View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF17380_low_26 (Length: 427)

Name: NF17380_low_26
Description: NF17380
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF17380_low_26
NF17380_low_26
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (213-390)||(5817379-5817556)
chr4 (213-392)||(45995892-45996070)
chr4 (213-389)||(24059135-24059309)
chr4 (213-391)||(37605689-37605867)
chr4 (221-394)||(51579594-51579767)
chr4 (213-284)||(51579326-51579397)
chr4 (213-298)||(41277221-41277306)
chr4 (213-389)||(17044009-17044184)
chr4 (213-389)||(25164471-25164647)
chr4 (213-377)||(32525034-32525198)
chr4 (213-389)||(55281214-55281390)
chr4 (213-283)||(25784014-25784084)
chr4 (213-298)||(42179228-42179313)
chr4 (213-284)||(20107116-20107188)
chr4 (213-272)||(32290220-32290279)
chr4 (213-389)||(43749098-43749276)
chr4 (213-298)||(50498216-50498301)
chr4 (213-272)||(3287090-3287149)
chr4 (213-297)||(48525332-48525416)
chr4 (213-283)||(36851233-36851303)
chr4 (213-256)||(39631271-39631314)
chr4 (325-389)||(39631010-39631074)
chr4 (325-392)||(3287197-3287265)
chr4 (342-394)||(48525461-48525513)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (215-389)||(9521812-9521991)
chr6 (213-298)||(23915978-23916063)
chr6 (213-389)||(9045839-9046014)
chr6 (213-277)||(14314098-14314162)
chr6 (213-389)||(34792651-34792827)
chr6 (213-277)||(29429590-29429654)
chr6 (213-266)||(1244679-1244732)
chr6 (213-284)||(12748217-12748288)
chr6 (213-261)||(16717996-16718044)
chr6 (346-390)||(16718136-16718180)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (213-395)||(36272655-36272837)
chr2 (213-395)||(13696959-13697141)
chr2 (213-298)||(3121616-3121701)
chr2 (213-389)||(32599248-32599424)
chr2 (213-295)||(14945830-14945912)
chr2 (215-297)||(25333152-25333234)
chr2 (213-391)||(17823585-17823763)
chr2 (213-298)||(33299985-33300070)
chr2 (213-278)||(14242626-14242691)
chr2 (213-298)||(23860255-23860340)
chr2 (213-298)||(24475792-24475877)
chr2 (213-272)||(36709308-36709367)
chr2 (213-285)||(4434694-4434766)
chr2 (213-277)||(40095269-40095333)
chr2 (213-297)||(40216415-40216499)
chr2 (213-298)||(42061322-42061407)
chr2 (213-277)||(33555475-33555539)
chr2 (335-389)||(14242524-14242578)
chr2 (335-389)||(33555362-33555416)
chr2 (213-298)||(5562942-5563027)
[»] chr3 (19 HSPs)
chr3 (213-297)||(23004762-23004846)
chr3 (215-389)||(54713532-54713706)
chr3 (213-390)||(8330592-8330768)
chr3 (213-298)||(33288138-33288223)
chr3 (213-391)||(38247804-38247981)
chr3 (213-277)||(9271116-9271180)
chr3 (213-277)||(50989209-50989273)
chr3 (213-277)||(51092341-51092405)
chr3 (213-277)||(46135533-46135597)
chr3 (213-296)||(39947250-39947333)
chr3 (211-277)||(8496710-8496776)
chr3 (213-298)||(12224094-12224179)
chr3 (213-297)||(36674611-36674695)
chr3 (213-395)||(48034802-48034985)
chr3 (339-389)||(46135657-46135707)
chr3 (213-258)||(29915090-29915135)
chr3 (213-258)||(29964243-29964288)
chr3 (346-391)||(36674517-36674562)
chr3 (215-276)||(54413511-54413572)
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (213-389)||(13988253-13988429)
chr5 (213-298)||(15285335-15285420)
chr5 (213-389)||(36890383-36890558)
chr5 (213-298)||(43100299-43100384)
chr5 (213-298)||(33687653-33687738)
chr5 (213-389)||(11247198-11247374)
chr5 (213-298)||(6043012-6043095)
chr5 (213-283)||(35906000-35906070)
chr5 (213-268)||(8378350-8378405)
chr5 (213-284)||(12248279-12248350)
chr5 (213-276)||(20151390-20151453)
chr5 (229-283)||(1447853-1447907)
chr5 (346-390)||(43100207-43100251)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (213-389)||(2402925-2403101)
chr1 (213-298)||(46845747-46845832)
chr1 (213-388)||(29637211-29637386)
chr1 (213-298)||(526990-527075)
chr1 (213-298)||(39858353-39858438)
chr1 (213-389)||(1994959-1995134)
chr1 (213-266)||(1673375-1673428)
chr1 (213-298)||(49430555-49430640)
chr1 (213-277)||(6487734-6487798)
chr1 (213-297)||(26040976-26041060)
chr1 (213-389)||(27325627-27325804)
chr1 (213-390)||(33502523-33502700)
chr1 (213-266)||(44797589-44797642)
chr1 (213-297)||(7178203-7178287)
chr1 (213-298)||(13276555-13276640)
chr1 (214-295)||(19989246-19989327)
chr1 (213-298)||(29731194-29731279)
chr1 (213-277)||(32267577-32267641)
chr1 (213-298)||(15225082-15225167)
chr1 (213-298)||(40314098-40314183)
chr1 (213-259)||(40030844-40030890)
chr1 (213-275)||(40294845-40294907)
chr1 (213-297)||(47571655-47571739)
chr1 (342-393)||(29731323-29731374)
chr1 (255-297)||(12907642-12907684)
chr1 (325-389)||(40030904-40030968)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (213-298)||(2599537-2599622)
chr8 (213-293)||(41075693-41075773)
chr8 (215-277)||(8368483-8368545)
chr8 (213-298)||(28898001-28898086)
chr8 (213-297)||(10391397-10391481)
chr8 (213-293)||(31774730-31774810)
chr8 (213-298)||(45413629-45413714)
chr8 (213-297)||(1993732-1993816)
chr8 (213-277)||(16465724-16465788)
chr8 (213-277)||(43066016-43066080)
chr8 (213-284)||(11904859-11904930)
chr8 (213-266)||(14342312-14342365)
chr8 (229-298)||(27497194-27497263)
chr8 (241-298)||(10592010-10592067)
chr8 (213-293)||(31523608-31523688)
chr8 (213-297)||(44081073-44081157)
chr8 (213-264)||(4077086-4077137)
chr8 (215-297)||(45502670-45502752)
chr8 (213-282)||(35200562-35200631)
chr8 (213-273)||(12142087-12142147)
chr8 (325-389)||(14342187-14342251)
chr8 (215-248)||(44077642-44077675)
[»] chr7 (12 HSPs)
chr7 (213-389)||(38754897-38755071)
chr7 (213-298)||(31741049-31741134)
chr7 (213-298)||(42974469-42974554)
chr7 (213-389)||(46576242-46576418)
chr7 (214-389)||(33496506-33496681)
chr7 (213-297)||(38349551-38349635)
chr7 (214-297)||(11752604-11752687)
chr7 (213-297)||(28713683-28713767)
chr7 (213-277)||(47480125-47480188)
chr7 (213-389)||(30922710-30922886)
chr7 (213-277)||(48460665-48460729)
chr7 (213-282)||(37536422-37536491)
[»] scaffold0933 (1 HSPs)
scaffold0933 (213-277)||(3165-3230)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 213 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5817556 - 5817379
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||       |||||||    
T  5817556 tgatacatagaccatcttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgtccatgtggtccccacacacaccaaaaaactcatat 5817457  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcca 390  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5817456 ttattgtctcctacacacttttacatggggtggtacaatgtgtgtatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcca 5817379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 213 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 45996070 - 45995892
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| |||||||       |||| ||    
T  45996070 tgatacatagaccatcttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgttcttgtggtctcc-cacacacaaaaaaactcacat 45995972  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatccata 392  Q
     |||| |||   ||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  45995971 gtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaaatgtgtacatgaaacattatccata 45995892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 24059309 - 24059135
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||         ||  ||    
T  24059309 tgatacatagaccaccttagatggcatgtatcatttgtacacccacatacaattgtgacatgtgtccatgtggttcccacacacaaaaaaaatatc--at 24059212  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
    ||||| |||  |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||  ||||||| |||||||||||    
