View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17380_low_21 (Length: 449)

Name: NF17380_low_21
Description: NF17380
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17380_low_21
NF17380_low_21
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (39-299)||(31002328-31002590)
chr2 (40-299)||(13456051-13456311)
chr2 (77-299)||(13149671-13149892)
chr2 (33-250)||(35090591-35090807)
chr2 (70-299)||(31008306-31008537)
chr2 (75-299)||(30965279-30965505)
chr2 (75-299)||(36750366-36750591)
chr2 (75-299)||(13461992-13462217)
chr2 (75-299)||(28682928-28683153)
chr2 (74-299)||(44716786-44717013)
chr2 (81-250)||(35084665-35084834)
chr2 (39-239)||(29833222-29833420)
chr2 (310-432)||(13455893-13456017)
chr2 (310-432)||(13461834-13461958)
chr2 (310-432)||(36750208-36750332)
chr2 (310-432)||(44717047-44717171)
chr2 (310-432)||(30965121-30965245)
chr2 (310-432)||(31002170-31002294)
chr2 (310-432)||(35084921-35085045)
chr2 (310-432)||(35090894-35091018)
chr2 (310-432)||(28683187-28683310)
chr2 (310-432)||(31008148-31008272)
chr2 (75-247)||(11048536-11048708)
chr2 (310-427)||(23343353-23343471)
chr2 (75-250)||(35438693-35438858)
chr2 (310-432)||(11048793-11048920)
chr2 (310-432)||(13149926-13150055)
chr2 (135-238)||(23343574-23343678)
chr2 (310-404)||(19879422-19879516)
chr2 (310-367)||(35438947-35439004)
chr2 (375-432)||(35439677-35439736)
chr2 (310-351)||(29034697-29034738)
chr2 (154-193)||(31651664-31651703)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (33-299)||(28531423-28531690)
chr5 (39-251)||(32096907-32097119)
chr5 (40-299)||(12692229-12692489)
chr5 (75-261)||(32094142-32094328)
chr5 (75-299)||(28525369-28525594)
chr5 (75-299)||(7389531-7389755)
chr5 (75-299)||(12686162-12686387)
chr5 (43-250)||(24054335-24054545)
chr5 (74-248)||(30384358-30384533)
chr5 (34-234)||(19066049-19066249)
chr5 (75-237)||(41297291-41297453)
chr5 (310-432)||(41297073-41297200)
chr5 (310-432)||(32094463-32094587)
chr5 (310-432)||(32097264-32097388)
chr5 (75-226)||(16215157-16215308)
chr5 (310-432)||(12686421-12686544)
chr5 (310-432)||(12692523-12692646)
chr5 (310-432)||(28525628-28525751)
chr5 (310-432)||(20499932-20500056)
chr5 (310-432)||(7389789-7389913)
chr5 (310-432)||(19066354-19066477)
chr5 (310-432)||(28531724-28531847)
chr5 (75-205)||(14610196-14610327)
chr5 (74-238)||(19059746-19059910)
chr5 (72-243)||(30772291-30772463)
chr5 (310-432)||(19060013-19060136)
chr5 (310-428)||(30772080-30772199)
chr5 (159-299)||(20500090-20500231)
chr5 (310-427)||(14609968-14610086)
chr5 (310-422)||(30384628-30384740)
chr5 (97-202)||(26316796-26316901)
chr5 (154-220)||(28542269-28542336)
chr5 (138-220)||(26509882-26509964)
chr5 (80-206)||(37896286-37896411)
chr5 (314-428)||(26318506-26318621)
chr5 (235-299)||(32097165-32097230)
chr5 (309-353)||(26509722-26509766)
chr5 (132-191)||(33753291-33753350)
chr5 (314-404)||(33753481-33753570)
chr5 (140-235)||(33848933-33849030)
[»] chr3 (49 HSPs)
chr3 (45-299)||(11846016-11846271)
chr3 (33-299)||(49151563-49151830)
chr3 (40-286)||(10244282-10244528)
chr3 (40-299)||(42197110-42197370)
chr3 (34-249)||(10766813-10767028)
chr3 (40-299)||(38455500-38455758)
chr3 (75-299)||(10760633-10760858)
chr3 (75-299)||(17055775-17056001)
chr3 (60-286)||(17593249-17593476)
chr3 (75-299)||(11839708-11839933)
chr3 (75-299)||(49157630-49157855)
chr3 (80-285)||(55003400-55003605)
chr3 (81-299)||(30051091-30051310)
chr3 (74-299)||(42191202-42191428)
chr3 (75-286)||(10238195-10238406)
chr3 (104-299)||(38449074-38449271)
chr3 (75-286)||(8331752-8331963)
chr3 (81-250)||(53069043-53069213)
chr3 (74-204)||(28964916-28965043)
chr3 (310-432)||(11839967-11840091)
chr3 (310-432)||(38449305-38449429)
chr3 (310-432)||(38455792-38455916)
chr3 (310-432)||(42191462-42191586)
chr3 (310-432)||(42197404-42197528)
chr3 (310-432)||(10238454-10238578)
chr3 (310-432)||(10244576-10244700)
chr3 (310-432)||(10769211-10769335)
chr3 (310-432)||(26429659-26429783)
chr3 (310-432)||(8331581-8331704)
chr3 (310-432)||(10760892-10761016)
chr3 (75-225)||(48128030-48128180)
chr3 (310-432)||(17056035-17056158)
chr3 (310-432)||(49151406-49151529)
chr3 (310-432)||(49157473-49157596)
chr3 (140-250)||(34300498-34300609)
chr3 (310-427)||(30051344-30051462)
chr3 (310-432)||(13444851-13444975)
chr3 (311-416)||(55003652-55003758)
chr3 (75-242)||(13445070-13445227)
chr3 (310-432)||(48128282-48128405)
chr3 (330-427)||(28964679-28964777)
chr3 (310-367)||(13837534-13837591)
chr3 (97-250)||(46656685-46656839)
chr3 (142-245)||(12108716-12108820)
chr3 (338-432)||(53069319-53069416)
chr3 (344-432)||(13367114-13367202)
chr3 (344-427)||(9760517-9760600)
chr3 (73-176)||(24643532-24643635)
chr3 (310-432)||(46656474-46656591)
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (34-299)||(31051496-31051766)
chr1 (40-299)||(25387452-25387712)
chr1 (74-286)||(31058010-31058221)
chr1 (75-299)||(50306141-50306365)
chr1 (74-247)||(1078228-1078401)
chr1 (75-299)||(25381518-25381743)
chr1 (80-287)||(34739950-34740157)
chr1 (109-299)||(8092862-8093054)
chr1 (310-432)||(25381777-25381901)
chr1 (75-197)||(27955216-27955336)
chr1 (310-432)||(1078038-1078162)
chr1 (310-432)||(25387746-25387870)
chr1 (310-432)||(31051338-31051462)
chr1 (75-247)||(44410016-44410186)
chr1 (310-432)||(31057838-31057962)
chr1 (135-251)||(12183626-12183742)
chr1 (40-236)||(38151923-38152113)
chr1 (48-236)||(24963657-24963846)
chr1 (310-432)||(34739780-34739903)
chr1 (310-427)||(44409799-44409918)
chr1 (81-236)||(24926744-24926898)
chr1 (310-432)||(24927003-24927126)
chr1 (310-432)||(8093088-8093211)
chr1 (332-432)||(50305991-50306092)
chr1 (310-423)||(38152206-38152320)
chr1 (310-427)||(24963951-24964069)
chr1 (311-421)||(27954968-27955076)
chr1 (313-386)||(23253991-23254063)
chr1 (314-346)||(12183835-12183867)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (75-299)||(25354163-25354388)
chr6 (39-299)||(25343576-25343841)
chr6 (72-280)||(21782733-21782941)
chr6 (81-299)||(8650792-8651011)
chr6 (75-299)||(4580304-4580529)
chr6 (33-233)||(8662722-8662922)
chr6 (75-286)||(32035269-32035480)
chr6 (75-286)||(21190849-21191060)
chr6 (40-247)||(21196969-21197174)
chr6 (310-432)||(4580563-4580687)
chr6 (310-432)||(8651045-8651169)
chr6 (310-432)||(25343419-25343542)
chr6 (310-432)||(25354005-25354129)
chr6 (75-250)||(31756196-31756373)
chr6 (81-247)||(21770546-21770711)
chr6 (74-250)||(18778584-18778761)
chr6 (42-233)||(6097999-6098191)
chr6 (310-432)||(21770809-21770931)
chr6 (80-250)||(17581636-17581797)
chr6 (310-427)||(21191108-21191230)
chr6 (124-247)||(21783340-21783462)
chr6 (124-247)||(21789563-21789685)
chr6 (310-432)||(31756462-31756585)
chr6 (323-432)||(21783579-21783691)
chr6 (323-432)||(21789802-21789914)
chr6 (310-432)||(30905824-30905946)
chr6 (310-432)||(21197272-21197406)
chr6 (310-404)||(17581459-17581550)
chr6 (99-205)||(34603337-34603442)
chr6 (99-205)||(34724614-34724719)
chr6 (310-432)||(28728078-28728199)
chr6 (80-182)||(6102693-6102799)
chr6 (326-407)||(17900402-17900484)
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (33-299)||(32890840-32891107)
chr8 (34-299)||(42992946-42993211)
chr8 (74-299)||(10705789-10706021)
chr8 (75-299)||(14417892-14418114)
chr8 (75-299)||(9935230-9935455)
chr8 (75-299)||(32896964-32897189)
chr8 (74-282)||(7771202-7771409)
chr8 (75-299)||(36818923-36819147)
chr8 (75-241)||(14799399-14799564)
chr8 (75-284)||(5542143-5542352)
chr8 (40-286)||(10699995-10700222)
chr8 (310-432)||(5542402-5542526)
chr8 (310-432)||(22219969-22220093)
chr8 (67-238)||(1882726-1882899)
chr8 (310-432)||(32890682-32890806)
chr8 (310-432)||(32896806-32896930)
chr8 (58-242)||(39735514-39735702)
chr8 (310-432)||(42033595-42033718)
chr8 (310-427)||(10705636-10705755)
chr8 (82-239)||(22219706-22219864)
chr8 (310-432)||(10699823-10699947)
chr8 (310-423)||(9935085-9935196)
chr8 (310-404)||(14417765-14417858)
chr8 (310-432)||(36818766-36818889)
chr8 (74-248)||(39727299-39727467)
chr8 (310-432)||(42993245-42993366)
chr8 (310-404)||(39727550-39727644)
chr8 (310-401)||(1883061-1883151)
chr8 (81-184)||(24250171-24250272)
chr8 (310-382)||(39735790-39735862)
chr8 (39-85)||(31373514-31373560)
chr8 (183-247)||(1171351-1171414)
chr8 (35-85)||(31398947-31398997)
chr8 (101-173)||(31379430-31379502)
chr8 (135-175)||(31399079-31399119)
[»] chr4 (48 HSPs)
chr4 (40-299)||(24287938-24288196)
chr4 (75-299)||(33458249-33458475)
chr4 (34-299)||(48160911-48161173)
chr4 (35-286)||(10739281-10739533)
chr4 (35-286)||(10953050-10953302)
chr4 (74-299)||(6257187-6257413)
chr4 (75-299)||(48167130-48167351)
chr4 (55-299)||(33461361-33461600)
chr4 (100-286)||(10733253-10733440)
chr4 (100-286)||(10947022-10947209)
chr4 (43-247)||(26963292-26963494)
chr4 (34-205)||(49976634-49976804)
chr4 (310-427)||(6257447-6257566)
chr4 (310-432)||(24287781-24287904)
chr4 (310-432)||(10733594-10733715)
chr4 (310-432)||(10947363-10947484)
chr4 (310-432)||(26957045-26957169)
chr4 (310-432)||(48166972-48167096)
chr4 (310-432)||(10739581-10739702)
chr4 (310-432)||(10953350-10953471)
chr4 (310-432)||(48160753-48160877)
chr4 (75-250)||(50168595-50168769)
chr4 (310-432)||(50168389-50168511)
chr4 (314-427)||(33458513-33458627)
chr4 (161-250)||(4632393-4632482)
chr4 (310-432)||(33461634-33461757)
chr4 (310-414)||(4632193-4632299)
chr4 (75-193)||(26956812-26956929)
chr4 (139-288)||(44831658-44831808)
chr4 (337-427)||(26971824-26971916)
chr4 (74-170)||(4632869-4632964)
chr4 (310-427)||(44831861-44831975)
chr4 (146-233)||(3769586-3769673)
chr4 (106-233)||(19686341-19686469)
chr4 (314-427)||(35177595-35177710)
chr4 (138-261)||(50427358-50427489)
chr4 (326-432)||(49976386-49976488)
chr4 (145-205)||(9237410-9237470)
chr4 (321-427)||(50155757-50155865)
chr4 (310-362)||(17627022-17627074)
chr4 (76-181)||(55473129-55473230)
chr4 (77-166)||(34308057-34308144)
chr4 (310-407)||(32284501-32284597)
chr4 (163-206)||(50156003-50156046)
chr4 (314-367)||(19686567-19686620)
chr4 (140-209)||(33045259-33045328)
chr4 (39-154)||(50156043-50156159)
chr4 (144-204)||(28704559-28704619)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (30-299)||(3817249-3817519)
chr7 (74-299)||(20238902-20239128)
chr7 (74-287)||(42767276-42767490)
chr7 (34-245)||(339377-339588)
chr7 (81-299)||(5979162-5979382)
chr7 (75-299)||(3811152-3811377)
chr7 (75-299)||(28420942-28421167)
chr7 (74-281)||(351756-351963)
chr7 (84-250)||(35147996-35148163)
chr7 (74-237)||(12804014-12804177)
chr7 (310-432)||(351581-351704)
chr7 (310-432)||(28421201-28421324)
chr7 (310-432)||(3811411-3811534)
chr7 (310-432)||(3817553-3817676)
chr7 (310-422)||(5979416-5979531)
chr7 (310-414)||(20238762-20238868)
chr7 (310-432)||(35148251-35148374)
chr7 (97-247)||(43539989-43540140)
chr7 (310-423)||(339183-339297)
chr7 (137-245)||(22741969-22742076)
chr7 (135-247)||(5849529-5849642)
chr7 (310-427)||(5849329-5849447)
chr7 (315-432)||(22742176-22742295)
chr7 (104-247)||(26383630-26383774)
chr7 (135-250)||(30219288-30219404)
chr7 (315-393)||(35150788-35150865)
chr7 (310-432)||(15843740-15843864)
chr7 (310-432)||(15860849-15860973)
chr7 (327-432)||(26383463-26383569)
chr7 (310-430)||(43539773-43539897)
chr7 (310-421)||(26380890-26381001)
chr7 (213-286)||(15843912-15843985)
chr7 (213-286)||(15861021-15861094)
chr7 (144-200)||(18666547-18666602)
chr7 (310-362)||(3677890-3677942)
chr7 (34-185)||(26381136-26381284)
chr7 (33-84)||(30219215-30219266)
chr7 (39-85)||(18656697-18656744)
chr7 (309-355)||(7608315-7608361)
chr7 (389-432)||(35152849-35152894)
[»] scaffold0363 (2 HSPs)
scaffold0363 (75-299)||(605-827)
scaffold0363 (310-404)||(861-954)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (33-299)||(172831-173098)
scaffold0012 (310-432)||(173132-173255)
[»] scaffold0440 (2 HSPs)
scaffold0440 (75-299)||(1176-1402)
scaffold0440 (311-432)||(1437-1559)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (74-299)||(5486-5712)
[»] scaffold0208 (4 HSPs)
scaffold0208 (40-299)||(6474-6734)
scaffold0208 (310-432)||(6316-6440)
scaffold0208 (310-432)||(12189-12313)
scaffold0208 (135-299)||(12347-12513)
[»] scaffold0085 (2 HSPs)
scaffold0085 (310-429)||(38224-38344)
scaffold0085 (92-247)||(38434-38588)
[»] scaffold1114 (3 HSPs)
scaffold1114 (341-432)||(857-949)
scaffold1114 (310-361)||(950-1001)
scaffold1114 (75-250)||(1089-1261)
[»] scaffold0185 (2 HSPs)
scaffold0185 (135-220)||(5954-6040)
scaffold0185 (310-346)||(5826-5862)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (380-432)||(14067-14121)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31002590 - 31002328
Alignment:
Q  39 caataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatca 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  31002590 caataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatca 31002491  T
Q  139 atagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattatgaattagggtattaagaatacctgg 237  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||     
T  31002490 atagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatatcaagaattagggtattaggaatacctga 31002391  T
Q  238 ataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    ||||||||||  ||  |||||||| || | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  31002390 ataaagcttttgtagcagccctctcatcaacaacgataaccaaaaagaggagatgatctgaaa 31002328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13456311 - 13456051
Alignment:
Q  40 aataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||    
T  13456311 aataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatataggtcttaat-ataaatagatttcataatacatgttcaacaattgtgaatcaa 13456213  T
Q  140 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctgga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13456212 tagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattagggtattaggaatacctgga 13456113  T
Q  239 taaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||||    |||||||| || | |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13456112 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaactataaccaaagagaggagatgatctgaaa 13456051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 77 - 299
Target Start/End: Original strand, 13149671 - 13149892
Alignment:
Q  77 ttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgat 176  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13149671 ttagaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgat 13149769  T
Q  177 cggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataa 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||  |||||||| || | |||||||||    
T  13149770 cggatctacgacatgtttgatttatcaagatattaagaattagggtattaagaatacct-gataaaacttttgtagcagccctctcatcaacaacgataa 13149868  T
Q  277 ccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||    
T  13149869 ccaaagagaggagatgatctgaaa 13149892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 33 - 250
Target Start/End: Original strand, 35090591 - 35090807
Alignment:
Q  33 taatctcaataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |    
T  35090591 taatctcaataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgtt-gaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattat 35090688  T
Q  133 agatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattatgaattagggtattaagaat 231  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||    
T  35090689 gaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaattagtgtattaggaat 35090788  T
Q  232 acctggataaagctttcat 250  Q
    |||||||||||||||||||    
T  35090789 acctggataaagctttcat 35090807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31008537 - 31008306
Alignment:
Q  70 ccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatga 169  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31008537 ccacctgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatga 31008438  T
Q  170 ttatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatc 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||  |||||||| || | |    
T  31008437 ttatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagaatatcaagaattagggtattaggaatacctgaataaagcttttgtagcagccctctcatcaac 31008338  T
Q  269 aacgataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  31008337 aacgataaccaaaaagaggagatgatctgaaa 31008306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 30965505 - 30965279
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30965505 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcataaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatg 30965406  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||  ||  |||||||| || | ||||||    
T  30965405 atcggatctacgacatgtttgatttatcaattattttaagaattagggtattaggaatacctgtataaatcttttgtagcagccctctcatcaacaacga 30965306  T
Q  274 taaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  30965305 taaccaaagagatgagatgatctgaaa 30965279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 36750591 - 36750366
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36750591 tgttggaaatttaagtcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 36750493  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  36750492 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaaactttcatagcagccctctaatcaacaacga 36750393  T
Q  274 taaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  36750392 taaccaaagagaggagatgatctgaaa 36750366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13462217 - 13461992
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13462217 tgttggaaatataggtcttaat-ataaatagatttcataatacatgttcaacaattgtgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatg 13462119  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||| |    
T  13462118 atcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacta 13462019  T
Q  274 taaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  13462018 taaccaaagagaggagatgatctgaaa 13461992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Original strand, 28682928 - 28683153
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28682928 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 28683026  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    | |||||| || | ||||||    
T  28683027 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggttattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagacaaccctctcatcaacaacga 28683126  T
Q  274 taaccaaagagagagg-tgatctgaaa 299  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||    
T  28683127 taaccaaggagagtggatgatctgaaa 28683153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 74 - 299
Target Start/End: Original strand, 44716786 - 44717013
Alignment:
Q  74 ttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaac-aaaacattgaacatgatta 172  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||  |  |  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44716786 ttgttagaaatttaggtcttaat-aaaaacagatatcataaaacatgttcaacggttatcaatcaatagcggaagcaaaagaaaacattgaacatgatta 44716884  T
Q  173 tgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaac 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  ||| |||| || | ||||    
T  44716885 tgatcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagcagctctctcatcaacaac 44716984  T
Q  272 gataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44716985 gataaccaaagagaggagatgatctgaaa 44717013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 250
Target Start/End: Original strand, 35084665 - 35084834
Alignment:
Q  81 aaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgga 180  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35084665 aaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaaaatgattatgatcgga 35084763  T
Q  181 tctacgacatgtttgatttatcaag-atattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35084764 tctacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaattagtgtattaggaatacctggataaagctttcat 35084834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 29833420 - 29833222
Alignment:
Q  39 caataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatca 138  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||    
T  29833420 caataaatcaaacatgaagactgctctgatactacttgttagaaatttaggtataaat-ataaagagatttcataatacatgtttaataattgtgaatca 29833322  T
Q  139 atagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatacctgga 238  Q
    ||| ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  29833321 ataacggaaacaaataaaatattgaacataattatgatcggatcgacaacatgtttgatttatcaagataacaataatta-ggtattaagaatacctgga 29833223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13456017 - 13455893
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  13456017 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata 13455918  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  13455917 ttggatggccattagggtttcccat 13455893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13461958 - 13461834
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  13461958 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata 13461859  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  13461858 ttggatggccattagggtttcccat 13461834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36750332 - 36750208
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  36750332 cttcctcaaccggtatctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggagaccatagcctcttttata 36750233  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  36750232 ttggatggccattagggtttcccat 36750208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 44717047 - 44717171
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  44717047 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagatagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata 44717146  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||  ||||||||||||||||    
T  44717147 ttggatggtcattagggttttccat 44717171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 30965245 - 30965121
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  30965245 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 30965146  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    || |||| |||||||| ||| ||||    
