View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17372_high_3 (Length: 488)

Name: NF17372_high_3
Description: NF17372
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17372_high_3
NF17372_high_3
[»] chr7 (13 HSPs)
chr7 (1-476)||(2692826-2693301)
chr7 (1-396)||(2103687-2104082)
chr7 (4-408)||(2064581-2064985)
chr7 (4-406)||(2124763-2125165)
chr7 (1-412)||(2137274-2137685)
chr7 (5-406)||(2097394-2097795)
chr7 (4-408)||(2071689-2072093)
chr7 (4-406)||(2246709-2247111)
chr7 (4-413)||(2134160-2134569)
chr7 (42-408)||(2121409-2121775)
chr7 (4-412)||(2055291-2055699)
chr7 (5-403)||(1697839-1698237)
chr7 (242-297)||(2119670-2119725)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 464; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 2693301 - 2692826
Alignment:
Q  1 cagctgatccccacacagaccttggttaccctcaaatgaatcacctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagtttattaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2693301 cagctgatccccacacagaccttggttaccctcaaatgaatcacctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctctgagtttattaaag 2693202  T
Q  101 gacacatttaagtactccaaaaaggtgatttcagccaactgttgtggaattttcccagagagactgttgtgagaaagatctagtgtttcaaggtttgaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2693201 gacacatttaagtactccaaaaaggtgatttcagccaactgttgtggaattttcccagagagactgttgtgagaaagatctagtgtttcaaggtttgaaa 2693102  T
Q  201 gcttccctacggaagatggaatgctgccaataaggaggttatttgacaagttgagcaaaacaagacccttcaagtcgcctatgacttgtggtatctctcc 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2693101 gcttccctactgaagatggaatgctgccaataaggaggttatttgacaagttgagcaaaacaagacccttcaagtcgcctatgacttgtggtatctctcc 2693002  T
Q  301 accgattttgttgcttgaaatatcaatggctatcaagctgtaaaactcttgaagtttctcataaaccctagtcaaccctttgtttgacattgtgaatgaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2693001 accgattttgttgcttgaaatatcaatggctatcaagctgtaaaactcttgaagtttctcataaaccctagtcaaccctttgtttgacattgtgaatgaa 2692902  T
Q  401 taaaacttatctgcagccgcatgatactctcctgaattgttcgaccccgagtataataacagtttttgctcatatt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2692901 taaaacttatctgcagctgcatgatactctcctgaattgttcgaccccgagtataataacagtttttgctcatatt 2692826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 2103687 - 2104082
Alignment:
Q  1 cagctgatccccacacagaccttggttaccctcaaatgaatcacctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagtttattaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2103687 cagctgatccccacacagaccttggttaccctcaaatgaatcacctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaag 2103786  T
Q  101 gacacatttaagtactccaaaaaggtgatttcagccaactgttgtggaattttcccagagagactgttgtgagaaagatctagtgtttcaaggtttgaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2103787 gacacatttaagtactccaaaaaggtgatttctgccaactgttcgggaattttccctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaa 2103886  T
Q  201 gcttccctacggaagatggaatgctgccaataaggaggttatttgacaagttgagcaaaacaagacccttcaagtcgcctatgacttgtggtatctctcc 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||    
T  2103887 gcttccctaaggaagatggaatgctgccaataagattgttattcgacaagttgagcaaaacaagacccttcaactcgtctatgatttgtggtatttctcc 2103986  T
Q  301 accgattttgttgcttgaaatatcaatggctatcaagctgtaaaactcttgaagtttctcataaaccctagtcaaccctttgtttgacattgtgaa 396  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||||    
T  2103987 actgattttgttgcttgaaatatcaatggctatcaagctgtaaaactcttgaagcttctcataaaccctgtccatccctttgcttgacattgtgaa 2104082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 4 - 408
Target Start/End: Original strand, 2064581 - 2064985
Alignment:
Q  4 ctgatccccacacagaccttggttaccctcaaatgaatcacctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagtttattaaaggac 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  2064581 ctgatccccacacagaccttgattaccctcaaatgaatcacctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaatgac 2064680  T
Q  104 acatttaagtactccaaaaaggtgatttcagccaactgttgtggaattttcccagagagactgttgtgagaaagatctagtgtttcaaggtttgaaagct 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2064681 acatttaagaactccaaaaaggtgatttcagccaactgttgaggaattttccctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagct 2064780  T
Q  204 tccctacggaagatggaatgctgccaataaggaggttatttgacaagttgagcaaaacaagacccttcaagtcgcctatgacttgtggtatctctccacc 303  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| |     
T  2064781 tccctaaggaagatggaatgctgccaataagcatattatttgacaagtttagcaaaacaagaccctttaactcgcctatcatttgtggtatctctccgct 2064880  T
Q  304 gattttgttgcttgaaatatcaatggctatcaagctgtaaaactcttgaagtttctcataaaccctagtcaaccctttgtttgacattgtgaatgaataa 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  2064881 gattttgttgcttgaaatatcaatggctatcaagctgtaaaatttttgaagcttctcataaaccctggccagtcctttgtttgacattgtgaaagaataa 2064980  T
Q  404 aactt 408  Q
    |||||    
T  2064981 aactt 2064985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 4 - 406
Target Start/End: Original strand, 2124763 - 2125165
Alignment:
Q  4 ctgatccccacacagaccttggttaccctcaaatgaatcacctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagtttattaaaggac 103  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  2124763 ctgatccccatacaaaccttggttaccctcaaatgaatcatctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaaggac 2124862  T
Q  104 acatttaagtactccaaaaaggtgatttcagccaactgttgtggaattttcccagagagactgttgtgagaaagatctagtgtttcaaggtttgaaagct 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  2124863 acatttaagtactccaaaaaggtgatttctgccaactgttggggaatttttcctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagat 2124962  T
Q  204 tccctacggaagatggaatgctgccaataaggaggttatttgacaagttgagcaaaacaagacccttcaagtcgcctatgacttgtggtatctctccacc 303  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||     
T  2124963 tccctaaggaagatggtatgctgccaataaggtggttatttgacaagttgagtaaaacaagtcccttcaactcgcctataacatgtggtatctctccact 2125062  T
Q  304 gattttgttgcttgaaatatcaatggctatcaagctgtaaaactcttgaagtttctcataaaccctagtcaaccctttgtttgacattgtgaatgaataa 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2125063 gattttgttgcttgaaatatcaatggctattaagctgtagaaattttgaagcttctcataaacccttgcaaaccctttgtttgacattgtgaatgtataa 2125162  T
Q  404 aac 406  Q
    |||    
T  2125163 aac 2125165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Original strand, 2137274 - 2137685
Alignment:
Q  1 cagctgatccccacacagaccttggttaccctcaaatgaatcacctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagtttattaaag 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2137274 cagctgatccccacacaatccttggttaccctcaaatgaatcacttttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaag 2137373  T
Q  101 gacacatttaagtactccaaaaaggtgatttcagccaactgttgtggaattttcccagagagactgttgtgagaaagatctagtgtttcaaggtttgaaa 200  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2137374 gacacatttaagaacgccaaaaaggtgatttctgccaactgttggggaatttttcctgaaagactgttgcgagaaagatctagtgcttcaaggttcgaaa 2137473  T
Q  201 gcttccctacggaagatggaatgctgccaataaggaggttatttgacaagttgagcaaaacaagacccttcaagtcgcctatgacttgtggtatctctcc 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  2137474 gcttccctaaggaagatggaatgctgccaataaggtggttatttgacaagttgagcaaaacaagacccttcaactcgccaatcacttgtggtatctctcc 2137573  T