T  24059211 ttattgtctcttacacactcttacatggggtggtacaatgtgtgtatggaagaaagtgtgtacataaaacattatcc 24059135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 37605867 - 37605689
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| || || |||||||        ||| ||    
T  37605867 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggtccccccacacacaaaaaaagtcacat 37605768  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatccat 391  Q
     |||| ||    ||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  37605767 gtattgtccctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatccat 37605689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 221 - 394
Target Start/End: Original strand, 51579594 - 51579767
Alignment:
Q  221 agaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatatttattatc 320  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||       |||| ||||||| ||    
T  51579594 agaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccaaatacaattgtgacatgtgtccatgtgattcccacacatacaaaaaaactcacatttattgtc 51579693  T
Q  321 ttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatccataaa 394  Q
    |  |||||||| | |||||||||| |||||||||| |||| |  ||||  | ||||| ||||||||||| ||||    
T  51579694 tcttacacactctcacatggggtggtacaatgtgtgtatgaaagaaagtgtttacataaaacattatccttaaa 51579767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 284
Target Start/End: Original strand, 51579326 - 51579397
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtg 284  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  51579326 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacatacaattgtgacatgtgtccatgtg 51579397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Original strand, 41277221 - 41277306
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    ||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  41277221 tgatacatagatcaccttaggtgacatgtaccacctgtacacccacatacaattgtgacatgtgttcatgtggtccccacacacac 41277306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 389
Target Start/End: Original strand, 17044009 - 17044184
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| | ||| |||||||        ||  ||    
T  17044009 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggt-tccccacacacaaaaaaagtcccat 17044107  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
     |||| |||   ||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  17044108 gtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 17044184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 25164647 - 25164471
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| |  |  |||||||       |||| ||    
T  25164647 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggttcctccacacacaaaaaaactcacat 25164548  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
     |||| |||   ||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  25164547 gtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatgcaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 25164471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 32525198 - 32525034
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  |||||||||       ||   ||    
T  32525198 tgatacatagaccatcttaggtggcatataccacttatacatccacacacaattgtgatatgtgtctatgtgttccacacacacacacaaaaactgtcat 32525099  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacat 377  Q
    |||||||||   ||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||    
T  32525098 ttattatctctcacacactctcatatggggtgatacaatgtgtgtatggaaaaaaaggtgtacat 32525034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 389
Target Start/End: Original strand, 55281214 - 55281390
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| || || |||||||        ||| ||    
T  55281214 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggtccccccacacacaaaaaaagtcacat 55281313  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
     |||| |||   ||||| | | |||||| ||| |||||||| | |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  55281314 gtattgtctctcacacattctcacatggagtggtacaatgtatgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 55281390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25784084 - 25784014
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgt 283  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  25784084 tgatacatagatcatcttaggtggcatgtaccacttgtacatccacacataattgtgacatgtattcatgt 25784014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 42179313 - 42179228
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  42179313 tgatacatagaccaccttaggtggtatgtaccacttatacacccatgcacaattgtgacatgtgtccatgtggtccccacacacac 42179228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 284
Target Start/End: Original strand, 20107116 - 20107188
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtaca-cccacacacaattgtgacatgtgttcatgtg 284  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20107116 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacaccccgcacacaattgtgacatgtgtccatgtg 20107188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 272
Target Start/End: Original strand, 32290220 - 32290279
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgaca 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  32290220 tgatacatagaccatcttaggtggcatgtaccacttatacacccatacacaattgtgaca 32290279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 389
Target Start/End: Original strand, 43749098 - 43749276
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgat--ctccacacacacnnnnnnnctcat 310  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| | |||| |  ||||||||||||       ||||     
T  43749098 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacataattttgacaagtgtccttgtggtccctccacacacacaaaaaagctcac 43749197  T
Q  311 atttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
    || |||| ||    ||||||| |||||||| ||| |||||| | | |||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  43749198 atatattgtccctcacacactcttacatggagtggtacaatatatgtatgaaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 43749276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Original strand, 50498216 - 50498301
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    ||||||||||| || ||||| | | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  50498216 tgatacatagatcaccttaggtagtatgtaccacttatacacccatacacaattgtgacatgtgtccatgtggtccccacacacac 50498301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 272
Target Start/End: Original strand, 3287090 - 3287149
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgaca 272  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3287090 tgatacataaaccaccttagatggtatgtaccacttgtacacccacacacaattttgaca 3287149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 297
Target Start/End: Original strand, 48525332 - 48525416
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacaca 297  Q
    ||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  48525332 tgatacataaaccactttaggtggcatataccacttgtacatccacatataattgtgacatgtgttcatgtgttccctacacaca 48525416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 283
Target Start/End: Original strand, 36851233 - 36851303
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgt 283  Q
    |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  36851233 tgatgcatagaccaccttaagtggcatgtaccacttgtacacccacgcatgattgtgacatgtgtccatgt 36851303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39631314 - 39631271
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacaccc 256  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39631314 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacaccc 39631271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 39631074 - 39631010