T  30965145 ttagatggccattaggatttcccat 30965121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31002294 - 31002170
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  31002294 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgttgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 31002195  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||    
T  31002194 ttggatggccattatggtttcccat 31002170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 35084921 - 35085045
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  35084921 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 35085020  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||    
T  35085021 ttggatagccattagggtttcccat 35085045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 35090894 - 35091018
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  35090894 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 35090993  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||  |||||||||||| ||||    
T  35090994 ttggatagccattagggtttcccat 35091018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 28683187 - 28683310
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  28683187 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 28683285  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  28683286 ttggatggccattagggtttcccat 28683310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31008272 - 31008148
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  31008272 cttcctcaaccggtacttttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgttgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 31008173  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||    
T  31008172 ttggatggccattatggtttcccat 31008148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 247
Target Start/End: Original strand, 11048536 - 11048708
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||  ||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11048536 tgttggaaatttaggtctta-ttaaaaataaatttcataaaacatgtccaacaattatgaatcaatagctgaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 11048634  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagcttt 247  Q
    || |||| |||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||||||| | || |||||| |||||||||||||    
T  11048635 attggatatacgtcatgtttgatgtaccaaggatattaagaattagggcactaggaatacttggataaagcttt 11048708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 310 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 23343471 - 23343353
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  23343471 cttcctcaaccgatacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttcccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata 23343373  T
Q  408 ttggatgaccattagggttt 427  Q
    |||||||  |||||||||||    
T  23343372 ttggatggtcattagggttt 23343353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 250
Target Start/End: Original strand, 35438693 - 35438858
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||||| |||| |  |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35438693 tgttggaaatttaggccttaat--aaaacaaatttcataaaacatgttcaacagttatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatg 35438790  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||        || || ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  35438791 atcggatctacgacatgtttgatt--------tactaggaaatagggtattaggaatacctgtataaagctttcat 35438858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 11048793 - 11048920
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagt---attgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--tt 404  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  11048793 cttcctcaactggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttggtttgccgtgtacgatgtattggggaccatagcctctttt 11048892  T
Q  405 atattggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||    
T  11048893 atattggatcgccattagggtttcccat 11048920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 13149926 - 13150055
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggg-----gagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc-- 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     |||||||| || ||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||      
T  13149926 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgagatgaggagaagagagaatattgccgtgtacggtatattggggaccataacctctt 13150025  T
Q  403 ttatattggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13150026 ttatattagatgaccattagggtttcccat 13150055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23343678 - 23343574
Alignment:
Q  135 atcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatac 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||    
T  23343678 atcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgaatatgaacgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagagttggggtattaggaatac 23343579  T
Q  234 ctgga 238  Q
     ||||    
T  23343578 atgga 23343574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 310 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19879516 - 19879422
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctctt 404  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  19879516 cttcttcaatcggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtgtacgatgtattggcgaccataacctctt 19879422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 310 - 367
Target Start/End: Original strand, 35438947 - 35439004
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35438947 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt 35439004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 432
Target Start/End: Original strand, 35439677 - 35439736
Alignment:
Q  375 tgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatattggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  35439677 tgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccat 35439736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 310 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29034738 - 29034697
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagat 351  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29034738 cttcctcaactggtacctttatgtctcaagttctcttcagat 29034697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31651703 - 31651664
Alignment:
Q  154 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtt 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31651703 aaaacattgaacatgattatgatcggatttatgacatgtt 31651664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 33 - 299
Target Start/End: Original strand, 28531423 - 28531690
Alignment:
Q  33 taatctcaataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  28531423 taatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaattat 28531521  T
Q  133 agatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaat 231  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28531522 gaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaat 28531621  T
Q  232 acctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28531622 acctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaa 28531690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 39 - 251
Target Start/End: Original strand, 32096907 - 32097119
Alignment:
Q  39 caataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatca 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  32096907 caataaatcaaacatgaagaccgctctgataccatttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatca 32097006  T
Q  139 atagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctgg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||||     
T  32097007 atagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgataggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatta-ggtattaggattacctga 32097105  T
Q  238 ataaagctttcata 251  Q
    ||||||||||||||    
T  32097106 ataaagctttcata 32097119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Original strand, 12692229 - 12692489
Alignment:
Q  40 aataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaa 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  || |||||    
T  12692229 aataaatcaaacatgaagacggctctgataccacttgttggaaatttagctcttgat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatcaa 12692327  T
Q  140 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctgga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  12692328 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctgga 12692427  T
Q  239 taaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12692428 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaa 12692489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 261
Target Start/End: Original strand, 32094142 - 32094328
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32094142 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagattttataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 32094241  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctct 261  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  32094242 ataggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatta-ggtattaggaatacctgaataaagctttcatagcagccctct 32094328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Original strand, 28525369 - 28525594
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28525369 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 28525467  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||    
T  28525468 atcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacga 28525567  T
Q  274 taaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28525568 taaccaaagagaggagatgatctgaaa 28525594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Original strand, 7389531 - 7389755
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7389531 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacaaatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 7389629  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgat 274  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||   || |||| || | |||||||    
T  7389630 atcggatccacgacatgtttgatttatcaagatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagccgctctctcatcaacaacgat 7389729  T
Q  275 aaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  7389730 aaccaaagagaggagatgatctgaaa 7389755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Original strand, 12686162 - 12686387
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12686162 tgttggaaatttagctcttgat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 12686260  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||    
T  12686261 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacga 12686360  T
Q  274 taaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12686361 taaccaaagagaggagatgatctgaaa 12686387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24054545 - 24054335
Alignment:
Q  43 aaatcaaacatgaagacc-gctcttataccacttgttagaaattt-aggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaat 140  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  || ||| ||    
T  24054545 aaatcaaacaaaaagacccgctctgataccacttgttgaaaattttaggtcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatctat 24054447  T
Q  141 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattaggg-tattaagaatacctgga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  24054446 agcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatttgggatattaggaatacctgga 24054347  T
Q  239 taaagctttcat 250  Q
    ||||||||||||    
T  24054346 taaagctttcat 24054335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 74 - 248
Target Start/End: Original strand, 30384358 - 30384533
Alignment:
Q  74 ttgttagaaatttaggtcttaattaaaa-acagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgatta 172  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30384358 ttgttggaaatttaggttttaataaaaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacacgatta 30384457  T
Q  173 tgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttc 248  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30384458 tgatcggatcta-gacatgtctgatttatcaaggatattaagaataagggtattaagaatacctggatgaagctttc 30384533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 234
Target Start/End: Original strand, 19066049 - 19066249
Alignment:
Q  34 aatctcaataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgta 133  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  |||||| ||| ||  ||    
T  19066049 aatcccaataaatcaaacgcgaagaccgctctgataccactagttggaaatttaagtcttaat-aaaaacatatttcataaaccatgttcaacgattata 19066147  T
Q  134 gatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaata 232  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  19066148 aatcattagcggaagcaaacaaaacattaagcatgaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattatggtattaggaata 19066247  T
Q  233 cc 234  Q
    ||    
T  19066248 cc 19066249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41297453 - 41297291
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41297453 tgttggaaatttgggtcttaat-ataaagagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcagaagcaaacaaaacattgaacataattatg 41297355  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctgg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  41297354 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatataaagaattagggtattaggaatacctgg 41297291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 41297200 - 41297073
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagt---tctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--tt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  41297200 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagtagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctctttt 41297101  T
Q  405 atattggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41297100 atattggatgaccattagggtttcccat 41297073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 32094463 - 32094587
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  32094463 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtatttgggaccatagcctcttttata 32094562  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    || |||| |||||||||||| ||||    
T  32094563 ttagatggccattagggtttcccat 32094587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 32097264 - 32097388
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  32097264 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaatagagagtatttccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata 32097363  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  32097364 ttggatggccattagggtttcccat 32097388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 226
Target Start/End: Original strand, 16215157 - 16215308
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16215157 tgttagaaatttaggtctttat-aaaaacagatttcataacacatattcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacatttaacatgattatg 16215255  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtatta 226  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  16215256 attggatctacgaaatgtttgatttatcaaggatattaaaaattagggtatta 16215308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 12686421 - 12686544
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  12686421 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata 12686519  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    || |||| |||||||||||| ||||    
T  12686520 tttgatggccattagggtttcccat 12686544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 12692523 - 12692646
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  12692523 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata 12692621  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    || |||| |||||||||||| ||||    
T  12692622 tttgatggccattagggtttcccat 12692646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 28525628 - 28525751
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  28525628 cttcctcaaccggtacctttatgcctcacgttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 28525726  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  28525727 ttggatggccattagggtttcccat 28525751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20500056 - 20499932
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctctta--ta 407  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  20500056 cttccttaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcaaatggagagaacagagagttttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttattta 20499957  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20499956 ttggatgaccattagggttttccat 20499932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 7389789 - 7389913
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| || ||||||| |||||||||||  |||||    
T  7389789 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtgtacagtatattgggaaccatagcctcttttata 7389888  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  7389889 ttggatggccattagagtttcccat 7389913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 19066354 - 19066477
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcc--tcttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||  | |||||    
T  19066354 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgtcgtgtccggtgtattggggaccacaacctattttata 19066452  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||  ||||||||||||||||    
T  19066453 ttggatggtcattagggttttccat 19066477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 28531724 - 28531847
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||    
T  28531724 cttcctcaaccagtacctttatgcctcacgttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtatattggagaccatagcctcttttata 28531822  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  28531823 ttggatggccattagggtttcccat 28531847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14610327 - 14610196
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaa-cagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 173  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14610327 tgttaaaaatttaggtcttaacaaaaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaattaatagcggaagcaaataaaccattgaacatgattat 14610228  T
Q  174 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14610227 gatcggatttacgacatgtttgatttatcaag 14610196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Original strand, 19059746 - 19059910
Alignment:
Q  74 ttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | || ||| ||  || |||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  19059746 ttgttggaaatttaggtcttaat-aaaaacatatttcataaaacgtattcaacgattataaatcattaggggaagcaaacaaaatattaaacatgaatat 19059844  T
Q  174 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctgga 238  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  19059845 aaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattagaaatacctgga 19059910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 30772463 - 30772291
Alignment:
Q  72 acttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaa-cattgaacatgat 170  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| || |||  |  || || || |||||||||||||| || ||||||||||    
T  30772463 acttgttggaaatttagttcttaat-aaaaataaatttcataaaacatgttcaataattatgaataaacagtggaagcaaacaaaaacaatgaacatgat 30772365  T
Q  171 tatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaag 243  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  30772364 tatgatcggatcgacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggattacctggataaag 30772291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 19060013 - 19060136
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||| |||  | |||||||||||||||||||||  |||||    
T  19060013 cttcctcaactggtacttttatgcctcaagttctcttcatatcgggagaagagagagt-ttgtcgtgtctgatgtattggggaccatagcctcttttata 19060111  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  19060112 ttggatggccattagggtttcccat 19060136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 310 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 30772199 - 30772080
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctct--tata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  | | ||||| ||||||||| ||||  ||||    
T  30772199 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgtcgtgtctgatatattgtggaccatagtctcttctata 30772101  T
Q  408 ttggatgaccattagggtttt 428  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  30772100 ttggatgatcatcagggtttt 30772080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20500231 - 20500090
Alignment:
Q  159 attgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagcc 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||||| ||||||  |||||||||||||| |||| ||   ||||    
T  20500231 attgaacatgattatgatcggatctacgacatacttgatttatcaaggatactaagaattagagtattagaaatacctggataaaacttttatggcagcc 20500132  T
Q  258 ctctaattatcaacgataaccaaagagagaggtgatctgaaa 299  Q
    |||| |  ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||    
T  20500131 ctctcaacatcaacgataaacagagagaaaggcgatctgaaa 20500090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 310 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 14610086 - 14609968
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||  ||| |    
T  14610086 cttcctcaaccggtacttttatgcctaaagttctcttcagatggggagaaaagaaagt-ttgccgtgttcggtgtattggggaccataacctcttttaca 14609988  T
Q  408 ttggatgaccattagggttt 427  Q
    || |||||||||||||||||    
T  14609987 ttagatgaccattagggttt 14609968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 310 - 422
Target Start/End: Original strand, 30384628 - 30384740
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||   || ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||    
T  30384628 cttcctcaaccggtacctttatacctcgagttctcttcagatggggagaagagaatgt-ttgccgtgtacggtgtatt-gggaccatagtctcttttata 30384725  T
Q  408 ttggatgaccattag 422  Q
