5674976  T
Q  391 tttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5674977 tttttactctttgattaccactatcttttgctccacacatctt 5675019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Original strand, 5674554 - 5674633
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5674554 caaaggagggaaccaaa-gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 5674633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 5343527 - 5343326
Alignment:
Q  230 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaat 327  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| || || |||||  ||||| |||  |     
T  5343527 tctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttag 5343432  T
Q  328 ctctt-gtgtgg-ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctcc 424  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  5343431 ctcttagtgtggtttttgctatactttaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctcc 5343333  T
Q  425 acacatc 431  Q
    |||||||    
T  5343332 acacatc 5343326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 5757479 - 5757575
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5757479 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5757575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21356132 - 21356036
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21356132 tcttgtaactcttagtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 21356036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 276
Target Start/End: Original strand, 10077176 - 10077263
Alignment:
Q  191 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  10077176 ttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 10077263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 5572241 - 5572339
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  5572241 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 5572339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 276
Target Start/End: Original strand, 31086485 - 31086571
Alignment:
Q  192 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31086485 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccctagattagatcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 31086571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 331 - 433
Target Start/End: Original strand, 30125944 - 30126046
Alignment:
Q  331 ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacaca 429  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||    
T  30125944 ttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgtagttagcttggagaccatttg-gctcatagattatcactacctcttgctccacaca 30126042  T
Q  430 tctt 433  Q
    ||||    
T  30126043 tctt 30126046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4630040 - 4629954
Alignment:
Q  191 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4630040 ttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctcttccctagattaggtcatattggactgaactgagtcaacaatctt 4629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31979610 - 31979512
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31979610 tcttgtaactcttttgcaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 31979512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22963796 - 22963699
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  22963796 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatcttg 22963699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 23824597 - 23824694
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  23824597 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatcttg 23824694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 263
Target Start/End: Original strand, 21801344 - 21801429
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgg 263  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21801344 tcttgtaactcttttgtaacacttttatcttagtggattggagagctgctcgctcccccagattaggtcatattggactgaactgg 21801429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22709102 - 22709041
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg 253  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22709102 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattg 22709041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18232942 - 18232867
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 254  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18232942 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtgaattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattgg 18232867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 276
Target Start/End: Original strand, 5017482 - 5017567
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccata-ttggctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  5017482 ttgtaacactttcatcatagtagattggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaatcttg 5017567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 31936651 - 31936586
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  31936651 tggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 31936586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12195575 - 12195515
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  12195575 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 12195515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 5343710 - 5343628
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaa 126  Q
    ||||| ||||||||  |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||    
T  5343710 ctttgatgagagtgaatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaa 5343628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4816291 - 4816231
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  4816291 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 4816231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5273276 - 5273216
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  5273276 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5273216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19704627 - 19704567
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  19704627 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 19704567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20915416 - 20915356
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  20915416 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 20915356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26932622 - 26932562
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  26932622 tggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 26932562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 29754769 - 29754709
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  29754769 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 29754709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 33309110 - 33309170
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  33309110 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 33309170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Original strand, 9224230 - 9224646
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224230 tagcaaaggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaa-cattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 9224327  T
Q  113 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatat 211  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9224328 gtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttctaaccttttgtaacactttctcatat 9224427  T
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtctt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  9224428 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttaccgcttatctt 9224526  T
Q  312 gtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattacca 410  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224527 gttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattacca 9224625  T
Q  411 ctatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  9224626 ctatctcttgctccacacatc 9224646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Original strand, 9229017 - 9229433
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229017 tagcaaaggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaa-cattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 9229114  T
Q  113 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagag-tcttgtaaccttttgtaacactttctcatat 211  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9229115 gtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttctaaccttttgtaacactttctcatat 9229214  T
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtctt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  9229215 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttaccgcttatctt 9229313  T
Q  312 gtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattacca 410  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229314 gttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattacca 9229412  T
Q  411 ctatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  9229413 ctatctcttgctccacacatc 9229433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 32 - 431
Target Start/End: Original strand, 45347658 - 45348057
Alignment:
Q  32 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 131  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347658 atggggtgtgtgcctttgatgagagtgtctcttaggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttggggtttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 45347756  T
Q  132 aaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctaga-gtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 230  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347757 aaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagaggtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 45347856  T
Q  231 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc-tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatct 329  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  45347857 ctcccccagattaagccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttccttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatct 45347955  T
Q  330 cttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacaca 429  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45347956 cttgtgtggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgttctcatagattaccactatcacttgctccacaca 45348055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 17 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 51520715 - 51520302
Alignment:
Q  17 aaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtga 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  51520715 aaaggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatattaaga 51520618  T
Q  117 gagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattgga 215  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520617 gagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattgga 51520518  T
Q  216 ttggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtcttgttt 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||| | ||| ||||||||    
T  51520517 ttggagagctgctctctcccccagattaggccatattggcagaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgttt 51520419  T
Q  316 atgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactat 414  Q
    ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520418 atgctttgttatctctttgtatggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactat 51520319  T
Q  415 cgcttgctccacacatc 431  Q
    | |||||||||||||||    
T  51520318 ctcttgctccacacatc 51520302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 32 - 431
Target Start/End: Original strand, 45357138 - 45357536
Alignment:
Q  32 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 131  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357138 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttggggtttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 45357236  T
Q  132 aaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctc 231  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357237 aaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctc 45357336  T
Q  232 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc-tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc 330  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  45357337 tcccccagattatgccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttccttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatctc 45357435  T
Q  331 ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacat 430  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45357436 ttgtgtggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgttctcatagattaccactatcacttgctccacacat 45357535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 32 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 5732907 - 5732507
Alignment:
Q  32 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 131  Q
    ||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5732907 atggggtgtgtgcctttgatgagagtgtttcttaggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggattaagggtttatagtgtgagagtgggaaaatacc 5732809  T
Q  132 aaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctc 231  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732808 aaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctc 5732710  T
Q  232 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtg----ttttgttctttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||  |     
T  5732709 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcctttaccgtttatcttgtt--tgctttgttag 5732612  T
Q  328 ctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccac 426  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5732611 ctctttgtgtggttttactatacactagcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcattgattaccaccatcacttgctccac 5732512  T
Q  427 acatc 431  Q
    |||||    
T  5732511 acatc 5732507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 32 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 3814266 - 3813869