Q  301 accgattttgttgcttgaaatatcaatggctatcaagctgtaaaactcttgaagtttctcataaaccctagtcaaccctttgtttgacattgtgaatgaa 400  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |  ||||| |  |  |||||| | | || |||||| |||||||||||||| |||    
T  2137574 actgattttgttgcttgaaatatcaatggctattaagcggtaaaaattctgaaggtgattgtaaaccatggccagccctttatttgacattgtgaacgaa 2137673  T
Q  401 taaaacttatct 412  Q
    ||||||||||||    
T  2137674 taaaacttatct 2137685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 5 - 406
Target Start/End: Original strand, 2097394 - 2097795
Alignment:
Q  5 tgatccccacacagaccttggttaccctcaaatgaatcacctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagtttattaaaggaca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2097394 tgatccccacacagaccttggttaccctcaaatgaatcatctttgaatgtggaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaaggaca 2097493  T
Q  105 catttaagtactccaaaaaggtgatttcagccaactgttgtggaattttcccagagagactgttgtgagaaagatctagtgtttcaaggtttgaaagctt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2097494 catttaagtactccaaaaaggtgatttctgccaactgtttgggaatttttcctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaagttttgaaagctt 2097593  T
Q  205 ccctacggaagatggaatgctgccaataaggaggttatttgacaagttgagcaaaacaagacccttcaagtcgcctatgacttgtggtatctctccaccg 304  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  2097594 ccctaaggaagatggtatgcttccaataagcatattattcgacaagttgagcaaaacaagaccctttaactcgcctatcacttgtggtatctctccactg 2097693  T
Q  305 attttgttgcttgaaatatcaatggctatcaagctgtaaaactcttgaagtttctcataaaccctagtcaaccctttgtttgacattgtgaatgaataaa 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2097694 attttgttgcttgaaatatcaatggctattaagctgtagaaattctgaaggttctcataaacccttgaaaaccctttgtttgacaatgtgaatgtataaa 2097793  T
Q  405 ac 406  Q
    ||    
T  2097794 ac 2097795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 4 - 408
Target Start/End: Original strand, 2071689 - 2072093
Alignment:
Q  4 ctgatccccacacagaccttggttaccctcaaatgaatcacctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagtttattaaaggac 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  2071689 ctgatccccacacaaaccttggttaccctcaaatgaatcacctttgaacgtagaaaactgattattttgtggtattggacccgtgagattgttaaaggac 2071788  T
Q  104 acatttaagtactccaaaaaggtgatttcagccaactgttgtggaattttcccagagagactgttgtgagaaagatctagtgtttcaaggtttgaaagct 203  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||  |||||||||||  | ||||||||| |||||||    
T  2071789 acatttaagaattccaaaaaggtgatttgtgccaactgttggggaattttccctgaaagactgttgacagaaagatctaacgcttcaaggttagaaagct 2071888  T
Q  204 tccctacggaagatggaatgctgccaataaggaggttatttgacaagttgagcaaaacaagacccttcaagtcgcctatgacttgtggtatctctccacc 303  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |     
T  2071889 tccctaaggaagatggtatgcttccaataaggtggttatttgacaagttgagcaaaacaagacccttcaactcgcctatcacttgtggtatctctccgct 2071988  T
Q  304 gattttgttgcttgaaatatcaatggctatcaagctgtaaaactcttgaagtttctcataaaccctagtcaaccctttgtttgacattgtgaatgaataa 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||| | ||  |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2071989 gattttgttgcttgaaatatcaatggctatcaagctgtaaaatttttgaagcttcacataaaccctggccagtcctttgtttgacatagtgaaagaataa 2072088  T
Q  404 aactt 408  Q
    |||||    
T  2072089 aactt 2072093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 4 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 2247111 - 2246709
Alignment:
Q  4 ctgatccccacacagaccttggttaccctcaaatgaatcacctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagtttattaaaggac 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  2247111 ctgatccccacacaaaccttggttaccctcaaatgaatcacctttgaatgtagaaaactgattatgttctggtataggacctgtgagattgttaaaagac 2247012  T