    ||||||||| |||||    
T  30384726 ttggatgactattag 30384740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 202
Target Start/End: Original strand, 26316796 - 26316901
Alignment:
Q  97 taaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttga 196  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| || |||  || || ||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||    
T  26316796 taaaaacatatttcataaaacatgttcaataattttaaattaatagtggaagcaaaaaaaacattgaacattaatatgattggatctaggacatgtttga 26316895  T
Q  197 tttatc 202  Q
    ||||||    
T  26316896 tttatc 26316901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28542336 - 28542269
Alignment:
Q  154 aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28542336 aaaacattgaacatgattatgatcgaaactacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagg 28542269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26509964 - 26509882
Alignment:
Q  138 aatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagg 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26509964 aatagtggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatataaactacgacatatttgattcatcaagatattaagaattagg 26509882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 206
Target Start/End: Original strand, 37896286 - 37896411
Alignment:
Q  80 gaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgg 179  Q
    |||| ||||||||||| |||||  | |||||||||  ||| ||||| |||| |  ||||| ||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  37896286 gaaaattaggtcttaaataaaacga-atttcataaatcatatttaataatcatgaatcaacagcagaagtaaataaaatgttgaacatgattatgatcgg 37896384  T
Q  180 atctacgacatgtttgatttatcaaga 206  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37896385 atctacgacatgattgatttatcaaga 37896411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 428
Target Start/End: Original strand, 26318506 - 26318621
Alignment:
Q  314 ctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctcttatattg--- 410  Q
    |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| | | || | ||||||||| ||||||||||||||| |       
T  26318506 ctcaaccggtacatttataccataagttctcttcagat-gggagaagagagagt-ttgtcgtttccgatatattggggatcatagcctcttatatagtgt 26318603  T
Q  411 gatgaccattagggtttt 428  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26318604 gatgaccattagggtttt 26318621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 235 - 299
Target Start/End: Original strand, 32097165 - 32097230
Alignment:
Q  235 tggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32097165 tggataaagctttcatagcagccctttaatcaacaacgataaccaaagagatgagatgatctgaaa 32097230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 26509766 - 26509722
Alignment:
Q  309 acttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgg 353  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  26509766 acttcctcaatcggtacctttatgcctctagttctcatcagatgg 26509722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Original strand, 33753291 - 33753350
Alignment:
Q  132 tagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatg 191  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| |||||| |||||    
T  33753291 tagatcattagcggaagcaaaaaaaactttgagcatgaatatgatcgaatctacaacatg 33753350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 404
Target Start/End: Original strand, 33753481 - 33753570
Alignment:
Q  314 ctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctctt 404  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  33753481 ctcaaacggtatttttatgcctcaagttctccttggatggggagaagagagagtatggt-gtgtacggtgtactgaggaacataggctctt 33753570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Original strand, 33848933 - 33849030
Alignment:
Q  140 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatg---tttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatacct 235  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||||    ||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  33848933 tagcggaagcaaaaaaaactttgagcatggatatgatcgaatctacgacatgcatgttgatctatcaagatactaataatta-ggtattaggaatacct 33849030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 49)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 45 - 299
Target Start/End: Original strand, 11846016 - 11846271
Alignment:
Q  45 atcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcg 144  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||  || ||||||||||    
T  11846016 atcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaattaaaa-cagattttataatacatgttcaacaattataaatcaatagcg 11846114  T
Q  145 gaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattatgaattagggtattaagaatacctggataaag 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11846115 gaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagtatattaagaattagggtattaggaatacctggataaag 11846214  T
Q  244 ctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagagag-aggtgatctgaaa 299  Q
    ||||  ||  |||||||| || | ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  11846215 cttttgtaacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagagaagatgatctgaaa 11846271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 33 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 49151830 - 49151563
Alignment:
Q  33 taatctcaataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  49151830 taatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaattat 49151732  T
Q  133 agatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaat 231  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  49151731 gaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaat 49151632  T
Q  232 acctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  49151631 acctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaa 49151563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 286
Target Start/End: Original strand, 10244282 - 10244528
Alignment:
Q  40 aataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |  |||||    
T  10244282 aataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttagctcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaa 10244380  T
Q  140 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctgga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  10244381 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctgga 10244480  T
Q  239 taaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagagag 286  Q
    |||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  10244481 taaagctttcaagacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagag 10244528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Original strand, 42197110 - 42197370
Alignment:
Q  40 aataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||    
T  42197110 aataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatataggtcttaat-ataaatagatttcataatacatgttcaacaattgtgaatcaa 42197208  T
Q  140 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctgga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  42197209 tagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattagggtattaggaatacctgga 42197308  T
Q  239 taaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||||    |||||||| || | |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42197309 taaagctttcaaggcagccctctcatcaacaactataaccaaagagaggagatgatctgaaa 42197370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 249
Target Start/End: Original strand, 10766813 - 10767028
Alignment:
Q  34 aatctcaataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgta 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  10766813 aatctcaataaatcaaacatgaaggtggctctgataccacttgttggaaatttaggtctta-ttaaaaacaaatttcataatacatgttcaacaattata 10766911  T
Q  134 gatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaata 232  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10766912 aatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgaccggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaata 10767011  T
Q  233 cctggataaagctttca 249  Q
    |||||||||||||||||    
T  10767012 cctggataaagctttca 10767028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Original strand, 38455500 - 38455758
Alignment:
Q  40 aataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||  |||   |||||||||||||||||| ||||||  || |||||    
T  38455500 aataaatcaaacatgaagaccgctctgataccatttgttggaaatttcggtcttaatataaa---gatttcataatacatgttcaacaattataaatcaa 38455596  T
Q  140 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctgga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  38455597 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 38455696  T
Q  239 taaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    ||||||||||     |||||||| || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38455697 taaagctttcgaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaa 38455758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Original strand, 10760633 - 10760858
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10760633 tgttggaaatttaggtctta-ttaaaaacagatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatg 10760731  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||    
T  10760732 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacga 10760831  T
Q  274 taaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10760832 taaccaaagagaggagatgatctgaaa 10760858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Original strand, 17055775 - 17056001
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17055775 tgttcgaaatttaggtcttaataaaaaacagttttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 17055874  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||     
T  17055875 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcatagcagccctctaatcaacaacgg 17055974  T
Q  274 taaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||    
T  17055975 taaccaaagataggagatgatctgaaa 17056001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 60 - 286
Target Start/End: Original strand, 17593249 - 17593476
Alignment:
Q  60 cgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaaca 159  Q
    |||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  17593249 cgctctgataacacttgtaggaaatttaggtcttaattaaaaatatatttcataatagatgttcaacaatcgtaaatcaatcgcggaagcaaacaaaaca 17593348  T
Q  160 ttgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     |||||    
T  17593349 ttgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttaatttatcaagaatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcgaggcagccc 17593448  T
Q  259 tctaattatcaacgataaccaaagagag 286  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||    
T  17593449 tctcatcaacaacgataaccaaagagag 17593476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Original strand, 11839708 - 11839933
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11839708 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcatgatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 11839806  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||    
T  11839807 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacga 11839906  T
Q  274 taaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11839907 taaccaaagagaggagatgatctgaaa 11839933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 49157855 - 49157630
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49157855 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 49157757  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||    
T  49157756 atcggatctacgacatgtttgatttattaaggatattaagaattagggtattatgaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacga 49157657  T
Q  274 taaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  49157656 taaccaaagagaggagatgatctgaaa 49157630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 80 - 285
Target Start/End: Original strand, 55003400 - 55003605
Alignment:
Q  80 gaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgg 179  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55003400 gaaatttaggtcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcagaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcgg 55003498  T
Q  180 atctacgacatgtttgatttatcaag-atattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataacc 278  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||    
T  55003499 atctacgacatgtttaatttatcaagtatattaagaattagggtattagaaatatctggataaagctttcatagcagccctctaatcaacaacgataacc 55003598  T
Q  279 aaagaga 285  Q
    |||||||    
T  55003599 aaagaga 55003605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 81 - 299
Target Start/End: Original strand, 30051091 - 30051310
Alignment:
Q  81 aaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgga 180  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  30051091 aaatttaggtcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattataatcaga 30051189  T
Q  181 tctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataacca 279  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||   |||| |||||||    
T  30051190 tctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcattacagccctctaatcgacaacaataacca 30051289  T
Q  280 aagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||| ||| ||||||||||    
T  30051290 aagagaggagatgatctgaaa 30051310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 299
Target Start/End: Original strand, 42191202 - 42191428
Alignment:
Q  74 ttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 173  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42191202 ttgttggaaatataggtcttaat-ataaatagatttcataatacatgttcaacaattgtgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacctgattat 42191300  T
Q  174 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||     
T  42191301 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaagggtattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaact 42191400  T
Q  273 ataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42191401 ataaccaaagagaggagatgatctgaaa 42191428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 75 - 286
Target Start/End: Original strand, 10238195 - 10238406
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238195 tgttggaaatttagctcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 10238293  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||    
T  10238294 atcagatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaagacagccctctcatcaacaacga 10238393  T
Q  274 taaccaaagagag 286  Q
    |||||||||||||    
T  10238394 taaccaaagagag 10238406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 104 - 299
Target Start/End: Original strand, 38449074 - 38449271
Alignment:
Q  104 agatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatca 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38449074 agatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttgatttatca 38449173  T
Q  204 a-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     |||||||| || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38449174 aggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaaactttcgaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaa 38449271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 75 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8331963 - 8331752
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | ||| |||||| |||| ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8331963 tgttggaaatttagctcttaat-ataaatagattttataaaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 8331865  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||  | | ||||||    
T  8331864 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcgtcaacaacga 8331765  T
Q  274 taaccaaagagag 286  Q
    |||||||||||||    
T  8331764 taaccaaagagag 8331752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 81 - 250
Target Start/End: Original strand, 53069043 - 53069213
Alignment:
Q  81 aaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgga 180  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53069043 aaatttaggtcttaat-aaaaacagattttataaaacatgttcaacaattataaatcgatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgga 53069141  T
Q  181 tctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaatta-gggtattaagaatacctggataaagctttcat 250  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53069142 tctatgacatgtttgatttatcaaggatattaagaatcaggggtattaagaatacctggataaaactttcat 53069213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 74 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28965043 - 28964916
Alignment:
Q  74 ttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28965043 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataaaacatgttcaacaatga---atcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 28964947  T
Q  174 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28964946 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 28964916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 11839967 - 11840091
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  11839967 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata 11840066  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  11840067 ttggatggccattagggtttcccat 11840091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 38449305 - 38449429
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  38449305 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 38449404  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  38449405 ttggatgaccattagggtttcccat 38449429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 38455792 - 38455916
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  38455792 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 38455891  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  38455892 ttggatgaccattagggtttcccat 38455916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 42191462 - 42191586
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  42191462 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata 42191561  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  42191562 ttggatggccattagggtttcccat 42191586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 42197404 - 42197528
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  42197404 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata 42197503  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  42197504 ttggatggccattagggtttcccat 42197528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 10238454 - 10238578
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  10238454 cttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata 10238553  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  10238554 ttggatggccattagggtttcccat 10238578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 10244576 - 10244700
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  10244576 cttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata 10244675  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  10244676 ttggatggccattagggtttcccat 10244700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 10769211 - 10769335
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  10769211 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 10769310  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  10769311 ttggatggccattagggtttcccat 10769335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 26429659 - 26429783
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  26429659 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 26429758  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
     ||||||||||||||||||| ||||    
T  26429759 ctggatgaccattagggtttcccat 26429783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 8331704 - 8331581
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  8331704 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacagtgtattggggaccatagcctcttttata 8331606  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  8331605 ttggatgaccattagggtttcccat 8331581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 10760892 - 10761016
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  10760892 cttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 10760991  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||    
T  10760992 ttggatggtcattagggtttcccat 10761016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 225
Target Start/End: Original strand, 48128030 - 48128180
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48128030 tgttggaaatttaggtctcaat-aaaaacagatttcatgaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaaacaaacaaaacattgaacatgattatg 48128128  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattatgaattagggtatt 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  48128129 atcggttctacgacatgtttgatttattaagaatattaagaattagggtatt 48128180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 17056035 - 17056158
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  17056035 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacgatgtattggggaccatagcctcttttata 17056133  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  17056134 ttggatgtccattagggtttcccat 17056158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 49151529 - 49151406
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  49151529 cttcctcaaccggtacctttatgcctcacgttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 49151431  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  49151430 ttggatggccattagggtttcccat 49151406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 49157596 - 49157473
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  49157596 cttcctcaaccggtacctttatgcctcacgttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 49157498  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  49157497 ttggatggccattagggtttcccat 49157473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 140 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34300609 - 34300498
Alignment:
Q  140 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctgga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  34300609 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatatttgatttataaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgaa 34300510  T
Q  239 taaagctttcat 250  Q
    | ||||||||||    
T  34300509 ttaagctttcat 34300498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 310 - 427
Target Start/End: Original strand, 30051344 - 30051462
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  30051344 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgggcagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 30051442  T
Q  408 ttggatgaccattagggttt 427  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  30051443 ttggatggccattagggttt 30051462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 13444975 - 13444851
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcc--tcttata 407  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||    
T  13444975 cttcctcaaccgatacttttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagaatatcgttgtgtacggtgtattggggaccataacctattttata 13444876  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  13444875 ttggatggccattagggtttcccat 13444851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 311 - 416
Target Start/End: Original strand, 55003652 - 55003758
Alignment:
Q  311 ttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatat 408  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||    
T  55003652 ttcctcaatcggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgtcgtgtacggtatattggggaccataacctcttttatat 55003750  T
Q  409 tggatgac 416  Q
    ||||||||    
T  55003751 tggatgac 55003758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 75 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13445227 - 13445070
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||  ||||||| ||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||          |||    
T  13445227 tgttagaaatttaggtctaaat-aaaaatagatttgatagaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaataaaacatt----------atg 13445139  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13445138 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctagataaa 13445070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 48128282 - 48128405
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||   || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  48128282 cttcctcaactggtacctttatgcctttagttctcttcagacagggagaagagaatgt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 48128380  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  48128381 ttggatgaccattaaggttttccat 48128405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 330 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 28964777 - 28964679
Alignment:
Q  330 atgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatattggatgaccattagggttt 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28964777 atgcctcgagttctcttcagatggggagaagagagagt-tttccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggttt 28964679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 310 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13837591 - 13837534
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13837591 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt 13837534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 46656839 - 46656685
Alignment:
Q  97 taaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttga 196  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| || ||   |  || |||||| |||| ||| |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46656839 taaaaacatatttcataaaacatgttcaataaatatgaattaatagctgaagtaaataaaacattcaatataattatgatcggatctacgatatgtttga 46656740  T
Q  197 tttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcat 250  Q
    |||||||| ||||||  |||| |||||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  46656739 tttatcaatgatattgagaatgagggtattagaaatacctgaatgaagctttcat 46656685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 245
Target Start/End: Original strand, 12108716 - 12108820
Alignment:
Q  142 gcggaagcaaa-caaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggat 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12108716 gcggaagcaaatcaaaacattgaatatgattatgatttgatctaagacatgtttgatttatcaaggatattaacaatta-ggtattaagaatacctgaat 12108814  T
Q  240 aaagct 245  Q
     |||||    
T  12108815 gaagct 12108820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 338 - 432
Target Start/End: Original strand, 53069319 - 53069416
Alignment:
Q  338 agttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc----ttatattggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  53069319 agttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattgaggaccatagcctcttttttatattggacgatcattagggtttcccat 53069416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 432
Target Start/End: Original strand, 13367114 - 13367202
Alignment:
Q  344 cttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc-ttatattggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  13367114 cttcagatggggagaagagcg-gttttgctatgtacggtatattggggaccatagcctctttatattggatggtcattagggtttcccat 13367202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 9760600 - 9760517
Alignment:
Q  344 cttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctctt-atattggatgaccattagggttt 427  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||   ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9760600 cttcagatggggagaagagcg-gttttactatgtacggtatattggggaccatatcctctttatattggatgaccattagggttt 9760517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Original strand, 24643532 - 24643635
Alignment:
Q  73 cttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcata--atacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgat 170  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||| | ||||||  | ||||||| |||| |  |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24643532 cttgttggaaatttaggtcttaat--aaaacaaacttcatataaaacatgttcaacatttatgaatcaatagcggaagtaaataaaacattgaacatgat 24643629  T
Q  171 tatgat 176  Q
    ||||||    
T  24643630 tatgat 24643635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 46656591 - 46656474
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||     | |||  | |||||||||||||| |||||| ||||  |||||    
T  46656591 cttccttaaccggcacctttatgtctctaattctattcagatggggagaagag-----aatgt--tttacggtgtattgggaaccataacctcttttata 46656499  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||    
T  46656498 ttggataaccaatagggtttcccat 46656474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 34 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31051766 - 31051496
Alignment:
Q  34 aatctcaataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcata-----atacatgtttaacaa 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||     ||||||||| |||||    
T  31051766 aatctcaatagatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttaggaatttaggtcttaat-ataaacagatttcatatcataatacatgttcaacaa 31051668  T
Q  129 tcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaag 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31051667 tcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgattggatctacgacatgtttgatttatcaagatattaagaattagggtattaag 31051568  T
Q  229 aatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||||||| ||||  ||  | |||| | || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  31051567 aatacctggataaaacttttgtagcaaccctttcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaa 31051496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Original strand, 25387452 - 25387712
Alignment:
Q  40 aataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||   |  |||||    
T  25387452 aataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatatagatcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaaatatgaatcaa 25387550  T
Q  140 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctgga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25387551 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgga 25387650  T
Q  239 taaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    ||||||||| | |  |||||||| || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25387651 taaagctttaaaaacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaa 25387712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 74 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31058221 - 31058010
Alignment:
Q  74 ttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31058221 ttgttagaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 31058123  T
Q  174 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||  | |||||| || | ||||||    
T  31058122 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattaagaattagggtattaagaatacttggataaaacttttgtagcaaccctctcatcaacaacga 31058023  T
Q  274 taaccaaagagag 286  Q
    |||||||||||||    
T  31058022 taaccaaagagag 31058010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 50306365 - 50306141
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50306365 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattata 50306267  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||    
T  50306266 atcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgat 50306167  T
Q  275 aaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  50306166 aaccaaagagaggagatgatctgaaa 50306141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 74 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1078401 - 1078228
Alignment:
Q  74 ttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1078401 ttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaattattaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 1078303  T
Q  174 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattatgaattagggtattaagaatacctggataaagcttt 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1078302 gatcggatctacgacatgtttgatttaccaagaatattaagaattagggtattaagaatacctggataaagcttt 1078228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Original strand, 25381518 - 25381743
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25381518 tgttggaaatataggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaactatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 25381616  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  |||||||| || | ||||||    
T  25381617 atcggatctacgaaatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtaacagccctctcatcaacaacga 25381716  T
Q  274 taaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25381717 taaccaaagagaggagatgatctgaaa 25381743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 80 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 34740157 - 34739950
Alignment:
Q  80 gaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgg 179  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| | ||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34740157 gaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcatcaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgg 34740059  T
Q  180 atctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataacc 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    |||||||| || | |||||||||||    
T  34740058 atctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctgaataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataacc 34739959  T
Q  279 aaagagaga 287  Q
    |||||||||    
T  34739958 aaagagaga 34739950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 109 - 299
Target Start/End: Original strand, 8092862 - 8093054
Alignment:
Q  109 tcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gat 207  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  8092862 tcataatacatattcaacaatcgtaaatcaatagcagaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatctatgacatgtttgatttatcaaggat 8092961  T
Q  208 attatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||  ||  || ||||| || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8092962 attaagaatttgggtatgaggaatacctggataaagcttttgtagcagtcctctcatcaacaacgataaccaaagagatgagatgatctgaaa 8093054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 25381777 - 25381901
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  25381777 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata 25381876  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  25381877 ttggatggccattagggtttcccat 25381901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27955336 - 27955216
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27955336 tgttagaaatttaggtcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgtttaataatcata-atcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 27955239  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgat 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  27955238 atcggatctacaacatgtttgat 27955216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1078162 - 1078038
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  1078162 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggtgagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata 1078063  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  1078062 ttggatggccattagggtttcccat 1078038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 25387746 - 25387870
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  25387746 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 25387845  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  25387846 ttggatggccattagggtttcccat 25387870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31051462 - 31051338
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  31051462 cttccttaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 31051363  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  31051362 ttggatggccattagggtttcccat 31051338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 75 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 44410186 - 44410016
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  44410186 tgttggaaatttaggtcttact-aaaaacagatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataaatatg 44410088  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagcttt 247  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  44410087 aacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattaggaatacctggataaagcttt 44410016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 31057962 - 31057838
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  |||||    
T  31057962 cttccttaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggggatcatagcctcttttata 31057863  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  31057862 ttgtatggccattagggtttcccat 31057838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 251
Target Start/End: Original strand, 12183626 - 12183742
Alignment:
Q  135 atcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatacc 234  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||    
T  12183626 atcaatagtggaagcaaacaaaatattgaacataattatgattggatctacgacatgtttgatttatcaagatattaagaatttgagtattaggaatacc 12183725  T
Q  235 tggataaagctttcata 251  Q
    || ||||||||||||||    
T  12183726 tgaataaagctttcata 12183742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 236
Target Start/End: Original strand, 38151923 - 38152113
Alignment:
Q  40 aataaatcaaacatgaagac-cgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatca 138  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |  ||||    
T  38151923 aataaatcaaacatgaagactcgctctgataccacttgttagaaatccaagtcttaat--aaaatagatttcataaaacatgttcaacaattattaatca 38152020  T
Q  139 atagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatc-aagatattatgaattagggtattaagaatacctg 236  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||      |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  38152021 acagcggaagcaaacaaaatattgaac------atgatcagatctacgacatgtttgatttatcaaacatattaagaattagggtattaggaatacctg 38152113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 236
Target Start/End: Original strand, 24963657 - 24963846
Alignment:
Q  48 aaacatgaagacc-gctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcgga 146  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |   |  ||||||||||||    
T  24963657 aaacatgaagacatgctctaataccatttgttgaaaatttagatcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgttcaacgaatatgaatcaatagcgga 24963755  T
Q  147 agcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattatgaattagggtattaagaatacctg 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||  |||||| |||||||||    
T  24963756 agcaaacaaaacattgaacatgaatatgaacggatctacgccatgtttgatttatcaagaatagtaagaattaaagtattaggaatacctg 24963846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 34739903 - 34739780
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||    
T  34739903 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagattgggagaagagagagt-ttgtcgtgtacggtatattggggaccacagcctcttttata 34739805  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  34739804 ttggatggccattagggtttcccat 34739780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 310 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 44409918 - 44409799
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  44409918 cttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgtcgtgtatagtgtattggggaccataacctcttttata 44409819  T
Q  408 ttggatgaccattagggttt 427  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  44409818 ttggatggccattagggttt 44409799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 236
Target Start/End: Original strand, 24926744 - 24926898
Alignment:
Q  81 aaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgga 180  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  24926744 aaatttaggtcttaat-aaaaacagatt-cataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaccaaaacattgaacattaatatgaacgga 24926841  T
Q  181 tctacgacatgtttgatttatcaag-atattatgaattagggtattaagaatacctg 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| |||||||||    
T  24926842 tctacgacatgtttgatttatcaagaatattaagaattaacgtattaggaatacctg 24926898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 24927003 - 24927126
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  || ||| || |||||||| |||||||||||  |||||    
T  24927003 cttcctcaaccggtacctatatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-tttccacgtatggagtattgggaaccatagcctcttttata 24927101  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  24927102 ttggatgaccattagggtttcccat 24927126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 8093088 - 8093211
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| | ||| |||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  8093088 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaaaagagagt-ttgccgtgttcggtatattggggaccatagcctcttttata 8093186  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    || ||||| | ||||||||| ||||    
T  8093187 tttgatgatcgttagggtttcccat 8093211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 332 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 50306092 - 50305991
Alignment:
Q  332 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatattggatgaccattagggttttc 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  50306092 gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagaat-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcc 50305994  T
Q  430 cat 432  Q
    |||    
T  50305993 cat 50305991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 310 - 423
Target Start/End: Original strand, 38152206 - 38152320
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  38152206 cttcttcaaccggtacctttatgcttcaagttttctttagatggggagaagaacgagt-ttgtcgtgtacggtgtattgggaaccatagcctcttttata 38152304  T
Q  408 ttggatgaccattagg 423  Q
    |||||||  |||||||    
T  38152305 ttggatggtcattagg 38152320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 427
Target Start/End: Original strand, 24963951 - 24964069
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagc--ctcttata 407  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  |||||||| |||| || ||||||  || |||||    
T  24963951 cttcctcaaccagtacatttatgcctcaagtcctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccacatacggtgtcttggtgatcatagcatcttttata 24964049  T
Q  408 ttggatgaccattagggttt 427  Q
    || |||||| ||||||||||    
T  24964050 ttagatgacaattagggttt 24964069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 27955076 - 27954968
Alignment:
Q  311 ttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagc--ctcttatat 408  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||   |||||||||||| |||| |  || ||||||    
T  27955076 ttcctcaaccggtacctttatgtcttaagttctc-tcagatggggagaagagaatgtattgtcgtgt---gtgtattggggatcataacatcttttatat 27954981  T
Q  409 tggatgaccatta 421  Q
    |||||||||||||    
T  27954980 tggatgaccatta 27954968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 23254063 - 23253991
Alignment:
Q  313 cctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtat 386  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||  |||||| |||||    
T  23254063 cctcaaccg-tacatttatgcatcaagttcttttcatatggggagaagagagtgtattgttgtgtacgatgtat 23253991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 346
Target Start/End: Original strand, 12183835 - 12183867
Alignment:
Q  314 ctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 346  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12183835 ctcaaccgctacctttatgcctcaagttctctt 12183867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25354388 - 25354163
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25354388 tgttggaaatttagatcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaagcattgaacatgattatg 25354289  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  |||||||| || | |||||||    
T  25354288 atcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagcagccctctcatcaacaacgat 25354189  T
Q  275 aaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25354188 aaccaaagagaggagatgatctgaaa 25354163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25343841 - 25343576