Alignment:
Q  32 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 131  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3814266 atggggtgtgtgtctttgatgagagtgtttcttaggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 3814168  T
Q  132 aaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctc 231  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3814167 aaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctctc 3814069  T
Q  232 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc- 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||| |||  | |||     
T  3814068 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgcatggtgttttgttc-ttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctct 3813971  T
Q  331 ttgtgtgg-ttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacaca 429  Q
    |||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3813970 ttgtgtggtttttgcgatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgctctcattgattaccactatcacttgctccacaca 3813871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 69 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18855933 - 18855572
Alignment:
Q  69 ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagct 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||    
T  18855933 ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggattgtgggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagct 18855835  T
Q  169 tga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtca 267  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855834 tgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtca 18855736  T
Q  268 acaatcttgttcggtgttttgttctttcc-tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgt 365  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18855735 acaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagctctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg- 18855638  T
Q  366 tttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18855637 tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 18855572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 145 - 431
Target Start/End: Original strand, 56146664 - 56146951
Alignment:
Q  145 taggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagatta 243  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56146664 tagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagatta 56146763  T
Q  244 ggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggtttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| | |||| | ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  56146764 ggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggtttt 56146862  T
Q  343 gctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  56146863 gctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccacacatc 56146951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 97 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24742121 - 24741786
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| |||    
T  24742121 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaacccttt 24742023  T
Q  195 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  24742022 gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-t 24741925  T
Q  294 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccat 391  Q
    ||||||   |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24741924 tcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggaaaccat 24741827  T
Q  392 ttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24741826 tt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctt 24741786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 99 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 29760821 - 29760488
Alignment:
Q  99 ttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgttt-atgtgtaaagcttgaaggcta--gagtcttgtaaccttttg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||| ||||||  |  |||||||||| ||||    
T  29760821 ttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgt-aagcttgcaggctattgtttcttgtaaccctttg 29760723  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt 294  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  29760722 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-tt 29760625  T
Q  295 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccattt 393  Q
    |||||   |||| |||||||| |||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  29760624 cctttcttgcttatcttgttt-tgctttgttctctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggttgttttgttgttgtt-gcttggaaaccattt 29760527  T
Q  394 gttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
     |  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29760526 -tgtttattgattaccactatctcttgctccacacatctt 29760488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 103
Target Start/End: Original strand, 18712589 - 18712677
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagg 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18712589 tagcaaaggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattgttatcaccttgggttttagg 18712677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 193 - 275
Target Start/End: Original strand, 28468542 - 28468625
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28468542 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt 28468625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 24742253 - 24742174
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24742253 caaaggagggaaccaaa-gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 24742174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 29760954 - 29760874
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  29760954 caaaggagggaaccaaa-gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaaacattgtaatcaccttgggt 29760874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 10047476 - 10047378
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10047476 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 10047378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 39246091 - 39245993
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  39246091 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 39245993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 36315230 - 36315327
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  36315230 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattcttg 36315327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 36329439 - 36329536
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  36329439 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattcttg 36329536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 31985635 - 31985730
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31985635 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 31985730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 16623293 - 16623391
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  16623293 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttg 16623391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 5396672 - 5396768
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5396672 tcttgtaactctttgcaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5396768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Original strand, 38152449 - 38152537
Alignment:
Q  190 cttttgtaacactttctc-atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  38152449 cttttgtaacactttcaccatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 38152537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 278
Target Start/End: Original strand, 5269204 - 5269291
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgtt 278  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  5269204 ttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttgtt 5269291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 3796519 - 3796616
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3796519 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattagagagttgctctctcccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaatctt 3796616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5143345 - 5143260
Alignment:
Q  191 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 274  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  5143345 ttttgtaacactttcatcatagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatct 5143260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5147763 - 5147678
Alignment:
Q  191 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 274  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5147763 ttttgtaacactttcatcataatggactggagagctgctccctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 5147678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 24333896 - 24333808
Alignment:
Q  190 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| || ||||||||||    
T  24333896 cttttgtaacacgttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagttaacaatcttg 24333808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3777645 - 3777550
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 274  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3777645 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcctctagattaggttatattggaccgaactgggtcaacaatct 3777550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 270
Target Start/End: Original strand, 6743425 - 6743507
Alignment:
Q  190 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaaca 270  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  6743425 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 16630680 - 16630778
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||| | ||||| ||||||||| ||||    
T  16630680 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgttctctcctccagattatgtcatattggaccgaactaggtcaacaaccttg 16630778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 276
Target Start/End: Original strand, 25862035 - 25862120
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  25862035 ttgtaacactttcatcatagtggattggagggccgctctcttccccatattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 25862120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16931849 - 16931789
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16931849 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16931789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16934203 - 16934143
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16934203 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16934143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22780433 - 22780373
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22780433 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22780373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 44599898 - 44599838
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  44599898 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 44599838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 254
Target Start/End: Original strand, 39774305 - 39774380
Alignment:
Q  181 tcttgtaacct-tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 254  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  39774305 tcttgtaacctatttgtatcactttcattttagtggattggagagctgctctatcccccagagtaggtcatattgg 39774380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 54867269 - 54867183
Alignment:
Q  191 ttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||| |||| ||||| | ||||| || |||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  54867269 ttttgtaacattttcatcatagttgattgaagggctgctctctcccc-agactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 54867183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 6765117 - 6765177
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  6765117 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 6765177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 7941596 - 7941656
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  7941596 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 7941656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18709224 - 18709164
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  18709224 tggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 18709164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22782798 - 22782738
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||| |||||||    
T  22782798 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaa 22782738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Original strand, 34885 - 35301
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34885 tagcaaaggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaa-cattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 34982  T
Q  113 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagag-tcttgtaaccttttgtaacactttctcatat 211  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34983 gtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttctaaccttttgtaacactttctcatat 35082  T
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtctt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  35083 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttaccgcttatctt 35181  T
Q  312 gtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattacca 410  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35182 gttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattacca 35280  T
Q  411 ctatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  35281 ctatctcttgctccacacatc 35301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 40)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 13 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 41398498 - 41398084
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398498 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 41398400  T
Q  113 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatatt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398399 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatatt 41398300  T