Alignment:
Q  325 acacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
    ||||||| | |||| | ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39631074 acacactctcacatagagtggtacaatgtgtatatggaaaaaagtatgtacatgaaacattatcc 39631010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 325 - 392
Target Start/End: Original strand, 3287197 - 3287265
Alignment:
Q  325 acacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaagga-tgtacatgaaacattatccata 392  Q
    ||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  3287197 acacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaaagtgtgtacatgaaacattatccata 3287265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 342 - 394
Target Start/End: Original strand, 48525461 - 48525513
Alignment:
Q  342 gtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatccataaa 394  Q
    ||| |||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  48525461 gtggtacaatgtgtgtatagaggaaagggtgttcatgaaacattatccataaa 48525513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 215 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 9521991 - 9521812
Alignment:
Q  215 atacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacaca--attgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnn---ctca 309  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||          ||||    
T  9521991 atacatagatcaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacataattgtgacatatattcatgtgatccccacatacacacacaaaaaactca 9521892  T
Q  310 tatttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9521891 tatttattgtctcctacacacttttacatgggatggtacaatgtgtgtatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 9521812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Original strand, 23915978 - 23916063
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  23915978 tgatacatagatcaccttagatggcatgtaccacttatacacccatacacaattgtgacatgtgtccatgtggtccccacatacac 23916063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 389
Target Start/End: Original strand, 9045839 - 9046014
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgat-ctccacacacacnnnnnnnctcata 311  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | ||||||||||||       || | |    
T  9045839 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtatcacttgtacacccacacacaattttgacaagtgttcttgtggtcctccacacacac--aaaaacttaca 9045936  T
Q  312 tttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
    | |||| |||   ||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  9045937 tgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatgaaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 9046014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14314162 - 14314098
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgt 277  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14314162 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgt 14314098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 34792827 - 34792651
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||| | |||| ||||   ||||||       |||| ||    
T  34792827 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacatataattttgacaagtgtccttgtggtctctctacacacacaaaaactcacat 34792728  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
     |||| |||   ||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  34792727 gtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatgcaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 34792651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 277
Target Start/End: Original strand, 29429590 - 29429654
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgt 277  Q
    ||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29429590 tgatacacagactaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacatacaattgtgacatgtgt 29429654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1244732 - 1244679
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaatt 266  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1244732 tgatacatagaccaccttaagtggcatgtaccacttgtacatccacacacaatt 1244679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 284
Target Start/End: Original strand, 12748217 - 12748288
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtg 284  Q
    ||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||    
T  12748217 tgatacataaaccactttaggtggcatataccacttgtacacccacatataattgtgacatctgtccatgtg 12748288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 261
Target Start/End: Original strand, 16717996 - 16718044
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacaca 261  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16717996 tgatacataaaccaccttaggtggcatataccacttgtacacccacaca 16718044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 390
Target Start/End: Original strand, 16718136 - 16718180
Alignment:
Q  346 tacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcca 390  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16718136 tacaatgtgtgtatagagaaaagggtgttcatgaaacattatcca 16718180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 36272837 - 36272655
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| || ||||||||||       |||| ||    
T  36272837 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggtccccacacacacaaaaaaactcacat 36272738  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatccataaaa 395  Q
     |||| ||||  ||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  36272737 gtattgtctttcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtatatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatccaaaaaa 36272655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13697141 - 13696959
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| |  || |||||||        ||| ||    
T  13697141 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggttcccccacacacaaaaaaagtcacat 13697042  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatccataaaa 395  Q
     |||| |||   ||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  13697041 gtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatccaaaaaa 13696959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Original strand, 3121616 - 3121701
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  3121616 tgatacatagaccaccttagatggcatgtaccacttatacactcatacacaattgtgacatgtgtccatgtggtccccacatacac 3121701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 32599424 - 32599248
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| | |||| || |  |||||||       |||| ||    
T  32599424 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacatccacacataattttgacaagtgtccttgtggtccctccacacacaaaaaaactcacat 32599325  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
     |||| |||   ||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  32599324 gtattgtctgtcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 32599248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14945912 - 14945830
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacaca 295  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || || || |||||||    
T  14945912 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaaatgtaacatgtgtttatttggtccccacaca 14945830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 215 - 297
Target Start/End: Original strand, 25333152 - 25333234
Alignment:
Q  215 atacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacaca 297  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25333152 atacatagaccaccttggatcgcatgtaccacttgtacatcaacacacatttgtgacatgtgttcatgtgatcctcacacaca 25333234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 391
Target Start/End: Original strand, 17823585 - 17823763
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||| | |||| | |||| || || |||||||       |||| ||    
T  17823585 tgatacataaaccaccttagatggtatgtatcacttgtacacccacatacaattttgataagtgtccttgtggtccccccacacacaaaaaaactcacat 17823684  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatccat 391  Q
     |||| |||   ||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  17823685 gtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatccat 17823763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Original strand, 33299985 - 33300070
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  33299985 tgatacatagaccaccttaagtggcatgtaccatttatacacccatatacaattgtgacatgtgttcatgtggtccccacacacac 33300070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14242691 - 14242626
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgtt 278  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14242691 tgatacatagaccatcttaggtggtatgtaccacctgtacacccacacacaattttgacaagtgtt 14242626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23860340 - 23860255
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||| || |||||||    
T  23860340 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtatactcacacactattttgacaagtgttcttgtgatccccccacacac 23860255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24475877 - 24475792
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||    
T  24475877 tgatacatagaccaccttaggtggtatgtatcacttatacacccatacacaattgtgacatgtgtccatgtagtccccacacacac 24475792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36709367 - 36709308
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgaca 272  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  36709367 tgatacatagaccatcttaggtggtatgtaccacttatacacccacacacaattttgaca 36709308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 4434766 - 4434694
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtga 285  Q
    ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4434766 tgatatatagaccaccttatgtggcatgtaccacttgtacttccacacactattgtgacatgtgtccatgtga 4434694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 277
Target Start/End: Original strand, 40095269 - 40095333
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgt 277  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||    
T  40095269 tgatacatagaccaccttagatgacatgtaccacttgtacatccacatacaattttgacaagtgt 40095333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 297
Target Start/End: Original strand, 40216415 - 40216499
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacaca 297  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||  || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| || | |||||||    
T  40216415 tgatatataaaccaccttagatgatatataccacttgtacacccacatataattgtgacatgtgtccatgtggtccctacacaca 40216499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 42061407 - 42061322
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    ||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | |||| || || |||||||    
T  42061407 tgatacatagagcactttgggtggcatgtaccacttgtacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtccccccacacac 42061322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33555539 - 33555475
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgt 277  Q
    ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||    
T  33555539 tgatacatagatcaccttaagtggcatgtaccacttgtacacttacacacaattttgacaagtgt 33555475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 14242578 - 14242524
Alignment:
Q  335 acatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  14242578 acatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 14242524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 335 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 33555416 - 33555362
Alignment:
Q  335 acatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  33555416 acatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 33555362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Original strand, 5562942 - 5563027
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||| || ||||  || | | |||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  5562942 tgatacatagactattttaggtggcatgtaccatttatacattcatatataattttgacatgtgtcgatgtggtctccacacacac 5563027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 19)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 213 - 297
Target Start/End: Original strand, 23004762 - 23004846
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacaca 297  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  23004762 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtattcatgtggtccccacacaca 23004846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 389
Target Start/End: Original strand, 54713532 - 54713706
Alignment:
Q  215 atacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatattt 314  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| ||       |||||||||    
T  54713532 atacatagaccacgttaggtggcatgtaccacttgaacatccacacataattatgacatgtgtccatgtaatccccacacatacaaaagaactcatattt 54713631  T
Q  315 attatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
    ||| |||   ||||||| | ||||||||| ||| ||||| | | |||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  54713632 attgtctctcacacactctcacatggggttatataatgtatgtgtggaaaaaagggtgtacatgaaatattatcc 54713706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8330768 - 8330592
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||||| || ||| |  |||       |||| ||    
T  8330768 tgatacatagaccaccttagatggcatgtaccacttgtacattcacacacaattgtgatatatgtccatgtggtccccatatgcac-aaaaaactcacat 8330670  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcca 390  Q
    ||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||||  ||| ||| |||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  8330669 ttattatctttcatacactctcacatggggtgatacaaaatgtgtatagagaaatgaatgtccatgaaatattatcca 8330592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Original strand, 33288138 - 33288223
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  |||||||||    
T  33288138 tgatacatagaccaccttaggtggtatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgatatgtgtctatgtggtcctcacacacac 33288223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 391
Target Start/End: Original strand, 38247804 - 38247981
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| |  || |||||||        ||| ||    
T  38247804 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggttcccccacacacaaaaaaagtcacat 38247903  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatccat 391  Q
     |||| |||   ||||||| | |||| | ||| |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  38247904 gtattgtctctcacacactctcacatagagtggtacaatgtgtgtatgga-aaaagtgtgtacatgaaacattatccat 38247981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 277
Target Start/End: Original strand, 9271116 - 9271180
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgt 277  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  9271116 tgatacatagaccaccttagatggcatgtaccacttgtacacccacacataattttgacaagtgt 9271180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 277
Target Start/End: Original strand, 50989209 - 50989273