Alignment:
Q  39 caataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatg----tttaacaatcgtag 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    || ||||||||||     
T  25343841 caataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttatatcttaattaaaaacaaatttcataatacatgcatgttcaacaatcgtaa 25343742  T
Q  135 atcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatacc 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  25343741 atcaatagcagaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatttttgatttatcaagatattaagaattagagtattaggaatacc 25343642  T
Q  235 tggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    | |||||||||||  ||  |||||| | || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25343641 tagataaagcttttgtagcagccctttcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaa 25343576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 280
Target Start/End: Original strand, 21782733 - 21782941
Alignment:
Q  72 acttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgatt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21782733 acttgttagaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgatt 21782831  T
Q  172 atgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaa 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    |||||||| || | |||    
T  21782832 atgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatagctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaa 21782931  T
Q  271 cgataaccaa 280  Q
    ||||||||||    
T  21782932 cgataaccaa 21782941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 81 - 299
Target Start/End: Original strand, 8650792 - 8651011
Alignment:
Q  81 aaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgga 180  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8650792 aaatttagctcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgga 8650890  T
Q  181 tctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataacca 279  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||    
T  8650891 tctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataacca 8650990  T
Q  280 aagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||| ||| ||||||||||    
T  8650991 aagagaggagatgatctgaaa 8651011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Original strand, 4580304 - 4580529
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4580304 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaactatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 4580402  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  | |||||| || | ||||||    
T  4580403 atcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtaacaaccctctcatcaacaacga 4580502  T
Q  274 taaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4580503 taaccaaagagaggagatgatctgaaa 4580529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 33 - 233
Target Start/End: Original strand, 8662722 - 8662922
Alignment:
Q  33 taatctcaataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |    
T  8662722 taatcccaataaatcaaacataaagaccgctctgataccacttgttgtaaatttagctcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattat 8662820  T
Q  133 agatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaat 231  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  8662821 gaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaat 8662920  T
Q  232 ac 233  Q
    ||    
T  8662921 ac 8662922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 75 - 286
Target Start/End: Original strand, 32035269 - 32035480
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32035269 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 32035367  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    |||||||| || | ||||||    
T  32035368 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggttattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacga 32035467  T
Q  274 taaccaaagagag 286  Q
    |||||||||||||    
T  32035468 taaccaaagagag 32035480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 75 - 286
Target Start/End: Original strand, 21190849 - 21191060
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21190849 tgttggaaatttaggtctta-ttataaacagatttcataaaatatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 21190947  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatc-aagatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||    
T  21190948 atcggatctacgatatatttgatttatcaaagatattaagaattagggtattagaaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacga 21191047  T
Q  274 taaccaaagagag 286  Q
    |||||||||||||    
T  21191048 taaccaaagagag 21191060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 247
Target Start/End: Original strand, 21196969 - 21197174
Alignment:
Q  40 aataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaa 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |  |||||    
T  21196969 aataaatcaaacataaagaccgctctgataccacttgttggaaatttaggtcatagt-aaaaacagatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaa 21197067  T
Q  140 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctgga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||    
T  21197068 tagcggaagcaaacaaaacattgaacataagtatgaacggatctacaacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattatgaatacctgga 21197165  T
Q  239 taaagcttt 247  Q
    |||| ||||    
T  21197166 taaatcttt 21197174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 4580563 - 4580687
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  4580563 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata 4580662  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  4580663 ttggatggccattagggtttcccat 4580687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 8651045 - 8651169
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  8651045 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 8651144  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  8651145 ttggatgaccattagggtttcccat 8651169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 25343542 - 25343419
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  25343542 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattgggga-catagcctcttttata 25343444  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  25343443 ttggatgaccattagggtttcccat 25343419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 25354129 - 25354005
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  25354129 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata 25354030  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    || |||||||||||| |||| ||||    
T  25354029 ttagatgaccattagagtttcccat 25354005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 250
Target Start/End: Original strand, 31756196 - 31756373
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaa-acagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 173  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  |  ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31756196 tgttggaaatttaggtcttaataaaaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaacaacggaagcaaataaaacattgaacatgattat 31756295  T
Q  174 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcat 250  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  31756296 aatcggatctacgacatgtttgaattatcaaggatattaagaattagggtattatgaatatctggatagagctttcat 31756373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 247
Target Start/End: Original strand, 21770546 - 21770711
Alignment:
Q  81 aaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgga 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  21770546 aaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgatcaacaatcgtaaattaatagaggaagtaaacaaaacattgaacataaatatgaacgga 21770645  T
Q  181 tctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagcttt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  21770646 tctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattaggaatatctgaataaagcttt 21770711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 74 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18778761 - 18778584
Alignment:
Q  74 ttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataata-catgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgatta 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||| || |||  |  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18778761 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaa-caaatttcataaaaacatgttcaataattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacgttgaacataatta 18778663  T
Q  173 tgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaatta-gggtattaagaatacctggataaagctttcat 250  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18778662 tgatcggatctacgacgtatttgatttatcaatatattaagaattaggggttttaggaatacctggataaaactttcat 18778584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6098191 - 6097999
Alignment:
Q  42 taaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaa---tcgtagatca 138  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||   |  |  ||||    
T  6098191 taaatcaaacatgaagattgctctcataccacttgttgaaaacttaggtcttaataaaaaacaaatttcataaaacatgttcaacaacaattatgaatca 6098092  T
Q  139 a-tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatac 233  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||||||    || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  6098091 aatagcggaagtagacaaaacattgaacatgaa---gaacggatctacgacgtgtttgatttatcaagatgttaagaattagggtattaggaatac 6097999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 21770809 - 21770931
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  21770809 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagat--ggagaagagagagttttgccgtgtacggtgtattggggaccgtagcctcttttata 21770906  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||| || |||||||||||| ||||    
T  21770907 ttggttggccattagggtttcccat 21770931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17581797 - 17581636
Alignment:
Q  80 gaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgg 179  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||| ||| ||  |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17581797 gaaatttagatctaaat-aaaaacataattcataaaacatgttcaactattatgaatcgatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattattatagg 17581699  T
Q  180 atctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcat 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17581698 atctacgacatgtttgatttaccaa--------gaattagggtattaggaatacctggataaagctttcat 17581636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 310 - 427
Target Start/End: Original strand, 21191108 - 21191230
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctca---agttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--tt 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||  ||    
T  21191108 cttcctcaaccggtacctttatgcctcatcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtaaggtatattggggaccatagcctctttt 21191207  T
Q  405 atattggatgaccattagggttt 427  Q
    |||||||||| |||||| |||||    
T  21191208 atattggatggccattatggttt 21191230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 247
Target Start/End: Original strand, 21783340 - 21783462
Alignment:
Q  124 aacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggt 222  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||    
T  21783340 aacaatagtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gt 21783437  T
Q  223 attaagaatacctggataaagcttt 247  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  21783438 attaggaatacctgaataaagcttt 21783462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 247
Target Start/End: Original strand, 21789563 - 21789685
Alignment:
Q  124 aacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggt 222  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||    
T  21789563 aacaatagtaaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gt 21789660  T
Q  223 attaagaatacctggataaagcttt 247  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  21789661 attaggaatacctgaataaagcttt 21789685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 31756462 - 31756585
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  | | |||||||||||||||||||  |||||    
T  31756462 cttcctcaacaggtacctttatacctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgtcgtgtttgatatattggggaccatagcctcttttata 31756560  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  31756561 ttggatggccattagggtttcccat 31756585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 323 - 432
Target Start/End: Original strand, 21783579 - 21783691
Alignment:
Q  323 tacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattgggg--accatagcctc--ttatattggatgacca 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| |||    
T  21783579 tacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtgtacggtgtattggggacaccatagcctcttttatattggatg-cca 21783677  T
Q  419 ttagggttttccat 432  Q
    ||||||||| ||||    
T  21783678 ttagggtttcccat 21783691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 323 - 432
Target Start/End: Original strand, 21789802 - 21789914
Alignment:
Q  323 tacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattgggg--accatagcctc--ttatattggatgacca 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| |||    
T  21789802 tacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtgtacggtgtattggggacaccatagcctcttttatattggatg-cca 21789900  T
Q  419 ttagggttttccat 432  Q
    ||||||||| ||||    
T  21789901 ttagggtttcccat 21789914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 30905824 - 30905946
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  30905824 cttcctcaattggtatatttatgcctcaagttctcttcagatgggg-gaagagagagt-ttgtcgagtacggtgtattgggaaccatagcctcttttata 30905921  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  30905922 ttggatgaccattatggtttcccat 30905946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 21197272 - 21197406
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagag----------ggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagc 399  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  21197272 cttcctcaaccggtatctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagc 21197371  T
Q  400 ctc--ttatattggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||  |||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  21197372 ctcttttatattggatggccattaggttttcccat 21197406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 310 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 17581550 - 17581459
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctctt 404  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  17581550 cttcctcaacttgtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgtcgtgtacagt---ttggggaccatagcctctt 17581459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 205
Target Start/End: Original strand, 34603337 - 34603442
Alignment:
Q  99 aaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatt 198  Q
    |||||| |||| |||| |||||| |||||||  |  || ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34603337 aaaacatatttaataaaacatgtgtaacaattatgaataaatagcg-aagcaaacaaagcattgaacataattatgatcggatctatggcatgtttgatt 34603435  T
Q  199 tatcaag 205  Q
    |||||||    
T  34603436 tatcaag 34603442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 205
Target Start/End: Original strand, 34724614 - 34724719
Alignment:
Q  99 aaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatt 198  Q
    |||||| |||| |||| |||||| |||||||  |  || ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  34724614 aaaacatatttaataaaacatgtgtaacaattatgaataaatagcg-aagcaaacaaagcattgaacataattatgatcggatctatggcatgtttgatt 34724712  T
Q  199 tatcaag 205  Q
    |||||||    
T  34724713 tatcaag 34724719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 28728199 - 28728078
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc-ttatat 408  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  || | | ||||||||||||||||||| | || |||   |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  28728199 cttcctcaaccggtacctcgatgccctaa-tgcgcttcagatggggagaagagcg-gttttgctgtgtacggtatattggggaccatagcctcattatat 28728102  T
Q  409 tggatgaccattagggttttccat 432  Q
     ||||| |||||||||||| ||||    
T  28728101 aggatggccattagggtttcccat 28728078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 6102799 - 6102693
Alignment:
Q  80 gaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaa---tcgtagatcaa-tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 175  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | ||||| |||||   || |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  6102799 gaaatttaggtcttcataaaaaacatatttcataaaatatgttcaacaacaatcatgaatcaaatagcggaagcagacaaaacattgaacatcaatatga 6102700  T
Q  176 tcggatc 182  Q
     ||||||    
T  6102699 acggatc 6102693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 407
Target Start/End: Original strand, 17900402 - 17900484
Alignment:
Q  326 ctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggacc--atagcctcttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||| ||  || |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  17900402 ctttatgcctcaagttctcttcatatccgaagaagagagaacat-gtcatgtacgatgtattggggaccatatagcctcttata 17900484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 33 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32891107 - 32890840
Alignment:
Q  33 taatctcaataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  32891107 taatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaattat 32891009  T
Q  133 agatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaat 231  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32891008 gaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaat 32890909  T
Q  232 acctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    ||||||||||||||||||    | |||||| || | |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32890908 acctggataaagctttcaaggcaaccctctcatcaacaacaataaccaaagagatgagatgatctgaaa 32890840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 34 - 299
Target Start/End: Original strand, 42992946 - 42993211
Alignment:
Q  34 aatctcaataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgta 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |     
T  42992946 aatcccaataaatcaaacatgaagtg-gctctgataccacttgatggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaattatg 42993044  T
Q  134 gatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatac 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42993045 aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattaagaattagggtattaggaatac 42993144  T
Q  234 ctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    || |||||||||||  ||    |||||| || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42993145 cttgataaagcttttgtagccaccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaa 42993211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 74 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10706021 - 10705789
Alignment:
Q  74 ttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgatta- 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  10706021 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtaaatcaatagcgtaagcaaacaaaacattgaacatgattat 10705922  T
Q  173 -----tgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattat 267  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||  |||||||| || |     
T  10705921 gattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattaagaattagggtattaggattacctggataaagcttttgtagcagccctctcatcaa 10705822  T
Q  268 caacgataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10705821 caacgataaccaaagagaggagatgatctgaaa 10705789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14418114 - 14417892
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14418114 tgttggaaatttaggtcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgtttaactatga---atcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 14418019  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | | ||||    
T  14418018 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcatagcagccctctaatcaacgacga 14417919  T
Q  274 taaccaaagagag-aggtgatctgaaa 299  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||    
T  14417918 taaccaaagagagaagatgatctgaaa 14417892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9935455 - 9935230
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9935455 tgttggaaatttaggtcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaatatgattatg 9935357  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||     
T  9935356 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaatctttcatagcagccctctaatcaacaacgt 9935257  T
Q  274 taaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||    
T  9935256 taaccaaagataggagatgatctgaaa 9935230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32897189 - 32896964
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32897189 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 32897091  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    | |||||| || | |||| |    
T  32897090 atcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaagacaaccctctcatcaacaacaa 32896991  T
Q  274 taaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  32896990 taaccaaagagatgagatgatctgaaa 32896964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 74 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7771409 - 7771202
Alignment:
Q  74 ttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7771409 ttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 7771311  T
Q  174 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  | |||||| || | |||||    
T  7771310 gatcggatctacgacatgtttgatttaccaaggatattaagaattagggtattaagaatacctggat-aagcttttgtagcaaccctctcatcaacaacg 7771212  T
Q  273 ataaccaaag 282  Q
    ||||||||||    
T  7771211 ataaccaaag 7771202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 36819147 - 36818923