Q  213 ggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtcttg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||     ||| |||||    
T  41398299 ggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgacctgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-ttcctt-----cttatcttg 41398207  T
Q  313 tttatgctttggaatctc-ttgtgtgg--ttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttg---gcttggagaccatttgttctcattgatt 406  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41398206 tttatgctttggtatctctttgtgtggttttttgctatacactag-ttagggctgttttgttgttgttgtttgcttggagaccatatgttctcattgatt 41398108  T
Q  407 accactatcgcttgctccacacat 430  Q
    | ||||||| ||||||||||||||    
T  41398107 atcactatcacttgctccacacat 41398084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 41390843 - 41390485
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390843 tagcaaaggagggaaccaaatggattgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 41390745  T
Q  113 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatatt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390744 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatatt 41390645  T
Q  213 ggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtcttg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||     ||| |||||    
T  41390644 ggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgatctgggtcaacaatctt-ctcgatgttttgttc-ttcctt-----cttatcttg 41390552  T
Q  313 tttatgctttggaatctc-ttgtgtgg--ttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgtt 377  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41390551 tttatgctttgatatctctttgtgtggttttttgctatacactag-ttagggctgttttgttgttgtt 41390485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 32 - 431
Target Start/End: Original strand, 25444931 - 25445329
Alignment:
Q  32 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 131  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25444931 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 25445029  T
Q  132 aaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 230  Q
    |||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445030 aaagggtagc-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 25445128  T
Q  231 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc-tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatct 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| || |||  | ||    
T  25445129 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttacgc-ttgttagct 25445227  T
Q  330 c-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacac 428  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25445228 ctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcgcttgctccacac 25445326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 32 - 431
Target Start/End: Original strand, 44023716 - 44024112
Alignment:
Q  32 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 131  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44023716 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 44023814  T
Q  132 aaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 230  Q
    |||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  44023815 aaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctct 44023912  T
Q  231 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||  | |||    
T  44023913 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctttaccatttatcttgtttatgc-ttgttagctc 44024011  T
Q  331 -ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacaca 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  44024012 tttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcagttgctccacaca 44024110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 32 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 39445742 - 39445345
Alignment:
Q  32 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 131  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445742 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 39445644  T
Q  132 aaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 230  Q
    |||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39445643 aaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctct 39445546  T
Q  231 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc-tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatct 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||  | ||    
T  39445545 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagct 39445447  T
Q  330 c-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacac 428  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  39445446 ctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttcacattgattatcactatcacttgctccacac 39445348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 32 - 431
Target Start/End: Original strand, 1054854 - 1055251
Alignment:
Q  32 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 131  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1054854 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 1054952  T
Q  132 aaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 230  Q
    |||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  1054953 aaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagttgctct 1055050  T
Q  231 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc-tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatct 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||  | ||    
T  1055051 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagct 1055149  T
Q  330 c-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacac 428  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||   ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1055150 ctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtaagcttggaagacatttgttcacattgattatcactatcacttgctccacac 1055248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 97 - 433
Target Start/End: Original strand, 24787280 - 24787619
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| |||    
T  24787280 ttttagggttcatattgtgagagttgggaaacaccaaagggtagaatctaggatttgttcttgtgtaatgcttgaaggctattgtttcttgtaacccttt 24787379  T
Q  195 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  24787380 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctcccccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttcttc 24787478  T
Q  295 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg--ttttgttgttgttg--gcttggagacc 389  Q
    | |||   |||| |||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||  ||||||||||||||  ||||||| |||    
T  24787479 cttttcttgcttatcttgtt--tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacataagtctagggctgttttttgttgttgttgttgcttggaaacc 24787576  T
Q  390 atttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    |||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24787577 attt-tgctcatttattaccactatctcttgctccacacatctt 24787619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 431
Target Start/End: Original strand, 43988314 - 43988705
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |    
T  43988314 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggatgggaaaatgccaaagggtaga-t 43988412  T
Q  144 ctaggctttgttta--tgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 239  Q
    ||||| ||| ||    |||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43988413 ctagggttttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 43988512  T
Q  240 attaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttac-cgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtg 337  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||| |  | || | |  | ||||| |||  | ||||| |||||    
T  43988513 attaggccacattggctgaactgggtaaacaatcttgcttggtgttttgttcttttcttttcatggttttatcttgtatgc-ttgttagctcttagtgtg 43988611  T
Q  338 gttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  43988612 gttgtgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatc 43988705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 388
Target Start/End: Original strand, 24202686 - 24202973
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| || || ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| ||||    
T  24202686 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttg 24202784  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttctt 293  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |    
T  24202785 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc-t 24202882  T
Q  294 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagac 388  Q
    ||||||   |||| |||||||  ||||||| | |||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24202883 tcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagtttagggctgttttgttgttgtttgcttggagac 24202973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 171
Target Start/End: Original strand, 25439738 - 25439875
Alignment:
Q  32 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 131  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25439738 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 25439836  T
Q  132 aaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga 171  Q
    |||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  25439837 aaagggtag-ctctagggtttgttcatgtgtaaagcttga 25439875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Original strand, 19358760 - 19358939
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||| || || ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| ||||    
T  19358760 ttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttg 19358858  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19358859 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt 19358939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Original strand, 19361349 - 19361528
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||| || || ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| |  |||   | ||||||||| ||||    
T  19361349 ttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaaactatttttcttgtaaccctttg 19361447  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19361448 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt 19361528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Original strand, 19379989 - 19380168
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||| || || ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| |  |||   | ||||||||| ||||    
T  19379989 ttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaaactatttttcttgtaaccctttg 19380087  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19380088 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt 19380168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Original strand, 24787148 - 24787226
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttggg 96  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  24787148 caaaggagggaaccaaa-gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattataatcaccttggg 24787226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 26644898 - 26644994
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26644898 tcttgtaactctttgtaacactttcatcataatggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 26644994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Original strand, 47703946 - 47704034
Alignment:
Q  190 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47703946 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 47704034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19073025 - 19072928
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19073025 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19072928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19120915 - 19120818
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19120915 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19120818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 16124516 - 16124614
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  16124516 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 16124614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 27104372 - 27104470
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  27104372 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaatcttg 27104470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3281804 - 3281708
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3281804 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatcgtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatctt 3281708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9476348 - 9476260
Alignment:
Q  190 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9476348 cttttgtaatactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9476260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 13598485 - 13598397
Alignment:
Q  190 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13598485 cttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 13598397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 29651898 - 29651810
Alignment:
Q  190 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  29651898 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaaaatcttg 29651810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Original strand, 24202573 - 24202635
Alignment:
Q  34 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24202573 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 24202635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 37069864 - 37069770
Alignment:
Q  183 ttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37069864 ttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 37069770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 775759 - 775671
Alignment:
Q  190 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  775759 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 775671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 276
Target Start/End: Original strand, 47098837 - 47098922