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgt 277  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  50989209 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgt 50989273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 277
Target Start/End: Original strand, 51092341 - 51092405
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgt 277  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  51092341 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgt 51092405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 277
Target Start/End: Original strand, 46135533 - 46135597
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgt 277  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  46135533 tgatacatagaccatcttaaatggcatgtatcatttgtacacctacatacaattgtgacatgtgt 46135597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 39947333 - 39947250
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacac 296  Q
    ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  39947333 tgatatatagaccaccttaagtgacatgtaccacttatacacccacatacaattgtgatatgtgtccatgtgatcttcacacac 39947250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 277
Target Start/End: Original strand, 8496710 - 8496776
Alignment:
Q  211 attgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgt 277  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||    
T  8496710 attgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtccacccacatacaattttgacaagtgt 8496776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 12224179 - 12224094
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| || || |||||||    
T  12224179 tgatacataaaccaccttaggtggcatgtaccatttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggtcccctcacacac 12224094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 36674695 - 36674611
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacaca 297  Q
    ||||||||| |||| ||||| || ||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  36674695 tgatacataaaccaccttaggtgacatataccacttgtacactcacatataattgtgacatgtgtccatgtgatcactacacaca 36674611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 48034985 - 48034802
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgat-ctccacacacacnnnnnnnctcata 311  Q
    ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | |||| | | || |||||||       |||| |    
T  48034985 tgatacataaaccaccttaggtgacatgtaccacttgtacacccacatacaattttgacaagtgtccttgtggtcccccccacacacaaaaaaactcaaa 48034886  T
Q  312 tttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatccataaaa 395  Q
    | |||| |||   ||||||| | |||||  ||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  48034885 tgtattgtctctcacacactctcacatgaagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacataaaacattatccaaaaaa 48034802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 389
Target Start/End: Original strand, 46135657 - 46135707
Alignment:
Q  339 ggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  46135657 ggggtggtacaatgtgtgtatggagaaaatgatgttcatgaaacattatcc 46135707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29915135 - 29915090
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccac 258  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  29915135 tgatacatagaccaccttatgtggcatataccacttgtacacccac 29915090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29964288 - 29964243
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccac 258  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  29964288 tgatacatagaccaccttatgtggcatataccacttgtacacccac 29964243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 36674562 - 36674517
Alignment:
Q  346 tacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatccat 391  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  36674562 tacaatgtgtgtatagagaaaaggatgttcatgaaacataatccat 36674517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 54413572 - 54413511
Alignment:
Q  215 atacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtg 276  Q
    |||||||||||| ||||  || ||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54413572 atacatagaccaccttaactgacaactaacacttgtacacccacacacaattgcgacatgtg 54413511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 389
Target Start/End: Original strand, 13988253 - 13988429
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| || || |||||||        ||| ||    
T  13988253 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggtccccccacacacaaaaaaagtcacat 13988352  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
     |||| |||   ||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  13988353 gtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 13988429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Original strand, 15285335 - 15285420
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  15285335 tgatacatagaccaccttagatggcatgtaccacttatacactcatacacaattgtgacatgtgtccatgtggtccccacatacac 15285420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 389
Target Start/End: Original strand, 36890383 - 36890558
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| || || |||||||       |||| ||    
T  36890383 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggtc-ccccacacacaaaaaaactcacat 36890481  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
     |||| |||   | ||||| | |||| | ||| |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  36890482 gtattgtctctcatacactctcacatcgagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 36890558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 43100384 - 43100299
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  43100384 tgatacataaaccatcttaggtggtatataccacttgtacacccacatataattgtgacatgtgtccatgtggtctctacacacac 43100299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Original strand, 33687653 - 33687738
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33687653 tgatacataaatcatcttaggtggcatataccacttgtacatccatatataattgtgacatgtgtccatgtgatctctacacacac 33687738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 389
Target Start/End: Original strand, 11247198 - 11247374
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||  |||   ||||||| ||  ||||||       |||| ||    
T  11247198 tgatacatagactaccttagatggcatatactacttgtacatccacacacaattttgacaaatgtctttgtgatccccctacacacaaaaaaactcacat 11247297  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
     |||| |||   ||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  11247298 gtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 11247374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Original strand, 6043012 - 6043095
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    ||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  6043012 tgatacataaacaatcttaga--gtatgtaccacttgtacacccatatataattgtgacatatgttcatgtgctatccacacacac 6043095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 283
Target Start/End: Original strand, 35906000 - 35906070
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgt 283  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  35906000 tgatacatagaccaccttaggtggtatgtatcacttatacacccatatacaattgtgacatgtgtccatgt 35906070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 268
Target Start/End: Original strand, 8378350 - 8378405
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgt 268  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  8378350 tgatacatagaccaccttagatgacatgtaccatttgtacatccacacacagttgt 8378405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 284
Target Start/End: Original strand, 12248279 - 12248350