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| ||||||  |  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36819147 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacaaatctcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagtggaagcaaacaaaacattgaatatgattatg 36819049  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||   ||||||| || | |||||||    
T  36819048 atcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagccgccctctcatcaacaacgat 36818949  T
Q  275 aaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  36818948 aaccaaagagaggagatgatctgaaa 36818923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 75 - 241
Target Start/End: Original strand, 14799399 - 14799564
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14799399 tgttggaaatttaggtcttaat-ataaacaaatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 14799497  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatacctggataa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14799498 atcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattaagaattagggtattaggaatacctggataa 14799564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 75 - 284
Target Start/End: Original strand, 5542143 - 5542352
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542143 tgttggaaatttaggttttaat-ataaatagattttataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 5542241  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    |||||||| || | ||||||    
T  5542242 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctagataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacga 5542341  T
Q  274 taaccaaagag 284  Q
    |||||||||||    
T  5542342 taaccaaagag 5542352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 40 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10700222 - 10699995
Alignment:
Q  40 aataaatcaaacatgaagacc-gctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatca 138  Q
    |||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||         
T  10700222 aataaatcaaacatgatgacccgagctgataccacttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacatatttcataatacatgtttaacaatcgta----- 10700128  T
Q  139 atagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatacctgga 238  Q
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  10700127 ---------------aaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattaagaattagggtattaggaatatctgga 10700043  T
Q  239 taaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagagag 286  Q
    |||| ||||  ||  |||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  10700042 taaaacttttgtagcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagag 10699995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 5542402 - 5542526
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  5542402 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata 5542501  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  5542502 ttggatggccattagggtttcccat 5542526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 22219969 - 22220093
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  22219969 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 22220068  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  22220069 ttggatgaccattagggtttcccat 22220093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 238
Target Start/End: Original strand, 1882726 - 1882899
Alignment:
Q  67 ataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaaca 166  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1882726 ataccacttgttggaaatttaggtcttaatataaaacagatttcatagaacatgttcaacaattaagaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaaca 1882825  T
Q  167 tgattatgatcggatct-acgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctgga 238  Q
    ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1882826 tgaatatgaacggatctaatgacatgtttgatttatcaaggatgttaagaattagggtattaggaatacctgga 1882899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 32890806 - 32890682
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  32890806 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 32890707  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  32890706 ttggatggccattagggtttcccat 32890682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 32896930 - 32896806
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  32896930 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 32896831  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  32896830 ttggatggccattagggtttcccat 32896806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 58 - 242
Target Start/End: Original strand, 39735514 - 39735702
Alignment:
Q  58 accgctcttataccacttgttagaaatttaggtctt-aat--taaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaaca 154  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |  |||||||||||||| ||| |    
T  39735514 accgctctgataccacttgttggaaatttaggtttttaataataaaaatagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagtaaata 39735613  T
Q  155 aaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatc-aagatattatgaattagggtattaagaatacctggataaa 242  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  39735614 aaatattgaacatgattatgattgtatctacgacatgtttgatttatcaaagatattaagaactagggtataaggaatacctggataaa 39735702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 42033718 - 42033595
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||||  |||||    
T  42033718 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggagagaagagagagt-ttgccgtgtacaatgtattggggaccatagcctcctttata 42033620  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  42033619 ttggatgaccattagggtttcccat 42033595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 310 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 10705755 - 10705636
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||  |||||    
T  10705755 cttcctcaaccggtacctttatggcttaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtatattggagaccatagcctcttttata 10705656  T
Q  408 ttggatgaccattagggttt 427  Q
    || |||||| ||||||||||    
T  10705655 tttgatgactattagggttt 10705636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 239
Target Start/End: Original strand, 22219706 - 22219864
Alignment:
Q  82 aatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaac-aaaacattgaacatgattatgatcgga 180  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| || | |  |  ||||||||| |||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22219706 aatttaggtcttaat-aaaaagagatttcataaaacatgttcaatagttatgaatcaatagcagaagaaaaagaaaactttgaacatgattatgatcgga 22219804  T
Q  181 tctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggat 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22219805 tctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggat 22219864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10699947 - 10699823
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||    
T  10699947 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttttcgtcagatggagagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagtctcttttata 10699848  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    || ||||||||||||||||| ||||    
T  10699847 tttgatgaccattagggtttcccat 10699823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 310 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 9935196 - 9935085
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctcttata-t 408  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  9935196 cttcctcaatcggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaaga--gagt-ttgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatt 9935100  T
Q  409 tggatgaccattagg 423  Q
    |||||| ||||||||    
T  9935099 tggatggccattagg 9935085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 310 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 14417858 - 14417765
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctctt 404  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14417858 cttcctcaaccggtacgtttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctctt 14417765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36818889 - 36818766
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  36818889 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcatcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 36818791  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    || |||  |||||||||||| ||||    
T  36818790 tttgatagccattagggtttcccat 36818766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 248
Target Start/End: Original strand, 39727299 - 39727467
Alignment:
Q  74 ttgttagaaatttaggtcttaat--taaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgatt 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39727299 ttgttggaaatttaggtcttaataataaaaatagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaataacggaagcaaacaaaacattgaacatgatt 39727398  T
Q  172 atgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttc 248  Q
    ||||||         |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||    
T  39727399 atgatc---------acatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtataagaaatacctggaaaaaactttc 39727467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 42993245 - 42993366
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| | ||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||    
T  42993245 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaa---agagtattgccgtgttcggtatattggggaccataacctcttttata 42993341  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||    
T  42993342 ttggatggcgattagggtttcccat 42993366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 310 - 404
Target Start/End: Original strand, 39727550 - 39727644
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctctt 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39727550 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagtactcttgagatggggagaagagagagttttgttgtgtacggtatattggggaccatatcctctt 39727644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 310 - 401
Target Start/End: Original strand, 1883061 - 1883151
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcct 401  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  1883061 cttcctcaaccagtacctttatgtctcaagttctcttcagatggggagaagagaaagt-ttgccgtgtattgtgtattggggaccatagcct 1883151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 81 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24250272 - 24250171
Alignment:
Q  81 aaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgga 180  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| |||||   |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24250272 aaatttaggtcttaa--aaaaacatatttcataaaacatgttgaacaaatatgaatcaatagcggaaacaaacaaaatattgaacattattatgatcgga 24250175  T
Q  181 tcta 184  Q
    ||||    
T  24250174 tcta 24250171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 310 - 382
Target Start/End: Original strand, 39735790 - 39735862
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggt 382  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  39735790 cttccttaactggtacatttatgcctcaagtactcttcagatggggagaagagagagttttgtcgtgtacggt 39735862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 85
Target Start/End: Original strand, 31373514 - 31373560
Alignment:
Q  39 caataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatt 85  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  31373514 caataaatcaaacatgaagaccgttctgataccacttgttagaaatt 31373560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1171414 - 1171351
Alignment:
Q  183 tacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagcttt 247  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  | |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1171414 tacgacatatttgatttatcaagataacaagaatta-ggtattaggaatacctggttaaagcttt 1171351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 85
Target Start/End: Original strand, 31398947 - 31398997
Alignment:
Q  35 atctcaataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatt 85  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  31398947 atcttaataaatcaaacataaagaccgttttgataccacttgttagaaatt 31398997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 173
Target Start/End: Original strand, 31379430 - 31379502
Alignment:
Q  101 aacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 173  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||  |  ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31379430 aacaaatttcataacacatgtttaataattatgaatcaatgacggaggcaaataaaacattgaacatgattat 31379502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 175
Target Start/End: Original strand, 31399079 - 31399119
Alignment:
Q  135 atcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 175  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  31399079 atcaatagtggaggcaaacaatacattgaacatgattatga 31399119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 48)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24288196 - 24287938
Alignment:
Q  40 aataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |  |||||    
T  24288196 aataaatcaaacatgaagaccgctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaat---aaatagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaa 24288100  T
Q  140 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctgga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24288099 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgtatctacgacatgtttgatttatcaaggttattaagaattagggtattaggaatacctgga 24288000  T
Q  239 taaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24287999 taaaactttcatagcagccctctaatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaa 24287938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Original strand, 33458249 - 33458475
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33458249 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatatatgttcaacaatcgtaaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattatg 33458348  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || | ||||||    
T  33458349 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcttagcagccctctcatcaacaacga 33458448  T
Q  274 taaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  33458449 taaccaaagagatgagatgatctgaaa 33458475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 48161173 - 48160911
Alignment:
Q  34 aatctcaataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgta 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||| ||        
T  48161173 aatctcaataaatcaaacatgaaggtggctctgataccacttgttagaaatttaggtcttaat-aaaaatagatttcataaaatatgttcaactatga-- 48161077  T
Q  134 gatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatac 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  48161076 -atcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattaagaattagggtattaggaatac 48160978  T
Q  234 ctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    ||| ||||||||||  ||  |||||||| || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  48160977 ctgaataaagcttttgtaacagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaa 48160911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 286
Target Start/End: Original strand, 10739281 - 10739533
Alignment:
Q  35 atctcaataaatcaaacatgaagacc-gctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgta 133  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| || |||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |     
T  10739281 atcttaataaaccaaacatgtagacctgctctgataccacttgttggacatttagctcttaac-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatg 10739379  T
Q  134 gatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaata 232  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10739380 aatcaatagcagaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaata 10739479  T
Q  233 cctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagagag 286  Q
    |||||||||| ||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  10739480 cctggataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagag 10739533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 286
Target Start/End: Original strand, 10953050 - 10953302
Alignment:
Q  35 atctcaataaatcaaacatgaagacc-gctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgta 133  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| || |||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |     
T  10953050 atcttaataaaccaaacatgtagacctgctctgataccacttgttggacatttagctcttaac-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatg 10953148  T
Q  134 gatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaata 232  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10953149 aatcaatagcagaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaata 10953248  T
Q  233 cctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagagag 286  Q
    |||||||||| ||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  10953249 cctggataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagag 10953302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 74 - 299
Target Start/End: Original strand, 6257187 - 6257413
Alignment:
Q  74 ttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6257187 ttgttggaaatttaggtcttaat-ataaatagatttcataatacatgttcaacaatcataaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 6257285  T
Q  174 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacg 272  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || | |||||    
T  6257286 gatcggatctacaacatgtttgatttatcaaggatgttaagaattaggatattaggaatacctggataaagctttcgtagcagccctctcatcaacaacg 6257385  T
Q  273 ataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||    
T  6257386 ataaccaaagtgaggagatgatctgaaa 6257413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 48167351 - 48167130
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||| ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48167351 tgttagaaatttaggtcttaat-aaaaatagatttcataaaatatgttcaactatga---atcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacataattatg 48167256  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||  |||||||| || | |||||||    
T  48167255 atcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattaagaattagggtattaggaatacctgaataaagcttttgtaacagccctctcatcaacaacgat 48167156  T
Q  275 aaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  48167155 aaccaaagagaggagatgatctgaaa 48167130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 55 - 299
Target Start/End: Original strand, 33461361 - 33461600
Alignment:
Q  55 aagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaaca 154  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||     || ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33461361 aagaccgctctgatacca-ttgttagaaatttaaatcttaattaaaaacatattt-----tatatgttcaacaatcgtaaatcaatagtggaagcaaaca 33461454  T
Q  155 aaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataa 254  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   |  |    
T  33461455 aaacattgaacatgattatggtcggatttacgacatgtttgatttatcaagatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagcttttgcagca 33461554  T
Q  255 gccctctaattatcaacgataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    ||||||| || | ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  33461555 gccctctcatcaacaacgataatcaaagagatgagatgatctgaaa 33461600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 286
Target Start/End: Original strand, 10733253 - 10733440
Alignment:
Q  100 aaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgattt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733253 aaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgattt 10733352  T
Q  200 atcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagagag 286  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  10733353 atcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagag 10733440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 286
Target Start/End: Original strand, 10947022 - 10947209
Alignment:
Q  100 aaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgattt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10947022 aaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgattt 10947121  T
Q  200 atcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagagag 286  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  10947122 atcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaacctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagag 10947209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 43 - 247
Target Start/End: Original strand, 26963292 - 26963494
Alignment:
Q  43 aaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatag 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||  |  ||||||||    
T  26963292 aaatcaaacatgaagaccgctctgatactacttgttggaaatttaggtcttaat-aaaaacaaatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatag 26963390  T
Q  143 cggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  26963391 cggaagcaaacaaaacattgaacataagtatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaatta--gtattaggaatacctggataa 26963488  T
Q  242 agcttt 247  Q
    ||||||    
T  26963489 agcttt 26963494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 49976804 - 49976634
Alignment:
Q  34 aatctcaataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgta 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| |||| || ||||||  |     
T  49976804 aatcccaataaatcaaacatgaagaccactctgataccacttgttagaaatttagattttaat-aaaaacaaatttcataaaacatattcaacaattatg 49976706  T
Q  134 gatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 205  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49976705 aatcgatagcgaaagcaaacaaaacattgaatatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 49976634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 310 - 427
Target Start/End: Original strand, 6257447 - 6257566
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  6257447 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata 6257546  T