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47098837 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 47098922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 13604624 - 13604720
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  13604624 tcttgtaactctttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatctt 13604720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 21536570 - 21536666
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggcca-tattggctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||  | |||||||||||||||||||    
T  21536570 tcttgtaactctttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaatctt 21536666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 379 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 41386646 - 41386594
Alignment:
Q  379 gcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41386646 gcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 41386594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 32889523 - 32889438
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  32889523 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctatcccccagactaggtcatattggaccgaactagatcaacaatcttg 32889438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 272
Target Start/End: Original strand, 47102874 - 47102935
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 272  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  47102874 tggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 47102935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 9459479 - 9459419
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9459479 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9459419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 9463306 - 9463246
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9463306 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9463246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 16226386 - 16226446
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16226386 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16226446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Original strand, 19366112 - 19366174
Alignment:
Q  34 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19366112 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttggg-ttgggaaaaatattgtaaacaccttgggt 19366174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Original strand, 19361237 - 19361298
Alignment:
Q  34 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| | |||  |||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||    
T  19361237 gggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggtt--gggaaaacattgtaaacaccttgggt 19361298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 23786058 - 23786118
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  23786058 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 23786118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 51752582 - 51752642
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  51752582 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 51752642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Original strand, 22173018 - 22173434
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 112  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22173018 tagcaaagtagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatatt 22173115  T
Q  113 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatat 211  Q
      ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173116 aggagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatat 22173215  T
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtctt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  22173216 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttaccgcttatctt 22173314  T
Q  312 gtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattacca 410  Q
     ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173315 attt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattacca 22173413  T
Q  411 ctatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  22173414 ctatctcttgctccacacatc 22173434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 32 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18656677 - 18656277
Alignment:
Q  32 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 131  Q
    ||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18656677 atggggtgtgtgcctttgatgagagtgtttcttaggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggattaagggtttatagtgtgagagtgggaaaatacc 18656579  T
Q  132 aaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctc 231  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656578 aaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatgctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctc 18656480  T
Q  232 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtg----ttttgttctttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaat 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||  |     
T  18656479 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcctttaccgtttatcttgtt--tgctttgttag 18656382  T
Q  328 ctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccac 426  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18656381 ctctttgtgtggtttttctatacactagcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcattgattaccaccatcacttgctccac 18656282  T
Q  427 acatc 431  Q
    |||||    
T  18656281 acatc 18656277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 97 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 7167425 - 7167090
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| |||    
T  7167425 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaacccttt 7167327  T
Q  195 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  7167326 gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-t 7167229  T
Q  294 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatt 392  Q
    ||||||   |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7167228 tcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgttttgttgttgtt-gcttggaaaccatt 7167130  T
Q  393 tgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    | | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7167129 t-tgctcatagattaccactatctcttgctccacacatctt 7167090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 97 - 431
Target Start/End: Original strand, 28503780 - 28504104
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28503780 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 28503879  T
Q  195 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  28503880 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctcttccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-tt 28503977  T
Q  295 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccattt 393  Q
    ||||         ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  28503978 cctt---------tcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtcaagggctgttttgttgttgtt-gcttggaaaccattt 28504067  T
Q  394 gttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
     ||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  28504068 -ttctcatagattatcactaccttttgctccacacatc 28504104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 431
Target Start/End: Original strand, 2676939 - 2677327
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  2676939 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 2677037  T
Q  144 ctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 241  Q
    ||||| |||  | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677038 ctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 2677137  T
Q  242 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttccttt--accgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||  |  | || ||||| |||||| |||  | ||||| ||||||    
T  2677138 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgtgg 2677234  T
Q  339 ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  2677235 ttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatc 2677327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 45 - 431
Target Start/End: Original strand, 2672783 - 2673171
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  2672783 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttaaggttcatagtgtgaggatgggaaaataccaaagggtaga-t 2672881  T
Q  144 ctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 241  Q
    ||||| |||  | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2672882 ctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 2672981  T
Q  242 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttccttt--accgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||  |  | || ||||| |||||| |||  | ||||| ||||||    
T  2672982 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgtgg 2673078  T
Q  339 ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  2673079 ttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttactctcatagattatctctatcacttgctccacacatc 2673171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 24968340 - 24967957
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |    
T  24968340 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggatttagggttcatagtgtgaggatgggaaagtaccaaagggtaga-t 24968242  T
Q  144 ctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 241  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  24968241 ctcgggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactctctccccaaaat 24968142  T
Q  242 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 338  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| ||||||    
T  24968141 taagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 24968046  T
Q  339 ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccaca 427  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||    
T  24968045 ttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccaca 24967957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 97 - 433
Target Start/End: Original strand, 2671502 - 2671838
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||  ||| |  ||||||| ||||| |  |||  ||  ||||||||| |||    
T  2671502 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttggtcttgtgtaa-gcttgcaatctattgtttcttgtaacccttt 2671600  T
Q  195 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  2671601 gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-t 2671698  T
Q  294 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccat 391  Q
    ||||||   |||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||| || ||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2671699 tcctttcttgcttatcttgttt-tgctttgttatctctttgtgtggtttttctctacactagactagggctgtttttgttgttgtttgcttggagaccat 2671797  T
Q  392 ttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    |||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2671798 ttg-gctcatagattaccactatctcttgctccacacatctt 2671838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8512450 - 8512061
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  |    
T  8512450 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-t 8512352  T
Q  144 ctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 241  Q
    ||||| |||  |  |||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8512351 ctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 8512252  T
Q  242 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcctttaccg-cttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtg 337  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||| ||  || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||    
T  8512251 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttcgtttatcgttttatcttg--tatgc-ttgttaactcttagtgtg 8512155  T
Q  338 gttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||| ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  8512154 gttgtgctacacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatc 8512061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 8517330 - 8516941
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  |    
T  8517330 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-t 8517232  T
Q  144 ctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 241  Q
    ||||| |||  |  |||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8517231 ctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 8517132  T
Q  242 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcctttaccg-cttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtg 337  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||| ||  || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||    
T  8517131 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttcgtttatcgttttatcttg--tatgc-ttgttaactcttagtgtg 8517035  T
Q  338 gttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||| ||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  8517034 gttgtgctacacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccacacatc 8516941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 100 - 433
Target Start/End: Original strand, 8738982 - 8739316
Alignment:
Q  100 tagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttgta 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||    
T  8738982 tagggttcatattgtgagagtggggaaatacatatgggtagaatctagggattgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgta 8739080  T
Q  198 acactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc 296  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  8739081 acactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-ttcc 8739178  T
Q  297 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtgg-ttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccattt 393  Q
    |||   |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| | || || ||  |||||| | |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  8739179 tttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggtttttgttctaaacaagtctagggcggtttttgttgttatttgcttggaaaccattt 8739277  T