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtg 284  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  12248279 tgatacataaatcaccttaggtggcatataccacttgtacatccacatataattgtgacatgtgtccatgtg 12248350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 276
Target Start/End: Original strand, 20151390 - 20151453
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtg 276  Q
    ||||||||||||||  |||| | |||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  20151390 tgatacatagaccactttaggtagcatataccacttgaacacccacacataattatgacatgtg 20151453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1447907 - 1447853
Alignment:
Q  229 ttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgt 283  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  1447907 ttaggtggcatgtaccacttatacatccacgcacaattgtgacatatgtccatgt 1447853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 43100251 - 43100207
Alignment:
Q  346 tacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcca 390  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  43100251 tacaatgtgtgtatagagaaaagggtgttcatgaaacattatcca 43100207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 2403101 - 2402925
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||| || || ||||||        |||| ||    
T  2403101 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgaaaagtgttcttgtggtccccccacacaaaaaaaaactcacat 2403002  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
     |||| |||    |||||| | ||||||  || |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  2403001 gtattgtctctcgcacactctcacatggaatggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 2402925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 46845832 - 46845747
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  46845832 tgatacatagaccaccttagatggcatgtaccacttatacacccatacacaattgtgacatgtgtccatgtggtccccacatacac 46845747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 29637386 - 29637211
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||  | |||||||       |||||||    
T  29637386 tgatacatagaccatcttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggtcctcccacacacaaaaaaactcatat 29637287  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatc 388  Q
     |||| |||    |||||| | | ||| |||| |||||||||| |||| | |||||  ||||||||||||||||||    
T  29637286 gtattgtctctctcacactctcatatgtggtggtacaatgtgtgtatgaaaaaaagtgtgtacatgaaacattatc 29637211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 527075 - 526990
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  527075 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccatacacaattgtgacatgtgtccatgtggtccccacatacac 526990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Original strand, 39858353 - 39858438
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  39858353 tgatacatagaccaccttaggtggcatataccacttatacacccatacacaattgtgacatgtgtccatgtggtccccacacacac 39858438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 213 - 389
Target Start/End: Original strand, 1994959 - 1995134
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgat-ctccacacacacnnnnnnnctcata 311  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   |||| | |||||||||||        |||| |    
T  1994959 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtctttgtggtcctccacacaca--aaaaaactcaca 1995056  T
Q  312 tttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
    | |||| |||   ||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  1995057 tgtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 1995134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Original strand, 1673375 - 1673428
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaatt 266  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1673375 tgatacatagaccatcttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaatt 1673428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 49430640 - 49430555
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  49430640 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacatcaatacacaattgtgacatgtgtccatctggtctccacacacac 49430555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 277
Target Start/End: Original strand, 6487734 - 6487798
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgt 277  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6487734 tgatacatagaccaatttaggtggcatgtaccacttgtacatccacacacaattgtgacatgtgt 6487798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 297
Target Start/End: Original strand, 26040976 - 26041060
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacaca 297  Q
    ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| || |||||||||    
T  26040976 tgatacacaaaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacatacaattgtgacatgtgtccacgtggtccccacacaca 26041060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 27325804 - 27325627
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| | |||| |  || |||||||        ||| ||    
T  27325804 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttgataagtgtccttgtggttcccccacacacaaaaaaagtcacat 27325705  T
Q  313 ttattatcttatacacact-tttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
     |||| |||   ||||||| || |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  27325704 gtattgtctctcacacactcttcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 27325627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 33502700 - 33502523
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||  || |||||||||||||       |||| ||    
T  33502700 tgatacatagaccacattagatgacatgtaccacttgtacacctacatgcaattgtgacatatgttcacatggtctccacacacac-aaaaaactcacat 33502602  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacat-ggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcca 390  Q
    ||  ||||||  ||||||| | |||| | |||| |||||||| | || | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33502601 tttatatctttcacacactctcacatagaggtggtacaatgtatgtacgaagaaaaggatgttcatgaaacattatcca 33502523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 44797642 - 44797589
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaatt 266  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44797642 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaatt 44797589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7178287 - 7178203
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacaca 297  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||    
T  7178287 tgatacatagaccaccttaggtgacatgtaccatttgtacacccacatacaattgtgacaagtgtctatgtggtctcgacacaca 7178203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13276640 - 13276555
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  13276640 tgatacatagaccaccttaggtggtatgtaccacttatacactcatacacaattatgacatgtgtccatgtggtacccacacacac 13276555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 295
Target Start/End: Original strand, 19989246 - 19989327
Alignment:
Q  214 gatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacaca 295  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  19989246 gatacataaaccaccttagatgacatataccacttgtacatccacatacaagtgtgacatgtgtccatgtggtttccacaca 19989327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Original strand, 29731194 - 29731279
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||    
T  29731194 tgatacataaaccaccttaggtggcatataccactagtacacccacatataattgtgacatgtgtccatgtggtccctacacacac 29731279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 32267641 - 32267577