Q  104 acatttaagtactccaaaaaggtgatttcagccaactgttgtggaattttcccagagagactgttgtgagaaagatctagtgtttcaaggtttgaaagct 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2247011 acatttaagtattccaaaaaggtgatttgtgccaactgttggggtattttccctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagct 2246912  T
Q  204 tccctacggaagatggaatgctgccaataaggaggttatttgacaagttgagcaaaacaagacccttcaagtcgcctatgacttgtggtatctctccacc 303  Q
    || | |  |||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||     
T  2246911 tcgcaattgaagatggaatgctgccaataagattgttattcgacaagttgagcaaaacaagacccttcaactcacctatgacttgtggtatttctccact 2246812  T
Q  304 gattttgttgcttgaaatatcaatggctatcaagctgtaaaactcttgaagtttctcataaaccctagtcaaccctttgtttgacattgtgaatgaataa 403  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||| || ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2246811 gattttattgcttgaaatatcaatggctattaaactgtaaaatttttgaagcttttcataaaccctggccaatcctttgtttgacattgtgaatgaataa 2246712  T
Q  404 aac 406  Q
    |||    
T  2246711 aac 2246709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 4 - 413
Target Start/End: Original strand, 2134160 - 2134569
Alignment:
Q  4 ctgatccccacacagaccttggttaccctcaaatgaatcacctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagtttattaaaggac 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  2134160 ctgatccccacacagaccttgattaccctcaaatgaatcacctttgaacgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagattgttaaaggac 2134259  T
Q  104 acatttaagtactccaaaaaggtgatttcagccaactgttgtggaattttcccagagagactgttgtgagaaagatctagtgtttcaaggtttgaaagct 203  Q
    | ||||||| ||| ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2134260 aaatttaagaactgcaaaaaggtaatttgtgccaactgttggggaattttccctgaaagactgttgacagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagct 2134359  T
Q  204 tccctacggaagatggaatgctgccaataaggaggttatttgacaagttgagcaaaacaagacccttcaagtcgcctatgacttgtggtatctctccacc 303  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||     
T  2134360 tccctaaggaagattgaatgctgccaataaggaggttattagagaagttgagcaaaacaaggcccttcaactcgcctatgccttgtggtatttctccact 2134459  T
Q  304 gattttgttgcttgaaatatcaatggctatcaagctgtaaaactcttgaagtttctcataaaccctagtcaaccctttgtttgacattgtgaatgaataa 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | |||||| || |  |||||| | | || ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  2134460 gattttgttgcttgaaatatcaatggctattaagttgtaaattttttgaaggttattgtaaaccatggccacccctttgtttgacattgtgagcgaataa 2134559  T
Q  404 aacttatctg 413  Q
    ||||| ||||    
T  2134560 aacttttctg 2134569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 42 - 408
Target Start/End: Original strand, 2121409 - 2121775
Alignment:
Q  42 cacctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagtttattaaaggacacatttaagtactccaaaaaggtgatttcagccaactg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  2121409 cacctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtaagattgttaaatgacacatttaagtattccaaaaaggtgatttgtgccaactg 2121508  T
Q  142 ttgtggaattttcccagagagactgttgtgagaaagatctagtgtttcaaggtttgaaagcttccctacggaagatggaatgctgccaataaggaggtta 241  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  2121509 ttggggaattttccctgaaagactgttgagagaaagatctagtgcttcaaggtttgaaagcttccctaaggaagatggaatgctgccaataagcatatta 2121608  T
Q  242 tttgacaagttgagcaaaacaagacccttcaagtcgcctatgacttgtggtatctctccaccgattttgttgcttgaaatatcaatggctatcaagctgt 341  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2121609 tttgacaagtttagcaaaacaagaccctttaattcgcctatcatttgtggtatctctccgctgattttgttgcttgaaatatcaatggctatcaagctgt 2121708  T