Q  394 gttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    |  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8739278 g-actcatagattaccactatttcttgctccacacatctt 8739316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 100 - 433
Target Start/End: Original strand, 9091220 - 9091554
Alignment:
Q  100 tagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttgta 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||    
T  9091220 tagggttcatattgtgagagtggggaaatacatatgggtagaatctagggattgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttgta 9091318  T
Q  198 acactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc 296  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  9091319 acactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-ttcc 9091416  T
Q  297 tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtgg-ttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccattt 393  Q
    |||   |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| | || || ||  |||||| | |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  9091417 tttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggtttttgttctaaacaagtctagggcggtttttgttgttatttgcttggaaaccattt 9091515  T
Q  394 gttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    |  ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9091516 g-actcatagattaccactatttcttgctccacacatctt 9091554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 97 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 8477545 - 8477210
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtggga-aaataccaaagggtagaatctaggctttgtttat-gtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctt 192  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||| | ||||  ||  ||||||||| |    
T  8477545 ttttagggttcatattgtgagagtgggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttattgtgtaa-gcttgcaagctattgtttcttgtaaccct 8477447  T
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgtt 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  8477446 ttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgtgtttgtt 8477348  T
Q  291 ctttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggct-gttttgttgttgttggcttggagacc 389  Q
    |||| ||||   |||| |||||||  ||||||| | | |||| |||||| ||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||||||  | ||| ||     
T  8477347 cttt-ctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattatctt-tgtggtgttgttctacactagtctagggctggttttgttgttgttgcttgggaaac- 8477253  T
Q  390 atttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
     ||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8477252 -tttttactctttgattaccactatcttttgctccacacatctt 8477210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 32475717 - 32475328
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaat-accaaagggtagaa 142  Q
    ||||| ||||||||  |||| |||| || ||| ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||||||      
T  32475717 ctttgatgagagtgaatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcatcttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaatttatcaaagggtagg- 32475619  T
Q  143 tctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 241  Q
    |||||| |||  |  |||||||||||||| | |||||| |||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32475618 tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactctttgtaa-acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 32475520  T
Q  242 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| ||||||    
T  32475519 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 32475423  T
Q  339 ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
     |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  32475422 atttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctt 32475328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 32480575 - 32480186
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaat-accaaagggtagaa 142  Q
    ||||| ||||||||  |||| |||| || ||| ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||||||      
T  32480575 ctttgatgagagtgaatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcatcttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaatttatcaaagggtagg- 32480477  T
Q  143 tctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 241  Q
    |||||| |||  |  |||||||||||||| | |||||| |||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32480476 tctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactctttgtaa-acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 32480378  T
Q  242 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| ||||||    
T  32480377 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttggttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 32480281  T
Q  339 ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
     |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  32480280 atttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctt 32480186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 232
Target Start/End: Original strand, 28501613 - 28501750
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagag--tcttgtaacctttt 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28501613 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 28501712  T
Q  195 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28501713 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctct 28501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 293
Target Start/End: Original strand, 40372712 - 40372908
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| ||||    
T  40372712 ttttagggttcatattatgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttg 40372810  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 293  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40372811 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttctt 40372908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Original strand, 26928507 - 26928687
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| || || ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   |  ||||||||| |||    
T  26928507 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctattttttcttgtaacccttt 26928605  T
Q  195 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26928606 gtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt 26928687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 10207983 - 10207779
Alignment:
Q  227 ctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttccttt--accgcttgtcttgtttatgctttgg 324  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||  |  | || ||||| |||||| |||     
T  10207983 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggtttatcttg-ttatgc-ttgt 10207887  T
Q  325 aatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgct 422  Q
     | ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  10207886 tagctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgct 10207788  T
Q  423 ccacacatc 431  Q
    |||||||||    
T  10207787 ccacacatc 10207779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 32143501 - 32143321
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||| || || ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| ||||    
T  32143501 ttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttg 32143403  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  32143402 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 32143321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1306044 - 1305949
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306044 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcgtagtggattggagagctgctatctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 1305949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 7167558 - 7167478
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  7167558 caaaggagggaaccaaa-gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaaacattgtaatcaccttgggt 7167478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Original strand, 28501480 - 28501560
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28501480 caaaggagggaaccaaaagggatgagtgtctttgttgagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 28501560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Original strand, 28503647 - 28503727
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28503647 caaaggagggaaccaaaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttggg-ttgggaaaaatattgtaatcaccttgggt 28503727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Original strand, 2671370 - 2671449
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671370 caaaggagggaaccaaa-gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 2671449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Original strand, 40372580 - 40372659
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40372580 caaaggagggaaccaaa-gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 40372659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 8370477 - 8370573
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8370477 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8370573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 27974943 - 27975039
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27974943 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 27975039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 8477674 - 8477598
Alignment:
Q  19 aggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8477674 aggagggaaccaaa-gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 8477598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 97
Target Start/End: Original strand, 8738846 - 8738926
Alignment:
Q  15 gcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8738846 gcaaaggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgtagagagtatctcttggg-ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 8738926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 18552873 - 18552971
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18552873 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 18552971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Original strand, 9091085 - 9091164
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9091085 caaaggagggaaccaaa-gggttgagtgtctttgtagagagtatctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 9091164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 21711319 - 21711222
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21711319 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 21711222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27453138 - 27452958
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||| || || ||||||||  ||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| ||||    
T  27453138 ttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaaaataggaattgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttg 27453040  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  27453039 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 27452958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16264446 - 16264350
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  16264446 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 16264350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 193 - 275
Target Start/End: Original strand, 27986449 - 27986533
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27986449 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 27986533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 181 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 36029190 - 36029094
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 274  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36029190 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaatct 36029094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 272
Target Start/End: Original strand, 1736295 - 1736389
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 272  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  1736295 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 1736389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 30709780 - 30709877
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30709780 tcttgtaactcttttgtaacaatttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 30709877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 275
Target Start/End: Original strand, 33386669 - 33386753
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  33386669 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 33386753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 3715992 - 3716090
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  3715992 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 3716090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 40592772 - 40592870
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  40592772 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtcgattggagagcttctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 40592870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 48438311 - 48438213
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  48438311 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaataatcttg 48438213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 6794704 - 6794801
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  6794704 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggacctaaccgggtcaacaatcttg 6794801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26299085 - 26298987
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  26299085 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttg 26298987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 276
Target Start/End: Original strand, 1417493 - 1417578
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttct-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1417493 ttgtaacactttcttcttagtggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 1417578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25795878 - 25795781