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgt 277  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32267641 tgatacatagaccatcttaagtggcatgtacaatttgtacacccacacacaattttgacaagtgt 32267577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15225167 - 15225082
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||  || || ||||||||||    
T  15225167 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtacaacttatacacccacatgcaattgtgacatatgtccacatggtccccacacacac 15225082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Original strand, 40314098 - 40314183
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    ||||||||| |||| ||||| | | |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  40314098 tgatacataaaccaccttaggtagtatgtaccatttatacatccatacacaattgtgacatgtgtccatgtggtccccacacacac 40314183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 259
Target Start/End: Original strand, 40030844 - 40030890
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccaca 259  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  40030844 tgatacatagaccaccttaggtagcatgtaccacttgtacacccaca 40030890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 40294907 - 40294845
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgt 275  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  40294907 tgatacatagaccactttaggtggcacgtaccacttgtccacctatacacaattgtgacatgt 40294845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 47571739 - 47571655
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacaca 297  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| || | |||||||    
T  47571739 tgatatataaaccaccttaggtgacatatgccacttgtacacccacatataattgtgacatgtgtccatgtggtccctacacaca 47571655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 393
Target Start/End: Original strand, 29731323 - 29731374
Alignment:
Q  342 gtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatccataa 393  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  29731323 gtgatacaatgtgtgtatagagaaaagggtgttcatgaaacattatctataa 29731374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12907684 - 12907642
Alignment:
Q  255 ccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacaca 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  12907684 ccacacacaattgtgacatgtgtttatgtggtccccacacaca 12907642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 325 - 389
Target Start/End: Original strand, 40030904 - 40030968
Alignment:
Q  325 acacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
    ||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  40030904 acacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatgaaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 40030968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Original strand, 2599537 - 2599622
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  2599537 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccatacacaattgtgacatgtgttcatgtggtccccacatacac 2599622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 41075773 - 41075693
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccaca 293  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  41075773 tgatacatagaccaccttaggtgacatgtaccacttgtacacccacatacaattgtgacatgtgttcatgtggtccccaca 41075693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 8368545 - 8368483
Alignment:
Q  215 atacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgt 277  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8368545 atacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgt 8368483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Original strand, 28898001 - 28898086
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  28898001 tgatacatagaccaccttaggtggcatataccacttatacacccatacacaattgtgacatgtgtccatgtggtccccacacacac 28898086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 213 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10391481 - 10391397
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacaca 297  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  10391481 tgatacatagatcatcttaggtggcatgtgccacttatacacccatacacaattgtgacatgtgtccatgtggtccccacacaca 10391397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 213 - 293
Target Start/End: Original strand, 31774730 - 31774810
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccaca 293  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  31774730 tgatacatagaccaccttaggtgacatgtaccacttgtacactcacatacaattgtgacatgtgttcatgtggtccccaca 31774810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 45413714 - 45413629
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||    
T  45413714 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacatccatacacaattgtgacatgtgtccatatggtccccacacacac 45413629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1993816 - 1993732
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacaca 297  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||| ||||||    
T  1993816 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtatcacttgtacacccacacacaattttgacaagtgtccttgtggtctccccacaca 1993732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16465788 - 16465724
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgt 277  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16465788 tgatacatagaccaccttagacggcatgtaccacttgtatacccacatacaattgtgacatgtgt 16465724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 43066080 - 43066016
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgt 277  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  43066080 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacatccacacacaattttgacaagtgt 43066016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 284
Target Start/End: Original strand, 11904859 - 11904930
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtg 284  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  11904859 tgatacataaaccaccttaggtggcatataccacttgtacacccacatataattgtgacatgtgtccatgtg 11904930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14342365 - 14342312
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaatt 266  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14342365 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacacacaatt 14342312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 298
Target Start/End: Original strand, 27497194 - 27497263
Alignment:
Q  229 ttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  27497194 ttaggtggcatgtaccacttgtacatccacagacaattgcgacatgtgttcatgtggtttccatacacac 27497263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 298
Target Start/End: Original strand, 10592010 - 10592067
Alignment:
Q  241 taccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  10592010 taccacttgtacacccacatataattgtgacatgtgtccatgtggtctctacacacac 10592067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 31523688 - 31523608
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccaca 293  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | | | |||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  31523688 tgatagatagaccatcttagatgacatgtatcacttgtacatctatatataattgtgataagtgtccatgtgatctccaca 31523608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 297
Target Start/End: Original strand, 44081073 - 44081157
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacaca 297  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||||||||  || |||||  |||||||||    
T  44081073 tgatacatacaccaccttagatggcatgtatcatttgtacatccacacgtaattgtgacatgtgcccacgtgattcccacacaca 44081157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4077137 - 4077086