Q  408 ttggatgaccattagggttt 427  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6257547 ttggatgaccattagggttt 6257566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 24287904 - 24287781
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  24287904 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattgggga-catagcctcttttata 24287806  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  24287805 ttggatgaccattagggtttcccat 24287781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 10733594 - 10733715
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctcttatatt 409  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733594 cttcctcaaccgatacctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttatatt 10733692  T
Q  410 ggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||| |||||||||||| ||||    
T  10733693 ggatggccattagggtttcccat 10733715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 10947363 - 10947484
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctcttatatt 409  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10947363 cttcctcaaccgatacctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttatatt 10947461  T
Q  410 ggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||| |||||||||||| ||||    
T  10947462 ggatggccattagggtttcccat 10947484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 26957045 - 26957169
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  26957045 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 26957144  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    || |||| |||||||||||| ||||    
T  26957145 tttgatggccattagggtttcccat 26957169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 48167096 - 48166972
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  48167096 cttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 48166997  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  48166996 ttggatggccattagggtttcccat 48166972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 10739581 - 10739702
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctcttatatt 409  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10739581 cttcctcaaccgatacctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagt-ttaccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttatatt 10739679  T
Q  410 ggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||| |||||||||||| ||||    
T  10739680 ggatggccattagggtttcccat 10739702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 10953350 - 10953471
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctcttatatt 409  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10953350 cttcctcaaccgatacctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagt-ttaccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttatatt 10953448  T
Q  410 ggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||| |||||||||||| ||||    
T  10953449 ggatggccattagggtttcccat 10953471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 48160877 - 48160753
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  48160877 cttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 48160778  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    || |||| |||||||||||| ||||    
T  48160777 tttgatggccattagggtttcccat 48160753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 50168769 - 50168595
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50168769 tgttggaaatttaggtcttaat-aaaaccagattacataaaacacgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 50168671  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcat 250  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| | |||||||||| | | ||||||||    
T  50168670 atcgaatatacgacatgtttgatttatcaagaatattaacaatta-ggtataaggaatacctggttgaggctttcat 50168595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 50168511 - 50168389
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  50168511 cttcctcaac-ggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggagagaaaagagagttttg-cgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata 50168414  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  50168413 ttgaatgaccattagggttttccat 50168389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 314 - 427
Target Start/End: Original strand, 33458513 - 33458627
Alignment:
Q  314 ctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatattgg 411  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33458513 ctcaaccgatacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagaaagt-ttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattgg 33458611  T
Q  412 atgaccattagggttt 427  Q
    |||||| |||||||||    
T  33458612 atgaccgttagggttt 33458627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4632482 - 4632393
Alignment:
Q  161 tgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||    
T  4632482 tgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattaagaattagggtatcagaaatacttggataaagctttcat 4632393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 33461634 - 33461757
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  33461634 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttcttttcagatggggagaagagagagt-ttaccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 33461732  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||    
T  33461733 ttggatgatcatcagggtttcccat 33461757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 310 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 4632299 - 4632193
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||    
T  4632299 cttcctcaaccggtatctttatgcctcaagttctcttcagatgagaagaagagaaagtattgtcatgtactgtatattggggaccataacctcttttata 4632200  T
Q  408 ttggatg 414  Q
    |||||||    
T  4632199 ttggatg 4632193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Original strand, 26956812 - 26956929
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  26956812 tgttggaaatttaggtcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaaataaaacattgaacataagtatg 26956910  T
Q  175 atcggatctacgacatgtt 193  Q
    | |||||||||||||||||    
T  26956911 aacggatctacgacatgtt 26956929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 288
Target Start/End: Original strand, 44831658 - 44831808
Alignment:
Q  139 atagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctgg 237  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  44831658 atagcggaagcaaattaatcattgaacatgaatatgatcgaatctacgacatgtttaatttatcaaggatattaagaactagggtattaagaatacctag 44831757  T
Q  238 ataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagagagag 288  Q
    || ||||||| |||  | |||||| |  | ||||||||| || ||||||||    
T  44831758 atgaagctttgataacaaccctctcaacaacaacgataaacagagagagag 44831808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 337 - 427
Target Start/End: Original strand, 26971824 - 26971916
Alignment:
Q  337 aagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatattggatgaccattagggttt 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  26971824 aagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagtctcttttatattggatggccattagggttt 26971916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 4632964 - 4632869
Alignment:
Q  74 ttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgat 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4632964 ttgttggaaatttaggtcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattattaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgat 4632869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 310 - 427
Target Start/End: Original strand, 44831861 - 44831975
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||  |||   ||| |||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  44831861 cttcctcaaccggtatttttatgcctcaagttctcttcggatgcggagaagagagag--ttg---tgttcggtatattggggaccatagcctcttttata 44831955  T
Q  408 ttggatgaccattagggttt 427  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  44831956 ttggatgaccattagggttt 44831975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3769673 - 3769586
Alignment:
Q  146 aagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatac 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  3769673 aagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttcattaatcaaggatattaataatta-ggtattaggaatac 3769586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 233
Target Start/End: Original strand, 19686341 - 19686469
Alignment:
Q  106 atttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 205  Q
    ||||||||| ||||||| || ||   || ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  19686341 atttcataaaacatgttcaataactataaatcaataacggaagcaaacaaaatattgaacgtaattatcatcggatctacaacatgcttgattaatcaag 19686440  T
Q  206 -atattatgaattagggtattaagaatac 233  Q
     |||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  19686441 catattaagaattcgggtattatgaatac 19686469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 314 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 35177710 - 35177595
Alignment:
Q  314 ctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatattgg 411  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  | |   ||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||||  |||||||||    
T  35177710 ctcaaccgatacatttatgcctcaagttctcttcagatgaggagaccatgatttattgttgtgtacggtgtattgaggactataacctcttttatattgg 35177611  T
Q  412 atgaccattagggttt 427  Q
    ||||||||||||||||    
T  35177610 atgaccattagggttt 35177595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 50427489 - 50427358
Alignment:
Q  138 aatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgt--------ttgatttatcaag-atattatgaattagggtattaag 228  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |    
T  50427489 aatagtggaagcaatcaaaacattgaa-atgattatgatcggatgtacgacatgtttaatttattgatttatcaagaagattaagaattagggtattagg 50427391  T
Q  229 aatacctggataaagctttcatataagccctct 261  Q
    |||||||||||| ||| |||||  |||||||||    
T  50427390 aatacctggatatagcgttcatggaagccctct 50427358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 326 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 49976488 - 49976386
Alignment:
Q  326 ctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatattggatgaccattagg 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||     ||| ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||    
T  49976488 ctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacgg-----tggagaccataacctcttttatattggatggccattagg 49976395  T
Q  424 gttttccat 432  Q
    |||||||||    
T  49976394 gttttccat 49976386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9237470 - 9237410
Alignment:
Q  145 gaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaag 205  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9237470 gaagcaaacagaacattgaatatgattatgctcggatttacgacatgtttgatttatcaag 9237410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 50155865 - 50155757
Alignment:
Q  321 ggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggag-aagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagc--ctcttatattggatgacc 417  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |    
T  50155865 ggtacctttatgccttaagttcttttcagatgaggagaaagagagagttttg-cgtgtacggtgtattggggaccataacttcttttatattggatgatc 50155767  T
Q  418 attagggttt 427  Q
    |||| |||||    
T  50155766 attatggttt 50155757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 362
Target Start/End: Original strand, 17627022 - 17627074
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagag 362  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  17627022 cttcctcaaccggtacttttatgcttctagttctcttcagatggggagaagag 17627074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 181
Target Start/End: Original strand, 55473129 - 55473230
Alignment:
Q  76 gttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatga 175  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||| || |||   | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  55473129 gttagaaatttaggtcttaat-agaaacaaatttcataaaatatgttcaataat---aaatcaatagcggaagcaaataaaatattgaatatgattatga 55473224  T
Q  176 tcggat 181  Q
    | ||||    
T  55473225 ttggat 55473230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 166
Target Start/End: Original strand, 34308057 - 34308144
Alignment:
Q  77 ttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaaca 166  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||| || |||  |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  34308057 ttagaaatttacgtcttaat--aaaacagattttataaaacatgttcaataattatgaatcaatagcggaagcatacaaaatattgaaca 34308144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 310 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 32284597 - 32284501
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctcttata 407  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || || || | ||||||| | |||||| ||||||||||  |||||||    
T  32284597 cttcctcgatcggtacctttaggcctcaagttttcttcagatgaggagaatagagaata-tatcatgtatgatgtattagggaccatagaatcttata 32284501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 50156046 - 50156003
Alignment:
Q  163 aacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaga 206  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50156046 aacataattaagatcggatatacgacatgtttgatttatcaaga 50156003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 367
Target Start/End: Original strand, 19686567 - 19686620
Alignment:
Q  314 ctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagt 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| ||||    
T  19686567 ctcaaccggtaccattatgcctcaatttctcttgggatgaggagaagagagagt 19686620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33045328 - 33045259
Alignment:
Q  140 tagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatat 209  Q
    |||| |||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| ||||    
T  33045328 tagcagaagcaaataaaaaactaaacatgattataatcggatctacaacttgtttgatctatcaaaatat 33045259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 50156159 - 50156043
Alignment:
Q  39 caataaatcaaa-catgaagacc-gctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagat 136  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||  | ||||| |||| ||||||  |||| ||||||| ||||||  |  ||    
T  50156159 caataaatcaaaacatgaagacccgctctgatatcacttgttaaaaatttaattgttaat-aaaaccagattatataaaacatgttcaacaattatgaat 50156061  T
Q  137 caatagcggaagcaaaca 154  Q
    |||||||||||| |||||    
T  50156060 caatagcggaagtaaaca 50156043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28704619 - 28704559
Alignment:
Q  144 ggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa 204  Q
    |||| |||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28704619 ggaaacaaataaaatattgagcatgaatatgatcagatctacaacatgtttgatgtatcaa 28704559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 299
Target Start/End: Original strand, 3817249 - 3817519
Alignment:
Q  30 tcataatctcaataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaat 129  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3817249 tcataattccaatagatcaaacataaacaccgctctgataccacttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaat 3817347  T
Q  130 cgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaag 228  Q
      |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  3817348 tatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattagg 3817447  T
Q  229 aatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagagag-aggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||    | |||||| || | ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3817448 aatacctggataaagctttcaaggcaaccctctcatcaacaacgataaccaaagagagaagatgatctgaaa 3817519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 74 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20239128 - 20238902
Alignment:
Q  74 ttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20239128 ttgttggaaatttaggtcttaat-ataaacaaatttcataaaacatgttcaacaatcatacatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 20239030  T
Q  174 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||     
T  20239029 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaaca 20238930  T
Q  273 ataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20238929 ataaccaaagagatgagatgatctgaaa 20238902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 74 - 287
Target Start/End: Original strand, 42767276 - 42767490
Alignment:
Q  74 ttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42767276 ttgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaatattgaacatgattat 42767375  T
Q  174 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacg 272  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||  |||||||| || | |||||    
T  42767376 gatcggatctacgacatatttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatatctggataaagcttttgtagcagccctctcatcaacaacg 42767475  T
Q  273 ataaccaaagagaga 287  Q
    |||| ||||||||||    
T  42767476 ataatcaaagagaga 42767490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 34 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 339588 - 339377
Alignment:
Q  34 aatctcaataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgta 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |     
T  339588 aatctcaataaatcaaacatgaaggtggctctgataccacttgttggaaatttagctcttaat-ataaagagatttcataaaacatgttcaacaattatg 339490  T
Q  134 gatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaata 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  339489 aatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaata 339390  T
Q  233 cctggataaagct 245  Q
    |||||||||||||    
T  339389 cctggataaagct 339377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 81 - 299
Target Start/End: Original strand, 5979162 - 5979382
Alignment:
Q  81 aaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcgga 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  5979162 aaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgttgaacaatcgtaaatcaatagcgaaagcaaacaaactattgaacatgattatgattgga 5979261  T
Q  181 tctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataacca 279  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  ||| |||| || | ||||||||||||    
T  5979262 tctacgacatgtttgatttattaaggatgttaagaattagggtattaggaatacctggataaagcttttgtagcagctctctcatcaacaacgataacca 5979361  T
Q  280 aagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||| ||| ||||||||||    
T  5979362 aagagaggagatgatctgaaa 5979382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Original strand, 3811152 - 3811377
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3811152 tgttggaaatgtaggtcttaat-ataaacagatttcataatacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 3811250  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    | |||||| || | ||||||    
T  3811251 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcaaccctctcatcaacaacga 3811350  T
Q  274 taaccaaagagag-aggtgatctgaaa 299  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||    
T  3811351 taacaaaagagagaagatgatctgaaa 3811377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Original strand, 28420942 - 28421167
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28420942 tgttggaaatttagctcttgat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 28421040  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||    
T  28421041 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacga 28421140  T
Q  274 taaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28421141 taaccaaagagaggagatgatctgaaa 28421167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 74 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 351963 - 351756
Alignment:
Q  74 ttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 173  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  351963 ttgttggaaatttagctcttaat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaacagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 351865  T
Q  174 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||    
T  351864 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacg 351765  T
Q  273 ataaccaaa 281  Q
    |||||||||    
T  351764 ataaccaaa 351756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 250
Target Start/End: Original strand, 35147996 - 35148163
Alignment:
Q  84 tttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatct 183  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35147996 tttatgtcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattataaatcgatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatct 35148094  T
Q  184 acgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaatta-gggtattaagaatacctggataaagctttcat 250  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35148095 acgacacgtttgatttatcaaggatattaagaattaggggtattaggaatacctggataaagctttcat 35148163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 74 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12804177 - 12804014
Alignment:
Q  74 ttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 173  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  12804177 ttgttggaaatttaggtcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgttcaacgattatgaatcaatagcggaagcaagcaaaacattgaacatgaacat 12804079  T
Q  174 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattatgaattagggtattaagaatacctgg 237  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12804078 gaacggatctacgacatgtttgatttatcaagaatattaagaattagggtattaagaatacctgg 12804014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 351704 - 351581
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  351704 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 351606  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  351605 ttggatggccattagggtttcccat 351581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 28421201 - 28421324
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  28421201 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata 28421299  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  28421300 ttggatggccattagggtttcccat 28421324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 3811411 - 3811534