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  25795878 tcttgtaactctttcgtaacactttcatcttagtagattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 25795781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 47923896 - 47923994
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47923896 tcttgtaactcttttgtagcactttcatcatagtagattgaagggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatcttg 47923994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 37466375 - 37466290
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  37466375 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaatcttg 37466290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 275
Target Start/End: Original strand, 39039995 - 39040079
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  39039995 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctcttccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 39040079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 40844748 - 40844651
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  40844748 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggatttgagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgaatcaacaatcttg 40844651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 276
Target Start/End: Original strand, 3328359 - 3328444
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3328359 ttgtaacactttcatcttagtggattgaagggctgctctctcctctagattaggtcatattggaatgaactgggtcaacaatcttg 3328444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Original strand, 4386947 - 4387014
Alignment:
Q  209 tattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  || |||||||| |||||||||    
T  4386947 tattggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatactgaactaaactgggtaaacaatctt 4387014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 24695154 - 24695252
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||| ||| | |||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  24695154 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagcggattagagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 24695252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 1306239 - 1306179
Alignment:
Q  36 gttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||| | |||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1306239 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggtt-gggaaaaacattgtaaacaccttgggt 1306179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 38210569 - 38210629
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  38210569 tggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 38210629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 365 - 429
Target Start/End: Original strand, 40372980 - 40373043
Alignment:
Q  365 ttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacaca 429  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40372980 ttttgatgttgtttgcttggaaaccattt-tgcccattgattaccactatctcttgctccacaca 40373043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 50494198 - 50494258
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  50494198 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 50494258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 53894119 - 53894055
Alignment:
Q  208 atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  53894119 atattggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 53894055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 254
Target Start/End: Original strand, 3323693 - 3323755
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 254  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3323693 ttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgttctctctcccagattaggtcatattgg 3323755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 458483 - 458543
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  458483 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaa 458543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6063504 - 6063444
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||| ||||    
T  6063504 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaa 6063444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10621588 - 10621528
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  10621588 tggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaa 10621528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 228 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 39153405 - 39153357
Alignment:
Q  228 tctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  39153405 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaatctt 39153357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 48)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 13 - 431
Target Start/End: Original strand, 7289749 - 7290166
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7289749 tagcaaaggagggaaccaa-tgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatatt 7289846  T
Q  113 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttgtaacactttctcatat 211  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289847 gtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatatagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttgtaacactttctcatat 7289946  T
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtctt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||| | ||| ||||    
T  7289947 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccttttatcacttatctt 7290045  T
Q  312 gtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattacca 410  Q
    ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7290046 gtttatggtttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgtttggagaccatttgttctcattgattacca 7290145  T
Q  411 ctatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  7290146 ctatctcttgctccacacatc 7290166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 32 - 431
Target Start/End: Original strand, 25328120 - 25328517
Alignment:
Q  32 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 131  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||    
T  25328120 atgggttgtgtgtctttgatgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacacc 25328218  T
Q  132 aaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctc 231  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328219 aaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctc 25328318  T
Q  232 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-tttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||| ||||| |||||    
T  25328319 tcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttttcctttaccgtttatctcgtttatgttttggtatctc 25328417  T
Q  331 ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacat 430  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  25328418 ttgtgtggttttgctatacactag-ttagggttgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccgcacat 25328516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 32 - 433
Target Start/End: Original strand, 39784665 - 39785065
Alignment:
Q  32 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 131  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39784665 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtctcttaggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 39784763  T
Q  132 aaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 230  Q
    |||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39784764 aaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctct 39784861  T
Q  231 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttccttt-accgcttgtcttgtttatgctttggaatct 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  39784862 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgcttatcttgtttgtgctttggaatct 39784961  T
Q  330 cttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacaca 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  39784962 cttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttattggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacaca 39785061  T
Q  430 tctt 433  Q
    ||||    
T  39785062 tctt 39785065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 97 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 6311477 - 6311143
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 194  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6311477 ttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgtct-tgtgtaaagcttgaaggctagagtttcttgtaacctttt 6311379  T
Q  195 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  6311378 gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-tt 6311281  T
Q  295 cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccattt 393  Q
    |||||   |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6311280 cctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctcttagtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggaaaccattt 6311181  T
Q  394 gttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6311180 gttctcattgattaccactatcacttgctccacacatc 6311143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 97 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 36979558 - 36979223
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| |||    
T  36979558 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaacccttt 36979460  T
Q  195 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  36979459 gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-t 36979362  T
Q  294 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccat 391  Q
    ||||||   |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  36979361 tcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggaaaccat 36979264  T
Q  392 ttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36979263 tt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctt 36979223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 35745624 - 35745237
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  35745624 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgagggtgggaaaataccaaagggtagg-t 35745526  T
Q  144 ctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 241  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35745525 ctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 35745426  T
Q  242 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttt--cctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| ||||||    
T  35745425 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcttttccttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 35745330  T
Q  339 ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  35745329 ttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatc 35745237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 98 - 433
Target Start/End: Original strand, 33037724 - 33038058
Alignment:
Q  98 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttttg 195  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| ||||    
T  33037724 tttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctttg 33037822  T
Q  196 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttc 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  33037823 taacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc-ttc 33037920  T
Q  296 ctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtt--ttgttgttgttggcttggagaccatt 392  Q
     |||   |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33037921 ttttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttattgttgttgtt-gcttggaaaccatt 33038018  T
Q  393 tgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    | |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33038019 t-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctt 33038058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 97 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 30655827 - 30655486
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| |||    
T  30655827 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaacccttt 30655729  T
Q  195 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtg----ttttgt 289  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    ||||||    
T  30655728 gtaacactttcatcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttttttgt 30655630  T
Q  290 tctttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctct-tgtgtggttttgctatacactagcttagggctg--ttttgttgttgttggcttggag 386  Q
    || |||||||   |||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  30655629 tc-ttcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctatgtgtggttttgctctacactagtctagggctgttttttgttgttgtt-gcttggaa 30655532  T
Q  387 accatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30655531 accattt-tgttcattgattaccactatctcttgctccacacatctt 30655486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 97 - 433
Target Start/End: Original strand, 4759991 - 4760327
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacctttt 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| |||    
T  4759991 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaacccttt 4760089  T
Q  195 gtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctt 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |    
T  4760090 gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-gatgttttgttc-t 4760187  T
Q  294 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagaccat 391  Q
    ||||||   |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4760188 tcctttcttgcttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt-gcttggaaaccat 4760286  T
Q  392 ttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    || | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4760287 tt-tgctcattgattaccactatctctagctccacacatctt 4760327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 97 - 433
Target Start/End: Original strand, 18853083 - 18853420
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacc-ttt 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||    
T  18853083 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtaaaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaatgctattgtttcttgtaacccttt 18853181  T