Q  342 aaaactcttgaagtttctcataaaccctagtcaaccctttgtttgacattgtgaatgaataaaactt 408  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2121709 aaaatttttgaagcttctcataaaccctggccagtcctttgtttgacattgtgaaagaataaaactt 2121775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 4 - 412
Target Start/End: Original strand, 2055291 - 2055699
Alignment:
Q  4 ctgatccccacacagaccttggttaccctcaaatgaatcacctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagtttattaaaggac 103  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  2055291 ctgatcaccacacagatcttgattaccctcaaacgagtcatctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctctgagattgttaaaggac 2055390  T
Q  104 acatttaagtactccaaaaaggtgatttcagccaactgttgtggaattttcccagagagactgttgtgagaaagatctagtgtttcaaggtttgaaagct 203  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| |||||| || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  2055391 acatttaagaactccaaaatggtgatttctgtcaactgttagggaactttccctgaaagactgttgagggaaagatctagtgcttcaaggtttataagct 2055490  T
Q  204 tccctacggaagatggaatgctgccaataaggaggttatttgacaagttgagcaaaacaagacccttcaagtcgcctatgacttgtggtatctctccacc 303  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||     
T  2055491 tccctaaggatgatggtatgctaccagtaaggaggttatttgacaagttgagcaaaacaagacccttcaagtcttctatcacttgcggtatctctccact 2055590  T
Q  304 gattttgttgcttgaaatatcaatggctatcaagctgtaaaactcttgaagtttctcataaaccctagtcaaccctttgtttgacattgtgaatgaataa 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| || | |||||| ||   ||||||||| |  || |||||||| ||||||||||| |||||     
T  2055591 gattttgttgcttgaaatatcaatggctattaaattgtacaaattttgaagcttgatataaacccttgaaaatcctttgttagacattgtgaacgaatag 2055690  T
Q  404 aacttatct 412  Q
    || ||||||    
T  2055691 aaattatct 2055699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 1698237 - 1697839
Alignment:
Q  5 tgatccccacacagaccttggttaccctcaaatgaatcacctttgaatgtagaaaactgattattttgtggtataggacctgtgagtttattaaaggaca 104  Q
    |||||||||||||  |||||||| || |||||||||| | |||  |||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||| ||| || || |||||||    
T  1698237 tgatccccacacaagccttggttgccttcaaatgaattatcttgaaatgtagagaactgctgattctgcggtataggacctgagagattgttgaaggaca 1698138  T
Q  105 catttaagtactccaaaaaggtgatttcagccaactgttgtggaattttcccagagagactgttgtgagaaagatctagtgtttcaaggtttgaaagctt 204  Q
    |||| | | ||||||||||||| |  |  |  |||||||| ||||| ||||| || ||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1698137 cattaaggaactccaaaaaggtaaggtgtgttaactgttgaggaatcttccccgacagattgttgaaagaaagatccagtgcttcaaggtttgaaagctt 1698038  T
Q  205 ccctacggaagatggaatgctgccaataaggaggttatttgacaagttgagcaaaacaagacccttcaagtcgcctatgacttgtggtatctctccaccg 304  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||      
T  1698037 ccctaaggaagatggtatgttgccagtaaggatgttatttgacaagttgagcaaaacaaggcccttcaattcgcctatcgctcttggtatctctccactt 1697938  T
Q  305 attttgttgcttgaaatatcaatggctatcaagctgtaaaactcttgaagtttctcataaaccctagtcaaccctttgtttgacattgtgaatgaataa 403  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||  ||||||||||| |    |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1697937 atttggttgcttgaaatatcaatggctatcattttataaaactcttgaagcctctcataaaccatcactaaccctttatttgacattgtgaacgaataa 1697839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 297
Target Start/End: Original strand, 2119670 - 2119725
Alignment:
Q  242 tttgacaagttgagcaaaacaagacccttcaagtcgcctatgacttgtggtatctc 297  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2119670 tttgagaagttgagcaaaacgaaacctttcaagtcgcctatgacttttggtatctc 2119725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University