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  3811411 cttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 3811509  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  3811510 ttggatgaccattagggtttcccat 3811534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 3817553 - 3817676
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  3817553 cttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 3817651  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  3817652 ttggatgaccattagggtttcccat 3817676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 310 - 422
Target Start/End: Original strand, 5979416 - 5979531
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctctt---at 406  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    |    
T  5979416 cttcctcaaccggtacttttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccataacctcttttatt 5979515  T
Q  407 attggatgaccattag 422  Q
    ||||||||||||||||    
T  5979516 attggatgaccattag 5979531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 310 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 20238868 - 20238762
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  20238868 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttata 20238769  T
Q  408 ttggatg 414  Q
    |||||||    
T  20238768 ttggatg 20238762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 35148251 - 35148374
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  35148251 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggatcatagcctcttttata 35148349  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  35148350 ttggatggccattagagtttcccat 35148374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 43540140 - 43539989
Alignment:
Q  97 taaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttga 196  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| || |||  |  |||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43540140 taaaaacagatttcatagaacatgttcaataattatgaatcaatagcggaattaaataaaatattgaacatgattatgatcggatctacaacatgtttga 43540041  T
Q  197 tttatcaag-atattatgaattagggtattaagaatacctggataaagcttt 247  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  43540040 tttatcaagaatattaaaaattagggtattatgaatacctggatgaagcttt 43539989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 310 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 339297 - 339183
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||  ||||  |||||    
T  339297 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgtcgtgtacggtatattggggaccatgacctcttttata 339199  T
Q  408 ttggatgaccattagg 423  Q
    ||||||| ||||||||    
T  339198 ttggatggccattagg 339183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 137 - 245
Target Start/End: Original strand, 22741969 - 22742076
Alignment:
Q  137 caatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattatgaattagggtattaagaatacctg 236  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||| |||||||||    
T  22741969 caatagcggaagcaaactgaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaagatattgaggatta-ggtattaggaatacctg 22742067  T
Q  237 gataaagct 245  Q
    ||| |||||    
T  22742068 gatgaagct 22742076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5849642 - 5849529
Alignment:
Q  135 atcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatac 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||||||    
T  5849642 atcaatagcggaagcaaccaaaacattgaacataaatatgaacggatctacgacatgtttgatttatcaaggatatcaagaattaggatattaggaatac 5849543  T
Q  234 ctggataaagcttt 247  Q
    |||||| |||||||    
T  5849542 ctggatgaagcttt 5849529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 310 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 5849447 - 5849329
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||    
T  5849447 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttatcttcagatggggagaaaagagagt-ttgccgtgtacggtatattgaggaccatagcctcttttata 5849349  T
Q  408 ttggatgaccattagggttt 427  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  5849348 ttggatgaccattaaggttt 5849329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 315 - 432
Target Start/End: Original strand, 22742176 - 22742295
Alignment:
Q  315 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatattgga 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  22742176 tcaactggtacctttatgcctcaagttctcttcagattgggagaagagagagttttgccatgtacggtatattggagaccatagtctcttttatattgga 22742275  T
Q  413 tgaccattagggttttccat 432  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  22742276 tggccattagggtttcccat 22742295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26383774 - 26383630
Alignment:
Q  104 agatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatca 203  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||  |  ||||| | | ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26383774 agatttcataagacatgttcaacaattatgaatcaacaacagaaacaaacaaaatattgaacatgatcatgatcggatctacgacatgtttgatttatca 26383675  T
Q  204 ag-atattatgaattagggtattaagaatacctggataaagcttt 247  Q
    || ||| || |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  26383674 agcatactaagaattagggtattaggaataccttgatgaagcttt 26383630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 250
Target Start/End: Original strand, 30219288 - 30219404
Alignment:
Q  135 atcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgattta-tcaagatattatgaattagggtattaagaatac 233  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||| |||||     
T  30219288 atcattagcggaatcaaacaaaacgttgaacatgaatatgaacggatctacgacatgtttgatttattaaagatattaagaattatggtattaggaatat 30219387  T
Q  234 ctggataaagctttcat 250  Q
    |||||||||||||||||    
T  30219388 ctggataaagctttcat 30219404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 315 - 393
Target Start/End: Original strand, 35150788 - 35150865
Alignment:
Q  315 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggac 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  35150788 tcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccatgtacggtgtattggggac 35150865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15843864 - 15843740
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgta-cggtgtattggggaccatagcctc--ttat 406  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||    
T  15843864 cttcctcaactggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaatagagagt-ttgccgtgtaccggtgtattggagaccataacctcttttat 15843766  T
Q  407 attggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||    
T  15843765 attggatgaccattagagtttcccat 15843740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15860973 - 15860849
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgta-cggtgtattggggaccatagcctc--ttat 406  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||    
T  15860973 cttcctcaactggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaatagagagt-ttgccgtgtaccggtgtattggagaccataacctcttttat 15860875  T
Q  407 attggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||    
T  15860874 attggatgaccattagagtttcccat 15860849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 327 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 26383569 - 26383463
Alignment:
Q  327 tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatattggatgaccattaggg 424  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26383569 tttatgcctcaagttctcttcaaatagggagaagagagagt-ttgccgtgtccggtgtattagggaccatagcctcttttatattggatgaccattaggg 26383471  T
Q  425 ttttccat 432  Q
    ||| ||||    
T  26383470 tttcccat 26383463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 310 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 43539897 - 43539773
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgg---ggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--tt 404  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||||  ||    
T  43539897 cttcctcaaccagtacctttatgcctaaagttctcttcagatgggaaggagaagagagagt-ttgccgtgcacggtatattggggaccataacctctttt 43539799  T
Q  405 atattggatgaccattagggttttcc 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  43539798 atattgggtgaccattagggttttcc 43539773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 26381001 - 26380890
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagc-ctcttatat 408  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||  | |||| ||||||||||||| || ||||||    
T  26381001 cttcctcaactgctacctttatgcctaaagttttcttcagatcgggagaagagagagt-ttgtcgtgtctgatgtactggggaccatagctcttttatat 26380903  T
Q  409 tggatgaccatta 421  Q
    |||||||||||||    
T  26380902 tggatgaccatta 26380890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15843985 - 15843912
Alignment:
Q  213 gaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagagag 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  15843985 gaattagggtattaggaatacctggatcaagctttcatagcagccctctaatcaacaacaataaccaaagagag 15843912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15861094 - 15861021
Alignment:
Q  213 gaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagagag 286  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  15861094 gaattagggtattaggaatacctggatcaagctttcatagcagccctctaatcaacaacaataaccaaagagag 15861021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 200
Target Start/End: Original strand, 18666547 - 18666602
Alignment:
Q  144 ggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgattta 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18666547 ggaagcaaacaaaacattgaacttgattatgatcagat-tacgacatgtttgattta 18666602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3677942 - 3677890
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagag 362  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3677942 cttcctcaaccgatacttttatgcctcaatttctcttcagatggagagaagag 3677890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26381284 - 26381136
Alignment:
Q  34 aatctcaataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgta 133  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |     
T  26381284 aatcccaataaatcaaatatgaacac-gctctgatatcactcattagaaatttaggtctaaat--aaaatagatttcataagacatgttcaacaattatg 26381188  T
Q  134 gatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctac 185  Q
     |||||  | | || |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||    
T  26381187 aatcaagggggaaaacaaacacaatattgaacatgatcatgatcagatctac 26381136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 84
Target Start/End: Original strand, 30219215 - 30219266
Alignment:
Q  33 taatctcaataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaat 84  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30219215 taatcccaataaatcaaacatgaataccgctctgataccacgtgttagaaat 30219266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 85
Target Start/End: Original strand, 18656697 - 18656744
Alignment:
Q  39 caataaatcaaacatgaagac-cgctcttataccacttgttagaaatt 85  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  18656697 caataaatcaaacatgaagacatgctcttatatcacttgttagaaatt 18656744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 309 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 7608361 - 7608315
Alignment:
Q  309 acttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgggg 355  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  7608361 acttcctaaatcggtacctttatgactcaagttctcttccgatgggg 7608315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 389 - 432
Target Start/End: Original strand, 35152849 - 35152894
Alignment:
Q  389 gggaccatagcctctt--atattggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35152849 gggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccat 35152894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Original strand, 605 - 827
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  605 tgttggaaatttaggtcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgtttaactatga---atcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 700  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | | ||||    
T  701 atcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcatagcagccctctaatcaacgacga 800  T
Q  274 taaccaaagagag-aggtgatctgaaa 299  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||    
T  801 taaccaaagagagaagatgatctgaaa 827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 310 - 404
Target Start/End: Original strand, 861 - 954
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctctt 404  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  861 cttcctcaaccggtacgtttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctctt 954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 33 - 299
Target Start/End: Original strand, 172831 - 173098
Alignment:
Q  33 taatctcaataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||  |||||  |    
T  172831 taatcccaataaatcaaacatgaagaccgctctgatactacttgttgaaaatttaggtcttaat-ataaacaggtttcataaaacatgttctacaattat 172929  T
Q  133 agatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaat 231  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  172930 gaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaaaatgattatgatcggatctacgacatgtttaatttatcaaggatattaagaattaggatattaggaat 173029  T
Q  232 acctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagagag-aggtgatctgaaa 299  Q
    || |||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  173030 acatggataaagctttcaagatagccctcttatcaacaacgataaccaaagagagaagatgatctgaaa 173098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Original strand, 173132 - 173255
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  173132 cttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtatacggtgtattggggaccatagcctcttttata 173230  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  173231 ttggatgaccattagggtttcccat 173255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 299
Target Start/End: Original strand, 1176 - 1402
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1176 tgttggaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaaaggcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 1275  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacga 273  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    | |||||| || | ||||||    
T  1276 atcggatctacgatatgtttgatttatcaaggatattaagaattagggtattaggaatacctggataaagctttcaaggcatccctctcatcaacaacga 1375  T
Q  274 taaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1376 taaccaaagagaggagatgatctgaaa 1402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 311 - 432
Target Start/End: Original strand, 1437 - 1559
Alignment:
Q  311 ttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatat 408  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||| | | |||||||||||||||||||  ||||||    
T  1437 ttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatat 1535  T
Q  409 tggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||| |||||||| ||||||||    
T  1536 tggatggccattaggattttccat 1559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5712 - 5486
Alignment:
Q  74 ttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 173  Q
    ||||| ||||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||||| ||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5712 ttgttggaaatttagctcttgat-ataaacagatttcataaaacatgttcaacaattatgaatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattat 5614  T
Q  174 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacg 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||    
T  5613 gatcggatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctggataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacg 5514  T
Q  273 ataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5513 ataaccaaagagaggagatgatctgaaa 5486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 4)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 6734 - 6474
Alignment:
Q  40 aataaatcaaacatgaagaccgctcttataccacttgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtaga-tca 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||  |||||| ||||||    || |||    
T  6734 aataaatcaaacatgaagacggctctgataccacttgttggaaatttagctcttaat-ataaaca-atttcataaaccatgttcaacaatttatgaatca 6637  T
Q  139 atagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatacctgg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  6636 atagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgactgaatctacaacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatacctgg 6537  T
Q  238 ataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    ||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  6536 ataaagctttcaaggcagccctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaa 6474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 6440 - 6316
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  6440 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata 6341  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  6340 ttggatggccattagggtttcccat 6316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 310 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 12313 - 12189
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttata 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  12313 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttata 12214  T
Q  408 ttggatgaccattagggttttccat 432  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||    
T  12213 ttggatggccattagggtttcccat 12189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0208; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12513 - 12347
Alignment:
Q  135 atcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaa-gatattatgaattagggtattaagaatac 233  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  12513 atcaatagcggaagcaaataaaacattgaacataattatgatcgaatctacgacatgtttgatttatcaaggatattaagaattaggctattaggaatat 12414  T
Q  234 ctggataaagctttcatataagccctctaattatcaacgataaccaaagaga-gaggtgatctgaaa 299  Q
    ||||||||||||||||    || ||||| || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12413 ctggataaagctttcaaggcagtcctctcatcaacaacgataaccaaagagaggagatgatctgaaa 12347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 310 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 38344 - 38224
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctcttatatt 409  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  38344 cttcctcaactgatacctttatgtctcaagttctcttcagatgggaagaatagagtgtattatcatgtacggtgtattggagaccataacctcttatagt 38245  T
Q  410 g-gatgaccattagggttttc 429  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  38244 gtgatgatcattagggttttc 38224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 92 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38588 - 38434
Alignment:
Q  92 ttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatg 191  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||  ||   | ||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  38588 ttaaataaaaccagatttcataagacatgttcaatcattagaaatcaacagtggaagcaaacaaaacattgaacatagttatgatcggatctacaacatg 38489  T
Q  192 tttgatttatcaag-atattatgaattagggtattaagaatacctggataaagcttt 247  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  38488 tttg-tttatcaagaatattaataatta-ggtattaggaatacctggatgaagcttt 38434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold1114
Description:

Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 341 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 949 - 857
Alignment:
Q  341 tctcttcagatggggagaagagggagtattgtcatgtacggtgtattggggaccatagcctc--ttatattggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  949 tctcttcagatggggagaagagagagt-ttgtcgtgtacagtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccat 857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 310 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1001 - 950
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaaga 361  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1001 cttcctcaaccgttatctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaaga 950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1114; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 75 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1261 - 1089
Alignment:
Q  75 tgttagaaatttaggtcttaattaaaaacagatttcataatacatgtttaacaatcgtagatcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatg 174  Q
    |||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |  ||||||| || ||||||||||    ||  | |||||||||    
T  1261 tgttggaaattcagatcttaat-aaaaacagatttcataaaacatgttcaaccattatgaatcaatatcgaaagcaaacaat---ttagatatgattatg 1166  T
Q  175 atcggatctacgacatgtttgatttatcaag-atattatgaattagggtattaagaatacctggataaagctttcat 250  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||  |||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||    
T  1165 atcggatcaacgacatgtttgacttatcatgcatattaacaattagagtattagaaatatctggataaaactttcat 1089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6040 - 5954
Alignment:
Q  135 atcaatagcggaagcaaacaaaacattgaacatgattatgatcggatctacgacatgtttgatttatc-aagatattatgaattagg 220  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  6040 atcaatagcggcattaaacaaaacattgaacatgaatatgatcggatctacgacatgtttgatttatcaaaaatattattaattagg 5954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 310 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5862 - 5826
Alignment:
Q  310 cttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctctt 346  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5862 cttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttatctt 5826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 380 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 14121 - 14067
Alignment:
Q  380 ggtgtattggggaccatagcctctt--atattggatgaccattagggttttccat 432  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14121 ggtgtattggggaccataacctcttttatattggatgaccattagggtttcccat 14067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University