Q  194 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttct 292  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  18853182 tgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc- 18853279  T
Q  293 ttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggc-tgttttgttgttgttggcttggagacca 390  Q
    |||||||   |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || || ||  |||||| | |||| |||||||| ||||||| ||||    
T  18853280 ttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggcgtttttttttgttgtttgcttggaaacca 18853378  T
Q  391 tttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18853379 tttg-actcatagattaccactatctcttgctccacacatctt 18853420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 97 - 433
Target Start/End: Original strand, 18870477 - 18870811
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaacc-ttt 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||  ||  ||||||||| |||    
T  18870477 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaa-gcttgaatgctattgtttcttgtaacccttt 18870575  T
Q  194 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttct 292  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  18870576 tgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggatgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc- 18870673  T
Q  293 ttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccat 391  Q
    |||||||   |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || || ||  |||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  18870674 ttcctttcttgcttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctaaacaagtctagggc-gtttt-ttgttgtttgcttggaaaccat 18870770  T
Q  392 ttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    ||   ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18870771 tt-aactcatagattaccattatctcttgctccacacatctt 18870811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 45 - 433
Target Start/End: Original strand, 10684116 - 10684506
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  |    
T  10684116 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-t 10684214  T
Q  144 ctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 241  Q
    ||||| |||  |  |||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684215 ctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 10684314  T
Q  242 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| ||||||    
T  10684315 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 10684411  T
Q  339 ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
     |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10684412 atttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctt 10684506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 97 - 433
Target Start/End: Original strand, 10689058 - 10689394
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaa-gggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt--cttgtaaccttt 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| | || | ||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||| |     
T  10689058 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaa-gcttgaaggctattgtttcttgtaaccctc 10689156  T
Q  194 tgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttct 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  10689157 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttc- 10689254  T
Q  293 ttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctc-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-ttttgttgttgttggcttggagacca 390  Q
    |||||||    ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10689255 ttcctttcttacttatcttgttt-tgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactacactagggttgtttttgttgttgtt-gcttggaaacca 10689352  T
Q  391 tttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    || |  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10689353 ttag-actcatagattaccactatctcttgctccacacatctt 10689394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Original strand, 1261871 - 1262050
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| || || ||||||||||||||  ||||   ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| ||||    
T  1261871 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgtacttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttg 1261969  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1261970 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggttgaactgggtcaacaatctt 1262050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26287985 - 26287902
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26287985 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 26287902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26301242 - 26301159
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26301242 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 26301159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26313236 - 26313153
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313236 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 26313153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Original strand, 31071146 - 31071326
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||| |||||  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| ||||    
T  31071146 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttg 31071244  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  31071245 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaatctt 31071326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 6311614 - 6311532
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311614 tagcaaaggagggaaccaaa-gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 6311532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Original strand, 18870345 - 18870424
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18870345 caaaggagggaaccaaa-gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 18870424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 30655959 - 30655880
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655959 caaaggagggaaccaaa-gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 30655880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Original strand, 10688924 - 10689003
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10688924 caaaggagggaaccaaa-gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttggg-ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 10689003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Original strand, 18852951 - 18853030
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18852951 caaaggagggaaccaaa-gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttggg-ttgggaaaaatattgtaatcaccttgggt 18853030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 109
Target Start/End: Original strand, 25327994 - 25328070
Alignment:
Q  32 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcat 109  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25327994 atgggttgtgtgtctttgatgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcat 25328070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Original strand, 26403240 - 26403328
Alignment:
Q  190 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26403240 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 26403328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Original strand, 33037592 - 33037671
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33037592 caaaggagggaaccaaa-gggttgagtgtcttcgtagagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 33037671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4456124 - 4456028
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  4456124 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggaccgaaccgggtcagcaatctt 4456028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 97
Target Start/End: Original strand, 4759857 - 4759938
Alignment:
Q  15 gcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  4759857 gcaaaggaggtaaccaaa-gggttgagtgtctttgtagagagagtctcttgggttgggaaaaaacattgtaatcaccttgggt 4759938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7412437 - 7412344
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 272  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  7412437 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 7412344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 19175755 - 19175851
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  19175755 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 19175851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 23799577 - 23799675
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23799577 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 23799675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 276
Target Start/End: Original strand, 4696609 - 4696694
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggct-gaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  4696609 ttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatcttg 4696694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Original strand, 1261758 - 1261820
Alignment:
Q  34 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1261758 gggttgagtgtctttgtagagagggtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 1261820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Original strand, 5702483 - 5702581
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5702483 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 5702581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6127318 - 6127224
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 272  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  6127318 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaat 6127224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 273
Target Start/End: Original strand, 9765852 - 9765914
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatc 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  9765852 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc 9765914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 36979689 - 36979611
Alignment:
Q  16 caaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  36979689 caaagaagggaaccaaa-gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttaggtt--gggaaaacattgtaatcaccttgggt 36979611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 276
Target Start/End: Original strand, 19752407 - 19752492
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  19752407 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 19752492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 97
Target Start/End: Original strand, 31071035 - 31071095
Alignment:
Q  36 gttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||| | |||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31071035 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggtt-gggaaaaacattgtaaacaccttgggt 31071095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 43079877 - 43079937
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  43079877 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 43079937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 43082248 - 43082308
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  43082248 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 43082308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6813750 - 6813683
Alignment:
Q  209 tattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  6813750 tattggattggagagctgctctctcccctagtgtaggttatattggaccgaactgggttaacaatctt 6813683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 26288183 - 26288121
Alignment:
Q  34 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26288183 gggttgaatgtctttgtagagagaatctcttgagtt-gggaaaaacattgtaaacaccttgggt 26288121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 26301440 - 26301378
Alignment:
Q  34 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26301440 gggttgaatgtctttgtagagagaatctcttgagtt-gggaaaaacattgtaaacaccttgggt 26301378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 26313434 - 26313372
Alignment:
Q  34 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26313434 gggttgaatgtctttgtagagagaatctcttgagtt-gggaaaaacattgtaaacaccttgggt 26313372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 7412629 - 7412569
Alignment:
Q  34 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||    
T  7412629 gggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggt 7412569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 245
Target Start/End: Original strand, 18810982 - 18811015
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattagg 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18810982 tggattggagggctgctctctcccccagattagg 18811015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 44721118 - 44721178
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  44721118 tggattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 44721178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 3)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 69 - 431
Target Start/End: Original strand, 9521 - 9879
Alignment:
Q  69 ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagct 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  9521 ttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagct 9619  T
Q  169 tgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaa 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9620 tgaaggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaa 9719  T
Q  269 caatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgtttt 368  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9720 caatctt-ctcggtgttttgttc-ttcctttcttgcttatcttgtttatgc-ttgttagctcttgtgtggttttgctatatactagcttagggctgtttt 9816  T
Q  369 gttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9817 gttgttgtttggttggagaccatttgctctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 9879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Original strand, 3671 - 3845