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaa 264  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4077137 tgatatatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtatacccacacacaa 4077086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 297
Target Start/End: Original strand, 45502670 - 45502752
Alignment:
Q  215 atacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacaca 297  Q
    ||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  45502670 atacataaaccaccttaagtggtatgtaccacttgtacattcatatacaattgtgacatgtgtccatgtggtctccatacaca 45502752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 282
Target Start/End: Original strand, 35200562 - 35200631
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatg 282  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  35200562 tgatacataaaccaccttaggtggcatatattacttgtacacccacatataattgtgacatgtgtccatg 35200631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 273
Target Start/End: Original strand, 12142087 - 12142147
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacat 273  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  12142087 tgatacataaaccaccttaggtggcatataccacttgtacatccacatataattgtgacat 12142147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 14342251 - 14342187
Alignment:
Q  325 acacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
    ||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  14342251 acacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 14342187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 248
Target Start/End: Original strand, 44077642 - 44077675
Alignment:
Q  215 atacatagaccatcttagatggcatgtaccactt 248  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44077642 atacatagatcatcttagatggcatgtaccactt 44077675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 12)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 38755071 - 38754897
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||        |||| ||    
T  38755071 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgaacacccatacataattatgacatgtgtccatgtgatccccacacaca--aaaaaactcacat 38754974  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
    ||||| |||   ||||||| | |||||||||| || ||||| | |||||| |||| | ||||||||||| |||||||    
T  38754973 ttattgtctctcacacactctcacatggggtggtataatgtatgtatggaaaaaaaggtgtacatgaaatattatcc 38754897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Original strand, 31741049 - 31741134
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||    
T  31741049 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccatacacaattgtgacatgtgtctatgtgctccccacacacac 31741134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 213 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 42974554 - 42974469
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacac 298  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  42974554 tgatacataaaccaccttaggtggcatgtaccacttatacacccacatacaattgtgacatgtgttcatatggtccccacacacac 42974469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 46576418 - 46576242
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| | |||| |  || |||||||        ||| ||    
T  46576418 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccacttgtacacccacacacaattttaacaagtgtccttgtggttcccccacacacaaaaaaagtcacat 46576319  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
     |||| |||   ||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  46576318 gtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 46576242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 214 - 389
Target Start/End: Original strand, 33496506 - 33496681
Alignment:
Q  214 gatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatatt 313  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||   ||||||| || |||||||       |||||||     
T  33496506 gatacatagaccaccttaggtgacatgtaccacttgtacacccacatataattttgacaagtgtctttgtgatccccccacacacaaaaaaactcatatg 33496605  T
Q  314 tattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
    |||| |||   ||||||| | |||||| ||| || ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  33496606 tattgtctctcacacactctcacatggagtggtataatgtgtgtatggaaaaaagtgtgtacatgaaacattatcc 33496681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38349635 - 38349551
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacaca 297  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| || | |||||||    
T  38349635 tgatacataaaccatcttaggtggcatataccacttgtacacccacatataattgtgacatgtgtccatgtgttccctacacaca 38349551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 297
Target Start/End: Original strand, 11752604 - 11752687
Alignment:
Q  214 gatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacaca 297  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  11752604 gatacatagaccaccttaggtggcatgtatcacttgtacacctacatataattgtgacatgtgttcacgtggtccccacacaca 11752687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 297
Target Start/End: Original strand, 28713683 - 28713767
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacaca 297  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| || | |||||||    
T  28713683 tgatacataaaccaccttaggtggcatataccacttgtacacccacatataattgtgacatgtgtccatgtgttccctacacaca 28713767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 47480188 - 47480125
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgt 277  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  47480188 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccatttgtacaccca-atacaattgtgacatgtgt 47480125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 30922886 - 30922710
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatgtgatctccacacacacnnnnnnnctcatat 312  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||| |||| ||||| |||| | |||  || || |||||||       |||| ||    
T  30922886 tgatacatagatcaccttaggtggtatgtaccacatgtacattcacacataattttgacaagtgtccttgtagtccccccacacacaaaaaaactcacat 30922787  T
Q  313 ttattatcttatacacacttttacatggggtgatacaatgtgtttatggagaaaaggatgtacatgaaacattatcc 389  Q
     |||| |||   ||||||| | |||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30922786 gtattgtctctcacacactctcacatggagtggtacaatgtgtgtatggaaaaaagtatgtacatgaaacattatcc 30922710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 277
Target Start/End: Original strand, 48460665 - 48460729
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgt 277  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| ||||    
T  48460665 tgatacatagaccaccttaggtggcatgtaccatttgtacatccacatacaattttgacaagtgt 48460729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 37536491 - 37536422
Alignment:
Q  213 tgatacatagaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgttcatg 282  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||| || ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  37536491 tgatacataaatcatcttaggtggcatatatcacatgtacacccacatataattgtgacatgtgtccatg 37536422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0933 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0933
Description:

Target: scaffold0933; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3230 - 3165
Alignment:
Q  213 tgatacata-gaccatcttagatggcatgtaccacttgtacacccacacacaattgtgacatgtgt 277  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  3230 tgatacataagaccatcttagatgacatgtaccatttgtacacccacatacaattttgacaagtgt 3165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University