Alignment:
Q  13 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3671 tagcaaaggagggaaccaaatgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttaggttagg-aaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagt 3769  T
Q  113 gtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaac 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3770 gtgagagtgggaaaataccaaagggtag-atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaac 3845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 333 - 412
Target Start/End: Original strand, 28 - 107
Alignment:
Q  333 gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccact 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28 gtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgtttacttggagaccatttgctctcattgattatcact 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 32 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 605 - 206
Alignment:
Q  32 atgggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 131  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  605 atggggtgtgtgcctttgatgagagagtttcttaggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggattttgggttcatagtgtgagagtgggaaaatacc 507  T
Q  132 aaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaaccttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctct 230  Q
    |||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  506 aaagggtagt-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaaccttttgtaacactt-cacatattggattggagagctgctct 409  T
Q  231 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcc-tttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatct 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||  | ||    
T  408 ctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccgtttatcttgtttatgc-ttgttagct 310  T
Q  330 c-ttgtgtggttttgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacac 428  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  309 ctttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcaccatcacttgctccacac 211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 45 - 431
Target Start/End: Original strand, 148808 - 149195
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |    
T  148808 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtaga-t 148906  T
Q  144 cta-ggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaga 240  Q
    ||| || ||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  148907 ctatggttttgtct-tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactctctcccccaga 149005  T
Q  241 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtg 337  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||    
T  149006 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 149101  T
Q  338 gttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  149102 gttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatc 149195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 45 - 431
Target Start/End: Original strand, 2103 - 2490
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |    
T  2103 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtaga-t 2201  T
Q  144 cta-ggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaga 240  Q
    ||| || ||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2202 ctatggttttgtct-tgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactctctcccccaga 2300  T
Q  241 ttaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtg 337  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||    
T  2301 ttaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcctttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtg 2396  T
Q  338 gttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  2397 gttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatggattatctttatcacttgctccacacatc 2490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 45 - 433
Target Start/End: Original strand, 14161 - 14551
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||  |    
T  14161 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtagg-t 14259  T
Q  144 ctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 241  Q
    ||||| |||  |  |||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14260 ctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 14359  T
Q  242 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| ||||||    
T  14360 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 14456  T
Q  339 ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
     |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14457 atttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctccacacatctt 14551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 431
Target Start/End: Original strand, 19017 - 19404
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaat 143  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |    
T  19017 ctttgatgagagtgtttcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttggaattatgggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtaga-t 19115  T
Q  144 ctaggctttgtttatgtgtaaagcttga-aggctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 241  Q
    ||||| |||  |  |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19116 ctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacactcacatattgtattggagagctgctctctcccccagat 19215  T
Q  242 taggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtgg 338  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| |||| || || |||||  ||||| |||  | ||||| ||||||    
T  19216 taggccacaatggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtg-tttgttcgttttcttttatcgtttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtgg 19311  T
Q  339 ttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  19312 ttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccacacatc 19404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 97 - 388
Target Start/End: Original strand, 17869 - 18157
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||| ||| |  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| ||||    
T  17869 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttg 17967  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgt-tttgttctt 293  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |    
T  17968 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-tttggtgtgtttgttc-t 18065  T
Q  294 tcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctcttgtgtggttttgctatacactagcttagggctg--ttttgttgttgttggcttggagac 388  Q
    ||||||   |||| |||||||  ||||||| | |||||  |||||| ||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  18066 tcctttcttgcttatcttgtt--tgctttgtattctct--tgtggtgttgctctacactagtctagggctggtttttgttgttgtt-gcttggagac 18157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 275
Target Start/End: Original strand, 23962 - 24141
Alignment:
Q  97 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctaggctttgtttatgtgtaaagcttgaaggctagagt-cttgtaaccttttg 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||| ||| |  |||||  ||||||| ||||| | ||||   | ||||||||| ||||    
T  23962 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaa-gcttgcaagctatttttcttgtaaccctttg 24060  T
Q  196 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24061 taacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 24141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Original strand, 17756 - 17818
Alignment:
Q  34 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17756 gggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 17818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 97
Target Start/End: Original strand, 23849 - 23911
Alignment:
Q  34 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 97  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23849 gggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 23911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 207 - 433
Target Start/End: Original strand, 181980 - 182206
Alignment:
Q  207 catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc--tttcctttaccgc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| ||     
T  181980 catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttcttttatcgt 182079  T
Q  305 ttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttg-ttggcttggagaccatttgttctcat 401  Q
    || |||||  ||||| |||  | ||||| |||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||  |||||    
T  182080 ttatcttg--tatgc-ttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggctta-ggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcat 182174  T
Q  402 tgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
     ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  182175 agattacctctatctcttgctccacacatctt 182206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 140
Target Start/End: Original strand, 176829 - 176925
Alignment:
Q  45 ctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaa-aacattgtaatcaccttgggttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtag 140  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  176829 ctttgatgagagtgtatcttaggttgggaaaacaacattgtaatcaccttgggattatgggttcatagtgtgaggttgggaaattaccaaagggtag 176925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 243 - 433
Target Start/End: Original strand, 300 - 489
Alignment:
Q  243 aggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttcctttaccgcttgtcttgtttatgctttggaatctctt-gtgtggttt 341  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||   |||| |||||||| ||||||   ||||||| |||||||||    
T  300 aggccatattggctgaactaggtcaacaatcttctt-ggtgttttgttctttc-tttctagcttatcttgttt-tgctttattatctctttgtgtggttt 396  T
Q  342 tgctatacactagcttagggctgttttgttgttgttg--gcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    ||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  397 tgctcctcactagtttagggctgtttt-ttgttgttgttgcttggaaaccatttttgctcatagattaccactatctcttgctccacacatctt 489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 8420 - 8516
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8420 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 22343 - 22403
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22343 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 24618 - 24678
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  24618 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 24678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 181 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 85779 - 85684
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatct 274  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  85779 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatggtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatct 85684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 43962 - 44058
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  43962 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 44058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 36833 - 36929
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  36833 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtgggttggcgagctgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 36929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 5770 - 5682
Alignment:
Q  190 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5770 cttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 5682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2579 - 2491
Alignment:
Q  190 cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  2579 cttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaatcttg 2491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 133281 - 133377
Alignment:
Q  181 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  133281 tcttgtaactctttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatctt 133377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 10826 - 10728
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 276  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  10826 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttg 10728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 379 - 431
Target Start/End: Original strand, 34136 - 34188
Alignment:
Q  379 gcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34136 gcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccacacatc 34188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 45337 - 45253
Alignment:
Q  193 ttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattg-gctgaactgggtcaacaatctt 275  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  45337 ttgtaacgctttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaacaatctt 45253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17360 - 17266
Alignment:
Q  181 tcttgtaac-cttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaat 272  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| |||||||  | ||||||||||||||||    
T  17360 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcataatggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaat 17266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 269 - 329
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  269 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 13233 - 13192
Alignment:
Q  392 ttgttctcattgattaccactatcgcttgctccacacatctt 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  13233 ttgttctcattgattatcactatcacttgctccacatatctt 13192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11533 - 11500
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattagg 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11533 tggattggagagctgctctctcccccagactagg 11500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 69352 - 69292
Alignment:
Q  212 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg-ctgaactgggtcaacaa 271  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  69352 tggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 69292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University